Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score GTTAGCAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2R 2427611 5' + Doc 71 1 67.12 GCTGCTGGTCCGAATCGCGACGCGAGGTCAGTTCACGATCCGAATCGCTAGGCGCTACGTTACTTCTGTAGTCGCTAGAAGAAGTTAAGAGGCCGGAACTATTATGGAAATACAATGCATGAGCATACGTGGGCACACATAAAG:1 - chrX 15094146 5' - 1360 174 1 75.69 ACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chrX 21224561 5' + roo 8748 2 76.71 CCGGCGATAAGGCGTGTGCCGCAGCCGGGGAATCGATGGATGCCGCCCCCGGCGGCCCGTTGAAAGATGCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGGCTAGAGGGTTGGGGTTGGTGTATGTATCTTGCTTGGTTTGTTGGTGGGATGGG:1 + chr3L 21777674 5' - I-element 5060 1 50.00 AACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTG:1 + chr3R 19225010 5' + HMS-Beagle 6876 2 73.29 TAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:2 - 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chr3R 905082 5' - rover 7289 2 78.08 GTTTTGTGTGCGCCGTGTCGTGTTTCCATTTCAACCGCGAATTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 7850081 5' - roo 396 1 75.17 TATGATGATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGG:1 - chr2L 7618590 5' + X-element 4463 1 58.90 GTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGATTTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTT:1 - chrX 19038440 5' + hopper 90 1 76.03 AGAGGGCTTCGTTTAAAAATCATCGTTAGTCACATGTCTGAAAATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTA:1 - chr2R 6622684 5' + S-element 34 2 62.33 AATGTCCCTATGTGTGTGTTTGTATACGAATACAATACAAAAGCCTATTGATCTGTAAGAGCAAAGAATATGACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGC:1 + chrX 22906739 5' - transib3 2834 1 53.57 ACCCTTCCGAAACGGCAGACAATCCTGGCCATCGTCATCCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTACTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAA:2 + chr3L 14103203 5' + I-element 390 1 72.60 GTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACC:1 + chrX 22840502 5' + copia 4958 2 78.08 ACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 9544942 5' + roo 8719 2 56.85 TGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGGGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chrX 14450386 5' - hopper2 1558 1 51.39 AAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 + chrX 10521651 5' + Tabor 6922 2 71.92 CTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGC:1 + chr3R 2522292 5' + Tc1-2 121 1 59.59 ATCCAAATCGCGAACCAAAATAAAACCACAAACCTTATCTAAGCTACGAACAAACAATAATCAAAATTCAAGACCAACAAACTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCA:1 - chr3R 3374369 5' + invader2 305 1 60.69 GGGCCAATTTGTGGACCATCATCAAGTGAGAAATTTCCAATTTCCGAAATGTTCAATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 5390011 5' + roo 15 2 73.97 ATTTGTATGTATTCCCTTAAATCACTACAAAAAAACGAGCTATTTGCACAAATTAATTTGTAAAATATTAATCGGTGTAAGTAAATGCAGTTCTTAAAATGCTTAAAATGAAAAAAAAAATCAAA:1 - chr3R 13068702 5' - INE-1 472 1 71.20 CTATCTCTGGCCGCAAGGATTAATGGGGTCAATTTGGCTGTGACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCG:1 - chr3R 12786140 5' + F-element 4527 1 66.93 AATCTAAGCCAGCAGCAGCACAACTTGAACCATTTATGCCTACTCTATAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAAAATATGTCAGCCCGACGG:1 + chrX 18008759 5' + 412 7494 2 64.44 AATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 + chr3R 11810621 5' + roo 8712 2 51.37 AAAGAGAGAAAATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr2R 15652008 5' + hobo 60 1 57.53 AAGGCACCAAAATTATATACGCTTTTATCATCTCTAAACTTGACACTCAATTAGAAATTACGTGCATCGATTTGACAAAAAACTTTGCCACGCCCACTCTAACGGCGCAAAGCCGACAAACCGGTCACGCCCACACGTTTGAACAA:1 - chr3L 16035579 5' + INE-1 252 1 55.48 CTATTCCAATTATCCGTCAAATATGGTTGGAATTTAAATAAGAAAAAGGTAAATTCGCAACTTTGCTTGAATTCCTTGAATAGTTTGTTTTGCAAAATTTTTATTTTGCTCCGCGACTTATAATTTTGTC:1 - chr2R 3009305 5' - HMS-Beagle 306 1 70.00 GGGAATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr4 303828 5' - pogo 2053 1 53.42 AAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGC:1 - chrX 22689443 5' - 1360 3361 1 52.05 GTTTTTAGAAAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr2L 12251037 5' + 412 7070 2 69.86 GTGTGTGTGTGTGTTGGAAGGAGAGAGATAGTCCGAGAGAGATAGAGATATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATG:1 + chr2R 18066510 5' - Q-element 329 2 64.49 ATAAAAAGTGCTGGCAGGCGGTGTCGCAGCCAGGAGTCCTGTTATGATGCCTACACTGAGACAAAAGAAATCATTAGAAACATGAATAAGATAAATTGTTATTTATAGTAAATTATTTGCAATGAATTATTATTTATTTTATTTTT:1 - chr3L 15457410 5' - jockey 4825 1 45.21 AAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGAATT:1 + chr3R 11191365 5' - roo 9038 1 60.27 AGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATA:1 + chr3R 11040072 5' - Bari1 1629 1 72.41 ATTTTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCC:1 + chr2R 12185267 5' - accord 7373 2 75.17 ATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 12986610 5' + roo 8715 2 67.54 CCTGAATGCAATTCTGTGTACTTTCCTCAACAATTCATAAATTCCTTTAAGACTACTTGGTAGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chr3R 25432959 5' + transib2 18 1 45.45 TTGTATTTGCTTAAATTAATTACCCGTTGAAGATTCTTCGTTGACAAGAACGGAACAGGCAGAAGGAAGCGATTCCGACTATATAAAGTATATACATTCATTATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCATGCGATATCCGTCTGTC:1 - chr2L 21743507 5' + INE-1 114 1 66.90 CGTAATCGGATCAAGATTCAAACCCTAAAAATTTAAACTAAACAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATC:1 + chr2R 954660 5' + mdg1 7093 2 53.42 AGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACTGCGAAAAAATCGGGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTT:1 + chr2L 11391506 5' - 1360 19 1 45.93 AGTAACAATTTTAATTCGCACACAATCTTGAGTAGACTCCAAAATCTAACTCCTGAGTTTCACTACACGTTTCTCCTTTAGGCAGCTCCGAGG:1 - chr3L 25254565 5' - 1731 355 1 74.19 AGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3L 21769119 5' - I-element 5302 1 54.11 TTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 5532908 5' - roo 9036 1 57.45 ATTTTATTTAGTTTGTCATTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3R 25428103 5' + 297 6590 2 76.03 TGACTTGATGGTCAAACCCCTCGAAGAAGAAGCATTTTGAGCGACTGTAGAGCAGAAATCGCCAGTATCTTCCTGTTCCTGCATATGCATATATCATTAAAATAGGTCCAGACACATATGTACATACATATATATACATATATACA:2 - chrX 19819401 5' - G3 4510 1 54.11 GTTGAATAATTCTATAAATGGAAAGCTTATATGGGGTGCAGAAAAATATTCTAATTTATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTT:1 - 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chr2L 20840148 5' + P-element 2681 1 21.92 ACATATCCCACTCCGTGGATACAATCCTATACCAATTTCTTAACCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAAGCTTTGCCCACCATTTAAAACAAAATAATTTCGTTTTCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTT:1 + chr3L 7017299 5' + FB 666 2 69.18 CGCATTGGGGAGAGTGCTCCAATGGGTGGCATTATTGTTTGTTTATGTGTTTGCTTTGCTTTGTCTAAGGATTAAGCTGGAAAAATAGAGCCCACATTGAATGCTCATATGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAAC:1 - chr3R 28742149 5' + hopper2 1316 1 76.71 CAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 29084967 5' + 412 80 2 74.66 ACAATCAGTGATGCTAGCAACTAATTTCCATTGATTTTCAACAAAGCGGTGCTGACTTATTTAATTAATTTAATTTAGACCCGTTGGCTCCCGTCCCAGACCGCAAATCATTTG:1 + chrX 4102341 5' + mariner2 254 1 84.21 AAATTAACGGTTGCGTTACTTGTTACATGCATCCCGTGGACAGGGGTAAGGGTTAGGTGTTCATTGGGCAACGCCCTGAACCTATCCGATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 11795097 5' + opus 25 4 68.28 AAAAGATTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTT:1 - 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I-element 4931 1 65.07 CACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 21224636 5' - roo 347 2 59.15 ATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCC:1 + chr2L 8894666 5' + I-element 5280 1 71.23 AAAAAGGAGCTACAATTTCTTTAGAGCAATTTACGTTAATAGAAATGAACTCCATTTTTTTTGTTTAACTTTTGAACAAAGTGCATAGTTGTTCCGTTGGCAATGTTCTATGATAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTG:1 - chr2L 3987107 5' + invader1 3876 2 76.71 AGAGAAAAAGATAGCAACACAAGGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCTTGTAATATCGTATGCTGTCTTCTGCTTGATAAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACA:1 + chr2R 13934919 5' + copia 252 1 26.32 CATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAAATTAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 15072642 5' - pogo 2034 1 70.23 TTTCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATCTAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCG:1 - chrX 22576493 5' + Burdock 187 2 56.85 CTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAA:1 + chr3R 19450186 5' + roo 9033 1 59.86 AAAATAGAGTATATAAATTCAGAAAATACACAAGAATATCTTGGAATATCTATGCAGTCAGCAAGGAATTCCGTCGGTACCTGTAAACAGGTCTACACTTTAGTCAAGTTTCTTGACTATCAGATACCAGCTACTCAGCTAGTGTG:1 - chr3R 4356202 5' - INE-1 539 1 69.18 AAAATCGGAACACAACTTGTCTGCCATTGCCAGACAAATTCGAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTT:1 - chr2R 20474606 5' + hobo 2632 1 72.97 ATCAAACATATTAAATGTCCTTAAAATTTCACCAATCAATCTTAACAGGATTACTTCGCTAGCTCTTAATTAAAATTTATTGTTAGCTCGATTTTATGGCATTAGAGTGGGCTTGGCATAACGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAAT:1 - chr3L 22639596 5' - INE-1 310 1 60.96 AGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 - chr3L 13581721 5' + jockey 4838 1 70.55 AACCAAATACTTAGGAGGAAATAATGGAAAAATTTCTAGGAGAATGTCTACAAAAATTGCAATACAGTTAGATGACCCAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAG:1 + chr2R 2880045 5' + Doc 4433 1 68.49 ATCCATAAAAACGTTTTAGAAACGCTTAAGTTTTTATTCAAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - 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accord 7346 2 56.55 CATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGCGTGCT:1 + chr2R 22287443 5' + jockey 92 1 71.92 AGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 + chr3R 9298463 5' + hopper 60 1 57.53 GAATTGCCATCATTGGCAGTCACGAGTGCCTGCTGACGTAGTTGCCAAAATATCGCCGATTGGACGCAGTGCACTCGATTAGGTCTCAAACTGAACTCTCATAGTTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGG:1 + chr3R 13395579 5' - Idefix 436 2 55.88 GCCCGAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 19054202 5' + jockey 20 1 74.83 TTGGAAAAACTTGCTGCTGGCTTGACTTTTTTTCTTTTTACTTTTATTTATCTTATATTAGTCTTTATTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAA:1 - chr3R 18104326 5' - invader2 226 2 58.90 AATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - 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roo 9038 1 60.96 CTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 15790869 5' + roo 87 2 78.08 ATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAGG:1 + chrX 6688962 5' - INE-1 136 1 62.02 GAGTGCTTATCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCCTCATCATGCCAGACCCGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATTTCA:1 - chrX 21087711 5' - mdg3 5477 2 67.59 AGTACCGCGAAAATTTGGATCTTACCAAGCTGGACCAACCGGGAGCTAGTTATTGGTGCAACATTTTTGGAAAGTGTATTTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 - chr2L 21774623 5' + INE-1 16 1 45.21 CTAACCTCAAGCCTAAACGGGTTAAAAAAAAGGGACGTAGAAGGTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCATACATTGGTTTGGCAATGGATCTAGAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGAGAGAG:1 + chrX 18131269 5' + 1360 88 1 67.12 AGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGTGTAACGCCATACGTTTTTTTGGAACACGTTTTATTCGCCGTGGCTCTAGAGGGGGCTCCAGGCTCTCTCGACT:1 + chr3L 23146522 5' + 1360 77 1 79.28 AACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 - 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F-element 4597 1 72.34 AATATTTTTAAAAATTACTTTAATCGATCAAAAGCAGAAATAATTAAATATGCAATTAAATTAAATTGCAAAAGTAATATCAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCCACGGCCAAAAAATCGTGGGCCAAAAA:1 + chr3L 1490232 5' - 1360 41 1 73.29 ATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGAATTCT:1 - chr3R 15364017 5' - flea 4953 1 59.59 AAATTCAATTTTATTTTTCCTTATTTTAAGGAAATCTTGACTACTGTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGGGACATGAGAAT:1 + chr3L 2554517 5' - roo 332 2 67.12 GCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 - chr3L 3983854 5' - P-element 2783 1 15.07 AGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCG:1 - chr3R 16533696 5' + X-element 4426 1 46.85 ACCAATTGAATTTCTGCGAGACCAACATAACACATAAAAATTTCCAACTACTGTGATCTGAACAAAGCTCTAAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chr3R 9342371 5' + jockey 4859 1 52.05 TAGAGCATTGTTGTAACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr3R 28469300 5' - 412 7484 2 64.38 GATTTCTGCGCGACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:2 - chr3R 28385657 5' + transib2 32 1 63.70 GGCTTTAGAATCGGCGCAGAGGCCTTTGTATGACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 4964047 5' - roo 394 1 76.03 GTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3364 1 53.62 ATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATT:1 + chr3R 21276538 5' + BS 5062 1 60.96 ATGTAAATAGCTCAGTAATCGATTATTTATATTCTTTATTATATTAGTAACCTACCGTCTACTGAGTGAACTATGACATTGTCGGTTGCCCTTCATCATATTAATGATGATGCTGTGTCCCC:1 + chr3L 17527428 5' - Rt1b 4753 1 72.13 TCCAATGCAAATGCCTAAGCACATGAGAAAAGCTGTTTTTAATGATCTAACTTAATGATAATGTCAAGCAAGTAGTTTAATTGTGTCACATTCAATTTTTAGATTTCTTACACTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTT:1 - chr3R 29089066 5' + 1360 3309 1 67.81 TGTTATTCCCTGCAATCAAGCTAGCGAAAATAATGTGCGAAAACCCAAATCAAATAGAACCAATTTTCGCATACCCTAATTCCCCACACAAATGCACCCAAATGCTGAATAGAGTAAAACAAAGGGAAGATTCAAAAAATAATATA:1 - chrX 5827958 5' + Doc 4678 1 73.29 CTGCAATCTCTGATTGTGCGCAATAGAATATTTTTTAGATAAGACGTGGTCCGGGGTATCAACCAAAAGCAACTGTAAACATATATCTGCGGTTGGGGAACTCCACAGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 + chr3R 9363183 5' + TART-B 10199 1 73.29 GTTTTTTTAGTCTGATTGCATTAATCTCGTAGCGCTCGATCAAGTCAATTAAACAAGATAGGTAATAAAATATCGATAAGCATGAAACATTCCAAGGTATAAAAAAACAATGTGTTTTATTTTTTATTTGTTTTTTTTTTTAATAA:2 - chr2L 5207166 5' + hopper 154 1 58.90 TCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATAC:1 + chr3R 10270546 5' + Juan 4062 1 59.59 AACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGG:1 - chr2L 15550767 5' + Bari1 60 1 59.59 TTCTTTCGGCAGAGGCGCTATTTTCGCGCATATTGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGTGATATGGATTTTCGAAAAAGTTCGACAATGTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAATTTTTTT:1 - chr3L 15593093 5' + FB 169 1 71.92 GTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGGGCACGTTTGCTTG:1 - chrX 18282664 5' + P-element 61 1 32.79 GGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 - chr2L 12250970 5' + 412 7137 2 75.34 AGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr3R 15790071 5' + flea 4777 2 72.66 TTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:2 - chr3L 20711704 5' + jockey 4815 1 54.79 GTGAAATAAAATAAGTGCTGGAAACAGCAAAAGTTATGCCAAGTATTCCCGGCTAAGCATGAATCAAGTGCCATACAACGAACACCCCGACAGACCGAGAAAAGTGGGAAATGCGGGCAAAGCGACAAAATTACTTCAAAAACATT:1 + chr2R 15294102 5' + I-element 209 1 82.88 TTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chr3L 14720897 5' + F-element 87 1 66.44 ATTCATAAGTAATCTTTGGCCGCAGCCACATCGGCGGATCAACTCCACGGAAGTCGGTCTTGTGACCACGACGTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGGAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 11810772 5' - roo 9025 2 46.90 CAAGTCTCTGTTGTTTTTTTTTTTGTCTTATTTGATTTTTGTTTAATTTGCATTTACTTGCACATACATAACACACATAAAACGGCAATCGTTTTGCAATTGTTTTTTTTATTGTACTTTTTTTTT:1 + chrX 13169349 5' - Doc2-element 253 1 79.37 GTCAGTTTTTCAATTTAAGACCAAACTAAAGTTTAACCTTCAGGTCAACCCATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACA:1 - chr2R 8857105 5' + Ivk 5053 1 65.07 ACAATTAATTATTCTCTTTAATATATTTAAAAAAATGTTAGTGTGCGCTCCGTGATAGTTCAACGACGACTGACTCTTCGTTTATTCAGCACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 + chr2L 16858664 5' - Burdock 6366 2 68.28 AGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATT:1 + chr2R 3593676 5' + gypsy 1 2 59.57 AGATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGGGAATGAAAGGGCATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAGTTTTTGGCACACGAT:1 - chr2L 11391586 5' + 1360 34 1 48.74 TAATGTCAGTAGTTCTGGAGTTTAAGATTGACGTATTTGTTTGTATTTCGTACATATCTACAGCTGTGTTCAGAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGTGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTA:1 - chr3R 5367027 5' - HB 1562 1 61.64 ATTATACAATTTAAACGCTTGTTAGTGAAATATATTGCCGAAACGTGACAATCGCCTTTAATTAACAGTCTGAACAAACCTACATTGGTGTCGCTAACTATCTATTGGTTTTTATACATCTGTAATCTTGCCATATCCGCCTGTCC:1 + chr3R 7083205 5' + INE-1 115 1 63.01 AGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGCAATTTT:1 - chr2R 3120310 5' + 1360 3310 1 93.15 CACCTGTTTATGCATTTTTTATCTTAAATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAC:3 - chr2L 15936913 5' + copia 13 2 76.71 CAGATAAATTCGGAGCGAGCGCGCCAAATACAAAAGTTCGCAACGCGTTCAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCCC:1 + chr2R 21175326 5' + diver 424 1 53.33 AAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTCCTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGATTTTTATTTGGAAATATCTGCGGGTTAAATAGGT:1 + chr3R 14980316 5' - roo 343 2 57.75 AAATGAGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGGACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCA:1 - chr2R 2318283 5' + ZAM 7970 2 77.37 ATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr2L 22193444 5' + roo 89 2 79.45 CCATTAACGTTCCAAAAATTTCTTAAAAAATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 5582242 5' + pogo 25 1 68.49 ATGTTGTAAATAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAA:1 + chr3L 22890313 5' + FB 20 1 70.55 TTTATTTGTAAATTTCATGTAATTTATGCAACGCACACGGAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGT:1 + chr2L 20550590 5' - I-element 4958 1 70.15 AGAGGCCTTTGTATGACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 4964064 5' - roo 393 1 72.31 GTCTATTCACAAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3R 7420166 5' - 1360 3365 1 67.81 TTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:1 - chr2L 13844254 5' + Stalker2 64 2 59.72 ATTTGAAATTGAAATGCTGAAATTGTTGTGTGGAAAAAAAGTAAAAAATGGAAAATAAAATACGTGGAGGCCCGCCCCTACTCACATGGGACAAAAGATAAACACAAGAAGAAACGTTCTAAAAACAACAAAAAAAAAATTGT:1 - chr3R 13638158 5' - Tc3 86 1 69.93 AACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCGCT:1 + chr2L 7580915 5' + Transpac 6 2 38.75 ATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGATTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 2989900 5' - roo 9046 1 65.75 ATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 10731917 5' + 297 6596 2 69.44 CCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTAAGTAG:1 + chr3L 21996186 5' + Transpac 5001 2 73.38 TATTATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACA:1 + chr2L 22674735 5' + mdg1 16 2 74.66 CATTATTTTAAACATACCGGGTACTTCTGATCTTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAATGTGTTTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATTT:1 + chr2L 7579161 5' - 1360 3048 1 67.81 AGGTTTCAGAAATTTGAAAATGAAAATCCTTCAAGTTTTCTAAATCTATTTCCGTTAGCATAGGTGAATATAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCGGGTTTATTTAT:1 + chr3L 17855140 5' + 3S18 6100 2 55.71 AATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 + chr3R 15724292 5' - Juan 4164 1 51.37 GCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 18403098 5' - P-element 2861 1 68.49 ATTTATTTGTATCCTTTTTGCTGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chrX 15357786 5' + hopper 28 1 64.75 ATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr3L 2544633 5' + Tirant 8170 2 68.22 TTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAG:1 + chr2R 2591108 5' + roo 75 2 52.52 CGGCGAAGCAAAGATATGGATAAATGAGATGAAAAAGAAAACTTAAACAAAGTAAAAAAAAACCTGTTACATTTTTTTCATATATTATTATTGATATTAATAGCATAAAATATGTTAATAATTATTGAAAATTTATAAAAAAACAA:1 + chr2L 4032098 5' + TART-C 11093 1 54.79 AATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTACTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chrX 661866 5' - 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chr2R 2318265 5' + ZAM 35 2 61.64 CTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 - chr3L 10425862 5' - I-element 5272 1 76.03 TTATGAAACATTTTTTCGGACTTTGTTCGTTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 - chr2R 3564163 5' - Tabor 7283 2 56.85 ATATTGCATAGTTTGAAAATATTTTCGTTAGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:2 + chr2R 10161737 5' + transib2 14 1 76.03 TGAGATAGAGTCGAAGAAAGAGACAGGGATTCCGTCTACGACTGAGCTCGGCACATTTAGAGATTATAATTTTACAACGACACAAACTTTTCACGACTAGACTCCACGACTATTTTATTGGAAAAGAAATAAAACGGAA:1 + chr3L 11015302 5' - Gypsy12A_LTR 249 1 55.40 TATATTTTTGCGCTAGGATTGCTACAAACATTGATTTAGTTTAATGTTTAGGTTTAGTTTTAGGGTTTATGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGT:1 + chr3R 6897689 5' + 297 6925 2 50.68 CAGTCATAATAAAAACCAATTCCAAACGCTCAAATGTTTTGATTTTCCTTTGTTTTGTTGTTTGTCCTGCCAATTTTTATCGGTATACCTAAAAGAATGTGCCCTTTTTTCTATGTTTTTTTCTATACATTTTTTTT:1 + chr4 1002639 5' + Tc3 77 1 72.99 ATAAGAAAAGTCTTACCTTAAGTAGTCGCCACATTTGTTTCTGTAGCGGTTTGTGTTTCTTTACCTTATTTTCACCATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAATTCTGAATTCTTACCTTTAAAGTCAAAAATTCAAATTAT:1 + chr2L 17563523 5' - S-element 34 2 51.37 CAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3R 15325185 5' + 297 42 2 56.59 GCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr3L 19349909 5' - 1360 3350 1 56.16 CTGGCAAGTTGCCTCCCACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGG:1 - chr3R 8049046 5' + Q-element 112 2 66.44 AATTAACAAAAATTAGTAGCTGCTTAACGGGACCAACCACATCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGACCAGTCCTG:1 - chrX 6193906 5' - R1A1-element 4963 1 58.43 CATCTGTTTGATATACCTAACTATGGCCAGTTTTTGTATTTTTCCATTCGGTTAGTTCTCTTTAAGTGTACATTTCTATTGTGAAATAAAGATTTTGCGAAACTTGTAGTTTTTAAATAAAGTTTTCTTTTTTTATTTTCCTCTT:1 + chr2L 9391550 5' - Doc2-element 258 1 51.03 AAACAAAAATCCCACCCGCAATTCGATGGCCAATATTTGAGCCTTCTTGTCTCTCGTATGAACATACAAGCAATACTTCGCACAAATGCGATTACCCAAAACAATCCCACGCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATTA:1 + chr3R 18861874 5' + I-element 4920 1 56.94 AAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACT:1 + chr3R 10270569 5' + Juan 4085 1 55.48 AAACGATTATTACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr2L 9038273 5' + I-element 52 1 54.62 ATTCGAAAACAATCTTGATGCATTGCCTCCAATGCCTGCTATAGCTAATTTCCCCCCTGACACCGGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 - chr2L 7698490 5' + copia 26 2 55.48 CTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAA:3 - chr2L 13556470 5' + transib2 33 1 57.53 AGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:2 - chr3L 6447104 5' - transib2 2743 1 73.29 TAGGTAAAATTCATGAAGAAATAAATTAATCTGTCATAACGATAACATATTTTTAAGTTAATTATCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGC:1 + chrX 20338746 5' + 412 295 2 50.77 TTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 + chr3L 12315728 5' + transib2 67 1 63.70 CGGACAGATAGATAATACGAACACATCGGACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1 + chr3R 28901173 5' + transib2 12 1 72.22 AGACAGACCTGGTTCTAATGATCTACAATCTATGCTGAAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGAT:1 + chr3L 21655825 5' - HMS-Beagle2 7192 2 78.08 TATACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGTGAGTTAACTTCGTCCACCTACTTCTTTTCATATTAAAAAACACACATGCAAACATACGAGAAAATATATATATGTAAATATATATATAT:1 + chrX 9359280 5' + G3 4505 1 46.72 GACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 + chr2R 9158079 5' - mdg3 5412 2 77.94 AGAAATCCAAAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTA:2 + chr3R 23911364 5' + 3S18 5851 2 73.29 TGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAACAATATTACGAAAAATAATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGCCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACA:1 + chr2L 20840102 5' - INE-1 132 1 77.40 AACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chrX 10537837 5' + I-element 43 1 53.79 TATTTACATATTTGCGCTGAGTGGCACACTTCATAGTTGGCTCTTGTGTTTTGTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACCCTTGTT:1 - chr3L 12222863 5' + Circe 117 1 61.27 TATTTATTAAGAGCGCGCTCTCTTTCGTAACGATTCTGGTTACGCGCGCAAACTGAAGGCGATTGAAAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAA:1 + chr3L 16026067 5' + Porto1 4528 1 54.11 GGTGGGTTAAAATAGGAAGTTTTGTTTGCAGTGCGCACAGCAACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 16540896 5' + hobo 29 1 66.44 TGTGAAATACCATGAATAATCATCAGGTTTAAAATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 + chrX 2781236 5' + FB 88 1 79.45 GTAGGATCTGTTAACCGTACTCTTAGTACGGTACTGACAAAGAAACAAGAATAACATGAAGAGTAACGCCATACGATTGTTTGGCACACGATTTT:1 + chr2R 2427618 5' + 1360 37 1 87.37 GTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3R 30347347 5' + P-element 56 1 29.52 GTTGCATCTATTTCTTTTTAAAAAAAGGAGACCCCTTTTTAGGATTTGAAAATGGGTTGGCTATATTTTTTTTTTTAATTTTT:1 - chr3L 5452574 5' - Doc 4697 2 38.55 AATCCCACATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr3R 13973096 5' - 412 478 2 73.97 CTAAGCAGCGTCGAAAGCTCATAACGAGTTTGATTCACCAAACCAGTTGAATGGCTGAGAAAACACACAGACCAAGACAAACTCATAAAACACAAAACAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 7891973 5' + G2 3076 2 65.32 GTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGGGGTCCTATTT:1 - chr2L 23295872 5' + micropia 5020 4 60.84 AAATTTAATTTTATTATTATATATACTTTTTGGAACAGGAATCAATATAAAATGTCCATGGGATGGAATAAGAATCCGCTGCCGAATACGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTA:1 - chr3L 20595176 5' + Idefix 36 2 54.11 GTAATTTCGTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGGTTATATTTGTGCGCGTACATAGCCATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAAT:1 + chr2L 22340121 5' - 1360 3166 1 53.72 ATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2R 8047338 5' - 1360 3351 1 61.47 AGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTG:1 + chr2L 12818230 5' - hobo 2882 1 54.11 CAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:2 - chr3L 22035652 5' + F-element 78 1 70.55 TGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 - chrX 19038476 5' + hopper 54 1 54.79 AAAGTATGGAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCG:1 + chrX 18396029 5' - roo 399 1 68.49 TGATGGATTGGAGCTCCATTGTCTTCACATGAGTCACTAAACCACGAGAATCTTATAGAGTGTATCACTTGCTGCAGTAACTCACTCTAGAATAAGGAAATATAATCGAAACAAGTCAGAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTA:1 - chr2R 21868639 5' - INE-1 566 1 74.48 ATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 24219296 5' + roo 88 2 79.45 AAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 - chr3L 17940230 5' + 1360 46 1 51.37 ATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAA:3 - chr2L 13556441 5' + transib2 62 1 59.59 GCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGACGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTTGATAG:1 - chr2L 16275000 5' + FB 28 1 61.25 TCTTTTTTGGCCTTTTTCAATATATATTTTAGCCGGCAATAAATATTTACACAAGGCAGGCGAAAGAAAAAAAAATTCTATACGAGGAAAATCGTTTCAAATGCCAGGATACAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 12262979 5' + G2 3071 1 65.35 TTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTG:1 - chr2R 5303163 5' - FB 209 1 53.47 AGTCTGTCTGTCCTTTCGTATAATTCAGGAACCACAAGAGTGGAAGTTATAAACAAAATCGAAATCGCTTTACTTGCATTGCAGTGCATTTCTTCAACTTCACTGCACTTCCATCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGAT:1 - chr2L 20935320 5' + INE-1 545 1 51.45 GGAAGTCGTGACTGTACCGATTAAAGAAGGATGACTTTCCCACCCTAGCAAGCGCCCTTGGAATCAAGCCGGGGTTAAGGCCATCAGCGGAAATCACGATCAGCTGAAAGGCACTCTATTTACGATAACCAAACTATCCAAAAACT:1 - chr3L 23768565 5' - Gypsy12A_LTR 164 1 52.74 AACAATGAAAATAAGTAAAATGAAAATACATATAACAAATAAATTTGTCGTGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACAGCCCGAAAAAGTTAATTTAAC:1 + chrX 14631163 5' - hopper2 1495 1 48.63 TATTAACCTTTTCCGGAGTAAATCGCTCGCTATTGCGCAAGGACAACGAAGTTGTGTGGCTAACCGTACATTTGCAGCGTAATCGTTTTATGTTAGTTGTTAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 6103074 5' + roo 8681 2 68.28 TGGAATGGTTTATGTCTGAACTCCAGCCACCTTGTAATTTCGTATGTCGTTTTCTGCCTGTAAAAAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGC:1 + chr2L 8287212 5' + Gypsy12A_LTR 2173 1 41.35 GTACATATTCATAAGTAGATATTATTATAGATGATACTTATTATGTAGTAGCTCATTTTCGACTATATAAAGTATATAAATTATTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATATAGTTATGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCGAGAT:1 - chr2L 21794146 5' + INE-1 131 1 63.70 AAAAGGCTTACAAATTTGAAAAGATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:5 + chrX 12986481 5' - roo 398 1 76.71 AAGCTGTTAATAGGCTGTTGTGAGTGGTTGGTTTGTGAGTCACAGGTGGGTGTTCTTTCCATCAGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGG:1 - chrX 11698968 5' - mdg3 5274 2 54.81 AATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr2R 14653147 5' + 297 40 2 52.05 ACCATCGTGTTAAGTCCGGTTAATTAATGCGCCCTTAACCGGAAAAAACAATTCTGCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAAGATTAAGA:1 - chr3R 26178528 5' + 412 7 2 78.08 TAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:1 - chr2L 11257132 5' + rover 6992 2 58.22 GTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 14980421 5' + roo 50 2 52.05 GGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACA:2 + chr2R 5106238 5' + Stalker2 35 2 59.59 AATAACCAAGAGATAGTCAATCCCAGCCACATTTTCGACTGTCACAATGCACAATTTGTGGCCATTTAGGGGAGAGGCGCTCAAATAAATTAAATGAATGTTAACCCCAATACGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGC:1 + chr2R 23221497 5' + 1360 258 1 78.08 GCGACAGCATTTTGTTCTGATTTTTCTATTAAAGACCGAGAAATTTTATTTATTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAATGGTATGGAAAATATTTATTTATTTTTATAATGTAGGTACATGTTT:1 - chr2R 5185487 5' - mariner2 814 1 69.18 AGTGCACATATGAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCTTTTTTGTGTTCT:1 - chrX 10521770 5' - Tabor 477 2 75.19 AAAGAGACGCCGCGCAGCTTAACATCCGCATGAGTGTTGGTCGGACAGCGTTTGTGTTGGGCCTTTCAATTTAAATACATACACCCACACGCACACACACACACACAAATATACA:1 + chr3R 22921155 5' + accord 7032 2 79.13 AGTTAATTAGTTTCAGCACGCTGCATAATATATTCTTTAATTTAATAAGTTAATTTATAACAAACAACGATAAAATCTTTTATTAATTATCTAATTGTTTAATTACGTAATTTTAATTGCGTATAATTAAAAATAAAATTTAAAAA:2 + chr3L 10463632 5' - hopper 180 1 78.08 TAAAAAGAATTAAGTTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 20898671 5' - roo 393 1 75.34 TCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 - chr3R 31886919 5' - hopper 1333 1 73.29 CTCAAGGCGATCTTGGCACACTTTGAGCATAAATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:3 + chrX 1263916 5' - Burdock 6359 2 60.96 CATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3L 18403096 5' - P-element 2859 1 67.12 AAATACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr2L 20266055 5' + roo 8709 2 53.42 AACAGCGTCAGACTGTCTGGTATGCCACTTTGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTT:1 - chr3L 16211584 5' - transib2 2769 1 71.05 AAGCGCACCAAAGACACAATTTCAGATTGGTTGAACATTTGGGCAAATGCGATTGGTGGAAAATGTGGCCGAATGCTTCTTAAATCATTCTATTCTATGCTTTTTTAGGGTATATTTTTTTTGTTTTTGAACATTTT:1 - chr2R 20377738 5' - TART-A 13403 1 63.50 CAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAACAACAAAACTTTGATTTTTCCGACCCC:1 - chr2R 1076508 5' - FB 15 1 79.31 GCTGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr3L 1692098 5' - blood 303 2 73.19 GAAAATTGCTGTAGACAGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTT:1 + chr3L 13365699 5' + BS 5007 1 68.49 AAATCACTCTTTAGCTCTCTCACCCACGGTTCGATGGCTTTTCACAATTTAACACCAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 - chr3R 16519042 5' - Tirant 394 2 79.45 CGAGTTACCGACCCATCGGAACCATACACCAAAGACCCTAGAAAAACAAGATGCGCAACGCCATACGATTTTTTGACAATCGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3R 443018 5' + 1360 54 1 88.46 TGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 - chr3R 16630350 5' + FB 72 1 66.44 ACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCGAAACCAGCCACTATCATTATTTCAAA:1 - chr2L 14074574 5' + 297 6607 2 66.42 CTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1 - chr2R 21160747 5' + Transpac 76 2 69.86 GGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 - chr2R 20349065 5' - transib2 2772 1 53.42 ACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTT:2 - chr3R 1844842 5' + Cr1a 178 1 64.38 ATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAG:1 + chr3R 19449919 5' - roo 8952 2 57.58 AGTTTATGACAGCTTTCCAGGCACATGGCAAATATCTCACATTGTTTCGACACCTGAGATAGATTCCCAAATTGAATGCAGAATTTCGGAGAATGGCGTTGGCATCTTAATATCTCTTCCCGTTCTGGATTTATTAATTTGGGCCA:1 - chr2L 12961555 5' - Transib-N1_DM 28 1 69.86 AGCAGCGCACAAAAGTAGGCAACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGATTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 12930685 5' + jockey 18 1 64.65 ATTCGTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATTGTTATCTTTTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAAATTAAAT:1 - chr2R 4870273 5' + Juan 58 1 49.29 TTCGGACAGATGGGGCCTACTAAGCTGCATATAACCGGCAAACAAGTCAACTTAAAACTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGGCGAGTTCCCCGACTATCA:1 + chr3L 90940 5' - INE-1 563 1 60.00 ATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACTGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chrX 8092516 5' + pogo 33 1 61.64 ACTTTATTAATTACAAATACATATGGTTTGCACTGTGTCCAGTTTCACTTTGAGATACATATTGAAAGGTGGAAGTGTCGTCAAAGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 11159224 5' + roo 8699 2 51.37 AAATATTGAGATGCTCGATCTTTGATTTCCACTAAAGGAAAGCACAACTTTCTTTTAAAATTTGTACCAGAACTCGCAAATTTTATTAAAATGTTCAATATATGTTTATACAATTTTTTAAACCATAAGATAAATTAAAGTGAAG:1 + chr3L 7429840 5' + TART-A 13104 1 33.10 AATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr3L 5881680 5' - pogo 2083 1 62.50 AGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chrX 19074896 5' - mdg1 393 2 62.24 CATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTT:1 - chr3L 16973464 5' - S-element 1661 1 61.43 CTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 - chrX 5323162 5' - Juan 4191 1 32.88 AGCTAGTGGCAGCCCAAAAAACATCAACTTGGGAATGCGAAGCATGCCTGGCAAAGAATGATATGTCGCGGAAGACGTGTATCTGCTGTGAACAGATGTCCCAGCGTTTCTGTGTTTTCTGACACTTTTTCATAATTTTACTCACT:1 + chrX 16604147 5' - Tc1 1572 1 67.12 CAGAAGAGCAACCGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chr2L 12822870 5' - P-element 2820 1 38.36 GTACAGTTAAAAAGAAATTCAAAATATTTTTCAAAATTGAGGTAAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTATATTTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCT:1 - chr3R 7518708 5' - FB 1 1 62.39 AGCCAATTGATAAATGCATAACCAAGACTTCATTCGAAAGGCTTGTTAACTTTCTCATTTGGTACTTCACAACTTCAATTTTGTTTTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTC:1 - chr3R 9599555 5' - Tirant 480 1 63.01 GTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chrX 9530433 5' + 297 6624 2 55.48 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCA:4 - chr3L 16731387 5' - rover 7243 2 78.08 AACACAGTCCCGAAAAATATGTATTTATATCCATCTGTACATCTGTGTGTGCCTCAATGTATGCTTGCATATTTCACTTTGTGAGGCATTTAAATGAATTAAGTGCTGTCAGGATATACAAAAAAAAAATTTAAAAAATTAAAAAA:1 + chr2R 18001287 5' + HB 318 1 51.37 GTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGG:1 + chrX 6475266 5' + Doc 16 1 73.23 GGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 - chrX 9950590 5' + jockey 4754 1 73.97 TGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 20167682 5' + roo 45 2 55.22 TATAATATACATAATTATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTT:1 - chr2R 24170048 5' - transib2 2822 1 56.16 GTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:5 - chr3L 16470350 5' + jockey 4749 1 69.86 TATTTATTCAATTTCTTCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGTCCATG:1 + chr3L 19045000 5' + 412 92 2 75.34 AGATAACATAATCCATGGCCGGGAACCGTGAGCAACCTTTTTTGGTTTTGTTTTCATTTTAAAGGGAGACGGGCAACGAAAATACCGGGCTTCAAAAATAATCTTCAA:1 - chr2L 20969679 5' + Q-element 276 2 73.15 ATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGGCGCGCTCTCTGC:1 + chrX 4808539 5' - mdg3 5409 2 74.66 TGTGGCCGCTTATGTGGAACTAACCTCGGATACGGACGACAGCAGCCGTAGATCTGATACGCCTGCCAATGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGGTCTC:1 - chr3L 14415358 5' + 1360 3221 1 55.20 AAACACCAGAGAATTTACAAAAATTCTAGGAAATTAATTAACTAGTTATATAATAATATAATATATATAAACTATATTTTTTATACCCGTATCCCGTGGAGTAGAAGGGTATAGTATGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTTTTT:1 - chrX 22969432 5' - 297 6499 1 76.03 TTATAACTAATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGC:1 + chr2L 14026092 5' + F-element 430 1 75.89 ATATGTAAAAGAAATTGTGCAGAACTGCGGGTCTTCCTTTCTTGTTTTTACTCCAAAACTTGAGTTTCTTCGCCAGTTTATGGACTACTAACCCGGGCTCGAGTTCGAAGTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGAAGTGG:1 + chr3L 376327 5' - FB 106 1 67.81 GAAGAGAGTCCGAACAATTTGTAATTTAAATTAACCAGCTGGCTGTGTTCCGTGTGTCCATTTGCGTTTTGCTCTTATGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGACATAAAGATCGAGCAGTC:1 + chr2R 8417804 5' - Tabor 193 2 54.11 TTTTTAAGTCATTTTTTTGCAGTCACTTCACTTTATTATTATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCTTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGAT:1 + chr3L 6254307 5' + Cr1a 4048 1 73.29 AATTTCAGCCAGCATGTAACATTCGTTGAAAGCGCACAAGTTGTTGCAATAAATAGTCATAGTAATTGTTGTTTTTTTTTTTGTTT:1 + chr2L 4824749 5' - gypsy7 5013 3 75.58 ATATGCAGCCATATTTTCCAACTGTGATTTTCCGCCAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGGACGTGGCGATG:1 + chr2R 20413886 5' - Burdock 167 2 76.71 GCATGGTTTTAGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2L 16564618 5' - roo 406 1 76.43 GGGTAGCCTTAAGCGGATTGCTCTTACTTGCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACT:3 - chr3L 16973494 5' - S-element 1685 2 62.33 ATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCATTATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGATCTAATGTCCCGTCA:1 + chr3L 10373827 5' - 297 370 2 55.88 TTGTGACTTTTGACTACACGTCGCACAGTGAGGCAGATGATTTTTCTAGCGAAAAAAATTTTTTAATATTTAAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 + chr2R 2590656 5' - HMS-Beagle 231 2 73.97 CCGTTTCTGGAGGAAGCCCTCTCTCGAAGTTCCACACACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCC:1 - chr3L 15921023 5' + F-element 4523 1 65.05 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTG:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 7565 2 63.04 AGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:1 + chr2R 24427585 5' + jockey 4756 1 71.23 ATCCATGGAAGCAGTGGTTCCGTCAGAGATCAAAAATAAAAAAAGTTTGCATTCCAAAAGCAACCTTCATCAAAGGCATCATACTTTCAGTGAGGAGCTTTGATTTAAATAATTTAGAAAGGATTTTAAAATAGAAGGTATTTACT:1 + chr3L 23962222 5' + Transib5 279 1 65.07 AGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:2 + chrX 12066115 5' + transib2 66 1 63.01 ATCTGCCCCCCTGAACAACAAGTGATGGTGACGATCAAGTGTACGGCCCCTACAGTAGATTATGCTCTTTTTGTTTTAGACTTGTATTTTATTATTATACTTTTGGTGGCTTAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTG:1 + chr2R 15897559 5' - Juan 135 1 70.83 AGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 4575730 5' + jockey 70 1 60.27 GGTAATTCCTGCAAAGGGTGATTTCCCTCCAGTCCCGCGCCTCGCGGGTTCTCTCGAGGTATATTTCATGGAATTTAGTGCACTTGCATGTGGAGACACGCGCTCCTATGTTCGTATAATTTGTTTATTGATATAGATACTT:1 + chr3R 24428768 5' - Idefix 7106 2 37.32 GCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCAACAAAGGGATCATATCTTAAGAACTATGTTTAAATAATCTTAATATTTGGTTGCGTGAC:1 + chr2R 5410982 5' - Tc1 1335 1 70.55 ATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chrX 14450514 5' + hopper 39 1 57.75 ATGTCAACGATAATCCACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTT:1 - chr2L 17809311 5' + jockey 22 1 73.97 CAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chr3R 16630373 5' + FB 28 1 44.17 AGATATAATAAGGGGGAAAAAAAGCCAGTTGCGAAAATGTGGCAGAATGGATTCCGAATCTGTTGCCGTCGAGTGCAGTCGAACCATTTCGGCTAGATACAGCTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCA:1 + chr3R 14962496 5' - Stalker 7076 4 64.38 ATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - 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X-element 4387 1 74.44 CAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr3L 22035645 5' + F-element 79 1 74.29 GTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTTGCCAAAGGGCC:1 + chr3R 19450018 5' - roo 8650 1 72.60 GTTGTAGTTTAGTTGTAAGTGTGGGCATTAAATTACAATTGGTTCAATTGAATTAAAAGCTGAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTTAGTTTTTAATTTGTTTCTCATTTTGTTCACCAATATTTATCGATATCTCAGAAAAA:1 - chrX 19810393 5' + INE-1 500 1 59.59 TACCATGTCCAAGGGAGTAATAATTTGAAATAAATTGTTAAAGATTATCATACCAATGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCGC:1 + chr4 960143 5' + 1360 62 1 61.03 TAGGCAATGCCAAATGTAAGTTCCCTTTCTTCAGTCTAAAAAAAAAAGTGGCAGCATTTTTTAATACTCAACTTTTAAGTTTATTGTTGGGTTAATTTCTTTGGTATTGAATTGATGAACTCCAATTAAGAACAAAAGTCCGTTT:1 + chr3L 13836565 5' - 412 477 2 48.28 AATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:3 - 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accord 7353 2 61.64 TGAATAACGTATGCATGGCGGCGATTCCGGCGGATTTCTGATCGATTTTCCACTGCCGCCTTCTGGTATTTTCTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATT:1 + chr3L 21476179 5' - Transpac 4882 1 65.18 CCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr3R 7420334 5' + 1360 29 1 67.12 TTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:1 + chr3L 24934295 5' + HMS-Beagle2 59 2 60.27 TATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chrX 6475316 5' + Doc 84 1 71.72 GATGGTGGTTAGTTCCGAATGGAATGGAGCCTACAGCCAATCCCATTCACATGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGT:1 - chr2L 4231092 5' - I-element 4872 1 63.57 AAGGTGAAGAGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3R 13406371 5' - pogo 2082 1 72.60 CCCTTGAGACATTTGATGCAATGCCAACAGGGGGCAACAAACATGATATATCTAAGTTCATCTATTGAAAGTCATTGTGCTGCACTAACTACCGACAGATGGCTGCACTTTCAGTAAACAAAGAAAAACAAAAAAAAAGGAAAAAA:1 + chr2L 13317718 5' + Doc2-element 229 4 78.77 GTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTA:1 + chr3R 11040078 5' - Bari1 1622 1 76.71 AACGAAAACAAAATGCTCGAATATGAAAATTTATGGACAAATGAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAA:2 - chr3R 20168339 5' - Tc1-2 1618 1 53.42 ATCGGTTAATGTCTGTCACGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATA:1 + chr2R 17712743 5' - invader1 3560 1 56.85 ACAATACCGATGACTGCGTAAGATTTCCGCATTTGCCGACCTTATTTCTCAGTGCACTGGTCGTGGCCAGAAATCAAGCTCTCATGAAACACCACCAACACCGAGGACAGCCAAAAAAAAACATATACAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chrX 19818887 5' + BS 5103 10 69.86 CAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATAT:1 - chr3R 23618199 5' + hopper 88 1 76.03 CTTCAGACCCAACATCATCATGCGCGCCACCCAAAAGAAGATAATATCATGGCCAGTCTGCATTATGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCAT:1 + chr3L 8962843 5' - Doc 213 1 55.80 ATTAAAACAAAAATTATGTTTTTTATAATAAAGCTTCCCCAATAGTAATTTTAATTGTTACATTTATTTTCATTGCAAATTTTAAAATTTTTATGTATTTCTTAATTATTATTATTATTTTTATTATT:1 + chr2R 3204466 5' - mdg1 7066 2 78.91 ATATAAATAAATATGTACAAATGTATTTGTCGCAGATCATTTATATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1 - chr2R 1374689 5' + invader1 32 2 77.50 AATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:2 - chr3L 22035644 5' + F-element 86 1 76.03 ATACATAATTATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr2R 24170042 5' - transib2 2816 1 52.05 AGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCT:1 + chrX 20999522 5' - 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roo 344 2 62.76 AAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAA:1 + chr3R 18399356 5' + Juan 4065 1 41.78 ATATATTTCTTTTCTTTTAGACTTTAAAGCGAAGTGTGTTCCAATTTATTTTTGCGTTTGTCAAAACCAGTGACGGTTTTTAATACATTCTTTAATTATCTTATATTGTAAACATAATTATTAAATAGTGATTCTTTGTGATTTGT:1 - chr2R 4350430 5' + Cr1a 139 1 64.38 GTCGTATTTGTTCTTGTTTTTCTTCAGCTCGTCAATGGACAGCTGTTTTGAGATTGTTTCCTGGTGCTCGAGAAAAATAACAAATAAACAACACAGCTGCATATGTATGCAAAGAAAATACAATTGTTCAAACTACACTTTACACT:1 - chr3L 11554657 5' - Doc 102 1 65.07 TTATATCAAAGGGAATTTTGATTATGATTATATCCGTTACTTGTAGTGTAAAGGGGTTTACTAGATTCGTTGAAAGTATGTAACGGCAGAAAAAAGAGTTTCCGACTATATAAAGTATATACATATATTCTTGATCAGGGTCAAAA:1 + chr4 814949 5' + INE-1 84 1 74.66 ATAAGGGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGGCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 + chr3R 9594981 5' - Tirant 8466 2 58.22 TATGCAACGTAATAATAACGTTAAACAATAATGAGAACAGGCAAGCCTATGTAATGGTATGCATTCGGAATTGGCGCCCAACGCAGAATAGCGCTGCTAGCCCGTATATGTATATATAGTTAAATATCCATAAGTCCCCAAGACTT:1 + chr2L 18212072 5' + Idefix 7 2 72.60 TTCTTCGTTTTATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCTGAA:1 + chr2L 17282920 5' + INE-1 545 1 56.20 TCCGTAGGTCAAAATGCAATAAACACACATGGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGGGTGAGAGGCA:1 - 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rover 495 1 66.21 AATGGCGTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chrX 9530439 5' + 297 37 2 59.59 AACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chr3L 22890377 5' + FB 60 1 68.03 AACTACNATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTA:1 - chr3R 27083114 5' + jockey 4600 1 65.97 AGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:2 - chrX 18239429 5' + jockey 67 1 57.53 ATATATATATACTATATATATTATACCCAAAGACAATTAGAAACAAACTCCACTAAATATATATTGAGTTATCGACGTTATGCGTAAAGTAATTTTGGGAACTGTAATGTCAGTGAGTTATTGTATTATTGTTATTATATTTGTAT:2 - chrX 3391352 5' - mdg1 9 2 67.12 TGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCAC:2 - 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chr2R 5756245 5' + Cr1a 3973 1 69.23 ATCGGCAGCCTCAGCATAATTAAAGCCGCCGACATGCCCTGAAAGACTGTGTTCGGGGCAAAGAGGGTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 8075885 5' + 412 7073 2 58.93 ATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATTTTGGATAAATACAGAGGTGGGCAAAAGAATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTCGC:1 - chr3L 3501808 5' - Bari1 1637 1 62.76 ATCAAAATTGTGTTCTTCTTTCTTTTGCTTATAAGTAGTTATAATAATTTATATTTTACTTCCTTTAATTATTTAGCATACTTATTAAGTCATTTGACTTAATATGATTTATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 - chr2R 11453481 5' - invader4 316 2 64.38 AAATAAGAAGATTCCAATAATGTGCTCTCGTAGGCAAAAGGCTCATCTTGTCATCCAGTCATTATAACGAGAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTATTTTCTGTCAGAAATTGTCAGAAAATAAGTAATACTCCACGAAA:1 + chr2L 22548731 5' - transib2 402 1 53.10 TACGATCACAAAATCAATATCCGATAATTGTACAAAATTTACTAATGGAACCCGAGAGCAAACCCCACCCCCCATAATTCCGCCTGAATAAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTCTCATCATCA:1 - chrX 13598905 5' - Dm88 349 1 52.90 GTTTGTTTAAATTTAAAGTATCGGGAAAGGTTATTGATAGCGTTATTGGTTTTTTTTCCTGAAGAACTTTAGTTATATCTGCTTGGAGCCCCGTTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAA:1 + chr4 1157471 5' - Juan 171 1 56.85 AATCGAATCTAGTCCAATTGAAATGGGAACTATTATATGGTTGCCATCATATTAGTGGTTTCAAATGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAA:1 - chr2L 14670945 5' - FB 892 3 54.79 ATACAACAATAAATAAATAAATTATAAAAAATGTTGTCTATATCTACTTTATAAAGCGTTTAGCCGCACATCTTGTAAAATTTTGATGATTTAGTAAGACGTAAATAAAACAGGCTTTTTGTAATATTAATAATAAATAAATATTC:1 - chr2L 306916 5' - copia 5095 1 28.77 AATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTGGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATGTAGGATT:1 + chr3R 24219289 5' + roo 79 2 72.22 AAACAATTCTGCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 26178483 5' + 412 51 2 51.72 CCTTGCTTCTAAAAACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chr3R 4805743 5' + 1360 22 1 70.55 AGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:2 - chr2L 13556465 5' + transib2 38 1 54.11 GTAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 26178354 5' - 412 7505 2 53.79 CTGTACTGCCTCGCCGGATGTCATTACCATTTTATGCGGCTAGCCGGGATCGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGGGGGTAAGCGGG:1 - chrX 9575667 5' + blood 7272 2 54.21 CACATCGAATTCCAGCGGCGAGCGGCCAGCGAAAAGAGCCCACAAAATAGGCAAAAACAAGTAAAGAAAATATTATAGAAAAAAAATATACTACATTAACACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGA:1 + chr3R 7523774 5' - gypsy2 6658 2 76.55 AATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 + chr2L 10156117 5' - hopper2 1539 1 65.07 AATTCTAAAAAATATTCAAACTTGTTAAGTGATTTTTCAATATTTTTGTCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTACTCTCTTTCCGC:1 - chr3R 24485547 5' - 1360 3313 1 62.33 ATGCTATCACTGCCATCGTTTGCAGTGTGTAAACAAGTCTGAGCTGATAATTGGCAATTTGGCTGTTCATTTAGCTGCTGCTCAACTGGCTGGAGAGGAAGTCCCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTG:1 + chr3L 5807750 5' + Circe 7106 1 68.97 GGAGAAACTCATTCGCGTAGTACCAATTATCGTGATACTAGCGCTGGATTCGTTTCACTGTATGCTGCAGTTGGCGCAGCCGGATTACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTAAAGGGGTGATGAACATGTGACGGCAG:1 + chr2L 14792759 5' - accord2 7363 1 52.14 AAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGAT:1 - chrX 19980671 5' + X-element 4565 1 71.92 ATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGTGCTACAGACTTGAAACTTTGGACATTTTGTTTTTAA:1 + chrX 18817290 5' - transib2 2761 1 62.22 AAAAATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCC:1 - chr3R 14505376 5' + F-element 4502 1 52.00 AAATTCGTATTATATGTGTGAAGTCATTAACTTATTGGATTCGCCAGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTG:1 - chr3L 9700679 5' - I-element 4919 1 67.14 AATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:2 + chr3L 17940100 5' + 1360 78 1 73.29 TAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATAT:1 - chr3R 10736164 5' + McClintock 24 2 65.52 CAGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGCAACAGGAGGCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTAC:1 + chrX 18742812 5' - invader4 292 2 58.72 ACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr2R 7090746 5' + I-element 32 1 61.76 GATGAGCTGGAAAGTGTCGGATAAATCAAATTTCGTTAGCACCATTCGACTTATTAAACTGTCAGTGGGGGATTCATTAGGTGTCAGGACAATTAGAGTCCAGAAATACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAA:1 + chr3R 15500563 5' - jockey 4891 1 69.86 GTAAGATATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGGGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 19588174 5' - roo 9045 1 65.75 GAAAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr2R 16817979 5' + 412 58 2 58.22 AGATACAACGGCGCACCAATACACACGCGCGATCAGTGCGATACATACAGATGCAATTCCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGTTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCAATTTGGGCACTTG:1 + chr2L 1644493 5' - HMS-Beagle2 63 2 56.85 TTTTGGTTAATACTTTCTATTTTTTGCTGCGAGTAGGGCGTGGTGCGGGGGGTGGAGTTGAAATAACTTAAAATATAAAT:1 - chr2L 16944298 5' + copia 5051 2 61.25 ATAAACACCGCAAACCCCCCGCATCATGGCATTGATCACTGCCACTGACCCATTGATAATGCGTCTTAGACTTTCAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTAT:1 - chr3R 24566844 5' + 1360 301 1 56.85 AAAATAAAACTAATTCATGCTTTTAAACTGCGCTTCTCTCCCACCGCCACTCCCCCGACAACTCCAAACTCCAAAACTTCAAACTCCCGAAACACCCGAACTTGAAACTCCGACTAAACCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAC:1 - chr3R 22716792 5' + roo 9036 1 78.08 TTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:2 + chrX 18009937 5' - 412 428 2 60.96 ATTTTCCAAGGGAACTTGCCACAATGGAAGTTAGTTTTCTTGAACAACTTGAATCACGCAATTTTTATCTATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAA:1 + chr3R 13984277 5' + FB 835 3 55.15 CGGGGAAACAGAAGATCCAATTCAAATACCAAACTGAAACCAAAACAAAACCCTCGCCAAAACAAACTTAAAAAAAAAAATCTAACTAAAAGTGCAAAACAAACTAAAAACCTAACCACAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATGAAC:1 - chr3R 31932692 5' + gypsy2 491 1 57.53 AAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr2L 3672973 5' - P-element 2799 1 25.34 GAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGC:1 - chr3R 10736138 5' + McClintock 30 2 56.45 ATGCCAATTGTGTATTAGTTGTTTGAAATTGTAACGGAAATGGGGAAAATGCGAGCAAAAATGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAAATTT:1 + chrX 12469055 5' + I-element 464 1 60.69 GAACAAATAGAACAAAATTATTTGAAATCGCTACACGGATAAATTGTTAATTGTAATATTTGTTTTATTGTTTGTATCAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGCCCCTGAAAGGGCTGAATTGATAGCGACC:1 - chr3L 23434323 5' + BS3 1709 1 70.54 ATTATTGAATGACCGCAGGTAATATAATAATTTTTAATAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTAGAAAGGTAGATGAATGGGCGGCGAAGGTGGTGAGGGTGTTATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGAATCCGGAGGTG:1 + chr2R 15451903 5' - transib4 2376 1 67.36 CATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTCATTTAATTATTAGTTTAATT:1 - 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roo 386 2 68.49 AATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 + chr3R 18971708 5' - Juan 4151 1 61.64 ACATACGGACATATGGAGGGGATGAAGGGAAACCTTACATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTTCCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTCATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCC:1 + chr2R 1596647 5' + Cr1a 4060 1 72.41 TATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 + chr3R 15363891 5' + flea 35 2 60.00 ATGTTCATGTAAAATAATTCAACTAATTAATCTTTTTAAGGTATAATTCAATAAGTATATATCTAAATTTAAAGACCTAGCTTTCCTTGAGAGCAATGGCTCTAGTGGCCCCTTATGTGCCCTATGTCCGGAGAAACATCAGCCGA:1 + chr3R 6862360 5' - Gypsy12A_LTR 1887 1 53.42 CTATAGAAAAGCGTGTTAAGTATATGTTTAAGATGGATTAGTTTTTAAACGAGAAGTCAATGTCTGGGAAAAATGTCCCAAAAAATTTTACCAATAATACGGTCAGAAATGTCGACGAATACCTAATATATCGTCGAAGAAATCC:1 - chrX 8116446 5' + Helitron 540 1 53.10 ATGTTTCTAGACCTGTGGTATTTTTTTCAAAATACCATCTAACCGCTTTATCCTCCACGAAAAATGTTTAATCAACCCAACTTTTGTAATCAAGCGTAATGCAAGTTAAAATCCCTTCTACCTGCACCCTACTTCTGTATTTTAAA:1 - 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invader1 3723 2 75.68 AGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTT:1 + chr2L 4123848 5' + transib2 57 1 57.53 CTTATTCATTATTTTCTCTACGGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 + chr2L 8629403 5' + Max-element 42 2 46.58 CAATGACACCGTGTTGGGCGGGAGTCTCCAGCGGGTTACGGTTGGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr3R 5368604 5' - 1360 3333 1 69.35 TTATCGNATATAGGAACGTAATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:1 - chr2L 11257153 5' + rover 6971 2 71.92 ATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGTTAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr2R 12133820 5' + jockey 72 1 70.63 TGATATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 + chr2R 21160614 5' - Transpac 308 2 81.20 ATAAGTGGTGGATGAGGCAGAAGGGAAAGTCGAGGGATAAAGGATAAAAATATCAACAATCCAGCCATAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTA:1 + chr2L 9040985 5' + I-element 482 1 54.11 ATGTACCGACATAGTCACACTTGTCCATTCATTTATTTTTATATTTTTTGTTTTCCTACTTTGTCTTGCCCATTTTCTTAGAACGAACTCGAATTTTCCGTTATTTTGGGCTTTTGCATTGCTTTTTAGAACGCTTCTATTGAAAT:1 - chr3L 6983042 5' + S-element 315 1 70.55 ATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chr3L 12004277 5' - P-element 2790 1 20.55 ACACACTGTGGAATCCCCATAACCCCTGACCTATAACACGTATAAACATACATATGTACACACATATGTATGTATATTCTTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACC:1 + chrX 6321385 5' + I-element 5094 1 54.11 AATATAAAAGGATTAAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:2 - chr2L 15940380 5' - pogo 2098 1 83.56 AAAAGCTCTAGTTCTTCCTTTATTGGAATTAATAAAAACGTTTAATAATACATAAAAAAGCTACTTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTC:1 - chr2R 4103363 5' - invader1 4000 2 64.38 AATGCAATATGTGTACAATGTACATACGGTGAGTGTAAGAATGGAAATATGGGTATTTGCACACAACACCTACGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTAC:1 + chr2L 13943168 5' - 412 120 2 61.60 AACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGGCCACGCCACTACTTCC:1 - chrX 21639695 5' + gypsy5 85 2 73.97 CCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATA:3 + chr3L 23249377 5' + rover 7003 2 52.74 AAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr2L 20266029 5' + roo 71 2 68.49 CTTGTCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr3R 16630383 5' + FB 39 1 57.53 ATGTTAAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3L 10731730 5' - 297 6955 2 69.86 AATTTATACACTGTGCGAATTGAGCCGTTAAATTGTATCTACAATTTATTCAGCTCATTTTAAATGGCTAAAATTTTGCTATTAAATATTAGTAATGCAGCTACTTAAGTTATTTATAAATATAGTTAATAAATAAAATAAATAAA:1 - chrX 16189441 5' + X-element 4713 1 78.77 CATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 + chr3L 17275413 5' - Transpac 264 2 60.00 CTATATTCAAAAGCTTAGTGATTGCAAATAAAACCAATCTGCAATGAATTATGAATTGATGTATAATTTTTCATGCCACATTTTACTGTATATATCCCATCAGTTACCAACGTAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCA:1 + chr2R 18989022 5' + F-element 4436 1 35.86 ATATATTTAATTTAAAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTGCATATCTTATGTAA:1 + chrX 8360512 5' + roo 8710 2 54.11 CATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCAT:3 - chrX 23182955 5' + Idefix 13 2 63.70 AACTGTCAATTAACGGAGCATTAGAGGGGGTGGATTTTTTCGGAACTAACAAGAGTGGGTTGTACTGATACAGACGGTTCTACGATTTTGTCTTAATTCATTGAGGATCTAACTATGATTTGCATGAGCCTTACAGAGTATT:1 + chr3L 7861466 5' + Cr1a 4176 1 73.24 TACGTTTAGTATTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 13947236 5' - HMS-Beagle2 489 1 82.76 TAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:1 - chr2R 9967119 5' - Bari1 1633 1 67.81 AACGGTCACCAATGACACCGTGTTGGGCGGGAGTCTCCAGCGGGTTACGGTTGGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTC:1 + chr3R 5368595 5' - 1360 3320 1 66.44 GACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr3L 21327086 5' - copia 5085 2 65.75 TTGTCTTTTATCTGTTTCTTTTCATTTTATTATTTAATCATTATCCTTTTGCTTATCCAGCCAGGAATACAGAAATGTTAAGAAATACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAAT:1 - chr2L 9728449 5' + P-element 2668 1 24.66 ATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr3L 18505764 5' + I-element 39 1 58.90 AGAATTTCCCGGAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3L 11326640 5' - pogo 2070 1 63.70 AAATTGGAGACATCTTAAATGTATAGGTTCTAGTTTGGCCTGCCCCACTGTACCGCGCTATCAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr3R 5216126 5' + FB 21 1 60.38 ATGCCATAAAATACCCAACCAAGGAAATGAATTTCAATTGAAGTTGTATTGTACAATAAAAAAAAGCAAATAACAAAGCACAAACATTGACCTCGAGCGAACAGCAATTAAAACAAAGTGAGAAAATAAAAAAAAAAAGGAAAATC:2 + chr3R 10621239 5' + Doc2-element 248 1 78.08 TCACAGGACCTGGGATAACACGCGAAGCGGAAGCCACAAAAAGTGAATGGAAACTACATTCCTGTACCCACACGTGAGCAAAAACAGAATTACCATAATTACGTTGG:1 - chr2L 19934777 5' - gypsy3 265 2 73.83 ACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGCTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAA:1 - chr3L 26290979 5' - Tabor 7263 2 55.86 ATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 23180254 5' - roo 358 2 76.53 GCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 - chr2R 12779718 5' + I-element 64 1 60.27 AATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 10156071 5' + hopper 7 2 75.38 GTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 - chr3L 19111588 5' + Doc 85 1 75.34 GTATGTTTGAAGTCCAAGTTTTTCTTCTTTTTGCCCATTTCCCTGTACTCCTCACCTATTTCCGTGCTCTTTTAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAG:1 - chr3L 2532804 5' - Tirant 440 1 52.05 GTACTTCATTTCCAGGACAAAAGGCGCAAATCTCCTGTCTGTTCCTTTCTTCTCTGTAGTTTTGCGCAGAATTTCAGGGGCAAAAAAAAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 12549870 5' + Doc2-element 218 4 80.91 CCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCACTACATTCAGGCACC:1 + chrX 21585268 5' + mariner2 281 1 53.03 AGTTGGGTTTATGAAAGTGAAGCTTGGGCAGAGAACTCAGGGCCACATGTGCTCCTAAAAAGAGCGCAGAAAAAAATATACAAAATGATAATAATACTTGAATACACACGCAAAGCAGTTGTTTTTTTTTATTTTTTGTTTTTTTT:1 - chr3R 22051919 5' + hopper 146 108 56.16 AGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 - chr3R 13875113 5' - P-element 2815 1 28.46 ACTTTCCGACAGCAAGTTAATATTGCTACTCAAATTTGCAGTAATGTTATCGTTTTTCATAAACGCTTGTTGCTTGTAACCAGAAATGCAATTTTTGAGAAACTACAATACATTTTAGTTACCATACTAAAGTAAAGTAAAGTAA:1 - chrX 3344894 5' + TART-A 13147 1 80.00 CTCTGGAATTGATTTTGAAGCTTGAAGTTCCTGACTTGCATTCCAAGTAATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr3R 30813302 5' + FB 15 1 71.88 TTAACTTTCTATTTCACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGTCATTTTAATCCACAATATCTATCGATATGACAGAAAAACTATGAAATTTCGCGTTGGCAATTCCGCTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chr3L 23287351 5' + INE-1 541 1 65.07 TGTTCGTAATACCCATGCACTTGTGCCTGGCTGTTTTAAAACCGTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGGTATATAAGTTAACCACTAACAATGTAATGCTTCGTAGCAACTAAGCAGCCTTGTATGAACAATGCT:1 + chr2R 3593619 5' + gypsy 39 2 54.93 ATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGAGCACTATGGGGCCTTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGATTTTCACAAGTATGCAAAGTTGCTATATTTTAGTATTGGTATATTGGA:1 - chr2R 22989673 5' - hopper2 1540 1 57.35 AATAATTTTTTTTTATATTTTATTAAATTTATTGCTCTTCTTCAACTTCCTCCTCTAAAAATATATTAAGGAAATTGAATTCGTCTTCCACTTCTTCTTCTTGTTCATTATTAGAATGATAACTTGATTTATAAAGTTCTGCATCC:1 + chr3L 14918215 5' - transib4 2158 1 84.93 ACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATG:1 - chr2L 2527700 5' - hopper 1328 1 76.03 AACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACTAAATCGTCTGACATTCGGCTTTCCACAGTCT:1 + chr3L 18281864 5' + Doc 1 1 70.67 TTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAA:1 + chrX 3431882 5' + G7 1144 1 62.33 CTATACTTTAAAACAATTTATTAGTCCATTTCATTTTATAAGTTAATGAAACATCTATAATCTGGGCTTTAAACTTTAATAAATTGCAGACAACCAAACGATTTTTCCCCCTTAAACTTTATTTTTTTTTCTTTTTATTTTATTTT:1 - chr3L 16017256 5' - F-element 4681 4 42.47 GTACGCGACATCCGAAGTTCACTGTACTCGTGTATCGCAGCTCGTCATATCGAACTTCGTTCTTAAGCTGGAACAAAACCGAATTACCGGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCG:1 - chr2L 3991804 5' + pogo 2077 1 68.10 ACAAAGCATAGAGCTTTAAAGTCTATGTCGCATTCTGTTAGTTCTCCACAAAACAAACTCATATAGAATAATTAATCATTCAGTCTAACAAAATACTTGTTGAATATTCGATTGAAGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGTGACTTTAA:1 + chr2R 17673679 5' + Stalker 456 1 78.08 GTGCCATATTTAATTCTTTTTATTTTCGGCCTGCTTCTTTTGAGGGAATGTGCGTGGCCTGTGGCATTTCAAGTGAAAAGACGTGTTTTCATCGAGCGTCGTATAAAATAGCTAATAACATATAATAAATATATAAATCGAAAGCG:1 + chrX 18533605 5' + Doc3-element 87 1 76.71 CTCGCACTCGCAGCAATTGCAATTGTTTTCTATGGTGCCTGCATCGATGATATGGTCATGACTTGCTGTTCAGTTATCTTAGCCGTTTGCTCTCTTGTTTCCCATCCCGCCGCACAAAACTGTCACGCCCACACTTTTAAAAAATC:1 - chr2L 17881071 5' + INE-1 254 1 76.03 ACTCATTTTGGTCGGTTTTTTATGCAAAACACTTGACAGCCTCATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTC:1 - chr2R 20227355 5' - hopper 1390 1 65.75 GATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 19073309 5' - roo 9036 1 60.27 GGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTCGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAA:1 - chr2L 13556414 5' + transib2 85 1 74.13 AAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:2 + chr3R 10931606 5' + 297 6620 2 55.48 GAATGGCGTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chrX 9530440 5' + 297 36 2 60.27 AAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACA:1 - chr3L 3501866 5' - Bari1 1695 1 70.55 ACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr3L 18402998 5' + P-element 87 1 22.30 GTCCCATAAGCTCTATTTTACTCATCTGTCCTTTAAATTGCTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:2 + chr3R 6625679 5' - flea 4976 2 58.90 AAAGAAAAAATGTGAGGGTTAATTATTTATAAATATTTTGAATTTAATCATTATATTTAAAAAAAAATTATACAATTTGAAACCATTTTCTGAAATATGATGTTAAGCGTGGTTTGAATAAGTCAAATTTTTTTTAAATTTTTATT:1 - chr3L 12132052 5' - P-element 2697 1 32.19 AACGAACCTCACAGGGAGGTTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr2R 5480002 5' + F-element 49 1 58.46 TAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3R 13406403 5' - pogo 2050 1 56.16 AATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 - chr2R 15376182 5' - 1360 3323 1 63.70 ACTCAGTTTTGCATGTTTAAAAAGCGCGAGACAAAAGTTTGGTCCAATAAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTACTGCACAAGTCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGA:2 - chr2R 14704314 5' - Cr1a 126 1 65.07 ATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTTTTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 19032695 5' - roo 9015 2 61.15 CGGCAAACGGAAGTCGCAGAGTCGGGCTACAGTCGAAAGTCCGAAGCGGTACGGATGCATATTAAATTAATAATTTGACCCATCCTGTGATTATTTGAAAATAGATTAAAAATAGCCAAAAAAAATAAATTTAAAAAATGACTTTA:1 + chr3R 20359395 5' + 1360 374 1 61.64 GGAGCTNATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chrX 20455644 5' - hobo 2913 1 55.06 GGGAACGGAAACGGAAGTGGACATTTTGAAGGACAGTCCCAGACCAAAACTCACACACACACACACACACATATAGACAC:1 + chrX 12331975 5' + accord 7035 2 83.75 GTCAGTTTGGAATCACCCTTCAGCGACATATACTAATTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCATATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACG:1 - chr3R 15365062 5' + flea 4618 1 55.68 ACACCAAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr3R 27315083 5' + jockey 4683 1 66.34 ACTCCTCGGAAAGCCACTTGGCCTCGCAAGGTTTTTGTTACAAATTTCGGAAGATAAACATCAGGAAAATATATATATATAATTATATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAAATTTTATTTCACTAAATGATTACAAA:1 + chrX 23182806 5' - Idefix 7346 2 55.48 ACCTAAAGGAAGGATTTTATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTT:1 - chr3L 14720961 5' + F-element 22 1 75.17 AACAGTAGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCGTCCATACACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGC:1 - chr2L 23400847 5' - S-element 1678 2 50.68 TGATAAGTGAAATATTGTGTATTTGTATTGGGCTGCCCTATTTTTGGTGTTCTAAAACTTGAAAATTTACTGAAATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGA:1 + chr2L 10362546 5' + rover 191 2 56.85 TCTTTCTTACCGACAACAGATTGTGAGGAATTTTCTTGTTGTACAACACTCCTCCCTCAAGTTTTTTATTTCTAGATCTTTTTATTACGGATTTTACGTTATTACGACACTTAAGCGCGTTGGACGCTAATTAAACCAAATACGTT:1 - chr3L 23529572 5' - gypsy10 347 1 54.11 GCCGACGATCTGTAGAATGGTCTTTAGGGGTTAATAGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 - chr3L 47034 5' + FB 34 1 60.27 CATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAA:1 - chr3L 15099679 5' + G4 3816 1 51.37 ATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3L 4219428 5' + jockey 27 1 65.71 AAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3L 14366633 5' + roo 57 2 56.94 GGTTAAGCCACGTGTTTCACAATCGGAATGATTATCCTGGGTAGGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCGTACATTGGTTTTGCACTATGCAGCTACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTC:1 + chr3L 23241869 5' - 1360 3311 1 67.81 GCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTAT:1 - chr2L 21930225 5' - Copia1_DM 62 1 75.34 CAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 + chr3L 24934279 5' + HMS-Beagle2 43 2 56.16 AATATGCATGTATATGTGGGGGTAATGCACAAGTAGAGTCAGCCGCCTCGTAAACATTATAGTAACCAAAAAAAAAGCAAAAAAAATA:1 + chr3R 15151970 5' + gypsy7 5006 1 57.95 CTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATA:1 + chr3R 904926 5' + rover 6985 2 56.55 ATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr2R 17796523 5' + jockey 4705 1 61.81 CTAAGCTATTTCGGTGAGCTGACGCATATGTTTACAAACCGTTTTTTGTGCAAAAACTAAATTTGCAAAATAGCCAAAAATTAAATATTTTAATTAAAATTAAGAAACAAGAAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATT:1 - chr3R 10648173 5' + jockey 4825 1 76.71 GTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAA:1 + chr3R 20675846 5' + jockey 4939 1 66.44 CGATGATCTTAGTATTTCCGCAGTGTGACCCGTCATGTGGCGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGCTTCACTA:1 - chr3L 25479140 5' + Cr1a 4106 1 62.75 ATATGTGATTTCCAGTGTGACCGGAACTCGCAGGCTCGCACATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTCCCCCCCCC:1 + chr3R 8716173 5' - invader1 141 2 55.56 TAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCG:1 - chr3R 11191495 5' + roo 56 2 55.94 ATCCCCAACCCCGAGTTTTACTGACACAGCTCCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2R 18515011 5' + P-element 16 1 71.01 CACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr2R 19199766 5' - hopper 1374 2 44.14 AGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAGGACCTCCCTAACC:1 + chr2R 17796579 5' + jockey 4763 1 78.77 ATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chrX 10537826 5' + I-element 33 1 60.96 TTATGTCATGCCGTATTTCCGTTGCCTAGAGCATTGATGTAACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCCTTCCACAGTAATGATGAACTCCAATTAAGGACACAAGTCCGTTTAAAG:1 - chr3R 28469326 5' - 412 473 2 59.23 GTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCATGGGTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCACAAGTATTTTCACAACGC:1 - chr3L 3501868 5' - Bari1 1698 1 69.66 CATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGA:1 - chr2L 7618578 5' + X-element 4475 1 50.68 AATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 29084853 5' - 412 465 2 63.01 AATAATAAAAGGCCCTGTTTTGGCACTATTTATTATTTTGTTTGGCCACCCTTGTTTTTAATTACTTCAA:1 - chr3L 24088809 5' - Tc3 1404 1 71.43 TTTTACTTTATTTATTATATTTTATACTTATTTTACTATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:2 + chrX 8915707 5' + I-element 9 1 77.40 CATATCATTCAGTTGATCAGTACCGTACTAAAAGGACGAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATT:1 - chr3R 3822430 5' - rover 7008 2 76.15 TATTAATTCCTCGTTAAATAAACAAACATTTCCTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTATGTGCATACATATGGAAAAATAATTCTTATGTACTACGTGGCTA:1 + chr2L 8385285 5' - Tom1 153 1 75.00 GTGAGCGCCTCGAACTTTTCCAGATTCTGCTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTAT:1 + chr3R 27231949 5' - I-element 313 1 69.07 ACCAGAAGACATAGTCGTGATCGTAGATCTCCCTATACCGCTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGT:1 + chrX 16597591 5' - G2 2815 1 64.04 ATTTTCTCGTTGTTCTTTTGCGCTAAAATAGATAATTAGCCAAGTAACCAGAAGGGATGCACTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chrX 10639224 5' + FB 10 1 76.03 GTGTGGATAGATTTTCGATGACAGAGGGAGGAGAAAAAATTGGAGGGGTGGGCATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGGTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGATTCGACTT:1 - chr2R 9950353 5' - Ivk 4903 1 63.01 TTACACCACGAGAAGCACATTAATGTAAATTTTGCCCGCCCGTTTCAACTGTTTTGCTATTCCTTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGA:1 + chr2L 1706534 5' - Bica 186 1 69.18 ATTAATAACTTAGATATATTTATGCTAGAGAACACTAACACATTACCGGAAGTTACGCCTAAGACAAAAATTATAAATGAAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAAAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3L 13605761 5' - roo 9030 1 57.53 AGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAA:1 + chr3R 3985685 5' + S-element 67 1 82.76 ATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTGGTTAG:1 - chr2L 15076180 5' + 1360 86 1 73.29 AATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGA:3 + chr2L 21367215 5' + Doc 67 1 58.22 TGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTC:1 - chr3R 11469380 5' - Tabor 399 2 74.66 CTATCTATCGGATCCAAGATACAAAGCATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 5389796 5' - roo 8992 2 72.60 CCACTCCGGTAAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 3233972 5' + roo 8717 2 65.83 TAATATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATTTCTTTAAAGGGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 17077208 5' + roo 51 2 54.79 ATTATAAAATTTAAATAAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGG:1 + chr4 156525 5' - Cr1a 4420 1 40.50 CTGGAGCATCCTCTTCGGCGGCATGGTCATTGTGGCGACGGGCGGTAACCTGATTGTTGTCTGGATCGTGATGACGACCAAGCGGATGCGGACGGGAACCAACTATTTCATAGTACTGTAGACAGTGATACGGTAGATTCAAAAAA:1 - chr3R 29959122 5' - Circe 7295 1 76.03 ATTCTCTTCAGATTTCGCACAATACTCAATTCTTTGAGATAAGCTTGTATGTAAGTCGTTTGTTAAGTTAATCTTATCATTACGTTTACAGGCTCATAAAGTAATCAAAAAGTTTTAATGGAGAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGA:1 - chr2L 9012133 5' - G2 2673 1 82.07 AAAGGAGCCGGAGCCAGATGAAAGCGGAACTCCATTACCTCCGGAGCTGGGTAGCTTGGGTAGCTGGGTAGCTGTGGAGTTGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTTTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTT:1 + chrX 19364583 5' - mdg3 5118 1 57.53 CTGGCTCGGATCAGCCAGCAGTCTGCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 8308380 5' + roo 44 2 55.48 TCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTTAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr3L 16970432 5' + roo 8754 2 82.07 ATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 2989896 5' - roo 9050 2 69.86 AGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chrX 8092385 5' - pogo 2039 1 58.90 TTTTATATTTAATTTTCAATGGTTCTAAATTTTTTCACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 - chr3R 12242393 5' - transib2 2800 1 67.81 CCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 22960516 5' + Tirant 63 2 68.75 AGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAATATCGTCTTCTAGCAAAA:1 - chr3L 19350011 5' + 1360 3198 1 52.94 TAGTTTTCAACTTCATGCAACAGAGATTCGTTTAAGAGCAGGGAATATGCAATTATACCATCAGAATTCGATTTCAATGGCTCATTAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTA:1 + chr2R 21604814 5' - Idefix 190 1 63.43 TTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCA:1 - chr3R 10970352 5' + G-element 49 1 49.32 ACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr3L 14720894 5' + F-element 62 1 61.02 CCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 + chr3R 904903 5' + rover 11 2 65.52 TTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2R 9871052 5' - roo 8991 2 76.03 TGTCATAGGGGTAACAATTTTTTTGCCAATTTTTTCCTGTGCAAAAAGCTCTTCTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTTTCATATTGTATGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATT:1 + chrX 16581888 5' - TAHRE 10159 1 62.33 ATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:2 + chr2L 18226776 5' - roo 344 2 63.01 CACCTAAGAATTGATGTCTACTAGACAATGAGTACTCTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATAACAAATATTCAAATATAAAAAAAAATATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATAATAACGTTAAGGCAATGCA:1 + chr2L 21745617 5' - 1360 301 1 74.66 TGTGAGGTCGCTCGGTGGGTGGTGGGAAAACTGACGCAGAGGGTTGGAACAAACTCCAGAGCTTGGGAAAACTTTTGCAGCTGACTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCT:1 - chr2L 1662822 5' + transib2 2522 1 57.53 GTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAA:1 + chr2L 4888731 5' - BS 5027 1 63.70 TATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAAACAAGAATAT:1 - 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P-element 2873 1 76.71 AATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGC:1 - chr2R 7306553 5' + Max-element 56 2 66.13 AGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chrX 15903133 5' + INE-1 92 1 73.29 GTGAGTATATAATTTGACAAATTTGCAAAGCCACTAACATTACATTTAAGAGGAGAAGATGGACATGTGTACAAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAATAAGCGGACCAAGATAGCTCCCTTG:1 - chr2R 4941226 5' - Q-element 493 2 60.47 AATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAAAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGT:1 + chr2R 13766204 5' - roo 344 2 60.96 AATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1 + chr3L 13365767 5' + BS 5076 1 71.92 AACGTTTAATCTTATCAAAGAATATTTATATTCTGCAAAAATCCAATTAACTGCGTCTTGCTTTTGGTAAATGCCCTATTGACAGGATTCCCCTTTTTTCACATTTTCTTGCTTCTTGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAA:1 - chr3L 14375553 5' - transib2 2558 1 76.03 GTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 12986645 5' + roo 48 2 53.42 AATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCAT:1 + chr2L 22121334 5' - I-element 5310 1 67.12 ATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 + chr2R 7090663 5' - I-element 5267 1 76.71 GTACTTGGTCACTAAATTTATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 - chr2R 21926490 5' + opus 7163 4 55.48 ATGTGTAGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chr3R 27986458 5' + roo 8713 2 56.16 CCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAGTTCTTCTTTTGTTT:1 + chr3R 27160102 5' - 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Burdock 217 2 59.59 AGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:2 - chr3R 16630369 5' + FB 53 1 53.42 TGTGAGATCCTTCAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3L 23906325 5' + 1360 31 1 42.47 TACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAAC:1 + chr3R 907895 5' + gypsy11 4334 2 34.93 AAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:2 - chr3R 18093421 5' + I-element 16 1 71.92 AATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 + chr3R 23618127 5' - hopper 1352 1 60.96 AGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3L 14720881 5' + F-element 49 1 64.13 ATGAAAGATGCAATATGGCACGATGGGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 - chr3R 15942848 5' + hopper 14 1 76.71 ACTTGCATTCCAAGTAATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGCGTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCGCC:1 + chr3R 30813335 5' + FB 66 1 58.22 ATGGCCGTTGCTGAAGGGCCACCCACTGGGCAGCAGATTAGGCATCGAGACGTAGTGAAGTGCTTTCCAAATCGAAGCTTGCCAGGTGCAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTA:1 - chr3R 27168959 5' - 412 7077 2 67.12 ATTATGACCAACCAGCGATGTCATATGCAAAAAAGTTATACCATTTTTTGTTTGTGATCTCTGAAGGTAAAACCTTCGCTGAAATTGGACGCATTGTCGGAT:1 + chr3R 9272532 5' + Tc1 437 1 54.90 GACTGCAGGAATAAATTTGTATATAACTTTCCCGATATCGTTGCTAGAAATAGTCGTCTTATGCGAAAAGAATAATTTTAAACATTTTGTCAATTTGTTGCTAACAGCATATATAGCGGTTACTCTTTATTTTATTTTTTATATAT:1 - chr3R 7367577 5' + transib1 1906 1 57.53 GACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGA:2 + chr2R 9158064 5' - mdg3 173 2 67.39 AATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 17055441 5' + Tirant 8114 2 67.50 GAGCAGATGTGGTTGCCAGCTTATCATCAACCTCTTTCTCAGCAGTGTCGGCAATCTGGGCGGGAGTTGTAGCCTCTGGCTGTTCAGTGGGCGCCGCAAAGTCAGCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAG:1 - chr3R 25016892 5' + 3S18 5825 2 72.60 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 + chr3L 16731387 5' + rover 7009 2 64.83 TATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 809674 5' + jockey 30 1 51.09 AAGCCTTGCCATCCCTGTCTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTGCAATTTGGGGCTCCGTTC:1 - chrX 4341322 5' + roo 8697 2 67.09 AATGGAATAAATTATGTTTTATGTATGTGACAATCCGCAATTGGAATTTTTTTTTCTTATCGCTCCTGGTGGGTGGGATAGCGATGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTG:1 - chrX 16417179 5' - Doc3-element 4506 1 61.64 CCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 - chr3R 15942817 5' - hopper2 1563 1 55.48 ATTAAATGTCGATTTCGTTTTGCACCCGCGGCGCAGATACGCAGCTTGTGATACGGGAAGTACGCAGTGGTGCCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chr3R 23491839 5' - transib2 2799 1 62.90 TGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 + chr3R 4679462 5' - hopper2 1539 1 64.79 GTTAGCCAGAGCCCACTGTATCACCAAAACACCACCCCGGGAGAACCTTGCCAAAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACCTTT:1 + chr2R 10078127 5' + jockey 76 1 52.74 ATTATTCCACTTCAAGTCAATTGAATCCACTGAATGCAGCAGCTTCGCGAGCAAGGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATC:1 + chr2R 24228943 5' + F-element 4408 1 68.49 TGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATAC:1 + chr2L 4754848 5' + Stalker4 13 4 51.16 CAATTCAGTTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - 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Bari1 1643 1 62.76 CTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGGGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr2L 7660900 5' - I-element 5305 1 50.68 GTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 22193409 5' + roo 52 2 55.56 CTTTTCCCCAACTCTTACCTTTCTCTTCTCTTCACCGCTGCACCTCCCCCCCCCCTTTCTTTGTTTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 11286608 5' - Doc2-element 251 6 63.86 AAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATG:1 + chr3R 19450055 5' + roo 8645 1 57.53 AAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGG:1 - chr2L 16946125 5' - hopper 1348 1 60.96 GGAGGTGGTTGGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGGTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCGTCTTGAGGGGATCACTCATGGGTA:1 - chrX 1640829 5' - Quasimodo 263 2 80.90 ACCAAGCTCAGTTCATTGTGCGTACAAATAGTTTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 24369015 5' - roo 357 2 50.68 GTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr3R 8075987 5' - 412 7486 2 58.22 CAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 21216730 5' - roo 9006 2 68.12 TAATGAAAAAAATGTAATGTATTTCTAATTAATTGTGAATACTTAATGTGACAAATTCTAGCTTTTAAACTTCCGGAGATCTCGAAGTTTATACGGACGGACAGACGAACAGGGCCAGATCGACTCAGCTATTGATCCTGATCAAG:1 - chrX 21315343 5' - INE-1 89 1 54.11 GTCGTTAAATTAAATCAAGTTGTGCAAAATGAAGTGAAAATTCAAAATAACAGAGTAAACGGTGAGTAAAACTAGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAA:2 + chr3L 14003355 5' + 1360 484 1 52.74 TTTTTGTCATTCCAAAACGCCCAAAACTGTAACGCCCACAAATTATTTCATTTTAATTTCTTCTCATTTTATTCCTAAATTCTATTCTATCGATAAGCCAGAATAATTATTAATTATCTTGTTCAGTGAACACCAGAATTTCTGCC:1 + chrX 22689461 5' + HB 1439 1 65.75 CCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chr2R 7244782 5' + diver 20 2 68.89 TTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:1 - chr3R 11469381 5' - Tabor 400 2 73.97 ATTATTTGCATCGATTGAAACCAAATAGGTTTTAATACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:3 - chr3R 20167720 5' + roo 8683 2 71.92 ATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCAT:1 - chr3R 8890092 5' + FB 57 1 70.09 GGTTTACTTATTAATGCGCCACCTTCGACGTGTCGGCCCTTCGGCCATAAACTCAACTGCAAATAATAATGGCAATCAACAACCGGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr3R 22288089 5' - transib2 2791 1 60.96 ATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2L 21367231 5' + Doc 82 1 68.97 CATACATCAACTGATGATAAGCAAAAAGAAGCAGCAGGCCAAGGACAAGAAGTGAAAATTAAAAAAGTTATTTAGTATAAGAACAGCAAAAGTGATTTTTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGAT:1 - chr3L 4634469 5' + I-element 432 1 71.23 ATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 20167596 5' - roo 327 2 75.34 ATTGAAATCTGTCTGCCAGCTGTGGATTACATATACTCGTATTGTATGAGACCTCCAGCCTTCACACATCAAAGTCTTTAATCGTAATGGAGCTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCA:1 + chr2R 9780944 5' - P-element 255 1 62.33 ATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGGCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCT:1 + chr3R 9557499 5' + G2 2998 1 64.39 GTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTAT:1 - chrX 19074873 5' - mdg1 367 2 54.11 AACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGC:1 - chr3R 1844846 5' + Cr1a 173 1 61.38 ATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTA:3 - chr2L 21570261 5' + Dm88 4426 2 63.01 TGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 24090473 5' + roo 50 2 73.33 ATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGGATGATATCAGT:1 + chr3R 6419832 5' - Tabor 434 2 54.11 ATAGGTGTTGGTGTGAATAAATGCTGGAACACTTACAAACTAGTTGCTAACAATATAGCTAAAAATATAGCTAACAATTTCTACGAGCTACGAAAATTGTACAATGAACTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGAT:1 + chr3R 23522840 5' - flea 4742 1 72.60 AAATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 + chrX 18817263 5' - transib2 2778 1 52.41 GAGCTATTGCATTAACCGCAACTGTGGATGCATGACAACAATGCCCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAT:1 - chrX 16647216 5' + G2 3042 1 67.88 ATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCT:1 - chr3L 24934398 5' - HMS-Beagle2 250 2 61.64 GTCCACCTTTAGATTTTAGTTGGGCCGCCTTTCTGTGCGTAACTGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTTAGCTCGGTATAATA:1 - chr3L 997784 5' + gypsy2 6717 2 70.55 TTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAA:1 - chr3R 27083151 5' + jockey 4565 1 58.22 ACTGGCACCTTTGCTTTTATGTGAGCCCAACTTTCCGTTTGTCCAACTTGAAACACCCTGACCACACTCAATGCACCCCACATGCATCCGTGGCAATTTGATATGGGGCTCAACATTTATTTTATTTTATTTAACAAAATTAAATA:2 + chr3L 18125853 5' - Ivk 5373 1 76.03 AGGATTTATATTAGTGCCTTAATACAAATAATTATGTGAAAACCCCAAAATATGACCCCAAAAAATGCATCCTGAACTTTAAAAATGATCGAGGTGGGAAACTACTCAAAAGAATTATGATTTACTATATGTATATATATATATAA:1 - chr2L 9463932 5' + 1731 4411 1 81.51 AAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 - chr3R 29690776 5' - I-element 5280 1 70.55 AAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGGGTACATTAAATAT:1 + chr2R 3338784 5' + Juan 60 1 56.16 AAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:2 + chrX 7795488 5' + roo 8701 2 62.33 ATAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGGGGGGGGGATGGGTGGGGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3L 13295003 5' - roo 9039 1 58.70 AGAATAAAAAAAAATGTAGGACTACCCCTAACAATTGGGGGGATAAAAAAATATATGTTGACCAAAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCATTACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCT:1 + chr2R 4426847 5' + 1360 63 1 58.22 ACATTGGCCCAGTCTCAAGGCGATCTTGGCACACTTTGAGCATAAATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:3 + chrX 1263903 5' - Burdock 6372 2 69.86 CGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTTACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACG:1 + chr3L 20189594 5' - FB 212 1 45.14 TATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAT:1 + chr3R 19450146 5' - roo 8746 2 67.59 TTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr3R 18093302 5' - I-element 5277 1 72.60 GTGTGTTTGTTATCTGTATACAATAATAATAATAATAATA:1 + chr2R 5678727 5' + mdg1 7060 6 65.00 AATATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 + chr3R 19992614 5' + hopper 39 1 57.34 AATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATGTAACGCTACATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAT:1 - chr2L 21750457 5' + Stalker4 7169 4 94.52 CACATATGCAGACGGTAGTCTTCCAGTTGCTATCGTTTTGAAAATATTTGATTGTTTCAAGGGACATTTCAATAAAAGAAAATCTAAAGAAAATATAATATTTATTTTGTGCTGTAAAAGATGTCACCTTGTAAAATAAAATAATA:1 - chr2R 14143427 5' + jockey 4922 1 62.33 AATCTTTAGAATTAGTAATTACTGTCATATTTATATTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr2L 6239484 5' - Doc2-element 234 2 45.10 AAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 13406511 5' + pogo 56 1 61.48 GAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2L 17809255 5' + jockey 79 1 65.07 AATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 21224537 5' + roo 60 2 60.27 ACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1 + chr3R 16630288 5' + FB 85 1 75.34 TTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTAT:1 + chr3R 11040079 5' - Bari1 1621 1 77.40 GCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAAATTG:1 + chr3L 23906342 5' - 1360 3368 1 69.50 TCTTTTGCGCTAAAATAGATAATTAGCCAAGTAACCAGAAGGGATGCACTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chrX 10639211 5' + FB 23 1 67.12 TCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTTGTGTACAT:1 - chr2L 17180148 5' + Juan 53 1 51.43 GGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAG:1 + chr2L 9636035 5' - 412 7526 2 68.97 ATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:2 - chr3L 16033429 5' + Doc 62 1 57.24 TATCTTTATGCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr3R 23639269 5' - pogo 2065 1 54.79 TTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTT:1 - chr3R 25709875 5' + hopper 56 1 52.74 GACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr3L 18281855 5' + Doc 63 1 61.64 GGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 + chr3L 3983834 5' + P-element 96 1 21.23 CATTATTTTAAACATACCGGGTACTTCTGATCTTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTACTGTGTTTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATTT:1 + chr2L 7579161 5' - 1360 3048 1 67.81 AGTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 21216705 5' - roo 9023 2 52.74 TGTATCAAAGAGACTCACAGAGATACAACCAAATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chrX 11209826 5' + hobo 39 1 58.90 CATGGACACAAGGACAGAGTGGCCATTCAACGAAAACGAAAAACGCGTTCTTATGCTTTTCCGAATCTGGTAACACCTCTTATTAGCGCTAAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTAC:1 - chr3R 10144649 5' - Juan 3748 1 68.06 TCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chrX 8092370 5' - pogo 2059 1 55.32 AATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCT:1 - chrX 20999593 5' + BS 55 1 59.59 AATAATTTATACAATTTATTAGCAAATTAAAATAATAAACTACCGCTGCCGTCGATTTGATTTATTTATTTTCTGGAACATAAAATGGAAATAAAATTGGAGAAAAAATAAAAAAAACAAGAGGGAATGCTATAGTAGAGTTCCCC:1 + chrX 11465644 5' - INE-1 571 1 50.68 GACGAGGGCATCGTGTTTCATTTTTCGTTTTTGTCGCTTTTCGGTAGTCAATTAAATTTCCCAGAAATTCAATAACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAA:1 + chr2L 7125604 5' - R1A1-element 4936 1 53.42 GTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTTTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAAACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGATCAAGAATATATA:1 - chr3L 11826425 5' - INE-1 81 1 63.70 ATGAAAACTTGGCCAAGCCGAAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:2 - chr2L 12984267 5' + hopper 14 1 75.34 TCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGGAGCCCAGTCCAGGCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTATG:1 + chr3R 30347305 5' + P-element 14 1 65.71 ATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3L 15103782 5' - Transpac 5191 2 60.00 ATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCTTATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 18488375 5' + roo 48 2 59.68 GAAATTATCGTAGATTTTTCCCTGCTTCCCTTTGGTGTTGGTTGCTATTTATTTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3R 25709928 5' - hopper 1411 2 78.08 ATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:1 + chr2R 5106289 5' + Stalker2 86 2 76.71 CGGGAATCCCTTACGTACAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAT:1 + chr3R 30059398 5' + FB 67 1 65.07 ATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAGT:2 + chrX 23431600 5' - 297 318 2 71.92 GCATTGTTCGAGAGATCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTACGAACAA:1 + chr3L 2694033 5' - Cr1a 236 1 74.60 ATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAGCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chr2L 14671811 5' + FB 51 1 52.41 AAAGAACCCCTTGAAGGTATTTCGAATCATTTTGGACCATGTTGGTTAACTATTTAATAATCGTAAAGGCGTTGATAATAACATTTTATTTATTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3L 8673413 5' - I-element 5322 1 58.62 CGGTGGCTTTCCCTGGAGAGATCTCTCTGCCGTAGCTTTTCCCCCTTGCGGAGCTGATCCTGTTGAGCTTCCCGAGCTCCCTGCTCCTGCTCGTCTGCTCTCACCCTGCCCTGTCCCATGGCCCTGAGGATCGGCGCCGGCG:1 + chrX 21030489 5' - Rt1c 168 1 61.27 TTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:1 - chr3L 23839740 5' + 17.6 6962 2 68.49 TGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chr3L 11257404 5' + 1360 3387 2 35.56 CAGTAATAGTAGGCTTAGTTCCTGCCAATACAGATACACCCTGTTCGTCTTAATCCTCTATTGGCCTTTTCTCGACGTGAATTTTTAATAATTATTTTTTTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAAAACTACCCTAATAT:1 + chr2L 2754946 5' + 1360 3133 1 50.00 GGATACAAAATAATTTCATACGATTTGTGAGTTTTGTAGTCATCATAACAATGTTGGTGCCGCGGCATGTGGGTTATTCTTGGTCGAGGTCACAACAAAAGACAAAAAATAAAAGAAAAAAAAAAACAATAA:1 + chrX 20806598 5' + gypsy7 5012 1 70.45 AATAAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 17343508 5' - I-element 5328 1 60.00 TGGTTGTACCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATATCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTT:1 + chr3R 15942695 5' + hopper 56 1 54.11 ATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGACTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATACCTGCTTTATA:1 - chr2L 11839707 5' - mdg1 318 2 78.77 GTTTCGTGTATATGTACTACATACATAGTGTTATCAAAGACACTAGAATAATAGGGTCTTTGGTATTATGTAGGTAGGTACGATGTTGGCTTTTAACCATTTTAATCTACGCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGTG:1 - chr3R 4635394 5' - accord 180 2 77.70 TAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3L 3983928 5' - P-element 2858 1 64.83 TGCAAATAATTTCCCACCATGCCATGCCACAACGCACCGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3R 24733531 5' + hobo 63 1 70.31 ACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:3 + chr3R 17996150 5' + diver 45 2 53.42 AAGAAACATTTCTCTGTTTGTTAATGTATTAAGGAACCTAATCTTAAGGATTAGAAGTGCATACTAGTGCTTTAGTTGGTTTTGATTCATAGTTATGAGGTTGATTTATGTTACATTATGTATTTATTTTATTTTATTTAAGTAAA:2 - chr3L 8333849 5' - G7 1146 1 75.34 ATTTACATCATTTAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATA:2 + chr2L 14874103 5' - copia 256 1 59.59 CAGAATGCTGCCATATTCATTCTTATAACACAAAGATACCAATAATTCTGATTTAATTTTTCTTCGTTTTCATTTTTACCTAGATCAGTTTATTCATATACAGAACGTTGTTGATATTCATTTAAAAAACTAATTGGTAGGCAAAC:1 - chrX 15945919 5' - FB 79 1 72.60 TTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCC:1 + chrX 15903165 5' + INE-1 87 1 67.89 ATATGATTTCATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr3R 8890134 5' + FB 44 1 56.85 ATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAA:1 - chr2L 47161 5' - roo 8980 2 80.82 AACAGCTGCTGACCAAATAGAAGATGAATATCTTATCATTTACAGTCTAATATGTATTGATTAAAACGTGAATTAAAAGCATTATATTAATTTAATTTAATTT:1 + chr2R 11949134 5' - TAHRE 48 1 86.41 TATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTTGTTATATGCAATCCGA:1 + chr3R 4357516 5' - Tc3 1669 1 47.79 GGTTTCTTTTTAAATTTACGCTAGTTTCAGTGCTTTAAGCCGTGTCATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:2 + chr2L 14074400 5' - 297 6960 2 76.03 ATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATAATATGCTTCTCATATT:2 - chr2L 22369232 5' + rover 4 2 67.12 GTAGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAATAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 + chrX 18742811 5' - invader4 3060 2 60.40 AGGTGCGAGCAACTAAAAGTGGCAATTAATTTGACACGTTCTCATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGCGCAACAGAG:1 - chrX 4190290 5' - accord 6999 2 65.59 GATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3L 8959717 5' + 1360 32 1 60.56 ATTTAGTTTTTTTTTTTCTTTTTTACT:1 + chrX 18530548 5' - gypsy7 5007 3 85.19 GTGAATGGGTTGCATGCCAAAATCCAAATCGAAACCAAAAAATATAACCAAAAATAAAAGAAACTTAACACCAAGAAGGAAGGAAGAGCTCAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3L 2432151 5' - 1360 3359 1 77.93 ATATGTCGGAAAATTATAAAATCCATAACAGAGGCAAAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAAACCTTCTTAGCAAACCCAATTCAGATAACATACAAAATACATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAA:1 + chrX 1004959 5' + I-element 5167 1 73.97 ATAAAAAGCCATTCAGACGAAGATAAGAGTATTCTTGGCAAATAAATTATTCTAGTTTGGTATTTGAAATGGCAATTTTAGCTGACTGTGAGGATGAATATATGAATTATCTATGAA:1 + chr2R 18055772 5' + micropia 192 2 57.26 TTGTGCTTAAACCGACCACACCAAACGGTGCCCCCCGTCCAATTTTGCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCTGTTTAATCATAGAACAGTTGGAACAATAATACAAC:1 - chr2L 257749 5' + F-element 4579 1 55.05 GAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCCTAAGCGACGGATTGCCCGACA:1 - chr3L 23702250 5' + G4 68 1 62.33 AAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chrX 19074857 5' - mdg1 351 2 65.07 ACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr3L 21327087 5' - copia 5084 2 66.44 ATGCCACACCACGAATTATTGTTTAAACGAAATCAGTTTGAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTCTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTA:1 - chrX 6116376 5' - transib2 2793 1 65.07 TATTTCAAAATTATGTTCTTAATTTTAAATGTTAAGAGGCTCATTATAACATATAACATCTCAATATAAGCTTTCTGCCCTTTTTTTGGCATAATTTTTATAAATCTTAATGTTTTAATGCTATCTTATTGTTTTTTTTTATAAAA:1 + chrX 12248231 5' + Porto1 4639 1 75.34 AATGAAAAATGGATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chrX 20888407 5' + 297 6617 2 54.48 ATCGGTGACCGTTATCGCAAATCAGAAATCGACAAATACCCGTTCTAAAGTCAAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAG:1 + chr3R 18399304 5' + HeT-A 382 1 50.68 TATTATATTATTTAAAAATTAAAAATTTAGGATTAGGATGGACCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATT:1 - chr2R 959931 5' - mdg1 25 2 71.92 GTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTG:1 + chr2R 9158062 5' - mdg3 5422 2 67.13 ATAAGTATAATTTTGGTTTTGCTTTTGGTTGATGGATCGTAACGATCGTAACGATGATTACCCAGATTTCTTCGCTTGTGCGTACACTTAATATGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGC:1 - chr2R 16330798 5' - rooA 312 2 55.22 AATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCAGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 + chr2L 10156071 5' - hopper 1392 1 67.12 GAAAATATTGAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAA:1 + chr2L 22966882 5' + 1360 3198 1 50.00 TGGTAATTTGCTCGGTTCTGCCTGTAAAGGAATGGGGATTTCCCTTTTTTTTTATTTTTC:1 - chrX 9409752 5' - Bica 336 1 60.00 ATGCCTGTGTCTGCCCGAATCCATGTGAGCTTTTGTTGTTGGGGAAGAGACGATTTCCGTTTTCGGACTAGCTGCTATATGGCTATAGTGTATTGTTTTGTTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTCT:1 + chr2L 634992 5' - Doc2-element 221 1 76.42 AGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 - chr2R 9158124 5' + mdg3 5335 2 71.92 AAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 20266030 5' + roo 8730 2 66.90 AATTTATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 + chr2L 7660875 5' - I-element 5330 1 65.75 TTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 - chr3L 15103908 5' + Transpac 4978 2 59.59 TTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3R 23295607 5' - P-element 2858 1 36.99 ATTCTCAATCGAGTAATAGCAGAATAGCAGAATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chrX 661836 5' - 412 455 2 57.64 CAGGGAGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAA:2 + chr2L 4754829 5' + Stalker4 6966 4 58.62 CAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2R 8047267 5' + 1360 53 1 64.52 CGGGATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCC:1 - chr2L 9782144 5' - P-element 104 1 33.60 ATTTTAACATTTTAAGCCTACCTCCTTTGTTTAATAAAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGATTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 18226736 5' - roo 9051 2 66.44 TCATGTCCCACAAAAATTATATAATGACATATACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 22193493 5' - roo 323 2 77.40 GTAATTGTTACACCCTGATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:2 + chr3R 4682858 5' + Burdock 33 2 61.64 GGTAAAATAAATTGTCTGTTAGATTATATATATGTACATATGTACATACGTGGGTAACTTAAAGACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCGTCTAGTGTGAATGCG:1 - chr3L 23023835 5' - INE-1 533 1 77.27 CCGGCAACCAAACTGCACACACAATAGTAATTATTATTATTATTATTTTTATTTTATTTTATTTTATTTGATTATTTTTTATAATACCGCGTACGTTCGCTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTT:1 + chr3L 24041097 5' - Bica 476 1 71.23 ATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chrX 8092516 5' + pogo 32 1 62.07 CTCTTATGCATTGTGCAAAAACAGTTGGCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:2 - chr2R 5674769 5' + S-element 37 2 63.70 AAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAGTTAAACGCAATT:1 - chr3L 17568107 5' + S-element 75 1 68.49 GCCAGCGAAGCGAATTTTGAACAGGAAAAAACAAATGCCGTGGCAGACTGACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATACGTATTCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTGG:1 - chr3R 25616888 5' + 1360 225 1 64.38 TTAAGCATTTTATTTTTTAACTGGCAGGGGGTTTTCGAGTATCCGACTAAGTAATACCTCCTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCTGCTACTCACCACCCTCATGACCTTCTTAACCTGGTTTTGACCT:1 + chrX 13134842 5' + jockey 4775 1 67.12 AATAACAACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 - chr3R 22590624 5' + rover 17 2 73.29 TATAATGAATATCTAAAAAAATACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:2 + chr3L 18046549 5' + roo 8 2 78.77 GTACATATATACGGAGGATTGCGAAGGATACATTTTTAAATTGTCTTCGGCTACCTTAGAAATTATCAAAACATATTAGAATTTCCAAATCAAATGGGCAATATTAGTAGCATTTCCTCAGTAGTCCT:1 + chr3R 4459755 5' - blood 430 1 63.28 AAGAGGATCAAATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGGATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTAT:1 + chr3L 22531936 5' - Cr1a 4209 1 61.64 GCCTACAATGGGTTGGGCGACTTGTTTCATAAAATTTAGTTACACAAAACTCGAGAGAAAGATTTGACACCAGAGATCGTTCACAATTTGGTGGATTCAGTAACGGACTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTT:1 + chr2R 4785186 5' + Juan 4038 1 75.34 AAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATC:1 - chr3R 22590602 5' + rover 39 2 58.22 ACCAAGCTGACAAAAGGAGGCGACTCATCATTTGGCGTCCTCCTCCTGCGAAGCTGGTAAATGGGTTTCATGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGGATG:1 - chrX 5995352 5' - 17.6 6941 1 52.21 AATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGTACTTAATGAGACGAATCGTAAGTACGTG:1 + chr2R 21410888 5' - Burdock 173 2 71.92 CCGCAGATTGAAATGGTGATGGCAATTTTGTATAAAGAAATCGGATTTTTTATAACAACTGTCTTGGCCAATGGACGCCATTTGAACCTATTTAGGAGGAATTTTTTAATACATTTAATAAAATGTTACATTATTATTATTGTTT:1 + chr2L 18044372 5' - invader3 5044 1 56.55 ACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr3R 3850990 5' + transib2 34 1 61.38 AGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chrX 15357647 5' - hopper 1388 1 57.14 CAGTCCACTACTGTTATAAATACCAAAAAAAAACCACCGGGTATTTAGGTTAACACTTGAACAAAAATATTTTTTAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 19450161 5' + roo 22 2 24.44 CAAAAATGCGTAATGAAATAAATAACAATAAAGGAAAAACAGCAGGATAATGCCCCCTGTCATAAGGCCAAACTGATTACGCAGTTTCTGAAAGATGTTTGCGTAAACACATTGAATTAGCCACCTCACAGTCCAGACCTCAACAT:1 + chrX 18144190 5' + Tc1-2 1164 1 73.29 AAACCTCCCCATTCCCCTCAACACCATTGTCCTTGTTGTTAGTGTGGCTTACATTGGTTTATTAATTTTGTGCGCATTTAATTGTATGTATATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCATCATAAGCACATTATGTGTTTGT:1 + chr3R 25563232 5' - Tc1 1619 1 56.85 TAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 - chr4 303823 5' - pogo 2048 1 55.48 GTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 18403046 5' - P-element 2852 1 38.46 AAGGAGTTGCGTTTTTGGGCTTGTATGTGCTGCTCCTGGCTGCTTTGGTGCGTCCCCAGATGAACTTCAGCATATTCGTGGACTCGTTCTTCCTGCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATAC:1 - chr3R 22337570 5' - baggins 5295 1 76.74 ATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr2L 21328156 5' - 297 333 2 68.49 AAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACT:1 - chr3R 9238193 5' - P-element 50 1 20.00 ATAAAGCAGCACAATGATACATATCTTTATCAGGATATCGAGAATGAAGGCAGATTTTCTTTAAGACTTACCCATGATGAAGTCGCTGGTGATGAAATCGTTGTCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTG:1 + chrX 10575319 5' + X-element 4309 1 63.70 AGATGGAATTGTTGCTCAAAAAAGAATACTAATTTTACACACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 - chrX 14771864 5' - BS 5085 1 76.03 ATCAAATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chrX 1135413 5' - P-element 2864 1 64.52 AGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGAAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTTCCCATGTTTG:1 + chr3L 22890355 5' + FB 62 1 54.11 ATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 10931608 5' + 297 40 2 54.48 AAATGAATGGATGGCTGCCACCAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 - chr3R 25433418 5' + transib2 13 1 74.24 CATAGACACTCCCGGTCATGAAATTAGTAGCCGTTGCTAGTAGCCATTTGACACACTCCATTTAAACATACCTAAATCAAAATATTGACATGTCTCGGCATTTGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAA:1 - chr3L 15587699 5' - 297 6623 2 78.42 ATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGAAGTTCATAGACTTTAAAT:1 + chr2L 22255074 5' + 1360 234 1 69.86 AATAGTGGTTTACCGAAATAAGATCAATTTATGATAAAAATTAACAAGTGTTATTTTAAGTTAGAAATACGTAAAGCTTTCAAAGAGAACGGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTT:1 - chr3L 21484661 5' + Cr1a 57 1 72.60 CTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chrX 18409472 5' + jockey 4689 1 65.38 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCA:1 + chr3R 19450160 5' + roo 347 2 76.71 CCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTC:1 - chr2R 20802650 5' - mdg3 5422 2 66.43 AAAAAACCTTAAGTGGTTTTAACTACTGTATTGTGTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTT:1 + chr2L 7618427 5' - X-element 4686 1 61.38 AATGATGGGGCAGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGCTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 14051696 5' - roo 404 1 75.00 TGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 21933265 5' + pogo 38 1 63.01 ATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 - chr3L 21769138 5' - I-element 5321 1 55.48 GGGGGATTGCTTCGATGGCACTGGAGTGGTGAGTTGTGGTGAGTAAGAGTTTGTGTTGAGTAGTGCTTGCTACAGAGGTACAGTTTACACCTTAGAAACTATTTTATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATT:1 + chrX 13597111 5' - 297 478 1 76.71 GGGTGTTGGTGCGGTTGATGAGGAAGTCGTTTGGGGCACGCCCTTTGTTTGCCGGGGTTTCTCCGGGGCCGCCTGCTATCTCTGACATGTTACTGTCACAAAACCCCCAATCCCC:1 + chr2L 14524518 5' + Doc2-element 478 1 82.61 AATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - 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chr3L 14571812 5' + TART-C 11096 1 83.45 AAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGCACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGGGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTATATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAG:1 + chr3L 22960443 5' - Tirant 341 2 60.61 ATTGAAACCAAATAGGTTTTAATACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 20167707 5' + roo 8696 2 63.01 AAAAGACAGCGCGGCAATTTGGAAACTGAGCAAAAAGTTTTTTGTCCCTGGCGAACATAGAAGAAACTTTACCTGTATGCCAAATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTAATCACTATTATTATATTGTAAGTA:1 + chr3L 22043075 5' + Burdock 461 1 57.53 ATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCACGCCCGGGAGGCGACATCAGCAAAGT:1 - chr2R 12185378 5' + accord 59 2 78.85 AGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTAGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 - chr2R 22034730 5' + copia 4950 2 70.55 AGATTATTTCTTTTGATATTTTCAGCGATGAACTTAGCTTAAATACGGATCATTTCATCGGCTCAATTAAAAAATATTTAACTGGCG:1 + chrX 5209665 5' + McClintock 482 1 64.37 AAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1 + chr2R 8047269 5' + 1360 77 1 71.23 CGGGGAATTTAAGTTATAGTTATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 15325224 5' + 297 14 2 72.86 CATATATTTGATACAATATATGTAATTTGGAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTATTCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGT:1 + chr2R 8157209 5' - mdg1 7362 2 80.82 AAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAA:2 + chr2R 3338780 5' + Juan 56 1 54.79 AACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATAC:1 - chr2L 2527713 5' - hopper 1342 1 66.90 AACTAAAACCACAAAAAGTATCTGAAGTTAAAAAAATAATGAAACGGCAAAACCCCAACTCTAACTCCGACACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAAT:1 - chr3R 28203882 5' - I-element 265 1 52.05 TGACACTCAGAGTCTGAGCGAACGCATCCGAGTGCTTCTCTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 19266952 5' + roo 39 2 60.96 GCAAATACAAGTAAACTGCCAAATCAGATTTCGGATGTAATGTTGACATAAACAAAAAGAGAGACTGGTATAGTCGAGT:1 - chr2R 3492328 5' - INE-1 576 1 84.81 GAATGGTGATCTTTAAGGCGCTGCCACAGTGGCACTTCAATTTAGTGGAAAAAGCGCTAATTTACTGGTTCACTGTAAGAATCGGATTCACTGTAATATAAAATAAAATAAAAATTTCATAAAATATGTATATATAGTAATATGAA:1 - chr2R 14720950 5' + Dm88 25 2 54.79 AATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGC:1 + chr2L 13844189 5' - Stalker2 7558 2 77.40 AACAAAAAACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 17940248 5' + 1360 8 2 79.45 ACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAA:1 - chr2R 12645475 5' + X-element 96 1 75.54 GTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTA:1 + chrX 19038394 5' - hopper 1330 1 78.47 AGTCGGCGCATACTAAGCAGAAAGAGAGGCGCTGAGCTAATGAGACAAAGACGGGGCGAAACACTTGGCCAAGTCACGCAGCAAATTTGCATTCTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCC:1 - chr2L 6989324 5' + hopper 1408 2 63.77 ATCAAGTCGAACGCTCGCGCCGCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chrX 18282693 5' + P-element 56 1 45.89 AGATTCAGTTGGCATATTCAATTTTAAAATATATTGTGGCACTAACTAAATAATTTCTGGCAAAAATGTTACCGAGTTATCCATAGAAATAATTACAGACTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATA:1 + chrX 7503472 5' - I-element 5179 1 62.76 ATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1 - chr2R 24170006 5' - transib2 2780 1 46.58 TAATATATAATATGTTAAATATTTATATTAAAGGAAAAATGAAAAATGGATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr3R 14017333 5' + 297 6581 1 79.45 GCCGGTNCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chrX 661952 5' + 412 66 2 62.07 ATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTTTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:1 + chrX 2479493 5' - mdg3 5431 2 58.90 AGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGTTTTTCTATAATTTTCTTCTGACTTGGCTTTAGACCTTCTGAATTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 19032717 5' - roo 390 2 47.26 ATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCC:1 - chr2R 2318244 5' + ZAM 11 2 68.32 ATAACGATTAGGAGGGAACTGTTCAATCGAATCAATCTATCATAATGGAATTAAAGGAGTTTGAGCTGTTAAGTATCAGGCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 + chr3L 2240376 5' - S-element 1677 1 58.90 AGGTATTGAAGTACTTTGATCAGAAATTTCAACTAATAAATTTCGAATTTCTTTTTACGATTAAACAAATTCAAATATAAATAGCCAATAGTGAAAATAGAATGAGTGTGTGAAGTGATGAGGTCTTATACTATGGCACATATGCT:1 - chr3R 7508268 5' - Quasimodo 4 2 43.15 CTCTCGCAGCTGAGTTTTCGGTTTCCGCTTCAGTATCGTGCCAAACATGCTGGAAGAAGGTTGGTGTAACTGCTTTTCGCTGTGCCCAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATG:1 + chr2R 22270889 5' - Tabor 6853 2 62.76 ATGGGAAACAAAGGGGTCTGGGAACATTTTTAGCGAAATGAAAATATGGGAAGAGATGCAAACGTAAAGCAGCAAAGCACTTGACTATAGACCTATAGACCTGTCAAATTACCTCTTCCGCCATCGGGGACTGACCACG:1 + chr3R 8884653 5' - R1-2 358 1 53.96 TCTTCGCCTTTATATGCTCCGTCTTTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAATAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAAT:1 + chrX 4226415 5' - Porto1 4430 1 80.14 GCCCGCCAATCGACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3R 16157402 5' + pogo 48 1 52.74 ATGTATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:3 - chr2L 11839750 5' - mdg1 7399 2 53.42 CACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:2 - chr2L 16943908 5' - copia 239 1 50.68 AAAGGGGAAGCTTATTTTCATTGCAAATTGTACAATTTTTTATACATTCCTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATATAATCTATTGATTTGTTTGTAATTTTCATCTAAACCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 - chr3L 9270004 5' + copia 4872 2 76.03 TTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 - chr3L 15103908 5' + Transpac 52 2 57.55 CATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 11062711 5' + roo 14 2 70.83 AATAATATAATTATGGCGAACCACATATAAATCAAATTTCAATCATAAATGTACGAAATCGTCTAACAAGTTTAGTAAAAAAAATAAAAGTAAATTATGAAATAAAGACAATAAACGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGA:1 + chr2L 13462535 5' + Transpac 4783 1 74.66 GAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 - chr3R 11040174 5' + Bari1 24 1 64.52 ATCCACAGACGCACCAATAGATTTTTGATCACATCGCCGGCCTTCTTTAGGAACTTTGAGGTCTTCTTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGC:1 - chr2L 8177410 5' - invader2 457 1 54.11 ATTATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAA:1 - chr3L 27670265 5' - I-element 5337 1 56.85 TGGAGAAGTGCAGTCTTTTTTATTACGATGTGTGTGGTTATTGGTATAGCGAAAGCTGT:1 + chr3L 24916852 5' - Porto1 445 1 61.02 CGGAAAGAGTACTTAGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 + chr2R 24169939 5' + transib2 30 1 37.67 TTAACAGCACAATTACGGGCGATTTAAAACGCACTCGGCGGCGGGCGAAGGAGGCAGCGGGAATCGATAATATGTAAATGCAGACAAGACACCCCGTTG:1 - chr3R 9886193 5' + hobo 120 1 77.78 TACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 13406547 5' + pogo 31 1 60.27 TCTCTATAGGTCTCCTCTGGTCATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAAT:1 + chr3R 2522264 5' + Tc1-2 92 1 48.97 TTCCACATTACATATTTTTAATAGACTCATCTTCTACTCTAGAAATAACGGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr4 372906 5' - pogo 2087 1 76.03 AGGAAAAGGAAGTTTAATCGGCGGTGGCAAGAGGAAGACCAGCAGCTAGTGATGGCACATGCCAGAGGGTATTAAGCTATCGATATTCTAGCAGGGCTGGCAAGTCGATATTCTACAATTGGGCTTGTTGGATGATTTTTAC:1 + chrX 21053244 5' - Fw2 3593 1 76.06 CACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:1 + chr2R 5941332 5' - copia 193 2 60.96 CGGTTAGATGTCTATAATTCCCGCGTTAATTAGACCAACATTTCAGTAGTGCAGATAAAACCAAACAAGACAAATTCAACAACATCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 + chrX 12886863 5' + I-element 5141 1 59.59 ATTCCATGACACTGTGCATACTTTTAGGCAGGCCCAAACAAAGTATAAATATTCCCGCTTAGTTTTCATATTTTTCGTTTTATTTCTGAGTCAAGCTAAACGTACACTCCATCAAAATAATAGTATTTAAATGTATATTAAATAGA:1 + chrX 3704631 5' + transib3 2625 1 78.77 ATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTTGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 - chr2L 17180124 5' + Juan 80 1 69.23 ATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTC:1 - chrX 9950598 5' + jockey 4732 1 65.15 AAAGAAATGGCAGCGATACCATATAGCTTGTGATGCTGTTAGAACATTATAAAGTATAACTAAATCAAATCTGTTTTTAAAAACACGCAAACACAATACACGATACATAATCACAATACACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTC:1 + chr3R 17526190 5' - Stalker2 446 1 58.90 TTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTGTTAAGATCGCAAGCGACC:1 - chr3R 26504342 5' - HMS-Beagle 219 2 65.22 ATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr3L 2544640 5' + Tirant 66 2 72.80 ATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTTGATAACAAAATCCTAAATATAATT:1 + chr3R 19450139 5' - roo 85 2 60.71 AGCTGTGACAAGGCAATTGCTTCAAGATAACAGTTTGCCTTACTTCGATTTTTAAGCTGCTTCCGACAGCTTTAATAGTTTAAAACCAGTCGGTAACATTTTCAAAATTGTAAATAAATATTAATAATATTAATATTATTATTATT:2 + chr3R 11095126 5' - mdg1 7078 2 71.92 TTTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTT:1 + chrX 4808484 5' - mdg3 5465 2 62.33 AAATCGTAGACTATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - 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roo 9058 1 74.66 CATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGTTTAGGAGCGGAGGCACCCGGTGCTTCAGATGTATTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 + chr3R 17996160 5' + diver 49 2 48.57 TTTAAATGTTATACTTTTTAGGCTTAAGTCCCGAATTATTGGAAATTTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACACATAAGTTCAAGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTT:1 + chr3R 10450737 5' + 1360 213 1 70.55 TATAATAAATGATAAAATTAATATAAAAATTAAAATTAATGAAGAAAATAGAGTTAATTTTATTTATAAATTAAA:1 - chr2L 14778335 5' + S-element 123 2 38.67 CAATCTATGGAGACGTACGCCCTCGTCCATCAGTCGCTTGGCTGCTTCGATTTGGCGAGCTGGTGGCTCCATATTCACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGGGCCCAAATTAGGAGACAAG:1 - chr3L 9350692 5' + jockey 4609 1 62.90 ATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCAT:1 - chr3R 21630338 5' - I-element 5282 1 67.81 GTTTGTTGTATTGTATTTTAAAGTAACTGTTAAGAATCACTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAACGGAGCTATGCTTCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTTTATATAGCATGGCGACCGTGACAGGAT:1 + chr3R 19045994 5' + gypsy11 449 1 57.53 ACACATGTGCCTACAATTATCCTGGCATTTGAAATGCTTTAATACTAACTTTAAACTCATGCGTATGTGGATTATAGTATTGTAAATTAAAAGGTTTGACCAGCGGGCCCACTTACATGTTCTGTATGATGTGGGCG:1 - 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I-element 5325 1 63.01 TACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGA:1 + chr3R 19450192 5' + roo 9043 1 54.11 GTAAACAACCCCATTAACTTTACGGACATCGCACATTAGGAATACGTCGGTGTCGCACCTCTACAGTGAACATTCACTCAAACATTCTCACCGTGATTTTAAATTGTCGTTCTTCCAGATATGACTTTAAAGTACAGAAGTGGGG:1 + chr2R 4009105 5' - Helena 469 1 57.93 AGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 13158726 5' + roo 75 2 69.86 GGGCGTAACAGCATTTTGCATCTTGTCGGCGTCAGAGTGGGTGTGGGCAATATATAATATTGGCAACAAACTTGTGATACGTCTATGTTATTAGAATCAGTATTCTTATTCTTAACATTATAGCTTTTAATGTTCCTGAGATCTCG:1 - chr4 387583 5' - INE-1 147 1 60.96 ACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGC:1 - chr3R 1446144 5' - 1360 3377 1 27.40 CTGTCGATAAGAAAGTGCGTGTGAAAAGGGTTCCTTGGTGGCTGCATAAATTTGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTTAAAAGGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCTCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTT:1 + chr3R 10489093 5' + 1360 3091 1 67.81 CCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr2L 11391504 5' - 1360 11 1 51.03 ATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:2 + chr2L 6654609 5' + diver 5910 2 67.81 CACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGA:1 + chr3R 2169848 5' + gypsy11 112 2 69.86 ATGTTCACAATTATCCAAATGCAAGAAGGGGCTGATGAAAATGGGGGGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTATTTGTTGCTTTTTTTTAATAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCA:1 - chr2L 4026334 5' - Porto1 4371 1 66.44 AACCATGGAGGCAGCCGAATGCCACATTCAGCTGTATAACCAACCGATTATGGTTATGGGAGTGCAAATCCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCCAGCCAC:1 - chr2L 16573720 5' + Ivk 186 1 47.90 ACATAATGCGCGCCCTGTCAAACGGGCAACCTGATACGAAGGAAACGACTTCTCTTCCTTCGGCGAGGACTCCATAAAAACGAGGGGAGCTCCGTATAAAATCGGGTGTTTTTAAGTAAGTGAATGATTATTAATATATTAC:1 - chr3L 4080822 5' + Doc2-element 73 1 64.08 CGGGCGTTGTTTTTAGTGGGAAAAATCGAAGCCCGAGTGCGCTGTGTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATGGGCTATGTATAATTAGGGATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGGAGAAGGAGCAGCCTACTA:1 + chr3R 20948972 5' - mdg3 5255 1 64.14 CGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCGGGGGTTAATGCTGACCCTCGGTCT:1 + chr2R 24427554 5' + jockey 4714 1 52.59 TCTATAAAAAAAAAAACAAAAACTACAAAAATGTCGATTGTGTTTTATTTCCCCCAATTTCCCGTCAGCCGATGAAGCTTTCCCGACCGTGCTATCTTCACTTAGAAGAAAAAAATAAGAAACAGGACCC:1 - chr2L 11444797 5' + mdg3 5161 1 71.54 AATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 4341278 5' - roo 8993 2 71.23 AAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 + chr2L 11298047 5' - I-element 5289 1 67.81 AATATTCAATTGAAAGCCGCACCGTGATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAG:2 + chr3R 20675791 5' + jockey 4884 1 70.55 GGAAGATATATTGACCATTGTTGGCCGATTTTTGAATTAATACATTTCGTAAATACTAGATTCGTTCTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCCGTCCGACCATATAAAGTATTCTTGTATTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATT:2 - chrX 22519291 5' + INE-1 96 1 52.05 ATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:2 - chr2R 24169999 5' - transib2 2773 1 51.37 AAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATT:1 - chr3R 19992741 5' + hopper 54 1 53.42 GACAATGATTTCGATATTTTTAAACCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chrX 19767026 5' + diver 5975 2 76.76 ATCAAATGATTAATCCTTCGTAATACAAGCATGCATGTTTTTTAACTATTATTTCGACTGCTATTGTAAGTGTCTGTTTTTGTTATGGCAGTTATTGTTGCTAAATGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTG:1 - chr3R 25659851 5' - Doc3-element 490 1 55.32 GTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAT:1 + chr3R 25709779 5' - hopper 1344 1 66.44 ATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr2L 18549901 5' - roo 8983 2 76.71 AATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCGAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 11191411 5' - roo 328 2 73.97 AATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTC:1 - chr3L 3501797 5' - Bari1 1625 1 74.66 ATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr3L 15103768 5' - Transpac 5210 2 72.14 AGAATGTTGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 13168606 5' - P-element 2874 1 76.43 CCCTATCTACCATATCTGTTTAAAAACTCCCCCCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 21993590 5' + hopper 133 1 61.70 TTTTTTTGTCGTTTTGATAAATTTATTTTCACAGATTTCAGACTCGTTATCATCTTTTTTATCTTCTTCTACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATC:1 - chr3R 19444974 5' + roo 431 1 51.20 TTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 7889672 5' - roo 361 2 53.10 TTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:2 - chr3R 30675493 5' + 297 6599 2 69.86 GTGCCCCATACATCGAAGCTCAGACAACGAACCGAAAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATTATAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCTACAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATA:1 + chr2R 5953784 5' + I-element 5123 1 75.34 CTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 - chr3L 19455005 5' - mdg1 350 2 69.63 CTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr2L 21328278 5' + 297 41 2 64.38 ATAGTTAGTGGGGATTTTGTTTTAGGTTTTGACTGAACGATCTACATTTTTTAAATTAAATGCGTATGAATAACTTGGATTACTGATATTTGTTATACTTATCAAAATATCTATAGGCGTGTTATTAATTAATTTTAATCGTAAA:1 - chrX 22844551 5' + Rt1c 5396 1 68.97 CAGTGATCACACGACCAGCTCAATTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCGTG:1 - chr3L 12004339 5' + P-element 61 1 43.15 GATTTAATTAGCATTGCTGACTGGGCAGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGAACAAAGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr3L 8453709 5' + FB 32 1 62.24 ACAAACACAAACGTTGAAAACAACCCAGATCCAGAATGTGGCAAAAGGTGTTGAACTCTTTTGCGTTTTACGAGAAGTTCTGGGGCAAGTTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAAAATAGAAATAGCCAAATCTTTGTACA:1 - chr3R 12291599 5' + 1360 340 1 61.64 ATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTGATTTTTTTT:1 - chrX 21224661 5' - roo 9032 1 57.53 TTGTATGCAGAATATTATTTGGCTTTCGCTCCCCCGTTTCCATTTGAATTTTTGTTATTTTTTGCTTGACATTGCAATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGGTCTTAATAT:1 + chr3R 19202951 5' - 412 20 2 57.53 ACAGCAATTTAACTATGCCTTCCTCCTTCCCCACCTGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTT:1 + chr2L 7629254 5' + Doc 4639 1 77.40 AAAAACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 17940244 5' - 1360 3377 1 76.71 TATGTAATAAAAAGTGAGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chrX 18817264 5' - transib2 2776 1 51.37 TTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3L 18046612 5' + roo 71 2 68.49 TATACATATGTATTTACATTCAGGCAGTCAGACACACACACACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGG:1 + chrX 21243862 5' - opus 68 4 56.52 TCTTGTTAAAAATACTCGTCGCATGAGACATCCATGTTTTCACTATATTGACAATATTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTCTAACAAACAAATTTA:1 + chr2L 21253263 5' + 1360 3000 1 63.01 GAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGA:1 - chr2L 16946104 5' - hopper 1327 1 75.34 CCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr3R 26774056 5' - hobo 2883 1 80.00 GCTGTGGCATATGTCACAGTGACACAGGTTGAAATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGGCTTTTTGAAAATTGAAAGCTGGAATCGTTTGTCCACTT:1 - chr3R 16630333 5' + FB 48 1 58.10 TTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATA:1 - chr3R 20380572 5' - P-element 221 1 21.48 ACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGGTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr2L 7581012 5' - Transpac 5211 2 55.24 CTGTTTAAAATCTTTAAAAGCTGTGCAACAAGAGGGGAATTGAATGGAATTATATAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCAGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAAT:2 - chr2R 14551977 5' - F-element 4310 1 60.96 CTGTCGCTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 + chrX 10319585 5' + mdg1 40 2 58.22 TCACCTTTCCATAATCTTAGAGCTTAGTTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTAT:1 + chr2R 21897396 5' - FB 205 1 58.54 TAATGTTAATTGATAAATTTATCAGTTGATTGCGGCCAGATGTTTGGCCAAGATCAGCAAAGATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTAGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATCGCCCACCTCGATATGACAACCAAC:1 - chr3R 17736965 5' - opus 443 2 51.03 AAATGAGAAATTCTTGTGGGTGTGCGTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTTACACCCT:1 + chr3L 22325839 5' - hobo 2875 1 78.07 CAGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGGTGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTTGACCTAT:1 + chr3R 22642238 5' + blood 7028 2 72.60 AGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAA:1 + chr2R 10161785 5' + transib2 62 1 59.59 GGACTCGTCCGGGATGGCCCAAGTTGTGTATGCATAAGTGCGAATTGATGAGTGCGAGCGAATTGCGACAACGACGCAAGAAAAAAAAAAGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chr2R 3601400 5' + 17.6 6952 1 69.44 AAAATTGAAATTCTGCAACACGAGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGGATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCA:1 + chrX 13490617 5' + 297 10 2 74.19 GAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTG:1 + chr3R 19450036 5' + roo 8625 1 70.55 TTAATGACAATTGAGCAGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 + chr3R 6419790 5' - Tabor 7315 2 77.40 GCATAATAAAAACCAGACCAAGGTGATGCGTATTGGATAATGTAGATGCTAGTCAACCTAGCTGAGCTCACAATATCATTATGTATTTCGTTATTTTATTTGTCATGTGTGCTTCTTTTTGCAGCTATGTTTATTATTTAATATTG:1 - chr3L 14260117 5' + Chouto 5853 1 60.27 TGTAGTGATCCTCATATATATTGTGACGTTAATTCACGTTGCGTCCTCTTTGCGCACGCACTG:1 - chr2L 23197576 5' - gypsy8 238 2 87.30 TTATCATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCCGCAAGATATCGGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr3L 8627250 5' + pogo 49 1 68.22 AAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:3 + chr3R 13972975 5' + 412 7140 2 76.03 ATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr3R 31886950 5' - hopper 1393 1 63.25 TCTTCGTTTTATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAA:1 + chr2L 17282921 5' + INE-1 555 1 53.42 TGTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr2L 16943781 5' + copia 45 2 55.48 ATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTTTACGAAAATTCATA:1 + chr2L 15940232 5' + pogo 84 1 72.60 CAGCCAGCAAATGAAAATGAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 + chr3R 26504175 5' + HMS-Beagle 6818 2 70.55 TTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATA:1 + chr3L 22531948 5' - Cr1a 4197 1 71.23 GACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATA:1 + chrX 20999490 5' - BS 5055 1 54.68 AATTCGAGCTAATTGAAGTTGAATGCTTTGCAGTACACCAGCATGGTTTTTGTGCTCTTCATCCTGCAACTGGTGCTCACGTGCTGGGTGTTCGTGAACCGATCTGCCTTCCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCA:1 + chr2R 7007948 5' + roo 317 2 75.34 AAAAGTATCATTTATCTGACAATCGATAAAATCTAATTAGGCGTTCTCTTATGTTATACCCGTGAAAGGGTATACTAAATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACCGTATGTATGTTCTTGATCAGGAT:1 + chr3L 22511786 5' + INE-1 79 1 63.70 GAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGG:1 - chr2R 2318242 5' + ZAM 8020 2 55.48 AATAAAAAAACCTGGAGTTGGCAGCAATCTAAGATTTAAAATAACTGAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACAG:2 - chr2R 12989064 5' + INE-1 17 1 43.84 ATCGGATGATTTAGCCCATGATGATTGCAATGAAAACGATATTGGCCGATTGTTGGACGCTCATCGCTCTTATCCCATGAAAAAAAGACCGAACTGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGT:1 + chr3L 23907890 5' + 1360 170 1 65.07 TAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGG:1 + chr2L 14026174 5' + F-element 450 1 65.82 ACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAAT:2 - chr2L 16539735 5' + Juan 4098 1 60.27 AATATATTGAAATGCACAGCACTCGGGGGATCAAAAGAGGGGGGAGCAGAGTTGCACAGGGGTGCTTTGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTGTGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGG:1 + chr2R 12978980 5' - F-element 114 2 53.10 ATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTC:1 - chr2L 15076204 5' + 1360 62 1 58.22 ACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGGATTTTGCAGTTTTCGTCTTT:1 - chr3R 1844834 5' + Cr1a 186 1 67.12 ATTGATTGCAGGCACCCCTCGAATTGCCCCGCCTTCTAATCACCAGCTGTGTTTTACGTCTTTCCTAATTTTCTATTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chrX 6620168 5' + hopper 144 109 90.82 AACAGTTTTATATATTTAATTTAAAATCAAATACATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCGTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAA:1 + chrX 8360503 5' - roo 8698 2 75.34 AGATATAGACAGAAACATATACTAATATATTATAACTTTATTGAAGATATGTTATTTCTCAAACATTTTTAAAGTCATTTGTTTAAAAAACCCCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCG:1 + chr2R 21215415 5' - 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chr3R 9039020 5' - Juan 4156 1 60.27 CGAAGCGACCAAGCGAGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr2R 20349089 5' - transib2 2796 1 64.38 AAAATGGCAGGGAAAATGTTTGACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3L 9809370 5' - 412 7508 2 58.62 TCATACGATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:2 + chr2L 13556300 5' - transib2 2802 1 70.55 AAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:6 + chrX 11661373 5' - pogo 2057 1 56.16 CCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 10167470 5' - roo 347 2 58.22 GGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGA:1 + chr3R 9298488 5' + hopper 84 1 72.60 CTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - 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hopper 144 111 85.14 GTGGCAAAGTAATTTGAAATGAAAATTAATGACATGCAATCAATTTTCGTAGTCGTCGTTATTTGTTATTTTGATGACTTGCCTTGCGCACACACAAACTTGGGTTATTATTTGTCGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTG:1 + chr2L 14470886 5' - gypsy7 5006 1 70.55 CTTAAGCTTCAATTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chr2R 8157123 5' - mdg1 7448 2 77.40 AATATGCAGTGCATATTATCAGACTAAATCAAATAGATTATAGATTACTATTATTGATTTGATAAAGGGTTTACGCCAAATCAATGAGATCTTTTCGAAAACAGTCATTCCACATTCCACAGCATTTATTATTAAAAAAAAAATAA:2 - chrX 16370642 5' - hopper 158 1 67.12 AATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 + chr3L 10373790 5' - 297 6970 2 79.17 AGAATAGAAAATATTAACATCAGCTGGCTGTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 28146098 5' - roo 358 2 52.74 AACATATAGAAATCTAGAAATCTTGAAATCACGACATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATCAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAAT:1 - chr2L 3301629 5' - P-element 2650 1 28.08 AATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATCAGAAATAGCCA:1 - chr3L 25508749 5' + 1360 328 1 65.93 TTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 - chr3L 19455007 5' - mdg1 348 2 69.06 ATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 + chr2L 3675822 5' + Juan 4050 1 60.45 GACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1 - chr3R 15054295 5' - copia 179 2 75.34 AAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGA:1 + chr3L 27356081 5' - Tc3 1636 1 67.12 ATAATATGGATATGGATAATATGGATATGGATGGACAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCAGGCACGCACCGA:1 + chrX 17650545 5' + invader4 437 1 74.66 AAATTGATACATTTCATACAATTTACTTGCAGTTGCATTTCAGTCCGCCAGGACGCGTGACTTTGTGACATTTAATGCCAGTTTGTCAGCTGGCTTTCTCGACGGCATCGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 + chrX 585581 5' - Tirant 8495 2 78.08 AAATATTTACTATTGACTGCGAAACATTTTTTACCATTTGGCGGGCGTGACTTTTTCTTTGTTTCTCTGTTTTTGTTTTATTTTGTTATTTTATTTTTT:1 - chr2R 21735762 5' - gypsy11 3933 1 81.82 TCATAACTCTACCACACCACCTCAAAATTGATTACTCCGAACAAAAACCGAAAAAATACTTGAAAAATACCCAATCAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCTC:1 - chr3L 5544303 5' + Porto1 492 1 53.42 TGAAAGATTTTCCATTAAATAAAACACTTTATGGAATGGCCCAGCAGCACGCAGTTCCCGTCGTCTAGCGTTTTTTTCCCGCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGGAACTGATGGG:1 + chr3L 6372751 5' - F-element 4408 1 70.43 TCTAACCTTTCGGTTATCTTGGATATCCGTAATATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 17077237 5' + roo 22 2 69.18 AGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGGGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAA:1 + chr3L 3501730 5' + Bari1 78 1 69.86 AGCCGCATTCAACGGGGCGTGTGGGCCATGTTATCATCATCATCAAACTCTTGGCCCTTGTGCACGGCAATTGTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATA:1 - chr2L 17766237 5' + Doc 156 1 75.34 ACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:2 + chr3L 17275433 5' - Transpac 223 2 79.45 AAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGGATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr3R 21630356 5' - I-element 5300 1 55.48 AAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATTTAAATGAATCG:1 - chr3L 14366632 5' + roo 54 2 55.00 AATATGTAAGAAAACTTTACCAATGAGGTTTGTGTACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr3R 30946637 5' - Transpac 5192 2 60.27 AATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 18488389 5' + roo 80 2 76.06 TGGGGAAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:2 - chr3R 31886964 5' - hopper 1378 1 60.27 ATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:1 + chr2R 9966949 5' + Bari1 27 1 42.25 TAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGGAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 1279187 5' - roo 393 1 60.95 CAACATTTTTACAGAGCTTAACTATCACATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAATGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTT:1 - chr2L 20152850 5' + copia 94 2 77.40 ACTCGGGATGCGAGGCTGGAGGATTGGGAGCGTCCCCTAAGTCCATGGCACATGAAATCACTCCCTTATTTTACACCTAGTTGGCTGGTTGTGGGCGTGCGTCGGGGGGGCTATTTTTAGTCTTGTTTTTATTT:1 - chr2L 1844100 5' + invader6 4502 2 74.63 TGGACTTGTGTATCTCTACCGTATACCCATTAATTTGTATCCGTTAATGCAAGACCCAGTTGCTCCTGTGTCTGCTTTAGTGAATGTAACCATAAAAGATTCAAGACCTTAATGACACATGGGAAAAAACACCGTGCGCCTTTTCA:1 + chrX 11139211 5' + baggins 5110 1 57.53 TTTACCCCCTGGCCGCTCTCAACCTCATCATCACACTTGAAAGAGTAAATAAAATATAATTCCTCAAGGGTGTTATAAATAAAATTATCTGAATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACT:1 - chrX 17810247 5' - Idefix 7229 2 65.07 ACCACTGAGGCAACCACAACGACTGAAAGAGCCACCACAACCACAGAAGCAATAAGCACAACCACACTGAAGATCACCACTGCCGAAATAAATAGTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCT:1 + chr3L 9608538 5' + F-element 4214 1 66.44 AGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 14051707 5' - roo 405 1 75.00 AGTCAATTGCCAACAAAAGTTTTGTTCCCCAACAACGGACGTGCATTTCATTAATCTCTCCGTGGCTTTATTTTTATTCCCCCCTATTTTTTCCATACCCACTCCACCAGGCAGTTATTTTCAAAGTTTTTTTTTCTTTTTTTTGT:1 - chr2L 18265704 5' - HMS-Beagle2 489 1 80.14 GAATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:2 - chr3L 11326805 5' + pogo 30 1 60.96 AAACCAATCGAAGTAGCCGAAGCAAAGCCATTTAAAAAACTATTCCAAGAAAATTAAATATGGAACAAACAAAAACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGATAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAG:1 - chrX 5071448 5' + Porto1 4502 1 54.11 CTTTATGGCTTCTTTTTTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATTGTGGTATTTTTACGGGAAATGTAGAACCTTGCACTGTGGGTCCGAATTCGATTGTTTTGGCATAAAGTCTA:1 - chr3L 12315865 5' - transib2 2805 1 66.44 TATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCT:1 - chr2R 23780588 5' + Ivk 98 1 73.97 GTTGTGAACTGATAGAGCATTTTTTTTTTTAATGAAAATTAAAAAAGTTTATAATTTT:1 - chr2L 15289766 5' + transib1 245 1 79.31 GCGCTTCAATTGGCCCTATTTAACATATGCGTAGAGTGCTTTCCCCTAACTCAAGACCAACTACTTTCAACACTCCTCCGTCTATCCCAGAAAAATGATAAATTTTCGCATTCGCATTAACACTAGCTGAGTAATGGG:1 - chr2R 14679235 5' + INE-1 537 1 60.87 ATCTAATAAAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chrX 8027369 5' - Juan 4203 1 71.23 ATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTTACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCAC:1 - chr2L 17005775 5' + Stalker2 7339 2 77.40 GTTGAATTTTGAATATTCCTTTTTAACCAGTGGCCGTGGTTTTTCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGGTACTATTGTTCATGTTTTTGTGGCGG:1 + chrX 7424572 5' - G6 1931 1 52.69 ACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTATGAGCAATACATTTTTACACTCTCAATTTAACG:1 - chrX 16361595 5' + Tc1 138 1 59.59 GTTGACCCATACCCAAAAAAGAAAAGCAGAAACTGACCTAACTTACCCCCAGCCCAATTTCCGACATTTATCCGACCTCAATTTCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2R 23180347 5' - roo 402 1 75.34 GCATCTCTATATTTCAGGTGTGCATATGTGCACATATGCGCTGTTTCTGTCTCTATTTTTTGCAATTTACTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTG:1 - chr2R 10576609 5' + opus 7464 2 52.05 AAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 - chrX 14722218 5' + diver 51 2 50.68 AGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chrX 9950587 5' + jockey 4708 1 65.98 ATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGA:2 - chrX 20999621 5' + BS 27 1 60.96 CCGAGATCCCCGGCGAGATTCACTCGGTCTCACGGAGTGGAAATGTGCGCCGTACTCAAGTGCTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTACAAATAAATTAT:1 - chr3R 21388827 5' + FB 690 2 60.78 AAGTCCAAAAGTAAAATGCAATATACCCGAATCTTTGTTTCAGTAAGAAGGAATCGTTTCCAACTATATAAAGTCTATATATACATATATCAATAGCCGAATCGATCTGGCCATATCCGTCTGTCCGACTGTCCGTATGAACGTCG:2 - chr2L 22034635 5' + INE-1 127 1 72.60 GTGCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 27123572 5' - roo 341 2 60.00 CTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGGAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAA:1 - chrX 19980705 5' + X-element 4515 1 49.23 GTGTCATTAATTCAGTTTCGCTCTTTCCTGCATATGATTTCATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 - chr3R 8890165 5' + FB 13 1 78.08 GTTTTCAATAAGATATTGAAAATAACTCATCAATATCTGAGTGGCATTTTTCTTTTACGTCCGTTCTAACTAGATACAAATATTTACCAATGGTCCTACAAACGAAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 - chr3R 5261163 5' - S-element 1702 1 65.07 GTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr3L 17940058 5' + 1360 36 1 45.21 ATTGAACGTAAAGAAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chrX 8092543 5' + pogo 5 1 79.31 GGCAATTGGCCAAGTTAATAGAGAGCCGGCGTTCGTCTTG:1 + chr3L 10003702 5' - Doc 252 1 72.50 AATGTTTAAAAATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGAGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGGTTTCCTTAATAAATAATAA:1 + chr2L 3675811 5' + Juan 4050 1 61.38 AAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTT:1 + chr2L 18226769 5' - roo 351 2 56.85 GTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGAT:1 + chr3R 23020787 5' - INE-1 560 1 65.07 GTATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:2 - chr3R 4679594 5' + hopper 18 1 71.92 AATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATCACCCGGTGCCTGCTGTGCAATAACCGTTTGGGGGAGTGGACGCACAAGCAACGATCGACCACAGGTCATTTTTTGTA:1 + chr2R 4709855 5' - hobo 2731 1 57.53 CATGTTCCATCGCAAGCTCTGGAATTCGTTTACTCGAACTCTGAAAACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCA:1 + chrX 23183422 5' + Idefix 331 2 68.49 CGGGGCTAACCAAAAAGATGGCTCAAATCTGGCACGAGAAGATGGGCAAGATGGAGGGTGGAGTGCGAAAGGTGGGAAGAGGACATATCCTATTTAGTCTATCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGATTGTTCCATTCTCGAG:1 + chr3R 17999557 5' - Idefix 140 2 60.27 TGCCAATGTTACACTTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr2L 14671781 5' + FB 22 1 70.55 ACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTAT:1 + chr2L 10156134 5' - hopper2 1522 2 76.71 ACACATTTATATTTATGTTTAATTGTAAATATATATTTTTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGGGGCTCTAGGGGTGTTTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3R 13466950 5' + 1360 81 1 54.46 AATATTGATTGGGGCCAAAATCACGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 2544651 5' + Tirant 8114 2 58.18 AAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATATAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chrX 8308428 5' + roo 8756 2 80.14 GTTTACTAAATTAGGTGTTGCTATTTATAATTTGGCTATTGTGTGCATCAACTAGTCTTGCTTCTGTAGCATATCTACCCCACCTATCAAATAAAGAATGGGTATAACTTTGCATAAATACATTGTGACACTTTGTCATAGTAAAC:1 - chr2R 8067061 5' + Stalker 71 4 56.85 ATTCCATTATAACTAATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAG:1 + chr2L 14026086 5' + F-element 429 1 77.40 ACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAA:2 + chr3R 19450167 5' + roo 9018 2 71.92 AATTGAAATGGAAAAGTAGGTAAATTTAAGAAAAAAAAAATAGTGATTAATTAATCAAAATAACACTAAGAAATTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chrX 8998921 5' - gypsy7 5010 2 72.63 AACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chr3R 16342008 5' + P-element 68 1 27.78 CTTATATGTAAGATATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGCGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 19588181 5' - roo 9052 2 70.55 ATACCCCGAAATGCTTCTGCGTTTGTTCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 + chr3L 23249349 5' + rover 24 2 69.86 GCTGCTCCTCGGAGATTGCCTAATTTTTGCGTTTTTCAGATGACTCTGTATCCAGTCTATCTAAATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAA:1 + chr3L 4254139 5' + 1360 3324 1 53.66 ACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chrX 12066123 5' + transib2 74 1 68.49 TTATTTGTGTACCCAAAACCCTGGGAGCTCAGCTTGCCATTTGTTCGGTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr3R 8889976 5' + FB 17 1 67.12 TGCAAGACGCATACAAAAGTAAGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTC:1 - chr3R 28901621 5' - transib2 2807 1 54.35 TATTTGTTTTTCTGTCTTTTCTAAAGTTTCACAAGTCACACACAATTTTTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTG:1 + chr3L 11346374 5' - Porto1 4590 1 51.37 GGTCGTTAATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTA:1 - chrX 21587787 5' + INE-1 118 1 43.45 CCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2L 4003761 5' - mdg1 7416 2 64.42 ACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTAGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr3L 16437238 5' + F-element 21 1 37.65 AAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAA:1 - chr2R 12645511 5' + X-element 23 1 58.82 AAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 - chrX 8200337 5' - flea 233 2 71.23 TATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAA:1 - chrX 14771789 5' - BS 5027 1 70.54 GATGGGTATATGATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 19073320 5' - roo 9047 1 67.12 AAAGTAAGACCCTTTTACAAAAAATATATATGAACAAAACAATCAGGAGAAACGCTATATTAGATAAGAGAAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 + chrX 20373528 5' - 297 6973 2 69.18 ACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAATTGTATACAAGATGGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCTGACCATATAAAGTATATATATTCCGTCTGTCCGATCTCGATCCCAGGCACTATAAAAGCTAGA:1 + chr4 836079 5' + INE-1 153 1 59.59 AAATAAAACAAATAATATCCGGGAAGGGGCTATTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATA:1 + chr3R 10145642 5' - Juan 4123 1 76.71 TAATAATCAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2R 14653126 5' + 297 19 2 57.53 AATCACCCTCAAAAGCCTGAAGTTATTGCAGATTTAACGGATATCTCCGTATTCAAAATTGTACTACGTAAAGAAAAAGAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 + chr3L 27865980 5' + Max-element 8277 2 48.63 TATCTCGGGATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAAAT:1 - chr2L 9782149 5' - P-element 109 1 37.60 GCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chr3R 23618135 5' - hopper 1372 1 58.47 ACCGGAGTCCTTAATATCCACATGCACACGTCCATAGCCACGACATCTATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAAC:1 - chr2L 7705856 5' + gypsy7 290 1 77.86 TTTATGACTCTTTTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3L 5489832 5' + jockey 16 1 71.92 CTGGAGAGAGAGCGCAAAGCTGCATTGCGAGTCATTATTAAGTCGTAAGTATATTATATCCACTAAATTGTAATTATTAGTATAATCCTTTTCAATAATTTAAATAAGACAACAATCATTAAGCCTAAGCTTAAAACTAGTTTAAA:1 - chr2L 10839555 5' + Penelope 320 1 56.85 AGGCATCGGCCGTCTCCTGGCCCTTCAGATAGATCTTTAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 - chr3R 18971824 5' + Juan 4050 1 61.64 ATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCG:1 - chr3R 14505372 5' + F-element 4497 1 51.72 CGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGGAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCC:1 - chr2L 11391558 5' + 1360 43 1 66.00 ACGTAAATATTGAAGTAGCTGCGAGTCATTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGTGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGA:1 - chr2R 19199861 5' + hopper 48 1 49.32 CTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2L 6102934 5' - roo 9007 2 64.38 AAAGCAGACAAGATCAGTGCTTTTCAATCAATGACAACGCGTTTAAAAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAGGTGCAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACCATCATATAATAGCGAAAATGCACTAACACATATTTATCTGTGTTAA:1 + chr3R 11402724 5' + Porto1 115 1 67.59 TAATATGCAAAGTCAGTTATCGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTGTTTATGATACAGTCTAGATCTAGAATCATCAGATTGTGTAAAGTTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTTCAATATGAATAAATTTCCTCTGGG:1 + chr3R 19448463 5' - R2-element 215 1 51.37 AACTTGATGTCAAATCCGACTTTCCAAGACCAATCCTCCAGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACT:1 - chrX 18336727 5' + mdg3 5267 2 76.03 AAGCCTCTTCGGAGCAACCAGCACTTCACAATTTAGAGGAAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTTTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGAATTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTG:1 - chr3L 27386530 5' + 1360 256 1 71.23 AAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCTGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 + chr3R 4682906 5' + Burdock 81 2 73.97 ATCACTAAGAGAGAGAAAAAGGCGACAATATTAACATAAGCAATAACGTAGAATTTTTTAATTATTTTATTAAAATTTTAAAAGTTTTGGTATGTAGTATGTTCCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGA:1 - chr3R 22331874 5' - S-element 1382 1 65.07 TAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 19449939 5' - roo 8998 2 75.00 ATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:2 - chrY 2720371 5' + 297 6640 2 67.12 CCTTATCGGCATCCTTAGAGGAGCCACGATTCAGGGGAGCTGGTTTTCTGGGAAAACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chrX 10639039 5' + FB 24 1 65.07 GTGGCAGGTAACTCACACTGTTTTTTAACCCACTCCGGTAAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 3233943 5' + roo 50 2 52.05 GACAAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGCGGTGGC:1 - chr2R 5531246 5' + 1360 60 1 76.03 AAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTA:1 + chr3R 19450178 5' + roo 9029 1 64.38 TATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr3L 18931073 5' + I-element 45 1 52.74 ATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 13158630 5' - roo 9020 2 52.05 CCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr3L 14094702 5' + I-element 43 1 56.16 ATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCGACGTCCACCCGATTAACACTCGGT:1 + chr2L 12818206 5' - hobo 2906 1 63.01 ACATACAAACCAGGCAGATCGAACGTCGTCGCAGATGCCTTGCCATCGTGTCCGAGGGCGATGCCGATTCCGTGGCTACAGTACACAGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCG:1 + chr2R 2318109 5' - ZAM 8413 2 78.26 CAACTGCAACTTATTTTGCATATCTTAAAAAATAGAACATACGCAGATCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACATAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGA:1 + chr3R 12058295 5' + I-element 272 1 69.18 TAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr3R 25709872 5' + hopper 59 1 54.79 GCTAGCATATATACTAAACATTTAAAGCATACTTCCAAAATAATCAGACATTATATATTCATATTTTTTTTAAGTTTCAATAGAAGAGTTTAGTTCTAGAGGTACAAACGTACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAAT:1 + chr3L 21891404 5' - transib2 420 1 70.55 ATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAACTCCTAAACTAC:2 - chr3R 4679578 5' + hopper 34 1 60.96 TAGCCGATACATAAACCGTTAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGACTGTAGTTGGAAGGTTGAACTC:1 - chr3R 30946585 5' - Transpac 5142 2 72.92 GTACTAAAGCCTGCTCCGCTCTCTTTCCGCTCTTCTGTACACGCGAGCCGACTGGAAAATTTGGAAAGCCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3L 22960584 5' + Tirant 8120 2 78.08 GAATGTCTCCAAGGTTGCAGATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 13300881 5' + roo 73 2 74.44 ACTATTTCTCCATGTTTAGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCC:1 + chr2L 15004774 5' - INE-1 157 1 68.97 CGTTGGGTGCTGCTGTTGCAGTGCACTAGGCCATTGGCATCTCGCAACCTTTTGCAGATGGAGGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 - chr2L 16275081 5' + FB 13 1 76.71 GGTCTGGGCATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 11062877 5' - roo 9055 2 71.23 GTAGGAAGCAGACTGAGCAAAGGCTCAAAAGATAATCAAAAGCAAATCAAGGAATGCCGAGTGCTTTTGGCCAAAGAGAATTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTC:1 + chr3R 16340244 5' - Bica 385 2 62.33 CTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGT:2 - chr3R 24381392 5' - Juan 4150 1 60.27 AGGACAACGCTTCAGGTTACAGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 22400394 5' - 1360 3363 1 67.12 TAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 + chr2R 5106292 5' + Stalker2 88 2 78.62 GATTAAATATTGGTAAATTTTAGTCAACTTTTTCGATATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGAT:1 - chr4 957977 5' - Bica 4533 1 69.17 TGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTGTTTATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGT:1 + chr3R 26178404 5' - 412 7454 2 75.34 ATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 - chr3R 8890114 5' + FB 32 1 55.26 AAAAGTGTCAATCGAATTAAGGAGCGCATGTATAAATGCTGGCTTGAAAGAGAGTAAAATCAAAGCCAAAAAAAGACACCACGCCAAGCCTCTTCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGC:1 + chr2L 20503715 5' + G4 30 1 65.75 GAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 11804727 5' + pogo 63 1 63.70 GGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:2 - chr3R 30675456 5' + 297 55 2 60.27 ATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACA:1 + chr2L 15490094 5' + Juan 4077 1 50.00 GAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chrX 8080707 5' + P-element 103 1 13.70 TCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 - chr2L 13844246 5' + Stalker2 74 2 65.75 GTAAGCTATTGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:2 + chr2L 17205143 5' + hopper 29 1 65.75 AAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2L 20266030 5' + roo 8734 2 67.81 CTGGGCAGCGTCATCAAAAGGTATTTTGAATTAATTCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAA:1 + chr3L 17233006 5' + I-element 5169 1 75.17 TTTTACCAAATTAACGTGAATGCCTTCTAACTTTCTTAATTTTTTATCCCTGCTGTAGCTTGCTGGAACCATCCACACTGAGCTAAAAAAGGAACTTTTTGTGGGACCGCAAAAGCATTGCACCATTTTTTGGGATATCGATAGAT:1 + chr4 819250 5' - INE-1 500 1 67.12 AAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGTTGTACATT:1 + chr2R 3338781 5' + Juan 54 1 53.15 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACAAAAAGGAGACGAAGAACCAAAGATTAAAGTTAAATCCACCAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAATAAC:1 - chr4 1294995 5' + HeT-A 25 1 58.90 AATCGTTCATACATACAAACAATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGAGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGA:1 + chr3L 22723794 5' - HMS-Beagle2 7178 2 76.55 CTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGGGTCGCGCG:1 - chrX 20999634 5' + BS 14 1 69.86 TGGTTAAGCGGTTGGTTTCGTTTGGCATTGATTAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACGTAGTACATATTAGGGTAGT:1 - chr2L 9244235 5' - 1360 3142 1 75.34 CATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 - chr2R 3563164 5' + Transpac 4988 2 69.77 ATCAAGTAGTCCTTTGGTTTTACCTCGCTCACATTTCAACTGGGACTGCTCATAAGGTGATCCACTATCGCACCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAA:1 - chrX 6294384 5' + Idefix 151 2 50.00 CAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 19924023 5' - roo 9019 2 64.17 GATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 9544931 5' + roo 66 2 64.38 ATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 - chr2R 13259404 5' + mdg1 38 2 56.25 AACGCACCACGAACCGATTCAAATTAAATATATAAATATATTTATATATTTATATATATAATATATGTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr3R 4217811 5' - 297 6934 2 69.86 CATATATAATAAGTAATGAATTTGTGCTGGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACGGCGTAGCCCCG:1 - chrX 11468247 5' + BS 4644 1 52.31 ATTTTCGTAAATTAATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 20265899 5' - roo 9050 2 70.55 AATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTGTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATGTTGTTTTTAA:1 - chr3L 12315821 5' - transib2 2761 1 56.85 CAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2L 16690752 5' - P-element 2856 1 63.01 AGGCAGTGGGATCGCTTCCGGCATTAATTTCTTTAAATATGACAAGCTAGTAAGCTAATAAATGAAGTGAGGACAGTCCTAGACGAACTAGAAGCTGTCAGCAAACTAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACGCCGTGCGCATTT:1 - chrX 22371804 5' + baggins 5107 1 34.93 AGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGGATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 22642239 5' + blood 18 2 71.92 ATAAAACGAGGGACAATTGGCTGAGTGTAGGGGGGAAATATTGCGGAAAATATTTACGGAGGAAGTGGCAAAGGAATCTCGACGTAATTCCCGATGCTGATTCTAGCATATTTTTTTCTTTCTTTTTTTCTCACGGGTCCCACGGC:2 + chr3L 15482471 5' - Cr1a 4446 1 55.48 GTTTTCAGGCATTGCATAAACAAAGGGCGAGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAG:1 + chr3R 15512808 5' - F-element 4240 1 75.41 AATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 + chr2L 3675821 5' + Juan 4043 1 64.06 TCTGTTGCTTAAAAAGCAACATGGTTGCCTATTGGGAGTTGGTTGTGTAGGTGCTTGTCAACTCTATTGGTTTTTATTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTATTTT:1 + chr2L 4551713 5' - F-element 4686 4 48.62 ATTATGTGTGCAATAATGTACGTTATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr3R 17736891 5' + opus 145 4 73.81 GAAAAACGATCGCGTGAACGAAGAATTCCTGATCAGTGATCACACGACCAGCTCAATTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAATGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 12004372 5' + P-element 10 2 73.44 ATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCG:1 + chr2R 16510095 5' + F-element 26 1 50.00 CAGCTGCAACATCTGCATAGCATCTTGTCATGTCTTTTGTCGCTCAACTTTTCCAACGCGCTCCTCATCTGTTTTTATTACTCCATGCGGCGTCTCACCAGAATTTCACAAACACGTTAAATGTATTTTCCATTTTTCAGAACTC:1 + chr3R 19071923 5' - mariner2 876 1 53.79 ATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 - chr2L 17005791 5' + Stalker2 65 2 65.44 TAGATTGAAAAGTATGGAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGAC:2 + chrX 18396021 5' - roo 407 1 73.97 AAACCGTTAAGTGGAAGCGGTAAAAGATACCCGTTATACTAGATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAAGTATATATTATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAATCGAT:1 - chr3R 4548389 5' + INE-1 95 1 77.94 TATGCAGTGCATATTATCAGACTAAATCAAATAGATTATAGATTACTATTATTGATTTGATAAAGGGTTTACGCCAAATCAATGAGATCTTTTCGAAAACAGTCATTCCACATTCCACAGCATTTATTATTAAAAAAAAAATAACA:1 - chrX 16370640 5' - hopper 156 1 65.75 AACATGGGACAGTCACGCATTCTTCGAGGGTATGACGAACAGAACCCAACCCTCGGATCCAAATGGACGTCTCAGTTTCAGAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 19923915 5' + roo 38 2 59.59 TAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTAC:1 - chr2L 4034964 5' - TAHRE 10374 1 78.08 AGTGCTTGACGCCAGCCATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTTTAGT:1 - chr2R 22989697 5' - hopper2 1554 1 50.00 ATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr2R 7090637 5' - I-element 5305 1 55.22 TGGTTGTCGTGACAACTTGATTTTCTCATAAGCTAACGGTTTCTCATTTCCTACTGCCATGAATTTGATAAGATTTTATTACGATTTTTGCCGGTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATC:1 - chr3L 5996991 5' - invader2 4715 1 65.07 ATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGGAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCA:1 - chr2L 10156189 5' + hopper 81 1 73.79 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTGCACTCGCATACTTGTTTTTATATTAACACACACACACACACA:1 - chrX 7978952 5' + accord 180 2 47.44 AAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCG:1 - chr2L 23295925 5' + micropia 4970 2 73.29 AAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chrX 12986613 5' + roo 8744 2 72.60 GGTTGGGGCATTGATTGGGTAAGGAAGGGGGGGGGGCGTCACTGGGCGTGTAGTTTACTTATGGATCGCTCTGCATTTGACTTTATTTCGTCTTT:1 - chr2R 18354732 5' - G3 4349 1 51.58 ATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCCTTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 + chr3R 15072583 5' + pogo 85 1 77.40 TTGTCTGCTAAGGGAATCATTTTTCAACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTA:1 - chr2L 21930269 5' - Copia1_DM 107 1 53.10 AAACACTTCACAGAGCATTTGCATAGGGATATACTAGCACTTATTTTTTATGACTTTATGACTTTTACTTATGACTTTCTCACAAAAATAGTTTAGTAA:1 + chrX 2082417 5' + Transib-N1_DM 138 1 72.73 CAGAAGAAGCCGCCTGCTGAGCTTGAACATCAGGGCAATTACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCC:1 + chr3L 19046155 5' + I-element 5049 1 71.43 AAAGAAACAGCATGGATGATCAGCCGTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGGGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGCGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 + chr2L 4123796 5' + transib2 6 1 78.77 TTTGTCTTTTATCTGTTTCTTTTCATTTTATTATTTAATCATTATCCTTTTGCTTATCCAGCCAGGAATACAGAAATGTTAAGAAATACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAAC:1 - chr2L 9728450 5' + P-element 2661 1 22.14 GAAATCGTATTTATCAAGGCTGCTTTTGGCGCTAACCCACATTGTGAGCAGTCATTTGGCCTCCATTATAGACTCATTGACATAAAAAATAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAA:1 + chr2L 13418499 5' - hopper 22 1 49.31 CAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chr2R 24169988 5' - transib2 2762 1 58.90 ATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 - chr3R 5351484 5' + jockey 4728 1 56.16 GTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr2L 15188467 5' + 297 6634 2 59.59 TATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chrX 6106827 5' - 297 347 2 66.44 CCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chr2R 12779730 5' + I-element 47 1 52.48 GTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTA:1 - chr2R 21410944 5' + Burdock 6222 2 76.71 GGGACTATTTCTCCGTGCGAGTGTTTTGGACCGGCACCAATTGTTAATGTCCTTCGAGTGCAGGTAACTCAGTGGGCGGCTCTGTGTGCTGTGTGCTCTGCGACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGTTTAGGCCAATATG:1 + chr3L 5088866 5' - Stalker 6 4 64.38 GTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chrX 6513450 5' + hobo 57 1 67.72 ATGTGCACTGAGAGAAAGAAGGCTGTAGTTGCGTTTTTTTTTTCAATTTAT:1 - chrX 13437047 5' + Tc1-2 1398 1 70.59 AGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:2 - chr4 373051 5' + pogo 67 1 67.81 GTTAAAGCTAGAAAAAATCTCCTTGAACAACACTGAACGCCAGCAGTGAAAAAGCGACTATGCGATAATAAGAAAAAAAGGCTGATAACTTGGCATTTTTCGAATTAAATTAAAATTAAATTAAAA:1 + chrX 6077778 5' - Rt1b 126 1 77.78 ATATTTGTCATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3L 8627386 5' - pogo 2097 1 41.38 GACTCTTTTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 5489837 5' + jockey 21 1 68.49 AACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGT:1 + chr2L 18347265 5' + transib2 41 1 56.16 CATTATAACTTTATTTTAACAAAATTTTAATATGGTTTAGTAGTCCCTTAAATTCACATAATATACAATTTTTTCAGTACAGATAGAATATGTATATAACTATTTTGTGATTAGTCCGATATACTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGA:1 + chr3L 4081043 5' - 1360 3298 1 54.79 AAAAAGGGGGTGGAATTCAGCAGAAACAGCCGCAAAATGTTTTGATATTTTGTTATAACTAGGAGGTCCCTTTTGAACGCATACACTTTGTCACATGTAAAAGTTTTGTACACTTTCTTGTAAATAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 24752302 5' + BS 5094 5 57.34 CTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGAGCGCTGGACAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGCGTTTGCCGGCTG:1 + chrX 22398534 5' - Gypsy6A_LTR 94 1 38.73 ACTATGACCAATTTGTACTTTATTAAATTGTTTTCTATTCAAAAATAATATGTTGTTTTTTTTTTAATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCTTTTTACTTAA:1 - chr3R 16292352 5' - Doc3-element 4695 1 62.50 CATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATT:2 - chr3R 27406059 5' - diver 157 2 61.64 TATTATATATATATTATATTATATTATTAGATATATATATTTTATATATATTATATATATTATATATATTTTTTTCCGTGTTGCTCGAGACTGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr2L 22989437 5' - Transpac 276 2 50.68 AATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chrX 8200292 5' - flea 4947 1 64.38 AGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 + chr2L 6654650 5' + diver 5951 2 58.90 AAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTG:1 - chr2R 23000262 5' - FB 300 1 80.14 ATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3L 12249824 5' + roo 79 2 76.06 AAGCGCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATA:1 + chr3R 11040008 5' - Bari1 1692 1 73.97 CTAAGCTAGTCCGTAGCACTTAAAGCTATTTTCAAATAACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTTACACGTCGTAAGCTGAATATTCTTTTTTTTTCTCCATGTTTTGCTTATTTATTTCCCCTTTACTTAAGAGACTA:1 - chr3R 15529477 5' - Doc3-element 4688 1 73.24 GCACAGGCAGCATTTGCCTGTGTTGAAGTTACCGTTATTCACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGC:1 - chr2R 6482583 5' + gypsy 11 2 76.71 TAGGAATTGATATGTTTCAAGTGCTTTTAAGCATCCTGTCTTATATTTTGTTGCAATTCTATGAGACTATTTAGGCTTAACTAGACTTTAGTTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chrX 6009282 5' + 297 6624 2 66.44 AATAAGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 1279072 5' + roo 51 2 54.11 GACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATG:3 - chr3R 11040150 5' + Bari1 70 1 64.38 ATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAATATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 + chr3R 23639148 5' + pogo 69 1 63.01 AAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2L 18226797 5' - roo 323 2 77.40 CGTGTCAATATCTGGGCAATGATAAATGGTTTTCACTTTTCTTATCTTTAATTACACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCA:1 - chr3L 8070119 5' - invader2 4649 1 78.77 TATTGCAGTTTAATCTGCCCGGACCATTGCATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACCTACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGCTAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr3L 21996301 5' - Transpac 297 2 71.22 CTTTAATTTATTCCATATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTATACG:1 + chr3L 18768444 5' + S-element 70 1 70.29 ATAGACGTAAGGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:3 - chrX 16946702 5' + FB 81 1 73.97 TGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:2 - chr3R 4461153 5' - blood 7351 2 63.70 ACTGCAAGGCGGGGGACACATGTCCAGTTCGAGTGACATAGATGGGGTGTTGTTGCTGCGGTGGCTGCTG:1 - chr3R 13747478 5' - Max-element 267 2 85.71 CCTGTCAACGCGGCGCGTTTCTGGGGGCAGGCCGGTTGAAGGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 7849950 5' + roo 8742 2 71.23 AAAAAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3L 23906520 5' + 1360 17 1 71.23 ATTTGGCAAATTAAACTAATTGCCAGTTGAGAGACAACAAGAACAAGATAAAACAAAAAAAAAGGCAACCACACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATCTTGTAAGGGAAAGCGAAAGAGTGAGAGAGTGATAGCGAAA:1 - chr2L 3905551 5' - Cr1a 287 1 56.16 AACCGATTTGACCGATTACCATAATTTTTCGTACTGTGTGTTGTTTTTGCTTTGTTTTGTGGTGTACGTGTGTGTGTTTGTTTGTGTGCACATCTGTCGCTTAAATGCGCACGTGTGTATTGCATTTTTTTTTTGTTTGTTTATAA:1 - chr3R 14965782 5' - HMS-Beagle2 481 1 72.60 AGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chrX 13134877 5' + jockey 4809 1 49.66 TTTGTTGCATTAAGTATAACGTTTTATATTTCGGGCCAGAAAGCTCTGATACCACCTATTCTTGTAAGCCCACGTCAAGGGTTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 - chrX 1488090 5' - Juan 4172 1 58.90 ATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chr2R 20227201 5' + hopper 44 1 50.00 GTGGTACTAATCGATGCAGACACGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCGCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 9003031 5' + roo 42 2 56.85 AGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chrX 22840485 5' + copia 42 2 59.48 AGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 - chrX 14722258 5' + diver 5 2 74.83 CTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCAGTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:1 - chr2L 15913346 5' - transib2 2773 1 54.11 TTATACATAACGAACGAGATCTTCCCATGTGATTCGATTCAGAAGCGCAAGCCAAAGAAATTATGCGCTTTTCGGCACGCCCACGTTTTGTTATATTTTCAATTGGAAAAACATTTCTTAATTTTTCTTTTTTCTTTTCTTTTT:1 + chrX 16388071 5' - Doc2-element 233 4 63.19 TATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAGGT:1 - chr3L 14366648 5' + roo 8708 2 58.22 AGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTC:1 - chr3R 27083104 5' + jockey 4612 1 73.29 AGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCACGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAG:1 - chr3R 4805673 5' - 1360 3299 1 65.07 ATGGAACCGCGCATTCGAACTAAAGCCGAGCTCAAGGGCTTCACATTTACGCCGCCGGTGCTCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCATCATGCTCGCGCTGA:1 - chr3L 18806658 5' - F-element 221 1 55.86 GTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCT:1 + chr2R 7244836 5' + diver 85 2 73.97 AGACTATGATTAGCATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGC:1 - chr3L 19350076 5' + 1360 3194 1 75.34 ACCCGTCCAATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3L 19455032 5' - mdg1 7404 2 53.42 ACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTA:1 + chr2L 14523129 5' - HMS-Beagle2 249 2 60.96 GTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAA:2 + chr3R 9038929 5' + Juan 4072 1 59.59 TTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAACTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTACGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2L 12251015 5' + 412 39 2 53.42 GACAAGCCGTAACTTATATACCCCTTCAGCTAACTTCATATTATTAAAGAACGTTTGGAATTTTTATAAAATTAAACACTCATTTTAGTTTGATTAGTTTGATCATATGATATTATTGTCCAATTAAAAATACTTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 21117816 5' + TART-B 10626 2 74.66 GTGGTCTTTGGTATTATCCCCCAATATTTGGGCTACCACAAGTATGTCATAGAAAAACTAGTGTATAGTTGGCAATTAAAGCGTGGAGAACCCAAATATAATTACATGTTATATTGTTTTATTTTTTTAAATTTAAAATATATTTT:3 + chr2L 12503723 5' + P-element 2598 1 56.85 AAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chr3L 16470380 5' + jockey 4718 1 53.79 TGTTAAAAATTGTCCTTAAAATCTGGATGAAACAGAAGATACCGCAGTTGGTTAATAGATAAGCGGACGGACATACGGACTTGTCCAGATTGACTTAAATAGTAATCCTGATTTATTAGACCGGAAACGCTTCCTTCGGCCTGTTA:1 - chr2R 7102203 5' - INE-1 33 1 75.34 CATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAACACAAAAACGTAATTGTG:1 + chrX 19054239 5' + jockey 59 1 49.66 TTCATTTAAAAATGCGCTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTT:2 - chrX 22840599 5' - copia 5089 1 58.90 AGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:2 - chr3L 14720922 5' + F-element 54 1 50.72 AGCAATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGGGCATGGGTCACAAACA:1 - chr3R 11040184 5' + Bari1 36 1 61.64 GAAAAGCTTACCATCAATAAAATATTAAAAAATAAAAAATTATTTTTTTAAATAATTTATACCGCAAAAAGTTAATTTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGC:1 + chr2L 22948973 5' - Stalker4 144 4 86.99 TGGCTTTCGATTTTAAAAGTCAAACGCGAAACTTTTTGTTTCCCCACACACTCGAGTTCAATTCGAAATTGTTTAACTTTATTTCCCTGCCACTTTTTGTTTGACGCTCCCTGAAATCATCCTTGTTTTATTAATTAAATTTTTTT:1 - chr2R 20958936 5' - TAHRE 49 1 69.86 GTATGTGTGTGTGTGTGTATGGGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTAT:1 - chr2R 7989159 5' - hopper 1329 1 75.17 ATGCTGTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 + chr2L 15550644 5' + Bari1 44 1 55.86 CCAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACA:1 + chr3L 23933527 5' - Cr1a 249 1 51.20 TATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAGGCTCTCTC:3 - chr2L 15076193 5' + 1360 73 1 65.75 GTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chrX 11661510 5' + pogo 44 1 55.17 AAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr2L 13556485 5' + transib2 18 1 67.81 GATCATACTCCTCGCCATCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTAATATTGTTATTGTTGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGGGGTCAAGCCATACAAAACATATGTATGCCTTCTGCAT:1 + chr2R 24766562 5' + Stalker2 7480 2 50.68 TCTTCGATTTCAATCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr2L 12822816 5' + P-element 42 1 29.21 ATAGTCTTTTAAAAGTTAAAGTTCATGTTTCTATGAACTTTATTCTATTTCTATTTCTATTATTTACATATGTTTAAGTAGTAACACTTACCATTATTGTTCACACATGAACACGAATAAATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTC:1 + chr3L 20898492 5' + roo 8692 2 67.12 GAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2R 8047369 5' - 1360 3358 1 57.14 TATCTATGGTGTGGAACCCTTGCGCTGTTTTAGTTGGTGGGGTGAACTGGGGAGGTTTGGGCACCGCGTCAATGG:1 - chrX 9755310 5' - HMS-Beagle2 6773 1 52.00 ATTTTATAAGCATTCAAATGCATTATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAAAAATTAA:1 + chr2R 20227177 5' + hopper 19 1 62.07 ATAATTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr3R 4679402 5' + hopper 13 1 75.34 AGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:3 - chr3L 25401029 5' + Doc 40 1 49.32 TTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGAT:1 + chr3L 1279083 5' + roo 8726 2 60.27 GAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2R 8047246 5' + 1360 51 1 54.55 ATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chr3L 21996231 5' - Transpac 5165 2 75.00 AGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr3L 14094660 5' + I-element 84 1 77.93 GAAAGCTGTGGCTTTTCGGGTTGGGGCTGAGTGGATATTTTTGTGGGTGTCTAACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGT:1 - chr3R 11937399 5' - flea 4949 1 62.33 TGGGAAATAAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:4 - chrX 17343513 5' - I-element 5332 1 63.01 TGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 + chrX 8027382 5' - Juan 4190 1 62.33 GAGGACTAAGTACCATAATGCCATACACACTTCGCTGGTAATTCAAATTAGTCCAAGCGAGCCCCACTAACCGATGCGGAAAATCCAATTGAATTTATATTTATTTATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAA:1 + chrX 5856638 5' - diver2 409 1 67.81 ATTATAAACGCCAAAAGCGCTTTTCTAGCGGCCTTGTTGCGTTTTTCAGTGTATACAAAAACCAAAAACAAAGAACCAGTGGTAACTGTACCTGAGCAAACTGCTTGCTAAAAAACAAAAGCCAAAATAATAAAAAAAAAAATGAA:1 - chrX 7695600 5' + Rt1b 5148 3 60.96 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAATTATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCCAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 5797286 5' + jockey 4681 1 67.12 TATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAGACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3R 16342040 5' + P-element 55 1 46.21 TACGAGAGAATGCAAAAGAACGAGTCAAGAAATAAGAAAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAATGGTCCTTATTGAGAAAGACAGTTTCCACATAATTCCCCTGACCAAGGGCAACATTCATGAAACAAAAGTGCAAGTCA:1 - chr3L 17059820 5' + Fw2 320 1 76.71 AATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:2 - chr2L 17005848 5' + Stalker2 18 2 71.92 TTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3L 11326774 5' + pogo 61 1 65.75 GTGACTCTTGTTCGTTGGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGCAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr3R 18006541 5' + accord 185 2 53.98 GCTAAATTTTTTTTCTAAATATTCACTGCTTTTATTGCCTTGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGGTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAC:1 + chr2R 950325 5' + INE-1 214 1 71.72 GGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTT:1 + chr2R 5674656 5' + S-element 80 2 74.66 AAGCTTTTCAATTCAAATTTGAGCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr2L 4003838 5' - mdg1 7452 2 77.40 AAACATCTCATTCACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3R 28469162 5' + 412 22 2 70.34 AGCGACCAATATACTGGGGTATCAACAATTACAAAAGGGGGAGTATCGACTAGCAGGGGAGAGGGTTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCG:1 - chr2R 4027222 5' - Doc2-element 11 1 53.90 ATAGAGGAATATTTAGGAATCTCAGTGAAGTGCTGCTAAAGAAATGTTTACGATATGAGACTATTTGTACCATCGTTCTAATATGTTATACAGATTTGGAATATGTTCGGAATAATAAAAAGTTATTAGGGTTGGATGGATTTGTT:1 - chr3R 18902404 5' - Quasimodo 156 2 63.01 TATCAAATAAAAATGTTTTCTTAAACGAAAAAAAACCCATCGATATCCTTTTTTATTTTCCTACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCACTTAACCAACAATCATGACAGACC:1 + chrX 7676853 5' + I-element 175 1 57.60 ATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGGTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAGG:1 - chr2R 5296378 5' - INE-1 89 1 80.14 GCTAATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGAC:1 - chrX 19980723 5' + X-element 4513 1 54.79 CAAAAGACACAAAGGGGGCTGTGTTCCAACACTTGAGTTCTGTTTTTTAGCAGTCGGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTA:2 + chr2R 22989590 5' + hopper 62 1 60.96 CTTGGCTCAAAAAGGGCTTTAAAAGATACAAAGCTTCAATGCGAAGGATAAAATAATATCGCACCAGTGCTTCAAAAACCAAAACTATGCCTAAGGCTGGAAATTTAACCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr3L 17999291 5' - Transpac 5185 2 73.97 ATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 21224538 5' + roo 8725 2 59.59 ATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAGACTTTGTACA:1 - chr2R 24169999 5' - transib2 2773 1 50.00 AAATTATCACAAGCTTTTAAGACAAGAACCAGGTAATTAATCTGAGTTGCAAACAAAAAAAATAAATATTAAAATATTATATAAAAATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTT:1 + chr3L 23694783 5' - Quasimodo 7344 2 67.81 AATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTAT:1 - chr2R 23780592 5' + Ivk 93 1 71.03 TGATTGCCTCGGAGCAGTTTAATTCCGGAATACAAACCCTTTTGGGTCGTTTGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAAGAAACTTGCGCTGGGTCTATGTCTCTAGAACCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 - chr3L 19625324 5' - INE-1 156 1 73.29 CCACCAAAAGATTTGGGAGAAGCCAATGAGATGAGCTCATAGAAGCTGGGTTCGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTGAAAAGCTTTAATTGTTTGCCCACCAATTAGTTTCAATTTTTTTCAATTTTTTTTTAAATCGCAATAACA:1 + chrX 19502442 5' + FB 189 1 78.08 AGATACACAGTGAATACCGAAAGCAATTCCATTTCAAATCCCATTAAGATTTGACATAATTTGAAATTTGGATTTTACGTATCTTTACCTTACTTCGCATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTACAAAAGCAAGAA:1 - chr2R 17805273 5' + INE-1 154 1 74.81 ATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:2 + chr3L 10731767 5' - 297 6918 2 60.96 TTTATAGGTTTTTTTGTTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3R 15072713 5' - pogo 2090 1 75.34 GATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCC:1 + chr2L 18549802 5' + roo 29 2 62.59 AGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGG:1 + chr2R 9966977 5' + Bari1 59 1 55.48 GGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGATAAAT:1 - chr2L 4063909 5' + roo 8730 2 73.39 TATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTTGTACGATTGTTAGTATTTATTGAAAATATATTGAAAATAAAAGCCAAGGTATG:1 + chr2L 23008370 5' + transib2 273 1 63.70 CCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2R 8047262 5' + 1360 53 1 62.02 CGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGGGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTGGTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 16540939 5' + hobo 28 1 55.88 AATGAGTCCTATGCAAATATATCGTTAGACTTAAGTGTGTATACGTGTTGTGTCTTGACCCGATAAGCGAGCGAAAAGGGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAAGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTA:1 - chr2R 14043246 5' - roo 8941 2 52.74 GTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:2 + chrX 2479478 5' - mdg3 5446 2 50.00 AAGTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATAT:1 + chr3R 3922949 5' + Cr1a 81 1 72.60 TATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACGGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGAGGGGGTGTATTGGCCACAAGGGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCG:1 + chr2L 23299984 5' + invader4 382 1 59.09 TATGAAAAATTAATGTTTGGCGCAACAACTTGTTTCACAACTTGTTAATTTCGTTGAAAGGTATATAAAAGGCTGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATACAGTATATACATATGTACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAA:1 - chrX 18812140 5' + INE-1 90 1 59.59 AGGGGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCCGCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr3L 1692081 5' - blood 308 2 79.31 ACCAGAATCAGCAGCAACAACAGCAGTGTGTCATTGCAAAAAATAACACCAAAACAGCACTGCGAACAACCCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACGTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCAC:1 + chr2R 15076772 5' - Cr1a 159 1 76.71 GGCATACATACATATGTACAAATAATGAAATGTTTGTTTTTTATGGAGTCGAACTACTGTCCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAATATTATCGTTGAAATAGATTTCACCTCCTTATTCTTTTGATCTCAGCT:1 - chr3L 18016532 5' - 297 6870 2 62.33 GCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTGTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAATATTGATCATAT:1 + chr2L 18347306 5' + transib2 79 1 71.33 TAATCAACTATCTATCAGCTGATATCGCTGATATAATCGCTTGACATTTACTTCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 - chr2R 6546752 5' + I-element 5141 1 65.75 TTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3L 18046578 5' + roo 8664 1 78.90 GGTTGCAGGCGAGGATTACCAGTCCTCCCGATAAGCCTAGAAATATAAGATATACATAAGAACGCCG:1 + chrX 1342404 5' + 412 7326 2 61.19 GTGGAATTTGCTTATTTGCTCACGGGCGTGAAAATATAATTACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 9002867 5' - roo 9055 2 75.34 AAAGAAGTCTATTATCCTTTTTGCCAGCCAGTTTTGTTTTTGTTGTCGTTGCTGTTGCTGCCGCTGCGACGACGACTGCAGGATCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGC:2 + chr2L 18884911 5' + 297 6769 2 57.53 ATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 - chr3L 46989 5' + FB 78 1 68.49 AATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:2 - chr3R 12780918 5' + hopper 8 2 80.00 TAACACGCGCCCTGTTGCATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAAC:1 + chr2L 6647647 5' - mdg3 182 2 61.65 ACACTCACCCGATCTGATATCAAGTCGCAGTCCTCCTGAATCAGACGGGAGAGGAACGAATTTGGGTCACGGGAGAGCGTCGTCTTTGTGGTGAGGAAGTAGGTACCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTATATGATAAGAACCT:1 - chrX 1513635 5' + rooA 260 2 73.29 ATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 + chr3R 8051119 5' + jockey 4817 1 60.27 AAAATAATTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTGGCAATCGAGATATTGCTTCCTAAAAAATGAAATTTCTCAAAAATCCGCAAAATACGCACATAGAGACTACCTTATATTTGTTAGGAAGTGAACACACTACAACATGGA:1 + chr3R 4679399 5' + hopper2 1166 2 67.81 ATATCAAAAAAATTTTTGTTGATATAAAATTGTAATTTTAATTTCGGGATTTTACGTTGGTCAAAA:1 + chr4 847361 5' - HB 234 1 72.73 GGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 - chr3L 13739635 5' + BS 5078 1 74.66 ATTTTCCATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:2 + chr3R 15724260 5' - Juan 4196 1 69.86 TATGAGAAAAATATTTAAAATTGCTAATAGTTTTATTATTTTAAAGTTACGTACAAAAAACGATACTATCGATAGTATCGAATATTTGCTCTCAAAACATCCGCTGCCGAATCCGATATTCCCACCAAAGGGCCAAAAACGCTTAC:1 + chrX 21963446 5' + Quasimodo 216 2 66.44 GTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 + chr2R 7090661 5' - I-element 5278 1 73.72 ATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr3L 22890342 5' + FB 49 1 50.00 GCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGGAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:1 + chr3R 28042978 5' - Stalker2 7632 2 66.67 AATAATTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTTTAAACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGATTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3R 4679401 5' - hopper 1403 2 73.29 CTTTGGTTCTGGGTATGTGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTTTTTTG:1 + chr3R 22234396 5' - R2-element 3585 4 75.00 AAAAGGGGGAGGATGGGATTAATCCACCTTAGTTCACTTTGATTCCATAAATGAAAACACTGCTCCACGTTGGCCAGTGTGTTTTTCTAGTAACGCTTATATATATAACGCCGATCGCGGAACGTGGGAATGCTGAGCATGCACTT:1 - chr3L 16298241 5' + Stalker4 7150 4 61.64 TGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCTTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 - chr3R 18093383 5' + I-element 54 1 51.37 CAGAAGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 + chrX 2214226 5' + jockey 4795 1 60.96 TGACACTACAAAATGGGGCGTATACGTAATACATACTGCATACTATTAGGCGCTCATAAAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTA:1 - chr3R 24450526 5' - 412 437 2 52.74 AAAGCTTAAATTATCGATAAAAAACAGTCTTCGAAGAGTGAAGCGCTTTGAAAGATCGGTTAAAGAATTTAATATGAAGAATGAATATGTAACTACATATATATAGTGACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGG:1 - chr3R 4159306 5' + invader2 64 2 77.40 ATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGAC:2 + chrX 23431608 5' - 297 6891 2 77.40 ATAAAATCACTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCCCCCCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chr3L 15913804 5' + jockey 4776 1 72.60 AATTGAGTGCGTTAAATCTGGTTTAAGATGCATATATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGTCGAATAGTAAGGACGTG:1 + chr2R 6964795 5' - Burdock 6309 2 76.03 TTTAAAGAGTTCTAATAACCAATAACGTATTGTATACCAAATTTGGTGTCTCTAGCTTGAACAATACCCAAGATCATATAGAAAGGTTCTTACCAAATCGACGATATACAAATGTATTGAATATAATTAAATATTTGAACTAAACA:1 + chrX 18514209 5' + G7 1159 1 73.97 ACATTAAATTGAGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chrX 18009901 5' - 412 7517 2 44.52 TTTACTCCTTTCCCAAATGTCCTTTTTCCTCTTTTTGCGGCTGGTATTTGCATTGGAATTTCAGGAAGTTGCACCCCCCATCCACAACAAAGCCAATGTAGGCAAATAAAAAGCTTTTAAATGTTTTTTTTTTGT:1 - chrX 18730095 5' + Circe 424 1 62.22 TTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCC:1 - chr3L 23456274 5' - 1360 3332 1 57.53 GTCAACTCAGTATATTATTTCGTCGCTTGATTTCCTTTTTTGTTATTATTTTAATAATATATTTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTTACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTA:1 + chr3L 76946 5' + hopper 243 1 70.55 CGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 - chr3R 23295574 5' - P-element 2826 1 14.48 AGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTC:3 + chr3L 24213771 5' - invader2 5037 2 64.38 GAATTGCACCACAAAGAAACCGACGAGATGATGTTTCTTTGTGTCAAAGGTCACCGATCCGTTAAAATTAGATAGGATAACTTAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 + chr3R 1715457 5' + mdg1 7075 10 65.74 CCCATAAACAATGGCACAAAAGTCCACCCAGTCGACATCCATAAAAACACAAATCTATTAACTGGCGCCCAACATTCACCTCCATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTT:1 + chr3R 14980083 5' + gypsy7 276 1 68.81 AAAAAAAATAAAATGAATAATCTGTTTCCAAGTTTCGTAATAGCGTTGAAGAGATAGCATTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAAATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGG:1 - chr2R 4024277 5' - Doc2-element 469 1 59.59 TTATGAATTTGCTGCGACACACAAACGATGTGCCATCCTCACAAAAAGTGGCAAGAATAACACTTAGAAAAACAATTTGATCTAAGCTTTACAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr3L 20041979 5' + 297 16 2 78.77 TTGTTGGTCGTTGTTTAGTTAACAGTTAGTTAGGTATTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTACTTGAAGCGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCG:1 + chr2L 10865197 5' - Stalker 7151 4 78.08 AGGCGGTTCCTTTTTTTTTGCGGGCGTGGGAGAAACTGCGTCTATTTCTCTAGAGTCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTATCTTTAATAGATTCTGACTTTTAGATTTACACTCGGCTGTTGATCCTGATCAA:1 + chr2L 12273834 5' - INE-1 90 1 75.37 AGATCTATCATCGATCTGTGCAGGTCTGTTCACACATAGCATACATAACAAACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr3L 23354541 5' + F-element 27 1 60.58 AATTTTCCCCACTAGCCGAAAAGTATGCAGCAGTTCAGGGGTCAAGCACCATTGCATTGCCAACAATGAAAACCTTTAAATAGACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAA:1 + chr3L 7432479 5' + jockey 4805 1 56.85 ACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTT:1 + chr2R 20227215 5' + hopper 58 1 58.22 TCGTTCAAATTTCGATTGATAGTGGTGACTTCTTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAG:1 + chr3L 3091177 5' - 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chr2L 15940362 5' - pogo 2080 1 71.23 GCAGAGTGCGAAAGGAATTGCATTCCGGCCATTGGACCAAAAACAAACCAAAACAAGCATCCAAAAATCAACACCAAA:1 + chr2R 20424401 5' - Cr1a 251 1 76.92 GATTGTGATTTATTTACAAATGCAAATAGTCCCGTCACACATCAAACATATAGAGAAGCGAAAAATGATGAAAACTTTTCAAAGATTTCTTCGCCCAGAAGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAACACATACACAGAGACCTAAA:1 - chr2L 16333079 5' + Doc 4407 1 69.86 GGAATGCATATTTATGTTTAGTTTTGTTTTTGTTTTTAGCCCGCAGACAAAGTCGAAAGCCCGTTGAAAAGTTGAAAATGAGGAAGTGAGTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCT:1 + chr2R 16730450 5' - Transpac 4966 2 60.96 CGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 15072566 5' + pogo 50 1 62.50 AGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3L 12004243 5' - P-element 2825 1 44.14 CGGCACTTGTTGTTGTCCTTGCACCCACCCTCCTTTGGACCCAACCGCTCAGCCTTAACCCGCATCCGTGGCAGGACTTTACGACACTTAAGTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 28347110 5' - pogo 2077 1 65.28 TTTACCCCCAGCGAGAGTTTAGCGTGCTGGCCTTGTATTGGCCGCATTGAAAGAAAAGGCTTTCGAAAAATGTTACAAGTTAAGAAAAAATTGTGCCGAAGGGAGACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCTTGAGAATTTGTTGCC:1 - chr2L 12867814 5' - Gypsy12A_LTR 2006 1 64.38 GAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTT:1 + chr3L 22890370 5' + FB 77 1 68.49 ATCTGAATAAAATTAGCCGAGATTTTTCATTTCGTTTTTCAGTTTTATTTTGGATTAGAATTTATGGTAGTCGCTGACGCTACAGCTCCGCTCGGTATAATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTT:1 - chr2R 17874420 5' + gypsy2 255 2 58.59 GAATGTATTTTTATTCCATTGTTATCATTTTGCGCAAGGGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGGGGGGGTGTAAAATCCCACATAAGAAGACATTACTCGTTGAG:1 - chr3L 18046744 5' - roo 394 1 71.63 AACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTT:1 - chr3L 20187421 5' - FB 475 1 51.03 GTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:1 - chr3R 11469381 5' - Tabor 7239 2 73.97 GATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCT:1 - chrX 21639690 5' + gypsy5 6958 2 56.00 TTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:1 + chr2L 17180059 5' - Juan 4168 1 52.74 CCATGAATTTGGTATTCTCATTAAACAAAATTGTTATTATAATTAAATTTAATTTTATTTAACCCTTTAAGTCAGTTGGAAGAACCTTTTAATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 21505781 5' - roo 9051 2 69.93 GTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGACCCCGACTATATTTAAAGACTTACCATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGCATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGACTTTGTTATCTAAGG:1 + chr3R 19073214 5' + roo 92 2 73.97 ACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTATGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 + chr2R 12185296 5' - accord 7343 2 54.79 TATAATTCTGTATATTCATAACTTTTGAAAGTAGTAGTAGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATTCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAG:1 + chr2L 20265533 5' + roo 9002 2 64.35 TGTATGGCCTGCCTTTTAACTTTCCCTTCCAGCAGTCCAATGGCACACGTTGTTATTTTTAAAAACGTTGGTAACAAAAGGGCTAGAAAAAGTGAACTATGTTTAAAAATATTGGCGAATATTTATATTTATATTCTTGATCAGG:1 + chr2R 7464371 5' + INE-1 77 1 64.14 ATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr2R 17796537 5' + jockey 4709 1 55.97 AACGTGATTTGAAGTTATGACACGTGATTTTTCTATTAAGTTGTTTATTTAAGATTTTATTTATTTTAAGTTGTGATTACTTTATACAGCATTATATTTCTATTCGTATTTTTGTATTTGTATACTGTGTATTTGTATATTTATAT:2 + chr2L 21750065 5' - Stalker 91 4 57.53 AGCCAATCCAATAAACCAATAAATGCCCATTCGGCATACAGTTTGTCAAGACTGTTGTTGTCAACTGTTTACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTCGCTTTAAAGGTAAATATGAAGGTTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTT:1 - chr3R 11958152 5' + S-element 78 1 76.71 GTATGTATACATTGATTAAGCGTACGCAAATTTATATTGTATTTCGCAATTATTATTTTTGTAGTATCGTTAATATTCATTCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr2L 20875827 5' + Doc 59 1 60.00 ATTGAAACAAAGAAGATTCTCTACCCTTATTACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCTTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATC:1 - chrX 2655532 5' + copia 5052 2 77.40 ACTGAACCAATAACGGTTATAAATTTCTTTAAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCAAGAATGGAAAAAAACCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAA:1 - chr3R 4165270 5' + Idefix 6987 2 67.29 AGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAATTTGATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 2989926 5' - roo 9020 2 50.68 TGTACATACTATTTTATGATCAAATAATATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAA:1 - 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chr3R 17736928 5' - opus 7440 2 73.68 TGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGGGAAGACGTCTTTATCGTGC:1 - chr3L 14720900 5' + F-element 29 1 52.75 ATCACAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAGTTCGCAAACACAAATCATATATGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCACTTTTTTGCACACATGAAATCTACGTCTTATCGCTATGACCGCAAAATTAC:1 - chr2L 23135988 5' - diver 5998 2 76.03 TGGTTTATAGAATTTGATTGGGTTAAGCATTAACGAGAACAGAGAACGGCAATTAGGGTTTTACAAACAATTTTAAGTATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCTC:1 + chrX 2492135 5' + mdg3 251 1 60.27 ATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr3L 16690892 5' - I-element 5305 1 54.79 AAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGCATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr3R 11040038 5' - Bari1 1662 1 54.79 CATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGGGCCCCGAACAAGTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 7795482 5' + roo 8672 2 73.98 ATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:1 + chr3R 19992641 5' + hopper 33 1 52.73 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGGGA:1 - 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roo 9011 2 60.00 GAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr3R 27160145 5' + 412 7134 2 73.29 GAATCGATTTTCAGAATTACAGTTATATAATAAATCGCAATAATCAAAATTGTTGTCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACA:1 - chr3R 25186463 5' + gypsy4 420 2 74.19 ATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 - chr2L 18549962 5' - roo 9044 1 70.55 GTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:2 + chr2L 16539638 5' - Juan 4167 1 54.11 TAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTATTATAGTCTCAAAACGCAGCTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 - chrX 19074858 5' - mdg1 7390 2 60.27 CACAGCTTCTATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr2L 12818183 5' - hobo 2929 1 78.08 GAGAACCTTGCCAAAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTT:1 + chr2R 10078167 5' + jockey 116 1 76.03 AGTTGTTTGATTTGTACGGAAAAGCAAACGGACATGTCTTAGGTACTTCGTTTTCAGATTACCCCAAAGATGGTGAAACCTCCATTTAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCA:1 + chr2L 5561314 5' + I-element 177 1 58.90 GTTAGCCTTACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chr3R 4683027 5' - Burdock 6374 2 73.05 AACTCTAACCAGTCTATTTACTGTAGAGCAAACCATTTATAAATAAACTATTATCATGAAAAACACAAAAATCACTCAAGACTTTAAGCAACTACTATTAAGTGACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTAT:1 + chr2R 18567636 5' + I-element 5160 1 56.85 AATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACC:1 + chrX 20455650 5' - hobo 2921 1 52.00 AGCTATTAACTATTTTAAATCGTGTATATATGTATATATGTATATAATATAGTATATAGGGTTTATGCGTAATTGTTTTAACTTTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATTATTATTA:1 + chr3R 18093224 5' - mdg1 7071 2 72.60 TAGCTTAAAAGGTCAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 14366485 5' - roo 393 1 74.66 GGTTGGGTAATTTTGGGGCCGAAAAAGGACGAGTTCTATATCGGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGGCGTGCTTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGTTGAGATATTTA:1 + chr2R 14139921 5' - F-element 4401 1 64.38 GTATCAAAGAGACTCACAGAGATACAACCAAATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTG:1 + chrX 11209827 5' + hobo 39 1 58.62 ATCAATGTTCGCATCCATAACATTTTGAAAGACGGTGGATATGTGATTGCTGCGGTGGTAGCTTAAGAACTTGATACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGATACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTTATTTCGTGGAGT:1 - chrX 18527036 5' - Doc3-element 407 1 71.43 CATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAG:1 - chr2R 12779687 5' + I-element 95 1 81.51 AACGACATGCTAAAGTTGAAGACCAGCAGCAACAACAACAGCACTAGTAACAGCAATAATAATGCAATCATGTCGCAGTCGCTGACGGGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCA:1 + chr3R 28909915 5' + F-element 4342 1 75.00 AAAATCACTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1 + chr3L 15913806 5' + jockey 4778 1 71.23 ATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr3R 30347368 5' - P-element 2794 1 16.79 AGAAATCTATATACAAGCATATATACATATATATTTTGGGCATCGGGCCAACATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAA:1 + chr3L 21382955 5' + I-element 380 1 60.90 TGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3L 25401025 5' + Doc 44 1 46.58 AGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTNATTATAT:1 - chrX 12129417 5' - flea 204 2 52.05 GAAGAAATATCACCCAACTAAGTTGACTTCGATGTCAAAAAGACTTTTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATGTATTGCTTTAAGAAGGGCAGAGAGTCAAGAAAACAGATAATAGGATAAA:2 + chr2R 11694304 5' - Cr1a 4218 1 68.49 CTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 + chr3R 5523927 5' + FB 82 1 74.66 ACAAGAGGTTATAAACGGTGGAGCGAAAGGAAGGAATTGCGGTGATCATACCCATCATCCTGATCCACGACGGGCAGCTGGTCCACGCGGTGTTTCTTCATCAGGGCAATAGCCTAGGAAAATGGATCGGAATATTATCTTTATCT:1 - chrX 21048628 5' + Circe 7073 1 78.77 CCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chrX 6475280 5' + Doc 49 1 54.11 ATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 12818267 5' - hobo 2911 1 62.50 AGTGTCGGTGTCCAATCAGATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1 - chr2R 21160796 5' + Transpac 27 2 62.33 TGTTGCTTGAGTGCCCACACTCGCGCACATTCGCACACTCCAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGGCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 - chr2L 2527760 5' - hopper 1389 1 62.07 CACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:2 + chr3L 12315731 5' + transib2 70 1 65.75 CGAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chrX 19266819 5' - roo 9033 1 50.00 CGACGACTCACAATGGAAATGAAAATTTTCAACCTTAGCACTTTCTTTCTTTGCGCCTTCCCATTTTCACTTGAACCCCACCCCCTCTTTTCCACGCCCGCAGATTATAATTTTACAACGACAACAACTTTTCACGACTAGACTCC:1 - chr3R 16666908 5' - Gypsy12A_LTR 283 1 64.38 ATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 - chr3L 18505746 5' + I-element 57 1 57.53 CTTAGTAATTATAGACGTTAGAAGTCGCATATATAGGTGTCTGACTTGTCCGGGGCATTAAACGTGCCATCGAGTCGGTTTTTTCTCAAGGTTTATTGATGAACTCATTTTCACTTCGATAAGTTTTTCGTATTAAATCCCTGAA:1 + chr3R 14005403 5' - Dm88 280 1 65.52 ACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTAACAAATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTAT:1 - chr2L 14074519 5' + 297 20 2 59.21 CTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3L 17940202 5' - 1360 3335 1 56.85 TGTGCGTTCTTGGGCAACAATTTGTGTGTGCTATATTAAGTCAAAATTAATGGTAGTGAACATTAAATGCAACTCCGTTGTTTAAATAAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 23320022 5' + roo 8697 2 61.64 CAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCTGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr3R 15790062 5' + flea 4767 2 75.00 AGATATTGTAATTTGTTTTAATTCTGCTGCGCAGTTAGATATTTTTAAAATTGTATTATTTTCAATATACGAATTAACTTAACCGAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATAATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACAC:1 + chrX 21633383 5' - HB 226 1 61.38 AACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACATAACCA:1 + chr2L 18212107 5' + Quasimodo 42 2 53.68 AAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 - chr3R 13875105 5' - P-element 2791 1 19.86 GGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTCCTA:1 + chr3L 12315722 5' + transib2 61 1 58.22 GCCATCGAATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 - chr3L 13739677 5' + BS 5019 1 61.24 ATATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTA:2 + chr2L 22121303 5' - I-element 5341 1 47.95 ATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 15072544 5' + pogo 46 1 52.05 ACTAACCTTATAACAAACGCGGATCGTGTCAGTTAACCTGTTCACCGCGGAAAAGTGTTAACCAATGGTACTCAATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCACAGCAAGCTTTACACGCACCCCAAC:1 - chrX 22093374 5' + F-element 4456 1 55.48 AATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAG:2 + chr3R 15724312 5' - Juan 4144 1 65.07 TAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 22193450 5' + roo 25 2 69.74 AGTTGTTTTGCGCTGCGCGTTGTGAAATATTGAGGAATTAGGAAATTGAGGGAGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGGTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3L 9809340 5' - 412 7511 2 48.21 GTGTGCATGACAACATTCAATAGCAGCGTAATCAACAAAACAAAAATAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCACAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCT:1 + chr3L 18062912 5' + Porto1 348 1 72.60 GGATAATCAGATGACTTGCGTCAGTAAAATATGTTTATTTTTTTGAAATATATGTATTTGGATTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAACTTTAACTGATTCGGCAGCGGAT:2 + chr3R 23262584 5' - Quasimodo 190 2 54.11 GATGGAGTCATGCCAAAATCCAAAAACCACAAACAATTAAACAAAATTGCAAATTAGACGTTATTTAGACCAGAAATGCCGGTCCCCAAAAAGTTGACAGCCACCAACTAACCCACCCACATTCCATACACACACACACACAAACA:1 + chr3L 9999523 5' + Quasimodo 36 2 71.92 AGGGAATGCAGTGAAAGAAATTACTTTGGCTAATAAAAAATATATTTCTTCTATGACATTTCTACACATCAATACAACTGGTATATGAAGTTATTAAAAAAGATCAAATATATTTTTTTAGTAATAATCTTAATAATATTAATAAT:1 + chr2L 3844945 5' + mdg1 39 2 72.60 CCGGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAA:1 + chr2R 18316038 5' + HMS-Beagle2 6948 2 61.54 TTTGAAAGATATTGAATCTTATATCTCATAGATATCTCATCTGCGTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATGTTTATTTA:1 + chr3R 28986069 5' - I-element 5279 1 66.44 TTACAAAAAATTTTCAAAATGATGTCAGAAAAGACTATTCAATTCCTTAAGAAGCAGTCCGAAATTATTTTGGAAATTAGAAAGTTGGAAGTAAAACCAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCAT:1 + chr2L 8232594 5' + mdg3 5276 2 69.18 TAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 - 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chr3R 3286223 5' - Gypsy12A_LTR 1950 1 72.92 ATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr3L 5881689 5' - pogo 2050 1 54.79 AAGGTGTTGTGCAGTGAAGAGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chrX 21217342 5' + roo 8740 2 72.41 AAGCTAGAAGGGTTGACTTGAGGTTGTTGACCGTAAGGTCATGAGTATAATCTAGTCCGTACTTAACGGGCGCGAGATTTTACCATTTTATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTTAGTAATACAAATGT:1 + chr2R 25180136 5' + HB 36 1 73.97 AATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chr3L 15913837 5' + jockey 4809 1 52.74 AGTTGAGTATGAGGGTGATTCTAACTATAAAATATATTATTTATATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCTGCAGTCTGCGTTGGTAAATACAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGC:1 - chr3L 21740814 5' - rooA 182 2 69.86 GCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:1 - chrX 22840572 5' - copia 5062 2 58.90 GTGCATCCTCTGCCTCCTTCTTCACTTTTCGTCGGAAGTCAGTCTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chr2R 21414090 5' + Burdock 17 2 41.55 AATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAG:1 + chr2L 4003710 5' + mdg1 7125 2 78.08 ATGCTGGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 22400218 5' + 1360 19 1 72.60 TCCCTCGACTCATTTCGGTGACTGAGCGACTTGGACCTCTGAGCACCTGTCCAACCAATGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGTCACACAATTTTTTTGCCGTGGCT:1 - chr3L 12782657 5' + 1360 49 1 61.60 ACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACAATGATAACCGATTTGCCATTTTAGCCGATTTAGACGATCTACCAAATTCTGACA:1 - chr2L 14892271 5' + Fw2 164 1 67.81 GACACCTTCATAATGCCCTTTATCTATCGGCATTCTCAGACTGAAAGTTGGCTATACTTCCTGCCCGCCAATCGTAAATATAAATCGGTTGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAATAAATTATACCAAAAAATC:1 + chr2R 12925439 5' + I-element 5171 1 65.07 GGGCACTTAAATTGGCTTGTCGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTTTGTTTAT:1 - chr3R 26178432 5' + 412 74 2 76.92 ATTTAGCCTGGGTTAACTGGACATGATAGTAAAGTTAATTTACTTAAACAAGAGGGAAAGCTTTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCATAACTC:1 + chr3R 14576786 5' - INE-1 549 1 75.76 GACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACAT:1 - chr3R 15790112 5' + flea 4743 1 61.64 ATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr3L 5881594 5' + pogo 64 1 71.54 GGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGC:1 + chrX 18336607 5' - mdg3 5409 2 75.34 AAGCGGCTGCCAAACCAAACTCTCAGATAAAAGCTTTATAGCGGACTCTTTAACTGGAAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGCACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr3L 22960386 5' - Tirant 8492 2 74.48 GATTGGTCAGATGGGTCAGTCTGACTGGGCAGCTTTGGCGTTTAACGAGTTTTCACGCATAAAATGAATTGAATTAAGAAACAACTTCAAACGGCAAAGAGTTGATGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGG:1 - chrX 10953741 5' + opus 7300 2 73.97 ACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGC:2 - chr2L 18347368 5' - transib2 2745 1 70.55 AAGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 + chr3L 16690881 5' - I-element 5316 1 47.95 AAAATAAAATCACTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chr3L 15913801 5' + jockey 4773 1 74.66 AAAACAGTAAATAAAACGGAGCGAAAGACGTAACTTTGGAATTGATTGGCAGTGGGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATTAAAAAGATACATAAGAAAAATTCAGCTTAAAT:1 - chrX 2102114 5' + transib3 2650 1 42.47 GACTATGCATTTATTTGATGGCCTCAAAGTGGGTGTTCGTAATACCCATGCACTTGTGCCTGGCTGTTTTAAAAACGTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAG:1 + chr2R 3593586 5' + gypsy 10 2 78.77 AAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chr3L 17940230 5' + 1360 38 1 47.10 ATTTGTGTACCCAAAACCCTGGGAGCTCAGCTTGCCACAATAACCGCCCCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chr3R 8889978 5' + FB 1 1 43.00 CATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3R 21630361 5' - I-element 5305 1 53.42 GCATTTATAATGATTTTCCGTACCACTTGTCGCTTTGAATAGAACCTCCAGAAATGTCCTTTTGCGCCTCGTAACTCGAAATTACCAGTATTTTTATGGCATGCCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 28146254 5' + roo 8681 2 67.12 TAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 - chrX 8200338 5' - flea 235 2 72.41 ATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:3 - chr2L 15076220 5' + 1360 46 1 54.11 TATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr3L 16662356 5' - jockey 4959 1 58.45 AGATGGATGATTAATGTAGGGGAATAGCATAAAATCAAGAACTTGTGCACTTACTAACTGACTCTTCTTTGTTGTTTTTTTTTCTCTTTT:1 - chr3R 11617145 5' - gypsy7 5012 1 92.22 GTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGC:1 + chr2L 15550649 5' + Bari1 50 1 52.05 AGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:2 - chr4 373059 5' + pogo 59 1 62.33 GTAAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2L 9636205 5' + 412 7085 2 52.74 CTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAGCGG:1 - chrX 8092527 5' + pogo 21 1 69.66 CTGTTGTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 24090547 5' - roo 354 2 54.79 CCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chrX 18396158 5' + roo 8746 2 77.78 CTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chrX 1135401 5' - P-element 2830 1 46.58 GTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1 + chr2L 18347291 5' + transib2 63 1 64.08 ATAAATAACATTAAGCGATGGAAACTGAACGAAAACCAACAGCAACCACAACCAATATGTAATCAAAAGCAAGTTGACCAGGATAAAAGGTCCATTAAAGCCAAAGAAAAAACAAAAAACAAAAAACAA:1 + chrX 9177641 5' + Porto1 163 3 58.14 ATAAAAAGTGATTACTAATAAATGTCTTGCGTTTTCTGACTAATTTGCTTAGTAAATTTCTAAAATCTTATCAGCAGCATTTTAGCTAATAAAAGCGTACTCAAAAAATTTAAAAATAACACATTTAAAATTTGTTTTTTAAGTTG:4 - chrX 12510231 5' + FB 1005 1 61.64 AATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 - chr3R 18093379 5' + I-element 55 1 54.55 AGTTCAGCTGACAGCTGTTGCAACGAATTCTCAATCGAGTAATAGCAGAATAGCAGAATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chrX 661810 5' - 412 479 2 74.66 TTGAAAGCAAACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chrX 19038321 5' - hopper 1401 1 74.66 TATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTA:1 + chr3R 4160055 5' - invader2 5056 2 51.37 CATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:2 + chr3L 9809242 5' + 412 7109 2 56.85 ATAGCAAATACCATCGTTCATACGTTCGTATGTGACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATT:1 - chr2R 18413404 5' + Ivk 5241 1 76.22 CCTTTGCTTTTATGTGAGCCCAACTTTCCGTTTGTCCAACTTGAAACACCCTGACCACACTCAATGCACCCCACATGCATCCGTGGCAATTTGATATGGGGCTCAACATTTATTTTATTTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATA:1 + chr3L 18125860 5' - Ivk 5366 1 71.23 AAGAATACTTTCATAGCCAAAAGCTAGAAGTTAAAAGTAGTAATACCACTAATTCACCACGTCCATACCCCAAACTCACCCCATGTAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACCCACTGTAATCAAAG:1 + chr2L 7306531 5' + HeT-A 5993 1 62.33 CCTAAGTACACACATTTTTCTAAGTGCTTAGGATGGGTTAGGAGACCCACCTTCTGACAGAACCGCTGCCGGCATATGTGACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGTATAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAGAATG:1 - chr3R 25627540 5' - invader1 403 1 54.11 TATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAATTAGCACTCACCAGT:1 + chrX 14771743 5' + BS 82 1 72.60 AAAAACTAAAAGAAAGCCGTAAGGCTTGACCAAAAATTAATAACTGATAAAAGCAGGAAAGGCAAAACACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAG:1 + chr3L 22035510 5' + 1731 55 2 53.42 CAATAGTCAACTTAAAAGTGACAAAATCACAAAGAAAAATATTTGTACAAAATATGTATAAATTGATTTCGAAATCAAACGCACCAAAAGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGC:1 + chr3L 18788796 5' + TAHRE 10419 2 67.81 AGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTT:1 - chr3L 19350011 5' + 1360 3218 1 42.86 TGAAACTAAGACATTTCGCAACATTTATTTTAGGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATA:1 - chrX 23280396 5' + Transpac 5004 2 75.86 ACTGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCT:1 + chr3L 24757194 5' - Cr1a 4260 1 54.79 TATTATTTATTGTAGTTGTTCCGTTGAATATTATTAAACATGATCCGTCTAAATGAGAATTGTTTACAATATTACTTCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTAAATATGATGCAATTCGGATTAATAGACTGGTACCTGT:1 + chr3R 2646805 5' - Ivk 4962 1 59.86 CATATTTTACAATTACGAAACAATTCGGCCCACAACTAAATACAGAAACCTCAGGCACTCTTCAGCTCTTTAGCCAAGCACACTGAACAATTTTAAAATTTTTTCTCACATTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATA:1 - chr2L 18744978 5' + INE-1 502 1 60.96 CGTTATTATTTGATTTTCATTTTGGGCACGTGTGCGAACTTTTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:2 + chr2R 15326787 5' - copia 248 1 79.45 ATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATA:1 - chr4 373034 5' + pogo 84 1 76.71 AACAATTTATGCTGGCTTTAATATTACAAGTATACTATCTTGTACCGACTGTCATCGCTAATCGACGCGCAGGAACATTATCATCATCATCAAGGCAGGGCAGGGCCGGACCGAAAGCGGTGGGGGGTTATTTGAAGAAAAAAGTG:1 + chr3R 28363174 5' + S2 1260 1 82.19 AAGCTTTCTTTCTTGTTGTTTTAATTTTATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAGATACATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTT:1 - chr2R 25178779 5' - HB 21 1 76.86 TTTGTAAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTATTAAAAAATTTTACTTAATTATTATTTCATTTTGTATAA:1 + chr3L 3548096 5' - Tc1-2 384 1 59.59 CACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr2L 15076207 5' + 1360 52 1 55.40 TAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAA:1 + chr2L 10156127 5' - hopper2 1530 1 71.72 AGGCAGAACAAACGCACGGAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr2L 15076251 5' + 1360 15 1 75.34 TTAATTAAAACTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGCCCTGGCCTAACTGCGGGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAA:1 - chr2L 71295 5' - 412 7121 2 56.88 CCTTTTATTTAATTTTTGTTTTGCTCAACAATTTACGCACACACATGTTCTCATCCATCAGCAGAGGTTTGTTGTTGCTGGTTCCTCTATATATATATACCCTTTTTTTTCCGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCA:1 - chr3L 9358013 5' - Bica 499 1 71.23 GTCAACAATGGGAATAGGTGGTGATGTGGGTGGTGGCTACAAGGTTGCGCAGCGAGAGTAGAAACTGCACTGGCTATTGCACATATAGCTTTAATTGCTAATTTTGGAAGAGCACAGTAACAGCAAAACAAAAAAAGTGAAAACAA:1 + chr3R 24071572 5' + Porto1 173 1 73.29 ATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTTTAGTATTGGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 - chr2R 22989669 5' - hopper2 1526 1 67.81 GTGAATGCTCTGCCTGCGGCGGTACAAGGAGCTGGGACCTGGTGCGGAATAAGCAGAGGGAACGGATCTGTAATAATTATTTTTCCAATATATAATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACC:1 + chrX 23176759 5' - Cr1a 72 1 50.83 CATCATGTTCCCCAGCCGACTTTATTTTTGGACTAGCAAATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTGGAGTTTTT:1 + chr3L 3030162 5' - roo 9052 2 71.23 ACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:3 - chr3L 16470366 5' + jockey 4733 1 58.90 GTGTGAGTGTGTGGGTGTTTTTGGGTGAACTGGCCAATGCACCGCTATCGGTATTGAGCATAGAGTTGATGTTGATGCTGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAAGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAG:1 + chr3R 20214757 5' - Doc3-element 486 1 72.14 GTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATCGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 + chr2R 12779645 5' - I-element 5272 1 72.60 ATGACAATAAACAAATGAAGACTTCAATGGCAGCATTTTTGTAAACAAAGTTGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGC:1 - chr2R 20731901 5' + 17.6 7026 2 64.38 AAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:2 + chr3R 29612034 5' + jockey 95 1 75.34 ATAACGATATAAAGCGAGTTTAACCATAAGTCAAGCTGGACAACCGAAAAACCAGGAGCAGGAACAGCAAACATAGAGCTATATCGAATGCACAAGCTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAA:1 - chrX 10791669 5' - diver2 4725 2 54.11 AGACATCACAAGTTTAAAATCATCACTGTCGCCAAAGTGGGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAAT:1 + chrX 1799101 5' + invader4 2800 2 57.53 ATAACCCCAAAACAAAAACATATTCTCCTTATCAAATTTCAATCGGAAATTGCCCATGAACTTTTACATTCCACTGGCACTACTCCATTTGAAAAAAGAGACGTCGAAAAATGATAGGTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTC:1 + chr3L 23282699 5' + invader2 4638 1 76.03 CGTCAAGTGTGTCCGAAAATAGCAAGGTAAATGAAAAATTCAACACGGCGAAATGAGGCAAAATCAGCCAGCAAACGAGAGAAAATTGAAAAAGCCAAAATAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATTGG:1 + chr2L 16875483 5' - ZAM 7972 2 68.49 AAAGGGGGCTGTGTTCCAACACTTGAGTTCTGTTTTTTAGCAGTCGGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr2R 22989600 5' + hopper 57 1 64.12 ATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTC:4 + chr3R 7420209 5' - 1360 3322 1 63.70 GTGGGGGTATAAAAGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGG:1 - chr2R 1597629 5' - F-element 4516 1 67.44 TTACAATTTTTTTTGATTGGACTTCGTGATCTTTTTCATATATACATTTATCGAGCTATAATTCCTAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGGGTCTAGAATCTGTATGCTCTCTCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 + chr2L 21795560 5' - INE-1 147 1 54.48 AAGTGAATGCCTTAAAGAGCAAATTCATTCAATTAAATATAAATATCACCAAAATAGACCAAAAACTGTAGTGAATAAAATATGACTTTATTTTCAAAATAAAACTGCAATGATAACTTTTTTAATAACATAATGTACACGTTTTT:1 + chr3L 18265144 5' - S2 1388 1 76.03 TAACTCTGAATTATTTTCTATTTCTCAGTGGAGAACATCAGAAAGGGGAAGCTTATTTTCATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCT:3 - chr3L 9270045 5' + copia 2 2 68.49 TAATTTGTTGCTATATTTGATTGTGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr3R 12242210 5' + transib2 16 1 74.66 ATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chrY 2720333 5' - 297 6922 2 79.82 AATCCAATAAAAAATAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAGTCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 - chr3R 24381435 5' - Juan 4193 1 78.77 AATCAACGGCATCAATAGCTAGGGAACATAACATTGTGTATTAAAAGCCTTTAACGTTGCTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAA:1 + chr3R 8359900 5' + 1360 3322 1 59.59 AAAAAAAAACTTAAATACTGAACTCGGCTGGTGTTTCTCCGGACATATTACCTTATATTCCCTTAACTTACTTTAGTATGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTATATACTTATTATTAGTTATAAATATTGCTATTAATT:1 - chrX 16249470 5' + gypsy12 9765 3 67.81 ATTTAATTCAAGCTTCGCCTTTTAGCTTGCTATTCAAGTGCAGCAAGAAGATACATTTGACATCTCAATTAATTATTACAGTAAAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTTCATTATTTTTCCATT:1 - chr2R 7304134 5' + pogo 47 1 50.68 CTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATA:1 - chr3R 19992705 5' - hopper 1325 1 78.08 CGTAAGCTACAATAATCGTGTGACAAACGTACATGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 + chr2L 11357847 5' + blood 86 2 76.71 CTAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCA:3 - chr2L 12984204 5' + hopper 77 1 69.18 GATGGAGGTAACAGGTAGTCTGCGAGTTGTAAATTGCACTTTTAGGAGTATTAGCTGAAACAATTAGTAATGTTTAACTAGAGATTTAAACATGAACTTTTTTCTTTTTTTTTTAATTCGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGTCCA:1 - chr3L 18588702 5' - Cr1a 4431 1 75.34 AATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 - chr3L 16470363 5' + jockey 4734 1 60.42 CGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:1 - chr2L 13844277 5' + Stalker2 43 2 55.48 CAACGAAATTGTTAACGTTATATTTTTTCGTCGGCCATCGTCACAAAAATAAATAACAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr3L 24228583 5' - copia 225 1 61.38 CATCGCAAATATCCATAGACACACAGACAGGGCAACGCATACAATTCCATATACATACTTATAAACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTCTAAGAACTTTAACATTGTAACACACACATATTCACTGTTAGCTTATTT:1 + chr2L 2266205 5' + ZAM 8244 1 81.51 CCAAGAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr3R 16630234 5' + FB 28 1 64.14 AGCAGTTATCTTAATTGAAGATCGCGCGAAAGTCTAAGTGCAAATAAGCGGTTAGAGTTTTCTATTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACA:1 + chr2L 5295728 5' + F-element 407 1 54.79 TTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTAATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350028 5' + 1360 3224 1 46.88 AGGCGAACGCCAGCAGCAAGAAGAAGCCGAGAAGGTCCACCTTCAATCTGCGCAGACGCACCTTGGTCAAGCAGCAAATGGAGTCGAACTGAATTTCGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATACGGCTTTTTGTAAAATATTAATTAT:1 - chrX 2410147 5' - TLD2_LTR 108 1 62.33 ACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAAT:1 - chr3R 27843223 5' - I-element 5275 1 77.21 ATGCGACATATCATTAACATATCTCTTAAAACATAACCCAGTGCATAAAATAAAACGCATTACAAAATCTCATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAG:1 - chr3L 17570926 5' + roo 481 1 53.79 GCAATCATTCGCATCAATCTTATAATGGAAACTCAATTGTATAAGTTAATAATTACTGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTTAAACTAAATCTA:1 - chr3R 19225072 5' - HMS-Beagle 6981 2 67.20 GTCCGAGAATTTTTAACATCTTTCAAGAATATCGATTGAACTTGGGAAAAAAGTTAATTTTAATTCCCTAAGGTGTGGGCGTGACCGGTTTGGGGCTTTAGGGCGGGGCGAAAAGATTTTTGGCAAATCGATAGAAATGTACAAGA:1 + chr4 250384 5' - INE-1 302 1 49.32 GATCTGTAAAGTGCGGAGTAATGCGAGCAGGGATGTGGTCATCGATACGGAGCCCAAGGAAGAAAAGGGAGACTTGGGCGAAGTCGAGAAGAACTATGTGTAAGTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAA:1 - chr3L 20296162 5' - flea 485 1 72.60 AGTGTTAACTATGAAAAGCCCCCTTCTAAAGCCCCAAGTTAATAATTAATAACATGACTTTATTTAGTACTTCACGTGTTCAGTTTTAGTATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTCCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGC:1 - chr3R 20745049 5' - invader2 4972 2 60.27 AAAAAGAAAAAAACACCGTTTAAAATATATATAATTATAACTTCTTCATAAACATCCGCAGTCTTATTCGTTATTCCCACTAGAAGGGTGAAAACTGCTTACACAACTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAA:1 - chr2L 23022532 5' + Quasimodo 376 2 72.66 GCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 29084860 5' - 412 460 2 59.03 AAAATGAATATATTTCTCGGAGTGTATTGTAGTACGCATTCTATGCCAGAATGCACTTGTTGCGTGGAAGGCAAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTAT:1 - chr3R 28533755 5' + Doc 114 1 54.89 GTATACGTAATACATACTGCATACTATTAGGCGCTCATAAAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3R 24450507 5' - 412 7472 2 65.52 GTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2L 16539634 5' - Juan 4171 1 56.85 TCCACACACTGCATGGCTTTAAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 7889707 5' - roo 396 1 76.71 AGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 + chr3R 4860448 5' - Transpac 5163 2 70.15 GAAACAACGAAATTTTGTGTCTTGAGGAAAAATGTCCAAAAATACACAGGACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTTCAAATGGCTGTGAAGTCG:1 + chr2L 23052724 5' - baggins 5155 1 65.07 GTATACCCTTTTACTCTACAAGACCTATCATGAATATAGCTGACGAACAGTTAAGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3L 25245594 5' - 1360 3338 1 60.00 ACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 18281836 5' + Doc 14 1 72.41 AATTGAATTAAGAAGAATGCACTTGCGAAAAAATTTCCCAGAATATAAGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGT:1 + chr2L 17071348 5' - HMS-Beagle 6658 1 61.29 GATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCA:1 + chr3R 11191358 5' - roo 9045 1 65.07 TTAACAATTTAATTTGTATTTATCATAATTATATTAATTACTAAAATGACAAATAGCTTTTGTAGATTAGATTCAAGTTAATGAAATTTTAGGCAGCAGAACGTTATAATTTCAGTGCTATTTGTCATTTTAGTAATTAATATAAT:1 - chr2L 13907522 5' - transib3 2674 1 65.75 TAATTTAAAATGAGCTAAGAAAACACACTCTACACTCTGCTCGGATTAGTAACGTTCCTAGCAGTCATCTTATGGCTGCACCGACGAACGAAACACATCGTCCACATCCACGAGGATCATCACG:1 + chrX 583830 5' + Tirant 8027 1 79.03 ACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:2 - chr3L 24131529 5' - Transpac 281 2 65.07 GTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCACTTAGTTTTTTT:1 - chr3R 16630330 5' + FB 81 1 77.04 ATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr2L 9636077 5' - 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aurora-element 4179 1 57.53 AGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chrY 495734 5' + Doc 75 1 70.83 GGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 12818224 5' - hobo 2909 1 58.40 TGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATATACATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGA:1 + chr3L 5061570 5' - 17.6 7332 2 77.93 CCGAGAGACTATACGAGAAATAATTGAGAGGCACACACACACTTACACACACACACAC:1 - chr2R 8652765 5' + Quasimodo 31 2 87.93 TAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCG:1 - chr3L 24131518 5' - Transpac 5192 2 58.74 CGTTGGGTTTTATTTAAATGTTTTCTTTTATTGTTTTGATAATTGCTCCTTAACCTAAAACTAACATTTGTATTAAAGTACTAATTTAAACAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCATAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTA:1 - chr2R 25064633 5' + McClintock 309 2 67.12 CAGGCGTGGCCACAAACCAACCAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:1 + chr2R 8158064 5' + mdg1 7128 2 80.14 ACTAAAAGAACGCCGTAAGGCTTGACCAAAAATTAATACCTGTTAAAAGCCGGGAAGGCAAAACACTGTTGAAGATAGGCAATGCCCACGTGTGTGTTGTATATAGGCCATTT:1 + chr3L 22035514 5' + 1731 4338 2 49.56 ATTCGATTCCATTTCTTTGGTTGTCGTGGAATTAAATTCAGATAATTTATTTCCTCTAATTGGCAACACAAACAATTAACTACAGATTAGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATT:1 - chr3L 18927410 5' - I-element 5130 1 65.07 ATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCT:1 + chr3R 14860156 5' - BS 5016 1 71.23 AAATGTGTTCACCATAATTTAAATTCAAATTCAAATTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCCAGTC:1 + chr3L 26310025 5' + mdg3 55 2 59.00 CCCACACTAAAAATAGCTTAATATTTTTATTTAATTGGTTATTAAGGAAATCACATATTAATGGTAAGTAATTAAATGCATTCTCTTTACTCTCTTTTTTATAATTTTTAGAACAAGTAATCAAAAAAAAAAACAACTAAATATAT:1 - 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chrX 6777950 5' - accord 6944 2 56.00 ATATTATTTCTTAGCTATACCCGTATAGTAAAAGTGTATATATTTATATATAAGTATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGACGAGATCTCAGAAACTTTAAAAGCTA:1 - chr2R 25196366 5' + INE-1 151 1 78.08 GACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2L 15188475 5' + 297 44 2 55.86 TACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGTATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCT:1 - chrX 10521725 5' - Tabor 7258 2 60.27 ACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCAT:1 - chrX 1799207 5' - invader4 324 2 67.14 GTATGTACGACCATCCAATAACTCGGGAGCAAATCGAACTCGACCTCAAGGAGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATTGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCC:1 + chr2R 21692517 5' + jockey 4664 1 69.84 GAGGATGTGTCCCGCGGACAGTTGAGCGGCATCATCCGATTGAGCGACTGCTCGCGCGTTGTCCAGCGCTTGGCCGATATTGGCAAGGAGAAGAAGGAGAAGAAATCCGATGAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCT:1 + chr2R 18998004 5' - roo 76 2 75.34 AAAATATATAGAAAAATGGTAATTAACTAACGTATATGTATAAGTTGAAAAGTTCACCGCTCTATCCATCAAAACATTTTTATAATTTCTCTTCACGTTTTTTTGTTTGATTTTTTTTTTT:1 - chr3R 30518092 5' - gypsy2 436 3 42.15 AGATTCTTTGTCGGGTGACAAATCAGAAATGTATACACAACATTACTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTC:1 + chr2L 274729 5' - Stalker4 7322 2 52.05 ATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1 - chr3R 27083118 5' + jockey 4586 1 60.45 ATGGGTAGAGCATGTGTTTGAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 11191524 5' + roo 8694 2 65.75 ATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr4 303824 5' - pogo 2049 1 54.79 ACTTTTTCCTGGCACCACAACTTAAATAGGTTACAGCAATGCCGAAATAAAGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3L 46911 5' + FB 40 1 54.47 GCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chrX 11661371 5' - pogo 2063 1 58.45 AAAGTCCCGTAAATCAAAAATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:3 + chrX 1341582 5' - 412 482 2 74.66 CTCTGCGAAATTGGCAGCTGGTCAAGTGAGGCTGCCTCAATAATAAGTAATTGCCAAATTCTGTACCTCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACAAACAGGCGTGTGCCACATT:1 - chrX 18678207 5' - invader4 2934 2 63.56 TATTTCCTCATTCCAATTACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTT:1 - chr2L 18689261 5' - Gypsy6A_LTR 263 1 69.18 AACTGAAAACTGAAACTCGCCGCTAAAAAAATATTCAGCTCACTTAAAAAAAAAAAGAGAAAGACAGAATGAGAGAGAGAGAGAGCAGGCGGAAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCT:1 + chrX 9977399 5' - 17.6 7113 2 66.44 GCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGATCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 - chr3R 27083144 5' + jockey 4555 1 60.47 AATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATTTTGTTCAATTGTATTGGGAAAGATTATTATATCATCCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr2L 17886976 5' - opus 7441 2 63.01 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGAT:1 - chrX 12657099 5' - Stalker4 160 6 78.62 GGCAGGGAAAATGTTTGACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr3L 9809365 5' - 412 449 2 54.79 AGGCCCATGCGCCATAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 13295016 5' - roo 9044 1 67.12 ATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTA:1 + chr3R 16157259 5' - pogo 2062 1 54.79 ACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 5389925 5' + roo 56 2 86.14 GCCATTTTCTTTTTTTCCAAAGTCTGCGGCTCTTTTGGGCGTAAAAGTTCATGAAAATTCAATAAGTTTTCCCTTAAATAAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTA:2 - chr3L 21396272 5' - Cr1a 4021 1 58.22 CTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATC:1 - chr3R 16533691 5' + X-element 4425 1 48.18 GCCTCTTTTCCCACTTTATCTGTGGCACTATAAATTTGTTTTTATTTTCAGCTGATGAGTGGTTTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAG:1 + chr2L 17207754 5' - hopper 1072 2 54.20 CCTTTTTGCCGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 15357774 5' + hopper 6 2 72.38 CAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 - chrX 10319710 5' - mdg1 7401 2 56.85 ACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3L 17055424 5' + Tirant 38 2 55.47 AAACAAAAACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTTAATAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chrX 6839189 5' - 412 7543 2 50.00 GATCGAAGTCGAGGAAGGCCTTTTTCATGGCCACCTCAATGCTATTGTCCCGATACTCCTGCCACTTCTTAGCTTATTTTTTTTCGGGGTCCCGCGGGATCTCATTTCTGCTACTATTAATTTTTATTATTTTTTTTTAAAT:1 - chr3L 581845 5' - TART-C 11099 2 57.04 AATTCACTGCCAAGTGAATATCTGTGAACTGATCTGCATAGATAGATAATAGATCTGCACAATTGGAATTAAGAAGCCAAAAAAATAATTGTATATATTATGATATATATATATATATAATTAAATGCTTGCAATATTTATAAGTG:1 + chr3R 3854734 5' - Idefix 7384 2 32.88 GTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGATTGAAGGAGCTGGGGTCGGAGAAATCGAGTTTTTGTAATTTGAA:1 + chr3L 22890356 5' + FB 26 1 55.05 CTTATGTTCGTGAAGGTGATCCACCTTCCTTGGTTAAAGCAAAGACACTAGAAAGACACTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGGTAT:1 + chr3L 23650348 5' - 1360 14 1 50.41 CACTAGCTTCAGGGCGATTAGCAGGGCGGCAACCAGAACGAAAACGGCGATGAAAGCTTCCACGCGCCAGGCGGACTATATATGCCGGACTCATGGTGCCATGTGCCTTGTTTGGTGAATTGGTCTGGTATGATGGACCCAGCTCT:1 - chrX 4920129 5' + R1-2 3094 1 60.27 ATGTTCTTTCCACAGTGCAAGGGAATGTATGGAAGACACTGAAACCGAATAAATGCAAAACAAGAAATTCTTACATGGTGCCAATTGATCCAAAATAATATAGATATTTTGACAAATTTACAATGCATGAGCA:1 + chr3R 22743758 5' - 1360 193 1 68.42 TATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAA:1 - chr2L 589568 5' - Copia1_DM 92 1 75.34 CAGTGAAGGTTCGATTAGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3R 14858299 5' - hobo 2906 1 81.33 AGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGGGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 + chr3R 27405960 5' + diver 5892 2 70.21 ATTGTAATTACTTAGGCAGGAAATGGGTAAATGAGCACCAAATCGTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACAC:1 + chr3L 13605973 5' + R2-element 3513 1 69.18 AGCTTGCCCTCTGGACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTA:1 - chrX 21639713 5' + gypsy5 36 2 53.04 ATTTTGGTCGGGCTGATTGGGACTTTTCCTCACTTTTAACATAATAAAATGCAATTAGTATTGGTTGAAAGTTTTCAATATTGCAATGATTTTCTACAAACAATATAGTTGTATAATTATAAATAAATAAATAAAATAAAATAATA:1 + chr2R 18513729 5' + G7 1149 1 77.40 TATAGGTCTCCTCTGGTCATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAG:1 + chr3R 2522268 5' + Tc1-2 97 1 45.89 GTTACATTTAATTAATAAAACATTCTGTTTGATTCATTCGTTTAAAATATTCCTTTGCTTTATTGAAATATACAAAGGAATTTTGCTAAAGAGCTAAATCAGCTACAAATTTTTTTAAACTATTTTATTT:1 - chrX 8876899 5' + 1360 3091 1 69.23 TATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr2R 10411460 5' + 297 50 2 58.22 TAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 5489845 5' + jockey 21 1 66.67 TATGCTGTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 + chr2L 15550643 5' + Bari1 44 1 56.16 TAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chr3R 15364037 5' - flea 214 2 58.22 AGATATAGATACATTTTCTATAAGTGGATAATAATTTTTGATATTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTG:1 + chr2L 11297885 5' + I-element 5192 1 69.50 ACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3L 2544645 5' + Tirant 30 2 65.48 TCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3R 16341920 5' - P-element 2843 1 55.48 CTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chr2L 7580905 5' + Transpac 61 2 60.69 AGTGTCCCAAACTTTGACACATGTCAGTATGGGGGCTGCTGGCCGGCAAAAAATAAGAAAAAAAAAAGAAAA:1 - chrX 4173948 5' + Rt1b 5148 5 79.17 TATTACGATAGTTCTAATTTTAACGAAGGAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 - chr3L 22744757 5' + FB 29 1 77.40 GTGGCGGTGTTTATTTGGAGAGGGCTTCTAGAGACTCGAACCTGTCAAAGAGTTGGAAAAGTTCCTTCCAAACTGTTGACCCAACAAGACATAAGATTAGTTCATTTTCGACTCCATATTGAAGATAAAGATAATATTTCG:1 - chr2L 18556806 5' - Circe 7076 1 60.28 AGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr3L 3983911 5' - P-element 2853 1 58.65 AATCGTTCATACATACAAACAATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGCCTTTGTGGGTGGATATAAGGAAATAATTACAATTTATTTATTTTTATTTTGTAGAT:1 + chr3L 22723794 5' - HMS-Beagle2 294 2 74.66 AATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAA:1 + chr2R 21410875 5' - Burdock 186 2 65.75 TTAAGCTACAGCTACTATTTCAAAACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGCGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGAT:2 + chr3R 10735998 5' - McClintock 447 2 64.38 ATCTCATTATCAACAATTACATTTTTCTGCTCAGCTAGAAACCCACACACACACACACACACCAGCCCACAGAAGCTCACACGCATAAAAGTAAACAACATTTTCCACCATTGCCACCAAGGCCCCTTATTATTATTATTGTTATT:1 - chrX 19606291 5' - mdg1 7069 2 43.84 AAACTGCCCAAGACATTTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACCGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 4460983 5' + blood 7036 2 67.81 CATAATTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr3L 23287309 5' - 1360 3319 1 65.97 CATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3L 11326676 5' - pogo 2034 1 67.12 GGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAGAGTATTCTGAGTGTCGGATTG:1 - chr3R 30347377 5' - P-element 2804 1 23.53 GCTAAGNGAAGAGAAAATCAAGGAGAAGGAAAAAGAAGAAAAGCTCCGAAAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGG:1 + chrX 11831160 5' + Tc1-2 1322 1 65.75 ATCAGCGTATGCAAAATGCTGTCACACGCTTTGTCGTCCGCTCCCTGGCATCATCATCCGACCAATCCCGTTCCCGTTCCCTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 - chr3R 11058162 5' - roo 308 2 55.48 AGGTAGGCTACGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTT:1 + chr3L 19349888 5' + 1360 3263 1 59.59 ATGCCTAACTTTTTATGTAACAATTAACAGAAATTAACTGAAGGCCTAAAAAACATTTTTAATAACATTTTCTTAAAACTCATGATGTTAGTTAGTCTAGTCTAGTCTAGTATTTTAGTTATTTATAATTATTATATTATTATTAA:2 - chr2R 9720937 5' - invader3 5049 5 65.07 GCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAA:1 + chr2L 18347286 5' + transib2 62 1 61.64 TAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCAT:1 - chr2R 23780614 5' + Ivk 60 1 56.16 ATTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGACACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTAAT:2 + chr3L 27282407 5' + INE-1 534 1 42.47 ACCTCTGTTGCGCGTACAGTAGGCAACAAAACATGCGGCGAGTTACTGAGAACGGAAAACACAAGGCGGCCCTAATAAATTCGATTTGTAGTTAGTTCGTAACAGACCAGAATTAAGAGCAGTTGACTCTAATAAAAGAACCATAT:1 - chr3R 10356447 5' + gypsy10 316 2 56.16 GATATAATAATTTATAAGAATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGGATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATAC:1 + chr2L 12341780 5' - BS 5075 1 68.49 TCCAGCCTCCATCCTAAACAACCGCCACATCCTCCAATAATCACCAGCAACAGCCATCAGACTCGCGAGCTGAACCAATTTTATTTATTACATAAAAAATACCAATTAATATAGGTAAAGAAACTAATAAAGTATAAAATAATAAA:1 - chrX 11980947 5' + BS3 1768 1 45.89 TGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 + chr3R 16518896 5' + Tirant 8176 2 66.43 AAATTATTACACTATCCTCTAATAGAAAAAATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATGGCAAAACATGTCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 + chr2R 4709826 5' - INE-1 84 1 43.84 TCCACGGCTATGGCTCGAGGATCCACCATCGGTTCACGCTCCAGCACGTCCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCC:1 - chr2L 4965052 5' + F-element 4490 1 63.10 TATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 - chr3L 12315851 5' + transib2 21 2 68.66 GTTGTTATCTATCATTGAGTGGCCTTTGCTTGGTCAGCTTTTATTTTTATGACAGTTGTCAGACCAAGCTTTCACTGCGCATTTGTCTCTACAATCTGTATTCTGAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGAC:1 + chrX 22872825 5' - INE-1 145 1 58.90 CCTTTGGCAAATTACTATTATGCATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 23180146 5' + roo 11 2 76.43 AAGCCGTGAATATCTTATGCGCAGTGTTACCGTTAACCAAAAACATTGAAAATTGGGTTCTTCTCTTTCAAACTGCCATATTATTCGAAAAATTTCCTAATTCTAGACCTGAATCGCTCTTATTATACGAAATATATTCAATATAT:1 - chr2R 16867748 5' - Tc1-2 1600 1 75.34 CTTTACTTTACTTTACTTTGTCTTATGGAAAAGGAGAAAATAGTTTTGGAGAGTAATTTTAAGGAATTGTTGAGCGATG:1 + chrX 20787043 5' - TART-A 13052 1 87.34 TGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr3R 31264109 5' + jockey 4798 1 51.03 CTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr2L 16943906 5' - copia 237 1 51.37 TTTGAAAGCCATGTAAATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2L 10156056 5' + hopper 8 2 76.03 CAGAATGCAACAGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGG:1 - chr3R 3396660 5' - invader2 211 2 62.68 CAGAACCAATTACGCCAATAATATTCAGGCCAGTTCGAGAAAATTCAACAGTCCTCCTGGACCAGCACCACCCTTGCCAAGAAGAAACATACAACCAAACTCCCTTCTAACTGTAACTTATTTACGTCTTATGCTAGTTTAATCGT:1 - chr3L 27720410 5' + 3S18 5955 2 69.86 AAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr3R 18093361 5' + I-element 72 1 66.90 ATTTCTTTCTTTTTTTGCACGACGGAACTNATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 5151329 5' + roo 8716 2 55.94 AAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTT:1 - chr2L 6654745 5' - diver 160 2 60.27 CAGATTTACTTAAATACTGATCTATATCTATACAAGCATATGCATATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGAATCAAATAACAA:1 - chrX 18324453 5' + 17.6 84 2 67.81 ATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1 + chr2R 8157192 5' - mdg1 7379 2 73.97 AGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 5769013 5' - roo 9007 2 60.96 AACAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTG:1 + chr2L 13158625 5' - roo 9051 2 65.00 ATTTAAATGTTGATAAATTGCTCTTCAGAATTAATTTGTATATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAAAAAAAAAACGAAAACGTGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGATGACTATTTTTTGGCCGAAATCAACTCTGATCTACGAAA:1 + chr3R 30303743 5' - 1360 3171 1 69.66 GAAATGAAATAAAAACTGAAACTGAGTAAAGAAATACCGAAAAGTACGAGAAAAAAAATGAAATTGAAACAATATGCGTTGAGGCCTGCTTACATAACATTCGCGCCCTGAATATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGT:1 + chr2R 19619968 5' - 1360 3009 1 65.75 AGCACACAGGATGCCGGCTAGGATGAACTTATTACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTA:1 + chr3R 28403181 5' + 17.6 7048 2 77.40 ATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 15791005 5' - roo 9009 2 63.01 CGGTCATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 21933273 5' + pogo 29 1 68.97 TAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 24219336 5' - roo 8988 2 80.00 TAAAACCAAGTTTAAAACAAACTTTTTTTTTTATTTTACTTTGTTTT:1 + chr3R 2339295 5' - F-element 4676 1 87.23 AGCGAGTAAAAGTGCTGGAATCGAAGTGGGGTCCTTCAAGTGAGAAAATCCAAGGCGATGCAAGACATATAACAGATAAAAAAACATAAATTGTCTCCATATAAATTTCTTTTAAACCTCAAGGAGTTTAAAAATCTTAAATATAT:2 - chr2R 15403700 5' - F-element 4618 1 80.82 GACAATCGAAAACTAAAAATTTTTTTAATCGAAATTCTCTTTCGTAAAACTACAGTTTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGAATGTATATGTTATTGCCCTATTAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:1 - chr3L 22723971 5' + HMS-Beagle2 28 2 61.38 TTCACATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTTCTAC:1 + chr3L 25008295 5' + 297 6949 2 77.24 TTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGACAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 - chr3R 11040179 5' + Bari1 41 1 58.22 CAAGCCCTTTTGGCCGACGAATTAAATGGCTAGTATATATGTGTATGTTAAGTAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGA:1 - chr3R 5351053 5' - jockey 4818 1 63.45 CTAACTAAATATTTTGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:2 + chr2R 21410832 5' - Burdock 228 2 65.75 CGGGAAAGAGACAACGCTGCGTATAAAGCATAACAAGGGAAAATATAAATACGCATACGACAAGTGCGCCCAGTGAAAGGGGGAAAAAGGAAAAACGTGGCCAGAAAGCAGCAAAAGCGAAAGCTTAAATTAGTCAAGCGCAAAAT:1 - chr3L 5890058 5' - invader2 396 1 66.44 ACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3L 1279165 5' - roo 336 2 74.10 TTTAATGAAAATCATCAACAAAGTGGTGGCCATTAAGGCGGCCCGCAATCATTAATCTCCGTTTGCCGCTAAGAAGGGGAAGTACCCCAATGATGAAGGTACCGCCACCCGCCCTCACAAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAA:1 + chr2R 13306590 5' - transib1 1902 3 73.79 TTATGTTCAGTCAATATGTTTTGCCCTTTTAAGTTTTTTGACACAAAGGCGCTAATTAACCTTTTCTTTGGTTGAAAGGTATGTAACAGGAAGAACGAAGCGTCTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTAGAA:2 - chr2R 5359603 5' + INE-1 154 1 55.48 AAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGGGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACAT:1 + chr3R 178121 5' + BS 86 1 76.71 ATGGTAGTTAATGGGCTTTGCTTTTTCTATTATTCGGTCTATTGCTGATTTGTATGGGGGACGTTTTGATGAGCGGTATGATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGT:1 - chr4 195057 5' - I-element 5113 1 60.27 AATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr2L 71244 5' + 412 7140 2 76.55 AAGAAAAGAAAAAAAGTTTGTTGAATTCAGACTAAAATTTCAAAACTTTTGTTAAAACGTTTTTTTATTACCTCTGCCATGACTATCGTAGAGGGAAAGTGTATACTAGATTTGTTTAAAGGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGT:1 - chr4 392120 5' + INE-1 31 1 63.70 GATAACATCAAATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:2 + chr2R 22034600 5' - copia 244 1 77.40 TATGATTAGCATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCA:1 - chr3L 19350072 5' + 1360 3195 1 74.13 TATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCAT:1 + chr2L 14523114 5' - HMS-Beagle2 7147 2 50.68 GTTTGCGGGTTTGCTTTTGATCGCTCCATATGGAAATTGGAAAACTTTTTACGCGCTGGCCTCGCGTGAAGCCAACATGAAAATTGAGGAGTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCA:1 + chr2L 7660580 5' - transib2 436 1 62.33 CTGTGTATTGTATTTCGATTTCCAAGCTGATTTTCTGCCTTTTTCGATTGCGTTCGCTGAATAAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTTTATTTCATATGTTCATATTGGTTTTATTATCGTCTTGTATATT:1 - chrX 5601456 5' - Porto1 4241 1 70.83 TCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGAA:1 - chr2L 18689241 5' - Gypsy6A_LTR 243 1 72.60 GCTTGTTTTTGCATCCTTATATATGTTTTCTTTTATTTTAAGACTGCATTTTTTTTATGAAATTTTATGAAATTTTGAATATGAAAATCAAACTGTTCTACATGGCTTTTTAAGAACAATATATATTATATATAATAATATATAAA:1 + chrX 14897107 5' + Tc3 288 1 61.64 ATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATACACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAACTTT:1 - chr3R 31886950 5' - hopper2 1567 2 53.68 GTTAAGGAATTTAATCGCATTTAACCAAACACAAATATTTGCACGTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAAT:2 + chr2L 4003635 5' + mdg1 12 2 76.03 GGTTTATTTGAGCACTTCTCTTTAGAAGTTCTGTTCTGATACATCCCCTCAACTAATAAAAGCAATATAATAGTGGTCAGAAATACAATATAAAAACAAACTTTAGACATGTACCTACATTATAAAAATAACTAAATATTTTCCG:1 - chr3R 21608882 5' + mariner2 833 1 66.21 AATGGCAGGCACGGCACGTAAAGGCCAAAGCATTTTGTCCCGCCAGTTTTTCACTCGGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19703304 5' - Porto1 170 1 84.06 AAAGTCAGACACAAAACGGGAATATAACAAAGGCAACTTTTGCATTGATCTTAGCGCGATTAAGACATACAAAAACAAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAA:1 - chr3L 11080133 5' + I-element 213 1 57.93 CTACAGCACGTGTCTGTGTGAGTGGGTAAAATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:2 + chr3R 31886795 5' + hopper 17 1 75.34 CTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTCTTGACTACTGGAATGATGGACTCCAATTAAGAACCCAAGTCC:1 - chr3R 13973068 5' - 412 7534 2 70.18 AGGATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGTGTGGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr3L 1692047 5' + blood 89 2 80.14 TGGGATCCTGGTCATGGTTCTTTTTGAGCAATTGTAATCTTGACTTTAATTGTTGCCTTATGGGTTTGTTGCTTTGAATTTGCGGTTATTCTTTAATTGTGTTAGTGCATGGTGCGCCTGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGCTTGG:1 + chr2R 10174868 5' - Fw2 3613 1 54.79 ATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 + chr3R 9485829 5' + micropia 27 2 61.24 GAGCGTCCAAGTGTGGATGTGTGGGTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTCAGCTTTTTGTTTATTTCCTTGCGATCATCAATAATGCCAGCCAAAGGAAGCGCATGTACATGTCCGTGTACTGTTTTTTTCAATTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 27220832 5' + FB 174 1 79.45 AATTAAAATATTATAAGTTCTGAAACAGACAATACTGCACAACAAATAGAAATGGAAGACGTTCCATTACCCCTACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTT:1 + chr3L 26802849 5' + 297 6549 2 68.70 ATTAAAAATATTCAATTGCTCTTCAAGGAGTCGAGTTTAGCAGTTGGAGCGACTCCTCAACACCAATCATTTATGCCGGATTATATTCTTTTACTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAAC:1 + chr2R 23780487 5' - Ivk 5355 1 67.12 GAAAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTTCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr2L 9636031 5' - 412 476 2 69.18 CTCAACATTTGTATAATATACGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATGTTGTGTGCGGGAGCTACTCGTCACGCACATCGC:1 - chr2L 12818321 5' + hobo 65 1 61.83 CATATACGGTAAAATTGAATAATAAATGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr2R 5941473 5' + copia 19 2 73.29 AAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - chr3R 16630353 5' + FB 67 1 63.89 CTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTA:2 - chr3R 12949112 5' + Juan 55 1 52.74 ATGTTAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGT:1 - chrX 12129442 5' - flea 4988 2 67.12 TTACAACTTTGCAGTCGTAAATCTTACTTTGTGTTCGTCATTGGGTTGTTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 + chr2L 4888675 5' - BS 5083 1 76.03 TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGG:2 + chr2L 23069854 5' + Stalker4 175 4 76.03 AATCTCTTGTTTTCCAACGAATCCTTTAATAAAAAAAATGTAGAATCGAGTTTGATATAAATTTGGTTCTTATCAAGATATTGTTAAGAATTGTCTTTAATACTTTATTTGTACATGCACAAAAGAACTAAAATATTAAAAAGAAA:2 - chr2L 16519167 5' + HB 1355 1 73.29 TACCAGACGGGCACGAGTGATGGCGTCTGCTGCCTCCTTTTGCGCCCCTACGCCCATGAAAAAAGCATCACCCCGGGGGGGTCCTCCCCCATTATTAGTTTATCCTATTATCCGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAAT:1 - chr3L 3656907 5' + Cr1a 4244 1 63.70 TCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr3R 25709772 5' - hopper 1351 1 61.64 GTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAAAGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3R 26178379 5' - 412 7511 2 51.75 ATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAAT:1 + chrX 5323219 5' + Juan 4094 1 52.74 AATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 4575721 5' + jockey 57 1 52.82 TAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAAT:1 + chr3L 22760389 5' + F-element 161 1 73.91 AAAAAACAATGACGAATGGCCTGCAAAAACGGGGTTTAATTACAAGAAAACAACACGGAGAACTCCTGTATGTACACAATATTGTTTTTGTATGGCATAACAGTAGACCATACGTAGTAAATCATTTTTATTTTGTTTATTGTTAT:1 + chr2R 8546539 5' - Porto1 188 1 51.37 AGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1 + chrX 2214261 5' + jockey 4830 1 65.07 ATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGATGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGGT:1 - chr2R 13168706 5' + P-element 63 1 25.00 TAATGTCGGGTTTTTGGGTATAGACGATATAGTTTGTATTGCCATCGCTGTACTTCTCTGGGACTCTTTGATTTTTTGATTTCGGTTCTGTGCATTTAGCAGGTCGCTCATTAAAGGGCTCCCTATCCAATGTTTAATATATTGAC:1 + chrX 14184392 5' - invader2 4696 1 47.95 CTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 - chr2L 17180147 5' + Juan 60 1 55.48 TGGGTGTACAATTTTCTTATCTAGGCTAGGTAGATTTCAAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGGATTCCTCTTT:1 + chrX 9159078 5' - invader3 180 2 64.35 AGATAACAACGTTCTTCTTCTTCCCATGGCCTAAATTAAATTCAAAACTGCATTTGGGGGCGCTAATCTGATGACGCGCAGTGTATATACTGCACAATCGATGCTGAATGGGGCAGAAAATATACAGTTTGTCAAGAAATTGGTTG:1 - chr2L 21396871 5' - S2 1714 2 50.00 ACAGTCTGGAGGATGTTTTATAAGTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 - chr2R 18530002 5' - jockey 4968 1 69.18 AACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 1135403 5' - P-element 2832 1 47.95 AGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2L 14074554 5' + 297 6636 2 58.90 GTTATATAATGTCAATGGTCAACATGGGATGCTACAGCGGTGTCTCGGGTATAGCAGTGCGAGGGAAACTTAGTAATACAAATGTATCTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAAT:1 - chr2R 25185372 5' + HB 97 1 60.96 AAACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTA:1 + chr2L 11839661 5' + mdg1 80 2 72.60 CTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 9871023 5' - roo 356 2 56.16 AGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 21224528 5' + roo 8715 2 54.11 ACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr2R 21160760 5' + Transpac 4959 2 53.66 AAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:1 + chr2L 4713872 5' - transib2 2750 1 68.49 TAGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTAC:1 + chr2R 5106237 5' + Stalker2 7282 2 60.96 TCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTT:1 + chr3R 17673761 5' + FB 77 1 71.23 GTTGTGGGTCTCTTCAATACCGATCTATAATTAGTCTGGCTTTTATTTGGATGTATCTACAAATCCATACCAAAATGTAGTGAATGGGCTTGTGACGGCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTAGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATC:1 - chr3L 18832777 5' - 1360 3286 1 65.07 CAATCACCTCGCGGTGGAAGGCCGATATCAGGGACGTGGGATTCAGCAACAGCGGTCCGTCCGGCAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAA:1 + chr2R 8139223 5' - S-element 76 1 54.03 CTAAGTTTCCTCAGCCCGCGCGCCAAATCATTGAAGCCAGAAAATGGCTTAAATTGTTGCCTGCACTTTGCATCTGGGCGACTGCCAAATGGCACACATAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGA:1 - chr2R 16904441 5' - jockey 4858 1 67.12 TATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:2 + chr3R 11191390 5' - roo 9013 2 60.96 GCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3L 3983835 5' + P-element 97 1 20.55 AAACACACTCACACACACATATATTCTGCCTGCGACGCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCGAGGAACTGCAG:1 + chr3R 5993681 5' + jockey 4688 1 63.08 TATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:2 - chr3R 15791019 5' - roo 9023 2 53.42 TATTATTAAAAACAAAAGTTTAATTAAAACTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGGGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 71314 5' + 412 7071 2 73.29 TATATGTTTCATGATAAGCTCCCACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATATCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGG:1 + chr2L 21689243 5' - INE-1 121 1 71.60 ATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 - chr3R 31886950 5' - hopper 1364 1 50.68 AATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATGTCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 19450196 5' - roo 9011 2 57.97 TTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAAT:1 + chr3R 904929 5' + rover 38 2 58.90 AGGGAACTCAGACTCACAGCATTATTATGATTCCAGAAGATATAGGCTGGCGGCTCCGGGGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAA:1 + chr3R 15062334 5' - copia 4998 2 58.90 CAACAAGCCACTGAACTAAGGGGCATTCCGGATAGCGTTCATCTTTCATTGGCCTTAAGAACTTTGGCTTTTCATAATATTATTTGAAGTGTAGAAAGTTTGTTTTCCAATAATTTGCTTTGGCATAATAAAAAATTAAAAAAAAA:1 + chrX 18320271 5' + BS 5100 5 69.86 ATTGTTAGCTCCATGGCCATGATTGATTGGCTGGAAGGCTGGACGAAGTTGGTACTCCGGCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACCAATAAAATCC:1 + chr2L 14253371 5' + accord2 7332 1 57.53 TAATGGGCTTCTGCATGTACTATTTCTTCCTGACCTTTCACACGTCC:1 + chrX 7419863 5' - invader4 2734 1 68.09 AAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:2 + chr2R 8157173 5' - mdg1 360 2 60.96 GCCTTATCAACCATCGAGAATCGGTGTCAGCTAATCGAGCACGCTCCTGCCCTTCCGCTCTATTGGCTCC:1 + chrX 17587850 5' + F-element 379 1 60.00 AATCTGATCACAAAGAAGATTGATCTTTTTAATTTGTTATTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGATTAATTATATGTTATACTAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAA:1 + chr3L 25607896 5' - S-element 75 1 69.72 GCTGCATGTGCAGCTTTTCCTGCTCCTCCTTTGAGTGTGGACTTTATTTTCTCTTTTTTTTTAGCCTGATCTGGCTTTCAGCTTTATCTGTGGCATTAGCCTCCTTGCCACGGCACCAAGTTTTTTTATTTTTTTTATTT:1 + chrX 17539267 5' - HMS-Beagle2 489 1 75.71 AAGAAGCGCATTATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTC:1 + chr3L 23250405 5' - 1360 12 1 76.71 GACTTAATTTCTTAAATTTACATACTTGGGTGGACTGTGGCCATTCATTTTCCAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCCC:1 - chr3L 12279883 5' + Fw2 183 1 71.08 GTATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2R 15326865 5' - copia 5073 2 73.97 GGAAAACTTTTTATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGCGAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGC:1 + chr3R 19445959 5' - 1360 24 1 54.11 ATGCAGTTCACTGCCTTCACTGTGCTTCCTTCACCTTTTCAGCCACATACGAGTATGTATGTACATATGTGTGCATATGCATTTGTAAAGTGTTCGTCTATTGTGGAGTGAGAAATGATTTGTGCCAATTTGTGCCAAAAACTAAT:1 + chrX 710221 5' + transib3 429 1 66.44 ATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr2R 6861435 5' + opus 7164 4 62.99 TAATTCCTTCACTTGAAAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2R 16817993 5' + 412 7093 2 56.34 ATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAG:1 + chr3R 19450044 5' - roo 8604 1 77.69 AATCCTTTGCCCTTTTTTTGGCGTAGTTACACGTGAAAAAAAAACAAACCAGCGCGTTCGAATGCGTTTTTTTTTTGTATTTTACAATTCACGACGAAGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 - chrX 4909237 5' - jockey 4955 1 69.18 CGTAAACAAGATAAACAAGGTTGGCACGAGAACATAACGGTATTTGTCATACTTTTACATCTATACAGAAGCAAAAGTGGAAAAATAACTGTTAATGGGATAAAAATAGAAGCATTGAACTGATCCTTGTCTGTTGTCAAAAGTAT:1 + chr2R 4803579 5' - Bari2 981 2 79.45 AAAGAAAGTACTAGTAAGTCCGTATTCCTTACAAAACAAATTTTAAAGGGGGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCG:1 + chr2R 4134153 5' - FB 621 3 72.13 ATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGAC:1 + chr3L 25008300 5' + 297 357 2 77.52 GGTAAATAATAATAACAATATAGTCAGTAATTAAATGACACTGGCACGTGGCGCGACGTAGCCAACAACAAAGTTCACAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTG:1 + chrX 4215549 5' + I-element 4990 1 60.00 AAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCAAAATTGCTCTC:1 + chr3R 7420219 5' - 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Quasimodo 38 4 72.60 TTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:2 + chr3L 5532908 5' - roo 9031 1 55.48 AATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 - chr2R 13259408 5' + mdg1 7074 2 58.22 TAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAGGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTT:1 - chr3R 17996263 5' - diver 6048 2 60.96 ATTCGGAGTCGCAAAATGTGGATGTGGCATCGCAGGCCCAAACGCAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTC:1 - chrX 12954499 5' - F-element 234 1 54.95 GTATACNAAATATCATAATAGTTATTTATGTTAAAAAAAAAATTGTAAGAGCAACAAGAGTACTCTAAAAACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTC:1 - chr2L 172510 5' + F-element 189 1 59.84 TATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 - 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chr3R 7666749 5' - I-element 5319 1 61.64 TGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrX 20888394 5' + 297 39 2 57.04 GGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGC:2 - chr2L 17766155 5' + Doc 246 1 75.34 AGTTTGATGAAGTTTTCGCCTCGATTCTTGTCTATTTGCTGACCCGTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCACATGCCAGCCAAAAGTGCCACGTACCTTTTTTTTTTTGTTAACGAAATTATTTTTTTTATTTGACTA:1 + chrX 5519302 5' - jockey2 3377 1 72.66 ACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAA:1 - chr2L 16946122 5' - hopper 1346 1 62.76 AAATGAAATTAGTCTGATGCTTCGGTTCGTTTTTTCTTTTTTTTTTTATTTTTTACTTTATTTTGCATTGGCTGCTTGCTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTGG:1 - chr3R 13567650 5' - gypsy7 5006 2 72.55 GCTGATGATTGGTTGCCCAGATGGATGACTTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGTTGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGGTCTGCAG:1 - chr3R 22438100 5' - gypsy4 6356 1 34.45 CAGCACTTGCCGCCCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 18239465 5' + jockey 12 1 77.34 CTAAAGGAAGGATTTTATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTA:1 - chr3L 14720959 5' + F-element 23 1 74.31 AGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCT:1 + chr2L 11257008 5' - rover 7257 2 53.91 TATATACATATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTTCCAACATACATAAATTTTGTATCCACACTTGTACAATTTTTGTTTAACCAAATATAAGTTACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 - chrX 23431789 5' - hopper 1394 1 65.75 GTCAGAAATCATTAGAAGACTTTTATTTACAGATTGGTCAAGCATCAGGGCGTTTAGAGAACTACAAAATATTCTGGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATG:1 + chr2L 5963077 5' - roo 125 2 53.42 GAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAAAGCAATTTTTTTATAAA:1 - chr2R 5674721 5' - S-element 1631 2 71.92 GATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGA:2 + chr3R 4682874 5' + Burdock 49 2 53.42 GTAAGTTCTAACTAAAATTACAAATTACAATTGGTATTGGGTCTTAAGAATTCCATAGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACACGAAATTTCATTATTTTGCTGGGATATCGATAGAG:1 + chr4 515632 5' - INE-1 500 1 66.44 AAATCGAAGTTTAAAAGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGAAATAACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACAAAACGAAAA:1 - chr2L 8232631 5' + Porto1 188 1 61.11 CCGAGGCGACAGGAAGTTTTACTATTTTTGGCCCCTTTTATTCCTGCCTGGGTGTGGGTGTGTTGGTAATGTTTTGTGTGTGTGGTTTTGCGTATCTAATTGTTGTGTGTGTGTTTATGTAAGTTATTGCCATATAAGTTATTGTC:1 - chrX 18235174 5' + HMS-Beagle2 4 2 50.00 AACTTGTTGGTTTCCCTCATATTAACAATAGTCTCAAGCTTAAGATGAACCTAATTATCACTATAACTAAATACTTTACTTTACTTTATCTTATGGAAAAGGAGAAAAGAGTTTTGGTGAGTAATTTTAAGGTATAGTTGAGCG:1 + chrX 11377671 5' - TART-A 13055 1 50.69 TTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:2 + chr3R 14980338 5' - roo 317 2 77.40 AGTAACCAGAAGGGATGCACTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCTATTTTTTG:1 - chrX 10639182 5' + FB 52 1 51.37 AAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:2 + chr2L 18347273 5' + transib2 49 1 52.74 GCGCCATCCTGGCTGTCCTTAAACTCGCTGGGAAAATCGCTGATGCTGTCACTGCAGGGGAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGC:1 + chr3R 24510931 5' - jockey 4706 1 58.90 GCGCATATGGGTATGGTTGCGGCCTGGAAAACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACGGCGTTG:1 + chr2L 14662926 5' + accord 200 2 62.22 GATGTCTAAAAGTATGCCACAATAAATTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chrX 12083217 5' - pogo 2078 1 41.10 ATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 + chr2L 22674746 5' + mdg1 26 2 68.97 AAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTG:1 + chr3R 18346608 5' - INE-1 541 1 48.97 ATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATTATATAAACCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGA:1 + chr3R 19450016 5' - roo 8668 2 64.21 ACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 2544610 5' + Tirant 8114 2 72.92 TTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTAC:1 - chr3R 9298535 5' - hopper2 1517 1 78.77 TAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chrX 12129438 5' - flea 226 2 64.83 AATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:2 + chr2L 18226791 5' - roo 8993 2 73.29 TCTTCGATTTCAATCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 + chr2L 12822816 5' + P-element 98 1 17.93 AGAATGCAACAGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCT:1 - chr3R 3396659 5' - invader2 5064 2 63.70 TTTAATTTTATAACATACGGTGGGTGCAAAGACCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAAGGCC:1 + chr2R 6287680 5' - roo 8975 2 77.46 CTAGGAGAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr3R 3850969 5' + transib2 16 1 74.66 ATTATGTTTGCTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAAAGAATTAATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3R 4461167 5' - blood 360 2 72.66 TTAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr2R 6622641 5' + S-element 77 1 72.60 CCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19450098 5' + roo 17 2 70.50 TATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:3 - chr3R 18093370 5' + I-element 67 1 61.64 GAGTACCGTTGTTCCGAGCCCTATGATTCTGAATTTAAAATAACCTCAATGGGGTGAGTGTTTGTGGTTTTTTGTTTTTTACTTTATCATTTGATGATTTCTACGTTTT:1 - chr3L 15598137 5' - hobo 2520 1 79.82 AGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGAT:2 - chr2L 12984240 5' + hopper 41 1 56.85 CGAAACTATTGGCTCCTCAAATGAATTTTTTACGCCTCTTAATACTCCTAATACCTTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCT:1 - chr2R 22080238 5' - I-element 192 1 61.64 AAGACAGGGAAGCAACATGACCCTGTTGGAGTATTATGATGAGGTCGAGAAAAAACTCACCTTTTTTTTTTTCCATGTTTTGCTTATTTATTTAATCTTCCCTTTTACTT:1 + chr2L 13722255 5' - Doc3-element 4697 1 65.45 AATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 5582214 5' + pogo 39 1 56.06 CCTATAAAAATGTAATGTAAAAAAGAACTCCATTCACACCAATAAGAGCAACTGGCACTAACACAGGCGAAACTTTAGTCAGACGCACTTTAATTAAAAACAAGAGTGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chrX 9299923 5' - INE-1 556 1 65.28 TAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAA:2 + chr3R 3922967 5' + Cr1a 101 1 79.45 AAGGACGATGGAAAACAGCTGTCTGGGTCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 19924084 5' - roo 391 2 65.07 AAAGATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 12986500 5' - roo 9042 1 63.70 AAAAACTCAACGGGATACAACAACACACCTAATCCGAGTGCCAGGCGGAGATGTAACATTAATTGAAAACTCTGATTGAATTGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTC:1 + chr3R 5928897 5' - Stalker4 485 1 60.80 GGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3L 24131489 5' - Transpac 5160 2 65.07 AGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - 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chr3R 31886935 5' - hopper 1358 1 56.93 TTATGATTATTACATATTGTATTATGTATAAAAGATCATTTACCTTCCTTAGCTATAGTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTGTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr3L 23650283 5' + 1360 58 1 75.52 TATTTCTCTGCTGGCTGCATTGTTTTTGTTTTATGTGCTCAGTTGCAGTTCTTGCTCACTTGCCCCTTTTTCCCTCTCCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTC:1 + chrX 8003861 5' + blood 7180 2 75.22 AACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 20898649 5' - roo 9034 1 60.27 GCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACCATCGCCGTTACATTGATATTT:1 - chr3L 18125976 5' + Ivk 91 1 67.81 GATTCATTGCGAAGGAGTCTCAATTTCGGTACTACAATATCGGTTGCTTCAGTAAAAATATATAACTATATGTATATACAAAGTTTGTGGACTGCATGTGTCCTTTAAAATAATGAAATTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 7956961 5' - gypsy7 5017 5 67.88 AAAAAAAACAAAAGAATATGAAAAGTGTGGATCTACCCTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAACCCATGGTCGGCAAGCCGACTCAGCATTTATGCAACATAGCTTGGTACCCCGGAGCAGAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCGCGT:1 + chr2R 17247274 5' - gtwin 6986 2 75.34 GAGGACCAGAGGTCCCGAGGCTTGCGTTTTTGCGTTTTTGCGGTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGAGCGCGAGTGTCGCTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGAT:1 + chr3L 3245522 5' - F-element 148 1 77.40 AAAAAAAAACAATCAGTAACAAAAGCAACTGGAATTTGTCGACAAAGTATGTAACAGTCTGAAGGGAGCGTTTACGACTATATATAAAGTATATATATATATATATGTATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTA:1 - chr3R 17899328 5' + INE-1 98 1 70.55 AAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 14304034 5' + roo 43 2 54.79 GCAGCATTTTGCGGCATAATTTATTTTTTAACTAAGTTTAAACGGCTTTTCAGTTGATTAAAAAACTTTGGCCTTTGGCAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCT:1 + chr3R 25751241 5' - jockey 4797 1 58.90 TTTTCTTTGTTGCCGATGGCCAAGGTGGAAAAGAGGGCTGTTACCTATTTTTTTTGTATAAATACTCACTAATTTAATAATGAATTTTTACACGTATACTTACAGAAAGTAGGTAAAATATTAATGTATTTATTTAAATATTATAT:1 - chr2L 14245057 5' - transib1 1935 1 44.52 AATGTCCCTATGTGTGTGTTTGTATACGAATACAATACAAAAGCCTATTGATCTGTAAGAGCAAAGAATATGACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAA:1 + chrX 22906739 5' - transib3 2836 1 54.35 TGATTGATGGCAGTTGATCTCAGCTGGTTTTGATCAAACTTTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTT:1 - chr3L 10374489 5' - 297 398 1 71.72 ATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGCCTAGAGTCAAAAGA:1 + chr2R 17796589 5' + jockey 4726 1 78.79 GTGGCATCCTATCCAAACTTTAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGGGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTTTTATAGTTCGTAAGATCTC:1 + chrX 19330535 5' - INE-1 148 1 54.86 GGAATAGTGTGCAAGTTTTGGTAAGAATCGGTCGGGTCATTGGTGCTCCTAGCTTGTACGTTGATTTTTTTTTGGTACGGTTGGACCTAATATGGCTTTTATTAAAAGAGCCTTAGTTGCCATATGGAGTTTGCTTGAGTGGAAAA:1 - chr3R 17933385 5' - G5A 2360 1 77.40 TATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTTTTTTAATATCTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAATTTTTTTATCTTTGCTGTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 - chr3R 545849 5' - TAHRE 10433 1 57.78 TTCCTCACGTTCCGATCGTATGTTCGTATACATATAGATATTTAAACGTATACGTGATATCCAAAGACATATCAGAGTTACATCTCACAGCAAAGGCTCTGTTGTAGAGATACGACTTCAAGAGTTTATGGGTGTTTTGGGGGAG:1 + chr2L 19472984 5' - Fw3 2770 1 55.17 ATTTATTTAATTGGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr3R 4104333 5' - HeT-A 6056 2 76.92 AGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chrX 9530415 5' + 297 61 2 64.38 TAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGATTAAAAGTAGCCGAAATTTATATATGTAAGATTTATTTTTATTATTTTTTATTATTAATTT:1 - chrX 12129438 5' - flea 4998 2 66.67 AAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 24219346 5' - roo 8987 2 74.66 GCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr3L 14720924 5' + F-element 59 1 49.66 CTTGAGATGAACATTGACTTAAGTTTTTGGAAACCATACTTGATGTGTGGATGTTCTAGTCTAAAATCTATAAGCAACGCAATAGCTTTGCTATGAGCTGCTTTAGTAGTTTTTTAATTTGTATAAAAAAACTAAT:1 - chr3L 10600589 5' + Transib5 297 1 47.79 CGTAAAGAAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:2 - chrX 8092537 5' + pogo 12 1 76.03 GGTTATACATATTGCGTACTTTTACGCCTGTCGACAGGCAACCATATTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCAATTCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCT:1 - chr2L 8403964 5' - Bica 438 1 63.31 AGCGGACAGGATCAAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3L 5881556 5' + pogo 42 1 54.11 AGAAAAGCTTAGAGTCGACATTGCATATCTACATAACATCGATTATAAAGCGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 11326653 5' - pogo 2095 1 66.67 ATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGAATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3R 29084854 5' - 412 464 2 60.96 CTTCATTAGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3L 5881702 5' - pogo 2063 1 59.59 AGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3R 22642263 5' + blood 42 2 55.48 CTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr2R 6965598 5' + Transpac 49 2 52.05 GTGTATCATTCTTTTTCTGTTAAGACCAAAATATGTTGAAGTGAGTTTTTTTTTTAGCTAGAGAAGTCGCAGAAAGTCAGTCGACGGAGGAATAATGAATACATACATATTCACTGTTAGCTGATTTA:1 - chrX 9551264 5' + ZAM 8245 2 75.78 ATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACG:1 - chr3R 9238191 5' - P-element 73 1 23.81 CACCTCGTCCCGCTCGCCGTTGTCGTCAGTCATTTAGTCGGCGTGGCGTGCCTTAGTGAGTGTAAATCTGTCGACAATGCGCAGATACACCTCTTATTTGTAGGTGTGCATATATCTGATGGCTCTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTT:1 + chr3L 8460589 5' - Doc2-element 255 3 77.40 AAGTTAATTTCTTAATCACTCAATCAATGGAAACTGTGGCAAAACACTTTCCCAAAGTCGTTCATCCGCTGTAAAAAATGTTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCT:1 - chrX 5597950 5' - invader2 5102 2 62.33 ACGCATCTGCTGCCGTCTCGCTCACACCCACACAATCCAACGCCCACCCACGGCAACCCACACACAGAGTTGTCACCTACACAAAAATCAATAATTTTATTTATAAAATGTAAACACAACATACAATGTGATAATGTTACCAGTCC:1 - chrX 10822244 5' + TAHRE 10214 2 63.01 TACACCCTGATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr3R 4682866 5' + Burdock 6177 2 56.16 TCAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2L 3233981 5' + roo 8752 2 78.08 AGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chrX 10537812 5' + I-element 13 1 73.57 TTATTTGAATTGCAAGCGAAGTAAAAGAGTATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 - chrX 17717129 5' + FB 29 1 61.38 ATAATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 + chr2R 20010153 5' - Juan 4196 1 70.55 AGCCACAGCCTCAAGTGTTAAGCACTTGAAACCCCTCGGATTGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGCACAATTA:1 + chr3L 6518508 5' + 412 14 2 76.71 GTGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGGTTATGTAAGACTTTTCAG:1 - chr3R 6419923 5' + Tabor 6920 2 69.18 TGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGGTTGAATCGGTTT:1 + chr3R 28042937 5' - Stalker2 348 2 54.29 ATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGATATG:1 + chr3R 28146130 5' - roo 9001 2 71.11 AGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACT:1 + chr3R 26504241 5' + HMS-Beagle 6872 2 77.61 TATCATCCTGCCATACACGATGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGGGGAATCGTGTTTGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCGTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGCCC:1 + chr2L 3678225 5' - gypsy12 9876 3 79.17 GTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAAATAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCG:1 - chrX 21852448 5' + gtwin 6994 2 70.55 ATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3R 15790980 5' - roo 320 2 80.14 TTATTTTAAACATTTTGTTTTTTGCTGTGAGTAGG:1 - chr3R 19450007 5' + copia 139 2 60.00 CTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr2R 8735587 5' - mdg1 7384 2 72.60 AAAACATCTCATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGCGTTCACACATGAAAACTAATATATTTATAGACTTACAATTTTGGGCTCAGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 2145873 5' + roo 42 2 49.31 CTTAGCTGGCGGGAATTCGCGGGATAATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGG:1 - chr3R 8074672 5' + 412 7363 2 73.26 AACTGGGGCCATTCGTGGGCTCCAACAGCGTCAGACTGTCTGGTATGCCACTTTGCCAGTGCACTGTGGTCCCGAATTCGTTTT:1 - chr3L 16211607 5' + transib2 2 2 75.00 GTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAAA:1 + chr3R 9557550 5' + G2 3063 1 76.03 AGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 12818203 5' - hobo 2909 1 64.38 TTACGAACGCATCCCCCAGGGTGGTAGTTTCCATTTCAACAACCCTCACTTTCGACTCGCCATCTTTGGGGTTCTGATTTGGATGCTGGGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCT:1 - chr3R 19018759 5' - Idefix 461 2 60.27 GAACGCNATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3R 15882575 5' + jockey 60 1 51.72 CAAATACATAATTTTTAATATATCCACCGAATTAATTGTTTAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAA:1 - chr3R 19408024 5' - diver 6075 2 56.85 ATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAT:1 - chr2R 13259402 5' + mdg1 7080 2 54.11 CAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATC:1 + chr2L 14026137 5' + F-element 448 1 54.39 TCATAAACAATTTATTGTTTTCTTCAAGTTCCGATAACTGACTTTGCATATTATCTAAGACTAGACTACATTAAGCTAAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTCAAAAAACCCTTGAATGTTCTGCCCAAATGGTATCCGA:1 - chr3R 19448494 5' + HB 451 1 52.74 TGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 - chr3L 23287314 5' - 1360 3322 1 63.01 ATCAGATTGCATTCGGATCTACTTGACGCCATTTTCGAGTGTCCCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chrX 11209931 5' - hobo 2929 1 62.50 TATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr2R 8735542 5' - mdg1 7429 2 64.38 AAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 - chr2R 10161865 5' - transib2 2743 1 73.97 AATGCAATTGAAGTCACTATCGCACTTGTGGGTCTTTCTGAGGGTAACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGGGGCTCCAGGCTC:1 + chr3R 2916135 5' + 1360 69 1 77.86 GTATATTTTTATTGATTAAATGCACATCTTAATCGTTCTAAAACTTGTTTAAATCTCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCA:1 - chr2L 19414852 5' + jockey 4948 1 65.75 AAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1 - chrX 10319697 5' - mdg1 7391 2 65.03 ATGTGTAATAATTTGTAGCCTTTCCACATATGTAGCTCTTTATAGTCGAAACATAGGGACTACTAAGGATTAATGTCCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGAGCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAA:1 + chr2L 5738641 5' + I-element 4950 1 54.11 CATGACCCACAACCTAGTAATACCAAAAACCCGTATTTTAATAGGCAGCATAAGTCTCCTACGTCTCACCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCTTCTT:1 - chr3L 25783700 5' + F-element 326 1 54.69 CGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 + chr2R 12472004 5' - 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F-element 417 1 50.77 ATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATA:2 + chr3R 29690690 5' + I-element 5246 1 52.05 TATCGAGTCTACAAGATCCCAGTAAAACTGCTGCATATATAGATTTAAAAAGAAATTAACAAATTCACTTTAAAAGAAAAAATGTGGCATATCAAGAGAAAAACTTTTTTTTTTATTAACGAAATTATTTTATTTAATTGACTAGC:1 - chrX 4141332 5' - jockey2 3375 1 75.34 ATGCTAGATTTCTTTTTAAACTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGG:1 + chr3R 19558307 5' + hopper 93 1 81.58 AATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCCAAAAAAGAAGACTTTTCTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATTCGGATTA:1 + chr3R 19449989 5' - roo 9014 2 74.00 GGCTGACAATCAACAAAAACAATAAAAGCAAAGCCTACACACAGGCGTATGCGTCTAGCCAACAGCTGTTTTTCGTGCGCGCTCCGTATTCAGCATAATGACTTAAACATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAGCAGCA:1 - chr3R 5086869 5' + Porto1 4426 1 63.70 AAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:6 - 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chr2L 15771558 5' - Transib-N1_DM 11 1 76.56 ACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 18549844 5' + roo 78 2 74.66 AATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTT:1 + chr3R 4160058 5' - invader2 5053 2 53.42 GAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 - chr3R 11040162 5' + Bari1 58 1 56.16 AAAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3L 12004207 5' - P-element 2860 1 68.49 ATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAA:1 - chr3L 25508748 5' + 1360 329 1 65.93 ATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr3L 12004238 5' - P-element 2851 1 55.65 GGAGCGCCGGATGGGTCCGGAAATTGCAAATTATGTTCCGTGACAAAGTTCCATCAAGGAGAGCTGCCTGACGGAGCCAGCTTTCAGGCAAACTTATTAAAAAGTAAGCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAC:1 - chr2R 20979826 5' + Idefix 287 2 76.03 ATTGAAAAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr3L 12004202 5' - P-element 2865 1 71.92 AGAATAGACAGTATGCAGTTGGTAGTTAATAGTTGCGGTCCAGTTAGATGGGTCAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGCGATATGTGAGAACTCGAACTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGA:1 + chrX 16520877 5' - transib2 497 1 57.53 AAATCTGTATTTCTACAACTTAAAAACAAATACAACTTAAAAAAAAAACACTATGAGCCAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCA:1 - chrX 11944251 5' + Doc2-element 320 1 66.07 ATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATT:1 - chr3L 13581734 5' + jockey 4825 1 61.64 ATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - 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chrX 12986629 5' + roo 8728 2 63.01 GTAGCAGCCAAGAGCCTTTTACTAATCCCCATTTCGAAAATCCTCTAACACACGTTCCAAATTTTCTATCCGTTTTCCTTTTGAATACGTTAATTAGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTATCCAGCACAGCCTTACAC:1 + chr2R 8879360 5' - HB 1305 1 53.42 GTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 11257394 5' + 1360 2 2 65.15 CATCGAAAAGAAAACTTGATAAACACAAAAACAAGAGAGAATTCTAAAGTCGATTTCCCCGACCATCAGATACCCGTTCCTCAGCTAG:1 + chr2R 671371 5' - INE-1 543 1 64.77 TTTTCTCTCTGCAAGTTCCACCTTGTCTTCGACGAGCTTAAGTGGCTGTGCGTCTAACAATTGGTTGGGGACTTATTTCAATTAAGGCGCATTACGATCTTGGCTCTCTAGCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTA:1 - chr3R 30656867 5' + Cr1a 4264 1 73.29 GGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGTGCAGAGCAAAAAACAACACCAAAGAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATGCTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACA:1 + chr3L 21011225 5' - Cr1a 151 1 82.88 ATTTGTCAGTGCCTTGTCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGGTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 + chr3R 10270530 5' + Juan 4046 1 70.55 ACACCCTTGGCCATTCAAATTGTTCATACCTTGTTCACATTTTTAGCCTGGAGAACGACCTGGAGCTGTCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACATCAAGATCTGAGGTACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAT:1 + chr2L 2948043 5' + INE-1 170 1 50.68 ATCTATCGATTTTTAACGCGAGGCTGACGTTAATAGGGTCCCGGATTGGAACAGAGATGAGAGCTCAAGCTTACTGGAAAGAGGTAGATATGGAAATACTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTG:1 + chr3R 21462293 5' - diver 5813 1 67.38 GACAGTTCAGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2L 47229 5' - roo 9048 2 69.18 ATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:2 + chr2L 4003687 5' + mdg1 64 2 62.33 GTGTGTGTTATGGGTGTTGCAACTGCTAGCCGAGGCAATAGCCATAACATTCTGGAAGGCGTGGCAAGGGTGTGTGTCTAGATATATATATAAATATATATATATATGTATT:1 - chr3L 9523569 5' + G3 4512 1 50.89 CAATATAAAAATCACTTGTATACTTTTTTACGTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chrX 17716983 5' + FB 23 1 60.32 GTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTT:1 - chrX 1799235 5' - invader4 3035 2 52.74 GTTTAAGTTCAAGTTCAAATTGTTTTTACGTCAATATTTGCTGATTCTTTTAATTCTTTTGTTTTTTTTGCCCATTGCTTCGCTGTTACGACCAAAAATAACTGTACCGCCTGGCCAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACT:1 - chrX 8137612 5' + Burdock 6245 2 80.14 ACTTATTATATTTCCACATTTTAAGTCCCATGCTTTGATTGCGATTCAAGAAAGTTAATCGGGCCTATTACCCGGCTCCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCAG:1 + chr3R 16391575 5' + F-element 4491 1 69.91 AAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr2L 18347259 5' + transib2 35 1 60.27 GAATAATATGCCCACATCGATGTACTTGAATATTACATAAATATTATTTGCAAGCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAATC:1 + chrX 19259728 5' + INE-1 149 1 35.62 AGAGCAGGATCGATGGGGTGTAGTGCTATCCTTCGGCATTCATGAATGCGCCAAAAAATATGCTACCAATTTGTCGCCGTGTGCAGCAGTTTCATGAATCTTTCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATACGATTTCAAATCTTAT:1 - chr3L 6630583 5' - Doc3-element 4666 1 64.58 TATTCATGCCAAAGAAAGTGAATGTTGCACGTTGGAAAAAGACAAAAAAAGATGAATTGAATTGAATGTATATACATATATTACATAACTTGAGTTGATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 14319274 5' - roo 323 2 73.97 AACATACCGGCACAAAGCCCCAACATATTGCTGGTTGGATTTGACAGTCCTGCCTGTCAGTCAATATATTTGCAGCGTGCTTGTTGTGCAGCGTTTTCGACAACTCATTTTATTAGACCGCACGTACAGCTGAGGTGAAAATAATA:1 - chr2L 11729480 5' + Tc1 1 1 78.08 GCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTTTATTTACATTCTTG:1 + chr4 123986 5' + HB 165 1 71.92 ATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chrX 19054208 5' + jockey 29 1 69.18 CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTATAGGCATAAAGAAGCGTTGCCGCACGCTGTACACATGTAAATTTGTTTTTTGGATCAGAATTGTTTTAGGCCGCACACATATACACGATCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAA:1 - chr2L 22211544 5' + 1360 3252 1 71.23 AATTATTCCATTACGACAATCTGTTTCTGATTTTCTATGGCTAACTCGGCAGAGCACTCGACAAATGGGCAATCAAAACTTCATATTCACCTCCTTATTCTAGTATACTACTTTTAATTAATTTACCGCCCCTAGCTAAACGTAGA:1 + chrX 21051036 5' + Cr1a 4003 1 64.38 GGGAGAGAAAAAAAAACGAGTAAAAATGTCCGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3R 26774150 5' + hobo 18 1 72.14 AATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 + chr3L 10373790 5' - 297 363 2 65.07 GTTTTCCCTGCCTCGAAAAGAAAATGCAGTACATGCAAATCATTCATAATTGTATTTCAGCTGCTTGGCACATCAGTAATTAAGTCAATTTATCATTAACCTGGGGGACCATCCACCCACTCCCAAACACACACACACACACATAT:3 + chrX 12140537 5' + accord 183 2 75.34 CTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 + chr3L 15913818 5' + jockey 4790 1 63.01 CTAAAGGAAGGATTTTATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr3L 14720959 5' + F-element 14 1 79.26 ATAATCTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:3 - chr2R 15326980 5' + copia 30 2 51.37 ACATGTTCGTTATGTTAAAATACAGCTGCCGACTCTTGGATGGAACCGACATCTGAGTTGGATGTCGGAGCTACGGGCATGGGAAATGATTCCTCGCCCAACATGCTACGAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGC:1 - chr2R 17788406 5' + Stalker2 7606 2 75.34 TTTTCGTTTTGTGTGCGCCGTGTCGTGTTTCCATTTCAACCGCGAATTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2R 7850086 5' - roo 400 1 78.08 GCACCGTGATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACA:1 + chr3R 20675809 5' + jockey 4902 1 58.22 ATTTTAAGGTATTGTATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 14366662 5' + roo 8694 2 67.81 GGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAA:1 + chr2L 15550674 5' + Bari1 75 1 66.44 ACCGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chr2L 16943878 5' - copia 209 2 70.55 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTT:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 392 2 66.42 ATAATTACATACACCAATAGGTAAATGTACAAAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 14304003 5' + roo 12 2 67.81 TTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAA:1 + chr2L 11256994 5' - rover 302 2 54.11 GACAATTACAGTGAAAACTTTCCAAAACAGATACAATATCAACAAACAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGCA:1 - chr2L 2791706 5' + Porto1 387 1 71.23 TAGGGCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 + chr2R 16510077 5' + F-element 50 1 47.95 TTGTGCACTGCAAAGTTTGCTTTGACACTTTGACATTGACAATGATGTATGTGCTCGCTTTGTTTGGGTGTGTGAGTGTTGTCATGGAAAACAGTAGCACAGGTATGTAGATTTGTAGTTCACTAACATTTTGGTGTATGTTATAT:2 + chr2R 14642381 5' + transib1 311 1 54.79 TGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr2R 3563091 5' - Transpac 263 2 54.69 ATCCCCATATTTTCAAACTTCTCTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATT:1 - chrX 22596813 5' + INE-1 96 1 78.72 CAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 - chr2R 19941615 5' - hopper 1401 1 55.70 ATGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAATAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 17940076 5' + 1360 51 1 53.15 AACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 + chr2R 12472002 5' - transib2 2781 1 55.48 GGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chr2R 6847824 5' + Doc 86 1 73.97 GTTTTGTACGGCTTTTGTTCGGGGGCTTTTCCGGAATCGCCCGGATTGGCTGACGTTTGCTTTGTAGCACCGCAAACTGTGTCCAGCATTTTTGCGTGTTTATAAAAAATTGAAAATAAAAATCA:1 + chr2L 18908912 5' + P-element 2639 1 56.80 TCTGATCAATTTTTGGCCTCTTTTCAGCACTTTAATATTCTTTCCTCCCCTTCAGAAATTACAAGTTGATTTCTCAGACCTCCCTGAAACACAGTCCAAGAATCCGAGATATTTAGTTGTCTCA:1 - chr3R 4811177 5' + Ivk 326 1 59.68 TATACAGTTTCTCCGTAAACTTAGCCAAGGGCTTAGAACCTTTAACCAGAAACAGAAAAATCAAAGAAAAAGTGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTAGGATTTCGCGGCAGGTCCCCACACC:1 + chr3L 15478945 5' - G5 4401 1 56.69 ATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAA:1 - chrX 21994017 5' + McClintock 5989 2 59.59 ATCATAAATGTCAGATGGGATGGGGAAACTCCGGGGCTTCGCCAGATGAAACCTACACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCAT:1 + chr2L 9038033 5' + I-element 5043 1 62.33 CTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 47169 5' - roo 324 2 76.03 AAAAATGCGCTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chrX 22840592 5' - copia 5083 2 54.48 AAGTTATTGCCCTCTTCTACTCTCCTTTTTAGTGCTCATAAATACGAAAAACACTTGCAGTCAGAATAGTATATTAAAAAAAAAA:1 - chrX 11548104 5' + BS4 729 1 71.76 AAATGTGTAAGTGTGCAAGTGTAAGGTTTTCGGTAGCTTGTCGTGTCAAATAAAAGAAAAAGGTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGC:1 - chr3L 16431132 5' - Stalker4 301 4 56.85 ATTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 - chr2R 1916460 5' + Juan 51 1 49.32 GAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTG:1 - chr2L 21403568 5' + G5 4425 1 50.36 AAATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3L 16470386 5' + jockey 4709 1 59.15 TGTTGCTATATTACATAGTGGAGTGCCCTCCTTCGTTGCAGGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAA:1 + chr3L 16470878 5' + jockey 4890 1 71.92 AAAGACATACCTCCGCATACATAACTCATTCGCGAGTGAAGGCGATGACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAA:1 + chr2R 18200090 5' + I-element 5149 1 67.81 TAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAACAGAATAGTGAAAGTT:1 - chr3L 16033401 5' + Doc 72 1 68.50 AAACGAATGTTTCTCTTTGAAGGCCCTGCTTAATGACGTCACAAGCGTAGCAGAGTGCAACAGACAGACAACAATGACCGATGAGCATAAAAGTAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAG:1 + chr3R 20622562 5' - pogo 1932 1 66.90 AAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 - chr3R 15790073 5' + flea 4769 2 69.92 TAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:2 + chr2R 15326863 5' - copia 5075 2 72.60 AATAGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chr3L 47002 5' + FB 65 1 60.96 AAATGATGTTATAAAAGAAAAAGCAAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATACAATT:1 + chr3L 7889534 5' + roo 8670 2 73.04 AGTAACGCTGAAGACTGGACTAGCAAAAGTACAGACAGAAACTTTTCGATTAATTCATGTGATTGATCTAGAACAATACCAGAACACTCTTGAAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGGC:1 - chr3L 27716930 5' + 412 7499 2 69.93 CAATGAAATAGCAGTGCGATGGAAACTAAGAAATACAAAAGTATTTTTCCAAGTCCCTTTTCGAAATCGACGCTTTATTCCACATGTGTAGATAGGAAAAAATACTTTTTCGTCTTATCCTTTATTCTTTACATTCTTGAGCAAAT:1 - chr3L 17245744 5' + HB 172 1 45.89 ACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:2 - chrX 10167471 5' - roo 9012 2 57.53 AAGGGTATGATAAGGATTACATTATGAAGCATGTGGAAACTTTCAATTAACCCACCAAACCCAGACCGGCCACCCCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAAAGATGCGCTCATGTCT:1 - chr3L 9090444 5' + G2 66 1 67.12 ATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chrX 6475317 5' + Doc 75 1 68.89 TTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr2L 4123980 5' - transib2 2791 1 60.27 ATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chrX 9950606 5' + jockey 4737 1 62.76 CTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCT:2 - chr3R 24381378 5' - Juan 4136 1 69.86 TAGTGAGGTGGAGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGAGAATGCGCGTTTGAGGAATTGCTTTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 - chr3R 6625833 5' + flea 4755 1 78.76 AAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCA:1 + chrX 14771738 5' + BS 77 1 70.55 ATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 30347463 5' - P-element 2881 2 76.30 ACGATTTGCTGCATTATTAACCTTTTCCGGAGTAAATCGCTCGCTATTGCGCAAGGACAACGAAGTTGTGTGGCTAACCGTACATTTGCAGCGTAATCGTTTTATGTTAGTTGTTAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 6103088 5' + roo 8668 2 77.40 TATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAAATTCGGGGGCTCCTT:1 - chr3R 27083140 5' + jockey 4550 1 61.67 ATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTC:1 + chr3R 9557499 5' + G2 2995 1 66.67 ATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:2 + chrX 19038358 5' - hopper 1364 1 54.11 TATGGTTACCAGGCCATTAAGCGTCTCCGAGGATGTGGCGCCTCCTGTTGATCCTGTGGCCGTAATGGGAAATGGCCGGAT:1 + chr3R 12144488 5' + accord2 261 1 75.31 ACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:1 - chr3R 15364021 5' - flea 4957 2 58.22 CTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 - chr3L 14720928 5' + F-element 56 1 52.05 TGGTCATATGCATTGTAGAGCTGGAACTCGTTCCGTCACACGAGGATTTCCCGCTGACTATGAAGCACAAACTCCCACGCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAACAACCACGGCACCCTAGACACCCACA:1 - chr2L 4189791 5' - R1A1-element 5268 1 54.79 ACACATCCAGCTGTCAATCAAACCCAACTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTTCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTT:1 + chr3L 3982824 5' - P-element 122 1 28.33 CTAAAATCTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCA:1 + chrX 15903122 5' + INE-1 81 1 73.29 AAAAACACAAAAAAATTAAATTATTTTTCCTTCTAAGAAAGTTAAACATAAATCCAAAAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATT:1 - chrX 6346877 5' - Stalker4 6903 2 52.85 AAACCCATTTAAAAATTACTTTTTAGACAAATGAAAAATATAATTTACAACAAACTTGCGCTGCGTCTATGTATTCAGAATGAATGCTTGTTTCAATCCTCATAGGTTGAGGCGGACATGGCCAGTTCGACTCGGCTATTGATTCT:1 - chr4 395038 5' - INE-1 96 1 67.81 CTTTAAGTATATGCAAACTCATTAGTTAAGTACTCACACCAAATTCACATCCGTAACGGGATTGGCAATAGGGTAATCCCGAAATTGGCCTAAATTGATTAGGATTAAAAATTTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAA:1 - chrX 11956020 5' + jockey 4911 1 66.44 TAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:2 - chr2R 18514978 5' + P-element 57 1 44.52 GCAGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGGGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3R 22642237 5' + blood 7025 2 74.31 TCACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 24369113 5' + roo 75 2 69.18 GATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr3R 23639141 5' + pogo 61 1 59.59 CTGTCCTGTTCTGTTCTGTTATGTTGTTGTTGTTTTTTTTCGAGGGGAGTATGCTTTTAATTGTGGGCGTGTCGGGACTTAATGAGATCGCTTGAAAACATAAAGCAATTTCAATGCTCGGAATTTTTAAAAAGGACTTGTTGCGT:1 - chr2L 20722050 5' - Q-element 430 2 66.44 CTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 - chr3L 9907371 5' + BS 5043 1 51.03 TTACGAAGTTAGCTTTATGCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 23639278 5' - pogo 2076 1 63.19 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCTCCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCA:1 + chr3R 19450188 5' + roo 9039 1 56.85 AACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAA:1 + chr3R 9557535 5' + G2 3037 2 62.96 AGCAGGAAAAGGTGTAGCATCGTTGTTTCAGTAAGTAGTTAATATGAATCAAATAAAAATAATACGACTTAGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATACAATACCAACTTGTCCGTTTTGTCAAG:1 - chr2R 8414101 5' + I-element 5004 1 65.07 AAACAATGCGATTGCATTTATTATAACATTCATGGGAACTCAAATTTTTCACTAAAATAAGGGCTAATAACAATATTGATATATGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGGC:1 + chr3R 16156374 5' + pogo 494 1 72.31 AAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATGTATATAGATAGTGACGTATTTGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTA:1 - chrX 22905334 5' - Idefix 205 2 74.31 TAGATATAAACCTCTTTCTCCATGGAGCTGCATTAAAAAATGTATTTGCCATGGTCGGATCCAGAGTTCCTAGGGTATCGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACC:1 + chrX 693247 5' + mdg3 5096 1 57.53 GTCTCCATGATCCGATATCCCAGAAGATAGTACATGTACATGACCTGCGACCAGCGCTTCTTGTGCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGC:1 - chr3L 21967420 5' - opus 7078 4 58.12 CGAATTTTAAAAAATTTTTTTTATTTGATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCT:1 - chrX 12441594 5' + 1360 3257 1 68.28 ATTAACAAATTCAAAAGCAAAACGGACGATAGCATTATAGATTGGGATAACTTTAAATACACAAGAATGCTCGTTCTAAAAAGTAGAGTACATTCTTTGATTCTAGAAACAGATGTACACTACTTTTCATATTATTATATATACTT:2 - chr2L 5460090 5' - Dm88 26 2 41.78 GAAGCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 - chr2R 23780664 5' + Ivk 8 1 78.47 AATTTCTTAAAAAATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAGCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr2L 5582226 5' + pogo 41 1 57.53 TAAACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTA:1 - chr4 829134 5' - INE-1 155 1 71.92 CTGGGGGCGGTTGTGACTATGCTGCCATTTGGCTCAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTAATCGCTCTCGATTCATTTAC:1 + chr2L 15737908 5' - roo 8728 2 74.66 ATTAAAATGAGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACC:1 - chr2R 2318287 5' + ZAM 10 2 78.32 AGGGCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 + chr2R 16510078 5' + F-element 38 1 51.88 CGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chrX 10537831 5' + I-element 38 1 57.53 AATATATATCACTGCCGAATATATGTAGAAAAAGGCTTTTACATTTTTCTATAGAAGAATTCATGTTACCAAACAAGACTTAATTTCTCTCTCACGAAATCAATATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCT:1 + chr3R 31072483 5' + diver2 4681 2 69.18 AATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 - chr3L 18505738 5' + I-element 65 1 63.01 GCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGACTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 + chr2R 8099134 5' + jockey 4815 1 54.11 TTTTTAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTTTTCCCAATTTCTATCCAGAAAATATCAAAAAAATGATTAATTTTCGCGCTCGCATTCGCACTAGCTGAGGTACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACT:1 + chrX 21452468 5' + INE-1 557 1 64.34 ACATTACAGTAGAACAATTTTAGAAGAACAATACATATCTAAATAAGCCATATATGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGT:1 - chr3L 23909115 5' - I-element 4952 1 64.38 TTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATTTC:1 - chr2R 4886043 5' - INE-1 574 1 52.05 AATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:2 - chr3L 19455024 5' - mdg1 7396 2 58.90 AAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTC:1 - chr3L 14497703 5' - 412 7225 2 80.62 GCATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 15376203 5' - 1360 3377 1 69.91 AAATCGATTGCTTTTGGCCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:2 + chr3R 8051079 5' + jockey 4777 1 73.29 TCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:2 - chrX 12986643 5' + roo 8714 2 53.42 TTGTGTTGGAGTGAATTAAAGTCATTAACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGG:1 + chr3L 16973307 5' + S-element 1525 1 77.40 GGATATAAATGTGCACAGGGAGAAATATCTCCAAAAAGGATAATAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAATTTTTTTCGTGATATAATGATTCGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAA:2 - chr3L 963191 5' - 1360 305 1 69.18 TGGCAGAAGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 + chrX 22840478 5' + copia 4933 2 62.76 ACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 - chr2L 15940312 5' - pogo 2048 1 58.39 TAATAACATAATCTTAGTGTAGCTTATCTTAATCAATAAATAATTTAATACCTAGCGGGTAACGAAGTTTTTTTTAATTCATTTGGCATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAGTCCCTAATATCTTTTAAGCTACACATTAG:1 + chr2R 17544993 5' + G5A 2775 1 58.22 CTCTGCAAACCCCCGGCTCGACTTGGTCCATCAAGTGCTTAACCCATTCACTAACACAATCTAAGTAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTC:1 - chr3R 12789336 5' + Doc 343 1 67.62 GGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTGACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTTATT:1 + chr3R 27405998 5' + diver 94 2 76.71 ATTACCAACAAATGCGTTGCCTAGAGCATTGTTGTAACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 + chr3R 28471852 5' - 412 494 1 64.42 ATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAG:1 - chrX 12129404 5' - flea 4950 1 61.64 TTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr2R 9544933 5' + roo 64 2 63.01 GTTCGTCGTAAGCGACACATAAACCATAATTAAAAGCGCAAAACAGTTGGCCCCAAATCGAAGCCACCGAAAAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGGTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 9595147 5' + Tirant 12 2 77.54 TATAATATTCCCAAACATTTTTTTAAGAACATTACTATCTCACGCATAAAGTTTTTTTTATTTTTTTAAGTATT:1 + chr2L 15368671 5' - TART-B 10630 1 72.97 GAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 22287397 5' + jockey 36 1 59.12 TTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:2 - chr2L 7581039 5' - Transpac 274 2 57.53 GTTGAGAGATGTTAACAACCAACCTCGCTAGAATTGTCATCGGAGGAATATATTGTTTTAACCATCTCGGGATTTTTTTTACTTGTCCCATGATTATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGG:1 + chr2R 4235972 5' + Stalker 6828 2 68.49 ATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAA:1 + chr3R 907903 5' + gypsy11 366 2 29.45 CGGTATGGAGCAAAAATATAAACATCAATCAGCTCTCGTCTTCTATCTGTTATTCCATTTGCCTGGTTTTTTTTTTGGGTTTTTTCTGTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTTGCTTTATTTTTTGAAAGC:1 - chr3L 9326814 5' - X-element 407 1 63.43 TTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGTGGATTTATATATCTTATCTTATATAGTGAAGTAATTGGGAGGTCCAAACCTGTCACTTCCATTTTTTCAAAGAAATCAGAAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chrX 20373663 5' + 297 6634 2 56.59 CAAAAAGCGCAAAAGCCAAGGACAAAGGCAATTAAGCCAACTGGCAGGAGGTGTTTGATGTGAATAGAGATTGACTCTCTTCAAGAGCGCCAAAATAGGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTG:1 - chrX 21092178 5' + R1A1-element 5129 1 72.27 AATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 14051727 5' - roo 9044 1 58.09 GTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 + chr3R 24729535 5' - Juan 4193 1 58.90 ACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 18549954 5' - roo 9036 1 65.07 AAAATTTCACAATTGCACTTTTAATCGAAATATATTTTTAAACAAAAATATAATATAATTTTTAGTACCATCAGGAATGATGGAATACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGT:1 - chr4 274300 5' - Stalker4 74 4 69.18 AACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr3L 22890389 5' + FB 27 1 64.94 AGTGTACTTTTCAAACTTTTCCCGTAAATACACATTTTTTGCTTTGTTGATTCTCTGATTAATTTGAACAAGAACAGAGGAATATTTTATTAATTGTTAAATCTTTTTCATATGTATGCACATAAGCATACGCAAGAGGCGCTCTC:1 + chr3L 10239685 5' + Tom1 198 1 70.55 ATCTTACCGCAAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTCTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTATAAATATTATAATAGCATTTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTTAT:3 + chrX 22576289 5' - Burdock 152 2 48.63 GCACATATTAGTGCAACGTCATTCTGAAAATAAATATTGATTCCACGAGGCGAGGTTTCATATGTTAGATCAGCTGTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGCGAAGCTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACACCACGTGTC:1 - chr3R 20565336 5' + transib3 231 1 57.53 AAATAAAGCAAAAGGAAAGAAAAACTTTTGGCAAACACCAAGAAATAGACCCAGAACTTTTTTCTAATTTATTTTTTT:1 + chrX 3511736 5' + FB 173 1 61.54 TCTAGAGAAATCAGTTGATCAAAGTATCGGCTTGGTAACTATATGGTTTATATGGTATATATTATATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3R 21933134 5' - pogo 2049 1 61.64 TTTTATTTACATTTCAAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chrX 2479573 5' + mdg3 5321 2 64.29 AGTTGAATATATCTGCGTTATTAATTATGAATGGGGCAGGTAGCTAGAATACGAAACACAGGGGAATTTTCTATTAAAATACACATAAATTGGATGTTACACAACACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAACTAAATACGTT:2 - chr3R 16916400 5' - transib2 303 1 68.49 CAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 18488451 5' - roo 331 2 74.66 ACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:3 + chr3R 14980328 5' - roo 327 2 70.55 GAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGGTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 11062818 5' - roo 9011 2 61.83 ACTATCTGGTTGGTCCCACGAATGTTGCCGCCCAGCTGCTCAAAGACAACTTGTAAAATTCCTTATATTCGAAATCAGTTCCATGACATGTTATGCTCATTGGTTGTTTTTATGTTTAAATAATTTTTTAAAAATCTTCTATAATT:1 + chr2R 20317652 5' + Cr1a 74 1 65.75 GATGGAAAAAAGAGACATAAAAAATGAGGAGCTAAGGTTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTAAGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATTTAAAACTAACATTGTT:1 - chr2R 12223272 5' - TAHRE 10143 1 72.60 GTTAGCCATTGGTATTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 + chr3R 11186516 5' - BS 5053 1 56.16 ATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 18488377 5' + roo 8736 2 67.12 AACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 - chr2R 5479967 5' + F-element 98 1 74.31 AAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:4 - chr3L 18505778 5' + I-element 25 1 68.49 ACCAAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:1 + chr2L 11298044 5' - I-element 5292 1 65.75 ATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chrX 661963 5' + 412 7096 2 51.88 AGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGTGATATTTGGATGAATT:1 - chr2L 12984227 5' + hopper 54 1 52.74 TAAATACAATACATATAAAAAGCAAGCATCCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGAACCAAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGTATTCAGATCG:1 - chr3L 10701921 5' - Idefix 7207 2 73.43 TTATCCGAAGATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGCCGGGCTGACATAAATTTATTCAATTTCTTCT:1 - chr2R 955167 5' - 412 428 2 75.78 CTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGGGAAATGCAAAAAAACTTTTGCT:1 + chr3L 3501738 5' + Bari1 86 1 75.34 TTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATT:1 + chr3R 21624422 5' - TAHRE 10388 1 88.36 ATTCCTGGACATGGTATTTCAAAATACCAACTATATTTAATTGGTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACA:1 - chr3R 16533745 5' + X-element 4380 1 51.37 AGTATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGCGTGGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3L 1692047 5' + blood 18 2 57.33 CTGCTCTTTGTGGTGGGCCTGTCTGTTATTTATTTAGCTTTTATGTAAATTTTATTCGATTGCTGAGTATTTTTGTTTATAGCCTCGATGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTCGTGCAGGGGT:1 + chr2L 9184894 5' - BS3 1423 1 65.04 AAGACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - chr3R 31264128 5' + jockey 4777 1 65.03 GTGAGCGTGATCAATGTACAGAGGGAATGGTTTAAATGTAAATCAATTAAAGCATGAGTCTCTTTGATTTTATGTGCTGGATGAGATGCGCTTTCTTGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTC:1 - chr3L 23015015 5' - F-element 4433 1 70.34 ATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGC:1 - chr2L 23295923 5' + micropia 15 2 72.41 ACAAAGAATTATATTACGTATACGCCGCCTTGGTTTCGGTTTTTTTTTCTCCATGTTTTGCTTATTTATTTCCCCTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTACTTTAAACTAACTAAATATCATTTTATGACATA:1 + chr2L 1642249 5' - Doc3-element 4634 1 71.72 ATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2R 6847839 5' + Doc 50 1 57.60 ACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTT:1 - chr3L 20187384 5' - FB 443 1 75.00 AATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:2 + chrX 7795523 5' + roo 8736 2 71.23 ATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:2 + chr3L 5532943 5' - roo 8996 2 72.60 TAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCA:1 + chr3R 22642283 5' + blood 62 2 57.53 TAAAACAGATATGAAGATTATTACTAAGTTTCTGTAAATCGTGTTAATCTTATTGTTTACAAAATCATTTCTTTAATTTCCATGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 - chr2L 22674687 5' + mdg1 7079 2 59.59 TCTCGTCTTCTAACAACTCATTTACCAGCGACTGCTTCTTCTTGGACTTCTTTTCTTGGTAGTGATCCAAATGCGAAGGTAGCACAGTACCGATTTGGAAAAATTTGGGCAGAAATAATAGAAAAGAAGGACACAAAGGGGCTCCA:1 + chr3R 7472589 5' + X-element 4675 1 77.40 GTATAATTTGTAAATAATTAATAAATGCGTATGGAAATCAATAGGAAATACATAATATGTTCATAATTAGTTAATGTTATGTTTTTTATATTTTTCTTATGCTTACTGCTTAGTTAATTATCTGATTTTTTTTTTTAATTAATATA:1 + chrX 14156879 5' - jockey2 3407 1 82.88 ATAATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATA:2 + chr2L 23069853 5' + Stalker2 249 6 58.90 CCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 - chr2L 14671903 5' + FB 75 1 73.97 CTTAATCTATGCCATATTTTGTGAAAAGCCAAAGCATTTGCTCGTGGTTTTGTATTTATCAGTTAATAATTGCAACTCCTTTAACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTA:1 + chr3L 21876285 5' - mdg3 5232 1 59.59 ATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATAT:1 + chr2L 22329018 5' - invader2 4702 1 69.18 GACAAGGGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 47177 5' - roo 8996 2 68.49 TTTCGCGTCTTTTTTTTTGTTTTGTTCGCG:1 + chr2R 7885844 5' - gypsy2 396 1 73.33 GAACGTAAAGAAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chrX 8092540 5' + pogo 9 1 77.40 CTTTACAACTTCTACCCACCCTAGTTAGCTTTTGTTTTGACGGAACCTTCCAAGTGCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1 + chr2L 10547153 5' + INE-1 246 1 63.04 CTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGG:1 + chr2L 19817785 5' - G4 3784 1 58.22 AATCTTGATGCCCAATTAACCTTAAAAGTGGATTTTCGCATTGTTTCTGCTTCTTTTTCCATCTGTTTTTTTCAGGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTTCCATTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAG:1 - chr3L 20601146 5' - Doc3-element 4660 1 60.27 TTTTTTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGGCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGAGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCTTATATTTTAAACATAAT:1 + chr3R 3922961 5' + Cr1a 95 1 72.60 CGAAGAAGTTCGCGCTGCAAACATTCATTATGTCGCCTATAATGCATGGGGATAAAATGATTTTTAGTTAGTG:1 - chrX 4077288 5' + Doc3-element 4640 1 90.41 AAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGTATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATTCAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTT:1 + chr3R 11040038 5' - Bari1 1672 1 56.62 AGGAAAATAAATAAATAAAGTTTCCATAACGAATACGAAATTTATTAATTTGAGTTTAGTTTTTTTTTTATTTAATTTCTTTTT:1 + chr2L 21320939 5' - X-element 4717 1 72.62 GTAGTTTTTCGACGAAGTCAATGAGATCGCACCTCATAAACATCCGCTGCCGAATCCGGTATTCCCACCGAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCT:1 - chr3L 22352220 5' + Quasimodo 6950 2 62.11 AACATCTCTTACGAAATATCCTTCATCCTTCAACCCCTAATAGCAAATCAGAAAGCCTTTTGAATGGTATATAATTTTCATACCCGTTACTCGTATTCCCTTTTATATTGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGTAGGAAGCG:1 - chr4 408018 5' + INE-1 30 1 71.23 AGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAG:1 + chr3R 11040072 5' - Bari1 1628 1 72.60 ATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCCCGGACTAGAGGCAAAA:1 - chr3L 16470374 5' + jockey 4724 1 51.03 AGGGGATGCTTGGCCTATCGCAAGGAGGATCGCATGGATGTGTTCGCACTGGCCAGGCACGAGTACATTCAGCCACCGATACCGAAACATGGGCGCGGTTCGCTCAACCACTCGACGTAGGCATAATTCCACTAGGG:1 + chrX 3786153 5' + Rt1b 5052 1 77.37 CAAGATAATGTTATTCGTAATAAGAGCGTCAATCGGTACATCGGGCGCTATTTCCCACTACACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACACACTGTAATC:1 - chr2L 20683985 5' + HeT-A 5989 1 57.53 CTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3L 8627344 5' - pogo 2087 1 43.36 TTGTGCATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2R 15376207 5' - 1360 3351 1 58.04 TTTGTGCGTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 7795466 5' + roo 15 2 77.40 GCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGC:1 - chrX 20999576 5' + BS 72 1 71.23 GTATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTG:1 + chr3R 15763489 5' - flea 4946 1 72.60 ATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 14310339 5' - roo 9034 1 44.52 ATTCATAAGTAATCTTTGGCCGCAGCCACATCGGCGGATCAACTCCACGGAAGTCGGTCTTGTGACCACGACGTGGTTGTAAAATTCAAAATAAGAAGAATTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 11810772 5' - roo 387 2 38.33 GATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:2 - chr2L 17809246 5' + jockey 88 1 71.23 CTGCCATGCAATAACAATACCAAATACTTGAACTGTGTTCCCGCCCCATTCCGCCCACTTTTTCTGGCCAAAAATAAACGATAACTAGTAAAAATGTTTTCAAATTATTTTTATGCTATCTTGTTACCTAGGAATCAAAAAATGAA:1 + chr2R 21455878 5' - transib4 72 1 55.48 TGGAAGAAAATAGATAAAAAAGATACCTTCAATCGAAATCCATTTGAACAGGATATATACTTCATATATCTTCAATCATCAGCTCGTATAATCATCGACATATCAAATAAGTTTCTGGGTGGTAAGATAATTCACATCAAAGACCA:2 - chr2L 858366 5' + Stalker2 7338 2 73.29 TATTACGAGTATATACAAAATACATTAATTTAAACAAATTTTTTTTCATTTTATTTCCCAATATCTCTTGATATCCCAAAATAAATGATACTTTCGCGTTCTCATTCACACTAGCTGAGTAACGG:1 - chr2L 21347313 5' + INE-1 536 1 72.00 ATGTTGCTATAGGTAGTCGTTGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGGCGGGTGAAGCTTGCTATGGTTTTTTTTCTTAAGTT:1 - chr2R 5928146 5' - F-element 4434 1 77.24 AGGTCAGATAATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGA:1 - chr2L 17180170 5' + Juan 37 1 45.89 GATAGAGCTGTTGCTGAACGGGGCCACTTGCGCTGCTTGGGTAGAAAGGGAAAACTATATTATGTAGAGGGAATTCCAAAAATTGAGTA:1 - chrY 152056 5' + micropia 5259 2 84.27 ACACTATACGGTTAACGAACTCCTTTTCGCAGTGGCAATCTTATTATTGGCGTGAAGCCCATCATTCTGATAGTCACACTACCATACTTTATTAATAAGCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCC:1 - chr3L 6611375 5' + jockey 4856 1 70.55 AATAAAAAAAAGTGAATTCTCATTAAATTGCAGTTATGTTTGATACCATAAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACT:1 + chr3L 21996924 5' - Transpac 38 2 64.38 GTTGATGGGCAAAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGGATTCGATTTTTTTGGTATAAAGTCTAAAAATTGAGTTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAA:1 - chr2R 10161876 5' - transib2 2754 1 62.33 ATGGAAATTTGCAATCCTGTTCGTCCTGTCGCCTGTCTGCTTCTGGTCCTGCTCCTGTGGCAAACTGCTTGTGTAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCACTT:1 - chr2R 18316144 5' - HMS-Beagle2 262 2 53.42 GCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAG:1 - chrX 1799241 5' - invader4 3041 2 54.79 TACTTCCTTTGTGCCCTTTCATGTGCCCTTTCAAATTGTCCGTTCGGGAAAATAACACTGTTTTAAAAGGAGCGTAAGGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr3R 2648070 5' - 1360 3363 1 75.79 AGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 + chr3R 4682890 5' + Burdock 65 2 64.38 AGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:2 + chr3R 22642239 5' + blood 7029 2 71.92 ACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 - chr2R 13168708 5' + P-element 99 1 19.86 GTTGTTTCCAAGCGCCTTGGTGAAGTGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr3L 10373922 5' + 297 6642 2 60.27 GAGGGTCCTTGCTCGCTGAGAGGTAAAACACACCGAATTTGCTTGTCAATTTGGAAATCTTCCTAGTGGAACCACCTATGTACATATGTATATATGTG:1 - chr3R 29579204 5' + G3 4508 1 89.80 GAAACGATTATTACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr2L 9038274 5' + I-element 52 1 54.20 ATATCTCAAGCAGATTGTAAATGATAAAGATAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGTAAATTGGAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCAGAA:1 - chr3R 10584716 5' - Cr1a 150 1 77.24 TAGGGAATAGTTTGTATAACTGCGGAGTGGGACAACCCAGGAAACACCCTTAAAACATAATTTGCACACATATGCTCATGTATT:1 + chr2R 1590676 5' + 1360 183 1 76.19 TAGGCGGAGTGTGACCATGCAAGTAATTTATTCGTTCGGTTTCCAATGTTAATTAAAATACTTTAATTTAAAATCAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGAT:1 - chr3L 10541387 5' - mdg3 5213 1 51.37 AGATAGGTCAGTAACGGACGAGGATGACCTGGTGCCACCTACGCAGGTATCTACCGAACAAATGGAGATTGATGAACCAGCAGCGGAAAAAGCAGCCGAAAATAATGAAGATACTAGCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTA:1 - chr3R 15271361 5' + Stalker4 247 4 80.14 GACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 24090439 5' + roo 8720 2 56.85 CTCATATTCTCGATCACGCCCACAATGGGGATATTTTGCTTTTTACAAAAGTTGATCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAA:1 - chr2L 16733317 5' + hopper 96 1 63.85 CTGGAGCAAACTAAGCTGGGGGTTTCCTGAGGGGGCGAGGCACCCAGGATTGGGAAAACTATGCACCAACACACACACACACACA:1 - chr2L 12390491 5' + accord 7026 4 78.82 GGGAAACGTTAAGCACACATAGGAGAAAAAGAGGGAAGTGGAATAAGTATGCAAAAATAAGAAGAATTTTAAATGAAGCCCGAAACAGTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGAAGCCAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAA:1 + chr3R 8401254 5' + GATE 387 1 60.27 AATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCACAAGATCGT:1 + chr3L 15103781 5' - Transpac 272 2 60.27 CAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 - chr3L 16970431 5' + roo 8756 2 84.25 CATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACATGTTTTGTGCTGATCTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATAAATCACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAG:1 - chr2R 4368663 5' + Doc4-element 27 1 78.77 GGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:1 + chr2R 12779625 5' - I-element 5292 1 58.90 TTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2R 14051729 5' - roo 9032 1 52.74 AAAATAACTATATTAAATATTACTTTTTTATTACATAATTAGATGTTAGTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTCGTTATATATGTTACCTCCTTATTCTAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTA:1 - chr3R 4594538 5' + Cr1a 4001 1 39.73 TTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 - chr3L 16470372 5' + jockey 4726 1 54.48 TAGTAAGCCTATAAAAATATGTGGTAGTCATCATTTTGTACCACTAATTTTTAAACATTCAGAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAA:1 - chrX 22508862 5' - INE-1 298 1 56.82 ACTGAAGTAATTATTTGGTCACCATAAATATTTACCTAGATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGAC:1 - chr3L 13741310 5' + I-element 4932 1 73.29 CTATAGGAGATTGATATTCAGATAGGTAGACCAACAGGATTTTCTTTTTTTCCCTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAGATACATTTGTATTACTAAGTTTCC:1 - chr2R 25177649 5' - HB 36 1 75.34 ACTACAATATTTTACTAAAGGCTCTAAATTAAGTTTAGAAAATTCATTAGGCTTTAAAGACACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chr3R 30210472 5' + Transpac 17 2 58.22 CCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3L 12315835 5' - transib2 2775 1 52.05 AATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGA:1 - chr3R 15790128 5' + flea 4727 1 71.23 AAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 - chr2R 9967132 5' - Bari1 1646 1 58.90 ATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATT:2 + chr2L 14523115 5' - HMS-Beagle2 263 2 51.37 ATTACTGGCATCACTACGGCTTTCAATTGTGATAGTACATCAAATTATATAGTATAGAAGAGCTTAAGGATTACAGTAGTATAAAATAAACTATACATATCCCAAAAGTAGCTAAGTACCTACATTTAAATCTTATAAATTGAAAT:2 - chr3L 9955318 5' - Tc1-2 1408 1 47.26 ATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chr2R 21681327 5' - roo 323 2 76.03 GGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:2 - chr3L 10731890 5' + 297 6625 2 51.37 GGGCAGGATGGGCGTGGTCACGCTGGTGGCCGTTTGGCCCAGCGGTATGTTAATGTTGCTGGCCAGGTTCCAGAGACTGGCCTGATTAAGTTTAAATCATTTATTATTATGCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAAC:1 - chr2L 12298978 5' - G5A 2797 1 54.48 AATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCT:1 + chr2L 17005734 5' - Stalker2 325 2 75.19 AAGACTTTAAGGGGTAACATATAATGAACATACATACTAAATAAATAATATATATCAGTAGAATTACATCAGTTGATTATAGAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAA:1 - chr3L 3508932 5' - transib2 122 1 57.53 TTTTATGCTGATGTCCACAATTCGACAGGTGTTGCAACCGTGAAAGATAGAAAAAGCGTATTTATGTCGTCATGTACTTTGCTACAAACTTGCTACGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTACAGCATTCTCTCTTGT:1 - chr2L 9173207 5' + INE-1 579 1 53.42 TGTAAGAGAATGTTGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:2 + chr2R 13168600 5' - P-element 2874 1 77.40 ATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2L 21328281 5' + 297 6618 2 62.07 ATATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:2 + chr3R 15054171 5' + copia 4891 2 66.44 AAGTCCGCAATAAATTAACCGCTCCACGTCCGTCAGTATTATTCAGGCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 25616595 5' + roo 73 2 69.86 AACTAATATACTAATGTACATCTCTGCTTGCTGGCACTTGGGCAGAATGTTCACACATGAACAAGAATATATTTCAAGACTTACAATTATGGTCTCCGATCAGATCTTTTGTTAAGGGATCGAGGGCGTTAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 19450184 5' + roo 76 2 79.17 CATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chrX 585711 5' + Tirant 20 2 54.32 GTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 - chr2R 13168719 5' + P-element 88 1 27.40 GTCTCTCCTTTACCCCTGATTGTGCGTTTCAGTATGTTTCGCCCGTTTCCATATTGATTTCCTGTAAATTATTATTTTTTTCATCGTTTCCTGTTTACTTCGACGGGCAAAAATTTGCGTGAAACATTTTATAACGATCGATTTGT:1 + chr2L 17945789 5' - Doc3-element 202 1 78.77 TTTTCAATTACTCAACGCTTCTCCAACTCCCGATTTTCATGGGGATCCCCAGCTCCCGTTTCGCCTGTCATGTTTCCTTTTTCCATTCTATCCATATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTATTAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 - chr2L 15327236 5' + INE-1 544 1 59.59 AATCCAGAGAAAGCCTTTCTAGAGCGGAATATCGTATTACCTTTTGTACGCAGACCCACTTGGCTGGCATTGACCTATTTCATTTTTGCAACAACCAGATCCAGTGACATTACCATCTGGTGTATGTGGTTTAAAGAAATATCACC:1 + chrX 8309504 5' - I-element 5025 1 66.44 AACATGAGCACCCTGGACATGAAGTTTCGGGATTAAGCTACAGTTGCCTGCAACAATATATATATATATATATATATAATATATATACAAATATATATAAATATTTCTTATTTCGTAATATATATACATA:1 - chrX 4757393 5' - 1731 106 2 75.38 GGATGACAATGCAAGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:2 + chr3R 11810592 5' + roo 8683 2 70.55 AATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTT:1 - chr2R 4785318 5' - Juan 4147 1 59.59 TTATTTGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:2 + chr2R 13259292 5' - mdg1 350 2 64.38 TTTAACTGCTTTTAAAAAAATGTTCGTACACGGTACTCGATAGTCGGTGCTCTCGACAGTAGTGTATCCCCATTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr2L 6498454 5' + hopper 138 1 68.18 TTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCTTTTGGAACAAATTAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAATC:1 - chr4 987672 5' - Tc1 260 1 78.77 ACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 + chr2L 15940224 5' + pogo 76 1 68.49 TGATACAATTTGGACAATCCGCAACATACTGTCAAAATATAGTTTCGAAATTCTTCATTCAGGTGGATGCCATTAGAGGAGAGCCTGCCTGAAAATCATAATTAATAGACACGAATATATATAAAAACCAAAAAAAAA:1 + chr3L 15767080 5' + transib2 99 1 57.97 AAACAGCTTTGTGTTCTGTGTGTGGGTGGGGAGGGGAGATGAGGGTTTTGTTAACTGCAATTGAAAGATTTTCCCACGAATTGCGAATTTCCATTAAACCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAC:1 + chr2L 13156770 5' + roo 333 2 73.57 GTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGGGTCGTATTGAGTCTGAG:1 + chr2R 13931568 5' - P-element 2796 1 22.14 AAGGGAGGTGGTGGCAGGGATGTGTCGAGGGCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3R 29084981 5' + 412 7098 2 59.20 AAAACATTTTATTGCTCATCATGTGCGGTCATAAATCTGAGAACGCAATCAGTTCTGGCCGGCTCCCCTATATATTCCGGCCATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2R 11794923 5' - opus 472 2 67.81 GAGAATTTTTAACATCTTTCAAGAATATCGATTGAACTTGGGAAAAAAGTTAATTTTAATTCCCTAAGGTGTGGGCGTGACCGGTTTGGGGCTTTAGGGCGGGGCTAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATGTACAAGAATAA:1 + chr4 250388 5' - INE-1 298 1 52.05 ATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr3R 30675461 5' + 297 50 2 56.85 TTTTTCCATATTTCCATAAACAACCCAATAACCCAGTACGTCTA:1 + chr3L 13281445 5' + Tom1 238 1 40.91 ACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2R 13766188 5' - roo 360 2 52.74 ATAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2R 24427545 5' + jockey 4707 1 56.93 ATCTTCAGAGATACGGTGGGATCTACTTTTTCTGGCTCTGAGAAAGCAGTAGCTGTCAAGGCGAACGGTATTGTTTTTATTTTGCGGTTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTTATTATTAT:1 - chr2R 1568520 5' + Cr1a 79 1 73.97 AAGACCATCACAGACAATTTCTCAGAACTTTCTGTCGACATCAATTTGGGATCGGGCGGAAAGGGTATTTGTATCACACAAAAGATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTT:1 - chr2L 21906885 5' + invader1 293 2 42.47 GAAGGTAGGCTACGGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr3L 19349886 5' - 1360 3373 1 71.92 TTTGAACCATTTCGTTTATTGATTATAAAATTTTATGTTAATATGAATACAATTACACAAAAAAAGCTTAATAAAGTTTAATAGTATTTAATAAAGTATACATTTATTTGTATAAACCAAAATTCCAAGGCACTGGATAGTTTAAA:1 + chr2L 14271832 5' - Tc3 1472 1 61.64 AGGGGAATTTAATATAAACGAAAGCTTAATAAGAATTTAAAAAATTTAAATCGATTTCCAGGAATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr2L 7125913 5' - I-element 5306 1 53.10 GAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGA:1 + chrX 6116257 5' + transib2 73 1 68.49 CTGCAGGCCAACATCCCGGCCTCATCCTTGGCAGCCATTTGGCGCACAAACAATCCGTTAACACTTTTCTATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCACGCCTTATCGAGGTCCCA:1 - chr3R 28190851 5' - roo 266 2 50.00 AATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTC:2 - chr3R 17996258 5' - diver 155 2 63.70 CAAGTGAGAATATTTTATACCCTACAATTACTTCACGATGACACGATGAATACAGTTGCGGTAACAATAATAAGCGGATTTCGTGTTTGTCCCAGTGTTTCTGTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAA:1 + chrX 19695270 5' - Tc1 1563 1 66.44 AAGTTCGATTTGCGTCCAATTGGACTGATGCGATACATGGTCGATTGTTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTGATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTAT:2 + chrX 10324146 5' - G5A 2751 1 67.81 ATCTAGAACAACCTTCCCATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTG:1 + chr3L 17183629 5' + diver 5906 2 66.67 AGGAGCACCAATGACAACCGATTTTGCATCTTAGCAGAACTCGAGAACCACCAAGCAGAGGAAACTTTAATGCTGCCTGAGTATACTGCCCTCCGACTTTTAGATGGACAGATGCTATTGCTAGGCAGTTTATCACACAATTTGGA:1 - chr2R 5480591 5' + G5A 378 1 63.01 AGTTCCCACCACATTTGAGCATCATTTAAAAAAATAATTCAAAACGGTGTTGGGACGCAGCGTCTCTTTAATTCTTTATATCAGCTCTTCATAATTGTTCCCAGATCGACTCTGCTTGGGATCCTGATCAAGAATATATAT:1 - chr2L 22099060 5' - INE-1 80 1 72.34 ATATGCCTAACAAATAGCTCTAGGTGAAGAGAGAAATGAACTTAATAATACTTATCAATACTTTCGATCTTAAGTTTTCTCGAATTTGTTTACGAATCGAAGATGCCGACTGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTT:1 + chr2L 6929293 5' - 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chr3L 9907383 5' + BS 5032 1 53.42 ATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAA:3 - chr3R 2520349 5' - Tc1-2 1605 1 59.59 CTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCA:1 - chrX 17717089 5' + FB 69 1 64.14 AGATCGCTTTCGTGCTTGCAGCAATTAGCAGCATGCAATTAGTTGACGCTAATCATAATGAATCAGCAACACAAAAAGTTCGAATGACATGGAGGGGAAATGCTCTAGATATATGTACAGCTGTGTTAAGAAAAATAGCAGTGCTT:1 - chr3R 5364665 5' - HB 1620 1 53.42 TAATCACATTCTCCCGAAATTCTGTGTTTTGGTGAAGACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGAT:1 + chr2R 4673533 5' - Quasimodo 7337 2 64.38 ATTAATCATGTAAACAAAACTTGGCTAGCTTATACATTTACGCCCAACTTTCCTGGCCCCTCACGAATCTCAAAAACTTCAAAGGGCCAAACAAACATATAATTAATAACAAAAGCTAAGAGGCCAAAAATCAAAAAAA:1 - chr2R 21884891 5' + Transib5 15 1 77.70 AATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGAGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 + chr3L 15103829 5' - Transpac 250 2 70.00 TTATAACTGTAGACGACAACGGCGATACATATCAAGTGGGCGGAATGGGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGGCAGCATACGGCCGG:1 + chrX 7519773 5' - Tirant 8196 2 60.00 ATTGACGGTTCGCTTGGAGGCAGCAGCAGCCGACCCACACACACACACACACACACACACTTTGTCGCACACACGGACATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGACATAAAATCATGTATCCAATAAGA:1 + chr3R 29660167 5' + Quasimodo 114 2 51.82 AAGCCCGTAACTTATAGTTTAACATATGATTTTCCTACTTGTTTTTGTGTTTCCTTTGTGAAATAATTGGTTTCTTTATCTTCATGGAATACAAGTATATTACTACGGGTTTAATTGAATAGTTTTTTTTTTCTTGTTTCTTTTTT:1 + chrX 21076827 5' - Doc2-element 237 2 74.66 CAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 14980307 5' - roo 9013 2 55.86 TGAGACCAATTTCTATTGTTAGGATAAACATCTCCATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2L 21328117 5' - 297 372 2 68.49 GCTGTACTGTTTTTCTCGTTTCTCCCATTTTTCCCATTTTTTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr3R 26774024 5' - hobo 2932 1 59.14 AAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCCCGTCATCGGCTG:1 + chr2L 14026131 5' + F-element 453 1 54.40 AAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 - chr3L 24131499 5' - Transpac 5171 2 57.93 ATAGAAATTGGTGTCGGTTTTATCTAAGCTTCTCTGTTTCATGTACTCTCATGCTTTTATGTCCCTGTGAGCATAAATTTCACCTGTGTTTTTCCAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 - chr3R 25705746 5' - hopper 1337 1 65.75 ATAGCTTAAAGGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAA:1 + chr2L 19817754 5' - G4 3814 1 39.73 TTATGTTGCTTTTGTTGAAGCATTAACAATAGGTACGATACTAGGTACATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATACGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGCCTACTTC:2 - chr3R 1312414 5' - diver2 67 2 71.92 AAAGCATCTGGCAAATAAATGGCAACTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 5389818 5' - roo 393 1 75.34 AAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 + chr3R 18971703 5' - Juan 4156 1 58.22 AATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 - chr2R 21410953 5' + Burdock 6201 2 67.91 ATGACTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 - chr3R 23067559 5' - roo 9040 1 66.44 TATGGCACGATGGGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3R 15942835 5' - hopper 1388 1 67.81 CTATGAACTCAAAATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:2 + chr3R 30675330 5' - 297 351 2 54.11 TCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAATTA:1 + chr3L 23456283 5' - Gypsy6A_LTR 243 1 77.40 AACTTATTTTTGCGGCCAATACGAAACAAGAGTTTAATGCTTGATTGCATTGCTTGCAAAAAACTTTAATGACAAATATATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr3L 14094554 5' - I-element 5319 1 53.42 GTCCGATTGTGTGGGTGCTGGCTACTGTGGTGGTGGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGGGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATC:1 - chrX 2576545 5' - 17.6 93 2 73.94 ATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr3L 14094687 5' + I-element 58 1 59.59 GGCTGGGTTTATTAATGGGTTAAATTGAAATTTCACGCTTTGCTGGCTCCGCATCTCGTTGTCAGGGCTTGGAATAGGTCAGGTTGAGATCTCGCCGTTTGTACGGACAGACGGACATGGCTA:1 + chr3R 7552873 5' - INE-1 118 1 69.11 CTAAATACTTTTAATCAACTAGCACTCATTACATGGCGTGGACACACATTCAAACTAAAAGCCAATTGGCTTCTTAGTATACGCTCTCCCCTAAGACCATAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCCGTC:1 - chr3L 27411758 5' + Fw2 3514 1 75.97 TGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAAT:2 - chr2R 5674732 5' + S-element 74 1 67.12 GGAAGTATACACTTGTAAAAATATACAATCTTCGTTTAGTAGTTCAGCTAACATAAAGGGAAAAGTATCGCTTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCT:1 - chr4 94102 5' - Transpac 471 1 52.05 AAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 3920619 5' - roo 9041 1 64.38 TCCTCTTAGGGTTGCTAATTTTGGGGCTTTGGGGGAGCTAATTTTGTTCAGAATGTTGAAGACGGTTTTTACTTTAAAATCCTTATCATTAAATGCTTGCGTTATCTCAGTAGGTGTTACTTTAGGTCTATATTCTT:1 + chrX 4254640 5' - Fw3 209 1 64.96 CTGGGTAATGCGTCTCAAGGACCTCTGCACTATGGGCCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2R 19941571 5' + hopper 10 2 60.34 ATTGAATTGTTGCCATTGCTTTGCCCGCTCACGTTGTTTCCGATTGTTGTTGCTGTTTTCTGCATGGTATTTATGACCGCTTCCTTTACTTTTCCTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGA:1 - chr2R 22524567 5' - P-element 2590 1 68.49 AAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACT:2 + chr3R 4160064 5' - invader2 189 2 57.53 CTTGTACTTAAATCTCATATTGTCAAAGTTACCTTGCAGCCGTTATGGGCGGACTAATGGACGAAGAGCTCTCTACAACATTGTTGCGCAAGAAACAAAACCAAAATATG:1 - chr2R 9644577 5' + Porto1 192 1 68.18 AACGTATACGTAATTTCCTATTTATGTATGTGCTAAGTATATTACTGTACATGTTAAGTTAAGTGTTAATTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTC:1 + chr3R 24690004 5' - FB 156 1 51.72 GGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 + chrX 18817279 5' - transib2 2761 1 58.90 ATAAGGCAATTTAAAAATACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 20266069 5' + roo 8695 2 63.01 GTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGAAATTTTTATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGGAGCGT:1 + chr2L 21936074 5' + INE-1 31 1 49.32 ATTACCCCTTTTTTGTGAAGTGTAACAATGGGTTGGGAAGGCACAGGAGATGGTCAACTGAAATGAGCAAATGTCAAGTGCATGCCCGAAGAAGCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAA:1 - 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Bari1 1692 1 73.97 GAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAG:1 + chr3R 22590502 5' - rover 279 2 74.05 ATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTC:1 - chr3R 10270644 5' - Juan 4133 1 68.49 ATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr3L 14366627 5' + roo 8729 2 61.64 TACTTATTATAAGAACTGGATACAAATTCAACACATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 19032554 5' + roo 8682 2 71.92 AAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATATTCATGTGTTTTTCACAAGTTTGCAAATTT:1 - chr3R 19992742 5' - hopper2 1567 2 52.24 AAACAGAAGTTAACTTTTTTCAGGTGTTTTCCAATTGTTGGTAACAAAGAGCAAATGTTTTCGCTGCCTTCTTTTCGCGGAAAAAACATGATATTATAGAATGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCT:1 + chr2R 22362443 5' - 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roo 9017 2 54.79 ATTCAAAATTGTACTACGTAAAGAAAAAGAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGC:1 - chr3R 2337191 5' + Max-element 60 2 76.32 GTGCGAGTTGTGGCTGCCTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCAATCATGGGTACTGATCAGCCGAGAAC:1 - chr2R 18231224 5' - Quasimodo 6975 2 74.03 ATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTT:1 + chr3L 23249413 5' + rover 7039 2 74.66 CGAGCTGTCGGCGTTCTACTGTCGAGCACTCGAAAACTTCACTTCGATTCCGCAACAGAATTGGCTAAAATAAAACCAGGGCTTATGCGCATATGTGGCCAGCGGCCAGCGGGGGAATGCTGACTTAGCTTGAA:1 - chr2R 23431991 5' - blood 7127 2 58.21 AAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATTGTAATAATTGTATTGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 + chr2R 21757921 5' - Tabor 437 2 53.85 AATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 + chrX 10521622 5' + Tabor 6893 2 52.05 ATGTGGGGCGGGGCGAAGAAAACATAAACATTGTCAGCCAGGAGGCGTCTAGGAAAAATATTTAATGCCTGCAAACAACAACAAGGAGACTGTGAGGAATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 19351510 5' - 1360 3365 1 73.97 AAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chr2L 14671826 5' + FB 51 1 60.00 AATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAA:1 + chr3R 19450196 5' + roo 9047 1 51.37 GTTCCCGCCTTTCGCCGCGAACTTTCAGTGTTCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATG:1 + chr3L 3030047 5' + roo 8898 2 68.63 ATTCTCTCTTTTCTTTTTGGGTGTCTCCCTCTCTTCAATAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTATTCTCGGT:1 - chr3R 12467936 5' - invader1 3985 2 45.71 TCCAATGACACATCACAAAATCTCTTTTTTCGACTTCTCCCTTCAAGCTTACGCCACCGAATGCCG:1 + chrX 756689 5' - invader3 200 2 68.18 GAAAGCTACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTCG:1 + chr3R 27133569 5' + opus 7159 4 53.62 ACACGTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 - 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roo 9026 1 60.68 CCTCTATATATGGAATTTTAGGATTTTACAATCCTTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGGGGAAGCGAGACGGGAATAACAAATGAAGGGGAAAAGGGAATACCCAAGA:1 - chr2R 14032120 5' - hobo 2630 1 60.71 AAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chr2L 4713846 5' - transib2 2776 1 52.74 ATAGCATACTTTTAGGTGGAAGACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 - chr3R 31264147 5' + jockey 4761 1 76.71 ATTATTCCACTTCAAGTCAATTGAATCCACTGAATGCAGCAGCTTCGCGAGCAAGGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAAT:1 + chr2R 24228943 5' + F-element 4407 1 68.28 ATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr3R 27083042 5' - jockey 4930 1 62.76 GTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:1 - 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HeT-A 5883 1 74.80 ATACACTTGCCGGCTTGTCTGCTAAGGGAATCATTTTTCAACTCGGTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTTTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGTAA:1 - chr2L 21930283 5' - Copia1_DM 131 1 65.93 TGGATGCCCACTTCACTGAACTTGCCAGAAATCCCCGAAACGCATCGATTTCGAGCAGCAGGATTAGTTTGCGCTCTCAGAATTGATTTTAAAGACATAGACGCCCACTCTAACGCCCACAATC:1 + chrX 22597379 5' + INE-1 218 1 74.19 CTCAACAAAATCGTATTGTTGCGTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chrX 10319750 5' - mdg1 403 2 72.60 CGATCGATAAACTATGCTAGCATTGTTTTTAAAAATCAGCGGAAATTTTACAAGTCAGCAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTCCAAAA:1 + chr3R 15094221 5' + I-element 204 1 56.16 AAATTAGAAATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAA:1 + chrX 8092341 5' - pogo 2083 1 73.29 CAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:2 - 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copia 226 1 61.64 AGTTGATCTTTTCTAATATAATAATAATAATAATAATAATAAGGTTAATCGTTTTTTGATGTTCTTTTTCATAATTTAATTGCCAATAAATCGTTGATTTATATGTTTATTTATTTTAATCGTTTTATTTAATTATTTTATTTTAT:2 - chr2L 16164084 5' - Doc3-element 77 1 60.27 AATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCGTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr3L 21380633 5' + I-element 51 1 50.68 ATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATAT:2 + chr3R 18346660 5' - INE-1 84 1 58.90 AGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTTAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chr3L 18403022 5' - P-element 2796 1 17.78 ATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2R 10315295 5' + Doc 36 1 48.28 CAATACTGTAGACAGAAAAACGGTATATAAAAAAAAACGATAACCAAA:1 + chr3R 479556 5' - Circe 70 2 89.58 AAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTA:2 + chr2R 3338779 5' + Juan 55 1 54.11 ATAGTCGAAATAATTATTAATTGTTAGTAAAAATTGTTTACATCTTTCTATGTTTCAAATAAAAATAGTATATTTGTTTTTAACTGAGAATTCCAACTGCAAGACCACAATACACACACACACACACACACACATAGTTA:1 - 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INE-1 577 1 54.11 GAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 12986540 5' - roo 338 2 65.07 ACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGC:1 - chr2L 12984205 5' + hopper 76 1 69.18 TTCATCGACTGCGTCCTTGCCGTCGTCCTTGAGCACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACC:1 - chr3L 21968656 5' - opus 7268 2 65.26 TTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 - chrX 19038454 5' + hopper 53 1 64.23 GGTTAAGACCTAACCGTAAGACAAAGACGGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 - chr3L 24208257 5' + Quasimodo 12 2 73.97 AGATTCGTGCAATCGCAGGCATTAGGTGCCCCCTTATTGTGGGCCAACCCAGTGGCGTGACCGTGAGCAGTAGTGTTTGTGTTTTTATGCCTTCCGTCTAATTAATTTATTTTTCCATTTATTTGTTT:1 - 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chr3L 18046707 5' - roo 351 2 53.42 ATCATTTTCCAATTAATTTTGACTATTGAGTAAAATGGAACTATAATATTATTCAAATTGCTTTTAGTATAAATTTGGTTTCATCACTTAGTTATCTGTTCAAACACTTTTTTTTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGCT:1 + chr3L 21860937 5' + 297 264 2 78.08 AATATTCTATTTTTACCTGAGCCACTTCACTGACAACAAAACCCCTTTAGCAAATTTACAAATTTCCGCAATAAACCAAATAACGAAAATGAATACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAA:2 - chr2R 20414897 5' + S-element 1509 1 69.86 GTTAAACAATAATGAGAACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGGCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACA:1 + chr2L 18212091 5' + Quasimodo 36 2 58.90 CATAGCATACATAACAAACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAA:1 - chr3L 23354507 5' + F-element 70 1 56.85 AATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3R 8051105 5' + jockey 4803 1 55.48 AGCGTACACTTGGAGTAACACTCACTAATGTTTGCTTATGTTTGTTGCTGAACCACATATGTATCGAACATCATAGTATACTAAACAAGTTGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAA:1 - chrX 19361601 5' + mdg3 5089 1 67.59 AAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 47048 5' + roo 8686 2 71.23 AACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:2 - chrX 18409455 5' + jockey 4748 1 68.49 AATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 - chr2R 12472126 5' + transib2 56 1 55.48 CAATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 - chrX 1264033 5' + Burdock 6208 2 74.66 CTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chrX 4808502 5' - mdg3 194 2 50.68 CATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 29084861 5' - 412 7510 2 57.53 TGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTC:1 - chr3R 4860517 5' + Transpac 77 2 71.23 AGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGTGTATTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCGTTCATATATTATGTAAATGAATAGAGAGCGA:1 - chr2R 14051831 5' + roo 61 2 72.22 AATGAATTTATAAGGCAATTTAAAAATACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:2 - chr2L 20266078 5' + roo 8686 2 69.18 GGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCCATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1 + chr2R 8735580 5' - mdg1 353 2 66.44 GAGAGGGGTTGGATGAGCGCCTAATGGCGAACGCGCTTTTATGTTCAATTTCAACCGAGGTAAGCCCTCCGACAGTTTCTTTCGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTT:1 - chrX 4455912 5' - gypsy7 5004 1 48.11 TGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTA:1 - chr3L 22035591 5' - 1731 4541 1 74.66 GGGGAGCGCACATCCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2R 10411492 5' + 297 6596 2 72.73 TATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 + chr2L 19958706 5' - flea 4934 1 80.82 CGTGTGATTAAAAAATAACAAGCTTTAAATGCGCATAAATAACAAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAAAATTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAA:1 + chr2R 18922009 5' + 1360 3118 1 73.97 CAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 - chr3R 17673840 5' + FB 63 1 60.96 AAGGGAGTTGCATTAGTCCAGCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGGAGCGCCCAAGCTTAACG:1 - chrY 1565492 5' - diver2 172 2 78.41 TATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 - chr3L 15103905 5' + Transpac 4981 2 61.64 GTTGGGATTAGGATTGGGGATTACGAAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACGTTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chrX 19539605 5' - pogo 2093 1 59.59 AACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGGGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAA:1 - chr3R 11040145 5' + Bari1 34 1 53.33 ATATATAAAATATAAACTTGGATTCAGTTGTTTTTATCGTTCATTGCTAATAGTTTTGTTATTCTTTTTATAAATAAAAAAATGCATAATAGATAACAAAAAGCCCTATAATTTTGCATTGAAAGGCAGAAAATACAATTTACTTT:2 + chr2R 11690973 5' - S2 30 1 60.27 TATGCCCTGCAAAATTTTTGTACAGTGCATGGGGAGGGAGAGGGCAATACGCGAACGCAGGCCGATGAATTTTTTTTCGTCTAATGCTCCTAAGGGTGGGTCTGTAAGAGAGAGAGAGAGAGGG:1 + chr3L 17608812 5' - blood 169 2 58.06 ATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 5769123 5' + roo 8712 2 56.16 GTACAGGAACCCTCCTGAACCGCCAAAAAGCCGACGCTATGATCTACGCAACTCCAAGCGAAATCCTCGTTGAGTCTGCCACTCATTGGAATTGTATGGTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGGTTTT:1 - chr2R 21865042 5' + 1360 22 1 70.55 ACATTTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGGCGGTAAAAGTATTTATAAGCATAAGCAAATATATATTGTAGTATGTGCATAGATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACATAGCAACACTTAG:1 + chr3R 4460995 5' + blood 7048 2 45.89 AAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 14980419 5' + roo 51 2 52.74 AGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAA:1 + chr3R 3922954 5' + Cr1a 88 1 70.55 TAATTGCAGAACAGACTGTATATCGGCAAACACACTCAAAATTATATAAATATTTATATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATAT:1 + chr2R 7370040 5' - copia 4877 2 60.96 ACTGGCATGGCAATGGGCTGGATGCATGGGCAAAACTTCCTCCGAAACGATGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGCGTAAGGCTGTGC:1 - chrX 15427978 5' + HB 1297 1 73.96 CAAATAAACAATGGAAAATAAGAAAAAGAAGCCCAAGGCGATTCTTTAATACCCTTGAAGCAATAGAAATTAAATTTTAAAGAACTACAATACATAGATATAAATCCTTTAAAATAGTCGAATTAAATATTATTTAAATAATTAAA:1 + chr2L 13076911 5' + S-element 1450 1 76.71 AGGATTTTATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCG:1 - chr3L 14720951 5' + F-element 33 1 67.81 ATAAGAGAACATATGAAAACTATGTGTAACTAAAACCAAACTGGAATGGAAGAAGTTCCACTACCCTCACTATATCCATCAGTCCCAGCCCAAGTATAGGCTTATCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCA:1 + chr2L 14840388 5' + McClintock 5 2 73.97 AAAACTTTTAAAATTTTAATAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTT:1 - chr2L 4089305 5' - S-element 1529 1 78.18 ACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTT:1 + chr2R 3563119 5' - Transpac 5148 2 77.61 GCAACACAAACACGGACTGAGCACACACACATACACTAATACAAGCACTGGAGCACGGAATCAAACTACACACACACACACACA:1 - chrX 13494272 5' + accord 253 2 85.71 ATCGTGGAGCTAATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTT:1 + chrX 20455639 5' - hobo 2885 1 61.48 ATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chrX 18009916 5' - 412 449 2 46.58 GATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 - chr3L 15103913 5' + Transpac 54 2 56.16 GTTGTTGTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 - chr3L 6964796 5' + P-element 88 1 25.34 TGCTTCTCATATTAGCACTATTATCTAAGGCGAAACTAATCTCCCTTACATACATATATAATTATCGAATTGGTAATGAAATTTCCATTATTCAAGGTTAAGTAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1 - chrX 4338675 5' - roo 8968 2 73.29 AAATTCGGAGTAAGGGAGCCAGCCAAGAGATAGCAATGCACTGGGAGAAAATCTTCGAATTGGTAATTAATTGGTTTATATATAATACTGTTTAGTGTTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGT:1 + chr2L 4180049 5' - Cr1a 4242 1 55.48 GTTTTAACGGAAGCTGGCGCTGTTGTTGTTTTTATGCTTTTTAATTTCCTTAACCATTTTCTTTTGTGCTTTTTGTTCCACTTCTCGCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGT:1 - chr2L 1658251 5' - Stalker 6786 2 63.70 GCTTTAAGTTAATTTTCTGTTCAAGCAACTGTGTGCCATTAATTACAGGGTACTCATAAAGTGCAGACGTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAGGTAACTTTGATAAATTTGTCACTTACTTCCCTGGAGTTAACCAG:1 + chr2L 10759826 5' - Ivk 468 1 54.11 CTAATGACTTTTGAGATATTCCCCAGTTCCGTCCTGCCAACTGGGTATTATTTTATTTTTATTATTTTCATTTTTTTTTTT:1 + chrX 4603951 5' - Doc2-element 251 2 60.49 ATCATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 + chr3L 4219425 5' + jockey 30 1 65.07 CTATTGGCCAGCCTTGTTGTTGTTGTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 6964814 5' + P-element 10 2 63.95 TACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:3 + chr3L 2989965 5' - roo 8981 2 80.14 ATTGTTTTTGTGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chrX 8437619 5' - P-element 2861 1 68.49 ATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - chr2L 14074540 5' + 297 62 2 66.91 AGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - 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chr3R 13875110 5' - P-element 2796 1 23.29 ACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:3 + chr3L 23287192 5' + 1360 32 1 62.33 ACTAAACGGCGGACGGCCGCTCGACTCCAAAATGGGTAAGACGTCCGCCGCACACTCAAACACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2R 22514097 5' + P-element 45 1 52.24 CATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 - chr3L 5061638 5' + 17.6 68 2 71.92 GTTACAACAACTGCTGGTTTCGAAATCTTCATTACCAAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 + chr2L 11298011 5' - I-element 5325 1 63.01 GAATATTCTAGTGTCTTTGACCGGACCAAGTTGTGCGCAAATTCAAGAGGTAATTTTATTCAAGTCTTTATTCAAGTTCTCCAAGTCATTCTTGGAGAACAGTCTATTTCCTGAGGTGAATGCATGCGCATTTAAGATATGGAGG:1 + chr3L 22757139 5' - Bari2 856 1 41.38 CGGGAAATGAAACGATTAAACTGTAAGAAATTCTAAAAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATA:1 + chr3R 9353367 5' - jockey 4856 1 74.66 ATTATATTTTATACTTATTTTACTATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 10548648 5' + I-element 21 1 68.97 AATATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 14310353 5' - roo 9048 2 52.74 ATTATCCACAGGACTAAGATGCCAAAGGAAACTTTCAAGATCAGTTTCCAAAACAAAACATAAAATATATTCAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCA:1 + chr2L 16870383 5' + Porto1 314 1 53.42 CAAATGCTGCCCGAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 19054194 5' + jockey 15 1 78.77 AATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGT:1 + chr2L 6654677 5' + diver 5978 2 77.40 AAATGTATTTATTTCACGCCAGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chrX 19074916 5' - mdg1 410 2 74.66 TATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:2 - chr3R 4679593 5' + hopper 19 1 71.23 GATATAAATAATCCTATGTCCCCTCTTGGGATCTTGGGAACTGTATTAGATAAAATATATATATATTCTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGA:1 + chrX 20344947 5' + INE-1 138 1 73.97 CATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGGTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - chr3L 18126026 5' + Ivk 29 1 57.53 CCACTCAGCTGAAATGATTAAAACCTATCTCTCTCTATATATTTTTTTCTGGACCTAAATTGTCAAAGCCAGCTTCGTCTTTGTCTCTAGGATCTGTGTGCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGACGTTCATAC:1 - chr2L 22029321 5' - INE-1 137 1 45.89 CAGAAATTAGTTATTTCCTTCGTAATACGTTTATCATAATACCTACTTTAACTAATATACTTAAATCTAAAACGGACTTGATTAGTAATACGATTTTAAAACTTCAAACTAAAATTAATTCAGATAAAATTAAAATTAAAATTTTT:1 - chr3L 16942353 5' + 1360 3046 1 28.77 TTCCGGTGGATAGGTATTTGTACTTGTTTGAAATATTATGAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTAGCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATA:1 - chr2L 20640332 5' - Stalker4 7205 4 64.08 TTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 11062864 5' - roo 392 2 68.42 GCCTGTTGCTCGTTTTATCGGTCGAGCTGAATGCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGTGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAG:1 + chr2L 8900912 5' + micropia 5169 1 77.24 GAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2L 4123858 5' + transib2 61 1 62.86 GAAATGATTAATCATGTAAACAAAACTTGGCTAGCTTATACATTTACGCCCAACTTTCCTGGCCCCTCACGAATCTCAAAAACTTCAAAGGGCCAAACAAACATATAATTAATAACAAAAGCTAAGAGGCCAAAAATCAAAAAAAC:1 - chr2R 21884897 5' + Transib5 16 1 78.77 CGAAGCGTCAGTCTTGACAATTCGATCTAAATATTCTGGATTTGCAATTTAAAAAGCGTGTGAATAAAATTTATGATCAAAATGGACCCGAAATCCCGCCAAAAGAATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGC:1 - chrX 15556026 5' - INE-1 32 1 70.55 GGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 13294968 5' - roo 8996 2 69.18 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGC:2 + chr3L 16731387 5' + rover 49 2 58.22 CGGACACCAGCGCACCGCACAGTTAATTTGACGTGGCCAATGGCTTTTATGGGACGTGCAACGGGGCGTATGCGCAACAATTGACTGGCTGACCGGGGGGAAATCCGTGGTCTAC:1 + chr3R 27458749 5' + Rt1b 300 1 79.13 AAGTAAAGTTGGCGATTTAATATTTTCAAATCTTCGAAATGGTTGGACTTTGGTTCACTGAGGTTCAATCGCCAAACTGTTTGCAATCTAATCACTTGCTGCTGTTAAACCCAAAACCCTGACAGTGAGCATACGATTGCTGGA:1 - chr2L 488555 5' + R1A1-element 326 1 77.78 TATTGAGCAACAGAGGATAATCGCTTGCATATTGGTTGTCTTTTATCAAGACTACGCAAGTCTTTGAACATTTCTTATCATAAATATTTGAGAGATACTTTTTAA:1 - chrX 13697644 5' + hobo 2461 1 81.90 ATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr3L 11326780 5' + pogo 53 1 61.11 ATAGAAAGCATTTTTATTAACTCCAGTTAGCTCATCAGAAAATCTAGTCATAGAAATTCAATTTCAGCCAAATCGCCATGAAGCGAATCCAATCTGTTCGATGTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 + chr2L 1300628 5' + GATE 8269 2 62.86 CATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chr3R 30347369 5' - P-element 2786 1 16.44 CGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATAT:1 + chr3L 16973340 5' + S-element 1558 2 56.16 TGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 - chr2L 4003781 5' - mdg1 7397 2 59.72 GAAGTGTTTTTCTTTTTTGACGACTGTTATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATCAAAGGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCTGGATCAA:1 - chr2L 21726590 5' + INE-1 82 1 76.71 AAGAGAGGTATATATGTCAGCGAATCACAGGGGTTGGAAAGTTAACATTTGGTAACAAGAAATATACAGAGGGGGTCAAAAGGATTT:1 + chr2L 14843917 5' - Bari1 1707 1 77.01 AAATGTACTAAGAATTCTTCTTTTGAATATATTTTTTATATTCTAGCGGCGCCACTGGCATATATGAATATACCAAAACGTCTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAACATCATAGCGGCCTCTGCCAATGCGCAGAGCTTCTGCC:1 + chrX 4458567 5' - springer 7227 2 58.22 AATATATTCCTAGCTTAAACTTTAAAGTTATTTAACAAATATAGACTACTTGGATTTGTACAATAGTTGATGCCCAAGGTTGGGAAAATGTGAATATTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACA:2 - chr2R 8706448 5' - jockey 4978 1 71.23 TAACAAATTCAAAAGCAAAACGGACGATAGCATTATAGATTGGGTTAACTTTAAATACACAAGAATGCTCGTTCTAAAAAATAGAGTACATTCTTTGATTCTAGAAACAGATGTACACTACTTTTCATATTATTATATATACTTA:1 - chr2L 5460088 5' - Dm88 25 2 39.31 AACCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 - chr3R 17673850 5' + FB 47 1 52.14 ATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGGGTGGAATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTAA:1 + chrX 10319625 5' + mdg1 69 2 65.93 GTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCCTCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATACGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATAATTTCT:1 + chr3L 24934284 5' + HMS-Beagle2 32 2 57.69 GTTCTAAAGTCAAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATAT:1 + chr3R 18399345 5' + Juan 4054 1 34.25 CATGAAGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:2 + chr2R 11804586 5' - pogo 2079 1 69.18 AATTACCAAGTGAATTATAAAAATAAAAATCCATAGTAATGATTTTTGTGCGTAATAAAATGTTTATCTACCATTAAAAGGGTGAATCACCCCGTGCGCCCTTGATGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTG:1 - chr3R 21259148 5' + micropia 202 2 46.58 GTGCGCTTCCCTGTTCTACCAATTTTTACCCCACACACCCAAAACACACACACAGAGCATAACTAATCGCTCATACCTTGGCTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTT:1 + chr3L 2433904 5' + I-element 4996 1 48.63 AGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 + chrX 2479501 5' - mdg3 5423 2 65.75 ACAAATTTAGGAAATCCGAACAGTAAAATGAAAAAGCTAATAAAATCACAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTTCCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAG:1 + chr3R 2690091 5' + F-element 4469 1 65.07 AAGAGAATGTTGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr2R 13168603 5' - P-element 2871 1 75.34 AAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7795615 5' - roo 9013 2 58.22 CGGAAGAGAGTTGTAAAACTGATTTGGATTATTGATATTTTGGTTGTTGAGGTCGTTTTGCACAAGGAATCTATTGTCGTGCACACTTTAGAGTCCGGCTCCTTTTTGCTACATTAATGAATAAGATTAAGAATTGAGCGTGCTTG:1 - chr3R 4382750 5' - Gypsy12A_LTR 2112 1 56.85 CACACAACTGCAGCGCCACTCACACAGATACTCGCCCCCGTCCCTTCCCAAGCACGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGAGAGTCCTGACGACGATCTCAAGAAGAGGGTTCGTAACGTA:1 + chr3L 17990144 5' - opus 7115 2 50.00 CTTGGGCTGCAATCATTATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTTCCG:1 - chr3R 27133690 5' - opus 7474 2 63.77 CATTTCCTTTTCCACATTGTTTTTTTTCTACTTCCCCCGCCCCCTTACCCGTACTCCTACTCCTACTCGATTTTGCAATGAGCTTTAGCAGGAAGGCACACAAATATTATTCAGAATTACTAAGGAGTTATTTTATATCAACTATA:2 + chr3L 16475962 5' - blood 6956 1 56.16 AACACTTCATTTATAAAAAGACAACCACCAATTCCACCCCCAAGAATGAGAATCCAGCACACAGACTCTACAGGCAAATTCTAGCATGTTGGTACGCCCAAGTTGGTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTAT:1 + chr2L 22257092 5' - 1360 3356 1 71.92 CATTGATTGACCAAAATTGGCCTACTCACACAAATGTACGGGTGGTTTTTTTCTGATGCCACTTGCTTGGTTAGTAATTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAG:1 - chr2R 8746365 5' - mdg1 295 2 56.85 ACTTTGAAAACATTTTCTAATTCAGAAATAGCACAAAATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chrX 12129281 5' + flea 4793 2 59.59 TGACACTCAGAGTCTGAGCGAACGCATCCGAGTGCTTCTCTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chrX 19266952 5' + roo 8684 2 70.08 GACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chrX 19054277 5' + jockey 98 1 78.77 GTTTCACGCAATGCAGGCGATTGATTTATGATTCGATATAGGGAATTACACAGCTCTGTAAGTTTTCCAATTTGGATTTTATTAAGAGTGGTAATTGTAAATTTGTATTGCTTTGCCAATAAACGCCCTACAACCGACCAAAACT:1 - chr2L 11943429 5' + INE-1 346 1 67.59 AAGAGGAATTAGGTTTACACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:1 - chr3L 26290997 5' - Tabor 441 2 52.05 ATATAGATTTCAAATATCCGTTTCCTATACATACAGCTGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTT:1 - chr4 126676 5' - Tc1 1364 1 72.46 GGCAGCCTCAGCATAATTAAAGCCGCCGACATGCCATGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3R 8075888 5' + 412 57 2 54.79 CATTTAATTGAAAACCAAAGGGGAATTTAATATAAACGAAAGCTTAATAAGAATTTAAAAAATTTAAATCGATTTCCAGGAATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr2L 7125931 5' - I-element 5334 1 37.78 GTATGTATACATTGATTAAGCGTACGCAAATTTATATTGTATTTCGCAATTATTATTTTTGTAGTATCGTTAATATTCATTCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2L 20875827 5' + Doc 60 1 59.59 CAGTGAATTGCCATCTCGTTTGCTGTTCTGACAAAATAGCAATTTGCGTTTTCCAACAAAACGATACGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGT:1 - chr3L 17183800 5' - diver 200 2 69.66 AAGGTGCAAGGTGAACAATAAAACTAAGAACAATCTAATGTGGGCGTTGGAGTGGTCATGGAAACATGGGTCAACAATCTTGGGCTGCGTCGTGGTCTCTATCATTAACCTCAATATCAACCCTTTAGCGTTTATAGTTCCTGAG:1 + chr3L 9446433 5' - INE-1 153 1 64.83 AGAATTAAAGCACTCTTCAATCGAAGATACAAACTTTTGAGATTGATATTCTCTTCATTTCAAATTAAATTTATATAAAAAATATAATATATATAAAAATTAGAAATCTAAATTTCTATTAGAATTGATTGCTTTAAGAGCTGCAG:1 - chrX 12960931 5' - Cr1a 4247 1 55.48 AGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 - chr2L 14523250 5' + HMS-Beagle2 54 2 54.11 CGTTTAAAACGCGCGCCGCGTCGATGATTTAAGTAACAGCCATGTAATGCACTGAGCGAAATCGTATTATAAGATTAAATAAACATATTGCAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATG:1 + chr2L 4180535 5' - jockey 84 1 37.67 GGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATT:2 + chr3L 18930993 5' - I-element 5269 1 77.40 AATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 - chrX 5323159 5' - Juan 4193 1 34.04 AACATTCGTTAGGAGCATTTTACAGAGTTCTCAAGCACTAATATTAAACATCCAATGTGAAAATCGCTAAATTTTAACCATTTTACATATACATATTGAATCATAAATTATATAAATAAAACTAATTATTTAATTAATTTATTAAA:1 - chr3L 15445498 5' - jockey2 3402 1 52.74 ACCAAGATTAATGACCAGGCAAGGGCTGCAGGCCGCTCCGCTTTGGCTCATCGCACACAACAAAAGGCAATAAAAACATAATAAATTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCCCGCC:1 - chr3L 2816874 5' + ZAM 7994 2 76.23 AGTTGTAGTTTAGTTGTAAGTGTGGGCATTAAATTACAATTGGTTCAATTGAATTAAAAGCTGAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTTAGTTTTTAATTTGTTTCTCATTTTGTTCACCAATATTTATCGATATCTCAGAAAA:2 - chrX 19810394 5' + INE-1 499 1 58.90 CTTAATTCCCTGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr2R 13168769 5' + P-element 38 1 61.64 AACAGCAAGTTCTAATTCATTTGGTGTACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 23103599 5' + 1360 56 1 77.95 CAGTGCTAATATATTGAAAATTAAGTGTTCAAAGATTTTATCTAATTTTTAGACAGATGTATGTTTGTACAAAATATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCT:1 + chrX 5063223 5' - mdg1 7325 2 53.42 TATGTATAGACCTGCCCCCAACATATATCCGCCTTTTTTCCATCGGCTACATATATATGTTTATATTTATATTTATATTTATATTTATATATATATATAAATATATACATTGCGCCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTT:1 - chrX 3504032 5' - P-element 150 1 80.14 CGTGTCGTGTTTCCATTTCAACCGCGAATTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 7850068 5' - roo 9045 1 65.75 TTGTGCGGTCATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 21933278 5' + pogo 25 1 71.92 CAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 + chr2L 11391505 5' + 1360 3380 2 52.05 AGCGGAGAAAAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCTCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 19032727 5' - roo 9048 2 67.39 AAATTACATTTGACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGT:1 + chr3L 18281818 5' + Doc 7 1 79.53 AGGAACGTAATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:2 - chr2L 11257142 5' + rover 6981 2 65.52 CACACATAGCATACATAACAAACCTGCACAGATCGATGATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGA:1 - chr3L 23354511 5' + gypsy2 67 2 53.42 AAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCA:1 - chrX 22840555 5' - copia 176 2 70.55 AGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 18046708 5' - roo 9016 2 55.48 ATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAAGAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 14366563 5' - roo 321 2 82.73 AATTTGTATGACATTCGCAATGACACACTTGGCAGGAACTGGGAAAAAAAAGGGGGCGCAAAAAAAAA:1 - chrX 4758901 5' - Cr1a 24 1 69.12 ATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:2 - chrX 10521706 5' - Tabor 400 2 74.66 CACACACACACACTCACTCGCGCGCGAAGGGAGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 + chr2L 18302194 5' - hobo 2861 1 74.82 AAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 20167555 5' - roo 9032 1 55.48 ATAACCATTTTGAATGATTATGGCACACAAATTGAATTCATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chr3L 8673254 5' + I-element 16 1 69.18 TTTTTATATTCCTTTCATTGCTGTGTACATATTTTTTTTTTTGCTCTGCCTGTCAACGCGGCGCGGTTCTGGGGGCAGGCCGGTTGAAGGTTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2R 7849901 5' + roo 8672 2 70.97 GTAATTTGTGTATTTATTCTAAAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 - chr2L 6647772 5' + mdg3 21 2 71.92 CCAACGTTTATTAGCGCAATAATCGTTTGGAAATGAAAATGAATCAAATAGTACGCATTAAAAACCGATTAATATTGACAATTCACTAGAAACAAGCTTTACTAAAAAAATACCCGTCCATAACAATAAAATAAAATAATAAAAAA:1 - chrX 19366416 5' + BS4 725 1 67.12 AAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 2544613 5' + Tirant 8147 2 53.17 AGTTGGTAACGCCCCAAGTAGCAACATGTTGCGGCAGCATGTTTCCGCCGCGCTTTGTTGGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGCATGGAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCT:1 - chrX 18742947 5' + invader4 18 2 71.23 CCATTCCACTTCGTCCTTTAGCCAGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGGGGCGAC:1 - chr3R 30351927 5' + accord 7053 2 75.00 GAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAAT:1 + chr3L 3501721 5' + Bari1 69 1 65.07 CGATAATCCACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2L 17809304 5' + jockey 29 1 69.18 TGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chrX 8092495 5' + pogo 54 1 58.22 GAAAACAGAAAAGTTCAACTGATCTACAGCATTGAAGAGGCCAAGTGCGTTACCGTTAATTCACGGTCTCACCGCTTTGCCCTGCACCGCGGC:1 + chr2R 17025757 5' - gypsy8 55 2 58.06 TTTAAATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTG:1 - chr2R 12253341 5' + BS 4653 1 57.89 ACCGTTATTCCAACACGAAAATACATATTTCTAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATATAAATACATATATGCATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAG:1 + chr3L 23688510 5' - Quasimodo 7325 2 55.48 CATCGAAAACTAAAAATTTTTTTAATCGAAATTCTCTTTCGTAAAACTACAGTGTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 - chr3L 22723968 5' + HMS-Beagle2 6915 2 62.33 TATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACA:1 + chr3R 19450175 5' - roo 8727 2 80.82 TTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 - chrX 7795634 5' - roo 9032 1 58.22 GAGCAATTGTCGCTGGAAAAGGAGGAGTGACGAGGGTGGAGTGGGGACAAGGGTTAATGCCATCAGCATATTTATATAAATTTCTGTGGGTAAGCTTTACTCTAGTGTATCGACGTAGTTTAAAAATAAACAGTATGGGAAAATA:1 + chrX 4345930 5' + diver2 301 2 66.21 AATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 - chr2R 6964850 5' + Burdock 6201 2 73.60 ATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 - chr2R 5479978 5' + F-element 89 1 67.12 AAACTGCATTTGTCCACTTTGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chrX 19038495 5' + hopper 35 1 61.64 AACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCCCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTC:1 - chr3L 16470367 5' + jockey 4732 1 55.48 ATAATATATTAAAATTATGGCTGTAACAGCGGTTTGTAATCAAAAAAATATTCTCAACTTTTTAGCTTTTATAGCTCCCCAGATTTCAGCCTATGAATCTGATCAAGAACTTTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATT:1 + chr3L 22753828 5' - FB 240 1 78.77 AGCCGCAACAACGGCGACGAGGAGGGTTTTCAGTTTAGGGTTCGTGTTTGGCATCTATTTTTATGCGACAACGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 24450407 5' + 412 48 2 50.00 ACTGTATCGCCGAGAACGCCAATCCGGCGGCGGAGATTGTCTGGTTCCAGGGCGAAGTTCCAGTCTCTACGGGTGAGTTTAAGTCATATAATAATAATATAAACTTTAAAGTATATAAGTTAATGTGTAATATGTTATACTATCCT:2 + chr2R 15036437 5' - G5 4675 1 74.66 AAATGAAATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chrX 10537800 5' + I-element 7 1 78.77 ATCATTGAAATGCCAACAATCATACGCAGCGTGGGCGCTCCAGCTCAGCGAGCATAAAACAGTAACAACAGACATCAGGTTGTCATAAAGAGTGTTTATTCTTTGAATATCCAAAACGAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAA:1 - chr3R 13907776 5' - springer 130 2 64.83 TGATCATCAAGAGTAATGCCTAAATTTAAAGAAAAGCTTATTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTA:1 + chr4 972204 5' + Doc 4507 1 71.72 GGCCGGTTTCAAGCGCAACAGTTTGGTTAGTGCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 + chrX 1135326 5' - P-element 2799 1 25.34 ATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:2 + chrX 18009936 5' - 412 7482 2 60.27 ATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 - chr3L 11844820 5' + rover 58 2 63.70 AGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 9544852 5' - roo 330 2 71.23 AAAAGAATTTACATATTTTTACATTTTTGAACTCTATATTGTAAATTAAAACGGTTTCTAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGA:1 - chr2L 4001646 5' + mdg1 405 2 59.59 TACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATGTTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 4219429 5' + jockey 20 1 67.42 ATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 + chr2R 22034617 5' - copia 227 1 65.75 AAAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3L 21769143 5' - I-element 5326 1 58.90 AAATAAAAAACAGTTGTATAATTTCTTCATTTTTTTTTAAACCTTCGGAAGCTTAAAAGGCTTATTCTCCGGTATTTTTTTTCCCGGTTTTTTTTGGCTTGTTCTTAGCTTTCCTTTTTGTTTTTTTTTTTAATT:1 - chrX 19345164 5' - Doc 4700 1 45.93 AAATAAAAATATACAGCCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAT:1 + chr3R 19449948 5' + roo 402 1 56.85 AGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 + chr3L 15103797 5' - Transpac 256 2 54.79 TCGGAAATACAGTAAAATTTTCAACCGTCTTCATAGTGATTACAGAGCATGTTTCATAACCTTTTATTGTAGTCTTCCAATTAAACGCATTTTGAGAAAAAAAAAACAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTTTCAGATACC:1 + chr2L 21362885 5' - INE-1 557 1 66.44 ATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 - chr3L 15103904 5' + Transpac 55 2 60.14 CCATTCTTGGCAAAATGATAGCATAGAAAAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 + chr2L 18347231 5' + transib2 7 1 78.08 CACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 13294874 5' + roo 53 2 54.79 GACCGGCATGCTCAGGAAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGGTGGACAGCGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATTGGCGCCCAACGTGGGGCCAGTCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTAC:1 - chr3R 2993049 5' + Circe 280 1 85.93 AGCAACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr2L 16540934 5' + hobo 56 1 68.15 CTTCCCATCTCAACGTGAAATACATTTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCTGCAACAACAACTAAGAAAGTTCTAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCAAGCAATTAGTT:1 + chr3R 29690671 5' + I-element 5216 1 60.00 AAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCG:1 + chr2L 11391487 5' - 1360 61 1 58.04 TTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 + chr3R 21276508 5' + BS 5032 1 58.22 AAAATAATAACATAATTTAAGATGACTTAGAACTTACTTAGTGTTTCTTTTTAATGTGTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACCTAATTTACCTTACCCATGTTTACCCACCAATT:1 + chr2R 5731319 5' + FB 72 1 60.96 GGCAGCTTCTAAATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATA:1 - chr2R 5321238 5' - INE-1 509 1 68.28 CATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 - chrX 22840580 5' - copia 5070 2 53.42 GTACAGCTCTGATTGAAATACCGCTTTCGTCTGGCAATGCAACAGCTTCATTTGGACAACCAATGAGAAAAGAAAATGAAAAAAATCAAGGAGAAACCGAAAGGTGGAAATCAGCACCACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAA:1 + chr2L 14551149 5' + gypsy7 5009 1 76.71 AAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 11810617 5' + roo 8708 2 54.11 TTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTT:1 - chr2R 9967123 5' - Bari1 1639 1 64.58 ATAAATGGCAACTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 5389832 5' - roo 9042 1 65.75 TGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:2 - chr2L 12250982 5' + 412 72 2 67.12 TTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCTG:1 + chr3L 13836624 5' - 412 456 2 59.26 AACACTGAGAAATAAAACACAATAAAAGAAGAGCAACTACAACTTTTGGCAAACACTGACACACACCCACTCCGCTCTCTAATGATGATCCCAAAAGTCAACTTGCTAAAGTAACACGAGCTCAAACATGCACATACACACACACA:1 + chr2R 18958365 5' + accord 247 2 67.81 AATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 + chr2L 3675826 5' + Juan 4066 1 52.74 CATGGATGGATGTAATTATATATAAAAATGATTTTTATACCCGTTACTCGTAAATTAAATTGGTTGAAAATTATGTAACAGTCCGTTTGTCCGTTTGTCCGTATCAACGTTGAGATACAGAAACTATAAAAGCTAGACGGTATAGA:1 - chr2R 6948986 5' + INE-1 162 1 57.53 GTGCATGACTGAACATAAAGAAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 - chr3R 30813424 5' + FB 64 1 62.33 ATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCTTAAA:1 - chr2R 2745201 5' + Stalker3T 123 1 74.48 AAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr2R 21116481 5' - mdg1 359 2 63.01 ATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 - chr3R 21630341 5' - I-element 5285 1 67.12 AGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:2 - chr3L 16437269 5' + F-element 51 1 45.21 ATGAGAGTGATGAATTCTCCCTGTTGGCCGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2L 9072176 5' + Tirant 8147 2 78.57 TTTTAAAAAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAAC:1 - chrX 21100303 5' + mdg1 7053 2 76.03 CTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATGCAGGCAACTTAA:1 - chr3R 15072684 5' - pogo 2061 1 56.16 TGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 + chrX 19074745 5' + mdg1 41 2 53.42 AATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr3R 30813356 5' + FB 30 1 62.92 AGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGTAGCTTGGGTCGGAAA:1 + chr3L 22890362 5' + FB 4 1 66.67 AAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAT:1 + chr3R 6419838 5' - Tabor 429 2 59.31 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chr3L 3983880 5' - P-element 2809 1 32.88 TTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCATGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr3R 21933237 5' + pogo 66 1 65.75 GCTAGCAGAACTAATAAAATAGTTCGTTTCAGAATCTTGTAAGCAGGTCCGTTATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3L 27130348 5' - 1360 3362 1 64.76 AGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - chr3L 18931043 5' + I-element 75 1 67.12 ATAAAGTCTTGAGTAAGCAAAGTATTTAAATAGGCAAACGCGTAATGGTAGCCGTTTAAAAAATTCTTTTTTTTTGTTATAGAATTATATACGGCGATTATTTTCAAGTGATGAATTTCGCACTTTTACGATATTTCATTTTTTTT:1 + chrX 5167749 5' - P-element 146 1 71.92 ATTTTAATTTCGTATTCACGCATCGCTTAGTTGTAAATCCATTTGGTACAGTGAAAACCAGTTTAGTGGAAAACAACATATATCTTGGGTAATCGGAACTAATTAGTGGCAAGCCTGTGGGGAAAAAGAAAAAGGAAAATAAAGAA:1 + chrX 9443932 5' + Doc2-element 253 1 76.03 ATCTGACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGCTGTGTGCG:1 + chr3L 6964718 5' + P-element 83 1 28.08 ATCATTATGGAAAAGAATCAAAAAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAAT:1 - chr3L 21769164 5' - I-element 5347 1 73.29 ATATGTTAACTTACGTGTTTGGTATAGGCTTGCCTATCAGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 - chr2R 15005159 5' + BS 5010 1 60.27 GATATGTGGAGCTCCACATTGTACTATGTACACATATAAGCTACAAGCTGCTTACAATTAATCTCGAGTGACCCTACACAACTGACCTACAATGAATAGAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAA:1 + chr3R 16603489 5' + F-element 336 1 76.12 ACCAGAACCGGCTGCTAGCCGCTGAACAACAGCAACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGGATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chr2R 7090780 5' + I-element 8 1 78.08 TATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAA:1 - chr3L 19350049 5' + 1360 3196 1 68.60 AACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 24219391 5' - roo 9033 1 57.53 AGAGTACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCATCA:1 - chr3R 10736184 5' + McClintock 5957 2 75.34 CATAATGGGGCCAGCTAGCAAGCGAACTGGGTACCGAATCTCCCAGAGGCTGCATAGGCAAACCTAAAATAAAAGAAAAGGAACACAGACCAAAAACAGAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGT:1 + chr2R 14956814 5' + I-element 4995 1 69.86 ATATATATATAGATTTATAGATAGATTCCATTTTCGTTTGCTTAAACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 - chrX 13314478 5' + mdg1 37 2 57.53 ATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:2 - chr3R 30347463 5' - P-element 2870 1 70.55 GGCGTCCAATCTTTTGTCGTCGTCAATCAAAATTCGAAATTTCTTTGACGCATTCTGCGGATGCATGCGCCTAGGCTTTGAATTTCCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTA:1 - chr3R 15128548 5' - R1A1-element 44 1 58.22 ACTTGCCGGTGACGTATGTGGAGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTATATAAGAA:1 - chr2R 24655206 5' - gypsy 302 2 78.85 AAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3R 30347459 5' - P-element 2872 1 70.71 GTGAAAATTTCTAAAATCCCACATATATCGTGAGAGTATATTGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGG:1 + chr2R 17926315 5' - opus 7493 2 52.50 GAAATATTTTGAATAGTTTTCAATGCCAATGGCATCGGGTGAAATTTGTCTTAGACAGTGCACTGCAAAAAATGCACCTAGTCCAGCACTTTCTGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTACGGCGT:1 + chr3R 14483486 5' + 1360 414 1 66.67 ATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGTGGACGAATTTTTTTT:1 - chr2R 13168710 5' + P-element 97 1 21.23 AGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCACGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2R 17796575 5' + jockey 4713 1 65.00 AAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3R 30347459 5' - P-element 2867 1 68.28 AGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:1 - chr2R 23780603 5' + Ivk 47 1 56.56 ATTTAAGTTTGTTGTGTTGTTCACTTATTAATTTAATTCACTTATAATGTTTGTTATTCACTTAGTTATAGTTCTTTAGCTTAGGTTTTGTTGAATTTTCGCACTTATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAG:2 + chrX 8823735 5' + rover 353 1 78.77 CCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr2R 22034621 5' - copia 223 1 63.01 ATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 23295590 5' - P-element 2841 1 25.34 GTGGATCCCTATTTGGGTGAACTATAGGGCGATGGCGAAACTTGATGTAGGACGTGTGTACGGATTATGAGCGTAGTCACTCGGTGCTACAGCTGTCATAACAGCGGATTAACATTCTATGGGTCGATCCTAATTGAACTCAACTG:1 - chr2L 19010957 5' + diver 5957 2 76.71 AAAAAGAAAAAACACAATGAGCCAGAACGACACTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCCCATTGCAACGAAACAACGCGCACTTCTCTTACGTCTCCGCG:1 - chr2L 12150090 5' + Doc2-element 359 1 85.22 AAAGTACAAGGAAAATTAGAAAATCTTTACAGGTCCCAGAGACAAATGGCGAAATGTTTTTTGATGTTGGGCCGACGGCGAGGGCGATATTTTTATTAGACATTTTGATTTATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTC:1 - chr3L 19581155 5' - invader1 4003 2 58.22 AAATGAAAACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 - chr3L 21327204 5' + copia 29 2 65.28 ATCTACGTACTAAAAAGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATT:1 - chr3R 17615232 5' - Tc3 305 1 76.55 ATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:2 - chrX 10167437 5' - roo 314 2 80.82 AAAAAAAGGGAAAGAGATGGGTGTAAGGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 4341223 5' - roo 9047 1 67.12 AGATCTTTAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGT:2 - chr3R 18971794 5' + Juan 4080 1 52.74 ATTGTTTCATTATCTTCAATGACTGATTGTAAGAAATTGTACAATTGGACCCAAGTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAA:1 - chr2R 7244942 5' - diver 193 2 67.81 AGCTGCTGCCACTTCCCAGCATTTGTGCTCAATTTTTTGGACGATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr3L 21763819 5' + jockey 29 1 69.86 ATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chr3R 19992723 5' - hopper 1343 1 65.75 GGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAT:1 + chr2R 12779647 5' - I-element 5270 1 73.97 CATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2L 15936877 5' + copia 4918 2 52.05 ACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAA:1 - chr2L 1924025 5' + G2 3011 1 53.42 TTTCGGTCGCCTGCAATTCAATGTGCCTTAAAAACAATAAAACACCTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCT:1 - 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roo 401 1 66.40 GTTGTACAAGAAATACAAATTTGCAAAATAAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAA:1 - chr3L 22485598 5' + BS 4913 1 78.42 TGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 + chr3R 8051114 5' + jockey 4812 1 56.85 CTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAA:1 - chr2L 7618568 5' + X-element 4461 1 52.46 AAATATATTGCCTTTATAAATAAAACAATTTGTTCCGTTCTTCGATTTGTAAAGTAAAAGTACAGTCAGTCGAGATTTCTAGAAATGCACTACTTTTTATCAAATTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 14574801 5' + FB 175 1 68.38 GACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCG:1 - chrX 22386792 5' + hobo 52 1 63.27 ATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTACACATCTCAACCCACTGTGCACTGTAGTCATTGCGTTTTGCCGGACCATTTGACGCCTAATAGGAGCCACCGTCGCCGTTTCAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACA:1 - chr2L 20840118 5' + mdg1 7054 2 73.29 ATGGCGCTCAGAAATGAATTCAAAATTATTGCTGGCTTGTTTGCGGTCAATTTCGACTGCAACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGCCAATTAAACTGAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr3L 22325948 5' + hobo 15 1 75.34 AATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr3L 2544614 5' + Tirant 61 2 58.90 AGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 809626 5' + jockey 30 1 62.86 GAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTA:1 + chrX 3431841 5' + Ivk 5341 1 56.16 ATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 - chr2R 13259404 5' + mdg1 7078 2 55.48 ACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chr3L 12004248 5' - P-element 2819 1 40.41 ATAAGAGTGCTTATCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCCTCATCATGCCAGACCCGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATT:1 - chrX 21087715 5' - mdg3 228 2 69.86 GCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 27123612 5' - roo 9044 1 66.44 ATAATAAGCCCGTCTAGGTTGTGATAATGTTGTATTAAGTATCCGCAACGTGTACCAGGCCATCGACGCGTGACTTTCGATCATTGCAGTGGAAACTGATTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr3R 15376219 5' + jockey 4689 1 68.28 TGCTAATCCATATACTTACAGGTGTAAGGCTTCAAATGTTTTCACGGAATGTAAGGGTGAATTCGGATTTTTTTGTTGTGTAACATGCAATTTATGTGTATTTTTACAGAAGTATAATTCATTTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTC:1 - chr3L 27293011 5' + transib2 434 1 53.42 ACTTGTTTGTACATGTGTGCGTAGCACCATGCGTGTGTGCATGTGCGTTACTCTCAACTGTCAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAG:1 + chr2R 12837232 5' - micropia 5361 2 56.94 ACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGTGTAAACACAAGGGCCCAAAATGCTGACAAAAGGTCTGCATTCTTTC:1 + chr2R 18316051 5' + HMS-Beagle2 80 2 66.90 TAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chrX 21224554 5' + roo 74 2 71.33 GTATAATGTATATTTATATTATTTATGCCTCTAACTGGAACGTACCTTGAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 + chrX 14262272 5' + HMS-Beagle 36 2 58.77 CGGGAAAAACACGTTAAAGCCATTAGCGCGTACCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTAAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACT:1 - chr2R 14457098 5' + F-element 4618 1 59.59 AATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTT:1 + chr3R 22590493 5' - rover 7224 2 70.55 ATCAAAAGACCCCCTACAGTAGTGCCAATGAGCTGTTAATGCGAGCGGCAAGGATTTCATTTCATTTTGTTCGCTCTTCTTTTTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chr3L 10942373 5' - gypsy7 5010 1 72.07 AGGAGTTGATCTTTTCTAATATAATAATAATAATAATAATAATAAGGTTAATCGTTTTTTGATGTTCTTTTTCATAATTTAATTGCCAATAAATCGTTGATTTATATGTTTATTTATTTTAATCGTTTTATTTAATTATTTTAT:1 - chr2L 16164087 5' - Doc3-element 82 1 73.61 GCCAGTTGTCTGGCGTCTCGATCTGACCACATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCTGACTAATCCAGTCGGGACTCTCAACACCACCACGA:1 + chr2L 22207133 5' - Cr1a 4060 1 73.94 AAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 - chr3R 31886956 5' - hopper 1371 1 55.17 ATATAAAAGGTTCACTGAATACTTAAAACTAATTACGAGAACACAATAATAATAAAAAATCAGAACTCAACTACAAACCCAAATAAAACCCAACAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTT:1 + chr2R 611671 5' + F-element 133 1 64.38 AATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTCTCTGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCTTTGGTGAG:1 + chr3L 18452044 5' - Doc3-element 391 1 57.14 AGAAGTCCTTGCCCAGCTGGTAGACCTCCACCTCCATGGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGC:1 + chr3L 2666142 5' - gypsy12 10168 2 55.56 AGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAA:1 - chr3R 21276645 5' - BS 5054 1 48.63 AAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATATAT:1 - chrX 14979248 5' - INE-1 80 1 60.74 TTATAATTTATAATTATAATTTATTATAATAATTATAATAAAAGTCAGGGCGCGAATTTTAAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAG:1 - chr3L 20297264 5' + 1360 3162 1 73.97 ATTTGAGCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr2L 4003822 5' - mdg1 398 2 66.44 CTTTATTTATTATTGGTAGTATAGATGTCGGAATGAGATGGAGGAAAAACAAGAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTTAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGAT:1 - chr3R 903944 5' - INE-1 510 1 71.03 TTCAGAGCTGCTTAATTGGATGTGCTCCATATGAGCAAAAAGAGGAGAGCACACAAACTACAAGACCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACG:1 - chr2R 8253474 5' + jockey 485 1 55.48 GTGAATGTTAAGTCGGCGGATGTTGGGTTATTGAAATTAAATTGTGTGTGGTTGTTGTTGAATTGTCAAATGTATTGCTTGTGAGTATTTTCAATTGTTTACTAACTAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGG:1 + chr2R 1576681 5' + transib4 408 1 73.10 AGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 + chr3L 22890369 5' + FB 76 1 67.81 AGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTT:1 - chr3R 27406055 5' - diver 153 2 64.38 AAATGCAATCGAAAAATATATGAATTTTTATCAGATTGAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTT:1 + chrX 7701032 5' + hopper 302 1 74.16 ATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCC:1 + chr3R 9485829 5' + micropia 4987 2 59.40 ATAGACAACAACAGCAGAATATTACAGAAAGTGACTATAAAACACTGATGGTGATATATGGGTGTTTGTATTCTCAATGCAAGAAAGTAGTGGATATTATTATTATTATTATTATT:1 - chrX 13631880 5' - mdg1 28 10 79.31 ATAAGCATGCACTACTTGTCCAACCAGTTTGGGCTTATGATTTAAATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr2R 6964894 5' + Burdock 6178 2 56.85 ATCTTTGCATGTTTCTTATTTATGGTAGCCCTATAGATCATGGTTGAAGCCAATTTCCTTGGGCTTTGGTCATTTCCCACTCTCCGTTAGCGAATGGGCTAGTTGTTTCCCGGG:1 - chr3L 22042681 5' - baggins 264 1 71.05 TGAAAATTTCAAGTGTGTGTCCGTCTCAACGTTCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACA:2 + chr3L 23127785 5' + Stalker4 403 1 76.71 ACAAATATGTATATCCACATATGTATATAGCTAGTTATATGTTCGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATA:1 + chrX 16760402 5' - Quasimodo 38 2 61.64 AAAATGCCTCACATAGTCTCTTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2R 22992463 5' - hobo 2915 1 55.43 ATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:2 - chr3L 12315820 5' - transib2 2760 1 60.27 TCCAAAGGCCACATAATCCATTTAAAATGCATGAATAAATAATAGGCCTATTTAGAAGATTATCCTCGTTGTCAATAACTAATAACTATTTCGGCTGCATTCACCTCTTAGACAGCGGCGCGCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATA:1 - chr3R 11522396 5' + Tabor 7081 2 71.23 ATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2L 16564552 5' - roo 8989 2 78.08 ACTCCATTTGTATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGTAACTAATTTTATT:1 - chr3R 13300974 5' - roo 9033 1 55.00 GGCGCAGTGATGGGGCACATTTGCCTTTCCTGCTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACT:1 + chr3R 30122135 5' + G-element 62 1 56.16 ATTTGAACGCCATTCAGACAATGTGTCCGCACATCATGCGTTACCATATTGGTGACCCCGCCATTAGCAAAATGCATAACACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACCCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGC:1 - chr3L 16785917 5' + Chimpo 284 1 67.81 TGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 + chr3R 17673768 5' + FB 84 1 76.03 TAACGCGTGCCAGTGTCCAACCTCTGTCACCATTTCTACTCTATTTCCCCGAGTGTGTTCTGCCCACGGAATTTGTTTACACAGCTGCCAGCAGTTTGCGGAGCGGAGAAAGAAAAGAAAAAAAAAAACAAACA:1 + chr2L 9679913 5' + gypsy7 5012 4 75.37 GTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chrX 8092386 5' - pogo 2038 1 59.59 AAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCAT:1 - chrX 4808617 5' + mdg3 5309 2 54.11 CTATAGATAAATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATA:2 - chr2R 20010738 5' + Juan 4103 1 74.66 AAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr2L 18347274 5' + transib2 50 1 53.42 AGACTGGAGTTTCATTGTCTGCTGTACAACACTGGGTTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTTTTTATTTAGAAGCGATGAA:1 - chr3L 13365851 5' - BS 5082 1 64.60 GTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr2R 6847854 5' + Doc 56 1 53.42 AGAATCGCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGAC:2 + chr3L 11844681 5' - rover 7271 2 65.07 TGTAAATTCGACAAAATATGCTTTTCACCTTATATGTAAAAAATTCTTGTTTCGCTTGCGGCGTGTAAAAAATGAATAAGACACTGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAATATATGACCAAAGCAAAGACACT:1 + chr3R 4571527 5' + 1360 495 1 55.17 CAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTT:3 - chr2R 9967157 5' - Bari1 1671 1 60.96 ATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCT:1 - chr3R 10970341 5' + G-element 59 1 56.55 AATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 15791000 5' - roo 9004 2 65.07 TGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCC:1 - chr2L 6647731 5' + mdg3 5255 1 73.56 ACCCACTGAACATAAAGGTGAGACATAAAGCAAAGGAAGCGAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATAT:1 - 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INE-1 302 1 65.07 TAGTCACCTAAAAAAGGTAGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCG:1 - chr3L 22760585 5' + F-element 4345 1 80.21 GTTTGGCTTTTAAATTTTTCTCTATATCTTCTCAAAGGGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCAAAGGAGCGCAGAGTGCGCG:1 + chr2R 18485394 5' + Porto1 396 1 68.97 ATTGACTTTTGCTTTGTGGCTGTTTGCTCCTCTCATCGTCTGATAAGATATGCGATCTTACTACTACTACTACTATTTGCCCACTTGAGATGTGCTAACTGTTTCAATATTTGAATAAAATAAAATAATTTAATCAGATCA:1 + chr3L 2433422 5' + jockey 4933 1 79.43 AATGGANTTTTATTGCATACTCGCACTCGCATTCTGTTTGCGCAAGCGAAACATGTTTCACTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATA:1 - chr2R 13389355 5' - Circe 7090 1 58.90 ACAAGAAGAAAATGTGGCACAAGGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 + chr3L 16690860 5' - I-element 5337 1 60.27 ATAATAGTAATTATAAAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAGTGACAAT:1 + chr3R 19073142 5' + roo 19 2 63.45 CAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAGACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGCAATTTT:1 - chr3R 15325190 5' + 297 6635 2 53.42 CAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 21224515 5' + roo 8681 2 68.80 AGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGT:1 + chr2L 15550653 5' + Bari1 54 1 52.05 ACCTATCAGCTATTAACTATTTTAAATCGTGTATATATGTATATATGTATATAATATAGTATATAGGGTTTATGCGTAATTGTTTTAACTTTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATT:1 + chr3R 18093217 5' - mdg1 7078 2 78.08 AGTTAGTGTATGAGTAATGAACGAGTTAAAAAGCGTGAAGGCATTTGGTCTATTTAACTGTTTTTTATTTTAAATATTTAAAACTATTTAAAACTAAACTAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGC:1 - chr2R 25105343 5' + R1A1-element 381 1 69.18 GACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCG:1 + chr3L 6964722 5' + P-element 10 2 53.62 ATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 29084877 5' - 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chr3L 21769089 5' - I-element 5272 1 73.29 AATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCCATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAG:1 - chr3R 15790128 5' + flea 4725 1 72.22 ACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr2L 16943907 5' - copia 238 1 50.68 ATCACGGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGAC:1 - chrX 15200947 5' - 17.6 441 2 56.85 AAGCACATGACAGCTACACATGAAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGG:1 + chrX 21585235 5' + mariner2 262 1 67.81 AAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr3L 10731735 5' - 297 6950 2 66.44 TTTTAATTCGTCCTTGTTCTCCTTATGATCTTCGTCGTTCTCTTCGTCTTCAGATTCTCCAGAGTCCTCTTCATCTTCGCCGGATTCCGCATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATAC:1 + chr2R 24667678 5' + 1360 3213 1 67.12 ATTTAATGTCATGCATTGTGCACAAATATTTATAAAGTCGCTGAACGAAGTTGTTATGAACCTCCTAATAGACAAACATTATGAAGCTTGCACTCAGCTAAAAGATTCTAATTTAGGGTCATTTTAAATGCAATATTATGCATCGG:1 - chr3L 11762667 5' + Gypsy12A_LTR 97 1 65.07 CATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTT:2 - chr2R 5206897 5' + G4 3770 1 56.16 GTAGCTTCTGCATTATCCTTAACTTCTGTTCAACTCCTTCGGCTTCGATTTCTGCGTGAGTGCGTGCGTGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGAAGGTTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTAC:1 + chrX 18132548 5' - 1360 3162 1 63.01 ATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGGGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chr2R 13168704 5' + P-element 103 1 17.12 AATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 3920560 5' - roo 318 2 80.14 AGCTTGCTATTCAAGTGCAGCAAGAAGATACATTTGACATCTCAATTAATTATTACAGTAAAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 - chr2R 7304111 5' + pogo 68 1 65.97 CATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCC:2 + chr3R 5523900 5' + FB 55 1 56.16 CAGCTGCTGAATTTACGAAGCCAAAAAGGAAAGTCATTCTTCCTTTGCAAAGAGAAAAAGTTCTTAATTTGTGTTAATTAAGTGTTCTGCTAATAAAGGATATGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2R 949620 5' - 1360 3370 1 56.55 TAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGATGACATGAAAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCGACGCAG:1 + chr3R 19449923 5' - roo 304 2 52.34 TGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTAAAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTAATTTGGAAATATC:1 + chr3L 14366539 5' - roo 9023 2 60.00 GTGAGATATTTGAACGATTACCTATGATTTGCCATGTGTTCACCATAGTTCAAACATTTCTATCATCGCGCTCGAAGAAGCTAGCGTCCTAAAAAAAAATTATTAAAAC:1 + chr3L 2945895 5' + Tc1 50 1 87.16 TTTACATTATTGTATAAATGCACATTAGATTTTCTATATTTGCTTAAATAAGTATATAGATTGTTGGTAAGTAGTGTACGTAGCATGGAGTTATGTAAAAAATGCATTGTCAAAACTGTCGCTACACACACACACACATAAATTAC:1 - chr2L 10910901 5' + Quasimodo 40 2 80.14 TTCATTTTTGAGGATACGTTTGGACCTGTCGTTTTTTCTCTTTTTTTAATGTTCTTGCCATGCATGGAAACTGCTTCTATGTTTAAATCATTATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTT:1 + chr3R 12781257 5' - Porto1 4361 1 58.91 CCAGAGTATTTTTGTTGGCCCGGAGCTCCGGCAAACTGCCACAGGAACCAGAAGAGAGACCGGCTAAGGCAGCAGCAGCAGTAGCAACAACAACAATAATAACAATAA:1 + chr3R 15019276 5' + mdg1 7058 5 73.15 ATTTGGACATTTAAATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 17940023 5' + 1360 1 2 69.18 AATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATC:1 + chr3R 11937308 5' + flea 57 2 63.24 TTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGAGGCTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATT:1 + chr3R 3922965 5' + Cr1a 99 1 77.40 AATTCCGCTCGTATTTTTGCAGCTGGTCTCGGCGTTGCTTTTTTCGTCCCCGTTCTCTGGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACAGCCCGCAAAAGTTAATTTAACAGCGCATCATTATAATAACAGCTGTT:1 - chr3R 4679065 5' - hopper2 1469 1 59.59 AGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGT:1 - chrX 22460191 5' - HB 1541 1 78.77 AGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTT:1 - chr3R 10736139 5' + McClintock 51 2 57.53 AAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1 - chr2L 6647747 5' + mdg3 5298 2 54.79 AATGTATATCTTCGTTGATGAAGTCCAATGTGCATTGATAGCGTACATGTTCATTCGACAACACAAAAAGCCTCATTCGAGCTGACCAATATCCACATTTGTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACG:1 - chr3L 23287624 5' + 1360 3275 1 43.84 ATCTTATAAATTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - chr3L 20711742 5' + jockey 4777 1 70.55 TCGCTCACTTTGCTACTCAACTTGGTTGAGCTGCCCTTTTTTAGAAGTTCTGAGTTGTCTCGTGCTGCGCGCCGCCTCACTGGCGTTTTTGCATTTGACTGAGTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAA:1 + chr3L 22851759 5' + FB 685 2 72.73 TGTACAATGAGCAAATGTTTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAA:1 + chr2L 16539546 5' + Juan 4051 1 47.95 GTGTGCCCCTTCCCCTGGGTGCCCACTTCGTGGGGAAATCGAATTAGTAGGCCAAGTTATTCCACTATAACTTTAATTCTCAAAAGTAACGAAGTTAAATTACACTTATCTAGAATTAATGCCCGTGTTGAGTCATGCAGCCGCCA:1 + chrX 20356646 5' + diver2 4532 1 53.42 ATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 + chr2L 6654653 5' + diver 66 2 60.96 TTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1 - chr2L 13556491 5' + transib2 12 1 71.92 CATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCC:1 - chr2L 7618527 5' + X-element 4500 1 73.33 ATAACCGATAAAGCCGTAAGCCGCAAAACAGTTTAATTTATGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGCTG:1 - chr3R 18634214 5' + flea 4777 2 67.81 CATGTCGCCACCGCCGGCGGTTGCCCGCCAAGCGCCGCTCGTCGATAGATAGCACACTGTTAATGAAAAATTGAAGGATCGTTAGCATCGCCACCCCAGCACAGTGCACACACACACACACACACA:1 - chr2L 7999283 5' + accord 182 2 89.68 ATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAATACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTT:1 + chrX 8092362 5' - pogo 2063 1 57.93 CATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr3R 23295599 5' - P-element 2850 1 31.51 CACATTCGGGCATTTGGATAATCAGTTTTGTTTTCGCACACACACGCACACACACAA:1 - chrX 12927733 5' - Stalker 444 1 92.98 GACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATACCGCC:1 + chrX 22906771 5' - transib3 2740 1 69.44 AGGATGGGCTGAGACAAATTCATATTTTCCTATCCCCTCCCTTGAGTTATCCTTTGTAAATTGAGCACGGAAATATCACACATTTCCGCATGCATTAAGTTTTAAGCCAAGTCTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 20129448 5' - accord 185 2 56.82 AGATTTCTCAGGAGTTTCAAATCACAAAGCAGTCTCATTTGACCCCATATGTCAACTGAACACACCACTGGCGCATATAACTGAATATAATGTATTGCAACCATCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACA:1 - chr3R 7740445 5' - 1731 4469 2 75.17 TTCTCATTCAAATCCCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTTCCCATGTTT:1 - chr2L 14671917 5' + FB 61 1 63.01 CTCAAGCTATCTATCTAAACAATAATGTATCAAAACTTGAACCACTAATACATTCAGACAAAAGAAATAATCGAACAACACAATCAGTTTTGAATTTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTC:1 - chrX 22218819 5' - 1360 328 1 59.59 TCAATTCAATTGATGCAACGTGCTAATCACTTGCTTACTACAAGAATATATATGACTAAATGCAGTTTTTTTTTTCATATTTTTATAATAATTTAAAAA:1 + chr2L 12494066 5' + looper1 245 1 66.67 TTTTGTTGACAACTGTCTTTTAATATAACTAGCTGTCGGGCGGCAGTTATTGAGTTGGTGAACGCAGAACGTGTAACGAACTAAATTGATTGAGGGTGCACGCTTTAGAGACCGGCTCTAGCTTATGGCGTTGGGTGTAGTGGTCT:1 - chr3L 24240856 5' - Gypsy12A_LTR 2176 1 67.12 AAATGCAACTCACCCGAAAGTAAAGAGGAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 - chr3L 21656013 5' + HMS-Beagle2 29 2 64.38 ATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr3R 8890029 5' + FB 61 1 63.50 AAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2L 18226797 5' - roo 8988 2 77.24 ATGCTAATCGAAACGAAGGTAGAAGTAATAACATAAGATGCGTTCTACGTATAAAAGATATTCAGCTTCTTTTGAAGAAATCTAATAAATACTAAAACTTTCAATTGTTTTTTTGATGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 14104569 5' - gypsy11 3933 7 65.89 GTATGTACGACCATCCAATAACTCGGGAGCAAATCGAACTCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr2R 21692517 5' + jockey 4684 1 76.71 ATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTC:1 - chr3R 9238191 5' - P-element 38 1 17.86 AGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 - chr3L 23906458 5' + 1360 79 1 71.23 AGAAAAGATTTTAATATTTATGGCAATTTCTAGCTGAATAAGTTTCAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATT:1 + chrX 21221949 5' + roo 8771 2 68.49 AGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATAGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 7719808 5' + roo 73 2 71.03 TATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGCGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGG:1 + chr2R 9966944 5' + Bari1 26 1 43.15 TTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:2 - chr2L 13556456 5' + transib2 47 1 49.32 GACTAAGTCAAAAATTTTCTAATCAAATAAATTTAACATTTTAATAGGTTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACG:1 + chr3R 9140479 5' + I-element 4924 1 62.50 AACATCTAACGATCGGCAGCAACATGTTGCAGGCAAACCCAAGACTGCTTTAATTTTTAACATTTTCAATTTTATACTTGTTGATGATTTGAACAGCTGTTATATATTATCAAATAATAATAATAATAATAATG:1 + chrX 15626636 5' + mdg1 7081 12 50.00 ATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chr2R 16510093 5' + F-element 65 1 51.72 TTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 - chr3L 18505717 5' + I-element 86 1 77.40 AATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 + chr2R 13259307 5' - mdg1 343 2 73.19 ACTAGCCTGCATAGGCAATCACACTTGGACTCTGGCATGGGATTTTCAAATTTTAGTTCAACTTAATTAGTTCAAATTTGAATTTGAATTCGAATTTCGGGCCCAACGAGCGCGCGGCCG:1 + chr2L 7749335 5' - Rt1a 286 1 64.17 CATTTGTTCTCATTAAAAACATACACAACAAGTTGTGTAGTCCCAGTAATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATAC:1 - chr3R 8793574 5' + I-element 4923 1 67.12 GGATATATCTAATACTAAATTCTAAACATCTCAATCTGTGCTCGGTCATTGCTTGTAATTATAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAG:1 - chr2R 11650670 5' + mariner2 736 1 60.92 GGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCGAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAAGGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAA:1 + chr2R 17796564 5' + jockey 4722 1 56.67 ATTTTAAAAAATAATAATACTATTGGAAAAAAGGGATCTAAGTTGTGCAAACAATGCTGACGCGCTATAATAGAGTTCAGCCAAAGACGCTGGAATAACAAGCTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr2R 2980318 5' - 1360 3345 1 45.21 ACTGTGGAATTGATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 + chr2L 6654597 5' + diver 10 2 76.03 GTTGCTCGTTGGCGTTTCTTGCCACCTTCAAAAGTTACAGCGAGGCGGCCATAACATGGCACAGGTTCGGGCCCAAAGCAAACGCGAGAGGTAGGTTTTGACGTTTACCTTT:1 + chr2L 9738305 5' + Tc1-2 132 1 70.54 ATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAA:1 + chr3R 21400026 5' - G4 3834 1 71.23 GAAAATGAACAAAGCAAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chr2L 4713831 5' - transib2 2791 1 63.01 GATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chr2L 12818225 5' - hobo 2887 1 50.68 AAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:3 + chr3R 4682904 5' + Burdock 6215 2 73.97 TTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAG:1 + chr3R 9557512 5' + G2 3025 1 50.00 AACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACTTTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTAAAGTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAA:1 + chr3L 20189562 5' - FB 242 1 44.44 CCCCTTCGCGCCAAGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACTACGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTCGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGTTCATATAAATAAA:1 + chr2R 20348980 5' + transib2 86 1 71.92 TATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chrX 14450522 5' + hopper 35 1 61.64 TTTCTTAATTGGTTAAACCAAATTCCCTTTGACCTTCGTTGCTATCTCCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTTCTGCTTCCGTCGAAATCT:1 - chrX 17064859 5' - invader2 467 1 76.03 ATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACACACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 - chr2L 18347366 5' - transib2 2743 1 71.92 GTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chr3L 22400363 5' - 1360 3332 1 54.79 AAATAAGGTGAAGAGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3R 13406367 5' - pogo 2086 1 75.34 GTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGA:1 - chr3R 28385616 5' + transib2 73 1 66.44 AATGAAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAATAACTTATGGTCTAAAAAAAATATTTTTAAAATGTAGTAAG:1 + chr4 300252 5' - Transib5 2721 1 71.92 TGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 + chr3L 10731765 5' - 297 6926 2 57.86 AATTGAAAATATGGCGAGGTAGTAAAAAAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3R 7943711 5' + blood 44 2 54.11 CATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCC:1 + chr3L 23456270 5' - Gypsy6A_LTR 265 1 66.42 TTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 20167656 5' + roo 8747 2 76.71 AAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGC:2 - chr3R 10736143 5' + McClintock 5999 2 54.79 ATAATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTT:1 - chr2L 17180163 5' + Juan 43 1 44.14 AAAAGAAAAAGAAAAGGCGAAAAAGATGCGGGGGCGTCGCGCCATCTCCTTTCCATCTATCTGCCTTGTTCTACTGCTCCTTTCTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10170899 5' - Doc2-element 232 1 53.92 TCGCTTGATAACCGTGTAGTAGTCCTTAACCTGTTTCTTGTTGACAGGCTTAAGGAAAGGCCATTTGGATTTCGGGAGAGCCTCGCTGTTGGGGTCTTAAGTTTAGGTAGCGTTG:1 - chr3R 6652620 5' - 297 6760 2 54.78 CTTACTTCTAGATTTTTTTTTTTATTTTTTT:1 - chrX 3595800 5' - HMS-Beagle2 489 4 74.19 TTTTATCGAATTTAACACAAATGCATGTAATAGTTCTTTGGTATTTGGCTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACG:1 - chr2L 8560043 5' - transib3 2785 1 37.93 ATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr3R 19032621 5' + roo 85 2 79.45 CATATATACCATTAACATAAACTTATTATTAATTAGATTATCAAAAGTTCCTTTTATATTCATATATACTCATAGTTATTCAAATTATGCAGATTTGGGGCTTGGCTTGCGCTAGCC:1 + chr3R 22098247 5' + BS3 1325 1 64.10 ATAATTTGTGTTGACTCTTTCAATTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTCTTCCTCAAAAAAAAAAACCAATTTATACCACAAAATCTTAAAACAAA:1 + chr3L 19221728 5' + I-element 5181 1 76.52 TATAATTAATAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 - chr3R 21630374 5' - I-element 5318 1 60.96 AATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2L 14074583 5' + 297 6607 2 68.49 GGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3R 22642258 5' + blood 7045 2 60.14 TTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGGGTGAAGTCGTTTT:1 - chr2R 5479983 5' + F-element 21 1 68.67 AGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCT:1 - chr3L 17183734 5' - diver 6021 2 79.45 GGCCAAGAATACCAGATGCTGAGGTAAATAAACATAATAGCAAGTTTTAAAACAAATTCAAAGAAGCGAATCCACGCATGTAAAGGGCTTATTCCAAACTGAAGAGTTTGAGACTTAGTATCAAAAATATCTGAATTAAAATCATT:1 + chr3R 8115086 5' - transib1 1747 1 73.29 TTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:3 + chr3R 4679425 5' - hopper 1379 1 59.59 TGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGG:1 - chrX 19038476 5' + hopper 47 1 52.52 ACTTTTGTAATGCGAGTTTAACGAATCTTTAATTTAGAAATACATTTAATAAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTCAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATT:2 + chr2L 12044381 5' + FB 841 2 65.75 TGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTT:1 + chr2L 6654670 5' + diver 5900 2 53.33 AAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr3L 3983920 5' - P-element 2850 1 60.69 AAATTTTTAGAGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:2 - chr3R 13187546 5' - I-element 5321 1 52.05 GGCAGGCTGTGCTTCTCCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1 - 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chr3R 9039056 5' - Juan 4192 1 69.18 GAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 - chr3R 6625804 5' + flea 4811 2 57.86 CAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGA:1 - chr2R 2590768 5' + HMS-Beagle 52 2 75.25 AGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTTTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chrX 13134867 5' + jockey 4800 1 56.85 GGGGGCGTCGGCGAATCGCTGCGTGGCTCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:2 + chr3R 13875015 5' + P-element 27 1 64.03 GACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 - chr3R 5351465 5' + jockey 4747 1 69.18 AAGACCTCTGCTCTGACTCGACTATTTGAAAATCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACTGCAGCGAGGGATCCCCCTGCAGCCCCACCACATTTAATAA:1 + chr3L 5469722 5' + gypsy3 6950 2 78.77 TATGTTCGTGCCGTTGGGTTCTTTATTTTTTGCAAATTGATTTACTTTTCATTTACTCTCTATTTTTCCAACGGCACGAACATAACAAAGGGAGAAAGTGAAAAGTACACACAGAAAAATTTGATAAATTAATAATATAAAAAAAA:1 + chr2R 21206703 5' + BS 5093 1 50.00 ATTGGAGGATTTCCAAAGAATTTCCCGGAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 11326624 5' - pogo 2086 1 74.66 GGCTTGTCTTTTGTTTTGATTATATCGCCATTAGGTTTATAACATAGGAAAGCAGTAATTAACTAGAAGTTAGGGCTTATTAGTTGCATACACATATTAAAAAATATATAGATAGAATAAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTT:1 + chr3L 4123235 5' + G4 3632 1 65.75 ATCTATTAATTTTAATGAGTAATAAGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 1279052 5' + roo 8695 2 52.74 CGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAAT:1 + chr2R 1320650 5' - diver2 4880 2 64.89 ATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 + chr2R 12472012 5' - transib2 2771 1 54.11 GTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACC:1 - chr3L 5061649 5' + 17.6 57 1 64.38 ATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTACAGAGGTGGCGCCAGGCTCTCTCGAAGTT:1 + chr3L 24292003 5' + 1360 79 1 75.76 TAAACAATCATCGTCAACTAACTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3R 16157228 5' - pogo 2093 1 76.03 ATTAAGTCTTTAAAAATAAATAATAAAATAAGAGTAAGATCGAGGAATAATATTAAGCTTAAAATTAAACATTACAAAATCAATTATTGAAAACAATCTGGAAAATTTAATTAAATTAAATTAGGTGTTGGGCCATGCAGCCGCCA:1 - chr3R 2391920 5' + diver2 4532 1 78.08 ATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGAGATGCCTCACTGCTTTGACAGCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACA:1 - chr3R 27406058 5' - diver 6064 2 53.17 CTTACAGGTGTTGAAGGTAGCAAGGTGCATAATTTACTCTGGGCACCGGCTTGCGGGGGAAAAAAAAGTTACAATATTCAATATTAAACTATGTTGCAATTTACACCAATCTCTGAAATTCCTTTAAATAAATGACATAAAAAAAA:1 - chr2R 8499133 5' + X-element 4718 1 21.92 ATACAATAATAATAATAATAATAATTTCAACACATTCTTTAAAAGTGTGGGCGTAGCAGTTTTGTGGTTTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3R 9485835 5' - INE-1 217 1 56.04 AAAACGTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGA:1 + chr2R 3593657 5' + gypsy 73 2 71.01 TACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 - chrX 20999636 5' + BS 11 1 71.72 ATATAAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTG:1 + chr2L 20057786 5' - gypsy9 5180 2 75.34 ATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 14980314 5' - roo 347 2 60.71 TATGAACTTTAAAAGAAACCTTTGGCTTATTTTTGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAAAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTGGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTA:1 + chr3R 12713069 5' - I-element 5268 1 76.71 GAACGAACATAATATTGGGGCAAAATGCCTTTGAAGTGTTTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTGTTATTTTTTACATATTGATGGAAAAAAACCTATGAATAAATAGATATTAATAAAAAAAATTCATGAATTTTAATAAGAGG:1 - chr3R 18915444 5' + S2 1642 1 69.86 AAAAGGAAGTTGCGGCGACATGTTGTCAATAAATTGACAGCAATTGAAGGTTTATAAAACACTTTTTGGCCTTTTCCTTACGACACGATGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTT:1 - chr2L 17944729 5' + Circe 7238 2 65.07 TAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAG:1 - 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chr3L 18046679 5' - roo 8987 2 75.34 TATTATTCCGATTTTAACTATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAAAGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCATGCACATCGCGGG:1 - chrX 22386824 5' + hobo 68 1 61.64 GGAGGATTTCCAAAGAATTTCCCGGAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3L 11326627 5' - pogo 2083 1 72.60 CAGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:3 - chrX 19074897 5' - mdg1 391 2 61.64 ACGAATTGTGGGTGTTTAACACCTAATCGCCCGTTATGGGAGGTCCTCCAAAAAGGGTTCAAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3R 29517932 5' - Tc3 91 1 46.75 TACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACTGCAACTGGAACACCGCATC:1 + chr3L 2544623 5' + Tirant 8175 2 63.19 ACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 25428126 5' + 297 6613 2 60.27 AAGGGAGGGATTCAGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGAGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 15882529 5' + jockey 14 1 74.66 ATATGTTATCTCTATACATATATTATATATTTTCAATAGCAAACCAACCCAAAGGATATAAATTCGAAAAATAGTATTTTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGT:1 - 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G2 178 1 56.70 TTATATTGCCCGACCGATACTTGAAGGATATGATATAGACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATT:1 - chr2L 20556285 5' - 1360 331 1 73.97 ATTAATCTTCTGCAGAGAGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGAGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 10167495 5' - roo 9036 1 58.90 AACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2R 11159345 5' - roo 341 2 64.38 CACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2L 15076207 5' + 1360 56 1 56.64 TTAACAATTCAAAATGGGGAATTTGATCGCTTTTTTTATGCATAAATGTGTTTTTAAAAATTTGGAAATTTTGGAAATTTTATTTTGTAGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGT:1 + chrX 19056691 5' - jockey 4861 1 64.38 ATAAAAGGTGAAGCCTTATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:2 + chrX 6116233 5' + transib2 49 1 52.05 AGCAGAGAATCGAATAATGGCACTCAGCTAAATCAGCTTTATATTGTTTTTTTACCTTTTGTTTCCTTTTGCTCGTGTCGCGCGCTTTTCTTGTTTTATTTGTTTGTTTTATTATTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGATT:1 + chrX 4696666 5' - 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Transpac 239 2 67.36 GGCTACGGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr3L 19349893 5' - 1360 3366 1 67.12 TATAGTAAAATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTACGTGTTTCTGCTTGGTACGCGCCATGCAGAC:1 - chr2L 21794186 5' + invader1 41 2 56.43 GAGCAACCCTTGCTAAAATCTATTAGAACGCATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr2R 21116446 5' - mdg1 7432 2 43.15 GTTATATAATGTCAATGGTCAACATGGGATGCTACAGCGGTGTCTCGGGTATAGCAGTGCGAGGGAAACTTATTAATACAAATGTATCTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCA:1 - chr2R 25185372 5' + HB 76 1 55.20 GAAGTGCTCAATTATTGGCGCTTTAAATCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 16970459 5' + roo 56 2 63.04 AAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 + chr2L 22193433 5' + roo 8742 2 71.92 TATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCG:1 + chr3L 25255411 5' + INE-1 298 1 65.52 AAGATGCTAGATAAGCGTTTATCAAGAACTATGGCACTCTAATAATTTTATTATTACTACAATATTTTAAGATTTATGAGCTAAAGCTAAAATCTTAAAAAATGATAGAATTGCGGGAAGATTATTTGTTATTATTATTATCATA:1 + chrX 12961664 5' - 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chr3L 9195602 5' + Transib5 2792 1 57.98 GTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 - chr3L 18126008 5' + Ivk 4 1 66.02 ATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:1 + chr2R 5941341 5' - copia 5053 2 67.12 AACAGACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCG:1 - chr3R 30347470 5' + P-element 10 2 75.34 GTTTCGCTCTTTCCTGCATATGATTTCATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chr3R 8890151 5' + FB 23 1 70.42 GCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 + chr3R 20441236 5' - I-element 5291 1 60.27 ATCGTCCGCGCTACTATCGATCGCAGTCGTCGAGCATGTGGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGCGGAGCCTTTTGTGCAG:1 - chr3L 17055516 5' - Tirant 382 2 50.59 ACTTGTAGGCGGTGAGACTTTTCTTCACATTTTTGGAGCCAATTGCTTTGTTTTCATTTTATTCCCCATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCGCACTAGCTGAGTAACGGG:1 - chr3R 25075081 5' + INE-1 537 1 64.39 GTATTGCGTGTTCCGTGTGACCAAAGCACAGCATAAGGTTTACTTAGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCATTTGTTTTACTTGCACTTG:1 + chr3R 27504305 5' + accord2 7266 1 67.12 AGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 10931594 5' + 297 27 2 62.33 TAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 + chr3R 23618147 5' - hopper 1333 1 74.48 TGTCACTGTTTTCTGTTCGTGTTTGTGTATGGTCGTTTCGCATGTATGTGTGTAGGTCTCTGGGGGCGCCGTATGATTAAAAAACTCACCGAAAAACAAAAAAAAAAACTTT:1 - chr3L 11789802 5' - Tc1 1472 2 50.89 CTAGAGGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAAGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGC:1 - chrX 22727599 5' + Ivk 5101 1 53.62 ATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACACATTGCTTACATATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCGCACTCCGCGATCG:1 - chr2R 1234692 5' - Stalker 7030 4 77.40 CTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTA:1 + chr3L 11913169 5' + BS 5035 1 58.90 TATTGATTATTATTTTGTTAGAAAAATTTCATTCGACCCGTGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGGGGCCCGTGAAACAACTAGCCCAG:1 - chr2R 5398395 5' + baggins 263 1 75.29 ACAAAACAATCGGCAGAAAAAACCCCCTTACAAAACCTAATATTTCAATTGTACGAAATGTGTGTGTTTTGCCTTTACACCCAAGTGAAATTTCTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACCAACCAAGCAAG:1 - chr2L 12720376 5' + I-element 5064 1 69.86 GGAGGATGTTTTATAAGTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr2R 18529995 5' - jockey 4961 1 64.38 CATCATACGATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr2L 13556298 5' - transib2 2804 1 71.92 TGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chr3L 12004303 5' + P-element 97 1 19.86 TAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2L 14874115 5' - copia 244 1 51.37 AGCAGAAGCTGGAACTGAAACAGGAGGGCTAGCATCCGCCTCGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 29611961 5' + jockey 21 1 73.97 AGATACTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAATGTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCACACATTG:1 + chr2L 15076077 5' - 1360 3368 1 65.93 AGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 - chr3R 15054310 5' - copia 194 2 65.07 AACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTNNNNNCTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 11062714 5' + roo 8707 2 56.16 CTTACGCAGCCACTGGTATTTATATTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chr2L 17809137 5' - jockey 4972 1 68.49 AGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAT:1 + chr3R 21276523 5' + BS 5047 1 50.68 TTATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 + chr2L 7660878 5' - I-element 5327 1 60.96 AAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGATACTGTTATTGCATTGTATTTATTCATCGCTTCT:1 + chr3L 13365763 5' + BS 5072 1 66.44 ATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chrX 18009936 5' - 412 7483 2 60.00 ATATAGTAGAGTAAACATCTTTGGCGGGCTGATTGGGACTTTTCCTCACTTTTAACATAATAAAATGCAATTAGTATTGGTTGAAAGTTTTCAATATTGCAATGATTTTCTACAAACAATATAGTTGGATAATTATAAATAAATAA:1 - chr2R 18512981 5' + Burdock 308 1 74.66 ATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - 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chr2L 18549903 5' - roo 324 2 74.83 ATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTNNNTTANTATTGTTTATTCTTAATTTAAT:1 - chrX 8200340 5' - flea 4995 2 73.29 ACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 23287216 5' + 1360 56 1 57.53 AAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGT:1 - chr3R 11040173 5' + Bari1 45 1 54.86 AATGGTTCTTAAATTATTTGAATTGCAAGCGAAGTAAAAGAGTATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:2 - chrX 17717142 5' + FB 17 1 69.86 ATTAAATACATCGCTTTGCCATCAGGTGGAGAAAGGGGTGGCTCAATCAAACGCCTATTCTATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3L 6397596 5' + roo 3 2 78.77 ATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 13294855 5' + roo 8698 2 60.96 ATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGTTTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAATACAACAGTTTAGTGAAAGT:1 - chr2R 6847839 5' + Doc 71 1 60.96 ATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGGCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGTGGCTTGCTTGTGTGAGGAAAAACAAGAGACGAGAA:1 + chr2R 5530007 5' - 1360 3238 1 69.60 ACATGACACCCTCGTTCCTAATGTTATTATTGCTAATGTCGATTAGCTCCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATCGGACCAGACTCGACCAAA:1 + chr2L 6640042 5' + I-element 4911 1 62.50 CCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chr3R 15054231 5' + copia 4944 2 76.98 AAGCCTGAAGTTATTGCAGATTTAACGGATATCTCCGTATTCAAAATTGTACTACGTAAAGAAAAAGAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGGGTAAGCGGCCAATGCTTG:1 + chr3L 27865992 5' + Max-element 8270 2 47.24 CTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTTATAGAAAATTGATCA:1 + chr2L 18347307 5' + transib2 76 1 73.38 CATTGCTGATTAACGCTTATTGGATTTAAGAACATTCGATTTGTTCATACTTGTGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATA:1 + chr2L 3655827 5' - 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mdg1 7420 2 55.56 TGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGG:1 + chr3L 16690899 5' - I-element 5299 1 59.31 TACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 - chr2R 6847850 5' + Doc 60 1 56.16 AGCTTTACAGATTTTCCAGAGATTTCTGCGCGACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1 - chr3R 28385677 5' + transib2 12 1 77.40 AAAACAATTATTACAAAAGAAAAAACACAAAGCTGAATTTTCCAATTGCAATGAATAGTTCGAAGATTTGAATTACACCATATTTTATTTCACATCGAGAATCTACTCTCGAGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTA:1 + chrX 1187323 5' - Tirant 204 2 71.92 TGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTGTCTTTCAAG:1 + chr3L 18281873 5' + Doc 27 1 54.35 TAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - 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chrX 12066255 5' - transib2 2808 1 70.55 CAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCA:1 - chr2R 19941615 5' + hopper 81 1 69.86 AGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 + chr2R 13931538 5' - P-element 2820 1 41.78 GCTGTGACCCCATTTGGCGCATCACATTTCTAAACATAAAAAGTAAATTAAAAATGCTAATTGAGCACGTGCTACTTCCATTCATCTCTAATTATGCATAAATAAATTTTCTCCAAACGATTTAGTCTTCAACTTTAACCCAAGAG:1 + chr3L 17505772 5' + Bica 4480 1 71.92 AAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:3 + chr2L 4123862 5' + transib2 71 1 67.12 AAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGGAGCAAGTGG:1 + chr3L 3501735 5' + Bari1 56 1 67.23 TCCTAATCGTGGAGCTAATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chrX 20455634 5' - hobo 2932 1 65.00 TAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 - chr2R 8157299 5' + mdg1 7074 2 60.96 TGTGTGACGACAGTAGCCAGCCACTTACGATCTGCGATCCATTCAAAAGGCTGAAGTACGAATAACTTTTAGGAAACATTCAACCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCT:1 - chr3L 19563951 5' - Transpac 221 2 55.48 CTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCACACTGAGTTCAGCGC:1 - chrX 21852454 5' + gtwin 6988 2 66.44 GGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 4939191 5' - 1360 3359 1 36.99 AAATGAGCCGCGTTAATTGCTCTTTTTGTTTTATTGACAGAGACGGCAAGGTTTTGTTTAATTAAAAAACAAATTAAGCGTGTCAAAAATGTGCAGCGATCTTTTGAGAAATTTTGGAAATCGTACTGTTGCAGCTCCAACGCGC:1 - chr3R 18579173 5' - Osvaldo 174 1 74.48 ATGCGTGACCAAGGGGGGGCGCGTTGGTGGAGGGGCGTCCAGAGACGCGGAATCTTGCCAACTGTGACTTTCTTATACAACAACAACGACAACTTTTGACTGTTTTACAGGACAAATATATGTAGAAAAAAAAAACAGGGAAAAGA:1 - chrX 18935050 5' + Bica 339 1 57.53 TGGAGGGGTGTGAGGGAATGTCGCTCTCCAAGCCGAATTGTGTATATATTATATGCGGGATTTATAGAGCTGGCAGTTAGTAGCGAGTCTGGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGTAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCT:1 - chr3L 17482897 5' - ZAM 8025 2 63.70 ATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGGGAAATGAATCCTAGCGATAGCCATCGAAGGTATGCACTATGGGGCATTTGGCCTTTTTTTTTTACAAAAATTAATTCCTCCTAAACCATTG:1 + chr3R 19992629 5' + hopper 36 1 48.00 AAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr2L 12250975 5' + 412 79 2 71.92 TGTGATCCAAAAATAATTCCTTATGTTTGCAAGGCAGCAGAGTTATTTATATAAGCAATATAACTGAATTCTATGCACACACACACCCACCCACACACACACCACGCAATGTAATTCTAAAAAACCAAATAATTGTACCTATATAT:1 + chrX 10771321 5' + HeT-A 5973 1 71.92 TCGAAATCGTTTTTGATCCCCAAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGACGTTCACACATGAACACGAAAATATTTAAAGAC:1 + chr3R 24219233 5' + roo 12 2 75.19 AACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2R 10411465 5' + 297 6615 2 58.52 GGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAAC:1 + chrX 13134908 5' + jockey 4841 1 71.23 ATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGC:1 - chr3L 21763776 5' + jockey 32 1 55.66 CATTAAAATGTGCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTAT:4 - chr3L 20187466 5' - FB 856 2 78.77 ACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCT:1 + chr2L 4888742 5' - BS 5016 1 71.23 AAATATGCATATACAATATTCAATATTTTAACTATTTCTTTTATATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 + chr2L 14948144 5' - 1360 205 1 69.86 CCGTGCNATGTGTGTGAAAAGTTTCTTTAGCAGGGAAAGTGTCTGAGATCGTTTGGCGAACTTGTTCTGAGGATTTTCTCGGTGATTCATAATGAAATGGCTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCA:1 - chr2L 18893692 5' - 412 58 2 72.60 ATATACGAATTTTTAGGTCGACATAACTGATAACCTTTTAAATTTACGCGTTATTTTATTTTTACATGATAGGAACATATGTATTTACACAGAGGTGTGTTTGTCATATACAAATATACAAATATACAAATATACAAATATACAA:1 + chr3L 9357206 5' + Stalker 6940 4 81.38 CTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATTTATCTCTATACTTACGGATTTTACTCTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGGATTTTTTTGT:1 + chr3R 22590499 5' - rover 267 2 69.18 CAATTCATCCATAAAAACGTTTTAGAAACGCTTAAGTTTTTATTCAAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 2990079 5' + roo 17 2 70.14 CATACGTACGCGGGGATAGTCGAGGAGAGTACGAGCACGAGCGGTCCTACCGGGTTTTTTTTTGAGCTCCGATTTTTATTTTGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAAGTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGT:1 + chr3R 2532060 5' + Cr1a 109 1 63.01 ATAATTATAAAAGGTCTTGGGTCTAAAGACAAAATAAAGGCAAATGTAGAGCGATACATAAGTAAACTACACGACTATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATATCACCAGC:1 + chrX 292141 5' + G3 4420 1 76.92 TAAACTCCAACCTAAATACTTAAAACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2R 21681276 5' - roo 9038 1 62.33 ATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTT:1 + chr2R 12472018 5' - transib2 2765 1 58.22 AGACAAATATATGTTTTTTTTTCGAAATAACGGGTGGCAGTGGTCTAAAGAGATCCACATGTAATGAGCAGTTTCGGTATATTCTGCAATGTTCGACTAAAAGTCAGTCATCTATTAGCTTTTAAAGCGAACGGTCGTATTTTTTT:1 - chr2L 16579672 5' + Cr1a 11 1 21.92 AAACAAGAAAATGACTTTACTCATAAATAAAACTATAATGACTTATGGAAAGGACAACGTTATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATT:1 - chr3R 908351 5' - TLD2_LTR 110 1 58.90 TTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCTAACTCTACGACAACCCGATAAACACTCGGTACGCGGGGCACCCCGCAGTTTTTGACACCCTACTTGCG:1 + chr2R 22992483 5' - hobo 2868 1 65.55 GCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGTCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr2L 4123826 5' + transib2 35 1 60.96 AGGCCATTGTTATGTGTAGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATC:1 - chr3R 27986469 5' + roo 38 2 58.90 CACCTCTTCAAAAATCCTGCTATTCCTTTCATGGAGCTTTTTCAAGCGGACTTTGGCATTCTCATATCGATCTAGTTGCTGAAAACTTCGTCGAACGTTAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTG:1 - chr3R 5630722 5' + 297 254 2 67.81 GAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGGGGGGGGGATGGGGGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTTTACTCGTAGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3L 13294979 5' - roo 9030 1 51.22 TATAAATATTTCTATAGAAATGACATTTTTGACGAGATTTTTAAATATTTCCGAACAGTCTTACTGTTGGCAGTACTGTAACTTGTTTGCGGCTACACTTAAAAGTAATTAAGAGGAATTAAGTCCTCACATGCTTAGTGCGAGG:1 + chr3L 16731619 5' + BS 4999 1 65.52 GAATGTTCTACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chrX 14450367 5' - hopper 1382 1 60.27 AGAAGTAAATCAAGAGGCTTGTATGAACGGCAAGCAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGA:1 + chr3R 3282347 5' - 1360 228 1 76.03 GGCCAGAGACTGAAAAACGATCGCGTGAACGAAGAATTCCTGATCAGTGATCACACGACCAGCTCAATTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3L 12004383 5' + P-element 17 1 73.29 TATACAAAATTAAAGAAAATAAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACCAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTCACTTGATTTTTTTTTTC:1 + chr3L 16184094 5' - Porto1 170 1 56.85 TATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:2 - chr3L 22035673 5' + F-element 57 1 56.16 ATGGGCAAAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:3 - chr2R 10161872 5' - transib2 2750 1 69.18 ATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 12115271 5' + 1360 48 1 59.52 TTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2L 20265951 5' - roo 8998 2 69.86 ACATTCCGAGGGCTGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATATACATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCC:1 + chr3L 5061557 5' - 17.6 7344 2 69.18 AAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3R 18093423 5' + I-element 14 1 73.29 AGAAGAGCAACCGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2L 12822869 5' - P-element 2874 1 60.44 TTTTTACACATTTCTCATTTTTCAACCCTCCATTATCCGTTCTTCTTTGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGA:1 + chr3L 22221648 5' + Doc 409 1 57.52 AGAAGGTAACAAAAAGGCAGTGGAAAATCCTTCGCGCAAACAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCGTACCTCTCATTCACCACCATATCAAACTA:1 + chr2L 4313743 5' + Porto1 284 1 74.66 TACCTTACTGAAGACATCTATATAAAGACGCCAAAAAAATTTGAGCTTGACAATGATCGGATTTGTAGCTCAAGAAAACCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCG:1 + chr2L 23318638 5' - ZAM 129 2 64.62 GCCTTACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:1 - chr3R 4683023 5' - Burdock 6365 2 67.81 ACAAGCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAACATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCC:1 - chr3L 23702313 5' + G4 5 1 76.71 ATTGTAACGGTACCGCTTTCTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTCG:1 - chrX 10537958 5' - I-element 5322 1 56.92 GCCACTCCTGCAGCACCACTACCACTACTAGCTTCAAGCAACGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAACCCAGATAACATACAAAAACTCATACCTTTC:1 - chr3R 24939712 5' + I-element 5141 1 68.49 ATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 15376191 5' - 1360 3343 1 54.07 GAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 - chr3L 18126012 5' + Ivk 7 1 65.45 ATGTAAGAATTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3L 23287181 5' + 1360 21 1 70.55 TGTGTAAGGCACTTTGGGTTACCCACTATATGTGGCAGCAAGCCATTTATAACGAGATATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTTTGCGGCAGCGAG:1 + chrX 14421997 5' + opus 459 2 50.00 ATCGAAATCGTTTTTGATCCCCAAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:3 + chr3R 24219232 5' + roo 8688 2 69.18 GGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 - chr3R 15364011 5' - flea 4948 1 64.83 GTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 - chr3R 12949119 5' + Juan 48 1 47.95 AGAGCCCTATTGCTGGCTCACTCCCACTCGCGTTCACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCTATC:1 - chrX 11817408 5' + I-element 5044 1 74.10 GTCACAAGCTGCTGGCATTAATATTGGCGAATTGAGTTGGATGCGTTCCAAGTCGCTTTAGGTATATAGCCTTCTGCTGGGCAATTTCAGTTTTACAACTGGTCTTGGTGGATGTTCGCGTTCCG:1 + chr3L 15448965 5' - Doc4-element 2710 1 79.20 CCGGTCGATCCAGAGCGTACTCCACCACCCAATTCACCCACTTCACCCACTTGGCCGCTGAAAACCCAGCTAAAATATGCACAAAAGAACGGAAAAAGAACG:1 - chr2L 1515167 5' - rover 7089 2 86.27 AGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:2 + chr3R 6419814 5' - Tabor 452 2 60.96 ATTTTAAGTTAATTTAAAGTTCAAAGACTGCAATGTTTGTAACAGGCACAAGGAAGTGTTCCCGACCATATAAAGTATATACGAATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 - chr2L 22758153 5' + INE-1 85 1 67.62 ATGCTGCCATCCTAATTTATAAGGACACTGAGTGCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGAATTAATACACATGAATTACTGGTATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 + chr3R 30946475 5' + Transpac 17 2 69.57 ACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 - chr3R 15790089 5' + flea 4766 2 61.64 AATGCCATTTAACAATGGCGCAAATAAATAAAAAAGCAAGCTGGAAACGAAAGCGCGCCGAACAAAAACAAATGCACTAAGCAAAACAATTAAAAGCTACAACGCAACAGAAAAAGACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 14393683 5' + Doc2-element 220 1 55.04 ATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAA:1 - chr3R 19407981 5' - diver 6032 2 70.55 TGTATGAGGCCAAAAGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2R 22514238 5' - P-element 2866 1 68.28 ATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATCCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3R 15072680 5' - pogo 2070 1 57.89 AATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 7889686 5' - roo 9038 1 62.33 AATCAAAAGTTGGGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chr2L 17005653 5' - Stalker2 392 2 69.18 CTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 14980292 5' - roo 9027 1 54.79 AGCGTAGTGTTCTGATAGCTTCAGATTTATGGGACGTGGTATGTGGTAGTGTGAAAGAACCCGATGATGCGCCAGAGCCTACGAAATGGAACACTAAAGACGCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATA:1 + chr3R 3178555 5' + G6 1837 1 72.60 AATCAATAATAATAATACGATAATAATTTAAAAAAAATTATAAAAACAATAGGAAAAAGATTAATAATAATAAAAATAAAATAATAATAACAATAATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATA:1 - chr3L 12990282 5' + mdg1 25 2 47.95 GGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAAC:1 + chr3R 14860148 5' - BS 5025 1 65.52 ATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATC:1 - chr3R 15790132 5' + flea 4723 1 73.97 GTCAGCCAGCACTTGCCGCCCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 18239471 5' + jockey 14 1 77.21 ACTATAAAAGAAATTCATTTTTTAATTTGCTCATCACTTTTTAATGACTCTAACGCCAAAAGTTTCCCAAAACTGCAACGCTTTTGAACAATTAAAAAATTTTTTCTCATTTTCTTCACCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAAT:1 - chr2L 22163840 5' + INE-1 501 1 68.49 CATTTATAATGATTTTCCGTACCACTTGTCGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 28146253 5' + roo 35 2 44.52 ACATCGACCGTGGAAGTTGACTGCTGAAGTACAAAGCGCTAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGGTTGGTGTCA:1 - chr2L 2799936 5' - accord 7236 2 71.23 GTGTATTTATGGGACTTTGGTTTTGGAGTTGGTTTTGTGGCACATTAACGAACACACACACACACACAC:1 - chrX 7211540 5' + accord 181 2 88.41 ATATACCAGCGAAACAAACACGTAGCGAATATTGCTTGAATTATAAATAAATTAATGTTTGCCAAAAACAAGGCTATCAATATGTCAAACAAGGACCTCGTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGACTTAGTTTTAAAA:1 - chr3R 15880889 5' + jockey 4795 1 71.92 AAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:2 - chr3R 18093416 5' + I-element 21 1 68.49 AAAGATCTACATGTATTCATAGAAAATATGTTCAGTTGCGGTAACCCAAAGACGAGTTAACATTTGCATCTTTATTTTCGGTTCACACTATAAACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTAACTCGCTGCTGCGA:1 + chr2R 5680945 5' - rooA 310 2 47.92 TATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTG:1 - chr2R 5303165 5' - FB 209 1 54.11 CTTTAGTCAAGGCATGCTTAGTGCTTGCTCGCTCACAAGACAAACAAATTATGGACTGACCAAGAAATCTAGTTCTGAATGGATTTTATTTTTTCAACCTAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGG:1 - chr3R 31470130 5' + Stalker 175 4 66.44 ATAACAGAAACCCATTAAAATGTTATGGCATTTTCAAAGCCTTTCGAACACACACACACATGCACACACTCGAGTTTAAGAGTTTTCACGAATTTATTTGGGGAAATGTTTTGAGTACTGGACAATAAAATTAAACTTATTTTCCA:1 + chrX 2469536 5' - 297 464 1 50.68 AATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr3L 15103820 5' - Transpac 249 2 66.92 ATTTTCGGGACTCACTCTTCCCGTTAAACTCTAGTTTTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCT:1 + chr3L 21974413 5' + GATE 33 2 60.00 ATCCCTGTCTTGTTTTGTAACATAATACTCGTTATCATCGCCATCAATATCAATGTGGCTCCTTTCCGTTGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTGTTT:1 + chr2L 10155821 5' - hopper 1409 2 51.37 TATTTTGATTGTTGTGCAGTTTTATTGTTGTGTCAATAATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 6397787 5' - roo 9041 1 64.14 TTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 + chr3R 27160092 5' - 412 410 2 79.29 TGGCATTTCGAATTCGCTTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATATCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCCTAAATTCGTTTTGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2R 4193305 5' - 1360 3345 1 59.69 ATATCACACCATCGATAACCCAACAGAGTGTTGAATCTGTGCCCTGATAAGTTAACAACTAAGAGCACAGACATTCATGTCAACAATACATAAACACTAAGTTACCACATATAAGCAATGCTGACGCGCCCCAACGGAGTTCAGCG:1 - chrX 22544974 5' + gtwin 71 2 68.49 ACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3L 1279185 5' - roo 9013 2 61.64 AGCACTTGCCGCCCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chrX 18239464 5' + jockey 31 1 67.12 ATAATAGCTAATTACTATCATTTGAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGAT:1 - chr2R 12645549 5' + X-element 29 1 67.12 TTAAAGCATTCGCCGAAGGTAAATGCATCTTTTATGATCACTCAATTTCCCATTCAAACCTTCTAAAATAAAAGTCCATACTATAAATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACTGGGCTTAC:1 - chr3L 10426160 5' - I-element 5294 1 71.92 AAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTCATT:1 + chr3L 5881569 5' + pogo 47 1 51.45 AAGGAAGGATTTTATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTG:1 - chr3L 14720956 5' + F-element 28 1 71.23 GTAATTGTTTAAAATATTCGAAAACTGCCCAAGACATTTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:1 + chr3R 4460962 5' + blood 4 2 82.19 TAAATCGAGTTATATATAGCTGGGAGCAAGTTGACTAAAAGTTGGCGAGGGTACCTCAAGTCGACACACACTTTTTTAAAGTGACACAACTCTTTTGACGGACAAGCTGCAAACTGATATATGCATTTTATTAGTTCAAGTATTTT:1 + chr3R 30255524 5' - G7 1162 1 64.38 GAGAAAGACTTATGTCGCCTAAGGAGTTTAATTTTAATGTCGTTTTGATTGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 - chr2L 22369284 5' + rover 24 2 69.86 AGACTTTGTACTGCGGCCCACATAAATCAAACATCGACACCCTTTCGAACATTACTTGCATTATTAAACTTTGAGTTTATTTTAAATTATGGAAAAAAAAAGTCAGAGTATGTAAATTATTCGTGAATATATGTTTTCCGATAATT:1 + chr2L 2123867 5' + transib4 306 1 55.48 ACTAAAGTGTTTTAAACTAAATGTATAACAAAAATATATAATTGTAAGAGTGCCCATAGTAATCTCCCTTTACTTCATCATTTTTCTTCATTGCTTAGTTGACGAGTTGCCTTCTGCTAACCTCATTTAAATGTAATTTTGGATTT:1 + chr3R 32015728 5' - transib4 2551 1 60.96 ATTTAAAGCACCAGTAGCCATTCTCACCTCCCTCACCGCCCGCGCCATCCCCGCCAGAAAACCCCACTGAGTATGCTGTTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTT:1 - chr3L 1690987 5' + blood 497 1 52.05 ATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACATAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTG:1 + chr3R 29534665 5' + Stalker4 183 4 74.66 AAAATAAGAGCTATACCATTATGTATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 14980265 5' - roo 9054 2 73.29 GGCGCTATATTATTATACAAGATTAAGAAGTGGCTGAAAAATTTGAATAATGTTTTTAAAGGTTCAAGTAAGGTATATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGATCCACACTGAAGGGA:1 + chr3L 12946654 5' - R1A1-element 5297 1 56.82 GTTAGCCTTACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 4683027 5' - Burdock 6369 2 70.55 AAGAAGGTATTAAAATTCAAATTGGATTATTCTCTACTATCTAAAAGACACACATCCTGCGGCAGAGTACAAGCATGTAAGACAATTAATAATACTTAAAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGA:1 + chr2R 21890597 5' + invader2 387 1 68.49 AGGCTCACCGAACAGGGTACAAAAAAAAAAAGGAAACAAAAGGAAGGAATTTTAAAAATAATTCCGGATGAAATCAAAACCTTTACGACATTGCAATAACCTAATTTAATAAAAGAAAAGAATAAAAAA:1 - chrX 4436164 5' + Bica 127 1 65.89 CTACATCGGGTGGTCCACGTCCAGTAGTACACAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAG:2 - chr3R 10270688 5' - Juan 4177 1 60.27 CTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:2 - chr2R 15326975 5' + copia 35 2 47.95 AATCGAATTTTAATTGCCCGAAAGTGGATCTAACCGATCGGGAAGAGATTGCTTTGGTTTTTGGGATTTTTTCTTGGTAGCTTGGAAGGAAGGCGTATTAAGGGTTCACTCAATATAAATATCAAATATTTTATATATATTATATA:1 + chrX 7529404 5' - transib1 1923 1 80.82 AAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3L 11326652 5' - pogo 2058 1 55.48 GGGGCAGAAACGGGAAAAAAAACCAATCGCATGACGCACAAAGTGCCAGGGCATACATTTTGACAAACATTCCCCCCAACACACACAGCAAATAGTGACCCCC:1 - chr3R 24458597 5' + X-element 107 1 72.82 AATCGAAATATACTATGCACTTCTTCCACAAATTTAAATATAACCCAATGGAATCGTAGTTGTTGATAAGGCAGCAGTTGCGTCTATGTTTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTCGCA:1 - chrX 9665192 5' - Burdock 5925 1 64.14 ATGGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATC:2 - chr2L 4754952 5' - Stalker 7183 4 65.75 GTATATAATATATGGCCAATGCGGGATGCATGTGAGCGTGATCAGCGCTTTTTGCAAGCATTTATTTAGATTAAAAAAAGGAAAATATTTCCAAAGTCGGTGGGGGCTTAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATT:1 + chr2R 5901648 5' - G4 127 1 70.00 CTCGGAAAACAAATACAAGTTGCCGACTCTCATGGCATTTAGAATACACTCCTTGCCTTGTACAACATTTGCTATTCTTATGCCATTCATTTCTCTTTTTAATGTTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCTTAACGGCCA:1 - chr2R 4265220 5' - 1360 3375 1 49.32 AATCAAAAACAAGCAATACACAGAGGGAAATTACGGAAAAATGTGTTACGGACGCAGGTGATGGCTCCGTCAACACACACACACACACATATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAAACATAGAATGCCTTAGGATATA:1 + chr3R 17557219 5' + Quasimodo 87 2 59.59 ACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr2R 21410979 5' + Burdock 6186 2 52.41 GTTAGTTGTAAAAATAATGGTACAAATAATGAAGGAAATAGGACTTGTTGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGAGTTACTCTCTG:1 + chr3R 8843209 5' - FB 300 1 65.07 TAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:2 - chr3R 21630365 5' - I-element 5309 1 54.79 GCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 + chr3R 10270550 5' + Juan 4066 1 56.85 ATAAAAATCTTTCTCCTCTTCTTCTGCTGGTTCTACGCTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTT:1 + chr3R 9230153 5' - blood 7176 2 76.67 AACATTTGTTACAAATATTTCGAACTTTCCACGTTTCGCTTTGTACCAAAATTGTTGGCCTACGTTTTTTTTCTCTGTTTTTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATATCGCTC:1 - chrX 8915586 5' - transib2 2366 1 55.17 CTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCT:1 - chr2R 6847865 5' + Doc 45 1 59.59 AAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3R 17673743 5' + FB 31 1 56.78 ACAAGGGGGATTGGCCAAAAGTGGAGCTGGTAGATGGTAGCTGGTAGCTGGTAACTGCCAACGGCTATGCATACAAAACGCCGTCGGCCATTTTTTGTATTTTCCTTTTTTTTTGCCTTTTT:1 - chr3R 28135147 5' - Doc2-element 245 1 63.93 AGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 - chr2R 21410968 5' + Burdock 6198 2 60.27 AAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:3 - chrX 17343505 5' - I-element 5324 1 57.53 ACCGCCTTAATTCCCTGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 - chr2R 13168774 5' + P-element 20 1 71.43 AATAGAGGAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2R 21926347 5' - opus 451 2 50.68 TATCACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 24369115 5' + roo 73 2 67.81 GTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2R 10417118 5' - 1360 3343 1 52.74 CCATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chrX 8200342 5' - flea 239 2 75.17 TGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:2 + chr3R 29084834 5' - 412 7537 2 74.66 ATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTG:1 - chr2R 12253301 5' + BS 4653 1 56.76 TCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTT:1 + chrX 3431856 5' + Ivk 5356 1 45.89 ATATACAAGCCACAATACAGCAGCCACAATGCGTCAAATGTGGCGTATACGTAATGTGTAATTAAACACACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAA:1 - chr3R 26196774 5' - flea 427 1 53.42 CGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:2 - chr3R 5351456 5' + jockey 4756 1 75.34 ACAGCAGTCTGCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCGTTCATAT:1 + chrX 8308394 5' + roo 37 2 52.80 TTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 2989958 5' - roo 324 2 75.34 CCGCCAAAGATTTAACCCATTACAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACT:1 - chr2L 1924060 5' + G2 2976 1 76.03 TCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 20898626 5' - roo 347 2 61.64 CTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr2L 13556470 5' - transib2 2791 1 57.53 AATGGATATGTTAATATATATACAGTTTGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAA:1 - chr3L 26003318 5' + S-element 1712 2 67.11 TCTCTCTCGTTTTGTTCTGTACAATGCATATCAGCCGGCAGAGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGGAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTTGATGTTTTCACTCCGAAC:1 - chr2R 2514430 5' - F-element 4373 1 69.44 CTGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGCTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3L 8959592 5' - 1360 3329 1 61.64 CTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 19032678 5' - roo 8991 2 76.03 ACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATA:2 + chr2L 10156111 5' - hopper2 1545 1 60.96 ATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAATTGCAGCTGTGGTC:1 + chr2R 24427577 5' + jockey 4696 1 51.06 AAAAAAGACCTCTTTTACTTTTTTTTCTCACTGCAGATTCGTTTGACCAACGTAAAGTCCCGAAATGATTAATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTAGATAAGTAAATTCGTATATTTAAATCGGCAATAAATTAAAAAAAAAATTTAA:1 - chrX 22846474 5' + S-element 135 2 70.55 AGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3L 5489895 5' + jockey 80 1 63.70 AGAGTTCAGCTGACAGCTGTTGCAACGAATTCTCAATCGAGTAATAGCAGAATAGCAGAATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chrX 661808 5' - 412 481 2 75.34 TGTGTCATTCGTTACAGTTTCCAGCTTAAACAAGCTCTGTATTAGAGATTAATAGGTTTTGCGATGCCAGCATTGAATCTCATGGAGCCTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAATCTCAT:1 + chr3L 23236578 5' + HMS-Beagle2 6911 2 78.08 GTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr2R 17796535 5' + jockey 4688 1 66.96 TCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 - chr2R 12779721 5' + I-element 60 1 57.93 CGAGAGCCGTTTTGGCCCCCGCTCGAAATGTATATATAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTT:1 - chr3R 10931713 5' - 297 6897 2 78.08 TGATAAGTGAAATATTGTGTATTTGTATTGGGCTGCCCTATTTTTGGTGTTCTAAAACTTGAAAATTTACTGAAATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGC:1 + chr2L 10362546 5' + rover 7139 2 58.04 AACCGAACAGAACAGAACATAACAGAACGAAGCTGAATGGAAACTAATTAAACAGCAACAAAGCAACTGAGGAAACCAAAAAATCGAAACAACCAAAGCTGGGGAACCGAACTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTC:1 + chr3R 21326805 5' - F-element 306 1 77.40 CATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCT:1 + chr3L 8673292 5' - I-element 295 1 79.72 CATTGACCATTGCCCACTTTCAATTATTCACTATTCACCTCGCCATTCATTCCAGCATTCTAAATATTTTGCAAAAAGCCTAAAACATAAATATATACGGATGCTGATTCTTTTTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAA:1 - chr3R 27842471 5' + I-element 5276 1 35.42 AAGTAGTATGGTGGGGGGAGAGAGGAGGAGGGGTCAGGGCGGAGGGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAACGATAGGTAGCTGCATCG:1 - chr3L 4234028 5' + pogo 20 1 66.92 TTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:4 + chr2R 5106291 5' + Stalker2 88 2 78.08 AATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGA:1 + chr3R 29690689 5' + I-element 5244 1 53.10 GAAAAGCATTTTCAACGACTTTGATTATCATGTCAGATTTATGTTTATTTTTCATGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGA:1 - chr3R 19044637 5' - Transpac 74 2 62.07 AACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2L 20266048 5' + roo 8716 2 55.48 AGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGATTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 - chr2R 6622639 5' - S-element 1637 2 71.92 AATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAA:3 + chr3R 23067446 5' + roo 9035 1 40.41 CCACGAATTATTGTTTAAACGAAATCAGTTTGAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 - chrX 6116368 5' - transib2 2785 1 59.59 CAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGATTCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAAAAATTACATTTAG:1 + chrX 21224553 5' + roo 75 2 68.28 ATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chr3R 16157263 5' - pogo 2099 1 72.38 GTGTACTTTAAGCCAGAAACCGATCGTATGAGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 + chr3R 19224962 5' + HMS-Beagle 23 2 70.80 GTTTCTCTTTTTTCAATCATCCTCCACTCCCAAGTGCAGGAGGAGCCCCATCAAGTGGTCGTTACTGTCGGCAGCAGCAGATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 - chr2L 6161059 5' - I-element 5318 1 60.42 GACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCC:2 - chr3R 28385646 5' + transib2 43 1 56.16 TTAATCGTATAGGCACTCCTAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACATTTTTGTGAGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3R 14858285 5' + hobo 52 1 77.08 ATCTAAATGTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 12133889 5' + jockey 22 1 73.97 AATTGTGCTTAATTATTAGATTCATTGAGCACGATCGTGTTCTTGTTTTTTTTTTCTAAAATGAAAACAAATGCAAGTAAATGACTAACACATTTTTACTTAATAAAAACGTCACTTTTTTGCTTAATAATAATAATAGCTTAATA:1 + chr2R 12239661 5' + invader3 5064 1 80.14 GATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr2L 11391585 5' + 1360 62 1 59.59 AATAAGATCAGATAATCTTTAAAGATTTATTTAACATAATATAATAACAATTCAATTATCAATCAGTTTATTAATTTTAAAGTTTTTTGAAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCG:1 + chr3L 15708612 5' - I-element 153 1 60.27 AAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr2R 6847841 5' + Doc 69 1 62.33 GGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAA:1 - chr2L 15550755 5' + Bari1 75 1 66.44 ATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTC:1 + chr2R 7244829 5' + diver 78 2 70.55 AAACTAATTATGAATGTGAATGTGTTCAATATATTGCATTTTTCCTGCACAATTATTTTCTCAATAACTGGCTATATTCTATCTTAATTCGTATTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGT:1 - chrX 19042274 5' - hopper2 1193 2 47.95 CATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chrX 585711 5' + Tirant 65 2 70.63 ATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCGGAAGCTGCATACTTAATATCAACCTTCTATCTTTTATAGTTTCTG:1 + chrX 22902353 5' - INE-1 155 1 51.91 TGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 11062831 5' - roo 345 2 58.22 AGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3R 26774097 5' + hobo 34 1 56.31 TTGAAACTAATTGTTTTTTATTAATTTGTTATAATTTTTTTGTTGATTTTTTTCTTTTAAATTTATGACATTTAAATAATTTGTCTAAATACTTAAGCCACCTCTAATTTGTAAAAAAGTAATTTTTGGTAA:1 + chrX 22946017 5' + Tc1-2 1464 1 72.73 GAATCGGGTTTTTTCGCTAATTAATCCGCGAAAATGTTTACGACTCGGATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 + chr3L 18930932 5' - I-element 5330 1 65.75 GAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACC:1 + chr2R 5484776 5' + mdg1 7129 2 78.77 AAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAA:1 - chr3R 27083098 5' + jockey 4617 1 77.24 ATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAA:2 + chr3R 20675817 5' + jockey 4910 1 52.74 ACGTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAAT:2 + chr3R 29690683 5' + I-element 5239 1 56.85 TATATACGCATATCTTAATCTGTAGATACATTTTAATGTATCCCAACCTGCAGATACATCTTGAAGTACCAACACCAGTCACCGTTTTTGCTGCCCAGAGTGTAGCTCACCCTGCCCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAAT:1 + chrX 11472757 5' - Juan 4005 1 68.49 CCTTATATAGGAGAAGTTAGTGAAGCGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAGTTCTGCTTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTAGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTTT:1 + chr3R 19449625 5' - Porto1 4449 1 64.38 CTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTGGTACGATTGTTAGTATTTATTGAAAATATATTGAAAATAAAAGCCAAGGTATGTTG:2 + chr2L 23008373 5' + transib2 276 1 67.12 GTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 31653154 5' - roo 8999 2 69.18 GGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCATGTGGG:1 - chr2L 15550755 5' + Bari1 57 1 57.46 AAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTTCGCT:1 - chr2R 2590781 5' + HMS-Beagle 84 2 70.55 ATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAA:1 + chr2R 10161810 5' + transib2 87 1 75.34 GTCCTTTTTACTTTCAAGTTTCCATATACTAGACAACCAAACAGAATACCCCTTAATAGAGAGAACCTCATCTCGAGATATAGAACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAA:1 - chr2R 16875138 5' + X-element 4444 1 67.67 TATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGACCGCATTCTGTTCACACATTAACACGAATATATTTAATGACTTACAATTTT:1 - chr2R 9871583 5' + roo 8686 2 66.13 ATTCTCTTTCGTAAAACTACAGTGTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1 - chr3L 22723938 5' + HMS-Beagle2 62 2 61.64 GCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3R 26178473 5' + 412 7115 2 58.90 AGAATCAGAAATAAATAATCTTATTTCCAACACGTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGC:1 - chr2R 20802705 5' - mdg3 222 2 67.12 ATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 - chr3L 12315820 5' - transib2 2768 1 57.97 AAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2R 22992544 5' + hobo 54 1 56.83 GGCTGGTATCCTGCTGCCAAGGGAATCTCATTAGCCGCATCTAAAAGTGGAAAAAAGTGAGTTCTTTACCCGGCACTGGGGTTTTGAATACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAG:1 + chr3L 8964425 5' - HeT-A 6003 2 58.22 ATCGTCAACTAACTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 16157237 5' - pogo 2084 1 69.86 GATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr3L 2544605 5' + Tirant 52 2 52.74 GCATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 - chr3L 21996273 5' - Transpac 5181 2 50.00 AACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3L 18281864 5' + Doc 59 1 64.66 ATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 11062816 5' - roo 330 2 68.49 CAGATGTTTGGCCAAGATCAGCAAAGATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCCGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAACTAATAG:1 - chr3R 17736929 5' - opus 7422 2 78.20 TATTTATGGTTTGTTGTAAAGCTTAGCATTTAATGGGTGGATGTTTTTGGTGTTCGGTGGTCGCCCCAGTCATCAATTTGGTAAAAGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTG:1 - chr2R 4330228 5' - I-element 5043 1 65.07 ACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 13766185 5' - roo 9028 1 55.17 ACTGTAATAATGCCGCCCGATTTGAGCCGCGACAACACAAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 - chrX 1264094 5' + Burdock 6147 2 76.71 GCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr2L 4123826 5' + transib2 35 1 60.96 TTTATCAATCTAAAAACTGGCAAACAATTGAAATAGTTTTTACATTTGAGCGCACTTATCATTTTAGGCCTTTCTAACATCCTTTGGATTGCTGAGTCGGCTTGCCGACCATGGGTTTATGGCGTGATGCATTGGAGCCAGGGTAG:1 - chrX 5821630 5' + gtwin 7116 2 61.64 AAATTGTTGAATTAAAAATGCATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAGTTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATACCAAATAAGAAGA:1 - chr2R 14724954 5' - roo 408 1 73.97 AGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 18396181 5' + roo 8725 2 62.33 GAACTAAAACAAAAAGTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCT:1 - chr3L 6447167 5' - transib2 2806 1 73.29 GGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 4341250 5' - roo 9029 1 53.62 AACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 18488448 5' - roo 328 2 76.71 AGACATTTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGGATGTGCATATATCGAGGGGACACTGGACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 4460993 5' + blood 7042 2 62.68 AGAAATGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTT:3 + chrX 21639579 5' - gypsy5 387 2 69.86 TTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTTCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - 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pogo 2055 1 50.34 AAAGTTGTTAAAAAGTTAAATAATTTAATAAATAATAAATTAATAAATATACTTGTATAGAACACCTAAAATTAGATAATACAAAGTAGGACTAATAGGTCTTAACTAGATTAATAGATCTTAGATATTTATAAATTAATAAAATA:2 - chrX 16193534 5' + G7 1141 1 79.45 GAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chrX 10537846 5' + I-element 53 1 53.42 GTCGTTCCTCTGATGATTTTTGCCCCTGTTCACTGGTTTTCCAGGCTTGTGGATCATCAAAATAACAGCCATTTTCCATTGTCTTGGAACACTTGAATCCTTAAAATAGCATTCAAGATTAGTGCTATATAGATTATCGCTTTTAT:1 - chr3R 22800504 5' - Helena 52 1 70.55 AATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:1 + chr3L 15913853 5' + jockey 4824 1 63.45 AGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAA:1 - chrX 6116336 5' - transib2 2753 1 66.44 TTTTTAAATGAAAATATTGAAATAATACTGGAAAGAGGACTGAATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGATTTCGAGCGTT:1 + chr3R 1588573 5' + invader1 3911 2 49.46 AGTATCGTATTTTAAGGTATTGTATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - 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BS 5001 1 77.40 AATGTTAACTATTTATATTTAACTAACTAACTATTTATATTACTATATATTATAGTA:1 + chrX 10562400 5' - Tc3 284 1 42.11 TTTATTTAATATTTTATTTATTAGACTTATTCGAAAGTATCTAGTGTGTAACGAAATAATTTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGCGG:2 - chr3L 20717702 5' - Gypsy12A_LTR 2228 1 81.52 GACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 - chr2L 15188475 5' + 297 45 2 55.48 GGAATGATGATTATATAGATCTAAACCTTATATTTTTATTTCACTTATTTTATTTGTTGTGGTCCCTTTTTATTGTGCATAATAATTGATCTTAGCCTAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCG:1 - chr2L 10109172 5' - blood 217 2 55.00 CATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr2L 47162 5' - roo 317 2 77.40 AAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:2 - chrX 17343505 5' - I-element 5325 1 57.93 GCTGCAACTACGCCGATTCCGATGACGATGCCAATACCAATACCAATACCAATGCCAATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCA:1 + chr2R 11804143 5' + pogo 1735 1 60.96 GATAAGAATGCAATTCCGTTCAAAGGTAAGAAAGGCGAAGGAGCAGCTAAACGTGTCTGATCCGTCGATCTAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGTCTCCCGCAAATTTAAAACATAGATTAATACTTG:1 + chr3L 2191782 5' + TART-A 13262 1 51.37 GTGGACAGGCGGCAAACAGGCCAAGATGGTCAAGATGGTCGAGATGGTCCAAAGCAAACACGGAGAGATCGGACCGGGCAAACATACTTAAGCGCAGCGAAAACAGCAGAAACCCATTCAAAACAAAACAAAGTTAAAAAAATAAA:1 + chr3L 11925085 5' + gypsy2 424 1 76.71 ATGTTGCCACGAAGCGACCAAGCGAGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 - 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roo 8996 2 69.86 AGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2R 13766213 5' - roo 8999 2 69.18 GTAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr2L 15076234 5' + 1360 32 1 62.33 AAAGAAAATCTGATTTATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 11062690 5' + roo 19 2 72.60 ATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3L 2544635 5' + Tirant 8139 2 59.38 ATACGGCGAAAAGAACTGAAATAAAACTAGGGGAAAATTCCAAGAGTGCCCGAACAAACAACACCAACCCAGCGAATTAGTGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACCA:1 + chr2L 6875369 5' + F-element 4578 1 57.63 AAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTC:1 + chr3R 26178367 5' - 412 7491 2 52.74 GACTCACTCTGGACAAAAATCGAGCAGACCAGAAAGGGCATGATGTAGGATTTTACGGTCAGCTATAACATACAATTCTTTATTTTACCTTAAAAA:1 + chrX 746519 5' + pogo 2016 1 69.79 CCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTT:1 - chr3L 13581726 5' + jockey 4833 1 67.12 TAACCATTTAATAACGATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAA:1 + chrX 14722084 5' - diver 6075 2 60.27 TGAACANTAGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:1 - chr2L 23400849 5' - S-element 1674 1 56.16 AGCCTTTGTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chr2R 7244771 5' + diver 5908 2 71.23 TAAGCTTTTTAATATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGCACACTGTACCCTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTTAAACAATTTT:1 + chr2L 7921632 5' + Juan 3778 1 68.38 CCGTAGGGAGGAACGGCATGCGTGATGGAGACAAGAACATCTGCAAGAAGGCAAAATTTTGATTGGGAACTTAATGAACGCAGTCCACCTAAAAAGACTCTGTCTACTTTTTGACCAGCATGTTCAGGGAAAATGGAAGTGGGTTT:1 + chr2R 20284820 5' - Circe 151 2 47.95 AAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3L 23906492 5' + 1360 43 1 52.78 TAATTGCTCTCCTTACTTGCTTGTATTTTATTATTATTATGTATGCTAAACCAAGTGGTTAGCAATGCAAACATTATGTAGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr3R 7943849 5' - blood 7348 2 56.85 TGGGGATTACGAAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chrX 19539591 5' - pogo 2079 1 51.37 AATTATGGCGCTCAGAAATGAATTCAAAATTATTGCTGGCTTGTTTGCGGTCAATTTCGACTGCAACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGCCAATTAAACTGAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3L 22325952 5' + hobo 11 1 78.08 CTTGGCAGATTTGGTCAAGCAGGGACGCGTCAAGCGGAGACGAATTGCAGCAGGACTCATCCCCTAGATTTGG:1 - chr2R 4932838 5' + G7 1047 1 73.97 GATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 + chr3L 13365734 5' + BS 5042 1 48.63 AAGAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:2 + chr2L 18549795 5' + roo 29 2 64.38 GTGTGTGGTGTTGTATCTTGTGTTTTTACAGCGTGTTTGGTGTGAGGCTTTTGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCGCTCTCACTCGATCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCT:1 + chr2R 16329179 5' + Cr1a 318 1 66.90 TTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 4063925 5' + roo 72 2 67.81 ACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2R 13168645 5' - P-element 2842 1 51.13 TTTATAAGTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 - chr2R 18529986 5' - jockey 4953 1 58.62 TTGTTTCATTATCTTCAATGACTGATTGTAAGAAATTGTACAATTGGACCCAAGTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAAT:1 - chr2R 7244941 5' - diver 192 2 67.12 ATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATA:1 - chr3L 17568099 5' + S-element 83 2 75.34 CAACATTTGCATTTAAAATGTCATTGTGAAATTATAACTTTAAAGCCCTCGCCCACATGCATGTTAATAAATGTTCGCACCTACCTATACAAGCATCCATAAATGCACACACACACACACACACACTGAG:1 + chr2L 4748962 5' + accord 258 2 50.77 ATTTGGAAGTAAAAACCAAAGCTTTCTTCGCCGTGGTTCTTTCTTTTCGACAAACAGCAGTGCTCTGCGGATCATTTCGTTTGTCCAACCGACACTGCCACCAATTTC:1 + chr2L 18113503 5' - Tc1 437 1 64.81 ATTTGTTTGCCAAACGTGTTTGTTTGTCCGCTGCCACCCCCAACTGCCATTTCGGTATTAATTGGCATGGCAATTGACACTTGGGTGTGATGAATATTCGAGCACTCAACAATCATTGCCCTTTTAATTTT:1 + chr3R 10031601 5' - 1360 440 1 79.39 AGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr3R 18093392 5' + I-element 45 1 52.05 CATGGGCGGTTCCATGTTGTCCTCGATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGGGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTT:1 - chr2L 15550808 5' - Bari1 1689 1 70.55 AGTACGAATAGCACTACTGTCACTTTTCTTAGGCATTGCCACCTTGTTCGATTTCAGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 13158781 5' + roo 8684 2 71.92 CCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCC:1 - chr3R 30813396 5' + FB 55 1 75.23 TAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr2R 19941633 5' - hopper 1352 1 58.22 AGCCTTAACTGGCGTTGCATAAGTGCCAGCTTACTTAATTAAAGTATTCAAATAAGTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTT:1 + chr2R 20300380 5' + I-element 5016 1 64.38 GGGCTTCGTTTAAAAATCATCGTTAGTCACATGTCTGAAAATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAATTTGAATTTTTGACTT:1 - chr2R 6622681 5' - S2 1684 3 62.41 AATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chrX 8360532 5' + roo 66 2 64.38 AATCAGTCTCTGTTGGATTCTGTAGCGGAATGAATCCCTAATCCAATTCACGATACGTGTACATGTACCACCGCCATCATTCATATTTTTGCGGTTTTTTATTTATCGTTTTTCGCTTTTTGTTTTTTATTTTGTTTTTCCTTT:1 + chrX 8322266 5' - Doc2-element 240 1 55.56 ACTATTAATTATGTTGCCTTTTTACGACCGTAGAACGTAGCACATAAATGTGGTTTTTGGACTGTAAGTGTGTGTGTGTGACATGTGTGTGTGTGTCAAAATAGTGGTGCGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTGGTTACAGTT:1 - chrX 8672475 5' + Circe 223 1 67.12 TTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 19032660 5' - roo 342 2 84.96 ATGCTCGATTAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 7719843 5' + roo 39 2 58.90 GGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 + chr2L 17180067 5' - Juan 4161 1 51.72 ATATCTGAATGTTAATTAAATTAGATTCTAACAACTGCTAAAAGCGAGCTGGCGAAAAATTGATCTATTGTGCTTCATTGGCCATACATACATACATATGTACATATGTACATATATAGGTACATATATATACATATACACATAT:1 - chrX 19290999 5' - G3 4507 1 78.62 TATAGCGGACTCTTTAACTGGAAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGCACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGCGTAAATGTATGAAGGATTTTAAGGT:1 + chr3L 22960422 5' - Tirant 348 2 49.32 TCAACGATTTGTGTTACCCTATGAAATAAAATATTAAATATGTTAATATTTTTTATTTTCCCAGCCTCTTTTTTCTAATTGGAAGCATCGGATATCAGACACCTGCGTGAGTGTGTAGATACTTGTCGTCGGTGTTGTTGTTGGCG:1 - chr3L 2586803 5' - gypsy10 5705 2 57.53 ATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr2R 21160618 5' - 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chrX 8687247 5' + I-element 252 1 54.11 GTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGATTAGGGATTAATGGATAACTACTGCATCTGTTAATTT:1 - chr2R 5532371 5' + G4 3775 1 52.74 AGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAGAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 - chr3L 14720938 5' + F-element 45 1 57.93 AAACGAATGTTTCTCTTTGAAGGCCCTGCTTAATGACGTCACAAGCGTAGCAGAGTGCAACAGACAGACAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATG:2 + chr3R 20622562 5' - pogo 1927 1 56.16 TTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTGGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 + chr2R 21160669 5' - Transpac 5163 2 67.61 CCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chrX 8437667 5' - P-element 2827 1 39.39 GGAGCTCATGTGCGGATTCCCCATTTACAGCTCACGCTGGTTAAATGCAGTGTAAGTTTTAAAAACATCAAATAACTTACCTTTAATCATCGCTTCTAAATAAAT:1 - 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chr2L 19359267 5' + HMS-Beagle2 7099 2 70.55 CTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTA:1 - chr3R 31264122 5' + jockey 4786 1 59.59 TATTATGTATAAGTGTTTTTGACATAAATTGAATAAATAATCAATAATGTTCTTTTTCTAGTTCATTATTATAAATTTCCGAATCTGATCTCGAATCAGAATCAGAATGTAAATCCAATATTTT:1 + chr3R 1965365 5' - transib2 2523 1 72.58 CCAACACAAGACATGCGAAAAAGGGGGGAATTATTCTGAATGATCGAAGGATTCCAGCTTTTAGCACGTGTCCAAAATCTATTTGTGGGGCGGCGGAGAGAGGGGTGGTATGAAAACACACACACACACAT:1 + chrX 12439141 5' + accord 7027 2 77.10 ACCGCCTTAATTCCCCGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2R 13168774 5' + P-element 27 1 66.43 ATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 23295584 5' - P-element 2837 1 21.53 TTATAAGTCACATGTTTTCCATCAATCCTGCAGTATTTCCACCTTAAGCTCGGCCAGCTTTTCTAAGATTTAATATTTGCTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAA:1 - chr2L 18220175 5' + I-element 5146 1 58.22 AGCAAAAAATTAAAAGGTCCAAAAAGGAATCCAAAATAATTGTGCTTACAAGGTGATTGTAATAATAATAAAGTGAAGTGACTGCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAA:1 - chr3L 6254388 5' + I-element 260 1 62.07 AAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr2L 15550751 5' - Bari1 1648 1 67.69 TTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr2L 18347402 5' - transib2 2779 1 54.79 AAGAGAAGGAGAGAATATTCAATCCGCATATTATATACCCTCGAGCGTATAACCATCTGTACAAAAAAGGATTTCCTTTGCCCAGTCGTACGACTTTGTACAGATGGTTATCAGATGTGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAA:1 - chrX 1135751 5' + P-element 2566 1 28.77 AAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chr2L 15188469 5' + 297 51 2 58.22 CACTTCTTATAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAAC:1 - chr3L 22035605 5' - 1731 4573 2 60.16 AACTGTTTTAGCTCGCGTGCGTTTGTCTGGCGGGTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATA:1 + chr3R 23492495 5' - transib2 2419 1 59.02 CACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCA:1 + chr2R 18514894 5' - P-element 323 1 32.88 AATTAAATCGAAATAAAATAGTACAATAATGGCTATTGAAAATGGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAAAGAATGCTATAATCGACTTTCAGACCCGACTAGCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGTG:1 - chrX 14770788 5' - INE-1 539 1 77.40 ATGTTTAGCTTAAAAGGTCAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 14366480 5' - roo 398 1 79.45 GGCTCGGAGCATTTATCAAGTCTGTGGCATTAACCGACTCATGAATGTTTCAAATATCCGCTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCCGTATGCATTCTGATACACAAATTCTTTGAC:1 - chr3L 2919064 5' + 17.6 164 2 59.31 GTGGTAGGATAATAATTTGGGTATACATGGCAGGTCAGAGGGGAAAATGGTGTGTCATACAGGACACAACCAAAGATACTAGAATAAAAAGATGCGCAACACCATACGATTTTTTGGCACACGATTCTTTCGCCGTG:1 - 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chrX 22889893 5' + Doc 4509 1 73.04 AACTATTAAAAAGCCCTTTTCGAAAGTCGTATAATGTATAACATTTCTTCCCATCCCATGACCCTATGCAATAGCTACACCCTTTAGGCAATATCTTTATCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAAT:1 - chr3R 5297009 5' + 297 240 2 66.44 GAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATT:1 - chr2R 5532365 5' + G4 3781 1 48.63 ATATCGACTATTGGATACCCAGTAAACAAAAAGCAAAGTTGAAACCATGAATGCAACAAAAATACTTAATGCTGCGCCAAGTTGTAAGCATCTTTCAGACTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATA:1 - chr2L 12212663 5' - blood 155 2 61.64 AATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTTTTCTTTTTTCATTTTAACTTTGCTTTTTATCTTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chr2L 9744640 5' - TAHRE 10428 2 40.41 AGGTTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr2R 5479986 5' + F-element 72 1 59.12 TGAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAG:1 - 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HMS-Beagle 211 4 54.79 GTTTTTGGGGATGCGGATGCTGGCGGTGTGGATATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTGACCCTTTGGTGGG:1 - chr3L 13085949 5' - Quasimodo 212 2 79.23 GGCTATTTCACATTTTGCTAATAAAATTTCGATAAACATTAATATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGTCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATGTTATAAATTGAAAAAAAAAAAGTCAACTACAAAATTATGACAAATTAA:1 + chr3R 25258633 5' - Tc1-2 1375 1 69.18 AATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACCTACAATTTTGGGTTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 20525228 5' + roo 8721 2 60.96 ATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGAATGGCCGTTA:1 + chr3R 19448807 5' + 1360 3362 1 64.84 AGGCAGCATTTGCCTGTGTTGAAGTTACCGTTATTCACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 - chr2R 6482579 5' + gypsy 7002 2 73.97 CTCTTCACAGAGGACCTGTTACAATACTACAATGTGTGCATAATAATAATTCGAAGTCGCGGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTTGAGTGGTTAAGCGGGCAGAACCG:1 - chr2L 11386889 5' + blood 269 2 55.45 AAATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chrX 10537805 5' + I-element 10 1 76.39 AAAAAGGGAAAGAGATGGGTGTAAGGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chrX 4341225 5' - roo 9045 1 66.44 CGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr3R 26774099 5' + hobo 75 1 67.81 GATATATTTGTTTCTTCATTATGGTCTATCTATCTACAAATGTACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGATTTACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATAGGCCATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATG:1 - chr2L 22750405 5' - Tc3 1642 1 71.23 ACGCATCCGAGTGCTTCTCTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 19266931 5' + roo 8724 2 59.59 AATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCCGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2L 15940361 5' - pogo 2079 1 70.55 TATAAAATTATCCAGCGATTTGGTGTAGAATTGAATATAAATAAATGTCACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCA:1 - chr2L 14358844 5' - diver 6039 2 70.55 ATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 - chr3L 20711706 5' + jockey 4813 1 53.42 ATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAG:1 - chr2L 7618577 5' + X-element 4462 1 55.30 AGCACTAAAGCAGCGCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr3R 27123626 5' - roo 395 1 76.03 ACAGCTTCTATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTTGCACTCTAC:1 + chr2L 12818184 5' - hobo 2928 1 78.08 TAAGTAATCTTTGGCCGCAGCCACATCGGCGGATCAACTCCACGGAAGTCGGTCTTGTGACCACGACGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAGATCTTC:1 - chr3R 11810767 5' - roo 356 2 51.72 GGCTTAGCTTCGGCAGGAATAGAAAATCAAAAAAAAAATATAAACTTTGACAGTACAAACAACGAGATTCCACACATTCCACGGGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTTATAAGAAAGCTAGACAG:1 - chr3L 18418159 5' + Tc1-2 167 1 56.16 AAACCTGCGGGCTTTTGGGGGCCCGCGATGGGTGTTTTGTTTTGTTTATGTTTTTCTTTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 15124342 5' - Doc2-element 223 5 72.84 TTATCTTTTAACCATTTCTGTTGTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTA:2 - chr3R 24090564 5' - roo 371 1 52.74 TGGTGTTTCATAAATTATAACGCAGCTTTTCCCCAAATTTGTGATTCCCACTTTAATGACTCGCAGTGGAAGGCTGCACC:1 - chr3R 8168349 5' + P-element 301 1 48.75 AAAAGCAAAACAAAAAACGTAATGAAGGAAAAATGATCAAAAATTGACATTAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACA:2 - chr2L 16466835 5' + Porto1 250 1 65.07 AAAAGCATCCCGAGGCGAATTTGCATAGGCTTAATTTAAATTCCCTTAAACAGCAGCCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAATAA:1 - chr2L 12984414 5' - hopper 1400 1 54.11 TATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTG:1 - chrX 20999573 5' + BS 61 1 70.45 GATGGCTTTGGGGTGGAACAAATGTGCCTATTTGTCGCTGGTGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1 + chr3R 28042896 5' - Stalker2 383 2 71.92 GTAATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTA:1 + chrY 680448 5' + invader2 34 2 69.78 CGCATCCAACCCAGAGCAGTGCGGCCGAACAATTTGTGCTCGTCTATGTCGAATATCCTCTTCGACCACGGCAGGTCCTTCTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCCTTGACAACTTGATTGCTTCTAT:1 + chr3R 19227947 5' - HMS-Beagle 6600 1 56.55 AAGCTGATCCAATGGAGAGCGGAGAAACAACAACAGCACAGCCATTGACATTGAGCAAACTTCGGCAAATGGCACGTGAGCGGAAAAGAGATGACGAAAGAGCGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3L 11486414 5' - Cr1a 292 1 75.86 CAAAAGAAACTTCTCATGTCAAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATA:1 - chr2L 18347435 5' - transib2 2812 1 77.40 TGTTAAGCATAATTATTCATTGCGTTAAATAAATTATTCAAATCAGAGACTAAATTTAATTCTATTGCCACCGAAGGTATCTAACTCAACATAACCAATAATATTTATGTTTAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATA:1 + chr2R 14532783 5' + hopper2 1170 2 74.66 GGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGCATGGAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCG:1 - chrX 18742888 5' + invader4 76 2 73.10 GGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTT:1 - chr3L 22744695 5' + FB 80 1 80.74 ATTTAACCCATTACAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAG:1 - chr2L 1924051 5' + G2 2985 1 69.86 GTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chrX 9530397 5' + 297 53 2 71.67 ACCAGGTAAAGTAAGGTTGTCCAAATGTTCGCAGGATAACTGATTGCTTCAAAAAAGATGCTATTACCAAAATTGGCGGTAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGAACATTTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTG:1 + chr2L 22707233 5' - Cr1a 4262 1 53.42 GTGGTGGGCGTGGCAGAACTACCAAGCTGGGGGCAATCATGTATCGCTATTCTAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGATGGCATT:1 - chrX 6513345 5' - hobo 2538 1 63.64 GATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr2R 7244838 5' + diver 87 2 73.97 AATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chrX 8092349 5' - pogo 2081 1 70.71 CATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCACCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr2L 19675084 5' + 297 42 2 56.16 TATATACTTTTTTTTTATTTTTTAGAATTTCATTAACATAAATATTTACCAATAATGGACAGCAGTTATTGCCTATTTCTTATTTGAAATGCTACTAAATAGCTGGGTTAACAAAAACTAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 8217693 5' + Doc 4693 1 81.54 AAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGCCATACTTGCTCCAACGTGGAGCTATGCCATCCAGGATTGGGGATCTGCCGCCAAATTCCA:1 - chr2L 21403535 5' + G5 4406 1 68.24 TATTCAACTAGAAGTATATAAATTGATCAGTAGCCGTGGTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGT:1 - chr3L 27859940 5' - INE-1 576 1 73.29 ATGGCGAGGTAGTAAAAAAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:2 + chr3R 7943721 5' + blood 7065 2 53.42 ACTTCCTCATCCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chr3L 6446998 5' + transib2 36 1 60.96 ATATATAATTTCCAGAGGAATGCCGTGCACGTCCATAGCTCGTTAATTCGAAGAACTCAAAAATCATATGTGCGAGTATTTTACTCCCCCAGGGAAACCCCAAAATCCACCATAACCAGAAACAAATATAAACAAAGTGAGGA:1 - chr2R 19821032 5' - Transib5 2633 1 62.24 ATTAATATGAGTAAGAGTAAGGCCTTTTGTTTTTGATTGCATTGATGACTGGTGGAATATTTAAGTCTCATTGGATGTTTTCGTTCCGAACGCACCACGGTGCCC:1 + chr3R 24958301 5' - F-element 4359 1 68.57 AACAAGTTGGTTATAACAGTTTCTTACAAATCAAGAGATAATTTGAAAAATGTATTAATATTAATAACAAATTGTAGTACTAGTAAAAAAATCAAAAAATACGCCTTTAATAAAAACAAAGGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 + chr4 228248 5' - INE-1 571 1 73.10 AAAGAAATTGGTAAAAAACGATTCTATATTACATCCTAATATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCACAAAGCAATTGATTTTACCTTTTTTTATTTCATGATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTATAT:1 + chr4 931155 5' + Cr1a 4312 1 76.71 ATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGT:1 - chr3L 2544710 5' - Tirant 330 2 63.70 AAACAAACGACAAAATATTTGCCGTCATAAAAAAGCTCAATATCAGCATTTGCTGATAGCGAATAGGTAGGTAGGTACTCTTAATTATTTCTATTGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGG:1 - chr2L 4004010 5' - mdg1 494 1 65.28 GTCAAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCT:1 + chr2R 4887630 5' + jockey2 3016 1 71.92 GGCTGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3L 3983813 5' + P-element 63 1 37.31 AAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2R 6847842 5' + Doc 68 1 61.64 TGAAAAACCAAAAAAACACACTATATGAACAATGGTGGAACGTTCAAAAGAAACATATTATTTTGTATTGTTTTAGAACACATTTTTGATCAATTCATTGCTAATTTCCAGTAAATATGCAATATATAAATATATAAATATATAAA:1 + chrX 3764912 5' + Stalker4 7048 4 71.92 AGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chrX 14722258 5' + diver 5895 2 73.79 ATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 + chrX 13134895 5' + jockey 4828 1 62.33 AGTACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2R 2427631 5' + Doc 50 1 53.10 CATCGTGTCCGAGGGCGATGCCGATTCCGTGGCTACAGTACACAGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGGAGGTATTATCACTCAGAAGATAGAGGAGTTATGCGGTCCAGAACGTAGCCACGGTCGTCTTGGGAGAATTTTG:1 + chr2R 2318152 5' - ZAM 8337 2 68.49 TCTATANTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3L 22035680 5' + F-element 50 1 52.05 CACTGGAAAAAATGCATCTAAAGCTTAGCAAAATCATTTCAATTCAATCCTTACTGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGTAGCCCCCGAAATTCTGCTTA:1 + chr2L 12754945 5' - jockey 4548 1 58.16 AATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 4964082 5' - roo 358 2 53.42 ATAGCAGCAAAAAATGACGAGAGAAGCAGACGAAGACGATGGCAGGAAGAGGGGGCTCCAGCAACATACAAATAAAACTTTTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACA:1 + chr2L 675496 5' + Doc3-element 4486 1 50.43 GGATCCAGCTTCTGTTCTTGTTTTTATGAGTTTGGATTTGGATTTTGGTTTGGGGGTTTGAAAACCGTCCGAGAAGTTTGACAAAAGCTCACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCGAAAAATG:1 + chrX 4528892 5' - FB 65 1 59.85 TATCCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3L 8959560 5' - 1360 3361 1 66.44 GTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGCCCGATT:1 - chr2R 9967112 5' - Bari1 1640 1 68.18 ACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAA:1 - chr2R 8157294 5' + mdg1 7067 8 57.53 CAGTGCACTAGGCCATTGGCATCTCGCAACCTTTTGCAGATGGAGGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr2L 16275063 5' + FB 31 1 64.38 ATACGAATTTTTAGGTCGACATAACTGATAACCTTTTAAATTTACGCGTTATTTTATTTTTACATGATAGGAACATATGTATTTACACAGAGGTGTGTTTGTCATATACAAATATACAAATATACAAATATACAAATATACAAATA:1 + chr3L 9357208 5' + Stalker4 7050 4 79.45 TTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACA:2 - chr3L 19274882 5' - transib2 2755 1 67.12 AATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 - chrX 14771822 5' - BS 5043 1 52.74 ACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2L 18549810 5' + roo 8708 2 54.11 ATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAGG:1 + chr3R 19450016 5' - roo 8644 1 53.78 ATTCACGAAGACGTTTATCATCATAACTTTGTTAAAACTTGTCGTACAGTTTACAATTTAGTAGTTTTGTGCAGTTGTTGTTGTAGTTGTTTTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACT:1 - chrX 6351772 5' - Doc3-element 491 1 50.37 ATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:2 + chr2R 8735574 5' - mdg1 359 2 63.70 ATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAA:1 - chr2L 4713940 5' + transib2 81 1 76.03 ATAATAAATGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:2 - chr2R 5941455 5' + copia 37 2 60.96 TACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3L 1279162 5' - roo 8990 2 77.40 AATATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 + chr3R 19992614 5' + hopper 36 1 58.57 TTATTTCTCCAGTTTTGCGTCAACAATACAAAAGTAATTGTTGTTCAGCCGCGGCAGTGGGAAAATTTCTCGCTTAATGCGTTTTTTTATTATTTTATTTTCTTTTTTTTT:1 - chr3L 11670236 5' - Doc2-element 254 3 76.58 ATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCATAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:1 - chr2R 9967124 5' - Bari1 1638 1 63.01 ATGCAACTCACCCGAAAGTAAAGAGGAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1 - chr3L 21656011 5' + HMS-Beagle2 31 2 63.01 AGCCAATTAAAATGCTTTGATATCGTGACAACATAACATTGGACATTGCCGTATGTTGAGATAGTCTCCGACTTCGACTCTCCCTACTTACATACATTCCCCATCCTCACCCGTTTTTAGTTAATTTTTTTGTTTTTTTTTTTACC:1 + chr2L 11397167 5' - G-element 4325 2 73.29 ACGCAACGCCTTTCTTTTTTCGATCTGTTCACTGAGTATATAGTTTAATAGTTCGCCAGTTTTTCAAGAGTTGTTCTTTTCAGGTGCTGTAGTTGCTGATGCTGTTGTTTTTTTTTTGTTTTTGATCG:1 + chrX 1098286 5' - R2-element 3581 1 53.12 CATCTAATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2R 17796506 5' + jockey 4685 1 75.18 GTTGATTATTATTAACGCATAGTGTGTCACTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - 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Doc 192 1 45.56 ATGTTTTTTCTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAAT:1 - chrX 22824279 5' - Gypsy12A_LTR 2259 1 67.12 AAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3R 28469178 5' + 412 39 2 58.90 AAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 - chr2L 16275013 5' + FB 81 1 73.97 AAAAACAATCGCCGATTGACGTTTTGTTTTACTTCGCCAGCTGCCGTACATCGTACGGCTCGATTCG:1 + chr3R 30099717 5' - Cr1a 4389 1 70.15 TTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - chr3R 16342022 5' + P-element 74 1 33.56 CTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTTG:1 + chr3R 28042961 5' - 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chrX 661972 5' + 412 41 2 55.71 GGATTCTAAGAACGTATCATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2R 17878664 5' + Doc 39 1 60.27 AATGGCAATTTTCTGAAACTCCTTGCTGTGTCCAAGTCTGCCTTTCTGTGCACATTCATTCAATTATTATTCGCTTTCGCTCAAAGTCTCATTTTTGCTACTTTGTACTATGGAAAATTTGACCACTTTTTGTGGCCAAAATTAAT:1 - chr2R 15664786 5' + Transib-N1_DM 20 1 69.86 AAATAGAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr3R 2527709 5' - INE-1 546 1 47.95 TTTCACTATCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTAAGCTGCATCGGCACGATATCTGCAT:1 - chr2R 11804755 5' + pogo 35 1 61.64 AAGAATTTCCCGGAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr3L 11326639 5' - pogo 2097 1 78.33 TAGGCGAAGAGGATGTTTTCGGGACTGGAATTGCAAGGATTGCCAGGATCCGTCCGGCTGTCGATGCCTGCTCACTTTTTGCTCCCCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTTCAAACATAAGTGCCCCGTGTACATTTCAACATCGCTCT:1 - chr3R 12871500 5' - invader6 250 2 62.07 GTAACTCTTTCGCGTTCCATAAAATAATCTATTTCAATCCGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 + chr3L 21380493 5' - I-element 5321 1 57.53 AAAAAATTATAAAGATCTAGTCAATATATCTGGGGAATTTGCTCAGCATCATGTTTGAACAAAAAATCACTTCTCTATGATATTTTTTATATAATACAAATATTCAATATTTTTATTCTGAATAAATAATTATTAATAATAATATC:1 + chr2R 11534685 5' + gypsy9 298 2 54.79 ATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCA:1 - chr2L 15076173 5' + 1360 64 1 74.36 AGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGAGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3R 30675457 5' + 297 6635 2 59.59 CTTAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chr2R 8157301 5' + mdg1 7072 2 62.33 AGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAA:3 - 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F-element 243 1 69.86 AATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr3L 2544614 5' + Tirant 9 2 70.21 ATTCATTTAAGTGCTTTGCATAATATCTAAGAGGAGATGGGACAGATAGTGCAGCTCTATGGGGTCACGATTTACGGCAATCATTATGCTGTCGAAGGTGTTGAATTTGTCAAAGGACTTCATTGAATAATAATAAATAAATAACT:1 + chr3R 10981430 5' + Burdock 310 1 66.44 CATTGATGTGTGTGTGTAATTGTTTACGATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTATAGAATGGATATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:1 - chr2R 4189112 5' - S-element 1674 1 49.32 GAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 15791012 5' - roo 352 2 58.22 TTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATA:1 + chr2R 16510121 5' + F-element 77 1 67.44 AATTGGATTGGAGTTGATAACAATTTGTGCAATAAATAAATATACCTGATTTATGCAAGCAATGCCAATTTATTTAAATGCATTGTTAGTGCATATATAAAAGAAACCAATTAAAGTTAAACTTAAAATACACATAAAAAACCAAT:3 + chr2R 14123818 5' + transib1 2143 2 80.14 CACATTAAACAATTCATCCATAAAAACGTTTTAGAAACGCTTAAGTTTTTATTCAAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 2990088 5' + roo 10 2 75.34 ATGATACGCATTGGAAATGAACGAAAAATAAAATAAAAAACACAAAAAAA:1 - chrX 13914711 5' + F-element 4685 3 60.00 CATAGTTTGAAAATATTTTCGTTAGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTACGGCCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGGCT:1 + chr2R 10161743 5' + transib2 18 1 72.92 ACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCCGGAAGACGGCAACTG:1 + chr3L 2544610 5' + Tirant 56 2 54.48 ATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGTGAGGTAAGATTATTTATTATACATCATGGACGGAGTAGGAGCGGAGCCACCCGGTACTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chr2L 6654647 5' + diver 5924 2 49.18 ATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATAATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 - chrX 8200320 5' - flea 4995 2 69.05 TAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 - chr3L 16033428 5' + Doc 64 1 59.59 GCTCTAATGTTTATTTAACTGTTACCGCTACCTTAAAGTGTCCCGTCCTAGATTTCCTTTTTCCTCGCCCTTTTTATTTGTCCTGCCCGGGCAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGG:1 + chr2R 18055322 5' - Idefix 91 2 68.46 GTGAGATCCTTCAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3L 23906326 5' - 1360 3379 2 77.40 CTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 19450107 5' + roo 22 2 76.30 ACTTCACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:3 + chr2L 14675630 5' + 297 6621 2 58.22 CATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCTCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGACTTTTCCTCTTT:1 + chr3L 23456270 5' - Gypsy6A_LTR 277 1 58.40 AAGTTAAATGTCAACCGCTTGCTTTGAACTTTAAAGTTCAAGTGTTAAACAGGCATGCCCAACAAATTTTCTTGCCGACCATGGGTATATGGCGTGATGCATTGGAG:1 - chrX 326274 5' + gtwin 191 2 63.55 ATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 11257435 5' + 1360 4 2 77.06 CTTTAACCCATTCGATTTGATTCATTTGAATTTATTTAGTTTTCATAATTTCTGTATGCTACGCTTAGATTTCTTGTATTTTTTACTGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGAT:1 + chr3L 10340604 5' - Bari1 473 1 60.69 GAGCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 - chr2R 8735716 5' + mdg1 19 2 71.23 ATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:2 + chr3R 19992617 5' + hopper 45 1 54.79 CAATACAATATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGGCAAAATTATTTTCACAAA:1 + chr2R 9966936 5' + Bari1 8 1 53.68 ATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr2R 17796539 5' + jockey 4702 1 58.40 GCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGGGTGCGGACGAATTT:1 - chr3L 3983866 5' + P-element 92 1 23.29 GCTGCCTTTTATTCGAATGCGAGCGCCAAAAAGCATTCACTTTCAATTTCTCAAGGCAGCGCGTCCCTGGAAGATAATACACAAATTAATATAAAACGCTGTCTGTCTATCGTCTGTCTGCTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 + chr2L 3586141 5' + INE-1 134 1 71.92 AGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 - chr2L 47178 5' - roo 8997 2 67.81 AACAGCCACCGACAATGGAAATTTGCAATCCTGTTCGTCCTGTCGCCTGTCTGCTTCTGGTCCTGCTCCTGTGGCAAACTGCTTGTGTAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 - chr2R 18316158 5' - HMS-Beagle 212 4 58.22 AACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGCACTGAACTGGATTCTTTCTTTCTCTCTTG:1 + chr3R 27405993 5' + diver 5977 2 71.92 CTGTTAAGTTCATATTTTCAAATTTGTTGGTATTGATTTTGGAGATGGTGTTGTTGTTGTTGTGGTGCAGTTGGTTCATTGTGAATAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:2 + chr2R 6932698 5' - I-element 5290 1 65.75 TCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATC:1 + chr2R 5106285 5' + Stalker2 7330 2 73.97 ACCTGTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGGAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3R 5523885 5' + FB 40 1 57.53 TTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:2 + chr3R 16341932 5' - P-element 2831 1 47.26 TTTATTTATGGGAAAGCCTTTTATTTATGCTCATTTGTTCACATTCGAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGGTTTGTTTTTCCTGTTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTACTAGATTCGTTGAAATGTATG:1 - chrX 11906383 5' + INE-1 11 1 51.37 ATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGG:1 - chr2L 17180160 5' + Juan 46 1 46.21 AGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3R 13406395 5' - pogo 2074 1 63.08 GGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTCTACACGTTGTGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2L 4063820 5' - roo 9037 1 58.52 GAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGCTTGACTATTTGTTTAGGGTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGA:1 + chr3L 27356069 5' - Tc3 1669 1 56.80 TGTTGACTGCTGCTTTGCCACTTTGTGGGATTTATGAAATGCTGTGTAATTAACTATTTATGACTCGTTTGCCCTCTACAAAGCAATCGATTTTAACGTTTTTATTACATAACTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAAAAT:1 - chr3L 18357577 5' + Cr1a 4299 1 51.41 ACTTTTATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTC:1 + chr3R 4679414 5' - hopper 1390 1 67.12 AATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATAAGTAAGCTTAGGAGCACCC:1 - chrX 21947719 5' + mdg1 7133 2 65.75 CGCGAAATTTCATCATTTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGAAAATAAAATGGAAAAAAAATACAAATTGTTCAAAAGTGGGCTCTAGAATCAGCATGCATCATCTCAGCCTTTTAGCTTTCATAGTTCCTGAAATCTGGACGTT:1 - chrY 2458274 5' - INE-1 142 1 54.11 ATTATTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:2 + chr2L 13844117 5' - Stalker2 383 2 69.18 ATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACAT:1 - chr2R 2590796 5' + HMS-Beagle 69 2 63.70 ATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTAAAAAA:1 + chr2R 19199700 5' + hopper 97 1 78.77 CATCGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGA:1 - chr2L 12286082 5' - INE-1 94 1 76.69 ATTTAATTGGTGGTACAAAAATTAAGATCATCATTTTTATGAGCTAACTTCGGAAAAGGCCATGTGCGAATTTCAATTATCTTTATATAAACACATGAACCTATTGCTAGGGAAAATAACTTAAATTTTTTTTTTTAG:1 + chr3R 25661548 5' - pogo 2030 1 39.86 GGGTCTTTCGAAGTACTCATTGTACTAAGCTCATTGGAATGCAAAAGCATTGCATTTCTTCAATTAACTGCTCTTATATCTATCGATATCCCAGGAAAATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAACGG:1 - chr3L 19491106 5' + INE-1 536 1 56.03 AAGTTGCACATTTAAAATTTGGCACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 - chr2L 16943930 5' - copia 248 1 75.20 AATTTCTTAGAATAATTTTTGTCCCGAAAGTGTATGAAAATTGTTTGCTGTGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGATAACCACCGAGCTCAGGAGAGCGGAGAGAGCCAGGAGGGTCCACGAGGGA:1 - chr3L 23426200 5' + Rt1c 5286 1 59.23 AAAATGTCAAATGTCAGGCGATAAAGCATAGGCCTGCCAGACTCATACACCCACAAAAACACACACCCACATCTCCGCCATGCACACCCACCCAAACATTTAATTATTGTCCCCATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGATCGA:1 + chr2R 13740019 5' + G-element 4305 1 61.64 ATTTGTACAGGAACCACTCCAAAAAGAAACTAATGACAATGAGAATATTCAACAAGGAAATAATATTACCTTATACCCAAATTTAACCACCTGAGGATAGGCCAAATTCAAAGGTTGGGGGAGTGACATATTCATAAGTCCCTAAG:1 - chr3L 16003553 5' + Idefix 3 2 78.77 CTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr3L 22035665 5' + F-element 39 1 53.33 ATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 2544651 5' + Tirant 7 2 58.18 ACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATACTTGCAATAAGTG:1 - chr2L 8338222 5' - P-element 2839 1 53.42 CACCTATTAACCCCAAACCCTCTTTTCCACTTTGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 + chr3R 25433281 5' - transib2 2771 1 57.14 AATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCG:1 - chr2R 11329662 5' - P-element 37 1 16.55 TTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 4063815 5' - roo 9031 1 57.53 AGCAGCTTTATTGTTGTTGCTCATAGCGCTTAGCCAGACAGTTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGC:1 - chr3R 13612615 5' + F-element 198 1 55.56 GGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1 - chr3R 16630376 5' + FB 46 1 54.11 GAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2L 20265939 5' - roo 349 2 60.84 TTTCAGCTTAGTCCCAATCTAAACAAAAACAAGCACAAAACAATATATTACTTAAATTCCAAACATTTAATAAAAAACAACGCATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAA:1 - chrX 8013807 5' + hopper 1177 1 56.16 GTGATCTGCTGTTGTTAGGTTTCTTATGCTGTGTGTTTTCATATTCGTTCTTTAAGACTTTTTGCACATACCCAGAATGCAATTTGCAATCAGTTTTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACA:1 - chr3R 2216849 5' + invader2 29 2 38.36 TTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTCATCCGTCAGGTTTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTG:1 - chr2R 3104465 5' - Gypsy6A_LTR 336 1 69.86 CATTTGCGTGGCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGT:1 + chr2R 18316016 5' + HMS-Beagle2 46 2 54.11 GTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3R 4805684 5' + 1360 81 1 73.97 GCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:2 - chr3R 31264085 5' + jockey 4823 1 58.90 CTATTTCCTCATTCCAATTACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGT:1 - chr2L 18689262 5' - Gypsy6A_LTR 264 1 77.40 CGATGGTGGAGCGGAAGGAAGATGCAGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTATGTCAGCGCAGCAA:1 + chrX 18742788 5' - invader4 3038 2 54.11 AAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTG:5 - chr2L 16946126 5' - hopper 1349 1 60.27 ATTCCGCGCTACATGACACCCCACATTCGGCATCCCGCATGACCCCCAAAAAGATCCTTTGCCACCAAACACCATGCCACACAATCGCATGCACACACGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCC:1 + chr2R 12388779 5' + jockey 4656 1 75.19 AATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chrX 7795610 5' - roo 9008 2 61.64 ATAACTAATTAAAAAAGAAATTAATGTTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTTTGTTTTTCTTTTTTTATCTGATCTAATATCAGACTTATTATATAGTCTTCTTGAACTTCTCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr2R 14871221 5' - INE-1 553 1 79.86 TACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr2R 12133819 5' + jockey 93 1 76.71 ATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 + chr3R 15724300 5' - Juan 4156 1 56.85 AGTTGCCCTTTTGATTACTTGCGATCGGGTTGTGAATTTGATGAAATGGGTATGCAGAATAATTGATCATGGAATGTCCAATGTAATCGAAGCAGCCCGTTTGGTAGGCTCTCGGAATCTCTGCCAACTCAAAAAAACA:1 - 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17.6 216 2 78.42 GAATATACATGTATATATATATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 - chrX 9179727 5' + micropia 6 2 64.89 GGTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr3L 19111602 5' + Doc 66 1 64.54 AAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 29612018 5' + jockey 79 1 64.38 GTCACTAAGGTACTATCGCAGCTGCGACGGACCCAATGTTTCCAAGGAGGAGGAGCGAGCTTATCAGAAACAGTTCGACGAAATGCGGCTGGCCATCCAGCAGCAAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAAACCTTCT:1 + chr2L 3310828 5' + I-element 5098 1 73.97 ATTTTAATAGCATACCACAACAAAAAGCAGATCTTTATATTTATTTTTTTTTTCACCCATACTTGCTTGTGATTTTTCCTCTGTGCATTTTCTGCAGATGACTTTTGTTTGTTGATATTTATTTAGCGGCTCTCAAGCAAAATCTA:1 + chrX 10722337 5' - G7 1060 1 71.92 ATTAGCAAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3L 18505784 5' + I-element 19 1 72.60 CACCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCA:1 + chr2L 16946050 5' + hopper 81 1 71.92 TTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 15072686 5' - pogo 2069 1 59.29 GTATGTTTGAAGTCCAAGTTTTTCTTCTTTTTGCCCATTTCCCTGTACTCCTCACCTATTTCCGTGCTCTTTTAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTTCATGTTTACTTACAGGGAG:1 - chr3L 2532804 5' - Tirant 458 1 57.81 CTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 47090 5' + roo 51 2 56.20 TCTAAAGTCAAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTG:1 + chr3R 18399347 5' + Juan 4056 1 35.62 GAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 15791030 5' - roo 9034 1 59.59 TAATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGATC:1 - chr3L 24535832 5' - rooA 7138 1 56.64 ATAATAATACATCAAATAGAATGAATAATAATTGGAATAATAATCAGAATAATCACAAAAGCCTAATGGTACATTAGGAACGAAGATATACGTAATGATTT:1 + chrY 1801350 5' + Porto1 4384 1 57.43 TAATGTATTAAAATATTTTAATTGTGTGTTTGCAGATAGACGGAAGATTATATGATTCGAAATAAGTTCTTATAAATTCCTCGGGATCTGTAATGTCGGACTCGTCGCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAA:1 + chr2R 17700046 5' - 297 272 2 67.81 AACAAATTCAAGCCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr3R 17673860 5' + FB 43 1 56.85 CGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGGAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr2R 23780660 5' + Ivk 12 1 70.83 AGAGCAATTTTCTCATATAATGAAGAGCTAAAAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 8047209 5' + 1360 17 1 69.86 AGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 47221 5' - roo 9041 1 64.14 TTTAGCAATTTCCCTGGTATACTCCAATTTCTATTTTACAAATGTTTTTTCATCGCCCACCGCCCGCTGCGTCATTTTCTCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACATTCATAC:1 + chr3R 11530911 5' - INE-1 137 1 53.42 AAAAGTGTGTGAGCGGGACAACCGTATGCGCATCGCTCGCTGCCGTTGTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAA:1 - chr2R 9692016 5' + FB 144 1 67.12 ATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATT:1 - chr2L 17766145 5' - Doc 163 1 66.67 ACTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chr2L 14523271 5' + HMS-Beagle2 6916 2 38.36 GGACGGGTTTCGAGTGTTTCGGAAAAATCTAATTTTCCGTATCCGCAGCGTTCAAATATGGTGATTTAAGGCCCAACAAATTTATGAATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAATACTATAATAAACTTTAAAAATATATTAGGAAA:2 + chr3L 13922383 5' - hopper 168 1 87.67 AATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 - chr3R 16157367 5' + pogo 83 1 73.29 AGATATTTTAGGTTTTGGGTTAGGAGTTTAAAGTAACAATCAAAAAATTTACTTTTTTTTTCACCAAAAACCAACAACACATTTGGAAATATGTATATAGCTTATGTATATATAATATATATACATAATATATACATACATATATA:1 - chr2R 8287021 5' + INE-1 65 1 77.40 TATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGTATT:1 - chrX 22460188 5' - HB 1538 1 78.77 GATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTGGACATGAGAATCGCATC:1 + chrX 18396101 5' - roo 8990 2 71.23 GTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTTTGATCCATCACAA:1 + chr3L 4219464 5' + jockey 70 1 58.22 AGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATA:1 + chrX 2214255 5' + jockey 4822 1 60.42 TGATTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTG:1 - chr2R 5206905 5' + G4 3762 1 61.64 ATACATAAACAATATAGAGAGTGTTGGCACAGCGAATATTGGATTTGTTTTTCATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAAT:1 - chrX 14993269 5' - mdg3 5033 1 64.38 ACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2L 18549936 5' - roo 354 2 52.74 ATTGCCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3R 15072526 5' + pogo 28 1 64.38 GGAGGGGTCAGGGCGGAGAGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3L 4234002 5' + pogo 8 1 68.48 ATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTA:2 + chr3R 4679479 5' - hopper2 1518 2 77.40 AAGGGAAAGGAGTGAAGTGTACAGTGAACCTTATTGGACGTGTTAAAGGTGCACTGCTCGAAATCTAAACAAACAGCAGCAAAAAACACACAAATCAATTA:1 + chrX 23447803 5' + Porto1 4446 1 70.30 ATTCAAAAGCATCTCCGCATAAAGTGTTTTATATAATGCACCCAAAACATGAGATAAACGAAACGGAACCACTTTTCATTCTTTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTA:1 - chr3R 16686730 5' - invader2 451 1 63.01 TTTCACGGTGCATTTGTCATGGACATAACCCCTTTTTACCCCCAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCC:1 + chr3R 22806581 5' + G2 2952 1 71.23 TTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTT:1 - chr3R 28959226 5' - TAHRE 10381 1 67.36 ATTAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3R 4217666 5' + 297 44 2 60.96 AAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 2989898 5' - roo 9049 2 68.97 GTGTGCACATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCGGACCCTCGGAC:1 - chrX 9950614 5' + jockey 4713 1 51.94 GAAATGGCAAATGATTTTCTTCCAACATTCTGCGACTCCATAACGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGAT:1 + chr2L 11040771 5' - 297 6841 2 69.66 GTCATCTTATTCGATAAAAGGCCACCGTTATTCCAACACGAAAATACATATTTCTAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATAATAAATAATATAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAG:1 + chr3L 23688487 5' - Quasimodo 7349 2 71.43 TTTCACTTATACTATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGT:1 - chr2R 5303177 5' - FB 221 1 62.33 ATCTGTTAGTCAATAAGAGGAACTAAAGTTTTTCAGCCGCTGTTCATGATTTCCCACACAAATTGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTG:1 + chr3L 16689320 5' - I-element 5123 1 69.89 ATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr4 373082 5' + pogo 36 1 59.59 ATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAA:1 - chrX 20999579 5' + BS 67 1 68.75 AGAAATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGGATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chrX 8092346 5' - pogo 2089 1 75.56 CCAACACGAAAATACATATTTCTAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATAATAAATAATATAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAA:1 + chr3L 23688519 5' - Quasimodo 7326 2 59.85 CATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGA:1 + chrX 12217459 5' - rover 290 2 79.31 ATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAAC:1 + chr3L 19454947 5' + mdg1 7121 2 71.92 TCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTAT:1 + chr3R 10270546 5' + Juan 4060 1 60.42 GCTCATGCATTGTAAATTTGACACAATATGCTTTTCATCTTAGAAGTTCTTCGACTTTTTATTTTCTACAACATAATAGTTTTATGCAATATTTTTTTTTCGATGTAATGATTGATTTTTTTACACTTTAAGTCTATATTATTTTT:2 - chr2R 4745228 5' + 1360 247 1 77.40 AAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3L 2989910 5' - roo 9036 1 60.27 AAGCATTTTATTTTTTAACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chrX 13134844 5' + jockey 4777 1 71.23 AATATTAAAATTATTTTACAGTCAGACAGATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGTTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTT:1 - chr3L 14390620 5' - I-element 4935 1 78.47 CATTACAACAGTCTCGCACACCACTTTATGGTTTGCACTAATTACACACACATACACATA:1 - chr3R 28118665 5' + Quasimodo 34 2 76.67 AGATAATTGCTCTCCTTACTTGCTTGTATTTTATTATTATTATGTATGCTAAACCAAGTGGTTAGCAATGCAAACATTATGTAGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chr3R 7943852 5' - blood 339 2 58.90 TTATTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAA:1 + chr2L 13844118 5' - Stalker2 382 2 69.18 CTTTTCGCAATGTAATCATGTAATCCAAAATTTATTTAAAACAAGATAGAATGCCATAGTCGAGTTCCAAGACTATCAGATACGCGTTACTTAGCTAGTGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCTATAGA:1 + chr2R 5117896 5' - INE-1 501 1 75.34 GTGGTGCCGCCCCCGATGGGGAATTGCCACGGGCTGTCGTCATCGTCGTTATCGTCTTAATAGCGCCTGGCGACCGAAACTATTTGTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTC:1 - chr3L 4964046 5' - HMS-Beagle2 340 1 65.12 ATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 11191359 5' - roo 9044 1 64.38 ATTTGAAAGCAAACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chrX 19038319 5' + hopper 12 2 76.03 TAGATGGGTTGCAAGGAGTATATAGTGGAACAGCATCTCACTCACGACACTCCAGAATAGGTAACTGCCGAATAAAAGTAGATGAAAGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCTTCTTAACT:1 - chr2R 13175409 5' + opus 7393 2 68.18 CATTTGCAGCGTAATCGTTTTATGTTAGTTGTTAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2L 6103006 5' + roo 80 2 77.86 TGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 - chrX 10521746 5' - Tabor 440 2 52.05 AACAACAACAAAAACTACAACTACAACTACAACAACACATCAAATGCGTCTTACTAAAACTAAAAACCAAAAACTGCCAAGAAAACAATTAACCCAACAAGAAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTA:1 - chr2R 19568654 5' + F-element 4443 1 72.60 ATCCCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGATATTTGAAAGCTG:1 - chr2L 14671906 5' + FB 31 1 59.05 GAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr3L 13365719 5' + BS 5026 1 55.17 TTCCACTCAATCTAAAAGTTGCCCTGTACTTGTCATTTAAATGCAAGCCTAGGACATTCAAGGTCTCCTAAACACCCCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 - chr3R 8138552 5' + I-element 4919 1 52.82 TGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTT:1 - chrX 8027481 5' + Juan 69 1 63.01 TGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATA:2 + chrX 10319621 5' + mdg1 76 2 70.55 AACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATC:1 + chr3R 27765114 5' - mdg1 333 2 78.08 AGAGATAAAGAGATCCGTAAATCCCCCATGAACAATGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGTAAAATCGAATTTT:1 - chr3L 8452884 5' + FB 15 1 41.84 CCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 + chr3R 27160083 5' - 412 413 2 73.97 GAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTTATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3R 4461152 5' - blood 7350 2 61.64 GCTGCTTGGGAAATGAAAAATGGCGAATGGAGTGCATGCATACATATATCAATCGCCGGTGACAGCATTTTCCAGCGTTTTCCCAATCAGGATCAATATCCGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTAGAGATC:1 + chr3R 22944341 5' + INE-1 132 1 56.85 CATAGTTAAGTTTTCCTCAAGTGTACAGGCTAAATGTCTAAAACGTAAATGTGTCACGTAAATGGAGCGTAAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTC:1 + chr3R 23622045 5' + hopper 251 1 54.11 AAAACTTAAAATCAATGTTGATTTGAAAGCAACTTGTTTATTTAACTTGCTTTGTCGTTCCCCAAATAATCACACATATGTAATACTAAGTTCATTTATAGAAGTTTCTTCACATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:2 - chr2R 21116623 5' + mdg1 11 2 27.40 AGGGAGGGATTCAGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 15882530 5' + jockey 15 1 75.34 ACTTAGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr3L 12315702 5' + transib2 34 1 60.43 CATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 - chr2R 12472118 5' + transib2 42 1 54.03 AAGGCAGCTGCTGACATGCAAAGGCTGATTGACACACAAAGCGAGCATTCTGCTGGGATGCTTAACCATGGACCTCGAACCTCGACCCTCATGACCTCCCTAAACTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:1 + chrX 7048642 5' + jockey 4804 1 59.59 TGACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCGTAAGTACGTGTCG:1 + chr2R 21410891 5' - Burdock 170 2 73.97 TTTTCCAATTCAACTCGGTCTAATACCTGTCTTTGCATCTGTATAGGTATATATATATGTATGTGTGTTTTTCAGTTTCCCACTCGAGGATCAATTGTTAAGTAGACAAATATTGTGATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGA:1 - chr2R 15189942 5' + 412 237 2 81.51 AGTTAAGTTGAATGATATGAGTAGTCAAGGGTTACAATATAGGCCCGGGGACGTGTAATACATAACAATCACATAGAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAA:1 + chr2R 3030236 5' - X-element 4530 1 51.61 ACATTATGGGTGAAATTTCATTCGACTTCATCTGGCTCATATGTAAATATTAACCGAAAATATTTATGCACCGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATACACCATGTGGCT:1 - chr3L 3272567 5' - hopper 1242 1 50.81 CCAAAAATTTCTTAAAAAATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 5582231 5' + pogo 22 1 67.42 CTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 13294954 5' - roo 333 2 76.34 ATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATTATGTGTTTTTTTCAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 + chr3R 23618149 5' - hopper 1331 1 71.72 CATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGTTCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 - chr3R 10970373 5' + G-element 23 1 63.83 AAATGAACACAGGCGGCCAGGGTGAAGACTGTAGTCCAACACCCGGTAGGCTACAATACCAAATGAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCCAGCGCGAGGGCTAATCCAGCCCAGCAGC:1 - chr2L 2407188 5' + F-element 4489 1 56.92 AGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACG:1 - chrX 19980677 5' + X-element 4534 1 61.16 ATAAATGCTCGGCACAGAGATGGTACCGCCGCGGTCAATGGGTTAAGTGCTCCAGACACGCGGTTAACCACACCAACCAGATACATACATATGTGCTGAACCCAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:2 + chr2R 12134161 5' + jockey 4802 1 73.29 GTTACTTTTATTTACATAAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAACATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGC:1 - chr2L 21570288 5' + Dm88 38 2 60.96 AGACATTTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTCCACAGCAACACTT:1 + chr3R 4460993 5' + blood 7046 2 60.96 GGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 27123593 5' - roo 361 2 53.42 CAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATACCAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3R 12115240 5' + 1360 17 1 68.25 ACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATTATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGAT:1 + chr2L 11839663 5' + mdg1 100 2 70.55 AGCATAGCGGCTAACAGAAACCGTTATTCAACAATTTCTTGAATAAAACAACAACGACAACAACAACAACATCGTAAAGCATACAAGTGAAAGAAGGCCCAAAACCCTTTTCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAA:1 - chr3L 18819680 5' + I-element 94 1 69.86 AGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:1 - chr2R 12779693 5' + I-element 89 1 77.40 CAACACATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 19032582 5' + roo 46 2 52.74 CTTGTGNATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - 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chr3L 13684658 5' + Tom1 112 1 78.62 GGGGGGAATATATTGAAGATCTCTGGATGTGGGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATAT:1 + chrX 1799141 5' + invader4 2808 2 64.35 ATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1 - chr2R 6965580 5' + Transpac 4986 2 63.01 GGCGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAA:1 + chr3L 15099517 5' - G4 3805 1 73.29 AGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 3983931 5' - P-element 2873 1 72.93 CTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2L 19675089 5' + 297 25 2 59.70 GGGAGTCTCCAGCGGGTTACGGTTGGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr3R 5368623 5' - 1360 3325 1 82.30 AATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAACGC:1 + chr3L 14366548 5' - roo 329 2 73.29 AATATTGAATGTTTATTTTTTTTAAAGTCAGATTGCGGTAACAATAATATCACCATAAGCACATTTTGTGTTTGTCCCAGCG:1 - chr3R 15678521 5' - Tc1 1612 1 60.98 TTGGAAAATATTCTTTACATATGTCGTGCACTAATTGGCATTTACTTTGCCCGCAGAAAGCCACAACCAACATACTTCAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACCCTTTACACAAAACACTAAACCTAAGTTT:1 + chr2R 19556054 5' - S-element 1484 1 56.85 GAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chrX 8027506 5' + Juan 44 1 45.89 ATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chrX 18009950 5' - 412 415 2 69.86 AAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2L 18226875 5' + roo 60 2 59.59 AATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chr3R 29690775 5' - I-element 5279 1 71.23 AATGCTAGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - chrX 20999644 5' + BS 4 1 76.71 GTTACAGAAAAACTAAAAGAAAGCCGTAAGGCTTGACCAAAAATTAATAACTGATAAAAGCAGGTAAGGCAAAACACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATT:1 + chr3L 22035503 5' + 1731 46 2 52.08 ATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 - chrX 19074852 5' - mdg1 346 2 67.12 ATTGATAAAGTACAATATTACAATAATAACTACTATGATTAATGTTGTAAATGTTATTATATGAAAGATATTATTCGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTTTAAATAATAATAACGTTAAGG:1 + chrX 22218676 5' - 1360 308 1 63.41 AAAATGCTCTGAAATAATTAAACATAAACATTCTAAGGATTGCTATAAAAAAAAGAGCTTTCTAACATACAAACAATTTTTTTAGTTTTAAAAAGGTTCACTATTGTTATAATGTTTTGATTTATAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGC:1 - chr3L 6837828 5' - 1360 3026 1 32.88 ATTAAGAAGTGCAATGGATCTAACACATCTACGCATCGCAATTTTTAAAAATAAAGTGAAATGAAAATACATTGTTTTGTTAGACATATTATTACAGTAAACTTTATCCAACAATGTGCTGTTGATTGTTGATTAACCCTTTGG:1 + chr3L 2766850 5' - P-element 2761 1 65.97 GAATGTATTTTTATTCCATTGTTATCATTTTGCGCAAGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 18046744 5' - roo 389 2 71.92 CAATACTCATCCGAAAAATAGAGAAAATACACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGAAAAAGGCAAAGAATCGCAAA:1 - chr3L 20718806 5' + Bica 473 1 77.27 ATTTTTAACCTTTGATGGTATAAAGTGCATCATGAATTGCTAGGGCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGT:1 + chr2R 16510037 5' + F-element 10 1 71.23 ATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTGGTAACACCAAGGGAAAAGTGGCAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAACAACAAGAAGCG:1 - chr3L 17940220 5' + 1360 5 2 71.30 TATAATTTTAATTGTATTTCTTCATGTTTTTGAGCAAGGAACCCAAGTCGCCTTAGTTAACAAAATCCTAATTATAATTTA:1 - chr2L 13056709 5' - roo 83 2 62.96 ATGACATATTTTACTAATTTTTTTTTAAGAA:1 + chr2L 20033280 5' - Tc1 48 1 83.87 ACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3R 16157390 5' + pogo 60 1 57.53 AAGACCCTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAG:1 + chrX 14317416 5' + 1360 90 1 76.26 TCTACAGATCCATAATAATAATAATCTTTTTAGCATTAATTTAAAGAGGCGAAAACACAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTG:1 + chr2L 18961773 5' - hopper 236 1 73.29 AGTGGTTGAGTTTAATCCACTTACATGCTTTATTGTGGTCGATTCTACATGACGAAAGCAAATGGCTCAGTGGATGCATATATGTGTTGTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 4272502 5' - accord 184 2 67.26 AATTAGTGGCAGCTTCCTTTATTATTTATGTACGCGCGCAAATATAACTATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3L 23320140 5' - roo 9012 2 64.93 ATTTCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGGCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGTGGCTTTCTTGTGTGAGGAAAAACAAGA:1 + chr2R 5261103 5' - 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chrX 20999634 5' + BS 14 1 69.86 TTCTAAACGTGCTTGCTATTTTAGAGCTAAAGTAAAAATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1 - chr2L 2538541 5' + jockey 4740 1 76.71 AAATATGTATTTTGGTAAAAGGGACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATATTCAAGCCACCAACGAATGACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCAT:1 + chr3L 27253340 5' + Ivk 5022 1 75.96 TCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 + chr2R 10161807 5' + transib2 84 1 73.29 AATTAACTTAGATAAACAAAGACGCCAAAGGGACATTCGCCAGCAAGTGCGACTATGTCCTTCGAGGACCACCAGCACCATCATGCCGCAACGAAAGGGAGGGTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTT:1 + chr2L 8577609 5' - transib2 2452 1 69.86 ATCATGTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2L 7581046 5' - Transpac 281 2 60.96 AATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr3L 4219452 5' + jockey 58 1 51.37 CTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATAAAATGTAA:1 + chr3R 24455350 5' - Cr1a 4328 1 70.23 ATGGGGACTGTAAAAAGTGTATAAAAATGTAAGTTCGACAGCATTTACAGCAAAAACCATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGAAATCCCGAAAAACAAAAGTA:1 - chrX 16903066 5' + Idefix 7089 2 60.69 TCTATAAGTTTTCCGCTTTTCTGCGGATTTTGTCAACTTTTCGGTTTCATTTTATCTAAAAATTAAAAAAAAATGAAA:1 + chrX 9416614 5' + Doc 4696 1 67.95 GAAATGAACGCAAGGACATGGACTTGAAAGTGGAAAGTGCCAAATGGCAACTGCGAAAAGTTGCAAACGGGCGGTGAAAGTTTGTCATAAATCAGAATATTTTAATAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTT:1 + chr2R 23498886 5' - Stalker 7117 4 71.92 ATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 19032681 5' - roo 8994 2 73.97 GAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCAT:1 - chr3L 13739647 5' + BS 5065 1 64.83 AACTCAGACACACACAAGGATATGGCCGTGAGAAGGGCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGGGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGCGCCGAAGCAGG:1 + chr2R 14954178 5' - Doc 402 1 64.22 AACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGA:1 + chr2L 21299312 5' - roo 334 2 70.55 CTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 11164363 5' - roo 9059 1 66.19 ATATCTCGACATGTTTGTCGTTGTCGTTCGTCATCGGTGCGGATCCGTACACCTGTCCGGGCATTGAGCGACACCGTAGTGTCCAAGTACAGGGACATCATGCTGGCGGATGACGGGTTCCATCGGCCTG:1 - chr3R 28563768 5' + GATE 8034 1 73.08 TGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAC:1 + chr3R 20675864 5' + jockey 4956 1 78.62 ACGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3R 26774121 5' + hobo 53 1 52.74 AACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1 - chr3L 16470367 5' + jockey 4732 1 58.22 CAGCAAATAGAATTTGGGAGCAACATTTGTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 25616457 5' - roo 397 1 77.40 ATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 18046685 5' - roo 8993 2 71.23 ATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chrX 8092382 5' - pogo 2070 1 55.93 GTTGCAGAAAAACTAAAAGAAAGCCGTAAGGCTTGACCAAAAATTAATAACTGATAAAAGCAGGTAAGGCAAAACACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCT:1 + chr3L 22035503 5' + 1731 48 2 52.74 AAACTGTTGCTGAGTAATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:2 + chr3R 7666594 5' + I-element 22 1 69.18 CAACTCGTAGTCAAACTTGTCGTAGGCATCGGCCGTCTCCTGGCCCTTCAGATAGATCTTTAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCC:1 - chr3R 18971847 5' + Juan 4027 1 77.40 AGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACAT:1 - chr2L 15779634 5' + hopper 74 1 69.18 AACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTGAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3L 14094704 5' + I-element 41 1 56.16 AGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:3 - chr2L 17005836 5' + Stalker2 30 2 63.70 CTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chrX 10167489 5' - roo 9030 1 56.16 GAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGGTCTTTTTGCCGCTGAGCGCGCAATTCGCG:1 - chr3R 20683401 5' - Doc3-element 230 1 64.66 AGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTAGGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGAT:1 - chrX 17971839 5' - hopper 1326 1 76.71 ATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr4 373073 5' + pogo 44 1 53.79 AATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATG:2 - chr2R 20010729 5' + Juan 4112 1 68.49 GATTGATTTGATTTAAGTTTTTGTTTTCTTACCCCACCCACCTTAGAAGTTCTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACTATCCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATATATTAGA:1 + chr3R 21189886 5' + 1360 320 1 72.60 AATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3L 18046620 5' + roo 73 2 72.86 AATTTTCTTTATACCAATTATTTATTTAATCTATTTAAGAACAAACCTTATGTATTTTTCAGTTTAGTACTAAAAACAAAACAAAAAAAAACCCATCATATTATGTTTATACGTTCTTGCGATTCTATTGAATCTGATCAAGAATA:1 + chrX 19410235 5' - INE-1 85 1 70.55 AAAAGTCTGGTTCCACAAGCGGATGCTTGTGACTAGTAAGCATATTTCGAAATACAATCCCAAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAGAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTATATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCA:1 - chr2R 2363247 5' + Idefix 341 2 59.72 TATAACACTCATTTCGGGCTCTTTGACTAGGAAATGCTGATCAAAGAAACATTGAAAATTTAAATATCTAGATAAATTATTCTGCCTTTTTGATCTTATATTTTTATTTCTTTTCTTTTTTTTTAGCTTTAAAACTAAAAAACTTT:3 + chr3L 6837582 5' + 1360 3025 1 50.68 ATTTGTACTTGTTTGAAATATTATGAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTATCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATTGA:1 - chr2L 20640317 5' - Stalker4 230 6 53.42 ATTTGCCATAAAAGTCAACAACTTTCCCTGGCGCAACGCTGATAAAGGCCAGTCCATGACTACCGACTTCCCTTCGTTCCTGCCCATTCATTTCGATTGAATTACGCGTAATCGTTGCGAGTGCTTAAAAATTAAATTAAAATTTT:1 - chr3R 18833155 5' + 1360 3045 1 78.77 ACTCTTCTATCATGGTTTACGCCAGCTTCTGGGGAAGCACACACACTTAAATTCAGCCCCGCCAAATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATG:1 - chr3L 20239801 5' + hobo 444 1 50.00 TTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr3R 20441232 5' - I-element 5295 1 57.53 ATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr2R 8157175 5' - mdg1 358 2 62.33 AAGGTAATCCACATTGGGTCCCGTAAGGTGATCCGCCATCAATCCGTTCCCCCGTAGCTCAGGTGTCCAGATCTCGTCCAGCGCCGCATCCACCACGATACTCTCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGC:1 - chr3R 11654910 5' - R1A1-element 4970 1 72.87 ATTGAAAAATAGAGGCGGGGTTTATTAAGAAATTTTTTTTTGGCAAAGATATTAGCTTTTTTTTTTTCAATAAATTTTTTTT:1 - chr3R 22208515 5' + Tc3 77 1 39.02 AGAATAGAGTGCCAAGATAGCATTTCTTATCCGTACATACCCACAGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATATTATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr3L 21969774 5' - opus 492 2 50.00 ATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGC:1 + chr2R 9966989 5' + Bari1 71 1 63.70 TCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGGTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 + chr2L 7660889 5' - I-element 5316 1 53.42 ATGAATACGCGTAGTTACAATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2L 18549981 5' - roo 400 1 77.40 TAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCCTCGAGTGCTTGGCACAAT:1 + chrX 8092420 5' - pogo 2082 1 54.41 TTATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr2L 22674737 5' + mdg1 17 2 75.17 ATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 + chr3L 21380536 5' - I-element 5278 1 72.60 AGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 7889629 5' - roo 354 2 73.39 ATTATCGCAGAGATCGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACAAGAAATATATTCAATATATTTCTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGT:1 - chr2R 6164625 5' - Tc1-2 1549 1 66.44 AAATAAATCAAAGTACTCCATTAATAACATGTGTTGAATACTCACTCGCATTTACTATTATCTTTCTTGTTTTCAATTTTTCTTTTTGAATATGGACTATTTATCCAAATACAATTTTCTGTTTATTATTATTATTATTATTATTA:2 + chrX 3290096 5' - mdg1 39 8 82.88 ATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 + chr3L 15913823 5' + jockey 4795 1 59.59 TAATGAAAAAATTACAGATACCACACGAATGGATTATGAAATGACATATGCAAGTGTGCGGGTCTTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAA:1 + chr3L 21694878 5' - Burdock 6280 2 56.16 ACTTTGAGGTGGACTCCTCGATGACATTCTCATTTGAGGCGAAGGAAACTGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTG:1 - chr3R 11668514 5' - Quasimodo 282 2 60.80 AATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGATTGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTGGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 15103794 5' - Transpac 5204 2 60.83 ATGATGAAAATTCGAAAATATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 8360660 5' - roo 9043 1 66.44 GGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTAC:1 + chr3R 27083059 5' - jockey 4912 1 76.03 ATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 - chr2R 5941412 5' + copia 59 2 65.60 TAATGCCACAACAAATTCAGAACCATCAATGTCGACGGTGGCAATCTCTTGCCAATCCGGCAAACATTTAACAAACGGAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTAC:1 + chr3R 21978571 5' + diver2 4683 2 60.96 AGTAGAAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTT:2 + chr3L 20189556 5' - FB 248 1 49.32 CTAACACAACGGAGGATCCGCCCAGCAACCAGGACTGGAAAGAGTCCTATAAAACTCAACACAGTGTGTCTGTGTTGTGTAGTGGTGTATGAAAGAGAATAAGAAGGGAAGACGGTTGGAGTCTCAAAATCACACCTTTGCGGAAC:1 - chr2L 22695221 5' + invader5 416 1 76.03 GGGCGTTCGTTGTTGGCCATTGTTATTGGGCTTAATAATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAG:1 - chrX 588989 5' - Tirant 8378 2 74.66 ATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2R 9871032 5' - roo 347 2 62.33 GGGAATAAAATGAGAAACAATTTAAAATTATTATGACAACATATCCAACAATCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCAAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGAT:1 + chr4 809184 5' + 1360 143 1 65.07 AATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chr2R 24427558 5' + jockey 4692 1 61.47 CAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCCGACCAAAG:1 + chr2R 18316039 5' + HMS-Beagle2 66 2 60.84 AAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 15375358 5' + 1360 63 1 58.97 TTAAATTCGATTTTTTCTAAATGCGTTGCGGCTTTTTAATTTTCGTGGCTTCCAGAAATTTCGTCAATGAATCTTGGGTAATTTTTGATTTTATTTATTTT:1 + chr2L 7441767 5' - transib4 2541 3 78.22 ATTTATTATTTATTTATTGTTTGTTAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCC:1 - chr3R 15793505 5' - TAHRE 10398 1 68.49 ACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCGGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 + chr3R 19407894 5' + diver 5940 2 53.15 ACCGGAGTTCGTTTAATGGGAAAATACGAAGATATTTCTGCCGCTGTACAATCGATATATAAACCTCTGATTGCCAAACTCCACTACTTTCGATCTATTTAGGGACCCACAAAGCATTTACAAAATTACTTCAACAACATACCAA:1 - chrX 12007611 5' + I-element 213 1 75.17 ATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGGTATTTGGAGGAATTTTT:1 - chr2L 15779644 5' + hopper 57 1 57.55 AGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAA:1 + chr2R 5674644 5' + S-element 68 1 67.12 GCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAAC:1 + chr3R 6419843 5' - Tabor 423 2 63.01 CACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3R 16341958 5' - P-element 2861 1 47.78 AATAAATAAATTGTAATTGAAATTAGTTAGCTGGGCCGCGCGCGCTCTGATTTTGGTATCGGTTATGGGTAATCGTACAATAATGGATAATGGATAATCGGTTAACCGGCACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAG:1 + chrX 14896713 5' + Stalker3T 291 1 74.83 AGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 - chr3L 21380608 5' + I-element 76 1 68.49 TAAACTTAATTCATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCCCTACAAAATATGCATAATTTTGCTCTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATGTTATTTATTTAACAAAAATAAATATAGTATACA:1 - chrX 3432007 5' - Ivk 5364 1 67.12 ATTAATTTAGACCAATAGGCGATGATGGCATACAATTATTTAATGACACAATTTGTTGGAAATAATTGAATAAATACAAATGAAAAGACAGGATTAAAATAAGGTAATATAAGAAAAAAAAAATGTTTTAATTAATTAAATGACTA:1 + chr2L 17007246 5' + Stalker2 7195 1 73.97 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:1 + chr3L 16731387 5' + rover 6970 2 75.34 AAGCTTAGTGTAAATAGTTTATGGGGCGCTCTTTATCCACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTAT:1 - 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roo 9032 1 58.22 ACACAGGTATGATGGAAAGCAACACAATTGCATCGCGGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCA:1 + chr3R 22590454 5' - rover 7263 2 62.33 ATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:3 + chr2L 14874161 5' - copia 232 1 54.11 TAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 - chr2R 12779725 5' + I-element 57 1 55.48 TTTGTAATGATATTGGTTCTAGGCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAACTTCGGTTTAA:1 - chr3R 23067532 5' - roo 349 2 54.11 TCGCTCTTTAGTTTTCGTACTGCCTCCAACTTTTGTTTTGCTTTCACTTTCTCATATCTTCCATACTCTCCGCATTCCATCCATTAACACTTCCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATAC:1 + chr2R 18142371 5' + I-element 210 1 64.38 AATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 12004237 5' - P-element 2876 1 70.00 TGGTTATCTAACAAATTCTTCATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTC:1 - chr3R 19448627 5' + mdg3 5218 1 54.48 AAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGATTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 - chr2L 16946136 5' - hopper 1359 1 52.05 GCACAAGGGTTAAGGGCGAATAAAGGAACGCCAAGGAGACACTTGGAAGTGTCGACACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGACTTTTCTGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTC:2 - chr2L 4012864 5' - invader2 462 1 62.33 ATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 - chr3R 19032706 5' - roo 355 2 56.85 GTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr2L 13556451 5' + transib2 52 1 52.74 GGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTAT:1 - 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P-element 2603 1 78.32 GTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chrX 21224532 5' + roo 8719 2 56.85 ATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:2 + chr2L 17180043 5' - Juan 4184 1 63.70 GAAAATTATCAATATTTTTTAAAAAGTGTGTTTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTCAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAATTATATTTTAGTCGGTAGAGAACCGCACTGCTCCCAGAAGAAAAGAATGTTAATTCT:1 - chr3L 3763145 5' + HB 376 1 83.33 CGGAAAATTTATTTCACGCACCTTGGACTACTTTGAGGCGTTGTCATCGGTCAGCGGGCCAAACAAGATTCCCCAGCCAACACACACATACTCACACACTCACACACATA:1 + chr3R 9905636 5' + Quasimodo 34 2 80.00 TAGTGAACTTTTTCTAGGTTAAATTTAAGATGAAATTTAGCGATTTTACTAAAAAAAAAAACAGATACAAGCATCAAGAAACTATATTAAAGTATAAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACCCGTTAAT:1 + chrX 13526672 5' + gypsy5 7347 2 70.55 TTGGTCGGAAAATAGGTTGTATGAGCGAATATATTTCTTTTTTTTCTCATTTTCTCTTT:1 + chr3L 17442818 5' + INE-1 477 1 61.02 AAAGATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 1279196 5' - roo 360 2 51.37 TTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 + chr3R 7666663 5' + I-element 54 1 67.89 ATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATA:1 + chr2R 3262651 5' + mdg1 7274 2 68.49 TTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 18093365 5' + I-element 30 1 50.96 GTGTCTAGGAAACGTTACATTTGAAGTTTACTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 - chr2L 14523300 5' + HMS-Beagle2 4 2 52.05 AAAAGATAAATTTAAACGGTACAAAATCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGG:1 - chr2R 11707151 5' - HB 1297 1 56.45 GGATTCTAATTGCTTGAGTAAGAAACATTTAAGACATTTTCTCCTTAGTTCTTAGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 9544799 5' - roo 9047 1 69.18 CAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3L 12004224 5' - P-element 2843 1 56.85 TGTTACATACTTTTCAACGAAGCTAGCATACCCTTTATGCCAATACAAATAATATAACAAACAAGTGAAAATGCCGTATTCGAGTTCCCCGACTATCATATACCCCTTACTCAGGTAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCT:2 - chrX 124082 5' - INE-1 515 1 74.66 TGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chrX 8092383 5' - pogo 2041 1 57.53 CATATCTCCAGGTCAAAGTTGCTGCATTTATAGCAGTAGCATGACAAGATACTATCCTTGTTCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCATATACACATATATATATACGCTGCCCTTCTGCCTCTGT:1 + chr3L 20965849 5' + blood 7212 2 55.48 ATGGTTGTTGTTCTCGCTCTCATTCTCTCTTTTGATTCACTTGCATTTGTATTAGCGTAAGGTTCGTGTGGAAGATCAAAAGTAAAGTTTAACTTTGCTTATAATTGTCGATAAGGAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGAATTTC:1 - chr2L 2363606 5' - INE-1 573 1 69.86 ATTGGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGTGAT:1 - chr3R 17077186 5' + roo 62 2 65.93 GCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 - 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chrX 7837614 5' - F-element 4683 1 65.07 GTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCACCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 - chrX 18239399 5' + jockey 88 1 75.18 GGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 15103824 5' - Transpac 247 2 69.53 ACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 31653158 5' - roo 9003 2 66.44 ATTCTATTTTTACATTTCGTAACTCGTTTTTGTAGAAATGTAAAAATAAAGCGTGCGGCAGTATAATTTCCTTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTCATATCATAGCGAAACGCTACTGGCCACGTTCAAGAGGGGCTACT:1 - chr2R 7395162 5' + mariner2 77 1 76.03 ATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACATC:1 - chrX 14450532 5' + hopper 25 1 68.49 GTACTTTCTCGCATACTTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 - chr2R 19199788 5' - hopper 1395 1 57.53 AGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr2L 12250999 5' + 412 7108 2 55.48 AAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAG:1 + chr2L 15550652 5' + Bari1 53 1 51.37 AGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 6102939 5' - roo 9021 2 62.99 AGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCAATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 - chr2R 21410968 5' + Burdock 6198 2 58.90 CAATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 21224663 5' - roo 397 1 71.67 AATATAAACCATAATTGAAATCCAATAAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCATCACAAATCAATCAGAGAAGGATTCTTTTGATACTGTAAAATCCCAAATAATAAGACT:1 + chr3R 19450061 5' - roo 406 1 46.61 TTCTATAAAATTTAATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGC:2 + chr2L 22255043 5' + 1360 203 1 49.32 TGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGC:1 - chrX 22689462 5' + mariner2 48 1 65.07 TTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATG:1 - chr2R 20010673 5' + Juan 4168 1 61.64 AATTAAGAAAATACAGTGCGATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3L 13836702 5' + 412 68 2 64.14 GTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAACATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAA:1 + chr3R 9298455 5' + hopper 52 1 52.05 TGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:2 - chr2R 14051843 5' + roo 8733 2 73.29 TAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGGAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 13295002 5' - roo 9033 1 58.74 CATAGTCTTTTAAAAGTTAAAGTTCATGTTTCTATGAACTTTATTCTATTTCTATTTCTATTATTTACATATGTTTAAGTAGTAACACTTACCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 20898491 5' + roo 27 2 67.81 TGGAACACAACATTATTTAGCTACTTGGTAATACATAGCTTTATTTCTTTGATTTCACTTTGTTTGTCGTAGTTCGGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTG:1 - chr3R 23982786 5' - Stalker4 75 4 57.24 AACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chr2R 17926311 5' - opus 7431 2 72.60 GCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr3L 25401027 5' + Doc 42 1 47.95 CATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGTATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAA:1 + chrX 23338844 5' - GATE 361 1 41.10 CTCAGCATCCCCGACCATGGATTGCCGAAACCGAGCAGACGAAGCGAAAATCAACAACAACAACGAAAAAATCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 4453679 5' - hopper 145 105 72.63 ATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2L 12251026 5' + 412 28 2 62.33 ATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 + chr3L 18930980 5' - I-element 5282 1 68.49 TTTAAATTTTTCTTCGTTTTATTTTTTGTTTTTGCTAATTTTTATTGGTATACCAAAAACACTAGCCACGCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTA:1 - chr3L 24787907 5' + INE-1 479 2 64.38 ATTGAGTGCTGATTGGTTGGTTTGATTGGATGAGGCGTCGTTGTTAAACTCATAGGCGCAATTGCGATTGAGGTTTGAAGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAAT:1 - chrX 11383004 5' - I-element 5347 1 57.53 AAGGAGCCCCAGTACAATACTATATATAGGGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 25428190 5' + 297 6623 2 78.89 GTATTCTGGATGTCCAGCATCTCCGCTTTTAATGGCTCAAATGTCTTGTAAGCTGTGGGTTGATAAAGAAATTAAATAATATCGTTACTATTATCGTTTTAAGTTTTTTATGTGGAAAAGTTTTG:1 - chr2L 18486656 5' + NOF 357 1 78.40 TATCTATAATAATATCTCTCTCTCCAGAGTCTAAGGAATTCTCGCAGATATCCCCAATGCCCGGTATTTTGTCACGGATGACTCTGTCTAGTCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 + chr2R 3681704 5' + mdg3 5340 2 62.96 GCGTTCTTTCTGATCATATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCA:1 + chr3R 4357500 5' - Tc3 1675 1 49.32 TATAATAAAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 3920626 5' - roo 9048 2 69.18 AATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATT:1 + chr2L 7618470 5' - X-element 4654 1 64.93 GGTGGAGAAGAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:2 - chr3R 14980456 5' + roo 14 2 76.03 TTATTGTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGT:1 - chr3L 15099692 5' + G4 3803 1 60.27 CTTATCTATGTACATATAAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr2R 981777 5' - Tc3 316 1 60.96 ACCTATATCATCTACCTTATAGACTATACCTCATATATACTTTTTAAAACACTTCTCCATTTGATATTGCATAGATATAGATTCGAATTATTCACGGACTGCACTCAATTCTTTTTTGAATTTTAGATTTTTTATTTAAAAATGAT:1 - chrX 15495016 5' - jockey 4879 1 89.04 CAATCTTATCGCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3L 18403108 5' - P-element 2872 1 75.86 ATTCGCGATGTTTGCATCGGGAGGCGTTTTGTTTGTCAAATGATGGGCTTCACTGTGGGTGTGGTAACATGAATCAACAAACTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1 - chrX 10804070 5' - INE-1 151 1 63.01 AAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr3L 23906517 5' + 1360 20 1 69.18 ATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTT:1 - chr3R 11062845 5' - roo 9036 1 54.14 GCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATG:1 - chr3L 20187455 5' - FB 847 3 72.22 ATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1 - chr3R 4682980 5' - Burdock 6323 2 69.86 TTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:2 + chr2L 7660881 5' - I-element 5324 1 61.64 TTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 + chr2R 7244800 5' + diver 5937 2 51.37 ACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 + chr2L 13844143 5' - Stalker2 357 2 52.05 ACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 + chr3R 11191361 5' - roo 9042 1 63.01 TAACATTTTAGGTCTCATTCCAAGGCCAACGCCTTGGTTATTATCGTATGCATAACATATTATGAAATAAAAGAACTGTTCAAGTTACGCTCACCCGCTTTCACCCGCTGTCATCCACTGTCA:1 + chr3L 25373325 5' + GATE 8251 2 56.91 ATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACTCA:1 + chr2R 20227230 5' + hopper 73 1 67.12 CCAAGTGAATATCTGTGAACTGATCTGCATAGATAGATAATAGATCTGCACAATTGGAATTAAGAAGCCAAAAAAATAATTGTATATATTATGATATATATATATATATAATTAAATGCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAATA:1 + chr3R 3854743 5' - Idefix 7376 2 37.93 CGACATTCGCACCTGCGGCGAATGGCGTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:2 - chrX 9530459 5' + 297 6598 2 73.29 ATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 + chr2L 17180038 5' - Juan 4189 1 67.12 TATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTCCCGGCAGCGCAGCTAGG:1 - chr3R 13973079 5' + 412 307 2 47.73 TATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 - chr4 373044 5' + pogo 74 1 69.86 AATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chrX 1135409 5' - P-element 2854 1 58.46 TCGAACCAAAAAATCGTTACGAAAAATTGCCCTCCAGGGAGAATATTTAAACGAGCTACAAAATATTTATTTATGCCCATTCTCTGTGTGTATATGTGTTTGTGTGTGTTTGTGGGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTT:1 + chr3L 10747491 5' - I-element 4936 1 77.70 AACTATCTACACACCGCACACTCTGTCGCATAACGCAAGTGCTAATTTAACCAACGAATTTTTTTTGCAAAATTTTTATTTTGCTCCGCGACTTAGAATTTTTGTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTGGTGTTTACCCAGAAATGTT:1 + chrX 5744880 5' - HMS-Beagle2 45 2 71.23 GAATACAAGACTAAAAGAAATATTACAGTTCACACTGGGCCAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTCAAATTATAAAGCTCTCTGCATTTTTGTAGAATTGGTGTATTTCACATTTAAAATACGTACGTGAAATTTCAAGTAAATC:2 - chr3R 1836633 5' - transib3 2763 1 71.92 ATATTTAAAATAAATTCTATAAAAAAGAGAAGTAATTTTATTGTAGTCTTAAAACTTTAAGATGGTGCCTAAATAATAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGATCACTGTGCACAAAAACACAAGATC:1 - chr3R 3322704 5' - Cr1a 393 1 56.16 ATACCCTACATACCTCGGTAGCTTTGGCACTTGGGTATTAGTTTTACGACAAATTTTCGAATAATCTTGGCACTATCAGTTTAGTTTCGAAATGGATCAAGAATCTGCCTGCGAAACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAA:1 + chrX 6778914 5' + BS 4908 1 64.38 AATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGGCCTTTGTGTTTCT:1 + chrX 21639588 5' - gypsy5 7317 2 63.70 TAGGGTCTGCCAATAAAACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 11159382 5' - roo 389 2 69.12 TCATTATTTTAAACATACCGGGTACTTCTGATCTTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAATGTGTTTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATT:2 + chr2L 7579160 5' - 1360 3049 1 68.49 ATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATCTTAATCATACGCATGTGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3L 5489912 5' + jockey 86 1 68.89 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr3L 20525229 5' - mdg1 7374 2 76.71 ATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATGTTATGGTATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr3L 10731917 5' + 297 17 2 65.75 AAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 + chr2R 16510106 5' + F-element 79 1 60.96 AATGAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 21216840 5' + roo 8703 2 60.27 AATATAAAAATCACTTGTATACTTTTTTACGTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 + chrX 17716984 5' + FB 44 1 51.37 GATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATG:1 + chr2L 17205178 5' + hopper 64 1 60.27 TGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 + chr2L 13556355 5' - transib2 2747 1 71.23 GCCCGGTCAAGTGTCCCCCCTTGAATTTGAATAACAATGCCGTTCGGCTCGGCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGG:1 + chr2R 11796694 5' + opus 483 2 52.38 ATATTAATAATAATAATAATAACTATAGACGGCATTTTGGGAATGAAACGTGGTGCTTTTCTAGAATAGAAATGTTTTTGGGAATTTTTCAAATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGT:1 + chr2R 5171812 5' - G2 3076 1 80.87 AAAAATTCGGCATTCAATAAGCGGAGAAAAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTTTTGCTGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTG:1 - 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INE-1 152 1 68.97 ACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 + chr2R 20010186 5' - Juan 4163 1 53.42 ACCACAATGCAAAGACGCAAAACATAAAATGATAAAATAATTTGAGCTTATGCAAAATATGTGCTCAATTTGCACTCTAAGAAACCAGCAATCTTTATACTCCGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTT:1 - chr2R 4161355 5' + Max-element 428 1 71.23 GCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 8308510 5' - roo 359 2 53.42 ATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTAC:1 - chr3L 25508748 5' + 1360 339 1 61.38 AACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTG:1 + chr3L 3501736 5' + Bari1 84 1 75.34 AATCCCCTTTATCACACTCGTACACACACACACACATGCAAA:1 - chr3R 26810193 5' + Quasimodo 38 2 78.57 AGGGGGGGCTTTTTCTATCCATGACAATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCACAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 13766344 5' + roo 8683 2 70.55 CATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAA:1 + chrX 15200851 5' + 17.6 67 2 71.23 GACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTA:1 + chr3L 24272055 5' + gypsy11 67 2 61.38 CACAGGGCACTCCAATCAATAATCTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:2 - chr2R 15326998 5' + copia 4881 2 63.70 CTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chrX 15903129 5' + INE-1 88 1 73.29 AGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTATTTCAAGAAGAAAACTGTGGGAAACTAACTGACTTAAATGAAAATGAAATGAGAATTTACCTGGAGATGATTTTCGAAATATTTAAAGAGTTTTAAAACAAATTATTTTATTTATTTTATTT:1 - chr2L 12553473 5' - HeT-A 6 1 74.66 GAGTGCTAAAATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 17421337 5' - pogo 2077 1 53.15 AATCATTGGACTGCGTAGCGGAAGTTTATTCGTAGCTAGGGAATCGATTATGATTCAAAATTATGAGTCTATTTGCCAATAAATAAAAAAAAAAACAAA:1 - chr2L 14999054 5' + BS 5095 8 54.55 ATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 + chr2L 9636075 5' - 412 7486 2 55.48 AATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 + chr3R 20167576 5' - roo 347 2 61.64 CCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 + chr3R 17996168 5' + diver 5951 2 60.27 TACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGCGTTCACACATGAACACGAATATTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTCCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr2L 47114 5' + roo 84 2 69.18 TTAAAACCCACGCCCTTTTTCCCTGAGTTGGACAACGCTCTATGAGTG:1 + chr2R 6486684 5' + Circe 7420 2 91.67 GTTAATTTCTTTCTCAGTTTCGGCCGCCAGAAGTTCTTCGTGGCAACTTCAAAGCTATTTCGCTTGATAAATGAAAACTTTTTACGTTGTGGGTCTTTGCTTTGAGGGGGTATGCTTTGATAATTGTTTGTGTGGTTTGATCTGTG:1 - chr2R 10186638 5' - Porto1 292 1 61.64 TTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 + chr2L 13556319 5' - transib2 2783 1 57.53 GGGAAANTCTTCGCTTGGCGTAGCCATCTAACCTACATTGAAATGTATTAATCCCCGATCCGCCATCTTGAACTTTTTGCTTGGCGCAGCCATCGCGCAGCAGCATTGGTGCCCAGACCCGATGGTTCGACTGGGGCAGCCGCAGG:1 - chr3R 3668961 5' + Gypsy12A_LTR 427 1 50.00 ATTTTGAATGATTATGGCACACAAATTGAATTCATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:3 + chr3L 8673260 5' + I-element 22 1 65.07 TAGCATTTTACATGCTGTACTGTTTTTCTCGTTTCTCCCATTTTTCCCATTTTTTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 26774011 5' - hobo 2933 1 60.00 GGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chrY 2720393 5' + 297 6612 2 63.57 GTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chrX 9530331 5' - 297 313 2 76.55 TAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGCTTGGAGCAGTCCTTATTTATAAGCTTATTCGTGGTGATATTGAGAGTCCCGACTTGATTAG:1 + chr2R 9869132 5' + Cr1a 4071 1 69.29 TTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTTCCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTAGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGAGATCCAT:1 + chr3R 15882585 5' + jockey 65 1 54.29 AAATTGTGTGGAAACACAAACCGCCGCCGCCTAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGACGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGGCGCGCG:1 + chrX 14771680 5' + BS 14 1 68.09 TTTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:2 - chr2L 23381791 5' - flea 5006 2 80.14 GGCACAAAGTCATTTGGTTTATTAGCACTCGAATGGCAAATCCCAAGACAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTGACATATAATCACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTT:1 - chr3R 27806350 5' - 1360 372 1 67.12 GTACCTCGTACATGATTCTTACCATTTGTACAGCGGCGTAAAGACGTTACTCATACGCAGTGTTGTTCAAAGCCATTCTAATTAATAATATATTTCTTTATATATTTATATTTATTTATTAATATTTCTTATTAATATATTGTTTA:1 - chr3R 5761862 5' - hopper 1112 1 56.85 CGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chrX 20455699 5' + hobo 73 1 72.26 GGGTTGCCAGCCTAATAGAAAAGAGTAATGGCGGGGAGTTTCTTTTTTTTGTTTTTTT:1 - chr2L 12653913 5' - HMS-Beagle2 489 2 63.79 ACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 17940240 5' - 1360 3374 1 74.48 AATGAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGGTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 21216840 5' + roo 8703 2 58.90 AAGGCAATCTTATCGCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3L 18403112 5' - P-element 2875 1 78.08 AAGATAATAATTGCCCAAAGCAAAGAGAAAGCTAAAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAA:1 - chr2L 12818752 5' - hobo 378 1 75.69 ATTTTTGTCACACAAGTTGAGAGAATGTGCAAAAGGGAATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:2 - chr4 303862 5' - pogo 2087 1 76.71 AAATTAATCTCAACGCTGTTTTAAATGCAATTTTCATTTTGAAAAGGGATAGAAGGTATCAAGGGTGGGAAAATCGGCCAAAACGGTAAGGCAGGCGATAAGCGACAATGGGTTGGAGAAGGGGATTTTTAAACTTATTGTTAGTT:1 + chr3R 17340114 5' + F-element 4629 1 73.29 ATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 9871582 5' + roo 45 2 56.85 AACTCTATGAATTAATGTTATTATTCTTGTGGGTTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCT:1 - chr2L 11257383 5' - rover 7158 2 60.92 TATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCT:1 - chr3R 545849 5' - TAHRE 10382 1 65.75 AATACGCACAACATACATTAGAAATGATAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 ATCACCTTTCTCCACACACCGAAACACACACGCAACAACAAAAGTAACGGCGAACATGACGACAGAAGCGGGGTACGCAGTTACAAGAACAACAATGCAGACGGGGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTA:1 - chrX 12783607 5' + Tirant 17 2 78.08 GTGGGCGTGTGTTTATTGTCAACAAGTCCGTTAAAAAGCACAGTGTGTTTTTTTTTATTTTTTT:1 + chrX 17565218 5' - Tc1-2 484 1 79.69 ACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTC:1 - chr3R 10736179 5' + McClintock 10 2 75.34 GGGCATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 11062872 5' - roo 405 1 77.34 AGTGGATTTTTAAGGAATATTTACTTGTTTTTTTAACTAACCCATAAGCTTATCAGATAATTGGGGCCCTTGTGCTAGAAAAACAACTAATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAA:1 - chr2L 8336944 5' + P-element 440 1 56.85 AGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - chr3L 12004314 5' + P-element 79 1 28.78 TTATATTCTGGGTGTTGCCATCGAATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTATCTTTTATATG:1 - chr3L 13739693 5' + BS 5020 1 65.07 GGAACACGTCCAGGGTCACTGCAGAGGGGGGGTGGGGTGTTAAATTGACCCATGCTCGCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr2L 20821315 5' + Burdock 50 2 55.48 ATTATGGGAGGTTGTTCATTGAATATTCAGAACCAGCGAATATGTGAGTGTGTATATGGTTGCGTAATAAACAAATATCAAGTAAAAAAGAGGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCC:1 + chr2R 25128049 5' - 1731 4239 1 62.33 AAATCAATAAGATGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATTTGCAAGCCACAGCGTCAACAAATAGACAGTAGGGCCATCATACTGGCTAAGCAGGTTAGCGAGTTCAACGCAGATCGCCAATACGAACTCTGACG:1 - chr3R 3396358 5' - accord2 135 2 79.10 TATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2L 15936774 5' - copia 219 2 63.70 GCACAAAGTTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTT:1 - chr3L 9907401 5' + BS 5014 1 66.44 TTTTACTAAATTTTAAATCGTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr2L 15936737 5' - copia 256 1 63.01 ATTCATGTGAAAGGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 - chr3L 11844861 5' + rover 17 2 70.55 AAGTAAAACACATGATCATTGTATAACTTCTTCATTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGA:2 + chr2R 6271541 5' + rover 240 2 73.97 AAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAATAACTTATGGTCTAAAAAAAATATTTTTAAAATGTAGTAAGAACA:2 - chr2L 19618675 5' - Transib5 2717 1 74.66 TATAAGAACTGGATACAAATTCAACACATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 19032561 5' + roo 24 2 67.59 AGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAACAAATATTGTTTAA:1 + chr3L 17567891 5' + S-element 1603 2 71.23 GCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCTTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACT:1 - chr2L 7945387 5' - Stalker4 461 1 61.64 AGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAAAAAAACGCACACATATACGCGTTCTCG:1 - chr2R 3120309 5' + 1360 3222 1 68.42 ATTGTTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCT:1 + chr2L 11256990 5' - rover 306 2 56.85 GGACTGGATATAACTGCTTCTACTTCTGACACAAATTTACAGGGAATAGCAGCCCATTTAAAGATGAAAATAAAGTGAGAATGCTATAGGCGAGTTCCCCGA:1 - chrX 155978 5' - INE-1 569 1 89.22 AGGTGAGCTGAAGAGTGTGCAGAAAATGTGTACATGACGGAAGTTATGGTCGCGCATTCCCGTTAATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCC:1 - chr2L 6998795 5' - Ivk 4948 1 65.94 ATATAAAGTGAAGTCAAATATATGGACAGTTTGTGGCACCGTATGATTTAAATAAAAAAATAATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAAGTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr2L 6102866 5' - roo 411 1 75.34 TTATCTTAAATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr2L 15936895 5' + copia 4900 2 64.38 AAAAGATTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGG:1 - chr2R 1916465 5' + Juan 46 1 45.89 GATCTTCTTGCCATATCAGACTTTGCAGTAGGGCGTGGGGGTGGGCGGGATTGTGACGTGGTGGACATCTTCCTCTGCACTCTCATCATCTGAATCTTTCGTAGATCTGCGAATCTGGTCTAAATAAAACATATTTATAGTTTGCC:1 + chr4 623511 5' - rooA 32 2 53.42 AATGTCATCAGCATTGATATTGCGAAGATTTTTTAGAGCAATGGCACAAAAAGTGCAACCAAACGATAAAAACCATTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAAATGGACGTGGGCAAAAGAAACTAATTTG:1 - chr2R 5180380 5' - FB 88 1 58.22 AATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 19032609 5' + roo 73 2 71.23 ACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:1 + chrX 8027384 5' - Juan 4188 1 60.96 ACTAAAAATATATAGAAAATTTAAAAAAAAACCTTTGTTCTCAAGTCGCGTTTCTTATCTTGTGAAGGTTCTTTAAGATATCAGCAACTTTCTAATGTGTTAGAAATTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAGTATAATTTGAAATGGAT:1 - chr3L 17856172 5' - hopper2 1364 1 65.07 CAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3R 29084848 5' - 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hopper 1346 1 25.18 AAGCGTGAATAACTAATTGCCCCAAGCTGCGGAGAAAGTTTAAGCGGATGTCCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTATCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGAAGACCTC:1 + chr3R 28733787 5' + Transpac 95 2 62.33 AGAGTTTTTTTATTTATTAGTAATGCTGTATAATAATTTTATTGCAACCCTCAAACAATTAAGTAATCAGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAA:1 - chr3L 9692012 5' + F-element 4426 1 51.11 TACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 - chr3R 7666710 5' - I-element 5280 1 67.12 TTTGGCATTCAACATGCAATGTCCATTACAGAAATTGCAATTCTGTGGCCAAAACAAAAAGCCATCCTTTTTAAGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAATTCCAATATTGTTAGTGATTTACCGTACG:1 + chr3R 11015295 5' - Copia1_DM 184 1 55.56 CTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 9002996 5' + roo 8740 2 73.10 ATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGGGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAATTAGAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2R 23180169 5' + roo 40 2 56.16 AATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 21216731 5' - 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chr2R 18353330 5' - I-element 32 1 78.62 CTGACACTGAAGACATTCCACAATTTGTATGACATTCGCAATGACACACTTGGCAGGAACTGGGAAAAAAAAGGGGGCGCAAAAAAAAA:1 - chrX 4758922 5' - Cr1a 24 1 76.40 AAAGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 + chr2R 19199649 5' + hopper 45 1 53.42 GCTTTGGGGTGGAACAAATGTGCCTATTTGTCGCTGGTGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGGAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 + chr3R 28042900 5' - Stalker2 379 2 69.18 ATTGCTGACTGGGCAGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGAACAAAGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 + chr3L 8453721 5' + FB 41 1 55.00 GTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 + chr2L 16943782 5' + copia 4913 2 55.56 ATCTTTATTACCAAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 + chr2L 11298035 5' - I-element 5301 1 59.59 CAGCAGCGCACAAAAGAAGGCAACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGATTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCA:1 + chr3R 12930684 5' + jockey 64 1 55.17 ATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chr2L 6654613 5' + diver 5913 2 66.90 AATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3L 11326804 5' + pogo 31 1 60.27 AAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:2 - chrX 14722259 5' + diver 5895 2 73.97 AAAATAATAAAAACACACAAGCATACATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCAACGATA:1 + chr3R 19109162 5' - Circe 6985 1 82.88 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGTCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGGCGCTGTTTCCTTCTTCTCCATGTT:1 - 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chr3L 16873789 5' + Quasimodo 35 2 41.55 GAGTAAAACTTCTAGTGTTGTTCGTTCAAAAATATTCGGAAAAATTCAATAAAAAAACAGTTTCTATTATAATGTTAGTCGTATGTTAGAACAATTATACATTCAGTTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAA:1 - chr2L 18285918 5' + Bica 213 1 72.41 GTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr2L 4003791 5' - mdg1 367 2 53.42 ATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3L 1279095 5' + roo 74 2 69.86 CTGCTGTGTGCGGTGTCCTCTTCCCCAAATTTCGCCCATTTGTAATTGTAGGACAGACTTCTTGGGGTAATACAATTTTCTAGTTATTCACACATAAAATTTAAAAAAAGAACAAGAGAAAATAAAATTAAATTAAATTAAGAAAA:2 - chr3L 3726139 5' + TAHRE 48 1 56.16 AGTAAATCGTAAGTACCTAAATATTTATAGAACTTAACTAAAAAATCTATTAAATGGAAATCTATAAAATTATCCAGCGATTTGGTGTAGAATTGAATATAAATAAATGTCACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATC:1 - chr2L 14358907 5' - diver 213 1 56.85 TATGCGTATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGGTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGAGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 10931578 5' + 297 6589 2 73.43 AGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGGTATGAATGGCCACA:1 + chr3R 15054203 5' + copia 4922 2 57.24 AAAAACAGGAGGCCCCACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 + chr2R 18258745 5' - 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chr2L 3667469 5' + GATE 286 1 76.92 GGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAA:1 + chr3R 28042942 5' - Stalker2 7585 2 62.33 TTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAGGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chrX 19054267 5' + jockey 72 1 66.92 AGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTT:3 - chr2L 18347371 5' - transib2 2748 1 68.49 ACCTGCGCTGAAAAAAGATGGCGGCAAGGGGCACTAGCTGAACGTGCAGCGCGTAACTGATATGCAACGATTAGCACCCACCCACACACACACACACAAATACACTAGCACACCCAGGAAATGCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCAT:1 - chr2L 4756533 5' + Stalker 7073 4 82.19 GTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:1 + chr3R 15724273 5' - Juan 4183 1 60.96 AAAATCGCTCTCATTCGCTCTTCCTCTTCATGTACACACACACACACACACGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAGA:1 - chrX 13087428 5' + Doc2-element 4629 1 63.77 TGATAAGTTTTTAGCACATGATAAATTTTAATATTGTGTGGCAGAGGAACTTGCTACTCTGACACAAGCTGCGCACAAAAAGAGCCACTGATGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAGCGGCGGC:1 + chrX 13921012 5' + TART-B 155 2 75.81 AAAGGGCCAAAAACTTCAAGGTGCTCTATAAGGAAGTCGCACTGTAAGTGACGATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 18201514 5' - roo 396 1 46.58 ATGGGAAGTGTATATTTGGGCGTACCTGGCTGGTAGTCTAGGTACAACAATTTACTCTATGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATAT:1 - chr2R 13167683 5' - P-element 2729 1 41.10 ATAATTGCTCAAATTGCCGTGGCAGCGTGCCAACTGATTGGATTTTTATGGGGGTATGAAGGGTTGGGCAAATAGCTGAGATGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGGGGGGCGTGGAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAG:1 - chr3R 12642767 5' - F-element 4436 1 43.84 GCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 9298585 5' - hopper 1374 2 56.16 TATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - 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chr3R 2520361 5' - Tc1-2 1617 1 68.49 ATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTGTCTTTCCG:1 - chr2R 8047338 5' - 1360 3314 1 69.86 AAACGTTTGCTATTGATTCTATTAAAGTAGCAATATCAGCCTTGGGCTAACGAAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chr2R 14653297 5' - 297 378 2 69.86 CTCAGCTAGTACGGCTTTTCCCGGCTCCCCCTCGCGTTTTTCTTGCATTTTTTTTGCCCCATTTTGCC:1 + chr3L 9565986 5' + transib4 496 1 38.24 ATTACTTTTAGAAAAGATTCAAATTAAGCCCACTTAACAATATAAGCTCTAGTCCAAAAAATAAAAATAAATAATTAAATAAATAATAATTTCT:1 + chr3L 10830785 5' + jockey 4828 1 87.23 CGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 7795593 5' - roo 8991 2 73.29 CTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTATAAATGCAG:1 - 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Stalker 6966 4 75.34 GTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 16564574 5' - roo 350 2 60.84 AAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAAT:1 + chr3L 20189561 5' - FB 241 1 45.89 TGATCTTGTGATATAGACTAAATTAATTTACAAGTTTAACCATCCAATATCTATCCATATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTATTAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCCAAGAACTCGGCTATAGCATTCTCTCTCTT:1 + chr2L 21850290 5' + INE-1 579 1 70.14 AACCCAAGTTTCTATTGAGTTTTCCTGTCTAACCTCATATTAAGTCACAATGTTAGTAGAAAAGTAAATAGATTAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGTTCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACG:1 + chr2L 20019270 5' + INE-1 124 1 53.42 GGCACATGTGCAGGTTACAACCACTGCCCCCAAATTGCCACTCTATTCTTCGCCGAGTTCTTTTGTTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:2 + chr3L 7300092 5' + roo 12 2 76.71 TGGGTATTTCCCGTTTTTTGTTTTCCCATCAAATGAAGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 - 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INE-1 541 1 49.32 CTTGGCGGGTAAAAAGTACTTAACGGCTTCGAACTGACATTGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGGATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGGGGTTGGTATTTGTTTATCAAGATTTTGTTGATAAGAGTTGTG:1 + chr2L 7864231 5' - I-element 69 1 65.07 AATGGCATTCAGCGTGTGTCCTTCTGTTTTCATGTATATGTATGTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCC:1 + chr2L 13025555 5' - 412 175 2 66.15 AGCCATCAAAAGTGACTTTACTTACCAGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTGA:1 - chr3R 14767403 5' + roo 15 2 58.82 GAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAATCACAA:1 - chrX 6116337 5' - transib2 2754 1 64.38 ACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr3L 17275433 5' - Transpac 5154 2 77.61 GGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACTGGTTCACATTGGTACGATCCGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATA:1 - 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chr3R 29100556 5' + micropia 274 2 64.38 ACAATATGCATTGTGGTTGGGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATCCGATTTTT:1 + chrX 18817222 5' - transib2 2820 1 82.64 TTATTATGGAGCAGCTTTATTGTTGTTGCTCATAGCGCTTAGCCAGACAGTTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCG:1 - chr3R 13612624 5' + F-element 199 1 57.93 ATAGGCGTACTGGCCATGCTCATCCTGTGGTGATACTGACTGATCGTATATCAATAATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATAC:1 - chr3L 16365116 5' - Bica 93 1 63.57 AACTAACCTTGTTCACTGAAGTTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAA:1 + chr2R 2591087 5' + roo 8725 2 58.22 TGAACTCGTGATTTGATCGTAATGCTATTCGCCAGATTTTAGCACTTTCAAATACTAAATGTATCGAACGTTTCGGCGAAAGGACCAAACCGATCTGACCCTGTCCGTTTGTCGGTCCGTCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGAA:1 - chr2R 25107434 5' + INE-1 139 1 58.22 CTCATCGTAATGGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr2L 11298151 5' + I-element 32 1 59.70 AAGGGAGGGATTCAGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTTTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 15882529 5' + jockey 14 1 73.97 CTGAAAGGGTTTTAATGTAAATGTAAAAGTTTAATTATTTAAGGTGCACAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATCGTTTGTGTCCCAGATATGTATGTATTTACAGCTGTGTTCAATAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGAAA:1 - chr2L 21787247 5' + HB 27 1 71.92 ACCAGACATTCCGAGGGCTGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATATACATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTT:1 + chr3L 5061552 5' - 17.6 422 2 65.75 ATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGGGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3L 8959688 5' + 1360 59 1 62.14 ATGGATAGGAATGGTATTCGCGGGGAGCAGCTCGAGCTCCACTTAAATGCTGGTGATGATGATAATGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCG:1 - chr3L 20774191 5' - F-element 473 1 53.62 AGCATGCAAATAGATTAAAATTTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 - chr3R 30946829 5' + Transpac 4 2 73.42 GAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 + chr3R 4805625 5' - 1360 3309 1 72.41 TTATGGAAAAGAATCAAAAAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3L 21769160 5' - I-element 5343 1 70.55 AATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 + chr3R 7666647 5' + I-element 75 1 65.07 TGGGTCTTGTTAACATTCGCATTTTTCTCGGAAAATTCGTTCGGCTGCAGTATAATGATGATGCTGGGAGTTGATTTCGCTGAGTTACTGCAATAATTGGAATTTATGAGTATTACATTGCATTGGGTGAGTTTGTGGCTTGGGCG:1 + chr2L 6373066 5' - HeT-A 5928 1 71.23 GTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:3 - chr4 373064 5' + pogo 54 1 58.90 GAATCACAAAGTAAAACTCTGCCTTCAGTGCCAGCATGGGTGGAATCTAACAAGAAGATTTCATTAAAAGGGAATTATCATCCTGGAAGTGGGGGCATCCTACCTTCTCCTACCCGCGAACAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAA:1 - chr2L 5563243 5' - invader1 100 2 75.34 AGTTTTACAACTGAGCAACTTTCATTTCGTGCCGATGCTTAAGCATGTTCAGCTTACATACATAAAGCCATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAA:1 + chrX 15200783 5' + 17.6 9 2 77.40 AAAATGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGTAAGCGTTAGAACAGTCAGCATGGGTCAACAAACTTGTGCTGCGTCTTTGTCTCTAAAATCTGTACGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGGGATCTCGACGTT:1 + chr3L 21609977 5' - INE-1 142 1 73.97 CTTAGAGGAGCCACGATTCAGGGGAGCTGGTTTTCTGGGAAAACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 + chrX 10639052 5' + FB 37 1 56.16 CTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCAC:3 - chr3L 19274883 5' - transib2 2756 1 66.44 TTACTACTACTTCATACACTTACCAGTGTCGATCAAAATACAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGAATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAG:1 + chr3L 16042384 5' + Doc 4544 1 70.55 CATGCCTAGTCACTCCGGTATTCCAGAAAATGATCTCGTGTACCTGGCCGCCAAAAATGCATCGAAGCAAGGAATTTTCATTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCT:1 + chr2L 21153682 5' - Doc 4635 1 53.42 CAACCTAAGCGTTTGTCATTTTGACTAATGGCTTATCAAACAAACGCAAACAAACGGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAA:1 - chr2R 12773897 5' + I-element 442 1 61.11 AATCGATAACATCAAATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2R 22034596 5' - copia 248 1 80.14 TCTTGTTGCTGGTTTGTGGACGATAGTTGGTGGTGCTGGCAGGCCAGATCATTTTGCTTCCTAGTTGCATGTGGCCCATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 - chr3R 18490460 5' - Stalker2 7606 2 57.93 GTCTCTGGGCATCGTTCAGACCCTCGGACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 27123511 5' + roo 72 2 77.42 ACTCGCGTCTCCCTTATTCGTGAAGTGGTAAGTATCACGCAATATAGTAATGACTTATGACTAATTCATAAACACAGGTGCGCTTGAATGTTCCTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTCAATCTATATTATTTTTGAT:1 - chr3R 4432522 5' + 1360 250 1 70.29 TACCATCTACTTGAACAGTAGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACT:1 - chr2L 23400860 5' + S-element 31 2 64.38 AGAGTGCCGCTGCTTGTTGTTTGATTGTATGATTCGGTGATTTGTGTTTTGTTTTTTTTATCCATAAAGCGATATATACACACAGCTTTCATGGGCTACGTGAAATTCGATTGGTGGTCACTTTATGGGATTGAGTACCATTGGTT:1 + chr3R 18103104 5' - rover 480 1 50.00 TATTATTTGCCTTGCTATGTTTTATTGATTTAAAAATCTGTTGCGGAACTTGACCAAGACAGAACACAGAAATTCGAAAATTCTTTTTAAAATTACACCGAATCCTGAACCAAAGAACCTAGAATAACAAGCTGCGTAACGCCAT:1 + chr2R 5309047 5' + 1360 14 1 68.97 ATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGGATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 - chr2R 20227312 5' - hopper2 1551 1 60.74 AATGTTTAATCAACCCAACTTTTGTAATCAAGCGTAATGCAGCGAAACACCACCCTGCACAAAGACCTAAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCG:1 - chr3L 23224515 5' + X-element 4426 1 71.92 ATTGTGTCTTATATATCTCTTTTTTTTTTTGGTCTCGAATTGTATTTCAATGTCCGACATTAAAGTCGCTGGCCGATAAGTTTTTTTTGTGGACAGCTGTGGTTTTTTTTTGTGTTTTTAATTT:1 - chr2L 5229768 5' - Doc 4699 2 66.94 ATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chr3R 7420273 5' + 1360 80 1 79.41 GTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGCGTTGCGTGTGGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATCAAG:1 + chr3R 27160046 5' - 412 492 2 72.12 CCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr3L 4219471 5' + jockey 77 1 64.38 AATTATTTGCCGGGTTAAGCCCAGCCAGACTTAGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chr3L 12315674 5' + transib2 13 1 76.71 ATCATTTACCAAAAAGTACCCCAAAAATATCGAGAACCACGGCACATTGTCATTTATTTCGACTAATGATAAATGCGATTTCTTTCTTCGCTTTCGTTTGCATTGAACTGGAAATTTTTAGATATCTTACGCTCTCAGCGTAAGCG:1 + chr2R 10793933 5' + 1360 3290 1 77.40 TATTTATTAAGAGCGCGCTCTCTTTCGTAACGATTCTGGTTACGCGCGCAAACTGAAGGCGATTGAAAGCCGGCAAACAACAGAGAGACCGGGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAAAATTAAACTA:1 + chr3L 16026067 5' + Porto1 4538 1 66.44 AAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTT:1 + chr3R 26178372 5' - 412 7486 2 56.16 ATACACCTATTTTCACAGTAGCCGTCGGCAGGGCGTCATGGAGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 - chr3R 4860573 5' + Transpac 4940 2 71.23 TTAGTTTATTGAACTTTAATAATTTTCATTATCTTTTAGAGATCTGCCTCTAAAAACTAACACTGTAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATT:1 - chrX 4427805 5' - 297 6771 2 54.48 TATAAAACTTATTATCATAGGATGCTTACATCAAGGATAGAATGAAGCTCAAGTCTTTATAGGTTTTCGGGAGCAAATATACACATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 17926432 5' + opus 7146 4 64.83 CTTATAAAGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:2 - chr3R 29690801 5' - I-element 5305 1 53.42 GTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAAAAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAAAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACAATCAG:1 - chrX 22672485 5' - INE-1 562 1 37.67 CATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATG:1 + chr2L 13158649 5' - roo 9001 2 65.07 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCG:2 - chr3L 16731387 5' - rover 342 2 82.88 CAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGC:1 + chr2R 22287440 5' + jockey 87 1 70.14 AATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2L 14074583 5' + 297 21 2 70.92 TCCATAAAATGTTTCAGCTGGCAGGCAGGCAAAACTAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAATATAATATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTAATCACTA:1 - chr2R 8699844 5' + Burdock 444 1 78.77 ACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr3L 21327099 5' - copia 203 2 74.66 GGTCCCGCTCTGTTCGAAGTCAATTTGTGAATATCTTCGTGATCTACTTACAAAGCTTTCTTAGCCTAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGGATAT:1 + chr3R 2526198 5' - blood 198 2 53.12 AGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGAGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 5769013 5' - roo 9008 2 60.69 AACTGCATCGCATTGAGATTTTGATAATTGTTAGTTATGTCTGGATATCGTTACAATTTGAGAGTTTTGTGAAAGTTTCCTTCTATTCCCCCATTAAGTTGCCTCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCG:1 - chr3L 5485278 5' + jockey 4988 1 71.23 GCAAAAATAAATAAACGTGAAAATTTATTGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3R 27843284 5' - I-element 5326 1 54.79 AAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAATCACTCACGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTA:1 + chr3R 30486951 5' - Cr1a 113 1 75.34 TATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3R 23295612 5' - P-element 2864 1 40.69 AGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 12986556 5' - roo 8986 2 77.40 AAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCC:1 + chr3L 23456277 5' - Gypsy6A_LTR 269 1 69.05 GTATAAGTATTTTTTGTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTG:1 + chr3L 23797646 5' + Helena 1151 1 60.27 CTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 20898605 5' - roo 347 2 72.00 ATAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 13295003 5' - roo 9031 1 58.22 GCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAAT:1 - chr3R 15363977 5' + flea 4975 2 29.45 CAGGTGTACCCTGTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGG:1 - chr3R 27083173 5' + jockey 4543 1 73.29 GGAAGACAGACCTGGTTCTAATGATCTACAATCTATGCTGAAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGGAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATT:1 + chr3L 21655822 5' - HMS-Beagle2 7195 1 78.77 CTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2R 9871536 5' + roo 73 2 78.91 AAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chrX 20373701 5' + 297 6613 2 64.38 AACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGAGAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAAATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAGACAATT:1 - chr3R 4805730 5' + 1360 35 1 60.27 AAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATG:1 - chr3L 22035595 5' - 1731 4545 1 71.92 GAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAAG:1 + chr2L 20265939 5' - roo 346 2 60.27 ACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCATCTTAAAGTA:1 - chr3L 12249874 5' - roo 8982 2 78.08 AGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr3R 13875113 5' - P-element 2799 1 25.34 AATTTCTTAAAAAATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2L 5582226 5' + pogo 38 1 58.74 AAGGAAATCTAATGGATCGGCTGGCTGCCAGATAAAACGGAAACTCTATGACTTGCGGTACTGATCGAAATGTCAGTTTAAATTACAATTGAAAATTTAAAAAAAAAA:1 + chr2L 2729864 5' + TART-C 11091 1 73.15 CCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGGGT:1 - chr3L 18126039 5' + Ivk 5 1 73.33 AGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTACAGACACAGCGGGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAA:1 - chrY 1428633 5' + G2 2851 1 67.14 CGGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chrX 18336689 5' + mdg3 53 2 51.37 TATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGC:1 - chr3L 19350020 5' + 1360 3250 1 50.68 AACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAA:2 - chr3R 26504325 5' - HMS-Beagle 194 2 53.42 ATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3R 31886946 5' - hopper 1412 2 74.47 TAAACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGGGGCTCCAGG:1 - chr2R 5531240 5' + 1360 66 1 71.92 AGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGCATTCTTTCTTTCTCTCTT:1 + chr3R 17996194 5' + diver 88 2 75.17 GCGATATTGCATAGTTTGAAAATATTTTCGTTAGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 + chr2R 10161734 5' + transib2 11 1 78.08 CAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATTGTTTTTATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCTAGT:1 + chr2R 22034622 5' - copia 222 1 62.33 ACCTTAAAATTTTCTGAAACTGTCCAGAGCTCGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACATCCGAAGGACCTCATCAAACGTCCCCCTTGACGAGAACCAGGAGATTAT:1 - chr3L 24051728 5' + BS3 1601 1 79.82 AAACAGTAGACGGGCTTAAATACATGCATACATATGTATACGTGTGTAAGTGTGGGTGCATTGGTGTAGGTGTGTGGCAGGTGATTTCGTCTAACATAAAAGTTTATTATATGACAAGTAAGTATGTATGTGTGTGGGTGTGTG:1 - chr3L 19631168 5' - Quasimodo 38 2 66.67 TCTATAAATAACATATGGCATATGTTAGTCTAAATTTATAAAAAAAAATTCATTCAATT:1 + chr3L 18068767 5' - hopper 63 1 54.24 AGAGCAAGCCAAAGTTCGCTTTTTTATACGTTGGGGAAATTTTCATGCCCCAGCATGAGGATATCTCTCTCTGTCTCTCGTTCTCTCTCTCTCTTCCTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAG:1 - chr2R 14437644 5' - Idefix 6956 2 67.12 TGTCAACAATTGTGGCTTTCACAGCGGCAATAACAAATCAAAGGGAAAAGCTGCAAATTTATGTTTATTAGCTTTACAGTGGAAACGTCTGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACAAGGAAGGA:1 - chr3R 26313661 5' + gypsy8 496 1 59.50 AGCTCATTAATTTATAATTAAATTTTTATAATCTATTCCATGTCAGTAAATGAGTATACTAGAATCGTTGAATAGTATGTAACAAGCAGAAGAAAGCGTTTCCAACTATATAACGTATATTAATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 + chr3L 3001950 5' + INE-1 85 1 53.85 AATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 14310331 5' - roo 9026 1 50.00 AAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 - chrX 1264056 5' + Burdock 6184 2 58.62 ATTTAAGAGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACA:1 + chr2R 9158048 5' - mdg3 181 2 58.22 ATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGTTGTCGATATGT:1 + chr3L 23354593 5' + gypsy2 72 2 66.22 ATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTAGCTTAGCTGCCTC:1 - chr3R 15072690 5' - pogo 2098 1 75.65 CTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 - chr3R 4683017 5' - Burdock 6359 2 63.70 ATCCATGTTCATCCTTGAGTATTGACGAAACACTGTCTCCTCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACCAGAGGTGGTCAAAAGCATTTTCACAACGC:1 + chr3R 11039857 5' - Bari1 1698 1 72.60 AACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 - chrX 17343466 5' - I-element 5285 1 68.49 AGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1 + chr3R 27083055 5' - jockey 4916 1 71.92 AAGATCAGAGCAGGATCGTAATGATCAGGAAATAAAGGGAGAAAAATAGCAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAACACAGTCTAATTGAAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGATTTACATTCTGAT:1 + chr3R 4809281 5' + transib2 2525 1 72.60 CTTATTCAACAATGAACATACTTTTTATTAATAGTGGCGGCAGGCTCATGGTCCACAAAAATTATATAATGACATATACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTACGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2L 22193538 5' - roo 9032 1 55.48 GTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTA:2 - chr2L 21930231 5' - Copia1_DM 68 1 71.23 ACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATAGTGATCCATCACA:1 - chr2L 17809265 5' + jockey 69 1 55.48 TTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACC:1 - chr2L 15913331 5' - transib2 2758 1 64.38 AACTGTTTTTTTTTCATAACAACTCTCTAACAGTTTCAGTTTCCAGTTTCACAAATAGGACAACCTCGGCATAAATTCGAGATTTTCTTTCTACGGTAACTGGCGATAACTTTATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATA:2 - chrX 3765116 5' - Stalker 6941 4 78.77 GTTACGTTTTTCTCCGTTATGTGTAGCTATGCGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATCA:1 - chrX 9164776 5' + Quasimodo 39 2 70.59 ATTCTTCATACAAGCAACAAATCGGATAAGTTATAAATCGGACAGATCTTTTTTGTTTTTTGATTATTTT:1 - chr2L 9722549 5' - TART-A 13403 1 55.71 ATCATCGCCATGCGGTGTTTTCTTGCCATTTGTTTCCCGAAACTCTTTCACTCACTCCTCTGGCAAAGACAACTTCCACATAATACCCCCAAAAAAGGGCAGCATCCACGAAACTAAGGTCCTAGTAAAAA:1 - chrX 20972841 5' + Fw3 95 1 54.20 GGCCTGTCAGACTGACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3L 6518683 5' - 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chr2L 422528 5' - HeT-A 245 1 87.67 CTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2R 6847865 5' + Doc 39 1 62.14 ACAACAGCAACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 - chr2R 7090755 5' + I-element 33 1 63.70 ACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 18488447 5' - roo 8991 2 77.40 GGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTTAAAATTTATAACCCCTTAACCTATTGTGGTTATTTGGATGATTTTTTTTT:1 - chr2R 19941622 5' + hopper 60 1 38.35 CATGAAGCTATAGCGAAAGTCATCTTTCTATTGTAGGTAGTATAAACATAAGTTGTATTGCCCTCATGGGAAAATTTTGAGGTATATGTCAAATAGTTTCCATAAAAACAGGATTCTTCACTTAATAAATATATATAAATAAACAC:1 + chr2L 21860255 5' + Tc1-2 482 1 70.55 ATGCAACAATTTGAAATATTACGTATACGTTGGCTGGCATGAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:1 + chr2R 12783457 5' + I-element 470 1 71.92 TATATANTTTCAAACAATTTAAAGAAAAGTGTAATGCAGCAGAAGAAGATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAG:1 + chr3R 11048764 5' + P-element 309 1 35.62 GCTTTCAATTATCATTGTTTTGATTATTATTTTAATGTTTTGCACAAACATTTAGCTCATCCCAATCGTTTACGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCG:1 - 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I-element 5311 1 66.44 TGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2L 15076203 5' + 1360 55 1 57.97 AGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2L 6647739 5' + mdg3 52 2 50.69 GCTGCATCTACCGGTTAAATTTGTCCACCTCTGCGATTCCCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAAC:1 + chrX 7452491 5' + jockey 4841 1 72.60 AAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATA:1 - chr2R 9158133 5' + mdg3 5326 2 65.75 ATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr2L 18347397 5' - transib2 2779 1 53.19 ATTAATATCGGCCTCACGAGTCGCGACCAACTACTAAGCAACATTTTCAACACTCCTTCTCAATGCAATATGTCAACCCTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTATTTTAAACCCATCCCG:1 - chr2R 23418351 5' - Dm88 4267 1 70.55 TATCACCTAGTTCTCAACCTCGAAAACTCGCTTGTATTTTAGTATTAATAAATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGTTATAGCCCGCATACGTTAATTTAACAGTGCACCGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGAG:1 + chr2L 18900154 5' - hopper 1260 1 75.69 TCCCATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAACGATGAGTTTCGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGCGCTTCAGCTGTCT:1 + chr3L 17183643 5' + diver 21 2 60.15 GGATTGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3L 6518545 5' + 412 51 2 52.05 AATTGGCTGAATCTCCTCAAGCGTTTCGTCAATCACTTTCATGGCCAAAAGACAAGAAAAACAAGAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chr3R 12155013 5' + gypsy7 5002 3 63.41 ATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATG:1 - chr3R 15790132 5' + flea 4717 1 77.14 GGTTGCCGCTGGGGAAGGTCATTCGGTGGGCGGTGATTACAGAGGGGTGGGCAGCAGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCG:1 + chr3R 27757677 5' - F-element 370 1 65.56 GAGAGTTCCTGAAACCACACAATTCCCACACACTAATCGGCAGCTGGATGCCATTTGGTATCAAACTGTCAAAATCTATTTAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACT:1 - chr2L 666830 5' + I-element 265 1 60.96 AATTCCCTTACGCATAATTGAAATGGAAAAGTAGGTAAATTTAAGAAAAAAAAAATAGTGATTAATTAATCAAAATAACACTAAGAAATTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chrX 8998936 5' - gypsy7 5010 2 76.36 ATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:2 + chrX 3797449 5' - 297 342 2 69.86 GCTTTTGACATTTTGGTGACATACGGGACTGCCACCTAAAAAGACACACATGTAGATGCACAGACAAGGCCAACATATTAGGAACATAGGCTGTTTTTTTTTAAATTTAAATAAAAGTATATAAGTATATATAATAATAT:1 + chr2L 5459873 5' + Dm88 22 3 68.57 CTCAACAAAATCGTATTGTTGCGTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAACTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chrX 10319750 5' - mdg1 7441 2 71.23 AGGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGGGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGA:1 - chr2L 21930219 5' - Copia1_DM 56 1 78.08 AAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAA:1 - chr2L 19924032 5' - roo 349 2 60.00 AACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTATTGCGATTAAAAA:1 - chr2R 5303127 5' - FB 193 1 67.74 CAGCTGTCGTCACTGCAATTTGTGGACATTTTTATTAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17473755 5' - hopper 146 103 65.62 GGACCACGCGCTGAAACATATGTTTACTTTGAAAGCTCACAGAGGATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 - chr2R 2590841 5' + HMS-Beagle 24 2 71.92 TGATACCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACG:2 - chr3R 10970380 5' + G-element 21 1 66.44 TAGGTGAGCATATGTGCACATATATGTACATCTCATGACGCTTAGATGGCGACCTCAACGCATGACTAATATAGCTTACAAGAAGATAAATTACTTACGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTA:1 - chr3R 25048407 5' + roo 8967 2 73.17 AAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chr3R 17421318 5' - pogo 2067 1 51.49 AGGCGGCATCGATCACTTGTGCGAAGAACCACGGGCAAAAAAGCTAAGCAGCAAAAAGAATAAAAGAGTGCCAAGCGAAACTTTCAAAAAACAACAACAAACAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAA:1 + chrX 6571926 5' - Cr1a 206 1 54.11 GTCGGTGTCCAATCAGATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:2 - chr2R 21160793 5' + Transpac 4949 2 60.27 ATTAGGTCTGAAGGAGGTCAACTCCGAAAGCTGCGAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAA:1 - chr3R 3854489 5' - INE-1 21 1 54.11 GTATATATATTCATGATCAGGATCATTAAGGAGTCGATTTGGCCATGTCCGTCTGTGATATCTTAGGAACTATAAAAGCT:1 - chrX 14345275 5' + INE-1 150 1 82.50 TTTATTGCTCAAAATAGCTAATCAGAAGATTAAAAGTAATTTCGTTGGGTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGGCTATTTTTGTGCGCGTACATAGCCATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAA:1 + chr2L 22340086 5' - 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chr3L 16470347 5' + jockey 4746 1 70.71 TTATTTTATCTTATATTCAACTTTGCATTTTTACGCAATTTGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATATGAT:1 + chr2R 10809152 5' - mdg1 7085 3 66.67 AAACATCCTCCTTAAAGTTTTATGTGTTCATTTCGAGGCGTACGTCGTTTGAATGACAACATTAACTTCACAAAAAAAAAGAAAAAAATA:1 - chr2L 7537301 5' + gypsy7 5004 1 52.22 ACTTTCACTATCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr2R 11804757 5' + pogo 33 1 63.01 CGGGGAAGATTCGATTCGGATTAATCTAAAAGGGCGAGGTGAGAGGAATAATGCTGACGACTCACTTCATCATAAATTCACCTGTCGTTGCCAGCTCAACGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGT:1 + chr3L 1404404 5' - jockey 124 1 64.38 AAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAGTAATT:1 + chr3R 11191365 5' - roo 9038 1 60.27 GTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGATAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCG:1 - chr2R 2308825 5' + McClintock 46 2 69.86 GTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 - chr3L 19111588 5' + Doc 81 1 74.65 CAGCGACATGGACGTGGCACATGCTAACATGGTACAGGACACTCTGCCCGCTCTATAAATAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGAGGCAGCATAATTAG:1 + chr2L 20393270 5' + Tabor 7003 2 57.24 GATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 - chr2L 17180125 5' + Juan 80 1 70.14 CCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2L 13158667 5' - roo 320 2 78.62 GGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATA:2 + chr2L 19817764 5' - G4 3804 1 45.21 AAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTT:1 - 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HB 1345 1 79.45 ATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 7795613 5' - roo 9012 2 59.31 CACTTTTTTGCGCACACACACAGTGGCAACCGCACACCCACAGCCACTCACACACACACACACACACACACATGC:1 + chr2L 11603621 5' + accord 7031 3 80.00 GTCTTTCTTTTGCAATCTACACACACCCATACCATGAAAACTGCTTTATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGAAGCAGAGGAGATCTCCCGCTCCAGCGAGAGATACGCTAAACGACTGGACAACCACCCAAACCATCTGGC:1 + chrX 10695762 5' + G-element 4109 1 77.24 GTCATCAGTGCTACAAGCAGATAACTGTTGAGTCGCGAATGTGCTTCGACGCCAAGCCAATCGGTAAGTGCCTTCTGTGTTTTTACCGAACATATAAAATGATGTTCGTCTGTCACTCCGCTTTTATTTTTTTTTTAAATTT:1 + chr2L 8051636 5' - TART-C 11097 1 55.63 AAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 + chr3L 13365730 5' + BS 5038 1 47.26 AACGTGATGTAGGAACTCGAAACGCTAAATGTGCGAAAAGTGTGTGTAATTATGTGTGCAATAATGTACGTTATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 17736843 5' + opus 7156 4 55.71 TGTGTGCACTGTGAAAAAACTCTACATTCAATTAAAATACATACATAACATACATAATACACACATAAATCAAGAAAAAAACATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 - 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Stalker2 7173 1 34.25 GTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACC:1 + chr2L 14026134 5' + F-element 457 1 51.59 ATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr2R 13259308 5' - mdg1 7372 2 75.34 CAATTTCACCGGGACCCGGAATGGGTCCGTATGCCGCCAGAAGTAGTCCAATGTCGAGGGCAACCCCCACGCATCCACCACCTAGCGAGAAATCTAACCCATCTCAGCAGTCGGCTCCGACGAAAGGACCTACC:1 - chr3L 20999779 5' + F-element 4518 1 59.70 GTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:2 + chr2L 7660902 5' - I-element 5303 1 52.05 AGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAG:1 - chrX 22689467 5' + mariner2 42 1 68.97 CCTCTCGTTCGGCTACCACAACAAAATATTTTGTCAGTAGGAGCAAAATAAATTGCCTCGGCTGCTAGTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTACTTTTT:1 + chr3L 14478450 5' - Doc 4697 2 66.32 AATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 5389869 5' - roo 352 2 63.70 ATATCGGATGCTGCCATCCTAATTTATAAGGACACTGAGTGCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr3R 30946468 5' + Transpac 4937 2 73.29 CATAGCTAAGCAAGTCAATTTTAATGAATCTAGCCAAATTTTAAGTTTTACCAGGACATGATCAGAAGCATAAAGAGAATTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGAAGGCAGATGTTCTAA:1 + chr3R 12501165 5' + Dm88 4205 1 52.74 AAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 18239417 5' + jockey 12 1 48.57 AGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGACCAGAATTAGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 + chrX 12066115 5' + transib2 66 1 60.27 AGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 - chr2R 6847827 5' + Doc 83 1 71.92 TGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGA:1 - chr3R 28385623 5' + transib2 66 1 61.64 AAAAGGCATTGGTCAATGGCAGAGGAGGGCCAAAGGAGGTGGGAGGCGCAAGTGGGAGTGGTCATGTCCTGAGACATCCTTTGCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAG:1 + chr3R 11040227 5' + Bari1 156 1 63.16 TGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAA:1 - chr2R 12645488 5' + X-element 69 1 62.40 CATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 4964117 5' - roo 323 2 77.40 TTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr2L 13556327 5' - transib2 2786 1 56.30 AGAAATTATCACAAGCTTTTAAGACAAGAACTAGGTAATTAATCTGAGTTGCAAACAAAAAAAATAAATATTAAAATATTATATAAAAATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATT:2 + chr3L 23694781 5' - Quasimodo 7346 2 70.55 AGGAGGCTTTGGAGATGCCGAAATTGTGCACACAATAAGCTGTTAATACATGTTCTTAATAGTATTGGAAGTTTTAAAAGATTTGGCTAGACTTTTTCCCTAGGCTTGGTCCAATGGCTTTTTAAGTTCTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 14783161 5' - HMS-Beagle2 490 2 70.34 GGAAGAAGTCCGGAGTCCCCACATCGACACAAGGACCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCGCACGATTTTT:1 - chr3R 5368662 5' + 1360 38 1 63.64 ACATACGATCCTGGTTAAGTAAATTCGTATATTCAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAATTATATTTTAGTCGGTAGAGAACCGCACTGCTCCCAGAAGAAAAGAATGTTAATTCT:1 + chrX 15047812 5' + HB 376 1 77.39 TCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCGCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 - chr3R 7420317 5' + 1360 46 1 54.11 CGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:1 - chr2R 20349066 5' - transib2 2773 1 52.74 CCAATGCTTACTGGTATACCTACTATGTGATAATCGGGGAACTTGACAAATGTAGCTGTGTTTCGTGGAATTTAACATTGTATGGCAAACTACTTCAAACGAATTTAAACGGCAAGTTATTAACTAACATGTGTATAATATTATAC:2 - chr3L 24736927 5' + transib1 468 1 59.59 AAGCATGTGAGTCTAAAAAACAGGGAGAGAGAGCAAGGGTGGCGCTGAAGATACTTCACCCATCTTCCTTGCATATAAGTGAATTATTTGAGAAGTGCAAAAATAACAATAGAGAATGCAATAGTCGAG:1 + chr2R 3143552 5' - INE-1 577 1 74.42 ACAAGGACAACAAGCGAGCTCAACAGGCGCCATCACTCAATGGGCCAGAAACGAGGATGGGAATGGGAATGGACAGGGCCACAACCTTAAATCAAACAAGGTCAGCACGCACGGACGCCTTCGTGGCCAAAAGAACGAAAATGAA:1 - chr3L 11740272 5' + Stalker4 495 1 49.66 TTTCGCTCTGGATTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 5769139 5' + roo 8694 2 64.58 CTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAA:1 - chr3R 23491920 5' + transib2 88 1 80.43 CTATTTGTCATAGTGCACAGTGTAATTTTGCATTTGCTAATTACCGAACAGAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGTCCATGTTTGCCCACCA:1 + chrX 2814250 5' + FB 69 1 64.14 GGGCGTCAGACGCGCTCTAACCGTAACTGATAACTGTAAAGTGCCGTTAAGCGCTACAGTTTCCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGTACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTA:1 + chr3L 8358829 5' + P-element 411 1 47.59 AGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGC:1 + chr3L 11913184 5' + BS 5050 1 54.11 TGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 15790989 5' - roo 329 2 73.97 GAAATTAGGAATATACATAAAAAACCGACTGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAAGTCGAGGTCTCAGGAACTATTAAAAGCTAGGTTGAGATTAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCT:1 + chr3L 24327152 5' + 1360 3279 1 60.90 AATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chrX 20455650 5' - hobo 2913 1 56.63 CTTGTCGCCCACTTCTATATCTATAATAATATCTCTCTCTCCAGAGTCTAAGGTATTCTCGCAGATATCCCCAATGCCCGGTATTTTGTCACGGCTGACTCTGTCTAGTCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATC:1 + chr2R 3681687 5' + mdg3 82 2 69.86 CTTTTTGTAAATATCAATTGCAAATTTAACTATTTACAAATTTCAATTTTAGGTTTGTAACTGTTAAAGTGATAAGCCCATTCTTATTTAATATGCTTTTATTCATTTTATTCGTAATTAAAAAATACCCATTAAATAAAAAA:1 - chr2L 16541581 5' - accord2 357 1 84.62 ATTAATTTTGTCATTTGCTTTTTACACCGATGACGATGGATTTACCGGAAAACGAGCGAGTCTGTAATCCATCCATTTTCGAATTCTGCAAGGACTTTTCATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATCTCC:1 - chrX 847347 5' - invader4 430 1 60.96 ACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGG:1 - chrX 22824264 5' - Gypsy12A_LTR 2244 1 56.85 TATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAACTTCTTGGGTGTTTAAAATAGCACTCACCA:1 + chrX 14771743 5' + BS 80 1 70.83 TCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCAT:1 - chr2R 23780584 5' + Ivk 60 1 70.69 ATCCTCCTGGGCACACAGATGCATGGGAGTTAGACCATTCTTAGCCGGATGATTGACGGCGGCCTTGTGCTCGATCAACTGATTGGACGTAAAATACATTCTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGGGG:1 + chr3L 7708331 5' + Gypsy6A_LTR 262 1 58.22 ACCATAACAAAAATTTGTTACCATTTTGCAGTACACATTTAACTGAGAATTAAATTTAATAAACATATAAAAAACATGAAAATGAAGAATTACAGATAATTGTATGAAATATAAATTACATTGTATGTATATGTATATGTATATAT:1 + chr2R 16845946 5' + Stalker 244 4 76.03 AACAAACAACACATATAGTAAACATTAAATATTAAATCACAAGTTTTAGAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGC:1 + chr2R 24343386 5' + TAHRE 10419 2 63.70 ATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAGACAATAATGTTC:1 + chr3R 2169841 5' + gypsy11 105 2 67.12 AGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAG:1 - chr3R 15790104 5' + flea 4751 1 56.16 TATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGGAATTT:1 + chr3L 22890332 5' + FB 23 1 63.85 AAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 5389868 5' - roo 9009 2 65.03 TATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 - chr3R 4679593 5' + hopper 18 1 71.72 ATTGCGAAATTTAAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:2 - chr2L 13844292 5' + Stalker2 28 2 65.07 AGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr2R 17796531 5' + jockey 4703 1 60.45 AAGATGGAAAACAGCTGTCTGGGGCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 19924080 5' - roo 9056 1 55.71 ATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTT:1 + chr3L 13365728 5' + BS 5034 1 49.31 ATGTTTTCGCTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 - chr3R 16630392 5' + FB 30 1 65.07 ACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAAT:1 - chr3R 25709845 5' + hopper 86 1 73.29 AGAGATATTAAATTCGGTTGCCATTCCGTTAGGCAAATAAACAAGATACAGCGCTGATATCTGGAATGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGGAGCACCCGCACACAAAATTG:1 + chr3R 24736229 5' - hobo 49 1 53.42 TATGTCTTCACTTATTTGGTTACTATAAATGAACGTTAAATACATATTTTATTTACTTACCTTTTATTTTAATCAGCAAATACGTTGTCACTGCTATTTTTGTTACCCCCTCATTTCGC:1 + chr4 1045096 5' - Tc1 196 1 56.30 CGTTGCAATTTATCCGGAAAGTGGGCGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:2 - chr2L 4124007 5' - transib2 2818 1 78.77 TTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 20898657 5' - roo 9042 1 65.75 TTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAA:1 + chrX 6116265 5' + transib2 81 1 72.60 AACGAAAATTGCTGTAGACAGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGG:1 + chr3L 13365696 5' + BS 5004 1 70.55 GTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGANNANACAGAGGTGGTNNNNNGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCA:1 - chr2R 9967172 5' - Bari1 1686 1 67.81 TAGCTGTGGCCAAAATCAAATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGCGACATCC:1 - chrX 1135427 5' - P-element 2864 1 68.12 ATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 + chr3R 27405933 5' + diver 5917 2 65.07 TTATTGTTTAAACGAAATCAGTTTGAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 - chrX 6116361 5' - transib2 2778 1 54.79 AGAATCATTCAAGTATCAAAAAAAAGCTGAATAATAACTAAATATACCCAATCCCATAAGAAAAAAGTTTAAAATTATTTAAAATTTTCCTTTTGCTAAAAAAAATGGCCCAAAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCC:1 - chr2L 18503290 5' + Idefix 217 2 76.71 TTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAA:1 - chr2R 5479983 5' - F-element 172 1 69.75 TGGGTGTTGCCATCGAATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 - chr3L 13739685 5' + BS 5026 1 60.42 ACAATTGGCAATTATTTAAAATTAATGGTCAAAGCAAAATTGGCCAAATTGTTAAAAATCAATTGTTTCTAGGGCGCGATGCATTGCTCGAGGGTAAACTTAGTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGACGAAAT:1 + chr2R 11930094 5' + gypsy 7225 2 50.68 TAAACAATAATGAGAACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACATA:3 + chr2L 18212093 5' + Quasimodo 38 2 58.90 AGGCTTACACAGTGAGAAATTTGATCGTGCAACATGTATAAACGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAAGAT:1 + chr3R 29369111 5' - 297 233 2 68.49 GGGGAGAACTTGATATGATACTTTGCCTTTAATTCCTTCACTTGAAAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 16818022 5' + 412 7068 2 73.29 TATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3L 18403064 5' - P-element 2832 1 46.81 TCGTTAATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATG:1 - chrX 21587785 5' + INE-1 120 1 44.83 ATTAATAAACTTACCATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGGATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGC:1 + chrX 23338830 5' - GATE 375 1 50.68 TGGCAAATCACGGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAAC:1 - chrX 15200953 5' - 17.6 447 2 55.48 GCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 11062805 5' - roo 9001 2 72.66 ATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 3920577 5' - roo 8999 2 68.49 GGCTGCTAGCCGCTGAACAACAGCAACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr2R 7090771 5' + I-element 17 1 73.29 CTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTCATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATA:1 - chr3R 14860188 5' + diver2 444 1 79.45 TGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAT:1 + chr3L 18930992 5' - I-element 5270 1 76.71 ATTAATAGCTGTGGCCAAAATCAAATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 1135432 5' - P-element 2861 1 67.81 ATGCCACATGGGTTCTTAATGGGTTAAGCAAGTTTCATAGCATTTAACATCGATTTTCATACTGTGGTTAGTACCTCAAAACGCAAAGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTA:1 + chr2R 13557480 5' + Circe 7306 1 59.59 TGAGCAGCGAATGGCTGGACACTCGGCCGCACCGCTCTCCATTTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAA:1 + chr3L 1531631 5' - 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chr3R 20441375 5' + I-element 9 1 78.08 TTTTATTTTAGCTTTTGTGCCACGTTTGCTCTTATTAGCATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chrX 17343338 5' + I-element 14 1 74.66 GTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGG:1 + chr3R 9557539 5' + G2 3052 1 68.49 CATTGGCATAATTAATTTTTCACTTAATCGATTTATGATCACTTTTGCTTGTTTTCTCGGGACTCCCTCTGCTTAACTTGGCTCTTTTTCAACACGATTTATTTCATTATTCTCGGCCGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTAAGTT:1 + chr2L 20968380 5' - TART-C 11098 4 58.90 GTAAAGTAATGAACCTATGATTAATACTAGTGAATGTTTTCTAAAAGTGGGCAGGTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1 + chr3R 16910313 5' + INE-1 11 1 42.47 AAAAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:2 + chrX 21216687 5' - roo 9041 1 64.38 CGGGAAAGGCGGCAGTTTGGTGGCTTGGGGAGCCCAAACCGGAGCTACAAATACAATACAAAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTTCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCG:1 + chr2R 12908844 5' + G2 2817 1 56.85 CACGCTAAATAAGATAACGAGGTTATTCTACTACTAAACAACACGGACGTTACAGTTTTGTGCGGCTATTTTAACCAAAAATGTTTGAGTGGGCGGAGCAAAAAGATTACAACACTACTAAAACAAGATAGAATGCCATAGTCGAG:1 + chr2R 5119138 5' - INE-1 577 1 69.86 AAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 + chr3R 4682904 5' + Burdock 38 2 63.81 ATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr3L 18505758 5' + I-element 38 1 57.55 ATCTGTATTAAATCGTTACAAAAGACCTAAGGTTTTTTTGGCTATAATTTAACTACAAATAATAATAATTATAAA:1 - chr2L 13427199 5' + P-element 2499 2 33.33 CCTATTTACCAAAACTTCTTTTTACTTCTTTTTGAAATTTAAACTCATTTTAATACCCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATACATATTCTTGATCAGGATCAATA:1 + chr4 669987 5' + INE-1 84 1 56.85 TATGTGTTCAAAATATGCTTCTTGACTGCAGTGAACTTTCTGAAGATCCCAACAATTTTAGAACCCAATGTCGATCTCCCTCTGTCCGCTCGATTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTT:1 + chr3R 16240249 5' - 1360 3272 1 59.23 ATAAGTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chrX 8437740 5' + P-element 41 1 44.74 ACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTTTAATGTATGCGTTTTTATTGTTAATGTAATTGGTCACATTGGCGCGTCAGATCAGTTCGTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCAC:1 + chr2R 5106270 5' - 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chr3R 30059522 5' + FB 26 1 67.36 CTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr2L 13556463 5' - transib2 2796 1 57.46 ATCGCAAACTTTTAAATTAAAATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2R 22287369 5' + jockey 17 1 73.29 TCAAAATAGCTAATCAGAAGATTAAAAGTAATTTCGTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGGTTATATTTGTGCGCGTACATAGCCATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGA:1 + chr2L 22340094 5' - 1360 3168 1 63.01 GGTTACAACATTTTGGGGGTTTTCGGTTTTGAAATGTAAGGTGCAGAATTGTGGGCGTGGCAACATGGTTCAACAAACTTGAGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTCATAGTTCGTG:1 + chr2R 6131741 5' - INE-1 155 1 72.41 TTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGGTTAAAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTA:1 + chr3R 15095976 5' + Juan 3768 1 57.69 AATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 7719680 5' - roo 9051 2 71.23 AAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 - chr3R 29690768 5' - mdg1 38 8 53.23 GCAGGCGATTGATTTATGATTCGATATAGGGAATTACACAGCTCTGTAAGTTTTCCAATTTGGATTTTATTAAGAGTGGTAATTGTAAATTTGTATTGCTTTGCCAATAAACGCCCTACAACCGACCAAAA:1 - chr2L 11943417 5' + INE-1 344 1 65.65 ATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATATATCTTCGGTTT:1 + chr2L 13158654 5' - roo 9015 2 63.78 ATTAAAAGCCAGTAAAACTAGGCTCATTGAAATTTTAGCTGCAAAGTAAATGAATATATTTCAAATAAATTCAGTCCACTACTGTTTTAAATGCAACTACTATACTAATGTAC:1 + chr3R 19450090 5' + roo 8614 1 82.30 AAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGCCGGTTTGGTGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCCACATGGGTAAATTAATTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 4322610 5' - 412 469 2 68.28 TAATGGCCCTCGCTTTGCTTTATATATATATATATACACGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGGGTGGGAATAGAATATGGCCAATAACATCT:1 - chrX 22715107 5' + Circe 2 2 74.40 TACCTATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTGGTACGATTGTTAGTATTTATTGAAAATATATTGAAAATAAAAGCCAAGG:1 + chr2L 23008366 5' + transib2 269 1 62.33 AATTAATAAGAACAAGTCGTGCAGAAAGAGTATTATTATTCCCATCACTCGTACGCCTACAAACCGCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATAAAATTTCGCCTTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGGT:1 + chr4 616587 5' + INE-1 545 1 68.97 AATAACCATAATTGAGCTTGACCGACAATAAATGTTTGTTTCTCCAATTTTTTGTTTGCCTTGTAGGTCGTAATAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAA:1 - chrX 1119830 5' + roo 8609 1 50.00 AACTTGGCCTCGATATTGCTGAGCTCCATATATCCGATATTAAGTACTTGTAATTGCCATTGTAACAGACGGACGGCCAACATCAAAGATGCTAGAAAAATACATTTTTTCGTTTGCCCACCCTTTAGAATTAGTTTTTTTCGTTT:1 + chr2L 20268429 5' + FB 728 2 65.07 TATGACATTGAAATTCATTTGTTTGGCGCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 13972909 5' + 412 7074 2 71.92 AAATTTTTTTTTTTAATAATTTATACCACAAAAAGTTAATTTGCACATAATGACGCAACGTAAACTTACATTGTTTAGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAAATTGGTTTGG:1 - chr2R 3493929 5' - 1360 3362 1 82.17 ATTAAACTTAATTCATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTAT:1 - chrX 3432009 5' - Ivk 5367 1 71.72 AACAAAACAAGACACTTGCGATTTGAGAGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTT:1 + chr3L 12249781 5' + roo 8704 2 56.85 GTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:3 - chrX 9950602 5' + jockey 4742 1 65.75 CGAAAGGTAGTCTTTAGCATCAAGGCGTTCAAAAGTAGAATCTGTATGCTGAATCTCCACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGAGATATCGAC:1 - chrX 722220 5' - INE-1 145 1 61.96 GTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:1 - chr3R 9038999 5' - Juan 4135 1 74.66 ATACTAACATCTCCTAGATTTCAAACATTACATGGCGACCGTGACAGTGTTCCCGTGTGCATGAAGTTAACGATTACATATGTATATGTCGGCTCGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTG:1 - chr3R 1330079 5' + invader4 123 2 69.70 CTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chr3L 15103909 5' + Transpac 58 2 58.90 TGGAGAAAGGATTCCGAGAAATATGACCTCAAAGATGAAGGTGAAGCTGTTGATTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGATATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTG:1 + chrX 20453681 5' + INE-1 543 1 79.45 AAGTGTTAAGCACTTGAAACCCCTCGGATTGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGAGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3L 6518520 5' + 412 7079 2 67.12 CTAAATAAAAATAAATATGTAAAGTCTCTGTATTTGCGTGGCTTTGTTCACCCATTTTCAATTTGTTTTGGCTTGGTTCGTTGATGGTGTGCTGTTGAAGTTAGCTGTCGCCGGGTTTTTCACCATTTTCTTCTTTTTCCTTTTTT:1 - 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chr3R 4357852 5' + Tc3 1648 1 64.38 AACCATTTCTTTCTTTACACTCTGCCCTTGTTTTGTTGCTACAGCCCTGTTAATGCGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTTAGTTTGTTTTGCACTTGTAGTTAGATTTTATTTTTTTTTTTAGGTTTGTTTTGCACT:1 + chr3R 7604295 5' - gypsy2 419 1 80.14 CTGACCTTGCTTCTAAAAACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 4805747 5' + 1360 18 1 73.29 CCGAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chrX 19054204 5' + jockey 25 1 71.92 CGTTGATGGGCAAAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACA:1 - chr2R 10161877 5' - transib2 2755 1 65.75 GGCGGCTATTAGTTTTGATAAATTATTTTATTATAAATATCATATTGCTACGAAATCGGCAAAAACTATCCCAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAG:1 - chr2L 10172463 5' + 1360 3245 1 60.96 GAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGT:1 + chr3L 27356069 5' - Tc3 1694 1 78.00 GAAAGGAATATGGAGATATTATGTCCCGAAAGTCGGCAAGTAGTTTCTAGAGGAGGCAAAGTAATGCTAAATACTAAAACTTTTCAAATATTAACAAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTAGTTTAGTGTTTTGTGTAAAG:1 + chr3L 5661164 5' + S-element 1490 1 53.42 GCGTATACGTAATACATACTGCATACTATTAGGCGCTCATAAAAAATGTAATGCAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3R 24450509 5' - 412 7514 2 53.33 ATATTTTTTAGGAACACTTTCTCCACTTTAGATAGAAATTTTTCATTACATTTACATACATACATATGTACATATGTACATATGTACATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAA:1 - chr3L 23249511 5' - rover 317 2 54.11 TACAAGGAAATGGAATGAGGTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGTTAAACTATATATATTCTTGACCAGGATC:1 - chr2R 4886711 5' + INE-1 80 1 64.17 ATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCACAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr3L 18505719 5' + I-element 84 1 74.66 AATCAATGTTGATTTGAAAGCAACTTGTTTATTTAACTTGCTTTGTCGTTCCCCAAATAATCACACATATGTAATACTAAGTTCATTTATAGAAGTTTCTTCACATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr2R 21116614 5' + mdg1 20 2 30.82 ACATTTTTGGACAGATTACAGTTCCTTGTTTAACATTTTTGAATGGTGATTCACAGCGAAAACCACTTTTGCCTGTAAGGAAAATATATATTCTGACCAACCTTAATTGGCTTTAATTGGTTATCGTTATTATTATTTGAAAATA:1 - chr3L 18365786 5' + 1360 313 1 77.24 AGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr2R 22514203 5' - P-element 2846 1 50.77 TACTAGAAGTGATAAAAATTACATTAGTGCTGCAAGAACAAGACCATTAAAGGGTAACTGAAACCCCAGGTTTTGTGTATTAAATAAAGACAGTGGGTAGCCCTCCTGAGTGGATCGCTCCTGGGTACTGATCAGCCTAGAACTTG:1 - chr3R 2082050 5' - Quasimodo 6972 2 70.55 CCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCCCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGA:1 + chr3L 24213792 5' - invader2 160 2 77.08 AAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:3 + chrX 12986538 5' - roo 340 2 65.07 ATGTGTAAACTGAAAAACTTTGATAATATTGCCAGCGTTTTCAATTTGCGCATAACACAAAACCAAATCCAATGTGCCTTGCGTCCAGTTCATTGACACTATAATCCCCTGGATGCCAAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAA:1 - chr2L 508275 5' - transib1 1900 1 50.68 ACATTGTAAAATTAATATATACCTGAAAAATATTCTGGCAATTCTGCGGAGACTGTTTAGACACTATGAAAAAAGTTAAATTTTTGACTTTAAAGG:1 - chr4 1055153 5' - S-element 1678 2 63.54 GTGTATTTTTTTTTTTCTTTTTTTGTTCAATGTTACTGAGCTAAAAGTATTGTATGTGAATTATTATTATTATCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATT:1 - chr2L 14085193 5' - mdg1 7069 2 57.53 AGTTTCTTTTCAAAGTCACTGCATATAAATAAATTTCACCCACTCAAAGCGAGAGGGAAAGACAAAGAGACACTCCCTGCTAATTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAAT:1 + chr3R 16515505 5' - FB 454 1 53.42 TTTGGAATGTTAACTTATTTGTATTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 1341776 5' + 412 7070 2 72.60 ATACATATATATATAAAGTATATATTATATATTCTTAATCAAGACCATTGGCAGAGTCGATCAGGCTTGTCCGTCCGTATTAACGTCGAGTTCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCA:1 - chr2L 7336159 5' + INE-1 169 1 71.54 CAGATGTTTTGCTATTGTACCTGTTTGGGTTTCACTTTCAGTTGGTGTTTGCCAGCCTGTTTGTTTGTTGCATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAAT:1 + chrX 16999284 5' - Porto1 4323 1 51.37 ATACCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCAC:3 - chr3L 3501874 5' - Bari1 1703 1 76.03 CTTCGGCTCGACGACTTCGACTCGCACATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr3R 23295557 5' - P-element 2794 1 17.81 AACATTTCATGATTTTAAAACTAAACCGTATGTGTTGTTATGTTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACATGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2R 15373402 5' + 1360 53 1 64.21 GCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTG:1 - chr2L 15550772 5' - Bari1 1653 1 56.85 GCCAAGGCCCAGAAATAATTCGTTTCGTTTGTTATTTAACATATTTATTAATAAAGTTCCAGGAAAATAGTCCGTCTATCGATGTAATGTGGCTCAAAATACAAATACTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATG:1 - chr3L 20265563 5' - Transpac 5049 2 78.36 AATATACGATGTATTTAGCTAATACATAAATTATTTTACTTAAAAACTTCAATCATGTACCTGTTGTTTTTTATACCCGTTACTCGTAAAGCAAAAGGGTATACTATTATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAG:1 - chr4 103954 5' + INE-1 28 1 68.49 AAATGCTGACTGTGACTTTTCGCTCTGGATTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3R 5769156 5' + roo 8679 2 75.34 GGAAAGAGTACTTAGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chr2R 24169940 5' + transib2 31 1 38.36 AAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3L 7889687 5' - roo 9039 1 63.01 TGTTATGTCGCCGCTTAAAGGTCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chr2L 12984084 5' + hopper 2 2 77.42 GTGTGCAACTTAAAATGCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:2 + chr2R 4606176 5' - 1360 3352 1 60.27 GATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chrX 14722254 5' + diver 5894 2 73.57 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTACATTTCTAT:1 - chrX 392290 5' + INE-1 296 1 68.31 ATAGAATTTGGGAGCAACATTTGTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 25616463 5' - roo 9054 2 73.29 AGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:1 + chr3R 19992660 5' + hopper 83 1 75.18 TGATCACACCAAACGATGAGAATATAATCTTGGGCTTTCGGAACTTGTGCATAATGGGAATCTGCAAGGATATGCTTAGAAAATCTTGAAACTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCT:1 - chr2R 19366330 5' + 17.6 279 2 61.64 ATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGAATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chr3R 19407885 5' + diver 25 2 60.00 CTGTGAAGTGTGCAGTGGGCAAAAAATGGTTAAAAATGTCTAAAAATATGTAGATATAAATTCATTAGTAATTTAGAAAAAACCAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCG:1 - chr3R 29783981 5' + HMS-Beagle 6615 1 70.00 TAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3R 17077171 5' + roo 88 2 80.14 GTATAGATACGATTCAATTTTATTGTCTAGGTTTCCTCGGCACTCCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGG:1 + chr3L 22889757 5' - FB 724 2 61.11 GTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chrX 19054257 5' + jockey 72 1 63.57 ACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAT:2 + chr3L 16690927 5' - I-element 5270 1 78.77 GAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 - chr3R 5523978 5' + FB 82 1 76.76 TTATTCTTTATTTACTGTCTACAGTCCGGAAGCGTTTTCTCTTGTACTTCAATCATGTACCTGTTGTTTTTTATACCCGTTACTCGTAAAGCAAAAGGGTATACTATTATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAG:1 - chr2L 21591288 5' + INE-1 28 1 67.81 TTATGAACATGCACCGAACATACGTTTTTTACATTCGATTTTTCTCTCTTTACCGTCTTCCTTTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATA:1 + chr2L 15092763 5' + hopper 295 1 63.70 GGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3L 6964732 5' + P-element 97 1 18.49 CTCGACTCCAAAATGGGTAAGACGTCCGCCGCACACTCAAACACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGA:1 + chr2R 22514116 5' + P-element 75 1 35.17 AGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 + chr3L 12315706 5' + transib2 44 1 55.17 ATCCCGTTATCGCATTGTTTCGTCTTTCATTTTTAAATGTTTGCTCGTTGCTGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGGT:1 - chrX 5365817 5' - Doc 4465 1 69.57 GCTATATGATATCTAAGTGGGTTCCCTGTCATCTTTTCCTCATTTTAATTACACATATCGGCTCAAAAGTTGACGCAATTTCACTACACTTGTTAGCCTAACATGCAACATCTCTTTTTAGACACTTTCTTAAAATATAAATAAAT:1 - chrX 13894300 5' - copia 230 1 75.34 AATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGACGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chrX 18239404 5' + jockey 80 1 69.40 CAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCGCGCTCTC:1 - chr2R 20802643 5' - mdg3 5412 2 71.92 AACCCACCACCCAGAACCCCCACCCACTTTTCCCATGTACAAAAGGACGACAGAGAGAGAAACAGTCGATTAAAAAAGGAGGGACAACATGGGGGTTTCTTTTTGCCGCTTCCGTTTTCTTTTTTTTTTCAATTT:1 + chrX 6583685 5' + Tc1-2 1396 1 73.33 ACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 - chr3R 28385643 5' + transib2 46 1 54.11 AGAAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGGTTTTA:1 + chr2R 4362739 5' + F-element 23 1 68.49 AAATATGTAAGAAAACTTTACCAATGAGGTTTGTGTACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chr3R 30946638 5' - Transpac 274 2 60.96 CAATACTTATTATTTTTGTATTTATTCAGGTTGGATTTTGGCAAAACTTATTTTATCTTATATTCAACTTTGCATTTTTACGCAATTTGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCAT:1 + chr2R 10809105 5' - mdg1 29 8 77.40 AAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 + chr2R 3338778 5' + Juan 54 1 53.42 AATAATGTGTTGCATGTGTTAATAATAAAACATGAAAAGTCTAGTGACACTTCTTCAGAGAACAAGTTTGTTTGCTATGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAGATGTCAGGAACAATAAAAGCTAG:1 + chr4 1186775 5' + INE-1 152 1 79.31 CATGCCATGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr3R 8075917 5' + 412 86 2 74.66 CCCTAAAGGGGTGTGTGCAACTTAAAATGCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 4606164 5' + 1360 8 2 75.97 AGGTATGATGGAAAGCAACACAATTGCATCGCGGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGC:1 + chr3R 22590458 5' - rover 308 2 59.59 CGGTGCACACAATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr2L 14074593 5' + 297 6591 2 78.57 ATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr3R 7420178 5' - 1360 3353 1 59.59 TTATTTAATTGATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTATTAACTTTGTTTAACTTTGCTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAAT:1 + chr2L 20766889 5' - HeT-A 6043 1 58.74 GGTCCGACTTTCTTTTTGTTTATCGCTGCAGCTGCCACATCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAT:1 - chr3R 24492922 5' + jockey 4847 1 70.15 ATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:1 - chr3R 4682966 5' - Burdock 173 2 79.45 AAATGAGAAATTCTTGTGGGTGTGCGTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3L 22325839 5' - hobo 2913 1 69.74 ATTGTTGTAAATCTTGTATTATTTTGATTGTTGTGCAGTTTTATTGTTGTGTCAATAATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 6397806 5' - roo 396 1 76.71 CAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr3R 19992765 5' - hopper 1385 1 65.75 AAGCGGTGCACACAATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:2 - chr2L 14074596 5' + 297 6594 2 77.40 ATTAACGCATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chrX 11661525 5' + pogo 30 1 65.07 GTGAGAAAGACTTATGTCGCCTAAGGAGTTTAATTTTAATGTCGTTTTGATTGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACAC:1 - chr2L 22369286 5' + rover 22 2 71.23 ATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1 + chr2R 21410865 5' - Burdock 196 2 58.90 ACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr3R 29690785 5' - I-element 5289 1 64.38 ACATACACCAATAGGTAAATGTACAAAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 14304009 5' + roo 8682 2 63.70 GTTCCAAAGTCAAAGGAAAATTGTTCAATTGCAGAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACACAAAGCTTTTTCTCTTCATGATCAAAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGCCA:1 + chrX 11442181 5' + Idefix 7248 2 75.89 AATTCTGTGACCATGTGGACTATATACGTTTTATCTGCGTTTCATAGACGTAAGGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chrX 16946745 5' + FB 38 1 60.27 ATATTTTTCGCATACACATGCACACAGTGTAGATCAAGGAATACATTTCTGCCCGACCCTCCCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCACAACCACCTAGCGCG:1 - chr2R 5875515 5' + F-element 4467 1 51.59 ACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 - chr2L 12984224 5' + hopper 57 1 56.16 GTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTAGATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAA:1 - chrX 9530433 5' + 297 6583 2 72.38 TGCAAATTGAATCTGCTTTTCATGGAACGACAGAAATAACTGAAAGAGTCGAGCAATAATTCAGGAAATTATTATTGGGGTTTATTTAATCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 - chr3R 13580745 5' - copia 197 2 60.96 AAGTTGGGTTGAACATCGAAGTTTCAAAAGGAACGGTCTTATAAATATTTGAAAGTTACTCTTAATTATCAGTAGATATCACTAGTATATCACTAGATATATAATCAAAAAAATAGTTTAGTTAAGAAAATTATCCTAATATCTTT:2 - chr2L 12331943 5' - Transib-N1_DM 57 1 49.32 AAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 5389850 5' - roo 360 2 53.42 CCCTACTCTTGGCATTCCAAACTGGTTAGTAATACTCATAATGAACAAACAGCCAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTA:1 + chr2R 11062838 5' + F-element 4221 1 65.75 ATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAA:1 + chr3R 9557510 5' + G2 3011 1 69.18 GGTTTCACGGCATTAGTACAAGCAGCTAGCCAGCGAATCCGAGTCGGTCTTTTGTTTCATTTTGTGGGCATAAAACAAACTGGAGTAGGTGCTGTCGTTAAGACAATGCGGCCAAATTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGAGATCAT:1 - chr2L 21008158 5' - Tc1 410 1 68.49 CAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGCATGTGTAGATAGGAA:1 + chr4 123964 5' + HB 110 1 50.00 TAAATAAAAATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 7719672 5' - roo 396 1 76.71 GCTTAGGCACGTTATAATTGAACTACAAAGGCTAAACATTTTCAAATTAGACTTGAAATGTTCAACAGTTGCACTCCCAATTGTTCGAAACCAACTTATACCTAGCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGC:1 - chr2R 8413705 5' + F-element 4439 1 70.55 CGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGAATTCTG:1 - chr3L 18403041 5' - P-element 2816 1 32.09 AAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 12004231 5' - P-element 2837 1 52.41 CCGAAAATGAAAACTTGGCCAAGCCGAAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 12984273 5' + hopper 8 2 79.45 ATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATG:1 - chr3L 25482972 5' - accord 487 2 65.00 ATCAAAAGAAAATGCATTTTATACCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCCAGCTAACCGGAGAACTATGCTTGGTACAATCTTTATTTGTAAGTTTATTCGTGG:1 + chrX 160205 5' + Cr1a 4044 1 72.03 ACAAAAACGAAAAAGCAAGGGGAACATGGAGAAGAAGTAA:1 - chr3L 9920354 5' - micropia 127 4 67.50 CTATTGTAGAGATTAAATTAAATTCGAAACTTCCAATTGGAATATCTAATATATAATATTTACATTTGTTACACTCAAAGGAGTGTATCTTTGACCCCATTTTCTTTAAAACAAATGCACACTTACACACACACACACACACA:1 - chr3L 12041098 5' + Quasimodo 36 2 46.15 CTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 18488470 5' - roo 350 2 61.64 GGAGATTCAAAGCTTTCAGGCTGCGTGGTCTTCCCACGCGTACGAATTTCAATTAAGGAATGCAACCAAAAGGGGAGCCTTTTATCGACGGTGATACCTAGATATGTTGCTTGCAGCGGTTGATTCAGGGGAACTCCTTCTAGCCG:1 + chrX 4642966 5' - Helena 859 1 56.85 TGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:2 - chr3R 15790998 5' - roo 338 2 67.81 CGGTGTTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGTTCTCCGAGTATCAGATACCCGTTACT:1 - chr3L 27859907 5' - INE-1 550 1 53.24 TACAAAAAATCTGCAGTTATACATTTGACTTTGGTTTATTTTTGTGATTTGCCTGCTTCGCTTTAAAAGGAACGTTGGGTAAGTCATTTTAGAGTTGTCTTAAACGAAATACATTGAACTACCAACACTACCTAAATCCAAATTCA:1 - chrX 19129073 5' + I-element 4979 1 45.21 GGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAACGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTA:1 - chr2L 3675924 5' - Juan 4141 1 68.49 CAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:3 + chr3L 15913856 5' + jockey 4828 1 65.75 GTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCT:1 + chr2R 2591136 5' + roo 110 2 75.34 ATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAAT:1 + chr3R 15724332 5' - Juan 4124 1 78.77 GAAAGTATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:3 - chr3R 23295633 5' + P-element 3 2 54.79 AAAGAAAAGAATCCCAATTATATAAAGTAAAGTTGGTGTGTCAAAATTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGG:1 + chr2R 4840781 5' - Idefix 7018 2 65.69 CTGTTGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 2146002 5' - roo 358 2 50.68 ATTGAATATCTTTTTAGAGCAGATTGTAATGGTACCGCTTTCTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 10537980 5' - I-element 5328 1 64.38 ATGTTTACGACTCGGATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 + chr3L 18930965 5' - I-element 5298 1 57.93 TTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGA:1 + chr3L 24131422 5' + Transpac 5007 2 79.45 AGTGTATCGTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 - 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chr3L 3501808 5' - Bari1 1636 1 67.12 AAAAATTCGTGAACTAGAAAAAGAACACCCAGAAAATGGATTAGTATCTTAAAAACAGAGCTGGCATTAACACGCACTGAGATTCGCTCGGGCGTAGACCAGTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAAT:1 + chr3L 13061693 5' + 1360 272 1 69.18 ACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:2 - chr2R 9544923 5' + roo 8738 2 69.86 TATCACATTCTTACCATCTCAACGTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAC:1 + chr3R 29690662 5' + I-element 5218 1 71.23 AGTCTGTGCAGGAAGAGCGGCTCCCTGCACTTGTCCCATAAAACTCTGGTGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGGCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACA:1 + chr2L 13010318 5' + G-element 3962 1 53.57 AAAAACTAAACCAACAGTGAAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCAT:1 + chr2R 330101 5' - HMS-Beagle2 7147 2 52.74 TTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGGTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTT:1 - chr3R 1844822 5' + Cr1a 192 1 75.71 GAGTCTTAGTTATAGTCGGCTTAGTTCAAAGTTTAAGTCCATGCAGCAAGAAGTGACAAGATATGATTTTTCTTATGATCTCGAAAAAAGACGAAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATATAGCAAACGTCGAATA:1 - chr3R 12263274 5' + Bica 319 1 66.44 ATTATCTTCAATGACTGATTGTAAGAAATTGTACAATTGGACCCAAGTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATC:4 - chr2R 7244934 5' - diver 6073 2 62.33 AAGCTTGATTTTGTGCTTGTGTTGGCCATTATGTGATGTTAGTGGGCCAACTTTATGGCCGGTTCGACGATCCCAAGCGATCGCAACGCGTAATCGCCGGCAATTTGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTC:1 - chr2L 13918494 5' - roo 9041 1 73.79 CAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chr3L 22960505 5' + Tirant 30 2 65.48 ATACATGCAACCTGCTTGCCGTCCTGCTCATTTGCGTGGCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr2R 18315988 5' + HMS-Beagle2 18 2 71.92 TGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 11257380 5' + 1360 5 2 65.45 AAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTA:1 + chr3R 19449911 5' - roo 8941 2 59.59 AATGCCGCCCGATTTGAGCCGCGACAACACAAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 - chrX 1264086 5' + Burdock 6147 2 76.81 ATTGTGTTATCCTGCAGTGTATGATTCTTGGGTAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGTTAAAAACGTCAGTTTTTACCTT:1 + chr2L 4132146 5' + transib2 446 1 53.19 ATGGCTTTAAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 - chr3L 7889695 5' - roo 9047 1 68.49 CTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCGCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGGTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2L 6102934 5' - roo 343 2 60.27 TGGATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 - chrX 20888398 5' + 297 46 2 57.53 GTAGTATATTATTCTGTGAACAGATTATAAAACAATACTGAACAGATTGTGGAGTAGTTTGCTTTGGTGGGGGGAGTGGGAAACCTTTAAAGCTTTAAAATTAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAG:1 - chr2R 10418593 5' + 1360 3059 1 59.59 CTACTGTCCCTATCTACTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGACTAATACAGGTTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGGAG:1 - chr3R 9201034 5' + R1A1-element 4899 1 81.30 TTAAATCGTTCGCTTGAATATTGTAAGTTGATCCGGGAGGCAGAATATGAAATCACAGAAGGAA:1 - chr4 913836 5' - invader4 32 2 67.19 ATTTGTACCATGTGGCTTGGTATTCAGTTGGTATTCTTAGGCTGATTGCGTGTGTTGAAATATACATAAATATTTGCTTTTATCGGTATAAAGGCCTGACAAAGGGGAATATCCCCTAAGCGATTTATTTTCTTTTTTTTTGTTGT:2 - chr2R 10387693 5' - gypsy7 5002 1 72.60 AGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr3R 4805621 5' - 1360 3327 1 66.41 CTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACG:1 + chrX 6475287 5' + Doc 32 1 59.02 ATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 + chr3R 27083031 5' - jockey 4940 1 55.48 GTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATTAATAA:1 - chr3R 4679586 5' + hopper 22 1 67.83 AGGAAAATAAGCGCAAGAAGGAATTAGCGGCAACTCCCGTTATTTGGCAATGTACGCGCACAAATAAAAATCTTTTTGTATATGCAATCTTGCGTTACCAACGCGGTTCCGTCCGCATGAAGTTTATATATTCTTGATCAGGAACA:1 + chr3L 27367843 5' + INE-1 81 1 71.23 AGTATTAAAATGCCCCAAAACTTTGCTACCACACACCCAGACATTCCGAGGGCTGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATATACATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCC:1 + chr3L 5061517 5' - 17.6 457 2 62.33 TGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGGCCAGG:1 + chr3R 8075924 5' + 412 92 2 76.55 AACAAACAAAGCAAAAATATAAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAATAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTGAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCC:1 + chrX 21569297 5' + Idefix 6993 2 70.55 AAAGTTTAAGCTAGCGAAGTTTGACTGTACTCCCATCTTTTGCTGGATTGTAACGGGCCGACGACTTTCGCATGAAACGTGCTCGGCATAAAACGTTATATGCTGCAGCCTTTCTTCGGTTGACT:1 - chr3L 5264887 5' - Chouto 6125 1 74.40 GTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 15790840 5' + roo 8722 2 58.22 ACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chr3L 16470325 5' + jockey 4705 1 75.32 TAATACTATATACTATAATACTATATAATACTATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATA:1 + chrX 5323197 5' + Juan 4061 1 66.90 ATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTT:1 - chr3R 11062857 5' - roo 9036 1 57.93 AACTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2L 18347285 5' + transib2 61 1 60.96 TTTATTATGTATATTTATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTT:1 - chr2L 20118490 5' + S-element 61 1 63.01 CTTCATCGTTTTCAGGGGATGTACAAAGAAATCACAACAGCTACGAAGCAAAAAGTTCTCAAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATA:1 - chr3R 25678761 5' - hopper 1119 1 58.22 AGAACAATCTATACACTTCCCTTTAATTACGTACATTCCTCGCTGCAATACCATCGATTATCGTTTTGTTATTCCTGGAAACGCTCAGACTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGAAGTGTGAAAAATTAATA:1 + chr3L 3074068 5' + 1360 428 1 59.59 AGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chr3R 20441318 5' + I-element 47 1 54.33 ATATTATTTCTTAGCTATACCCGTATAGTAAAAGTGTATATATTTATATATAAGTATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGACGAGATCTC:1 - chr2R 25196366 5' + INE-1 134 1 75.19 ATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chrX 12986508 5' - roo 9034 1 58.22 ATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGACGACGTTTTTATCGTTCTCC:1 - chr3L 22035699 5' + F-element 32 1 65.75 GGATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAG:1 + chrX 292390 5' - G3 4537 1 58.87 TTTATAAGAATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAA:2 + chr2L 12341790 5' - BS 5065 1 63.70 ATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 11062868 5' - roo 9046 1 65.07 TTGGATATTCTCATATTTATTTCTTTTTCACAATCATAGACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTA:1 + chr3R 4530947 5' + Idefix 170 2 77.40 ACAAGATTAAATAATGATGAACTTAATTGTATCGCACACATATACCCGTTTTCGTCTATTGCTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTCTACTTTTAGATTTCTTACGCTCTTAGCGTAAGCGAGCGAAAAGAGAGCAATTTTGGCC:2 - chr2L 23164088 5' + 1360 3314 1 78.08 GAAGCTATCAAAAGGTTAAACAATTTGTCTAATGTTGACACTTCCATTGACCAATTACCACCGCACGAGCTTATCTCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAA:1 - 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chr2L 17180165 5' + Juan 42 1 43.15 AGCTCACAGAGGATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATAGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCCCATAGTCTCCGCTGC:1 - chr2R 2590808 5' + HMS-Beagle 37 2 53.97 TAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 31653153 5' - roo 334 2 69.86 AGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 + chr2R 19199651 5' + hopper 45 1 52.78 TATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAATTCTAAAAA:1 - chr2R 24170026 5' - transib2 2801 1 41.10 ATTGTTGTACTCAGTTTGGTGTGATTTGTTGTTGGTTCTTGTTTATGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAA:1 + chr3R 21930641 5' + pogo 1915 1 69.18 ATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTTT:1 - 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Doc 4280 1 69.86 TATGTTTAAGATATATATAGTTTGTTTCGTTTATCTTGTGATAAGGTTTTATCACATATAAATATGTGTTAGCGACTTTTCGCTCTTATATAATGGTTACATTTGGGCTTAAATTTCGCACTTAAACTTCGATATTAACTGGAGCT:1 - chrX 9172365 5' - Porto1 39 1 75.34 ATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAACTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGCCAAAATTATTTTTACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGCCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chr3L 3501725 5' + Bari1 49 1 56.56 ACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr3L 22400243 5' + 1360 44 1 55.48 AGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAA:1 - chr3R 25433377 5' + transib2 67 1 60.96 CAATCATCGTCAACTAACTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGGTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3R 16157232 5' - pogo 2095 1 75.00 ATTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2R 8157134 5' - 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chr2L 10563699 5' - Burdock 193 2 73.29 AATTGGTAGAATTTGTTAATTCTGCGAATTGTTTTGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTTTAGGAGAAATAGTTTC:1 + chrX 20888304 5' - 297 6896 2 77.24 GGCGCTCTTTGGCAAACCGGATGGGGAGCTAACAGGGAATATGTGGGTGTTACAATGGTAAAGTTCTTAGAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATAGGTATGTATATGGAAT:1 + chr3R 23284950 5' - ZAM 8154 2 70.97 GTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr3L 24131521 5' - Transpac 273 2 59.59 TTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3L 11326661 5' - pogo 2056 1 54.68 ATGAAGTGAGAGGCAAGAGTTTTGCTTGGAATGTGAGGGTTTTGAGATCCGGAAGGGGTACAATGTTGATGGATTTGTTTGTTACTGTGGCTGTTGTTTGTATGTGTGAGGTTTTCATTTCGTGCATTCATAAGCATTGGTGAGCA:1 + chr3L 9169657 5' - Doc3-element 389 1 79.45 TTATTGACCAGTAGTGGCTGAAATTTGTACGCTGTGCCCTCTTTTCACGCCCGATGAGCGAAATAAATTAATAATTGGCGAAACTCAATCAAAAGGCAGGGCATTCAAGAATAACATTTTATTTGATTTTCTGTATATAATATCAA:1 + chr2L 13765358 5' + transib1 1914 1 75.34 TGACATGCCCACTTCTGAGCTTTTCGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGGCGTCGGC:1 - 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chr3R 11937390 5' - flea 4940 1 68.49 ACGCACTCCGGATCAGATCATTTACACATATAACATTTCACATGCCAGATCAAGGAGCTGGAGCCATGCCAAAGCGCTTCACATATCTGCGAAAGCAACCGTGTCCACTGATCAGTTGCGTTAGATGGAACGTTATTTCGCCA:1 + chrX 20187584 5' - Rt1c 4977 1 51.75 AATATACCCATGCATTTCCATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCACGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:2 + chr3L 21996113 5' + Transpac 16 2 78.08 AGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATAT:2 - chr3L 19350011 5' + 1360 3259 1 58.22 AATGTCCTTATTTTAAAATTGTGAATATGAAGATACTATTGAGTTGCATTTTTAATTTTGAGTCGTAAAGATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTA:1 - chr2R 3175747 5' - Tc1-2 21 1 52.05 GTTCCCCGATACTTCCCCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 4964100 5' - roo 9019 2 53.42 ACTGAAAACACTCACCAATTTAATTTATAGCTGATCATGTTTTTATATACATTCGTATCTTCCATGACGAGTTTATTTTTACAGCGATTACATCTACCAAACTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGA:1 + chr3L 10884204 5' - micropia 144 4 67.81 AATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAACGATAAATTATCTTTAGGAATTTGTT:1 + chr3R 19032620 5' + roo 84 2 73.29 AATAATCTGGGACTTCCCCGTTACCTTTCAACCGTTGCCAAGTTTTGCCCTTTAGATTAGGTGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTT:1 + chr3R 7210772 5' - Quasimodo 245 2 54.79 TCCCAGCTTGATTCCGTGTTGATAAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr2R 17926261 5' - opus 478 2 69.86 ATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTCG:1 + chr3R 7819179 5' - invader3 165 2 64.57 AGCTTTCATAATTTTTTTTGGTGCATAATAAATTTTACCCGAAAATTTAAACGCGCACTCTCTGAAAATGAACTCATCTTAGAAAACTAATTAGATTAGATTAATCTGATCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATGCTCAAAGTGTG:1 + chr2R 2608330 5' - Stalker4 7282 4 67.81 TAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 1279187 5' - roo 9015 2 60.27 ATTGATTGTCAAGTGCTCAGCGAAAAAAGAAAGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGC:1 - chrX 17337265 5' - F-element 245 1 56.92 GCATCATTCAGCAGGTGACTGGTGGGCGTGGCCTGACCGGTGGACAGATGCAAATGGCTCAGGTACGTGTCCAATTCATGACTACTCAGGTGTGTTAAAAAAGTTATAATTGATTGCTGTAAGAGCGGCAGAGAGTAAAGATTACA:1 - chr3R 13754401 5' - Cr1a 4232 1 58.90 TATTTAATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chrX 19539451 5' + pogo 23 1 54.35 AATGCATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTGCTTCAATTTCCTACCAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 2989891 5' - roo 392 2 70.55 AGTGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 4063789 5' - roo 394 1 74.66 TAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chrX 10167440 5' - roo 8981 2 78.77 AAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:3 - chr3R 19992743 5' - hopper 1363 1 52.05 ATGAAATGAAAACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chr3L 21327207 5' + copia 4897 2 66.44 CGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7795586 5' - roo 9013 2 72.65 AGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTGGCCATATCTGACTTTTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAAC:1 + chr4 836649 5' + Doc 190 1 58.33 AATACTTGTTGACTTGTTTTAATCGGAACATTTAAGGGTAATAAAATCCCTAAACACAAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGACA:1 - chr3R 2746117 5' - Cr1a 452 1 74.19 AAAGGCAATCTTATCGCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - 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roo 9047 1 65.75 AACGCAGCCGGAAGGTAGGCTACGGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr3L 19349876 5' + 1360 6 2 78.77 AAAAAAGAATACTAATTTTACACACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAG:1 - chrX 14771847 5' - BS 5068 1 64.38 ATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGATCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCG:1 - chr3R 14505372 5' + F-element 4527 1 60.27 AATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 - chr3L 21380620 5' + I-element 64 1 60.27 TGATGCTTTAGCTGCAACAATGTTGTGCAACAAGAAGTAGAAACATTCTCCCCGTGTATTCGGCCATTTTAATTTCTTTATTACGGCATTTCCTTGCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAG:1 - chr3R 29513096 5' - F-element 4264 1 64.38 GATTTGAGAGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 12249800 5' + roo 59 2 61.64 TGTTTGCCCGGTTTGGCCTGCCCTTGTTTCGGCTGAAAATCTCTCTTCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 17350011 5' + roo 83 2 69.86 ATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGGCAAGAGACATCCA:1 - 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INE-1 579 1 69.78 GTACCGCTGTTACCGGATATGGCAAAAAACAAACCTCACGGAGAGGTATAAAACAAGATGGACGGACATGAAAATTCGACTCGGCTATTGATCCTGG:1 - chr4 1052383 5' - INE-1 94 1 59.79 CAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chrX 10537835 5' + I-element 42 1 54.79 AATGCTGCCCGAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAGAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chrX 19054196 5' + jockey 17 1 76.03 CAGATGTTGGTGGCATTGTTTCTCTTTTTTCAATCATCCTCCACTCCCAAGTGCAGGAGGAGCCCCATCAAGTGGTCGTTACTGTCGGCAGCAGCAGATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr2L 6161076 5' - I-element 5337 1 73.24 CTCGCTATTGTGGGACTTTTCAGAAAATATTTACTAATTAGATTTTAAGCATACATTTTGTTATTATCCTGTGATTTGATTATGTTTCCATACACCATTTTAACACATTTTGACTTTTTTAAGTAAAAACAATAATAATAAATAAT:1 + chrX 17508082 5' + flea 248 2 77.40 AAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2L 16690751 5' - P-element 2856 1 62.76 CATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 28146135 5' - roo 8986 2 77.93 ATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGGAGGAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 13766182 5' - roo 404 1 70.64 TGGGACGGGTTTCGAGTGTTTCGGAAAAATCTAATTTTCCGTATCCGCAGCGTTCAAATATGGTGATTTAAGGCCCAACAAATTTATGAATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAATACTATAATAAACTTTAAAAATATATTAGGA:1 + chr3L 13922381 5' - hopper 170 1 87.67 AAGATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 1279195 5' - roo 359 2 54.79 AATAATTGCGAAATCCCTGACACTAACATCGCTCCACGCAATGTACTCTCAAAAATTCAAATTATTGTACCTAAATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAG:1 + chr3R 12361186 5' + TAHRE 10389 1 72.00 GCACAGAAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2R 4362735 5' + F-element 19 1 71.23 TTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 + chr3L 16662343 5' - jockey 4968 1 65.75 CAAATACTTTCAAACAGTAAGCTGGGATTTCGCTTTCCGTATTTACATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATAT:1 - chr3R 4461627 5' + blood 7189 2 53.06 GTCGGCGGTAATTTAAAACAATTAAAAGTATATGCATTCGCAGCCCGCTTCTCTGCAGGCAACCAACGAGCATAATAATAATAATAATAATAACAATAACCATAA:1 + chr3L 3445610 5' + mdg1 26 2 82.86 ATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr2R 22475977 5' + Stalker 6910 4 59.59 CATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:2 - chr2L 47162 5' - roo 317 2 78.77 AAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCG:1 - chr3L 23702277 5' + G4 41 1 54.79 ATGCCACATGGGTTCTTAATGGGTTAAGCAAGTTTCATAGCATTTAACATCGATTTTCATACTGTGGTTAGTACCTCAAAACGCAAAGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTCTTTTTTTGAATCTACCGTATC:1 + chr2R 13557480 5' + Circe 7293 1 65.41 AGTTCGATAATTTCTCGTAATTTTCTCCAATTTTAACCATTTTCTCGAAGTGCAGCTTCTGTGCGTCAAAGTCGCTCTGCTGCGTGGCAGGTCACGCTTGTTTGCAGGATGTTTTATTATGCTCGTTGTATTATTTAAATGTTGCT:1 + chr2L 19019537 5' - Doc4-element 2638 1 71.92 AATATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 17077207 5' + roo 52 2 55.48 ATACACGCCAATTAACAAGTGTATCCCATATCCTGTAGCTATAGCTTCTGATCCAAGAGTTTGTTCTGTTTGTTGGTTGGTTTGTATGTTGGTTAGTGTTATGTTGCTTGTGTTATGTTGCTTGTGGTCTTATACTATGGCACATA:2 + chr3R 22711157 5' - Quasimodo 8 2 76.03 ATCACTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 + chr3L 15913809 5' + jockey 4781 1 69.18 GTTTTCTACGGCTATAACTAGGACTACGTGAGAAGATCGCCGGGTTTGGGTGATCGCAACTTACTTGGCGGTGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGCAATTGG:1 - chrX 14924883 5' + 17.6 493 1 61.60 AGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAA:1 - chr3R 28385602 5' + transib2 87 1 74.66 AATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 - chr3L 16470363 5' + jockey 4736 1 60.96 ATTTATATAAAGAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCT:1 - chr3L 16033447 5' + Doc 45 1 54.79 ATATGTTCGAATGATGTGGTCTGCTTCAAAAGGATTTGAAATTTAAAAATCATCAACTGTTTGATTTCGTTTGATTCAACTATTATTACACTATAAATAATAAATAAAAAAAAA:1 - chrX 3445015 5' + BS 5096 2 78.95 ATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 - chr3R 13406519 5' + pogo 59 1 58.90 AAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 + chr2L 22674744 5' + mdg1 7063 2 72.60 ATGAAACAGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 21421583 5' - accord 257 2 56.67 AATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTC:1 + chr3R 7420224 5' - 1360 3307 1 73.97 ACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr3R 23639133 5' + pogo 52 1 53.79 GTGGTGCCCCAATGCAGCTCAGATCAATGTTCAAATTAGTGGCATTCCCTCAGTAAAAGAAATCAAAAGAAAGTAAAAAGTGAAAATTATGTGAAGGCAGCTAAGCAACTGAGAAATGGCATAAAAACAAAGTTATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14418600 5' + gypsy2 425 1 63.70 TAAAAATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr3R 7719676 5' - roo 9055 2 73.97 TATGGGNAACTAAAACCGAGCGATTTTATGACCGCGACGATTCGACATTTACTAACCGTTTGCCATTACAATTGTAATAGGTTCAAAAACATACCAATCTCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACA:1 + chr3R 18506521 5' + I-element 262 1 58.22 GGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 + chr2R 24427579 5' + jockey 4733 1 62.79 ATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr3L 16973448 5' + S-element 77 1 71.23 CTGTGGGAAAATATGCTCTAATGGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGCAAAACTGGGAACACGAATACAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGACTAACCGAGACTTCACATAAAACTTACTTAATTATAATCTTCTAAA:1 + chrX 2517978 5' + jockey2 3226 1 53.42 ACATTCGGGATAACGTATCACGAAACAGACTATGAAATCGTTTTTGCTCAACTGCCACGACCACACTTTTGAAAATCGATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCCCATAAACCGCCCAGAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAT:1 + chr2R 6033925 5' + INE-1 252 1 66.44 AGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAAAAATTAAT:1 - chr2L 15779652 5' + hopper 20 1 65.45 TCGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCAT:1 + chrX 14722109 5' - diver 6050 2 58.90 ATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:3 - chr3L 5881679 5' - pogo 2040 1 61.64 ATACATATATATATATATATATATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATATATATATACATATATACATATATACATATATATATATATACATATATACATATATACATAT:1 - chr3L 16731387 5' - G3 4507 2 93.84 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCTGTACCACGGGGTGAGCACCTATCCAAGCCTGCTCAT:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 4954 1 61.70 TTAATGGACCTATCCGAAAATCCCCTATCGAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3L 14094734 5' + I-element 11 1 75.34 AGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATAT:3 - chr3R 18971770 5' + Juan 4104 1 69.18 AAAGATCAACTCCAAAGCCCTTCAAGAATAAAATAAGAACTAAATTAGAAACACATAATGAGTTACAAAATATATTGAATATATTTCT:1 - chr3L 23559183 5' + Tc1-2 1597 1 67.05 GCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 - chr3L 22960506 5' + Tirant 8180 2 76.56 TAATAAATTAACAATATTTTTACCCTATATCAAAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAATTTACACGAGGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTT:1 + chr3L 15749194 5' - 1360 3128 1 76.71 CAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGGCCATTTTTT:1 + chr3L 22890381 5' + FB 51 1 64.22 ATTATATGCGAACTAATTAACTTAAGCCAATACATCAAAATATGTTTAAATATTATATCAAAAATAATAAAGTTTTTATTTCAAGAAATTCCCCATCAAACATTTCCTAATCCAATTTCATTCAGTTTGCTGTAAGATTTATTGTC:1 + chrX 9502016 5' + GATE 408 1 71.92 GAATTGTTTTCGGACAGTAGCCGAACTGCTGCTATTTCCGCTGAGAAAGACGGAGTAGAGTGAGTTATCCTTCCACATCCTGTGTGTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCG:1 - chr3L 5621647 5' + HeT-A 5731 1 68.80 GGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTG:2 + chr3L 19274799 5' + transib2 72 1 65.75 ATGATCGTTTTGATTTCTCTAGCACGATATTTGCCTTGACTTAATTACCTAAATGAATGTAACATTCGTTTCGTACAATTTAATATCTCAGCACCATTTTTATTTTATGTTTTTCAAACCAGCCGTGGTTTTGAATTATCTTCTT:1 - 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chr3R 13646630 5' + Doc 290 1 58.40 GTAGTACAATCCCTTCCAGATGCGCATGAAGTCGTCCTCGTTGAAGGGAAAGGAGCTACCGGCACGCGCCATGCAGGCGTCTTTTCTGTTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCT:1 + chr2L 13365807 5' + invader1 89 2 56.00 GAAAACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chr3L 21327200 5' + copia 4904 2 61.64 CGTAAGAAGAGAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCT:1 - chr3L 12249908 5' - roo 9016 2 53.42 AGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chrX 19074885 5' - mdg1 7419 2 54.17 ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACA:1 + chr4 1301730 5' + 1731 67 2 60.69 AACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATG:1 - chr2L 12984206 5' + hopper 75 1 68.49 GTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3L 3983901 5' - P-element 2857 1 57.98 GTGATGACGGGTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2L 22193399 5' + roo 8708 2 57.53 TATATGATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 19073314 5' - roo 9041 1 63.70 AATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 18046593 5' + roo 8716 2 55.48 AAACGGTTATGGTACGCACACGCACACACACGCACACACACA:1 + chrX 5302825 5' - Stalker 445 1 66.67 GTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2R 24427520 5' + jockey 4691 1 71.92 CTGCAGTTGGAGGTGGTGCGCCGCGAAGAAGTAAGCTCAGCACCAGCCACTTACTTAATTTGCTACCTCCTTGGTTTAATAAAGAGTTGACACACCTAAGAAATGTAAAGTCCAATGGTAACTTATGTAGTTACCGC:1 + chr3R 15291496 5' - Chimpo 184 1 54.74 CCTCCCCCCTTTTTTCCACATTTTGTTTATTAAATTGAGTGTTTGCCCTCTCGCTCACTCTGTCTCTGTGTTAAACAAGCCAACAAGGTCATAAAAACCAATAAAAACATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTAT:1 - chr3L 16640811 5' - mdg1 32 2 63.70 TGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chr2L 7593123 5' + jockey 4712 1 51.85 AATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTCTCTTTATTTGGTTTTT:1 - chr3L 19455024 5' - mdg1 358 2 57.53 AAGTTCCCTTTCTTCAGTCTAAAAAAAAAAGTGGCAGACATTTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:3 + chr3L 13836582 5' - 412 459 2 59.59 TTGTAAGAGATATCAACAATGATTCAAAGATTATTTTTTTATATACCATTTATCAGATATTTTCGTGCACAGTGGTCTGATGTCAGATAAACATGGAAACCGTATATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAA:1 + chrX 16714466 5' + Cr1a 467 1 58.22 ATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 20167564 5' - roo 359 2 53.42 TCTGTGCTCAAGAGGAGCTTGGATTGCCGAAAGCCACGAGATCGTGGCAGCCCCAACTGGCCACGAAATTATATTGCGGAATATTGATCAGACCCGATACCAAGGTTTTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATAT:1 + chr3R 21647481 5' - hopper 106 1 73.97 AAAAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGGGTTACCGTCGGCAAGGGACATCCACT:1 + chr3L 12004206 5' - P-element 2861 1 69.18 ATGTACATATTTATAGTATACCCAATACTTTCGTGCACTCGTAAATCGCACACAGTTAATATTATCACTGGGCCATATCGCGCGGGTCACTTTCCAGGAATTCGTACACTTTTATACATATTTGTTTTTTTTTTTACTTTTTCT:1 - chrX 18130333 5' - Doc2-element 221 1 77.78 CATAGACAATAATAAGAAACATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:2 - chr3R 7666750 5' - I-element 5320 1 62.33 CGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 + chr2R 10161772 5' + transib2 49 1 52.05 GCTTCGACTTAATCTTACCATGGAGTTGCTTTCGCTGCAGAAGCTGGAAGTGGTAACACCAAGTAGTTGTCACCCCAATGAACCAACCACGGGAACTAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATT:1 + chr2R 16554809 5' + invader2 393 1 64.84 ATAGCATTTCTTATCCGTACATACCCACAGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3L 21969790 5' - opus 476 2 56.16 ACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAGTTTGTT:1 + chrX 21224561 5' + roo 8748 2 75.34 GATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 8959717 5' - 1360 3387 2 76.79 AGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 30347383 5' - P-element 2847 1 37.37 TTATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAAT:3 + chr2L 22674737 5' + mdg1 7056 2 74.66 AGTCCAAGGGCAAAGGACACCAACACCGGCAGTCGCAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCA:2 + chrX 894637 5' + I-element 5209 1 75.34 GACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTTCCGCCATTCCACTTTGGGGCTTTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3R 19992716 5' - hopper 1387 1 50.53 GGTTTCCTTTTTATTTTTTGCAACGCTCGCTTGCCACATTCACTGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAA:1 - chr3R 17702253 5' + G2 2866 1 56.47 GCGAGCTTTTGTCAGCCAGCACTTGCCGCCCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 18239481 5' + jockey 14 1 78.77 ATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGGGTAAGTCCTCACCTGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAACTTTT:1 + chr3L 13365737 5' + BS 5015 1 52.59 ACAAAGCTTCCAGACACTTTGTTGTACGACTTCTACGTCTTTCAGAGTGTGTATGTACAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCCACGACCTCCCAGCC:1 + chr3L 16040473 5' + Doc 4546 1 58.90 TCAACATATACATGTTACAGCTCTCGCACACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCCCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAACAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACT:1 - chr3R 11040333 5' - Bari1 1682 1 47.26 TTATGTGGCGATAAACTTGGCCAGGATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGTGTGGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 1692025 5' + blood 62 2 63.83 TTTTGAGATGTATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:2 + chr3L 19454878 5' + mdg1 14 2 74.66 AAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr2L 15936762 5' - copia 231 1 55.48 AAAAAACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGG:1 - chr3L 17940245 5' - 1360 3378 1 77.40 GGATTGCCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3R 15072524 5' + pogo 25 1 66.21 TCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCT:1 - chr3R 10270640 5' - Juan 4129 1 71.23 ATTCTAAAAACCTAAAGCATGGAGTAAGTATTATCGTTTCCGACTATATAAAGCATATATATTCTTGATGACGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGAAATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAATC:1 + chr2R 3932543 5' + INE-1 149 1 73.79 CCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAA:1 + chr2R 20227209 5' + hopper 52 1 54.11 AAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 + chr3L 21996169 5' + Transpac 4991 2 64.38 ACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCA:1 - chrX 22840543 5' - copia 5033 2 78.77 TTATTGCTTAGTGATAAGCGTTTTGTGTTTAATTGTATCTCTGTATCTGTATCTGAATGCACCGAGCGAAGTAGAGGAAGAGGCAGAGCAGAGGAGCTGAATTAAAACGAAGGAATTCTGCGGATTGTTGTTATTATTGTTATTAT:1 - chr2L 523073 5' - mdg1 7055 2 56.85 CGGAGGACTATCCATATTTCAATGAGCTATTGCGACAGTGCACCGATGAATATCCCAATCATAGGGTGTGCTACATGGATGGATAATTTTAATAAAAAGTGTGTAGATGGATGGATAAATTTCATAAAATTATTACAAATTAATAA:2 - chr3L 11887949 5' - Tc1-2 1372 1 63.01 ATGTAGGTGGCTTTGGAGGCGCAGACCCTTGAACGAGGAAGAGAAAAACCAATATCATTTAAAAACAAAAAAAAAAATGTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTAAATGACTACATGTATTACGTCATTTCTTTAAAATGG:1 + chr3R 24774245 5' + Stalker4 6931 2 71.23 AACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 - chrX 18409461 5' + jockey 4742 1 64.38 CAATATACCCATGCATTTCCATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:2 + chr3L 21996112 5' + Transpac 15 2 80.14 CCATTTGACTTTAGAAAAAGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAAAGGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGTGTTTTTTGCTTACTTAAACGCAATTTTTTTTATAAAATATTATTAAACA:1 + chr2L 6101105 5' - S-element 1618 2 90.41 AAGTGTATTTAAATTGATGTGTACGTGACGAAGTTTAGTGGAATTATGCTCATGTTCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTA:1 + chr3R 10705037 5' + Juan 250 1 61.64 AGAGTTATTACGTCCGCCCTTTTGTAAGGCAACAGCTTTGCGAGCATGGCGCGTGGGTGGGCAAAAAGTTTTTTTCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTTAAAGAATACCAACACATTTTTCTAAAGTGTGGGC:2 + chr2R 926808 5' - INE-1 256 1 65.75 TATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGG:1 - chr3L 20187388 5' - FB 488 1 61.62 ATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr3L 21996271 5' - Transpac 5195 2 54.62 GGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:2 + chr3L 16690884 5' - I-element 5313 1 49.32 CATAACACCGACCAACCACGCCAGTGCATTTTCTAATTAGTGGCCAGTGGCCGATCTACCTATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTT:1 + chr2L 23008310 5' + transib2 203 1 74.66 ATAGGTAAGTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTT:1 - chr2R 5149175 5' - F-element 4658 1 58.26 GGAACTAAAAAAAAAGATAATCAGGGCATTTAACCTGAAGGAAGACCCCAGCAGAAACATCAGCCGAGTCATTATTTAAGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAGCATTCGTCGTTGCTTAATAGCAAAAAATAAGTACATAATAAAG:1 + chr2R 5397230 5' - gypsy12 9743 2 63.01 TGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3R 28469185 5' + 412 46 2 54.11 CAGCACAGGGCAATCTGCCTTGACTGCGGCGACTGAAGGAGCCCCACCTGCCATGTTTGTCATCTTGCCTCCTTGTTGCATCATCAAAAAGAAGGGGATGAAGGAAAGGGAAGAGGAAGAGAAGAAAAGACAACCAAAAA:1 + chr2L 6962414 5' + mdg3 5101 1 65.00 CCAAAGACCGCAAATCGTTTTCGGAGACTGTTGCGCGTTTACTTTGCTCGCTAGCACACACTCTTACACGTCCTCATCCACATGCCACGCACACACACCCACTCGAAGGCCACAAAGAATAAGTGCATGGTCAGC:1 - chr3R 8077555 5' + 412 7233 2 72.59 CTTTTCCTAAAGTTTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTC:1 + chr3L 24213787 5' - invader2 186 2 70.73 GCATCTCTTTTGGGCAAAATTGTGGCGATGACTGGCGGACAACCAGAGAACTATCTGCAGGCGCGATACTTCGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 + chrX 696440 5' + FB 9 1 77.78 TACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCG:1 + chr2R 15004743 5' - BS 5049 1 50.34 AAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 - chr3R 18093361 5' + I-element 76 1 67.81 ATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTC:1 - chr2L 17180143 5' + Juan 64 1 58.22 AAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGG:1 + chr3R 26504232 5' + HMS-Beagle 56 2 68.29 AGCTTAAAATTTATGTAAGCTATTGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGTGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 + chr2L 17205129 5' + hopper 15 1 75.34 CTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chrX 7795538 5' + roo 8750 2 81.38 TATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr3L 22890332 5' + FB 39 1 56.85 ATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGAGGCTCTAGAGGAGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTTT:1 - chr2R 5531212 5' + 1360 84 1 56.62 AGGGCAACAAATTGAGCGCACTCGACGAAAAATATTCGAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3L 21380673 5' + I-element 11 1 78.08 AGGGCTTTTTAACTAACTATTAACCATCTCCCTTAACACTTACATAAAAGAGCCATATAATTGATGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCT:1 - chr3R 30607771 5' - Circe 7013 1 64.38 AATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 7719813 5' + roo 66 2 68.53 AATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTCTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3L 23146465 5' + 1360 55 1 54.11 CAAACTCAAGGGTTCCAGCAAGGTATATCATACTTTTTTGCTCATATATGTAAGGGCTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 - chr2R 21681434 5' + roo 31 2 64.38 ATAAGTGTCTTTTAATAAAGTGATAAGTTGAAAAGTTTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAC:1 + chr2R 4679897 5' + I-element 4946 1 74.83 AGCTGAAGGAATGCTCTTGGACTTAAAATTAAAAATAACCTATATTAGCGGAAAAAGCTGGAAATATTTTTGAAATCACAGATATCATATATTAGGTTTTAAATCCCAACAGAAATAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTA:1 - chr2L 15327867 5' - Juan 4145 1 42.47 ATTAAATCATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3L 4219420 5' + jockey 25 1 68.49 AATTTAAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:2 - chr2L 13844285 5' + Stalker2 7283 2 60.96 CAATATGCATTGTGGTTGGGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 + chrX 18817223 5' - transib2 2817 1 80.82 TATCAGAATTTGTAATATATAGAATAAATATTATACAACTTAAAAATCTTAGCCAGGCTGATTTGTTTTCTAGTTAAAATGGAAGGGGATGCAGTAGTTTTTTAAAAACAGGAATTTGTGGAATTTATGTATATTTTTATATTTAT:1 + chrX 19762827 5' - Stalker4 93 4 58.22 ATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGGATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCAT:1 - chr3L 21769099 5' - I-element 5282 1 65.07 ATACTTTCAGATTCACACACCGAAACAGACAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 4203475 5' - hopper 147 108 81.82 CAGCGAAATCATTTGGCGAACCACAAAATCGCATCAAAATATTGCGTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chrX 6513495 5' + hobo 31 1 64.38 AATACATTTCCATTTTTACGTCTAATATACTTTAAACTATTTCAATTCCATATAAATTTATGTGCCAATAATAAGTAATAATGTACCTTGCCCTTTATTTTTCCATATTTTACTATAATTTATGGCTACGTATTAACGATCGTACC:1 + chr3L 15709405 5' - transib2 231 1 53.42 GAAGGAAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chrX 20373706 5' + 297 26 2 68.28 ATACATACACATGGCCCTTCACCATCGACAAGCGCCATCTTGAAGGAGCACGATTCTTGGCTATTTTTTAGTTGGTTTTTTTTT:1 - chr3R 20106316 5' + Tc1-2 1388 1 72.62 GAATGGGAGTCCTGCCGTCCTGGCATCCCGGCTTTCTCGGGCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCC:1 - chrX 9947567 5' - jockey 4700 1 69.40 AAGTATAATGATTATGACGTGCTAGAAGCACGAAGGACGTCATTTGCGCCGCGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTCAAGCTTTTATAGTGCCTGAGATCTCGACGTTAACATGGACAGACGGACATGGCTAGATCG:1 - chr2R 5182973 5' - INE-1 113 1 70.34 AAGCTGGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 + chr2L 6174047 5' - I-element 5300 1 54.11 CTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr3L 10731907 5' + 297 6607 2 62.07 CTATTCTATTAAGCTTTTTAAAATGAAATTAATAGTTTCAAACGACGCATCTTCCAACTGTTTGAATAGCACAATGCACTCTGATACGCGTGCTACCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chr3R 28553009 5' + F-element 44 1 57.53 ATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACC:1 - chr3R 27083132 5' + jockey 4583 1 53.79 TTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3L 20898627 5' - roo 9012 2 60.96 AAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3L 2990012 5' + roo 8749 2 78.08 TTTCAAATTGGCTTCCACATCCATTTCCATGCAAATGCATGCAGAGCCCCCTTAGTTTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCAACCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGCTTATGCCTTTATTGATGTTATG:1 + chr3R 15864688 5' - R2-element 3394 1 58.22 TATAAAAGTTGTGTCTTTAACTAAAATCGTTAAATGCTAGCATTTTCATAGTTTTTATGCTCACATTGGCTTATTTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGAGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 + chr2L 672638 5' + P-element 98 1 63.08 AACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAA:1 - chr3R 17673833 5' + FB 70 1 65.75 CATTAATATTTGACAGCGGTGGCAGAACTTTCTGCCCAGGTATTTATACAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAAATTTTTTT:1 - chr3R 3468551 5' - Stalker 6764 2 67.12 GGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 47107 5' + roo 8731 2 69.85 GTGGTCCTGCCAGAGATTAAAGCTACCCATATATATATTTTTTTTCCTTTTCAGCTCTGGGAAAACCTCGGCGCCCCAAACTGTGCTGCGGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTT:1 - chr3L 13590975 5' - I-element 5149 1 65.07 AAGGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACG:1 - chrX 16946694 5' + FB 89 1 79.45 AGCACTGAGTCCTCTTTGTATCTATGCCATAATATAATTCTAACAAAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAGGTGCAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGTTAAAA:1 - chr3L 8312975 5' + Porto1 117 1 72.60 GGGAGAATCGGAAATTGAGAAGCACGTGGCTCCCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3L 2543799 5' + Tirant 12 2 65.07 GTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr3L 24934424 5' - HMS-Beagle2 279 2 64.34 TTTAGAGGAGCAGTTGGAGCACTTTCTGCCAGGTCGACCACCCTAAGCATGTAATGAAGGCGTTTCCAGAAAAAACGGTCGAGCAAATTGCGGGAGTTTAATGCTCGATATCTCTTTGCGTTAATATTATTACTTTAATTATTAGG:1 + chr3L 13745224 5' - flea 4988 2 67.12 ATTGTTTTCTCTTTTTCCGGTTAGCTACTCGCATTTATTTGTATCCTTTTTGCTGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chrX 15357818 5' + hopper 3 2 83.56 AATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGGGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 - chr2R 5479974 5' + F-element 86 1 66.91 AGTCTTGACTGAAATACGTACTAAAAATCATATTAAGTTAAGATTTTCTGTATGAAAACAAAAAACATAAATTTGATAGTTTACGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGC:1 + chr3L 1268820 5' + 1360 3246 1 54.11 TATATATATATATACATATAGCTGTAGATGTATCTGTATCTATGACTACAGCTATATGTATATATATATATAA:1 - chrX 11978484 5' + 1731 4411 1 49.32 ATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:2 - chrX 7795609 5' - roo 343 2 62.33 CCTTTTTTTAATACCCTTGACTATTTTCTCTCTCTGCTGCAACAACAACTAAGCAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGT:1 + chr3R 29690703 5' + I-element 5258 1 57.24 ACAGCAATTAAGCACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:1 + chr3R 17673698 5' + FB 14 1 76.71 GATTAGGTAGAAGATACGGTTCGGATAAGTCTGCCAGCTCAGTTCGCTGACGTTAGGCGTATCGATATCCTGGTCTTGCACATTTTCTTCGTTTTGGTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAAATATCGCAACAA:2 + chr3R 31803107 5' + Fw2 3720 1 73.29 GGTCGAATTTAAATTAAATTCAACTTTTTTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACGGCAATA:1 + chr2R 6847941 5' + Doc 482 1 76.69 TATAAGTATTAAAATATTGTTTACGTCTACAAAAAAAAACTTTTTTTCTTTGTCCTTTGAGCGTTTTTAGGGCGTGGCAACATGCGTCTCTAGAATCTATATGCTGAACCCTTTCGCTTTTATATTTCCTGAGATCTCGA:1 + chr4 201696 5' - INE-1 146 1 62.14 CTATCTCTATGGTTAACGCTACTAGGCTTTGATTTTCTTTCGCTATTTCTACTAGAATTATGTTGCTTCTGATGTTGCTTCTGTTGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGGTTTTGTTTTGTTTAGCTT:1 + chr3L 8160783 5' - Porto1 251 1 63.77 GGCTTCTATGTGGCTGAACAAATGCTGTGTTGATAAACGTTTTCCAAAGCAAATTGTAATGTTCAAAGATAGTTTACTGAGAAAACGTCATTGGAAAATAAAAGATATATATTTTTTTTATACATATTTTTTTTTTTAAATATTCT:1 + chr3L 3435106 5' - TART-B 10507 2 34.93 GATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTG:1 + chr2L 13556356 5' - transib2 2746 1 71.92 TACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr4 303820 5' - pogo 2045 1 57.53 AAACCCCACGGGAAACGGCTCAACTGAGCATGCCCACATCAACCCTGGAGTTGACCAGCAGGAGAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATATAATGTCTTTACTGATATACTTTACAGGTATAGTCGGATATTGTTTTCGG:1 + chr2R 557131 5' - Ivk 360 1 71.23 AGAAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 15790795 5' + roo 13 2 67.12 GCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGGGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGC:1 + chr3R 1267677 5' - accord 229 2 53.03 ATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCGGTATGGTCCAGAGTTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTACATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTATTATAAAATTGATCCTATAAATAAAAACCAAAA:1 + chr2R 10161821 5' + transib2 94 1 71.83 ATTATAATTATTATTATTTTTATTATAATTATTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAG:1 - chrX 2961929 5' - Copia1_DM 133 1 47.95 ATTGCTTTGATTTTTGTTTTTATTTTTTAGGTACATCTGCAGGTGAGTATTGTGTTTGTATTGCATTGTTATTTGTTTTAATGATTGTATTAATTTTTGTTTTTTCAGGTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAA:2 - chr2R 9278230 5' - TAHRE 10413 1 36.99 TGATGAGACATCGCCCACAGACAGTTTGGTCAGCAGCACCGAAGATTCCGAGGAGGCAGGTGGCAAGTTGCAGAAGCACAAGCTCAATGAGGAGCGTCAGCAGAAGGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACC:1 - chr3L 9747878 5' + I-element 4952 1 80.00 TAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2R 11164526 5' + roo 29 2 62.96 AATCCCCTATCGAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:2 - chr3L 14094716 5' + I-element 29 1 64.38 ACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGC:1 + chr3R 15724319 5' - Juan 4137 1 69.86 GAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGCGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCAAGA:1 + chr3L 22400296 5' + 1360 95 1 79.86 AGTTGGCTCTCATCTGGCTGGCTCCTTCTCGCGCGTCAGCTGAGCGCAACAGGTGAGAGCGTGCACGTAATACATAATACCCATTACCATTACCGCGTGGGGGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAACCAAGTATTAG:1 - chr3R 7162758 5' + HB 1329 1 65.75 ACAAGAGTTAAAAGTTAAGCGTCTCTGGTGGGAAAAAATTATACCAAAATAATTTGCATATAAATTATGACTGAAAGCGTTTTGGAGCCAAAAGGTGTCAACTGGTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAA:1 + chr3L 9201176 5' - mdg1 7038 1 69.86 TCTTATATAATTTAAACGTTTATAATAAGAACAACTATTCTGAGCGCAGAAGGAATCCTAAAATAATGATATTTTATAATTATTTTTTATATCAACAATATAAGGAACGCACTGTTACCTATGTGGC:1 - chrX 5672206 5' - jockey 4964 1 42.52 AATAATAATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTC:2 + chr3R 556396 5' - Juan 4133 1 73.29 CTAACATCGATCTTGAATCCTGACCCTTCATTAGCATAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAAT:1 + chr3L 7338285 5' + Doc 4553 1 71.54 ACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr3R 4964121 5' - roo 8983 2 80.14 AATAAAACGCAGGAAAAAATGAGAGGAGAATAAGAGAAAAAACAAATGATTTTATGACCACAACTTAAGTGTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTT:1 + chr3R 30744266 5' - transib2 115 1 52.05 ATAATATTCTAGAGTCTTTGGTAATATCTGTGCGGATCATCAATTTGGATTTCGCGGCAATATAGAACAGGTCTACAGACTGGTGAAACATATATTACAGACTTTCGACTCGAGTACTCCATCGCTGTCTTT:1 - chr2R 5876923 5' + Helena 372 1 87.88 AATGGAGGTGGGGCGACTTGGAGTCATCGATTTTTTATTAGTATTATTATTATTATT:1 - chrX 7576400 5' - mdg1 37 2 89.47 CTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chrX 18396187 5' + roo 55 2 58.22 AATGCCTGCTACAACAGTTTTTATTCCTTCCTCCTTTTCTCTTTTAGTCCTTGCTGCATGTGAGTGTTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTGCGTGATTGCGTTG:1 - 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roo 8650 1 67.65 AGTTATTTTATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGA:1 - chr3L 11257223 5' - HeT-A 6045 1 45.21 CGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATCACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2R 13931525 5' - P-element 2870 1 67.89 CTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:2 - chr3R 4964184 5' + roo 8736 2 71.92 AACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chrX 9410549 5' - I-element 5279 1 68.49 ATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGCGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr2R 4606293 5' + 1360 60 1 61.15 GAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGA:1 - 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roo 365 1 55.48 TTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATC:2 - chr3R 10270641 5' - Juan 4130 1 70.55 TTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chr2L 13556319 5' - transib2 2784 1 57.93 ATTTGCAGCTGAAGACAAAAATGGAAGAGGCCGAGCAGGAACGGCAGAACGCCAACGAACGAGTGGGCATACTCCACGAAGCCCTAAAGCAGCTACAGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 - chr3R 15364911 5' + flea 4809 2 73.10 TAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chr3R 4860424 5' - Transpac 5187 2 52.99 GTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTGAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTATACGCAATTTTTTTTTATAAAATATAATAAA:2 - chr2L 22150619 5' + S-element 95 2 83.56 TGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - 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chr3R 8793156 5' + 412 58 2 61.15 TAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chrX 8437719 5' + P-element 94 1 20.55 TATTAAAAGCATTTAATTATATACATATAGTAGCATATGTGCCATACACATAATCATAGAATGCCTTGGGATATAAGTCATAAATTCAAGTATAACATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCTAATG:2 + chrX 17607933 5' + Quasimodo 157 2 68.28 ACTTCTATTACCATAAATGCCTGAGCCTTGGTACGTGTAAACATTTGGCTGAGCCTCGGCAAGTACCTTTGGGTGACAAACCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAATT:1 + chr2L 4618309 5' - pogo 2015 1 53.42 TCGATCGCTACTTCTTTTTTTTTTGGAAACATTTATTT:1 - chr2L 14082153 5' - FB 476 1 89.47 GCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTAC:1 - chrX 3431954 5' - Ivk 5327 1 60.77 TGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr2L 15936784 5' - copia 5078 2 70.55 ACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCA:1 - chr3L 20711680 5' + jockey 4839 1 71.23 AATAATAATAATAACTATAGTAACCGTGGAGGAAGACGAGGACAAATTAGTAGCGGCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATTCATGGGGTTGGCACTAGGCATTTGAACTTCAACCCCGACGG:1 - chr2R 20180364 5' + Porto1 2 1 69.40 GTTTATGGGTATCATAAATTGTTGTTTGCCGCGAACCTGCGCGACCCTTGGGCTTTTCACATGAGATTTTTCCAATATGAAGAGGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAG:1 + chr3R 30667221 5' - Stalker2 7274 2 74.56 GGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 + chrX 18817244 5' - transib2 2813 1 75.19 AGTATCTATTGTTAACTAATTTGCTTAATCCAAATTGGGAATGATTGCAAGTGTTCCAGCAAATGATTTCAACTGGTGGTTATAGCTTATTAATTGAGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAA:1 - chr3R 13821779 5' - S-element 387 1 57.53 GGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr3L 22890340 5' + FB 27 1 59.52 AAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - 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Cr1a 157 1 78.08 GAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 12249885 5' - roo 9006 2 69.17 TGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:2 + chr2R 21410846 5' - Burdock 214 2 56.16 TCATAGTTTTTGCGTTATAGCGTGGTTTAACTAATCCGTCCGATGATATTCGATTCGGTTTTCTTAATATAGGAAGTAGAACAGTTGCGTCAGGAGAAGATGGATTAAATATATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAA:1 - chr3R 10104847 5' - rover 7291 2 71.23 AATGCATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 2989891 5' - roo 392 2 73.29 GGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chrX 20373697 5' + 297 36 2 61.64 TTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTGAACTTTTAAAAACTTTGCTTTTAATTTTATCTTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAAT:2 - chrX 8976036 5' - HeT-A 6043 1 47.95 AGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3R 15072636 5' - pogo 2085 1 60.81 ATTTATGACTCTTTTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3L 5489831 5' + jockey 15 1 72.60 ATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3R 10931627 5' + 297 6598 2 60.19 ATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chrX 12986615 5' + roo 8742 2 72.60 ATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACTCGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAGAAGAAGACACCGGATGTGACTCGGAGAATTCAAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTCTTGCGTCC:2 - chr2R 1005988 5' - Q-element 428 2 59.59 CATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - 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1360 3327 1 64.38 GTATTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 + chr3R 11186527 5' - BS 5042 1 50.68 ATTATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATT:1 - chr2L 4034963 5' - HeT-A 6019 1 55.48 AAAGGAACGTTTAAAACTGGAAGATCTGCCGGAGATCGCATTGGAGGAGGTGGCCCAGCACGACAGCTTCGACGATTGCTGGCACACGATTAAAAAATATTCTGATCTTTTACTTATGTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGAT:1 - chr2L 17591995 5' + INE-1 300 1 56.16 CTTGATGCCATCTTGTTTAATTAATTTGTGAAGCGACGGCACAAAAGGAAGCACAATTTCCCCACACTCACTCACACACACTCACACCTCAGGATATGCAAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 21008320 5' + F-element 4686 2 77.34 CACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr3L 16033409 5' + Doc 82 1 71.03 ACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTGTCACAACGCA:1 + chr3R 11040016 5' - Bari1 1697 1 75.19 GTCAGGATCAAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3L 5881560 5' + pogo 46 1 51.37 AAACAAAACTGAAACGAAAACAAAGAGGCTTAAAATACTATTTAAATTAAGAAAATACAGTGCGATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3L 13836736 5' + 412 7078 2 48.63 CGGTTAGAGGTTGGGGGTAAGGCGGGGCAGTTTTGTGCGGGTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAATATGGGTCAACATGCGCTGCGTCTTTGCCGGTAAAATCTGTATGCTAAATCTCATCCTTCTGGCTTTTATAGGTCCTG:1 + chrX 19084603 5' - INE-1 155 1 79.45 AAAAAAATAACTTTTCGTTGTACAAAAAAGTATGATTGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGG:1 + chr3L 24766090 5' - I-element 4993 1 66.36 AGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 + chr2L 17005680 5' - Stalker2 7613 2 52.05 GTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGA:1 - chr2L 11839713 5' - mdg1 7362 2 78.77 AGGATTTATATGTACATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCCCACCGTGTCGATCTAAGGCAATTTGGTAACTCACGCAGCTGTACAAATTGAGTAGTGAAAATCATTATGAGTGACGCCGATATGGACGGACGGACGA:1 + chr2R 981775 5' + micropia 424 2 54.79 CCTAAGATCCTGATGTGTTACTTTGACCTCCTCCTTAACTATTTTGAGTTCATTACTCTCATCTTTTTCTTCACTCTTCAAGGTTTCTTTTGTTTCTTGGTGTGAGACCAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGA:1 + chr3L 14508569 5' + transib2 331 1 73.29 ATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 3920574 5' - roo 9002 2 69.29 CGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCCCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr3L 22890347 5' + FB 17 1 63.30 GGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 4341250 5' - roo 9021 2 52.05 ACATTTAAATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTA:1 + chr3L 17940029 5' + 1360 7 2 65.07 AAATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:3 + chr3R 7719679 5' - roo 9052 2 71.92 CTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:2 - chr3L 20898652 5' - roo 9037 1 62.33 GTGTATTTGTACAGAGAGAAAAAATATGGGATACAATTTTGCATTTTATATCATATGCATTTTAAGAACCATATATAAAGTACAGAGATTGCATTTAATCACTTTTGTAAGCTAGTTGTATTTATTATTTTTTTTTATTAAATTTT:1 + chr3L 11896838 5' - TART-C 11096 1 68.49 GGTTCAGGGAATTCAAGTTCCTCGACCAATTCTCCCCATTCTCACTGGGACGTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 + chr3L 22760316 5' + F-element 96 1 68.49 AAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 11062824 5' - roo 347 2 60.58 GCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAG:1 + chrX 14317413 5' + 1360 94 1 78.77 TGTTGCTCCAAAATTCGTTGTCCTTGCTCGTTAACTGCATTCTTTGGACTATCTTTCAATTCCGTTTCGGTGGTATTGTTTTTAGCTTAGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAATCAAA:1 - chrX 3463995 5' + 1360 489 1 63.31 CTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGGCTTAACAGCGGATTAA:1 + chr3R 27405939 5' + diver 35 2 60.96 GGTTAAAATAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 21224507 5' + roo 8694 2 65.07 GTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAAAAAAAATAATACCTCCTAAAACAATGGGGGTATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr2L 12984222 5' + hopper 59 1 47.95 ACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 17809295 5' + jockey 12 1 76.67 TGAAAGTATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3R 23295634 5' - P-element 2885 2 55.48 GGACAAACGGCCAGGATTACGTGCATATAAAAAAAATGAAGAAAAAAAAGTGGAAAAAAGATGCAAAGAAATTCAAGGAAGATTGTATTCAAAATATTAAATTGCGCTCTGTCCGCTGGCGTACGCTGAGAGCGTAAGGAATCTA:1 + chrX 12527600 5' - 1360 3284 1 64.14 GCGTGATGATAAATAAAAATAAATACAAAGAAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAGGAAAACGAA:1 - chr3R 16402229 5' + Doc2-element 231 1 54.29 CTGAGAGACTTTTTCACTTATACTATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGG:1 - chr2R 5303188 5' - FB 232 1 69.86 CAACAGCAAAATGCTTTTATCTTTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAA:1 + chr3R 24381250 5' + Juan 4114 1 79.31 CTATCATATGTAAATATTTTATTAAATGTATAAATCAACGCATTGCTCTAACGAACTGTGCGTCGATCCTCTATCTCTGTGGTTTTACGTTTGGTACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGTATTG:1 - chr3R 5364472 5' - HB 470 1 68.89 CAATTAAACAAAATGGGCCTTCTGCAGGGCTGGATAAAATGCATGAGAATTCCTTCAACTTAACATACTAGCTTTTGGAAAATAAAACGAGCCTCAATTGAAATTGTATTTTTTTTAAGATTTATCGCGGAGGTATGGAAATCTTC:1 + chr2L 14537514 5' - R2-element 3562 1 78.77 CAGAAGAAGCCGCCTGCTGAGCTTGAACATCAGGGCAATTACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAA:1 + chr3L 19046155 5' + I-element 5054 1 72.41 ATTCTCTATAGGTCTCCTCTGGTCATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAA:1 + chr3R 2522262 5' + Tc1-2 91 1 50.00 TGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 + chr2L 19573656 5' - Juan 4172 1 50.00 TTTTCCCCCAGCGAAACTGTCACAATTTCAATTCGAATCCCACTCAACTGACAAAGCCAAACGGTCGGATATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTGCCATAGGTCCATATGGGTTT:1 + chr3R 10076286 5' - Doc3-element 4312 1 59.02 GCAGCTTTGTGGTTTCACATGGTGGCGCTGTTCAGTCCGCCATTCACATCTTTTATTTTGCGCCTGTTAAAGTAAAAAATCGGACAGGCTACAACGTTGTTTCCGACAAATATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTTACACACTATAA:1 - chr2L 20118569 5' - S-element 1705 1 71.23 TTTTAAGCATGTTTTCAGCGCCAATTTAGAAAGAGTACATAAATCCCCTTAACTAATAGACTTTTTCTAACCAGCTTCTAGTATCGGAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCCTGTT:1 + chr3R 9171997 5' + Circe 7116 1 56.16 GTTAACATTTAAGTTGGGTTTTTTTCTATAAGTAAATGTTAACCGTCCTAGCGGCCTAAGTTTGTTAAAGGCATTCCCTAAATATCTGCAGTGGCTCGACAAATATTAATAAGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGG:1 + chrX 22436145 5' + 1360 2979 1 75.00 AGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 15882600 5' + jockey 86 1 69.18 CTGCAACTGCAACTGCAACTACATGCATGTCTGACTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCAAAAGGTATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCGCCTTCATTTTCTTGTT:1 + chrX 10247137 5' + gypsy12 10043 2 61.38 AATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGT:1 - chrX 5323316 5' - Juan 4150 1 56.85 CAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 13158627 5' - roo 9024 2 52.41 TATTGGAGTTCGAATTGCAATTGAGATTGGTTGCACTGCATAGTGGGCTATGTGCACTGAACAAAATATGGTAGATAAAAAAATGTTATAGTATGGCTATATGTTATGTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTAATTAATTTCTTA:1 + chrX 20861327 5' - jockey2 3404 1 46.58 TAACAACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGCGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACAGATGTATTATGTATATATAGAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATAC:1 - chr3R 22590622 5' + rover 16 2 68.53 TGTGTCTTTTTGTCTTCGGCAAGTCATTCATGTGTGGGTGGGTTGTGACAGTGTGTGTGTAACTGGGTAATGCGTCTCAAGGACCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chr2R 19941130 5' - hopper 1379 1 43.15 TTGCGAATATGCCGTACACACGTATTCGTGTTAACAGTTAGCTCTGCCATTGCTATTGCTTTGGCTATTGTTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTAGTCGCCGTCGTCGTCTGGCTACAGGTTGTTTTTCGAATTTGTTTATTTTTT:1 + chr3L 5625316 5' - transib4 2539 1 69.66 GTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACA:1 - chr3L 3501868 5' - Bari1 1702 1 74.47 AGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACAT:1 + chr2L 18212129 5' + Quasimodo 37 2 62.39 GTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chrX 6513450 5' + hobo 68 1 68.84 CTTACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 - chr3R 4683021 5' - Burdock 227 2 66.44 CATGGTGATGGCGCCACCAGGTCCGGTAACCATTCCCCCGCAATCTAGAGGTGTAATAGAGATATGTACATAAGCATTTATTTATGTGCTCTTGCATCATGCATTGATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1 + chr3L 8354567 5' + Tabor 33 2 72.60 GGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTT:1 - chr2L 7618572 5' + X-element 4440 1 64.76 CGTGTGCGAGCGAGACGCCAGCAGTATTGCTGCGCTGGAAGTACAAGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 13875158 5' - P-element 2847 1 57.34 CTTAGTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTATACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGATAG:3 + chr2R 16193768 5' + INE-1 547 1 47.26 AGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr2L 3234024 5' - roo 8980 2 80.14 ATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chr2L 71147 5' - 412 7516 2 62.32 GTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTT:1 + chr2L 11298056 5' - I-element 5280 1 72.60 ATAAGATCAACGTGTGAGCCTTTGCCATGCTGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAGGCCACCCTT:1 - chr3L 1692126 5' - blood 7334 1 52.74 GAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATAATAAATAATATAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGGATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTATCACAATT:1 + chr3L 23688541 5' - Quasimodo 7290 2 74.66 ATTCGTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chr3R 12949123 5' + Juan 44 1 45.21 TATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAT:2 + chr3L 19454888 5' + mdg1 7062 2 67.81 CAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATA:1 + chr3L 15913864 5' + jockey 4836 1 71.23 AGCGAAAAAAATTTTTTAATATTTAAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAG:1 + chr2R 2590703 5' - HMS-Beagle 184 2 60.96 AATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAA:1 - chrX 20999580 5' + BS 68 1 68.49 TAAAAGTTTCCATTGCCGAAGTTTATTTAAAAACAAAGTTTGTATTAAAAACCCATTAAGCTACAAGAAAGGAGGACTGAGTCCCACTGGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCAACAG:1 + chr2R 1983388 5' + G5A 2600 1 62.31 CTTGTACCTCGTACCTCATCCATCGCAAATAGATCGACAATCAGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 17077078 5' - 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P-element 2797 1 24.66 CTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chrX 661956 5' + 412 7103 2 55.64 AAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCTGACTATCAGATGCCCGTTACTCAGCTTGTG:1 + chr3R 2527715 5' - INE-1 541 1 44.83 TAGCTGATAATATTCCAATAAATGATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCCCATCACTTAGAAGGAAG:1 - chr2L 9010198 5' + G2 2693 1 75.34 TAATATATAATATAAATATACAATATATATACACAGGGTTGAAGTAAGGTGCAATAATATCTAATAAATTTAATATCTAATACATTTTTAAATTCCTGCGTAACAAACTTTCTAATTTATTCGTTTTTTCCTTTTTTTTTAAATAT:2 - chr3L 7611522 5' - TART-B 10631 1 76.71 AACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTCATCTCTTCGTGTAGCAG:1 - chr2L 11357900 5' - blood 7305 2 72.60 ATAACATCGTCTTTAACGCGTCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTT:1 + chr2L 22328989 5' - invader2 4732 1 48.97 AGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 + chr3R 4217684 5' + 297 6643 2 73.29 CTTACGCCATGACCTTCCACCGCATTTTTTACAAATTTTGAAACTTCTTGTCGGAAAATTTGACTTTCGGATCTCTTGATTTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTCGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACA:1 - chr2L 21682874 5' - HB 1314 1 62.33 GGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAGAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTTATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGG:1 - chr3R 11040164 5' + Bari1 26 1 58.62 ATGAAAAGAGCGAGCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr2R 8735727 5' + mdg1 8 2 77.40 GTACTAGAAATTACATTTGACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18281811 5' + Doc 8 1 78.52 ATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 + chr2L 9782089 5' + P-element 82 1 29.45 AACAGAGGAAGAAACATGGCGAAAACTAATGATTGAGAGGAGTGGAGTCTAGAAACCAGCTGGAACTGCAACGCATAAATGAGAGACAACTACTGGTCCCCCCGGAGAATGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAA:1 - 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hobo 2891 1 51.03 ATTCCACCGAAAAGCCACAAATATTTTCGTGCAGCAAAGAATTTGGCAGAAGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chrX 22840435 5' + copia 22 2 68.49 AGAAGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGCTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 + chrX 22840482 5' + copia 4938 2 64.38 ACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2R 9871058 5' - roo 8986 2 80.00 GAATTATTGATTTGAATGCTCTTCAATCTGCTGCCCTGCTCATTTTTCTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTTTAATT:1 + chrX 6452155 5' - Doc 4700 1 66.67 CAACACTTTCCACTTAAGTAACCAAAATTAAAGTAAACACAACCTCCATTTCGAGACCAAGCCAGGGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATACCTT:1 + chr3L 26015496 5' + invader4 224 2 53.78 GCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2R 20010178 5' - Juan 4171 1 54.79 GAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr3R 14980379 5' + roo 8755 2 80.14 AAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTGGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTCCGTCAACTTAAGAACAATTA:1 - chr3R 25186432 5' - invader4 2671 1 52.41 AACAAGGCAACAAAAGTCTCATTACTTTTACTTGGCAAATAATGAAGCTAACAACAAAACAGAAACACACACACACACACATACACTCGCACACACACACACACACATTCACTCGCACACACACACACACACATA:1 - chrX 7770419 5' + accord 182 2 68.89 AAATTGATTGAACATTAAATTGAGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chrX 18009890 5' - 412 7528 2 52.05 CACGGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 + chr3L 12315731 5' + transib2 70 1 65.75 AGGTAAATGCATCTTTTATGATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGAAATATTTAAAAACACCAACCC:1 - 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chr2R 12472100 5' + transib2 82 1 73.29 ATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chr3L 21380604 5' + I-element 80 1 71.23 AGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 27160174 5' + 412 41 2 54.07 ATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 + chrX 14450394 5' - hopper 1393 1 56.48 GTTCGAGATACAAAAATTATCTAATCATATTCGATCCGCAATACCAAATAGAGCTGCATACTGACGCAAGTTGTATTGGGTATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTT:1 + chr3R 7757716 5' - Circe 7396 2 76.71 ACCAACTATATTTAATTGGTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAG:1 - chr3R 16533720 5' + X-element 4405 1 34.25 TAAACAATCAAAAATTATTTATTATACACATAGTTTTATATTCATTATTCAGGTTGAATAATCAAATTACCATAATAAAATAATTATAAATTATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA:1 + chr3L 16013267 5' + mdg1 7067 8 40.41 GGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:2 - chr3L 19455003 5' - mdg1 337 2 73.29 ATATATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGAAACTGAAACTGTTAGAGAGTTGTTATGAAAAAAAAACAGTTTTAAT:2 + chr2R 15330152 5' - looper1 1624 1 82.19 ATATATATGTGTCCTTTGGATTTATTTTTTGTGAAATAAGGACTCGAAATATTTTGAAACCAATCAAAGCCTGTAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGCCAACCCGGGATCAAGCCCTAAACCAACAATTAT:1 + chr2L 3044456 5' + I-element 167 1 55.48 TTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGAC:3 - chr2L 16539744 5' + Juan 4089 1 54.11 CCAGCTCCCATCAGCCTGCCCAATACCATATCCATAACGAGCAGTTCCGGAGGAGCCCCACTTAATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCA:1 - chr3L 2722838 5' + I-element 5058 1 60.18 GTGAAGTGACAGTCTGCAGACTTAAACGGGCTTATCAGAAATTCTGATAATCAAGGATTCGCCACTAGCTGGAATCTGATATCTTCATCTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTG:1 - chr3L 3528121 5' + Porto1 39 1 73.10 TGAATATCCTTTATATGCCCATTATTCTACCTTTTTCTTATTAGCTAATTTATGGCTGAATTGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGC:1 - 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chr2R 4350443 5' + Cr1a 103 1 74.10 AAATATATATTTCATAAAAATACTAGTAGAAAATAATAATTTATAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGA:1 + chr2L 22929234 5' + 1360 437 1 65.15 AGGTGTAATGGAACCATAGATTTAGTAACAGACCAAAAACCAATAAAAATCAGTGATAAAATCCAAGATTACAAAAAAAAAATACTAATTATAAACTAACCCACCACGCCCAAGCCACAAACTCACC:1 - chr3L 27612954 5' + HeT-A 5927 1 51.97 ATCACATGCTTCGTTAAAGGCCTATCAAACGGAGACTTGAATTCAAAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACACCCACGCCTC:1 - chrX 585781 5' + Tirant 8122 2 76.71 AACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAAT:1 + chr3R 19449945 5' - roo 290 2 72.73 AGATGATTCGTGGTGGGATTTTCTGAAAAGAAAATTCGTTTAGCTCAATAAGATCATTGTTACCGTTGCTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTT:1 - chr2R 23684248 5' - Bica 445 1 60.27 AGTTTTAAAACTATTTTCATGAAAATTTCTTTCTTTTTTTGCACGACGGAACTGATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 5151353 5' + roo 8695 2 61.64 ATCATGTGCGGTCATAAATCTGAGAACGCAATCAGTTCTGGCCGGCTCCCCTATATATTCCGGCCATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCAG:1 + chr2R 11794940 5' - opus 7460 2 56.94 ATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - chr2R 6847811 5' + Doc 63 1 75.45 CCGCATGGCATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:1 - chr3R 23491964 5' + transib2 55 1 53.42 TAAAAATAAGATTTAAAATATCTTAATCATATATTCAAACTAGCTGAGTAACGATTTCGTGAAGTATGTATAGTATTGTATGTGTAATAAAAAAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr3L 23175349 5' - INE-1 546 1 89.04 ATTTTTGCGGTGGACTGACATTTAATTTAAACACCCAGAATGGGAGTTTAAGAACGGATTAACAGAGATCCGTTTGCTGAAAGCATTCATAATTTAGACCCCAATTTTTTCTTTTTTATAAAAGTTAAAAGTTTCTAAAGTTAATT:1 + chr2R 10767151 5' + hopper2 8 1 65.07 AAGGTGGCAATAACATCGTCTTTAACGCGTCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACTACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCTTATCTTTAATTAT:1 + chr2L 22328980 5' - invader2 4740 1 52.05 GGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr4 373061 5' + pogo 57 1 60.96 AACACCTAGGATAAAAGGTGAAGCCTTATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:2 + chrX 6116223 5' + transib2 39 1 57.53 TTTAAGGAATATTTTTAATAAAGAATATTTTGAAACTGAAGATATTTTGACTGCTATTCTAATGGCGTCTTTTGCACTACATCTTTCACTACTTTTTCTCTTCATTTTGAGCAATACACTTGACTTTGCTTTACTTTCACTTGCAC:1 + chr2R 8976395 5' + accord2 7269 1 71.23 AAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:2 - chr2R 14051853 5' + roo 59 2 66.44 ATAAAACATATCCAAGAAAATCCACAAAAATACTCCGAAAAATGAAAATAGCGAAGCAAACCAGCGCACTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAGTAATTTTTGGATGCTCAGGATTTATAACCTGGAAGCAATTTTT:1 + chr3L 21769843 5' - Cr1a 465 1 56.85 ATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAAAGAGATTTTTTTGAAAATTTATTAAAATTTTAATTTACATT:1 + chr2L 7579221 5' - 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chr2R 8157281 5' + mdg1 7092 2 55.48 GAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:1 + chr2R 5484776 5' + mdg1 90 2 78.62 TGAATAAATCATTATTTATTTTTGTCGGCTCATGTCGAAGTGAGTTGCAAGTTAGGCAAAAAAGGTGATATCAAGCTGAGCTAAATTTATAATCGATCATTGATGGAAAAAATGAAAAAATGGATGAAAATTGAAAAAAAAAAATA:1 - chr3R 12518597 5' + TART-C 11094 1 78.08 GTTATTTTTACAGCTCCTTGAGCCACTGACCAAATTTTCCTTTTGCTTTCCTCATTTTTTTTTCTTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCT:1 - chrX 15439914 5' - I-element 5024 1 55.48 ACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3L 8959680 5' + 1360 73 1 69.18 TAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3R 5769038 5' - roo 318 2 78.08 TATTTTAAAAAGTTGTGTATTTCTTTATGAATCATTAATAAAACCCAAATAACACAAGGAATATTCCCTTTTATAAAAAATGGCAAATACATTTATATTTTAGGATTTCAAAATCTGTACTGTTTTTTTTTTATTTTTAACTTT:1 + chr2L 19100424 5' - TAHRE 10441 1 39.58 AAATGCTATATGAAGTCAACATGGCGGATGAGTGATATGTTATCAAGAGGTTAATATTTTAAATAATAAAACGACTTTTTCAATACAACTAAAAAGGAATAATATAATAACTAATAATAATAGTAATAAATTAAACAATTTAAAAA:2 + chr3L 10619274 5' + HB 317 1 52.05 ATTGACCTTCATTACGTCACTTCCAGTAAAAAGACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTAGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAGGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGACGCATTCGCGACTTCCACCA:1 + chr3L 27349042 5' + Quasimodo 7048 2 79.45 AGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 16564608 5' - roo 390 2 66.44 AGATACTCCCGGACTCTAATCTCACACAAACAACAATGAAAATAAGTAAAATGAAAATACATATAACAAATAAATTTGTCGTGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 + chr2L 15779522 5' - hopper2 1526 1 60.27 AGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCG:1 - chrX 23108329 5' + BS3 1464 1 56.85 ACCAGCTGTCCATGTAGAGTCCAAATATGACCTGTTCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGCTAATTATAAATTTAGGTT:1 - chr2L 14531977 5' - I-element 248 1 74.48 CCCACATTGTTGGCCTAATTGTTGCCTGTCAGTTGTAGTTTTCTGGCCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATAGTTGTTATATTTTTGAGTCGAACTAATATCCCGTCAGTTGGCTAAGGACAACGCTAAG:1 + chr2L 1788545 5' - 297 6929 2 66.44 ATGCATCCGTGGCAATTTGATATGGGGCTCAACATTTATTTTATTTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTAGGGGTTAATTG:1 + chr3L 18125933 5' - Ivk 5293 1 73.79 ATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 - chr2L 19924027 5' - roo 8997 2 66.44 ACCGAAAGCGACAAAAACAACAACTGATATTTTTGGGGGGCAGGGGGGCTCCGACTGCATCACCATCATCAACCGACGGACAGGCAGGTTATATACTTAATGGTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTCTGTGTACCTC:1 - chr2R 12701886 5' - invader2 4871 2 56.85 TTAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAC:1 + chrX 22596324 5' - INE-1 568 1 67.12 GTGTGTGTATTCTTTGTAAACTTTAGCACTGACAGCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 + chr2L 129035 5' + jockey 4806 1 76.03 AATATATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 + chr2L 16539601 5' - Juan 4204 1 78.08 TCGTAAAATAAATTAATTTAAATAAAAATTATGAAATTAAAATCAACCCCAATGGTCATTGATTTTAATTTCATAATTTTTTTTTAATTTAATTTATTTT:1 + chr2L 18919636 5' - X-element 4718 1 52.00 CACAGCTCATGATAAATTTACAATGCTCCGCATGCGAAGGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 31654242 5' - roo 8991 2 72.60 TATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:2 + chr3R 23639103 5' + pogo 23 1 68.49 TAAATCGTTTCCGAAGCAACAAGTGGCAGAATTGTGGCTAATAGCGAGTGAGCCCAACCCAAAACCAAAACCCCTCTATGCCCTACGACCAAAATCACTGATTCCGCCTCCTCTGGCAGCCCGGGCCAAATGGCCCAGCAGCAGC:1 - chr3R 21173144 5' - R1-2 2821 1 63.45 GAGACGCTTCCGTTTTCCCCACTTCCGCTATGCGATATCCCCCCTTTTTCTCCACTTGGCACGCAGCGGTTGTTTAAATTGTTTTTTAATTAACTGTCAGTGACATTTTCTTTTCATTGTTTTTCGCGTTTT:1 + chrX 8541027 5' - Bari2 916 1 47.73 ATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACT:2 + chr3R 23020797 5' - INE-1 550 1 62.33 CTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chrX 18010038 5' + 412 36 2 52.63 GGACATGGTATTTCAAAATACCAACTATATTTAATTGGTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACT:1 - chr3R 16533739 5' + X-element 4386 1 47.26 GTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTT:1 - chr3L 3501790 5' + Bari1 89 1 73.79 CTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAA:1 - chr3R 934264 5' - Rt1b 4713 1 42.47 GTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2L 14074557 5' + 297 27 2 61.16 TTATCCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:2 + chr3L 8959559 5' - 1360 3362 1 67.12 CCTCCATTTCAACCAGGCCCCCAAAAGGTTTTCAGGCCCCAAGCTTATAACTGTCAAAAGCCTAAATTACAAAAATACTAACTACTTTAACATTAACATTAACATTAACTATGTCCAACTCCCAAACTCACCACATGCAATGTTAA:1 + chr2R 8494655 5' + HeT-A 5941 1 67.81 ATATAGGAACGTAATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1 - chr2L 11257146 5' + rover 6978 2 67.81 CCCGGAGGAGTTCCACGTTTTTTCTATCGATATCCCAGAAGAAGAATGATGAAATTTCGACTTCGAATTCACACTAGCGGAGTAACGGGGATCTGATAGTCGGGG:1 + chr3R 19964250 5' + INE-1 553 1 79.05 TAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 11062811 5' - roo 8989 2 71.92 GGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2L 9636152 5' + 412 69 2 72.31 TTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAA:1 - chr3L 13365815 5' - BS 5021 1 73.19 AGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGC:2 + chrX 14771733 5' + BS 72 1 67.12 ATCTTCGTATCTTACAGACTTATTGCACAGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 8698434 5' + hopper 147 102 77.11 CGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGAGCTTTTCCCAGCTATAGATCGAGCTTTAC:1 - chrX 1264049 5' + Burdock 6192 2 60.96 TGGCAAATAAATGGCAACTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 5389826 5' - roo 385 2 69.86 CTTTTCAATTCATTATAGTATTCTATAAACCTAATAAAGTAGATTTAATAATGTTAAGTGCTAAAGGGCAATAATTCACAAATGGATAACCCGCGCACAAAATTACTGATTGGGTGTATATCTCTTTTTTTGATTATTTATTTTGA:1 - chr2L 12390316 5' - BS 5091 1 58.90 GGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr3L 18281874 5' + Doc 82 1 73.29 ATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGCAGACCTTAAG:1 + chr2R 16929781 5' + jockey 4530 1 79.17 AAAGTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATAT:1 + chr3R 3922948 5' + Cr1a 81 1 68.28 GTAAGAGCTGTATGTGTGTGTGCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGGACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3R 24733570 5' - hobo 2912 1 73.97 ATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 11810650 5' + roo 54 2 65.85 GTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr2L 7125728 5' + I-element 34 1 60.27 GGATTTGGGGCTGGTGAGCCCAAAAGCAAACTACTTAAAAAGAGATCGCAACTTTGACAAGAAGTGTGCAATTAGCAGTTGGGCGTCCGAGCAGCGTGACGATGGCAAAGTTGTCACATTATCATATTGGATGG:1 - chr3R 31873002 5' - TAHRE 10208 1 59.70 AAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chrX 12129401 5' - flea 4947 1 63.70 ATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGTCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chrX 18009950 5' - 412 426 2 65.93 CGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAGAAAAGATAAAACCA:1 + chr2L 4888747 5' - BS 5023 1 70.90 ATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAACGCAATTAACATATAAATGA:1 + chr3R 14860141 5' - BS 5031 1 59.59 ATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTAT:1 + chr3L 8673297 5' + I-element 59 1 59.59 GTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTAGCGCAAGCCCAAAACTATTATCATCAAAATCTTGATAAACATATATC:1 + chrX 17343412 5' + I-element 85 1 72.03 GATGCTTTCTACACTTTGACATGCCAAAAAGCCCGAATGATATCATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAA:1 - chr2R 18826358 5' + I-element 5168 1 69.86 GCTAACAACTGGCGAGGTGTTTTCCGTGGTTTATTAATTGCAAATATTTTTTTAACTTAATTAAATGATCCGAAGTTAAATGGAATGGGTTTTTCCTTTATTTTATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATG:1 + chr2R 15277250 5' - R1A1-element 307 1 60.96 ATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCTTCCAAAAAATTTAATTA:1 - chr2L 1924005 5' + G2 3014 1 55.81 TTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCT:3 - chr3L 16470340 5' + jockey 4759 1 76.71 TTTTCATCGTTTTCGTTGTTGCTCCCTGAAACGCAGTGCAAGAATCGGAGATATTTAGTTGTCTCATCAAACAACTCTCCGAAAACC:1 - chr3R 24617618 5' + Ivk 347 1 73.56 ATGTAACACGGTCAACAGGCACTTGAAAACGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTCCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAAC:1 - chr3R 7666347 5' + I-element 264 1 78.08 GAGATTCAAATGACCGCAATATTCTTTAAGCTTGATTATCTTTAAGCATCAATCAAAATAAGATTCAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGTGAGCATGACGAACGC:1 - chr2L 2325070 5' + F-element 221 1 54.79 CAGACATCTAAGATCGTGCTATGATAGGATGTTAAATTCATGAAATATGGCTCTTCCAATGAATCTGTGAGCCCACAGAAAACTGAATTTCGACACAGTAAAAGCTATTAGGTCCATTTACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGAT:1 - chr2R 23101193 5' + INE-1 545 1 65.75 GTACATCTTAGTTGAGGGAATACAGAAATATATTTTAAAAGTGAGAACTTAAATTTAAAAAATGTATGTGCATAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGGCAAAAACTTTTTGCCACGACCACTTTAACGCCCTACAACCGCCCAAA:1 + chr2R 5119861 5' + INE-1 343 1 70.55 GAGGAAAACAAGAGAATAGGCTACAGATCTCGACGTTCATACGGACAGATGGACAGTCGGACAGACGGACATGGCTAGATCGATTCGGCTATTAATCC:1 + chrX 22492837 5' - INE-1 97 1 71.43 CACATCACCGGAGCACTTTCCTCTTTTACCCTTTATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 - chr2R 3563219 5' + Transpac 31 2 63.01 TAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr3L 14720927 5' + F-element 54 1 52.45 ACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 2990021 5' + roo 8739 2 71.72 GTGTAGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 27986456 5' + roo 8715 2 57.53 AGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 - chr3R 27843244 5' - I-element 5286 1 65.75 AGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:2 + chrX 19038354 5' - hopper 1368 1 53.42 AAGTAGACTGGAGTTTCATTGTCTGCTGTCCAACACTGGGTTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 - chr3L 13365855 5' - BS 5053 1 51.37 AGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGT:2 - chrX 14722258 5' + diver 8 2 73.29 TTTTAATGTATAATTGGAATACATAATATGTATTACATGTGTATGTATGTACATATCCACGTTTTTGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAA:1 + chrX 1001678 5' + Idefix 95 2 55.48 GGTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 22193408 5' + roo 53 2 55.48 AAATTAATATATGTCGAGGGGCTGCCAAGTGTATGAGGCAAATAAATGACGGACCAAAATACACCATTGTTTTTGTGGGCGGAGAAGAAGGCGTTGTCAGATCAAAAAATAAACAAAATCCAAAATTCTATTTAAATCCTAATTAT:1 - chr3R 9476428 5' + transib4 2560 1 55.48 AACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chrX 12986619 5' + roo 8738 2 69.86 ATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 + chrX 19074742 5' + mdg1 38 2 55.48 GCAAATATCAATACTGTTGCCATTGCTATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAATATTTTTTTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTA:1 - chr2L 13585785 5' - Quasimodo 7284 2 76.71 GGCGGCTTGATGGGTGTAAACGGGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAACGCATCT:1 + chr3R 25616529 5' - roo 325 2 73.79 ACAATCGTAATGAAAAACTGATGTCAAAATACACACGGCCGCACACTCACACACACACACACACGTGAAGAGGGGCAGGATTGATGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAACTT:1 - chr2L 2538181 5' + Tc1 1455 1 56.16 ATTTTTAGAGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3R 13187544 5' - I-element 5322 1 58.90 GAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr2L 16690735 5' - P-element 2850 1 55.56 ATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:1 - chr2R 9967110 5' - Bari1 1624 1 72.60 CCAAGGAATCTCTGGAGGAAAATGTGTGATGAGTGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAG:1 + chr2L 14658174 5' + I-element 5314 1 75.34 TTAAGCCTCATCATGCCAGACCCGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATTTCAATTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 - chrX 21087655 5' - mdg3 5420 2 68.28 GTGTAAGAGTGTGTGTTTGTGTGCCGAAGAACTCTGTGATTGGCATCTATTTTGTGTGCCGAATGTAGCATTAAATTAGCCAAATTACAAAAGAGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACG:2 - chr3R 11083444 5' - I-element 5014 1 68.49 TGGGTAAACCGAACTGGACTCGTGGCTGTATTGGTCATTGATAGGTAAGTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTG:1 + chr3R 14505232 5' - F-element 4667 1 71.23 GCACTAAAGCAGCGCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGGCTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACT:1 - chr3R 27123625 5' - roo 401 1 77.70 GATAGAAAGCATTTTTATTAACTCCAGTTAGCTCATCAGAAAATCTAGTCATAGAAATTCAATTTCAGCCAAATCGCCATGAAGCGAATCCAATCTGTTCGAGTTACGGGGGTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCCTACG:1 + chr2L 1300627 5' + GATE 39 2 60.96 TAAAAAAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 + chr3R 7943733 5' + blood 66 2 60.27 ATGGCATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTC:3 - chr3R 23491960 5' + transib2 59 1 56.16 TGAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGGGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATATTAATTCATTTTTGTGTTCTTTATAGTACTTTTAGTGAAATAG:1 - chrX 10521760 5' - Tabor 7293 2 60.27 ATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCATAAACAGCACAAAACTGATACGCCCACACTTTTGAAAAACGTGTCTATAATTTTTCACATATGTATTAGTCCTGCAAATCGATTTGCCAAAAAACTCTAACGCCCTAAAACCACCCAAA:2 + chr4 71479 5' + INE-1 343 1 58.22 ACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTG:1 + chr3L 18046571 5' + roo 8687 2 66.43 GAAGACTCCTTCAAAAGTAATGGGGAATCTTCAAATCTGGGCTTTTGTCCTCTCTGCAACAAGAAACACCTGCGCTTGCCACCTCCTTTCTGATCAGGGAAATAAATCAAAATAGACAAATGGCAAATGCAAAATAGCTGGAAA:1 - 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TART-C 11097 1 74.65 CAAGTAGATGATACAACTCACAATAATAAGGCTTTATTGAAAAACGATTATGTAAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCCCTATCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr2R 3878947 5' + 1360 32 1 65.52 ACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chrX 14450376 5' - hopper 1373 2 54.11 ATTGTATTGGGAATAATTAATAATAATAAAAACATTAAAAAAAAACAAAAATAAATATAATAATTATATAAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACT:1 - chr3R 4170723 5' - gypsy9 5272 2 56.16 AGCGACGCACCCACGCAGGCAAAAGGGATCCCAGGACGAAGGCCGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCATACCGAAGTATA:1 + chr2L 8338125 5' + P-element 34 1 46.67 AGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCT:1 - chr2R 2318278 5' + ZAM 19 2 72.03 AAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAAAATTTAATACCTCCTAAA:1 - chr2L 12984247 5' + hopper 30 1 63.38 TATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGCGAAATTGAAACAAGTGTTCACACATGAACACGAATCTATTTAAAGACTTTCAATTTTGGGC:1 + chrX 21224544 5' + roo 8690 2 50.48 GGTAAGCACGACAGTAATGTAACCACCCACAAAAAAGAGAAAGAGAGAGAGATAGTATTGTGCAGTTGCATTTCACATGCATTTATTTCTTTGTTTAAGAAAAGCTATACCACTGCAGTCTTTTAAAAATAAGAAAAAAAACAACA:1 + chrX 9305967 5' + gypsy7 5011 3 67.81 CATATACACACATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:2 - chr3R 15364064 5' - flea 5000 2 76.71 CAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:2 - chr3R 24090535 5' - roo 9006 2 63.01 CTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCG:1 - chrX 19980705 5' + X-element 4522 1 46.72 ATAAGGCCTTTTATTCTAAAACTAAAACTAATGTTTTATTAAAGCCGATCGCATATTAACTAAAAAAAAGAGAGAACGTCATAGTACAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGA:1 + chr3L 19468154 5' - INE-1 532 1 55.22 AGTTTGTCTCATGAACGCTCTGGGGACACACGCTTTTGAATAACAAACAAATACTAAAAACATAACTGAATTATTTTATGGATGCTGAACAATTTCATATTATCCTAATCGACTTGCTTTTATAAAATAGGTTTTGGCCAAAAAAA:2 - chrX 7087325 5' + Transib-N1_DM 472 1 65.75 ACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr3R 17673711 5' + FB 27 1 67.81 CAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACTGTCTCCATGTACTATAATTAAATTTATAAGTCCGACCAGATAAGAGAAACCAAAAGAGAATTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAAAATTCTGCCAA:1 + chr2L 47200 5' - roo 8656 1 76.03 AATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGC:1 - chr2L 23295924 5' + micropia 4971 2 72.60 CAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr2L 7581011 5' - Transpac 5169 2 60.96 GTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCCCTTAGCTGCC:1 + chr3R 13406455 5' - pogo 2100 1 59.09 GACTTCTGACTTTATTTCTGTTGTATCCGTTTGTTTCCTCTATAAAAACCTGTTCCTCATTTGTCATTTTGGAATAGATTTTCCTAACCACCAGTTTATTAATTGGGTACTTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAA:1 - chr2R 4896782 5' - S-element 396 1 52.74 AACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGAAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 + chrX 13134860 5' + jockey 4770 1 71.54 AGCAAACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGTCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chrX 19038326 5' - hopper 1396 1 71.23 ATTGGCGCCATAATTACCGAACATTAATTGCTTGAAGAGTTCATTGTTCCAAAATCAATCCATTCACCTTATGCTACACTCTTTTATTATAGAAAATATATTTGGAATATTTTATATTATTATTTATTATTATTATTTATTATTAT:1 - chr2R 12067069 5' - flea 5001 2 80.14 CATATCAAGATAATAATAAATATTGATTCCAGTTGCCATATGCTGGGGAAAATTTGTGGGTTCATTTGAAGAAAAAGTGGCAAAAAGGTCACCAAACAATTACCTCAAGTTATTATAATTTGTTATAAACTATAAGTCTAAGATAG:1 + chr2R 10916656 5' + S2 1468 1 67.81 AAACTAATTTGGTAGGATTTTCTAGAGTTTCTTTCTTACTGCGCCCAATTAGTTTGTGCAGCTTAATAATCACTCGGTTGAGGGGGCTGCATTATAATACCTAAGTGTTTATGGATATTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATT:1 - chrX 6479686 5' - G4 3522 1 73.97 CTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 + chr3L 15913813 5' + jockey 4785 1 66.44 ATCCAAGTAACAATACTCAAAATAGTACAGATTACGTGGGCGATTCTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAAAACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTAAATACATTGTGACACTTTGTCATAA:1 - chr3L 17613151 5' + Stalker 6915 4 68.49 CAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 - chr3R 15790074 5' + flea 24 2 71.92 ATTAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAG:2 + chr2R 3564062 5' + Tabor 81 2 70.55 AAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr2L 3233982 5' + roo 89 2 78.77 AAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chrX 8092424 5' - pogo 2072 1 71.62 GAATTCCCCGACAATAACTCACTTCAGCAAATCGAACAAACCATTCAATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTA:1 + chr2L 16648847 5' - Idefix 40 2 70.55 TATTGTTATTAATTATTAGTCACCAAAATTAATACAGAAATGAACATCTAAAAATTTAAATACTGAACTCGGCTAATGCTCCTTAACGAAATAGGTACGGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACA:1 + chr2R 4774816 5' + Gypsy12A_LTR 1991 1 43.84 GGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 - chr3L 20711690 5' + jockey 4829 1 64.38 CTTTATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 - chr2R 3563189 5' + Transpac 60 2 55.86 TAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGAC:1 + chr3R 19224997 5' + HMS-Beagle 6863 2 64.38 ACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chr3R 4682998 5' - Burdock 220 2 56.92 GAACCCGGCAATGAGCGCGAGAAGTCCTTGCCCAGCTGGTAGACCTCCACCTCCATGGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGGACCTGTACTTGCGGG:1 + chr3L 2666123 5' - gypsy12 10165 2 52.68 TTTATAGATTCGGTTTTGTTTTTTT:1 - chrX 10707765 5' - McClintock 6284 2 84.00 TGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAA:1 - chr3L 23702306 5' + G4 12 1 73.29 GAAGTCCTGGAAAGCGCTGTCAGTTCTTGGCCCGAAAATCGTCTTCTAACACAACATGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACCAGCAAGCAAATTCTATTT:1 - chr2R 8296485 5' + 1360 3261 1 76.07 ATACATACAAACAATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCG:1 + chr3L 22723802 5' - HMS-Beagle2 286 2 71.92 CTCCACACGCCTGGACAAGGACAAGAGCGACGAGTACAACACAAAGCTGTTGAGAAAGACGGCGGCGCGGGATCCAACCACCACGAATAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCC:1 - chr2L 7802922 5' + HeT-A 5644 1 58.22 TATAAATATATAAATTTTTGGGTACAATGCGATTTTTAAAGCGGGTTGCCCAATCTGTAACATTATTAATTTTTAATATATAATGTATTATATTATTAATTATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATTATTATAATTATT:1 + chr2R 8186624 5' - mdg1 7069 10 48.63 ATTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3R 5769128 5' + roo 43 2 56.16 CGCATTGGCAAACAATTCGGGTTTGACCCACAACCAGTAAGATGTAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAACATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAA:1 + chr3R 14553453 5' + F-element 4666 1 69.18 AAGGCTGCTCCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGGATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTGCAAAATTTGCAATTTTTCATTTTTTTT:1 + chr3L 21834527 5' - P-element 146 1 24.58 GGGCGGAGAGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3L 4233992 5' + pogo 49 1 65.04 TAAAGTATAAGCACGATTTCCAGACATGATAAAATGAATTGCAACTCGTACTTTTCGTGTCGTCATTGCTGACAGTTTCAAAAACGCTAGTTTCCAATAAACACTAGATCAGTTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCAT:1 - chr3L 3408472 5' + Tc1 77 1 76.71 AAACACACACACACACACTATCCCACAAACACACAGACACTATTTCACAAACACACACACACACTATCCCACAAACACACAGACACTATTTCACAAACACACACACACTCTCTCACACACACACACACATACA:1 - chr3L 11247424 5' + Quasimodo 36 2 82.71 ATGATTGCCAGAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGTAATTTGAAAG:1 - chr3R 8890104 5' + FB 28 1 51.00 CATAGTTTTTGGGTAAAAGGAGAGGGGTAAATATATATATATATATATCTATATATATATATGTTATAAGAACTGACATCCACAATACGCTTATTTGGAATGCATGTTCAAATTTGAGTTTGAATTCG:1 - chrX 9622605 5' - Rt1a 314 1 73.44 AATGCAAATTAATTTACCGAACGATGCAGCCTGGCCACAGTTGAACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCTATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGAGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 + chr3L 23840718 5' - 1360 3316 1 69.29 CAGCATTTGCCTGTGTTGAAGTTACCGTTATTCACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTGCGTAGCAACTAA:1 - chr2R 6482576 5' + gypsy 7004 2 72.41 TGATTATTATTAATAACTTTACACTGATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCG:1 + chrX 190024 5' - INE-1 555 1 69.18 AAGTGCAACTATATATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 + chr3R 15054159 5' + copia 4879 2 74.66 ATAAGGGAAACCGACACAATTGCAAATGGGCAAAGGAAGAAGTTCCAAATAATGCGCTTTTGAAGGTGTTTTGCAATGAAAAGAGACAATATAATGAGGATGGGACCTCTCAACACTTTGGCTTACACACACACCCATATACA:1 + chr2L 18324514 5' + Quasimodo 36 2 73.43 ACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 3030217 5' - roo 333 2 73.29 AGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 10931599 5' + 297 32 2 60.27 CTTAGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATCAATTATATTT:1 - chr3R 17077186 5' + roo 73 2 68.49 AAGCAGGTCTTTTTAATATCAATTTAACCTTTTTCGAACCCAAAGTAAAGGTCTTAAAAATAGGTTTCTTAAATTCGAAAAATCCTACGTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAT:1 - chrX 9145615 5' + Cr1a 4095 1 58.22 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGAT:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 5320 1 76.71 GACATCGCGGCAGCACGTGGCTCCCAGATAAGATTCACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGGTTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3L 2544574 5' + Tirant 8128 2 68.49 AACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTGGCTCGGTTTAGCGAATGGGTTATACATTAAAACCAGAGATTATGCTATAGTCGTGTACCCCGACTATCAAATACCCGTTACTAAGCTAGTGTAA:1 + chr3R 24279333 5' - INE-1 538 1 75.61 AGATTTAACCCATTACAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACATTCGATG:1 - chr2L 1924053 5' + G2 2972 1 77.04 ATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1 - chrY 311343 5' + 1360 46 1 54.81 GGGTCTTGTTAACATTCGCATTTTTCTCGGAAAATTCGTTCGGCTGCAGTATAATGATGATGCTGGGAGTTGATTTCGCTGAGTTAATGCAATGTAATACTCATAAATTCAAATAATTGTACTTATATATTGCACACACTGTAAT:1 + chr2L 6373067 5' + HeT-A 5988 1 61.38 GGGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGAAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAGCTT:1 - chr3L 13294954 5' - roo 8988 2 72.14 CTCAGTGTTAAGATCAGCATTATCACGTTAAGTAATGACTTTTAACCGCAAAAATATTCAAAGTCGTAACTGAACGAGCTCTTTAACTGGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAAT:1 + chr2L 17593381 5' - Tc3 314 2 78.26 TGATGAAGGTGAATACAGAGTGCAGTGAAAATCCACAAAATGTATCAAATTGGTAGAATTTGTTAATTCTGCGAATTGTTTTGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chrX 20888249 5' - 297 361 2 59.59 ATTGAACGCAGCCGAAGGACGATGGAAAACAGCTGTCTGGGTCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chr2L 19924098 5' - roo 9068 1 73.97 CTAAATAATGTTCAATTTGAATGTTAAGTCACTCTTTTAGTGAGTTTTAGTAAGTTTTTTAAATAGTAACAAAAATAGTATTTATTAAAAATAATCTTTCTTACCACAATATACCCATATTTTCTTTTATATTCTTTTATATTCAG:2 + chrX 16879327 5' + gtwin 7146 2 63.01 TCCCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr2L 14671905 5' + FB 54 1 68.50 ATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGGTAATATTCTAATACAATTTCACGTTACTCTTTTATT:1 + chrX 4808487 5' - mdg3 210 2 60.27 AATGCCGACTGAATGAGCACAGAAAACAGAAAACAACATCAAAAATAAAATCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTT:1 + chrX 6793811 5' - invader2 294 1 65.75 ATTAAATATTTATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1 - chr2L 9247305 5' - TAHRE 10434 1 48.61 TATTACAACGAATCAATTAAATTCTTCAATTCACTAGTAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:2 + chr3R 26178318 5' - 412 7540 2 76.71 ATTATAACATTTTAAAAGACGATTGTGTACAATACTTCGACAAATACTTGCTGTTTTGCAATGAACTGGATTAAATAACCGAGACTGCCTCTCATGACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGC:1 + chr2L 14478517 5' - R2-element 3235 1 52.74 AACAACGTATATAATTAATAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:2 - chr3R 21630383 5' - I-element 5327 1 67.12 ATGCAGCAGCAACATCTAACGATCGGCAGCAACATGTTGCAGGCAAACCCAAGACTGCTTCAATTTTTAACATTTTCAATTTTATACTTGTTGATGATTTGAACAGCTGCTATATATTATCAAATAATAATAATAATAATAATGA:1 + chrX 15626626 5' + mdg1 38 10 54.48 GACGCCAAAAGGAGCCGGAACGGAACCTGATGCGCCCTGAATTTTGCCGCTACGAGTGTGACAACTTCCCGGGTTTTTGGTTTTCTGTTTTTTATTTTTTTTTTTATTCT:1 + chrX 4766666 5' - F-element 4686 7 63.64 ACCAAATACCTCGACGAAAAAATTCTGTTGATTGCCTACTAGTTGATGTCACAGAAAACAAAACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTGGATGC:1 + chr2R 25198244 5' + Bica 4706 1 60.27 AATTTCTATTATTTCTATTACTTTTCACGCAAGAGAATAATTACAGGATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGGTTG:1 - chr3R 4132260 5' + INE-1 159 1 65.07 AAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:4 - chr2R 11164538 5' + roo 28 2 66.44 AAGCCGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTCATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 - chr3R 9039057 5' - Juan 4193 1 68.49 CTCAGATCGAAAAGGGGTGTTTGGGGGTTTGAGTCGCTGTGTAGGCATTGAGATAGCTTTGCTGTCGATTTCAATAAAGTGATGAGCATACGTGTAGTGTATATTGGGGAAATGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAAAAACAA:1 - chr3R 16783970 5' + Porto1 251 1 72.22 AGTTTCTAATATATCTCTTGATAAATCATTAGGTATCAATGTGTGTAATTAACAAATTTTGGAAACTAGTTGCAACCAAGCATATTAATTTGGTATACCATGATTAATTCAAGAAAATCTTGATTTTTTTTTAAGAAAATATAAAG:1 + chr3R 14811848 5' - pogo 2019 1 86.30 GCAACTACACATTTAATCAAATATATCTTTAAAATCCCTACAGTTATACCAACTCCTTGTTCGTAGCGCACTTTAGTGAAATGTACAGCCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr3R 18067921 5' + Transpac 10 2 58.90 AATGTGTTTTCACAAAAAAAGTTAAGATCATTTAGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAG:1 - chr2R 7306601 5' + Max-element 30 2 65.07 CTGTATTTTTCCGTTCCGAATTCGAATTGATTTTAAATTTGAAGAGATTCTAAAGCGTGATTTCACTCCCTCGTTGACTTTTTTCCACGCTGCCAGCAAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAAT:1 + chr3R 15292535 5' - F-element 4310 1 71.23 GGTGGTGGCAGTGGGCGTGGTTGATTAGTTTATAATTAGTATATTTTCTAGTCTTAGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAGGTTTGTTTACGTTTAACAATTGAAATTATTTTTCAAAAAACATTG:1 - chr3R 22252846 5' - HeT-A 5799 1 78.77 CGTGTGCAGCGCAAATGAGCCGTAATTGCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 26405100 5' - hobo 2909 1 59.84 AAAATCGATGGAACACAAAGATTTTGGTATCAAAACAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATACCATTAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGG:1 - chrX 4351745 5' + G-element 4038 1 73.68 ACATTTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1 + chr3L 13836620 5' - 412 7475 2 67.12 AGATCATTTAGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTCTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr2R 7306577 5' + Max-element 53 2 54.48 TGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAAAATCAACACGAGGTATT:1 + chr3L 11844727 5' - rover 7225 2 68.49 TACCATTTGAACTGCATCGCTTGCATATTTATACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGAATACTAGATTCGTTGAACGCAGAAGAAAGCGTTTCAGACTATATAAAGTATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGGCG:1 + chr4 499653 5' + INE-1 93 1 66.44 AAAACAAAAGTACATATTTTAAAGTTTATTTCAAATATTTTCCACATAGCGCTTGATTCCTCGGACCCACAATAGTGGGTATAATAATCAACAATTTGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAACAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGC:1 - chr3L 21916313 5' + transib2 2449 1 76.71 AATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACA:1 + chr3R 10270575 5' + Juan 4090 1 59.31 AATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3L 12004237 5' - P-element 2830 1 47.95 GCCCTTATTTCGAGTCTCACATTTCGGCGATCATGAACATACCAAAGGTAGAGGGTTCATCTTCTGTAAAGGTGCGTGAACTGTCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3L 25412018 5' + 1360 17 1 58.90 AAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAACAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCT:1 + chrX 22901585 5' + 297 6736 2 67.12 AAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3R 19992752 5' - hopper 1372 1 56.85 ACCTGCAATGATTAACAAGCACAATTATATTAATTAGTAACTATCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCC:1 + chr3R 11218035 5' + copia 4764 1 53.52 ATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCGGAGTGAGACAGCGATA:1 - chr3R 30347366 5' - P-element 2783 1 14.38 GGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 - chr2L 17005785 5' + Stalker2 80 2 71.72 CCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 - chr2L 4003815 5' - mdg1 391 2 61.64 GGTTACAGTCGGCCGTCATTGTCATAGCTTATCTTTTAACCATTTCTTTTGTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCATGCTGAAAAATCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAGGAAGACTTTACT:1 - chr3R 24090592 5' - roo 401 1 64.58 GAGAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:2 + chr3R 3850973 5' + transib2 20 1 72.60 GGCAGGCTCATGTCCCACAAAAATTATATAATGACATATACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2L 22193500 5' - roo 8994 2 72.60 TTTATATACATACATATATGAGCTTTTATTTTTACGTATATGAGAAAACTCAGTGGGTGTTGGGTGTTAGCCAGAATCAGCCCTTCATTCACCAAAAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGA:1 - chr3R 8601576 5' + TLD2_LTR 154 1 63.45 GTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 - chrX 5323320 5' - Juan 4154 1 54.11 CCTATATAACCAGTAGATATAATTATGTCTTGCATGACTTGATAATTTATTTATTTATAAATATAAATTACCAATACTTTTTGATTCCCCAATTAAATTTCGCTTTGACTTTCCACTAGCTGAGTAACGGATATCTGAT:1 - chr4 1193952 5' + INE-1 545 1 43.17 ATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGCTATGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3R 29084857 5' - 412 476 2 64.89 AGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 13294980 5' - roo 9009 2 60.69 TGAACTGAACTGAGCTTCTTCGATTTCAATCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 + chr2L 12822800 5' + P-element 83 1 28.77 CGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 9298584 5' - hopper2 1566 2 55.48 GGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chrX 14450387 5' - hopper2 1555 1 54.11 AGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACATGTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAAATTTTGACTTTAAA:1 + chr2R 4188969 5' + S-element 36 2 56.03 ATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCTCTAGATCATTCGGAAGACGCATTTCAATGCCAGTCAAGATTTTAAAAGGCGACACTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2R 18511741 5' - 412 473 2 43.84 CTTCCACCCCACCACCCATCGCCACCCCCTGCAAACATCTCCGGTTTGGAGTCCGTTTCGAAAAATGCAAGCCGCAATGCGCTGGCAGTGGAGTTTTGCACATTCTAACAGATTAGGTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATA:1 - chr2L 17044637 5' - Circe 7090 1 78.08 TTTTTTTTTTTAATATTTTCAGTCCCCTTCGGCGCTGTCTTTTTTTTGTACTCTGATTTTTTATAAAATATATAGTTACAATTTATGGCATT:1 - chr2L 3701147 5' - TART-B 10553 2 67.39 TATTTGTTTATGGTAAAAGCGTTAAAATATGCAATCATGTCCGCGCATTCTTATGATTTTGCATTTCAATGCATACTATTTTTGTGGCACACAAACGCATTACTTAAACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1 - chr3R 8073473 5' + I-element 4979 1 75.34 TGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3L 7889646 5' - roo 335 2 68.28 ATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3R 23295614 5' - P-element 2872 1 43.88 AGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3R 4461012 5' + blood 54 2 55.48 CGCCAAAACAGTATCAGCGAGAGATTGAGATTAGGACTCTCTTTTAGGACCCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGGAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTTAAATTAAAGGTTTTTTGCTTAATTAAA:1 + chrX 15076765 5' + S-element 68 1 90.41 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGAGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGT:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 5367 2 66.90 TTTCATAAATAAATGTTTGAGTTATGTAGAAAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGGCGCCCGAAC:1 + chr2R 22868083 5' + HMS-Beagle 256 1 77.70 CGAAAATGTAGTATATTAGCAATGGATAAATGCTGGATAAATTTTAGATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2L 11391635 5' + 1360 16 1 68.49 CTATTCTATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGGATATATTTAAATATTTACAATTT:1 + chr3L 6397653 5' + roo 21 2 61.82 CAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:1 - chr3R 10270657 5' - Juan 4146 1 59.59 ATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCT:1 - chr2L 11257133 5' + rover 6991 2 58.90 TAAAACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2R 21681296 5' - roo 9018 2 54.79 ATGATGGAGAATTTGACTCTCCTAAGAGGGGTAATCTAGTTATTCGTACCTAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCATTAGCTAAACATTGGTGACCCAAACGTG:1 + chr3R 1312343 5' + diver2 381 1 64.83 AATTTATAAATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:1 - chr2L 17005856 5' + Stalker2 7258 2 77.40 AATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACCTCGCAGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTCTTTTGATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGCGACAAATTCACGTCGTAAACAATTGAAGTATGAATA:1 + chr2R 4673592 5' - Quasimodo 7278 2 75.34 ACAAGCCTTCTCACTACTTTCGTCCATTCATCGAGTAATTGTGCTTGTTTCAAGCGATGTACAACAGTATCGCTCAGCATAAAACACGATACTCTACTCAACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAG:1 - chr2R 3635997 5' + 1360 3245 1 71.92 GTTTTCGACCATATAAAGTATTTTTATTCTTGATTAGGATTAATAGCCGAGTCG:1 + chr2L 22136609 5' + INE-1 93 1 83.33 AACAAGTGTAAGTGCAAAGCAAGTGATATGCTAAATGCAAAAGCAGAGAAAAGAAAATAAAAGCAGAGAAAATGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAA:1 - chr3L 3787542 5' + Porto1 457 1 50.00 TTTTTAACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chrX 13134855 5' + jockey 4788 1 63.70 CTTGTAGGTTGTTGGAGCTGTTTTGCGGTTGTGGTCATTAGCTTAAATCACAATTGTTTTGCACTTTTTTCATGTATTGGGAAGCCTTTGCTTTTTGAACGCTTTGCTTCTTGATTTTGCTTTCTTTTTTTTTTAACACAGGCACA:1 + chr3R 17916155 5' - Stalker2 497 1 61.64 TACAAATGAAATGCGAGGAAATCGTGGTGAGGGTGTTGGGCATTTTGTAGTTTGTATGTGTATTGGCATTTTGTTCTCTCACTCTACTCACTTGAAAACAACTATGATGAAAGGGAGTTGCATTAGTCCAGTTTCCGACTGCGCCA:1 - chr3R 27861382 5' - gypsy5 430 1 73.97 ACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAG:1 + chr3R 19450000 5' - roo 8648 1 76.19 TGAAAAAGAAACTTTTGAAAATACGAGAATAAAAAATTTTTATATCCGCTATTCGTAAAAGAAGAGGATATACTAGATTCGTTGAAACGTATGTAGCATATAGACGGAAACATTTTCGACCCTATATATATGTATATATATAAG:1 + chr4 686849 5' + 1731 4412 1 77.08 AAACGGGGGAAGACCGATGAACTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 - chr3L 17568139 5' - S-element 1673 1 56.16 GTGACCAATGTGACGTTTTAGATAAGGTACAACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 + chr2L 22993613 5' + 1360 70 1 75.00 AGATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:2 - chr2L 19675107 5' + 297 6599 2 67.59 AACAATTTTTAAAAATTTTCTCATTTTATTCCCCATAATCTATCGATATGTCCAAAAACTAATAAATTTCTCGCATTTCTACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3R 31401818 5' - mdg1 7438 2 70.55 GTACTTTTTATCGCATATAGGAACGTAATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTAC:1 - chr2L 11257160 5' + rover 12 2 77.93 AACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 11191481 5' + roo 8719 2 63.28 TAATGAATATCTAAAAAAATACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 18046551 5' + roo 10 2 77.40 AAACATACATAAAATAAAATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr3L 22035717 5' + F-element 10 1 79.72 ATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2R 21681304 5' - roo 346 2 60.27 ATTTCAAAGCATGCTTGACTTTATAATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 12986676 5' + roo 17 2 74.66 AAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr2R 6965596 5' + Transpac 51 2 52.05 ACACATAATAAATATTAATTTTCATATGTATATGATTTAATTTACTCATATAATTGCCAAAATCATATGAACACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 14683582 5' + roo 8714 2 52.74 TAAGCCCTTCCTCCAAGAGTTATTATCATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 12818380 5' + hobo 13 1 75.34 TATGGCTTCTTTATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 - chr3L 12315862 5' - transib2 2802 1 70.55 TACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTC:1 - chrX 15019099 5' - S-element 1546 2 65.07 TCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAA:1 - chr3R 10970317 5' + G-element 50 1 65.18 AGACAACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2L 16690764 5' - P-element 2868 1 71.23 AAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr3L 6518572 5' + 412 78 2 70.55 AAACCCAAATAAAACAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGCTTTTATCGTGC:1 - chr3L 16437288 5' + F-element 29 1 58.04 TTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGCAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 19924026 5' - roo 9019 2 56.91 TTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGAT:1 - chr3L 14094671 5' + I-element 74 1 70.55 AGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chr3L 15103787 5' - Transpac 266 2 56.16 GCCAAATGTTTAAAAATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 + chr2L 3675807 5' + Juan 4046 1 66.21 GTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3L 5881693 5' - pogo 2073 1 61.42 AACTGGGGCCATTCGTGGGCTCCAACAGCGTCAGACTGTCTGGTATGCCACTTTGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 - chr3L 16211607 5' - transib2 2760 1 61.64 CCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chrX 12129424 5' - flea 211 2 54.79 AGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:4 + chrX 13134867 5' + jockey 4800 1 56.85 CTACACGTCGCACAGTGAGGCAGATGATTTTTCTAGCGAAAAAAATTTTTTAATATTTAAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 + chr2R 2590669 5' - HMS-Beagle 7014 2 65.07 ATACAGCTCTAAGGCAGATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATT:1 + chr2L 22107366 5' + Transib-N1_DM 17 1 56.16 CCCGAAACTCGAAAGAGCGCTCAAATCATCTCCAAAGATTTTGTCCGCCATCATAGCAGCAACCAA:1 + chr3R 7239443 5' - Rt1a 4672 1 56.06 TAATTATCTTTGAATGAATTTATAAGGCAATTTAAAAATACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 20266090 5' + roo 10 2 77.40 TTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3L 5881674 5' - pogo 2035 1 65.07 AATTTTTCGATTTTAGGTTATAATGTTGTAGGTTAGCAGCTTTTTATTTCGATTGATTTAATTATTTT:1 - chr2L 12975416 5' - Doc3-element 84 1 85.29 ACCCACCACCGTTCATGATATAGAGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 - chrX 1264019 5' + Burdock 6151 2 65.33 AAAATGGCAGGGAAAATGTTTGACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGGAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3L 9809370 5' - 412 477 2 67.48 ATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 + chrX 8027405 5' - Juan 4167 1 50.00 ATATATTGATTTTTTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3R 13406561 5' + pogo 17 1 68.49 ATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr3R 20140506 5' + jockey 4758 1 79.72 ATGGTTAATGCATGAATTGGGTGTAAATTGGATGGAGAAATTCAGCTCCTGGAAGATTAAAGAATTTATTATATATTTAATAAAAAAAA:1 - chr2L 7568007 5' + TART-B 10448 2 79.78 GAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 21224519 5' + roo 36 2 59.29 TTTTTTTTTCATTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 - chr3R 7317691 5' - I-element 5317 1 58.22 TTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 19032708 5' - roo 360 2 53.15 CTTAGAGGAGCCACGATTCAGGGGAGCTGGGTTTCTGGGAAAACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGATATTTGAAAGCTGGAATTG:1 + chrX 10639052 5' + FB 37 1 54.79 AAAAAAGAGGAAAAACAAAACGAAGAAGAAAGTAAAAAACAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATGTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGTTCGGTTGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGG:1 - chrX 7134732 5' - G5 4629 1 72.60 AAATGGGCAGGAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr2R 6965452 5' - Transpac 290 2 62.33 GGTGCTGCTGTCAACTAATTGCCAAATGTAATCAGCTTTGGGCGCACGTAAGCCGCTTATTGTGCGCCATTAAATTTTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAG:1 - chr2L 4295865 5' - roo 232 2 69.83 ATTCTTCTGTCTGACCAGGTTGTCTGTTTCTGGCTTTTCGCCGCTCTCTGTTTTCCCCCCTTTGGGTATTTCCCGTTTTTTGTTTTTCCATCAAATGAAGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr2R 16929871 5' - jockey 4973 1 66.44 TTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr3L 6447138 5' - transib2 2777 1 53.42 CCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAA:1 - chr3L 20187407 5' - FB 460 1 60.96 AGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTCCGCGTAAGCCCAAAACTCTTTTCAGCAAAAGCTTG:1 - chr3R 20441309 5' + I-element 72 1 61.54 ATGGAGCTTCCAAAAAGGTCCCTTTTGCCTGATATGCTTGCACACCAAGAATAGGTATTACAAAAAAGCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAAGGATTTGGGAAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCA:1 - chr2R 1650359 5' + Tc1-2 1284 1 58.22 ATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATAT:1 + chr3R 19450139 5' - roo 89 2 61.11 TGTTTCGTATAGGCTGTGTTTTTTTCCAGCGGTGATGCTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCGGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTATTTTAGTACATAATTAGATCCTACTAACACT:1 - chr2L 13484432 5' + Cr1a 4287 1 72.60 GGCAGAGACCGATAACAACGCTCATTTAGTTGTATGCGCACTCAGTCAGTGAGTCAGTCAGTTAGTCAGTCAGTCAGGTTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGAC:1 - chr3R 28961765 5' - G5 4759 1 52.74 CAATACTAATAAGAAAATAAACATCGGTTTCATCAACAATTTCAGCTTGAATTAGTTCTTCAATTACATCTTCCAGAGTAACTAACCCGACCGCTTCTTGGATTAGAATTGATTTAGGCCCGAAAATAGTCTTCTAGCACAATACG:1 + chr2R 3919511 5' + 1360 3202 1 51.37 CTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAC:1 + chr3R 23067452 5' + roo 9041 1 44.52 AATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGGCCGCTCTTCC:1 + chr2L 14026103 5' + F-element 440 1 68.57 GCAATGTGCCCACAGACTAACCCAATTAGAACTAGCAGATACTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2R 8099258 5' - jockey 4966 1 60.96 AATTCCCTGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2R 13168766 5' + P-element 9 2 76.32 GGTCTAGGCCGAAATTGAGATACTCTCCTCGCAAAAGGGCAAATAATAATGGGGATTTTTGCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAAAATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 31653028 5' + roo 8684 2 71.13 TTTAATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr2R 4886048 5' - INE-1 579 1 55.48 GTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGA:1 + chr3R 21276536 5' + BS 5060 1 59.59 GTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGGA:1 - chr2R 23780618 5' + Ivk 52 1 50.70 AGTGGANAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTC:1 + chrX 14722107 5' - diver 164 2 57.53 AAATATTTAAATACTTACCCAACATTTATTGCTGCTGAGCCGGCTGACACGATTCAAAACTATTAAACAAACCAATTTGGGGGCAATCGAGTGGGAAGGAGAGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAA:1 - chr3L 7491175 5' - FB 892 3 67.12 CTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGGGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chr3R 6419975 5' + Tabor 6859 2 62.33 CAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGCCATCCACTTAACGT:1 + chr2R 13168664 5' - P-element 2855 1 48.51 AAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATATAGTTTAAAAATTGA:1 - chr2L 18347415 5' - transib2 2797 1 65.96 TTTTTTTGTCTCAACTGAATAGGTTTGACCTATACATTTATTAGTATAAAGCAAAATTTCAAGGTACATACACTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGAAACTGCCGGGCTTTTCATAGTACAGTCAAATAAATAAG:1 - chr2R 4723309 5' + Tc1-2 60 1 58.90 TATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGCGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATATGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGTAATATATTCGGTTTAA:1 - chr3R 11062833 5' - roo 9013 2 52.08 ACGAAGCGCAGGACGCTGCCCACAATGCGAACCGAACTGGAGTGGAGGCAGATGGGTGGTAAGAGGGAAGAGGCAAGAAGTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGG:1 + chrX 2481284 5' - HMS-Beagle 6932 2 60.34 AGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 13766178 5' - roo 9034 1 59.59 AGGCACCAGGATCGCGGCCCCAAAGGCGGTTAATGTCATTAACAACAAATTGGAGACAAGATTCAGGAAATAGCGAAAAAATACAACGACTAATATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAAAGCC:1 - chr2L 5793552 5' + jockey2 3129 1 69.44 AAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATTAATAACTCAAGAACGGGGAGAGATATTAAGATA:1 + chr2L 22107399 5' + Transib-N1_DM 50 1 77.40 CGAACATGACATTTGCTTCTGTTTTCTTATTTCTTTCTTGAATAATTCGAATAATCTGTGAATTATCTTCGGTTCGCAGTGCATTTCCCCGTGGCATTCGCATTTATGGATGAAGTACATACATAAATGTATGTATGTATGTATAT:1 - chrX 17718565 5' + 1731 97 1 72.60 AATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr3R 13973085 5' - 412 7541 2 77.60 GTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGCTTGGGGGCGTTAGAGAGGGCGGGGCAATATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTAGAGGCTCTAGAGTCTGTGTGTTGAATCTCAACCTTCTAGATTT:1 - chr3L 19271025 5' - INE-1 166 1 83.20 AAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr2R 16510091 5' + F-element 64 1 50.68 AGGCAATAACATCGTCTTTAACGCGTCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTATTTAT:1 + chr2L 22328984 5' - invader2 4740 1 51.41 ACACAAACTGGCAATATGTCTTTCAAAGTAACTTAACAAGCCATAAATATGAAATATAAAATTTAATTTTTTAGGTATATTTATCAATTTTTTCTATTTTTCTAGATTTTCCGTTGCAGAGTAGCTGCGTTCAGCGTTCTACTGG:1 - chr4 1262829 5' - Osvaldo 14 2 73.10 ATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCT:1 - chrX 14722186 5' + diver 5967 2 71.83 ATAAGCGCCATAAACGCTGAATTCATTATGACAACGCCAGAGACGTGACTCTTGTTCGTTGGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGCAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACA:1 - 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transib2 2753 1 65.75 AAAGTGTCTCGTTGCATTTAAATGTTATTATAGCTTAACTTTATTAAGCAGACTACTTTAATATGCTTTTTGTGTTTGTCGTTTAATTTCAATATTTACTTAAAAGCTTTTGACATGGTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTT:1 - chr3L 11876551 5' - gypsy4 40 2 69.86 GATTAGCAAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:3 - chr3L 18505785 5' + I-element 18 1 73.29 GGCGACAGGGTCAGGTGTATAAATTGCACAAATATACACATACATGCATATGACCATATATGCGCTCACATATCTCAACATATATCAAAATATATACATACATATATCTATATAGGTATAGATATATGTACATATGTACATATATG:1 + chrX 13979921 5' + G3 4508 1 65.07 TATAGATTTTTATTTTTTTATTTAATAATACCAACATTCAATGTTCGGGGAAGGAAGCGTCTCGAACCAAAAAAATATTCTGGTTTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATGTT:1 - chrX 160031 5' + INE-1 134 1 66.44 TCCTTTTTGCCATGGCAATGGCTAAATGATTGGACCAGTATGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGT:1 - chrX 20833837 5' - Quasimodo 35 2 72.60 ACGTTGAAATCAATGTCTGGCCATGATTACGAGTGTCAAATGTACATTCAGCTGCTGGCCAAGCACGATAACTGTTATTATTGCATCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGGGATATTTC:1 + chr2R 22992837 5' + I-element 5014 1 63.70 CTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3L 4219458 5' + jockey 64 1 55.48 GATGCTGTCCCAGCAGGACATCGGCAGCCTCAGCATAATTAAAGCCGCCGACATGCCATGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATATCATATTAACTT:1 + chr3R 8075866 5' + 412 7088 2 62.33 ACATAAAGAAATCCTGAATGCGTTTTTGAATAAGAGTAAAATACAATATATACATTTAGTGAATACTCTATCACAAATTCAATTTTGGTGGAAAATATCTAGAAGGGCGTTAGACACCCCAATTAAAATAATTTTGAAATGACAAA:1 + chr3L 15405902 5' + P-element 2507 1 79.45 AAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTAT:3 - chr2R 20227294 5' - hopper 1329 2 77.40 GAGAAAATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2R 15652003 5' + hobo 37 1 51.69 TATATATATATATACATTGTGTATCTAAAGGATACAAAGAACCCATTATATGTACCCACATATATATATATGTATATATACTAAT:1 - chr3L 2355729 5' + Dm88 4380 2 83.53 ATCTGTAAGCTGGCGAGAGTGCGAGCGTGTCTATTATGCAAAAGTTTCGCCCAACAAAAGTTCCCTTTATAATTTTTTCCTGTGCTATTTCCTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTAT:1 - chr3L 15391382 5' - Porto1 163 8 67.52 AAAAAAAAACATATTTGTTCACAGTGTAAATTGTAACACACAGAGAGCGAAAAGACACTAACACATATGTATATGTGTTAAAAACCTTATTTATCTTTGTGAACAAGATAAACAAAAAAACAATTGAAAACAATAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 9302514 5' + Porto1 186 1 66.44 AGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCCCT:1 - chr3L 3983931 5' - P-element 2861 1 66.90 AGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGACATCC:1 - chr2L 16690740 5' - P-element 2864 1 63.49 AAATCAATTGCTATCAAATTCCTTGTGAAACGAAAAGGCTCTTGCCCTGTTGGTTTCTTGTGTCAGCAATCTTTGACATTTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAAT:1 + chr2L 12810358 5' - Doc 4637 1 58.22 GTTGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 27391436 5' + 1360 10 2 68.49 ATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCAT:1 + chr2L 22121335 5' - I-element 5310 1 67.59 CTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAAC:2 + chrX 2214272 5' + jockey 4841 1 72.60 CTATTCAAAATGGACCTGGTGGCAAATTCTGCTTGCGAAAAAAAAAACTGTTGATCAAATCTGAATCAGAAATAGGCTGACAAAATGGCGCTTATGAATTTTTATCTAGTGAAAAGAAAATTAAAAAAAAAAGAAAACAAGAAAAA:1 + chrX 10242101 5' - HB 152 2 76.71 ATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2R 8735543 5' - mdg1 7430 2 64.58 CTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGTCCGGCA:1 + chr2L 14026170 5' + F-element 428 1 47.54 AACCCCTTGATGCCCCCTGGCCAGACGAAGTTGCCAAAAAGTTAAAGTTTCCGTGGCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTCTTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCAG:1 - chrX 7777905 5' + F-element 414 1 59.72 AATTGTATTAAAAATATATTAGGTACCACCAATTTGTTTTCATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATGTAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAAC:1 - chrY 1421288 5' - flea 4937 1 71.53 AACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 + chr3R 28901215 5' - transib2 2768 1 56.16 GTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCC:1 - chr2L 15076194 5' + 1360 63 1 62.77 ATCTAACAAATTGCCAATGTTACACTTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCGCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGA:1 + chr2L 14671770 5' + FB 10 1 78.62 ATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTG:1 + chr2L 15550670 5' + Bari1 65 1 62.14 CGGAGGGTTTTCCGCCTGATCACCCGTCCAATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGGGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3L 19455053 5' - mdg1 7453 2 74.58 TTTTCAATAAATGTACATACATATGTATGTATATATATATATATGTAATGTGAATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr3R 10152347 5' + transib2 27 1 67.12 ACTGGACAAAGACGGCAAATGCAACTCACCCGAAAGTAAAGAGGAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTT:1 - chr3L 21656029 5' + HMS-Beagle2 13 2 75.34 GTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 6397671 5' + roo 75 2 66.44 ACTCGATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTGGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTT:1 - chr3L 2544715 5' - Tirant 8442 2 60.27 ATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 11326677 5' - pogo 2033 1 67.81 AAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAA:1 - chr2R 1916454 5' + Juan 57 1 53.42 ATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGGTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAA:1 + chr3L 10373830 5' - 297 6904 2 69.86 ATTAATGTTTAACCTAGCATAAACCATACGGGATCCTGAAACCAATTCACATTTTTGCTTACACCTAAGCGCAT:1 + chr2R 3145997 5' + rover 96 2 54.05 GTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr2L 12984222 5' + hopper 59 1 57.53 TATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 5531213 5' + 1360 63 1 67.24 AAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATT:4 + chr3R 19450156 5' + roo 9007 2 79.45 AGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTA:3 - chr3R 30059477 5' + FB 73 1 68.49 AAAACAGACGAAGAGCAGCCGACAGGCTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 - chr3L 15336577 5' - P-element 2808 1 25.37 AATGGTCCTTCAAACGAAATATACAGTTTGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTT:1 + chr3R 5259351 5' + S-element 1703 1 64.71 CTCTAGTTACATTTTTAAGAGATGCAAATGCTATTTGCCTAGGATAATAGAATGAAATTGTTGAAACAATTGCCGACAATATACGAAGGACATAGAGAGCGACTGAGAGCGATAGAGCGAGAGAGGG:1 + chr2R 10682523 5' - Cr1a 296 1 42.52 ATTAAAAACAATTTTTGTTGGCTCAGTTTTTCCAGCAGCAGGAAAAGCGATTGTTCATCCGTGTGGGTTTCCGTATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGGAGTTGTTGTTGGTGTACGCGCAGAT:1 + chrX 6378973 5' - Porto1 426 1 60.84 GCGGCAACTTAAGTCAACTCTCGGACTGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCATTTTATGCCACTGGACTCACACTCAACAATTTTGAGTGGAGTTGCCACTCACCACTCACATTGCGGGTACTTACAAACACCCAGTAAAA:1 + chr3L 23123695 5' + hobo 90 1 78.87 AGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chrX 19588121 5' - roo 329 2 68.97 CATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:3 - chr2R 12472118 5' + transib2 64 1 60.96 CTGTGCTTCTCCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAA:1 - chr3L 5061676 5' + 17.6 6957 1 63.70 TATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTCTT:1 - chr2L 11839747 5' - mdg1 7397 2 53.79 ATTTGATTGTTTTGCCAAACTCCCAGATTTGAACAGTCTAAATTGATATTGGTGTCAAAATTTGATTATTTATCGGTCAACTTGCCAAATTCAGTTTTATATTTAAAACGTTATCACGGCACCATATTTGAAAGCTATCTAGATCG:1 + chr2L 22345510 5' - Q-element 642 1 68.49 TATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACCCCAGGCACCC:1 + chr2L 12818257 5' - hobo 2893 1 59.26 AAATATAGCTTAATACACAAATGCATTTTGTTTACCTATACAGGCAATGAACTCTGCGGCGCCTAAATTGGGATGCAAACCATATATTACCTCCTTATTCCAGTAGATTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGA:1 - chr2L 4355316 5' + Cr1a 4003 1 61.64 GTGAATGTTAAGTCGGCGGATGTTGGGTTATTGAAATTAAATTGTGTGTGGTTGTTGTTGAATTGTCAAATGTATTGCTTGTGAGTATTTTCAATTGTTTACTAACTAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGC:1 + chr2R 1576681 5' + transib4 409 1 73.29 AGCCACAAGGTTTTGGCTGCCAAAAAACTCGAGAGCCGTTTTGGCCCCCGCTCGAAATGTATATATAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chr3R 10931742 5' - 297 345 2 58.22 TTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 11164517 5' + roo 48 2 55.17 TTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGTTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGC:1 - chr2R 8047320 5' - 1360 3313 1 79.84 TATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACAATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCGTA:1 + chr2R 21410880 5' - Burdock 181 2 67.81 TTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 + chr2R 21160655 5' - Transpac 5173 2 60.27 TTCCTAGGCTAAGCAAAAATTTTCTAAAATAAATACAATTATCCCCTTTATAGAAACTATAGATCGATGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCC:1 - chr3L 2698196 5' + 412 446 2 54.11 ACACACACATCAAAAATGTTGGGGTATACCAATGTTTTTTTACACACATTTCACGCATAAGAAATATCTCTAAATTATTTATATCCAAAAATCCATAAAAAAAATTAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTC:1 - chr2R 18684179 5' + transib4 2616 1 66.44 CCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 - chrX 10537934 5' - I-element 5282 1 66.44 ATTATACGGCACACAGTCTGGAGGATGTTTTATAAGTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr2R 18530014 5' - jockey 4980 1 77.40 AGTTCCATTATGAAAGCCAAATTCTCAGTATTATTGCAAATATATATATATTTAGTAGAATTGACAAAACTAAGATATATAATGGTTGATATCAAACTTGAGGTATAACATTATTTACTTATATTTTAAAATTTAATTTAAAATTA:1 - chr3L 11854223 5' + 1360 3044 1 44.52 AGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGA:1 + chrX 6116258 5' + transib2 73 1 68.97 AACTATATATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chr3R 15054165 5' + copia 4885 2 70.55 TGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAGATAAATAA:1 - chr3R 28901297 5' + transib2 85 1 73.97 GTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCA:1 - chr2R 9967172 5' - Bari1 1686 1 69.86 TCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 23639124 5' + pogo 44 1 54.11 ATCCCAATAAACCTAATAGAATAATCACTTAAACAGCAGTTTTCCTTGCTTTTCCGTGACTCTCCTTGAGTTTTTGCCCGTAGAACCCG:1 + chr2R 7358504 5' - jockey2 2958 1 55.06 GGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 + chr3R 29084909 5' - 412 410 2 73.10 ATTATTACTTGTGGGGAAGGGAAATGCACAAAATAAATATAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTAAGTTTGATTTAACTCATCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTT:1 - chr3R 6422941 5' + 17.6 7273 2 73.97 AATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTAT:1 + chr3R 4357532 5' - Tc3 1647 1 61.27 AGTCTATAATAAAGAGAAGCAATGTTTACTAAAATCCTGAAAAGCACCATTATAAGTTTTCTTACCCAATCCCGGTAACTGAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAA:1 + chr2L 124022 5' - 1731 171 2 61.64 AGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chrX 19054237 5' + jockey 56 1 51.39 ATAATAGATCTGCACAATTGTGGAATTATGGAACCTGAACCGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGC:1 + chr3R 3855232 5' + Transib5 2968 1 64.29 AATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGGATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 10931635 5' + 297 6606 2 52.43 GATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 - chr3L 18403021 5' - P-element 2784 1 15.75 GCTTAGCACACGTCGCATGAGGCTAAAAGATTGGGAGTTAGGGGCTGGTGCATGAATACCCGGGATGGGACCGTCAAGGGACAACTGGAGGCTCCTATGATGAATATAGGAGTTAGTAAACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATAT:1 + chr3R 15793036 5' - Gypsy12A_LTR 2059 1 71.92 CACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3L 18403073 5' - P-element 2845 1 54.74 TATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACA:1 - chrX 23182921 5' + Idefix 47 2 59.23 TATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2R 15375351 5' + 1360 59 1 54.17 GGGCGGAAATGTATTTATTTCACGCCAGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chrX 19074922 5' - mdg1 7454 2 78.77 AGGCAGATGATTTTTCTAGCGAAAAAAATTTTTTAATATTTAAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chr2R 2590686 5' - HMS-Beagle 202 2 53.79 TTGTTTGTCAGTTGAACTGCAACTTGTGCATAAATTTCAAATTGCCATTGCCACGTATCCGCTGACGATCACTGCTTCGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTATTTTTTTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGTT:1 - chrX 15262123 5' + HMS-Beagle2 232 2 64.83 TTATTATTAATAACTTTACACTGATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTA:1 + chrX 190027 5' - INE-1 552 1 67.12 AAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGG:2 - chr3R 11040160 5' + Bari1 60 1 57.53 AAATCTGTTTTTCCTACCATTTAGCTCTGCTGCCTTTTCAAATTTTCAATCCATTTTCCGGACTACGAATGTAGTCTGTAGAATGTTGTGATCGGATTCTACATCTCCCTACACATGATTTTTTTTTATTTTATTTTTTTTT:1 + chrX 4945736 5' - Doc2-element 254 108 75.35 GACGCGCATGAATGGATCAACGAGATTCCTACAGTCCCAATCTACTATCGTGGGGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGATGTTTGAGTT:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 5041 1 55.05 ATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTT:1 - chr3L 20187429 5' - FB 482 1 54.79 CTATCAGCTACAATGACTGGGCAAAAGCCAATTATTTAAATAAAATCATTATCTGGTAAAATATACTGCACGCAATTAAGTGCACAATTTTCTTTTGAATATATGAAAGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCATTAGAGGTGGCTC:1 - chr2L 106883 5' + 1360 62 1 74.66 ATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCCAGATATCTGCAT:1 - chr3R 13406543 5' + pogo 35 1 57.53 TAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr2L 14874165 5' - copia 228 1 56.85 TTTTAACTGCTTTTAAAAAAATGTTCGTACACGGTACTCGATAGTCGGTGCTCTCGACAGTAGTGTATCCCCATTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr2L 6498453 5' + hopper 138 1 68.54 ACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr3L 3983903 5' - P-element 2850 1 55.47 CTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATG:1 + chr3R 7819174 5' - invader3 173 2 59.68 TCCGGTGTTGAATGTCTCCAAGGTTGCAGATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 13300872 5' + roo 8740 2 70.34 TTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr2R 8157135 5' - mdg1 398 2 69.18 GTGTGTCTTGATCGGGATGCGGTGTCCTCGGAATTACAAAGTATTACTAATTATTTGTTATCTATTATTGTTGTTGATGATGGCTTGCTAGCTAGCTGGCTGCACTTAACCACGACCGCTCTAACGCCCACAAACCGCCCAAAACT:1 + chrX 8166970 5' + INE-1 346 1 63.70 ATGGTGGTTTTATTTACTGCTTTATCAGGATGACACACATACCGCCGCACTGTATTTGGTATTTGGATAGTTATACTTCAGCAAAATCCTAAAGTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGG:1 - chr2L 170051 5' + hobo 2820 1 75.41 ATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 - chr3L 14720901 5' + F-element 83 1 63.70 CATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 25428130 5' + 297 6617 2 57.53 CATTGACATCGCCCAACCCGCTTAATCCTTGCCATCCCTGTCTCTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chrX 4341345 5' + roo 8740 2 68.97 AAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2R 13931521 5' - P-element 2837 1 53.42 AAATGTTGCTTTGTGAACTTGTTATAATTGCGCTGTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2L 9782049 5' + P-element 39 1 58.04 GCTGGTTAAAAAGTTGTCTTTGATGGTCTTCTAACAAGAAAACTCAGAATTAAGTTAATTGTTTGTACAGTTTCCACCTAGGAAGTGGTTCAACTAGGCGTATACATATAACAAACGAGAGGGAATGCTATAGTCGAGCTCCCCGA:1 + chr2R 5198129 5' - INE-1 569 1 54.11 CTCATAGAGGAAAAGGGTATACAAGTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATAAATTAAG:1 + chr3L 25481529 5' - Cr1a 4147 1 72.60 ATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTACCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 + chr3R 28901211 5' - transib2 2772 1 53.42 TGATAAGTTGAAAGCGAGCAGTGATCCGTCCTGCGAAGCCACGCGGGTCATCAAGAAGAACTGTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGGCATGATTGTTG:1 + chr3L 268839 5' - I-element 179 1 55.48 GTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 11062800 5' - roo 8988 2 76.47 TATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2R 9871009 5' - roo 9034 1 59.59 CTTTATTATGTATGAGCTTCCGGCCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGGTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCC:1 - chrX 21772479 5' - gypsy3 6565 1 53.47 CGACAGTGTCTTGGCGCCAGTTTGATTTGATGGCCGCTTTGGTTTATTTGGAACTTCACGAGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCCTCTATGCTTGTTGCTA:1 + chr3L 9003762 5' - invader2 120 2 72.65 AAGCACTTCGACTTCAAACTGGAAGCATATGTCTACCATCGATTATAAACAATAATATTTTTAAATACTTATAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACC:2 + chr3L 21372496 5' + I-element 5219 1 54.11 ATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCAT:2 - chr4 829118 5' - INE-1 139 1 60.96 TGTAATAGCAACGGGAGCCATGACAAAAAGCGGGGTGATATCTCGTCGGCCCATTTGCATCAAGCCGAACGTCATTCAGATGAAAAGACAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCG:1 - chr4 600914 5' - gypsy6 7612 2 63.24 CAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3R 5769025 5' - roo 331 2 69.18 ACAATGCCCGATGACCAGCGAAAACTTGGATAATATGACTATGCCATCGTTTGGTACTTTAGGCCAGAGTCAAGCTACAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAACCACGGTACTTA:1 + chrX 12111661 5' + F-element 4418 1 70.69 CAATATGCATACATTCATATATATATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2L 18549964 5' - roo 9046 1 70.55 ATACAATTTTCCCTTGAACTCTATGGGGATATTAGTTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACGT:1 - chr3L 13318609 5' - gypsy4 465 1 73.29 GAATGTCTCCAAGGTTGCAGATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3R 13300881 5' + roo 8730 2 73.02 GATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTTA:1 + chr2L 13556306 5' - transib2 2797 1 66.90 AATTATAGCATTCAAGTTCAAAGCTCCTCGCATCTGTCCATGCATTTTAAATGCCATAATGGGATACAAATAATAAGCCGGAAAGGACCAACGATTAAGTACGTCGAGGTTGGTAGCATATAAATTATTTAAAGATTGATCGCACC:1 - chr2R 17644019 5' - Gypsy6A_LTR 397 1 66.44 AAGCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTG:1 - chr3L 23702311 5' + G4 7 1 76.71 ATGCGGCTAAAAATCCATGCACACGAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 + chr3L 6964760 5' - P-element 2791 1 20.55 GTGGCTGTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 9544957 5' + roo 8697 2 61.87 AAATTAATACAAACGTAATACGTGCAGTCAAAATCTCTCTCTTATATATGTATTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 + chr3R 4626180 5' + INE-1 13 1 64.38 ATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3L 24131487 5' - Transpac 299 2 61.63 ACTTCGAAGATGGGTATTACTCTCAAACGAATCCATTTCTATGAACTCAATGCGATTGTGCTGCAGTGATAAACTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCT:1 + chr2L 14030902 5' - F-element 4327 1 56.43 TGTTGGAATTCTGCATTATACAATCTTGGAAAAAAGTTTGTCCTAACAAAGCATTTATTTGATATACTAAACTGAATTTAGAATCTCATATATTTCGACAACAAGTTGTCAATCAGAATCCATTGAAATTAAAAATGAAAAAAAA:1 + chr3L 13102174 5' + P-element 2646 1 86.21 AACATAAAACCGTTTGGGAACTACAATTCAAAACTTAGGATTAGTATTCAGTAGTGGGATTTCAATTCTATGCTTGGAATTTCTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTA:1 - chr2L 11314867 5' + G2 2963 1 69.77 AAGCTTCATAATTAAGCAGCCAGACGTAGGAAAGTCAGGACATTTCTTTTATTCCTCCACTTCCGTCTTGGCGAACTTTTTCATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGT:1 - chr3R 9207802 5' - I-element 4879 1 66.44 GAACCTAATCAAAACACGTAAATTTTAAACTTATCAAGAGCCACGTCTTGTTCACTTAATTTTCGAGTCTTCTCGTGTTTATTTTTGACTTTTGTTCATTGGATTTGCAGCCCTGTGTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTAATTTT:1 - chr3R 8780198 5' - Doc 4698 2 63.01 CTGTCAATCAATTGGTTGTCTGTTCGGCACGCTGATCAGTCCAAAACAATTTGCAACGGCTTGTCGAGAACTATGAACACGAGCTGAGAATAATAAAGATCTAAACTAAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAA:1 - chr3L 3612011 5' + rover 285 2 62.76 CTGCATGTCCTTGCTTCACACCGTTTTAGCTGCTCGCTGGTTCGGCAAAACGTTTTGGCCCCCGTTTATCTGCTTTCCTTTCGTTGACACGCTCTTGTCGATTTGCACAAGTATTACACTAATCAAATGTTCGCTTTT:1 - chr2L 3981648 5' - HeT-A 198 1 72.46 AAGAGAGTGACGATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGGGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 3234062 5' - roo 401 1 71.00 CAATCAGATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr2R 21160784 5' + Transpac 4958 2 54.11 AAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 15790983 5' - roo 323 2 78.08 AAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAA:2 - chr3L 16973458 5' + S-element 67 1 67.12 ATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTT:1 - chr3R 18093366 5' + I-element 71 1 64.38 TAAAACAAAAAGTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 - chr3L 6447163 5' - transib2 2802 1 70.55 ATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 7719812 5' + roo 8721 2 66.92 GAGTTGAAGTGGAAATGGGAAAGTCGCTGGCCGGGGAAATGGCACTCAGCTGCAAAACATTGGCCCAAACGATAAGTGACAAACATGCAAATCCAGCCTACCCTAATAACATAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCC:1 + chr2L 13712573 5' + Quasimodo 192 2 58.22 GGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3L 13294955 5' - roo 319 2 78.08 TAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGCCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTGCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 - chr3R 30946585 5' - Transpac 223 2 75.69 TTTTATTTAGTTTGTCATTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACC:1 + chr3R 25428104 5' + 297 5 2 78.01 AATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGACTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 - chr3L 14094688 5' + I-element 57 1 57.53 AATCTAAGAATATAATGTTTTAATTCATTCTGAGAGTCAAAGTCCACTTCTCAAAGTAACAGAAAACGGTCCTTAACTTGAAATTAAAAATAAATCTGCGACAAGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGT:1 - chr2R 6462715 5' - S-element 1698 1 63.70 AAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 11191364 5' - roo 9039 1 60.96 GTCTTTTATTTTCTTCTCTTGGGCTGTCAAGGCGGCCGAAAAATAAGAGCCAGACCCCAAAACCATGCCACCCCCACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAATTTTTC:1 + chr3L 17104972 5' + G5 4706 1 52.05 ATCGTAGAGCCGTACAAATCTAACAACAAGTTTGCCTGCCAATTAACAGAACAACTTCTCACTAAAACGGGCGATGCTCTCGAAAAATATATAAAAAATGTTTAAAGTAAAGCAATAAAGCATTGCTATTATTTTTACCTCAACTG:1 + chr2R 12029275 5' + Tc1 1643 1 56.85 ATTATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:2 - chrX 5323170 5' - Juan 4199 1 35.62 TAATTGGGACATAGTTACATATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 5768979 5' - roo 9041 1 64.38 AAAGGGAGTAAAGGGCAATGTTTTATTTAAGGAATTCAAACCATTTAATAACAATTACCAAGTAATCAAGTACTCCTGATTTTTTTACTTAAATAAAATAATAAGAGTGTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCA:1 + chr2R 17397781 5' - roo 8657 1 47.95 GTAACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGACAATTAAAATGAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGCGTGGCACTTTTTTATCACTCGACTCACA:1 - chr3L 22325890 5' + hobo 22 1 48.42 GGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr2R 8735589 5' - mdg1 346 2 73.61 GGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 27123593 5' - roo 361 2 53.42 TAATAGCAGAATAGCAGAATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chrX 661849 5' - 412 447 2 51.80 GCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 + chr2R 22034658 5' - copia 5055 2 67.12 ACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGGCGGATGATGATGATCAGGAG:1 - chr3R 15790107 5' + flea 4728 1 67.46 AGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGCCGTG:1 + chr2L 7125719 5' + I-element 14 1 71.85 ATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 9544937 5' + roo 8718 2 58.57 CTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 - chr3R 4461157 5' - blood 7355 2 66.44 ATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 - chr3R 9039050 5' - Juan 4186 1 65.07 TCTTGAACTTCCGCTGAATGTTATTTAGTTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAG:1 - chr2R 18781781 5' - G2 43 1 76.23 GGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTT:1 + chr3L 15103817 5' - Transpac 5155 2 68.49 GAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATA:1 - chr2R 5321208 5' - INE-1 503 1 57.02 AACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAA:1 - chr3R 11040145 5' + Bari1 75 1 67.81 TCTCAATACCTGCATACAGATTGATATGTTATAAGTGCAAAAAGTTCAATTTGTGTATTGGATATACTATTACTTAACTGAATGGGGTTCACAGCATCTTTACATAAAAGCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAG:1 - chr3L 23252458 5' + transib2 2690 1 75.34 ACAAACAACAGACTTTAATCAATACTCGTGGCCGAATCCCAAATTGTCAATATTTTCTAAAAAGTAAGGTCATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAGGAAATAAAAAAATTATATCTTAGTGGGTAGAGGACAGCA:1 + chr3R 4524233 5' + HB 346 1 75.34 AACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGGCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTT:1 + chr2R 12472028 5' - transib2 2763 1 60.14 CTTTTTGCCCCATCAAAATGTTCGGAATCTGAACAGACTTTTCCAGTCAAGTCCCAGGGATCTCAACTATTTGGTTGTCATTGGATCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGGGAGAAGCTTATTGGTG:1 - chr2L 10197146 5' + R1A1-element 218 1 74.60 ATGACGAACAGAACCCAACCCTCGGATCCAAATGGACGTCTCAGTTTCAGAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2L 19923946 5' + roo 8733 2 65.07 TATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTT:1 - chrX 3646355 5' - TAHRE 10406 1 53.42 AGAATCATTCAAGTATCAAAAAAAAGTTGAATAATAACTAAATATACCCAATCCCATAAGAAAAAAGTTTAAAATTATTTAAAATTTTCCTTTTGCTAAAAAAAATGGCCCAAAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCC:1 - chr2L 18503290 5' + Idefix 7034 2 78.08 TATTCAGAGTGGATTTCTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTTTATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATAC:2 + chr2L 13585703 5' + Quasimodo 35 2 49.32 CTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1 + chrX 10319591 5' + mdg1 46 2 54.11 TAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 - chr2L 15550781 5' - Bari1 1662 1 52.05 ATCAATTCAGCAGCTTTGTTGCAATTTTCGCTAAAGTCGAACTCAGCTGAATATTCATCACGATCGTGAGCTATAGCTTTTGGATATATAGAGGTGTTTATGTTTTTGCGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAAC:1 + chrX 14179502 5' + Tc1 192 1 66.44 GTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 + chr3L 24934290 5' + HMS-Beagle2 54 2 56.85 GAAGAAACTACGGGCTCAAGGGTATTTTAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 24219419 5' - roo 398 1 75.34 ATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 - chr3L 18505719 5' + I-element 83 1 75.86 TTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 19448799 5' - roo 9041 1 40.00 AAATCAATCTAATGAGAAATTTATCGTCTCCCACGAAACTCTTAGATCCAAAAGAACTTAATTGACTGCTAGAAATAAATAAAACGAATTGGAAAGCAAAACAAAATCGAACTGAAGCTGAACTAAAAAAATAATAAAAAATAAAA:1 - chr3R 7059205 5' + BS 5094 4 70.55 TGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1 + chr3R 23618151 5' - hopper 1334 1 76.43 CCTGAGCCGCCTCAAAAACGCTAATAACTTTTAAGCTGAGCCTGTTTCCAGCTCCAGCCCAACTCAACGATTAGCCAGCACTCTT:1 + chr3R 13600915 5' - baggins 149 1 56.47 GTACAACACTTCGTTTGTTAAGCCTGTATTTTGGAAAAGGGGCTCACTAGATTGGTTATGAAGTATGAAAACAGAAGTACGTAAAACAGATGGAGTCGTTTCCTACTCTATATATATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCTG:1 - chr3R 7436706 5' + INE-1 88 1 77.24 AAGTAGCCAAGTTTTTAGGGATACGCTATAGCCCGTTTTTGCACAGTCCATATTTCTCGGAACATGGTCAGAAAAGCAAACAAAACAAAAGAAGGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATCGGATA:1 - chrX 22785421 5' - INE-1 559 1 62.10 AAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr2R 17878618 5' + Doc 82 1 68.53 TTACAGGCGCGATTTGTTGTTCCAAGCAGAAGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:2 + chrX 2214200 5' + jockey 4769 1 78.77 ATTTTTATTTATTTTTAAGAAACACAAATATATTATTCCGATCCTTCATTGTCGAGTCCTGAATATTTATTAGATGATTTGCTGTAGGTATTAATATAAATCGGGAAAATCACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATC:1 + chr2L 1905154 5' + McClintock 4 2 54.86 AAATTAAAATCAATGAAATTAATTGAAATATTAAGTACTGATAGCAAAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCTTTT:1 + chr3R 7800479 5' + I-element 4997 1 66.44 GTTGATGGCTAACGATGCTGTCGAGGTCGCCCAGCGTGTAATTAATTGAATTATCTGTAACTTAAACTGTTGTAAATGCAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACA:1 + chr3R 10146965 5' + Juan 4129 1 58.90 GTGTAGTTGTGTGTGTGTCATATATGCATGGAATTGTTGTCGAAGCTTAATACAGCGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCTA:1 - chr3L 23025052 5' - Porto1 342 1 62.33 ATACTGTAAATTGAACAAGACTGCCATTCGTATGCATGGGTAATGCATATGTATGTACATACATATGTACATATGTTCATACATATGTACATACGTTCTTACACGAGCTGTCGCTGCAGAACCTCCAACATATTGGTAGTCTGAAA:1 + chrX 1481408 5' + gypsy4 6367 1 66.44 GCTGCTTTGGCGCACGCGCACCGAGCCACGTGTGCGAGCGAGACGCCAGCAGTATTGCTGCGCTGGAAGTACAAGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3R 13875186 5' + P-element 9 2 78.57 TTTATTTCATATTTTTGTTCACACTCCCTAGCAGCTTATTGTGATCTGTCGGATGCCTAGAATAGGGATCTTTTAGGCAGGAAAAATGTGTCAAAAAGAAAAAGAACAAAAAAAACGAAA:1 - chr2R 6240339 5' + Doc2-element 245 1 75.00 TACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:2 - chr3L 21769102 5' - I-element 5285 1 65.75 ACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr2R 21410983 5' + Burdock 6183 2 52.74 AATTTAAAAGGATTGAGTATTATCAACTGCAGCAAGGACACTTTGCACAAAGGATGTTATTAAAAATATCTAGTATGTGTATTAAATTCATACTACTTTTAAACATTAGTTAGGAATGCCACACTAAATAAATAAAATTGATTAAA:1 + chr3L 11668610 5' + HeT-A 1 1 46.58 ACAATTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 5532890 5' - roo 9049 2 68.49 ATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 23067521 5' - roo 347 2 63.50 ACTGAGAAAAAGCATTCCAATCGAGTAACGGGAATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTC:1 + chrX 22743460 5' + INE-1 563 1 63.79 AAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr3R 15054190 5' + copia 41 2 53.42 CTCTTGTTTTTCTCGCTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCAGTATAGTATAAGTATAAGATATTATAAGATAAGATATTAATTATAAGTAGTATAAGACCACATATACTTA:1 - chr2R 4673662 5' + Quasimodo 18 2 41.78 AATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr3R 12780918 5' + hopper 9 2 79.45 ATTAAACAAAACCCGAAGGAAAAAAAAAAGCAAATGGAAGCTCTTCATCGCAGATTGCTCTTACCAGATGTTATTGCACCGATATATCCACACCGAGTGCGAGTCGCAGTTTGCAGCGCCAAGCTATGCGGCGACAACATAAGTTC:1 - chr3L 1375665 5' + Copia1_DM 4065 1 72.60 CTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 + chr3R 25554215 5' + micropia 40 4 57.53 AGATCACTGTTTGATCGGTTCACCAAGCTCAGTTCATTGTGCGTACAAATAGTTTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 24368994 5' - roo 9042 1 58.90 AATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATATGCTAGTGTCAGCA:1 + chr2R 19727745 5' + mdg1 250 2 70.55 AATACTGTTGCCATTGCCATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAATATTTTTTTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGATTGTCGGAGGCAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGGATGAATAAAA:1 - chr2L 13585776 5' - Quasimodo 7275 2 76.03 GTTAATAATCACACTAACATGTTTCGCTTAATATAAATAATATAATAAACAATTATAATAATATAATAATATAAATACAACAAAACAATTATTAAACAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACGATGTCTCATAT:1 - chr3L 22972464 5' - BS 4979 1 66.44 GTCACTTCTCCTTTTAACTCAGTTATTGATTTGTTAAGCATTTTTGCCAGAATCCAAAAATGCCTCACATAGTCTCTTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr2R 22992407 5' + hobo 2708 1 78.51 CTACACATGAAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCACTACATTCA:1 + chrX 21585248 5' + mariner2 275 1 60.27 AGGAAAGATAAATATATTCGCCTTTTAACATCCTAAAGCCCGACATAAACAGATTTGACTGCTCCCTTTGCTCTCTCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCATGAGCAATGCTCTCC:1 - chrX 22577356 5' + 17.6 7186 2 73.68 CAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCATCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr3L 14094666 5' + I-element 79 1 72.60 ATTTGCCATTGGCACATTCGTGTCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3R 23295605 5' - P-element 2856 1 34.25 AGTATGCAAATAAGAATTGAGAACATGACAGAAGTTCTTAAAGAAAATTATTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTGATTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAA:1 + chr3R 19448749 5' - roo 8871 2 77.40 AGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCACATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTG:1 - chr3L 14720886 5' + F-element 95 1 71.33 GCTCCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTGACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2R 18514983 5' + P-element 52 1 47.95 TCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 23067515 5' - roo 332 2 69.86 CTTTACCTCCTTTAGAGTTAGCGGGCGCAGAATACTGCCTCACTACTAGAATATTACTACGCTTTTAGCTTGGCGTAAAAGGCGACTAAAG:1 - chr3L 26290800 5' + Rt1b 4885 1 73.63 CGGGTGAGGTTGATGTCTCCCGGCTCTGCTGGCTTACAGAGCAGTTGTCGGGGAAACGGTGTGGATACACTAACAGTTTGCTGTTGTTTTCTGCATCATGGACGCTTATTACTCGCCGTTCTCT:1 - chr3R 11056803 5' + GATE 495 1 77.42 ATACCATGTAAAAAGATACTTAAAGGAAAAAAAAGGAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 24674234 5' + Doc2-element 237 4 50.00 TTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAA:1 + chrX 3431883 5' + G7 1144 1 62.76 GTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:3 - chr2R 24169990 5' - transib2 2764 1 57.53 AGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCTAGGGGGGAAGTTCACACATGATCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTCTGTAAATGAATCGTGAGCG:1 + chr2R 23180211 5' + roo 8724 2 66.13 AATTGGTTCTCTTTAATTTGAAACTGTTCACTTGAAATGCCACAGAGAAAAATTCTAATGACAAATATTCTTATATAAACTCATTTTTATGTACATAGATTAAGCTTTTACTATTTCAAAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTA:1 - chr2R 1845052 5' - 1360 311 1 76.03 TGCCACGCCCACTCTAACGACCACAAACCTCCCATTTCTTCTTGTCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTCACATTCACACTAGCTGAGTAGCTGATATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTTTAGCA:1 - chr2L 18111227 5' + INE-1 568 1 67.81 TTTCAATTATAGACCCGAAATATATATGAGAGCACAGAAACGATAAATTAACTAAAGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCC:1 + chr2L 22745905 5' - Gypsy6A_LTR 332 1 68.66 GAAAAATAAAGTTGGGCGAAACTTTTCTTAAGGGTACGATGCAACTCGTATATACATTTTTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3R 16512913 5' + Tirant 15 2 70.65 AATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chr2R 5479974 5' + F-element 87 1 68.57 ACATCGAAATAATATAGTACACGTTAGTTATGCGCTTGTTCCGGTTTGCATTTGGTTAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTATAAAGTCTTAGTCTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 - chr2R 17799154 5' + jockey 4812 1 57.64 ATTCGCTGTGGAAGAGAATTTAAGACTCGGATCCTGGAAAAGATTCAGTTTTTTCATTTCCAATTCGGTTTATTGTTCCCATTGTTTTTGCCACTGATTTCTTGTATGTTTTTTTTTATGTTGTATTTATT:1 - chr3L 5250785 5' - jockey 4994 1 46.56 ATTAAAGCCGCCGACATGCCGTGAAAGACTGTGTTCGGGGCAAAGAGGTTGCCGGGAGGGGGTGCCGAGGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 8075903 5' + 412 7089 2 41.82 AAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTA:1 + chr3R 23067457 5' + roo 9046 1 47.95 ATTCCAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr3L 14720943 5' + F-element 41 1 62.33 AAAACCAATCTTAAAAATCTTAAGTTATTAAACCTTTAGATTTAAGTAACTGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCCCAATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCCGTTGGTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTC:1 + chrX 2429630 5' - G5A 2510 1 65.75 CCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTTTAGTATTGGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTAT:1 - chr2R 22989665 5' - hopper2 1522 2 70.55 CCTCTAGTGTTTTAGGGACCTGCCCCAACCACTTTCCTTGCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 + chrX 959013 5' - 412 412 2 71.92 TGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 - chrX 12129417 5' - flea 204 2 52.74 ATTTAAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 - chr2L 13844284 5' + Stalker2 7284 2 60.27 CCCACGAATACCGTTTATCTATGTGATAGTCTACAACGTTTTGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAAT:1 - chr2R 15562861 5' - 297 6852 2 70.00 TCTTGAGCTCTATTCGCACCTCTTTCCCGGTACCATAGCCAACGTTTTTGTTATTTTTTTTTTTATTTT:1 - chrX 5420300 5' - gypsy7 5012 5 78.26 GAGTAAAACTTCTAGTGTTGTTCGTTCAAAAATATTCGGAAAAATTCAATAAAAAAACAGTTTCTATTATAATGTTAGTCGTATGTTAGAACAATTATACATTCAGTTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAA:1 - chr2L 18285918 5' + Bica 214 1 71.92 ACAACATTGGGCCCACAACAATTTCCAGGGCGAAAATAGAAAGGAGCAAGTCGAAATCTAACAAGAGGGAATGCTATAGTCGATTTCCCCG:1 + chr3L 19435263 5' - INE-1 570 1 56.04 CTCGGTTTTCCACCCGCACACTTGAGACAGCAATGAAATTTATTTCGACGAGTTTTCATTTGATTTTCTCTTTCGTAAAAAATTTTATTTGCTCCCCGACTTAGAGTTTTGTCTGTCGTACTCGTTATTCGCTG:1 - chr3R 23621571 5' - HMS-Beagle2 350 1 54.48 TCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chrX 18282670 5' + P-element 29 1 47.92 ATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCAT:1 - chr4 829109 5' - INE-1 139 1 58.39 ATTGCATTTGAAAATCATTCATTGCTGTGCGCTTATCATATAATTGATCTGCAATTTTTAGGGTTTTTTTTTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 + chr2R 21444307 5' - jockey 4946 1 58.90 AATGTAGCGAATTCGTTTTGATTTCATAAAAAAGAAAATTATAAAACAAGCTTGTTATATTTCTCAAACTACTTGTACCTTATTTACTTAATATACTACACCTAATATGACTGCTACATTATTCTTTATTAAAATAATTTTATTTT:2 + chr3R 20394804 5' + 1360 3092 1 63.01 ATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:3 + chrX 18817301 5' - transib2 2739 1 75.34 TGGTTATTTCATAGTTCAAATGTGTGTGGCATGGGCAAATAAATAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 - chr3R 25428240 5' - 297 330 2 71.64 CATATATACATATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 9871608 5' + roo 19 2 73.29 CATCAGCTGGCTGTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 28146115 5' - roo 9006 2 62.07 AATAGCTGAAGAGATAAAACCGCATATCTGTGATAAAATATAGTCCAATTTAAATAGCGGTTAAAAATGCTGGAAAAAGTCTTGTAAGAATGTGTATTTGGCTGCAGATGTGAACTGTTTATACATACATATACATATGTACATAT:1 + chr2L 3787405 5' - G3 4507 1 76.71 AGAATAGTTAGTCCGAGTAATAGAAACTGCTTTTGTTCCTTGATAACTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 22776634 5' + F-element 4680 1 70.55 ATAAGTAAACATATAAATTTATGCGTGTTTGTATAGGTGGGCAGCAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGATCGTCAGATGCGCTCATATTTTAGTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTT:1 + chr2L 11181400 5' - Porto1 180 1 69.18 AACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTA:1 - chrX 22840536 5' - copia 157 2 83.56 AATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 24219289 5' + roo 81 2 74.66 CAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:2 - chr2L 15940311 5' - pogo 2038 1 61.64 TATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTA:1 - chr3L 15103899 5' + Transpac 68 2 65.75 TAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTG:1 - chr3R 28959225 5' - TAHRE 10379 1 68.97 AACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 - chrX 18409435 5' + jockey 4724 1 74.51 ACGGTTCATGCTCACCGCTTTCTGTTGCGTGTGGCAGGCGACACAAATGTGAAGCAAACAAAATTTAACTGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTG:1 + chr3R 19354700 5' - 1731 4474 2 59.84 GGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chr3R 27405944 5' + diver 40 2 57.53 AAACACATTGTTTACATTTTCATATTATTACATAAAAAGTTCTTCATTGTATTCAAAACAGTTATATATATATTTTAATTTTAATTTTTATATTTAATTTTAAAACAAACAAAGTCGAGTTTCCGGACTATCCGATACCCGTTACT:2 + chrX 21004268 5' - INE-1 550 1 79.45 TATAATACTATATAATACTATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 + chr3L 14578736 5' + Juan 4075 1 58.90 AGAGTGAATTCCGAAATCCGTGCATATATAATTAAGTTCTATATATGTGTATAGTAGATGTAAGTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGCTTACT:1 - chr3R 19056044 5' - Doc 4438 1 54.79 AATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTATAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 + chr3R 23639165 5' + pogo 81 1 74.65 GGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr2L 47098 5' + roo 8732 2 65.75 TAAGGGGGGTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 - chr2R 9967180 5' - Bari1 1694 1 75.34 GCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATATCTCTTTGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTTTGCGATTTGCTTATCTCGTAGTTACCATCGCCCAGCTTATCGCCG:1 - chr3L 18125976 5' + Ivk 77 1 63.89 GACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTATTATGTTAT:1 - chr3L 13581702 5' + jockey 4835 1 79.03 ACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr2L 7593114 5' + jockey 4688 1 54.67 AAGGTGTCATGTTGAAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTG:2 + chrX 7045552 5' + P-element 196 1 19.31 ATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGTCTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAAC:1 + chr3R 25099120 5' - R2-element 3220 1 73.61 AAAAGGATATGAGTAGAGTCTTCTTTTTACAGGGCTTATCAGTAAAATTCTTTATCAGAATACTGAAAAAGATTACAACACTACTAAAACAAGATAGAATGCCATAGTCGAGTTCCAAGACTATCAGATACGCGTTACTTAGCTAG:1 - chr2R 101025 5' - INE-1 543 1 55.48 GTAAGTGGTGGAAGGAAAACTGTAAATAGTGAGGAAGAGGGGTGAATACAGACAAGCAAGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGT:1 + chrX 7338107 5' - I-element 4927 1 60.27 CACCCCAACCAGAACAGAAAAAAAAAAACAAAAAA:1 - chr3L 15365909 5' + gypsy7 5013 5 85.71 GTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTAAACCTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAA:1 + chr3L 20189571 5' - FB 236 1 40.43 CGGGACGTCATGTTTTTTGAAGATTACTTGGGCAGAAATGGTTTGCCTGGTGAAACGGAGTTAAAATTGGTTGAACTCCAAGGCAAATCTACGCTTGTGGTTGGTGAGTTGGCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTT:1 - chr3R 1521113 5' - Doc 492 1 76.55 AAGGAAACTGTTAACTGGGTCCATAAATTCAACTTTGTTGTATATACATACATACATACTGTATGTTCATATAAGTACGTCACTTTAAACATCTGCCTTCGTTTCCTTTAACTAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTT:3 + chr3L 21821366 5' + Tc3 314 1 77.40 AAAAAAATAAAGAAAAATTTTGCAGGTGGAAAATTTGAAAAATTTTGCGCGGACTATATTGTTAAATAAATTTAGTTTAATTATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTG:1 + chr2L 13048517 5' - TAHRE 10437 1 70.55 ACACACACACATTCAAATCAAACAACAAATCAATCAGTCAATCAACAAATCAAACCAATCTGACAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAA:1 + chr3R 4952057 5' + I-element 5199 1 56.16 TATAACTGCAGGCGCGGGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAA:1 + chr2R 16929760 5' + jockey 4535 1 69.86 AACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCGTTGCTTATC:1 - chr3L 18126006 5' + Ivk 47 1 46.53 TTCGGTTATCCCTATCGTACTTTCTCGCATACTTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2R 19199804 5' + hopper 4 2 67.81 ATATGTATATATGCATATATGTATATATGTATATATGTATACTTACACACACACACACATACATAACCACATTGGAACAGCC:1 - chrX 9463052 5' + Quasimodo 55 2 52.44 GATTGAGTTTCGTTAGGAACTCGCTTTATAACCAAAAGCAGAATTGCGGACTCTTTAGAACTTTTTCTTTCATTTAGTGTAACTCCATGTCTTCAATTGAATTTTTTCCAAACT:1 + chr2L 13048774 5' + Tc1 316 1 71.93 TAAATGGCAACTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCG:1 + chr3L 5389833 5' - roo 9041 1 65.07 ATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 - chr3R 4679592 5' + hopper 20 1 70.55 CGGGGGCATTATGCATGGTTTATTCTTCGCTAAGCCGCAACAACGGCGACGAGGAGGGTTTTCAGTTTAGGGTTCGTGTTTGGCTTCTTTTTTTTTGCGACAACGTTACTGTAGGATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAA:1 + chr3R 24450375 5' + 412 15 2 67.59 ATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTAGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr2R 14653156 5' + 297 6630 2 56.85 CATAATTACAGTTGCATTCCGTGTGCAAACACCTGCAGGCACACACACATACACACACACACACACACACACTAATAACTAGGTGCCGAAAAGAAAGCAAAGAGAAAGCGCAGGCATGAAAAAAAATGGACACACACACACACACA:1 - chrX 10169079 5' + accord 7026 2 78.77 GGAAGCTGCTTTGGTTGAAATGGGCAGGAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGC:1 + chr2R 6965435 5' - Transpac 307 2 73.97 ATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:3 + chr2R 15326857 5' - copia 5081 2 68.49 ATCTCGTACACGTAGAGTTCAATCTTTTAAAGAGTGTAGAAAATGGTTTGCTTCTTAAAACACACACAGTCAGACATGGAAAATGAAAAATGAAAGCATTCAAATTGTTCGTATTACAAACAAAAAAAGAAACAAATAATAATAAA:1 + chr2L 9794441 5' - accord2 457 2 61.64 GGTGGTGGCAGTGGGCGTGGTTGATTAGTTTATAATTATTAAATTTTCTAGTCTTAGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGCAACATTAACATATTGCAAGGTTTGTTTACGTTTAAC:1 - chr3R 22252846 5' - HeT-A 5827 1 77.12 AAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:2 - chr2L 18347415 5' - transib2 2792 1 63.70 AAACAAAATCAACAAATCTTGTTTTTCAATCCCCTTTACCAAATCGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATA:2 + chr2L 12134506 5' + jockey 4836 1 69.86 TATATATTATGTTGTCTTTTTATTTAATAGTAAAGAGCGATTTTACGAACTAACATTATCATTATTACGAATACACATACAGTTATACAGAAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCG:1 - chr3L 17546360 5' + invader1 171 2 63.45 TATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:3 - chr3L 14366648 5' + roo 8708 2 58.22 ATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTTTAAATGCATCGCTGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATA:1 + chr3R 19450145 5' + pogo 164 1 63.96 TATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 + chr3R 11937266 5' + flea 4782 2 69.86 GGATTAAGCTGCTCGTATATTAATAAATCAGCAATTATTTAGTTTCGATTATTCCATGATGCCTTCAGACCAAAGCCACTTCGCCTTCAATTTACATACTTTTTCTCTAATTGAAACATTAAGATTATTAGTATTATTGTTGTTAT:1 + chr3R 20305522 5' - mdg1 7067 2 45.89 GGGGTTCAGCTAGAGTCCCTGATTCTGCACTTGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 18488518 5' - roo 399 1 74.66 GGAAGTAGATTCAATTTATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 - chrX 1799262 5' - invader4 304 2 70.34 AATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr2L 23381788 5' - flea 244 2 78.08 AAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACCAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr3R 4805703 5' + 1360 62 1 58.22 AAAACAAATGAGGTCTATAGAAAACAGTTTTAAAATGTTATAGATATCATGCAAGTGCTAACATTTCTATCAAAAAACCAACGTAATTATTGGTGGATTTTTCATTTCATATTTTTTCAAAAAATTTTCTTTTTTTTTAAATTAAA:1 - chr3L 3547830 5' - transib2 2633 1 78.08 AGATGACTCTCATGTTAGATTTTCCAGCAAGGAAAATAAAATTTAAATTGACTACTTGCGAAATATAACATTTATATAGGATAGGCAAACTTTTTATAAAAAAAATCCACTGAATGTGGAATGAAATAATAATAACAATAATAATA:1 + chr3R 13765157 5' + mdg1 25 2 50.00 GTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAA:1 + chr3L 19274819 5' + transib2 92 1 78.08 ATTATCGTTTGGTACTGTGTGACTTCTTAAACTTATAGCTCAGTAGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 16564470 5' + roo 8713 2 57.53 CAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2L 19924048 5' - roo 9018 2 53.42 TTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr3R 20441305 5' + I-element 79 1 69.18 AGGGCGATGTCTGGACTGAAAGTCGGTCTACCTACAAGCTCGCTGTTTTTTATTGTTATTGCCAGTTGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAA:1 - chr2L 19341970 5' + F-element 4508 1 64.15 TATCGTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 - chr2R 12472155 5' + transib2 27 1 67.12 ATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3L 3030220 5' - roo 8991 2 78.77 TTTGGTATTCAAGCGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGTCGGGAGAAGGATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3R 4460999 5' + blood 7022 2 47.41 ACGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATG:1 - chrX 9950592 5' + jockey 4751 1 72.41 AGACCAATTTCTATTGTTAGGATAAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:2 + chr2L 21328119 5' - 297 6951 2 68.49 ATGAACGTGGGTTTTTCCAATACGTGTCAATGGTGACTTTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGC:1 + chrX 17094540 5' + F-element 239 1 67.94 AGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGG:1 + chr2R 19199651 5' + hopper 47 1 52.05 CATTTCTTATTAGGCCACCGATTGCATCGGTGTTTTGTCCTTGTCTTCGTACTTGTAGATTTTCTAGCTTTACTCGCACAAAAAACTAAACATAAAACATAACGTTTTATTTAATTTTTATATTTCACCACTCACTAATAAAATCC:1 - chrX 748478 5' + accord2 7332 1 75.34 AGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 31653172 5' - roo 9017 2 56.85 TTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 20898620 5' - roo 9021 2 61.54 ATATGAAAGTGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATT:2 + chrX 3431831 5' + Ivk 5331 1 63.01 GAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACC:1 - chr3L 16470368 5' + jockey 4731 1 55.48 ATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 + chr2L 17180050 5' - Juan 4178 1 58.90 CATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 11661497 5' + pogo 52 1 59.29 AAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3R 26774079 5' + hobo 53 1 74.04 AATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGAATTTATTTAATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTACGGTTTCAAT:1 + chr3R 20167576 5' - roo 9011 2 55.48 ATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAATGCTTTCATCTGACAT:1 - chr3R 24381366 5' - Juan 4124 1 75.34 GAACGTAAAAACTTGTGCATAACTCAGAAAAGTCTTAATGAATTATGAGCCCAACGTTGCTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCT:1 - chr3L 13307760 5' - Idefix 261 2 58.90 CAAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr3L 18505779 5' + I-element 24 1 69.18 TTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:2 - chr3L 20711717 5' + jockey 4802 1 53.42 CAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 - chr2L 15936883 5' + copia 43 2 56.16 AAGGAATTCGTTTCTATAGATATGAAAGTAAAGTATTTTGTGATAAATACTAAGACTTTTTAAAATAATAAGCTTTTATAATTTTTAAACTAGTTACAGAAAAATGCGGTATGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACT:1 - chr3R 22127119 5' + invader1 3818 2 64.38 TGTTCTTGCATATCCTTATTCTCTTTTCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGA:2 + chr3L 23033297 5' + mdg3 5173 1 81.51 CTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 5389843 5' - roo 9047 1 65.38 ATGTGTATGGTATGTAAAGCATTCAAATTTGCAAGGTATGGCCTCGATACAACACACAAAAAAGTTTAATAAACATCGTAATGCATTTTATGGATTATTAAAAAAAAAAACTATTTAGAATCTTTCTTTTTCCTAGTTTTTTTTT:1 + chr3R 13218930 5' - Doc2-element 231 1 52.41 ATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:2 - chr2L 16564558 5' - roo 8995 2 73.97 GGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTC:1 + chr3L 19349948 5' - 1360 3311 1 72.60 ACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 - chrX 13490729 5' - 297 6895 2 80.82 AGAGCAATGATGAGACCAATGTGAACTGTCAGATGACACCGAATTCTCAAAATGTTTGTATACACTTTCTTAACAGTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 - chrX 4799971 5' + jockey 4684 1 55.48 ATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTG:1 - chrX 15200925 5' - 17.6 419 2 71.92 ATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTCGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 16970366 5' - roo 9006 2 63.70 GGTTGGCACCAGTCACCGTTTCAGGAAAACTTTTTATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGC:1 + chr3R 19445936 5' - 1360 47 1 58.22 GGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGGCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 - chr2L 4713974 5' + transib2 47 1 52.74 TAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGACTTTCCAATTGTGTGGGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCAT:1 - chr2R 23780614 5' + Ivk 60 1 53.42 TGTTGGGGATGGTGTTGGTGTCCATGTTGGTGTTGGTGTTGCTCGTGGTGTTCACGATGATGATGGTGGGGGTGGTGTTGTTCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTT:1 + chr3L 13872031 5' + micropia 201 2 60.00 AATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 6102928 5' - roo 9023 2 57.35 GGAAATTGTTGAAATGTTTCCCAGTTCCTGTGCTTCTTATTCGACTCGCCGCTTTTCGTGCCACAAAATTGAAATTGTGGCCAAATGTTTTCGCCAACGGTTTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAA:1 + chr2L 10164248 5' + hopper 366 1 75.34 ATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACAGTTACC:1 + chr3L 16662345 5' - jockey 4972 1 67.14 ATGTAAATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGT:1 + chr2L 10156066 5' - hopper 1397 1 70.55 GTAGGAGTTATCGCTTTAATTCAGATGCTGCTGGTCAAGAGCAATATTTAAGATTGGCATTTTAAGGCCTAAATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAG:1 + chr3R 6626774 5' + flea 448 1 53.10 CATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1 - chr2L 4123936 5' + transib2 76 1 69.86 CAGACACGAGCTGGCTAATAGAAGCATTAGACGGCTGGACTTCGCCTCCGCAAATGAGTAAAAAGAAAAGAGAGGGCGTAGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAA:1 + chr2L 13567910 5' + transib2 2745 1 57.48 CTTGACAGCCTCATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 - chr2R 20227324 5' - hopper2 1552 1 56.85 GAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:2 - chr3R 11040136 5' - Bari1 1624 1 73.29 CCAGCATTGTTTATCCGCGTGCCGATCCGATCCGATACCACCATTATTTTTGGCGACAGTTCAGGGTTATACGGTATTTTTGAAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTG:1 - chr2R 24073983 5' - Stalker3T 277 1 58.90 GTAACACGCAGTTTTTCCATAGCCTCCGGGTCCACGTGAACCTTGGATCGTAGAAAAGCAAATGATGATGGTAATTTTAGAATAGTGGAACAGTCGAACGTTAACCGCTTTCTACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGGTGA:1 + chr3R 13835497 5' + Quasimodo 459 2 76.03 TCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3L 21769122 5' - I-element 5302 1 54.11 CACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGCAGCTTTGAATGAAC:1 - chr2R 6482544 5' + gypsy 7020 2 56.59 AGCAGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3R 6419803 5' - Tabor 7303 2 68.97 CTAGCTGAATCTAGAAAATAAGAAGAACATTTCATAGACGCAATCCTAGAAGCAATAAGCACACCCGGAAAAGGAAATGAAAGTTAGAACAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGAC:1 - chrX 20769205 5' - Doc 303 1 61.64 CGACAAAGAAATAGCCAACTCAATAAAAGCAACAAGATCTGAGAAAAAACAGAAGCCATCCGCACTTTGCAAGCCACCCACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGG:1 - chr3R 6778357 5' + Ivk 5037 1 62.02 ATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGCACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAATAATGCGTTTTTCAC:1 + chrX 19038345 5' - hopper 1388 1 62.96 GGCATGCACGTTCTTACCAACCCAAGTATTTAGTACCTGCGGCATGTGTTAACATAGGTTTTTCATTCAGCCCTTTTTATTTACTTACAGACTTTTTTCAAATTTTGGCATAACATTCAAGGGTTTTTTGGATGTCCTTATATGGT:1 + chr3R 14001813 5' - HB 419 1 65.07 ATGTGGAAAATAATTGTTATGGCCGTACCGAAATCCTTTCCCTTGCAATTTAAAACAATTTGAAACACTTTGCCGGCGCTTAACATGTCTATCCATGTGCCACAGCAAACCACTCCCAACCAAA:1 + chr2R 15032319 5' + G2 100 1 68.55 GCATTTGGGGGCGCTAATCTGATGACGCGCAGTGTATATACTGCACAATCGATGCTGAATGGTGCAGAAAATATAGAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTAATTACAAAATTAAGGGCTCTTTGTT:1 - chr2L 21396822 5' + S2 59 1 69.86 TGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 - chr2L 4713971 5' + transib2 50 1 56.16 CACCAAGTCCGCAATAAATTAACCGCTCCACGTCCGTCAGTATTATTCAGGCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 25616599 5' + roo 69 2 67.12 AGAAACATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr3R 7666736 5' - I-element 5306 1 52.74 TTCCAAGTCCATTATTTTTACGAACTGAAAGTGTCCACAATGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGGTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGGTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAATTGCTTGG:1 - chr2L 17180328 5' - Juan 231 1 69.18 ATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCT:1 - chr3R 27083139 5' + jockey 4540 1 66.97 GACACAGAGGGCCGGGTTATTGATTTTGAAGCTTGAAGTTCCTGACTTGCATTCCAAGGAATTATTTTAAGGGTGGGCAAATGACTTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGTAACATCGAATTTTTGAAATT:1 - chr3R 30813603 5' + FB 22 1 52.74 GTCATTCATCGCGCTGTCAGCTCGCTTCCTGCTGCACTGGAATTTTCAGTCTCTCGGGCGAAGTTTGGAGGGAAAGTTTTTTCGGTCAACTACACGCACACGTTGTGAAGGAATGGAGTGCGACTTGGCCTCACATCCTGCTCACC:1 - chr2R 20432353 5' + Rt1b 4956 1 76.71 CAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTTCTTTATCCCTTAT:1 + chr2R 18258763 5' - Juan 4201 1 62.18 AAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 + chr3R 19450014 5' - roo 8618 1 59.59 GAATTATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 23639097 5' + pogo 17 1 72.60 GGGGAATATTTTAAGCACTAATTGTTGTTATGGTGAATATATTTAATTGTCATTTCTCGCAGTATGCAGCCAAAGCCGCCTCCAACGGAATGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAAGCATTTCATA:1 + chrX 8698126 5' + Doc3-element 4621 1 58.22 GTTCTGTTAGATTTATTTCCGTTTTTCTCACTTTTGTTGCAACTTTTTGTCTGGGCTACTGGGGAATCCACGTCAGCACTCCAAAGAAGGTTTTCTGCGGGCTGGCCTGACAGAAACTGTGATCCACCAATGGGCAATG:1 - chr2L 10957214 5' - HMS-Beagle 484 1 68.35 GTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3R 11191472 5' + roo 26 2 60.00 AATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 19450153 5' + roo 51 2 60.00 TGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCT:1 - chr2L 15779630 5' + hopper 78 1 71.92 TTAAATATTTATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 - chr2L 9247304 5' - HeT-A 6062 2 47.26 ATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr2R 17796567 5' + jockey 4709 1 60.58 GGTAGCTCAACTCCCAGCTTGATTCCGTGTTGATAAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2R 17926250 5' - opus 490 2 77.93 ATTTGCCCTCATGCAGACAAACAGCGCCGCATTTTATTTTTTTTTGTACCCTT:1 - chrX 11039411 5' - G2 3070 1 84.91 ATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTT:2 + chr3R 27405981 5' + diver 5965 2 67.81 TTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr3L 24291995 5' + 1360 66 1 74.80 CAGAGCCGCTTGAGCAGTGGCAACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 + chr3L 19274762 5' + transib2 26 1 65.94 CAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chr3L 10373812 5' - 297 6922 2 58.90 TATTTATTATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 - chrX 5323175 5' - Juan 4204 1 35.62 ATTTGCACCGGTAACCAAACTGTTTACACACAATAGCAATGATGTGGGTGTGTTTATGCATAAAGTCAATTGTTTTTGCACAGACAAAACGACACGAA:1 + chr3L 24041090 5' - G3 5 1 78.57 GACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 12251011 5' + 412 42 2 52.41 AGCAATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACA:1 - chr3R 11040184 5' + Bari1 36 1 61.64 TTTTCCNGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 - chr2L 4003765 5' - mdg1 340 2 71.92 TTGGTAAAACCCAAGAAAATCACATGTGTCCAACTGCGAAGAGCTGGATTCTCTACATTCTTTAATTATTTAATTATTATAGTATAATCTCATATCCCTCTTCCTATGCACATAACATGTGGATTTATTCATACTT:1 - chr3L 5945861 5' + Fw2 3673 1 63.24 AGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAACAAATATTGTTTA:1 + chr3L 17567891 5' + S-element 1602 2 71.03 CAGCAATCCACGTGGTGACGAAGCGCATTAGGAGAGTGTCCGGAGGAGACTTAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAAT:1 + chr3L 25107562 5' + F-element 137 1 50.49 TATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAA:1 - chr3R 11062833 5' - roo 349 2 54.86 AATAAACTGCTCACTGGTGGTGTGTTGTTGTTGTTGTTGATGTGTTGTTGTACTGTTGTAATTGTTGTTGTCACTCGCATTGCGGCTGTTTAATTGTCATTTCGTGTTCAGCAACCGAAATGCCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGG:1 + chrX 11307551 5' - transib2 2378 1 82.88 ACTTGTGCATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2R 15376209 5' - 1360 3350 1 58.22 AAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 19449951 5' - roo 9020 2 67.16 ATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGCTTGC:1 - chr3L 12315805 5' - transib2 2745 1 67.12 AGAGGTTTGATACTCTCGAACGCAAATGCTCGATCAAGACTGAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAA:1 + chr2L 21829228 5' + Doc 4490 1 71.23 ATGTTGTTTATCTGCCAGTGCCAGTGGCACTCCTCCTGCTACCACTCCATCTCCAGATCCCCGCTGCTACGTCGAGTGGCATGTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAATTAGATT:1 - chrX 6144425 5' + 1360 317 1 67.81 TATGTGCCAGTTAATATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:2 - chrX 14450547 5' - hopper 1405 2 78.77 GTTGTTGTTGTTCTGGTGCTTGGGCGTTCGCAGTGCTGCAGTTGTTGTTGTTGCAGTTGCATGTTGCTGTTGCACTTTGTGGGGGTCGCCGCCGGCATCTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCT:1 - chrX 1636503 5' - Stalker 6906 4 67.81 CTATTTTTTAATTGTAACCCTGAATCATAAAGAGTTCTCTTGCATTCTCCTCACTCGTCAGCTCGCAATGATTTCTTCCCTAATTAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAAT:1 + chrX 692708 5' - FB 185 1 61.64 AATAAGGCGCACTGCCAGAAAAAGGGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATA:1 + chrX 20999462 5' - BS 5076 1 69.86 ATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr3L 2145959 5' - roo 315 2 79.45 TGGAGCAACTGGCAACCAGCAACTTGCAACTTGCAACCAGGGAACGGCCTCGAGTTCCGACCATGCAATTATTTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTAACGCAGCTCAATTTCTC:1 + chr3R 8228387 5' + Quasimodo 6959 2 67.83 AAAAAATAATTTTCTCAGAATCACCGCCGAAATTCGACAAGTCCATGCAAAAATGGTTCAATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTG:1 + chr2R 11653891 5' - hobo 2670 1 58.62 TTAACATTAAGAAAGTCGAATTTGTCAAAGCTTCAATTGCAGACTCAATTTCTTCTCATTCACATGTGATCCAAGGGGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 - chr2R 17878594 5' + Doc 84 1 47.26 ATTATGCAGTTGTAAAGATTTTTAGTGCTAATAAAGTTGAATTTGAATTTGAGATATATGTTATATACACAGAAGTAAATAGACGTGTTGCATGATGCCTTTCTTCTCTCTGTACATCACAAGCGCACTAAACACATCGATATTAA:1 + chrX 21210228 5' + Copia1_DM 4122 1 74.66 ATATCCCGTCACCGAAAACTAAAAGCGACTCAGGCTAAACACATAGAGCAATGTGTTTATTTTCACTTTGGTAACGAGTCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 + chr3L 9278997 5' + copia 4880 2 58.22 ACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr2R 6847818 5' + Doc 80 1 76.12 CAGAGCCCTTGATCTATTCCATCCTATAACCCATACCCTATATGTAGTTAAATGCAGATACAATCCTACCTGACTCTGCCTCTTTGGGCGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACATAGC:1 + chr2L 3814930 5' + pogo 334 1 56.85 ATTGCCATTTAAGTTGCGTTTCCGGCAAAGACGACCGGAAAGTTTGTGCTCATGGATTTGGATTTGGATTTGATGAGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATG:1 - chr3R 10658345 5' - Idefix 5 2 59.59 GACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 11804741 5' + pogo 49 1 54.11 AGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr2L 16946150 5' - hopper 1373 2 55.48 AAGGTCAAGTCGTCACCACTCCCGATTATAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 - chr2R 19941661 5' + hopper 34 1 62.07 CAGGAAGTGGTAGCATTTGAGGGAGGCCAAGCCAAAAGTAACCAAAAAAATCAAAAA:1 - chr2R 14417891 5' - Tc1 1402 1 80.70 AACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:3 + chrX 2214235 5' + jockey 4804 1 54.79 CTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTT:2 + chr3R 904967 5' + rover 7027 2 82.19 ATCCATTAATTGCTCTATAGAGTACACACACACACACACAGTGC:1 + chr2R 11600901 5' + accord 7103 2 84.09 GAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:2 - 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Juan 4200 1 75.34 AGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2R 14051831 5' + roo 25 2 70.00 ATATGCAATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:2 + chr2R 7090630 5' - I-element 5300 1 54.11 CTTGTCGCCCACTTCTATATCTATAATAATATCTCTCTCTCCAGAGTCTAAGGTATTCTCGCAGATATCCCCAATGCCCGGTATTTTGTCACGGATGACTCTGTCTAGTCAATCTAGGCATAAGCTTATACACCCATACACCCATC:1 + chr2R 3681687 5' + mdg3 82 2 71.23 ACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGGGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTT:1 - chr3L 13256530 5' - 412 7081 2 80.82 ATTTAAAAATAGTTTTTTTTTATTATTTAATATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGT:1 + chr3R 2627686 5' - hobo 80 1 53.85 AAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACACACTGTTACCCAGGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr3L 4219554 5' - jockey 4944 1 54.79 GTTGCCCCGGAACTGCAAAACCGAAGCGCAACATAAACCGCTCAAAACTGCCACGCAGTTATAGTAGTTTTATTAGTCTTGTAAATCTCTATCGATTTGTCACAAAACTGTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCA:1 - 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I-element 5321 1 78.08 ATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATATCAC:1 - chrX 20999574 5' + BS 74 1 71.23 AGTGTGGCGCCAACAGTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGCTTTTTATTTTGTAGATCGC:1 - chr3L 24934439 5' - HMS-Beagle2 291 2 73.29 AGATTGTTTTTGTGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chrX 8437617 5' - P-element 2863 1 69.86 AATCATAACAGTAAAATATGTTTTTAATTTTAAGTTAATTTAAAGTTCAAAGACTGCAATGTTTGTAACAGGCACAAGGAAGTGTTCCCGACCATATAAAGTATATACGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATATGGC:1 - chr2L 22758179 5' + INE-1 100 1 58.90 AAATACGTGAATCGTTAGCCGTAAACAACAAAACAAGACACTTGCGATTTGAGAGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 12249755 5' + roo 8 2 76.43 TTTTGGACGATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - 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opus 441 2 63.70 AGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:1 - chrX 20999638 5' + BS 10 1 72.60 GGTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGC:1 - chr2R 9967173 5' - Bari1 1687 1 70.55 TTTTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTTTTTATTTATGCCTGCTTTTGTTTTGGCTTTTTTGGTATAATTTAGTTGTTTTGAGGTAAATTATGTGGTTTTGTATGT:1 - chr3R 18266519 5' - 17.6 6940 2 76.69 TTATTCTTGTCTACGCCTACAGCAAGCACGTCTTTTTGAAGAAAAACAGGCACACACTGACTCACACTCATCCTCACACTCACACTCCCACCCCCACTCACACACACACACACATA:1 - chr3R 7304103 5' + Quasimodo 34 2 54.31 ATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 23287195 5' + 1360 22 1 67.67 TTATATGTATGCATACAGGGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr3R 15325205 5' + 297 26 2 60.90 GTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr2R 6847854 5' + Doc 55 1 53.10 GAGATGAAAAGCTGATGCTGAGCTTGCTGAATTTTTGCCAATATTTTGCATGGGCCACTTGAAAGTTAATTACAAGATTCGCCCCCTCATGTACCAATGAGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAG:1 + chr3L 8923657 5' - Quasimodo 36 2 78.20 ATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:2 + chr2R 22034613 5' - copia 231 1 68.49 AGAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAA:1 - chr3L 22035597 5' - 1731 4547 1 70.55 CTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGA:1 + chr2L 4754840 5' + Stalker 6871 4 50.68 GTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCAT:3 + chr3L 19454921 5' + mdg1 7095 2 54.79 GAATTATTTCAAAATTTCAAAATCTCTTCTATTTGGGGATCCATCGGTTGAACAACAGTCAAATTAACACCCACACCTCCTTCGCCAGCCATCCATCTCCCTTTAAAACCGCTTTCATTTGTATAT:1 + chr2R 4547537 5' + transib4 2451 1 69.84 AACATTAGATCCCAGTATGAGCCGGACCAAGTTTTAATCCCTTCGCACTGACAGATGTTAGACATTAGAAAGCCTAGATAAAAGTATGGAGTTTACAGCAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTATCAAAAAGTTTTGGGAT:1 + chr2L 4687351 5' - Q-element 136 2 67.81 TGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:1 + chr2R 20010214 5' - Juan 4135 1 72.60 ACATGGTTTATTTCATTGCCTCCTCTCTTATTTTCTTACTTTTCTTATTGATAATTGTTGCAGGCCTTTTCCGACCCTCCCCTCACCCTTTGCTATTATGCGGGTTCCTATTTATTATCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAAGT:1 - chrX 17506408 5' + micropia 183 2 57.24 GATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTG:1 + chr3R 4357544 5' - Tc3 1650 1 66.14 GGCAATTGAAGTAAAGGTACATATACACAGTTTTATGTATGTACAGCTGTGTTAATTGAAGCAGTGCTTGGGACCTACGAGTTTAAGATACAAAATCCTTTGATACAGTTCTAATGGGCAGAAATTCTGGTATTCAATGAAATAGC:1 + chr4 839976 5' - HB 1431 1 69.18 CTTAATGAAATACCCATATCATAGTTTCTGAAAAACAACTTGGTTATCATTGTAGTCCTTTTTTTTCTATTTCCATTTTTATGTAGACCTAATCAGAATAGTTGAGCTTATTCTTGAAGTGAAGTGAGGACACAAGCCCTCAACAA:1 - chr3L 19081021 5' - 1360 459 1 70.55 CATTACACTTGGGAAAATATCTGTATATTAATTACTAACTTGTGAAGCAAGAGTAATTAAAATTAAAAAAAAAAA:1 - 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BS 5058 1 56.16 AGCGATCGAGCCAAATTAGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:2 + chr2R 5106221 5' + Stalker2 7270 2 71.92 AGACTTTGGGTGTAGGCAAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 - chr3L 4219572 5' - jockey 4963 1 48.97 ATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:2 - chrX 18396183 5' + roo 59 2 60.96 CCCCCATCCCCTGGCCAATCCCTTTTGCATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chr3R 15807412 5' + FB 71 1 77.87 TGATAATGTTTATTATATGTATATCTTTCTTCTCCCACGCCCACTTTAACGCCCTAAAGTCGTCGAACCGGTGACGCCCACACTTTGGAACAATTCTTAAATTTTTTCTCATTTTAATCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAGA:1 - chr3L 11360590 5' + INE-1 499 1 79.45 ACTAAATTCTAAATTTAAATTTAAATATTTCATGGACAATTCTTAATTTAATTCAAAACAAAAAAATAAAAAAAATTATCTCCACCGGTCATTTTTTTTTGCTGTTTTTGATTTTTTGTCTTATGCTG:1 + chrX 22761900 5' + 297 6853 2 72.66 CCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chrX 18409487 5' + jockey 4716 1 56.85 AGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGGGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3L 25401028 5' + Doc 41 1 46.58 TGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGAGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 2145998 5' - roo 354 2 50.68 TTAACATCATACGATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr2L 13556294 5' - transib2 2808 1 74.66 AGGGTATGAGTTAAAGTCAATGAAATGCGTAGTTTATTTCAGTTGTAAATTGGTTTTCCTGTACAATTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTT:1 - chr3R 1006125 5' - Doc 4433 1 54.11 GGATCCCACGTTTGTGGCACCCACGGCGGTGTAGGAGAAGAATCCGTGCTTCCATTGGCCCATGTACATACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGG:1 - chr3R 24053087 5' + Cr1a 4044 1 52.74 GGGGGATTTGAATTTTATGCTTCTTGGGCTGCAATCATTATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3R 27133712 5' - opus 7488 2 75.34 ATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATA:2 + chr2L 22121325 5' - I-element 5319 1 62.33 TTTTATGAAAATTTAGAGCAAGTTGCTTTCTTCTTGTTTATTTATATTAGTATCTGCTCAGATATTTTTCTGTTTACTTTGCTGTCTTGTAGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 1349028 5' + roo 8694 2 47.26 AAACAAAGAAAATCTGATTTATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 11062686 5' + roo 8678 2 75.86 TAATTGATTTAAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr2R 3563063 5' - Transpac 273 2 60.27 ATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr3L 2544658 5' + Tirant 8149 2 80.72 CAGCCAAATGTCTGATTACCGCACACCATCACCACCACCACCACCCCCGCATGAAACTTTTGGCAAAAGGTTTTGATATTTTTTCATATTTTTGTGAATTTTTATTGATTTGCCAAAAACTTTTTGCCATGCCCACTCTAACGTTC:1 - chrX 12041427 5' + INE-1 212 1 60.96 GCTTCTCTCATTTTTCATGCGCGCCAGCTAAGCTTTTAATTAAATGCAAGAAAATTCAATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTTGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTAC:2 - chr2L 15881612 5' - gypsy5 268 2 57.53 AACGCTGACTAAAGACACACTTCTTGAACTTCGTTTGGCAGTAGCTAAAGAACGAGTGCAAATAAAATAAAACCAACAACAATACCGCCAACCCGGGCTCAAGCTCTTAGCCAACAATCATGACAGACCCACCAAACACTTACAAA:1 - chr2L 20338129 5' + I-element 192 1 56.85 TATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 8308490 5' - roo 9036 1 44.52 TAATACGATTTCGCTCAGTGCATTACATGGCTGTTACTTAAATCATCGACGCGGCGCGCGTTTTAAACGCGTTTCTCCTGCTTTTCGTGTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 - chr3R 28928494 5' - jockey 4963 1 41.96 AGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1 - chr3R 11469382 5' - Tabor 7241 2 73.10 GTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:3 - chr3R 18093397 5' + I-element 40 1 55.48 AAGAGCTAAAAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr2R 8047231 5' + 1360 39 1 54.79 TGGAAGAAATTTTTCATTTGAATCCGCTTCTAACCGAACACAATATCAATAAACTAGTAACCATGTGAAAACAAAAAACAATAACCTTAGAATAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAGAGCGCTACAG:1 + chr3R 3744984 5' + 1360 113 1 64.38 CCCACACTCGCACACATTCGCACACTCCAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2L 2527747 5' - hopper 1375 1 55.48 AAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3R 13406530 5' + pogo 37 1 52.59 GTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2R 22514202 5' - P-element 2829 1 44.52 TATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATG:1 - chr3L 23839700 5' + 17.6 63 1 76.03 ATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chr3R 10931627 5' + 297 6640 2 63.45 ATGATGTTTTATTTTAGCTTTTGTGCCACGTTTGCTCTTATTAGCATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:2 + chrX 17343332 5' + I-element 8 1 77.40 GTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 809663 5' + jockey 30 1 49.51 CGAAATTCACTCTAAGTTTCTAATCTATTTCACCAATGAATTTAAGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAATGTTATCCAAT:1 + chr3R 12367466 5' + GATE 8085 1 75.89 ATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAA:1 - chr2R 8157256 5' + mdg1 7091 2 66.67 TTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTTTTTTAATATCTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAATTTTTTTATCTTTGCTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATT:1 + chr3L 8748915 5' - HeT-A 6042 1 49.32 CGATTAATTTTGGAATTATTTCACTAACATGGATTTAGTATGTCATTCCTAATCATTTTCCATTATGAAAGATCGACTGTGAGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGT:1 + chrX 10889627 5' - mdg1 7277 2 45.89 CGGACAGTGATGATGAGCACCAACTGATCGCTCAGTATTGCCAGGCTCTGCCCGGAACTTCAAATGGAAGTGCGAGCAATATGATAAAATAAAATAATTATTAAAAATTCACGTCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAAT:1 + chr3R 19592468 5' - 1360 3017 1 50.00 CTTCAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3L 23906334 5' - 1360 3375 1 73.94 GCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGAT:1 - chr2R 4870251 5' + Juan 86 1 69.18 TTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 - chr3L 19111590 5' + Doc 83 1 73.97 TATATCACGCTCTGTTGTTTTTTAATTAATTAGTGGATTGCGTTAGATGCTGGCTTGTAATAGATTTATTTTAAATGAACAGACGTGATATAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATTAATATAATGTAAAATAACTGTATTAAATA:1 + chr2R 1949728 5' - Cr1a 4311 1 57.53 ATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr3R 29084907 5' - 412 7464 2 71.92 CAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGG:1 - chr2L 2527720 5' - hopper 1348 1 62.33 GTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chrX 585707 5' + Tirant 37 2 64.89 TATCAAATAAAAATGTTTTCTTAAACGAAAAAAAACCCATCGATATCCTTTTTTATTTTCCTACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCACTTAA:1 + chrX 7676853 5' + I-element 156 1 67.92 ACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGGACGGAATACAGATCTGGGGCATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATGCAGGTATTGC:1 - chr2R 12253289 5' + BS 4714 1 78.86 ACACTCAAGCCATCAACCAACTCAAATATTATATCCAGCAAACATTTACAAAATCACTCCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTT:1 - chr2R 24906629 5' + I-element 280 1 71.43 TAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAATAACTTAGATAGTATAGCATT:1 - chr3R 21630365 5' - I-element 5309 1 53.42 GTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGC:1 + chr3L 3501728 5' + Bari1 50 1 63.33 AGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 + chr2L 17809191 5' - jockey 4918 1 67.12 AAGAAATCCATGGTTGCACTTAATATTTTTCGAAACTCCTCAACTCAATAGTATTTCTACAATCATCACCTATTTGAGGTCTGATAATCGACCAGTCACGAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAAC:1 + chr3L 1347760 5' - transib2 169 1 60.27 TATTGGCCATAAAGCCAAGGGGTGGATTATAGTGGCTGGCAGGGGTAGCCGGGCCAAGTCATTGGCAATCCAGCCCTGGCGGTTTGGGAACAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 13940481 5' + Osvaldo 1522 5 87.16 ATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3L 16970379 5' - roo 8993 2 73.97 GGGGCATTACGCATTACACAGTTAGATGTTCAAAACCAAAGTAGTATGCAAAAAAGAACGAAAAAGAAAAAAGAGAAAAACCATGCAAGAGTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 + chr3L 16405981 5' - jockey 4906 1 62.33 AAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTT:2 - chr3L 19350001 5' + 1360 3269 1 65.07 GAGATGGAAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 + chrX 12066097 5' + transib2 46 1 50.69 TGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr2R 24170005 5' - transib2 2779 1 47.26 GAGCGTGTGTGAGTGCGGCACAAGCATCGAGTTTGTCGCCTAAGTCATTTGTTATTGCCCGATACCGATGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCG:1 + chr3L 21789252 5' - Quasimodo 7044 2 77.66 AAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chrX 21505666 5' + roo 84 2 79.45 ATCTTTTAACCATTTCTGTTGTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 24090562 5' - roo 369 1 51.37 ATAATAAAAAATGATTTATAATGAAAAAATTAAAGTGAAAGGGTATACTAGATTCGTTGACGAGTGTGCAACAGATAGAAGGCAGTGTTTACGAACATATAGATTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGG:1 - chr2R 5968375 5' + INE-1 99 1 79.45 CTATAGCCAACGATGATATGCTGGTTTCAAGCGCTTCATACACACGATGAGTGCCAGCAGGGCATAGAATAAATGTTCAATTCAGTGCTGCCCTCTTTGTCTGTTTCTTTGTTTATTTATTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 14287733 5' - gypsy11 3933 3 73.91 ATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAA:1 + chrX 23431596 5' - 297 6903 2 69.18 GGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2R 13766313 5' + roo 50 2 53.42 ATGAGCGATGGCGTCACCGTGATGCGTACGAAGAAACAAGCAGTGGCTGCAGCCAAGGCGGAAGCAGAACTGAAGTTGAAATGTACATATATTGTATAATTAATATAAAACAAGAAGGAATGTTATAGTCGAGTTGCCCGACTATC:1 - chr3R 5548860 5' - INE-1 564 1 55.48 ATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 4341279 5' - roo 328 2 71.92 ATCTCGTCCCGACTCAGACTGATCTTCTAAATCTTAATCCTAATCCACTCAACCTCGGCCAGAAGCTTTTCTTTAGGATTCTCTTAAGCTTTTTAATATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chr2L 22170090 5' - Juan 4196 1 67.81 TTGTTTAAGTATTTCTAAAAGTGTTATAGAGTATTCGGCAGGTTGTTTTTAGGGCTTTAAACGAGCGGTACAGTTTTGTATTTCATGTAATATAAGCAACTCCAACATTGAAATATTCCAGAGATACCAGTCTATGACGCTAAGAA:1 + chrX 292194 5' + G3 4259 1 60.96 GAAAAAGGATGCAGTGCAGCAGTGCCCGACAAGGAATCTGGCCAGGTGCCATGCGTCAAGTGCCGAGATATTGCCATCAAATTGAGGTAAAAGAAATCGCTAGAAAAAATAAACAACAAACTTAACCAATTGGCGCTGTGCATAGT:1 + chrX 17260246 5' + gypsy7 5039 1 77.40 ATATAAATATACCTACTACATACATATACAAACTGATATATCAAACATTAACAATTTTTATAAAATATATTTTATAAGTGCTGACTCGGCTGATGTTTCTCCTGACGTAGGGCACTAA:1 - chr2R 10546695 5' + gypsy12 9852 2 40.68 AACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGGGAATGGGCCATGAATGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 13295001 5' - roo 9041 1 59.70 GGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 - chr2L 11298140 5' + I-element 55 1 50.68 TTATTATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:4 - chrX 5323172 5' - Juan 4201 1 35.62 ATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGGTAGTCAGAAACTACTTATAATTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 20265933 5' - roo 9017 2 47.59 ATAGGTAAGTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCT:4 - chr2R 5149175 5' - F-element 4627 1 50.00 ATCTACGCGTTCTTTCTGATCATATTTTANTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTT:1 + chr3R 4357494 5' - Tc3 1682 1 53.10 TGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGG:1 - chr3R 11062840 5' - roo 9030 1 50.00 ATACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGTAGATCGTGAAACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 - chr3L 25411882 5' + 1360 74 1 71.92 CGGACAGATAGATAATACGAACACATCGGACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCCGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 + chr3R 28901173 5' - transib2 2820 1 77.94 AAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCATACGTGATCTAT:1 + chrX 14771728 5' + BS 32 1 48.65 GCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAACGGGTAGTGTTTGCCAGCTATGCACGGGCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGTG:1 - chr3R 19450162 5' - gypsy6 52 2 51.88 TCTTTCGCGTTCCATAAAATAATCTATTTCAATCCGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 + chr3L 21380498 5' - I-element 5316 1 50.68 GACTGGAAAATTTGGAAAGCCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr3L 22960535 5' + Tirant 8149 2 53.17 TTATTTCATCATATCATTGTGTATCAGTAAATGTCAGTATTCGATTTTTTAAGTACCTTGCATTTTCTACTTGGAAAATGATTCTAATTATTTTGAAAGCTTGTTTCTCTTTTACCCAGCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTA:1 - chr2R 6209757 5' - gypsy8 325 1 80.14 CAGTTGCATTTCAGTCCGCCAGGACGCGTGACTTTGTGACATTTAATGCCAGTTTGTCAGCTGGCTTTCTCGACGGCATCGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 + chrX 585610 5' - Tirant 359 2 58.22 TTCTATAGTTGTTGATTCCAACGTTGTTGTGGTTGTTGATGTTGTGGAATTTGTTTTGGTCTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 + chr2L 7252046 5' + transib2 68 1 57.14 ATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 + chr3R 24729576 5' - Juan 4152 1 62.33 CAAAGAGGGGACAAATTGAAAAGAAAATAATTAAAACACAAAGCCAGTCAAATAAAGTGGAAACCAGAGACACTGGGAGAGCTCTCACAGTGCCACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAA:1 - chr2L 1389557 5' + TART-A 13226 1 67.39 AGTTCATAAATCGACTGGTTGTCTTACTATCTATTAAAATTGTTTAATTTTACCTATTTATTATATACATTTTCTGTTATCAGAATTTATGTTCGGTGGGCTTGATCCCGGCTTAGAGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 10423540 5' - I-element 125 1 69.18 AATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACT:1 + chr3R 4679470 5' - hopper2 1527 1 71.23 ATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 14366619 5' + roo 73 2 67.12 ATATTATATATTGTAATTACAATAAATAATTGCAATACTCATATGTAAAAATATATATAATTTTATTTTACTGAATGATTACAATATTTATTCTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAAT:1 - chr3R 31270272 5' - Idefix 7284 2 76.03 CGGGGGATTTTCCAAATGCCTCACTCTGCTCCACTTTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1 + chr2L 16941677 5' - copia 5048 2 76.03 GCCAGCTTGTACAAGACAGCCAAAAATTGTCAGAGTCCTTTGGCAAACTTATCCTTTGCCATAACAAAAAAGAAAAGAGGAACCAAGCATTTTTGACAAAAATAAATAAATATTT:1 + chr3L 1001700 5' + mariner2 829 1 72.17 ATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:1 - chrX 8027497 5' + Juan 39 1 46.97 AGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGGAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1 + chr3L 13365732 5' + BS 5040 1 45.89 CAACGAAATTGTTAACGTTATATTTTTTCGTCGGCCATCGTCACAAAAATAAATAACAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 + chr3L 24228583 5' - copia 224 1 61.64 CAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTC:1 + chr2R 12185273 5' - accord 7366 2 70.55 ATTAAATATCAATGCTAAAAGCCGATAACAAATCTGTTGAATGGATCTCAATGCCACATCGTAACTGATAAGCCTCATTTTTTTGTTGCCAATAAGCAAAACTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATT:1 + chr2R 12323070 5' - Tc1-2 1522 1 68.49 TTGCCACGACTTGCATAAGTCGGGCTTTCGTTTTAAACGCGCACACACACACACACATATT:1 + chrX 8877176 5' + accord 184 2 73.77 GTAGAACATCGGAATCGGAGGAGCTGGTGGACTGGGCCTTTGTGTGGTTCTTATACGGTAATTCTACGGTGCAAAAGAAACTGTAGCTTGTATATTGGATGCACTTCATTTTTCCGGATGGCTTTAGTGTCAGGTTCCCGCT:1 - chr3R 10489753 5' - Fw3 335 1 79.58 CAATTAAAAGCGGCCCAAACACGCGCCACCGCTGTCGCTGCTGCAGCTGCGGTATGGCTATATACTATATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCATAAATAACGTC:1 + chr2R 17354362 5' - copia 4849 1 67.62 AGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 + chr2R 9158055 5' - mdg3 5426 2 63.01 AGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATC:2 - chr2R 23780613 5' + Ivk 61 1 56.85 AATGCACTTGAAACCTTCCATTGGATGCAAGAGTAGAAAACGTGGTAAGAGGGGTGTGTGGGCGTAGCAACATGAGTAAACAAACTATGCCTCTGAAATCTATATGCTTAATCTCAATATTGTAGGTTTTATAGTTCCTCAGATCT:1 + chr2L 21341686 5' - INE-1 149 1 63.70 TAATGGTAGTATTAATAATATATTTCATATGGAAATGTGCTGTGCAACAAAGAATGCAAGCAATAACCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTATAAATATCAAGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 19449818 5' - 1360 3371 1 68.49 GTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 10931595 5' + 297 21 2 64.75 GCTTTGATTTTATTTTATTTTTTCCTTCTCGTAGCACAATCATCTTCTCCGTCTGCCTCTTAATCATAATCAGAATGATTATTAATATGATTATGATTAT:1 - chr3L 11374276 5' - mdg1 7076 2 45.00 AACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGGCTCGATGCAGGTA:1 - chrX 19539579 5' - pogo 2067 1 43.15 CTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 + chr3R 27405939 5' + diver 5911 2 66.42 AGATCTATTAATTTTAATGAGTAATAAGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 1279050 5' + roo 29 2 54.11 AGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr3R 15790087 5' + flea 11 2 63.01 GGCTGCTAAACTTTGTTGAATTGCTCATTTTGTTGACATGTTGTTTCCAAGCGCCTTGGTGAAGTGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3L 10373961 5' + 297 6603 2 70.55 ATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGGATTCTTTCTTTCT:1 - chrX 14722186 5' + diver 5971 2 70.55 ATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 23639104 5' + pogo 24 1 67.81 AAAAAAGGGACTCTCCGTTGCTGTATTAAATTAGTACTGTGCTCCACGGCAATTGCTTGATTAGCTCCTAAAAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTAC:1 - chrX 9461329 5' - transib2 331 1 54.11 ACCTAATACACTGAGAGAAATAACAAAGAGATATCAATTTATTGGCATAACGTATACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCT:1 + chr2L 4114113 5' + Doc2-element 106 2 48.63 ACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACTAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTTAC:1 - chr2R 12645475 5' + X-element 103 1 73.97 AAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACCGTTGCTTGTGCAGCAAGGGGGGG:1 - chr3R 11040161 5' + Bari1 59 1 54.79 ATATAANTGCGGTTCAAAGTGCAATAAATTCAATATTTAACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 + chr3R 20441185 5' - I-element 5342 1 72.60 AATAAACAAACTACACATGTAAGCAGAAACACTCGCTGTAGCGCTCTCCACTCTCTCGCTCTCTCTCAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTT:1 - chrX 18132053 5' - 1360 74 1 63.54 ACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2L 12818302 5' + hobo 51 1 68.87 GGTGTCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2L 21367181 5' + Doc 34 1 60.27 AACATGATATTTTTATACTACGCGGTTAACAGGCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAATAATTGAGTGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGTGAAATTTTAGGTGTATATTAATTATTTTCTGTTTTTTTCT:1 - chr2L 17180130 5' + Juan 75 1 33.33 CAGTGTGCAGCATGAAAAGGGTGTTGTCCAAATCCTCGAATAAAACATGAGCTCAAGATTCTGATTACGACTGTAACCTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2R 17663725 5' - roo 9007 2 52.74 AAGAAAAAAGATGGAGTTTACATGAATTCTTGTACGCACTGATGGAAATAGCTAAGCCAGCAAAGCTTGAAGATGAGAGCATTATTAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2R 6421458 5' - roo 9018 2 58.22 ACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 - chr3R 7420299 5' + 1360 48 1 55.38 ATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:3 - chr3R 15364053 5' - flea 230 2 69.18 ATGAATCCCAGATACAAAACTTTAGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:3 + chrX 15357624 5' - hopper 1384 1 62.33 GCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTG:2 + chr3R 11040012 5' - Bari1 1688 1 71.23 CGAACATATAGTTTGCGCAATGTTGCACATAAAATTTCCATCACCCATAACCCCTTTGAAGTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTG:1 - chr2L 4801245 5' - Doc2-element 4501 1 58.22 CAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:1 + chr3L 19454954 5' + mdg1 90 2 77.40 AGTGAGACAGTCAAAGTGCGAGCGGTATAGCGCTATCAGATATGCCCATTTCCGGTTAGATATGTTCCTCTTAGAAGGCTGTCATCGGTATTTGCCTCAAGTTTGTGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTATTTGTGTGTTTTTTGCTGT:1 + chr2R 13738818 5' - Porto1 4442 1 47.26 AAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr2R 10417114 5' - 1360 3347 1 55.48 AGAGAGTGGTCGCCTGGCAGGCCTGTTAATTAGCGTGGCACCCACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACA:1 + chrX 12148632 5' + accord 192 2 56.82 GTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2R 14051778 5' - roo 8988 2 78.01 ATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:2 + chrX 19539466 5' + pogo 46 1 52.05 TGGCCATAGGATAGTTAATGGATTTTTTATGGGAATATATAAAGATAGCTTAACTAATGCATTGCAATTTCTACCACAGACATTTTATTGCCTAACTAAATTTTTAGTTAATTTAGTTAATTTTAGATTTAATTTTAGTTAATTTT:2 - chr2L 3485076 5' - Penelope 312 1 73.97 ACATCCACCCAAAGTATAGTTAAATAGCTTAAAGGAATTAATAAAAATACAAGAAGAATAGTGAAAAATAAAAGAAGCGGCCCTTTCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAAGTATTGGTGGCTAAGTAGTTT:1 + chr2R 5413858 5' - Porto1 4462 1 56.30 AATTGTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAA:1 - chr2L 17766177 5' + Doc 224 1 60.27 ATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAGTATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr2R 14653156 5' + 297 49 2 58.22 GTATGGGTCGGTGCTATGCTTGAATTCCTATTTGTGTACGAATGGCATAACAAGATTGCAAATAAAATATATAAAATATAGATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2R 13176454 5' + opus 7146 4 64.83 CAGGGGGCTTGTAATAAATGCGATTCTGTAACCCATTTCTGGGCTTTCTGGGTTAATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACAT:1 - chr3R 31485203 5' - roo 8630 1 60.96 AATATGTATAAACACAGAATACTTCACATATGTACATATCTCCCGGCGAACACGAGAATATTTATTGCGTAGGAATCGACCGAGATACTAAATGTAAGAAAAGCCCCACGGGTTTCGGGCTTCCATTCATAGTTAATG:1 - chr3L 2416273 5' - HB 476 1 76.09 TTTTAATTATTGTATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:2 - chr2R 17059887 5' - flea 198 2 65.07 GTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chr2R 8047355 5' - 1360 3331 1 59.59 ATCATTTTAATGAGCCCAAAATGTAATTTGTCTGCCTGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3R 16518833 5' + Tirant 8119 2 78.77 ATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTT:1 + chr3R 7719693 5' - roo 389 2 68.94 ATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2L 19675072 5' + 297 6628 2 64.03 TTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 25428121 5' + 297 6608 2 63.70 TATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 - chr2R 8157290 5' + mdg1 45 2 54.79 CGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 27160140 5' + 412 86 2 76.71 GGTTGGATTTATAAGATCGTGAACAACTCTCCTTGGCCCAAGGCTAGGATTTGTTTCCAGCCGAAGCTGCTCGACTGATTCGATAGGCATATTTTGAAAGATTTACAATGCAAGAGCATACATGTGCACA:1 - chr3L 19067461 5' - 1360 181 1 63.85 TTTCTCTTAAGTTGGATTATATTCAAGATCAGGAACAATAGCCGAATCGATTTAGCAACACACTTTCTAACACTTTCGCATTTCGAATTTATACTAGCTTATTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTC:1 - chr2L 4031197 5' + INE-1 558 1 50.77 TTAAATGGAAACTTAGTTATTGTAAACTATGTCTTGCAAGTTGCAGTATCTACATAGATACTGCAAAATGTAAAACTTATAATATAAATAATAAA:1 + chr2L 19643146 5' + copia 188 2 74.74 ATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGGCTGTGTC:1 - chr3L 18126033 5' + Ivk 20 1 64.58 TTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chr2L 6654731 5' - diver 6034 2 69.86 ATCTAACCATTATCGTACGATAGTTGAATTCAAAATGATTTCAACTCGATTTCGTATTACCATTTTAATATATATAATTGAAAGAAACCCCATCATTCGTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATA:1 - chrX 19424087 5' - G2 263 1 71.23 AAGCGGCAGCGTCCCCTTCTAAAGTTCCAGCAAATCTTACGGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGGTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAAAACCAACATATTCTT:2 + chr2R 9167086 5' + 17.6 7207 2 71.92 AATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chrX 2214238 5' + jockey 4807 1 52.74 ATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGC:1 + chr3L 24272061 5' + gypsy11 74 2 56.85 AGTATTAAAGTAGCTTCAACATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 - chr2L 3675947 5' - Juan 4164 1 54.11 AGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACAATTTTGGCCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTATTT:1 - chr2R 11164489 5' + roo 8737 2 68.31 TTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCC:1 - chr3R 10736125 5' + McClintock 64 2 66.90 ATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:2 + chr3L 4219453 5' + jockey 59 1 52.05 CCCAACGAAGAGGTGGCATAAAAGTCGTTAAGACTGGGGCGTGGGCGTTATAAAAGTATGAAAACAAATTACGATTAAATGTGTCACGTCCAAACAACAAAAATTTCATTTATATTCGCATATATATGTAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 1209369 5' + TART-B 10632 1 49.32 GCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACA:1 + chr3R 26504227 5' + HMS-Beagle 6870 2 69.86 AATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 16970368 5' - roo 340 2 65.07 GTGTATCTTAAGTGGACGCCAAGTAGCTCCAATCTATTCGGATCGTATCCAAGTGGTCAATGCAACGGAGCTTATCTAGTGCCGAACAGTTGCCACTTTGTTGTTTGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTT:1 - chr3R 16533176 5' - X-element 4464 1 77.40 GTTGTTCTTCAGATAATTGATAACTATCCTAGTGGGCTTTTCTCTGGCCCCACCTCCTCTCCACGGATTTTTACTTGAGAATTGTAGCAGGGTGCGGCAGCATAATTTTCTTTTTTCAGAACTCAATGGAAACTATTATAGG:1 - chrX 8429955 5' - mariner2 858 1 61.27 GATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 + chr3L 15913846 5' + jockey 4813 1 57.45 AATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr3R 7666632 5' + I-element 60 1 54.79 ATTATGATCTTTATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 + chr2L 14523103 5' - HMS-Beagle 7007 4 49.32 ATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:2 + chrX 10537856 5' + I-element 63 1 60.27 TAATTATCTCAATTTATTTTGCTCAGAAAATTGATAAAAAAAACATTAAATAAAAATAAAACTTTAAAAT:1 + chr3L 14613126 5' + P-element 2691 1 87.14 GAATGTTAACATAATAATTCCAAAATTTTTGATAATAGATACCATACAAATCGCTGACATAATTATCAATAAGCTTGCTTTTTGTCTAGAAGGTTACTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCGTATAAG:1 - chr2L 19589543 5' - I-element 76 1 69.06 TGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3R 13973043 5' - 412 7479 2 62.76 CATACAACTGACCATGTCCTTTTTGCGTACTTTTTTTTTGTAAGGACTTCAAATGTTGAAGCAGGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTA:1 - chr2R 17641647 5' - P-element 2723 1 50.71 AATTACTGGCAGAGGAAAGGAAACCCAGCAACAGCCACTGATGGCATCCCTCAGGCATCTAAAGCCAGCCTGGCAATCGAATCCCACATACGCCCTGTCTAGCCACGCAGCTCGGCACTCGGCAATTCTAATCTGTTATTATTATT:1 - chr3R 31867496 5' - invader3 5065 1 53.42 GAACCTATAATAAAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 3920631 5' - roo 390 2 72.60 AGGGCATATATCCATTTAGCAAATTGGACTACGAAAAAAAACACGAATAGTACTCTATACAACTTTATTCTAAAATGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACTATCGACACGCAGATAAC:1 + chr3L 26875733 5' - McClintock 152 2 57.53 AAATATCAATTTAGCATACGAAGAAGCTGCATACCCAAGAAAACCTTTTCCAGCTAAATATCCCTTAAAGCTGGATTTTTGGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCG:1 + chr3L 9184557 5' - Quasimodo 316 2 68.03 AGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 + chr2R 14653144 5' + 297 37 2 50.00 GATATTAATTTATGTATTAGACGAATATTCTAATTTAGTTTTTTACCGCAATCAAACTGACACGTTCCAAAATTTCCGCCCTGTACAAGCAAATTAAAGCAGTCGAGGAACCCGGCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGG:1 + chr2R 19140920 5' - hobo 2680 1 77.93 TCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3L 8627351 5' - pogo 2061 1 51.37 GTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 14051778 5' - roo 8990 2 76.26 TCCAGTCCGACTGCTATGCTCACGACGACGGAGCACCGCAAATCCGTGCCGCCATTGATGTGGACAAGATCCAGGCCCGTCCGGTTCGAAAAGCTCACCCGCAA:1 - chr3R 7115167 5' - R1A1-element 197 1 80.77 TTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAG:2 + chr3R 17673758 5' + FB 74 1 69.86 CAATAATAAGAAACATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:2 - chr3R 7666744 5' - I-element 5314 1 58.22 ATGCGCAATCATTCGCATCAATCTTATAATGGAAACTCAATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCACAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1 - chr3R 19225076 5' - HMS-Beagle 168 2 70.55 ATGTGTTTTGCACTGCGCAAAAATGTGGCTGTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:2 - chr2R 9544981 5' + roo 8680 2 75.34 AGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3L 12249808 5' + roo 63 2 66.20 AGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGAC:1 + chr2R 13766208 5' - roo 9004 2 64.38 GTGCATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr2R 15376205 5' - 1360 3346 1 55.48 TTAGAATTCCCAGCGCTATCTGATTTCTCCTCATACTGCAATATTACAATTCCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGTTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCAC:1 - 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TLD2_LTR 73 1 73.97 ATGGGTGGGAAATGGCCGGGAAATGGGTGGTGGGTTGCGTGCTGATCCTGTTTGATTTTGGAGAAACACTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAA:1 - chrX 21011174 5' - FB 225 1 53.42 GATTATAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTT:2 - chr2R 19941638 5' + hopper 58 1 56.85 GAGTGCAGCAGACGGCCTTTCTTCTGCGGCAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr3L 5102194 5' + jockey 4757 1 78.01 CCCACTCCCTCTCTCAGTTTTTGCATGGTAACTTTTCGGTCATTGTACTGTTGTTGTTGTCTTGCACACCGCAAGAGAACAACAACAATCGGAGAAACACTGATAGCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:1 - chr3R 5216267 5' + FB 14 1 75.52 ATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAG:2 + chr2L 13844128 5' - Stalker2 372 2 62.33 CTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAA:3 - 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chrX 6513450 5' + hobo 60 1 66.92 TGGAAAACAATCCTTTGTGGTCCGACCGCAAAGGCAAACACGAGTGCCAATACAAGAGCACCCTAACACGCACACACACACACACACACACACACATT:1 - chrX 16979598 5' + accord 184 2 54.08 AAGAACTGAATGCCGACTGACGGGCAACAAAAAAGTTTGACAAAAAAGAAAAAAAATTCTTTTACACAAATTATTCTGAGACCAAACTTTTTCTAATAGAAAGGATAAATAAGAAATAATATAAGAAAAAAAATGTTTTAATTAAT:1 - chrX 4978606 5' + Stalker2 7185 1 76.03 AGCCTTTGAAGGTGGCCACTTGGAAAAGGCACAGATACGCGTTACCTACATGATCGAAATTCATTGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGGCCTAAGTTT:1 + chrX 16474485 5' - mdg1 7139 2 54.79 TGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr2L 4063791 5' - roo 9055 2 73.97 AAAATATATATATACATATATGTATATATTAGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACG:1 - chr2L 14465019 5' - Tc1 1274 1 68.37 TCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 + chr3L 16690925 5' - I-element 5272 1 77.40 ATTTAACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 + chr3R 20441219 5' - I-element 5308 1 50.00 AATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCG:1 - chrX 7795610 5' - roo 9019 2 57.04 GTATGCNATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chrX 8092486 5' + pogo 63 1 64.38 TATTTCGAAACTTATTTTATATGTCATTATTAAGACATTCATTTGCTTTGAAGCTTATATTTTTCGCTAATCTATTTGGGGATTAGTAACAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAG:1 + chr2L 7620541 5' + X-element 4650 1 63.70 ATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr2L 71241 5' + 412 85 2 77.86 CTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 29611989 5' + jockey 18 1 71.30 TAATGCCCGTGGAAATACAACTCTGAATATTTGCGAACATGAAACGTGAAAATTGCACTAATTAGTCAAGTCATCGATTATTTATCGATGGGGCACAAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGT:1 + chr2R 15794497 5' + 1360 398 1 63.70 TATTAACAAGTGGCGCTCGAAGGCGACTTATCAACACTACAGCAGCGCACAAAAGTAGGCAACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGCTTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 12930645 5' + jockey 25 1 69.86 GTTATCAATAGTGGCTTGCAGCAGGATGTCCAGCAAAGTCATTTTAGCTTTACCACCGATATCATCGTCTCCCATTACTATAAAATAGGTTAGATTATACAATATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGAT:1 - chr2L 7606835 5' - jockey 4829 1 68.49 ACTGATGGGGAACGTGTAAAGGTTTAAAGTGTAGGCAACTGGAGGAAAAAAGTAGACAGAAAAACGGAAAAGCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAGCACAGCATATTTGCGTGGCCG:1 + chr2L 17137953 5' + Gypsy6A_LTR 104 1 66.95 GGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTGTGTA:1 + chr2R 14051718 5' - roo 9049 2 62.86 AATGCGGGATTTAGAACATAAGCTATTTAAATTCAAATACATAATTTTTAATATATCCACCGAATTAATTGTTTAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTT:1 - chr3R 19408057 5' - diver 220 1 79.45 TTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 47168 5' - roo 8987 2 74.66 ATCGCATTTTTGTTTAATTACGATCTATTTTCAGTTTCAACAAAAGTGTTTAAATGTTGTTGTAAATTGTACCTATTTTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGC:1 - chr3L 16672163 5' - jockey 4756 1 54.79 GTCATCTACCTTTACTGAGCTCAGCCTGGTTAAACTAATTACATGGTTATTACCATTTCTTAAAACTTAACCCATATTTTGTAAATAATAGATGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTA:1 + chr3L 8674508 5' - I-element 5174 1 67.12 GGAAGATACTGAGCTACGATGAAGCCCTGCAAGTACTGCAGGAAAACAAGGACAGTCTTAAGACTCCTATTAGCCTGAACGAAGGATTCTCCAAGGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 + chr2R 17003072 5' + FB 10 1 64.38 AATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 20265912 5' - roo 9037 1 61.64 AACTAAATTTCGTACAGATACTAGAGGCGAAAATAGTACAAATAACTTGGTTGCGAGTGCACGTGAGTTATGCACACAATGGCCCACTTACATCGTCGGTCGTTGATCAATATGGAATTTATATCGCGCAACAGCTGACTTTAACA:1 - chr3R 9313996 5' + hopper 1258 1 58.90 GTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr2L 7581041 5' - Transpac 5195 2 58.90 ACTGACAGATTCAGAGGAAAAAAAAATTTTTTTTAAGTTTCTCAAAAACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2R 5941283 5' - copia 241 1 74.66 CACTTGAGACGCCCTTTACAAATTTCATATGACAGTTCTATTTTAGTTGGGGAAATTATAAATATTTTCTAAAAAAAAAGTGAGTTTGGTTAAGTTAATTCGCGTATTTAAAGGGGCAATAATTAAAAAAAAATTATTTTAGTGGG:1 - chr2L 21898327 5' + HB 334 1 62.33 GTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr3R 11937265 5' + flea 24 2 70.55 GAATTTCAATCAGCCAACCAATAAATATTCGTTTCAGCATAAAGGATTAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCAC:1 + chr2L 4721293 5' + transib2 117 1 75.34 AAATTCAGTCTGCTTACATTTTAGCTTATATTTGTAGCAAATGCAATATTCATATTTTTGGATATCATACATATACATCTATGTGTGTCTGTATTTCGAAATGAATTTTTGTAATTGTTTAATTTTTTTTCCTTTTCCTTTTGTTT:2 - chrX 5053711 5' - Doc2-element 235 1 72.60 TATTAAGAGAGACATTGAAGATTAGTCTTTGAAGATTAGTCTTTGATTTGCATTGAGTAAGTGAAGATCTAGTTGATGTTGATCGCTTAATTGGAACTTAAACTAAATGTTAACAGGTAAGTTAATATATAAA:1 - chr4 891060 5' + Bari2 212 1 74.44 ATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 + chr2L 13556330 5' - transib2 2772 1 54.11 GTTGTGTGGCTAACCGTACATTTGCAGCGTAATCGTTTTATGTTAGTTGTTAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - 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copia 208 2 71.23 CAGGATTTTTGTCGAACTCATAAATTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:2 + chr3R 4966086 5' + roo 63 2 65.75 CCATAAAATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr2R 13259414 5' + mdg1 28 2 63.19 GGTAGTTGGTAGAAGTTTCAGTTCAGGTACCTGTTATGCGGGCAGCTGTCGGCTGCCTGTCCATGTGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 - chr2R 20328143 5' - Quasimodo 318 2 71.43 GCCTACTTTCGGGCCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chrX 18409500 5' + jockey 4703 1 65.75 ATAACTTTAAATATTTGTAACACCTACCATCTAATATGTATACAACTATTGTTTCAGTGTAACAACTGAAAACTAGCAACAACACGGCAACAAACTTGGGCTGCGTCCTTGTCCCTTGAATCTGTAAGCTGAATCTCAACCTTCTA:1 + chrX 10515552 5' - INE-1 171 1 52.05 GAAACGTTCGTTATGCGACTTAATTGTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr2L 16943757 5' + copia 4886 2 73.94 ATTGTACCTTGATTTTTCAATATTTTTCCTAACATTTTTTTTTACAATTTTTAAAATTTTTCTTTCTATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGG:1 - chr3L 12586406 5' + INE-1 551 1 79.45 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGGAAAA:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 5305 1 71.54 CTCCGAGTTGAGCCACTCAAGCCAAATTACAATTCATTTGAGCTCCCCTCAGAGTTACCTACGTACGAGTATGTACATATACATATACAAATATATATGTGCATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chr2L 5640087 5' + I-element 17 1 73.79 TATTTAACCTTAAGTTGCATGTTTGTATGTGCGAACTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chrX 18240128 5' + jockey 69 1 69.92 CCTCTGTTGAGGGCTTTGAACTGAAGGTCGGTGATGATAGCAGACGAGATAGTCGACCTGGTGGACTGGTGTTTGAAATACTGGTAGTAGCGAAGGCTGGATCTTCAATTTGCCAGCTCTTTTTTATTTGCTCCCG:1 - chr3L 9338472 5' - G5 489 1 71.32 CGAACACTCCGTCGGTTGCAATGAGAATCACGTCGCCATCCCGCACCGGAAAGCTCATCGTGTCCGCCGACTCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAACACTCCCGATAG:1 + chr3L 1535826 5' - gypsy 126 2 68.81 AAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:1 - chr3R 25433379 5' + transib2 5 1 69.41 TAATATATAAATATAATATAAAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - 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chr3L 6518651 5' - 412 456 2 49.18 ATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACG:2 + chr3R 19450191 5' + roo 9042 1 54.79 TAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTGTGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGT:1 - chr2R 9967153 5' - Bari1 1667 1 56.85 GTTCAATCTCCGCTTTGGACAATAGGGGCGGAAGATGTAAAACGTAGAGGAGTTTCAGCTTCTCCATGTTCTTGTTGGAACAGACCAGGCCCAATTATTTAATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGCTTACCCCATGTTT:1 + chr3L 21339684 5' - Tc1-2 352 1 65.97 ATTTTCGTAAATTAATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 20265899 5' - roo 9051 2 71.03 TGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTT:1 - chr3R 11062838 5' - roo 9036 1 51.59 TTTACTTTCAGAGAAGCGTTAATTATTTGAAAGAAAAGCTGTTTCTGTTGATGTTTTTGTAACCAGTTGTTGTCATTATAGTTGTAATTGCTGTAACATTATTTACCACACATAATAATAATAATAATAGCAATAATAATAATT:1 + chr3L 2409402 5' + mdg1 7066 3 68.75 AAATCGATGGTCTCCTTCAGGTGTATGGACCAAAGCAGCTCGGTTGCAGCGTCTCCCACGGCTCTGCAGCACAGTCAGTTCTGCCATGTAAGCATTGTATAGCAGGGGCCAATTCCTTTATGATCAGAGCGCGCTTCACCAAATTT:1 + chr2R 4932679 5' - G7 464 1 76.03 CACTAGGCCATTGGCATCTCGCAACCTTTTGCAGATGGAGGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:2 - chr2L 16275058 5' + FB 36 1 60.96 ACCATTTTTCACATTGTTTTCTGTGCCCGCCAAGTTACAAAAAAAAAACAAAAAAATACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGATTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr2L 19674945 5' - 297 6933 2 54.35 ACCCTCATTGATGATCTTATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTTGCATGTTGGTAGCGCCGTTCTCTTCAGTAAGTGTTGTTGTGTG:1 + chr3R 29317400 5' - Ivk 5071 1 75.53 AATGAGTCGGAGAGTTCAGAGAAAACGAAGGCTCAGCCAAAAGTAGACCACAAGAAGAAAAATAGGGATCCAGAGACAGCGAAGATTCAGGAGTTGGAGTCAAGGATTCATGGACCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTA:1 - chrX 484465 5' + Tc1 1267 1 65.07 ATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 6397726 5' - roo 402 1 55.00 AAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:3 - chr3R 27765159 5' + mdg1 7128 2 78.77 AATATGGGTACCCAGCTCCTGTATCTTTCATTCGCGAAATCACAACAGCACACACAACAAATCCTAAATTGGGGGAAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAACA:1 + chrX 19381342 5' + gypsy7 5008 1 37.00 TTTTCCGCTTTCGCTTCATTGCGTTTCCTTTAATTTGATTTGATTTGAATTCCTTTCGTCCTCCCTTTCCGTTCGAATGCTTTGCTTCCGGCTTTTGTTGTTTCGAGTAGTAGTATTTGATTTGATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 5253299 5' + hopper 143 7 67.12 TCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr3R 7420288 5' + 1360 70 1 69.50 TAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACAT:1 - chrY 2720373 5' + ZAM 187 3 77.40 AGTGGGCGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTT:1 - chr2L 4123988 5' - transib2 2819 1 76.19 CTTAAGTTTTATATAATTGCAAAAGCCATCAATAAGCTAACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTA:1 - chr3L 21326586 5' - copia 4916 2 73.29 GCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 9298583 5' - hopper 1374 2 55.56 AATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 6518634 5' - 412 417 2 70.14 TTCCATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 + chr3R 15724263 5' - Juan 4193 1 67.81 AGTTTTGCTTTTCGGATTAAAAACAAAAAAAAAAATTGTTTAAGTGTCCTCCTGTCGTCCTGGCCAAAGCTTTTGCATTTGCTCTTGCTTCTGCTCTTGCCTTTGCTATTCACAAACTTTGTCAGAACACACACACACACACACAC:1 + chrX 1216327 5' + accord 7029 2 70.55 ATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTAC:1 + chr2R 8099146 5' + jockey 4827 1 63.70 AAACTTGATGCTTCCATTTAACAACTCAAAATTTAATCAATCTAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAA:1 + chr3R 20821995 5' - 1360 264 1 78.08 ATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCTAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr3L 16033399 5' + Doc 50 1 65.05 AACAACAGCAACAGCGCACACACAGAAAACCAAAGTGTTCCCTCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 + chr3R 25709730 5' - hopper 1393 1 69.18 GTATTTGATAACATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr3R 30675506 5' + 297 6586 2 77.40 ATTGAGAGTAAGTTTAATTTGCCTGAAGGTTATAGTTTCGAATAGTTGCGGATCACCGAAAATTGGGAAAAAGGTTCGAAAGAAAATTTTTAAAAAAAAAAGGAAAAAAA:1 + chr3L 15858315 5' + TART-C 11100 1 57.27 AAACGTTGTCTGCGCTTGTTTGCTGTTGACTCTACCCCCTTTCCCGGTCCCCGTTTCAGGGACTACACTGGTAAAAATAAGGTAATTTGTAAGAGATACGTGTATATATTATAATTACATTAAAGAAAGTACAAATTATTAAAAAT:1 + chr3R 9379002 5' + P-element 2678 1 78.77 ATTTTATTTTCGCAGGTAGTCCATTAATAAATGATAGAAATAAAGAAAAAGTAAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 7889272 5' + roo 9 2 52.05 ACATCATTTTCATATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGGAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr2R 8735530 5' - mdg1 414 2 78.52 CGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 15791044 5' - roo 9052 2 71.13 CAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3R 13406393 5' - pogo 2060 1 57.53 TTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATTATAATATGATGGCTGGAAAAAAATTAATTTTAATAGACAGAATGTTGTAATTTATATTTTCTATTTCATTTCTTTATGATGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTTATA:1 + chr2R 15326828 5' - copia 241 1 47.26 TAGGAATCTACTTTTCAATATAATTTGACAAGTGTCTTTTAAAAGAAGTAGTTTTGAAATGATTGTAAATAAATATAAATACAGCCGAAAACTTTTTGTGTGTACACGAATACTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCT:1 + chr3L 20987174 5' + 1360 206 1 54.48 TATGAGAAAAATATTTAAAATTGCTAATATTTTTATTATTTTAAAGTTACGTACAAAAAACGATACTATCGATAGTATCGAATATTTGCTCTCAAAACATCCGCTGCCGAATCCGATATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTAC:1 + chrX 21963446 5' + Quasimodo 6944 2 67.81 AGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 - chr2R 22514176 5' - P-element 2804 1 28.28 AAAGAGCCACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCGTCAGCTG:1 + chr3R 19407858 5' + diver 18 2 71.72 GTCGAAAAACCCAACTATAGATTTATCTCGTATTATACCCGTGAAAGGGTATACTAAATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGAAGAAGGAAGCGTTTCCGACCGTATGTATGTTCTTGATCAGGATCAATACCCGAGTTG:1 - chrX 151586 5' + INE-1 93 1 76.26 AATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2L 809649 5' + jockey 15 1 63.73 TAGCAAAATAGTGACTAGACAAAAAGTCGCACTAATTCGCTAATGAGCGGCTCATCCATAATTTAATGAAATAAAAATGTCCAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTT:1 - chr3L 7743377 5' - pogo 240 1 51.37 ATTCTATGATTTTGAATTAAAAAAAAACATATATAATAAAAGACAATTTAAAATGGTTCTAAACTTTCTTATGCTTGCGAATCTTAAGTACTTTAGATATAGTTTAAGTGTATAAGTTTAAATAATAAATATATAAATAAATAAAA:1 + chr2L 8303064 5' + Juan 4215 1 67.81 CGAAAGGAATGTGCCAAAATTCCTCGCGTGAAAGAGACAGAGTACATTTTTGAGTGTGTCTTATTCCGTCGCACATGTGTTATTATGCCAGTATACTTGTAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCG:1 - chr2L 20205425 5' + P-element 10 2 76.87 AAAGAATTTCATTGCATTGTCAATTAGGTAATTGTATTCAAGTACTACTTAATAAGCAATTTCTAATTTTAATTAAAGCCTTTTTGCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chrX 696611 5' + FB 37 1 56.16 ATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGA:2 + chr3L 3501718 5' + Bari1 66 1 63.01 GAGACTTTGTTACATACATATGTATATTTTTTAGGAACACTTTCTCCACTTTAGATAGAAATTTTTCATTACATTTACATACATACATATGTACATATGTACATATGTACATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAA:1 - chr3L 23249534 5' - rover 340 2 69.86 AAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATT:1 - chr3L 13581714 5' + jockey 4845 1 75.34 ATGTTGATTAAGTTGTGCTTAAAGTTTGCCATCAAGCGACCCTCGTTGGCCCGCCCCCTCCATTCATCCGCTTTTCATGTGAAATCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCA:1 - chr2R 10930054 5' - transib2 27 1 57.93 CTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 19992633 5' + hopper 61 1 57.53 GGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATA:3 - chr2R 6622635 5' + S-element 83 2 76.03 ACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chr2R 6847818 5' + Doc 86 1 77.14 AATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGC:1 - chr3R 15072674 5' - pogo 2087 1 66.36 GAAGACAAGAAGAAAATGTGGCACAAGGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:3 + chr3L 16690856 5' - I-element 5341 1 63.01 ACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3L 12249831 5' + roo 8754 2 82.88 GGTGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:1 + chr3L 24213773 5' - invader2 5035 2 65.75 AATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:2 - chr2L 15940315 5' - pogo 2042 1 58.90 GCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCTATAAA:1 + chr3L 18046623 5' + roo 65 2 67.44 ATTATTTTAAACATACCGGGTACTTCTGATCTTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAATGTGTTTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATTTT:2 + chr2L 7579162 5' - 1360 3047 1 67.12 GCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTT:1 - chr3R 905038 5' - rover 7246 2 58.62 AGGTAAATGCATCTTTTATGATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAA:1 - chr3L 10426144 5' + I-element 5077 1 64.29 AAAAACTAGGCCCATTTAAATCTTAGTTGCAAAATAAATAAACATATATCAAATAAAAACAGACCACTACTGTTATAAATGCAACAAATATACTAATGTACATCTCAG:1 + chr3R 19450102 5' + roo 8621 1 90.74 AAGTACATCGACAAACACACTTTCGAAGAACTGATAAAAACAATGCAAGCATACAGTTGAAAAAAGTCTATCAGCCACTAAACCTTTTTCTGTTTGTGGAATAATAAAGTAAAAAAGTAAAAAAAAAATAGACAACGAACAAATCG:1 - chr2R 14009738 5' + Doc3-element 188 1 60.96 TATAAAAAGTAATAAATGTTCGCATTCAAAAATTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTATTCTATATTTTCGAAACTATT:1 - chr3R 4189697 5' + HB 1474 1 72.50 ATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAAC:1 - chr3L 16973456 5' + S-element 69 1 68.49 TAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGGCATCGAAGGAA:1 + chr3R 15363942 5' + flea 4844 1 77.40 AGTCAGTTGGAAGAACCTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATTGGTGACATGCGAATCGCACCTTAAAG:1 - chrX 21505712 5' - roo 320 2 72.03 ACTTGACAACAAATTTTTTTTCACGTTCGCAGAGAGAAAAATAATTTAGTCTGAACCAAATGGTTTTTTATACCCGTTACTCCTGGAGTAAAGGGGTATACTAGATTCTTTGAAATGTATGTAAC:1 - chr2L 11154339 5' + INE-1 15 1 75.20 ATTAGTCTTCTGGATATCTCGGGATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGC:1 - chr2L 9782163 5' - P-element 102 1 41.78 AGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGAT:1 - chr2R 5532366 5' + G4 3780 1 49.32 AATACTTTTGCTTTTTTTCTTTAGCACAGCAGTATTGTCCGCATAAGTGGCTGCGATGTGAGGATGCATTGTAATGATGAACTCCCTTTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr2L 8980698 5' - 412 7529 2 51.85 GTCGAACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 + chr2R 12471998 5' - transib2 2785 1 58.22 ACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTTCACGTTTGCTTGTTGAGAGGATAGGTTGTGTGC:1 + chr3L 6964723 5' + P-element 82 1 25.71 GATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:2 - 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Tc3 313 1 73.29 ATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:2 + chr3L 5389846 5' - roo 9028 1 56.16 GAATAACCATTTTGAATGATTATGGCACACAAATTGAATTCATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr3L 8673252 5' + I-element 14 1 70.55 AATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGG:2 - chr2L 17180161 5' + Juan 46 1 45.89 AATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2R 11164529 5' + roo 8701 2 60.27 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTT:2 + chr3L 16731387 5' + rover 7029 2 75.86 ATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - 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chr2R 4545199 5' - invader1 3564 1 71.92 GCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:1 - chr2L 7593130 5' + jockey 4743 1 60.96 CCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 24090536 5' - roo 343 2 62.33 GGTTGTCCGCGTAATGACGACGAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 19266799 5' - roo 9053 2 63.70 GTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAACGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr3R 30059476 5' + FB 62 1 66.42 AGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAAT:2 + chr3R 14860127 5' - BS 5045 1 52.74 AAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAAGATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3L 7889584 5' + roo 8746 2 82.27 TTATAACATTTTAATAAATGCCACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTA:3 + chr3R 7942731 5' + Tc1-2 1537 1 64.38 TGTAATAAGGTCTTCATACTTTTTCGCTCAGGGGCCCCGCATATGCCCTTTGTTGTTGGGCGAGGAAAGAAAAAGAAAAAAAATAAA:1 + chr2L 16601129 5' + Doc2-element 219 1 71.26 GTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:3 + chr2L 15936756 5' - copia 237 1 51.37 AACAATGAAGCTTAATAAGCTAGCAATTTACTATTTTTAATGCTAGTTTTTTCACCCCCACTGTTCGTTGCGTCTACGTAGTTTTGGGCCGCGCTTTAATTTGGATAACATGGCTAAAGAGAGCAATTACTTATTACTTATTACAT:1 + chrX 11452831 5' + Stalker2 404 1 55.48 TGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr3L 3983816 5' + P-element 66 1 33.58 AAAAACACAAGGTGCAAATTACGAAGTTAGCTTTATGCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr3R 23639296 5' - pogo 2098 1 76.43 AATATAGTTATTTATATTTATTATTTTTTTTTTCGCACGGGGCCCACGGCCAC:1 - chr2L 11834408 5' - Cr1a 4443 1 81.13 ACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAG:1 - chr2R 19941605 5' + hopper 82 1 75.18 ATGTTTTCGCTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 - chr3R 16630392 5' + FB 24 1 67.86 GATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1 - chr2L 7593122 5' + jockey 4740 1 63.70 ATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3L 18403093 5' - P-element 2859 1 66.43 ATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTT:1 + chr3R 19449909 5' - roo 8692 2 70.18 TCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTT:1 + chr2R 2591143 5' + roo 8737 2 71.57 AGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCA:1 - chr3R 15054297 5' - copia 182 2 73.79 GTGTGCCAGGTACTTAGGTTTGTGGAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 4964213 5' + roo 8686 2 64.80 AAAGAGTATCAACTATCAGATACCCCTTGCACTTCGCTTCAATTTTATAATTTCTTAATAAATCTCAAACTTATGAAATCAGTGATCGGAACAAAAAAGTTGATTTAAGAAACCAACTATATATTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTT:2 - chrX 20081284 5' - gypsy7 5004 1 43.84 CAGGGCAGTGAGCCCCAACACCCAAACCCACCCCTTCGCGCCACGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACTATGGCCCAGTATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 + chr2R 20348950 5' + transib2 11 1 64.36 AAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:2 + chr2L 18549848 5' + roo 82 2 77.40 CAGATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATTAATAA:1 + chr2L 22107380 5' + Transib-N1_DM 22 1 63.50 CATGCTTGACTTTATAATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chrX 12986667 5' + roo 26 2 68.49 ATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACANGNACACGAATATATTTAANGACTTACA:1 + chr3R 11062706 5' + roo 8681 2 70.31 CAAACTACTTTTAATCCTTTTTTTAAAGGCAATTGGACGACAATGTAAGTTCTATTCTATTTAATGTACATTATGTTTTTTGGTTAAGTTTTGTTATTGTGATGACTAATGAGTTGAAAATTGAAAAATTTTAATTTTAATTTTAT:1 + chr3L 16942124 5' - 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chr2R 4206662 5' + 1360 316 1 75.34 TAAATAAACAATAAAATAATATAACTAATAAAAATATTCAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAGGTGAG:1 + chr3R 19449923 5' - roo 335 2 63.16 CTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAC:2 + chr2R 17796555 5' + jockey 4739 1 63.70 TGGATTCCCTGGGGTGTCATAATTCTTGACGAGCTCATCTTTTACTTAAGTTTTACATAATTTTCATGTCGTCGAATGGGGATGCTATGCTCATCGCGAAGGAGCAGGGAATGGGGTTGGAGGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 - chrX 17799098 5' + Tc1 1471 2 53.57 AATAAAAACGTTTAACAATATATAAAAAACCACAACTGTGTTCTCTGTCCATATGATCGTCGAGGATCCATTCCGACCATATAGATCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTAAGGAA:1 - chrX 22905693 5' + INE-1 139 1 57.34 GTCATAGTGCACAGTGTAATTTTGCATTTGCTAATTACCGAACAGAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 + chrX 2814256 5' + FB 76 1 69.18 GCGAGCGAGACGCCAGCAGTATTGCTGCGCTGGAAGTACAAGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - 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chr2R 6024633 5' - INE-1 507 1 63.01 ATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chrY 311343 5' + 1360 56 1 56.85 ATGTTAATACAATTAACTCTTTTTATCCGCAAAAGAACTACGTATAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAGTGCAAAACAAACTAAAAAAAATCTAACTACAAGTTAAT:1 - chr2R 892099 5' + gypsy2 472 1 69.18 AAAATCAATTTCAAACTATTGTGTCCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 + chr3L 21764805 5' - jockey 4962 1 66.00 GGCGTTGCGGTTTGCTTGCCAACTGTTGATTTAGCGACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 + chr3L 21327051 5' - copia 251 1 58.90 AGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTCTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3R 7420313 5' + 1360 50 1 52.74 ATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 11661496 5' + pogo 52 1 59.71 ATACTTTTTGCAGCAAGTGTTAAATGCTTTACCCAAAGCATTAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACA:1 - chr2L 7119444 5' - hopper 1301 1 71.23 GATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCC:1 + chr3R 9557519 5' + G2 2996 1 60.00 AAAAGCGGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATTAGTAAGGTTCAAACATGAACACGAATATAATTAAAGACTTACAATTTTGAGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 2990013 5' + roo 8704 2 58.82 ATTTTTTTTTTATTTAAAATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGC:1 - chr3R 4351543 5' + Quasimodo 371 2 79.07 AAGAACATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 + chr3R 21276482 5' + BS 5006 1 74.66 AAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 - chr4 373047 5' + pogo 71 1 67.81 GCTTCTTATTGAACATTACTCACCATTGCCTTGCAATGGCTAAATTTTATTACTGTTAGTAGGATCCAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGTGGCAGAGTCAAGATTACAAATAATAGAATAAAGTCTAT:1 + chr3L 27392202 5' - Cr1a 4212 1 67.81 AAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATG:2 - chr3L 9907378 5' + BS 5037 1 53.42 AATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 + chr3R 23639165 5' + pogo 85 1 75.34 TATCTACCCGCCGGCAGGTATTTCTCACTAGCCCAGTTCGGCCACAAAGAGCATACGTCAGGAAAGACATACAAAGGAAAAGAAAAAAAAAACGGAAAAAG:1 - chr2R 23862617 5' + Doc2-element 229 1 77.23 AAAAAATAATTTTCTTTTTTTAAATATTTT:1 - chr4 1091908 5' - TART-B 10628 2 90.00 CCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3R 10931625 5' + 297 6639 2 62.33 AGTGCTGTAATTAATATTATATTATAGTTCTATAAATGGACAATACTAAACATATGCAACTTAGAATATGTCCGTGGTTCTGATTTTATGCTTCACAATGTTGGCGAAGGTAATTTAGCCCCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAA:1 + chr2L 13343891 5' - mdg3 235 2 58.90 CCGTCTAGCAGATAAAAATCAGCGCCTCAAAAAAGCAGTTTGAGGTAGTTGAATTTGGGAAATAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACAT:2 - chr3R 8859186 5' + I-element 5255 1 57.53 GGGTATGCTACAAGATTGTGGCCATAAAACACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTAAATGTTAAAGAACAATTAAAGTCAGAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAACTTAAAGTTTGGGAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACG:1 + chrX 2569083 5' + Idefix 428 2 53.79 TAAGAAACCGAAAGTAAATTTGTGCTGCTTTGTTAATATCATTAATATTATTATTAT:1 + chr2R 21917086 5' - mdg1 41 2 84.21 TCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 17055411 5' + Tirant 12 2 71.30 TCTTAAATTATTTGAATTGCAAGCGAAGTAAAAGAGTATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chrX 17717136 5' + FB 28 1 62.33 ACAACTATTCAGTTCCGATTAGGCCCGCATAAACGTTTAGGTCGCATCCCCAGTTTTTGGGTGGAAAATAGCCCCCGGAAAAGCAACGAACTATTGATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATC:1 - chr3L 3500781 5' + Bari1 1257 1 64.80 TAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACATAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATT:1 + chr3R 4160057 5' - invader2 196 2 51.37 CATTAGAAAGCCGATTTCCAGACTGCCCAACCATGAGTAAATAAATGTACTGGACCTGCCATATAGATTTACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCAT:1 + chr3R 13401910 5' + G3 4535 1 69.86 TTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:2 - chr3L 19455007 5' - mdg1 7379 2 70.55 AAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:2 + chrX 8027377 5' - Juan 4195 1 65.75 TGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAGCAAATAAATAATAATTACTATGTTAT:1 - chr3L 13581724 5' + jockey 4835 1 67.12 TTATGACAATATACAAATCATGGTTAAACAAAAGGACAAATACATGATTATTGAAATTATGTTTTAAAAAAAAATAATCTACGCGATGCAACTGTAACATTGAAATAATACAGAGATCACAGGTGCTCCATGGTATATGATTAATC:1 - chr2L 16178649 5' + G3 4292 1 56.85 AAATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:2 - chr2L 17005849 5' + Stalker2 17 2 72.60 TATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAA:1 - chrX 9950599 5' + jockey 4723 1 62.10 CATTGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACG:1 + chr3L 22400267 5' - 1360 3169 1 46.58 ACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCGATTTTTTTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 21224613 5' - roo 351 2 66.09 GATAGTTTATGGAACGTGCTGAACTTTGAATAAGTATGATCTAGATAGTAAAGAATAGAAGTGTAAAGATTAAGGCTAAAACATATATTTTACTAAAAGTGATATAAGAAAATAGCATATATATATTAATATTATATAAAATTCAA:2 - chr3L 5994369 5' - Tc3 252 1 77.40 ACAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 29611980 5' + jockey 36 1 64.08 ATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chrX 1341747 5' + 412 47 2 53.42 AAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 19073209 5' + roo 8750 2 80.00 AGGCGCAAAATCCACTGCCACCTACAGACAGACGTCGAGAACTTATCAACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCACTT:1 + chr3R 9712332 5' + Transpac 128 2 65.28 AGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:2 + chr2L 13556363 5' - transib2 2739 1 76.71 TCTCAAGTTTGCGACAATATCTATTGTACATATATGTATTAAATGTACTTTTAGAAGAGACTTGGTATCTTATAGTCTAAGCGCTCAACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTTAAACTAAA:1 + chrX 6154213 5' + FB 624 3 56.39 AAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2R 7090742 5' + I-element 27 1 62.99 TTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3R 8075975 5' - 412 7474 2 66.44 AAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTT:2 - chrX 3431961 5' - Ivk 5318 1 60.27 CTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr3L 16662352 5' - jockey 4959 1 59.59 AATGTGCTTGTAATTTCCTTTTTGGAAATATATTGATTTTAAAATGACATACATATTTGCTCAGTTTATTTTATTAATTTCAGTTGAATGTGTGAAGTTTTTCCAATACTTTTTCCGCTTTGAAAATTTTAATTTAAAATTTCAA:1 - chr3L 10513267 5' - 1360 3044 1 64.83 CTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:3 - chr2R 5941444 5' + copia 48 2 53.42 AGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2R 11804591 5' - pogo 2076 1 66.67 CTTATTAAATATATTTTTTTTTTTGTATTTCTATGTTTTTTTGTTATTTATACTTTATTAATGAATACGGGG:1 - chr2L 8803944 5' - BS3 1756 1 45.83 TTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr2R 21116486 5' - mdg1 7392 2 66.44 CACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2L 12818343 5' + hobo 31 1 57.48 ACCTATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 16342043 5' + P-element 53 1 47.95 AAGATGTGGCAAAGGAAAAGAGAGAAAATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCGAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2R 15652024 5' + hobo 35 1 56.20 ATATAATAATTTATAAGAATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGGCGACACTATATTTTTATATTTATTTTTTTAGAAGCGATGAATCAATA:1 + chr2L 12341781 5' - BS 5076 1 69.44 TGGAAAAGCGGGTTGAATGAGCAACGACTGTGGAAACTCTAAAATAATAAAAAAAAACCTAAAACTTTTAAGCCATTTAAACTCATATTTCAAGACAAAATAAAAAACAAATTAATAAATTTGTATTTACAATTAAAATGATATTA:1 - chr2R 20419843 5' - TAHRE 10176 1 38.36 AAAAGGAGTGGAACACGCCATGCCCGAACCAAAAACCGATGGCAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAAC:1 + chr2R 11713490 5' + Burdock 97 2 71.23 CCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTCAAGCCGCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATC:1 + chr2L 7125763 5' + I-element 69 1 60.27 ATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 13158640 5' - roo 346 2 60.27 TGAAATTCTTTCTGTTTTCCCCCAGCCTTTTCCACCCACTCGTCCTTCCGCCCCCTTTTATTTGTTGAAATAAATTCAGAGTTTATTGCTTCGTTATTTTTTCTGTATTTTCCTTTTTTTTTTGCCTT:1 + chrX 13899012 5' - Doc2-element 247 1 50.78 TATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chrX 8092485 5' + pogo 64 1 65.07 AATAAAGAATTCCCTTGCGAAAAAAAACCAATATTCGCGCCAAGAATTTTCTCTTTGGGGGATGTGAAAATTGAATTTATATTCGAGTTTCCAGACACTTGGCTGTTTTGTTGCTTTTTATAACTTGTAGCCAAAGCCAATG:1 - chrX 11899993 5' + S-element 1400 1 80.99 TATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGT:2 - chrX 20999566 5' + BS 82 1 77.40 GATAGCCGTCGTGCCATCACTCTGCTCCAAGCGCCTTGTTGTTGCTCGTCGCAACCGCAGACGCGTGCGCAGGCGTAGCGGCCGGTTTCAAGCGCAACAGTTTGGTTAGTGCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTC:1 + chrX 1135247 5' + P-element 9 2 78.08 CTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chr3R 16630358 5' + FB 23 1 58.10 ATTGAACAAAACCATTGCTGGAATCTAAATAATACTTTGAAAAAAAAAAACATAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCCTTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCGCAGTCG:1 - chr3L 10570598 5' + McClintock 488 1 63.70 TATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3L 2989962 5' - roo 320 2 78.08 GGTAGGTCTGTAGATGTCGGCTAGTGTCTAATAGAGTGTATTACGGTTTTAGGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCTACATGGGTCCACAAATTTGCGTTGCGTCTTTGTCTCTACAATATGTATGCTGAATCGCAACCTTCTAGCTTTT:1 + chr3L 3954664 5' - INE-1 165 1 67.81 ATAATAATTTTATTTTTTCTTTTCGGTCAAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 18226903 5' + roo 8703 2 53.42 CTGTAATAATTTTGCCGTTTGATTTTTAGTCTTAAGCAGAGGTCCAAAGAATAAAGGCGTGAAACGATTTCTCCTAAAAAATATTTTTTTATTTCTTGGCTTTGTCCTTAGTCCACTGACGGGACATTAGTTC:1 + chr2L 14074041 5' + 297 6946 2 78.95 ATTATTATTATGTATGCTAAACCAAGTGGTTAGCAATGCAAACATTATGTAGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr3R 7943820 5' - blood 7319 2 67.12 ATTTTTATGAGGCGCAAGACAGAAAGTATGCTATGCCCTTTGAGCCCAGTTCACTGGGCACCGAGGGCCACAAAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCG:1 + chr3R 5770824 5' + roo 420 1 54.11 ATCCACAGACGCACCAATAGATTTTTGATCACATCGCCGGCCTTCTTTAGGAACTTTGAGGTCTTCTTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCT:1 - chr2L 8177410 5' - invader2 460 1 53.15 AGAAATTATTTTCTTTGAAAAATTGGTTGATTTTAATTATTAATGCCTGTAGGGAAAAGGTATTTGTACAAGCAAGACCGCCACACCATGAGCTAAAGCCGGACTTTAAAGCGTGCACCCGCAAG:1 + chrX 19595638 5' + gypsy12 10151 2 77.60 ATATGATATATAAAATGTATGATCTAAACTAAGTTATAAATGGAATATAAATAATTTATGTATGAGCTATAAAAACAATTGAAAAATAAATGCAATCACTCAATTTCACCACGAATAAGCTTACAAATAAACACTGTTCCAAGCAT:1 + chr2R 25073853 5' - Cr1a 4028 1 67.12 AAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCCCACTTATATACAGAGAAAAGCTCGAATACTTTTGTATACAAAATAATTGAACTTGTTCGAAAATACAACTTCCGCATAATACCCCAAAAAAAGGACAGCATCCACGAAACTAAGGTCCA:1 + chr3L 25552487 5' + Fw3 87 1 75.34 TGAGCTTTCAATTTGTCATTAGCATGCTCGATTAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 7719866 5' + roo 13 2 76.22 ATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCC:2 + chr2L 15950935 5' - TAHRE 10404 1 55.21 CAAAAACTCTTATTTCGAGAATGCTCACAGTGGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCACATCTTAAAGT:1 - chr3R 4507942 5' - roo 319 2 74.66 CAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCTCG:1 - chr2R 12779741 5' + I-element 41 1 58.22 GCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCCTCTTAAAGTAAATG:1 - chr3R 15790974 5' - roo 8978 2 82.88 AAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCGTAGATTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 + chr3R 8051132 5' + jockey 4812 1 61.72 TTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 15790803 5' + roo 21 2 61.64 CTGGCCACGCCCCCGTTTCCTTGACCAAAGTCCGTACACACCGCACTTTGTTATGTTTTGTTTGACTTTGCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTC:1 - chr3R 17816612 5' + Cr1a 279 1 60.27 ATATTATTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGT:1 + chr2R 11367660 5' - Copia1_DM 110 1 63.89 AGTGGACAGCAATTGCAATCCCAACCTGATCACCTATCCGGTGCCCGGCAACGATGACTCGCCGGCCGCAGTGGAGCTCTATTGCAACCTCTTCAAGGATAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTG:1 - chr2L 4849683 5' + Bari1 406 1 76.74 TTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 19073199 5' + roo 8741 2 73.29 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAG:1 + chr3R 19450171 5' + roo 358 2 69.18 GGCTTAGATATTAATTTTCTAGGATGCTATAGCACTGCTCACTTGCTTCTGATGCTTCTGCGAACGACTGCGAGATCGCTCCTTGAAGCACAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 22476000 5' + G2 3075 5 80.00 GAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 - 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chr2L 16690701 5' - P-element 2852 1 41.41 ATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTT:1 + chr2L 22329013 5' - invader2 4707 1 65.75 CAAACACAGAAACAGGCGAATTAGTTAATCGGGACGTTAAAGCAATAAATATATATAAGGTACAATGATAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACA:1 + chr3R 13431576 5' - BS 4993 1 57.53 ACATAAGAAAGGATACAAATAAAAGGTCACAATGGGAAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGA:2 - chr3L 25322836 5' - Transib5 2979 1 67.81 TTAACGCTCACAAACCGCACAAAACTCACATGTTTATTAGTCTTGTACATTTCTATTGATTTGTAAAAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTA:1 + chr2L 21377564 5' - 1360 3212 1 52.14 ATTAAAATGATTGCTGATAATAATATATAAATATAATATAAAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGT:1 - chr2L 6654785 5' - diver 200 2 69.18 CGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGGGGTCGTGGGGGGTTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 + chr2R 12779624 5' - I-element 5334 1 53.33 ATTCGCATTATTTATGGCCGCCTCTTGCTTTTGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCA:1 - chr2L 12809679 5' - Idefix 2 2 46.58 ACTATTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 12779757 5' + I-element 25 1 69.18 ATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 14366553 5' - roo 324 2 78.08 ACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGGGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3R 27160054 5' - 412 466 2 58.20 TATCATAGGGTATCGGTTCGCAGGCTTGTGTGCGTAATTTGGTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCC:1 + chrX 21993562 5' - gtwin 465 2 65.82 TAAACATAACGTGCATCACCGTATGGCAGATGAACCAGGAGTAGGGCACCAGAATGGTAACCAGGGCAGCCACCGAGATAAGCGGATACACCTCCTAAAATAGTCCCTTA:1 - chr3L 18954466 5' + roo 188 2 78.18 ACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - 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I-element 361 1 70.23 ACAATAATGTATCAAAACTTGAACCACTAATACATTCAGACAAAAGAAATAATCGAACAACACAATCAGACGAATAATATCTTTGTGATGATTTGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTCTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATG:1 - chrX 22218801 5' - 1360 303 1 52.74 GGAATCACACAAACTGATGGTCAACTAGAGAACCCCCAACGGCAGCTAATCCACTATAGATATATCTTAAGTCGTTAAGGCCAATCTCTCATATCTCAACTCTTATTACATTGGCGACGAGGTAAATTTAAACAAAAAGAAAAAA:1 - chr3R 9804895 5' + TART-C 11097 1 64.14 AAAAAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATG:1 + chr4 123926 5' + HB 98 1 67.12 ATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:2 - chr3L 18505724 5' + I-element 79 1 72.60 GGGGAATTGTTTTATACTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 15569136 5' + hopper 144 103 74.36 TTGACGTTGCCTGCTTTTAGGGGCATCCAATATGGCTGCCGGGCAAGCTCAATCTCACCAACACAGCCATGTCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACCAAAACGGAATTGTG:1 + chr3R 28928420 5' + jockey 59 1 50.34 CTCTAGTGCGGCACCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTCGTTTTACAATTCATTA:1 - chr3L 13581755 5' + jockey 4802 1 56.94 ATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATT:1 - chr3R 21276635 5' - BS 5044 1 50.68 CGGGATCTACTTACCGGATCTCCGTTGCGCAGCCAGTCGATTGTTGGATTAGGATCGGCCTTTACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATG:1 + chrX 4143613 5' - F-element 4410 1 61.64 ACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3L 18046704 5' - roo 348 2 58.22 TATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTGTACAAAAATTAA:1 - chr3R 4679593 5' + hopper 19 1 71.23 AGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2R 14051754 5' - roo 9009 2 61.81 GGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCGGACCCTCGG:1 + chr2R 17796534 5' + jockey 4711 1 56.12 TAATATAATAATATAATAATATAACAATATAATAATATAATAATATAATAATAAAATAATATAATAATATAATAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTTGAAAATATGTATGTAATATGTAT:1 - chr2L 15490094 5' + Dm88 4366 2 87.67 TTCCTCAACTTGTTACATAAATCGTAATTTTCTATAGACTTGTTCTATATCTAATGTATATTGATTTATTCTTTTCAGGTACCCCCGTCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAG:1 - chrX 4962992 5' - TAHRE 10060 1 59.15 AGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTG:1 - chr3R 23067512 5' - roo 8994 2 70.34 TCTATTGCCGCCCCTGTCAATGGGTGCATTTCTTTGCGTTGCATCACAATGCTGAAAACGTTTTGTATTTATTCTATTTTTTTTTCTTTAATTTTTTGATGCCTACATTTAACTGGTTTTCTTTTTTTCTTTTCCTTT:1 - chr3R 18002411 5' - Doc2-element 219 1 49.28 CGTTGAAGAGTATGTAACAGGCAGATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTAT:1 + chr3L 19471446 5' + INE-1 143 1 69.18 AACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 2989923 5' - roo 359 2 51.37 ATTTATTTCCGTTTTTCTCACTTTTGTTGCAACTTTTTGTTTAGGTTAGGTTTGGAGTTTCTGGTTGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTG:1 - chr2L 10957204 5' - Juan 3846 1 54.79 TTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 - chr3R 13187487 5' - I-element 5265 1 76.03 CAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTTTGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAA:1 + chr3R 12242282 5' + transib2 88 1 77.40 ACCAAGAAAAAACAAACCAAAACAATCCAATCAGCTTGGCCAGCACTCACACTGACTCTTGAAAGCGAAAGCGGACGGGAACCAAACAAAAAACTTTGTCAAACAGGGCTGGAACGCTACATCCAAATAAAGCGAAAGCTAAGCCC:1 - chr3R 15873627 5' + Fw2 36 2 70.55 ATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGGGTGCTTATCTCA:1 - chr2R 12133813 5' + jockey 99 1 78.08 AATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAA:1 - chr3R 27083133 5' + jockey 4562 1 53.60 TCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGAAATAT:1 + chr2L 17205203 5' + hopper 88 1 75.34 CCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATAT:1 - chr3L 24934384 5' - HMS-Beagle2 7119 2 71.23 TCACACCCCGCTGCTTCTATGTACGTTGACGTTGACGTCGACTGCGAGACTTTGAGCAACCAGCATGAAAATGCAGGAGGGGCGGAAGAGTAGGATTCGTTTATTTGTCACAGCTGTGGCTG:1 - chr3L 5187022 5' - gypsy4 325 2 77.87 TACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAAACACTAGAATAACAAGATCCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 23287289 5' - 1360 3368 1 58.67 ACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGGCCACATATTTCGAGGCACTGCACTATGGTCCAGACTTCGAATTTTTTGGCATAAAGTCTAAACTTTTA:1 - chr2R 12472104 5' + transib2 27 1 45.26 ATAGGAGTGTCGCAGGGGAGATGATGAGGGGTGTGTGTACTTCGAGAATTGAACGTGCTTGCAACAAAGGAATAAAGGAGCTAGTATACAAAATCGAAGGAAGCAAATTAATATATTCAAAAGAAGATAGTTCTAGAAGAGAAGGA:1 + chr2R 18073198 5' - Gypsy12A_LTR 2027 1 74.66 TATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 3030200 5' - roo 350 2 63.01 TTAAAGCACAAAAATGTAAATGGATCTGAATGAAATTCAAAGACGAAGTTTTAAAATAAATGATATATATTTTTGTAATTTTTATGGCATGCTCTACAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTTAAGACCTTCAACATCTTT:1 - chr2R 7617551 5' - invader2 4641 1 66.44 CCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTA:1 - chr3R 15790106 5' + flea 4749 1 57.53 GCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAA:1 + chr3L 22890363 5' + FB 3 1 67.09 ATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 + chr3R 10270589 5' + Juan 4105 1 69.18 AAGGATTTTCCTAATTATTAGGTATTTAAGCTTCAAATGCTAATTTCTAACAACTGGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCC:1 - chr3L 13098639 5' - 1360 2999 1 63.70 TTCACGTGCACATCGCCCCGTTGCCACGTTGTTCGGCCTTTTGAATTTATTGGCCTTTTACTTTTATTTAATTTAACAGTGCACCGTTATAATGACATTTATTTAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAACTTAAAAAGAAGA:1 - chr3R 31199088 5' - hopper 1187 1 59.59 CTTGTGCCCATTCTCCACTGATATTTTCTGAAATATTGCACAGTTACAGTTTTTGGAATCACTTGACAAGAATTGAGGTTGTTTATCAAACCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCA:1 + chr2L 23320520 5' - I-element 34 1 59.57 GGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 - chr3R 11040163 5' + Bari1 57 1 55.48 AATCCCATGAGCTTATCTTAAGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 27160194 5' + 412 7085 2 63.70 GTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCA:3 - chr3L 16973453 5' + S-element 72 1 70.55 CATAACTGAGCTGTTGGACTGAACAAAATTAATTTCTTGCATAAATTGCGAGGCCCAAAAGGGCTGCTCCAATTTAATTGTGGAAAACGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGGCC:1 + chr2R 19048449 5' - F-element 4359 1 62.86 TGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3L 9809337 5' - 412 427 2 64.29 ATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTTTTTTAATATCTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAAT:3 + chr3L 15781845 5' - TAHRE 10416 1 63.70 ACAAGGGCAGGCCAAACCGGGCAAACAAATATGCATGTAAATTATATTTAATTCAGAGCAAATGAAGTTAACAAATATTTGCATACCAGCAAGCAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCT:1 - chr2R 17350016 5' + TAHRE 10411 1 67.81 ATGATACTTTGCCTTTAATTCCTTCACTTGAAAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 16818008 5' + 412 29 2 65.07 AGAACCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 + chrY 495734 5' + Doc 3 1 63.89 TAGGCCNACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3R 11062738 5' + roo 8731 2 63.70 AAGAAATATTATCTGCATCTTTGCTACTACTTTCAATTATTTACGTTTAAATTGAATTAAGTGCCAAAATTCGCCTCCCCAGCAATTGCTGTTTTTTGCGTCACAATGCCAATATACATATATATACATATTTATAT:1 + chr2L 13148176 5' - G3 4509 1 72.26 TTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 5532894 5' - roo 9045 1 65.07 AGTGGGCCATTGGAGGTCGATTTACATAGTTATTGGAATATCTACCAGTATTGAATTTGTGCCATATTCGAGCTGGAACAGCAACAAGTTGCACAGAAAGAAAAAAAAGTAAAAATAAAAAAAGTAAAAAAAAATAAAAATACCAT:1 + chrX 11848638 5' + TART-C 414 2 69.18 AGGGAAAACTAAGCTGCCTTAAGTGTCCATACCTTATCGGGGGTATTTGCCACCCTCGGTCTCGTTTCCCTACTTCCTCACTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCTTTTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGTCCTTACT:1 + chr3L 479885 5' - 412 102 2 56.16 GTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTGTTTTGCTTAATTAAACGC:1 - chr3L 16973453 5' + S-element 71 1 68.97 GCATTGTTCGAGAGATCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACAC:1 + chr3L 2694033 5' - Cr1a 255 1 72.73 AAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 14980419 5' + roo 50 2 52.41 CAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 13158627 5' - roo 9023 2 52.05 ATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATTCGTTAATTATATAAAGTATTCTTTGTTTGT:1 - chr3R 15363992 5' - flea 4945 1 70.54 GTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGA:1 + chr2L 11257006 5' - rover 290 2 58.22 GGACTGAGAAGAGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 5389887 5' - roo 8987 2 78.77 AATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACT:1 - chr2R 20802646 5' + mdg3 5362 2 79.37 AGATGCTTTAAAAATTGGTTTGTATTAATGGTTTATGTTAAATAAGTCAATGACTCTTGTTCTAAATTTACTAGACATGAAATGATGAAATCCAAAGTGGGTTGGTTTAAAACAATTTTTTTTATAGAATATATTAATAATGAAAA:1 + chr3L 6366834 5' + transib3 2507 1 17.81 ATGATCCTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2R 6847871 5' + Doc 39 1 63.70 AATATCGATTTTGCCCAGACCTGCGAAGTGAAGTGGAGTGGGGTGGGTGGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3R 20818421 5' - 1360 3329 1 64.93 TGATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chr2L 6654607 5' + diver 20 2 69.18 CACAAGAGCATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 27986320 5' - roo 9048 2 68.66 AAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:3 + chr2R 3338784 5' + Juan 60 1 57.53 CTAATGTATCTATCAGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCCGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - chr3R 16157369 5' + pogo 81 1 71.92 TATTAAATATAAACATGTATAAATAAATATGAGCCACAAAGATGCGCTCATGTCTATCCAAGTGCCACAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAAGATCCGCAACCC:1 + chr2L 20142859 5' + G2 132 1 77.69 CGCTAGTTCTTCTGTAAGAACGTCGACTGATCAATAAAAACAAACACAACAAAATTAGATTTTTTAAAAATTGTTCGATATTATTTATAACTTTATTAGTACCCCCCCAATATTTCGCGTTTGCATTCCCAATAGCTGAGTAACGG:1 + chr3L 19424910 5' + INE-1 536 1 69.86 CGTCCACAAAAATTACCGCCAAATATTTCATATGAAGGTAAGGAAGGAGTCTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGTAGATAGACGTGATGTATAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATATATATAACGAAAATAACTATATTAAATAT:1 - chr3R 1953056 5' - Cr1a 4310 1 65.07 ACACACACGGCCGCAAAACACACTGAAATCCACTAAACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACGGCACAAATCACAAAGAATCACTCACGAAGCGAACGGATCTTAAATAATTATGTTTAAAATATA:1 + chr3L 5744331 5' - Cr1a 100 1 73.97 TTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTT:1 - chr3L 19350036 5' + 1360 3234 1 47.95 ATAAACATTAAATAAAAAACGGGACAGAGAAAAGGGTAAAATAAGAACAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCCGGCATGGGA:1 + chr2L 18927034 5' - accord 6961 2 56.99 AAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATT:1 + chrX 15553112 5' - X-element 4616 1 77.55 ATGTATTTTCCTACAACAAAAATATTCTTAAATTTTAATACTTTCTTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTA:2 + chr3L 18768400 5' - S-element 1682 2 62.33 ACATGCATACGAACATACACATGCACAATCCGCAAACTACATACCCACACCCAAACGCACACACCAATACCAATGGCAATACCAATACCAAAACCAATACACACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATT:1 + chr3R 19764982 5' + TAHRE 10393 1 68.49 CAATAAAGTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 + chr3R 4805601 5' - 1360 3332 1 56.16 ATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:2 - chr2R 9967129 5' - Bari1 1643 1 60.96 GTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCAC:1 - chrX 19038452 5' + hopper 78 1 69.86 ATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 3920574 5' - roo 332 2 70.55 AAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGG:1 - chr3R 10736142 5' + McClintock 42 2 53.57 AAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr3L 22890371 5' + FB 54 1 63.11 GTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:2 - chr2L 16943875 5' - copia 206 2 72.60 AAAACGTTTGCTATTGATTCTATTAAAGTAGCAATATCAGCCTTGGGCTAACGAAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr2R 14653298 5' - 297 6960 2 70.55 AATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGC:1 - chr2R 12185385 5' + accord 32 2 70.24 ATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr2R 17878646 5' + Doc 57 1 50.00 CATTTGAAATCATAAAATCACGCCTAAAAGCTTTTAGGTTACAAGGCCCAATTGTGCCTCCATTGGATGATCTGGAAGCTGCTTCTGGGGGTTGATCTGGACTGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTTTAGATTGGTCGGGG:1 + chrX 4799743 5' - G-element 4222 1 73.29 ATAGTCACTCAAATTAATATGTTTTACAATTAAAAAGTTTATGGGTTTTCAACTCCTTACAATTGTTTGTTAATTGAATCATCTAATGTAGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTC:1 + chr3R 19289843 5' + roo 8810 2 62.07 TTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 9544856 5' - roo 8990 2 73.97 GGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTA:1 + chr2L 7660922 5' - I-element 5283 1 65.75 TGAAATATACTAAAATAGCGCAGTCATTTCAGTCCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTC:1 - chr3R 28662589 5' + jockey 4547 1 76.06 CTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:2 + chr2L 7660915 5' - I-element 5290 1 60.96 GGTTCCCTGCCCATTTCCACCACCCCCACATGTGCGCACACACTCACTTACACGCGATTTTCCACACACATTTCCCCACTTTCCCCTCTCGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTT:1 + chrX 20630953 5' + I-element 5139 1 63.31 ATAACGGTTGCTGAACTTTTAAGGCTGAGCTTTTGAAGCTGTCTCTCCGCTTTCGCGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAAACATAAATGTGGTCTGCTTTTATA:1 - chrX 12043597 5' + Cr1a 444 1 61.64 TGATCAAATACGTCAATACGTCATAACAAGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 26160457 5' - roo 351 2 78.38 TAGATTCAATTTATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAT:1 - chrX 1799257 5' - invader4 3070 2 72.93 GATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTAAAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTT:1 + chr3L 24039754 5' + springer 7307 4 52.05 CCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATAGTTTAAATACTTCCAGCCAAAACCAGTT:1 + chrX 22564582 5' + Transib5 90 1 59.59 AGAAAATAACAATAGGTTATGGGCCCAGACACAAAACAGAAGAAACTCCATTTCCCATACTATATCCATCAAT:1 - chr2R 1365228 5' + 297 6523 1 53.42 CAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3R 16341934 5' - P-element 2842 1 50.38 AAGCAGCTGCGGTGAGATACGGCACAACAAAAAAAATGTGCAAAAATTCCATAAATTAAGACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTA:1 + chr2R 13800060 5' + I-element 5159 1 58.90 TTTTTCTCGTTTCTCCCATTTTTCCCATTTTTTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 26774033 5' - hobo 2916 1 47.00 GTAATTGACAATAATTTTACAAATATGTAAGAAAACTTTACCAATGAGGTTTGTGTACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr3R 30946658 5' - Transpac 5213 2 74.66 TTAATTTTTCCATCATTAGTGTTAAAGATTATTTTTGCTTTTTGCGGAATAAACGAAATCTGAAACATAACTTATTTGCCGATTGTTACGCCTCCAACTTCGAACTTCGTATCGATATAAAATGTACGTTATAATTTGATATTAAA:1 + chrX 23184340 5' - invader5 16 2 47.95 TTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 + chr2R 20227207 5' + hopper 26 1 54.92 AGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAAT:1 + chr3L 3501730 5' - Bari1 1630 1 70.55 AATTTTCCAAAACATAACATGTATACCCGAAGATCAATACATTTTTTGATTCAAAGACAAGAGAGAACCGACTATAAGATAACCGTTTCAATACTTTTTAGAATATCGTGAAATTGGGGAAAATAAAATATTTTATTGAAAAAAAA:1 + chr2R 5883520 5' - hopper 162 1 71.92 AACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:2 + chrX 8027398 5' - Juan 4174 1 51.37 AAATGATTTAGATCTGAAATAATTGGATTAAGCGATAATCTATATAGATATAATATAGATATAGATAGATATAGATAATATAGATCTATAGATAGATATAGATAATATAGATAATCTTTAATGCAATTTTAAGGATCCAAGTGTTC:1 - chr3L 23212655 5' + Helena 90 1 53.42 GAAATTAAGCCGGAAAAGTGTTTAAAAACCTTTAAAAGCAAAGCTAGCAGAGGGAAAAATCCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCA:1 - chr2R 10604521 5' + Ivk 5033 1 58.90 GTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTCCGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chrX 17717014 5' + FB 63 1 64.44 AGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGCAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr3R 13187536 5' - I-element 5314 1 52.05 TCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCAT:1 + chr2R 4854965 5' + 17.6 6965 2 55.22 ATTTAACCCATTACAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGT:1 - chr2L 1924051 5' + G2 2973 1 76.12 AATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr3L 14094663 5' + I-element 79 1 75.52 ATTCAGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGCGTGGACGTGTT:1 + chr3R 15882538 5' + jockey 22 1 70.34 AAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTAATT:1 + chr3R 27160085 5' - 412 7487 2 65.04 GTATACAGTTTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:2 - chr2L 13556500 5' + transib2 3 1 78.08 ATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3L 16470374 5' + jockey 4686 1 69.16 AAAAAGTATATGATGACTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 23067571 5' - roo 9052 2 74.66 GGCCACTGTACATGTAATTGCATTCGTGTGGGTGTGGGCCAGGCTGTGTGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTAGGGTTATGGGTGATTGACC:1 + chr2R 14280713 5' - Doc2-element 400 1 65.07 ACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCT:1 - chr3L 17940178 5' - 1360 3312 1 71.92 TTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAG:2 - chr2R 21410943 5' + Burdock 6223 2 77.40 AATCTTTCTTCATGTGTTCATACGGACAGACAGACAGACGGTTATGGCCAGATCGACCTGGCTAATGATCCTGATCAAGAATATATA:1 + chrX 20526703 5' - INE-1 81 1 73.56 CAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chrX 8308422 5' + roo 86 2 77.40 AAATGTTTAAAAATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGAGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTATCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 + chr2L 3675810 5' + Juan 4050 1 61.64 TGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTAT:1 - chrX 19980665 5' + X-element 4571 1 76.03 GTGCTTATGATGAGCTCGGATTATGGCGCAATGGACTGTAGCCTGCCGTCATTATCCGTAGCATCTGAAGGATGAAAACTGTGAGAGTCTTAAGGAACCAAGACACATTTTAAAATAAAATAATTTAAGCAG:1 - chrX 18586732 5' + jockey 4929 1 33.33 AACATTTTTCAAAAGCTTGTGGGTTACAGTTTCGCATGCTTTCCAAATTTCATAGTTTACAAGACTAATCAAAATGTGAATAAATATCGTCTGTATCATACGGCCAGACGGACATAGCGAGATCGACTCGGCTATCGATCCTGATC:1 - chr2R 5694905 5' - INE-1 92 1 62.33 TATATATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:2 - chrX 11978486 5' - roo 9054 2 43.15 AACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 - chr2L 12984245 5' + hopper 36 1 60.27 CATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chr3R 7420319 5' + 1360 44 1 56.85 CAGCTGTTCGGAAGCTGACTTCAAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2R 10417092 5' - 1360 3377 1 74.64 GGCTCTNTGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 24090466 5' + roo 8748 2 76.03 AGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTTGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTT:1 - chr3L 20187415 5' - FB 475 1 51.80 TTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGGGGTGATTTTTTTTTGCCGTTTGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAA:1 + chr2R 5582136 5' + Cr1a 42 1 77.78 TCTTTTGCCGTCCAAGTCTGTCTGTTAGCCGGGAAATCTGGCCTTCTGTTGGCCTACGGACATATACAAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 11061545 5' + roo 8712 2 53.42 TTATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chr2R 24170034 5' - transib2 2808 1 46.58 AGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3L 14720931 5' + F-element 47 1 56.43 ATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCAACAAAGGGATCATATCTTAAGAACTATGTTTAAATAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTT:1 + chr2R 5410989 5' - Tc1 1328 1 75.34 GGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chrX 18817241 5' - transib2 2799 1 68.49 ATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTGATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTG:1 + chr3R 24729581 5' - Juan 4158 1 62.96 AGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAATGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATATAATAGTTTACAAAAATAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTATGGGGCTT:1 + chr2R 7090644 5' - I-element 5296 1 56.62 TCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chrX 19539477 5' + pogo 57 1 59.59 ATGCTAAAAACAAATTTTGCTTTTTTCCCTTTTGTTCCGGCTTAATGCCACAAGCCGATTTCGTTGGTCGGCTCTGGCATTTGCATTTGTTGGGATTGGTATTATTTTGGGGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGG:1 + chr3L 14859772 5' - I-element 196 1 70.15 AAATTATTTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAA:1 - chrX 15215588 5' - transib2 340 1 70.21 ATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chrX 2214242 5' + jockey 4779 1 64.04 TTGCATCAAAGAAAACTTAAAGCGCTTTTCCAGTTCTTTCCTCATCGAAGTGACAGATTTTTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGT:2 - chr3R 12345536 5' + accord2 7239 1 58.22 ATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr2L 7125754 5' + I-element 60 1 56.85 AATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3L 3983919 5' - P-element 2848 1 59.59 GAAATGAAATGAAAACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGGGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCCACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - 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chr2R 21681415 5' + roo 50 2 52.74 AATTATGCAATGCAAGGAAGCACGCATAAGACAGAGAAGGCCAAAAGAGAGATGTACTGAGACTCCAGAGCCAACACCTATGCATAAATAATGAAAACCCACACGGGACACACTGTTAGCTTATTCAAGACCAAGAATAAAGACGA:1 + chr3R 32017685 5' + ZAM 8264 2 76.71 TATCTTGACTTTTATGATAATCAATAGCAGCATTAAGATTATTCCGCATTGGTTTATGGTTAACATGCCCAAATTACGACCTACCTCAATATTGTGTTTTCTTTTGTATGCCTTCAAAAACTGAAAGTTTTTTTTTTCTTTTTTGT:1 - chr2L 18418128 5' - HMS-Beagle2 490 1 67.81 AGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3L 23906445 5' + 1360 81 1 78.52 AATTTATAAGGACACTGAGTGCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3R 30946488 5' + Transpac 4956 2 60.00 TATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACC:2 - chr2R 12185464 5' + accord 15 2 72.60 TAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAA:1 + chrX 18817303 5' - transib2 2737 1 76.71 TGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 7889680 5' - roo 9032 1 58.22 AGGTACTTCGAATCATTTTGGACCATGTTGGTTAACTATTTAATAATCGTAAAGGCGTTGATAATAACATTTTATTTATTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chr3L 8673399 5' - I-element 5307 1 50.68 GAGGAACACAACTGCGAGTTAAGCGAACCGAAAGCGATCTATCTCCGCCTGCCCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTT:1 + chr2L 14534515 5' - P-element 148 1 38.36 CGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAAC:1 - chr3R 10736133 5' + McClintock 6009 2 61.64 AGGATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAAGAGAGAATGCTATAATCAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGCTACTCAGCTAGTGTGAATGCGA:1 + chr2R 5503707 5' - INE-1 532 1 71.58 AGTATCGGGTGTACGGCGGAAACACCCAACAAAGGAAGAACCTTTAGAATTAATAACCAGTCGGGCTTTTGAGTCTCTGTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAAC:1 - 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Cr1a 4152 1 69.18 GTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGACAGTCAGGATTAGAGGTAAGAGGAGGTATTAGAGGTAATACTCTATAGATGCTGTAATGACCCGATTATTCAGTAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATA:1 + chr3L 25481553 5' - Cr1a 4154 1 66.44 AAGGACTCACGTAGCTCTACAGGCGAGAAGTCCTGGGAGTTGGCTGGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGG:1 + chrX 21567771 5' + micropia 5409 2 64.34 GCAAATAAAACAAATAATATCCGGGAAGGGGCTATTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAA:2 + chr3R 10145640 5' - Juan 4125 1 75.34 CCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:3 + chr3R 15054233 5' + copia 4953 2 78.08 GCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACA:1 + chr2L 6174066 5' - I-element 5293 1 64.18 AAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - 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412 7536 2 76.03 ATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3L 1279082 5' + roo 60 2 60.69 TGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 - chr2R 9967138 5' + Bari1 56 1 54.79 ATAAGATCAACGTGTGAGCCTTTGCCATGCTGTGGCATCTGCAGCAGGGGTTGCGCTTTCAGGTGCTGCTGGAATAAACCAATATATGCC:1 - chr3L 1692126 5' - blood 378 1 72.22 TAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 - chr3R 24381421 5' - Juan 4179 1 70.55 GTGTGGCTTTGCTGGGCTTTCGTTTAGTGTTTTGTCCAGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGACAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATA:1 + chr3L 2665294 5' - Porto1 4275 1 67.81 AAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 + chr3R 4682906 5' + Burdock 81 2 75.34 AATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACAC:1 - chr2R 5532328 5' + G4 3821 1 64.83 CCTCACGGACTACACACCTTACTTACACCTTACCTTACACTACATACTAGACCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAA:1 - chr2R 4934109 5' + Doc 4577 1 65.07 GAAAGCGATCTTTGTAGCACCAAGTATTAACTAATCTGAAGCAGCAGCAGCAGTAGCCGCCAGCTATTGAGAACATTGTTCTATGGTTAATAAGCAGAGCTTATTTAAAAGCTGGGTGTCATCAGAATTGTTCTCATCCATTGTCT:1 - chr2L 408446 5' - BS 336 1 52.74 TCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 + chr2R 7244788 5' + diver 5925 2 59.59 ATCTTGTTCGATTTCAGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2L 13158741 5' + roo 60 2 59.59 AGAACAAACGCACGGAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAACATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr2L 15076247 5' + 1360 19 1 72.60 AGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTTCTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCT:1 - chr2L 23295887 5' + micropia 5087 4 50.36 GTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTA:2 + chrX 2214265 5' + jockey 4834 1 67.81 CAGTACATCGCACTCAGCACCTTTGGATTCTACACTAATGGCCATTTGGATGTGCAGCTCAGCAAATTGACTTTTGACAATGAGCAGTCTACAGATTTGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTT:1 - chrX 9231905 5' - Ivk 321 1 69.18 CACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 17809266 5' + jockey 36 1 54.78 AGAGAAAGTGGAGATAAATGCATGCAGAACATGAAAACCTATAGGATCAGCAGTGGAATCAATTCATACGAATAACTCACACACAAACAATTATACCCAAATTCGACCGGACTCGATCAAATATAAATAATACGACATCGACTAGG:1 - chrX 13858358 5' + I-element 4936 1 67.81 TTCATTTGTAAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr3L 11913157 5' + BS 5017 1 68.57 AAATAATGCAAAGGGAACCAACTTTAGTCCAGGGGTTAAAATAATATTATTATGCGATGCACTTCATTGTCTTGGTCTTTTTGCCGTTGAGAGCGCAATTCGCGTTGGCTCTTTTTATAACGATCGATTCGTTCGTTG:1 + chr3R 19493285 5' - Doc3-element 196 1 50.72 AAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCACTCGCAGATATTATGTTGAGAGGGACTTTCCTCTTTT:1 + chr3L 23456277 5' - Gypsy6A_LTR 276 1 62.18 GCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTT:2 + chr2R 18316048 5' + HMS-Beagle2 78 2 69.18 CTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCTCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTTCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTT:1 - chr3R 9298537 5' - hopper2 1519 1 74.66 GGATATTATTTTACTACAATATATTGGTTATAATGTGATCGTTAATATTCAAACCTGAAAAGCCTACACAAAGTACTAAGTTTAGTTAAATTAGTTGTCCATAATTTTTGAAATATTTTTATTTAGAATTATTATTATTTGCATAA:3 + chr3L 5502863 5' - P-element 2496 1 61.64 CATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGTGCCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chrX 9950607 5' + jockey 4737 1 60.96 ATAGCATAGAAAAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr2L 18347248 5' + transib2 24 1 67.81 GCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTT:1 + chr2L 15550688 5' + Bari1 89 1 76.03 TAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 5389847 5' - 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rover 7106 2 76.83 AGCCAAATTAGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATA:1 + chr2R 5106229 5' + Stalker2 7276 2 67.36 ATATATCAAAGCAGAGGGCATTGATTCTTGTTGGAACCAATAAACCGCCAGAATGTGTAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAAT:1 + chr3R 2157779 5' + mdg1 7101 2 59.59 ATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAA:1 - chr3L 20187418 5' - FB 655 3 53.42 AAGCAATGGTCAATTGACATGGCAGCAACAACAATTGTGGCTTAGTTGGCTGGCCCCCTTCCATCTGTTTTTTGATTTTTTTTCTTTTTATTTTTCTT:1 - chrX 3064041 5' - F-element 4682 3 63.27 AAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTAAAAACCACACTGTTCACACATGTTCACGAATATA:1 - chr2L 20266022 5' + roo 8667 2 60.56 ATTCATAGTTATAACAAACGACCTTTTTATGTCCGCAGATCCTAATTCCAACTAGAAGCCCACTTATCCGTTATCCACTTATCCACTACTTACTACCTAAGTCCAAATTCAATACCAACTTATCCGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 - chr3R 4969530 5' + I-element 5013 1 65.52 GAGAAATGTTGTCCCTTTTGCCTCTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTAACTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGATGAGTCGCCTCCTTTTAAAAGTCTGACCTT:1 + chrX 1141303 5' - P-element 328 1 20.63 CCTTTTGCGATTGCAATCATGATCTCACTCGATTGCGCATCCGTTTTTACTTGACAATTGTTATCCTAGATCGTTTTATTTGCTCTATTCTGTTTGCTTGGTTATAAAAGTTCAAATATTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCTTATT:1 + chr3L 13924115 5' - Rt1a 5078 9 75.34 ACACTAATAATAATATTAATAATAGTTATTTTACCTTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTGCTATACCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTCCGTCGGTTGG:1 - chr3L 13905027 5' + Cr1a 4412 1 80.60 AAATAAAACAAATAATATCCGGGAAGGGGCTATTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAAT:1 + chr3R 10145642 5' - Juan 4124 1 76.55 AACAGTTGAATTTGAAATTTTGCAAGCCACACGGAGAGGAGGTGGGCAGATATGGGCAGATACCGCCAGTTGGCAAGTGGTTCTCGCTGGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACTTAT:1 + chr3R 28742955 5' - Stalker4 248 4 64.66 AGGAGGGGGTGTCGAAGGAAGTAGTATGGTGGGGGGAGAGAGGAGGAGGGGTCAGGGCGGAGAGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCCGC:1 - chr3L 4234046 5' + pogo 16 1 74.31 AAATTGACCTTTGGAAAAGTATATGAAATTCACGCTAAATAACTGGCAATTATTTTTGGTATTTACATTATTTCTTTTATTTGAACATTCTCTATAAAAGTAAAATCATGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 20839495 5' - mdg1 378 2 66.44 TTTGTACTATAGATAAATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAA:2 - chr2R 20010744 5' + Juan 4097 1 77.40 AGTATCATGCTCGGGAGTAGGCCTGGAATTATCGTTATTATATTTACTTTTATTAATTTTCTTTTTCTTTTTATAGTGTATTATTTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTGGAACCTTTTATGGTTATATTTACGGAGGAGAAT:1 - chr2R 4354609 5' - baggins 5056 1 63.01 ATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATA:2 + chr3R 4679461 5' - hopper2 1536 1 65.07 AGCTAANTGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 - chr2L 17005809 5' + Stalker2 7305 2 55.48 GAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 + chr3R 3850975 5' + transib2 22 1 71.23 AAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAA:1 + chr3R 2169839 5' + gypsy11 4070 2 72.99 TAATGTTTAGCTTAAAAGGTCAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 14366478 5' - roo 400 1 80.82 CTAAGGAAATGCTGCTGAGATTGGAGCTTAAAATATGTTTAGAGTGCTATATTTACGGGTTGGATAACTCTCCCCCTTCTAATATGTCGCGCCAGCTTAATTATGAATTTAGAGAACATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATC:1 - chr4 1155877 5' + invader4 2979 2 73.97 AATTCTTTGTTTAAAGAAAAATTTTTTTGCCTATAATTTTTATAAATTTTCCTGCCTATTGTTTTTGTATAGCTTTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3L 13696504 5' - 297 376 2 39.37 GTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1 - chr2L 4123981 5' - transib2 2792 1 60.96 CTCAAACATATCCACCGACACTTAGCTCCAAACGTGGAATCGATACGGACTTGATCAGGACCACCGCAACAAGGGTGACTCGAAAACTGCATCCAACTGCAACTCGAGCGTAGGGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAT:1 - chr2L 6639617 5' + mdg1 9 2 71.33 AGCAAGCTCAGTGGCAACAACAAATGCTACTACTAATTTACTTACCAAATTGAATTAGTAAATTGTTAGAAAGATTTCAGAGGAAAATAAAGAAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTG:1 + chr3R 17129011 5' - jockey 4760 1 70.55 ATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - 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chr3R 6625838 5' + flea 15 2 74.81 GGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGTTATATTTCCCAAACATTAATGAAAAAATAAAACAGATAATTCAAAACTGTAATGTATGCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAG:1 - chr2L 23374433 5' + flea 152 1 63.01 AATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 - chr3L 16470375 5' + jockey 4724 1 52.74 ACGAAAGGAATGTGCCAAAATTCCTCGCGTGAAAGAGACAGAGTACATTTTTGAGTGTGTCTTATTCCGTCGCACATGTGTTATTATGCCAGTATACTTGTAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:2 - chr2L 20205426 5' - P-element 2866 1 71.23 CNTTCATTTAAGTGCTTTGCATAATATCTAAGAGGAGATGGGACAGATAGTGCAGCTCTATGGGGTCACGATTTACGGCAATCATTATGCTGTCGAAGGTGTTGAATTTGTCAAAGGACTTCATTGAATAATAATAAATAAATAAC:1 + chr3R 10981429 5' + Burdock 309 1 66.44 TTCTAAGAAACACCCTAAGACGTCTGTCAAAGCATCGATTAGAAAAATTAAGATCGGAGGGGGGGTCTAACACACAAGAGACGGCAACCGGTTAATAAAAACCAACAACGAATTACACGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAA:1 + chr3R 2137169 5' + I-element 418 1 53.42 GAGGAAAATCAACAGCCAGCCAGCTGGCATAATGAAAGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 - chrX 4808662 5' + mdg3 5264 1 78.77 GTCACATGGGCAGGATATGAAGCTAATTTTTTTTGCGGGCGTGCCATCGGCTGTTTTTTTTTTTCTTTCTT:1 + chr3L 4353111 5' - gypsy7 5010 1 84.51 GCAAGTTTTCTATTGCGCATAAAAGTATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:2 + chr2L 16946002 5' + hopper 33 1 61.64 AAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 30347459 5' + P-element 6 2 50.00 GTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTT:1 + chrX 7795473 5' + roo 22 2 72.60 ATGAGGGGTAGGTAAGTACAATCCTCATTTTGGACTCTCCCTATCAATGGTCTGTGAATGTTCTTACAGTAAGTAACTCTCTTGAACTTCTTATCCAAGCTTGTGCCTTAACCACCTATGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGTT:1 + chr2L 22942440 5' - Porto1 4383 1 78.77 TTTTACATTTTTATTAGTCTTGAAATCGATAGAAATGTATATTTATTTATAGAAAAAAAAACTTTTCGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGTCGCCTAACCGGTCACTCCCTGAGTAACGGGCATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 + chr2L 22063440 5' + INE-1 559 1 75.34 AAACCAAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chrX 8200154 5' + flea 26 2 66.20 GTATAAGAAATGGGATTGCAGAAGCGAAGCGAGACGGTCGTCGCTAACTAAATGTCCTCCCACACAGGAAATAAAGTTCATTAATATGTTTGGCAATCAAGTCAGCTTTTAAAGGTGAAGTCTTAAACAGCTGATTCGGAGAATG:1 + chr3R 8432092 5' + transib2 173 1 75.86 ATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 11062736 5' + roo 8729 2 62.33 GCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGGTTACACA:1 + chr2R 4188964 5' + S-element 5 2 73.04 ATGAGTTTAAGAACCATGTCAATTTGGCCATTAGCTTACACTCAAAAAAGCGCGTGGGGCAACTAAAAAAAAAAATTTTAAAAAA:1 + chr3R 25810967 5' - FB 174 1 65.88 AGCTTGCAGCAATTGCTCAACGGTCACCAATGACACCGTGTTGGGCGGGAGTCTCCAGCGGGTTACGGGTGGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 5368577 5' + 1360 5 2 73.00 TTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTAT:1 - chr2L 13268395 5' - TAHRE 10389 1 62.33 AACTATTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGGCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr2R 12779758 5' + I-element 24 1 69.86 AAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2L 19924047 5' - roo 9017 2 54.11 TATTAACTCCAGTTAGCTCATCAGAAAATCTAGTCATAGAAATTCAATTTCAGCCAAATCGCCATGAAGCGAATCCAATCTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:1 + chr2L 1300642 5' + GATE 8267 2 59.68 AAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATCTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chr3R 13187529 5' - I-element 5307 1 48.63 TTTACCTTTGGAAATTGAAAAGCATCCCCAAACCGCTGGCTATCAGACTAAATTTGTATAACTTCGGACAAAAATAAAGGAAAAATGGAGAAAAAATCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAAGTTTTTCGAAAATTCATAT:1 + chr3R 26357832 5' - FB 124 1 66.44 ATTTCTGATTAAGCAGGGCAGTGAGCCCCAACACCCAAACCCACCCCTTCGCGCGAAGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACGCTGGTCGAGAATTCGTTTGTTTT:1 + chr2R 20348937 5' + transib2 6 1 71.56 AACCCAACAAAATTTATTAGATTAAATAAATTCATAAATCAATCTCGTAGGCTCGATCATCTGAACTATGTACCTAGCTTAAGGATTACATTAGACTATTTGTATTTTTAGGTTTTTTGAGGAAACGTATGAGGTTTTGTATGT:1 + chr3R 7317757 5' - I-element 5140 1 77.78 GAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr2R 8047329 5' - 1360 3346 1 68.57 TGATTGAACATTAAATTGAGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:2 + chrX 18009894 5' - 412 7524 2 49.32 ATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 - chr3R 24381409 5' - Juan 4180 1 68.42 ATAACTAATTAAAAAAGAAATTAATGTTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTTTGTTTTTCTTTTTTTATCTGATCTAATATCAGACTTATTATATAGTCTTCTTGAACTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr2R 14871221 5' - INE-1 551 1 80.14 AATCTAATTATATCGTTAAGCACACCAAAATTGGCAGCATATCCACCCCTGAAAAAGGAAACCTCATCTTCACTCCACCCAGGTGGTTTTGGCAAAACAAACCAAAAAAAAAA:1 - chr2R 17185940 5' + gypsy2 422 1 81.42 GACTCCGCCGCCGTCGCCACTTCCTCATCCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chr3L 6446980 5' + transib2 18 1 71.92 TGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGG:1 - chr2L 17766156 5' + Doc 245 1 74.66 ACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:2 - chrX 11661498 5' + pogo 57 1 60.27 ATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAG:1 - chrX 1799245 5' - invader4 3046 2 58.62 AAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACAC:1 - chr3R 22590584 5' + rover 7008 2 63.70 ATACTCTACACAGACGGATCTCGAAACAAGGAAATTGTAAAGGGATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTTCACTGAAGGAAGGGAATGCGACCT:1 - chrX 21084346 5' + Rt1b 4936 1 84.85 TTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTATGCCCAAAACTCTTATCA:1 - chr3L 18505742 5' + I-element 61 1 58.90 CAATAGCAACAACACGCTAGAGCAGCGATAACGGTGGCCGGCGAAAAAAAAAATGGCTGCTGTCGCATTTACTCTAAATAACGTCCAAA:1 - chr3R 23628335 5' + Doc4-element 2386 1 77.53 ACGTTTACTCTTGGCTTTTTTTTCCCAACCTCTTTGGACCCCATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAG:1 + chrX 17554120 5' + transib2 436 1 71.92 TCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGC:1 + chrX 2479508 5' - mdg3 164 2 70.55 AGAAGCTCCCGCTTTGCAAGATAAAAAAACAATATCATATATGGGTATGTAAAGCAGAGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGGAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTAGGCCTCATCT:1 - chr4 173279 5' + Circe 7223 2 64.03 TTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3L 6397741 5' - roo 330 2 69.18 GGGAGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3L 13294951 5' - roo 317 2 80.56 TGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTT:2 - chr3L 20187428 5' - FB 481 1 54.11 ATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 7795613 5' - roo 9011 2 59.59 CAATGCAGTGCAGCCACGTTTTTTATTCGCTTTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTGCTGGTAGCGGGGGACG:1 + chr3R 16281106 5' - accord 6980 2 62.14 ATTTGTCAACATTTATTCTAGATGGCATAATTTCCGAGTTAACAATTCCATCCGAACGTGAAAAACGACGGAAAATTGCTCAATTTTCCATGCGCACAAGGTAAAACGGTGGAAAGAGCAGGAAAAGGAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 15577540 5' + Doc2-element 218 2 59.72 AACACGCCACTCTTTTGCATGTGTTATACTTTCAATCATTCTTGAATCACTCGAATCGAACACGATTGCTGCTGACCTTCCATAGGCGCGTCGAGTCTCTTAACTTTATTTGTATGCTATAACAATAACATTTAAAATATTTTAGC:1 + chrX 15896818 5' + gypsy3 497 1 65.07 GGAGAAAAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCTCCCGATTTTCTTTATTTTTATTGTCTCTTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTTCTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 19032724 5' - roo 9052 2 62.60 AAAAATATTTGATCCGTTAGGATGGTTGGCACCAGTCACCGTTTCAGGAAAACTTTTTATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAG:1 + chr3R 19445913 5' - 1360 71 1 74.48 GTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCATTTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGCTCGGTTGTGTCGCGC:1 + chrX 14771716 5' + BS 13 1 55.77 ATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr3R 21630350 5' - I-element 5303 1 58.39 TTCTACTAAATGAATTATAAAGTGCTCGGCTGAGAACTAATTCAATAGAAAAATTGTTATTTTTACTACTTGGCTTTAAACAATGTTGTGAGCGTCAAGTGTTATTTTAATATAATTTTCAAATAAAATAAATTTTTAAAAAAAAA:1 - chr2L 3197566 5' - hopper 162 1 78.77 CCAGCAGTTGATTTAGCAACTACGCAATTACATGCAAAGTAAAATGCACTCAGGGATTGATTTAAAACTAAAAACCAAACCGAAAACAATAAACAAAACACAAATATGAGCGCATCCGACGCTCA:1 - chr2R 7717901 5' + Porto1 209 1 69.60 TGATTGATATTAATCACGGTAGGCTAAATACAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATTGCCAAAATTCAGTAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATATCGCTCATCGTATTGATCCGACTAT:1 + chr3R 19448900 5' - transib2 2347 1 56.34 TATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACG:1 + chr2L 19958706 5' - flea 4936 1 80.56 TTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 - chr2L 6647700 5' + mdg3 5327 2 75.00 GTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGA:1 + chr3R 11040058 5' - 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1360 427 1 52.74 AAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTA:1 + chr3R 19450152 5' - roo 8758 2 63.04 AGAGAAGATAGCATGGAGATAAATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr2R 4606331 5' + 1360 17 1 70.15 CACCCCATCTACTTCGCCTTTTCTGTATTTTCACATCCTTCAGCTACCATTTCTTTGCCATTAATCTCACTTGAACAGATTCGTCCTGCTGCTCGTCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGA:1 + chr3L 13672962 5' + 297 6565 1 63.70 GGCGAACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTTTTTATTTAGAAGCGATGAACCAATAAAATGCA:1 + chr2R 15004728 5' - BS 5069 1 36.43 AAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGACTTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 + chr3R 15942716 5' + hopper 77 1 67.12 CAACAAAAATGCTTTGCATTCATTATGATTTTTATAACCGTTACTCGTATAGTGAAGGTGTATACAAGATTCGTTGTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 - chrX 22592623 5' + INE-1 82 1 73.29 TTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGA:2 + chr2R 5106290 5' + Stalker2 7335 2 77.40 GTTAGTGTCATTTAGACAAATTCGCCCATTCATCGCGCCGCGGGTCGAAAGTGATAAACAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 787451 5' + Porto1 162 1 75.68 GCAATAACATATGTGACCAATGTGACGTTTTAGATAAGGTACAACCAAAGATACCCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr2L 22993601 5' + 1360 73 1 54.90 AATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTG:1 - chr2R 11329662 5' - P-element 164 1 14.38 TATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAG:1 + chrX 23431599 5' - 297 6900 2 71.23 AGCATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 27986326 5' - roo 9030 1 58.90 CATACAATCGAGCATGTAAAGAATTCAACGAAATGCTTATAGACCTTAAAATTAATGCTCTAAGAGCTTATCTGGTCTATCTTTAGGCTCAAGACATAATCTTTGGAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAA:1 + chr3L 23450961 5' + F-element 318 1 74.66 GAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 18549797 5' + roo 17 2 69.70 GCAGCAATCAAGCATACGCCGTGTGTACCGTTCTACAAACGATCCAAAACAACACCAAACAGCACTGCGGACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAAAGAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTAC:1 + chr2R 16119953 5' - Cr1a 164 1 67.81 CATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1 - chr3R 11469393 5' - Tabor 412 2 65.75 CCAATTCTCCCCATTCTCACTGGGACGTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAT:1 + chr3L 22760341 5' + F-element 121 1 52.05 ACTCAANTGACGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - 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roo 362 2 53.85 GTGGTCTTGGCAACAACTGTCTTGGCTCGATTGCTGGGTTAAGTTTTCAAGGCCAAGCGCGTGCAGAGAGGCAGTGATGGTGGGAGAGAGACAGGGAGCGCATAGTGTGGGACAGAAACAGGTTTTTCTAATTTCCTTTTTTTTT:1 - chrX 13934742 5' - Doc2-element 253 1 66.21 CATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTT:1 - chr3R 11062852 5' - roo 9036 1 56.43 GATGAGTAATGGGGAAATGTTAATTATGGCCAAGCGAAAGAAGTAAATGAGTGGCCTATGCTTTTAGCCAAGTTGCCCTTTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCG:1 + chr2R 21133370 5' + Chouto 476 1 56.74 ATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 - chr3L 11257433 5' - 1360 20 1 56.16 TATAGATTGTTTGCCAGTTTATTGGGCGTGCGCCACGCCCTCGGGTGTCGTTGGAACATATGTACGCCCCGTTTTCAGATATCTCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCTCCGTTTGTCG:1 + chr3R 19828608 5' - Bica 454 1 65.07 AATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:2 - chr3R 24381395 5' - Juan 4153 1 58.22 TAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 18046583 5' + roo 8706 2 55.48 GTAAGTGGTGGAAGGAAAACTGTAAATAGTGAGGAAGAGGGGTGAATACAGACAAGCAAGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTG:1 + chrX 7338107 5' - I-element 4959 1 59.65 AAACAACCAACCCCTTGCAGGTTGCCTCATGCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGATCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 + chr2R 8099104 5' + jockey 4785 1 67.12 AAACCCAAAGGGTTAAAATAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 21224497 5' + roo 8673 2 77.78 TACAAAAGTTTAAAGCTTCAGCTTAGAGAGAAGAAAAAATGTCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGAGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCGTGC:1 - chr2R 9160470 5' - mdg3 406 1 71.55 ACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGC:1 + chr3L 27356055 5' - Tc3 1662 1 63.01 GGTAGAGATACAAACCGCCGAAAATGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 + chr3R 21705946 5' - flea 196 2 59.59 TTATTGGATTTCAAAATGAAATCCATTTGATGGCAAACGAAGCTTTGATATGTGTGTTAGCGTGGCCTTTAAAACACGGTAGTTGAATAAATTAACAGGAGAAAACAAATAAGGTGAAGGACATATTTAGTCAAATTTACAATGCA:1 + chr2R 25132746 5' - 1360 199 1 73.29 AAAAAGATTGCTTTCAAATCCATATCTATTTCCAAAAATGTCCCCAGGTTAAAGCAATAAAGGCAAACGGATAAGAAACCAATATGGACGTATGGAACGGAATTTTGCGGAATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCA:1 + chr3R 13303776 5' + Porto1 4309 1 50.68 AATGCTTTCCTTCAGATTTTAATCGCTCACGTGAGTCCTTAAAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGCTGTTTCTGTTTGTTTTTTTATATTT:1 + chr3R 28045750 5' - Tc1-2 488 1 71.00 CAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:2 + chr2R 14653133 5' + 297 6606 2 42.07 TATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chr3R 13406411 5' - pogo 2042 1 61.64 CCATAACAGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 13766171 5' - roo 9041 1 64.38 ATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAA:1 + chr2R 24427556 5' + jockey 4727 1 51.37 ATGGATGATCAGCCGTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr2L 4123807 5' + transib3 16 2 73.97 GCTGATATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr2R 21160612 5' - Transpac 5217 2 75.86 AATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGCGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 19054211 5' + jockey 15 1 75.97 AGCACAAAGTTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTT:2 - chr3L 9907402 5' + BS 5013 1 67.12 GATGGAATGCAGTGAAAGAAATTACTTTGGCTAATAAAAAATATATTTCTTCTATGACATTTCTACACATCAATACAACTGGTATATGAAGTTATTAAAAAAGATCAAATATATTTTTTTAGTAATAATCTTAATAATATTAATAA:1 + chr2L 3844944 5' + mdg1 7076 2 73.97 TAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:2 - chrX 19539551 5' - pogo 2039 1 61.64 TTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATA:1 + chr2R 19199690 5' + hopper 87 1 76.03 CATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 29084861 5' - 412 7514 2 59.15 TTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 8360617 5' - roo 336 2 67.81 TATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:2 + chr3R 25554216 5' + micropia 4997 4 57.53 GGAAAAAAGTATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 + chr3L 15103758 5' - Transpac 295 2 76.03 AAAAGAATCACGGCAAACCTAAACGTAAAGCAAAACAAAAGAAAACAGATAGAAAAAAAAGTGAAATGAATGAGTGAATCGATTGCCATGAATGCAGAGGGAATTTCAAAAGTGTTGCAATCACTTTTGTTTTTTGAATTAAGATA:1 + chrX 15863826 5' + Dm88 4296 1 43.15 TGCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGT:1 + chr3L 11837727 5' - G5A 2736 1 52.88 AACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 29084838 5' - 412 480 2 71.92 GAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGGGCCGCTTCGGAGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGGGTGTCGTCAATTATGGTTTTTCTTCTCCCTTGCTTTTCTTAATAAATAATAAATATTGTT:1 + chr2L 3675825 5' + Juan 4058 1 48.92 TAGACGCCTCTGCCAGTACCCGACCCCCTCCCCGCCAAGTAGAGCAATCGCTAGACAAGCTTACTACTTATTCAACATTCAGACATTTAAATGAAAAACAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 22525352 5' + Porto1 157 1 76.27 GTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGGGCCCAAAATGCTGACCAAAGGACTGC:1 + chr3L 24934308 5' + HMS-Beagle2 6955 2 66.44 GTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGACACAAACCTATTGGAATGCCCATAGGTTCTTAATTCATATTTTTTATGTTAGTTGTAAGTCATTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATTTTGTTATACAAAA:1 + chr3R 9038923 5' + Juan 4066 1 51.37 CCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCT:1 - 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Juan 4145 1 65.07 TTAGCAACTAAGTAGCTTCGCATAAACAATGCTGACGCGCTATAATAGAGTTCAGCCAAAGACGCTGGAATAACAAGCTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chrY 475865 5' - 1360 3343 1 76.42 AGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr3L 15913830 5' + jockey 4802 1 56.16 CATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2R 22803270 5' + 297 6636 2 63.45 ATTTATTTTTCCTGTTTTATACAAAATCGATCGCCGACGGGTGAGGACG:1 - chr2R 3689314 5' + F-element 17 1 83.67 ATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr2L 7580997 5' - Transpac 248 2 67.91 ATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGGGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGG:1 + chr3L 23354574 5' + gypsy2 6566 2 59.00 AATCGCATAGCTTAAAGGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAAT:1 + chr2L 19817748 5' - 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Doc 4242 1 75.63 CGCTGGGCCTGGAAAAATGGTTAAATAAATAGGTAATGGGACAAAGAAATATCTTAATATTGTTTTACGAACGTGAGACAACAATGGGCAGATAAAAATTAAAAAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGAC:1 + chr3L 3532046 5' + Stalker2 7551 2 38.36 CAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 - chr3R 30347385 5' - P-element 2802 1 27.40 GTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGC:2 + chr3R 18346610 5' - INE-1 538 1 47.26 ATAAAAGTGCGAATGTCGGTGGCAAGGTGACAAGTTAGCGGTTATTATTATGCCAAACGCCCACCCAAACAAAAAAACAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGGAAA:1 + chrX 6515406 5' + Doc2-element 245 1 64.08 ATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATGATCAGTCATTTGTTAAATATCA:1 + chr3R 4357559 5' - Tc3 1615 1 74.66 AATGCCACTCCCGATCCCAACCGCCAACAGTTTGCTTCATTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 + chr3R 11469325 5' + Tabor 82 2 75.34 ACTTTATAATTACACTCCGAAGAGGCTGAAGTCGTATTCAAAGGCGGATTGTAAATTTAATCTTTTACAAAGGAAAGTACTTGGGGATGTGGGGACTAAACTTTTAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGTT:1 + chr3L 13693154 5' - Cr1a 345 1 63.89 ATCGACGCGGCGCGCGTTTTAAACGCGTTTCTCCTGCTTTTCGTGTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCCTGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1 - chr2L 4180538 5' - jockey 4923 1 66.19 TTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 11062864 5' - roo 9048 2 65.00 AAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAGATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3L 2544603 5' + Tirant 8146 2 55.56 AACGTGGTTCTGCTGGCCAGACCGACCAGCCCTAAGCTGGACCAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGA:1 + chr3R 6347459 5' + P-element 2790 1 34.25 ACGTGCTTGGCTCATTTCCATTCGCTCACTTTCGGCAACATTGTTCCCCGGAGAATTCCACCATTCTTCGGCAGATACAAAAAAAAGAAACACAGATACAGATACAAAAATACTCCGGATGTACCCAACAGCAACCAGATAAGAA:1 - chrX 14696834 5' + Idefix 6916 2 73.10 ACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGCCAAAATTGATCTCTGTCCACTCGCTTACGCTGAGGGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTCGTTTGCTAAAATCGCCACGCGAAGCTACCGTTCACATACTTATAT:2 - chr4 872519 5' - 1360 2967 1 66.44 AATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTA:2 - chr3R 21630335 5' - I-element 5279 1 69.86 ATCGTAAGTACCTAAATATTTATAAAACTTAACTAAAAAATCTATTAAATGGAAATCTATAAAATTATCCAGCGATTTGGTGTAGAATTGAATATAAATAAATGTCACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGT:1 - chr2L 14358902 5' - diver 208 1 56.85 TATGTGCAGGCTTCGCATTTTTTGGTGTGTTAGTTTCCCGACTCACACACACACACACACACACATATCGAACGGTGGCAGCCATAAATAAAATTTAAGATACACCACACTATGGGGCATTTGGCGTGTTTTTT:1 + chr2L 2527583 5' - hopper 1409 2 76.87 ATTTAAGAGTCATCATTGATATCTAAGTATATATAAGTACGCCAAAAATAGAACAAGTGTGATCAAAAGCAATAAGTTGTACTTTTTTATTATTTATTTTATTTTTAATTTTATTCCCCAATATCTATCTATATCCCAGAAAAATG:1 - chr2R 5722605 5' + INE-1 502 1 67.81 TCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chrX 661937 5' + 412 77 2 75.18 CTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:1 - 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chr3L 11314567 5' - Tc3 315 1 45.21 ATAATGCGCCCAGGCTGATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr3L 16970326 5' - roo 9046 1 66.44 AAATTTAATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCAT:1 + chr2L 22255050 5' + 1360 210 1 53.42 GGACATCAACGTGGCAACGTCGAACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 + chr2R 12471980 5' + transib2 21 2 70.55 AAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAACTACGGG:1 - chr3R 21630356 5' - I-element 5300 1 55.48 ACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chrX 19038331 5' - hopper 1392 1 68.28 ATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGGAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 7719693 5' - 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roo 9048 2 69.18 CTTATTGACGAAATCAGTATCATGTCCAGTATATTGGAGTTATTATTGTAGCTTGATTCGCGAAAAGATAGATGCGATTAAGAAAAGAAAACAGAAACGAGGAAATGAATATATTGTAAAATGCCTGTATTAAGTATTAGTGTTAG:1 - chr2L 22720939 5' - Cr1a 4301 1 66.44 TNTTTAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCG:1 - chr3L 23940560 5' - Cr1a 4403 1 73.29 ACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGCCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 + chr3L 19274822 5' + transib2 84 1 77.04 ATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGG:4 - chrX 4339129 5' - G6 1958 1 58.22 TGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chrX 14722243 5' + diver 5894 2 71.32 ATTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:1 + chr3R 11186529 5' - BS 5040 1 52.05 ATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 17809274 5' + jockey 33 1 59.17 ATACTAATATTATTTATATTACCGAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATAC:1 - chr3R 556484 5' + Juan 4149 1 55.17 CTTAAACTCAACTTCTCAACTTCCTCACACACTCACTGGTAACCACGGGCCCTCGAGCACTACACACTGCTTGCGCTGGATGCGAAAAAATCACACAGACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAA:1 + chr2R 22936563 5' + I-element 5126 1 71.23 GTAGGAGAGAAGTTTAAGCGATTGTGCGATTGGAAAATTATTCAGCTCAAAGAAGCTGGAGTCGAAAAAATGGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCTCATTTGTTGTCTTTATTTGCCCACGTTTGGCCACTCTTT:2 - chr2R 3591416 5' + FB 216 1 75.34 AATACACATAGGCAAACAGTAAATACTGCCAACGAACTTTGGACGGAGCTACGTCATCTGGTGGACGGGTCTAAAGTCCAACTTGTTGCACCGACCCTTTCTTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATG:1 + chr2R 9911017 5' + Tc1 182 1 63.45 CCTCACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr2L 14675631 5' + 297 41 2 56.16 GTGTGCCGCGGACTTCCCGCATGGAATTTGGCCGTGGAAAAGCTGCCTTTATAGCTCATTTCGTCGCGAGAAGATAGACGCGGTATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAA:1 - 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chr2L 16539790 5' + Juan 4043 1 69.86 ATGCTATAATACGTTAAAGCGAGCCATTTTCGATTTCGTTTTCGGATTACTTTGACAGCAAATTCGACAGCATTTATTTTTAGATGGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chr2R 13931660 5' + P-element 31 1 65.75 AGTTAGCTAATCATGAAAAGTTGCTTAAATTATGGCATGCAAATTAAAATTACAAAAGCAAAGCGTTTTTTTATTATCGATAAAATGACCAAAATCTTGAGAATTTTATCGCCCACTTTCAAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 - chrX 18234935 5' - INE-1 147 1 77.40 ATACGTTTATTTTATGACGAACCGTAATAGAAGGTGAACTGAACTTATTAAGATTTTAGCAAACTTTAAAATACGGTTGGAATCGTTCAATGAAAATTAATAGCTGTCATTTTCGTAATTTTTTTATTTCATTTTTTTTTATTGC:1 - chr2L 3669844 5' - P-element 140 1 42.76 ATGGATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chrX 20888399 5' + 297 6626 2 56.85 CGCGACTCCTCCTTGGGCAGGCCAATTCGGACGGAACTCGGATCCGGACTGGTGGCACGACAGACGAACCTGAATCGCCTCTCCGTGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTCATTTTGTGTTTT:1 + chr3L 12069267 5' + Cr1a 384 1 68.42 CTATTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCC:2 + chrX 22596320 5' - INE-1 572 1 67.12 TTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:2 + chr2L 7660882 5' - I-element 5323 1 60.96 TAATTATGTGCTACTTATTAATTTTTCCAAAATTCTACAAATGAGCTTTAAAGCTCTTCTAATCAAAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCAACCGAACTCCCTACCCGGAGGATAG:1 - chr2R 3257476 5' + G5 4660 1 75.34 AAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 14980310 5' - roo 9009 2 61.64 GTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - chr2L 7593154 5' + jockey 4713 1 57.86 AAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr2L 18347259 5' + transib2 34 1 60.27 AGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTTCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chrX 11661394 5' - pogo 2036 1 69.18 TGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGT:1 + chr2L 17205181 5' + hopper 67 1 62.33 GCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chrX 18239411 5' + jockey 84 1 69.66 TTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 + chr3L 18768445 5' - S-element 1637 2 75.34 ACCTTTGTAGTGGTTGCTGTCGCTAATGCGAAATATCAATTTTCCCAAGAGTTCACGTGTGTGATTTTGTGTGTGCCGAGCTTATTGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTAGCAGTCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 + chr2L 3563618 5' - Quasimodo 324 2 63.45 AAATTGAATTTTACATCACATGGCGTAAAGTCATCAAAAATAATTGTACAGGAAAACCAATTTACAACTGAAATAAACTACGCATTTCATTGACTTTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAA:1 + chr3R 1006038 5' + blood 6979 1 68.75 GCAATGCCCTAAATATAGTCTATATTAACATAAATTCATTTTACTTAAATACGACCCATTAATATATATCGTTCTGATATTATTATTTTGTTAATATTCGTCTTGCCAGAGATAATTTAAATTTAATTTATATTTATTTTTTTATA:1 + chr3L 12731662 5' + S2 100 1 72.60 ATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATA:3 + chrX 14450397 5' - hopper2 1545 1 60.96 GTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGGGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTTTTTAATT:1 - chrX 8027469 5' + Juan 81 1 68.49 GGATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATTTATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATATAGTATTCTTAGTTT:1 + chr2L 17752139 5' - flea 4947 1 68.97 ACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCA:1 + chr2R 21926382 5' - opus 7419 2 74.66 ATCAAATAATATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 14310360 5' - roo 9055 2 52.74 ATGGAAAGTGGTTAAAAAAAGTAGTAATAGGCGTAATAAGAATAATTGGCGATAGCTCGGATGGGGCTTAGAGTTAGGCGGAGACCTGGTGCGTGTTCTGGGGTCCGCAGCTAATAGGGGTTGAAAAAATAAGAAAAAAAAAAACA:1 - chr2L 11223643 5' + gypsy7 5008 1 71.23 AAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 - chr3L 18126037 5' + Ivk 18 1 66.44 GCTTCAGTTTTTTTACCCGGAATTTTGACCGTTTTGTTTTTCGTTTGTTTTTATTTGTTGTCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAG:1 - chrX 4322715 5' - F-element 374 1 60.00 ATTTGTATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 13300969 5' - roo 9022 2 49.32 CAGAGCGTCATACTCGTATAGACTCTAGCTGCCATGATGATAATCGCATAACTTTTAGTTCTGTCGCCTGCTTTTTGTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACC:1 + chr3R 4665823 5' - Doc 483 1 51.37 CAGTGAGGTGGAGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTG:1 - chr3R 6625833 5' + flea 4788 2 65.75 CATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAAT:2 - chr2R 5941406 5' + copia 86 2 73.97 ATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAA:1 + chrX 1263948 5' - Burdock 6331 2 65.73 AGAAGACAGGTAAAGTAAAGCGAAATTCGCAGAACACGAATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTA:1 - chr2L 18838870 5' + F-element 4462 1 71.11 ATTGATGAATCCTGTAGGCCGTCTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCATTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGGATTACTGACATCGGAAAGACCTTCATGACTCATAGATCCCCCTTGAGTCCAATGCACTGTATAATTG:1 - chr2R 10910366 5' - baggins 5348 1 65.75 CAAAGTGAGCCCCAAACCTTGAATCGGTTTGCAAACTGGGTATTTGTAAACGCAGATTTAGGGGAAACACCAACTAACCTACCAACCAACCAACCAACCAACCAATCAACCAACAAGCCAGCAATTTGTTACCAAATTA:1 - chr3R 17956702 5' + I-element 5225 1 68.35 AGAGAATGTTGGGAACCACAAGTTGAAAAACATTCGGAGTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCA:1 - chr2R 21691579 5' + I-element 292 1 76.71 TTATCATTTTGCGCAAGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - chr3L 18046723 5' - roo 9031 1 57.53 GGCGAGCTTTGCAGTTGACATTCCGTTACGCACGTTGCCTCCATTTGGTCCTTGTTCTTGTTTTTACTGCTGCTGCTGCAATATCATGTGTTCCCGATGGATGCAACCAAGAAAATATGAAAATATTTCTTTTAATAATTTAAAAT:1 + chr3R 19210756 5' - I-element 255 1 54.11 CAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr3R 16630373 5' + FB 54 1 54.11 CAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr3L 18126021 5' + Ivk 34 1 55.48 ATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2L 19675057 5' + 297 6602 2 64.29 GAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATAAAGTTACCAAGATTTATATAACTACTGCCAGAGAACTTCAGCCCTCCACACGAACTCTACGTCCACCCGATACACACTCGGT:1 + chr2L 12818231 5' - hobo 2906 1 49.59 CAAAGTTGCAACAACTTGCCGGAGTTTAAAGTTTACACACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTTTGGA:1 + chr3L 10253752 5' + TAHRE 10379 1 70.59 ATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr3R 20140488 5' + jockey 4697 1 53.00 TCAGTTTAGAAGATTTTATTAAATGATTGTCTAGCCACAAATGTAACCAGGAATCCACTAAAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTAGAGTTCCC:1 - chr3R 3625144 5' - INE-1 572 1 63.54 AATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTGTGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTG:1 + chr3R 19992665 5' + hopper 92 1 76.71 AAAAATTTCTTTCGGTAAAGTAAATAAATGATCACAGTTCCTCGAAAATGTGTATATATTTTCGTCTCGGTCGCAGCGTCTATGTCTCTGGAAACTGTATGTTTAATCTCAACTTCTTAGCTTCTTTAGTTCCTGAGATCTCAACG:1 + chr4 625887 5' - INE-1 144 1 53.42 ATTGAGGTAGGCGAATTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAA:1 - chr3L 11257457 5' - 1360 3370 1 72.60 GTTCGTCTTTTTGTAGCGAAAAATGCACACAAAAAAATTAGTGTTTAATTTGCTTTCAGCCTTGAAGAAATGAAATTCCAAGTGATTAAACTTATCTTAAAGAAGGAAATATCTTAAAGTAACTTTTTTTTTAAAAATATATATTA:1 - chr2L 12837626 5' - TART-C 11031 1 63.01 TCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCATATATATATATATA:1 + chrX 12649914 5' + blood 7190 4 78.38 CACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2L 21328274 5' + 297 45 2 67.12 ACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTTGCTAAGGCTT:2 - chr2R 4785306 5' - Juan 4135 1 66.44 TTTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAACATTTTATAACATTTTAATAAATGCCACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGAT:1 + chr3R 30896007 5' + Tc1-2 1476 1 69.86 ATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3L 22035675 5' + F-element 49 1 52.86 AATGAGTGTTATGCAGGTGTGCAATATTTTGGATTGGATTTAGAACTGATTAGAAAGCTCGGCTTACAAAAGTTGACGCAAATGAACATAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGTGAATCTTG:1 + chr3L 13842420 5' + frogger 125 2 60.00 AAAAAATAATTTTCTCAGAATCACCGCCGAAATTCGACAAGTCCATGCAAAAATGGTTCAATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTA:1 + chr2R 11653891 5' - hobo 2693 1 50.82 TGGGAATGCAAGTGTTTTGTTTTCGCTGCACTTGCTTGCGGTTAAGAATTGGGAACACGTCCAGGGTCACTGCAGAGGGGGGGTGGGGTGTTAAATTGACCCATGCTCGCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAAC:1 - chr2L 20821366 5' + Burdock 6135 1 85.62 AGTTGAATTGAAAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 20167544 5' - roo 9043 1 63.01 ATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3L 24131481 5' - Transpac 265 2 62.28 AAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGTTTATACTTTAGGTTCGTTTTAAATTATCATAAAAGTAAATTACTAATTTCACAAGTTCCACCGAGACAATATCGAAACAATAATTATTGTGAT:1 + chr3R 23849168 5' - looper1 193 1 67.12 TATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAG:1 - chr3R 9039003 5' - Juan 4139 1 71.92 ATTTAAACTACATGCGACTGTGTCCTTAATTTTTATACCCGTTACTCGTAAAGTAGAAGGATATCCTAGATTTACTAAAAGCTTTTAACAGGCAAAAATAGCCGAGTCGATCAGTCTGTCTGTATGAACGTCGAGATCTCAGTAAC:1 - chr2R 4828789 5' + INE-1 140 1 63.01 GTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 21216739 5' - roo 9027 1 65.74 AATTCAGTTCTGCAAGACAATCATCGCAAAATGAAAAAAACCCAAAAGTCTATGGAAAAAATACTTCACTTCAATACTACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAATTCGCTTTGC:1 - chr2L 16332553 5' - gypsy4 389 1 63.70 GTTTACGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3R 8076009 5' - 412 7508 2 50.00 ATGATAACCTTTTTTCCAGAGTTAGTAACTTAGTCTAACTTTCTTTATCACAACCCCTAACGGACGTCTTAAAAGGCGAAAATGGTAAAAAAAAGTGACAGTGGTAAAAAAAAAGTGAAGCGTCTATATCTTCTCGCAAATCGAGC:1 + chrX 19215025 5' + Cr1a 4377 1 36.99 TATTGCCCTTCCTGGGCGCCCTTAATTTGCACTGCCCGGAGTCCTACAATCCAGCGGATTACTGTGAGTTTACGGGTTGGTAAACTCCGTGGGAGATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGG:1 - chr2L 3296797 5' - 297 6610 2 69.86 AACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr2R 5479959 5' + F-element 47 1 65.88 TAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:2 + chr2L 14874162 5' - copia 231 1 54.79 CCTTCTTCTCTTGCTCCGCCCTTCCTCGCAAATAAAACAAATAATATCCGGGAAGGGGCTATTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 + chr3R 10145613 5' - Juan 4152 1 56.85 ATATATAGAGGGCTTCGTTTAAAAATCATCGTTAGTCACATGTCTGAAAATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAA:1 - chr2R 6622690 5' - S-element 1700 1 72.39 TTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGAT:1 - chr3R 545850 5' - TAHRE 10377 1 78.08 GACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAACAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 - chr3R 5351465 5' + jockey 4747 1 67.81 ATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 21216748 5' - roo 9024 2 74.76 TTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCA:1 - chr3R 13612574 5' + F-element 211 1 66.36 ACGTTGACGTCGCGATTACGCTGTGAGTATGTGTGAGAGAAGGATCATGTTAATTTCAACGGCGA:1 + chr2R 21616193 5' - accord 7079 2 70.77 CAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTC:1 - chr4 829120 5' - INE-1 141 1 34.93 CAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGGGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr2L 16943898 5' - copia 233 1 55.63 ATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGTGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATAAGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCG:1 - chrX 14815831 5' + INE-1 93 1 73.02 CGGTACATTAAATTTATATTAAACATAATTAAGAAACAGTTTTATCTAGAAATCGCGAAGAAACGATTTTGAAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTT:1 - chr3L 8394147 5' + Tc1-2 1315 1 76.71 ACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCCTTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr3L 21327087 5' - copia 5084 2 66.44 TGCGCCGTGAGCCCCTGGTGGCCGCCGTTGCCGCCGCTCCTGCTGCCGTCGTTATAAATGGAAAATATATATAAGCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTTTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAA:1 + chr3R 6687281 5' - G4 3831 1 64.38 ATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTA:3 - chr2L 17180152 5' + Juan 55 1 52.05 GGTATTTTAGAGGGATAATATTGTATGAACGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGTCACCGTGG:1 - chrX 17442964 5' + F-element 4348 1 74.60 AGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATC:1 + chrX 19266845 5' - roo 331 2 67.81 GTAGTACCTTTTCACGAATTTCTTTAAATAGTGCAGAATATGTAAATGAAATTGCAATATGAATTGATTATTAATGAATATCCCATTTTTTTTTATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 7229844 5' + hopper 149 103 77.78 CTTTGTGGCGGTAAGTGGGTTAATTTTCTTTTGTTACTATGTCTTATTGAATTCTGTTTTTTTCTTTCTTTACAGACGCAACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCT:1 + chr2R 17791775 5' + accord 236 2 53.85 AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGTCGGTTTTATGGCGTTAGAGCGGGCGTGGCAATATGTGTCAAGAAACTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTCAATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTATATAGTTCCTGAGATTTCGACGTT:1 + chr3R 4322609 5' - INE-1 142 1 71.92 CACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chrX 12066124 5' + transib2 74 1 68.97 CGGGCTACTATATCGTTGTTAAAAATGGCGATCGGCAAAATATACTGGATTAATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCATGTTTCGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTGGAAAATAGATTAGAAATAGCCAA:1 + chr4 185574 5' + 1360 329 1 61.64 TGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATT:1 - chrX 17678734 5' - flea 5013 2 87.67 CGTTACTTATTCATTTAAAACTCAATTAGAATTGATTGAATATATTGATATTGATATAAATACGATTCGAAAACTTAAGCTTGATTGCAATTTGATTTCTTAAGTGTGTCGCAAATAATCTTCCTTAAATATACATACAAATTACA:1 + chr2R 10563763 5' - Dm88 4376 2 39.73 AATTATTTTAAAATCAAAAATTGCATTAAAACCTAGTAAACTTGTCCGACAAAGCAAACATTTTATTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGAACACCAGCA:1 + chr3R 4172207 5' + springer 20 2 58.62 AGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGGGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCATCCATTGTCTTCCTTCTGTGGGCCTTTGTGT:1 + chrX 21639584 5' - gypsy5 382 2 64.38 CGTAAATCAAAAATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chrX 1341589 5' - 412 475 2 69.86 AAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGGGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1 + chr3L 24213770 5' - invader2 5038 2 62.33 ATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTCTTTGTA:1 + chrX 12986515 5' - roo 386 2 60.80 AATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 + chrX 13134912 5' + jockey 4844 1 73.79 ATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 - chr2L 12250990 5' + 412 7117 2 61.64 AGTCTTATGAAACATTTTTTCGGACTTTGTTCGTTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 - chr2R 3564167 5' - Tabor 7287 2 57.53 GAGGATGTTTTATAAGTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:2 - chr2R 18529994 5' - jockey 4960 1 63.70 AGAGCTCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2R 7303995 5' - pogo 2061 1 61.64 AGAAACTTGGGGATTCGATTATATAAGGGCATAAGGATATGCAAATGTAAGGGGAGTTTTGATGGCTTTTAACTGTATATATTATATATATTATTATTATATATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 - chr3L 21969906 5' + opus 6 2 53.96 AGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2R 8735552 5' - mdg1 381 2 56.85 CAATGAAATTCCTGATCTGTGCACTTTTCCTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15142434 5' - Doc2-element 232 1 60.42 ATAGGGCAACTTGTCACCGAGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr2L 7125700 5' + I-element 6 1 78.08 ATTATTATTAATAACTTTACACTGATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCC:1 + chrX 190026 5' - INE-1 556 1 69.23 GACCATCGAAAACTAAAAATTTTTTTAATCGAAATTCTCTTTAGTAAAACTAAAGTGTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACTTCTTATATTTTAACA:1 - chr3L 22723971 5' + HMS-Beagle2 24 2 63.83 TATTTTAAAAATGTAACGTCACAAAAGTTAATATGAAATTCCGCGTTTGTATTCGCTCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAATTC:1 - chr4 234439 5' + INE-1 558 1 59.57 ATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGAGATATA:1 + chr3R 7943753 5' + blood 77 2 70.80 CCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 16970386 5' - roo 8986 2 78.77 ACTTGACTTTCATTTCTTCCTACAGTTAGACACTTTTATTGTGTTTCACATTACTTTTGTCTGTGCGAGTTTGTTTGCCATGCGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTCGGTGTGGTTTTTTGCATGC:1 - chr2L 1558538 5' + Cr1a 251 1 63.01 AGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3R 13187527 5' - I-element 5305 1 49.32 ATGATACCTATAAATACGTGCATTTTGTATTAAAAGTAAAGTAAAAGTTTCATATCGTTTAGCGCGGGTAACTAAATTAAAGAAAGATTTTTACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTTCCAAATAAATAAATATAAAAAAACAC:1 + chr4 350037 5' + Tc1-2 482 1 67.12 CGTAAGACCCCCGATTTTTGGCTCTGTGTGCGCCGTGCTCGAGCATTTTTACCTGTGGTCGAGCACTTTGTTCAGATTATGAAATTGCCGGAGAGAACGAGAACTGTTTGCTCCAAGATATCTTTGAAGTGAACCAATATTTTGTG:1 - chr3L 20395645 5' + hopper2 357 1 72.60 CAGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAAACAGAATCTTTC:1 - chr2R 4545178 5' - invader1 3543 1 58.22 TAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 - chr2L 4003784 5' - mdg1 360 2 58.22 ATATGCAACAGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 - chr3R 23618239 5' + hopper 37 1 56.30 TGTTAGTTCCCGTACTCCGTGCTTCTTGGAGTACACATAGCCCAGGGAATCGCCAACATTACACGAGCACACGACATATTTCCCTGGCGCTGCCCAGCTGCCACGCGGTCGCACAAACAGCTGTTTGC:1 + chr3R 8737634 5' + X-element 230 1 71.09 AAAGAAAAGAATCCCAATTATATAAAGTAAAGTTGGTGTGTCAAAATTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGGGGGAATGTGTCGATGGGGTGTGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAATTTAGGGGACGGA:1 + chr2R 4840781 5' - Idefix 196 1 61.27 ATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 - chr3L 24131507 5' - Transpac 5178 2 52.74 TAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTTTTGGGTGCTTAAA:1 - chrX 20999581 5' + BS 67 1 66.44 GTTTTTGTGTGTTTCAGCCAAATCCCTGAATGCAAGTTTGCATCTCCCGAGTGGCTAGTGTTTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCTTCTTTTTGTT:1 - chr3R 9188062 5' + Cr1a 191 1 51.69 GCATAGAAAAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr2L 18347251 5' + transib2 27 1 65.75 CATAATCACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 - chr3L 15103929 5' + Transpac 4957 2 58.22 AAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 - chr3R 27133650 5' - opus 7437 2 79.26 AGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3R 30675457 5' + 297 6590 2 68.32 CATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCCTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACA:1 - chr3L 23702234 5' + G4 73 1 71.11 CATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 23180181 5' + roo 8716 2 53.42 CCCAACTTTCCGTTTGTCCAACTTGAAACACCCTGACCACACTCAATGCACCCCACATGCATCCGTGGCAATTTGATATGGGGCTCAACATTTATTTTATTTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTA:1 + chr3L 18125878 5' - Ivk 5348 1 58.90 ATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3R 16157259 5' - pogo 2062 1 54.79 ATGCCATGACACTCAGAGTCTGAGCGAACGCATCCGAGTGCTTCTCTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 19266958 5' + roo 25 2 68.84 AAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAATAACTTATGGTCTAAAAAATATTTTTAAAATGTAGTAAGAACATG:1 - chr2L 19618675 5' - Transib5 2715 1 75.34 CATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACG:1 - chr2L 9010155 5' + G2 2736 1 56.85 ACATTCCTTCAAGGTCACTGGTCTGGACTTTTGCGGCCCATTTTATTACAAAAATGCTGTTTGGAATAAATCCTAGCGAAATATGACTCCTGCATTGCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGATCGTGTGAAGCGCAA:1 + chr3R 3594699 5' + gypsy4 121 2 51.06 ATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTT:1 + chr2R 4260434 5' + micropia 5212 1 50.00 AGCCAAAGAAGCTCTTACGGCTGGACTCACGGTTTCCACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAATCGGGGAAGTTGACTATATCCTTCTCTCTTGTTTGATATACATATGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACAC:1 + chr4 419911 5' + S-element 4 2 76.55 ATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATTTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2L 15940314 5' - pogo 2072 1 55.65 ATTATATCCGTTTCTCGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGCATGTAAGTATGTAACAGACAGTATGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAAC:1 + chr2R 2749405 5' + INE-1 132 1 54.79 AGCCTATCTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chr2R 6965605 5' + Transpac 4961 2 56.85 CTAAGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGCAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 + chr2R 24169930 5' - transib2 2803 2 37.67 ATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 - chr3R 6419925 5' + Tabor 79 2 69.18 AGCTCGTGTAATGAATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 4063940 5' + roo 56 2 57.24 AAGACTAAGAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACCATTTTG:1 + chr2L 18549789 5' + roo 23 2 67.12 AACTAGAGAAGCAGAACTAAAAAAAAACCCATCAAAGCACATCACAAGTGAGTTCCAAATTTCGTCCTTTCACAAACACACCACAGAATGTATATAAACACACACACACACACAC:1 - chr2R 13189587 5' + accord 181 2 84.35 ATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 + chr2R 20227224 5' + hopper 60 1 62.59 GCACTCAAACGACCGTGTGTGGGAGAGAGCGCTTCGTGTGTACTTCGGCTCGACGACTTCGACTCGCACATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr3R 23295515 5' + P-element 51 1 46.58 ATGTTTTTCAATTAAATAAAAGAATTTC:1 - chr3L 2320773 5' + jockey2 3379 1 89.29 ATATCGTAAAATCGCATAGCTTAAAGGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATA:1 + chr2L 19817739 5' - G4 3830 1 48.97 CACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr3R 13875096 5' - P-element 2798 1 15.38 AAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr2L 71280 5' + 412 7105 2 52.05 AAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chrX 19038353 5' - hopper 1369 1 54.11 TTTGAATAAAAGCAGCAGCAGCAGCCTCGGACTCCAGGACTGCCAACTGGGAGTTTCGAGTTGCCGCTGCAGTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chr3R 28385517 5' - transib2 2776 1 51.75 AGGCTACGGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr3L 19349892 5' - 1360 3367 1 67.81 GTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chr2R 3563111 5' - Transpac 251 2 68.33 GTACCTATGTACCTAAGTATCAAATGTACATATGTACATAAATTCATATGCAAGAGACGTCGCTGTTTCTCGGCTTTCCCCGGATCAAACATCATCTGATGTATTGTCTTATATACAAGACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGCCG:1 - chr2L 21205565 5' - INE-1 579 1 54.79 CCTAAAAATTGTTACTTGTTTACATGCCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCGCTGCGCTC:1 - chr2L 22633113 5' - 1360 117 1 76.61 AAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chr3L 16470364 5' + jockey 4712 1 52.85 TATAAATAAATGAGCTTGATAAACAAACGAAAGCTACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr3R 27133541 5' + opus 7024 2 68.75 CAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 8360560 5' + roo 8739 2 81.10 CAAATGACTGTGTCAACAAACACAATTCGCGGAAAAACGAATCACACTGCAAATTTGGAGCCGCACACTGACGGGCACGGGACAAAAGCTCACTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chr3L 8685279 5' - I-element 5331 1 66.67 GTTCTTTCGGATATATCCGATCGGATCGGGTCTTTATAAATAGATACAAACGCCTCCTATTTACTAAAATTATTGAACAATTTTGCTTTAAGTTAACAATGAGTTACAAAGAAATATATTGAATATATTTCTTGTCCAAATACTTA:1 - chr3R 22701931 5' + Tc1-2 1611 1 62.33 GGCTTGTCTGCTAAGGGAATCATTTTTCAACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTT:1 - chr2L 21930272 5' - Copia1_DM 109 1 54.79 TTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 11191398 5' - roo 341 2 66.44 CTGAATTTTACTTTTTTAATTGGGAGGAGTTTTTATCGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTG:1 + chrX 13084244 5' + S-element 341 1 74.66 ATTGTATTATTTTTATTATTATGCAGTATTTTAAGACGACTAAAGGGTAATTTACAGCATATAAAACTATTTTTATAATCGAATTAAAGATTCCTATATTTACTTATGCAAAGAATATCTTTTTAATTGAAATAATTATTAAAAAT:2 + chr3L 10538831 5' + invader2 436 1 52.05 GCTTAAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr3R 15363869 5' + flea 11 2 76.22 AGAACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTTCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATAAATAGTAGCATATGAGCCATAGAATAAGACCACTTATACTTACAAAAACACACACATACATAACCACATAAGAA:1 + chr2L 18212105 5' + Quasimodo 50 2 46.58 AAAAGGCTTAAATAATATTTCTTTCCGTGCATACTTTATTGGCTCTTATGTTTGCGTTTCGGTTTTGCTTAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGT:1 + chr2R 21377456 5' - I-element 5095 1 66.32 AATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3L 23456272 5' - 1360 3335 1 60.28 GCCCCCCGCAAGACAGTTACAATAAATGTCATGTTTAAGGCAGTCAAGCGACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATAGAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGC:1 - chr3R 30312549 5' + hopper2 1207 2 64.38 CCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGGGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 5769009 5' - roo 9011 2 56.85 ATTTTGTTGTGGCTCTGCATGGGTGTGGGGATAATCTGGGAACAAAATATGCGAAAAGTTGACGGCAGATTTGTAATTGGTAAAGTTTGAATTGGAAATAATCAACATGTAGATGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCT:1 - chrX 5203112 5' - hopper 1022 1 68.49 AGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chrX 19054259 5' + jockey 80 1 66.44 GGGTTTAAACATTCATATTGTTTAGATTTTATTTTCTACTATTTCTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAC:1 + chr4 711161 5' + 1360 460 1 69.18 GGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 + chrX 21224526 5' + roo 49 2 54.79 GCCTATCAGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAC:1 - chr2R 15005128 5' + BS 5041 1 50.68 AAACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3L 2145874 5' + roo 45 2 54.79 CCCTGCTTCCCTTTGGTGTTGGTTGCTATTTATTTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 - chr3R 25709909 5' + hopper 23 1 65.07 AATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3L 2990018 5' + roo 8743 2 73.97 AATCTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 + chrX 15903126 5' + INE-1 85 1 73.29 AAAGATATTTCGGAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAATTCTATAACTAGAATAATATTCTATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACC:1 + chr3L 14638585 5' - Tc3 235 1 54.11 CATTATACCCCACTGTTTTCTCTATGTACACTTGCAAAAAGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAG:1 - chrX 13795586 5' + 412 79 2 73.29 GCATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGA:1 + chr3R 27986327 5' - roo 9029 1 58.22 TATCAATGTGTTTTCACAAAAAAAGTTAAGATCATTTAGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGGTGAGCGGCAGTGTAAG:1 - chr2R 7306605 5' + Max-element 22 2 69.72 ATTTTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGG:1 + chr2R 12185267 5' - accord 7376 2 76.76 CAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2L 18549910 5' - roo 328 2 70.55 GTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2L 7593154 5' + jockey 4694 1 66.94 AAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTATTTGTAAGAAACTGATTTTATATGGAAATATCTTC:1 + chr3L 16970354 5' - roo 356 2 53.47 CGTCTGTTTGCTTTTTATACCAATGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 - chr2L 15913378 5' - transib2 2805 1 72.60 ATCCTGTGTGGCCAAGCATGGTAACTCTTTCGCGTTCCATAAAATAATCTATTTCAATCCGCGATTCCCATTTCCCATCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 + chr3L 21380473 5' - I-element 5341 1 69.86 AACACGCGCCCTGTTGCATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chr2L 6647648 5' - mdg3 5420 2 65.75 ATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 4063923 5' + roo 8730 2 67.39 AAGGAGTCGAGTTTAGCAGTTGGAGCGACTCCTCAACACCAATCATTTATGCCGGATTATATTCTTTTACTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTA:1 + chr2R 23780511 5' - Ivk 5332 1 51.03 CCAGTATCGGCGCAATTCAAAACGCGTAATTGTTACACCCTGATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAT:2 + chr3R 4682833 5' + Burdock 8 2 78.77 TGTTGCAAGTTCTTTTGGGGTTAACTTATATTAAGAGAACACGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 + chr2R 2879703 5' + opus 7057 4 56.85 AAAATAATAAAAACCCTCATGCATATATAAAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGACCTTATTCTAT:1 - chr2L 9223846 5' - Circe 7211 2 77.78 AACGCACGCCAGGTGAGTGTTGCCCCCGGGGGGGCACGGGAAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAA:1 + chr3R 22287949 5' + transib2 51 1 52.74 TTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGT:1 + chrX 12130195 5' - Porto1 4533 1 80.14 GAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGGATTCTTAGTTTGTGACCG:1 - chrX 8200285 5' - flea 4940 1 67.81 AATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTACAATTAGGTATTTACAGT:1 - chr3R 9039014 5' - Juan 4150 1 63.01 CAATTTATTGTAAAAACATTGTCAGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGGTATGAGGGAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTG:1 + chr3R 4860396 5' - Transpac 5207 2 69.72 ATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr2R 22514218 5' - P-element 2845 1 55.48 ATCTACTAAGTACACTTTATTTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 6788369 5' + transib2 2630 1 88.24 GTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAA:1 + chr3R 10270584 5' + Juan 4100 1 65.75 ATTAGTTGTAATTAGGTTTATTTTGTTTTCACTTGGTTACACTGTTATTATTATTGTTCGTTGATCTTTGTCTTCGTCATAGACGGATCATTTATTCGACTC:1 + chrY 3649193 5' + Tom1 369 1 60.78 ATGTGTTTGGCCTGGCCGGGACTGGTGTCGACACTTTCACAACATCCACACTTCCACATCCTCATCGACAGCAACAAAGACATCGCAGTCAGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGC:1 - chrX 20332486 5' + opus 7333 2 68.84 AAAACGTTTTAGAAACGCTTAAGTTTTTATTCAAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 2990066 5' + roo 16 2 67.69 AGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAACTGG:1 - chr2L 7593107 5' + jockey 4766 1 75.34 CTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:2 + chr3L 9269896 5' - 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chr2L 13843949 5' - 17.6 7048 2 61.64 CATTGCTGATTAACGCTTATTGGATTTAAGAACATTCGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATAT:1 + chr2L 3655827 5' - 17.6 108 2 74.66 ACCGAAAATGAAAACTTGGCCAAGCCGAAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 12984274 5' + hopper 7 2 80.14 CAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 + chr2R 19199656 5' + hopper 46 1 52.86 TAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 - chr3R 30347393 5' - P-element 2811 1 31.72 AGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 + chr3L 19454897 5' + mdg1 7071 2 61.64 GCGAAACCAGCGAGTGTCATCGCTAAGGGGGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTT:1 + chr3R 9038873 5' + Juan 4016 1 78.08 ACTGAATATAACAAAGACCGTTATTAAAGTTTCAACATTCATCTTGACCTAAACTAATATTATTAACCACATTTCGACTATTGTCAATAAGACCAGGGGTGTGCTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:1 - 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P-element 77 1 20.00 TAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATAC:1 + chr3R 19450060 5' + Burdock 6244 2 71.92 GCCATCGATTTAATATCCGATGAGATATTCATAACTTGCAATTAGGTTTGGTGCACAGTTATCTTGTTTTACTCAAACGTATTTTATTAGAAAATGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGT:1 - chr3R 23043448 5' - Stalker 471 1 68.49 AAAGTTATTATGTATCCCACGGTTATCCTAATCCATGTAAGCCCTACACGCAAAATATACACATTGTTTTACTAAAAGTCGATTTGCCTAAAACGAACAAAGATAATATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTA:1 + chr2L 20964656 5' + Burdock 437 1 69.18 GTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTTTTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 - chr3R 10970328 5' + G-element 11 1 55.95 ATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 - chr2R 6965594 5' + Transpac 53 2 53.42 GCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 15651993 5' + hobo 28 1 52.53 ATCAGAAACATCCACTCGAAATCAAGCGGGAAGATGAGCGCAAAAAAGAATTAGTGGCAGCTTCCTTTATTATTTATGTACGCGCGCAAATATAACTATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 23320188 5' - roo 401 1 77.69 ATTCCTGTTAGCCAGAGCCCACTGTATCACCAAAACACCACCCCGGGAGAACCTTGCCAAAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 10078121 5' + jockey 70 1 56.85 TGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 16564550 5' - roo 8987 2 79.45 AGTCAATTAAAGTGAGACCCCCGCCCCAAAGTTCGAGGCTAATTTTGGTCCCGTGTGACACACACGAAAAAATAAAAATAAATAAAAATAAAAAAAAATTGCACATCATTTCTTTCTACAGAGAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAA:1 - chrX 10107128 5' + Doc2-element 225 3 54.79 ATAACCGCGACTGCGCGCGTGTTTCCAACGCTTCGATCGCAGATCGCGCCGTTCTCCAGCGGCTGCTCGTCAATCTTATTACTCCGACTGAACGTCGTAAAGTATATTTGTACTAATTACTCTGCCAGACCACAA:1 - chr3L 16328062 5' + Gypsy6A_LTR 243 1 53.33 TACTGAAAAAGCAGAAGGATGCACAAAAAAAGCAGACAAGTGCTCAGTTACTTTATACTTTACTTTGGAAATGCACCCATAGTCCTTTGACCTCTGCTGTACCCGACCCATCGCACTCAAGTCTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTT:1 + chrX 11456760 5' - gypsy7 5010 3 75.34 AGGAGCCCCATCAAGTGGTCGTTACTGTCGGCAGCAGCAGATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAA:1 - chr2L 6161019 5' - I-element 5276 1 71.92 TGTTGCCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGCGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAGTAAATAAA:1 - chr3R 30987601 5' + F-element 88 1 59.68 TAGCAAAATACCACAGAGATCTTTGGGATAGCTCCCCCCGCCCCCTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 22108005 5' + hopper 137 1 83.33 TTCTGATCATATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGAT:1 + chr3R 4357507 5' - Tc3 1668 1 46.58 ATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2R 21681317 5' - roo 333 2 69.18 ATATTAAAAACAAAAATATATATTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr2R 987464 5' + I-element 29 1 48.63 AATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTTCATGGGGGGAGTTCATGGGGATGCATTCTCTTCAGACGTCGAAGG:1 - chr3L 11816240 5' - G5A 2673 1 60.96 GTATGAGGGACTTGGAGGTTCGGGGAAGTGGCAGTTTTGGGCGGGTTTAGGGACACTTATACGGACAGACGGACATGGCCAG:1 + chrX 1678540 5' - INE-1 117 1 64.63 TGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 23773164 5' - roo 9039 1 43.84 CAAATGTATGTGTGCACGAAAAGAAAGTCAATTTAATTGTTTAAACTCTCAGTTGGTCCTCTATGTATTTGCAAAAACTTTCAAACTGTCACCTGCAGTCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGC:1 - chr3L 15062430 5' + 1360 458 1 67.81 ATCAGAAAGGGGAAGCTTATTTTCATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 - chr3L 9270009 5' + copia 4907 2 45.21 ACTTCCCCCCAAACAACCAACCCCTTGCAGGTTGCCTCATGCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr2R 8099094 5' + jockey 4763 1 80.60 CTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 - chr3L 6447132 5' - transib2 2771 1 54.11 GAATTAATTGGGTGGGTCTTTTTTTTCGCAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACCGAATTCAACAGAACTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:2 - chr3R 2944498 5' + 1360 48 1 57.53 TAATAAGAAAATTAAAAAACTATCATTCTTGGCTGTCCACGAAATTTTGCCTAGCACTTCATTATGTTTCGATGGCTGTTAAACAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGAT:1 + chrX 11468037 5' + BS 4646 1 54.11 GTTTCAAGCTAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTATAATTTTAGCCGCCGATAACAGAAGTTAATATTCTATTACAATTTCACGTGATTCTTTTCTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGTTTCAACAGCGTCTGAC:1 + chrX 18336593 5' - mdg3 172 2 56.55 AGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chrX 11661507 5' + pogo 39 1 56.20 CAAAGAAAGACAGAGGGGGATGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAATACCCTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3R 19310190 5' + 1360 4 2 43.33 AATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGC:1 - chr2L 7618519 5' + X-element 4467 1 69.62 GTATATAATATAGTATATAGGGTTTATGCGTAATTGTTTTAACTTTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:2 - chr3R 4153456 5' - I-element 5321 1 54.11 AATGGAAGCTTAGAATACATTAAGCAGTATCACCAATTCAATATCATAAACATTGAAGATAAAGAAAAGAGTAGAGCTATGTATTTTGTACAGGCTTTTATTTCTTTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGT:1 - chr2L 1199775 5' - Max-element 8519 2 69.86 AGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCACTCTAGT:1 - chr2L 6647739 5' + mdg3 5306 2 50.00 GCCATAAACTCAACTGCAAATAATAATGGCAATCAACAACCGGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAACTAGTT:1 - chr3R 22288046 5' - transib2 2748 1 68.49 AATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:2 - chr3R 7420279 5' + 1360 84 1 76.71 GGGTAAACCGAACTGGACTCGTGGCTGTATTGGTCATTGATAGGTAAGTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGA:1 + chr3R 14505233 5' - F-element 4666 1 70.55 AAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATAC:1 - chr3R 1844840 5' + Cr1a 161 1 60.63 AAATATTAAGATTGATATTGCCGGAAATAATAATAATAATAATAATTATAATAATAATAATAATTTAGTTATAATAATATTAATATTAATAATAATAATAATAAT:1 - chr3L 18397192 5' + mdg1 30 9 80.00 ATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGGCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTATACACAAAGTGTAAA:1 - chr2R 4727316 5' + Doc 88 1 53.79 AAGTGATACATGATCCTTCAGAGAATTCGAATCAATGGTGTGCGTGATGCAGGGCCAGATAGCCGGCAACAGTATGTGTGCACACGTATGCACATATGCAAATATGCCCTTCTTCATCTTAAAAGTTCTTAGACCTTAAATCTATA:2 - chr3L 11065384 5' + 1360 239 1 59.59 GTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 - chr3R 29690791 5' - I-element 5295 1 60.27 ATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGG:1 - chr3R 9039002 5' - Juan 4138 1 72.60 TTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:2 - chr3R 7420332 5' + 1360 31 1 65.75 AGGGGTTGTGAACGAGATGAAATCGATGCGTCAAACTAAAGGGGCTTGTTAGGACTGAATAACAGTTTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr2R 12912612 5' - 1360 3335 1 56.85 TGAAATTAATTTTTTCTTTTATATTAGTCAAAATAAGAACTTTTTCATTGTTGTCATTTTACACAAATAAAATTTTGCAACTGAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 + chr3L 18458725 5' - HMS-Beagle2 7161 2 58.22 AAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATC:1 + chr2L 11391476 5' - 1360 38 1 52.05 CATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTTA:1 + chrX 17678734 5' + flea 4756 1 86.01 TAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:1 - chr2L 13844260 5' + Stalker2 7308 2 56.16 AAGGCAGCTTCTAAATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGAT:1 - chr2R 5321240 5' - INE-1 510 1 69.18 GTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGTA:1 + chr3L 17183702 5' + diver 66 2 76.99 AATTCTTTGTTTAAAGAAAAATTTTTTTGCCTATAATTTTTATAAATTTTCCTGCCTATTGTTTTTGTATAGCTTTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr3L 13696504 5' - 297 357 2 47.26 AGGCAAGAAGTCAGCACAGAGAATGAAACCCAGGCACCGATCTCATAGGTGTAGTTGGGGCAAGAAACCAAGCTGCAGTTCGAAGAGCGCGAATTAATAAACTTGAGCTGTGGGTCAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGC:1 - chr3L 3904734 5' + flea 4856 1 78.77 CGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 + chr2R 12472004 5' - transib2 2779 1 54.11 ATCTTTATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 + chr2L 14523109 5' - HMS-Beagle2 269 2 47.26 CAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:2 - chr3L 16470365 5' + jockey 4734 1 59.59 AATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATG:1 + chr3R 7819169 5' - invader3 173 2 57.36 ACAAATAATTATCTTTGAACATAATGTAAGCTTATATTTTCATATTTTGATATTATTCTATTCTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 3120427 5' - 1360 3359 1 51.67 ATTTGTGTGGCTTTTGTGTCACGATATCTCCAAGCAGCGCATTTAATTTAATGATGACGATTTTATTAATGAAATTCAAGAAGAAAGCCAACGCCAGCGAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chr3R 27597238 5' - jockey 4965 1 69.86 GGTTAATATTGACCATTCAGGCTTTAAATCCTCCCATACACTACTGCTCACGTAATTATACCCGTAGAGTTAAAGAGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATGTACTTGCAAAAAATAAACGTGATAGTCGGGGAACTCGACTAAAG:1 - chr3R 20126133 5' + INE-1 566 1 62.33 AACTAGTGTTATAATAGAAGATAAAACATATGCTAGAAAGTCTTTTCATTAATAGTGTTCTAAGGGATACAGATATACTCAGATATAGCAAATCCTTTAGATACTATATTTCCATTGTTTCTTTTTATTTTTTATTTGATTTATTT:1 - chr2L 9944057 5' - X-element 4719 1 76.03 CTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTAAAATAGGAGACATGAGAATCGCATCCTAAAGTAAA:1 + chr3R 9002942 5' - roo 316 2 74.66 ATAAACTTTTCAACGAGGTGTGATCTTTAATCGCAGTCCGCCAAAGCTCAACAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:2 + chr2R 15331546 5' + I-element 470 1 64.38 ATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 + chrX 23431604 5' - 297 314 2 74.66 AAACCGTTTTATGCTGTGCCATCTTCGTGGGTCACTTGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGT:1 - chrX 8313211 5' - Stalker4 278 4 76.55 GACGTCGCACTCGACGCTCTCAATGGCTGACTAAACTTTTGAATAAAAGCAGCAGCAGCAGCCTCGGACTCCAGGACTGCCAACTGGGAGTTTCGAGTTGCCGCTGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 + chr3R 28385480 5' - transib2 2816 1 79.29 TAAAATTAAATGCACATTCCAAAGTTGTCTAATTGCCTCAATTAGTTGTCTTGTATGCTTTTTTACAGCTATTAAATTAATGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCA:1 + chr3L 16033549 5' + Doc 4511 1 54.79 TATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATT:2 + chr2L 7660924 5' - I-element 5281 1 67.12 AGATGGGGAGTATAGGGAATAGGGAAAGTAAAGAAACATTGTTGGTGTTGAATAATTTTACGGAATACAATAAATTATATTAAATTGTTATGTGATAGTAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAAATTA:1 + chr3L 3235148 5' - 1360 3163 1 54.11 AGAAGTTCTTTCATTTGTATTCATATACATTGCTATTATTACTAATTTTATCACATTGTTATTGTTCTCGGTCATTATATATTTTTTCAGATACTGGAATTATTTGATTGTAATCTTTTTTCGAAGCGTTGCCCCATAGCTCGGAG:1 + chr3R 19075291 5' - Doc3-element 4332 1 66.44 AACAATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTATAACATTCTCTCTTT:1 + chrX 21452473 5' + INE-1 578 1 72.60 ATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3R 4964108 5' - roo 332 2 71.23 TGCAATTTAAATTTTTGCCTTAATGACATTGAAACGGAATCAAAGTAACAACAGAACAGCTAATTCCCCGAAATTAACACACCCACATTTTTGAACCATTTTTCGATATTTTTTATTATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCG:1 + chrX 3702110 5' + INE-1 298 1 60.00 TCTCAACAGCCCTATTGTGAACGATGAGTGCAAGAACGATCGCAAGAAGATCCTGGTCGACTACTTCATTGGCAACCTGAACCGCCACAATTTCTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 + chrX 6999560 5' + I-element 5013 1 65.07 ACTTGTATCAATTACCACAAAATTCAGCTGCTGACAGGAATTTAAATTTGAAACAAA:1 - chrX 7596243 5' - copia 4674 1 40.35 CAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAANAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 19073266 5' - roo 329 2 71.92 ATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGGATTTCGGGGGCTCCTTTGTATATGAGAACA:1 - chr3R 27083141 5' + jockey 4564 1 55.56 GATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 13766193 5' - roo 9019 2 55.48 ATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCCCCTAAACTATTGGGGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 - chr3R 23618222 5' + hopper 60 1 56.74 AGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr3R 4860532 5' + Transpac 51 2 57.78 TTGTGCGTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 7795467 5' + roo 16 2 76.71 ATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGACAC:1 + chr2L 12818251 5' - hobo 2878 1 62.79 AAGGGCGGAGAGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3L 4233994 5' + pogo 3 1 68.35 GACACGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAATGAATC:1 - chr3R 9003013 5' + roo 53 2 58.27 CTATTTGTCTGTGGAATCAGGATCTAAACTGAATCTGAGATGTAACCTGTCCCCAAAACTATACAAGTTTAACTGACATTATTATCTCAGATCATCAGACTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGG:1 - chr3R 7059307 5' - Doc 394 1 67.86 TGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 + chr2R 16510125 5' + F-element 98 1 73.29 TGTAATAGCGTTTCTTTGTCGATTTTTTTTTGTGTGCTCCACACTTTACCAATTAGCTCTAATTGCGAGTATCTCCCATCTTTCCCAATTAGCGAATTGCGGTGGATGTGAAAGAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGAC:1 + chr2R 16331098 5' + gypsy4 6647 2 72.60 ACATACATAACATACATAATACACACATAAATCAAGAAAAAAACATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTA:1 - chr2R 9121372 5' - Juan 4145 1 62.33 ATTCTTTTGAATTTGGTTCGTTTTCGAAAAAAGTTTTAACAAAATTCAGCTTATATGGGAACTTTATTAGTATTTAACAAAAAAAAAAACATTATAAGTAATTAATAAAATAAAAAAAAATTTAA:1 - chrX 7584617 5' + transib4 2279 4 76.00 ATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGCTCCC:1 - chr3R 14505372 5' + F-element 4496 1 49.57 AAATTAATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 20265907 5' - roo 9042 1 65.07 GGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGAAG:1 + chr3L 21996187 5' + Transpac 90 2 75.34 ATAGGAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 19449919 5' - roo 8998 2 76.25 ATCGATGCGATGGATCGAGATAACATATACTATACCGTGGTGGATATTTCAGGCTAAGAACGGCCGAGTGGGATGGGTAACATTTCACTGGCGCGTGCTCATTTTTTTGTGGCTTTTTTTTTCTGTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 28563360 5' - Rt1a 5087 6 53.42 CCCATTTCTTTGCATCCTAATTCTCTAGCTTTAATTTTTAATGACCACTTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTG:1 + chr3L 15898338 5' - I-element 144 1 62.88 GCGAACGTCGTAAACACACATTTTGTGGCCAATTGTTTTGTTTTGGCTGCGCGTACAGTGCGCGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTTCGGGGAATAAAAAAAAATGA:1 - chr3R 30341886 5' + P-element 135 1 44.52 TTAGTCATTTTGTTTTTGTGAATTTTGTCAAGATGCCGACTGCAGCGCTGCTCTCTGTGTTGCCCTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTTTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTAT:1 + chr2L 5306504 5' - I-element 317 1 56.91 CAATCATCGTCAACTAACTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCACTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3R 16157232 5' - pogo 2089 1 73.29 ACTCGTTTCATATTCCCCAGCGATAGCTGACACCTCTTATCCAAGTCTCCCAGTTGGTGGACCACAAAACCGGCAGTCATACATACGTGTCCGACATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCACCTAATTACGGTAAACATAAATG:1 + chr3L 12095406 5' + Quasimodo 7169 2 71.23 TATTAACAATCAGAATTATTGTGTAATAGTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTAGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 27160018 5' - 412 7531 2 73.29 GTAATAGCCACGTGGGTTAGTCCTTCGTGCTCGAGGAAAAATGTTCAATTAAAAACTAAACGAAATCGTAATTTGTATCGGTCAATATATATCGGGTTTTGTTGTTTTTTTAATTACACGCATCAATTTTTTGGTGTTCTTTTCTT:1 + chrX 12213183 5' - mdg3 5104 1 71.23 AATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 + chr2L 21367241 5' + Doc 93 1 76.03 ATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3L 22400262 5' + 1360 63 1 59.59 TATCTATATGTTTAGTACGTGTATCGCTCATTTATGATTGATATACTCGCATAGCAAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAA:1 + chr3L 21907625 5' + I-element 5151 1 61.64 AAGTTTTGTAACGAAAATTGCTGTAGACAGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTG:2 + chr3L 13365687 5' + BS 4994 1 77.24 AATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTCTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGA:1 - chr2L 14025657 5' - HeT-A 6053 2 39.73 GGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 - chr3R 30675454 5' + 297 6638 2 61.64 ATGACTTTAATTTATTATTTATGTTAATTGTAAATGATTTTGCTTGGCAGCAAACATTTGTAGAGCAGCAGCATCGGCATCAGCATCATCATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTG:1 - chr3L 7892930 5' + pogo 180 1 69.06 TTCGAATGACACGTTAAGTGTCAGCAGCTTCAAGAGAAGTTTCCCTGGCTTTGAATTCCCTTGGCACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTTCTAATTGGCGCCCCACCAGTGGGATTTGACAG:1 - chr3L 14433750 5' + gypsy2 358 1 55.17 AGGACCCAGAACCGAGGATGTGAGTGTGTGGTGTGCGTTGCGTCTGCCATTCCCTGTGTCATTTAAAATCATTTTGCAAGTTTTGAGCTGACTTTGAGTTTGGTTTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCT:1 + chr2L 20259269 5' - INE-1 175 1 76.12 TTGTTGCCTTCTCGCTCACACACACACATGCAGCGATTTGCCGCCTTTTGGAGCCTCTTCTTCTGCATTTTCCCCGTCTTTCTCTTACTTTATGTATTACGTTTTTATTTTTTTTTTGTTTTTCTTTT:1 - chr2R 10559678 5' + hopper 143 9 71.09 AGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chrX 19038369 5' - hopper 1371 1 56.25 ATAAAAATTTCGGCCAGCCAAAAGGCTCGATTCGTGAGAAGATGGACGAGATAGTAAAGAGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAAAAGTT:1 + chr3L 23953297 5' - Cr1a 4273 1 71.23 ACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGTTTAGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGA:1 + chr3R 4357539 5' - Tc3 1636 1 69.18 GAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGA:1 + chrX 292390 5' - G3 4538 1 60.71 GATGCAATTGTAACGTCTAAGGGATGTGCGTTACGGTGTCGGGGCTTTAAATTAAAAATGCATTAAGTGCACATGCACCATATACTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAA:1 - chr2R 20682806 5' + R1A1-element 5275 1 52.94 TTCTACTTTCACTATCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:2 - chr2R 11804761 5' + pogo 29 1 65.75 ATATGGATTAGCATGTAATATGCCACATTCGCACACAGGCACACACACACACACACATAGAAAAATAACAAAAAAATTCAGAAAAACCATAGAAATATTTATAAATACCAAGCAGAAGAAAAAATTAAAAAAACCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 10577798 5' - hopper 151 4 56.85 TTTCTCCCACGGAGTAGGCGGGTTGTGTGGTAAATCGAAGTTTAACGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACGCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chrX 20455744 5' + hobo 37 1 60.27 TCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 - chrX 585712 5' + Tirant 8179 2 71.64 AGTTGATTGAGCTGCAAGTGTTTTGCGTAATGTGTTGTTGTCGTTGGGAATCGCGGAATCGCAGATCATTGCATCGGTGGTTTGCAGGGTAACTCCTTCTAGCCGGATTGGAGGGGTGTTTTGGACAAGCGTTTTTAATGTGAAG:1 + chrX 19521386 5' - Helena 819 1 62.07 CTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGAGTTCTT:1 + chr3R 6419819 5' - Tabor 476 2 71.79 AATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAG:1 - chr3R 11040167 5' + Bari1 53 1 52.74 ACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAT:1 + chrX 2214249 5' + jockey 4818 1 56.85 ATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAA:1 + chr3L 15913868 5' + jockey 4840 1 73.97 CAAAGAATTTCATTGCATTGTCAATTAGGTCATTGTATTCAAGTACTACTTAATAAGCAATTTCTAATTTTAATTAAAGCCTTTTTGCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:2 - chrX 696612 5' + FB 36 1 58.22 AATTGTTGATATAATTGTTTCAAAGGGTTGCAGTAATCAAACATGCTAAAGATTTTTAGATATAGCATTTAGATATAGATATAGCATTATTTCTAGTTCAACCAACGATACTAGCATATTCTATTGTTATTCTAGTGTCTTTG:1 - chrX 20145717 5' + 1360 3388 2 35.66 GCTAGTCGCAAGGTTCTATCTTGGCCTTCGTGCTTGTTTCCTTGCACCTCTTTTTGCGCTTTTCGATTTCGGTTTTTGTTGGTTTTGTGTGTTTTTTTTT:1 + chrX 18995604 5' - Tc1-2 492 1 67.00 GCATTTAAATAGTATCTGTTGCGGATTAATTGCTTTGAAACATGAAACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTTTCCATAT:1 - chr3R 20498895 5' - transib2 269 1 68.49 ATATGGTTTATATATCTATAATCGATCTACATATCTCGCTGTTTTCTGTTATTTGAAAGCGTATTGAAATTCTGTTTTGTAACATTAAGCTTTTTCCATTGTTGTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCT:1 - chr3L 15486375 5' - Cr1a 3983 1 68.49 AACTGTAACTTACTTTTAGGAATGCAGCATTATGTGATTGTGAACGATCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTTTACAATTCTATATTG:1 + chr3L 17880563 5' + F-element 4234 1 61.36 AATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr2R 21160642 5' - Transpac 267 2 54.79 AATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 3234030 5' - roo 322 2 76.03 AAATTATTTTTTCTAATCATTATAAATATTTAAATATTTTGGAACGTCAAATGAGTTATTTTTATACGCATTGCTCGTAGTATATATACGTAGTATATATTTTCGTGACCAGGATCAATAGCCGAGGGGAT:1 + chr4 462506 5' + INE-1 95 1 65.65 TAATTTTTATCTGCCCATTGTTGTCTCACGTTCGTAAAACAATATTAAGATATTTCTTTGTCCCATTACCTATTTATTTAACCATTTTTTTATTTTTTTTTTACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTT:1 + chr2R 14665677 5' - Bica 492 1 42.47 GTGCAAAATCAACAACCACCCCGAACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 + chr3R 25992355 5' + I-element 4984 1 77.42 ATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 13406383 5' - pogo 2070 1 64.38 TTAGTGCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGATGGGAACTCCGATATAGTCCTGTATACCCCTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTCATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr3R 30946503 5' + Transpac 4960 2 51.13 AATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCGCGC:2 - chr2R 20802646 5' - mdg3 5416 2 69.66 AGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGCGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGGATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr3L 18281881 5' + Doc 89 1 76.71 GTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTC:1 - chrX 22689472 5' + mariner2 38 1 71.92 AACAAATTTACGGTACAAAAAAAATTCAAAATTGTTGTCGTGGCACTTGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAACATGGGTCAACAAACTAGAGCTGCGAGTATGCGTGTCTCTAGAATCCGACTCGGCTATTGATCCTGATC:1 - chr3L 18195806 5' - INE-1 92 1 67.12 AAATATTCTTACTAATCTAATCTTTAGCTATGTTGTTCACTTTTGTCCTTTCCATATATTCTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTC:1 + chr2L 10046079 5' - jockey 4579 1 64.89 AGATAGAACGATAAGCAAACTCAAGGGTTCCAGCAAGGTATATCATACTTTTTTGCTCATATATGTAAGGGCTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 21681449 5' + roo 16 2 74.66 GAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCA:1 - chr3R 4357603 5' - Tc3 4 1 84.25 ATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGCGAGAGGGTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTTATCGCTTCTAA:1 - chr3R 14860202 5' + BS 5074 1 69.50 ACCCACTGTGCACTGTAGTCATTGCGTTTTGCCGGACCATTTGACGCCTAATAGGAGCCACCGTCGCCGTTTCAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 - chr2L 20840085 5' + mdg1 7087 2 50.68 AAGTGCTACATACGGACATATGGGGGGATGAAGGGAAACCTTACATTGCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTGCCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAG:1 + chr2R 1596640 5' + Cr1a 4054 1 69.66 AAAGAAACCAAATCTTATAAATTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:1 - chr3L 20711753 5' + jockey 4766 1 78.08 ATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:4 - chr3R 23295611 5' - P-element 2862 1 39.73 AATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 7719706 5' - roo 403 1 74.29 AGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAA:1 - chr2L 15550750 5' - Bari1 1632 1 71.72 ATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 14366600 5' + roo 8739 2 76.92 CAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGCGAAAGGAATA:1 + chr2R 13168650 5' - P-element 2824 1 43.15 ACGTGCATCCCCAACCCCGAGTTTTACTGACACAGCTCCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2R 18515017 5' + P-element 2 2 80.00 TTTGGATATATTTTTGTAATTATATTAGTCTTTTTAATTTCTATCGATTTGCCAATATACTTCTTGCCACGCCCTGACTATTAAGAGTTTGAAGTTTTTTAAATTCGTTTGTTAAGATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACAT:1 - chr2L 4951727 5' - 1360 2975 1 54.11 ACCCGCTGTTTCAATTCAAGATATATCACCAGATCAAGAATTAACAGATTCAGATTCAAGCACTACCATTCAGGAAATAAAACTCGACACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr2R 4855152 5' + transib2 25 1 67.14 AAACTTAAGGTTAGGCATCTCGCACGCCCGCTGAAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCACACATACCTAATTATAC:1 - 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Transpac 5220 2 78.62 ATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAG:1 - chr2L 21930222 5' - Copia1_DM 66 1 76.26 AAACAATCAGGAGAAACGCTATATTAGATAAGAGAAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:2 + chrX 20373563 5' - 297 6937 2 51.37 GTGGCTTGTTCCTGTTGGGAGTGGACAAAATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGG:1 + chr2R 12474072 5' + transib2 2511 1 77.59 AAAGAAAAGAATCCCAATTATATAAAGTAAAGTTGGGGGGTCAAAATTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGGGAGGCTTAAGCAAGGA:1 + chr2R 4840781 5' - Idefix 218 2 59.17 GGATATAAATGTGCACAGGGAGAAATATCTCCAAAAAGGATAACAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAATTTTTTTCGTGATATAATGATTCGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTTTAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1 - chr3L 963191 5' - 1360 306 1 70.34 AGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - 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chrX 8521087 5' + I-element 5182 1 58.90 GTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGAC:1 - chr2R 20802655 5' - mdg3 5424 2 63.70 TATTAAATAAAATTAATTGATTTATTAAATAAGTTTAATTTATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTAACTATGCTGGTGGATTTAGCTTTTGTTCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAC:1 + chr3R 13659748 5' - TAHRE 10421 2 75.34 CAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2L 17809264 5' + jockey 70 1 58.90 ATTTGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGATCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTTGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGGTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2R 13259294 5' - mdg1 364 2 60.00 AACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTTGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTTAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCA:1 - chr3R 11040139 5' + Bari1 30 1 54.74 GATCGATGGACATGATGCCCACGCTTTGAACAATTTATAAATTTCTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTGAGGATATCTCAAAAAAAAAATGATGAAATTTGCGTTCGAATTTACACTAGCTGATTAACGG:1 - 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transib2 2768 1 56.16 GATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAAT:2 - chr3R 7666705 5' - I-element 5275 1 70.55 TATTTCTAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATAATAAATAATATAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTAC:1 + chr3L 23688535 5' - Quasimodo 7296 2 74.66 GATTCTCATAAATATGGAAAAGATTGAAAAATTTAGTTTTAGTAGCTGACAAATGCTATTTACATGCAATGTATCTTTAGAGTATATGTATTAGTCTGTAAATCAAAAAATAAATTAAAAATATTAAATATTCAAGAAAATAAACA:1 + chr2L 10589032 5' + S-element 162 2 48.63 AACGATAATCCACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:2 - chr2L 17809306 5' + jockey 27 1 70.55 GGATCCAAGAAAGATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 1279205 5' - roo 9033 1 57.53 ATAAATTCAATATTTGACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr3R 20441208 5' - I-element 5319 1 56.16 ATTAAATGTCCTTTGATTCCTAATTGAAATTTTTTGACTTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATC:1 + chrX 7795519 5' + roo 38 2 58.62 ATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:2 - chr3L 18126029 5' + Ivk 26 1 60.96 AATGTCATCAGCATTGATATTGCGAAGATTTTTTAGAGCAATGGCACAAAAAGTGCAACCAAACGATAAAAACCATTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAAATGGACGTGGGCAAAAGAAACTA:1 - chr2R 5180380 5' - FB 93 1 56.74 GGTTGCCTCCCATCAAGGTCAAGATTTTGTGCACTCCGAAAAATTATGTGTAATTAGTTTTAAATGTAAATAACGACATTTAATAATGTACTAGAGAAATAAGATAATTAAGATTAAATGAGTTTATATATTTATATTTATTTAT:1 - chr3L 15447193 5' - diver2 447 1 80.69 AGGCCGGTGATTAGAGAGGAAGTAAACTCTCCAACCTAATCTTCATAAGAAGACTGTCCCTTACAATCTAGAGGTGGCCCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTC:1 - chr2R 5043936 5' + 1360 128 1 54.79 TATAGCGGACTCTTTAACTGGAAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGCACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTT:1 + chr3L 22960422 5' - 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chr3R 19447210 5' + transib3 381 1 67.12 ATAATACTTGGCAAAGATAAGAATTCGCATAGCTAAAAACCAACAAAAACCCAATAAAGAAAAAGAACTGGAATTTGAATATACATATAACAAAAAAGGGTAATACTATATTAAAACAAAAAA:1 - chr3L 10667164 5' + BS4 730 2 67.48 CATATTTATGCCCCTTCGGCTCGCTCAATTTATATAAATACATATATGCATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGT:1 - chr2L 18212213 5' - Quasimodo 7301 2 72.60 AACCCCCAACCCACATCTATCTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGGCTCTTCGCTCCACGACTTGGGAGCCG:1 + chr3L 11384720 5' - Doc 409 1 74.75 AGAAACTGGAAGGACCAAGATAAAGACGGGGTTGGATGCCGAGGGAAGATTACAGGCTCTCCGTGGTACATGAGGATCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGTGACACAAATTGGAGACAAGATTCAGGAAATAGCGAAAAAATA:1 + chr3R 4508173 5' + jockey2 3064 1 70.55 CTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCAAGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTGACCGAAGCATAGACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTAGTGAGGAAAG:1 + chr3L 3983836 5' + P-element 73 1 23.97 CTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACATTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - 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chr2L 11048110 5' + INE-1 513 1 71.72 TCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCT:2 + chrX 15408716 5' + INE-1 527 1 43.15 AATTAAAAATTGTTTCGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGAT:1 + chrX 9662229 5' - hobo 2598 1 73.77 ATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCAC:1 - chrX 20999574 5' + BS 74 1 72.60 AATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 + chr3L 15103813 5' - Transpac 241 2 65.52 ATCAAAAGAGCTAGAAAAACAACGGGCAAACAATGCAAATGTATTTAGCAGAATGAGACAGGAGGAATGTGCAAAAATGCAAACATTTGCGGAGGAAGAATGGGGGGGCAGAGCATTCCCACGCTCCGCG:1 - chr3R 13500703 5' - Stalker4 185 4 80.77 AAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGA:1 - chr2L 12984197 5' + hopper 84 1 73.29 GAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTTTTTGTA:1 - chr3R 27123564 5' - roo 9049 2 52.69 ATTAATTTTCCATTTTTATGAGTTAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACTACCCGAAATATAGTCGTAATCCTCAAGTGCTTT:1 - chr3L 2921848 5' + Burdock 32 2 56.56 CACCTCCTGCCTGCCTTTGATTTTTAAATTGAAAATAATAATTTTGCGCACTCAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAAATGATAGGGAGAATTA:1 - chr2R 25126296 5' - jockey 4868 1 62.33 GAATGAATAATAATTGCAATATACAAGGCGATAAAATAACAATATGGTCGGATGGAATAGAACTCTGAGTAACTGCCA:1 - chr3L 25839905 5' + Porto1 4281 1 78.21 AATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAAT:1 + chrX 12129317 5' + flea 4829 1 69.18 ATGGGAAGGTGAACGGCAGGAACAACAACATAGGGTGGCGCTTATTATGCGTATAGTTAACATTTATTTTTGCCAGACAGGAGTTTTATGTGTGCGTGTGAAAGGCTTACACACACATACACACACA:1 + chr2R 19080218 5' + Quasimodo 36 2 88.19 ATTAAACAGGTGCTTGCGATCCTAATCGTGGAGCTAATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCTGCCCGCCACTCGCACGC:1 + chrX 20455615 5' - hobo 2931 1 71.00 ATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGTTAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr3L 16690902 5' - I-element 5304 1 55.47 TTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 + chr3R 15724294 5' - Juan 4162 1 51.37 AGTCGAGCTTCGACGACGATCGTCGGCGAAATTTTTTGTTATATTTATAATTAT:1 - chr2R 9499495 5' - transib4 2574 1 57.41 CTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chrX 6475281 5' + Doc 50 1 53.42 ATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTT:1 + chr3R 20441243 5' - I-element 5284 1 65.07 CCCCGAAAGTGATTTGCAAAACAAAACACACAAACGACGGAGAAAAATGCACAAACGAAAAAAACTGCTTAAATTGCCGAAATAACCCAGAACTTGACCATCAACACAGCCCAATTGACCGCAGATGAGGATGTAACAGTAAGTGA:1 - chr2R 20934734 5' + I-element 446 1 71.92 ATTAATGACGCGTTCCGGGGACCCAACACAAATGTTGTCAAAGGCATCAAAGTGCCTGCCCACACACACCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 - chr3R 8423441 5' + jockey 4817 1 54.79 TGGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - chr2L 16946159 5' - hopper 1382 1 61.64 GAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 - chr3L 21655986 5' + HMS-Beagle2 6939 2 56.16 ACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 - chrX 5323155 5' - Juan 4184 1 33.56 AACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGCCAATTAAACTGAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 22325888 5' + hobo 33 1 52.88 GCCTGCCCTTTTGATGAAAACAACTCAATGACGTGATTTGTGCCCCCAACGTTGCCGACCATTCCATCCATCCCCGTGTGCCCATCCTATGCGATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGCGAAAGTT:1 - chr3R 22176413 5' + Doc 4604 1 65.75 AAATTCAAAAATAATTTACATAGTTTTTGGGTAAAAGGAGAGGGGTAAATATATATATATATATATCTATATATATATATGTTATAAGAACTGACATCCACAATACGCTTATTTGGAATGCATGTTCAAATTTGAGTTTGAATTCG:1 - chrX 9622623 5' - Rt1a 314 1 78.77 ATAGTTTGAAAATATTTTCGTTAGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr2R 10161744 5' + transib2 20 1 71.72 CTGATCCTGATTCAGAATATATACCTTATATGGTCGAGAACTATACCTTCTATCATTAAAAAAAAATCTCACATACCAGAAACTGAAAAATTTTTATTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1 + chr2L 21948363 5' - Max-element 8511 2 64.14 CGGGCATATGGACGTGGGCGTGGTGGTGTCAGATGTGTTGTGGATTGTATGTGGTGTGGATGATGTTCAATTTAAGTTTAGATTCTAAGTTAACAAGTAACATCAGGAACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGG:1 + chr2L 11800760 5' + Chouto 44 1 58.27 GCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAACAAATCATCGGACACTGAACCGGG:1 - chrX 585696 5' + Tirant 8150 2 70.79 GTTGATTAATCGACTTTTAGCGCTGCTCATCGCACAGATACAGCACGTGAAATAAACCGAAGGCGCAAAATAGAAACAAAAGAAAAAAAACAAAAAACT:1 - chrX 14023921 5' + HMS-Beagle2 489 1 44.44 CTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 16157249 5' - pogo 2072 1 61.64 ATTTTCCTGCACTTATCCAGAGACTGAGGGTGAGATCAGCGATTTTTAAACAGCAACAAGACATCCAAGGCATCCATGTCCAAAACGCCCACCAAAAACCACGCAAAAAAAAACCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTA:1 - chr2L 7846845 5' + F-element 56 1 77.40 AACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 19450067 5' - roo 399 1 52.94 GCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3R 26774084 5' + hobo 54 1 69.09 AATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACCAGAGAACTTCAGCCCGC:1 - chr3R 26405072 5' + hobo 2708 1 71.21 AAACAATGCATTGAATTGCTTATTTTAACAGCCAATACAATGATGCAAATTCAATGTTCAAATGAAATCACAAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 - chr2R 5187236 5' - INE-1 575 1 66.67 ATGGCAAATCAAGTTTGTCTAGCACATTGCACAAATATTTCGTTTTGACACACAAGTATTTCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCG:1 + chr3L 19943477 5' - F-element 469 1 57.69 TGTGTGCTTTCTATTTCGATTTTACCTTCTTTCTTGGGAAAAGTTGCAGCTATGAATTTATTACCTTGCCAAAGGTTCAAATTTTTTTATTTTTAAA:1 + chr3L 11678993 5' + FB 178 1 52.58 CTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCATTTTCTTGGGTGCTTAA:1 - chrX 20999582 5' + BS 66 1 65.75 AACTAATATAGAGTTTAATATTTTCTCACCAACCTCAAGACCTGACTGACCGGAAATTGACATAAATCAAATCTTAATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAGACACAAAATAAAAAACGGGGCGCAAAAA:1 - chr3R 25087664 5' - Cr1a 28 1 58.22 AGCGAGAAAATCGTAGTGAATCTGTAGTAAATTTGCTTTTGGCTAGGTTAGGCCCTGTTAACCAAACTATTTAATACTTTTCCTTGGGTTTTTTTTGTTTAATTTATATTTATTT:1 + chr3R 21899191 5' + S2 93 1 72.17 ATAAAATTTAATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTT:1 + chr2L 22255047 5' + 1360 207 1 51.37 GATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGGGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGA:1 - chr3R 15790116 5' + flea 4721 1 71.88 TAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr3L 10731749 5' - 297 6936 2 56.85 GAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chr3R 30347379 5' - P-element 2796 1 23.29 AAATTGAATATCTTTTTAGAGCAGATTGTAACGGTACCGCTTTCTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:4 - chrX 10537982 5' - I-element 5330 1 67.12 GGTGTTCGTAATACCCATGCACTTGTGCCTGGCTGTTTTAAAAACGTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGA:1 + chr2R 3593617 5' + gypsy 7028 2 57.53 ATTCAGAGGAAAAAAAAATTTTTTTTAAGTTTCTCAAAAAAACACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGACACACCTT:1 + chr2R 5941291 5' + copia 4926 2 54.08 AAAGAGAAAATGTGTATCGAAACGGAGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2L 809601 5' + jockey 10 1 77.93 CTTCGTGGTTCGATAACAGTGTTTTCTAACGGCCTTACAGAATGTGCCAAATAACAGCGCCTTTACAACTACTGGCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTG:1 - chr3L 4298894 5' + BS 4994 1 68.07 CTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3R 7420333 5' + 1360 30 1 66.44 ATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCG:1 + chr2R 15004742 5' - BS 5049 1 50.00 CTGTTGTTTATTTGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1 + chr2R 13259285 5' - mdg1 357 2 60.96 TGTACTGATAACAAAACGGAAAGAGGAACATGTTTGGAATGCATTTGCTTGCATCATACCGACTGGCTATAAAAGTGCACTAGGTTTTATGAATTTTTTTAATATCTATTTATTCATGTTTTTTTATCAATATGTAAAAAAATAAT:1 - chr3R 19068567 5' - S2 1584 2 63.01 TTGTGCTATTTTACGCAAATTGAGGACAAAAAGAAAAAAAAAGAGAAAAAAGAACGAAATTAGCGACCGAAAACGCACGGAAAACGCGGCCAAAACGCAGCGGGCGGTGGCTGCAAAGATACATAAATAAACTTAAAAAAAAAACA:1 + chrX 11522120 5' + gypsy2 425 1 65.07 TAACCCAACTTTTTTAAATTCAGAGTATGAGATTACTGAATTGGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr2R 5074614 5' + 1360 17 1 69.40 TGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAATTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 + chr3R 25433313 5' - transib2 2743 1 75.56 AATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 12249888 5' - roo 345 2 66.92 CATAGAAATATGTTAGAAATTAAAAACTTAATTCAAACCAAAGTAATTGCACAATTTAAGTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 25256432 5' + hopper 145 110 70.24 AAGGCTGCATCTCCCTCTTTCGCACTGGCGACTTACGCACCCAGCAAAGAAATTAATAATACAATTACTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAAAAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAAT:2 - chr2L 5335748 5' + Doc2-element 4740 1 73.29 AAATGAAAAAAGTATACATATATATAAAAAAAAAACAACAAAAAAAGAAAATCCAACCACTCATCCACCCACTGATAGCTGAAAGTGACAAAAAATGAAAAAAAAACAGAAAAAAAAAAATGAAA:1 + chrX 578102 5' + Doc2-element 245 1 59.20 AAGTGACGGGGAAATGCTTTTCGCCTACATGCACAAGGCGGAACCGACAACTAGCTTGCAGGCAGCGTATTTCCATCACATCTCGCTGGATCTGAAAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGT:1 - chr2R 12097905 5' - jockey 4773 1 65.75 CGTGAAACTACAAAGGCTCTATCAAAGACACTAGACACTAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCTCTCGCTCACGCTGAGAGTGCAAGAAATCTAATATAGAATTTTCTTGCTTGT:1 + chr3L 27145360 5' - 1360 3262 1 70.00 AAATTTGTCATCGTGTGCGAAAACATGCGATATGTGGCTCAAGAGTTCTGAGCCGCATTGAGGATGCCTGGAATGCTTGCTTATGGAGTTGTTGGCTGGCTTTTGGGTATTTGTATAATTATATTTAT:1 - chrX 19390048 5' - Stalker 6936 4 56.25 CTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr2L 7580887 5' + Transpac 44 2 48.63 ATAAGATCAACGTGTGAGCCTTTGCCATGCTGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr3L 1692126 5' - blood 7334 1 55.48 AGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGAAATGCACTC:1 - chr2L 15188472 5' + 297 44 2 54.93 TGATGGTTATTATACAGGGCCGCACTGTATTGACTTTTCCCGGCCTTCGGTTCGGCAATCGACTGACAGACCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGGCGACTGA:1 + chr3R 16283069 5' + Tirant 493 1 50.68 ATACGAATGAAAACCAAATTTAAGCTAAAACGTAAAGATGAAAGCCTAAGCAAGGACACTAACATGTACCTAGATATATATACTTACCATACATACATACTTACAAGAAGATAAAAGCTTAAATAAGTAATTATTATTAATAATTA:1 - chr3L 7812352 5' + gypsy9 297 4 56.85 ACGTTGAATTACCCGTCAACAAAAAAACTAATAGCTTGGGATGAAGCTATGAAGCCGTCGATGAACTTTCAGACAAAGAAAAAATTCATAATCTAGTGTATCACATAAAATAATATTTCCAGTATAAATATAAATATAAAAATAAA:1 + chr2R 952434 5' + Stalker 88 4 36.30 AGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 14366527 5' - roo 350 2 60.27 TAATAAGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 1279071 5' + roo 8714 2 53.42 AATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2L 18549850 5' + roo 56 2 72.03 ATTAATAACTTAGATATATTTATGCTAGAGAACACTAACACATTACCGGAAGTTACGCCTAAGACAAAAATTATAAATGAAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGG:3 - chr3L 13605761 5' - roo 9030 1 57.53 AAACTTCCCACGTAAAATAACGGGCACAATAACGCACAAAAGTGATAGCAGACAAATGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACGTTAAATCTATATTAT:1 - chr4 302587 5' + 1360 243 1 78.08 TTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr2R 21160646 5' - Transpac 5182 2 54.11 TGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:2 - chr3R 18093396 5' + I-element 41 1 54.79 ATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACATTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 18226776 5' - roo 391 2 62.00 AGAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTA:1 - chr3L 16033437 5' + Doc 53 1 50.00 AAACGCCCTGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATGCTGACCCT:1 - chr3R 5351495 5' + jockey 4708 1 55.47 AAGCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGGGTTCTAGGGTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 - chr2R 23780663 5' + Ivk 4 1 77.70 AAGTTTAATTAAAACTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 71299 5' + 412 33 2 63.01 ACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:1 - chr2R 12472104 5' + transib2 71 1 69.06 GGTGGACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3R 15054337 5' - copia 221 1 58.90 ATTTCGCGAAATTTCATAATACGATATGATATGAGAATTAGAATCAGAATGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTT:1 + chr2L 20223251 5' - transib2 2443 1 76.71 GTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGC:1 - chr3R 16533693 5' + X-element 4432 1 50.00 ACACAGGATATTATGACCTCTGGATTGTCCATGCTGAAGTCTGCATCGATGACATCCAACTACTTCACTGCCTCTGATCGAGTTATCTTCTGTTCGTTTCCATCCTAGGTCCTTCCAGGACCCATGTCACGGTCGCCATGTCTTAT:1 + chr2R 294340 5' - gypsy11 445 1 76.03 ACTTTGTTCCCGGAATACTTGAACTCTTGCTACTTGGCCTGATAAATTACAAGCTATTTTTAATTGTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCT:1 - chr3R 20004577 5' + hopper 1238 1 54.79 TATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTAACTTTGCTTTTTTGCTTTGCTGGTGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACA:1 + chrX 5343780 5' - TAHRE 10373 2 80.82 AGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 + chrX 18817296 5' - transib2 2744 1 71.92 CTGGGTGGTGCTGGAACTATTGGTGCTGGAACTGGTGGTGGTGAGAAGATTTTGATGCGTTGAGCTAATAGGAAATGGGATCATACTCCTCGCCATCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTAATATTGTTATTG:1 + chr3L 14126135 5' - mdg1 18 2 51.37 GAATGTCTTGTCTGGAGGCCGATTGTGGGAATTGGTTTGAGTAAAAATAGTCGGAGTGGCAACTTTTGCACTCGACTCCCCTTTACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTT:1 + chr3L 25633734 5' + 1360 22 1 55.04 AATGTAAAATAAGAGCTATACCATTATGTATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 14980260 5' - roo 9059 1 76.71 AGCCTCAAGTGTTAAGCACTTGAAACCCCTCGGATTGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 6518514 5' + 412 20 2 72.60 TTTCATTGGGTTCAGCCAATTAAACCTATGGTTATCCCGACTTTTTTAATATAGTTTCAGTTATAATATATTTTTTTTATACAAGCAGAGCAAAATCATAATGAAATATATATATATATA:1 - chr3L 13316241 5' + Juan 4180 1 62.50 CGAAGATCTTCCCACGGACTGGAGGCCAAGTGAGCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chrX 21133567 5' + jockey 4859 1 76.71 ATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATGAATATTATTTAATAAAATTAAATTAAATATTATTCATAAAAAAAATTGCGTTTAATTTAACAAAGAACACTTAATTTTTACCTTTAAAGTCA:1 + chr3L 23583097 5' + S-element 1668 1 91.10 TGTTTTAAATACAAAATATTGGTTCTTGTTACTTTCTGTTTAAAAAACCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11307999 5' + TART-C 11100 1 50.00 AAATTATGGCCTGCGATTTGGCTCACTCGAAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATTCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTTTTTTGGTTAGTTTTATCAAACTACGAGAAA:1 - chr3R 4827403 5' + Tc1 1420 1 78.08 ACCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAA:1 - chr3L 13581743 5' + jockey 4816 1 55.48 AGCATGCCGGTCAAAATAGTAAGCAGAGTGTATTGAGCGTTGACCACCCCAACACACT:1 + chr3R 2988393 5' - Circe 7410 2 60.34 AAATACCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTC:1 - chr3L 3501876 5' - Bari1 1705 1 77.40 AAAAATAAAAAGGGGAACAGAACGGAGGACGAAAAATGTTGACTGTGGCATACATGGCGGATACGGAACGCCATTGAGTTCGATTCATTTTCCCTATCCTGCTACTATTTCATCATATTCTCTTCTGGCTA:1 + chr2L 14931761 5' - invader4 198 2 72.52 AATTTATTTCGTTTCTAGGTTTTCAAGTTAAAAAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3L 9809202 5' + 412 16 2 73.29 AAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr2L 15940366 5' - pogo 2084 1 73.97 TTATAAACATTCTTATACAACCAATATAACAAATAATTACATTTTATTGAATT:1 - chr3L 16483860 5' - HMS-Beagle2 7190 2 92.45 AGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATCTTAACTTATG:1 - chr2L 9636199 5' + 412 7091 2 50.00 AAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 - chr3L 14094678 5' + I-element 67 1 65.75 AGTAGGCAACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGATTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 12930698 5' + jockey 79 1 66.44 GATTCGGGTGAGCATTTGCTAGATTAAAATATGTTTTAATATTTGCTTTCGTTACGCTCCGGCAGAGCCAATCCCCCAGGAAAGACACCTCCGGATTCACCGGTTGAACCACAGACATATAACACCCACACCTCCTTCGCCACCCA:1 + chrX 3539396 5' + transib4 2416 1 52.74 TATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTC:1 - chr2L 23295902 5' + micropia 37 2 57.53 ATAGAAAATATTAACATCAGCTGGCTGTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 28146101 5' - roo 355 2 54.79 ATCAACGTGGCAACGTCGAACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chr2R 12471984 5' - transib2 2799 1 67.81 TTTAAACTTATCAAAACTACTAGAACAATTATCAGAAATGAGACATACATAACGATAAAAACTAATAATAATGGCTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGGTTTAAGAGATGGGCAAACGATGTACGCTCTGATTAGACC:1 - chr3R 14723196 5' - FB 292 1 60.27 TCCCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCGCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr3L 2544595 5' + Tirant 8143 2 60.71 AACAAAAAGTTGGGGATACGGTAGAGTATTAACATGCCCAATAGGCCAGGGTATTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCTTTTGCACAAAATTGGCATTGCAGACAGGGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAG:1 + chr2L 9633490 5' + baggins 5210 1 60.00 AGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAACATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr3L 14720922 5' + F-element 62 1 47.95 CTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACT:1 + chr3R 19450186 5' + roo 9037 1 58.22 ATCGAAATCGCGGTCATATTTTAGGAAACTTTTTTAATTTGATTATTATTTTATGTATTTATTGTGTTTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATT:1 - chr3L 21763338 5' - jockey 4843 1 60.27 AATTAGCTATTTTGACCATCGACTCGACTTATTGATAGATCGGCAGTTTGTCGATTATTAATAGTATATAATAAATAATATTAGGTATTAATTATTTGATGTTGGGTTAACTAATATATTGTGTATTGTGCTAGAAGACGATTTTC:2 - chrX 22442864 5' - 1360 3199 1 79.45 AACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGACTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTT:1 + chr3L 6447039 5' + transib2 56 1 62.40 AACCAAATAATATTGGGTAAATTATTAAATATTCTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTATAGTAGAGTTATAGTGAGGGAAGATACACTAC:1 - chr2L 17006273 5' - Stalker2 2 2 71.21 AGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2R 8735552 5' - mdg1 382 2 57.24 ATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr2R 9967155 5' - Bari1 1669 1 59.59 ACGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 - chr3R 11040166 5' + Bari1 44 1 51.47 ATGTAAATTTCGTTTCGACGGAATTTTCTTCACCATTTATCTTGTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTAACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2L 15940157 5' + pogo 7 1 77.40 AATTCCCAGAAACTTCTAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr2R 18529626 5' + P-element 64 1 19.85 AAATGCTGCCCGAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 19054195 5' + jockey 15 1 78.62 TATTGCGTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 - 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chr2L 13844252 5' + Stalker2 7279 2 51.38 AATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTATTTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 - chr3L 13739670 5' + BS 5043 1 49.32 CTTTGCTGTTTATCTGTTTTTCTGCTGCAACTGCGCTGCTTTTCCCTACGCAGTGCACGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAG:1 - chrX 13994951 5' - accord 6960 2 60.00 TACTAGCTTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGCAGAAGGAAGCGTTTTCGACTATATATAGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr2L 22211546 5' - pogo 2081 1 60.58 ATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chr2R 13168668 5' - P-element 2806 1 30.82 AATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 26774077 5' + hobo 37 1 70.93 ATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTAC:1 - 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gypsy7 5002 1 77.40 CGCCACTTCCTCATCCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 + chr3L 6446994 5' + transib2 23 1 67.15 ATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr2R 14653156 5' + 297 49 2 58.22 TGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGT:1 - chr2R 9967113 5' - Bari1 1627 1 71.92 ATATGATTGATTGCCTGATGGTTATATGGATTTCTTGTTTTTAGATCTGATACTAACTGCTGCGCATTGCGTAACGTCCAACTCAAAACTGTAAGTAACTGCTCAAATCGATGAAAAAATCTTAAATGAATAAATGTTTATATTTT:1 + chr2L 14768917 5' + Tc1 60 1 41.78 TACCTCTCTTAATTCCCAGTTACTCTTTGTAACCGCCTATTATAGGTAGTTCATTCAATTCTTTTTTCAAACAAGACCTTTCTTTCTTTTCGCCTTATTATTATTATTATTTTT:1 - chr3L 1593225 5' - invader6 4388 1 65.79 GGTATTGGATCGGTTGGAAAGTTCATTTTTTTAACGTGTTGTTCCTTTTTTTTCTGCAGTTCACCTGTCGGATAGCATAATGTGCACAATGTACATGGGTATTTTTCAATGTATCTCTTTCTGGCACACACACACACACACATA:1 + chrX 6188485 5' + accord 7028 2 77.78 ATCTTTAATTACATTTCGTACTTACACATTGATGTGTGTGTGTAATTGTTTACGATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTATAGAATGGATATGTTAATATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAA:1 - 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INE-1 532 1 52.05 ACTTTGTTGGGACTTTATAGACTTTATGATACAACGGGGGTTCGTTTAAGGGTTTAATAGTCAAGAGTCCAGACGTGGAGCAGTCACAGGTTAGTGAAGATCGGGCGGAAAAGTGATATGTTAGTTGACGCGAAGGTTCTAACTGT:1 + chr3R 19242429 5' + Gypsy12A_LTR 477 1 49.32 GATGGGGCAGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGCTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2R 14051699 5' - roo 399 1 71.92 CAGCCCAATTTCCGACATTTATCCGACCTCAATTTCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 23180296 5' - roo 9016 2 55.48 AAGACAAATAAAATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 + chr3L 10373776 5' - 297 380 2 76.22 ATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAGGCTCTCTCG:1 - chr2L 15076192 5' + 1360 74 1 66.44 TATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGATATAATTATTAAATTGACACAAAATATAGACAAGCCCCACAGTGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCGATGACTCGGTTGCTCATATACCAGGGGAGCCCAG:1 + chr3L 25245595 5' - G5A 2519 1 51.94 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3L 3983880 5' - P-element 2828 1 37.80 TATAATTGCGCTGTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATGTAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr2L 9782071 5' + P-element 64 1 40.41 GTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGAT:1 + chr3L 4219447 5' + jockey 22 1 62.07 TATAACATCTTGTTATGTGGGTAGCTATTTTCGATTGGTTTGGGCTTGTGTTCGGATTCGGTTTCGGAATTGGGTTTGTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTA:1 - chr2R 16059423 5' - I-element 5155 1 56.16 GAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTT:1 + chrX 3431841 5' + Ivk 5336 1 58.16 CTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 3030211 5' - 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chr3L 16033403 5' + Doc 89 1 78.08 TAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr3L 3501819 5' - Bari1 1648 1 59.31 TAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 - chrX 8200293 5' - flea 4948 1 63.70 GGGTATGTTCTTAAATAATTTAGGCTATTAGTTTTTATATCGATTTTTGTTCTTTATTAAGCTAAATCACGTGATTTCTTTTTTCTTTTTTAATAATATATTTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATCATTCATAACCG:1 + chr2L 15085007 5' + hopper 204 1 67.81 AAAAACGCAAATAGATTTTGAAGCCCACCCCCCCTATAATCCTCTATGTGCATAAAAAATTAACCACGGCCATACGTACGCAACAACAAGAATAAAAAACAAAAAATAAAA:1 - chr2L 1674914 5' + Osvaldo 1522 1 54.95 CTTTAAATAAGTGAGCCATATGCATTTATATTGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAA:2 - chr2L 13065684 5' + 297 6894 2 78.08 AAAGTCAATTTGAGATCACACCTAAACTGCGATAGACATTTATGGGAAAGAAAATATGCTAATAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAGTTAGAATTAAACATAAATATAAATTTGTAAACGATAGCTA:1 - 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chr3R 11062815 5' - roo 8993 2 69.18 GCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr2L 71161 5' - 412 7506 2 53.73 TATTGAAGCCATTAAAGAAATATTAAATCACCCTCAAAAGCCTGAAGTTATTGCAGATTTAACGGATATCTCCGTATTCAAAATTGTACTACGTAAAGAAAAAGAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 + chr3L 27865955 5' + Max-element 15 2 66.67 AAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr2L 15936762 5' - copia 232 1 55.17 TTGATACTTTCAGCGGATCCCAAATAATCTTTGGAACTTCACTAACCTCTTCCATCACTTTGAAGGGGTAAGCTTTGTTAATTGTTTGTGTAGTT:1 - chr3R 19449664 5' - Porto1 301 1 53.68 ACAACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACA:3 - chr3R 22590620 5' + rover 21 2 70.55 ACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr2R 21160667 5' - 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mdg1 362 2 60.27 CCTGCCCAAGTGACTGCAAATAATTTCCCACCATGCCATGCCACAACGCACCGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3R 24733517 5' + hobo 61 1 62.86 TGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGGCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTA:1 - chr3R 28556521 5' + micropia 5002 4 54.11 CCTCAATACCATTACCAGAATTCAATCAAATAAACATATTTTTGATTCGTACTCATTTATGTTAATTCAGTTTTAAATAGCCCATTTTTATACCTGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 + chr4 1125291 5' + INE-1 16 1 54.79 CACAAAATCCGATTGCACCGGTTGGGGCAGATAATCGGATTTGTAGGAAAATTCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATGGTTCACACATTAACACGAATATATT:1 - chr2R 14051907 5' + roo 5 2 78.08 GCAAAGTATGATGGACATGTGAACCTGTTTATCTGCAGGTTGAAAGCCCCTCACGAGCTTCTTCTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTTTATACATGATTTT:1 - chr2L 12593339 5' - Quasimodo 115 2 50.76 ATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2R 22034611 5' - copia 233 1 69.86 CTGCAGGCTTATTCTCTGGTTCCTTGATTATTTCGATTTTTATATCCGTTACCGAAGTTTAAATTGGTCTACTAGATTAGATAGATAGACTAGATAAAAGGGTATACTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGGGAGAAGGAAGCA:1 - chr2R 12626769 5' + INE-1 30 1 41.78 ACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGCATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr3L 4219470 5' + jockey 75 1 62.07 CCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 - chr3L 13581742 5' + jockey 4817 1 56.16 TATTAANGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 13406400 5' - pogo 2100 1 76.77 ATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTA:1 - chrX 17343449 5' - I-element 5268 1 80.14 ATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTGAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 7666616 5' + I-element 44 1 54.11 AAATTAGTATTAAGTGAAATGTAATGATGACAACGCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATGGAAACCAATCTGGAC:1 + chr3R 5970779 5' + F-element 4248 1 74.66 TAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACGTACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr3L 15103918 5' + Transpac 49 2 52.74 AATCAATGTTGATAATTAATTAATTAATAGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr3R 30059507 5' + FB 43 1 56.16 AGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chrX 2214232 5' + jockey 4801 1 56.85 CTGTTAAGTTCATATTTTCAAATTTGTTGGTACTGATTTTGGAGATGGTGTTGTTGTTGTTGTGGTGCAGTTGGTTCATTGTGAATAATAGTTTACAGATGACAGAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATG:1 + chr2R 6932698 5' - I-element 5153 1 77.40 GAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATATTTAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 14366513 5' - roo 9051 2 64.23 CAATGTATTCTATTTAATGCCTACACGAACAATGCTTGTTTAAGTCCTGTCTGTGCTGCTCTGCGCGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 9403770 5' - accord 7032 2 64.04 AGTGAACAAGAAACGATTCATGCTTAAAATGTAATTTTTTTTTATAATAATAATAAGAACTATAATGAACTATAATAATGATTAAGAACTCTAATTACTAACACGCGGAGCCCTTAATATGTATATATAAATATACATATATACAT:1 + chr2R 18858168 5' + Stalker4 91 4 30.14 GTGGGAGCGAGGTGGAGCGAGGGGATGGCGGGATGAAAGCCAACAGACCAACAAAATCGAACCTTTTGTAAATTGGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGT:1 - chr2L 14075382 5' - Quasimodo 33 2 48.80 AATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 + chr2L 13556342 5' - transib2 2760 1 62.33 AGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAG:1 + chr3R 9038944 5' + Juan 4087 1 69.86 AGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGCCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAT:1 - chr2R 20349074 5' - transib2 2781 1 54.11 TAGATACTTAATATATTCGAAGAATCATATCTATATTTATGTATTAACGG:1 - chr2R 18258894 5' - diver2 441 1 94.00 AGAAGAAGTAGAGGCAAGGCCGAAGGTTGGTAAAAAGAAAAGTATTTATTTATAAACGGGATGAGTGCACTAATTAATGCATGCAAATTAACGCGATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTT:1 + chr2R 1320370 5' - diver2 354 2 71.23 GGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 - chr2L 17180156 5' + Juan 51 1 49.32 ATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATAT:1 + chr3R 21923951 5' + G3 4505 1 82.58 AGCAACACTAAAGGAAAACTCTTTAGAAATACAGTTTTTCGCATTTTTTTTTTACTCTAGTCCGAGGGGCAGCATT:1 + chr3R 24662948 5' - jockey 4718 1 65.79 ATATTGAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGC:1 + chr2L 22966886 5' + 1360 3194 1 50.72 AAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAACAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr3L 21996246 5' - Transpac 238 2 67.13 ACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3R 10931610 5' + 297 38 2 50.68 AGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCCAGGAACTGCAGCTGTGGCCAATGCCGACCCTCGGACAAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGA:1 + chr2R 24427572 5' + jockey 4738 1 55.32 AAAAGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAG:1 - chr3R 27765170 5' + mdg1 7116 2 71.03 CAGTTCAAGTACCATACCCATTCCCAATCCCATTCATCATTCCAATCCAACGCAACCGATCTTCAGCCCAAGCAAAAGCAAAAGCAAAAAAAAAA:1 - chrX 7517178 5' + Doc2-element 218 2 65.26 GTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chr2L 21582262 5' + INE-1 92 1 78.08 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3L 3983880 5' - P-element 2846 1 42.20 ATCGATATGACAAAAATTTGTTGAAATTTCTCTTTCGAGTCACCTCAAGTGGTGCTGGGCGTGGAAACATTGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATTTGTTTGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCC:1 - chr2L 21295815 5' - INE-1 157 1 58.22 AAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGG:1 - chr3R 11040161 5' + Bari1 59 1 56.85 CACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATTTTGTTCAA:1 - chr2R 2875213 5' - TLD2_LTR 77 1 51.37 GGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTATC:1 - chr3R 30675456 5' + 297 55 2 58.90 ACACATGATTAGCAAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3L 18505791 5' + I-element 12 1 77.40 ATTTTAAAATTTTTTCATTAAATGAAGAGAAGATTAATTACACAAGTGCATAATATCTATTGTGAAAACATAAAAAATACAAAAAAATTGTAAGTTGCATGCGGATAGGAAATATTTTCAAAGGAAATAAACTTTAAATATTTATT:2 - chr2L 17456646 5' - hopper 174 1 73.29 GCTAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGTCACACATA:1 - chr2R 12645487 5' + X-element 91 1 67.12 AAGGGGAGCAGTGAAATGGAATTACAAATTAATAAGTTCGTGGAGTACTGAAAAAAAAAATTTAAAGGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 5084504 5' + TART-C 11096 1 79.49 GCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr3R 29612010 5' + jockey 71 1 58.90 ATATAGTAAATATATACATAAATAAATATATATATAGTAGCATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATACT:1 - chr3R 26264798 5' - Quasimodo 4 2 66.67 GTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr2L 14671828 5' + FB 63 1 64.29 ACACCANATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 2544608 5' + Tirant 8147 2 54.20 CTATAAACTGTGTGCCAAAAAAAGCTATTCGAACGAATGTTTCCGTATACATTTACCTTTTTCGCTAATTTCCCTAAGGCTTTCCCCTGCATAACTAAAACCTCCACCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:1 - chr2L 2659219 5' + roo 9048 2 68.49 CTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr2R 14051847 5' + roo 65 2 70.55 AATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATAT:1 - chr2R 20010664 5' + Juan 4177 1 67.81 ATGCATTTCCATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:2 + chr3L 21996122 5' + Transpac 25 2 73.29 AGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:2 + chr2L 18347285 5' + transib2 61 1 60.96 CAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACAC:1 - chr2L 11257087 5' + rover 86 2 78.77 AATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr3L 10731750 5' - 297 355 2 56.55 GTTTGTTTTTAGGTTTTTTGGTTTTAGCGTCAACTCGCTGTTGGCGCTCATTAAGTTGGAAGTTTATGGGAGCAGCAAGGGGTCCTGATCTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCG:1 - chr3L 18118348 5' - TAHRE 10403 1 53.62 TAGTTTATATTAGTTCAGTTAGTTTCAAGTTAGTTTTGCTTTACAGCGGATATGATATGATTATACTCTTTACTTGTATATTAATAATATTATGGGTATGGGTATTTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACG:1 - chr3R 10066640 5' - F-element 281 1 73.97 CATGGAAATTATTTAGTTGCAACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 - chr2R 330254 5' + HMS-Beagle2 6906 2 68.49 ATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 7889654 5' - roo 342 2 63.01 GTAAACAAATAGCACAGCCAAATATTATGTTGAATAATTTATTATGATATTATTAATTGCATTTGCAAAAAAACACATTAGATACCCGTTACTCAGCTAATATGCGAACGCGAAATTTTTTTATTTTTCTGGGATAACGATAGATA:1 + chr2R 6254425 5' - INE-1 499 1 58.90 ATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:2 + chr3L 10731751 5' - 297 353 2 55.48 AATCGAAATCGAAAACATTATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 2425659 5' - 1360 3359 1 60.33 AGTTGGTAAAGTTGCAGATGACTGCATAAAAGTGGATGGTTTAAAGAAGCACAAAAATGGATTGGCCAAGCTAGGCATGTAGAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTGTGCAGCC:1 - chr2R 4324250 5' - 1360 3350 1 45.21 CAAGAAAATATTGAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAAT:1 + chr2L 22966879 5' + 1360 3183 1 52.99 GGAATTGTTGCTCAAAAAAGAATACTAATTTTACACACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:2 - chrX 14771860 5' - BS 5081 1 73.29 ATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:2 + chr3L 15103802 5' - Transpac 251 2 58.22 TTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGAGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGCAGACTCAAGC:1 - chrX 18409467 5' + jockey 4736 1 57.53 ACCAAAGATACCAATCAGTTCCGTATGTTTCAAATCAGTTTCTTCTATTGCTTTAAAATTAAAAGGCTTAAACTTTTATCATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 8627136 5' + pogo 13 1 28.08 TAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 11191392 5' - roo 351 2 61.27 TATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGA:1 - chr2L 15076177 5' + 1360 89 1 76.71 ATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACT:1 - chr2R 8157251 5' + mdg1 84 2 76.03 ATTTATTTAAAACATATAAGTAAAATTAAAAACATTGCACTATGAGGTGGCAGGTGTATGTCAACAGTGATAGCGAGTAAGGTATGAAGCACAAAAATACAGCACTTACACATGGGGAATATATAAATATAAATACAT:1 - 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chr2R 21020034 5' + transib2 2633 1 80.00 AAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr2L 15936765 5' - copia 236 1 55.07 AGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1 + chr2L 13556322 5' - transib2 2780 1 55.48 AAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3R 13973086 5' - 412 7524 2 68.53 GCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 - chr2R 23780661 5' + Ivk 13 1 75.34 TTAACTTATTAACTTGTCACGATTCCTAATATTAAAGTTTAACCTTTTTTATTTTTATTGAAATGAATTTTTTGCAGCGTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCG:1 + chr2R 7940907 5' - F-element 479 1 56.85 TTTGTTCGGTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGGTT:1 + chr3R 8890015 5' + FB 40 1 49.23 ATTTAATAAACCGCCTAAATTATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAA:1 - chr2R 2875253 5' - TLD2_LTR 119 1 75.34 ACATAGTATCTGTATCTTTGAGCCGTATGGGAGAGTGGACGCACAGTCAACGAACGGCCGCAGGTCCTTTTTTGTAT:1 + chrX 18290734 5' - hobo 2730 1 67.53 AATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGTGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 11191490 5' + roo 8686 2 57.69 GCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGC:1 - chr3L 3983858 5' - P-element 2787 1 17.81 AATGACATGATTTTGCCAAATCACCTAACAAACTCCTTTATGAAGAACATAAAATAATAAAAAAAAAAATTAAAA:1 - chr2L 21124960 5' + Rt1b 5150 3 80.00 ATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACG:1 - chr3R 905053 5' - rover 309 2 58.22 AAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 20266011 5' + roo 8753 2 80.82 CATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 11164534 5' + roo 8694 2 64.58 ATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 - chr2L 17180141 5' + Juan 66 1 59.59 GGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCT:2 + chr3R 2522301 5' + Tc1-2 130 1 65.75 TATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATGGAGGTAGTAAATTAATTGTGTGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 20265932 5' - roo 9022 2 56.03 GCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chrX 6475286 5' + Doc 55 1 51.37 ATGTACAGAAATTCCAGTTTATGATTTCCCAAAATAAAAACATAAAAATTCTAAATAGTTAAGTTCTTGTCATTTTTTCAGAAATTAAAAACAACTTGTAACCAAATCGTTTAAAATAAAAGAATATTATTATGATTAATAATATA:1 + chr3L 13324989 5' - mdg1 7102 2 61.64 ATATTTATAGTATACCCAATACTTTCGTGCACTCGTAAATCGCACACAGTTAATATTATCACTGGGCCATATCGCGCGGGTCACTTTCCAGGAATTCATACACTTTTATACATATTTGTTTTTTTTTTTACTTTTTCT:1 - chrX 18130327 5' - Doc2-element 221 1 78.26 GTTTTTTAATTTGCCGAAACAAAAATTATAATGAAGAAAAAAAATATCAATAATTAATCTGTTGACTAGATGTGAAAAAAGAAAAGAAGCGGACCTTCCCAGTGCAAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCT:1 - chr3L 26325014 5' - Porto1 4548 1 73.29 CGATGTTAACACCTGGTGGGTCAGACAGTGGGTGCAATTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGAAGAATTGAATAGGGGTACTATCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGACGGCGCCACTTACGTATTTTACTA:1 - chrX 12531558 5' - rover 351 1 70.00 AAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 3983932 5' + P-element 6 2 79.37 TATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGG:1 + chr3R 9557513 5' + G2 3026 1 50.68 CAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3L 27391419 5' - 1360 3362 1 62.33 ATTTAGGGAGGTGCTATTTTCCTGAAGGCGATGAAGGATGCGACGGCGTCTGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGG:1 + chrX 7281336 5' - ZAM 7993 2 70.55 AATGAGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCAC:1 - chr2R 2318282 5' + ZAM 9 2 78.10 CAGAAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 15790794 5' + roo 8 2 69.72 GTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3L 22400347 5' - 1360 3329 1 63.91 ATCAATCACTTGTTTAATTCGCGTGCTAAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGCCGACAGTCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATAC:1 + chr3R 1428774 5' + G5 4589 1 70.53 TCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 + chr2R 14051722 5' - roo 9039 1 57.53 TCCTTTTATTTCCCAGATCTATTAATTTTAATGAGTAATAAGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 1279036 5' + roo 8679 2 62.33 ACATAAATAAACTTAGGAAATGTATGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTC:1 - chr2L 5707733 5' - Q-element 253 2 60.00 GAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGATTATGTTTATGTTTATGCTCGCAGTTA:1 + chr3R 8075925 5' + 412 85 2 75.91 AATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 - chr3L 1117397 5' - 297 6940 2 60.71 AAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 2989898 5' - roo 9048 2 68.49 AGCGCCGGACTATCCGGAGGCCTCTTTTTTTAATGCGGGGGGACAACAAGCAATAGAAACAACAATAACAGCAACAACAACAATAATAATAATAATAATAGTAAT:1 + chr3R 13996022 5' + mdg1 39 10 51.43 AAATCGTTTCCGAGATGTTTTCAAACGAAATATGATCGAAAGCAGCTGATAAACAGCGGGAAAACAGCAGTAAATAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATAT:1 - chr2L 17260493 5' + hopper 335 1 49.32 AAGATTTGAAAAAAAAAAACACCCAGAAACCCGAAACCAACCCAACCTTTTTGTTTTGTGTAACTGGCTTGAAATAATTTTATTTGTTTTTTTATTTTTCTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 16483026 5' + hopper 143 10 63.48 GGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr3R 8076003 5' - 412 7502 2 47.26 AATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:2 - chr2L 5582214 5' + pogo 53 1 56.85 TCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGAACATATCTTATGCAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 7795527 5' + roo 75 2 69.66 ANTTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 - chr3L 20711734 5' + jockey 4779 1 67.14 GTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1 + chr2R 5941346 5' - copia 179 2 70.55 TCCACCATGGCAGCGGCGAACTGATCCTCGACTCGATCAAAGTTGTCCTCATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTGTTGGCATAAGGTCTAAATTTTTTTGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:1 - chr2R 12472123 5' + transib2 53 1 51.43 AATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGT:2 + chr3L 15913860 5' + jockey 4832 1 68.49 TAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAA:1 + chr3R 846553 5' + 17.6 154 2 68.84 TCATGGAGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - chr3R 4860538 5' + Transpac 56 2 56.85 TTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTGATGTAAATGAATC:1 - chrX 18396189 5' + roo 53 2 54.79 AAGTACACTGGGCGAAATTTGTGGGGGGAAGTATACAGTTTGTACATAGTACTATATAGCTTAATTGAAGGTTAAATCAATTGAATTCTTTCACAAGCATATTTGCTAAATTCTTTCTAACAATTAGATATAATTAACAAATATTT:2 + chr3R 18029193 5' + Juan 4106 1 43.15 TTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3L 8959687 5' + 1360 55 1 62.96 AGTTAGTGGCGTGCTGCCGGCGCGAATTGTTTTCACTCTCTACGAGGGGTATAGTTCTATAGGCTTATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chrX 20934854 5' - 412 403 2 58.72 ACTCCATTGCTCTCATTTCGGTTGCCAAAAAAGAAAATCTTACCAAAAAATTATTTACATTAATAAAAAAGAATTTTTTAGTTTATACAATCTTTAGTATTAATTTTTGTAATATAATAGCTGCAATAATAATAATAATATAAA:1 - chrX 9824625 5' + mdg1 7073 2 77.78 AGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chr2R 10417149 5' - 1360 3326 1 68.18 GATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2L 12818225 5' - hobo 2893 1 51.43 GAAACACACAACAACACACACAAACACACAGATTATGTAAGTGAGCTGGGAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTCCAGTTTATCTACATGCAAAAAACAACACCATACAGCCCTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACA:1 + chrX 8904556 5' - Cr1a 214 1 71.23 ACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3L 23287252 5' + 1360 81 1 79.26 TATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 + chr3R 16341943 5' - P-element 2820 1 39.73 ACTTCCTCATCCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr3L 6446998 5' + transib2 24 1 66.42 TCCATGTCGGTTTGTATGTATGTGTATTTGGCGTATGCGGTGGCATGAATTGCTGGCCATCTTGGTGGCTATTTCTAGGCCCAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2L 10942025 5' - mdg3 5419 2 55.48 TGTAAATAAAAACAAAACCCGAAAGGAAGCTAGCTTCGAATAGCTTTTTATTGTATATATGTATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chr2R 5957161 5' + Burdock 10 2 69.00 ATCCCTACCAATTTGGAACCACATGTTTTAATTCTTTTTTAAAATGGAACAAAAAAAAACTTAAGTGCATCCTGAGAAAGGAGAATCCAATTGCAGATAGGGACATCTATGGAAAACAAGAGAGAATGCGATAGTCGAGTTCCCCG:1 + chr2R 7925342 5' - INE-1 570 1 76.03 AATGTTTTTATTTTCACCGACACTGCATCCGGACCAAGACACATCGGAACTCCGACATATGCATATTTAAGTGCAGTTGCATTCTCCATACGCCTTGTCTTAGAAACGTTTCCAGGCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAG:1 - chr3L 22965445 5' - GATE 63 2 78.08 TAATAATAATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAACTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1 + chr3R 556395 5' - Juan 4134 1 71.23 ATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chrX 19588127 5' - roo 334 2 65.75 CTCCTATTTCACATATGCCGCCGACGAGGAGGTCAAACAGGCGAAGCTTCGACAGGCCGCCTTTTGTCAGGTGTACGAGGATTTTACAGGTATTTCAAGATTCCCAGATAAATGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTATTT:1 - chr3L 7909228 5' + diver 94 2 79.14 GGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2L 16540942 5' + hobo 63 1 72.39 ATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTG:2 + chr2L 23069853 5' + Stalker 174 7 76.03 TATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATA:1 + chr2L 12341800 5' - BS 5055 1 56.85 AAGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3R 7719801 5' + roo 8745 2 77.40 GGTTGGGTAATTTTGGGGCCGAAAAAGGACGAGTTCTATATCGGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGCTTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGGAACTGATGAGATATTTA:1 + chr2R 14139921 5' - F-element 4401 1 64.38 ACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGC:1 + chrX 5323243 5' + Juan 4117 1 64.83 AGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACGTTTATTG:1 + chr3R 6419806 5' - Tabor 460 2 66.44 GGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCG:1 - chr2R 23780612 5' + Ivk 62 1 57.53 AAGACAGGAACAAATCGCACACGAGGGCCAAAACGGACACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:2 + chrX 13670353 5' + 297 6628 2 53.42 TATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGGGACCTATATGGCTTTATTGCTGCAATGTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTCCATTCGG:1 - chrX 20999557 5' + BS 90 1 73.10 TGGCCTCAAAGTGGGTGTTCGTAATACCCATGCACTTGTGCCTGGCTGTTTTAAAAACGTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTT:1 + chr2R 3593604 5' + gypsy 7012 2 67.83 TCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr2L 11357904 5' - blood 7309 2 72.60 TGTATGCCTCTGAATTCTCCATCGTTCCTCATAGCAACACTGTCTCAAGGTGTTATTACCATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGATTTAAAATTCA:2 + chr3L 4220286 5' + jockey 4799 1 56.16 ATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 15882587 5' + jockey 59 1 56.06 GTCGTATTCGCACTCCCTACCGCATTTGTATTCGTATTCGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGGGAATATGT:1 - chrX 18217169 5' - accord 199 2 64.66 TATTTAACTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGTTTTAACTTTCCTGGTGGAGGGACAGAGAAAGAATAAATTCTGTTCGGCTTCTACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGTAATATATAGGTACAATTAT:1 + chrX 23028822 5' - HeT-A 5977 2 77.54 TCAGGTTATTTAAAAAGTTGTATTTTTCTGGATGAGATATTAATTTATATAACTTATAAGTATTAATGATATACACTTTTAAAGTAAAGATATTTGGTTGATTTAAATTTGAAATGTATCATTTATCAATATTCTATTATAAAATA:1 - chr3R 15058404 5' - transib2 74 1 42.47 GCCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGCAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chrX 18409488 5' + jockey 4694 1 67.20 TAAGCCGCTGTGAGGAGTAGAAGTCCAGGTCGATACGATGAACAACCTTATCAAGGGCTCCTTGGCAACATACTGCTGCCTGTGCCTGCTACTGATACTGATTGACCCAGTTAAGAAGACTCTAACAAGAGATGGGATGGTGCGAC:1 + chr2R 22127818 5' - frogger 477 1 72.60 AGCTCTAAGGCAGATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATTAATA:3 + chr2L 22107370 5' + Transib-N1_DM 21 1 58.90 ATTTCATGTTTCAAATTAGTTAGCTACAACAGCAGTCTCACAGTCTCTTAATGCATGATACTTGCTAATGCTTTTTCGTCCTTCGCGTCGAACAAAGCTCAGCACTATCACTTTCG:1 - chr3L 23889077 5' - Dm88 445 1 72.41 ATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 14980401 5' + roo 8733 2 65.07 TCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 15790870 5' + roo 40 2 68.37 ACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCTCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTACACTGTTATGATAT:1 - chr2L 2527696 5' - hopper 1324 1 76.03 GTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3342 1 60.00 ATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGATTGGTGTAGAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 13294990 5' - roo 9041 1 56.91 GTTCATATTAGATGTATACCACTTTTTTAATATATTATTACTTCAGCCGAGGCCATGTATCCCCGGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 - chr3L 21763065 5' + jockey 4764 1 57.02 CAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATATGCTAG:1 - chrX 13383543 5' + mdg1 7280 2 68.28 AGAATTGAACAACTTTTTCCAGCTACAAGTTAATTGCATGTTGTTTGAATATATTTTTCGAATTAAAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTATGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAATGAGCG:1 + chr3L 16003458 5' - Cr1a 304 1 54.79 ATTACTTTTGAGGCAGAACCAAATGTACCAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCC:1 + chr2L 15621113 5' - Juan 4206 1 57.53 AAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGGC:1 - chr2L 6647736 5' + mdg3 5307 2 51.39 AAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chr3R 27083010 5' - jockey 4961 1 59.59 AACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTTCGCTGT:1 + chr3L 11913167 5' + BS 5033 1 58.90 ACACGCGAGGAAGTCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAA:1 - chr3R 14164212 5' + F-element 4317 1 70.21 CATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 19073261 5' - roo 324 2 74.66 ATGTTTTATTTTAGCTTTTGTGCCACGTTTGCTCTTATTAGCATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:2 + chrX 17343335 5' + I-element 11 1 76.71 AAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTC:2 + chr3R 7420220 5' - 1360 3311 1 71.23 TAAAGAAAAATAGTCTCCCAGTTTTAAAACTATTTTCATGAAAATTTCTTTCTTTTTTTGCACGACGGAACTGATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 5151372 5' + roo 8676 2 74.66 AGATGTATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chr3L 19454883 5' + mdg1 19 2 71.23 ATTATGGAGCAGCTTTATTGTTGTTGCTCATAGCGCTTAGCCAGACAGTTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTC:1 - chr3R 13612622 5' + F-element 201 1 56.55 ACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chrX 21224567 5' + roo 8754 2 80.82 ATTGAAACAAACCGGCTACCGAGGTTCACGGCCCCTTTATGCAAATGTTGACAGTCCTTTTAACCACACTGCCACCGCTTCTCTTCCCGAATCCCCTTCGAAAACATACACAGACACCTGAAAATCAAATTAGAAATCGAAGTAA:1 - chr3R 19495190 5' + Doc 4430 1 72.41 AATTTCCAAAATTTTTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 1838562 5' - roo 9000 2 63.70 TATGTTATTCAAGTTACCTCTTATGTTAGCTTAAATGTTAATGCAACATGCTTTGCTTTTGCCTTGCATCGCCACAATAGCGAAACATATAATAATAAAAAAAAGTAAA:1 - chr2R 7376433 5' + Rt1a 5072 1 72.48 CAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:2 - chr3R 19073266 5' - roo 329 2 72.60 GCTGCTTAGTGGTTCCCAGCAGTCGGTATTCCTGAAGGGCACTGTAAATATATTTGGCGTCCTATCACTATGGTTATACCCGTTCCTCGTAGACTAAAAAGGGCATACTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAAGC:1 - chr2L 21998243 5' + INE-1 29 1 52.05 GTAATAAATATGGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGAATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGTTCTGTTTGAATCTG:1 - chr2L 4754961 5' - Stalker 349 4 55.00 GATGGTGCCCCTTTGCGCTTTTATTGTTTAATTAGCTTGAAATGCGTTTATTTTCATTCGTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:3 - chr3R 12949178 5' + Juan 9 1 80.14 GTTCAGAGAATTAGCTACCATAATAAATAGCCAACAAAATAATAAAGTTGTTAATAACCGTGAACAAACCGTGCAAATTGTTAATGCTGTCAAGAAAGTGGCGAACGGATTAGCCTAATCTTCGCGATGGTAACCTTTTCTTGCTG:1 + chr3L 3756366 5' + Ivk 449 1 76.71 AAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 + chr3R 11937307 5' + flea 4786 2 55.96 TCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGT:1 - chr3R 9039012 5' - Juan 4148 1 65.75 CAGATGGTTAAAGACGATGGTTAAAGACAATCGAACGCGATTGGTCATCGAAATTGTTTTCCAATGTGGGTTTTCAAGAACCAATCAACTTTTTAACAATTTAAAAACTATGGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATA:1 - chr2L 10032513 5' + roo 341 2 73.97 TGGTCGCGGTAGTTTTGGTTGTAACGGATATACAAATATTTTGAAATTTTGTTATTTTTGTATTGAATGTTTTGAGCTTCTTGCACCGTGGTCTGATTTTACACAATTATTTATTACAAATAATAAATGTTGTCTGTTTTTATAA:1 - chr2R 3936877 5' + Cr1a 445 1 57.93 CATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTGACCACCCCACCCCCTA:1 + chr3L 17055415 5' + Tirant 8108 2 78.00 TTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:2 - chr2L 4123966 5' - transib2 2777 1 50.68 AATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 + chr3L 15103820 5' - Transpac 234 2 70.34 ACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACATAACCACATAGGAACAG:1 + chr2L 18212108 5' + Quasimodo 53 2 57.53 CAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTA:1 + chr3R 4679441 5' - hopper2 1556 1 51.37 GGACTAGCAAATGCGGTAAGATATTCTCAGTTCAGTTTTCTTCTGAATATAGATAATTATTATTATTATTATGGCTTGTAAAATCCCAAATGATAAGACTTTACT:1 + chr3L 3030191 5' - roo 9064 1 52.38 ATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTT:1 - chr3L 25761126 5' - Porto1 4524 1 78.62 TTTTAACAATTTTTAAAAATTTTCTCATTTTATTCCCCATAATCTATCGATATGTCCAAAAACTAATAAATATCTCGCATTTCTACTAGCTGAGTATAGGGTATCCGTGTAGTTAATTAGAATTCTCATACT:1 - chr3R 5053104 5' - mdg1 7456 2 75.00 AAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr3R 20441335 5' + I-element 49 1 50.68 AGAAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCA:4 + chr3L 20189559 5' - FB 245 1 47.26 GATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTT:1 - chrX 14722254 5' + diver 5900 2 70.55 CTTTATAACATCCTCAAGCGATCGCTGCCTCTTAACGGGCTGTGGTATTAAACAAACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCC:1 + chr2L 3509959 5' + G2 2979 1 60.99 AATTTGCATTAGAATTATGGAAGTTTGTCTCAAACATAAATTCTTAGTTAGTCAGCTGTTGCGAGTACATACCACGTGGCTGCATTTAGCTTAACTTTCAACGTGTTAGAAATTAAAAAGAAGATCGCAAATGAGTATAATTTG:1 - chr3L 14844756 5' - hopper2 1372 1 61.11 AACTGCGTTCTTTGATTGTACATATATTCTGTTCCAATCCTCTTAATGTATCAAGCTAACGCTTAAAAATCATTATATATAAAATCTGTCAATGTAAATCGGTCAATTTGTAAAATACACTTGTTAATTTTATTTATTTATTTATT:4 + chr2L 22732201 5' - HeT-A 33 2 58.22 AACCATTTAAAACATGCACTATCAAAAAGAAAACCACAAAAAGAAACCGCGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAACAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGAT:1 + chr2R 291712 5' - Bari1 239 1 59.09 GTATGCNACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3L 5489896 5' + jockey 81 1 64.38 ATGACACGCTAAAGACCCGCAGATCCAGCAGATCCCGCAGATCTTGCAGATCCCGAATATCCCAAATATCCCCGGGCTGCGCACGTCTGCTTTTCTAATCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTC:1 - 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chr3R 28901298 5' + transib2 84 1 74.66 GTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3L 7889563 5' + roo 66 2 69.86 GTTATACTATTTATACATGATAAAACTTGCTAATTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGTAGACTAGATTCGTTGAAAGTTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATAAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr2R 6609662 5' + INE-1 80 1 69.18 AAGTAAAACACATGATCATTGTATAACTTCTTCATTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGAT:1 + chr2R 6271541 5' + rover 7192 2 76.71 CTGTGCTTCTCCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGGCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGGATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGATGAAACATATTGAAA:1 - chr3L 5061676 5' + 17.6 6957 1 60.96 ATAATGATTCCTATGCAGTTTGGCCAACTTCTCCAACCAAACCCAACACACACACACACACAGTCTAGCATATTGTACATAATAAGTGTGTGCGGATGTGAGGCATGTGCTTGAGATTAGGGAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAAT:1 + chr2R 21575128 5' - 297 162 2 73.97 AAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 + chrX 10521627 5' + Tabor 6894 2 54.23 GAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCA:1 - chr3R 6419913 5' + Tabor 91 2 77.40 CTATATTAAGTCAAAATTAATGGTAGTGAACATTAAATGCAACTCCGTTGTTTAAATAAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3L 23320052 5' + roo 8727 2 66.44 CAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCTTGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGGCGAAA:1 + chr3L 3983818 5' + P-element 13 1 55.70 ATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:2 - chr3L 22035699 5' + F-element 31 1 65.75 TTATTTCGGCCTTAAAGGGTCCGATTGGAGTAACCATAAGGAACCTGGGGGTCCTGAATATAGCCAATTACCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAACTTGGGCATTCGATATAGCTCGTTGTCGGCCCTAGCTGCTG:1 + chr2R 1322951 5' + diver2 266 2 54.61 AAAAGATAAAGATAAAGATAAATAAAAAAATAAAGACAGACTTCACCATGCAAGGAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATGTGTTTCACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCTATAATATCATCAATTAATTTAAGGAGGC:1 - chr2R 7999139 5' - hopper2 170 1 77.40 TAATACTATATACTATAATACTATATAATACTATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATAC:2 + chrX 5323197 5' + Juan 4062 1 66.44 AGCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - 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chr3L 6457341 5' + Tc1-2 9 1 67.12 CGAGGGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGCATAAAGTCTAAAA:1 - chr2R 20349076 5' - transib2 2802 1 62.20 AGGGATCGAGTGCAGCCGCGAACGATCATGATAGCGCGCTGATCACTTCACCGATCCACTCGAGAATAGGGTGTACTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 - chr3R 28901697 5' - transib2 2813 1 52.74 TATAGGGTTTCTAATTGAAAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 9636221 5' + 412 15 2 65.52 ATATGGTGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTGTGAGTTTTAT:1 + chr2R 15326865 5' - copia 5074 2 72.41 ACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 + chr3L 11913177 5' + BS 5042 1 53.79 ACTTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 + chr3L 12315717 5' + transib2 56 1 56.16 ATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr2R 3563088 5' - Transpac 5168 2 57.93 ACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 - chr3L 16437238 5' + F-element 82 1 65.07 GCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 - chr2R 4870251 5' + Juan 80 1 67.86 AAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr3R 20441346 5' + I-element 38 1 58.22 AGTTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 7795636 5' - roo 9034 1 59.59 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCCATAAGTGCGAGGGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chr3L 3983880 5' - P-element 2809 1 32.88 GAATTTAAGACGATTTCCAAAATAGTCCTAATACAATTTTTTACCTTGCCTTGAAAGCAATTAACGAAACATCCGGTTCTATTTGGTAAAAATTTTTAAAATATTTAATTTTTAATATTTAAATTTAAATTGTAAATTGTAAAAAT:1 - chr3R 20913202 5' + TAHRE 10185 1 54.79 GTTGAAATTTGACTTTTATGAGTCGTTTACGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAG:1 - chr3R 8076033 5' - 412 7537 2 68.79 CTAATTGAAAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2L 9636211 5' + 412 26 2 58.22 AAAGCAGCCGCTGCCTGATGCACCAAGGGCAATGCACGTCTTCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCC:1 - chr3L 22758470 5' + F-element 4495 1 61.11 ATACATTTTTTGATTCAAAGACAAGAGAGAACCGACTATAAGATAACCGTTTCAATACTTTTTAGAATATCGTGAAATTGGGGAAAATAAAATATTTTATTGAAAAAAAAATTAATTTAAATTAATTTAATTTAAATTTTAAAATT:1 + chr2R 5883556 5' - 1360 3041 1 47.26 TCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTAT:1 + chr3L 15913863 5' + jockey 4835 1 70.55 GAACTGACAATTAGCTCTGTTGCCTCTTTCAATCGGAAATTCTTGATGGCGGCCCCAAACCCTCTTACCCCCATAGATGCCGCCACTAGCTGCCACAAGCGCTACTTATGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTTGT:1 + chr3R 758875 5' + INE-1 579 1 68.49 ATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAG:1 - 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pogo 2074 1 58.62 TCATGGAATGTATTTTTATTCCATTGTTATCATTTTGCGCAAGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGGAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTTCTCGTTGAG:1 - chr3L 18046749 5' - roo 394 2 75.34 AATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 18396082 5' - roo 345 2 58.22 ATTTTGCTACTTTTTTCTATATCCACAGTCCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGAGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTT:1 - chrX 7666036 5' - 17.6 106 2 74.60 AAACAATGAATCCCAGATACAAAACTTTAGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chrX 15357619 5' - hopper 1389 1 65.75 GAATGCAGTATTTGGTTTTTACTACTGTTCAGCAGTAGTAATTTTCTCGATATAATTTTTCTTAGTTTTGTATATACCATTATCATGATGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGC:1 + chr2R 8135367 5' - FB 12 1 65.25 TTCCATGTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 - chr2L 21580586 5' - INE-1 167 1 61.64 CAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTTGATGAATTTTTTTTT:1 - chr3R 23618214 5' + hopper 61 1 61.94 ACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 4964185 5' + roo 71 2 71.23 GAAGGAAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTAATTGTGTGGTCCAAACCAGCCACTGC:1 - chrX 20373706 5' + 297 14 2 74.44 ATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGG:1 - chr3R 27083141 5' + jockey 4544 1 65.22 AAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 + chr2R 15326852 5' - copia 5086 2 65.07 AATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATC:2 - chr3L 18505734 5' + I-element 69 1 65.75 GACAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGC:1 + chr2R 982348 5' - rooA 7473 2 41.10 TGGCTTGCATATCCTAAATATGCATTTTATTATTATATGTTATATAGCGTTATAAAACATATATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATATGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGGTCAACAAAAGA:1 - chr2L 15074286 5' + hopper 420 1 55.48 AAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - chr2L 14074534 5' + 297 62 2 69.92 GAAATATACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGTAGATCGTGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTTGCACACGATTTTTTGGCCTTGGCTCTAG:1 - chr3L 25411887 5' + 1360 53 1 69.23 ACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGAGGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAATTTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 + chr3L 16662411 5' - jockey 4915 1 77.10 AAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTT:1 + chr3L 27356070 5' - Tc3 1650 1 59.44 ATGTATGCAGGGCTCGTCTGGGGGCTTGCAGATTAAAGCTAAAGACACCAGCCGCGCCCCTTCCAAAGGGAGGCGTTAATGAAGTTTTCGTGTCTCGATTGCGTTTGGTTCGGTTCGGGCTTCCTTTTATATTTT:1 + chr3R 16082313 5' - HB 479 1 75.56 GAGAGTGTCAGCAGTTAGTTTTAGTCAGCGGACCAGAACTGATAGCTCGTGACACGGTTTCGTTTGTTGTCGTGTACTTGGTTAGAACTCAAATACGTACGTGCTTAATATCAACATTTTAGCTTTTATTGTTCCTGAGATCTCGA:1 - chr2L 20910991 5' - INE-1 146 1 36.30 AAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:1 - chr2R 17651800 5' + GATE 8267 2 66.67 TTTAATTGAATGCCTGTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTC:1 - chr3R 905071 5' - rover 7278 2 70.55 AAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGT:1 + chr3R 11040033 5' - Bari1 1667 1 57.53 TGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGCGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGGCAGGCCACCCTTTTATTTTTTCGTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 - chr3L 1692096 5' - blood 7304 2 69.18 GACATAATGGCATGCAATGACATATTATTGGCAGTTAAGAGACTGTTGACCTTTAGCTCTGCTGCAATCAATAATCCCCGGGACGGAATTCGTGTTAAACAATAAATATTATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAAATAT:1 - chr2L 5776850 5' + mdg1 45 2 79.45 GTAATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr3R 27082998 5' - jockey 4973 1 67.81 ATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 13300950 5' - roo 9028 1 53.72 CAATATGGTATCAAACATCAAACCAAAGTCATCTTAACAGCTACATTTTTTTAAGTGTAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGATAGCATTCTCGAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTT:1 + chrX 22518943 5' - INE-1 553 1 68.49 CAGCAAGGACACCGGAACAGGGAGCTTCTTGACTTGCTCAGTTTCAGGAAGCAGCGGCAACAACAAGGTAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTT:1 - chr2L 16102410 5' + G5 4560 1 57.93 GATCCTTCTGAGCCAGAGTGTCCTGGCTCTCACTCGCGTCCCTATACATACTATACAACACAATCCTTCCTTCTGACTACAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAA:1 + chr3R 5378446 5' + hobo 442 1 62.59 CCGATCGAAATCTTATTCAACAATGAACATACTTTTTATTAATAGTGGCGGCAGGCTCATGTCCCACAAAAATTATATAATGACATATACATAAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTATTCGTTGGGTTTTT:1 - chr2L 22193549 5' - roo 9052 2 67.88 CAGCAGAGCGAGAGAGTGAGAGGGCAAAATAGAGAAAGGAAACCCAACTTAAACTCAAAGTCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCACTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGC:1 - chrX 6421508 5' + F-element 4217 1 65.04 CTTTGGTTTTTTTTATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chrX 14336288 5' - TAHRE 10431 2 75.17 ATTTGACTAATTTTCCTAGCTATTTTCATTATGGCCACAATTTCTCGCCTGTCCTCGTTGTTCAAACTTTTCCGGCCCATTATCTCAATCAAGAAATATACAAATATAAATATATATATATATATATAAATATGTAAATATGTAAA:1 - chrX 10131969 5' + G3 4502 1 82.19 ATAGTAACCCAAGGTTTCGATGGTGGAGCGGAAGGAAGATGCAGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGCCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTCAGCGATTT:1 + chrX 18742771 5' - invader4 297 2 66.21 GGACGGATGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGTCTTAAAAATGGGTTTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCAT:1 + chr2R 13766221 5' - roo 8991 2 67.81 ATGCGCAAAACATAGGGCACCATACCGCGAAAAGGTCCGCGACTTCCGAAGCGCATCATGTGAACAGACGCTTGGAAGACTGTGCGAAATTCGCCGGGTCTGGAGTTCATCATAATGGTCCTTATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAG:1 - 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roo 8994 2 70.55 AATGCCTCACATAGTCTCTTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2R 22992465 5' - hobo 2905 1 61.00 ATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCA:1 + chrX 292397 5' - G3 4561 1 70.91 AAGCACCGTCGAATATCGGAACCATTTCCTTTCCAAGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTTATGGGTTATACATG:1 + chr2R 5238634 5' + hopper 75 1 62.14 CTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3L 11326660 5' - pogo 2050 1 56.16 TATGCTAATACAATCAATCGGTCTAATCGAATCAAACGTTTTGACAACCCAACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAA:1 + chr3R 11496982 5' - accord2 7275 1 65.07 AAAAATGCATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 2989888 5' - roo 395 1 75.34 CTTTGCAAAATGGCAGGGAAAATGTTTGACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3L 9809376 5' - 412 460 2 62.33 AGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3L 9269914 5' - copia 199 2 76.71 ATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:2 + chr2L 18347298 5' + transib2 74 1 69.86 ACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATGCATTACATCTCCATATACAAACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 10931610 5' + 297 21 2 45.74 TTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACT:2 + chrX 10319629 5' + mdg1 7122 2 76.03 AAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2L 21299330 5' - roo 9002 2 79.84 AAGGCTCCGGCCGCAACTCGGAAAATTCAACCAACCAACCAACCAACCAATCAATTAATACGAATACCTCACACATGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAGAACCCACCAA:1 - chr2L 1620006 5' + I-element 4958 1 65.38 AACTTCGCTGGTCAGAGAATAGCTGAGTAAACACTGGAAAGCGATTAACTGCAGTCCGCTTGGCACAATAATTTCCACTTACCCACTTTTCTTGTTGACTTCAACCAAACTCACTTTTTAGAAAATATTGACAATTTCGGGACTTT:1 - chr3R 31882363 5' - HB 247 1 76.03 TAAGAAATCCGCGCGTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chrX 6475252 5' + Doc 21 1 73.29 AAACCAGTTTAACGGGACTCGCACACACATAAGTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 8437768 5' + P-element 45 1 54.11 AAATGCAATATATCAGTTGAAAATCTAATATAAAATGGGATTCTTCAGTGGCATTGTTTAATTTATTTACCCGATCACATGGCTTCCGATTGTGTAAACTTGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTA:1 + chr3R 29075787 5' + Stalker2 7489 6 65.75 TGCAGAACGAGAGGGGTAAACACCTGGCGAAAGAGAGATAGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGTGTATGGGCGGCGAAAGAGAGGGGAAATCTAAAATTAAATAAAACGTTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGC:1 + chr2R 7693021 5' - accord2 7281 1 64.38 AACTGTTTTGGCAGCCACTTTCAGTAGCTCTCAAACTGCGCCAACTGCACTTTTTGTTAGCATATGTTTTTCTTCGGTCAGTTTTCAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAA:1 + chr2L 13642033 5' + F-element 4365 1 62.33 ACTGTTTGACAGCCTGCCTGATTGACCGTCCAGTCAACCGAACAGCACTGCGAACAACGTACAAAAGGGAGAGTAAACAGAACACAAGTACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACT:1 + chr2R 21940866 5' - Cr1a 163 1 69.23 ACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCACAA:1 + chr3L 4219470 5' + jockey 70 1 60.71 CATATGCAAATATCAATACTGTTGCCATTGCCATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAATATTTTTTTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTG:2 - chr2L 13585790 5' - Quasimodo 7289 2 70.55 AGTTGCCTCTAGTGCGGCACCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAAT:1 - chr3L 13581761 5' + jockey 4796 1 61.11 ATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTT:1 - chr2L 7580990 5' - Transpac 229 2 75.34 AGAAACGATTATTACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 - chr2L 9038275 5' + I-element 66 1 58.22 TTGTTTCTTTTCATATTTATGCCCCTTCGGCTCGCTCAATTTATATAAATACATATATGCATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAAT:1 - chr2L 18212224 5' - Quasimodo 7320 2 63.04 CTGTGTCCGTGTCCTGGCATTAAGCACTCACAAAATGCACAATCAAAGCTGACCGTTGGCGTTATTAACGCAAATGAAAGTGGTGCAATACCGCTACACCTGCGGCCGAAATAG:1 + chr3L 19441219 5' + Bari1 442 1 72.81 GAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGCAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTGGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCGCAGCTTG:1 + chr3R 19450036 5' + roo 8625 1 67.81 TTATGCCACATATCACGTATACGCAGTGCTTGACGCCAGCCATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACCAAAATGTGTTTTT:1 - chr2R 22989721 5' - hopper 1391 1 67.86 GTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:2 + chr3R 29084831 5' - 412 487 2 76.71 GTAGTATATGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 + chr2R 3563108 5' - Transpac 228 2 71.92 ACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:3 - chr3R 23295619 5' - P-element 2870 1 45.21 TTTTCATTCGTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:2 - chr3R 12949128 5' + Juan 39 1 45.89 ATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCAT:3 - chr3L 21769099 5' - I-element 5282 1 66.44 ATGCTTGATACTAGCATATTTGGAATATAACTAACCTTGTTCACTGAAGTTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTT:1 + chr2R 2591059 5' + roo 32 2 77.93 AGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATA:1 + chrX 5323224 5' + Juan 4099 1 52.05 TATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chrX 11661482 5' + pogo 7 1 65.00 AAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGT:3 + chr3L 24213769 5' - invader2 181 2 63.01 AAGTTTTTATTCAAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 2990045 5' + roo 8716 2 55.48 GGGAAATTTTCAAAGAATTTCTTTATAGTAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTAGTTGACATCTGTTTGAAGATTATTCTTGAAATCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGT:1 + chr3L 15840099 5' - Q-element 238 2 76.03 GACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 12133858 5' + jockey 15 1 71.30 CTGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACTCTTAAATTCAGGGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3L 3983815 5' + P-element 63 1 36.36 TTCCAAGTCCATTATTTTTACGAACTGAAAGTGTCCACAATGTGGGTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGGTTCAATAGGTT:1 - chr2L 17180328 5' - Juan 291 1 52.33 GTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:2 + chr3R 11040042 5' - Bari1 1658 1 52.05 AATTAATATTTATAAACTGAATAAAAATATGGAAACTGATTATTGCTAAAGGGATTTCTTGAGAAACGAAGTGCGGTCTTCTTAATTTTTCATACGTCGCAAATTGAATACTGCCCATTAATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTC:1 - chr2L 9650777 5' - 1360 246 1 50.68 GTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGTGACATGGGTGCAGTGCT:1 + chr2R 2591136 5' + roo 8774 2 73.97 AATATGGAATCCAATGAAAACAGAAACAAAATCCCTTTTTAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGA:2 + chr3R 9235505 5' + I-element 169 1 73.29 TAGTTAAATTACAAAACTCGAAAACAACATTAAATAAGTTTAATGTTTTAGTTTTTGTCCAGAATGGTCGTATTCTTTATTTTCCTTTGATATTTCAGTTTTTACTAGAGATGGGATTTTGTATTTTTTTTTTTAAATATTT:1 - chr3L 11830970 5' - TART-B 10629 2 59.15 AATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCT:5 + chr2R 20010207 5' - Juan 4142 1 67.81 AAAGGCGTCCCACAATTTAAACTCAAACTAAAGGCAATTTGATATACGATATGCTTTTTTCCAGAATCTATATAATAAAATCAATATTTTTTGATATAGAAGGTTGCCTACTTTTGGTCCCACAATTTTTTTAAATAAAATAAATT:2 - chr4 97361 5' - TAHRE 71 3 69.18 ACAATATGCATTGTGGTTGGGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 + chrX 18817222 5' - transib2 2818 1 81.51 TGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGTTAGTATTTTTGTAATCTTGGATTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAACATTAACATATTGTAAGGCTTGTTTACATTTAACATTTGAAATTATTTTACAAAAAACATTGAAATTTGG:1 + chr2L 21971405 5' - HeT-A 5791 1 75.18 AAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATG:2 - chr3R 21276662 5' - BS 5071 1 60.27 ATGATGCTGATTTTCTTTATGGGATTTGGCCGTGGAAATCCCGGGGACAAACACCCGAACGAAGGAGCCCACACCTCACCACCACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCG:1 + chr3R 26531585 5' + I-element 4994 1 72.03 GAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 + chr3L 17275392 5' - Transpac 264 2 53.42 ATCGGGAACTATAAAACTTAAGGTTAGGCATCTCGCACGCCCGCTGAAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTCCTCTTAGTCATACAT:1 - chr2R 9158179 5' + mdg3 5280 2 67.12 GTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:1 - chr3L 18126008 5' + Ivk 47 1 47.26 GCAAATAATACACTTATATGCAAGGAAGATGGGGGAAGTATCTACAGCAGATCAGCTGCGTGAGCAACTAATCTCTCGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTAGTACTCTAGCACCTACACCTCGTGATCAGGATCAATAGCCC:1 - chr2R 3143611 5' + INE-1 88 1 69.18 ACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATTTGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCAGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 5769094 5' + roo 66 2 71.11 GGAATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 + chr3L 23354571 5' + gypsy2 60 2 49.41 ATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:6 + chr3L 4219428 5' + jockey 33 1 63.01 AACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 6518573 5' + 412 7091 2 62.86 AATTGATTTTGAAGCTTGAAGTTCCTGACTTGCATTCCAAGTAATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr3R 30813308 5' + FB 39 1 58.90 GTAAGTTTTTCTTGTGATTGCATTTTTGTTGCCACAGACGGTGGACAAAACGATTTTCAACTAGTTTTGAGAGATTGCAATGTATGTATGTGACAATGGCTGTTTTTCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTT:1 + chr2L 14701120 5' - Doc2-element 252 1 59.69 ACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTG:2 - chr3R 15790100 5' + flea 4755 1 54.11 ATCATCATCATCAAGCTAGAAATTCCCCCAGCACAAATCCCATGAAGAGAATCCCATCAGTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAATAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTG:1 + chr3L 10364974 5' + Idefix 6978 2 54.74 TAGAGGAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr2R 21926349 5' - opus 449 2 52.05 ATATTTGCCTCGGTCTTTTAACAATTTTTTATAGCTGCCCACTGGAAACTGGAATTCTATATTCTCTAATTTCCATTCATTTCGCTTTT:1 - chrX 2935010 5' - invader2 424 1 57.30 GGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 - chr3R 31886954 5' - hopper 1368 1 53.42 TTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 + chr3R 4679454 5' - hopper2 1543 1 60.27 GGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1 + chr2L 4123867 5' + transib2 76 1 70.55 TTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:2 - chr2L 21328288 5' + 297 6612 2 65.07 TAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 + chrX 8092380 5' - pogo 2045 1 55.17 CTGCATGGCTTTAAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 7889699 5' - roo 9051 2 71.23 GATTATGAATATATGAATATATGAATCCGAATCCAGGCCTGGCGCATCTTGGGCCCAATTGCCAAAATCGCTGTACTGCCTCTCTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2R 15656086 5' + jockey 11 1 42.61 ATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTTCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTAACACGTGGCGAAAATAATGAA:1 - chr2L 23295850 5' + micropia 5045 1 76.03 CATGTTGTTAGCCGCATTGATATTTTCCAAGAGAGGGAAAGACCAGCGTTCGAACGCTTGCATATACCTTCCGAACAGCTGATAAGACAGAAAATACTAACTACAAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAA:2 + chr3R 2725642 5' + mdg1 7076 10 76.71 TAATAAAATAACTGTATTTAATAAAGGAATTTGAAACGTATTAAATGAGATAAGTGACCACCATGCTAATGTGAATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTG:1 - chr3R 1272108 5' + 17.6 130 2 65.07 GCTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3R 16518886 5' + Tirant 8137 2 54.05 AATGTACTCTGAGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr2R 4886038 5' - INE-1 580 1 51.11 AACCGGTCAGACATTATTTTAAAGTCATTTAAATGCACCATTGGTCTACTAAAAGCAGGCCAGAAAGTAACTATGTATAAGAATTTAATTTAATATCAGGTCCAAACTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chrX 10264550 5' - roo 320 2 55.48 GGCAGCCTTTCGCTCCGCAAAAAAAATGATATATAACTGTGGTTACTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATATTCTTAATAGTGATTAATACCCAAGTCGATCTGGCTCTGTTCGTCCGTATGAACGTGGAGATCT:1 + chr2L 22724031 5' + INE-1 133 1 46.58 CAGACCGAGAGCTGAGGAGAGCCTGGCGGATTGGATCCTTTCGCTGGAAAGCCGTTGGATAAGGGGAGGGGGGTTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTT:1 + chr2R 15048549 5' - F-element 118 1 51.37 ATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 21933268 5' + pogo 35 1 65.07 TTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTA:1 + chr3L 15913862 5' + jockey 4834 1 69.86 ATATTTAAAATCCAAATCCTAAATTTGCATCCGAAGTGCTCAATTATTGGCGCTTTAAATCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3L 16970491 5' + roo 32 2 58.22 ATTTTTTAAAAAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAAT:1 - chrX 21100306 5' + mdg1 12 2 78.08 CAATGGATTCAGTACGATTCGGTTCATTCATTGTTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAAT:3 + chr2L 11256961 5' - rover 335 2 76.71 CTTAACAATTGGAAAGCTTGTCCTGGACAGTAGAAGTTTCTCGGAGGAGTTACAAAATCATTCGAAGGAATGGAGTAACTAAAATTAAAGGGAAGCAAAACAAGGAAGAAAGCTATAGTCGAGTTCTCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chr3L 20259647 5' - INE-1 553 1 63.70 TATACATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAAC:1 - chrY 2720344 5' + gypsy 14 2 76.03 GTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 - chr3R 18971769 5' + Juan 4105 1 69.86 TTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1 + chr2R 8157194 5' - mdg1 339 2 75.34 GTATGCTGATACCAAGGTAAAAAGGTTGGGGGTGCTGCTGTGCAATTAATAACTCATTTTCCATGTGCTGAAAAGAAACACCCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCATAATAGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCA:1 + chr3L 25354684 5' - GATE 8391 2 65.75 GGGTATCTGATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGAC:1 + chr2L 22121314 5' - I-element 5330 1 54.79 GGTAGAGATTATGCTTGATTTCAAAACCTATTTTCTTTTTTAAATAGCTATTCTTCCATTCTATTATTCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAA:2 + chr2L 5141073 5' + I-element 4914 1 54.11 TTATTTGTTTTGTCGATTCACGGAGCATAGCGCAAAACGCTCACCCTTTTTGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATAACTATATATATATATATATAT:1 + chr2R 17937082 5' + 1731 4409 1 71.79 GTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chrX 21100284 5' + mdg1 34 2 63.01 AAATGTTTGTGCTCAACTTTTGGCTGCAAACTTTTGAGGTTTCGCCAAACTATGCATAAACCAGGTGCCGAAAACTGTTGCTTATTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 21987542 5' - roo 344 2 57.53 TGCTATTTGCAGTTAATATGAAAGTGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTAC:1 + chrX 3431816 5' + Ivk 5316 1 71.92 GTAATAATAACTATCATAAAATGAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTT:1 + chr3R 7819146 5' - invader3 179 2 51.37 TTCTTACTTGTCGATAAACTGGTTGGACAAACACGAAATAAAAATCGGGTCGCAAAAAAAAAA:1 - chr4 249019 5' - Cr1a 23 1 71.43 AACAATTTAAAGTTCGAAAATCGATCATTGTTCTCAAGAGAATATATTTCAATATTATTTTTTTTTATTTTTATTGCCCATTTAAAAATGCGAATTAACTTAACCAAACACACGGCTATTCCTATGAACAGCCTAAAAGTTGTGAA:1 - chrX 18776002 5' - HB 193 1 62.33 CTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:3 - chr3R 18488454 5' - roo 8998 2 72.60 AAAATTGCATACATTTTTTCAATAAATGTACATACATATGTATGTATATATATATATATGTAATGTGAATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:2 + chr2L 21822432 5' + transib2 12 1 77.40 GTTTGCATTTTTTACCATATGTGTAGCTTGTATTTTGATCTGCCCGCCTCGGCAGAGCTCCCGTTAAATTACGCTTCGACCACTCCATCAATGTGGCCTTCACTTTATTCCAGGGGGGG:1 - chr2R 5400834 5' + gypsy5 6915 1 54.62 CACAGACTAACCCAATTAGAACTAGCAGATACTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:2 - chr2R 8099248 5' - jockey 4956 1 54.11 TATAACTAATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTGCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCG:1 + chr2L 14026093 5' + F-element 425 1 77.04 ATTTCATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chr3R 8890129 5' + FB 49 1 53.42 ATTTAGCGGTTTTTTTTATTTGCCAGGCACCACCGTTTGCCAACAGAAAGAAGCAACAAAATTCATGGAGCCGCAGCAGAAGTAGAACTTTGTGTGAGTTGGTTTGTTTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGT:1 + chr2L 21013517 5' - rover 6991 2 77.40 ATAATTGTTAAAGATATAATCAAAATTTTTAGAGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr3R 13187568 5' - I-element 5346 1 72.60 AATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 11164542 5' + roo 8688 2 69.18 TTTTGTTATGTCGCCGCTTAAAGGTCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2L 12984081 5' + hopper 8 2 74.44 ATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGT:2 - chr3R 4682975 5' - Burdock 182 2 73.29 AAGAGTTTTAGAATTGGGCCATGAAGGACATCCTGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTA:1 - chr2L 22738399 5' - F-element 185 1 72.66 ACCAAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAATTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGTGATGAATCATT:1 - chr3R 21276665 5' - BS 5077 1 62.24 AGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCT:2 + chr3L 24213775 5' - invader2 175 2 67.12 GGATCGGTGTCGGTGGCACGTGCAACACTTGCCACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 - chr2L 15779687 5' + hopper 21 1 73.29 AACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chr3L 21327146 5' + copia 88 2 77.24 AAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGAATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAA:1 - chr2L 16946120 5' - hopper 1346 1 62.24 AGTAAGCTATTGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr2L 17205142 5' + hopper 28 1 65.75 TTTCATTCGTAAGTGCTGTAAACAACGCGTCAGGTGAGGCTATATATAGGGAGATATATTGTATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTTAGAACA:1 - chr3R 12949127 5' + Juan 40 1 45.21 ATAAATTGAATATCTTTTTAGAGCAGATTGTAACGGTACCGCTTTCTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 - chrX 10537984 5' - I-element 5332 1 68.49 TGGCAAAATGATAGCATAGAAAAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1 + chr2L 18347238 5' + transib2 12 1 75.69 ATCGACAAGTGCCGTCAGGGTCAACGGGTGGGCGCTAAGTCTGTTGGCTTATCGGCTGCT:1 + chr3L 18058159 5' - G5A 2602 1 60.00 TATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chrX 19539481 5' + pogo 61 1 62.33 ACATCTATCACGTCATCGTTCTTTTTCGGCTTCCCATCTTCATTTCCCTTAGCGTTGTTGTTCTGTCCATGTTGGTGGCTACGTTCTCTCCTTGCTGTTTTCGCGCGTAAAATTCATCGCTCTTTCTCTCCCTCTCCTGCCTTCCC:1 - chr2R 17549325 5' + Max-element 111 2 54.79 ACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 10167449 5' - roo 8990 2 71.23 TGTAAATTCGACAAAATATGCTTTTCACCTTATATGTAAAAAATTCTTGTTTCGCTTGCGGCGTGTAAAAAATGAATAAGACACTGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAATATATGACCAAAGCAAAGACACTA:1 + chr3R 4571527 5' + 1360 496 1 54.79 AGCAACATGTTGCGGCAGCATGTTTCCGCAGCGCTTTGTTGGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGCATGGAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATG:1 - chrX 18742928 5' + invader4 2796 2 59.59 GCTAACTTTTCGTGGGCAAACACGCGCTACAGCGAAAAAACAAAAATTCAACCAACTACCGTCTATTGACGCGCTCAAAATTTTACTCATATATATAGATACA:1 + chr3R 24026653 5' - 1731 4416 1 53.40 TTAATAAGGAAAATAAGTGCACTACTGAATCTAATATGGTGGACTTATAAAAATCGTGATAGGGTGATAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATACAAAAACAACACCAAACAGCACTGCG:1 + chr3R 1439427 5' - Cr1a 241 1 55.30 GTGATTATAAAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGGGTTCACACATTAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 47039 5' + roo 11 2 75.69 ATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr2L 4063926 5' + roo 8735 2 67.12 TATACCGTTATATGATACCTTTTACACCTGTAACTCGAAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATATGATTTTTTGGCACACGATTGTTTGGCCGGGGCGCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 4697619 5' + 1360 63 1 65.91 AAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGACGTGCCTCT:1 - chr3R 18093416 5' + I-element 19 1 69.44 TTATCGCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3L 18403103 5' - P-element 2866 1 71.92 ATATCGTATTTAATGTTTTTGAGATAACCAGGAACACCTAGGATAAAAGGTGAAGCCTTATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTG:2 + chrX 6116191 5' + transib2 7 1 78.08 ACCCGCAATTCGATGGCCAATATTTGAGCCTTCTTGTCTCTCGTATGAACATACAAGCAATATCGCACAATAAATCCAAAACTAAGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCT:1 + chr3R 18861887 5' - Quasimodo 7193 2 58.22 CGGGGGAAAAGGTAGCAAAAAGAGATTGAGAGGTAATTCATATTAGTAAACATTGGCAGTGAGAACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACA:1 + chr3L 9163041 5' + Stalker 82 4 56.16 GGACCTTCGAGTTTAGCTAGGCAAAGTATCACTCAACAACAAAGCGCATCGCAGCGCGTTTTATCCTTTGAAATCCTCTAATGAGAAGGGTTGAAAGTGACAAATGTCCTTTTGCATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 10445357 5' - Quasimodo 39 2 73.28 GTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTAGTGTGCG:1 + chr3R 13875067 5' + P-element 83 1 25.87 AACTGCATTTGTCCACTTTGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 - chrX 19038494 5' + hopper 27 1 64.96 AAAGGAAGGGCCAGAGGAAGAGGAAGTAACTGCCTGCACAATGGCGCAGCGGAAAATTACTGTTGACTACCCAGTTAAATGATTAAATGAGATGGAAGTAAGCTACATGCCAAGCTCAAATATTTTACTTAATTTAT:1 + chr2L 7652485 5' - G7 1151 1 62.77 TTGTGGGCCAATTTGTGGACCATCATCAAGTGAGAAATTTCCAATTTCCGAAATGTTCAATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 5390015 5' + roo 8675 2 76.71 ACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 + chrX 18817250 5' - transib2 2790 1 62.33 ATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTGCGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 - chr3R 29690774 5' - I-element 5278 1 70.55 ATAATTATTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTT:2 + chr2R 11721488 5' - Copia1_DM 109 1 63.70 AGAGAGTGACGATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGGGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAG:1 - chr2L 3234061 5' - roo 394 1 60.38 TGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 21216719 5' - roo 9009 2 60.96 AGGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr2L 18549921 5' - roo 9003 2 63.01 ATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 11191412 5' - roo 327 2 76.03 GATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 + chr2R 17796516 5' + jockey 4698 1 66.67 ACGAGACAGGGAAAAGTCCTGACAAAAATCTGGAGTAACAATTTGGGAAAGCTTTTTTTACATTAAAAACAAAAACGTTAAACTTTTGTAAACTTACGTGCTCAAAATTGGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGG:1 + chrX 21223476 5' - roo 186 2 68.49 AATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 9544940 5' + roo 8720 2 57.93 TCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 - chr2L 7580995 5' - Transpac 5153 2 71.92 TATTTCGGTTATTTGTTGTAATTAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATA:2 - chr3R 17996285 5' - diver 182 2 56.16 ACCTCAACGAAAGAAAATCAATCAATGTTGATAATTAATTAATTAATAGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 - chr3R 30059526 5' + FB 24 1 69.18 AGCAATTATCCGCTGGTCAAACAAAAGTCATTAAATTGCGGAAATCGGGTCACCAAACCGACAACAAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTT:1 - chr2L 21039409 5' + F-element 4598 1 54.79 CAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chrX 8092420 5' - pogo 2055 1 73.68 GAACATCTGCTTTGTGAACCACCCGGACCCATTTATTGTGTCCCCCATCCCCTGGCCAATCCCTTTTGCATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCGGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chr3R 15807453 5' + FB 51 1 51.05 CTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:2 + chr3L 11913210 5' + BS 5076 1 73.29 AAATAAAATGTAAATTTTAGTAGCCCAACAGTGAGCGCACAAAATAGAAATAACAAAACGAAATAAAATTGTTAAAAAAAAGCAAGGAACATCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGCCTGGAGTTCAAAGCTCTCCT:1 - chr3L 10522845 5' + Doc 4242 1 54.11 CAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:2 + chr2L 18347277 5' + transib2 53 1 55.48 AGGGATGTTCTTCATTTGTATTTCACATAGCATTAATTTGCTTTTCAATTTATTGGGTTTTGTTTGTGTTTTTTTTT:1 + chr3R 26977508 5' - transib1 2140 2 75.32 ACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 21224635 5' - roo 351 2 56.93 AAATAAGCCGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:2 - chr3R 9039061 5' - Juan 4197 1 72.60 TATCGCTAGATCAATAACCAAATCGGAGATAGAGAGAGAATCGGGGACTGAGCTCGCCGTATGACTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATCGATC:1 + chr2L 19514624 5' - Doc2-element 4378 1 53.47 ATTGGAAATTCTCAGGTGATTAGTCTTTTCTTCTGTCTTTCAAGATTACCAGGAATGTTTTAAAATGGATTGGCAATGGGATTTTCGGTCCAGTCGGGAAATTCTTAATTTTGGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTG:3 + chrX 7002459 5' - 1360 3137 1 63.01 GTGATTGTGATTTATGGTTGCCAAGTTTTTCGGTTAAGTTTATTTTTCACTCGCCGCTGCAAGTTTAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTT:1 + chrX 8948179 5' - transib2 2345 1 54.79 AGAGTTTGTTTAAATTGTTTATATTGAGTAAGTGTATATATATTCTTCTTATCAGGATCAGTATCCAAGTCGATCTGACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGAAGAATTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAG:1 + chr4 373598 5' + INE-1 167 1 77.40 TGTTGTAATAATAAATTGTTTACTGTAATATATTGACGTTTATTGTTTAAAGATCTTTAATTTCTTCAATCGTGAAAGCTTTTTGCCCACAGCAATATACTCTTTAATTGTTATCGGCGGGTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr4 548405 5' + hopper 147 107 59.31 AATTTTCTGAATACTGAGATGTGTACCACTTGATAAAATCAAAAATTATATTGGTACAAGAGTGTGTTTTTTAAAATGACTTCTAATAACTGAACCTAAAAATATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAAC:1 - chrX 17330555 5' + I-element 409 1 76.71 ATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTA:1 + chrX 14771744 5' + BS 83 1 74.66 ATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGTGTTTGGGTG:2 + chr3R 12367519 5' + GATE 8143 1 54.79 TGGTAGATTAAGGTATCACTGGTATCACTGCTTGTGAAGCGAAATAAGCCCTTGAAGTGAGTGTTATATCTCATTCTATTTATTTTAGTTCCAAATGTAATCGTTCAGTCAATTCAGCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGG:2 - chr2R 18777907 5' - G5 4769 1 56.85 GGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGCTTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 + chr3R 27405944 5' + diver 9 2 73.04 TTATTAACAATATGTCTTGGCCACATATCAATTCAGGCCTTTGACTTGTAACGTAAATTCTGATATAGAATTTTAAGTAAATTGAGTGTGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCG:1 - chr2L 268174 5' - roo 8938 2 61.64 AAATAGTTTGGCTAATAAGAACTTCACATTTTCATAGCATTGTGTTCGTTGCACTTTTGTTTCAAATTTCCTAGCTTTTTTAATCAATCGAGTACTGTCCACATTTTTAAAAATTCCAATATATTTTTTTTTTTGTAATTTTTCTT:1 + chrX 17066401 5' - Doc 4694 1 63.01 TATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 + chr2R 7244811 5' + diver 60 2 58.22 CGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTGTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATAT:1 - chr3R 8075989 5' - 412 7499 2 50.37 AAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:3 + chr2L 13158638 5' - roo 9012 2 58.90 AGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 - chr2L 17005809 5' + Stalker2 57 2 55.48 ATTTTTTAATTTGTTTATCTAACCTATGTTTTACACCCAAGCTGCATTTCGATTGGAAACGTTTCATCAGTTTATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAG:1 - chr3R 9562736 5' - Porto1 4197 1 53.42 ACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCGGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr2R 11804629 5' - pogo 2036 1 65.07 AATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGTAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 11094151 5' - roo 360 2 53.42 ACCTGCCCTCTACGGCGCACCAGCATCATCTCAGTCAGACGCATCACCTGGCCGCCTACAACAAGCCAACGCCCACTTGAAAATAAGTAGGAAATACTGAAGATGGGAAGTTGCCGAAGAACAGTATTCGACGTTTGCAATATCCT:1 - chr3L 6731747 5' - Bica 319 1 52.74 TTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGA:3 - chr3R 15363999 5' - flea 4935 1 73.29 AATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 + chrX 12066105 5' + transib2 56 1 56.16 ATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACATACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3L 18046626 5' + roo 8740 2 73.72 CCATGCTAGTAACATTGCAGTTTTAAACAAGTATATTTTACTTTAAGTACTATAGACTAGTTCTATATTATCAAAATAGCTTTGAACAGTTTTGGCACATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAG:1 - chr3L 22253526 5' + G2 2606 1 73.13 TTCCTGTTTATGCGCCAACGCCTCCTGCTCTCCTGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCA:1 + chr3L 14723075 5' + F-element 428 1 76.29 CGACAATCAGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3R 17077112 5' - roo 332 2 71.23 ATACCCTTTAAACTTAGAAAGTCGGGTGTGCCTCTATTGTTTAATAGCTTAGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGT:1 + chr2R 5674594 5' - S-element 1698 1 71.92 AGATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3R 15072675 5' - pogo 2053 1 53.10 AAATGCAGGCAAAGTTATACTCGACGCACTCAAATGGTTATACGTGTGAAAAACTTCTCGATATATAGTTATAGGGAGCGATATAACTCAATTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCT:1 + chr2R 20153240 5' + accord2 7290 1 61.94 CCTTATTGTGAGTGTCACCGATGGATCCTCGTGTTTTGCTGGCAGTTAAGCAGTACTGTTTATTGCTAGAGGTTTTGCTTTCGCTGACTT:1 - chr3L 21907881 5' - F-element 495 1 58.89 ATACTGGGCTTTCTCTTTCGAGGAGAAAGAAATATTCGGAAAAAATATACTACACAGTGCAGTGCAGTGCGGGTGCAAAATGGAAAAACGCAACTGAGCTGGCTCCTAAAAACAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 28658033 5' - hopper 150 11 68.75 ATAACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:2 + chr2R 13931513 5' - P-element 2863 1 67.19 AATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACA:1 + chr3L 22531946 5' - Cr1a 4199 1 69.86 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 + chr2L 22211546 5' + 1360 69 1 73.28 AAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chr3L 15913835 5' + jockey 4807 1 52.74 AGGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAAGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTC:1 - chrX 22727595 5' + Ivk 5113 1 52.05 AAATGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:2 - chr2L 15913358 5' - transib2 2785 1 58.22 TAATTGCCTTGCACAAAGGGGCAGGTAACTCTTACTGACAACATAAATGAGCAAGCTAAAATTTTATACTTTTTTATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAA:1 + chr3R 26088616 5' + P-element 2829 1 66.98 ATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAT:1 + chr2L 11391492 5' - 1360 22 1 43.15 AGTGCAGGAAATCACAGGCAACAAGTGGCCACGACAATGGCGTAGTTTTAGCTCCTGTGGCCATTTTAATTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTATT:1 + chr2L 20962370 5' - gypsy7 5001 1 35.11 AATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chrX 12129317 5' + flea 45 2 62.18 CGCATGTTAAAAACATGTCCATGGTTTGCATTTAGGGGTTGGCTCGTAAATTCCAGGGGCGGGGTTGGGTCCCTATCTTCCTTTGTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 - chrX 3386320 5' - gypsy7 5009 2 72.22 TCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGGGTCGGATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 - chr2L 16690684 5' - P-element 2788 1 17.81 CAACTCACTACCTAATTTTTCCGACTCTCAACTATTTAAGGTCTAGACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACAC:1 + chr3L 9960943 5' + accord 254 2 65.93 CATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGATCCAGGC:1 + chr3R 12115270 5' + 1360 67 1 63.01 GCCAGTGTCCATTCGGCTGTCTTCTTATTGCCTGTCTTTCACCTACTCGACGGACTCCCCTTCCCACTTGTCCCACAAACAATCCCCCCAAATTTTGGCGTAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTT:1 - chr2R 23351016 5' - hopper2 1335 1 65.07 TGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chrX 12129414 5' - flea 201 2 54.79 GATATGGCCAGATCGATTCGGCTATTGATCCTGATATATACTTTATTTCGTCGGAATCGCTTCCTTCAGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 21256472 5' + 1360 15 1 82.19 GAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGAATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chr3L 18403027 5' - P-element 2825 1 26.13 AATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:3 + chrX 18817269 5' - transib2 2771 1 53.42 ACTAGCAAATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 3030193 5' - roo 9047 1 60.83 TGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1 + chr2L 13556338 5' - transib2 2764 1 59.59 AAGTTGTTAACGAATCGAACAAAGGACATAAATTCATTGATGTGCAGGCAAGTACCTCACGAATTTCCGCTTCCCACTTTTCCACCAGAAACACGCACATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAA:1 + chrX 3553450 5' - R1A1-element 32 1 67.81 ATGGCAACCGAAACATTCCACATACGTGCTTTGTGTATATCAGTGCCAGGTTGAGTCCTATTCATGCTGGGCTATTTCCTGGTCTGGACCTCAGCTTACTCTTCTCACTCGTGCTTTGTTTTTCTGTTGTCGCTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 14952599 5' - Porto1 172 1 58.90 TGGGTAGAGCATGTGTTTGAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 11191523 5' + roo 31 2 65.07 ATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAG:1 - chr2L 23295923 5' + micropia 4967 2 74.47 ATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 5532898 5' - roo 9041 1 62.33 GAACGTTTCAAAAGCGGCTTTAAAGCATTGTTCCTTGAAACTGTGATACTTTCAGGAAACTGCATACCTTCGCAATCCCCTTGAAAACATTGCACTGTGGTCTAGAATTCGATTTTTTTGGCTTAAAGTCTAAAAATTGAGTTACA:1 - chr2R 24441797 5' - transib2 2791 1 63.01 GCGGCAACGTGTTCGAGTGGCTCGGCGGGGATTTGCTTTTGGGGGGGGCTCCACTTTGTTGCTTTTTTATTTTCCTTTTTTTTTATTCATACTTTTTTTTTTGTTAAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 7809613 5' - gypsy2 436 2 77.31 CTAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 + chr2L 4713845 5' - transib2 2778 1 52.41 TTATCAATACAGAAATATCCACAACGTACATTAAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAA:1 - chr3R 13389640 5' + I-element 160 1 75.86 GGTGTGTGCAGTGCAGCGGCGATAAGATCAACGTGTGAGCCTTTGCCATGCTGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCATGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCTACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3L 1692147 5' - blood 360 2 68.22 CCTTTCGGTGCGGCATTTCAAAGAAATGTTCCGACATTTCTACCAGGCGAACAGCAACGTCGACAGCCGGCGATGATGTGCTGTGCCAAAAAGTGAATGAAATCGAAAACGCGACCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGC:1 + chr2L 1007789 5' - mdg1 171 2 78.77 AGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGG:1 - chrX 7795600 5' - roo 342 2 65.22 AAAACATTGTCAGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCCAAAGATCGT:1 + chr3R 4860408 5' - Transpac 272 2 59.59 TTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTA:1 + chr3R 24381272 5' + Juan 4125 1 69.40 TCATCGGCGTGTCGAGCATACTTATAATGAGCGGGCTGGAGGCAGGAGGTGGCTTACATGCAAAATGACATTTAAAAAATGTTTCATTTTTTTATTTTTTTTATTTAAATTTATTAAACGAAATTATTTT:1 - chrX 13504564 5' - jockey2 3390 1 56.92 GGATGGGTCTATGGAAATTTTCACTGGCTTATGTACTTAAACAGCCCCGCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAC:1 - chrX 16241053 5' + mdg1 27 8 57.50 GTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCA:1 + chr2L 4003679 5' + mdg1 56 2 56.85 CAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3R 7719798 5' + roo 8748 2 79.45 GGTCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chr2L 12984103 5' - hopper 1372 1 52.74 ATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTT:1 + chr2R 9966949 5' + Bari1 18 1 45.11 GTTTAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 13294846 5' + roo 19 2 70.00 TGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 - 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chrX 18010042 5' + 412 7117 2 60.27 CGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:2 - chr3R 23295616 5' - P-element 2867 1 43.15 TTATTCAACTAGAAGTATATAAATTGATCAGTAGCCGTGTTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAG:1 - chr3L 27859941 5' - INE-1 577 1 75.34 CCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCACGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chr3L 15913817 5' + jockey 4788 1 64.14 AGTGTGTCTTATTCCGTCGCACATGTGTTATTATGCCAGTATACTTGTAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAGGAATAGTATT:1 - chr2L 20205373 5' - P-element 2819 1 36.43 TGTGGAAACACAAACCGCCGCCGCCTAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 + chrX 14771686 5' + BS 25 1 61.64 TGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 - chr3L 18505749 5' + I-element 54 1 55.48 TCTTTTAGCTCTTCTTTATTCAAATGCTCTGTCCTCATCTTATGCAATGGAATGCTCCCACTGTCGTTTTTCTTTTCCTCTATGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGT:1 + chr3L 27412207 5' - hopper2 1349 1 59.59 TTTTTATAAGTCTCTAATTGCTTGCATTTAGGAAGATACCTTTTTTTGTATACATGTGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTATATGCGTATAAAAGAGCTGTTCGCTGT:1 + chr3R 4051695 5' - 1360 131 1 54.46 AGACCAATCCTCCAGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chrX 18336701 5' + mdg3 41 2 58.22 ACCAAACCTAGTAATTGATTTAAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr2R 3563052 5' - Transpac 5204 2 68.28 ATGTCCTTTAATGATTAATAACTTTTCACTCCTTTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCA:1 + chrX 11039586 5' + I-element 147 1 76.71 TTTATTAATTGATACGAAATAATTATGGTTAGGTAGGTGAGAAGTTGGTCTGAAATGATCTGCAATTGGTTATGACCATCAAAAGTAACAGCGTGCCTTATTGATTATTTATTTATTTAGAAATTACAAACATTACAGACTAGTAT:1 + chr2R 14643671 5' - 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chr3L 14720895 5' + F-element 82 1 66.19 ACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3L 16470366 5' + jockey 4710 1 53.66 ATGTACATTGATATTTCAGGGCCAGCTATTGTAATTTTTTTAATTCACAGTATAGGAAACATTTTTCTTTATAATGACAATTTAGGTGTGGTAAGA:1 + chr3L 23282517 5' - looper1 1642 1 69.79 ATGATAAATCGCATAAGGCAAGTAATTCTGATTATCTAATTTCCATTAAAAAGCGAGGCAATCTCGATCGATTCATTCTTCTATCAGTTCGGTAATAATCGGACATTATTGTTAAAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGT:1 + chr3L 3455855 5' + Circe 488 1 52.05 ACGGGAATGCATATGCCTGATGCATCGTTTTCCTCGGCCTGAGCTGCTGATGATGTGGAGCTGTGGAACGAACCGCCAACTGATGCTGATAACAAAAAGCACACACCATCTATGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGATT:1 + chr3L 10349383 5' + INE-1 562 1 74.66 GTTTTGTGATTAAATTAAGTGTGTAAAATGTGTTTTCTTTTGGCCACATTCTTCTTCACAAGCCATTCGGTTTGCAGCTATTTCGGTTATTCAATTAATTTTAGTTTGTAACCAGTTATATTCTGCAGCTTTTCTTCGTTTGACTA:1 + chr3L 16542322 5' - Chouto 6124 1 68.49 ATAAGCAACGAAACTTCCACCTATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3R 16342061 5' + P-element 34 1 60.69 CAACTATTTTGTTTCATTTGTAAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATC:2 + chr3L 11913145 5' + BS 5011 1 72.60 ATCGGGTATACATGCAACCTGCTTGCCGTCCTGCTCATTTGCGTGGCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:1 + chr2R 18315981 5' + HMS-Beagle2 11 2 76.71 CTTTAAGTCAGTTGGAAGAACCTTTTAATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chrX 21505717 5' - roo 8984 2 80.82 TTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACA:1 - chr2R 1916459 5' + Juan 52 1 50.00 CCTCAAAGCAATAAAAATGCATTTCGATATGTTTATATAATTTATTAATATGTTTATATATAGTTTGTTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATT:1 - chr3R 17569110 5' - Stalker4 6986 4 57.53 ATTTTTATTTGGATATGTTTACTTTTGTTTCCATATAATTTAAAAAAAATCTTTACATTTTTGATTTTTTTTTTCTGGAATTTTTTTTT:1 - chr3L 15014434 5' + Tc3 77 1 51.69 GTGGACGGTTGTCCGCGTAATGACGACGAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 19266793 5' - roo 396 1 67.81 GTGGATATGGTAACAATAACTAAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGCCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 - chrX 13490755 5' - 297 340 2 61.64 AAAAATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:3 - chr3L 16470388 5' + jockey 4711 1 58.90 GATTTTATGTGAAGCAGATAAGCGCATCTTACACAAGGACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTC:1 - chr2L 6298998 5' + F-element 4501 1 73.43 GAAGGGAAATAAATTGCGTTTCGCTTCTAATCCGTAAGTCCGTAAATCCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2R 24244091 5' + hobo 5 1 48.63 AATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1 - chr2L 6647713 5' + mdg3 79 2 68.97 GAACAAACTTAGCATAAAGTAAACATGTCGCTGGCATAAAGAAAATCCCATTCCAGGTTTCGGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTT:1 - chr3R 20708549 5' - I-element 202 1 57.53 ATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTT:1 - chr3R 27083139 5' + jockey 4550 1 61.34 CGGGGGGTCGAGTTGGGGGCGGGGGCCTTGAGGCGGGGGTGCTGGGATGCAGAGTGGGGCGCTCTTCGACTGTCGTTAGTCAGCGCAGAGGCAAAAATGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTG:1 - chr3L 15257862 5' + 17.6 209 2 67.81 TATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAAAGTTGGAACTTAGTTAAATGCAATCCGATTAAAGC:1 + chr3R 4357516 5' - Tc3 1662 1 39.16 TGATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 5151301 5' + roo 83 2 76.03 GGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2L 47055 5' + roo 29 2 66.44 AGGCATCCACTGGTGACGAAGGCACCGAAATAGAGGACATAATGGAGGAGGATGAGGATCTGGCTCTTTCAGATATGACTTTAAAATACAGAAGTAGGGTGCAGGTAGAAGGGTTTTTATCTTGCATAATAATCCAACATGCCATA:1 - chr2L 6763188 5' - Helena 422 1 56.16 TTGATACCTCGTTTTCGTAAGTTTTTGGTAACAATCCGAAATTAATTGAAATATCTGGGCTTAACTGAATGTTTTGAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATATAGG:1 + chr3R 9004060 5' + roo 8740 2 51.72 ATGAATGAGCGCTTATTGAATACAAGTACAAACTAGACTTATGGTCTACAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTA:1 - chr3L 20829611 5' + 17.6 450 2 66.44 ATTTGCAGTTAATATGAAAGTGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCAT:2 + chrX 3431820 5' + Ivk 5320 1 70.55 TATATTTCATATTGGAACAATTCTTTCCTTAATAGCACGTGCAAGTTAACAACTAAAAATATATTACTTCAGAGCAACTAAGTAAGTAGCTTTTTATAAACAAAGTTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGAGAAGCTGACACTTC:2 - chrX 3428870 5' + gypsy 104 2 58.90 TATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 20265932 5' - roo 353 2 56.85 ATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAG:1 - chr2R 8157247 5' + mdg1 87 2 78.62 ATCCAAAAATATACTCAACTGCTGTGCCTATATAACTGCGCCTCTTTCAAAAAGATAATATGCTAAACCTTCGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTT:1 - chr3L 8945438 5' + F-element 133 1 58.87 ACATCTATAGAAACCTAATTAAAGTAGAAATGATCTTTTAGAGCTTAACAATACGTTTTGTTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACA:1 - chr3L 15191157 5' + Q-element 191 2 58.90 AACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:2 + chr3L 12249830 5' + roo 8753 2 82.19 AAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTATTGGCCGAGGCTCTAGAGGTGGCTCCCGGC:1 - chr2R 4606277 5' + 1360 67 1 67.69 AACGAACTGCTTTGTTATTGTTATTAACATTTCTTATTTGCACACCTACGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATC:1 + chr3R 24137943 5' - 1360 335 1 67.12 GCTAGCAATTTCTGCATAAATTACAGGGGACTGCAACATTAAGTGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGT:1 + chr2R 21993201 5' + P-element 118 1 53.33 TATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCTCAACGACATACGTTCTCAGCGA:1 - chr2L 17766144 5' + Doc 221 1 73.64 AACTACCCAGAAACGTTCGTTATGCGACTTAATTGTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 + chr2L 16943748 5' + copia 12 2 78.08 CATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:1 + chrX 14450389 5' - hopper 1391 1 57.39 ACTGTTGCTGAGTAATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr3R 7666596 5' + I-element 24 1 67.81 GGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAAC:3 - chr3L 24208229 5' + Quasimodo 40 2 56.16 AAGGACTCACGTAGCTCTACAGGCGAGAAGTCCTGGGAGTTGGCTGGAGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATG:1 + chrX 21567771 5' + micropia 5396 2 58.62 CAGTTGATTTAAACGATCCAGCGGCATGCAGATGAGTTTTTGATTTTCCATTTTCCATTTTCCAATTGTGTTTGCTCTTATGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAGAGAGGCATGTGGACATAAAGATCGAGC:1 + chrX 15201317 5' - Tabor 197 2 54.48 ACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chrX 18817258 5' - transib2 2798 1 63.85 TTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCT:2 + chrX 13383541 5' - invader1 3989 2 70.55 TTATATTTCATTACATGATTAAAAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 20898638 5' - roo 9023 2 53.42 ATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:2 - chr3R 13973088 5' - 412 7523 2 68.49 CTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chrX 22840583 5' - copia 204 2 51.37 TCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr2L 7593164 5' + jockey 4708 1 61.38 AAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAA:2 + chr3R 4357535 5' - Tc3 1640 1 64.38 ATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTTTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 5389882 5' - roo 335 2 71.22 GTACCTATGTACCTAAGTATCAAATGTACATATGTACATAAATTCATATGCAAGAGACGTCGCTGTTTCTCGGCTTTCCCCGGATCAAACATCATCTGATGTATTGTCTTATATACAAGACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr2L 21205565 5' - INE-1 579 1 56.16 ACAACGACAAAGAGCCACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chr3R 19407850 5' + diver 5899 2 76.71 CAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGCTAT:1 + chr2R 1751259 5' - INE-1 103 1 52.59 CACAAATGCGGTACAGTGAAAGCTCGGCGGAATAAACGGGGGAAGACCGATGAACTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTG:1 - chr3L 17568172 5' - S-element 1706 1 78.77 CTGGGCCGCAGACCACGCATCCCACACACCCCAGCACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAT:1 + chr2R 18136147 5' + I-element 5189 1 76.71 AGCACCGGAAACATCTCATTCACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGGGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3R 28469154 5' + 412 15 2 73.29 TCGATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2L 71144 5' - 412 458 2 60.96 GGTGAAGAGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACTATGC:1 + chr3R 13406373 5' - pogo 2080 1 71.23 ATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCATCTAAAAGTAGTAGTCAGAGCACTTGCTCAGGGTATCAGGGAAGAATGTCACCTAATTGTGTCACACGAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr3L 23583087 5' + FB 26 1 66.44 ATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGA:3 - chrX 21852442 5' + gtwin 84 2 76.03 AGCTGAATAATTGAATGCTGTGCTAATTTAACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr2R 22034781 5' + copia 4899 2 63.70 TAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTTAG:1 - chrX 18396151 5' + roo 91 2 81.51 ATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTACATTTCTATCGATGTGCAAAA:1 - chr2R 1751255 5' + INE-1 308 1 62.33 TATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAAACTTAAGAACATGCAAACTCACAAAAACCCATACAACATGGACACCCAAACAAACCCTACACAACTCCGAAAGTACCCAACAGAAACTAGATAAGAAT:1 - chr3L 24486371 5' + Idefix 101 2 79.69 AAAAGACTAAGGCAACTTTTCATTTCCTTCCCCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGAAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTT:1 + chr3L 18768199 5' + S-element 1530 1 76.71 TGAACGCTTGGCATTGTTGACTCAAGCGAAACACTTTGCAGGTTATAATTGTTGGGCATGTTAGTTTTCTGTCTTCTTATGTCACAATTTATTTTTGATTTATTACCCATTGAATAATTTTGCGGGCTTAGTTTTCGCTTTATT:1 + chrX 3394760 5' - Fw2 37 1 70.83 AAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2L 13556466 5' + transib2 26 1 59.26 TAGCTAGCAAAAAGATAGCTGTAAAGGCTAATTTTGAAACCAATAAAAAAACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 9410607 5' - I-element 5328 1 64.38 CGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:1 + chr2L 17809170 5' - jockey 4939 1 52.74 CTATTTAATAATCGTAAAGGCGTTGATAATAACATTTTATTTATTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 - chr3L 8673364 5' - I-element 5272 1 74.66 AGAGCAACCGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr2L 12822866 5' - P-element 2839 1 42.28 AGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCT:1 - chr3R 22590601 5' + rover 6991 2 57.53 AGTTCTTTATCGATTTCTTGATCAAGACGATGGATATTTGCTGCCAATTGTCTCCCATTGCCACCCAGGCTGTTTATACGCCCCCCCACCTCCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 14728059 5' + roo 8724 2 69.60 TATGATATATAAAAACAGATATTACACGTCTTTTCTATTTTTATTTATGTTTAATAAAGGATGTTTACCGTTGCGAACAATTTGCACGGCTTAGGGTTCAGTCATCTTTTTCTATGCGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCT:1 - chr3L 5614263 5' + S-element 281 1 76.55 AGTTCTGGCCGGCTCCCCTATATATTCCGGCCATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACAAGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr2R 11794973 5' - opus 469 2 65.66 AAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAAT:1 + chr3R 11040071 5' - Bari1 1630 1 71.72 GTGGGCTCCAACAGCGTCAGACTGTCTGGTATGCCACTTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTG:1 - chr3L 16211593 5' - transib2 2746 1 71.23 ATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 7719681 5' - roo 392 2 73.05 AATGAAGACAAATTGTAAATAAAAGTAAATTTTAACTTGCATCTCTTTTTATGTTTTTTTTTTCTTT:1 + chr3R 13991870 5' + Circe 426 5 47.76 ATACCGNTGGGGGGAACCCAAATGGACACACATGTGTCACATGGTCCGACTCCAAGAGATTGTCACATCGCAGACCTCCCCCGAACACTTACTACATTATTTTTTTATTTATTTATTATTATTATTATTATATT:1 - chrX 7167724 5' - mdg1 7052 4 73.88 CACCGGAAACATCTCATTCACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3R 28469156 5' + 412 7068 2 75.00 TTTACACCGCTGTTTTAATCGTCATGAATTAATATCGCCAAAGCTGCTTATAAATAAGCATATTACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCCAAACACTGTAAATACCT:1 - chr3R 24729663 5' + Juan 4141 1 58.90 TCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3R 24219277 5' + roo 69 2 66.44 TTTTTATTTAAAACATAAAATTCATTTTAAAGTCACAATTAAACGCCCCAGCTTAACGGAGGTAGATAACAAAAGGAAAAA:1 - chr2L 22216641 5' - diver2 149 2 49.38 TTGGGGTTTTTGTTTCTATTCATGATTTTTTAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCC:1 + chr3L 8665040 5' + FB 209 1 60.94 ATTAAACATCTTTTGAATTGCAACAAGATAGTTGTCATATATCTCGTCCGTTTTCAGTTCTAATAAGCTAACCATTATATTTTTAATTGCTACCATCGAGTTTTTCTTCTTAAAACGTGCCAACATGTTTTTTTTTTCTATCTTTT:1 - chr2L 12930599 5' + Circe 431 1 47.26 AATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chrX 1341600 5' - 412 464 2 62.33 CTTGTACAGTGGAGTCTCAGCACATCCTACCCAAATTATCTTTAAATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGA:1 - chr2R 12253381 5' + BS 4645 1 65.75 ACTTTTTATCGCATATAGGAACGTAATAATTGTTGTAAGATTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCAACGCCGCCTATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCTCTGGGATGTTATATAGGAACATAATATGCTTCGCATATTAC:1 - chr2L 11257158 5' + rover 6 2 64.96 CTATTCTTCGCCGAGTTCTTTTGTTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 7300134 5' + roo 8717 2 55.86 CAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGCATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 29611981 5' + jockey 15 1 71.67 TTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGT:1 + chr3R 29690727 5' + I-element 5283 1 73.97 AACAATCCGGCTTTCAATCCTTAACCAATCTGGAAACGGACTCGGATGTTCCTGACAGTAGGGGTGAAAGTCTTTTAGGATTAGTGCAACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATACCCT:1 - chr3R 8019761 5' - Circe 7147 1 65.03 ATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:2 - chr3R 23639250 5' - pogo 2046 1 59.59 ATGAGAGCAGTGGCAAGTTTTTCAATCGCACTATATACTTACGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGCCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATAGGGGTACCAACCACAGCCACCAAGATA:1 + chr3R 2576610 5' - R1A1-element 4999 1 60.83 TCTGACCTGCTGCAGGAAGAGCCAAATGAATGGATGGCTGCCACCAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGGTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTT:1 - chr3R 25433441 5' + transib2 4 1 81.51 GGACCACGCGCTGAAACATATGTTTACTTGGAAAGCTCACAGAGGATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 - chr2R 2590841 5' + HMS-Beagle 6820 2 70.55 ATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAAAATAAGGTGGCCCCGTCGGCAAGAGACAACCACT:1 - chr3L 18403095 5' - P-element 2861 1 67.83 CTGATTATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1 - 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P-element 2803 1 21.54 GGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGGTTCT:1 - chrX 16946692 5' + FB 79 1 75.37 ATTTCAAGAATTTGCATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chrX 661978 5' + 412 7073 2 67.20 GGCTGAATTTGAAAAAAATTTCGTTGAGTTCGTTTTTGGATGTTGCGATCAGATTTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTG:1 + chr3R 15175960 5' - I-element 360 1 62.07 CTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAA:1 + chr3L 23933552 5' - Cr1a 240 1 63.30 TGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 15790978 5' - roo 8982 2 81.51 GCCCAGGTTCTTCTTCTTTTTCTAATTCTGCCTCAATGTCAAGTGCCTGTTGCCAGAGCGAGAAGGCAGCACAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCG:1 + chr2L 19398975 5' + X-element 4414 1 71.70 AACTCAAATGACGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - 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Bica 341 1 58.74 CCGAGAAAACGTTGGCCAACTCCTTCCACGGAACTCTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGATAACTATTTTCTTCGCAATATCTCCACGAGC:1 + chrX 8406359 5' - R1A1-element 19 1 68.00 GTGTGTGCAACTTAAAATGCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr2R 4606174 5' - 1360 3359 1 63.83 GAAATTACCCATTTGCTTTTCAAAATAAAAAAGCTGACAATATAGGATGGTTAAGGATTCGCACATTAAGTATACGCCACATTGAACCCATGACAAATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGC:1 - chr2L 19925262 5' + Quasimodo 212 2 72.60 ATCAAGTGGTTTAATTGGAAAGCAAACTCGCATTTAATTGACACTCGCATCGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCA:1 + chr3R 24500510 5' + Doc 4532 1 65.07 AGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAAATGTGATCCAT:1 + chrX 19054271 5' + jockey 65 1 65.55 GGAGATATTTAAAGGAATTCGAAGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGG:1 + chr3L 20142645 5' - 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invader2 4687 1 65.07 ACCAATAAGCCCTTCCTCCAAGAGTTATTATCATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2L 12818385 5' + hobo 8 1 78.77 CACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3L 18505752 5' + I-element 50 1 53.10 ATGATTAGAACAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCTAGGAATCTTCTCCTAATCTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCTCAC:1 + chrX 22901627 5' + 17.6 7187 2 55.48 TAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 + chr2R 3564064 5' + Tabor 83 2 71.92 CAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATT:1 - chrX 20999594 5' + BS 52 1 58.33 ATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr3R 10931627 5' + 297 6641 2 63.70 AACCAAAATGTGTGAACAATAAAAATAAATTATTTTGGTTAGGATAACTGCTCTAATACGTCTTAAAAATTATATATTAATTTATAACAATTGTAGTTTTCACACAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chr3R 25757447 5' + jockey 4859 1 69.18 TGTATGCCTCTGAATTCTCCATCGTTCCTCATAGCAACACTGTCTCAAGGTGTTATTACCATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGCTTTAAAATTCA:1 + chr3L 4220286 5' + jockey 4799 1 56.16 TATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATT:1 - 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chr2L 20821337 5' + Burdock 28 2 65.75 GGCCAACGCAGACCAACAAAAATACACAAATATTTCAACACAAATAACAATTATCATAAAGAAACACAGTCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCAC:1 - chrX 17171650 5' + 297 6508 1 52.05 CAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAA:1 + chr3R 9038950 5' + Juan 4093 1 73.97 AGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAG:1 + chr3R 12170081 5' - INE-1 89 1 56.16 ATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAA:1 + chr2R 5106289 5' + Stalker2 7332 2 76.39 AATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:3 + chr3R 31886824 5' + hopper 46 1 55.48 GAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 13972962 5' + 412 7127 2 67.12 ATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAATAGC:1 + chr3L 27356101 5' - Tc3 1616 1 79.45 CATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTA:2 - chr3L 21769096 5' - I-element 5279 1 68.49 GTTCCCCGATACTTCCCCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAATCGTTGAGTTT:1 + chr3R 4964100 5' - roo 391 2 49.55 AAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATT:1 - chr3L 20187400 5' - FB 453 1 65.07 ATTGTATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGT:2 - chr3R 21624141 5' - flea 4949 1 70.55 AATTATTATCAACACCTTATATAGGAGAAGTTAGTGGAGTGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATTTGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATG:1 + chr3R 19449611 5' - roo 8802 2 71.92 GGCGTCTAATTATAAATAGACACACGATGTGCATACATTTGTATGTCAATATGAGAGGTATCACCTCTAAGAAAAGGTTTTTTTCAAGGCTACAAATAATATTAAGTATGTTTAATGAGTATTGAAATTAAAAAAAATAAAACAAT:1 + chr3L 18138692 5' + HB 320 2 42.47 ATCGTTCATACATACAAACAATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATC:1 + chr3L 22723795 5' - HMS-Beagle2 7176 2 76.71 AATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCA:1 - chr2L 6647713 5' + mdg3 80 2 69.18 CTCATTCGCACTCACTTCACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr2L 14675617 5' + 297 27 2 67.12 TAGGGAAAAAAGTATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3L 15103755 5' - Transpac 298 2 78.08 CTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 21299302 5' - roo 344 2 65.07 TTGATATTGATAGTTTTGTTAACAACTAAAGAACAAGAACATTGCACACACACACACACACACACATATCACACATATGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCAGG:1 - chr3L 13537608 5' + Rt1b 4907 1 45.37 TTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr2R 5074574 5' + 1360 69 1 66.44 GATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTAGTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATT:1 + chr3L 17183697 5' + diver 5982 2 78.77 AGGAACAGAATTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chrX 18010051 5' + 412 7089 2 51.97 TTTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGCCTAGAAACGAAAAAAAAAAGAACCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGTTAGTTTAAT:1 - chr2L 12636390 5' - Porto1 4551 1 70.29 GTTTTCATTTTAACGAGTAACGACGATATTTTTTTAATACGTTGTGGGTGTGATAAGATATAATTATTTTTGATTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGG:1 - chr3L 5846266 5' - I-element 5012 1 48.95 CTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:2 - chr3L 18931066 5' + I-element 52 1 51.37 TACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr3R 4683019 5' - Burdock 6376 2 72.52 ACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTTTATCTAT:1 + chrX 292437 5' - G3 4497 1 72.60 ACTTTGTTTTTGAATTCATCCAAATCGTCCATAACTAGTCGTCGGTGAACACTTATAAAAGCAAGGAATCACCTAAATAAGGTCGGGGTTCTACAAGCCAAGTCCCTAAGAAAAATTTCCTTGGTACATGAGAACCAG:1 - chrX 21157389 5' + jockey2 2998 1 44.93 GTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chr3L 6964783 5' + P-element 101 1 16.44 ATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGTG:1 + chr2L 15936782 5' - copia 5080 2 67.81 AAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3L 21380634 5' + I-element 50 1 51.37 TGGTGACTCCGACGCAACCCAAGAGCTGTAAACTGCTGGAGAAGGAGAAGCAGACCGATCGCACCACGAGGATGCTTCTGGCGGTACTGCTGCTCTTCCTGGTCACCGAGTTTTCACAGTCACAAACACATAATACAAGCCACACT:1 + chr3L 2299088 5' + Transib-N1_DM 226 1 78.77 GTTCGGAAGCTGACTTCAAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 10417097 5' + 1360 8 2 75.97 ACTTTTGAATAAAAGCAGCAGCAGCAGCCTCGGACTCCAGGACTGCCAACTGGGAGTTTCGAGTTGCCGCTGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chr3R 28385514 5' - transib2 2776 1 52.74 TAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGGCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACTCACATAGAAACCATATGTTTACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 13294849 5' + roo 8671 2 72.00 TTAATTTAATTTTTGCTTAAAATTAAAAGTTATAGTGGTCAGCAGAGGGCGGCCATAA:1 + chr2R 13712090 5' + springer 7101 1 72.41 GTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATA:2 - chrX 12129416 5' - flea 4962 2 53.42 ACAAGTGGGTAAATAGCACCTGAATATTTGTTACGCTAACCAACGAAAATAATACTTTTGCTTAATATTAAACGTAATCAGTTACAAAGTTCCTAAGCGGAATTGTTTAAAAAATAATTTGACATTACTTAAATAATATTTTTATT:1 + chr3L 10812969 5' - blood 6914 1 87.67 GACGAAACAATAATATACTTTATACAATAATAGTTAATACGATAACACTTAATACCGCTCAAAAGAGTTATTATAAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTATACAAGATACGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGA:1 - chr2L 22156524 5' + INE-1 29 1 58.22 GTTGCAGTGCACTAGGCCATTGGCATCTCGCAACCTTTTGCAGATGGAGGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chr2L 16275067 5' + FB 27 1 67.12 GTGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:3 + chr2L 4063790 5' - roo 393 1 74.66 AAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAA:1 + chr3L 21655862 5' - HMS-Beagle2 272 2 52.74 GGTAGATACTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAAACTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2L 15076074 5' - 1360 3360 1 65.75 GTTAGTTATGGGTTGCACGTAATTGAAGATGCAACGAGGTAGTTTTACACACTAAAGCTTATTCTAATGCGTTGGGTTCTCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTCGGAGACTCTGTGGTGAAGAGCGGGAGAGTGTAAG:1 - chr2L 1300736 5' - GATE 8290 3 75.18 AATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:2 + chr2R 24169962 5' + transib2 53 1 53.42 CTATTCATCTGAAATGCAATTTCAAAATTTTTTCAACAACTCCTTCTGCAGTTCGCATCGCTTTTGGACACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGC:1 - chr3R 11293910 5' + HMS-Beagle2 97 2 53.91 AAGTGTCTTACTGCTTATCAAATTTTGAATTTGGGCGCCTAAAGAGATTTATTCGATAAACTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTATTTT:1 + chr2R 10429576 5' - F-element 4686 5 61.11 TATTGGGGAGCGCACATCCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr2R 10411496 5' + 297 14 2 73.97 TGAAATATACTAAAATAGCGCAGTCATTTCAGTCCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1 - chr3R 28662589 5' + jockey 4551 1 76.71 ATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCCTGTTTGCCCATCACTTAGTTTTTTTTGCCCACGTC:1 - chr3R 30059459 5' + FB 91 1 76.71 CTGTGCAGCAGGCCATGAAAATGTGTGTGCATGAATGGGGCATACATGTCGTATATATATATATATATATATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:1 + chr2R 18752601 5' + jockey 4804 1 68.49 TATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3L 18403064 5' - P-element 2827 1 45.21 CGCTGAACCATCATCAGCAAACCAGGTAATCGGAACACTCCATTTGTATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 13301010 5' - roo 400 1 76.03 AAGGGCACAGTTGTGAATCCATTGAATGTGTGTGCACTTTGAAAAGCCAGTGTGTCTTTCTTTCTGTAACGATGCATTAAATTGAAAACGGCAAAGAAAGTGCTCCGCAGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGGTTT:1 + chr2R 5893125 5' - F-element 186 1 76.71 CTTAGTTCATTTAAGCCAGACTGACGTGACTGGTTGACTCGAGTAAACGCTCGAAAAATCAAACATTGCGATAAAATGGATTAATGAATCGAGAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTA:1 + chr2L 802666 5' + mdg1 7154 2 64.38 GGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCTCTTAGCTGCATCGATCGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr3R 23639106 5' + pogo 26 1 66.44 ACAGATTAATTTCCATCAAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr2L 11357947 5' - blood 7352 2 59.59 AATAACACGAATCTAAAATCAAAAGAAAACCCTAGAAGGACAGCAATAAAAACGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAA:1 - chr3R 6799603 5' - FB 80 1 63.70 AAAAAATTGAAATTAAAAATAAAAAACAAAAGTTAATTGGAAAAGACAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTAAATTTAATATTATGAGTTAATTCAAACACCA:1 - chr2R 13235658 5' + P-element 2732 1 22.61 TTTCTATTGCGCATAAAAGTATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 + chr2L 16946008 5' + hopper 36 1 58.74 ACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:2 + chr3R 6419809 5' - Tabor 457 2 64.38 ATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTTGTCGCTGGTTAC:1 - chr2L 23295917 5' + micropia 22 2 67.81 TAAATATTTATTAACTTTGAGATTTCGATAAAAAACTTCAGGCTGTTTCTTTGGCCGGATGTTCATTTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCTTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTA:1 + chr3R 12652626 5' - Bica 368 2 54.11 TTTTCCAAATTTGAATTTCCCATTGGCCACATAACATCTGCGACTGTGGTCGATCGCGAAGGCCGCACCGTTTGCATTAACCATCATTTACTATTGTCATTATTATTAATTATTATTAATTATTATTATTATTATTGTTTAGTTTT:1 + chr3L 14602071 5' - invader3 5038 1 71.23 TAATACATATGCAAATGTCAACACTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATACCGCCCATAT:1 + chrX 22906774 5' - transib3 2735 1 71.92 TTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTTCATGGGGGTAGTTCATGGGGATGCATTCTCTTCAGACGTCGTAGGGAAATAG:1 - chr3L 11816233 5' - G5A 2666 1 63.01 ATAATTATTTATATATATAATGTGTGTGTGTGTGTGTATGGATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATTAAAAAGATACATAAGAAAAATTCAGCTTAAATTTATTATATGAATTAATAAAAAGAAATA:1 + chr3R 8376597 5' + transib3 2678 1 49.32 GGCTGAGATGCTGGCCGGTTTCACCAGTTCAGATGTTGGGCCCGAGGCGGAGGGTAACTATATAAAAAGACTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGC:1 - chr3L 5662113 5' - invader2 333 1 57.01 AAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 15072675 5' - pogo 2072 1 58.73 CATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr3R 15325194 5' + 297 50 2 56.85 ATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCG:1 - chr4 651046 5' + micropia 53 4 55.17 TTAATATTTAAATATATAATCAATGAAACGTTTTGTTCAAGGTAAGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCACTCATACGCTCTTCACAGCAGAGTCTCCA:1 + chr3L 10707839 5' + GATE 8303 2 59.05 CATTTATTTTAGCTATAAAAATACATTTATTGAAGGAATTGATATATGCCAATTAAATGGTGTATTTTTAATTTCTTTCAATAAAAACATAATTGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1 + chrX 23205139 5' + 3S18 5789 2 66.67 ATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTATTGCGATTAAAAAAA:1 - chr2R 5303147 5' - FB 191 1 58.90 TGAAACCCCTCGGATTGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACTTATG:1 + chr3L 6518534 5' + 412 38 2 58.62 AGCAACTTGCGGAGTCTTCTCCACAGCTGGCACCTAATCAAAGGAGCCGAATGGTACATTAGACACGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAACAGCAAAAAACACACAAATCAACT:1 + chr2R 11088847 5' + Porto1 4445 1 65.75 AAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 - chrX 14722205 5' + diver 5948 2 58.45 AAATGTACAAAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 14304025 5' + roo 8697 2 54.48 TTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAA:1 - chrX 22824255 5' - Gypsy12A_LTR 2241 1 52.86 AATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 - chr3R 7317671 5' - I-element 5297 1 56.85 AGCACAAACAAAGTAGTTTGAAGTGCGGAAAATACAGAAGCATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAA:1 + chrX 588709 5' + Tirant 276 2 69.18 AAATCTTTATTACCAAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr2L 11298033 5' - I-element 5303 1 58.22 TATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAAT:1 - chrX 8360642 5' - roo 9026 1 54.48 TTATATTTAATTTCCCGTAATTGAGCCATTATTTGATGTGGACTCAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTTT:1 - chr3L 23841819 5' - 1360 440 1 49.35 AAATTAGTTGGTGCAGCAGCGGCAGCAGACAGAGTCATACTATAATTAAATTTATAGTTTGACCTAGAAATGTTTTGAAGTTGAAAGTGCGCGGAAACGGACCGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCTGACCCAGCACCGGG:1 + chr3R 19317743 5' + Gypsy6A_LTR 57 1 74.66 AGCCAAGCCGAAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 - chr2L 12984257 5' + hopper 24 1 67.81 GGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:2 + chr3L 17940078 5' + 1360 56 1 58.22 TCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCT:1 - chr3R 28385629 5' + transib2 60 1 57.53 CGTAGACCCAATATAAGCATGCACTACTTGTCCAACCAGTTTGGGCTTATGATTTAAATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCT:1 - 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hopper 1358 1 56.15 ATATTATTCCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTG:1 - chrX 22386825 5' + hobo 45 1 76.61 TCTAAGAACGTATCATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr2R 17878660 5' + Doc 41 1 58.33 AAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr2L 12984230 5' + hopper 51 1 52.05 AACTATCAATATTAAATCATACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCG:1 + chr3R 19449677 5' - roo 8681 2 72.46 TGGCATAATGAAAGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 - chrX 4808638 5' + mdg3 36 2 62.33 GTTTCTCTGCGGACTAAAATAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 9871542 5' + roo 26 2 64.37 TAATGCCCTACACTACTTATACAGCGTAGTTCTAATAGAATTAGTCTGCTTAATAAATTCTACGCTCATACCCTAACATTTCTAGTATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATAT:1 - chr2R 7124184 5' + F-element 4290 1 61.64 AAGTAAAAGGGTATACTAGCTTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGCAGAAGGAAGCGTTTTCGACTATATATAGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3L 12067354 5' - pogo 2052 1 55.48 ATGGGAAAGCCTTTTATTTATGCTCATTTGTTCACATTCGAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGGTTTGTTTTTCCTGTTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTACTAGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGA:1 - chrX 11906376 5' + INE-1 18 1 46.58 AAGATAATTGCAAATGGAGTTGTACAGTTGTTTCAAACTATGAAACTTAACACTTTGCGTCCCATCACTTCGGGACTTGACTGCTTGACCTTTTTTTTTATTATTCATTAATCTTAAAGTCACTAGGAATCGTTTAGTTCCTTCTA:1 - chr3R 2846376 5' - G5A 2805 1 80.14 AGATTTTATTTTTAGCTGCAATTCCAGGGAAGTGAAGATCATCATCCGTTTCAACATCATTCAGCGAACACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAGAGACTTAAATATCCCATCAGT:1 - chr4 134664 5' + F-element 4395 1 61.64 AAAGAATTTAACTCTTTACAACCACGAGGTCAAACCAAGTCAAAAGTGTAGCACATATTCAGTTGAGCCAAAAAATAAAGCTTTTTTTTTGTTTAAAAAAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACAGATCTATTCATACAT:1 - chr3L 27357514 5' + Tc3 1627 1 66.44 TGATTATAAAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 47040 5' + roo 8678 2 76.71 ATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3L 9809266 5' + 412 7133 2 73.29 CATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 27123586 5' - roo 9018 2 54.11 ACCCTGTCATAAACAGGGTGCTATATACACGTGAAGACAATTTATTGTTTATAAATTACCTTAGAGAAAACATATACATCTTAGGAATAGAATGGATAAGTATGGGCCTCTATTTACTTGCTTCAATAAATAATAAAATAAATAAA:2 - chr2R 10186311 5' + BS 5095 1 76.71 TTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:2 + chr3L 5489844 5' + jockey 28 1 63.70 TTTTAAATGAAAATTAATTTATGCGAATCGATAAGCCGTCGGCTGGCCGTTGGAAAAAAAAAAAGTTTGCGGGAGTTGTTGGAAAAACCAAATGGAAAAAGTTTAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 7593112 5' + TART-C 11097 3 71.67 ATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 + chrX 11209858 5' + hobo 71 1 65.07 AAAAAGCGGAAAAAATAAGGAGAAGAGCCAACTTTCAAAACCCGAAACTTTCATACCCTGGCATTAATAGAATACTATTGACTAGACGACCAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAA:1 + chr2L 15936591 5' + copia 4678 1 56.85 AAACCAATTCAGCGCTTTGCGTACAAAACGCAACTAATGGCAAGATGGGTCAACAAACTTTCGCTGCATCTTTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGGTTTTATATTTCCTGAGATTTCGACGTTCATACGGACATACGG:1 + chr2R 5745727 5' - INE-1 127 1 73.57 TATCATCATCATCAAACTCTTGGCCCTTGTGCACGGCAATTGTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAG:1 - chr2L 17766206 5' + Doc 187 1 56.85 ACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTT:1 - chr3R 3179351 5' - S-element 1270 1 74.78 GTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 11164521 5' + roo 8709 2 54.79 TATACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGATTCGTTGAAAATTATGTAACACGCAGAAGAAAGCGTTTCCGACTTTATAAAGTATATACAGCTGTGTTCGTAAAAATAGCAGTGCAAGGGAAACTAAGTAATACAAAGG:1 + chr2R 5249885 5' + HB 35 1 71.92 GTGATAACTCATTCTGCTCATTTTGCAGGTTGAGCAAAGTCGCAGTTTCATTTCATATTAATGACAGAAGGTCCCCAAAAAAATAAGAGAGTGAAATAAAGTTGTTAAAAAGTTAAATAATTTAATAAATAATAAATTAATAAAT:1 - chrX 16193631 5' - INE-1 413 1 76.55 ACTGGGCCCACTTTTTTGGCCATGGCCATGGAGGCCGCTATGTGAGAACTCGAACTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACA:1 - 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Juan 4206 1 79.31 AAGTGAACAAGAAACGATTCATGCTTAAAATGTAATTTTTTTTTATAATAATAATAAGAACTATAATGAACTATAATAATGATTAAGAACTCTAATTACCAACACGCGGAGCCCTTAATATGTATATATAAATATACATATATACA:1 + chr2R 18858167 5' + Stalker 6939 4 31.51 TACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr3R 7420300 5' + 1360 58 1 60.99 TGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chr2L 6654627 5' + diver 5928 2 56.85 AAAATGTAATTTAATGGCCTGGCTAACGCTACAGAAACTCCAGGATGGAGCAGGGGAAACGCATGGAAATAAAACCAATAAATCAAAAGCATGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGG:1 + chrX 560938 5' + micropia 5405 2 60.96 AGTTGTTGGGCAACTTCAAAGCTGGAAGTCGTATTTAAACCGTGCTTTTAGCACATATTCCGCGTGTCAACAGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGT:1 + chr3L 17567820 5' + S-element 1532 1 76.03 TTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCGCTAGAGG:1 - 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chr3R 13939125 5' + micropia 5031 2 64.38 AGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 5769028 5' - roo 345 2 67.44 AGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3L 27391418 5' - 1360 3361 1 61.64 CAGCAGCAACAGCGACAACAACAACGACGGCTACTGTGACTGACTTTTACGAGTACCGAGTAGTAAAATAAAAAACAAAACCAACCAATATCTCAGAAAGTCACCCGAACGCACTGAGAGCGTATCTCTCAAGCTCTCCCCATCCC:1 - chr2L 18797815 5' + Doc3-element 443 1 76.03 ATAAAATAAAAGTATGGCAGCAAAAGATGAACGATTCGCAGATAGTTTATGGTGCACAGGAACTGTAAAGAAGTATTCTCCATAACTATGAAATTAAAGAAAAGCAAGGGGTATTTGAATATTTTTTTAAAACAATTTTTAATCCA:1 - chr2L 15351070 5' + Juan 3785 1 71.23 CTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:2 + chr3R 23639146 5' + pogo 66 1 63.01 ACACTGAATTACTATTGGCCAGCCTTGGTGATGTTGTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTT:1 - chr3L 6964825 5' + P-element 39 1 49.21 GAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGACTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 - chr2R 20349045 5' - transib2 2761 1 63.50 AATATATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGAAACTGAAACTGTTAGAGAGTTGTTATGAAAAAAAAACAGTTTTAA:2 - chr2R 5663397 5' - looper1 1625 1 81.51 TTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 + chr3R 19073200 5' + roo 78 2 73.97 CATAGTGCACAGTGTAATTTTGCATTTGCTAATTACCGAACAGAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 + chrX 2814258 5' + FB 78 1 70.55 GTATGACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:2 + chr3R 4964074 5' - roo 9030 1 57.53 TGACAGTGGCCAAGTGCACACGCATTGAGTCATTCAGTCGGGCATTCCAACACTCAATCCGCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGAGTTAAATTTGTAAGGCCA:1 - chr2L 7125383 5' + Doc3-element 4600 1 62.33 AGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 - chr3L 17874020 5' + 1360 42 1 79.07 AATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chrX 19054207 5' + jockey 28 1 69.86 AGTTAACAAAACCTTATCCAATTTATCCACTACATTTGTATAGTCATCTGGCAGAAATGCAGTGATTCTCTCTATCGATATGTCAAAAAATTTGGACCCGCCCATTTTAACGCCATTTTAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCG:1 - chr4 666031 5' - INE-1 570 1 61.38 AGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr2L 15936784 5' - copia 209 2 70.55 ACTAAACTCACACCGATGTAGAACCAACCACCCACACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 26404971 5' + hobo 28 1 62.88 GGCACAGAAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 + chr2R 4362734 5' + F-element 18 1 71.23 AGTATTCATCAGACATTTTTCTAAAAATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACC:1 - 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copia 4878 2 67.12 ACATCCAACCAAAATTATCTTAACAGGTACCTTTTTTCAATTTATAAAATTTTTCTCTCATTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTGAATTTTATAATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCAT:1 - chr3L 22639847 5' - G4 3770 1 66.44 AATGTAGCAGAAGAAGACTCCGGACTCAGTCACTTTGCAAACAGTATCCCCCACTAAGCTCTGACTAGCGAAATTTGCAGCCAGGCACCGGAATTTCTGTCGTCGAGTCGGTT:1 + chr2R 22754286 5' + Chimpo 317 1 79.65 TTTATATTATATTATTATATTTAGAGTAAATGGGTATACTAGATTCGTTTAAAAATGTATGTAACAATCATATGGACAGACGGACATGGCCAGACCGACTCGGCTATT:1 + chrY 2448411 5' - INE-1 102 1 68.52 TCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAG:1 + chr3R 14860110 5' - BS 5062 1 58.90 GCCGCATCTAATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGTAAGCTAGGCACTGC:1 + chr2R 17796502 5' + jockey 4686 1 75.34 CACGGGTCCTATCTTAATAAAATTAAATGAAATTCGCCAACAATTTTTGCGTCATGGGCAATATTTGGTTAATTATAATTGCGGCTAAATAACTGCTAGTTAATTAAGTTTTAAGAGCAAAGGTTTTATTTTATTTTTTTAAATTT:1 + chr3R 20136331 5' - TART-C 11097 1 76.03 GTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAGAAAAC:1 - chrX 22906774 5' - Transib-N1_DM 22 1 69.86 ATTCTGCAACATTATTTTTTCAACATTTAATTCAAGCTTCGCCTTTTAGCTTGCTATTCAAGTGCAGCAAGAAGATACATTTGACATCTCAATTAATTATTACAGTAAAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2R 7304158 5' + pogo 23 1 67.12 CAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATCATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 + chrX 13134866 5' + jockey 4799 1 56.16 TTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAT:2 + chrX 13134914 5' + jockey 4847 1 75.34 CTTGCTTGTTAATTTTCAGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAA:1 - chr2R 4545194 5' - invader1 3559 1 69.18 ATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:4 + chr3R 15724269 5' - Juan 4187 1 63.70 ATATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr3L 10731919 5' + 297 8 2 73.38 CGAAGATACGATACGATCACTGGCATTACAGTCGATTGATAATGCTATTATTGAAAATAAATATGCATATGCATTTTTAAATTCTCATCAATCAGCTAGTGGAAATGCGAATGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGGCAG:1 - chrX 22517579 5' - INE-1 502 1 80.14 AATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 + chr2R 9966962 5' + Bari1 44 1 45.21 TTATACTGTCAACGTTTACTGCTAGATATTATAATTAAATTTCTTTTTAAATTTATTTCTATAATTGCCTTTTTATTTTTCTTACTAAGAGAGTGATAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCAAGCAAAAAACAACACCAAACAGCAC:1 + chr3R 21014406 5' - Cr1a 245 1 57.53 ATACTGAAATATTGGTCGAATCCTTCATGACTCAGGGAACATGGTTTAAAAGCCTGAAGTCCAAAAAAGGCGCAGCTATTAATGCTTATAATGGATACACCAATTTAGAAAACAAATGTAGTAAGCTAGAGGTACACAGACATAAG:1 + chrX 21100419 5' + invader2 9 2 63.70 TAATAATAATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:2 + chr3R 556395 5' - Juan 4134 1 72.60 GTGTGACTCTTGAAAGTTGCCTCAAGTTGCCTATTTGTTTCTTTTCATATTTATGCCCCTTCGGCTCGCTCAATTTATATAAATACATATATGCATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATT:1 - chr2L 18212258 5' - Quasimodo 7346 2 71.92 TATTATTAAAAACAAAAGTTTAATTAAAACTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 71314 5' + 412 18 2 73.29 ATAGATATGCAATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr2R 7090626 5' - I-element 5305 1 51.03 AGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGCTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGGCCATACATTTGGTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr3R 4487816 5' - 1360 3350 1 62.00 GTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 + chr2R 3563117 5' - Transpac 5165 2 73.11 AACGTAAAGAAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:2 - chrX 8092539 5' + pogo 10 1 77.40 TGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 14366539 5' - roo 338 2 68.49 AACACAAAAAATAGCCAATAATTTGAACTTTTATCATAATCATATGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTG:1 + chr3R 6623677 5' + flea 4863 1 69.18 TAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:3 + chr2R 20010188 5' - Juan 4161 1 54.79 AAGCAAAGGTATCGAGTCCCATAAGCTCTATTTTACTCATCTGTCCTTTAAATTGCTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3R 6625664 5' - flea 4991 2 69.18 ATTCGGAGTCGCAAAATGTGGATGTGGCATCGCAGGCCCAAACGCAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTG:1 - chrX 12954499 5' - F-element 206 1 65.55 ATTTGCACGTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 + chr2L 4003671 5' + mdg1 7086 2 52.74 ATGATTGCTTCACTTATAGGGTAAAGGGTAGGGTATATCCACATAGGCGAGTGCGAAGCAAAGGCTTATTTATTTACATTGGCATCGCATAATACAAGATATATTTTATATTTACCAAGAAGTAATAATATTAATAATATTAATT:1 + chr3R 21725612 5' + mdg1 37 2 60.69 CTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chrX 18396107 5' - roo 321 2 75.17 TGATCAAGTAGTACTACTACTATCCAACTTTCAACTCTCCATGAAGATTTCAGATCAGAAAGTTCAGATCTTCACACATGGCTGTTTTGACTCCGTTGTTGAAATTATAAAGAACTGTTGTTTTAAATAATAACAAAAAATAAAAA:1 - chr2R 9493898 5' + BS 5098 2 80.14 AGGAACGACTGGTGGAGAACAAGAAAAGAGGAATTCAAAAAAATACAACGACAGACTAGAATCTCATCGTAATAGTCTAGCTAAACGACTTAGTATCGCAGCCCAAGTACGAGAAGAAGATTAAAACGCCACCACCCTCAAGACC:1 - chr4 731546 5' + jockey2 3177 1 71.72 AAAACAACCATACTCACACTAACACACTCACTTGGTAAAATGATGATACATTTAAACAAGGAATAAATCATTATACCCGTTATTTGTAGAGTAAAAGGGTATACCACAGTCGTAGATATATATTCTTGATCAGGATAAATAGCC:1 - chr2R 4387441 5' + INE-1 87 1 79.17 AATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:3 + chr2L 10156125 5' - hopper2 1531 1 70.55 ATTTACCTGATGACGGTTTTCATTTTGGTACCGCCCCTTCTTCAGCTTTTCCATCAATCGGTGACAAATTATTCACGCTGTCATGTGGAACACTTTTCGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3L 11392677 5' - accord 185 2 45.90 TAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCAGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCAACAATTTCTGAGATTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGAAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATCGTCTCCGC:1 + chr3R 26504205 5' + HMS-Beagle 34 2 47.66 AATTAAACTGAGCGCACGCACCAGAGAACGGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3L 22325859 5' + hobo 41 1 73.49 GACGCAATTTACCTATCGAGGGTCCCAGGTGCTCTGAAAGGCCAATGGACTGGTATTGCAGCACACCGCGCCATACACACCGCAACAAAATCGTAGGAAATAAATAAATATATTCGAAAGAAGACAGTTCTAGAAAAGGAGGAAA:1 + chr2R 5024258 5' - Gypsy12A_LTR 2025 1 63.45 ATATTCGAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chr3L 21380642 5' + I-element 31 1 61.48 ATTATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGAATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 - chrX 5323170 5' - Juan 4199 1 34.25 TTCTTCGATTTCAATCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATT:1 + chr2L 12822815 5' - P-element 2805 1 18.62 CTTACATGAAGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr2R 11804582 5' - pogo 2095 1 78.36 TTGATATTGCGAAGATTTTTTAGAGCAATGGCACAAAAAGTGCAACCAAACGATAAAAACCATTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAAATGGACGTGGGCAAAAGAAACTAAT:1 - chr2R 5180367 5' - FB 91 1 63.08 GATAAAGCAAACAAAAAGCCCACAGCAAGTATAACATGTTAATTAACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGATTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 + chr3L 18505604 5' - I-element 5337 1 74.83 TAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTATAA:1 + chr2L 18471703 5' - Juan 3797 1 75.34 AATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 11191396 5' - roo 343 2 65.07 GGATAAGTTTTTACAGAAAAGCTCTGCTATTTGTAATTTGTGGTAGCGCTTGTGTTTGTGGAGGGATTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTAATCTCTTCAGACGTCGGAGGAAAATGGGGTCGACAAGATCA:1 - chr2R 5616956 5' - G5A 2652 1 59.29 ATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 5769118 5' + roo 53 2 59.59 AGACCTGGTTCTAATGATCTACAATCTATGCTGAAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTT:3 + chr3L 21655829 5' - HMS-Beagle2 305 2 75.34 ATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 23067508 5' - roo 325 2 74.66 TCATTCGCCATTTGGCACAAGCATCATTAACAACAAACCTTTTACCAAAAAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr2L 8550664 5' + Juan 9 1 43.85 AAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 + chr3R 17996148 5' + diver 29 2 60.61 TGGGGAAATGAAAAAAGAGCTTTTGGAATAGTCAGAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGTCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATCTAACAATTACC:1 + chrX 7925296 5' - Doc 185 1 73.29 TGGAACCGCTTAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 - chr2R 8157309 5' + mdg1 7064 2 67.81 GTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGA:3 + chrX 20999507 5' - BS 5031 1 62.33 ACATATGCAGACGGTAGTCTTCCAGTTGCTATCGTTTTGAAAATATTTGATTGTTTCAAGGGACATTTCAATAAAAGAAAATCTAAAGAAAATATAATATTTATTTTGTGCTGTAAAAGAGGGCACCTTGTAAAATAAAATAATAT:1 - chr2R 14143426 5' + jockey 4923 1 61.64 ACAATTNTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTC:1 - chr3L 46976 5' + FB 91 1 77.40 AATACAAATTCAACTGCGCTCTTTTCTGTGTTTTGCAATTCACAATTGCGTGGCGAAGGCAAAAAGGAACAAATAAAGAATAACAAAAAAAGTTTTGTTACCACAAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAA:1 + chr2L 19862394 5' - invader4 2674 1 75.34 GTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTG:2 - chr2R 9967120 5' - Bari1 1634 1 67.12 AAATAGTGAAAGAATCTTATAGTAAAGGTGCCACCTTGATCTTTAACTCGTAATCATCTTTCATTCCCCTCAGTTCAGTAATTTACAAGGCGTATTTGCCTTTCTACCTATGTCCATTGGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATT:1 - chr2R 16479913 5' - accord 7026 2 58.22 AAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCAT:1 + chr3R 19073157 5' + roo 35 2 56.16 GAAGAGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 13406376 5' - pogo 2077 1 69.18 TATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCTGTAATGCAC:1 - chr3R 15325202 5' + 297 6623 2 54.79 AACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCG:1 - chr2R 4794832 5' + 3S18 6089 2 76.38 TATATAATTAATAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chr3R 21630376 5' - I-element 5320 1 62.33 ATTAGGACGCGTTCGCTACAATGAGAACCGACGACCGACAAGGATGCCTGCGGGGCAGGATGTGTGATGTGGATGTGCATGTGTGGATGATTTTAACTCAATTTCACATAATTTTTTTATAAAATATAATTAAACAATATTTATTT:1 + chr3L 19245425 5' + S-element 108 2 72.60 CAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGAGGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAA:1 + chr2L 11391475 5' - 1360 41 1 52.08 ANTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTT:1 + chr3R 26178398 5' - 412 7480 2 69.84 ATGTTTAGCTTAAAAGGTCAATGGGGTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 14366480 5' - roo 399 1 78.62 ATAAATATATATGTAATATAGAAGCGTGTGATATTGTTAAGATTTCTTCAGTTCTGGAATTTTTTACTCTCATTAATTTTCTTTTATTATCATATATTGTTAACATAATTATTTAATAGCCGTGCGCTTCGCGGGTGATTCTTTGT:1 - chr2R 3931928 5' + Cr1a 132 1 58.22 TGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 19032602 5' + roo 60 2 65.00 ACAGCTACGCTTAATCAAAGGGCTCTCGATCTTTGATTACATTTCGAACTTAGACATTAATGTGTGACTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTACACATATGTACTTATCTTACGTGTAAGGAGTTAATGGG:1 + chr3L 24234046 5' - G5A 2699 1 63.01 TTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATG:1 + chr3R 31886854 5' + hopper 75 1 71.72 AAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr2R 17926284 5' - opus 7468 2 59.56 CTATCGCACTGCTGAATATATCAGAAAAATGCCGCAAGGACCTGCGCCCCTGATGGCCTCCAGGCACTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAATATCAGAATTTTTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATTTTTTTGAAA:1 - chr3R 14179516 5' + HB 1469 1 47.18 CAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 + chr3R 8051146 5' + jockey 4844 1 78.77 CTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTGGTGATTTTTTTTTGCCGTTTGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACC:1 + chr2R 5582142 5' + Cr1a 44 1 78.63 ATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAA:2 - chr3R 21276650 5' - BS 5059 1 52.05 GGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2L 18549864 5' + roo 8711 2 82.11 CCCACAAAAGTCTACTATTTAATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chrX 19539436 5' + pogo 16 1 61.64 GTATCCTCACAAAAAGGCATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 - chr2R 21411020 5' + Burdock 6 2 80.28 ATAACTATTTAAAAGATTCTAGCGATTGAAGTACAGATAATATTTGTTCATTTCACTTGGCTTATAAATCAGATGAATCTGGTTTATGTTTCCTAATTAATCTACTTTGTGAAAGTTCACAAAGTCATAACTAAAACAACAATATT:1 - chr3L 2108089 5' + 297 6971 2 50.00 TAAAACGAAGACTCATGTCAGGTGACTTAAATACCCTTGCGAGCCGATTCATCAAATACAGATGATATTTGCAATAGTAATTTAATACCTGCGCTTCATCAAACACTAATAATAATATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 13905124 5' + Rt1a 5073 1 77.69 CACCAACAAGTACATGAACTTGTATGAGGCCAAAAGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCCGAGAGTGCGAGTGCGGGGGTGCTCGAGGGCATGGTGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2R 22514258 5' + P-element 2 2 76.03 ATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 14366556 5' - roo 322 2 78.62 TGTAACATTTTCTTTTTATTTACATTTCAAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCTGATATTATTAGTGATAAATACTCTATTATAAATAGACAATCTAGTCATAAGCT:1 - chrX 2479586 5' + mdg3 62 2 43.84 GTTCTTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - 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chr2R 22041227 5' - Quasimodo 124 2 45.89 AAAACCCTCCCACGGGGATATCCGTGACATATGTAAAGTGTAAGCTCGTCCAAGGACCTGGGAGCAAGGACTCGCGGCAAGGACAAGAGGGGGCAGTTCGACGACTCGGCCTG:1 + chr3R 8225627 5' - diver 5696 1 80.53 GTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACT:1 + chr2R 18514884 5' - P-element 375 1 55.77 GTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:1 - chr2R 6965583 5' + Transpac 64 2 60.96 CTCCGCTCTCTTTCCGCTCTTCTGTACACGCGAGCCGACTGGAAAATTTGGAAAGCCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGGGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 22960571 5' + Tirant 15 2 73.33 CCATACCCCCCTAGCTTGTCAATTTTTTAATTTAAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGGGATATTTCTT:1 + chr2R 17366128 5' + I-element 5016 1 74.65 AATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTAATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 16510092 5' + F-element 49 1 43.85 TGGTCGAACAAAAGAAAAATTCTGGCTGAAAAATGAATATTTTCACCCAAATCCATAGACTGAAACGGGTTCTCATACTGAGACGATCCTTTTTGGGTCCGTGCTTTTTGATTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGCTCGCG:1 - chr3R 11305716 5' - G6 5 1 78.42 ACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 4964079 5' - roo 9025 2 54.11 ACAAAAAGCGACACTTTAATCATTCTGAGCAAGCGCTAAACATTTCCGACCAACAAAAACAGAAACTTGAGCATATTTCCGCTGGATTTCGTATAACCACATCGGTACGATGCAGTTGGCAAGCACAGCTCTTTTGCACCTCAGCG:1 - chr3L 12436319 5' - Helena 1022 1 64.38 TAGGCTGGCCCAGGCTAATGTCCCATTGTTAAGGCTTCCATTTCGCCGTTAGGCAAGTGGCGATGGACCACAATGAAAAACTAACGGGATTTTTTTTTTCCTATCTACACATTCAATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTC:1 + chr3R 24989054 5' - HB 84 1 50.34 ACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACCCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACAATGCACTATGGGGCATGTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 + chr2R 20227215 5' + hopper 32 1 46.67 TTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCATCCAACAATTTTGTTTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chrX 22386812 5' + hobo 80 1 56.16 AAATCTATTCCTAGAATGTTTGAGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 3355098 5' + 1360 53 1 57.97 AAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:2 - chr3R 21630356 5' - I-element 5300 1 56.85 TTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:1 - chr2L 13844261 5' + Stalker2 59 2 55.48 AAGAGTTTTTGAAATTCTGGGCAATAGAAGCACTTACTTATATGATGATGATGAACATACATAGACATAATATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTT:1 + chr2R 6989053 5' + HB 54 1 54.11 TGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 - chr2L 15913345 5' - transib2 2772 1 54.79 AGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2R 17796531 5' + jockey 4694 1 64.80 TATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAAAGAATGCTATAATCGACTTTCAGACCCGACTAGCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGTGAATACGAACGCGAAATTTTATAATTTTTCTGGGACATCGATAGAT:1 - chrX 14770743 5' - INE-1 500 1 67.12 AATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 14366523 5' - roo 9018 2 57.53 GGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr2L 12250970 5' + 412 83 2 75.17 GCGCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTT:1 - chr3R 27123614 5' - roo 389 2 67.86 AAATGAAAATGAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCATTTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACTT:1 + chr3R 26504183 5' + HMS-Beagle 6821 2 65.96 AGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGC:1 + chr3R 19224992 5' + HMS-Beagle 6858 2 60.96 AATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr3R 30675450 5' + 297 6642 2 64.38 ACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATG:1 + chr2L 10156136 5' - hopper2 1521 2 77.93 ATCGGAGGTTTTCTGTAAACACTATATTTGTATGTACGCATATTTCTCAACGCAAGACATTTTTTTTGACACTCGTCGTGTGTGAGATATTTTAGAACATCCAATGGATATAGGGATTATTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAT:1 + chrX 2280921 5' + micropia 5108 4 78.08 TTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAAGCATTTGGAGATTAAGAGCAGAAAATATTTGCAATAAACAGCACGCGCATCACAATAATTATTGTTTCGATATTGTCTCGGTGGAACTTGTGAAATTAGT:1 - chr4 976564 5' + looper1 219 1 66.21 GTGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCCGGCCCAATGCTTTGTCAGCAATTTGGCC:1 - chrX 21772484 5' - gypsy6 7475 2 72.22 ACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:2 + chr2R 22034651 5' - copia 5062 2 62.33 AGGAGAAGCAGAAACAGAAGCTGGTGGACATGATCAAGTGCGCCCTGAACGAGGTGGGATGCGAGGAGCTGCCCTCCGGATATAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAG:1 - chr3R 9372877 5' + transib2 142 1 54.11 TTATTTAATTATTAATTATTAAATTTATTTATTATTAAAATTTAAAAATTATTTTCATTTATAATATATATATATATATATATATATATATAATTTTTATTAATTATTTTAAATAATTTTATTCATAAAATAATTTATTATAAAAA:1 + chrX 13690466 5' + BS4 726 1 26.03 TTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCATGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAG:2 + chr2R 3919678 5' + 1360 90 1 78.08 TAAATGATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAAC:1 - chr2L 9010180 5' + G2 2711 1 63.01 AAAACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 2145873 5' + roo 44 2 54.11 AAGCTGTAGATAAATAATGGAATCGAAAGTACAGGAGCATAGATAACGTAAGTCTTATCCTATTTTTTTTTGTATACTATGTTTTATACTATTAATAAGTAGATTTTTTTTTGCTATTATTTTGTTTTTTTTTATTTAATTTTTTG:1 + chrX 17088054 5' - X-element 4719 1 67.81 ATATACCTGTATACATATGTACATATATACATATATCCAAAGATACATATATACATTTATCCATATATACATATATTCTTATATACATATATTCATGTATACATATATACATATATATATATATACATATATACATATATACATAT:1 + chr4 503510 5' - G3 4507 2 78.77 CACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGATACGAATAGCA:1 - chr3L 19111571 5' + Doc 39 1 74.70 GCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 - chr2R 4606285 5' + 1360 74 1 69.66 ATATCGGCAAATCATAACAGTAAAATATGTTTTTAATTTTAAGTTAATTTAAAGTTCAAAGACTGCAATGTTTGTAACAGGCACAAGGAAGTGTTCCCGACCATATAAAGTATATACGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 - chr2L 22758188 5' + INE-1 91 1 52.74 GGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chrX 14722257 5' + diver 5895 2 73.61 TGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGT:1 - chr3L 12004311 5' + P-element 48 1 35.24 GTCCTGATTTACGACCTACTTCCGTGTGTTTGTTTATGTTTTTATGTTTTAGGCCTTCACTTAAGATACTCTAGTCGCTATCGATTTGTAAACATATTGGTAGTCCCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATG:1 + chr2L 6738591 5' + Doc3-element 4712 1 61.64 TGGCACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr2L 16943911 5' - copia 242 1 52.74 AATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAACGTTGCCTCCAGAAACGA:1 + chr2R 21160652 5' - Transpac 257 2 56.85 GTACATATATTCAGCAAAATTTTACATACACATAAAATTATACATACCCATAAATATACATATCCATACATATCCACATATATTCCAATAAAATTTACATCCACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr3L 25175663 5' + flea 4771 2 75.86 CTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 - chr3L 15103909 5' + Transpac 57 2 58.62 ACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chrY 311461 5' + 1360 3 2 53.42 ATCAGCGATCAGCATTAAGTTTTCCAAAGCCGATTCGGTCATTTAAAGCGATTATATTATCTTATAATAAAAATGATCGTAATTGGACCAATTAAAATGAACTTCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGT:1 - chr3L 21918903 5' - Juan 4089 1 75.34 GTTGCATGCGACATACTGAAAAATTAGGCAAAGCAACAAATTCAAGCCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTATTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3R 17673894 5' + FB 1 1 80.43 ATTCAATGCCCTAATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 + chr3L 10731754 5' - 297 351 2 52.41 AAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2L 9636050 5' - 412 458 2 58.22 ATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGGTAAAAATTAAGTGTTCTTTGTTAAATTAAACGCAATTTTTTTTATGAATAATATTTAATTTAATTTTATTAAATAATATTCATT:1 - chrX 15019100 5' - TAHRE 71 1 89.73 CATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3L 20898625 5' - roo 9010 2 62.33 TAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAAAATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACT:1 - chr3L 13365814 5' - BS 5012 1 73.97 TGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACA:3 - chrX 12217459 5' + rover 46 2 56.85 CTTTCTCCTTTTTGGCGAAATGAAATGAAAACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGGGGGCGGGGGGTGGGGGGATACTGTTGGAATATACTATCCAACCTACAAAAA:1 - chr3L 21327226 5' + copia 9 2 75.34 TGTTTGACATTTACTAATTAGTTAATGCATGGATCCCCACAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTC:1 + chr3R 8145684 5' + I-element 5014 1 73.29 AATATGGTATCAAACATCAAACCAAAGTCATCTTAACAGCTACATTTTTTTAAGTGTAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGATAGCATTCTCGAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 + chrX 22518944 5' - INE-1 563 1 73.33 ATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1 + chr3L 13365768 5' + BS 5077 1 72.60 AATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chrX 661871 5' - 412 7472 2 68.28 TGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATT:1 - chr2L 17005790 5' + Stalker2 76 2 68.49 GAAAACAATAAAGATGAAGAAAAACGAAAAGTGTTGTTATTTATTTGGGAAATCTGATATCATTAGCTAAAACCCCATATTGTCCATGCCCCAATTCAAACAAGCAGATATAATTTTTTCAATTTTTTTTTTATTTTATTTTTAAA:1 + chrX 11801562 5' - TART-C 11100 1 50.00 AGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3L 24291990 5' + 1360 63 1 71.32 TGATGGTTAAGGCCATTTTGGATAGTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr3L 24131383 5' + Transpac 4968 2 55.48 ACCACGAACCGATTCAAATTAAATATATAAATATATTTATATATTTATATATATAATATATGTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr3R 4217806 5' - 297 349 2 73.10 ATAATTCGCGATCTGTGATCATATGAAAGCGCTGCCTATCTTTTCGAAAAACCTCGGGTAAGCTTTTAGTTACTTTAAGTACAATACATAAGCGGTCCACCCGGGCAGAGATCCACAGTACCCGGGTAAGGCTAACCAGACCAGAC:1 + chr2L 22391584 5' - baggins 317 1 58.22 CAATCAAGAAAAGGAACTGGAGATGAAAGTAACAGATGTTACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTAAAGATCCCGACATGTCCGGAATGGCTAGTGATCCTGATCAAGAAT:1 - chr2R 13259730 5' - INE-1 86 1 67.81 TGAGTGTGTGGGTGGGGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAA:1 + chr3R 9038924 5' + Juan 4067 1 56.16 ATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 - chr2R 7306539 5' + Max-element 58 2 75.00 TAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr3R 4805620 5' - 1360 3313 1 69.18 ATTTGAATACCCTATTTTACATTTCTAAAATCTTTGAGTTAGAGTATTTTCGTCTTCGGTCTATTCAAACACTTCCCTTTACTTCTGGCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAG:1 + chr3R 13992897 5' + Bica 4689 1 72.13 CGTTGCCTGCTTTTAGGGGCATCCAATATGGCTGCCGGGCAAGCTCAATCTCACCAACACAGCCATGTCACTCGCATGGGAGATGAGCAAACGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 28928424 5' + jockey 30 1 58.41 GCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGTAAGGCGAAGCTT:1 - chrX 18282672 5' + P-element 23 1 52.17 GAGACTGAAGATATGGTGGGAGATGCTCTTGAATATGGACGCTATGGATGGATATGGATGATATGAATGCTCTCAATACTTGCAAGGAAAATGAATTATGGCCACTAATAATCAAAATATATATTAATAACAAAAAAAA:1 + chrX 19198822 5' + Rt1a 5070 1 52.52 ACCACTCCCGATTATAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGTCCTGTTTTTTTTTTTATAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr2R 19941647 5' + hopper 35 1 57.58 TTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 + chr3R 8051120 5' + jockey 4817 1 60.69 ATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTCCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chrX 17343387 5' + I-element 60 1 60.14 CGCACATCGATGTTCTATTAAAGCGGGCATAATGTATGCATTTATATATTAATTTATAGCCTTACAGCAGCTCAAAGAAGCAGTCCGAAATTATTTTGAAATTTGAAAGCTGGAACCACGTCCAGGTTTTGAGATATGAATTTTCG:1 - chr2L 21707822 5' + FB 115 1 54.11 AAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 13168757 5' + P-element 50 1 53.42 GACCACTCCCAACCGAGCTGAATAATTGAATGCTGTGCTAATTTAACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chr2R 22034796 5' + copia 4884 2 73.97 AAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTC:1 - chr3R 10736141 5' + McClintock 6001 2 56.16 TTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chr2L 7660882 5' - I-element 5324 1 61.38 AGTTTTAAAACTATTTTCATGAAAATTTCTTTCTTTTTTTGCACGACGGAACTGATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 5151353 5' + roo 8694 2 62.07 AACCTCTCATCGTGCGTTCGATCAAGTTTTCATATCTTTGGCACTATCTTTATGGCACTTCGCATTTGCATTTGCACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATAGTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCCATTC:1 + chr3L 22771175 5' - Porto1 4234 1 56.85 AGTTGGGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 + chr2L 17005660 5' - Stalker2 7634 2 64.83 CTGACTTCTACCAGCTTTGCGACAATGAAATTAGCATTAGAAATTTGTCTCCTGTCAGCTGTCCCCTGTTTGCATTTGTTTAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2R 9737211 5' + transib2 2634 1 56.25 TATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 - chrX 14722212 5' + diver 5899 2 66.00 GTTGATTTAAATATATATATGGTTTAACTAATTTTAAGTTGCAAACAAATCGAAAACATCAAACAAGAAAAGATACCAGCGAAATTTAAGAATGGAACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCG:1 - chr2L 3146762 5' + invader4 2758 1 66.44 ATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chrX 18239408 5' + jockey 75 1 69.17 AATGACGTTAATATTAAAAGATAAGAAAATGAGGGGCGAGCTAAAAACAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16232326 5' - hopper 145 108 63.89 TATGGGCTTTGAGGGAGTGAATAAATAAGTTCCGATTGTTTTATATATATATATACATTTTTTTTTTTGCATTGCGGATCACAGAGATATACACGGTCTTAACACATATAAGTCACATAAGTGTTACCGTCTTTTCGCTTTTACAT:1 + chrX 19891816 5' - Porto1 94 1 52.74 CTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTGTGCT:1 + chr3R 13875049 5' + P-element 59 1 40.15 CATTCAAATCCCAACCAATTAAGCCCTAGTCAAAGCGTATTGAAAAATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTTAAATTGCTTCACAGGCGACCGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGG:1 - 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roo 9031 1 55.71 TTTAACACTTGGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGGACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 16946168 5' - hopper 1407 2 77.69 TACTCGTTGAGTAAAAGGGTATACTATTGAATACTTTTGAGGCAGAAGTATAAAGTATATATATATTCTGGATCCGGATCAATAGATTCGATCTGGATATGTCCGTCTGTCCATATGAACGACGAGATCTTAGGAACTATAAAAGT:1 - chr3L 25245596 5' + INE-1 149 1 71.92 AAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGT:1 + chr3R 2169839 5' + gypsy11 4079 2 68.49 GACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCGAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTAGCTTGTGCAGCAAGAGGGGGGAGGTGAAATG:1 - chr3R 11040150 5' + Bari1 70 1 60.27 ATGAACAAAGCAAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr2L 4713835 5' - transib2 2787 1 60.27 TATTAATTTGTTAAAATTTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr2L 21367211 5' + Doc 53 1 53.57 ACATGTGGGTTAGCCCCCGTTTTCCACCATCCACCACCTCTTTTTTTTGAGCCATTTTGCAGTCGCTTCAAGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATTTAATTT:1 - 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chrX 18982700 5' + Idefix 6964 2 60.27 CGACTACACGCAGTAGAAACTGAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACTGAGGGAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAA:1 + chr3L 20189545 5' - FB 243 1 78.33 CCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 + chr3L 17275425 5' - Transpac 5150 2 73.97 CAATTGTCTTTCCGAACCTCAAATAAAAATAAAAGCAACCATCAAATGCCGAGTTAAAATGTTTTATTATTTCACTTTATGCCC:1 + chr3R 30407156 5' + transib3 2836 1 79.76 AAATATGAAAGTGAACACAAAAAAAAAGCCCAACAATGTTATCTTAATTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGGGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACAT:1 - chr2L 7098184 5' - G6 1969 1 58.27 GCAGAGGAAGGCACTGAAAATTTGGAAACAGGCTTTTCGCCTAATTAGACGATGGCGAATGGGAAATGCAGGCAGCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAACTATTAGGGCCGGTTAAACA:1 + chr2L 15239755 5' + F-element 4553 1 56.85 ATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATGCTAATCTTCACGCATACTCAGCGCATTGAGAGC:1 - chr3L 22035583 5' - 1731 4557 1 71.31 GATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGGAGGATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 + chrX 19074746 5' + mdg1 7049 2 66.96 CTAAGTTTCTAATCTATTTCACCAATGAATTTAAGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTT:1 + chr3R 12367477 5' + GATE 8101 1 65.75 GCTCAAAGTTATAACTTTAATATTAATGTTGAAATTTCTGGCGTTTGTCGTGACTCTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGTAATTTCCTTTTGGATGTTGGTTTTCAAATCTTGTAGGGTTCTTGGTCGGTTCATATAAACA:1 - chr3R 2679147 5' - mariner2 625 1 64.83 CCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr2R 18514980 5' + P-element 55 1 45.89 TAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGCTTGGAGCAGTCCTTATTTATAAGCTTATTCGTGGTGATATTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCT:1 + chr2R 9869132 5' + Cr1a 4077 1 70.55 AACACAGATGTCTATTTGCCAGCCTTTTAGCCAGCTTTTCATTGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGC:1 + chr3R 29718518 5' + F-element 4255 1 70.34 ATTCATTGCACTTTAGAAAATCTTTATCATATTCAATTACCATTAACAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 - 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roo 9051 2 69.86 GCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTT:2 - chr3L 12315825 5' - transib2 2765 1 56.85 TTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTTATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 + chr2L 13556327 5' - transib2 2775 1 52.05 ATTGATGTGATCGATACTTTTGAATAGGAGCTAAGGCACGATGTCATCACAAGTTCTCGAGTTTCACGTGCGCAAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCGGTTTTGTTTTTAGAT:1 - chrX 3017135 5' - I-element 5190 1 52.74 TGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGCGA:1 - chr2R 23780639 5' + Ivk 35 1 60.27 CCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGGATTAATACATTGGAAATACGTTAAAC:1 - chr3R 31886921 5' - hopper 1335 1 70.55 TATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:1 - 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chr2L 15913326 5' - transib2 2753 1 67.81 TACTATAAATATCAATATTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGGCCAATATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAGCGCATCGTAAAGTAAATGGCC:1 + chr3R 19449905 5' - roo 8975 2 48.31 AATCGGTAGTAAGAAAGAGTGGTCTGGGCCGACAAGTCAAAGGCTGGTAATCCTTTGAGTGTTATTAATTTAAATTTAACATTTATGTGCAAACTAATTTTCTTGCTAGCTTTTCATTTATATGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTT:1 + chr2L 2277913 5' - mdg3 385 1 70.55 TTAGGTTTGTGGAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 4964200 5' + roo 56 2 60.96 GAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 + chr2R 6965462 5' - Transpac 280 2 55.48 TTTTATCTTTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACA:1 + chr3R 24381264 5' + Juan 4129 1 69.18 GTGGGAGAGAAAAAAAAACGAGTAAAAATGTCCGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 26774152 5' + hobo 22 1 70.55 ATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 + chrX 19054274 5' + jockey 94 1 76.55 GTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3L 18505762 5' + I-element 41 1 57.53 ATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAACATATAAAGTATATTTATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGAG:1 - chr3L 22721126 5' + INE-1 90 1 77.93 ATATTCCGCGTGTCAACAGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTA:1 + chr3L 17567874 5' + S-element 1586 2 60.96 AAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 + chr3L 5881587 5' + pogo 73 1 67.81 CGATGATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACTGCAGATTT:1 + chr3L 23354550 5' + gypsy2 6582 2 53.57 GCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 8437647 5' - P-element 2842 1 52.55 CCTACGGATTTTGTTTGCGTGTGCATGACATAAACAACCGAGAGCTGGTGGGAATGGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTG:1 - chr3R 12180059 5' - transib2 2413 1 61.64 CGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCA:1 - chr2R 8735666 5' + mdg1 69 2 65.07 AACCGCTTAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 - chr2R 8157306 5' + mdg1 29 2 65.75 AGGCGGAAGATAGCTCAATGACAAGGTAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 8887726 5' + accord 7028 2 77.08 GATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2L 18226794 5' - roo 326 2 75.34 TTTCATTTTAAAAGCACACCCTCTTTTTATTTTCAAAACGTTATTTCTCACACTTCCGACTATATAAAGTATATATTTTCATTTTCATTTCATTAGGATCTATAGCCGAGTAGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGCC:1 + chr4 340090 5' + INE-1 126 1 65.07 GTGAGCTAGCTCTTAGCCCCATAATAAGTTGTTGTTGTGTGAGTGAGTGCGCGTGTGTATCTGTGCATCTCCTGTACGTTTAAGAGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTA:1 + chr3L 7018237 5' - accord 7058 2 65.52 ATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:2 - chr2R 13259407 5' + mdg1 37 2 57.53 AGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:2 - chr3R 13875104 5' - P-element 2812 1 22.58 CATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:2 + chr3R 10931626 5' + 297 59 2 63.01 TAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3L 5881692 5' - pogo 2053 1 52.74 ATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2L 20266024 5' + roo 8740 2 71.92 TAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:2 + chr3R 18488382 5' + roo 77 2 71.92 CCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACAGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr3R 30987596 5' + F-element 68 1 73.74 CCTCGCTATCACCCTGTCTTACATTGAAAATTAAAACTTTCATTGGCCACTTTTGGACTGTGATTTCCTTTTCGCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATC:1 - chr2L 6608407 5' + McClintock 254 2 53.42 ATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 - chr2R 6965567 5' + Transpac 80 2 71.92 AAGACCGATGAACTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chr3L 17568130 5' - S-element 1679 2 55.73 CTGACAGATTGACACAAAATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chr3R 5351629 5' + jockey 4809 1 51.37 AATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr2L 13556483 5' + transib2 20 1 66.44 ATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:2 - chr3R 29690774 5' - I-element 5278 1 71.92 CAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1 + chr3R 16341966 5' - P-element 2810 1 26.32 AATAAGAATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGAAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCACATTACCCGAACTCCT:1 - chrX 19980681 5' + X-element 4508 1 44.44 CGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 - chr3R 5351456 5' + jockey 4746 1 72.06 CATTATCTTGAGTTTAAAGTGTTACTTTTAGCTTGCTTTAGAAAAAAAGTGCGCGAAATTTTGTCCCCTACCCAAGTACATTCGATTTACTCCCCTTACGTTAATGTTTCC:1 - chr3L 21769378 5' + G2 2996 1 70.27 ATACCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 7420337 5' + 1360 14 1 72.39 GTCTTTAAGTGCTTAAAGACAATTGTTATTGCTTTTAATTTAATAGCTTGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATCCGCTCATATTTTTGTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 1833821 5' - Porto1 171 1 59.17 CAATACTGTTGCCATTGCCATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAATATTTTTTTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAA:1 - chr2L 13585777 5' - Quasimodo 7309 2 73.45 ACATACTGCATACTATTAGGCGCTCATAAAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 - chr3R 24450496 5' - 412 7464 2 72.54 CTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGGAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 11164363 5' - roo 9052 2 63.01 ATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATGGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGTAG:1 + chr3R 19449933 5' - roo 8968 2 57.73 CTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:2 - chr3L 17940200 5' - 1360 3333 1 58.22 TATTGCAATTTTTATCACATCACCGGAGCACTTTCCTCTTTTACCCTTTATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chr2R 3563234 5' + Transpac 4935 2 73.29 ATGTCCCACAAAAATTATATAATGACATATACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 22193491 5' - roo 322 2 78.62 GTCCGTCAGTCTGTCTGTCCTTTCGTATAATTCAGGAACCACAAGAGTGGAAGTTATAAACAAAATCGAAATCGCTTTACTTGCATTGCAGTGCATTTCTTCAACTTCACTGCACTTCCATCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATA:1 - chr2L 20935327 5' + INE-1 546 1 53.42 AGATTAATTTCCATCAAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr2L 11357945 5' - blood 7350 2 58.22 TCTATGTTGTCAACAAAAAATGGTTCAATAGCCAGTGTCGACAATGGTAAAACTATTTAATAAAGTATACATTTATTTGTATAAAGGAAAATTTCAAGGCACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGCAATATTTAG:1 + chr2R 4719807 5' - Tc3 1441 1 67.81 ATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2L 14074579 5' + 297 6611 2 65.75 AATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 17940036 5' + 1360 14 1 60.27 ACGTGGGGTTAGGATGGGTTATCAGCTATCACTGATACTTCGACTTGCCTCAAGTGGGAACTATTTCAAAATTAACTGAGGACATGTAAAAGCCAGACACATATGGGCTTACAAATCCTTCCACATTCGGACTTCTCAAAAATACT:1 - chr2R 20111047 5' - aurora-element 4084 1 52.05 CAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTG:1 + chr3R 17996169 5' + diver 64 2 60.96 TTTTTATCTTAAATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chr2L 15936898 5' + copia 4897 2 66.44 AAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr2R 8157138 5' - mdg1 395 2 67.12 CTAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACA:1 - chr2L 12984204 5' + hopper 71 1 68.57 GTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACG:1 - chr2L 6654721 5' - diver 6024 2 76.71 AAAATTGAATTGAGTACGTGTGGTAATTGTCGATGGCAGCTTCAATCTTAAAGCATTTGTTCCGTGCTGAAGGACACGAAGAAAGCCATTCTTGAAGCATTAAAGACCCGTTGCGAGATTCAGGTCTCTGTGCAGGG:1 - chr2L 15153017 5' - X-element 4354 1 78.83 TCTGTGTGTAAGTTAACCGGACTTATTTGAAAACCCGAACAGCGATACTTGGACTTATTAGTATATATGTACATATATTTGATTGATTGATTGCCATTTTGCGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGG:1 - chrX 2702870 5' + 297 6773 2 76.71 GCCATCGGGCTGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 - chr2L 4713984 5' + transib2 36 1 60.69 ATAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 - chr3R 24381422 5' - Juan 4180 1 71.23 GATTAACATTATAATGCAAATATGATGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGATTATTATTTTTGTTTTTTATTAATTTAATTATTAGT:1 - chrX 8200333 5' - flea 229 2 67.12 ATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTAATACG:1 - chr4 373032 5' + pogo 86 1 76.71 ACACACGATGCGTGCAACGGCGCAAGGCTGACTACGTGCCACAAAAGAAAAATAAAAAAAAAACCATCTAAATATATTTACGCATAAAGTAACCAAATTGTCTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTGGCTTC:1 - chr3R 18966875 5' + Transib5 98 1 66.44 TATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCA:2 + chr3L 3501724 5' + Bari1 72 1 67.12 ATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr2L 11357910 5' - blood 7315 2 68.49 ATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 + chr2L 6174056 5' - I-element 5291 1 60.27 AAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGC:1 - chr3R 6850969 5' - Bari1 1492 1 79.45 AAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTA:3 + chr2L 4003709 5' + mdg1 86 2 77.40 TTTCTTCTAATTTCTTCCAAGTCTCTAATTTCACTACCATAATCAACCCAAAGCCACTAAAATAACAAGATGCGAAACGC:1 - chrX 17164262 5' + 1360 11 1 42.50 ACTTTTTTTAAAACTTTACTTTGCTATTAAAAAAAATCTTTTTTTTTGCTTTTCTTTTAAAGGGTTCCAGTTGGTACTGGGCGAAGTAGTCATAAAGCGAGGCAGAAATAGTTTCTGTCAACGCAGTCTGGCATGGGCATGAATGG:1 + chr2L 11199877 5' + invader5 3816 2 58.90 AAAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:2 - chr3R 19032719 5' - roo 9032 1 58.22 GCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 + chr2L 18347306 5' + transib2 82 1 74.66 CTTTGAATATTTCAAGGTATAAAATCTTTCATACAAAATGTTAGATTTTTTAATCAAACATTTAGTGGTAATAATGGCCCGCTAATTGATATTCAGTCGTGCTTTGGCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTC:1 - chr3L 3544399 5' - Doc2-element 218 2 41.86 AACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 - chr2L 16943904 5' - copia 235 1 52.74 AATGTTATATGGGTTCCTGCATAGCTATTGAATGAAAAGAATCCGATTGGGAAAAGGCAAGAGGGACAATTGACTTTGTGATGAGCCACACTTAGTTACTAATTAGCAGAGGACTAGAAAAAGTCGAAGTGGTTTTTTCCTATTTT:1 + chr3R 28150617 5' - transib2 2443 1 82.88 ATACATGACAATTTACATGACAATATTGTTTTTGGTTTTT:1 - chrX 19500121 5' - transib2 105 1 75.00 GGGAAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACACATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3R 18093426 5' + I-element 11 1 69.86 CCTGTGACTTTTGCAGCCGCATTCCAACTTTGCACTTTAAAACCTTTTCCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGTGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 + chr2R 12779575 5' - I-element 5342 1 74.66 CATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr2R 4362744 5' + F-element 22 1 67.86 CCCGTTTCCAAAGTTCTGATGGGGAGTGTTGTATATCCGCTTGTGTATCCAATAACCGCAGCGCAGCCCCCAAATGCTTTTGTTATTTATTATCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGCTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2R 16817842 5' - 412 7518 2 65.75 AGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chrX 11661343 5' - pogo 2087 1 75.34 TATAATACTATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACT:3 + chrX 5323210 5' + Juan 4085 1 58.90 AGTTTTAAAAATGAGCCCATTGGTTTTGGTTTTGCGTTGTTTGGTGGCTCTTAATTATGTCCTTATCAGTTATATGTTATGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTAC:1 + chr3R 5784729 5' - I-element 365 1 59.59 TAAAAGAAAAAGTAAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 + chr3L 7889545 5' + roo 48 2 57.53 TTTTTTTTGGTCTCACCATGGCAAATCACGGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTT:1 - chrX 15200971 5' - 17.6 482 2 76.74 GTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:1 - chr2R 23780620 5' + Ivk 47 1 49.64 AAGGAAAAGCGGAACCAGAGACAGTTAAATTGATGATTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 + chr2L 4713525 5' + transib2 21 2 46.58 GTCGGTGGCACGTGCAACACTTGCCACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 - chr2L 15779679 5' + hopper 29 1 67.81 GAAAGCGTAAGCAAAACGCCCTGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGAAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chr3R 5351508 5' + jockey 4704 1 60.96 CATCCTAATTTATAAGGACACTGAGTGCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3R 30946482 5' + Transpac 32 2 63.70 CGGGTCATTTTCGGCTGACCGACGTGGCAGAATGGTGAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGATAGGCTATTTGCTAGTCGGTTCGGGTGGACCATACGCCTGTCGGCATAACGGCT:1 - chr3R 5825971 5' - G5 4561 1 75.17 AGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 22193427 5' + roo 72 2 67.81 ATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chr2R 8735585 5' - mdg1 7386 2 71.23 TATGTTGTAAAAAATGCTTAAGTAATAAACAATTTAATTTAATTATTGCCGTTTTTATAATTATTATCGTTGTTTTAATACTTAATACCTATCCGGGAGATCTAGCACGTAAAATCTTTTAAGTCTTTTGACATTGTTATTATTAT:2 - chr3L 22634189 5' - G4 3664 1 54.79 ATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 - chr2R 23780651 5' + Ivk 1 1 80.65 TCATGAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAAT:1 - chrX 23108347 5' + BS3 1446 1 50.00 CTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGCACGCGCCCTCAAGG:1 - chr3R 27083127 5' + jockey 4589 1 54.79 AACTATTCAATTATCATAATGGACCTAATTATTATGTTTCTTTATTTTTTACACTCTGACCGCGGTCGATCGCTTTATTGGGTGAAGGTCACGCCGGCTGCCTTTTGTTTTTATTTTTTTTTATTTTTTTTGTTT:1 - chrX 3390741 5' + hopper 145 105 70.37 AACTAAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATGTATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGCTTTTAGGAGAA:1 - chrX 13490738 5' - 297 6904 2 71.92 CGAGACGGCGAGTGCAATGAACCAGGAGTGAAGTGCAGAGTGGAGTCAGAATAGTATATTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11545075 5' + BS4 730 1 66.20 AAAAGCATATTAATAAGGCCTGAAAAACTTATTATGTGTGATCAAAAAATAGATAAAGTTTATTTACTAATAACGTTACACTATAAAAATTTGTCAGGAAAGGTAACTTGTTTATTATCACTATCATTTCATTTAGTTTAATAATT:1 + chr3L 7949348 5' - S-element 385 1 57.53 TGCTATTGATTCTATTAAAGTAGCAATATCAGCCTTGGGCTAACGAAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:2 - chr2R 14653290 5' - 297 371 2 65.07 CATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 - chr2R 13168711 5' + P-element 96 1 21.92 CAGCAAGGACACCGGAACAGGGAGCTTCTTGACTTGCTTAGTTTCAGGAAGCAGCGGCAACAACAAGGTAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTATCCCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGGGATG:1 - chr2L 16102410 5' + G5 4549 1 49.25 TTACACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTG:1 - chr3L 26290983 5' - Tabor 427 2 54.79 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTGCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGA:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 134 2 62.68 AGTATTTTATAAGCATTCAAATGCATTATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 + chr2R 20227174 5' + hopper 17 1 67.12 AAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTC:2 + chr2L 17005669 5' - Stalker2 7624 2 58.22 TACACATAAGTATGTTCTGAGTTTATTATTCATCATATTTTCTTTTTAGTGGGGAAACATATACATATGTATGTACACTTAACAAATACAGTTAACAAAAGGCTATGTGAAGAAGTTTATACCTTTTACTTTTATACTTAATAATT:1 + chr3R 25741352 5' + G5 4724 1 71.92 AATCGCTGCGTGGCTCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 + chr3R 13875028 5' + P-element 16 1 66.09 AAGGGCGCTGTTGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 2146009 5' - roo 9029 1 55.48 GTTTAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGT:2 - chr3L 23940559 5' - Cr1a 4402 1 73.29 AACATCAGGAAGGATGGACCTTGCAACGAGACAAACTGAAATATTATTCAACCTTCGATCCCAACTGGAAACAAATACCTAAACACTGTAGTGATGAGTGCAGTCGTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTCGTTCGCA:1 + chr2L 11843421 5' + Cr1a 223 1 66.44 TGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:1 + chr3R 17673770 5' + FB 86 1 77.40 AAGATTCAATAAACGTTAAGATCGGTTTAATGTACTCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAGATC:1 + chr2R 12471690 5' - transib2 2799 1 43.84 AGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATCCCTCACCTTGATAGGACAACCAAC:1 + chr2R 17926296 5' - opus 443 2 59.59 ACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr4 303807 5' - pogo 2099 1 72.15 ACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr2R 12133818 5' + jockey 94 1 77.40 ATATTATAAAATTATTATGATATATTTAAATTATATTTATCCCACTCGTCTGTAGCTGATTAACAGTTATCTGAATATGATTCCAAAATTAAGATTAAGTATATATGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAG:1 + chrX 20390928 5' - roo 232 2 73.97 AACAGGCACAGGTACGCTGTTTAAATAACACTGAGTCTACCTCAAAAAGCAGCGCGCACTAAATGTGCTTCTTTTATAGCCCGCGACGCCCTGTCGTTGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTATCAGATAGCCGTTACTCAGCTAGTA:1 - chr3R 4130544 5' - INE-1 541 1 69.18 TAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAA:1 - chr2L 17766168 5' + Doc 233 1 66.44 TTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr3R 4575726 5' + jockey 65 1 57.24 ATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCGATAGTCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGG:1 + chr2R 9237012 5' - INE-1 540 1 78.89 CGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 + chr3L 5881585 5' + pogo 71 1 66.44 GAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 17275392 5' - Transpac 5215 2 68.42 CTCTATGAATTAATGTTATTATTTTTTTAGTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACGGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGCT:1 - chr2L 11257381 5' - rover 191 2 75.70 CCAGTGTGGTGCCATTTTGAGCCGCTTTGTCGCCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTA:1 + chrX 965436 5' - Juan 3836 1 78.08 CTATTTAACGATCGATCATTTGATTCTATAAGTTTCCATTTCGTGCTGGCATCTGGCTTTTACTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr3L 10425924 5' - I-element 5334 1 65.75 AAAAGTTATGTAAAAATTTTGTTTAGCTTAAACATACATGTAGACAAAATGTAGAAAGTATTTGGTATGTATGGAAGTAAGTAAATATACTCGTAGAGTAAGAGGGTATACTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 + chr2L 20024450 5' + INE-1 21 1 71.23 GGGGTATTTCCACTGAAAGCCATTTGCAATCAATCAAAACATTTAAGACACTTGTAAAAATTAATGCCTCGATAAGTGTGATCAAGTCAATAAATATTGTACTAAAACTGGCTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCA:1 - chrX 5771544 5' + F-element 4449 1 76.03 AGACAGCATATGGCTTAAATTGCAGTTACCGTTACAGTTAACAGGGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGC:1 + chrX 10548323 5' - Chouto 54 1 56.73 GTGTGCGCCGTGTCGTGTTTCCATTTCAACCGCGAATTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 7850076 5' - roo 390 2 71.23 AATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTT:1 - chr3L 25482975 5' - accord 464 2 69.18 TCAGTGAGGAACCGATCGTAGAAGGTTGAGGTGACGGTGGTGTGGCGGATCTCCAGCTTGCCGGGCTGATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCCCTTTCTTGATTTGTTG:1 - chr3R 10249364 5' - F-element 352 1 67.27 CTCACTTCACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2L 14675627 5' + 297 37 2 60.27 AGACGTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr4 373099 5' + pogo 19 1 71.23 CCATTGTCAGTAGCTCGTTCCGGTGGGTGGCAATGTTACTCTATAGAAAGCTGTGGCTTTTCGGGTTGGGGCTGAGTGGATATTTTTGTGGGTGTCTAACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 - chr3R 11937444 5' - flea 235 2 74.66 AGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAA:1 - chr2R 2318278 5' + ZAM 7983 2 71.03 ATGTGTAAATCCCATATCGAAGTGCTTCAAGCTTTTGTGTCATGTATCGTACAGATTGGACAGGACAGTAGTCTTCCTTCATCGAACGTTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTA:1 + chr3L 2926303 5' - Quasimodo 7284 2 57.53 AGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCT:2 - chr3R 9039006 5' - Juan 4142 1 69.86 ATAAAATGTATATAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCG:1 - chr3L 10336131 5' - Cr1a 4394 1 50.35 AGAAGGAAGCGTTTCCCACCATATAAAGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACCGCTCGTCCGCTGACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCACGCATTTG:1 + chr4 836649 5' + springer 47 2 67.31 CCGATAACAATGGCATATAGCATCACTCATGACATGGGTTCTTACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr3R 7420287 5' + 1360 58 1 69.11 CAATTCTTTCGATTTTCATTTCCGTATCCTCTCCAGGCACAACACAACAACAGTACAACTACACATATATAAACAACATACATACGTTAAAAGAACATACCTTCGCCTTTATTTTCGATATTTCACTATAATTTATGGATGAGTAT:1 - chr3L 1181339 5' - transib2 244 1 75.34 GGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGT:1 + chr3L 20189573 5' - FB 231 1 37.67 AGATTGAAATCTGAGCAAACGCAACGCCTTTCTTTTTTCGATCTGTTCACTGAGTATATAGTTTAATAGTTCGCCAGTTTTTCAAGAGTTGTTCTTTTCAGGTGCTGTAGTTGCTGATGCTGTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTT:1 + chrX 1098268 5' - Rt1a 5087 6 50.68 TGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:2 - chrX 22840573 5' - copia 194 2 58.22 GATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTA:1 + chr3R 20675816 5' + jockey 4909 1 53.42 GCTGGTTATTACCCTGTGATATTTTAAGGTAACTTTAAAATTGTACAAATTTATTCCAATTATTGGCTCTTTACATACAAAAAGACAGTTGTTTCAATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTG:1 - chr3L 12380276 5' + G5 4802 1 69.86 GGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTT:1 - chr2L 15913338 5' - transib2 2765 1 59.59 GATTAAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:2 - chr2L 15940370 5' - pogo 2088 1 76.71 CATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATAT:1 + chr3R 10270588 5' + Juan 4104 1 68.49 GGAGCGGGAGCAAGTGGAGCACGGCACAGTGGTACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCC:1 + chr3R 24141110 5' + 17.6 228 2 54.79 ATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chrX 20455651 5' - hobo 2937 1 60.34 ATGCACATTTAAGGCTTAAAATATACTTTTACACTATGGTTTCTGCTGCGGTTGCTGTCTCGGCCAGTAAATTCACATTTGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGGCTGTCATGATTGTT:1 - chr3L 5254824 5' - I-element 180 1 67.97 TGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGCTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 + chr3L 18402983 5' + P-element 79 1 31.51 CTTTAGCTTCTACGGCATAACGCCGCCAATATAGGGAATGCCGGTCGCTCAGAAAACTGTTTTTGGGTGGTTCGTGTCCGGTGCCTGCAG:1 + chr3L 23666371 5' + GATE 8164 1 62.22 AATATAGACGTTAATATTGGCAGGACATAGCATAACCAATTAATTGTAAACAAATGGTTTCATAATTAATAATGGGTATTAATTGATTTGAAATACTTGGGAGATTTATGTTATTATTATAATTAATTATTATTATTATAATTATT:1 + chr2R 15720678 5' - mdg1 7081 2 72.60 GGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAATTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCA:1 + chr3L 24213772 5' - invader2 178 2 63.70 CGTCATTCATTTCTTAATTAATTGTTTGCTTTATATATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATAGATCAAAAACTGAAGCGAATGTCGGATACAAATTCACGTCTTACAC:1 + chr3R 3457470 5' - Quasimodo 7294 2 74.66 ATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTAAGAAATTTGTTTGCTTTTTTAAAAATTCGAATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 - chrX 21636193 5' + INE-1 542 1 59.62 GAGGAAAATCGGAAAATTCCGGTGGGATATGGGATGGTATGCTGTGGGTGGTACCGAAAGTGGCCTGTGAGCAACGTTGGACAGTAGTAAGGATTGTAATTTTTTTAATTCACAGTATATGAAACATTTTTCTTTATAATGACAAT:1 + chrX 15645926 5' - looper1 1657 1 69.86 GTTATTCTGCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAA:1 - chr2L 22224619 5' - Rt1c 5413 1 63.01 CATAAATCTAAATAACAAACGTGTCGCCAAGGACCAAAAAGGATGGCTAACGAAAATAACCCACACAAACACTGGCCAAAAAAATAATAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 23141650 5' + Rt1b 5147 6 71.57 TTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTAT:1 - chr3R 11062856 5' - roo 9034 1 56.85 GGAAACGGTAGGGCCACTTTGATGACATCATTATGGCTTTGGGAAACAAAAGTTACCACATATAAGCAATGCTGACGCGCCCCAACGGAGTTCAGCGCTCTGCGCTACGAACGGTCAGCAACAGCAATTGGACACCC:1 - chr2L 4869895 5' + gtwin 7027 2 66.42 ATATTTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATAATTGTTT:1 - chr2L 23381794 5' - flea 5009 2 82.19 ATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr2L 15936886 5' + copia 4909 2 58.22 ATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr2R 6622641 5' + S-element 77 1 71.92 AATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:3 + chr2R 7090639 5' - I-element 5291 1 60.27 CTGATCAAGTAGTACTACTACTATCCAACTTTCAACTCTCCATGAAGATTTCAGATCAGAAAGTTCAGATCTTCACACATGGCTGTTTTGACTCCGTTGTTGAAATTATAAAGAACTGTTGTTTTAAATAATAACAAAAAATAAAA:1 - chr2R 9493899 5' + BS 5097 1 80.82 TTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACCAGCTCCAGAACATCGCC:1 - chr3R 27083092 5' + jockey 4624 1 80.14 TATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 + chr3L 12004254 5' - P-element 2813 1 36.30 CTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr3L 11913169 5' + BS 5026 1 62.77 AGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCGCGCTCTC:1 - chr2R 20802641 5' - mdg3 5412 2 72.92 AGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:2 + chr2L 10156101 5' - hopper2 1555 1 54.11 ACCATGGCTATTAACAAGTGGCGCTCGAAGGCGAATTAAAAACACTACAGCAGCGCACAAAAGCAGGCAACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGATTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3R 12930637 5' + jockey 11 1 74.29 GTCGCTATATTCAATTTGAGTGGTATCATGCCCTCTCATGCATCATGTAGCACATTTGTTTATTTTCAAGTTTCTCTCGCTTTCATTTCGGTTCGAAAATCTTTTCCACTTGGCTACGTATGCATTTTCGTAGAAATT:1 - chrX 12577749 5' - pogo 86 1 55.80 ATTCACTAGTAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAA:1 + chr3R 26178346 5' - 412 468 2 62.77 CTATGAAGAGTTGAAAAACCTGTCGCTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 + chrX 10319566 5' + mdg1 7058 2 71.72 AACCCCGGAATGGAACTACAAGTTCATGAAAAAAAAATCGAGAAAAATAAGGCAAATAGGAACGAAGGTTGCAAATTGAATAAAGAAGTGACACAATCGACAAGGATACTCTGATGGGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGT:1 - chrX 6210463 5' - accord 7303 2 74.66 AGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCC:1 - chr3L 3983922 5' + P-element 6 2 77.59 TATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACACAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chr3L 14720910 5' + F-element 63 1 52.59 ACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3R 19407866 5' + diver 5915 2 65.75 TAGCATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chrX 17343373 5' + I-element 33 1 60.00 AATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3L 18046625 5' + roo 8743 2 76.60 ACACTTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr2L 14671791 5' + FB 32 1 63.70 ATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATT:1 - chrX 3431987 5' - Ivk 5344 1 56.16 ATCTAAATGTCATTAGATTATGGTTTATCTGTTGGTGGTTAAGAATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGG:1 - chr3L 14685851 5' - G2 2864 1 73.79 CAGGCAAGCAATTTGCCGACAAAAAAAAACAACAGCAATTGTGTCTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAA:1 - chr2R 5627694 5' - TLD2_LTR 97 1 79.31 TTATTCAAATTGAATTCTTGTACTACTCACTCACTGTTTGAATTTAAAAAATACCATATATATTTTATGCCATTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTCGCAAACCGAGCCGGACGATACAAGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCG:1 - chr2R 19546163 5' + Cr1a 4415 1 51.37 TAAGCAAAACGCCCTGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 5351501 5' + jockey 4711 1 56.16 TGTATCGTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGCTTTTT:1 - chr2R 12472157 5' + transib2 4 1 80.00 AACAAATTCAAAAGCAAAACGGACGATAGCATTATAGATTGGGATAACTTTAAATACACAAGAATGCTCGTTCTAAAAAGTAGAGTACATTCTTTGATTCTAGAAACAGATGTACACTACTTTTCATATTATTATATATACTTATA:2 - chr2L 5460087 5' - Dm88 23 2 39.73 TATAAAGTTTTTATATTCTTAATCAGAATAACCAGCCGAGCCGAAACTAAGTATAAAAATAGATATTCAGAAACCCGAAGAATAAAGTCTACGCAAGTTCGTTCTAAAGCAATACCATGCCGACTCTAACGTCTACAAAC:1 + chrX 23067463 5' + INE-1 218 1 54.29 CGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGCGGTCAATGCTGAC:1 - chr3R 5351456 5' + jockey 4705 1 60.00 GTAGATTCAATTTATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCTAGACGGGCACGTACATACATATGTCTGCGAAACAGGATAATCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chrX 1799258 5' - invader4 301 2 66.67 GCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr2R 8735714 5' + mdg1 20 2 70.34 ATGTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr2L 7581043 5' - Transpac 279 2 60.69 CGTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chrX 7795472 5' + roo 8685 2 73.29 TAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr3L 22890323 5' + FB 6 1 76.23 ATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATC:1 - chr2R 12253301 5' + BS 4720 1 77.30 CATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr2R 18258784 5' - Juan 4153 1 56.85 AGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATA:1 + chr3R 904906 5' + rover 15 2 63.01 AGGCTATAAGCTTAAATGGTTTGATTTTGCTAATGACTTCTAAATGGCTTGTGAAATCGAAACAAAAAAATATCTGTCATCATAAAATCTAGTGAGCTAAAGCTTCACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAA:1 + chr3R 20932528 5' + roo 337 2 68.49 ACCTTATAAACGGTAAGTAATAACCGATCTTTATGGCCCATGATTGGCAATTTCCAAAATCATTTCTTAATTTGCAGTATTTATATATTTATAATTATT:1 - chr3R 23727991 5' - Stalker 6935 4 72.73 CAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGCAGCAGAGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAAAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 13972974 5' + 412 42 2 59.80 GTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 - chr3L 24131492 5' - Transpac 271 2 54.62 GCGATATATATTTTGATTCATAAATAATGCAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAA:1 + chr2L 13571519 5' + transib2 360 1 79.31 ACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGACACCGACTATCTCTCTGCGAGTGCGGACGT:1 - chr3L 18126016 5' + Ivk 13 1 63.33 ATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGGCGCATACTTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 + chr2R 21926372 5' - opus 430 2 62.68 AAAGCAACTTTGGCGACATACGCAGCCTGGCACAAAAAGTAATAAGTAGTGATGAAAATTATACCCAAATTTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 - chrX 7938017 5' + Idefix 93 2 60.27 AGGTATCTTTGAATGAAATATTATTTTCTGCTCTTAATTTTATTTCAAGTCGAACTATAAAATGACTCAAAAAGCTTTGGGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTCATATTCTTATAATTTGTTT:1 - chr3R 18008269 5' - Idefix 7122 2 53.42 AAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCT:2 - chrX 14722194 5' + diver 5963 2 67.12 GAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1 - chrX 18409463 5' + jockey 4740 1 63.01 GGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 - chr2L 16946158 5' - hopper 1381 1 60.96 TAGATAACAAAGATAATGCTGCACAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGGTTAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAGTCATTTTTGAAATTTAT:1 + chr2R 1106120 5' - 1360 374 1 53.06 CCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGATATTTCCCGTTCGCATTAACCCTAGCTAAGTAATGGGTATCTGACAGTCGGG:1 + chrX 23078696 5' + INE-1 552 1 93.10 TTTCCCATTTTCCCAGACGGTCACCAGGCCACACTCGCTGGTAGATGAGGAGGGAGGGCTGACGGGCGGCAGAGTGGTAGGGGCAGGGAAATGGATTTAGTTAACTATACATACTCGCCAATCCAATAAATAAAATAAAATATAAG:1 + chr2L 18315184 5' + G7 1150 1 59.59 GAACCGAGAGACTCGATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTC:1 + chr3R 9557484 5' + G2 2995 1 70.14 CCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3L 13294903 5' + roo 82 2 74.66 TTTTCACTCTCTTTTATGCGTTTTTGTTGGCTTCTTCCTCGCCTTCTGCGTAAATATTTATGTTGCTTAAAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACG:1 + chrX 11653467 5' - hobo 483 1 54.11 AATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCCAAACTCTTATCAGCAAAAT:1 - chr3L 14094677 5' + I-element 68 1 65.07 ATAGCAATTTTGGCTGTACTGATACACCTTTTGAGAACATTGTATTTGTAAAGATTTATTAAACTAACGTAATCATACTCCCTCCTATTTTCCGTTCTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATC:1 - chr2R 16142895 5' - invader2 140 2 64.38 CTAAATGAGTTTAACACTTGACAGCCTCATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCTCAAGTATGCAAA:1 - chr2L 16946177 5' - hopper 1377 1 47.92 ACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTT:1 + chr3R 13972959 5' + 412 71 2 63.70 ACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3R 30347465 5' - P-element 2872 1 71.92 GTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTT:1 + chrX 18817277 5' - transib2 2763 1 58.90 AAAATGATTTTACACAAAAACAATTTTAGATATTGCAACATTCCACAAATCGTAAACGGCGCTTGACGCCTTGTTCGCTTGTACACTGTTGAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr2R 10504606 5' + 1360 28 1 60.84 CTGTTGCAGGCAAATGTTGCATTCCGTGCAAAAGGCAACGACAAAAGGTGTTAAGAAAGCCATTTCGCCTGCTAATGAGTGACGATGCCTCAGAGGTCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGACTGATATGGCTAAGTAATC:1 + chr2R 22464514 5' - Helena 1262 1 62.33 ACATTTTCTCCTTAGTTCTTAGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 9544832 5' - roo 9014 2 57.53 ACAAATTTTCCGTTTACGTCATGTTCGAGCAAAACAAAAAAACCCAATTGGTGGATACATCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCT:1 + chr3L 13877831 5' - hopper 282 1 63.70 ATGGCCAAAATCCGTTCGCTTCTTTTTTTTCCGCCGCTGCAGTTGTTACTCGATGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAATGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTAT:1 + chrX 7844802 5' + hopper 1269 1 63.01 ATATATACATGTCAAAATGCACTACGACTTATGCCCTTAAACTTGAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGCCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTG:1 - chr2R 3592332 5' - FB 361 1 69.18 ATATTATTATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCA:1 + chr2R 10835618 5' - Tc1 1642 1 24.66 TAAATAATCAACCAAAATGAGAGAGAGAGAGACGGACGCTCCACGGATTCTACAAATACGTAAAAATCGAAATCAAAGAGGAGCTCGCATCCCAAAACAAAAACAAAAAAGATTTACACAAAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2L 4096136 5' - hopper 150 14 72.60 TACAGAATTACATGTTTTAAAGTTTTCAGCCCCTTTTAAAACTATGTTTTACTTCCTTCCTTTTTTGTATATCAAAACGACACTATTCAGAAAAATTAAATAAAA:1 - chr2L 9090003 5' + 412 7074 2 88.57 AAATAAACAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGTCAGTTTGTAGGCGTAAGAGTGGGTGTGACTACATGGCAAAACACTTCTGCGGCGTCTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGA:1 + chr2L 16839709 5' - INE-1 152 1 71.23 AAAAGAAATTCATTTTTTAATTTGCTCATCACTTTTTAATGCCCACTAACCGCCCAAAAGTGCCACTCCCACACTTTTAAAAAACGTGTT:1 - chr2L 22163835 5' + INE-1 258 1 60.00 ATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAA:1 - chr3L 15099678 5' + G4 3817 1 50.68 ATCTCCAGCAGAGTCGGCTGTTTGAGCATTGTAAAGTAGTTTATTTTTTAAACCATATTGTAAATTGCATATTCCAGTTAGCGTTATAAGAAGCACAATTAAATTATAAACAGTTGCAATTCAAAATAATACTTTAAAAA:1 + chr2R 21882246 5' + P-element 2691 1 77.86 TCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 9871022 5' - roo 9021 2 55.48 ATACATACACTTACACACTTAATACACTTTATATCTGAATATAATCGAATTTTCAGCTATCGGGTCTCTGTCTACATTATTATTTCAGCGACACTCTGGTTCATCTTAACACAAAACCCACTTCCATTTTCCCTGAACATGCTGGT:1 + chr2R 5085326 5' + Circe 7373 1 81.51 ATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 23287312 5' - 1360 3363 1 55.34 AAGTACATTTAGTTCTCCAAAATTGGTTCACCCTAACGAAAGCTCGTCCACTGCAAAGAGCGAGCAGTGTAATGTTAATTTTGAGCTTCAAGTTAACAGTGTCAGTTAAAAAAACGAGAGAAGTAAATTCTTTATTTTTT:1 + chr3R 20308723 5' + pogo 2008 1 49.29 CAAGACAAAAGAAAGTGCGGCCACCAGTGGGCATTGCGGGGCCTTTCCGGCGGCAATAGCAATAGCAACACCTTGAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAGAAACAAAAAA:1 + chr3R 9215719 5' + gypsy7 5005 2 72.22 TATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3L 20898603 5' - roo 8988 2 77.40 ACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr3L 2544620 5' + Tirant 8173 2 62.76 AAGCATGGTAACTCTTTCGCGTTCCATAAAATAATCTATTTCAATCCGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 + chr3L 21380486 5' - I-element 5328 1 58.90 AACAGCTTCTTCTAGGTCCCTTTCTGAGTTTATCGGTCGCCATGTGATAGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTTTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATA:1 - chr2R 5615708 5' - Stalker3T 288 1 75.86 CCTGTCAGACTGACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 6518681 5' - 412 7515 2 60.27 CACTTTGTAAAAAGGCAAAAATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 - chr3L 16470404 5' + jockey 4687 1 72.46 AATGTGGATTCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGATATTGCCTTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTTATCATCATTTC:1 + chr3L 24934305 5' + HMS-Beagle2 31 2 50.00 CCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATTTGTCGTAGTTCGGGATTTTGCGTTACATGAATACGTTTATAAATAAATTTGGCTGCAATTCCCCAAATCTCGATCCCGTATAACCACATCGGTAC:1 + chrX 21639990 5' - Helena 1060 1 78.77 AGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr2R 17796531 5' + jockey 4709 1 57.86 TCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGCATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAATTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 - chr2L 4123934 5' - transib2 2760 1 67.18 ATAAAACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2R 11159370 5' - roo 9030 1 56.16 CGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCCACCATATAAAGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACCGCTCGTCCGCTGACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGCAGCTCGAGCATAGC:1 + chr3L 19471446 5' + gypsy3 44 2 62.33 TATTGGTTTTTTTTTCTCTGTGACTACCTGTTCCAAGTTCTGAAGGGGTGGCAGTTTTGTCTGATTGGGGGCGTCTGGCGTTTCGCACACACACACACACACACACACATACACACT:1 - chr3R 17957912 5' + accord 7101 2 80.34 TAGCATCAGCAACAACAACAACAGCGGCAGCAGTTGCAGGAAATGATCTCACAGCAAAATCCAATTGGCACATTCCGAAGTCCCGTACTCCTCGCCGGCCCCCTGGCCAGAAACAGGGGCCTGCG:1 + chr3R 13239625 5' + TART-A 221 2 83.20 TGCAACTGCAAAAGATCGGGCTGCCTCAAGAACTATTGTGAGTGCTATGAGGCAAAGATTCCCTGCTCCAGCATATGTAAATGCGTTGGTACAGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATCAG:1 + chr2R 13512349 5' - 297 188 2 72.22 ATTCCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATC:1 - chrX 22386820 5' + hobo 63 1 65.69 GTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCAAATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAAAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATGTTACGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTGACTCGGTGA:1 + chr3R 19446715 5' - roo 9058 1 56.16 CAAATATATAGGTATGCAACTTGTAGGAAGGTTTTTGCTCGTTTTTAATGTTTTGCCATCTAAGCAACTTAAACAAACTCAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 19397436 5' + G2 3076 2 70.91 TGCAGGTTGCCTCATGCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 + chr2R 8099119 5' + jockey 4769 1 72.17 TTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCA:1 + chrX 19054243 5' + jockey 64 1 54.11 AAAGTTTTGTAAAATGTTAATTTCTTTGAAGTAATTTGTAATAAGTAATTTTAAACTGTTTAGTTTTTAAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTGTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAACGCCCAAAGTGCGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAT:1 - chr3R 14843602 5' - Stalker 306 4 70.55 AAACACTTTTGGCAAACAAATTCGCCTCACTGCTGCAGATTGAATTGGTTTGTGTGCCTTTCTATCTGCGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATTTCTGTGTTTTTGTTTCTT:1 - chr2R 7626762 5' + pogo 299 1 78.07 AGAAAACAGCCCTTATGTGCAGGGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTT:1 + chrX 19330557 5' - INE-1 549 1 60.78 CAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 + chr2L 22674754 5' + mdg1 7073 2 65.75 AAAAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGACAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGCGTTAGGGCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAGGC:1 - chr3L 23906519 5' + 1360 4 2 73.48 CTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACA:1 + chr3R 904904 5' + rover 13 2 64.38 AAAGCGTCAGCAAAATCATGTTTTTTATCGGAGCGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTTCAGGCTCTC:1 - chr4 202949 5' + 1360 71 1 60.49 AACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 - chr2R 17878631 5' + Doc 72 1 60.27 ATGGGAAATTTTTTTGCCATTTTACACAAAAATTACAAATTAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGTACTGTATC:1 + chr2R 3564024 5' + Tabor 6853 2 70.09 AACACCATTATATTCTGGGTGTTGCCATCGAATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTT:1 - chr3L 13739700 5' + BS 5007 1 72.86 TGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:2 + chr2L 4063807 5' - roo 9039 1 63.01 CCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTTTATTCATTCGCATGGGTGAACCTTGCCACAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACTGGAGTCGCGGATAAAACCAAAAAGTAATTGTGATCCCTCACAAACATT:1 - chrX 18239394 5' + jockey 75 1 50.00 TAAAAGTCCGGCTGACTATCAAGTGGCCAAATGCAGACCCATCCATCGCACGTCCTGCCCACTCCTCTTGGATTCCAGTGTATGTCTATGTGTGTGTAAGTGTGTGCATCCTTCGTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 30642898 5' - Bica 341 1 71.21 ACTTTTTTTCTTACTGTGTGGAAAAGCAATTGGAAAGACATCAAGAAAATGGCACTACTACAACAACACAAACAGCAATCTAACTAAGCACTCCGTTTAACTTCAAGGATTTCCAAAGTCGAATCAAGCTATACCTCGAAGAAAAG:1 - chr3R 22576455 5' + Ivk 4912 1 58.22 GGATCTTCCGCTTAAATCGAAACATATGTATATTATCAAAAATTGATGGGATGAGCTGAAATAAGAATTTTCATTTAAAGCCCCTTGCACTCCATTTTATTCCCCAATATGTATCGATATCCCAGAAAAATTA:1 + chr2L 16295947 5' + INE-1 503 1 66.92 AATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chrX 19038348 5' - hopper 1375 1 57.93 TTTTTTTTTTTGCTTATCGATAGAAATTTACTAAGTCTTGTAAATTGTAAAAATGTGAGAAAATGTCAACATATTTTTCAAAAGTGTATGCGTCGCAATTTGTGTCTCTATGTCTCTAAAACCTTTATGCTGAATCTCAACCTTCT:1 - chr3L 25231735 5' - INE-1 172 1 32.88 CACCTCTTCAAAAATCCTGCTATTCCTTTCATGGAGCTTTTTCAAGCGGACTTTGGCATTCTCATATCGATCTAGTTGCTGAAAACTTCGTCGAACGTTAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCTTCAATCCAATTTGCATTTG:1 - chr3R 5630722 5' + 297 254 2 67.81 AATAGTATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCCATGTATG:1 - chr2R 5424289 5' + 1360 3355 1 61.95 ATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTT:1 + chr3L 23249407 5' + rover 82 2 70.55 ATTTAATGCGGCATTTATGCTGACAATTTTTTTTCCACCCAGAATCGCAAAATAACGCATGTAAGTTCATACAAGAATGTTTAAAGGATGGAGAAATTATTCGTTAATTTCATAATGATTTAGGATGTAATAAAAAAGTGAAAATA:2 - chr3L 16240932 5' - Cr1a 4267 1 49.32 GCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGCCTAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATCTTCTAATAGAAAATTGTTTATATAAA:1 + chr2L 18347306 5' + transib2 82 1 69.18 AGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3R 7420313 5' + 1360 17 1 47.89 ATTGTGTTTCAAGCAAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 + chrX 18336588 5' - mdg3 184 2 60.14 ATGCAAACCTACCTGATGGCTTCCGACAGCATGGTGGAGAGGATGCGGGTGGTATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGGTTTGACCCTCTG:1 + chr2L 9574457 5' - Quasimodo 340 2 56.80 GGCAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 29084969 5' + 412 7100 2 66.09 AGGATTTACGAGCCACACAACATTCACAACAGCCACCGACAATGGAAATTTGCAATCCTGTTCGTCCTGTCGCCTGTCTGCTTCTGGTCCTGCTCCTGTGGCAAACTGCTTGTGTAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTAT:1 - chr2R 18316185 5' - HMS-Beagle2 7186 2 76.71 ATGAAGTCATATTTATTATTTTACATTTTATCACTATTTACTAGATTCGTTGAAAAGAAGGAAGCGTATCCGACCATATAAAGTACATATATATATTCTTGTATGAAGGTCGAGAAGGTCTCAGGAACTATAATAGCTAGAAG:1 - chr3R 4104695 5' + INE-1 155 1 77.62 ATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 - chr3L 18403020 5' - P-element 2806 1 17.89 AATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:2 + chr3R 7666609 5' + I-element 37 1 58.90 GCATATATATTTATAAAAATTACCATATAGACGAATACCAAAGAATACCAAATATTTATTGAACTATTCAAACTTAAACCAAGGATAAAACCAAAGTTGCAGCATAAACATCAACAACGGGTCAGACGCCGACATCCGCCCAAAAT:1 + chrX 19728056 5' + ZAM 8089 2 69.18 TATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 3920575 5' - roo 333 2 68.49 TGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 981616 5' + 1360 39 1 62.33 AAAAACGAATCACACTGCAAATTTGGAGCCGCACACTGACGGGCACGGGACAAAAGCTCACTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 - chr3L 8685247 5' - I-element 5297 1 54.79 TACAGTGTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTT:1 - chr3L 22723921 5' + HMS-Beagle2 6962 2 73.29 CTATCCATACATATGCGTATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chr3R 10931567 5' + 297 6581 1 80.82 TTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 19992634 5' + hopper 61 1 57.93 TAAGTATTCTCACACATGATCATCAATTAGAATGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTTCCCTCAGCGAACGAC:1 + chr2L 17766618 5' + Doc 353 1 76.03 TAATGGATTGTCCTCTGACTTAACCATAAATATTTGGTACACCGGAATTGTACACCGCTATCGGTATTGAGCATAGAGTTGATGTTGATGCTGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAAGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATT:1 + chr3R 26025625 5' - Doc3-element 499 1 76.43 TATAAGCAACGAAACTTCCACCTATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr3R 16342062 5' + P-element 30 1 62.68 CAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTA:1 + chr2L 22966919 5' + 1360 3235 1 75.34 AACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 - chr2L 12984238 5' + hopper 43 1 55.48 AGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGATGGGGGGTGAATGGGCCATGAATGGTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3L 13294980 5' - roo 344 2 60.00 AGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 + chr3R 11937262 5' + flea 4778 2 72.60 AATCGCTGCGTGGCTCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:2 + chr3R 13875028 5' + P-element 47 1 52.05 ATCTACTTGACGCCATTTTCGAGTGTCCCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCCTTTTTTGACACCCTACTTGCGGC:1 - chrX 11209915 5' - hobo 2866 1 74.80 CTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTT:1 + chr2R 3338795 5' + Juan 70 1 64.83 CCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 19032679 5' - roo 8992 2 75.34 GAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2R 4606295 5' + 1360 59 1 61.43 CCTCTAGTGTTTTAGGGACCTGCCCCAACCACTTTCCTTGCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAATGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTACTTTTGCTTT:1 + chrX 959013 5' - 412 7473 2 65.94 GAATCATTGCTTTTGAATCGTGCATGACTGAACATAAAGAAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTACCC:1 - chr3R 30813443 5' + FB 44 1 56.55 AGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACGGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGCCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCGCGCTCCC:1 - chr2R 20802641 5' - mdg3 160 2 68.75 CTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 15790805 5' + roo 23 2 60.27 AGATATATTACACTTGTATTTTACATAATGCAACAGCTGGCTGGAAACTGAACCACCCAAACCACCCAACCACCCAACTCATCCGATCCGACTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:2 - chr2L 2676782 5' + jockey 4812 1 66.44 ATTATGTACTTATTTTTATCTATAAATATTGTTATTAATTTTAAAGCAAATTAATACCTTCGGAAGAGGACAGTTCTAGAACAGGAGAAGAGGTTTGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAACACAGGTGGAAT:1 - chr3L 26170625 5' - gypsy12 9941 2 66.92 CGCATATTTTCTCAATAATCCTTCAATCGGTAAATGCGCCAAACAAAAACAATAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 + chr3L 18335322 5' + Doc2-element 228 3 63.75 AAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGT:1 + chr2R 2492933 5' - invader2 183 2 62.07 AATGATGTTATAAAAGAAAAAGTAAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 7889535 5' + roo 17 2 68.00 AAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3R 16518923 5' + Tirant 38 2 75.61 AATCACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr3L 15103926 5' + Transpac 41 2 56.16 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAA:1 + chr3R 19450184 5' + roo 9035 1 59.59 TAAACAAAGATTACATATTTTGATTAGCATATCTAATCGTAGTAATTGGGAAATATTGCACTTTTTAAGTGTGTTCGTTACGGTTACAATTGGCGCCCCAACGTGGGGCAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAAC:1 - chr2L 5335253 5' + Circe 284 1 51.37 TTCCCAAGGATATCTATTGAGTTTAGATCTATTCATTTTCATAAGAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTA:1 - chr2R 23574051 5' + jockey 4834 1 69.18 AACAAAAGAAAAGTTAAATAAAAATAATAAAACAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAATAACTCTCACGCGCAAATTTTATTAAATTCGCCTTGCAAGTT:1 + chrX 19147812 5' + TAHRE 134 1 39.04 GGTTCAGCTAGAGTCCCTGATTCTGCACTTGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 18488516 5' - roo 397 1 73.29 ACTTAAGTGGCAGCACTTGTGCCGTTTTATCTGGAGAACCAGATGATGACTCCAGACTCCGCACTCCAACTCCACTTCCAACTCAACTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGACGGGGG:1 - chr3L 15423694 5' + TAHRE 10099 2 60.56 ATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3L 17055457 5' + Tirant 8146 2 67.71 ATGGAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 18396034 5' - roo 394 1 65.07 AGAAAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 - chr2L 12251031 5' + 412 7076 2 65.75 AATGATAATGCGCCCAGGCTGATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 16970322 5' - roo 9050 2 69.18 ATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCTTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 + chr2L 6647665 5' - mdg3 5418 2 73.28 GCTACCATCAGAACTTTGCGGAACCACCCAAGCATCCCCCCAAACATGGTTCCATCAATAATCCTAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chr3L 4202532 5' - mdg1 393 2 55.48 TGTTCCAACAGCGATAAAAAACATTTGTGTAAGCATGAGGTCTTTTTTGTATCTTAAATTTTTTCCCTGACCTTTTTTTGTATACTTTCTTTTTTTTTTTATTCAACGGTT:1 + chr2R 17906253 5' - Bica 329 1 89.19 ATTCGAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chr3L 21380640 5' + I-element 35 1 59.12 TGGGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAG:1 + chrX 1799139 5' + invader4 69 2 68.61 AGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3L 16690883 5' - I-element 5318 1 47.89 GCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 - chr3R 5351486 5' + jockey 4726 1 54.79 TATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGGGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCAT:1 - chr2R 23780590 5' + Ivk 96 1 71.23 AATAAACACCATTATATTCTGGGTGTTGCCATCGAATGCATTTTTACGGCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTA:1 - chr3L 13739704 5' + BS 5009 1 72.60 CCTTTGTATGACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 4964069 5' - roo 9036 1 61.38 GTTGACATGTTGTTTCCAAGCGCCTTGGTGAAGTGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3L 10373930 5' + 297 53 2 54.79 CACCCACCTACAAGACATTTGTGATTTGTGTCTCTCGTTTTTATTTCCAATCGAAATGAGGAAAAGTCTGGCAATGTTATCGTCACCACACATAAACCTTCTCAAGAAGTCTGTGGACAGTCTTCGTCTTAGAAAGGGAGGAGTT:1 - chr2L 7912862 5' + Burdock 6119 2 51.72 AGTGCAGACGGCCAAGCGGGCCGAAGGAATTAATAATTCAGTCTGGAGCCGCCCAATGGCTTTTTGCCGGACTCGATTGGGCCTGTATTTTGTATTTTGTATTTTGAGTTGGTATTGTTACAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGGGC:1 - chr2L 19322247 5' + BS3 1683 1 76.71 TCATATCAAGTGCCCCTCTGGCTGGGATTATAGCGATCTCATTCTTCTATGTTGATCTCACTGTGGGTGCCCTCGAAGCCAGGTTCGCATTTGCGGGTATAGGGTCCAATCTGGGAATTAATATAAGTACAATATTAAT:1 - chr3R 24309889 5' - hopper2 491 1 81.29 AAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAA:1 + chr3R 19450014 5' - roo 8645 1 55.83 CACAACAACAATGCAAAACGTCTGCATTTCAACTAACGCCACCCGATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAAC:1 - chr3L 10670086 5' + G6 2019 1 69.86 AGCAGATTTGCAGCTTGATTTTAAATTAAGTTTGTATCGCAATGCAATGCTGAGCAAAGCCCATTAAAATCAGACCCAGCTTCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATAGTAAGGATGGGTGTATTAATGTATAAGCTTAT:1 - chr3R 26754140 5' - mdg3 77 2 54.11 ATAGGAATACACTTTAAAAACATAATAAAATGTCTTTCAAGCCCTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAAAACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCA:1 + chr2R 5582026 5' - Cr1a 143 1 73.29 TGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 - chr2L 4713950 5' + transib2 70 1 70.34 CTGGGATCTAAATAATTCTGTGTGATCTATGAACTCAAAATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr3R 30675304 5' - 297 6958 2 70.55 AATTGTATGTCTGTCTGCACGGAAATAGCTGAAATACCTAGTAAAGTTTTCATTCGGAATAAGATAGTTTGAAACAGACTAAAAAAGGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCTAATGTCGGAGACAAATTCACGCCTTACACAA:1 - chr2R 6980348 5' - Quasimodo 7292 2 54.79 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGATCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGCTAGA:1 - chr3L 11720529 5' - R1A1-element 299 1 61.64 CCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACG:2 + chr2L 11257015 5' - rover 7232 2 64.38 AATAAGCTTTAAAAATATATTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGC:1 - chr2L 15235872 5' + hopper 76 1 69.86 AATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCCCTCT:1 + chr3R 7819169 5' - invader3 5353 2 57.78 TGGCGCTGTGGATGGGGCTTCGAGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 22900507 5' + roo 8745 2 77.70 ACACTGATCGAAAATGGATTATAGATTGGTTGTGTTGTGTTCCAGGACGCATATTACTGGTGATGTGAACTTCTTTATTGTGTACGGCCCGTCAAATCTCGGGGCCAATTTTGCCACGAAACCTTCGGCTGCC:1 + chrX 10615188 5' - Osvaldo 1341 2 78.20 ATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr3L 13836629 5' - 412 7473 2 71.94 GATTTAGCGACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCACTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 + chr3L 21327078 5' - copia 224 1 57.53 ACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAT:1 + chr3L 19454906 5' + mdg1 42 2 55.48 CAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 8360627 5' - roo 9010 2 60.96 TGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACTCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr2R 8047254 5' + 1360 38 1 50.00 CAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 - chr2R 17878615 5' + Doc 78 1 69.12 GGTTATGAAATATAAAACGTATCATTATGGATACCAATAACTAATGTGTAGAATCCTAGAACTCCATATGCTCACTTCACCAGTCAAGTCATACAAAGACAGCCCTCGAAAACCACGTGTGCAAACTATTTGTGATTTAACAACAA:1 - chr2R 4516679 5' + transib2 2749 1 76.71 ATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr2L 15076223 5' + 1360 43 1 56.16 CTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chrX 19266913 5' + roo 8742 2 71.92 TAGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCA:1 + chr2L 15004790 5' - INE-1 140 1 57.53 CCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 7889662 5' - roo 9014 2 57.53 CGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - 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INE-1 253 1 60.96 GCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chrY 2720396 5' + 297 6615 2 63.01 CATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCGCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATACAAAATAAGAAGACTGTACTCGTTGGGTTTTTGTAAGAAACTGAGTTTATTTGGGAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 4341269 5' - roo 338 2 58.22 ATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGT:1 + chr3R 19449919 5' - roo 8603 1 62.96 AAAGGATTAAATAAATTCGGTACATTCCGNACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr2L 15940374 5' - pogo 2092 1 78.77 ATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr2R 6861435 5' + opus 7166 4 64.62 TAAATCATTACGTTTATATCTTCACATTTCTATTTTGTTTCTTGTTTATGCCATGTATAATAAAACCAATATGGACGTAT:1 - 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chr3L 8673364 5' - I-element 5273 1 74.48 AAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTGTGTAAGAAACTGGTTT:1 - chr3R 15791011 5' - roo 9037 1 54.84 AAAGTCATTCTCACACGGTGGACACGCAAGGGATTCGTCTATACTATCTGGGTCAATAATGGGCATAGCTGCAATCAATAAAAGATTAAGAATTTCTAAGATAAAGGCCATATTTAGTCAAATTTACAATGCATAAGCATACGTGT:1 + chr3L 20529688 5' - 1360 186 1 63.70 GAAGACAAATTGTTGATTTTGTGTTTAGTAAATACTGTTTTTTTAGTTAAAAATTCTATAGCCAAGGAAAGGTATTAATATCGTGTTTAGTGTTCTCTAAAATTAAAATATTCCATACCTTTAAATTATAAAATTTAATGCAATGC:1 + chr2L 15033051 5' + S-element 386 1 73.97 AGAGGAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr2R 21926350 5' - opus 499 1 72.63 TAATGAAAACATTACAATTATAGGAAATAAAAATAAAAAACAGATAGTCCTAAGTTTACTTATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATAATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCC:1 + chr2L 9293293 5' - mdg1 7033 1 68.28 ACTCTAGTAATCCTCGAAAATCCGGAGCTATATGAGTAATAAATGGGAAAAAAAACCCCGCGAACGCATATACGATTTACCCTAATTTATACTAAGTTGAGATTTAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTA:2 + chr3R 11406378 5' + rooA 354 2 74.66 CACACCCGAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27476738 5' - hopper 145 103 88.24 AACGATTTTTTGGCCTTAGCCAGGATTTTATTTATGTGGTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 12930705 5' + jockey 86 1 71.23 AATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 - chr3L 13581739 5' + jockey 4820 1 58.22 AACAAAAAAAAAATAGCAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGTCCTGTTTTTTTTACAATA:1 - chr3R 19992781 5' - hopper 1401 1 76.71 ACAGAGAGAAATAATATCGACATGTAAATAATGAAATGTATAGTAGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACAATTTAAAAACTCACATTTGCAATGCGGTATTCTTCTCAATTTAAAATGAAATTTAAAAAATATTTTTTTT:1 - chr2R 18695093 5' + Transib5 2727 2 57.53 AAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 - chrX 10167476 5' - roo 353 2 54.11 AATGGGGATTCGGATTTGATTTTGGATTCCCATTCGAATGGCGGCTACCGCTTTTGGTGGCACACAGGTGTCATAACTGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGTATATGGTGCATGTG:1 + chrX 6990809 5' - R1A1-element 5247 1 60.00 TTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3L 23287231 5' + 1360 63 1 65.22 AAAATTGGAATAGCAATTCAGTTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr2R 8047402 5' - 1360 3378 1 74.66 AAACAAAAATTAGAAATAAAATTAGGAAACCTAATAAGGAAAACAATTATATTACATGACATTAAAATTGAATGAGCACTAAAGATAATTCCATAGTAGAATGTGCCTAAGCACTATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrY 541476 5' + 412 7070 2 67.42 AAATTCAGCAGAACTTAAAGCGGATACTTTGGATGGAATGGCAGAGGCGATGGCCAAGTTTGTTATTTGCTCAACGGAAAATATTGAAGATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTT:1 - chr3L 19549411 5' + micropia 4992 2 74.62 GGTAAATTGGAAAAAAGAAACCTGTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr3R 5523866 5' + FB 21 1 71.92 ATTTGCTCAAATAGTATGTGTAGTTAAGCTAAACATAATAAGTCCAAAATTATGAATACGTTTTATATTCCTATTATAAAGATCAAAGTAAACAGAATATTTTTGTTAGCAGAATCTAGTTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGAT:1 + chr2L 10926931 5' - Cr1a 4264 1 65.07 ATTGTTCCTGTAACCCTGTATGGGTTGCCTGTGTTTGTGCTATTTAGGTTTTGCTGGTTATTTCTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTG:1 - chr3R 3195390 5' - I-element 182 1 55.56 ACATTAACTTACACAAAGCAAGGAAAGAAGTCAAAACTATACTACTGTAGTATATACGAACATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAA:1 + chr2R 954731 5' + mdg1 139 2 58.62 CGGGGGATCCGTCTGATCCCGAGCGCCGCTCATGTTCGCACTGAGCAGGGGGCATGTTAACTCCTCTCCAAAGAGAAGGCCATAAGGGGAAATG:1 + chr3R 5563097 5' + accord2 254 1 55.32 TTACGCAAATTAATGTTGAGTTTATTTATTTTCAGCACGAAAACAAATAAATAATTCAAATAAAAAAAA:1 - chrX 13073797 5' + X-element 4718 1 91.30 TTTATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 11062703 5' + roo 8688 2 67.39 GGATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr2L 15936780 5' - copia 5082 2 67.81 CAGTAAGCTTTGCTCGCTGTCGCCATTCATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGGATGATAAGAACCTATGTATGAATGAATAA:1 - chr3L 24351386 5' + rooA 7511 2 75.00 ACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 2989913 5' - roo 9034 1 58.62 AATAGTTTGGCTAATAAGAACTTCACATTTTCATAGCATTGTGTTCGTTGCACTTTTGTTTCAAATTTCCTAGCTTTTTTAATCAATCGAGTACTGTCCACATTTTTAAAAATTCCAATATATTTTTTTTTTTGTAATTTTTCTT:1 + chrX 17066402 5' - Doc 4694 1 62.76 TATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATC:2 + chr3R 904930 5' + rover 6990 2 59.59 CCCAATTAGGAGCAGCCATAAATTCAGGCTGCATTCAGCGGGGCAATAGAAGGGAAAAGGAGCGCGTGTGATTATTCACTTTTATAAGTAGACAATTGATTTGAATGCGCTGCATATTTAGCCTTCTGCTGAACAATTTCAGTTCT:1 + chr3L 10212253 5' - Doc4-element 2752 1 58.22 AATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGGCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCT:1 - chr3L 21996232 5' - Transpac 221 2 76.71 GGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTGCCGTGGCTCTAGA:1 - chrY 311345 5' + 1360 54 1 55.48 CTGTGATCAAGAAGTTGAGAAATTTAAAATATTAGATATAAAAATAAATAAATTGAAACACGAATATTTCAGTGAGCGTCTTTATTCTAAAACTGTCAGCTTAAGACTGACTGTA:1 + chr3L 12489116 5' - rover 7176 2 59.13 GTTTTTGCATTTCCCCCCTTAAAAAAAAAATTAAATGTATATACATACATACGTACATATATCTTGAAAGCGAGAAAGGCAAAAAAAAAATAATAATAATAAAAAAAAATAAAAATTACCAAGGTAGAAAACTCTTAAAACTAACA:1 - chrX 9064589 5' + I-element 414 1 76.71 ATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 + chrX 12066111 5' + transib2 45 1 55.04 ACCTGCAGCCTGGAACGCCAACGCGCAGTTCGCATCCCCAGCTGCAGCATCCGCATCACTATCCACCATCGCCCACTCTGACGGCAACAAGTCACCCAAAACTGTCACGCCCACACTTTTGAAT:1 + chr3L 9471621 5' + INE-1 250 1 62.10 ATCATAACTTTGATAACTAACACCAATGAGTGTCATTCGATTAGTAACTCAATTATAGTATAGTACCACTTAAATAACTAGATAAACCCAAGCAGCAGCATGCTTTCATTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTATA:1 + chr2R 13489288 5' - Tc1 153 1 71.23 ATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGTAAGACGGCAA:1 + chr3L 2544606 5' + Tirant 53 2 52.05 CATTACGTTAACGGGATTTCAATGGAGCGCCAGTGCACTGAGGAGGAGGGGCGTTTAGCTCAACATCTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTATTACTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAG:1 - chr3R 13476613 5' + R1A1-element 4860 1 71.92 AACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 20265925 5' - roo 9031 1 55.40 GACTAATTTTCCTAGCCATTTTCATTATGACCACAATTTCTCGCCTGTCCTCGTTGTTCAAACTTTTCCGGCCCATTATCTCAATCAAGAAATATACAAATATAAATATATATATATATATATAAATATGTAAATATGTAAATATA:1 - chrX 10131965 5' + G3 4506 1 80.82 ATGGAGTTAACCAGACAGTTGACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3R 20441370 5' + I-element 12 1 75.69 ACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTGCATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATG:1 - chr2L 13556474 5' + transib2 29 1 58.90 AAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGAAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 - chrX 2479558 5' + mdg3 5341 2 75.17 GGTTGAAATGGGCAGGAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 + chr2R 6965447 5' - Transpac 5214 2 65.75 AGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTAATGCTTTGCTCTACGTTTTTCGCGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACCAGTATGCAA:1 - chr3R 9298589 5' - hopper 1378 1 56.16 GCGTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTT:1 + chrX 6475264 5' + Doc 22 1 70.37 AATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAGTGGA:1 + chrX 190082 5' - INE-1 539 1 45.19 AAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chrX 10319705 5' - mdg1 7453 2 68.54 ACACGAACAGGTATGGGGTGGGATCCTCATCCTCCTGATTAGTTGGCTTAACTTATCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACC:1 - chr2L 16768717 5' + Cr1a 4163 1 70.90 CCTGTCCCCTGCCCACCACTTCCTCTGCTGACCAGGCGCAGTAATTAAGCCAGGATACATATATCCTTGATCAGAATCAATAGCTGAGTCGATC:1 - chr2L 19601997 5' + INE-1 96 1 63.83 AAATGGACTTGAGAATCATGAACCTTGAATTGTGTCCACTTAATCCCCAAAAAGTAGGCAATGAAGAATCGCAAAGGTTCGTAATTTTAAATAAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 - chr2L 7937363 5' - BS 5085 1 68.46 ATATAAAGAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACTTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTAAAGCTATGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 16033443 5' + Doc 48 1 51.03 CTACTAATATTATTTCTTTAAAAAATAGCTTAGAGATGAGAACTTGGAGATAATAGATACCAATTGCAAACTAGAGTGGGAGCTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTG:1 - chr3L 4380780 5' - mdg1 7352 2 56.85 TTTGCGCATTTGTTAGCCTGTCTTTGCTCTTCCCTTCATAATTTTATTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTGTGGC:1 + chrX 9655521 5' - gypsy4 327 2 67.81 CTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chrX 21216694 5' - roo 9034 1 59.59 TTCTAACATTTAATATTGATAAACTTTATCATTTAGCCCAAGGCCGTCTTCTTCACCTGCATGGACAGTAGAATGATTCCCACCCGGTACACCGACACTCACGTGGGCGATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGG:1 + chr3R 8981795 5' - 1360 3196 1 78.08 TTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr3R 30059421 5' + FB 63 1 77.31 ACGTGCTCTCTCTTTCGTTCTTGTTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGGGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTTCTGTGCTGGTAGCTGAAGAGCTTGACACCTTTTGGAACGGGGGGAGCTTGAG:1 + chr2L 18001168 5' - Doc3-element 446 1 80.49 ATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCGTTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr3R 12780917 5' + hopper 7 2 80.42 ACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:2 + chr3R 19407894 5' + diver 55 2 55.48 AAGCATAGATAAAATGATAATGCGCCCAGGCTGATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 16970310 5' - roo 399 1 77.40 AGGATGGTTGGCACCAGTCACCGTTTCAGGAAAACTTTTTATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCT:1 + chr3R 19445931 5' - 1360 73 1 72.00 CTTCTACACCAAATCGAAAGGTCTAGGTGTACATTCCGCGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGGACCACGGCGC:1 + chr3L 27141399 5' - Doc 4385 1 70.50 GTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1 - 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HB 84 1 52.74 AAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGTGGTAAAATTAGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTCATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 5389880 5' - roo 330 2 67.81 AAGCTTCAATTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 8157126 5' - mdg1 7445 2 75.34 ATTATGTTTGCTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 - chr3R 4461167 5' - blood 7371 2 76.43 AAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTG:1 - chr2L 16946125 5' - hopper 1349 1 60.69 ATGAGGAGAAGTAGCTAATAAAGAGGATAATTGGAGCGTTGTATAGAAATAAATAAACTGTATTTTCGTTACATACAATAATGAATAAGACCAAGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAA:1 - chr2R 21939263 5' - gypsy12 10034 2 56.16 ACCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:3 + chr3R 904902 5' + rover 6962 2 65.75 AAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 + chr2L 15550661 5' + Bari1 56 1 55.71 CATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 - chr3L 21769108 5' - I-element 5291 1 61.64 CATTATAATTGGGACATAGTTACATATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr3R 5768974 5' - roo 9046 1 67.81 TATCGTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2R 12472155 5' + transib2 26 1 67.59 TATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGGAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 + chr3R 9595007 5' - Tirant 334 2 64.14 GTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:2 - chr2L 18347408 5' - transib2 2785 1 58.90 CCCATATCATATAATATCACTAAACCATATCACTCTACCAAATATCACTCTACCAAATAAGCATAAACGAACGCAACCTACAATCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCATTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACC:1 - chr3R 25590189 5' + F-element 4518 1 41.10 GTAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr3R 29084968 5' + 412 7132 2 72.60 CTGGGCGATACTTTTGCTACTGGCTTGTATCGGTTTATTTGGCTGCCTGGTTCTTCGTCCTTCTGCTTCCTTCGGCGTTGGTGCCAGTCGGAGTCGGATTATTTTTATTTGGGCGAG:1 + chr2R 16437364 5' - I-element 4923 1 71.79 ATGAACTAACTCAAATGACGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGGTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTTAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 15791062 5' - roo 405 1 79.86 ATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr2R 12779745 5' + I-element 28 1 64.96 ATATTCCGCGTGTCAACAGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGGGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTA:1 + chr3L 17567874 5' + S-element 1586 2 59.59 CGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:2 + chr2R 21160620 5' - Transpac 289 2 69.86 ATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACT:1 + chr3R 7719693 5' - roo 9038 1 62.33 GGGGGATTTTCCTCCTTGTCCTGTATCTTGGCTTTGACGTTTTCGATGGTAAATCAGATTAGGGCTGGCCCACTCACACACCCACACACACACATACACAC:1 + chrX 6283071 5' + accord 254 2 56.44 ATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 20265933 5' - roo 9016 2 57.53 AACCCCTTGATGCCCCCTGGCCAGACGAAGTTGCCAAAAAGTTAAAGTTTCCGTGGCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTCTTAGCCCCGACAGAAGCCCCGCGAC:1 - chrX 7777905 5' + F-element 396 1 52.38 TTAAAGCTTTTAACGAACTTAAAGATAATTTAATAGCACAAGTGGAATTAGTTCAACCTGATTATAACAAAAAATTCACTTTTACGATAGACGCATCCACAACTCATTGTTTATTTTTTTTTTATCGCACGGGTCTCACGGCCACC:1 + chrY 382984 5' - Cr1a 4442 1 65.07 AGGTTAACGAACTTCCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCTCACTTGAACACGAATATATTTAAAGACTTACATTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATTGAGAGCGTTAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3R 11191463 5' + roo 8745 2 72.79 AAATAAGAGTACCAAGATGCGCTTGAATGATTTTTGTTTCGTGCAAATATTTTATTGACTATTATTCTGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTT:1 + chr3L 13243603 5' - mdg3 5191 1 51.43 TAAAAATTATTTTTTTTAGATTTATTCTGGCCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGGGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACG:1 - chr2R 2833297 5' - 1360 189 1 72.73 ATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCTTCCATATCGTTTTTACATATATATAATTATAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAAATATTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAACGTCGGAGACAAATTCAC:1 - chr2L 13585861 5' - Quasimodo 7303 2 76.76 CAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 23067445 5' + roo 56 2 73.60 AGAAACTGATAACATAGAGCGATCTATTTGCCCGTTACACGTAGAGTAAAAGTATATACCAGATTCGTTGAAAAGTAGAAGAAAACGCTTCCGACCATATAAAGTAAAAGTCGATTCAAGGTCTGTAGACTACTCGTTACAAGAG:1 - chrX 22694301 5' - invader5 4002 2 73.79 CTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 17940044 5' + 1360 22 1 54.79 TTTATCGTTTCTGGCTCAGTTCTTGTTCTCGAGATACCTATACTTTAAACATAATTATTAAAGATTCGTTCACTTCGCGAGTGATTCCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTT:1 + chr3L 18038210 5' + Cr1a 185 1 73.97 ATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:2 - chr3R 17421327 5' - pogo 2064 1 49.32 ATCACACTCGCAAAAACTAGTATAATTTAAAAAAAAATTATAACATTTTATACTGGTACTCTTCGAACCAAACGCTTTTTTCTTCATAATTGCCGCCGTCTTGATGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCT:1 + chr3R 5094029 5' - mdg1 488 1 52.74 AGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3L 14366508 5' - roo 9033 1 59.59 AATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr3R 4805688 5' + 1360 66 1 68.89 GTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2L 4063849 5' - roo 8997 2 69.86 AACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATG:1 - chr2L 13556472 5' + transib2 29 1 59.72 AATAAATGATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAA:2 - chr2L 9010182 5' + G2 2709 1 64.38 ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTG:1 + chrX 12657098 5' + blood 7083 2 65.75 CCCTAATATAAAAGAATGCACGCCCAGAATTGTGCATTTCGAGCTGGATGGTGATGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGTTTGTCACTATGCAGCCATTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr2L 22339702 5' - 1360 3333 1 76.42 AAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:2 + chr2L 14874170 5' - copia 223 1 60.27 CCATGCTAGTAACATTGCAGTTTTAAACAAGTATATTTTACTTTAAGTACTATAGACTAGTTCTATATTATCAAAATAGCTTTGAACAGTTTTGGCACATCGGGAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCT:1 - chr3L 22253526 5' + G2 2611 1 70.50 AAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACCATCGCCG:1 - chr3L 18125990 5' + Ivk 65 1 58.22 AGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACATTGTTGCCATGTGTATGTTTATGTTTAT:1 - chrX 959062 5' + 412 7127 2 74.80 AGCTTCTATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2L 12818186 5' - hobo 2926 1 76.03 AACTCTATGACTTGCCTACGTGTGCTGTTATAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGG:1 - chr3L 13754493 5' + 297 6578 1 78.77 GTTTTATGGATTAGCCTTTTCCATTGCTCCTAAATATACATAGTTGACTTTTGCTGTCAATATTAACCACACAATTTGTCTAATTCTATCGACGGGAAGGCAGCTCTGCGGGTCTGGATGATCCGAG:1 + chr3R 4708582 5' - Burdock 5967 1 72.44 TAATGAAGAGCTAAAAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr2R 8047226 5' + 1360 34 1 58.90 AGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAA:2 + chr3L 15913833 5' + jockey 4805 1 54.11 AATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAG:1 + chr3L 10373818 5' - 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chr3R 18093400 5' + I-element 37 1 57.53 ACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTAAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 12897000 5' - accord 188 2 51.11 GATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCA:1 - chrX 21994018 5' + McClintock 36 2 60.27 AAGAAGAGAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3L 12249905 5' - roo 9013 2 58.22 ATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3L 21996271 5' - Transpac 261 2 51.72 CTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 - chr3R 23639245 5' - pogo 2041 1 63.01 ATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 + chr2R 24427556 5' + jockey 4726 1 51.03 CCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCA:1 - chr2R 23780583 5' + Ivk 95 1 76.09 ATATTTCTTTAAGATTTTGTAACTTAACATTTTGTCTTTACCATTGTGCCCTTTGGCCAACAATTATTATTAATTATTATTATTAAAGCGCTTTTATAGTTCGACGTTTATACGTTCATTCCAGATCGACTCGGCTATTGATCATG:1 - chrX 22760013 5' - INE-1 95 1 64.38 GGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2R 17796534 5' + jockey 4718 1 53.42 AGTGTATAGTGTATATAGTGTATTATATCACATCTTTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAAAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCT:1 + chr2L 23075567 5' + invader4 2822 2 72.87 GGTAAGATTGAACACTTAAGTTTGGAGAGAGAAAATGTAGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAA:1 + chrX 13851867 5' + blood 7344 2 65.49 ATCAACTTATTTTCGATCGTCAATTAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 4217644 5' + 297 24 2 69.86 AAGAAAAAGGCTTTCAGGCCTTCAACTCATTTGGGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGGGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGG:1 + chr2R 8182114 5' - I-element 4875 1 68.91 AAAAAGGTAAAAAATAAATGTTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 4944245 5' + BS 5094 1 81.82 GTTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 15072698 5' - pogo 2076 1 65.52 CAAGCGTCGTGCTCCTTCACCTTCGTCAAGTGCTCCAGTGACAGAAAGAAGTCAGCGCAAGCACTTTCGACATCCGCTTTTGTGTTCTCGTTCGATAGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr3R 31585273 5' + F-element 36 1 66.92 AATCAGTTGATCAAAGTATCGGCTTGGTAACTATATGGTTTATATGGTATATATTATATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3R 21933142 5' - pogo 2041 1 65.75 CTACAAACCAACAGCTGGCCATTAACATAAAATTAGTGATAAGCGTAATTAAAAAAATAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 493706 5' - hopper 148 109 77.50 GGCAAATTACTATTATGCATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2R 23180151 5' + roo 22 2 69.86 ACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATA:1 + chr2L 10156121 5' - hopper2 1536 1 67.59 TAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGGATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGAGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chr3L 14720927 5' + F-element 37 1 57.94 GCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTTGAG:1 + chr2R 16510081 5' + F-element 54 1 45.21 GCGTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chrX 6475264 5' + Doc 33 1 65.07 ATAACAATAAAACAATGTAAAATCAAAATAGGAAACATAATACTTAACGAAAACAAGCTAAACCCCGAGATAAACCTTTCGGATTTGAAAGAATCAACACGAGGTATTTTTACTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAG:1 - chr3L 17474848 5' - rover 235 2 53.42 CAAAGCTCGATTGGAAACAGCTGTCGAGTGCCCTTGAGTGGGTGGGCAAGATCGTCATCATCATCATCGTCGTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 + chr2R 10078869 5' + jockey 4767 1 58.73 GTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGGATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1 + chrX 19038388 5' - 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pogo 2080 1 71.23 GACTGGAAAATTAGTTGAAAATATTGAAGCTGCATCGACGCACAAGACACGTATTCCACGTACAGGATCACAATCACCACCTGCCTATTTACGCTCCAGCAATACCTTCGCTATGGCCGTCGCTTCAA:1 + chr2R 2865048 5' + Tirant 8074 1 76.56 TTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr3R 30675460 5' + 297 6631 2 57.24 CATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3R 8890125 5' + FB 31 1 59.68 CTGGAAGTCGTATTTAAACCGTGCTTTTAGCACATATTCCGCGGGTCAACAGCTTGTATTTTGATCTTAAACTGCAACTTGTACGCAACATGACAGGCTCAAAAGTGTGTATACTTGGAATTTGTTGGTTATTTTCTTGTATATTT:1 + chr3L 17567841 5' + S-element 1553 2 57.53 AAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 15790976 5' - roo 8987 2 82.01 GTAAAACCCCCCTCATTTCTTCGCATGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCGGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCA:1 - chr3R 9138369 5' - Doc2-element 343 1 76.19 ATTATGTATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 14980282 5' - roo 9037 1 61.64 CAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790088 5' + flea 4747 1 56.35 TTCTCTACTGCTCTTCACCCCATCCCTTCCTCTCGTATTTATTTAATTTTTTCTTCTGTACGTTTTTTGGCACTCTTCTGATGTCGCTGTTTATTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAA:1 + chrX 17345859 5' + copia 5063 2 65.75 GTTGAAGTTTTTCATGTCGTTGCATATTTTTCAACCCTCCCCCCCTCCAACCCCATCAACGATCACTCAAAAAACAACAACAAAGTAAGAGGCTGCCTTTGTGTTCGTTTTTTGTTTGTCTATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 22668195 5' + Tc3 79 1 75.00 GTGATTTCTGTTGGGGTCAAAGTAAAAAAGTTCAAATGGGTTTATGCGAAAAATAAGAGGAACGCTATACAAAAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTTTGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTG:1 - chr3L 6844546 5' - hopper2 1313 1 48.57 ATCATTTGCATCTTGATGATAAATTTAAAATTTATCTCTTTTCATATATCTCTCTGGTAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - 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chr3L 14366606 5' + roo 86 2 76.03 AATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 16970368 5' - roo 9004 2 66.44 AGCATTTCTTATCCGTACATACCCACAGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3L 21969792 5' - opus 474 2 56.16 TATTAATCTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:3 - chrX 10167496 5' - roo 9037 1 60.96 GTAAGCATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTAATTATTGAATCTT:1 + chr2L 1567633 5' - Doc 4680 1 77.36 AGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chrX 19054237 5' + jockey 58 1 51.37 AAAGAAGTAGAAATTGCTTAAACCATATACATATATGTACTAAAAGCTACGGGTCAAAAAATAAGAATAAGCTTTTAAGGCTTGCGAATGTGCAAAAAAAACTAAAGTGAACAGTTTAATAGAATAGAATAAAAAAAAAACTATAA:1 + chr2R 11793020 5' - 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chr3R 9039015 5' - Juan 4152 1 63.45 AAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 9871586 5' + roo 14 2 73.11 GAGGCAGATGATTTTTCTAGCGAAAAAAATTTTTTAATATTTAAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr2R 2590685 5' - HMS-Beagle 7009 2 58.52 AGCAGTAATTAAGCCAAAATATGAATACCTAACAGTAATTCTCCGATGAAAAAGTAGTAGTGTAGATTATTAGTGTATTAATGTCATGAAAATATAGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGG:1 - chr2L 22927855 5' - G2 2779 1 72.39 CTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATATATATTGTTTAATTATATTTTATAAA:1 + chr3L 16973399 5' + S-element 1617 2 78.08 TTTAAAATAAGTATTTACTTTCTGTTTACTTGAATTATATCACAAGCCAGCGATCAAACGAAGCCAAAAAACAGTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCC:1 + chrX 17261165 5' + X-element 4500 1 51.37 TATTATTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:1 + chr2L 13844116 5' - Stalker2 7632 2 69.18 ACGCACAATTTGAAATTGCCAGGGGTTGGGAGCTGGGAGGAGCAGAAGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGAC:1 - chr2R 18965745 5' + micropia 355 2 67.13 ATTTTTTCGCCTCGCGTCGTCGTCCATCGGTGACTTTTGGCGTAAAAACCGCAGCACAATATTAACAATGACGCATGGAGCACTCACACACACACACACACAGAGACAGACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCC:1 - chr2R 16367740 5' + I-element 4993 1 73.10 ATCGAGGGAACAACAGCAGCCAAAAGGGGCAAAGGCACCACCTAAAATACCCTTTAAGGATGATGTTTCAAAATTAAAATTAAAAAAAAAAAT:1 - chrX 8940160 5' + Doc 4694 1 55.91 AACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCCTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chrX 12986542 5' - roo 9001 2 66.21 ATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTC:1 + chr2L 14074465 5' - 297 6896 2 75.34 ATAGTTTAAATAAATAATTATAGTTGGCATGCAATTATCTAATTTAGAGAGTGTAATTAAGCATTTCTTTTTAGTGATACATCATTTTACTAGGTTTTATAATCCCTTTAAACTCATCGTATACATTCGGAAGGGGACAGTTCTAG:1 + chr2L 14438066 5' - gypsy12 9990 3 73.29 TTAAGTTACCATTCTTTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAAAGTATGTCGTTTTGATTCATT:1 - chr2R 17878699 5' - Doc 212 1 77.50 GATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:2 + chr2L 13556306 5' - transib2 2796 1 66.44 ACCAAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 - chr3R 21276665 5' - BS 5074 1 62.33 TATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr3L 21996139 5' + Transpac 4961 2 61.64 CCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3L 21327195 5' + copia 4909 2 58.22 AACTAAATGTTCTTTGTAATTAAATTACGACCAATAGCTCTTAAAACGTGTTTAATAACCACTCTTCTGTCAGTTACCGACTTAAATTCTACACTCAGTTACATTTTGGGCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTC:1 - chr3L 9904491 5' + GATE 294 1 69.18 CTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGA:2 - chrX 22824263 5' - Gypsy12A_LTR 2243 1 56.16 GAATCCAGAGCCCGTCAACGTTGAATTATCCGTCAAAAATAAAACTAATAGCTTGGGACGGGAAATTAATTAAAAGTAGCATAC:1 + chr2R 3522123 5' - Cr1a 3981 1 61.90 TATGCCTGAGATACATGTGTATATATCGTGTGGGTGGCATGTTAACCCATCTCTCCAAAAAAGTATAAAGAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 5230276 5' - hopper 145 115 65.17 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACAT:3 + chr3L 16731387 5' + rover 7010 2 65.07 GTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 21224532 5' + roo 8713 2 57.14 AGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr3R 15790071 5' + flea 11 2 70.77 AATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 + chr3R 30813350 5' + FB 81 1 73.29 AGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 12115296 5' + 1360 51 1 75.00 AAAACACCCTTATGGCACAGTTAATGGCAGGATATTATTAATATTATTTTTATT:1 + chrX 5359948 5' - mdg1 7078 2 92.59 TAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chrX 19054244 5' + jockey 65 1 56.16 CCTGTTGTCTTCTTAAAAATAAATCTTTGAAAAT:1 - chrX 21236653 5' + P-element 2692 1 70.59 AGAAAGGGTAGGCCGTTCCATATTCTTAGCAAATCCAGCATATTTAAAAGCAGATAAAAGAGAGCGGGATTCATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATTTATGTGT:1 - chr3L 25675488 5' - Quasimodo 49 2 52.05 TTTGGCATTCAGATTGGTGCCAATACACCGGGCTACCACGATCCCGCAATGCCGCCGACGCATCCACTGTTTGTTACTTGACCGCGCGCTCTCACTCCCGAACTCCTACTGGTAACGCTTCGACGCACTATCTCCTTCCACGCGCG:1 - chr2R 17416450 5' - gypsy8 397 1 66.44 CGTCTCCTGGCCCTTCAGATAGATCTTTAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTA:1 - chr3R 18971814 5' + Juan 4059 1 55.17 GGTTAGGCATCTCGCACGCCCGCTGAAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2R 9158158 5' + mdg3 49 2 52.74 AATGAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCTTTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGAAACTTATTTGTTCACACATGAACACGATTTTATTTAAAGACTTAAAATTTTGGGCTC:1 - chrX 21216840 5' + roo 28 2 55.56 AATAAGCCAAAAAAAAAGCAAAGCAGCCAAGCCAAATTAAAGTAAAAATTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 13567346 5' + Doc 4692 2 86.67 TCTAAGGCTAAGTGCCGGCGAGGGCCAACAGAGTGAAACAAAAAAGGCTAAGGCTAAGTGAAAATAATTTGTTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAA:1 - chr3R 9920301 5' - S-element 75 1 56.16 ATATGTAGAACTACTTCACTAGCCGAGGCAGCAGCACAACTAGCCCAAAGATATATGCAAATAGATGAGAAACATTACGAAGAAACAAATAGAGGAAGAAAAGTTGAACACTATATTGTAAATATAAATTTTAAAAAACAAAAAAA:1 - chrX 18111848 5' - Tc3 389 1 60.96 AAATAAATTTAAGCCCATGTATTTTAAAAAGCAAAAACTAAAAAAAACGAATGCTTAAAAATCCACTTTTTGAATAGCAACAATTATTTATGCATATGAGAAACTAATGAAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCA:1 - chr3L 20616158 5' + mdg1 111 2 76.71 ATGTATGTTAGCTTATTATTAGAGTGTGCTATTTTTCACTGTGCGTTCATGGTTTTGCTTGGGTGTGTTAAGTGTTTGTAGTTAGAAGTTTTTGCACGCAATTTTAATACATTTAATTTTTAAGTATTTTATTTGATTTATTTTAA:1 - chr3R 26398794 5' - G7 1146 1 60.96 ACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chrX 661928 5' + 412 78 2 75.19 ACCGGGCAAATTTGTTAATGAAATCGAATCAGGGGGAAATGGGAAGTGCCTTTAAGTAAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGC:1 - chr3L 14516688 5' - Ivk 390 1 56.15 AATTATTACTATACTATACTATAAGAGAATTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTTGGAATAACATAGCGTCAATACATTGGGACCCTTTGTCATAATAAATATA:1 - chr3L 27124003 5' + Stalker 6923 4 73.97 ACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATT:2 + chr3L 16973334 5' + S-element 1552 2 60.27 ATTTCCGAGAATACTATATATTGAACTTTCAATCAATATGCAGGCACAGCAAGCCCATGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCC:1 - chr3L 21895733 5' - roo 45 2 60.96 TACTGTGCTTCACTTTTTTTCCCCATTTGCTACACAAATCTTTCGATATTTCCTTTATATTTTGTCGTTTTGTTGCAATAGTAAAGTACGGATATGGATCAGAATTGACTTTGGCCCGAAAGTCGTCTTCTAGCACAACACG:1 + chr3L 10436155 5' + 1360 3202 1 66.90 GGCACACAAGTCCCGTATCTAAAGGACAGCGGCGCTGGATACACTCACCTATAATAGGCGGCTTGAAGCGCTGGCCGGACATGCAGAGTGCAAGTGGCACGTATCCAGAGTCCACAA:1 - chr3R 9502377 5' + TAHRE 10011 1 72.65 GAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGTTGAGCA:1 + chr3R 15882557 5' + jockey 6 1 75.45 AATTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATAAAATAACTTAAATAATTAAAATAATCGCGCTTTGCTTGCCAAAGACTCTCAGGCGCTAAACTAATTAAAATCAAATTTCA:2 + chr3R 24494252 5' + HeT-A 96 1 76.71 ATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 + chr3R 17673752 5' + FB 68 1 65.75 AGTGGAAAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCG:2 + chr2L 9636027 5' - 412 480 2 72.60 GGGAGAAGCCAAAAAAGGGGTTATCCACATGCATAAGTGAGAGCAGAAGAGTTTAGAGTGGGGGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGATTTGAGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTG:1 - chr3R 30813790 5' - Porto1 394 1 74.66 GGAAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCTAAGAAA:1 - chrX 20373703 5' + 297 6611 2 65.75 GTGTCTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGG:1 + chr3L 28063316 5' - Stalker 6970 4 78.08 AAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 - chr2R 10161865 5' - transib2 2744 1 72.41 TATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:2 - chr3L 14720906 5' + F-element 78 1 60.27 CTGGTGTATACCGAATGAGAACAATTTTCCGATTATCCCAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 5151243 5' - roo 8990 2 71.92 GTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chr3L 25782375 5' + F-element 90 1 71.23 GGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chr3R 7317653 5' - I-element 5279 1 69.18 ATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chrX 20373690 5' + 297 6607 2 64.34 TTTTTTGTTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3R 15072704 5' - pogo 2087 1 72.14 CTTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGCGACGGATTGGGGTGGTCCACACTAGCCACTTCCATT:1 - chr2L 21328301 5' + 297 6599 2 73.97 CTGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCACTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 16518868 5' + Tirant 8136 2 62.50 ATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:2 + chr3L 2989963 5' - roo 319 2 78.77 TAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chr3L 23456273 5' - 1360 3331 1 59.59 TAGAATTCAGGAAGTAGAAGGTGGATATAAAGTATTCTGCTCTTAATTTTTGTTTAAGAGCAAGAGGGCGGAGAACTCTACAGCCAGCAGCTGTTTTTCCGCATCCAGTGACTTAGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATT:1 - chr3L 22722782 5' + 1360 255 1 72.60 ACTCTTGCTTGTCTGGGTTTAGGGACATGTTCATTAGACCAAAAATGAGCCCAATTGAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTAACGGGGTGGTCGCTATGTACTTAGCT:1 - chr2R 9241396 5' + R1A1-element 5186 1 58.22 AATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 19073285 5' - roo 349 2 59.31 GAATTAGGGTTAGTCGTTTCGGTGTGACTAGGCATCAGTGGTTGAACCTACCTTGTTGGCGTGATCCAGAGCAATCTCAAGCTCGTTGATGTCAGCCTCCAGCTTCTTCTTCAATATAACCATAAAAGGTTCAAGATCTTAATGAC:1 - chr2L 16785871 5' + baggins 5081 1 76.03 CCTATCTATATATATATTTATATATATATATATATACTTTCGTGTTCTCATAAGATATAGGTTATATTAATGTATATTCATATTTTTACCCATTTATTATCTCCTGGCGCATTTAGAATTTAAGTTTTTTTTTTGCATTTTCCTTT:1 + chr3R 18851023 5' - Doc2-element 240 1 68.49 CGGTGGGTTAAAATAGGAAGTTTTGTTTGCAGTGCGCACAGCAACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 16540895 5' + hobo 28 1 67.12 AAAAAGTAGTTCATGATCATATTATTATGGTTACCAAAATGGGCGGGAATGTATTCATTTGTGTGTGGAGAGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCAAAAATAATGA:1 + chr3R 12059970 5' + micropia 5044 1 51.37 AGTTAAGATCATTTAGTTCCTTTAAGTAGTATTTTTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 - chr2R 7306582 5' + Max-element 8240 2 70.59 TTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 - chr3R 10970367 5' + G-element 34 1 57.53 ATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - chr3R 4461122 5' - blood 7320 1 67.12 AATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAA:1 - chr3L 22035593 5' - 1731 4547 1 72.54 AAATTAACTTGTTTCGTGTTAAAGTTTCTGTGGTTTAAGTTGGTTCTGAAAAGCTGAACAACTTATTGGATTAGTCAGGTGTTTGAAGACGAATTAATGAGATTAGTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCG:1 + chr3L 13235205 5' + roo 335 2 72.60 AACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACCTACGGAATATATACATATAACATATCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTTTTTTTTTGCGTTTTTTTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTT:1 + chr2R 5582150 5' + Cr1a 66 1 74.66 TATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGGTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTT:1 + chr3L 22890332 5' + FB 16 1 67.48 AATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGA:1 + chr2L 22255056 5' + 1360 216 1 57.53 TTGCACTTTAAAACCTTTTCCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 + chr2R 12779604 5' - I-element 5332 1 64.57 AAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAGGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCACTCA:1 + chrX 20999525 5' - BS 5014 1 71.72 GGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTC:2 - chr2L 15550764 5' - Bari1 1645 1 62.33 GGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 + chr2R 17796564 5' + jockey 4706 1 57.69 AACAGAATATGGGCATTGATATTTATGATGAAAATATATCCGAGTCAATTATTAAGATGTATTAAAAAAGAATTTACGAATAGATAGGCAAATAGTACTAATATCTCTCCGTCTTCGGATCTCAGGAACTATAAAAACTAGAAGGT:1 - chr2L 15841621 5' + INE-1 157 1 71.23 CTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 12818260 5' - hobo 2877 1 69.42 TTCACAACAATCTCCAGATCTTTGCAGCTGCATCTAACAAGAAACTCGACAAAACCCGCGCTCGTGCCAGCTTTCCTCTTTTTTTTTCTTTCTC:1 + chr3L 6863393 5' - Doc2-element 244 1 56.38 AAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 13972941 5' + 412 42 2 54.07 GAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGGGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr2R 17878611 5' + Doc 80 1 70.15 AAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 - chrX 17717084 5' + FB 75 1 67.81 ATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAA:1 + chr3R 30675343 5' - 297 338 2 60.96 ATGGAGTGGATATGGTAACAATAACTAAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chrX 13490760 5' - 297 345 2 59.59 AGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACAC:1 + chr4 1301734 5' + 1731 72 2 63.70 GCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - 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Transpac 5215 2 74.13 GTTTGAGATGAGTGTTAACTGCAGGAACCCAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 + chr3L 20196256 5' + FB 79 1 76.87 GAAATTCTTTGGCAGACTCTGTTGTTTTCGGTTTACACTCAACTAGCGTTTGCGCCTTCTTGTCTTCCTTCTTCTTATTTCGCATTTATGTCATCAACACACGTTTTCCACACACGCACTCACACACACACACTCATACTCACACA:1 + chr2L 1461523 5' + accord 190 2 66.44 AAAACTCTCGTGACACATTTTGTTGGGCTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 21682808 5' + roo 8724 2 59.59 TTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr2R 5479983 5' + F-element 22 1 67.86 ATTCCATGGAAAGCTCTTTGGCGACGGCAAGGTGCCATGGTCTCCCCATAGCGGATACTTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGTGGTCTAATCCAGC:1 - chr3R 6849812 5' + F-element 4481 1 58.22 AAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - 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transib2 2785 1 47.22 GCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 + chr3L 18505659 5' - I-element 5279 1 68.49 TATTGATTCTATTAAAGTAGCAATATCAGCCTTGGGCTAACGAAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr2R 14653287 5' - 297 368 2 63.01 ATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTG:1 + chrX 18009916 5' - 412 7505 2 44.06 AGGACTAATTGTCTTGTTCTTAATATTCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAGCAACTCCTACCTCTCATTCACCGACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTTAAA:1 - chr3L 22119572 5' + Porto1 316 1 78.23 AGCATTCAAATTTGCAAGGTATGGCCCCGATACAACATACAAAAAAGTTTAATAAACATCGTAATGCATTTTATGGATTATTAAAAAAAAAAACTATTTAGAATCTTTCTTTTTCCTAGTTTTTTTTT:1 + chr3R 13218947 5' - Doc2-element 231 1 49.22 CATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3L 8627378 5' - pogo 2088 1 35.62 ATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACA:1 - chr2R 2318200 5' + ZAM 7998 2 71.95 TACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3L 1279162 5' - roo 335 2 74.45 ATAAAATAAAATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr3L 22035709 5' + F-element 21 1 72.60 AAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 4939194 5' - 1360 3362 1 34.93 GCAAGACCGTGAATGCGTCTCGCGTCTTCGTTCTGGGTGATTTTTGATTTAGGTTTTGGTTTTTATATCGATTTGGTTAGTTCATTAATTGATTTAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGG:1 - chr2L 16896819 5' - Idefix 6975 2 65.07 GTGCGTTTGGGGATGTGAGAATGTTGCATTTTTTAGGGCTCTTTTTAGGTACAGCGATGGAAATGTTTTTTATTTAGCATTTGCCCAGCTGTTTTTCCATTGCCGTTACGCGTCTGCTTTTATATTAATTTGCTTTATTTTATTTT:1 - chrX 11442138 5' - TAHRE 33 1 66.44 ATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGAAAAACGAGTGGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCCTTAAATTTAATTATGATTAGTATTG:1 + chrX 3431844 5' + Ivk 5344 1 43.84 GAAACATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGCATAGCATTAGCT:1 - chr3R 7666735 5' - I-element 5305 1 52.05 GGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chrX 18817241 5' - transib2 2799 1 68.49 TATTGGCGCTTTAAATCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3L 16970447 5' + roo 8740 2 73.29 ATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 - chrX 17717099 5' + FB 60 1 57.53 AATGTAATCATCCACACAGCGTATGAACCATTGACAATTGTCCGGATATATTTTAGAGGAGAAAGTTGAAGAATAGCAATAAGCTTAATAAAATATAGAAAAATGTATTGACTTTTATTTCATAATAATGGTTTTTGCATCTTGTG:1 - chr3L 5482025 5' + transib4 2317 1 67.81 TGATGATGTTTTTATATTCGTCAAGTTTTTGAAGGTAGTCGTGTTCGTTATTGTGGGAGACATCTTGGGTTAGTAAATGGGGTCTCTCAAAGGGTGGGTATTTTGTTGTTTCCTGTCTTTGTTCAGAATGTTGAAGACGATTTT:1 + chr3L 27369911 5' - Fw3 277 1 75.00 AATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 - chr2L 21328282 5' + 297 6618 2 61.64 AATCCTTCATTCAATATTGCAGACCATTCTACTAACAGCCAGACAAATACAAATATTTGTTCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAA:1 + chr2L 10546450 5' + Tabor 401 2 56.43 ATCTAAATTATGAATATCAAAGACAAGAATTTTTCTACTACTGATCTAATTGTACCTGACATACAACGCGGCTGAAAGTATATCTCCTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGA:1 + chrX 3463826 5' + hopper 1192 1 65.75 CATGTTTATCTTTAGCTTATATTATTTGTTGTTTTCATGTTGTTTTGTGTTATGTGTTGTGTTTTGGGTTTTGAGGTTCGTTCACACGTATTTTCACTCAAC:1 + chr3R 10500251 5' - Bari1 1470 1 69.61 GAGTCGACTAGTTGAGCAACCCTTGCTAAAATCTATTAGAACCCATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGGAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 21116433 5' - mdg1 7445 2 53.42 GATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGAT:4 + chr3R 9557519 5' + G6 1992 2 54.79 AATTTGTTCAAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 + chrX 19074728 5' + mdg1 7061 2 65.52 AAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 + chr3R 22287990 5' + transib2 26 1 64.20 CAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr3L 15103789 5' - Transpac 273 2 58.39 GATTTCATTGTATTGGTTTCTAGAAATAAGGAGACTCCAGCTTTGGCTTTATGCCTCCAGGCCATTTAAATGACTTTTCTTTGGCACATGTTGCCACGCCCATTCTAACGCCTACATACCGCACAAAACTGTCACTCCCACACTTT:1 + chr3L 14336180 5' + INE-1 245 1 56.85 ATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:3 + chr2R 16510114 5' + F-element 87 1 66.44 AAAACGTCAATGGGTTCGATTGTCGTTTGCGATGATTATGATGATGATCGTTTGGTTGGTTAGTTAGTCAGTTTGTTTGGTTGTTGTTTTTTGAAAGTTTCGCTTGAATGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATT:1 + chrX 19304663 5' + Cr1a 403 1 56.85 TGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 14366529 5' - roo 9012 2 61.64 AAGTGGTTTACTTTTCAGATCACAGAGGTCGGATATGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACG:1 - chr3L 3982914 5' + P-element 186 1 28.77 AAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 19073157 5' + roo 8699 2 56.16 TTTTTAAGTACTTTTATAACCCATTAAATCACACTTTTTTTGTACGGTGTATATAAGAGCACTCCCGCGAAACTGGCAAACTGATGCAATGACAAACTGACGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCG:1 + chrX 11651696 5' + rover 7124 2 65.75 GAGCACATAAAAATAATCTAACACATCCTCAAGGCTTATTTGGGAATTCGCGTCAAAATTAATGTTGTTTCATCACGGGAAATAAGCTTTGAATAGGACAATATCGATGTCTACTCAAGTTTTATTTATTTATTTAAAATTGTCCA:1 + chr2L 9828660 5' - G7 1138 1 23.97 ATTTGTGCTCAATTTTTTGGACGATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:2 - chr3L 21763799 5' + jockey 12 1 75.23 TTTAATTATTTACTATAATTATTAAGTCATTTGGCTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTTAAAAAAAAATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAATGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATT:2 + chr3R 7193311 5' + 1360 2984 1 55.48 ACAATCTTACCGAAACGTTTTGCTAACTTCTTGGCACTGCTTTTCATTTAAATTGTTGAACAAAAAATATATAAATTAAACAATTATTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATA:2 - chr2R 13557748 5' - gypsy9 5275 2 60.96 GAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr2R 13259306 5' - mdg1 336 2 73.97 ATGTGGACTATATACGTTTTATCTGCGTTTCATAGACGTAAGGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chrX 16946733 5' + FB 50 1 52.74 TAATACTCCTCCAATAATGGGCAGTAGCCAACGTGGTAGCATTTTGGTTCAAATTCAATTACATTGAGCAGATTTTTATGGTTTATATAGCTGGGGTTTTATAAATGGAATTGTTTGCCCATGGTTGCCGACAAATTAGTTTTTTT:1 - chr2R 18293895 5' + FB 81 1 69.86 ATATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 10731919 5' + 297 15 2 69.86 GAACTTATTGTAATTATTCAGTTTGCGGCGGCTCAGGAGCAACATCGCCAACAGGTGCATCAACAGCAGCAGCAGCATCAGCAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACAACAACAACAGCAGCAG:1 - chrX 13270642 5' + TART-A 127 2 62.70 ATAGCAGATACAGCAGAGAAGATAGCATGGAGATAAATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr2R 4606345 5' + 1360 15 1 73.97 GCAGCCGCAAAGTATGCAATGAATTTCATGTCGCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCTCAAAGTGCATTTTTG:1 - chr3R 28746123 5' + Bari1 19 1 60.90 CTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTT:1 + chr3R 9298459 5' + hopper 56 1 56.16 AATGTCACTTTGGCCCGGCTGATGCATGAATACATCCGTCGCCTGCCTGGTGTCTCCCCAAACAGGACCTAATTTTAAAGGGGGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTA:1 + chr2L 11662629 5' - FB 975 2 50.36 ATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCGCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 - chr3R 27083132 5' + jockey 4577 1 50.36 AAATGAGTACTGCGGATGAGAATCATAGGTGTCCTCACTCCCAGATGATTTCGCGGGCAGTGGACCAGCTTGAGCCAAGCCGATGAGGGTCACAAGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACT:1 - chr3R 6684662 5' - G4 3549 1 62.33 AAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr2R 16817977 5' + 412 7113 2 59.59 AATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:2 - chr2L 16564559 5' - roo 8996 2 73.29 GCCCACCACCGCCCATATAAACCCACACACACACACACACACACACTCACTCGCGCGCGAAGGGAGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCCCTCCACGACCACCCGATAAACACT:1 + chrX 6513358 5' - hobo 2910 1 56.10 GCTGAGATAATAATGATCCCAAAAACACCAGACACGCAGCCAAACAAAAAAAACATCTTAATATATTTACGCATAAAGTAACCAAATTGTCGTCTCCAAATAGTCAAAATAATTCCAGATAAAACCAGTTTGTGCTTCAAACCTAA:1 - chr3L 22538189 5' + Transib5 106 1 70.55 GCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3L 18281862 5' + Doc 36 1 54.46 GCTCAGTTCCGACGCTGTATGGTCACATTGGCTGCAGACCTTATATGCATCCATTGGTCACACTGATTAATTGATATCTAATGCATATTATAAATCGCTCATTTATTTTTATTTTTTTTTATTTTAATTTT:1 + chrX 12276050 5' - Doc 4698 1 64.12 GAGTTGAGTGAAGCCTCACCCACCCACCTTTCTCCCAGTCCCGACTCAGAAACATCAACACCGACAACAACAAGCACAACAACAACGAAACAACCCGAACTGGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 + chrX 10033997 5' + I-element 5133 1 71.03 AGAGTGATTCGAAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGATTTTTTTTTTATGCGTTACACA:1 - chr2L 15779634 5' + hopper 73 1 67.59 GTTCGGTATTCTCGTTTGACTTTAACTAAGAATTTTAAAACAAGAGATCTTGGTATCTAATCTAAAGCAAGCCCTTCTGTAATGTTGGTCATCACAGAGTACGGGGCTTACTAACGTCACTAGAGGAAGAAAAAAGTCTGTCCTT:1 - chr2L 10384819 5' + baggins 5000 1 48.28 AACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 - chr2L 16946115 5' - hopper 1338 1 67.81 TAATTCGCTGATATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 + chr2R 21160606 5' - Transpac 5222 2 79.45 GGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAGCGTTTGCCCATTTT:1 + chr3R 15807392 5' + FB 49 1 78.02 CTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1 - chr3L 19455005 5' - mdg1 339 2 71.92 CAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 - chr2L 16943893 5' - copia 224 1 60.27 TAAAGGGATTCCCATTACGGTGCGAGGGTTTTCGATTGGGCTAAACTCATGGTATATTGTCCCTGAATAAGGGCACACACATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAG:1 - chr2L 13025700 5' + 1360 98 1 54.79 GAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 + chr2L 71189 5' - 412 7466 2 69.18 AATTTCAATTACGTTATTTATAGCCGGGCAAGGGACATACGACAAGCGACAAGAGACAAGCAGGCTGCACGAAGCTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAG:1 + chr3R 31461639 5' + micropia 342 2 55.46 AAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 21224549 5' + roo 72 2 68.49 AAAATGTACTTCTACATAGAAAAGGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 19449987 5' - roo 399 1 66.67 TTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCCTGTT:1 + chr2L 12569981 5' + micropia 4992 2 59.59 AAGCTTAGTGTAAATAGTTTATGGGGCGCTCTTTATCCACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTCAACTTAAAAGCCTTAT:1 - chr3R 14725059 5' - FB 270 1 72.60 GACGCTATGCGACCGCATTTCGAGCGATAAAACAGAAAGGTGTGCTTCTCTCTCCCTCTCTCGGCACTCTCTCACCTGAGCTGCTAATACAAATGTTGTTTTCCTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAGTTTTTAA:1 - chr3L 15094486 5' - 1360 3095 1 77.40 AAATATGGTTATACTTGGAATATGGAATACTTCCTAGCTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTAGTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGTTTTTAATAATCTTCTCTAATTATCATATATTTTAAACATA:1 - chr3R 1847815 5' + Cr1a 93 1 68.49 AGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGT:1 + chr2L 15550663 5' + Bari1 54 1 55.88 GTCAGGAGGTGCTTCTTTTGCTTCCTGATTCTCATCATTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACAT:1 + chr2L 15834715 5' + Transpac 305 2 55.95 ATATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 9871599 5' + roo 28 2 67.12 AATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 + chr3L 2544650 5' + Tirant 8155 2 75.26 AAGGAATTTAATCGCATTTAACCAAACACAAATATTTGCACGTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAAC:1 + chr2L 4003638 5' + mdg1 7053 2 73.97 ATATTCAACTTGTATGTAAAACTGAAGACATTCCAAATCATATATAACCACAGCGAGATCTATGACTTTGTCAACAACAATTGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTAATGAAGATGAGGTCCAGATGTTA:1 - chr3L 3217330 5' - Circe 16 2 54.79 AAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATA:1 + chr3R 8051151 5' + jockey 4848 1 82.07 CTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACCACACGCACTCATATACGCGTTCTCGTC:1 + chr2L 22966908 5' + 1360 3224 1 65.07 ATAATTTTTTATTATAGTTTCATTCTTGTAAAAAATTAATGAAATTGATGTCCGTCACATAGAGATATGACCAAAGGCACTAGAATGGCGTAACGCTATACGATTTTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGCTGACGGCCAAAAT:1 - chr4 374796 5' - 1360 3327 1 75.34 ACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 + chr3R 4860444 5' - Transpac 243 2 68.35 CTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2R 14051724 5' - roo 9037 1 56.16 AACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 - chrX 4808614 5' + mdg3 5311 2 55.86 TTTCACACTTTGGCAGGCAAACTAAATGCAGACAATAAACAGAAAGGGTGGACTTCACAAAAAATATAGCAAATGTCAAATGTGTGTTTACACAGCCCGAATGCGAATGCACACACACACACACACAC:1 + chr3R 17319699 5' + accord 181 2 57.03 GACTTGGCATCTTGCATTGTTTCTTAGCGAAATGATTAAATTTAATTGTCTATTGGCTTGAATATATTAGGTGAATAGAGCTATTGTAAGTTCTATTTCGGTTTTGTATTTTAATCACTTATACTCTCTATTTTTTGACATTTTTT:1 - chr3R 14178574 5' - Tc1 1588 1 58.22 ATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr2L 18347397 5' - transib2 2774 1 51.37 TTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGTT:1 - chr3R 15072697 5' - pogo 2074 1 64.38 AAAAGCAGGTGGCCTGTCAGACTGACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr3L 6518693 5' - 412 474 2 68.49 TAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGGCTTTCCAATTGCGTGAGCTTTGCTTATCG:1 - chr3L 18126007 5' + Ivk 48 1 45.89 GGAAATTGCGACAGCAGAAAAAAAAACTGATTGCTTAATTAGAAAGCAGCGCAAAAAAAAAAACAGCACATTCTAAATAAAAGAAATGAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTATA:1 - chrX 3001299 5' + Porto1 4201 1 58.90 GACCATAACAGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 13766169 5' - roo 9044 1 66.21 AAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGA:1 - chr2R 14653245 5' - 297 326 2 69.86 GTACACAATTAGTTAAAACATTGTGTCCGGTAAGTGTGGTTTGCACGTGTGCAGGACATTAAGAAGCAGTAGTAGTCACATAAAGAAAACTTTTCACCAGCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGATGCATGACCCTT:1 - chr4 815724 5' + Cr1a 4166 1 71.23 AAATAAACAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCCAGTTTGTAGGCGTAAGAGTGGGTGTGACTACATGGCAAAACACTTCTGCGGCGTCTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTC:1 + chr2L 16839709 5' - INE-1 173 1 66.40 ATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTA:1 - chrX 14771790 5' - BS 5011 1 73.29 ACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 21224552 5' + roo 8706 2 61.95 AGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCAC:1 + chr3R 904936 5' + rover 45 2 63.70 AACAGCATATGGCAGAGATATGGAATCGTTTGTGAATGATGTGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATT:1 - chrX 15616470 5' + invader2 4724 1 65.85 CCTCATGAAAAATGGCAAAGTGTTTGCCAAGAAATGTTTGGTTAGGTCTCGCTTTTCACTCGCTTGCCCTTCTCATTCCTCCCTCCGCTTTAGTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATA:1 + chr3R 26395533 5' - Transpac 311 1 73.29 TATAACAGGATATGCCTGACATAAATATTATTTGCTTATATTTATCCTACGATACAACGCAACTATTAAGACAGAGTAAACACTTATTGTTTACATTAAGATAAAATTCCTGACTTTATTTGGAAATTTGTAAATTTCTTAGATAT:1 + chr2R 13735793 5' - Ivk 5241 1 87.67 ACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 17275396 5' - Transpac 5179 2 54.11 TATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAA:1 + chr3R 3922956 5' + Cr1a 89 1 71.92 ATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACAGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTC:1 - chr3L 11257418 5' + 1360 3384 2 31.51 AAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:2 + chr3R 14980309 5' - roo 346 2 60.96 AATTACCTCTTAATTGCATATTTTGGCTTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 4299113 5' + pogo 2022 1 92.50 AAAAAGACAAACAAATATAGCTTTAATATTCAACTGAATGCAATGAAAATTAAATTACTAATTTGTTTTGCGGTTGATTTGTTTACTTACTAGGAAATGAACAGTAACAGCAGCGTAAAAATCATCCAACAAGCCCAATCGAAAAT:1 + chr3R 15768560 5' + Fw2 3603 1 75.34 TATTTACTCAGTAGGCAAGAATTAAAAAAAAGTCCTTGCAAAATATAGCTTTCTTGGAACAAATAAAATATAATATTAATT:1 - chr2L 17114162 5' + Burdock 405 1 77.78 ATTATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3L 3983939 5' - P-element 2875 1 76.98 ATAACACCGGAAGCGTTACATTTAAAGTTAGATGTTCTTAAATTAAATGTAAAATGTCGATCATAAAAATTCTTTTATATTCTTTTAATACCGTCGGCGTATTGTACTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAA:1 + chr4 310217 5' - 1360 3175 1 72.60 ATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439047 5' - P-element 2495 1 65.67 AAAGCAAACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chrX 19038324 5' - hopper 1398 1 72.60 ATTAAGAAACCATTCCACCTCGGATCACACTCTTCGCCGTCATCGTCATCACACTCACACACACACACACACATACGTAT:1 + chrX 18040987 5' + Quasimodo 39 2 56.25 AGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCTGGCAGCGGA:1 - chr2R 6482503 5' + gypsy 7078 2 76.03 ATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTA:1 + chrX 3431858 5' + Ivk 5357 1 46.90 ACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 5389872 5' - roo 338 2 68.49 CTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:2 + chr3R 22642255 5' + blood 7045 2 60.96 TCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 - chr2R 24170028 5' - transib2 2802 1 42.47 TATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTT:2 - chr3R 9298542 5' - hopper 1331 2 73.97 AGAACTCGGGGTTTCCGGTGGATAGGTATTTGTACTTGTTTGAAATATTATGAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTATCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACA:1 - chr2L 20640344 5' - Stalker 7106 4 71.92 CCCCAGCCGACTTTATTTTTGGACTAGCAAATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 3030171 5' - roo 9044 1 65.52 CATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 + chr2R 8157201 5' - mdg1 7370 2 80.14 GGGACTTCTCAAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr3R 28901330 5' + transib2 52 1 52.74 ATCATTACTTTTTCCTGGCACCACAACTTAAATAGGTTACAGCAATGCCGAAATAAAGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCAT:1 + chr3L 46905 5' + FB 57 1 55.48 CGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAG:1 - chrX 14722251 5' + diver 15 2 68.49 ACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAAACACTTACATTCAGTGCACG:1 + chr3R 30347303 5' + P-element 53 1 51.37 TAATTATCTTTGAATGAATTTATAAGGCAATTTAAAAATACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGACCACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 20266090 5' + roo 8674 2 77.40 ATTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCC:2 - chr2R 5206903 5' + G4 3764 1 60.27 AATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 + chr2L 7125780 5' + I-element 86 1 74.66 TGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3L 22890328 5' + FB 29 1 62.14 TTTATTTATTATTAATTTAATTTATATAAATAATATAATAATTTAATTAATTATTATATATTTATAAATTTATATATTATTGAATATTTATATAATATATATATATATATAGAAAAATAAAATTATTTAAATAATTTTACATAAAA:2 - chr2L 2756334 5' - HeT-A 5804 1 36.30 AATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chrX 1341600 5' - 412 7533 2 70.00 AAATGTCAAAGAATGCGTAAGTGGAATATGTTATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCT:1 + chrX 19385252 5' - accord 182 3 63.08 GATTCAGGGGAGCTGGTTTTCTGGGAAAACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGGTTGCCCATTTTTT:1 + chrX 10639066 5' + FB 51 1 50.00 AATGCAAGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 11810599 5' + roo 26 2 66.44 TTGATAAACAAACGAAAGCTACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr3R 27133556 5' + opus 151 4 57.53 AATGGATTGGAGGATTTCCAAAGAATTTCCCGGAAGGAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGTTTATAAAGTGTCCAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCTAGTACT:1 + chr3L 11326619 5' - pogo 2091 1 73.97 ACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 + chr3L 19454912 5' + mdg1 7085 2 53.10 AACTGTAACTATGATGACAGACAGTTTGTCTAAAGTAAATGTCATGGCAGGGTTGTCACCGATTATTTTGATTTAAAAAAAAATGTAATAGATAACGTTCTTATTTAGGGTTTTTTAAAGCGTTGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 8724636 5' + gypsy7 5005 2 76.03 TGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 + chr3R 20441263 5' - I-element 5265 1 78.62 ATAGAGTAAAAGGATATACTAGATTAGTTAAAAAATGCCACAGGTTAAAGAGTTATCGACCACATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATTAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 + chr3L 23746961 5' + INE-1 134 1 68.49 GCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 - chr3L 17940203 5' - 1360 3336 1 56.16 CATTTGTTCGGTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr3R 8890013 5' + FB 54 1 54.79 ATCGGAACACTCCATTTGTATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGTGGAATCGCTTCTGGGGCACTGTAAAATCCCAATAAGACGAGTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 13300982 5' - roo 388 2 59.23 AGTTTGCCTCGGGTTCTATGGGGGATAGAGTGCAGCTGATAGAGAGAGTGAGGAGCACATCCAGTTCAAGCTGCAGTAACAGTCAACGGAGCGCTACTAACACTAATACTTAATACAGGCATTTTACAATATATTCATTTCCTCGT:1 - chr2L 16346470 5' + Cr1a 4329 1 63.70 ATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:2 + chrX 18817270 5' - transib2 2770 1 54.11 CTTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTT:1 + chr3L 18768444 5' + S-element 78 1 73.29 ATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 - chr3L 6447142 5' - transib2 2781 1 56.16 AAGATGCCCAAAAGATTTCTGCAAGATTAATGAAGTCTTTTACAGAAATCAGGAACAAAAGCATCCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCAAAAAACAAAACACAAAGACGAAGAATGCAAAAGACTTTGTATATT:1 - chr3L 18283204 5' - Cr1a 176 1 56.16 CATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 14720879 5' + F-element 79 1 70.83 AGTAGAAGCCAAGCTGGGAAACTGTCACACACACTATTTTTACGCACAAATTTCCACAATTTTTTCGTATCACTTTTATCGGCCGGACATTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGGTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3L 19102305 5' - opus 7488 2 77.40 AGTGATGACGGGTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 22193398 5' + roo 43 2 58.22 AACTAAACTAAGTTTAAGCTGTCTAATTTAAATTTGTAAGCCAGTTTACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACTCAAATCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCCCCC:1 - chr3L 17206719 5' + Porto1 494 1 67.59 GTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAATTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2L 11391557 5' + 1360 63 1 72.27 GCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAGTTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTG:1 + chrX 14771720 5' + BS 57 1 57.64 ACATGATCAAATACGTCAATACGTCATAACAAGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:2 + chr3L 26160454 5' - roo 8983 2 81.51 AACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr2R 11804598 5' - pogo 2067 1 60.96 GGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCATAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAAC:1 + chr3R 9038941 5' + Juan 4084 1 67.81 TTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:2 - chr2L 13556478 5' + transib2 25 1 63.01 ATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATTTTGTTATCTA:1 + chr2L 22193444 5' + roo 8753 2 78.08 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGG:1 - chr2R 3262652 5' - invader1 3981 2 65.07 CCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 - chrX 1264024 5' + Burdock 6217 2 80.82 CTAGTTTCAGTGCTTTAAGCCGTGTCATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAAATAGTTGTAATATTTTATTATTTGAGTCGAATAAATGTCCCGTCAGTTG:2 + chr2L 14074420 5' - 297 366 2 62.33 TAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCTAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr3R 27160056 5' - 412 440 2 55.48 ATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 13766318 5' + roo 8709 2 55.48 TCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGAT:3 - chr3L 3501813 5' - Bari1 1641 1 63.70 TGTATTTACTTGCCAGCAAGGCGAGGAAGTGAATTTGTCACCAAGATAATGGTTACTTGCTTGCTTTACCTATATGGCCAGCATCTTGTGTATGTGTGTGTGTAGGGTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCAC:1 - chrX 11517329 5' - accord 7067 2 72.14 GCCCTCGGCTGGCGATTGTCATTGCCACCTTTTGCCCTTTGATGGGAGGGGGCGACTTTTCTTGGATTTCCGATTTGCGTGTGTCCTGCGCGCAATGAGTGTGTGTATGTGTGCGTGTGTGTAAG:1 - chrX 681534 5' - Quasimodo 36 2 67.20 TCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTTGCTTAATGTCTTCCTACACAAAACACGATTTAATCACCCAAGACCAGAGAGCGCACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCGAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAGCGAAGAGTGCACTTCCCCAATGCC:1 + chr2L 20434855 5' + Doc4-element 176 1 60.27 TTCTTCCGCAACTTAGCTGACTTGGTATTAGAAATTAGGCGATAATCAAAAAAAGTGGAAAACATCCCCATAAACTCCTTACACGTAAGAAAGTATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAATCCA:1 + chr3R 4211892 5' + G5A 2750 1 60.96 ATAAATTCGAGGGATTTCAGAGGGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTCATCGGGG:1 + chr2R 4544477 5' - roo 271 2 75.79 ACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGCAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 - chr2R 8157294 5' + mdg1 41 2 57.53 GCCACGCCCACTCTTACGCCTACAACTTTGGAACAATTTACATTTTTATTCTCATTCTATCCCGCAATATCTATCGATATCCCAGCTAATGATGAAATTTCGCTTTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGAT:1 - chr2R 543216 5' + INE-1 545 1 85.07 CAGGACACATGTGTGTGTCCTTGTCTGTTTCTTTTTCGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGA:1 - chr3L 6097917 5' - 17.6 7161 2 74.66 TAGCATTCCCCATATCCACAACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAACAATCTTATTCTTATCTGGTAT:1 + chrX 7914911 5' - Idefix 6924 2 48.72 GTTCAATGACGTTCCCCCCGCCGTCTATGTGTAACAATCATAATCATAATAATAATAATAATTATTTTT:1 - chr2R 11721519 5' - gypsy9 5308 3 79.71 AAAAAGCGATTTGCAAGTTTTCTATTGCGCATAAAAGTATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:2 + chr2L 16945990 5' + hopper 21 1 69.86 ATCTATTTTCCACTGCTTGCCCGGCTTCCACCAGTTTATTCTGCTTATCTAATCGATCTTTGCTTCTTTCTCGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAACAAAAACGCAAAGCGGATTCATTTGGAGTTTTTATTTATTTCG:1 - chr3L 2821765 5' + Tom1 329 1 53.47 AAGAGCCCCGACCAAAGGGATCCAAATGGACGAAGCAAGGGCTGTGCCAAAACTTTCTTCAACTTTTCGTGAAAGCGTGCCTAATTAAAAATTTAAATTAATATTTAAAA:1 - chr2R 20713120 5' + 1360 3048 1 61.82 CTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAT:1 + chr2R 8099166 5' + jockey 4847 1 77.40 CTCGGTAAATTGGCTGAAACCTGGAAACTTCACTCTCGATTTGTGCCAAGGCACTGCGATGTCGGATTCTAATTAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAA:1 + chr2L 13700229 5' - Tirant 8420 2 58.90 CAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr3L 21327185 5' + copia 50 2 52.05 ATGATGATGATGACAGTATTAAAATGCCCCAAAACTTTGCTACCACACACCCAGACATTCCGAGGGCTGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATATACATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATT:1 + chr3L 5061503 5' - 17.6 7398 2 71.92 AACATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGTGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGAATTTGGGCGGTCCAAACCAGCTACTTC:1 - chr3R 30675497 5' + 297 14 2 71.23 AACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr3L 3983909 5' - P-element 2838 1 52.74 CTATGGATTACCGTGTAATAAAGCCGCTCAACTGGAGCCAATAACCACGCCTTCAAATACAATAAACTAGTAGCTGAGGAGACCCTTCGCTATCAATCTTTTAACGTATTGACC:1 + chr3L 5068395 5' - R2-element 3211 1 62.28 GACTAGCTTGTGCCGGACCCGATACTGTGCACCGAAAATACAGATCCCTAGAATCCATTTACTTCAATAAACTTACAAGCTCAAATATAATCCAAATATAATTCGTAGGCCAAAGACACGACATCCATA:1 + chr2R 4899227 5' + gypsy7 5445 2 51.94 AATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chrX 11661381 5' - pogo 2049 1 61.64 AGTTAAACAGACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3R 30347475 5' + P-element 5 2 78.77 GGACGATCAAACTCAGATGGTTCAAATGGCTCCACAACGAACTCTCCGTCCTTGGGTTTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATA:1 + chr3L 2050967 5' - F-element 4309 1 60.96 ATAAGCCGACGAGGAAAACAAATAAAATCAAAAAAAATACAAATAAGGGGGGATTATGGGGAATTAAGGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 7592876 5' + Doc 4585 1 31.25 AGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGACATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr2L 18347409 5' - transib2 2791 1 61.70 ATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAGTTTTTGGCCGTG:1 - chr2L 15076220 5' + 1360 46 1 54.11 GTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 - chr3L 18403038 5' - P-element 2817 1 30.77 CAGCATAAATTTAAAATGTTCTATGCCAAACAATAAAATTGCGCTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGAAGAATTGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGAC:1 - chr3R 12558373 5' - rover 374 1 70.34 GCAAATTGATATTAAGCCGCCAATCATAATCAGCACCGATATTAATTAAAAACCCGCTAACAGTCAACAATAACCAAGCAACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 + chr3R 25867218 5' + jockey 4808 1 55.48 ACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 14366536 5' - roo 9018 2 63.16 TTAAAAACTTTTGCATCTCGACCCAAGCGAAAACACATTATCAACGAAAACTACGAATGCAGAAGTTTGTATTGTACATAGCAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTA:1 + chr3L 18579072 5' + I-element 244 1 61.64 GAAAAGTTGCAAAATATGAAGACACCACAGCCACAACAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 - chr2R 13396477 5' + I-element 4903 1 76.71 AGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATT:2 - chr2R 15005121 5' + BS 5048 1 55.48 CTAGTCCAGTGATAAATCATAAAATGATTTACAATTCGGGTACGCTCCGTTTTCATTTGTATTTGCGTTTGTTTCTCTTTTATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTCGCTCCATGCTCTCTCGAATTTT:1 + chr3R 13988341 5' + 1360 80 1 68.22 TCCAGCAGCAAGTGCATAAAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACCCACTCAA:1 - chrX 11289884 5' + Porto1 457 1 73.08 CAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATATCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3L 2989909 5' - roo 9037 1 59.59 ACCTCTTATGCATTGTGCAAAAACAGTTGGCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATACGTTGAATTTTTGACTTTAA:1 - chr2R 5674771 5' - S-element 1681 2 65.07 ATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chrX 661963 5' + 412 56 2 54.79 CACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTCTACATT:1 - chrX 10319687 5' - mdg1 340 2 71.23 ACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 20167684 5' + roo 55 2 57.53 TTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATTCGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3R 7420332 5' + 1360 31 1 65.75 CTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3R 30347450 5' - P-element 2857 1 61.64 AGAATTTCGAGTTCGAAACACTTTATTTTGTGGCATACAAACAGGATTTTAGGTAAATTTCGTGAACTTTTTTAAAAGGTTGAATAAAACAATGTATGTATGTATTTCCCAATCTATAGATATCCCAGAAAAATC:1 - chr3R 12363719 5' + INE-1 502 1 71.11 ANATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 + chr3R 18399357 5' + Juan 4066 1 42.47 ATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr3R 7420189 5' - 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chr2R 10689966 5' + INE-1 235 1 66.44 ATTTACGCTAATTAAAATACACAGGTAAAAATAATTTCATTGTTTAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCG:1 + chr3L 20994285 5' - I-element 4950 1 69.18 TTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAAC:2 + chrX 6475307 5' + Doc 76 1 65.75 AATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGACATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3L 5389957 5' + roo 69 2 67.12 AAACCGAAGACAACTATTGCCGTTTCTTTCTTGAGCACAGCAAACGCGGATGCTGAACTGCAGTCTCCACACTTCTCTCTCTCCCTCTTCGCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr2R 12453364 5' - 1360 106 1 70.48 ATTGATGGCTGGGTGCATGGAGTTCCTGTGAGGTGTACCCCCGATGCCGCTGTCAGTTTGAGATGAGTGTTAACTGCAGGAACCCAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr3L 20196201 5' + FB 33 1 60.84 AAGCCACACCACGAATTATTGTTTAAACGAAATCAGTTTGAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chrX 6116376 5' - transib2 2793 1 63.70 GTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTG:1 + chr3R 15363875 5' + flea 20 2 70.55 AATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr3R 4805613 5' - 1360 3337 1 59.69 CATCCCATTCTGCCACATGCACGTGTGCACATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chrX 9950636 5' + jockey 4707 1 57.93 GATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGAGGTCGATACGTAGC:1 + chr3L 23354554 5' + gypsy2 75 2 50.43 AAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCC:1 - chr3R 10736137 5' + McClintock 5997 2 56.52 AATAAAAAATTTATAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAACTGCCTTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3L 6851464 5' + pogo 50 1 58.14 CCCCACCACACACTCCACTTTTCGACGAGCCTCTCGACTGGTGACGCATCCATACCAATACCATACTATACCATACTATATCATACAATACCAAACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCC:1 - chr2R 10475681 5' + G2 3000 1 70.34 CAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTTTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGCTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr3R 8890094 5' + FB 54 1 66.38 ATGCATTGCTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGTGTGGGGTTGTGTGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATAT:1 + chr3L 7220975 5' - Stalker2 7283 2 65.75 GCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2R 13168641 5' - P-element 2870 1 66.06 CAATACTTTCAATTTGATTGCTCATCGATCATTGATCTTTGGACTCTCTTTGAATTAAAGTCGAATTACTTGGAACTTTAGTTGAAGAAAATAACTACGCAAGGAACTTTGTGCCAAATTGTGTGATGAACTGCCCAAAAATAGCA:1 - chrX 7691100 5' - G5A 366 1 65.07 ATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGGGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCCG:1 - chr3L 16437256 5' + F-element 44 1 42.06 CTGGACATCCTCCCTACCACACTTTCCATTTTATTTGGTCCGCCATAAAAGTATTTTTTGGTCGTTTTATGACAGTCACTTTTGCATTTCGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATACGAAATCTAAACATAGAATTTGC:1 - chr2L 8167692 5' - 1360 3270 1 60.27 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCAT:2 + chr3R 19450170 5' - roo 68 2 77.40 ATCCATTATGATCTTTATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTT:2 + chr2L 14523099 5' - HMS-Beagle2 7162 2 52.05 AAAATATTCTTCCATATTTTCTTAATAGATAGATTCAAGTTAGATATTCATATTCATTTCATAGCTTTAACTATTATTTTCAGTTTCAACTTCCGTTTCCGTTTCGGGACTTCACCCACACAGACATAAACACACACACACATACA:1 + chr3R 11333867 5' + accord 7026 4 58.22 ATACAGCCTTATCGATAAGGCGGTCTGCTGGGCGGAATCATAGACAAGTTGTAATTTAATTATAATATCGTAGATAAACGATGAGATTAAAAAAATTTTAATGGCAAGTTATTACCTAAAATGTTTATAATATTATACAACTAGTT:1 - chrX 14729589 5' + transib1 476 1 59.59 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTTAAAAAGCAAAGTTAAATTAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAATAACTTAAATAATTAAAATAATCGCGCTTCGCTTGCCAAAGACTCTTAGG:1 - chr4 1294991 5' + HeT-A 69 1 77.40 TTTCACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTTTTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 23287340 5' - 1360 3355 1 43.17 AGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAACCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr2L 12818230 5' - hobo 2923 1 64.76 AATTGTTTTCTCTTTTTCCGGTTAGCTACTCGCATTTATTTGTATCCTTTTTGCTGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:2 - chrX 15357819 5' + hopper 2 2 84.25 ACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2L 12251010 5' + 412 7092 2 51.77 GATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTGAGTA:1 - chr2R 21160742 5' + Transpac 81 2 69.86 CGATATCATTTACAGAGCCGCTCAACTGAATGGGTTTGACTACTTGTTTAGGTTTGAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTG:1 - chr3R 3589838 5' + 1360 46 1 58.62 CTGTTCTGACAAAATAGCAATTTGCGTTTTCCAACAAAAGGATACGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCTTATATAC:1 - chr3L 17183778 5' - diver 6065 2 52.74 TATGAAAGAAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 + chrX 23431579 5' - 297 6920 2 58.90 GGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 27123593 5' - roo 361 2 53.42 TGGATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAACCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chrX 20888398 5' + 297 6625 2 53.42 AAATCCATGCACACGAACTCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCCAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCGAGGGAACGGAATAGCATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATAT:1 + chr3L 6964770 5' - P-element 2782 1 13.79 TGTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATC:1 - chr3R 905057 5' - rover 313 2 60.96 TTTAATAAACCGCCTAAATTATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAA:1 - chr2R 2875252 5' - TLD2_LTR 118 1 74.66 GTTTTCGATTAAAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:1 + chr3L 24934247 5' + HMS-Beagle2 6894 2 78.08 AGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATT:1 + chr3R 17996178 5' + diver 73 2 67.12 AAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chr3L 14720914 5' + F-element 37 1 54.87 AAATTAAAATCAATGAAATTAATTGAAATATTAAGTACTGATAGCAAAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTT:1 + chr3R 7800479 5' + I-element 4997 1 67.81 AAAAGGGATCCCAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 + chr2L 8338145 5' + P-element 95 1 21.23 GTTTGCTTAAACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACT:1 + chr2L 11839653 5' + mdg1 7110 2 67.12 GCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chrX 8308404 5' + roo 8732 2 65.07 CGGCAAGAGGAAAGGACGGGTGCAAGCCAAGCCGAGGGAATTTGACTTAAAAATGGGGGTAAAATCCCAAATAAGACAACTTTACTCGGTGAGCTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 13766208 5' - roo 352 2 54.48 TCTATCTGAGAAATATCGATTTGGTTGTACCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr3R 15942674 5' + hopper 35 1 60.27 CGTTAGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 + chr2R 10161762 5' + transib2 39 1 58.90 CACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chr3R 13972972 5' + 412 7137 2 73.97 ACCAAAAGATTTGGGAGAAGCCAATGAGANGAGCTCATAGAAGCTGGGTTCGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTGAAAAGCTTTAATTGTTTGCCCACCAATTAGTTTCAATTTTTTTCAATTTTTTTTTAAATCGCAATAACATT:1 + chrX 19502444 5' + FB 191 1 76.03 CCAATTGTTTGGCAGACAAACGGGTGGATATGAACCAGTTTATCCTTGGTGGCTGCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGATG:1 - chr2L 13318805 5' - accord 7026 2 72.34 CCGTTGACGATCATAAAAAAGGTGGAACAGTACACCCTCACAACGAAAAGCCCACAAATTCTCCTCAGTATTTTATTCAAAATCCGGTTGTGGAACATATCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCT:1 - chr3R 12634131 5' - blood 7282 2 66.44 TAAAAAAAAATTACAAGCTTTCCTCGGATTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2R 4550843 5' - roo 348 2 62.33 AGAAGTCAATTTGTCAATGCTCTTATGATCTACATACCAAGGTTTCTTAGCCAAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGGATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAAC:1 - chr2R 3194096 5' + McClintock 5951 1 66.44 CCGTTTAATGCAGCTTCCTCATTTATATCTATACCGTTGGCACACCCTAACATAATTCTCTTAGAACGTCTGCAAGTGGTGGCATGTGGCTCATTTGTTGCTGCCCCGTGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTGTT:1 + chr2R 17269310 5' - gypsy7 5004 1 55.30 TTACTCTGCTCCTCTGGTATCTGTCATTGTGTATTTCTCTTTGGTGGTCGTATGGTGAAATTCGATATGTGGAGTCAAGTGATTCCCCGTTTTCATAGAACCAAAGACACTAGAACTATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGA:1 + chr2L 14387183 5' - Tc3 238 1 53.42 ATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrY 2720375 5' + 297 6620 2 60.00 TGTTGGTTTACTAACCTTGCGTTTAAATGGGCTATGCATTCTAATGTTTTCCATCATAATTCTGTTCCACCATGTCGCATTTGGTTGTTCGTGTTGAATCTTCCCTTTTACTTA:1 - chr3R 24433260 5' - Doc3-element 4696 1 80.70 AGAAGGGCAAACAAAAGCGAACCGGAAGCGTGCAAAAGAACATGCGAGAGAATTTTTAATTAAAAACGCTTGTCCAAAACACCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCA:1 - chr3R 23078402 5' + Helena 863 1 53.39 GGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr2R 13168721 5' + P-element 83 1 29.37 ATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAA:1 + chr3L 3501725 5' + Bari1 73 1 67.81 TGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 10167468 5' - roo 9009 2 59.59 TAAATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 10156069 5' - hopper 1405 2 74.07 AATATTTATTTATTTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 - chr3L 14165103 5' - HeT-A 6062 2 44.76 GTCCGCTGTGTCCGCCTCTGGAATATGCATAAACAATCCCACCTCATACCTTTTATTGTTCCCGAGATTTCGATCTTCGTACGGATAGACGGACGAACAGACGAACATGTTCATATTGACTCGGCTATTGATACTGATCAATAATA:1 - chr4 700834 5' - INE-1 85 1 58.22 AAGGGGGGTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAAT:2 - chr2R 9967179 5' - Bari1 1693 1 74.66 CAACAACAAAAGGCCGCATCGTCGGCATTAACAACAGACCTTTAATACTTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGAATTTTAAAAACCACGGCTGG:1 + chrX 3927190 5' - Cr1a 64 1 59.00 AATTCTTCTGTCTGACCAGGTTGTCTGTTTCTGGCTTTTCGCCGCTCTCTGTTTTCCCCCCTTTGGGTATTTCCCGTTTTTTGTTTTCCCATCAAATGAAGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr2R 16929872 5' - jockey 4974 1 68.49 GGCTGCATTACAGACCGTCTGCCTTAATTACAAAAACATTTGCCATTATGTATAATTATGAGCCACGAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGA:1 - chr3R 25736545 5' - pogo 10 1 54.62 AAGGTTTAAAACATGTTTTAAACATGTTTAAAACATATAGTTCGAAATGTCTATTTAGTAATTCTGATCAACAAGTACGTAAAGAAATTAATGATTGAAATAATAAGAGTATGCCAATTACTTTCTGATTTTATTTGAAAATATTT:1 - chr3L 15547093 5' - roo 9022 2 60.96 GTGTTAAACTTTTCAACCTATCACTTTATTACAAGAACTTATTCTTATGTAGTGATTCATTTGTAAACCGTTTTTTTAATCCTCCCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACTTAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAA:1 - chr2R 618077 5' + Doc2-element 4515 1 62.24 AGGAGGATGGTAAAACGTGGGGAGCGGAAAAAAAGTTAAGAAAACTCATTCACATAATTTTGCAGTTTATTGTGAGCTGCTGTTGGCCTCAAATACACACACACACACACGCACACAACAATGTCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 29455410 5' - flea 324 1 83.70 TTTAACGCTGTTACAGAACTGTATCTTACAGCACACCAAAGAAATATTATATTATTTAAAAATTAAAAATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGT:2 - chr2L 23050153 5' - mdg1 91 2 64.38 TGTTGGATTGCCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:3 + chr3R 15072520 5' + pogo 22 1 67.81 CAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr3R 19073190 5' + roo 68 2 67.12 CATTATCTTCAAAGCGGTCAACTTGAAAGTAGGTTTTATATTGATATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCCAATTATATAATGCAGCGCTTGTTAG:1 + chr2L 17475044 5' - rooA 242 2 55.56 TAATGGGTATATGATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 19073321 5' - roo 9048 2 68.49 TGCCATCAGGTGGAGAAAGGGGTGGCTCAATCAAACGCCTATTCTATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATACTTACAAT:1 + chr3L 6397612 5' + roo 19 2 67.81 ATCCAGCATTCCAAAGGAAACGATCTTGAGCCCCTCCCAAAGAAAGTAAAATGATTATATTCTTTATAACATTATAATAACAATAGTAATAATA:1 + chr3R 14588208 5' + mdg1 28 4 78.72 TATTTCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGGCACTAGAATAATAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGTGGCTTGCTTGTGTGAGGAAAAACAAGAGACG:1 + chr2R 5261102 5' - 1360 3242 1 72.31 TTTGTTTATTGATTCCAAGTGATAACCGCAACTTACAGCCACAAGTTAAGATCTCTCCCTATATCTACCTCCTATATTCCTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCG:1 + chrX 11777844 5' - Bica 79 1 54.11 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATTAATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTT:2 + chrX 124082 5' - 17.6 7349 2 64.38 ACATCCCAGTCGGGCATATCTGGCGGGGAAGGCACAGCTTTGTAGGCAACTTTATAATCCACATAATGCATGGGGATTTCGACGATAACACTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATAACAAATATTCAA:1 + chr2R 24552494 5' - 1360 399 1 67.91 TTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr4 372957 5' - pogo 2036 1 64.38 CATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAATGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chrX 1135370 5' - P-element 2828 1 31.62 AAGAATTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:1 + chr3L 23287185 5' + 1360 2 2 81.30 CCCATTTTGTACTGATTCCATTCCCTTGCAAAGAAGAAAAGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGTCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2R 19199612 5' + hopper 8 2 77.40 TTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 14051771 5' - roo 8990 2 73.97 TCTACATCATATACATAGATATAGAAATGAGAGAGAGCTTATCGATCGATCGAATGTTTCGTTTTCATTTCGGTTTCCCCAACCATTATCATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTT:1 - chrX 10057202 5' + FB 377 1 66.67 ATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGGTTACAAAACTAGA:1 + chr2L 7660880 5' - I-element 5331 1 65.00 CCTGGACTTTTCGACTGTACAATGCATTATTAAACGTATAAATTTCAAGTCAAGTGACAGGGAAACCCAAAAACGGACACACCCAGGTCCCAGGACGTAGGGGGAATCCTGATCTACAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAC:1 - chrX 20273662 5' + S-element 2 2 67.81 ATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr2R 17796521 5' + jockey 4705 1 62.33 CCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3L 21996261 5' - Transpac 250 2 58.90 AGTGCAGGAAATTAAAGGACATATGATGAAGGTGAATACAGAGTGCAGTGAAAATCCACAAAATGTATCAAATTGGTAGAATTTGTTAATTCTGCGAATTGTTTTGAATATATACAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 + chrX 20888226 5' - 297 6965 2 74.66 ACTTCTATGGAAAGTAATCGTTCTCCTGTTGAGATCTTATTCACATGATTATTTACAATTGCAAAGTGAATACTCCTTTGTAATGAAATCAAAAAATATTCTTAATATTAGATTATTCATTTTATTAATTTTTTTTTTCATTTTAT:1 + chr3L 14182581 5' + INE-1 473 1 51.37 ATAATGACATTGGCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 8308522 5' - roo 9035 1 61.64 TTTATAAGGCAATTTAAAAAAACTAACCATTAAATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2L 20266072 5' + roo 8676 2 71.54 AACATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 + chr3R 21276485 5' + BS 5006 1 74.13 TACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:2 - chr2R 18529978 5' - jockey 4944 1 52.74 ATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:2 + chr2L 20265941 5' - roo 344 2 63.01 AAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGCTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTTTAGTTTAGGGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAAAAG:1 - chr2L 17005840 5' + Stalker2 26 2 62.33 TTAATAAAGTTAATTGAGTTTTTTGAATGAACAATTTCGTGGGCTTGGCGTATTGAGTAGAGCGTGAATTGGCTAAAAATATAATTGCTCAGAAAATGCAGGGTGTGGCACAGATCCCACTTCTGATGTCGGG:1 + chr3R 26119608 5' - micropia 470 1 59.40 CAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3L 13294895 5' + roo 74 2 69.18 TATATACGAATTTTTAGGTCGACATAACTGATAACCTTTTAAATTTACGCGTTATTTTATTTTTACATGATAGGAACATATGTATTTACACAGAGGTGTGTTTGTCATATACAAGTATACAAATATACAAATATATAAATATACAA:1 + chr3L 9357205 5' + Stalker4 91 4 80.14 GTCCTCGATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTT:1 - chr2L 15550790 5' - Bari1 1671 1 58.22 ATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 17940037 5' + 1360 15 1 59.59 ATATTTTGCAAAAAGCCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTTTAAACTATTCTATCTATCATA:1 + chr3R 27843160 5' + I-element 5340 1 57.24 ACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr2L 17809267 5' + jockey 67 1 56.85 GCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGAACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 7795621 5' - roo 9047 1 59.32 GAAAATCAAGTCGAACGCTCGCGCCGCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCCGGCCCATGGTGAAATAAAATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 18282697 5' + P-element 10 2 66.35 TCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGA:1 + chr3L 24213786 5' - invader2 5022 2 74.66 GTTTGGGTGGTCGTTGGTGGTGTAATTGGAATCAAGTAATTTACGCGCCATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 - chr3R 27406107 5' - diver 205 1 69.18 ATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCATATTTGTT:1 - chrX 19980680 5' + X-element 4556 1 64.38 AAATACTACGAACATACATAGTTAAAAAACCCTACTCTACTGAATACTCTAATGACAAATATTTTTATATAAAGTCATTTTTGAAAGTTATTTATGATAATATGTACATAGATTTGGCTACTTGTAATCTATTTTCAAATAATCAT:1 + chr3L 23249000 5' - 1360 318 1 64.38 CGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCT:1 - chr3R 3286195 5' - Gypsy12A_LTR 1932 1 60.45 TTGTTTAAGTATTTCTAAAAGTGTTATAGAGTATTCGGCAGGTTGTTTTTAGGGCTTTAAACGAGCGGTACAGTTTTGTATTTCATGTAATATAAGCAACTCCAACATTGAAATATTCCAGAGATACCAGTCTAT:1 + chrX 292194 5' + G3 4248 1 57.78 AAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 + chrX 19074737 5' + mdg1 33 2 58.90 AAGCGGATTTAATCAGTTGAAAGGCCATTACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACA:1 + chrX 17531212 5' + I-element 5053 1 80.14 TTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 3920576 5' - roo 8998 2 69.18 ATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 - chr3L 46980 5' + FB 79 1 73.19 TGAAAGATAAGTCTAGGCTACAAAGGATGCTTACTTAATCAAAATCAAATGAGATAGTACGATCGACTGCTTACCTACGACTCGCTTCCTTTCATTTTCCCACCTTAAAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACGC:1 + chr2L 1690801 5' + I-element 5108 1 77.78 ACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGTCATAATTATTAACTATTTCAGATGAAAG:1 + chrX 5323243 5' + Juan 4116 1 60.42 ATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGCCTGTAGGTT:1 + chr2R 21160673 5' - Transpac 5155 2 71.23 TATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2L 12818192 5' - hobo 2920 1 71.92 TAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 20167568 5' - roo 9019 2 56.16 CCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 + chr3R 8051096 5' + jockey 4794 1 61.64 ATTTTGAAACCAATAAAAAAACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 - chrX 9410568 5' - I-element 5298 1 55.48 GACACACACTAGCAAATACCGATACACATACAAATGTACATATGTATGTACATACATATATACCGCAAAATATATGCATGCCAAAAAAAAAAAGGAAAAAATAA:1 + chrX 19149500 5' + Doc2-element 232 5 70.19 GCTCATAAATAATTATTTGCATCGATTGAACCCAAATAGGTTTTAATACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCACGTGCGGTGATCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 20167731 5' + roo 8672 2 73.97 TTAATGCATATTAACTGCACTTAACGCGACATGGCGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGATATTACTTATTACTTATTACATGGCGACC:1 - chr3L 12263771 5' + Stalker2 411 1 74.66 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTAAATAGATTAGAAATAGCCAAAACTA:1 - chr2R 5260086 5' + 1360 334 1 73.02 GTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATT:1 + chr3R 19407918 5' + diver 5961 2 70.71 TATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGTTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr3R 23295612 5' - P-element 2863 1 40.41 ATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:5 + chr2R 15326867 5' - copia 202 2 75.34 TTGAGTTGCAAGCTAATCTTGTTTAAGGGCTGTATCTATATTTATGTTTGTTTTGTAAACAACATTTTTACTTATAAATATAAAAATTAGAGAACACGCTTTAGTTGTGTGTTGCGACTATAAAAAATTATTTATTTATTTTTAGA:1 - chr3L 8809457 5' - mariner2 830 1 68.49 TTACACGATGCTCGATATACTACTGATAGTAGTTTGCTAAAACTAAATAAAAGGAAAAATTAAACAAATGGATTATATCTGAAGAGCTGTTGGCAATGACAGCTGCG:1 - chr2L 23177317 5' - Tc1 1312 1 71.03 TATTAATGCTGTAAAAGCATTTAATATATAAATTAGGTTTTAATTATTGTATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:2 - chr2R 1269008 5' - flea 4994 2 72.60 AAATAATTAGATTCATACATTTTGCCAAGAAAATGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTAGTT:1 - chr3R 22710764 5' + S2 24 2 67.74 GAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATAT:1 + chr2L 19817765 5' - G4 3803 1 45.21 ATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGG:1 - chr3L 7889654 5' - roo 342 2 61.64 ATCTTAGCACAGATAAGAGGATCAAATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGG:1 + chr3L 22531922 5' - Cr1a 4223 1 53.42 AATCAGTGTTTTGTTTTAATGAGTGCTCTCAGTACTTTTTTATTTTTATTTTATTTACGAATCTGGGGAAAACATTTTTAATTTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAACAATACAATCTCTTATAGTTCCTGAGATGTCGACGTCCA:1 + chr2R 23385452 5' - INE-1 140 1 56.16 CGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 + chr3R 26504203 5' + HMS-Beagle 50 2 53.42 TACACCCACCCCACGAAAGGAGGGCGTGCCTCCTTTACAGTCACTGCATTTTGCAATAAATATCCAAAATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTG:1 - chr2R 16507664 5' - copia 4979 2 53.42 AACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGGAACATGGAGTAAGG:1 - chr3R 15790090 5' + flea 4752 1 55.64 AAGAAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 - chr3R 30813407 5' + FB 81 1 73.97 TTTTTTTTTAGTAAATAGATATGCAATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr2R 7090612 5' - I-element 5318 1 56.85 GTTGTACTCGATCAGCATGTTTCTGCTTTAGTTTTCTATTAAGTGCTTATTGCTAATAGGGCTCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATG:1 - chr3L 1469477 5' + roo 8784 2 58.90 AGACCAACTGGAGGCACCAAGACAGTATCAATGGGCGGCTATCGGACATGGTGACGCATTGGCAGCCAACACAGTATAATGTGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTTTCTGCAATGTCAATCTT:1 + chr3R 31488901 5' - baggins 5176 1 51.37 AGTGACTAAAAGTACTTAAAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATC:1 - chr3L 18848447 5' + P-element 2753 1 19.18 GTAAGGGGTGTTTTGATGGCTTTTAACTGTATATATTATATATATTATTATTATATATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 - chr3L 21969860 5' + opus 57 4 72.22 AATAACTATAATCAATTATTGAAAATATTTAATCCCAATTGGGTTGAGATATTTGAAAACGAATACAATTTCCCTTAACGCAGGCCAGAGGAAAAGCTATCTGATAAAGATAGGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAA:1 - chr3R 10298020 5' + Bica 4599 1 76.71 ATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCT:2 + chr3R 21276507 5' + BS 5031 1 58.90 GATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGCAATTTG:1 + chr2L 14671810 5' + FB 24 1 62.18 TTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATTAACGCACTGTTACCCAT:1 + chr2L 17809161 5' - jockey 4969 1 60.80 TTAACAATTTAGCTAGCAAAAAGATAGCTGTAAAGGCTAATTTTGAAACCAATAAAAAAACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:2 - chrX 9410616 5' - I-element 5337 1 70.55 GTGTGTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGGTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr3R 29084827 5' - 412 7544 2 78.08 ATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 14980442 5' + roo 28 2 66.44 TAGCAGTAAAAGTTTATGACCACACTCGGAAAGCTCCAGTCCCTCTGTCAAAAATGCTGCAGAATGTAGCAGGCAATTAGGCGCCGTATAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGT:1 - chr3L 22923137 5' - copia 91 2 65.75 AATTAATAAGTCTTGAATCCTTTTCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGCTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATTTTTTGAACCAAACGTTTTAGCTAAGTCCAATCTCGTGAAAACCCGCTCAGG:1 - chr3L 16216535 5' - R2-element 3324 1 78.08 AAATGCTTTTATCTTTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGC:1 + chr3R 24381258 5' + Juan 4123 1 73.29 CAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:2 - chr3R 25433397 5' + transib2 48 1 52.74 ATTAGAATAACAAGATGCGTAACGGAAATTTATGCAATTTAAATAATTTGTCTAAATACGTATGCCACCTCTAATTAAAAAAAAAATAATTTTTCCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTT:1 - chr2R 4618425 5' + 1360 3009 1 66.67 AGTCTCGGAACCAGTGGAAATTTACAAGTGTTTTCCTCTACTCAGTCGGTCAAACTTGGAAGGTGAGAAGAACGCTGAGGAGGGACACGGAGCCGAGAGGCCGGTTATTATTTTTTTATTATTTATT:1 + chr2L 12464373 5' - BS 5095 1 62.20 CTCCACTCCACTTCACCCTCTTACCCTCTTACCCTAAAACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACACCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAA:1 + chr3L 1593614 5' - Circe 7062 1 76.71 TATTATTGTAAAACTACGTTGCAGCTTTACACAAAATCAATTTCAAATTAATCGGACGCAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCC:1 + chr3R 4091286 5' + I-element 176 1 60.27 GTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTC:1 + chr3L 24213784 5' - invader2 166 2 73.29 AAACGATTCCACACACCCCGGGAAAAAGCAACAATAACACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAGTGGG:1 - chr2L 8627543 5' - hopper 140 1 75.95 GCAGTAGTTGTAGTACTACGTACAACCTATGCACACACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATTTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCACCC:1 + chrX 6188842 5' + G-element 4250 1 72.09 GGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGGGTCGTATTGAG:1 - chr2L 12822840 5' - P-element 2802 1 20.90 CAGAGTGCAATTCAGTAGTGCAAAATAATAGTTTCGCTTTATCTCGAGGGCTTGGCTTCGTTTGTTTGTGTGGTTTGATATGTGGGTGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTTGTTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAG:1 + chrX 2512172 5' - Porto1 227 1 58.22 TGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATCAAT:1 + chr3R 19032602 5' + roo 8730 2 63.70 AAATGATTTATAATGAAAAAATTAAAGTGTTTATTTTCAATGTTTATATACTAGATTCGTTGACGAGTGTGCAACAGATAGAAGGCAGTGTTTACGAACATATAGATTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 - chr2R 5968367 5' + INE-1 94 1 68.06 ATAACAAACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3L 23354497 5' + F-element 49 1 53.91 CACTAAGTTGAACCACTGCCTCTGTGACCGCCGGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTG:1 - chr3L 3296933 5' - Circe 7008 1 77.40 AGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3L 1279076 5' + roo 55 2 55.48 AAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chr2R 13259396 5' + mdg1 48 2 50.00 TTGATTTATGACTCCCTGATCGAGCGCATTTGTTCGGGTGAGGGAGGGCGGCGGAGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACAT:1 - chr2R 7411289 5' + invader4 2968 2 62.33 GCTCTTGGAAGTTTGTGTAAAAAATAAAATGTTTTTTGAAGAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1 - chr3R 5524018 5' + FB 46 1 54.11 CTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTTGCTGCATCGG:1 - chrX 11661504 5' + pogo 21 1 63.79 GTAGCCAATGCACAACCTACCCACCCCACCCTATTCACAACCCCTTGCCGGAAAATGAAGCTGTCTGGAAATGCGATTTCCCACTACCAACCGCTATTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chr2L 17205404 5' + jockey 4801 1 71.23 CATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 + chr3R 27986328 5' - roo 9028 1 57.53 TAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTA:1 + chr3L 18768447 5' + S-element 81 2 74.66 GAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr2R 22514162 5' - P-element 2792 1 18.88 AATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:2 - chr4 373046 5' + pogo 72 1 68.49 AGCTGTGGCTTTTCGGGTTGGGGCTGAGTGGATATTTTTGTGGGTGTCTAACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chr3R 11937396 5' - flea 4947 1 64.14 TAGAGCAAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAG:1 - chrX 14722265 5' + diver 5887 1 77.78 TTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGGAGGGTTTAATTTAAGAATGAAAAAAATATATGTCTGCTTAAGTTTTTTATTCTCCAATGTTTTCCTTAACAAATAATAAATATTG:1 - chr2L 16539751 5' + Juan 4056 1 31.67 GTCTTGGATTTTTATTAAGTTTTCCTTTTGTCCACTTTTGGTTGGCTTTCAGACATATGCAAATTCAAACTGAAGCTTAAAATTATTCTTATAGCT:1 - chrX 10501277 5' - Gypsy6A_LTR 141 1 54.17 TTTTGCATAAAAATATTTTGCATAATAGCATAAAAATAATTTTAGAACATAGAACGAGTTATCGTTATTTTTGGCACGCTTTCAAAGCCAGCTGATTCAGAGGTGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCGGAAAAAGTTTAACAAATTG:1 - chrX 12767363 5' + transib4 201 1 68.49 AATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 + chr2R 19199669 5' + hopper 39 1 55.83 GTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 + chr2R 3563108 5' - Transpac 228 2 71.92 GATTCCGGGGGGCGTGGCAGCAGTCTGATGAGCGGCATTCGCTACTTGCTCGGTATTAGAAACTTTGCGCTAATATAATAACAGATTAATATTGTATGTACATATGTATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAGCAAT:1 + chr3L 10187866 5' + invader3 5119 1 52.74 AGATCTTGCATACAAACGAAGAACGTAAAGAATCTCATTGTATTGAAAACTCAATTTCGTTTTATAAATATGTATTTCATTAATCGCGACTATCGCAGCAGCCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTAT:1 + chr3R 26086449 5' + copia 4814 1 78.77 TTAGTATTCCTAACTTAAGAAAAACAAACAAGAGTGTTGAGGCGTATATGAGTGTAAGAAGTTTATAGTTTCTAGATTCGTTCTTTGTTTATGGCTTTTTTGCTACAATTTTCTGTTCCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chr3L 15731253 5' - gypsy7 5007 9 59.29 CAAGGGGAAACTTCCTGTGACGGATTCCATGGCATACTTTTCAGGGCTCTCTGGGGCCACTTTGGGCTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAACATGCCCTTCATCTAAGAAGTTCTTAGACTGTAATTCTAT:1 + chr3R 5197795 5' + 1360 238 1 46.58 ATACGCAACACGCAGGTGGCAATTTTGTGGCCTACGCTTGGGTCAGATTCCCTTATTTTTGACATAAAGTCAAATAAAATTGTATTTTGAACTTAACTACATATTATGAAAGAGCATCATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAA:1 + chr3L 4662001 5' + transib3 100 1 73.97 ATGATCACATTTTTGTGCTTCTTAAATCCTCAGTTCGGGAGAGATTTCAAAGCCCTGGAAAGATACCTTTTTCTAAGCTGGAGCATAAGAAATCTAAAAATAAAATTTGTTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCG:1 + chr2R 5555430 5' - 1360 3234 1 54.79 CAAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTT:1 + chr2L 9636032 5' - 412 475 2 69.86 AATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAGCAATGCA:1 - chrX 16876075 5' + Doc3-element 277 1 54.55 AAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCAACCCAGCGAATAAATTACTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAA:1 - chr2L 1923982 5' + F-element 4615 1 69.18 CATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCT:1 - chr3R 26504289 5' - HMS-Beagle 6954 2 78.08 ACTATAGAAGACGGTTAACTATCAGAGGAAAAAATACAACAACACAAATGACAAAAATAACAAGAATAACGGGAATAGCACAGGAAAAGTCCAAGCTGACGGGCGCCGCAATTTGCTGTCAACATAAAATAAATAAAATAAAATAA:1 + chrX 7702513 5' + G7 1147 1 76.03 ATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTG:1 - chr2R 3262649 5' - R1A1-element 5099 1 71.92 GTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 7795526 5' + roo 8739 2 73.29 GTATATTAAAATTGTAGTTTTCGTATTTTTTGTGTGTGTTTTCTTGGAGTAAAGGCTTTGTCAGTTGTTCAGGAGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTT:1 + chrX 12786915 5' - I-element 157 1 66.96 GAAATGGGCAGGAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 + chr2R 6965451 5' - Transpac 5221 2 68.15 AAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3L 24131478 5' - Transpac 5160 2 70.37 TATAAAAATCACTTGTATACTTTTTTACGTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 + chrX 17716986 5' + FB 41 1 51.77 AATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGT:2 - chr2L 16539753 5' + Juan 4080 1 47.95 ACAATTTGTTGATTTCAAAATGTAAAATCAGCAATCATTTTTGTTCAAGAGCGATAGATCTAAACCGCAAACAGCTCTTTTCTGCGCATACAGACTACCGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCATTGTAACTTTGAC:1 + chr3L 5096569 5' + 1360 194 1 75.34 TATAAGAAGGATTTATATGTACATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCCCACCGTGTCGATCTAAGGCAATTTGGTAACTCACGCAGCTGTACAAATTGAGTAGTGAAAATCATTATGAGTGACGCCGATATGGACGG:1 + chr2R 981768 5' + micropia 5401 2 60.00 ATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTCTACT:1 - chrX 22824248 5' - Gypsy12A_LTR 2233 1 47.52 CGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 11810610 5' + roo 8700 2 59.31 CAATAAGCCTAGAAATCCAGCTCCTACGGTCCTTCGTCCTCATCTGCTCCCTACTACCATATACATAACCAACAGCATCATCATCATCATCATCATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACT:1 - chrX 10680961 5' - pogo 1660 1 60.96 GAAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:3 - chr3R 18093424 5' + I-element 13 1 73.97 AGACGCGCTCACTTAAATCGATTACTTATTTGTATTTGTATGTGTACTAGTATTTTGGGCTTGTGACCCTAGTGACAGGACATATTGAGAGAACAAGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGATGATAATCTTTTCTAATACAG:1 + chr3R 25021743 5' + TLD2_LTR 55 1 58.22 AACATCATACGATATATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACGGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chr2L 13556296 5' - transib2 2806 1 73.29 CTTAGCAGCACAAAAATTGAAATGTAAAAGAAAAACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGGCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGT:1 + chr2L 389095 5' + 1360 3217 1 76.71 CAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCGGT:1 - chr3R 15790062 5' + flea 30 2 77.86 ATTTCCACTTCCATTTCCCTTAAGCAGCTTACGCACTCAGCAAGCGGTTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGGAGCGGG:1 - chr3L 17462747 5' - accord 139 2 57.80 GTAAGAAATCCGCGCGTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chrX 6475251 5' + Doc 20 1 73.97 GTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTG:1 - chr2L 11839713 5' - mdg1 325 2 78.62 CTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 - chr3L 6447120 5' - transib2 2759 1 62.33 TGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 19032692 5' - roo 341 2 66.44 CCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACA:1 - chr3L 5061639 5' + 17.6 6 2 68.24 TTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 9002937 5' - roo 8985 2 75.34 ATTCATTTTTTAACAAATCACATTTTTTTTTTACTTATGGAACAAAAATTTACTTTGTGCACACTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTTTTTAGCAGAAAGTAAAAAAAATATTTGAACGGAATAAAAAAA:1 - chr3L 24739492 5' + transib1 48 1 67.19 TATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 28146129 5' - roo 8991 2 73.97 TATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:2 - chr3L 24131504 5' - Transpac 5175 2 54.79 TTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 20167559 5' - roo 9032 1 54.23 GGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCC:1 - chr2L 15550755 5' - Bari1 1636 1 68.49 AGTAACTTATAGGTTGCATTAATATAAATTGATTATTTGATTTTTGAACTTAATTTGGTTTAAACATAATAAATATAATAAGGAGTCAATTAGATTATAGTTAGTCGCCATGATTATTCCGTAACTTTAAAAGTATTTTTTTTACG:1 - chr3L 617529 5' + FB 879 1 28.08 TTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr2R 8047273 5' + 1360 81 1 73.97 CAGTAATATAGAATGCTACGGTTCGATAGGGGTAATTTATCGATTAGCCTCACGGTTAAGATAAAATAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAAC:1 - chr2R 8672550 5' + TAHRE 10387 1 54.79 CTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr2L 13556470 5' + transib2 32 1 57.93 ACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3R 4461143 5' - blood 7341 2 56.85 ACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:2 - chr2L 19675092 5' + 297 6615 2 56.85 ATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCAGAAAGCGAAAGAGACGCTATATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATTTAGTGATTTGTTATTTTAAATAATACAACTATGAGTCAGAATGATACTCGCGCACAGCG:1 - chrX 14974616 5' + F-element 199 1 84.62 ATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTA:2 + chr3R 19449913 5' + flea 380 1 57.53 GGAGAACTAATGCAAATCGTAGACTATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 18396221 5' + roo 8685 2 71.23 TTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAAAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 - chr3L 14720877 5' + F-element 96 1 76.30 CGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr3R 8076004 5' - 412 7503 2 46.58 CTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 6397743 5' - roo 9014 2 64.84 GGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 + chr3L 16690890 5' - I-element 5307 1 53.42 CCTCCAGTTCGTTTTTCATTTGTGGCACCTGCTTGATGATATTCCGTCTCAGTTTTCCCAATCTCTCGCCCAATGCTGGCGCCCCCTTATCCGCCTGACAACTTGTGACAATCTGTCTCTCACTCATTATTATTATTATTATTATT:1 + chrX 9979973 5' - mdg1 43 12 52.05 ATGCAAACGGCGTGCATTTTGCCCAGCTAAAGAGCATAAATCGTGGGAAAATGCTTGATTACATAGATTTTAAGGATAATAGATAGCTTTGCTAGAGGTAAAAATTCTAAAGATATATAGATTATTTTTAAAACTATCTTTAAAAT:1 - chr2L 12075980 5' - pogo 1887 1 60.96 CTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAGCGCATCTT:1 - chr2L 47169 5' - roo 8988 2 72.60 TCGGGAAAGGCGTTCAGGGTGGGGGAATCCCCAAACTGGGCCTTGGAAACCCAGCTCACCGTGCTGGTGCCTAAGCAGAGGCTC:1 + chr3R 13411301 5' + Rt1b 235 1 70.24 ATTGAAATGGAAAAAGGAAATGAAAAAAACGAACGACTGTTGTTTTAATTAAAGCCCTTCATACGAAAACAAGTGTAAATTTTTTTAAAAATTTTAATTTTATCTAATGAAAAATATAATTAATAAAATGAAAAAAAAAATTAATA:1 - chr3L 14182728 5' - INE-1 471 1 52.74 TTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGACTTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTGGGGCTCCGTTCATATCTTAGGTAAATGAATCGCGAGCGATAAATTATATTTAGGAGTTTGTT:1 - chr3R 27986422 5' + roo 84 2 75.17 ACTGCAGCCACGGTGCGAAAATACATGAAAAGAGCAAAACAACAGAAAACTAAACAAAAACCGCCAACAGTTTTTGTGTACAAATAAAAGCAGCGGTTCCGCGCATATAATACTTAAATTGTGTATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 18777196 5' - Quasimodo 40 2 69.06 AGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 + chr2L 7660905 5' - I-element 5300 1 54.11 AAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 + chr3L 10373823 5' - 297 6917 2 65.00 ATTTTCTTCACCATTTATCTTGTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTAACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2L 15940179 5' + pogo 29 1 62.33 GTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATT:1 + chr3R 21276524 5' + BS 5048 1 51.37 CGTGTAACAAGTGCCACTCAAAAAAGAGCGAAAAAAAGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1 - chr3R 27765204 5' + mdg1 7084 2 53.42 AATATTGTTTAATTTAAAATGTTGTCTTTTTATTTATTATTCTTATTTTTAATTTTTATCAAATAGAATTTTTACTTATTTATTTATTATTCTTACTTTTGATTTGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCA:1 - chr3L 7733222 5' + 17.6 413 2 76.69 TAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGA:2 + chr2R 3262649 5' + mdg1 233 2 59.31 GACTAAAAAGTTAATTGAATGACTATCTGCAAACTTCAAAATGTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTAGTGTAAGGCAATGCCAAAAGAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGTGGTCAAATTTTCC:1 - chr2L 13327655 5' - Transib-N1_DM 7 1 78.08 ACCACAATACATAAAGATGGGCGGGAAGGCGACGAACCCTGTCAAGCTGGCCACCGCCGACTATTTTTATAACAATTTGATTATATTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAA:1 - chr2L 1261844 5' - 17.6 10 2 62.33 ACCTTCCCATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTAAGCTGTCTTAACAGGGG:1 + chr3L 17183639 5' + diver 5918 2 58.90 TTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAAACTATGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACGATTATAATTTTAAAGCGTTTTAAATT:1 - chr2R 4826124 5' - 1360 3016 1 66.44 CTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 + chr2R 21160668 5' - Transpac 259 2 64.84 ATGTGCATATTTCTCACCAAAGCAAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 + chr2R 2832904 5' - 1360 3332 1 63.91 ACATATTTAATATTTCCATTTGGAGTTATCAGCTGTTATAGCTAGTTTTTAAAAGCTAGATTCAGTTACTTTATACAGCTATTCACTTATAGTTTTTTTTTACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTT:1 + chr3L 23532219 5' - Bica 492 1 66.90 TGGCAAGGTCAAATGTGCAAGCACTTAGTCTAATGATAAGCAAAGAATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAATATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 + chr2L 11931323 5' + I-element 4938 1 68.31 AATTGAGTAGGTAAATCATGAAGTTGGCGCACACTGTGGGCGACCAATCTTTTTCCTGTAAATGAAAAATTTAGTTTCTTAAGTTAGTAGAACAAGAGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAG:1 - chr2R 11887277 5' + mdg3 404 1 77.60 AATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 14366559 5' - roo 9049 2 67.09 ATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAGCAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 11804631 5' - pogo 2034 1 67.81 TTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGATACG:1 + chrX 21948991 5' - 412 307 2 75.22 CGACTGGAAAATTTGGAAAGCCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGTCAA:1 - chr3L 22960536 5' + Tirant 8160 2 55.07 TAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 - chrX 21100289 5' + mdg1 29 2 66.44 AAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACG:2 + chr2R 21410873 5' - Burdock 6324 2 64.38 AAACCAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCTTCTGCCGGTAAGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGGGT:1 + chrX 14976814 5' - accord 7031 2 90.79 AATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAAAATA:1 - chr2R 6622630 5' + S-element 88 2 79.45 ATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 - chrX 19539556 5' - pogo 2044 1 58.22 ACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:3 - chr3L 17940213 5' - 1360 3346 1 56.85 AACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATATTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:1 + chr3L 18505648 5' - I-element 5290 1 63.70 GCATGGTTTTAGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2L 16564618 5' - roo 400 1 73.29 TAATTGGCCAATTTCGCCGATGCGATCGTTTTCGGGCATATTACAAATGGATCGACGCATACAGTGACAGCACACGTATTGTTCATGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 - chrX 3461920 5' - hopper 1384 1 62.33 AATAATAAACAAAATTTTAAAAAAAAATTATCACTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCGAAACATGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTC:1 - chr4 181382 5' - 1360 236 1 72.31 ATGCTGGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCT:1 + chr3L 22400218 5' + 1360 19 1 72.60 ATAGGCTATGTGCATATTTCTCACCAAAGCAAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chr2R 2832897 5' - 1360 3326 1 62.33 GGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGC:1 + chrX 1799142 5' + invader4 75 2 71.43 GTTTCGNCCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 9002988 5' + roo 85 2 78.77 ATTCTACTTTCACTATCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATGTTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 11804762 5' + pogo 17 1 70.37 TATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chrX 3797450 5' - 297 6922 2 70.55 ATTTTACTTTTTTCAAATTTTTATTTAAATCAAGTATTAAGTATTTAAATAAAGTATGTGCAATCGAAAAAATGTTTGTTAAAGGTTTACTTAAGGGTGGGCAAACGATGAAAACTAATAATTGTTGGGCAAACGTTTTTTATTGA:1 + chr3L 14735230 5' - FB 342 1 54.11 AAATATAATTAAAAACGCAAACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTTGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGGAATAATGGAAGTG:1 - chr2L 14074544 5' - 297 6611 2 80.80 GACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGG:1 + chr2L 11391465 5' - 1360 49 1 59.59 CAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:2 - chr3R 19073269 5' - roo 8996 2 70.55 CCCACACTAAAATTATATAATATATATGGAAGAACAGGAATGACTGGTGACTTTGGGTTAGGATGGGAGGTGCAATCCTAAGACGATGTTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAAT:1 + chr2L 19558432 5' - Stalker4 6930 2 60.27 GTTTCCATTGCCGTTGCTATATTCTAGAGGAGCAAAAGAAGAAGAATCAATTGGAGATCTAAGCGCTATTCTTTAAATTCTAAATTTCTAGGATACAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAA:1 + chr3L 4832155 5' + Cr1a 89 1 69.86 ACACACACACACACACATATCACACATATGACTAAAGGGGGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGC:1 + chrX 2805657 5' + Rt1b 4951 1 69.90 TATCCCTATTCGCTGAGAGACTTTTTCACTTATACTATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAA:2 - chr2R 5303200 5' - FB 244 1 78.08 AAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 8338227 5' - P-element 2844 1 56.85 CATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTAC:4 + chr3R 23020796 5' - INE-1 551 1 60.27 GGGGTTATATAAGAAGGGGAATTTACGTGTACAAGTAGTTCGAGCTGATAAGCGAAACATTTGTCAGACACCAAAATGTGGAGCTTAAATTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGG:1 - chr2R 21301094 5' - G6 1583 1 65.81 ATTAGCAGCAATTTGAATATATTATCATCTCGTTCGTCCGTCGCCATTTTGTTTGTCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGC:1 - chr2L 5720 5' + G6 15 1 65.19 AACGAACATGGGCCATGTAATCACACTTGAGCTCCTCGCCCAGCCACACAGATGAATGTTTCCCGTTCTATTGTGCCGCATTGGAAAATAAACTTACGGGCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAGCCTAACGGTACTTTCTAAA:1 + chr3R 18568851 5' + Transib5 120 1 45.89 AACCTTGTTCACTGAAGTTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAA:1 + chr2R 2591091 5' + roo 8729 2 55.48 GTCGTATTTAAACCGTGCTTTTAGCACATATTCCGCGTGTCAACAGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATT:1 + chr3L 17567847 5' - S-element 157 2 57.53 CTAGTATGCCAAATGCATCTGCTAGAACTTGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGGCCAAACCAGACACTTCCATTAT:1 + chrX 8038562 5' + 297 20 2 72.60 AAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2L 12251028 5' + 412 7079 2 63.70 AGCTGAGTTCATATTACGAGCTAAGTGAGGAGATTGGTTTCAAAGGTAGGTTTTTATCAATTTCTGCTGGTATTGGTATGGGTGTGGGTGTGTGCTAGTGTGATTGTGTGTATGTGTAACTGTGTATGTGTGAGTGTGTGTGTGTG:2 - chr3R 15370342 5' - accord 192 2 54.79 ATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr3R 7666730 5' - I-element 5300 1 53.42 TTATGACCGCCTTCCAAAAAAAAAAACCCGCTCTAAAATTTCCTGAAGCTTCTCCAACGAAGACAGTCTTCTGAAGAAAGCCTTAGCTAAACACTGAAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTATATATATATATA:1 - chr3L 5631740 5' + Juan 4182 1 54.11 ATAGAAATGCTGCTTCTCCTTAGCTATTAAATATACATCCTTTTATAATATTACTATCGTAATGATAAGGTAACCAGTTATATCTGGTCATCATGTTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 - chr2R 10809300 5' + mdg1 37 10 80.14 GTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 16518927 5' + Tirant 29 2 76.81 AGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTAGGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr2R 19199657 5' + hopper 5 2 71.43 TAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:2 - chr3L 6447137 5' - transib2 2776 1 52.74 ATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chrX 1341734 5' + 412 60 2 57.53 GATGCAGACACGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 9003019 5' + roo 54 2 57.53 ACTTTGGAATGTTAACTTATTTGTATTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCTATATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 1341778 5' + 412 15 2 75.17 GATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr2R 4362753 5' + F-element 28 1 62.77 ATTCTTTGCCCATATTAAAATATTGTATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAATTATAGAATATTATTCTAGTTATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAC:1 - chr3L 14638709 5' + Tc3 319 1 49.32 AACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTGTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGC:1 - chr2R 5479955 5' + F-element 100 1 78.36 AACAAGAGATAATGCTATAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTC:1 - chr2R 5485807 5' - INE-1 173 1 78.08 TGATCAAAGTATCGGCTTGGTAACTATATGGTTTATATGGTATATATTATATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 21933149 5' - pogo 2100 1 66.25 ATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 + chr2R 24169965 5' + transib2 56 1 55.48 TTCATTTCATTATGTTCAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGACCCTTAGTGGGAG:1 + chr2R 11164053 5' + roo 8859 2 77.91 AGCTCACAGAGGATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCGGCCATCAACGCCAA:1 - chr2R 2590808 5' + HMS-Beagle 6845 2 52.17 AAATAATATTTGGCGAAGCTTAGCTGCATTTATTAACTACAGCATAACAGTTTTTGTTAGTTAACTCGAAAGAGATCCATCCTTTGTTTTAGAAAGTTCGTGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCG:1 - chr3L 17983641 5' - invader2 282 1 72.60 TTAAACGCTAAAACATAGTATCAACAAACATCCGAAATGCTGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGC:1 - chr2L 23177144 5' - diver2 83 2 77.40 AAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATCATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr3L 5881569 5' + pogo 55 1 56.16 AATAATTTTACCCACAAAAGTCTACTATTTAATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chrX 19539426 5' + pogo 6 1 68.49 CCCATGACAGCGACAGTCCACAAAATATTGGTTCACTTCAAAGATATCTTGGAGCAAACAGTTCGACTATTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTT:1 + chr3L 17863026 5' - hopper 368 1 51.06 AAAACAATATTGAAGCCTTAATGATTTATTATTAACAAAGATTATTGAGATAAGTGAGTATGAAAATTTAATGACTGTGTGCTCAAAAGATGAATGTATGGCAATATTGCTGTTGCTGTCCTTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGG:1 - chr3R 20238486 5' - F-element 4269 1 63.01 CTGCACGCGTATTGGTGCACTCGTGTGTGTGAGTGCCTCACTGCCAATTTGAATAATGACAACGACATCACCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAAC:1 - chr3L 21149341 5' + I-element 5120 1 54.11 TACTATATGATTTACCCGAGATTGGGAGCTGAATGCAAATAAGCAACTGAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAAGGAAA:1 + chr2L 9177139 5' + Doc2-element 245 2 72.73 TTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 2145977 5' - roo 333 2 67.12 CCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 + chr2L 13556314 5' - transib2 2788 1 60.96 TATAAATATGTACACATATATCTAGGGGTATATGTTGGTTTTTTTGAGAAAAAGTATGAATTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTGGGTTTGTAGGAGGG:1 + chr3R 28703744 5' - I-element 5065 1 79.45 TAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTAACAATATCGCGACCTTGCGACAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTACAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAA:1 - chr2R 17350560 5' + I-element 4890 1 73.97 ATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGAATTATATGAAGAAATTATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:1 - chr3L 24934414 5' - HMS-Beagle2 292 2 65.00 ATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATTATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 23295614 5' - P-element 2865 1 41.78 GTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3R 11191461 5' + roo 8741 2 80.77 GTGATAAATGGGACATACATCAAATGAAATCATAGCATGCAAATAACTATCAACCGATTTTCGCTTAGGCTTCAATGCTCAACTGTTATTTTGAAATTAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAAAT:1 + chr2R 25000358 5' + I-element 462 1 69.86 AATAAGGAAAACAACAAAGCCTTGGCCAAAAGCAAACGAGGCCAGACAAACAAACAACTTAAAATGTCAGTTAAACATTTTGTTCGGCAGCCGCGAAATAATACAATACAAATAAAAAAAAACTAAAAAAATAAAAAACAAGGAAA:1 + chr2R 16896685 5' + transib2 2642 1 73.29 TGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATC:1 + chrX 12129325 5' + flea 4837 2 74.66 ATTATTACACTATCCTCTAATAGAAAAAATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATGGCAAAACATGTCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 + chr2R 4709828 5' - INE-1 82 1 42.47 ACAAGTCCTTTTCCTCTTTTCCAGTGTACACAACGAGACGCTTCTTACAGGATGGCGTTGAAATTGGAAAAATTGTATCAATAGATGGTTGTCTGCATATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 17448999 5' - accord 188 2 66.37 ATCGTCTACATCTCCATTATCATCATCATTTATCTTGTAAATTAATTTGTTATCTTCCTTGGATTGCGTACAATTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCG:1 + chrX 16560942 5' + 1360 92 1 54.79 GCAGCTTCTAAATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATAT:1 - chr2R 5321237 5' - INE-1 508 1 67.59 TCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr2L 12984105 5' - hopper 1370 1 51.37 AGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 + chrX 6116254 5' + transib2 70 1 66.44 AATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr3R 4805613 5' - 1360 3335 1 60.31 GTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr2L 16540960 5' + hobo 58 1 84.68 TTCGATGGCTTTTCACAATTTAACACCAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 - chr3R 16519013 5' - Tirant 8472 2 59.59 TTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 11164517 5' + roo 8713 2 54.11 ATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAA:1 - chr3R 26504320 5' - HMS-Beagle 6985 2 56.85 AATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATGTAAAGACTT:1 - chr2R 13766319 5' + roo 8678 2 70.69 AGGTGTTTAGATTGACAGCGAGAAATGCGCTTTCAATTTCAATATAAGATTCGCTTTCAACTTCAACCACTACAGCCCATGGAATATCCATGATATTGAAACAAAATCAAGCATATATTTATACATTTATACATATACATATATA:1 - chr2L 3703183 5' - Stalker 7094 4 75.86 CTAGACGCGTTTGCGATTTCGATGGGTTGCAGGTATCCGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCACACCTCTTCTCCTCAGAATTAGAAGATAT:1 - chr2L 5426894 5' - gypsy6 293 2 70.79 CACTATCACAGTGGGTTAGTCACATAATAAAAGTTATTAAAAAGAAAAAAAAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTT:1 + chrX 2822577 5' - FB 797 3 69.66 AAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 19924047 5' - roo 9020 2 53.15 CTTTAACCCAATTAATGTAGATATACCATGCGAACTCGATGTAAGCCATTAAATTAACTGATCTTTAAAAATTCTTAAATACAAGCTGTCTCGGCTGTTGCTACGCCACTCCC:1 + chr3L 10717848 5' - gypsy8 4688 2 56.64 AAAACTTTACAGCTAATATATTTAAGGGCATTGAATATGGGTGAGTCAGTTGAGGTTGTCCTTATGGACCACCCTCCCCTTAATGAGGACTGTGGTCCCCATGTATCAAGCGAGATAGAGCGTTGTTGAACTGTACACGGGGC:1 - chr3L 26716436 5' + invader6 4747 2 71.33 CAATTTCAAGCGTTAGCCAAATGATACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCG:1 - chr3R 11366810 5' - invader1 3696 2 73.03 CAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 + chr3R 15072581 5' + pogo 83 1 77.40 ATCATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2R 17878649 5' + Doc 53 1 50.34 AAACCTAATCAATAGCTTTAATTTCAGGACTATAAGTAAAAGACATAAAAAAAGACATAGATCTAACAGGTAGTGCTTGAAAATAGTTGGCTGAATCCCCAAATAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATG:1 - chr2R 4547649 5' - F-element 308 1 75.34 TATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTGCAGCGCT:1 - chrX 21852451 5' + gtwin 6989 2 68.06 ATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGAATTCACGCCAACTCAACACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACC:1 - chrX 21994017 5' + McClintock 34 2 60.84 GAGTATTCAACTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGAGCGTGGTGTGCTAGAAGACGATTGTCGGGACGAAATCAATTCTG:1 + chr2R 22189416 5' - 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chr4 625703 5' - jockey2 3110 1 71.92 ATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 7889641 5' - roo 329 2 71.92 AATCTCAATACTCAAGCCTGTAAATCGCTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATT:1 + chr3R 3854660 5' + Idefix 7265 2 69.23 TACATTTGAAAACAGATTAATTTCCATCAAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:2 - chr2L 11357958 5' - blood 351 2 67.12 ATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATTTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGATTG:1 + chr2L 6647665 5' - mdg3 5422 2 70.87 TATTCCATGAATTTGGTATTCTCATTAAACAAAATTGTTATTATAATTAAATTTAATTTTATTTAACCCTTTAAGTCAGTTGGAAGAACCTTTTAATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chrX 21505785 5' - roo 9052 2 71.23 TGTTTAAAGAAATTGACGAAAGTCTGTGAATAAAATAAATAAGCGTAAAGAAATAAAATATCACTGCACTACCAATAAAAAAAAAGCAGTATAACAAGTTACTCATTAATTTAGTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTT:1 - 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chr3R 15054291 5' - copia 5045 2 76.55 AAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3R 30347459 5' + P-element 28 1 42.47 ATTCGACGGTAAAACGCCAAATTAGCGTAAAGTGTACCCCTACAAAAGAATAGAGACGAGAAAACTATTTTCCGTTCATTTTTAATCTTAGCGTTGTCCTTAGTCCACTGACGGGGC:1 + chr3L 15483444 5' + 297 6938 2 70.09 GGCCATTCATTCAAGTCCGACTTCGGAGAGCACGAGAGAGCGCCAAGCGCAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATAT:1 + chrX 17698744 5' + blood 178 2 61.94 ATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350046 5' + 1360 3224 1 54.79 AAAAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3R 17996146 5' + diver 30 2 60.74 GTCAAATTTACAATGCATGAGCACAACGCGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAA:1 + chr2R 4745228 5' + 1360 3252 1 76.25 TATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 + chr3L 24934292 5' + HMS-Beagle2 40 2 53.08 GCAGCAAAAAACATTGCCTAATTGGGCAAGGTATTCGCTGACCGTAATTATGTTTTTGCCCTCTTCTATTCTCCCTTTTGGAATTCTATCTGCTCTTCTGCTTCTGACATTGTTTCCTTTTCATTTTTTTTTTT:1 - chrX 11548153 5' - Doc2-element 232 1 62.69 AGGCTTGACCAAAAATTAATAACTGATAAAAGCAGGTAAGGCAAAACACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGATGTATGTATATATATTAGTA:1 + chr3L 22035531 5' + 1731 4414 1 53.42 AGCTTATTTAATTCTTGTTTATATAATTGATTAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGATGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTAT:1 - chr2R 5426549 5' - 1360 155 1 79.45 GCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGGCGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGCCATACGATTT:1 + chr3L 17940043 5' + 1360 21 1 55.48 TATTTGTTCAAGACCCCTCAAATACCCCAATTGTAAATTGATTTGAAAAATGAAATCAACGACCAATCAAGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGACGGCAAGAGACATCC:1 - chr3R 16340546 5' - P-element 2864 1 61.90 ATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chrX 21216717 5' - roo 348 2 60.69 TTTTTTTTGCACATCGATAGAAATGTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 + chr2R 5667265 5' - INE-1 167 1 59.59 AGTGGTAGATGGAGAGAGGGGTGTAATAAACTGCATATGGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGA:1 + chr2R 15031245 5' + R2-element 3477 1 73.29 AGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAA:1 + chr3L 25255422 5' + INE-1 310 1 65.75 ATCAATAGCATCCACATAGCTGGTGCATGAACTCAGGATGTTTGTCACCTCCTTGATAATACAGTTGGTGCCTCGAACCGTTTTCAATGCCTTGCGAAGGATTTTACGGCATGAAATCGATTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 - chr3R 25505567 5' - INE-1 551 1 74.66 CTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCT:1 - chr3L 13739641 5' + BS 5072 1 70.55 ATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTGGAAGGTTGA:1 - chr3L 24131476 5' - Transpac 227 2 76.03 CCAGGCGTTGACACCAAACAATTTGTCAAAAGATAATTTGTTGTTGCAGCTACATATGTGGCTATGTGGATAGTAACCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 + chr3R 30266597 5' + jockey 4770 1 59.26 ATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGGAATGCAA:1 + chr3L 3501725 5' + Bari1 73 1 66.44 GGATGTGGAGTACAAGCCGACTGCGCCAGGTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGGGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACATT:1 + chr2L 23400703 5' - S-element 1709 2 72.17 CATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 19054247 5' + jockey 20 1 64.65 ACCTATCCGAAAATCCCCTATCGAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:2 - chr3L 14094727 5' + I-element 18 1 71.92 ACCTACAGGTATTAAAAAAAATGTAATGACGGTTTGTTTCCAAAGTCGAGTCGATCTGACCCTTTCCGACTGTATGAACGTCGAGAGGATGGATAATATATGTACACTTTATATGTTCCGAAATGCTTCCTTCTGCCTGTTACCCT:1 + chr3L 23207318 5' - INE-1 29 1 56.85 CCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2L 20265917 5' - roo 9032 1 58.22 ATCGACTCATAGCTTTACTCGTCTTCAGGCACAATGCATAGTTGTATGCAATTAAATCGAATTGACGTTTCACCCTAGTTGAGAAGCAGATCTGTGTTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTA:1 + chr3R 5016183 5' - mdg1 308 2 66.21 GCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGT:2 + chr3R 11040051 5' - Bari1 1649 1 58.22 ACATTATTAGACTAGCATTCCTCCAGTTAAATTTTGTTTTGTGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCTCTGACAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGAC:1 - chr2L 6914079 5' - F-element 464 1 68.66 TGGCATCCGAGGTGGCCATGGCTTTCTTGAGACTCGCCGCATTGTCCAAGCAAAAGCCAAAGACGACGAGCGGACAAAATTTGTCGCATGATGCACCGAAGTAGGCCGCTCTCGTCTCCTTGACGGTCCTCAAACTGTCTTGCGAC:1 + chr2R 10488217 5' - baggins 452 1 39.04 ATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr2R 24427542 5' + jockey 4701 1 61.94 AACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 + chr2L 22674752 5' + mdg1 7071 2 64.38 GTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTATACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGATAGTCGA:1 + chr2R 16193772 5' + INE-1 551 1 50.00 GTTTTATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAA:1 + chr2L 21854825 5' + INE-1 555 1 54.61 ATTTTATGCTTCTTGGGCTGCAATCTTTATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTGCCACTTGCATCAGTGTTCT:1 - chr3R 27133701 5' - opus 7489 2 72.39 ACGAATATAATTAGGTCTGAAGGAGGTCAACTCCGAAAGCTGCGAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACAT:1 - chr3R 3854498 5' - INE-1 30 1 60.27 GTTACTTTTTTTCAACGGATTTGGAATATCTTCTAATGTCTTTTTGCTAAATCAAGTTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCTGACTAGTAACCTTCTAGCTTTTATCGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGA:1 + chr2L 21256546 5' - INE-1 134 1 56.94 AAAAGTTTGCGGCATTTCGTCTGACATTTTGTCGATTGCGTGAAAAGTTGTTGCAAAATCAATATTTTCTTTACTGATATGTTAAAATGGATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTG:1 + chr3R 20062968 5' - mdg1 303 2 63.45 TAGTGGACATCAACGTGGCAACGTCGAACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2R 12471976 5' - transib2 2807 1 73.29 AAATTGATATCTTTTTTAACTATCTCTCCAACACCATCACCACCACAGCTACGACGAACTAGAAGACATGCTTCACTACTTTTAGTGG:1 + chrX 15030552 5' + frogger 2382 2 48.86 TTCAGTAGCCAAACAGACCGCTCGGCGTAAGAAGTCGTCGGGAATTGTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACATTGTATTGCTTCGCAGCAACTAAGCAGCTTTGTA:1 - chr2R 6482535 5' + gypsy 28 2 48.70 TTATAGAAAATACTGATCGTGCCTAAATGTTGCTCATACATTTACAAATACTTAGCATATTTAGTTGCTAAAAAATATTTCAGTTTTTAAAAAACCTTTTATTCCCGTGTAAGCCAAAGATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATAT:1 - chr3L 19231366 5' - transib2 97 1 80.00 AATTTTACTGTCGCATTTGATCATAAATTAAGCGATTAACAAATAAGGGGCACCGTGGGTCAACAATCTTGCGCTGCGTCTTTGTTTCTACAATCTTTATGCTGAATCTCAAACTTCTCGTTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACA:1 + chr2L 21916043 5' - INE-1 144 1 59.59 TTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 7300157 5' + roo 75 2 71.53 AAAAGAGCGCGAAGAGAAGGCTAAGGAGAAACAACGAGAAGAAAAGCTAAGAGAGGAAAAGATAAAGGAAAAGGAAAGGGAGGAAAAACTCAAGGAGAAGCTAAGGGAAGAGAAAATCAAGGAGAGTGTCTTTTCTTTGAGCTAT:1 + chrX 11831061 5' - Ivk 4918 1 79.31 GGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:2 - chr3L 13294952 5' - roo 8980 2 80.14 GTATGTTGTATAATTTTTAGAGGTGATTTTATTATTTTATTTGGATCATTATTTTTATTAATGATTTGTTGACTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTACTTCACTAAAATCAAGTGATTTTA:1 - chr4 1165809 5' - Doc3-element 43 1 54.11 ATGAAGCCACAATTCAATCTCAAAGAATTGGATTGGTACTATAGGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTACTTGAAAAT:1 + chr3R 2470638 5' + 1360 312 1 67.83 TATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr2R 14653153 5' + 297 46 2 56.16 CCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 - chr3R 10970375 5' + G-element 26 1 63.01 CCACACTCATTAGGATTTTTTTGATTAGAGTAGAGTAAAAGGGTATCCGTTGAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAGGCGTTTCCGACCACATAAAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:1 - chr4 643211 5' - HMS-Beagle2 292 2 71.53 ATTTCATAGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:2 - chr2L 12286086 5' - INE-1 85 1 80.14 TCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr2R 14051855 5' + roo 57 2 65.07 CATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAATAGGTGACCTGAGAATCG:1 - chr3L 18046686 5' - roo 8994 2 67.81 ATTTCTACTTTTGTTTTTGCCAGCTTATATTCTTTTATTGCTTATAATTGCCTGCCGTAGTTTGTTGTTGGCCCTTTTGAGAACAAACAAACATACAGTTTGTCAAGAAATAAATTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAA:1 - chr3L 25610100 5' - S-element 1668 1 69.66 GTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACAT:1 - chr2L 11257103 5' + rover 14 2 62.22 AGGCGGCCTATCTATCGGTTAGTGGCTTTTATGGGCGGTAGAAGTATATATATGCATATGCATATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3R 4461012 5' + blood 30 2 54.92 ACTGGTATTTATATTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chr2L 17809148 5' - jockey 4961 1 60.96 AGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTG:2 - chr3L 13739654 5' + BS 5059 1 61.64 GCCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 3234017 5' - roo 9030 1 75.28 ATTATGGTTGGATGCTGGTCCCACTGAAAGGCTTTTCAAAAGTTTTTTTTTTCGCACGGGCCCAACGGCCACACC:1 + chr3R 2561723 5' - Cr1a 4440 1 49.33 ATAAGGGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTTAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTT:1 + chr3R 9594981 5' - Tirant 390 2 73.91 ATTTATTCTAAAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:2 - chr2L 6647761 5' + mdg3 5284 2 64.38 AATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCGTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAT:1 - chr3R 9039019 5' - Juan 4182 1 53.78 ATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGCAAATAAATAT:1 + chr3R 29690713 5' + I-element 5268 1 62.76 ACCACAAAGTAGCGAATAGCTGAAAGGAAGTTGAGATTTCGGGGAATATAAGTGAAAAATCAAAAATCACACTAACACACACACACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAG:1 - chrX 20916158 5' + 1360 3265 1 60.96 GGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr2L 6174052 5' - I-element 5295 1 57.53 AAACGTTTAACAATATATAAAAAACCACAACTGTGTTCTCTGTCCATATGATCGTCGAGGATCCATTCCGACCATATAGATCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGCATGTATGAACGTTGAGATCTAAGGAACTAT:1 - chrX 22905688 5' + INE-1 143 1 54.23 GAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr2L 17205156 5' + hopper 35 1 59.71 CTTTGAATAGCTTTACTTTATTATTATTTATAGTTGGGTATATTCTTTTCAGTGTCTGCGGCACTCAAATCATTCTGCATGGTTCCGGAATAGCGTATCCTTGCACTGGGCCGCTTCTTTTATTTTTCACATCTAGTCAACCAATT:1 - chr2R 9367569 5' + Porto1 4616 1 60.27 TGATCGAAGCTTTGCTTTCTTTAATTGGAGTTTATGGCACTGGCCACTGGAAAGTGTTGGGGGGTTTTGTTTGTGTGT:1 + chr2R 23190773 5' - I-element 4958 1 74.36 TTACAACCACTGCCCCCAAATTGCCACTCTATTCTTCGCCGAGTTCTTTTGTTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3L 7300106 5' + roo 8689 2 67.59 AATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 - chr2R 330220 5' + HMS-Beagle2 6939 2 57.93 AAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chrX 10537818 5' + I-element 25 1 66.44 GTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATA:1 - chr2R 20227308 5' - hopper2 1536 1 67.81 CAAAGCATCTGGCAAATAAATGGCAACTGATAAAAATACCTCGCTAAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 5389817 5' - roo 394 1 75.34 CCTGTGTTTGCCCCTCAATTCCCCGCATTTCTCCCGCAGGAAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAA:1 - chrX 1118487 5' + HeT-A 6017 1 71.92 TACGTCATCATGACCGCCAAGGAAGATGGCAGCCGGAGCCAGATCCGGCCACAGGCTATCCGGGATTTCCTCGACGCGCAGTTTGTAGATGTAGGGAATAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTT:1 + chr2L 814018 5' - jockey 4744 1 70.55 GATCTGACAGCCGATTGCCCCAAGGACATACAGGAGATCATTAACATGTCTGGTTAGTAGGAAATTTAGGTTTAAAACTTAAGATTAAGTTTGACTAGACTGAAATGTTTCAGCTGATTTTTTTTTTACTTTCGAGCATAAATATA:1 - chr2R 17017331 5' + transib3 2412 1 76.03 CATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2R 7850011 5' - roo 325 2 72.60 CTGATGGTTAAGGCCATTTTGGATAGTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr3L 24131382 5' + Transpac 2 2 63.70 TTTATAGGTTTTCGGGAGCAAATATACACATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 17926377 5' + opus 19 2 65.82 ACCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAACAACAACGGCAACAACAAGTTGGCCCGGCTAAGACTGTCGAGTAACGAACGACCTTAGAGGTAATAAACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCT:1 - chr3L 8440411 5' + I-element 5172 1 66.44 CAATGTTTTGGATACTGAATACACCGTTATGAACCTCATCGAGATGGGTGATTACGAATTTCGAGTATTTGTTTACTTCCGAGGGTTGCGCCAGAACATCAGATACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGG:1 + chr4 766084 5' - Chimpo 449 1 56.16 GAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGAGCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGA:1 - chr3R 27083099 5' + jockey 4616 1 75.17 ATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:2 + chr3L 9809239 5' + 412 53 2 54.79 ATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr2L 5582210 5' + pogo 57 1 59.59 AAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:2 + chr3L 24213770 5' - invader2 5038 2 63.70 CTATTATTTATTTAAAGCACCCCGATAAAATCTTAATGTTGCTTGAACAACCGACAATGCGGCCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGGGATCATGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTTTCCGCGACCC:1 - chr2L 8923959 5' - Tc1 361 1 74.66 CCATGGAAAACGCTATGCACTGCAAAAACATTTCTTATTTAATGATGCTTTTAATATAATATCGAAATAAGTACACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACC:1 - chr3L 21772827 5' + I-element 5094 1 54.79 AAACCGAACCGACTTAATTTAAGCGTTCATAACAACACGGCTACAAAACCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAACCGGCAGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCA:1 + chr3R 21185682 5' + Doc 4551 1 60.50 CTATAATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:3 + chrX 5323217 5' + Juan 4092 1 54.11 TATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGC:1 + chr3R 19449914 5' - roo 300 2 53.33 ACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCGTAAGTAC:1 + chr2R 21410886 5' - Burdock 176 2 71.72 CTTGAACCGAGGCTTATCGTCACCACCGCCGCTTGTTTGGTTAATTAGTTCCATTAATCGATGAAGGGAATTTGCTCAGGCTATTTATTATGCGCGTGACATAATATTCATACTTTCGAATTTGTGTGTTTATTTTCCCTCTATTC:1 + chr3R 22766198 5' - gypsy5 7304 2 47.26 TCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCCATAAGTG:1 - chr3R 23295588 5' - P-element 2839 1 23.97 GGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 25616532 5' - roo 8985 2 77.40 GAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTC:1 - chr3R 27406054 5' - diver 6040 2 65.07 ATCATGTTCCCCAGCCGACTTTATTTTTGGACTAGCAAATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 3030163 5' - roo 9051 2 70.55 TTTCGCATTCCCATTCGCCACTTGTTGAGTGGCTAGCTTTGCATGTTCCCTCGGCTTCGTTCTTCCATGAAGTCGTAAATTGTTTATGTTTACCCTTGGCCAATACCCTCTCCAACAAGGTCTTAACAGAAGATACAATTTTACTG:1 + chr2L 16883591 5' + Tabor 416 2 81.51 AAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGACGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 25406607 5' + 1360 14 1 69.18 TAGGAATTACAATTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 5532882 5' - roo 394 1 73.29 AATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:2 + chr3L 16662368 5' - jockey 4943 1 52.74 TAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGA:1 + chr2L 10156116 5' - hopper2 1540 1 64.38 TAACACTTATAAAATGGTTTTTTAAGCTCTATTTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:1 - chrX 7701810 5' + invader4 2748 1 54.67 ATAAGAGTATTTTAGGAATTGATTAATCTCTCCGCACTAGGGGGGGAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGGGCCAACGC:1 + chr2R 12183600 5' + accord 6913 2 80.29 GAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:2 + chr3L 15913826 5' + jockey 4798 1 57.53 AGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:3 + chrX 19074762 5' + mdg1 58 2 55.48 GTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 19992647 5' - hopper 1412 2 67.57 TTTTGCTCCTGCTTTCGCTTTTGGCGGCGTTGCGGTTTGCTTGCCAACTGTTGATTTAGCGACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr3L 21327026 5' - copia 242 1 76.03 GGGGAAAGGGGGCGATCCCCAGCGAACAGACAAACAAATAAACAAACATATGGCACACATAAACCCGAACATCGGCATACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTT:1 + chr2L 290557 5' - mdg3 5070 1 56.16 ACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 + chr2L 14675635 5' + 297 45 2 54.79 AACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3R 5351479 5' + jockey 4710 1 52.03 TTTGTTGTTTTTTTTGTTTTAACAATTATTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAGCAAGTGCCCACCAAAAAAAAGAACCGTTACATT:1 - chr3R 16284542 5' - Tc1 151 1 64.44 AATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 11164373 5' - roo 9042 1 56.16 GTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 - chr3R 22590613 5' + rover 28 2 65.75 ATAATTAGCCAAGAAACCAGAAGGGATGCACTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCCCAAAGAACCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chrX 10639193 5' + FB 21 1 61.90 ATGCGATATGAGTATATTTTCATAATTAATTTCTTTGCCTTTTGTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGAT:1 + chrX 19229204 5' - Quasimodo 296 2 69.66 TATAAAACTTTTAGTCTAAATACACAGCACTCGGTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATG:1 + chr3L 9269838 5' - copia 241 1 72.60 GGAAACGGCTTTTGATTGTCTTTCACCGGATACAACCCATTCGTCCCTCTAAAACCCTCAAATCTCCCATCATTATTTTCTCAATCAGCATCGGCTTCTTTTTTATTGTTCCTTTTTTTT:1 - chr3R 23204875 5' - Doc2-element 235 2 75.00 TGTATATATTTGTAGAATATATTTAAAAATTCATCTGTAAGCCATTTATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTC:1 - chr3R 30911547 5' + mdg1 7195 2 67.81 GATGATCTCTTCGTTGCTCCGTTTTTCCCTTGCATTGTTCGTCCTTGTTCACACAGGAACAAGAATATATTTAAAGACTTACAAATTTGGGCTT:1 - chr3R 2541723 5' + roo 28 2 87.23 AGAATCAGACGCTGATGATGACTACTTCCAGCGCAAAAGAAAGAAACCCGAAAATAATATCTATTTCCATTGTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12296776 5' - transib2 2641 1 68.97 AAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGGTTAAAGAAATA:1 - chr3R 1844862 5' + Cr1a 158 1 49.32 ACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3L 17940207 5' - 1360 3356 1 59.23 TGGGTGGTGAAGGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATTTTCTGTTTGAATAGGTTACATTAGAATCGCATCTTAAAGAAAATTGCCTA:1 - chr3L 13294944 5' - roo 8973 2 74.48 GTCAATTCACTTGACATATTGCGTGCGGTTAATTGTCAATTATTTTACTCACGAAACCTGTGCCAGGACTTGGTGGACTACATGCCAAGACGATGGGCGGCTGTCATTGGCACCAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTT:1 + chr2L 7442030 5' + Tc1 1340 1 59.31 ATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGCTATGTGGAAGGATGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGCTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGCT:1 + chr3L 15103838 5' - Transpac 5169 2 70.27 GCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chr3R 4805681 5' + 1360 84 1 73.29 TCATATTTATTTCGTAATTGAGGTCTAGGAAAAATTCCAGGAAATTACAATCCGTGCAAAATTTTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 - chr2L 22252587 5' + FB 68 1 54.29 TAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:2 - chr2L 16946154 5' - hopper 1377 1 58.22 GAGTGACAATGGACAGCCCAAGCAGTCGTCGACGAGGATCCTTCAGATTGCCATTCTGGATGTGGATGACCACGAACCTCGATTCGCAAGAGAAGCTGTAAGTGAATACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATAATTCTG:1 - chr3L 17369930 5' - Idefix 460 2 71.72 ATGGGGCAGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 14051700 5' - roo 398 1 72.60 GCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCTATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTATCAGCTGCCATCAACGC:1 + chr3R 26504215 5' + HMS-Beagle 6842 2 53.85 CGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:2 + chr2L 7125757 5' + I-element 63 1 58.90 ATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chr2R 3563085 5' - Transpac 251 2 56.16 ATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAACCTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGGAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATAAATAAGACGAT:1 + chr3R 29534665 5' + Stalker2 152 6 71.43 CTTCCCAAAGTGTAAGACCTAGCTTCTATCCTTGCAATTCTATTTAATATATTATTATAATTAAATAAAAAAATATTTAGAAATGTTGAAATTTTTTTTCGCACTATCCTAGTTGCGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAAAACTTG:1 - chr2R 5519800 5' + INE-1 559 1 60.27 GGAAAATGGAAAGCATTCCAAACAAATATGATAAACCATCCGTCGAGATGAGAACTTTTGTCATTTTCATTTTCCCCAATTTGAGCACAAACCACAGGCAAATATCGACGGATGGTTTATCATATTATATTGTAAGTATAACGCTT:1 - chr2R 9366491 5' + Burdock 469 1 47.95 AAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chr2L 14874144 5' - copia 249 1 42.47 ACCGTAGTGCAGACATCAACCTGAACTTAGCCAGATACTTCTTATATACTACTACTTATTACTGCTAAATCGAGAACAGGAACGAAGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAA:1 - chr3L 23181750 5' - Cr1a 4256 1 52.74 CAGGAACATCATTTTCATATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:2 + chr2R 8735525 5' - mdg1 7446 2 76.03 AATAATAATGGGGATTTTTGCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:2 + chr3R 31653069 5' + roo 8729 2 63.01 AACCCCTTCCCTCCAGCAGCGACATGCAAATCTGACTGTTGATGGCGCATTTTGCTTCGTCGGGCTTTCATTTTTCTACCCCACGTTGATGCTCACGTAGTTGCCGAAGTGTGTTGCGGCGAGGTGCTGCCCACAACAGAGTCA:1 - chr2L 17281554 5' - Chouto 470 1 56.94 GTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTAGATTTATTTACATAAGATATTAACGGAGCCCAAAATTGTTAGTCTTTAAA:1 + chr3R 19449992 5' - roo 25 2 78.57 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGC:1 + chr3L 20525229 5' + 3S18 61 2 58.90 TATAATTCTTGTGTTCCGTACCTCTATTCTTGTTGCACTGTCTGCAATGACGACATTGTAATGCCGATCGCTGTCGTATTTGTGGAAGTAAGCACAACAAATTGCTACATTTTGGCTCAAGGCCTTCGTCATCTCGCTCCCAGCCT:1 - chr3L 6884469 5' + G3 265 1 66.44 ATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATGGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGGACTTGCTTGCCG:1 - chr2R 19727744 5' - R1A1-element 5157 1 58.25 TTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:1 - chr2R 330228 5' + HMS-Beagle2 6932 2 52.74 CCAGTCAGTCGGACTTTACGACAATGGCACAACTATGAAAAGCCCAAAGCGCAAATTAACCCAAACACCCACTCGCACACATACACACACACACACATATACAC:1 + chr2R 19599331 5' + accord 7033 2 63.46 TGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 27986341 5' - roo 351 2 57.53 TTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3L 16437255 5' + F-element 44 1 45.60 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATAT:1 - chr3L 16731387 5' - G3 4505 1 95.89 ATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 12986519 5' - roo 359 2 52.05 ATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:3 - chr2L 13556479 5' + transib2 24 1 63.70 GACGTCATTTATTACTCATATTGTAGTGTCACCTGTTTAGTTACGTGAATTTCTATCGATTTGACAAAAAACTTTATGCCACGCACACTCTAACGCCAACCAACCGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTA:1 - chr3R 3525112 5' + INE-1 260 1 63.70 TGTAAGTGATGTCGCAATGTGACTCTTATTTATTTTATAAATGATTTTATTGGTTGTATTACTATGAGATGCATGACCCTTACATAGTATTATGTTCTGACTATATCTCATTATCCCATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCC:1 - chr3L 16492150 5' + Cr1a 4233 1 58.90 GCATTAACCTTCGTCCTTTTGTCGACGTTCGATTTGTAACGTATATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGT:1 + chr3R 23566950 5' + micropia 162 2 70.55 TACTGAACCCTGTGTAGTGAAAATAAAGATATATTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTGATTTTTCTTAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGACAGTT:1 + chr3R 15864921 5' - Porto1 4295 1 77.40 CATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCT:1 + chr2L 14026109 5' + F-element 452 1 61.64 GATAAAGTTACCACTTTTGGCACAATTTAATTAGACAAAACGTGATCCGTTGTAAAGGAATTTATTATACCCATTACTCTTAGAGTAAAAAGGGTATACTAGATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTC:1 + chr2R 18487142 5' + INE-1 34 1 51.41 GTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCA:2 - chr3R 905056 5' - rover 7263 2 60.27 AGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 - chr3R 18093392 5' + I-element 44 1 52.41 ACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTGGTGATTTTTTTTTGCCGTTTGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCTGCCGTG:1 + chr2R 5582141 5' + Cr1a 51 1 74.82 AACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGG:1 + chr3R 14980349 5' - roo 467 1 53.10 AGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr2L 18226847 5' + roo 8752 2 78.77 ATGCTTAAAAACAGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1 - chr3R 11469415 5' - Tabor 434 2 51.37 AGATAAACACCAAACTACCATTAGAAGGCTGCCATTTTGTTATAAAATTTACTAGTATGATTGTACTTTACGGAAACACATAGCATTACAAACATTACAGAAAGCCTCTTAAGTTAATGCCCCCCACCCAAACATTTAATTA:1 + chr2L 1256037 5' + G-element 4265 1 78.17 TACACCCACCCCACGAAAGGAGGGCGTGCCTCCTTTACAGTCACTGCATTTTGCAATAAATATCCAAAATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAA:1 - chr2R 16507664 5' - copia 118 2 51.45 CGATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 + chrX 14722098 5' - diver 173 2 51.37 TATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTT:1 + chr3R 23067464 5' + roo 390 2 52.74 AGCCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3L 18126041 5' + Ivk 12 1 70.14 CAAAGAATTTACTTAGGGTTGCAATTCTTCCGAGAGAAGACCCGACAGGAGAGAGAAAAGCAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTT:1 + chr2R 8745894 5' + X-element 478 1 57.78 ACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGC:3 + chr2L 17005667 5' - Stalker2 7626 2 59.59 ATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 3920566 5' - roo 8988 2 76.03 TACTTACTTCTCAAGTATGTCCTGTTTTTTGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAG:1 - chr3L 16819290 5' - Juan 18 1 68.49 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCGACAAAGCGAAGAGCTGGAGTCCCTCGACCCGTTAGATCACCTGAGAACATTGAAGCAGTGAGAGCGTCAATATTGCGATCTCCA:1 - chrX 12657099 5' + mariner2 376 1 64.38 TATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1 - chr3L 2544709 5' - Tirant 329 2 65.75 ACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chrX 18409452 5' + jockey 4701 1 55.21 AACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 11661340 5' - pogo 2090 1 78.08 GTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATG:1 - chr3L 20711688 5' + jockey 4831 1 65.75 CAAACAGAAATATTAAGTTCTTACTTAAGAAAGGGATTAGCATCAGCCTTGAAATATATGAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3R 15325076 5' + 297 6637 2 60.27 AATATGTGTAGGCAATGCCAAATGTAAGTTCCCTTTCTTCAGTCTAAAAAAAAAAGTGGCAGACATTTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAAACAGG:1 + chr3L 13836557 5' - 412 7537 2 76.03 ACAAATAAAAAACAGGTAATGGACAAAACGTGCAAACATTTTGGTGAAATACAATAGGATTATTTAACTTGATTTTTGTATATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 - chr2L 17178648 5' - Juan 4156 1 62.33 AATCAGTTTACAAGGAAATCTGGGGTAGCCTTAAGCGGATTGCTCTTACTTGCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGT:1 - chr3L 16973516 5' - S-element 1707 1 77.40 TCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr2R 7304000 5' - pogo 2056 1 58.22 GTCCTTTCATCTATGTCCTGCGCGTTTCTTTCTGTCCGACCTTCTCCGCGGGTTCTAGCTTACTGTCCCGATCTGCGTTGTTTGAGGTGTGAAAT:1 - chr2R 1861786 5' + accord2 7483 2 76.84 TGGATGGCCTCAGAAAACTTGCTTCAAACAAAGTCATGTGGACACCGGGCAATGGGCGGTGGCGAAGAGTTTGAGGTGAACCTTCGTCCATAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGT:1 + chr2L 21930601 5' - Copia1_DM 122 1 65.07 ACAAAATCCGATTGCACCGGTTGGGGCAGATAATCGGATTTGTAGGAAAATTCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 14051906 5' + roo 8670 2 77.40 CTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2R 9871007 5' - roo 9036 1 60.96 ATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 - chr3L 16033431 5' + Doc 61 1 56.16 CACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCG:1 - chr2R 6482544 5' + gypsy 49 2 50.34 ATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 14980429 5' + roo 41 2 57.53 TATTATTACATACATAGATTCTTGGTGTCTTGGTGGTGTGGATTATGCTTGTCTTGGTAGGTTGAGTGTATCGAGTGTCTCCTGTGTTGATTGTGGGGTGTGTGAAACGTTTTCGCTTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCT:1 - chr2L 3810007 5' - Doc2-element 221 1 77.40 ATAACAAACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:4 - chr3R 12115353 5' - 1360 3318 1 65.07 AGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTA:1 - chr3R 10736136 5' + McClintock 54 2 59.59 ACAATCATAACTTGGCAACCTATAATGCTATCGATATTGAAGCTTGGCAAAAGAAAAGTGGGTTATTTAAGCAAGGATCGTGTGAGGTTTTTAGTAAATAGTACAAGCTAGTTTCCTCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTGA:1 - chrX 8640330 5' - Doc3-element 4491 1 71.23 TATATTATATTGTAGATCTAATACTTCAATTATTATGTTATAGTAAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chr3L 5102465 5' + jockey 4725 1 52.04 TTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAG:1 - chr2L 3675919 5' - Juan 4144 1 71.74 CACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chr2L 16690705 5' - P-element 2809 1 30.82 AATAATTTGTTACATAATTTATTTATTGATCTTGCTGCAACTTGCGGCCGTATAATAAGGGCCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACGAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAGTGAACATAAAACATT:2 + chr3R 4126762 5' + I-element 458 1 60.27 CTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAATTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chrX 19539475 5' + pogo 55 1 58.22 GGTGGAAGACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCT:1 - chr3R 31264133 5' + jockey 4775 1 67.12 AACGGAATCGCGCCCCCAGTTGCATAATCACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chr3L 15103951 5' + Transpac 4935 2 73.29 AAATATATGGACAGTTTGTGGCACCGTATGATTTAAATAAAAAAATAATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 6102881 5' - roo 396 1 65.07 AAAAAGGCTAAAATGGGGTACAAAACAACAAAAAGAACAAGGAATGCGCGGCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCGTACAAAATT:1 + chr3L 15729137 5' - diver2 4586 2 77.78 AAGGAACGCTTATATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTTTATTTATTTCCGCGTTCCTGTTCTCTTATTTATTTCG:1 - chr3L 19471666 5' + Cr1a 4351 1 81.15 GTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGGCCCGTCAGTTGACTAAGGTCAACGCCAAGAAATCA:1 + chr2L 14074463 5' - 297 342 2 65.00 TGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3R 23639105 5' + pogo 25 1 67.12 GGTAATTTACACGCCTGCTCTTTGTACAAATTAGAAAAAGAGTTGGCCGGCGGTTGACGCGCGCGGCTTTTACTAACGAAGTGGCAGG:1 + chr3R 7716724 5' - gypsy2 6782 2 71.59 AACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTCGAGTCAAAAGAAGAATCAAGCGACAC:1 - chrX 18409430 5' + jockey 4741 1 78.07 CGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:2 - chr3R 19992711 5' - hopper 1331 1 73.97 AGTTAATGCGACCAGCGGAAATAGTCGCAGTCAAAATGGCGCAACAACCAAACGGAAGTGCGCCAAACGCCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2R 10909193 5' - hobo 2920 1 64.66 TATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATT:1 - chr3L 24934365 5' + HMS-Beagle2 304 2 59.59 TTGTTACCTCGTTTTCGTAAGTTTTTGGTAACAATCCGAAATTAATTGAAATATCTGGGCTTAACTGAATGTTTTGAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:2 + chr3R 9004060 5' + roo 77 2 52.74 AATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGGGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAA:1 - chrX 20999580 5' + BS 68 1 67.12 TAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chrX 19054209 5' + jockey 30 1 68.49 CGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTCAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1 + chr2L 7125757 5' + I-element 63 1 57.53 AAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 19073286 5' - roo 349 2 58.90 GTAATGGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr2L 11298145 5' + I-element 50 1 50.68 AAGAGGAAAGTATTTTTAAATTTCAAAGATCAAATAAGGAATTCCAGCTTAACACAACTAGTTAAAAAAAAAACTATGATTTAGCTCAACACCATAAATTAAATGCTACCTTAGGTTTATTTTTTAGTTTTATTTTAT:1 - chr2R 22230454 5' - Doc3-element 169 1 79.71 GATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCC:1 + chr2R 2590728 5' - HMS-Beagle 159 2 78.08 GTGCGTTTTTATATAGAAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGGGAGGGGGCTCGATCACCGATTTGAGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAG:1 + chr3L 18281628 5' - Doc 267 1 78.90 GCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 8360630 5' - roo 349 2 58.90 ATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 - chr4 373045 5' + pogo 73 1 69.18 AAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGCGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 18226875 5' + roo 8682 2 56.73 TATGCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 4606189 5' - 1360 3341 1 53.47 TATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr4 373033 5' + pogo 65 1 76.98 CAGTTAATCAACAGTTTTTATGCAAAACTACTAAAGCACACACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACA:1 - chr3L 18235031 5' + HeT-A 6019 1 71.92 AGTGGTTTCCATTTAATTGCTTAATAACGTTTTATTATTTTATTTATTGTCTTGTAAAAAATGTAGTTACTTAGTCTGCAATTTCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACTCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAA:1 + chr3R 7310216 5' + F-element 318 1 63.70 AACATGGTCAGGTAGAAATATTAAATTGGATCGCTTTGTTTAATCTGCAAAGTTATTTAAGATTTTATCTTCAGTGTTATTGCATTTTGGATATTGGCGATAGATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 - chr2R 12956999 5' - Tirant 326 2 73.29 CGTTTGGGCCGGATGAATGGGGAGGGGGCGTTTGGGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGGCTCCTCAGCAAATATGATAGT:1 + chr3R 27373850 5' + R2-element 3243 1 74.66 CAAAGCTAATTAAAAAGATTATTAGCTCAATAATGACTGAAAAATATGTATCACCATCGACCATCTAAATTATAGATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chr2R 2049429 5' + INE-1 88 1 61.39 ACCGTATAAAGTATATAAATTCTTGCTCAGGATCAATATCGAGACGATTAAGCCATGTCCGTCGGTTTGTCCGTATGAGCGCTGTGATCTTCGGAACTATGTATGTATGTGTCGGCGAAACAGGAGTTTCATCCATATTATTTATT:1 + chr3L 14954099 5' - invader4 310 2 73.29 GGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTG:1 + chr3L 3501743 5' + Bari1 65 1 75.83 CAGCGACAAATGGCTACACAGCAATTCAGAAAATAACCTTGTTCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTTCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCAATT:1 + chr3L 149242 5' - invader2 436 1 69.50 ACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3L 4219470 5' + jockey 74 1 63.19 ATATTAAAAAACGTTTTATACCTCGTTAAGTTACGTTGGATTAAATTTAAGTAAATTACAAATAAATAAAATAACACAAATAAATATTAGTGTTATCGCTTTCTAGAACCGAGAAGTTAAGCCGGGACTCTCAACTTCACCACGAA:1 - chr3R 1878697 5' - Cr1a 4059 1 58.22 AAGATTAGTTTAAATGGTTGGCGACGTGCCTTTGCCCTCGTTTCGCAGTTGCAGCTGCAGCTGGTAACTGCATCCTGCCAGGTTATTATGACAAAGTGTTACAATGTATTGACGCTAAGTTAAA:1 - chr3L 15878017 5' - Stalker4 7005 4 66.13 ACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr2R 17878630 5' + Doc 62 1 57.78 ATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr3R 22642310 5' + blood 7100 2 76.03 AGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:3 - chr3L 18403029 5' - P-element 2792 1 21.23 ATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTAGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAAAA:2 + chr3L 25255424 5' + INE-1 312 1 64.38 AGAATAGAAAAAATTAACATCAGCTGGCTGTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGAATAACAGGTTTCAGGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTATGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 28146098 5' - roo 9037 1 51.15 TGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 - chr3R 14860218 5' + BS 5042 1 56.00 CATAAATCGCAAACGTGAGAGTGTCCATGTGGGCGTGACTTGCCAAACATCCTGCTATCCTAGCATCCTGGCATCCCGGCGGAGGAGCAACAGCAGCAGCGCCAAGCTGAAATTTACAAATTTAA:1 - chr3R 7717714 5' + Bari1 1448 1 67.20 GAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3R 17077182 5' + roo 8741 2 72.60 TGTTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTT:1 + chr2L 11256992 5' - rover 7255 2 55.48 TTTACATGATCCTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - chr2R 6847876 5' + Doc 18 1 75.38 CAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:3 - chr3L 14094666 5' + I-element 79 1 73.97 CAATATAATATAATATAATATATATAGAAGCATAATATGCTTCACATTTTTGCTTCCACTCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAGCTCTGTACATAAGCATGGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAA:2 + chr3L 20525227 5' + rover 7013 2 52.05 AATCGCGCTTCCCATTCCAACATTATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTT:1 + chrX 22641696 5' - G6 1982 1 49.32 GAATAAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chrX 19054206 5' + jockey 27 1 70.55 AATAAGAATAAATTGTAATCCATTGAGATAGAAGAGTGGTTAGTCCTCCAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATG:1 + chr3R 4557619 5' + Quasimodo 441 2 63.70 CGGAAGAGCCTAATAAAGACCTTGGAGGCCCTTAGAAATCGATCTATCAACAGCAGCTGAAGCGGAAGAAACCGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCCA:1 + chrX 5059639 5' + Idefix 185 1 60.00 GGGTGGGTGTTTTGGTTGTCTGTCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGCAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTGGTTATCTAAGGCG:1 + chr3R 3920526 5' + roo 8758 2 80.99 CATTGAGAGCTATATGCCGTAGTCGTCCCAGGTTTATCAAACAGAAATTATGTTGGAGTTTATTTAGTTAAACTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAT:1 - chr4 962917 5' - BS 5037 1 63.70 AATTGTTGATATAATTGTTTCAAAGGGTTGCAGTAATCAAACATGCTAAAGATTTTTAGATATAGCATTTAGATATAGATATAGCATTATTTCTAGTTCAACCAAAGATACTAGAATATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTT:2 - chrX 20145717 5' + Tc3 313 1 34.93 AGTCCATGCCGCAGGTAAGCCAGCCACGCATCCAGCGGAAGAGATGGAGGAGGGAATAGAGGTGCAGCAGGTACACGGAGAACAAAACTACAGCAACAAGATCAGAGATCAAGAACAAAAAGATCAAGGAATGA:1 - chr2R 13576019 5' - diver2 142 2 42.54 ATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTTAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTG:1 - chr3R 29091412 5' + F-element 4623 1 52.05 ATCACTTCATGTGAAGTAATTCAATTCGTTAGTGTTTCGGAAGCTCAAAGAAGATGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATAAGTTTTTTTTT:1 - chr2L 22252665 5' + FB 83 1 70.55 TGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGA:1 + chr3R 6625720 5' - flea 4935 1 75.34 ATGGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 11191355 5' - roo 9048 2 67.12 TCATACTTCTTCGCACAGCATTAAAATGAATAACAAAAGAGCGGCAGGAAATTTACATTTTCGGCCATCAAAACCAGCGCACTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAATCATTTTTGGCTG:1 - chr2R 19113783 5' - Cr1a 495 1 51.94 ATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCC:1 - chr2L 1924031 5' + G2 2979 1 70.00 CAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3L 15103780 5' - Transpac 279 2 63.57 AGCGCAGCCCCCAAATGCTTTTGTTATTTATTATCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2R 16817901 5' - 412 7524 2 55.56 AGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAGG:1 - chr2L 9636199 5' + 412 38 2 50.00 CCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGGGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGGGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chr3R 28469198 5' + 412 59 2 56.16 AAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTT:1 - chr2L 14147250 5' + transib2 2592 1 69.86 TGTATAAACAGCCTTTGTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chr2R 7244762 5' + diver 11 2 77.40 TAGGTGTTTAGATTGACAGCGAGAAACGCGCTTTCAATTTCAATATAAGATTCGCTTTCAACTTCAACCACTACAGCCCATGGAATATCCATGATATTGAAACAAAATCAAGCATATATTTATACATTTATACATATACATATATA:1 - chr2L 3703184 5' - Stalker4 245 4 76.71 TAAAGGACGTTAATCAACCATTGATTTATAGTATAAAGAAATCAAGAGGAAATTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACAACAGTCACGACATACGCCAGAAATCGTTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGAGACGTCACCTATC:1 + chr3L 23569267 5' + mariner2 756 1 71.23 ATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 - chr3R 23491955 5' - transib2 2801 1 57.55 ATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGGTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr2L 18226781 5' - roo 9003 2 65.75 AATGATCCTTGGGTTCAATGAAACATAATTCTTAAATTAATTTTCTTGGGAAAACCAACTATCTTATCATATCATAGCCAAAAGCAGATGGTTCCAGCCACCCTGTGGAGAGTGTAGTTGCATTTCCAGTAGTGTGTCACAATTAC:1 - chr3L 2121547 5' - baggins 61 1 59.59 TGGCCCGCCCAAGTGCTTTGTGTTTACCTATAGAGTGCGAAGGGCCAAAAACTTTTCCCTAGGTTTAGTTCAGTTCAGTACGGATCGTCGTGGTTCATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGGTATGTATGTGTGTG:1 + chr2L 13597842 5' - Quasimodo 46 2 73.91 GTTTCACTGTCATTTTAATTCAACGTTGCCGATTTTTATAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAA:1 + chr2R 13426134 5' + 1360 434 1 73.29 AAATCAGCAAAAATGGCAGCAGGCATGAGAATCTTGAATTGAGGTGTGTGTCGTGTTTGAATTATTTTTTTTATTTTTTTGGTGAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTTTTTTTGTTACCGTCTAAATTTGAAGG:1 - chr3L 2583784 5' + Tc1 1454 1 54.29 TCTTTTGGCCCCCTGAGCTAGGTCGAACTTCGATCTGTCCTTCATTGATCTTGTTGCACCTCCTTCTCCTCGAAGGAGCGAAAAAAAATGAAAAAAAAAAAGAAAA:1 + chrX 10811873 5' + Doc2-element 245 6 75.47 TAGGGAGAGGAGAACCCTAATTGAACTAGAATCTTAATTCGTGCAGTTTCGCCATTAGCAACAGACATTTCCATCGGATTTTATCTAAAATCAGACCACTTTGGACGAAAACACAAAATGAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAG:1 + chr3R 5682216 5' - Cr1a 367 1 58.90 TTTATTTGAAAGCAAACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 + chrX 19038316 5' - hopper 1406 2 76.71 AATAACACGAATCTAAAATCAAAAGAAAACCCTAGAAGGACAGCAATAAAAACGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAA:1 - chr3R 6799603 5' - FB 81 1 63.45 TTTTTTTTTTTGCAAGTCGATACAAATTTTTAAGACACGTTTTTAAAAAGTGTTGCCGAGGCAGCTTTACAAACTTACCCTGCGTATATGTCTCTGGAAGTTGCATGCTTAATCTCAGCATTATAGCTTTTATAGTTCCTG:1 - chrY 3652558 5' - INE-1 155 1 70.92 CAAACATACATATATAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTTCCGGGCAGCTTGAACCAAA:1 + chr2L 10164372 5' + hopper 477 1 77.92 AGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTG:1 + chr3R 18346609 5' - INE-1 539 1 47.95 AATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATAT:2 + chr3R 29690712 5' + I-element 5268 1 63.70 TATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTCTGTAAGAAAATTGATTCTATCTGGAAATATCTTCGGTTTAACTCGGTG:1 + chr3R 11191407 5' - roo 342 2 57.66 TAATGAAAGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chrX 4808633 5' + mdg3 41 2 58.90 GGCAAACAAAAATGGCCTAATAAAATTATAATAGTCAGGCCGCGAATTTTTAAAAATT:2 + chr2L 7664605 5' + 1360 3082 1 81.03 ATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 - chr2R 21410959 5' + Burdock 6207 2 66.44 AAAATACACGGCATTACGACACAAAACCAAATTCCCCCCCCAACAAAAAAGCCTTCTCGTTCGCCAGGGAAAAACTCTTCAGGCCGCATGATTCGACAGAAAAGAAAATCCTTACCAAAAGTGTAAATTTATAAAAAAAAAAAGAA:2 + chr3L 5204158 5' + TART-C 11097 1 72.60 AAAACCGACCCAATACAAAACCACTACAACCCCCTGTAATTTAAACAACAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 - chr3R 14830929 5' + I-element 4938 1 66.44 GCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTAC:1 + chr2R 5206901 5' + Doc4-element 71 1 68.49 AAACAACAAAAAAAATTCTTACAAATGGCACCTCCCACGCCAATAAACAACCATTAATGCGGTGCCCAAACCTCCACGAATCACCCCACCAACGATGCGTCTCAACAACATCCCGTTCGTCTGATGACCGCTCGAGGACAAGCGT:1 + chr2L 22974996 5' + HMS-Beagle 6759 1 55.86 GTGTGTTCCAATTTATTTTTGCGTTTGTCAAAACCAGTGACGGTTTTTAATACATTCTTTAATAATTCTCCTCTTATGTATTTGTCTTTTTGTTTTGTTCACTCTCCCTTTTGAGCGTTGTTCGCAATGCTGTTTGGTGCTGTTTT:1 - chr2R 4350397 5' + Cr1a 243 1 74.66 AACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2R 20010185 5' - Juan 4171 1 52.52 AAGAGTTTTAGAATTGGGCCATGAAGGACATCCTGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTA:1 - chr2L 22738399 5' - F-element 178 1 73.97 ATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 - chr3L 17940191 5' - 1360 3325 1 64.14 ATTGCTTAATAAACCTCGTCCTTTAATTACTTAAGATTTTTTGTTTTTTACTTTTTTTCAGATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 25514153 5' + FB 173 2 53.42 AACCGGGTCAAGCCTCCTTTAATCCCAACTATCCCGGCAAGTTGATATCCCAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGATATCTGCAAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACTAAAGAATT:1 - chr2L 37207 5' + hopper 423 1 55.12 TCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chrX 8092370 5' - pogo 2054 1 53.42 AATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3R 7420177 5' - 1360 3354 1 60.27 AACGTATACGTAATTTCCTATTTATGTATGTGCTAAGTATATTACTGTACATGTTAAGTTAAGTGTTAATTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCG:1 + chr3R 24690004 5' - FB 155 1 52.05 GAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chrX 9530421 5' + 297 55 2 60.27 TCCTATCCCGTTGTAAATCGTCACAGTCTGTGCGTCGGTGTAGTTAGTTATTTCAATGAGTCCATTTGCCGAGTTATGGGTGATAGACCGCTCGCTCATTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTG:1 - chr3L 26386123 5' - Doc2-element 321 1 51.13 ATTATCATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2L 12818359 5' + hobo 34 1 60.96 AAGAAAGGATTAGAAATTTGCTAGCTAAACACTGGCCTAATTGAGCTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATA:1 + chr2R 5296632 5' - INE-1 83 1 66.22 AATATGGAAGGCTAGATTTGGAAAACTAGTGCCTCTTCTCACATGGCACACAAGTTAGAAACTGAAGATACGATACGATACGATACAATACTGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGT:1 - chrX 2673785 5' + invader4 247 2 64.38 TATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2R 21410997 5' + Burdock 6169 2 62.33 GACACCACTCCACGGGAAGGTTAATCGCTTCCCGGCCGGACATTGGCCACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGTCCACGCACTGTAGTTCTCATCATCAAGTTTTTCTATTTG:1 + chr2L 11339522 5' - Dm88 335 1 64.23 TTTTCATTGCAAATTGTACAATTTTTTATACATTCCTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATATAATCTATTGATTTGTTTGTAATTTTCATCTAAACCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr3L 26505825 5' + copia 4886 2 73.97 ACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2L 15076188 5' + 1360 46 1 48.63 AATATATTTAAAATCTGTAGATTTTTTTTTTCATTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:4 - chr3R 7317712 5' - I-element 5339 1 71.92 TACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 18549928 5' - roo 9010 2 58.22 GCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1 + chr2R 3338792 5' + Juan 68 1 63.01 ATACACGCCCTACAGTTGAGCCCTGTAACTCTTGTACCTCGTACCTCATCCATCGCAAATAGATCGACAATCAGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 17077048 5' - roo 397 1 76.03 TGGTACCATTTCCATAAAGAGGAAGTTGGAGTTATTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCCTTTAACAGCTCGCTTGAATGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCG:1 + chr3R 29288558 5' + Cr1a 423 1 73.68 ATTTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCAC:1 + chr3R 7819170 5' - invader3 5395 2 54.44 AATTTAAATTTAAATATTATGTTACTTTACGTTACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTACTTTGTCTCATCGCTGGATACCAAGTCATCGCTCAACTATACCTTAAAATTACTCACCAAAACTATTTTCTC:1 + chrX 16858026 5' + TART-A 13076 1 53.42 ATCGTATTTCGTTAATGGGCGGGAAATGCAACTGTCGCCGCACACGAATGTCAAGGAAAACACCGGCGTACATAAGTAAGTCGTCTTCTTACACAAGTACGCACACATATACACGTTATCGTCTCTTGTTTTCACTGACACAAGCA:1 - chr3L 7598027 5' + 1360 3247 1 53.42 AGTACCGACTTTTAGGTACCTCTACAAATAATTTAATGGTAATATTATAAGAAATGAATATGTTCATTATATATTTATTTCTAGTGTACGAAAACCGATTTAAAATGCTTGTATAATCCACACAAGCTGAATAAATATAAATAAAT:1 - chr2R 16726845 5' + Burdock 306 1 68.49 AAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGGGGCTCCAGGCTCTCCCGCATTTTTGTT:1 + chr2R 8047276 5' + 1360 84 1 71.92 ATCCTGCGGAATAAGAACAAGGATAAGGCAGGTGGTCCGGAAATAGTTGACAATGCACCGCCAAGAACCCTACAAGATTTAAAAACCATCATCCAAGAAGAAATTGCCAACATAACACCTGTTATGCTAACAAGAGTCACGACAAA:1 - chr3L 14192649 5' + mariner2 705 1 54.79 AGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCA:1 - chr2R 6271505 5' - rover 6919 1 78.08 AGGGAGAGAATGAGGTGGGAAAACACGCCCCCCCTCATATTAAAGCGTGTAATTAGTTTTGGGTAGATATCCCCCAGGGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTAC:1 - chr3L 523538 5' - Transpac 5019 2 52.74 ATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr3R 7666628 5' + I-element 56 1 52.05 ATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2L 210747 5' + jockey 14 1 79.45 GACCAAGGACAACTGTAGTGACAACAACGACTCAAAAACGCAGTACGACAACTCACAACACCTCACCAGATACAAAAACAACAATAAGATCTACAACGCTTTCTCCGAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAA:1 - chrX 1556353 5' + I-element 415 1 77.40 TTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:1 - chr3L 11844838 5' + rover 30 2 58.82 GAAAACGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:2 - chr2L 12984248 5' + hopper 32 1 62.76 ATTTTGTTGATAGTTGAAGTTGGCCGATGGCGTCTTCAAAGGATCCGTCTTTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGGACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGGTT:1 + chr3R 2724356 5' - Ivk 4934 1 63.01 TTTAACTGCGTAAGCATTCGGGTGTCATTGGTCGCGACTAAGAGATCGTCTATTCCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTC:1 + chr2R 3118730 5' - F-element 32 1 60.96 GACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAAT:1 - chr3L 21327149 5' + copia 86 2 75.34 GGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chr3R 30059479 5' + FB 71 1 67.12 GAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3R 22642262 5' + blood 21 2 65.08 AATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1 + chr3R 19224994 5' + HMS-Beagle 47 2 57.36 GTTCTTCTTGGCGGAAGTCACTTTACAATCTATGGTAATTACAAGAGTTTGGAGACGAGACCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCC:1 - chr3R 30574137 5' + F-element 431 1 64.52 TCATCGACGCGGCGCGCGTTTTAAACGCGTTTCTCCTGCTTTTCGTGTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 - chr2L 4180540 5' - jockey 4918 1 67.81 AAACTATGTAAATTTAATTTAATTTCTTAGACAACATTTCTTTAATGAAATCGAATTTGTATCATTTATTTTGCAAGCCCCTACAATTGGGGGTTTGAACTCGACTTAGGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGA:1 - chr3L 9864452 5' + jockey 4638 1 68.49 ATAATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chr2L 17180163 5' + Juan 44 1 44.52 ATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:3 + chr3L 15913820 5' + jockey 4792 1 61.64 ATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAG:1 + chr2L 16539628 5' - Juan 4177 1 60.96 ATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAG:1 - chr2R 8157256 5' + mdg1 7116 2 72.41 GAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGGACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGGTTCCCTCCAAAA:1 + chr3R 9557502 5' + G2 3004 1 60.00 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTATTGGAGTCGTCGGCTTTAGATGTCCTGGAATAACCAAAAGGACAACAACAAATTGCAGTAAACAGTAGAAAAAGTAGCCAAATGTGTAGGTCTGAGAGTACAAGAGAGAAAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 5' - blood 169 2 72.41 GTCAGACTGACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - 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X-element 4661 1 53.42 GACGTAATTTGTGTATTTATTCTAAAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chr2L 6647775 5' + mdg3 5270 2 73.97 CATTGGGCAACGCCCTGAACCTATCCGATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCT:1 - chr2R 11795036 5' + opus 7036 4 68.48 GTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr3R 16157364 5' + pogo 77 1 73.72 AAATCATCTAACTATTTTTCACATGTCGGTAAAAATTTGTTTTATATTTTTTACGGTTTTATTGACTTAGTAATAACAGTTGAATATCCAGACCTCATTTAAATTTATTGTAAATATATTTCAAATTCAAATTCAAATT:1 + chr3L 14920332 5' + Rt1a 310 2 52.52 AGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 29084966 5' + 412 80 2 73.79 GGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAG:1 - chr2R 2318254 5' + ZAM 46 2 54.11 ATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTCC:1 - chrX 20373674 5' + 297 14 2 66.34 AAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAA:1 + chr2R 3338783 5' + Juan 57 1 56.25 CATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2R 21116476 5' - mdg1 364 2 59.59 AACTGAACTTAATCTAAATTCAATTTGGATTTAAAACAATCTCAATGAAATCGCAAGCGCAAACAACAACAAAATAACCGACAAAAAAAGAAAAGAAAAACAAAACTGCGCATGAGAAAAATGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAA:1 + chrX 3488634 5' + hobo 2716 1 67.81 TCTGACAAAATAGCAATTTGCGTTTTCCAACAAAACGATACGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 - chr3L 17183774 5' - diver 173 2 52.05 GTTACAATAGCCGTGTTAATTTATTATGTATATTTATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:1 - 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Porto1 219 1 66.92 AGGCGCGATACTTCGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chrX 696498 5' + FB 50 1 59.06 TAGTAAGGGGTGATTTCACTTCAATGGTCTTCATGGGCAGGGAATGATGTTAAATTTTAATTAAAAATTTGAATTCCCATAACTTATCAAATACTTATCAAACCACTGGTAGACCAAACATCCGTCTCCTAATTTAAACAATTCCT:1 + chr3L 1712166 5' + Idefix 7017 2 67.12 ACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 21224611 5' - roo 354 2 70.00 ATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACG:1 - chr2L 23400821 5' + S-element 70 1 66.44 TTTAGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 16564611 5' - roo 393 1 68.49 GTTTATGCGCAGCGAATTGCTGTGAAACCCAAATAAAACAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGT:1 - chr3L 16437312 5' + F-element 8 1 73.29 ACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3R 13973072 5' - 412 476 2 67.74 TTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGTAATA:1 + chr2L 9636108 5' - 412 7500 2 61.62 CTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 - chrX 17717076 5' + FB 79 1 72.54 GGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 18396166 5' + roo 75 2 72.41 GAAAATGAACAAAACGGAAAGAGCTAATTGAAATCCCTCCCCCTGCGATAATGCGATAATTTAAGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCT:1 - chrX 16557178 5' + Doc2-element 4571 1 57.48 TATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr3L 12315851 5' - transib2 2791 1 63.01 AATAAGATTCAAAGTGTTATGTGTGTATATGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAA:1 - chrX 6465861 5' - G2 2938 1 63.41 GTATAATAAGCCTAATCGAGTTATCATTTTCAGCGCCAGGACTAGTGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAAATTTTTTTAAAAATTCGCGTCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTT:1 - chr3L 25076600 5' - 1360 3011 1 68.28 GGGCAAAAATAGCAAACCAGTTACGTCAAGAGCTCACACTTAAGTCAACATACTCACTTGGCCAAGTAAGGTTATTAAAACATTTGCCAGTCTCAGCGCTAGCCCC:1 + chr2L 20029693 5' + Ivk 230 1 77.36 CTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGC:1 + chr2L 4713877 5' - transib2 2745 1 71.92 AGATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chr2L 22674852 5' - mdg1 345 2 76.52 TTTCAAGTTATTTTATAATAAATAACCTTCTAAAAGTCGAACAAAAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 18488328 5' + roo 24 2 63.01 AATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAA:1 - chrX 22824260 5' - Gypsy12A_LTR 2241 1 54.48 ACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 + chrX 19038364 5' - hopper 1358 1 58.22 CCTTACTTGCAGTTTAATGGCACCATTGTTTGCCAAAATCCATGGCATTCGAAAGTAACCAAAAAAAATAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGAT:1 + chrX 10841955 5' + G6 1878 1 69.30 CTGTATTATTTTCTTCAAAACTTCACACTGCAATGTATTGTAATGATGAACTGCCGTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 + chr2L 12250917 5' - 412 407 2 72.60 GTTCGTCCATAAAATGTACCCAACAGGCTGTTGCATACTTCATGGCTTTAAGAACACACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 19896329 5' - hobo 2915 1 53.70 AACTGGGCACAAATATACCGGCCTGGGTACTTACACCTATATGTACGTACATATATGCTAAGACTGCTATTGTATATGAGGGGGAGCTATGTGCATATATATATATGTATGTATATATATGTATATATGTATATATGTATATGTAT:1 + chr2R 17785047 5' + G3 4507 1 80.14 CATGTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr2L 7581044 5' - Transpac 5198 2 60.27 TAGTCCATAACAAGGAGTATAAAGCGAAAAGAGCACGTCACATAAATAAGATACGTTGTGGTGCAAATATTATATATTATATTATTATATTATATAACCACCATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGT:1 + chr3L 23742965 5' + G3 4507 2 54.79 AATATAAATGTTGCTTTGTGAACTTGTTATAATTGCGCTGTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAGTGTGGTCCCGTCGTAAGCAGAAGCTTACCGAA:1 + chr2L 9782044 5' + P-element 29 1 63.77 TTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGAA:1 - chr2R 21410958 5' + Burdock 71 2 65.52 ATAGTGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGTT:1 + chr4 699131 5' + 1360 3103 1 92.68 ATTAATAAACTTACCATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGTATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGC:1 + chrX 23338830 5' - GATE 375 1 50.68 AAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAAC:1 + chr2R 5070933 5' + Tirant 19 2 31.88 AATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCA:1 - chr3R 15790128 5' + flea 4724 1 72.73 ATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCT:1 + chr2R 10417157 5' - 1360 3321 1 73.64 TAATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACA:2 - chrX 19980721 5' + X-element 4514 1 53.79 GTCATCGTCTTATCATATTATAAGTAAAATATCGTAGTAGATATGCTTCCGACCGTCCACCTTTTATTATTATTTCCCAACTTCTACCGATACTCCCAGAAAGTATTGAAATCTTTTACACTTACAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 + chr4 630423 5' + INE-1 544 1 57.53 ACCATAAAACGCAAAGTTAACGCCGACGATCTGTAGAATGGTCTTTAGGGGTTAATAGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:2 - chr3L 47055 5' + FB 12 1 74.66 GGTCTCCCTGGATTTGGAAATCGCCGCATACGACAAGCTGCTGGTGGGCGAGGAGGCTCGTTTGAACATCACCCCAGCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGGGATATTTCTTTAAA:1 + chr2L 5544806 5' + I-element 5020 1 59.59 ATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr3R 8890116 5' + FB 62 1 59.59 AGAAGGGAATTTTAATGTTAAAAAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:2 + chr3R 18971675 5' - Juan 4184 1 56.16 GTATTTATTCATTACGGTGGCAAAATGTAGTATACTTTTGGGCGGCGGAAGGATTGGGACAAATGTCTGGTGGTAGTTTGAAAACCGAAAATTTTCAACTTACTTAAATAAAATATTAATTACTTACTTAAAATATTACTTACTTA:1 + chrX 2679566 5' - Stalker3T 43 1 58.22 GATGTTTTATTTTAGCTTTTGTGCCACGTTTGCTCTTATTAGCATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chrX 17343334 5' + I-element 10 1 76.71 AAATGCTCTGAAATAATTAAACATAAACATTCTAAGGATTGCTATAAAAAAAAGAACTTTCTAACATACAAACAATTTTTTTAGTTTTAAAAAGGATCACTATTGTTATAATGTTTTGATTTATAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGCT:1 - chr3L 6837827 5' - 1360 3025 1 77.40 ATAATACCCCGAAATGCTTCTGCGTTTGTTCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACA:1 + chr3L 23249346 5' + rover 21 2 71.92 GCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 + chr3L 3501716 5' + Bari1 46 1 56.25 AAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGTTGCCGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr3R 13406405 5' - pogo 2048 1 54.79 CCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:2 + chr2R 14051723 5' - roo 9038 1 56.85 TAGGCTGGCCCAGGCTAATGTCCCATTGTTAAGGCTTCCATTTCGCCGTTAGGCAAGTGGCGATGGACCACAATGAAAAACTAACGGGATTTTTTTTTTCCTATCTACACATTCAATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAA:1 + chr3R 24989054 5' - HB 89 1 52.14 CTTCCTCCAAGAGTTATTATCATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2L 12818374 5' + hobo 19 1 71.23 ACATACATAAAATAAAATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr3L 22035715 5' + F-element 15 1 76.71 TTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTT:1 - chr2L 23295881 5' + micropia 5013 4 57.93 CTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 2989928 5' - roo 354 2 54.79 ATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:4 - chr2L 13556453 5' + transib2 50 1 51.37 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGGGAGGAAAAACAAGAGA:1 + chr2R 5260087 5' - 1360 3244 1 77.22 ACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAA:1 + chr2R 15004733 5' - BS 5059 1 43.45 AAAACCTTTTCCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr2R 12779613 5' - I-element 5304 1 50.68 GGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 - chr2L 4003757 5' - mdg1 7370 2 77.40 TACTACAGATTACGCATACCAAGATATTTTGTCTGAAGGATAATTATACCCGTTACTCGTAAAGTGAAAGGGTACACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGGAGAAGGAAGCGTTACCGTATGAACTTCGAGATCTCAGGAAC:1 + chr2L 23001111 5' + INE-1 140 1 63.01 ATTAGCATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAA:1 - chr3L 19350068 5' + 1360 3197 1 72.34 ATGAAAAACCAAAAAAACACACTATATGAACAATGGTGGAACGTTCAAAAGAAACATATTATTTTGTATTGTTTTAGAACACATTTTTGATCAATTCATTGCTAATTTCCAGTAAATATGCAATATATAAATATATAAATATATAA:1 + chrX 3764911 5' + Stalker 91 4 72.60 TGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 26178468 5' + 412 66 2 62.07 TTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGA:1 + chr2L 16943818 5' + copia 4951 2 73.29 GGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTT:3 + chr2R 3338786 5' + Juan 62 1 58.90 GAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:2 - chr2R 20349034 5' - transib2 2741 1 74.66 GTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chr3L 16662355 5' - 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P-element 2605 1 60.96 ACAGGTGTACCCTGTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTC:1 - chr3R 27083174 5' + jockey 4539 1 75.52 TTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 25616515 5' - roo 9002 2 65.75 AAGTCGCACGAATGTAGCGACATTTGCAACAGGATTTGCCTTCATCGACAGCCAACGCAGATGGCCGTCCTCGAAACTTGAATTTCCATTAGCGGTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2L 5582063 5' - pogo 2085 1 72.14 ACATTTAAAATTTGGCACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 - chr2L 16943923 5' - copia 254 1 59.59 ACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:2 - chr2R 4206658 5' + 1360 320 1 72.60 CTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACG:1 + chr3R 19450194 5' + roo 9042 1 53.85 GTACTACGATCAGGGGCAGCCGCGGGGCGGTTTGCCCCGCCCCCGAGACAAAAGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAAAAT:1 + chr3L 13255712 5' + 1360 201 1 51.00 ATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - 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chrX 7795583 5' - roo 8981 2 80.14 AACGAATGACATATTGCTGGATCTGTTGCATCCAGAACATAACAAAATTTACGCATCTTTGTTCTTTTTTCTTCGAATTTTAAGCTTCCATCTGCATTGACTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTA:1 + chrX 19980788 5' + X-element 4580 1 76.03 TTTATATTTTATATTTTATATATTTTATATTTATATATATGGTAATTTATTAAGAACAAAATATAATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTAAGAATAAAATCTAAAT:1 - chr3R 15039856 5' - Quasimodo 7268 2 56.85 TATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAATTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 - chrX 19588107 5' - roo 314 2 78.77 AATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCAT:1 - chr2L 4034963 5' - TAHRE 10400 1 74.66 TAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:1 - chr2L 17005806 5' + Stalker2 60 2 57.53 AAAACCCAAAGGGTTAAAATAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTGACAAT:1 + chrX 21224496 5' + roo 19 2 72.60 ATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCT:1 + chr3R 21276488 5' + BS 5012 1 70.55 AATGCTTCTGCGTTTGTTCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACAT:2 + chr3L 23249358 5' + rover 6984 2 63.70 TTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - 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transib3 2733 1 73.29 ACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTACGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 8360535 5' + roo 8725 2 63.04 GAGGTTAAATTAAATTAGATATTCTCGCAGGTTCGTTAGTTGTGTAAAAGCAACAGGCACATACACACACACATACACA:1 - chr3R 5600185 5' + accord 253 2 89.87 CTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 + chr3R 27083061 5' - jockey 4910 1 76.03 ACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTGTTCTTC:1 - chr2L 17180133 5' + Juan 74 1 63.70 AAACAAAAAGCCCACAGCAAGTATAACATGTTAATTAACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 + chr3L 18505612 5' - I-element 5326 1 69.18 TTATCGGGTTACACTTTTCTATCTGCTCGGCTGATTGACTTGCTCTTGCATGAATTGCTCCAAAGGACCGCGTTAATATATTAATTAATTTGCTATAA:1 - chr3R 26554240 5' - gtwin 38 2 89.80 ATGCTATCCATTGAAAATCCCTTCTTGTAGTACCAAAAAGATTTCTTCATTGGGTAACAGTTGACTAACACTTTAGGTCGACCATAAGTACTCGACCATAAGACACTTCAATAGCTTGATGATATTTTGTTTTCTTTTTTTTTTAT:1 - chr2L 16769026 5' - Rt1a 5079 8 48.63 CTGTGCAGCAGGCCATGAAAATGTGTGTGCATGAATGGGGCATACATGTCGTATATATATATATATATATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 + chr2R 18752601 5' + jockey 4806 1 68.49 GAAGAATAACCAAAAAAAATGAAACCCTGAAGAAAAACAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGG:2 - chrX 6629085 5' + P-element 232 1 31.51 AATAGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGGGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCTATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 - chr3R 30059482 5' + FB 64 1 61.97 AAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 + chr3R 17421241 5' + pogo 80 1 71.23 ATGTGTATCGAAACGGAGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 809610 5' + jockey 18 1 72.22 ACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGTGCTTACAGCT:1 + chr3L 18505649 5' - 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chr3L 14720918 5' + F-element 66 1 50.68 CTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTCGTTG:1 + chr2R 14051733 5' - roo 396 1 63.48 AATGAGGTTAAAAAAACGTCAATTAATTCCAACAGTTTTTCCTACTGCATTTTTGTTGCTTTGTACACTCCCCCCCAGGCCTCACTGTATCCTTGTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTAAG:1 - chr3R 23667525 5' + jockey2 3299 1 63.70 GGGAGTCAATCAATTCGGATGTGGCCTCCCCGGCTGAGGGCTCCGTGTGAATTATGTGGCGATAAACTTGGCCAGGATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGTGTGGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3L 1691974 5' + blood 7027 2 73.29 ACAACTTTACTCTATATTCCGATTGATATATATATATATATATATATATATATATTTTATATATTTTGTATATAGTTTTGATTGTTTTTTTTGTTTTT:1 - chr3L 15707912 5' - transib2 2642 1 42.86 TTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr3R 11937257 5' + flea 4773 2 76.03 GGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - 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invader2 5050 2 55.48 GTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGGTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTA:1 - chr2L 21930231 5' - Copia1_DM 68 1 69.86 AATATTTTATGGCCCCAGCCGAATGGCAACCGAAAAATGTTTTTGGCTTTAAAACGAGCAGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chrX 959121 5' + 412 32 2 63.19 ACTTTTCCGAGTGCACTGCATCAAAGTCAAAATGGCGGTCGAGTGTGTTTGTGGAAGAAGTGAGACAAATACCGCCATAATTCCTTTCTAAAGAGGCATTAGACATTTAATATTTATGCATTTTTTTTAAGTTAATTGTAATTCAA:1 + chr3R 19533146 5' + Juan 4008 1 69.86 TCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chr2L 21328149 5' - 297 340 2 63.70 AAGCTCGTTAGCCGGTTAACGGTCGAGGTAGAGAGTTACCATCATGTTGTATGGTCATGAGATAAGACACTTCAGACAGCACTTCATGTTTATGGCGTGCCTTCTTCCCCTTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 - chr2L 18570885 5' + jockey 4787 1 80.14 ATATCAGATTGTCTCATTTGTTCCATTGCAACCTATTGGTTTTAATACCCAAATAGGTGTAAAACTTCTATGTTTTCGAGATTGGCTATATTTCATAGCCAATACATATACATACATAAATATATATTATATATACATATATATTT:4 + chrX 20113091 5' - Dm88 18 2 78.77 GACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACACCGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTG:1 - chr3R 11040150 5' - Bari1 1650 1 58.96 CCATGGACTAGAGTTGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:2 + chr3R 23618103 5' - hopper 1376 1 58.90 TACTATGCGAAAATCCAAATAAATATGAAAGTGAACACAAAAAAAAAGCCCAACAATGTTATCTTAATTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACA:1 - chr2L 7098204 5' - G6 1970 1 51.37 GGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 - chr3R 11040163 5' + Bari1 46 1 51.85 ACATGAGCCGAGTTCGACATGAAGTCACACAAAAAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACT:1 - chr2L 15501685 5' - Transpac 5143 2 68.52 AAGAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:3 + chr3R 16630236 5' + FB 31 1 62.33 AAAAAATTTATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:2 + chr2L 7660871 5' - I-element 5334 1 68.49 AAGTAAAGAGGAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTTTGGGTAAACACAAGT:1 - chr3L 21655996 5' + HMS-Beagle2 6929 2 52.74 AGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACG:1 + chr3R 26504206 5' + HMS-Beagle 51 2 54.86 CTATTGTGGCACCAAAAAGTATTCACATGAACAAAACCCTTATACGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAA:1 + chrX 16823496 5' + I-element 160 1 78.77 ACCTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2R 9871558 5' + roo 8733 2 66.44 TAATATATTTTGACACACAGGGATGCACTTTAACTCTTAGTCGGTTAGGTACGGGCAAAGACCCTAGAATCACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCTTGGCT:1 + chr3R 2308622 5' + 1360 49 1 76.80 AATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1 + chr3R 556402 5' - Juan 4127 1 77.40 CCTCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCC:1 - chrX 5627071 5' + Cr1a 298 1 86.49 CCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 7795528 5' + roo 60 2 71.32 AAATTTGTTCTAAATGGCAAGTCATCCTTATGATCTAGTTAAATATGTAGATGCCTTGTCTATATCGTGGCAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGGTTGCACTATGGGCCTCGCAACT:1 - chr2L 22743414 5' - diver2 85 2 51.37 ACTTTCGTTCGCTTTCTCCCACGGAGTAGGCGGGTTGTGTGGTAAATCGAAGTTTAACGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGACAGAGAACGGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chrX 20455756 5' + hobo 24 1 66.90 ATTAGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATGCAG:1 - chr3L 5881698 5' - pogo 2070 1 61.48 CTTGAAATGACATCTAGAAAGTATTACTTTTGAATTTCTTAATTTTTTTTACTTTGCTTGTATTTATTGAATCTTCTTGTATAATAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGGACAGTTGTATTATT:1 + chr2R 5374773 5' - F-element 4590 1 68.49 CCATAGGGCGGCAGAAAGCGATATGGAAACGGAAAAAAAACAAGAGACGAGAACGTATATGTGTGCGTGTTGTGTTAGAAGACGATTTCCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTATATATTAGGGTAG:1 - chrX 21379793 5' - 1360 3143 1 71.23 CTCGCCCATCGCCCATGTCATGCATGCATAAGCGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 + chr2L 17205192 5' + hopper 77 1 68.97 ACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:3 + chrX 18817258 5' - transib2 2782 1 56.85 AAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAA:2 - chr3R 4682988 5' - Burdock 6331 2 64.38 TTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2R 16510083 5' + F-element 56 1 45.21 TATAGGAACGTAATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGTATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 - chr2L 11257145 5' + rover 28 2 67.12 ATGCTTTTGTATTGTACGATCGCAATAGTGCTTAGTTTTTTCTAAGAGGAAATCAAAGAAATAAAAATGAACTGAAAATGGATCTGACAAAATGGTAAAAAGTGCTTAGCGTGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGGTGGCA:1 + chr3R 3511570 5' + Tc1-2 188 1 80.14 ACTTTTGGAATCAAGCGTAATGCAGCGAAACACAACCCTGCACAAAGACCTAACACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGCCTGGAGCGCCACATAA:1 - chr3L 23224498 5' + X-element 4422 1 74.40 GTGTAATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr3R 27082996 5' - jockey 4975 1 69.18 ATTATCATATAGAGAAGAAAAGCTATAATTTGATTTAATTTTCAAATACCGAATTAAGGATACTTTTTATGATTTAATGGTTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACACTATGTTATACCCAATCATTTATG:1 - chr2R 12367050 5' - Stalker 6884 4 57.34 AACTCCGAAATTATTACGAGTGACTTTTTACAAATTCATTTCCGATTTAAACCCGATCGAAAACCTGTAGGGGGACATTAAACAATATGTGTCGAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCAT:1 - chr2L 22093900 5' + HB 1228 1 71.92 TATATGAACAAAACAATCAGGAGAAACGCTATATTAGATAAGAGAAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chrX 20373553 5' - 297 6949 2 54.86 TGAGTTTTCAAACAATTTGTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTT:1 + chrX 2479460 5' - mdg3 5465 2 56.16 ACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGGGATGGGAGTCAATAATGACTTTATT:1 - chr3L 25482969 5' - accord 461 2 71.33 CTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGCTGGGTTGGGCCACCCCAATACGTCACTCCCCTTCCC:1 + chr3R 10931729 5' - 297 6573 1 50.00 AGTAATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr3R 7666606 5' + I-element 34 1 60.96 TCCAAAGGCCACATAATCCATTTAAAATGCATGAATAAATAATAGGCCTATTTAGAAGATTATCCTCGTTGTCAATAACTAATAACTATTTCGGCTGCATTCACCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATA:1 - chr3R 11522396 5' + Tabor 242 2 71.23 AAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAG:1 - chr3L 23839744 5' + 17.6 6959 1 70.34 GAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGNCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 + chr3R 4860436 5' - Transpac 5163 2 64.38 ATTTAATAACGATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATA:1 + chrX 14722089 5' - diver 182 2 56.85 AGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:2 + chr3L 12315706 5' + transib2 45 1 54.79 ACTATCATATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2R 11804751 5' + pogo 39 1 57.53 GTGGCAGGTAACTCACACTGTTTTTTAACCCACTCCGGGAAAGCGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 3233943 5' + roo 8714 2 52.05 CTGGGCACAAATATACCGGCCTGGGTACTTACACCTATATGTACGTACATATATGCTAAGACTGCTATTGTATATGAGGGGGGAGCTATGTGCATATATATATATGTATGTATATATATGTATATATGTATATATGTATATGTAT:1 + chr2R 17785049 5' + G3 4507 1 78.62 TGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGGTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCTAGTG:1 + chr2R 9966973 5' + Bari1 55 1 51.37 ATTACGTAATCGCTTCTTCAAAAATCAATCCACGAAATGGCCAGATCTGATGATTATTCACTATGCCACCGCCGATTTCGCTTTCTTTTGCGATTCGAATGCGTCATGATCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAA:1 + chr3L 4119333 5' + Juan 271 1 74.66 AGTTTGAGAAAAAGATCCACTAAAGTCAAATAATAAGATTATACGGTACAAAAATCTTAACAATAATTACTCTGTTAAAATAAAATTTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGC:1 - 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chrX 12986617 5' + roo 8739 2 71.03 ATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 4341288 5' - roo 320 2 77.93 AATTAAACAATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCAACGGGATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTTAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTG:1 - chr3R 1960330 5' - gypsy9 5180 2 57.53 CTGGAACTGAAACAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 29611969 5' + jockey 29 1 69.86 TAAAAACGGTGTAAAAATTCACGTAGCACAGTCACAAAATTGCAATATTTTTTCCATTTTTTTCTTTTTTTTTTTAATAATATATTTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCAAACCCGTCTTCCTCTTCACAAT:1 - chrX 12121494 5' + hopper 220 1 60.27 CCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAAC:2 - chr3L 3501871 5' - Bari1 1700 1 73.97 TACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chrY 311462 5' + 1360 2 2 53.42 ACCAAATTACTTGATGCTCTGGTTTTTGGCTGAATACACACACACACACACATATGCACGTACACACACACACACACACATCTGC:1 - chr2L 12813717 5' + accord 7031 2 75.29 TTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2R 7850040 5' - roo 354 2 51.37 AGAGTGTATTTCCAAGACTTTTCTTTCATTATTTTTTTATTTTTTTTT:1 + chr2R 14773308 5' + hopper 142 4 87.50 AAACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCT:1 - chr3L 18505778 5' + I-element 25 1 68.49 ACAGATGTGTTAGTATGTACAGCCTCGGCCAACGTAATAGCTCCGATTTATATCCTAATGTTTTAAGTTAACTGTTCTTGTTCTAAAGTGTCGGTTGACATATTGCATTGAGAAG:1 + chr3L 15494276 5' + Dm88 4336 1 70.43 AGGTCGAAAAAATACAGTAAACATTGGTTAGAGATGAAACAAAGCGGAAAATCGGCGACATTCCTTTGATTTCAATATATAAAAAGGTTTTAAGGGAAAATTTTTTTTTTTATTTTTTAAA:1 - chr3L 10660255 5' - TART-C 11100 2 79.34 AGCAACAGCTCTCTCAACCACCAGCCAAACCACCCAGGACATCGTTGACACCACTTCAGCCGAGAAGCATGATGATACCTCCACCAACAACAGCTGGAGATACACCGACAGCCCGCTCTACCTCG:1 - chr3L 14415905 5' + F-element 443 1 67.20 TTTGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCATTGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGAT:1 + chr2L 12460698 5' - Porto1 297 1 68.97 CACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCT:1 - chr2L 21403544 5' + G5 4455 1 68.97 ATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATA:5 - chrX 23182954 5' + Idefix 14 2 63.01 AGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAA:1 - chr3R 20441316 5' + I-element 67 1 60.00 CTGATTGTTGCAGCAGCTGTTGCATTCCGGTTGCTGATTATATAGTTTTTCGCTTCGATCACGGACCGTTGTCATAAAAGTCAATCTCATTCCGACATGTCTTGACCCTTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTG:1 - chr2L 13730325 5' - baggins 5047 1 78.08 TAGTATAATTTAAGTTTTTTCGATTCATTTCGAAAAAAATTAGATGTTTAACACTTTTATATTTAAATTAGAATATTTATATATTTCATCGTCTTGAGCCGTACGATACGCGGCTGCGCCCCTCG:1 + chr3L 22464819 5' + Cr1a 4403 1 62.40 ACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr2R 4362743 5' + F-element 27 1 65.75 TGCAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3R 13406391 5' - pogo 2062 1 57.53 GTATTAATTTCATGTAGACATCTTATAAACACAACCCTTTTTTTAAAGGTAGAACGAATACGGTAATAACATATAAATATTGCAAAAGTTCATTGCGGTTATTAAAGGCCTTGAGCCTGAAATAAATCCTGAGGAAATATCAGGAG:1 + chr3R 869301 5' + Fw2 467 1 66.44 AAGAAAAAAAGTTGTGCTTATTTTTTTTCCATACCGTAGAGTAAACCAAGATTCGTTAAAAAGTACAGAGTAGATAGATGGAAGCGTTTTCGACGTTATAAAGTAGATATGCACATATATTGTTGATCAGGATCACTAGTCGAGTC:2 - chr3L 86110 5' + INE-1 92 1 68.49 ATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr2L 71147 5' - 412 7508 2 58.90 CACACGCTGTGAACAAGTTTGTCTACAGGAAGGAAAGTCGTCCGTTTGCGGATACCGCGGGCCGTGCGGACGTCTACAACGCGATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTT:2 + chr3L 24947520 5' - Porto1 4437 1 63.01 GTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 27986445 5' + roo 8725 2 63.45 ACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:2 + chrX 13490646 5' + 297 6642 2 64.38 CTCCGCCTTTCAACAAGTTGGCAAGCAATGCAATTTACGGATGCAGAGCCCGGCGAAATGGATGAAGTGGAACGGGTGCCAGGATGCAAGGACATGGCCATATATAATTTTAATGTCAGAATACTATTTATTTATTTATTTCATG:1 + chr2R 15793297 5' - Doc3-element 81 1 69.66 ATTTGACTTTTATGAGTCGTTTACGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 8076027 5' - 412 473 2 62.33 TATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 3920587 5' - roo 9009 2 61.64 ACTTGCTTTTCAGCAAACTGGGTGTTGGCGTGGCCCAGAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 + chr2L 16274956 5' + FB 81 1 73.97 AGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAACTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chrX 1341731 5' + 412 7115 2 57.93 ATTCGTCTGTTTGCTTTTTATACCAATGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:3 - chr2L 15913381 5' - transib2 2808 1 74.66 CGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTCTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - 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Juan 4188 1 60.96 AATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2R 15375359 5' + 1360 58 1 57.66 ACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGGGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTT:1 + chr2L 4123841 5' + transib2 3 1 73.47 CTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:1 - chr3L 23287317 5' - 1360 3325 1 60.96 AAGTGGGTTTTTCTTCTACTTGCCGTGGTTTCGGTTTATTTTGAATTTTCTTCTGGTATTCATAGGAATTTCCAATTGATTTTCAGTTTCGAAAGATTTTTTCTTTTCTTTTAATAATAATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGAT:1 + chrX 4999328 5' - I-element 234 1 60.27 GATCCGTCTTTAACATTAGATCAGATCACCTGACGCGGGAAACTCTCGTAGACTTTATACAATTCAAAAAGACCAAAATCGTTACTTGACACAAATATCATAACTAATGCATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAAG:1 + chr3R 21061770 5' + invader3 5116 1 76.03 GTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTT:1 + chr3R 8051135 5' + jockey 4833 1 71.23 ATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1 + chr2L 12818258 5' - 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roo 9011 2 60.27 CAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATAT:2 + chr3R 18346662 5' - INE-1 82 1 57.53 ATTTCGCTCAGTGCATTACATGGCTGTTACTTAAATCATCGACGCGGCGTGCCTTTTTAACGAGCTTCTCATGCTTTTCGGGTTTATTTCGATGTTGCTATTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCTTGCGTCAACTTAATTT:1 - chr3R 28928487 5' - jockey 4954 1 35.86 AGGGGTTGGTGTAGAGTATATACAAGTCGTATAGCTAGTTGTCAGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGAAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCC:1 + chr2L 11815777 5' - F-element 4377 1 61.34 ACAGGATCAAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3L 5881561 5' + pogo 25 1 60.48 AAAATCNTATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chr2R 13259410 5' + mdg1 7072 2 58.90 AAGGGAGGTGGTGGCAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGGATGTGCCGGTGCAATATTTAGAAAAATTAAATAAA:1 - 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Transpac 243 2 64.38 CAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTCACCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 - chr2R 6965560 5' + Transpac 80 2 72.66 GGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGC:1 - chr3L 22744696 5' + FB 90 1 80.82 AACATTTTTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTAATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGCCATATCCATAAGTCCCTAAGACTTA:1 - chrX 23182957 5' + Idefix 8 2 65.03 AGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chr3R 15790080 5' + flea 18 2 67.81 AACTGGGGCCATTCGTGGGCTCCAACAGCGTCAGACTGTCTGGTATGCCACTTTGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 - chr3L 16211607 5' - transib2 2761 1 61.38 TCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3L 27391421 5' - 1360 3364 1 63.70 AGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 - chr2L 16690680 5' - P-element 2805 1 17.60 CTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATAATATGCTTCTCATATTATGC:1 - chr2L 22369228 5' + rover 8 2 69.86 ATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTCTGTTTATGTTTATGGTT:1 - chr3L 13836682 5' + 412 7125 2 70.54 GTCATAATACCCCGAAATGCTTCTGCGTTTGTTCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCAGGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTT:1 + chr3L 23249343 5' + rover 18 2 72.60 AAAATATGATACATGTAGTATGCACTATTAATTAATTTCGGGATTTTACGTTGGTCAAAAGCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAGTT:1 + chr4 847241 5' - HB 198 1 64.58 AGGCGCGATTTGTTGTTCCAAGCAGAAGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGGACTCCACCCTCATGACCTCCTTTACCTGGTTTTGAC:1 + chrX 2214204 5' + jockey 4773 1 74.66 AAGAAATCCGCGCGTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCAATCGGCATTCCACAGGCTTCGGGTGGTGACGTGTTTCTT:1 + chrX 6475253 5' + Doc 22 1 72.60 AAAAAACGAGCACGCGTAGTCGAATTGCTATTTACGCCATGGGTTGGTCACCGCGTCAATGTTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTT:1 + chr2R 7064455 5' - 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pogo 2095 1 74.04 GGGCACTGTTGTCTGGTCGAATGCTTTACATTCGGTGTATAATTAATAGTTTTTCTGCTCACCTGACATTTTCCGTACTTTCCTCGGCGGCTTATTTATATTTTATAAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCTCCCATTCTCC:1 + chr2L 12809795 5' - mariner2 754 1 65.03 AGCTCTCTCACCCACGGTTCGATGGCTTTTCACAATTTAACACCAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 - chr3R 16519030 5' - Tirant 388 2 74.29 TATAACACCTAAGTCATAGTATCCATTGGACTTGATATACCCGTAACTTGTAAAGTAAAAAAGACACTACAATAACGAGATGCGTAACGTCATAAGATTTTTTTGCGCACGATTTTTTCGGTGAGGCTCTAGATGTGGCTCCAGGC:1 + chr4 41349 5' + 1360 67 1 61.64 ATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:3 + chr2R 20010164 5' - Juan 4185 1 63.01 TCCCATAAGCTCTATTTTACTCATCTGTCCTTTAAATTGCTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 + chr3R 6625680 5' - flea 216 2 58.22 TAACAGCATTTTAATTAAGGAACAACGCTGGCAAATAATGCAAAAAGTATTGCACATAATGAGTGCCGCTTCAGTTTATTCAGCTCAAATATTTGCTTGACATATATATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 5533082 5' + roo 9 2 78.77 CAGGGTGATAAAATCAAGCACAAATTAAGCAAATGATTAGATAAGCAAATGCAAATTAGATAAGACAGTGTGGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTCCGGGTCAT:1 - chrX 14119907 5' - Doc2-element 282 1 48.63 ATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1 + chr3R 9038921 5' + Juan 4064 1 54.11 TGGGGATTAATTGCATTTTGCCTTCTTTCCTGCACTTCATGCACTTTCCTCTATTCTCCCTTAATTGCTATTTCGTAGCACACACACACACACACACAAATAAACACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGG:1 - chr2L 1652228 5' + Quasimodo 82 2 71.92 ATTATAGAGCATATCTGCAAAACAGTTATTAAGGATGCGAGTGACTCCTCGGAGTCGCAATCCCGAAAA:1 + chrX 23182764 5' + Idefix 263 2 65.22 ATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:2 + chr2L 14874157 5' - copia 236 1 51.37 ATTTCCCTATTAACCAAAAAAACATCAATACCATTACTGGACTATTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTT:1 + chr3L 23853467 5' - I-element 5094 1 69.86 ATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:2 + chr3R 19032590 5' + roo 54 2 58.22 ATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 - chr3R 15364017 5' - flea 4953 1 60.96 ACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr2L 16690759 5' - P-element 2863 1 67.81 AATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACT:1 + chr3R 10270554 5' + Juan 4070 1 54.11 AGCGACTAAAAGCAGTGTTGTGCGGTTCGTTAGCGGCCCTTATCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCA:1 - chrX 276128 5' + I-element 159 1 75.17 ATAATAAAAAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr3L 23906525 5' + 1360 11 1 75.17 ATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCTAC:1 + chr3L 2544615 5' + Tirant 8117 2 69.15 AAACAAAAAACAAACAATCAAACCTAAAAGAAATTCAACCAAAATCCAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAAAAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCCGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCA:1 - chrX 1679992 5' + I-element 394 1 66.44 AACGTATTAGCTTCATATAATTAAAACAAGAGGAATAAAATTATGAAAAAGCTCGATAAATGGTTCAAAAATGTGGGCGTGTCAGATTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGG:1 + chr3L 23618123 5' - INE-1 341 1 73.64 GTACTTATAAACAGCACACTTATTTCTGTGGAAAAAATAGATAAGAATGATTATAGCATTTGCTTGAGTATATTTGGCGGTCTTTTTTTGTTTTCTTTTTTCTTTTACCTTTTT:1 + chr3L 9866003 5' - Doc2-element 238 1 50.00 GCCCTTTAAAAGTAACATACATAAATCAGTGCATCGTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATT:1 + chr3L 8157163 5' - jockey 4837 1 75.34 AACTGCGCACCATCACGAAGGAAATATTTTCCCGTGGGTTCGTCAAGGGACTGAGAATGCTATAGCCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATATGTGCGAACTCAAAATTTCATATTTTTTCTGGGATATCGA:1 + chr4 981710 5' - INE-1 505 1 64.38 AGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACC:1 - chr3L 18125996 5' + Ivk 58 1 53.79 CGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 16564604 5' - roo 386 2 63.70 AAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAG:2 - chr2R 8735648 5' + mdg1 7125 2 76.71 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 - chr2L 5069689 5' - flea 4990 2 71.92 AAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATC:1 - chr3R 28901307 5' + transib2 75 1 68.49 CTAGTCGATGCTTTCCCTCAACTAACAAAGGAATATCATAACCACGAAACACCATAAAGTAGGACATATCTTTTTTCCTAAGATATTTTCTGGCATAATGACTGGCGGAATATTAAAGTCTCTTTGGATGTTTTCGTTCC:1 + chr2R 1954173 5' - F-element 4377 1 72.86 GACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATAC:1 + chrX 22906771 5' - transib3 2744 1 68.57 AAAAAAGCTTGCCACTCACTGGCCGCACTCCGCTTCATTTGGTTTAATTAAAACTCTTTTTGCCATAATCCAATTAAGACCAAAGGCAAAAACCAAATGACAACAAATGGTAAATTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAAC:1 - chrX 846826 5' + Porto1 4388 1 74.66 TATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chrX 12986616 5' + roo 77 2 71.92 GTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 11164492 5' + roo 8738 2 72.60 ATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAG:1 - chr3R 7420273 5' + 1360 90 1 79.45 ACAAAAGTCTACTATTTAATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chrX 19539439 5' + pogo 19 1 59.59 ACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 18488438 5' - roo 8982 2 83.56 ATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr3R 27133673 5' - opus 7449 2 65.07 ACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:2 - chr3L 18126005 5' + Ivk 50 1 49.32 AAATTCGAAGGTTGTGAACCGATGGCAAAAGTTTCTCTGCGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 13318710 5' - hobo 2921 1 54.32 ATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:2 + chrX 10537848 5' + I-element 55 1 54.79 CCATTATAGTAATCTACTTACCCTGGAGATATGCGTATGTTGTAGTATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGT:1 - chr3L 24311974 5' + G3 4507 2 88.36 TAAGAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:2 + chr2L 18549794 5' + roo 28 2 65.07 GAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3L 7889643 5' - roo 331 2 69.18 CTATCTATCGGATCCAAGATACAAAGCATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 5389796 5' - roo 9015 2 67.48 ACCTTCATTTTTTTATTTGTGTACCCAAAACCCTGGGAGCTCAGCTTGCCATTTGTTCGGTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAA:1 + chr3R 8889964 5' + FB 5 1 75.34 CTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTA:1 + chr2L 16946031 5' + hopper 62 1 58.90 AATTACATCTTTAAACTGATAGTCATGGCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTCGTTGAGAGGAACGGCTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr3R 30342351 5' + P-element 91 1 21.92 AACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTGAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:1 + chr2L 6654633 5' + diver 5927 2 53.96 CAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chr2L 15940225 5' + pogo 78 1 68.49 GAAAGAAACGAGATTGCACACAATCGTTTACGACGAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCCATGCTGACCC:1 + chr3R 11628828 5' + jockey 4707 1 71.32 TAAAACGCTCTGCCGCCGTCGCTGCCACCTCTTGTGCTTCGCTCAAGGCTATGCTAACTGGCTAACTTTAATTATATGTTTACGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAAATAGCTGAAATAGATCAAATTTCGCGAAGA:1 - 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chr3R 18971802 5' + Juan 4072 1 47.26 ACAAGGACGCCCTGTGGGGCTTCCTCCTTGGGAGTCGAGAAAATTGGAAATCTATTCCCATTTCTTCCTCGATTCATTCTCTTCCTCAATTCTGTTTTTGCATACTTGTGAAAAACAAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGC:1 - chr3L 18984707 5' + hopper 1405 2 65.07 TTTACGACTCGGATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chr3L 18930968 5' - I-element 5294 1 60.27 GTTGTTGCCTTTGCTACAATTTTTGCACTTGCGTTAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTTCTGTGAGTGTGTTTGCACACAGATACAGGCTTATGTGCTCGTTTTTTTTCCCCATTTTTTTTTCTTTTTT:1 + chrX 3761389 5' + hopper 138 1 61.15 GAGTGCTTCGAATTTTCCACGCCAGCTTCATTTCTTTCATTCTGAATGCTACTTACATTTGTAGATTTCTCAGCAAAGCAGCGTGATATGTTTTTCTCTAGACCTTCTGGGCAGTCTAAGATTTTCCTCCGTGAATATAACCATAA:1 + chr3L 12777493 5' + baggins 5060 1 73.29 ATTTAATTGTATCCTTTTCCTGGTCTTCATTCAAATTTAAATCTGAGTTCTATAATTAGCTTTGCACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCACTTCGCACTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAG:1 + chr2R 15230328 5' - gypsy4 307 1 71.92 AAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:2 - 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TART-B 10630 1 36.30 ATTTACATTTGAACAAAGTTATTGTTTTGTGTGTGTGTGTGTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATTATTAAATGTGGGGGTGCTGCAGGGGGTCCCACGCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCTCTTACAGG:1 + chrX 14797569 5' - gypsy3 6887 2 79.45 GGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAA:1 + chr2L 4713868 5' - transib2 2754 1 65.75 ATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:1 + chr3R 6419825 5' - Tabor 7280 2 53.42 GATATACTTATGTATTTTCTTGGACAAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 20898611 5' - roo 332 2 71.92 ATGTAATCTTGGCCAGCCGAGTAACTCATTTACGTGGCCATGTCTTCCGCTCCTCACCTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTT:1 - chr3L 22232604 5' - mdg3 5052 1 55.04 AAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 3983920 5' - P-element 2852 1 61.54 GGGCGAGCGGAATCCCGAAATTTAGTCATACAAATTTAGTGGAAATTTGATAAAAACAATGTAAAAATATTATATATATAATATATAATATATATTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCATATA:1 - chr3L 23688692 5' + Quasimodo 12 2 56.74 ATCATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 4219425 5' + jockey 12 1 74.22 GTCTACGATATGATAACCTAATTTCCTCCCAGGAAAGAGGCGAAACGATTTTAACGAAAATTTAAACGGGCTCAGAGAGAGAGAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTC:1 - chr3R 19828823 5' + copia 345 1 56.85 GAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAA:1 - chr3L 5061658 5' + 17.6 48 1 58.22 ACATACGCGCACACACAGACACGAACATAGACACATAATCTACAATACCAAACAAAATGATACACACGTCCACTTGAGTTTACAATTTGTAGATAACTCAAAATACATTTTTTTTCTCTATGTTTTCCTTTCCTTTTTAG:1 + chrX 10000032 5' - invader5 3592 1 57.14 AATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chrX 7795606 5' - roo 9004 2 64.38 TTGCATAATCACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 - chr3L 15103932 5' + Transpac 4954 2 60.27 GTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr2L 71200 5' - 412 415 2 74.44 AGAGAAACTACCTCCACGTGCGGCTATTGCAAATAGAAAAAAGTTAAAAAACTTGCCCATATAAAATTAAATTACTAAATAGGATAAGTCCCTCGTACCATAATTCTTAAAAGCAGTGCCCTTTAAATTGTTTTATTTTTTTTAAT:2 - chr3L 18138926 5' - HB 322 1 59.59 AATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:2 + chr2R 13259307 5' - mdg1 335 2 74.66 AACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 - chr2R 4785325 5' - Juan 4167 1 50.38 AAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 - chrX 18336657 5' + mdg3 85 2 73.29 TTATTCAATTATTTTTTTTATAATATTTTTATATATATAAATATAAAATATAAATATGTATATATATATTTTTATTTCACTAAATGTTTACAAAACTTTTTAGTTGAGAAGCACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAA:1 + chrX 21792820 5' - Idefix 477 2 60.27 CTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTTGCTAAGGCTTTCATCT:1 - chr2R 4785300 5' - Juan 4129 1 70.55 GAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATAATATGCTTCTCA:1 - chr2L 22369234 5' + rover 6951 1 68.75 AAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGCTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chrX 8200316 5' - flea 4980 2 60.58 AACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:1 - chr3R 11040145 5' - Bari1 1633 1 67.12 ACGATACCACCTCGTGGTCCCTGGGATCCACTGTCTCTTACATTCAATTAAGTACGCCTCATTTGATAAGTCGCGAGTCATTGGACCTCATCGAACGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 + chrX 3483486 5' - blood 7310 2 78.36 ATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chr2L 5069689 5' + flea 4776 2 72.60 AAAGAGAGATTTTCATTTCCGCAGGCACGTCCTTATTGCTCACTTGTGGATTTTTTAAGCTACTTGAAATCTGAGTAATACAGGCTGTTATTTGTATATATCAAAATATATTTTAAATCAATAATATAAAATATT:1 - chr2R 13104959 5' + G7 1148 1 72.59 GCCATTCATTTAAGGCAATTAAAGGGTAATTGGGGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTC:1 + chr3L 15627848 5' - mdg3 5249 1 76.87 GAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 14980447 5' + roo 21 2 70.83 CCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAA:1 + chr3R 30675358 5' - 297 323 2 71.23 TCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr3R 4805670 5' + 1360 69 1 80.00 GAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTG:1 - chr3L 12249898 5' - roo 9006 2 61.64 CTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chr2L 13556463 5' + transib2 39 1 53.10 GAGTAAATAAGTCTGGTGAGAACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 + chr2R 4188940 5' - S-element 1704 1 73.97 ATTTTAAATATTTTTTAAGGCATTTAAAACAGCCAAAGTCTTGGTAAAGTTTTGCTTATTTGCATTCTCAAATATGTGACCAGCAATCGGACCTTCCATTGGTAAGTTATACTGCCCGGCGTTTCCACACTTTAAAATTTTTTTTT:1 + chr2L 20474108 5' + FB 874 3 50.68 CTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCNTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTA:1 + chr2L 16946031 5' + hopper 62 1 58.90 CCCCAATATCTATCGATATCCCAAAAAAATTATAAAATCAAAAACGACTATCAGATACCCGTTACTTGGC:1 + chrX 23078696 5' - INE-1 546 1 57.14 AGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAATATAGCATTGGCTACGGGGCTTACGGCTAT:1 - chr3R 7317662 5' - I-element 5288 1 59.59 ATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAG:1 - chr2L 11391572 5' + 1360 66 1 64.23 CCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTA:1 + chr3R 4682884 5' + Burdock 59 2 60.27 TTTAGTTTTAGTTTATTTTTAATTTATTCAAACTTTATATCTTCAGTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTTCTCAATCTCACTCACATTTAGAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTATACCGTAAAGTT:1 - chrX 19808587 5' + McClintock 285 2 63.45 AGTTAACAGTGTACTAACCTGCAAACCTCCTGGTGAATCGCCTGCGTATACAGCGGTTCCAGAATAGGTGCTTGAGAATTGCCTGTAATGCGCATCCCTACCACGAGAATGTCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTC:1 + chr2L 7874014 5' + G6 1749 1 76.71 ACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCCCCCATTAGTTTTT:1 + chr3L 22890378 5' + FB 79 1 68.57 ATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:2 + chr3R 6419865 5' - Tabor 7240 2 78.08 GATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3L 16970365 5' - roo 343 2 64.38 AGTTAGTGTACTTGGTCACTAAATTTATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2R 21926497 5' + opus 153 4 50.68 TCAAGTTTTTCTGGATGTAACGGTGTTTGAGGATTGGCTTCAACCGAAGTGCTGGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAG:2 - chr3L 17558242 5' - Bari1 1560 1 62.76 TATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAACTTGGGAATTATAAAAGTGTGGGAGTCGAGCCAAAATGGCAACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 + chr3L 20756363 5' + Transpac 4 2 48.97 ATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 5769107 5' + roo 60 2 66.20 CTAACGGCGATTAGATCATTATATATTCGAGAAATATTTGTTTCATAACTTTGAATTATATTTAGATGTAGATTAGATATAGATATGTTTAGGTTTAGGCTGTGGCCTCTTTTTGTCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 - chrX 12066267 5' - transib2 2820 1 78.77 TCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:2 + chr3L 10373820 5' - 297 333 2 64.38 CATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3R 7420316 5' + 1360 47 1 54.79 GTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 + chr3L 10373794 5' - 297 6940 2 62.33 GATAAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr2R 17926281 5' - opus 7461 2 56.85 TATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAGTTGCGCAG:1 + chr3L 5489897 5' + jockey 82 1 63.70 ATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGG:1 + chr2L 18178219 5' - mdg1 122 2 69.18 CAATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 - chr2L 18549964 5' - roo 9046 1 71.92 CTCGGAAAATGAACAAAGCAAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 + chr2L 4713827 5' - transib2 2796 1 66.21 AACAGACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCG:1 - chr3R 30347470 5' + P-element 10 2 75.34 TTTTACACTATTTCTTTGAACGCAACTGTATTTGAAAATAGTTGCATATGAAGATCAAGTAAATATGAAAATGTTACCAGGAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTTT:1 - chr2R 5447438 5' + 1360 222 1 78.81 TTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTT:1 + chrX 10521644 5' + Tabor 76 2 67.12 AGATCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGGTGCACGTCAACTACCAAGCTTAAAGCAGAATAAATAGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAAAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAA:1 - chr2R 13259384 5' + mdg1 59 2 53.10 GTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr2L 16943782 5' + copia 46 2 54.79 AATCTGCGATGAACTGCGAGCCATTGTGTTGTAGATGCTGCTGCTGATGTACCTGCAATTTTAGCCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 - chr2L 9705536 5' - hopper2 1560 1 47.95 ATTCTTTATCAGAATACTGAAAAAGATAAATAAAATAAATAACTTTGCAGAAACTCACTATTTATTAAGTCCAGACTGAACACATCATTTAACAAGAGAGAGATATAGTCGAGTTCCCCGTTTATCAGATACCAGTTACTCAGCTT:1 - chr2R 100979 5' - INE-1 544 1 54.79 TAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTTTATAGTGACGTATTTGGGTGGTTCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 20373654 5' + 297 6595 2 59.26 AATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 + chr3L 15913857 5' + jockey 4829 1 66.44 AATTTGGTTGCGGGCCACAATTTGCATACACATACTGTAACAGGTCTGAGAAGTCTTAATTGTTCGTTTGAAGTTTCGTGATGTAGATTGGAAAAGATCAGTTCTGACTAGTCAAGAAATACTGTTTCTAATTTAAAGAATTTACA:1 + chr3L 14338099 5' - TLD2_LTR 156 1 78.77 AAAATACCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTT:1 - chr3L 3501877 5' - Bari1 1706 1 78.08 AGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAT:2 + chr2R 16510112 5' + F-element 85 1 65.07 TATCACTTATCACTTATAAGGGTGTTACAAAATGGTTCTTTAAAAAATCTTTATAAAATTTTTATTTCAAGCTGGTGTTTGTTTACTTTAAATGTTCCCCATATACTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCGTCGGTT:1 + chr3L 17933750 5' - roo 9016 2 71.92 CACTGAAGTTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTA:1 + chr2R 2591100 5' + roo 74 2 50.68 GGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 13294901 5' + roo 8744 2 73.29 AATGCTCGCTCTTCCTCTCTGAGTTCTTTAACAAGTCATTTTGGGCTGCTCAGGTTTT:1 + chr3L 21485140 5' - Cr1a 485 1 58.62 AATCTTTTTGGTTGAAAATAGGGGTACCAAAAATGCTTCCGTCGTGAGCATAGGATTTAAAGACAACCTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGG:1 + chr3R 10531897 5' - 1360 3339 1 56.55 CCAGAACACACACGGCGACAGTGGAAAGACAACAATGAGCCACAGAAAGTGGGTTTCCGCTCCGAGTAGTATATCTATTTGGTGGGTTTTTAGATGGTGTTCGACTATGGCCTTGCTGTTC:1 + chrX 1278575 5' - G6 1652 1 62.81 GCCAGTATAATTACACACACCATACATGTTTATGTAATTGTCTGCGTGCAGCTATCATTCATATTGTGAAAACCTTGGAATTGCTTCTATTACTGTTGATATTTATTTTTTTTTTTATTGTTT:1 - chr3L 11260971 5' - Rt1b 5148 5 78.86 TCTAGCCCATGGACTAGAGTTGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chr3R 23618097 5' - hopper 1396 1 69.70 ATCGGCTGCCTGGTGACTTTGCTACGGGACTTTCGGGTTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTTCGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTT:1 - chrX 6999008 5' - Idefix 309 2 70.87 ACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:2 - chr3L 18497501 5' + 297 6644 2 79.45 ATAACCTTCTACTCTATCTTATCCATTCTGGGGCCCTTTAAGGTTTCATGGACTCCTTTCCGATCCATTTGCAGTTGTTATTGTTTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAA:1 - chr2L 15910380 5' + transib2 2433 1 60.96 CAGGTCTTTAGCTTGGCCCTAACGATAGTTACATCATGTTTGCCATTGCGATTACCAGGTTGATGGTGATGATGTGGGTGTGGATGAAGTGTAGCTATGACGTTTATTGGTTTTACTGTTAATCTTATTATTATAATTATTATTAT:1 + chr2R 11236919 5' - mdg1 29 8 62.33 TGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 - chrX 17678734 5' - flea 245 2 81.38 AAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 + chr2L 6647669 5' - mdg3 191 2 73.53 ACTTATTTTGTTACAATAGCCGTGTTAATTTATTATGTATATTTATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTT:3 - chr2L 20118518 5' - S-element 1683 2 63.01 TGCAAATAGATTTGCCGAACAATTCATTTAAAAATGCGCTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATG:1 - chrX 22840621 5' - copia 241 1 73.97 AAAAACATTGTCAGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGGCCAAAAGATCG:1 + chr3R 4860407 5' - Transpac 5192 2 60.27 ATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGT:1 + chr2L 11391498 5' - 1360 17 1 46.90 ACGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr3R 8076005 5' - 412 7504 2 47.26 ACAAAAACAGCAATCGTTGGTGCTTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTCCAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTACAGAGT:1 + chr3R 7625274 5' - mdg3 5042 1 52.74 AAATGAAAATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCGGAAGCTGCATACTTAATCTCAACCTTCTATCTTTTATAGTTCCTGAGATT:1 - chr3L 24163240 5' - INE-1 150 1 52.78 CAGTAAAAGTCTTTAACGAACTCAAAGATAATTTAATAGCAGAAGTCGAATTAGTTCAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGC:1 - chr3R 2649403 5' + I-element 357 1 56.72 AAGAAAAGGAACTGGAGATGAAAGTAACAGATGTTACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTAAAGATCCCGACATGTCCGGAATGGCTAGTGATCCTGATCAAGAATATATA:4 - chr2R 13259725 5' - INE-1 81 1 64.38 GTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCACTAAGTG:1 + chr3L 12004253 5' - P-element 2839 1 44.63 TTTTCGCCCTAGCTACTTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACCGCCAAATTCGTGTCGTTTTGTCTGTGCAAAAACAATTGACTTTATGCATAAACACACACACATCATTGCTAT:1 + chr3L 23751467 5' + G3 49 1 78.46 ACCAAGAAGACAAGACCACAATCGGAGAAGATCCCACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCAATGCCTCGTTCCGGTTCTTTTTTTTATATCGCGT:1 - chr3R 13725019 5' + Cr1a 4354 1 67.57 CTTATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr4 303814 5' - pogo 2039 1 61.64 AGGAATTGCATTTCAATGCAATAAGCAAGTTTATTTCTTTGCCGAAGGGGTAGGGCAAGTGCACCCTTCAAAATGGACAGATCCTTTGCTTTGAGCTCGAATTTCTGGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAT:1 + chrX 22798612 5' - 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P-element 2847 1 42.59 AATCATACGTAAGCTTTCATAAATCCATTTTAGTATCTACCGGACTTTACTGCCCTGAACGCCCACACATTTTCACGGAGTGAGAATTTCATATCACGTTTGCATTTTTTTAATATTTTATAATAATAATAATATTTCTAATAA:1 + chr3L 6694864 5' + mdg1 7079 2 62.50 GGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGCTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 - chr2R 6622639 5' + S-element 79 2 71.92 CATATATATTTACATATATACATATATATATACATATATACATATATATATACATATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAG:2 - chr2L 20026636 5' - Quasimodo 7313 2 61.64 GATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTT:1 + chr2L 11391497 5' - 1360 28 1 42.22 AAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATA:1 - chr2L 17180131 5' + Juan 59 1 62.02 ATATTTCGTGGTGTCCACTTTCAATATTCATGGATGTCTGCGTCGCTTAAACGAGTGCCGTCCACAACCATCAGCCGGCCGAAATGTGACAGGGGGCACAATGATATCCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGAACAATAGAC:1 + chr2L 11908620 5' + INE-1 87 1 72.60 CCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATT:2 + chr3R 11186564 5' - BS 5005 1 75.34 AGATGAATGGTTATTTATTTGTCCCTTGCAGAGTGCTACTCTCACAATTCGTAGGACTTATCGCTAATAACAAAAAATATCAGGATATCCTAGCAGTGAAGACCGCAAGATGAATACTCTACTGACAAATATTCTTATATAAAGTC:1 - chr3R 18288974 5' - 1360 389 1 67.81 AATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr3L 16033423 5' + Doc 62 1 58.27 ACAGAGATATCCTGCTAGATGATTCTGATTTGTACTGGTACATACAAACATGTTGGTAATAAGTTAAAGTCGAACTCATAGAAATTAAAAGTCAATTCTAGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATC:1 - chr2L 19767698 5' - accord2 80 2 67.81 AACTACATTTTCGCATCATTACAATTTGCATGCATAAGCAGTAAGAGCTGCTGCACACAATAAATTTTGCATAGCCCAAGTCAGTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTA:1 - chr3R 25934688 5' + Porto1 4354 1 61.64 ATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTT:5 + chr3R 4160066 5' - invader2 5045 2 58.90 CAAAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - 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HMS-Beagle 7021 2 71.23 GCCTTTTATTAGCAATGCTAGTCGCAGGCTTTTTCTAACCATCAATAGATATTTAATATGGATACACCTAGTTCATGTAAACCTCAAAGTCAAAGTCAAATGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAG:1 - chr2L 17593552 5' + Tc3 316 2 73.97 ATGCAGGACTTCGTTTGCCTTTGCCTTTGCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCT:1 - chr2L 17342681 5' - F-element 4508 1 72.22 ATTAGAACCCATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 21116467 5' - mdg1 373 2 53.42 TGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAGAAAACG:1 - chrX 22906772 5' - Transib-N1_DM 21 1 69.66 GTTGCTCCTGCTGTGTGTTTTCTCCTTGATTTCCCATTTTTTCGATACTTTATTCGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATC:1 + chrX 20899159 5' - I-element 4887 1 62.07 AGGCAATCCACTCGATTAATTCATCATCTTGACATCTTTTTAAAAATCTAATGTATGAGCCGCAAGAAAAAGAATCATTTAAATTTTACACATTGATTGGATATTTTTATTGATGTATGGTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTCCTTT:1 + chrX 21061800 5' + pogo 301 1 72.60 CCAGCATTTGTGCTCAATTTTTTGGACGATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3L 21763804 5' + jockey 23 1 69.60 CTGTTCCTGGCCCTTGGACTTCGGCTCATTCAACTAGTCAACATACAAAACACACACAGCGGAGAGTGAAGAAAATATTACGATGGGGAATAAAGTAAAATAAAATGAAAA:1 + chr3L 10418480 5' + Doc3-element 4493 1 89.19 AGTTGTACTAAAGTAAATGAAGCGTGACGCTTTGTTTTCCTTTGATTTAGTTTTATGAGTCTGCATCGGATGTAATTGAATTATGCAAGTTGGCGCCGACGGCCAACTTAGAGTATACATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAG:1 + chr2R 13083656 5' + 1360 430 1 73.29 GATTATTATTAACGCATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chrX 11661532 5' + pogo 23 1 69.86 AACATTAAATTGAGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:2 + chrX 18009900 5' - 412 465 2 45.21 ATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 + chr2L 13556359 5' - transib2 2743 1 73.97 CATTGCATTGCGAAATTTAAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:1 - 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chr3R 17421330 5' - pogo 2074 1 46.76 ATCGGACCCTGAGCCGTTCCTTTCTCTCCTCGCGGCAGGACCATCGCTCATCTCGTCGTCCTCTGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGG:1 - chr3R 4485525 5' - F-element 4419 1 57.14 ATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATC:5 + chr3L 15913838 5' + jockey 4810 1 53.42 CATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGGAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTGGAGCAGCAACAGGATTGTCGGAACTC:1 + chrX 12129336 5' + flea 57 2 69.64 TATAAAGGTGGCAATAACATCGTCTTTAACGCGTCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTT:1 + chr2L 22328976 5' - invader2 4746 1 56.94 ATTTATCCGGCGAGCCAACGACAAATAAAAAGGCCAGCTTAGAGCACGCGTGTGTGGTGTTGCTGCTGTGTGATTAAATATTAAATATTTGATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 3519302 5' - hopper 160 1 81.90 AAAACATTTTGCAAAATTGTGGGCGTGGCTTGCTATGTGTCTAGAAGCTGCAAGCTAAGTCTTAACATTCCTAAGATCGAGACGCTCATACGGCCAGATTGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr2R 5733422 5' - INE-1 87 1 66.14 AAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTG:1 - chr3L 9907355 5' + BS 5059 1 62.07 GAAAAAGGCCGCCAAAATGACATAATCTGCCACATGTGGCATTCGAGCCAAGGAAGAAGGTGCGTGAGCCCGCAAAATAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCA:1 + chr2L 6229180 5' + Doc 4511 1 55.48 ATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAG:1 + chr2L 17180050 5' - Juan 4177 1 58.90 AAAAGATTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chr2R 1916465 5' + Juan 44 1 45.14 GCACATAAATTGCGTAAAGTGCACATTTTTTTGTTTTGCGTTTTTTGTTCTGCCCTAACACGTTTACACGGCCTCGTCGAGGTCCTGGCTTCCTCAGCCAAAGGTCCATTGTAGGCAAGCCTACAATCCAAGTGGCCGCCCGAAT:1 - chr2R 20948666 5' + Doc4-element 438 1 73.79 AGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chrX 18396051 5' - roo 9040 1 54.79 CGCAGTCAATTGCCCGGCGGAGATGTGACCCCAACCTACTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAG:1 + chr3L 5569733 5' + I-element 471 1 77.40 TGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr2R 13259297 5' - mdg1 345 2 67.81 ATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:3 - chr2R 5479976 5' + F-element 91 1 68.49 GCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 - chr3L 19455009 5' - mdg1 7381 2 69.18 AAAAGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chr2R 19199648 5' + hopper 44 1 54.11 ATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr3L 11326771 5' + pogo 64 1 67.81 GAAAATCAAGTCGAACGCTCGCGCCGCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 18282697 5' - P-element 2886 2 74.74 TGAATTATATTATATGTTTTAATGTTTGTGTGAGATTGTGAGTGTGCGTTGGGGTATGGATGTTTGTTCTCGCAAAGAACTCGTTTCGTAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGA:1 + chr3R 5545225 5' - 17.6 7075 2 66.44 GTATGAGTTCTTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:2 - chr2L 21328310 5' + 297 6590 2 80.14 GTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 - chr3R 13973056 5' - 412 438 2 54.11 GTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3L 6397682 5' + roo 8750 2 73.97 AAGTCGTCACCACTCCCGATTATAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTGTTTCACAAGTATGC:1 - chr2R 19941655 5' - hopper 1380 1 60.00 AGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:2 - chr2L 9636202 5' + 412 35 2 52.05 GGGGGAAAAAGAAAAATGTTAATTAAAACAGAGAGTTGTAATATTAAAAAAAAATTAAAGACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 12175582 5' + Doc 4699 1 89.04 GTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACG:2 + chr3R 17673773 5' + FB 89 1 79.45 CATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGTTGGAATCGTTTGCTCATT:1 - chr3R 8890125 5' + FB 47 1 47.26 ACAGGCAACACTCGTGATGCAGTGCAACTATTTTTGTTGGCCTGTGTCCCTTTCCTACCCTCCACAACCGACAACCAACCCATTATATATATATCGTCTTTGTGTTTTGTTTGCTCTCCCTTTT:1 + chr2L 9568226 5' + Cr1a 209 1 64.52 GCTAGGGTCTGCCAATAAAACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - 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chr3L 22400340 5' - 1360 3337 1 66.95 AATTACCAGTATTTTTATGGCATGCCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGG:1 - chr3R 28146175 5' + roo 8689 2 66.67 GTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 + chr3R 4860423 5' - Transpac 257 2 55.48 GTAACGATAAATAAAGTAATTTTAAAATCGAATATAAGAAGATTCTACTACATAATTAGATCCCAATTTAAAATGTTAAACAGAGTACTTTGAGTGCAGAGTTCATAGAGAGATTTATGATAATAAATTAAAAATAAAATAAAAAA:3 - chr2L 17292463 5' + Doc 4699 1 69.86 CTATCCGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCC:1 + chr3L 25482861 5' + accord 24 2 66.42 TGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 18488441 5' - roo 8985 2 81.51 GTGTGTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr3R 29084827 5' - 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chr3L 26291027 5' - Tabor 471 2 73.97 GGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAG:1 + chrX 1799141 5' + invader4 80 2 71.92 AGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:3 - chr2L 18347382 5' - transib2 2759 1 60.96 CAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAGTTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr2L 14874169 5' - copia 225 1 57.93 AACACTAACAACAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATATTATTATTATTGTTTTAATTATTATTATTATAATAATTATTATTATTTTTATTATTATTATTATTATTGTTATAATTATTATTAAATTTATTATTAT:1 + chr3R 30899665 5' - mdg1 41 2 69.86 CCAACGGAGGATCGCGCACCGTAACCAACCCAAAAATGCAATGGTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACA:1 - chrX 2427855 5' + HeT-A 6019 1 70.40 AAAAAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCTGC:1 - 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I-element 5322 1 47.48 GTCATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 + chr2L 14074443 5' - 297 6923 2 60.00 AATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGCAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAACGTCTCCAAACGCTGTTGGTCATTTTCTCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTG:1 - chr2L 11839708 5' - mdg1 7363 2 69.29 GGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACAATGCTGTGCGTCTATGTCTCTAGGATCTGTATGCTGAATGCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 - chr2L 2545704 5' - INE-1 137 1 85.29 ACTAAACTCACACCGATGTAGAACCAACCACCCACACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3R 26404971 5' + hobo 42 1 56.85 ATTTCAACAGTTTTTGTGTATTTTTTTAGTTTGCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 19173737 5' - Doc2-element 251 2 91.11 GAGTATTTTATTAAAAAATAATTACGATAATAATTAAATTCTATTTGTCATTACACACAAATGGGTGTAGCATATCGGACTAATCTACCCTACCAATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAA:2 + chrX 3789225 5' + Stalker 6942 4 38.36 TGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 22400341 5' - 1360 3343 1 66.37 ATTTATATTCATCGAAACAAAACCTTTAGATTTCAGTTACAGAAAACACTGAGCTGACCTGGAAAGACATCCAGTGTGAGTAAAAACAGGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAG:1 + chr3L 5871793 5' - 1360 3208 1 57.36 CATTAAATGTCGATTTCGTTTTGCACCCGCGGCGCAGATACGCAGCTTGTGATACGGGAAGTACGCAGTGGTGCCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 + chr3R 23491838 5' - transib2 2785 1 56.83 ATCTGTGAAGAAATGCCTAATTTTCCATAAATATACAAGAGGTAAAACCATAAAAAAATGCAAATTTTAGATAAGAAAACACTTCATTGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAAATTTTTTTT:1 - chr2R 12222542 5' + hopper 132 1 58.90 ATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATG:1 + chr3L 16731387 5' + rover 48 2 57.93 TTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 23287190 5' + 1360 29 1 64.14 GAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 + chr3R 15054183 5' + copia 4903 2 58.22 AATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:2 + chr2R 22034653 5' - copia 191 2 63.70 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACAC:1 - chr3L 16731387 5' - rover 7233 2 82.19 TAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTT:1 + chr2L 17005718 5' - Stalker2 328 2 66.44 AGAGAACACTGTGACGAGTTGTACGATCGATCCATTTCTGTACGGATTCCGGAGGCCAGAAATGGGAGCCACTAACGCAACGTATAAGATTGGTGGATTACTTATGGATCGCTCTACAT:1 + chrX 21393377 5' - G3 4368 1 67.23 ATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 19450064 5' + roo 8740 2 71.72 AACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAA:1 - chrX 15200936 5' - 17.6 7357 2 64.38 AGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGC:1 - chr3R 10970369 5' + G-element 31 1 59.31 AGATATCCCCCCAACGCCTTTCTGTATCTCCGATATATTCCTGTGTGTCCTTGCCAAAAAACTGTTTACGTACCAAATAAATTTGCCATTAGATGAAGCCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCT:1 - chr3R 27895161 5' + Q-element 485 2 73.13 TATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3R 15325204 5' + 297 28 2 61.19 GTGGTCATTGGCTTGCTTTTCCTGTTTCTAGTTACTATTATTAAGCTCAATCTATTACTTACATTTAAATCTATATAAATTTACAAGACTAATTAAATAATGAAAAAATATCGAAAAAGGGTTAAAAAATGTGGGCGTGGTAGTTT:1 + chr2L 11943195 5' - INE-1 246 1 50.00 GTACCCTGTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGTGGGCTCC:1 - chr3R 27083168 5' + jockey 4548 1 69.86 CAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr2R 13168650 5' - P-element 2828 1 44.37 GTCTACAAATAGTAAGAGCCGTCATTGATTTCTCATATATAATGAATTATTGAAGTGCGGCTGATGAATCTTTCCCAGCTCCAAAATGGCGGCGCCTCTGCGCGTCCGAAATGGCGGCTTTGACGCCTC:1 - chr2R 3209529 5' - aurora-element 409 1 56.59 TATTAATTTGAAAAAAAAATTTTTCC:1 + chr3R 20348880 5' + Stalker 6757 1 80.77 CAGCAAGGTATATCATACTTTTTTGCTCATATATGTAAGGGCTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 21681419 5' + roo 46 2 54.11 CCTCACTAGCCACCCAGGTTTCCCCCTACGAAACTGCGCCTGGATCTTTGCCAATATACTTCTTGCCACGCCCACTTTTACGCTCCAAAGCCGCCAAAAACTGCCGCGCCCACACTTTTGAAAAAGGTT:1 - chr3L 12511751 5' + INE-1 256 1 64.34 ATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chr2R 21411002 5' + Burdock 28 2 65.75 ATTGTGTTTCGATTGCAGTCGTGACTCCGAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCAAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAGTACTATGTTATATCAA:1 - chr3R 28923075 5' + jockey 4840 1 76.03 AAAACTCTATAGTATTCCCTGTATCTTGCTATTATTTTATTAATTCTTTTAAAGACTTAATATTATTTTCTGCTCACGATATTTTCCTTCCGTTTAGTTGTCCTTTAATTTTATTAAAGAAATTATTTTATTTAATTGACTAG:1 - chr3R 904671 5' - jockey2 3376 1 46.15 ATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr3L 3983934 5' - P-element 2863 1 67.12 TGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAAACAGAATCTTTCAAA:1 - chr2R 4545175 5' - invader1 3540 1 56.16 ATTCCCTTGTAAGGTAAAACATTACAGGGTATTTCTAGTTCGACATGCTCAACTTTACCTTCCTTGTTCTGCTTCTGATATTGCGCTTGCGCAATCCCAAAAAGCATCTTCGCCTTTTCTGCTACCACTGACTACTTCGGTTTACA:1 - chr3L 12054198 5' - diver2 4591 2 76.71 ATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2R 13168752 5' + P-element 53 1 50.69 ATCTTTATACCCTAGTTCACGCAGCTGGGATCCTCGAATAGGGCGATTTCCTGGAGAATGCCTATAGGAAAATCCCCGAAATTCTTGGTGCCGTGATAAAGTGTTAGACTTAAATGTCTCCAAGTGTAAAGGTATGACCTTT:1 + chr3L 19863757 5' + Q-element 670 2 62.68 AGAATAGCAAGAATAGCGTTAAAGTTTAAAGGATATTATTATAGTAGCTAATTGAACATAAAAGGTAGAGATATCAGCCAGAGCACTTTCGGTAGTAGTTTTTAAATTACATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTA:1 - chr2L 17460610 5' - roo 293 2 74.66 AACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:2 + chrX 7795515 5' + roo 8728 2 65.75 AAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAA:2 - chr2L 13556420 5' + transib2 82 1 71.92 ATGGGCGGTTCCATGTTGTCCTCGATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 - chr2L 15550807 5' - Bari1 1699 1 75.56 TTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 28146131 5' - roo 8989 2 75.34 AAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:1 + chr3L 24934298 5' + HMS-Beagle2 49 2 58.65 GCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAG:1 - chr2L 7618528 5' + X-element 4525 1 77.40 TGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGT:1 - chr3R 12242342 5' - transib2 2749 1 71.23 AAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATTTTTCCT:1 + chr2L 14874143 5' - copia 250 1 40.41 ATTTAAATTCAAATACATAATTTTTAATATATCCACCGAATTAATTGTTTAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCG:1 - chr3R 19408033 5' - diver 197 2 63.45 ATCAAAGTTGAAAATTTAAATGAACCGACAAAATTAGGTTCGTTTCCAATTAAGCCAAATGCAGCAAAAAGCCAAGAAAGAAAATGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr2R 20802547 5' + mdg3 5293 2 57.53 ACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGGGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAA:1 - chr3R 1844842 5' + Cr1a 155 1 56.10 GCAAGTATACAATTGCCGAGGTAAGCGGTCTCTAAAGTTCATATTCCCCTGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGT:1 + chr3R 4705761 5' - Quasimodo 347 2 59.52 AAGTTGCCTCAAGTTGCCTATTTGTTTCTTTTCATATTTATGCCCCTTCGGCTCGCTCAATTTATATAAATACATATATGCATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAA:1 - chr2L 18212245 5' - Quasimodo 7333 2 63.01 ATCTAAAGCGTATCTTTTGTTTATACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGAAAGTTTATTTCCTAAAAAAAATTATTGAATTCTTATTTTTTTAAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGTCTCTCTA:1 + chr2R 22210970 5' + Tc1 107 1 83.56 CCTTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACTGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATAAACGTATTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGATATCGATTTGATTTTGAAGAGCGCAA:1 - chr3R 26504344 5' - HMS-Beagle 7021 2 62.69 AACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:3 - chr2L 11839723 5' - mdg1 7372 2 71.92 TTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2L 13556477 5' + transib2 26 1 62.33 CATGAAGGTAGTAAGCGCAAAAGCGTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTATACGCAA:1 - chr2L 22150643 5' + S-element 73 1 84.93 CTGTGAGGATTTACGAGCCACACAACATTCACAACAGCCACCGACAATGGAAATTTGCAATCCTGTTCGTCCTGTCGCCTGTCTGCTTCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAG:1 - chr2R 18316190 5' - HMS-Beagle2 296 2 62.76 CATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 + chr3R 15363883 5' + flea 25 2 66.43 GACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 20266034 5' + roo 8718 2 61.94 ACTAAATTTTAAATCGTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr2L 15936741 5' - copia 252 1 60.27 ATTCTGATCGATTTGTGTTCCCATTACAGACGCCCACTCTAACACCCTAAAACCGTCCAAAACTGCCAAGCCCGCAACTTTTTGCCACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTG:1 - chr3L 16074931 5' + INE-1 347 1 73.64 ATTCCTTTCGACTCAAATCGCATTAAGAGCAATCAAAATTTATGCGGCCATCTTTTTCAGCCTAAACACGCAACTTCCGTTGTTGCAAATTCGTCATTTCCGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGA:1 + chr2L 7570455 5' - gypsy5 6962 2 70.55 TTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:2 - chr3L 14720898 5' + F-element 86 1 65.75 TTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:2 + chrX 18396084 5' - roo 343 2 59.59 AAAACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATT:1 - chrX 9410551 5' - I-element 5281 1 67.12 ATACCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAGTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAAGTTTTTAGACTTTAAATTTGTATTATTTT:1 - chr2L 20523319 5' + 1360 246 1 78.77 GATATTAAAACAAGCTTTGGCTATTACTATCATATTTCAGAACCTTTCAACTGTCATTCGATTATGAAACGCACTTTATGTACCACACACACACACACACACACTATGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 11874397 5' - roo 9003 2 72.60 ATTCTAATAAGCTTCAATATGCATTTCGTACCTTAAGAATTTTATATAATCCTTATGGATTTTTTTTAGTTA:1 + chr3L 14228259 5' + S2 83 1 75.00 AAATATTTTGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:3 + chr2R 21410838 5' - Burdock 222 2 61.64 AAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGGTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTATGTGTACATTAAATAT:1 + chr2R 3338784 5' + Juan 60 1 54.79 AGTAACGCTTACGTATCAACTTTTTTTTATTATTATTTTTTTCCATCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTATTCTTAAATAAACAGAGGCAGTTGTT:1 + chr2L 19817842 5' - G4 3776 1 66.41 CAGACAACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr2L 16690765 5' - P-element 2869 1 71.92 AATATTATAGTTTGCGCATAAATTTTACTGCAAGTCCAACGTTTTTATGACTTACATGTGCGCACACATGATTGTTTGTTAAACAAAACTCTTTAAAATGGCTCTTCTATGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 + chr2L 19155867 5' - 1360 204 1 76.26 CAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 - chr3L 18505739 5' + I-element 64 1 62.33 TATCAGATCACGGCCAAGAGAGTCCTTTGTGTGTACAAGGCCATCTGGTGTTACACTGACAATGCCATTACTTCGATCGTCCAGTTTATAGACCACATTATCCATATTAGATTTAACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACAC:1 - chr2R 5765855 5' - Circe 200 2 80.00 AAACATTTTAAATGTTTACTTTGATTTCCTAACATACCTTACTAAAGTGTGCACTGCCCCCTCTAAAGAAGTTACCGAGAAATTATAGGCAATTTTTTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCT:1 - chr3R 32061685 5' - 1360 339 1 67.12 AAGGGGAAGCTTATTTTCATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr3L 9270003 5' + copia 44 2 47.95 AATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGT:1 + chrX 292387 5' - G3 4535 1 60.27 CATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chrX 17678734 5' + flea 4793 2 59.29 TATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGGCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 5768998 5' - roo 358 2 51.37 AGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGCTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr2L 16943785 5' + copia 49 2 52.74 AATATCGACAGTATTATATTATCCACCCATATAATTATTCTCTATGCTCTCTTAATTATTTTCTAACAAAAAAAAAGAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAC:1 + chr3L 6796208 5' + I-element 4983 1 58.22 AACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr2L 13556472 5' - transib2 2793 1 58.90 GTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGATGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 + chr3R 29084904 5' - 412 428 2 65.15 TTAATTTCAGTCAATTTTGGGTTACATTTCGAATCAGTCATTTAAAGGTATCACAGAAATATATCAATTCACTGAAATGAACACCAGAATTTCTGCCTGCTGTTGTTTTAATCTATATGTTCTAAAATGTTGAAGAAATAAAAGTG:1 + chr2L 15600323 5' + HB 1489 1 52.05 AACATAAGTAATCCCATGAGCTTATCTTAAGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 - chr3R 27160203 5' + 412 7076 2 69.86 TGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTGTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTGTATGTCAATATATCGTCC:1 - chr2R 12472138 5' + transib2 43 1 54.48 ATACTCGTATATATTATCCATCTATCCAGAATTGTATCTCAATGTGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTACGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCT:3 - chrX 18324602 5' + I-element 5050 1 69.18 TTTTCCATATATTTTAGTTTTAAAAATAACCAATTCTACAAAAATCTCTATTGCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 10934520 5' + 297 6591 2 63.70 ATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAG:2 - chr2R 4206653 5' + 1360 325 1 69.18 AATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCT:1 + chrX 21639588 5' - gypsy5 7317 2 63.70 AGCATTTGTGACTTTAACGATTACAACCTGAAGATGATATTCAGTGGACAAGAGTGTAAGTATCACAGCAGTTCAAACACCACGATTTATAATTGTATAATAAGACTATGAAACAATTGTTAAATAATGTATTGCTTATTGTGTGC:1 + chrX 12968080 5' - hopper2 1308 2 73.97 ATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 + chr2R 16510085 5' + F-element 58 1 46.58 TTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCAAATGAATCGA:1 - chrX 18396175 5' + roo 8719 2 54.11 GGTGCGGGTGCTCACCATTAATCTGTCGCTGGGATTTGGCCGAAAGGCAAATCGAGGGCTTTGATTTTTTCGTACTTCGGCTTCCGATTGCTTCTTTCGCAATGCTGCTTTTTAAGGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chr3L 11764214 5' + Tc1 1468 1 70.23 AGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 - chr3L 20711728 5' + jockey 4791 1 60.96 CATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr2R 11804630 5' - pogo 2035 1 67.12 CGAATGCAGATACATAGAAAGTTATACGAATGTTACGTGAGCAGAGTGCCAGAGCAGTGGAAACTGTAACAATGGGCGGGTGACCCCGACACCTTAACCCAACCACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1 + chrX 5434989 5' + Quasimodo 67 2 73.97 TGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTNATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 12004252 5' - P-element 2837 1 43.55 CTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGGTA:1 + chrX 21949006 5' - 412 7362 2 72.92 AATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTGGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 + chr2L 10156125 5' - hopper2 1531 1 69.18 TAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2R 5941443 5' + copia 49 2 52.74 TTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 18046600 5' + roo 8723 2 60.27 TTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTT:2 - chr3L 6447138 5' - transib2 2819 1 75.00 AATGACCACCAACTATCGTGTCGTTCTGCAGGCGATCAGCATGCTGGTGGTAATTGTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCA:1 - chr3R 11576894 5' - R1A1-element 16 1 63.70 TATCTATCGTATGATAAATCAATTACCAACTAAACTGGGCTAACAAAACCCATATCCTTACACACACACACACACACACATATATATATAACCACATAGGAACAGCCA:1 + chrX 8432427 5' + Quasimodo 56 2 55.56 GGAAGTGGTTAGGTGGTACGACAATGCCAAGAAAGTGATATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTGATGGGGGGTGCTGGTCCTGGAAAATTCCTAGTTTGCCGTAGGATGGCTATGTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGG:1 - chr3R 12366337 5' + GATE 8207 1 47.95 CTCTCCTTTCTTTTTCGCCCTTTCTTCATTTCCGTTTTGCCTGCTGTTCGAACCAAACAGCTGCCATTTGGTGAAGCCCAACAAGCTGCGCACAAAAAGAGCCACTGATGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAGCGGCGG:1 - chrX 12524265 5' + TART-B 154 2 60.00 AAAATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:2 + chr3R 31886822 5' + hopper 44 1 56.85 TGGGTAAATTATGTATGTCATTGGGTGTTCCACCACAGATCCAGCGAGTCCTTACAAAAGTCAAGTCCTGGGGAAGAGAGGGATCAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 11957601 5' + R2-element 3583 1 75.00 ACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:2 + chr2R 21681300 5' - roo 9014 2 57.53 CAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCATCAATTAGTTTTTTTTGC:2 + chr3R 30059415 5' + FB 84 1 76.03 ATAAAATGTAAATATAGTACAGTTTTAGCAAGGGAGCTCCCTTTGGAACTCCTATGCTCACTTGTCCAGTAATACCCAATTTTTTCGAGTGTACTGCAATAGGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAG:1 - chr3R 12315644 5' - F-element 4460 1 77.24 CATAAATATTTACCAAATTACGAATTTCAAATACGATATTTTTCAAAATTCACCACCTCAACTATATGGCAATTATGAACTTATTAGGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTC:2 + chr2L 21862546 5' - Tabor 119 2 58.22 GTCAACACCTAATAATACATTTCATCGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 31653215 5' - roo 398 1 78.62 CATATAATCTTGATCTGTCCGCCTGTCCGTTCGCATGCAAGTTAGTGCGTTCGCAAGCCCTCGGGGTCGACTTCACTTGCACATGAGCAAGTGAATAATAAATTCTAAATAAGTCTAAAATAAATTACAAAAGAGAGAATGCTATA:1 - chr3L 22944888 5' - INE-1 583 1 61.64 AACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGACAA:1 - chrX 18409461 5' + jockey 4698 1 55.88 TACAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCC:1 - chr2L 1924040 5' + G2 2996 1 63.70 GTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 - chrX 4808599 5' + mdg3 75 2 66.44 ACACTAGAATAACAAGATCCGTAACGTCCATACATTGGATTTGCACTTTGCAGCCACTTTTTTCGGAAAAGATTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCG:1 - chr2R 1982173 5' + diver2 294 2 58.22 AGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAA:1 + chr2R 15004757 5' - BS 5034 1 60.27 GTAGATAAGAGGTTGTTTACGTTCTGGTATAAATCAATATGTTAATATTTTTAGTCTTATTAGGTTTATTTCAAGTTGACTATTAAGCATATTATTATAATTTTTAGTATACAGGATTTTTATTGCAGTTTTTTAAAGAAAAAAA:1 - chr3L 9761674 5' + flea 313 1 33.10 AAACCACAACTGTGTTCTCTGTCCATATGATCGTCGAGGATCCATTCCGACCATATAGATCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCT:1 - chrX 22905667 5' + INE-1 150 1 53.12 GAAAGCTTTCAATAAATTTCAATAAAATAAGATAACTTTGTTACCGAACTGTGATATTTTATGTATAGGCTATTTTTTTATTCTTATTAGTACAAACAAAAGATAATGCTATAGTCGTGTTCCCTGACTATTAGATACCCGTTAC:1 - chr4 357235 5' - INE-1 551 1 73.10 ATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACCGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr2R 10417157 5' - 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chr2L 17325204 5' + Porto1 4203 1 56.85 CTGCAAATCGGCGGAGCGTGCCGAAAGATCGCCCGCCAATCGACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3R 16157432 5' + pogo 18 1 73.29 ATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGCTCCCTT:1 + chr3R 25554217 5' + micropia 4997 4 56.16 AAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCT:1 + chr2R 12185294 5' - accord 7365 2 65.08 TGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGGTTAAATAAATCAACTGCTCGGGTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAA:1 + chr2R 12185350 5' - accord 7218 2 77.40 CTAATCTATTTCACCAATGAATTTAAGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGG:1 + chr3R 12367485 5' + GATE 8109 1 60.27 GACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 - chr3R 15054333 5' - copia 217 2 56.16 ACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chr2R 3563123 5' - Transpac 5158 2 78.33 AAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 + chr2L 22674751 5' + mdg1 29 2 66.43 GCGCGTGCGTGTGTTTGTGTGTGTGTGGGT:1 - chr2R 22080391 5' - accord 7100 2 86.67 GAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGAACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCA:1 - chr2R 2318271 5' + ZAM 7963 2 79.66 AGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACC:1 - chrX 8200286 5' - flea 4941 1 68.49 AGCGAATTAAGTACTTACAGGGTAGCTATCGATATAAGCAACGAAACTTCCACCTATAGTTTCGTATCAACGTCATAATTATCGATAACTACTATGCACCCATGGGATTTACCCAAATCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3R 16342094 5' + P-element 1 2 77.93 GGTTGCAGAACGATATTGCGTGTTTAGTTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 7795661 5' - roo 396 1 76.71 GTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAAC:1 - chr3R 27765165 5' + mdg1 7121 2 74.48 GCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chr2L 17205158 5' + hopper 44 1 55.48 TCATGTCTTTTTTCTGGCCTCACCGGGGTTCTCCTGGCTTGAGTTTGAGTTCGGGTTTTTTTTTAGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAA:1 - chr2L 21020082 5' - I-element 91 1 55.48 CACCATATTGGATTCAAATGAAGTTATACCTTCGCTGATCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTTTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCC:1 + chr2L 2340341 5' + accord2 7426 1 71.92 TATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 + chr3L 15103767 5' - Transpac 286 2 69.86 GACCTCGCATAGTTGTCCTCGACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - 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Cr1a 3986 1 67.06 GTTAAACGTACATTAGGAGTATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 - chr2R 4785350 5' - Juan 4179 1 60.27 AGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 + chr2R 16510109 5' + F-element 82 1 63.01 AATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATA:1 + chr2L 14523134 5' - HMS-Beagle2 244 2 64.38 GGGTTAAGCCCAGCCAGACTTAGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr3L 12315685 5' + transib2 24 1 69.18 ACTGGCTGTAAATCAGAAAAGGCCCAAAAAAGTTAATGCGGCTATTACACAGCGGGAAATTGTTTAGGTCATTTTTGAGTCAATTTTAGTTTATAATTTGTGGTAATTTTTGAATTTGTTTTATTTATTTTGTTTTAATTTTTATT:1 + chr2L 5353998 5' - Doc 4694 2 76.03 TTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 - 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I-element 5296 1 58.04 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:3 + chr3R 29487012 5' - flea 5002 2 80.14 AAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 + chr3R 7666626 5' + I-element 54 1 50.68 ATTTTCAAATGCTTATATTAGTTTCCTGGCATAATTAGTAAACCTGCCCTGTGACAACGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTA:1 - chr2R 5538472 5' - pogo 15 1 60.27 CATGTTATAAAATAATGTTTAAATGTCCTTGGCCTTTTTTTCCATTTATCCCGCCGTTCTTCGTTTTTGTTCTTTTTTTTTGTTTAATTTACTT:1 + chr3L 14861279 5' - X-element 4719 2 88.30 GTAATTGACGTTGCCAAAAATTAAGAAAGAAAGAAAAACAAACAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGACAGGAGGATGGAGAAGATGT:1 + chrX 19354460 5' + G2 196 1 68.49 ATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACT:1 - chr3L 14366627 5' + roo 8599 1 74.66 CGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 + chrX 18817243 5' - transib2 2797 1 67.12 GACATACATATATTGTTTTGATTTTGCCCAACATATTTAGTTAGAAAAAATGTATGTATGCATTTAAAAAAAAATATTTGTTTTAATAGTAAAAAAAAGTAAAAGCATGAGAAATTTGTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTG:1 - chr2L 20117974 5' - Gypsy12A_LTR 1983 1 28.08 CGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 4964097 5' - roo 346 2 62.94 AAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 21216825 5' + roo 8718 2 56.85 TATCTAACAAATTGCCAATGTTACACTTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 + chr2L 14671769 5' + FB 10 1 78.77 TTAAGCAATTTAGTATTTTAACAGTTTCGGAAATAATATAAATACAAACTTTGGACATTTACCTACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCAATGCCTATAATAGTTTCCATTGAGTTTTGAAAAAAGAAAATTATGCTGC:1 + chrX 23041675 5' + mariner2 882 1 74.65 AAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chrX 18396091 5' - 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invader2 4732 1 47.95 AGAGATGTATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr3L 19454881 5' + mdg1 17 2 71.92 GTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23639237 5' - pogo 2033 1 68.49 ATTTTGCCATTGTCAGTAGCTCGTTCCGGTGGGGGGCAATGTTACTCTATAGAAAGCTGTGGCTTTTCGGGTTGGGGCTGAGTGGAGATTTTTGGGGGGGTCTAACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTTTTGTTTATTATTAAT:1 - chr3R 11937450 5' - flea 241 2 73.29 GCTCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2R 7303998 5' - pogo 2058 1 59.59 CCGTAAGAAGTGCAACTTCTTCGCCCTTCCTTTGGCAAACAGAATTGGTAAAAAAAAAACTTGAAATATAATTAAGCTGTTTTGTCGGACAGTTGCCGTCGCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT:1 + chrX 6156691 5' - Doc2-element 234 3 49.23 ACTGCTGGGAAAAGTAAGGAATATATCTTTGCAAATTCTTAATTTTTGGTTGTGATTATTGTGAAAACATGAATAAACGAAATGAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGACAACACTCAAAACTAGAATTA:2 - 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chr2R 8099214 5' - jockey 4928 1 66.43 AGCAGCGCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 27123618 5' - roo 9050 2 70.55 CAATCGCAAGCTAAAGCATCTGAATCTGGGTGAGCTTCTAGATAGCTTCAGTTTTGTTGCGTTTAACCAATTGCATTTGTTGCCCATTGCTCAAGCATTTTGTGGTGTCTCGGTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCG:1 - chrX 14235451 5' + Doc3-element 19 2 78.08 CATGGCTAATGCAAGCCGACGATTTACAAGTCGAATGGCCAGAACGGCATAGCCAACAACAACAGCCACAAGCAAAAGGCAAACGGCCAAAAGCATTAAATAAGAAAATTAAGCTCTTTCTCATACAAATTATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 16054580 5' + Doc 4695 2 79.17 GACTAAGTCAAAAATTTTCTAATCAAATAAATTTAACATTTTAATAGGTTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACACACATAA:1 + chr3R 9140479 5' + I-element 4950 1 67.81 ACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr3R 30347465 5' + P-element 4 2 47.76 CGGTGGTTGCCATTTGTTAGAGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 - chr3L 19111603 5' + Doc 28 1 60.58 AAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3L 8627354 5' - pogo 2070 1 47.14 CGTATGTTTCAGTCTTGATCGAGCATTTGCGTTCGAGAGTATCAAACCTCTGCTTCTTTGACTAGATATGATGGCGGCCTGGAAAACACTCGGTCTATCCTCCCCCATATGTACATTAATGATTAAGATCATGAAT:1 - chr2L 21829257 5' - Gypsy12A_LTR 2124 1 77.21 ACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 3920598 5' - roo 9020 2 54.11 AGCCGGGCTGTATTCGTTAGCCCTGCACCCGCGAGTTCAATTTGATTATGAATATGAATTTTAGCCAGTTTTGTGAGTTTTTAAAACTAAAGACAAAAAACTTAAGTTTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCACG:1 - chr3R 30172350 5' - gypsy4 156 2 54.11 AATTACAACAACATTTACTTGGGAATTACTTTGTTTTTCGTATTTCACTTCCACTTATTATTGGATAACCGAATTGGAATTATAATCCAAGTTGAAGAGTTTTCACGAATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAA:1 - chrX 8239724 5' - 297 482 1 75.86 AGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGT:1 + chr3R 12367510 5' + GATE 8134 1 48.63 AAGGCACAAAATCAAACACTTTGCTGGGCAAAGCAATCGAATAAAATCCAGTTTCGAGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGCCTAT:1 + chr2L 7009733 5' - Cr1a 4212 1 59.79 ATGACTCTTTTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chr3L 5489835 5' + jockey 19 1 69.86 ACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTATTTAGGAT:1 + chr3L 1279100 5' + roo 8742 2 71.72 CCTAACCCAACTTTTTTAAATTCAGAGTATGAGATTACTGAATTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr2R 5074616 5' + 1360 27 1 39.04 AGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCAC:1 + chr2L 14026133 5' + F-element 464 1 49.25 ACAAAGAGCCACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 + chr3R 19407856 5' + diver 16 2 73.10 GTTAAAGGCCTATCAAACGGAGACTTGAATTCAAAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGATACAACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chrX 585769 5' + Tirant 13 2 75.76 ATTTTTTGTATAATTCTGACATTATACAAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATAATTAATAAGAAAAATCAATATCAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAACACAATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATT:1 + chr3L 8085880 5' + Stalker 6839 2 73.97 CATACGAAACAATGAATCCCAGATACAAAACTTTAGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 + chrX 15357613 5' - hopper 1395 1 69.86 AGAGTGGCGCGGCGGCGAGCATTAAAATGTGATCCGATATAATACATGAATTATGTAAACTATTTTTATTTTTGTTTTGCCTATTTATTTTTGCATTTTTTCGCGTTAGCATTTTCAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1 - chr3R 7288577 5' + INE-1 553 1 74.66 ATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 + chr2R 17796539 5' + jockey 4706 1 56.59 ACGATCTATCAAGCCAACTTAAGCTACAGCTACTATTTCAAAACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGCGCCGAACAAATGAT:1 + chr3R 10735980 5' - McClintock 6417 2 76.71 ATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAA:1 - chrX 9950598 5' + jockey 4724 1 62.90 TATATTTATCTTAGCCGTCTTAAACTGTTCTCGTTTGAAATAGCCGTCTTTCAAATGTATTGAAAGTTAATTATGCAATGGATACAGAGCCTCTAAGTAGAAAAACCCTAAGATATTATTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 30669642 5' - hopper 161 1 85.38 ATGGATCGGGACTTCCTAAGATCTCCAAATAAATCGCTATATTTCTAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAAGAGGAAAGAAGACCGCAACCAGGAAAAGTCAAAAAAAAAAGGAAAGGAGGAA:1 + chr3R 27215173 5' + Bica 343 1 67.81 GGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr3L 18505661 5' - I-element 5277 1 69.86 GTAAGCCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 18126044 5' + Ivk 9 1 70.83 ACATAAATTCATGTGAAAGGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 - chr3L 11844867 5' + rover 6962 2 74.66 CAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACAC:2 + chr3R 15942711 5' + hopper 72 1 65.75 GTTTTCTTAAAAATTATTATTAAAAAGCGCGGAAG:1 + chr2L 8707329 5' + invader2 444 1 65.71 AGCTCAGTCAGTCACGATCGAACTCTCGCAGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGAT:1 + chr2R 6482458 5' - gypsy 381 2 74.82 AAATTAAATGGAGAATCGCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAAT:1 + chr3L 11844670 5' - rover 7286 2 74.65 TACATAAATTAAAAATATTTTATCTATTTGCTAAATTAAGTATCATTTAAACCATTTATGATGCTGTATGCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCAC:1 - chr3L 17949834 5' + 297 6508 1 73.29 GCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGCGAATTGAA:1 - chrX 11661491 5' + pogo 64 1 62.33 GAGTGAGTGGAAAATTATGCTGTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTC:1 + chr2L 15550628 5' + Bari1 29 1 66.44 TCAATTAAAAACTAAACGAAATCGTAATTTGTATCGGTCAATATATATCTGATTTATTACGACACCGTGACGCTCAGAAACGCGGCGCAAACCCCAGAGTGGATTTGCAGGTTTATGTTGCAGTTTACGGCTGACCGGACT:1 + chrX 12213227 5' - Rt1a 65 1 67.38 GAGGGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3R 9594983 5' - Tirant 8481 2 63.57 CCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGGGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 16690731 5' - P-element 2835 1 47.26 AATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 + chr3R 19407871 5' + diver 32 2 62.33 TAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:5 + chr2R 15326860 5' - copia 5078 2 70.55 TAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr3L 2544602 5' + Tirant 33 2 60.00 CGATTTCAATCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGACAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAA:1 + chr2L 12822820 5' + P-element 102 1 15.17 AAAGCAGAAACTGACCTAACTTACCCCCAGCCCAATTTCCGACATTTATCCGACCTCAATTTCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAG:1 - chr2R 23180323 5' - roo 9047 1 64.08 AACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACA:1 - chrX 6116325 5' - transib2 2742 1 73.97 ATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2L 13158663 5' - roo 324 2 75.86 TATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 - chr3R 30059469 5' + FB 81 1 73.97 GGAATCTGTTGACTAAATTGTGTTGATTAGCTGGGCATGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAA:1 + chr2R 12667417 5' - Doc 4398 1 73.97 GAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 - chr3R 30347409 5' + P-element 61 1 41.10 GCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCT:2 - chr3L 16973465 5' - S-element 1656 2 62.33 TGGGAATGCAAGTGTTTTGTTTTCGCTGCACTTGCTTGCGGTTAAGAATTGGGAACACGTCCAGGGTCACTGCAGAGGGGGGGTGGGGGGTTAAATTGACCCATGCTCTCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAAC:1 - chr2L 20821366 5' + Burdock 6135 1 82.88 ATTGAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAAAGTATAGTGAAGGTTAAACACA:1 + chr2L 2157852 5' + Doc 79 1 45.89 ACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 20898648 5' - roo 9033 1 59.59 AGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr3R 6419806 5' - Tabor 461 2 66.90 ATGGTTAATCTGCCTAAGCGATCCAAACAGAAATATTAAGTTCTTACTTAAGAAAGGGATTAGCATCAGCCTTGAAATATATGAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr3R 15325053 5' + 297 33 2 63.70 GTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTATTGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTTTTTATGAGTCGAACTAATGTCCCTTCAGTTGACTAAG:1 + chrY 2720331 5' - 297 360 2 64.52 AAAATTTAAAAATTGTTTAAAAGTGTTGCCGTTCCCGTTTTGGTCGTTTTGTTGGTAAAATGAGGGGCGTGGCCACAGTGCACTATGAGTAAAATTTTACCCATTTTATTTTTGGTATTAATTACAATTTTAAAGTTAGCGACTTG:1 - chrX 21452468 5' - transib4 2597 1 43.84 AATCGAGAGTATTAAAGTAGCTTCAACATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 - chr2L 3675954 5' - Juan 4171 1 50.00 CATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 18226780 5' - roo 9004 2 65.75 AAAAGTCCCGTAAATCAAAAATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTGAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 + chrX 1341581 5' - 412 7538 2 75.00 ATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTTTAGATGGGGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTCGGCTCCGTTCATTTCTTACGTAAATGAATCGAGTGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 27986428 5' + roo 8737 2 65.71 ATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAGGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCTACCAATTAGTTT:1 - chr3R 8890101 5' + FB 77 1 67.12 GGACGAACAATAAAGAATGATTAACTAAATATGCAATTGCATCTCCTGATAACATTATATCAGCAGTGTATGCAGTTTTAGTCAGCTTACTAATTTACAAATTAAGAATCCACTTTTGATGATTCCTTAATAAATAAATTAATAAA:2 + chr2L 14700680 5' + X-element 4712 1 63.70 GCACACAAATATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 + chr3R 19992607 5' + hopper 27 1 63.77 CAGCTAATGCAATTGTTAGCCCATCGCCATCGACCTGTTGGCCATATAGTCATCTATATACATACATATATATAAACGCGTCATTAAACTGTTCCATTTTACGCGAGCGGAGAGAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAA:1 - chr2L 2935507 5' + 1360 3325 1 35.21 TAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTTCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGTTCAACTAGACATA:1 + chr3R 10270577 5' + Juan 4092 1 57.93 GGAAGTGCCGCGTATTTTAAAATAAATGCGCGTGGGGGCTGTCGTGGGGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTA:1 - chr2R 14440791 5' + copia 243 1 71.03 TTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAA:1 + chr2L 17180087 5' - Juan 4140 1 65.75 GTTGCAACACCTGCTCGGATGTGGCTCCTTTCCATCCCGGAGCACCGCTTAGAATGCCGGGCAACTGCGGAGCAACAAAAAGGAGCACACGCACCCCAACCACCCAGCGCGAGGGCTA:1 + chr3L 18693750 5' + F-element 4474 1 70.34 ATGATATAACTGGCTTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 - chr3R 9298612 5' + hopper 13 1 75.17 TGATACGAATGTGAAGTGACGCAGCAGCAGCAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGAT:1 + chr3R 23067415 5' + roo 9004 2 50.68 ATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTTATTCATCGCTT:1 + chr3L 11913204 5' + BS 5070 1 67.81 AATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr3L 24131524 5' - Transpac 5195 2 61.64 CGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGGTTCACGA:1 - chrX 13490726 5' - 297 6892 2 81.51 CCTACTACCGCCACAATTGATCAAACTATTTTTCGCAAATGTTTTGCTATATTTTGCGATTTGTTTTTATGCACACTCTCGTTTCGTTTTGGAACAACACGCGCCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCAC:1 + chr2L 5152699 5' + roo 200 2 71.03 GACAACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2L 16690763 5' - P-element 2867 1 70.55 AATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTC:1 + chrX 8092349 5' - pogo 2077 1 68.75 GTTTCCAAAGTTCTGATGGGGAGTGTTGTATATCCGCTTGTGTATCCAATAACCGCAGCGCAGCCCCCAAATGCTTTTGTTATTTATTATCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2R 16817845 5' - 412 465 2 65.03 TATTTACTTCATTTTGCCCTACTCTTCAGAGAAACCCAACTACAATTGATATTTCGCTTGATATATGAATATATATATATTTTTTTTTGCTTTTCTGC:1 + chrX 11475558 5' - transib1 30 1 58.16 CCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTNACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 - chr3L 23287287 5' - 1360 3316 1 77.60 ACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAAA:1 - chr3L 21327145 5' + copia 4936 2 73.98 AGACACCGAGTGCTGGGAAAATCTATTTTCACATTCGATCTGTTTTTTATTATGGGCTCTTCAAATTGTGAACCTGTATTGAAAATAGTTAATAAATAAATAATAAATAATATAATAAATAAATAAATAAATAATAAAAATAATAA:1 + chr2L 15942712 5' + BS 5094 1 60.96 AACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAA:1 - chr4 829132 5' - INE-1 153 1 70.55 AATGCGATGTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:2 + chr3R 24729527 5' - Juan 4201 1 64.38 GGGAATCGGAAGAATGTTTTAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 + chr3L 15103817 5' - Transpac 5207 2 53.19 GTCTTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATG:1 - chr2L 16548587 5' + micropia 4 2 79.71 AAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:2 - chrX 22840570 5' - copia 191 2 60.27 GTGGTTTCAAATTTTTCTTGCTTTTGCAGTTGAATGGAGCTGTCACTCAGACAGACACACTCGCTCACACGCACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGT:1 - chrX 15409599 5' + Quasimodo 103 2 56.85 CTGATAAAGCAAACAAAAAGCCCACAGCAAGTATAACATGTTAATTAACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:2 + chr3L 18505602 5' - I-element 5336 1 76.03 ATAAAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 19073154 5' + roo 8696 2 58.22 ACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr3R 13972959 5' + 412 65 2 63.57 AAATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2R 22034609 5' - copia 235 1 71.23 GTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTAACTC:1 + chr3L 23797661 5' + Helena 1166 1 50.00 TAAAAGAAAATTTTATTAACATTTTCTTTGTACATCTCGCTTTGTTCAGTCATTTTACAGTATTATTTCAAACAAAACGCTAGGCTTGACATAAGTTGCTGCACTTGAAAAAAAAATTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATG:1 - chr2L 9191570 5' - Stalker4 83 4 73.29 ACTGCCATTTATAATCCGGCAACCCAACCCATTCCCATTTCATCTGGGATACCATGCACACGCATGGCATGTAAGGCTGTGACCTGTAAACTGTAACCTGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAAGTTC:1 + chr3L 15944841 5' - 1360 236 1 52.74 GGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACAGGAACACCGCATC:1 - chrX 585722 5' + Tirant 68 2 64.29 ACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr2L 71275 5' + 412 57 2 55.48 TAATAATTTCCTCGTTCTTAGGTAATGCCCTTCCTATTGAGGAGCGTATCAATGGCGAAAATGGGTGGTTTGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATAAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAAG:1 - chr3R 27018186 5' + roo 8844 2 55.48 ATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 + chr2R 17796525 5' + jockey 4708 1 60.00 TAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chr3R 11937260 5' + flea 4776 2 73.97 TAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAGATGACAAC:1 + chr2R 17926292 5' - opus 7450 2 58.22 TGTGATGAAGCGGTAATATTAATGTTCATATCTGTGTGAATGTATCTCGTTTGCTTGTTTTTTTGTTTGTTTTCGCCGTTTGCTATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTACAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTCATAAAA:2 - chr2R 10528626 5' + S-element 1618 2 43.15 GAGGGTGATTAGAGATAAATTCAATTACGATTTTCGGGCGGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATAT:1 + chr3L 24764647 5' - 1360 3151 1 66.27 AATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 585735 5' + Tirant 8146 2 53.23 TGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATATTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTTACATTAGAATCGCATCT:1 + chr3R 19449977 5' - roo 8989 2 72.26 GTGTTTAAAGTATAATGAAAAAATTGTCGATTTCGTTGCGAGAAAGAATAAAAATAAAAGCTAAACAAACAACAAATAAAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAGACTAGAATTACATAA:1 + chr2R 12274549 5' + Porto1 4210 1 63.70 ACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - chr3R 17673828 5' + FB 36 1 57.94 AAGTGGTTTTAACTACTGTATTGTGTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCT:1 + chr2L 7618437 5' - X-element 4675 1 54.11 TTATCAAAATCAGCTGTTCGGAAGCTGACTTCAAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2R 10417082 5' + 1360 10 2 77.40 CAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 15791001 5' - roo 9030 1 58.68 GGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3L 17940154 5' - 1360 3367 1 77.27 TTATATACAAAATTTTTTTATGTAATACAATTTTAATACCCGTTACTCCTAGAGTAAAAGGGTATAATAGATTCGTTAGAAACAATTTATCAGGCATAATGGATCATATATATGTATATATATATTCTTGGTCAGGATCAATAGCC:1 - chr3L 22956165 5' + INE-1 87 1 71.92 CTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 2990024 5' + roo 73 2 69.86 ACCACAGGACAGCCCACTTTGGACCCCAGCCCTCAGAAAATCCCATTCCCACATCCTTTTTGGGTTGTTTGTTTTTGTGTTGTTTTGGGCGTGCGCCGCCTGTTTGTCGAAAGTGGCCCGATCTTTTTTTTTTCCTTTTCCTTTC:1 + chrX 12395074 5' - Doc2-element 239 1 59.31 CTCGATATCATATGTATGTACATGTAATATTAGATGTACATTTGCGTTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCGTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATA:1 + chr3L 24031880 5' + Tc1 85 1 70.42 GTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 - chr2R 11804707 5' + pogo 83 1 75.34 ACAATTAAATATATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTT:1 + chr2L 16539594 5' - Juan 4211 1 82.88 CGATAACGAGCCAAGCAATTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATTACACCCTTGATGAAATAACATAAGGTGGACCCGGCGG:1 + chr2R 13931525 5' - P-element 2876 1 66.02 AAACTATGTTTTTAAGAAGTTAGTTGCAGTTATAAAGAATGTCAATTCCGAATTAAGTGTATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACCTGTTATAGTTAAGATTTTTA:1 - chrX 13987921 5' + F-element 4614 1 57.53 TTTTTATATTGTGTTTCGATATGGTGTGATGTTTTTGTGATGCAAGATAATAAACATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTA:1 + chr3R 25708689 5' + hopper 1268 1 62.33 TCATAGCTGCTGCTGAAATATTTCAGGTATTTTGCAAGTATATATATAAAGTATTTGTATATATTTTTGATCAATAGCCGAGTCGATCGGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAACTATAAAATCTAG:1 - chrX 711823 5' + INE-1 152 1 68.75 AAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCT:1 + chr3R 19225009 5' + HMS-Beagle 6875 2 72.60 TATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCT:1 + chr2L 13844134 5' - Stalker2 7615 2 58.62 TACATACATATATACTCTAAGTGCAGCCTGGCAACAGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATT:1 - chr3R 9048741 5' + Juan 4010 1 57.53 TGCGCTTGTCAACGAAATTGTTAACGTTATATTTTTTCGTCGGCCATCGTCACAAAAATAAATAACAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2R 880379 5' - copia 233 1 55.48 ATAGGCAAACAGGTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAA:1 + chr3R 9557528 5' + G2 3041 2 60.96 GGATGCGTGATGCAGCCAAGTAAATGTGCTGGCCACCACCATCTCCACCGATTATGTGCTCTTTAAACATTTTCCTTTTCAATTTTCTTTGGCTAGTTCTTGATCATATGGAAAAGATGGCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTAC:1 + chrX 12432536 5' - blood 165 2 74.66 TTTGACAAGCCTTTAATGCCAAAAAAGGTTAAACGTACATTAGGAGTATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCC:1 - chr2R 4785377 5' - Juan 4206 1 78.77 GTTTTACAAAGAGGAATATTCAAATGTTCTTCTTACATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTAATCTACCGTACCACT:1 - chrX 17007249 5' + Circe 85 2 63.96 ATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTAC:1 + chr2R 1320668 5' - diver2 315 2 48.63 ATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTACTGTAAGCAACTGCTTTTATCTGGAAATATCT:1 - chrX 7795613 5' - roo 9022 2 51.11 TACAACTTTAATTGTATTTCTTCATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATTCTTAATATAATTTATC:1 + chr2L 46640 5' - roo 8745 2 68.67 GTTGCAACACCTGCTCGGATGTGGCTCCTTTCCATCCCGGAGCACCGCTTAGAATGCTGGGCAACTGCGGAGCAACAAAAAGGAGCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGGCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCC:1 + chr3L 18693750 5' + F-element 4502 1 58.22 AGAGTTGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGCAT:1 + chr3R 23618112 5' - hopper 1367 1 52.74 TTATTTGCTTATAAAAGAAATGCTCAATCCTTTCTCATTCAAATCCCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 - chr2L 14671952 5' + FB 30 1 62.33 TCCCTATTCTTATACTATAATTCATTTCATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTTAAAACAAAAAAAAAAATGAAATTTCGTTGACTCC:1 - chr2L 4124274 5' + transib2 2655 1 70.53 TATACCATTATGTATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 14980276 5' - roo 9043 1 65.75 AGAAGGAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chr3L 22744734 5' + FB 51 1 61.38 ATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr2L 10156077 5' - hopper 1386 1 63.01 AGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAACCGAATTTTTG:1 - chr3R 16630367 5' + FB 17 1 64.81 GAGGCTTTGGATATTCCATGAGATCAGAGATCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCCAAC:1 + chr3R 18596986 5' + Doc 451 1 80.00 AAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTCGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chrX 19539580 5' - pogo 2085 1 49.61 GCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3R 23295601 5' - P-element 2852 1 32.88 ACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1 - chrX 4808595 5' + mdg3 5331 2 69.18 AATTTCCCACCATGCCATGCCACAACGCACCGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 24733538 5' + hobo 40 1 68.37 CCTGCTGGCTGTCTTCCTTTGACTTGCCGTGCATAATTAAATCAGATCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATATAGCTCTGGGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTTA:1 + chr3R 28436136 5' + G4 3457 1 66.44 CTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2R 19199769 5' - hopper 1376 1 45.21 GTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGAGACTCTTTTATTTTTTATCTGTCCTTTAGCTTC:1 - chr2R 20802672 5' - mdg3 189 2 50.00 TATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGGATGCGGGTAGTCGCGGGTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 + chr3R 25554216 5' + micropia 40 4 56.85 GCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 - chrX 14450516 5' + hopper 34 1 60.43 AGGTGCTTGGAACTGATCGCCATCGCCTCCTATACATGCAACTGTGGGGAACATCTGGCAACTCTAACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCAATGGTATATGACTAATGATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTTAA:1 + chr2R 5301878 5' + G3 4329 1 76.03 TTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 16033414 5' + Doc 57 1 60.80 GGTATAAATATAATAGAATAACAAAAACTCGTGACGCGAATGTATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGATGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGG:1 + chr2L 18689428 5' - gypsy6 126 2 74.66 AGTACACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACAATAACAATATATACAAGTCTTTAGACTACGAAAACAAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAA:1 - chr3L 25237732 5' + I-element 5129 1 57.64 ACGCCTGACCACGCCTACCTCGCGGCAAGGCGGCAGTGATGCCGCCTCCTCGAGCGGAGAAAATATTACATAAATTTACCTATATGCAATAGATGTGCCACAACACAGATATGACAAGATATATATATTTTTATATTTATATT:1 + chr3L 19514447 5' - Stalker4 90 4 60.84 TTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAG:1 + chr3R 3851032 5' + transib2 79 1 69.18 GATGGCTAAGTTGAATGAGCCAAACGCGTCGCAGACAAGACACACAAATAAAGAAATCCAAAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTA:1 + chr3R 23911313 5' + 3S18 35 2 61.64 GGGGTGGTTCGCTGCCCAAAGTGGGCGGCGCAGAGTGGGAGTGGTTAACTAAGTTAATCGGACTGATCGTCCGCTGACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCGAGC:1 - chr2R 8021697 5' + gypsy3 39 2 69.60 ATCGAAGCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTAC:1 - chr2R 23780667 5' + Ivk 7 1 79.45 CTTCACATCCCGAAAAGGTTTCGTTTGGGCTCCACTGCGAAGCTCTTTCCTTTTGTACAAATACCAAAACTAGTTATAATTTAGTTATGTTACTTTAGTTTGTAATTAAGTCTAGGTTGTACGCGGGTAGGAGCGGGGG:1 - chr2L 8943763 5' + invader1 3733 2 82.01 ATTCTTTAATTTAAACATTTAATACATAATTTTGTCTAATGGCCTGTATTTATGAAGTTTTGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACGATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACA:1 + chr3R 2973429 5' + Cr1a 4169 1 72.22 TTATATAACTCGTTATATAGCACATATGTGCTCCATCTACATATGTACTTGCTTTTCAGCAAACTGGGTGTTGGCGTGGCCCAGAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr2L 16274910 5' + FB 17 1 70.31 ACTAATGCAAATCGTAGACTATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chrX 18396216 5' + roo 8690 2 67.81 AATGTACAATTTAATTAAATGTTTACACTTGCTCTTGGAAGTTTGTGTAAAAAATAAAATGTTTTTTGAAGAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 - chr3R 5524048 5' + FB 16 1 73.29 AATAAAGAATGATTAACTAAATATGCAATTGCATCTCCTGATAACATTATATCAGCAGTGTATGCAGTTTTAGTCAGCTTACTAATTTACAAATTAAGAATCCACTTTTGATGATTCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14700688 5' + jockey2 3405 2 58.22 TTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATTATCATTATACGGAGCTCGATGATAACACATCTGTTCACTTGAAATGCCACAGAGAAAAATTCTAATGACAAATATTCTTATATAAACT:2 + chr3R 25099124 5' - 1360 390 1 49.32 ATTTTTTCACTGCACTCATACGAGTACCGACCAATTTAATTCATTACGCACTGTGGCCAATGATCAGTTAAAATAAAGCAACGTTCCATTAGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTACAGAGT:1 - chr2R 9993761 5' - mdg3 5042 1 58.22 AATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGTC:1 + chrX 6688961 5' - INE-1 120 1 63.01 ATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 24219294 5' + roo 86 2 78.08 CACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGGAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGC:1 + chr3L 20189602 5' - FB 202 1 51.37 AAGTTCCTCGACCAATTCTCCCCATTCTCACTGGGACGTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACG:1 + chr3L 22760330 5' + F-element 110 1 59.59 AAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCAGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 + chr2L 6654611 5' + diver 5912 2 67.81 CAGGAACAGGCAAAGTAAATTTCACGCGAATGTGCAATGTGAAAAAAGCGAAGAGCCGAGCGATTGAGCTATTAAAAAGTCATAATTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATT:1 - chr2L 7342232 5' + G5 4795 1 58.22 ATTATTTAGTTGCAACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 - chr2R 330247 5' + HMS-Beagle2 6913 2 63.70 ATTTCGTAATTGAGGTCTAGGAAAAATTCCAGGAAATTACAATCCGTGCAAAATTTTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATAAGTTTTTTTT:1 - chr2L 22252579 5' + FB 82 1 79.45 GGGGAAAACTTTTTTGTGTGCGCGCCCCAAAGTATGCAGCTAAAAAGGAAAATGCTGCGAGTGCTCCAGTTTTTCGCCTTCCCGGTTCAGTGTCCGACAATGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGG:1 - chrX 5436881 5' - Tirant 8123 2 50.00 TATGTTTGTAGATTTATAATTTTCAAATTTCAACCTTGCAAAGTTTTGGAAAGCAATATCAACTTGTATCCAATATAAAAAGAAGAGAGAATGCTATTGTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACT:1 - chr3L 23257477 5' - INE-1 557 1 68.22 AGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3L 9809340 5' - 412 427 2 62.24 AAATGCGCTGCGAAAAAATAGTCCATAATACTCCAAAACTTATATTTTTTTAGTGAATAAAAAAGCATATTCTAAAGATAGAATTTTAAAATACAAAATTCTAACATAGAAAAACTGATTAAATATAAATAAATATAAATATATAA:1 + chr3L 15446935 5' + diver2 447 1 67.81 CACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3L 12315799 5' - transib2 2739 1 74.66 CGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:2 - chr2R 5941440 5' + copia 52 2 51.37 ATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATTGTTAGCTTCATTGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3L 11326745 5' + pogo 48 1 74.04 CGTGTATGATTTCGTATCAAAAAGCTATTGGAGGCTATTACTACGCAGCAGGCAAATTAATCAAGCGTGCAAAAAAATCAAGAACCCCAACCAATACAAATAACCGTACCAAATAAAATACATATATTATATATACATATATATG:1 + chr3L 7906127 5' - Stalker2 7505 2 86.21 GAAAATACTTCAAATATGTTTGCAATTAGAGCTCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTC:1 + chr2R 7303967 5' - pogo 2088 1 78.08 ACTCACGTGTCCTTGGAAATTTCCTGGTTGTCTGGCTTTCGGCCTGCTCGCCTGTTGTTATCTCGCATCCTTGCCTGTAAAAGACATATGCGAAGCTACTAATAG:1 + chr2L 15082205 5' + hopper 391 1 71.43 ATAAAAACTATATATATATATAACTATATAAAAACTATATATATATATATATAACATATATATATATATATATATATAAAAAAAAATATATATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATAAAATATA:1 - chrX 10298027 5' - transib1 1907 1 73.10 TTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 11257442 5' - 1360 3374 1 71.65 ATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAAA:2 - chr2R 6622633 5' - S-element 1631 2 77.40 ATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 - chr3R 11062866 5' - roo 9044 1 63.70 TTTGGCAATTTTTGCATAATTTCGGACAAATTTACTATGCCAGATCCATTTCACATAATGATGGAATCGGATACTTCATAATTGTGGAAATTTTCTCAGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGC:1 - chr2R 2880018 5' - TLD2_LTR 180 1 57.93 TTCATGTGCCCACACCCATCCACACATATATACTTAATCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGACGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACACTTTTTTTTTACTTTTCTTAT:3 + chr3R 22480639 5' - invader2 4750 1 74.66 GAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 21224519 5' + roo 42 2 56.85 GACTATATTATCTGTGTAAATATTAAAGATAAGCCAAGTTTCTCGAAACAAAGTGGGCTTGTCTAAAGTAACACAGTTTTGAAATGCACCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCC:1 + chr2L 10322435 5' + FB 761 3 60.27 ATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 27986329 5' - roo 9028 1 57.24 AAATACAGCACAACATGTAAATGCTTCAAAACACGCACATAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAATTCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATT:1 - chrX 15347377 5' + Max-element 382 1 72.60 TTACTTTTACTGTAGATTCGTGAGATTTATGCGATTTAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATAC:1 - chr2R 9328336 5' - Tirant 306 2 74.66 ATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGTGCCGTTT:1 + chr2L 4642955 5' + F-element 4548 1 78.42 AGTTTCAATATTTTGGCGCCCAACGTGTGGCATACTAATTACAAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGT:1 - chr2R 15081905 5' - Cr1a 4182 1 71.23 GAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3L 18281867 5' + Doc 16 1 62.07 AAAATCCGAGAGCAAATGAAAACGACGATGCGCTGGGTGCGGCTGCCAGAGTTAAAAAGTAGGGGACCGCCCATTGACGCCCTAGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAAGTGTTTAAATTAGGAG:1 + chrX 22731499 5' - Idefix 7018 2 46.67 CGATCGACGCGAACCCGGCAATGAGCGCGAGAAGTCCTTGCCCAGCTGGTAGACCTCCACCTCCATGGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGC:1 + chr3L 2666113 5' - gypsy12 10168 2 57.98 AAAAAAACAATGACGAATGGCCTGCAAAAACGGGGTTTAATTACAAGAAAACAACACGGAGAACTCCTGTATGTACACAATATTGTTTTTGTATGGCATAACAGTAGACCATACGTAGTAAATCATTTTTATTTTGTTTATTGTT:1 + chr2R 8546538 5' - Porto1 190 1 50.34 ATCAAATTTCGCCTCGCAGACATGAAAGGAGTGGGCGGGGCAAATGAAATGAAATCAAATTACATTAACATAAAATTTAATATCAGCATACTGTGTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGCGTGTGTGTG:1 - chr3L 9961104 5' - accord 190 2 76.64 TTAGAATAAACTTGTCCTGTGTGTACGTCAATACGTATGATGATATAATAATCTTTTCTAATACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACACATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAG:1 - chr3L 25106651 5' + TLD2_LTR 153 1 66.44 TGTTTTTTTAGTCTGATTGCATTAATCTCGTAGCGCTCGATCAAGTCAATTAAACAAGATAGGTAATAAAATATCGATAAGCATGAAACATTCCAAGGTATAAAAAAACAATGTGTTTTATTTTTTATTTGTTTTTTTTTTTAATA:1 - chr2L 5207167 5' + hopper 153 1 58.90 ACGAGTAAAAATGTCCGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATTATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr3R 26774135 5' + hobo 15 1 69.11 TTATTTGAATGTTCTACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCAC:2 + chrX 14450361 5' - hopper 1388 1 64.38 CATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAG:1 + chr3R 2522285 5' + Tc1-2 110 1 53.52 ATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chrX 18239413 5' + jockey 83 1 68.49 CAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTA:1 - chr3R 15790105 5' + flea 4749 1 57.24 GCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 11164490 5' + roo 76 2 73.97 ATGTGTTGGTGGGGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAG:1 - 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chr3R 25533533 5' - F-element 355 1 59.42 ATTTACATTTGAGGAAGTGCAGTTCCCTCGGGACTCAGAAAAGTTAAATGTAAACATGCGGGGGGTTTTGTAGAGGTGACTAAAAGCAGTGGGTAATAAAGTCTCGATGAATAATCGA:1 - chr3R 14872392 5' + gypsy12 29 2 51.69 GAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAATTTCTAAAAACTACAA:1 - chr3L 16033436 5' + Doc 56 1 51.37 GCTTACAAATTTGAAAAGATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 12986486 5' - roo 393 1 73.29 CTAAGATACATTTGCTAGACAAAACCCGCTCGCGGGATCTTTGACCTGCTGGGACTTCTCAAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 + chr3R 24893869 5' + transib2 2 1 54.79 CTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTG:1 - chr2L 9782132 5' - P-element 71 1 20.55 AAGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 11810604 5' + roo 31 2 63.01 ATAAACGTGAAAATTTATTGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGATTACAAA:1 - 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diver2 4840 2 53.42 AAAACCAATAAGCCCTTCCGCCAAATAACACTTTTTCCTTTGTGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCCTTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGAT:1 - chr2L 12818388 5' - hobo 471 1 74.51 AGGTGGTCAGTTGGTCTGGTCGCGATGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chrX 17093458 5' + 412 7116 2 63.01 ACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAT:1 + chr3R 23067469 5' + roo 395 1 55.48 AAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCAC:1 + chrX 20999525 5' - BS 5013 1 74.66 ACCGATGGAGCTGCTCCGGCGGCACTGCCGTTGTTGGTCGCAGTTTTGGTTTCCGATTTTTTCATGGTTTCTCTCACTTTGTGGCCTCGAAAGACGGCTTGGATTTTTGTTGCGGCTTATATAATAAAAATAATAATAATAATAA:1 - chr2R 15180612 5' + mdg1 29 15 80.69 GGATCTTTGGGTTGGGGGAATATTTGGTAAATATCGTTGTTCATTCCCACGGAGGTGGCCCTTGATGCCATTGTCCGGCCACTAATTGCCACAAGTGTTCCGCTCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTAT:1 + chr2R 25045724 5' - 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chr2R 22514177 5' - P-element 2804 1 28.77 GTGTTGTTTAGGTTCGAATTCTTTTTTTTTCCTTTGTTCG:1 + chrX 7392216 5' - gypsy2 398 1 87.50 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACACCAGCTTCTTTGAGCTTCTAATTGCGACTTAAAAAAATTTTCATTTTCAATTTTCGAACTTTTTGAAAATTCAGATCTCGAAAACTGGACGTGGGCAAA:1 + chr2R 1522953 5' - FB 101 1 56.85 TTGAAGTTTGCCTTTAGTGTGTTGATTTTTCGATTATTTGTTTAGTGGATTTCAGTGTGTTTTGCGGCCGTGTGTGTGGGTTGTGCACACACTGGGATTCTCGGTTAAATTTGTTGTTTGTTTT:1 - chr3L 5744386 5' - gypsy7 5020 1 70.16 CTGCTTTGGCGCACGCGCACCGAGCCACGTGTGCGAGCGAGACGCCAGCAGTATTGCTGCGCTGGAAGTACAAGCAAAGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr3R 13875185 5' - P-element 2871 1 74.66 CAATAAAATCAAATAAATATATCGTTTGAGGCCAGGGCCATCCACCTGAGATCCGCACGCATATAAATAACCAATGATGCGGCATTTATCTGAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTAT:1 - chr2R 16385345 5' + 1360 172 1 61.64 ATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr3L 24131487 5' - Transpac 239 2 66.44 CAACTGCACGAACTGCACCAACCCATTCCCATTCCCATCCCCATCTCCATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTG:1 - chrX 21228470 5' + I-element 5192 1 66.44 CTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 30347450 5' - P-element 2865 1 65.22 TTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3L 9809261 5' + 412 7128 2 68.49 CTATTATCTTATACACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 - chr3R 15882631 5' - jockey 4920 1 71.43 CTAGAATTATATTGACAATTGCTTTTGAAAATCGGTTTTATATCGAAATTATATATTAATATAAAAAAAAA:1 - chr3L 11511205 5' + Rt1a 5070 1 46.48 ATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:2 - chr3R 15325193 5' + 297 6632 2 57.53 ATTATATTATACATCTGTACTGATTTGAATGGATGAAAAATTTTTAAAAGTGTTAACAGATTTAACGTTATGAATTTTCTTGCAGTACCATAGATTTTAACTGCTGAATACTCACTCAAATATTTTAATATATTTATTTTATATTA:2 + chr3R 18544614 5' + Cr1a 4314 1 78.77 ACTTTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 + chr3R 18093299 5' - I-element 5280 1 70.55 TTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chr3R 4679434 5' + hopper 2 2 75.73 TGGATTTAGGATTGTCCTGAGCCCTTCGCTAGGACAACGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTT:1 - chr3R 16339825 5' - P-element 2648 1 28.28 AGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCA:2 - chr2L 9038251 5' + I-element 90 1 74.66 GGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr4 372955 5' - pogo 2038 1 63.01 CTCCAAAACCTAAGCCTAAGCCACTCCACACTCGACCATGCCACATCAGTCCATGGAACACCATCCTGCTGACGACAACCACGCAACTCCTTTCCAAGACCGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACA:1 - chr3R 21898127 5' + HeT-A 6019 1 38.36 AAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCG:1 - chr3R 10736160 5' + McClintock 29 2 62.33 ATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAAC:2 + chr3R 19449919 5' + roo 9036 1 78.08 TTATTAAAAAGTGCTTGCTACAACTCGTTGATTACCGTCCTTAAAATCGAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTA:2 - chrX 16361648 5' + Tc1 32 1 73.97 GAAAGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCCGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCCG:1 + chr2R 18514856 5' - P-element 361 1 57.53 ACACGAAGCGCAAATATGCGAAATCTCTTCAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGG:1 + chr3R 11763355 5' - F-element 277 1 70.00 ATCCTCACAAAAAGGCATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 - chr2R 21411018 5' + Burdock 6148 2 76.71 CCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATT:2 + chr3R 21276529 5' + BS 5053 1 54.79 ATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 - chr3R 30059468 5' + FB 82 1 74.66 AACTCATAGAGGAAAAGGGTATACAAGTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATAAATTA:1 + chr3L 25481527 5' - Cr1a 4149 1 71.23 GCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr3L 18403051 5' - P-element 2814 1 36.30 ATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAA:1 + chr3R 19450189 5' + roo 9040 1 56.16 TAAAAGGATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGTCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGTCAGTTTTTTTTACAAAAATTTATACCTCCTAAACTGTTGGAGTTATT:1 + chr2L 16946021 5' + hopper 44 1 46.38 CCTCACTCAACTTTATGTCCTTCCCTTCTATTGCTTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2L 16690371 5' - P-element 2842 1 31.30 ATAGGGGTATATAGACTAATCTGAGATCAATTGCATTACACTCCTTTAGACATGTACCACCCATATACAAAAGAAACATGGAATTCAAAATCGAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATACAATACCAACTTGTCCGT:2 + chr3L 4097029 5' + I-element 4995 1 62.33 AACGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chrX 19038330 5' - hopper 1392 1 68.49 TTTTGTCTTTTATCTGTTTCTTTTCATTTTATTATTTAATCATTATCCTTTTGCTTATCCAGCCAGGAATACAGAAATGTTAAGAAATACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAA:1 - chr2L 9728451 5' + P-element 2666 1 17.12 ATGAAANTTCGAAAATATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chrX 8360657 5' - roo 9040 1 63.70 ATTAGGTCATTGTATTCAAGTACTACTTAATAAGCAATTTCTAATTTTAATTAAAGCCTTTTTGCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:1 - chrX 696589 5' + FB 59 1 55.48 GATCCCTAGCCGTAGCCCCTGCCCCTTCCCCCCCACCCCCCCCCA:1 + chr2L 20292766 5' + accord2 225 1 77.78 ACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 - chr3L 16470366 5' + jockey 4720 1 54.89 TGGGAGTAACTGTTTCTATAAAATTTAATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATT:2 + chr2L 22255030 5' + 1360 190 1 58.22 ATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTC:2 + chr3R 19450203 5' + roo 9054 2 53.42 CTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAG:1 + chr3L 16973366 5' - S-element 132 2 56.85 AGGCGGTAGGATACCGAAAAGAAAGTACTAGTAAGTCCGTATTCCTTTCAATATCAAGTGAAAAGGTAAAACGAAATATTATCAATAAAAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATG:1 + chr2R 4134136 5' - FB 940 4 66.21 ACACCAGGTCATTTTTTAATTGGAAGACCACCTTTAGAAATAGTCGAACCAATGGAAGATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAA:1 + chr3R 19447744 5' + I-element 379 1 60.27 ACATGACACCCTCGTTCCTAATGTTATTATTGCTAATGTCGATTAGCTCCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATCGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 + chr2L 6640042 5' + I-element 4929 1 67.12 TTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 + chr2L 16539620 5' - Juan 4185 1 66.44 ATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGGTGCCTCCAGAAACG:1 + chr3L 15103795 5' - Transpac 258 2 50.68 GGTCATCGAAGGTACATTTTCCAATTTATTTTTCGATTGTTCCAATGGCACCTATATAATATAGTGGTCCGGACTCGACTTAAAGATAGCAAAATGAAAACGTTTTAAATGTGTGGGCGTGACAGTTT:1 + chrX 22663770 5' - INE-1 246 1 76.56 ATATTTGTCATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr3L 8627386 5' - pogo 2096 1 41.10 AACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chr3R 17996249 5' - diver 6034 2 69.86 CTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 19073278 5' - roo 341 2 64.38 AGCGGCTCAAGTCAGCTTCCGCATGCCAAAAAGCCGACAGCCAACAATAATAATAAAAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAA:1 - chr2R 21116737 5' + mdg1 7064 8 66.44 ATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTT:1 + chr2R 9966951 5' - Bari1 1689 1 43.94 CCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTTTTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 + chr2L 16946049 5' + hopper 60 1 65.08 ACCTTTGGGGGAACGCGAGCCCCAACATAGACATTATAGAATATGTCAATCAAAGATTCTGCGAACTGTTAGTATCAAATTTGAGAAGATTCAATACAAAAAAAGGCAAAAGCAAAGCAAAAAAAAAGCAAAAGAAAAAAAATAAA:1 - chr2R 4570977 5' + Doc2-element 219 3 65.75 AGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAG:1 - chr3R 27083097 5' + jockey 4588 1 72.17 GTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTT:1 - chr3L 24934410 5' - HMS-Beagle2 7145 2 53.42 CTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 + chr2R 20227216 5' + hopper 59 1 58.90 CGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGT:1 + chr3R 26504210 5' + HMS-Beagle 57 2 58.22 AGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGGT:1 + chr3L 22890369 5' + FB 60 1 60.77 AAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 14366625 5' + roo 67 2 63.01 ATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3L 2544658 5' + Tirant 41 2 80.49 CCCTAACAATTTTCAACTGATTTTCGTAACTGAGTGTGAGCTTTTGTGGCTGTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTAT:1 - chr2R 17111145 5' - Doc 4334 1 62.04 AAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2R 15326837 5' - copia 233 1 53.10 CATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2R 11804744 5' + pogo 46 1 54.11 AAAAGGATTAAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr2L 15940375 5' - pogo 2093 1 80.14 CCCTACTTGCAACTTGTGGCGTAGGAGTTGCATACTCGGGTTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGCGGTCAGGTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTCATACTTCGATTACTAAT:1 + chr3L 7872258 5' - Doc 4435 1 69.84 AATGTTTTAATACGAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 + chr3L 16662325 5' - jockey 4986 1 76.71 AAGTATTCCATGAATTTGGTATTCTCATTAAACAAAATTGTTATTATAATTAAATTTAATTTTATTTAACCCTTTAAGTCAGTTGGAAGAACCTTTTAATATATATATTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 21505788 5' - roo 392 2 73.29 ATATTCATTCATACACACATTAGGCTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGAACCAAAATAAATAGAATAAAAAAAAAATAGTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAG:1 + chr2L 14703376 5' - G2 3018 1 55.48 ATTACTAGGTTCTCCGAAAGACTCTGCTGAATTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACCAATTTTCTATTCACACAAAAAAA:1 - chr3R 19448984 5' - pogo 67 1 63.19 AGACCAACAAATGCAGAAAGAGAAAGCTCAGTGGTATCATTGGGATCCCCAAGCAGTGTTTCTTCGCATTAATCAAAGAAGTACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTT:1 + chr3L 25911963 5' + looper1 1513 1 77.40 ATATATATAAAAAAGTATATGATGACTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:3 - chr3R 23067580 5' - roo 398 1 80.82 CGTTTCAAAAAACCCATTGAATAAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 21505644 5' + roo 62 2 64.38 AGACTTCTACAGCGCACGGAAGCCAAACACAACAACCGCAAACATAAAGTAACAAAACAAACAAACAATCACTGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGGTTGCTAAGAA:1 + chr3R 15416008 5' - I-element 5116 1 63.33 ACAATAAACTACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAA:1 + chrX 9530303 5' - 297 6921 2 58.22 ATTAATTGCTTGAAGAGTTCATTGTTCCAAAATCAATCCATTCACCTTATGCTACACTCTTTTATTATAGAAAATATATTTGGAATATTTTATATTATTATTTATTATTATTATTTATTATTATTATTTATATTATTATTATTATC:1 - chr2R 12067047 5' - mdg1 37 2 66.44 GGGTTATTTGAATGATCTACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACCATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chrX 14450358 5' + hopper 2 2 76.61 TATAGACGTTAATATTGGCAGGACATAGCATAACCAATTAATTGTAAACAAATGGTTTCATAATTAATAATGGGTATTAATTGATTTGAAATACTTGGGAGATTTATGTTATTATTATAATTAATTATTATTATTATAATTATTAT:1 + chr2R 15720680 5' - mdg1 29 8 71.23 AAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATA:1 + chr3R 24381324 5' + Juan 4189 1 71.23 AGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 + chr3R 9038926 5' + Juan 4069 1 57.53 TCTACCTGAAAAATAAAGTCTTACAATTAGTAAGGGAAATGTATCAAATTCGAGGTTACCCTTTTAGGGTAGGGTAAAATCATGCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATG:1 - chr3L 2990397 5' - roo 117 2 57.53 ACTGAGTCATGGTCAAATCGTATATAAATAAATGAGCTTGATAAACAAACGAAAGCTACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCG:2 + chr3R 27133519 5' + opus 1 2 82.88 TTATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTT:1 - chr3L 25482984 5' - accord 7349 2 53.45 TCAGACTCGATATCATCTTTTTCTTCTTCTTCCACTTCCCAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATA:1 - chr3R 19444937 5' - Cr1a 4197 1 72.60 GCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACT:1 - chr2R 8735650 5' + mdg1 7122 2 75.17 AAAGGGCACTCCAATCAATAATCTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr2R 15326997 5' + copia 7 2 64.29 TTACATGCATCCCGTGGACAGGGGTAAGGGTTAGGTGTTCATTGGGCAACGCCCTGAACCTATCCGATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTCGGGCCC:1 - chr2R 11795075 5' + opus 48 4 53.42 AATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 - chr3R 15790095 5' + flea 4760 1 57.53 ACAGCTTCATTTTCCGGCAAGGGGTTGTGAATAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTTGGGGGTACA:1 - chr2L 17205446 5' - jockey 4669 1 73.48 AGAAGATGGAGTGGATATGGTAACAATAACTAAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chrX 13490765 5' - 297 350 2 56.16 TGCCTTTGAGCGACAGCATCGATGGCAGTTGTGCAATGTCCAATGTCCAGGTGAGCGGAAATGCCAGCGATGTTGACGTTTGTGTCGCGTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGC:1 + chr3R 25202561 5' - copia 4755 1 59.59 CTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGGCGTAGGATGACTTGGTGCACAGTTTCGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 - chrX 14317413 5' + FB 68 1 65.75 TTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr2L 21328300 5' + 297 19 2 73.29 ATTTGATAACATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAATCAG:1 - chr3R 30675504 5' + 297 6588 2 77.40 AAACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 17940242 5' - 1360 3375 1 75.34 CGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 + chr2L 17205167 5' + hopper 53 1 52.74 TTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chrX 8200304 5' - flea 4960 2 55.86 CAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTA:1 - chr2R 23780594 5' + Ivk 92 1 69.86 TGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTC:1 + chrX 19074772 5' + mdg1 7106 2 62.33 GGTAGTTGCATATTTTTTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chrX 4808469 5' - mdg3 228 2 72.60 TGCCTTTAATTCCTTCACTTGAAAGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 16817999 5' + 412 7091 2 58.90 TTACATATTTTTAATAGACTCATCTTCTACTCTAGAAATAACGGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:2 + chr4 372913 5' - pogo 2080 1 71.23 AATGACATGGAGGGGAAATGCTCTAGATATATCTACAGCTGTGTTCAGAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCTTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAA:1 + chr3R 5365339 5' + HB 96 1 79.45 AGATAACTCGAACGCGTCGCGTAGATAATGCCAGCGACTAACTAACTGTAAACATATACTATTTAGGTTATCACTATCATTTTCAGCTCGCAGCTGACAAGATAAAGTTGTTCCACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAAC:1 + chr3R 14480273 5' + Doc 108 1 77.40 AATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 9544940 5' + roo 8719 2 57.64 AAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAA:2 - chr2L 17005837 5' + Stalker2 29 2 64.38 CATATTCCGGGCATGGCCCAAAGCCCTGGGAACCCATCCCATCGACCCCAGATGCGTGAGTGTGTGTGACTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 18696176 5' - accord 7036 2 77.38 CGAGGAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chr2R 21926350 5' - opus 7451 2 52.74 AGGGCAAATATATGTATACATACGAGTGCAGTATAAAGATGGTAAAGTCATAAAACTGTTGAATTGCACGTAAATCTCCAGGGCTTTGCACTCCACCGGGGGAGAGACACCACATTCTTTTCTCTCAGACAGGGCAACGCATACAA:1 + chr2R 20180686 5' + ZAM 8133 2 75.34 AAAAACAAAATCAACAAATCTTGTTTTTCAATCCCCTTTACCAAATCGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTA:2 + chr2L 12134504 5' + jockey 4834 1 68.49 GTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3L 10373890 5' + 297 55 2 75.93 GCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr2L 4003816 5' - mdg1 7430 2 62.33 ATAATTGTTGTAAGTTTCCTAACCCAAAGCGTTCATCCATCGCCGCCAATCAAGGAGCTCCTCTGCAATCATTGGCATATTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACCTACAATCT:1 - chr2L 11257133 5' + rover 40 2 57.53 ATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 - chr3R 1977617 5' - micropia 417 2 59.05 ATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:2 + chr2L 15936773 5' - copia 220 1 63.01 AACAATTAGTTGAAAATATTCTTGACCTTCCCCTTACAGAGTTTTATTTTCTGATTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCG:1 + chrX 159974 5' + Cr1a 4231 1 66.00 GGCGATAAACTTGGCCAGGATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGTGTGGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 + chr3L 1692031 5' + blood 7084 2 69.18 ACAAATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 4964079 5' - roo 9026 1 54.48 AATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCGCATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:1 - chr2R 5531242 5' + 1360 52 1 78.36 AAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 18549905 5' - roo 8987 2 73.97 CCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAGGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3L 11326748 5' + pogo 51 1 76.36 CCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr3R 7420334 5' + 1360 26 1 68.53 ATTGTGGTACTAATCGATGCAGACACGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 9003034 5' + roo 17 2 69.35 TTGTATGATATTAATAAAAAAGCTTAATTTTGTAATGAGGATTTACTTCTGCGTAATGAGGATTTCTTTCTGCGTATCTAACTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCT:2 - chr3R 16952094 5' + roo 9052 2 54.79 AATTTATAATTTATAATTCTACAAGTCTTCGAGTGTTTTTTCGAGTGCTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACA:1 - chr3R 23466562 5' + copia 4941 2 71.03 CCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATT:1 + chr3L 22723829 5' - HMS-Beagle2 263 2 54.93 GGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 - chr2L 14523263 5' + HMS-Beagle2 41 2 45.21 AAGTGTGTGTAATTATGTGTGCAATAATGTACGTTATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 + chr3R 17736880 5' + opus 7061 4 72.73 ATCTAATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:2 + chr2R 17796507 5' + jockey 4691 1 71.92 AGGCAATCCACTCGATTAATTCATCATCTTGACATCTTTTTAAAAATCTAATGTATGAGCCGCAAGAAAAAGAATCATTTAAATTTTACACATTGATTGGATATTTTTATTGATGTATGGTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTCTTTT:1 + chrX 21061800 5' + pogo 301 1 72.60 ATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr2R 13168679 5' - P-element 2816 1 27.20 AAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:1 + chrX 13134890 5' + jockey 4823 1 58.90 AGTTTTGCATGTTTATGACGGGAAGTGGAAGTTGCCTGTTAGCAGCGGCACATTCGCAATTTGTAATGCCAAGTGCAACGGGGGGAGTGGTGTATACTTCACCGTCGGGTCAGACGCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACTCGG:1 + chr2R 20747590 5' + Doc3-element 326 1 62.94 AGCTGCAAAGTGGACATCGGTTAGAGGATAAGGAGAACCTTCCTTAAGTTGCACACTGAATACGTCGACATTGTCTCTATCGGTGTACAATAATTCGGCCAGCTTGTTGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAG:1 + chr2L 17798985 5' - Juan 339 1 73.29 ATAATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chr2R 20010153 5' - Juan 4197 1 71.03 ATAAAAAATGTTATGTTTAATTTTATTTATAATATAATTCAATATTACCTGATAGACACATTTTTCAAAACTGTGGGTGTG:1 - chr3L 23264197 5' - INE-1 253 1 74.07 TTCCAACCCGGTCATAAAACCAAAAAAGTTCGGCTAATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAA:1 - 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hobo 2909 1 51.89 TAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTCCTCCGCACAAAATC:1 - chr3L 22035649 5' + F-element 42 1 60.75 GTGACAGTTTTTGGCTATCGATAGAATGATATCAACAAAATCTCAAGACTTCAAAATTGTGGCCTTTACGAATTTAGTATAACATTTTACAAGATTGGTTGTAAAGTATGTAACAGGCCAAAGGATCATCAGGATCAATAGCCGAG:1 + chr3R 6388634 5' + INE-1 90 1 61.64 GAAAGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCT:1 - chrX 4808629 5' + mdg3 17 2 69.49 AATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCT:1 - chr3L 17940188 5' - 1360 3321 1 66.44 CCATTCAAATGCTATTATCAAGTGGTATTTATACCAGTTATTTGAAAAGTAAAAGGCTATGCTAGGATCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTCGATTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATAG:2 - chrX 22844472 5' + INE-1 85 1 89.04 ATTAATGCAGAAATGCTAAATATCTGAAGCGCAAACTAACACACACAAATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCA:1 - 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chr2R 20961157 5' + 1360 157 1 65.75 CATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3R 7420274 5' + 1360 73 1 77.69 CTATGTGGGTGCAGCACACTCGCCAATCAAAACTGGGATTCGAACTGCGCTGAACTTGCCCGGTTGCAAGTAGAAATTCAAATGAATTCGAGTGACCGCAATGAAATTCCTGATCTGTGCACTTTTCCTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 15142497 5' - Doc2-element 232 1 63.01 TCTACCATAAAATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 - chr2R 13259418 5' + mdg1 7064 2 65.07 CCGTATCTCTTCAAGTCAGTTTCTTATAGGTAAAGCTC:1 + chr2R 6963807 5' - Burdock 6205 2 81.58 GTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2L 21299280 5' - roo 366 1 56.16 AATGTTAAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr3L 10731729 5' - 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chr2R 22989723 5' - hopper 1387 1 66.44 AATTACTATCATTTGAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAA:1 - chr2R 12645540 5' + X-element 38 1 60.96 CTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAA:1 - chr3R 4682973 5' - Burdock 6316 2 74.66 TTTATAAAAAGTGATTACTAATAAATGTCTTGCGTTTTCTGACTAATTTGCTTAGTAAATTTCTAAAATCTTATCAGCAGCATTTTAGCTAATAAAAGCGTACTCAAAAAATTTAAAAATAACACATTTAAAATTTGTTTTTTAAG:1 - chrX 12510234 5' + FB 1002 1 62.33 CTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 18046581 5' + roo 15 2 68.60 ATGGTTTTTAATAAAAAAAAAATCCAATAAATCGGTTTTTTTAATTGCACAACATTTTATTTTTAATTTTTTTTAT:1 - chr2R 24535620 5' - Doc 4692 2 84.21 CTTCTCTGGTCGGTCGCCTGCTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chrX 19266918 5' + roo 8737 2 68.49 AAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 11810647 5' + roo 8738 2 69.18 CGTGCCCTTGCTGGAAAACCCAACCCCTCCCCCCTCCCCCCCCC:1 - chr2L 3677682 5' + accord2 222 1 50.00 ATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 28146136 5' - roo 8984 2 78.77 TAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chr2R 8735701 5' + mdg1 7072 2 60.96 AGATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chrX 12986502 5' - roo 9040 1 62.33 CTGTTTGAATCAGGTTGATGGAAAATGTTTCCACTTATTTAGTGTATTTTGCGCATTTTCGTTCATGCTGAAAAAAAAATTCCACAAAAAAAAAAACTCGTTTTAATTTTTTTTTGCATTTTT:1 - chrX 3922738 5' - Bari2 915 1 74.80 AGGTAAGGAGAATGCCTTTGTCTTGGCTTCTTTGAGGATTTGAGCTTCTTTTGCTCTTTCGGGTTTTGAATTTCAGCCATTTTTTGTTCATTTTTTTTTTTCGTGGGTATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACT:1 + chrX 3430746 5' + Cr1a 4082 1 54.86 AGTAATAATAGTTATAAACAATACAACACCCCCCCCTTTTTAGAAAATTTGTGCACCACTTCCAC:2 + chrX 5288175 5' - R1A1-element 91 1 73.85 CTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:3 + chr2L 14874119 5' - copia 240 1 48.63 ACAAACACAGCGAACACAAGCACACCCACACCAATAGGAACACCTATAGACACGCCCACGCCCACGGCAATCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTT:1 + chrX 1624381 5' + gypsy4 451 1 59.59 GTGCAGTGCATTATAATTGGGACATAGTTACATATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGTGGTT:1 + chr3R 5768966 5' - roo 9054 2 73.29 AAATAGCTGGCTAATTTGTTGCTCCTTGTTGATTGCGATTTAAAAATTTGTTGATTTTGCCGGGGGGATTTGTTGATCGCCGTTTGCTGTTGTTAACTGGCACTGTTTTAGCATTATTTAGTATTTGGTATGGCCACCCTCGTTTT:1 - 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chr3L 23702251 5' + G4 48 1 51.18 CAATTATGGATCTGATCGTTATCAAGCGCTCAGTAATTTGATCCTCAAGTCTTTGCCGATGCTTATTGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATGCGGACAGATGGACATGGCTAGATCGCCTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:1 - chr2L 20640461 5' - INE-1 86 1 58.22 ACGTGAATTCTTCAGTGCTCAATAATTCAAACCATCCAACTTAACCCTGTTCAGTTTATTGCGAGAGCATTTGTTCGCCAATTTCCTTGCCAAGGACTACTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 13709297 5' + hopper 143 12 60.00 GTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 14074557 5' + 297 11 2 70.48 AGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAGGAACAGTATTCTGAGTG:1 - chr3R 30347392 5' - P-element 2812 1 31.47 TTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTC:1 - chr2L 13556444 5' + transib2 59 1 57.53 GGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTT:1 + chr2L 7660922 5' - I-element 5284 1 65.52 TAAGATGTGAGGAGCCTTAAAACTCCCGGACGGGAAAACGTCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCG:1 + chr2L 23310550 5' + gypsy4 35 2 63.46 ATTCAAATTATACATTCAAATTTAGAATTTTTAATTCGCCCACAAATTAACTTTGATATTAGATTCTTTAAATCACACCAAGCTTAACAATTTATTAAGATTCTCTAAGAAAATGCAATTATTGTATCTTGATTATGTTTCCTTTT:1 + chr2R 20960128 5' + Circe 6960 1 64.38 GAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr3R 29084910 5' - 412 408 2 73.97 GCGAATTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3L 11257447 5' - 1360 3376 1 73.85 TTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTTGC:1 - chr2R 19199756 5' - hopper2 1565 1 45.99 ATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - 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chr3R 8075994 5' - 412 7493 2 53.42 TTATGACATTGAAATTCATTTGTTTGGCGCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 13972908 5' + 412 20 2 72.60 TCCAAGACCAATCCTCCAGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGCTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 - chrX 18336705 5' + mdg3 5288 2 61.38 ATACATTCGCAATGGCTAAGCAGAGAAAACATATAGTTTTCTCAATATTTATTCGTTTGAAATATTCTTTGATTTCCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATTAGTGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACA:1 + chrX 20923011 5' + F-element 4577 1 56.85 CTTGTCCCGTCTCTGGGCATCGTTCAGACCCTCGGACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTTTATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 27123503 5' + roo 8750 2 73.97 GCCTAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 + chrX 14771708 5' + BS 42 1 48.23 AAGACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 - 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chr3L 5061637 5' + 17.6 69 2 72.60 AGATGATTGTTAGTGTTTTTTATTTAAAATTACGTAAAGGTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATAAGGGGTTATTTGTTTAATTAAACGCAATTTTTTTATGAAATAT:1 + chr3R 11956987 5' - S-element 1627 2 72.60 ACACTTTTTATTTCCTAATTTGTTAATTAGCAAAAGTATTTTAAAATTTCGTAAAGCAAGATAATGAAAAGTTTTTATACTTATTGAAATACGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAA:1 + chr3R 27081154 5' + I-element 202 1 69.18 GTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:2 - chr3L 23456268 5' - 1360 3326 1 63.01 AATGGCACTGAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAAAAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAAAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAG:1 - chrX 22672500 5' - INE-1 577 1 33.56 ACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2R 9544917 5' + roo 8744 2 73.97 GTGCTGAAAATGCTATACTCACATGAGGCGAATTGTAAATACGTGGCGATGACCGACGCTT:1 + chr2R 1771584 5' - Burdock 157 2 63.93 GTTGATTGCGGCCAGATGTTTGGCCAAGATCAGCAAAGATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGT:1 - chr3R 17736941 5' - opus 418 2 74.66 TTTTTGAGTTTTCAAACAATTTGTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATATGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTC:1 + chrX 2479456 5' - mdg3 5469 2 57.53 CTAATGTGAGTTGACGGACGCTTTAGAGCGGTTTTGTGTCATCAAGGTGGCATTTCGAATATGGCAAGTATTGGGATCGCAACAAACAAGAGAGAATGTGTAGGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr2R 1728212 5' - INE-1 541 1 68.28 GCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr2L 18347395 5' - transib2 2797 1 60.33 GCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chrX 1341750 5' + 412 7094 2 56.64 CAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 + chr3R 12115292 5' + 1360 79 1 77.94 GATATAACTGGCTTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3R 9298610 5' + hopper 15 1 73.79 ATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 + chr3R 20140506 5' + jockey 4671 1 58.93 GCAAGCATATAAATCTATTATCCTTTAATTTAGCCACAGAAATAATGAAGCATGTAAGAGTCTTTTGTGTATCTTCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATT:1 - chrX 19053343 5' + jockey 337 1 54.11 AAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCCTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAA:1 - chr3L 23702241 5' + G4 77 1 68.49 TGCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr3R 23639261 5' - pogo 2057 1 52.05 AAAATGGATTCATATTATCGGTTTTATGTTACATATAAAATCAAATTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATGACTTCACCGTCAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAGCTGACGTTTTTAACTTTTGTCTGAAAT:1 - chrX 23283401 5' - transib2 431 1 76.22 CATAATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGC:2 + chr2L 11391452 5' - 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1360 3354 1 60.00 TCTTAATTGGGGGCAGCACTTGCAGGTTGATATAAATAACATAAAAAAACAGCTAAATTGTCAACAAAAAACAGCAATTTTGGTAAAAATCACGTATACATTTCCCTTCTTCAACATAT:1 + chr2L 3646715 5' - invader4 2970 2 74.79 CCATTCCTTTCCCGGTGGGATACCCACATACCATCGTGTTAAGTCCGGTTAATTAATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1 - chr3R 26178557 5' + 412 4 2 45.89 AGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:4 - chr3R 18093418 5' + I-element 19 1 69.86 ATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr2L 18347405 5' - transib2 2782 1 56.85 GTATAGAAAGAAAATTATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATTG:1 - chr3L 24131521 5' - Transpac 273 2 58.22 AACGAAGGAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr3L 22744736 5' + FB 50 1 63.01 AAAATTTAAAAAATAAATTTATAAAATTTTTATATTATTATAATATGATAAAAATTTTATTATAAAATTAAATTATTTTAATATTTAATTAAAATTAATTTTAATTTTTCTTTAAAAAATTATTTTAATAAAAATTATTAATATTT:1 + chr2R 25250415 5' - BS 315 1 27.40 ATATTATACAATCAGGGTGCCGGAAATCTGAAGCCGAGTCGTTCTAGAGTTGTAGAACAAAGCGAGTGACGCCCATTAATGCAGTCCCATTCAGGCGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACC:1 + chr3L 12346096 5' + F-element 4460 1 65.75 AGAAGCGCCTCCAGGATCGGGATAGGAGGGCGCCTCTGATGACCGAGCGGAGGATCCTTTCGGGGGAGCAGGAGCAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGCGGGGGTCCCCTCACTATTATGTCGTTTTAATCTTTATTTTCGAAACTATT:1 - chr3R 5425847 5' + HB 1474 1 74.66 ATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 18396183 5' + roo 8724 2 62.94 TTGTCATTACACTTTCTTTTGCCATGTTGTATATTCTTTACGTATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chr2R 13176572 5' - opus 7446 2 67.91 AGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 - chr2R 20349074 5' - transib2 2781 1 54.11 TAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 24219392 5' - roo 9051 2 57.89 GTTCGATAACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2R 13931508 5' - P-element 2850 1 62.33 GAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGGTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr3L 16662338 5' - jockey 4973 1 67.81 AGACACGCTTATCAACATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 9003014 5' + roo 8722 2 59.31 ATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 - chr2R 21411002 5' + Burdock 11 2 74.42 AAACTTAAGAGTACTTAACATTATTATTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGCGACTGACGCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTT:1 + chr3L 13294522 5' - roo 8800 2 66.67 ATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCGGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chrX 12217460 5' - pogo 2039 1 75.83 TTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 2544638 5' + Tirant 8119 2 57.53 AGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 21224516 5' + roo 39 2 58.90 CACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGGTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chrX 11661499 5' + pogo 50 1 56.43 AAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3R 15790864 5' + roo 61 2 70.40 GAAGTAAAAGAGTATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:2 - chrX 17717112 5' + FB 47 1 50.68 ATACATTTTTACTTGACAATGTAAATGAAAATGTATATAAATTGGTTAATGTCTTGGCTAAATCTTTAAACCTTAGTTTGCAGAAAGAAATGCAAGATTCTATATTATAACTTAAAAAGATAGCTAAAATTAAATTTAAATTAATT:1 - chr3L 14212811 5' + NOF 3958 1 66.44 ACCATCCACATTTGTCTTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACTCTCTGATTAGACTGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACG:1 + chr3L 20189603 5' - FB 212 1 66.44 ATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr3L 2544601 5' + Tirant 8143 2 58.96 TATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:2 - chrX 8092517 5' + pogo 32 1 62.33 CAAGACACACAAATAAAGAAATCCAAAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTAT:1 + chr3R 23911348 5' + 3S18 70 2 62.33 CATGAANACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 23180181 5' + roo 51 2 53.10 TTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCT:1 + chr2R 3338796 5' + Juan 72 1 65.75 AAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATAC:1 + chr3R 14860115 5' - BS 5075 1 60.16 AAATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 - chr3R 29690774 5' - I-element 5278 1 71.92 CTCTTATTCGCCCAAAGAGTATCTGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTTTTGAGGGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGGGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTGACCCTT:1 - chr3R 29134040 5' - Quasimodo 219 2 76.15 ATTGTAAAAACATTGTCAGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 + chr3R 4860402 5' - Transpac 5197 2 63.70 CAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCGAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr3R 27315081 5' + jockey 4705 1 56.80 CGGTGGTAATGGCCCGGCAAGTAGTGGTTCGGGTAGTAGTGGTTGGGGGGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACT:1 - chr3R 22104120 5' - F-element 4379 1 71.43 AGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACAACGTCGCCGAATCACCCTTTTCAGATCCCGCCATTTACCCTTACGGCCTTCTCTTCGGACT:1 + chr2L 246024 5' - accord2 246 1 76.84 GAGTTATCTGCAAAAGATTGGCGAATTTAGTTAGATTAGGACAGGTCTTTCAAATTATGGGTGAGGATGTAAGGTTATTATGGTTTTTCGTTGGTAGTGAAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTAAGCGCG:1 - chr3R 21367348 5' - F-element 210 1 68.97 ACGGGATCTGGGAGCTCTCGAAGTGATCGGCCACCTGCTGGGACTTCTCAAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 - chr3R 28901369 5' + transib2 13 1 76.71 CCTACTGGCAAGTGCAAGCCGTCTATTTACAGCTTAGAACCGAAGTACCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAA:1 - chr3L 9647898 5' - R2-element 3382 1 73.97 AGAGGATCCAAGAAAGATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:2 - chr3L 1279208 5' - roo 9036 1 59.59 ACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGC:1 - chr3R 11040149 5' + Bari1 71 1 65.07 GGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr3L 25401034 5' + Doc 35 1 52.74 AAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:3 + chr3L 9809234 5' + 412 7101 2 52.74 CTATTAAAATGCCACGCAAAATGACAGCCATAAAGCAAACCAAACACAAACACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:2 - chr3L 14662710 5' + I-element 4979 1 67.12 GCCCACACTCGCACACATTCGCACACTCCAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2L 2527748 5' - hopper 1376 1 56.16 AGTCATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACATGTTTTGTGCTGATCTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATAAATCACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGT:1 - chr2R 4368666 5' + Doc4-element 24 1 80.14 AGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:2 - chr2L 15188472 5' + 297 48 2 56.16 ACATCGAACACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACA:1 - chr3R 2520363 5' - Tc1-2 1619 1 59.59 ACCCAGGACTGAGTCTAAGCCTGGCCAGAGGAGAGCTGGCCTTAGCCGGGGTGGGGGTTCTGCTTGCGGTTGTGGGCCGCCACATCGGCGTCCGTCTCTAACTAATACAATTACTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATA:1 - chr2R 24368984 5' + Doc2-element 4694 1 63.70 AATTAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCTCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCA:1 - chr3R 17996266 5' - diver 6051 2 57.53 ATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 - chr2L 13556479 5' - transib2 2800 1 63.70 AATAAACTTACCATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGTATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGA:1 + chrX 23338833 5' - GATE 372 1 48.63 TAGTATTATTTTTATGAAATATTTATTTCTCAACGTAATGTCTTCTTTTTTTTGTACTTCCTTTAAATATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGGCGCATTTAACTTATGTATTTGGAAGACAAAACCAAAGACACTAGAA:1 - chr2L 22929240 5' + 1360 499 1 65.75 ACATGAACTTGTATGAGGCCAAAAGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2R 22514247 5' - P-element 2874 1 73.97 AAACATTTTCTAATTCAGAAATAGCACAAAATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 + chrX 12129288 5' + flea 4784 2 61.54 AGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGGAATCGC:1 - chr2L 19924022 5' - roo 8993 2 68.28 TATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACA:1 + chr3R 9557516 5' + G2 3029 2 52.74 TTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 19924026 5' - roo 332 2 67.12 TTTGAATTTTACAAAATTTTAACCACATTCTTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTAT:1 - chrX 15408992 5' + INE-1 540 1 61.86 CTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 18396187 5' + roo 8708 2 54.81 AGGGCAGTGAGGTAACAGCGCAACCTGTTACGACACCCTGCACCTAAACCTAATGTATACCCTTTTACTCTACGAGTGGAAAATAAGTTCAATTTTATAATCCAGTGCTCGAAACATTTCCCAA:1 + chr3L 25245540 5' + 297 490 1 62.10 GCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr3R 30347456 5' - P-element 2863 1 65.75 ATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGTAGTTATCTGCATCGGCAAGATATCTTCATTATTTTTTCATTTTT:1 - chrX 11661483 5' + pogo 50 1 58.87 GCAGCGACTTAATCTGTGCTCCAGTTTTTCGTAGTACCCCCCCAAAAAAAATGGCCACCATACACACACACATTTAACGGTTAAGCCGTTGTCCTTTTTTCCCAAGAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTATCCAGCATTGGAG:1 + chrX 4412461 5' + Porto1 354 1 73.29 TTTACTTTATTTATTATATTTTATACTTATTTTACTATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chrX 8915708 5' + I-element 10 1 76.71 ATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 16662345 5' - jockey 4966 1 64.38 CTATAGACTACAAACCTTTAATAACTTGATTGTCGGGCAACAATTGTTTTCAACAGCCGATTTCATTGCTGTGGCGCCATTTTTATTTTTTTCTGGTATGCAAAA:1 - chr3R 20114972 5' + Transib-N1_DM 388 1 61.90 CTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:1 - chr2L 14523270 5' + HMS-Beagle2 6917 2 40.41 AATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTC:1 - chr3L 23597293 5' + invader4 2757 1 71.83 CTGCATATGTGAAAAGGAGCTGGAAGTTGCAGTCCATGGAACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAA:1 + chr3L 19439604 5' + I-element 4911 1 76.03 AGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chrX 8092359 5' - pogo 2082 1 68.22 AGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGAACAAAGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr3L 8453735 5' + FB 61 1 59.59 AATGGTCGACCATCGAAAACTAAAAATTTTTTTAATCGAAATTCTCTTTCGTAAAACTACAGTGTAAACAGTTGGGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTACATTTCAA:1 - chr3L 22723978 5' + HMS-Beagle2 6905 2 67.81 TTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:5 + chrX 19038356 5' - hopper 1366 1 52.74 AGTGAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAACACCTTCGTAAGCACTCCCGCGCCCCAGTCATACGATCTCAC:1 - chr3L 3421024 5' + Stalker 145 4 78.67 GCATCTCTTTTGGGCAAAATTGTGGCGATGACTGGCGGACAACCAGAGAACTATCTGCAGGCGCGATACTTCGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 + chrX 696440 5' + FB 11 1 76.71 AAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3R 16157275 5' - pogo 2091 1 63.37 GCCACACAAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 - chr2R 12028397 5' + accord 7029 4 79.59 TATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr3R 15325180 5' + 297 6644 2 66.21 ATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1 - chr2L 4713940 5' + transib2 64 1 74.42 AAAAACTATTTTTTAAATAATTAAATAGTAACAATACTAATTTACATTATACTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGC:1 + chr2L 22307163 5' + Cr1a 4426 1 71.22 GTGGCTCGTCTGTCGGTTGGATTGCCTCTGTTTGCTTTTTGAATGGGTTTTTTTAACTGGCGACAACAGTTTTCCCAATCCGAGGGATTGGAAGGAGTATCTTAAATTAATTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3R 15072506 5' + pogo 1 1 67.63 ATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCAT:1 + chr3R 11191412 5' - roo 8991 2 74.66 TATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGA:1 - chr3L 18505730 5' + I-element 73 1 68.49 AGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACA:1 + chr2L 13556363 5' - transib2 2740 1 76.55 CAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 809647 5' + jockey 36 1 53.60 AAAACATTTTGATTCATAATGTTATGTACATTTTAAATGTAAAAAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAA:1 - chr2R 16107428 5' + I-element 204 1 71.92 TTTTCGAAGAAACTACGGGCTCAAGGGAATTTTAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAATGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAGAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 24219424 5' - roo 403 1 76.03 CTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 + chr3R 26405015 5' + hobo 75 1 74.07 TTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAAT:2 + chr3R 24381272 5' + Juan 4137 1 63.70 AGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 17940046 5' + 1360 17 1 56.12 ATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 7719687 5' - roo 9044 1 66.44 GGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATT:2 + chr3R 27405998 5' + diver 94 2 79.45 CTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACT:3 + chr3R 19450186 5' + roo 9037 1 58.22 AAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATA:2 - chr3R 23067497 5' - roo 21 2 67.81 AGACGGCAAATGCAACTCACCCGAAAGTAAAGAGGAGAAATATGGCCCAGCCCCACCCTTTAGTATCGCCGAAATATATATACATACATATAGCCAGCATATAAGGGATTGCCCTATAAGTTATCGCCCCACATCTTACA:1 - chr3L 21656020 5' + HMS-Beagle2 16 2 69.29 GAGATGGCGAGTTCTACAGCTGCTAGAGGCGTTACGTGACGTGTTTGTTCTAATGGAGCTCAAACCTCGGCTTGAAGACGTTTTTTTTGTTCCTTTTTTTTT:1 + chr2L 2166818 5' - Doc2-element 253 3 89.22 ATTCCCAGATTAATGCATTCAGACGAAAATATTTACCAGGCAAGTTTCTTACGCTAACATCACTTTATTTCGGCTTTCAGTTTAGAACTAAGTTATACAAAGAAAGAACGCTTAAGATTACCCCATCTCGC:1 - chr3R 5026104 5' - Chouto 91 1 58.78 TATTATTTTTATAAAATTTTTATTTTGTTCATTCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAG:1 - chr2L 386616 5' + 297 103 2 69.52 AAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3L 6397691 5' + roo 8747 2 78.36 AAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr3L 14720918 5' + F-element 66 1 52.05 CAATAGAACTTCCAGAAGGTTTGGGTTGGGTGAAATAACTTTATTGCTACGTTGTAGTGAGAATGAAATAGCTTTATTCAAACAATATTCGGCATATACACAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAAATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2L 23233991 5' - 1360 3370 1 36.99 AAATTTTTTCTTTAAATACGACATTGAAAAGCTTAAACAATATTCGATATCCACTAATATTTCATACCTGTTACTCAGATCAAAGACACTAGAAGAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:2 + chr3R 3746220 5' - 1360 3344 1 78.77 ATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 7889586 5' + roo 8715 2 71.30 AATATAACACAGAATATCTGCTACCCTATTAATTGTTGAACAAAATTCATTGACTAACAACATGCTAACTTCGTTCAGTTTTTTGCTGTTTCTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chrX 16526075 5' - Rt1a 5087 5 60.00 AGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr3R 23639115 5' + pogo 35 1 60.27 AAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3R 14980382 5' + roo 8752 2 78.08 TAGCTCTTGATTTTTCTTCATTCTTCTTCTCTTTATCACGAGTTCACTTTTCCATTTATTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTCGAGAAATAAGGAACTACAAAAGCTAGAAAGTT:1 - chr2R 14560692 5' + INE-1 158 1 56.30 CAGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr3L 14720939 5' + F-element 39 1 62.14 ATGAACTCCATTCACCTCGTGTGGCTTAAAGTTCGTCTGAAACACACAGTTTTTAAGTTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTAAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGACATGG:1 + chr3R 14943906 5' - R1A1-element 5023 1 51.88 ATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGGACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGATTGGCACTA:1 + chr2L 23372624 5' - 1360 3357 1 60.20 CTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 15791023 5' - roo 9027 1 54.79 ACTTGTAACTCGATAATTGCACGTTCTGCGCTCGGATATGACTTCATTCTTTCCCAGCATTCACAAGTGGCTGATTTAAAGGCATTATAGGTTCAGTGCGGAGCTTTGATTTAAATAATTTAAAGTAGAAGGTATTTACTTTGTAT:1 - chr3L 1591074 5' + Transib5 285 1 55.48 TTTTTCAAAATTATGTTCTTAATTTTAAATGTTAAGAGGCTCATTATAACATATAACATCTCAATATAAGCTTTCTGCCCTTTTTTTGGCATAATTTTTATAAATCTTAATGTTTTAATGCTATCTTATTGTTTTTTTTTATAAAA:2 + chrX 12248231 5' + Porto1 4639 1 76.71 ATGAGCTTTCCAATTGAGCGCCAATCAAATTGCCGGTGTCAGCATTTTACTGTAAGAATATCGACGCTTCTTCCAATTACAGGCATATCCTTGTTTCGTTGAGTTAAGAATGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCAT:1 + chr3R 20197152 5' + R1A1-element 5025 1 76.71 GTATTGAACCTATAATAAAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 3920636 5' - roo 395 1 76.03 GGGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAA:1 + chr3R 9038901 5' + Juan 4044 1 58.90 TNTATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTAC:1 - chr3R 4543659 5' + rover 7023 2 71.23 AGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 + chr2R 9158055 5' - mdg3 192 2 57.81 GGAAAGCCACATTTTTTGTTTGGGCATAATAATTTTATTTTTTCTTTTCGGTCAAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 18226928 5' + roo 7 2 79.45 GATTTAAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chr2R 3563068 5' - Transpac 5187 2 56.85 GACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chrX 8308508 5' - roo 357 2 54.79 AAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2R 11164408 5' - roo 343 2 63.01 TGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 + chr3R 9038932 5' + Juan 4075 1 61.64 TCTTCCTTCTGTCCCTTGTGCGAATTTCCCACAACTTATAGTTATCGTTTTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr3L 6964621 5' + P-element 45 1 34.93 AAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTG:3 - chr2L 13844268 5' + Stalker2 7300 2 50.68 AACCCCAATTAATTGTACTTAATCCCATAAATGTTTTTAGGGGCGATACTTGCAGAATTGAAAAACGCATGGAAATACAGATTATTGTTAGTGTAACCCGCACAAATATGTTAAATGTTATAAACTTTATTTAAATGCAGTAGGGG:1 + chr3R 20795402 5' - gypsy3 472 1 51.37 ATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGATACTTTGTACATTTTGGTTTTAAACCACAAATAG:1 - chr3R 12242343 5' - transib2 2750 1 67.81 ATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 19073299 5' - roo 9026 1 53.42 ATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTGTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGC:1 + chr3R 26504217 5' + HMS-Beagle 6860 2 61.64 CTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAG:2 - chr2L 21930229 5' - Copia1_DM 66 1 72.60 TGTTATTCGTTGCCGCCACACTCAGTTTCTTTGGGCGATTATCCATCTGGTAAGGTGAATGAAACTAAAAACATTTTAAAAAGAGAAGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACTCAGCTGG:1 + chr3L 25113162 5' - INE-1 543 1 60.45 TTGTATTTACTTTAGCAAAGCGAACTACTGCACTTAATAGGATTTGTGCAAAGTATCCTTGGCATGCGACAGCCATATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAAAAAGGTAGCAATACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGGGCGAA:1 + chr3R 21802986 5' + X-element 4326 1 59.59 AATGGATTCAGTACGATTCGGTTCATTCATTGTTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATG:1 + chr2L 11256962 5' - rover 7285 2 76.03 GCATCGAGTCCTTTTCAATTACCACCACAGCGTGCAGGTGCACTGGAAAAAATTGAACTTGAATAAAGGAACAAGAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAA:1 + chr2R 10934582 5' + F-element 159 1 52.74 ATATGAATAACGCAAGTTTACCGCTTCTTGGGAGCTAAATCAAAACAGAAATTAACAACAAAAATTATTCAAAATACCAGGCTGTCTCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGAC:1 - chr3L 5980025 5' + G2 2795 1 60.96 ACTACGACTACGGCGGGGCGTGAAAAACAAAGGATACAAAGGACAAAAAAGAGCGAGAGGGAGAAGGTTGAATTGGAAGCAAAGGCAAAGGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 6884541 5' + Doc2-element 240 1 87.25 TAAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTCCAAAGATATATATATATATATATATTTAAATAGTTTTATATTGAGCCGAACAAATGAT:1 + chr2L 21328141 5' - McClintock 6417 2 52.63 TGCTATTAAACATTTAATAAAAAGCTATCATTTTTAGTGGCATTCAATTCTGAATCCATTCAGAAGACTTAAATCGCAAAACCAAATTTTAAATTTTGCCCAATAGCTCGTAAATAAATTCTTTTTGTTTATAATAAATAATTTGT:1 + chr3L 10970584 5' - gtwin 6959 2 79.45 TAAAGAAGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chrX 8092535 5' + pogo 14 1 74.66 AATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 - chr2R 4785322 5' - Juan 4151 1 56.85 CGGTTAATTAATGCGCCCTTAACCGGAAAAAACAATTCTGCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 26178512 5' + 412 18 2 69.50 CATATGTACATAAACTTTAGTCTCTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATCCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAGCAGGCAGAAGGAATCGTTTTCGACCATATAAAGTATAAATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCG:1 + chr3R 32037321 5' + INE-1 88 1 73.97 CTCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGGGGCAGTTTTCTGCGGTTTGTAGGCGTTATTGAGGGTGTGGCCACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTTTACAGTTC:1 - chr2R 5212081 5' - INE-1 158 1 73.29 ATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:4 + chr2R 24427577 5' + jockey 4748 1 65.75 GGCAGCACGTGGCTCCCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3L 2544582 5' + Tirant 8120 2 75.38 GCTCCAAATGACTGTGTCAACAAACACAATTCGCGGAAAAACGAATCACACTGCAAATTTGGAGCCGCACACTGACGGGCACGGGACAAAAGCTCACTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGATTACAAAACTA:1 - chr3L 8685283 5' - I-element 5333 1 68.49 TCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCT:1 + chr3R 19450204 5' + roo 9055 2 54.11 GGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCT:1 + chr3R 11040027 5' - Bari1 1673 1 60.96 GGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAG:1 + chrX 10319623 5' + mdg1 78 2 71.92 ACCTTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGAGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAAT:1 - chr2L 23373501 5' - Tc1-2 1555 1 71.65 GAGATATTCAGTGAATGACAACCAGCTCAAAGTATATTGAACACACACACCCACTCAGCACACACAGCTCACACCACACACCATACACATACTGATATGCTGAGACAACAAGGGACTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 + chr2R 15458108 5' + INE-1 148 1 78.08 GGGTATGCTTTCTCACCCAGTTTCTTTTCAGTTGCCCAAAAGGGGCCGAAATGGGCGGAAAGAGCTGAACTGATCGATCGATGATTTTTTTGTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 403291 5' - gypsy11 3934 1 77.14 AAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACG:1 + chr3R 30813359 5' + FB 89 1 79.31 ATATCTACTACAATATATAAATGTAACATGCATTTATAGCCAGCTTAGGACGTATTCTTTCTATACACATATACGATTTATTTACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAAATACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAG:1 + chr3R 14475666 5' - copia 112 2 57.93 GATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGTTTCGATCGCCGAGGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr2R 4362753 5' + F-element 22 1 65.65 TCTGCAACTCAATCTCACCGAAAGATGGTAAGTAATTTGCAGCAAGATCTGTACTTAATTTCACTTTGGCTAATGGGGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGGTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAA:1 + chr2L 17618881 5' - jockey 469 1 57.04 ATTTACAGGGAATAGCAGCCCTTTTAAAGATGTAAAACAAAAGAGGAAAAAAAATCGATAGAAATTTACAAAAATAATTAAGAAAATGAAAAAACATTACATTTTCCAAAAGTGTGGGTGTG:1 - chrX 155944 5' - INE-1 253 1 77.87 ACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 - chrX 14450507 5' + hopper 43 1 53.96 AAATGTGTGTGCACGTATTCCAAATGTTTGTTGAGGGAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAAAGTTTACTGTCTGC:1 - chr3L 11909121 5' - baggins 5188 1 67.83 AGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2R 5531207 5' + 1360 56 1 69.90 AATGAGTGCATTTGTTGTTGCTCATCGTAATGGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:2 - chr2L 11298171 5' + I-element 24 1 68.49 TTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGGTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - 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chr3R 15791000 5' - roo 340 2 66.44 ACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chrX 21224635 5' - roo 9006 2 60.96 TAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:2 + chr3R 904932 5' + rover 6992 2 60.96 AGGAATGGATGGCTGCCACCAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTAGGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3R 25433416 5' + transib2 3 1 78.33 AACCGATCGATATTTTTGATTACATTTACAATACAGCGAGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTA:1 + chr3L 1069609 5' + invader2 431 1 73.29 GAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chr3L 16470368 5' + jockey 4704 1 57.14 CATGTCTCAGGCATATAGCAAGCATAAGATCAAAGATCTTTGCAAAAGGGATAGTTCCTTTCATGTGCTCCTTAAAATCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCCAATA:1 + chr2R 14055479 5' - 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hopper 1351 1 64.38 CGGGGAAACAGAAGATCCAATTCAAATACCAAACTGAAACCAAAACAAAACCCTCGCCAAAACAAACTTAAAAAAAAAAATCTAACTAAAAGTGCAAAACAAACTAAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCA:1 - chr3R 31932692 5' + gypsy2 480 1 57.04 CATTTTGCCATCTTCCAGTATTCCAATCTCATTAATAACAACCTCGATCCAGACCCCAGCTTGCCATTGTACACACTTTTATTTTAAAAAAAAATTAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCA:1 - chr3L 22230122 5' + transib2 2686 1 51.05 TGCTTAAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chr3R 15363868 5' + flea 4770 2 75.34 GATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 11191358 5' - roo 390 2 68.84 ATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr2R 6847833 5' + Doc 77 1 67.81 GTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAATAA:1 + chr2L 15913258 5' + transib2 84 1 73.97 AAATGACGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 15791050 5' - roo 9054 2 73.29 TATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTAATGCCTC:1 - chr2R 5206901 5' + G4 3766 1 58.90 TATACATAGTTCATTGCACTTGTCATTGGTCAGTTATAATAACAAAACTATTTTCGGGACTCACACTTCCCGTTAAACTCTAGTTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 + chr3L 21974364 5' + GATE 8269 2 62.31 TAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATACCGCCCATA:1 + chrX 22906774 5' - transib3 2736 1 71.72 GATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCGTGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 + chr3L 16690891 5' - I-element 5306 1 54.11 ATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAT:1 + chr3R 30059417 5' + FB 67 1 74.80 AATTAATAACTACGTAAGTATATATATATAAATAAATATGTACAAATGTACTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTT:1 - 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chr3L 2859661 5' + 1360 3212 1 72.60 GAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 12249898 5' - roo 342 2 63.01 ATTTTCGATTTCGTTTTCGGATTACTTTGACAGCAAATTCGACAGCATTTATTTTTAGATGGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2R 13931635 5' + P-element 56 1 48.63 AACCAGTGACGGGTTAAACTTTTTGCTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCAACCAAATACGTCACTCCCCTTCCC:1 - chr2R 18312542 5' - 297 6573 1 67.42 CCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr2R 10417144 5' - 1360 3329 1 64.93 AGTAGAAATCGATTTCTGTGTACTTTAAGCCAGAAACCGATCGTATGAGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGT:1 + chr3R 19224945 5' + HMS-Beagle 15 2 78.08 CATTGTGTTTCAAGCAAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:2 + chrX 18336587 5' - mdg3 5429 2 61.64 ACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 - chr3L 21996237 5' - Transpac 242 2 72.31 TATTAATTATATTATACATCTGTACTGATTTGAATGGATGAAAAATTTTTAAAAGTGTTAACAGATTTAACGTTATGAATTTTCTTGCAGTACCATAGATTTTAACTGCTGATTACTCACTCAAATATTTTAATTTATTTAT:1 + chr3R 18544609 5' - G7 1151 1 75.35 CTCAGTATCTCCAGGTCGATGTCCACACCCTCGGGGGGGCACACCTGCTCCTGCAGTTGGGACTGCGGAATGTGCCATTTGGATTTTGCTGTGAGATCAT:1 + chr2R 6763930 5' - TART-A 161 2 66.00 TCTATATATAGACTAACTTTCGGACGGATATGCATCGTTTTTTTTTTTCCTTCTGCACAACTGACCAGTGCTTGTCGAGAATGATTTTCACATGTATCTATTAGATACGTTTGTATCTCTATGATTTTTTTCTTTTCCTTTTTTTT:1 - chr2L 9072139 5' - Doc2-element 254 1 54.11 GATTAAATCATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 + chr3L 4219419 5' + jockey 24 1 68.49 AAACAAAAGAAAACAGTCCAACATCGAAGATGTCTCGACCTGAAAGTGAATCATGAGAAAATTTGGTTCTTTGAAATCGTAGATGAATTTTTGGAAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATAT:1 + chr3L 6820364 5' - G2 2843 1 65.07 ATCTTACTTTGTGTTCGTCATTGGGTTGTTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAAGA:1 + chr2L 4888695 5' - BS 5063 1 62.33 AAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:2 - chr3L 19274910 5' - transib2 2783 1 56.85 AGGCGGAGAGGCGGAAAGGCGGACAAGGCGGGGAAAAAGCGGCAACAGTGGCAGCATCAGGGGCAGCCCCACACAAAAGAAAATTGAAATAACAACAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGGAAA:1 + chrX 12698995 5' + Doc2-element 221 3 85.60 ACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:2 - chrX 8200328 5' - flea 224 2 65.07 GTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCG:1 - chr3R 4682963 5' - Burdock 6306 2 81.51 ATAGTGTTGTTCCTGGTTGGGGATTCTTTGGGGCTTTGTTTTCTCTTTTGGTTTATTATTTTGTGTTAAGGTTTTTTTTTCACAATTTGTAGACCTGTTACTCGTAAAGTAAAGTGTGTAACAGGTAGCTGAGTAACGGGTATGTG:1 - 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chr2R 2590785 5' + HMS-Beagle 6876 2 71.23 ATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGGGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTT:1 - chr3L 20187418 5' - FB 481 1 50.74 GATGACATTTTACCCTTATTAGTTCAGTAGGTGCCATAAGCTTCTGGGAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAA:1 + chr3L 21764919 5' + jockey 4912 1 67.12 GGTTAACAAATGTAGGAACACCGCCATAAAGGTGTTGAAATAACTGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAA:1 + chr3R 30993834 5' + Doc 4620 1 68.75 ACCTTTCTGCTGCCGCTGGTCTTCGTGGCCCTCATCTACATTTCGTTCCTGGTGCTATTCATCTACAAGCTGCACAGCACTGATCGCACCGTTGATCTGGCAAC:1 + chrX 11340669 5' - Rt1b 41 1 74.04 ATACTTTCTGGATGACCAGTATTGCGTTCTTGTGATAATTGAGCTACGATTAAAAAAATAGTTAATATAGTTTCTTAAATCAACCTTAAGTACACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTGTAA:1 - chr2L 15234418 5' - Cr1a 4256 1 58.22 ATCAACACATTTTCCAAAAGTGTGGGTGTGGTAGTTTTTGCAGCTTGTGGGCGTAGCAACATGGTTCAGCAAACTTGCGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAATCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATA:1 - chr2R 5212081 5' - INE-1 150 1 70.55 CAATTTCATAGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr2L 12286088 5' - INE-1 87 1 80.14 GCTAAGCCTTCTTATAATCCCCTAGAGAGCACGCAAAATGCTCGACCAAGAGAATTAACTAGGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTTGGAAT:1 - chr3R 19419581 5' + HB 61 1 59.00 AGAACGCCGTCACGGTTCTGCCCACACACACACACATTCAAACA:1 - chr3L 7435044 5' + accord 190 2 59.09 AAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 + chr3R 18971697 5' - Juan 4162 1 54.11 AGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:2 + chr3L 9809255 5' + 412 69 2 65.75 AATGGGTGTTTACATCTGTTAATAATTTAGGCGTACTACTTTGAACATACAAACATCCCATAACACACGGGAGTCATCGATATTTCTATATATTATATTATAATATACATTCTTTTATTTCTTATAATATACATATAATTCTACTA:1 + chr2R 402017 5' - transib3 2619 1 53.42 ATAACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATC:1 - chr3L 13295003 5' + roo 356 2 82.19 AAATTTAAAAATTGAAATTGAAAAATATAATTTTAACGAAGGAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chrX 7080684 5' + FB 16 1 67.81 TAGTGAAAATGATATGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 8959745 5' - 1360 3381 2 78.08 GATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 - chr2L 22674851 5' - mdg1 7374 2 80.00 CCTCGCCATAGTTTTTTGATATATGGTCACAGGGGCGGGCCAATCTCGTGGCACGTTCGGGGTGTTGGGACAGGTCCAGAACTTGGGGGCAGATGTCTTCGAGGATTTCCATCGTTACATCAGACACAAACATATCCCACCAACGC:1 - chrX 765534 5' + I-element 4961 1 52.05 GGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr2R 4606297 5' + 1360 50 1 57.89 ATTTGTCAGTGCCTTGTCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:3 + chr3R 10270530 5' + Juan 4046 1 70.55 AGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTA:1 - chr3L 20187439 5' - FB 492 1 60.27 AAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGTGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 - chr3R 9298596 5' + hopper 13 1 72.09 ATTTCGCTTTTTTCAAATTTTTTTTTTTAAAATCCAATTAACATCTTTTCCCACCTTTGCCCCCCCCTTTAAAATTTTAAAAAAATTAAACTTTTAGAAAATATAAGCTTTTTAAGTT:1 + chr2R 10573871 5' + FB 264 1 72.88 TAATTCACTTTATTAAACATCTCAAACAGTTACATGGCTGATTGAGATGTTTAATAAAGTGAATTATAATTTAATATCGTTTAACTAAGTACACGCGAATGTTTTATTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 14019393 5' + 1360 15 1 55.48 AATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGCGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr3L 16437257 5' + F-element 38 1 44.63 TCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGG:1 - chr3R 21630343 5' - I-element 5299 1 62.69 AACAAGTTGGTTATAACAGTTTCTTACAAATCAAGAGATAATTTGAAAAATGTATTAATATTAATAACAAATTGTAGTACTAGTAAAAAAATCAAAAAATACGCCTTTAATAAAAACAAAGGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCG:1 + chr4 228248 5' - INE-1 570 1 72.60 ATACGGTAAAATTGAATAATAAATGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 - chr2R 5941470 5' + copia 4891 2 71.23 AATCTAGTGCCAATCGGGAATCCCTTACGTACAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr3R 30059384 5' + FB 49 1 54.93 TATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 + chr2L 13556358 5' - transib2 2744 1 73.29 ATAAATTTATAAATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:3 - chr2L 17005859 5' + Stalker2 7 2 79.45 CAGTTGACTGGCTTTTGGGTAAGAAATAACTTTATTAATTACAAATACATATGGTTTGCACTGTGTCCAGTTTCACTTTGAGATACATATTGAAAGGGGGAAGTGTCGTCAAAGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 11159196 5' + roo 7 2 74.66 TACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCA:1 - chr3R 3286197 5' - gypsy12 9891 3 63.36 GTGCTGATCAGAGCGAGATGGAAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:3 + chrX 12066083 5' + transib2 34 1 58.22 AGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAA:1 + chr2R 12185339 5' - accord 7229 2 72.60 GTCTGCGAAATGTGGCGCCCAGGGGATGTGGCTAATTCAAATCGAAATGTGCATCCAAAAATTATAGTAAGATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTAT:1 + chr2R 12473757 5' + transib2 322 1 64.38 ACAAAGAATGAAGTGGAAACCCGAGCAAATATCTAATTCCGGCTCCGTTTTGGTGTGTCAGTGATGTGTCGAGAAATCGGAGGGAAGACGGTTATGAATTATACATTATTGAAATTAAAAATAAACTTTAAAAATATATTATTAAA:1 + chr3L 11469814 5' - hopper 168 1 48.63 ATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3R 30675485 5' + 297 6606 2 64.83 ATTATGCTTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:2 + chr3R 20441231 5' - I-element 5296 1 56.85 GGTATATGTACGCCTGAGTGACTTTGCTTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGGAGTCCAGATAAGAGACCACACCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr2R 17796534 5' + jockey 4679 1 65.42 CTTTAAAAATTTTCGTAAATTAATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 20265891 5' - roo 395 1 76.03 GGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTG:1 - chrX 21639678 5' + gypsy5 44 2 78.41 AAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chr2L 21328142 5' - 297 364 2 59.69 GGGCGAGGGAGTCCATGCCGCAGGTAAGCCAGCCACGCATCCAGCGGAAGAGATGGAGGAGGGAATAGAGGTGCAGCAGGTACACGGAGAACAAAACTACAGCAACAAGATCAGAGATCAAGAACAAAAAGATCAAGGAATGATCG:1 - chr2R 13576028 5' - diver2 139 2 44.52 ACTTAGGAAAGGAAAATAGATTAATGTATAGGCAACGGATCTTTGAAATCTATATGGGTTAACGCTTTCCTAATAGGTTTTTATACCCGTAGAGTAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAG:1 + chr4 450554 5' + INE-1 28 1 60.14 ATACTTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAAAAATG:1 - chr2R 19199776 5' - hopper 1398 2 55.73 GGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr2R 22034628 5' - copia 5085 2 58.22 TTCTTTAAACAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTATGTGAAATTAGTTTT:1 - chr3L 25008191 5' + X-element 46 1 41.84 ATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3L 24131481 5' - Transpac 5163 2 68.15 TTCAAATAGGCTTTTTCCTGAAAAAGTACGCAAACCACTGCGCAACTTCTTTTCGAGCTCTTGTCACGTACACTTTTCTTATATTTTTATTTTTGTTTATATTTATTTATTTATTTATTTATTATTCTCGTTAATAAATTAAAAGC:1 + chr2L 13195188 5' + HeT-A 451 1 56.85 CGCATAAAGACATTAAGCGCATTTAATTTGAAGTGGCAGGATGAATGGAAATTTGCAACGAGGCAAAATGAACACCCACCCACCAACCAACGACGACAACATGAAAATGTAGAATGAAATGAAA:1 + chrX 19415900 5' + Copia1_DM 4160 1 73.39 CTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr3L 23146470 5' + 1360 60 1 58.90 GTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3R 28146127 5' - roo 8995 2 72.22 GATTTAATTAGCATTGCTGACTGGGCAGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGAACAAAGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr3L 8453709 5' + FB 35 1 60.96 CTAGGTTTTCAAGTTAAAAAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 9809216 5' + 412 7082 2 64.14 GTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTT:1 + chr2R 8735576 5' - mdg1 7395 2 64.38 ATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 14310341 5' - roo 9036 1 44.52 AGCGATCCAATCTGAAATAGATTAACAACGATTAAATGAGTGCTTAGAACTTAATTAAGAAACTCTATTCTCACCTTATATTGCACAATGAGCGGATGAAACTTGGTGTATGTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chrX 11337053 5' + mdg3 5275 2 76.71 ATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATT:1 + chr2L 6654660 5' + diver 73 2 65.75 CGATTCTCGAATTTTGATCACCTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTCGGGCCTAATACTTGGCTGGATAGCCTTTGCTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGAAGTCCACCAGGGCC:1 - chr3L 22742770 5' - HB 1278 1 75.61 TTATATAAGAATTTCTCCATGTGATCGATAAATGCGTGCTAGCAAAATAGCAGAACACACAATCACGCAGGTCAATTGAAAGGCATTTCACTTGGAGAATGACAGCAACTAATCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAA:1 - chr2L 12414055 5' + Stalker 7091 4 76.71 ATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATG:1 + chr2L 15950935 5' + Max-element 31 2 52.74 CTAAGCGTTCAGTTTTTCGATAGATTTCTCAGAAGTGGTTGAAATGATTTCACTGACAATCTACGAAAATCGAATAAAGTCTTGGCTTATTAAAAAGGGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGTAGAGGAAGAC:1 + chr2L 8538198 5' - hopper 225 1 69.86 CTTTACTCCTCACACTTTTCCTTTCGAGCTGGATTGGGAAAATGGCACATATTTAATGCGAGAACTCTTTTTTTGGGGCAAGGACGAGCTGCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAT:1 + chr2R 9933014 5' + F-element 308 1 61.64 AAGAGCAATTTTCTCATATAATGAAGAGCTAAAAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2R 8047208 5' - 1360 3374 1 71.03 ATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chrX 8200170 5' + flea 4803 2 56.16 CTATCAAACGGAGACTTGAATTCAAAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chrX 585760 5' + Tirant 36 2 62.33 AAAACGTTGATACACAAATAGAAAAATCCGTCTAAGTAGCAAAAATAACACTGACCACGTATTTGTTCAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGAATTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAAGGAGTTGCATTAAAGGTTTTA:1 - chr3L 10112059 5' + Tc1 297 1 65.75 ATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:1 + chr3L 17183647 5' + diver 38 2 53.42 ATATTTCGTTTAGATCACCATAGTAGTAAACAAAGACACTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTTTTGGCGTGGCTCTAGAGGGGGCTC:1 - chrX 22945125 5' + 1360 62 1 68.32 ATCTATCTTCCTTAAGACACTAAGAAAAATGAATTGCAAAAGACTTTTACAAGGATGTACTAAAATCAAGAACGTTTTCATTATTTAAAAAATGTGTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr2R 19597132 5' + 1360 203 1 58.90 TTTAGCTATAAAAATACATTTATTGAAGGAATTGATATATGCCAATTAAATGGTGTATTTTTAATTTCTTTCAATAAAAACATAATTGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATT:1 + chrX 23205146 5' + 3S18 33 2 60.96 TTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGATAG:1 + chrX 14304049 5' + roo 8722 2 63.70 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACGAAACTGTGCACCAAGTCATCCTACGCCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATACGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2R 1522953 5' + 1360 26 1 56.85 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:2 + chr3R 29487012 5' - flea 223 2 66.44 CCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 21299293 5' - roo 353 2 58.90 CAGTTCCCGGCACGCCAAACGGCAAAGCCAATCCGCATCGCCCAGGTCACTAAAGCTCAATGGTCACTGTCCTGAGCATTTCCTCCAAACTGGCGTGCAATTTGTTTCCCCGCCGTGTATTTGTATAAATGTAATTATTATTATTA:1 + chr2R 13208149 5' - invader6 4393 1 66.44 ATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGT:2 - chrX 19980674 5' + X-element 4562 1 69.86 TGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCA:1 + chrX 20999515 5' - BS 5023 1 67.81 TTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGGGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 - chr3R 22590612 5' + rover 6977 2 65.03 ATTCCCAAAACTAATTACCAAAAGCGAAAACCCTAAAAAAAATGAAAACCCCACAGTTGACATGAACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGC:1 - chrX 20799342 5' + 412 7335 2 56.59 GGTTATGTTTTGGGCTGTTTTTGATCAAAGGACACTTTTCGTGATCATCGGCATCGTTTTATATTATCTTTTGATATTTTAGAGTATTTCTCATATAGATTTTTGTGTGTTTTACAAATATTTTTTTTCTTTAATTTTGTTTT:1 - chrX 20688932 5' - gypsy2 424 2 55.24 ACCACTTACATTCCTATCTATGCTTCATAAGTAATTTGAAAGTATTTAAGAAGTATAACTATTTCCCGGTGTTTTAACTATTTCGGTGTTTTTAAAAAGGATAACTAATAGATTTGATTAAATAGCAACATAGTATATAAACATTA:2 - chr2R 14456818 5' + invader2 45 2 45.21 AAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCA:1 + chr2L 22966892 5' + 1360 3204 1 55.63 ATTTCTTTCTCTGCACGTATTCTCGATAATTTAGTATGTGTTTTATAAGGTTTCCCCACCAAATCGCCGGACTTGTGACTAAGGGACTACCAATATGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAGTATCATTTTATGAAATGATT:1 + chr3L 2012562 5' - Doc3-element 4631 1 47.26 CAGGCCCAAGCACAGGCGCACCACCATCACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGTGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAA:1 + chr3L 6994009 5' + F-element 4529 1 76.92 CGATTCGGCTGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr3L 3983807 5' + P-element 41 1 45.76 GTGGCAAAAAAGAAAATCGTCTTCGAGGGAGATAAATCGGTTTAGATGTTATAAAAAACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAACTACATACTTACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTGCCATATTTTACTATA:1 + chr3L 3433623 5' - transib2 260 1 70.34 GACCAATTCTGGATTGCTCTTTTTTTTCTTCGCTTTATTATTACTACACACAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGT:1 - chrX 17324169 5' + Doc 4642 1 65.73 AAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 14980384 5' + roo 8750 2 76.71 TTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATTTATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 - chr2L 13844254 5' + Stalker2 7313 2 58.62 TATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 14980300 5' - roo 9019 2 54.79 ATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 - chr3L 15103906 5' + Transpac 4980 2 60.96 TGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 + chr3L 16690906 5' - I-element 5291 1 64.38 ATATTTTTCAGATCGCAAATAATGTTCTTTCCATTTCGTTTCCCGATGGAAGTAATGATATATTTCTAATAATAGTAATAATAATAATAATAATAATTAAA:1 + chrX 22803877 5' + mdg1 46 2 90.10 GGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chr3L 3983834 5' - P-element 2812 1 22.14 TTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCACCGTTCA:1 - chr3R 5769127 5' + roo 34 2 59.56 TATAGATGGAAAAACATATTATATGCTAAAAATCTAACTTTAATTTGTGAATTGAAAGGTGGTGTGTTTTCTTTCCAGTGTAAAGTTTCATCTCCGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTG:1 + chr3L 20549576 5' - accord 206 2 67.12 AGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2R 13766208 5' - roo 9006 2 65.28 GTGTCCAGTTTCACTTTGAGATACATATTGAAAGGTGGAAGTGTCGTCAAAGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2R 11159258 5' + roo 69 2 67.12 AGACTAAACCTTTAGCTCAGCAAGTCCCATGTCTAACCCAATTTTTATTTTAGCCCCAATAGAGGTGGTGTTACCAATTCTTCGAAGATTCCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATA:1 + chr2L 5964671 5' + I-element 5161 1 63.01 AAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTA:1 - chrX 4808588 5' + mdg3 86 2 73.97 CGTACTTACTGTCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 + chr3L 17055400 5' + Tirant 25 2 66.91 GAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCCATCCGATT:1 + chr3R 4357531 5' - Tc3 1667 1 54.47 TTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATC:1 + chr3R 15363921 5' + flea 4823 1 64.38 AAACATTTAAACCCGCACCCGAATCTGGATTCGCTTATAAATGTCCAACAAATGACAAACTTGACAAAAGAAGGACGGCAAAAGTTTTTCCCATGGCAAAGAAAACTCGCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr2R 15389034 5' + I-element 33 1 77.40 TATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 + chrX 8027418 5' - Juan 4154 1 58.90 CGTACATTAGGAGTATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAA:1 - chr2R 4785344 5' - Juan 4173 1 56.16 AGGTACTCAGCGACTCACTCCGCAGTGCTGCGTATGTAAATGATACGAATGTGAAGTGACGCAGCAGCAGCAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:2 + chr3R 23067375 5' + roo 7 2 78.08 CATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:2 - chr3R 8075968 5' - 412 7467 2 71.23 ATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAGTAATTATAATATGAAT:1 + chr3L 19454918 5' + mdg1 7092 2 51.37 TGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 - chr2L 6647710 5' + mdg3 83 2 71.23 ATAAAAGGATTAAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:2 - chr2L 15940377 5' - pogo 2095 1 81.51 ACAGCCTTTGTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTG:1 + chr2R 7244769 5' + diver 18 2 72.60 TCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGCAGCGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCG:1 - chr3R 23021000 5' + INE-1 550 1 45.95 ATTTACATCATTTAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chr2L 14874103 5' - copia 257 1 60.00 ATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTACTCCAGGCTCTC:1 - chr2L 15076173 5' + 1360 71 1 74.19 GGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTGCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTAT:1 - chr2R 11164488 5' + roo 78 2 72.60 CAACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACA:1 - chr2R 16395904 5' + I-element 5166 1 77.40 AAAATGAATTCTTCATTCATCAACGATAATGAAGATAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCCAGCACAAGGACATATCTCGCCATTTGGACTTACAATCTAACTATGAGTTGCATGAC:1 + chr3L 23052369 5' + Cr1a 4162 1 59.59 AGGAGTATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr2R 4785336 5' - Juan 4166 1 51.03 AAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAAT:1 + chr3R 9595025 5' - Tirant 8422 2 78.08 TACATGAACTTGTATGAGGCCAAAAGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2R 22514248 5' - P-element 2876 1 73.79 CGTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr2L 15936755 5' - copia 238 1 50.68 AATTCGGTGTCTAGGAAACGTTACATTTGAAGTTTACTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTT:1 - chr2L 14523306 5' + HMS-Beagle2 6881 1 56.16 GCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chrX 19054238 5' + jockey 59 1 52.05 GTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:2 + chr3R 6419815 5' - Tabor 7290 2 60.27 ATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 + chr2L 6654647 5' + diver 5948 2 56.85 ATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCG:1 - chr2R 2318248 5' + ZAM 8014 2 51.37 GAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 14980447 5' + roo 23 2 69.86 TTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr2L 21328300 5' + 297 18 2 73.79 TAAACAATTTGTCTAATGTTGACACTTCCATTGACCAATTACCACCGCACGAGCTTATCTCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr3L 8453842 5' + FB 39 1 53.73 AATTGTTATAGTTGCTAATTTGGTAAATATAACATAGATAATGGATGTTAAAAGCAGGTGGACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACCATCTTTTG:1 + chr3R 15724089 5' + Juan 3972 1 49.02 ATGCGTCTGTGTGTGGGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAATAATGTGTTTTTCACAAGGATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 + chr3R 15681183 5' - hopper 1336 1 70.00 TTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTATTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTT:1 + chrX 3431875 5' + Ivk 5361 1 53.03 AAATACCATTCGTTTAAGAAAGAATTCGTAAAGATTTTAAAAAATGTTTAAGAAATTATATTATTAGATTTAGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAA:1 - chr2L 15772937 5' - Gypsy6A_LTR 236 1 51.37 ATGCGTAAACTTAATTCTTAGTTCTTAACATTTGTCAAGCCACAATTAGTCAAATAACGAAAAAGTTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACACCTTATATTTC:1 - chr2R 22685651 5' + HMS-Beagle2 6903 2 44.52 AAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 + chr2L 15550661 5' - Bari1 1646 1 52.05 AGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATT:1 - chr2R 13168700 5' + P-element 107 1 14.38 GCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 + chr2R 18316026 5' + HMS-Beagle2 6939 2 54.11 AGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 - chr3R 4860532 5' + Transpac 4981 2 60.96 TAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:1 + chr3L 12315716 5' + transib2 55 1 55.48 ACCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTAT:1 + chr3R 15942702 5' + hopper 63 1 59.59 CGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3R 23295574 5' - P-element 2829 1 14.79 AACTTACCATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCNNTCAGGTGCAACCGAAAGCCNNNNNATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGG:1 + chrX 23338837 5' - GATE 368 1 45.89 AATTGATTGAATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:2 + chr3R 27405923 5' + diver 5907 2 71.92 GTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:4 - chr2L 14074557 5' + 297 52 2 56.85 TTAAAGGCCGCTTTGGCGCTCCAAGGTTTCAGTGTGCGAAAGGTTGGCAATGCTATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGCTGATCTGATTTATTACCAGTTTACTGGATCACTCGTGAATTCCGGAACGACACCGTGACGCTCAGAA:1 + chr3L 3187517 5' - Rt1a 126 1 76.55 CACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTT:1 - chr3R 12242358 5' - transib2 2765 1 60.27 CAAAGCTCTCGCTTAAATAGTTTTCTAAATATCTCTCATAAGAATAACGCAACTAATGTCCATTCAGTTTAATAAGGACAACGCTTAGAAATAAATAAATATCAGCGAAATAGTTTTCACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTA:2 - chrX 22891648 5' - 297 6868 2 71.92 GTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTATACGGCTAGGGCCGACAACGAGCTAT:1 + chr2R 1320703 5' - diver2 4793 2 54.11 AGAAAATACAAAACATTTTTGAAAAGTGGGTCTATCCTTGCAGTAGCTCAAAGAAGCTGGGTTCGTGAAAATGGAATTTTTTAAATTTGAAAGCTGGAAACGTGGGCCCACCAATTAGGTTTTTTTT:1 + chr4 785567 5' + FB 83 1 65.35 GACATATGATTTTCCATTTAACTATGTAATACAAAATAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGTTAGTGTGAATGAGAACGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGAT:1 + chr2R 6172340 5' - INE-1 504 1 78.87 TTATGGGTTTAAGTTTGCTGCAACAAATTGTATTAAAAATATATTAGGTACCACCAATTTGTTTTCATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATGTAAA:1 - chrY 1421313 5' - flea 201 2 54.79 AGTGCAACGTTTGCACTGAAAGTGACATTGAAAGTGAAGATAGCAAGTAAACACCGAAACACACATGCGTATGATCGGACTTGAAGTTCTTCTGGTCTATTGTTCGTTCTATTTTCATTGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGT:1 + chrX 2635713 5' - blood 190 2 45.21 CTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGACGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3L 12004312 5' + P-element 52 1 32.73 AACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3L 19274902 5' - transib2 2775 1 53.42 AGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 - chr3L 21380608 5' + I-element 67 1 66.42 TAGACGCTTGTTATCTATATAGCGAAAGAAAAGACCTCTACTGTAAATCGAGAAATAGACAGAAATTCACCTTAAGCCTTAGTTAGCTGACGAAGCGAGTGGCGCACGTTCTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGT:1 + chrX 2197794 5' + pogo 286 1 73.29 ACAGCTGCGTGGTTTTTCACACTACACTCGCACAAATCGTGTGTAGCCTCGGAAAAGCAATGAAAATTGGAATGAAAATAGGAATAAATGTGTTTGGGCTTCAACTTTCATAAACATAAACATAAACATAAACATATA:1 + chrX 13798758 5' - 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chr3L 13294943 5' - roo 351 2 80.39 ATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 - chr2L 17005791 5' + Stalker2 7323 2 67.81 GAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 15791042 5' - roo 9046 1 67.81 TAAATCATACTGAGGAATTTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGGTCATGTGTGAACATTCTGCCAAA:1 + chr3R 19449689 5' - roo 8655 1 75.00 ACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chr2L 4123838 5' + transib2 31 1 59.23 AATGAGGTTAAAAAAACGTCAATTAATTCCAACAGTTTTTCCTACTGCATTTTTGTTGCTTTGTACACTCCCCCCCAGGCCTCACTGTATCCTTGTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTAA:1 - chr3R 23667525 5' + jockey2 3298 1 64.14 ATTCGCACCTGCGGCGAATGGCGTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGGATTTGGGGGGTCCAAA:1 - 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chr3L 9741270 5' - F-element 4413 1 61.64 GAGAGACTCGATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAA:1 + chr3R 9557489 5' + G2 3002 1 65.75 ATACACATACGTAAGTATGTATACGAAATGCAATAACAAAGCTCGCTATTCTTTGTTATGCTTTGGGGTCATTGTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTT:1 + chrX 18870319 5' - mdg3 5040 1 64.14 CAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 + chr3R 27315081 5' + jockey 4690 1 64.55 AGCCACCATCAAACACTCCTAACTTTTAGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAA:1 - chr2R 23027243 5' - gypsy12 10024 2 65.00 TATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:2 + chr3R 15054174 5' + copia 4894 2 64.38 AAAAGGAGTGGAACACGCCATGCCCGAACCAAAAACCGATGGCAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGT:1 + chr2R 11713490 5' + Burdock 70 2 64.71 TTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTA:1 + chr3L 12315715 5' + transib2 54 1 54.79 AAGTGCGTGGCTAAAATCAACTACCAATTACACTGGCCAACGTGGATGATGAATTGCAAAAGGTACAATAAAATGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAACCACTCGCGAAGCGA:1 - 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flea 278 1 55.48 GGGAGGTGGTGGCAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 29084979 5' + 412 41 2 58.82 CATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 - chr3R 31886917 5' - hopper 1331 1 74.66 ATGGCGGTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCCACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTAATTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 9530438 5' + 297 10 2 69.49 GAGCTAATTGATCGGGTTTTCTGGTTTTCTGATCTTTTGGTTTTCCGATTCTCTGGTTTTCAGTTTCTCAGTTTCTTATTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGCTTGTTTAGCTTCTTTATTTTAATTTTAATTTTTAT:1 + chrX 8453423 5' + Rt1b 128 1 52.05 CTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 + chrX 6116264 5' + transib2 80 1 71.92 TTTATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATATATACAATTACAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATT:1 + chr2L 7749231 5' - 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chr2L 14074573 5' + 297 36 2 61.64 TTTAATTTAAATATATTTTTACTTACACGACTTCTATTTGTCATAGTGCACAGTGTAATTTTGCATTTGCTAATTACCGAACAGAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - chr3R 13487648 5' + FB 36 1 55.17 AATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGCCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chrX 17717094 5' + FB 17 1 56.99 ACCAAAGATTACATTAAACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 18673376 5' + hopper 142 2 72.50 TATATAACATAGTCATTGTATAGTGTTCTTCAAAACCTCCTTATTCCAGTAGACAACTTTTAATTAATTTACCGCCCCTAGCTAACCGGAGAACTATGC:1 + chr3L 22531818 5' + Cr1a 4010 1 61.62 ATCCATAGCCAATGACATATTCTAATATTTGATAAACTACTATAACCGTAGTACAACTTAATCAATTACTGATGCAATATACTCTTTTCTTTTTACTGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACTACAGTGCACGAAAACACAAGAT:1 - chrX 11970006 5' - Cr1a 394 1 65.75 ATTTCTCCATGTTTAGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTG:1 + chr2L 15004777 5' - INE-1 155 1 67.36 AAATCTGAAATTAGGCAGACTTAGACTCCATCCAAAAAATCTAAGAAGTCGACCAAAGAATAACGTGATGAATAACGCTCAGTTATCACGTTCGACTGTCTGTCCGTCTGTCCGTATGAATGTTG:1 - chr3R 4989846 5' + INE-1 127 1 71.20 ACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAATACGGCAAC:1 + chr3L 2544610 5' + Tirant 54 2 53.85 TTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chrX 18409467 5' + jockey 4725 1 57.04 GCTTAAACTTCATTAGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:2 - chr3L 5881709 5' - pogo 2070 1 64.38 AATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 7719813 5' + roo 8733 2 69.18 CCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 + chr3R 20140486 5' + jockey 4741 1 66.44 TGCCTGACCTTGCCCAACACGACGTCATAAAGGGGCATGTCCCTCCCCATCCCGTTGCGATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGTATTATTATTATTATCATTATTATTATTATTATTATT:1 + chr2L 19454131 5' - mdg1 7075 12 58.22 AATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:2 + chr2R 20010155 5' - Juan 4194 1 69.18 CTACTACCAATGCGGCTAAAAATCCATGCACACGAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chr3L 6964751 5' - P-element 2800 1 26.71 TGTATGTGTATGTAGCACTGTGAGAAGTGCATTATGATATTCGCAACAAACAACCAACCAAAAACAACAATACCGCTAACCC:1 - chr3R 30968642 5' + I-element 140 1 79.27 TCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chr3R 11937276 5' + flea 13 2 74.19 CCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chr2L 2527715 5' - hopper 1343 1 65.75 CACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTCATATGACATCCAACATGCTGTTGTTCTCC:1 + chr2R 21926385 5' - opus 7431 2 69.47 TGGTATACAGTTTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTT:1 - chr2L 13556502 5' + transib2 1 1 79.45 CTTGGGAGACAGTGATGCCAGTTGGTCAATGGAGAGTGTGGGAATAGAAAAAGTATATTCCATGCATAGGAAATCATACAGAAAACCATATTTTTTGAAGAATTAATAAGGAACGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 - chr3R 19380588 5' + jockey 4741 1 77.40 AACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1 + chr2R 12472031 5' - transib2 2752 1 67.12 AAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 17940222 5' - 1360 3355 1 63.01 CAGAACAATTTGTTATTAGTTTTAGTAATAGTAAACCTAATATTATATTTATTAACCACCTCAAAGCCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTCATATATAAAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCTAAAAGTCGCGAA:1 - chr3L 13099825 5' + Tc1-2 1228 1 65.75 TCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACA:1 + chr3L 23249410 5' + rover 7036 2 72.60 AAACTTCAATTCCCATTTGTAATCCCATTTTTGCAAATAAAGTTATTTTAGCTCTGGGCCTTGCCTTTGGTAGGGGGAAACAAGAGTCACTTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGT:1 - chr3L 22139890 5' - roo 486 1 58.90 AGATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chr2R 21160779 5' + Transpac 4962 2 51.03 ACATCGGCGGATCAACTCCACGGAAGTCGGTCTTGTGACCACGACGGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 11810745 5' - roo 333 2 68.49 CAATGANCTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGA:1 - chr2R 12645507 5' + X-element 71 1 54.79 CAGGATCAATTGTAATGGGGAAAACGAAATCTTTCATTTTTTTCCGCATTCCTAGTCTGATGCCAGTGCAACACAGTGCCCTGTGTATGTCTGGCCGTAAAGCTTCACGACAGGCGTTACAGTTTTGGCCGGTTTTAGGGCGTC:1 + chr3L 18847766 5' - INE-1 344 1 50.00 AGGAAAATGCCAGTACTATATTGCTCATTCGCAGCGTATGACCGTCGGATATTGCAGTTCAACTTAAGCCGCATTTTTTGTTGCTTGTAGTGGACATCTG:1 + chr3L 5416996 5' - Fw3 2979 1 55.00 TGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 - chr3R 4805713 5' + 1360 44 1 52.90 AAGTGAATGAAATCGTCAGCGGCCTCCCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCCACGACCTCCCAGCCC:1 + chr2L 18465422 5' + Doc 4547 1 73.08 AGTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 27160045 5' - 412 7515 2 60.74 GTTGCAATTTATCCGGAAAGTGGGCGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 - chr2L 4124006 5' - transib2 2817 1 78.08 TTGTAATTGTAATTGTTATTGTGTTTTGAATTTTACATAGTATAAAAACAAAATCAACAAATCTTGTTTTTCAATCCCCTTTACCAAATCGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr3R 21328240 5' + jockey 4763 1 72.88 ACGGGCAATATCGGTTGCATATAAACAAAAACAAACAAACAAACAGACACTCTGTCAGGCGATAACATCAAAAAACTACTTGAGAACGCAAAGCAAAAATGTTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGAT:1 - chrX 3688875 5' + Porto1 4370 1 66.44 TTACATGATCCTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr2R 6847875 5' + Doc 16 1 76.38 CTCTGGAATTGATTTTGAAGCTTGAAGTTCCTGACTTGCATTCCAAGTAATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr3R 30813302 5' + FB 33 1 63.01 TAACCATCCTTTTGTTAGTGTTTCGGTTTTTGTGCCCACCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGGCGTTCAGGATGGTTT:1 + chrX 20423458 5' - mdg3 306 1 74.77 GACTTCGTAATATAACCTTTAGGTAATGAGGTTAATACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTTATGTTTCCCTCCCAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGAC:1 - chr3R 5726306 5' + G6 1988 2 72.14 AGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chr2L 10156101 5' - hopper2 1555 1 52.74 GCCTGCTGCTCCGCCTGTGCCTCTCCCACTGTGGAAAATCCTGTGGAAAGTCCTGTTTTTCCACACCCCACCGATCTCCCTACACCCTTACACAATAAGAAATTAATAACTAGATACATTTTCCCTTTTGTACTTAATAATTAAGA:1 + chr2L 2561567 5' + G5 4728 1 56.16 TATTATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACA:1 - chr2R 12185467 5' + accord 12 2 74.66 AAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:1 + chr3L 21655863 5' - HMS-Beagle2 271 2 52.05 CTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCACTTATCTTCACTTATCTTCACTTATCTTCTCTTATCTTCACNTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chr2R 6629974 5' - Stalker3T 205 1 40.41 AACATGACGTAAACGGAAAATTTGTCATTTCTGCCGACTGACTCTGGGCGGCAGTTGATGGTCAGAAAGGCGTTTGCATTTGGCATTTAAAAGCGGCGATAATTAATTTTCTTTTATTTT:1 - chr3L 13877834 5' - NOF 3960 1 74.17 ATCAGATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr2R 21160782 5' + Transpac 4960 2 52.74 AATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 12779733 5' + I-element 25 1 63.11 TTCTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGA:1 - 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chrX 22840552 5' - copia 206 2 71.92 TATATATGAACAAAACAATCAGGAGAAACGCTATATTAGATAAGAGAAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chrX 20373551 5' - 297 368 2 55.48 CGCTGCCACACACACTCGCACTCGCCGAGGGTGAGAACATAACCAGCTAGAATACAACAAACACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGG:1 + chr3L 19414184 5' + HeT-A 5732 1 63.64 CTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr3R 15054229 5' + copia 54 2 71.67 GTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGATTCACCCGGTGCTTC:1 + chr2R 7244778 5' + diver 13 2 73.48 AGGCCATTTTGGATAGTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 + chr3L 24131392 5' + Transpac 4977 2 61.64 ATACACTCTAAACAAAGAGCTGAAAATCCGTCTTCACAAAAGAATGAACACGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 22960503 5' + Tirant 8170 2 61.70 ATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGA:1 - chr2L 4754940 5' - Stalker4 7278 4 73.97 AGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACAGGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATAATATCTTATGTAAATGAAACGAGATCGATAAAT:1 - chr3R 14980381 5' + roo 66 2 58.87 GAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCAT:1 + chr3L 24272066 5' + gypsy11 4052 2 57.34 ATTCACGAGTTTGCACAATTTTTGCATTCGATTTGAAAATTCTTTTCGAATTCGAGTCGGGTTCTGTTCCCTTTTTTCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTTCCA:1 - chr3L 15186073 5' - hopper 1387 1 74.31 AGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 5769085 5' + roo 8725 2 78.51 TATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTA:2 - chr2L 4034961 5' - TAHRE 10390 1 68.49 CGCAGGGGAGAAAAGTGAGAAAAATTGTGTTTGAGTTGGTTTTTTGGTTTCGTTTTCGGGTTATTAGTTTTGTGGTTTCATTGTTGATTGATTTGGTTGGTTGGTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGA:1 - chrX 15003902 5' - Porto1 228 1 75.69 AAATGTTGTAAAAGCCCACACAAAACACAACCCAACAACAAATGCCACAAAAACCAACTGAAAAACCATTAAAGATTTTATACTGTAGCTCTGCAGTTATGAAAGAACTTTGTGATCACTTTTATTTTTTTTAATTTTCATTTAAT:1 + chr2L 19174109 5' + S2 92 1 57.53 AAAGATTACTTTGATTAAAGTTCGACCTAAAGTCACAATATACACAAAGTAAGCTGAGATACCAAAATATTTGTAAACCAGAGGCGTGCCAACTTAAAATGGAGGGGGCTAGATATTCAGATGACAAAGTTAAAAAAATAAAAAAT:1 - chr3L 10548953 5' + TAHRE 10440 1 69.18 TATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2L 12818266 5' - hobo 2886 1 68.87 ATATCCTTGAGTTACGCAAAAAGTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTC:1 - chr2L 12821945 5' + P-element 2773 1 18.49 AAAATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATA:1 + chrX 22564554 5' + Transib5 62 1 76.03 CTAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGTCG:1 + chr3L 6397690 5' + roo 8758 2 78.08 CTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 12115249 5' + 1360 46 1 50.68 GATTAAAATAAATGTGCTCCAAATGCGACAAGTAATTGACGCTCACCTATACGGACGTAAGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATATTCACAAA:1 - chr3L 162846 5' + Porto1 4342 1 69.86 TATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 19073283 5' - roo 347 2 60.69 TATGGATGATGGGGGGAATTGGGGATTGTTGCTGGGGGATTCGTGCTCTGGTTTATCCCTCTGCGGATTCAGTCCCTTCATTAATTCCTCTACAACTGGACCTTAATTGCTTGCATAAACATAAATATAAACATAGCAACAA:1 + chr2R 11071123 5' - 412 68 2 70.42 GATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGG:1 + chrX 14722099 5' - diver 201 2 62.39 TCTCATGTCAAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 - chr2L 18347424 5' - transib2 2801 1 69.86 GTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTG:2 + chrX 19038373 5' - hopper 1349 1 64.38 GGTTGGCTAGCTGAAATGGCAACCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCCAAAAACGAAAATGGAAACGAAAACAAGAGGACGGGCTTCAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCC:1 - 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accord 7030 2 58.22 GTAAGATGAAAATAAAAATTGCAGCAAAGAAGGTACAAACGGGGGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATT:1 - chr3L 10406403 5' - hobo 2550 1 69.86 ATTTATACATTATTGTTTTGTCTTGAGTGTTCATTGGAATTTTGTTTGTTGTGTTTGCAACTTTTTTATACAATGTCGTCGACCCAGCTATCTGGGTGTCGTCGACGTGGCGGAATTATTTCGCGCACCACTATAGGCGAAGG:1 + chr2R 2363293 5' - gypsy12 364 2 75.52 ATTTTTTCGTTTCATTTTGCCAATCTTTTTGCCTTTTTTATGCTGATTGTCCATTGGGCATTCATTGGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGA:1 - chr3L 5392192 5' + diver 196 2 53.42 AATACAGAGGCGTAATATGAGTTGCCAAACATGCCCCATTGCTCTTCTTTCTTAGGTTAGATTGGATTTTCTTTAGCTTTTAAAAATGTATGTGCTGGTAATTGGTAGTGATATTTCTAACCATTTCGAAAAATATAAAATTTTTG:1 - chr3R 8896042 5' + Tc1-2 255 1 72.60 GTAATCTCGCAGAGATTTTTTTTTGACCATTTGAGCGTATCTGCATCTGAAGTGATTTGCTTGACGAGCTTTCATTACACAATTCTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGC:1 - chrX 9484300 5' - P-element 360 1 61.59 AGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 + chr3L 19274811 5' + transib2 84 1 72.60 TATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr2R 9738418 5' - HeT-A 6060 2 34.53 GTGGCATTTTAATGGCGGCCCTTGCTATTAAAATTTGGATTAAAATTTT:1 + chr2L 12373514 5' + 1360 3045 1 67.35 GAATGTTCTACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAACAATGTGTTTT:1 + chrX 14450367 5' - hopper 1392 1 64.71 TATGTTGTGCTGTATGTATATTTCCGTTTTTTCACTGGTTTTTTTTTATATTTACTTGGTTCCTTTAGTATGTACTTATTTTTAGATATAAATATTGTTATTAATTATTAAGCATTGATTGATTTTGAAAATATGAATTTCTAAAA:1 + chr3L 9166197 5' + gypsy12 9805 2 71.92 GGTGGCAAATGAATCAATTGGAGGTCAATTGCTGAGCAATTTGTGGCGCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGTTTAA:1 + chrX 13707324 5' - micropia 5318 2 62.41 AAACAATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTA:2 + chr3L 22723810 5' - HMS-Beagle2 7161 2 66.44 AACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATTTATAAGCGTATGTAAACAGATGTAAACGTACTATATGTGAAAAGAACTGCTGGGACTTGATCAGAACGTAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 - chr2L 22315530 5' - INE-1 560 1 46.21 AGCCATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGC:1 + chrX 15200848 5' + 17.6 64 1 69.18 ACTCGATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAAAAGGGAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGCACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAAT:1 + chr3R 9557494 5' + G2 3007 1 59.59 CCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 - chr3R 28385640 5' + transib2 49 1 52.05 AATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2L 13158723 5' + roo 78 2 71.92 GTTAATAAATTTGGCGCAAAATTGTCAATGGCCAGAAGACAAGGTATTTATGACGATGTGGCTGCTGTTGTTGTTGGGGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAG:1 - chr3L 6804173 5' - F-element 397 1 72.00 AAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGACAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGAT:1 - 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1731 4300 1 73.72 AGTTTCGTTCCACATTGTACATTTTATAGAACTATTCTATTCTATATTCTGTTCTATTTTATAGAACTATAATGTTTTTATACTATTTTAACTTGTGATATAAAAAAATGGAAAAAGTAAAAGCAAAAAAAAAATAATTATTGAAA:1 + chr3L 20792401 5' - Tc3 81 1 42.47 TGAACTCGTGATTTGATCGTAATGCTATTCGCCAGATTTTAGCACTTTCAAATACTAAATGTATCGAACGTTTCGGCGAAAGGACCAAACCGATCTGACCCTGTCCGTTTGTCGGTCCGTCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGA:1 - chr2R 25107434 5' + INE-1 138 1 58.62 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 + chr3L 20525229 5' + Max-element 58 2 65.60 ACTTTTAAAATATTTAGTTGATTTGATGAATTTCCGCCTCTGTAAAACAACTTTGCTAATACCTTGTTACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGTTACAATACTG:1 - chr3L 4156168 5' - Circe 7323 1 51.43 TGTCCATCCTATCAGCATCATCGTATCACCAAAGTCAATGTGTTTCCGTCAGCTGCCGTTGGCCTCAGCTCAGCAGGCCAGAAAGCCAGATGAACAGAAAGCTCGAAAGGAGCTGCCATTGTTGCCAAAAAAACGTATGGCGTTAC:1 - chr3L 3074939 5' - 1360 26 1 82.88 GAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:2 + chr3R 19224993 5' + HMS-Beagle 63 2 61.64 GGCTGGGCTGCAAAGGATTTGGGGCGCTGAGCAACTTAATCCGGCGGCCACCCCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCT:1 - chr3R 24611181 5' - Stalker2 333 2 64.38 AAGTGGAAGAAGAAGAAAAAGATGATATCGAGTCTGAAATCTGTGCAAATAAATTTATCAAAACAACAAAAAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATTCCATTCAAGGAGGATTGTAGGGTATCTACCCTCAATAT:1 + chr3R 19444922 5' + Stalker3T 2 1 91.10 GGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 + chr2L 10156086 5' - hopper 1377 1 56.85 AAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACA:1 - chr3R 26774094 5' + hobo 80 1 69.86 ACTGGAGTTTAGTGTTGCCAAATACCAAAGCATGACCGCCTACCAGAATGTTTGCACTACGATAGATAAAATACTAAAAGTTACAAAAAAATGATATATATCTTTGTTTAATTTTTTTGTATATTTGTTTTTTTTTTTGTATTAT:1 - chr3R 26717886 5' - Rt1b 5150 4 77.93 ATATTATTAATATGACCACACCGTCCAACTGAAGAAAGCTGAACGATATCATTTACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGTTTTGAAACTTAACTTAGTTATATACAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTG:1 - chr3R 3589881 5' - Tc3 1650 1 71.92 AAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:1 + chrX 18336602 5' - mdg3 5414 2 71.92 AGATTTTACATGATGAAAATTCGAAAATATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 8360669 5' - roo 9052 2 72.60 GAGCAGAGATCAGAAATCAATTACAATCACAAAGAGCGGGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAA:1 - chr2L 5805344 5' + I-element 274 1 76.71 TCAACACATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 19032581 5' + roo 45 2 53.42 TTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr2R 2591108 5' + roo 82 2 56.16 CGGGTTTTTAGAAAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2L 12251040 5' + 412 14 2 71.92 AATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCA:1 + chr2R 545172 5' - Stalker 7083 6 66.67 GTAGTCAAAAGAACTCGGAGATGGATGGACGGGATGGCCACCGGCAGTGTTCTCGCCAGATTGGAGCAGAGTGAGTTATTAAAATCTGCTTAGAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTA:1 + chr2L 6176110 5' + I-element 5232 1 66.44 GAACGCTCGCGCCGCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chrX 18282685 5' + P-element 16 1 62.24 GATTACTTGTTAGTAATTTTATATCATTTTGTAAAATGGATCTGGAATAATAAATTTCGCATCTGTTTGTTATTTCAGGTTATTTTATATAAATAATTTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTGGCTGCGG:1 - chr3L 27866135 5' - Max-element 276 2 65.75 AAGCGAGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr2R 20349079 5' - transib2 2804 1 65.62 ATTGATTGAATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chr3R 27405924 5' + diver 20 2 71.23 ATTAGGTTGTGTGTTTGGTGCTCAGGATTCCCCCGCTAAGTATTTATTTTAATTAACAAACAAAGCCAGTAATAAACATCCATGTTTAACAACTTGAGAACTTCGCTTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTT:2 - chr2L 20694388 5' - Porto1 200 1 73.29 AACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTC:1 - chr3R 15790108 5' + flea 4709 1 79.63 ATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAAT:1 + chr3R 19449913 5' - roo 8762 2 74.66 CGTTGATATTTATTGATACTGACAATGGACCGACCTCCCTTCTCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGGCCCAC:1 + chr3L 6395670 5' - roo 8929 2 60.00 GGCAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chr3R 29084969 5' + 412 7131 2 73.29 GGCTTATTGTGGTACTAATCGATGCAGACACGCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 9003039 5' + roo 34 2 62.33 CAACTATATATATGTATATATATATAGATTTATAGATAGATTCCATTTTCGTTTGCTTAAACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:1 - chr2R 20328008 5' + mdg1 22 2 63.70 AGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTAT:1 - chrX 19980677 5' + X-element 4558 1 67.59 GACTTAGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:2 + chr3L 12315701 5' + transib2 40 1 58.22 GAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr3L 25782382 5' + F-element 97 1 75.34 ATGGGATGCTTCGTTCTTTCCGCGTCCATTGAAACGTATTTCCACACCTTTCGATTTGACATACTCTTGTATGTGCAATACGTTTTTCAGTTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGA:1 + chr2L 10273014 5' - Burdock 192 2 60.96 GTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGA:1 + chr3L 22760367 5' + F-element 146 1 60.00 ATAAATAAAATTTAAGCTACACCACACGATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGTTATTTTGATGAATTTT:1 + chr2L 2527665 5' + hopper 56 1 71.57 AAAAAAACAGAAAATTATTACACTATCCTCTAATAGAAAAAATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATGGCAAAACATGTCCAGATCGACTCGGCTATTGTTCCTG:1 + chr2R 4709815 5' - INE-1 95 1 51.37 GAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTG:2 - chr3R 11040136 5' + Bari1 84 1 73.97 AGCCGCCAAATCCACCGACAATAATACCCTTAACGCACGCCAGGTGAGTGTTGCCCCCGGGGGGGCACGGGAAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGG:1 + chr3R 22287918 5' + transib2 8 1 70.90 AAAACGAAACCAAGTTTCGGTGTTGATTAAAATTTTGCACGTTAAAAAGGAAAGTTTTTTGGTGTTTTCGGGGTAGAAAGAAATTTATTAATTGGATAACTTCAAAAGTGAAAATCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATT:1 + chr2L 11819089 5' - S-element 385 1 58.90 CTGAAACACGGGATGCACAAATCAACAGGACTACGAGTACAATACAAAAAAAGGGTGACTAAACAACAAGCCAGCAAAGAAATCCTAGGGCCGTCTCTAACTAATACAATTACTTCATAATGTAATTCATATAAGTTATATAATAA:1 + chr3L 1525784 5' + Doc2-element 4695 1 52.74 AAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAACGCCAAAAAAAATAAACTAAATA:1 - chr2R 5479961 5' + F-element 86 1 72.22 AAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 28469224 5' + 412 42 2 65.05 ATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3L 21996132 5' + Transpac 4954 2 66.44 AATTCCATTATAACTAATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGC:1 + chr2L 14026085 5' + F-element 427 1 78.62 ATGGATGCTTAAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chr3R 15363863 5' + flea 4765 1 78.77 AGAAATATCGATTTGGTTGCACCGATTGCCAGGGAAATACGATAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 + chr3R 15942682 5' + hopper 1 2 73.08 TGAGTCAGCGAGACTCATCCACCCTCACTTCCTTTCCCCAGCAGCAGCAACAACAACTGGCACAGGCAGTAGCAGAAATGTATAACAAAAACCAAGAAAATTAATGTTAAATTAAACAACAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - 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chrX 18409469 5' + jockey 4724 1 55.88 AGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGGTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chrX 2214232 5' + jockey 4792 1 59.12 ACGAGGCTCAGACGAACGACCGACAGACGCCTATTAATCATGCAGACTTTACGTTCCATTAAGCAGTCAAGGACTAGAATTTAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAAATGGATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 + chr2L 17137420 5' - Tirant 339 2 58.90 ATAAAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGAGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 47045 5' + roo 19 2 71.92 ATTGTGGTGAGTTTCCCTTTTCATCAGCATTGTTATTGTTGGGATAGGTTCTGTTTGTGAGGGATTTTATTCCTTTTTTCGGTTAATTTGCATCAACTTTGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr2L 13459086 5' + blood 7176 2 61.79 GATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 + chrX 12986503 5' - roo 9039 1 61.64 ATTTCTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTTTATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAG:2 + chr2L 13585715 5' + Quasimodo 47 2 49.32 ATTCCTGCTTTTCATTACAATAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 20167791 5' + roo 60 2 63.01 ATTATGTTGTAAATAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTG:1 + chr3L 22890310 5' + FB 17 1 72.60 ATTGACAGTGGGCCAAAACCGACGCAATAACCAAATAATATACATTATTTTTCTTATAAGATGATCATTTTGTAATATTGATATTATAGTATATTTTATAATAAGTGAATCCAATTGGTTACCTTTTTAATGGAGAGGAATCACAA:1 - chr3L 11450771 5' - Q-element 62 2 71.92 TGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAA:2 - chr2L 17005782 5' + Stalker2 7332 2 73.97 GTCTTGCTAATTTGTTTCTTGTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:2 + chr2L 21299260 5' - roo 9049 2 69.86 GTCCCTGCCGTAGAAATATAATTGAGAGAAGACTGAACCGAAAAAACAACGCTTCAACCTTTAACCTCTTCTTTCGGTTGCCCGGAGACACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTC:1 - chrX 3504797 5' + accord 7059 2 76.26 GCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 - chr2L 17005801 5' + Stalker2 7259 2 65.22 ATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATGAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 11810650 5' + roo 77 2 71.23 CTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1 - chr2R 8099217 5' - jockey 4925 1 65.75 TATTATCCTTTCAGCTACATCACCAACGCACCCAAGCTGACCTTCCTCTCGAAGGACGTATTTTAAAATTAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAGTTTTTAAAAATTATTTTATTT:2 + chr3R 17729598 5' + 1360 3091 1 58.22 AATCATGAAAAGGACGAAAAAAAATGGACACGTGCGCTCCCTGATTTTTTTACGACTACTTGGCTTTCGGGCAGGAGGAGCTCGGCTCGGTGGTGGAGAGGGCTGTTTACGAGGGTGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATTAG:1 + chr2L 8748062 5' - Idefix 204 2 73.29 ATTACCCCACGAACTTAGTCAACAAATTGACATACTCTTTCCAAAACTAAAATACTAATAACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr2R 10909351 5' + hobo 9 1 75.34 ATCCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3L 8959561 5' - 1360 3360 1 65.75 GGGGGAAAAATAAAATAAAAAAGGGGAAAA:1 + chrX 3029736 5' + Bica 337 1 86.67 GTAAAGGCTGTAATATAATTATTCACAAGCATTTTATTACAGAATGCACAGTGCAAGTTCCTGATGAAGCGAATATATTTTTTTTTCGCACGGGTCTCACGGCCACTCCTCCCGCCCAAGTGACCGAGGGGCGCTGCCG:1 + chr2R 20698227 5' - Cr1a 4410 1 73.38 CTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACAT:1 + chr2R 15004735 5' - BS 5056 1 45.21 AATGCGAGTGCACTTATGGAAAGGCATTTTTACATCGCCCCACCTTTTACATTCCACTCCACACACACACACACATTCACCC:1 - chr3L 16052323 5' + accord 7035 2 90.24 GATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATT:1 + chr2L 7660937 5' - I-element 5269 1 75.86 GCGAAGGGCACTCTTATATGGCACTTGGCAAGCGAGAGCGAGAGGGCGAGATATAGATTTTGGGGCCCTTAAGAAAAACGCTCGTGCCCATATGTTTTGCTGTGTGTGTGTGTTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCAG:1 - chr2L 1636671 5' - hopper2 1563 1 75.54 TTTAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTA:1 - chr3L 23940558 5' - Cr1a 4401 1 72.60 TTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 14310343 5' - roo 9038 1 45.89 AAGCGTGGCCCAGAGCGAATAATCAGTTGGAACCATACCAGCCAGGCAGCAGGACAGCCGGAGCGATGGTGGGTTCTGTGATTACATTGATGACTTACGGAATATTAAAGGCTCTTTGGATGTTTTCGTTCCG:1 + chr3R 24739178 5' - F-element 4376 1 56.39 AAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGAGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGAC:1 - chrX 23108342 5' + BS3 1417 1 58.93 AATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCCAGAGACATCCACTTAACG:1 + chrX 18282612 5' - P-element 2856 1 44.68 AATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTATTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 19924028 5' - roo 9014 2 61.54 ATATTTAACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:2 + chr3R 20441217 5' - I-element 5310 1 51.37 ATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 + chrY 2720333 5' - 297 336 2 73.97 ATTTTAACATTCTAAATTAGTTCTTTGGTTAATTGTTTCTTTGTTATCGTGCGCGTGTTATTTTATTTAACGAGGAATTAATACGGCGGACCACCGCGGTCGGTTTTT:1 + chr2R 5267322 5' - Tom1 40 1 60.19 ACCTAGGATAAAAGGTGAAGCCTTATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chrX 6116226 5' + transib2 42 1 53.42 TATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAAC:2 - chr2R 6847834 5' + Doc 76 1 67.12 CAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr3R 16630266 5' + FB 63 1 60.27 ATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGTGCTGACATATATTTATTCAATT:1 + chr3L 13836629 5' - 412 434 2 68.80 ATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTAT:2 + chr2R 3262651 5' - mdg1 7055 2 62.33 CGAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTTATACCTCCTAAACTATTGG:1 - chr2L 12984243 5' + hopper 37 1 59.31 AAAATCGAAACAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 13158617 5' - roo 9033 1 58.90 ATCAAGTAATTTACGCGCCATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGGTCGCAAATAAGAATCATATATACAC:1 - chr3R 27406077 5' - diver 175 2 48.63 ATTTATTATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCA:1 - chr2R 12185470 5' + accord 9 2 76.71 TTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCT:1 - chr3L 3501789 5' - Bari1 1617 1 80.14 AGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:2 + chr2R 8735557 5' - mdg1 7414 2 54.11 GTGTTCTCTTTCGCCCGCCATGGCAGACAGTGCCCTGCTATTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCCGCTTGCGTCGAAATCTTCTTCCGCGCTTTTTAATAATAA:1 - chr3L 18078033 5' - invader2 444 1 69.18 ATTTAGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 - chr2R 7306572 5' + Max-element 8293 2 57.93 CATGTAAATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATG:2 + chr2L 10156065 5' + hopper 17 2 71.23 AAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAATGACTTACA:1 + chr2R 23180172 5' + roo 8681 2 67.50 AAATCATTGTATGACAAATTGACTTCAAAAAGCAATGAAAAAGGGCAGACAAAGTAAATTTATAGTTGCTAAACACAGAAAAAAAGTACACAAAAAAGCGAAGGGAACTGTGTGGAAAAACATTTTTGAAATCTATTTCGTTATGA:1 - chr3L 18814734 5' - 1360 364 1 60.96 TAGGTTTTTTTGTTTACCTATATTTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACT:1 - chr3R 15072709 5' - pogo 2091 1 75.18 AGCGAAATAATAATGAGAAATCAGAGGCAGACTGCAAAAAAAAAAGAAAGAAAATGCAACACTGGGACACATCCATGCACTCCACTAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCATTTTGCCAAGGTGATATTTCAA:1 + chr3L 11760819 5' + I-element 5016 1 63.01 AATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCA:1 + chr3R 19450032 5' + roo 8620 1 73.79 CTACAATAATCGTGTGACAAACGTACATGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATATTTAAATGTCTCAAGTGAGCGGGATCTAAGATCACCCATTTA:1 + chr2L 11357853 5' + blood 7102 2 75.17 TATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 15072543 5' + pogo 44 1 53.10 AAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3L 2544613 5' + Tirant 8 2 71.28 TACACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGT:1 - chr3L 26290982 5' - Tabor 7265 2 55.48 GCGATTCTTCGATAGAGGTGTGTGATTTACTAGGACCACGGTGTACAGAACACAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAA:1 - chrX 22354524 5' - copia 56 2 64.38 TTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTC:1 + chr2L 6654661 5' + diver 5962 2 66.44 GTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATTTGTCGTAGTTCGGGATTTTGCGTTACATGAATACGTTTATAAATAAATTTGGCTGCAATTCCCCAA:1 - chrX 15231530 5' - Helena 1089 1 60.27 AAGGATGGATAAATTAAGATAATTGGTACATGCATCTTCCAAAAAACACAATTATGCCGGATTTATCCAAGGATATTCTCTTATAACTACTATTCAAATAACCCGCACTTACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACA:1 + chr3R 31630086 5' - Stalker4 265 4 70.42 CATTACATCTCCATATACATACATATATTTTCGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCACTTCCTTTTTTTCAAAGAAATCAGTATTGCCCT:1 - chrY 2720331 5' + 297 43 2 64.44 GCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACA:4 - chr2L 15913328 5' - transib2 2755 1 66.44 GTAGTTGCGCTTAAACTTCATTAGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3L 5881717 5' - pogo 2091 1 76.69 TCTATATAAAGAACAAGAACAGGAGAATGTCCTCGAAGAGGCGGTGGGATAGGTGTGTGGGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGG:1 + chr3R 22252490 5' - accord 122 2 58.78 GTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTTTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCTTTTGGGCTCGCCGGCTAACT:1 + chr2L 7618493 5' - X-element 4636 1 78.29 CATACGAAACATACATCTCATAACCAGACGCCCGCGAGAGCCAAATCTTCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGACAACGATCGC:1 + chr3R 24699537 5' + Doc3-element 362 1 67.74 CTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTTACATGATA:1 - chrX 21224627 5' - roo 334 2 63.70 AGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr2R 8047343 5' - 1360 3319 1 67.81 ACATTTTAAGTCTGCAGCCCCCGAGCAAAGTTTGCCTTTCACAAAAGATATGCCAAGAAAAATACATTTCACATAGAGACCAAGCCAAGCCTATCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCA:1 - chr3L 13586353 5' + G4 26 1 55.24 GTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCAGGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACTTTTGCTTGT:1 + chr2L 9782083 5' + P-element 62 1 37.12 GTGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3L 25406604 5' + 1360 11 1 67.12 CTTAAAAATTATATATTACTTTAGTACTCTGTCTCTAGAATCTGTATGGTGAATTTTAACCTCCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTGCACATTTATACGGACAGACGGACCTGGCCAGATCGCCTCGGCTATT:1 - chr2R 6199074 5' - INE-1 102 1 78.52 CACACACACACACACAGAGAGTCTACACCCATACCAATCTATTAATAGGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAATAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 + chr2L 10825084 5' + I-element 4944 1 78.77 ATAAAACTTAAGGTTAGGCATCTCGCACGCCCGCTGAAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr2R 9158169 5' + mdg3 38 2 60.27 ACTCAAAAAAAGTACAAATAAAGACACAAAAACTCCGCCACACCAAGCTGCGAAATCTGAAACAAGAGGAACAATACGCTCAGAACCGATGTATAGAGCACAATCACAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGAAG:1 + chr2L 16633465 5' + F-element 4348 1 60.43 AAGGTAGATACACTCAAAAAAAAAATACTCAATCAATTGATATACCGATTTAATTCAGTTAATTTTTTTTGTAGTTACCTATGTAGCAAACTATACTCAAGCCTTTCTATTGCGGTATCAAATACCAATTTTTTTAATTTTTTTAA:2 - chr3R 18990764 5' - HB 323 1 43.15 GGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGGTTAAGCGCTTGGCTATATGAGACAAAGTTGTAAGGCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTAGGTTACTGTTATTGCATTGTATTGAGTCAT:1 + chrX 18193643 5' + BS 5065 1 69.86 AAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2R 14051776 5' - roo 321 2 77.40 TATTCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAA:1 + chr3R 14860107 5' - BS 5065 1 60.96 AACCACCCCAAAACTCCATCCGAAAAATTTGAAATGCTGGCATTTTGTTGGCCAAAATAAAAGGGAAATGAGCAATTTTAATTCAGCCCTTTCATCCGCGACGGCTACCCAAAGTTAGCTGCAACATAACAATAATA:1 + chrX 18057049 5' - BS3 1663 1 58.39 AATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGTACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 28469179 5' + 412 38 2 59.03 TTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTC:1 - chr2L 9010162 5' + G2 2729 1 52.05 AAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:1 + chrX 12066104 5' + transib2 55 1 55.48 TTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACA:1 + chr2L 12818256 5' - hobo 2862 1 70.71 ATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr3R 30675348 5' - 297 6914 2 64.38 TGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 - chrX 21100292 5' + mdg1 7064 2 68.49 AACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAGGA:1 - chr3R 11062822 5' - roo 336 2 63.01 ATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACA:1 - chrX 15357750 5' + hopper 71 1 65.75 AAACCCAAAAGAAACTCTATAATGGCATACACGGCATACACACTCACACTACACCCGTCCCACTCCCACACTCCACCTCTCTCACTTCCGACCATTTGGGGGTTTCTTTTGGGTTTTCTCCTCTTTTCCGATTCTTTTTTTCTGTA:1 - chr2L 16017543 5' + McClintock 211 2 71.92 ATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 + chrX 6116250 5' + transib2 66 1 63.70 CATTAGATGTGAGTAATCCAGAGTCACTGAAATTAAAGTTGCATCTAAATGCAAGAAGAGTGAATAGTTAGAGAAATACTTTAAATCAGAACTATAATTCCTAAGAACCAATTACTCAAATTAGAATGTTCTTTTTTTTAACAATA:2 + chr2R 22268593 5' - Circe 470 1 54.79 AGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTT:1 + chr3R 11040077 5' - Bari1 1623 1 76.03 CTTATATACAAAAAAATATATATATGGGATGGCAATGTTGGCGGGGGCAGAAACATTAATGCGCCTTGCAAAGGAGCTGAGTAAAAATGTATACAGTTTTTGATTTTTTTTTTATTTTA:1 - chr3L 9988537 5' - F-element 4685 3 83.19 AATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 7719826 5' + roo 8702 2 54.69 AGGGCAGTGCCAACAGCAACTAAAACCAAATTAACAAATGAATCCCTGCGCATACATAAACATATAAAAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACAC:1 - chrX 7291130 5' + accord 240 2 58.22 ATTTTGAATTTAATTTTAAAGCTCCTTTGAAAGTGAAAGTGAATTTAGCTGGCAAAAGGGATATACCAATATACCCATGTCTAAATTTCTAATCATTTCTTAATAAACTTGAACCATATATGTAATTTAATATTAATTTCGATTCT:1 - chr3L 14480929 5' + Rt1b 131 1 47.26 AGGCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCG:2 + chr2R 5617460 5' - invader1 3987 2 61.64 ATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2R 9544935 5' + roo 62 2 61.64 CGATACTTGGATAATTAAAATTCTCACCTATTTATATGCATTTATATGTATTTAAAAAAAGGGTATATTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCACCATATAAAGTATATTTATATTCTTGATCAGGAT:1 - chr2R 1112646 5' + INE-1 79 1 60.27 AACTCTTTGCTTTTCTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGTTTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2L 7580873 5' + Transpac 4949 2 41.78 ATACCCTTTAAACTTAGAAAGTCGGGTGTGCCTCTATTATTTAATAGCTTAGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGT:1 + chr2R 5674594 5' - S-element 1698 1 73.29 AAAAAAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAATATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAAT:1 - chr2L 10304042 5' + P-element 2705 1 21.23 TGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr3R 22642270 5' + blood 48 2 51.03 CAGTTAATCAACAGTTTTTATGCAAAACTACTAAAGCACACACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAA:1 - chr3L 18235031 5' + HeT-A 6017 1 71.53 AAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr3L 16033435 5' + Doc 35 1 56.45 AAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1 + chr2R 13259301 5' - mdg1 341 2 70.55 CAATTCNGTTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 8047389 5' - 1360 3365 1 65.07 TGCCAGAAAAAGTGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAAC:1 + chrX 20999474 5' - BS 5064 1 61.64 ATAATAATTATTGCTCATAACGAATATTTGAACACCCTCCTTAACTAAAAACACTTTCGATGGACTAACAAACCCACACAAGCACACACACACACACACA:1 - chr2R 16775573 5' + accord 180 2 65.00 TATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3L 3983935 5' - P-element 2864 1 70.55 CCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 10931592 5' + 297 25 2 63.70 ACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTCAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr2L 15913312 5' - transib2 2739 1 74.66 TGTGATGTTTTTGAGTAGCGATGAATTATCGAACCCACAGGAGGCGATGCAACATTTTTACACCCCTTACGCGTAGAGTAAAAGGGAATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chr2R 5771511 5' + INE-1 10 1 71.82 AAACGGGTTTCGTTTCGCTCACATCAAAAAACCAAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAATCAGCCAACGAAGTAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGG:1 + chrX 8200125 5' + flea 4759 1 80.14 TTACTCTCAGTCTCTTTTCCCTAGCAGCATCCCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAG:1 - chr3R 21630764 5' + I-element 5064 1 78.08 AAATAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 - chr3R 24381424 5' - Juan 4193 1 78.52 TAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 + chr3R 26504205 5' + HMS-Beagle 6841 2 52.52 ATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3R 15072662 5' - pogo 2089 1 63.54 AGTTACAAAATACATTTAATACAAGTTTTAGGGAATGCAATTTTTAATTTTCCGAGCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTATTTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAAT:1 + chr3R 25581081 5' + G2 3046 1 60.27 GATATATTATCTTAAACGTTCTTCAAAAATTTTGTTAAATAAATGTGAATAATTGACAAAAATTCACATACGGGCTCACATGGAAAGTACTTTGCTCAACTCATTTGTATATTAGTAATGTGCAATTGAAAAACAAATTCAAGATA:2 - chr2R 23658962 5' - S-element 1577 2 67.81 ACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr3L 9809348 5' - 412 433 2 57.24 CCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAA:1 + chr3R 27843175 5' + mdg1 38 8 69.18 CATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACAT:1 + chr3L 22760387 5' + F-element 141 1 68.33 CTTTCTATTTCACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 23287347 5' - 1360 3355 1 41.10 GAATTGGTACAACTACGAGGAATTAGGTTTACACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 - chr3L 26291011 5' - Tabor 7294 2 63.01 AACATACATATTTTGTCTTTGCAGGTTGCGATGCGTTGAAAAGAGTTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGCCAAAAA:1 + chr4 853418 5' - 1360 41 1 76.71 CATGTATATGTATATAAATAGAGTTTCTACTTTAAAGCGCTAAATCTTAAGTTGAAGAAATTCAATATCAATAAGGCAGAATCACGTAGTAAACTATTTTAGTACCAAGGTGTCCGAAGAGTTCAAAATATTAAACATTGGATAGG:2 - chr3L 11380928 5' + invader2 4699 1 66.44 CAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTATTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 + chr2R 10161792 5' + transib2 67 1 59.72 AAGATTTATGAACATAATAATAACAAATTTGCTAATTGATTTATTGTCGAGTGTATAAACACCATTCGCAGTTGTGTCTCATCGTTTGTGTCCCAGATATGTATGTATTTACAGCTGTGTTCAATAAAATAGCAGTGCGAGGGAAA:1 - chr2L 21798828 5' + HB 19 1 56.16 ACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATAAA:1 - chr2L 15936850 5' + copia 4914 2 60.00 AACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 + chrX 10639093 5' + FB 78 1 69.86 AGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 17940083 5' + 1360 56 1 60.28 GGAGAAGAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 14980453 5' + roo 17 2 73.97 ATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 11062866 5' - roo 397 1 71.54 AGGGGAATTTAATATAAACGAAAGCTTAATAAGAATTTAAAAAATTTAAATCGATTTCCAGGGATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 - chr2L 7125913 5' - I-element 5340 1 41.44 ATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 31653166 5' - roo 9011 2 60.96 ATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTT:2 - chr3L 19350009 5' + 1360 3261 1 58.22 CTGGAGATGGCTTGATTTCGCATAAATTACTTAATGGCAAACATAAGGAAAGTGAGACAATGTGTGTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTA:1 + chr3L 15914547 5' - jockey 4842 1 58.90 CGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr3R 11040072 5' - Bari1 1662 1 64.29 AAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:2 + chr3R 15054184 5' + copia 35 2 57.53 GGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 + chr3R 9594990 5' - Tirant 8459 2 53.47 AATTATAGAAACAAAATGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGCGGTGGTCAAAAGCATTT:1 - chr3R 11040181 5' - Bari1 1707 1 69.05 AGATACACAATCCACAGACAGTTTGTCGGAAATTCAAAATTCCATTTGAAAATACTTTGGATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATT:1 - chr2R 24514704 5' - mdg3 307 1 58.90 AGCACGGTGCACTGCACGAAAAGGTTGAGTAGCTACTGGCTAAGCCCAAGTCCATTAATCCGCCTCAGAGGGCCAAATAGTTCAGTTAGTTCTATTAGCTATAGCTTTTTCATTAATATTATTATTATTA:1 - chr3R 13671929 5' - mdg1 7077 2 64.62 ATTCTAAAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 - chr2L 6647757 5' + mdg3 5288 2 61.64 AATCTCAGCACAGAAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 + chr2R 4362728 5' + F-element 12 1 76.03 AATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGGGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3L 13294971 5' - roo 348 2 63.91 GTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr3L 6447152 5' - transib2 2791 1 63.01 TTATAAAATATATTTAAAATCTGTAGATTTTTTTTTTCATTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAG:2 - chr3R 7317718 5' - I-element 5345 1 76.03 AGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 + chr2R 17796563 5' + jockey 4745 1 68.75 ATTGTTTGCTATTATGTTTGCTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3R 4461177 5' - blood 363 2 80.14 AATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chrX 8092349 5' - pogo 2075 1 67.81 TAATTCCACACAAGCCACACAGGAATGATGGAAAGCAACACAATTGCATCGCGGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACCAATGATCCGT:1 + chr3R 22590438 5' - rover 7279 2 71.92 ACGACAAAAACAACGGCAAGGGGCACAACTGGTGCTGCATTGCCGCATGATGAAGAGAATGAGAATGATGAATGTAGGTGCTTTAACTATAACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGAC:1 - chr3R 21342238 5' + micropia 454 2 67.81 CCGAGACTTTGTTACATACATATGTATATTTTTTAGGAACACTTTCTCCACTTTAGATAGAAATTTTTCATTACATTTACATACATACATATGTACATATGTACATATGTACATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCG:2 - chr3L 23249536 5' - rover 342 2 71.23 AGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAAACGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr3L 22890369 5' + FB 24 1 48.94 GACGCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr3R 20140482 5' + jockey 4691 1 57.00 ATATATTTCATATTGGAACAATTCTTTCCTTAATAGCACGTGCAAGTTAACAACTAAAAATATATTACTTCAGAGCAACTAAGTAAGTAGCTTTTTATAAACAAAGTTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGAGAAGCTGACACTT:2 - chrX 3428871 5' + gypsy 103 2 59.59 GGACATATTACCATCTCAGGACTGGGGACCTCGAGCTCGAAGGACACAGCCACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGA:1 - chrX 4262742 5' + Quasimodo 39 2 74.56 CTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 + chr2L 7580887 5' + Transpac 43 2 48.28 GCCAGTGCAGTAAATTTTTTTCTGCAACTCCCTCATCGCTCAGAGCTCAGTCATGATGAAAAATTCATAAAGTACCTGGCCTGGTCTGACCTGATGTGCATGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACG:1 + chr2R 21428515 5' + invader4 2710 1 66.44 TCATAGTCCCATTATCCCCAAAACTAGTTAGGCAGTCAGCAAATATAGCCCCTTAAAGTTCAAAGCATCTTAACCCAATCAGTCTTCCTATCTGAATATAGCCTGTACACTTTAAGCTTGTCACACACACACACACACACACTGGG:1 + chr3L 2762837 5' + accord 258 2 78.08 GTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chrX 585707 5' + Tirant 63 2 72.50 TACTTCGAAATGCATATAAAGTTGTAGGAAACTGGAAATTGCATATTTAACGTAGTATATTGATTGGTTATAGGGAAAGAGAGTTGAGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCT:1 - chrX 6651146 5' - Quasimodo 341 2 63.83 TCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAA:1 - chr3R 15942783 5' - hopper2 1530 1 73.79 GTTATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 15325206 5' + 297 38 2 57.53 TAATTAATTTCACATGGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTAACTCGT:1 + chr3R 11191342 5' - roo 398 1 76.03 AAACTACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAG:1 + chrX 9530308 5' - 297 335 2 61.64 ATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGG:1 + chrX 8027412 5' - Juan 4160 1 54.79 ATTTAAATATCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTC:1 + chrX 15408707 5' + INE-1 518 1 38.36 AAAACATATCCACTGCAAACGAAAACCAATCTAACCACAACTTATTATATTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCAAAGTGATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACA:1 + chr3L 21926976 5' + Porto1 359 1 65.03 AGTAAGGGTGTAGATGCTATGTAGAATGTATGGTGTAAATATCAGTCAAAAATGTAACTTCTTTCCGAAAATGTTGATAATATATTAAACAAAATGTTGTAAATATAAATTCTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAG:1 - chr3L 19569155 5' - Dm88 4481 2 77.40 TTTATCTCCCGAAAGCATTAACACAGCAGCCAAAAAGCAACAACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGA:1 - chr2R 13019305 5' - 297 6966 2 71.23 ATACTATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAAC:2 - chr2R 5303169 5' - FB 213 1 56.85 ATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 + chr2R 9966985 5' + Bari1 56 1 57.78 ACACCTTCCAATCACGCCTTGCATTCTTGGACTTTTGGATTTTTACAAACTGCTTCCAAAAGCTTAAATACAAAAGAATTCCATGTTTTGCGAAAATATCAAACATATCAAAAATTTTAAGATTTTATTTATTATATTTTTAAGTT:3 - chr3L 7065057 5' + INE-1 426 1 79.45 CACTTTNTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2L 12251008 5' + 412 7099 2 49.32 ACACATTCATTTTTTACTTCTTTATTTTCGGTATTATAAACTTTATTTTCTTTTTCAAAATATGATTGTGTGTCTGTGTAATCTAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGGGGCTTCTGTCGGAGCTAAGAGAGCGGGAGAGC:1 + chrX 7475563 5' - F-element 379 1 67.14 AAATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGAT:1 - chr2R 20010730 5' + Juan 4111 1 69.18 AAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2L 18549848 5' + roo 81 2 77.24 GTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2R 6847857 5' + Doc 53 1 54.11 TTATATTATATTATGTTATATTATATTATATTATCTTATATTATATTATATTATATTATATTATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATGATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAA:1 - chr3L 20525228 5' + mdg1 7097 2 60.96 CTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGT:1 + chr2R 1320659 5' - diver2 4856 2 52.05 AGGTAATTCTTGTCCTTTTAGATGGAAGTAAGGAGTTGCTTTGAGTTCTTAATAAAGGCTTTACGAATTTTTTTGAATTTATATTCAATGTTAAAAGTATATTTCAAGCACTATTATATATAAATATATAATATATATAAAATATT:1 - chrX 7529661 5' + transib1 1923 1 70.55 TAATCTTATAATACGATTTCGCTCAGTGCATTACATGGCTGTTACTTAAATCATCGACGCGGCGCGCGTTTTAAACGCGTTTCTCCTGCTTTTCGTGTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr3R 28928502 5' - jockey 4987 1 47.24 GGAACTGGGCCAACATAACGTCCGCAGCGCCAAAGGAAGCGAACGATGGGGGCTGAGATACCATTCGGCTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGCACGGGGCTCC:1 + chr3R 16532974 5' + Juan 211 1 62.61 ATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr2R 21160618 5' - Transpac 5213 2 72.73 TTTAATTCTCAACAAAATCGTATTGTTGCGTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chrX 10319757 5' - mdg1 410 2 77.40 GGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 - chr3L 24131490 5' - Transpac 242 2 64.38 CTGGCATATTTACGCAGCATTTTTGTATGCTTAAAAACAGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 - chr3R 11469442 5' - Tabor 462 2 69.44 CTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGG:1 + chr3L 28063320 5' - Stalker4 118 4 75.86 AAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:5 - chr3R 15325183 5' + 297 6642 2 64.38 CGCTCCGAATTATTGAAATCTAATACGCTGAATTGCAGGACTGCGTGAACGATGAAGGCGGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTG:1 - chr3L 9212551 5' + Bica 154 1 72.60 ATTGTATTAAAAATATATTAGGTACCACCAATTTGTTTTCATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATGTAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 - chrY 1421287 5' - flea 4934 1 72.60 AACTTCATATTTGCCAACCAACCCAGCGACCGGGCGTATGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAG:1 - chr3R 1817462 5' - GATE 114 2 72.22 GCTTATGACAAATTGAAACTGCAAAGACATCACAAGTTTAAAATCATCACTGTCGCCAAAGTGGGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTA:1 + chrX 1799077 5' + invader4 2763 2 81.20 GAAATAAAAACGAAACGAAATGAAATTTATTATTTATTTATTTCGTTATCACTTTGTATGCGACACAAAACCGAAAACCGCACAGTGCCCCGCACTCGTCCATTCCGAATGGCCCAGCGCCACAGAAATCGCCTAGTCAAGGCACT:1 + chrX 6515026 5' + BS3 1512 1 80.14 TATTACAAATTAAGTCTTGAAAGTGTGTGTTTGTAGTTTGAGTGGCTCTGGTTTCTGATTACTGCCAGCGAGTGCCATAATTGAATCGACTAATTACAATACCTATATATCTCACAATTACAAATATATATGTATGTACGTATGTA:1 + chr2L 6293833 5' - 412 7280 2 77.40 TAATTGAAAACCAAAGGGGAATTTAATATAAACGAAAGCTTAATAAGAATTTAAAAAATTTAAATCGATTTCCAGGAATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 - chr2L 7125927 5' - I-element 5319 1 44.52 CTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 9871051 5' - roo 328 2 75.34 CAGCGACTTTTCCTTTCTTCCTTGAAGCGATTACGAGGTGGGTTTAACTTTTGTTCTTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGGC:1 + chr3R 24583825 5' - HeT-A 245 1 55.56 AAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGG:4 + chr3R 10270563 5' + Juan 4079 1 51.37 TATGGTTATTATTCCAATTATTCTGAATAACTAAATTTCCAACTAATGCCAATTCTTCGCGACTTTTAGATAAGTTTGCACGCCTTTTTTTGTTTTATATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGGCTTTGAGGTGG:1 - chr3R 3508022 5' - Tc1-2 1160 1 69.18 GTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTCTATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr3L 9269871 5' - copia 242 1 50.00 AGGAAACACACAACAAATAGTTTAAGCCACAGCACAAACAACAACTTTCTTTCAAGCACTTTCTTTTAGCCAGTGAGAGACTGAGAATCGAATGCAATGTAAACAACTCTCACCCAAATTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 + chr2R 24017104 5' + I-element 4929 1 76.71 CTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCAC:2 - chr3L 24208226 5' + Quasimodo 43 2 54.11 CGATCACGTCTCTTTATCTTTTACTATACCCGTTACTCATAGAGTAAAAGGGTATATTAGAATTGCTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAACCTTTTTGGACCATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAG:1 + chr3L 38349 5' + INE-1 90 1 70.55 AGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr2L 7593107 5' + jockey 4710 1 62.22 GCTCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 - chr2L 17809246 5' + jockey 88 1 71.23 ATGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:3 - chr2L 15913356 5' - transib2 2783 1 57.53 AGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr2R 11804625 5' - pogo 2040 1 63.70 TGATTGATGGCAATTTGAGCCACTGCGATTCAATCATAAGCCGTCCATTGATTATCCCTATTTTTACTCAAGTCCGCTGTTGCTTGGCGTAAGAGACGACTAATACAGCGACAGGATCCTCTAACCAAGCTTGTCGGAGCAAAAGG:1 - chr3R 24473539 5' + R1A1-element 4893 1 47.95 CTTGCTCTTGGAAGTTTGTGTAAAAAATAAAATGTTTTTTGAAGAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAACTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr3R 5524021 5' + FB 43 1 56.16 TATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2L 18549930 5' - roo 348 2 56.85 CATTTGACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAA:1 + chr3L 18281824 5' + Doc 26 1 67.86 ATATCTTAAAATAAACAACGCTTGGGCATTAGATATATACATGTATATAAGATATGATTTAAAGATGGACGCGGCAAGGATCGGCCAACTACTCTTCGTCAACTTGCACCTGCAGCCTTAATCCTGCCCTTTCTTCACTAGTCAAA:1 + chr3L 25537988 5' + Chouto 6110 1 54.11 CTTAATTTCGTGTTAAAGGATTTGCGCTGCCCTGGTCGTTTGTCGTTGTATTTTACTTTATTATCTACTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAATCTCTGTGTATATTCTCGTTTCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAAT:1 - chr3R 13578546 5' - Doc3-element 4408 1 69.18 TGTGCCTTCATCGACAGCCAACGCAGATGGCCGTCCTCGAAACTTGAATTTCCATTAGCGGTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATACCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2L 5582097 5' - pogo 2048 1 53.85 GTTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 + chr2R 20010174 5' - Juan 4175 1 56.85 GCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCCGTTAATTGAATATTCGC:1 - chrX 21994026 5' + McClintock 5980 2 65.75 TATTTAGTATATTTATTAAATCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTCAAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACAAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTG:1 + chr3R 25504188 5' - 1360 3217 1 54.14 GCCAGGATGCTGTCCCAGCAGGACATCGGCAGCCTCAGCATAATTAAAGCCGCCGACATGCCATGAAAGACTGTGGTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATT:1 + chr3R 8075861 5' + 412 7083 2 64.38 TTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chrX 8092355 5' - pogo 2069 1 63.70 CAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3R 16341966 5' - P-element 2853 1 37.78 GTCATGTCGACTTTACATTTTCAAATAATTTCTGATTAAGCAGGGCAGTGAGCCCCAACACCCAAACCCACCCCTTCGCGCCAAGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chr2R 20348910 5' + transib2 13 1 74.83 GCTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr2R 21681379 5' + roo 8750 2 77.40 ACCACACTTTTTGAAAATGTTTTCATATATTTTCATTTTACTGTTTGTCTTGCTAATTTCTACCGGTATTACAAAATTTTATTTTGCTTGCCACACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGAG:1 - chr2L 21666891 5' - invader2 4673 1 69.18 GGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCACAC:1 + chr3L 22400271 5' + 1360 16 1 58.89 CCAACAAAACATTATAAATTAAGTCATTTAGCATAATTTCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCA:1 - chr3R 13933479 5' + F-element 4271 1 67.50 TTAATATTAACATTTTAAAATATACAATATTTTCGTTATACCTTGAATTTTGGGTGTATATGTGTGTCATTGTATTTTTCAAAACAGTTTGATAAGCCATATTGTCATATATCAGTTACCTTCCCTAGCTATCCGTAGAACTATGC:1 + chrX 12485565 5' + Cr1a 4010 1 78.08 AATTCAACTGCCATGGTTGTATAGAACCTATGTATGTGTGTATTATACTTAAAGGTGAATTCTACTGTATATAACAGTTATTGAATTTCCCCTTAACATAACTCATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTGTTATTA:1 + chr3L 15554632 5' - Q-element 548 2 71.03 ATATGAAAAAGTAACATAAATATAAAGTTTGTTATCAGTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGCATCAGTTTTTCATTATGTCAAGGTTTAGAATAATGGAAAATCTTCAAATACACAACTTATACTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTA:1 - chr3R 25427928 5' - BS4 727 2 58.62 ATGGGTCGGTGCTATGCTTGAATTCCTATTTGTGTACGAATGGCATAACAAGATTGCAAATAAAATATATAAAATATAGATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGGCGG:1 + chr2R 13176456 5' + opus 12 2 73.60 AATGTGCTTGTAATTTCCTTTTTGGAAATATATTGATTTTAAAATGACATACATATTTGCTCAGTTTATTTTATTAATTTCAGTTGAATGTGTGAAGTTTTTCCAATACTTTTTCCGCTTTGAAAATTTTAATTTAAAATTTCAAA:1 - chr3L 10513267 5' - 1360 3043 1 64.38 GGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 - chr3L 11844849 5' + rover 28 2 62.76 AAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGG:1 + chr2L 15550661 5' + Bari1 59 1 56.64 AAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 31886959 5' - hopper 1374 2 57.24 GCCTGAGTTGAGCACTACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 + chr2L 20205331 5' + P-element 104 1 14.38 GCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTCAACGTATGC:1 + chrX 8437647 5' - P-element 2851 1 56.25 ATCAAAAGGTTAAACAATTTGTCTAATGTTGACACTTCCATTGACCAATTACCACCGCACGAGCTTATCTCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 - chr3L 8453852 5' + FB 41 1 56.16 AAAGAAAACAAAACTGACCATCGTCAACGGACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGAGATATT:1 - chr3L 16831096 5' + I-element 5012 1 61.80 AATTAAGTCAGTTTGCTTTAATAAAGCGATGATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATGGTATGTGCGGGGCGACAGTGCGTGACCAAAAACTGATGATGGCAGAAACGGACTTATAAACAAGAGAGAAGGCTATACTCGAG:1 + chr2L 19691206 5' - INE-1 577 1 62.33 TGTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 + chr3R 29084830 5' - 412 488 2 77.40 ACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 - chr2R 21410950 5' + Burdock 6216 2 72.60 GAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr3L 21996249 5' - Transpac 238 2 67.12 ATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGGATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr2R 6847833 5' + Doc 77 1 66.44 GCTTGTTTGCGGTCAATTTCGACTGCAACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGCCAATTAAACTGAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 22325914 5' + hobo 48 1 52.41 CGACAACATCCCGTCATGGCCGACATTATACCTGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTGGCAGGAAGAAGGAAGCTCTTAAACGCTTCATATAAAGTATATTCTTGATCAGGATCATTAGCCG:1 + chr2L 22690654 5' + INE-1 88 1 80.69 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGGGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGGTAAGAATATCAGGGGCCT:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 451 2 60.00 TTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGC:1 - chr3L 28092981 5' + gypsy11 80 2 76.53 GAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAA:1 + chr3R 8051151 5' + jockey 4849 1 82.19 ACCTATAATAAAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 3920629 5' - roo 388 2 71.23 AATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGTGGAGCTATGCCATCCAGGTGTG:1 - chr2L 21403572 5' + G5 4385 1 74.44 TTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 + chr2L 14671795 5' + FB 36 1 60.96 TATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chrX 19588168 5' - roo 9039 1 63.01 CATATAAAGTGAAGTCAAATATATGGACAGTTTGTGGCACCGTATGATTTAAATAAAAAAATAATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAA:1 + chr2L 6102865 5' - roo 413 1 75.17 ACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2L 20266033 5' + roo 67 2 65.75 TCCCAATGCCTCGTCCCAAATCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 2149515 5' - roo 8994 2 69.66 GTTCCTCTGCTTTGTAAATAAAGCTTTGCCTATTTGCTATACAAATCGGGATTAAGTATTATTATTGTTTTACTTCCTCGTATTAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATT:1 - chr3L 25843275 5' + transib2 2810 1 61.64 AATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 14980399 5' + roo 71 2 66.44 TTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAA:2 - chr3L 24934396 5' - HMS-Beagle2 7131 2 63.01 TCTTTCTCACGGGGGTGGTGTTGTTGTTGTAGCTGCCGATTTTAAAGTTTCAAAAAGTTGAGCGCGATTATTACACTTCTTCTTCTACTAGCACTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTG:1 + chr3R 10133373 5' + Cr1a 4334 1 65.49 GAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAACGGACACTCA:1 + chr3R 16518897 5' + Tirant 8144 2 55.14 AATTACATTTCGTACTTACACATTGATGTGTGTGTGTAATTGTTTACGATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTATAGAATGGATATGTTAATATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAA:1 - chr2R 4189132 5' - S-element 1694 1 70.55 ACAAATTTGAAAAGATTTATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCAGGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTT:1 + chrX 12986490 5' - roo 9052 2 69.18 TCTTGTTTTGTAACATAATACTCGTAGCTCAAATTGAATTGCTCGGCATGAACTCGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 10155828 5' + hopper 10 2 61.48 AGCAGATACTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr2R 8099225 5' - jockey 4933 1 60.27 AAAGGATTCGCAGAATTCAAAGGATACGAAGTGCCTGCTGCTTGGTATCCTTTGCGCGTTATTGCCAAGAGAATAAAAACTGATTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTGAAACCGCCCAAAAC:1 + chr3R 14205616 5' + INE-1 345 1 56.56 GAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:2 + chrX 19266820 5' - roo 9032 1 49.32 TTTCACATCTCAAAAATAAAACCAAACAACAAGGACGAACTCAGACCAGCACTGGCTCCTCTGTCTTCAAATACCCACAAGCTGACTGAAACTGCGACGCCCCCACTTTTTTAAAATGTTTTTTTTT:1 + chrX 12635759 5' + FB 173 1 55.12 TATAATACGTTAAAGCGAGCCATTTTCGATTTCGTTTTCGGATTACTTTGACAGCAAATTCGACAGCATTTATTTTTAGATGGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2R 13931656 5' + P-element 27 1 66.67 GAAGGATTAAATAAATCTATCGAAATAAGCAAGTCCTATATATGCATAAGGTGAGACAAGTAAAAAGTTTTTATTATATTTCTAACTTTTCAGAATCAGCTGCAAACAACACGAAATAATTCAATTTTTAATTTAATTTGAATTTT:1 - chr3L 14568217 5' + Rt1b 125 1 48.63 AATGTTTTCGCGTGCAAAATAAAATTACATATGTAGGTTTTCTTTCAATATAGTTATTATATTCATTTCTTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATTACGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATAAACGGCAGCGCCCCTCG:1 - chrX 6333039 5' + Cr1a 4403 1 70.55 AATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTA:1 - chr2L 23295918 5' + micropia 21 2 68.49 AGGGTGATGACTTTGATTTGTGCGGTTCCACTGCCTCTGGTGGGTTTAGCTTCTTTTGTGGCGAGTTGCGCAATCTGTGCAGTTTGCTCGAACTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGA:1 + chr3R 22638309 5' - transib2 497 1 58.62 ATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 12004250 5' - P-element 2848 1 49.57 CTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 7795596 5' - roo 8994 2 69.86 ATTTCACAAAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATT:2 + chrX 14448471 5' - 1360 377 1 81.51 ACCTTGCTTCTAAAAACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCTCAGATTGCGACACAGTTGCGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3R 4805744 5' + 1360 17 1 58.90 AAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 16033435 5' + Doc 57 1 53.42 CTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 + chr2R 21160665 5' - Transpac 5165 2 66.67 AAAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGGGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 8338228 5' - P-element 2848 1 58.74 GTTATTCTAAGCGATAGCATCAAAATTAAACTTAATCTACTTTTCCAGTTTTTCCACTCTAGCCGTCTCTCTATCTAATTTTCCTCTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAA:1 + chr3R 23637137 5' - pogo 316 1 57.53 AACGAAAATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 - chr2R 14653249 5' - 297 330 2 67.12 TAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGT:2 - 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hobo 2886 1 51.37 AATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 + chr3L 13294912 5' + roo 8755 2 80.82 AAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCAC:1 - chr2L 9010134 5' + G2 2750 1 69.78 AATGTGAGTGTGAATCGTGATAGGGGGAATCCCCGCAAGTAAGAGCTGTATGTGTGTGTGCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 - chr3R 24733608 5' - hobo 2877 1 62.33 ATAGCACAAAATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAG:1 + chrX 12129308 5' + flea 4818 1 62.50 AGGGCGTCATGGAGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr3R 4860544 5' + Transpac 40 2 45.21 TTGTCATCCTGGTCGCCCTGATCGCCATCGTCACTCTGCTCTACTTCCTGAAGAGGTAAGTTCATCTTGGTTCATATCTGGAGGCACAAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGCCGCAAG:1 + chrX 16410810 5' - 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chr2R 4886044 5' - INE-1 575 1 52.74 TACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 5769095 5' + roo 8740 2 75.34 GCTAGGGCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr2R 16510075 5' + F-element 48 1 48.63 AGATTTCTGCGCGACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr3R 28385658 5' - transib2 2793 1 64.38 TGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 - chr2R 24170005 5' + transib2 42 1 46.15 AACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr2R 13931515 5' - P-element 2843 1 57.53 AGTTATTGATTTGTTAAGCATTTTTGCCAGAATCCAAAAATGCCTCACATAGTCTCTTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:2 + chr2R 22992427 5' - hobo 2897 1 51.37 CATCTGCCGAATGAAGGCAACTATTAGCCACAAAGCTGTAAGTAATGACAAGCTGAGTGCAATTTGATGACAGTTGCCAGTCAGATTGAGCAGCTCATCCTACAAGCCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCT:1 + chr2L 16417316 5' + I-element 5095 1 73.29 ACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr2L 13556471 5' + transib2 32 1 58.22 AATGAATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3L 11326808 5' + pogo 27 1 59.59 AATGGATTTTAAAATAAACTTCTTTCCTCGGGCGATTTATAGCACCCCTCTGCTATTTTTTTCTCCTTATATATAAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTG:1 - chr2R 16516924 5' + diver 6013 2 52.74 ATACTTGATGTCAAATCCGACTTTCCAAGACCAATCCTCCAGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTAC:1 - chrX 18336728 5' + mdg3 5266 1 75.34 GTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGAC:1 + chr3R 9038946 5' + Juan 4089 1 71.23 AACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr2L 16690760 5' - P-element 2870 1 71.43 TAACATTGATAATTTCATTTGATAATATTTAAAGAAACAGATACAGATACAGATACAATCACGAAACGTTGGCGCTCGGTCAATAGCCAGAGAGCCTGTTAATTATGCCGTCTTACCAACCAACGAAAAATTATGACAAATTTATA:1 + chr3R 20584565 5' - Tc1-2 1373 1 68.49 AGCAATCCCCAAATTTGAAATTATTTACATACCGTTTGCTCTTTGATCGCACTGATCATGCCATCTACATCGGACTCTAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTT:1 + chr2L 20921240 5' + I-element 111 1 58.22 ATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAG:1 - chr3R 28901317 5' + transib2 65 1 61.64 GCTACGTCAAATGGCGCAAAAAATAAATCGAATAATTACAAAAATATTTACTGACATTTCATTCTGTAAAATGGGACAAATAAAAGTTAACTAGTTGAAAAATGTGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGA:1 + chr3L 10837389 5' + invader1 163 2 75.34 TTATACCCCACTGTTTTCTCTATGTACACTTGCAAAAAGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chrX 13795584 5' + 412 75 2 75.00 AGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2R 17926285 5' - 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chr3R 30346846 5' + P-element 427 1 55.48 GCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTT:1 - chr2R 23780595 5' + Ivk 91 1 69.18 ATAATCTGTATAACAATTTCGTAATTGAACAGGCCACCCTGGTATTCCTTCTTGATCACCTGATCATGGTTTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATCTGTTA:1 + chr3R 31836840 5' - invader3 5073 1 63.01 CTCCAGCAGGGGGCGTGGCAGTTTTGAGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGTGTTGCAGCATGGGCCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATC:1 + chr3R 14559447 5' - INE-1 150 1 74.64 CGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2R 7850027 5' - roo 341 2 61.64 AGATCATATATATACATATGTATATAT:1 - chr2R 13588559 5' - G3 4507 1 85.19 CTATGCTGAAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTT:1 + chr3L 21655854 5' - 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mdg3 193 2 51.37 CTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 - chr3L 18505770 5' + I-element 33 1 63.01 AAAAAGTTCGATAACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr2R 13931503 5' - P-element 2855 1 65.75 AAAAAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACA:1 - chrX 6698731 5' - Juan 20 1 76.77 GTTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGACAAAAACGGTTGTACGGTTGGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTATAGAGAGAGAGTCTGCCGGGCTGGGGGCCCGGGT:1 - chrY 9413 5' + baggins 249 1 71.77 TTACCCTTTATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr2R 3563194 5' + Transpac 40 2 51.54 GCCAAGTATTGAGCGGAACGGAAGAGGGTTGTGGTCGGTGTCACTGAAAGCTAACAATGGCATACAAATGCAATTACCTCGTATAGGAAGTCCGAAATGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAA:1 - chr2L 17660573 5' + Quasimodo 95 2 70.55 TTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACGTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2R 10411452 5' + 297 6615 2 54.92 ATGTGAGTATGAATATCCAAATCCAAATCTAAATATCCGCATTCCTCATGTCTTTTAAGTCCTAACAATAAATTCTAGTCATCATATTATTACTGTTATTACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTA:1 + chr4 551605 5' - mdg1 7068 8 62.33 ATATACGGTTTGCTTTATGTATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:2 - chr2L 11839766 5' - mdg1 7415 2 57.53 GAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:2 - chr2L 14074547 5' + 297 62 2 63.70 ATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTTCTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGGACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 + chr3R 24729576 5' - Juan 4152 1 60.96 ATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTA:1 - chr3R 905047 5' - rover 303 2 54.11 ATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chrX 21216807 5' + roo 72 2 69.18 GGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTA:1 + chr3R 22590490 5' - rover 7227 2 68.49 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGGGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCTTCCGTCCGCCCCTATCAGCGGCGCCCAAATCTCTTTTTACTCTATA:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5382 2 55.04 TTGCTCTGCCTGTCAACGCGGCGCGTTTCTGGGGGCAGGCCGGTTGAAGGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2R 7849942 5' + roo 66 2 64.79 CCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:1 + chr2L 17205197 5' + hopper 83 1 72.60 TGTTGATGTTGCTGCTGTGCCGGTGATGGAGGCTGCCCAAATTTACTGGAGATCTTGCCCAAGGCATTGAACTGTAATGGCCAGAACGTACAAGTCAACAAAAGGCAAACCAAGACCATCTGAAAATTTAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 19411752 5' + TART-C 11096 1 62.50 AAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 19924052 5' - roo 358 2 50.68 CAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGTGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr3L 15103780 5' - Transpac 273 2 60.96 ACCACAAAATCGCATCAAAATATTGCGTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTAC:1 - chrX 6513476 5' + hobo 49 1 52.41 GTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCTGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGA:1 - chr3R 15790103 5' + flea 4734 1 63.28 CTTGGCGGACTGGCTGCAACAATGTTGCACAGCATAGGACGGCCAAGAATCAGACGATGGGCATTGGTCTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAA:1 + chr3L 1118603 5' + TART-A 12987 2 67.37 AAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATA:2 + chr2L 22674750 5' + mdg1 7069 2 65.75 AGAGAAATAATATCGACATGTAAATAATGAAATGTATAGTAGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACAATTTAAAAACTCACATTTGCAATGCGGTATTCTTCTCAATTTAAAATGAAATTTAAAAAATATTTTTTTT:1 - chr2R 18695089 5' + Transib5 2727 2 56.34 ATGAGGCCAAAAGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2R 22514235 5' - P-element 2862 1 65.75 TATTTATCATCTTATCTTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGGGGCCCGGGGGCCATGGTTATTAAATT:1 + chr3R 20532019 5' - Ivk 180 1 80.37 GTTCGACTGATTCGATTAGTCCTCACAACGGGACTACAGACTCCCAGACTCTGTGTTCGAAATGTGAGCAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTTCCACGGGAAATAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTC:1 + chrX 3629557 5' + baggins 5323 1 51.13 CTTGTGGTTGTCTGTTGGGTTAGTTTCGGTTTTGTTTCTTATAAGGGGGGGTGTTTTGGTTGTCTGTCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 3920482 5' + roo 8716 2 54.86 CCAGGAGGCCCCACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:3 + chr2R 18258749 5' - Juan 4188 1 59.59 GTTTTCCAAAAGTCAGTGTAAAAAAAATTATTGGTCACTGCTCTGCGGTGACGGATTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACA:1 - chr3L 23466710 5' + jockey 246 1 62.33 ATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 + chr3R 15724267 5' - Juan 4191 1 65.97 GGACTTGGCTGATAACAATTAAAGCTGGCCTACACTCGAAATGTATATGTAGTATATATAATATTCTTTGTAAAAAGATATTTCAAAGTATTTTGATATTTTAATTATTTATTTATTTATTAAATATTTTTTTATATTTAGTTATT:1 - chrX 15564910 5' - Tc1-2 481 1 65.75 CGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTG:1 - chr2L 15936849 5' + copia 4946 2 70.55 CTCGATTTGCATCAAGGCATTGTGTTTCAAGCAAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chrX 18336570 5' - mdg3 5446 2 50.68 AGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:2 + chr2R 13168655 5' - P-element 2819 1 39.73 TTATTAATCTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 10167497 5' - roo 9038 1 61.64 TATGTGTAAATAGAAGGCAATAAATGCATGTTTAGAAAACACAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGAATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGT:1 - chr2L 9932292 5' - I-element 5273 1 71.23 CACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAA:1 + chr3L 19274808 5' + transib2 81 1 70.55 AAAATATTAAAGTAAAGTGTAGCACAGAGAAAAAATTGATTCAAGGCTGCTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAA:1 + chrX 10815341 5' - Juan 239 1 65.75 AACCGCACCGGAAACATCTCATTCACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3R 28469151 5' + 412 12 2 77.40 ATCTATGATTGAAATGTCTCAACTTGAGAAACTTTAGGAGTCTATTCCATAAAATTGGAGCTTATTCATTTCATTGATGTAAGGTCCCCAGCCTGGCAGACTCTCGGCACTGGTCGACTGACACCTTAGTCCGGCCCGGAGATGGG:1 - chr3R 20280112 5' - baggins 202 1 52.74 AAAGGAAAATAAAATCACCAAAGCTGAAAAACCAAAATCGAGAATAACACAAAAATGCCCGACAAATAGCACAATAAAAAAAAAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAG:1 + chr3L 1375490 5' + mdg3 5213 1 57.53 AAAGCGTAAGCAAAACGCCCTGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3R 5351507 5' + jockey 4675 1 75.86 TATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGCTCTCCAA:1 - chr3R 27133653 5' - opus 7429 2 77.40 GATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:2 + chr3R 7943752 5' + blood 85 2 73.29 GTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAT:1 + chr2L 4123870 5' + transib2 79 1 71.92 TTTCATAAATAAATGTTTGAGTTATGTAGAAAAACATTTTGAACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTCGCGATTTTCAAAATCAAAGCGATAATTGTAATTATTAACT:1 + chr2R 22868083 5' + HMS-Beagle 7041 2 67.97 GAAGGCTCCGGCCGCAACTCGGAAAATTTAACCTAACAAACATCTATCCATTTTCCAGCCCAAGCCAGGAAAAACTTTAAACTAACGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGA:1 - chr2L 1620007 5' - copia 4991 2 67.16 AATTTAATATAGCTCATAATGCCTTGTAAACTCTGATAACTAAATTGTCAAATCAACACAGGCAGCAAAAAAATAAAAAAATAA:1 - chr3L 5064829 5' - Tc1 1398 1 58.33 AGTATTGCACATAATGAGTGCCGCTTCAGTTTATTCAGCTCAAATATTTGCTTGACATATATATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 5533037 5' + roo 54 2 54.79 AATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGG:1 + chr2R 4887636 5' + jockey2 3022 1 76.03 TTTATTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGACACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATT:2 - chrY 1654285 5' + INE-1 531 1 41.78 ACAGTTCTCTGCTTTCCATCTCTCTCTGGCTGCACATATATTTGTATAAAATATACAACATTAATATATTTGTAAAATATGTCGGTCAAATGACACTCATTGACGGTACTACTTTTTTTTCTTTGGGAAGGTAAATATTTTTATGT:1 + chr3L 14303062 5' + transib1 1979 1 67.12 TTACATGAAGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr2R 11804583 5' - pogo 2083 1 71.72 CCGTTGAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAGGCGTTTCCGACCACATAAAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATA:1 + chrX 124084 5' - HMS-Beagle2 244 2 65.07 AAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACCATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAA:1 - chr2L 13556421 5' + transib2 81 1 69.86 GTTTGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTT:1 - chr2L 22684612 5' + transib3 59 1 51.37 AATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 25406608 5' + 1360 15 1 69.86 TATACATATATATATATATATATGTATAAGATCG:1 - chrX 12657091 5' - blood 7192 2 85.29 AAATCGATAGAAATTTACCAGACCCATAAATATCAAAACATTTTCTGGGAGGTTTGTGGTCGTTTCGTTAGTGTGGGCATGTCAAAATGCGCTGCGTCTGTGTCTCTTAAATCTGCCTTATCTCAACCTTCTACTTTTTATAGTTC:2 - chr2L 21761881 5' - INE-1 158 1 56.85 GAAAAGAGCGAGCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATA:1 - chr2R 8735725 5' + mdg1 7048 2 77.40 GATAAGTTATCAAAAAAAAAGTCAGCTACTATGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAAT:1 - chr2R 23942270 5' - roo 9011 2 73.11 ATACCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3R 7420337 5' + 1360 21 1 71.63 GTATTAAACTATTAGTTCTTCATGAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGG:1 - chr3L 4219618 5' - hopper 141 1 76.80 AGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGC:2 + chr2L 15550684 5' + Bari1 85 1 73.29 AACTATCACCACACATATTACACATATTTACAAAGTATAATTTATGGATAAAAGGATAGCAGATACAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTGGGCACTATGC:1 - chr2R 4606400 5' - 1360 3354 1 44.14 TTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTACTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGAAGTTCATAGACTTTAAATC:1 + chr2L 22255075 5' + 1360 235 1 69.18 ATTCGANGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - 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chrX 6513504 5' + hobo 6 1 79.23 AAAAGACTTATGAAAAAGGAAAGACTCACAGTTGAAAATCTTTGAAATAGGTGAATCTAATTGAATCCAATTGTTTTTATTACGTATATTAATATCTAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACC:1 - chr2L 10827173 5' + G2 2856 1 65.75 AAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2L 18549847 5' + roo 81 2 73.97 GGAATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr4 303827 5' - pogo 2056 1 54.23 TCCCGAATATGCAACAGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATA:1 - chr3R 23618245 5' + hopper 42 1 55.48 CCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2L 15940348 5' - pogo 2082 1 69.23 ATGGAACCGCGCATTCGAACTAAAGCCGAGCTCAAGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGA:1 - chr3L 18806658 5' - F-element 285 1 58.82 GAAAAGTAAGTGGATATGGAATTGTTTTTTATTTGCTCGCCCCGAAGTGCGAACAAAATGAGCGGAGGAATGGAAAAAAAGGCGCTCGAAAAACTTAATTGACGGCAGGGAATTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACA:1 - chr3R 29568844 5' + G5 4749 1 76.03 TAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATATGTACGAA:1 + chr3R 23639156 5' + pogo 76 1 67.81 AACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 - chr2R 7090722 5' + I-element 66 1 60.27 ATACATATGTATGTATATATATATATATGTAATGTGAATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCC:2 - chr3R 23085629 5' + transib2 43 1 56.16 ATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATTGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAA:1 + chr3L 3501725 5' + Bari1 73 1 66.44 ATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGG:1 + chr3R 15724298 5' - Juan 4160 1 54.86 ATATTACATCCAGAAGCCTTTCAGAGTAATCTTAGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCCCTGTCCACCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATCTCGAGCGCTACAGCGCACAGCTCTTTTC:1 + chr2R 4615287 5' + 1360 128 1 74.66 AATGCCAAAAAAGGTTAAACGTACATTAGGAGTATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 - chr2R 4785363 5' - Juan 4192 1 69.18 GGCATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:2 - chr3R 23491958 5' + transib2 61 1 57.53 TTAATATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGAGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATATGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 - chrX 14450537 5' + hopper 18 1 71.53 TGATATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr2R 21160614 5' - Transpac 296 2 74.48 ACATATGTTTACTTTGAAAGCTCACAGAGGATCATGTAAACAAACAAACACTCTTATACAAACTCTTATATGCGTATGAGCATATTAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 - chr2R 2590826 5' + HMS-Beagle 16 2 73.17 TATTAATCGGGTTTTTTTTTTTGCTTTCAGGTAAGACTTGTATAAGACTGCATAGCCAAACTACTTGCTTAAATTCATAAATAAGTTAAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCA:1 + chr3R 7423059 5' - invader4 2741 1 63.70 GTCTTCTTGTTGTAATATTTGTGCAGTTTGATTGTCTCGAGCAGTTGGAGACGTACTATTTGAACTATTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCTTTCTGACTCATAGTTTTA:1 + chrX 8969873 5' - F-element 185 1 53.42 CTTAGCTGCTCACGAAGCTTATCTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:1 - chr3R 2689475 5' - diver2 4476 1 76.55 CTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGCCTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 + chr2R 24427592 5' + jockey 4744 1 70.87 AACCCACTGTAATTGGGGACACCTGCATGCGCCGAATTCGAGTTTTCCGCTTTTCGAGTTCAAGGCGAAAACCAGTTCGCCAAGGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAA:1 + chr2R 9279920 5' + 297 449 1 77.27 CTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr3R 23295582 5' - P-element 2839 1 20.71 GATCATTTGATTCTATAAGTTTCCATTTCGTGCTGGCATCTGGCTTTTACTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 - chr3L 10425911 5' - I-element 5321 1 56.85 AAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCATCGCATTGCGAGCAAAGGCCGAATG:1 - chr3L 22035595 5' - 1731 4545 1 69.18 AAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 + chr3R 15363873 5' + flea 18 2 71.92 CTTCACTGTGCTACATTGTAAGTCAAGCAAGTAAAATTAAAAAAAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAG:1 - chr2R 8413144 5' + Bica 430 1 76.03 GAATGACCACAATTCGCTTATAAATCAAGACGAAGAGATCAGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTAGATATCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAACATAACGTAGAGTAAACA:1 - chr2R 15230724 5' + 17.6 6949 1 35.29 GAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:2 + chr2R 14653145 5' + 297 38 2 50.68 CATGTCGCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 + chr3L 3501710 5' + Bari1 58 1 57.53 AGAAAGGATTACGATAACGAATAATATTTCAACATTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTGGCAGAAAGTCAAAAAAATGTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTCCTCAGAGAATTAAAAAAGTTTAAAGTGTTGTCATGGAAAACAGTA:1 + chr2R 3141774 5' + transib1 261 1 73.97 ACTGGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGACACGGCTGCGGCCATATAAAGTATATATATTCGTGATCAGGATCAATAGCC:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 87 1 82.95 GTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAATATAATTCACATCAAAGACCAC:1 + chr2R 5106294 5' + Stalker2 91 2 78.77 CTACACGGCACTCCTTATTTCGATATGGCGAACGAGGAGCGCCACTCCGTTACCGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTT:1 + chr3R 25676607 5' - Bica 475 1 56.31 ATCAGGGTTTGGATTAATTTTAAAAAGGAACAGAATTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 18010076 5' + 412 30 2 62.33 ATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATC:3 - chr2R 23780589 5' + Ivk 97 1 73.29 TTTCACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:2 - chr3R 12242361 5' - transib2 2768 1 58.22 GTGAGTGGTTGGGATTTCCCCGGGGGGTTGGTGGGTGGCAATGTCGCAGTGTTTGTGAGCGTGTGTGCGGGTGTTTGGTGTGTGTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAA:1 + chr2R 7697792 5' - Quasimodo 6970 2 64.38 AAATGAACTTCGCGTTACTCAGTCTCTCCAGGATGTTGTTGATACGAGGTAGCGGGTACGTATCAGTAACTGACTACTATTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCATGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTT:1 + chr2R 5272005 5' + Cr1a 4036 1 53.79 GTAAGAATTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr3L 23287183 5' - 1360 3374 1 73.97 AGAACAAGATCAGCGACTTTGTGTTCGCCCGCAAGACAGAGAAGGAGGAGCTGCTCAAGGACTTGACCACAGAGTCCAGCCGCCAGGCATGTCCGGCCATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAG:1 - chr3R 27697260 5' + Quasimodo 89 2 68.75 AATGTTGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr2R 13168608 5' - P-element 2875 1 76.64 AGAATCATCGTATTTTTCCACAGTGTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2R 22514224 5' - P-element 2851 1 56.16 ATGACTGTCAGATACCTATTAAAGTCACCATCGGCACCTAGCTTTTATTGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGATGGACAGTCGGACAGACGGACATGGCTAGATCGATTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAA:1 + chrX 22492665 5' - INE-1 87 1 68.57 AAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 24219353 5' - roo 330 2 69.86 GTTCGCGAGGTTTCAAAGGTCACTGATTGGGCAGACGGAAAAAAGAATATGGGACAGCTCGACTCGTCTTGTGATCCTGGACTTACAGGGAACTCAATACACACATATACCTAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATAATTTCGGG:1 + chrX 21631180 5' - HB 252 1 76.03 ATGCTTAAGCATGTTCAGCTTACATACATAAAGCCATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 + chrX 15200817 5' + 17.6 6958 1 58.96 AAGAATTTTTTTTATAATTTTTCGAATTTTTTCTTATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGATGACGAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAGCTCACGCTAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTGGACCATAGCATTCT:2 + chr3R 13700778 5' + INE-1 572 1 78.77 GTTGAAAGGAACCTGGAATGACTTAAAGTCCCAGGCTTATGGAAAATTTGAAACGGGATTACAGGGCAACGGGACTTAGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCG:1 - chr2R 10785297 5' - diver 370 2 57.53 CATGTGCACGTATTATGTCATGCCGAATTTCCGTTGCCTAGAGCATTGTTGTAACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATTAACTCCAATTAAGAACACATGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3R 28469338 5' - 412 469 2 67.12 AATCATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGG:1 + chr2L 18177000 5' - INE-1 540 1 76.71 ACGAGGAGCACCTATACAACATAATTCTATTGCTTTTTTAAACCCCTCATGCTATAAAGTATAATTGAGTTCCATTTTACCGGTATTTAGGACTGATCTTTTGTTTATATTAAGGCTTGAAAGTAAAGGATCCGATGAATCCATGG:1 - chr3L 25751343 5' - transib3 2393 1 71.92 GAAACAAGTTCCTTGGGCTGCTGAAAATTTCTGATAGATTACTGCGGGCAAGGGTCTGCTGCGGGCTGGGAATTCGGTTTGGGATAAGGGTTTGTTGCCAAAAAAAAAGAAAAAAAAATGG:1 + chr2R 14986767 5' - hopper 141 1 75.21 TGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 - chr3L 11257416 5' + 1360 3386 2 32.88 CTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 8308496 5' - roo 351 2 61.43 TTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGG:1 - chr3L 18505743 5' - I-element 199 1 73.68 AAACATCTCATTCACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 28469162 5' + 412 7073 2 71.33 GGAATATTTTCTTGCTGACCTAAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 22992565 5' + hobo 40 1 54.11 GTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAC:1 - chr3L 16470360 5' + jockey 4739 1 63.01 GCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 29084860 5' - 412 7520 2 62.04 ATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGCGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGGCGTGTACACAGACGTCGCGGAAAAAACAAAAACGTAAGTGTGGTCCATCACAAA:1 + chr3R 29612024 5' + jockey 71 1 56.06 GGCATTCTATTAAAATTCCTAATGGAATATTCCTGTTCCAACTAAAGAAGGAGAAAATTTACACATCGACATTTATTACGCGCAAAGTCTTATTTTCTTGTATTCTAATCCGGCTCGAAGGACCATGGAATGGAGTG:1 - chr3L 26505792 5' - Max-element 310 1 72.26 ATTATATGAAAATTAATCTCAGTTGTAGACAATACCTAAACATTGGAAAATTGGTTGCTTCTATTTAATTTATTATGTACAATCAATACCGGCAATAAAATTTCAATAGACAATGCTCATCGTAAATATATATATATATATATAGT:1 + chr3L 21306086 5' - 1731 4410 1 67.12 AAATGAGATGGCGAATGTATCCTGAATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCC:1 - chr2R 2318283 5' + ZAM 15 2 75.00 GATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 + chr3R 9038903 5' + Juan 4046 1 57.53 GTCCTTTAATAATAATTTCGGAAATCATTATTATTCTAGAAATTATTAAAACAATCAAAGACAGGGTATTCAGAGCACTCAGAATCGAACGGATCTTTAATAAATATATTTAAAATATATCATAATTAAAGAAGATTATTAAAAAC:2 - chr2R 2566782 5' - Cr1a 73 1 58.22 TTATTTCAGGTTATTTTATATAAATAATTTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTGGCTGCGGCGG:1 - chr3L 27866066 5' - Max-element 8508 2 61.25 ATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3R 22642265 5' + blood 7055 2 54.11 CATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAA:1 + chr2L 3675836 5' + Juan 4065 1 49.63 AGGGTCGCAGGGCGAGGTGTTCAGAGTGAATGGTGAGCAAATTGACAAACGTTCAAAATGTAATCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCC:1 - chrX 17335724 5' + F-element 313 1 56.25 ATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:1 - chr3R 12242343 5' - transib2 2750 1 70.55 ATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 11810622 5' + roo 8704 2 54.01 AACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr3L 12004222 5' - P-element 2845 1 58.22 TCTAAACAATAATGTATCAAAACTTGAACCACTAATACATTCAGACAAAAGAAATAATCGAACAACACAATCAGACGAATAATATCTTTGTGATGATTTGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTCTAAATAATAATAACGTTAAGG:1 - chrX 22218806 5' - 1360 308 1 56.16 GGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCG:1 + chr3L 27356091 5' - Tc3 1670 1 66.67 ATTTTTGGTGTGTTGGCCAAAAGCGTGGAAGTCCACATATAAAATAAAATATTTTTCTGTCGTGATTCTTGATCAGGATCCAAATCAACGTGTCGATCCCAGGAACACCCACAAACCAGCCAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGA:1 - chr2R 5273701 5' + INE-1 248 1 56.16 AGTGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 - chr2L 17005792 5' + Stalker2 7322 2 67.12 TACTATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCC:1 + chr3R 19449905 5' - roo 8658 1 72.63 AATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTT:1 - chrX 8027488 5' + Juan 62 1 58.22 CAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 30347293 5' + P-element 30 1 63.91 AGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGGGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 - chr2R 6622639 5' + S-element 79 2 71.92 TTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1 + chrX 17343388 5' + I-element 63 1 62.76 GTGCATTCGTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAAT:1 - chr2R 4870277 5' + Juan 58 1 50.69 AGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chrX 12986530 5' - roo 349 2 59.31 TAGAGATACAGATACATCCGTACTTGTATCAAAGAGACTCACAGAGATACAACCAAATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTGTT:1 + chrX 11209802 5' + hobo 6 1 78.83 GGGTATGGAAGCCAGTACGGCAAGTTCTGCATCGGAAATCGCTTTATGGGCTTACATGTTAAAACAAATTATTAAAATGGGAACCAAAACATGATCAAATACGTCAATACGTCATAACAAGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 12859903 5' - roo 408 1 61.64 TATCATAAAATGAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGTATCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTC:1 + chr3R 7819157 5' - invader3 168 2 54.11 ATAAAAATAGATCACCCCATTTCGGTAAAATTGAATATATTATATATATTTTTTGATATTTTTCGTATAACCGAATTCAGTTTTTTTTTTTAAGTTTTCAAA:1 - chr3R 26020439 5' - TART-C 11092 1 52.94 CATAGTTTAATGCTCAATATTGCATAATATTTATTAAATTCGAGATGCAGTACGTGGGTTTATTATTAACAAGTCATCTCACTTGATTTATGGCGCAGCAAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 20017257 5' - accord 7031 2 51.26 ACATCCTAAGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGTGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATAAGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:2 - chrX 14815846 5' + INE-1 98 1 75.34 TAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chr2R 5599052 5' - INE-1 85 1 71.19 TTATAAAATATTTTAATTTCCTTAATTCACACGTAAAATAATCTTTGTATACCCGTTACTCGTATAGTAAAATGGTATACTAAATTCGATTTCGACCATACAAAGTATATATATTCTTGATCGGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:2 - chrX 14766996 5' + INE-1 98 1 58.22 GGACAGAGAATTGTTCTCATCTCGTGCCTCGAGCTTTATCCTTTCAAACGACAGCAGTCCGCTGTTGAGCATACTCAGTTTGATGGTGTTCGGTATGGAGAGCGGGCCGTGCGCAAAAGGGAAAATAACGTGATCCCCGCGGCCT:1 + chr2L 18183893 5' + gypsy8 323 1 69.66 ATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 21631076 5' - roo 324 2 76.03 GGCAGAACAAACGCACGGAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2L 15076250 5' + 1360 16 1 74.66 ATGGGTAAGACGTCCGCCGCACACTCAAACACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 + chr2R 22514128 5' + P-element 88 1 26.71 CCAACAGTCATCACCCAGAACTGTTCGTTACGGAAAAAAAGTAAAGTAAAAAATAAAACAGAAAGAGAGGTAGAAGAGCGCACAACTCATCCATTAAAAAGTAAAAATCGCTGAAAAATCCTAAAGAAAATAAAAAAAAAGGAAGA:1 + chr3L 15536054 5' + Doc2-element 227 1 54.11 CATAGTTCTTGATTTTTTATGGGAAATTTTTTTGCCATTTTACACAAAAATTACAAATTAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr2R 3564006 5' + Tabor 25 2 68.49 ATATGTTAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:2 - chrX 12129444 5' - flea 231 2 68.49 GGGAATTTAAGTTATAGTTATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3R 15325222 5' + 297 22 2 68.49 ATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGA:1 - chr2R 20227312 5' - hopper2 1540 1 65.07 TCTCAGATAAAAGCTTTATAGCGGACTCTTTAACTGGAAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGAACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chr3L 22960406 5' - Tirant 364 2 58.90 AAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr3L 8959600 5' - 1360 3321 1 67.81 ACTGTGTGACTTCTTAAACTTATAGCTCAGTAGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATTTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr2L 16564483 5' + roo 62 2 65.07 GGCCAGCTTGGTCAGAACTGCTTGCTGGTGTCTATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 - chr3R 16630439 5' + FB 84 1 74.66 AACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2R 9871558 5' + roo 69 2 66.44 ATCACAGAAACATAGAAATTGGTGCCGAATATTTTCAACATATGAATTTGTAAAAATATTACACAAATATGAAGCCACCTAATAAAAAGTAAATTTTACAAAAAATTACGAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chrX 12448984 5' + I-element 27 1 77.40 TTGAAAGTAGGTACATTTTAGTTTCGATTATGAGGTATCTACTTTTGAGATGTTGTTTCATTACTTCGTGGTTAGTGTATTCCATCTTCTAGGTGCCACATTTTCAACAATGTATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTT:1 - chr2L 19307829 5' - rover 355 1 71.23 TGCCGATAATAATATATAAATATAATATAAAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAG:1 - chr2L 6654774 5' - diver 6077 2 60.27 CCTTACGTATGTAAATCGATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr2L 71129 5' - 412 7526 2 71.23 AAATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr3R 17421329 5' - pogo 2066 1 47.95 AGCAGAGAAGATAGCATGGAGATAAATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGGTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAATT:1 - chr2R 4606334 5' + 1360 21 1 67.38 ATCTATTTTTATGCGACAACGATACTGTAGAATGAGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGCTGCTCTGTTTATGTTTATGTTTTTGCACGCAG:1 + chr3R 24450459 5' + 412 7135 2 75.78 TGTGCCCACAGACTAACCCAATTAGAACTAGCAGATACTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr2R 8099254 5' - jockey 4962 1 58.22 TATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3R 17673724 5' + FB 40 1 58.90 ATAGTTGAATTAAACAGTTATTAAAATCTACTTTTAAAGGTAAACAAATACCTTAAAAAATTTTTAATATATTCCATTTATTAAATTAAATAAATAACAAGTCGATTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCCAGCGTGA:1 + chrX 21387970 5' - INE-1 538 1 61.38 AAAAATAAAAAGGAAAGGAAATAAGCTTTACGTCATATTATTTAAAAAATTGTAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTAGTTAGTTTCTTGTATATTAAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAG:1 - chrX 4188167 5' + S-element 1584 2 68.97 GTGCTCAATTTTTTGGACGATTTTCGCGCTGCCTACTTTTGGGCGCATAATTTATGACCGCCCGGCATTAAATTAGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3L 21763795 5' + jockey 14 1 72.90 AATTGTAAAACGAGACGCATAAACAAATGCACCAACGCAAACTCAACCAAACACACAAGACAGTCGTTGAGTAAATAATAAAGCAAAAAAACAAAGAGGTAAAAGCTTGCAACGAGAAAAGATGGAAAAAGAAAAAAA:1 - chr2L 16423132 5' + Doc2-element 236 1 81.16 ACTTGGTCACTAAATTTATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGTCTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 - chr2R 21926488 5' + opus 7165 4 55.48 TTAGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAGGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTC:1 + chr2L 15004789 5' - INE-1 141 1 56.85 AGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chr3R 16630352 5' + FB 51 1 59.84 AAACTGAATATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTTATTTGTGGCGAATGTGGCTATGTGGCGAGTATACAGCTGTGTTCATAACACAGCGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGA:1 + chr3L 17244973 5' - HB 1585 1 54.11 ATATGTGCTTAATTACGATTTCCCACAATTAATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTA:1 - chr3R 15405708 5' - I-element 208 1 78.77 AATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCA:1 - chr2R 12253310 5' + BS 4702 1 68.94 AGGGTTAAAATAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACGATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 21224505 5' + roo 11 2 73.64 ATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTC:1 + chr3R 14860156 5' - BS 5017 1 71.03 GTTGTCTCATATAAAACGCAAAAGCATTAAAAGTAAAAAAACAAAAATGGGAACCCGATCCTCGTCAGCTATCAAGCGCAAAAAAAAAAGGTTTCAGTTTACAACTGTGGGCCAAAAACAAAAAAAATGAAAAAAAAA:1 - chr3L 16137862 5' + gypsy7 5004 1 58.70 GACGAAGGCGACGATAATGAAGAGTTTTCCAGCCACAGTACTGGTAGCGATGGCAATGCCAATAATGAACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAACAATCAACA:2 - chr2L 205558 5' + gypsy7 322 1 53.42 ATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGC:1 + chrX 20999488 5' - BS 5050 1 53.42 GATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATT:1 + chrX 3431860 5' + Ivk 5360 1 48.63 AGTGAGTAGCGTTTCACGAGAGGATGGGCAAATTTTCATTGGGGGGAAAGTGGGGTCAACGCCCATCAGTTCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chrX 14302000 5' + roo 90 2 51.37 ATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAG:1 - chrX 17343407 5' - I-element 5115 1 67.81 GTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 - chr3L 19111601 5' + Doc 72 1 66.44 ATATGCACTATAAATGCATTTTGTGTTATAATTGATATAAAAAATATTTTTAAAACATATACTGCCTGTATCGAAAAACGACATGCGAAAGATATTTTAAAACTCACAGAACAGACACGATCAAGACGTTGAACTGGCAGAACCAT:1 + chr2R 12857236 5' + 412 7437 2 51.37 ATCGCANACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 29084857 5' - 412 7514 2 59.59 CCACATTACATATTTTTAATAGACTCATCTTCTACTCTAGAAATAACGGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr4 372908 5' - pogo 2085 1 74.66 AACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGTAGAAATAGTTTC:1 - chrX 13490730 5' - 297 6896 2 78.77 ATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAAT:1 + chr2L 13844160 5' - Stalker2 340 2 58.90 TGGATTTAATTTTGCACTTTTACGGGCACAGTCAACCCAACCACACACACACACACAAACACACAGACAAGTGGGAAAATGCTTAGCATGAACCTACACACACACATACACACTG:1 + chr3L 10567401 5' + accord 256 2 76.52 TTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAATATG:1 - chr3L 16260407 5' - hopper 1381 1 62.33 AATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGG:1 + chr2R 9966984 5' + Bari1 60 1 58.57 GCACAGAGCCATGATCGAGCCACAGCAAATCAATTGGGATACCAGATAGGAATAAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTAAAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGAAGA:1 - chr3R 18060169 5' + Idefix 167 2 67.50 GCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATG:1 - chr3R 29690770 5' - I-element 5274 1 74.66 ATCGTATGCAATCTTAAAAATATAAACGAATTCATTCATATTTTTTCCATTTTTTCCCATATTATTTATTTCTCCAGTATTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTCT:1 + chr3L 18920391 5' - mdg1 7079 13 68.28 ATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTTAGTCGAATTTCTCGACTATCAGATACCAG:1 + chrX 4459349 5' - INE-1 555 1 76.38 GTGAAATTATTGGTTAACGTTTTCCTATTTCGGGCTTCGAAACGGTAAATTAAGATGTCTACTGACAATAAATCCAAGCAATACAAAAGGGATGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGC:1 - chr2R 5463519 5' + F-element 487 1 77.34 GAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAA:1 + chrX 5323226 5' + Juan 4101 1 53.42 GTTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGGGAAAAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTG:1 - chr2L 15550783 5' + Bari1 65 1 59.59 AATATACTAATTAAGCGCAATTATATTTCGTATTTGACCAAAACAGAATAAGTATGATTGCGTGTACAATGGTTAAAAGTAAAACTAGTAAAATAAGATTTCTACAAAGAAATTTTTATATTTAATTTTTTTTATTTTTATAAATA:2 + chr3R 14694137 5' - transib4 2575 1 71.23 ACAGGGACCGCAAGCATCCGATTGTAGTGGTGGCTTTGACCAGTGACAGACACCTTAAACCCATGATCCAAGGACTTTTCTTGGAGATCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTAT:1 + chr2R 10881791 5' - ZAM 187 3 69.66 AGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:1 - chr3R 17673817 5' + FB 86 1 76.71 AAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTAT:2 + chrX 3431842 5' + Ivk 5342 1 55.48 ATAAAGCCAAAGGCAACAAAACAAAAAAAAACACTAGTTTCTAAAGGTTGCACTCTGCGCTGCTGCTATCTGTTCCTCTACATGTACTCATCTCTGTCAGTTCTCGATATTATTATTATTATTAATATTATTTTTTT:1 - chrX 5135172 5' - mdg1 41 5 57.66 AGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 18126020 5' + Ivk 9 1 66.67 ATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTT:1 + chr4 123982 5' + HB 150 1 66.91 ATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTATTATCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGAATCTCAGGACCACTTCATCCGCCGAAGAGATA:1 + chrX 10537807 5' + I-element 7 1 71.22 TTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:1 + chr3R 21276558 5' + BS 5082 1 74.66 ACTAATTTTAGATCTATCGAAAGCGTGATTTACGCTTTTCGGTTTTGTATTCCCATTTTGCTCAACCAGAGTCTGTGGGCGGAGTGTGCCCCTCTTGTTATTATTTTATTTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACTATGCGAAAAA:1 - 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chr3R 26024191 5' + Doc 474 1 60.45 AAATTCAATTTTATTTTTCCTTATTTTAAGGAAATCTTGACTACTGTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3L 2554517 5' - roo 332 2 69.86 GGGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 + chrX 19038368 5' - hopper 1354 1 60.96 TAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 9809262 5' + 412 7127 2 70.14 GACATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chrX 18282606 5' - P-element 2816 1 34.29 GTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr2R 14051851 5' + roo 8725 2 67.81 AATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - 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roo 8987 2 78.77 AAATGTTTGCCACACGGCGAATCCTGTCTACTTATATAGTTTCAACTATCAAGGACCTCTTAGCTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 + chr2R 16122147 5' + Stalker2 80 2 56.55 ATTTGATTCTATAAGTTTCCATTTCGTGCTGGCATCTGGCTTTTACTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:2 - chr3L 10425907 5' - I-element 5317 1 54.11 AACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCT:1 - chr2R 20010684 5' + Juan 4157 1 54.11 ACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chrX 6475296 5' + Doc 59 1 56.43 AAAGGGCAACTTGTCACCGAGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGGGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGCGAT:1 + chr2L 7125700 5' + I-element 6 1 78.08 AAATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATT:1 - 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mdg1 336 2 77.40 ATTAAAAACGCTGCCAAGTTGCGGCATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr3R 27765072 5' - mdg1 382 2 55.40 GACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 + chr2L 10156113 5' - hopper2 1543 1 62.33 CAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGT:2 + chrX 14771721 5' + BS 60 1 58.90 GTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chrX 19038335 5' - hopper 1387 1 65.07 TCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 + chrX 18817247 5' - transib2 2793 1 64.38 GGCAATACATAATGGGAGACCATCAAAGCGCCAGAAAGTATGCAACAAATGGCGAGTCAGCAGAGTCAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTT:1 + chr3R 11191182 5' - roo 405 1 50.68 AATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTT:1 - chr3R 20441296 5' + I-element 71 1 72.09 GTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 - chr2L 15913348 5' - transib2 2776 1 52.41 GGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3R 16518894 5' + Tirant 8147 2 56.64 CAGCATAGTCATCATCTTCTGGCCTTGACAATAGGAGCAAAAAAAACAGGGTACACTCAGAAAAAAACAATTTTTACATAACACAAATGCGTGCCAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAAATT:1 + chr2R 21851636 5' - 1360 377 1 60.27 ATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATA:2 + chr3R 556454 5' - Tc1-2 1544 1 71.23 TTAAGTTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - 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roo 66 2 74.24 AGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr3L 23906482 5' + 1360 20 1 59.46 CTTGTCACCGAGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:2 + chr2L 7125709 5' + I-element 15 1 73.29 AAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 13158628 5' - roo 358 2 52.05 TTGCATTCCGAGTGTGCTGGCCATTGTTGTTGCACTTGTTGTTGATTGTTTGTGGGCGACAGCTGAGTGGGGCACGTCTGAGCATTTAAGCGGGGAAGAATGTGGGTGCGCGGGGGGGGCGGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTTG:1 + chr3R 7754681 5' - G6 308 1 72.41 ATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 19032695 5' - roo 344 2 64.38 CACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 - 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chr3R 15017464 5' - Tc1-2 1568 1 60.27 GCCGTTTCCAATACGAATTCAATTAAAATTTCAATTTGGTAAAAACAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAA:1 - chr3L 6086715 5' + hobo 482 1 68.97 TAGTGAGATAGTTTTCCAGCAGCGAAAATGAAAATGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAGAGTTTCTTGGCAGTCTCAAAAGTTTGTAAACTTGGAAT:1 + chr2L 6095687 5' + S-element 1528 1 73.97 TTTACATTTCCTGAAAACTGTTGCTGAGTAATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr3R 7666580 5' + I-element 8 1 78.77 GTAAACATTGCAACAGAGTAACCTAACCATAGTTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCTGGC:1 + chr2R 3593662 5' + gypsy 7072 2 75.86 ATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGGCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr2L 71243 5' + 412 76 2 73.68 AAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3L 5881691 5' - pogo 2052 1 53.42 GTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:2 + chr3R 5523893 5' + FB 48 1 53.42 AGGCGTAGTTACAATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 18549975 5' - roo 398 1 80.28 AGGAAAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr2L 18347255 5' + transib2 27 1 63.38 CTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAAGGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - chr2L 15188442 5' + 297 62 2 74.62 GCCAAGNTGCGGCATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 + chr3R 27765084 5' - mdg1 7401 2 57.53 TTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTAGGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGATGTTTTCACAAGCATGCAAAATTGAAGTATTTTAGTATTAA:1 - chr2R 22989678 5' - hopper 1356 1 51.39 GATCTCAGGAACTTCGGTACTGCCGGCAGCTATTCGACCAACCAGTTGGGTCCTCTCTCCCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTA:1 + chrX 19662981 5' - 1360 72 1 64.00 CATCCATTCATCCAGGCATCCAGGCATCAGGGCATCCAACAATCCCGGTACATGAGCTTAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 + chr3R 11474163 5' + I-element 4984 1 54.26 ACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAA:1 - chr3L 20187420 5' - FB 473 1 52.05 CTTTTCATCCGCTGCTTGGCTGGGTTTTTTTTCGCTTTTCGGGATATTCAATTTCCCATTTTTCACACATTCAGTTCTTGTAGACTACTGAGGTGTTTTATTTTCCTTTTTTTTTCCC:1 + chr3R 22227288 5' - Doc2-element 250 1 72.88 GGTGTGGGTGGAACTCTTTTGCGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTTTCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTAT:1 - chr3L 4086639 5' - Porto1 4228 1 74.74 ATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAG:1 - chr3L 22035592 5' - 1731 4543 1 73.79 GAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAGCAT:1 - chr2R 2318206 5' + ZAM 86 2 78.99 GAACAAGGATCAAATCAATTCGAATCAATTGAAAAGGCAGCCACAAAGTATTATATAAGTTAATATATGTGTGTTTTCATGTATGTCGTGACTGTGGCCTACGAATTACATATATTTATTGTAGATTAAATTTGAGCTTGTAAGTT:1 - chr3R 16161350 5' - gypsy7 172 2 67.81 AAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGTACTAATGTCCTGTCAGTTGACTAAGGACTACG:1 + chr3L 10373817 5' - 297 353 2 52.71 CTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 + chr3R 20441225 5' - I-element 5302 1 52.74 AATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr2L 7581033 5' - Transpac 269 2 53.79 AAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chrX 11661352 5' - pogo 2085 1 73.38 GATGAGCACTATCAATTTGTAGTATTGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACACGAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chrX 20888396 5' + 297 6629 2 58.90 GATGATGGGAAGGGATAGCAATGCAGGGATGCGAGGGCTAAGGGATGATGAGCAATTATGGCCAGTGGGGCAGCAGTTGAGAGTCCCTACTTGTTTAGTCGGCTTAACTCCTCGGTTTCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTC:1 + chr3R 24667006 5' + Cr1a 4086 1 50.00 AACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGT:1 - chr2L 4123938 5' - transib2 2749 1 69.18 TTGTGCGTCTAGTCAGTTATCAGTTATCAGTTGTCTATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTAGTTTTTCTTTTTTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTTAA:1 - chrX 18834903 5' - Doc3-element 130 1 67.27 CAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:1 - chrX 9950588 5' + jockey 4756 1 75.34 ATAAACACCCGACACGCAAAAGTTTTTTGGCACGCACTCACACACACACACACACACATCGCAACTAACACACTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - 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roo 9026 1 54.11 TCCATTTAATTGATTTTATGCTAGCTCAATGAGTGGTATTTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAA:1 - chrX 8675978 5' - 1360 413 1 61.43 ACTTACATCTAGATACTAGTGCGATTAAGTATACGCATAGTTGATTGCTTAGTCTCGGGGACGCGCTGATGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGGATTTTTCCTTAAGTTCCTTG:1 + chr3R 14177550 5' - F-element 4429 1 52.05 AATTTCATACTCCTCAATGAAAATAAGTTCCTCGAACGCACTTAGGCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGACATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCCTTCTTTCC:1 + chr4 1167721 5' - 1360 3315 1 67.81 ACATTCAGAAAAGTTGGATAATTCCAAGAGTGCAAATCAAACCGTAAAACCCGAAAATAGCGATATCAAAATATCATTACTGCAGATACCTAATCCCCAAGATAAGAAATCTAAAAATTTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAA:1 - chr3L 16143453 5' - 1360 3251 1 66.44 GAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 7889643 5' - roo 342 2 68.15 ATTAATGAAACAAAAACGCCCACAAGGCAAATAAAAAATCAGCAAAAACCCCAAATATGTAAAATACAAGGAACAGGAAGCTTGTTGAGATAGTGTATCAATTTAAAATACAAAGTGTAAATTTAAAAATAAATATAAAAATTTAA:2 + chr3L 10384325 5' - 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chr3R 24053087 5' + Cr1a 4044 1 52.74 GCGCTATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGG:1 - chr3R 27083144 5' + jockey 4541 1 66.09 ACCACGATCCAATCAATGATCCATAAAGCGCTAACAACAAATCATGAAAGAGGGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCCAAACCACCACGCC:1 - chr3R 26006765 5' + ZAM 7994 2 65.14 ATTCAAAATTGCAATTTTATATGCGCAACGCTCACCAGCAACTTTGGAAACAATTTGTGACAGCCTTGAGGGATAATCGAGTGGCCCAGATTGAGGATGAAATCAATTTGATTAAAGGGGGACTTTGGCTTGTTGGTCCCCAGCGC:1 + chrX 19413501 5' - Rt1a 400 1 76.03 GCATCTTCAGGTCTCTTTTTATGGTGGAATTTCGGACTTCGGAATTTCGCCTAAATTGGGATTACCTCCTTATTCCAGTAAACTACTTTCAATTAATTTACCTTCCTAACCGTACAACGATGCTTGGAACAGTCTTCATTT:1 + chr2R 1930909 5' + Cr1a 4028 1 64.54 GAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACG:1 - chr3L 11257438 5' - 1360 25 1 59.59 CTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAATTATGCATATTAGAAGTATTTTAGTATTAACACATTGGAAATACG:1 - chr3R 19992713 5' - hopper 1341 1 65.22 AGAAACAGTTAAACAATTGTCTTTGCTCCCTGCGCTTTGTTTTCCCCCTGCCACGCCCACATTTCCATCACTTGAGCTCATTATATGTATGTATATAGAATGAT:1 + chrX 17501247 5' + Dm88 4380 2 63.46 CCATCATTCTTCGCTAATATAACTGTTATTTCCATGAAAAATGGCATGAAGTTCAAAGGTCAATCAACCTCAGATTTCGCTATCAACCTAAAGAAAAAAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCA:1 + chr3L 14981522 5' - roo 8792 2 71.23 AGGGGGGTAACAAAAATTTACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATA:1 - chr2R 9967178 5' - Bari1 1692 1 73.97 CGATTCGGCTGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 + chr3L 3983807 5' + P-element 61 1 39.13 ATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3R 29084862 5' - 412 7509 2 56.85 TGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGGTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr3L 25406605 5' + 1360 12 1 66.44 GAAATTACATTTGACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:2 + chr3L 18281817 5' + Doc 25 1 69.86 TTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGACTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAA:1 - chrX 22824262 5' - Gypsy12A_LTR 2242 1 55.48 ATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTTGCCCTTTGGCAGAATGTTCA:1 + chr3R 19450059 5' + roo 8649 1 54.79 CATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGCCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 11062869 5' - roo 9050 2 67.13 ATATAATGAAGAGCTAAAAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr2R 8047223 5' + 1360 31 1 60.27 CAATTAAATAAAATAGCATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTTCGACAGCA:1 + chr3L 11720528 5' - 412 301 2 61.76 AGAGCTTCTCCGCTGGTTTTTGTGATCTTTGCCGGGCAAGAAACCTTGATCGACCCATTTCCGCTTTTCAGTATCCAAATATTTTTATTTTATTTTCTTTTTTTTTGGCCACAAGTCTTTTTTCCGAATCTCTTTTTGCTCTTGT:1 - chr3R 14459976 5' - Bica 288 1 82.07 GGCAAAAAGGGCTGCGAAGTCCCAAAAGGGTCGCAAGATAAATGCCTGGCCATCGTGGGTCATGGGATGGTGAAGCTGTAGCTATATATAGCTATAGCTATAGCTATATATATATATATATTTATATATT:1 - chr3L 20909438 5' - G3 4506 1 79.23 ATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTAACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 19450044 5' - roo 9047 1 41.09 ACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 10167449 5' - roo 8990 2 72.60 ATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTTAATTATTT:1 - chr2R 18529962 5' - jockey 4936 1 55.80 CAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr2R 14653139 5' + 297 32 2 48.63 ATGTCATTTTATATAAATTAATTTCACCAATGACATTCAATGTCTGCTCGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTATTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAACAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAG:1 - chr3L 5281294 5' + Circe 7182 1 65.07 TGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTAGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATG:1 + chr3R 28042949 5' - Stalker2 330 2 67.12 AGAAATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chrX 8092346 5' - pogo 2095 1 79.07 TATTTTACCTATTCCCTCATTCCTCTTAACAAGCTCCACAAACTTATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTT:1 - chr2R 7340454 5' + gypsy7 299 1 69.86 TGTAGGGCCAGAAAGAAAATCAGTCTTCAGTTCGAGGCATGATGAGATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2R 6885532 5' - P-element 2876 1 56.52 ATTTAAAAATGACAATTGTAATCTGTAATCACTCAAATAGGGTCGTCCGAGGGCAGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATC:1 - chr3L 24564569 5' + springer 5 4 69.41 CTACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrY 311463 5' + 1360 1 2 58.90 TAAACAGCCTTTGAAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAG:1 + chr2R 7244766 5' + diver 15 2 73.29 TCTATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATTAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 12818190 5' - hobo 2922 1 71.92 GCCATCGGGCTGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 - chr2L 4713984 5' + transib2 37 1 60.27 AGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:2 + chr2R 8157161 5' - mdg1 372 2 52.74 ATAAATTCAATATTTAACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr3R 20441208 5' - I-element 5319 1 57.53 ATTCTGATGGATCATTACCAGCCAAACCAGATGCCATCATACCACTTCCGCCCACTTTTCGATGGGTATTTAAAGAAGCTGGATGAAGAAATAGCAGCAGAGCAAAAAATAAAAAAAAGGAAAATG:1 + chr2L 5388101 5' + Doc2-element 229 1 85.71 GCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGGGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chrX 6475322 5' + Doc 88 1 74.13 GACCGGATTCCCATTGAAATGGACAATGATGAACAGGATGATGATTCGGATGACGATGGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTT:1 - chr3R 15834098 5' + invader4 3076 2 52.59 TAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCAC:1 - chr2R 12185462 5' + accord 17 2 71.23 AAATTAATTTCTTTTCGGCGTGGCGGGAGAGAGAAGGACAGAGCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGGGGGGGTGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGG:1 - chr2L 2886707 5' - blood 7117 2 67.44 ATAAACGTGCGAGGCAAACCGCAAAAGAGACAAACCCAAAAAGGGCAAACAGAGGGGCACAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chrX 14974995 5' + G2 3076 2 77.50 ACTATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATT:1 - chr2L 4034963 5' - TAHRE 10392 1 72.60 GTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2L 19675100 5' + 297 26 2 62.33 GTTTACTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 - chr2L 14523275 5' + HMS-Beagle2 6912 2 36.99 TTGATTTATTTTTAATTATCAGTGACGTGCGGTGCAAAAATAAATAAACGTGAAAATTTATTGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTAT:1 - chr3R 27843317 5' - mdg1 7076 12 76.03 AATATGTATAAACACAGAATACTTCACATATGTACATATCTCCCGGCGAACACGAGAATATTTATTGCGTAGGAATCGACCGAGATACTAAATGTAAGAAAAGCCCCACGGGTTTCGGGCTTCCATTCATATTTACTGGCATTGGA:1 - chr3L 2416273 5' - HB 468 1 71.92 GTGCAACACTTGCCACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCGTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chr2L 15779668 5' + hopper 39 1 59.31 CCGTAATGCGTTGCACTCGTGCCAACGCAGAGGCGACAATGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 24820795 5' + 1360 55 1 60.00 ATAAAGAAATCCAAAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAA:2 + chr3R 23911360 5' + 3S18 82 2 70.55 ATGACTGTGCCAAATTCGCCCTTGTGCAACCATATTTAATTGTCACAAATTAATTAAATTAATGAATGAGTTTGGATAGAAGATTTCGAGTCATTTGTCTTAAAATTTGCCAGTATTGCGGTAATTTAAAAAAAAAAATAAAAAAG:1 - chr3R 9181356 5' + TART-C 11100 1 76.03 TTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:5 + chr3R 15072541 5' + pogo 43 1 54.11 AAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3R 17421325 5' - pogo 2062 1 50.68 GTGTGGCGCCAACAGTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 - chr3L 24934438 5' - HMS-Beagle2 290 2 72.60 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCATAGTTAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGTTAAATAACAAAATAAATAAAACTTATTTAATAAATCAATTAATTTTATTTAATAAAA:1 - chr4 1294995 5' + TAHRE 70 1 76.03 CATTAAATACTATCTTGATGATCTTCTAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGGTTGCAGCAATTAAGGCGTTAAAGTCCATTTTTATGCG:1 + chr2L 15942592 5' + pogo 1764 1 76.56 TAAAGCCGCCGACATGCCATGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 8075905 5' + 412 74 2 66.44 GGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chrX 19588134 5' - roo 343 2 61.11 CTCGACTGACATTCGCATATTATAGTTTTCCTGACAGCTGGGACTTCTCTTTACTTTCATTAAGCTTATTGCCGATTATATATTGCACTGTTATCCAAGCTTGAGGATTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATC:1 + chr3R 18345571 5' + Max-element 444 1 73.29 ACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chrX 18817256 5' - transib2 2784 1 58.22 ATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 + chr2R 12472015 5' - transib2 2768 1 56.16 ATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGGC:1 + chr3R 16341969 5' - P-element 2810 1 24.62 ATTGAAATTCATTTGTTTGGCGCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 13972915 5' + 412 20 2 71.22 GCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATT:1 - chr2R 19941607 5' + hopper 89 1 75.34 ATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGGGAAAGGAATAG:1 - chr3R 16342010 5' - P-element 2823 1 28.23 TAATCCATCCGGAATATACCCTCCTTAATATATTCCATGTAGTATTTTTGCGGTTTTGTTTGGCGATGACGTCAGCAATATCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATAAGCAAGTCCATTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGGGTC:1 + chr3R 4787699 5' - BS3 151 1 68.49 AAAATCCGATTGCACCGGTTGGGGCAGATAATCGGATTTGTAGGAAAATTCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2R 14051904 5' + roo 8672 2 76.03 CGTTTTCCCAGTGTGCCGAGTTCTATATATATTTTATTTTCCCTATTTTATTTATTTTTTTGAAGATTAAATCTGATAGTTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGTGTAAACCGATTTCTGGCGTTTGTCGCGACTCTTGTTAG:1 + chr3R 19718081 5' - mariner2 707 1 64.14 AGTTGCATTTCAGTCCGCCAGGACGCGTGACTTTGTGACATTTAATGCCAGTTTGTCAGCTGGCTTTCTCGACGGCATCGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chrX 585611 5' - Tirant 8465 2 57.53 ATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:2 - 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chr3R 11040178 5' + Bari1 42 1 57.53 AGTAAACATTGAAATGTGAACAAAGGGTTTGAAATGTTATGTATAAATTAAAACCTACATTCGTTGAAAAGTTTGTAACGGGCAAAAGGAAGCGTTTAAGACCATGTAAAGTATATGTTTATATTCTTGATAAGGATCAATAACCG:1 - chr4 193093 5' + INE-1 88 1 61.64 AATACGTAAAGCACTGGCCACGTTGCGTATACGCAATGTGTGTGTGTGTGTGCGTCCTACTTTGTCTGGTCCTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCA:1 + chr2L 15138168 5' - accord 7195 2 52.41 TCTTGGGGTCGTTGTTGCGGTTCTTTGTGGCCTCGCCGCCAGCTCTTTCAACACTTTGGGCATGCTAAAATTTAATAATCTTCTTTAAGTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCAGTAGTTTAAACAAATA:1 + chr2L 12114706 5' + Cr1a 158 1 52.05 CTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATTAAGTCTAAATTTT:1 + chr2L 18347307 5' + transib2 25 1 57.95 AATAATCAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:2 + chr2R 14653127 5' + 297 6601 2 56.85 GTGGCACATCCGCCCATATTTGCACCCACCTGCCACCCATAAAGTGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGTACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGA:1 + chr2L 17567249 5' - invader2 4835 1 73.97 GAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr3L 22400296 5' + 1360 44 1 73.12 CTGTTGATTCATTAGAGCACTTGAATCTTCACTTATTTAGATTAATCTCATATTTTAGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCCGATGTTG:1 - chr3R 10669295 5' - invader2 106 2 63.70 CTTTAACAATTAATTATTCTCTTTAATATATTTAAAAAAATGTTAGTGTGCGCTCCGTGATAGTTCAACGACGACTGACTCTTCGTTTATTCAGCACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 + chr2L 16858659 5' - Burdock 6370 2 71.23 AACAAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3L 17940241 5' + 1360 12 1 48.94 ATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:2 - chr3L 20711713 5' + jockey 4806 1 50.68 GCAAGCACCCGGCTGTGCGCGCACCCGAATCAATACATAACGGAGGATAGAGAAGACAAACAATCAGAAAAAGACATTTGCCTAAAAAGGGATGATAGGCAAAACACTAACTGGTTTCCCGTTAAGCACATGGGTGTTTCCAAAAA:1 + chr3R 1465886 5' + hobo 242 1 60.27 AAGGCCATCCCCTAATGCTTGTTAAACCTGTTCATAGAAACTCATTGTTATGCGGCAAAGATTGATGGATTAACTTCAAAACAAAAGAGAGAAAGCTTGAGTCAAGTTCCCCGCCTATCAGATACGCGTTACACAGCTAGTGTG:1 - chr3L 21857600 5' - INE-1 539 1 79.17 TTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCT:1 + chr2L 6654662 5' + diver 75 2 67.12 ATCCAAAAATATCCTTGCACTGCAAAGGGCTAAGATGGAAAAATTCATAAAAATATGGCTGGGCACGGGTATTATTTATTTTCATTTCTGCCTACTCCAAAATCAAA:1 - chr3R 10716326 5' + 412 406 2 84.11 TATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chr2R 13168659 5' - P-element 2819 1 38.03 ATAAAAAAGTTGATATTAAATAAATACCAAATCAATGTTTAAGAATGGCGCTACATCGATATCCGATATTCCAAGAAATATTTAATTTTCTCGTTTAACTTCCAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATAT:1 + chr3R 24719515 5' + INE-1 566 1 57.53 ACAAAGTCCTGTTTTTCATGCCGGTGGCTCAATCAAACTAGTAATCATGTTGACCACGTTGCATCTGTGTTTTTGTCGTATTGTATTTATTTATTATTCGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATATTCTAAAGATACCACCGTCCGT:1 + chr2L 4461565 5' - Rt1b 5101 1 65.75 AAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2R 13766212 5' - roo 336 2 68.49 CATGTAAATACTATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTTATAGATCGTGTTTAATCAATGCACTATGGGGCCTTTGGCCTGTTTTTGTT:1 + chr2L 10156065 5' - hopper 1407 2 71.53 CCGTATTCCTTTCAATATCAAGTGAAAAGGTAAAACGAAATATTATCAATAAAAAACAAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGG:1 + chr2R 4134172 5' - FB 464 1 63.01 GAATAATGAATCCCCAAGGAGGCATGACTCAACAGCGGGAAAGAGAGCCAACCGTGCGAACCCATGACATGGAGAATCAGCAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGC:1 + chr2R 21410292 5' + Burdock 5995 1 63.01 CTGACATTCCAATTATTCTTATCGCATCAGAGGAACATGGCCCATGGCCCACGGAACCCCACCATCTAACCCAAGCCCAAACCCATCCCGGTTATAAATAGCCCGACGAGAGGGGCGCAAGGGCATCGTGGCGGAGATCTACAGCA:1 - chrX 14410360 5' + aurora-element 3894 1 71.23 TATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:1 - chrX 17717100 5' + FB 59 1 56.85 TAATGCAACAAACGCTTAAACTTTAATTAAACTTTGATATAAACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAACACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAA:1 + chr3R 11100099 5' + I-element 193 1 69.86 ATAAAGGCCAATGGCGGAAAATGTAATTTTCCTTTGCCCCAACAAATGGCTTTGGGTTTATCATATTCATTGCAGTTTCACTTTTAGCTAAAGACAATGGTTCGTTTTTATGATCTGCTTTTTTTTATTTTTCTTTAATT:1 + chr3L 9557903 5' - Doc 4700 1 52.86 ATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTC:1 - chr3L 23940551 5' - Cr1a 4395 1 68.28 GACCGCAAATAGTTTGTCTTTGCTTCACATTTTTTGTGTACAGTGGCTATCGCTTAAAGGTAACGAAAAACGAAACAGGAAACTTAATTTCAGGAAGTGCAGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTA:1 - chr3L 4624206 5' - roo 293 2 71.23 AAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2L 18226859 5' + roo 8740 2 70.55 TGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGACATGCAA:1 - chr2R 9967121 5' + Bari1 73 1 65.07 TGGCCTTGATGAACTGGTTGAAATCGCGCTTGGTCCAGGCAGTGAAACCCTGTGAGAGTAGATTCTCCTTCTCCTGGATCTCATCCTCGGTAAGCGGCTCTGCCTCATCGATCTTGTATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCA:1 - chr2R 12639546 5' - roo 8657 1 76.71 AAAATGTGTATCGAAACGGAGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGGTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr2L 809607 5' + jockey 16 1 70.34 ATGCCAATTGTCAGGCAATGCAATCAGCGTGTTTATTGATTTGGAAAATTAAATATTTTTCCTTGATTTCCCAATTGTGTGCGCTTTGCATATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTGATCTTTATCATCTT:1 + chr2L 16018627 5' + Ivk 99 1 52.05 ATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCTCAAACATCTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chrX 19054274 5' + jockey 95 1 73.97 AATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTC:2 + chr3R 27405986 5' + diver 5970 2 71.23 ACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3L 6397675 5' + roo 8743 2 69.18 TCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 + chr2L 7660889 5' - I-element 5316 1 53.42 ACTCTCATATCACTTTAAATTCTGAAGAGTATTCAAATCTTAAACATTTAGTTAACTTTTTAAAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGAACCCCCGACC:1 + chr3L 14168542 5' + G-element 4208 1 54.68 CATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTT:1 - chr3R 16518968 5' - Tirant 320 2 71.23 TAGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGCATATATATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCCTCTTTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGACGAA:1 - chr4 281582 5' + INE-1 139 1 77.40 TTTAGTTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 7795639 5' - roo 9037 1 61.64 ATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGC:1 - chr3R 934253 5' - Rt1b 4702 1 49.32 ATTGTTTTTATGTGAACGTGTTTAAAATCTAACACCCAAACAGACACAACAAAAAAATACACACACACACACACACTGA:1 - chr3R 9171822 5' + accord 257 2 59.49 GGGAGAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCT:2 + chr3R 3850971 5' + transib2 18 1 73.29 AAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr2L 16690734 5' - P-element 2838 1 50.68 CTCGTGTTCGTTGGCAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chr3R 30347279 5' + P-element 29 1 67.81 GTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 - chr2R 21410994 5' + Burdock 36 2 60.27 TTGGACGATTTTCGCGCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr3L 21763783 5' + jockey 74 1 63.31 AATAATACCCTTAACGCACGCCAGGTGAGTGTTGCCCCCGGGGGGGCACGGGAAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 + chr3R 22287937 5' + transib2 39 1 52.05 ACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 2989933 5' - roo 349 2 58.22 AGTTGCAACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 - chr2R 330240 5' + HMS-Beagle2 37 2 58.90 GTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 + chr3R 9038923 5' + Juan 4066 1 55.48 GTTCAGATAAAGATGCTTTAAATGAGATAATCCATCAAAGGAGTCATTCTCTATTTGACTAATCCGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGGCCAGATTGGTTTC:1 + chr2L 14031034 5' - F-element 4255 1 54.11 GCTATTGTTTTTAGCCTATCTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 - chr2R 6965617 5' + Transpac 4949 2 65.07 TACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr2L 12984235 5' - hopper 1380 1 57.04 AATAAAAATACCTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATAT:1 - chr3R 5719758 5' - G3 4505 1 67.81 ATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 + chr2L 17180072 5' - Juan 4155 1 55.48 ATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTG:1 - chrX 5323315 5' - Juan 4149 1 57.53 ACAAGCTGTTGGCACACATAGAATGTGCTGAAAGCCCAAAGACACTCGAAAGTATGCTACAGTTGCCGGCAAATGTCTTCACACATACACACACACACAACTTGTGCTTAGCGTAAGTTGGGTGGGGCCCAGCACACTTGCCACCT:1 + chr2L 8749812 5' - jockey2 384 1 67.81 AATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chr2R 18316053 5' + HMS-Beagle2 30 2 60.22 AAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCC:1 + chr2L 22966902 5' + 1360 3177 1 49.52 AATATCAAGACAAGATTCATCAGCAAGCAAATTTGTAATGAAAAAAATGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCTGAGGATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAG:1 + chrX 21075162 5' + Doc 4544 1 71.92 TACCACGGTCGAAGGGTGTTCAAAGGGATCTCCAGAGCCATGTTCTATCTACCTCAACAGCAATTGTGGCGCTCCAAAAAGGTAAATTTCCCCTCTTCTCATTTTATTCCCCAAAATCTATCGACATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 - chr2R 564768 5' + INE-1 559 1 70.55 CCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 + chr3R 15054231 5' + copia 81 2 76.55 GATTTCATTTGCAGTTTGTCGCTTAAATGTTAGGGAAAATGTCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAAGAACCCA:1 - chr3R 6380169 5' + F-element 307 1 69.86 AGCGGCGGCCAACGACCGCACATTTTTAGCACATTTTTTGGCTCGCTTCGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGGAACGCC:1 - chr3L 22400481 5' + 1360 12 1 43.53 ACGCAGTGCTTGACGCCAGCCATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTT:1 - chr2R 22989701 5' - hopper2 1558 1 51.37 CATCGGTTAAATTCTTTGCTCTAACGGATCAATGAGGCTTTTTTTATGTCCATATATGTTCATGTATTCGTAGGCAAGGACACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACATCAGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTA:1 - chr3L 28079857 5' + invader3 315 1 56.85 AGAAAGCATTTTTATTAACTCCAGTTAGCTCATCAGAAAATCTAGTCATAGAAATTCAATTTCAGCCAAATCGCCATGAAGCGAATCCAATCTGTTCGAGTTACGGGGTTTGCACTGTCACGCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTT:1 + chr2L 1300630 5' + GATE 8276 2 59.31 AATTAATATTTATAAACTGAATAAAAATATGGAAACTGATTATTGCTAAAGGGATTTCTTGAGATACGAAGTGCGGTCTTCTTAATTTTTCATACGTCGCAAATTGAATACTGCCCATTAATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTC:1 - chr2L 9650777 5' - 1360 246 1 49.32 GTGGTATAGTAAAGTAGAGCATAAAGTCAAGATGAAAGTACTTCTGGCTAGAAGGTTTAATGTTTAAAATCAAAGCAATGCTTTCCTAAAACAACCACAAGCTTTTGAAGTCGTATCTCTACAACAGAGCCTTTGCTG:1 + chr3R 14929602 5' + Fw3 2806 1 69.57 AAAAGTAAAAACTAAACCAACAGTGAAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTTTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr2R 330095 5' - HMS-Beagle2 277 2 59.71 TATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chr3R 20441233 5' - I-element 5294 1 58.22 TATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 + chr2L 7660941 5' - I-element 5265 1 78.62 GTCATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:2 - chr3L 8627380 5' - pogo 2090 1 36.99 AGGCGCGATACTTCGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chrX 696498 5' + FB 54 1 60.31 GTTTAGATTGTTTTTGGGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGGCA:1 + chrX 8437613 5' - P-element 2874 1 74.82 ATGCTGTACTGTTTTTCTCGTTTCTCCCATTTTTCCCATTTTTTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr3R 26774022 5' - hobo 2919 1 52.78 GATATGGCAACAATAACTAAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 - chrX 13490752 5' - 297 337 2 65.07 TCACAAAAGGAACTGGAGTGGAAAATTTGCAAGAAAAGAATTCACCGCATATTATTTCACATGCATGGCGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATA:1 + chr3L 7064354 5' + hopper 1079 1 71.43 TTTATATGTGGTAGCTTAGTGGTATATTATTATTCATATTTATTATGTTTAAGCAAAGAATAGAAGCATAATAATAATCCTTATGAAATACATTTGCATAAGTATAAATCTTTTTTAAGTGTTTTCATTGTTTTTTTTTCATAAAT:1 - chr3L 10500566 5' - looper1 1693 1 65.75 AAAGTTACTATGTTTTCATGCTCTTTGTTCTGGTTTTTCTCGTTTTTTGTTTGTCTGTGAGTGTCAGTGTTGCTGCTTAGTGTGCTCTTTGTTACCGACACACGACACGCTCATAAAGTTTGCTTGTTTGTTTTTTTATGTTTATT:1 + chr3L 8432887 5' - Tc1-2 485 1 56.16 TAGGGCCTCATAGTCTGGCACGAAAGTATGGTGTAGCTTTTAGCAAGGTTCCGCACCAGGGTTGAGTATTTGCTTCTTTCTTAATGGGCATTTAAAGCCCACGTTGTTTAAACTAGTTTGAATAGAATAAAAAAAAAAACAAGAAA:1 - chrX 1819177 5' + Osvaldo 1522 1 78.77 TATATAATTTCGGGAGCGAGATCGCTCTCTAGAAATATTGATTGTATACAATGAGTTGATGTGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTAT:1 - chr3L 23219537 5' - X-element 4395 1 58.62 AACAAAGCGCAAAGAATTGTTACCAAATTTGGGAATGGCAAATATTCAGAGTGGATTTCTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTTTATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 + chr2L 13585661 5' + Idefix 11 2 76.03 GAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr3R 23639129 5' + pogo 49 1 51.37 TAGATAAGAATGATTATAGTATTTGCTTGAGTATATTTGGCGGTCTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTACCTTTTT:1 + chr3L 9866040 5' - Doc2-element 238 1 55.84 GGGTGTTTTTTGGGAGGGGATTTACACATTGATTGTTTGATCGTTAGGCAATTGTTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTT:1 + chr3R 8813674 5' - Quasimodo 70 2 63.01 ATTAGCATCATAATTGCATTATTTACGTTTTATTTCACTCACTCCTAATCTGTACAACATCGGAATGCTAGATCTCATAAATTCAAATAATTGTACCTACATATTGCATTCTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGG:1 + chr3R 20501597 5' + TAHRE 10384 1 48.63 CAGATAAATTAAACAAAAACATCTGGTTTTTTAGACGTTGAGTAAGATCTCTCTGTGTAATCTAAACAGTTGCACATACATACGATTACCTCAAACAATCTCACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTT:1 + chr3R 4699309 5' + I-element 4928 1 51.37 GAAGAAACATAAGTAATCCCATGAGCTTATCTTAAGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 27160208 5' + 412 18 2 73.29 TAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 16970367 5' - roo 341 2 65.75 CTGAAAATTGGTTTAATGGCCAAGCGCTTTGGCAAACACCCACACACACACATGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAG:1 + chr3R 5420172 5' + I-element 5091 1 64.38 CTGGATTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 5769132 5' + roo 39 2 58.90 CGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCAACGGTCATATCTTATGTAAACGAATCGAGGGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 11062769 5' + roo 8738 2 72.13 AGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2 - chr2L 18226855 5' + roo 8744 2 73.29 AGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 + chr2L 17005682 5' - Stalker2 7634 2 60.16 TTGTAAGAATTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCGTAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3L 23287181 5' + 1360 21 1 69.86 GTGGAATGAACATCAGCGAAATCATTTGGCGAACCACAAAATCGCATCAAAATATTGCGTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTCTTTACCACTCGACT:1 - chrX 6513508 5' + hobo 18 1 73.29 GTTTTATGGGTGGGCTTGTGACCGAGATTTTGGTATTGGATGGGATAGCCCAACAAACTTGCGCTACGCCTTTGTTTCTAGAATCTGTATGCTGAATTTCAACCTTTTATCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 + chr2L 19908091 5' - INE-1 147 1 60.15 CTTTGCTTTGGTCATATATTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCAGTGTCTTATTCATTTTTTACACGCCGCAAGCGAAACAAGAATTTTTTACATATAAGGTGAAAAGCATATTTTGTCGAATTTACAATGCAT:1 - chr3L 10590623 5' - 1360 198 1 51.37 CGAGTGTCATCGCTAAGGGGGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCC:1 + chr3R 9038883 5' + Juan 4026 1 71.23 AAAGCCTTGTATAACTTGATAAAAAAAAGAAAATAAAAAAAAAAACGGAAAAA:1 + chrX 9736110 5' + Bica 337 1 69.81 GCTACCATCAGAACTTTGCGGAACCACCCAAGCATCCCCCCAAACATGGTTCCATCAATAATCCTAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGCTGTAGTTAA:1 - chr3L 4202532 5' - mdg1 7442 2 51.85 TATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 16033413 5' + Doc 48 1 63.48 ACAGTTCGTTGTTATAAATAAAATAGTGTCATTTCCATGAGGAAAGTAAGCCAAGAGCATACTACAATGTAAACTAGGTAGCAAGCTCAGGAAATAGTAAAAAAATCCTACAACTCAGAGCTTTAATAATTAATTATATTTTATTT:1 + chr2R 21792845 5' - NOF 3961 1 69.86 CNAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCG:1 + chr2L 11391469 5' - 1360 52 1 58.99 AAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGGT:1 - chr3R 11040168 5' + Bari1 39 1 55.64 ATCGATTTTGTGTCAAGGATAAGCGGAACCACTGTCATATATTGGGCTATTTGGTTTGGCAATCATGGCCCGATGGCGCTGCGTTCTCCATTCTGCATTCTGCGTTTGCTTTTTGGTTTCAGGCTCTTTTTTTCTTTTTCATTTTT:1 + chr3R 21728428 5' - Doc2-element 238 1 68.49 AATTGATTGAACATTAAATTGAGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chrX 18009891 5' - 412 7527 2 51.37 TTTTATTGTTAATGTAATTGGTCACATTGGCGCGTCAGATCAGTTCGTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 5106312 5' + 1360 23 1 60.96 ATAGTGTGCCATAATATCGATTTTGCCCAGACCTGCGAAGTGAAGTGGAGTGGGGTGGGTGGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3R 20818433 5' - 1360 3329 1 59.59 AGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:2 - chr3L 6518641 5' - 412 422 2 65.75 ACGAAGTTTTACTATTATTGCCGTTGGTTTTATTGCCGACTAAAGCAAAGTGTGTTGTCATTTATCGATTTTATAGCAACCGCACACGAATCCCTTCATAAAATTATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTAGAAAACCTATTGTT:1 + chr2L 18180421 5' + Doc3-element 4667 1 67.12 CGAATGTGAAGTGACGCAGCAGCAGCAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTC:1 + chr3R 23067420 5' + roo 9009 2 47.26 ATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGTATTT:1 - chrX 22460187 5' - HB 1537 1 78.77 AGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 4964086 5' - roo 355 2 55.86 GGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCC:1 - chr3R 16630349 5' + FB 55 1 60.94 AAATTAGAAATATATTTGCGTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACCTTGCACAA:1 + chrX 8092341 5' - pogo 2083 1 73.29 ACAAATAAAACAAGTAGGTAGGAGTACTATAAAAATATAGATATGAAAAACACGTATTCTAGCTGGACTTTTTTTTTAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTTATAAAAAAATTCGCAGTTGGCATTT:1 - chrX 3377424 5' + HMS-Beagle2 461 1 52.05 ACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr2R 10909291 5' + hobo 67 1 61.11 AGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - 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chr3R 31604771 5' - gypsy4 6639 2 55.79 GCAATTCGTCCATATAGGAGCTGTCACACGCACACACGCCCCGTATGCGCTATTGAGTGGACCGGCACGGCTTAATCAAATAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 31026403 5' + R2-element 3583 1 82.29 CCAGTATAATTGAAATATTCGCTGTCAATTTGTTGACTCCGGAAGACGACGACTCCAGGCCCGAGGCGAAGGTGTAAGCTGCATAAATGGTGGATCGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAA:2 + chr2L 19459829 5' + F-element 4401 1 67.81 TGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 + chr3L 11913205 5' + BS 5069 1 69.44 AAAAGTGTGGGGAAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr3R 31886971 5' - hopper 1385 1 65.07 ACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 13158666 5' - roo 322 2 77.78 CTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 15790871 5' + roo 8752 2 79.31 GTTGGTTAACTATTTAATAATCGTAAAGGCGTTGATAATAACATTTTATTTATTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATT:1 - chr3L 8673373 5' - I-element 5281 1 68.49 AGATTAAGTGCAGATCCAGCCAGGCGCAACCGAGAAACCGAAAAACTGGAAAACCGAAAAAGGAGAAGGCAGACTAAACCGCAACGACCCCCCAGCCCAGCAAT:1 - chr3R 11442554 5' + Doc 4553 1 77.88 GTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:2 - chr3L 25401038 5' + Doc 31 1 55.48 ATATTAATATTAATATACGAATTGGTAGGTAGATCTCAAGTGATTAAGATTTCGATTTCAATTTCAAATTCGAATTAATGGTGGTGGGAGTATCGTGGGGGCAGAAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGTAG:1 + chrX 14788845 5' + R1A1-element 5127 1 60.42 AGGGACATCAACAATAACAACAACAGTGGCTATGATAATGAAGGCATTCATTATTATTCCAATTGCTCGCTTCGCCCACAACTCGCCATCCTGCGACCAGACGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGC:1 + chr3L 13750192 5' - Stalker4 144 4 70.71 ATGCGATTTCTGCGTTGATTTATGTTTTTATTTTCTGCATTATATTCGAGTTTATATTTAAAACATTAGACAACGTCAGCGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAA:1 + chr2L 20611781 5' + I-element 415 1 58.87 ATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGATTAATTATAT:1 + chr3L 2145900 5' + roo 8735 2 69.86 ACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chrX 11661498 5' + pogo 51 1 58.57 TATTATGTTTGCTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr3R 4461168 5' - blood 7366 2 73.97 AGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 8308425 5' + roo 8753 2 79.45 AACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 + chr3R 29084886 5' - 412 7485 2 57.53 AAAGTTGCAACAACTTGCCGGAGTTTAAAGTTTACACACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGCTGCGGAACAG:1 + chr3L 10253753 5' + TAHRE 10389 1 73.10 AAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 - chr3L 3501865 5' - Bari1 1694 1 69.86 CAAGAAAAGGAACTGGAGATGAAAGTAACAGATGTTACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTAAAGATCCCGACATGTCCGGAATGGCTAGTGATCCTGATCAAGAATATAT:2 - chr2R 13259726 5' - INE-1 82 1 65.07 TAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 + chr2R 20010157 5' - Juan 4192 1 67.81 TAATCTTAACTTTGGTTTGTCCAGGTTTTTTTTTATCATAGCATAGTTGATTGACAAATTTAACATTTAATAAAAACGGATTTATGATTCGTGTCTACCAATACGCAGCTGAAAATGTGGAACAAGTGAAGTTAGTTTTCGCAGTA:1 - chr2R 5617157 5' + X-element 53 1 70.55 AGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 - chrX 4808626 5' + mdg3 48 2 54.11 CTAGTATACCCTTTTACTCTACAAGACCTATCATGAATATAGCTGACGAACAGTTAAGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 2473817 5' - 1360 3343 1 58.59 ACAGCATGCTCTTAAAACGATTTAAGCCTGCGATCTGTGGTCTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTTGGAATTCTAAACAGCGACAAC:1 + chr3L 1686360 5' + blood 472 1 70.30 AAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 18488388 5' + roo 8747 2 76.03 ACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 - chr2L 20118472 5' - S-element 1637 2 75.34 GTTTCGCTCACATCAAAAAACCAAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chrX 8200136 5' + flea 4770 2 75.34 AATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 7719706 5' - roo 9052 2 65.55 GTAGCCACAGGGAGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACC:1 + chr2L 4754822 5' + Stalker 6852 4 63.45 TTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr2L 23069852 5' + GATE 8269 2 76.98 GTGAGGACTAGCGATCGAGCCAAATTAGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 + chr2R 5106212 5' + Stalker2 13 2 78.08 ATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 5389956 5' + roo 29 2 57.14 GTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 + chr3R 5523889 5' + FB 44 1 56.16 ATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGCATGCCCCATACATATGTTGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTC:1 - chr2R 13168745 5' - P-element 2883 2 70.45 GATGGAATTGTTGCTCAAAAAAGAATACTAATTTTACACACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATG:1 - chrX 14771863 5' - BS 5084 1 75.34 CACCGAAAAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr3R 9595083 5' + Tirant 38 2 68.00 AACATTNAGCAAGGAGAAAAACAACAAACATAATAAAAATAGGGCCAAGCCAAGTAGGGTTGACGTCCGATAAAGTTGCAAATGCTTGTTGAATGAACTTTGCAATCGATTATCGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 12662269 5' + roo 41 2 74.66 TTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr2L 4003807 5' - mdg1 7421 2 56.16 ATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTG:1 + chrX 3431844 5' + Ivk 5344 1 54.11 GACCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGATTCTCATATTACGTT:1 + chr3R 904901 5' + rover 9 2 66.90 TTACATTGCAGTTAAGCAATTGAGCTTGAGGTACACATAAAGAGTATTTCTAGGGTAGATGGAACATGATCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGG:1 + chrX 20326523 5' - F-element 242 1 51.72 ATTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGAAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATA:1 + chr2L 13844120 5' - Stalker2 380 2 67.81 GAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTCCTATTATGCTGTGGAGTATGTGCTTAAATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3R 22642240 5' + blood 19 2 69.86 GGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTT:3 - chr3L 11844801 5' + rover 7028 2 73.97 TGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2R 8047366 5' - 1360 3342 1 52.05 GACCTCAGAGTCGAGATCTCGAGGGGCTCTCAAGTTGATGCGCAGAATTTGTGCAATTTAAATTGAAACTCGAGCGGAGGAGTCACTTATTCATGGCGACAGGTGGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCAT:1 + chr3L 12251379 5' - roo 8732 2 76.03 ATTGCGTTAAGTCGAAAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAGCAACGCACGGGTACCCATGCGGCAACT:1 + chr2L 17809166 5' - jockey 4960 1 53.49 AGGAATGGGCGATTTGATACCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTG:1 - chr3R 10970394 5' + G-element 7 1 74.66 TGAATCGAATTAATTGCCTGATCAACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGACGATGAT:1 - chr3R 15790135 5' + flea 4719 1 75.17 GTATGAGAGTGTGCATGATATTCTCTCGTCAATCGTATCTGAAAATTATCGAATATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGG:1 - chr3L 8470104 5' - G2 335 1 61.15 TTTGAGTTTTCAAACAATTTGTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTT:1 + chrX 2479458 5' - mdg3 215 2 57.53 CATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATA:1 + chr3R 24381315 5' + Juan 4180 1 65.07 GTATACTTTTTTACGTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chrX 17717000 5' + FB 60 1 57.53 TTGTCACTTCTTATAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGA:1 - chr3L 22035609 5' - 1731 4561 1 61.81 CGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 31653190 5' - roo 9036 1 62.76 AAAACCTGGAGTTGGCAGCAATCTAAGATTTAAAATAACTGAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACAGGTAGAA:1 - chr2R 12989058 5' + INE-1 23 1 39.73 ATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCA:1 + chr3L 27356088 5' - Tc3 1629 1 71.23 AATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGT:1 - chr3L 16470379 5' + jockey 4719 1 53.79 CTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3L 5532945 5' - roo 9000 2 72.86 GAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - chr3R 3320504 5' + 1360 67 1 77.50 GTGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 + chr3R 12242232 5' + transib2 38 1 59.59 CGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAAGTGGGCGTGCCCC:1 - chr2L 16946108 5' + hopper 110 1 63.01 CTTGTTCTCGTCTTTTGCTTTCTATTGTAGTACACTGCGCGAAACGGGGGCACTATATATTTTCAAGTGATATAAGACCAAACTGATGAGAGGCAACTAGTGCGGTATCCCAAAGGCAGAGCCAAATAAATAATAATAAAAAAACA:1 - chrX 6511320 5' + Tc1-2 481 2 71.23 TGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:3 - chr3L 16470355 5' + jockey 4744 1 66.44 AAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr3R 13406405 5' - pogo 2048 1 57.53 ATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:2 + chr3L 9269909 5' - copia 204 2 73.29 ATCGTTTTTGATCCCCAAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 24219238 5' + roo 22 2 68.84 ATAAGGAAGATCATCGCAACTGGAGAGCTTTGAATAGTCCAACTCCCGGCCGCAAGTACTCCAACCAGATCCGACTGCCCTCTCAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGA:1 + chr3L 9614713 5' + S-element 395 1 58.22 GTAGATTATTTGCCTCTCATTTCTTCAAAGTTATATTCAAAACATTTACATTTAGACCTCCTTTTAGCTTTTTTCTCTCTTATTAGTTGTTTTTTTTTTTATTTATTTTATTT:1 + chr2L 5512497 5' - X-element 4719 1 47.79 ACGAACCTCACAGGGAGGTTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2R 5480001 5' + F-element 44 1 60.48 TATCAAGATCACATTGACAATGCGTCAAATAAGAAGAAATCTTACTAGTCAAAGCTTGAATATTTTTTATTTTATTCATTAATGCAACAAGAACAACAACAAAAATGAAAAAAGGATACATATATATAAAAAAAAAACAGAAAAAA:1 - chrX 8647778 5' + HMS-Beagle2 482 2 73.97 AACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATT:1 + chr3L 20189600 5' - FB 204 1 50.00 GCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTATTT:1 - chr2L 14074528 5' + 297 52 2 69.23 TCTCGGTTGTGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 4063782 5' - roo 401 1 80.14 ATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACCTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chrX 12129331 5' + flea 4774 2 57.14 AGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 19054237 5' + jockey 57 1 51.03 AATGAGTGCAATAAGAAGTTCAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chrX 16946660 5' + FB 39 1 75.28 AATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1 + chr2R 9158070 5' - mdg3 159 2 73.29 TGATCGATACATGATAATGATGTTTAGCACTTAAGTTTTAGTTGTAACCATATACCATAATATTTTTCATTGATATCCGCCTTGGCAACAACAAATGCAAAATCAAAAGGAAACATATACAAAACAAAACAAAAAAAAATAAATAA:1 - chrX 12684297 5' - Tc3 87 2 67.81 ATAAGAGGATCAAATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATT:1 + chr3L 22531934 5' - Cr1a 4211 1 61.64 CCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTACATGCTCTATGCATAACCTTAATACCTGTCAGGTAGATC:1 + chr2L 10261460 5' - G4 3708 1 79.45 TTACTTTTTGTTCGATGTGTCGAAAACGGCAAGCGGTTGAGTTGATTCAAGAGAACCCCATCTACAGCCTCGTATCTAATCGCATATAAGAGTAGTGACCAAGGTTTGTTAACAATCAGTCATTAAATACCCAAAAAACAATTAAA:1 + chr3L 12598211 5' + Bari2 915 1 50.00 CTCAACATTTTGTAATATTAAAACCTGCGGTCAGGTCTGCAACTGAATGTGAATCTGGTAGTGGTATTGGTACTGGGCGTGGTTGCAACAGTTGCATCAGTTGCATCAGAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATAC:1 - chr3L 18276455 5' + I-element 5162 1 65.75 CACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr2L 12818297 5' + hobo 56 1 75.47 GTTAACNTTTAGTTTAGATAAGACATGCACACTCTAGAAAGAACGCTGCAAATTTTACAAACCGGCCACTCCTACAATTTTAAGACGCGTGAGGATATACTAGATTGGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 - chr2L 21285180 5' + INE-1 30 1 60.43 GTTTGTTGTGCTACCCTCTCGCTTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chrX 6475266 5' + Doc 14 1 74.40 ACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 + chr3L 9269905 5' - copia 5077 2 70.55 CAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 19073269 5' - roo 351 2 66.14 AACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGGATA:1 + chr2L 16540956 5' + hobo 89 1 84.25 AAAAGCCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAA:1 + chr3R 27843170 5' + I-element 5350 1 65.52 ACGGAAAAGTGTGGGGAAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3R 31886975 5' - hopper 1396 1 71.22 AGCATAGCCATCCCACTGCTCAGCCTCAGNTTCAGATAAATAAGGAACTGAGAACTACTACTGAGAACTACTTCGAACTGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGAACTCTTAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAA:1 - chr4 928042 5' - Cr1a 4047 1 73.57 AATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 11810621 5' + roo 15 2 66.37 CCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3R 30347453 5' + P-element 27 1 63.70 ATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 11810650 5' + roo 77 2 71.23 CAATTAAATAAAATAAGAGGAAATGCAATAAATGTGTCTGTATTATTTTCTTCAAAACTTCACACTGCAATGTATTGTAATGATGAACTGCCGTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chrX 4966762 5' - 412 7497 2 47.26 CGGTGCGGCAACGACTTCCGAGGCGGCAGCTGACGCTTTGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr2R 22903047 5' - hopper 1412 2 41.75 TAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAATAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTA:1 + chr3R 556458 5' - Tc1-2 1540 1 73.29 AATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGGA:1 + chr3L 22890349 5' + FB 34 1 53.23 GACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr2L 16943887 5' - copia 218 2 64.38 ATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 + chrX 6475324 5' + Doc 93 1 77.40 AAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCCCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chrX 8092415 5' - pogo 2035 1 73.33 ACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18281830 5' + Doc 8 1 76.72 CTCAAAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACC:1 + chr3R 23020779 5' - INE-1 572 1 68.31 TGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGG:1 - chr3R 5351487 5' + jockey 4694 1 59.13 GAACAATTGATTCAAATTTTACATATTGCTAAAACCAACAAATGACAAAGGTCGTTGAATAAATAAATATTTATTTTTTAATTCCCTAAGTCTTAATTTTCAAGTATTATGGCATAAAAATAAGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTA:1 - chr3R 20516782 5' + HMS-Beagle2 437 1 69.86 ACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 + chr3R 27405938 5' + diver 5922 2 61.64 GACATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 - chr3R 23491958 5' + transib2 61 1 57.53 GCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chrX 8092482 5' + pogo 60 1 65.47 CAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTG:1 + chr2L 15550686 5' + Bari1 65 1 70.16 AAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTA:1 - chrX 17343452 5' - I-element 5271 1 78.08 CAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAAAGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAA:1 - chr2L 14523251 5' + HMS-Beagle2 6936 2 53.42 TTAACTTATTTGTATTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chrX 1341767 5' + 412 7080 2 67.12 GCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr2L 71161 5' - 412 7494 2 49.32 AATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTATGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATA:1 - chr2R 1916452 5' + Juan 59 1 50.68 AGGAGGTGGCGTAGGCGGGGTCGTCGGAGGCGTAGAGTGCATTGGGGCGTGATCATTTCGGAACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGCGATTTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAA:1 + chr2R 25096245 5' - HB 168 1 65.75 GTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr3L 16662364 5' - jockey 4947 1 51.37 ATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGGATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTG:1 - chr2R 6482538 5' + gypsy 7027 2 48.46 AAAAGCATATTAATAAGGCCTGAAAAACTTATTATGAGTGATCAAAAAATAGATAAAGTTTATTTACTAATAACGTTACACTATAAAAATTTGTCAGGAAAGGTAACTTGATTATTATCACTATCATTTCATTTAGTTTAATAATT:1 + chr3L 7949348 5' - S-element 385 1 58.90 GAAGCGAAACGCAATTAAAATTAATGGAATCAGTGGAAATTTATACAGTGGGGCTAGGGGGAAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGGGAAGTAATAACG:1 - chr2L 1606231 5' - McClintock 6121 2 55.24 ATTCTCACACTTACAAATCCATGCTCATTTTCTTGCGGTCGTAGTGTAGTGGGTATTTAACAGCCGACTCACTTGTTTCTTATTTTATACAAGGCAAGTGAAAACTCTACAGTCGAGTCTCTCGACTCTCAGATACCCGTTTCTCA:1 - chr2L 21791597 5' - INE-1 548 1 69.18 CAAAATGCAAAAGTATAACAAACACATGGAAGTCGACGTCCCAGACCGCCAGCGAACACTGAGTACAGTAAACACACAGCGAACGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCG:1 + chr2L 8782815 5' - roo 17 2 66.41 TAATAAGAAACATATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - 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chr2R 10418564 5' + 1360 3082 1 57.86 ATTGTTCAATTCAAGTTTTAGGTAATGCCTCTTGGTTACATTCTTGATTTTGCAGTTAGTAAAACATTTGTTACACCTTCTTTCCTTTAGAAGCGTTTCCGATCGTATAAAGTATATATATTTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAG:1 - chr3L 20098380 5' + INE-1 90 1 66.21 AAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:1 - chr3L 17940169 5' - 1360 3303 1 79.31 ACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAA:1 + chr3R 907896 5' + gypsy11 357 2 34.72 CTTTATATTGGAACAGGTGAAATAAGATATTGGTAAGCAAGTTAGCGTGCAGTCACAGCAACGGGCAAGCATTTATAGATAATTAAGGGAAATACGTTAAAAATGTTATGCCTATATATATGTAGTTGTACAAATTTTGTTTCAAC:1 - chrX 16815534 5' + flea 417 1 47.26 TATCTGGGGTGCGATGGGGCAACAGCAAAAGGCTTTTAATTGATAGATCAATATCACGATGATTGGTTTTGTGCGTAGCATATGGCGAGCGAGGCCTATCGCAATATTTTTTTCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGGAG:1 - chr3L 11530678 5' - roo 8821 2 78.77 AAGAGCCACCAAAAAGTAGTTCCCTATTGGCCCTCTATCTCGTTTTCTCTCTCTCTCGCTTCTCTCCACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr2L 16690557 5' - P-element 2855 1 47.62 GAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAAT:1 + chr2L 11257009 5' - rover 288 2 60.00 ATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCC:1 + chr2L 23295811 5' - micropia 5435 2 51.79 CTCAAGTTTAAAATCATCACTGTCGCCAAAGTGGGGGGTGATGTATTGTAGATCTCTGGATGTGAGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTTCAGAAATTCCTTCTTTGTTTTCATCTTCCGATGAAATTGTAAT:1 + chrX 1799107 5' + invader4 47 2 46.58 CAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3L 16437274 5' + F-element 44 1 48.61 AAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 3983932 5' - P-element 2861 1 68.49 AATGTTNTACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chrX 14450368 5' - hopper 1381 1 58.90 GGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGACAAAATTATTTTCACAAAGGGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGATGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 + chr2L 15550655 5' + Bari1 56 1 49.32 TAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTTCAGAAACGAC:1 + chr3R 4860424 5' - Transpac 256 2 54.79 GTAGAGTGCACTTGTAAATGTGATTCAAAACGTAATTTCATCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGGTCAATTTGCTGTAAGATT:1 - chrX 11060393 5' + GATE 401 1 44.60 GCGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1 - chr2L 4123983 5' - transib2 2794 1 62.33 AAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr3R 20441344 5' + I-element 39 1 57.24 AATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATA:1 - chr2R 5321227 5' - INE-1 503 1 62.86 GGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCAATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTG:1 + chr3L 3501743 5' + Bari1 90 1 78.77 GACACTGTCGGTAATTTTCAATACGGGACTTAGAATTGGAGTTTACGACGAAAGACATTATTAGATTTACGACTTGACTTGTAATTAATACCCGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTC:1 + chr2R 4852618 5' - accord 7359 2 79.17 TGATAAGGAAGTAATAATAACTATCATAAAATGAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCG:1 + chr3R 7819136 5' - invader3 5382 2 62.04 AAAGCACAAATAATTAAAAGTAAAATAGTGATAAGTTAAAAATAAAACAAGTAAAAGTGTTTGAAGAGATTGACAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTT:1 - chr3L 27287373 5' - FB 7 1 76.92 ATTTATTACCTGCGCACACTTATGTTTCGTTTTATGGGTTTTTCCTTCTATCATCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATCTAGAGGAGCCGATATATGA:1 + chr3R 23429801 5' + Bica 4883 1 60.96 ACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2R 13168645 5' - P-element 2829 1 46.58 ATATAAAAAAAATGGAAGCCAAAAGACGAGGAAGCAGCTAGCAAGCAAATATTGAGCGAAAAGGCAGCAACAATAAAATCGGGCCAATTCAAAATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAAATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCT:1 + chr3L 4001377 5' - P-element 2462 1 56.85 ATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATA:1 + chr3L 19454925 5' + mdg1 7099 2 57.53 TCTTGGCCTACTATCCCATTAATGACTTTCTTATCACTCGACAGCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACT:1 + chr3R 19498597 5' + jockey 4842 1 72.60 GACTTATCCTTGTTCACCGGCTCTGTTTGTTCTTCCTTTTTCTGTTCACCAGACTGCGAGGATGCACTTCTTTTTTGCTGCTTTTTTTTTAACAGTTTCGTTGACTGTTCCTATGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAA:1 - chr3R 5792157 5' - Porto1 4378 1 53.42 TGGGTTGAAGTAACATTTTCACAAGCCCTCGAAATTGCTTCCTCATTTTCCAGCACTTGACAAAAGAGAGTGAAATGGTTTTTCGATTTTTTTATGTGTGCTCCAAAAGAGCGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACA:1 + chr2L 20986144 5' + micropia 5440 2 76.03 AAATGTTTTTGATGGTTTTATCTGCCGGTGTCATAGATTCAAGTGCGAATCAGAGGATAGACTATCGCAGATACACCCGATCCCCCCCCAGCTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTT:1 - chr3L 4087508 5' - Juan 3878 1 58.90 TTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATTAACATGCACTCCAGC:1 - chrX 23108327 5' + BS3 1462 1 57.04 ATTTATAAAATCAAAAAAAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAACGAGAGTATAATTAAATAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGGCAATTTTGGCCGTCACTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chr2R 19863835 5' + 1360 3376 1 58.22 AGATAATCGGATTTGTAGGAAAATTCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 14051879 5' + roo 33 2 60.27 ACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGC:2 + chrX 10521658 5' + Tabor 90 2 76.71 ATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACG:2 - chr3R 10970372 5' + G-element 29 1 60.96 AAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr2R 8047269 5' + 1360 65 1 68.66 TTCTTCATATAATTATTAAGTTGGTTAATATGTGCACGATGCATGGTAAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGGGTAAGGCTGGGCTGGCTAACGA:1 - chr3R 7141859 5' + HB 1307 1 72.36 AAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 11191364 5' - roo 9041 1 61.38 AAAACATCTGATTATATAAGAATGTATACATAAATCCGAAGTTGTAGATGTATAATTATTATTTTTTTATTTAGTTTTCTATTCTTAACATTTTGAAAAGAGCTTGAATGTATGTTT:1 - chr3L 13705678 5' + P-element 2469 1 41.03 GGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 + chr2R 7090666 5' - I-element 5265 1 78.62 CAATTCACTTTCAATTTTATTTACTACACTATAATAATACCACGCTGTTAACAGTTAGCTGGTGAGGTGTGCTCTATGAATGATAATTCTTTAGAGGACCGTCACGTTCTCTGCGGAATCCACAATTTAAACAAGAGAGAATGCTA:1 + chr3L 19465565 5' - INE-1 585 1 76.71 CCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3R 15072530 5' + pogo 32 1 61.64 ATAATCCACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 17809302 5' + jockey 31 1 67.81 GTAATTGAAAGATGATTAGTTTACGACTTAGGAACTAGTTAAGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGG:1 + chrX 2409558 5' - G2 145 1 67.69 GGGGGCCTTGGTGATCGTCTCGCCGTCTGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 + chr3L 18402956 5' + P-element 17 1 65.77 ACGTGGTAAAGCAGTAACTTCGAAAATATTTTTTTTTTAGATCTTAATCAATTTAAGCTTGCCTATTTATTTATATTTGGTGGCTCCCCACCAATTTCACACGACATGAAAGAGCCCAATAATTTATTCGCTGGGTTGG:1 + chr3L 5249665 5' - F-element 4538 1 73.38 CTCTTGTGGCCTCAAAGTTTTTAATTACGAAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:2 + chrX 19539744 5' - pogo 2097 1 47.95 ATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr3L 22890333 5' + FB 32 1 59.42 GTTAGATCTGAGAAAGGGGAATAAAATGTGAAAAAAAAAACAAGAAAAAATGCTGTAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACC:1 - chrX 182181 5' - INE-1 557 1 78.31 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAATAAGAAGAAGCAAGAATTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTC:2 - chr2L 22211545 5' + INE-1 134 1 73.97 AATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3R 17421321 5' - pogo 2058 1 53.42 CAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chrX 10319710 5' - mdg1 7413 2 52.99 AATGAAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAATAACTTATGGTCTAAAAAAAATATTTTTAAAATGTAGTAA:1 + chr4 300252 5' - Transib5 2722 1 71.72 GGTGTGGTGCTACACTGGAAATAATTGTATTGAAAAGAGATCTATACACCCATGTGATGCGCATATTTCTGGATTTACATTGAACTTTTCTTTAAACGACGTGTAAATATTACACATTTGAAACCTTAAAATTATAATAAATAAAA:1 + chr3R 13135782 5' - INE-1 424 1 63.70 AGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 + chr2R 18258778 5' - Juan 4159 1 52.74 AAAAAAATTTTGGGGAAACTTGTGTTTGACTTGCAGCTGTCATTGGCAATAAAAATAATAACACCCATCGATTGCTCGAAAGTAACAAACGCAACAGCAATCAAACATTTTCGCTGCGTCGGTTTCTTTTTCATTTTTTTTTTAT:1 - chr2L 18432120 5' - Doc2-element 231 1 73.79 ATTAATTTTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTTACGGTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTATCTTTTTATCTTTGCTGGTGGATGTATTTAACTTTGCTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr3L 22748016 5' - HeT-A 6061 2 55.48 CATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2L 18226780 5' - roo 9005 2 65.52 ATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGGTAAGCTTTAG:1 - chr2R 6964849 5' + Burdock 87 2 76.71 TTGTAATTTTCCCTAATTTGTTTCTTGTTTCCAAGTTAATATTGATTTCCAGTGCTAAAAACTTCGGCATTGGCCATAATTAACGGATACCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACC:1 - chr3L 17776583 5' - roo 8892 2 59.59 GAAAACCTTTCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 - chr2L 7593173 5' + jockey 4700 1 67.12 AGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 9002916 5' - roo 345 2 60.14 AAGAGTTTTAGAATTGGGCCATGAAGGACATCCTGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTA:1 - chr2L 22738399 5' - F-element 178 1 73.97 TATTAATTAATTATTTTGTTTATACAGCTGTGATAATGGATACTACAGGAGATCGTGCGGCAAGAAATTTCAGATAAGTGACGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATT:1 + chrX 498048 5' - TAHRE 10388 1 43.84 AAACAATTTTTATGTTAAAAGCAAGAACAGCTACTACATAAGAACAATAGTATTTGTAAATCTAAAATATGCATTAACTATAATGTAAATATAACATAATAAATTAAGAATTGGCAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGATG:1 - chr3L 16535816 5' - Idefix 7058 2 75.86 TTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2L 15940343 5' - pogo 2061 1 57.53 TATATAAAATATCTTATTATATACACTAAGCAAAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAAA:2 + chr2R 11445125 5' + I-element 4912 1 76.71 AGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGA:1 - chr3R 30987563 5' + F-element 120 1 64.41 ATCAACAGCCAGCCAGCTGGCATAATGAAAGAGCTGCGAAAAACCAGCGACAGCTTGTTGACAATGTAAATAATGTGACAAAGGGGGCGGTGAAGAATGGAGCATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 - chrX 4808655 5' + mdg3 5264 1 77.70 TTAAGACTAAACGTTCACGTTCATTTAATTTCTTATAATATAAATATATGTTTAATAGATATAAATAATTAAATATCAAATACATACTATTTCCTTTTAAGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 - chr3R 7417523 5' + invader4 34 2 73.97 CTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1 - chr3R 16518971 5' - Tirant 8436 2 67.86 AGCGCAAAAAAGAATTAGTGGCAGCTTCCTTTATTATTTATGTACGGGCGCTAATATAACTATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTTGGTTTTTG:1 - chr3L 23320152 5' - roo 388 2 57.01 CTGCAGAAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3R 15790791 5' + roo 8673 2 69.86 TTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:2 - chr3L 6447102 5' - transib2 2741 1 74.66 GGATATGTGATTAGGGGACCCGGTCCCCTATTATACCCATTGCGCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAATTATATTTCGTTCGTATTTCCACTACCTGCGTAACGGGTATTTGATAGTC:2 + chrX 22957860 5' + INE-1 549 1 43.84 AAATATAAAAAAATATCTTAATATTCACTTTATTGTACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCG:1 + chr2R 4750340 5' - 1360 3310 1 76.03 AATTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr3R 4679404 5' + hopper 13 1 75.00 TATTGACCTCAATTGCTGTGACAGAAATAGCAAAAAAATAAAATTGATTATATGTTTATTTGCATACCCGTTCGTTAAAAAGTATGTACCAAGAGAGGGTAGCGTTTTCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 - chr4 921911 5' + INE-1 82 1 52.74 CATCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 4805699 5' + 1360 53 1 60.15 AAAATTGAATGCTTTTGCACTTGCCTTTGCGGTCACAAAACAGCACTAAGAGAACTGAGAAAAATGCAGCAAAACTCCGTTATATTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTTGTTGACTTTGCTTGTGAAA:1 - chr3L 10993375 5' + S-element 336 1 57.53 AAAAACAAACACAACAAAATTAGATTTTTTAAAAATTGTTCGATATTATTTATAACTTTATTAGTACCCCCCCAATATTTCGCGTTTGCATTCCCAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAAATCGACTATAGCATTC:1 + chr3L 19424945 5' + INE-1 571 1 52.05 AAATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 + chrX 10537805 5' + I-element 12 1 75.34 CTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAATT:1 + chr3L 17940044 5' + 1360 21 1 55.17 GATTAAAAAGCATTTATAAACAATTTACAAAAATTGTGTATACAATTGCAATTAATTAATAAGCACAAAGAGGGGAGTGAGCAAAACAGAAAGACAAAATATGCGAGAGTTAGTTTCTTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAA:1 - chr3R 11357243 5' - Cr1a 149 1 58.22 ATCGTGGTTTACTTTTAGTTCGAAGAGTGCACTCAGAAAAGTAATTTAATTAAATTATGATTCGATAGGGAAAAAATAATAATATATGTAACAGCGAGAAAGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTA:1 - chr3L 8072966 5' + 17.6 425 2 58.90 TTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 - chr2R 21410998 5' + Burdock 6156 2 69.63 TTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr3L 23906356 5' - 1360 3349 1 58.22 ATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 - chr3L 16470370 5' + jockey 4729 1 56.16 GAGCACTTTCCTCTTTTACCCTTTATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr2R 3563209 5' + Transpac 41 2 56.16 ACAGACTGCAAAACAACTGAATCTAATATGCATTTTAAATAATAAAAATGGATCATTTACATACATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCA:1 + chr3L 27129533 5' - 1360 276 1 61.64 AGTTACCTAATCATCATAATGGAATTAAAAAGAAAAAATCCTTACAATAACCCATAACCCAACGAACCTTCTTATACCAACAAATCAACAAAGAGCGCAAGTTACCGACCCATCGGTACCA:1 - chr2L 17600226 5' + ZAM 1 2 55.37 GATCAGGGGAATATAGGCCCTCTCCCTGTTGTTTAGCAATTTGCAGTATATGGTCTAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTAT:1 - chr3L 15339582 5' + G4 3724 1 41.10 ATAGAGAACACAGCTCGAACAAGACAATTAACCCAAATAAATGGTAGTAGCGCGTGTTATCTGAAGAAATGCGGCTGCATTGAAATTGCGCTTCGATCTGCACAAACCATAACCGCACATTTTGCTTCCAAAATGGCGGTAGCTTG:1 + chrX 17595542 5' - Chimpo 347 1 77.40 CAAAGCGCAAAGAATTGTTACCAAATTTGGGAATGGCAAATATTCAGAGTGGATTTCTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTTTATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCAT:1 + chr2L 13585663 5' + Idefix 13 2 74.66 GGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2R 13766221 5' - roo 327 2 73.97 ACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTAT:1 - chr2R 5303161 5' - FB 205 1 51.37 AGTTAATAAGGGCTGTGATTACCCCGAGCTGGGAGAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr2R 24296191 5' - F-element 4384 1 78.77 AATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAATA:1 + chr3L 27356100 5' - 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roo 333 2 69.86 ATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:2 - chr2R 13168706 5' + P-element 101 1 18.49 ATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 + chr3L 19454915 5' + mdg1 7088 2 51.03 AGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCCGTCAAA:1 + chrX 18742813 5' - invader4 254 2 71.23 GCATCGTTGAAAGGCAGGGCAGTTAAGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGAT:1 + chrX 12301582 5' - gtwin 355 2 78.69 TATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAAGTACATATGTATGTATTACTTTTGACCAGTATCAAAAGCAGAGTCGATCTACCTATGTCCGTATGAGCGTTGAGATCTATAGGAACTATAAAATCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 6219127 5' + INE-1 159 1 59.85 AAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 15790864 5' + roo 8724 2 70.16 AAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 9809254 5' + 412 68 2 65.07 ACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCA:1 + chr3R 15942720 5' + hopper 81 1 71.23 AAAATAATAATCAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr2R 14653122 5' + 297 6596 2 60.27 ATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chr2R 21116492 5' - mdg1 7386 2 70.55 GGAAGTAGATTCAATTTATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCG:1 - chrX 1799262 5' - invader4 3062 2 69.86 GTTGTCTGTCAAGTGTTGACCTCGGTGGTAATCGTTCTATTATTAACAGATATTTGGATGCGTTGCAAGTCGCTTTAGGTTTCTAATGGACAATTTCTGTTTTTACAACT:1 + chr3R 4350871 5' - Doc4-element 2745 1 53.64 CCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 21299292 5' - roo 9017 2 58.22 ATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:2 + chr3R 14980289 5' - roo 9030 1 56.85 ATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr2R 15375352 5' + 1360 62 1 55.74 GAGAAGACAAGAAGAAAATGTGGCACAAGGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 + chr3L 16690854 5' - 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I-element 5342 1 48.63 GGATTATGACAGTCGGGTTAACATAGCTAGGAACATAGAATGAAAACAACTCTGATAAATATTATTGTTAGTAGGATCTAATTATGGATTAAAAAAAGTTAAAATCTCTTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAA:2 - chr3L 22938094 5' - Cr1a 4227 1 66.44 TACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCCAAAAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 19449993 5' - roo 9006 2 80.95 AGTTACGCATGCCTAAAGGACAATGCTGAAATTATCAGGCAACACAGAAAAGGAACGTGGAGCAATAAAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACATCTGACAA:1 + chr3L 22387917 5' - Bari1 207 1 52.74 CCCATTGGACTTTGGATTGCTGTGAGTTCGCAAAAATGCTCGAAGGGCTTAAGTAATGACGGAAACTTTAGGAATTTATGGAAAGAGGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCACACTGATTTTGAACT:2 - chr3L 7428620 5' + Tirant 269 2 60.96 AATCAGGAGCCACTCAAGCGACGCACCCACGCAGGCAAAAGGGATCCCAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr2L 8338109 5' + P-element 59 1 45.89 CAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3L 23906337 5' - 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chrX 5323158 5' - Juan 4187 1 32.88 CTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGCTT:1 + chr2L 13556337 5' - transib2 2765 1 57.53 AAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 24219254 5' + roo 8710 2 52.05 ATATTTCAGACAACTCTAGGTGGGCGGTGCAAGAAAAAGCCAAACGGAAGCAAGGCATCTTCAATATGTTAAAAAAGTCATAATTTATGTGGGATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATC:1 + chrX 839580 5' - I-element 5136 1 66.19 TATGCCAACTCGGGGAATTTAAGTTATAGTTATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 15325234 5' + 297 6591 2 76.71 GAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:4 - chr3L 10731885 5' + 297 6630 2 54.79 ACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - 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chr2L 19338945 5' + F-element 4493 1 62.96 TATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chrX 19054254 5' + jockey 71 1 61.97 CCAGTCGCATTGGTTTCAGTGCATTATGACTTTCATTTCGAGTTGGGGGTTTTTAAGCTAAAAAGCACATGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAG:1 - chr2R 11863949 5' - Stalker 7070 4 61.64 CAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 - chr3L 3501870 5' - Bari1 1699 1 73.29 ATCCGAAGTGCTCAATTATTGGCGCTTTAAATCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 16970463 5' + roo 8707 2 57.36 TTTAAACATCTGTGAAATTGTTAAGTTTAATTTTTGTCGAATCTTGATTTTCGTTTCATATTTTTATAATTAAAATATAATAAATATAGTTTTCATTATTTTTAATGTTTTTAAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 - chr2R 19399593 5' - 1360 3209 1 78.77 AAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCGATT:1 + chr3R 22686599 5' - Cr1a 4391 1 62.18 GGTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr3R 4805709 5' + 1360 56 1 56.85 GCGGTTTCAGTGCATTATGTGCACATATGTACATACAAACATATATGACAATTATATGAAAGTCATTTGCTTTCAAATAATTATGAACAAGGAAAAGATTCACTCTGAAGTTCGGCTGACATCACGACTTTATTCTTTGGATCTCA:1 - chr3L 11272162 5' - 297 292 2 74.66 ACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 20167684 5' + roo 8718 2 57.24 ATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chr3R 11062843 5' - roo 9021 2 50.00 GTCCGTCAGTCTGTCTGTCCTTTCGTATAATTCAGGAACCACAAGAGTGGAAGTTATAAACAAAATCGAAATCGCTTTACTTGCATTGCAGTGCATTTCTTCAACTTCACTGCACTTCCATCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGAT:1 - chr2L 20935327 5' + INE-1 545 1 53.79 CGTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGT:1 - 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BS 5049 1 50.34 AATGCGTCATAGCCTGGTATAATTTGAATAATTCTGCTTAAATTTATTATTAGCTCTGTTTCAGCGGTCATATTATATTATACTAGTCGGAAATTCACACACATTAAAAATAACAAAAAAAAAGATACAAAA:1 - chr2L 18516319 5' + gypsy7 5003 1 71.21 ACAATCAGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 17077114 5' - roo 330 2 72.60 GGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr2R 22034642 5' - copia 205 2 55.24 GATACAAACATAAGTGAATAAATATTTGAAATAAAAACTATGATAAGTGAAACAAGTTTAAATAAACAAACTTTTTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGAT:1 + chr2R 2603005 5' + diver2 383 1 60.27 ATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr3L 18403067 5' - P-element 2831 1 47.59 GTATGTATGTTTTTATCTTTATATTGTAAAGGTATGTGAATGTTTGTACATATGTATGTTGAATCTCAATCTCCCGAGAACCGGAGATCTCGACGTTCATACGGACG:1 - 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chrX 19042274 5' - hopper2 1204 2 51.85 ACTGAAAAGGAACATAGATGGATCGGGGGGTTTTTTTTCGAGGGAATTCAGAACAACTCTAACGCCCACAAACCGCTCAGAACAGCCACGACCACACATATGCGAAATGTTGTGATATTTTTTATGTTTTTATTTGTTTTTTTTT:1 + chr3R 22263023 5' + Circe 421 4 59.31 CAGGGTATACAAACAGTCTGTTGCCTAACAAATGATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTCTTTTTTTGGTTTTGATTCCGCATTTTGATTGCGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGAT:1 - chr2L 15736371 5' - Porto1 4307 1 76.71 GAGCTATTTCTATGGTAATGGACGCAATTTATTAGCTTATTGACTTATATTTGCTTAAGCAGTGGAATCTAATCATGATATTGAGGCTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACA:1 - chrX 21511925 5' - pogo 1836 1 61.64 AAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr2R 14653146 5' + 297 6619 2 51.03 CAAAGCAAATGGATGGCACCGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 + chr2L 4713840 5' - transib2 2782 1 56.85 GGGACCAACTGAGTTGCCTTTTAAGGATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTT:1 - chr3L 18768631 5' + S-element 61 1 61.64 CGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:2 - chr2L 4123982 5' - transib2 2793 1 61.64 AGGCGGTAGGATACCGAAAAGAAAGTACTAGTAAGTCCGTATTCCTTTCAATATCAAGTGAAAAGGTAAAACGAAATATTATCAATAAAAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTCTTTAGTTTT:1 + chr2R 4134136 5' - FB 945 3 68.57 ATTTTTATTAGTTTCGTTTCAAAAAACCCATTGAATAAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 21505630 5' + roo 48 2 54.79 GCTAATCAAAAGATAGGCTCCTTAAAAATCAAGTATTTCTTGCTCGTCTTGTTGCTTAAATAACAATGTTAATTTAAATATTATATGGTGAAACAAATTTATAAAATTATGAAAAAAAGCTTTTATAGTTCCTGAAATCTCGACTT:1 - chr2L 9540349 5' - INE-1 143 1 67.12 TTAACAGCAGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACAG:1 + chr3R 22642231 5' + blood 7021 2 77.40 TTCATGAAATCTTTTACAATTGACAAACAGAAGGATCTAGAGCTGGGGGATTAATTTGACAGAAGGGGGAAAAAAAAACAGTCCGAGAGGAAGCAAATATTTTCGGAAAGAGACAGTTCTAGAAGAGGGGGAAAAA:1 - chr3L 3596323 5' - Gypsy12A_LTR 2023 1 68.38 AGTGAAATTTGCAACTAGAAACGGCTTCCGTATTACGGCGTTTTGTGAATTATGTGAGAAATTTGTTTGTGGGCTAAATAGTTTTCATGATTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAACTTTATTGTT:1 - chr3L 7580891 5' - transib2 2654 1 67.81 TCTTTTGCCATTATAAGTTTAAACATGCTCAAACCCTTTTGCATACCAAAATTCACAAGTGAAACCCAATCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGGGGTTGGGACCCATATCGCGGGGAGAGCCTTCATG:1 + chr3L 18996373 5' + R1A1-element 5026 1 54.55 AATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGGTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTCAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr2L 4003805 5' - mdg1 383 2 55.56 CCGACACTCAATCCCGACCTAAGCCCAATTTTTTGTTGCGTGAAGTTGACGAAGTGTGTTGTACTGCTGCAAGTGCAAGTCCCCGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAAATTGTCACAGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAG:1 - chrX 18726384 5' - Doc3-element 442 1 62.76 ACACGATATCTTCAGGGATCTAACCAGCACAGAAGTGCTGGTTGACGACATAATAATCCCTGCAGAAATAAAAAAACATAGAGCGTAAAATCTAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGAGAGCCGTTACT:1 - chr2R 4377453 5' - INE-1 550 1 52.41 TAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 11191392 5' - roo 347 2 62.33 ATTTTTATATTATTTTGACTTAGTTCCCATAAATTGTAAGATACTTCAGAGGCAAGGGTCCTAAAGCTCTCTTCGGTTTTTACTTGGACCTTAATTTCGTGGATGCTGCCCTTTTTTTTGTATTATGTGGAAGTTGTCTTTTC:1 - chr3R 22180119 5' - Fw3 48 1 64.34 AAAATGGTATTGGGAAATAAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 - chrX 17343523 5' - I-element 5342 1 69.86 AGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTA:2 + chr2L 19817842 5' - G4 3761 1 71.92 TCCTATATAAAGCCCAATATAAAGTTTTCAATAAGTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGG:1 + chrX 19050425 5' + hopper 433 1 76.03 TCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 - chr2R 7090702 5' + I-element 86 1 73.97 TGTCATATTAACCGATTTTGTAGCAGTTAAAATCAAACTAGCTGTATTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCA:1 - chrX 14604329 5' - Juan 298 1 68.49 AGATTAAAGGATACAATTTTTGTGCAATGTTGCTGGATATCTGTGCTCTGAATCTCAACCTTTTAGCCTTTAGAGTTACAATATGGTTATAGGTACAATCTTACAAGCAGATCGACTCGGCTCTTGATCCTGATCAAGAATATATA:1 - chr2L 19809211 5' - INE-1 81 1 72.60 TTTAAAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 8360522 5' + roo 8714 2 55.71 TTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 - chr2R 5479983 5' + F-element 84 1 63.70 CTAGAGCATTGTTGTAACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 28469301 5' - 412 458 2 55.83 GAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 25401033 5' + Doc 36 1 52.05 AATAAAAGAGTAACAAATTTTAATAGGCCCATCGAACGTTCGCATTTGGATCGTGATGGAAAAAGGGGGACCGGAGACATCTATTCATTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACAGCAAATTG:1 - chr2R 25007797 5' - GATE 406 1 60.27 ATTGTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCG:2 - chr3L 15099690 5' + G4 3805 1 58.90 ATATAAATTTTAATTGAATGCCTGTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAA:1 - chr3R 905079 5' - rover 336 2 76.55 ATACTTTTAGGTGGAAGACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATTTGAATCCTCACCACCCCCATGACCTCCCTAACCTGG:1 - chr3R 31264142 5' + jockey 4766 1 71.92 AAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAG:1 - chrX 22840548 5' - copia 5038 2 75.34 CACTTCAGAAGAGAAATTTCATTACACGCAATGAAATCATTAGATCCTTTTGATCCTTGCCCATGCCCAGTAGTAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGAAAAAATGACCAACTGCGTT:1 - chrX 19074665 5' + mdg1 371 2 49.32 ATTTGATTGCACACCATTTGCCACATTTGCCACTATGTGTGTGTGTGTGCGTGTGGGTTCGTGGAAGTCTCACCCCGCTCTCAATTAAGCCTAGAGAACCAAT:1 + chr2L 3424894 5' + G3 4142 1 67.96 GTACGCTCTCTCGCTGTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr2R 22514200 5' - P-element 2833 1 45.00 TTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACT:1 - chr2L 23295916 5' + micropia 23 2 67.12 GGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr3R 9594986 5' - Tirant 354 2 54.79 AAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTAT:2 - chr2R 23780593 5' + Ivk 93 1 70.55 AAATAATAAAAAAACAAAAATTTTTTTATTACATAATTAGACCCTCCTAACACTAATATTTAATATAGTTAAGTTACATTATACTCATTACCTCGTTCCTGTACTCTTTTTTATATCGC:1 - chr3L 7134158 5' + Cr1a 4352 1 72.27 AGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAGGAAT:1 - chr3R 30347408 5' - P-element 2825 1 40.41 TATTCCTATATGCTAAAATGTTTACTTTCTATTTCACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 23287371 5' + 1360 8 2 79.17 AAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTTTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTT:1 - chr2R 4870267 5' + Juan 70 1 56.85 GGTTGGGTGGCTTTGTGGCTCCTTTACCCCAGCCAGCTGCCAAAAAAATAAAGCAACAATAACAGGCCAGGGGCTTTTGTCTGCTTTTCTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 22899845 5' - gypsy11 3933 3 60.38 CGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 - chr3R 9039053 5' - Juan 4189 1 67.12 GATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chrX 190049 5' - INE-1 543 1 57.14 ATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGC:1 - chrX 1799245 5' - invader4 286 2 58.22 TAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 + chr3R 4860428 5' - Transpac 252 2 57.53 TTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGATTATTAATTA:1 - chr3R 4683016 5' - Burdock 222 2 63.01 GATTATAACGGAAATTGATGGCGGTTATTATGGTCATAATTGCGCTGGACTAAAGTGAAAATTCGTGGAGATCCGTGGGGGCAGATATAAGATGGAAAATAAATGTCAAG:1 + chr3L 5244551 5' + transib2 268 1 70.00 AAAAAGAAACCTGTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:2 + chr3R 5523877 5' + FB 32 1 64.38 CTTATAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGC:1 - chr3L 22035600 5' - 1731 4551 1 68.28 AACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCAC:1 + chr4 1294996 5' - TAHRE 10396 1 66.15 TTTTAAGGTATTACCTATTACTAAAAAAAAAAGAAAA:1 - chr2R 13635152 5' - hopper 156 1 89.19 GTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTTGCTGCATCGGCA:1 - chr4 373095 5' + pogo 23 1 68.49 AAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 - chr2L 15936881 5' + copia 4914 2 54.79 AATAATAATAATAATAAATAATCGAAATAAATAAATAAAAAAATAATAAATAAATCGTAATCGAAAGAGACTCCATTGGCAATGTTAAATTG:1 + chr2R 5171817 5' + Doc3-element 116 1 55.43 AAAAATAGAATTTCGAAATGCTATATGTGAAGGATATTTATCTATCTAGTTCCTTTGAAATTTTTAATTTTTACTAAGTGGAATGACTAAAGTTTCTACATGAAATAACTTTGTTAAAAAAAAACTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 4474422 5' - hopper 148 107 76.64 ATCTATTTTTTCGATACCAGCCTATCGTTCAGCAATAGGTGTCCTCATATCGATAGCGATAATAGCAAAGTTAACAATAACAAAAGATATATATAAGAAAGCCGCTCCGCCGGTGGCGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCTTAG:1 + chr3R 29116345 5' + 412 7368 2 59.59 AAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3L 5881587 5' + pogo 58 1 66.41 GTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATT:2 + chr2L 21930797 5' + INE-1 164 1 73.29 AAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 31886956 5' - hopper 1370 1 54.79 AAATTTCATTTTGTTTTTCAATTAGCGGAAACGGAAGTCAATTTGTCAGCTTGGGGCTGTTGTTCTTGTGGTACGAATAGTGTTTCTGCGCCGTTTTATTTTTCATTTTTCTCTTTTGTATTTTGTTTGTTTTTT:1 + chrX 14687103 5' - transib4 2539 1 62.96 AACAAAGTTTGACTTCTCTGGGGACAGAAGCCACTCGAATTGGAGAGTTGCGTGTTCTTTTATTGGGGCAGGTTGATGTGTGGATTATGTGCGCCCGACACGTAGGCGGATGAAGATCGCGCATTCCCGTTTATGTAGG:1 - chr2R 9428365 5' - Ivk 5014 1 54.68 AAACTGCATTTGTCCACTTTGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 - chrX 19038495 5' + hopper 19 1 69.23 ATGAACGTAGTGGACAACTAGCCCATCGACGATTGGAACTGCTTGTGTTTGTAGGTGGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAT:1 - chr3R 29860353 5' + roo 9006 2 60.96 GGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCG:2 + chr2L 16946035 5' + hopper 66 1 61.64 TTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACAGTAGTACCTGCGGGAGCAACCACACAGCAAACTACAGAGGTTTATTCGAATAATCAAAGGGTGCTGAAGGTGGGTTCAGCTAACCCGCACATCCATTGCT:1 - chr3L 24104320 5' - Stalker 7138 4 56.16 ACTTAGGTTTGTGGAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 4964202 5' + roo 54 2 59.59 ATATTTTCTTGCTGACCTAAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2R 22992562 5' + hobo 43 1 52.05 GTAGCTAAATGTAAGATACAAAACCGAAAATGGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATG:1 + chr3R 25364022 5' - Quasimodo 7040 2 74.19 ATTTAGCAAATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 11164550 5' + roo 16 2 74.66 ATTCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCC:1 + chrY 2346866 5' - micropia 450 2 67.42 CATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 - chr2R 5941406 5' + copia 84 2 73.61 TACTTCGAAATGCATATAAAGTTGTAGGAAACTGGAAATTGCATATTTAACGTAGTATATTGATTGGTTATAGGGAAAGAGAGTTGAGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGG:1 - chrX 6651146 5' - Quasimodo 336 2 61.64 AGAACAAACGCACGGAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr2L 15076247 5' + 1360 19 1 72.60 AACCCAGCCCATAAATTCGATATAAGTTAAGCAAAATTATTTGATATAAATGTATGGGCTAACCGTTTCACTTACTAGGAAAAATATTTTCAAATGCCGAGTAACAGCAACATAACAAAAATAATTAATTAATATTTTTATATATT:1 + chr3R 18694048 5' + Tc3 276 1 53.42 AAATATTAGAGCTTATGCAATCCCTGAATCCACCAACAACAGCACCCCCCATCACCCCAACATTGTTATTGTTACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTGTTATTATTATTGTTATTATTA:1 - chr3R 18620165 5' - mdg1 27 2 67.12 GCTTAGCTTGTCTTCATTTTCAATTCTTTTCGTTTTGTTCTTTTGTGGTTATTCTCTCATGTTTTTTTTTACTAACAATTGGCTAGAATCGCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAAAGCCATCGGACA:1 - chrX 6718586 5' + jockey2 3137 1 56.55 ATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACAATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATTAATAAC:1 - chr3R 4679567 5' + hopper 23 1 62.90 CTACACCTTTAAAAGCAAAGGTATCGAGTCCCATAAGCTCTATTTTACTCATCTGTCCTTTAAATTGCTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 + chr3R 6625652 5' - flea 244 2 77.40 AAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:3 - chr3L 12315811 5' - transib2 2751 1 66.44 GTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1 + chrX 19038388 5' - hopper 1334 1 74.66 ATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGAATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCA:1 + chrX 15903168 5' + INE-1 102 1 69.42 GAAACAACGGGACAGGATTGGCACTAAATTACTGGGAAAATGATTTAAATATGAATTTTGAAATAAATATCCAGTTTAGTAAATATTTACATTTTTTGGCTGATATTTAAATATTTACATATTTATTATTATTATTATTATTTTTA:2 + chr2L 4136621 5' - mdg1 42 14 63.70 AAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAAT:3 + chr2R 3338783 5' + Juan 58 1 56.55 GGATGCCAGATGGCCATTTGGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 + chr3R 15807373 5' + FB 65 1 71.43 GGGCCAATTTGTGGACCATCATCAAGTGAGAAATTTCCAATTTCCGAAATGTTCAATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 5390011 5' + roo 10 2 76.60 GCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGAT:1 + chr3L 11844687 5' - rover 314 2 60.96 AATTTGGCACTAACAAACAATGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chr2L 16943915 5' - copia 246 1 55.48 TAAAATTCAAATCGGAGAACAACGATTGTGTGTTACTACTAAAAACAAAATCTTCGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTC:1 - chr3R 18372640 5' + Bari1 3 1 51.37 TATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 10731918 5' + 297 6596 2 69.66 AAAATCGATTGCTTTTGGCCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 + chr3R 8051078 5' + jockey 4768 1 78.26 ATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATATGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chr2L 4123951 5' - transib2 2762 1 60.27 GTAACGACGCTGTCGACAACGCGACTTTCCCATCGATATGGCACGCGCTCAGCTTTCTGTCCCCTAATACCATGAAAGCGTTTAAAAAAAATCACACAAAACCAAAAAGAAAAAAAAAACGAAAGCAAATAAATAAATAAATAAAA:1 + chr3R 7878553 5' + Juan 4215 1 73.29 ATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATAT:1 - chrY 2720371 5' + ZAM 189 2 77.40 TTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:2 - chr2R 3564134 5' - Tabor 415 2 64.38 ATCAGAATTCGAAAATATCACTTGCGCGAGGATCATTTTAAATTGACATCTTAAACCATTTAAAACAAATTTTGAGTTTAGAAGTGCCTCTACCGTTGTTGAATAATTTAGATAGCAACTTAATTATTTAATTGCGAATTCATCTC:2 + chr3L 8085935 5' - invader4 2624 1 77.40 ATGTAGAATTTCTTGCGTTGTTTGATAAGGAAGTAATAATAACTATCATAAAATGAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCAC:1 + chr3R 7819114 5' - invader3 209 2 72.60 ATGCTTTCAATTTAAGTGAAAATATCTAAACGACAACTATGCCATCTTAAAATCCAACCTTAAAAATTTCAGCTTTTTAGGAAAGCTATAAAACGCCATATAGAATTCGAATTTATAATAATATAATAATAATAATAATATTCCTA:1 - chrX 15899308 5' + mdg1 7075 3 74.66 AAACATTCCCGTGGTTATTTCATAGTTCAAATGTGTGTGGCATGGGCAAATAAATAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3R 25428251 5' - 297 6941 2 57.39 CCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chrX 21100270 5' + mdg1 7086 2 53.42 TGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGTTTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2L 4063874 5' - roo 351 2 77.67 AAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCAATTAGTT:1 - chr3L 46991 5' + FB 76 1 67.12 CATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3L 17055461 5' + Tirant 8139 2 68.24 AGTCAGTCGCCGTCATCGACAGTTGCTGACTAAATTCTCAAATTCTCCTGCCCACATCCCATTTCGCCACCGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGAACGAATCATTTC:1 - chr2L 9119766 5' + Doc3-element 4618 1 51.37 GTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 18488457 5' - roo 9001 2 69.18 ACGCCCACTCTAACGCCCACACTTTTCAACAATTTTTTCTCATTTTATTCCCAAATGTCCATATCCCAGAAAAATGATGAAACTTGCTTGTTCGCATACACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 + chr3L 22511716 5' + INE-1 547 1 68.75 AAGTGAAAATCAGGTAAGGCTTTGAGAACTCATCAAGAATAACTTTTGAACCCCAAAAAAACAATCCCACCCAAATTCGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATAGC:1 - chr3L 21739746 5' + I-element 4951 1 57.04 TATGAATGGAGTTAACCAGACAGTTGACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGGTAAACAGTACCACTTCAACCTCTGAAGAGATAAG:1 - chr3R 20441375 5' + I-element 9 1 74.66 ATGTGCAGGTTACAACCACTGCCCCCAAATTGCCACTCTATTCTTCGCCGAGTTCTTTTGTTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 7300097 5' + roo 17 2 73.29 AGATAAAACGTAAATAAATTATAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 10580971 5' + Doc 4699 3 67.57 AAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTT:1 - chrX 14722188 5' + diver 81 2 71.23 GAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1 - chr2L 15936863 5' + copia 4932 2 60.96 ATACTGAGTTCAAGATCAAAGTTTTAGACATTAACCCCTTTACACGTAGAGTAACAGGTAGGGAATCGTTTCCGACCATATAATGTGAATATATATATTTCTGATCAGAATCAATCCGTATGAACGTCGAGATCTCGGGAACTACA:1 + chrX 20930218 5' + INE-1 144 1 72.60 ATTATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 + chr2R 15375349 5' + 1360 83 1 60.96 GTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3R 27160049 5' - 412 458 2 57.78 ATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3R 15325197 5' + 297 6628 2 54.79 TCTTTTAATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3L 5489840 5' + jockey 24 1 66.44 ATTAAGATTGGACTAATCTGCCTAAGAGCGTGTCAAATGCCCTTTCAACGGTTAAGCCATTTAATTTTGGTTTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTG:1 + chr2R 12098992 5' - invader2 182 2 58.22 GCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 7795618 5' - roo 352 2 56.16 ACCACGGCAAAAAGTTGGTGCAATGGATACTAACCATGACGCAACGTTGAAGTCTGCCCTGGAATTAACAATGTATTAATCGCAAACATCTACCAATTGGGGTACAAGAGATACTCACAAAATGACGGCGGCGCGGGAACAAACCA:1 - chr2R 18615485 5' + HeT-A 5592 1 54.79 AAACAAGCTACTAAGTCTTAAGGACAATTTTAAATCTACCTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACG:1 + chr3L 19351811 5' + 1360 3214 1 34.25 AATATACCCATGCATTTCCATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:3 + chr3L 21996113 5' + Transpac 16 2 79.45 GATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2R 14051842 5' + roo 8734 2 73.97 CATTATGCATGGTTTATTCTTCGCTAAGCCGCAACAACGGCGACGAGGAGGGTTTTCAGTTTAGGGTTCGTGTTTGGCATCTATTTTTATGCGACAACGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3R 24450381 5' + 412 7075 2 67.81 TCTTATAAAAATAAATGTGGAACTCCTTGAAGATCAAACTTCGAGCTTATATGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGATAGTATACTTAGCGACTAATGCAATGTAAGCATAATATGAGAAGCATATTATGT:1 - chr2R 4322450 5' - rover 6956 2 64.38 TAGAAGAGTTACATTGAGATAAACGCGTGCGTAATTAGCAATCGAAAAAAAAATGTTTGTTAAAGGTTTTTTTAAGGG:1 - chr3L 22751770 5' - FB 394 1 56.41 CATTAAAGAATTAAGTTGTACTTCTTTTTGGGGAGTCATGTCGAATAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGG:1 - chr3R 21661376 5' - G2 2973 1 65.79 AAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 + chrX 18817299 5' - transib2 2741 1 73.97 CATCACACCACCCAGAACCCATTGAGCATAAAGCACCATCGACATCCAAACGCCCGAGCATTTGGTGCATGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTC:1 + chr2R 20152792 5' - R1A1-element 5037 1 53.85 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCG:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4427 1 77.05 AATTCTCCCCATTCTCACTGGGACGTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATG:1 + chr3L 22760343 5' + F-element 122 1 51.03 AGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:1 + chr3R 27083029 5' - 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roo 9047 1 68.49 GACGTTCTTGCTCTTCCTGGGATTCAATTATTTGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTG:1 + chr2L 16335749 5' - I-element 106 1 77.40 ACCAGAGGAGGTGTTCCGCAAAGTTCTCATTAAGACGATCGTCAGCTGGGCCGAGGAGTCACAGATCGAGAATCCCAAACTGGTGCGCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTTCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAA:1 + chr2R 8875889 5' - R1A1-element 111 1 60.27 TACGAATTTTTGTTTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 24152585 5' + 1360 19 1 77.40 ACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 21224535 5' + roo 8722 2 58.90 ACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAATTTTTTGTGTG:1 - chrX 11661498 5' + pogo 57 1 58.90 TATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 + chr3R 15054200 5' + copia 51 2 56.85 GTAATCATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACT:1 + chr2L 18176998 5' - 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mdg1 7441 2 71.23 AGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGTATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 19450162 5' + roo 52 2 59.02 ATGATCTTTCAATGGCCTTTGCACTCACCTTTTTATATGTAGCTATGTTTAGGTTTCACTCTTTGATAAGTGCTTTAAATGGCTACAAGCGACATTAAGTTTGTATCCCATTTTAATTTTAGAATACAATTTTTTGATGTTTTTGA:3 - chr2R 12990483 5' - TART-B 10248 1 73.97 AGATGCTCATCCACACCAAACACAACACGCTTTTCCCTCTGTTGTCTGCTCGTGTTTTGTAGCTATTTTGTCTGCAATCGACTATAAACTCGTCTCGTAATTGACAAGAAATCTGCGCCGATGAGGTCCCGTGTAAGGCG:1 + chr3R 7194646 5' - Chimpo 3999 1 77.86 ATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATT:1 + chr2L 22121335 5' - I-element 5309 1 67.12 AGATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATTGGCTTCGTTCTTATCTTATGTTAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTTAGGA:1 + chr3R 13300899 5' + roo 8741 2 76.47 TTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGCCTGCACTTAATGAGACGAATCG:1 + chr2R 21410879 5' - Burdock 6319 2 65.52 ATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chr2L 13556311 5' - transib2 2791 1 63.01 TCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3R 28469267 5' - 412 7474 2 84.55 TGGCATTTCGAATTCGCTTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATATCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAAATTCGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGAAAAAA:1 + chr2R 4193305 5' - 1360 3328 1 57.53 TTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 21216706 5' - roo 394 1 65.77 ACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 + chrX 4808492 5' - mdg3 232 2 69.75 AAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - 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INE-1 80 1 43.45 ACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr2L 15779654 5' + hopper 35 1 58.27 AATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chrX 11661365 5' - pogo 2071 1 63.57 GGTAGAGTTACAAAAAAGTAGGTCACAATGTTAGGGTACTTTTGTTTATATATTTGTTCATTGGAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTC:1 - chrX 15073903 5' - invader2 4788 1 56.16 CCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 - chr3R 12115334 5' - 1360 3299 1 77.40 GTTTGGAGAAGAAACAATCCTTTGTAACACTTGGCACTTCCTTCAACTCCTTTCAGCAGAAAGTGCTTCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCC:1 + chr3R 29481411 5' - roo 44 2 53.42 CTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGGGTACATTAAATA:1 - 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Doc2-element 128 1 65.75 AAAATGAGAAAAGGAAAACAGAATGAGGCGAACCAAAAAGTGTAAACAAAGCCAAATAGAATGATAAAATAACTCTAACTCTAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAATAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCC:1 - chr3R 11030733 5' - Cr1a 4251 1 59.59 GGACGTGTCTCCGCATAACTTGGGCATAACAATTTTAATACTTATTATTATTATAAACTAAATAAAAAAATAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATA:1 + chr3L 22760363 5' + F-element 142 1 57.24 CAAGCCTTGTTTCTCTGGTTTCTCGTTTCTCTCCGTGCTTTTTGTTTATAGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGT:1 - chr3R 13864031 5' - F-element 4572 1 73.29 GACTCTCGCACCGCCCTATGTTTTGCAGTTTACGTGTTAAGTGCTTGGCAAGCACGATTAAGGCGCTTTATCACCCGCAACAACGGCAGTGCTTAATTTCAACCTCCTGGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTC:1 - chr2R 19029252 5' - INE-1 148 1 67.42 TTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chr3L 16470340 5' + jockey 4758 1 76.55 AATAATTCAAGAGTGAAACATCATCGGTTGCGGCATTTATAGAATCGCCCCGAATCCGAACGCGCAAACCCAAAAAACAATTTAAGATTTTAAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAAAAGATTCAATAAATAAAAGCAAATAAAA:1 + chr3R 9877238 5' + F-element 4667 2 55.48 TTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAA:1 - chr3R 905021 5' - rover 7236 2 68.84 ATAATGCCTGCAATATATCTTCAAAAAACAAATGCTTTATAAACAAATTGTTTGTATTTTCCACTGACCTAATTGAGATTTTCATTTAAATTTTATTTATGTTAAAACTAGAAACAACTGCTGCAATATAAATAAATATAAAGGGT:2 + chr3L 7860454 5' - 3S18 5804 2 78.08 GAGGTCATTATGGGATCGCACTTCAGAGATCAATCAAATCAAGGCTATAGTGGCAAAAAGTTATAAACAGCGAAAATACACTGTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAA:1 + chr3R 15206028 5' + G2 85 1 58.90 AAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTA:1 - chr3L 17568101 5' + S-element 81 2 73.97 TAAAATACCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTT:2 - chr3L 3501878 5' - Bari1 1707 1 78.77 AAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr3L 2544631 5' + Tirant 50 2 63.56 GGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTT:1 - chr3L 20187427 5' - FB 481 1 52.74 CCACATAATTGACCCACTTAGCTGGAGGCACAGCGATTCCATTTCATTGCTTTTGTGGTTCTGCCAACGTCCATTTGACATGTACCCACTTGACTTGGATATTGGCCATCCGCTGATGCTAAAGTGGGATCTGGGTGAAAAGTGGG:1 + chr3R 29453488 5' - G6 1720 2 77.40 ATTTACTGTGATTGCAGCAGCTATAAAACTAAGGCCATTCACCACCACCCCCTTTTAAGCCCCTTTTGTGTGCCATTTTCATATGCAAGTTACGTTTTTTTTTGTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 19319665 5' - Doc2-element 221 108 63.79 AAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAA:1 - chr3L 13739627 5' + BS 5086 1 79.45 ACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAA:1 + chr3L 19274814 5' + transib2 87 1 74.66 GGCGCATATGTTTAATCAGCAAAGTAAACCGACCCCAGAATGACCCGGGATCCAGTTAAATCTCACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTA:2 + chr2L 3742564 5' + I-element 5173 1 56.16 CGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 9871047 5' - roo 8996 2 72.60 AGAAAAGGGGGTGGAATTCAGCAGAAACAGCCGCAAAATGTTTTGATATTTTGTTATAACTAGGAGGTCCCTTTTGAACGCATACACTTTGTCACATGTAAAAGTTTTGTACACTTTCTTGTAAATAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 24752301 5' + BS 5094 5 56.94 CTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAAAAATTATATTTAGGATTTGGT:1 + chr2L 47116 5' + roo 8747 2 74.83 GTTTCCATTTCGTGCTGGCATCTGGCTTTTACTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr3L 10425893 5' - I-element 5303 1 54.79 ACGAAATGAACGTGAAGTGCCAGAGAAACGCGGTCGAAAAGAGACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 24090397 5' + roo 8678 2 72.60 GTGTTTTAAAATTTTAAACGTTGCAAATGTTTTGCAACATTTCGACGGCTTTACCAGCTGTGTGCTACTAGTATTCCACTTTTTTTTTGTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCG:1 + chr3L 6501350 5' - Bica 281 1 59.59 AAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:2 + chr2R 15326836 5' - copia 233 1 54.11 AAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATGCGAGTGGGGCTGGAGCCCCCTCTAGTGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGC:1 + chr3R 19445992 5' - 1360 47 1 53.33 CAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chr2L 17180041 5' - Juan 4186 1 65.07 AGTCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTA:1 + chr3L 15103813 5' - Transpac 240 2 65.75 AATTATAACCTTAATATTTAAACTAAATACAAAAAAGAAGATACGATTAAATCCAAACAAAATGCAAAAAATGAAGCGCCTTGCCGTTTTTACTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGT:1 + chr2R 8078751 5' + X-element 4593 1 68.49 ATATTCTTGATCAGGATCATGTTCGTCTGTCCGTTTGAACGTCAATGAACAATTTTAAAATGTTTTCTCATTTTATTCCGAAATATTTATCGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGGCTTCACACTGGCTGAGTAACGGGTAT:1 + chr2R 8443987 5' + INE-1 540 1 63.70 AGTTTGTTTTTGTTTTTCAATTCATTCATTTTTTTTTTGTCTCAACTGAATAGGTTTGACCTATACATTTATTAGTATAAAGCAAAATTTCAAGGTACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGTATTATTTAGCATT:1 + chr3R 6030682 5' - Tc3 1437 1 51.37 AACATAAAATACGAAATACGGCTGCGGCCGCACAAAGAAATTCCCATAAAAAAATCGGGGGACTTTGCCTGTGGAGGATAAGTTGAGGGAAGCAAA:1 + chrX 9525026 5' + I-element 342 1 50.00 TCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3L 15103774 5' - Transpac 5198 2 65.07 TGGATCTGCAAGCCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 - chr3L 18126051 5' + Ivk 1 1 77.62 CTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTATGTGTGCG:1 - chr2R 15651965 5' + hobo 41 1 75.00 TATTACAATTTCTGAACTTATGAAAGTTGGTATAATTAATTTATTTTTTATGTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTATTTAATTTT:1 - chr3L 14961190 5' - Doc 4698 1 65.06 AAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chr2L 20265962 5' - roo 323 2 77.40 CAATCTGCCGTTTAGCTAGCGCAACTGCCATCTCCTTCACACACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:2 + chrX 14988086 5' - copia 257 1 57.93 ACAATAATCGTGTGACAAACGTACATGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr2L 11357855 5' + blood 7073 2 77.19 CGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAGGAGA:1 + chr3R 4964106 5' - roo 334 2 68.49 ATATAAATGCGTTTAAATTAGATTTCTTTGTTTATTTTAAGAGAACAATTTAAAATGTTTATTTTATCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATGAGAAAAATGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACC:1 + chr3R 6509988 5' + hobo 2723 1 45.21 AGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 + chr3R 30347336 5' + P-element 86 1 28.77 GATTAAGAAACACGAAACACGAAGCACTCACTTACACACAAACACATATATATCTCCACCGACCCCAAGGAAAGAAGATGGAGCTGAAGAAAAAAATCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAA:1 + chr2R 10279232 5' - transib1 1902 3 48.76 ACAAAGGAGCAGAAGCTGGAACTGAAACAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 29611954 5' + jockey 14 1 80.14 AAATAAATTGAATCAATTGCTGAGAATAAAAAAAAAAACAGCTACTCTCGGGGCAATTATTCAAATTTCCATTTTTAATTAATGGTAAATGTTTTTTTCAACCCCTTGCTCGTTTTTATTTTTCATTACGCTTTATCCAATTT:1 + chrX 7151046 5' + accord2 7301 1 69.93 TTGGATTTCTGTTTAACTTTCTCAGTCTCAATTTGATTCGAGCGGAGGTCGGACGTGCTCCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAGCAGAATAGTGAAAGGTAAACACAAAGGGTAAAGTGCAGGTTGCAC:1 + chr2R 1193104 5' + Doc 101 1 82.98 GTTGCAGCCTCCCAATTCGCGGGTTCTCACCGACAATACCAAACGCAGACATCGAGCGGACAATAACCCAAAGCCCAGGAAACAT:1 + chr3L 14721096 5' + F-element 322 1 62.35 AATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTT:1 - chr3R 11040181 5' + Bari1 39 1 59.59 CCAACCCCGAATAATAAAAAAAAAAGTGAAAAGGCATTATGCAAAGTGCCAATTAAAGCATTAAAGGCTCAGCTAAACCATTTTTTTTTACTGAAATATTGATTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGT:1 - chr2R 18475067 5' - Doc 4557 1 66.21 GAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 + chr2R 19199658 5' + hopper 54 1 56.16 GTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGGTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAACAAATCAACTGCTCGGTGTGGT:1 + chr2R 12185348 5' - accord 7240 2 68.25 GGGCGCTTTTAACAATTACAATACAGTTAATCAAATAATACGGAGAGTGGAACAATATAAAACTTATATATATGTACAACAGTAAATAATAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCACATAGCAGCCAGCGATGGAAGCCCTTCATCTCT:1 + chr2R 21615272 5' + Gypsy6A_LTR 342 1 58.90 CGTCGCCTTCGTTCAACTCGCATCTGGAAAGCCATAAAAAAAAGGGGGCCCAACAAAGCCAGGACCAAGAGCACCCAAAGGACATCCAGCAAACACTTACTGGGACCTATGTACGTATATAAACGGAAATGCGCGACCTTCATCCG:1 - chr2R 12134054 5' + Ivk 5025 1 79.45 ACTGTGAGTCTATTCACAAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 7420159 5' - 1360 3372 1 75.34 GCTGGCGCAGACGAAGGCCTAATCAAAATTAATTGTTTATCATGTTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 10608463 5' - Doc2-element 232 4 64.79 AGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 21216818 5' + roo 8725 2 61.64 ATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTT:1 - chr3L 3501823 5' - Bari1 1651 1 56.85 TTCCACCTTCAACGCGCCGAAACGGGTAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAAT:1 - chr3R 24900285 5' - P-element 2725 1 22.60 TATCTTTACGGTTACTATCTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTT:1 - chr2R 3563379 5' - Transpac 5223 2 69.57 TTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 - chr2L 4003768 5' - mdg1 7381 2 69.86 ATACCCAAATATCTAATTTTTTCAACGGGCTCCACCACCTTCACGCCTCACCAAATTGGATTCAAGCGCATACGCAACGTGTTCTTTCCCAAAAAGCTTGATCCTGGGCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGA:1 - 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mdg1 7430 2 63.70 ATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTT:1 + chr3L 24213777 5' - invader2 5032 2 68.28 AAAAAGGAAAGCGAAACAAATGGGTAAAAGTGCGCCATATTGACCAAACGAGTGCAGCATGCAGCATTGCAAAAGCATTTCAATGAGACTCGAGGGTGTTCCGAAGTCGTGGGTAATGACTAACGTACTGTCAAATACCACTGGT:1 - chr2R 15105708 5' - gypsy2 362 1 71.72 CCATATCATAGGGTATCGGTTCGCAGGCTTGTGTGCGTAATTTGGTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGG:1 + chrX 21993559 5' - gtwin 7354 2 62.39 AATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGAGAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr2L 11298105 5' + I-element 72 1 69.53 AAAAACCGCAAAAAAAGCACATAGAGACTACCTGATTTGAGCTAGGAATTGAACACACTACAATATGTATATAA:1 + chr2L 3402392 5' + hopper2 1171 2 77.03 TTCGAAAACGATTCGTTCCAGTTAATACTTACTTTTTAACGTGTTAATTGTCATTGCACTCTACCCATTGACATTTTACATTATATCTTTTTATAAATCATCTGAACTTAACCCATTGTCTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTG:1 + chr3R 4786163 5' - 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chrX 2479558 5' + mdg3 90 2 75.34 ACACCTTTGGCTTAGTGTTTCGCTGTTCGCTCTGCAATTAATTAGGTCGCTCAATATTCATTCGCTTTCGTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATGCAGTGTCCCACAAGAAAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCTTATTTAT:1 + chr2R 1994778 5' + Q-element 512 1 54.11 ATTTATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTAATTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 - chr2L 9992091 5' - HeT-A 6056 2 43.84 AATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGC:1 - chr2R 4802883 5' - mariner2 264 1 32.73 ACATTTCCTTTGATTTGCATTGAACGTAAACACTACAATGTTTTTATGTGTACAATATTAAGCGCAGTACCATTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACT:1 + chr3L 11531747 5' - F-element 496 1 56.31 ACTAGAAAAAGGTAAAAGTTTTTGCAATTCGTTGGTGGCAACAGTGAAATGTTTGCAGTCTTGGCCCTAATTTTTAGTTATTAAACATCAGTTCACTGGCCCTACTAAATCTAAATGTTTATAATAGAAAGAACTGAAAAAGTTGA:1 - chr3R 6654002 5' + flea 467 1 49.32 AATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCATACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAG:1 - chr3R 433131 5' - 1731 233 1 71.23 CATTTGTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 25616480 5' - roo 9037 1 61.64 ATTCTGTGACCATGTGGACTATATACGTTTTATCTGCGTTTCATAGACGTAAGGCATTCTGGTTTTAATTTTTATATGAAATTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chrX 16946744 5' + FB 39 1 59.59 GTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3R 19992730 5' - hopper 1353 1 60.14 GTCAAATTTCGCATTCAGCATTTCACTCCCTTTCGCCCGCCTAAGAAAGGCTCATAAATTATAAGGCCAAAACCACAGATCAATTTATTTTGTGGCTGTGAAAATGTCGGCGAAAAAGGAAAAAACAATTAAAA:1 + chr2L 18376475 5' + Bari2 916 1 70.90 ACTCACGCGAGCATCTCCACTCCTTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1 - chr3R 26504365 5' - HMS-Beagle 234 2 77.40 ATGAAAGGGATCAAATCCCAGCCGAATTAGCTCTAACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTG:1 + chr2R 8967794 5' - I-element 5221 1 76.03 GTTGCGGAGAACTAATGCAAATCGTAGACTATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 18396226 5' + roo 16 2 74.66 AGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 - chr3R 23618230 5' + hopper 29 1 56.78 AAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCCAATACAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAA:1 - chr2R 5479961 5' + F-element 103 1 75.52 CACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 + chr3L 16690926 5' - I-element 5278 1 76.98 TAATAAAATCATTTACAATATAATTGCAGCAGGCGTGGATTTTGCTGTGCTCGATTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTCTTTTTATTTACTATCTGTTTTAAAAAAGTATGACAAT:1 - chr3L 7575714 5' - G4 3820 1 71.30 AAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGAAGTTCATAGACTTTAAATCTATATTTTG:1 + chr2L 22255084 5' + 1360 244 1 76.71 CGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 + chr3R 6419822 5' - 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P-element 2862 1 69.18 ATTTTACTTTTTTCAAATTTTTATTTAAATCAAGTATTAAGTATTTAAATAAAGTATGTGCAATCGAAAAAATGTTTGTTAAAGGTTTACTTAAGGGTGGGCAAACGATGAAAACTAATAATTGTTGGGCAAACGTTTTTTATTG:1 + chr3L 14735230 5' - FB 343 1 53.79 ATCTTCTAGCTACACTTTACATAATTCTCAATTATGATTTTGGCAAAAAACAAGTACATAAATATATGTATTTAAGCACTGAAATACTCTGTGCACTTAACTCGAGTGACTCAACAACAATATTTAGGTACAATAATTTGAATTTT:1 - chr3R 25059806 5' - TAHRE 10337 1 78.08 ATCATTTAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chr2L 14874109 5' - copia 250 1 55.48 ATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2L 11391580 5' + 1360 56 1 60.00 GTTATCGGTGTGACCCAGGGATTGTTGAAACCAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGCGAGCTTCTGCCGGTACGGGTGTATATGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 11982096 5' - accord 188 2 91.00 AATTAATTTCCAGGAGCTTTTGTTATATTCTGTTTGTGTACGCTCTGTTTCGGGTGTTTCTTTTCAGCACATGGAAAATGGAAAAATTACAGGACAGCAGCCCCCTACAACCCAACATTTTTTGGTCCTTCGAGTCGGATCACCTG:1 + chrX 4276514 5' + GATE 278 1 65.75 AAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chr2L 14671849 5' + FB 50 1 70.75 GACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGGCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGA:1 - 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Cr1a 4223 1 52.05 TCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 + chr3R 7666657 5' + I-element 85 1 71.92 GGATGAAAGGGAATGTAAGTTGACCACTCGATTTGGATCGCACAAACACCACAAGATACACAGCCGGTTGGCGCTTATCAAACGCATTTGTTATCCAGTTTATGAAACACACAACCACACACCCA:1 - chrX 12659635 5' + gypsy3 413 1 56.00 GTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 10931595 5' + 297 6609 2 61.64 GTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGATTTCGTTGTCGT:1 - chr3L 24131492 5' - Transpac 5164 2 61.38 ATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAACTCCTAAACT:2 - chr3R 4679580 5' + hopper 32 1 62.33 TCCAAACCTTTCCAAAAATATTCCCTAAGTTCGCATGAATTATGGGAAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - 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chr2L 11389244 5' - 1360 41 1 30.56 GATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 - chr2L 13556480 5' + transib2 23 1 64.38 AAGGCATTGTGTTTCAAGCAAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTTGTTCAACA:1 + chrX 18336583 5' - mdg3 5433 2 57.53 AGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGCCGGATGATGATGATCAGGAGGGCC:1 - chr3R 15790071 5' + flea 4732 1 57.45 TATATTTTGCTAATATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3L 10731931 5' + 297 6584 2 78.08 CAACTGCCGACTCACCATCTCCTCCGGCGCCATCCGGAACGAACTCGCTGCAACCCTGTGCAGGTGGATCTTTGGGATCCCTGCAGCACTTCTCCAGCGCTTCGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCA:1 + chr2L 328578 5' + G2 2942 1 75.34 TTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:1 + chr3R 21276509 5' + BS 5033 1 57.53 ATTCATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr3L 8673289 5' + I-element 51 1 54.11 AATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAT:1 + chr2L 15913253 5' + transib2 79 1 71.92 AGCCCACGGGAATCCGTAACCAGACGTCATCTGTGTTTATACAAATTAATTTACGCACGTGCAAACGCATCCCCGAAAAGAAAAACATAAACTGTCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTTATTCTGGCTCCG:1 + chr2R 22541750 5' + TAHRE 10406 1 69.44 GCATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3L 21996273 5' - Transpac 5201 2 57.94 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTATTTACTTAGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGGCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTTCCTTTCT:1 + chr3R 19450171 5' - roo 243 2 58.49 GTGTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:2 + chr3R 29084829 5' - 412 489 2 78.08 ATCTTGACTATCTATTCTTCTATTATCTTCTGCACGTGGCATAATAAGTTTCGTGCACTCGGTTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACAGCAACATTTAAATAATACAACGAGCATAATAAAACATCCTGCGAACAATAACTGGTG:1 - chr3L 26043576 5' + Doc4-element 2674 1 56.85 CAGTTTTATTAATATAAAGATTTATGTAGATTTAAGTCAGTTGTTTAGATCAGTGTATCTATAGGTACATTTTATTTTTCGCTTTATACAACAACTATGTATAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAAT:1 + chrX 9578701 5' + I-element 164 1 75.34 TTATAAAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 19073152 5' + roo 30 2 59.59 ACATGGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 11191353 5' - roo 9050 2 68.49 AAGCTGCTTGAATGATTGACAGCTGGACATTGTGGCTGAGTGAATAACTCACAGGCCGACAGGCCGACTGGCCGCTTGATTTATTTTGTTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTCTTAGAAAAAAATTGCTAAAGGACGATATATT:1 + chr3R 27440325 5' - transib2 53 1 57.53 GGTCTAATCTCAAGTTGAGTCCTGTAGTGTATCTACCATCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGAAACGTACATACATTG:1 - chr2L 13844217 5' + Stalker2 7290 2 70.59 CTTCAAGGATACGGGTATGATGATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAG:1 - chr2L 7618605 5' + X-element 4435 1 75.94 ATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTATTGCGATTAAAAAAAAAAATTTGAAAAAATCGAAATTTTTGATTTT:3 - chr2R 5303116 5' - FB 157 1 78.08 ATATCACATTCAAAATAGTATTTATGTACTTGAATGAGGGGGACCATATAAAAGCAATTGGGACCGGCACGACCAGATGGGATGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 - chr2R 5796253 5' - F-element 4413 1 58.62 TATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 14310349 5' - roo 9044 1 50.00 AAATGTAATTTGTCTGCCTGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr3R 16518851 5' + Tirant 8116 2 77.60 TCCTATGTTTCTTACGAGTGGACTGAGCGACATTAACACTAGCTGTTGCAATGCTTCGTTAGTTTAGATGGAGCAGTTCGGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTTAGATTCAGCATACAGAGACAAAGACGCAAGTAG:1 + chr4 56276 5' + INE-1 192 1 59.03 GTGTATCTGTGGGTGAATGGTGCTCGTCTGGGATTAAGGACAACAATAACAATAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 - chr3R 30356928 5' - copia 146 2 69.05 ATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTT:1 - chr2R 22989680 5' - hopper2 1558 1 55.20 TTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chr3L 11326767 5' + pogo 68 1 70.55 ATTCATGATATTAAAGACTCCGCAGCATCATAATTCATAATTTTCAGCAAGTTGCGGGCGCCATAAACTTCAAGATCGGCGTGCAATGCGAATGACATTCGTTGCACTATTTTCCCCATTTTTTATTTTATTTTATTATATTTTCT:1 + chrX 14127908 5' + transib1 1900 1 71.92 AATTGATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chr2L 6654604 5' + diver 17 2 71.23 AGGCGACATATACATACATATTACATACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGT:1 + chr3R 31293096 5' + Dm88 4357 1 60.00 AAACAACATGAATAAAAAGCCTTATATAAATTAACCAACGAATTTTTTTTTGCAAAATTTTATTTTGCTTCGCGACTTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGCCCCTGTTCGGGGGCCAGTAAATAATTACAGTTT:1 - chr2R 1263978 5' - HMS-Beagle2 315 1 77.93 TGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTAT:1 - chr3L 21769104 5' - I-element 5288 1 64.14 AAAATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chr2R 13259410 5' + mdg1 34 2 59.59 AGGAATTAAGTCTGCTTATTTGCAAGCAACATCGTAGAAAATATATAATAAATAGATTATAAAGAGTTTACATTTGTTAATTACGATTTATAGGAATCGTATCTTAAATTACTTAATAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTG:1 - chr2L 10526595 5' - Quasimodo 72 2 75.34 AAATTGTTCCTTAAAAGAGAAGGGAATTTTAATGTTAAAAAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 + chr3R 18971658 5' - Juan 4201 1 67.12 AGTTGGCCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr2R 16817976 5' + 412 44 2 56.59 ATAAGTCCGTTTCTGCCATCATCAGTTTTTGGTCACGCACTGTCGCCCCGCACATACCATACTATTCCTTTAATACCACTCTTCGTTTTCAAAATGATCTTTCTTTTTTATGCCCCCGGGCGATTTATTTTCATTCCGCAAACA:1 + chr2L 19688136 5' - S2 17 2 54.17 AACAATCAGAATTATTGTGTAATAGTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 27160022 5' - 412 480 2 75.00 CAAAACAGCGATCTGGCAAATAAATCATTTTATAATTTTCCGCAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2R 21663415 5' - opus 7492 2 49.32 AGGTGGGGAGGGCGGGGGGCCTTGGTGATCGTCTCGCCGTCTGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGAAGTCGAAGCTTACC:1 + chr3L 18402942 5' + P-element 26 1 64.18 GGTTTTCCATCGACGATGAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTGGTGTCCA:1 + chr3L 17275375 5' - Transpac 281 2 65.07 AAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAA:1 + chr3L 24934258 5' + HMS-Beagle2 22 2 70.55 AGCATATTTTGTCGAATTTACAATGCATGAGTATACGTGTGCAAGTTAACACAAGCCAACGTCCTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACATAATATAAAAGTGCTGTCCCAGCATTGGGCCGGATACCCGTGC:1 - chr3R 4571527 5' + Gypsy6A_LTR 71 1 60.74 ATAAGANCAACGTGTGAGCCTTTGCCATGCTGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr3L 1692126 5' - blood 7334 1 55.48 AAAAACTCTACATTCAATTAAAATACATACATAACATACATAATACACACATAAATCAAGAAAAAAACATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 - chr3R 12728084 5' - Juan 4169 1 50.00 AAAAAAACCAAAATTGTCGTTTTCTTTTCACGCAAATTTTCCTGGATTGGCTTACATTCTCACAGACACACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTA:1 + chr2R 12277191 5' - invader4 2648 1 53.96 AAAATAAACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 + chr2L 18347259 5' + transib2 23 1 65.67 TATTAATTTACATAGTTTGTTTTGGTGGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTGGGGTGTGTCTTTTGTGTTGTGTTTTGTGTGGGTTAGTGTGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGGTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATT:1 - chr2L 17401934 5' - I-element 101 1 61.64 TTCACACCAAACACTTTCTAGTCCAAACTTAAAAATCCCCACCAACAATATTCACCCAAAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAAAATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATT:1 - chr3R 6668114 5' + I-element 480 1 58.22 AAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr2R 17878637 5' + Doc 66 1 56.16 AAGGTCAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 14366493 5' - roo 386 2 71.03 AAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATGGGGTTCAACGCTCCACGCGACGA:1 - chr2R 6482507 5' + gypsy 7063 2 68.89 GATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 15791021 5' - roo 9025 2 53.42 AGTCGCAACATTACCACGGCCATCGCGATCGCAGATCACTGTTTGATCGGTTCACCAAGCTCAGTTCATTGTGCGTACAAATCGTTTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATGTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr3R 24368962 5' - roo 411 1 52.05 ATGACATTGGCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - 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chr2L 4123924 5' - transib2 2735 1 77.40 GACAAACAAACAAACATTGCCGACTGCCAGCCAGTCACGAAAGTGTCGTCTTTACTTTTGCTCGTTTGTTTTTTTATTTTTTTTTTGTGT:1 - chr2L 3428563 5' - G2 3076 2 83.33 AAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 20265924 5' - roo 361 2 53.42 CTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:2 + chr2R 11804600 5' - pogo 2065 1 59.59 AATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACA:1 - chr2R 9158131 5' + mdg3 76 2 67.12 ATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 + chr3R 15724267 5' - Juan 4189 1 65.07 GTCGCGCCGAGAAAATCCCTATTTCAATATTCCAACGAGCCACTATCACCGAAGTCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATATAATGTATTTATATTTATTCATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAAC:1 - chr3R 2694464 5' - diver2 408 1 74.66 ATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr2L 20266018 5' + roo 82 2 76.03 TGCCTCCTCCGCTCCTTTTCACCAGGATAGGGCTTTAAATGCAGCGCAAATATCCCAGCGAAATGAAGAAGGTCGCACACAGTGGGTGGTAAAAGCATGTGCATATGGAATTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACAG:1 - chr2R 15772242 5' + 1731 80 1 64.38 CGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chrX 11661359 5' - pogo 2072 1 64.83 TAATGGTTAGGCAACATTAAGATAAAGATTTCTTAAGACAGCACTGTTATGTACATATTGAGTCATAAGATTAAATAAAATGATTTAATAACTTTATGAGCCATATCAGGTAGTGAAACCAAAAAAATGTACTGTCTCTTAGGACC:1 - chr3L 9139867 5' + G3 4113 1 76.71 ATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTC:1 - chrX 8092504 5' + pogo 44 1 53.79 TATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTG:3 + chrX 5323257 5' + Juan 4132 1 74.66 GCGGCGCACTAAAGTGACTTCGTCAACTATTTGCCACACTTACCCTCATTTCGAAGAATGGCCCCCGAATTTTAGGCTCCACTGTAACTCGTAAAGTAAAGGGGTATACTAGATTCCTTAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGTAAG:1 - chr2R 3524110 5' + INE-1 28 1 65.07 CAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:1 - chr2L 10156185 5' + hopper 83 1 76.22 GTGAAACCAGAAAGTCAGCCTTCTGGATTAGGTCAAGGATTGAGATGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAG:2 + chr2R 17806767 5' - mdg3 5148 1 68.49 AGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCCTATGT:1 + chrX 21224528 5' + roo 44 2 53.24 GGTCTGGGCATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 11062877 5' - roo 9055 2 71.23 TTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr3R 17673730 5' + FB 35 1 59.26 TAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAC:2 + chrX 20999518 5' - BS 5020 1 69.86 TGGGAGTTAGCAAGGATTTAATTTTGTCTGAAAAGATTCTGATTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTGGTTCGTTTGCAGCACTCAACTTCTCCACCACAGGCAAAGTACACC:1 + chr2R 25034094 5' - I-element 324 1 55.56 ATAATTAAAGCCGCCGACATGCCATGAAAGACTGTGTTCGGGACAAAGAGGTTACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3R 8075900 5' + 412 7119 2 62.24 AAACATACAAAACAACAAGGCACCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 + chr3L 13590844 5' + jockey 4795 1 50.00 ATAGCCTGGCGTGCTAATTTATACGTTAGAACCGGATGGGCCCTCATTTAATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGGAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAAC:1 - chr3R 14173782 5' + Idefix 193 1 62.59 CATGTTTGTCCGTATCGAAATTTCACAATTATAAATTCTAAATTTTTTTAATTTTAATTTTTTTCGCTCTTTACACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTG:1 - chr2L 9172972 5' - 1360 3181 1 51.72 ATGTTTTATTCGTGCATTATTTGAGCATTTTTTTTTTTCACAATACGCTTGGAGGGATTTGCATAATACGCCGTAGGGCAGCCGTAAAATGTGTGAATAAATATGCCAGAGAGCGAGGTTAATTAAAAACATTTAAATTATTGAAT:1 + chr2L 19137568 5' + Bari1 313 1 63.01 ACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 - chr3R 8890095 5' + FB 82 1 73.79 AAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTTAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAACGAACTTTTGAAATTTG:1 + chr3L 22890382 5' + FB 24 1 50.62 AGCACTGAGAAGAGCCCGCTTCCGAATTTAACTTGCACGAGGTAGGATCTTCAGGTGGCAACTGGTCTGTTATGCATCTACATACATAATGGAATGCTAAAGTAGTTGTTGGCGCTCTTTTGGGTATTTGTATATTTATTTTTATT:1 - chr2R 8957084 5' - Stalker4 86 4 61.64 CTCGACCCAAACTTTCAGCTCCATTCCGGCTAATTGTCGTCGAGTCGAGTCTCTAAAGATCGGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 - chr3R 25662417 5' - Juan 4164 1 50.68 ATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTTAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTTA:1 - chr2R 11159341 5' - roo 349 2 61.19 CTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:2 - chr3R 10736176 5' + McClintock 5965 2 73.29 AATATACGTAGCCTACTTTCGGGCCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCAGTG:1 - chrX 18409510 5' + jockey 4693 1 72.60 CCATAACTCATAGAGGAAAAGGGTATACAAGTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATAA:1 + chr3L 25481523 5' - Cr1a 4153 1 68.49 TAATAACTTTTAACATTTTTTATAAATCGCTTATATAAAAAACCAATGTATTAATACTAAAATAATTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAA:1 + chrX 15357528 5' + hopper 1402 1 62.71 GGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr3L 12315722 5' + transib2 61 1 59.59 ATTTGATAATTTATGCAGCATAATCTGGCCGATGATGTTTATCGTTTGCCATTCCCATTTGTCCCCTCTTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTGATGCAACCAATATTAACTTTTTTAGTACATAACTAGATCCTACTA:1 - chr3R 8927618 5' + Cr1a 4282 1 45.52 AACCAAGCAATCTTAATTTTCAGGTAGCGGGGGCCGAGGCTTTGCTGGCATGGAAGCTCGAGATCAATATATATA:1 - chr2R 12185925 5' - accord 95 2 66.67 ATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGA:1 + chr3R 20140488 5' + jockey 4738 1 66.67 AATAATATTTTTATACCACGTTTGCTCCGTTTTTAGAATCTCAGGTATACGTCATCAGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGG:1 - chr3L 26010904 5' - invader4 368 1 57.78 ATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTA:1 + chr3R 23618149 5' - hopper 1330 1 76.03 GTGAATCATTAGGGTCTTTGAGAATCATATAACGAACCGCTCTTTCACACATAAAACAACCTCAAGACGTAAAAATAACAAAAAAAAAAGTAAAAAACAATT:1 + chr3L 10653048 5' + Bari2 912 1 69.61 AGACGAAAAAGATCAAGGCGCGCCTGTTGGGTCCCGTTTGGCTGGACGAGAACGGCAACAAGTCCGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAATCCATTTCAATT:1 - chrX 8603365 5' + Juan 409 1 59.66 CATAAGTCTGGTGAGAACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACCTATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAG:1 + chr2R 4188945 5' - S-element 1699 1 68.49 TGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGNACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 - chr2R 8099216 5' - jockey 4924 1 66.44 CTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 13294880 5' + roo 8723 2 58.90 AGTGGATTTTGGTTTTGCTAGACGAGCGCAAAAATTTGATTTTCAAAATTCCCATGGCACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAAT:1 - chr3L 9610180 5' + I-element 5170 1 60.27 CTGGGCCTGGGGCCCTTGTCCTCTGTACTTTCTCGTCTCTTTGTTTCCGTTTGGTTTTTATGTGCGCCAGAAATTGTTTTTAAAATATACATTAGATCTGTTACTAATTTTGTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGT:1 + chr3L 8257009 5' + Tc1 1548 1 55.48 TTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 25428122 5' + 297 6609 2 63.01 TTGCAAAGAAAATAAAAACCTAATTTTACCAATTTGTGCGCATGTGTGCGTGTGTGTGTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGT:1 + chrX 12609198 5' - Stalker2 7267 2 65.07 GAGATCTGAAGGCAATCAGGCTCACGAAAAGCAGCCCTGACTAGCAAGGACAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATAAAATTCACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAA:1 + chr3L 22643505 5' + G4 3832 1 65.07 AAAGCAAAGTGACAGGCAATTGCCGAGCACAAGTTATTCATGAATAAAGATTTAAGCGAACCTCTGAATGTTAAGCGGCGCGGGATACACTCACCTATAATAGGCTGCTTGCAGCGCTGGCCGGACATGCATATTGCAAGTGGCAC:1 + chr3R 21612301 5' + TAHRE 9994 1 53.42 AGAATCAAAAAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr3L 21769151 5' - I-element 5334 1 64.38 ACCTCCCATTTTCCCCACCCCTCGCACGCCCTCAAGGAAGATAGTTGACAACTTGTGGCTGGCCCCTTTCTCTTTTGCCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 19629877 5' - Bica 342 2 68.54 AAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 - chr3L 22035648 5' + F-element 82 1 73.29 TAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 + chr2L 10156093 5' - hopper2 1563 1 52.05 ATGAGAAACAATTTAAAATTATTATGACAACATATCCAACAATCTAGAGGTGGCCCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGC:1 - chr2R 12202634 5' + 1360 133 1 66.14 CATATCATCCACACTACCATTGGTCCAGTTGGTGGTCACTACTCCCGAAACCCGTTCGACTACTCATTGACCCAATCCAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAA:1 - chr2R 7850594 5' - Cr1a 197 1 60.96 TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGC:1 + chr2L 23069854 5' + Stalker 159 6 78.46 AAACGAGCAGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chrX 959070 5' + 412 85 2 76.71 AGCATATTTTGTCGAATTTACAATGCATGAGTATACGTGTGCAAGTTAACACAAGCCAACGTCCTAGAACAGTTG:1 - chr3R 4571527 5' + Gypsy6A_LTR 11 1 57.33 ATGTTTTTATTTTAAAATATGCATTGTTGAAATTTAAACGCAGGGCTACTCTTGTGATGAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chr2R 3563185 5' + Transpac 4984 2 58.90 GTGCTGGCATCCTCTCCCAGAAGGCGACTCCACTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGTTTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGGGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGGTTCGTG:1 - chr3L 16436889 5' - F-element 4429 1 70.55 TAATTTATTTAGTGCTATTGTTTTTAGCCTATCTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chr2R 6965630 5' + Transpac 4936 2 73.97 GAATCGCGCTTCCCATTCCAACATTATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTT:1 + chrX 22641695 5' - G6 1983 1 50.00 AGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr3L 24131517 5' - Transpac 5204 2 63.85 GGTATGAAAATATTTTAATCGAGAGTATTAAAGTAGCTTCAACATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 - chr2L 3675970 5' - Juan 4191 1 61.27 AAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCGCGCTCTCT:2 - chr2R 20802642 5' - mdg3 5411 2 72.60 CACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATGAAGCA:1 + chr3R 24381329 5' + Juan 4194 1 73.29 GATGTTGTTTGTCACGTGCCAGTTGCATACACACACACACACACACAAGAACAAGAACAGCCCACGTACACACTGGAGCATACACCTTAGATAATGGTGCTCTCTGAAGTGTGTATGCGTTTGTGAGGGAGCTAGGTGTACATTCT:1 + chr3L 20039270 5' - invader3 5322 2 69.18 GTGCTGATAAGAATCTGAATCCGAAAGAATCTATATACTGGAAGGCCAGCACACAGATACTTCAGCCAGCACACAAACACATCAACACACACACACACACACA:1 + chr2L 6833696 5' + accord 7028 3 76.70 GTGTATTTATTCTAAAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:3 - chr2L 6647765 5' + mdg3 28 2 67.12 ATTTTTCTTCTGTGCAATTAAGTACTGTATGATTTAGTTTGCCCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGGACCATCACTGGGGCACCGTGGTAC:1 + chr2R 3032557 5' + F-element 4351 1 71.23 TAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGGTTT:1 - chr3R 11062859 5' - roo 9037 1 58.90 TATTGCGCATAAAAGTATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:2 + chr2L 16946012 5' + hopper 43 1 54.79 ATCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2R 9871033 5' - roo 9010 2 63.01 ATGTCAAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:2 - chr2L 18347420 5' - transib2 2797 1 67.12 GGGTATGATGATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCA:2 - chr2L 7618593 5' + X-element 4460 1 60.96 GCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 - chr2R 23780630 5' + Ivk 44 1 54.11 ACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCGGGCGC:1 + chr3L 28092983 5' - invader1 3959 2 60.47 TAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 14051836 5' + roo 76 2 78.08 GAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCCGGTAACTTAAAA:1 + chr3L 11326651 5' - pogo 2059 1 56.16 AATATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGAT:1 + chr3R 19992614 5' + hopper 41 1 56.55 ATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 + chr3L 21996155 5' + Transpac 58 2 54.79 TTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATCCTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACTTTACATAGAAGGAAGATCCAGCGGTTTCAAAACAAATGGTTGAGAATA:1 - chr2L 9010148 5' + G2 2726 1 48.84 ATTTTATGATTGTATCACAAGAAATATCTGATTTTAAGCAAAACAAACGAAGATCTTGAAACGGTAAATGAAGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATGTAAGTGAAATGCTAGC:1 - chr3L 24402809 5' + G4 192 1 74.66 TATGAAAAAATATCAAAACATTTTGTAATAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAAGGCGTTAGAATGGGCTTGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCCCTGCGTCTTGGTCTATAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTT:1 + chrX 22902344 5' - INE-1 174 1 73.97 GGAGAAAAGTAAATTATTATAAGTTACAGTTAATATCCATAGAATTTTCTTTTATTTATCACAGCTAAATAAAATAGCTTTTCTCTATGTCTTCTCAAAATCCTCTATAATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCAC:1 - chr2R 21903028 5' - copia 163 2 67.12 TAACTAAAATGTTTTATAAAATCATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGGTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGG:1 + chr2R 917638 5' - micropia 5015 4 77.36 AATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr3R 19450084 5' + roo 2 2 60.14 AAAATTAACAAATTAATATCTTATCTCGAAAACTATAGGAGACTAGTTCTTATAAATACTTTTTTTTCAAATCGATAGACATTTACATTACTAGAATCTGTATGCTGAATCCCAATCGTATAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATCTCG:1 + chr4 228499 5' - INE-1 147 1 59.59 GTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chr3L 16470335 5' + jockey 4725 1 72.90 GAATCCATAATGAATGCACTCATTCGACCACATAAGGTATATATAACCTTGATCAGGATCGATAGCCGAGCCGAACTGGTCATGTCCGTCCGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACAAAAAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCA:1 + chrX 22696750 5' + INE-1 169 1 76.71 AGGTGCATTTTGCATGTGAGTTATGGGCAGACCGCTTTCAAATTCTGATTTCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTACCGCAACTCC:1 - chr3L 7089488 5' - R2-element 3471 1 63.01 AAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTGATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAA:1 + chr2R 3338783 5' + Juan 57 1 56.25 GATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACAC:1 - chr2L 14523262 5' + HMS-Beagle2 6925 2 45.89 ACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATAATATGCTTCTCATATTATG:1 - chr2L 22369229 5' + rover 6958 2 69.18 TTTGGCCGCCCGGGAACTTTCACCTAGTGTATGAGTGTTTGTGTGGGTGGGTTGTGACAGTGTGTGTGTAACTGGGTAATGCGTCTCAAGGACCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chr2R 19941500 5' - hopper 1401 1 73.68 ATGGGCAGCCCTATGATACAACTATATTAACTGGTGTGCTCAACCGAACCCTTAACAAACAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAA:1 - chr3L 183992 5' + flea 208 2 59.59 GGCGTGATTATAAAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2L 47036 5' + roo 8 2 79.17 ATAGCACAAAATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 + chrX 12129308 5' + flea 54 2 60.58 AAGTGTAAAATTAACAGTATAGTGTTGAAAAAAAACAGCTGTAAAGTCAGCTGTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAA:1 + chr2R 3338722 5' + Juan 18 1 74.66 AGTATCTTGAAGCTCGTGTAATGAATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:2 - chr2L 4063950 5' + roo 47 2 56.16 CGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCT:1 - chr3R 10736133 5' + McClintock 50 2 59.71 AAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3R 9002923 5' - roo 336 2 65.52 TAACAACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:2 - chr3R 22590622 5' + rover 6970 2 71.92 ATTGCCAACGCTATATGAGATAGTCTTATCAACATATTCATATTAAGACCAGGTGCTTAGATACGCTGTTATTAAAGATTATAATGCATATTTGTCACTCCATCAATATAATATCTATAATGCTTAATTTTAATTTTGATTTTAGT:1 + chr2R 23000828 5' + Rt1b 134 1 66.44 TAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAAT:1 - chr2R 15326934 5' + copia 86 2 78.62 ACTCCACACACTGCATGGCTTTAAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 7889709 5' - roo 398 1 78.08 TCTAAAAATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTT:1 - chr3R 3286209 5' - Gypsy12A_LTR 1944 3 69.85 GATAACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr2R 13931512 5' - P-element 2846 1 59.59 ATTGTAAATTTGACAAAATATGCTCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTATTGATCAATTGACACCATGCAAAAAATAGAAATAAAATAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTG:1 + chr3R 4571525 5' + 1360 256 1 57.53 ACAAGTGATTAACTATAGTCCGAGCCGCCCAAGGGACATAACTTGACGCGTTGACTGTTCAGATTGAAAAGAAGGCAAACCGGAAACATTAGTCGAGGCGTGGGCCAACGGCGGAAACCACGATCAGCTGAACA:1 - chr2L 14843205 5' - gypsy12 191 2 70.90 AATGGCCCTGCGGAGGAAAGTAACACAACCCTAGCTAAAAACCTATAGCTATAAAATGAATTTGGTTTTTAAGTATAACCAACCCTAAAAATAAAAAAGGAAAAGGCAAAAAAAAA:1 - chr3R 31055284 5' + Doc2-element 239 1 46.55 AATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGC:1 - chr3L 23597293 5' + invader4 2747 1 69.70 ATGTGGGTCATGTCGTATATTGACCACGAAATGGCAAACATTCCCGTGGTTATTTCATAGTTCAAATGTGTGTGGCATGGGCAAATAAATAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chr3R 25428286 5' - 297 6952 2 67.63 ACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTT:1 - chrX 20999595 5' + BS 53 1 58.22 AATGGCCAAAGTGCTGAAAAATAATCGGGCTGAGTCCCTCAACTGCCTTTATCATCACGGGCTCAACTTGGCGTTGATAATGAAGGAAGCGAAACGATGGTGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGA:1 + chr3L 13178584 5' - roo 8737 2 68.49 GACTATCAGATACCCCAATTTAAACAAAACCAAAAAAAATATATAGAAAATATAAAAAGAAACGCTAAAGTCGACCATCTCGACTATAAGATACTCGTTAATTGTGTAAAGAGCGAAAAAAATTAAAATTAAAAAAATTTAGAATT:1 + chr2R 6107131 5' + 1360 3031 2 69.86 TAACTTATGCGCGTAACTAAGTTATAGTACATAATACAGATATAAAGATCATTAGAATAATAATACAAAACAAATGCAAAATAAACGAAAATAAAAGGTCAAACAAAATCAAGGGAACTCAATAAAATACAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 24144982 5' + F-element 4686 2 78.62 AGCACTTCAAGTGCCAGAGCTCGAGTTGTTCGAGACCTATGTTGGTTTGGGCTTACGGAGTTTTTTCTCCGCTTGATGTTTATTTACATTTGTAATCCGGTTTCCTTCCGTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTT:1 - chr3R 10975765 5' - Doc2-element 245 1 52.24 CCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr3R 4964165 5' + roo 91 2 84.93 ATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 25428184 5' + 297 55 2 78.18 GCTGCCATGTGGGGCGGCCAAGACGTTATTACTGTCGGAATCAGGAGCCACTCAAGCGACGCACCCACGCAGGCAAAAGGGATCCCAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGC:1 + chr2L 8338071 5' + P-element 21 1 71.92 AACTACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chrX 9530309 5' - 297 6915 2 62.33 TTTGGTATCCGAGCATCCGTTGGCTCAGGTTGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTGGGGGGCATTTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACT:1 + chr3L 16478839 5' - I-element 42 1 57.04 ATGCTAAATTCGTTTGATATAATTAGGCTTCGCCATTATTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 16552554 5' + hopper 141 1 87.04 CAAGCTTAAGGGAAAGGGCCTAGCAGAAGAGGTTAAGATTATTGAAGAGCAAAAGCTTAACGAACAAGATGTCCCTGCCCATAACACATAAACAAACACGATACAACTACACAAAAACATATAACATACA:1 - chr3R 32057412 5' - transib1 321 1 63.08 ATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr2R 17796517 5' + jockey 4701 1 65.07 ATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCCATATTGTACGGCAAGAACCGACGATAAAATTCTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 + chr3R 19449509 5' + pogo 73 1 57.53 CCTCTTTAAAATTAAACATTGCCTTTAACCTTTTAGTTCGTTTCATTATGAAATTATAAACCTTTAAATGTATATTTGAATGCTTGAATAGTTCACCAATTTAATACCAACTTGCCTGTTTTGCCAAG:1 + chr2L 19864779 5' + I-element 5004 1 74.22 ATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTAGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439058 5' - P-element 2495 1 59.31 ACTCCCGATTATAATGCAAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr2R 19941644 5' + hopper 51 1 52.41 ACTGGTGCACTGCTATCTTGGGATTGGGATTCAATCCGCTTTCTTTGGAGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGACTTATCTAGAATTGGGATTTTCT:1 - chr3R 13271985 5' - Idefix 151 2 65.07 TATTGGTAAAAAGTAGTCTAACTATATATTCAATATTCAATGTTAGTTATGCCTTTTCATTTGAAATATCGTACATAAAACTACTTAATTAAGACAATGGCATTTTCGATAACTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGT:1 - chr3L 7996068 5' - R1A1-element 41 1 53.42 CCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGTTGATGATCAGGAGGGCCGCATGTAACATGG:1 - chr3R 15790110 5' + flea 4745 1 60.27 AATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAAACGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3L 15103781 5' - Transpac 272 2 58.90 AATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr2R 8157196 5' - mdg1 7375 2 76.71 ATGGCTGCCGGGCAAGCTCAATCTCACCAACACAGCCATGTCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr3R 28928451 5' + jockey 91 1 74.66 AAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:2 + chr2R 10161793 5' + transib2 70 1 65.07 TGTGTTTGTTTATGACCCGGCTGGGTTTGCATTTATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATTAACTATTA:1 - chr2L 10816907 5' + jockey 4846 1 76.03 ATAATCGTCTCTTAAACATGCAGAAATAAGTATTCCAACGCTTGTAGGAAGAACAAATCTCAATATGCTGTTAGACTTAATTTATATTATTAAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTATTGATCTTCTAAATGGGATTTCAAGCTG:1 + chr4 266310 5' + Q-element 395 1 69.86 TGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chrX 20373686 5' + 297 47 2 58.22 ACATTAATTTTGACAGCTGCTAACAGAGGCACCACTTAACATTTAACCTTATTCTATAGATTCTATGTTCGGGATAAAAATGCCAAGGAACACAAATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGG:1 + chr3L 7781385 5' + Bica 30 1 57.24 AAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCG:1 + chr2L 11391485 5' - 1360 37 1 48.55 ATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 + chr3R 27083004 5' - jockey 4985 1 72.66 TGAATACATAAATATAGTATATTTTTTGTGTATTTGGTGTTTTCGTAATTTATTCAATTAAAATATAATTCTCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTA:1 + chr2R 10519613 5' + 412 455 2 54.79 GGATGCTCCGTGGAACTGGTGCTGGAGAAGCCTGAAACGTGTGAGATTACACGGCATTAGTGAAAGCTATCAAAACAAATTGAATTTCAACAGCAAATTATTTTGAACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATAT:1 + chr2R 12225214 5' - FB 268 1 51.37 TGAGAGTCATAAAATTGGCTTTAAATAGACCTACACATTGGCCATAATGTGGCTCTCATATGGCTTGCCCTCTGGACTCTTGGGGAATGGGATGTGGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGA:1 - chr3R 14338291 5' + pogo 1662 1 69.18 AATTTGTTTCTTGTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGCCCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 21299268 5' - roo 9050 2 67.15 GAATAGGGTGCTGGATACCAGAGCAGTTGTAGTTTTCTGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGGGGTTCTCCAGTC:1 + chr3L 15801502 5' - G2 2854 1 61.17 CCGAATCATTTTATCAATGTGTTTTCACAAAAAAAGTTAAGATCATTTAGTTCCTTTAAGTAGAATTTGTTTCAGTTATTATAAAACCTTTACAATATTGCAGGTACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 - chr2R 7306616 5' + Max-element 14 2 75.86 GTAGGCCAAGTTTTTAATAAACACCCGACACGCAAAAGTTTTTTGGCACGCACTCACACACACACACACACACATCGCAACTAACACACTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 7300273 5' - roo 9044 1 64.38 CCTTGCTGCATATTTGTCTTGTTTTTGGCATTTACTGAATGGGAATAGGAAATGGTTGTCTGATCAATTAGGAGCACATCAAAGGAAGTGGATGAAATATCAAACGTAAGTAAACGGAATGGAAATAATAATAAACAATCATAATA:1 + chr2R 19000425 5' + flea 5001 2 73.29 ATTTTTTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:2 - chr3R 13406553 5' + pogo 25 1 64.38 AGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGGATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTA:1 - chr3R 19992709 5' - hopper 1330 1 72.60 GGGACGGGTTTCGAGTGTTTCGGAAAAATCTAATTTTCCGTATCCGCAGCGTTCAAATATGGTGATTTAAGGCCCAACAAATTTATGAATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAATACTATAATAAACTTTAAAAATATATTAGGAA:2 + chr3L 13922382 5' - hopper 169 1 87.67 GTTCTTACTTGTTTTTCAACTGTGGCTATGTATGTGCCTGCCTAGTGTCTGGGTTTTGGTTACGGCTT:1 + chrX 11606779 5' - Tom1 117 1 69.12 CATGCTAACACACATGCGCAAAAAATCAACAATGATATATTAAACCAAAATAAAATGACAACAATGTTCTCACCATTTGTGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTAATCAATTGGCACCATGCGA:1 + chr2R 17370695 5' + 1360 267 1 54.11 ATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 14366538 5' - roo 339 2 66.44 AAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:2 - chrX 18409462 5' + jockey 4741 1 63.70 GGAGGACTATCCATATTTCAATGAGCTATTGCGACAGTGCACCGATGAATATCCCAATCATAGGGTGTGCTACATGGATGGATAATTTTAATAAAAAGTGTGTAGATGGATGGATAAATTTCATAAAATTATTACAAATTAATAA:1 - chr3L 11887948 5' - Tc1-2 1372 1 62.76 ATTCTAACCGTAAGATTCATTCATTAGTTTTAGCGAATTCGGCTGCTCAAACATACAACTTAAATCTTCCTTAATCGTAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGA:1 - chr2L 2816234 5' + Bari1 1660 1 69.60 TATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:2 - chr3R 7317679 5' - I-element 5305 1 51.37 AATCACCTCCATTCATTCTTAGGTAAATACTAGCTGTATATTCGAGATAAGAGTTCACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCT:1 - chr2L 9128934 5' + mdg3 5167 1 61.64 ATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 11191378 5' - roo 361 2 51.37 ATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGC:1 + chr2R 4362745 5' + F-element 29 1 64.38 TAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGT:2 + chr2R 12472016 5' - transib2 2767 1 56.85 TAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 14366547 5' - roo 330 2 73.97 TTATTGGGCAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr3R 27315073 5' + jockey 4679 1 73.83 TTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATAC:1 - chr2R 2745199 5' + Stalker 6930 4 77.40 TAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 21224515 5' + roo 38 2 59.59 GGCAATTTCTGTGTGGAAGTTGGGGCTTTTAGGGGGCGGTTAGAATACGAGGCCAAGAGTGACGTCGTTGGAAGAGGGTCAAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAT:1 + chr2R 15330437 5' - I-element 5046 1 56.85 TCAAGCAGCAAGCAGGAGATTTGTATTTGTTTTCAACATAATTTTGTGCGGTTTGGCTTCCGTTGCAGTTTACCTTTCGAGCGGTTTTAAATAAAAGCCATAACAGCGATATACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAG:1 - chrX 11252758 5' + transib2 2417 1 57.53 ATTTATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 + chr2L 7660876 5' - I-element 5329 1 65.07 TGGCAGTATGATCACACTGCGCTGTTTTTGAAAATAGTTTTTGAAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 18346554 5' - INE-1 580 1 78.08 TGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr3L 13365718 5' + BS 5026 1 55.48 GTGACACATGTCACTTGCCACATTTCTCACTCACTCACTCACCCATGCAAACAAACAAGCAAACACACACACGCACACAACAACAAAACACTCAGATACATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAATTCAAGTATCCAATAAGA:1 - chr3R 14177365 5' + Quasimodo 114 2 67.81 TTCTTAAACTTTTTTGTAATTTTAAGGTATTTCACTTCGTGGTCGCTTTATGGGTATGAGGACCATTGGTTAACACT:1 + chr2L 13247191 5' - rover 474 1 84.42 AAATGCAAAGTTTGGAGTGCACATATGAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - 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Cr1a 184 1 62.00 AAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 1279157 5' - roo 8985 2 80.82 CTTGCAATTTCATAGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGATCA:2 - chr2L 12286092 5' - INE-1 91 1 80.14 ACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAACTTTTAT:1 + chr3L 6447012 5' + transib2 28 1 60.48 AGAAGAGAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 12249904 5' - roo 9019 2 56.83 AGCATGCCGGTCAAAATAGTAAGCAGAGTGTATTGAGCGTTGACCACCCCAACACACTCTGTCTACCATTTTTTCCGG:1 + chr3R 2988393 5' - Circe 7390 2 48.72 AGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 - chr2L 14523257 5' + HMS-Beagle2 18 2 36.75 GCATTTCTGGGATTCTGCTTTATGATCTCCGGTGATGACCAATCAAAGAGAAATAATTTTTAACAGACAGAATCATAATCATTTTTCGCCAAGACATAATTTTAATCGATAAAAAGTCTATCACCAAATAAATAATAAAAAAACAA:1 + chr3L 16442276 5' + BS 5093 2 67.12 GAAACGTCTCATTTCGTAATGATGTTGCAGGAAAATCTGAAGAAGAAAACACACACGATAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACT:2 + chr3L 21112320 5' - 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chr3R 4679586 5' + hopper 26 1 66.44 AGGAAATAAACCGACATTAATTTTTTTTCGAGCAACTGATTCGATATCCTTGATGGCCCATGGGTGAGGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCG:1 + chr2L 20472080 5' + roo 8832 2 53.42 ATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 17940220 5' - 1360 3354 1 62.07 AAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGAT:1 - chr3R 15790083 5' + flea 4716 1 67.78 TTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3R 13406415 5' - pogo 2038 1 64.38 CAGGCCGGTTTGGCGGAAGCGATAACAAAGCCGCTGACACTTGACAAACTTGCGCGAGTGTCAAAAAAAAAATCTCCGCGAAATGGTCGCCAGTTGAGGCAAAGGGCATGATTCCAAAGGAAAGAGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 10114329 5' + Doc2-element 239 2 80.88 AACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 + chr3L 3501736 5' + Bari1 43 1 65.71 GAAACACAATATGGTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCAT:2 + chr2L 20821162 5' - Burdock 250 2 64.38 TATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAA:1 + chr3R 19450148 5' - roo 8724 2 74.22 TAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 7719834 5' + roo 8686 2 64.17 TATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGCCATATCAGTCATGATTGGATATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCG:1 + chr2R 16510101 5' + F-element 33 1 44.76 CAATATCTTTAATCCCACATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTTTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr3R 13973106 5' - 412 488 2 79.45 GCATACCCTGGTTCCCCTTGTTCGCAGCGTGGAAAAAGATAGACATGCGTGTGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTTGGAATCGACTGT:1 + chr3R 31887735 5' + HB 68 1 59.72 GTGTTGATATTCTACAAGTCATTTGCTGACTTAATTTCCAGCGCTTGAAACGGAATAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTG:1 - chr3R 11341562 5' + I-element 363 1 61.64 ATTAGGACGTTCAATTGCTATTGCATTACATAACCGTATTAATTTTTTAGAATCCAAAATGGGATAATTTGAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGG:1 + chr3R 20120651 5' + invader2 4923 2 52.74 TTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2L 12251015 5' + 412 39 2 54.79 ATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr2L 7593162 5' + jockey 4711 1 59.59 ATCTCAAAAAACTTTGCGAAACGGACTAAAAAAAAGAAAGAACAGAACCCTTTGCGATACACCAAAATGATAGTCTAAAAAAAAAGCGAACAGACATCAGTTTTCAACTTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr3R 14740340 5' + copia 32 2 72.60 CATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:1 + chrX 6475323 5' + Doc 92 1 76.71 GACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 + chr2R 3338787 5' + Juan 60 1 58.74 AACATAAAATTAATCAACAAATTTTTAGAGTTGCTTGCTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCTAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTA:1 + chrX 12518126 5' - 1360 3149 1 77.40 ATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chrX 19539457 5' + pogo 37 1 47.26 CAAACATATTCTTTAAGGGTTGAACAATATAAAAGTCAATATCAAATAAACTAAAAAGGAACATTGCAAAAAGACAATATTAATAGTGAACAATTAATAAAGTAAACTACTAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATAATTAA:2 - chr2R 18056116 5' - Cr1a 4313 1 73.29 CATTGCATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGAGGAAGGTTGATAGTGCCTTCCGA:1 - chr3L 21996277 5' - Transpac 5219 2 68.75 GTTGGATTTCAGTATTTTTCGTAGCATACTTGCAAGCGTCACTTGCACCATACACACTCTACACACTCACCCAATATCACCCAATATAACCCCGAAAATGAAATGATGAAATATCGCGTTCGCATTCACAATAGCTGAGTAACGTG:1 + chr3R 7874877 5' + INE-1 537 1 58.22 ATCCTTCGAGTCCGAATCTTTGCCCTCAATCGCTCGGATGCCAGATGGCCATTTGGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr3R 15807338 5' + FB 15 1 63.96 CTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chrX 7795538 5' + roo 87 2 81.51 AACACTAATGATGGAAAAATTAAACCTTAAACAACTCAATAAAAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTA:1 - chrX 23184341 5' + 1360 394 1 61.45 ATTTGCGTGGCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTTTTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 + chr2R 18316017 5' + HMS-Beagle2 6930 2 52.05 GTATATATACATATATATATTATTATTATTATTATATATTTGTGACCTTGTGATCTTGTGAAACAGCGTTTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTTAATATCAACATTTTAGCTTTTATTGTTCCTGAGATCTCGACATTCATACAG:1 + chr3L 19941126 5' - INE-1 135 1 53.79 TAATATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 17077208 5' + roo 8715 2 54.79 ACTTTTAAAATATTTAGTTGATTTGATGAATTTCCGCCTCTGTAAAACAACTTTGCTAATACCTTGTTACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGTTACAATACTGTAGAC:1 - chr3L 4156168 5' - Circe 7318 1 53.10 CTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 - chr2L 17180147 5' + Juan 38 1 47.58 AAGATAGTTTAAAACTTGAAATTTTAAAGATTGTGTATCTCTGCTTCCACAGATTAGTTTATGTGAATATTAATATTATCATTATATAAATAAATCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGAC:1 + chr2R 12283494 5' - diver2 4605 2 65.07 ATGAATGGAGTTAACCAGACAGTTGACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:2 - chr3R 20441374 5' + I-element 10 1 77.40 AATAAAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 + chrX 8027373 5' - Juan 4199 1 68.49 AACAATAGCTGTCGAGTTCAAAATGAGCCTCTTAAAAATAAGAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 7565416 5' + Doc2-element 217 10 89.66 CGGTACGGAACAAGAAAGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTA:1 + chr2R 18514843 5' - P-element 374 1 67.81 ATGCGAGTCCTCCTCCGAGGAGGAACATATCATCGGAGCAATACAGCAATCGAGTCGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCC:1 - chr3L 12780951 5' + G6 1712 1 62.33 GTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1 + chrX 18817246 5' - transib2 2794 1 65.07 GAATATAATTAGGTCTGAAGGAGGTCAACTCCGAAAGCTGCGAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGTATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATAC:1 - chr3R 3854496 5' - INE-1 28 1 58.90 GGTGAGTTATACACTAACATCATTAAGTATAAACAAACAATTTTTTAGAAAAGAGTTAAAATTGAAAGGTGGAGTTACTTCCATTTTTCATGTAGTTATTCTTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAAT:1 + chr3R 13367276 5' + I-element 4912 1 70.55 GGGAGTGTGGGGGAGACACATAAATATATTTGTCTTTTTGCTGCCTTTGGCCGCTTTTTCCATTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 12006321 5' + hopper 141 1 55.56 CTTAACGCCATAAAAGTGTTAAAACCACTTAGCAAGCCATTTGCCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACA:2 - chrX 17330852 5' + I-element 259 1 70.55 AGGGGGTCATAAGCACACAGCAGTATAAAAGCGCAAATGGATCTACATACATACGAGTGGAAACTATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATTCACACCGCATTTTTCTGTATGCTT:1 + chrX 13222399 5' - invader1 174 2 54.11 TATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 13158644 5' - roo 9008 2 62.50 GACGTTNCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr2R 9871545 5' + roo 82 2 75.34 CTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTATATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1 + chr2L 13585719 5' + Quasimodo 51 2 49.32 TATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr2R 6847834 5' + Doc 62 1 63.64 AGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr2R 5106278 5' + Stalker2 75 2 69.18 AATTGCAATTGATTGAATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 + chr3R 27405917 5' + diver 13 2 76.03 AGTGAGGCTGGGGAAAAACTTCAGTGGCAACTTGGCAATGACAGAGCCAAACTTTCTGACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTT:1 + chr2L 4713859 5' - transib2 2763 1 59.59 TGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr2R 24427536 5' + jockey 4688 1 70.08 AAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCC:1 + chr3R 4805639 5' - 1360 3315 1 77.60 TCAGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGC:1 + chr3R 15882540 5' + jockey 5 1 79.37 ACCAATGAATTTAAGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCG:1 + chr3R 12367497 5' + GATE 8117 1 53.52 AACGGACTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGGTATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCAACAAAGGGATCATATCTTAAGAACTATGT:1 + chr2R 5410962 5' - Tc1 1365 1 53.68 GCATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chrX 11661519 5' + pogo 15 1 71.20 TGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3L 13294953 5' - roo 317 2 79.45 TAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr2L 7581038 5' - Transpac 5192 2 56.85 ATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:2 + chr3R 20140488 5' + jockey 4743 1 67.81 TAACGGACTAACTTATATTTTTATTTGATGAAACTATAAATAAAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTAGGTAAAAACAAGAGACGAGAA:1 - chr2L 22106148 5' - 1360 3238 1 68.97 GATTACATTTATTATAATGATTCTTAGTTTTAACGACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCC:1 - chr2R 12185476 5' + accord 3 2 79.45 CTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - 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chr2R 15326324 5' - copia 249 1 49.32 GAAGAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 14980450 5' + roo 8684 2 71.92 AATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACAAATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 8308417 5' + roo 8739 2 75.71 AAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr3L 8627356 5' - pogo 2066 1 47.95 ATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3R 15882587 5' + jockey 72 1 60.00 TGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3L 16470355 5' + jockey 4716 1 58.47 GTCAGCCGAGATGGAGCAGTTGGACAACTGATTTGAATATGAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAACAAAAAATAATTTTTAGGAGACATAGTTT:1 - 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Juan 4194 1 70.55 ACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr3L 20711721 5' + jockey 4798 1 56.16 GTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTA:1 + chr3R 29690685 5' + I-element 5241 1 55.48 ATGCGTCATCTAATAAATATTAATTACATATCAACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 2989820 5' - roo 348 2 60.27 CTATATTCAAAAGCTTAGTGATTGCAAATAAAACCAATCTGCAATGAATTATGAATTGATGTATAATTTTTCATGCCACATTTTACTGTATATATCCCATCAGTTACCAACGTAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAA:1 + chr2R 18989022 5' + F-element 4437 1 36.30 AGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTA:1 + chr2R 12779646 5' - I-element 5271 1 73.29 GTATTAAAGTAGCTTCAACATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 - chr2L 3675946 5' - Juan 4163 1 54.79 GTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATA:3 - chrX 8125356 5' - F-element 4619 1 55.48 CTGGCCGCATCTAATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr2R 17796499 5' + jockey 4683 1 77.40 ATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTCATACGCGTTCTCGTCTCTTGT:1 - chr3L 19350019 5' + 1360 3230 1 43.20 AAATGTGTGTTTTGGTTCACTCTTGATTGGTTCCCTTGCTGGCCTGGTCATTTATTTCCCTGGCCTGAGAGATGTGTCTACGTCTGCTGTCCGTTGTTTTTTTTTTTCTCCTTTTT:1 - chr2L 5180663 5' - gypsy7 5008 1 65.52 ATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:1 + chr2R 9966945 5' + Bari1 27 1 43.84 CATTGAGGTAGGCGAATTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 11257458 5' - 1360 3371 1 73.29 ATTGTGGAGTAGTTTGCTTTGGTGGGGGGAGTGGGAAACCTTTAAAGCTTTAAAATTAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTA:1 - chr2R 10418548 5' + 1360 3104 1 70.55 AGTTCAACAAACTTGTTTCTACGTTTTTTTTGTTTTTACTCACACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTGGCTTGCTTGTGTG:1 - chr3R 19982275 5' - 1360 3259 1 72.41 ATCATACAGTTTGAGGAGCATTGTTGAAATGGCCTAAAAGTATGCACCACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGGAGCATTTATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3L 4219425 5' + jockey 30 1 63.70 AATCGACAAACAGTCGTAAAGAGGTGTAAATTTATATGCAAACGACCGAATCTCACACACAATTATGAAAGTTAATAAAATTATTTGCACACTGTACCCTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAA:1 - chr3L 21057804 5' + Juan 3762 1 61.64 AACCATCAGGCTCAAAACTATTGTCACTCATTCGATGATCCAATTCGCTCTTCCCTTATTTCTTAAGCTCGCCTTTGATCCCAAGCCAAAAGCTCGACCCTTATCGTGAAAGCTTCAGTGCTTGCATTTGCCTCTCTTTGCTGCTC:1 - chr2R 4897777 5' - gypsy7 17 2 73.97 GATGGAATGCAGTGAAAGAAATTACTTTGGCTAATAAAAAATATATTTCTTCTATGGCATTTCTACACATCAATACAACTGGTATACGAAGTTATTAAAAAAGATCAAATATATTTTTTTAGTAATAATCTTAATAATATTAATAA:1 + chr2L 3844944 5' + mdg1 7076 2 72.60 AATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTCTTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3L 11326757 5' + pogo 60 1 72.66 AAAATAATCAAAACATTCATAGATTGAACTAATCAGAAGAGATTATCAAGTGAATTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTA:1 - chr3L 16751749 5' - jockey 4842 1 63.01 TATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3R 4964183 5' + roo 26 2 59.60 AACGTTCCGATTTCAGGATCCTCATTTGCGTCCAAAAGCTTTTGTGTATTCTTTAATGTCCTCTGCAATTAAACAGATAAAACATGTCACATTTACGCTTAATAGGCGAAGCTGTCCCCT:1 + chr3L 25798681 5' + Doc4-element 2363 1 65.83 AAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAT:1 - chr3R 21276621 5' - BS 5030 1 60.27 CAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr3R 30347385 5' - P-element 2839 1 36.70 AAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:3 - chr3R 19992742 5' - hopper 1362 1 52.74 GATCTTTAATTACATTTCGTACTTACACATTGATGTGTGTGTGTAATTGTTTACGATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTATAGAATGGATATGTTAATATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATA:1 - chr2R 4189139 5' - S-element 1701 1 75.34 CGTAAGCTACAGTTTTTCTTTATTTAATTAAATACTTTACTAAACCCAAAAATTATGTACGAATAGAAAATTTGATTTTATATAAAACCGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCATCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCC:1 + chr3R 4704948 5' - 1360 3322 1 58.90 GGGATGTGTCGAGGTCCTAGGGCAGAACAAATCAAACGTTAACTGTATTATGTGCCTATGAATTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 29084965 5' + 412 7095 2 61.32 GGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTT:1 - chr3L 23513841 5' + Juan 77 1 71.01 AAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 + chr3R 24729538 5' - Juan 4190 1 56.85 AATTGTTGTTGAGCAATGCATTAAGTGCACAAATGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGGCTATTGAGCCAAAAAGGATAGAAGAAATCTTTGAAATAATTAAATTACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATTT:2 - chr4 905656 5' + Helena 4 1 73.29 AAAGAACCCCTTGAAGGTATTTCGAATCATTTTGGACCATGTTGGTTAACTATTTAATAATCGTAAAGGCGTTGATAATAACATTTTATTTATTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 - chr3L 8673413 5' - I-element 5321 1 58.22 CTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGAAGAAATAACAAAAGGGGGGCCCGTTGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chrX 18282660 5' + P-element 26 1 43.37 ATGTTCACAGTACGCATTTGTAAAATAAGTGTTCCCGTCGAACGATGTCCGTCCCGGTCAACTATGCTAGCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATT:1 - chr2R 18164522 5' + roo 410 1 52.05 AATTTCGGTCTCATTGCCAGTGTAAAATTGTAATTTTTACACCTTCACACCGCCCAATAAACAACAGGTTATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCTAAAGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACT:1 + chrX 5200171 5' + 1731 396 1 63.01 TCATCAATCATGCTCTAAACTTATGCTCATTTATAGGCGAGCGAGGTGCGCTTCATGAGTTTCTACGAACAATGTTTACAAAAATACTTACTTTTAATATTAATACTAAATCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGCAAT:1 + chr3L 2474394 5' + HeT-A 5936 1 52.08 GCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chrX 6475291 5' + Doc 60 1 54.79 ATATTGCGTGTTTAGTTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 7795649 5' - roo 9047 1 68.49 CTGAACATAAAGAAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 - chr3R 30813416 5' + FB 72 1 67.81 CAGTTAATATGAAAGCGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAG:1 + chrX 3431825 5' + Ivk 5313 1 71.64 CGGCAGCATGTTTCCGCAGCGCTTTGTTGGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGCATGGAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATAT:1 - chrX 18742916 5' + invader4 2808 2 55.48 ATAATGCAAAAAGTATTGCACATAATGAGTGCCGCTTCAGTTTATTCAGCTCAAATATTTGCTTGACATATATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGCCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 5533048 5' + roo 8709 2 54.11 ATTTGTTAGGCTGCAACCAAAATTGTCGAGGGGAAATTGGTTTGGGTTGCCTGCTGGGGGTCCGACCCGCTTTTTTTTTTCTTTTTTATTATTT:1 + chr2L 12245744 5' - BS 5098 2 84.04 GTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chrX 585707 5' + Tirant 49 2 68.87 AAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTA:1 + chrX 14450392 5' - hopper2 1550 1 57.53 GGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:3 - chr2L 11839730 5' - mdg1 7379 2 67.12 CCTAATGCTTCATTGTAACAATAATAACAATTATTTTTTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTGTTTATCTTGTTCACAGAGATAAATAAGGTTTTTAACACATATACATATGTGTTAGTGTCTTTTCGCTTTTAGTTGATG:1 + chr2R 19530000 5' - Porto1 90 1 77.40 ACTATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAG:1 + chr3R 19449906 5' - roo 8648 1 65.38 TGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:2 + chr2R 17796558 5' + jockey 4742 1 65.75 ATTTAATTACACGCCAAGCAGAACATAAAAGACCCAAAATTGTTTGAATTACCCGCGTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTCC:1 + chr3R 20674187 5' - Quasimodo 7259 2 61.64 AAATGATATGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 8959739 5' + 1360 8 2 77.14 ATGCGGCGAGCGCGACATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chrX 18282593 5' - P-element 2835 1 45.52 CTTTGCGTTCGGTGTCTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTT:1 + chrX 4203432 5' + hopper 148 108 78.95 ATTGGAATATTTAATTAGTTGATTTATTGGGGTACAGCATGTTTTGCTGTTCTGGGTTTGCCCTCGTTTTTCCCTCGAGGTTTTGGTTTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTC:1 - chr3L 12998070 5' - F-element 228 1 77.24 ATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 9871597 5' + roo 8676 2 75.00 CACCACATCACCCAACACCCTCATGCCCGTCCTGCTCTTTGTTTTGTGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACGACACACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTC:1 + chr2R 8815038 5' + Tirant 306 2 65.07 GACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCACTA:1 - chr2L 8338217 5' - P-element 2843 1 53.28 AAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGC:1 - chr3L 13739645 5' + BS 5068 1 67.81 AAGCCATAATAATGATATAAAAGCTAGGTTGAGATTCAGCATACATATTCTACAGCAAAGACGCAGCGCAAGTTCATTGACTATCTAACGATATCTAACGAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAA:1 - chr3L 21605416 5' + F-element 40 1 60.96 GAATGGATGGCTGCCACCAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 - chr3R 25433414 5' + transib2 31 1 64.38 ATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTA:1 - chr3L 25968628 5' - invader1 3984 2 67.12 CTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAA:1 + chrX 3431877 5' + Ivk 5377 1 59.59 ACCGGCTCTATGTCATCAAATTTCTCGCTTCATTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTGGGGCTCCGTTC:1 + chr3R 24090463 5' + roo 33 2 62.24 TATGTACATATAAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 981771 5' + 1360 1 2 56.85 AGCTAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:2 + chrX 18817296 5' - transib2 2744 1 71.92 GTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 9002920 5' - roo 9002 2 63.70 TTTGTAGATAAATAGTTATTGTATTGGATTATCGTGGCAAAACCGAGGAAAAGGGAAAAGCAGCGAGAGAAATAATCACAAACAAACCGAAAGAAAGAAAGCTTTAACTAAAATATGTTTAACTATACTATATACATACATATATA:1 - chr3L 3828900 5' + INE-1 65 1 69.18 AGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr2R 6847827 5' + Doc 82 1 71.72 ATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:2 - chr2L 18549908 5' - roo 326 2 71.92 CAAGACCAATCCTCCAGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 - 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chr3L 17220897 5' - Doc 4654 1 58.22 AGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chrX 10521616 5' + Tabor 47 2 52.41 ATTTTTGTATGCTTAAAAACAGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 - chr3R 11469423 5' - Tabor 442 2 56.16 GTCTCGGCGCAGCCAGCAAATGAAAATGAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTT:1 + chr3R 26504166 5' + HMS-Beagle 6809 2 76.71 AGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chrX 18409464 5' + jockey 4708 1 52.17 AGGAGTTTGCTGCCATTGCTATGGTCACACAAAAAACATGATTCCTAATTTATGAAATTCCTTTTTCTACTGAATGAATTTTAAAGTGGAATTCGCATGAACTCGTTGGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCT:1 - chr2R 15195130 5' - Burdock 5949 1 71.23 AGAAGGCTGTGCATTACCCTTTTTTATATTTCTTTCACACCTCATAACGTTTGTAGGGTTTGTCAAAATTTCTGGATTCGAATTTTGTTGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAA:1 + chr3R 18598709 5' - 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chr3R 13973100 5' - 412 7535 2 76.71 TAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTAT:1 - chr3R 24219392 5' - roo 9034 1 58.22 GGCCAAAAACCAGGCGAATGCCAGACACGACCACCACGAGGATGTAACTCTTGCCAATGTTGCCCGATTTGCGGAGCAAAGCCAACGCATTTAATGAATGGGAATGATTTTAATTCAGATATTTTTGATACTAAGTCTCAAACTCT:1 - chr3L 14317198 5' + transib1 1769 1 72.60 ACTGAGCACCTATTAACCCCAAACCCTCTTTTCCACTTTGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGACACTTTGTACATT:1 + chr3R 25433275 5' - transib2 2771 1 53.42 AAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGT:1 - chr3L 12315827 5' - transib2 2767 1 55.48 CATCTCAACGTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTA:1 + chr3R 29690676 5' + I-element 5232 1 61.64 TTTCAATTCAAATTTGAGCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr2L 4003833 5' - mdg1 410 2 74.48 ATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:2 - chr2L 15940309 5' - pogo 2036 1 63.01 ACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 + chr3R 17673711 5' + FB 26 1 68.28 TTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 18396045 5' - roo 9046 1 57.53 AGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 + chr2L 16539637 5' - Juan 4169 1 55.17 AAACAAAAACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTCCCATTTTGTCCGAATATTTGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chrX 6839189 5' - 412 463 2 47.06 CAACACACACACACACAATAAGATCCAAACAAATGCAAAAACCAAACTAATGCAAATTCGTAAATAACCGCAAAACTGTTTTCGTCTCTAACCAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAACAA:1 - chr2L 3828518 5' + Porto1 293 1 71.23 AGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGCACATCTGCCCATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTT:1 + chr3R 19450162 5' - roo 8861 2 60.61 CTGAGTTGAGCACTACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr2L 20205333 5' + P-element 84 1 15.32 ATAATAATAATATTGCCTTTCCTAATTTTACGCAATCGAACAAATTTTTTTGTTTTGTGTGTTTTTATACTTTTTTGTTGTTACTTCTAATTTACGCGTGTTTCCTGTTTTGTCGGGAAATCCGTCGCTTAAGAGAGAGAATATAT:1 + chrX 7690725 5' - G4 54 1 71.23 TTTTTTATAATTTTTCGAATTTTTTCTTATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGATGACGAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAGCTCACGCTAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTGGACCATAGCATTCTC:1 - chr3R 29553965 5' + INE-1 573 1 78.57 GGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3L 8959730 5' + 1360 23 1 67.81 GCTGGCAAAATCGAAACAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 13158611 5' - roo 401 1 76.03 CTGTTGCCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGAC:1 - chr3R 30987602 5' + F-element 109 1 55.48 AAGCCTTGAACCACAAACCTCGCGAACCTCGCAAACCCCAGAAACCCCAGAAATTGGTAACAAGCAGCGCTAACTAACCAAACCAAACCAAACCGATGCAAAGGACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAA:1 - chr2L 20702114 5' - Cr1a 197 1 77.14 CATCTTAAGTATTTAGGCTCAACAGTCCATGCACCACTTCGCAGACCAGCAAGCTCCAGGGAAAGTTGGCTATTCAAATCTGAAACAAGTGGTGTTGTCAATTTCAAATTTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGG:1 + chr3R 10002362 5' + R1A1-element 79 1 81.51 TGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCNNGCAGATTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 15790998 5' - roo 397 1 60.23 GAGAACGGGTTAAGTTTTCGAGCGATATATGTATTAGCCGAACTGCGTATTCAATACCGCAGATGCACACAAGCAGAAGGAAGCGTGTCCGACCATATAAAGTATATATAAAGTATAAAGTATATTCTTGATCAGGATCAATGGT:1 + chr3R 4131085 5' + INE-1 86 1 51.72 GACCTTCTTTCAATTCCAATCCACCTCCTTTTTTGGGCAACAGTGAAATTTGCTAGACGACTATGTAAAAGAACTTGCAGAGCAATTAACGTTAATTAAAATATTTTTAATGT:1 + chr3L 17099747 5' + NOF 345 1 75.22 TAAAAACAGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTTTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 - chr3R 11469410 5' - Tabor 450 2 56.00 AATATATATATATATATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCTCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGGGATAGTCGGGGAACTCGACTATAG:1 + chr3R 18030719 5' + INE-1 566 1 68.97 GGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGG:1 - chr3R 16533698 5' + X-element 4427 1 46.58 GGACGAATTACGCATCTTGTTTTTCTAGGTCGGTTAAAAAAGAAATAACTGTTAAAAGTTTTAAACTGTAAAAACTGTAACAGACAAAACATGAGATTAAGCTATAGACGACTTACCCGACTATCAAATACCCGATACTCAGCTAG:1 - chr2R 556263 5' - INE-1 543 1 75.34 TGAAATCGATTTTTGTTGTTCTGTAAATTTCTTGTATTCCGTTGGCTTTTAATTGCCGTGACGTGTTTGTTCTACCGGTTTTTCCCACCGACGCACTTCGTTTTTTTTTGGGCAGTCTAAGTATTTATGTCATTATATCGTTCTT:1 - chrX 3063970 5' + transib2 45 1 57.24 CTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 + chr2L 18347304 5' + transib2 80 1 73.29 GGATTCCGCAGACAACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2L 16690773 5' + P-element 10 2 77.40 TTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr3L 8959677 5' + 1360 60 1 69.23 GTTCGATTTCAGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:2 - chr2L 13158736 5' + roo 8729 2 63.01 TTTCATAGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGATCAAGAATAA:1 - chr2L 12286085 5' - INE-1 84 1 80.14 AGGATAAAAAGAAAAGTTTTTGTCTTGTGCAATTTTTCGTGGTTCGTTAAGATTCAAGATTTGGTTGAACAACCAGGTGAGTGTACTCATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 18617527 5' + roo 8667 2 56.85 AATATAATATAAAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:1 - chr2L 6654756 5' - diver 6059 2 52.74 ATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 2544615 5' + Tirant 62 2 59.59 CTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chrX 8437688 5' - P-element 2792 1 21.23 GTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 15791008 5' - roo 9026 1 55.30 GAGGAANTATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGT:1 - chrX 14722198 5' + diver 70 2 64.14 CATTTTGGGCATAGACAGAGCTTTGACGTCAGATATCGGGCAGTTTTTGTTTATGATTTGGATGTCGGGACATGTGAGTTATGGGTTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGT:1 - chr3L 11714466 5' - Ivk 4920 1 62.33 GGGAGTTCTCTTTTTATGCCAAAAAAGTTTGGTTTTCGGTTTTTCTGTTGCTTTTTCTTGTTCTTTTGTTGGTGCGTATTTTTCTCCTTATTGTTTTTCTTATGTTTTTTTGTTTTTTTTTATTTTTGTTATTAT:1 - chr3L 18019132 5' - Rt1a 5076 4 66.67 CCCCATTTTTGTGGCTCCTAACACTGCGTTAGCCGCAATTAAACTAACTTAAAAGATCCAAGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACAAAAGAACAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAA:1 - chr3R 13303449 5' - Cr1a 368 1 55.83 GTTAAGGATGAAAACTAGTGGCCCTGAAGTGGCCGTTAGCGAGAGTATTTGAGCTGCTGCCTGGAAGAGATGGAGTCGCTCCAGTTGCTGTGCTGAGGACACCAACAGGATTCACGAAGCGGGGAGTGAATGAGCTGTGTCTGCTT:1 + chr3R 2689330 5' + diver2 4465 1 44.52 TTTTGTTTCATTTGTAAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr3L 11913151 5' + BS 5017 1 69.86 TGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:2 + chr2L 14671796 5' + FB 37 1 60.27 ACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 11810636 5' + roo 8712 2 57.25 ATTAATCTAATCATTTAATCAAAAAACAACTTAACTGTTGTAGACAATAGGTAATTAGGTATTAATAATAATACAAAAAAAAAA:1 + chrX 11519494 5' + Rt1a 5074 1 76.19 AAAGCGATCGATTACGGAAGGCACTAATGTACAGAAAGATCACAAAGAGTATGCTGCCCACATAGAGATATACGTAGAATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAAAACAATAAATGATTGGGT:1 + chr2L 3277564 5' + Stalker4 6984 4 52.05 ACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTTAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTT:1 - chr3L 20187420 5' - FB 480 1 51.08 AAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr3R 16157257 5' - pogo 2064 1 56.16 GGTCTGACGTTGCTCTCCTGTGTCTCCGTTTTGTTTTTGTTAAATTGTTAAAATAGTTGGTAATGAATTGAGATTTAGGTATTGTTGGTGTGTTTAGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGG:1 - chr3R 10119287 5' - I-element 4918 1 63.01 TTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTT:1 + chr3R 21276546 5' + BS 5070 1 66.44 GACGCATGTGCGTAAATACAGTTTAAGTGCTGCGGCAAAGGGCTTACGTATCAATATCCAAAATGGGAGGACGAGTTGGAGGACACTTCACGCCTTCATGTGACCATTAAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGA:2 + chr3R 25572692 5' + F-element 108 1 78.08 ACTCACACTGTTTTTTAACCCACTCCGGTAAAGTGCATCAATATTTTCTCACTTTTATTACTGCATGTGCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAATGAATCG:1 + chr2L 3233953 5' + roo 8718 2 54.29 ATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATC:1 + chr2R 16510114 5' + F-element 25 1 41.67 GTATCTGTCTACTACTACCGGACGGTCCAATAGCTCGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCTCAATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTTAATAACTCGGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGCCGCTCGCGATT:1 - 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Tc3 241 1 52.74 CATTTTATTTAGTTTGTCATTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:2 + chr3R 25428102 5' + 297 6589 2 76.71 GAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATC:1 - chr3L 13739647 5' + BS 5066 1 66.44 AAAGCATTCATGGTCTTCTAAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 9809234 5' + 412 7101 2 51.37 ACAAGCGTTGAGCTCCAAGTCGGACTTGCATTCCGACTTCATTTGGAGCTGAGAGCCGAGCCACAACTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTA:1 + chrX 13170643 5' + roo 8994 2 54.79 TTATATTATTATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAG:3 - chrX 19819762 5' - Tc1 1644 1 26.03 ACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 14366536 5' - 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chr3L 11442518 5' + hopper 151 17 71.58 AATTAACAAATTAATAAATGAAAAAAATTATGAAATTATGTGGGAGAGCGAAAGAGTTAGAGCTAAAAGTGTAGCTGATGTGCATGCCTAAAACAGCACCAAACAGCATTGCGAACAACGCTCAAAAGGGAGAGTGAACAAA:1 - chr2L 2669140 5' - Cr1a 212 1 75.35 CAGCCACTTACACACTCGCCCACGCACACACACACACACACACACACACACACGCAAATACAGACAGGGGGTATCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTTATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 + chr3R 19963420 5' + hopper 46 1 45.71 ATACAGTTTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:4 - chr2L 13556498 5' + transib2 5 1 76.71 ACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACA:1 - chr3R 905027 5' - rover 283 2 66.44 AATATTAAATATACAAGAAAATCCAAGTTTATGATGATCGCTATCATCGGTTGATGATAGCGATCATCATAAACTTGGATTTTCTTGTATATTTAATATT:1 - chr3L 23583097 5' - S-element 157 2 59.00 TCTCACCCCGTCTCTTTCCCACATCGCCATCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCC:1 - 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chr3L 25401034 5' + Doc 6 1 65.81 GGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chr3R 16630340 5' + FB 49 1 63.72 CCACTAACCGCTTTGGATGATTCTTTGACATGCGTCGAAAACACAGAAAAGCCGAGACTGCCTGACGCCTTCTTATTATCCGCTTATTTATGTTTATGCTTAGGATGCTAAACACAGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:2 - chr2R 24971466 5' + 1360 2 2 58.90 TGATCAGAGCGAGATGGAAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 + chrX 12066087 5' + transib2 3 1 72.97 AGTGGGAGAGAAAAAAAAACGAGTAAAAATGTCCGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTGTTTTACCACTCGAC:1 - chr3R 26774153 5' + hobo 17 1 73.24 CTTTTCCTCATTTATTGCAGGCTTGCAGCCGCAAAGTATGCAATGAATTTCATGTCGCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAA:1 + chr3L 3501670 5' + Bari1 8 1 69.18 CTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTGAGGAATCTACCCCAAAGTGCTTATAGCTTATAGTCCTTACTGGCAACGTTTGGGGGGAATTTTTGCCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAAGC:1 - chr3L 10133535 5' - HB 1224 1 63.01 AATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr2R 18258784 5' - Juan 4153 1 56.85 AAATAAAACAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr3L 16437282 5' + F-element 38 1 52.74 AGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTT:1 - chr3L 24368824 5' - invader2 199 2 62.94 CCTGTTGCCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 - chr3R 30987603 5' + F-element 107 1 56.55 GAAAACAATCTGCTATCAAATCGATATCAAACCAAAATCTCCATTCATCCGCATATACATATGTATGTACAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCA:1 + chr3L 8570191 5' + Porto1 314 1 53.42 GGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACA:1 + chr2R 15004739 5' - 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chr3L 10425908 5' - I-element 5318 1 54.79 TGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2L 15936759 5' - copia 234 1 53.42 TGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTTTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 + chr3R 9038932 5' + Juan 4074 1 61.38 TTTAGATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGGGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 - chr2L 22674855 5' - mdg1 336 2 76.39 ATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATG:1 + chr3R 20140500 5' + jockey 4751 1 77.62 CTTTTAACAGAGTCCTTAAGGTGCAGCATAAACAACTTGTCCACATAGCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2R 1089342 5' + 1360 61 1 71.32 AAATTATTTAGTTGCAACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:1 - chr2R 330249 5' + HMS-Beagle2 28 2 65.07 TTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 + chr3L 22890331 5' + FB 38 1 57.53 ATGTAGGCCAAGTTTTTAATAAACACCCGACACGCAAAAGTTTTTTGGCACGCACTCACACACACACACACACACATCGCAACTAACACACTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 7300275 5' - roo 9046 1 64.38 AAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2R 10411467 5' + 297 43 2 55.48 AATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGGGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAGT:1 - chrX 1341748 5' + 412 7099 2 52.74 ACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 - chr3L 16470325 5' + jockey 4734 1 82.08 TGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAG:1 - chr3R 1844855 5' + Cr1a 165 1 55.48 ATTACGAAAGTTTGCCGTGGCATAAGAAAAGATATTTATTCAACAAATAGATTGCAGTGAGAAAATTCTGAATAAGCTGCAAAAAGACCAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGC:1 - chrX 9867931 5' + micropia 5276 2 63.45 TGATCAGAGCGAGATGGAAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 + chrX 12066087 5' + transib2 38 1 55.48 CTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGTCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGGTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAAT:1 + chr2R 4188992 5' + S-element 64 1 64.38 AGATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:2 - chr2L 19675107 5' + 297 19 2 72.60 ACATCCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2R 10411483 5' + 297 6606 2 65.07 GTATTTCTATTAGATATTTATCTATACGATCTTCTCTATAGCTTAATTACATTTATTCTCTCATTTTATTTAAACATTCGTTGACAATTTTATTTAATAATAATTTGTATTGAT:1 - chrX 17041941 5' - invader2 433 1 22.81 GATGCTCACCTGGACCGAACAGATGGGTTATCCGGTGTTGAATGTCTCCAAGGTTGCAGATGGTAGTTTTAAGGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 13300842 5' + roo 8711 2 53.42 GATCATGATCTTGGTCGCTGTGGGATCAGCGGCATCTGGTGCAGTTCAATGACGGAGATTATTCCGCTCCGGAATGGGGCGCGCTGTGTTTGGATGCCCCCGGTTCACTTCATTACACATTCGTTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTT:1 + chr3R 13705457 5' - Doc2-element 246 2 66.90 ATCCGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 + chr3L 21380529 5' - I-element 5285 1 67.81 ATTTGAGGTAGGATGCTCGAGTTTAAAATCTAGGCCAATCCTAATCATTGAAGAACCATACGTTAGTATTTCAATCATGTTCGGTTGTGCTCTCAACGTGGCGACAAATTTCGTTTAACCATTATACCAAAGACACTAGAATAATA:1 - chr3R 26140389 5' + Tc3 240 1 73.97 ATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:2 + chr3R 10931585 5' + 297 18 2 68.49 AATAAAGTTTTCAACGTCTATTCTCCCGAAAAGAGATGTGTCTATTCTCCCGTTAAGAGAGGAGCTCCCGAAAAATGGGAGTAATTGGAGAATCCTGTTTATTATTGAATCTTGTACAATTAATTTTAGTTTGTATGGTAGATAA:1 - 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Tc3 1473 1 67.81 TNTTTATACCAATGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 - chr2L 15913367 5' - transib2 2800 1 67.14 CTTGTTAATTTTCAGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAA:1 - chr2R 4545190 5' - invader1 3555 1 66.44 ATTATACCACAAAATCAAAAAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr2R 4576113 5' - I-element 5344 1 63.01 AACGGCGATTAGATCATTATATATTCGAGAAATATTTGTTTCATAACTTTGAATTATATTTAGATGTAGATTAGATATAGATATGTTTAGGTTTAGGCTGTGGCCTCTTTTTGTCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 - chrX 12066265 5' - transib2 2818 1 77.40 TGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTA:1 - chr2L 17180157 5' + Juan 50 1 48.63 GAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 18549797 5' + roo 8684 2 68.15 CTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chrX 13779029 5' - P-element 2857 1 60.00 AACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3R 17421317 5' - pogo 2054 1 56.16 CACCTTACTTAGTAACAATGTATAGCTAAACTATGTAATTCGATCGACGGTGTGGAGTAGCCGTTTAAGGCAATTTCGAGCGCGAAGCTACAGCATTAAAAAAAAAGAAAGAATGCGATAGTCGAGTTTCCTGACAATCAGATACC:1 + chr2L 21622121 5' - INE-1 557 1 71.92 AATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATA:1 - chr3R 21276639 5' - BS 5055 1 46.76 ATTTGATACCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCT:1 - chr3R 10970383 5' + G-element 18 1 68.49 AAAGAATTTCATTGCATTGTCAATTAGGTCATTGTATTCAAGTACTACTTAATAAGCAATTTCTAATTTTAATTAAAGCCTTTTTGCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chrX 696611 5' + FB 37 1 57.53 ATACTATTTAAATTAAGAAAATACAGTGCGATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTT:1 - 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I-element 4908 1 59.38 ACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATAATAACATGGCAAAAACAGAAACATAACAGCGCAATAAACATATAAA:1 + chr2L 4888742 5' - BS 5034 1 56.25 GTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAAT:1 - chr3L 22035590 5' - 1731 4546 1 74.29 GATTTGTTGTTCCAAGCAGAAGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 + chrX 2214210 5' + jockey 4771 1 76.09 AGTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chr3R 4805607 5' - 1360 3326 1 60.27 ATTCGCACATTTGTCTGGCTACAAGTCTGTATTGCCTGCCGTGGATGTGATATGGCATGGTGTGGTATGGGGTAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCAC:1 - chr2R 6805799 5' + F-element 4343 1 54.11 GGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 - 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mdg1 36 4 70.55 CCCGACGACCCTGTTGCCCCACCTCTATCACATCGCCCAACCAACCACCCACTCATTGCCATGGCCCACAGCAAATTCTATTTACCAAACTAGTTACCATTAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAG:1 - chr2R 14438909 5' + I-element 395 1 69.86 AATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACA:1 - chr2L 17005816 5' + Stalker2 7287 2 54.07 AAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCATGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTATATATTTGATATGAATGGCCATACCTTT:1 - chr2L 15936854 5' + copia 4927 2 60.61 GAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 - chrX 14722195 5' + diver 68 2 65.00 ATCAAATACAAAATTAATAAAATTAATAATATAAAAGAAATTTATATTTTCCAATTGTAAATTTCAGTAAATGGGTTTAAAATATTAATGTTGCCAAGAGTAACCCCCCAGTTCCACTTTTCATTATTATTATTATTATTATTATT:1 + chr3R 2336614 5' - mdg1 31 10 70.55 ATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - 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chr2L 13844247 5' + Stalker2 7321 2 65.07 TCATCATTATCTTGAAAGATGAAATGTAAGAATGTTAGAAAAAGTTAAATTTTTCCACTTCTTGTGAGGGTACGCTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 + chr3R 1563101 5' + blood 7090 2 54.11 AAGCCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAGTTTTT:1 - chr3R 17673851 5' + FB 51 1 51.03 ATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3R 19032600 5' + roo 8728 2 65.07 GCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3L 18931068 5' + I-element 50 1 50.00 ATGCCAAATGTTTAAAAATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAAT:2 + chr2L 3675805 5' + Juan 4045 1 67.12 AATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTT:1 - 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roo 9004 2 61.64 ATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGAGCACCCATT:1 + chr3R 22642310 5' + blood 89 2 74.66 ATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCA:1 - chr3R 22590597 5' + rover 6995 2 54.79 ATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 + chr2R 17796560 5' + jockey 4744 1 67.12 AAACATNGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3L 18505778 5' + I-element 25 1 67.81 GCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGC:1 - chr3R 30987578 5' + F-element 123 1 58.09 ATAATATCCATATAAAGTAAGAATTTCAGATACATTTTTGGGACATTATCCTCTATATCGACTGACTTGCTGATCACAAAGATATTATTAGGTAAATATTATTATATTATAATATTTATTATTATTATTATTATTATTTATTATTA:1 + chr2L 5776668 5' - flea 5002 2 68.49 ATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGC:1 + chrX 8027435 5' - Juan 4137 1 70.55 AGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2R 14051754 5' - roo 343 2 62.33 ATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:1 + chr3R 20140488 5' + jockey 4743 1 66.44 ATGCACAGTTCCCGGATCCGGATTCGAGTGCGGCCGGGCTCCATTTGGGGGGAAAATGACGCAAGTTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAAT:1 - chr3R 28442893 5' - 17.6 7324 2 54.79 ACTTGTAGAACCGGGAGAGTTCGGCGAATTGCCCACTGCAGACATCGTATCTTGGCCCACTGTCAGATCGGAATTATCTCTTCAACAGCTGCGCCCGATATTTACCTCTCTTGGGACTGGTGGTTCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chrX 2104451 5' - gypsy7 5008 4 59.59 GTGCAGATGGCTCTTTATCTAAAAACGAAATGAGTACTTCAGTTAGGTCGGTATTCAGTGATAATAGGGAGAAACTATTTTCAAATTACTAGTAGTAAGCAAACATCCGCTTGAAACGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCACGCTCCT:1 + chr2R 8597830 5' - mariner2 150 1 65.07 GGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr2R 8735705 5' + mdg1 8 2 75.00 GGTTGCAGATCGTCATTTATTGCATTCTAAGACTGAGATATCCACCCTCTTTCTCAGCTATTGCCTTTTCGTCTATGTTTTGATATTTCTTCTTTAACATAATGGATTCCTAAGTCTTT:1 + chr3R 24325305 5' - G4 3558 1 64.71 ATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 11062848 5' - roo 9026 1 51.37 CATTAAAAACCCAAAGGGTTAAAATAGTGAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 21224491 5' + roo 8678 2 76.03 AGGCCGCGATAGGTCGAACCTTTTATCCGTGTTAAAATAATCTTGGCGAATATAACTGTAGACATACAAAATAATTAATAAACAGACTCGTAAATACTTTTATTCCAAGATTTCTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTG:1 + chr2L 7715565 5' - F-element 4391 1 74.48 AGTTTCGCGGAAAAGCGATGGGGTTTTTCGGGTGGACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 - 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chr2R 4387445 5' + INE-1 85 1 75.34 AGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 3920571 5' - roo 329 2 72.60 AATGACACACACACACACACAGATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:2 - chr2L 18786533 5' + 297 6580 1 79.45 AGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTTTATTCTCTCTGATAACAT:1 + chr2R 3338785 5' + Juan 41 1 36.51 ACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3R 15882606 5' + jockey 92 1 73.29 ACGTCATCGGGCGAAAAAGGTTCGTCATGACTCAGAGTCGAATATCGAGGAAGCCAGACTTCAAACAGCTGGATCGTTGTTATATAAACCAAGTCAAACACTACACCGAACTTATGTAAGGTTATTTTATTTTATTTTTTTTATAT:1 - chr3L 7807990 5' + transib1 1906 3 82.88 AAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTGCCATTATTTTAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2R 10411473 5' + 297 6618 2 59.59 GACACTCCACGCTAATGGAAATTTTATGATAGTTGCGTTGACAATTTTTATGCAACCGAAATAAAAGCCAAGGCAGCCCAAAGTATTTTTCCAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 22400646 5' + 1360 5 2 66.90 AAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGCCCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 - chr3R 26504322 5' - HMS-Beagle 198 2 51.80 TTTTACGAGTTCTCGATCCGGTCGTAATAAAAGTGCGAATGTCGGTGGCAAGGTGACAAGTTAGCGGTTATTATTATGCCAAACGCCCACCCAAACAAAAAAACAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGGAAA:1 + chrX 6515380 5' + Doc2-element 245 1 71.32 AGGGGGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAAT:1 + chr3R 9038898 5' + Juan 4041 1 60.96 GAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3L 2145982 5' - roo 338 2 63.70 CTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 - chr3R 20441298 5' + I-element 86 1 73.97 AGTGGCAGACATTTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTATGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chr3L 13836612 5' - 412 7483 2 61.64 ACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chrX 7795631 5' - roo 9029 1 56.16 GCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chrX 19539474 5' + pogo 54 1 57.53 GATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTT:1 - chrX 22689430 5' - 1360 3364 1 50.77 TTCCATTACCAAAATCACCAATCTTCGCAATTAAGCAGCTTTTAAAGGTATTCTTAAGCAAACAAAAGTTCAGAACACATTTAATATACAACAAACACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 12986880 5' + roo 25 2 56.85 GTTTTCTATCTGCTGTTGATTTTAATGTTTAAATGCAAGTACCTTTCTAGTTAATGCTTGTACTTTCCTAACTTAAAATATTCTAACTAGATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGA:1 + chr3R 16153263 5' + pogo 1809 1 69.18 AAATCGTTTTTGATCCCCAAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 24219236 5' + roo 8692 2 66.44 TCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 15790817 5' + roo 34 2 52.41 AGCAAATCGGTTTTGAAATGCAATAAAGCGTGATTTTCCAAACTGAAGCGTAACGAGCAACGAACGAGCAGCAACAAAGGCACCATATATATATATATATATATATCCAGTTAGACATATACATATGTATATGTATATGTATAAAT:1 - chrX 10101185 5' + Stalker4 7200 4 72.60 CACTACCACACCGGTTGAAACCTTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGCTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGGTAGCTGGGG:1 - chrX 18370813 5' - Tirant 153 2 76.98 TTCATTAGCTTCACATACGAATCAGTGTAATGTGGACTAAAGGAAGCAGTTGCATAACAATCGAATCAATTTACAGCTTTGAAAACCGTCCACACGCACACAGCAAACGAAAGAGAAAAAGATAATGAAAAAGAATGAGAAAGCGA:2 - chr2R 17412241 5' + invader5 202 2 54.11 GTGGTGTCGGGTAATTTAGTTCGAGTTTAGGCAGATAATTTACAAAAACAACATCGATAAGTCGTCCTTACGAAAAATGCAAAACAATTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACAG:1 - chr3L 3835288 5' - Cr1a 127 1 56.16 GGCACGGTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr3L 19111607 5' + Doc 66 1 62.33 ATTTAATGTTGCCGCTTGTAATTCCCCATGTTTTACAATGCACTCGTCGCATGCCCACTTCCATTTCCCATTTTCCCATGCAATAGTTTTCACCACATCCTGCTCACCGATGAATTACTTTGACTGGCAGTCC:1 - chr3R 18856223 5' + Rt1a 4910 1 67.67 ACTAAATTTGTGGTCGGTTTTTGCCCAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGGGGGTGGTGTAGGATGTGCCTAGGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 28469175 5' + 412 32 2 61.27 TTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTACCAGTAATTACATTCTATTTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 2989944 5' - roo 9041 1 52.34 GAGTTTTAAAATTATCTTGGGTATTTCAATTTCACATTCCACTCATTCTCATTCCACCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCTACTTCTGCCAACAAATC:1 - chr3R 6884726 5' + F-element 339 1 55.04 TACCAAAACAGCAATTGCGAAATCAGACGCAGATGTCTGTCTGTCTGTAACTCTGTCTTTTTTGAATAAAAATGTTTACGTTTCACTATTATTTCACTGATAGTCACTCCCTACACTATTTACGATATGTGCCAGTATTCTGGACT:1 + chr2R 5617223 5' - X-element 90 1 79.45 TGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAA:1 - chr2L 1924033 5' + G2 3003 1 58.90 TATTATGTTGTCCTTGCACTTCTGCAAACTTTTTCCACTTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGCATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGATGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTG:1 + chr3L 20054453 5' + flea 399 1 70.55 ATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:3 + chr3R 15724302 5' - Juan 4154 1 58.22 GAACAAATAAAAAACGAATTAGGTATTATGATTTGAACTTTTGGCTCATTTCTACGCATACAGTGACAGCACACGTATTGTTCATGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 - chrX 3465745 5' - hopper 1383 1 73.29 AACTAGCTGCAGCAATCAAAAAGGTGTACAAAAAAATGTTCGACCATTGCCAGCTAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16871936 5' + Doc2-element 217 1 64.10 TCAATCAGTGGCGTACCGATTAAATGAAATTTAATGACCCATGATTGCCACATTGGTTTCTTCTCGCACTGAGTGATTCTTGAGTGAGTAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAA:1 - chr3L 11236652 5' + Dm88 4347 1 58.62 CAAAAATGTGGCTGTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 9544964 5' + roo 16 2 72.09 CGTCGCAAAGTTGCTTTCAATTACCCAGTCAGGACACGCTTGCTGCCTTTTGTTTTTTTTCCTTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTT:2 - chr3R 17521760 5' - Doc 4620 1 65.75 ATTAATCACAAGAACTTCATGGATAAGCACTTTAACTTACAGGAATTGGATATGCCGTGGTGCTGATAGCCTTCTATGTGGACTTCTAGGAGTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCC:1 - chr2R 16561219 5' - I-element 354 1 59.59 TGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 11661503 5' + pogo 52 1 56.85 AATGCTTTTTTAATCCGGAAATCCATTAAAGCTCAAGAGTTAGCGGAATTCTTTATGCTTCTACCCATTATTCAGTCGCAGAATCAAAGGGAAGGCTAATTTTGTTGAAAAGTATGTAAAAAAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCT:1 + chrX 16245927 5' + Gypsy12A_LTR 2014 1 61.64 ACGACATCTTTAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCT:1 - chr2L 21403591 5' + G5 4409 1 63.01 CTACTGGATATATGATATTGTTTGATTATCGATTAAGGAGTTACAATGATTTAATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTC:1 + chr3R 6629234 5' + flea 4834 1 63.70 ATAAAGTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAACCACTTTTTTGGTGACGGCCCA:1 + chr3R 4805603 5' - 1360 3330 1 54.79 GTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:2 + chrX 7795533 5' + roo 8746 2 78.08 TATATGATCCGCTTTACACGTCGCAATCTCTTACTTGGTTTCTGTGTGACTCCTCGAGAACTTGAGAATGATGTCCTCGACGTGAACCATCCTGACATTTAAGATCACCTAATCTTGTCGAAATTTTCAACTTATAACTATTACAT:1 - chr3L 10264202 5' - invader2 4793 1 57.53 GAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAAT:2 + chr3R 3851023 5' + transib2 70 1 63.70 TTGATAAAGAAAGGCCAAGCCGAAAAGCGAATTTGAGCGGAAAGACCAGAATGGAAACTAATTAAGTGGGTGGAAGAGCAGGGAGCGCAATGAGTGCGGGGGGGAGTTGGAGTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGG:1 - chr2L 496892 5' + Doc 181 1 78.08 ATAAGAATTATTGCCTACCTTTCGGCGCGTGAGCTGCGTAGGTACGTTTGCAGTTTTCCCCGATTCACGTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCCAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAA:1 + chr3R 25198821 5' - Cr1a 90 1 53.42 GTTTGGGCATAATAATTTTATTTTTTCTTTTCGGTCAAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 18226911 5' + roo 21 2 69.23 AATTTGATATATTTTTATTAGTTTCGTTTCAAAAAACCCATTGAATAAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 21505620 5' + roo 38 2 58.22 ACATAGCATACATAACAAACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr3L 23354508 5' + F-element 41 1 45.76 TGATATAACTGGCTTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3R 9298611 5' + hopper 15 1 73.97 ACTTGATATTTAAAAAACAGAACCCTACTTAACAGTCGACTCAAGTTCGATCCCCCCGCAGGTACGCCCCTCAGTTCACCTATCGCTCGTTTGCCTTTGCCGCCTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAA:1 + chrX 11715937 5' - Cr1a 4280 1 71.23 GCCTGCTGAAATTTTCACTTGAATAATTTCAAAAAAGTTTTGATTAAGCTTTTAATTTAGTAGAAATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTA:1 + chr2R 10206279 5' - Stalker2 34 2 55.48 CTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 - chr2R 13259392 5' + mdg1 7090 2 51.37 CGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 19924056 5' - roo 9026 1 47.95 ATAAAAGCTTTGTCAAATGCAAATTAATTTACCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTG:1 + chr3L 23840703 5' + 1360 3371 1 52.38 TTGGCTCATCAGCAATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGG:1 - chr3R 11040194 5' + Bari1 26 1 68.49 AATAAGGCGCACTGCCAGAAAAAGTGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATA:1 + chrX 20999462 5' - BS 5076 1 69.86 TTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2R 15376195 5' - 1360 3337 1 54.48 GACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3R 24090439 5' + roo 6 2 66.67 TTGTGGTGCTTCATTGCGTTTACCCGACCATCTTGGCGGCTTCTCGAATTTCAGTGCGAATGAACGAGCAGCAGAGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTTCGCACAAGTTTATAGT:1 - chr2L 14893643 5' + rooA 7593 2 50.37 ATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAAC:1 - chr2L 9782140 5' - P-element 82 1 26.57 ATAACTGTCGTATATACACGTATAGATTTCCACAACAGGTCAATGACAAAAACAAAGTGACTGGGGACACGGAGCACATCCTGTGCAAGCGAGATGGGGCTAGTCGGGGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTT:1 - chr2L 19519953 5' - 1360 137 1 74.66 AATGCAACTAATACACTAATGTACATCTCAGCTTGCGGGCCCTTTGGCAGAAGGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 19450179 5' + roo 15 2 90.91 TTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTGTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 11062834 5' - roo 349 2 54.48 TTCTCAAAAACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2R 5941322 5' - copia 204 2 53.79 CTAGTTGAAATAGGTAATGTAATGTAAATAATCATTAAACTGCTTGGCCTTATTCCTTTCCTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 + chr3L 25671375 5' + mdg1 37 10 57.53 TGCAAGACGACTGCGTGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTC:1 - chr2L 16943895 5' - copia 226 1 58.90 AATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr2R 15326864 5' - copia 205 2 73.29 GTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTG:1 - chr3L 22035685 5' + F-element 9 1 74.55 ACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 47197 5' - roo 390 2 63.30 GAATAATTAAAATGAATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 11326818 5' + pogo 16 1 70.34 TGAGGAGTCTGTGGAAATCTAACCGAGCGATAACTCGTAAAAAGAAACTCACATACTCTGAAGTCCTTAAACATACTGTACAAAATCAATGGGAAGAAGCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATAT:1 - chr2R 5858998 5' - 297 6533 2 67.81 GCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 - chr3R 6419971 5' + Tabor 6863 2 59.59 ACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chrX 8092375 5' - pogo 2049 1 52.05 AAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:5 - chr3R 15790082 5' + flea 16 2 66.44 CTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 + chr2L 17809200 5' - jockey 4909 1 73.29 TATCTAAAAAAATACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 18046558 5' + roo 8681 2 72.60 TAATAAGAAATATGTATGAAAGCGGAATCTAGCATTCACCTAAAACAAAATAATTTCGTTTGCCC:1 - chr3L 22890898 5' + FB 947 3 60.00 ATATTATCTAGGCTAACTGTAGCATATTGTATCTTCTTTACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATAGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCC:1 - chr3R 18132886 5' + jockey 4945 1 73.29 AATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr2L 17809240 5' + jockey 94 1 75.34 TATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGA:3 + chr3L 25255411 5' + INE-1 299 1 65.75 AATACTGATCCTTGATGGGTTGTTATAAAAACAAACCTGCATCAACTACTTAAAAAGTACTATTCATATAATATGGAATTCTAAATTTAAAAAAATAAAAAAATT:1 + chr3L 18038298 5' + HB 321 1 70.48 TATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATA:1 + chr3L 10373833 5' - 297 320 2 73.29 AAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr2R 13168618 5' - P-element 2875 1 74.80 AATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTATG:1 - chr3L 11257425 5' - 1360 25 1 55.64 GTTGTTTTGATTACCGACCGTAATCGTTTCGTTTGAGAATTGCACCACAAAGGAACCGACGAGATGATGTTTCTTTGTGTCAAAGGTCACCGATCCGTTAAAGTTAGATAGGATAACTTAATAATAATAATAATAATAATAATAAT:1 + chrX 21933354 5' + mdg1 30 8 71.92 ATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATG:4 + chr3R 31886853 5' + hopper 75 1 71.23 CGGGGGAAAGTTTTTAATTTCTTGTACCTGGCCCCTGCCATTCCCGCTCCTCCTGGCCATTCGGCAAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTA:2 + chr3L 13625726 5' + I-element 238 1 54.79 AAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 + chr2R 10161780 5' + transib2 11 1 68.00 AAGATCTCCGATTATCTTGAGCAAGTGCGCAAACGTCTTTGATCTCTTTCCAAGATATATATATATTCTACAATTGTAATTGTGCCAAGCCACTGCTTACCATCTGGAACATCTTCCACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACG:1 - chr3R 5819421 5' + R1A1-element 48 1 65.75 AATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 19073285 5' - roo 398 1 61.86 TTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 2544637 5' + Tirant 8169 2 70.16 AAACTTTCGAACTACGTACACTAGAATAACAAAATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGACAAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAACGGCCATACCTTGGTATG:1 - chr3L 23457447 5' - 1360 3363 1 78.70 CTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 - chr2L 7593129 5' + jockey 4741 1 60.84 GTGGGAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3R 29084971 5' + 412 59 2 68.22 AAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTAT:1 - 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chr3L 18046729 5' - roo 394 1 69.84 TTTCGCACACGGAAAAGTGTGGGGAAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr3R 31886983 5' - hopper 1397 1 73.29 GGAGTTAACCAGACAGTTGACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr3R 20441368 5' + I-element 16 1 73.29 ACTGAGCACCTATTAACCCCAAACCCTCTTTTCCACTTTGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:3 + chr3R 25433275 5' - transib2 2771 1 54.79 GTATGTAGCCTAAATGATTTATAGTATTCTGTATGTCCACTACACGGCCTGACTTGGTTCTTTTCTCTCTTTCTGTCCGCTTAAAAAGTTAAAGCCTTCGCGTCTTTTCCCCCGATATTCAAAACCCTTTGACTGCCCCAGTCGAA:1 + chr2L 4903576 5' - Gypsy12A_LTR 428 1 74.66 CTTAGATAGAGAAGCTGCTCAGTTCCTTTGCTATTCTCTGTAGCTACTTTCGCGCAGTGCATTTTAAAGCAGCGTGCGAAATGGCCAAATCCACAGCTGTTTAAATATCCTTTTATAATTCCTGAGATCTCAACGTTCATACGA:1 - chr2R 15806849 5' - INE-1 135 1 63.19 GTAAAGGCATTTACTTTCGAAGAGATAAATTGCTGGCATACACGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTGGTTCCTGTTCTCTTTTGTGTAT:1 - 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Stalker2 377 2 61.83 GGCAGAAGAGCAACCGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGGGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr2L 12822872 5' - P-element 2845 1 45.53 CATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 + chr3R 15724297 5' - Juan 4159 1 54.79 ATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTT:2 - chr3L 20187442 5' - FB 495 1 62.33 TGCATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr2R 15376204 5' - 1360 3349 1 56.34 ATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACACGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCCCGCTCAGGTAATTGAATATTCGCTCCACCCAA:1 - chrX 21994017 5' + McClintock 5989 2 58.22 GTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAA:2 + chrX 5323239 5' + Juan 4114 1 62.33 TCTATCGGGAAATAGAATGGTTTCAACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 12818190 5' - hobo 2922 1 73.29 AAGTTTTGTAAAATGTTAATTTCTTTGAAGTAATTTGTAATAAGTAATTTTAAACTGTTTAGTTTTTAAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTGTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAACGCCCAAAGTGCGCTGAAGTTGGGTTCAGCTATC:1 - chr3R 14843601 5' - Stalker 7154 4 70.55 TTTAACTTCCAAGATATTTGCCAATGGTCAGACAAACTGGAGGAAGTCAATCTAAGGAAGCTATCTTTTTACCTTATTTATTAACGACCTCCCCTTAGTAATGAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTAT:1 - chr2R 22117168 5' + Q-element 577 2 58.90 TTATAGGGTTTCTAATTGAAAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 9636222 5' + 412 7068 2 65.75 CTAGATTAGCATTATCGTTTGGTACTGTGTGACTTCTTAAACTTATAGCTCAGTAGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 16564460 5' + roo 8703 2 50.68 ATTCCGAAGAACAAAATTTTTACATAGAATATATCTTTTAAGAAATCTCTATATTTAATGTTGAGCGAAACGTTCTTGGTCCAAGGACTTTTTTTTTTTATATTTTATTTATAAAGGCATACGGGGAATGCTTGAAGCCCCTTT:1 + chr3L 23295871 5' - X-element 4685 1 60.42 GAAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTTAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 15790796 5' + roo 8678 2 65.07 AGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGAACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chr3R 23639157 5' + pogo 77 1 67.81 AATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACTATTTTGGGCTCCGTT:1 - 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roo 9029 1 56.16 ATATAATAAGATGGTATTGAAATCGATCTGATCTATGTCATCTACTGAAACATACAGTACATCTCACGGCCAAAAAAATTACTAAAAAATTTAATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 14571774 5' + TART-B 10628 4 39.05 ATTATTNTATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3R 27986361 5' - roo 331 2 71.23 GAAAACTTTATGTGTGCTCGGTATTAAAGTGACCAAAATGTAAGAAATAAAAAAAAAAATAAAAATAAAATATAAAAAAAGTTATAAAAAAAAAC:1 - chr2L 8580191 5' - Tc3 76 1 72.63 TTTATGTTCTGGTCACCGCCTTTTAGGGTACCAAACGGTAGGCAAAGATCTCAGTAAAAATTTTCTTAATATAACATAGGCACATACTACAACTCAAAACTAGAATTACATAATTAAAATAGCAATATACAAGGCGTTAATAAAAC:1 - chr2R 5712925 5' + Porto1 4242 1 60.96 AAAATGGCTATATTGGCCACCAACCAATTTTGAACCCGACTGAACTCATAGCTGAACTACTTTACCTGGAAGAAGTCCGGAGTCCCCACATCGACACAAGGACCAACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGCCATACGT:1 - chr3R 5368729 5' + 1360 18 1 73.97 ACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTC:1 - 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chr2R 4785344 5' - Juan 4174 1 56.55 ACAATTGTGTTCCTTTGCAGCGTGGTTGAGTTCGTCACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACAATATTGAAAACTAAGTTTACCC:1 + chr3R 13665570 5' - gypsy 7191 2 67.86 AACACGAGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chrX 13490633 5' + 297 6629 2 55.48 TATATATTTTTTTCTTAATTTTCGTACCCCTGGTGTACATACAGCTGCGTTTAAAATAATAGCACTATTGCAGGTGGAAAGTTCATTTTCAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAA:1 + chr3R 4831839 5' + Tc1 87 1 73.97 GAATCAACATAAAGGAACAGGAAAAAAGCCAACAAAAATGGCATATGTGTGTAAAAGTGTGTGTGTCTGCACTGAGAGAAAAACGTAGGAAGAGAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATC:1 - chrX 8282273 5' + G2 122 1 64.14 CTTTAATCCCACATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGATTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr3R 13973100 5' - 412 482 2 75.34 ATTCTCAGAATCATTGCTTTTGAATCGTGCATGACTGAACATAAAGAAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAACAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr3R 30813450 5' + FB 38 1 60.96 GAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:2 + chr3R 3850979 5' + transib2 26 1 68.49 ATAATGCAATGCATTTTTAGTCTTGAAATAACGCCCTAAAGCCACCAAACCGGGCACACCCACACTATTAAACAATTTTAAAATTTAT:1 - chr2R 10426581 5' + 1360 3034 1 65.91 GTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 2145997 5' - roo 353 2 53.42 ACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:2 + chr3R 7420186 5' - 1360 3345 1 56.85 TTATTATGGAGCAGATTTATTGTTGTTGCTCATAGCGCTTAGCCAGACAGTTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTTTCTTATATAATAAAACTATG:1 - chr3R 13612624 5' + F-element 173 1 68.91 ATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGC:1 + chr2L 17205179 5' + hopper 65 1 60.96 GATCAATAAAAACAAACACAACAAAATTAGATTTTTTAAAAATTGTTCGATATTATTTATAACTTTATTAGTACCCCCCCAATATTTCGCGTTTGCATTCCCAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCC:1 + chr3L 19424938 5' + INE-1 549 1 56.49 TGATGACGTTGGGCGACAGGTTTGTGTTTCTCTCCTGTGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGGTTGGAGGGCTTGAC:1 - chr2R 1270859 5' - gypsy 363 2 72.46 TAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:2 - chrX 8200302 5' - flea 4957 2 57.53 CCAAAACAGTGAAAGTTGTAAACCAAAATGGCTGACCCTGCTCCTTGGCATATTTGTCTCTGTATCTGTGTCTGTACTCGTATCTGTATCTGTGTGTGTGTGTGACATCCAATTTATGCGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGT:1 + chrX 10822909 5' + transib2 372 1 64.38 ATTCGGGAAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:2 - chr3R 18093430 5' + I-element 7 1 78.08 CTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAA:1 + chr2L 13556349 5' - transib2 2753 1 67.12 AGTATTATTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:2 + chr3L 1279076 5' + roo 55 2 56.85 ATTAAATATATTTAATTTTATAGTTATGTAATGGTTTATTTAATTAGTTTAATACTTGTGCAAATTTGACAAGCTGCCGCCATAACAAAAAGGAGACGAAGAAACATAAAGAACAAAAGTTAAACCCA:1 + chr3R 20750648 5' + HeT-A 276 1 67.19 GAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGT:1 - chr2R 12645526 5' + X-element 52 1 51.37 GCCGCTCTTCTGCAATTCAAATTGTTTCAAATGGTTAACAAACGTATTGCACGCTGAATTAGTGCTACTCACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chrX 8440532 5' - P-element 2794 1 50.68 TGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2R 13168749 5' + P-element 52 1 50.00 ATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 + chr2R 9966985 5' + Bari1 46 1 54.40 GTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTC:2 - chr2L 14523195 5' + HMS-Beagle2 87 2 76.71 ATATTCGAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 - chr3L 21380642 5' + I-element 42 1 56.85 AACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr3R 15790065 5' + flea 20 2 75.94 ATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGGCAAGAAATAAAAAATA:1 + chrY 2720333 5' - 297 336 2 72.60 AAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 18226870 5' + roo 8708 2 56.80 GTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCACTTAGTTTT:1 + chr3R 17673773 5' + FB 78 1 76.30 ATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCGGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 + chr2R 16510095 5' + F-element 68 1 53.42 GGTTCTTTGTTCTTCCTTTATAGTTTGGCGAAAAAAGTTATTATTATATAAAAGGATTGCGGCTTTTATTCTTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTC:1 - chrX 22534117 5' - I-element 494 1 58.22 TAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGT:2 + chr2R 2492932 5' - invader2 183 2 61.64 AGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 15791009 5' - roo 349 2 60.27 TTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACTAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGA:1 - chrX 3431979 5' - Ivk 5338 1 52.78 CTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr3L 18281888 5' + Doc 75 1 81.60 TTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 + chr2L 13844121 5' - Stalker2 7627 2 67.12 AATAGCATTTGTAACACTGTATGAAAACCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCC:1 - chr2R 9967130 5' - Bari1 1644 1 60.27 TGTAATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:3 + chr3R 27082997 5' - jockey 4974 1 68.49 ATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 - chr2R 21410952 5' + Burdock 77 2 71.03 GTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTT:1 - chr2L 21930231 5' - Copia1_DM 83 1 67.94 GGGCGCTGTTGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 2146007 5' - roo 9028 1 54.48 TAGAGAAATTTATAATTTATCTTCGCTGCGTTTTCATTGAAAGTGATAGAGCATTGTGAATTGAAAATGTGACAGAAGTCCGAAAATATCTCTTAAGTTTATCTCAAAGTTTATATGTTAAACTTTTACTCAACTTTGTGATTCTG:1 - chr3R 17432472 5' + transib3 211 1 76.71 ATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 20898624 5' - roo 345 2 63.01 AACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 17878631 5' + Doc 40 1 50.00 CTCCAAAGAGGGCAAAATGGGGCAGGAACCGGGCGAAGTGTAAGGCAGCTCACTGCCGGAGAACAAAGTGCACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAACGAACAA:1 + chr2L 21961979 5' + I-element 349 1 51.39 GATGTACAGATAGAGATACAGATACATCCGTACTTGTATCAAAGAGACTCACAGAGATACAACCAAATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCACGGGGGGCACTTTT:1 + chrX 11209792 5' + hobo 5 1 80.82 CATAATTAAAAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 21216680 5' - roo 390 2 71.63 GGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTT:2 + chr2R 5674656 5' + S-element 80 2 75.34 GTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTTGGCTCGCCGGC:1 + chr2L 7618489 5' - X-element 4641 1 76.56 AAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 - chr2R 6847845 5' + Doc 65 1 59.59 GTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGAATATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 7889645 5' - roo 333 2 66.44 TTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chrX 4341289 5' - roo 318 2 78.77 AACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:4 - chr2L 16690754 5' - P-element 2858 1 64.38 GTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATATATATTGTTTAATTA:4 + chr3L 16973388 5' + S-element 1606 2 70.55 ATAGCAATTTGCGTTTTCCAACAAAACGATACGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTAAA:1 - chr3L 17183765 5' - diver 168 2 55.63 GACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATACCGCCCA:2 + chrX 22906771 5' - transib3 2738 1 69.86 TTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATT:1 - chr3R 27083117 5' + jockey 4599 1 64.38 AGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:4 + chr2R 7304013 5' - pogo 2043 1 60.27 AAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAAT:1 - chr3R 10736141 5' + McClintock 5974 2 61.34 ATCTTAAATGTATAGGTTCTAGTTTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAACGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 + chr3R 5216137 5' + FB 68 1 62.33 TGTGTCTGTGTCTGTGAAAGTCCTTCGAGGAAAAGGAATCAACATCGACAAGTCCTTACCTTTGGCATGCCTGCGTAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGG:1 + chr3R 28800870 5' + jockey 4552 1 54.86 ATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chr3R 7420318 5' + 1360 44 1 56.55 CAATTAATTACTAAATAAGGGACTTCTAAAACTAAAACAAACTGGAATCTTCATTACCGAAGCGGTTTTGACCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCGG:1 + chr2R 3032243 5' - Quasimodo 6920 2 57.84 CTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chr2L 15188460 5' + 297 60 2 64.38 ACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTAT:1 - chr2L 2527700 5' - hopper 1329 1 75.86 CATTTGTAACTTTGCGTTTTGGTTGGCATTTTCTTTGCGTACTACAGTAACCACCACACCTTACTTTATTTTCACACAACAAAAATTTTATAGTATAGCAATTTAACATTACCAATAGCGCCTCTTTCGCTTTCAATTTATTTATT:1 - chrX 12136772 5' - Doc3-element 90 1 56.85 ATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTATTGTTATCTA:1 + chr3R 19073217 5' + roo 8753 2 82.14 AATTACTATAATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3L 23287188 5' + 1360 28 1 66.44 ATATAATATATATATAATATATATATATATATATCACTATATATATATATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGC:1 - chrX 13592706 5' - gypsy6 374 2 84.71 ATCTCCACTCCTTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 - chr3R 26504353 5' - HMS-Beagle 222 2 69.18 CAACAGCCATAAATGTTAAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCG:2 + chr3L 10731718 5' - 297 6967 2 78.08 CAAAGTTCACAGTCGCAAATAAACCACCACACACCACCCACGACTACACCTCCCGTCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAAGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTA:1 - chr3L 778571 5' - 1360 3342 1 75.34 GAAGCCCTATGGAATGAATACACAATTGCAGCCGAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAAGTATGGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGAC:1 + chr2R 10330389 5' + 297 6566 1 76.71 ATGAATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGAT:2 - chr3R 15790136 5' + flea 4719 1 76.71 CCTTGACCGTACAATCAAAAGTTGGGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATA:1 + chr2L 17005641 5' - Stalker2 404 1 77.40 ATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 2989918 5' - roo 9028 1 54.79 AAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 - chr2R 24170008 5' - transib2 2787 1 43.26 TAATACGAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr3L 16662332 5' - jockey 4979 1 73.29 ACAAATAAAACAAGTAGGTAGGAGTACTATAAAAATATAGATATGAAAAACACGTATTCTAGCTGGACTTTTTTTTTAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAAATTCGCAGTTGGCATTT:1 - chrX 3377424 5' + HMS-Beagle2 461 1 52.05 ATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:2 - chrX 17343459 5' - I-element 5278 1 73.29 TATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:1 + chr3R 15724268 5' - Juan 4188 1 64.38 TTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr2R 9871541 5' + roo 86 2 78.08 TATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chr2L 22674738 5' + mdg1 19 2 76.71 AATACCCTTAACGCACGCCAGGTGAGTGTTGCCCCCGGGGGGGCACGGGAAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr3R 22287940 5' + transib2 42 1 50.00 CTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCATTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3L 10731747 5' - 297 6938 2 56.85 TAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTG:1 - chr3R 23067513 5' - roo 8994 2 69.86 GAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCG:1 + chrX 19074773 5' + mdg1 69 2 63.01 TTATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1 - chr3L 12315852 5' - transib2 2792 1 63.70 AGATTGTTTTCAATAATTGATTTTGTAATGTTTAATTTTAAGCTTAATATTATTCCTCGATCTTACTCTTATTTTATTATTTATTTTTAAAGACTTAATATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACA:1 + chr3R 2391843 5' - diver2 249 2 72.60 ATAGGGTGTATAAGGGAATTCAGGCTGGAGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACA:1 + chr2L 14788134 5' - mdg3 5253 1 79.05 CCATGAAAATGTGTGTGCATGAATGGGGCATACATGTCGTATATATATATATATATATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGGCTTAGTTTTAA:1 + chr2R 18752613 5' + jockey 4793 1 72.73 TTTTCATTTTATTATTTAATCATTATCCTTTTGCTTATCCAGCCAGGAATACAGAAATGTTAAGAAATACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTT:1 + chr3L 22604365 5' + P-element 2686 1 15.75 ATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1 - chr3R 28901317 5' + transib2 63 1 61.11 CTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCG:1 + chr2L 14026157 5' + F-element 459 1 58.10 CAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAGAGTATTCTGAG:1 - chr3R 30347385 5' - P-element 2814 1 29.85 GTACAANAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:2 + chr2R 7304014 5' - pogo 2042 1 60.96 TATTTTAATTTCCTTAATTCACACGTAAAATAATCTTTGTATACCCGTTACTCGTATAGTAAAATGGTATACTAAATTCGATTTCGACCATACAAAGTATATATATTCTTGATCGGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTC:1 - chrX 14766988 5' + INE-1 106 1 62.33 ATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAA:1 + chrX 5323222 5' + Juan 4097 1 50.68 AATGGAGATGTCATAGAGCAGATGCATCAGAAATCCGCCAGGAGCACCGTGAGTGTGGGTGCCACTGATGGCCACATTATCATTGTGGTAAATGTTGCCTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTT:1 - chr3R 30463283 5' + hopper 1072 2 63.70 ATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAA:1 - chrX 6513448 5' + hobo 78 1 71.92 AGATATAATCAACGCCCAGTACACTGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGGGCCTTCTT:1 + chr2L 8662455 5' - Quasimodo 283 2 67.07 TTGCACCTAATAATTTGTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATA:1 - chr2L 16539780 5' + Juan 4053 1 63.01 CTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 11062722 5' + roo 8715 2 52.74 AAAAAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:2 + chr2R 8047240 5' + 1360 48 1 51.37 CCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:1 + chr3L 6447015 5' + transib2 53 1 54.11 ATTTTTGATGACTAATAATAAATTATAATTGTTGATATAATTGTTTCAAAGGGTTGCAGTAATCAAACATGCTAAAGATTTTTAGATATAGCATTTAGATATAGATATAGCATTATTTCTAGTTCAACCAAAGATACTAGAATATT:1 - chrX 20145743 5' - Tc3 314 1 52.74 AGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - 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TART-B 10630 4 59.59 TAGAACTAAGAGAAACTGAGGTTGTTCACTGCTTATGTCTTTAGTGTTATTATAGCAACCATTTAACAGAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 + chr3L 16494713 5' - I-element 5320 1 45.21 GGTCGTGATTATAAAGTTCTGGTTTCATGTTTTCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2L 47035 5' + roo 9 2 80.14 GAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2L 20265939 5' - roo 9011 2 61.38 AAATAGCCTAATGTTTAAAAATTTTTATTATCAACGACTTGCAATAACAAGTTTACGAATACAAAACACCTGAATATTTTTAACAAGATTTTCTTACAAACCCTCTCGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAACA:1 + chr2R 24928738 5' + I-element 5129 1 69.86 GTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 12986633 5' + roo 8724 2 60.27 AGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - 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invader2 4743 1 52.48 AAGCTANTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 - chr3R 15054307 5' - copia 5061 2 66.90 GGGTCCNCAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 + chrX 18817244 5' - transib2 2796 1 65.75 GTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chrX 10537813 5' + I-element 20 1 69.86 ACTAATTTCAATTTCAATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 21224677 5' - roo 9053 2 70.92 GCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGT:1 - chr2L 9782133 5' - P-element 72 1 21.23 GTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 - chr2L 4003769 5' - mdg1 358 2 65.91 TTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr2L 7593127 5' + jockey 4737 1 60.58 GTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATA:1 - chrX 9410536 5' - I-element 5266 1 77.40 TTTTTGAGTCACGTAATTAGCTTAGTCTGGACATCAATCAAAGGATTTTCCGTAGGACGAAAGGAGCGGGGAAGGAGTGTATATGCCAAAGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGGGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAG:1 - chr3R 26314248 5' + R1A1-element 5018 1 64.38 GTCCTAATGCAATAGAATTAGAATTAGAATATTATGTCGTATGGAGAAACATGAGTAGATTTGCCATATGTGCTGCACAATCTGGTTAAAAAATTAAAAAAGAAAATTTACAAATTATGATACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGT:1 - chr3R 2689680 5' + accord 495 2 54.11 ATGTACATATGCACACACGAGTGGCGAGTGAGTAAAATCGAGCAGAGAGTTAAAAAAAATATATATGTATATATGTACATATATGCAGATTTATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTAC:1 + chrX 18340498 5' + I-element 4964 1 61.64 TCTGAGGGAGTGCATACACCACATACACCTGCAATTTTGTGACGCTTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCACCATCAAGTTTTT:1 + chr2R 17907318 5' - Dm88 342 1 69.18 ATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTG:1 - chr3L 3501859 5' - Bari1 1688 1 65.75 GAGAGAAAGATTTGACACCAGAGATCGTTCACAATTTGGTGGATTCAGTAACGGACTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGA:1 + chr2R 4785238 5' + Juan 4088 1 59.03 AAATGATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACA:1 - chr2L 9010179 5' + G2 2712 1 62.33 GGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 - chr2R 20349071 5' - transib2 2778 1 52.05 AGCTTAAAATGGAAATACTAAATTCACTTTTATTTATTTTAATTTTAATTTATTATTTTAATATATTTATTTTTTTAATATAAGTAAATATAAATAATATAAAATAAGCAAAATATTTTTTTTTTAATTTTTTTATTTTTTTAGTT:1 - chr2L 16707942 5' + Tc1 1398 1 82.19 AACCACAAAATCGCATCAAAATATTGCGTATGTGCGTGCCGCGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chrX 6513477 5' + hobo 49 1 53.42 CATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAAGATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 + chr3L 18403005 5' + P-element 98 1 16.78 GATATTTTTTCATAATTTTGTTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGACAAAAACGGTTGTACGGTTGGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTATAGAGAGAGAGTCTGCCGGGCTGGGGGCCCGGG:1 - chrY 1803444 5' + baggins 248 1 63.38 AATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTATTATGATAAATCAGCGAAATTTGCGGT:1 - chr2R 16660295 5' + gypsy9 5083 2 56.16 GAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTTAAGTAAACACTACATGAGGCAGTCACTTGAG:1 - chr3R 15791012 5' + roo 8821 2 52.24 AATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACA:1 + chr3R 19224998 5' + HMS-Beagle 6864 2 65.07 AGGTTTGCTACCAGTTCACATTTAAAGTACCATCTAATGAGCCATGAGAAACAATCAAAACACTCGTGCAGCGTCTGCCACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTT:1 + chr3R 15348502 5' - flea 295 1 62.79 TAAAGACCCATTTTAAGCCTATTGATTTAGTCTCATTTGATTGCGTATCGAGATGGTTTTTCGCATTGGTAATATTTAAGTGCTGTGATTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 - chr2R 9350157 5' - Juan 4155 1 61.64 AGAGGACAGGGACATCACGTCGACAGTCAAACTATGAACAGCATTTACAATTACTTTCGACAAAAATGTATATAGACAACAATAGACATAATGCAGCAATAACGACAGCAATTAGTTAACAAATTAGATATTAACTAAATTAAGAT:1 + chr3R 20438312 5' + I-element 5245 1 76.03 CCTGTTCGTGGCTAAGCTTGCAAATCCGGAACGGGAGGAGTGGTGAGCAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAG:1 - chr2R 5950532 5' - I-element 4923 1 66.67 AGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chr3R 4860429 5' - Transpac 5170 2 59.59 CTGGGCGAAAAATAATACGAAAACAAAAAAAATATCCTAAGGCCAATTGAATTAGCAGTATAATCTATTTTAAACACGACTTCTTCATATAAACATTTAATGGACTAACTAAAAGCGAATAATTAATCAGTGAATTATTTGTGCAA:1 - chr2R 18058776 5' + TAHRE 246 1 63.70 AATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 - chr2R 11804721 5' + pogo 69 1 66.44 ACTTGGTCACTAAATTTATATTCGGATTTCAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr2R 21926488 5' + opus 23 2 47.50 TTATTTAAACAAAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATAT:2 - chr3R 556457 5' + Juan 4177 1 72.60 GTGGCTCCCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACCAATCATCGGACACTCA:1 + chr3L 2544590 5' + Tirant 8144 2 61.64 GTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGC:1 - chr3L 23839701 5' + 17.6 64 1 75.34 TGCCATATATTTTTAGAAATATCTCGCGATCCAGCCTCTTCTCTCGTATCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTAATTTTTTTTTAAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTC:1 - chr3L 271991 5' - transib2 2598 1 63.70 GCAAATAAAAGCAAATGAAAATCTTAATCGGGAAACGGAAGGATGGTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTTTGTGGAAGTTTGATTGTGCCTTCCGAGCAGAGACAGTT:1 + chr3L 15103788 5' - Transpac 288 2 57.72 AATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTGT:1 + chr3R 556402 5' - Juan 4134 1 74.82 TAGACACATTCACTCGGCAAATTAAATAAACACCTCTTTTAGCATTCACACAACGAAATGTGCAATTACATTACCGACTAGGAGTATCGTTTTGTCCTGGAAAGGGGTTTCCATTAATCCCTACTACATACTCTATGCATAACATG:1 + chr2L 17552890 5' - G4 3738 1 69.18 TATCGATTGCGACCACTCACCACGACCTTGCAGAGAACAGAATGAATCATTAACAGCCACACTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGGGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAA:1 - chrX 6117077 5' + transib2 2743 1 56.16 ACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTG:1 + chr3L 20189601 5' - FB 203 1 50.68 GTCATTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 25428117 5' + 297 23 2 66.44 AAATAATAATGGGGATTTTTGCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 31653068 5' + roo 8694 2 54.46 AATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGCATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 20167566 5' - roo 9022 2 54.48 GCTTATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr3R 9003008 5' + roo 65 2 63.70 GATGGCAGCGTTGTTCTCTTCTCGACTATTAACTGGAATTTGTCGCTTCGTTTTTTGTCTGCCGGTTCAGAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGA:1 + chr3L 14166786 5' + pogo 1989 1 52.05 ATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATACATATATATATATATACATATATACATATATACATATAT:1 - chr3L 16731387 5' - G3 4505 1 86.30 GTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr2R 19199665 5' + hopper 57 1 59.86 AAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTTGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 12822856 5' - P-element 2844 1 38.89 TATAGCGGACTCTTTAACTGGAAGTTGGCTCGCTTACTTTATAGCGTTCTATTCAAGAGTGCACTAAGAGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 + chr3L 22960422 5' - Tirant 8455 2 52.74 CCGAAGAAGCGAACCGAACGCCGAACTGGAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGCACCTAAA:1 + chr3L 1145002 5' + I-element 234 1 78.77 AAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCCAC:1 + chr2R 22287398 5' + jockey 25 1 64.00 ATTCAATCCAATCAAACCCAATCCCAGCAAGCAAGCAAGCAACCCTCATCCCGCATCCGCAACCCAGTCAAGTGAAAAGTGTTTATTTATTGTTTAATGTAATCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTGTGTTTTG:1 + chr2R 9433404 5' - Porto1 199 1 72.54 TTAATATTTGTCATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3L 8627389 5' - pogo 2099 1 43.15 GTTAGCCGCCGCTTTAAATATAAAAATTATTATTTATGGAGGCACATGGCCGGGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAAC:1 - chr2R 21404427 5' - 1360 103 1 57.60 CATTGAAACACAATATGGTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTT:1 + chr2L 20821158 5' - Burdock 6390 2 67.12 AAAGATTTATATGAAGTAATAATGTTTGTATGTTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGTTTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACAGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTTAAGCTAAGATA:1 - chr3L 24934372 5' - HMS-Beagle2 7127 2 69.84 AACTTTGATATAATAATTTATAAGAATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGGATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACCATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGAAGAAT:1 + chr2L 12341774 5' - BS 5081 1 72.60 CATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGC:1 + chr2R 18316027 5' + HMS-Beagle2 57 2 54.79 GCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 - chr2R 13259394 5' + mdg1 7088 2 50.00 GAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr3R 16630238 5' + FB 33 1 60.96 ATCAGCCGTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 + chr2L 4123814 5' + transib2 23 1 69.18 AGGTAATATGGACGCTGGGGGAATTGCAGGGGGAAAAAGCAACAGTAACCGAGAAAAAGTGGTTCGCACAGTGGGAATATTTGGGTAATCTGGGAAATAACATTAAAAAAAATACAACAAAATA:1 + chrX 14981631 5' + gypsy11 3932 1 79.03 AATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTGTCAGTAAAAGGTGCTATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTA:1 + chr3R 19224994 5' + HMS-Beagle 6 2 69.32 ATTAGATTAAAACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 2145865 5' + roo 36 2 55.48 CAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATG:1 + chr2R 13931577 5' - P-element 2781 1 15.07 CAAGAAAAAGGGTTCGGTTCGGTTTGGTTCGGTGTTAAAAATGCTAGATAATTAATTTTAATGACACACTTACGACCTGCGACTCGCGACTCCCGGCGAATGCCACTTGATTTACATGGCACCCAAAAACGAAAAAGTAAAAAAAA:1 + chrX 14622651 5' + Doc2-element 238 1 78.08 AACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3L 7889559 5' + roo 8726 2 67.12 AAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3L 18505766 5' + I-element 36 1 60.69 AACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 5769113 5' + roo 58 2 63.01 GATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACATAAATTAAT:1 - chrX 19038475 5' + hopper 20 1 63.06 TAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGA:1 + chr2L 17205162 5' + hopper 48 1 52.74 AATTATGCTGTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 + chr2L 15550640 5' + Bari1 41 1 58.22 ATGTGTATATATAATATGTATGTATATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTT:1 + chr2L 12822380 5' - 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I-element 5316 1 58.22 TTATTCCATTGTTATCATTTTGCGCAAGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 18046734 5' - roo 9042 1 65.07 CCCTGTATTATTTTTGTGTTTTATGTTGATTCGTCTCCTTTCTTCGTCGGCCTCCAGCTGAATTGTCCAAATGTTTAGTTAGCAATTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAA:1 + chrX 3026529 5' - Porto1 4189 1 63.70 CCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1 + chr3R 8051145 5' + jockey 4843 1 78.08 ATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3R 13973078 5' - 412 7534 2 72.00 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATC:1 - chrX 12657099 5' - Stalker 7008 6 78.08 GGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGGTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCAC:1 + chrX 18742822 5' - 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Gypsy12A_LTR 1856 1 73.97 AAAGAAGAAAAGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:2 + chr2R 19199641 5' + hopper 37 1 58.90 CTAATTGTTTAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 13294840 5' + roo 8683 2 71.23 ATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATTATATTATATTATTATATTATTATATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:2 + chr2L 15490094 5' - copia 5074 2 54.11 AGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 + chr2R 19199657 5' + hopper 53 1 55.48 CAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - chr3L 16470365 5' + jockey 4713 1 52.80 CACATATGTGCACATGCGACTGCATGTGTGTGTGTGTGGGGCTCAGGGGAGACAATGCTCGGGGGTCTTTCATCTTTGGGTTTTTCACACTTGCCCGCACTTTTTTTTCTCTTTTCCCTTTTT:1 - 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INE-1 548 1 66.44 AGGTGACCCTCTCTCTGAAATGCTCCCTAATCCTGGTGCCTATCCGCATATCACTCCCGGACCTATCTAGAGTTTAGCTGAACATATTGTACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATACCACAAAATCTAA:1 + chr2R 9913813 5' + I-element 5174 1 66.44 ATATTTTGCTAATATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr3L 10731930 5' + 297 4 2 77.40 GTGTGGGAAATAAAACGCGAATTACATGCGAATGGCCACAATATGGGCAATAAAACAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTT:1 + chr3R 25165620 5' - transib3 34 1 46.58 AATAAAAGTTTGCGAGCAAACAACAGCAGCCCCCAAGAAATTAAGCGCGCCCACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTATACAAAATCGAAAGAAGCAAAT:1 + chrX 1989850 5' - Gypsy12A_LTR 2065 1 57.28 TATATATATATATGTAATGTGAATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:2 - chr2R 15593228 5' + transib2 58 1 58.22 ACTCACACACACACACACACACATCGCAACTAACACACTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2L 768921 5' - roo 329 2 69.86 CCGTTCATCTCCTTCTGCCGCTGATGATGTTTTGCTTGAGTTGAGGGTGCGGCATTTGGCGGCGCTTACGAGACTGAAGTGCCTTAAAAAAATTAAAAAAAAATTAAAAAAA:1 + chrX 16170575 5' + Doc 4700 1 54.46 ATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGCAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chr3L 15103814 5' - Transpac 5158 2 65.07 GCACACTCCAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGGATTAA:1 - chr2L 2527728 5' - hopper 1356 1 55.48 AAATTGGAAAAAAGAAACCTGTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr3R 5523869 5' + FB 24 1 69.86 ATGGAATGCAGTGAAAGAAATTACTTTGGCTAATAAAAAATATATTTCTTCTATGACATTTCTACACATCAATACAACTGGAATATGAAGTTATTAAAAAAGATCAAATATATTTTTTTAGTAATAATCTTAATAATATTAATAAT:1 + chr2L 3844945 5' + mdg1 39 2 72.60 TATATGCAAATAAATCTAAATAAATTGAATTAATTTCAATTAATTTTATTACAAATTATCCAAAAAACGTAGAAGAAAAAAAATTTATAAAATAAATAAAAATATAAAAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCCTGAGGCACGAAG:1 - chr2L 2798883 5' - 1360 481 1 58.22 GGAAAACAAAAAGAAGGTACATACATATATATGAAGGATAGGCGACCCGAAAAAGCACATCTATCAAAACTGGAGAGGTTCTGACTGACTGGCACACACATGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAAATTGTCCG:1 + chr3L 14306520 5' + I-element 4994 1 71.92 TGGGTATATGATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - chr3R 19073318 5' - roo 9045 1 66.44 TTTCCTTTTGTTTATTCTTTCACCACTTTTTTTTTTGCTTTAACAAATGTGACATGCAGAGTGGAGTATGTTTTTTTGGCATTGCTATGCTTCGTTTATTTTTGAACATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCAAGCTTTTAT:2 + chr3L 16212595 5' - Stalker4 475 1 73.29 GGATGCGTTTTTGAATAAGAGTAAAATACAATATATACATTTAGTGAATACTCTATCACAAATTCAATTTTGGTGGAAAATATCTAGAAGGGCGTTAGACACCCCAATTAAAATAATTTTGAAAGGACAAATA:1 + chr3L 15405917 5' + P-element 2509 1 77.44 AGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 - chr3L 22035647 5' + F-element 83 1 73.97 AATAACGATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 + chrX 14722093 5' - diver 6067 2 54.48 GTCTGCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCC:1 + chrX 292379 5' - G3 4543 1 65.75 AATAAAACAAATAATATCCGGGAAGGGGCTATTTTTATTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATAT:2 + chr3R 10145643 5' - Juan 4122 1 77.40 TGTCACTTCTTATAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAG:1 - chr3L 22035608 5' - 1731 4558 1 63.01 ATTACCAGTAAGTTTGTTTTAAAACGTTGCTATGCCTTTTGGGGCAGCCAAGCCGCTGTTCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACT:1 - chr2L 14026580 5' + F-element 4580 1 58.90 GTTTATATTTATGCAGTTTACGTGTCAGTCGGTCCAGGGTAGTTCCTTCTAAGGTCCTTTTTTTTCTCTGGATCTCAGTGTGTGAGAAAAAACAAGAGACGAGACCGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAATTTCGG:1 + chr3R 22851347 5' - 1360 3197 1 56.16 ATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGT:1 + chr2L 7241330 5' + pogo 1960 1 75.34 GATTTAGTTTCTACGGAATTCCGCTCTAATGTGCAAAGTGATTATCGAAAGTTCCGGCTATTTATGTTAGAACTATTTTTGGATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGAAAGACTATGTGT:1 + chrX 12284441 5' - Ivk 5198 1 62.33 CTTAGCATTTTAAAGGTGAACGATTCAATGAACGAGTCAGCGAAACAACCAATAATAAACACAAATATAACACGAATCCAAAAAAGGGTCTGAATAGTGCAAAACCAATGTATGG:1 - chr4 120468 5' + 1360 3356 1 73.04 AGGGGGAAAGAGTGGGAGAGGGTAAGGAACAGGGGGGCCAGAGAGCATGATTTGAATTGCCTTCTCAGTAAATTATGTGTGCTGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGGGTGT:1 + chr2R 11631104 5' - gypsy3 420 4 80.00 TGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGCCCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTC:1 - chr3R 6821599 5' - R2-element 3195 1 73.58 ACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 + chr2R 5941333 5' - copia 192 2 61.64 AATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTTATGTTGTCATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr2L 14874166 5' - copia 240 1 50.38 GAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTA:2 - chr2R 9967108 5' - Bari1 1622 1 75.34 TAATTGGAAACGTCTATGAAACCAGCTCGGTGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGTT:1 + chr3L 9909262 5' + BS 5061 1 69.81 CCACCGCAGACCCATCAGTATCATCAGCACAGCATAACGCCGCCCAGCGGCAGCATCGGACCCACCTTTCGTGTCACAAACTACACGAGCTAAAAATTGAGATTAAATAAGCAAAGAATCCTTAATTTTCAGCTTTAAAGTCAAAA:1 - chr2L 9381138 5' + S-element 1671 1 63.01 AGCTCAAGGCATCTGCATTTTGGATCAGATTTTTTTGGTTGAACATCTTGTGTTTGAAACTTATAGGAAATTTAGTACCTGTAATTATTTTTTATTTGAATA:1 + chrX 7416943 5' - jockey 4827 1 78.43 GCACGAGTAGAATGTAAATAGTTACAGAATTCACCCCACGGAAAACAACGCGCCAAAGGGTATGTAAGGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGG:1 - chr3L 8315411 5' + Circe 7169 1 56.00 GATAAATATGTTTTAATTGATTCGACGAATTATCGGCATACAGCCAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGTAGCGCCGTTGTACCTTCGGAACGAAAACAAACAC:1 + chr2L 13493356 5' + Doc 4396 1 52.34 ACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 18549927 5' - roo 9009 2 58.90 AATCACCAAAAAAATGAATAATGCTAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3R 3745939 5' + 1360 50 1 54.68 GAAGCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:2 - chr2R 23780664 5' + Ivk 10 1 77.40 TATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAAAAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 - chr3L 23839697 5' + 17.6 68 2 76.71 AGTCTTTATTAGTTTAATTTGGCTCAGAGCCTTCTTTGCATGGCTCGGACTGAATTTGAATTTGGGTTAAGCGTATATTAGTCGGTTCTAAACCAAAGTTCCCTTTGAGCGCCTGAGTATCTCTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTGT:1 + chr2L 10047379 5' - G2 3076 1 79.45 ATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATT:2 - chrX 15019100 5' - S-element 1547 2 64.38 GGCGCCGGCGTTTCTGTTCTCATGGGTATCGACTTTGGTGTTGAAGCCATCTCAAATGGCTATAATATGCTTATCATTTGCACAGTACGCCGTTGAGGCCTTTGTGAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAG:1 - chrX 14588061 5' + Stalker 6783 2 73.29 AACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAAT:1 + chr2L 11391477 5' - 1360 39 1 52.08 ATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACA:1 + chr3R 23067461 5' + roo 9031 1 43.31 AAATATAGAGTAATGGGTAGAGAGAGTGTCGGTGAGAGCGCCAAAGGCAACCGCATTCGTGAAGGTTTCGGGAAATGGTGAATTGTGGTAATGCAGGGAAAAACAAAGAGTGCAATTACATTTACACGCGAGAGG:1 - 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chr3R 26726040 5' - R2-element 3478 1 52.74 AGCATTTGTACAGAGAATAATAGCGCAAATACTATAGACCAAAACCTATACCAGTCCCAATACCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGT:1 + chr3R 19505525 5' - copia 4779 1 56.85 AAAAATGCATGAAAAATTCCAAAAAGGAAAACAACCAGGCACTGCGAAACAAAAAAAAAACGATTTCAATGAATCTAATCAATCAACCTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 19019967 5' + 1360 5 2 69.17 ACTGAAAAACTTCTCATCTCCATTATATTTGTATTTATTGTTTGTGCAGTATTTTAGTATTAATATATTGGAAATACTCTAAACTGTTATGTTTCAGCCCGCAAAAGTTAATTTAACAGCGCACCATTATAATAACAGCTGTTAAT:1 - chrX 7061449 5' - hopper2 1466 1 69.86 TGATCACGATTGTAAAACGGAAGACGACCACAGATCTGTAAGGAATTATTTTTGTTTTTAATACTTGTTAATAGTATTTGCAGATGCAACAAACTCACCATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGTACCCACGACCAATCTAC:1 - chr3R 16102524 5' + G-element 4215 1 71.23 TGGTTCTTTCTTGTTTTGCATATTTACTCTCAACCACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTT:1 - chr3R 8922415 5' - Juan 3891 1 76.03 AGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 + chr3L 17940063 5' + 1360 41 1 47.95 CTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATCAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTC:1 + chr2R 15326843 5' - copia 226 1 58.90 AAGTCGTCAAGGTTTCCGGACTCAGCCGCCTGAAACAGGAAAAACAGGTGTCATTCACTTTGGACAACAGTTTACTGGTCGCCTTAAGACACTTCTAGGATGCCCAAAAGTTAAAGCGTTGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAG:1 + chr3L 8900780 5' + gypsy7 5009 1 65.07 ATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAT:1 + chrX 22596350 5' - INE-1 551 1 68.61 ATATAGCTGACAAAGTTAGCAGGGAGCTGCTAATTCTTACAGGAGGAAAACGTGCAGAAAAGCACAAATGCCACAAGTGGAATTTGGTATTTAACAGGTGACTGGGAAATGCCCTTTCAATTAGAAAAAAAAATAGGAATATAAAA:1 + chr2L 5231340 5' + Doc2-element 251 1 67.12 AGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 19032690 5' - roo 9003 2 67.81 GAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr2R 24170021 5' - transib2 2796 1 37.93 AATCTCTTGCTTGTTAATTTTCAGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTC:2 - chr2R 4545199 5' - invader1 3564 1 72.60 TTTGTAACGAAAATTGCTGTAGACAGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 + chr3L 13365691 5' + BS 4999 1 73.97 GTAAAATAAAATCACTTTCCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 + chr3L 15913799 5' + jockey 4771 1 76.03 ATAAGTNATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:1 + chr2R 10161795 5' + transib2 71 1 66.21 ACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 + chrX 8027384 5' - Juan 4204 1 68.46 ACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGA:1 + chrX 4808523 5' - mdg3 5425 2 65.07 ACAAAAGAATTTAACTCTTTACAACCACGAGGTCAAACCAAGTCAAAAGTGTAGCACATATTCAGTTGAGCCAAAAAATAAAGCTTTTTTTTTGTTTAAAAAAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATA:1 - chr3L 27357517 5' + Tc3 1624 1 65.75 AATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTT:1 + chr3L 18281844 5' + Doc 19 1 68.14 AAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATC:1 - chr2L 21403534 5' + G5 4454 1 73.88 AAACAAAATTCGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr2L 6647751 5' + mdg3 38 2 59.15 ACTAATGGCTCAACTATTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:3 - chr2R 12779769 5' + I-element 13 1 77.40 AATGTATGGACGGAGTACGTGTCGCCCAATCCCTTTTGAATGGCCACGAAGAAAAGGGGTTGTAAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCCTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATG:1 + chrX 4809495 5' + Cr1a 4151 1 57.53 GTTTATTGACCCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAACTGCCATGCCCACACTTTTGAAACATATTTCAAAGTTTGCTTATAATTTTATTTGCCCTGTAAATTTCTTAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCG:1 - chr3L 25611189 5' + G5 4434 1 51.39 TTTATAATAATAATTAAAATATATTATTTATAATTTAATATAATATAATATACAGCTGTGCTCATAAAATTAATAGTGCTTGAGACCTTCGAGTTTAAGATAAAAAATTTTTTTTTAATATCATTAGGTATTTAATTTTAAACAAT:1 + chr3R 26191364 5' - HB 1524 1 36.99 GGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr2R 8735546 5' - mdg1 387 2 61.64 AGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTA:1 + chr3R 8051148 5' + jockey 4846 1 80.14 CAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTTTT:1 - chrX 8027473 5' + Juan 76 1 66.90 GTATCGTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2R 12472156 5' + transib2 26 1 67.81 AGGAAACGTGCTTACGTAAGAAGGAAAGGCTGTTCATAAGGGCTAATCCTTGCTACATATACTGGTACTAAATTTAACTATATATTCCATAAACTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAAT:1 + chr3R 8396989 5' + mdg1 147 2 62.33 TATGTAAATGATACGAATGTGAAGTGACGCAGCAGCAGCAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAA:1 + chr3R 23067407 5' + roo 331 2 56.55 CCTATTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCC:1 + chrX 22596319 5' - INE-1 573 1 67.12 ATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTNGGGGACGCCAAAATTGATCTCTGTCCACTCGCTTACGCTGAGGGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTCGTTTGCTAAAATCGCCACGCGAAGCTACCGTTCACATACTTATATTT:1 - chr4 872517 5' - 1360 2965 1 64.38 CATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTA:1 + chr2L 11391479 5' - 1360 35 1 50.00 CATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 + chrX 8027411 5' - Juan 4161 1 54.11 CGTTGCGGAGAACTAATGCAAATCGTAGACTATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 18396227 5' + roo 14 2 75.86 AAAGCACATTTATACGGAGGAACTAGCCTGACGCTGCTTTCTCCGCGGGATCGTTGAGCAGCAGACCGAGACGGGCGGGGAGCTGATCCTTCTGTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGAC:1 - chr3L 12010309 5' - Stalker4 60 4 35.62 AAATGAATTCAAAATGTATTACAAGACTATTAGGTGGAAAAGAAGCAGAATGTGAGACGAAGGACGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGC:1 - chr2R 3461585 5' - Quasimodo 6960 2 55.48 CTGGAAGAACTATATTTTAGCTACTTTTCACAACAAACGCCTACAACTAGCGACAGCCCCATAGCTCCAAATCAGAATATGGCAATGAATACATCGTCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 1094630 5' + 1360 23 1 54.79 GCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3R 7420180 5' - 1360 3351 1 58.22 CGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr3R 7420262 5' + 1360 52 1 82.47 AGGAGCCACGATTCAGGGGAGCTGGTTTTCTGGGAAAACCAATGGTAGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 + chrX 10639057 5' + FB 42 1 52.74 CTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 - chr3R 31264082 5' + jockey 4826 1 60.96 ATGGTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGGTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTGCAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr3R 9298452 5' + hopper 28 1 59.20 TGCTGCCCTGGGTGGCCACTTATAAAGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - 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chr3L 18126003 5' + Ivk 52 1 50.68 AATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr2L 19675058 5' + 297 42 2 70.00 GGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:2 + chr3L 16690900 5' - I-element 5297 1 60.27 GCACGGTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 - chr3L 19111606 5' + Doc 67 1 60.27 ATCAACTCGCTGTTGACAGAGCTGAAAAAAAGTGGGCAGAACGTTGGACTTCTCTCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAAC:1 - chr3L 21810527 5' + mdg1 7059 2 60.96 ATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 8308505 5' - roo 354 2 56.85 GCAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr3R 13972973 5' + 412 85 2 74.66 AGTCTTTTAAAAGTTAAAGTTCATGTTTCTATGAACTTTATTCTATTTCTATTTCTATTATTTACATATGTTTAAGTAGTAACACTTACCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 20898494 5' + roo 8694 2 65.75 AAACCCAAAAGAAACTCTATAATGGCATACACGGCATACACACTCACACTACACCCGTCCCACTCCCACACTCCACCTCTCTCACTTCCGACCATTTGGGGGTTTCTTTTGTGTTTTCTCCTCTTTTCCGATTCTTTTTTTCTGTA:1 - chr2L 16017543 5' + McClintock 211 2 71.92 CAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 - chr3R 15054324 5' - copia 208 2 55.48 TACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACAAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr3R 4679421 5' - hopper 1386 1 63.64 AAGAAGTGTCACTTCACCACACCCCCACAAAATGAGGAAAAAAGAGTAAAAAAAACAGCTTAAAGCCGACCTAAAAATAAAGGAAACATAATAAA:1 + chr2L 1269225 5' - Circe 6964 1 52.63 AAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGGGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chr2R 4362751 5' + F-element 32 1 61.54 TGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 15790993 5' - roo 334 2 71.03 ATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:2 + chr3L 24934281 5' + HMS-Beagle2 6928 2 54.79 CACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGC:2 + chr3L 20189602 5' - FB 202 1 51.37 TATAAACCTTGCATTCCTATTGCGAATTTACATAATTCTATCCTCTGAGAATCCGTATCTTGAAATTTAATTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAATATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAA:1 + chr3L 4022559 5' - Cr1a 4333 1 51.37 TCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 20898641 5' - roo 9026 1 54.79 GCTTTCGTTGCTTGCTTATTGCGCTGATTTTATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGGTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCGCT:1 + chrX 6149150 5' - jockey 4755 1 71.31 ATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAA:1 - chr3L 14720905 5' + F-element 73 1 59.29 ATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:2 - chr3R 11040180 5' + Bari1 40 1 58.90 CATTATTTATTGCACACGTCTGCAGTGTGAATCAAAACAAAATCGGAAGCGGCCCGAGAGTGGGAGAGAAAGAGGAGGAGGAGGAGAGAGTGAGAAACCCAGTGGAAAAGAAATAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 + chr2L 21108060 5' - copia 146 2 78.62 AATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chrX 18282612 5' - P-element 2823 1 33.07 GCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chrX 8437686 5' - P-element 2794 1 22.60 CTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATGACTTTTATTGAAATAGTGATTCAGGATGATATCAG:1 - chrX 10521726 5' - Tabor 435 2 51.91 TTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 - chrX 5323166 5' - Juan 4195 1 32.88 AATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCACCTCCCA:1 - chr3R 934254 5' - Rt1b 4746 1 50.49 AGAGGGTGGGGCTACCACCAGCCGGAGTTGATCGAATTAGTCTTCTGGATATCTCGGGATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACG:1 - chr2L 9782198 5' - P-element 137 1 65.75 ATCCTTCTCATCCTGCAAATAACAAGTGGTTGACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCATCTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCA:1 - chr3R 29392997 5' + I-element 5058 1 76.71 AGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAA:1 - chr2L 23400824 5' + S-element 67 1 64.38 TTTCACGCCAGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chrX 19074905 5' - mdg1 7450 2 73.68 AATTGTAAGTCGGTCAGGTCTTTTGTGCCGTGGATGAATGGCTCGAGAGGAATCACTTGAGTTTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTAATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTG:1 - chr2R 23171769 5' + S-element 1611 2 57.53 CTATCTAACTTTAACGGATCGGTGACCTTTAACACAAAGAAACATCATCTCGTCGGTTCCTTTGTGGTGCAATTCTCAAAAGAAACGATTACGGTCGGCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTAATT:1 - chr2R 1686865 5' + GATE 8337 2 68.49 ATCTATAAACAAATTGGCCAGAGAGTTTGGGGCTTGGAAGGAAGTGGCAGCGGGGGAGGTGGAAAAACTGAGCTAACGACTGGAAACTAGGAAACGCGCATCGGCAAAGACAGCAACAACAACGAGAATAATAATAATAATAATAA:1 + chrX 11372322 5' + mdg1 29 13 82.19 AACAGCGCCAAAAAAATGTTTTCTAAAACATTTATATACCCCATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAATTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAAAGCTGTTCGCTGTAGCGC:1 - 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412 7459 2 73.97 TGTAGGAAAATTCAAGTAACTCGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 14051866 5' + roo 8710 2 57.53 ACGTTCTGGAGCGCAAAACCAACGCTGCCTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAATTTTGTACGAAAATTCATACTTTTGCTGCATCGCAGATAA:1 - chr2L 765762 5' + pogo 105 1 77.40 ATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3L 5489878 5' + jockey 63 1 52.05 CTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3R 23067555 5' - roo 9036 1 63.70 AGGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chrX 18336688 5' + mdg3 5305 2 51.72 CTGGACTCATGCTCCTGTTCCTCTGAGTCCTTCTTTTTTCCAGAACAACCAATACAATGGTCAGTGCACGTGTTCATATCCATTCCGAACATATCCAACTGAAAATTTGATATTCTTCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATGAA:1 - chr3R 17188771 5' - Tc1-2 230 1 66.44 ACACAGATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2L 19675111 5' + 297 6596 2 69.86 AGATTGAAAAGTATGGAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACT:1 + chrX 18396022 5' - roo 406 1 73.29 AATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 + chrX 18817262 5' - transib2 2778 1 54.11 AAAGACATCACAAGTTTAAAATCATCACTGTCGCCAAAGTGGGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCT:1 + chrX 1799099 5' + invader4 2777 2 68.80 ATAATAAGAAATATGTATGAAAGCGGAATCTAGCATTCACTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAACTAAA:1 - chr3L 22890899 5' + FB 778 5 56.10 GTGGGTGGCAATGTTACTCTATAGAAAGCTGTGGCTTTTCGGGTTGGGGCTGAGTGGATATTTTTGTGGGTGTCTAACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chr3R 11937422 5' - flea 4972 2 59.59 CTCCATCGCACTCCCCATTCTTTTGGCTTTTTATGGCCTCATAAGCTCAGGCCAATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCCGAATCTCCGCAACCC:1 + chr3L 2543184 5' + G2 132 1 55.56 AGCGCACACACAGAAAACCAAAGTGTTCCCTCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chr3R 25709742 5' - hopper 1381 1 62.33 AATGCAGACAGTATGTAGATCGTAAAGAGGTGGTTCGTGGTTGACGTCTTAATTACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAG:1 - chr2R 962712 5' - blood 7216 2 54.81 ATATAAAACTTATTATCATAGGATGCTTACATCAAGGATAGAATGAAGCTCAAGTCTTTATAGGTTTTCGGGAGCAAATATACACATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 17926433 5' + opus 30 4 65.07 AATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:2 + chr2R 13766181 5' - roo 9031 1 57.53 ATTTAGCTATTGGGGAGCGCACATCCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2R 10411503 5' + 297 6587 2 79.31 TATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACGTCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATA:1 + chr3R 19450148 5' - roo 90 2 61.64 AACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTT:1 + chr3R 27405993 5' + diver 88 2 75.86 ACAAGCGCCTTGGTGAAGTGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3L 10373915 5' + 297 21 2 56.57 ATATTTCTAATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTTAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCATCTGTTTGGGG:1 + chr2L 17180029 5' + Juan 3814 1 51.55 TCTAAGCTTAAAATAAAGTGTAGTGCCTTAAATCAATTTCATATTTCATATTAAATTTTTCCTTGGTTTTGTACCTCTCCCCTTCCCAGCCACCAAAACGACTTTGAATTGTGTTTTTTTCCCCCCATTTCATACACATAATGTAA:1 + chrX 2777719 5' - hobo 2558 1 63.01 TGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 + chr3L 2544642 5' + Tirant 48 2 69.52 TAATAATACATTTCATCGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 31653206 5' - roo 388 2 73.29 ACTGAAGAATCGTATATATTATCTGTGCAATATATTCGATTGCTTCTCCGTTACATTCTCCTATGATTCAGCTTTTCAGTTCCCTTCTCTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 - chr3L 8941837 5' + Quasimodo 25 2 41.10 GAGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATAAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCCTTATCCCTTATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTG:1 - chr3R 9038994 5' - Juan 4149 1 68.00 TGAAGCTTGAAGTTCCTGACTTGCATTCCAAGTAATTATAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 + chr3R 30813317 5' + FB 48 1 52.74 AATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:2 - chrX 1341735 5' + 412 7112 2 56.85 TGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATAGTTTAAATACTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAG:1 + chrX 22564593 5' + Transib5 101 1 67.12 TAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCC:1 - chr3L 23112568 5' - R2-element 3197 1 53.79 TTACAGAAATGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGT:1 + chrX 21639575 5' - gypsy5 7330 2 71.23 ACAAAATAAAAATAAAAATAAATTAATTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCGGACAGATATGTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3L 13256530 5' - 412 427 2 58.04 TGAATGCCAAACAGGCAGCTCTTATATCCTGGCGCAGGCACATTGAAGCCAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGGTCTCCGCTCAGCCTCGACCACAAGTTCTTGCTCTACAAT:1 - chr3R 26274115 5' + F-element 4225 1 74.66 CCCAAACAACCAACCCCTTGCAGGTTGCCTCATGCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 + chr2R 8099101 5' + jockey 4770 1 75.37 ATTCGAGAAATGTGGACATCGCAAATGTCCTCAACATTCCCTCAGTTAGACAACAGATCAATTGTCATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTTCCACGGTGATATTTCAATAAGCCCCACATATTAAACTCATGCCCATCCC:1 - chr3L 23854191 5' + I-element 5046 1 52.86 GCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 - chrX 14722242 5' + diver 24 2 62.33 CTTTGTTTCCTAATTGAAATTTTTTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGATCGCTAAATTATATTTAGGAT:1 + chrX 7795529 5' + roo 8742 2 72.60 ACTTGTTGACATAATATTTCTTAAAAAGTAGAACAATAATTAACCCATTAAAGCCGCCCACTCGGCGTAAAAGTTTGATGTGTGAAGGATGTTCAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 19338685 5' - Tc3 92 1 63.64 AAGTGCCGACGCTTCGAAGGGGGTAAAAAGTCAAGAAAGGTTCCCAGGCCAGAAAAATCCAGATGCGAACTCAAAGCCAACAACTTACAATGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGAACTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACA:1 + chrX 7190569 5' + F-element 4223 1 50.00 ATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCT:1 + chr2L 10156092 5' - hopper2 1564 1 52.74 ATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 - chr2L 7593145 5' + jockey 4728 1 50.68 ATTATGTATTTTTCCATGCTTTCTTGCATTTTCCCCTGTGCAGTGATGTAGCATTGGACATGGAGCTGGCCGCACCCAAGTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGG:1 + chr3L 19055352 5' - roo 8895 2 78.57 ATAACAAGCAGGAAACATGAGCAATAAAAATACACAATATGAAACGAGAATAAGCGTAAAAAATATGGAGTTGGTGTGGGGAAAGGTCATGCTGATGTTGATGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGT:1 + chr3L 16246845 5' - Doc3-element 494 1 70.55 GACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr3L 6518670 5' - 412 451 2 52.74 AATGAACATCAGCGAAATCATTTGGCGAACCACAAAATCGCATCAAAATATTGCGTATGTGCGTGCCGAGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chrX 6513504 5' + hobo 22 1 70.55 AATTTCAAGGAGCGAAGCATTAGTTTTAAGAATTTTCCCCGACACGCACACACACACACACACACACACACAAATAC:1 + chr3L 12621401 5' + accord 7031 2 59.74 AAATGGGGCGTATACGTAATACATACTGCATACTATTAGGCGCTCATAAAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTAATTTCTTCTT:1 - chr3R 24450516 5' - 412 427 2 59.59 AAACCTCCTCCGTTGACTAAACCACCACCACCCCGCTCTCAAAAATTCAAATTATTGTACCTAAATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTTATTCTGTCTCCGAACCTCCACCAGCA:1 + chr2R 19263526 5' + HeT-A 6051 2 71.92 ACAAACAATAATCTAGGTATACCCATCAAGTAATCGAAAATCTGATGCAGTTCGGTCAACGTTACAGTAAAAACTTTGTAGTTCAGAATTTCGATTGTGCAATCCTAAGGTTGGTGGTTGCTAATTAATTAATTTAATAAATTTAA:1 + chr3L 2021375 5' - transib3 2666 1 56.16 AATTTTTGTTCGCAAAAGAAACTTTTGCCTTTAAAATCAAACAATGTTATTCTATTAAAACCGAATGCTGCTACAAATGAAAATAATTTAATAAATATGTTCAATTACAATTTAAAGAGGCGAAAACATA:1 + chr2R 19203012 5' - hopper 323 1 82.31 CTATGAACTCAAAATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3R 30675330 5' - 297 6955 2 64.23 CAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATG:1 + chrX 14526865 5' - P-element 2781 1 16.44 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCAC:1 - chr2L 4034960 5' - TAHRE 10396 1 68.97 ATCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGC:2 + chrX 15408715 5' + INE-1 526 1 43.15 TGGGTTAAAGGGTATACTAGAAAAGTATGTAAGTGGCATACTTTGGTTAAAGGGTATACTAGAAAAGTATGTAAGTGGCATATTTTTACAAGTAATTTCAATTTCTACACCTAAAAATCGACCAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1 + chr3R 4577571 5' + INE-1 246 1 71.23 ACAACAACGACAAAGAGCCACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 + chr3R 19407847 5' + diver 5895 2 79.31 ATTTTGCTCCTGCTTTCGCTTTTGGCGGCGTTGCGGTTTGCTTGCCAACTGTTGATTTAGCGACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGGTCCATTCGTATCTGTTTTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr3L 21327025 5' - 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chr2L 14074542 5' + 297 6618 2 55.17 AATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCT:1 + chr2L 23008376 5' + transib2 196 1 58.90 ATCTCGACGATGACGGATGACAATGCAAGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:2 + chr3R 11810578 5' + roo 5 2 79.45 ATTTGATTTTCATTTTGGGCACGTGTGCGAACTTTTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATG:2 + chr2R 15326794 5' - copia 241 1 74.66 TATAGAAATGCTGCTTCTCCTTAGCTATTAAATATACATCCTTTTATAATATTACTATCGTAATGATAAGGTAACCAGTTATATCTGGTCATCATGTTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT:1 - chr2R 10809301 5' + mdg1 30 8 80.82 GCCACTTCCGTCGCCGACATCGTGCAAACAAATGCGCATAAAAATCCATTATTTTAGCAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACCCACACACATATTCACACA:1 - chr3R 8425398 5' + accord 7036 2 51.67 GTATGAGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGT:1 + chr3R 19224987 5' + HMS-Beagle 57 2 57.53 ACCAACTAATTTCAATTTCAATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 21224681 5' - roo 390 2 70.55 CGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCG:1 + chr2L 11391464 5' - 1360 61 1 65.19 CAGACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr3R 30347468 5' - P-element 2876 1 74.48 ACCCCACTGTTTTCTCTATGTACACTTGCAAAAAGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chrX 13798965 5' + 412 7127 2 74.81 GATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGGGCAATGCTGACCCTCGGACTGGAGTCAAAAGA:1 + chr2R 24427555 5' + jockey 4726 1 47.95 AATTTTTGTTCGCAAAAGAAACTTTTGCCTTTAAAATCAAACAATGTTATTCTATTAAAACCGAATGCTGCTACAAATGAAAATAATTTAATAAATATGTTCAATTACAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTACCTCTTCC:1 + chr2R 19203012 5' - hopper 307 1 73.29 TCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 - chrX 5323330 5' - Juan 4164 1 47.26 ATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 + chrX 13134882 5' + jockey 4815 1 53.42 TTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 - chr3L 14094690 5' + I-element 55 1 57.53 GATAGACCAGTATTTAAAATTGGTTTTTATTGTTCAAAAACATGAACTTTTCACGACTTGACTCCACAACTATTTTATTAGATAAAAAAATATAACGGAACTAAAGCCGGGGTCTAGGCCATGCATAATACTGCATCTAATATGAC:1 + chr3L 26371550 5' - Gypsy12A_LTR 90 1 76.03 GTTGTTGCTCATAGCGCTTAGCCAGACAGTTAATACGAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGC:1 - chr3R 13612603 5' + F-element 204 1 49.61 TATATACGGTTTGCTTTATGTATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCTT:1 - chr2L 11839767 5' - mdg1 378 2 58.22 AATGTATGGCTTACGCAGCCACTGGTATTTATATTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGC:1 + chr2L 17809128 5' - jockey 4981 1 74.66 AGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGTCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCAACTTTTT:1 + chr2R 10417137 5' - 1360 3343 1 55.12 GGGGTGTTAAATTGACCCATGCTCGCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCT:1 - chr2L 20821275 5' + Burdock 83 2 78.08 GCATTAAGCGAAATTTTAATTACATTCTCGACAGCCCCTAGCCCTGAATCACCATAAATTTGATTAACAAATATCAACCACAAAGAAAAAATAAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCTCTAAGCCGGGATCAAGCCCTTA:1 + chr3L 9989882 5' + I-element 155 1 60.27 TAGGAGAGTGAGTTAATGACCCGAGCACTACGGATCACTTGGCAATTGTCTTTGTTTCTTTGCCCCGTCTGGGCTTTCTAAATGGTGTTAGCTTTAAGAATCACTTTAAGTTTCAGCTTAAATTTGCAGTTACCAGAATAA:1 - chr3L 18402238 5' + Gypsy6A_LTR 171 1 60.28 GTAAACGCTTTAACATGACCGAGTTTGGCAACCGGAAAATTGTCTTGGAATGCGGGGATATCTTCTCTCGAGGAAATCAACTGGCCTAGACCTTAAACCAGCGCTCCTTGCGGAAAAATCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTAT:1 + chr3L 20084343 5' + Max-element 381 1 66.44 AAATAAAACCCGAAAAAAAAGACAAGATTTTACTATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTAC:1 - chr2R 11196884 5' + F-element 4398 1 76.71 ATATGCATGTAAGAATCTGCTTATCTACAATAAAACATTGCCAGTATTAGATAATTTGAATGAATTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGCGAGCGCGAAATTTCACCATTTTTCTGGAATATCGATA:1 - chr2L 21384182 5' - INE-1 503 1 64.14 AAATTGCCCATAAAAATGCATGCGAAATCGTTTAGTCGCTCCTCCCACACGATGGATGATGGATGGTCTGCGCACTACGTACGTATGTTTTTAATGAGGTCGTCTTAATCAGCCAAATGAAGCTGGGGTCGGAAAAAAGGAATTTT:1 - chrX 18567736 5' + FB 15 1 57.53 TGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:2 + chr3L 9809259 5' + 412 7125 2 68.28 AAACTGTATTTATTATGGCCTTAATGTTTTTATTATTTCGATATTCGGTGCAACTTTTGGAATTATTAATTTACTTTTATAATACTTTAAAAAGAACCTAAAGTTTAAACAGCAAAGAGTTAACAAGACAGTGATATAGTCAAACT:2 + chr3R 21563704 5' + looper1 310 1 77.40 ACCAAGAATTCACTCCAAGTCTCATTCGATTTTCATATTGAACCAAACTTTTTAAAGAAAATCCTCAGACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATA:1 - chr3L 18314574 5' + I-element 5027 1 53.42 AAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr3L 23906460 5' + 1360 66 1 67.41 CATAGTTTAATTATACCTGTATTACTAGATGCGTTGAAAAGTGTGGGCGTGGCAAAATGAGATCAATACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCG:1 - chr3R 23891568 5' - INE-1 108 1 61.70 AACAATTAAATATATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCT:1 + chr2L 16539593 5' - Juan 4212 1 83.56 AACTACGGGCTCAAGGGTATTTTAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACTTTATTCGTTGAGT:1 - chr3R 24219414 5' - roo 393 1 71.92 ATCAAATGTTGAGATAATAAATCGGAATCGGAATCTCAATGGCCGCGCATCAATCAACTAAAGACACTTCCTCAATACACACACACACACACACACACAGATTA:1 - chr3L 11153160 5' + gypsy3 426 1 74.04 GGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3R 11191476 5' + roo 8742 2 72.60 GTCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATA:3 + chr3R 10270545 5' + Juan 4061 1 60.27 ATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 20898634 5' - roo 9019 2 56.16 GGCAGCACGTGGCTCCCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3L 2544582 5' + Tirant 29 2 67.12 GGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chr3R 23639158 5' + pogo 78 1 70.55 TATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGT:1 + chrX 2479485 5' - mdg3 187 2 54.79 CAAGACTAATAAAATTAAATTAAATTAAATTGCCGTAGCAATATAAGGCGCCTTGTGGCAACTTTCGCTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGTTGAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCTATACGTTCATACGGACAGA:1 - chrX 21019292 5' - INE-1 130 1 55.48 AATAGAAGGAGAGAATGAGAACGCAATGACATGCATATGGCTTGGGCCGTTGGCTAGGCTCAGAATAGGCACAAAAGCCG:1 - chr2R 16902648 5' + Porto1 4347 1 56.25 TATCTTGAAGCTCGTGTAATGAATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chr2L 4063948 5' + roo 8713 2 54.79 GAATGGAATGCGTTTGCTGTCGCCGACACCTTTGGCCTCAAATTGATTTCTGTGCTTAAAAAAAAGAAATGCAAATATTTTTTATATAAAGCGCAGCTCTGGCGTGAGTCAAACGAAGACTCAAGCGACACCCCCCTCATGACCT:1 - chr2L 17808147 5' + jockey 4755 1 70.34 ATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 - chr3L 46989 5' + FB 78 1 69.86 AGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 21216721 5' - roo 395 1 63.16 AGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGTAGAATGCCTG:1 - chr2R 6482506 5' + gypsy 83 2 71.63 AATAAAACGAGAAAGACAGCAAACAAGCCTACCAAACATGAGCGTACTAAAACCGCCTAAAACTGCCACGCCCACATTCTTTAACATTCTTGATCGATATAATTTCATAATTTTATTAATGGCGTACATTTCTATCGATTTGCAAA:1 - chr3R 26892761 5' + INE-1 307 1 69.86 TTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGCGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATT:1 + chrX 292428 5' - G3 4506 1 65.07 GGGGGAATAATCGGAAAAAAATTGATAAATCATCTGTTCAGCCAATGAGTTTTTTCATAAGCTTTTGTGTTTGTCAAACCAGTGGTAGCTTTTAATAATTTTCTTTTATTATCATATATTGTAAACATAATTATTGAAGATCCGTT:1 - chr2R 4525768 5' + Cr1a 110 1 57.53 GCAACATTTTGTGGCATGCTGCAGCAGCATAGCTAGAAAAAATGCAAAAAACAAAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTCCTTAGCAAACCCA:1 - chrX 7615934 5' + I-element 5109 1 61.64 ATAAAATGAGAAAAACTTAAAAATATTTTCTAAAGTGTTCGGCGGTTCGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAAAAGTTGTTTAGCAAATTTACAACACCAGCGAAAATATGAAAAAAGATCAAAACATTTTTCAAAA:1 + chr3L 24731967 5' - INE-1 264 1 67.12 ATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTT:1 - chr3R 11062860 5' - roo 9038 1 59.59 CCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGCGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chrX 8437667 5' - P-element 2850 1 47.71 GTGGAGATATGTATCAATTTGAAAAGCGAGAAAGAGACAAAAGGGGAACCCCCGTGGGCAGTGACCAAACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGATGGCCTTG:1 - chr3L 6294911 5' - G-element 3889 1 65.18 TATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 11164474 5' + roo 8717 2 79.44 GAAATCTCATTGCATACACACCTCGACAACAACAACACCACCACAACAAACAACCACATCATACACCCACAAACTCAAAACGACAACCACAAAACGGCAGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 + chr3R 27081333 5' + jockey 4624 1 71.92 GCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:1 + chr2L 11391528 5' - 1360 23 1 56.88 AAAAGGGCAACTTGTCACCGAGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 + chr2L 7125699 5' + I-element 5 1 80.14 AAGTGTTAAGCACTTGAAACCCCTCGGATGGAGATGCGCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 6518520 5' + 412 7073 2 70.00 CTTCTCTTGCTTTTCTACCCAATTCCCTTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTNATGTATACGCA:1 - chr2L 7533512 5' - accord 349 2 78.52 GATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAG:2 + chr3L 24131413 5' + Transpac 4998 2 74.66 CTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATGTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTGACTCGTTG:1 + chr3L 5532906 5' - roo 396 1 67.50 GGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCA:1 - chrX 9950582 5' + jockey 4721 1 71.43 TAAGTGCGGAGTTCTTCCAGACCGCACTTTTCCCATTTCCCTCCCACAGGCACAACCACACACACACACAAACACACATATGCACTGTGGTCCAGAATTCGACTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr2R 12703116 5' - transib2 2790 1 59.12 AGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGTCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr3L 23906448 5' + 1360 62 1 71.43 GGTGAAATTCGAATGTCATCAGCATTGATATTGCGAAGATTTTTTAGAGCAATGGCACAAAAAGTGCAACCAAACGATAAAAACCATTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAAATGGACGTGGGCAAAAG:1 - chr2R 5180391 5' - FB 99 1 50.68 AACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 13300930 5' - roo 9030 1 63.64 ACTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 23067556 5' - roo 9037 1 64.38 CTATTTCAATAGAACGGCAACACAAGGGAAAGATTATGTAGAATTATGAAAAATATTATAAAATGCTTTTATTGGCTTTATGTGAAGTCTTTTTAGGCACTTTATGCGTTTTTTGCCCACCACTATTATTCTGACCACAGCTGTAT:1 + chr2L 13261943 5' + HB 1630 1 47.26 TCTACTATTTTGTTTCATTTGTAAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 + chr3L 11913144 5' + BS 5010 1 74.66 GTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 25616485 5' - roo 9032 1 58.22 ATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTAT:1 - chr3L 21769105 5' - I-element 5288 1 63.70 AACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGT:1 + chr2R 2591133 5' + roo 107 2 73.29 ATATTTTCGTGCAGCAAAGAATTTGGCAGAAGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chrX 22840455 5' + copia 4911 2 56.16 TCTATGCTGAAAACCATTTCCTGTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr3L 21655853 5' - HMS-Beagle2 7164 2 58.90 AGAATCGTAGGATTTATAAAATAAAAAATTTATAAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3R 17421204 5' + pogo 29 1 57.81 ATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGGAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3R 19450191 5' + roo 67 2 57.41 TGTGAGTCTATTCACAAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3R 7420161 5' - 1360 3370 1 71.23 AATAGGATCTTTTATTATTCAAGGATTTTTTGTAACTTTCTTTCTTTTTAAACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAAATTTCCT:1 + chr2L 12806812 5' - pogo 425 1 73.29 AATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chrX 7795610 5' - roo 343 2 63.19 ATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCGGCATCGATTGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chrX 11661517 5' + pogo 31 1 61.15 AAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAA:1 + chrX 6116271 5' + transib2 87 1 76.71 ATACAATACCACCCCACATACTCCAAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3L 5489847 5' + jockey 29 1 62.50 TCTTAAATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 - chr2L 15936892 5' + copia 4903 2 62.33 CTTCCAGGCCTATAAAGTTTTTATATTCTTAATCAGAATAACCAACCGAGCCGAAACTAAGTATAAAAATAGATATTCAGAAACCCGAAGAATAAAGTCTACGCAAGTTCGTTCTAAAGCAATACCATGCCGACTCTAACGTCTAC:1 + chrX 23067453 5' + INE-1 214 1 54.79 ACAACAAATAAGCCGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 - chr3R 9039066 5' - Juan 4203 1 76.55 CTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACTAATAGCAATTT:1 - chr3L 25401026 5' + Doc 43 1 47.26 TTTATTGCCTGCTTGGCTCTGTTGATTTTCTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGTTTAGACCTCGC:1 + chr3R 17526656 5' - F-element 4486 1 75.40 TAATACTACAACAGTTAAATCTTTTTCAGAATTTTTAAAGACTTCTGGGCATGTATGTAGTTCCA:1 - chr3L 6155818 5' + baggins 5286 1 55.38 TATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 + chr2R 15326858 5' - copia 211 2 69.18 GTATGCTAAACCAAGTGGTTAGCAATGCAAACATTATGTAGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 - chr3R 7943809 5' - blood 7308 2 74.66 ATAAAATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 + chr3L 10373783 5' - 297 370 2 69.86 ATACAAATTTAATTTTAAATATCTTTGTATATGTATCCATATTCCCCCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAAGCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCG:1 + chr3L 14756197 5' + I-element 4930 1 66.44 CACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTC:1 + chr2L 14026142 5' + F-element 436 1 58.76 AAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATG:1 + chr3L 11257354 5' - 1360 3386 2 58.00 CATTGGTCAGTTATAATAACAAAACTATTTTCGGGACTCACACTTCCCGTTAAACTCTAGTTGTTCGAGTTACGGGGGTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTA:1 + chr3L 21974387 5' + GATE 37 2 54.55 ACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACCAAATAA:1 - chr3L 23354490 5' + F-element 87 1 67.12 AAACATACGTAAATAACAAAAGAGTCACAAGCCGATGGAGTGGACATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTAATTCC:1 + chrX 12744299 5' + Quasimodo 6920 2 68.49 AGGAAGAAGAAGCACACTCGAACTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGGTGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr3R 13875108 5' - P-element 2794 1 21.92 ATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:2 + chr3R 8051111 5' + jockey 4809 1 54.79 AAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGGCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGA:1 + chr2R 12185341 5' - accord 7227 2 72.60 CTAGGGCATAGATTTTTGATCCATTTGATTCTACTTCTACTGTGGTACATACAACAAATGAGAATGATATAGTAAGGTTCCCCGTTCCCCGATAACCATTAATCGAACGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATAT:1 - chrX 23064319 5' - INE-1 498 1 70.55 ATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 + chr2L 17180050 5' - Juan 4178 1 59.31 ATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACT:1 + chr2L 3675830 5' + Juan 4070 1 50.00 AATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:2 - chrY 2720378 5' + 297 6633 2 62.33 GTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGTTGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGA:1 - chrX 19038446 5' + hopper 84 1 71.92 AAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGT:1 + chrX 18817273 5' - transib2 2767 1 56.16 GGGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 21224519 5' + roo 8699 2 58.27 GTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 + chr3R 26504213 5' + HMS-Beagle 6844 2 56.72 AATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATTGTTCCTAAAATCTCGACGTTCA:1 - chr4 829119 5' - INE-1 140 1 61.64 ATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr3L 27391406 5' - 1360 3349 1 53.42 AGAGCCTGGATAGCAGTTTGGCTTAGATGTAGTTACAGGTTGTAATTGTTGCTGTCTTTGTTTAGGTCTTAGTTTAGGCAAAATCTAACCAAAGTGTTCGTCTATTGTGGTGTGAAAAATGATATGTGCCAAAAACTAATAACTGA:1 - chr3L 20421834 5' + transib3 435 1 72.60 GAGGAGTCTCGAAATGAAAGTCCTAACAATCCGCTGGAGCACGTAAGGCAATCCTATCGCTATGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 - chr3R 22708427 5' + jockey 4817 1 56.85 TAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chr3R 7420283 5' + 1360 80 1 73.97 CACACACACACACACCGAAAGCGGTTATTCAGGCGCGTATTTAAACCATTTACCAATCAAACATTCAACCCAGTCAATCCAGGCACCGAGCTTCCCCCTTCATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAAT:1 - chr3R 10899478 5' + accord 7255 2 69.86 CTTATAAAGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr3R 29690801 5' - I-element 5306 1 53.10 TCAACAAACACAATTCGCGGAAAAACGAATCACACTGCAAATTTGGAGCCGCACACTGACGGGCACGGGACAAAAGCTCACTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGT:1 - chr3L 8685267 5' - I-element 5317 1 57.53 GTTACTGGTTGTTCGTTTGTTTCGATTTTTGAAAACGTGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACT:1 - chr2R 19260017 5' - mdg3 5027 1 78.77 GCAATTGATTGAATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:2 + chr3R 27405921 5' + diver 17 2 73.29 ATATGAATATATACACATATATATGAATATGTATGGGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAACGGGGCAATTAACAGCCGAGACAC:1 + chr2L 20641547 5' - hobo 362 1 70.99 CATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:2 + chrX 19054261 5' + jockey 82 1 67.81 TAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACATCCATTAT:1 + chr3R 4217668 5' + 297 20 2 66.67 GGCAAAGAATGGGGGAGATGCGGTTTTTGGCTCCGCACCTGCGCCACAAGTAAGGGAGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTTTAAAGAAACTCAACCTCATAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACG:1 - chr3L 11826488 5' - INE-1 144 1 69.86 GTATTCATCACACACCAAACCACACTGTATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 3920616 5' - roo 9038 1 62.33 ATAGGAGAAGTTAGTGAAGCGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAT:1 + chr3R 19449631 5' - roo 20 2 58.16 ATTGGCAAGGAAAGTTGGGCGAAAAGAAGGAAAGAAAGAAGTTAAGATAAAAGAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chr3L 18814880 5' + blood 7176 2 61.33 CCAACACTTGAGTTCTGTTTTTTAGCAGTCGGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATA:1 + chr2R 22989615 5' + hopper 87 1 75.34 GTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2R 11164420 5' - roo 338 2 69.78 ATACTAGATTCATTGAAAGGTATGTAGCAGGCAGAAGAAAGCAATTTCCGAATATATAAAGTATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACATACACACACACACACATACA:1 - chr3R 4673566 5' + Quasimodo 36 2 57.66 TGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCACCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3R 16518869 5' + Tirant 8128 2 66.39 TGTTAAGAGCAATAAAAAACAAGATAGAAGGTAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGA:1 + chr2R 17773765 5' + mdg1 7127 2 77.40 TATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCACAGACC:1 - chr2L 13844231 5' + Stalker2 7337 2 74.66 AGTGGTTTTAACTACTGTATTGTGTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTT:1 + chr2L 7618438 5' - X-element 4674 1 53.42 ATGCAAGATCTTAATAATTACATACACCAATAGGTAAATGTACAAAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chrX 14303990 5' + roo 8663 1 75.34 ATAATATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 - chr2L 15490095 5' + pogo 76 1 72.03 ATATACATAATTATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:2 - chr2R 24170044 5' - transib2 2818 1 53.42 AAAGCAGGGGCGTATTCAAAGGGGTTGGAAAATATTTTAGAAAATTTTTTAAGTTGTTGATTGCTTAAAATCACAGTTCGTTTGTTAAATTATTTAAACTCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGAGGTTGGTTCTTTTACTTCA:1 + chr3R 29577505 5' - invader2 356 1 45.21 AAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3L 17940161 5' - 1360 3340 1 78.00 TATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chr2L 21328155 5' - 297 6915 2 67.81 CTGTTGCTGAGTGCGTTCTTGGGCAACAATTTGTGTGTGCTATATTAAGTCAAAATTAATGGTAGTGAACATTAAATGCAACTCCGTTGTTTAAATAAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 23320013 5' + roo 8688 2 65.07 ACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAAC:1 - 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chr3R 2424364 5' + Ivk 5358 1 65.62 TAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGCATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 + chr3R 19407870 5' + diver 5912 2 64.75 AATGATGTGATCCCATAATATTGTACTGACTATGTGTTTGAATATATTCCGTCTCTAGCACAGAAACATCTTATTTTTCAGTGCATCTACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCAT:1 - chr3R 31592679 5' - micropia 5253 2 63.01 AGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCTATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3L 10731891 5' + 297 6624 2 50.68 AAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTC:1 + chrX 21772482 5' - springer 19 2 64.06 CGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2R 22034641 5' - copia 5073 2 55.17 ATAAAAGTAACTGAGTATATCTATTTCTATGCCATTTGCCCATCCATACTCAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGAATCCAATAAGTACCC:1 + chr2R 4673481 5' + Quasimodo 118 2 54.63 CTTCTCCTGCAACCGTGCAAATAAATATTCGCCTAGAGTGGGCCTTTTGGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1 + chr3R 20595472 5' - Quasimodo 192 2 65.00 ATAATTATTAAATTGACACAAAATATAGACAAGCCCCACAGTGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCGATGACTCGGTTGCTCATATACCAGGGGAGCCCAGCTATTGTATTACTCTAAGCCTATCGAGCTGAGTCTTAGAGGCAGT:1 + chr3R 4331063 5' - G5A 2455 1 72.41 AGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTT:1 - chr2R 21410955 5' + Burdock 6211 2 69.18 GGAAGTAAACAGAGTTCTCTCTTCTAGTATCCGTTCCATCTTTTTGTTATGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTTTTAAAATTAATACGGTAAGATCATTATTAATTCTAACAGCTTGTTTT:1 - chr2L 17177663 5' - Juan 3877 1 39.44 GACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAGAAAACGTG:2 - chrX 22906771 5' - Transib-N1_DM 19 1 69.86 ATGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTCAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chrX 6116324 5' - transib2 2741 1 73.29 AAGTTCATTTTCGTTTTTGACATTTTGGTTTCATGTTTTAATTTAGAATTACAATAATTGTAATTTGGCAATCTCGAAAAGAGTAGATTCTTTTTATGTCCCTTATATTTCATCCACTCCCACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGAT:1 + chr3R 19717633 5' + INE-1 545 1 80.14 ACCTGAAACAAGTAGAGGGATAAAGGAAAACGACAAAATGCCAAAATAAATGACTGCGACAAAGTAAACTTCAGATAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCGGAACTCCAACAGAATTAAACTATTAAAT:1 + chrX 543514 5' + Porto1 4544 1 55.48 GTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 6518660 5' - 412 7501 2 50.36 TAATCTTCAAAATATCTTAATCCTAATCCACTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATTATCATTAT:1 - chr2R 1845001 5' - mdg1 7079 8 51.52 CCCCCCGAGTAAACTCAGAGGTACTAATTCGGTTGCACACTTGCCGGGCAGGAGCGCTTGCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGA:1 + chr2L 22245967 5' - R1A1-element 5105 1 49.00 ATTCTAGTTGCCCACCATAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1 + chr3R 19449571 5' - roo 8601 1 79.07 TCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAAC:1 - chr2R 12185455 5' + accord 1 2 78.86 AATAATGCCATAATACATATCCAGAGACATGTTTCAATTGCAATTATTTGTCTGCGACAAGTCACTTCCAAAGGTCCTTGTTTACCCATAGACATACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGT:1 - chr3R 23544889 5' - I-element 5254 1 63.01 ACCATGTGCTTCCGTGCGTCGTCATTTTCCTGCCCATTCTATATTTGTGCCTCATCATTCCCCTTCCTTAGCGTCTATCACCTTTTGGACTCGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGGTATAATCTATTGTAACATCCTTC:1 - chr3R 7218808 5' - Tc1-2 1279 1 57.24 AACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGG:1 + chr3R 19449945 5' + roo 399 1 60.27 AATCGAGGCAAATGTCAGCTATCGATTTTTGTCCAAGGGAATCACTGGCGTTGCAATTCCCCGAGGAAGTGGCTGAGGTGAGACCTAAATTCAGCATCACTCATACGCCGCTTAGGCAGCAGAAAAAAAAACAACAAAATAA:1 + chr2R 14414352 5' + gypsy11 3933 1 59.86 AAAATTATGCGCGTTAGTAGCATTTTACATGCTGTACTGTTTTTCTCGTTTCTCCCATTTTTCCCATTTTTTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 26773994 5' - hobo 2909 1 56.85 AAAAACTTTCGTTCGCTTTCTCCCACGGAGTAGGCGGGTTGTGTGGTAAATCGAAGTTTAACGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGTCCGAGAACGGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chrX 20455760 5' + hobo 21 1 69.86 AGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTNGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGCGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCCTTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 10931619 5' + 297 52 2 53.42 TTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTA:2 + chr3L 21576901 5' - G6 1947 1 65.75 AGACAAGCAGTCGAGCAGCCAAGCAGCTGAGATGACGACGACAAATTGGAGTAATGAAAATGTTTTCGAAGCATTTGCTTTGAGGTAGACGACGAAATCTTCAGACACAGCGTGAGAT:1 + chr2R 12908113 5' + G2 2823 1 77.97 GGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 23639128 5' + pogo 48 1 51.37 TTTTGATAATGTCAATCGTAGGACGGCAGAAAAGTTTTTGCCATTCTTGCGGTTTAAGTGGGTTCCCCTCTTCCCCTACCCAGTTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAAATTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTT:1 + chr3L 17230727 5' - invader2 4708 1 63.70 ATACATTTCATCGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 31653201 5' - roo 9046 1 69.86 AACTAACGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3R 28469286 5' - 412 7515 2 62.38 GACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 - chrX 14450510 5' + hopper 46 1 53.79 GCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:2 + chr3R 20140485 5' + jockey 4740 1 65.75 ATTACAACGAATCAATTAAATTCTTCAATTCACTAGTAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3R 26178319 5' - 412 486 2 76.03 AAACTGATTTCCATGGGGAAATCATAAGGATACGCTCGTCTGTTGCTCTGGCAGTTGAGAATGGTTTGTACACGCACCAAATGGACGTGTCGTCTGCCTACTTGAACAGTGATCTACCGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGC:1 - chr2L 12185061 5' + Tc1 11 1 76.03 ACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chrX 8027392 5' - Juan 4180 1 55.48 AGGTTAGCTAAATATGTGGAAAAGAGGGAGCTGGGCCCATTCAGACAGTGAAACCTGATGACACACACTTTTTAAAGGCATTTAATAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTT:1 - chr2R 18965165 5' - roo 278 2 56.55 AATGGTTAATATTGAAAGAGGATCTTGCCAAAAAATAAACAGTGATCGAACCTGTGTCGTAAACAAAACCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGGATTATACAAACGCCCAATTGCCAAAATCGCTGTGCTGCCTCTCTGCTG:1 - chr3R 12158516 5' + 3S18 5720 1 52.05 GTTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2R 8047382 5' - 1360 3358 1 60.96 TAAGTTCCCATTGGCTGTTTAAACTGGCATTTGCAACTGATGCACGACTATTGGGGTTTTTATTTATGCTTTTGATTTTTTTTTTCATTTTAAGCATTTTAAGAACTGCATTTACTTACAACGATTAATATTTTACAAATTAATTT:1 + chr3R 13068554 5' - Gypsy12A_LTR 1856 1 71.23 AAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr2R 10411474 5' + 297 6595 2 70.97 TACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 5389871 5' - roo 9003 2 67.81 AAATACTATTTAAATTAAGAAAATACAGTGCGATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3L 13836714 5' + 412 48 2 53.28 GTGCATAATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCAC:1 + chr2L 11391449 5' - 1360 65 1 69.86 CAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGCTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTTAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGCAA:1 - chr3L 6518624 5' - 412 405 2 70.55 AAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATAAGTC:1 + chrX 21772482 5' - springer 19 2 65.62 GCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACTATGCCT:1 + chrX 11661371 5' - pogo 2078 1 65.35 AAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 - chrX 14722217 5' + diver 5940 2 51.37 CTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGGTCTTGACTACTGTAATGTTGAACTCCAATTAAGTACACAAGACCGTTTGAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3R 13973046 5' - 412 460 2 50.88 ATACGATTCGGTAAAGATTGAGCTTCATAAAAGGTGCACATTTGTTGATTAATTGACGATTCTGATAACCGTTTTCAAAACTTGTACCAAGAAAAATTAATACACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAA:1 + chr2L 2674468 5' - pogo 278 1 67.41 CCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - 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chr3L 9218281 5' + invader2 4928 2 65.07 AAAGATACCAATCAGTTCCGTATGTTTCAAATCAGTTTCTTCTATTGCTTTAAAATTAAAAGGCTTAAACTTTTATCATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3L 8627139 5' + pogo 15 1 29.66 CATAACTTTAAATACTCTCATCCGAAACTGACGTTTTAGGTCCTGTCCAAGGCAAAAACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCATTTAAAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATGATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACA:1 - chr3L 19276259 5' - hopper 325 1 68.49 ATTTTTATCGGTATACCAAAAACACTTTGTCCACGCCCACACTTTTTAACAATTCTTAAATTTTTTCCGATTTTATTCCCCAATCTATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGAATTTTCGCAATTCACACTAGATGAGTACCGGG:1 - chr4 976498 5' + INE-1 537 1 69.86 CAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAGTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 12115292 5' + 1360 48 1 69.52 GAACAACACAATCAGACGAATAATATCTTTGTGATGATTTGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTCTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAA:1 - chrX 22218747 5' - 1360 250 1 78.77 AGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACCTTTTTGG:1 + chr2R 10417121 5' - 1360 3340 1 50.68 TATTTGCCGGCGGCTGAAGGAAAACACAGAAAAAAAAAAGATGTACACGAATAAACAAAAACAAAAAGAAAAGAAAACAATGAAA:1 - chrX 2767373 5' + transib2 2642 1 69.41 ATTTTTCGATTTTCATTTCATAATTGTAATCTTTTATCTTTTTCATTATTCATTTGGTTAGTTGCCGGATCCCCTACAAGATCCATGCCATTGCCTCTCCACACTCTCTCTCTCTCTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAC:1 - chr2L 19256337 5' + blood 170 2 68.06 GTCCAATCTTGTCTCGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 13612915 5' + hopper 149 103 76.32 TATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 - chrX 5323168 5' - Juan 4197 1 32.88 TTATAAATTAATAGATATTTATATATATATAAATATTTAATATATTATTATATATCTAATAATTTAAATAAAAAATTTTAAAATTTAAAAATGTAGATATAATTTATAAAAATTTATATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAA:1 - chr3L 5555248 5' - 1731 311 2 29.45 CCGGAAGCGCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCAC:1 + chr3R 11040004 5' - Bari1 1696 1 76.71 ATGGATGCTTCAATTATTATAAAGACTCAGATTATTGTTAGCGTAACCCGCACAAATATTTTAAATGTTATAAACTTTATTTAAATGCCGATGGGGCTTGGTGATAGTCGCTCACTTTCATAATCTGT:1 - chr3L 25268751 5' - gypsy3 440 1 67.97 AAATTGTTTCGGGTGTTTTGCTAACATGTCGAAGACAATTGGATTGGATTCATTTTACTTGCACATTTTGTTAAATAAGGCACGACATGCATATGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTTATTGAAAGGAAATTAAAAGTTG:1 + chr2L 3359724 5' + G5A 2551 1 53.42 TGGCACNCACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATC:1 + chr3R 20441263 5' - I-element 5264 1 78.77 GAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAA:1 - chr2L 4754949 5' - Stalker4 331 4 67.81 CATTTGGGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTTTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATCAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 11810662 5' + roo 8727 2 68.33 TGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGT:1 - chr3R 23021006 5' + INE-1 579 1 42.47 AATCAGCACAGCTGCTGGCCTAGTTTTAAGGCCTTTGTTTCACCCTGGACTACGGTTTTTTTTTTGTGTTTGTCAAACCAGGCGTGGGTTTTAATAATCTTCTTTAATTCTCATATATTTTAAACATAATTAGTAAAGATCCGGTC:1 + chr3L 4943281 5' + Cr1a 111 1 56.85 GACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr3R 23295620 5' - P-element 2871 1 45.89 CAAAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr2L 8338229 5' - P-element 2846 1 58.22 CTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chr2L 21328148 5' - 297 341 2 63.01 GTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGC:1 - chr3L 20187451 5' - FB 688 2 68.49 AACCCTCGGATCCAAATGGACGTCTCAGTTTCAGAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr2L 19923962 5' + roo 84 2 75.86 AGGTCAAAGGGGCGATGTGGTGGAGACGAGCTTCCGATTGCTGCTGCTCTCGGCCAACTACATTCCCGACCAATGTGCCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAA:1 - chrX 2151992 5' + I-element 191 1 61.11 GTGTGTATATTGTATTGTATATTGTATATTGTATCTATTTTGTAGATTTAAAAATATTGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATC:2 + chr3R 2259891 5' - hopper2 1186 2 60.27 CTGGTATTATCCGCGGCTTGTGTTCTGTGAAATGGATTCTAGGACGATCTTTAAAGGAGTGAAACCATTTAAAAATGGGTTATAATACATACTTTTGTTCGTATATGAAGACTTTTATAACGAGGAGTCTACAGACCTTGGATCGA:1 - chr2L 15859347 5' + invader5 4015 2 73.29 ATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 14310330 5' - roo 9026 1 50.34 ATGGCCAACATTTAAGCCGGCTCCGAACAGCAACAAGGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chrX 10167391 5' + roo 82 2 76.03 ATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTGAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTT:1 + chrX 13219900 5' + Doc 96 1 58.90 ATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chrX 19054242 5' + jockey 62 1 54.48 AGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3L 25782389 5' + F-element 91 1 78.95 CAAAGGCAATCTTATCGCCATATCAGTTTTCCGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGCATGAGTGGAGAAAAGGAGAGAGATAGAGCACCAGAGTCCGAAGCATGACGAAATAATATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 18403114 5' - P-element 2877 2 72.60 TGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 14366511 5' - roo 9030 1 58.22 AGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCACGACCTCCCT:1 + chr2R 17796575 5' + jockey 4759 1 76.03 AGCTAGAATTAAATCGAAATAAAATAGTACAATAATGGCTATTGAAAATGGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAAAGAATGCTATCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGGGAAAGCGAA:1 - chrX 14770794 5' - INE-1 531 1 58.90 ATTTTCTTTGTTTTTGAGGTCACGTTTCGTTTAAATTAGTAGGCATTGCGTAATAAATAATAATTTCAATTAATT:1 - chr3R 16001091 5' - invader2 432 1 84.00 ACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:2 + chr3L 19274805 5' + transib2 78 1 69.86 AAAGGAATATTTTCTTGCTGACCTAAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2R 22992568 5' + hobo 37 1 56.16 GTTGACGTCAGGTGGTCCAGGTGCGTGGGCGTCAAAGGGACCCGCTTACATTACCATTATGTTATGTGAGGGTTTTAGTTAAAAAATCCGAGGCGCATCCCTTTTATTTCTCATCATTTTCCGCTTCTTTTTTTTCTTTTTTCTT:1 + chr2R 19988469 5' - Doc2-element 241 1 71.03 AAAACAACTACCACAGAATCAACGACAATTTCAACAACTCCAACGACAACCGAGCCAACAACTCCAAAGACCACTACTACCGAGTCAACCACAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATAC:1 + chr3L 5483094 5' + I-element 5162 1 65.07 AAAATACATATTTCTAGAGGGGAAGGTTTTATTTTCTTATAATAAATAATATAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCA:1 + chr3L 23688527 5' - Quasimodo 7304 2 69.18 ATATATTCAGCAAAATTTTACATACACATAAAATTATACATACCCATAAATATACATATCCATACATATCCACATATATTCCAATAAAATTTACATCCACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chr3L 25031887 5' + flea 17 2 73.61 TAAATCGAATAAATAAGGTGTAGTGATTGAAAAATATTTCAATTATTTGTTGGCATGGGTATAGAAATAGGCAAGAAAACTGGTAAAATTAAATAGAAAAAATAAATAAAATTTAAAAATATA:1 - chr2R 5862191 5' - hopper 176 1 81.30 GTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:1 + chrX 12066108 5' + transib2 58 1 57.93 TCGCATTCGTTGGACTCCAATGCCAGTTGCAGCTGGTTCTGAAAGTTGATGGACTTCCTGCGCGTGTTAACTTGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAC:1 + chr2L 10372735 5' + 1360 3205 1 60.00 AGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATGTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACG:1 - chr2L 22063438 5' - INE-1 144 1 60.63 TATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 14310351 5' - roo 9046 1 51.37 TAATGTAAGAGAATGTTGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr2R 13168597 5' + P-element 10 2 79.45 CCCACTTAAAACCTAGCCAGCTAACTGAACTTGTAATTATAGTAAGGACTCCCTATTTATTATGACTAGTATTACTCCACAAAGATCAACAAATCTCACACAATCTGAGTCCCTAGGCCAATCGCATTAAGGAAGACAGTCATCTT:1 + chrX 13294140 5' + gypsy3 6817 2 68.49 ATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3L 22890333 5' + FB 40 1 56.16 CTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 2145963 5' - roo 320 2 76.55 CTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 18046581 5' + roo 8704 2 56.85 CAAAGCGATTATTTTGTCTTGTTTTCTTCGGCACAATGGTACATATTTTCTTTGCAATTATTTTGTTTGTAATTTTTTTAAACTTCTTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTAT:1 - chr3L 12360267 5' - Doc2-element 4713 1 54.11 GTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chr3L 23839738 5' + 17.6 36 2 67.59 AGGAGCTGTCGAAAATATTTTACACCTTTTGCACTGTGACTCACAATCTATGGGTTGTTGTTTTCGAGGGATGCGGACCTTATCTGGGGCTACCTGAAAAATATACCACCAAAGTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCT:1 + chr3L 14860646 5' - Transpac 5117 2 73.97 GAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTG:1 - chrY 2720332 5' + gypsy 7013 2 67.81 ACAGCTTCTTTGCCATGACCTGTTTAGGTAAAACGGTACAGCAATACAGGCTGACAGCAAGTTTGTAATGGATATCGATATTTTTCAGATAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGT:1 - chr3R 28667102 5' - jockey 4680 1 63.70 ACATAAGCTGGCCTTACATTTTCATACATGTTTATTTAAGAAGAGAAAAAAACATTTTAACATATACATTTTATTTAAGAATATACCAAACTGTTTGGAAATCTATTTATATAATCCAGACAAGAGACTATCAGATAGCCGTTACT:1 + chr2L 12156845 5' - INE-1 550 1 38.36 TATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3R 7420331 5' + 1360 32 1 65.07 AATACAATTTATTATGACAAGCAGTGGTTAGGTTTTGCTGGCATATGATTTATATTAGCTTTGTTCATGTCTATTCTATGAAAATCGATGCGAAACAAGAGAGAAGGATATAGTCAACTTCCCCGATTATCAGATACTCGTTACTC:1 + chrX 4820561 5' - INE-1 549 1 65.07 ATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:2 + chr3R 4571525 5' - pogo 2033 1 65.75 CCTCTCTCGCTGCTTTCGCTTTTCGCTGTGCCCGTGCGTCTGTGTGCGTGCCCTTGTAACTCTCACGTAGCTCTCCTTTTTCCCACTCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAG:1 + chr2R 9247497 5' + gypsy5 144 2 61.97 ACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGGGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAGCGCG:1 + chr2L 16540938 5' + hobo 66 1 68.79 TTGTGGAATTAATCTTAAGTCCTTGCAAGCGCAAAACCTAAGATGTTTAGTCTCATTAAATAGCATGGTTTCATGTTTAAATAGCAAACGTTCTTTCAGTATTATCCGATTAGTCCTATATGGAATGTATGTAGTCATTGAGTTCT:1 - chr2R 10194660 5' - Stalker4 6910 2 86.99 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGAAGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3L 27391422 5' - 1360 3366 1 69.66 GCCGATAACGATGACTTTTATGACTCTTGGCATCAAGATAAAGGGTATCTGGGTTACTGGAGCTTGGAAGAAAGTATCTATGCAATAAAAAGTATATTTATGTCTTAATAAGTATATTTATTGCCATGTAATTATATTATTATATT:1 + chr2L 8342087 5' - transib3 2612 3 79.45 GAGTGCATTTGTTGTTGCTCATCGTAATGGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2L 11298168 5' + I-element 27 1 66.44 GTGCAAATATTGCCTCAGGTGGAGTGGCTCGATACTGTTTACGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGAAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGC:1 - chr3L 17624025 5' + rooA 7530 2 62.04 AATGTCTGAAATGATTTAGATCTGAAATAATTGGATTAAGCGATAATCTATATAGATATAATATAGATATAGATAGATATAGATAATATAGATCTATAGATAGATATAGATAATATAGATAATCTTTAATGCAATTTTAAGGATCC:1 - chr3L 23212663 5' + Helena 82 1 53.42 TTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACACACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCGTTTTGTCTTAGCTT:1 + chr3L 21996158 5' + Transpac 4980 2 52.74 AGATGCCAGTAAGTTTTAGTTCAATCCCATTTAATGAAATTCAACTTGAATAATTTTATTATTTTGCACGTTCAGTTTTTGCTATGAATTTTTATGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGTTAG:1 - chr2R 16950728 5' + R1A1-element 5103 1 64.83 AATGAAAAGTATGCATTTTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTTTGAACTTATGTCGTTTTGATTTATTGTTCTAAGTCCTCATATATCTATTTTTGTAAGTAATTACTCTAGTCAATAATTGTT:1 - chrX 19281158 5' - Doc 127 1 64.38 CGGCACAGAAAGCGATGCTAACTTATAGATACAAGATACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAAC:1 + chr2R 15616711 5' + I-element 5200 1 74.66 TCATTTGTCTTGCTAATTTGTTTCTTGTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 21299254 5' - roo 405 1 77.44 ACCAGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAGAGAATTT:1 - chr3L 3501872 5' - Bari1 1707 1 77.86 AGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 - chr2R 8047323 5' - 1360 3299 1 81.51 ACCATTTAAATGCCATCGTTAATTAGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr3L 17968194 5' - mdg3 5419 2 69.18 TTATGAATTAAAAACGCTGCAAAGTTGCGGCATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGGTTTTTGCTTGTAGTTACTTTGAATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATATTGTCT:1 + chr3R 27765066 5' - mdg1 396 2 56.49 AGCAATGTTTATATGCTTAGACCCTGAAAAATGGCAATTATAAGTGTGTGTTGGGCGCGAGTGTGTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGG:1 + chr2L 8651289 5' + Transpac 245 2 55.48 GCCATTAAGAGCCTACCATCTCCTGGAGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGGTAGCGAGAGAAGACAATGTGGCACACTCC:1 + chrX 18741303 5' + invader4 2927 2 75.86 TTATTCTTATTTTGCTAAATCAAATTATAGTGCTTATTTGACAATTTTGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTAAGTATGTATATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTA:1 - chr3R 27907588 5' - mdg3 78 2 65.75 ATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 14366549 5' - roo 8992 2 75.34 CCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACCTCCACTT:1 - chr3R 30347446 5' - P-element 2860 1 61.87 GGACGGCCGCTCGACTCCAAAATGGGTAAGACGTCCGCCGCACACTCAAACACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr2R 22514107 5' + P-element 66 1 41.38 ACATGGTATTTCAAAATACCAACTATATTTAATTGGTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCG:1 - chr3R 16533737 5' + X-element 4388 1 45.89 ACGTAGCCTACTTTCGGGCCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chrX 18409505 5' + jockey 4689 1 73.72 ATGACTATAAACGAATTGGAAGGGGAAAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTTTTA:1 + chr3L 23241714 5' - 1360 398 1 75.25 AGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chrX 18239416 5' + jockey 80 1 66.44 CTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGT:1 - chr2L 4123956 5' - transib2 2767 1 56.85 CTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAG:1 - chr2L 17766153 5' + Doc 234 1 74.24 AGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCCGCTGTGG:1 + chr2R 24427554 5' + jockey 4694 1 60.87 ACCGTGTTCCAAGTGGGGCTATCGTTATCTACATCCCAAAACTAGTGACCTAATGCTATACAATAACATTGATTCTTTTAAATAAGCTATCGAAAATGGTAAAGCTTTTTTTATGAGTTGCACGACCCTTACAAACTTTTATGTTC:1 - chr2L 13437850 5' + Cr1a 4182 1 70.55 ATTAAATGCCATTCAGCAGCAATTTATCTGTCTGTAGAATCTAATTAATTTACATGCAAACAGTCGAAAAGAACGCTTTTTTGCTTACCTACCACAACAAGATATATATAAAAAAAAGAAAAAAAAATATTAATTATTAAAACAAG:1 - chr2L 8001212 5' + gypsy7 357 1 82.19 TTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chrX 6475300 5' + Doc 69 1 60.96 AAAGACGGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACA:2 - chr3L 24208235 5' + Quasimodo 34 2 60.27 ATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAACAATGAA:1 + chr3R 20140506 5' + jockey 4674 1 55.93 AATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:3 + chr2R 11804620 5' - pogo 2045 1 60.27 ATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2R 6847839 5' + Doc 71 1 63.70 GAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGCGACATCCACT:1 - chr3L 3983910 5' - P-element 2861 1 62.90 GAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 + chrX 10537846 5' + I-element 21 1 62.28 GGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 19445984 5' - 1360 11 1 70.15 TGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 19032692 5' - roo 9005 2 65.07 ACATAAATTCATGTGAAAGGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAACATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 - chr3L 11844867 5' + rover 11 2 74.66 AGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 22400374 5' + 1360 4 2 75.00 TTAACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 + chrX 13134858 5' + jockey 4791 1 63.01 CCTCTGCCAAATGACTATTATTTTTATTGTTATGATGTAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTGT:1 - chrX 2164088 5' - gypsy3 418 1 60.00 ATTCATCATCGCCCTACGAAGCAATTGACCCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAAC:1 + chr2L 8999645 5' + G2 2950 1 78.83 TTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGAACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 - chr2L 13556478 5' + transib2 25 1 64.38 GCTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTTTGGCTTTGGTCCGAAATGGAATTTTGTTAGCTAATTGAATTTCAGTTGCAACTCATTTGCCATGCACAGTCCGATGGAGAGGGGTAGAAAAGGGGGGGCTCATCACGAAAGAGCTAAGTC:1 + chr2L 19334043 5' + diver 422 1 71.92 AGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chr3L 22890355 5' + FB 50 1 54.48 AATTTAAAATTGTTTTAAAATTTTGCGCGGTTTAAGGGCGTTATGGGAAAATGTGAAAAATTATCAACACATTTATCAAAAGTGTGGGCGTGGCATCTTTGTGCGGTTTGTGACGTTAGAGTGGGCCTGGCAAC:1 + chr3L 8024990 5' - INE-1 210 1 50.00 CTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chrX 8092527 5' + pogo 15 1 72.66 ATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 3030201 5' - roo 9013 2 63.70 GAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGAT:1 - chrX 19980671 5' + X-element 4565 1 71.92 ATACAACTAGCTATTAGTTATATAAAGATATAATTATGGTACGAATATATGTTTGAGTTTCATTTGGTACTTCACAACTTCAATTTTGTTTTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTC:1 + chrX 20794824 5' - Tirant 485 1 71.23 AGTTAGAGAGCCAGAGTTACTCCAAGGTTTTTAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGTCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 - chr2R 1922120 5' + 1360 83 1 74.81 ATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTTGCTGGTCAAGCGCATAACCCGGTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATATGT:1 - chr3L 7889654 5' - roo 343 2 57.24 ACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:2 - chr3L 21769128 5' - I-element 5311 1 48.63 TTTCAGTTAAAAAATCAACTCCAGGGAGATTTTCGGTAGAGAGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATGTACAATGATTTAAAATAAGGG:1 + chr4 862483 5' - Cr1a 4140 1 74.66 AAGCGACACATAAACCATAATTAAAAGCGCAAAACAGTTGGCCCCAAATCGAAGCCACCGAAAAAAAAAACCAGGAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3R 9595138 5' + Tirant 7 2 77.42 TGTTGACAAACAAACAGCAAAAGGCCACAAAAGACACAAAGGGGGCTGTGTTCCAACACTTGAGTTCTGTTTTTTAGCAGTCGGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr2R 22989563 5' + hopper 35 1 61.64 CAATTCTATACTTTCAAAAATATATGTATATGCGAATTTCTATCGTTTTAAATCTATCTCCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAATATTATTATTGCTGCTT:1 + chrX 7923774 5' - invader2 479 1 63.70 TATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr2R 15326844 5' - copia 225 1 59.59 CATTCGTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGGGTACATTAAATATTTT:1 - chr2R 4870274 5' + Juan 63 1 52.05 CTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr3R 16630383 5' + FB 39 1 58.90 ATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGAGGAATCAATACAATGCAATAA:1 + chr2L 4888738 5' - BS 5065 1 52.48 ACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 - chrX 1135393 5' - P-element 2826 1 42.25 CTCTCTTATTACAACAGCATGATTATGGCGTATTAGCCCTACTAAATAAAAAATCCGAAAGCTATATTTTCCAAGAGCAGGAGCGCGTTCTTTCT:1 + chrX 5040446 5' - F-element 362 1 47.37 ATTTCACACGTTGACTAAACACTAAGTAGTGGTAGCGAAAAGGTGTTGATTAAATCAAAGAGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATA:1 - chr2R 7744077 5' + Burdock 223 2 58.22 ACAGGATCAAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3L 5881561 5' + pogo 47 1 52.05 GTGGAGGAGCTGTCCGGGGTATATGGGTTGGTTACAAAATTAAAAATGATATGGAATCAACGGCGAACAGTGGGCAATGGGGAGCTGGGGAAATTGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACC:1 + chrX 10119086 5' - FB 17 1 69.93 AAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCA:1 + chr2R 4854985 5' + 17.6 58 1 68.75 CATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 - chr3L 22035656 5' + F-element 74 1 67.81 GAGTTTAACACTTGGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 - chr2L 16946171 5' - hopper 1394 1 69.86 ATATCACAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:3 - chr3L 8627377 5' - pogo 2087 1 34.93 AAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGCAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGATCCACCTCTAGAGCCACGGC:1 + chr2L 11391471 5' - 1360 62 1 62.20 ATGATGGAAAGCAACACAATTGCATCGCGGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGGCTAAGATCAACGCCTTT:1 + chr3R 22590462 5' - rover 304 2 56.85 ACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATGTTTAAATTTTGTCTAGATTTTTTCACACCAATTGTT:1 + chr2R 3592003 5' + Tom1 260 1 76.12 GAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:3 - chr2L 13158712 5' + roo 8753 2 79.45 ACATATCACGTATACGCAGTGCTTGACGCCAGCCATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGGGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr2R 22989714 5' + hopper 10 2 72.27 AGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 - chr3L 23839742 5' + 17.6 6960 2 69.86 AAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3R 30946589 5' - Transpac 5169 2 71.07 TAGGGGGCTTTGTGTGTTGGACATTGACCGTCAAATGAGAAGTCAAAAAAGTGTAACACGCCTCGTCGCATTTTAACCCCTTCTGTCCCTCAGAAAGCTGAAACTATTGGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 - chrX 20491888 5' + jockey 4773 1 73.97 CATTAAGCGTGAAAAAAATGAATTTAATTAAATTGAAAGTACTAGGTCCCTTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTAGGTCTATATTATTAATCTATATTATTTTTTATCAATTCTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTT:1 - chrX 22927096 5' + Tc3 313 1 27.40 TCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTTCCTAGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 + chr3R 3851033 5' - transib2 2747 1 72.22 ATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr3R 15054196 5' + copia 4916 2 54.11 TTACTGGCATCACTACGGCTTTCAATTGTGATAGTACATCAAATTATATAGTATAGAAGAGCTTAAGGATTACAGTAGTATAAAATAAACTATACATATCCCAAAAGTAGCTAAGTACCTACATTTAAATCTTATAAATTGAAATA:1 - chr3L 9955317 5' - Tc1-2 1407 1 46.58 GAATAGAAAGTACCGGGAAATCGATGTTGTTCAGTGGATTCTTTTCAGATGATTTTTTGTATATATTTCTATGATACATTTACCTCGAAAAATAAGGCGATGCCTGCCTAAAAGGCGCTTGCATTTCTTCATTTTATATAAATAAA:1 - chr2L 10052583 5' - Bari1 1402 1 75.34 TCCTAGTTACCTTTTTTAATAACGACGAAGTTAGGCAAGAAATATAATATAACTACCTCAAAAAAAAAACGCATATTAAATTAAATTAAAACCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCC:1 + chr2R 8106930 5' - Tc1 1282 1 57.24 GAAGGGAATTTTAATGTTAAAAAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:2 + chr3R 18971676 5' - Juan 4183 1 56.16 CTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 - chrX 5323162 5' - Juan 4199 1 34.78 ATGGGCGGTTCCATGTTGTCCTCGATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGGAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAA:1 - chr2L 15550807 5' - Bari1 1701 1 75.19 CTAACCCAATTAGAACTAGCAGATACTGTATCTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr2R 8099242 5' - jockey 4950 1 50.00 AGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCG:1 + chr3R 7420228 5' - 1360 3310 1 75.54 TTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr3R 30675350 5' - 297 331 2 65.75 AACGAATTACGAATTACGGTGCAATTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr2L 13531822 5' - copia 246 1 45.21 AGTTGATATATTTATATTCTAAAGTACTTAACTTTGCTTGCAAATAGATCGAATTCCTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAAT:1 - chr3R 11735239 5' - diver 192 2 46.58 CGGTACGGAACAAGAAAGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATGACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTA:1 + chr2R 18514843 5' - P-element 374 1 67.81 GTGGCAATGCGTGCGGCCGAAGAAACGAAAACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTGTGAACGTCGAGATACCAGGAACTATAA:1 - chr3R 3586595 5' + INE-1 145 1 71.20 ATAATCCAATTTTTTGTAGGACGTTGTTGGGCGAACAATTTTAAAAGTCTTGGAAAGGAATTTCTGTTCTGTGTTGATACACAAACCAACAAAATAAAAAAA:1 + chr3R 13687195 5' - Tc1 1401 1 90.20 ATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr3R 16341944 5' - P-element 2858 1 53.27 CTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTGTTTACAGTGTTTAGCTAAGGCT:1 - chr3R 24381378 5' - Juan 4136 1 68.49 CAGAAATCAGAAATTAAAGCGGGACACGCAAGGTAAGAAATTCAATTAAGTAGGATTTGTCTCAGGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTGCGGGTGGTGGCGTTTCAATCATCTTCTAGTACTTGTCGGTTGGCTTTGGGCT:1 - chr3L 667820 5' - jockey2 3140 1 65.94 TGCAGCGTAATCGTTTTATGTTAGTTGTTAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2L 6103002 5' + roo 8754 2 81.51 AGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 14767377 5' + roo 8712 2 68.81 TCCCAATTTGTCAGACATGCATATGTACACACGGATATGTATGAGCATCTACATACGTAAGGAAAATAAATCGAGTGCAATCAACTTTATAAACACACACACACACACA:1 - chr2R 14712264 5' + accord 7026 2 66.06 TATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 - chr4 373033 5' + pogo 85 1 77.40 AGACTGTTGGTTGTCTGATTTATTCTCTATAGGTCTCCTCTGGTCATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTG:1 + chr3R 2522241 5' + Tc1-2 70 1 64.38 ATATATATATTTTGTAAAATCTCATAATTACTAGAAATGTATTTGACTTACTCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACAT:1 - chr3L 16033889 5' - Doc 197 1 63.89 GAAGGATTAAGACTTTGGGTGTAGGCAAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3L 4219581 5' - jockey 4971 1 53.42 AACAAAATCAAGTACAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 + chr3L 947591 5' - Burdock 6313 2 73.97 ACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 + chr2L 3675840 5' + Juan 4074 1 50.71 CGGTATGGAGCAAAAATATAAACATCAATAAGCTCTCGTCTTCTATCTGTTATTCCATTTGCCTGGTTTTTTTTTTGGGTTTTTTCTGTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTTGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAG:1 - chr3L 9326814 5' - X-element 395 1 59.59 CAAAACAGCGATCTGGCAAATAAATCATTTTATAATTTTCCGCAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGATCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2R 21663415 5' - opus 7492 2 49.32 TTATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - 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hopper 1328 1 77.40 TAAGAAATAATATTCAGAATATATGGTCTGTATGGTGTGTGTGTATGGTAAGTTCCATTCATCATTATGATAATTTTAAGCTAATTTAATCGTAAAATATAGAATATTTCACGAAAGTCGTTCTATCAGATACCAGTTACTCAG:1 + chrX 5711884 5' - INE-1 547 1 18.75 AAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:2 + chrX 11661351 5' - pogo 2079 1 70.55 ATTTGTGTCAGTTGACAAATGTTTGAAATTGACAGGCATAAGAAATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAATATAAT:1 - chr2L 18657278 5' + Burdock 398 1 69.86 ATTAAGAAAATTAATACCTTAACAATGCTTAAATTTTTATAGTTTACTTGTTTCTTATAGACAAACTAGCTACAAAGAACTGCCGCTCAGTTTTCTATTAAATTTTTCTATTGATGTTTATTAACGCTTAAAAATAAACATAAAT:1 + chr2L 12547317 5' - NOF 3870 1 86.90 AACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 20167598 5' - roo 325 2 76.71 GATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - 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Juan 4187 1 57.53 GAAAGTATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3R 23295633 5' + P-element 2 2 55.17 TAAGAAATTAAATGTACAGAACCAACACCTTGTTATTTTTTGTTTGTTTCGACTTGTCCCACGGCCACACCTCCCATCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCTTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGGG:1 - chr2R 4349845 5' - Cr1a 4376 1 74.07 AAAAAGAAAGTCACAATCCAAGCGATGAGCATGGAACAAGAAGAACTGTTGAGCATTCGGAACGAAACTGAAGAGCAGTTGATTCAGTTGAGAGGTTATTGTGGCCGCACTTGTCGTTTTTCTTAACATACCAATATTATCGAGAA:1 - chr2R 20797809 5' + mdg3 5359 2 78.77 GTGGTGGTCTTTCGATAGGAATGGGAATGGAAAGTAATCGACGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTGTAGATAAGGAGTACCCCCGTATGTTGGCGGGG:1 + chrX 20766262 5' + Rt1a 4787 1 65.32 TGGGCATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 - chr3R 11062873 5' - roo 388 2 68.49 TGTAATTTGTGTACGCTACTTTTGAAGCGAAGAAAAAATTGTTCTTTAGGTATATCTTTTTTCTATTTACTAATAAAATAAATAAATAACTTTAAAAAAAATTTGTGTCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTG:1 + chr2L 9207221 5' + R1A1-element 5210 1 63.70 TTAATATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:3 - 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chr2L 16363951 5' + Cr1a 4109 1 54.79 ACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 14366606 5' + roo 80 2 75.00 ATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGC:1 + chr3R 19992641 5' + hopper 65 1 61.97 AGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:3 + chr2R 13766208 5' - roo 9004 2 65.75 AGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCGGTTATGTTACTGTTAT:1 - chr3L 13739654 5' + BS 5047 1 56.72 AGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chr2L 12822835 5' - P-element 2786 1 15.86 GAATTCTAAACGCACACATTGCGGTATAACAGTTTTGCTGCGATTACCGCTGTTTCGGATTAAATTTCAGTTAGGTTAAGTGTGATTTGTAGGCACACGCAGATTGTAGAATATTGTGTTTTCAAAATGACGCAGTTTGATGCTTC:1 - chr3L 883348 5' + G2 224 1 72.60 ACCAATTAATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGAGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCT:1 - chr2R 9967159 5' - Bari1 1673 1 62.33 AAGCCAGTGCTAGAAATTCGTCAAAGAGCGTCTTTTGAAAAATATTTCCACACTGAAGGATCAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGA:1 + chr3L 24212597 5' + Quasimodo 130 2 56.85 CATAACAGGAGTTGATATGTTTACAGAGAGCCTAATGGGCGGCGCTGTCGGCGGGGGGGACGGGTGGTGAATGGGCCATGAAGGGTGCAAAATCCCAAAAAAGAAGACGTTACTACTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 13295004 5' - roo 9040 1 52.17 CATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAAT:3 + chr3R 556453 5' - Tc1-2 1545 1 70.55 CATCCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGCTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2R 10411482 5' + 297 6593 2 70.77 GGTTTCGTTTTGAGGTTCGGTCGGGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTCTGATTTTGTGTATGGCTGGTCCTTTGTGGTTATTTATGTGTGTGGGTGTGTGAAAGTATATGTGGTCTTATAC:1 - chrX 6321511 5' - Quasimodo 19 2 71.88 AATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3R 18093400 5' + I-element 36 1 57.93 ATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:3 - chrX 12129418 5' - flea 205 2 52.05 TATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATA:1 + chr3L 11913215 5' + BS 5081 1 76.71 ACTGCTTGGCAATACGCATTTGCACCTAATAATTTGTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTT:1 - chr2L 16539799 5' + Juan 4034 1 76.03 TGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3R 27160077 5' - 412 419 2 69.86 CAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 - chr2R 15651992 5' + hobo 76 1 68.49 CATAACGCTCAGCCTTTCCACCCCATCCACCATCCACCACCCACATTTCCATTCCAGCATTCTAAATATTTTGCAAAAAGCCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAA:1 + chr3R 27843095 5' + I-element 5276 1 75.34 AATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:2 - chr4 303825 5' - pogo 2050 1 54.11 CTAAGTACTCTTTTGTTTATTGTAAACCATTGTAAATTGCCTGCTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGAGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCATTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTT:1 + chrX 1656389 5' + 1731 303 1 65.69 GAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:2 + chr3R 11191369 5' - roo 9034 1 57.53 GGCTGGAAAGCGTAAGCAAAACGCCCTGCATACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr3R 5351513 5' + jockey 4697 1 65.28 ATTGTGGTACTAATCGATGCAGACACGCTNATCAAAATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 9003034 5' + roo 8703 2 58.22 ATAATAAGTAAACCAGATGTGTTGCGAAATTGTTTTGAATAACAGAAAAAATAGTGAATCGCCGTCGGATTTTTCATTCGATTTACGAACCACATTATTTACTTAGGATATATAATATTGATTTGTTTTTGTATATTTATTTTTTT:1 - chr3R 18359662 5' - Tc1-2 480 2 71.23 TGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 - chr3R 23491953 5' + transib2 66 1 60.96 ACTGAGAGAAATAACAAAGAGATATCAATTTATTGGCATAACGTATACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTTTACGATGC:1 - chr3L 25485704 5' + F-element 123 2 52.05 GGCAGAAGAGCAACCGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 12822872 5' - P-element 2848 1 48.33 ATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAAACAGAATCTTTCAAAGG:1 - chr2R 4545172 5' - invader1 3538 1 54.48 TTATAAAGCATACGCTGGTTTGTAAAGCTCGGCTTGATATTGATTGATTTTCTATGTTTTCAGAGCTAACTGTAGGCGTGCTTTTTGTTTTTATTTGCTCATTCTTTATGATAACGGTGCTTTTATGTGTCTACTCTAAATATGAA:1 - chr3R 9186946 5' + looper1 112 1 68.49 ACACGCGTGGACCTCGCATAGTTGTCCTCGACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr2L 15188504 5' + 297 16 2 75.34 ATTTTCCGAGCTAACGAGCAATCTGCAATCGATGGAATTGAAGGGGGACGTAGCGCATCCTTCAAGGTGTTCAATGTTTAGTGTTTTGTGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTT:1 - chr3R 14875067 5' - 17.6 7348 2 63.70 AATAATATAATATATAATTTCGGAGAAATATCACTAACTACTATTGCTCTCATCACATATCTTTAAAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCG:2 - chr3R 31916036 5' - INE-1 108 1 64.38 ATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAAT:1 + chr3R 556454 5' - Tc1-2 1545 1 71.03 AAATTGTAACATTTTCTTTTTATTTACATTTCAAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 - chrX 2479590 5' + mdg3 58 2 54.79 AACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 15790986 5' - roo 326 2 74.66 ATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGCACT:3 - chrX 22689440 5' - 1360 3358 1 50.00 AAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3L 2544631 5' + Tirant 38 2 59.43 GAAGAAGTTCCATTTATCAAAGCGCATTTGGGTTATACGAACTATATGGTATTGAAGATACGCACCATTTATCTAGTTAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAATCGTGCTGTGTGGCCTTACAAATTT:1 - chr3R 14750318 5' - Doc3-element 4607 1 55.48 ATATATACATATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 9871607 5' + roo 8684 2 72.60 ACCCACAAAAGTCTACTATTTAATTAAACTAATAAGATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chrX 19539435 5' + pogo 15 1 62.33 AATTCTATAGTCTTCATTTTTCACAGAGATGTATTTCATTTGCTTTAAGAGAATTCGTTTTCATTATATCAAAGATATATTAAATTTGTAAATATTCCTGTTCTAATTAGCGATAAAATGATAGAAATGATTTAAGAACAAATTTA:2 + chr2R 20705585 5' + Tc3 1578 1 79.45 ACCTATCAATGGGTGGCCATCACCCCAGAACACCGATCGCCAGATCAAAGGTCCACTGCTTCAGTCGCCACTACAATTGATCGCACCGTTTTGCGATGCTGTCGTAGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGTCAGCCT:1 - chr2L 3612763 5' - Gypsy6A_LTR 264 1 62.32 AGTATTATTAACCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 11339957 5' - hopper 156 1 91.67 CTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 + chrX 9530329 5' - 297 6895 2 75.34 ATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCTAGGAATCTTCTCCTAATCTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCTCACGAAATACCAATATTGTT:1 + chrX 22901644 5' + 297 6797 2 67.12 ATATTTCTGTTATTCATTAATTGTACATTCAATCTTGCCCATGCATAAATACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTT:1 + chr3R 17353734 5' + rover 7033 2 64.94 CATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAACAAAATTAA:1 - chr3R 25709833 5' + hopper 19 1 58.21 CAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr2R 17878634 5' + Doc 56 1 54.14 ATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTTTAGTATTGGTATATTGGAAAT:1 - chr2R 22989680 5' - hopper2 1537 1 60.27 TGTTAATTGCCAGAAAATTGGTAGTCACTAGGCCACGTGCGAAATTTTGAGTTTCTTCAGCTGCTCGTCAGAAGAATTTGAAACTTTGCTGACTATGCAACTTCAGTACATTTGACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCTACTT:1 + chr3R 30983069 5' - transib2 2578 1 77.40 GACAGTTCAGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 47229 5' - roo 9054 2 72.14 ACTTTGCAGTCGTAAATCTTACTTTGTGTTCGTCATTGGGTTGTTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAA:2 + chr2L 4888680 5' - BS 5078 1 72.60 ATGCGCAATCATTCGCATCAATCTTATAATGGAAACTCAATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAA:1 - chr3R 19225076 5' - HMS-Beagle 175 2 70.50 AAAACGAGCTAGTGATTTTAATGGCATAGTAATGCCAATGTCAAACATAGCCTTCAAAAGTCACATATAATTGGAATCTGCATTTTAAGTGTGTGTTTTGATATTTTTGCTGCTTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCT:1 + chr2L 925639 5' - Porto1 4412 1 77.24 TACAACACTGGGTTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 - 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chr2L 18549940 5' - roo 9022 2 55.48 ACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:1 + chr3R 6419818 5' - Tabor 449 2 58.62 TTTGTCTTTTATCTGTTTCTTTTCATTTTATTATTTAATCATTATCCTTTTGCTTATCCAGCCAGGAATACAGAAATGTTAAGAAATACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAA:1 - chr2L 9728450 5' + P-element 2667 1 24.66 GAGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 + chr3R 12242232 5' + transib2 38 1 58.22 ATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATA:1 + chr3L 2989936 5' - roo 9010 2 58.90 CATTAAGTCAATAAACAGTGACAAAACGTAGAGTGGGCGTAGAAAAAAGTTTTCTTTCAGCGTATCGAAAAAAATTTAAAACCGAGAGCGGTAGAAGTCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGGGTGAGTAAAAACAAAAGACGATA:1 + chrX 15525874 5' - 1360 3239 1 76.71 ATCGGGCACCCGGTTTCAGTTTTGAAAATAATTCAGCGATTTTGCTCGAAATTTCTTAATGTATTTATATTTATTTATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGGGGTCACCCATGTTTAG:1 - 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INE-1 551 1 72.60 AGAAACTTGCACGATAAGAGAACGGATTGCCGATAAATACCCACACACTCACAAACCGGGAAAAACTGCCAATGCTTTTTATAAATGTGTTGAATTTTGACACATTTTTTTTAGTTTTGTAAACTTTTTATCGATTTGCAAAAAAA:1 + chr2L 2364108 5' + INE-1 311 1 73.29 AAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTC:2 + chr3L 17183689 5' + diver 5974 2 74.66 TATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACACGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 27986351 5' - roo 393 1 64.21 CTTTGTATTTATTTTGTATGTTACTCCACACACTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTT:1 - chr3L 7889731 5' + roo 397 1 78.08 GTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:4 - chrX 18409447 5' + jockey 4756 1 73.97 ACTTGGTGTCTGCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATT:1 + chrX 292372 5' - G3 4550 1 70.55 TTACATGAAGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:3 + chr2R 11804583 5' - pogo 2082 1 71.23 AATAATTTCGCTCTTACAAAATAAATATTTAATTATGAAATTGTTCACACATTAACACGAATATATTTAAAGTCTTACAATT:1 + chr3R 19032620 5' + roo 20 2 57.32 GGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr3R 30347396 5' - P-element 2860 1 49.49 CATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAA:1 - chr2R 5532321 5' + G4 3829 1 69.18 TAGGTATTGGGGAATAAAATGATAAGCATTTTGTAGCTGAAAGGAAGAAGTTGGCCGCAGTTTGTTTGCAAATCGAAACTAATTTACAAGACCAAAAAAAAAAATGAGAAAAAATTTCCACACATTTTCCAAATGTGTGGGCGTG:1 + chr2R 5678668 5' - INE-1 253 1 45.52 CAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 - chrX 19074854 5' - mdg1 7386 2 67.12 GTCATTGGTCAGTTATAATAACAAAACTATTTTCGGGACTCACACTTCCCGTTAAACTCTAGTTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCT:1 + chr3L 21974385 5' + GATE 8286 3 57.24 AAGGGTATTTTAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:4 - chr3R 24219402 5' - roo 9044 1 65.07 CACTGACGTATCCGTATTCCCCTGTCCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAAC:1 + chrX 20380416 5' + 297 4 2 60.63 ATAGATNAAATGATAATGCGCCCAGGCTGATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 16970314 5' - roo 395 1 73.97 ATGCCAAATACGAGCCCAAGGAGATTCTGGGCAGGTAAGAATCGAACTACACTTGCCGTGATCTCAAACCTCTTATCAAATCCCTAATTGATCTTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAA:1 + chrX 11696507 5' + TLD2_LTR 94 1 55.48 ATTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCAGTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCG:1 + chrX 22596322 5' - INE-1 570 1 65.75 ATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chrX 6475314 5' + Doc 82 1 68.97 AAAATGAGCCCAGATGATTATACAATGGCAGCTGCAATGTGTTGGGGCAGCAATCAAATGTCATCACTTACAAACTTTTGGAGGGTCACAAAGGGAAGATTTATCGCGTGTCCAGGGAAATATCCAGATGTCCACTACAAGCAACA:1 - chr2L 13441293 5' + Fw3 2979 1 64.38 ATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGAT:1 - chr3L 18505729 5' + I-element 74 1 69.18 CGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAG:1 + chr2R 1320650 5' - diver2 4871 2 60.71 GCGAAATAAGGGGGAAAATAAGCTTAGTCGTTATGTAGGCCACTTCTCGTGGGTTAATTGCAAAAAGTTCAGAGTTGACATTCCTGGCGAGGGCGGATTTCAAATTCAATTCGGTAATCGAGATATTGCTTCCTAAAACATAATAT:1 - chrX 17552684 5' + hopper2 1094 1 73.29 ATATAAGTATACAAATAAAATAACTAGATAAAGGAGTTATTTTGCTTATTTTGAATTGGTATCATTTGAAGAATCCTAATATCTTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTA:1 - chr3L 12530448 5' - 412 105 2 58.22 TATGAGGTATGAAAATATTTTAATCGAGAGTATTAAAGTAGCTTCAACATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 - chr2L 3675975 5' - Juan 4192 1 63.01 AAAGCAAACTCATGAAAGCCAAGGGAAATAGGTTAAAAGAATCAACGAAATGACATATAAAATTCCAGTCGTGGCAGTACGGATAATAAATTTGGCACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATT:1 - chr3R 22045774 5' + 17.6 7084 2 68.49 AGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 31653146 5' - roo 327 2 74.66 ATGTACATCTCAGCTTGATGGCCCTTTGTCTTATTGTTCACACTTTAACACGTAGATATTTAAATACTTACTATTTTGGGCGCGGTTCCTATCTTTTGTAAATGAATCGTTAGCGATAGTTTTTATTTAGGATTTTGTTGTCTAA:1 + chr3R 19450197 5' + roo 90 2 71.03 CATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCCGCGCTTTAAAC:1 - chr2L 7618561 5' + X-element 4445 1 57.58 ATGTGATTATAAATTCTAAATGGTGTACCGGGGCATAATAAAAGCAGAAAAGAGAGCTTTTATTTAAGTTGGCTTCAGGAAAATCACTTATGCTACGCTGCAACAAATAATAATAATATTAATAATACA:1 - chr2L 9172119 5' + mdg1 7080 2 78.29 AATGAGAACTGAGGCATTGGAACGATGGGTGCGATAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 - chr2L 16997392 5' + hopper 17 1 49.32 ATTTCCCTATTAACCAAAAAAACATCAATACCATTACTGGACTATTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGTGGTGTTGTT:1 + chr3L 23853467 5' - I-element 5094 1 68.49 TTGTATTTATTTTCATTGCAAATTGTACAATTTTTTATACATTCCTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATATAATCTATTGATTTGTTTGTAATTTTCATCTAAACCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAA:1 + chr3L 26505816 5' + copia 4877 2 80.14 ATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTAAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chr3L 21996136 5' + Transpac 39 2 62.33 GTAGGTTGGATCACAGGTGGCCTTTGAGCTAAAGCAGCTGGCTGGCTCGTCCTCGCCATTGGGGCAATCGTGGTCATCGTCACAGCGCCAAGCCAGGAAAATACTTTTGACCACCTCTGGGCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAG:1 - chr2R 8221745 5' + Bari1 9 1 65.75 CTTGTGTTTGTTTATAGACACAAATCATTGACTATCGCGGCGCCAGACCGCCGTCTTTTATATGCTTTGCCGCTCTCTCCTTTTTTCTTAATTAATATTATTTAGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGGTGAAAGAAAATCCGC:1 + chr3R 31354140 5' - gypsy7 313 1 61.81 TGGAGGTAATGGGGATTCAAGCAATTGCATTTGCATAAATTCCTCTAGAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCA:1 + chr2L 17377299 5' + I-element 4889 1 66.90 AGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1 - chr3R 6625822 5' + flea 4799 2 58.22 TCCTAATCGTGGAGCTAATCTACAATATTCAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chrX 20455634 5' - hobo 2922 1 55.56 AATGTAAAAACGCTTCCGACTTTTCAATTTCAATTATTCATACGTTTTATGACCTTTTCCTTGGCTGGCGGATTGTGGATTGTGTTTTTCCAGTCAACAACTTTGTTTATTATTTTGTTTCTTTTATATTCCTTTTTTTT:1 - chr3L 1145098 5' - Doc2-element 254 1 65.71 TGGCGTAAGAAGAGAAGGCATTAAATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 12249911 5' - roo 9019 2 54.11 GAAGGTTATCTTAAATTATAGTTGAATTGAAAACTTTTAATAATAAACATTAGTTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 20167525 5' - roo 399 1 74.66 AAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 11191384 5' - roo 355 2 55.48 AAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3R 28901320 5' + transib2 3 1 72.41 AAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 + chr3R 27083054 5' - jockey 4917 1 71.23 ACATCGAAAATGTAGTATATTAGCAATGGATAAATGCTGGATAAATTTTAGATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr2L 11391639 5' + 1360 12 1 69.86 ATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chrX 11661488 5' + pogo 67 1 67.12 AGGTGTCTAAGATAGGTTGAGCAATATGAAAAGGGATTTCCACAACCTAAGAAACTGTATATTAATATTTATAAACAAGTCTTGTATCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGCGACGGGAACGG:1 - chr2L 22047687 5' - F-element 4510 1 73.02 GTGGCAACTACAATACAATATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACA:1 + chr2R 9966926 5' + Bari1 6 1 57.64 GTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr3R 15363879 5' + flea 24 2 67.81 TGTCTGTATTGTTTGTTTATTTTTGCTTCTTTTCCTGCCCACTTTGGTCACTCTGACCACCCGTTATTGGTGTGACCCTGCCGTCTCGAATGCTAAAGCTGAAACGGAAAGTATCAAATAAACCAA:1 + chr3L 9859611 5' + invader2 184 2 67.46 GCAGCCATAATTAAAAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 21216675 5' - roo 390 2 72.60 CTTTTATCTTTTCAACAATTTATTGACTTTTATTTATTTGGCAAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAAC:2 + chr3R 24381263 5' + Juan 4128 1 69.86 AGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - 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chr2R 2879484 5' - Stalker4 7052 4 47.95 ATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2L 13158717 5' + roo 84 2 76.03 GGGGAATAAAATGAGAAACAATTTAAAATTATTATGACAACATATCCAACAATCTAGAGGTGGCCCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGA:1 + chr4 809183 5' + 1360 142 1 63.70 ATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTACAGATCTATTCCTGATTTATA:1 - chr2L 11839707 5' - mdg1 318 2 81.51 GGTAAAAATCGTTAACGACTCGAACGCTCGCAGTGCCGTCAAGTAACTGAAGTCGCCGTCTTCAAGTGGCCCCCCAATCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAATGGAAGGACACAACAAGTCCTCTTTAAAAATTCT:1 + chr2R 24983151 5' + Q-element 435 2 55.80 ATTCGAAAACAATCTTGATGCATTGCCTCCAATGCCTGCTATAGCTAATTTCCCCCCTGACACCGGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr2L 7698490 5' + copia 25 2 55.17 CACATCCATGCTCACGAAATGCATTTGTTTTTGATGTCAACTCATCGATTTTTTTTTTCAAAAACAACAAAAAATCTTCATTTTTTTGGCTCAACTGAATATGTGCTACACTTTTGACTTGGTTTGACCTCGTGGTTGTAAAGAGT:1 - 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Stalker 6933 4 58.90 ATATGTGCATTGATCGCTCGAACAAATTGTGTTTTTGCTTACATTGTCAGAAAGAAGTAAATTAAATTATCAAAATTTTGGAACACAGCACTTTTTACACTTACTTTCAAAACAAAACAAAAAATTAATAAAATAAATTAAACAAA:1 - chr3L 14051087 5' + HeT-A 5 1 80.82 AGCGCTCGGAGGAATCTGACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 + chr3L 6964705 5' + P-element 68 1 36.11 GCTACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3R 27405935 5' + diver 5918 2 62.76 CATATCAACTTATTTTCGATCGTCAATTAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCCCTTCCTTT:1 + chr3R 4217641 5' + 297 18 2 73.79 AAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGAATTTTCACAACGCACAA:1 - chr3L 3501865 5' - Bari1 1694 1 69.86 GTGGCTGTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - 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hopper 1399 1 66.95 AAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:2 - chr2L 14074562 5' + 297 6628 2 54.11 ACGTGATTTCAAGTAAAAAGCTATAAAGACCCACCAATATCTACCACATTTCATTAGTATAACACTTGACTACATATACTTGCACACACACACACACACACACATACATTATAGCAACACATAGCAACAGCCATACACCAAATCAT:1 + chr3R 7432168 5' + Quasimodo 69 2 63.01 ATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTACATTATTTTATTTTA:1 + chr3R 27083042 5' - jockey 4929 1 61.64 TAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGTAAATAGTCCCCGCCTTATAGAGGTGCCACGCTCGG:1 + chr3R 19449920 5' - roo 259 2 67.96 CTGTTTCTCTCAAGGATTGGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGTCGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGGTTT:1 - chr3R 15936093 5' - Tirant 233 2 79.34 TTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTTTTAATTCAGCCCATTTGG:1 + chr2L 7618462 5' - X-element 4651 1 60.96 AATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTCTTTCAAAGAA:1 - chr2L 19675058 5' + 297 29 2 64.49 CTTCCGCTGCCTTTCAAATTATTAAACTGGACTTGTGTTGCGCCCTTTTGCATTTCCTTGGCCCGAATGTATGAAATCAAATTAATTACGGAGATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTT:1 - chr2L 18027881 5' - roo 8812 2 63.01 GTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3L 7889678 5' - roo 9035 1 58.87 CCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3R 15072658 5' - pogo 2035 1 65.07 GTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTTAGATTTTGTAAGAAAACTGATGTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTGAATATGTGACATGAGAATCG:1 - chr2R 7849995 5' - roo 330 2 72.80 GTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 + chrX 13134880 5' + jockey 4813 1 52.05 ACAAGCGATATTCAAAAGAATCGTCGGCGAAATGGCCCGGGCTTTAAAGTGTTAGCAGGATATGGCCACGTAACATACGCAGTTTATGGCCAATACACACAAAAGACGAAACAACAGCTCTTTTTTAACATTTTAGTTTAAATTTT:1 - 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chr2L 14358914 5' - diver 220 1 65.07 TGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3L 25401035 5' + Doc 32 1 54.17 TGGCTTTCGGTGTCTGGGTGCCTTGCAGCGCCTACTGCAGCGCCCCATTGATGGGTTAGCCATCGTTTTGATTTACTGACAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGGATATTGCTATTTTA:1 - chr2R 9517953 5' - Porto1 4232 1 52.05 AGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:2 - chr2R 24169987 5' - transib2 2761 1 59.59 AGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCG:1 - chr3L 23702289 5' + G4 29 1 61.64 ACATAAACAAACAAATCCAAAAAAATCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACGCGGAGGATTTTGTTTTAGTACGTAGGCTATTCCAATCGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGT:1 - chr3L 7907813 5' + Rt1b 5088 1 78.91 TTTGTCATTTAAACCGCATATTTCCCACGTCCAACACATGTACATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3R 25428114 5' + 297 6601 2 68.49 CTAAGCTGGATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATTTTTCAACATCATTTCTGG:1 - chr2L 14523270 5' + HMS-Beagle2 6917 2 39.04 ATCCCGCTCCCAGTGCGTTAACCAGGAATCCACTAAAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTAGAGTTCC:1 - chr3R 3625267 5' - INE-1 573 1 74.29 CTAAGCCAACGGAAAAGGGAGCCTACACAAAAAAAAAGGGGAAGAAAAACCGCACAAGCAGAGGGACAAAAGGCAATCAGACGTGCGTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCACTTCAC:1 + chr3L 3501524 5' + Idefix 7186 2 55.48 ATTGTGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr3R 12242229 5' + transib2 35 1 61.64 TGTATAATAACTCAATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 + chr2R 20010150 5' - Juan 4199 1 72.60 ATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTTAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:1 - chr3R 30059464 5' + FB 86 1 75.34 TGAGAGGATTGCACAACTTGCAATTGAAACTATGTATATTTCTGCTATTGTTCGCATTTTAATAGACAATGAGTCTAAGCTGGTGACGCGCATTGTTGTAGTTGTCTGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAAC:1 + chr2L 18548261 5' + P-element 464 1 73.97 TGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chrX 19038334 5' - hopper 1388 1 65.75 AAATATATAATATAAGTGATAGATATATCAAACAAAATGTAAGCCATATAAAATTGACCTTAATATAAAATTAAAAAAAAAAACCTACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr3R 18175274 5' + Burdock 45 2 64.14 ATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTT:2 - chr2R 23780587 5' + Ivk 99 1 73.29 ATATAGTATATATAGTCTATATGTCCGGACGAATTGGAACAACGAGAATTAATGAAGCGCACAAATGACAATTACAATGGGGCTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAA:1 - chr2R 10563473 5' + 1360 434 1 55.48 ATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 - chr2L 15779648 5' + hopper 60 1 59.59 GATTCAGAGGAAAAAAAAATTTTTTTTAAGTTTCTCAAAAACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGGGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTGGTAATTTATAATTTATTTTTCCGT:1 + chr2R 5941290 5' - copia 249 1 76.34 AGATGTGGATGAATGAAAACCTGGAGTGCTAAGTATATGGATGAGATGGGGAGCATGGCATGGGCAAATAAATAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGGCAACGCCAAG:1 + chr2R 7374808 5' - 297 348 2 52.41 TGTTAAGTAAATATGGAGATACTTAATAATAATATTAATAATATT:1 + chr3R 15088634 5' + mdg1 42 2 91.11 AGCAACCAACGACGTCTTTTCCACTTTTCTTTCCTACTATTTTTTTCTACTATTTTTTCGTTGCCCCTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATATCGCTCATCGTATTGATC:1 + chr3L 17081330 5' - transib2 2354 1 63.70 TGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTA:2 - chrX 8200311 5' - flea 207 2 53.42 AATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATGAAAATCGCATCTTAACGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAA:1 + chr3R 19449912 5' - roo 291 2 69.06 TGGAATATCTATGCCACATGAAAATTAGATAAAATTACTCAAAAACTTGAAATATAATTAAGCTGTTTTGTCGGACAGTTGTCGTCGCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chrX 6155594 5' - Doc2-element 235 2 57.39 TATAAGAATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr2L 12341792 5' - BS 5063 1 61.64 AGAAATAACGGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:2 + chr4 372946 5' - pogo 2047 1 56.85 CGACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:2 - chr3R 28385647 5' + transib2 42 1 56.85 AGTTGTTGTTGTTGCTGCAGTTGTGGTGTTGGTTTCTGATGTTGCTGAGAGCGGAAGAGTTGAGAGCGGCAGAGTTGAGGAAGATTACAGGCGCTCCTTGCTACATGAGGACCAGAGATATCGAACTCGATCTGAATGTGACAAAA:1 - chr3R 13999521 5' + jockey2 3029 1 50.00 CCAATCGACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 16157397 5' + pogo 20 1 63.72 ACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 11062717 5' + roo 46 2 54.11 GAACATTAATTGCTTGAAGAGTTCATTGTTCCAAAATCAATCCATTCACCTTATGCTACACTCTTTTATTATAGAAAATATATTTGGAATATTTTATATTATTATTTATTATTATTATTTATTATTATTATTTATATTATTATTAT:1 - chr2R 12067051 5' - mdg1 7079 2 69.18 AAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3R 4805703 5' + 1360 55 1 58.99 GACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATATGTGAC:1 - chr3R 15790992 5' - roo 9004 2 61.59 AAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 - chr2L 18347393 5' - transib2 2786 1 54.62 ATCTGGACTCGTTTCGACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:2 - chr3R 9002998 5' + roo 75 2 71.92 TCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGCCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 - chr2R 23780616 5' + Ivk 57 1 53.10 ACCGCATAAAAGTTTTTCAATTAAGTGCCATGCCCTACTTTGGACTTTTTGCTGAAGCCAACCCACACACACACTCACACAGTAAAGGAAATGATACCAAGGTGACACAAAATTTAGATGCATATTATTATATAACTTATATTGAA:1 - chrX 14400620 5' - Doc2-element 4695 1 56.85 ATTAAATACGAAAAAAATGAATGAAAAGTAACTTTTCCTACAGTGCAACCAAAAATATAAAGATTTACTATGCATTCGCTGACCCCGAAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGC:1 - chr3R 20963092 5' + 412 7335 2 68.18 GAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:2 + chr3R 4575728 5' + jockey 68 1 58.90 TAACACGTTCACACTGCCGAGCCAAAGCTTTCACTCAAATGTCACTTATCGCCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTT:1 + chr3R 29362642 5' + Doc 336 1 56.19 TAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1 + chr3R 12242270 5' + transib2 76 1 71.92 GTGCTTTCTTAGCAACCCATGAGCTGGGTGATATGGGATTTATTCGCACATGGACATGGAACGTGCTTATATGTTCTTCATTCCCTTCTTAACTTAAGCATTAACAATCTTTTCTCCTGGGAGCAGTTCTGTCCTCTACCCACTAA:1 - chr3R 6616780 5' - HB 348 1 57.53 AGGGGAAAAAATGCAAAAACAATATGAAGATTGCTGTTGCGTCATCTGTCGTCA:1 - chr3R 27031592 5' - Penelope 581 1 66.67 AGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1 - chr3L 19274878 5' - transib2 2752 1 69.66 ATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGGGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGCTTTTAATTAAA:1 + chrX 21639623 5' - gypsy5 343 2 60.96 CTTTAATGCACTCAAACAAGTTCTACACCATATTCTACTGCAATAGATTTAAAAAAAAGTAACTTTTTTAATCACTGTATACTTCACATGGAATATTTTTAGAGATTAAAACATTTATTTCTTCATTTTTTTTATTAATTTTTATT:1 - chr2L 16548706 5' - S2 1622 3 80.82 TGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 11326793 5' + pogo 42 1 54.11 TAATAAACCTAATTTGTTTTTCATTAATTAAAACAATTAACAGAAGATACAAAAAATATAAATTAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACTTTTAAAAATCATTATCATAATGATTTTTAAAAGTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 22405787 5' - HMS-Beagle2 489 1 72.66 AAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr3R 18093420 5' + I-element 17 1 71.23 AATGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:7 - chr2R 9967152 5' - Bari1 1666 1 57.53 TTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:1 - chr3R 7666717 5' - I-element 5287 1 62.33 GAGGCTAATATGTATTTCATTTCGTTAACCTATATAGATTTCAAAAAAACCTTCAAATTCAGGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATA:1 - chr4 126707 5' - Tc1 1380 1 71.23 GAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGGCTAAAGCCTCGCTTCGCGAAAGCCCAAA:1 + chrX 10537846 5' + I-element 51 1 50.00 AATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCCCCAAATAGT:1 + chrX 22564556 5' + Transib5 64 1 49.32 ATAATATTATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 3983944 5' - P-element 2873 1 76.71 CAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGTGAGGTAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chrX 14526865 5' + P-element 103 1 14.69 GTGGAGGAGGCTTTTGCAGATGAGGCAACCACTCTGGGCTATTTGGAGTGGGCGTGGCAGCATGGGTCAGCAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCGCTAGAAGCTGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGTTT:1 + chr2R 7048111 5' - INE-1 167 1 62.31 ACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 - chr3R 29487012 5' + flea 4758 1 84.93 GTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:3 + chr2R 17796527 5' + jockey 4711 1 58.22 ATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCT:1 - chrX 20999610 5' + BS 38 1 53.42 GAAGAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3L 11326651 5' - pogo 2059 1 56.16 TTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATG:1 + chr3R 4679406 5' + hopper 17 2 72.60 CTAATGAGAATATACCGAACCAAGAAATAAACAATAGAATAAATACGGCATTTCAGATCATAAATAACCGAACATGTAAGAAATGGTAGAGAATGCCTTCGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACA:1 + chr2L 14578832 5' - micropia 4984 2 76.71 AGTTCCTTGCCAATGACCGGATTAGCAATCTACAGGTGTTTACATGATGTTCTTCCCTGCTCTTTTATTATCTGGGCAAAGGGGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTG:1 - chr2L 3888662 5' + hobo 2928 1 67.18 AAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 18549923 5' - roo 9005 2 61.64 GTTAAACGTATTTACAGTGAAGGTTCGATTAGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCT:1 - chr3R 14858313 5' - hobo 2875 1 76.67 GCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTG:1 - chr3L 19111595 5' + Doc 16 1 67.86 AGCATATATATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCGAGCTAGCTATGTCCCTCTGACTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGACGAACTA:1 - chr3L 15869684 5' + INE-1 142 1 78.95 ATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr3R 18093405 5' + I-element 32 1 60.96 GCCCTCCTGGCCTCTAAACTCCCCCTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3L 6518557 5' + 412 62 2 60.00 AATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chrX 585716 5' + Tirant 8110 2 68.12 CATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:1 - chr2L 13844234 5' + Stalker2 86 2 73.97 ACTCTTTCCAAAACTAAAATACTAATAACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2R 10909318 5' + hobo 42 1 54.11 CCCCAAAAAAAAATCACAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 13719376 5' + jockey 4997 1 78.57 ATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGCAC:1 - chrX 22689427 5' - 1360 3359 1 53.79 TTATTTAAATATTTTTCGGCACTAATTTAACCAACGAATTTTTTTTTTTCAATATTTTATTTTGCTTCGCGAATTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTAT:1 + chr2R 22241253 5' - HMS-Beagle2 356 1 80.20 ATATACCAAGAGAAGATTCAATAAAATTCACCACCCCATTTAAATAAAAAGAAAACTTGGTTTGATTTAGAACAGAAACGATGAAATTAATATAATGTAAAATAACTCTAATATATATTAGTGTTATGTACTAAAAAAGTTAAAAT:2 - chr2R 5284498 5' - Cr1a 4268 1 56.85 ATCCAGCTATCAGCCCATCAGTCCACAATCAAAATCACCCAAACCCTCAAAACACCCCACCCTAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATA:1 - chrX 14328262 5' + I-element 5135 1 56.85 GTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTACGG:1 + chr3L 10373794 5' - 297 6940 2 62.33 ACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:2 - chrX 20999631 5' + BS 17 1 67.81 GTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAA:1 - chr3R 17996245 5' - diver 6030 2 72.60 TCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chrX 1341602 5' - 412 7515 2 60.96 CCATGTTTAGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTC:1 + chr2L 15004783 5' - INE-1 148 1 62.76 TTTAGATTGTTTTTGTGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 8437614 5' - P-element 2867 1 72.41 CACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 + chr3R 16341958 5' - P-element 2805 1 29.45 AATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCA:1 + chr3L 20525228 5' - 1731 312 1 20.00 GAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGCTCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCATT:1 - chr3R 4357601 5' - Tc3 2 1 84.25 AATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3R 4575721 5' + jockey 61 1 54.11 ATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 - chr3L 22035634 5' + F-element 96 1 75.34 CAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAA:2 - chr3R 23491950 5' + transib2 69 1 63.01 AAGAGCATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 27986323 5' - roo 9033 1 60.96 ATTTTTGGCCATAAAAAAACCCTGGGACCTCATATATTCTAGATCAGGATCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTAC:1 + chr4 591553 5' - R1A1-element 5019 1 60.80 TGAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 17275391 5' - Transpac 5184 2 54.11 AATTATATATTAAATATTAGTTATACGATTAGTAACTCAACTTTTTCTAGTACTAGATCAAGTTGTAGTTGCTCACTCGTAATTGATTTGAATAAATCTATATATACAGCTATAACTATTTTTATACAAGTTACTAGATTCGTTGA:1 - chrX 20417995 5' + INE-1 3 1 60.27 ACAGGAGGCCCCACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 + chr2R 18258749 5' - Juan 4190 1 61.11 AAGAAAGCCGTAAGGCTTGACCAAAAATTAATAACTGATAAAAGCAGGTAAGGCAAAACACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTC:1 + chr3L 22035519 5' + 1731 47 2 54.26 AAATGTAAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:2 + chr3L 5389862 5' - roo 348 2 61.64 TAATACTTTCTTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAAC:1 + chr3L 18768435 5' + S-element 69 1 67.12 ACTTGAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACA:1 - chrX 8027510 5' + Juan 40 1 44.52 TTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr2L 4063867 5' - roo 316 2 82.07 AAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACACAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAT:1 + chr3R 24381323 5' + Juan 4188 1 69.18 AGATTCAAAAGAACTACGTGTTATCGATAACACGAAGCGTTATTTGTCTGGACTTATCGCACCACCTATCGAAAAGACGATAGAATAAATAAAAAAAATCGTGTGCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTG:1 - chrX 4101055 5' - 1360 18 1 52.59 TTATCCACTATATTCCATTATGCACATTTTATATGGTTGTTATTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAAC:1 - chrX 12543971 5' + FB 478 1 71.03 AGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATTTTTAGGATTTT:1 - chrX 12986595 5' + roo 8745 2 79.84 ATTTAATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGGAA:1 - chrX 18396196 5' + roo 8710 2 54.11 CAATTAGTTTAATTGATGCGCTGTCACACGCCCACCAATGCCAAAGTGCAAGCAAAAATAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 + chr3R 26828307 5' + Doc2-element 231 11 70.89 ATAACGCAAGTGTAAAAACGAAACCAGAAATCAAGTAAGCAACAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAAT:1 - chr3R 27562918 5' - Burdock 6086 1 70.55 AAACAATTTATATAATTACCCGTCCAGTAGCTGCGCTTAACTGATTGCTTTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGG:1 - chr3R 17288424 5' - I-element 4880 1 57.02 AGTTTGGCCCTTTACATTTATCTCTCATTGCTTTTTCTTTTCCACTGCTGCGGCTGCTCTTGCTGGGAAAGTAAAAGTGTTGAGCTGGACAATTATGCGGCTCTACACGTATATAGACAAATTATTTAAATGGCATAAATTGAAAA:1 - chr3R 7991019 5' - Tc1-2 1408 1 73.29 TATGAATGAAGTTTTTATGTTCGGATATGTATGTATCTCACAGATGCGATCTGAGCAGATGATGTGTCTTTATGAGGCCCGTCACAAAGTTGAACTTAAAATGAATATTTCCAGTCGAAACCTTCCTAGACGCTTACTCCCTGCTA:1 + chr2L 9238696 5' + BS 4888 1 68.49 GCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 - chr2R 5941445 5' + copia 47 2 54.11 GGTTAGGCATCTCGCACGCCCGCTGAAAATGTTTAGAATTTTTTTTCTTCATTCATCATTTTAATTTTATTGTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCCCTTCCGTTACCCTTAGTCATACCTACCTAATCATACATAGC:1 - chr2R 9158158 5' + mdg3 5297 2 54.23 AATTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2R 8157133 5' - mdg1 7438 2 70.55 TGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTACGCATACAGTGACAGCACACGTATTGTTCATGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 + chrX 3464189 5' + hopper 51 1 72.60 AGTTAAGGGAAGATCTTGCCTCACAAGGCATTTCACAAGATGTCTCTAAATACGTTAACGGCGGAAACCACGATCAGCTGAACAACACTTTTCTCCGATAACCGAATTATACCAAACTTATCGGGGGCAGCTAATAAGGGTTGCAT:1 - 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Transpac 5154 2 74.81 ATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr2R 24427577 5' + jockey 4724 1 59.02 ATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGGTTTTATTAAGCGAGTGTACCTTC:1 - chr2L 11839728 5' - mdg1 339 2 65.75 ATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGG:1 + chr2L 15550659 5' + Bari1 60 1 56.16 AAAATAATAAGAATAAAATTTATCACCAATAAAGATATTAAAATATGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGCCTCTGAGGTGAAGAG:1 - chr2R 3502270 5' - GATE 8304 2 68.97 ATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCACGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr2L 20118474 5' + S-element 77 1 73.97 CTTTGCCCTTCAGCACCTTGATTGTTATCTGCATAGCAATTGCCGTAAAATTTATTAAAAAATTAAAAGTCAAACTCGAGAAGTCGAGCGATATAAACAATCTGTCTAATTTGCACTGTGTAAATAATTTTGACGTGTAAAAATTG:1 + chr3R 18167145 5' + Bari2 952 2 71.92 GTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 19073205 5' + roo 83 2 77.40 AGAAAAGGAGTAAAAAAAAAGCAACAAAAAAAAC:1 - 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P-element 324 1 32.17 AAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3R 16157274 5' - pogo 2076 1 55.56 ATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTA:1 - chr3L 21769095 5' - I-element 5279 1 68.97 ATATACTAATGTACATCTTAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATGATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 19450189 5' + roo 8751 2 63.08 TGTAAGCTATTTTTAGTCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCC:2 + chr2R 4854949 5' + 17.6 34 2 60.96 CAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATTTTTATGCACGCAG:1 - chr2L 71250 5' + 412 7135 2 71.23 ATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 15882560 5' + jockey 36 1 58.39 GCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 - chr3R 16630375 5' + FB 47 1 53.42 TACACTATCCTCTAATAGAAAAAATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATGGCAAAACATGTCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATATA:1 + chr2R 4709833 5' - INE-1 81 1 40.85 CAGAGAGTTCCGTCTTTGCTGGCGGATTTGTCCAAGTAGGCCGAACTCGATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 - chr3L 2544759 5' - Tirant 389 2 75.74 CAGGTACTTAGGTTTGTGGAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 4964207 5' + roo 49 2 56.16 AAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2L 18226797 5' - roo 8987 2 77.40 TAATAGCTGTGGCCAAAATCAAATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chrX 1135430 5' - P-element 2859 1 66.44 AGGGCAGCGTGACGATATTGTCAAGTCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGT:1 + chr2R 13428417 5' + roo 410 1 79.72 AGATTAGATTGTGGCCTCAGTATTTAAAATAGTTTCGAAAATACAGAGGATCTAGTCTTGTCCGTATGAAGGCATCGATCTCAGGAACTATGAAAGCTAGAGAACTTCAACTAGGCATGCAGAGCACGCCTACACTTTTGAAACAT:1 - 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chr3L 10128023 5' - Doc 4694 2 61.43 CTACAAATATTTCTTTCGACTGTTTGAACCATTAAGTTCAAACATGATCATAAATCAAATTTTTAGTCCAATTAATAGATGTTTCTCGGTAAAATAAATCTTGTTAAACCTTCAACCTTTGTCGTTTAAAAGATATTTAAACATTT:2 + chr3R 24571016 5' + Transib-N1_DM 288 1 78.08 AAATATTTAGCTAGATAATATTTGTGAAACAAATTTTCAGATGCTGAATTTACGCACGGTACAAAAATGTAATAAATATAATCATCTGGTTGGCTAAAATATTATGTTACATCCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAA:1 - chrX 5093457 5' + transib2 2424 1 73.29 ATAAGTAATCCCATGAGCTTATCTTAAGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 27160200 5' + 412 26 2 67.81 AGTCGCGTGTGCTGGAAGTTGTTATTGTTATACTTTTGTTTTTTTTTCCCTGCTGCTTTTACATAAACAATATTTTTTGTTGTAAACAAAAGTTCTGCTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTAAGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 3784950 5' + hopper 2 2 64.14 CTATAAAAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 + chr3R 17996142 5' + diver 37 2 58.90 GGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - 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hopper 1346 1 65.07 AATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 21216731 5' - roo 333 2 70.55 GGATCTACTTGACGCCATTTTCGAGGGTCCCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chrX 11209917 5' - hobo 2923 1 59.72 TCTGTGTTTTTACCCCAGTCCCACAATATGTTTTTAAATTTTTGCACTTACATATAATTTTTTCAACTTCTTTTCAAAATCTCTTTCGATTGGTGTATTACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTT:1 + chr2L 21372014 5' - Doc3-element 4513 1 71.23 AAAGAGCGAGCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGATTATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAAT:1 - chr2R 8735723 5' + mdg1 7050 2 74.66 ATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 16510093 5' + F-element 49 1 45.74 AACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chrX 9530410 5' + 297 9 2 65.17 ATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 + chr3R 3851005 5' + transib2 52 1 52.74 CTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAAT:1 + chr3L 19454895 5' + mdg1 7038 1 80.00 AATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACAGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGG:1 - chr2L 3234030 5' - roo 342 2 67.46 AACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCCCAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATA:1 + chr3R 9038918 5' + Juan 4049 1 50.00 AAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2L 8338227 5' + P-element 10 2 71.68 AGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 12249808 5' + roo 8707 2 60.66 AAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:2 + chr3R 29612016 5' + jockey 77 1 63.01 TAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGGAACATAACAGCGCAAGTAACATATAA:1 + chr2L 4888736 5' - BS 5035 1 60.90 ATACGAAACAATGAATCCCAGATACAAAACTTTAGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:2 + chrX 15357614 5' - hopper 1394 1 69.18 ATCAAATGGAATTAAAATAATTAAAACCGAATGAAACTCAGAGTGACGGTAAGAGTACTGCGTACTGTGGGATCTTAAAAAAAAAAGTTAAAAACATTTAAGTTGAAACACCGCATTTTTTATGCGATATCAAATTCATATGTA:1 + chrX 18869478 5' + transib3 151 1 65.28 AGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAAT:1 + chr2L 4754885 5' + Stalker4 7023 4 62.33 ATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr3R 16342001 5' - P-element 2792 1 18.49 AAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATC:1 + chr3R 11937307 5' + flea 4823 1 65.07 GCGAAGGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 + chrX 10521591 5' + Tabor 6862 2 68.49 AAAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:2 + chr3L 24934257 5' + HMS-Beagle2 6904 2 71.23 AAGGCCTTTATCCCCGGGAACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 - chr3L 24131548 5' - Transpac 301 2 78.62 AGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGCTTTTAG:1 + chr2L 9636034 5' - 412 473 2 69.18 CAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 + chr3R 24729537 5' - Juan 4191 1 57.53 GTTTATCATTTATGTAGAATATCCATATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTA:1 + chr2L 11256993 5' - rover 7254 2 54.79 TAACCTTGCTGCAGTAAGATTTGGATAATAACTTGTTTATTTATGATTTATGTTAATTCTACTAGCGAATGGTTTCTGGTCTTGGTGAACGAGCACTCTTCTGCTTTGCTCCTCGCTTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTA:1 - chr3L 7069042 5' + INE-1 532 1 68.49 ATGCTTAAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr3R 15363867 5' + flea 12 2 76.03 AAGGTAGCTCAACTCCCAGCTTGATTCCGTGTTGATAAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2R 17926248 5' - opus 491 2 78.77 GGTAAACGGTTTGGATGCTAACTGCACTTTATAAGCGTCATATTTTGTCCGTTTGTCCGCTGTCCGTCAGTTGGCATGGATCGTAAAAATTATCCATATAATTATCTTTTAAGCTACATATTGAGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAA:1 - chrX 12506886 5' + G5A 2797 1 67.81 TTATTATTATTATTATTAATTAATATTATTATATTGCGAAAGCTACTGACTGGGATGCGGTTCCCTCGATGCAGTTGCTCAGTGCCATGGTCAATTTACTACAACATGTAGTAGTAGTACTACACTAGAGGGCATAAGTATTTAGA:2 + chr3L 21356656 5' + Tc1-2 3 1 73.97 AACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 + chr2R 4188960 5' + S-element 32 2 60.27 CTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTC:1 - chr3L 19350051 5' + 1360 3219 1 58.22 GTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATCTTTGATATG:1 - chr3L 9269975 5' + copia 4912 2 57.26 AGTTGTATCTTAGAATGCTATAAAAGTTCTTTATAGGCTTGGAAACGGTACTAATTTTTACCTTTAAGCCCATCTATATATGTAGAATTTCTTATTTTAAAAGTATACAAGAGAAAATAAAAGTTAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 19100664 5' + TAHRE 10441 1 41.84 TATATGATGACTTTCATGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 23067565 5' - roo 9046 1 70.55 ATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTT:1 + chr3R 19449933 5' - roo 8906 2 70.23 ATAGGAGAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGT:2 + chr3R 3850969 5' + transib2 16 1 74.66 TTATCTAAAGTAAAATACATTTATAACGACTAAGTAAATTCAAGTTAATATTTAAATTAAATTTTTA:1 + chr3L 144037 5' + 1360 3046 1 88.06 CAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 + chr2R 19199656 5' + hopper 51 1 54.48 ATAATAACAAAATGAAACCCTTGATGGGCCTAATCAAAAATGTATTTATGAGATACACACGACGGGCCTATCTGACATCATAAATACACACACACACACACACATATA:1 - chrX 6611490 5' + accord 184 2 69.44 AATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 - chr2R 15651998 5' + hobo 70 1 64.38 TATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr2L 15936777 5' - copia 216 2 65.75 GTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGCCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCGAGTAATTTTCC:1 - chr2L 19675070 5' + 297 56 2 65.75 AGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTA:1 - chr3R 19992740 5' - hopper 1360 1 54.11 AATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 12986514 5' - roo 9028 1 54.11 TAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2L 14874159 5' - copia 234 1 52.74 GTGATCCGTGAGTGCGGCGGTAAAATGCATCTACGAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATG:1 - chr2L 8996325 5' - G2 2783 1 76.03 TTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGGGCCTTTTTTCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGGGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGTACAATTTAATTAAATAGCATATT:1 - chrX 1341753 5' + 412 7083 2 57.78 TACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAGATGCAGCTAACT:1 - chr3R 17421292 5' - pogo 2047 1 79.05 ATTTTGCAAAAAGCCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATA:1 + chr3R 27843162 5' + I-element 5343 1 60.27 AGCCAGCAGAAATAGGAAAATCAGTTCGTTACGCTCTAGAATATGTATGCTAAATATTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGATCATACGGGC:1 + chr3L 24248497 5' - INE-1 133 1 69.52 CACTACTGTCACTTTTCTTAGGCATTGCCACCTTGTTCGATTTCAGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 13158770 5' + roo 8686 2 68.61 ATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3R 19073273 5' - roo 9000 2 67.81 GTATGGTAATAGGTGCGATATTCATTCATTAGAAACACATTTCCAATCAGAAAACTAGGCCCAAACGTACGCTAATGTTGTTGGTGTCCAAATCGATGCAGGTGACATCCGTGGGTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTT:1 - chrX 8595510 5' - baggins 5053 1 74.66 AAAGCAATCTTTTTTTTATATGCCCTAATTTCTTGCAATGAAAACATTTTAGTTTGGACTTATTCTTAAAAGGTTTCTTCATAAATTTCATAGCTTTCTTAGTATACGCTCTCCCCTAAGACTAGAATATAAGGCCTTACTCTACA:1 + chr2R 1532967 5' + Fw2 3506 1 65.07 AAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 + chrX 8200174 5' + flea 50 2 58.90 GTTGGCTAATTAAGTACTTGTCCAATGGGTTAAGTCCTTGAACTGACGACACTTTGCATGGAAAATGCTTGTGTGACTTGAGTTCACGTCGTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATT:1 - chr3L 18475404 5' + F-element 4535 1 62.07 CTATCACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 24369116 5' + roo 8736 2 67.12 TGTTAATTTTTAATCAACGAAAGTTTGTAGGAGGAAGTTGATGTCAAGCATTTACATACCATTTTTTACTTCCTTTCTTTTTCTCATTTTTATCTCTGTGTTCATTATTAAATTGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACT:1 + chr2R 14579025 5' + gypsy6 245 2 72.41 ACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3R 30675429 5' + 297 6637 2 74.17 CCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 18226801 5' - roo 321 2 79.86 CTTTTTAGTTTGTTTAGATTGTTTTTGTGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 8437602 5' + P-element 9 2 80.14 ATACATTTTAAGAAATATATTTCATTAAAAATACTACGAACATACATAGTTAAAAAACCCTACTCTACTGAATACTCTAATGACAAATATTTTTATATAAAGTCATTTTTGAAAGTTATTTATGATAATATGTACATAGATTTGGC:1 + chr3L 23248972 5' - 1360 346 1 50.00 TGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr3R 31886952 5' - hopper 1366 1 52.05 AAAGGCTGAAAATATGTGGTATAATTTACTTGGCTTTCCGTTGAAGTTATCCCCCCTCTGGCAACAATGCTTTATTAATGGAGACCCTTTTTGTGTTGTCTTACTAAATACTGCGTCTGACCAAAGACTTTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 4805823 5' - 1360 3385 2 53.42 AAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCATGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 19450093 5' + roo 16 2 66.43 ATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:3 - chr3R 11062836 5' - roo 9014 2 54.79 CTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr3L 12315833 5' - transib2 2774 1 51.03 CATTTGAATTGTTGCACTTTTTACGCGTGTTTTTTGCACTCGTATTCGTGTCGATGGCCATGTGTGTGCTCTTTTTCACACACAATTTGTGTTCACACACGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 + chr3L 1107774 5' - Quasimodo 36 2 81.60 GGGAAAATCCGTGGCAAACGTGATGTAGGAACTCGAAACGCTAAATGTGCGAAAAGTGTGTGTAATTATGTGTGCAATAATGTACGTTATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:2 + chr3R 17736827 5' + opus 30 4 64.38 GACCTGCATTTCGTAATGAAAAACATTAAACAGAGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTA:1 + chr3R 5201724 5' - hopper 1304 1 76.71 TTAAATGACCATGAATAGGCACCGTGGTCATGATACTCTGAATACTCAACACCTAGAGAGCTGTAGTTTTGGCCGGTTTTAGGGCGTCGAGTGTGCGCGGCAAAGAATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGACAGATTT:1 + chr4 914304 5' - INE-1 245 1 56.16 AATATCTAAAAAAATACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 18046556 5' + roo 8679 2 73.97 AGATATTACCGGTGTTCTGCTGTTCGTCTTCTGTTGTACAAATTCTATTTTTATAAATAGTTAACAATTAAATTAACAATTAAAAATAACACTGGCATCCGCACCTAGGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGA:1 + chrX 8489365 5' + Bari1 1469 1 73.97 CCGACTGAACTCATAGCTGAACTACTTTACCTGGAAGAAGTCCGGAGTCCCCACATCGACACAAGGACCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGGCACACA:1 - chr3R 5368694 5' + 1360 32 1 58.40 TTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAT:1 + chr3R 11186536 5' - BS 5037 1 55.63 AAAGCAGGTGGCCTGTCAGACTGACTGACCTAGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3L 6518692 5' - 412 473 2 67.81 AAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:1 - chr3L 18505714 5' + I-element 89 1 79.45 GAAGGTAGTAAGCGCAAAAGCGTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTATACGCAATTT:1 - chr2L 22150640 5' + S-element 76 1 86.30 ATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:2 - chr3R 27986423 5' + roo 84 2 80.14 GAGCATTTAAATATGCACGAAATCAGCGTAACTCAAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGGACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCC:1 + chr2R 10916545 5' - R1A1-element 4983 1 71.57 TTTAAAGCCAGGGAAGTAAGTAAAGAGAAAACTCAAAATCTGTATACCCTTCATAAAAATCTTAGTTTGAGTTTTCAAGAAGCAGTAAAATATTAAGAAAAGTAATAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATA:1 - chr2L 11600188 5' + flea 256 1 73.10 GTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGA:1 - chrX 19038446 5' + hopper 84 1 73.29 ATTGGCTTCTTTTTACGTACTTCCTTTGCATTTTTCGCGCTGTCTCTTTTGGAAAATTAGTAAAGTGAGAAAACAGCACACTGTTGCTGCCGCTGCTGTTGATGCTGCTGCT:1 - chrX 12406334 5' - TART-B 153 2 71.43 ATGTATNGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr2L 15936778 5' - copia 215 2 66.44 AATGACCAGGCGAAATCTAATCCAATGATTTATTAAATGACATAATTATTTGACGGGCAAATTAGATGAGCTTAGGCCCGCCCCTTTTCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGACCCTTACAGAGTTTTATGCTCTGACT:1 - chr3R 21559808 5' + Cr1a 4187 1 59.59 AAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:2 + chr3R 23067459 5' + roo 385 2 49.32 AAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTGGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 25186432 5' - invader4 2670 1 54.11 GCTTGGGTGGACCGACCTATCACAATATCATTTCTATTAAATAATTAGATACATACATTTTGCCAAGAAAATGTTTGCAATATGAAAATAAATTGCATTTTTG:1 - chr3R 18917862 5' - S2 1688 1 78.64 TTTACGAAAAGTCCACGGATTCGTTAAACATCTCCCTTATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTATGGGGAACAGCCTCTAGGACTCAGCTCAATGGGCTTAGAGTAGTACAATCGCGAGCGGCACG:1 + chr3R 4203834 5' + G5A 2489 1 72.39 GGGTGTGTGAGAACAATTTCTCAGGAAATCATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr3R 29084827 5' - 412 7544 2 76.71 AATATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGT:2 + chr3L 22723814 5' - HMS-Beagle2 7157 2 63.70 TCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 + chr2R 10161800 5' + transib2 77 1 69.86 ATGGCAAGCGAAATAAAAAGTATAAAGCAAAAACATATATGAAAACACAAAATTTGAGGAAACGGAAAATTAAAAAGAATCTATGAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTACGGGCATCAACACCAATAGAAGG:1 - chr3L 9098095 5' + rover 6895 1 58.90 ATTGAAAATATGGCGAGGGAGTAAAAAAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3R 7943712 5' + blood 43 2 52.78 ACCTCTACTACTTGAAATCGTCATTTCAGGTGTTCTTTTAACTCGCTAACAATCTGCTAAAGTTCTCCATGTGCCCTTTGGCCCCAGATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:1 + chr2L 9638857 5' - 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Tc1 362 1 79.39 AACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATCCGTAACGTCCATACATTGGATTTGCACTTTGCAGCCACTTTTTTCGGAAAAGATTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCGAAATA:1 + chr3L 27729217 5' + diver2 284 2 51.37 AAATTTCTCTCCGAATTTTCGGTACACTTACCTTTATTTTTGTTTGATCCCTGCAGGCTACCGTAGATGATTTGTTCCCGAGCAATAACATCCATTTTCATCGGTTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGCTGTT:1 - chr3L 11252970 5' - I-element 280 1 73.29 GTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGG:1 - chr3R 27083161 5' + jockey 4543 1 70.90 AATTTGTGGAGCTGCCGCAGCTACCACATCGCATAGGCAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTT:1 - chr2R 7850042 5' - roo 372 1 53.85 TGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATATGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGA:1 + chr3R 28042937 5' - Stalker2 342 2 57.53 AAAACAATTCTGCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAATTATGGCA:1 - 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I-element 5296 1 60.96 AATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3L 16470385 5' + jockey 4707 1 59.71 AAATAACTTGTTGTTGTTTTCGGCAATTGAGTGCGTTAAATCTGGTTTAAGATGCATATATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 + chr2R 6964771 5' - Burdock 6333 2 62.33 TATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr2L 12818305 5' + hobo 36 1 63.83 AATAATTTTATTTTTTCTTTTCGGTCAAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 18226901 5' + roo 8698 2 60.96 AAATGTTAAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:3 + chr3L 10731728 5' - 297 6957 2 71.23 TTGTAGGCGTTAGAATGGGCGTGGCAATATGTTATAACAAACTTGCGCTAGAATCTGTATGCTGAGTCTCAGCTGGAAAACTTTTATAGATGCTGAGATCTCGAAGTTTATACG:1 - 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X-element 4668 1 51.05 CATTTCATTTGGTTAGTTCGTACTCTATTTATTTTGTTCTTTGCCGCACACCACATGACTTTGTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGCAA:1 - chr3L 19867782 5' + I-element 5210 1 54.20 AGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chrX 18817276 5' - transib2 2787 1 52.85 AACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chrX 8200329 5' - flea 226 2 66.21 TAGAGGAGTCAATTCCTAGTTTTTACTGGGATACTGGACTGAGATTTTGTTTTGCAAGTCGATAGAAATTTACATAACTTATAAAAATTTGAAAAAAATATGAACACGTTTTTCAAAAGAGTGGGCG:1 + chr3L 24925560 5' - INE-1 255 1 75.59 ATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:2 - chr3L 16470337 5' + jockey 4762 1 78.77 CTGTGGACGGTTGTCCGCGTAATGACGACGAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 19266791 5' - 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pogo 2070 1 54.87 GAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 + chr3L 21996162 5' + Transpac 65 2 59.59 AGAAATTAGGCACAAATCTTGTTGGCTGAGATTCTTCCGATTCCGATTCCTGTGATCTCAATGCCAATCGCCATCCCTCACTAATTAGCACATAAACCGACAGGGTAACTTAATTCTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTT:1 + chr3R 26090983 5' + Gypsy6A_LTR 254 1 76.71 GGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3R 30347457 5' - P-element 2864 1 66.44 AAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 - chr3R 15790073 5' + flea 25 2 72.60 ATGGACTAGAGTTGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr3R 23618105 5' - hopper 1374 2 57.53 AACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAT:1 - 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copia 5087 2 64.38 AATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 5532914 5' - roo 394 1 66.67 ACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chrX 18009918 5' - 412 7500 2 47.95 AGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 27986452 5' + roo 8719 2 60.27 GATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 - chr3R 8890102 5' + FB 76 1 69.18 AGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3R 30675490 5' + 297 21 2 67.81 AATCACACATATTTTACCATAAATATTTTGTACATACAATGGCGGTCTGAATACTAGTAGTTTGAACGCCTTTTAAATATTCCAATCGATTAAACCGCATATATATATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - 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P-element 2842 1 56.16 AAATAAAAAGCAGATCGCGTGAACCACTGCGGGCCCACAGACCTCAGAGTCGAGATCTCGAGGGGCTCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGT:1 + chr3L 12251340 5' - roo 8780 2 56.92 TATTCGCGGCGAAATAATTTTTCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCC:1 + chr3R 11334850 5' + Doc 459 1 66.67 CAACAAATCTGAAGAGTAAGCGCAAAATTATCTTATCCGCTTTCTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTCTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTTTTTTCATTTTTTTTTTT:1 - chrX 13061805 5' + hopper 142 2 79.17 ATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACCCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chrX 1135395 5' - P-element 2860 1 54.55 AATATAAGCATGCACTACTTGTCCAACCAGTTTGGGCTTATGATTTAAATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 - chr2R 6964897 5' + Burdock 6175 2 58.90 ACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr3L 17275422 5' - Transpac 5161 2 70.29 TGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTGAC:1 + chr3L 13294853 5' + roo 16 2 70.00 CATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chrX 11661357 5' - 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Quasimodo 324 2 74.29 TAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 + chr3L 10373789 5' - 297 6948 2 67.13 ATTAGCATGCTCGATTAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 7719849 5' + roo 33 2 63.01 GTGATCTATGAACTCAAAATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 + chr3R 30675325 5' - 297 6937 2 57.53 TGGCAAAATCGATCGGGATTAAGAATATAAGATATATACATATTACTTAGGATATAAAAATATTACTTTAGACAAACACCTCACAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAA:1 - chr2L 172399 5' - hobo 2632 1 64.38 CTTGTCACTTCTTATAAAATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGA:1 - chr3L 22035610 5' - 1731 4592 1 50.88 ATAATGATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCA:1 - 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roo 9040 1 63.45 ATGAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAAT:1 - chr3L 12249887 5' - roo 332 2 68.97 AAATTTAATCATTAAATAATTATTTGGAAAGTTTTTAAAATTTTTGCCCACGTCCAGGTTTCAATATCTGAAATTTTGATAAATTTTAAGAATCAACTAGTTGACTTTTTTCAAAAATTTTTAAATCGCAATAACATTGTTTGCCC:1 + chr2R 5353380 5' + FB 199 1 75.34 TCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 13300949 5' - roo 9002 2 62.33 TTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTTTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3L 6397742 5' - roo 331 2 69.86 AGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAA:1 - chr3R 1202714 5' - 1360 3257 1 80.82 AAACAAAAACAAAAGCAGTCTTAGCATGACAAAAACCACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAAC:1 + chr3L 3643917 5' + I-element 264 1 74.66 AATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGGCTTTTTTGGCACAAAGTCTAAATATTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 - 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roo 9066 2 77.40 CATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr3L 21996144 5' + Transpac 29 2 66.41 TACAATACAATATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTT:1 + chr2R 9966934 5' + Bari1 16 1 51.37 ACCATATTTAGCTGTTAAATGAATACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGTG:1 - chr2L 47158 5' - roo 394 1 57.58 GTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:2 - chr2R 14051844 5' + roo 8732 2 72.60 AATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3L 6447140 5' - transib2 2779 1 54.79 AGGTGTATAATTCGTTTATAATTGGATTGAATCAGAATGACTTAAGGATTTGAACGCAGTACTTAAAATACTCAGAATAAGTATGCCTCTCTCAAACAGAGTTTCATAGTTAAGTTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGA:1 - 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chr3L 16033430 5' + Doc 55 1 53.24 ATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAA:1 + chr2R 5106289 5' + Stalker2 85 2 76.55 TGTAATTAATTGAAAAAAAATTATTGGAAATTTTCCA:1 - chr3R 25848756 5' + R1A1-element 150 1 75.68 TNTTTTTTTGTTGACAATATTGGATATCGAAAAGTCTATACAATGTACTCCGTTTTGTCCTTTTTGTTTTTTCTTGCAGTTTTATTGCAAAGTTTATTTTTAAGGTTTATTTTTGATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTT:1 + chrX 14609529 5' + hopper 208 1 67.81 TATATATATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 + chr2R 18177426 5' - roo 393 1 43.15 AATGACTTTTGTAAGAAGTCCGTTCTTTTTTTTTTCTTGATCAGCAGAAGCTTTCTGTCTCTGGAATCTGTCTGCTGGTTCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAAGCGG:1 + chr2R 2247484 5' - INE-1 127 1 59.56 AGATGGCCATTTGGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCCTTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 + chr3R 15807380 5' + FB 79 1 76.69 ATATATAAATATAATATAAAAATATAAACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATA:1 - 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P-element 2856 1 65.75 AAAATATACAGTCCACCATATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 19449953 5' - roo 9006 2 72.15 CATCCAAGCTCAGTCAACACTCGAAACTCACTTGTTTCGCCTTTTATTAATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCTGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAAT:1 - chr3R 15573803 5' - rooA 7430 2 77.40 CAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTCTGGCACACGATTTT:1 + chr3R 12115240 5' + 1360 37 1 56.85 ATTGTAGATAATGATAGGTTGCACAGGAAGTGTTGCCCCAGATTTGCATTTCGTTAAGCATTTTCTTGAACTTATAATATTTATCTTCAAAATACAATTTACAAAATGTTTTGACTTTATGCCAAAAAAA:1 + chr3L 22957496 5' - transib3 21 1 62.31 AAGAGCGTGTGCACGGAGATCGAAGCGATATAGAACTGCAAGTCGACAGCCAAAGGAAGAGGCATTAACTGGGCGGTTGAAAGAGATAAAAGAGATGTCGACCATACAAAGAATATATATTCTTGATCGGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chr2R 15990348 5' + INE-1 92 1 67.12 TTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chr2R 10417125 5' - 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jockey 4949 1 52.08 AAAACAACCATACTCACACTAACACACTCACTTGGTAAAATGATGATACATTTAAACAAGGAATAAATCATTATACCCGTTATTTGTAGAGTAAAAGGGTATACCACAGTCGTAGATATATATTCTTGATCAGGATAAATAGCCGA:1 - chr2R 4387441 5' + INE-1 89 1 79.45 ATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAA:1 - chr3R 27083118 5' + jockey 4597 1 63.45 CACACACACACAGACACACACACATGCTGAAATACACACAGCATCTCACACTGACACTCGGGAGATGCAAACTTGCATTCAGGGATTTGGCTGAAACACACAAAAACAAACACA:1 - chrX 10730494 5' + gypsy3 413 3 52.63 ATATCTGCAACGCCATCTCTGGGATACGTCGGGATCCCCTTATCCCCTTATCCCCGATTTCCTATCCCAATATATTATATATATATGAATACCCCTTCCTGAAATACAAAAAAAAAAAGGGAAAAACAA:1 + chr3L 746914 5' + Doc2-element 231 1 81.40 GCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGCTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 + chr3L 3501716 5' + Bari1 58 1 60.00 AATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr3L 10373787 5' - 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roo 287 2 70.00 CTGTAGCGTGTTCGACTTGAGTATCTAATTTGTTGACTTCGCGTGAGGTTTTCTGTTTTATTTTAAAACTGTCAGCTTAAGACTGACTACAGAGTTTTTGATCGGCTTGAAGTGAGTCGCGAGAAAAGGGAATGTCTAATCAGTAT:1 + chr2R 2877769 5' - rover 7119 2 60.27 ATGACCTCTTCCCATTTTGGTTGTGGGCGTCACCTGAAGCCGTTAATTTTTTTATTTAGGGTCATATTAAATGCAGTATCATGCATCGGTAATATACTAGACGAGGTGCAACCCTTATAAGCTGCACCCGGGAAGTTTTG:1 - chr3R 28683440 5' + Gypsy12A_LTR 149 1 66.43 AAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 + chr2L 4123862 5' + transib2 39 1 57.89 TCTGCATATTCGTCTCGCTATGGCACACACACTAAAACACTCTAGATCACTCCAACACTGTCAAATGCGTACCCTTAACGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTTGCTACTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCT:1 - chr3R 20958529 5' - rooA 7522 2 55.48 ATTAAAAATACATTAAAAAGCATAACAAACACATATAATAAATAGG:1 - chr3R 7467550 5' - X-element 4568 1 63.04 AAATAAGAGCTATACCATTATGTATGCTATCATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 14980266 5' - 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Juan 4185 1 58.90 TTTAAGTACAAATAGTAGCCATTGACCCTGCCCGAAGATTTAATCTCAACTGTCCACCTCTGTGGTAATTTATTTTCAGAACAAACAGCCAGTCAGACCGAACTGGCTATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCT:1 + chr3L 6255196 5' - transib2 85 1 75.34 ATGAAAACCAACTAATCGTTGGTCGCCTCCTGGAAGTCCTGTTCGCCTGGTAATTTACGAACAAATGTTCAATTTATCTAAACAAAAAGTCAAAAGGTTGATATTCTTTGAACAACAGATCAATGCGAACTAATCAAATGTGATGT:1 - chrX 22255790 5' - Tc1-2 221 1 75.34 TTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr2R 8099209 5' - jockey 4917 1 71.23 GGGGATAGTGAAAGCACGCGGCACTCGGGCCCACATATTTAGGGCAAACAATGATTATAATCAAAAGCAATGATAATAATAATAATAACAATAGT:1 - chr2R 8331542 5' + mdg1 7059 2 65.26 AGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATG:1 - chr3L 5881695 5' - pogo 2056 1 54.79 ATGGGAGTGTCCTTGTCATTTATATGTCGCAATGTCGCCCGCTCCAGATTCTGCGCTTTGTACACTGTAAAAAATGTATGTGTTTTATGTTATGTAAATGCTTACTGTTTGATTCATTGATCATTATTAATATTATTAAGATTATT:2 - chr2L 3845208 5' - mdg1 37 2 69.18 ATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACA:1 - chr3R 21276654 5' - BS 5063 1 54.79 TAAGACAATCCCTTTTACCATTTTCCTTCTTGTTTAAACTCTATTATCGCAGACGAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGCTAAGTCTGTCGGCATACCGGCTGCTG:1 - chr3R 11892806 5' - G5A 2601 1 60.71 ATATGAAAGTGAACACAAAAAAAAAGCCCAACAATGTTATCTTAATTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGT:1 - chr2L 7098182 5' - G6 1948 1 66.44 CTGGATGACATTTGTCTCGGGTAAGTGTCCCCATATCGCAGGACTGTTCTGATCTTAAGCTCAAAACCAAAACGTATGCGAATTAAAATTGCTGCTATTTAATTATTTAAAAGAATAGTTTTTATATTTTATTAATTAATATTTAT:1 - chrX 21063800 5' - gypsy7 355 2 64.38 TTTCCTTCTGGCGAATTTCCCTCATTTTATTGGGCAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr3R 27315047 5' + jockey 4691 1 72.41 CGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 + chr3L 12315751 5' + transib2 68 1 75.81 AAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAA:1 + chrX 14722128 5' - diver 6031 2 71.23 CACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr3L 24291992 5' + 1360 61 1 72.00 GCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:2 + chr2R 13766210 5' - roo 338 2 67.12 AATGAGTCGGAGAGTTCAGAGAAAACGAAGGCTCAGCCAAAAGTAGACCACAAGAAGAAAAATAGGGATCCAGAGACAGCGAAGATTCAGGAGTTGGAGTCAAGGATTCACGGACCAAAATTCCTCAAAAACCGTGCCAGGACTT:1 - chrX 484465 5' + Tc1 1266 1 65.52 CAACACGTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGACGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACCATTT:1 - chr2R 20802678 5' - mdg3 5479 2 62.28 ATGCTTAAATTGAGATTAATTTTGTATAATTTTACTGTAGATTGTCGCTCAAGGGGGCATGTAAGTTTTCCGATTGTATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGG:1 - chr2R 4896815 5' - Max-element 8520 2 69.23 GTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3R 4805608 5' + 1360 59 1 65.15 GTGCACACAATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - 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hobo 2920 1 68.25 CAATCAAGAAAAGGAACTGGAGATGAAAGTAACAGATGTTACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTAAAGATCCCGACATGTCCGGAATGGCTAGTGATCCTGATCAAGA:1 - chr2R 13259730 5' - INE-1 88 1 68.75 CATATGTTTAAGTAGTAACACTTACCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTATCGCTCTTGATTCATT:1 + chr3L 20898558 5' - roo 67 2 53.33 ATTTGGGCTTACCATCGGCAAAGATTCCTCATAAATACATTACCATTTTTTGACACAGCCATTGCGGTCGGCATTAAGTCTTGTCTATGTCGCACCGAAATTATCTTTTGCGTTTTTTATAAGTTTTAATAATAGATTTTTAAACT:1 + chr2L 2025749 5' + hopper 168 1 86.99 GCTAATTAATCCGCGAAAATGTTTACGACTCGGATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:2 + chr3L 18930947 5' - I-element 5315 1 50.00 AATGGGAATGGGAATGGAAATGCGAATCGAAATCACAATCAGAGTCAGAGTAAAATACAAGGTATCAGTGCCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1 - chr3L 10367867 5' + Transpac 4966 2 53.42 TTATTACGGCATTTCCACCTTTGTTTTATATGGCCCACACCCGCCACACCCCACCTCCACTGTCCATCTGACTTTGGGTGTCAACGTCACCGATTGACATTGGCCAGGGGTTTTTTTTTCAACTATGTCCGATTTTGTTTTAGCTT:1 - chr2L 11895793 5' + pogo 270 1 80.82 GAAGCGCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAAT:1 + chr3R 11040007 5' - Bari1 1693 1 74.66 GCTATTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGTTTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGAGTATGAGCGGAGTCACCCGGCGCTTCAGC:1 + chr3R 17996175 5' + diver 16 2 52.17 TATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAG:1 + chrX 6475316 5' + Doc 84 1 70.34 TAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chrX 8092380 5' - pogo 2044 1 55.48 ATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTTC:1 - chrX 3646354 5' - TAHRE 10405 1 54.11 AAAGTCTAAAAACACAAATTTTCTATGATATTTATTTCGTTTTCATTTTCATCTAATTTCTGTTTGTCTACGCAAACGCGCACAAACGCAGGCACTTAAAAAACGAACGTGTTGAATTTTGGGTTTACAAAAACAAACAAAACACA:1 + chr2R 11180696 5' + Penelope 526 1 69.86 ATGATTATGGCACACAAATTGAATTCATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr3L 8673267 5' + I-element 29 1 60.27 AGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2R 14051777 5' - roo 8988 2 77.46 AAACTGATAACAACTTTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGTAGTTTATTGTCAGAAAGGGGCTACTCGAGTCCTTCGTTTTCTTCTTATA:1 - chr3L 22959927 5' - Tirant 8331 2 79.37 ATGGCCATTAACAACAGAGCTGATCGAAGACAGCAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACATCTTTTGGTTCAAGCTGCAC:1 - chr3R 25717781 5' - hopper 482 1 74.47 AAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGGGGCTCT:1 + chr3L 23287214 5' + 1360 51 1 53.85 CTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGATG:1 + chr2R 16510082 5' + F-element 47 1 47.10 AACTAAAATACTAATAACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2R 10909307 5' + hobo 53 1 53.42 GTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTA:1 + chr2R 3338774 5' + Juan 50 1 50.68 GTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGTAT:1 + chr2R 18316044 5' + HMS-Beagle2 74 2 65.07 CGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 + chr2L 17205152 5' + hopper 21 1 66.67 TAATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGCATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGAC:1 + chr2L 14026099 5' + F-element 423 1 77.17 AATACAATCGATTAAAAGTTAGCAAAGTTATTATTATAACTCCATATATATATACATACATATATATATATATATAAATATATATATATATATATGTATGTATATATAT:1 + chr3L 14957635 5' + 1731 4409 1 51.38 ATAAAGTGTCTTTAAAGAGACTTTTTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGGACACCCCACCGATC:1 + chr3R 5826705 5' + G5 4642 1 56.45 ATGCCGCATGAAATCATAATGAAAGCAATAAAAGCATCACCAACAACCAGAAACAGAACGCAGAACAGACAACCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chrX 4223728 5' - 1360 3343 1 56.85 CATTAATCAGCGGGCCAATGAAGCTGTTTTCGTGCCCAGTGGCTGGGTTCATCAGGTGTGGAACCTAACAGACACCATATCCGGCAATCACAACTGGTTCCATGGCTGCAACATATTCATGTACCTTAAACAATCCCCCCCAAAT:1 - chr2L 18157665 5' + I-element 4892 1 81.38 TATCCCCGGGAACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 24131540 5' - Transpac 5211 2 72.60 CAGAAATCTGTTACAGCATGATACCATTACAATGACATGCAACGGACCCCCAAAAGCACCCCCAACTCGGCATGGCCAAAGCCACCACAGAGCAAACTAGATACTTATACACATAAAAATGCCAGCTTTATGCGGCTGCTTATTTA:1 + chr3R 26731519 5' - 1731 4434 1 76.71 TNTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chr2L 13556469 5' + transib2 34 1 56.16 ATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAG:1 - chr3R 10970320 5' + G-element 80 1 69.66 TGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCAAT:1 + chrY 1732326 5' + gypsy11 4144 2 69.86 AATATAACTAGCTGTCGGGCGGCAGTTATTGAGTTGGTGAACGCAGAACGTGTAACGAAATGAAAGACTAAAGTAGCTATACTTGAGGGTGCACGCTTTAGAGACCGGCTCTAGCTGATGGCGTTGGGTGGAGTGGTCTTGCTTGT:1 - chr3L 24240835 5' - Gypsy12A_LTR 2169 1 67.12 CATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr2L 10156091 5' - hopper 1373 2 53.79 ATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGGGCCCAAATTAGGAGACAAG:1 - chr3R 27083107 5' + jockey 4609 1 69.86 GGTGTGCAGTATGCACTGGTTGTAGCACTCCTTAACAGGCAGATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGG:1 - chr2R 3384185 5' + INE-1 99 1 46.67 ATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGTCGT:1 - chr2L 22045844 5' - INE-1 143 1 78.77 ACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAAAACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATTTTACTTTTATTGAA:1 + chr3R 6419809 5' - Tabor 458 2 63.45 GTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAG:1 - 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HMS-Beagle 6974 2 64.38 TATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 + chrX 17343399 5' + I-element 75 1 70.55 ACAGGAGGCCCCACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:2 + chr2R 18258749 5' - Juan 4188 1 60.27 AGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3R 13875060 5' + P-element 38 1 41.90 AAGACCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGT:3 + chr3R 904899 5' + rover 6959 2 67.81 AAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 - chr3R 9039033 5' - Juan 4169 1 53.42 CCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGAAACTTAAAAAAGCAGTTAACTTAATTTTTTTGTT:1 - 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chrX 8308472 5' - roo 321 2 79.45 AGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAG:1 + chr3L 11844701 5' - rover 7251 2 52.74 CAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGGAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCATATTAAAGTAA:1 - chr3L 6397728 5' - roo 317 2 73.97 ATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAAAGCACTCGCAGCTGGTCGACACTAAATTTTTTTATTTTTTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAA:1 + chr2L 12341799 5' - BS 5065 1 59.85 TGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chrX 6475289 5' + Doc 58 1 53.42 AGTTTTGATTGGATTCGATTGGATTTACGGCTCAGTGGTGGTTGGATCAGTGGTGGTGCAAATAAATTAATTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCGATTTGGG:1 + chr3R 18695681 5' - I-element 4907 1 62.79 ATAATAAATAAATAATAATAATAATAAATAATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACT:1 - chr2R 8998352 5' + Doc3-element 160 1 60.27 ATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTCAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAA:1 + chr2L 22121323 5' - I-element 5321 1 59.59 AGCTATGTGCATTGCATTCTCTCAGCAAAGGGCTGTCGTTAAAAGTCACTTGTCAATGCACTTGACTTATTTTTCCTCCATGCCAGGCCGAATGTGAAATTGCTCAACCTTCTAGCTGTTATAGTTCCTGAGATCTCGAC:1 - chr3L 19218368 5' - INE-1 145 1 70.00 AACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 - chr2R 5941423 5' + copia 4938 2 63.01 AAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTT:1 - chr3L 21996247 5' - Transpac 5155 2 68.49 AGAACTTTTCGTTATGGCCTTCTTATTCATCCATTCCAACAAGGCGGTGCAACAGCACCCACTTCAAGAGCATCGATGGCTGTTTCGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTCGTGACCCA:1 + chr2R 2108647 5' - mariner2 281 1 63.89 ATTTATTATATTTTATACTTATTTTACTATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGAGCCTC:1 + chr3R 24688750 5' + I-element 18 1 71.23 ATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCC:1 - 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chr2R 7447263 5' + INE-1 156 1 68.06 AAAAAGATGGAGTTTACATGAATTCTTGTACGCACTGATGGAAATAGCTAAGCCAGCAAAGCTTGAAGATGAGAGCATTATTAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 6421462 5' - roo 9014 2 55.48 AGTGGCTGTGAAGGCGTCACAAAAATTGCACTAAAATAGCTGCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATATTGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCC:1 + chr3L 16470614 5' - Doc 4313 1 62.83 AGCGCTAGATAGATTGAGATACTTATAAAGCTGGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 + chr2L 6174020 5' - I-element 5327 1 62.33 ATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTG:1 + chr3R 4160059 5' - invader2 194 2 54.11 ATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:1 - chr3R 15364028 5' - flea 4964 2 53.42 TATTGATGTCAACGCCAATTGGCATATTCCATTATGCCGCTCATCACTCATGTGGCAGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTTTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAATACTAA:1 + chr2L 14399246 5' - 17.6 7275 2 59.59 TAAAATATAAAATCTATTATAAACTGTGATTTTTGTGTATAATATTCATGTATTAAACTAAAAAGCAAGAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCTCAAGATACTCAGTAAAATTGAGAGAGTGGAATTGCACAATTTTTCTGGGATAT:1 - chr4 112273 5' - INE-1 508 1 70.55 TGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTG:1 + chr3R 11040053 5' - Bari1 1647 1 59.59 AGGGATCAGATGTGACGTCTGGTTTTCCATGGCGGGGGCAGAAGCCGATAAGAAAAACTTAAATTGTAATACCAATAGCATTTACTATACAGGATAGAGCATCTCTCCTAAACTTGGATATAATAAAAAAAGAAATTTGCTTAAAA:1 - chr3L 11846250 5' + Tc1 386 1 73.97 ATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chr3L 21996160 5' + Transpac 4982 2 58.22 AGCGTTCTTTGGAGAATTCTTCTGACCCCCACAACCGTTTCTTTCCCTTCTTGCGTTTATCCTTGCCTTTTTTCTTTTTTTTCTCCTTTTTCCTTTTT:1 + chr2L 5298002 5' - Doc2-element 238 1 62.24 CAATAGCCATAGCAATCCACATCCAAATCCAAATGACAGGCAACAACAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAAT:1 - chr2L 15417031 5' + F-element 4384 1 73.29 TATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCATCATAAG:1 + chrX 22641242 5' - Tc1 1635 1 25.34 ATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr2L 19675063 5' + 297 6644 2 71.92 GCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:2 - chr3R 21630352 5' - I-element 5296 1 59.59 TAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 7795603 5' - roo 9001 2 66.44 ATTCGAATCGAATTGAATTGAACGTAAGCTACAATAATCGTGTGACAAACGTACATGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr2L 4906674 5' + blood 7073 2 61.11 GTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCA:1 - chr3L 3501868 5' - Bari1 1697 1 71.92 AAAAGACTAAGGCAACTTTTCATTTCCTTCCCCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGCAGAAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTT:1 + chr3L 18768199 5' - S-element 218 1 68.42 ACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3L 12315798 5' - transib2 2739 1 75.17 GTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr2L 7125732 5' + I-element 34 1 59.15 ACTTACTGTCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3L 17055403 5' + Tirant 8120 2 72.58 GTATATCGTTCTGCAGACCTAACACCCCCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGCTCTCATCATCAAGTTTTTCTGTTTG:1 + chr3R 22236610 5' - Dm88 335 1 76.15 TCTTAGAATGGATCTTTTCAGAAGGGTAACTGTTGTCCCACTGGGAGACCAATCAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAGACCACCCAAACATGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTTCGACGTC:1 + chr3R 22623010 5' + G5A 2662 1 77.40 GGTGTGGCATAGATAATAAAAATAGAAATAACAATGGTAAGAACGAGTTTTGTGGCCGATTTTGTTTGTTTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGATTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTT:1 + chr2R 8354224 5' - Porto1 230 1 58.22 TGGGCTTCGGCCTTTGGCAAATTACTATTATGCATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCAGACATGAACACGAATATATTT:1 + chr2R 23180136 5' + roo 8670 2 80.69 ATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr3R 16341962 5' - P-element 2828 1 32.77 AACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr2R 11159345 5' - roo 9006 2 64.14 AGAGCCACCAAAAAGTAGTTCCCGATTGGCCCTCTATCTCGTTTTCTCTCTCTCTCGCTTCTCTACACCACGAAACTTCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr2L 16690558 5' - P-element 2859 1 58.57 AGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAAT:1 + chr2L 4754834 5' + Stalker4 16 4 54.79 AAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr2L 9636203 5' + 412 7087 2 52.74 AAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTTATGTTTTAAAACAAGCACCTTATAGTCTATAGCTAAAGGTTGCTTTGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3L 10532420 5' - 412 7507 2 58.22 AGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATACCTTTCTGTCTTGTTTTTTCTTATTTTGTTTTTCTTTTGACAAACCGGTCAAAATTGCCAAGCCCACACTTATGCAAATTGATATTGATATTTTTTCATAATTTTATTAGTTCAT:2 + chr3L 21562702 5' + INE-1 405 1 49.32 AATTACACCAAAGAAATTGTTCTCATCCATTGTCTTAATAATAATTCTTAATATTTACAAAATAGCTT:1 - chr2L 7775224 5' - BS 303 1 79.41 ACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 7889560 5' + roo 8693 2 53.57 CAAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chrX 14722260 5' + diver 5894 2 74.66 ATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCTTACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 + chr3R 4805637 5' - 1360 3317 1 76.00 GATAGAGATACAGATACATCCGTACTTGTATCAAAGAGACTCACAGAGATACAACCAAATGTGGGGCCACAGACATTTGCATGGAGTGTGGGGCCGGATTCAGGGTCAGGGACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCAC:1 + chrX 11209800 5' + hobo 12 1 75.86 CCGTGAATATTCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr3R 14860100 5' - BS 5074 1 66.67 ATATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGTGCAGAGACCG:1 + chr3L 15103806 5' - Transpac 5209 2 59.22 ATGCTCACTTATACATTCAGTGTGACCGCGACAGAAGTTGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTTCTGCCTTTGAAAACTATTAACAATGAACCAGAAAAACAACTAAATCGAAGTTTG:2 - chr3R 2476306 5' - S2 1536 2 73.97 TGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chrX 10521608 5' + Tabor 6879 2 56.85 ACCTTAAAAATTAATTAATCACATAATTTATAGAGTGAATCATGGAGCCTACCCAACCTAATAGAAAAATAACTCCAGATCAATATAGAACAATCCTACCCAAATTGGATCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACA:1 + chr3R 9261498 5' + I-element 4939 1 72.60 ATGTATGTATATCTCTCTTGTTTCTTGCTTGCTTTTATTTATGTTTTATTGCCTGCAAATTCTGATTAAAAAATATTTTCGGAATGAGACAGTTCTAGAAGAGTGGAAAAAGCTGGAGAATTTGTTGCCTTCGAAACACCAGTGTA:1 - chr2L 2905852 5' - Gypsy12A_LTR 1989 1 56.16 ATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAA:3 + chr2L 11391456 5' - 1360 58 1 65.75 AGCGGGTTATTAACAAGCTGGAGAGAAATATACAATCGGAGTATGCAATTGAAAGTTTGTCAACAAAGGTGGGACAGTCGCAGGCCAGGACGGACATGTCCCGAGGAACGCCGAGATCTCAGGAACTA:1 + chr3R 775031 5' + INE-1 142 1 67.19 GATGGAAAGCAACACAATTGCATCGCGGTAATTTTCTTGAGGCAACGAACTGACATCGACATATGGACATGTATCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAA:1 + chr3R 22590464 5' - rover 302 2 55.48 CATACATTTGTCAGTGCCTTGTCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTA:1 + chr3R 10270525 5' + Juan 4039 1 75.00 GTTTCAGTGCTTTAAGCCGTGTCATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTT:1 + chr2L 14074423 5' + 297 6945 2 60.27 AATTCAGTTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 8047388 5' - 1360 3364 1 65.07 ATAAAATTAAATTTAAAAAATATACAAATGATATAAAAATTTAATGTGTTTGTATTATTAAACAAAAGGGGTTATTGCAAATCATACTTTTTTAAAAGCAAAGAAGTAAAAACTAAAAACATAGAAAAAAAACTATTAAATACAAA:2 - chr2L 21665146 5' - accord2 340 1 57.53 AAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:2 - chr3R 23639240 5' - pogo 2036 1 66.44 ACTTTCTTTTTGGTTTTCATATATATTTTTTTTTTCAGTTGCTTTTGTAAAACAAAATGTACACATATTGTTGTATTTTTTTTTTATATATCTGTATTGATATTTGTCAAAGCGCAATTTCATCATATTGCTACGAAATTGTCCAA:1 + chr2L 9728292 5' + 1360 3117 1 77.40 AGAAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:2 + chr2R 4362739 5' + F-element 23 1 68.49 AGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 + chr3L 18402995 5' + P-element 91 1 23.29 GTTGTATTATCTTCTGTATATGGTGCTATTGTGATGGAAGTTTCATAATGGAAAACCATTATTTTATTTTATAAACATTTTAAGAAAATAACTTAACTAGCTATCGATAGAACGATGCTTGGAACAGTCTTTGTTTGTAAGCTTAT:3 - chr3L 16636143 5' + Cr1a 4038 1 65.75 AAACCTCCTCCGTTGACTAAACCACCACCACCCCGCTCTCAAAAATTCAAATTATTGTACCTAAATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTTATTCTGTCTCCGCACCTCCACCAGCA:1 + chr2R 19263526 5' + HeT-A 6051 2 71.92 GACAAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr2R 5531246 5' + 1360 60 1 76.03 AAATTAAAAGTAAAAAAATTAATTCTCCTCCTTAACTTTACTTTGGGGTTTTCTTTAAATTATACATACATATACAGCCTTCGCGTCAACTAACAGATCACTTTTCCCCCCGATATTCACTAACATGT:1 + chrX 2582853 5' - Gypsy12A_LTR 444 1 75.78 AGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 11810605 5' + roo 29 2 63.64 ATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATTATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 + chr2R 22034646 5' - copia 5067 2 57.53 TTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1 - chr3R 24381376 5' - Juan 4134 1 71.23 TGATCGCTGTTTCGAGGCGAACGACAAGGGCGCTGTTGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 2146034 5' - roo 391 2 71.23 CCATCAATAAAGTCAACCAAGAGAGTGACGATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 3234080 5' - roo 9036 1 60.27 TAACTACCCCAAAATAAATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 16157246 5' - pogo 2075 1 63.70 GGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAATAG:1 - chr3R 13300922 5' - roo 345 2 66.96 CGGTTGTGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGCAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 4063785 5' - roo 398 1 78.08 CTAGGGTCTGCCAATAAAACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2R 11159383 5' - roo 9043 1 65.07 AGTGATGAAGTTTGACCTTTCACACGCTCCCAGATTGCCTGAATTTTGGATGCCCCACCGATCTCCCTACACCCTTACACAATAAGTAATTAATAACTAGATACATTTTCCCTTTTGTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCT:2 - chr3L 1407135 5' + G5 4741 1 64.38 AATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGT:1 + chr3R 15724306 5' - Juan 4150 1 59.59 TATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:2 + chrX 18817264 5' - transib2 2776 1 52.74 ACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAA:1 - chr2L 13556416 5' + transib2 86 1 74.66 CTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAA:1 - chr2L 13556470 5' + transib2 33 1 57.53 GGATTCAACTTAAGGAAATGGATTTCCAACAATTCCAAAATATTAACCACTGTGGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAATAAAAACCAAAAACGAATTACACGCCAGAAAACTCCT:1 + chr3R 19445698 5' + I-element 404 1 57.55 CTAATATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr2R 5531217 5' + 1360 66 1 66.67 TTTAGAATTTTTTTCAAGATTCTAGGAGTGTTTTTACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCC:1 - chr3R 21973882 5' + Doc 340 1 76.03 ATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAATCTACAAAAATAACGTTAAACAAACCTACTTCATATTTGATATGAATG:1 - chr2R 22034737 5' + copia 4916 2 52.10 GTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 11062839 5' - roo 9018 2 52.41 GAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:3 - chr2R 24170004 5' - transib2 2778 1 47.95 TTTGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 - chr3L 3983881 5' - P-element 2813 1 32.87 ATGGACATCTTGTTATCGGACTTTGGACCAACACGTTCCCAAATTATTATTGCAATCATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCC:1 - chr2R 7457483 5' + Tirant 8487 2 70.24 ATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 - chr2L 4713944 5' + transib2 77 1 74.66 GCAGTTAAACATGGCGTCTTGCGATTTTATTGCCGCCTCGAAAGTTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTT:1 + chr3R 12242926 5' - transib2 448 1 71.92 GTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGC:1 + chr2L 14026134 5' + F-element 434 1 63.11 TTCGCAATGGAAACTGACGCAAGCCCCCTTTAATGTGACAAAAAAAAAAAGGTTTAAGAAGCTCTTTTAAATACAAAAGTTGAAAAAAAAGAAAACAAAAAAAT:1 - chrX 15124657 5' - hopper 143 7 65.38 TTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAG:1 - chr3L 19349988 5' + 1360 3282 1 73.97 CCCACTTGCACTTTGGGGCAGGCCTGAAATCGAAACCAGGTCAAAGCGGAGCACATTCAACAATGGGGAGACGCTATTGAAATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCTC:1 - chr2L 20342577 5' + mdg3 251 1 60.00 TTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAATTT:1 - chr3R 23429887 5' - HeT-A 6000 1 71.92 GAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:2 - chr2L 13158724 5' + roo 76 2 71.03 ATTATATGATAAAGGTCAGATAATATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGT:1 - chr2L 17180182 5' + Juan 1 1 77.45 TATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 - chr3L 19274867 5' - transib2 2768 1 72.03 GTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGGATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr3L 19111598 5' + Doc 70 1 65.96 TTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCGGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 13406548 5' + pogo 30 1 60.96 ATGCCTTAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGCTTGGAGCAGTCCTTATTTATAAGCTTATTCGTGGTGATATTGAGAGTCCCGACTTGATTAG:1 - chr3L 26246021 5' + Cr1a 4071 1 66.44 TACTGCGTTCTTTGATTGTACATATATTCTGTTCCAATCCTCTTAATGTATCAAGCTAACGCTTAAAAATCATTATATATAAAATCTGTCAATGTAAATCGGTCAATGTGTAAAAAACACTTGTTAATTTTATTTATTTATTTATT:1 + chr2L 22732201 5' - HeT-A 33 2 55.48 ATCATCCATTGTATGTGATGGAGTGCTTTCTTTCAATGATTGTATAAAAGTTGCATGTTTATTGTCTCGAAGACAGTGGCTAGGTTGAGCTCTT:1 - chr2R 5148997 5' - BS3 1434 1 59.57 ACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCTTAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAATAAGAGGAGCACTGTTCTCACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3R 14980432 5' + roo 6 2 72.81 ATAAAGATTTAAAGATACATTAAGTTTGTTTCTTTTCGACATTTGTAAATTTTACGAATGGGTGCGGCAGCATCGCTTCCATTTTTTCAAATGCGCGCCATTCAGTTATTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCC:1 - chr2R 18585165 5' + mariner2 59 1 79.71 AAACATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:3 + chr2R 4362741 5' + F-element 25 1 67.12 AGGTCCTGCCGGGGGAATAAAATGACAATCAATCCTGTCCTTTTCAAGCTGCGCTGCAATCGTTATATTTCGCTTAAATTGGATTGCATATAACCTAGTTACAACGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAAC:1 - chr3R 19447542 5' + Tc3 1715 1 55.48 AAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:1 - chr3L 4219555 5' - jockey 4945 1 56.85 AATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCC:1 - chr2R 9967130 5' - Bari1 1644 1 60.27 TGTCATAGGGGTAACAATTTTTTTGCCAATTTTTTCCTGTGCAAAAAGCTCTTCTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTATGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATT:1 + chrX 16581888 5' - TAHRE 10159 1 63.70 AACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 6847819 5' + Doc 40 1 65.26 GAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:2 + chr3L 16662362 5' - jockey 4949 1 52.74 TAGCAAGATAACAAGCCGACGCTGCCAGCACCCTCTCTTCAACTAAGAAACACATAATGAAGATCGTAAGGAAAAAGAATATCATGTAGGGCAAGTTGTTAATAAAAAGAAATACTTGCAATAAATGTTTATTTTATTTAACAAAA:1 + chr3R 4153227 5' - Ivk 5380 1 67.81 ATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:2 + chr3R 9595008 5' - Tirant 8440 2 66.21 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGAT:1 - chr3L 16731387 5' - rover 7283 2 76.03 TGTATGTACAATATAAATACATTTTTTCCCCATTTTTACCCATAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAA:1 - chrX 20070795 5' - mdg3 5203 1 71.23 ATACAATTACTTTCGGACACATAATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:2 + chr2L 10156072 5' - hopper 1391 1 66.44 ATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr3L 24934300 5' + HMS-Beagle2 48 2 59.23 GGAAAAATTCAGCTCAATTTTCGTGAGTTCCGCTTGGCACATATGCTACTATATATAATTTCTGTTTTCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTCAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 - chr2L 16436406 5' - S-element 1673 1 75.54 AGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 14051835 5' + roo 76 2 78.62 ACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGGCT:1 - chr2L 23373501 5' - Tc1-2 1536 1 75.34 CGGTCTATAAAACAAGATCTGGTACGGTTTTGCCTGTGAGTTGTGATAAGTATGGCGTAGATGGTTTTCCTGTTGGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGAGGTTAAATGATTGAGACAATGAGGTGTGATTAGGGTGAATGCT:1 + chr3L 20443945 5' + frogger 45 2 73.29 AAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3R 31886948 5' - hopper 1362 1 53.42 GAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 15882557 5' + jockey 9 1 73.45 AATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 20167593 5' - roo 330 2 73.29 AGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTCGGATTTAGTATTATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACA:2 + chr2R 5106238 5' + Stalker2 7283 2 60.27 AACTCCCCGATCGCGGATCATGGTCTTCCAAAATGGATTTCATACTATCAGTAGTGGGCCTAGCTATTGGTGCTGATCAAGAATATATATACTTTTTGTGGGCGGAAACGTCTTCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 + chr4 631643 5' - INE-1 20 1 57.14 ATAGAAAGGTGGCACGCTGAGGGCCGCAAAACTGATGAACGATGCCAAAGACAACAGGAGATCCTGAACTAGCGGCACCCAGCATCACAAAATATCCAGAAAAAAAAAAATATAACAATGAAA:1 + chr2L 17156989 5' + transib2 2642 2 83.74 GTCAACTATACATATCTTTCCTAATGGGAGGTGTTAGTTAACTCGATTATTCCGGGTTATCAGAGCACTGAATTAATAAATTTGAACATCTGGCGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTG:1 - chr3R 9054031 5' - accord2 7317 1 67.59 AATACACAAAATAAAGAAGCAGCAGACGGAAAAGTGCACAAATGGTGCAGAACTGAGTGGAAAGGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGATTATATACTACGATGCTATTATGAACTGAAC:1 + chr3R 30023093 5' - invader2 30 2 56.00 AAAAATACTTACGCAAGACAAACAAGACGCACTCTGTGCTCCTCTTTCATTTTCCACTGGCCAGAAGGCTAAAAAGTCATTGACCGTGAAGTTGGAACG:1 - chrX 20004488 5' - G5A 142 1 67.68 TGAATATTGGGTAAATATTTAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCACGTTCACGTTCACAAAAATACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGCTG:1 - chr2R 14802119 5' - invader1 3703 2 79.80 AGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCG:1 - chr3R 30347458 5' + P-element 10 2 73.13 AAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCGCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 14051739 5' - roo 358 2 50.68 AGGGTATCTGATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGA:3 + chr2L 22121313 5' - I-element 5331 1 54.11 TTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 13294985 5' - roo 9015 2 56.94 TGGCATTAGCACTATGGCTTCTTTCGTTACACTTTTTTCGGTTTTTTCTTTCTCCGTCCGCCTTTTCTTTTCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTT:1 + chrX 8621576 5' - Doc2-element 251 1 68.09 ATCCGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGATTCTATTCCCCACCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTGACAAAACTAGACTAAATTAGATAG:1 + chr3L 21380529 5' - I-element 5318 1 54.87 ATGTGTATGGTATGTAAAGCATTCAAATTTGCAAGGTATGGCCCCGATACAACATACAAAAAAGTTTAATAAACATCGTAATGCATTTTATGGATTATTAAAAAAAAAAACTATTTAGAATCTTTCTTTTTCCTAGTTTTTTTTT:1 + chr3R 13218930 5' - Doc2-element 231 1 55.17 ATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr3L 24131483 5' - Transpac 297 2 58.33 GACCAGTGAATCCCCGACGATGGCTTTCAGGCGACTAGCTACCTCTTCCGGTACCACATCTCCGTTGGACCGGACGCACTCATAGTTCTCGTAGACCGGACCCCTAAGGCGACATGGGGGCATTGCTCAAAA:1 - chr2R 11224934 5' + roo 8779 2 73.48 TAGAACGGTGATAGCTTAACTTGTCTGAGCATATGTAAATTTAAGTTTCACATTTCAATTAATATTAATTGCCGAGAGACATATACAATTTAAGATCGAAAATGAACTAATCTGATGTATTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAG:1 + chr3L 4680413 5' + Circe 7138 1 63.01 CCTATCATCGAAGAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTATAAAGTCTTAGTT:1 + chr3L 15913817 5' + jockey 4789 1 63.70 GTTTAACTCACCTGCAAAGAGAGGAAAAAAAAACAGAACCCCAGAATAAATAGTGAGATGGTGAAGGGGATGAGGGGAGTACTTAAATTAAAATTGTCATGCCTGATTGCATTTTTGTGCCTGTATGTATGTGTGTGTGTGTATG:1 + chr3R 8852124 5' - Quasimodo 38 2 78.62 AGATTCTCATCAGCGAAAGTTGTGGTCAAATAAAAGAGCATTTGTCCTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCC:1 - chr2L 517562 5' + accord 7118 2 63.49 TTCATGCACCCCTTTCGTAATTGGTTGCATAGTTCTTCTTGCTGCTCCAACTTGGATGCCGCACCGGACTTGGAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAA:2 - chr3R 27374247 5' + Doc 4479 1 59.31 ACTTTCTCGGCTGATTATTGTTCGTTAGGTATTTTTTTTTTTGTTTTTCAACAAATGCACAAAAATGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATT:1 - chr2R 17841872 5' - Doc 4499 1 55.48 CATTCGTAAGGAACACACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGGGTACATTAAATATTT:1 - chr2R 4870274 5' + Juan 62 1 51.72 GGTTCGTTTTGCCGGCTTTCTGTGCGATTTGAACTTTAAATTTGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCGGAGCCATAAATCCATATGGGTTT:1 + chr3L 11427586 5' - Doc3-element 4312 1 59.22 TTAAAAAAAAATATTTGTTTTAATAGTAAAAAAAAGTAAAAGCATGAGAAATTTGTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTGTTCGCGGATTGCCCTACCGTACCTATTTCGTTAAGGAGCATTAGCCGAGTTCAGTATTTAAAT:1 + chrX 7082217 5' - Gypsy12A_LTR 1872 1 39.73 AAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAATAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCA:1 + chr3R 29477654 5' + Doc2-element 387 1 55.40 CGTCGATAAGGTGTGTTACAAATTCGTCATCGTTTTTTGTCGGCATGACTGTGAGAAATCCTTGACTATTTATAAAGTATGATGGGAACTATTTATTATCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACG:1 - chr2R 22589691 5' + micropia 194 2 62.77 AACATTGGCCCAGTCTCAAGGCGATCTTGGCACACTTTGAGCATAAATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCG:2 + chrX 1263902 5' - Burdock 237 2 70.55 AAATTAAGTCCCAAGGGGGTAGGTAAGCCTGTACATAAGATAAGAACAAGAAAAAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACGGTCAGATACACCTTACTCAGCTTGTGGGAATGCGAACACAAATTGTCATAATTTTTCTGGGATATCG:1 - chrX 22713793 5' - INE-1 506 1 68.49 AAAACATAAGTTATGCTATACCATAAGCAATTACTAGGAATAGCTTTCCTTAGTTCTTCAGGATATTTTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGGCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCACGCAATCACATAT:1 + chr2L 19089873 5' - baggins 5245 1 52.05 GTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTAAGAAGTATGTAACAGGCAGAAAAAAGAGTTTCCGACTATAAAAAGTATATACATAGTATATTCTTGATCAGGATAAATAGCCGAGTCGATCTATCCATTTCCGTCTTTCCGTATGAACGTC:1 + chr2R 4618504 5' + INE-1 126 1 77.40 CACTAGTTAGGGAACCATAACCATTTTTGCGTTTCTTTTTAATTTAGTTACTCAACAAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - 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I-element 5321 1 60.96 ATGCACTCGAATGCTTGCCCGATATACGGAGCGTTGCTAGCGAGGGTGCAAGCTAGACATTAATGTTTAGCTTCCCCCAGTGATTGCAAGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCACTCCCTCT:1 + chr3R 15190137 5' + GATE 35 2 50.68 CATGAAGCAGCGAAACAGTGTAAACAGTGGATCCGTGGTGCTGTCCGGAAAGAAGAGATTCTCATCGGATCTAAGGTTAAAGTTAAAAGTTATATCCGACCCCAACATATTTTGACTAACAATATATCTTATATATCTAGGCTTAT:1 + chr2L 16896097 5' - 412 258 2 80.82 ACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:2 - chrX 14722214 5' + diver 5943 2 53.42 TCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:1 + chr3R 3851001 5' + transib2 48 1 53.42 TAAATATGAAAGTGAACACAAAAAAAAAGCCCAACAATGTTATCTTAATTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTAT:1 - chr2L 7098185 5' - G6 1951 1 64.38 ATAAATAATCTTATTTCCAACACGTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTA:1 - chr2R 20802695 5' - mdg3 212 2 60.27 AATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGT:1 - chrX 19980681 5' + X-element 4555 1 65.07 AAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr3R 12115337 5' - 1360 3338 1 70.00 TGATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTATGCATCAAGTGCTTCTCCCATCTATAGATCG:1 + chr3R 4682873 5' + Burdock 48 2 51.37 AACAACATTGGGGGCATTATGCATGGTTTATTCTTCGCTAAGCCGCAACAACGGCGACGAGGAGGGTTTTCAGTTTAGGGGTCGTGTTTGGCATCTATTTTTATGCGACAACGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 + chr3R 24450367 5' + 412 8 2 76.03 ATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:4 - chr3R 8890124 5' + FB 54 1 54.11 CTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chr3L 19455017 5' - mdg1 351 2 63.70 ATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr2R 24170032 5' - transib2 2806 1 45.21 AAGAACGAACACTGCAATACCCTAACTAACTAAATATTTTGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTC:2 + chr2R 21410807 5' - Burdock 253 2 81.51 GACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 + chr3R 15072567 5' + pogo 69 1 67.81 ATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAG:1 - chr2R 12645486 5' + X-element 92 1 69.18 TTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAG:1 - chr2R 12185435 5' + accord 43 2 53.10 GTAAGCAGGATCACGTTATCATGGAGGAGCAGGAGCCCGACGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGAGC:1 - 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BS 5035 1 55.48 CTTACAAATGCAAGACATTTATAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCATTTTT:1 + chr3R 5523927 5' - FB 6 1 54.90 CGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAA:2 + chr2L 22329015 5' - invader2 4705 1 67.12 TGAAAATATGGCGAGGTAGAAAAAAAATTAGCCTTTGCGTTCTATTTTCCAATTACTAAATCTTTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTAATTGCATATATCGAGGTTACACTGTACCTATAAGTACAAAGCA:1 + chr3R 7943714 5' + blood 29 2 53.12 CATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 + chrX 14450380 5' - hopper2 1562 1 51.37 AACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3L 21327103 5' - copia 5068 2 77.40 AAATGTAAACCACATCGACGGCATGCTGCTGGTTGAAACGAACCTCACAGGGAGGTTTATATATAATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:2 - chr2R 5480038 5' + F-element 29 1 76.71 TCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3L 22035680 5' + F-element 50 1 52.74 GACTTCCCATCGAGTTCCCCGAGACACCCCCAATACTCTATTTGATCGGGTGCATGGCCAAAGAAAACAGTGTAAAATCCCACATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTGATTGTATTTGTAAATAT:1 + chr3R 4964087 5' - roo 9024 2 46.76 CTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 + chr3L 15103775 5' - Transpac 5205 2 68.12 AATGCACTAAAATAGACTCAGGACAACTCTATCCAATATCACCTAGGAAACTGCGGTTTCATTGTTAGGTTTGACCTTCCTCAATTCCATTTCTAACTGAAAAGGGGAACAACTACTTACCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTG:1 + chr3L 5795235 5' + Cr1a 493 1 76.71 TACCGCATGAATGGCATAAATAATAAACCTGCTGCATACTTCTTGGCGCCACACACGCACACACACATACACACATTCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTC:1 + chrX 14450375 5' - hopper 1390 1 61.54 TGTGTTCGTCATTGGGTTGTTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAA:1 + chr2L 4888704 5' - BS 5054 1 56.16 AAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACG:1 - 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chrX 12671042 5' - TAHRE 10391 1 56.85 TATTTTAACAATCTGGAATCAGAATGTTGATACATCAATGGAATCTAGTGCCAATCGGGAATCCCTTACGTACAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 + chr3R 30059343 5' + FB 12 1 77.40 AATGACATGGAGGGGAAATGCTCTAGATATATCTACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAAAATCATATGATTTTAAGTTTTAATGAGTAATCTTTTTTTATAATATCATTTGGT:1 + chr3R 5365339 5' - HB 1541 1 77.08 GACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2L 8338217 5' - P-element 2855 1 58.40 AATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr3L 23146502 5' + 1360 82 1 79.41 CTAATCAGGAATGGGCGATTTGATACCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAA:1 - chr3R 10970400 5' + G-element 1 1 78.77 ACTTAACTGGATTATTAAACGGAAGACCCGAAAATTGTTAACTGATCTAAGGCAGAACTACACACAAACTACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTATTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGA:1 + chr3R 29048616 5' + Idefix 99 2 52.74 ATGCCAGCCAGCTCTTTGCTGGGATCTTTTAAGGCATCAAGGAGTTGATAGCACGCAAAACAATTTGCTGTTAGTTCCTGATCTATTTTAAATACAACTTGCGCATGCCAAAGACCAATATTAATAATAATAATAATAACATTAAT:1 - chr2L 14627413 5' + mdg1 21 4 73.97 ATAATGTATGTGTTTTTATTGTTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGGTGCAACCACAAA:1 + chr2R 5106299 5' + Stalker2 7313 2 75.65 AAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTAAGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 + chr2L 7580901 5' + Transpac 4977 2 58.22 ATCACAAGAGCGAAAGTAAATCGTTCTAAGATCATCAACCGATCATTTAGTTTGAACAACCGACAATGCCACCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTTAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTAAAATGCT:1 + chr3L 4153168 5' - Tc1 372 1 69.44 CGCCGCCCACTTCCAAACAAACAGCCAACGCGCACAGACCTACAAATCTCACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAGGAATAAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTAAAAAAAAACCCAAATTCTAGATA:1 - chr3L 4130490 5' + Idefix 150 2 63.70 GTATAGACACTCAAAAGCAAAATCAAAAAAGGGAGAATGCTATAGTCGACTTCCAAGGCTTTTTGATACTCAGCTAGTGGAAAAGCGATTGGGGAATAAAATGAGCAAATATTGAAAAATTGTTCAAAATTGTGGGCGTG:2 + chrX 20632862 5' - INE-1 253 1 59.29 AGAGCCAAATGTTAAAAGTTATAAATAACTTTTGTTAAAACAGCACGTACCAATTGTAAAAAATGAGATCAGTTCATTATCACACTATAGAACTGCATGAGAGTTCCTATTCCTCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTC:1 + chr2R 1526955 5' + 1360 463 1 78.08 GTTAGGATAAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGGTGACTAAGGACAA:1 + chr2L 21328134 5' - 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Juan 4185 1 58.22 AAAAAATCATGTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr2L 7581051 5' - Transpac 286 2 64.38 AACGGGTATCTGATAGTCGGGGAGCTCGAGTATAGCATTTTGTCTGGTTTTTTATTTACGAAACGAAGGTAAAAAGCAAAATTGTATAATTACGAAAATAAGGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATTAAATAATAATTAAGTATA:1 + chrX 15903347 5' + Tc1-2 392 1 69.86 TGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 - chr3R 27843256 5' - I-element 5298 1 57.53 TGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACCGCAGCTGTGGTCA:1 + chr2R 17796558 5' + jockey 4697 1 53.47 CGTTTCGACGGAATTTTCTTCACCATTTATCTTGTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTAACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2L 15940167 5' + pogo 6 1 76.30 GAGCAGCATCACGTTTTTGTGCAGCAAGTCGGGCCACAACACCAACAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAAC:1 + chr2R 17421689 5' + I-element 5056 1 69.18 GTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr4 373095 5' + pogo 23 1 68.49 ATACTTCAACCTGGAATGTAAGATTTACGCTGAGACTGTGAACAATGTAAACCATTTTTGGATGCCAGTAAAATGAGTCCTCCGTGCTTTTTATTATCAGGGGAATAGGAAAAGTTCATTAATTTTAATTTAATTTATATATTA:1 - chr3R 26156835 5' - X-element 4715 1 77.08 CACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAGATTAATAA:1 + chrX 19074765 5' + mdg1 7076 2 48.78 CTAATTCCTCATTATTCCTTATCACCACATAACGAACACCAAAAAACAAATGCTAACCCACTGAACCCAGGGATCACATTTAGGAAAACTAAATACAACTTCCAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr2L 1419303 5' + F-element 26 1 70.55 TATCACATTTTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:2 - chr3L 10731918 5' + 297 6597 2 69.18 ATGTGGATGTTTTCACTAAAAATATTCGTTGAAAAGTATTAAACAGGCAGAAGGAAGCGATTCCGTTCATAAAACGTATTTCTGATCAGGATTAATAGCCGAGT:1 - chr3R 904201 5' + INE-1 91 1 79.81 GGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCC:2 - chr2L 12984201 5' + hopper 80 1 70.55 TAAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr2R 3563072 5' - Transpac 5184 2 54.48 ATGAAAAAATCGGAAATTTGGATAGGTGGAGACTTATCCAAAAAATGAAGAAAGATTTCTGGGTTAAGTGGAAAAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCAGCTGAAAAAGTGGAAAAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAA:1 + chr3R 19447802 5' + X-element 55 1 53.90 GGGCGTGGAGGAGGCGGTGCCTTTGTCATTTAGAGTCTGTATGGTGAATCTTAACCTTCTAGTTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTA:1 + chrX 13837874 5' - INE-1 118 1 80.70 AATTACGCTCCGCATATTTGCATTGCGCAAATAGCACAGCAGCATAGTGTGCCATAATATCGATTTTGCCCAGACCTGCGAAGTGAAGGGGAGTGGGGGGGGTGGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 20818476 5' + 1360 10 2 74.82 CCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTANNNNTATATGTACATTTCATTANNNNNNATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGC:1 - chr3R 24381385 5' - Juan 4143 1 58.22 AGTGCAGACGCGAACCTTGGTATAGAAACAAACTTAAAAAGATCTTTCCAAAGGAAATTAATTACTGAAGTTCAGTCAAAAGTACTTTTTTTTACTCAATTACGAAACGGGATCGTCTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGT:1 + chr3L 17242502 5' + HB 94 1 89.73 AAACTCTCCAGAAGGTGGAAGTCCTAAACGTGAGGATCGGCAATGAGTTAAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCT:1 - chr3L 15131013 5' - I-element 4955 1 69.86 AACCTAAAGATGATGGAGGGATACCTATTACTGGCTATGTAATAGAAAAAATGGATACCGCCACTGGTAAATGGGTTCCTGCTGGTTCCGGAGATCCAGAAAAATAGAATTGGCCGTCACTAAAAAAGTGG:1 + chr4 753695 5' + 1360 3330 1 77.86 ATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3R 11191408 5' - roo 8995 2 73.29 GTGAGAAAGACTTATGTCGCCTAAGGAGTTTAATTTTAATGTCGTTTTGATTGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGAAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACAC:1 - chr2L 22369286 5' + rover 6973 2 71.23 CAAATAGAGATACAGATACTCTCCAGCCGCGCCGTGATGTTTCTGCTTAGCAGCATGTGGCGATCGACTAGCTGAATAGTCGAATACTTGGCTGTGGTTTCGCTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCG:1 + chr3R 16602585 5' - R1A1-element 5333 1 58.90 GTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGAT:1 + chr3R 30946534 5' + Transpac 5003 2 74.66 TGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGC:1 - chr3L 25482979 5' - accord 7338 2 59.84 AGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 14980312 5' - roo 9009 2 62.50 ATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTTTATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr3L 3501820 5' - Bari1 1648 1 56.16 ATATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCG:2 + chr3L 25255410 5' + INE-1 298 1 65.75 ATTATACTACTTTTTTCCCAAATCGAAATATATAACCTGCTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr2R 15327146 5' - copia 245 1 67.96 AAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3R 14980392 5' + roo 8742 2 71.23 ACCAATTTTGAACCCGACTGAACTCATAGCTGAACTACTTTACCTGGAAGAAGTCCGGAGTCCCCACATCGACACAAGGACCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 - 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chr3R 15363998 5' - flea 4934 1 73.97 ATTTCCGAGAATACTATATATTGAACTTTCAATCAATATGCAGGCACAGCAAGCCCATGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTTCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAA:1 - chr3L 21895733 5' - roo 8716 2 57.55 AAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 - chr3L 24131500 5' - Transpac 5174 2 56.64 GAGTGTTTCTAAAGTTTTCCCAAGTCAAATTTCGAAAAATGGTTCAAAAGTGTGGGCGAGTCTGAGTCTGTAATCATCAACCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTACTGAGAACT:1 - chr3L 27861394 5' - INE-1 149 1 77.39 ATTCCTCTTTTAGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chr2L 13556311 5' - transib2 2791 1 63.01 GGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chr2R 13168648 5' - P-element 2826 1 44.52 GATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGACTCCA:1 - chr2L 15076202 5' + 1360 64 1 59.59 ACGGATGAGAAATGTATCTCAATTCGCCTCAATTCGGCGCTGGATGCCGAGCAAACAACACGCCAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAG:1 + chr3L 16035457 5' + Doc 4235 1 61.64 AACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAATCACTCACGAAGCGAACGGATCTTTA:1 + chrX 17125516 5' - Cr1a 120 1 77.40 GAACGGGGACACGAAAGCGATTTATTGGCAAAAGAAGAAAAATATTAAAATATTTTAAAATT:1 - chr3L 22173805 5' + 1360 3031 1 43.55 CTAACCGGCGCAACCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCCAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr3R 5351481 5' + jockey 4683 1 61.22 ATACATATGCGTATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:3 + chr3R 10931573 5' + 297 6587 2 76.71 GCCTAAATTATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTAT:1 - chr2R 2875241 5' - TLD2_LTR 108 1 68.97 ATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAGTCAGTTCCTCGACTATTAGATATCCGTTACTCAG:1 + chr2R 9237001 5' - INE-1 547 1 74.47 AACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 - chr3R 11040172 5' + Bari1 46 1 54.17 AAGGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:3 - chr3L 11844851 5' + rover 6978 2 63.70 AGAGGGGCGCAGAAAAACGAAGGATACAATCGCACGAAAGTAAGAGCAAAAGGTCAACCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGT:1 - chr2L 12822013 5' + HeT-A 5985 1 54.76 GTTAACTGTTTGGGTAGCTCTCGCTTTTCGACTTTTCGATGGAGTTTTGGGGGTACGGGTATGGGTATGGGTATGGGTACGGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGAC:1 + chr2L 7007701 5' - F-element 487 1 61.65 AGCGGAGGGGAGTGGAGTGGAGCGGTGTGTAGCGCACAAAACTCAAACAACCTGCCCAAGTGACTGCAAATAATTTCCCACCATGCCATGCCACAACGCACCGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 23333589 5' + hobo 17 1 73.97 ACGTATGCTCTATGACAACCAACCTCTCTTGGCTTGATTTCTCGATTCGCCAATCGGATTCAGTTAGCTTTGAACTTTTGCTTTCTCAACCGATCGATTGTTCGAGGTTCGTTATCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTAT:1 - 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Q-element 292 2 46.10 AAGAATGCAAAGACACTTATTCTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chr3L 21769142 5' - I-element 5327 1 59.03 AGAAGTACGATAAAATGGAGAAGATCGGGGAGGGCACCTACGGCACGGTGTTCAAGGGTCGCAACCGCGACACCATGGAAATAGTGGCCCTGAAACGGGTGCGCCATTTGTCGAATGTGCGTGTGATTTTTTTTTGCTTTTTTTTT:1 - chr2R 15571277 5' - gypsy7 5007 4 70.55 GCTTATCATTCGAGTTTAGATTTCCCCTTAAAATAAACTCACTCTCGAAAATGGTTACACCTGTTTAGAGTGGAAATCCTCAACCGTATTGGCGATTTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGC:1 - chr3R 12748737 5' + accord2 167 2 67.97 GCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACG:1 - chr3R 13612562 5' + F-element 216 1 76.00 AAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCG:2 + chr2L 11391460 5' - 1360 61 1 66.19 ATACGAGCGGGTCGACAAGGCAGCCGCGAGTGCGAAAGGAAAGTAAGAAAGCAGAAGGATCCCCAGTAAAATACCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 2534001 5' - 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chr3L 22723971 5' + HMS-Beagle2 29 2 64.38 CTCGTATCCAAAACCTCCATCTGAAAACTTTCATTTGGCTCTTCAGCATGGGGATCGCCTTCCTCAAACGACGAAGCTGGTCGGCTATCGGTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAA:1 + chr2L 3811759 5' + roo 9033 1 63.70 AAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 9870988 5' - roo 392 2 73.97 AAATAAAATTAAATGGAGAATCGCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAA:2 + chr3L 11844665 5' - rover 336 2 76.03 TGGCACGATGGGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAA:1 - chr3R 15942833 5' - hopper 1386 1 66.44 ATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGC:1 + chr2L 6654615 5' + diver 28 2 65.07 GGGTAATTTTTGGATCCAACATGTAATGCAATAAATATTGCTTCGAGGTATATTGTTGCCTTAAGAAAAGTATGGCTAACTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAG:1 + chr3L 19227875 5' - 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hopper 1376 1 52.94 ATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTT:1 - chr2R 5531212 5' + 1360 81 1 57.89 AGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGA:1 + chr3R 19450208 5' + roo 9043 1 51.54 ATGGTCAACTAGAGAACCCCCAACGGCAGCTAATCCACTATAGATATATCTTAAGTCGTTAAGGCCAATCTCTCAAATCTCTCGAGCGACAGGTTGTATCTAAAACAAAATAGGCATAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 9804879 5' + Osvaldo 1520 1 63.16 AATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:2 + chrX 10537819 5' + I-element 26 1 65.75 TATGTGCTGCGCCAGACCAAAAATTGAAATTCTGCAACACGAGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAATCAGCCACTT:1 + chrX 13490597 5' + 297 13 2 76.71 ACAACACTTTCTAAGAGCCAACAAACGACCGACCTCAAACAATCTCACCCAAATCGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACATAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 + chr3L 9056459 5' + I-element 4984 1 78.77 GCATACATAACAACGTATATAATTAATAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - 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chrX 305999 5' - INE-1 145 1 66.67 TTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:2 + chr3R 4679434 5' - hopper2 1563 1 53.42 TTCAATTGTGACAAAAGAGTTTAAATCAATTTGCCATGGACTACAATACTATATTTTAACTATACAATAATAACAAAAAACAATAAAAGCTTTATGCCATGGAAACTATCTACATATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAG:1 + chr3L 5083554 5' + pogo 108 1 67.81 CGCTAACCAAAAAGTTCGATAACGATAAAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGATAACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:2 + chr2R 13931495 5' - P-element 2863 1 71.23 ATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr2L 71154 5' - 412 7514 2 59.40 AAATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr3R 31886823 5' - hopper 1370 1 56.16 AAAACATTTTGTAAAAAAAAAATGGGCGTGGCAGTTATGTTCGGGGAATAAACTTGCTCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGTTTAATTTCAACCTTCTAGCTATTATAGGTCC:1 + chr2R 13770140 5' - INE-1 157 1 53.39 ATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGTAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr2L 19675057 5' + 297 61 2 73.19 AAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:2 + chrX 10537836 5' + I-element 43 1 54.11 TGGACGCAAGGATAGATTCAGATGAAAGAAGAATAGAAAATATTAACATCAGCTGGCTGTTATTAACATTTGCCTTGTCCTGCAACGTATAACAGTTTTCAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 28146070 5' - roo 9052 2 67.59 ACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr2L 9636091 5' - 412 417 2 66.44 GACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr2R 18923776 5' - P-element 2828 1 40.60 AGATTTTCGGGTAAGCGGCGATGAGTAGCTGGGAGCGATATTGAAAAGAAGGAGGGATCCTGATGAAATAAGATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCTACGCATGTGTTAATGCTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACA:1 + chr2L 9783993 5' - P-element 99 1 23.97 CTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chrX 8437662 5' - P-element 2854 1 51.82 GGGGGTTGCCACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 13612931 5' - hopper 148 103 82.35 ATATCAATGAGTTGAATGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 15791005 5' - roo 9010 2 60.00 ACTAGTGTAATTTATGCACGTGTGTTTTTGTATAATTCCGAACTATATATATGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTG:1 + chr2L 13580318 5' - Quasimodo 50 2 74.12 GGGAGAAATATGTACATCCGATATGGGGTCTACTTCACATAGTATGGCGGTTCTGCTGAAGCGAAATTATGATCTGTATTTCTGTATTTCAAATGCTTGCTCAACATACTAAAATTTGTAAATATCATTATTATTACTATTATT:1 - chr2R 14091873 5' - mdg1 46 2 54.86 TAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2R 15326834 5' - copia 235 1 52.74 CTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGTAT:4 - chrX 22460189 5' - HB 1539 1 78.77 AATTTCTTTTTACAACAATCAAAGCGTCGCCCTATAATTATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTAT:1 - chr2L 1927911 5' - Porto1 4281 1 68.14 CCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGAACCTTGCCAAAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATGGTGATCCATCACAAACATT:1 - chrX 18239394 5' + jockey 75 1 57.53 ATAGCACTAAATGCTGGTTGTTGCTGTTGCCGTGTTTTAATTGTGCCTTTTCGTTGTTTTTGTTATTGTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACAT:1 + chr3R 8878494 5' - Tabor 388 2 53.42 TTATCTTAAGTTCGCTGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 27160182 5' + 412 7079 2 63.28 ACTTTTAGACAAAGAGGAGCAAGCAACTAAACTTAAATGTGGGTAAACTTTTTTTTGGTGGAATTTAATTTGTACCAATTTGCAGCTGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCA:1 + chr3R 14966288 5' + Ivk 5114 1 69.60 AGGCTGTGCTTCTCCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:1 - chr3L 5061679 5' + 17.6 6954 1 65.75 ATACATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 - chrY 2720343 5' + gypsy 7002 2 75.34 CTTGGCTATCACTTATCGTTATCGTCATCGTCCGCGCTACTATCGATCGCAGTCGTCGAGCATTTTGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGCGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chr3L 17055542 5' - Tirant 8486 2 58.77 TTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr2R 8157199 5' - mdg1 334 2 78.77 AAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTT:1 + chr2R 8735560 5' - mdg1 7411 2 52.74 TTCCCCGCTTCTCCCTCAAAGGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3R 26774054 5' - hobo 2920 1 66.15 AAAACAGTTGGCCCCAAATCGAAGCCACCGAAAAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3R 9595108 5' + Tirant 13 2 68.00 GGATGTGGAGTACAAGCCGACTGCGCCAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGC:1 + chr2L 23400703 5' + S-element 38 2 59.59 AGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGT:1 - chr2L 1924018 5' + G2 3018 1 53.42 TTAAGAGTAATTCCTAAATTTACAATCTGATGTCGCGAAAGCCCCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGA:1 - chr3L 7357209 5' - Quasimodo 281 2 67.86 TTAATAGGAAATAATTGATTACATTGTTTTTTTTTTTAATTAAAA:1 - chr3L 15431762 5' - transib2 2633 1 84.44 GTGTAGGTCGATGGCAAGTAGGAGGGGCTGTAGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTT:1 + chr3R 10772348 5' - Porto1 231 1 70.37 AGTCGCAGTTCCAATTATAAAGATTGTAAGGCCCTGGGCCATACAAAATGGTGGCCAGTGGTCTGCGGTCTAGTTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTTAGACTAACAGATGTTTA:1 - chr2L 7990054 5' - jockey 4892 1 54.47 ATGCGATTCCCTCAGGAAATCAAATTAACAGAAATACAACGTTTTCATTTTTGTTTTTTTCAAAGCGAACGGTCGGGTTTTTTTGTGCCCTCATTTTTTATTTTATGTAGTTTTTAATATTCTTCTTTAATTATCATTTATTTTAA:1 - chr2R 5555302 5' + Cr1a 88 1 58.22 TTTTTGTTCATTGCATTGCGAAATTTAAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 - chr2L 13844306 5' + Stalker2 7261 2 74.48 CTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chrX 1341603 5' - 412 7514 2 60.27 ATTAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGGCCAAACCAGCCACTTCTATTATTTCAAA:1 + chr3R 4217666 5' + 297 6607 2 64.06 GAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 - chr3R 22000485 5' - hopper 1337 1 70.55 AGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 - chr3L 3501792 5' - Bari1 1620 1 76.71 TTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3R 23067531 5' - roo 9012 2 58.90 CATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACATTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAATATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTTGGTGAAT:1 + chr3L 8627254 5' + pogo 60 1 70.18 AATATTTCCCGCAAAGCACGAAAACGAACAGAAAAAAATGATTGGAATACATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTA:2 - chr3L 5093077 5' + jockey 4893 1 66.44 ATTTTGTCACACAGGGATGTAGTGTATAAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 + chr3R 2308628 5' - 1360 3332 1 62.32 GTACTGCGAACACTGTGAAACATAGAAGCATATGATATTTAGGAATATTATATAATAATATCGTAATATCTACGCTGGAGATAAGTTTGTATAATTTTGCACTAATTTGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCG:1 + chr2R 19258839 5' - G-element 4225 1 66.44 GACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chr3R 20441350 5' + I-element 34 1 60.96 GGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 585722 5' + Tirant 8150 2 58.26 TTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 + chr3R 13875075 5' + P-element 94 1 19.86 CATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chr3R 10931626 5' + 297 59 2 61.64 ATAGGTAGATACTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAAACTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:2 + chr2L 15076071 5' - 1360 3363 1 67.81 GATATGTAGAAATATTATGCAAATTCTATATTCTCTATTTTTAGACTCTTTGTTCGCGATTTCTTCGTTTGCAAAGCGTTTTTTGCACATTTTCTGCCAATAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTCTTAGCTCC:1 + chr3R 12961330 5' + F-element 379 1 67.12 GTTCTATATGTTTGTTCGTTTGCTTTCGTTACGTTGTTCATTTAACCTATTCCTTTTCCTTTATTTTGTACTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTACTTAACGTAATTTTTAGTTTAAAGATTAGGTTTAGGAAAATG:1 + chr3R 24689458 5' + Circe 7051 1 62.76 CACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3L 23287337 5' - 1360 3356 1 43.70 TTTGTATTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chrX 1341759 5' + 412 35 2 61.64 TAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 + chr3R 12242270 5' + transib2 80 1 75.34 AAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGGCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3L 23906459 5' + 1360 59 1 65.35 GACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTT:1 + chr2L 13556339 5' - transib2 2763 1 60.27 GCCTTGAAAGCTGCCTTTCCCTTCCGAAAGAGTTTTTGTCTTCCCTTTTAATAATAATAAATTTCGGT:1 - chr3L 15537420 5' - I-element 249 1 58.82 AACAAGAAGATCCTTGGCCTTCAGCAGCAAACGGAAGTGCTGGCAGCTCGGGATCCTGGCACTTCGGTGCGCTGTTTCGACTACTACATACCGCCCATATTAGGATATAAAGTTAAGGAGTGATTTGGTAAGATTATTTCTTTTT:1 - chr3R 29587940 5' - transib3 2689 1 57.93 TATAATAAAAAAGCTATAATAACAGGCTAGCAAAACGCATGTTCTGAACAGAAATGCATTTATAATTAAGTTGCTCTTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr2R 20226132 5' - jockey 4967 1 76.47 GTGAAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTGCATTTGAAACTAAAGCTA:1 + chr2R 330117 5' - HMS-Beagle2 249 2 61.38 CATGAAAAGTTACTTTTATATTCGATTTTTTACCACTGTCTAAAGTTGCGGTAACAATAATGGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCTCAACGTTTCTCTATTTTCTGAAATTTTTTCATACTTTTACTCCCTAAACTTAAATA:1 - chr3R 4805395 5' - Tc1 1561 1 67.81 AATTTCGTATGCTTTTTTTAGTCCAATCAAAAAACAACTTATTTCGTAATAATCAAAATTAAACCAAAGACACTCGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGAACACGATTTTTCCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr2R 5425347 5' + 1360 60 1 73.29 TGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 30347462 5' - P-element 2869 1 69.86 TAAAGCTGGATGAGAGTAGTAAGCCGAAAAAGGAAAAAACAGGCAAATGTAAGCTGAATGGCAACAGTAAACCCAACACTAAAGCCAAAAAAATCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGTGTTTCGCCAAAACACTT:1 - chr2L 21099764 5' + BS 4932 1 70.55 GATTTTCCATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chr3R 15724259 5' - Juan 4197 1 70.55 ATTTTAATTTATTTCGTTTCTAGGTTTTCAAGTTAAAAAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 9809197 5' + 412 10 2 77.24 ATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 + chr2R 4854994 5' + 17.6 6995 2 75.17 GTGAAAGGATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGAATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAAAATGTTATAACATGTTATTTCAGCATGTTCATGATGATATAACATAAGGTG:1 - chr3R 23295635 5' + P-element 1 2 53.42 GAAGCGACCAGACCAAGTCGCCGCGGGGCAAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAA:1 - chr3R 25764377 5' + I-element 5149 1 75.41 ATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGC:1 - chrX 19038465 5' + hopper 65 1 62.33 AAAAAAAAAGTATTTATAATGATATTTTTTACAATACCAATTATAAACTAATCCACCACGCCCAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTATTTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGAAATCAAAGGC:1 + chr3R 11399826 5' + HeT-A 5995 1 75.34 TCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:1 + chr2R 12472010 5' - transib2 2773 1 52.74 AATATAACAAAAATAAAAATTGTAAAACACAACGACATTGTTGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGG:1 - chr3L 10025448 5' - 297 153 2 71.03 CTGCAGGCGCGGGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGAGCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAG:1 + chr2R 16929765 5' + jockey 4533 1 70.50 AATCTTTATTACCGAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 + chr2L 11298034 5' - I-element 5302 1 58.90 ATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAA:1 + chr3L 13365770 5' + BS 5079 1 73.97 TACAAGAAACGTCAAAAATAACTCTTTAACAATCCTGCGGTTCCCCGAAATAAAAAAACCATTTATGAAATAATCGTATTTGGTTTAATAATTGACGTCCAACGCGCGTAATAAAAATATCTAAAAATCAAGGTCTCGTAACCGGG:1 + chr3L 20732283 5' + gypsy10 422 1 65.75 TCTATAAGTTTCCATTTCGTGCTGGCATCTGGCTTTTACTAGAAGCTCTCCCGCGTCCACTTGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3L 10425900 5' - I-element 5310 1 50.00 ATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:4 - chr3L 3501820 5' - Bari1 1648 1 58.90 AAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATA:1 - chr2L 16539730 5' + Juan 4103 1 63.70 TATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 + chr3L 19454888 5' + mdg1 23 2 68.28 GTACGTAACCGCTTGGGTTTGGCTGGCGATATCGATATTGTAAGCGATTTTGACCCTCTGGTGGAAGTCGCGAATGCGGCT:1 + chr3L 27863555 5' - Quasimodo 7047 2 51.85 ACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAACACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 21933248 5' + pogo 25 1 62.93 TGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAAT:1 + chrX 13134917 5' + jockey 4850 1 77.40 AGGTCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTGTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr2L 12984102 5' - hopper 1374 2 53.42 AACTGGTGTATACCGAATGAGAACAATTTTGCGATTATCCCAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 5151241 5' - roo 328 2 71.92 TGATAGTTGCGTTGACAATTTTTATGCAACCGAAATAAAAGCCAAGGCAGCCCAAAGTATTTTTCCAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3L 22400620 5' + 1360 32 1 48.63 ATTTATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:3 - chr2L 9992091 5' - TAHRE 10425 2 50.68 ACTTTGGATTCCAAGAAAATATTGAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTGGATC:1 + chr2L 22966868 5' + 1360 3160 1 67.21 TTGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCGAGAGCCACGGCCAAA:1 - chr4 1271904 5' - 1360 58 1 75.00 TATATACACGCTGTGTGTTTGCCGGGTGCAAAAGTTTATTTTCGACTTTTTCTTTACTTTTTCTCCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGC:1 + chr2R 22770396 5' - jockey 4706 1 56.16 CAAGAAAGATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3L 1279200 5' - roo 9038 1 58.09 AGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 + chr3L 21996164 5' + Transpac 51 2 56.15 TTTTAATACTTTCTTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTA:1 + chr3L 18768432 5' + S-element 66 1 65.07 AGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 - chr3R 31886936 5' - hopper 1350 1 61.64 TAGAAAATAAAAATTTATAAAATAAAAAAAATATATAAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAAATATTCTAGTTTCGTCTTTGCTTTTCGTTAGAGTTAGCGTGACAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAA:1 + chr3L 932672 5' - INE-1 311 1 57.53 ATTGCAATATGGCAATTGCAGCTCATTAAGCGAAAGAAGCGAAATAAATTAAAATTCAAAAGGTGACACGGCATTAAGCTCAAGGAGCCAAGCACCTTGTGCCAAAGTGTCCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACA:1 - chr2L 12774880 5' + 1360 3138 1 74.66 CTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAA:1 - chr2R 20010651 5' + Juan 4190 1 76.71 CAGCAAAGCAAATATTAATGTTGCAAGCATTAAACGTTCGTTGGTCTAGAGAACAGTTGCAATAAAAGTATACAATTTGGTTAAATACGCATTATGTTATTTTTTTAATCGACATTAAATAGGAATAATTATTAATTATATTATTA:1 + chr2L 13098997 5' - mdg1 45 2 75.34 ATAAAATTAAAAGCAAAGTTTTTAAAAGTTCAAAAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAATAACTCTCACGCGCAAATTTTATTAAAT:2 + chr2R 8861785 5' + TAHRE 120 1 50.00 GTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCG:1 - chr2L 17766157 5' + Doc 244 1 73.97 ATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 - chr2R 18514974 5' + P-element 61 1 41.78 GATATTATTTTACTACAATATATTGGTTATAATGTGATCGTTAATATTCAAACCTGAAAAGCCTACACAAAGTACTAAGTTTAGTTAAATTAGTTGTCCATAATTTTTGAAATATTTTTATTTAGAATTATTATTATTTGCATAAT:3 + chr3L 5502864 5' - P-element 2495 1 60.96 TTTTTCGGGTGGACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chr3R 15054344 5' - copia 228 1 63.70 ACAAGGACGCCCTGTGGTGCTTCCTCCTTGGGAGTCGAGAAAATTGGAAATCTATTCCCATTTCTTCCTCGATTCATTCTCTTCCTCAATTCTGTTTGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGC:1 - chr3L 18984707 5' + hopper 1405 2 67.12 GGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 + chr3L 2544643 5' + Tirant 73 2 75.97 ACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 + chr3R 27765115 5' - mdg1 332 2 78.77 AGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 + chr2L 16539641 5' - Juan 4164 1 52.05 GGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGC:1 - chr2L 15550755 5' + Bari1 47 1 58.47 ATGCCGTAACGATTTTCGCCTATCCAATCCCTGATTCGACGTGGTGGGAAATTGTCGGTGTCACTTGGACTAGCTGAGTATGGGTATAATTAGACTGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3R 2210550 5' - 1360 3367 1 58.22 AAAGGGAAATGTAAACAAAGCATAAAGTTCGATTCTTGAAACACAAACACACAATACATACACACACATAGACCTCACACTCTGCTCTCCAATCCAGATAACATACAAAAACTC:1 - chr3R 15409770 5' + I-element 5132 1 50.88 GTTTTCACCCAAGTGGCTCTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 - chr2R 12472151 5' + transib2 31 1 64.38 ATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3R 19407872 5' + diver 30 2 62.94 ATCGCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGA:1 + chr3L 11844684 5' - rover 7284 2 70.77 GAATATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTTATTTGTGGCGAATGTGGCTATGTGGCGAGTATACAGCTGTGTTCATAACACAGCGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTAC:1 + chr3L 17244978 5' - HB 1580 1 50.68 ACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCGCAATAG:1 - chr2L 7618579 5' + X-element 4474 1 51.37 AAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 23639130 5' + pogo 50 1 52.05 GTACTAATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGTATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:1 - chr2R 18529979 5' - jockey 4945 1 53.42 CCCGCCTCATGATCCTGACCTATTCCGCTCGTCTATGCACGCAGCTGCTCCCAACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCGAAAAACAATGTGCCCAGACACATATGGGCATACAA:1 - chr3L 24880598 5' - aurora-element 4116 1 58.02 ATACGAGAAACAAAACAAAAGCCCCCACAAGCTACAAACAGAAGTGTCAACAAATTGTCAGAATCATATTTGATGTGATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:2 + chr3R 16157263 5' - pogo 2058 1 52.05 AGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTGCAAGCTACGAATAGCACGGTCTAAAAAC:1 + chr3L 18281848 5' + Doc 51 1 51.77 GAAGCTTTTCTTTAGGATTCTCTTAAGCTTTTTAATATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:2 - chr2L 22170029 5' - Juan 4135 1 74.66 AGCACAACAAATAGTGTGCAGCAAAAACACTTGAATTATATTCAATTATTCGCAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTG:1 - chr3L 6943632 5' - blood 103 2 62.07 CACGTGTGCGAACTTTTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr2R 15326813 5' - copia 256 1 61.64 GTATTCATTATGCTGCATTCATTGCCCAAATAAAGCGAAATAATCACTATTTGCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCTGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAG:1 + chr3R 16594022 5' + invader1 182 2 62.33 GGGAGTAACTGTTTCTATAAAATTTAATGTTCCATTGAATGATATTTAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTT:2 + chr2L 22255031 5' + 1360 191 1 57.53 GTTGATAATATCCTAAGCAAAGCTTGTTTAAATTGTTCCTGCTTAACTGAAGTGCACCAAAACTATTAAAAGCGATACTGAATAAAAAACGTGAATTTAAACACTTTTAGCACTAACACTTACCCTCTCCCACATAAAATCTTAAT:1 - chr3L 14679027 5' + Cr1a 314 1 63.70 CTCTGAGCTGAAAACGAATATGATTTTTTCGCGTGCAGGATATGGTTAAATAGAGAATCCCTCTCTCCAGAGTTATCTTGAATTGGTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTT:1 - chr3L 17416069 5' - Quasimodo 431 2 60.27 AAAGAAACGCTTACATTCGCAAACAATTGCACTGAACTTATCGCTCGCTCTCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCC:1 + chr3R 25438374 5' - Doc 265 1 65.07 GATGAATGCAGTAGTAGATATATAACATACAAAATTAAAATATCAATGTGTAACACACTTATTATATATAATAATTTTGTTATTTTAATATTTAAACATCTTGTAAATCCTAGTTTGTTTGAAATAATAATAATAATATAAAAAAT:1 + chrX 11627136 5' + mdg1 7077 2 75.34 ATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGTCAAATAAAATAAA:1 - chr3L 14720905 5' + F-element 79 1 59.59 CTTTGCTTTTCTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:2 + chr2L 7580877 5' + Transpac 34 2 41.78 TTTCATTTGACTTTGCTTCATAGCTATCTTAAAGCTAACAGCACTGAGCACCTATTAACCCCAAACCCTCTTTTCCACTTTGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:3 + chr3R 25433233 5' - transib2 2813 1 78.08 ACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 + chrX 8437656 5' - P-element 2824 1 43.15 CACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:2 - chr3L 23287337 5' - 1360 3345 1 47.95 ATTTTTGGCTTTCTGCTGGCAAAATCGAAACAAATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 13158597 5' - roo 390 2 71.23 AAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chrX 585717 5' + Tirant 54 2 64.46 GTTCTTGGGCAACAATTTGTGTGTGCTATATTAAGTCAAAATTAATGGTAGTGAACATTAAATGCAACTCCGTTGTTTAAATAAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 23320027 5' + roo 8702 2 58.90 ACACTAAAGCGGCGGCACCGGTTTACTTATTAATGCGCCACCTTCGACGTGTCGGCCCTTCGCCCATAAACTCAACTGCAAATAATAATGGCAATCAACAACCGGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chr3R 22288108 5' - transib2 2810 1 72.60 AACCTAATGGTATCAGTACGAATTTTAAATTAAATAGTTGTCGTTACATTACTAGCATTAATTACCATATACATACAAATTTAGTTCGGACGGACTCTTATGCACTGAGGTTTATTATAATTCTATTTTTTTAACATAATTATTAA:1 - chrX 14453538 5' + Cr1a 101 1 67.12 AATTTGAAAAATTACAATGGTAATAAGCACTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 10458941 5' + hopper 143 12 86.00 AAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGC:1 - chrX 22689442 5' - 1360 3361 1 51.72 ACAAATGATTGAATCGTTAGGTATGGACTTGTAGATCTCAGCTACAATGTGTTATTATTATGGAGTGGAAAGCATTTTTAATCATATCAGCCGCGTACTTTTTGGAAAAGTGATTTAAAAAAATTTTAAATTTTAAA:1 + chr3L 11458412 5' + 1360 3035 1 45.99 GTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCG:1 - chrX 22689466 5' + mariner2 44 1 67.81 AATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chr3L 16662368 5' - 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Idefix 153 2 58.90 TATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGAGGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3L 3983937 5' - P-element 2866 1 71.92 AATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:4 + chr3R 15054185 5' + copia 36 2 56.85 TATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTCATT:1 - chr2L 18549941 5' - roo 9038 1 62.60 ATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCG:1 + chr2R 21410884 5' - Burdock 6319 2 69.29 CAAAAGAGTCGAAAATTTAAATAAAATATACATACACCCCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGAT:1 + chr3L 5880902 5' - pogo 188 1 73.29 AATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3R 8075973 5' - 412 7472 2 67.81 AATTTCCCCACGCTAAAGTGATTATGACAGCTAATGAACCAAGCTTCACCTCTGCTTAATTTAAAACCTTTGCACAAAGGTGTGTATTTAGCTTTTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGTAGAAAGTTTGT:1 + chr3R 1706096 5' - diver2 324 2 47.95 ATTCTTACCATCTCAACGTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATT:2 + chr3R 29690668 5' + I-element 5224 1 67.12 CTTGGACTCCATGCCCTTTTAACTGCCTCTTCTATGGCTAAAGTGTTCACTGGTCTTAAGTGAACTACATAAATAATTTATGCGAATGGCTATATTGCTATCTATGTATTCTTATATATATGTACATATGTATGCAGAAGGCATG:1 + chr3R 15119806 5' - Stalker4 232 6 69.66 AAAACATTATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCT:1 - chr3R 2425648 5' - 1360 3323 1 73.29 ACCCCAACAAAAAATCGTTTGTTTGCCTGGCACTGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGTCGAACTAGAAGCGTTGCTATCAGCTCATGGAATGGGGTACAATTAACCGTTTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATC:1 + chr3L 12150395 5' + Chouto 6017 1 76.71 AGAAAAATAAATAACACAAAAAAAAATACACAGAAAAGCTGCAGAAGTTCGCTTAAGCCCAGGGCATTCATCAACGTTCATCATCATCATATCAACGAACTCCTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTCGTTT:1 - chr3L 13893982 5' - Doc2-element 246 1 72.73 CCATTCATTCTAATCCATTAATTCGTGAAATTGCTGCATGCATTAAATATTTATTGGTCACTTGAACGATAAGCAGCAGAATTTGCACAACAAAGCGAATAGCGAAAAAACATGCTCCCCCAATGACACACACAAACAAACAGATT:1 + chr2L 12261018 5' + gypsy3 425 1 54.11 GAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAAAAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAAAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGAC:2 - chrX 22672491 5' - INE-1 568 1 33.56 TTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTAT:1 - chr3R 15942776 5' - hopper 1329 2 78.77 AGTCACCTCCATTCATTCTTAGGTAAATACTAGCTGTATATTCGAGATAAGAGTTCACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCT:1 - chr2L 9128934 5' + mdg3 5167 1 61.64 ATTTTCAAGTTATTTTATAATAAATAACCTTCTAAAAGTCGAACAAAAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 18488326 5' + roo 8686 2 63.70 AGTAAAGGATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGC:4 - chr3L 3501869 5' - Bari1 1698 1 72.60 GGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGGTGCTTG:1 - chr3R 11040164 5' + Bari1 44 1 52.24 ACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 + chr2R 22034644 5' - copia 200 2 57.53 GCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGGGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAATAG:1 - chr3R 27843243 5' - I-element 5307 1 58.87 ACTAAAGCTTCAATTTAAAAATAATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr2R 8157122 5' - mdg1 411 2 76.71 AATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 + chr2R 12472023 5' - transib2 2760 1 61.64 ACATTTAAGCCGCCACACTAACCGCATTTGGGGCTAAAAACCCCCACGAATCCACCGCCATACAATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTTTGTAGTGG:1 + chr2L 10579112 5' - Juan 257 1 54.84 GTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3L 12004253 5' - P-element 2857 1 52.43 CAGGATAACCAGGGTGCAAGCACCCTAGCTGATGCTAACCGAGTACGTCAGATGCAACAGAATTTAAGAAGACTTTGCGATGGTGATGATAGCTCCGAAGATGAAATAATCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTC:1 + chr2L 191763 5' + jockey 4783 1 74.66 ATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 - chr2L 15913324 5' - transib2 2751 1 69.18 CTGTAGCTTGCTGGAACCATCCACACTGAGCTAAAAAAGGAACTTTTTGTGGGACCGCAAAAGCATTGCACCATTTTTTGGGATATCGATAGATTTTGGGAAATGTAATGAGAAAAATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTT:1 + chr4 819302 5' - INE-1 245 1 67.12 ATACAAGGCACACACTCACATGGGTCAACAAACTTGCATTGGGGCTATATCTCTACAATCTGTAGGCTTAATCTCTACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 + chrX 693556 5' - INE-1 159 1 63.54 TGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 7795505 5' + roo 8686 2 64.91 ATGAAGTCGTAAAAGTAGAACTAATCGTTGATATCAAAACAGGTTTCAAATCTTAAACGTAAACAATATTACGTATATTAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTT:1 + chr3L 16152811 5' + Circe 62 2 57.53 GCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 + chr3L 3501716 5' + Bari1 57 1 59.71 CGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 11810610 5' + roo 8701 2 58.90 GACCATAACAGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 13766169 5' - roo 9051 2 69.57 CCTTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:2 - chr3R 26504344 5' - HMS-Beagle 7009 2 63.01 TCAATCAACCAGGGGTTAAAAAGCAAAATGCAACCACTGTGTTGTGTGTGTATTCTTTGTAAACTTTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 + chr2L 128992 5' + jockey 4744 1 54.79 AGTGTCGGTAATCGCCAAAATCCACAAAAAATTTAAGGATTTTTTAAAAAAACGCTCGCTAAACGCATTTCGTTCGTTCACTCACACACAAACATAACCCACCAAAACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGT:1 + chrX 18864104 5' + I-element 4995 1 61.97 AGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCGCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr3L 22890355 5' + FB 23 1 56.07 ACTTTGTAAAAAGGCAAAAATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:2 - chr3L 16470403 5' + jockey 4696 1 67.81 AGTTAACAATTACTTAAGTAGCGCTCGAAAAAAAGCTATTACGACAATTTTCGATCATTCAAAAGTTATACTTTGGGCAGTGTGTACTAACTGTTGACGAATTGTTTTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCC:1 - chr2R 5449938 5' - baggins 5417 1 71.03 ATAAAATATATTATTAAAAACAAATGTATTTGCTGCTCATCTACAAAAGCTCTTACAGCTTAAAGCACTCACAGCTGATCGCCTCATGAAGTTTTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTGGGC:1 + chr2R 3073401 5' - 1360 3361 1 69.18 CTGTTTGCTAATGAAAGTGCAGCAGGATATCCTCGCCTTTCACGCAATGCACCGTATAAGCCGGAGACTTAGGCATGGATATAGATCAGACGAGTTTGAGCTACGGGGACAGTTTTGAC:1 + chr2R 16985745 5' - Quasimodo 373 2 56.30 ATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:3 - chr3L 20898621 5' - roo 342 2 65.07 ACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 9002908 5' - roo 9014 2 55.48 TATTGCCAATATTGAACATCAGACATATATGTAAATAAAACAATAGAGAACGCTATAGTCGGGGAACTCGCCTATCAGATACCCGTTCTTCAGCTAGGGGGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAG:1 + chr3L 24727008 5' - INE-1 502 1 57.64 TTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 - chr2L 6647708 5' + mdg3 85 2 72.60 TAAATGACGGAATAAATTACATACTCGTACTTAGCCTAGGGCATAAAATTCGCACTACTATTAGCTGTTTGGTTTTTGTGTTTGGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGGCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGG:1 + chr2R 7836239 5' - I-element 4907 1 62.07 ATGGTTTCTCGTTTATTTTATTGTTTTTTTTTATTTCCGATTTTTGGCTCGGATTGCATTTAAGCTGCAATCAATTTGTGCTGCACGTGACTTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGC:1 - chr3L 18979529 5' - I-element 35 1 63.45 AGACGCGTCAGTTCTAAAACGCCCAACAACATATCCTTCGTCCTGCCACTTGCTGATATTGCTGTCGCCACCGTTGATGTTTTTTTGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGTGTTTGGGATTGT:1 + chr3L 19571886 5' - F-element 291 1 72.87 AGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 + chr2R 4188971 5' - S-element 1673 1 52.74 CAGCCAGGACATTCGGCCATTCAAGGAGCTTAATGGCTCTGGAAAGCCTGCTCCCCGTGTCGAAAGAGTGAAAGCAAAGTTAAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGTTAAAAAACCAGCAAAGTTAAAATAAACAAAATAAAATA:1 + chr2L 17849725 5' + G7 1146 1 52.74 ATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGTCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTTT:1 - chr3R 905015 5' - rover 7222 2 74.66 AAGAACGTATCATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGCGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 17878657 5' + Doc 46 1 55.48 ATGTATTGCAGCTTTGGTTTCCTTGATGTGCGCAGCATTCAGGCCACTTGCTATCGCGTACTATCGATTTCTGGGCGATAGGGTAATACACTTAAAAAATATACAGGCCGTTAGAGATTTGCGATTTGAATTCTTCAACTTGAAAG:1 + chr3L 2471505 5' - TAHRE 146 1 52.05 ATCTTATACAAGTTTATTGAATTCCCAGCAGCAGTCGTTCGGTCCCAAAATAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAAAAAACAATAATAATAAACAATCTTAC:1 - chrX 8200701 5' + flea 253 2 76.69 TATAACTTTACGAGTGAACATTTTGTTAACTTATTTTTGCGGCCAATACGAAACAAAAGTTTAATGCTTGATTGCATTGCTTGCAAAAAACTTTAATGACAAATATATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr3L 14094527 5' - I-element 5346 1 71.92 CAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGAAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 5389873 5' - roo 9001 2 67.81 ACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 13766185 5' - roo 9036 1 58.39 TAGGGCGATGTCTGGACTGAAAGTCGGTCTACCTACAAGCTCGCTGATTTTTATTGTTATGTCCAGTTGCCTAATCCAGCTCAGCAGCCG:1 - chr2L 19341971 5' + F-element 4491 1 72.22 CAGCTCCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 18514985 5' + P-element 50 1 49.32 ATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 23067521 5' - roo 338 2 65.75 GATGAGGTGCGTACATAGATAGTTTACCAGTTATTCCTAGAAATATCCATCAGCCAAACTCGATACTAATTGGATTTAGAAAACAAGCGCTACTCGAATTAGTGGCTCTATAGGAATATTATTATTATTATTATATTATTATAAAT:4 + chrX 15899069 5' - invader3 5048 4 42.47 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGGACTGCAACTGAGAGCCGAGGAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAAGAC:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 146 2 58.87 AGTAAAAACTAAACCAACAGTGAAAGTGCAGCTACTTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGG:1 + chr2R 330098 5' - HMS-Beagle2 338 2 59.26 AGCTGCGAACTAAAACAAAAAGTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATA:1 - chr3L 6447173 5' - transib2 2812 1 77.40 AATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCA:1 + chr3L 2989940 5' - roo 9028 1 54.84 GCATAGTTTAAGGTACAGACTATATTTCTTGCATAACCGTTACATTGAAAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGATGCAACATATGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTTAAAAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAC:1 - chr2R 16015062 5' - Tc1 51 1 75.34 TTTTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTT:1 + chrX 4808483 5' - mdg3 5466 2 63.01 AATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 + chr3R 23639154 5' + pogo 74 1 67.81 AAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr3R 29612015 5' + jockey 75 1 62.07 TGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr2R 24170001 5' - transib2 2775 1 50.00 AAAATAGCAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:2 - chr3R 19992772 5' - hopper 1392 1 70.55 TCATCGAAGCCCTGACCAGTGAGAATTTATCGCACAAAGCTCTGAACGAGCAGATGGGCCAGGAGCACGCTGATCTTTTGGAGCGTTTGGCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTT:1 - chr3R 19934054 5' - F-element 4336 1 66.42 ATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr2L 4123935 5' - transib2 2793 1 57.58 CTTTATTTATTATTGGTAGTATAGATGTCGGAATGAGATGGAGGAAAAACAAGAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTTAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGG:1 - chr3R 903944 5' - INE-1 512 1 70.63 TCTAAATTTTTTCACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr3R 12242370 5' - transib2 2777 1 52.05 ATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3R 4860426 5' - Transpac 5218 2 68.32 AATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 + chr3R 19224994 5' + HMS-Beagle 63 2 62.07 ATGGGACTTATGCCCGATAATGTGCTCCTCCTTGGCATTTGGCCCCCGGGGCGTTAACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGC:1 + chr2R 6849243 5' + Doc 418 1 54.47 GAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 - chr3R 15942787 5' - hopper2 1533 1 71.23 GAACTTTTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2R 15326822 5' - copia 248 1 55.86 CTTCACTGCTTGGCAATACGCATTTGCACCTAATAATTTGTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTG:1 - chr2L 16539803 5' + Juan 4030 1 78.77 GATTACTGTATTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr2R 5074584 5' + 1360 5 2 68.48 AAATAGAAATTAATGAAACAATTCAGAAACCGCCGCACTATGGGAAATTTACCCTCTTTTTTGGCCAAAACACATTTTATGAATGTCGGTCAATTAAGATAATATTAAAT:1 + chrX 15553057 5' - Transib-N1_DM 439 1 70.00 CAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTAATGAGTCCTATATATACATGAACTTCGCTTTTATTTTTCACTACTTACGTTCACTTAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGACAATTGATCAAA:1 - chr2L 20118831 5' - 1360 266 1 52.74 GCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAACGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGGTTGCAC:1 + chrX 18817297 5' - transib2 2743 1 68.49 CATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 + chr2R 22034645 5' - copia 200 2 57.93 TCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 11062720 5' + roo 49 2 52.05 CATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - 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pogo 2085 1 70.34 GGTTCGTCCTCGGAGTCCTTCGTCCTTTTTCCGTTACCGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTTCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTC:1 + chr3L 21481867 5' - Bica 448 1 78.07 AAAAGCTTTGCCACTGAAATTACTATTCTAATAGGCGCCTTTATTCTATTAAGACAACTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACGAACTCGAAACTTTTGCCC:1 - chr3R 8082537 5' + Doc 341 1 61.74 AACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chr3L 5489902 5' + jockey 87 1 68.49 CACAAATCACTTCGGGAATAATATTAAGCTAATAAGTTTTTTTATTTTTTTATTTTATTTATTTTTGATCATGAGTACCAGAGTATTCAGCTTGCGATGTGTGAGAAATTTATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTCTGTCCGCAC:1 - chr2R 4676328 5' + 1360 460 1 60.27 CATCCTAAGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGTGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATAAGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGG:1 - chrX 14815845 5' + INE-1 99 1 75.34 CTAGCGTCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:2 - chr3L 21769121 5' - I-element 5304 1 52.74 ATGAGCCCAATAACATGGCAATCTAATGACTTAAAGATAGCTAATAGTGTCTGGCTTGTATTTGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTG:1 + chrX 6526220 5' + invader4 2778 2 56.85 ATTCAGGTTGATTAAAAGTATGTAGAAAGCAAGTAAATTAAAGATATTAATACCTATATAATAATATGTAGTGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGT:2 - chr3L 6918016 5' - roo 8600 1 51.37 GAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 - chr3R 11040156 5' + Bari1 57 1 58.27 ATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr3L 21380632 5' + I-element 52 1 52.05 AAAACTTCGAATCCAATAAAGTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:2 + chr3R 4805588 5' - 1360 3345 1 56.16 ANGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 14051740 5' - roo 357 2 52.74 CGATGGGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3R 15942828 5' - hopper 1388 1 66.19 GTGGCATCCTATCCAAACTTTAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGGGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTTTTATAGTTCGTAAGATCTCGA:1 + chrX 19330535 5' - INE-1 146 1 55.48 TAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr3R 556407 5' - Juan 4153 1 75.65 AAAGACAAGAATTTTTCTACTACTGATCTAATTGTACCTGACATACAACACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTA:1 + chrX 3463844 5' + hopper 1386 1 63.20 TATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTAC:1 + chr2L 22121304 5' - I-element 5340 1 47.95 AGTTGGTTCAAATTTAAAGATCTATTCCACTATTATTATAAATGAATTCCAAGTACAAACTGACTTCTTGTTTCTTTTCTTTGTTTTACAATTGCATCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTAGAGAGTTTCTTAAATTATACTTTC:1 + chr4 707386 5' - mdg3 5024 1 54.11 TCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGCAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATAAATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 15790804 5' + roo 19 2 63.64 GGCTATTGCCATAAAGCATTTTTCAATCAAATTAACAGCATGTTAATAGCATAACAGAGACATGCCACTTGCGCATACATATGTATGTGAGTGAGAAAGAAATAAGGGTAGGGTTGACAGATGATATGCAATCTTATATTTCCAAC:2 - chr2R 9279421 5' + frogger 183 1 78.08 AGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTGATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGC:1 + chrX 18742813 5' - invader4 261 2 71.94 AATGATTTGGATCAAGCCAAAAAATGTTTATAACTTTCATTTATTTTAATTATTAACAAAAATACAAGGAACAGGAAGCTTGTTGAGATAGTGTATCAATTTAAAATACAAAGTGTAAATTTAAAAATAAATATAAAAATTTAATT:1 - chr3L 10380057 5' - copia 4657 1 42.47 AAAATGTAATTTGTCTGCCTGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCATTTAAATTCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCGCTCAACAAATCATCG:1 + chr3R 16518850 5' + Tirant 29 2 67.12 GTAATCACTAAGCGTACTTACTGTCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3L 17055388 5' + Tirant 8120 2 75.54 ATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCCCTTCCATTATTTCAA:1 - chr3R 30675485 5' + 297 25 2 64.83 GTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 - chr2L 4713958 5' + transib2 61 1 64.58 GGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCGGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGCGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACTGGCGAAGACCGTAAGAA:1 + chr2R 16929776 5' + jockey 4532 1 71.65 AATTTTAATTGAATGCCTGTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCC:1 - chr3R 905074 5' - rover 330 2 72.60 TTGCACTTTAAAACCTTTTCCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAG:1 + chr2R 12779604 5' - I-element 5313 1 56.16 AAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGT:3 + chr3R 18346608 5' - INE-1 540 1 48.63 ATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAATTAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTT:2 - chr3L 17667614 5' - P-element 177 1 21.92 AAAATTTCTTAAATAAATGCTTATTAAATTTACCTTTAGGAAATTTATGTTTATGTTACCTAATTTAACTACGATAGTCTACCCATTTACTAAAATTATTAATCATTTTTGCGTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATAT:1 - chr4 805706 5' + Tc1-2 1584 1 63.45 CCTGTACTCACAACAAAAACAATAAAAATACACAATAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAA:2 - chr3R 9485864 5' + I-element 5019 1 75.34 ATTTCAATTAGGGGCTGAGTCAATTTGCGTCCCAGCGCCGGTTCAATTGTCGTGAGGCTCGCGGACTAAAATTTATTTGATTTTTTTTTTGTATTTTTTTTTGTTTTTTT:1 + chrX 13732635 5' - gypsy7 5009 2 64.55 AATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - chr3L 21380602 5' + I-element 75 1 71.22 GCAAAACAATTGATTGAAAAACAATTTTAATTGATCACAAATAAAATAGATTGAAAACAGGCAGAATGTCGTATCTTCCCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGTGGCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chrX 12782318 5' - 1360 3375 1 52.05 ACATCCTTGGCGGGCAGGTCGCCGGGAATCGATGTACCATCCTCCGAGCAGAAGCAATCGGGCAGGACGCACACGGCTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCATTTGTCGATCTTCCTTG:1 + chr3L 19702381 5' - Bica 444 1 53.10 GTTAACTTATTTGTATTTGCAATACTTTTGCCAAATTAGATCGTCAGCTTGTGCCTTTTTGCGAGGGTGTGCTGTACATAACGGAAAAGAGGATCAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chrX 1341768 5' + 412 25 2 68.28 TGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 - chrX 19038453 5' + hopper 19 1 54.55 TAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGATAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTTGGGGGCTCCCT:1 - chr3R 27083124 5' + jockey 4550 1 51.92 AAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 - chr2R 23780579 5' + Ivk 58 1 73.39 TTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCG:1 - chrX 23182912 5' + Idefix 72 2 69.86 ATAACTTTACACTGATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chrX 190036 5' - INE-1 543 1 60.96 CATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:2 - chr3R 21630351 5' - I-element 5295 1 60.27 GTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 - chrX 9950602 5' + jockey 4741 1 65.52 AATTACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTG:1 - chr2L 18689247 5' - Gypsy6A_LTR 262 1 75.19 AAGACCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGAAACATAATATGCTTCTCATAT:1 + chr3R 904899 5' + rover 6954 2 70.21 CATAGCTTAAAGGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTA:1 + chr2L 19817753 5' - G4 3815 1 39.04 AAAGCTTAGCTTTATAAAACAATAAAAAAAAGATAATTATATGATTTTAAAGTGTCAATAATTATGTATATATTTTTTCAGACCAATAACAATAGCAATACCGAAAAAAGTTCATGTTTTGTTGTTTTTTTTTCTTATGTTTTGTT:1 + chr2L 15546273 5' - gypsy7 5004 1 77.40 AGACCGCAAGCTGCCCGCAACTCACCCGTCCACTACAACGTCCTAACTTTTGAACCATTTTAAAATTTTATTCCCCAATATCTATCAATACCCCAGAAACATGATAAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAACTGAGTAA:1 + chr2R 7372000 5' + INE-1 533 1 77.86 AAAACGCCAAAACCTTCCTTTCTATGGCGCCTATAAAAATCGGTGGAGCCAACAAATCACGAACATTTTTTTCCCACAGCAGTTATTTTATGCACATGAGTTCTGAATCAAAATTTATGTTAATTACGATTATTAAAACACAGCGT:1 + chr3L 11360916 5' + mariner2 193 1 50.68 TATATCGTTTGTTAATTTTTATGTTTATATTACTTACACCCAACAAATAAAAAATAATCATTATTATCATATTAAGTCATTTTAAAATTTTACTGCCAACAAAAAGCTTAGCATTTATTTTGTTAAAATACTTATGCCGACTAGTG:1 - chr2R 1070166 5' + Tc1-2 1623 2 76.03 TTTCCTCGATGCACTTGTTCATTTTGCAAACTTAAACGAAAATGTAAGCCCTGAGTTGCTTTATATATTTATTTTTGTAGCCAACAAGTCATTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGTCAATAATTTTTATAAAAGCAGCCAACA:1 - chrX 10654037 5' - Cr1a 449 1 50.00 AGGGTCTGAGGCGTTGAATCGGGTTTTTTCGCTAATTAATCCGCGAAAATGTTTACGACTCGGATGTCTCTTCACTGGACGGGTTAAAGGTAACAAGTTCTGGAAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAG:1 + chr3L 18930917 5' - I-element 5345 1 69.18 TTTAGCTCAGTAAAAAATAAAAATATATATTGTTTTCCATAACCTAGACTGCAATATGGAATAATTATATATCCTTGTTCTTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAA:1 - chr3R 17214673 5' + I-element 249 1 55.17 AATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3L 20898615 5' - roo 336 2 69.18 TATATATTTCTGTTCTTATTTTCATAAAGTAATCCTTTTAAATATTTTACTTGCATTATATACGAAAATATTAAAAAAATTGTAAATTGTAAATTGTTTCATATACGTTTTGGTAAAAAATGTAAAATATTTATCTTTATAATAAC:1 - chr3L 10167928 5' - looper1 1660 1 75.34 CGCAGGAGCGCGTCCTTGACCTTATCCTTTACACCGGGCGGCAATGTTCCCGCACTGACCATGTGATCGCACACCAGATCGGTAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAA:1 + chr2L 7234619 5' + 297 6928 2 55.17 CCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 - chr3R 24381405 5' - Juan 4163 1 59.59 ACTAGTCTTGTAAATTTCTATAAATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTA:1 - chr2L 23066895 5' + INE-1 532 1 40.41 TAAAGGAGCTTTAAAAACAGAAGCTAAAGAAACTTTAGAAAAATTATTTTAGATATGCTCAGAGTATGCGATTAGCTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACATAA:1 + chr3R 2556780 5' + I-element 4942 1 55.48 AGGCGGGTTTTTAGAAAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 - chr2L 12251043 5' + 412 11 2 73.29 GGTTCGCGATTTGGATAGGGTTTGAGTTCTCACTATTTGTATGGTAGATAAGTTGAAAAGCGCACACCGACCGGATATCATACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGG:2 + chr3R 3374375 5' + Chouto 5979 1 76.03 AATTAAATAAACAAAAGGTATAAGTCGCCCCAACAACAAATAATAAAAACAAAAAAATTGCAAAAAGTAACACGGAAAAATCGAAAAAAAAAATAATGAAGGGAATACAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTTAAAATCAG:1 - chr3R 18192724 5' + Porto1 216 1 73.97 ACTTAAAACACACAAATCAAGCAAAAGTTGAAAACACAATAACAATTGTTTTGGGACACACCATAAATTTGCATGCCAAGAAGAGTAATGCTCCCAGCCACATAGAAAAAAAAAATTGGTGAAAATAAAACATTAAACTTCTCTA:1 + chr3R 20412860 5' + I-element 469 1 76.55 ACTCTTGTGCGCAAAACACACAATCGTGTACTGTATAGATGGCAATGTCCCAAATCTAATCCAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACCTTTGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTA:1 + chrX 15196588 5' + 1360 237 1 58.22 TAGAAATAAGATATAAATTGAAATTTTTTTTTGGAGTTTCAAGTAAGACTTAAAATTATAAATGATATCATAAAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 3030318 5' + roo 8710 2 50.34 AAGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTA:2 + chr3R 24381305 5' + Juan 4170 1 58.22 AGCGTTCCCGTATTCTGAAATTAAAGGACCATTAGGCTATTATTATTTCTAAGCTATATTTAAATAAAAACAACGTTAAGGCAATTCAAAACAAAAAAATTTGTACATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATGTAGATTTAAAGTCT:1 - chr4 1192217 5' - 1360 245 1 78.08 ATTGAAACAATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 - chr2R 4785330 5' - Juan 4159 1 51.37 CAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAA:2 + chr2R 19199656 5' + hopper 52 1 54.79 AATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 12986527 5' - roo 351 2 57.53 ATTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 8308479 5' - roo 328 2 74.66 TATCTAAATGTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2R 12133890 5' + jockey 20 1 75.17 AATCCAATAAAAAATAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTTTATATATAT:1 - chr3R 24381435 5' - Juan 4193 1 80.14 AAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3R 19073191 5' + roo 8733 2 67.81 CGATAGTTAAATTACAAAACTCGAAAACAACATTAAATAAGTTTAATGTTTTAGTTTTTGTCCAGAATGGTCGTATTCTTTATTTTCCTTTGATATTTCAGTTTTTACTAGAGATGGGATTTTGTATTTTTTTTTTTAAATATTTG:1 - chr3L 11830973 5' - TART-B 10507 2 58.22 TAGATTAAAACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 2145867 5' + roo 8702 2 54.11 GCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 + chr2L 7660914 5' - I-element 5291 1 60.27 GGGCATAATAATTTTATTTTTTCTTTTCGGTCAAGCAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:2 - chr2L 18226907 5' + roo 28 2 65.07 GGGAATGATTTTTCGTGGATTTACTGTTTTGTCTCTGTCAGAAAGCGCCAGTTGTGGAGATTTTTGTAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAA:2 + chr4 464619 5' - 1360 3092 1 54.11 TATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGA:1 - chrX 3431957 5' - Ivk 5315 1 62.76 GGGAAAAAAGTATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 15103757 5' - Transpac 296 2 76.71 TAGGCAAAGAGCATAATCTTCGAGCTTAAACACATAAGCTAAACATTTGGAAAGTTCCACCTTAAATAAAACTAATTGTTCATACGAAATTGATAAAAGCATCAAAGACACAATACCTTGTTGTTGTTTTTTATGTGTGTTTTTTT:1 + chrX 19146425 5' + transib1 7 2 80.14 ATTATGCAATAAATTGTTAATATTAAGCTTTTGAATTTTTATCATATACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAA:1 - chr2R 14653242 5' - 297 6904 2 71.92 GGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1 + chr2R 8735580 5' - mdg1 353 2 67.81 ATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 1135408 5' - P-element 2853 1 57.69 TTATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:2 + chr3R 23639100 5' + pogo 20 1 70.55 ACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chrX 21224564 5' + roo 8750 2 78.62 TGGTAGTTGCATATTTTTTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 + chrX 4808468 5' - mdg3 235 2 76.43 AAAGTAGTCTTAGTTGTCTTAAAATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGTGCCTATATCTTTTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGC:1 + chr3R 4579201 5' + Cr1a 4392 1 77.45 CCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAGAAAGTTAAACACACAGTGTAAA:1 - chr2R 6847822 5' + Doc 88 1 71.92 ACAAGGGAGGGATTCAGGGAAGTGACCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGGACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 15882527 5' + jockey 12 1 74.66 ATGCGAACAGCGTCCTTTTTCCATTTTCACTTCCACCCCCCCGCCATCCATATTCCACCCTTTCAGCCAACGCGTTTTCCCTGCTTTTCCATGTCAACCTCATTTTTTTTTTAATAATATATTTTTAAGGGT:1 + chrX 19042530 5' + hopper 169 1 80.30 AAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:3 + chr3L 14366526 5' - roo 351 2 59.59 TGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 - chr2R 5941447 5' + copia 4914 2 55.48 GCTGCATCATTATAACCAATCCAGCAACAACGGAATAATTCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAAACCAATCCAGATAACATACAA:1 + chr3R 28236715 5' + I-element 5126 1 71.92 GGCAAATGCGAAAATGAATGTGGAAACTTTTCCGCCATCATTTTGAGTGATGTCAATTAGATTGATTTGATCAGCGAAAATATGTGATTTATCAGTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGT:1 + chr3L 12635063 5' - 1360 3219 1 65.07 AAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATA:1 + chr3R 27843179 5' + mdg1 7066 11 71.53 CAATTAATAAATAAATATGAAGCAAAGTTGTATGGAACTAAACATGCGTTTAACTTAGGATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 4217664 5' + 297 6623 2 59.59 ATTTTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTTTTGGAGATATTT:1 + chr3R 19992617 5' + hopper 45 1 54.79 ATAGATTCGCATAATAGCTAATTACTATCATTTGAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGGTCGTGTCTAACAATACGCACC:1 - chr2R 12645559 5' + X-element 16 1 75.52 CTCGAAAAGGCTTTTAGAACGCATTTGCATGGCAGCCGCGGCTGCAAAAGCCGCAACAACGTTTAATTCGCAACGAAAACAGCTCGTCGATCGCGCTTGCAAATATTATATCAAACATTAGCTCTTTATAAAATAAACAAAAAAAA:1 - chrX 15042565 5' + HMS-Beagle2 480 1 69.86 ACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 + chr2L 4123874 5' + transib2 82 1 73.79 CCTATCATTATTTTCATTAGGTTATTAGTATTTGTAGTATTGTGAAAAAAGCTGACAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAACTTATAACTAAGTTTGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCACGATG:1 - chr2L 3122091 5' + invader2 4830 1 55.48 GTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:2 + chrY 2720331 5' - 297 311 2 84.25 TACTATTTAAAACCTTCCTGAACCAGAACTTCTCAAAAGACCAGAAATAATACAAGGATATAGCGACGGACAACAAAACATTTATCCATCTCTAACAAGAAAGACTGAATCTATAGCCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 + chr2R 5437064 5' - INE-1 560 1 50.72 AATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr3R 7420177 5' - 1360 3367 1 66.17 ATGAACATTTTTATTCCATTACTCCATTTTGGTGAAGTAAACTTATTTATTCTAAGGATAAAAATTATTAATAGGTTTGTTTCCTTCACGAATGTCTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAAT:1 - chr2L 16200436 5' - F-element 4641 1 66.44 ATTTCGGTTATTTGTTGTAATTAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 - chr3R 17996284 5' - diver 184 2 57.34 CGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATG:1 - chr3R 23618209 5' + hopper 50 1 61.86 ATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTC:3 + chr3R 19450158 5' + roo 345 2 78.08 ATATGTAAGCTATTTTTAGTCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:2 + chr2R 4854946 5' + 17.6 6958 1 63.70 CTTACCATTCAATTATATTACCACTAAACTATTTAAATAAAACACAACTCGGTATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGTATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGC:1 + chrX 23338839 5' - GATE 367 1 44.83 AGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAATTATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 - chr3R 18971782 5' + Juan 4092 1 59.59 ACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:3 + chr2R 18258761 5' - Juan 4176 1 52.05 AGTAAGATTCCAACTATTGCTTGGAATCCAGAAAAATTGTCTGATGAGAGACAAATTAGAATTGAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAA:1 - chr2R 2884425 5' + 1360 3019 1 77.40 TCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAA:1 - chr3R 24219386 5' - roo 9028 1 54.11 AACAACTTGAATTACTATATTCTACTTAAGATAAACAGATTAGTATTATTATTTTTTTTTTTAATTACTTAATTCCTCGTTGATTTACACAAGCTTAAACTACATGTTTGAGGGTATACCCGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTA:1 - chr2L 9232407 5' - transib2 492 1 79.45 ATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chr3L 6518633 5' - 412 414 2 71.23 AACAGAATTTTATCTTCTATGGAAATTTGAAATATTTTGTACATTCGTTCAGATTGCTGTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTTTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATA:1 - chr3L 2529080 5' + S-element 380 1 64.38 ATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 + chr2L 5069689 5' + flea 29 2 65.75 AATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 - chr3L 3501818 5' - Bari1 1646 1 60.27 ATACAATTGCCAAGAGAAAAAGCAAATGCCATCATCACACTTACTGACGATGAAACAAATGACCAACGCAGCAAGAGCCCAGTCCCCGTGACCGTCAAACTCGTAGTTAGATTTTTTTAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTTTTGTT:1 + chr2R 13208257 5' - gypsy2 407 1 72.41 ATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:3 + chr2R 14653148 5' + 297 41 2 52.74 GCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCT:1 - chr3L 13581706 5' + jockey 4853 1 80.82 AGTTACATATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:2 + chr3R 5768991 5' - roo 9029 1 56.16 GGTGTAGGCAAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr3L 4219564 5' - jockey 4954 1 50.68 TTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:2 - chrX 18396175 5' + roo 67 2 66.44 GCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAA:1 + chr3R 9557525 5' + G2 3037 2 58.62 AGTAATTTTCTGTGGTTATTGGGCGGGAAGAGGGCGGGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr3R 12138401 5' + accord2 217 1 65.66 GCTATTGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:1 + chr2L 17205147 5' + hopper 33 1 63.01 TAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAATAACTTAAATAATTAAAATAATCGCGCTTTGCTTGCCAAAGACTCTCAGGCGCTAAACTAATTAAAATCAAATTTCAAGTGAACAAATAAATAGTTTAAAATTT:1 + chr2L 13268395 5' + HeT-A 123 1 84.93 TAACAAGTCTAATAAAAATATGAAAAGAAGAATCATAAAAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGAAAAATATCCAACAAATTTTAAAAAATGTGGGCGTCGCAGTTTTGGACGGTTTTAGGACGTTAGAGTGGGC:1 - chr2R 21878525 5' - INE-1 218 1 73.97 AATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 15882562 5' + jockey 35 1 58.21 GTTGCAAAGTCAAGAAAGCAGTGGCTGTGGTAGAGGGGTATGAAGAATCAGCTTAACTGAAGGAAAAAAATACACCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTAC:1 + chr3L 18305501 5' + jockey 4827 1 49.32 ATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGCCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr3L 12315850 5' - transib2 2790 1 62.33 ATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 21224661 5' - roo 388 2 66.14 GAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACG:2 + chr3L 1070855 5' - hopper 1341 1 67.81 ATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:2 - chr3R 15072682 5' - pogo 2059 1 55.48 TGTAAGTGTGAGTGAGTGTCCTGGGTGAGGCTGTTACTTTTTTTAGATCATTTGAGCATTTGTTCTTGATAACGTATTACTTCCTACTTTTATTTCATTCATAAATTTGTTAAGCATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTA:1 - chrX 7447219 5' + Tc1-2 365 1 69.18 ATATATATATACATATAGTATATATATAGCGAAATGAAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 24991145 5' - roo 9049 2 43.15 AATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3R 15072668 5' - pogo 2085 1 63.21 TGAAGGGAATTTCCTCATTTCGCTTACTTTTCAATCAGAAAGAGTTTATCCTTCGTGCTTGATGGCCACACCTCCCACCCAACCGACC:1 - chr3R 23248916 5' - Cr1a 4424 1 73.86 CTAGTTGTATTAAAAATAATTAAAACTACAAAAAATATTTTTATTTGTATTTAACATTCATCTTATCGTCCTGCCAGGCAGTAAATATGTAAAATCATGTGAGTTTTGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTG:1 + chr2L 243980 5' + invader4 21 2 65.52 ACAATTATTTAATTTTTTATTTTAAATATTTAATTTTCATTGGTCCTGTAAATTTTTATCGATTTGCAAACAATTTTAAAACCGCCCAAAACTGTCGTTATGAATGTCTATATATCAGGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATT:1 + chr2R 8273493 5' + INE-1 164 1 61.64 TTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGAACCACTCCAACCCCCGAAGAGATA:1 - chr2R 7090690 5' + I-element 7 1 50.91 TATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAA:1 - chr3L 23702281 5' + G4 37 1 56.16 ACCACCACACACTAAACGCAACTGCCACCCACTGAGCGCCACACAAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATGC:1 + chr2R 22279286 5' + accord 185 2 74.44 AGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 - chrX 14450497 5' + hopper 60 1 60.27 AATTTGTAATCGAAAATAGATACTGGAATACTAGATACATAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTAACAAAAATTGCAGATGTAGATGTAAGAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTATT:1 - chr2L 7218851 5' + I-element 484 1 73.29 CTTATCAAAATCAGCTGTTCGGAAGCTGACTTCAAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 10417081 5' + 1360 9 2 78.08 AAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGT:2 + chr2L 10156131 5' - hopper2 1525 1 74.66 ATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr2L 4003808 5' - mdg1 7428 2 59.29 ATTGCTTTTGGCCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTC:1 + chr3R 8051085 5' + jockey 4783 1 69.18 GCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAAT:1 - chr3R 24381406 5' - Juan 4164 1 60.27 GAGTGGCATGGTGGGGAGGGCGGGGGGCCTTGGGGATCGTCTCGCCGTCTGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chr3L 18402934 5' + P-element 23 1 65.47 GTTATCTTATCTACATTTATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACCACTCCCCAACCACACATGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTATGTTGGCGG:1 - chr3R 3389455 5' + Rt1a 4785 1 55.65 CATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chrX 19054273 5' + jockey 80 1 73.48 TTTAAATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACA:1 - chr2R 12253341 5' + BS 4664 1 52.80 AAGAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCTAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAGTTTGAAAGCTG:1 + chr3R 16630236 5' + FB 31 1 62.33 GGCCTCAAAGGGAAAATCACTCTTCAAAACATCCCTAACTAAAACAAGATACAATGCTATAGTCAAGATCCCCGATTATTACATACGCGCTAATCAGTTAGTGTGAATACGAACGAAAATTTTTATAATTTTTCTGGGATATCGAT:1 - chr2L 22759477 5' - INE-1 504 1 63.70 AAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAA:1 + chr3L 16662403 5' - jockey 4908 1 76.71 ATATTAAGGTAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 3920588 5' - roo 9010 2 60.96 AGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGATAAATTA:1 - chr3L 14366624 5' + roo 68 2 62.33 CCATAACAGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTG:1 + chr2R 13766171 5' - roo 9041 1 64.38 CACTTTAAAACCTTTTCCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAATTAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTTGGTAG:1 + chr2R 12779607 5' - I-element 5318 1 55.80 CATTTAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:2 + chr2L 14874111 5' - copia 248 1 54.11 AGGCAAATCAAATATATAGTCAATTTCTAACGATACATGCAAACATATATGGCTGGCACTCAAGATATACATACATATATATATATAAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGT:1 - chr2L 9712187 5' - Circe 7228 2 65.07 TGGCAAGTTGCCTCCCACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGC:1 - chr3R 8049045 5' + Q-element 113 2 66.44 TGATTGCTTACAACCTGTTGCGACTGCTGCTGTTGGTGCTGCTGGTGT:1 + chr2L 240824 5' - TART-B 151 2 60.42 ATCAATATCCTAAGCGGGCGATCTCGCTCCCTAAATAATATAAAAAAATGGCCCCTGTTTTAAACGGCTACCTATGTGGAAAACCAGCTTTTAACATTGAGGGTTGTTCCGGAGGTTTGTTCTCGGTCACCAGAGCCTCTGCTTAG:1 + chr3L 25674197 5' - Rt1b 243 1 30.82 TCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 - chr3R 9298551 5' - hopper2 1533 1 67.81 AAGGATCAGCAGACATTCAATCCCGAACATGGGACCTTTGCCAGCCAAACAGATAGTAACGAACTGAACTATCGCACCAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTC:1 - chr3R 27687447 5' - invader2 4820 1 64.06 TGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGATGACTAAGGACAAAGCCAAGAAATAAAAA:1 + chr2L 14074458 5' - 297 339 2 64.84 TAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATC:1 - chr2L 14025658 5' - HeT-A 6030 1 55.48 CTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCT:1 + chr3L 3501738 5' + Bari1 86 1 76.71 GCAACATGTTGCGGCAGCATGTTTCCGCAGCGGTTTGCTGGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGTATGGAATATATATATGTCGGATCGCGACTCTTCTCACTCCAGAAATAGCTTCTGTGACTTCATATTCTGTT:1 - chrX 18742927 5' + invader4 2795 2 55.56 AACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:1 + chr3L 18505648 5' - I-element 5290 1 60.96 TATTACCCAGTTTTTCTATTACTAGATCATAGACTACGTTCGAAAGTTTTGCAAGACTTTAAGACTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGG:2 - chr3R 7666729 5' - I-element 5299 1 54.11 ATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2R 17796537 5' + jockey 4721 1 51.37 ATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAG:1 + chr2L 11839670 5' + mdg1 78 2 77.04 GACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAAC:1 + chr2L 4123880 5' + transib2 89 1 78.08 GCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGG:1 + chr3L 3501716 5' + Bari1 63 1 61.38 AATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATAT:1 + chr3R 904933 5' + rover 3 2 60.75 AAAAGTATATGAAATTCACGCTAAATAACTGGCAATTATTTTTGGTATTTACATTATTTCTTTTATTTGAACATTCTCTATAAAAGTAAAATCATGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:2 + chr2L 20839509 5' - mdg1 7402 2 58.22 ATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 + chr3L 15913854 5' + jockey 4826 1 64.38 AAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3R 13875080 5' + P-element 97 1 16.67 AAATAACAATTTTTAATTGCCCCGAATTAAATCTGATAGCCTGGCACTTTGCAATTTTATTTAGTTCTCTTACTCGATCTGCCAATTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAT:1 - chr3R 24381424 5' - Juan 4182 1 72.60 AAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAA:1 + chr3L 2989898 5' - roo 385 2 68.49 GTACAACATGCTATTATTTAAAGAATTCTATATATATACATATATATATATATATACAAAAAAAATATATATTGTGCAATAAACAAACAAAAATATGACCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAA:2 - chrX 13264044 5' + Porto1 241 1 56.16 AGTTGTTAAAGAGTTAGAAATTAGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAAACTCCCGAGAGTTAATAAAAAAATTCGCAGTTGGCATTTATAAAA:1 - chr3L 4364156 5' + HMS-Beagle2 467 1 52.74 GCTCTCTCTCTCTGCAATAAAGTTTTATTTTATAACCTCTCCACGGTGCATTTTTATACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATGCCTACTGACTA:1 - chr3R 19755797 5' + G5A 2813 1 78.77 AAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGT:5 + chr4 123929 5' + HB 101 1 65.07 GGAAGATCGATGGACATGATGCCCACGCTTTGAACAATTTATAAATTTCTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTGAGGATATCTCAAAAAAAAAATGATGAAATTTGCGGTCGAATTCACACTAGCTGATTAACGG:1 - chr3L 20033469 5' + INE-1 536 1 58.52 GGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAA:1 + chr3R 9557549 5' + G2 3062 1 75.34 CATTAAGTCAATAAACAGTGACAAAACGTAGAGTGGGCGTAGAAAAAAGTTTTCTTTCAGCGTATCGAAAAAAATTTAAAACCGAGAGCGGTAGAAGTCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGA:1 + chrX 15525874 5' - 1360 3239 1 79.45 CACACACACACACACACACATATCACACATATGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGATTACACTGATGGACGGGAGTGCGACCTGGCCTCTCATCGTGCTCACCTAAGTCATA:1 + chrX 7978953 5' + Rt1b 4965 1 63.33 GGAACATGCGTTTCTGACTCTTTTGTACGAGTGAAGTCCTTAGAAGTTGGCCATGGCTTATACAAAATATTCTAAATAAATAAATAAATATAAAAAAACATAAAAATATAAATTTAATACTCAGCTCGTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 13294768 5' - Bica 341 1 59.31 CATCTCAGCAAAATGTACTGTTTGTGAACATATAAAATATTTCTTATTAAATGGAAAAAAAATACAAATTGTTCAAAAGTGGGCTCTAGAATCAGCATGCATCATCTCAGCCTTTTAGCTTTCATAGTTCCTGAAATCTGGACGTT:1 + chr3L 20870581 5' - INE-1 142 1 45.89 ATACATACAAACATATATACATATCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTACTTTTCCATAACG:1 + chr2R 16731997 5' + 297 62 2 74.48 TTAAGTTTCTGTGTGAGCTCGCTTGATAACTTTGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGGCTTAGGGAATGGCTGTGGGCTAGAAGGATGACGGCCGGGTGGCTGTGGTGG:1 - chr3R 3376861 5' - G2 2864 1 57.14 TTACAATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACGGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGGACTATGTGTGTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTA:1 - chr2L 18549967 5' - roo 9049 2 71.23 AAGTATCTTCTTATTGTACTAAGACAGAGTTCCCACATCATTTATTTTTTAACTAATCATGGCTTGCCTTAATATTGGCAATGTTAAGCATGGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3L 15231743 5' + blood 7037 2 61.64 GTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCACTACATTCA:1 + chrX 21585264 5' + mariner2 275 1 56.92 ATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTCGATTCGTGAGA:1 - chr3L 23940541 5' - Cr1a 4384 1 60.96 CATGCCACTGCGCTGTGCTACCTTTTGTTGCTTGAGTGCCCACACTCGCACACATTCGCACACTCCAACACCAACACACTAGCACACTGACTCGCACACACACAAGCTGTCGTCGTTCTGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr2L 2527785 5' - hopper 1413 2 80.14 GAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCACCTAAACTATTG:1 - chr2L 12984242 5' + hopper 36 1 59.44 CTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1 - chr2L 11357916 5' - blood 7321 1 64.38 TATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr2R 16510122 5' + F-element 94 1 71.03 AAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:2 + chr3R 23639131 5' + pogo 51 1 52.74 AAGTTCGAGATAAATAAACCTAATCTAACAACATTTAAATACAAATTTGAACAAGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 15228655 5' + roo 8708 2 62.75 CCAATATTCCCCTTAAATAAGATTCCATGTTCGGTGTACGTACAGGGTACTTGCCAAAAAATCACTCAAAATCAATTTTCATATACCAGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr2R 19505440 5' + Doc 37 1 52.74 CTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr3R 18093411 5' + I-element 26 1 65.07 ATTCAATTTAGCAGCCCGACATTTTCTTTCAGTGTCATTTATCTGTTTGCTTGTTTTGTGCTGGCGCTTTTCACTTAGCGCCAGGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAG:1 - chr3L 16957908 5' - Transpac 4913 1 50.68 TATAGGCACACTTTATAGGGTGGAGTCCCACAAAACTGATTGAAACGGTGCGGGGGATCAAAGATACTAATGACCATAGGCTCGACACAATGATGAGCATATGCTTGATATGAGTTTATTTTGTTTTAT:1 - chr2L 2435563 5' + transib1 1895 1 15.50 ATCCAAGACAAATAAAATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr3L 10373772 5' - 297 381 2 76.03 AGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3L 18281848 5' + Doc 56 1 56.85 GTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:1 - chr3L 19455015 5' - mdg1 349 2 65.07 GAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1 - chr2R 12472106 5' + transib2 76 1 69.18 ATTTAGCCGCGCAAATTACTGAACAAAAAACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 - chr2R 21160777 5' + Transpac 4965 2 49.32 CGTCATCAGGCGGACAAACAGTGCGCTGTTATCAATCTCGTGTATCTCGTGTATATGTGGATAAATGATGCTATTTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAAAAGGGTCGACAAGATCATT:1 - chrX 16910854 5' - G5A 2650 1 60.27 TTTCGATTAAAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTT:1 + chr3L 24934249 5' + HMS-Beagle2 13 2 76.71 AACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:2 + chr2L 15940223 5' + pogo 75 1 67.81 GGTGAAGTCGTAAAAACTCGAAAACGCGTCCCATGTGATGACCAACTCCTAGAAAATCTTATCCAAATAGTTTATATACCATTTTTAGTTTTTAATGCTTGCTTTACAATATTATTTTAATGTTGTTTATTATATTTTATTAAGTT:1 - chr2L 15741049 5' - transib4 2274 1 88.36 AGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 - chr3L 22744697 5' + FB 88 1 80.69 AAATGTGCCTATTTGTCGCTGGTGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAAGAGCTCAGAGCGTCTGTT:1 + chr3R 28042915 5' - Stalker2 364 2 58.90 ATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACATTTTATTGATTTTTATTTTGTAGTCCGCAAGCGACCGTTTTTTGTAATTGTCCATT:1 + chr2L 14523115 5' - HMS-Beagle2 7146 2 45.89 GAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 4964189 5' + roo 30 2 57.80 ATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGACTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGG:1 + chrX 15200856 5' + 17.6 6999 2 73.29 AAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCCCACTTATATACAGAGAAAAGCTCGAATACTTTTGTATACAAAATAATTGAACTTGTTCGAAAATACAACTTCCGCATAATACCCCAAAAAAAGGACAG:1 + chr3L 25552487 5' + Fw3 66 1 71.20 TAATAATTATTAAGCAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATTCTTCAATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATAGTTTTCTATCACAACACGCACACATATAC:1 - chr4 961609 5' + 1360 3213 1 45.89 AGAATAGAGTGCCAAGATAGCATTTCTTATCCGTACATACCCACAGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:2 + chr3L 21969774 5' - opus 492 2 51.37 TATTGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAAT:1 - chr3R 27843259 5' - I-element 5347 1 57.00 CAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACAGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 - chr2L 12818319 5' + hobo 74 1 65.75 CTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCGGCGCTTTAAACA:1 - chr2L 7618575 5' + X-element 4446 1 62.28 ACTGCCACAGCTACAACCACCGTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTGTTTCTTGGCCCTTTGGTTAACGTATCAAAAACCCAATATAATCACACCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGG:1 - chr2L 15395647 5' - 297 6525 1 61.81 AGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACA:1 - chr2R 5259039 5' - S-element 1534 1 73.29 ATGTGTTTGGCCTGGCCGGGACTGGTGTCGACACTTTCACAACATCCACACTTCCACATCCTCATCGACAGCAACAAAGACATCGCAGTCAGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGAT:1 - chrX 20332486 5' + opus 338 2 65.07 AAAATACCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 17940238 5' - 1360 3371 1 69.86 CAAACATTCCCGTGGTTATTTCATAGTTCAAATGTGTGTGGCATGGGCAAATAAATAATATAGAAAAATTGTTGTTTTATTTCTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 - chr3R 25428252 5' - 297 6911 2 63.01 GGCGGAAATGTATTTATTTCACGCCAGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chrX 19074921 5' - mdg1 415 2 78.08 CTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr2L 71285 5' + 412 47 2 53.42 AATACAGGCGGGGGAAAATAAGGCGAAGGTTGGGGAATTGAAGATATCCTGTAAGCAATGTACTTATAAATATGAGCTATATATTGTCTTGCCACAAAAAATCTAAATATTATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 23612190 5' - hopper 160 1 86.40 GTTTTTTTCTGGTTGGATTGGGGTAATGATTGATGGTCTGCTTGGGGGTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGCTT:1 - chr2L 16770074 5' - 297 6542 2 64.29 GAGAATACGGGCCGCATGAGAGGTCCAATTCGCTTAGGTATGTAAAGTCAAAGTGTGGCATCAAAGTTTAATACCAAAGACACTAGAATATCAAGATGCCTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCATGGCTCT:1 - chr3R 802027 5' + 1360 51 1 73.97 TTGTCAAATGCAAATTAATTTACCGAACGATGCAGCCTGGCCACAGTTTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGAACACGATTTTTTCTAAGCATACAGTGATAGCAGACA:1 + chr3L 23840712 5' + 1360 151 1 60.29 CAGTGGAAAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTC:1 + chr2L 9636026 5' - 412 7535 2 73.79 AAAGCAATTGTCCAAGTTATTCCAAAGTGCCCACAGGCAAAAGACACTCGCATGCAGAGGCAACTGGCAGGACAACTGGCAGAAATGGAAACTACGACCAGCACCGAATCTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACA:1 + chr3L 18614726 5' + 412 7546 2 71.85 TGTTATAGAGGAATAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCAATTTTAAATATCATATATTTTAAACATAATTATTA:1 - chr3R 1847843 5' + Cr1a 100 1 74.66 ATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 20167594 5' - roo 329 2 73.97 GGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr2R 22034637 5' - copia 207 2 52.74 GACTGCAGCCATAATTAAAAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 21216671 5' - roo 394 1 75.34 ACAGTTTTATATATTTAATTTAAAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 8360504 5' + roo 8702 2 59.59 CACAACACACATACAAAACTATCTAAAATGAGAACATTATGCAAAAAAACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCA:1 - chrX 8048495 5' + Quasimodo 119 2 67.12 ACCGCATAAAAGTTTTTCAATTAAGGGCCATGCCCTACTTTGGACTTTTTGCTGAAGCCAACCCACACACACACTCACACAGTAAAGGAAATGATACCAAGGTGACACAAAATTTAGATGCATATTATTATATAACTTATATTGAA:1 - chrX 14400620 5' - Doc2-element 4695 1 56.85 TCACATCAATCAAATTAAACAGTTCGATACAGTAAAACAGCACAAAACAAGAGAGAATGATGTAGATGAGCTCCCCGACTATCAGATACCCGTTGTTAATACCAGTGTGAATGCGAATTTAATCATTTTTCTGAGATATCGATAGA:1 + chr3R 12197972 5' - INE-1 501 1 76.03 GAAAGCGCTGCCTATCTTTTCGAAAAACCTCGGGTAAGCTTTTAGTTACTTTAAGTACAATACATAAGCGGTCCACCCGGGCAGAGATCCACAGTACCCGGGTAAGGCTAACCAGACCAGACTGACGCCACTTGCCCGGACTCTCC:1 + chr2L 22391608 5' - baggins 293 1 74.66 ATAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATTTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTT:1 - chr3R 20068273 5' - Stalker4 6994 4 56.48 TGCCATGACACTCAGAGTCTGAGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACGTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 19266957 5' + roo 32 2 46.83 ATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTA:1 + chrX 13134913 5' + jockey 4846 1 74.66 AATGGAAAATTTTTGTGCAGCCCAAAAAACCAAATGTGAACATAAAGGAAAGGCCGACAGTTCCGATTCTATAACGACTAAAAGTTAGTGACTATCTTCCAACACGCACGCATGTACGCCCGTGTGTGTGAGTATGTGTGTGTGTG:2 - chrX 5081937 5' - accord 190 2 63.70 ATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGG:1 - chrX 1135391 5' - P-element 2833 1 43.61 ATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATACATAAGCCGATCGCGGCGCTTG:1 + chr2R 545173 5' + Stalker3T 145 7 71.90 ACTATATATGTATGTATATACACTCTCCCACAACCACTCTCTATAAATTTTTATCACAATATTTGAGCGGGGAACAAAATAAACTTTCTATGGATCTCAGATGCCTTATCGAAGTGATTGTTTGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 10643267 5' - accord 7034 2 52.11 GCTTTAAATTTCTGGTATACTTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 7889692 5' - roo 9044 1 66.44 TTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACT:1 - chr2R 5206902 5' + G4 3758 1 62.59 TTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:2 - chr2L 16946141 5' - hopper 1364 1 50.00 CCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGTCGCCTAACCGGTCACTCCCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTTCACTCGACATGGTGAAATTTCGCGTTCGCTTTAACACTAGTTGAGTAACGGATATCTGATAG:1 + chr2L 2545706 5' + INE-1 547 1 68.49 ATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:3 - chr2R 14051838 5' + roo 8738 2 76.71 CTCGTGTTCGTTGGCAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr3R 30347279 5' + P-element 28 1 68.28 AATGTGGTTAAGTCTTTTAATATAAAAAGATGCTTTGCGGTTTTTTGAACTAAGCTTAGGACTTGACTTAAAACCTTATTTATTTCGTTAGTCCGTCCGATTCTCGAGTACGGATCACCTGTTTTATGTTCTGACTATAATAAACT:1 + chr3R 8041804 5' + Cr1a 4197 1 57.53 TTATAAAACCATTTTTCCAAATCAACTTGAGACAGATAATAATAATTCATTTTAATTAATCTATTTGAGAATTGATAGCTTCCTATTTTGTTGTATGTTCCTTATTCACAATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chr2R 8192390 5' - F-element 4413 1 73.97 TTAGCATTGCTGACTGGGCAGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGAACAAAGCTAAACCTTGGACCTAGTGGTGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3L 8453716 5' + FB 31 1 60.74 TGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3R 7420293 5' + 1360 63 1 65.47 AAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGAAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 18488373 5' + roo 42 2 56.67 GAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:1 - chrX 8027489 5' + Juan 61 1 57.53 GCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 - chr3L 6447145 5' - transib2 2784 1 58.22 AAAGCAACGCTTCAACAAGAGCAATATTTTAATAACAATACCAATCTTAGTAGGAACTTCAATCACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCC:1 - chr2R 14236352 5' + I-element 4888 1 56.85 AATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 18549963 5' - roo 9045 1 71.23 ACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGGTGACATATATTTCTTCAATTTCT:1 + chr3R 29084887 5' - 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chr2L 18549909 5' - roo 8991 2 71.23 CATTGAAATTTAATACAGCCGTCGGCACAATTCACAGGTTCGGAACATTTAGGCAGACAAAATGATAACTTCGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTG:1 - chrX 7708758 5' - Dm88 4414 2 51.37 AGTCAACAAATTGACATACTCTTTCCAAAACTAAAATACTAATAACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 10909335 5' + hobo 25 1 64.38 ATATGGTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTAT:2 + chr2L 20821170 5' - Burdock 6378 2 58.90 AAACATAAATTGAAATGATAGTTTACAACGGGAAGACCGATAGACAGCAACACACAACAAAAGACAAAAAATAAAAGAAAAAAAAAAACAATAA:1 + chrX 11795711 5' + gypsy7 5012 1 63.83 ACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 - chr2L 14671887 5' + FB 82 1 82.48 GTCTGGCTCGGATCAGCCAGCAGTCTGCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 8308378 5' + roo 42 2 56.85 ATGTTTACAAGCAAACAATACGTGCATCATCATCATCATCGTAGCAGAAAGAAGGAGACGCCAACGTTGCTGTCTTTTTCCTTATTTTTCCTATTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCG:1 - chr2L 12286438 5' - Doc2-element 330 1 82.05 AGATACCAATCAGTTCCGTATGTTTCAAATCAGTTTCTTCTATTGCTTTAAAATTAAAAGGCTTAAACTTTTATCATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3L 8627141 5' + pogo 18 1 31.51 GCCTAGGCAAATGGCGGACCAACAAAGTGGATAGCATTATCCTGGAATGGCAGTAAAGGAGGCACCGATTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCCATCTTTTAGGGTTGT:1 + chr3R 13356820 5' - mdg3 332 1 52.74 AAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCA:1 + chr3R 10270566 5' + Juan 4082 1 53.42 TAATAATAATAATAACGAATGATTTCAGTCAATCTTTTGCGAAATTGGAGAAAATGCAATCGAAAAATAAATGAATTTTTAAAATTTTTTTCAAATTGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAA:2 + chr2L 12010945 5' + invader4 2889 2 67.81 AAGCGGAACGAACAGATCGACAATATTAGAATTGGAAGTGCAGCGAGATAAGTACTACTGCTTTTAATCAGAAAACTACTTGCGGAGAATAAATAAAATATAAAAAAATCTATAAAATTCAAAAAAATAAATAATAAACATTAATA:1 + chr2L 7029240 5' + flea 4998 2 60.96 AATTTTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTTGCAATATACCATAGGAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCTCTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAG:1 + chr3R 15705405 5' - HB 72 1 63.08 ATGACACGTTATCCCAAAAAAATGGGTGATATTTCCGTCAGATTAAGTTTCTGTACTAGTATTGATAGTATTTTATGATAAAAAGTTAGTTTAAGTAAAGAATTTTTCAAAGGGCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTG:1 - chr3R 30185005 5' - Tc1 3 1 78.77 AAAAATAAAATTGTTAGGATATTCAATTATGTCTATTTCAATGGGGGATCACGGAAGTCTCGGTTTTTGATAATAGACCAAACATCCGTCTCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCAC:1 + chrX 19730317 5' + Idefix 7050 2 49.65 AGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGTGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 13766192 5' - roo 9042 1 56.45 ATTGTCAAATATTGTATTAATGAATTGAGATGGAGTCGAGAACAACAAGAACTCGCTGTGGCACATGAAAGGCATAACTTATGCATTGTTAGCATAATAATTTTCCAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCCAAATCAGAAGCGAG:1 - chr2R 22100360 5' + Porto1 223 1 37.67 TAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chrX 10537827 5' + I-element 34 1 60.27 ACACTTTTAAACAATTTTTAAAAATTTTCTCATTTTATTCCCCATAATCTATCGATATGTCCAAAAACTAATAAATTTCTCGCATTTCTACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr3L 24073178 5' - mdg1 7447 2 76.71 ATCCAGATGGAATTATTAAAAAAATCTATGTATATATTTTGCACAAAATTTCTCATCGTTTCAAAGGTAATTCCATATGTGTTGACATTTGGAAATGTAAAAGCTTTTCTATTTATTTTAAAAATTATTTTATTTTTTTTTATTAT:1 - chr3L 17652982 5' - BS 5100 3 84.25 AACGCAGTATTCAAAATTTTTACTAATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATA:1 - chr3L 24535855 5' - rooA 7158 1 43.15 GAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 19032691 5' - roo 9004 2 67.12 TATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2R 15375351 5' + 1360 56 1 52.99 TTCAACATATGAATACCTTATTATTGTGGGATCTGCAACAATCAGCCGAGCAAAGTCCATAACCTCTTTACCATAAGTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTTAAAAAACCAAATTATACCACAAA:1 - chr3L 27350316 5' + I-element 5168 1 54.79 TATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr3L 24486371 5' - flea 224 2 63.64 GACAACACAAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 - chrX 1264064 5' + Burdock 6153 2 68.85 AAATGGCGAACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAA:1 + chr2R 15004724 5' - BS 5068 1 37.93 AATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chrX 19038348 5' - hopper2 1567 2 57.53 AAAGACTAAGAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 18549788 5' + roo 8686 2 67.81 ATAAGCAACGAAACTTCCACCTATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr3R 16342061 5' + P-element 35 1 60.27 TCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - 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roo 328 2 78.77 GCTTAGCTTTTGGCCACAGATAGCGGCTAATGTTAATTGATAAATTTATCAGTTGATTGCGGCCAGATGTTTGGCCAAGATCAGCAAAGATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr3R 17736992 5' - opus 469 2 64.38 CAGCGAGCAAGCTAAGCAACAAAGTGTTCCTATACAGAGCGTTAGTGGTCCCTTCAATGACCTATTGCGTCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCGAATTCCCAATTCAATA:1 - chr3L 23854356 5' + I-element 4982 1 52.74 TAGGAGCATAATAAATTTAAAAGCATAATTTCTACTCTGGGATAATATCAATTATTATTATATTTTTTAATTCTTCTTTATGACCAGATTTCTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTCTGAAAAATT:1 + chr3R 21989334 5' + 1360 424 1 65.07 AGCTTCAATTTCTAAACATAAATTTCAGTGCAATTAATTTCCCGCAGTTCTCAATGAGGACGGAGCATTAAAAATAAAAAAAAAAAGCAAAAA:1 - chr3R 25566005 5' + F-element 4687 5 56.99 ACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 17940207 5' - 1360 3341 1 53.10 ACTATGCACTAACCAAAGTCCCCGACTGCACGTAGATTTCCCAAGCATTTTTATTGGGCATTTCAGGTCAGCGAACTCATCGGAATGAAGGGGATCTGGGTTTTCTGGGGGCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCG:1 - 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chrX 10537986 5' - I-element 5334 1 69.86 GCTTGTTGTGCCTCGTTGTCTCTTATTAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAATTA:1 + chr3L 16438731 5' + F-element 162 1 71.84 AGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGT:1 + chr3R 8051134 5' + jockey 4832 1 70.55 AAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 5389945 5' + roo 8745 2 76.71 TCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 11804747 5' + pogo 43 1 56.16 AATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr2R 3563084 5' - Transpac 279 2 56.30 AGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 18281858 5' + Doc 66 1 62.33 GCCAGTTGTCTGGCGTCTCGATCTGACCACATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCTGACTAATCCAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAA:1 + chr2L 22207133 5' - 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Juan 4196 1 65.75 CATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAATGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chr3R 11937290 5' + flea 30 2 61.42 TATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3R 10931584 5' + 297 17 2 69.18 CGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr2R 24427554 5' + jockey 4725 1 50.00 TATTTATTTTATTTATTATTTATTTATTGTTTGTTAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTG:1 - chr3R 14670427 5' - TAHRE 10408 1 63.01 CGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chr3L 16690886 5' - I-element 5311 1 50.68 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:1 - chr2L 5069689 5' - flea 5000 2 78.77 ACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 - chr3R 5351470 5' + jockey 4742 1 65.75 ACTAAANTTTAAATCGTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr2L 15936741 5' - copia 252 1 59.59 AATCCTTTAAACTTCCATCAAAGAAGGACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCGATGACCAAATGC:1 + chr3R 3376899 5' + looper1 1568 1 77.40 AATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:3 + chr3L 15103791 5' - Transpac 5181 2 53.42 TTAAGAGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:1 + chr2R 9158050 5' - mdg3 179 2 59.59 TAATACTTGATTTAAATAAAAATTTGAAAAAAGTAAAATTTTTGATTTTCGAACATTTTTAAACTTTATTTGAAAATTCATATCTCAAAATTTGGACGTGCGCAAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGG:2 - chr2R 18516192 5' - FB 64 1 76.71 AGGGTTGTCTCGTGGGTGGCGGTGAAAATGGGGAAAAATCGGAAAATCGGAGAGCGACTGCCTTTGTTTTCGAAGAATAACTTTTTGACTTTTTTTTAGATCAATTGAACATTTGTTCTTGATAACGTGTTACTACCTTCTTTTAT:1 - chr3L 14934116 5' + Tc1-2 312 1 55.48 GATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 + chr3R 23618152 5' - hopper 1338 1 76.30 GGAATGGCTAAACAAAAATTACATGTGACCGACCCAAGGGGCGGGGATGAAGGGCCGCTTCTTTTATTTTTCACATCAAGTCAACCAATTACTTA:1 - chrX 727985 5' + Porto1 4621 1 60.00 ATCTTTATTGTATTGTTGTTGCCTAAATCATATGAAGGGAATGTTTTAAAGTTCAGACAAATAGATCATCAAAAATATGCAGACATGGCATTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCC:1 - chr2R 5413479 5' + Rt1a 4973 1 48.63 AAAAGAGAAACAGTAATTCAAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATAAGTATTCATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCT:1 + chr3L 27671027 5' - ZAM 173 2 75.00 CGGGTTGGGAAGCGGGGAATGGCGAACACAGGAAAGCAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGCTGGTAATGAATTGGGATTTAGG:1 + chr2R 16704846 5' - I-element 4985 1 74.48 ACCCATTTGCCAAGAATGAGAATATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAAACTATTCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 + chr3R 903499 5' + INE-1 14 1 71.79 TGTATCAAAACTTGAACCACTAATACATTCAGACAAAAGAAATAATCGAACAACACAATCAGACGAATAATATCTTTGTGATGATTTGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTCTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACA:1 - chrX 22218794 5' - 1360 296 1 49.32 GAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGT:1 - chr2L 18347372 5' - transib2 2749 1 67.81 ATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 20265913 5' - roo 9037 1 61.38 TAATATTATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGGCTTTCGGCCCGTGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGAGGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3L 3983943 5' - P-element 2872 1 71.92 TATTAGATAATATTAAGGGCGTCTATCTGTTGTAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAAAATATTTTGTTACAATGATCTGATCGTGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATTC:1 + chr2L 15936801 5' + copia 4731 1 68.55 AAACCCCCTGATATGTGGAGCTCACAGCGTTCATAAGGACATGCAAACGGACAAACGGACAACGGACGGACAGGTTTAGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGC:1 - chr2L 20435360 5' - opus 286 2 71.77 ACTCAGAATCACCAAAAAGGGTGCTGGCATATTCCACAAACCAGAGAGAATGATATAGTAGAGTTTGGCAACTATCAGATACCTGTAACTCAACTAATGAAAGTGCGAACGCGAAATTGTATTATTTTTCTAGCATATCGATAGAT:1 - chr2L 22191814 5' - INE-1 500 1 74.66 AAACCAGTGGAAAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAA:1 + chr2L 9636022 5' - 412 7538 2 76.03 AGGCGTAGCGGCCGGTTTCAAGCGCAACAGTTTGGTTAGTGCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 + chrX 1135317 5' + P-element 77 1 31.94 AATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:2 - chr3L 19274886 5' - transib2 2759 1 64.38 ATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGATGACGAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAGCACACGCTACTGTATCTGCAAGTCGGGAAACTGGACCATAGC:1 + chrX 23078693 5' + INE-1 567 1 71.29 ATCTTAAACTCCAACCTAAATACTTAAAACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACCT:1 + chr2R 21681272 5' - roo 9042 1 65.07 AAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:2 - chrX 21100296 5' + mdg1 22 2 71.23 TGTTATATATAGAGGGCTTCGTTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTT:1 - chr2R 6622694 5' + S-element 1706 1 65.08 GATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 5151300 5' + roo 8691 2 59.55 CTGCATAATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCAC:1 + chr2L 11391449 5' - 1360 65 1 70.55 GGGTCTGCCAATAAAACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr2R 11159380 5' - roo 9040 1 63.01 TTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chrX 6475305 5' + Doc 74 1 64.38 AGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATT:1 - chr2L 23295876 5' + micropia 5105 4 61.64 ATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:3 - chr3R 30675485 5' + 297 26 2 64.38 AATTGAGCAGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTCGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1 + chr3R 6419798 5' - Tabor 7307 2 70.55 CTCAGCAGATTCAATTAGAGTCGTCACTCCTTGGTCTTTTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTTTTGTGTTTTACTTTATTATTCCACACACAGAGTAGTGCTTTGTAGTAAAGCAATTTAACATTGCCAA:1 + chr3L 4890808 5' - Doc3-element 121 1 69.66 TAATTATAAGATAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 3920579 5' - roo 9004 2 66.43 CCAACATTTAAGCCGGCTCCGAACAGCAACAAGGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 10167395 5' + roo 8712 2 69.44 ATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3L 20898621 5' - roo 9007 2 65.07 AGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACA:1 + chr3R 15942712 5' + hopper 73 1 65.75 CACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAGCCACTTAACGTAGGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3L 18403073 5' - P-element 2837 1 51.72 ACACCGAAATATTTGATTTTGGGCTGTTTTGCAACACTGTCATATATTTTTTGGGGCTTTCCGAAAATTTGAAATTATTTCCAACTGTTCTAAGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAG:1 + chrX 13967514 5' - F-element 4535 1 63.64 TTATATAAAAAGCTTAGGAGCACAAAACAATCTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAA:2 - chr3L 12012779 5' - P-element 2624 1 25.34 TATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGTTAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCT:1 + chr2L 13844134 5' - Stalker2 7649 2 74.77 CCGCTCCGATTTTTTACACTTTTAGTTAAACAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2R 23443780 5' + roo 8753 2 79.45 ACTTTCTTTGCTTCAGGCTTTCTTTCTTCAGACTTATTCTGCGTTCTTTCATGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGC:1 - chr3L 5585634 5' - micropia 5204 1 68.49 TGTTTCGGCGGTAGTTGGAACACGCGATTGGGCCCGAGATCGAGCCGCTACAGGATCGAAAGAGCTAGGGTCGCCACCCTAAGAGGGCTTATTTGGGCATTAATGAAAAAAAAAACTATCAATAAGTGAAAGTTAATTA:1 + chr2R 674931 5' + Doc 4609 1 64.03 CCATAAAAACTGAAAACCATATCGCTATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2R 10411479 5' + 297 15 2 71.54 TACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGC:1 - chr2L 21570252 5' + Dm88 75 2 69.18 ACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 13406392 5' - pogo 2061 1 58.22 AGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chr2L 6647729 5' + mdg3 5299 2 52.71 GAGGAGAAAGGAGGAGAAAGCAGGGCGAGTGCAGCAGACGGCCTTTCTTCTGCGGCAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 - chr3R 22498636 5' + jockey 4720 1 56.15 GAAATGATTTAGATCTGAAATAATTGGATTAAGCGATAATCTATATAGATATAATATAGATATAGATAGATATAGATAATATAGATCTATAGATAGATATAGATAATATAGATAATCTTTAATGCAATTTTAAGGATCCAAGTGTT:1 - chr3L 23212656 5' + Helena 89 1 53.42 GTGAGCACAACATTTGCATAAACCCTACCAAATTTACAATTACATTCAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCA:1 - chrX 16088849 5' + I-element 166 1 61.79 ATGTATCAATTATGTGAACGCAACGCCTTCTTACAACACAAAGCTTCTAAATATATACATATGTACGACATTTCTAGTAATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACCGTAGTCTGGCCGCTGGTAGGAGCGGGGG:1 - chr2L 22173305 5' + invader1 3733 2 50.00 TCCATTTTCCCTTCTGCTTTTGTTCGGCTCCCTTTAGCCATGCATAAATTGTGTAACTGCTTTCGGCCCTTCCTTTGTTAGCCATCCAGAGCTTAACGGTTTACTACTTTCGGACATACATTTTATTTTATTTTATTTCATTTTAT:1 - chr2R 15008825 5' + transib1 1900 1 78.08 AACTACTACTACAACCACGGAGGCCACTACAACTACCACTACCTCGACGACTACAACAACACCGCCACCACCTCCAAGCACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 + chr3L 4275192 5' + I-element 5133 1 60.45 TTAGTCAACAAATTGACATACTCTTTCCAAAACTAAAATACTAATAACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr2R 10909337 5' + hobo 23 1 65.75 ATGTATAAACAGCCTTTGTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 + chr2R 7244761 5' + diver 10 2 78.08 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATACAAAACAAGAATCGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTGACTCTGTTAATCAGTACCT:1 - chr3L 6630130 5' + Q-element 332 2 67.80 CGCTGGTGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:2 + chr3R 28042931 5' - Stalker2 7596 2 54.79 ATGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAG:1 + chrX 10319611 5' + mdg1 66 2 63.70 AATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCC:1 - chr2R 12253337 5' + BS 4689 1 53.42 ATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr2R 21160638 5' - Transpac 294 2 68.29 TGCAGGAGTTTTGAAACTAGTGGCTCGCCCCAAGGACAAAGAGGATAGAAGGATAGAAGCTAGCAAAAGGAAAGGTTGGGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAAATTTACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAA:1 - chrX 1134713 5' + P-element 145 1 48.63 GTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGG:1 + chr2L 14026120 5' + F-element 426 1 72.48 CTGTGAGGCAATTTCAATGTAAATCTGTCGAATTATGTAGGAATAGTTGGAATTATTATGTTTGTATATTTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAATTTATTGTATTTTTAGGGTAG:1 + chr3R 18693135 5' - Stalker4 6976 4 56.16 AACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 2145875 5' + roo 8710 2 55.48 AGTTCTTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:2 - chr2L 21328305 5' + 297 6595 2 76.71 AAAGGATGCAAAATAAATGTAATGGAACTGAGTAGAGTAATTTCTACTCGTCACTCCAAGAGTTAAAGTGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACATGATATACTATATATATTCTTGATAAGGATC:1 - chrX 20461119 5' + INE-1 80 1 47.26 ACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTT:1 - chr2L 23372629 5' - Gypsy6A_LTR 280 1 51.37 TGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 - chr3L 19111589 5' + Doc 84 1 74.66 CGAAACGGAGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr2L 809618 5' + jockey 28 1 65.75 ATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 - chrX 8200335 5' - flea 231 2 69.86 AGCGGTGTTGTAATCGGATATAATTCCTGCTCTCCAGAGAGCAGGCCGCCGGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2R 6588265 5' + jockey 4683 1 59.52 ATTCAATTTATTCTATGTCAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCCGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTT:1 + chr4 611922 5' + 1360 3310 1 75.64 GTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAAC:1 + chrX 5323253 5' + Juan 4128 1 71.92 AAGTAATTAATTTTATAAATGGAAATTTGGCTAAATTTTGAACGTTTGCCAGCTGGCGAGTGTCGAGAAACGGAGGGCAAATATTTATGAGTGGGCAATCATGGACAAAGGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTGGATTTTTC:1 + chr2L 18555888 5' - FB 22 1 67.12 ATGGAGACAGTTCAGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 47234 5' - roo 390 2 72.60 AGCAACGAAACTTCCACCTATAGTTTCGTATCAACGTTATAATTATCGATAACTACTATGCACCCAAGGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3R 16342058 5' + P-element 28 1 62.50 AACAAAAAAAAAATAATTATAATTTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGAC:1 - chr3L 10355064 5' + Stalker3T 70 1 77.93 ATTAACTGTCAAAACGGGCGAGATTCCCCGCCCGGAGGGGGGTGGTTGGATTAAATCAATAACCATGGCAATATCGGTTGTTATTCCTAAGACTTTATGGATACATGCATTTG:1 - chr3L 17456198 5' - G4 3541 1 63.72 GTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1 + chr2L 15936758 5' - copia 240 1 66.36 ACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAATGGAGATATTTGGATG:1 - chrX 14450507 5' + hopper 50 1 52.05 CATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTGTTGCCCATG:1 - chr3R 17673806 5' + FB 58 1 76.64 AGGGGCCAAAACTTCAACTTTGCAACTGCAAATGCCGAATTTATCCAGCGAGTTCTCAATTGTTTTGTACTTTTGGAGAACTAAAATGTTTGGGAGTTGAGATCCTGGAGGCAATATGTGTGTATGTGTGTGTG:1 + chrX 12254552 5' - accord 184 2 58.96 AAATGGGTAAGACGTCCGCCGCACACTCAAACACTCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGATGTGTGCGGAC:1 + chr2R 22514126 5' + P-element 86 1 28.08 TTTAGCTCTCTCACCCACGGTTCGATGGCTTTTCACAATTTAACACCAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr3R 16519033 5' - Tirant 385 2 73.29 ATCGTACTTTCTCGCATACTTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chr2R 19199791 5' + hopper 1 2 66.15 AAAAGACATTCACATGCTAGCGATGGACTTAAAATCTCTTGGGAAACAGAAATTAATTTCCCCACAGTGTGCCGTTGTAGGGCCAGAAAGAAAATCAGTCTTCAGTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 6885457 5' - P-element 2874 1 78.08 AATGCCGACTCCCCCACCCCGCTGTTCCAGTGACAGTTGTACAAGAAATACAAATTTGCAAAATAAGCAGAGGGCCAGGCCAGACCAGACCATTTTGAGATAAATGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCT:1 - chr3L 22485633 5' + BS 4887 1 76.71 AAAACATAATATAAACGTATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAAT:1 + chr2L 20265923 5' - roo 9026 1 52.74 CTCAAAATGTTCCGCCGCTTGAAAACGTTAAATATGATAAGTAAGTACTTGATGGCTAAGGTCAGGTTTTAGGCACTAAACTGGGAACTAAGCGAAAGCACCTCGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAATTCGTGTGCCAAAA:1 - chr2L 20081335 5' - 1360 42 1 74.66 AGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCCTGATGAAATAACATAAGGGGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 3983931 5' - P-element 2861 1 68.97 TTAAACTTGGCGATAGGAATCCGGACTTGCTTGCCTTATATACATTTCCGCTTTCGTCTCAGTTGATGAGTGCATCAAATTAAATAGACCTACAAATAAGAATTTACAAATTATATTATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTT:1 - chr4 1128556 5' + transib1 1899 1 74.66 GGTGTTGTTACATATTTTTTTTCCTCCTTTCCATAGTCGGCATCATTGCGGAGAAAATTACTCACAACGTTTTGACTTCGACCGATTTTCTTGGCTATTACACAGTGTATTAAGCCAGATTCAATATAGCCTTTGATTTT:1 - chr3L 27357744 5' - Tc3 477 1 88.57 AAGCCGTAACTTATATACCCCTTCAGCTAACTTCATATTATTAAAGAACGTTTGGAATTTTTATAAAATTAAACACTCATTTTAGTTTGATTAGTTTGATCATATGATATTATTGTCCAATTAAAAATACTTAAAAAAAAAAACAA:1 + chrX 21117819 5' + TART-B 10629 2 72.60 ATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 23146481 5' + 1360 53 1 61.72 AATTAATTAATAGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 - chr3R 30059490 5' + FB 60 1 59.59 CTGCACTTGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 18488494 5' - roo 9044 1 62.14 GTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chrX 8092486 5' + pogo 63 1 64.38 AATCACTTTTTCTCTCGGTGTACAAAAAGTAAAAAAGTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGA:1 - chrX 17015380 5' + G6 1832 1 67.81 TATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTATAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACG:1 - chr3R 17673814 5' + FB 89 1 78.77 AATTACTGTAATAATGCCGCCCGATTTGAGCCGCGACAACACAAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1 - chrX 1264098 5' + Burdock 6143 2 79.45 CACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr3R 12242236 5' + transib2 42 1 56.85 TTTTACTGTAATACTTTAATACTATCCCTAAAAATTGTATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACA:1 + chr2L 20829436 5' - micropia 5031 2 71.64 AAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGG:1 - chr2R 17878638 5' + Doc 65 1 54.79 AGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGAC:1 + chr2R 2591122 5' + roo 96 2 65.75 AAGTTGACAATTGAAAAAAAAGCACGTTGTGTAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAAGGAGTCTAGCTCCGCATTTTTGAGGAACACAACCAAATGTTTAAGTAAACAATAAAATACGCATAAAAAAGACAATAAAAAGGCCATT:1 - chr3L 23976919 5' - Transib5 364 1 60.27 TGGCCCGGTTTTCCATCGACGATGAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 + chr3L 17275369 5' - Transpac 5206 2 69.18 TAATCCGATTTAGTGCGTTGCCCGCCGCTAGTTTCCCGGATCCATGGTGCACACACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 + chr2L 4724155 5' + Tirant 8180 2 66.91 GAATGTAGCGACATTTGCAACAGGATTTGCCTTCATCGACAGCCAACGCAGATGGCCGTCCTCGAAACTTGAATTTCCATTAGCGGTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2L 5582072 5' - pogo 2070 1 63.01 AAAAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGT:1 + chr4 123927 5' + HB 99 1 66.44 ATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 + chr2L 3675830 5' + Juan 4069 1 50.34 TATATATTTTTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCAT:1 + chr3R 11937248 5' - flea 4763 1 80.14 TTTCTTTTTTCTTATTATTATATCTTTTTTCATTATTCCTCTGTGCTTTTAATTGCGATTCCGATCCTTTTCTTCTAATTTCTTTCAAGTCTCTAATTTCACTAACATTATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chrX 3752368 5' + 1360 9 2 78.08 ATAAGACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTA:1 - chr2R 4270293 5' + gypsy9 28 2 53.42 ATCTATGGGCATGCCGCTCCGGCAGCGGAAATGCTTCACAGAGATTAGCACAACAACATGACAACATGTCAGCGTTTTGATTTACCTGCACAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTT:1 + chr3R 28749009 5' + Dm88 4416 2 66.67 TATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3L 18046614 5' + roo 73 2 69.86 ACTGTGTGACTTCTTAAACTTATAGCTCAGTAGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 16564483 5' + roo 8703 2 60.16 GGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAA:1 + chr3R 9557548 5' + G2 3061 1 74.66 ATTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTAATTTTT:1 - chrX 14771803 5' - Doc 4697 1 77.14 GATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTA:3 - chr3R 15790116 5' + flea 4739 1 64.38 GGTTGTGGCGCTGGCAGTGCTGCCGGCAGCGACGTCGGCAGCGGCTTCCGACCGCTCCTCCCCCTCCCCCCCCCC:1 - chrX 20689789 5' + accord2 222 1 50.67 GGGGGATTGTGCTGGATGTTAGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 + chr3L 16690887 5' - I-element 5310 1 51.37 ATATACTAAAATAGCGCAGTCATTTCAGTCCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGG:1 - chr3R 28662585 5' + jockey 4543 1 77.61 GCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3L 13294902 5' + roo 81 2 73.97 ATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:3 + chr3R 11040067 5' - Bari1 1633 1 69.18 CACAAGGATACGCAAAGAAGGCCAGCGGCAAGAGCTGGGCAAAAACAATTTCAATGGGAATTCAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGGGTGCGTGTTGTG:1 + chr3L 6110155 5' - 1360 3215 1 54.89 AATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGGTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr2L 23381788 5' - flea 244 2 78.08 GCATGTATTTTCAAGTTATTTTATAATAAATAACCTTCTAAAAGTCGAACAAAAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 18488320 5' + roo 8680 2 67.81 AAAATAAGGATTTTCCATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCC:1 + chr3R 15724251 5' - Juan 4205 1 76.03 ACGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 13766315 5' + roo 8712 2 53.42 AAACAGGTTTATTGAACGTGGGATAACAAGTATGCAACAAAAAATAGTGTAATAACGGCTCCAGCTAATATCGCAACCGCATAAAAAAAAAATCCTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 5475370 5' + jockey 4997 1 56.07 TTAAAAGAACGCGCCAACATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTACGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 19332584 5' + F-element 4537 1 72.84 AGACATTTTTCTAAAAATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACCT:1 - chr3R 3286218 5' - Gypsy12A_LTR 1949 1 74.29 TAATAAAGACTAAGAGTAGATATTTAACAGATTGAAGGAGTATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 18549784 5' + roo 18 2 69.18 ATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:3 - chr3R 15790999 5' - roo 339 2 67.12 TGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr2R 13168625 5' - P-element 2849 1 60.27 AATAGAATGCTCATTACCGCATATCAAAGTCCACAGAGTGGAAGCAACTAATTTCGAATTTTGTTTACCGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:1 - chr2R 18529974 5' - jockey 4945 1 50.35 ACAGAAAGTTTTCTTAAATTGTTTTTATCATTATCATTAAGGAATTTCAATACGTCCTCCTTCGTTAAATGGCTCAGCATTTGTATTTGCGTTTCTATCCGACTAAGCGTCGTAAAATATATTCTTATTACTTACACTGCCAGACC:1 - 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chr2L 15076189 5' + 1360 63 1 65.15 AATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTA:1 + chr3R 29084841 5' - 412 494 1 79.07 ATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 2544606 5' + Tirant 40 2 55.64 TGGAGAGTCTGACGATTCAATTGAACTCGTATTAGCTACATTATCGCGGTTGATTAATAGCTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3R 27160167 5' + 412 7112 2 58.22 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAACCACCAGCAAAGCAAAAAAGCAAAGTTAAAATAATAAAAGTTAAACAAAAGAAAAGTTAAATAAAAATAATAAAACAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAAT:1 - chr4 1294990 5' + TAHRE 66 1 58.22 ACAAATATTCAACAGGCATTTGACAGAGTCTGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCT:1 + chr2L 4547372 5' - jockey 4521 1 75.20 GGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:2 - 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roo 355 2 52.74 ATGTGAGGAATGTGTAACTGAGAAACTTTGAATTACTAAGTTGGATTCGTTAAACAAGAAATATGTTCGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCATTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGC:1 + chr3R 28186178 5' - F-element 480 1 54.11 TATTATCATTTGTCTTGCTAATTTGTTTCTTGTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:3 + chr3R 4474949 5' - roo 397 1 76.71 TGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 + chr3L 16690911 5' - I-element 5286 1 67.81 AACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790108 5' + flea 4747 1 58.90 GAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCC:1 + chrX 292390 5' - G3 4543 1 62.96 AAATGCTCTGAAATAATTAAACATAAACATTCTAAGGATTGCTATAAAAAAAAGAACTTTCTAACATACAAACAATTTTTTTAGTTTTAAAAAGGTTCACTATTGTTATAATGTTTTGATTTATAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGC:1 - 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copia 5082 2 68.28 GTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 15790860 5' + roo 76 2 71.53 TTGTAGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chr2R 7244776 5' + diver 25 2 67.81 AGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 - chr2R 22514176 5' - P-element 2824 1 32.80 TTATATAAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAA:1 - chr2R 5508106 5' - baggins 5151 1 24.81 AACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCA:1 - chr3L 18505713 5' + I-element 90 1 80.14 AATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGC:2 + chr3R 27405932 5' + diver 5916 2 65.75 AGTGCTTTGCATTGTAAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTAC:1 + chr3R 24381306 5' + Juan 4171 1 58.90 AAGGCAGATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCCGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATTAAT:1 + chr2L 22107376 5' + Transib-N1_DM 20 1 54.68 ATGGCCTCTAAAATATAAACTAATCGGATGAGACACTTATGCATAGCTACAGGATGTGCTTACAGGATCTTACGAACGAAATTAAATGTTGCCATGTATAACACTTTAGTAGTTTATTATTATAATTATTATTATTATTATTATTA:1 - chrX 6233084 5' - mdg1 7068 8 49.32 GTTGATCGAATTAGTCTTCTGGATATCTCGGGATGAGTAGCTGGGGGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAA:1 - chr2L 9782172 5' - P-element 112 1 46.90 ACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTAAAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGAC:2 + chr3L 23635040 5' + gypsy6 187 2 56.16 ATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGG:1 - chr2L 7618583 5' + X-element 4466 1 55.63 TTTAATTTTTATTAATTATTATTTATTATTTATTTTTTATATATATATATATATATATATTTATTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTCACTTAATTAACTTTCACT:1 - chr3R 21440849 5' - Doc 4616 1 58.90 AATGCCTGTTATATTTATTTTCGTTGCAAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACT:2 - chr3R 905063 5' - rover 319 2 65.07 CATCGCTTTGCCATCAGGTGGAGAAAGGGGTGGCTCAATCAAACGCCTATTCTATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3L 6397604 5' + roo 8663 1 79.85 ATAAGTTGAATCAATTTTTTAATTTAATAAAAGACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGTGATCGGTTGTGT:1 + chrX 14771744 5' + BS 8 1 45.07 AATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGCCATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 14366552 5' - roo 8989 2 76.03 ATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAAT:1 + chr3R 29690694 5' + I-element 5250 1 51.37 GGGCCACGTAAATGCGGATGGAGGACCTTGACTTCCACTTCCTGCGACCGGAAGTGAGCGAGAAAGGCGAAAACGGAATGGCACTAAGCGCCGTCCTTCGAGTTGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGG:1 + chrX 9531414 5' - F-element 4419 1 54.11 CTTTATGGGCGAAGCCAGAAAGAGCACCAACAAAGGCGTTATTTTTAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:2 - chr2R 8099211 5' - jockey 4919 1 69.86 AATATATATTTATAATATAAGTAAATACTTAGTTCTTATTTACGATACAAGAATGTTTCCTTTGATAGGTTTGTATTTCTGGGTTTTATTAAATAATTACAGCAAACTTTGAAAATTTTCAATACATATTTTATTTTTTTTTTTCA:2 + chr3R 19920586 5' + INE-1 467 1 17.12 TAATAATATTTATATATTATAATATTCGCATAATATTTATCGCAGCATCATGTTGCCTCCTATTATGTGTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGCATGGAAGGCCAAGAGGTCCGCAAG:1 - chr3L 23372181 5' + gypsy2 6403 1 64.35 GTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 19032615 5' + roo 8737 2 72.86 GGAGGACTATCCATATTTCAATGAGCTATTGCGACAGTGCACCGATGAATATCCCAATCATAGGGTGTGCTACATGGATGGATAATTTTAATAAAAAGTGTGTAGATGGATGGATAAATTTCATAAAATTATTACAAATTAATAAT:1 - chr3L 11887948 5' - Tc1-2 1371 1 62.33 TGATAATGCAATAGATTATAAAAAGGTAATAAATTCCGGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACTCGAATATATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 18046616 5' + roo 8703 2 52.73 GGCAGAGTTTTGAGCGGCGATTGGATCGCATCGACTTAAGGTCTATTAAAAGTAAAGTATCTGTCCAAGGCACTCGACGACAACAACGCAGTTTGTGTGGAAAGTTAAATACACAAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGC:1 - chr3L 8557848 5' - accord 7025 2 67.12 GACTATCAGATACCCTTAACTCAGTTAGTGAGAGGGCGAGGGTGATGCAAAAACTCTTATTTCGAGAATGCTCACAGTGGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 14402160 5' - roo 9030 1 56.16 ATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCCATGTTTATGTTTA:1 - chr3R 29084962 5' + 412 67 2 73.44 TACTATTTTGTTTCATTTGTAAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 + chr3L 11913146 5' + BS 5012 1 73.29 GAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - 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chrX 22780968 5' + rooA 7577 2 59.59 CATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAA:1 + chr2L 13844159 5' - Stalker2 7589 2 58.22 AATTGATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 + chr2L 6654604 5' + diver 16 2 71.72 AAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTTTTTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 + chr2R 3338784 5' + Juan 48 1 47.76 AGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGA:1 + chr2L 809672 5' + jockey 83 1 66.44 GTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 12004219 5' - P-element 2848 1 60.27 ATACCCATTAGTTGTTGTATTGTAGATTTTGCAATACATGTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 - chr3R 10970378 5' + G-element 23 1 65.07 AAAAGAAACCTGTGTGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr3R 5523878 5' + FB 33 1 63.70 CGACCACTCCCAACCGAGCTGAATAATTGAATGCTGTGCTAATTTAACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr2R 22034797 5' + copia 14 2 74.66 GAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3L 14366530 5' - roo 347 2 62.33 TTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:2 - chr2L 8902506 5' - roo 325 2 74.66 TTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chrX 18010041 5' + 412 33 2 50.00 GTATTGTATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 14366654 5' + roo 8694 2 65.94 TTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 - chr3L 12315808 5' - transib2 2747 1 67.81 GTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3L 2989954 5' - roo 8993 2 72.41 GTATTATATTCCTATTATATACCTACGCTTCAAGTTTTCGTAAACTTTAAAATTGCAAAAAAAAAACGGACTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTA:1 + chr2R 5410899 5' - Tc1 1419 1 74.66 TACATATGTACTTGCTTTTCAGCAAACTGGGTGTTGGCGTGGCCCAGAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chr2L 16274947 5' + FB 60 1 64.93 TAATCATGTTTTGGATTGCACACACGAGCTAAAATTAATGTTAACTACACAGCAAACACACCCCCTACCCACACACACACACACACACACATACACACACACACCCACATTCAC:1 + chrX 9026935 5' + accord 187 2 73.68 AACGGATAGCTGGAAAGTCATGCATTCTGTCAATGAACAAGATTTCAGAAAAACGGGTAAATCTGTCAGAAATTTCAAGTACTTGGCTTCTTGCTGAGCAACGATTAGACCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAC:1 + chr3R 15054031 5' + copia 4882 2 60.96 GTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chrX 18239415 5' + jockey 79 1 66.67 TCCTCATTTATTTATTTTTTTTTATACTATTTGATTCGCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTAAATGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGT:1 + chrX 15626033 5' - I-element 5098 1 73.29 GATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATTTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGC:1 + chr2R 21410847 5' - Burdock 6349 2 53.42 CATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2L 4063914 5' + roo 8747 2 75.34 CTATCATTTGAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 - chr2R 12645535 5' + X-element 43 1 57.53 AAAATGCTCTGAAATAATTAAACATAAACATTCTAAGGATTGCTATAAAAAAAAGAACTTTCTAACATACAAACAATTTTTTTAGTTTTAAAAAGGTTCACTATTGTTATAATGTTTTGATTTATAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGC:1 - chr3L 6837828 5' - 1360 3026 1 80.14 AACCAGCTTGTGCGATTACATCTCGATGAGCCTACAGAGGAATACATTATCACAATTTCTTATTGTTGTATATAGTGCCTTAATTTGTTTTTATATCTTTTTTT:1 + chr3R 30213251 5' - Tc3 1575 1 76.92 TTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2R 17796556 5' + jockey 4711 1 55.56 AAGTATTAATAAGCAAATTTAAAAAGCTGGCAATACCCATATCATAATTTTCATCCATTATGCCCATTGCGTTTGATGTCACATATATACAAGTGAACAAAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACAGTAACGACCTTA:1 + chr3L 20265012 5' + I-element 496 1 58.22 AAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTAACTCCACACTTCATAAATACCTCAATATTCAC:1 + chr3L 23797690 5' + Helena 1194 1 57.24 TCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 + chr3L 15103815 5' - Transpac 238 2 67.12 TTAATTTTAAAGAAATGCAACATTATAAGTGGATTTTGGATATAATAAAGAATAAAACAACAACAAACTGTTATATAATTTATAAAATCAATTTAAGGTCTTGTAACATTATTTTTTTTTTTCTTTTTTAAAAA:1 + chr3L 9703806 5' - HMS-Beagle2 480 4 78.36 ATATCACAGTCCATTCTCTTTTTTCTCTGGCTTTGTTTTTAATACAAACTGCTGCTCATATTGCTAATGATTTTGGTTCACAGTCATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGGCAAAACTGCT:1 + chr2L 11697862 5' + Quasimodo 336 2 69.23 AGGCCTACTCCCGAGCATGATACTCATGTTATGCCTCCTATCGACAATTAACACACAATACCTAGAGTAACCCCTAACACCTAATATTTCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTT:1 + chr2R 4354607 5' + Cr1a 3981 1 64.49 GTTGTTCTTCTGTGTTTTTATATGTGTCCCTTATTTGTTTTTGTTTTTTTATGATTGCGTTTATAATTAGTATTTTTTTTTTTGTAATCTTGGATTTTAGACAGTAAAATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAGGCTTGTTT:1 + chr2L 1937712 5' - HeT-A 5836 1 52.41 TTTAGAAGAGCCGGCCCTTTCTTAATTTATTCATTCAGTCTGACCCCCCCATTAATGCGAGTTATCTATTCGATTGTAATTTAGTTGATTGTTTCAATCTTTTTTTTTTATGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTA:1 - chr2L 17174810 5' - Juan 4022 1 65.07 CTAGGTGGTATCAAAGACACTAGTGTCTTTGGTGGTATATTGAATGTAGCCGCTGCTAACCCTTCAAATGTAATCTTGGCCAGCCGAGTAACTCATTTACGTGGCCATGTCTTATATTTAACAAAACTAACCCTCTAGACCTTCTT:1 - chr3L 22232721 5' + I-element 5099 1 44.52 ATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 + chr2L 15550657 5' + Bari1 58 1 54.79 ATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chrX 8308418 5' + roo 8746 2 74.66 CAATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2L 14074584 5' + 297 6606 2 69.18 CAGTAGAAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTT:1 + chr3L 20189555 5' - FB 249 1 50.00 CAAAGCAAAATTCTGTAAGATCCCTATTTGAAATGCTATTTGCTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAAAAATCGATTTGCGGCCTGGGACGGGAGCCAAAGGGGTGAAATTAAGGAGATTCCGTAATGCACGCTGTGGTTT:1 + chr2R 7349521 5' - mariner2 203 1 55.32 AATTGTTTAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 13294842 5' + roo 8685 2 69.86 AATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr2R 6847840 5' + Doc 70 1 63.01 AGAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAATAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTCCGTCTCCGC:1 - chr2R 17838653 5' + Doc2-element 358 1 72.22 AGTTTAGTTCACTTTCGAACTTTGAGTAAATTTAAAGCGTTTCAAGCTGTAAATGTTTGTACTCATTCTAATTCATTCATTAAGCTATGTAATATCCATTATACATTATTATTATTATTAATTTATTATTATTATTGTTATTATT:1 - chr3R 27151486 5' - mdg1 28 2 57.93 GGAAATATACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGGAGATCGTGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - chr3L 25411888 5' + 1360 67 1 68.97 CGATCGGATGATAGCCACTCTGGGCGGCATCATCAATGGGTCTAAGGTATGGAATTCAACCTGGTCAGGCAATCGGGCAACTTGGCTGATATCTTATTCCATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACTCGGCGCTTCAGCTGTCTT:1 + chr2L 19127347 5' + diver 5910 2 69.18 GAAAGGGGAACGTGTGTTTCTCCAAATGGAGCAGGTCAAAAAACGAATGTGGAAGTCCGAAGAATGATTCAGAAACTGAAAATATACGAATAATTATTATCCTGAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTTGGGCACTGCA:1 - chr2R 9672296 5' + G2 2672 1 63.70 CCCACCATTTAGATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAANCGAGTGTACAT:1 - chr2L 22674862 5' - mdg1 341 2 72.60 GTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTTGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chrX 19054257 5' + jockey 77 1 64.83 ATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:3 - chr3R 18093357 5' + I-element 80 1 70.55 TATGTAAGCGTAAATTAAAATTTACTCTTGAGCTTAGGAATAATTTTAAATAGACTTAGATAAATTAAGATAAATCTAAGTGTAGTGTATGTGTATAAAAAAAAGGGAAAAGTTTAGCGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATG:1 - chrX 5739439 5' + 1360 159 1 79.45 ATTCTGTTATATTTTCTTTCTTGTTTCAAAATGTTAAAAAAAAAAATGTAGCAAACAAAAATGGAATGGTTAAAGTTTTGTATCAGAGTGGGGTGAATACCCCAACTAATTACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTT:1 - chr3L 15093472 5' - 1360 376 1 70.55 AGATACGCAGCTTGTGATACGGGAAGTACGCAGTGGTGCCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:2 + chr3R 23491873 5' - transib2 2743 1 71.92 TACCAGTCGTCGAAGCGATCGGGTGTAAGCGCACTCTCTGTGTAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCG:1 + chr3R 3528008 5' + F-element 192 1 69.18 ATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2L 19675105 5' + 297 21 2 65.75 ATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3R 20441323 5' + I-element 48 1 52.63 GTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chr3R 9595017 5' - Tirant 324 2 72.41 ATCACTAACTACTATTGCTCTCATCACATATCTTTAAAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGC:1 - chrX 20996692 5' - INE-1 106 1 65.55 ATTTTCACCCGCATTGGATTTCAATTTCTGTGCGGTCCGGCAAGGTCACAGCGGCAAGCATTTAGAAAACTTGTAGTATTTTTTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCG:1 + chr2R 20814486 5' - pogo 94 1 54.11 CTACAGAAGCGTCAGAATTTACCGCATTTGAAGACTAAAATCAGTAAGCTTTGCTCGCTGTACATGTGTTGAACCGGTCCTATTCGGTTAATAAAACAGCTCTAAATGGATAGCTTTACTCGCTAAACAGCTGTTGCACGCACAAT:1 - chr3L 24351427 5' - Transib-N1_DM 345 1 63.01 ATTTCATGCAAATAATCCTAGCATCGTCCTACCAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGT:1 - chr3L 6786916 5' + I-element 5215 1 77.24 ATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2L 4063923 5' + roo 74 2 69.18 AGACACACACACGTATAGCTGATAAGTATGTAGGTGTGTTATGTCCTTGTGTTGCGTCATGTGATCTGTCCCCACAACAAGAACACACACTTACAGTTACCCCCGCTTTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCAT:1 + chr3L 2939874 5' + R2-element 3246 1 69.86 TAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr2L 14874162 5' - copia 232 1 54.48 ATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCG:1 - chr2L 12984215 5' + hopper 66 1 62.33 AAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACATATGCTTGCAACA:1 - chr2L 8338226 5' - P-element 2843 1 56.16 ATTGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCT:2 + chr3L 24757194 5' - Cr1a 4260 1 56.16 AAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr2R 3563073 5' - Transpac 263 2 53.42 GAGAACGGGTTAAGTTTTCGAGCGATATATGTATTAGCCGAACTGCGTATTCAATACCGCAGATGCACACAAGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATAAAGTATAAAGTATATTCTTGATCAGGATCAATGGTC:1 + chr3R 4131085 5' + INE-1 87 1 53.42 GTTTTTATATGTAAAGTATTTTAGCTTAATTTAGACCTAAACCATTTTGAACAGCACCTCTCTTGTTTTTTAAAGGTTTTTAAAAGCAACAAAGATTTTATGATACGAACACTTTGTGCCTCCGATTAGTTTTCTTGTGAGGGGAT:1 - chr3L 25115086 5' - Doc 4500 1 62.33 GAAGGAAAAGAGAGAAAATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2R 15652014 5' + hobo 47 1 51.08 CTAGAGGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAAGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGA:2 - chrX 22727599 5' + Ivk 5109 1 50.68 AAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr3R 9595076 5' + Tirant 8176 2 79.84 CTTCAAAAACGGTGCGCATGCTGCCGCCAAAGCGATTGTAGTACTTGCGCAGCGAAGGAACCTCCCAGGTGGGTATATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr3R 10816330 5' - Transpac 288 2 51.37 ATGACTACGCTGTGATGAGCAATCGCCAAACATTTTTCTTTGCCAACCTTTGTCTAAAATTAACTTTTTGCCTATTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAG:1 + chr2L 9193422 5' - I-element 488 1 57.24 ATATGTAAGATATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 19588178 5' - roo 9049 2 68.49 AGAGCCCTATTGCTGGCTCACTCCCACTCGCGTTCACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCTATCCCTCC:1 - chrX 11817408 5' + I-element 5049 1 74.31 CGGGGACCTGAGCGTTATTATAAAGTCTATAATTTAACACTTTTTGCGGTCGATTTTGACGCCGTTGTGGTCGATGCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chrX 4452777 5' + F-element 48 1 47.20 TTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr3L 2544638 5' + Tirant 8150 2 65.38 ATACCCACAGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3L 21969810 5' - opus 7471 2 65.67 ATACAATTGAATTAAAGCATTATGCTTTAATTCAATTGTATCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTT:1 - chrX 13076138 5' + Rt1b 5112 1 63.72 AGTAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 26178353 5' - 412 452 2 54.11 GAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:2 - chr3R 15790129 5' + flea 4726 1 71.92 GATCGAAGCGATAAATAATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGGGTTCTAGGTTGGTTAAGTAACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTCCGAGTG:1 - chr2R 23780668 5' + Ivk 6 1 77.40 GAATTGCTCGGCATGAACTCGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTT:1 - chr2L 10156215 5' + hopper 56 1 56.85 TAGACACAGTTGTGGTTAAAGTTGGGTGATTGGTGAATATTTGATGTAGTAACATTGCAACGCATTGGGATTGGTTTTGATTTTGTTTTTGTTTTGGTTTTTGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCT:1 + chrX 11944308 5' - I-element 5111 1 77.08 CTTTTATCATCATAAAAGTTAGTTCATTATAGTCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3L 8627247 5' + pogo 47 1 69.44 ATTGCGGTTTCATTTGAAATCAAACAAACTCTATTGAAATGTTTTCTAAATAATTTAGCATTTGCGTTTGGCATGGCATTTACTCTATTGTTATACTCGCTGTATAAGCATTCCTTTTCCGTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTT:1 - chrX 10170787 5' + hopper 147 110 63.70 GAGCAATTTGATAACGTTTTAGGCGACCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGACCCGACGGCAAGAGACATCCACTTAACGAATGCTTGCAAGAAGAGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGCATTGAGGCTGAGT:1 + chr3L 12004272 5' - P-element 2795 1 21.23 ACCCTTAAACTTAAACCAATATCTTAATTATACCAGAAAGGAAAATAGACTCCGCAAGCCGAAATACCTTTACAGAAAAGTACTCATTTATTAAACAATTTCTAGGAACATCTCTTTAGCAAATATAAAATGTTGCAAAAAAAAAA:1 - chr2R 5526373 5' + HMS-Beagle2 397 1 51.37 TAATTATTAAATTTATTTATTATTAAAATTTAAAAATTATTTTCATTTATAATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTATTAATTATTTTAAATAATTTTATACATAAAATAATATATTATATAAA:1 + chr3R 20621991 5' + BS4 726 1 35.29 TATAGAATTATATGTTAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTTTTATTAATT:1 - chrX 12129453 5' - flea 240 2 74.66 GCCAATTTGCATTATAATCGGGAGTGGTGACGACTTGACCTTGTCACACTCACACACACTGTAACGGTGGCACAAACACAAGATACACACTCACACAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAATTTTTTT:1 + chr2R 19941641 5' + hopper 130 1 65.07 ATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr3R 21933260 5' + pogo 43 1 59.59 ATTAATTATTCTCTTTAATATATTTAAAAAAATGTTAGTGTGCGCTCCGTGATAGTTCAACGACGACTGACTCTTCGTTTATTCAGCACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:2 + chr2L 16858667 5' - Burdock 6362 2 65.75 AATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:1 - chr3R 15790128 5' + flea 4726 1 71.72 AAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGG:1 + chr3R 23911373 5' - 3S18 117 2 57.53 ATTATCTAATAAAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCC:2 + chrX 8027366 5' - Juan 4206 1 73.29 AGAAGGGGGGCTTTTTCTATCCATGACAATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 13766346 5' + roo 17 2 74.66 TGGTATTTATATTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr2L 17809150 5' - 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chr2L 17280100 5' + Cr1a 4391 1 73.97 ATCTTTCTTCTTCTCAATTTTTCTTTCTCACAGGCATATTGGTAGCGCCGTTCTCATCAGTAAGTATTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCT:1 + chr3R 21327231 5' - Ivk 5001 1 78.08 AAGGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 + chr3L 16690880 5' - I-element 5317 1 47.26 ATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAGAGTAGTCTGAGGGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 - chr3R 30347368 5' - P-element 2791 1 16.43 GGAGAGAGGAGGAGGGGTCAGGGCGGAGAGTCGCGAGTTCAAATGCGTCACAATCTCAATTTTATTCGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3L 4234012 5' + pogo 52 1 56.85 CATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chrX 17678734 5' + flea 4789 2 63.70 AAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:1 + chrX 8027378 5' - Juan 4194 1 65.07 GCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chrX 8437666 5' - P-element 2814 1 36.30 AATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAAT:2 - chr3L 3501802 5' - Bari1 1630 1 71.23 CCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 19266849 5' - roo 8991 2 71.92 TAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1 + chr2L 17809173 5' - jockey 4936 1 54.79 CATTTCTTTAAATATAATTTCAACATTTTTACAGAGCTTAACTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTA:1 + chrX 5816039 5' + mdg1 80 2 70.55 CGTATCCGACATGTTAATATTTACTGTCGTGGATGTGGCTTTTCCTAAATGGACAACAAAGGAAATTTTCGAATTTATAAAAAATTAAATAATTATTAAGTATAACGCTGGAATTTCGTTACAAAATATCATTGATTTATACAAAA:1 - chr3L 16986111 5' + Tc1-2 434 1 59.59 AATGTTTTAATTAGCTAAGAACAATGACTCATTGAAATCGAGAAACATTAAAAATTAACATCTTATTATCATTTTCGACAATAGTAATTAATAACAGCTTAGATAATAGTGTCAAAAAAGATAATAAGATGATTTTTTTT:1 + chr3L 18940754 5' + Transib-N1_DM 59 1 52.14 CTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 2145989 5' - roo 9009 2 58.90 CAAAGTGTTCCCTCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 + chr3R 25709760 5' - hopper 1364 1 53.10 ACAAGATACAAGAAACAAGAAAGATATGCAGTGCCGATGTGCACGAGTACGAGTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTTT:1 - chrX 19328450 5' - INE-1 548 1 51.22 GGTAGAACTCGGGGTTTCCGGTGGATAGGTATTTGTACTTGTTTGAAATATTATGAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTATCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTAT:1 - chr2L 20640347 5' - Stalker4 260 4 73.97 AAGGAGCTGGGTAAGTTGCCAAAACTAATTCGCAGTGCATCAAAAATAGAAAACCAAAGTGCTCGAGAGAGCGAGAGCGGGAGTGGAGGGAGAGAAAAGAAGCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAA:1 - chr3R 11566906 5' + F-element 136 1 73.97 TAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr3L 9269875 5' - copia 238 1 50.00 GTGTCTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTGATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGG:1 + chr3L 28063316 5' - Stalker 6970 4 76.03 AATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 18488389 5' + roo 8686 2 58.33 CATATATATATACATACACTTCTATACATATATATATATATATACATATATATAAATATTATATATTAAATGTTTCCTGTTGCAATCTCTCTTTAAAATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGG:1 + chr2R 10462417 5' - micropia 5101 4 70.55 AAAGTAATGGAATTACTCCAACAATTTCCCCACGCTAAAGTGATTATGACAGCTAATGAACCAAGCTTCACCTCTGCTTAATTTAAATCCTTTGCACAAAGGTGTGTATTTAGCTTTTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAA:1 + chr2R 2034784 5' - diver2 346 2 63.01 GGAGGGGGCTTTGGTTTCTTTCGGGTCTCTTGCCCCAGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCCGACTA:1 + chr2R 5480515 5' + F-element 474 1 53.16 GTGTTCGTTGGCAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGAGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGGCAAAGATGAAATAACAAAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCAGAA:1 + chr3R 30347282 5' + P-element 19 1 66.92 TTTCATAACAAACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr2R 24791014 5' - 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roo 8993 2 73.29 TTGTTTTTCCTTATCTGATTTCTTCGTTATATTTCAATGCAAGTATCCATAAAGTCTTAGGAATAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAGAT:2 - chr3R 6683614 5' + G4 3666 1 56.16 GTAAGGAGAGCTGCTCTGCCAAGTGTTTTGTGTTAGTGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTAGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGGTCATATTGGTTTT:1 - chr3L 14536017 5' - Porto1 4259 1 74.48 CGGAAAATCCAATTAGGAAAATCACACAGAGTCAGCAATTGCACTTTCACTTTTCATATACCTGTTGCACAACCGAGCCGAAAAAGCTGACCAAAGTGTCAAACTTCCTGCTCCGTTCGTCTACAAAAGAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2L 14223577 5' + Doc2-element 217 6 75.17 ATTTGTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 25616481 5' - roo 9036 1 60.96 TAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAA:1 + chr3R 19449981 5' - roo 8756 2 73.91 GATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAATACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATG:1 - 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mdg1 371 2 51.37 AACTCTGATTCGCGATTAGATAAGTGATAAAACAAGTCGCTTAATTAAGAGCTCTTAAGTAATGAGCTTAATGGTTGCCCGTGGAATTCTCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGCATGAAATAAAAGTAGG:1 + chr2L 14272979 5' - Tc1-2 323 1 51.37 CCGTGATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGAAACAT:1 + chr3R 20675812 5' + jockey 4905 1 56.16 TATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3L 6397659 5' + roo 63 2 58.22 GGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 + chr3L 16690883 5' - I-element 5314 1 48.63 AATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:3 - chr3R 9039051 5' - Juan 4187 1 65.75 AATGTGTGAGTATGGGAATGTATCGTTGGTAAGGACTTAATTTGTATTAATTGGTTCACCGCGTTGTTTCAATAGTTCTGACGTAGATATCCTCCTGTTGTCAGAAACCCACATCTCCTCCCAGTCCAACTTCAGGCTCTATGGCT:1 + chr2R 6767842 5' + G5A 145 1 56.16 ACATACATATGTAGTACATAAACGCAAATAGACAAAGCCCGGGAGAACGCTATAGTCCAGTAGTGCAAATGGTCAAGAAAACTCAAAATAAATAAAAAATAATTCCTGGGATCTCGACGTTTATA:1 - chr2L 174231 5' - INE-1 138 1 80.80 ATTTCCATTTCCACCTCGTCTTAAAGTCAAGCCGCAGAATCTCTTTTCTCCCAGGGCAAAGACTCGGTGTTTGGCCTTAATGAAAACTCACGCTTTAACAACCGCCACACATCCAAATCCTTTTGCAAGAAGACTTATTCGAGTAT:1 + chr2L 12962078 5' + Doc3-element 4540 1 74.66 CTCGACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr2L 15188478 5' + 297 6623 2 57.53 TTCTAATTTGGCAAACGATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 4470516 5' + hopper 147 105 70.00 AATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr2R 16510092 5' + F-element 52 1 46.62 AAAGACATCACAAGTTTAAAATCATCACTGTCGCCAAAGTGGGGGGGAATATATTGTAGATCTCTGGATGTGTGTGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAA:1 + chrX 1799099 5' + invader4 2798 2 58.90 TATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGAGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGAACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGG:1 + chr3R 9557513 5' + G2 3026 1 49.32 TATTAACTACAAATAACAATCACATGGATATTCTGAAAGCTGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATG:1 - chr3R 19031195 5' + F-element 183 1 73.39 TTATAATAAGATGCGCCATATCATTTCGCCTTCACATTAGCTGATTAACGGGTATCTGATAGTCCTTGAACACGAATATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr3R 32038212 5' + INE-1 580 1 70.53 CTTAAAAGAAAAAACTAAACCAACAGTGAAAGACCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGAAAATAATTACAGTTTATTGTT:1 + chr2R 330092 5' - HMS-Beagle2 309 2 72.73 AGAAGAAAATGTGGCACAAGGGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:2 + chr3L 16690863 5' - I-element 5334 1 58.22 CGACTATTACGCATACGCCACGTAGCCAATACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCTAACTTGAGACAAACACCGATGACAG:1 + chr2L 16711673 5' + Porto1 4489 1 60.00 CAGTTGTGTGTATATTAAATTCGTTGAATGGTATGTAAATGTCAGTTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAA:1 + chr3R 15880998 5' + copia 228 1 68.28 TGTAAATTGTTCCTTAAAAGAGAAGGGAATTTTAATGTTAAAAAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 + chr3R 18971655 5' - Juan 4204 1 69.18 ATCTTGAGTTTAAAGTGTTACTTTTAGCTTGCTTTAGAAAAAAAGGGCGCGAAATTTTGTCCCCTACCCAAGTACATTCGATGT:1 - chr3L 21769374 5' + G2 2973 1 69.05 ATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTT:1 - chr3L 14094687 5' - I-element 47 1 62.61 ATCTCATTGAATCGTGCGGGGAGCAAAGTTCAATGTCCCACCGGCTTAGCCTTGTCCATTTTCTATTGTTCGTCTGGTGCATTAGTCACACAGTAAAATTTTATCTTAAAAAATAAATAAAAACATTTAAATA:1 + chr2L 16570535 5' + Transib5 26 1 66.92 ATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:2 + chr3R 15724281 5' - Juan 4175 1 55.48 ATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGAATTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 4063811 5' - roo 9047 1 65.67 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGGATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 - chr3L 3983880 5' - P-element 2819 1 35.29 AGTTATTGATTTGTTAAGCATTTTTGCCAGAATCCAAAAATGCCTCACATAGTCTCTTATAGAATGCGACTTCGAGATGTGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2R 22992427 5' - hobo 2912 1 57.25 CATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chrX 10537825 5' + I-element 32 1 61.64 CGGCGAGCGCGACATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chrX 18282596 5' - P-element 2833 1 43.61 AAATGAGCCGCGTTAATTGCTCTTTTTGTTTTATTGACAGAGACGGCAAGGTTTTGTTTAATTAAAAAACAAATTAAGCGGGTCAAAAATGTGCAGCGATCTTTTGAGAAATTTTGGAAATCGTACTGTTGCAGCTCCAACGCGC:1 - chr3R 18579173 5' - Osvaldo 174 1 73.10 CTTTCTCCCTATAAGAATATCTAAAACAAGGGAACAACAATTTTGGATACCAAAAACGAATTACACGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:1 + chr3R 2136549 5' + I-element 470 1 67.12 AACAATAGTAACCCAAGGTTTCGATGGTGGAGCGGAAGGAAGATGCAGGGGTTATGGTTTGCATATGCTTTTGTTCATAACAATATGCATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 + chrX 18742767 5' - invader4 3059 2 68.49 AGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTATGCGG:1 + chr3R 13875066 5' + P-element 84 1 26.21 AGATTTTCATTATCAAATATCCATTTTATCCTTTACCCTTGGTTTGCCATATCCTTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGTTTTATTT:1 + chr2L 20992988 5' - X-element 416 1 64.83 GTTCAGCGTATGGGCTCTGTGATCTTGATCCGTGGGGTGTTGCTCGCACTTCGCACCCGGTTTACGTGGTTCACCGACAGTTGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTTTTATTATTTCCATGAGGTTATGGTTTTGTGT:1 + chr3L 26834539 5' - invader4 410 1 63.70 TAAGCCATGTTTCCCGTTTGTCGGTGGTGGCCGTGACCATGAAGCCCCGGCCGATATCTGGTCGTGTGCACTCTATATATGTGTACTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATAT:1 - chr3L 14616668 5' + F-element 4232 1 58.22 CGAGATTCCCCCCCAGCCGAAAAATAGACAATGAGTTCGCCAGTGGCGAGCTTCATTCATTTTCCAATTAATTGAGGCACGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACACTCAACT:1 - chr3R 10499256 5' + Porto1 459 1 57.53 GCGGCGGCATGCGGCGAGCGCGACATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 18282585 5' - P-element 2875 1 67.65 AACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr2R 22034752 5' + copia 4911 2 50.39 ACATGTTGTTTCCAAGCGCCTTGGTGAAGAGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 - chr3L 10373926 5' + 297 57 2 57.53 GGGTATATGATAATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 19073317 5' - roo 394 1 72.18 GGATTAGGATTGGGGATTACGAAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chrX 19539601 5' - pogo 2089 1 58.22 ACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCT:1 - chr2L 6654736 5' - diver 6042 2 65.73 AGCTGTGTTCCAGGAAAGCACCTTGTTCTCGAATGATATTCCCTGCTCCTGGCCCAGTTGGGCGGCCATGCTATTTAAGATAAGGGGTTAAGATATATAGGTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTGAGCCGACTAATCA:1 - chr2L 19445257 5' - Cr1a 4086 1 49.32 TAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATATAAATATATATAGAAACATAATATGCTTCTCATATT:1 + chr3R 904905 5' + rover 6955 2 67.39 CATTTGAACATGTGTGCTGCCCAGGCATTTTGTATTTGCATTTGACTTTTCGCATTTTCATATTTATTTTAGTTGTTTTGCACTTGTTTTTGTTGCTTCAGCCCTGTTGACGTGTCTGCGTTTGATTAACTTGTAGTTAGATTTTT:1 - chr2L 12494798 5' - gypsy2 472 1 58.22 ATTAAGCAGTCAGGTTACACATGATCGAATTAGTCTCTTGTTCCAGATAAAAACAATCAGTTATTGTGTAAAAAGCTAAAATGAAATTCCTGCGTTTTTTTTGTAAACTCCGTGTAAAGAATAAGCACTTATACATATATATATAC:1 - chrX 18223255 5' + blood 182 2 66.44 ACCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTT:1 + chr2R 21160673 5' - Transpac 236 2 72.60 TCACACNGTTTTTTAACCCACTCCGGTAAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr2L 3233955 5' + roo 8726 2 60.27 AAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTT:2 - chr2L 15550776 5' - Bari1 1657 1 54.11 GTGAAGTCAAATATATGGACAGTTTGTGGCACCGTATGATTTAAATAAAAAAATAATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 6102873 5' - roo 404 1 69.18 AATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr2L 13158629 5' - roo 9021 2 52.74 TTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGGGCTTTTCCC:1 - chr2R 21410993 5' + Burdock 6172 2 60.00 CAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATCATTATACGGAGCTCGATGATAACACATCTGTTCACTTGAAATGCCACAGAGAAAAATTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAC:1 - chr3R 26843969 5' - 1360 391 1 48.63 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGGCACTAATTTAACCAACGAATTTAAAAAATTTTTATTTTCTCCGCGACTTAGATTTTGTCTGTCATACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGG:1 - chr2R 3262649 5' - HMS-Beagle2 338 2 65.75 GTATCCTTTTTGCTGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:3 - chrX 15357778 5' + hopper 43 1 56.16 AAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTAT:1 - chr3L 20187400 5' - FB 491 1 53.70 ATGCAAAGGTATTAAATAAAAGTCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chrX 4341065 5' + roo 66 2 79.67 TATAATATATATATAATAGTATTGTCCTCTCTCTTGCACGTTTACTCGCAGCAGAGCACCAAATGTTAAACATTTCCGCATTTGAGAACCTTAAGTTACGCCCTAACTTTTAAGGGCGTTGGATGTGTTGTAGCATATTGGACTAA:1 + chr2L 22989441 5' + Stalker 6846 2 46.58 TTAAACGAAATCAGTTTGAGCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAGAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 - chrX 6116354 5' - transib2 2771 1 52.74 ATTTAATATCAGTGAATAATGAATGATCGAATTTTAACAACAGTATAATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCGTTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTTCTCAGAACCTTTGATTGTGCTCGTTGTATGATGTCAATATTGCT:1 + chrX 2787457 5' - F-element 4304 1 70.34 GTTCGTGTGTTTTTCTTCTCTTTTTTTATGTGCAACAGTTTTCGCTCGTGTGTTTTTTTCTAATTATTTTCCGCGAGTGTGATTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTAAGTTATTGCCATATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTT:1 - chrX 13983481 5' + HMS-Beagle2 6903 2 67.12 AAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 + chr3R 11937261 5' + flea 20 2 73.29 TGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr3R 21630359 5' - I-element 5303 1 54.79 AGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2R 24427550 5' + jockey 4721 1 51.37 ATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:3 + chr3R 11040062 5' - Bari1 1638 1 65.75 ATCTATCAATGGGTGGCCATCACCCCAGAACACCGATCGCCAGATCAAAGGTCCACTGCTTCAGTCGCCACTACAATTGATCGCACCGTTTTGCGATGCTGTCGTAGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGTCAGCCTT:1 - chr2L 3612763 5' - Gypsy6A_LTR 263 1 62.59 ATACGAGTCGACGCCATCATTAATCTAAAATATGGCTCACACGCACGAACACACACCCATATACCAATACACACACATACACAC:1 + chr3R 11554979 5' + accord 254 2 54.76 GAAATTTTCAGTGGCGGAAAAAAAAGGAAAGGATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCT:1 + chr3L 10730882 5' - roo 8886 2 76.98 CGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2R 13766208 5' - roo 344 2 64.79 AGTCAAACAAAAACGTTCAGTTCGCTTGAAATTTTATTAAAATGTACTAACAAATTCTATGCTAACTAACTACTTTTAACAAAAATTATCTTTTGCAACTGCAGTACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGGGCGCTCTGCCAG:1 - chr3L 11816578 5' - G2 442 1 69.18 GGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAA:1 - chr3R 23618226 5' + hopper 30 1 54.78 GTCAATAATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 6397756 5' - roo 9009 2 60.27 ATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAATCCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:3 + chr2L 22674739 5' + mdg1 20 2 76.03 ATAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATTTGTCCCTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAG:1 + chr3R 19448015 5' - roo 8644 1 60.96 ACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3R 24369111 5' + roo 77 2 70.55 ATAATGACATTGGCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 8308522 5' - roo 9036 1 62.07 CTAATCGTCTGATAATAAGCTATGAATTATAGTAAAGTGGCCCCACAAAATTATTTATAGCTTGAATTAAGCCCATTTTAATCAGTTAATTTTTTTGTCGTAATTTACTAGGCAGACCGGCAATTAAAAGGTATGGAGATTTCGT:1 + chr2R 22768097 5' - GATE 343 1 49.66 GAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATG:1 + chr3R 19450101 5' + roo 8655 1 65.45 AAATTTGGAGGCGAAACAAAGCGGAAACCCTAAAAACAAGGAAAAAAGACAAAACTCTACGACTGTACGCTTAGTTGGTCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGGCATCACATCCTGCTCAC:1 + chrX 1126453 5' + Rt1a 4884 1 65.75 AGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:2 + chr2L 17180064 5' - Juan 4163 1 50.00 AGTTCTTGATTTTTTATGGGAAATTTTTTTGCCATTTTACACAAAAATTACAAATTAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 + chr2R 3564009 5' + Tabor 6867 2 66.44 CTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCA:1 - chr2R 23780615 5' + Ivk 59 1 55.48 AATACGAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 + chr3L 16662333 5' - jockey 4987 1 77.37 GCTCAGGTGTCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 21367176 5' + Doc 29 1 63.70 GGCAAATAATTCGGAAAATGTTTAAGGTATTGAGGCCCGTCTCTGACCACGAGACGAGTATTTTGAGCAGCATTTGTTTCTTGAAAATGAGTTTACGTGTATATGTGTGCGTTTGTGTAAGAAGACGATTTTCTGGCCGAAATTA:1 - chr3R 27756170 5' - 1360 3187 1 64.14 AACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTA:2 - chr3L 20187421 5' - FB 474 1 51.37 AACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chrX 11661399 5' - pogo 2078 1 61.62 CCATCAGCTGCATATATTTACATACGTATGCAAATGATGGCCGTGCAGATGTTGCGTTGCCGCTGCAACCGATGATGCTACATTAAATTTCAATTTCGGGTTCGGATTTCTTCTAGCTAGGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 + chr2R 19018144 5' + INE-1 555 1 69.18 TAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAAACAC:1 - chr3R 19407984 5' - diver 175 2 57.14 TCCAAATGAAAGTATTTCCCTTTTTGCGGGCCCCAACATAAATTCAAATTTCTCCCGACCTCAGTGGACTACACAGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGGCATACCTTGATTGGCAGTCCCG:1 - chr3R 20890137 5' + Rt1b 4983 1 53.52 GAGGTTGTTCAAATAGCAATGGTGTATTTAAATTCTCAATCCATGTATTTTCCTACAACAAAAATATTCTTAAATTTTAATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:2 + chr3L 18768358 5' - S-element 1677 1 58.22 AAGCACATAGAACGCAATAAAATATAGATAAAATATTCCTAAATCTGTTACTAGAACATACACTACATCCATTTACATATCATATATATGACATCAACATATACTACATCTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAA:1 + chr2R 14369023 5' + Idefix 9 2 63.01 ATTGGCTTGAAAGAGCCAACAAACACCGAAAGAACTGGAAATATGGAACGTGTAACGAAATAAAGGGATGGAAGAAGGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGC:1 + chr2R 4285281 5' - gypsy12 10158 2 60.58 ATTACGCGTTTAATATATTTTCATTTAGTCCGGCATGGCGAAGAGCTGCCAGAAAACAGCGAGGAAAATATAGGAATAAGGATAAGGGGTGAGGAAGTGCTCAAAACTATAACTATAGCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTA:1 - chr3R 13114862 5' + Porto1 4270 1 68.49 GGTTGTGTGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 4063786 5' - roo 397 1 77.40 ATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3L 2544651 5' + Tirant 21 2 66.67 ATGATCTCCACATCGCTATCACTTTCCGCGTCCATGACACTCTTCGGTTGGTGGAATTATAAATAACAATTGTGACTGTATCAAAGTATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2R 9871763 5' + roo 8748 2 55.48 TATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3L 7889655 5' - roo 343 2 62.33 ATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr2R 24427556 5' + jockey 4724 1 50.35 ATTCCCCATGCCGCACAGCTGGAATGCTGCAGGGCGTAGAATGTAGAAAAAAAGCAATGGACTCTTCTTTTGTTTCTGCTGCGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTTAGTTTGTTTTGCACTTTTAGTTAGATTTTTT:1 + chr3L 9803325 5' - gypsy2 441 1 53.42 ATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr3L 19349927 5' - 1360 3352 1 53.17 ATTAGTGTGTGTGTGTGAGCGGTTAAACGAGTTGTTTTCTCGTTTTACTTGTTGTATCGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAA:1 - chr3R 31062513 5' + Ivk 5229 1 60.27 ACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chr3R 16341965 5' - P-element 2798 1 24.66 GAGGGGAGGGACGGAAAAGGACTGCAACANTTATCAATAAGAAAAGTAAGAAAATAAGAGAGGAGGCAATGAAAAATTAAGAGTCTACAAAATAGAAAAAATATAGAAAAATAGAAAAATAAAAAAAAGAAAGTATAATTTAAGAA:1 + chrX 17506346 5' + mdg3 5020 1 50.00 ATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTT:1 + chrX 17343395 5' + I-element 71 1 67.81 TAGATGAAATGGGTATACTAGATTCATTGAAAGGTATGTAGCAGGCAGAAGAAAGCAATTTCCGAATATATAAAGTATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chr2R 6606596 5' + Quasimodo 31 2 63.70 AATTTGAGCCTGCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr2L 4003823 5' - mdg1 7437 2 67.12 ATATACATATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:2 - chr2R 9871605 5' + roo 8686 2 71.23 GTCCGTTCTAACTAGATACAAATATTTACCAATGGTCCTACAAACGAAATATACAGTTTGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCT:1 + chr3R 5259321 5' + S-element 1705 1 59.00 AAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGTAAAGCTCTATTAACATCTAAGGTAGTAAATGAAGGACAGCCCTAAAAAAAAAATTGAAAGAAGTGAAATTTTTGATTTTCGG:1 - chrX 21976898 5' - FB 154 1 67.12 AGGAAATGGAAAACACTTGATTTTTTTTTCAAATATTTTGTATTTTATTTATTTCGCTAGTTTCTTTATGTTTTGTCCTTCATTTTTTATGTTCAGTGTTGATGCTTTTCCTCGCTTTCTTTACTTTTTTTTTCTTTTGGCCTCTG:1 + chrX 5070997 5' - Transib5 15 1 66.44 ATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr3L 16437256 5' + F-element 62 1 52.08 AACAACATTAGCTGCGCAGCTTGCAGCAATTGCTCAACGGTCACCAATGACACCGTGTTGGGCGGGAGTCTCCAGCGGGTTACGGTTGGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3R 5368560 5' - 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chrX 5271521 5' - Tc1-2 1415 1 65.07 AACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAG:2 - chr2L 4754948 5' - Stalker4 330 4 68.49 ATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAT:3 + chrX 8027390 5' - Juan 4182 1 56.85 ATGTTTATATAGATGAATTTCATAAATGAGTAATTATCTTTCTCAAATATACAGAAGCTAGGCATTTAATGGTTAGCATGTTCTTGAACAGCGCTATCTCGTGATCTCCTCCCAGGGAGGAATCGACTATCAGATTCCCGTTACTG:1 - chr2L 368532 5' - INE-1 549 1 60.27 CATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 23180168 5' + roo 8703 2 58.22 TGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 11257383 5' + 1360 8 2 63.93 ATTGAAATTCATTTGTTTGGCGCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr3R 13972915 5' + 412 7078 2 68.75 ATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTAT:7 - chr2L 15550783 5' - Bari1 1664 1 53.42 CTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTTTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 6102934 5' - roo 346 2 63.64 CAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACA:1 + chr3L 23933528 5' - Cr1a 230 1 55.24 ATGAATGGTCATTATACCCCACTGTTTTCTCTATGTACACTTGCAAAAAGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGT:2 - chrX 13795595 5' + 412 7129 2 79.45 AACACTTTGTAAAAAGGCAAAAATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr3L 16470406 5' + jockey 4693 1 69.86 AATTCGATATTTCTAATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:6 + chr2L 17180023 5' - Juan 4204 1 77.40 TGTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATA:1 - 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chr3L 17055543 5' - Tirant 8455 2 56.85 ATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGC:1 + chrX 13383540 5' - R1A1-element 5138 1 55.46 ATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTCACTTAATT:1 + chrX 8092382 5' - pogo 2042 1 55.48 AAGAAACCAAATCTTATAAATTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCACGACCTCCCTAACCTGGT:1 - chr3L 20711752 5' + jockey 4767 1 77.40 GATATAAAGGATGCAGACATATGAATTGTTTGGCAAAATGCTAAAACAGCTGCGGAATGACCATAATTTGGCGCTAAGTCAAATAATAAAGCTAGAGAGTTGAATTTTTTAGAATTGGTGCATTTGACATTTAAAATACGTACTTA:1 + chr2R 2521475 5' - transib3 2779 1 56.16 AAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2L 20266020 5' + roo 8744 2 74.66 GTGTACTTTAAGCCAGAAACCGATCGTATGAGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr3R 19224962 5' + HMS-Beagle 6828 2 66.44 AACAATATATATATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGGCCGGTGGTCTCCAGGCGGGGG:1 - chr3L 13372697 5' - gtwin 7362 2 75.38 ATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTAAATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTACATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 15950935 5' - roo 396 1 75.34 ATATTGCGCATTTATGCCAAATTTATAGCCAAATATATGGGATTGTGTGTTTAATCTAAATACTTTTATTTACCTAACCTTTAGACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTA:1 + chr3L 15914676 5' - jockey 4842 1 63.01 AGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 - chr3R 15942800 5' - hopper2 1546 1 62.33 ACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr2L 4063870 5' - roo 331 2 80.95 GTGCTATCTAAAAACCCGTCTAGTCCCTTTGCTTAGTTGGCTCTATCAACTAAGCCCACACATTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTAT:1 + chr3L 12078630 5' - F-element 4574 1 56.85 GGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 + chr2L 18347271 5' + transib2 47 1 52.05 CTTAAGCTACAGCTACTATTTCAAAACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGCGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGA:2 + chr3R 10735997 5' - 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opus 7447 2 62.07 AATGGAGTGGATATGGTAACAATAACTAAGACACGCGACGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 - chrX 13490761 5' - 297 6927 2 58.90 ATGATGAATTGTGTTTCATAAACATGTGGGTTTTGAATGCAACCTGTTTAGTAGCGCGGAAAAAGCCAATGCTCTGCTCTGACGTCACACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTT:1 - chr2L 1087020 5' + FB 645 3 59.59 TTTTACGTTCCTATCTAAAGAGTGGATAGGATTTCTTAAATGTTGCTTCATTGACTTCCAATGGTAAGTATTTCAATTTGGTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTC:1 - chrX 18322235 5' - roo 441 1 60.74 ATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 + chr2L 13556343 5' - transib2 2759 1 63.01 TGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr3L 9809259 5' + 412 7118 2 66.67 GTCAGCCAGTATTGGATTTTATTGATGACAATGGAAAACATCAACAAAAAATTTGTGTATTCAAAATAAATCAGGATCTGGGGTACCTTGTCGCGCCTTGCTTGACTACGGCTCGCAACTACACATAAGCAC:1 + chr3L 25412133 5' + G3 477 1 47.73 CATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 - 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Stalker4 7071 4 73.97 AAACAAAAAACCCAACAGCGCCAGACAATCCTTTCTTTTTCCTGTACTTTATGCTCTCCGACTTTTCTGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAGCATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTT:1 + chr3L 10329639 5' - invader2 441 1 67.12 ATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCACCTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAGATAAATTTGTATGTA:1 + chr3R 4357545 5' - Tc3 1644 1 65.15 ATTGTAGGGGCAGATCCCCTGAAGTATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTCGTGAGAGGGTTGGTTTTATCATTTTTATGTTAATTGCGCTGTTATG:1 - chr3R 14860244 5' + BS 5037 1 56.16 GGCGAACAATGCCGCAATCTCTATAATATTTATGCAAGCATTAGCAGGTTCCCATCCCATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCA:1 + chr2R 5895286 5' + F-element 4454 1 60.96 CGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:1 - chr2L 4754946 5' - Stalker 7177 4 69.86 GAATGTCTTGTCTGGAGGCCGATTGTGGGAATTGGTTTGAGTAAAAATAGTCGGAGTGGCAACTTTTGCACTCGACTCCCCTTTACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3L 25633734 5' + 1360 26 1 57.89 GATGGAGTTTACATGAATTCTTGTACGCACTGATGGAAATAGCTAAGCCAGCAAAGCTTGAAGATGAGAGCATTATTAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:2 + chr2R 6421467 5' - 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chr4 303832 5' - pogo 2057 1 56.16 AAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAAAATTGGTCTTTAGGGTTTTCATTTGGCGGCGTGTGAAAATTTAATAAGGAA:1 + chr2R 5260084 5' + 1360 433 1 80.95 AACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 - chr3R 15364040 5' - flea 4976 2 60.27 ATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:6 - chr2L 17180124 5' + Juan 83 1 71.23 TTAAGTTTCACTTTCAGCACTGCCCTTTCTCGTCTCGTACGTTCGTTGTGTGTGTTTTTTTTTCATATTTTTTTCTTTGATCTTTACATAGTATATCTATTTGTTTGTTTTTATTATCAGTGTTTAATTGTGTGTTCGTTTTTTTT:1 + chr3L 16656317 5' - invader3 5023 1 59.59 AGAATTATAGGATGCAGAATTATGATTCATTACAAATTACAAACATTAAAGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAAGAAACTATGCACAGTGCTAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGTTATT:1 - chr2R 4899121 5' - gypsy7 5001 10 80.82 TTAAACTCTCCACAACTCTAGGTGATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTTTCAGAATATATTTATACTTATAGGGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGCCATACGTTTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - 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chr3R 6958200 5' + Q-element 131 2 67.12 GCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACTTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr3R 6625799 5' + flea 20 2 61.39 TGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACCAACAGTTG:1 + chr2R 9966973 5' + Bari1 40 1 45.80 AAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr3L 19111579 5' + Doc 45 1 72.16 CTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTANTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr2R 7090732 5' + I-element 56 1 53.42 AGGAGGGGAGTGGAGTGGAGCGGTGTGTAGCGCACAAAACTCAAACAACCTGCCCAAGTGACTGCAAATAATTTCCCACCATGCCATGCCACAACGCACCGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACTACTCGACTC:1 + chr3R 23333591 5' + hobo 19 1 71.92 TGAGTACTCATTCACACTCATTCGCACTCACTTCACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2L 14675601 5' + 297 11 2 78.08 AAATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGATGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCA:1 - chr2R 6622643 5' + S-element 72 1 68.53 AATAAAAAAAGCAACATGAGATAATTAATTAAACTTATTTTTCCTGGATACCAAGTCATCGCTCAACTATACCTTAAAATTACTCACCAAAACTATTTTCTCCTTTTCCATAAGACAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAT:1 + chr2L 18563893 5' + TART-A 13129 1 65.52 GTACAATCAAAAGTTGGGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTG:1 + chr2L 17005649 5' - Stalker2 396 2 71.92 GATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 + chr3L 24291981 5' + 1360 70 1 68.28 CATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:3 + chr3R 17673762 5' + FB 78 1 71.92 AAGGTTTTTGTTACAAATTTCGGAAGATAAACATCAGGAAAATATATATATATAATTATATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAAATTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACTTTTTATTTTAGAAGAACACCGACC:1 + chrX 23182833 5' - Idefix 7320 2 67.12 AGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2R 10417121 5' - 1360 3343 1 51.75 CAGTAATATAGAATGCTACGGTTCGATAGGGGTAATTTATCGATTAGCCTCACGGTTAAGATAAAATAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAA:1 - chr2R 8672550 5' + TAHRE 10386 1 54.48 ATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGGAAAATCCTAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTAATTTTTTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 14366556 5' - roo 9006 2 70.40 ACAATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGT:1 - chr3R 1960324 5' - gypsy9 5181 2 88.49 GTATTGTATTAAAAATTATTGAAAGTTATAAGTCAATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 14366654 5' + roo 8702 2 62.33 AAATAGATATGCAATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:3 + chr2R 7090624 5' - I-element 5306 1 50.00 TGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 - chr3L 18505721 5' + I-element 81 1 74.48 TTTTAACAATTACTTTCACTTTTTACTCTTGTGGGTAAGAGCAATTCTGATTTTGTGAAATTTCGTTGACGCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAAC:1 + chr2L 13555337 5' + transib2 2729 1 60.27 CATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 - chr3R 6419926 5' + Tabor 6917 2 68.49 GAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAA:1 + chr3R 9038942 5' + Juan 4083 1 68.06 AATGCAACTGGAGGCTGCCGACGTGCCTTCCTTGCGGTCAGTTGTTGCACGTTGCAGGGTCAGAAGTCATTCAGCCTCTATTAGGCTGCTAATTGAAACACCAAATAGCATTGCGAACAACGCAC:1 + chr3L 14891967 5' - Cr1a 231 1 76.80 GGCAGCATTTGCCTGTGTTGAAGTTACCGTTATTCACTCGATTTTCAGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTA:1 - chr2R 6482578 5' + gypsy 7003 2 73.29 ATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCA:1 + chr2L 13556345 5' - transib2 2757 1 64.38 GTGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 + chrX 20999485 5' - BS 5053 1 54.11 TTTTAGTTTCGTTTCAAAAAACCCATTGAATAAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 21505635 5' + roo 53 2 58.22 GGCAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr3R 30347291 5' + P-element 41 1 59.59 AGAACATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTC:1 + chr3R 21276483 5' + BS 5007 1 73.97 TCACATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGTATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGACATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTTCTACTC:1 + chr3L 25008296 5' + 297 370 2 76.03 AAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 - chr3R 21276633 5' - BS 5042 1 52.05 GAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 13300946 5' - roo 8999 2 64.38 TTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr2L 15076227 5' + 1360 39 1 58.90 CATAAGCTATTTAAATTCAAATACATAATTTTTAATATATCCACCGAATTAATTGTTTAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATG:1 - chr3R 19408041 5' - diver 204 1 68.49 GTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 - chrX 19038450 5' + hopper 57 1 67.48 CAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3L 2544598 5' + Tirant 8139 2 61.65 ATTAAAAACCAAATTCAAGCAAAGAAGCTTATGCTGTTACTTATTGTTAGTGAATTTACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCC:1 - chr3L 13869310 5' + I-element 152 1 54.40 ATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTAATAGCTAC:1 - chrX 3431949 5' - Ivk 5327 1 61.60 ACATTATACAAGTGAGTTTGCCAACGCCATAATCTGCTTTAAAAGTGTGGTAAGTTATTATCAGCGATTTAATAGAACTATTTGCACAATTTCAGCTAATGCCACTGGCTTAATTAAATAAAAGTAGCTTTAATTTGAAATGAACA:1 - chr3L 8815919 5' + HMS-Beagle2 7132 2 75.34 CTTCACTTTGGCCCACACAGGCGGCGGAGGAGGGGTCGATAGGAATTTATGTTTGGTTTTTCGTCGAACTGCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTT:1 + chrX 14626180 5' - copia 456 1 48.51 AGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATAT:1 + chr3R 19407887 5' + diver 47 2 51.72 ATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCC:1 + chr2L 4642955 5' + F-element 4523 1 75.44 AATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:3 + chr3R 4679442 5' - hopper2 1555 1 52.05 ATAATTAATATGTTTTAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGTTCACATCGGTCTACTCAGAGAGTAAATCGTTT:1 - chrX 21458365 5' + FB 295 1 55.07 AAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:2 - chr2L 17005825 5' + Stalker2 7289 2 56.16 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATAATTATACCATTATATTAATCAAAACTTTCTACGTCCAAATGCATAGAAAATGGATCATCGTAATCCGAATCCGAGTCGCTATCATCGCTT:2 + chr3L 10795198 5' - transib3 2538 1 67.81 TGCGCATGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAAGGTCGTCTGGATAGGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGTCGAGGGAAGA:1 - chr3L 25232862 5' + accord2 7442 2 54.95 TAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 - chr2L 16946154 5' - hopper 1381 1 59.86 GATGTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:3 + chr3R 24729532 5' - Juan 4196 1 60.96 AGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCA:1 - chrX 15019096 5' - S-element 1544 1 66.90 TATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:2 - chr2R 11164516 5' + roo 50 2 56.16 ATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTAAAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAATA:1 + chr3R 19407872 5' + diver 5914 2 63.31 TTAATTAAAATAAATACTTATCTAATTGCGAGTTCGACTACTCCAAATCCACGGCACAACGGTCGCGATGGCCCATAAATAAAAGGCCTCCTAATTAATTAATTAATTAAAAAAA:1 + chr2L 20694354 5' + jockey2 3402 1 75.65 GCCATAAACAAATTGCAAATGAAAATCCTGCGAGGCAAGTTGCCAGCGTGGGATTCTCCAACATATATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGG:1 - chr3L 2432217 5' + micropia 5210 1 52.99 TTCCGATTGCCCTTTTTACTCTCAGTATGGAAACCGGGTGCATTGGATCCGATCCAGCTGTAGGATCCAGTTCCCCAAGGGTTGCATTTCCCGCAAAAAAAAGAAAAAAAAACAGGGAAA:1 + chr2R 10548069 5' + Doc2-element 246 1 73.33 AAATGATAAGCGAGGTACCCTCGGCGGACTGGTGACTAGAATTATCGCATCACTTGATTGTGTGCGTAGAGCTGGGATACTATCGATGGTACTATCGAGGTATCGAAAATTGAATTTTTACATGGTGCCAATTGAGCAAAAA:1 + chrX 9329064 5' - 1360 264 1 60.56 ATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3R 18488390 5' + roo 69 2 74.62 TTTCTCCGTGAATATTCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 + chr3R 14860095 5' - BS 5077 1 69.18 ATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:2 + chr3R 11191391 5' - roo 9012 2 61.64 GGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 + chr2L 18347268 5' + transib2 44 1 54.11 AGAGACTCTTGGGCGCCCATCGTCCATCGTTTGGCCTTGGGCAAATGGCTTGCGAAAAAGGAAAAGTTTCGCACAAATTACACTTAATTGCGTGTGGCATCATGAAAAAGTCATCATCGAGGGAAAAAAAAGAAAAACAAAAGCA:1 - chr3L 1879746 5' + gypsy7 5008 2 81.38 AAAAATATCAAAACATTTTTCATAAAAATCGGTTAACATGGGTCAATAAACTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGCATCTCAACCTTCTACAATAGCTTTTATAGTTTCTGAGACCTCGACGTTCATACGGAC:1 - chr3L 23054959 5' - INE-1 133 1 75.17 CAATGAGCGCGAGAAGTCCTTGCCCAGCTGGTAGACCTCCACCTCCATGGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGG:1 + chr3L 2666131 5' - gypsy12 10166 2 50.49 ATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 18549940 5' - roo 9022 2 55.48 CGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr3L 3983915 5' - P-element 2862 1 64.84 AACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATTAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3L 24131530 5' - Transpac 5201 2 64.38 GTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3L 21969819 5' - opus 447 2 74.66 CAGGAAACACTTGACCGACACGGCAGGCCATTTAATTATAATTGCCATCCATAAATATGTGGTTGTCCCCCAGTCGCCGTTGAACTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACAAAAACA:1 - chr3L 1902811 5' + 1360 487 1 72.27 ATAAGCCAGAGCTACAAAGTACACCTATACCACAATACCCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTGCCAACTTGTCCGGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 - chr2R 356105 5' + I-element 5013 1 73.97 CAAAATCACTTAAAATATTTTCATTGCGCTTATACCGATGTAGTTGGAAAGAGATGGAGACAGATATGCAGCGGTTTTCACTGTTGCTTGTGCAGCGTTGTTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTCACTGTTGTAGTGCAGCGCGCG:1 - chrX 18341712 5' - gypsy10 468 1 56.64 TATCGTAAAAATCTTACGAATTTGATTACCGTAGATCTTGTTTTTAAGTTTTTCTGAACTTGATAATTATAATAACAATTTACATTTTCTTAATTTTTAGAACTCTCTCCTACTTCAATATGTCTTGACAAATAAAATTAAATTAA:1 - chr2R 2846915 5' + NOF 3956 1 73.29 CGTCATGTAATCGAAAGCGTGTAGACCCATCAGCTTGACATCGTTTTTGCTAAAAACGTTGGAAAAGCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAACAA:1 - chr2L 6781668 5' + blood 7065 2 53.42 AACCATAAAAGATCTGAACAAAATATTTAAATGCGACTTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGATCGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGC:1 - chr2L 7928648 5' + Rt1b 5007 1 71.82 AACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGCACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAAACCCAAATAATAAGTCTTTACTCGTTTAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 20898649 5' - roo 9036 1 59.72 TACTCCCGGACTCTAATCTCACACAAACAACAATGAAAATAAGTAAAATGAAAATACATATAACAAATAAATTTGTCGTGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTA:1 + chr2L 15779525 5' - hopper 1330 2 58.22 AGAAGTTAATCCTTTTATATGATTCATCTACTTTGTTACTTTGTTCTTGAGCCCATCCTGTACTTTCTCGCATCTATCCCATCTGTTACCCACGTACATATATAACATACATATACATACATACATACATACATACATATAACATA:1 - chr2R 7882473 5' - Dm88 14 2 60.96 TATCTGAATCTCAAACGAAGTAACAATCCATTTTGATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCAGAAGGATAAT:1 - chr4 347746 5' - Tc1-2 157 1 73.10 CCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAACTCCTAAACTATGGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 15942703 5' + hopper 61 1 55.94 AATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGTC:1 - chr3R 5523977 5' + FB 85 1 76.39 TTTATTTATATTTATATTCATATTCATATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1 + chr2L 2361962 5' + INE-1 95 1 56.16 TTAGTCTATTTTCATTTTTCAGCGCTGTTTTCACTTAGCACTTCCATTTTCATTTGGCACTTGCATTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGCGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCG:1 + chr3L 18823339 5' + opus 287 2 53.42 AATTTTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTTGCAATATACCATAGGAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCCTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAGATAC:1 + chr3R 15705405 5' - HB 56 1 68.49 TATTTAATTCCATTCATTACTTGTATATTAAGGTAAAGAGAAGTACAATAAATTAATAACACACATTACACATAACCCATGTAGCGACCACAAGGTGGAGCTCGTGTGCCAGTTATTTAAGCTTAGTACCAGGTATCTGATAGTCG:1 + chr2R 8777903 5' + INE-1 550 1 49.32 ACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCAG:1 - chrX 20999629 5' + BS 2 1 75.19 GTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 23295586 5' - P-element 2837 1 22.60 AGCCAAGAAAGCCGCAATCATGCTGTTCCTCTACGGAATCGCATCCGCACTCCACATGAGCCTGCACAAGGAGTTCTTTGACTACTTCAGCAGCTCATCGCATATGCGCTGGTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGT:1 - chrX 18333896 5' - Bica 111 1 77.40 GGTGCTCAGGAAATCGATCAGGATACACTTAACACACAAGATCAGACAATCAATGGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAACATCATAGAAT:1 + chrX 10043755 5' + Quasimodo 74 2 56.43 ATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3R 15791018 5' - roo 9035 1 56.39 GATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 + chr3R 4964107 5' - roo 333 2 70.55 TAAAGAAATTACACAATGATCTCGCATGTTATCTGCCTAAATTCACCACTGTCAATTCAAACAAGCCAAGATGAATCCTAGAACCTAGTTTGGAGTGAAAACATCAAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCAC:1 - chr3L 27168355 5' + F-element 4410 1 62.33 GGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:3 - chr3R 15364011 5' - flea 4947 1 65.07 TTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:2 + chr3L 17275409 5' - Transpac 5166 2 63.01 AGTTATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTT:1 - chr3R 15325207 5' + 297 6603 2 64.89 AATCGAAATCGAAAACATTATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3R 2425659 5' - 1360 3334 1 67.12 GCTTAAAGACCACAATAATGCCAAGTCGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTC:1 + chr3R 26178406 5' - 412 7452 2 79.45 AGGCTAATTTTGAAACCAATAAAAAAACTCAATCAAGTGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 9410574 5' - I-element 5328 1 58.20 AGTAGTAGTTTCACCGGTCTGCCACTCTTGCGTAGAAAGCCGCCGCAAAGGCACGGCATGAATCAGCGAAGAAAGGAAGGGGTGCACCGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr3L 26290856 5' + Tabor 19 2 52.76 ATATATTGATTTTTTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATATTTAGCTGC:1 - chr3R 13406561 5' + pogo 16 1 68.97 CATATTTTTATAATTTGCATAATTATATGTGTGATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 11062869 5' - roo 9053 2 68.57 TGCACTGGAAAAAACTCTTTGCTTTTCTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:2 + chr2L 7580861 5' + Transpac 4937 2 50.00 CACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAG:1 - chrX 19980699 5' + X-element 4516 1 46.40 TATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAA:1 + chr3R 4357516 5' - Tc3 1659 1 51.37 TGGACGGTTGTCCGCGTAATGACGACGAATCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTTG:1 + chrX 19266794 5' - roo 396 1 66.21 ACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATG:1 - chr3R 15790107 5' + flea 4737 1 62.96 GATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr3L 25401024 5' + Doc 45 1 45.89 GTTTGGGCTTATGATTTAAATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 - chr2R 6964868 5' + Burdock 6204 2 65.07 AAAATAGCTAAGTCAACCCTTAAGTGGAAACGTAAGCCAAGTTAGCTGATGGACTTTTCCAAAAAGTTAATAAATGAGAAACCTATAGAATTTAAAAAAATCGAAGTAAGCAATATTAAACGCAAAAAAAATTCCCAACAATATCT:1 + chr3R 18496415 5' - INE-1 386 1 46.58 CCGATATATGTACATATATATATAACTGTGTATTTTGTATGAGCAGCTTTGTACAATATCGTGGTCTTTGTGAAAGTGAGAATGTGTCAGTAAGCCTTTCAGTGGAAATAATGTTGCGCGGCCAAAAGTCTTTTAATACATGCTGG:1 - chrX 15813430 5' - frogger 2027 1 76.03 ATTAGTTTCATTCAATGGTTTGAACCGGCCTGGGAGGGAAGATAATCTGTGCTCCTAGCCCTGCTTGTTGTTGCTATATGTAACCCCTACCTTTTTGCCACCCGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:1 + chr2L 179318 5' - INE-1 128 1 74.66 ACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chrX 21224561 5' + roo 8746 2 76.39 AAATAGATAGATGCTGTATCTCTTGCCGTTATTGTATAATAGAAAAAAACGAACATACAACAAAACTGTAAGAAATGCAAAGTATAATTGTGATTATAAATGTTGAAAACTGATATTTATATACTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTA:1 - chr4 1054838 5' + S-element 1518 1 58.22 CAGGGACTAAGCCAAACTGATGTCTCATTTAACTAAGCAGCGGGACACCAATAACAAAATCAGCATCCTGGCAAAAAATATAATTCACACTCCAACTATCTGCTGAAACTTAGAA:1 + chrX 379415 5' + Tirant 8442 2 70.43 GTCTGAAGGACAAATTGTATCCTGACAGACGCACCATGGGCTATCCCTTCGATAGGCGCCTGCCCAATGCCAATCTCAGCGAATTGGTCGGTGCCTTTGGTGACGCTGGGCGCGAGGGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTA:1 - chr2R 17887551 5' - F-element 178 1 67.12 AAATCATATTTTAAAGCCTTTGAGCAGTTCATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:3 - chr2R 13259409 5' + mdg1 35 2 58.90 AAATGAATATAAATATATATATATATATTATATATATATATATATATATATATATATAAGAGAGA:1 + chr2R 21597209 5' - blood 7191 2 76.92 TAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGGGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGGGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2L 7581031 5' - Transpac 5185 2 52.05 CAAAAGTGTGGCGCCAACAGTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAG:1 - chr3L 24934443 5' - HMS-Beagle2 7179 2 76.55 GGTTAAGTTAGTTAATGTCGTTCTCAATTGTGATTTTACCAGATCAATTTAATCCCAGCTCAAGTATAGGCTTCTTTTTACGGG:1 - chr3R 553203 5' + 297 6554 2 59.52 GTGGAAAATCAGGGTAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr2L 12984222 5' + hopper 59 1 57.53 CTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 + chrX 10537858 5' + I-element 65 1 61.64 ACAACAAAAATATTCTTAAATTTTAATACTTTCTTTAATTTATTCCAAATTAACAAAATAAATTTGATTTTGATAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 + chr3L 18768412 5' + TART-B 10199 1 54.11 TATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAG:1 + chr2R 9158076 5' - mdg3 153 2 77.40 AATTTTGGTCAGGATGATGCAGCCCCTAATCAGCCTGTGTCCCTGAGACACCTTTCCCCGACCCCTGGCCCCAATCCTTATCAGTCGCCTCCGTTGCGGGTGATTTTTCACATGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 22245618 5' + hopper 144 111 52.17 AAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAG:1 + chr3R 15724279 5' - Juan 4177 1 56.85 AATGAGTTATCTGTGTACAAAGGACGCGACGGGGGGGTAATAATAATAATGATAATAAT:1 - chr2R 18816043 5' + mdg1 39 9 71.19 TTTTTAAATTGTAAATATTTTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 4805519 5' + 1360 48 1 53.57 ATATTCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr3R 14860106 5' - BS 5074 1 65.22 AGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCC:1 + chr2L 14026113 5' + F-element 432 1 70.49 AACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGCATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 - chr2R 330234 5' + HMS-Beagle2 6926 2 53.42 GGGTAAAATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 + chr3R 31886818 5' + hopper 39 1 60.00 ATAGTGTTAACTATTTAATTAGGATAATTTAGAACGCCTTTATTTACAAAAATTTGCGAAAAGTTTTATTTTGGCCTCTTCAAAAAAGTCTAAAGCTGTCTATTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAA:1 - chr2L 21780568 5' - 412 388 2 50.00 GTAAGTCAAACTAACTCAAAATGTTGTTTATCCATACCAGAAATTAAGAACATCCATTTCAATATCGCATTTGTACTTGTCGAAAACATATCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGT:1 + chr3R 24700730 5' + F-element 4597 1 63.01 TTTGACATTCATTTCTTCATCAAGTTTTCTTTTTGGACAGACAGAGATAGAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTT:1 - chr3L 4582576 5' + flea 408 1 65.75 CGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 + chrX 696511 5' + FB 82 1 73.29 AAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr3L 17183690 5' + diver 87 2 75.34 TATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACATA:1 + chr3R 3922959 5' + Cr1a 93 1 73.97 GCTCTATTAACAACTAAGCAACTCCAATTGCAACCTTTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCAT:1 + chr3R 7556886 5' + Quasimodo 6976 2 74.22 CATTCGGTTTTACTCCACGCTTGCTGTCCACACACCGAACCCCGGCCTTTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATATTCTTCCTCGATTTTTAATAATAATTTCAAATGATTTCGCTTTTCGTT:1 - chr3L 3251876 5' - invader2 420 1 63.64 AAGGATACGGGTATGATGATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCA:1 - chr2L 7618601 5' + X-element 4434 1 75.78 ATCGGTTAATATTGACCATTCAGGCTTTAAATCCTCCCATACACTACTGCTCACGTAATTATACCCGTAGAGTTAAAGAGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATGTACTTGCAAAAAATAAACGGGATAGTCGGGGAACTCGACTA:3 - chr3R 20126136 5' + INE-1 563 1 64.38 GATTTGGTTGTACCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGAATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAA:1 + chr3R 15942691 5' + hopper 52 1 52.05 TGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCT:1 - chr4 829128 5' - INE-1 149 1 67.81 ATAAAAGCACCACTAACTCAATAACACGGGAGGTAGGTGCTAAAACACACGCACATGCTCACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAA:1 - chr4 510011 5' + I-element 253 1 58.62 ATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:2 - chr3L 16470341 5' + jockey 4758 1 76.03 TTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGAATGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 15791007 5' - roo 9024 2 54.89 AAAAAGGCAATGTACAATTTAATTAAATGTTTACACTTGCTCTTGGAAGTTTGTGTAAAAAATAAAATGTTTTTTGAAGAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATC:1 - chr3R 5524056 5' + FB 8 1 78.77 AAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGGAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3R 9595026 5' - Tirant 8443 2 73.39 AATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr3L 2544614 5' + Tirant 8112 2 73.33 GAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2L 18549823 5' + roo 57 2 62.33 CAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - chr3L 22035652 5' + F-element 51 1 63.87 ATGCACGTGTGACAAATTTTTGTCGCAACCAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 24449386 5' + Doc2-element 234 5 87.04 GAATAGAACGTCTCAAAACAGTAAGAACATAATGGATACTACAGGAGATCGTGCGGCAAGAAATTTCAGATAAGTGACGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGC:1 + chr2R 7481631 5' - TAHRE 10384 1 46.58 GGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCT:1 + chr2R 4606231 5' - 1360 3302 1 79.43 GTAATTTGTGGTTTTCGATTATCCTGCGGTATCTTTACGACTTGCGCGTTATTTCTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAA:1 + chr3L 12375900 5' + I-element 5182 1 55.14 TTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTATTTTAACTTTGCTGGTGTTTTAGATTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTG:1 - chr3R 545850 5' - TAHRE 10379 1 57.24 TACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCAT:1 + chr3R 19449993 5' - roo 8613 1 78.08 AAACTGCTCCTCGAGAACCGTGAACTTAATAAGGGACTGTGTGAGAGCAGCCAGGAGTCCAATCAGACACACACACACACACACAAACAAAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAC:1 - chr3L 7713585 5' + I-element 4983 1 64.80 GCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGT:1 - chr3R 9298538 5' - hopper2 1520 1 76.71 TTAATTAAAAAGAAACTATTTATATAAAATAAAAACTGTAGTCTTTTGAGCAGTGTTTAGTTGAAAATAATTTGATGTTGCATACTTTTGGGGGAAACAAAATATATCTCGGATTTTATTTCAATTGAAAAATTAACTGTTCATAT:1 - chr3R 10310596 5' + Bari1 149 1 57.53 AAAAACACGTCTTGCCCAGACGTTGCTACACATTGCTTCCAATTGCTGCAGCAACAGCAGCGTCTTATTC:1 + chrX 15152368 5' + TART-B 69 2 85.71 AGAAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 - chr2R 1193104 5' + GATE 8270 2 65.75 ATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGG:1 + chr2R 17796525 5' + jockey 4693 1 66.92 TATTCTATTTTAATTTGATTCTCAATGAGTTATCTGCTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 + chr3R 14723017 5' + FB 79 1 72.86 ATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 7795629 5' - roo 9027 1 54.79 AAAAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3L 12004206 5' - P-element 2861 1 69.18 AGTTTATTGCGCTGCTATTATATAGAGTATGCGATGATAGAGTATTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGT:1 + chr2R 11763140 5' - Stalker2 50 2 70.50 AACGTCTTTAGATTTTAACATTTTAAGCCTACCTCCTTTGTTTAATAAAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 18226725 5' - roo 399 1 75.34 TAATGGATTTATCGTATGCAATCTTAAAAATATAAACGAATTCATTCATATTTTTTCCATTTTTTCCCATATTATTTATTTCTCCAGTATTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTATTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 + chr3L 18920381 5' - mdg1 7076 8 74.66 GATCGGTCTCTTTTTCAAACCGAACCCGTTGACAAGGTCTAGGTGCAGCCCGTTTGTCAGCCGAGATGGAGCAGTTGGACAACTGATTTGAATATGAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chr2L 14675790 5' - 297 370 2 69.86 GTGAGTCCTCACCTCTTGTCGCTAGAATNGCCCTAGATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATG:1 + chr3R 18096914 5' + I-element 338 1 76.60 GTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTACCTCAGATC:1 - chr2L 21580569 5' - INE-1 150 1 73.29 AACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCTAAGAAATCAGTAATTCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2L 15188463 5' + 297 6636 2 57.64 GTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTGTTAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 + chrX 12066108 5' + transib2 56 1 54.55 AATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3L 15103807 5' - Transpac 5181 2 56.92 AAAGGGTGCTAATCTTCATTGTCATCGCATGTTGCAGACTGGTTGATAACCGGTTTTTTTCCCGTGTGTCATTATGGTCTTGAATTTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCATAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGGGTTCCC:1 + chr2L 19897116 5' - baggins 5024 1 63.70 GTGTGGTTGTTGTTGTTGGCGGTGACTTGTTGTTGTTGTCGTTTTCGTTATTTCCTTGTCATTTGCATTTATTACAGATTTGTGAATTTACTCCGTTTAAATACTTATTAAAATTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTATTTT:1 - chr2L 8089590 5' - transib2 100 3 71.94 AGGATGGTTGGCACCAGTCACCGTTTCAGGAAAACTTTTTATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCGAATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCG:1 + chr3R 19445931 5' - 1360 52 1 61.64 ATAATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCG:2 + chr2L 11391453 5' - 1360 61 1 67.81 GAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3L 25782382 5' + F-element 91 1 75.00 CAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr2R 17878634 5' + Doc 69 1 58.22 ATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2L 14074579 5' + 297 30 2 65.75 AAATATGAAAACCTTTCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chr2L 7593179 5' + jockey 4685 1 75.91 CACAGTTTTTAGCATAATAAAGCAGTCGACTGGAAAAAGGGTGAGTTGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGACTGCCCTTAAGGCTAGCCAACCAATTCAATGATAACAGCAGTAGCTGGAGCTGATTGAAGGCGCGATGCGCT:1 - chrX 4854156 5' - springer 177 2 68.49 CTCACTTTTTCTTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTTTATTTATCCTAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGTGTTTGGGTGGAT:1 + chr3R 12367523 5' + GATE 8146 1 57.24 CTATTAAATGTAATATAGATAAGGCTCTATGTACCACAATCTAACTTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:2 + chr2R 5941205 5' - copia 185 2 68.49 TGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:2 + chr2R 17796550 5' + jockey 4734 1 60.27 TATCTAAATGTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2R 12133890 5' + jockey 21 1 74.66 AGCTGAAAGCATGTATCCAAATAGTACAATAGTTTTAATGTAAACAATACATTTGATCGATAACTAACCTTTCTTGTGTTTACAGGGGGAGGTTTGCCAATTGTATTTTTTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAAT:1 - chr2L 4846280 5' - Bari1 344 1 64.14 TATATGTGCCAGTTAATATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - 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copia 248 1 77.93 AATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr3L 22744728 5' + FB 58 1 59.59 AAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr3L 12004208 5' - P-element 2859 1 67.81 GGCGCGATTTGTTGTTCCAAGCAGAAGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGGTTTGACC:1 + chrX 2214205 5' + jockey 4774 1 75.34 AACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 13766187 5' - roo 9026 1 53.79 TTGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 + chr2R 21410845 5' - Burdock 215 2 56.85 GGAGCGTGCCGAAAGATCGCCCGCCAATCGACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 16157420 5' + pogo 30 1 65.07 ATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTC:1 - chr2L 16539752 5' + Juan 4081 1 48.63 CCCCAACCTTCTTTCCCCCTTTTCCCAGTGCTTTCAGCTTTTCCTCTTCCATTTCTTTGAACTGAACTTTTGCTACGCTTTGCTTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGGTCTTGGATACAAGTGC:1 + chr3L 8007250 5' - Idefix 328 2 66.67 TGTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:1 + chr3R 24729534 5' - Juan 4194 1 59.59 AAATTGTACACTTTTTTATGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCA:2 - chr3R 905036 5' - rover 292 2 60.27 ATTTTCTTGCTAAGATTAAATAATTCTTAGAAAATGTGCTTCCTTGTGTGTGACGTGACCATATAAATTATATAATTTTTGATCAGGATCAACAGCCGAGTC:1 + chr4 1020070 5' + INE-1 92 1 76.47 ATATTTGATTGTGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 + chr3R 12242222 5' + transib2 28 1 66.44 ATTGGCTTAATAGGCCAAGACATCTGAAATTGCATTTTTATTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTA:1 + chr3L 23212697 5' - Ivk 5297 1 73.97 AAGCTCGTGTAATGAATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 4063941 5' + roo 56 2 56.85 ATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:3 - chr4 373032 5' + pogo 86 1 78.08 AAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3L 7889583 5' + roo 86 2 83.56 ATGAGGCTTGAAATAATGCTTGATTAATAGAAAAGTAAATGTTATACCCGTATACTTGTAGAGTAAAATGGTATGCTAGATTCGTTGAATATATATTGTAGAATACATATTCTTGATCAGGATCAA:1 - chrX 22511428 5' + INE-1 82 1 53.97 GGACATAGTTACATATTTATTCTGCCCTAGTAGTCCGATTCAAAGATTGGTGGCAGGGGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 5768985 5' - roo 9053 2 67.19 AATGAATGTTAATGACCTATTCGGAAGATATAAATATTTAATTGATGGGAAGTGTTGAGCTACAGCTCTTCAAACTCAATTTAAATTTTAAACTTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAATTTTTTTTTTGAAA:2 - chr3R 17166970 5' - Stalker 6759 1 65.75 AAAATTTATTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr2L 7660873 5' - I-element 5333 1 67.59 CGCCAAAAGAATTTTGAAAGAACCTGAGATATGCAAGCACGCTCGCTATTTGTCTGTCATTTCAACACTATTAGCTTTTCAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTGAGCTCCGATTTTTATTTTGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCT:1 + chr2L 22732450 5' + Cr1a 68 1 74.66 ATTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGATATCTGAAGAATTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chrY 9413 5' + roo 78 2 72.60 GTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTTATATATAATTCATTCGGCATTCCCCAGGCTTCGGG:1 - chr2R 2427625 5' + Doc 6 1 69.47 CTTCCCTTTGGTGTTGGTTGCTATTTATTTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCATAAATTAATACCTCCTA:1 - chr3R 25709904 5' + hopper 28 1 61.64 GGGGGCGTCGGCGAATCGCTGCGTGGCTCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr3R 13875015 5' + P-element 34 1 60.96 ATTAATGCGCCCTTAACCGGAAAAAACAATTCTGCAAATGGGGAAATTTAAATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 26178506 5' + 412 20 2 67.15 ATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCT:2 + chr3R 4805614 5' - 1360 3319 1 65.07 ATGAGCTATTGAAGTAAGTTTGTCCAGGACAATAGTAGAGGCCTCCTGCCCAGTTAGTTGCATTGAGATAACAATATATGTACCTTATTATGAAAAAAGTTAAAGGGAGATGGATGGGGGGAGAAGGAGATGTGGGTGGTAATATG:1 - chr3L 8809212 5' - transib4 2406 1 65.07 GTACAACATCGAATGGCTATCCAGAAACGAAGCTGACATCACCGACTGGCTAAGTGGAACGGCCGCGCTGCTGGGGAACTGTCAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 13302138 5' - roo 9026 1 44.14 TTACATACGGAGCATTCACTATCATCCAGGTGGTGGGTCAAGATCGCGCAATGCAGTTGATGGAGAATAAACCATACCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGGAAAGGGTCGAACATTCAATTTCGTTCCATTTGCTGTCAGATTTATT:1 - chrX 3463422 5' + GATE 405 1 48.97 CCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 - chr2L 4003761 5' - mdg1 7374 2 74.66 AAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chrX 18817253 5' - transib2 2787 1 60.27 ATAGTTGAATTGAAAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 20167542 5' - roo 9045 1 64.38 GTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr2R 17796541 5' + jockey 4725 1 54.11 TAGGGGGAAGTCCCCACTCCATCTGCTATTTTGAAGTCTGCCCAACACACACACGCACATAAGATGCTTATCCTTGGCTCTATCACATACACACACACACACACATAT:1 + chr2L 9315183 5' + accord 7029 2 46.30 TAATAAAAACGTATCAAAACATTTTTTAAAAGTGGGTACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCT:1 + chrX 2799680 5' + 17.6 145 2 58.89 TGCCGCCATCCTGGCCACCGGCTCGTCTTTTTTTTGCACGTCTGCGGCTATTTACATTTAAATTTTTCCTTTGTTTTTTTTTTTCTCTTTGTGG:1 - chr3L 17299653 5' - I-element 109 1 62.77 GACGGACTTTTGAATTCACAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAA:1 - chr3R 19449454 5' + roo 8643 1 60.00 TTTTTTTTTTTGAGTTTTCAAACAATTTGTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTTTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 + chrX 2479450 5' - mdg3 244 2 72.00 GTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chrX 8437736 5' + P-element 52 1 38.84 ATTTACCATTTACGTCGATTGGCGGGCTTGTGCAATTTCTGGGCGTTAGAGTGGGCGTAGCAACATGGTTCAACAAACTTGCGCTGCGTCCTTGCCTTCTAGCTTTTATAGTATTTGAGATCTTGACGTTCATACGGACAGATG:1 - chrX 11455176 5' - INE-1 128 1 72.22 CTTGTATATATATTTTTTGTATTATTATTTTCAAATTGACTAAAAAAAACGTATAGTTGTTCATTCGAAATTTTATTTATTTATTTATTATTTTTTTTTATAGACTTTATTAAGGCTGAGGGGTAGCTGAAAACCCCATGGTCACC:1 - chr3R 24395038 5' - BS3 1733 1 80.82 CCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:2 + chr3R 4679445 5' - hopper2 1552 1 54.11 TTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTT:1 + chrX 21639590 5' - gypsy5 376 2 62.33 TGGGACTTTCCTTCAAGACGACCGTTACAAAAAAAGGTTGCTACCTGAGCGTCAGACCCAAAATACATATACACAGATATACACATACACATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCG:1 + chr2R 15378642 5' - Stalker4 145 4 63.70 AGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:2 - chr3R 29690794 5' - I-element 5298 1 58.22 GTCACANACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGAC:1 + chr3R 9038946 5' + Juan 4089 1 71.23 CAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAAT:1 + chr3R 15363911 5' + flea 56 2 57.53 ATTTATACACAAGCACTGGAAGCTTGTCCGGAAAAGTTATATGAGCTGATTTCCACGAAAGTCTATGCGATTTTCAAAACTTGATGTCATTTTTCTCTAATAAAAATTATCAAAACGTTATTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTT:1 + chr4 263264 5' - INE-1 245 1 58.22 CAAGCGTCGTGCTCCTTCACCTTCGTCAAGTGCTCCAGTGACAGAAAGAAGTCAGCGCAAGCACTTTCGACATCCGCTTTTGTGTTCTCGTTCGATAGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3R 31585273 5' + F-element 49 1 60.96 ATTAAGATTATTCCGCATTGGTTTATGGTTAACATGCCCAAATTACGACCTACCTCAATATTGTGTTTTCTTTTGTATGCCTTCAAAAACTGAAAGTTTTTTTTTTCTTTTTTGTTAAATATTT:1 - chr2L 18418097 5' - TART-B 10508 3 56.45 ATTAATTTTAAAAAGGAACAGAATTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chrX 18010064 5' + 412 42 2 54.11 ATGGTCACAAATGCCTCTCACTGCGTTGGAAACCTCTGACTGAACTGAAGAGAGCACATATATTTTTATCTATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTC:1 - chr4 102327 5' + mdg3 5386 2 61.54 GTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCGCAATTTCATCATCGTTTTCAGCGTAATGCGAAACAAGAAAGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 - chr3R 26504335 5' - HMS-Beagle 204 2 56.85 TGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAGATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCATTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr2L 14074556 5' + 297 53 2 56.16 AAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTT:2 - chrX 22906785 5' - Transib-N1_DM 33 1 69.86 TTTCGCATTTATTTTAGCTATAAAAATACATTTATTGAAGGAATTGATATATGCCAATTAAATGGTGTATTTTTAATTTCTTTCAATAAAAACATAATTGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 + chrX 23205134 5' + 3S18 5786 2 69.18 AACTAATATTTCAGATGTAGTTTCCCAACTACTTAAAACTAGTATTGAAATTTTCCCTTCGATATATTTGTTAGAGGTGTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAGC:1 - chr2R 4187578 5' - X-element 394 1 60.27 ATTATATTATTTTGTATGAATCTACATTTTCTTTCTGTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATA:1 + chr2L 13844120 5' - Stalker2 7628 2 67.81 TTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAATTCGTGCCCCTCAGGCCAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCTCAAACCTCTT:1 + chrX 17343398 5' + I-element 57 1 56.59 GTTGCTGTCTGCTTGACTTGGATAGGTTTGGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAA:1 - chr3R 9298731 5' + hopper 478 1 74.79 TTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGCGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr2R 12779753 5' + I-element 29 1 66.44 ATACCTGTACAGCCCTTCACCATATTGCACTTCAATCGCTCATAAAGCTTACTCCGGCAACTGTCGTTATCATTATAAATTACCATAGCTATCTGAGTCCCTAGTCCAGAAGCCAAAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAAC:1 + chrX 5176566 5' + gypsy3 6823 2 75.71 AGTGTTTTCAAAATGAAATTCTTGGTGAGTGTTTTTAAAGTTAATGCAAGACAACAGATTCTTTAATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATA:1 + chr2L 16329996 5' - jockey 4574 1 56.16 ATATCTGTGCTCACACACAAGCACACACACACACACACA:1 + chr2L 11226603 5' + accord 180 2 84.62 ATATGTAGGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCCGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2R 17796537 5' + jockey 4721 1 50.00 TAATAATTTTTTTTATTATTATTATTATTAATTAAGGGAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAG:1 - chr3L 3999196 5' - Tc1 1463 1 51.90 ACAATAGTCGGATCAAGAATTGGTTTTCCTTTGTCTATGGGTTATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACGCGGTACT:1 + chr2L 12818215 5' - hobo 2903 1 58.57 AGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr3L 18126020 5' + Ivk 34 1 55.17 CGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAA:1 + chr3R 10270551 5' + Juan 4067 1 56.16 ATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGT:1 + chrX 22596350 5' - INE-1 542 1 70.55 CTGCGTTTTATCGCAATCGACGAAATGGTGATGGCTTTTTCGAACACCGCCTGCTGGTTGTTGTTGCTCGGATGGCTGCTGCTGCTGATCTGATTGATCGGGCCAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATT:1 - chr3R 17966738 5' + copia 4665 1 76.71 CAAATAAATAAATAAAATAATTGCTAAATAATTAAAGCAAATACAAAGGAAATTATTATAACTACTGTAATTAGAAACATCCAAATTATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATTAGAATAGCATATTTGTGATTAGAGTA:1 - chr3R 7302940 5' + 1360 399 1 43.45 GGCACTCCAATCAATAATCTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chr2R 15326993 5' + copia 4886 2 60.27 AGGGTTGGACAAGCTTTATAAAAACAAAAATAAACATATAAATGGTACTGTAAAAAGTACTAGGCGTGGACTAAATCGGAAAATCATCAAGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATGGTATGGCGTTACG:1 - chr2R 10023448 5' - 1360 25 1 65.38 ATAATACCCTTAACGCACGCCAGGTGAGTGTTGCCCCCGGGGGGGCACGGGAAGTTCCGTTCGGTTCAGTTGGGTCGGGGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGGCAATATATCGT:1 + chr3R 22287938 5' + transib2 41 1 51.37 AGACGATGCAGGGTGGCATAGGCATACCCCGCATAATCTGGTGCGGCAGCGAGGGCGACTACAATGTGATGGGGATGGAGCTAATCAAAAACAACGCGTATTTCTCGTTTGTTTCTACGGAAACGCTCAAGCCCTTTCAAGACCAG:1 - chr3R 31057661 5' + Doc4-element 99 1 55.48 ATATGCAACAGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 - chr3R 23618239 5' + hopper 27 1 60.80 TGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:2 - chrX 5323164 5' - Juan 4193 1 32.88 ATAAAATATGTAATTAAATATAGATACAACATTTTTTTTCTTTACGATATTCAACGTGGTACTCAAAGAGACCACCATTGCACACTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTTGGCAGAAATTTGAAATGATGACCTATCTTCACC:1 - chr2L 13528783 5' - transib1 2107 1 74.29 TTTACAAGGAAATCTGGGGTAGCCTTAAGCGGATTGCTCTTACTTGCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATA:1 - chr3L 16973510 5' - S-element 1701 1 73.29 AGCACCACCAGTTCCAAACTCAAAGCCCAGCCTACCCTAATGTATACATTAACATCCGCTGCCGCATTCACGACTCCCACCAGAGGGGCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCAAAACGTTCCACGTTGCT:1 - chrX 14627732 5' + Quasimodo 372 2 79.10 AATATTTCTCCAAGTGCTCGTGAGCAATTGTTGGAAAATGGGCAGTGGGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGGTAGG:1 + chrX 14522624 5' - jockey 474 1 56.14 CTTAGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATT:1 + chr2R 5674641 5' + S-element 65 1 65.07 TACACAGCAAAGATATCAAGTGAACTTTTTGAATGGGCTAAACAAGGTAATATTAAACTAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTA:1 - chr2L 5776025 5' + Juan 395 1 59.59 AGGAGGTAGTGTATTGTCATCGCTGTGAAAGTTTCGTGTGCGGCCACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGGGTT:1 - chr2L 15574390 5' - HMS-Beagle2 59 2 70.29 AGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATC:1 - chr3R 27083095 5' + jockey 4621 1 79.45 CGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 - chr2R 20349040 5' - transib2 2747 1 70.55 AATTTGTCATTAGCATGCTCGATTAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 7719857 5' + roo 8689 2 68.49 TTATGAACTTTGGACGACGCCGGTGATTACGCACGCAATGAGGTGGGGGGGCATGATCATTGAGTTCTTATGCGAACGGGGTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATT:1 - chr3R 13760799 5' - roo 8612 1 55.48 GGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATA:1 + chr2L 17005665 5' - Stalker2 7628 2 60.96 GTCTGGTGAGAACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGA:1 + chr2R 4188950 5' - S-element 1695 1 67.59 ATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:2 - chr3R 7317678 5' - I-element 5304 1 52.05 AAAAGGCCCGGACTTGTATTTATACGAATCAAAGGCAGTCAGTCGCTGCAGGCTGCAGCTGAATTCAAGTTGACTGCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGG:1 + chrX 13554287 5' + opus 7486 2 52.05 AGGGACAGTGCCATCGGGCTGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2L 4713993 5' + transib2 26 1 67.36 GATTGAAATCTGAGCAAACGCAACGCCTTTCTTTTTTCGATCTGTTCACTGAGTATATAGTTTAATAGTTCGCCAGTTTTTCAAGAGTTGTTCTTTTCAGGTGCTGTAGTTGCTGATGCTGTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTT:1 + chrX 1098269 5' + hopper 148 109 51.37 AAATTGATAAAAAAAAAATATACCCTCCC:1 - chr2R 15696572 5' - Tc1-2 1357 1 93.10 ATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 7889658 5' - roo 352 2 58.57 CCAAAAGGTAAGAGATCTGGGGCTAATTGAAGGGGGCAACTAAGGCAACTAGCAAATAGCTGGAATTCGGACAATTATTGTTTCCAGCATTGGGTCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCG:1 - chr3R 17180485 5' + Gypsy6A_LTR 109 1 63.70 AATCGTGAATGGTCAAATACTTACTATGCTTGCAAATAAAAGGCTTTCACTCTTTTATGCTGGTCATAAAAGAAAACACTTCTTTTTGTTAATAAATTTCTAGAATCTTGGTTTCCAATATTCTAACTCAAACTACATTTTTTTTG:1 - chr3R 24088613 5' - invader5 3616 1 52.74 AGTTTGTTTTCCTTTATTTTCGAAGGGTATACTCTTGAATGATTGGTTGCTATAACTTTGAAAGAAGCTATTAGTGTTTCGCAACAGAAAACCAAATCGTGCTGAATTCGTCATTTAATATTACTTTATTACTTTTACTGAAATAG:1 - chr3L 13337304 5' - Tabor 454 2 52.05 GTTTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAATCCCAAAAGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 19449978 5' - roo 389 2 65.15 GAACACGATGCGGCGGCAAAGGTCAAAACGTTTTGGCCAAAGTCAAGCTGCAAACACTTTCCACCCTCCTCCTTCCTCACCGCCCCTTTTTTTCTTCTTCGCCTTTGCCGGGCTTAGAAAGTTTTTATTTCTTTCGGCGTTT:1 + chr3R 8957374 5' + Tom1 335 1 56.34 GATTAAAACATCTTATTAAAGCTAGTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 2145869 5' + roo 8704 2 52.74 TATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATA:1 + chr3R 19450148 5' - roo 90 2 62.33 GATAACATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 30675500 5' + 297 11 2 74.66 TTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTGGTCGTCTGTAGG:1 - chr2L 7580999 5' - Transpac 238 2 67.81 GTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr2L 20821175 5' - Burdock 237 2 55.48 TGGAGAAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr2R 13168613 5' + P-element 10 2 76.92 ATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGGGGGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCTCACATGAACACGAATATTTTTAAAGACT:1 + chr2R 23180169 5' + roo 8677 2 70.59 ATCTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGC:1 + chrX 15903127 5' + INE-1 86 1 73.29 TTAACATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:3 - chr3L 7889672 5' - roo 360 2 52.74 AAAACAAAAAGTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:2 - chr3L 6447162 5' - transib2 2801 1 69.86 ATATGAGCCGTGATCGCGGGATACAGAGCACTGTTTCTGTCTCGCTCTAGCCTGGATGTGGGTGGAAGGTCGTGGTGGGGGAGTTGAGGGTATTTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGGTGTTGGTGTACGTGTAGATGAATTAGGCG:1 - chrX 12580854 5' - Porto1 416 1 56.16 GTGGTGAAAACTTTCCCACTGCCCCTATGTACATTACACTTAAAGGAGACCAAACGAAATTAATATTGGAACATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATTTAAAAAAA:1 + chr2L 16584508 5' - FB 174 2 72.38 TATTGCAACGTCAAAAGCGACGGCCGGCAAACGGCGACCTCAACAATGGCGTGTGTGCATGTGTGTGTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGATTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr3R 27843259 5' - I-element 5301 1 54.11 TTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:2 - chr3L 16470346 5' + jockey 4753 1 72.60 ACATCCATGTATTGTTGCTCTTGCGAATGCCATAGCTTGCTGCATGTTGCAGGCACTTCTCGCGTGGTTTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTGG:1 + chrX 8201081 5' - flea 4674 1 65.74 ATATAGTTATACTTTCTATATGCATTATTATGCATTAACAAATTCTTATATTGCACAAATATGTATAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGT:1 + chr3R 20078807 5' - HMS-Beagle2 7077 2 55.48 TATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTT:1 - chr3L 3501860 5' - Bari1 1689 1 66.44 CACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr3R 15882605 5' + jockey 91 1 72.60 GCTTGTATTCCTGTTTATGCGCCAACGCCTCCTGCTCTCCTGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACC:1 + chr3L 14723068 5' + F-element 424 1 70.00 AAGTGTGAATTTAAAATTCCTTTGCTCGTAAATATGTATGCTTTAAATCAATTTTCCAGCTTTTATAGTTACTGAGAACTCGACGTTCATAGGGACGGACGGACATGGCTAGATCCACTCGGCTAATGATCCTGTTCAAGAATATA:2 + chr4 815310 5' - INE-1 83 1 60.96 CTGATAGTTAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGTAAAGCTCTATTAACATCTAAGGTAGTAAATGAAGGACAGCCCTAAAAAAAAAATTGAAAGAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGAACTTTTGGAACTTTTTCGAAAATTCATATCT:1 + chr2R 4330779 5' - FB 122 1 49.32 GTAAACCACGCAAAATAGGATTAGTTATTATAATTTCATAGAAAGAAGCTACGTTTTTTGCCAGCTGGATCGCAGTTGTTTTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAGTTTATTTTCTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTTTA:1 + chr2R 10538915 5' - 1360 338 1 55.48 ATATCTATAATAATATCTCTCTCTCCAGAGTCTAAGGTATTCTCGCAGATATCCCCAATGCCCGGCATTTTGTCACGGATGACTCTGTCTAGTCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATAT:1 + chr2R 3681703 5' + mdg3 98 2 58.90 CCACTTGTCGCTTTGAATAGAACCTCCAGAAATGTCCTTTTGCGCCTCGTAACTCGAAATTACCAGTATTTTTATGGCATGCCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 28146232 5' + roo 8678 2 64.46 ATTCTGCACTTGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:3 - chr3R 18488497 5' - roo 9041 1 61.64 TTTCTTAAAAAATTTAATGTTAAGAAAGTAGCACATATTCTGAATATCACTTGCATTTAAAACACGCATATTTTCTACTAATAAAAATTTGAAAAAATATCAATATCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTTAACCTTCTA:1 - chr3L 9237641 5' - INE-1 171 1 27.40 ATTAAAGCCAAGAAAATCGAAGAAAACCAAGCACGACAACCTCACCTCCGCCGCATCGAGTTACTAATTTTTACGGCAAGTTAAATATAAGTCATTCAAGTTGAATATATTTAAAGCCTTAAAA:1 + chr2L 20341041 5' + roo 8682 2 50.81 TTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1 - chr2L 17180139 5' + Juan 68 1 60.96 TAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAA:1 + chr2R 4188998 5' + S-element 68 1 68.06 GCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGG:1 + chr3L 3501716 5' + Bari1 64 1 60.96 TGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 + chr3R 20441254 5' - I-element 5273 1 72.60 GGGCAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTTTAACTATTTTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 + chr3R 27083006 5' - jockey 4965 1 60.96 ACCTGAAGAAAGGGCAGGCCCATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAACCCGAA:1 - chr2R 22106699 5' + Porto1 4349 1 72.63 ATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:2 - chrX 15357760 5' + hopper 61 1 58.90 GAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCATAAAT:1 - chr2R 20349034 5' - transib2 2752 1 71.11 CATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chr3R 7719686 5' - roo 9045 1 67.12 ACTGTTGGCGTTAAAATTGCACTTATAACTTACTAAAAACTCATAATCAATTGGAAGAACTTATCAACATGAGTTGATGAGATTGATTTTAAAATGTCTATTGTTTGTACCAGCTCCAGCCCAACTACGATTAGCAAGCACTCTTA:1 + chr3R 15676301 5' - baggins 148 1 66.44 ACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 + chr3L 10373811 5' - 297 6929 2 56.43 ATTTGCCGGGTTAAGCCCAGCCAGACTTAGCAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 12315678 5' - transib3 2848 2 74.48 AACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 11062748 5' + roo 8723 2 66.41 CAATGTTCAGATGGCACAGTTGGTTCAGCNCCTCCTGGAAGGCGTGCACCTCGCCTCGTTCGTTTCTTCGATCAGAATAAATTTCGGCCCGAGAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTCTTA:1 - chr3R 30853622 5' + 1360 3235 1 61.64 ATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGG:1 - chr2R 17317515 5' - copia 4800 1 64.80 GGAAAGGCATTTTGTGATGCTCAGCATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGT:1 - chr3L 11844849 5' + rover 29 2 62.33 ATCCCACATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAATAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 13973095 5' - 412 477 2 73.29 GTTCTGCCTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGTGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr2R 22514185 5' - P-element 2812 1 32.88 AAAAAAGGAAATAACCCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGTAATCACGGAACTTAAGGAACA:1 - chrX 15993410 5' + F-element 4425 1 69.93 CATAATGACATTGGCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 8308523 5' - roo 9036 1 62.33 TTAGAGCTCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2R 7303993 5' - pogo 2063 1 62.33 ACAGTCAATGGACCGCCGAGGATGCTCGGCTCTGGCTCTCCTTCCTCAACGCACACACATCCTGGCAGAACTTTGGCATTGTATTCAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTAT:1 + chr3R 25712133 5' + hopper2 1358 2 60.69 ATAAATCAAAGTACTCCAGTAGAAACCAAACTAATGAATACTCACTCGCATTTACTATTATCTTTCTTGTTTTCAATTTTTCTTTTTGAATATGGACTATTTATCCAAATACAATTTTCTGTTTATTATTATTATTATTATTATTA:1 + chrX 3290098 5' - mdg1 27 8 72.60 AAACCGAATCTTAAACCAGAAACCGACTAAACTCGAACACAATTAAACAACAATAAATCCTCGAAACAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGA:1 - chrX 15834334 5' - pogo 215 1 54.79 CAGCCACTGTGGGGTTAATGAACTCCATCTAATTGGGTTACCACTCACCGGTTAGTGGTTAGCTCAACCAAAAAATACTACTTACAAAATGCAAATTAGTCGCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTC:1 - chr3L 9567523 5' + copia 4733 1 74.45 ACCCTGGTTGATATTTTCTTGGTTGTTATCCTTCTCGCTGGCGGCGGGCGTGTGATTTGCTTGGTATCGACATTTTAATGATGTGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAAGTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCC:1 + chr3R 23276510 5' + Cr1a 107 1 59.59 CATATTAAGCGTCCCTCTTGGAGGAAATATCTGGTCCTTCTTAGGAGTTCTTCTGGGCTATTTAAAAATCTAATTTATCCGATTCATAAGCCCTAGTGGGATTATGCCTTCGTACTGAGACAAAAACCTCCGTGTGCTCTTCAG:1 - 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Ivk 5342 1 57.93 ATAATTAAGTGCTGACCCAATTTGGTGTTATATTTCGCCTGAACACCTTGCAAAATACATTTTTGTTAGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCATCATGTT:3 + chr3L 4535351 5' - Dm88 4205 1 65.75 TAATGCAAAAAGTATTGCACATAATGAGTGCCGCTTCAGTTTATTCAGCTCAAATATTTGCTTGACATATATATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 5533047 5' + roo 44 2 54.79 AGCCGCCCGAGCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTCTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGAATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTAATGATATAG:1 + chr3R 23618157 5' - hopper 1322 1 76.03 CGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAA:1 - chr3R 27765167 5' + mdg1 82 2 73.29 GTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTT:1 - chrX 22689438 5' - 1360 3365 1 51.82 TAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGTGGGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3R 28469206 5' + 412 7107 2 59.40 TGGGAGTATCTGGGTGTGCTGGCCGACCATGAAAGGTCGTCGATGAGTCGTCGACTTGCCATCCAACTCACGTTACTTTTGTGGTAAAGCCCAAGACAGCTTATTTTTATTGCCCATTTAAAAATGCGAATTAACTTAACCAAACA:1 + chr3L 18163749 5' - HB 282 1 67.12 ATATATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr2L 16539602 5' - Juan 4203 1 77.40 AAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAA:1 - chr2L 17005825 5' + Stalker2 7277 2 61.19 ATTAATGCTAAAAAAGGAAGTCACAGAATTGGTACAACTACGAGGAATTAGGTTTACACAAACGGCGAAGTAGTTACCTTGCAACGTTCGAGGTAGGAGGTACAGCAAAAACACTGTGCTGTAATAATGGTAATGCATTTTTGTGT:1 - chr3L 26291036 5' - Tabor 7319 2 77.40 TGGTAGATTAAGGTATCACTGGTATCACTGCTTGTGAAGCGAAATAAGCCCTTGAAGTGAGTGTTATATCTCATTCTATTTATTTTAGTTCCAAATGTAATCGTTCAGTCAATTCAGCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAG:1 - chr2R 18777907 5' - G5 4770 1 56.55 TATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr3L 22400261 5' + 1360 62 1 58.90 GAGGCGCGTTTTGAATGTGTCCTTTGTTTTTGTTGCTGCTTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAG:1 + chr2R 11999091 5' + S-element 394 1 76.71 TCTCCCCTCCACCCCGCCGACTCATTTTGGTCGGTTTTTTATGCAAAACACTTGACAGCCTCATTAGTATTGAAACGGTCAAAGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr2R 20227374 5' + hopper 6 2 78.77 CTTTCCACGGAGTGGAAAAAGGACCTGAAATTGATGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAATAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTCTTAGCTCCGACAGAAGCC:1 + chrX 12973639 5' + F-element 389 1 74.13 ATTGGCCCAGTCTCAAGGCGATCTTGGCACACTTTGAGCATAAATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTA:1 + chrX 1263905 5' - Burdock 6376 2 71.43 GAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 18396037 5' - roo 9054 2 63.01 CTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGAAACTTAAAAATGCA:1 - chr3L 8627344 5' - pogo 2054 1 54.79 GGACGTGCTTCGTATTGGCTGCTTGAATTCACATTATTATTGTAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGAGGGGTTTCAGTACGGGATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCCAGACTAAGGGG:1 + chrX 22679338 5' - Doc2-element 4309 1 63.85 GAACTTTTCATTTGGTAGCTAATTTATATCGACCAACTGGTGTATACCGAATGAGAACAATTTTCCGATTATCCCAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAG:1 + chr2R 5151207 5' - roo 394 1 66.96 GAGGGAGGGAGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 21224519 5' + roo 35 2 59.71 AAATTGAATTGCTCGGCATGAACTCGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr2L 10156220 5' + hopper 51 1 53.42 TATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGNNTAAAACAAAAACGTAATTGNNNNNNATCACAAACATTTGCGCAGATCGCGTGCTTA:1 + chr2R 22287445 5' + jockey 94 1 67.81 ATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 - chr3R 18093359 5' + I-element 77 1 68.97 AAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3L 17940175 5' + 1360 63 1 71.09 AGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAAT:4 + chrX 19038367 5' - hopper 1355 1 60.27 AAAATTTTGATATGTTCAAAATTCAGGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr2R 19527602 5' + 1360 82 1 81.25 CCATTTGACGCCTAATAGGAGCCACCGCCGCCGTTTCAGTTGAAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTA:1 - chr2L 20840049 5' + mdg1 85 2 70.55 ATATGACGCAACCTAGTGTTTTTGGAAGTATTAGTAAGAAATCTAAAAAGATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGT:1 + chr4 311647 5' - 1360 3225 1 66.35 ATTGTTACCAAATTTGGGAATGGCAAATATTCAGAGTGGATTTCTCAGTTTGCGCATAACCCAGTTTCTGGTTTATAAATACAGACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACT:1 + chr2L 13585676 5' + Idefix 26 2 65.75 AGTTGTTGGGCAACTTCAAAGCTGGAAGTCGTATTTAAACCGTGCTTTTAGCACATATTCCGCGTGTCAACAGCTTGTATTTTGATCGTAAACTGCAACTTGTAAGCAACATGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGCATTTGT:1 + chr3L 17567820 5' + S-element 1532 1 76.03 AAAAAGTAGCATGTAATAGCAAATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 - 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P-element 2851 1 56.82 AAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAA:5 + chr2R 3338781 5' + Juan 57 1 55.48 ACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chr2L 12250980 5' + 412 7126 2 68.28 GTAATGTGTGCGTCTACCCTTTCTCGAAATACGCATCTTCTCGCTGCTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCGTTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCAT:1 + chr2L 1427005 5' + diver2 4703 2 67.20 ATATATGAACAAAACAATCAGGAGAAACGCTATATTAGATAAGAGAAGATATAGATATAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 + chrX 20373552 5' - 297 367 2 54.79 GCCACTTCTTTCCGCTCGAAACCAGGAGAGGGCCTCCTCATCCTTCGAGTCCGAATCTTTGCCCTCAATCGCTCGGATGCCAGATGGCCATTTGGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 + chr3R 15807299 5' + FB 11 1 75.34 CATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr2L 12250991 5' + 412 63 2 60.96 CAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2L 18549811 5' + roo 8671 2 72.22 TTTATGTATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 - chr2L 11839753 5' - mdg1 364 2 51.37 GGGTACGCCATATCGATGTCGATTAGCAGCCATATTTATATAATTGTTTGTTCAGCTTTAGCGTTCGACTTTAGCACTTCTTAGTGCCTATTTGTTTAATTTCTACTATTTTCTTATCCTTAATTATACAAATTCATTTTCTACTC:1 - chr2L 9906009 5' - invader2 4721 1 71.23 AATAAAACATAATATAAACGAATAAGATCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 20265920 5' - roo 9029 1 54.79 TGTGTAATAGTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 27160037 5' - 412 7522 2 66.18 AATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAA:1 - 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roo 343 2 62.33 AATACCCTAACTAACTAAATATTTTGATAATCATAAGCACTCCATATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGC:3 + chr2R 21410822 5' - Burdock 238 2 72.60 GTATTATAATATTTTCCAATAATTGTTACTTTAAAATCAGAAAATCAGAGAAGCGGCGAAAAGTGGAGACCTCAAAATATCAGAATAGAAGTTATGGAAAAGAAGAAAAACTAAAAAAAAATTGTAAAATGTT:1 - chrX 20918622 5' + Tc1 52 1 83.46 GATTGCTTTTGGCCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGT:2 + chr3R 8051084 5' + jockey 4782 1 69.86 TATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTCCCT:1 - chr2R 5531213 5' + 1360 72 1 62.40 ATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCAAATCCAAAATATAAAGAAATAAGTAATTACACTCAATACGGTATATACTTGATTAATAATAAAGACAATAAACTAAAAAT:1 + chr3L 15103782 5' + Transpac 4760 1 76.36 AATGGTTAGCTGGCCCTCCGGATCACGATGACTTAATTAAAATACAGAATAAAATAAACGACTTAATTAAAAACAAAATTATCGATTTCAATAAACAAGTTACAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGAA:1 - chr3R 2337512 5' + Idefix 7154 2 53.42 ATATATATTTGTATTTAATTAAATCAAATAAAACGTAGGCAATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCAACTA:1 + chr3R 10121548 5' + Doc3-element 4557 1 77.40 CAACTATTTCAAGTTTAGAAATATTATTGTTCTTTCCCTTGTTTATTATACCCGTGAAAGGGTATACTAAATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACCGTATGTATGTTCTTGATCAGGATCAATACCC:1 + chr2R 25217533 5' + INE-1 87 1 69.86 ACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3R 17421316 5' - pogo 2053 1 56.85 AACAACACGGCAGGCTGTGCTTCTCCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 - chr3L 5061690 5' + 17.6 6943 1 73.29 TTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:2 + chr3R 16341947 5' - P-element 2816 1 36.99 CTATGTGGATAATACGACACCGCTGCACAAGCCACATATCTCCTGGATCCTTAGAGAGTAATTCAAAACCAAAGCCGAAAATGTAACGAAAATAACATCAGTTTAAGCAAAAGGTCGTATATTTTACAACAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - 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chr2L 15351067 5' + Juan 3784 1 67.61 ATGCAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 21224538 5' + roo 8725 2 60.96 GGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGCCCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 + chr3R 13875077 5' - P-element 2804 1 17.04 GAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGTTCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr2R 21926354 5' - opus 7467 2 50.00 ATTTAGGTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGATCGCCAAA:1 - chr3L 14720890 5' + F-element 70 1 63.93 ACAAGGCTCCAAAGAAAGATCCCACAGAAATCTGGGAATAAAACACAAAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCAATGGAGGGACCCAACAAT:1 - chr3L 16757087 5' + Porto1 366 1 62.90 GCCAAGGCAACTGCAGTTGCTGCAATTGCCAATCTAACAGCAAAACTCACCTTTTATTTTTTTTTATTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGG:1 - chr2L 3000030 5' - F-element 4510 1 57.93 AATTCATTTGTTTGGCGCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTAAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTGTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 13972920 5' + 412 7085 2 63.01 ATGCGAAACAATTCATATATATGTGTATAGAGCCGTGCAGATATGATATATGTATGTGTTTATGCACTAAGGCGTATCGGAAAGTGGGAGTGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGAT:1 + chrX 21357612 5' - R1A1-element 5296 1 61.64 CTACAATACCGTAAAAAATATGTTTCCTTTGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTG:1 + chr3R 26648440 5' - Stalker2 7266 2 79.31 ATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:2 - chr3L 23456278 5' - 1360 3336 1 57.53 AAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTC:1 - chr3R 2520351 5' - Tc1-2 1607 1 59.59 GTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATG:2 + chrX 5323237 5' + Juan 4112 1 60.96 ATGGCCATGGCTGGTGGGAAAATTGTCGATGGCGTTCTTTTTTTTTTTCATTTGGTTCTTTTGCAAAAGGGATTTCTCTTTCTTTCGCTTTTGTCATTTT:1 - 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chr3R 15791037 5' - roo 9041 1 64.38 GCTCATTTGCGTGGCATATTCAGAGCCAGGGGTATGCAACAATTTTATTATTACGTTTATTTGACTTGCATATGTGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCAACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 + chr2R 18316013 5' + HMS-Beagle2 6926 2 56.16 AATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 16033423 5' + Doc 40 1 52.14 AATCCCAACCGCCCATAGAAAACACCGATCAGACAAAAGACATAAGCGTCAGGCGATCTTAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTT:1 - chr3R 23431885 5' + I-element 4998 1 59.59 AAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:1 + chr2L 17005670 5' - Stalker2 375 2 57.53 TAATAAAAATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGTTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 18226764 5' - roo 356 2 54.79 AACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 4964186 5' + roo 8730 2 69.72 CTAAGAACGTATCATTTTCGGAAAGCAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 17878659 5' + Doc 44 1 56.85 GGTGAGAACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTT:1 + chr2R 4188954 5' - S-element 1690 1 64.38 AAAGACTGAGTGGCATGCAACGGCTGCGGCTTCCCGTTGGACCGTCGGTTTGGACGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATG:1 + chr3L 12590697 5' - G2 81 1 70.41 TTGGAATCAAGTAATTTACGCGCCATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - chr3R 27406082 5' - diver 6068 2 52.05 CGAGGAAAAGTGAGCAGTAAGAGCGTGCAATTGTTTGTCCCTTTCGACTGCCTGTGTAATTACCAATTGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2L 6647741 5' + mdg3 52 2 50.68 CGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 2544646 5' + Tirant 12 2 56.92 ATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chr3R 11937267 5' + flea 26 2 69.18 AGTCTGTGCAGGAAGAGCGGCTCCCTGCACTTGTCCCATAAAACTCTGGTGAGTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAA:1 + chr2L 13010318 5' + G-element 3963 1 53.10 TTATATTCTTCTTTATGTCTTTCCGATTTTGGAGGTAGCTCGCCATGTGAAAGGAAATAATTACTTTATTTGTTGATTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 + chr2L 1074503 5' - accord 139 2 65.75 TCTATAATGAAACCACAAAGAATCTACAAATCCTTTAAAAAACACAATAAGTTATATAAGCAGAAAGCTATCTATTTAAATTATCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTT:1 + chr3L 5192412 5' + 297 6839 2 54.79 ATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGT:1 - chrX 15200929 5' - 17.6 423 2 69.18 AAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr2R 8047344 5' - 1360 3320 1 67.12 TTATGGGTTGGGAGTAGATGAAGGAGTCAATTAGTTGAATTTTGGTAATGGTAACATAGGGGTTGGGGATTGGACATAGATTTAGTATTAATATTAAAAGTAAGTATTTTTGTAAACATTGGGTTTTCGACAGTAACATGGACTGG:1 - chrX 6226393 5' - HeT-A 5864 1 57.53 AACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 + chr3R 17996149 5' + diver 44 2 54.11 ACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chr2L 8338219 5' - P-element 2836 1 51.37 AAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 - chr3L 14720916 5' + F-element 46 1 51.61 TTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAACCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr3R 4679425 5' - hopper 1379 1 58.22 TATCCATCCGCGTAAAAGGTTGTGACATAATGAGGCGACAGATCGCTACTCGATCCGATCGCTTGCGCCTTTTGCGCCACGATTCGGGAAATGCGCCAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 11369591 5' + Rt1a 5078 4 82.93 ATCTACAAAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:2 + chr2R 21410867 5' - Burdock 194 2 60.27 CTGCGTGAGGAATCCCCAGGGCCTTCACGCACACGTTCGCCTCATCGAAAGTGAAATTTGGGTGCGGTTTTGATATGTAAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGAT:1 + chrX 18761957 5' + invader4 2633 1 54.79 CCCACGTTTCACTGACTTACCGCCCATCTATGCATTGGACACAGCAAATCGCCGCAGCTCCGCAAATTGTTTCATAACTCAGTTAGCTTTAGCTCCACTTGGCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTA:1 + chr3R 14947820 5' + 1360 374 1 56.85 ATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGGGCCCAAAT:1 - 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chr2L 2527776 5' + hopper 11 2 73.97 GCCTGCGGCTTCGGATCGCCTTGCTCCTGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCTTCTTCTTCCTCTCCTGCAATTCCTGTGTCTCCCTCTTTTGGGCGCGATAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTTTTATCCTCTTTAGCGTGTA:1 + chr3R 27316142 5' + Dm88 111 2 46.58 GGAAAATGTTTAGCAAGTGTTGTCAAAATGTTTTGTGACTGATGGGATGTTTCTTTTACATATAAATAATTAAATTTATGTTGCTTTTAAAAATATAGGAAAAAGAAAAGGGAAAAAGAAAAAA:1 + chr3L 9586149 5' + Doc2-element 235 1 45.16 AATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 + chr3R 17996165 5' + diver 60 2 58.22 ATAAACTTGGGGAACTTATGATATTTTGTCCAAAAATTATAAGTGTTTTGTTTCAGACAGAAGGAATTTGATTGCACCTTTTTAATAAGTTAAACTTTCAAACAGCCCAATCTGTGACGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr2L 5416159 5' - pogo 2083 1 66.44 TAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAGAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGG:1 + chr3R 556458 5' - Tc1-2 1542 1 72.22 GGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr2L 7125750 5' + I-element 56 1 54.11 TATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATGTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 17077205 5' + roo 54 2 56.85 TTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 - chr3L 16470346 5' + jockey 4736 1 68.99 TATTAATCCAATGTCACCCAACCTTCCAACCTTCCACCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTTATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAAC:1 + chrX 1653793 5' + I-element 5061 1 75.34 CTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTT:1 - chr2R 5531197 5' + 1360 81 1 54.24 GGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 20167586 5' - roo 9001 2 68.49 TGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 + chr2L 6174068 5' - I-element 5279 1 68.49 AAAAAAACAAAAATTGTAAAATTGAGCGGAAATATTTCGTCCCGATGAGCCGTATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chrX 12685343 5' + 297 6641 2 67.12 ATCAGCAATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAA:1 - chr3R 11040187 5' + Bari1 33 1 63.70 ATGTGAAAATTGTATTGTATATATTGTAGAATGATAATATAATCAGAAGCATTATATCACTGTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTT:1 + chr3L 8672665 5' - I-element 317 1 57.53 CTATACCACCTATTTGGCATTTTATATCAGTTCGTCTTCATCGTCACTTATAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCTCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGCAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTT:1 - chr2R 3290336 5' + Idefix 7096 2 65.75 AGTTATTACATATTTAAGTTTATTGTTGCTGCTTTTGTATGCCAGGCACACGAAATAAAATAACCAGCAGCTTCAGTCAAATTTACAATGCACGAGCATACATGTGCACACATACAGTTGTCTGCCATCACTGTATGCGTAGAAAA:1 - chr3L 7098857 5' - 1360 145 1 56.85 CACATCATTGACCATGAATCGGTTCGTAAATTGACTTCCTTGGGCTTAATTCTCTAATAATAATAACAATGACCCGGTTTCTTGCCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGCGACCCTAAGGAATTAGGGTGG:1 - chrX 7548781 5' - mdg1 111 2 68.49 CGTCAACGAAATTGTTAACGTTATATTTTTTCGTCGGCCATCGTCACAAAAATAAATAACAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 + chr3L 24228580 5' - copia 227 1 59.59 TATTAATAATAAATTTTTATTAGGTTGCATAGAAATGAAGCTATCCTTTCTGTTATATTTATTTCCCACTATAAAAAACAGAATATGTGTTATATTACGAAATACCAGTGTTTCGTGTCCACGGTACACTACTACTTTCAAACCGC:1 - chr3L 15636985 5' + G5 288 1 73.97 ACTTTGGATTCCAAGAAAATATTGAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAA:1 + chr2L 22966868 5' + 1360 3182 1 56.94 TCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr3R 13973050 5' - 412 7486 2 57.93 AAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:2 - chr2R 5479970 5' + F-element 97 1 72.60 AAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2 + chrX 8360526 5' + roo 60 2 60.27 AATTTGGCATTTGCTGGTGGAACGACGTAGGACGTCGGACGGCAGAGAGAACTGAGAAAAAAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGCTAATTCAAACCCC:1 + chr2L 14893210 5' + P-element 2731 1 46.67 ACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 18226868 5' + roo 8730 2 64.14 AAGGAAGAAGTTGGCCGCAGTGTGTTTGTTATCTGTATACAATAATAATAATAATAATAATTTCAACACATTCTTTAAAAGTGTGGGCGTAGCAGTTTTGTGGTTTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGC:1 + chr2R 5678708 5' - INE-1 213 1 43.51 AAAAAACGTAGCATAACGCCAGGCGCAGCTGTGCAGGACTCAGGGAAAACGAAGGAGGAGGCGTGGTGAACAACAATGTCTGGGGAATGTCTGGGGGATGCCTTTGAAATTTGCTTTT:1 - chr3R 30355085 5' - Transib5 213 1 66.10 ACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 + chr3R 4682893 5' + Burdock 68 2 66.44 GTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 27391398 5' - 1360 3341 1 52.74 AAGGAATCAAATGTATATTCCTGTCAAAGTTTTAAGTGTTAGGAAATCGTTGTTGTTGCGCATCAATTTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr2R 8047243 5' + 1360 36 1 51.91 ATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAT:2 + chr3R 19449941 5' + roo 395 1 63.01 AAATCAACTTTATGGCCAATAATTAGCTATGGGGATCTACAATTGTGTTTGGATAAAAAAAAGTGCGCTTCTTGGGCCAAAGAAAACGAATTTACAGCCGAGTTCAATTCTGATCTAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGG:1 + chr3L 9559904 5' - 1360 3147 1 52.74 CTTCGAATCCAATAAAGTAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3R 4805592 5' - 1360 3351 1 55.88 ATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:2 - chr3R 4683012 5' - Burdock 6354 2 60.27 GCAACAACAATTTTTCAAGGCGAAATGGACGCGCCAAAAAAAGGGGGCACCACACACACTCATACATTTATAAGCAGAGGAACAGAAAAAAATATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATGTTATACTTTCCTCCGGGTAGG:1 - chr2R 10565133 5' - G5 4666 1 65.07 AAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:2 + chr3R 17421247 5' + pogo 86 1 75.34 AATGCGGACTTATGCATGAGTACTTTTTTTTATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACG:1 - chr2R 2318259 5' + ZAM 30 2 62.22 TTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - 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chr3R 19032720 5' - roo 9033 1 58.90 GTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 29084866 5' - 412 7505 2 54.11 ATTTTCCTGTTGCATATGGGAATGAACACGAAAAACTACACACTATCTACGTAATTTTCAACTCACCCAAAATAAATAGAGCAAAAAAACAACACCATACAGCACTGCGAAAAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAG:1 - chrX 15490240 5' - Cr1a 204 1 58.90 ATGTTTGGACATTTAAATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr3L 17940021 5' + Tc3 240 1 69.66 TAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:3 + chrX 19054236 5' + jockey 57 1 51.37 AATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAATAGTCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chrX 2990863 5' - pogo 2055 1 54.11 TTAAAAACCCACTGAAGCCACGCCTGTTATTAACAACCTTATCTACCCCACAAATAGCTCAACAATTTTCACTGCAACGCCTTTTCACACTTAATTGGCCTAAAAGTAGGCAAGCGATTCTTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATT:1 + chr3L 18418684 5' - 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BS 5065 1 38.89 TTCCATGAATGTTATTATTGACATAGGTGTTTTGCTTTTCAGTTTCATTTAATTGAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACGTCTTAAGCTATAAT:1 - chrX 21556371 5' - Copia1_DM 59 1 52.53 TGGATAGTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCGTGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1 + chr3L 24131401 5' + Transpac 4986 2 66.44 AACAAGTCTGGCCATTTTAGCATGCCTTCTGCGGTTTATCAATACAATAGAATTGAGGGGAAACCCAAGCCCACTTCTGATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCT:1 + chr3R 9387991 5' - micropia 5403 2 49.29 TGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3R 15325200 5' + 297 44 2 53.42 GTTGTTTTAACTTATTATTATTGTTTTGTTGTTACTTGCTTTAGACATAATTTGAAGTACAATTCATATGTATACATATAGGTATATATTTTGTTCTAGTTTCATATTTAGGCCATAATTTGTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 30093955 5' + hopper 149 103 75.34 GGATCAGCCAGCAGTCTGCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCGGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chrX 8308387 5' + roo 10 2 70.48 CAGAGGGCAATATTACAGGACTATCAAAAAAAAATACTTAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAA:1 + chrX 14137669 5' - Tc1-2 1615 1 51.37 TATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAC:1 + chr3R 19450190 5' + roo 9041 1 55.48 CTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTTTCTA:1 + chr3R 15790871 5' + roo 8753 2 78.08 AGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGTGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAATCGTTTTTGATTGGAAATTTTTATTTT:1 - chr3L 20187415 5' - FB 475 1 48.92 ATCTCGGTCACCACCCACTAGTTGGAGTTGATTAAAAAAAATAATGAATACTATAGACAAGTTCCCCGTCTATCAAATACCCGTTACACTGCTAGTGTGAATGCGAACTCTAATTTCATTATTTTTCTGGGATATCGATAGATAT:1 + chr2L 22115020 5' - INE-1 498 1 72.41 ATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTATGTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 + chr3L 13365737 5' + BS 5045 1 47.95 TACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAAC:1 - chr2L 9038263 5' + I-element 78 1 66.44 CCTTGGTGATCGTCTCGCCGTCTGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr3L 18402961 5' + P-element 57 1 46.58 GCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAACGGGTAGTGTTTGCCAGCTATGCACGGGCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATT:1 - chr3R 19450162 5' - gypsy6 7480 2 55.65 AAGATTCTTTTGTATCTTTTTGCTTTTTATATTTGTACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 12242943 5' - roo 9046 1 71.92 AGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATTAGTGCAGTGTAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATT:1 - chr2L 3234024 5' + roo 396 1 53.85 ACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTATCGTATGCTTGCAATAAGT:1 - chr2L 16690704 5' - P-element 2840 1 38.60 CTCTTCTCTGTGGTTGACATTATCGCATGCAACTAAATCACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCG:1 - chr3R 28026405 5' + accord 7112 2 72.46 CTAATCTCCAAATTGAATACCATACATACGTGAGTTTAGGGTTGATTAAACCCTTAAATGCGTGTGATGGTGATGGTGCGAAAGGATTTTTCTTCATACCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTC:1 - chr2R 11160707 5' - micropia 231 1 65.52 AGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCA:1 - chr2R 12253298 5' + BS 4706 1 76.61 TCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:1 + chr3R 12242265 5' + transib2 71 1 68.49 AATAAATTGTCTGTTAGATTATATATATGTACATATGTACATACGTGGGTAACTTAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCGGCTAGTGTGAAT:1 - chr3L 23023830 5' - INE-1 536 1 81.45 TTAATTAATTTCACATGGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 11191341 5' - roo 399 1 76.71 TCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:2 + chr3R 13875042 5' + P-element 61 1 42.47 ACAACTTTGGATATTCATACATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr2R 10909291 5' + hobo 66 1 60.84 GGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGGGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3R 7420276 5' + 1360 63 1 72.95 AATTTCTCAATAGTTATTTTAATACCGGTAATAACCCGAGTTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 18396192 5' + roo 8714 2 54.79 AGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:2 - chr3R 23491949 5' + transib2 70 1 63.70 GAATATGCAACAGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr3R 23618241 5' + hopper 35 1 57.78 AAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 15790853 5' + roo 65 2 65.71 AGCATGCAACCAAATTGATAAACAGTAGAATGAAAAATTAGGCTGAGATTCTAGGACAAGACCACCACACCACATAACCGACAAGGAGCAGCTGGACAGGCATTTCGTTTCAATTGAAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCAAGTT:1 - chr2L 23315576 5' - INE-1 575 1 56.16 TATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 + chr2L 3675829 5' + Juan 4069 1 50.68 GATATTTGCGCTATAAAAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3R 17996132 5' + diver 5915 2 65.75 AATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2L 809659 5' + jockey 70 1 58.90 CTCATATACGGTAAAATTGAATAATAAATGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chr2R 5941475 5' + copia 4886 2 74.66 CTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGTAATTTGGATGCATTTTTTTTTA:1 + chr2L 16946031 5' + hopper 62 1 54.79 ATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTAAACTTAAACGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTAA:1 + chr3L 20189606 5' - FB 196 1 63.70 AACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3L 18281864 5' + Doc 57 1 62.60 GTTCTTGATTTTTTATGGGAAATTTTTTTGCCATTTTACACAAAAATTACAAATTAGAAAATAAAAACTATTACCATTTTATCCCCTGGGACAATCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:2 + chr2R 3564010 5' + Tabor 29 2 65.75 TAGATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2L 11391587 5' + 1360 53 1 56.12 CATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 - chr3R 4805680 5' + 1360 82 1 76.22 ATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 - chr3L 18126033 5' + Ivk 1 1 74.40 ATACATTTGTCAGTGCCTTGTCTTGCGAAATACACTGAAAAAAAAACCTAATAGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATA:1 + chr3R 10270526 5' + Juan 4042 1 73.29 AAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chrX 8092373 5' - pogo 2051 1 51.37 GTTTCATAAATTATAACGCAGCTTTTCCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCATACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCTTACCTAGTTAAGT:1 - chr3R 8168345 5' + P-element 361 1 25.74 CAAAGATAGCAAACAAATAAAAACGCATCTGATGCCAGGAACAAGGATAACTAGACAAACTGAAATCCGAAACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCA:1 + chr2R 19930126 5' + accord 313 2 52.08 CATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAG:1 + chrX 12217459 5' - rover 7230 2 82.88 ATGTGGCTGTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2R 9544959 5' + roo 8702 2 60.27 ATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGGTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGATACAATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCG:1 - chr2R 12185457 5' + accord 22 2 66.44 ATCTGCCCCCCTGAACAACAAGTGATGGTGACGATCAAGTGTACGGCCCCTACAGTAGATTATGCTCTATTTGATTTAGACTTGGATTTTATTATTATACTTTTGGTGGCTTAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTG:1 + chr2R 15897559 5' - Juan 135 1 75.00 CAGACCAAACAAAAGAAAAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3L 8627371 5' - pogo 2081 1 37.67 AAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:3 - chr2L 19675074 5' + 297 52 2 64.38 ATTAATCTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 10167495 5' - roo 9036 1 60.27 GCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 - chr3R 25709859 5' + hopper 61 1 60.74 AGTTGTTTGAGCGCTTTCCCCTTCTCACACTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 - chr2R 20227292 5' - hopper2 1543 1 74.80 AATATAAATCCTTAAAAGAAATGTGTTTTGAAATATACTAAAATAGCGCAGTCATTTCAGTCCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGA:1 - chr3R 28662617 5' + jockey 4523 1 57.53 CTACACGGTATACCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:2 - chr3R 7420346 5' + 1360 17 1 75.34 CATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chrX 11661518 5' + pogo 25 1 65.67 AGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 + chr2R 17796531 5' + jockey 4677 1 75.00 ATAGGTTGTTGCTATCTAGAACAACCTTCCCATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 + chr3L 17183616 5' + diver 5895 2 74.66 GTCAGTGCCGAGGGATCCAATGTGATGCCATCAAGCTGCGAGGCGAAGGACAGCGGTGGTTGGATGGTCGTTGGTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAG:1 + chr2R 16629290 5' + flea 4858 1 52.41 TGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTT:1 + chrX 3431862 5' + Ivk 5362 1 50.00 GGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr3R 30347457 5' - P-element 2876 1 72.39 AACCGATCGTATGAGAATTAATAGCTTACAAAACCCATACACTTAACACCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 + chr3R 19224979 5' + HMS-Beagle 49 2 54.79 TCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 19032680 5' - roo 332 2 74.13 ATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:1 - chr2R 9967124 5' - Bari1 1638 1 64.38 AAAAACGCATTTGACAATTATACTTTAAATAAAATGCACGTTACAAACAATAACAGATGTGACCAACTTAACGTTTTCGATAAAACTTACTAAGACATCAAATTAAAATAAACCTATAAAACTTTACAATCTTAAGTCCT:1 + chr2R 9759255 5' + NOF 3922 1 45.71 GAAATGTTTTCGCTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chr3R 16630395 5' + FB 22 1 69.50 GTTGGAGATGTTGAAGTTGATTCTTCGGTTGATAAAGTTGGTTGTGAAGTGGTAGAGGAAGATGTAGTTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCTTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTT:1 - chr3L 12886781 5' - F-element 4393 1 52.14 ACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCGCCAGAAACGACTTCGTTGTCGGCTGTGGGTTGAAGGTTGAACT:1 + chr2R 21160690 5' - Transpac 224 2 78.72 AATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGC:1 - chr2R 20010724 5' + Juan 4117 1 65.07 GATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAAAAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAG:1 - chrX 15019101 5' + S-element 1512 1 77.40 TTATTTCAACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGA:3 - chrX 23182964 5' + Idefix 4 2 69.86 AGAATATACATATGTATAAATTAAGTATTTTATGCCGGTGTAATCGCGCGCGGCTATACGAGTCTGGGTGTCGGGCGGGGCCGCGACAATTAAAGACAAGGTTTTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGT:1 - chr4 1149887 5' + Q-element 284 2 69.18 CACTGCATCTGGAGCTTATGGCGCACAGCTACTTCCTGGCTCCGAATCTGGTGGTGGAACGCCACCGGCGGGATCTGCGCACTCGGTCACCGTTGACAACGCGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCA:1 + chrX 5703423 5' - R1A1-element 5260 1 79.07 GGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3R 8076003 5' - 412 7518 2 51.54 AGTCAATGATAGATTGTGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTA:1 - chr3R 23021103 5' - INE-1 566 1 53.10 ATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCT:2 - chr2R 1916446 5' + Juan 65 1 58.90 ATTTCCGACATTTATCCGACCTCAATTTCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:2 - chr2R 23180289 5' - roo 345 2 60.27 GGGTGTGCGTGCTAAAACAATTAACAAAATTTTATGCACTCAAAAATTGACAGTGGACCAAGCCCCATTTATAATTATGGGAACAAAGGAAATTTTTTTTTATTTTTGTTTTTA:1 + chr3L 18348593 5' - HMS-Beagle2 484 10 47.37 CAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 - chr3L 22035645 5' + F-element 84 1 75.17 AGAACATCAGAAAGGGGAAGCTTATTTTCATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:2 - chr3L 9270014 5' + copia 33 2 48.63 ATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3L 2145900 5' + roo 71 2 72.60 ACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCT:1 - chr3R 10736118 5' + McClintock 6024 2 71.23 AAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGTACAAACTTTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr2L 15076225 5' + 1360 21 1 66.67 AGTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 23067549 5' - roo 9030 1 58.90 AATTGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - 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P-element 2832 1 46.48 CTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2L 12818260 5' - hobo 2902 1 61.46 GAGGGGTGTTTTGATGGCTTTTAACTGTATATATTATATATATTATTATTATATATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGG:1 - chr3L 21969858 5' + opus 174 4 71.92 TCTTCAGTCTAAAAAAAAAAGGGGCAGACATTTTTAATACTCAACATTTAAAGTTACTGTACGGTTAAATTCCTTGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3L 13836592 5' - 412 7543 2 70.48 CCACACCCAATATCGAATTACGCCATTACCAATAGATCCTACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAACAGTCACCGACTATCTATCTTTGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTG:1 + chr2L 6106715 5' + Ivk 41 1 80.14 TAAAAAATGGGCAAAAAAAAAATCAAAGTTATATTAAGACATGGATTGCTACTTTACCCGCATCAACACGTCGATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 22684103 5' + roo 23 2 29.17 ATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGT:1 + chr2L 22121327 5' - I-element 5317 1 63.70 AGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACA:2 + chr2L 4754834 5' + Stalker4 6970 4 55.56 GTATCTGTCTACTACTACCGGACGGTCCAATAGCTCGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCTCAATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTTAAT:1 - 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Tc3 1465 1 37.67 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr3L 20525229 5' - mdg1 7419 2 58.22 AAAATTAGTTATAACAACTAATTGTCAAGTTAAAATAGTAATTGAATTCTATTTTCAGTAAATAAAATTATTCTGCTTTTTACAAAAAATAAATTAATAAAAATCCATAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGC:1 - chr2L 15359546 5' - pogo 129 1 76.03 GCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 - chr3R 19992739 5' - hopper 1359 1 54.79 ATCCTCACAAAAAGGCATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAT:1 - chr2R 21411018 5' + Burdock 8 2 78.87 GCTGCCATTCTGATTCCTAAGGATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 + chr3R 30946508 5' + Transpac 4976 2 56.55 TTATAAATTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTGACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - 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chr2L 13844250 5' + Stalker2 69 2 62.76 CTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCC:1 - chr3L 23702271 5' + G4 47 1 50.68 ACCACAGGTTGGTTTGCTTACTTTTCGATGAACTGAAATGCTAACAGCCCAATTGTCCTTTGGCAGCTGCGGAGGTAGCATCCTGTCGCCTCCTTGCCGCTCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCC:1 + chr2L 4434232 5' - G4 3772 1 76.74 CTGAGCAAAGTTTTTAATTAAAATAACCGAGCAATAAAACAGCGCAACGAACGAACACACACAAACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAA:1 + chr3L 7293048 5' + Quasimodo 109 2 61.64 ACCAGATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAACGGG:1 + chr3L 2544596 5' + Tirant 8150 2 56.85 ATGCATTGTGGTTGGGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTCTTTGGCAT:1 + chrX 18817227 5' - transib2 2813 1 78.08 CAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATA:1 + chr3R 11040037 5' - Bari1 1663 1 55.48 ATATACTAATGTACATATCAGCTTGCTGTCCCTTTGGCAGAATGGTCACACAGGAACACGAAGATAATTAATGACTTAAAATTTTAGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 19450189 5' + roo 42 2 82.86 TTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCC:1 - chr3R 934281 5' - Rt1b 4740 1 58.09 ATCATTTTGCGCAAGTGACAGGCGCAATTGCCGCACATAAACATTCATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 18046721 5' - roo 9030 1 56.55 GATCGTTTTAATCTGAATACCTAAATCTTATGAGAAATGAGTGCAATAAGAAGTTCAAAATTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chrX 16946625 5' + FB 61 1 59.59 GTTTAGGAAATAGTGGGGGTTGTAAATGCCAATTCCGGAATAAACTGAAACATTTATGGTTATTATATAACCAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCT:1 + chr3R 21943510 5' + Tc1 1594 1 52.05 AGAGACCACTACGACCACTGAATCAAGCTCGACTCAATCGGCATCAACAAACAACACCAAACAACACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCTAATTACTTTGTATATTTTTTTGAACT:2 - chr3R 23116275 5' - Cr1a 166 1 63.70 ATAAGGCATTGAAATTGAAGTTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAAGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAATAAAATTGATAGAATTGATAAAAAATAATATAGAT:3 - chr3L 16047751 5' - 1360 254 1 30.82 ATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTGTGCAAGCATTCGATTTTATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGTCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 19450145 5' - roo 9037 1 45.89 TATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGTCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 27986368 5' - roo 325 2 73.10 GAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTC:1 - chrX 14771795 5' - BS 5017 1 69.66 AAATGTTTATTTTTAACTATAAACTTCGGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAG:1 - chr3R 9296441 5' + hopper 479 1 74.31 TTTATTTAGTATATTTCGTGTGGAAAGCTCTTCATAGAGAATATTTTTTTGACGGATATTAAGCTTACATCCAATTTATTTTACTTTTTTTTTAATTTTT:1 - chr2R 19854312 5' - Doc 4697 1 65.00 AGTTCAAAACATAATGTTAGGGACTTTAAGTAGGTCAAAATATTTAAACGATTTAAAAAGTAATCATACCCGTTACTCGTAGAGTAACAGGGTATACTAGATTCGTTTTAATGTATATAACAGGGAGAAGGAAGCGTTT:1 + chrX 149906 5' + INE-1 33 1 62.59 ATAAATAAATAAATAAATAAAATAACAAGATGCGTAACTGCCATACATTAGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTGTTCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAGTCTAAAAATAGAATTT:1 - chr2R 19181480 5' - 1360 3272 1 79.45 ACCCCTTTAAATTTAAACTTTAATGAATTCTTTTTAATTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCTTG:1 + chr3L 2883627 5' - I-element 5056 1 68.03 CATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATACCGCCCATATTAGGATA:1 + chrX 22906781 5' - transib3 2728 1 76.71 AATTAAAATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 22287383 5' + jockey 31 1 63.70 TTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 - chr2R 12779696 5' + I-element 77 1 73.72 CTTTTCAATTAATTCTTGATGATTTATAAAGGTCTTCAGGGCTTCAACTTGCTTAACAAGCCTTTCTTAGTCGCCTCTTCTCAGCCATTATTGGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTT:1 - chr2L 21325587 5' - 297 6500 1 66.44 ACTCATCAATATCTGAGAGGCATTTTTCTTGTACAAAAATTTACCAATGGTCCTACAAACGAAATATACAGATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTTAAATAAGTTGAAATTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 - chr3R 5261139 5' + TART-B 10199 1 70.37 GGAGACAGTTCAGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 47232 5' - roo 388 2 71.23 GTTTTAATACGAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:2 + chr3L 16662328 5' - jockey 4983 1 76.03 TCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 2989960 5' - roo 8986 2 76.71 AGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACAT:1 - chr3R 30987570 5' + F-element 141 1 66.44 TTAAGGAATTTCAATTAACTGAGGATATTTGTTATTTTTATTCCGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 - chr3L 13369777 5' + BS 5006 1 38.62 AATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr3R 15882581 5' + jockey 67 1 56.16 CAAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2R 17878634 5' + Doc 68 1 63.70 TCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3R 29084874 5' - 412 444 2 49.32 TTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 + chr2L 17180073 5' - Juan 4154 1 56.16 TTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTCTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 18488469 5' - roo 9014 2 59.31 CGGGTGTTTTGGCCTAATGTATCTATCCGTCAGCGGTCGCGACCAATTTGCCTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr3R 16157382 5' + pogo 66 1 62.50 CACAGTTATAAATCTTAAAAGTTAAAACAACGAAGCTCAAATGAAAATTAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGTTTAATCCTAAATTTTTTAATTATTT:1 - chrX 8095159 5' - S-element 1461 1 69.86 AAAAAATACAACAAATATATCAGGAATAGGGCAAGGGACAATTCAGTCTCTAGGTACACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:1 + chrX 5001639 5' + Stalker2 7307 2 61.87 ACATCGAGTATCTCGAGAACCCCTGGAACACAGCATCCCAGATCCGAGCTTGCAGCTCCTCCACTGCCAATGTGACACACTTTGATTTGACTTTAATGCACAATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACG:1 + chr3R 28386695 5' + transib2 432 1 74.83 AATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2L 9636052 5' - 412 456 2 56.85 TAAAGGGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCCCGAGTATTTTGCACCATGCCTCGATGC:1 + chr3L 11326698 5' - pogo 2072 1 62.79 CAATCGGCCACATGTCTTCGGCACATTCCATCGCTTTCCCTTTACGAACCGCTCTACCATATCTTTCATTCTACCTGGCTTTACAATATCTGTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCT:1 - chrX 1559843 5' + Doc 4646 1 63.01 TTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCGTAAATCTAAACTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAAGTTTT:1 + chr3R 15095976 5' + Juan 3779 1 53.91 CATAGAGAGAAATAATATCGACATGTAAATAATGAAATGTATAGTAGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACAATTTAAAAACTCACATTTGCAATGCGGTATTCTTCTCAATTTAAAATGAAATTTAAAAAATATTTTTTT:2 - chr2R 18695094 5' + Transib5 2726 1 56.85 AAAATAGATGATCCTATTTACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACATAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATAT:1 + chr3R 19446628 5' - roo 8622 1 60.27 ATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 + chr3R 5523924 5' + FB 79 1 72.60 AATACGCATTTGCACCTAATAATTTGTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAA:1 - chr2L 16539789 5' + Juan 4044 1 69.18 GAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATGATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr3L 9269881 5' - copia 232 1 52.74 TGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 + chr2R 15326868 5' - copia 5070 2 76.03 CCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGT:1 - chrX 18239452 5' + jockey 21 1 69.35 ATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chrX 8092511 5' + pogo 30 1 61.59 AAAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 19032719 5' - roo 9033 1 58.62 ATTTCGAAAACAAGATTATTATATCATCCATAT:1 + chr3R 1683859 5' - TLD2_LTR 44 1 72.73 AAGACACGCGATGGGATTTTCTTTCCATTCCTATGTATGTATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1 - chrX 13490734 5' - 297 6900 2 77.40 ACCGGCTGCTAGCCGCTGAACAACAGGAACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2R 7090774 5' + I-element 14 1 73.97 TGGGTATTATGTGCTTTTTTTTTTGGTTATGTACAAATTGAAAATTTTGATGGAAATTGCTATATGAAGAATGACAACTGCTGTGCATCTTTGTATGTGTGTGGTGTTAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTG:1 - chrX 16607747 5' - hopper 1031 1 74.65 CAGGTGTCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2L 21367179 5' + Doc 32 1 61.64 AGGCACAAGTTCCATTACCTACTCTAATATTTAACGCAGCAATCTCTGAGCAGAACAATATCCTTCCAATTTGCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATT:1 + chr2L 20141488 5' + F-element 373 1 65.25 TTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - 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mdg3 5444 2 51.37 TTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 13766297 5' + roo 8710 2 58.73 ATTGCCACGCTAATCAGCCGAACTAAGTGAGCTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAGCTCCTATCAGCAAAATCTTGATCACCAAATATCAAC:1 + chr3L 8685182 5' + I-element 88 1 70.55 ATAAACTACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAAT:1 + chrX 9530306 5' - 297 337 2 60.27 GCAGGCTATCAGGATTCTAATTGCTTGAGTAAGAAACATTTAAGACATTTTCTCCTTAGTTCTTAGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2R 9544788 5' - roo 395 1 76.71 ACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chrX 11661354 5' - pogo 2076 1 68.49 ACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - 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chr2L 15550770 5' - Bari1 1651 1 56.85 AAGTTTGAAATCAAAAAGCTAGTGTACGCAATGTTATAGAAAATATAGCAAAAGTTTCCCAGGGCGACATGTCGATGTACAATGGTCCTCTCCTCATCACAAACGCATCTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATAT:1 - chr2L 1523217 5' + I-element 5070 1 74.66 TAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chrX 18239407 5' + jockey 89 1 72.60 TGTAATCAATATCACGGTGGGTAATCCAATCAGAAACAACTCCAGGACAGCATCCCCTACAACCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCAGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAAT:1 - chr2L 2383502 5' + GATE 328 1 71.23 AGTACACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACAATAACAATATATACAAGTCTTTAGACTACGAAAACAAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAAC:1 - chr3L 25237732 5' + I-element 5130 1 57.24 ACTTGATGCGATTTTAATTGTCTTTTCCTCAAAACTAAATCCATTTGCTCTGTAGAGATCACTGCGGCTCTCCGAATAAGAACAAGCTTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGAT:1 + chrX 19905794 5' + Tabor 7257 2 64.38 ACCCGCCATGCCACAGCTCCCAAGCTCCCAAAACACCCATCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATA:1 + chrX 12732554 5' + 412 427 2 73.10 AAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:2 + chr3R 10931618 5' + 297 6632 2 55.48 AGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 14051707 5' - roo 391 2 67.81 TGTTCTTCATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAAC:1 - chr2L 16539749 5' + Juan 4084 1 50.68 ATTTATTATTTATTTATTGTTAGTTAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1 - chr3R 15793505 5' - TAHRE 10423 2 69.18 TGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2R 4362755 5' + F-element 39 1 57.53 AGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGTTAGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 12986608 5' + roo 22 2 55.42 CCTAATCGTGGAGCTAATCTACAATATTTAGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chrX 20455635 5' - hobo 2914 1 52.58 GAAACGGAGAAGATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2L 809619 5' + jockey 29 1 65.07 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 5074 1 66.90 AACATTTAAGCCGGCTCCGAACAGCAACAAGGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGTGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chrX 10167397 5' + roo 88 2 78.77 CTTTATGCATATTATGTTTTCCGGCCCCTCACTCTTCCCCCCTTTTTTTCCGAGCCTTTAAAAACATTGTAGACGGTCTTACGGGATACAGGAAACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCCAACTGGTGGTTATAGTTTAT:2 - 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Porto1 310 1 67.42 AGAAACAACCAACAAACAAACGATTCTCTCTCGAACTTATTGTAATTATTCAGTTTGCGGTGAATTCACATGGCGTGGAATTTTAATAAACTTTTTCGCCAGCCAGTATTTGGGTTTTCTCCTCTTTTCCGATTCTTTTTTTCTGT:1 - chrX 13270674 5' + McClintock 210 2 52.05 GTCTAACACTGTCGGCATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGTTCGCAAGCG:1 + chr3L 21655875 5' - HMS-Beagle2 286 2 53.78 GTAGGCAACTGAAAAGTTTTCTCGACCATTGACTGCACAAACAATTTGGTCTGGCCATGGTTTAAACTTTGAACAAGAATACAACAACAACACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATT:1 - chr2L 5732497 5' + I-element 236 1 65.07 CGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAA:1 - chr3L 13739624 5' + BS 5089 1 80.82 CTTTTTTTTTACTCTTTTTTTAGTTGCGCCAGGCGGACAACTATTGTTTGCACTGAATGAATGTCATCAACAAATTTTAAGGCATTATTATGCGCACGAGAAGCTTTTGCAAAAGCCCCGTTGTTGAATCACACTCCGCATGGTGG:1 + chr3L 22980362 5' - 3S18 492 1 81.51 AAAGATGCTAGATAAGCGTTTATCAAGAACTATGGCACTCTAATAATTTTATTATTACTACAATATTTTAAGATTTATGAGCTAAAGCTAAAATCTTAAAAAATGATAGAATTGCGGGAAGATTATTTGTTATTATTATTATCATA:1 + chrX 12961663 5' - invader3 5059 1 47.95 TGCCGCCTTCTACATCTACCTCCTCCTCGATCTCTTCCTCCTCCGGATAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTC:1 + chr3R 19401992 5' + F-element 363 1 64.29 TTGTGCGGTCATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 21933278 5' + pogo 21 1 73.94 ACTTACCCTTAAGCTTTTAATACACTATTTAAGGTAAATCGAAGACAAATAAATATTTAACACACACACTTCATTGATGTTGATCGCTTAATTGGAACTTAAACTAACTGTTTACAGTTATGTTAATAGATAAAACTAA:1 + chr2L 17014811 5' + Bari2 217 1 52.52 TTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTG:1 - chr2R 14051823 5' + roo 82 2 84.89 TTTTTCTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGAT:1 - chrX 22824275 5' - Gypsy12A_LTR 2255 1 64.38 ATTGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 31653192 5' - roo 9037 1 62.33 AATTAAAAGCGCAAAACAGTTGGCCCCAAATCGAAGCCACCGAAAAAAAAAACCAGTAAGCAAAACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr3R 9595120 5' + Tirant 26 2 64.00 CATGGAATATGGAATTTGTTCAAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 + chrX 19074716 5' + mdg1 11 2 73.10 AAGGGGAGGGACAAGGCCATGCGAATGGCGGCGACCTGTTGTGTTGTTTAAGGAATTACTTAACATGGTAAAAGCATGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGAT:1 + chr3L 5011304 5' - F-element 4427 1 69.92 GCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr2R 10161773 5' + transib2 34 1 57.69 TTATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:2 + chr3L 1279083 5' + roo 8726 2 61.64 ATGCGTATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCACACCAGCCACT:1 + chr3R 10931579 5' + 297 12 2 72.60 ATACTAGATTCATTGAAAGGTATGTAGCAGGCAGAAGAAAGCAATTTCCGAATATATAAAGTATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACAT:1 - chr3R 4673566 5' + Quasimodo 45 2 60.27 TTACACCGCTGTTTTAATCGTCATGAATTAATATCGCCAAAGCTGCTTATAAATAAGCATATTACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTA:1 - chr3R 24729662 5' + Juan 4142 1 60.96 AAACTTTAACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 + chr3L 11913166 5' + BS 5032 1 59.59 AAACGAACGTAAAACCGTAAAACGAATATACCCTTCCCGTCACATGTACTAATCAGGCTAGTCATCCGCCTCTCACTTAGACCCTTGCACTATGGGAAATTTACCCACTTTTTCTGGCTAAAAGCCATTTTCTGAAAGTCGGTCGA:1 - chr2L 21331116 5' - Transib-N1_DM 456 1 74.66 GGAAAATGTATTCCTGATTTGGCGGAGAACACGGAACTCTACGCCAATTATTACGAAAAGACTGGTGAATTACAAGGTCTATTTTTTTTCGCACGGTTCCTACGGCCACACCTCCCGCACAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTTTA:1 - chr3L 25729195 5' - Cr1a 4406 1 60.96 AGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGC:1 + chr3L 24272067 5' + gypsy11 4056 2 58.90 ATTGCATTTAATATGCCCAGGTCCACTCTTTAGTATCGCCGATATATATATACATACATATATCCAGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 - chrX 3259483 5' + HMS-Beagle2 52 2 53.42 CTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3R 18488395 5' + roo 90 2 80.82 TTGTAGCATACTTCAAGGCGTCGTCGATTCCCTGCACGTATGTGTGTGTGTGTGAGCTTTCTTCCTTTCTTCTTCTGTGTGTCCCTGTATCCTTGTGTGCGTGTGTGAATTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGG:1 + chrX 11462679 5' - Tc1-2 44 1 68.49 AACACACCCAGCAGGGGCATCTTCGAGCCAAGTAATCCACTACCTCCAGCTTTACAGGTCAGGCGACTTCCGACAGTATGATCATGAAGAGAAAGAGCTTTGCGTTTATCTTGGATTCAAGTGCATTCGCTCTTGGATACAAGTGC:1 + chr2L 22183551 5' - Idefix 328 2 58.90 ATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3L 23287201 5' + 1360 36 1 58.16 TAATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3R 19073184 5' + roo 62 2 63.01 GATGGGGCAGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2R 14051699 5' - roo 400 1 73.79 AAACTCATTTTATTAGTTTATCCATCTCCACTCCATCTACTCAAAATTAGAGAAGCGTTTTGTACATCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15291838 5' - gypsy2 406 1 56.96 GTAAATTGGATGGAGAAATTCAGCTCCTGGAAGATTAAAGAATTTATTATATATTTAATAAAACAAAAGGCAGTACATATGCGATTCATTCTCAAGTTTGCATGGCAACAATACTTAGTATATATGTATATCCTTGATCAGGATCA:1 - chr2L 7567985 5' + INE-1 81 1 73.97 AATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTA:1 - chr3L 25508749 5' + 1360 338 1 61.38 CGATCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:2 + chr3R 16341917 5' - P-element 2846 1 57.53 TTTAGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGCGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 16564611 5' - roo 394 1 68.97 ATCGTAACATTTTTCTCACTGCAAGTGGAAGACCCAGAGATATATATTTCGAAATTTATTTATTTACATCTCAGCTTTGTTGGCCCTTTGGCAGAATGTTC:1 + chr3L 15269281 5' + roo 8648 1 66.34 TCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 585712 5' + Tirant 8115 2 61.43 GCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 15103798 5' - Transpac 5179 2 53.90 ATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTCAAGCCTCGCTTCG:1 - chr3L 18505764 5' + I-element 39 1 58.90 TTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 11164494 5' + roo 48 2 65.57 ATAATCACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:2 - chr3L 15103928 5' + Transpac 39 2 57.53 TGTTGGTGCGCTTGTCTGCTGCCCTGCTGTCTGCACGTTCTGCGTGGTGCATACATTTCGTAGTAATTGTGTAAACAACCTCACACACACGCTTATACATTAGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCAGTGACCACAGCTGCAGTTCCT:1 - chr3R 28662382 5' - jockey 4699 1 73.10 TATAATTGCGCTGTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGTTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTTAGTGCAC:1 + chr2L 9782071 5' + P-element 52 1 45.52 AATTAATATTTGTAGTTATCGTCGGAATCTTGTATATGTCGAAGAGTCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGT:1 + chr2L 21656625 5' + invader1 79 2 74.66 AAATGATACCCGCCATGTTTATAACATACGTTTTATATGTGAGACAAAACAAGGCTATAAAATACTATAACACTATATGTATGTGTCTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAAC:1 - chr2L 9010179 5' + G2 2711 1 61.38 AGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr3R 27160088 5' - 412 7461 2 77.40 ATATGCAAGGGTTGAAAAATTGTATATGCGGGGCATCTGGGTGGATGGGTGTATAGGTTTTATGGTCCGCCTAGCGACTGCTGGCGAAACTTTACGATTTGTAGTGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCG:1 + chr3R 28079930 5' + baggins 5241 1 73.24 ATATCTACCTTAACCTAATTAGGGTTTCGTCGAGGGTGAGATTTTATACCAGGGGCTAGGAAAATGATTTGGGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCG:1 - chr2R 14704642 5' + roo 8999 2 50.68 AAAAGAAAGAAGAAGAAGGGGTTGTGGCAAAAGGAAGTCGCGCTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAAT:1 + chr2R 10543527 5' + transib2 2506 1 70.55 TAAGTTAAACAGACATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr3R 30347477 5' + P-element 3 2 80.14 AACGAAACAAATACATATCATATCGTGTGCCAAAAAAGCGTAAGG:1 + chr2L 2194545 5' - 1360 32 1 55.56 GACCCCTGAACTAAATGATTAAGATTAAGATTAATTATAAGATTTAAGTGGAAGAAAACCATCTTGGCCTTCGGGTTCCGGCCGAACCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATC:1 + chrX 20385630 5' + blood 169 2 55.28 AACGCATCTAAATCAGTTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATCATGTATTAAAGAGGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGGACAAAATCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTATGGGTCTTGCAACTCATA:1 - chr3R 1164745 5' - Cr1a 4169 1 60.27 GTGGAATTAACCATTAGAATCAAATTCATTCGCAGCTGAAACAAACTCCGCCTCTGATTTTCTTTTTTTATTTTTTTTTTATTCC:1 - chrX 8291798 5' - Osvaldo 1521 1 60.00 TATATGCTAGAACTTTTATTAATATTTTCAAATTATTACTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAA:1 - chrX 22460238 5' + HB 1 1 76.71 AAAAACATTTCTCCGTGAATATTCTGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATG:2 + chr3R 14860088 5' - BS 5084 1 73.97 AACCATAACATAACTAAAGAAAACAAAGAACTATAATATAAAATAAAAATAAATTAAAAACGAAAAACTATTAAAATGCATATAAACCCGAATTGGCTTGATTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGA:1 + chr2L 11210832 5' - 1360 3239 1 73.44 AAGATATATTACTTTAATATTTTTGCAAAACATATAATATAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTCAAA:1 + chrX 12288691 5' + TAHRE 10428 2 72.60 GCCATCGGGCTGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGC:1 - chr2L 4713984 5' + transib2 9 1 74.58 TATTAAGTAACATTTATATTAGCGTCTTAATCATAACTCTATTTTGGCTAAGATAATGTACTGTGCTATTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAATGCAATGTTGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCA:1 - chr2R 18173553 5' - TLD2_LTR 47 1 56.85 AACAAGAAAGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGG:1 + chr2R 18514851 5' - P-element 367 1 62.76 AGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCACAG:1 - chr3R 6419911 5' + Tabor 6927 2 76.60 ACTCGATGACATCCTTTTGCCAGAATGAAGACAAAGCTTAAAGTTGCTCGGGCAATTCACCAAGTGAACCAAGTGAAGGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGC:1 - chr2L 10861599 5' + 1360 3289 1 55.48 ATCTGGAGACTGAAGATATGGTGGGAGATGCTCTTGAATATGGACGCTATGGATGGATATGGATGATATGAATGCTCTCAATACTTGCAAGGAAAATGAATTATGGCCACCAATAATCAAAATATATATTAATAAAATAAAAAAA:1 + chrX 19198817 5' - hopper 159 2 48.97 AACAAAAAGCGATTTGCAAGTTTTCTATTGCGCATAAAAGTATGCTATGGAACCTATTTTTTCCTCCGCTTGCTTGCCTATTTTTCCATCCTTTTTTTTCTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chr2L 16945987 5' + hopper 18 1 71.92 CAGTATTTATTTAAATTAAATGCAGTGAAACTACAAAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACCCGTACAATGCCCTATGGTCCAGAACTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCGAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATTTT:1 + chrX 9465234 5' + transib2 55 1 76.71 ACAACAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2L 16690762 5' - P-element 2872 1 72.86 ATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 16970343 5' - roo 9029 1 56.16 AAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3R 29084852 5' - 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INE-1 15 1 84.25 AATTGTTTTCTCTTTTTCCGGTTAGCTACTCGCATTTATTTGTATCCTTTTTGCTGCAAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chrX 15357819 5' + hopper 1 2 84.83 ATTATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGGGAT:1 + chr2R 20227198 5' + hopper 41 1 52.05 TTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 20898657 5' - roo 9047 1 65.96 GTGGCCCGGCTAGAAAAACGTGTGTCCAAGCACTGCCAACTGTGAGTGTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGCCACCACATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGTCAGGCCCGG:1 + chr2L 249335 5' + Rt1b 4984 2 54.69 CTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATGGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 + chr3L 10731747 5' - 297 6939 2 57.24 ATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 27986369 5' - 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hopper2 1523 2 73.97 AAATGCTGACTGTGACTTTTCGCTCTGGATTTAATTGCATTTCAACTAGATAGGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 5769156 5' + roo 8678 2 75.86 AAACATATTTTTATTTTTACTTACTCTATCAGACCACAAGGCTGGCAGTTTAAAGAGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTTTTTGGTTTGTAGGAGGGATAGGCATGAGTTTAATATG:1 - chr3L 18438817 5' - I-element 5045 1 58.90 ACGATGGGGCATGTTGTTTACATGTCTCACAACCCGCGCTTTCCACGTAGAAGAGGCTGTCCCAACAACCTTGCGAGAACCTACCAACCCAGCGAGGAAATTTTTAGAGACGTTTAATCTCAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAAC:1 + chr2R 5374109 5' + F-element 4579 1 57.53 GGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAA:1 + chr3R 30347339 5' + P-element 89 1 26.71 TGGGGGATTTGAATTTTATGCTTCTTGGGCTGCAATCATTATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGGTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr3R 27133713 5' - opus 7489 2 76.03 GGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 - chr3L 3501791 5' + Bari1 25 1 62.20 ATTTAAAATCCAAATCCTAAATTTGCATCCGAAGTGCTCAATTATTGGCGCTTTAAATCAATCCACTTGTTTGTTTCACTCTTTTCATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 16970489 5' + roo 8676 2 69.35 AAATATTAAGTTCTTACTTAAGAAAGGGATTAGCATCAGCCTTGAAATATATGAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 + chr3R 15325083 5' + 297 6644 2 65.07 GATATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 - chr2L 18347408 5' - transib2 2785 1 57.53 TTAACAAATAGCTGCGCAGATAAAAACGAACCAAACACCCCAAAAGCACCAAAAAAAAAAACACAAGAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGCTGATCGAAAGGAA:1 + chr3R 11020237 5' + Bica 490 1 69.90 GTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGT:1 + chr3R 11040058 5' - Bari1 1642 1 62.33 AGGATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATAACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTAAGTCGGTTTGAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 3589283 5' - 1360 3378 1 52.74 CTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCA:1 + chr3L 27356084 5' - Tc3 1633 1 69.18 AGAGTGAGATAGTAGCTCCAAAAGGAAGATACTATGCCCCACACACACACACACACACAGAGTAT:1 - chr3R 29280646 5' + gypsy3 427 1 69.23 GAGAGAAAAAAAAACGAGTAAAAATGTCCGGCGATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3R 26774148 5' + hobo 26 1 67.81 TGTGTTTACATATAAAGTGATGCAAGTGGAGCATTCTTACAAATGCAAGACATTTATAATGCGATGATATACATAATTAGCTCAAAGACGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chr3R 5523892 5' + FB 7 1 79.25 GTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCCCATGACCTCCCTAACCT:1 - chr3L 16470335 5' + jockey 4764 1 78.77 GATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 + chr3R 28901205 5' - transib2 2800 1 62.90 TGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:3 + chrX 18817266 5' - transib2 2774 1 51.37 ACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCT:1 - chr3R 10736179 5' + McClintock 9 2 75.86 ATCGATTGCTTTTGGCCATCAGCGAATTCCATATGCAGATTCATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGATCTAGAA:1 + chr3R 8051081 5' + jockey 4779 1 71.92 ATGAATTTATTCGTTTCCTGGCTGGAGGGGGAAATCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAA:1 + chr3R 16220724 5' - Tirant 283 2 76.03 TTACTATCATTTGAAACGAGCTGCCTTAAATCAATGAACTAGTACATCATTGATAGGCAGAGCACTCTTGATTTCAGTTCCAATTCCAATTGCGATTAGGCTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAAAT:1 - chr2R 12645538 5' + X-element 40 1 59.59 AATGATGAGTCCAAAAGTCCGAGCAGAGTCCGGGTACGAATTCGAGTCCCCGGCAGGGCCACAATGATCTCTTTAAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCACCTCTTCGTCTTT:1 + chr2L 21871751 5' - TAHRE 300 1 49.63 AAAACGATCGCGTGAACGAAGAATTCCTGATCAGTGATCACACGACCAGCTCAATTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 12004370 5' + P-element 5 2 76.03 TGGAGCTCAAAATGGCCGAAAATAGCATTTGTAACACTGTATGAAATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTAT:1 - chr2R 9967150 5' - Bari1 1664 1 56.16 TATATAAAGAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 16033444 5' + Doc 48 1 52.74 GTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCA:1 + chr3L 24272068 5' + gypsy11 81 2 59.59 ATAAGATACACCAAATTATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACTCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAG:1 + chr3L 2544601 5' + Tirant 8153 2 54.86 TATGAAATGAAACTAATGTTACTCAGGGACACATTAGACACTTAAGGGTTGCGACCACACTTTTGAAGAATTATTAAATTTTTTCATATTTTATTTCCCAATATCTATCGATTTCACAGAAAGACAAGAGAGAATGCTATAGTCAA:1 - chr3L 23023947 5' - INE-1 578 1 67.12 GGCTTTTCGCCGCTCTCTGTTTTCCCCCCTTTGGGTATTTCCCGTTTTTTGTTTTCCCATCAAATGAAGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:1 - chr2R 16929840 5' - jockey 4942 1 53.42 ATCTTAAACTCCAACCTAAATACTTAAAACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 21681272 5' - roo 9043 1 65.52 GTTTCGGCGTACAGGGGTTTTATTCGTGATCTGATATGATTCAATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAATC:2 + chr2L 1171857 5' - Doc3-element 4630 1 73.29 AAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 17940230 5' - 1360 3363 1 68.49 AAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 - chr3R 26774104 5' + hobo 70 1 64.38 CAATTACGCACGGGAATTTAAAACCAAAAGAAAGCAGCCCAAGAAAGTCAGCAGCTCTGCACAGTCCAGTTTTTTTTTGGTGATGGGGTATTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr2L 16316276 5' + hopper 145 106 64.35 ATGTCGACTTTACATTTTCAAATAATTTCTGATTAAGCAGGGCAGTGAGCCCCAACACCCAAACCCACCCCTTCGCGCCAAGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGGCTA:1 + chr2R 20348913 5' + transib2 19 1 71.23 TGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGG:1 + chr3R 9038936 5' + Juan 4079 1 64.38 CACGAAATTTTGCCTAGCACTTCATTATGTTTCGATGGCTGTTAAACAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCGGGGGTATTGCAGCA:1 + chrX 11468074 5' + BS 4683 1 78.08 ATATGCGTATCTGTGCCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3R 10931577 5' + 297 10 2 73.97 AATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - 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chr2R 14051888 5' + roo 8688 2 66.44 ATTTATGTTTGGCCCTTCGTAATCAAGTTTGTTTTTTATTGTTTTCCTATTGTCTTGGCGAACCCTTGCCTTTTGAGTCGTCTCAGAGGCTTAGCGGGGCTGAGACGTCTTGCAAGAAGACTGCTATGGCTCA:1 - chr3R 7475861 5' - Helena 1268 1 90.98 TATATTTAATTTTCAATGGTTCTAAATTTTTTCACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGCGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGACTAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr3R 12242390 5' - transib2 2797 1 65.75 ATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGGATACAGTCATGGGCAAAATTATTTTTACAAAGTGCGTTTTTG:1 - chr3R 11040177 5' + Bari1 19 1 64.75 ACAGTTATTAAAAGGATAGTAACATAATAATCCTAATATTGCAAAATTCATATAATTGTTCTTAAAACATCAACAAACTAACTTTTCAAGCAAATATGTATGAAAAATGAGAGTATAACAATTCATAAAAAAAATATTAATAATAA:1 + chr2L 14995126 5' + mdg1 41 4 65.07 AATTTGCGTAGGAAATTAGCATTGTTGGAGAATTCGCCTATCTTTAACTTCAAGTGCGTGAGGGTGTGGGTGCGCTAGTGAGCGATTGTGTGTGTGTCTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chrX 6215409 5' - accord 7029 2 60.80 GGAAGCGCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:2 + chr3R 11040006 5' - Bari1 1694 1 75.34 AGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTG:1 + chr2R 7244780 5' + diver 18 2 70.37 ATTTAGTCAACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:2 - chr2L 14523261 5' + HMS-Beagle2 43 2 46.58 AAACGAACTTGAATGTTCTGCGGCAAGGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGGATGGCCGTTACGTATCTTGTTAT:1 - chr3L 959102 5' + 1360 3375 1 73.04 GGTTGGACACACAAAATTAATTTGATATACCCGTTACTCGTAGATTAAGTGGTTATACTAAATTCGTTCAAATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGCTTCCGACCATATAAAGTATATATATCAGGAACAGGATCAAAAGCCGAGTCGA:1 + chr2R 5490266 5' + INE-1 94 1 77.40 ATACTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAAACTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr2L 15076079 5' - 1360 3355 1 62.33 GGGAACTGAATTAAGGCAAAGACTCTAAGTAGTTAAGTTGTGTTTTAACATTTTAATACATTTAATAACAATATATGATATCGAAGTGGACTAACACGCGTCCGGTTGACACTCGAAATAAATAAAAACTAATTTGCGGAATTCGA:1 - chrX 16197330 5' + Copia1_DM 303 1 63.01 TTATACATGAAAACTTAAAATCAATGTTGATTTGAAAGCAACTTGTTTATTTAACTTGCTTTGTCGTTCCCCAAATAATCACACATATGTAATACTAAGTTCATTTATAGAAGTTTCTTCACATGTAGTATATACGAACATAATAA:1 - chr2R 21116632 5' + mdg1 7040 2 32.88 TTCCACTCAATCTAAAAGTTGCCCTGTACTTGTCATTTAAATGCAAGCCTAGGACATTCAAGGTCTCCTAAACACCCCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATAC:1 - chr3R 8138552 5' + I-element 4923 1 51.37 ATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGTATCGCATCT:1 + chr2L 20265969 5' - roo 8989 2 78.10 GTTATTTTTCAGATTTTTTGCTGTCTGCGTTCATGTTGTTTGGCAATCTGCCTGAGCTCAAGTCTCGTTTTCAGTTTATGTGCAAATTTCCTCAATAATACGCAACGAAAATATTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCCGATACCCG:1 - chr3R 31988765 5' - INE-1 555 1 76.03 AATAATCTGCATTAGATAACGTTTTATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGC:1 + chr2L 14026100 5' + F-element 427 1 76.15 AATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:4 - chr3R 18093406 5' + I-element 31 1 61.64 TCTTTATAATGAAGGAATTTCAACATGACCGCGGCAATTAAACTCGTGTTGCACCTGAAGCGTCAACACCTTTCATGTGACTTTGCCCGTCAAAAGTAAAAACTTTTTGCCACGCCCTCTATAACGCCCTTAAACCGCCCAAAAC:1 + chr2L 18718905 5' + INE-1 345 1 71.72 GCTTTCGCTGCATCAATTTCGCTGCATCAATATTAATTGGGTCTACCAACTTGCACTGCGTCTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCATAATTCCCTTGCTTTTATAGTTAATGAGATTTTTACTCGGCTATTGATCCTGATCAA:1 + chr2R 4726234 5' - INE-1 90 1 74.66 ATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACA:1 + chr2L 13158647 5' - roo 339 2 63.70 GACAACTATGCCATCTTAAAATCCAACCTTAAAAATTTCAGCTTTTTAGGAAAGCTATAAAACGCCATATAGAATTCGAATTTATAATAATATAATAATAATAATAA:1 - chrX 15899277 5' + invader3 5054 1 67.29 ATCTAAAAAGTTGGAAGCTGTGTGCTACGCCCAGCAGAGTCCGCCTATATCTAGGTATATATGCACATGTATATATAGACGTGCATATACAGATCGAATTCTACACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATG:1 + chrX 16782080 5' - Doc 4493 1 75.34 CCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACTCCAACTCATCACGCTCAGGTAATTGAATA:1 - chr3R 10736166 5' + McClintock 5975 2 66.44 AGCTGCAAAGCTGCAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 - chrX 22840576 5' - copia 5076 2 51.47 TCATTTAACTCGCGTGAGTACTGCGCAAATCTGTGGCACGACTCTACCGGGTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATCTTTTCGCCG:1 + chr3R 3319637 5' + 1360 44 1 55.20 GTCTGTGTGTGTGTGGGAGAGCGTTTCTTGGCAGGAAGTATTTACGTGGGAAATTGTAACAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCG:1 + chr3R 28940109 5' + mdg3 5228 1 58.62 GTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2R 24427589 5' + jockey 4711 1 60.82 ATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 + chr3R 15724275 5' - Juan 4181 1 59.59 AAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 - chrX 19539550 5' - pogo 2038 1 62.33 AATATCAATTATTTCGCGGCACGTGGTTTGGTTTGTTTAAAGCTGAACAGAGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGA:1 - chrX 9843517 5' + 1360 267 1 65.07 GTATATATGTATACATTGAAAGCGCCTCTGAGTTCCCTTTTCAGGGTATTGAATGGTTCTGACTCTACATCGAAACCAGCTAACGCCATTTGTGGGTCAACTTTTGGTTTCTATTGCGCAACCAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACG:1 - chr2R 22909505 5' + Rt1a 4960 1 69.18 TTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 7889657 5' - roo 9009 2 60.96 CTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGAGAGCGTGATATAAG:1 + chr3R 7943746 5' + blood 7090 2 67.81 ACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAAACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr3L 22960499 5' + Tirant 62 2 77.27 ATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 - chr2L 18549960 5' - roo 9042 1 69.18 TGTGGCATCTGCAGCAGGTGTTTCGCTTTCAGGTGCTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 - chr3L 1692096 5' - blood 7360 2 61.11 AAGGGCGTGGTTGCACATTTTTCGCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2R 13168618 5' - P-element 2864 1 68.84 ATAAAGCTGGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr2L 6174044 5' - I-element 5303 1 52.05 AGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATAT:1 + chr3R 15942727 5' + hopper 88 1 76.03 GAAACATTTAAGACATTTTCTCCTTAGTTCTTAGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 9544820 5' - roo 9026 1 54.79 TCATTTCCAGGACAAAAGGCGCAAATCTCCTGTCTGTTCCTTTCTTCTCTGTAGTTTTGCGCAGAATTTCAGGGGCAAAAAAAAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 12549875 5' + Doc2-element 218 4 80.00 AATAGCAATTAATTAAGCTAATTTTCAAAGCGTGCTCATCAAATATTGTTAAATGTAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCAC:1 - chr2R 20960747 5' + HeT-A 5904 1 69.86 AATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:3 + chr2R 10161794 5' + transib2 71 1 65.75 ATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr3R 27765103 5' - mdg1 7383 2 70.34 AGATAAGAATGATTATAGTATTTGCTTGAGTATATTTGGCGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTCCTTTT:1 + chr3L 9866041 5' - Doc2-element 239 1 48.00 ATGTGCGGTCATAAATCTGAGAACGCAATCAGTTCTGGCCGGCTCCCCTATATATTCCGGCCATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chr2R 11794943 5' - opus 7457 2 58.33 CCACTTGTTGCCACTTGTCCTGCATTTCGGGTGCCGGTGCCGTTGGCAGGGCGACACTGGCGGCACAAACTCACAGGCGAGATTGGGATTGGGATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGGCTGTCATGATTGTTGGT:1 - chr3L 9003677 5' - I-element 177 1 55.48 ATAGATATAAATAGTAGGTCCTCCTATGTCATCTATTCGAATAGAAAATGCTATATTTGAGTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCGAACGCAAAATTTAATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATGT:1 - chr3L 23772596 5' - INE-1 498 1 70.55 GCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCC:1 + chr2R 6965511 5' - Transpac 222 2 80.14 AGTTTTCAAACAATTTGTATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTAT:1 + chrX 2479462 5' - mdg3 5463 2 54.79 CATAGCTTAAATTAATGCCAATGGACTCTCGCCTCTCCACACATATCCATACTCCTCTTGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGGGG:1 + chr3L 5531483 5' + roo 247 2 58.22 ATTGAAAATAAACAAAAAAAAAATGGGATGGTTTAGCGATTCTAGTGAGGCAAAGGACAATACTTTAAACACTTCGTGTGCGTCCTGCAATGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTG:1 - chrX 17209085 5' - gypsy11 449 3 56.14 CCCGCATTCCGCATCCTGGGTCTCGTATCCTGGCAAACACGCACAGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCT:1 + chrX 22831954 5' - Bari1 192 1 69.18 AGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - 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ZAM 8149 2 58.11 AGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGT:1 + chr2R 18514859 5' - P-element 358 1 56.85 GTATAATATTATATACATTTTAGGTAATAACTTGTTGTTAAAATTTTTTTTAAGTGGTTTGCTATACAAAAGTTATATTC:1 - chr3R 13922880 5' - transib1 410 1 90.00 TGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 - chrX 22840565 5' - copia 5055 2 63.70 TGATGGAATTCCGGCAGGGAGCTCTAATGATCTGGGTTACCATATGATTGCTATTGATTTATAAGCATAGCTGCAAATTTAATAAATAATATATTATAGATATAAATAGATATAGATATAGATATAAATAGATTTAAAATTAAAAA:1 - chrX 20635798 5' + 1360 3020 1 36.99 ATCAGCCGTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGGAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2L 4123814 5' - transib3 2846 3 70.71 AGCGAGTAATAAATACTTGTTCTTTATACGCTAATTAATAATCGCTAGTAGATCGTAAGAGATAGATAGAGATCTGAGGGGTGGCCGGGAGTCTGTCGAATTCTAAAGCTGAACACGGGAAGTATCAAAT:1 - chr3R 20970660 5' + invader2 5035 2 71.54 AGGGGGGGGTCTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 - chr2L 15913356 5' - transib2 2783 1 56.16 TATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGC:2 + chr2R 5674647 5' + S-element 71 1 69.18 TTTACATTTCCATCATATTTCCGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGGAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAA:1 + chr3R 19449765 5' - roo 104 2 80.65 ATTATATGAAATTTGCCCATTAACAATCATTAATTTCCATGATATACAAAAAAAAAAACAACAAAAAAA:1 + chrX 400765 5' + gypsy11 3933 2 68.12 AAATTATTTGAATTGCAAGCGAAGTAAAAGAGTATATCAATTACTAATAAAATAAACTTTTCAATTGTTCTGATATTGTGTCCTATTTAGTACTATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chrX 17717132 5' + FB 27 1 63.01 CACAAGCGCAAATACATACACATCAACTTCATGAGTACGCACACAGACCACTCACACACATATTTTCACAAGCGTCTCTTTCAAGCTCCCCCATTCCAAACGGTATCAAGTTCTTAAGCTACCATTACAGCAAACACGATATCTAC:1 - chr2L 17808850 5' + Doc3-element 492 1 52.74 TGTGGAGATTTTTAATTCACGGCAACTGGACAAGCCGCCCACTCCACCAGCTCCTCCCAAGAAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATCAACACGAACACCTCACATCCATGCGATTACCTTAAACACTCCCACCCAAAT:1 + chr3R 4702918 5' + I-element 4892 1 51.77 AGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chrX 13490642 5' + 297 6633 2 60.28 ATTTTGTTTTATATCAAATATATATATAATATTTGTTTTCTTTATTAGTAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAG:1 - chr2R 10017907 5' - I-element 287 1 72.60 CTTACTTACATAATATTACGAAAACGTATATTGAAATTACCATGCAATCTTTAATATCGTTGGTTTTCCAACACCTTCGTCAATACATACGAGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr3R 4683021 5' - Burdock 6364 2 66.90 GCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr2R 6965475 5' - Transpac 5188 2 48.61 CTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:1 - chrX 10537939 5' - I-element 5287 1 63.01 ATTTATTTAGTGCTATTGTTTTTAGCCTATCTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCGCAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chr2R 6965628 5' + Transpac 19 2 71.23 GAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 14366530 5' - roo 349 2 61.81 CGGTGAGGTGGAGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGGTG:1 - chr3R 6625833 5' + flea 20 2 69.63 AGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 + chr2R 24169953 5' + transib2 44 1 47.26 AAAAAAGAAAAAAACACCGTTTAAAATATATACATTTCTGAGTGAAACAATTTTAGCCCATATTTGATGGTAACTTTTGGATAATACAAATTTTTTTTTATGAACCAACAAACC:1 - chr2L 23022533 5' + Quasimodo 7352 2 50.00 AACCGAAACCCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:4 - chr3L 21327197 5' + copia 4907 2 59.59 GTTCCCGAAAAGGGCCTGTGCCAGTCAAGAGTTAAACTCCAGCGACAGGCGGTATGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAA:1 + chr3R 15718516 5' + mdg3 5141 1 62.33 CTTATATGCTCTATGAAACGTTCTAGAATGAAGGTCGAAACCGTTAGAGAGGTAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTT:1 + chr2R 4478574 5' + S-element 1523 1 63.70 AGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3R 30347408 5' - P-element 2848 1 47.97 AATATAATAAATCATAATTAAACATAAAATTATTTATTAAATAAAAATTTATAGAACCAATTTTATTTATTACATAAAAAATACCAATTAATATAGGTAAAGAAACTAATAAAGTATAAAATAATAAATATACAAATAGGCAAAAA:1 + chrX 2580681 5' + Stalker 6943 4 41.78 GTGGATCTGCAAGCCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:2 - chr3L 18126052 5' + Ivk 2 1 77.24 ATCTATATTTTACTATTTTTCTGTGTTTTTTTTTTGTCTTTTTTTTGTGGCTGGCGCCCCCTGCCCCTTGACACTTTTGCAATTTTCGCCTGGGGAAATTTTTTTTTTTGTTGTTTTTTTT:1 - chr2L 1834852 5' + hopper 147 108 61.98 ATTGATTTATGTTATCATAATGGGTATTGGATAGTCGAGTTTCTTGTAATATAAGCAACTCCAACATTGAAATATTCCAGAGATACCAGTCTATGACGCTAAGAACAATCACAGGGGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATC:1 + chrX 305915 5' + G3 4300 1 70.55 CCTTTGACCTTATCCCTTCAAGTGATCCCATCGAGTCAATTTAACTGAACCTATTGAATTTAATATAATAAAATACTTTTAAGTATATGTCGGAAATTCATCAGTACGCCCTTCTTCCTCTTCACGATTCTCGTT:1 + chr2R 3142678 5' - invader1 376 2 65.19 CCAGTAAAGTCATAAAATACGAAGCTAAGCTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 10931592 5' + 297 6606 2 62.33 AGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2R 24427568 5' + jockey 4710 1 49.57 AATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 18046625 5' + roo 8703 2 67.33 AAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3R 9002922 5' - roo 336 2 65.07 ATTTCTTTCAAGTCTCTAATTTCACTAACATTATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrX 20836708 5' + 1360 55 1 70.43 ATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGA:1 + chr3R 19407872 5' + diver 31 2 62.50 GTATCCGAAAATATGCCCAACTTATTGGGGGTGGATTCTTCCACAAAATTAGTGTTATAAAATACCAAGAAAATTTTGCATTTCCTAACGTCTGCCTAAAAGTATGCTTTTAAATTCATATAAATTAAATAAATTAAATACAAAAA:1 + chr2R 13558163 5' + X-element 4717 1 79.45 ATTGAAAAGGGTTAGTTCATTTCTATTAGCCCAAATGTCCTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATA:1 - chr2L 2898612 5' - 1360 3118 1 73.97 ATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr3R 4860510 5' + Transpac 4960 2 66.99 AGTGCTTTTCGGAAAGCGTTTAAACTCATTTACATAAAATAAGCAAAATTTGTGTTAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAACAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA:1 + chrX 14092084 5' + mdg1 7067 8 58.62 GCACCTCCTAATCGCATACTGATTTCGTTTCTGCGAAGCCCAATGGAGCGCCCGGGAGTGGGAAAATCTGGACAGACACTTGGTGATATGCATGACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATT:1 - chr2R 21079501 5' - Juan 427 1 65.75 CTTTGGCTAATTGGCCAACAGTACGGAACACCCCTCCGCGACCCGGTTTTCAGACCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGTCGGAATTACGCTCGTTGTTGAAACGTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAGTATTTA:1 - chrX 6633114 5' + Tc1-2 1427 1 72.60 AACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3R 4805630 5' - 1360 3329 1 70.83 ATAAAAATGCTTAAATTGAGATTAATTTTGTATAATTTTACTGTAGATTGTCGCTCAAGGGGGCATGTAAGTTTTCCGATTGTATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGG:1 - chr2R 4896821 5' - Max-element 8508 2 64.44 ATAATTCAATCTTGAAGAAACCCCTGCAATTATTCCTACCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCAATAATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTA:1 + chr2R 17503507 5' + 297 6919 2 71.92 CTAGTTGTTTTCAATCCAATTCGATCGCATTAAATTAAATTCCTGATCTGCTGGAAGACGAAATACACTTCTATATGTGTTCCACTGGTATCAATTTAAACGGTTCTTAATTTATAAGTTATTTACAAAGTTTATATGATTATGAG:1 + chr2R 23118011 5' - jockey2 3280 1 64.38 AAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGGTGTCGTCT:1 - chr3L 21996248 5' - Transpac 5162 2 65.00 AGAGGTAAACAAACAAATGGTTTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGGCC:1 - chr3L 9675936 5' - Bica 57 1 54.90 ACAACGTATATAATTAATAGCCATGTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chr3R 21630382 5' - I-element 5327 1 66.90 GCTGGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3L 22400220 5' + 1360 21 1 71.23 TTTATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 11062703 5' + roo 32 2 63.70 AAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTATGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 + chrX 8200159 5' + flea 4792 2 60.96 GGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr3L 25401040 5' + Doc 29 1 56.85 AAAAAGCCAAACGAACCGAGCGGAATAGCCGGCATATGGGCAAAAATGCGCCAAAAGTGCAAAACAAAAGGCCAGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGA:1 - chr3L 4658377 5' + roo 471 1 54.11 ATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:1 + chr3R 19450197 5' + roo 385 2 50.68 ATTGTGGAAATTTTTTCTGGATCTGTTTTAATTACATTTTGAGAAACAATATAACAAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGCTTCGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGGTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGGTTTTAG:1 + chr3L 25324241 5' + Doc2-element 46 1 53.10 ACGATACGCTGAGGGAAAAATACGGTTTTTTAATCATTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATC:1 - chr3L 17183740 5' - diver 6027 2 75.34 ATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3R 23639248 5' - pogo 2045 1 60.69 CAGCAGCATAGTGTGCCATAATATCGATTTTGCCCAGACCTGCGAAGTGAAGTGGAGTGGGGTGGGTGGTGGCTAGGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 20818440 5' - 1360 3362 1 59.17 ACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2R 17796554 5' + jockey 4718 1 55.56 TATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2R 10411454 5' + 297 6636 2 62.07 ATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCG:2 - chr3L 19350048 5' + 1360 3222 1 56.16 TAGATAAATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTT:1 - chr2R 20010735 5' + Juan 4106 1 72.60 GTGTGAATTATGTGGCGATAAACTTGGCCAGGATGGTGCAACTTGTTACCCATATTGTGTGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 1692018 5' + blood 7072 2 60.27 ACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - chrX 14310335 5' - roo 9031 1 46.90 AATAATTACTAGATAGCAAGAGCAGCTTAAAAATATTATAAATGAATTGTGATATAATATTCTAAATAGTATTAAGTGCACATAAATTGCAGTTGCTGCCTAACTCGTCAGCATTTATTTATATATATTATTTGAAAAGTTTTAAT:1 + chrX 9770589 5' - S-element 1437 1 67.12 AAATGTTCAATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCACAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 5389965 5' + roo 60 2 62.76 GTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCACAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCCAACCCGCACATACATTGCTTATATCTTTGTATTCTTA:1 - chr3R 16611515 5' - Stalker4 271 4 59.59 TGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr2L 7580992 5' - Transpac 231 2 73.97 CATGTGGAGTATATCAACCGACAAAAAGCATTTGTCACACGAAGGCCTTATCTATGTAAAGTAGAATATAAAGTTCGTTTTCATGCAGGAATGCAAAAAATTCCTTCTCTGCACTTAATATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTT:1 + chr2R 15785726 5' - Dm88 4514 2 78.08 GCAAGATAATGAAACAACCACATATTCGAGGATACTTGGGACTCCCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCA:1 - chrX 649201 5' + Doc 4568 1 69.86 ATTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2R 15376201 5' - 1360 3342 1 52.74 ACAATGAGTGGTTTTCTTTTTTTTGCTATATCTCTGTGCTTAGGATACGGGCTCTTTAAGCTGAGTGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCG:1 + chrX 1156761 5' - Doc 4444 1 54.48 ACTTTCTCGATGCCGAAAGAAGTTGACAAAAATACAAGGAGCAGGAAGAAAAAACGAGGAGTTGCCGCCAGGAGCTTGATTGATGTTTGTGCTGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGAA:1 - chr2L 19334836 5' - rooA 7410 2 63.01 ATCCGGAAAGTGGGCGTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTC:1 - chr2L 4123996 5' - transib2 2807 1 71.23 AAAAAAATACAGGCGGGTGAAAATAAGGCGAAGGGTGGGGAATTGAAGATATCCTGTAAGCAATGTACTTATAAATATGAGCTATATATTGTCTTGCCACAAAAAATCCAAATATTATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 23612185 5' - hopper 160 1 78.46 TATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCGCGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr2L 9782088 5' + P-element 66 1 33.59 TATTTGCACGTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 + chr2L 4003670 5' + mdg1 47 2 53.42 TAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAATCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 + chr3R 15724305 5' - Juan 4152 1 58.62 AAATGTTTACTGCAGGCGAAACAAAGCCGAAATATTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAAC:1 + chrX 18145412 5' + I-element 117 1 75.00 ATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTG:2 + chr3L 17307313 5' - Stalker4 150 4 74.66 GTGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 - chr3R 6419923 5' + Tabor 80 2 70.34 AGTAGAGGCGGAGCAGCAGAGGTGGGCGGTGGGTTAAAATAGGAAGTTTTGTTTGCAGTGCGCACAGCAACGAGGAGAGGCAGACACAACTGTAACTGGAATTGTGTGTTTGTTAGCTCGAAATAGCGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2L 16540869 5' + hobo 2 1 78.08 ACATGTCTGAAAATAGGGGGATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATT:1 - chr2R 6622653 5' + S-element 65 1 63.70 AATGCAAAGCTTTCTGTACGACTAATGACCTAATAGGAAAACACTTCCTTTAATCTTAATAGATCATGTTTAATCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 + chr2L 10156094 5' - hopper2 1562 1 51.37 AAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2L 11357930 5' - blood 7335 1 54.79 CTGGCCAGAGACTGAAAAACGATCGCGTGAACGAAGAATTCCTGATCAGTGATCACACGACCAGCTCAATTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3L 12004385 5' + P-element 15 1 74.66 AGCTATTTTGGGACACTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chrX 20455664 5' - hobo 2933 1 59.18 AGCTTAACAATTGGAAAGCTTGTCCTGGACAGTAGAAGTTTCTCGGAGGAGTTACAAAATCATTCGAAGGAATGGAGTAACTAAAATTAAAGGGAAGCAAAACAAGGAAGAAAGCTATAGTCGAGTTCTCGACTATCAGATACCCG:1 - chr3L 20259649 5' - INE-1 555 1 63.70 ATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 - chr3R 31886950 5' - hopper 1371 1 53.24 AAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr3R 17673736 5' + FB 40 1 55.22 TTTAAAATGTTCCTATTGTATCAGTCATCTCATGAATCCCGTTCTTTATAACGTGTTACTACCTACTTTTATTTCATGCATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGAG:1 + chr2R 3168807 5' + Tc1-2 359 1 66.39 GTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATACAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGC:1 + chr3L 23249393 5' + rover 7019 2 58.90 GTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:3 + chr3L 3030206 5' - roo 9008 2 67.12 AGGAAATAATCGCATACGTTGTGAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 29084849 5' - 412 7522 2 63.70 ATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGGCGTATTGAGTC:1 + chr3R 16341969 5' - P-element 2800 1 22.86 ATAAACTCAACTGCAAATAATAATGGCAATCAACAACCGGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGC:2 - chr3R 22288043 5' - transib2 2745 1 71.92 AGCAAGAATTCATTGTTCACATTGGCAATCACTCGGCCGCACACACATTGGAAATTTATTTAAGTTTTTTCTCATTTTGGTGCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTACTCTCGCATTCACACTAGCTAAG:1 - chr2R 3181462 5' + INE-1 530 1 76.03 ATCAAAACCCGGTCGGGGGTCGATTCGATTTCGATGTCCCTGGTTCTGATGTAACAAAGAGCCTCAGAAATCCTTCTTAGTGTCATATTCAGGTGACACATGTAGACCGTAGACTAGGCTGGGGGCTGAATTAATAGCTGCCAAGG:1 + chr4 413914 5' + BS3 1713 1 57.53 AGCCTTAAAATCGGAATAAATTTAATAACTTCAACTGACATATTGGGCTTATTGTCAAATTAGGCAGGGCAAAAGTATAGATTTTTTGTTTATGGAATTTATAATAAATATATATTTAGAAAACTTAACTGGCAAATAGGAAAACA:1 - 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chrX 9622615 5' - Rt1a 311 1 78.01 TTCTACAATTGACTTCAAAGGATGGAAATGCTCAATAAAAATAAAAACTTGTAAAAAAGCGAATAAAATTCCCATTAGTTGATTGGATTTTAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3L 10731909 5' + 297 6606 2 63.01 TATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr2L 5582211 5' + pogo 52 1 57.75 CTACGATGTTTCAGGATATTTGTTTAAAGTTTTTTTCTTGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTAT:1 - chr2L 16770102 5' - G5 4678 1 57.33 AAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr3R 7666613 5' + I-element 41 1 56.16 AAATGCGGCTGTTAACAGACGCACAAGTCCTGAGTTCTGTGTTCTGAGTCCTTCGTCCTTTCTGTCTCTGTATGTATGCGAGTGCTTGTGTGTGTCTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGAGAT:1 - chr3R 17559098 5' - F-element 4421 1 68.49 AGCAATATAAATTCCTTAATCATATCAATGCTGGAAAAACCCACTATCGCTTCACATTCCTCAGAAAAAAGGTTTATCCCATGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGA:1 + chr3R 8073559 5' + F-element 4566 1 54.79 GTTTGTTTTGTCGTGCTTTTTGTTTAAACATTGCGTTGTGTTTTTTGTTTATCGCCCCCGTGTCGATCTGATCTGATTGCGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTAC:1 + chrX 12631664 5' - Porto1 4303 1 70.27 AAATTTACATATAAAACTGCGAGTAACTTAAGTTATGAATGCTTCTGATAATAGCTTATAATATATAAATATATATAATA:1 + chr2R 14813653 5' - Tc3 287 1 72.50 ACCAATCGCATTTAGACGGTCTTCGATGGAGGAGGTAAGGTTATATGAGCCCATTGGGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCAT:1 + chr3R 11936911 5' - flea 4763 1 47.73 GGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3R 10931623 5' + 297 6637 2 60.96 AATAATGGGAAACCATTTAATTGAAAACCAAAGGGGAATTTAATATAAACGAAAGCTTAATAAGAATTTAAAAAATTTAAATCGATTTCCAGGAATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 - chr2L 7125944 5' - I-element 5336 1 36.30 AAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 + chrX 4808519 5' - mdg3 5429 2 62.33 ATCGGACAACTATATCAAATACATATATGGCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 5151294 5' + roo 8716 2 74.07 ATATTCTGTTTGTATAACTACGGTTTCAGGAAATGTTTTGTGTTTGTATATTTTTTTATCTGGCCAATTTTTATCAATATGGCAAAAAAGATTAGCCACGCTCAGTCTGCAATAAATCTAAAAATAGAGTTTGCTTGCTTGTGTGA:1 + chr2R 5027918 5' - 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chr3L 18126052 5' + Ivk 3 1 76.71 TAACGCGCCTGCATCTCCTCCATGTGCTTTACATAACAGCGACTGGGGAGTGCACAAGCAACAACAAAAAAAACAATACAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAG:1 - chr3L 19696290 5' + Doc 4505 1 58.22 ATGCCAAGTGAAGATCCATACCGCTGGCGATTTCAGTATCGTTTACAGCGATCGATAAGGTTTTGGCGCCAGGCCTCGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATA:2 - chr2R 7417648 5' + Stalker2 7504 2 53.42 ANTACTTTACCAGCTATGTTACATAATACCATATTTGTATTGTCGATTTCGACACTGATTTTTGTCTTCGAGTATGAAGACAAAAAGTGATTCATAAGTGTGTTATACCAAAGACCCTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTTATAC:1 + chr3R 14946921 5' + Tc3 317 1 71.92 AGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTGGTGGCCACGATCGG:1 - chr2R 4577053 5' - Chouto 399 1 78.62 ATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGT:2 + chr3R 23067461 5' + roo 387 2 50.68 TGGGAATCGAAACCGAAAATGCACCTAAACAAAAATAAATGCACCAGACCCTAGAAGAGGGTAACAATAGACAGGTCCCTAACATAAAAAATTTAAGCTATCCAAATTCTTATATAAGTTAATCATTTTTAAGTTTCAGTTTGAAT:1 + chr3L 14979478 5' + Gypsy6A_LTR 153 1 54.79 GTTACTGAGTTGACAAATAAGGTGCTTTGGAGGCAAGCTGGTTATGATTTAGATAGAATGCAGGCACTTTGTTGTCGAAGATTACATAGTTGTGTGTGGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1 + chr2L 19332665 5' - roo 8601 1 67.59 AGAGTGGGAACGGTACAGCAACGGGGAGTGAGAGAGCGGGACGAACAGATGGTAACTGCTGCACCCATTGCGTTTGTCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 - chr2R 20349076 5' - transib2 2795 1 59.70 AAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTG:2 - chrX 14722205 5' + diver 5952 2 59.59 TGGTGAGCAAAACAGCGAACAAGAGCAATAATGTACCGCAGACAACAAAGAACTCGTTGTGGAAAGACCACAGGAACCTACAGACACCAACAGAAACGGTTGTAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAA:1 - chr2L 4585890 5' - Cr1a 149 1 70.55 TTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr3R 15325165 5' + 297 6644 2 73.85 TAAACAAGGCCATCCAGAAAATGGCCGATCAAATGAATTGCGAAAAGCAGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTA:1 + chr3R 7063074 5' + F-element 4599 1 66.44 CAAGTTAATAGTTTCAGCAGCGGCAAAAAGAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - 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chr2R 3176037 5' + G5A 2797 1 59.46 TAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:2 - chr2R 2427621 5' + Doc 61 1 60.27 GTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 11257440 5' - 1360 3371 1 69.53 AAAATGGCATGAATCGTCTTCATCTGAGAATATGAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCATCGAGTCAGTTAGATTTAAAAACCCGAATT:1 + chr3L 26871052 5' + rooA 326 2 64.49 ATAGATATGTTTAGGTTTAGGCTGTGGCCTCTTTTTGTCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACA:1 - chr2R 16126310 5' - transib2 2742 1 74.66 TTTATAAATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTC:1 - chr2L 17005854 5' + Stalker2 7260 2 76.03 CCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:2 + chrX 7795528 5' + roo 8740 2 74.48 ATTGGCTTTTTCGCTTTCATATACTACGAGTCGATTTATTAACACTTGGTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAG:1 - 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roo 388 2 71.23 ACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3L 7889660 5' - roo 348 2 58.90 ATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGAGGAGCAATCGAGCGGACGTGT:1 + chr2R 22287417 5' + jockey 21 1 59.80 GAAGTTTCCAACTACATATAAACTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr2R 11804589 5' - pogo 2092 1 75.38 AAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3R 7420176 5' - 1360 3355 1 63.70 CAAGAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:2 + chr3R 16630235 5' + FB 30 1 63.01 CAACCTAAGCGTTTGTCATTTTGACTAATGGCTTATCAAACAAACGCAAACAAACGGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAG:1 - chr2R 12773897 5' + I-element 443 1 61.38 GATCCCGATCCCGATCCCGCGATTGGGGACCATTAGCGCACCGCTGAGCGCTGAGCGGGGGCTAAGCCAGCTGAAAAGCTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACC:1 + chr2R 22766543 5' - Doc 26 1 66.96 AGGCCTACTCCCGAGCATGATACTCATGTTATGCCTCCTATCGACAATTAACACACAATACCTAGAGTAACCCCTAACACCTAATATTTCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTAC:1 + chr2R 4354607 5' + Cr1a 3987 1 61.81 TTATTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGACACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTA:1 - chrY 1654284 5' + INE-1 532 1 43.15 ATAATTCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 - chrX 8200323 5' - flea 4979 2 60.69 AAAAATGCCTATTTAATTGCCGCGTCGGCGCCGAGGGCTTATCAAGCCATTCGCATTACCATTACCACCTAAGCAAAACGTAACCAAGAATGATGGGTCGACTATGCAGACTGGAATGGATCGCT:1 + chr3L 2887614 5' + Doc4-element 466 2 54.40 AAGTTTGTATTTTATTGTTTATGTCTATTATGTGCGTGTGCGTCTTATTTAATAATATTGTAGCATTTGTATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 23600417 5' - roo 9029 1 53.79 AAATATTTAAGTAAATCGTAAGTACCTAAATATTTATAAAACTTAACTAAAAAATCTATTAAATGGAAATCTATAAAATTATCCAGCGATTTGGTGTAGAATTGAATATAAATAAATGTCACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGC:1 - chr2L 14358916 5' - diver 222 1 66.44 GAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 11191505 5' + roo 8713 2 52.74 ATCTGCCTATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr3L 18931072 5' + I-element 46 1 52.05 ATAAAAATTCAATTTTATTTTTCCTTATTTTAAGGAAATCTTGACTACTGTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACATG:1 + chr2L 3224322 5' - roo 9001 2 65.52 AAGAAACCAAATCTTATAAATTTCAGGATAAACTCTTATATTTTACATTTATTTTACTCGGAGGGTATAGTTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 - chr3L 20711752 5' + jockey 4767 1 77.40 AACAAGCCGCACTTTCCTCTCTTTCGGCGCCACTAATGATGACATTCAAATTCACAGTTTGCACATGTAATTAAGTCGCTACAGTCCGAGTCCCTGAGTCCTGCTAACGGGTTGTTGTTTTCTTTTTGTACGCTGATTTTTTTT:1 + chr2L 11327924 5' - TART-B 10583 2 70.14 AAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2L 18549903 5' - roo 321 2 75.34 AAAAGCCATGCCCAGAGAATCGAAAGTGGAGTGTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCTTGCCGTAGGATGGCTATGTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGG:1 - chr2R 14822840 5' + GATE 8208 1 72.22 ATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCGGATTAAATA:1 - chr3L 7889658 5' - roo 346 2 57.53 GTTTTAATTTTTATCAGCAAAAAATTTAATTGAGTGCAAATCGCGAGCCGAACCGAGCAAGTTTCCAGAAATGTGAACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAAC:1 + chr3L 4545027 5' - R1A1-element 8 1 61.65 AAATAAACAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCCAGTCTTGGGCGGTTTGTAGGCGTAAGAGTGGGTGTGACTACATGGCAAAACACTTCTGCGGCGTCTATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 + chr2L 16839709 5' - INE-1 166 1 71.83 ATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATACATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:2 + chr2R 18258785 5' - Juan 4152 1 56.16 ATACATAATTTTTAATATATCCACCGAATTAATTGTTTAAATGCACTTTACTAAAGCGCACTGCAATAAACGCCTATTGTATGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 - chr3R 19408021 5' - diver 6072 2 54.79 TAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 5532896 5' - roo 9043 1 63.70 GAATTACTATTGGCCAGCCTTGTTGTTGTTGTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr3L 6964820 5' + P-element 60 1 42.96 AATTGAGTGCGCGGGGAATTGATTGTCAAGGACATGAACGTGGACCTGACTCGCGAGTGGATGGGGCTGGTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGGAGTACGGGTTGGTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCG:1 - chr3R 15595953 5' - F-element 240 1 58.02 ACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2L 17809276 5' + jockey 57 1 50.34 ACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAA:1 + chr3R 19449930 5' + roo 9047 1 70.55 GGGCGATATAGAGAGTGCATGTGTGTTGAAAGTTGGTGTAAGTGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGATGTGTTGCTTTAGATATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGTTTTTACAACTGGAAT:1 + chrX 5379120 5' - Doc4-element 2740 1 70.55 GCCTTGACCGTACAATCAAAAGTTGGGACAAAGGTTAATTAGAGCTTTAAATTTGGATTTTCTTGAAAAGAGAGTTTTAAAGCAATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAAT:1 + chr2L 17005640 5' - Stalker2 405 1 78.08 TGTTTAAGTGGGCAAAAAAGAAGAGCGCAAAAAGCATTGAGTGGGTGAGTTTCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGCGTTAGGGTGGGTGAACGTATTTACTTGTGTGCGTGAGCTAGATATATAATCTTATTGCTTAATGCTAGCTTA:1 + chr3R 8705695 5' - invader3 5302 2 71.92 AACTACTGTATTGTGTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTAT:1 + chr2L 7618447 5' - X-element 4672 1 50.00 AATTTGCGTTTCATTGTTAACCCTTTTTTTTTAGTAAATAGATATGCAATAATTCAGGCTTACATAGGTACCGTATGGGCTGTTACAAGGAACACGTCATGGTTAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 + chr2R 7090590 5' - I-element 5341 1 71.92 CGAGGAAATCATAAGGTACATTACGAAAGATTCCTCAAACTGAAGTGAATTGAAGGAGAAGTCTTGCATATAAATGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTA:1 + chr3L 19702539 5' - 17.6 63 1 56.16 AGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3L 17940046 5' + 1360 16 1 56.52 TCTGTTTGAGTGCCAATTCAGTGCCACGAAATTACAAAAACCCTAAGTGGATTCACAGCAGAGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr2R 10411586 5' + 297 56 2 57.53 CCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:2 + chr3L 6447008 5' + transib2 38 1 57.25 ATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGTCATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 4964118 5' - roo 8986 2 76.71 TAGTTAATACCATGACATAATCCCATAAAAATAAAATGAAACACAATGAAAAAAAGCAGGAGAATGAAACAAGTTTGACAACGTCATCGCGAGAAAATAGAAAAACAAAATATTAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 13937853 5' + BS4 730 2 77.60 TTATGTAACTAGTTGCGTTCAATATTGAATTTCATTTTAAGCCGATTAAGCTCTCAACTAAATTGCTATAAATAGGTAATTCTTTAAAGTATTTTATATATTTAAAGTAGATAAATAAAAAAATTTTATTTATTTTCATTTTTTTT:1 - chr3R 14445029 5' - Doc2-element 254 1 81.51 AATTTCATAGCAGTTTAAGATTTTATGTAGTATTTTAGCAAAGTTATTTAAAAAGGAATTTGCTTTCTTAAAATCAATACATAATACTGGACCTACACCGAATTAAAATCCTTCATTCGACTGCGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr2L 12286087 5' - INE-1 87 1 80.00 AATGGCTTTTTTTTTTTGAATTTATTTAAATCAATTTCCGCTCCCCAAAAGCATACCAATTTTCCTTATCCCCTTAGAATTTTATGTCTGATTTTCAGGTGTTTTCCGAAAAATAGCAGTGCGAG:1 + chr2L 229678 5' + HB 14 1 74.40 ATTGCTAGGGCTTATCTTCAAATATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr2R 16510072 5' + F-element 45 1 50.00 ACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTCATCCGTCAGGTTTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCT:1 - 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F-element 4260 1 79.45 AAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 15790797 5' + roo 15 2 65.75 ATAAAATCCTTCCTTTAGGTTGGGAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGAATCTCAATTTAGCGCAACAACGCGTACTT:1 + chr3L 14720963 5' + F-element 253 1 76.67 AGCCCCAGTCCTATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTCATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCAGTGCTCCAGCCGTCTTAACAGCG:1 + chr2R 7244780 5' + diver 5917 2 63.70 GGATTGTTTTCGGTTGAACAAATTTGAAACAAACATTTTCTTGATTCTTTGCCAGAACTTCCGCAGCCCTATTTTATATCATTAGGTATTTAATTTCAAACATTTCATAAAATGTTTCAATTTTATTTCTTCAATAGTTTT:1 + chr3L 14290948 5' - HB 1487 1 55.32 ATCTAAACACATATAAAACTTATTATCATAGGATGCTTACATCAAGGATAGAATGAAGCTCAAGTCTTTATAGGTTTTCGGGAGCAAATATACACATATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACC:2 - chr2R 17926443 5' + opus 20 2 71.92 TCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAA:1 - 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chr2L 20840118 5' + mdg1 7054 2 73.29 TAAACTTTGGCAGTTGGTCAGCGGAACATCACGAAATATCGAGCCGTACGGTTGGGCGGGGGGTGTGGC:1 + chr3L 12337814 5' + Cr1a 4426 1 60.87 AATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3R 23639112 5' + pogo 32 1 62.33 CTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 12251017 5' + 412 7090 2 56.16 AGATTTCCGAGTGACTAGGATAGTGATGGAGTTCAAAAGTGGCACAATTTTTATGATCATGCGACTTGGTTTGATGGCTCATCAGCGATCGCACCTCACATCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chr2L 7332386 5' - hobo 2887 1 54.79 GTCGTCCCACAAGTCCTTGTCAATTTCTGTACAACAATAATTTTGTGTTTAGCGCTTAGGTAAAAGAAATATCTCAGTTCTCCCTTCCATGGATTACGTTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTTAAGTGGCAAA:1 + chrX 8441062 5' + accord 408 2 68.49 ATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAG:1 - chr2R 6965557 5' + Transpac 90 2 78.77 ATACAGCACTAAGTGATGACGGGTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2L 22193387 5' + roo 32 2 65.75 AAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTGGTACGATTGTTAGTATTTATTGAAAATATATTGAAAATAAAAGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTA:1 + chr2L 23008384 5' + transib2 287 1 74.66 ATTGCAAATGGAGTTGTACAGTTGTTTCAAACTATGAAACTTAACACTTTGCGTCCCATCACTTCGGGACTTGACTGCTTGACCTTTTTTTTTTATTATTCATTAATCTTAAAGTCACTAGGAATCGTTTAGTTCCTTCTAAACTT:1 - chr3R 2846370 5' - G5A 2800 1 77.40 GATGGCGATGGCAAACAACATTTTGTCTGCTCATAGATTTTTGATTCAAATTTAATTACTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGGAGTGTTGGTGGGTTATGT:1 + chr3L 14817955 5' - I-element 4966 1 54.48 GTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 7795585 5' - roo 321 2 78.47 ATTTGCATTGATTAAACTTAATTCATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAA:1 - 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Tc3 1648 1 58.90 ATGGTTGTCTTACGGCTTTTGAGTAAAAGTAAATTTTGCAAAATAATTTCCCAAGGAGGGAAAAGTGCCAGAAAGAGTGGGAAAAGAGACAGAGAGATAGAGAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTCAA:1 - chr2R 13620305 5' - Cr1a 4318 1 69.18 ATTGTTATACGCAATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 - chr3R 19073305 5' - roo 9032 1 57.53 AAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr3R 9298477 5' + hopper 57 1 64.34 CCTTTAAAGTTGAATCTCTTGTTAAGTGGCAGGGAACTCACACTGTTTTTTAACCCACTCCGGTAAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 3233918 5' + roo 22 2 67.13 ATGCAAAAATCTCACTCACTCGACGACTCGACTGCAGCCACAAAGTGAATAATGAAAAACTTTTGCAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTG:1 - chr2L 15239191 5' - F-element 4499 1 57.26 ATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAT:1 + chr3R 19449909 5' - roo 8674 2 72.73 GGGGTGGCCAGATGACGACCCACGCGGGCGGAGATCACGAGATGCCCCACAATCTGCAGCACTTGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATT:1 - chrX 2664101 5' + I-element 420 1 58.46 GACAAAGTTTAATGGAAATACCAGTCAGTTATTACAAATATCATTAAATATGGCTACTTTACTTATTTATTTGTCT:1 + chr2R 11439889 5' - Tc1-2 67 1 86.84 AACGCAAATATTTTTGCTCGGTAACAAAGCGAGTTTATTTGGTTACCAAAACGTTCCGATCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAA:1 + chr3R 9647629 5' + G2 3062 1 59.59 CCTTAGAAGTTTTCGCAAATGTTGTAAACTCTCGCCGCTGCCTGTCGAGTGGCTCCCACTTTCATTAATACGAATCCCTCACACCCATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAA:1 - chr3R 20786462 5' + I-element 4890 1 60.00 GTTCATATTAGATGTATACCACTTTTTTAATATATTATTACTTCAGCCGAGGCCATGTATCCCCGGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 - chr3L 21763065 5' + jockey 4774 1 52.42 GTGGGCGTGTCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGGTAGATCGACTCGGCTAT:1 - chrX 14770553 5' - INE-1 103 1 80.14 ACAAGATAGCCTTTTAAAATTAACATACATAAGTTTTCAACCAGATTCAACTCACGTTTGTTGGCCCATGTTGCCACGCCCACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTT:1 - 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F-element 100 1 51.37 AAATGATATGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGACAT:1 - chr3L 8959739 5' + 1360 14 1 73.97 GCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:3 + chrX 7795476 5' + roo 8689 2 70.55 ATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 23773159 5' - roo 9045 1 47.59 AGGAAAGTAGCATATATCACAAACTAAATCCAATTTATATACATATCCTATAACTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAAT:1 + chr3R 10270578 5' + Juan 4094 1 61.64 TGATCCTAGAACGCCACTAAAATGAGTTCAAAGGTGAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAACTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATATATTAGAAATA:1 - chr3L 17031897 5' + 1360 324 1 75.17 AGTCTATAATAAAGAGAAGCAATGTTTACTAAAATCCTGAAAAGCACCATTATAAGTTTTCTTACCCAATCCCGGTAACTGAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAA:1 + chr2L 124022 5' - 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I-element 5084 1 71.23 AACCGGCTGCTAGCCGCTGAACAACAGCAACTTAAATTGGGTTCTCCTCGGCCAACTTTGTTCAACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chr2R 7090775 5' + I-element 8 1 78.72 TGTGCGAGAAATAATTGCGAAAATGCCAAAACATAAAGCCGAACAACAAACATAACCGAGTGCCGCCAAAATCGAAAAACAGAGAAAAACGCACCAAATTTGTTCAGCCTAAAGCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATA:1 + chr3R 28950707 5' + gypsy4 499 1 79.45 ATTCGAATGCGAGTGGTTTGGTGCATTGTGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTA:1 + chrX 588154 5' + Tirant 8425 2 78.08 TTCCCCTAACTCGAGTATTTATTTCAGTATTTTGTACTTCGCATTTCGTATTTATTTCTAAGTGGAATATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAA:1 + chr3L 2817775 5' + Bica 259 2 66.44 ATATTTTGACCATTTTCATTTTTCGGCTTATTAATATGCAGAACTTCACACTTTTTCTCACTCTCATCTTCGATGATTTCTCATTAATTATGTTCGTGGTTACAAAAATGCTTGATAAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGA:1 + chr3R 25583607 5' - G4 7 1 58.22 CTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - 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Juan 4155 1 58.62 GTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 + chr3R 8890023 5' + FB 64 1 61.64 ATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chrX 9950596 5' + jockey 4712 1 61.82 AAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGGGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chr3L 18403032 5' - P-element 2796 1 23.45 TTTTAATACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 20167691 5' + roo 8712 2 52.74 ATTAGAAAATTGTAATATTTATATTTATTTATCACGTATACTAAAAATTGCACTTCCCTTGACCTCTGCTTATAAATGATTTCGAACTTGTCCGGCACATTTCTAGGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAA:1 - chr3R 31943095 5' + 17.6 6947 1 73.29 AGAGCCGAGAGCTGACGTCATCGACGATGTACACTCGCATTTTGTGGGTCAATTGACAAACTAGCAGCAGCAACAATAACAAATATGGCACAAATACTCGGACGTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 + chr3L 4132430 5' - INE-1 82 1 69.18 AAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGATGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 + chr3R 13875080 5' + P-element 99 1 16.44 AGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGGTATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr3R 9594993 5' - Tirant 8454 2 54.79 ATTCAGAGTATGAGATTACTGAATTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:2 - chr2R 5074597 5' + 1360 46 1 50.68 GTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGTACTCTTTGATTTATTTGT:1 + chr3R 4160061 5' - invader2 193 2 53.79 ATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:3 + chr2R 21116477 5' - mdg1 7401 2 60.27 AGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:2 + chrX 6116262 5' + transib2 78 1 71.92 CCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCCCTCACTAATCATT:1 + chr3R 11186564 5' - 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roo 9029 1 53.42 ATAGAACCTCCAGAAATGTCCTTTTGCGCCTCGTAACTCGAAATTACCAGTATTTTTATGGCATGCCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 28146216 5' + roo 8703 2 50.77 ATATAGATATGTTTAGGTTTAGGCTGTGGCCTCTTTTTGTCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 - chr2R 16126312 5' - transib2 2744 1 73.29 ATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 11062712 5' + roo 41 2 57.53 AACTAAGCTAAGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 + chr2R 24169923 5' + transib2 14 1 43.84 ATTTGAATGTATTATTTCATTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chrX 17343377 5' + I-element 39 1 56.06 TGCTTCTAAAAACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - 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INE-1 10 1 71.23 GTGGCACGTGGAGACAGCCGCAGCGCAAGGATATGGCAAGGATATAGGAAATGGAGCGGGCGCAGTCAGGGGGCAGAGATGGGCAAAAGTTTCGAGGTAGTTGAAGGTGAGGGGGCTCGATCACCGGTTTGCGG:1 - chr2R 20852657 5' - Doc 309 1 65.67 ATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2L 22193429 5' + roo 74 2 69.18 GTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chrX 11661506 5' + pogo 49 1 54.79 CTTATTTTCATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:2 - chr3L 9269994 5' + copia 53 2 54.11 TTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGTATCTTAGAGTAAATGGC:1 + chr3R 24369062 5' - roo 312 2 80.00 AAATTATTTACTAGTTCAACTCTTTTAGTTTCGTCCAAGCGAATTATCGGCCAGGATATGGGGTAAAGTCCGTGCAGAAAATCATAATTATGAACTTTCCTTTGAATAAGGAGAATAGTTGAAATAGTATTCGAATATTAACTTCT:1 + chr2R 10379503 5' + mdg3 230 2 77.40 TTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCTTTTGGAACAAATTAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAA:1 - 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roo 8983 2 79.45 CTATTTGTCTGTGGAATCAGGATCTAAACTGAATCTGAGATGTAACCTGTCCCCAAAACTATACAAGTTTAACTGACATTATTATCTCAGATCATCAGACTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCG:1 - chr3R 7059307 5' - Doc 409 1 76.00 ACCAATTCGAATTTGACGGCCGGCTGACAGTCCAGGACGCGCCCAAAACAGCATATTACCCATACGACCCGTGGGCCAGGATTTACATGGAAAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAACAACTTGCCCGTTTTGCCA:1 + chr3L 13473956 5' + I-element 5002 1 69.57 ATAGTTTCTAACAAAACACGAAACCTCAATCCATATATATACATATTTACATATTTTTATCTATTTGTAAATCTATATGGCA:1 + chr2R 3599973 5' - G3 4479 1 70.73 CAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAA:1 - chr3L 15099638 5' + G4 3816 1 35.24 AATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTGGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAAT:1 + chr3L 26170623 5' - invader4 2669 1 54.79 CAGGTGAAGAAAGTGGCGAAAGGGGCGAACCACTTGACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATTTCAATATATCGTCCTCTAG:1 - chr3R 25433397 5' + transib2 48 1 52.74 GCCACAGGGAGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAA:1 + chr2L 4754825 5' + Stalker 6856 4 60.96 GGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 5389887 5' - roo 8987 2 78.77 AATTGATTAATCGCGAATCGAGAACGTAGCACAGCAACGAAATGAAAACGAAAACGGACAGAAGCGCTTCGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 + chr2L 7656559 5' - Quasimodo 324 2 58.96 ATTGCCGAACTTTAATTAACTAGATTTCGTACTTGATATCATGAAACGTACTGTAAATTTCTGACGCTCGTTCGTATATAACCAGCTGCAATTGCCTGCATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAAATTAAAAAGAAGATCGCAA:1 + chr2L 14860560 5' - hopper2 1386 1 62.33 AGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATCAAATAAACTAAATAA:1 + chr3L 25782384 5' + F-element 87 1 73.88 CACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 + chr3R 19407893 5' + diver 54 2 54.79 GTGTGCACTCCTGCTGCTGCGGCTGCTTTGGCTCTGTTGGCTGGCTGCAAGGGGTAGAGATGGTGGATTTGTATGGGGGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCCGCTTTTACTTCGATTACTAATTTGATTTTT:1 + chrX 18243048 5' - Doc 4426 1 50.70 GGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:3 + chr3R 11191357 5' - roo 9046 1 65.75 AGGTCTTCAGTGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAACAGTATGCAAATTT:1 + chr2L 12984102 5' - hopper 1374 2 53.42 AATACCCGTTCTAAAGTCAAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTACGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATACAATTAAGGGTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATA:1 + chr3R 18399338 5' + Juan 4042 1 28.37 CCGGCTTTTATCAGCGAATCGCGTGGGTGGGTGGTCGTGGGAGATTTATATAGAAATAGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chr2R 12779623 5' - I-element 5294 1 57.53 CAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCAC:1 - chr2L 12984203 5' + hopper 78 1 69.18 GAAAAGAAAGACGAGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGC:1 - chr3R 4287680 5' - F-element 4484 1 81.33 CATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCT:1 - chrX 3431996 5' - Ivk 5353 1 62.33 AACATCGGGTGGTCCACGTCCAGTAGTACACAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:3 - chr3R 10270687 5' - Juan 4176 1 60.96 ATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 - chr3R 21933222 5' + pogo 80 1 74.48 TATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3R 19073201 5' + roo 67 2 72.39 ACTTTTTTACGTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:2 + chrX 17717004 5' + FB 64 1 60.27 AGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGGGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 - chr3R 23491949 5' + transib2 70 1 63.70 AGATGGGCAAAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGCCTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTT:1 - chr2R 10161874 5' - transib2 2763 1 60.74 AAAAAAAAATAGCAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr3R 19992777 5' - hopper 1397 1 73.97 CTTTTTACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAG:1 - chrX 22824270 5' - Gypsy12A_LTR 2250 1 60.96 TTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 + chr2R 17796556 5' + jockey 4737 1 63.64 ACTATTAATTATGCCTCGTATCCTTGAATCTGTTATTGATGGCACACACTACTAAGCTTTAACCATACTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:3 + chr3R 20441224 5' - I-element 5303 1 52.05 TAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGAGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTACGTAGAGATAAGTCGTGACTCTCAGTCT:1 - chr2R 12779725 5' + I-element 25 1 58.77 GTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGA:1 + chrX 15903140 5' + INE-1 99 1 73.29 AAGGGTATTTTAAACGAAAACGATTTGAGCAATCCACTCAAGAGGGCATCCAATCCAACAGACATAAAAATGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAATCC:1 - 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Juan 398 1 59.59 TAGCCACGGGAAATTTATGCTTTTAGGTCGTGGCAACTAGGAGAAAGGCAAAAAAGAAAGCGGAACGGGAAGGGGAAGAGCAAAAGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGAGGC:1 + chr3L 15914275 5' + Bica 25 1 65.69 AGATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 - chr2R 8735710 5' + mdg1 25 2 65.75 ATTCTGCCACATGCACGTGTGCACATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - chrX 9950630 5' + jockey 4714 1 53.42 TTATTTGAATGTACAATATATTATTTAAACAGTGTGTATTGTATCCTAGAATATCCGCCTGAGGACAGGCTAAATTTAAAGGATGGGGAAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACA:1 + chrX 3389952 5' + Quasimodo 36 2 75.34 ACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr3R 23639151 5' + pogo 65 1 65.00 TATGCCTAAATTCATAATAGGTATTATTAAATATAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTACTTATAAGCAGAAGGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACT:1 + chr4 221334 5' - Tc1-2 106 1 79.45 ATGAGATCATTCAGCCATAGGCACTCACTCATTCGTTCAGGTGGGAAACTCATTGCATATTTACATACAATAATGAACGGCTGTGCTGAGCTCGTTATGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTT:1 - chr2R 20557602 5' - Idefix 191 1 71.72 AATGGCAATTTTCTGAAACTCCTTGCTGTGTCCAAGTCTGCCTTTCTGTGCACATTCATTCAATTATTATTCGCTTTCGCTCAAAGTCTCATTTTTGCTACTTAGTACTATGGAAAATTTGACCACTTTTTGTGGCCA:1 - chr2R 15664786 5' + Transib-N1_DM 12 1 71.01 ATGAATTAGAGCCATCCCTCGAGGATTAGTTGTGTATTGTGCAATTACTCATGTGGTTGGGCAACTGAAACTGATCGGTATAATTTTAACTATTCTTATTATCTAAGTTGTTTTTTACAAAGATTATATGATTAAGAGTATTAAAT:1 + chrX 22890260 5' - jockey2 3272 1 60.27 AACACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAAT:1 - chr3R 2520357 5' - Tc1-2 1613 1 64.38 ATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCA:2 - chr2L 13844230 5' + Stalker2 90 2 76.71 CTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAA:1 + chr3R 9038929 5' + Juan 4072 1 59.59 CGCCAGTGCATTTTCTAATTAGTGGCCAGTGGCCGATCTACCTATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTGGTACGATTGTT:1 + chr2L 23008328 5' + transib2 221 1 62.33 GCACTCGACCCCGTCCACACCGGCTATTGGAGCGCTGCTATGGCAAATGCGAGGATGAGGCATATTTAGACGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 5899093 5' - Transib5 27 1 59.04 CTAGTCCCCTGATTTGGCCGCCCGGGAACTTTCACCTAGTGTATGAGTGTTTGTGTGGGTGGGTTGTGACAGTGTGTGTGTAACTGGGTAATGCGTCTCAAGGACCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 + chr2R 19941488 5' - hopper 1400 1 74.66 TTCATTGCGAAAATATCTAAATACTTTTTACTACAGCAAGAGCTAAAAATATATCTATATGAGACACAGGATATAAATGCATTGAATTTAAGGAGGGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chrX 19119443 5' + Tirant 8122 2 69.63 AGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATG:1 - chr3R 15072644 5' - pogo 2073 1 58.51 CAGCAGAATGCATTCTGCGGCTTGGCAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTTCTATTATGCTGTGTAGTAGGGGCATATATCGAGGGT:1 + chr3R 22642235 5' + blood 4 2 78.68 ACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGTATTTTTGAACTTTGAAAGCTGGAATCGTTTGTCGATTTGTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTTGT:1 - chr3R 17673828 5' + FB 75 1 59.59 GTACAACATCGAATGGCTATCCAGAAACGAAGCTGACATCACCGACTGGCTAAGTGGAACGGCCTCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 13302138 5' - roo 9025 2 48.63 AAATTATTGCTGGCTTGTTTGCGGTCAATTTCGACTGCAACTATTGCATAATTTGAGGCTCCGGGCCAATTAAACTTAGCGCACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACCATTTTGTG:1 - chr3L 22325926 5' + hobo 37 1 58.90 AAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAC:1 + chr2L 16943807 5' + copia 71 2 67.12 ATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCTGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2R 23180182 5' + roo 8678 2 64.49 TGTTGCTTTGCATTTTGTTAGTGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr2R 21160730 5' + Transpac 4970 2 74.04 TATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2R 15326866 5' - copia 5073 2 74.48 ATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAGCTG:1 + chr2R 17796512 5' + jockey 4685 1 74.07 AAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAAT:1 + chr3R 15942725 5' + hopper 86 1 74.66 TTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGT:1 + chr3L 28063328 5' - Stalker4 109 4 69.86 TTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 + chr2R 4189005 5' + S-element 77 1 74.66 CCCCATTTTCGAAATTCTATTTTGAACAACCAAACTGTGTATATTGTACGGAGTGTAACCAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCT:1 - chr3R 21850870 5' + I-element 135 1 58.90 ATAGAAACCCTTTCGATCAAGGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGG:1 - chr2R 12253862 5' - F-element 325 1 73.56 TCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGCGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr2L 18347400 5' - transib2 2777 1 52.05 CGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACGGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGTTCTGCT:1 + chr2L 17809170 5' - jockey 4946 1 48.20 GCTCTATTAACAACTAAGCAACTCCAATTGCAACCTTTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCA:1 + chr3R 7556886 5' + Quasimodo 6990 2 73.94 AAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACA:3 - chr2L 17005805 5' + Stalker2 61 2 58.22 GCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTG:1 - chrX 21994001 5' + McClintock 52 2 56.55 ATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATTCAATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTG:1 + chr2L 23069853 5' + Stalker 7032 4 60.58 ATAAGTGCCCTTCTCCAGGAAAAGGACTTGGGCCGAGGGAGGTGCATTCGGGTCTTAGGACTGGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGGGGAAGGAGCAGCCTACTA:1 - chr3L 26309291 5' - mdg3 5255 1 59.59 ATTTGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTT:2 + chr2R 7244792 5' + diver 5929 2 56.85 AAAAATAAAACAATTTAAGAACCGAAAACAAGCCATTTGCCAGGCTGCGTGTCCTGCTCCTCCTGTTCGTCCTGCGAGTGTGTGTTTCCATGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGG:1 - chr3L 17270197 5' + Tc1-2 449 1 76.55 TCTGCTTTTTAACATCATACGATATATTCCTCTTTTTGCCTTTTATGTATGCTGACAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 + chr2L 13556286 5' - transib2 2816 1 78.77 ACGACCGTGTGTGGGAGAGAGCGCTTCGTGTGTACTTCGGCTCGACGGCTTCGACTCGCACATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 23295523 5' + P-element 30 1 49.57 TTTAATTAGCTCGAATGAAGGAAGCCGTTGGCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATACCAAGATGCGTAA:1 - chr2R 8047381 5' + 1360 8 2 72.13 AAGTAATATCCGGTGTTTGAAATTTGAGAAGTTTTGCTTAGAAGCCACCGATGAGTTTATGACCCAGAAAAGCTGCGAAACGAACACCGAAAATGACAAAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAAT:1 + chr2L 11540302 5' - pogo 55 1 67.81 CTATATATAAATACATCGAAATCGTTTTTGATCCCCAAAACCAAAATTTTCCAACATGCTCTAAACTTCCTAATAAATATATATTTTGAGCAGTTACATAATGAATTTTTGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3R 24219218 5' + roo 8673 2 79.31 ACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCA:2 - chr3L 27391432 5' - 1360 3375 1 67.81 CAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 14366498 5' - roo 396 1 75.38 AGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:2 + chr2L 18347270 5' + transib2 46 1 52.74 TTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chr2R 19199772 5' - hopper 1379 1 47.26 CCTAAGCCAATGAATTCCATCGTCACCAATACAAAGAGCTGATCTACCAGCATGGTTGCCTCTCTCACAACCGCAATCGCATCGACAACAACATTAACAGCAACAGTCTCTTCAACTCAAACGATTCAGTTAACGACCTCACGGGA:1 + chrX 12601603 5' + Doc4-element 356 1 70.55 ATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr3R 18093405 5' + I-element 29 1 62.24 AGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTAATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAGATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 14767377 5' + roo 85 2 73.97 GGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3L 25401028 5' + Doc 41 1 48.63 GATTCGGGAGCGCCCAAGAAGCGAAAGAAGGCGGCCGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACTCCAACCCTCTAGACCTTCTTAGAAAACCCAATCCAGATAATATACAAAAACTCATTCTTTTCCTAAAA:1 - chr2R 21698205 5' + I-element 5147 1 72.60 ATTTATATTAGTGCCTTAATACAAATAATTATGTGAAAACCCCAAAATATGACCCCAAAAAATGCATCCTGAACTTTAAAAATGATCGAGGTGGGAAACTACTCAAAAGAATTATGATTTACTATATGTATATATATATATAAGTA:2 - chr2L 9463929 5' + 1731 4414 1 81.51 GTATCTAACCTTTCGGTTATCTTGGATATCCGTAATATAGTACGTCATTTCACACTTGGAGGATTTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 17077240 5' + roo 8683 2 71.23 ATTATAGGTTGCCATTATTAATGAAAATATTAATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 6408578 5' + TART-B 10627 4 90.91 GATACTTCGGATAAAACAGTTTTCACAGATCTTAGTTCTGATGCAAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 + chrX 696504 5' + FB 75 1 68.49 CTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCT:1 - chr3R 28385628 5' + transib2 60 1 57.93 TTTTTTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAACATTTTATAACATTTTAATAAATGCCACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAAT:1 + chr3L 4526156 5' + Tc1-2 1473 1 69.86 GAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 - chr3R 16630338 5' + FB 84 1 74.66 ATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 23295614 5' - P-element 2865 1 41.78 GTCTCTCCGGCTGTTTCTCTTTTGTCTCTTGTTTTGTATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGTTTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAAGTTAAGCAGATCAAATTAAG:1 - chr2R 22774733 5' + jockey 4940 1 72.03 CTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTG:1 + chr3R 14860169 5' - BS 5003 1 80.14 TGCCATCAGGTGGAGAAAGGGGTGGCTCAATCAAACGCCTATTCTATGGACCATTTGTGCACCTGTCGTCGCAGCCAAAGGCGCTTGGAAATTGCGGAAATGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 6397612 5' + roo 19 2 67.81 TTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGT:1 - chrX 1799215 5' - invader4 265 2 64.23 CACCAAGCGACAGAAGTGAGGGCCGGCAATCCAGTCCAGTTCAGTCATCGTCCAAGTTAACGTCCCAAGTTTACACATGTTACAAAAGCGAATGCATCCAACATCCATCTCTGCGACTTTTCTGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGC:1 + chr3L 7122939 5' + 1360 432 1 69.18 ATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCATGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGTAAATTTGTACGA:1 - chr4 373043 5' + pogo 75 1 67.81 TTCATGATCAACGATCACGATTACATAGACTTTATATGGTTCAAAACGCTCCCTTCTTCAACGAATTTTCAACGAATGTGTTTATTTTTTTTTTATCGCACGGGTCCCACGGCCACCCCGCCCGACCAACCGACCGAGGGGCGCTG:1 + chr3L 25481436 5' - Cr1a 4413 1 52.05 GTTTCGTTTCGCTCACATCAAAAAACCAAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chrX 8200131 5' + flea 4765 1 78.77 CTCCATGAATTCCACCATGGCAGTGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 - chr2R 12472133 5' + transib2 49 1 52.05 ATTTCTTTGGAGTCTGCTTCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 4063823 5' - roo 359 2 52.05 AATGGAGTTAACCAGACAGTTGACCAAAAACCCGAGAAAACTTTTCCTATGAAAGAGTTTGCAGCTTTGCTCACTAATCCGCATTATATGAACCTAATTTAGTATGGTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr3R 20441371 5' + I-element 13 1 75.34 TTCAATGCAAACTATTATTTAAATTAACGCAGTATTCAAAATTTTTACTAATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGAT:2 - chr3L 24535880 5' - rooA 7183 1 54.79 GACTGTTTTTGGCCGAGTTATGATCTGCTGATGTTGGGTTTTAGTGACAAATTGGCAATGGTTTGGGAGGACCCTTAACTGGACTAATATCACTGAAAACTATATTATATTATATTTATATATATTATAAATTATTATTATTATAT:2 - chrX 7548304 5' + Tc3 273 1 67.81 AAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAGAACCCGACTTGCGCCAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGCGCCAACGC:1 + chr3L 25482893 5' + accord 67 2 62.33 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr3R 29487012 5' - flea 4972 2 59.59 CCAATTATCATTTGTGCCGTGTGTGCGCGGATTTCACGGTTTTCTATTGTTTTGCATTTTGCAATATAATGCAGAAAATACATCAATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGT:1 + chr3R 4677905 5' + hopper2 1561 1 58.22 ATAGCCGTGAGTTAAATATTTTTTAAATCCAAATTAAAAAAGAGAGTGAACAGAGTACTAAAGTCTGCATGCTTTATTGTATTTATTTGTATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCA:1 + chr4 909876 5' + invader1 34 2 64.38 ATTCCCAATATTTAGCTTTGTGAATCCAAAATCCAAAGCTTTTAAACGTTTTAAGGAACATTTCGGCCATACATACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGACCAAAATTGCTCTCAGTTCGCCCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAA:1 + chr2R 2951834 5' - 1360 3289 1 52.05 GATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 4341287 5' - roo 320 2 77.40 AAGTGATGGAGACGGGTGATTGCATCACTTGCTCTGGCAAGCAGGGCAGCATTGGAAATCGAGATATTGCTCCCTAAAAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAA:1 + chr3R 16041702 5' + hopper 946 1 73.29 AACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACCTAACGTATG:1 - chrX 1135403 5' - P-element 2852 1 55.56 GTAAATATCAATTTAAGCCGAGAAAGGACGATAACTTTGGCCAGCCGAAGCTTATATACCTTTGCTGTTAAAACCATGTATTTAATATGAAAGTTCGCACAATTTCGAGTATTATTATTATTATTATTATTATTA:1 + chrX 462564 5' - mdg1 7068 8 77.04 AAACTGCTCCTCGAGAACCGTGAACTTAATAAGGGACTGTGTGAGAGCAGCCAGGAGTCCAATCAGACACACACACACACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAG:1 - chr3L 7713585 5' + I-element 5004 1 56.16 CAATAATATGGATTTACATACATGTATCTAAAGATCCCTGTTTAAACCAAGGCACTATGGGTAAAAAGCCGGAAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTTTTGTGATTGATATTTTAATGCTCCTTTCATTTTTTGATTCCTAGGTAA:1 + chr2R 4547783 5' + transib4 73 1 69.86 AAATTACAATCGATTATATTGGTTATCCAACTTAATTAAGAATTTCTTCAAACAATAATTTATTTTTAATTGGGCTAACGAAATTATATGTATTTTTAGCGTTTGGATGTTTTTTTTAATTTTTTCAAAGGTTTTTTTAAGGGTGG:1 - chr3L 6217440 5' - FB 391 1 67.12 ATCAGCATCACGAAGCGGACGCTGGGCTTCCAAAACTTTGAATACTAATACCTGTTAGGGATGACCAGGCGCATCGGCATCGCATCGGCTCCGAATTCGTCGTCAACCTGTCCGCAATAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAA:1 + chr3L 20412174 5' + Bari1 99 1 80.82 ACTCAATTCCTAACTGGTTCCGGCCATCCAATCCCCTTCCCGATGGCATCTCGAATGCCAAATTCGCAAGTCAAAATAAATTATCGTTCACAGTCTGCTTTATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATAT:1 + chr2L 21068510 5' + I-element 5068 1 70.34 AACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - chrX 10521751 5' - Tabor 445 2 55.48 AATTTCAATTTTAAGCTGATAAAATAGATATTGAATATTGACGTTTTTTCACGCTCTACACCCTACTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTGTAATTTATGACGAGAACATGCATTTTGGTAAAAATACAAAAATAAACAAACAAATAAA:1 - chr3R 12050504 5' + HeT-A 307 1 67.81 AACAGCTGGCCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 - chr3R 23618233 5' + hopper 54 1 53.42 ATAAATAAATGAGCTTGATAAACAAACGAAAGCTACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3R 27133542 5' + opus 7140 4 67.12 ATTTGTCTTACTTTTATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 + chr3R 4679405 5' + hopper 16 1 73.29 AGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:3 - chr3R 13187536 5' - I-element 5314 1 53.42 CTAAGACATGTCGCTAAGTGTTCCTGCGATTTTGAATGTTCATCGTGCTCGCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTTACATTT:1 - chr3R 5746032 5' - Stalker 262 4 65.07 ATTTAAAATACAACCAACGAAAAAAATCAGTACCCAACTGAAAGGGGGCGAGAGCGGGAAAAAAAATAAACCCAAACTTGCAGATGAGGATGTAATAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:1 + chr3R 9148323 5' + I-element 470 1 62.79 AGCAGGTGGTGTGTATTCAAATTAATAATGCCAAATTGATTATAAAACATTTGTCAATGGCAATCTGCCGGGAATGACCCGTCCGGATTTCAAAAAACCCCATAGAAAAAAATCACAAGAGGACAGATCGGGAG:1 + chrX 20145973 5' - mariner2 573 1 64.18 CTGATATCGATATTTTCACGCAATCATCGAATGTTTCGCAATTTTCGCTGAGCTACTTTCATCGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr2R 21160613 5' - Transpac 5215 2 74.66 CTCTAGTGTTTTAGGGACCTGCCCCAACCACTTTCCTTGCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACACGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chrX 959014 5' - 412 457 2 58.00 ACTGGTGTATACCGAATGAGAACAATTTTCCGTTTATCCCAATGTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTAACTCGTTGAGTTTTAGTATGAAACTAATTTTATGTGGAAATATATTCGGTTTAA:1 + chr2R 5151242 5' - roo 9013 2 58.06 AATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGGGCTCCTTTCT:1 + chr2R 12185274 5' - accord 7365 2 69.86 AAAATGAATAAATGAAATGAATGGTCTGCATTCATGAAAATGTATAATGCAATGTATAATGCTATAGTTGAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACCCAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGG:1 - chr3L 22780674 5' - G2 2764 1 76.12 ATAAAATAAATAAAAATATGAAATCTGTTTATTGTAAAAACTGTTTATATTATTATGATATTAAGATTCTGCTATTACTATTTCTAAGCTGTAATTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAATAAGAATTTTTCGCATGATC:1 - chr2L 17663024 5' - 1360 279 1 52.05 CTACAGCGATTAAAGTTTTCACAAGCTTCATAGCAAGACAATTGCAAAACAAAAAAAAAAATAAGAAAGGAAAAAAAAAATCATACCGGGCAAGAAAATAAAAAAAATGGCAAAAAAAAATTAAAAATTTAAAAAATCAAAAAAAA:1 + chrX 20086694 5' + TART-C 11097 1 76.03 TATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:2 + chrY 2720332 5' - 297 6918 2 73.29 CTTCTGTCTGACCAGGTTGTCTGTTTCTGGCTTTTCGCCGCTCTCTGTTTTCCCCCCTTTGGGTATTTCCCGTTTTTTGTTTTCCCATCAAATGAAGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 - chr2R 16929868 5' - jockey 4970 1 65.75 AGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chrX 19054245 5' + jockey 66 1 56.85 TGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATG:1 - chrX 23108308 5' + BS3 1453 1 64.91 GTACTATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAAC:1 + chr3R 19449904 5' - roo 8666 2 73.10 TGGGAAAAAAGTATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3L 15103756 5' - Transpac 5217 2 77.24 ATGTGTGTAAGTGTATGTGTTTATGAGGGCCAATTTCTGTGTGTATAGGTGGATATATGAAAATATGTGCATATGCATATATGAATATATGTATATCTGTATATATAGATATATGAATATATGTATATATGTATATATGTATATAT:1 + chrX 14421829 5' + G3 4505 1 49.32 ATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2R 12133826 5' + jockey 86 1 71.92 CCTGTCTGACGGCATTTTCGACAAGTGCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGAGCGCCGGCTAACTATAGT:1 - chr3L 24127576 5' - X-element 4631 1 71.58 AAATGCGCTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chrX 22840590 5' - copia 213 2 53.47 CTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:2 + chr2L 7660890 5' - I-element 5315 1 52.74 GTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACCTCCCGCCCAACCGTACGGCTCGATTTGCGAGAAGATAGACGCGATATAAAACAGAGAACAGAAACAAGGAAATGAATATAATGAAA:1 - chr3R 14980421 5' - Cr1a 4328 1 63.01 CATAATACCCCGAAATGCTTCTGCGTTTGTTCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:3 + chr3L 23249345 5' + rover 6971 2 72.60 AGGTAATCGGAACACTCCATTTGTATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 13300987 5' - roo 9040 1 61.64 GTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAG:1 + chr3R 9038935 5' + Juan 4078 1 63.70 ATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 + chr3L 21996152 5' + Transpac 55 2 52.74 CTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTTTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTTTG:1 - chr2R 3564123 5' - Tabor 418 2 65.91 TTTTATATGAAATGTAAAACAGCGCCACACAAGAAGAATATCGAAAAAGAAACAGAATCAAAAACAGAAATAGTTGAAACTGAAAAACCAGTACCACAATTATATCCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACA:1 + chr2L 22674735 5' + mdg1 16 2 74.66 ACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr2R 6847818 5' + Doc 75 1 75.19 ATGAATTTTTAAAATTTTTTTCAAATTGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTG:1 + chr2R 10600515 5' + invader4 104 2 58.00 ACTCATCGGAGCCATCTGCGATACATCCACGAGTCTTTCATAGTGCATTCGTGTTGAGCATATCCAATTCAAGCTTTGCTCTTGCATAACAACGGATGGATAACTTTCATGGTATGCACCTTAAACAAAAAAAAAAACCTTTATA:1 - chr2R 24823994 5' - Tc1 1468 1 55.86 ACAGCAACAGCGCACACACAGAAAACCAAAGTGTTCCCTCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chr3R 25709734 5' - hopper 1389 1 66.44 ATACGAGTATTGAAACATTTGAAAATTCATGCTTTCAACGAGCGGTAAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTG:1 + chr2L 11257019 5' - rover 7273 2 53.47 ATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGACCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 29084857 5' - 412 7514 2 60.27 ATAGCTAAACAAAATGTTGTTTATTATATGTAAATATACGTGTAAAAATATGGAACAGGCAGAAGGAAGCATTTCCAACCACATAAATTATATATATTCTTGAATAGGATCTGGCCATGTCCGTCTATCCGTATG:1 + chr2R 5780175 5' + INE-1 120 1 68.15 CTCGATGGACGAGAGGATGCGCTGCAGCTCTACGCGTTGCTGCACTGTGGTCTGCCGGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTT:1 - chr3L 258710 5' + gypsy2 191 2 57.89 AAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 14980308 5' - roo 9011 2 58.22 AATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 + chr2R 9966984 5' - Bari1 1643 1 60.69 ATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATC:1 - chr3R 6625784 5' + flea 4837 2 73.29 ACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3R 23639135 5' - pogo 2041 1 46.58 ATGCAGTAGATAGGTTTTATTTAATTGTTTTTTTATCGAGTATGAACTTCATACGTATATATTGCAGAATTTGCT:1 + chr3L 25291787 5' + mdg1 240 2 52.00 CCTTAAAAGTATATATTCTACGAACAGGTGCGTACTTATAAACGGCACACTTATTTCTGTGGAAAAAATAGATAAGAATGATTATAGTATTTGCTTGAGTATATTTGGCGGTCTTTTTTTGTTTTCTTTTATCTTTTTCCTTTTTT:1 + chr3L 9865972 5' - Doc2-element 237 1 63.01 ATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGTGTAG:1 + chr3R 29084907 5' - 412 7465 2 70.34 AGTGTTACAAGTATTTATACGTATTTACAATAATGGCTATGATGATAAAGTTAAAACACAATGTTAATACTAAATCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGTAATGTACACCTCAAAAATTCAAATAATTGTACCTACATATT:1 - chrX 5650757 5' + HeT-A 5974 1 57.53 ATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCT:1 - chr2L 11391582 5' + 1360 64 1 60.69 CCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCCTTTGGCCTGTTTTTTTTACCATAATGTGTTT:1 - chr3R 23618224 5' - hopper 1393 1 58.10 AATCGGGATTTGGCGGGGAGGCGCTGCAGCATGCTGGAAGAAGAGGTGGAGGAGGAGGAGGGTTCTTACTTTTTCCTTGCGGCGCCCAAATTGGGATGCAAACCGGATATTACCTCTTTATTCTAGTAGACTACTTTTAATTAATT:1 + chr3R 29563682 5' + Cr1a 3980 1 56.16 CAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCC:1 + chr2L 14026137 5' + F-element 432 1 63.27 AAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGAAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACACGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCTGTTT:1 + chr3R 14980311 5' - roo 351 2 52.52 GTACCGATTGCCAGGGAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 15942700 5' + hopper 61 1 57.53 AGGAAACTGTTAACTGGGTCCATAAATTCAACTTTGTTGTATATACATACATACATACTGTATGTTCATATAAGTACGTCACTTTAAACATCTGCCTTCGTTTCCTTTAACTAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTTA:3 + chr3L 21821367 5' + Tc3 315 1 76.71 GGATTTGTAACACGCCCCCTTACACCCCCTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTAAGTTGAATGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAA:1 - chr3L 13798547 5' + Bari1 1479 1 40.45 AGACAGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTATCTTTTATAT:1 + chr3L 13365711 5' + BS 5019 1 60.27 ATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGGGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTGGAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chrX 19588157 5' - roo 9028 1 54.11 CGGCTCGATTCGGCTGCAAGGCGACGCGCCTCGGCCGGCCGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCC:1 + chr3L 3983802 5' + P-element 6 2 60.23 CACAGAAATAGGTTTATGGATAAGTTTAAGAGTTCTAGAAATAAGATATAAATTGAAATTTTTTTTTGGAGTTTCAAGTAAGACTTAAAATTATAAATGATATCATAAAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 3030353 5' + roo 8675 2 73.79 ATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 13168668 5' - P-element 2851 1 44.55 CTGTTACCGTTCATTAACAATTAAAAGTAGGCAGACAGCATCAGCATCTGTATCTGTATCTGTATCTGGATCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAG:1 + chr2L 14451584 5' - G4 122 1 62.04 ATCTATGCAGACTTCCAAAATGAGGACGCAATCCAGCAAGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCC:1 - chr3L 17874058 5' + 1360 43 1 77.60 AGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3L 14366610 5' + roo 61 2 68.80 AAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTTATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr3L 23839743 5' + 17.6 6958 1 71.03 CTTGCTCGTCCTTTTCGCCATGCCATTGTCCCGCACAAAATCTAAAATTGTAATCTAAAATCTAAAATCTAAGCGCGCTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACCGCTCGCTT:1 + chrX 18346791 5' + Cr1a 362 1 70.91 ACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCT:1 - chr2R 20010717 5' + Juan 4124 1 61.64 GAGCTTTTGTCAGCCAGCACTTGCCGCCCAAAAGTATGCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chrX 18239479 5' + jockey 16 1 77.40 TTATCATTTATTTGTTTTTTTTTTTGGTTTATTATT:1 + chr3L 17880099 5' - Rt1b 5149 3 75.00 CAAACTGCAGCCTTGTGAGTACCCCTCATCCTGGCATTATCCTGATATTGGGGCACGCAAATATTTGCAGATATAAATTACAGACAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATCTAGG:1 + chr2L 11913176 5' + springer 7408 2 66.14 CGTTTAAAAATTCTGCTGATACAAATTTTAAAATACACTTTTAAGTTGTAAAAAGTTTCATATGGTTCTTTTGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr3R 22229515 5' + FB 50 1 57.53 ACATCATCCGACGATCATAAGTAAAGTGGTCACCGTACAGCCTCAACAGGCAACCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCC:1 + chr2L 195494 5' + I-element 4888 1 54.05 CCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3L 7889561 5' + roo 8728 2 68.49 AGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAAT:1 + chr3R 4357537 5' - Tc3 1639 1 65.52 CGAGAAGACCAAAGAGTACGACTACTATGATAATTTGGCTAACGAAGAATCCGAGTCGCAAAACTATGATAATATGCACCCTAAAAGCTCTGATTTCAATGTGGATCTTACCAAGAATCTTGTTAATATGGTAGGCAAGAGAGGGC:1 + chr2L 9642181 5' + transib2 2695 1 80.14 ATTCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGTCGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 - chr2R 10411453 5' + 297 57 2 61.64 AAGCGATAACGAGCCAAGCACTTCATCAAGACGCTGTCGATTAATGGTAATGGGACAGGCCAGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2R 13931522 5' + P-element 49 1 47.14 AATTATATTATACATCTGTACTGATTTGAATGGATGAAAAATTTTTAAAAGTGTTAACAGATTTAACGTTATGAATTTTCTTGCAGTACCATAGATTTTAACTGCTGAATACTCACTCAAATATTTTAATATATTTATTTTATATT:1 + chr3R 18544613 5' + Cr1a 4313 1 78.77 AGGATGATATTAGTTCCCTGCCCCCAACGGTCACATCAACAAGCACAAGCACTCCTAGAAGTAACAAAAATTGCAGATGTAGATGTAAGAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTATTGTAACGACCT:1 + chr2L 4123119 5' + I-element 494 1 65.75 AAAAACTATTTTTTAAATAATTAAATAGTAACAATACTAATTTACATTATACTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCG:1 + chr2L 22307163 5' + Cr1a 4415 1 68.75 AGGTCGCATAGTGGTTTTTGCTCCCTTCACGGGCATCAGTTTAGAGGGCCATGTGATGCTTTTTACTGGTGATGTTAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTG:1 - 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chr3R 12780919 5' + hopper 8 2 80.14 GAGAAACGACACGAAAGACTAGAAATATGAGATCCGAACGGATTCTGTTCCCAATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTATTTTTTTGTTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGC:1 - chrX 8502914 5' - transib2 2602 1 66.44 CGAAGGATATCGAGGATATATGGTGATGGCAGGGGGGCGTGGCCGATGGAGACGTCATCAATTTCCATCCAGCCTATAAATACGACCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTCATTGTCCCACATCTCATATTTCA:1 - chr3R 29192814 5' + HMS-Beagle2 21 2 51.41 GTATAAAAACAAAATCAACAAATCTTGTTTTTCAATCCCCTTTACCAAATCGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:2 + chr2L 12134500 5' + jockey 4830 1 65.75 ACACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGG:1 + chr2L 11391506 5' - 1360 8 2 51.37 CATCAGCATATTTCCGTGGCTTTTCCACGTGGTTGCAATATACCAGCCGAATGTCATTCACTCGGTCAGCCAACCAGCCAGCCAGCCAGCCAGTCTGATCAAAAAATAAACAAAATCCAAAATTCTAATTAAATCCTAATTATAAA:1 - chrX 726400 5' + transib4 2563 1 56.85 AATTTGTTCAAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAT:1 + chrX 19074728 5' + mdg1 24 2 65.07 AGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - 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Ivk 5372 1 69.42 TGGCGCTGTCAACAAGCCCCTGTTTTGTACCTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTC:1 - chrX 12180108 5' + pogo 156 1 78.77 ATATGTGCTCCATCTACATATGTACTTGCTTTTCAGCAAACTGGGTGTTGGCGTGGCCCAGAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 + chr2L 16274933 5' + FB 58 1 58.22 TAATAATATTGTTTAAATATTAAATTATTACAACAAAGTGTGCATAAATGAATATGTCATCCGCAATCCCCGAGTTCCCTGGGCCAAAACGAAAAAAAAAACAAAAAAAAACT:1 + chrX 6643862 5' + HMS-Beagle2 489 1 51.33 AATTTCTTTCAAGTCTCTAATTTCACTAACATTATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 - chrX 20836709 5' + 1360 85 1 76.03 ATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 15072667 5' - pogo 2059 1 54.20 GTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATT:1 + chr2L 7618461 5' - X-element 4663 1 58.21 GAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGTT:1 - chr3L 18126012 5' + Ivk 43 1 49.32 AAAAACATAAATAAATAATGAATGTTTCTATGTGGAAGTTGTTCTTGTAAATTTTATAACAAATGCCACATAATATTACGCTTATCTTTATCGGGAAACACCAATAAAAGGGCACGTAACTACCAAATAAACTTAATAGTTTTATT:2 - chr2R 13170880 5' - TAHRE 63 1 60.96 CTACTTATGTTGATTTTATTTGCTTATAAAAGAAATGCTCAATCCTTTCTCATTCAAATCCCAATGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 - chr2L 14671967 5' + FB 15 1 71.23 AAAGTGCTGGTAAATGCATAGTGTTCAGGATTAATTTGATTTTTTTGTTTTATGCATTTTTCTTGGGAGGAAAAAGTTTACAAGCCTTATTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAAT:1 - chrX 4246443 5' + mdg1 7178 2 58.22 TGAATCACGTATTAGATAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATAAAATATATATATTTTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGAACGTCGAAATCTCAGGAAATATAAAACCTAG:1 + chr2R 5744285 5' + INE-1 152 1 80.14 TATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2L 4123852 5' + transib2 61 1 60.27 ATTTGCTCCTAAAAGTATGCTGTAAAATGTGTTCATCCGGGATATCCTTATCCTTAAGATATCCTCTTTTCAAATTGGTTCAATAATAGTAGGTTAAGTAAATTTATCTATTATCTGTGAGAACATTT:1 + chr3R 13937937 5' + Juan 43 1 60.16 GCTCTGAAAAGTATGCTTTAAAATGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 + chr2R 15004748 5' - BS 5043 1 54.11 TGTATTCGGGAAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 - chr3R 18093433 5' + I-element 4 1 80.14 TCGCATTTGATAACATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGAGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3R 30675508 5' + 297 6584 2 78.77 CAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAA:2 - chr2R 8157276 5' + mdg1 7097 2 58.90 AATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAA:4 + chr2L 11391455 5' - 1360 59 1 66.44 AACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2L 20265936 5' - roo 349 2 59.59 CCAAACAGAAATATTAAGTTCTTACTTAAGAAAGGGATTAGCATCAGCCTTGAAATATATGAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 15325075 5' + 297 6636 2 59.59 AGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 + chr3R 17673721 5' + FB 37 1 60.96 TTAACTTCCTTCTCGTCAACCTTCTGGGGCTTTTCCTCGCCTGTTTTCCCCTTTGGTGGTTTCTTGCTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCC:1 + chr2L 330391 5' + G2 2979 1 57.50 AAAATCGATAGTTAAATTACAAAACTCGAAAACAACATTAAATAAGTTTAATGTTTTAGTTTTTGTCCAGAATGGTCGTATTCTTTATTTTCCTTTGATATTTCAGTTTTTACTAGAGATGGGATTTTGTATTTTTTTTTTTAAAT:1 - chr3L 11830978 5' - TART-C 11099 2 54.79 TAACTAGTTTTTTTTAAATGAAAATCAATTAAAAAAGTTACTACCAGTATTAAATTTGTTTTATGTTGTCCAAACAAAAATCTGCCAGCAGTAAAGGGGGGGCTATTTTTAGTCTTGTTTTTATTTT:1 - chr2L 1840139 5' + invader6 11 2 76.38 AAGAATTGGGAACACGTCCAGGGTCACTGCAGAGGGGGGGTGGGGTGTTAAATTGACCCATGCTCGCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr2L 20821323 5' + Burdock 6178 2 56.16 ATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:1 + chrX 12066111 5' + transib2 58 1 59.15 TATTAAAAATGTATCCGACAGCTCCATGAAGTATTTCCCAAATTGAAGTTCTATGCCGACGTAGCCACCCCGGTTTTCAGTCGAATGGGGATGCTATGCTCATCGCGAAGGAGCAGGGAATGGGGTTGGAGGTTTTTTTTTTTGTT:1 + chrX 14645824 5' + Tc1 1468 1 73.29 ATTGGCCTAAAAGTATGCAGCTCCAAGGAAAGGCAGCCAATTCATCACACACTTTTCATTTCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTAACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 + chr3R 8051123 5' + jockey 4821 1 61.64 TAAAGCATTTTACAGACTTATTAAAAAACATGCACAACTATCTCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAA:1 - chr3L 14354043 5' + I-element 260 1 70.55 ATAATGGCAAGCTTGTAAAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCC:1 + chr2R 20226954 5' - hopper 307 1 61.70 TATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 + chr2L 17180071 5' - Juan 4156 1 54.79 ATAGTTGAATTAAACAGTTATTAAAATCTACTTTTAAAGGTAAACAAATACCTTAAAAAATTTTTAATATATTCCATTTATTAAATTAAATAAATAACAAGTCGATTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCCAGCGTGAA:2 + chrX 21387970 5' - INE-1 537 1 60.96 CATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGGCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTG:1 + chr3R 11040066 5' - Bari1 1634 1 67.12 TGGCAGTTCAAATAAAAAAATGGAGAAAGAATCTAAACATTTTTCCAGTTTTAATTTAAAATAGTCACTGCCATGCACTGCGTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGGT:1 - chr3L 26465789 5' + invader6 4606 2 80.00 ATCTTGCCCGATTGTTTCATTATCTTCAATGACTGATTGTAAGAAATTGTACAATTGGACCCAAGTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGG:2 - chr2R 7244952 5' - diver 203 2 74.66 CAGAGGAAAAAAAAATTTTTTTTAAGTTTCTCAAAAACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 + chr2R 5941294 5' - copia 230 1 67.12 AAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr2L 14074544 5' + 297 58 2 64.03 ATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 19449913 5' + roo 8671 2 78.08 ACCCATTGCCATTATATCAAGAGAACTTGAAGAAAAAATAGTATTATTACAGATAGTGCAACAAACATGCCGAAGGCCTTTTCCGACCATTTGAAGTATATATTTTTTGATCAGTATCAATAGCCGAG:1 + chr2L 21613259 5' + INE-1 90 1 52.34 AATGGTGGTGCAACCCCGGATGCTATTCTCCAAATCAGCAGCCTGAAGAATAGAAAACGTAGCCGCTGATGGGACGGGGAATTGTGACGGTAAGAGACCTTGTTAAAAAATATTATTTATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGTAC:1 + chr4 597773 5' - Tc1-2 1620 1 56.16 AAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTTGGTAAGCTTCGGCT:1 - chr3R 9238193 5' - P-element 34 1 15.75 ATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 20898602 5' - roo 323 2 78.08 ATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATTTATCGATGCTAATTGA:1 + chr2R 7244848 5' + diver 5948 2 76.15 AACATCGAACACGACCTAAACAAAATAAACTGAAAAAATAATAATAATAATAATAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAAT:2 + chr3R 556357 5' - Juan 4172 1 54.79 ATTCGATATTTCTAATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr2L 17180024 5' - Juan 4203 1 76.71 GTGAAGTAAAATTAGAGATAACTCCTCTCCTTAGATCGTTAATCTGATTGTGAGATACATCGACAGGTAACATTATCATATTGTAAGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATTTAAAACTAA:1 - chr2R 14273917 5' - TAHRE 10150 1 56.85 ACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGGCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTAT:1 - chrX 19980685 5' + X-element 4551 1 60.96 AAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTAGTTACAAACACAC:1 - chrX 22386788 5' + hobo 83 1 47.20 AGGCAACCGCAAAATATCCATCAGCATCAACAAGTGAAGCTGCAATTCGGGTTTATTAAATTTTCCACCTTCAGCTACATGCCTGGGCTGGGCGGATTGTGTTTTTACATACAATACAATACAATAAAATAAAATAAAATAAAATA:1 - chr3R 14544346 5' - transib1 1899 1 54.79 AATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACGGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 22642277 5' + blood 7063 2 52.11 AAAAGATGAACGATTCGCAGATAGTTTATGGTGCACAGGAACTGTAAAGAAGTATTCTCCATAACTATGAAATTAAAGAAAAGCAAGGGTTATTTGAATATTTTTTTAAAACATTTTTTAATCCA:1 - chr2L 15351049 5' + Juan 3785 1 67.20 AAGCTTTCCAAAAGATCGGCTGCCCCACCATTTAGATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGTGGAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chrX 21632970 5' - mdg1 7429 2 47.90 CGCCAGCTCAAGCTTATTTTAGATCCGGCCTGCGAAAAAACCGGATTCCGGTGTACCAAGGAATTTCGGTCTTATTTTAATTTAAATTTTATAA:1 - chr2R 20458373 5' - 1360 3043 1 87.23 TTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chr4 373063 5' + pogo 55 1 57.53 TCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 47067 5' + roo 41 2 58.22 AATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTNTTNTGANNNNNNNNATNNNNNNNNNNACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3R 13187532 5' - I-element 5310 1 50.68 ATTTATATTCTTGATCAGGATCAATTGCCGCCAAATCGATCTGGCCATTTAAGTCTGTCCGTATGAACATCGAGATCTCAGCAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTA:1 - chr2L 21071966 5' + Doc 4310 1 55.48 AGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 13406419 5' - pogo 2034 1 67.12 GTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTG:1 - chr2L 17766173 5' + Doc 228 1 63.01 TGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTC:3 - chr3R 18971767 5' + Juan 4107 1 71.23 ATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGT:1 - chr3L 11257418 5' + 1360 3383 2 33.10 ATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTT:1 - chrX 19074865 5' - mdg1 7397 2 59.59 CAAAAAGGCGCAACTGGCAAACGAATGAACGAGCGGGGAGGCGAAACAGATGAATCGTGACACACTCGAAAAATTAAGAAGAAGTCATGCTCAAAATCCCTAACCAAGAAGACAATTGAAAAATAAGAAAGAATGCTATAGTCGAG:1 - chr3L 19514222 5' - INE-1 577 1 73.97 GTTTACAAAGTGCTAATAAAGCTTCAATCTAACTTATTAAACCCACATTGTGAGTCAGCTCATGGGTTGTCTGCTCTTCTATGCTCTTCCGTGCAGGCAGTCAACGCCCCGCTGTTGTGGCTGCTGTTTGCATAAATACATTTAAA:1 + chr2R 7064893 5' + Bari1 304 1 56.16 CCTGGCCTGACTTTTTGATTTTATGACATTATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chrX 6475287 5' + Doc 56 1 52.05 GCGTTTTTCTTTTTATTTTCACAATAATCGCAACTGCAACAGCAGCAGCAAGAAAGCACTCGATTGCGCCAAAAGCAGCGACAGGGAGGAGGATTAAAACCTGCGGGAGGATACAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACC:1 + chrX 2867064 5' - Circe 41 2 77.40 TTACGAGTGAACATTTTGTTAACTTATTTTTGCGGCCAATACGAAACAAAAGTTTAATGCTTGATTGCATTGCTTGCAAAAAACTTTAATGACAAATATATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chr3L 14094534 5' - I-element 5339 1 67.12 TTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr3L 2544638 5' + Tirant 8140 2 61.70 AGGGGGGTTGCGAAGAGGATGTCGGTCGGGCCGGGGCTCAAAGCACTCTTCTGCGGGCAGAAGAAAGAAAGAGAGAGTGTGAGGGCAAAAGTGATGTGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chrX 3059970 5' - P-element 2865 1 70.55 CAAATGAAATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chrX 10537799 5' + I-element 6 1 79.45 AATGGAATTTCTCAAGAGCAACTTGAGAAGATGAATATACACGTAGCGGAATTGTCAACCTACCCAGCGAACTCCGCTATAACTACTTTAACATTAACATTAACATTAACTATGTCCAACTCCCAAACTCACCACATGCAATGTTA:1 - chr3L 10286321 5' + HeT-A 5940 2 54.11 AAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 18488383 5' + roo 78 2 72.60 ACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACT:1 - 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chr3L 8959725 5' + 1360 28 1 64.38 TTAAGCATTTTATTTTTTAACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCT:1 + chrX 13134842 5' + jockey 4775 1 72.60 GAGTATTCATCAGACATTTTTCTAAAAATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGAC:1 - chr3R 3286229 5' - Gypsy12A_LTR 1954 1 78.77 GAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTTTTTAAACGTGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr3R 15054183 5' + copia 4897 2 60.71 AATAATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 4575718 5' + jockey 57 1 51.72 TTCTATGTGCTATCTATCCATATCGGAAAACTATAGCATTCTCAATAGTCGAGGTCCCCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCTAGTGGGAAAGCGAA:1 + chr3R 893546 5' - INE-1 531 1 70.71 GAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTCCCG:1 - chr2R 20802648 5' - mdg3 5419 2 68.06 ATAGAATTTGGGAGCAACATTTGTCAGACGCACAGTTTCCCTAATTAGTTCATTCAAGGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 25616463 5' - roo 398 1 76.98 AGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 27123573 5' - roo 342 2 62.76 ACACAATTATAAAACTAACAACCGCAAAACGTGAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr2L 14074587 5' + 297 22 2 71.23 ACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chr2R 5941331 5' - copia 5063 2 60.27 AAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 18488449 5' - roo 8999 2 75.00 GGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTC:1 - 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transib2 2791 1 62.33 ACAGTTTTATATATTTAATTTAAAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 8360504 5' + roo 8700 2 60.42 ATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTATAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2L 4063811 5' - roo 9035 1 60.27 TGAGCTCACTGCGCACATATTAGTGCAACGTCATTCTGAAAATAAATATTGATTCCACGAGGCGAGGTTTCATATGTTAGATCAGCTGTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGCGAAGCTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAAT:1 - chr3R 20565348 5' + transib3 219 1 49.32 TGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTT:1 + chrX 21639584 5' - gypsy5 398 2 74.62 AACAGCATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCGTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAAC:1 + chr3L 27356029 5' - Tc3 1688 1 73.97 CTGAGTTGAGCACTACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACAT:1 + chr2L 20205333 5' + P-element 106 1 13.01 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGG:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4693 1 55.48 GATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATA:1 + chr3R 12242278 5' + transib2 84 1 77.40 ATAACGATAATCAAGTGGAAAAATCTTCATGAACAAGCCTGCATTTTATGGGTTATTGAATTACATTGAATTATAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:2 + chrX 14722094 5' - diver 6065 2 53.42 TTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 + chr2L 6654621 5' + diver 34 2 60.96 ATCAATTAAGATCTTTGCATTTTTGTACGATGTCTATGCGTTTCCATTATTCCGATTACATAATGAAAAAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAG:1 + chr2R 23789716 5' + Porto1 4298 1 63.01 TGTCAATAATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3L 6397757 5' - roo 9010 2 59.59 ACATCATAGGTGCAATAGGTATAATCCTGTAAAGGCAGATTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTT:1 - chr3L 12001919 5' - P-element 2641 1 32.19 CCCAATATCGAAGGCACAATTAACAGATATAAATAATCGGTTTGCCAGCTCGAAAGTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTAT:1 + chr2L 1144661 5' - Quasimodo 65 2 55.91 ATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:2 + chrX 20999496 5' - BS 5042 1 54.79 ATTGTGTTTCAAGCAAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:1 + chrX 18336588 5' - mdg3 5428 2 62.33 ACAACATTCACAACAGCCACCGACAATGGAAATTTGCAATCCTGTTCGTCCTGTCGCCTGTCTGCTTCTGGTCCTGCTCCTGTGGCAAACTGCTTGTGTAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGC:1 - chr2R 18316169 5' - HMS-Beagle2 7170 2 65.75 TAAATGTAAAACATTTTATATGAATCTTGTACAAGTTCTTTTAGGTACGCAAAGATAACTAGAAATTATTACACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTAGATAGGGAAAAAAAGAAAATCCGGTTAGTTTTTCATGTTATCCTTTT:1 - chr3L 20282073 5' + HB 149 1 54.11 TGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - 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mdg1 7315 2 63.01 AAACCAAAAAAGAAAATTATTCTTTACCCAAAATGGTTACACAATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCA:1 + chr2L 15982317 5' + pogo 204 1 70.55 ATGGGTAGAGCATGTGTTTGAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 11191524 5' + roo 22 2 69.57 TTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGC:1 - chr3L 19349987 5' + 1360 3283 1 73.29 TACCTATATTTTGGGAACTTGCTCGATCACTAGGGAGTCACTATCTGCCTGAGGCGATCCCGATACCACCATGGTCCCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAA:1 - chr2R 4736883 5' + Doc2-element 4518 1 54.79 GTGGACGGGATAATATTTTATAACATAATAAATTATGTGTAACACATAGACTGCACGGTGTGTGGGTCTGTGACAGCTTATTCGAAATACTGACAGACACAGGCTCCTATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACA:1 + chr3R 20403914 5' + I-element 4947 1 55.86 AAATATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:2 + chr2R 21410874 5' - Burdock 6323 2 65.07 ACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTT:1 + chr3R 19992632 5' + hopper 60 1 56.85 ATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATA:1 + chr3L 24292003 5' - 1360 262 1 84.71 GTGGAGAAGAGTAATACAATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3R 14980455 5' + roo 15 2 75.34 GGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 585723 5' + Tirant 8139 2 53.33 GCACTGGAAAAAACTCTTTGCTTTTCTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 + chr2L 7580862 5' + Transpac 4938 2 49.32 ACTTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGATTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCC:1 - 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copia 5073 2 74.48 ATAATAAATAATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACA:1 + chrX 12230150 5' + Doc3-element 174 1 70.71 ATGGAAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATCCTCTCTGAGAA:1 - chr2L 17180158 5' + Juan 38 1 42.22 TTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3R 21630344 5' - I-element 5322 1 54.46 GGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3R 30347383 5' - P-element 2872 1 51.35 CTTGGCAGCAGCGGCAGCCTTCACAGCAACCAGATAGATACATTTTTGACACGCTACGACAAATTTCTTCCGATCTTTATTTTTTATTTTTTTTTTGTTAA:1 - chr2R 13916547 5' + hopper 151 5 76.24 TTTTATTAACCTAATCGTTGTTTTATTATGAATTGAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 + chrX 17343396 5' + I-element 72 1 68.49 AGATGAACTCGTGATTTGATCGTAATGCTATTCGCCAGATTTTAGCACTTTCAAATACTAAATGTATCGAACGTTTCGGCGAAAGGACCAAACCGATCTGACCCTGTCCGTTTGTCGGTCCGTCCGTATGAACGTCGATATCTCAG:1 - 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roo 8989 2 76.03 ACCCGTAATATGAGCTGTGTCAACTGCGGCTTGATGGGTGTAAACGTGGCTAAATGTGAGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3R 31653158 5' - roo 9012 2 58.90 ATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGCACCATCGTGTATGTAACTAGTTCCTAAGCTATAAAGAGAGAATGCTATAGCCGAGT:1 - chr3L 27875015 5' - INE-1 576 1 76.03 TTATAATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chrX 12986656 5' + roo 37 2 60.96 CAGTATGCAAAACAAGGCAAACAACAACAATAAGCGTCGGAGCCGGAGAAATTGAAACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chrX 21224541 5' + roo 63 2 62.76 AAACAAAAACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCTTATGCAATATTAAGAA:1 + chrX 6839189 5' + 412 8 2 50.68 AACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCGTAAGTACGTGGCG:1 + chr2R 21410892 5' - Burdock 6306 2 75.86 AACGGAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 15791046 5' - roo 394 1 73.38 TTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 - chr3L 16033414 5' + Doc 78 1 67.81 ACGGCCTTCAGTTGGCCAGCCTCCTCCCTCCCCGCAGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAAC:1 - chr2R 5745582 5' + INE-1 345 1 57.53 AAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAATCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr3R 18093388 5' + I-element 49 1 49.32 AAATTAATACTCATGACATGTAATTAACCGATTTACATTAGTATGCCAGAAACACAAGGACATTTGATTGTGAAATGCGGTCATCTACATAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 8963277 5' - gypsy3 427 1 64.55 ATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACATCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGCCGAAATTAATAACTCAAGAACGGG:2 + chr2L 22107383 5' + Transib-N1_DM 34 1 67.81 CAAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chr3L 21380637 5' + I-element 47 1 52.05 TATACCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr3R 7420338 5' + 1360 25 1 69.86 AAACACAACAAATGTAAAAAATAAGAGGAGACTGCGGCACGACTGCTGACTCAATAACATCGCCGGACATTATGAAATTTTCAACGCGACTGCATTATTAATACAATAAACATAAACTTTCTCAAGAAGTCTGTGGACATCCTTCG:1 - chrX 5846901 5' + gypsy7 5199 2 74.66 AGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 + chr2L 14671827 5' + FB 68 1 65.07 GCCAGTGCATTTTCTAATTAGTGGCCAGTGGCCGATCTACCTATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCATGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAACGTGGTACGATTGTT:1 + chr2L 23008329 5' + transib2 221 1 63.45 ATTCTAGAGTCACTATATCACCATTTCCCCTCTCCAGAACTGAAAACGGGTGCTGCTCGATGTCCCCTTTGTCATGACGATGTTCACCTTCCCCAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGGGTATCTAAAGATC:1 + chr2L 19532491 5' - mdg1 141 2 66.44 TTTATCCTCCACGAAAAATGTTTAATCAACCCAACTTTTGTAATCAAGCGTAATGCAGCGAAACACCACCCTGCACAAAGACCTAAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGG:1 - chr3L 23224531 5' + X-element 4410 1 60.96 CAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 + chr3L 19274810 5' + transib2 82 1 71.72 GGGTCCTCTCACTTTTTACCTAAGTAAGCAACGCTGTGCCAAAAAAAAACAGTCAGGGGGGCATTGAAAAATGCACTTAACAAGTGTTGCAAGTGCTCCACATATCATCAATACGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGAGTGTGTG:1 + chrX 14421928 5' - accord 186 2 66.90 TATCGAAAAATAGCTTAAAGCCAAAGTAATAGTTAACGTCGCCACAAAAATTACAGAAATTGTAGCAAATAGCAAAGGGAATTTCAGGCGGAATAGCAGATATTTGTGTGTGCAACACATACACACACATACACACACACACACAT:1 + chr3R 22248557 5' + Quasimodo 33 2 69.18 CCATGGCAATTGCCTATCTGCCGAAAATTATCAGCCAGCGACTGAGTGACCTCGCCTCTTCTCTTCTTTTCTTTTCTTTTATTTGTTTCTCTATTTTCTGCGGATAATTTTTATTTATTTATTTATTTAT:1 + chr2L 13074122 5' - Juan 4215 1 67.69 ATCATCAACAAATCGTCAATAACACTTGACACTCGTTGCTGATTCTCAACCCTTTTGGCCCCAGACATGGTAAACTTTTTTAAGAAATTACATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATA:1 + chr3R 20472086 5' + jockey 4914 1 66.44 TTATTTAACTTTAGTTTTCATAAAAGACACGGTTTTTGCATATGCTTTTGCATGCATTAGTACATATGTACATACATATGTAAATCTGTGTGATCTTCTAATATTTAATACCTACAGAGTTTCTTGACACTCTCAAAATTGTGTAA:1 - chr3R 11957331 5' + S-element 1519 1 67.81 AGATATTCGGATTTAATATTCTGTTAATACCTTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATATCGCT:1 - chr2L 7524832 5' - transib2 2367 1 77.78 TATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chrX 14450522 5' + hopper 4 2 78.26 ATTACTTTTTCCTGGCACCACAACTTAAATAGGTTACAGCAATGCCGAAATAAAGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chr3L 46908 5' + FB 60 1 58.22 GTTATTATAAAGTATTAAATATTTTATTGTTTTTCGGAGTGATCCCCACTCCAGTCCAGTCAGAAAATGAACTAATCTGGTGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTT:1 + chr3L 4246134 5' + Circe 7173 1 56.16 AACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 12986521 5' - roo 357 2 53.42 TCTAGGCCGAAATTGAGATACTCTCCTCGCAAAAGGGCAAATAATAATGGGGATTTTTTCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 31653030 5' + roo 24 2 67.36 ATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGGCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTT:1 + chr3R 11040020 5' - Bari1 1680 1 65.75 AAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 - chrX 14722194 5' + diver 5940 2 60.98 ATAGTAATCGCAAAAACGAGCAAAAAAATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 - chr3R 26774115 5' + hobo 59 1 56.85 AAGTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTATGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chrX 8437738 5' + P-element 75 1 33.56 TTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:2 - chr2L 21328287 5' + 297 32 2 64.38 CTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr3L 18281831 5' + Doc 11 1 74.58 TTTATGCCACCAAGAAACTTGGGGATTCGATTATATAAGGGCAAAAGGATATGCAAATGTAAGGGGAGTTTTGAGGGCTTTGAACTGAATATATTATATATATTATTATTATATATATTATATAAGTTATGAACCCTCTTCTTGCG:1 - chr3L 21969918 5' + opus 7117 4 52.74 ACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACG:1 + chr3L 11837712 5' - G5A 2716 1 54.11 ATTCTAGTGTCTTTGGTAACGGTCTCTCATTTTAATTGAGAACCGATGGTCTTATAAGAATTTTAGGGTTTGCCATGTTGGCTTTTAATTCGGACAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 2053894 5' - 1360 3364 1 67.12 TCCACTGACCGCTTCTGCTGCACTTTGAATAGATCCCACACACACACACACACACACACACACGCGCACACATATATATATACACACACACACACACAGTGCG:1 - chr2L 15515302 5' + accord 7104 2 39.81 ACCTAAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 22992548 5' + hobo 34 1 50.41 ATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 + chr2L 16539651 5' - Juan 4154 1 57.53 TTTTTTTTTCATTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chr3R 7317691 5' - I-element 5324 1 61.15 AGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCG:1 - chr3R 15790087 5' + flea 4705 1 78.31 AACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGGCTTCGACTAGCTCTTGTCG:1 - chr2L 17180134 5' + Juan 3 1 58.93 TATACACACATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chr3R 15364062 5' - flea 239 2 75.34 AATGAAAATGAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGGTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 26504184 5' + HMS-Beagle 31 2 64.38 TCATGGTCGGAATTTTCCAAGGGGGTTGTCGTGTTCTTTGTTTTGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chrX 17764036 5' + roo 8667 2 50.00 ATTCACAAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3R 7420170 5' - 1360 3361 1 67.81 AGTTGCGTTGACAATTTTTATGCAACCGAAATAAAAGCCAAGGCAGCCCAAAGTATTTTTCCAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:2 - chr3L 22400616 5' + 1360 36 1 45.89 AAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATT:1 + chr2R 3338778 5' + Juan 42 1 49.25 TGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 6102941 5' - roo 9000 2 69.18 AACAAAGAAAATCTGATTTATGAACATAACACATCCTTAAATCCATCCAATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 11062687 5' + roo 16 2 74.66 TTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chr2L 16946147 5' - hopper 1370 1 53.42 ACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr2R 22992541 5' + hobo 64 1 60.96 CGATCGACGCGAACCCGGCAATGAGCGCGAGAAGTCCTTGCCCAGCTGGTAGACCTCCACCTCCATGGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGG:1 + chr3L 2666113 5' - gypsy12 10165 2 56.56 ATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGGATGCTTGC:1 - chrX 1135387 5' - P-element 2847 1 46.96 TTATGTTAAATTGATGGTTCTAAAATTTTTTGAATGACAATTTGATAATTAGATTAGGCGGATAGAAGGAAAACTTCCATCTATTTAAAAGAATTATTATACTTCCTAGCACTACCTGTAGTTAAGTAACAGGTATCTGATAATCG:1 + chr3R 6672372 5' + INE-1 550 1 65.07 AAAAAAGAAAATACATTTTAAAAAATATATTTCATAAAAATAATATAAACATACATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCCTCTGTCCGAATGAGCGTCCAGATCTCAGGAACAATAAAAGCCAGAAG:1 - chr4 100695 5' + INE-1 155 1 57.81 AAGCTGTCCGTTATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCTCACAATTTATTTGATTATATTACCTCGCATATTTTCCACTTTTAGTTAGCGCAGAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 19032718 5' - roo 398 1 38.81 CCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:2 + chr3R 15724271 5' - Juan 4185 1 62.33 GATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3L 11326800 5' + pogo 35 1 58.90 CGTGATGATTAGTAAGTGGAATTTTCATAATGGAAAATGTAATATTGTTATTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 14051845 5' + roo 8715 2 68.46 ACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGGCTTTACTCGTTGGGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 11062814 5' - roo 328 2 65.75 GTATGTCTGAGCTGCTTTTCATTTTTTCTTGGTATTTTCATCTGATTAACAGGAGGTCAGGATTGGGGCAGAAAAACCTTTGGCGGAGGGGACGCTCAAGCAACGAACGGGCGCAGGTCATTT:1 - chr2L 12262663 5' - hobo 2737 1 83.74 ATGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chrX 6116324 5' - transib2 2741 1 74.66 CAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACT:2 - chr3L 25008182 5' + X-element 60 1 47.26 TTATATAAGATAGTGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3L 3983938 5' + P-element 9 2 77.04 AAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1 - chrX 18336663 5' + mdg3 79 2 69.18 ACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGG:1 + chr2L 3675840 5' + Juan 4079 1 52.41 AAAATCTCATTGTACGTATGTACCTTAATATGAGTGCTGGTGCAAATTTTGCCATTAACAATAACAACCACATAACAGACACCATAGTGACCTAACACCTGCAGAATGCCAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGGCTG:1 + chr3L 49636 5' + Doc3-element 389 1 65.75 AAAATTGAAATTCTGCAACACGAGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chrX 13490617 5' + 297 26 2 67.14 TGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1 - chr2L 4003781 5' - mdg1 357 2 60.27 AACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTTGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chrX 19539579 5' - pogo 2067 1 43.15 CTCGTGTTATTATCTCTGAAAAATAGTTAACAGAAAACCTTACAAGCTTAAAAATACCTTTTCGATCGCCGATGCGTGAAGACGATTTTATCGAGCTCGGTTGTTTTGAGTGAAGGGAAAGCCATATAAAATAAACCAAATAAAAA:1 - chr3L 25331091 5' + F-element 90 1 89.04 ATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr3R 20140488 5' + jockey 4709 1 58.04 GACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATTTATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACAT:1 + chr3R 904965 5' + rover 7025 2 73.97 TGAAAGATGCAATATGGCACGATGGGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3R 15942847 5' + hopper 15 1 76.03 ACGAATTTTGAATTTTAAATTTCAACTCAAAACTTGCATAAGTTGCAAATACATAAATGAACAAGTATATAAGAATGTAACACTCAAAAAGAGAAACTTTTTAAATGTTTAAAAGGCAGGGGTATTTATTTTATTTTATTTGTTAT:2 + chr3L 15206230 5' + transib1 1902 1 48.63 TTAAAACGAGCAGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 - chrX 959073 5' + 412 82 2 73.29 TTACCAAAACGATATCCTTAAAAAGGTCATTAACTTTATTGATTTATTAAATATGGTGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACT:1 - chr3R 6135937 5' - hopper 248 1 59.57 AGGGGCGGTTGACTTTGTCTGAGATGTGATTTATGTTTGGGGCAAAGTTTTTCACAACTTTTTTCTGCCTTGAATTCATTCTTCTTTTCTCAGGTCTTATGTTTTTTCCGTTTTTTTTTTCTT:1 + chr2R 13791195 5' - Doc2-element 248 1 86.99 ATGTGTTATTAAAAAGCAGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:2 + chr2R 16510095 5' + F-element 68 1 53.42 GTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAA:3 + chr3L 3501728 5' + Bari1 76 1 69.86 AAAGAATGTCTGCGAGTTCATCAAGTGATTGCAGTGATTTGATCTTTAAATATCATAAAAGTAATTAATTGATATTAAAATGCTTATACATATCATAATTATATTATATGTTATTTATTTCTTATATAATTTTTTCCCTTATAAAT:1 - chr2L 7921691 5' + Idefix 7373 2 65.07 TACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATA:1 - chr2L 13844253 5' + Stalker2 7315 2 60.96 TGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 + chr2R 10161805 5' + transib2 82 1 71.92 TCTCAACTAAAAACATTGGTGAGGCAAACGACAAAATAATTACTTTCGAAACTATTTAAAAAATAAAAGTGAAACATTTGTTGATTGTTTGAAATTAAATACATAATGATATTATAAAAAATTTGCCCATTAAAACTGTAAATCAT:1 + chr4 1070320 5' + HB 1567 1 72.60 CAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCGGCTTGTTGTTCGTTAAATTGGGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGTGACGTGTTTCTTTCACGCTACGAACA:1 - chr2R 6847847 5' + Doc 36 1 51.26 ATATATTGCAAAAAAGGGAAATAACAAACGGCGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACTCGGAA:1 - chr2R 16889127 5' + gypsy8 493 1 74.29 CTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTG:1 - chr3L 20187454 5' - FB 844 3 70.55 ATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chrX 19054242 5' + jockey 63 1 54.79 CAACACGTGGTATTTCCACTGTCGTGTCCCGAAATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 - chr2R 20802678 5' - mdg3 195 2 49.32 ATAAATTGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAA:1 - chr3L 11844824 5' + rover 7005 2 60.96 TTAGCTGAACAACTGGCGAAGTTGAAAGTATTGGTTCGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr3L 12004316 5' + P-element 84 1 28.77 TGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:2 - chr2L 4713969 5' + transib2 52 1 57.53 ATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:3 - chr3L 21996271 5' - Transpac 5179 2 52.05 AAACTTAATTCATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAA:3 - chrX 3432006 5' - Ivk 5363 1 69.18 GCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 - chr3L 21996257 5' - Transpac 5197 2 51.75 CTCTTTTTTCCCCAGTGCACACATGTCCCTGCACTCTTTTTCTCCCTTCTGTTCACTTTCTCCGTGCTCGAGTGTAATATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATATTCCACTTAGAAATAAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGT:2 + chr3L 3724247 5' - Bica 162 1 54.79 AATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTCGTTGATGTCATAGCGGAGCGGC:1 - chrX 22689450 5' + mariner2 51 1 60.58 ATTTTATTTTTATTTTTGTTTTTACACTTTTATTGACCGTATGCAGTAGGTTCGACTATTGCGTGTCAAACACCGATTATACGTAGTTCTTTTGCGGATACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTA:1 + chrX 18670950 5' - accord2 7224 1 71.43 AACGGAGACTTGAATTCAAAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chrX 585754 5' + Tirant 8138 2 62.96 AAATTACGAAGTTAGCTTTATGCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 23639281 5' - pogo 2077 1 64.38 ACTTTTTTGTTCAGTTAGTATTGTTTTTATCCTTTTGGTTTTTTGCTTTTCGGATTTGACAGTCTTTTATTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTCTGTTTTTATTTTTTTTTTTGAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCT:1 + chrX 3054581 5' + Tc1 1427 1 50.68 AATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGAAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 9582678 5' + roo 8717 2 78.26 GAGCCATTTTCGATTTCGTTTTCGGATTACTTTGACAGCAAATTCGACAGCATTTATTTTTAGATGGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 13931640 5' + P-element 50 1 52.41 GTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 22400241 5' + 1360 15 1 69.75 ATGTGTTTGAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGGGGTAGGGAATAGGGTAACGAACTAACTTTTGAGAGCAGACATGGTGGTCACACAAGAACACGCATTAATTTAAAGACTTACAATTTTAGGCACCGT:1 - chr3R 11191513 5' + roo 8695 2 58.09 ATTTGGTGCAATTTAAGATAGTACAGAGAGTTATAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGA:1 + chr3R 18346617 5' - INE-1 532 1 49.66 AAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chrX 12986517 5' - roo 331 2 69.86 CATTGTTCGTTCGGCCTTTGTTTACATTTTGCCAGGAGCCAAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAAT:1 + chrX 8063199 5' + 1360 189 1 71.92 TTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 20898633 5' - roo 355 2 56.55 AATTGCCAGGCCCGCACTCACACACACACACTAGCAAGCACTGGCATGTTGGCCATAACTTCCGCCAACAGTTTAGCAAATATCAATATCAATAGGAAAGAATAGGAATAAAGTAAATGAAAACAACAACAACGA:1 - chr3R 25930762 5' + gypsy9 452 1 51.11 AATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 + chr3L 15103801 5' - Transpac 5171 2 57.53 TATTATTCCATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 1279084 5' + roo 8715 2 58.96 ACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATTTTTGGATGAATTTTT:1 - chr2L 12984224 5' + hopper 57 1 54.79 GGTCGAAAAGAGACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 24090428 5' + roo 8709 2 51.37 AAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTCTGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr3L 24131500 5' - Transpac 5179 2 57.25 AAAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3R 18488372 5' + roo 8731 2 65.07 TAATAATTATAATAATAATAATAAAATTAATAGTCATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAATAATTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAA:2 - chr3L 21356652 5' - Copia1_DM 140 1 54.11 AATTATGAATTATGCACAATTCTATTATAAACTTTTTTTGTCACCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCA:1 + chr2L 17902408 5' - mdg3 5408 2 70.55 GCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 31653177 5' - roo 358 2 53.42 GAATTGATAAATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 + chr2L 6654603 5' + diver 5904 2 71.92 AAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 18549847 5' + roo 8699 2 66.00 ACCGTGGAACCGGAGAACCAGTGAGGTGGAGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 - chr3R 6625851 5' + flea 13 2 78.08 CAAACTGATGGCCACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCC:1 - chr2L 1924038 5' + G2 2997 1 62.76 GGGTTAGCGGGAAAGCATAATAAGTTTCCCATGTGCTTCAGTGACCGCTAATCTAATCTAGGCTTATCTATTTGATAAATGCAGCTGTGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGTCCTA:1 - chr3L 21387187 5' - rooA 7414 2 63.03 TGTGTAGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 27986457 5' + roo 50 2 56.85 ACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chrX 6116324 5' - transib2 2741 1 74.66 GATAGCATGGAGATAAATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGGTCCACCACAGACCCTTGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr2R 4606325 5' + 1360 14 1 68.80 TCTTAATGCAGTCTGAAAGCTTCGCTTTTCGCAGACAAACAGGAAAAACAGCAAAGGATGCACTCGGAAAATTTAATCAGTCGATAAGCGGAAAGCGACCTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTC:1 - chr2R 23181838 5' + R1A1-element 5108 1 65.07 CATAATTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 - chr3L 23287309 5' - 1360 3317 1 66.44 GCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAAT:1 - chr3L 23702305 5' + G4 13 1 72.60 CCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2R 21681302 5' - roo 348 2 58.90 ATCATTTTCATATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr2R 8735532 5' - mdg1 401 2 71.23 CAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTGCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 - chr3R 16518987 5' - Tirant 378 2 55.14 ATAACTTTTATAGAGTTTGTTTAAATTGTTTATATTGAGTAAGTGTATCAGGCAGAATGAAGTATATATATTCTTCTTATCAGGATCAGTATCCAAGTCGATCTGACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGAAG:1 + chr4 373587 5' + INE-1 137 1 70.14 TGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTG:1 + chr3R 5310259 5' - TAHRE 10385 1 60.96 TAACAATGCCAATGATGGCAACGATGATGACGTGGTCCAAACACACAGACGCGCACCCAGAACGTTGCGGTGGCAGCTCTCAGAATTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGAAGTCCTCGTC:1 - chr2R 20457560 5' + accord 7123 2 56.85 AAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chrX 12986547 5' - roo 331 2 71.23 ACTTATATGTAAGATATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGGCCTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 19588182 5' - roo 390 2 72.60 ATCTATCGACTGCCCATCGACAAAAGAGCCGCGTGCACAGAGAGAAATTACAACCGCTTTGCCAACAGCATGCATGCATGTAAATATGTAAGAATTTTCGCATTTAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAAAAGCACTG:1 + chrX 12244138 5' - Tc1 1442 2 71.92 AGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 - chr2R 6847827 5' + Doc 83 1 70.55 AATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCGACTCGCCACGCACAGC:1 - chr3R 26774089 5' + hobo 63 1 66.94 TGGGACTTCTCAAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGAGCTTTTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGGTTTTT:1 - chr3R 28901331 5' + transib2 4 1 70.71 TGATAATAAAAAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 23906527 5' + 1360 5 2 78.72 AGCGCCACTGCATAACCAGAAGGGTAAGTTTGGCCGATTACTTAGCATTGACTTATTTTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTATGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATTTAAAACTA:1 + chr3L 17057715 5' - TAHRE 10151 1 60.69 ATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr3L 16470378 5' + jockey 4721 1 53.42 TCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr3L 17055411 5' + Tirant 8150 2 56.16 GGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGA:1 + chr3R 3617306 5' - micropia 5132 2 77.40 AAAATGTTGACCGAAAGGATGAGGGATAAGGAAAAGCGCCGGGGAAAGAAAAGTCGTTAGCCGTGTCTCTAATTGTCCAGGAAAGAGACCATTGTATTTAGTCTTTAGCCAGAGCTTTAATAAAGAGCAGCTATTCACTCCGGCTC:1 - chr2L 12263773 5' + gtwin 275 2 60.27 TTAAACATTTTTTTTTTTGCTTTGATTTCTTTGCCATTCATGACTTGGTCCGGGCTTTTGGGCTGCGTGTTTATTGCATCCGTTTTGTGGCATACTTTTCGTGCCGCTTTTGTTGCTATTTTTTTTTTTGCAAATTTTCTTTTTTT:1 - chr2L 16641989 5' + FB 174 1 78.77 ATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 9809266 5' + 412 7121 2 68.66 GCACAANGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr2L 16564563 5' - roo 9000 2 70.55 GGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 - chrX 14722257 5' + diver 5897 2 72.60 CACTTCAGTCACATTTCCAATGACTTTTTGTCCGCCGACTGGCGCGTGCAAGAAATCGAAAATGACTGACAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr2L 14675634 5' + 297 6625 2 55.48 AGTTTAAGCCATATCAAATGAATGTGTAGGTTATTGAGCTTGATGTGATATAATTATATGTTGTTCACGTGCTTTACTTAAATAATTTTCTTAAGAAGCCACCCCGGTAGCAATTCGAGGACTTGCTTGACGGGCAAGCACTCCCC:1 + chr2L 18314687 5' - R1A1-element 5143 1 30.14 ATCTAATGTCACCGCGTGTTGCTTTCTTTGGCACATTTTTGCAGCGCGTATTGTATTTTTCCCAATTTCTATCGATATGTCAAATAAATGTTTAAATTACTCTCTAGCTGAGTAAAGGGCATATGATAGTCGAGGAACTCGACTAT:1 + chr3L 22940593 5' + INE-1 564 1 62.33 GCAAGTAAAAAACAATTGAAGTCGAATACAATTCGACGGCTCAGAGCACTAACTTTTTTGAAGATGAGATACTGAAAGATACTGAAAGAAGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGAT:1 + chr3R 23224316 5' - FB 55 1 65.52 AATATATATATTGGAATATATATGAAAAGCGAGGGTGCCCGAGGTTATTTGCAAAGAGGACCGAAACCGAAACCGAAGCAAACCAAACCCAACCCAAC:1 + chr3L 726432 5' + G2 101 1 63.27 TAAGTGTGTGGTCCGGAGGGTTTTCCGCCTGATCACCCGTCCAATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3L 19455066 5' - mdg1 400 2 69.18 TATTTGCATGATTAATGAAGCCACGTAATTGATTACAGGACCAGAGATATCGAAAGCGATCTGAATGTGAAAAAAATTGGAGACAGGATTCAGGAAATAGCAAAAAAAAAATACAATGACAGACTAGAATCTCATCCTAATAGTCA:1 + chr3R 27431722 5' + jockey2 3097 1 72.60 CAGTGCGAATCCATCGATCGATTACTACATACATCCAGCCACATACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAAC:1 - chr3L 5133173 5' + I-element 261 1 69.86 AATAACNACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 - chr3R 22590624 5' + rover 6968 2 72.60 AAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chrX 20373701 5' + 297 6613 2 64.38 GCAGACAATTATAATTTTGTACGCAGGACCAAATTTTTGCTTGTGTATGAGAGTTGTGTCCCTATATACTATACTTTTTTATTCTTTTAGATAACGATACGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTCGTTCGTTTGCATCCCTCA:1 - chr2L 17142721 5' - I-element 351 1 72.41 AATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAA:1 + chr2L 71197 5' - 412 7458 2 74.66 AATAGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTTCCC:1 - chr3L 47002 5' + FB 65 1 55.48 ATGACTTTCATGTTGAGCGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 23067559 5' - roo 9040 1 65.07 ACGGAGGAAAACAATAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr2L 18347266 5' + transib2 25 1 62.79 AACACCCTGTGAAAGTATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTACTTCGGCTCGACGACTTCGACTCGCACATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3R 23295643 5' + P-element 27 1 45.21 ATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCGGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 5531212 5' + 1360 63 1 65.22 AATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:2 + chr2L 17180037 5' - Juan 4190 1 67.81 ATTGAGCGCACTCGACGAAAAATATTCGAAAATGGCAGCGACGAATTGTAAACAAAGGAATAATTCGCCAAATTTTGAAAGCCCCACATGAATTCAAATGGATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr3L 21380663 5' + I-element 21 1 71.23 CAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTCT:1 - chrX 10319692 5' - mdg1 345 2 67.81 TCGCATTTCTGGGATTCTGCTTTATGATCTCCGGCGAAAGAACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAA:1 + chr3L 16442274 5' + F-element 4615 1 78.62 GCAGTAGAAACAACGGGACAGGATTGGCACTAAATTACTGGGAAAATGATTTAAATATGAATTTTGAAATAAATATCCAGTTTAGTAAATATTTACATTTTTTGGCTGATATTTAAATATTTACATATTTATTATTATTATTATTA:2 + chr2L 4136615 5' - mdg1 7083 2 67.81 TCTGTTAACAGTAAGTGTCCTCTGCTCATGCGCGAACTCATTCTCTCTCTAGAGGGATATTTTCTCTCTGGCTCACTCTCTCCCACTTTCTCTGTCTCTCTCTCTTCCTCTTATTCGGTCCATGGTTTAAGGGAGAGAGAGAGAGA:1 + chr3R 15379110 5' - blood 7181 2 53.42 ATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3R 29084854 5' - 412 7517 2 62.33 TTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTTTTTTATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTAT:1 + chr3R 24729571 5' - Juan 4157 1 59.59 TGATCGAATTAGTCTTCTGGATATCTCGGGATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATT:2 - chr2L 9782170 5' - P-element 109 1 46.58 AAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 11804725 5' + pogo 63 1 64.58 AAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 4878273 5' - roo 9004 2 75.83 TGATAGCTCAGTCAGTCACGATCGAACTCTCGCAGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAG:1 + chr2R 6482454 5' - gypsy 7365 2 73.29 ACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTA:1 - chr2R 12185441 5' + accord 26 2 61.94 AATCTTTATTACCAAACATTAGGTATAAGAAAATATATATGTTTTGTTGGAATATATATATTTTTTTGAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:4 + chr2L 11298034 5' - I-element 5302 1 58.90 GCATAATTCTAATTTAGCGTCGAGTTCTAAGCACCGAAAACATGTTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGCACTCT:1 - chr3R 26405073 5' - hobo 2930 1 62.03 ATTATTACTTTACCATTAAACAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:2 + chr3L 22723817 5' - HMS-Beagle2 7154 2 61.64 CCATAAATATATTATCGTGTCAGGACAAAGTTTACCAGTAAACTGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGGCGA:1 + chr3L 6339407 5' + invader2 4835 1 71.23 ATGAGAGCTTTTTGAAATAGTTAGGAGTTGCATGAGCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCAAGTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTT:1 - chr3L 23941467 5' + Cr1a 4236 1 72.73 TGATCTTTGAGCGACTGGTTCGCGTCCTGGTGATCAGCATTGAGCAGAGTCAATGTGATTTGCTATTGCGGGCCAATATAAATATGGGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAAC:1 - chr2R 20823799 5' + Ivk 346 1 59.59 AAATGCTTCTGAAATTACTGAAAAGCGAGTTCCATTACTAGATTCATTAAAAAGTATGCATCCTGCCATTCCGAATTTACAAAGTATATTTAATCTTGATTCTTGAGAATCAGTAGCCGAGTCGATC:1 + chr3R 7838342 5' + INE-1 96 1 71.65 TGTTGTTCATTCTTTGTATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 + chr2R 7244795 5' + diver 5895 2 73.39 TATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCATCATAAGCACATTATGTGTTTGTCCCAGCTTCATTTCAGTTTCAGTTCATTCAGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGCTACAATG:2 - chr4 1026011 5' - Tc1 1553 1 73.29 TTCTACAACAGCGTCCGGTTGCCCCGACCGCGTGTCAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAATCGGGGAAGTTGACTATATCCTTCTCTCTTGTTTGATATACATATGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACT:1 + chr4 419832 5' + S-element 7 2 73.61 CATATTGTTGTGGTACTGAGTATTTGCGAAATTGCTAAAGTAATGAGATACCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTT:1 + chr3L 18931335 5' + I-element 311 1 65.75 TATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 20167595 5' - roo 328 2 74.66 AATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:1 - chrX 5323159 5' - Juan 4188 1 32.88 TACTGAACCCTGTGTAGTGAAAATAAAGATATATTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTGATTTTTCTTAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACGGACAGTT:1 + chr3R 15864921 5' - Porto1 4295 1 76.03 TGGAAGAAAATAGATAAAAAAGATACCTTCAATCGAAATCCATTTGAACAGGATATATACTTCATATATCTTCAATCATCAGCTCGTATAATCATCGACATATCAAATAAGTTTCTGGGTGGTAAGATAATTCACATCAAAGACC:1 - chr2L 858366 5' + Stalker2 7337 2 73.79 AATACCCTAGTTACGCCGGGCTTATGTTTGGAAATTATTAAAAATCAAATCAAATTGTTATATTTGCATATATGTACCATTCTAAAATATTTTTAAAATATTTAAACAATTAATTAAATAATTAAATAAATAAAATTAATAAAATA:1 + chrX 4812170 5' + HeT-A 41 1 72.60 GTGCAGGTCTGTTCACACATAGCATACATAACAAACATAAAATTTTTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTTG:1 - chr3L 23354524 5' + F-element 52 1 45.52 CAAAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr2L 8338229 5' - P-element 2846 1 58.22 TTTTATATTTAGTTTTAACTGCTTATTAAATTTCTAAAGTCACATTTTATTGATATATACATATATATGTGTCTGTATATCTCTAAAATTTCAATTTTGTTCTAGTTAGTGTTATTTTAAAAACATAACAAAAAAAATCAAAAAAA:3 - chr3L 14213027 5' + gypsy7 5002 1 86.99 ATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 + chr2L 15913254 5' + transib2 44 1 64.55 CATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 7795494 5' + roo 8707 2 58.22 ATTGAATAATAAATGGCTAATGTGTTAGTTATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr2R 5941460 5' + copia 4901 2 64.38 ATAGAATAAAAAAACAGAAAATTATTACACTATCCTCTAATAGAAAAAATAGAACAATTAAGCTATTAACTAGACAAACCCTTAAAAAAAACCCTAAACCCTAAATAAAAATATGGCAAAACATGTCCAGATCGACTCGGCTATTG:1 + chr2R 4709808 5' - INE-1 101 1 56.16 ACATCATTTAAGCTAATCAAAAATAGCTTTTATCTAAAAATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:3 + chr2L 14874107 5' - copia 252 1 56.85 CGGACCGATTTCTTAATTGACCGTATCGTGGGCAGGGCATCCTCCAGCGATGAAAACGTCTCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAG:1 - chrX 16807484 5' - R1A1-element 480 1 74.81 ATTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chr3R 7317681 5' - I-element 5307 1 51.37 CCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr3R 5351468 5' + jockey 4744 1 67.12 AGATACACTCAAAAAAAAAATACTCAATCAATTGATATACCGATTTAATTCAGTTAATTTTTTTTGTAGTTACCTATGTAGCAAACTATACTCAAGCCTTTCTATTGCGGTATCAAATACCAATTTTTTTAATTTTTTTAAGAT:1 - chrX 3250014 5' - HB 320 2 45.83 TGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTGCTCTTTGAGTTTTTGGAAGAAACTAATGTTATTTGGAAATATCTCAGGTTCAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 19449977 5' - roo 335 2 65.35 ATTAAAGAAAACTCCCGCTTTTATTAGAGACAAAATCAGACAAAAGCTTAAACTTAGGAGGGACCAGCATGTAAGAAATTCTAGCGAGTGCTAGAAGCCCTTATGTTAGATCACTCTGAAAGCTCCTGATAGACAAACTTTAGAAA:1 - chr3R 645895 5' + Gypsy12A_LTR 36 1 62.33 CATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGA:1 + chr3R 25709796 5' - hopper 1327 1 78.08 AGCAACTAAGTAGCCTCGCATAAACAATGCTGACGCGCCATAATAGAGTTTTTCGTGATATAATGATTCGTCTATTACTATTTCTAAGCTTTGTTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTG:1 + chrY 475867 5' - 1360 279 1 65.75 TGGGAATGGGAATGGAAATGCGAATCGAAATCACAAACAGAGTCAGAGTAAAATACAAGGTTTCAGTGCCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGAAATGTTAGAATACA:1 + chr3R 6688770 5' + Transpac 4952 2 55.38 TACTTTTCAACGAATCTGCTGGGTCACGTCTCTAGAATCTGCGTGCCTAATCTCGACCTAGTTGAGTTCACTAGTCTTTTAGTTCCTAAGATCTCGACGTAAATACGGACATTGCTAGATCGACTCGGCTCTTGATCCTGATCAAG:1 + chr2L 21614537 5' - INE-1 89 1 73.29 TTCACGGTGTTCCGTCGCAAGCGTGCTTGCTTCGACTGCAAGTGAGTAATGGCCTGTTCATTTGGTTTTCACGGATTTCGGGGATTCAAATTCCAAATATTCCATATTTCCGAACCCAGCTTCTT:1 - chr2R 12933690 5' - FB 7 1 70.40 ATAAGTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:2 + chr2L 15913254 5' + transib2 80 1 71.92 CATTAGGTAAATGTTTTCAAATATTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:2 - chr3L 5881699 5' - pogo 2060 1 57.53 TATATTGTTTTCGTTGCTTATAGAATAGTCTCTACATTACTTGATGTATGCTTTTACATCGCCATTCACACACCTTCAACTTTTGTATTTCTCAGCGTGCAGACCGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTG:1 - chr2L 1632752 5' + Cr1a 372 1 58.22 GGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 8308425 5' + roo 8753 2 79.45 GTCTGCCTGGAATCTTTTAAGCCTGTTAGCTGGGTGAGTTCTTTTAAATCCAAGAGCGCTCAAAAGTTATATTTTTATGGCGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3R 16518862 5' + Tirant 12 2 70.09 AACCCACCAACTTAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 12115214 5' + 1360 11 1 74.66 ACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTTAATAATCAAAATAACTTCACTAGGTTACGTTATTTTTCAAAAGGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATG:1 - chr3R 14144903 5' - 412 192 2 66.21 TATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTCCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 + chrX 2479485 5' - mdg3 229 2 56.19 AAGAAGCCAAGCAGGGCAAACGCGTATCCGTTTACTACATCGGCCGCCTGCAGTCGAACAACAAGACCTTCGACAGCCTCCTGAAGGGAAAACCATTCAAGTTCGCTTCGGGTGATGGATTAAAATAAATTAATTAAAATAATAAA:1 - chr3R 15331966 5' + jockey2 3406 1 69.86 AATAATAATAATAATGAATGAATTTGAAGATTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGA:1 - chr3L 19702985 5' + copia 232 1 78.77 CTGCAAATTGCCAGCGAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGGGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGCGCAGAGC:1 - chr3L 6472371 5' + P-element 227 1 21.74 TTAGGCATTGCCACCTTGTTCGATTTCAGGAATCGTATTGTGAATGGAAATATAAGTGTTGGAAATAAAAACTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 13158753 5' + roo 48 2 52.74 ATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTAT:3 + chr3R 4160056 5' - invader2 5055 2 52.05 GTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGGGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:1 + chr3R 11040042 5' - Bari1 1658 1 52.05 TCGGTTATCCCTATCGTACTTTCTCGCATACTTTCTCCACCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACCAAGCACTATTGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chr2R 19199803 5' - hopper 1410 2 64.38 TTTCCATTCCCTGTCTAAAAATAAAATTCTCGACTACCCCTGAGCACCCATACCGGGCAACAATGTCCGCTTCCCATCCTCGGATTTTCATTTTTCATACGGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTC:1 + chr3L 13679823 5' + I-element 5144 1 72.41 TCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACT:1 + chr2L 11839666 5' + mdg1 7122 2 75.86 GTCCAAGACAGCTCCTTAAACCCGAGCCCCATTACCAAAGTCAACAAAAGGACTCAAACAACAGCGGGCAAAATTCGCCTAGAAACGACATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGT:1 - chr2R 15418888 5' - HMS-Beagle2 281 2 50.68 CTATATACATGAAAACTTAAAATCAATGTTGATTTGAAAGCAACTTGTTTATTTAACTTGCTTTGACGTTCCCCAAATAATCATACATATGTAATACTAAGTTCATTTATAGAAGTTTCTTCACATGTAGTATATACGAACATA:1 - chr2R 21116634 5' + mdg1 7036 1 34.72 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTA:1 + chr3R 19450170 5' + roo 357 2 69.86 CTCCACTGTACTCCCCTTGTTCGCTTGGCTGGCTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGG:1 - chr2R 16456993 5' - Idefix 7054 2 51.96 TAAAGCCATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCA:1 + chrX 15200845 5' + 17.6 61 1 67.12 AAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGC:1 + chr3R 19450013 5' - roo 8651 1 80.69 TGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTT:2 - chr3L 1332295 5' - TAHRE 10391 1 60.96 TGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr2L 19675104 5' + 297 22 2 65.07 GTGAGAGCGAAAAAACCGAAAAAGCATTTCGTCGTTTTTAGCTGGCACGAACAGATCAATGACCTGCACACACAAACACACTTACACACACACACACACACATATCATAAACACACACACACACACAGA:1 + chr3L 18083986 5' + accord 182 2 50.39 TTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3R 21933267 5' + pogo 36 1 64.38 CTCTCGGTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 9269865 5' - copia 248 1 52.74 AAAATGTGCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTT:3 - chr3L 20187462 5' - FB 852 3 76.03 TTGCTCTCCTACAAATTGCCATCACTAACAAAGAAGGGACCTGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1 + chrX 1235345 5' + P-element 78 1 32.19 AATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAG:2 + chr3R 23067460 5' + roo 386 2 50.00 ATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGATATAATTATTAAATTGACACAAAATATAGACAAGCCCCACAGCGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCGATGA:1 + chr3L 25245596 5' - G5A 2549 1 67.35 TAAGTGTGTGGTCCGGAGGGTTTTCCGCCTGATCACCCGTCCAATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr3L 19455066 5' - mdg1 7439 2 69.66 AGTATTAAAATGCCCCAAAACTTTGCTACCACACACCCAGACATTCCGAGGGCAGCTAATTAAAAGACCGAAAAGCATTTATACACATATAATTACAAATCAATCGTTGCAATAAATAGTTTTGA:1 + chr3L 5061517 5' - 17.6 7405 2 69.60 CTTTACAGGGATTTTTACTAAAGATTGATTAACGGAAATGCTTTGTTTCACGGCAATGCGGTGTGCATTAGTATTGATGTATGCGGACTGGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAAT:2 + chr2L 1673691 5' + invader1 3866 2 63.01 ATTTGATTTAATTTGATTGAGTATGAGTAGTGTATGAGTCTTTATTTGTCAGTATAATCGTGGCGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAAAAACTATATACCCCTTATCT:1 + chr3R 31084894 5' + Cr1a 4127 1 73.97 ACTAGGGTATATTTATCTTTTAATTGCGTTTTCTAATTGTTGTTCTTTTAAATTTGCTGTGTATTTATGTTGTAATTTTCTGAACCTCTAAAGTGCTTAATTTTTCCATTGCTAATGCACCTTTGTCTCTGTGTTTTGTTTACTCT:2 + chr3R 31188723 5' + Cr1a 202 1 68.49 ATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1 + chr2L 6647665 5' - mdg3 165 2 75.00 AAACGTTGGCTGGGACAAGCGTTGTGATCTGGAGCACGAGAAATGAACAAAAGCTCCGTCGAGCAGCTGATAAGTATGTACAAATGAGTAATTTAATTATATGCAAATTCATTTTATTGGTTTTTTTTGTTTGTTTCTTTTTCTTT:2 - chr2L 9678920 5' - Doc2-element 219 1 76.71 ATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAACGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr2R 5151299 5' + roo 8749 2 74.66 TTATTAGCAACGAAGTTGAAGGGTAGTGACGCGGAGCATGCATAAGAACAATGTATACGCCACTAAAATTCAATTTTTACGAGCATAATATGTTTCAATGGCAACACACACACACACACACACAGACACACATACATAC:1 - chrX 4855266 5' + Quasimodo 39 2 51.80 GTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTTGGTAAACACAAGTGC:1 + chr3L 24934284 5' + HMS-Beagle2 6931 2 52.74 AATTACGATTATTAATTCGAAGCTACAAACCAACCACCTGCTTCCCACATTTATTAGTCCAACATGCTACACCTTCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAA:2 - chr2R 14516126 5' - Stalker4 6882 2 63.01 ATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAT:1 + chr2L 14074446 5' - 297 6925 2 60.74 AACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chrX 21224612 5' - roo 8984 2 76.55 GATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTATAGAATGGATATGTTAATATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAAC:1 - chr2R 4189085 5' + S-element 69 1 67.12 TTTTGGTCTCACCATGGCAAATCACGGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCG:1 - chrX 15200967 5' - 17.6 461 2 65.07 ATAAATGCAACTAATATCCTAAAGACACACTGATCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 19450176 5' + roo 8742 2 75.97 AAATAATATACATACATACGTACATCCACTTGAATCAGGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGTGTTTTTTGCTTACTTAAACGCAATTTTTTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAA:1 - chr4 744868 5' + S-element 123 2 69.18 ATACTTATTATTTTTGTATTTATTCAGGTTGGATTTTGGCAAAACTTATTTTATCTTATATTCAACTTTGCATTTTTACGCAATTTGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTA:1 + chr2R 10809107 5' - mdg1 7077 8 76.03 GTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 + chr3R 9038927 5' + Juan 4069 1 57.93 GAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 + chr3L 17275420 5' - Transpac 237 2 70.34 TCTTTATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr3L 12315855 5' - transib2 2796 1 66.21 TAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATACCTTATGTACATGAATCGAGTGCGATAAA:1 + chr3R 19073187 5' + roo 65 2 58.22 TATATGGCCCTGAAATGCTGTCATATCCAAGCCATATTCCAGTTGCACTTCCCTGCAGGGGGAGTGATCGAAAATAAACAAACAAAAATGTG:1 - chr3L 15763754 5' + Fw3 3058 1 73.91 GTTGAGGCAATAATTTACACAAATTGCCAATTCTGCTGGCCGAATAATGTCAGTCAAGTCAAGCCGGGCAGAAGTCAGATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTC:1 + chr3R 28194079 5' - invader2 4726 1 54.11 GTGTGGCACATGCGTCATTCAGTGCAGTTTAAATACCAAGCATTCATTTTATTCATGAGACAAAAATAAAGTTGCAATCAAAAAGAACGGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAACTTGGACCAGAC:1 - chrX 10803292 5' + I-element 4902 1 63.45 CCGCACTTCGTCGCCTTGAGCACCATCATTTGTCGCACACGAAACGCGTTAATTATGGCCATTGCAGTTTTCCCCACTTTCCCGCTGTTGCTTCCACCCCCCTGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTT:1 + chr3R 5979700 5' - hopper 1033 1 77.69 ATTAACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTAT:1 + chr3L 16973330 5' + S-element 1539 1 67.15 GTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTT:1 - chr3R 23067489 5' - roo 13 2 67.81 ATGTATCAAATTGGTAGAATTTGTTAATTCTGCGAATTGTTTTGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1 + chrX 20888296 5' - 297 6909 2 72.14 GAAACAAGTTAATTTGGCCAGAGTATTCCATGGGCAAAACCATTTGAAAATTTCGTTTAGCGTCGCCAGGACAAACAAGGAAAATAACAAAAAGGCAAACACAAAAAAAAAGGAAAATAAAACG:1 - chr3R 5931564 5' + Doc2-element 253 1 77.42 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:2 - chr3L 23456267 5' - 1360 3325 1 63.01 GTATTCCTTGGATTCGTACGTCAAAACACCGGCACTCTATGTGTACAGCTTAATTTTGGGTCTCAGAAAACGTGTCGCTTTAATTACGCAACACCGTAGTGACCCTGATATGAGTTAGTAATTGAACACA:1 - chr3R 15934119 5' + hopper 950 1 80.00 TAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTC:1 + chr3L 13294849 5' + roo 28 2 65.07 ACTTTGTGACATTTAATGCCAGTTTGTCAGCTGGCTTTCTCGACGGCATCGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1 + chrX 585640 5' - Tirant 329 2 63.70 ATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 19449970 5' + roo 8695 2 61.70 GTTTCACTTCCTTAAATCAGTCTTATGAAACATTTTTTCGGACTTTGTTCGTTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 - chr2R 3564185 5' - Tabor 466 2 71.92 GTTAGGATAAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2L 21328134 5' - 297 355 2 58.22 TGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 + chr3R 4805624 5' - 1360 3309 1 71.92 CAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1 + chr3L 24213770 5' - invader2 180 2 63.70 AAACACCATCCACATTTGTCTTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACTCTCTGATTAGACTGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCA:1 + chr3L 20189599 5' - FB 216 1 63.70 AAGTTGCGGCATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr3R 27765087 5' - mdg1 360 2 59.59 GTAAGCTATTTTTAGTCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGGACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACAAATTGAAAAGCCG:1 + chr2R 4854950 5' + 17.6 35 2 58.90 TTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chrX 19054267 5' + jockey 88 1 71.92 AGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 - chr3R 22590582 5' + rover 7009 2 64.83 ATTTTTATATTATTTTGACTTAGTTCCCATAAATTGTAAGATACTTCAGAGGCAAGGGTCCTAAAGCTCTCTTCGGTTTTTACTTGGACCTTAATTTCGTGGATGCTGCCCTTTTTTT:1 - chr3R 22180119 5' - Fw3 75 1 56.78 AATGGACACGGCAGTCTTCTGTCGTCACTGCGTGGTGGCGCTGGAACGCTTTTAAAGAACATTAAAGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGG:1 + chr3R 4222825 5' - 297 6606 2 56.59 TGTTAAACGTATTTACAGTGAAGGTTCGATTAGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAAT:1 - chr3R 14858314 5' - hobo 2856 1 79.29 AAAGTGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCTAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGCAGCTAGTACTCATTAAATTTACTTAGGTT:1 + chrX 3431836 5' + Ivk 5336 1 58.22 AGGGTATGCGTATATTTTCATCAGGCACTGTGAGTGCGCGAACGAGTGAGTGTACACAGATTTAACCCCAATTTGTAAGCTTATTCGCGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTCGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCATAGTAGAT:1 + chr2L 6205094 5' + Cr1a 4100 1 57.53 GCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATATTTAGGAGTTT:1 + chr3L 13294902 5' + roo 81 2 71.23 TTTCAAGAATCAATATTAAAAGACTTACTTTCTGAAGATGTTTGCGGAAACACATTGGATTAGCCACCGCAAAGTCCAGATCTCAACATAATAGAAAACTTCTGGTCATATA:1 + chr2R 2844690 5' + Tc1-2 1187 1 73.21 CCAATGAGTTTAAAAATATCACCAAATATCGTGATGAGTTAAAAATGCATTAGCAAAATATTTTAAACGACCGATGTGGCAGAGAGAAGCATATGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTATTGTTATCTCGCTCTTACTT:1 - chr3R 4605306 5' + invader3 93 2 51.72 ATATTTTTTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGGTAATATTCTAATACAAT:1 + chrX 4808478 5' - mdg3 5481 2 71.32 ACGAAAGAAAATCAATCAATGTTGATAATTAATTAATTAATAGAGTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTGTTGAAATTTGAAAGC:1 - chr3R 30059520 5' + FB 29 1 65.52 TAGCTAATATATTTTAATTATATTATCGTGCTTATGATTTTAAATATTATATTTTTTCAACTACTTAAATAAGGAATTCACCGTGCACTACTTTACAAGCAAAGGCATTCGAATAACAAGATGCATAACGGCCATACATTGCTT:1 - chr3L 23248390 5' - 1360 3365 1 71.53 GACGAAGGCGACGATAATGAAGAGTTTTCCAGCCACAGTACTGGTAGCGATGGCAATGCCAATAATGAACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTACTTTCCACATCAACAATCAACA:1 - chr2L 205558 5' + gypsy7 322 1 50.68 ATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGGGCACACATATCGAATAAGCACTGGATCAAAACAGAACATTGGGAACAATCACATTGAAGCACTGTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:1 + chrX 10521660 5' + Tabor 6914 2 67.44 GTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr3L 19454892 5' + mdg1 7066 2 65.07 TAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGA:1 + chr2R 10161796 5' + transib2 73 1 67.12 TATTTAAATAACATTTTAGTATGACATAGTGATAATAACTATAGAGCATATCTGCAAACAGGCTTAAACCAAAGACACTAGAATAATATA:1 + chrX 21097408 5' + Tc3 242 1 71.11 ATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 - 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chr2R 13168700 5' + P-element 106 1 14.48 AAGGCTGTTCTGCGGCTGGGGGCGAATTGAATAAGGCATAACAAAAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr2L 3004536 5' - INE-1 580 1 90.16 AGCATCATTATAAGTTATTCATTTTTCGACGACCACAACCTCAGCTGTGGGCATTACCCACTAAGCCTGACACTACATGGAATCAATTCTCAGTGCCCCAACTGAAGAAGTGGTTGGAAGG:1 - chr2R 23584889 5' + invader3 361 1 72.73 AATTACTATTGCAAATTCATTGCCTTCATTCATTCTCTGAACACATTCGGAGTCCGAACATATACGAACTGAACGCAACGAGAACAATATTCGATCCGCGACATCCCCGACCC:1 - chr3L 24895812 5' - aurora-element 4036 1 70.80 AATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2R 22034610 5' - copia 234 1 70.55 ACATATATGTATGTATATATGTAATCTTGATCAGGATCAATAGCCGAAACAACCTGACCGTGTGCGGATGAACGTCGACATCTCAGGAAATATAA:1 - chr3R 13731611 5' + INE-1 145 1 80.00 TGGTGGCATCATGTTCCCCAGCCGACTTTATTTTTGGACTAGCAAATGCGGTAAGCTATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 3030156 5' - roo 395 1 75.34 TTCATGTCGCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGT:1 + chr3L 3501708 5' + Bari1 38 1 51.56 ATATGCACATAAAGACTCCTTTTGCAGCCTTTAAATTAAGAATGAAAAAAAGATATGTCTGCTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTAATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 - chr2L 16539741 5' + Juan 4092 1 56.16 ATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGGAT:1 + chrX 18282609 5' - P-element 2853 1 45.00 GAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAA:1 - chr3L 3501803 5' - Bari1 1631 1 70.55 AATTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 + chr3L 5532892 5' - roo 9047 1 67.12 TTCTTCGCCGAGTTCTTTTGTTGCTCTCTAAACTTGTTCGTCAGAGTAATCATATAAATATTCCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 7300137 5' + roo 8720 2 57.93 GTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chr2L 15550649 5' + Bari1 49 1 52.41 TATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:2 - chr3L 24486371 5' - flea 221 2 62.33 CTCGTCAAGCCACGTCCTGGCAGGACATAAGGACGCCAGGACATTGGGCTGACAGGCGGCAGTTGGACAATGGAATAGCAAAAAAAAAATAAAAAAGGAAAATCAAA:1 + chr3R 11998087 5' + Doc2-element 251 1 71.03 CTTTACACTGATTGAAATTAAACAATCTAGCCAATTCTATACAATTTGAACTTATAATATTTTTAAATCAGTACCGACATTGGCAAGTTCCCCGACTACCTGTACAAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAGTGGA:1 + chrX 190040 5' - INE-1 539 1 58.22 TTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr2L 4003797 5' - mdg1 373 2 50.68 GTTATGAAGGAGGTTATTCCTAATACAGGGTGCGTCAGCATAATTTCGTTTTTTCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTTATTTTTATAATATAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTTTTT:1 - chr3L 23071834 5' - mariner2 792 1 78.08 AATATCTTTTTAGAGCAGATTGTAACGGTACCGCTTTCTTGACCCAGAGACAACAGCACAAAACGATATTATACAGATAGATACATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chrX 10537976 5' - I-element 5324 1 63.01 TTTCTGTTTCCTTGCGAGAATTATTTGTATATCTTTTTGTTTAGGAAGCGAAATTTGCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAA:1 - 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chrX 11074288 5' - X-element 4354 1 65.75 ATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTGTAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAATTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 20167601 5' - roo 322 2 76.71 TCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chrX 12986558 5' - roo 321 2 78.62 ACTTCAATGGGGTTTTTGCTTTTGGTGTTTTCCATTTATGATGCTGTATGCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTG:1 - chrX 11710076 5' - 297 6601 2 60.00 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGGGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTG:1 + chr3L 11115124 5' + micropia 8 2 68.83 AGGAAATCCAAAAGCACGCCGAATATAGCCAGCAACACCACCCAAGTAAAGTACATTAAAAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATA:1 - chr2R 5075353 5' + I-element 5161 1 60.96 AGATAAAAGGCTAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATC:1 - 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chr3L 17013306 5' - mdg1 7108 2 50.00 AAATATATGATAGTTAAAGAATTACAATTAATATTGAACTTGTGTTTATTCGCAGGTATAGGGTCCAATCTGCGAATAAACACAAGGTCAATATTAATTGTAATTCTTTAACTATCATATATTT:1 + chr3R 24309746 5' + Cr1a 85 1 58.87 TTTTACAATAAATAATACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCAGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGAAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3L 5881676 5' - pogo 2053 1 56.15 ACTGTGGCGTGTCTTCACTGTACTAGGGCACTGCTAAATGCCCAAATTAAGTGGAAATGGTTATATCGAAACACTATGTTTTCACTCCGATCGTGCTAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCACTGTAT:1 - chrX 10600655 5' - F-element 4319 1 54.11 ATTAGTTGAATCCCTAACGTTTTCGCTTTTAACTGAAAATTTCCCTTTTTATTAAGATGCCTGTGGCGGTGTCATCGAGTATCCGAATGGCACCATTACCTCGCCCTCGTTCCCCGGCCAATTGCGTCACTTGAACGTTTGATTGT:1 + chr3R 24746774 5' - Juan 122 1 79.45 CAGCTTTCTTGAGCACACACCCTGCTAACATGGCTGACAAGTTCATTACTCCGCTTCCCATCCCCATCCGCAGTCCCATCCACATCCATGGCCTCCCTGCCTTCCCTGCCCACCATGCCCACCATGCCCTCCCTGCCAACCATCC:1 - chr2R 23592660 5' + G2 418 1 73.79 TATTGATAGAAAGCATTTTTATTAACTCCAGTTAGCTCATCAGAAAATCTAGTCATAGAAATTCAATTTCAGCCAAATCGCCATGAAGCGAATCCAATCTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 + chr2L 1300623 5' + GATE 8270 2 63.70 CCTTAATTCCCTGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - 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roo 405 1 79.45 GTGGTGCGCACGGGCTGCGTTTGGGATTGGGTATGCGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCG:1 - chrX 17596891 5' - Doc 4507 1 63.27 ATATTAATTCACTGCCAAGTGAATATCTGTGAACTGATCTGCATAGATAGATAATAGATCTGCACAATTGGAATTAAGAAGCCAAAAAAATAATTGTATATATTATGATATATATATATATATAATTAAATGCTTGCAATATTTA:1 + chr3R 3854729 5' - Idefix 7390 2 31.72 AGTGAACAAATATTGGTAAGTTAGTGAACTTGGTCACTAAATTTTTATTCGGATTTTAACATTAAAGTACAGTACGAAAATACGACGAATGTAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr2R 21926515 5' + opus 21 2 47.59 ATGTTCTGCCAAAAAGAGCGATCGATCCGGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCCATTCGGAATGGCAAAGCTCTCTCCATTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 - chrX 2929699 5' + hopper 141 1 87.23 AAAAAACATAAACATAAGGTGGGAAAATGAAAGGAAGCGAGTTCGCGTGGTAGATGCTGAGGTGGCAATTCGGAAATGGTTGTTGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTATTTATGGGCT:1 - chr2L 1690900 5' + rooA 42 2 76.71 AACTCTGTTTTGGAGTTCTCTTAGCATTACACTCAGAAAAATAAAAAAAAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTTTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTA:2 - chr3L 14532072 5' + mdg3 5098 1 67.12 CTTACACGGGAAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGAAATCAGTA:1 - chr2L 21328278 5' + 297 36 2 60.28 ACATAGTGTCGCTGGAGAAATTATAATCCCCTAATAGCCAGATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGGGATCAATAGCCGACTCGATCTGGCCCTGCCCGTCCGTCTGTCTGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1 + chr2L 19076157 5' + INE-1 140 1 69.18 GTTTCCCTTCCCTCACTCTTGGATATCGTCAGACGAACTGATCTGACGCTCCAAGTATAGCTTAATTCTTAGTTAAATCGATGTGACCAATTACAATAATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 - chr2R 5106397 5' - Stalker2 7627 2 66.90 ACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACT:1 + chr3R 11040025 5' - Bari1 1676 1 62.76 AATATATAAATGCTTCTGAAATTACTGAAAAGCGAGTTCCATTACTAGATTCATTAAAAAGTATGCATCCTGCCATTCCGAATTTACAAAGTATATTTAATCTTGATTCTTGAGAATCAGTAGCCGAGTCGATCTAGCC:1 + chr3R 7838335 5' + INE-1 101 1 69.06 ATCACATTCACACAGATAATCCACACACAGACTACAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGAT:1 - chr4 1081201 5' + I-element 5228 1 76.03 ATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 - chr2L 13844243 5' + Stalker2 7325 2 67.81 TAATAATAATAATAACGAATGATTTCAGTCAATCTTTTGCGAAATTGGAGAAAATGCAATCGAAAAATAAATGAATTTTTAAAATTTTTTTCAAATTGGCACGAACAGCCTCTGCAGCGGAGTGAGGTCCGATC:1 + chr2L 12010945 5' + invader4 2877 2 73.88 TATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTC:1 - chrX 9950599 5' + jockey 4732 1 64.66 CCTGAGTATTGGTTAAGCAGAAATTTCACAGAACAAACTATATAGATACTAAGGCATATAAATTTATCCTGAATAGAACTGAGTTCTATTGGTTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATC:1 + chr2L 4335626 5' + transib2 75 1 63.01 GTATGGCCAATAAGGGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chr3R 9594972 5' - Tirant 399 1 81.74 ATTTTGAAAATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - 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chr2L 6654776 5' - diver 6079 2 63.01 GTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:2 - chr3L 16033433 5' + Doc 59 1 54.79 ATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr2L 18177009 5' - INE-1 548 1 75.19 AGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAG:1 + chr2L 19817788 5' - G4 3781 1 60.27 ACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 - chr3R 19449414 5' + roo 8685 2 76.03 TGTAACATTTAGTGAGTCCTTTTTTGACAACCAAAACAATCCCACGCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATTATACGACACACATAACCTACCAACACTACCTAAATCCAAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCTAA:1 + chrX 9178978 5' + I-element 5003 1 79.45 TTTTAAGAACTTTTTCGATAGAATTTTTAAGAACTTCCCAGAACACATGTCTCATCGTGTGGTCACCACCATTCGCTCACTTGTAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACATCACCATATATCATAAAAAATCGGTGGACTTTGCC:1 - chr3L 2401149 5' + I-element 315 1 56.16 CTTAGTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTATCCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTATACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGATAG:1 + chr2R 16193768 5' + INE-1 547 1 47.26 GTATTTACATTATTTCTTTTATTTGAACATTCTCTATAAAAGTAAAATCATGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTA:1 + chr2L 20839555 5' - mdg1 320 2 65.75 GATAGGGAATTATCCACTAATTTGTCCTGATTAATATACATTATATACATATATATCATTCTTCAACATTTTGTTCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATA:1 - chr3R 13805854 5' + Stalker4 497 1 54.79 AGTAATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chr3L 21969818 5' - opus 448 2 73.97 AAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 + chrX 18817252 5' - transib2 2788 1 60.96 TAATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:1 + chr3R 30813355 5' + FB 86 1 76.71 GATGTGGCTATTACAGTCGGTTTAGACGGCCAGCTAGAGAGTTGCCGG:1 + chr2L 7805336 5' + aurora-element 175 1 64.58 CTAAAGGATATGCACAAGGATAACAGCTCAAATTGATAGACATTTATATATATAGCGAGCCAGGAAAGCTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTCAAACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATT:1 - 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Doc3-element 125 1 58.22 GTCATAAATAATTTTTGTTCGTATCACGGTTCTGACAAGCAAAACTCTATTTAAGATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAAT:1 + chr2L 14074443 5' - 297 6917 2 60.27 CAAATATATGGACAGTTTGTGGCACCGTATGATTTAAATAAAAAAATAATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 6102880 5' - roo 397 1 65.75 AAATAATGAATCAGCAGAATGCCGGAATATGCTAATCACACCCTTACGTAATTCTATTTCTGGACTCGGTTGCCATTTAAGGGTCGATCCGGCTCCAGATCTGAACCCTATAGAAAATTTGTGGGTTCATTTAAAGAAAAAAGTGG:1 - chrX 15119031 5' + S2 1261 1 61.64 ATGCATGCATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGGCAAAAGGCATTAAATGAAGCCACACACAAAAATTCAACAAAGCCTTGCCTTGCGCGTTTTCTTCCTTTAATATTATTATTATTATTGTTGTTAT:1 - chr3L 20248336 5' - mdg1 7067 2 59.59 AATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAT:1 - chrX 21247594 5' + blood 168 2 76.67 CCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 - chr2L 4123933 5' - transib2 2744 1 72.60 GAAACCAATGCAAAACCCTCCACTGCACCAAATGCCGGCCCCTACCCCCGGAGGCATCATTGTACCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCCG:1 + chr2L 22966891 5' + 1360 3174 1 52.21 ATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGGCCACCCCCTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 3983880 5' + P-element 6 2 63.51 TGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 12249884 5' - roo 354 2 65.00 GGGGACAGTCATAGCAGTAAAATAAAATGTACAGCTGAAATTAAAAGGCCTGCCAATCATTTTAATTAAATAAAAGTGATCTTGTATGTGTTATTTGCATATTATAAATTCTAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGAC:1 - chr2L 20767016 5' + HMS-Beagle 6753 1 79.45 TAACTCTACTAATGCATTTCATTCGACCATTAATCCTACTAACAATGAATCAACAAACAAGACAAGTCCACAGCTGACATGGAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGAGCAAATAAATTCGCTCTT:1 - chr2L 15728226 5' + G4 46 1 62.33 AATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3R 15072668 5' - pogo 2045 1 58.22 AAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 - chr3R 11040156 5' + Bari1 58 1 58.57 GTAATTAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTT:2 - chr3R 17996268 5' - diver 6053 2 57.53 TAGGAGAGGGAAGCAAGTGCACCGGGTTAACTCTTATGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr3R 3850970 5' + transib2 17 1 74.66 TTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr2L 4123968 5' - transib2 2779 1 52.05 AAAATTACTTGGTCCCACCAAAAACTCCGACGTATACGAGTATGTATGCATGCGTTGGAGAAAGCGGAGTTATCTGCCCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCATGAGCAATGCTCTCCCGAAATACAAA:1 - chrX 21557502 5' + 297 209 2 65.35 ATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:2 + chr2L 16539606 5' - Juan 4199 1 74.66 ATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 27123559 5' - roo 8991 2 72.60 AATTGAATTCGGTCTGCTTAAAAGTAAAAACTAAACCAACAGTGAAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 + chr2R 330076 5' - HMS-Beagle2 289 2 69.86 AATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTAC:1 - chr3L 25508749 5' + 1360 339 1 60.96 ATGACTAGTGGTTTGAGACTTAGCGGTATTTAATCGGAAACTAATTATGCCTTACACCTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCCTTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCATAAGAAATCTATAAATAGAGTTTG:1 + chr2L 2075222 5' - 1360 3271 1 59.59 AGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 + chr3R 904942 5' + rover 11 2 55.66 ATGCCTATTAAGTACAAAAACTACGCCAGTTACAGTGCTGCCAAGGACAGTTGAAAAGCAGTGCCGTTTACTCTTGATATTGACAGTCAACGGTAATTTAATCAAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTAT:1 + chr2L 16550767 5' + S-element 1549 2 73.97 ATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3L 14094687 5' + I-element 48 1 56.62 CTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 + chr3L 21996166 5' + Transpac 4988 2 62.33 GGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATT:1 + chr3R 19450110 5' - roo 19 2 59.70 ATGAAATATGAAAACCTTTCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:2 - chr2L 7593182 5' + jockey 4691 1 73.29 ACCATAACACCGACCAACCACGCCAGTGCATTTTCTAATTAGTGGCCAGTGGCCGATCTACCTATCTAAATTCGAAAAAACACTGATGGGAATTGATGTCCAGACAAACGCGTGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTT:1 + chr2L 23008308 5' + transib2 201 1 76.03 CTCGCACACACATAAGTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 - chrX 8437751 5' + P-element 62 1 42.47 AAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:3 + chr2R 14653146 5' + 297 6620 2 51.37 CAATATAACTGAATTGATATGCAGCAAACAGATATCAAACATTTCCATAAAAGCAGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 + chr2L 13556341 5' - transib2 2761 1 61.64 GTGGTTAAACAAACTCCTTTTCTCAACGAGATTTCGCCGCGATTTTTTGTGTGGGCTGGCATTCAAACGGTGGGGAAAATCTGGGAGAGCGAACAGCGATCAAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGTTGGATACGAATTT:1 + chrX 9717630 5' - invader6 74 2 62.59 GAGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr2L 14074555 5' + 297 6635 2 56.85 TTTGCAGCATACTTGAAGGCGCCACCCACATACATACATACATAGCTCTTATTCCCTAAATTTGTCTGTGTATATTACGCTGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATT:1 - chrX 7384252 5' - 1360 3165 1 56.55 ATAGCACGATGACATTCCGTACTCATATTCATTCTTGCGCTTGGCTCGAAGGCCCGGGACTAAACGATCGTTTGGAGTGGAAAAAAGTGTCAAAAGGCAATGTACTTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCACCCTTCTAGCTTTT:1 + chr3L 37607 5' - INE-1 165 1 76.55 CAGGAAATCGTCCAGGCAGCCGAAGGAGAGCAGCAGTTGCAAAGGTCTAGAAGCTTGACAAACTAACTACAAAGTGCGAAGCGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGGTAATAATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAG:1 - chr2R 23608953 5' + gypsy4 406 1 54.11 GATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr2R 12133827 5' + jockey 85 1 71.23 ATTTTCCACATTTATTAAGGCTGTGAATATAGCGAGTTAGCTGGTCAAGCGCATAACCCGTTTGACTCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 7889667 5' - roo 9037 1 56.25 CAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 - chr3R 30347385 5' - P-element 2815 1 30.08 AAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:1 + chr3L 15913842 5' + jockey 4814 1 56.16 TGAGGAGGTACCCTGGTCATTAATCATTTGCTTACTGTCGCTCCCTCAACTGGCTGACTACGCCGTGTGCGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGAAGGTTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACAT:1 - chr3L 15225135 5' - 1360 3153 1 54.11 CAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 9557553 5' + G2 3066 1 78.08 CAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTAGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr3L 16437274 5' + F-element 14 1 61.40 GAAGTGTCTCTTTCTGTGTGGGCCCGTGACGCCGAAAAAAACCAAAAAAAAAAACCATTTAAAAGCA:1 - chr2L 1902180 5' - Circe 422 1 41.79 ATCAGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGCGAGAGGTTTGGTT:1 - chr2R 15005124 5' + BS 5006 1 57.01 CCATGCCCAATTGTAATCGGTTTCATAAATTATGCTAGATAAGCGACTTGTGCAGTGGCCTTAGAAGACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCC:1 + chr3L 19661552 5' - 297 6579 1 51.80 TTATTAAACAATTTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3R 7317680 5' - I-element 5310 1 52.11 TGTGGAATTTGCTTATTTGCTCACGGGCGTGAAAATATAATTACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 9002866 5' - roo 393 1 76.03 AAAACATTGTCAGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr3R 4860408 5' - Transpac 282 2 63.97 AACCTGTCGCTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 + chrX 10319582 5' + mdg1 37 2 60.27 GAAATAGTCTTTTTATGCTATGAGCTGGTTATATTCAAAGATTATATGTGAATATACAGATATTTTGTGTAAACTTGGAATTTGATGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTAAATTTATTTTACTTATAAATCCAAAAACAAA:1 - chrX 14586118 5' + S-element 130 2 46.58 TATATTTAATTTTCAATGGTTCTAAATTTTTTCACAACTTTTAAAACATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr3R 12242390 5' - transib2 2797 1 64.38 GTTTGTTTTGTCGTGCTTTTTGTTTAAACATTGCGTTGTGTTTTTTGTTTATCGCCCCCGTGTCGATCTGATCTGATTGCGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGG:2 + chrX 12631664 5' - Porto1 4309 1 74.29 ATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCA:1 - chr3L 46980 5' + FB 87 1 74.66 AGGGTTCGCCAGCGAAAGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCC:2 + chr2R 10161766 5' + transib2 43 1 56.16 GGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1 + chr2R 24427561 5' + jockey 4732 1 54.79 AGACAGCAACAATATAAGGCATGACGAAGCAGCAAGGACAGGAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAATAACAAAACAAAGTAG:1 + chr2R 4670395 5' - S-element 246 1 69.86 AATGCGGTACAGTGAAAGCTCGGCGGAATAAACGGGGGAAGACCGATGAACTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 - chr3L 17568168 5' - S-element 1702 1 76.03 CGATACTAAACTCACACCGATGTAGAACCAACCACCCACACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 26404967 5' + hobo 29 1 63.50 ATTTCGTTCCCTTGACTTCATTTAACAATCATTATTTGCACTTTCAGCCATCACATATTTTATTTATTGTTCATTGTATTCATTTTATTTGCTACAAAAAAATATTTTAAAATGGAGGATTAACAATTTGTCTTAATACTTTTGAT:1 + chr3L 3505222 5' - G4 3497 1 73.97 AACTAATTTTCTACAAATCCATATTTTAATATTTAACACACATAATCTTAAACTGTATAGAGATCAGTTTAAAATATGACAGAAAACTAAAGCATACTTTTATGAAAGCAAATAAACCTTTACCATTTGAAAATATTGTGTGAAAT:1 + chrX 13950605 5' + TART-C 397 1 76.03 ACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAGTCGA:1 + chrX 8200184 5' + flea 4816 1 61.38 TGATTGCCTCTTTTTGTTGCCACCGAATTTCCCTGTTGCCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATA:1 - chr3R 30987634 5' + F-element 77 1 77.40 TATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATTCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTA:1 + chr3R 27986368 5' - roo 9029 1 62.86 ATTTTATTTGTATTTTCTTTTTTTTTTCAATGTTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCG:1 + chrX 14771618 5' + hopper 104 1 77.93 AATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGGAAAT:1 - chrX 21224608 5' - roo 8979 2 76.71 GTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTTGTTATTTATATTACTTTTATTGAATTAGTGATTCAGTATG:1 - chrX 10521748 5' - Tabor 442 2 53.42 AGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGCAATTTGAAAGCTGGAATC:1 + chr3L 22890355 5' + FB 36 1 50.00 ATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGCT:1 - chr3L 19274875 5' - transib2 2748 1 70.55 AGGAAAAGTTTAGTGTTACCTGTTTTATTCATTTAACGGGTAGGGCAATCCGCAAACA:1 + chr2R 5605175 5' + Gypsy12A_LTR 1963 1 68.97 AAGTGTGCGTTTTGTTCGGTTGGAGAGCGAAAGTTGAGTGAAGTGCACATAAACAAAAGGGAAAGTTTTCATGCATTTGCAATGCGAAAAGTTTATCCAGGGAAGTTCCACTACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGGAGCTGTG:1 + chr3R 19422974 5' - Chouto 445 1 73.97 CTGTAAATAGGGCAATGCAACTTGAACGCGACCTGCGCGCAATTCGCATGTAAGTCGTGGTGAGCGCTGAAAAAAACGCGGATCGCGTGCGATGTTTATGCATTTTTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATTTTTTGAACGA:1 + chr3L 19818278 5' - R2-element 3365 1 60.00 AAGCCAGAGTGCTAAAATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 17421343 5' - pogo 2080 1 56.16 TTGTGATTTTTTCACAATTTTCCGTTGTTACTCTTGGTTGTCGCTATTTTTTCGTTTTTCTTTGTTTTTCGTATTTTTTATTTTTGTTACTTGGTTGTGTACTCCCACTGGGATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCT:1 - chrX 14021065 5' - P-element 386 1 67.12 AAATACACAGCACTCGGTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTACTGTTGTAATTTATAATTTA:1 + chr3L 9269855 5' - copia 258 1 60.96 AAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr3L 7889582 5' + roo 85 2 82.88 GAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTC:1 + chr3L 24213770 5' - invader2 186 2 62.14 TCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2L 7593164 5' + jockey 4694 1 67.94 ACTAGCAGTCAAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTCAGTGTATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGC:1 - chr2R 4545211 5' - invader1 3576 1 80.82 ATGCATGTGATCCAGCATAATAGTGGCACATGTACTCTGTATGCACGAACGTATGGAAAGTTAAGCCATTGCGGCAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGG:1 + chr2L 15209569 5' - roo 259 2 63.72 CTTCTTATGTAACCACCATTTCTCTCCTCCGGAAAACTATCATTTCGCCCTTTCTACCAACTTATATAACATGCAGGGAACGATTTTACCAGATAAAACCAGAGAGAATGCCTTAATCGATTTTCCCGACTATCAGATACTCG:1 + chrX 20911279 5' - INE-1 555 1 59.44 GAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAATAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGGAATTAGTTA:1 - chrX 17343503 5' + I-element 5217 1 69.18 GAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATAGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 + chrX 6116267 5' + transib2 80 1 72.03 CTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:2 - chr2L 19675087 5' + 297 6620 2 55.48 ATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 9002934 5' - roo 8988 2 73.29 TTTCTTTTTATTTTTAAATAAATTGCATCCTTTTAAACAACTCCTTGCTTAAGTCCTCACCCCATTGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCC:1 - chr2R 20815630 5' + Idefix 258 2 68.27 CTCAACGTGAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACT:2 + chr3R 29690679 5' + I-element 5235 1 59.59 AATGCGCTACATAAGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 - chrX 22840589 5' - copia 210 2 52.05 AACTTTAGATTTGATTGTTTGTTGCTTTGCATTTTGTTAGGGGTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 - chr2R 21160749 5' + Transpac 73 2 68.28 TAGATTCAGATTGGGACTAAAGTAGGGGGAATGAGGAATGTGCGCACATAGCATTCTCATTTCGAATAATTGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr3R 10604948 5' + FB 50 1 75.00 AAAAGTCCTAGGCTTCATATATAAATAAAAATAATTAATATTAGAAACTTTCTGAGAACCATCACTCGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACT:1 - chrX 21359451 5' + F-element 4416 1 65.07 AAACGATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACGTCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACAT:1 - chr2L 13844280 5' + Stalker2 40 2 56.16 TTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 13406399 5' - pogo 2069 1 59.54 CATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGCCCTCCCTAAC:1 - chr3L 16470333 5' + jockey 4762 1 79.58 GGGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr3R 30347381 5' - P-element 2798 1 23.29 AGACCCAATATAAGCATGCACTACTTGTCCAACCAGTTTGGGCTTATGATTTAAATGCAGCCAGTTAACTGGGTCAATGTTTCGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2R 6964903 5' + Burdock 33 2 63.01 ATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3L 20898608 5' - roo 330 2 73.79 TCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAA:1 + chr3R 15363916 5' + flea 4812 2 59.29 AAGAAATTATAATCAGGCATGCATTACCGAATAATCGTAATTTGTTTCCGAATTCGATTTGATTTCGTAAAATTTTTTTTAAGATAAATTAATTAAATTAATTAAATTAAGATAATTAATTCTTTTATATTTTATAAGTAAGTTTA:1 + chr4 958765 5' - Penelope 494 1 53.42 ATAGTTTTACATTAAGAAGTTTTAATAAACTGCGGAATAAGCTTTAGAATTTAGAAGATTTTACAAGAAAGTGTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGC:1 - chr4 647342 5' - I-element 60 1 80.81 AATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 + chr3L 15103807 5' - Transpac 246 2 61.64 AGTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTC:1 + chr3R 4860419 5' - Transpac 303 2 73.08 CTATATCTATAATAATATCTCTCTCTCCAGAGTCTAAGGTATTCTCGCAGATATCCCCAATGCCCGGTATTTTGTCACGGATGACTCTGTCTAGTCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAAT:2 + chr2R 3681701 5' + mdg3 96 2 61.64 GGGAAAACCTGTAAGTTGCAGTAACAACAACTGGCGCGTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAA:1 + chr3R 12538441 5' + I-element 5104 1 73.97 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTT:1 - chr2L 5069689 5' - flea 251 2 85.62 AAATTTCAATGACCAAAAGATAAGTTAGCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chrX 19054210 5' + jockey 31 1 67.81 AAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:5 - chr3R 15054307 5' - copia 191 2 67.12 AGTGTGTTTTTGAGTGTATGATTTCAAGAATTTGCATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chrX 661998 5' + 412 7074 2 71.23 GTTTTAAAGTATCTAAATTCATACGCATTTAATTGCTCCAGTATTTTTGGCGGTTTGTTTTGCAGCGCAATCGATAAAATTAAGCATTCAGCAATGCTCCCCTCTCAGTTTCCAAAACGAGAGATACAAAAAAAAGCAAAAAAAAA:1 - chrX 15374714 5' + G2 3075 1 66.44 ATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGTAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTT:1 + chr3R 7719689 5' - roo 9053 2 68.89 ATATTTGCGATTTTTTATGAGAAAATCTTGAACGTACTGATTTTTATGGGTAATGTAACTGGGACTTAAAGAATTGAATTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTA:1 - chr3R 22076317 5' - I-element 208 1 58.22 ATTCTAGTAACAAAATTTATTATTTTAAAACATTTTTTTCTTGCTCTTAAATGATTGCTATTATCTTGGACATAGCTGTAGTTATTTGTATATACTTGGGGGAATATATCCTTTAGCAATTATTATCTAATAGAAAATTGATCATA:1 + chr3L 7833628 5' + transib2 78 1 70.55 GCCTTAATTCTACAAATGCAGTTTATCCGAAACCAATTCATCACTGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAATGCCTGTTTTGTTTTT:1 - chr2L 20967796 5' - I-element 5194 1 56.12 ATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTT:1 + chr2L 6654667 5' + diver 80 2 70.55 CCTAGCAGATATTTATGCAGGTGAGCTGGTTGGTGTGTTTGTGTGTACGTGTAGATGAATTAGGCGCGTATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATGGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGATAGCAAGATCGCGCCCTTCCAT:1 + chr2L 11800994 5' - Porto1 341 1 68.79 AATAAAAAGCTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3L 23906523 5' + 1360 14 1 73.29 TGAAGTACATCGCCCTACGTTGGGCGCCAATTAAAATTGCTACTATTTAATTATTTAAAAACTTGATAGTTTTTACTAAGGTAAACAAAATAAGAAAGCCATGATAGAAACTAATTTAATTTTGATACCAAATATTAATTAAGAAA:1 - chr4 292615 5' + gypsy7 352 1 50.68 TCTTTTGTGCATATACATAAATAAGTTAAAAGTCTATTATCAGGAAACTAACTTTCTCGGCGCCCATATTTTTGGAATCTGCATTTCGAATCTAATCATTTTAACTTTTATAGTTCCTGAGATTGACTCGGCTATTGACCCTAATC:1 - chr3R 4164675 5' - INE-1 92 1 72.60 TTTGCATTACTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATAATATATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTA:1 - chr3R 905020 5' - rover 7227 2 71.23 ATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGG:1 + chrX 10319633 5' + mdg1 7126 2 78.77 ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATATGTAAGCAATGTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTC:1 + chrX 12657098 5' + invader2 4931 2 67.12 TATTACACAATAAAATATTACATTTACAGTGTAGCAAAATGCGGCCCGCTTTCCATGTGTGTGAAAAACCCTTTTTGTTTTGGTTTTTTGGTAATTCAGTTTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTACGTTATCTGGATTGG:1 + chr3R 25558762 5' - I-element 5128 1 60.96 TATAACTATTGCATATGTTCAGAGTTTGCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chrX 2479479 5' - mdg3 5446 2 50.34 GTTGCAGTTGCAGTTGCCAAATGGCGAACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATATATGTACCTACTTTTTTTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chr2R 15004706 5' - BS 5085 1 47.26 CATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chrX 11661357 5' - pogo 2073 1 66.44 AATGATATATTATATCATTCTTATATGGCACCTAAGTTCGAGAAATAATCTAAAGTCTAGCTTTAATTTGCCGAGATTTAGAAGTTCATACGGACGGAAAGACAGACGGACTGACATGGCTATATCGACTCGGCTATTGATTCAGA:1 + chr2L 22644765 5' - INE-1 94 1 79.45 ACGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 + chr3R 3851005 5' + transib2 52 1 52.74 AGCTGCAAAGCTGAAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 - chrX 22840576 5' - copia 5067 2 55.86 CAGAGCGCCAAAACAGTATCAGCGAGAGATTGAGATTAGGACTCTCTTTTAGGACCCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGGAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTTAAATTAAAGGTTTTTTGCTTA:1 + chrX 15076760 5' + S-element 62 1 90.34 TAATCCATCCGGAATATACCCTCCTTAATATATTCCATGTAGTATTTTTGCGGTTTTGTTTGGCGATGACGTCAGCAATATCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATAAGCAAGTCCATTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGGTTC:1 + chr3R 4787699 5' - BS3 151 1 69.86 GCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chr2L 16943871 5' - copia 5071 2 75.34 AAGAGCGGCGTGATCAATACCAATCTATTAGACCATGGAGATCGAGTCGATATTAAAAGGAACGGGGGTATGAGTGTATAAGCTTATG:1 - chr2R 5111335 5' - mdg3 76 2 75.00 AGTAAGTTAATCTAATATATATATTTAGACAAGGCACCATAAATAAATCAAGATTGCATTGGCTAATATTCACGCCATGACTATTATAATTTTAAAGTTTTCTAATATTCGTTTGCTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTAACGTTT:1 + chr3L 6316862 5' - 1360 2979 1 54.11 AAACCATTCATTCGTTTAATTTTACTATTTAAGCAGTGCAGATTAGCTGAGTGTACGTTTAATAAAGAAAGAAGTTGCTGTATATACAAAAATATTCTTTATTTG:1 - chr2R 12761412 5' + transib1 1958 1 56.19 AATTAATAAAATATATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTACTTTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 - chr2R 4785322 5' - Juan 4162 1 53.33 TTATTTTCGATCAAGCTTCGCTGGAAGTTTAACAAATGGGTGGAATTGAAATATCGATTATTATTTCATAACGACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chr2L 20769824 5' - jockey 4943 1 52.74 AAATACAAACAGAAATTGTGGACTGAGAAGTGGGACTGCTGGAGGTAAAATTACGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:2 + chr3L 5389868 5' - roo 342 2 65.75 GCTCTCTCGTAACTGTTTTTTGAGTTCTCGGCTACGCTTCGGCTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chrX 18282672 5' + P-element 41 1 43.64 AAGGCGCGGGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGG:1 + chr2R 16929768 5' + jockey 4543 1 75.34 ATTCGCACCTGCGGCGAATGGCGTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chrX 9530455 5' + 297 5 2 79.23 ATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTANTCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 9544921 5' + roo 8738 2 70.83 ATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 11804631 5' - pogo 2034 1 67.81 TATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCA:1 + chr2L 12341848 5' - BS 5007 1 73.29 CTTGGAATACGCAAACAAAACAAATTGCGAACAAAGTACGTCCTTCGCTAACCCTCAAAAAGAAAGCAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATT:1 + chr2L 21965943 5' + P-element 2723 1 49.32 GTATTCCCTTAAGCTATAATAGCTACGGGTATAATAAGCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAAACA:1 + chr2L 22033557 5' + transib2 97 1 73.29 ACTCGTTGAGCTTTCAATTTGTCATTAGCATGCTCGATTAATTAGGAATTTCTGCTGTTAATCAAGTTATCAGGCAAATGACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAATATTTGGACATTGTTCACACATGAGCACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 7719872 5' + roo 8674 2 77.40 ATTTCTCAACTTCCTTTTATTTTTCATGCACAAAATTTGAGAACCGTAAAAAATCAAGGTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATG:1 - chr2R 5941430 5' + copia 4931 2 58.22 GTTAGTAATTTTATATCATTTTGTAAAATGGATCTGGAATAATAAATTTCGCATCTGTTTGTTATTTCAGGTTATTTTATATAAATAATTTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTGGCTG:1 - chr3L 27866127 5' - Max-element 8514 2 65.93 TATAACACTCATTTCGGGCTCTTTGACTAGGAAATGCTGATCAAAGAAACATTGAAAATTTAAATATCTAGATAAATTATTCTGCCTTTTTGATCTTATATTTTTATTTCTTTGCTTTTTTTTTAGCTTTAAAACTAAAAAACTTT:1 + chr3L 6837582 5' + 1360 3025 1 50.68 TCTTTGATTGTTCGTGATTCTATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCT:1 + chr2L 47067 5' + roo 8703 2 59.03 TATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAA:1 + chr2L 23299982 5' + invader4 394 1 71.23 TTTATATTTTTTTTTCGGCAGTTGAGCAATCTTTTTTTGAGCATTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGCTTCAAATTCGCA:1 - chr3L 5621955 5' + hopper 260 1 67.15 TGATAATATAGAAAATTATTAATTATATTATATTGGGCTTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGTCCACAGCGTGTTTGGTACACATAGAAAATACATTAAAACAACAGAGAATGCTAAAGTCGAGCTCCCCGACTATCAGATACC:1 + chrX 22780116 5' - INE-1 557 1 56.16 ATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATATGCAAACTTCAACTT:1 + chr2R 9966951 5' - Bari1 1675 1 39.73 CAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 2145972 5' - roo 8992 2 70.55 AGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:3 + chr2R 3338785 5' + Juan 61 1 58.22 AAGAATCCAGCCAGTACACACCAACTGCAGCAACAACAAGAGACACTTAACCGGATGGAGCTAAAAAATAATACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTG:1 - chr3R 13857852 5' + I-element 485 1 52.74 GCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr2L 4123826 5' + transib2 34 1 61.38 AAGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 - chr3R 4805679 5' + 1360 86 1 77.40 TGTGCCATTTGGCCGAGCGCTTCAGGTATACATTGTGTCTGGTCGTTTGCCAGAAGTAGGATTGGTTTTGTGACATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGA:1 - chr3R 15199025 5' - gtwin 356 2 64.00 AATATTAAATGCTCTACCTTTTTACCTTTTTGCAAGGAACATGTAAGTTATATGATAGCTTGCAGCTATGTTTTTTTATATATAAAAAAAACAGTTCAATTAACAATCAAAACAATTAAACAATTAAATAAATTATAAAATAAAAA:1 + chr3L 15760681 5' + BS 5093 1 58.90 ATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACA:1 + chr3L 22531947 5' - Cr1a 4199 1 70.34 GCAAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 - chrX 14722261 5' + diver 5 2 75.34 ATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTA:1 + chr3R 21400026 5' - G4 3835 1 71.72 CTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 - chr3L 14094680 5' + I-element 65 1 64.38 ACTTTTGAATAAAAGCAGCAGCAGCAGCCTCGGACTCCAGGACTGCCAACTGGGAGTTTCGAGTTGCCGCTGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 + chr3R 28385514 5' - transib2 2782 1 55.00 ACTTAGAAAGTCGGGTGTGCCTCTATTATTTAATAGCTTAGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAA:1 + chr2R 5674605 5' - S-element 1704 1 74.42 AAAATTAAAGAAAATATTCAATTCTGTGTAACTAATTTATTTGTTTTATTCAAGGGCATTTTTACTACTGATTGTAAGCATTTGTAACCAGTTATATTCTGCAGCATTTCTTCGTTTGACTAGTGAAGAAAGGGCAGGAT:1 - chr3R 11488286 5' - Chouto 6106 1 53.57 TCTAAGAATATTAACAATCAGAATTATTGTGTAATAGTCGTGTGACTAATATCACTTAAATCTCGAGTGATAACCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3R 27160010 5' - 412 486 2 78.77 AGTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:2 + chr2L 15004791 5' - INE-1 139 1 56.85 GTAATTGGAATCAAGTAATTTACGCGCCATTAGAGCGACCTGTCGAACCTACTGCAGGTCAGTTTCACCATCCAATTAACGTGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCATATAAGACTC:1 - chr3R 27406086 5' - diver 185 2 55.17 AACGGCGACAGGGTCAGGTGTATAAATTGCACAAATATACACATACATGCATATGACCATATATGCGCTCACATATCTCAACATATATCAAAATATATACATACATATATCTATATAGGTATAGATATATGTACATATGTACATAT:1 + chrX 13979918 5' - G3 4507 1 67.12 TAAATATTTTAAAATTCACTTTCAAGCAATTTCCGAAATAGGAATTTTTACACACATTGCAGTATGTATTTTCTTTTTTTTTGGAGAGAGCCTAGTTGATTTCATTTAAAGATGAAGCAACAAGTGATAAATTGTTAAATTTTTTA:1 - chr3L 16988325 5' - NOF 4123 2 71.23 TGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 3983925 5' + P-element 6 2 77.31 AAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAAT:1 - chr2R 4206655 5' + 1360 323 1 70.55 CATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:2 + chrX 8092381 5' - pogo 2043 1 56.16 CCTTAGACAGATTTCTGTTTGCTATTGGGCCTTCGTGTTTGTTTTCCATGTTAATTAAGCTTTACCAGCTGCTTACCCTGCGGGCATGCACACACTGGTGCAGCTGGGAAAGAAGTGTTTTCGCAAAATTTTAATTTGAATTTTAT:1 - chr3L 18116751 5' - 1360 3045 1 56.16 TTTTAGAGCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:2 - chr3R 13187542 5' - I-element 5320 1 57.53 AATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATA:2 - chr3L 13739632 5' + BS 5081 1 76.71 ATTTTCTGGCATCAATCTTCTACGACCTTGCTTATCTACTTCGCGATAAGATTAAAGTCCAATCGAACCGAAATCAGCATTTTGGTTAAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACA:1 - chr2L 7679779 5' + 17.6 7080 2 52.74 ATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCTTTACA:1 - chrX 15357750 5' + hopper 71 1 64.38 GGGAAAACATTATGGCGCGCGAACGGAAGTTGCCAACTTTTTTGTGGGCGGTTAAGAAAAAAGAAAGCGAACAAAAAGAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2L 5448226 5' - hopper 147 106 67.37 ATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 - chr3R 30347368 5' - P-element 2785 1 15.75 GCGTATGCGTAATTCCCACATGCCTCTTGCAATTATTTCCTTGGCTCTCAGTCGCTTTTCCTTTTTGTCTTTTGCATTCCTTTTTACAACGCTTCTATTGCAATTTTTTCACTTTGCTTGT:1 - chr3R 27783610 5' + S-element 332 1 63.64 GTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 + chr2R 17796541 5' + jockey 4704 1 56.80 CAAAGTGATTAAATTAATTTAAATTTTCAAACATTTTTCTTTTACTGCGTGCAGGTTTGAGCTCGAGTCAGTGTGCTGTGCATTTCGATGCTCCTGATTGTTATGTCTGTTTGTGCTGCTATTGTTATTATTATTATTCTTATTAT:1 - chr3L 14857707 5' - mdg1 29 2 63.70 ACAATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3L 4219473 5' + jockey 79 1 65.75 GCTGACATACTTTTCTTTTGGCAAATGGATTAAGTAATTGTGTTCCTTATTTTTAGTAAAAGAATTGACTTGAATTTTTATGTTATGTTTTACCAATTCCATTATGAAGTTGATCCCTCCCCTTTAAGTTTATTATATTATTTAAT:1 + chrX 21963288 5' + transib3 2667 1 60.27 GCTTAGATAAGCAAACTGGCAATCGAGAGATTCAATGATTGCTGGAATGTTTCTGGCAGCCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAA:1 + chrX 10445508 5' - INE-1 537 1 80.82 ATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 + chr2L 20265921 5' - roo 9028 1 55.48 CTATGTAATAACTTTTATTTTTGGGTTCTAACAATAAAGTTTATCTAAGCGGTTTAAAATAAATTTAGAATACATAATTCGTACACTAAATATGTCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATATATATTATTTTTGATCAAT:1 + chr2L 12482002 5' + 1360 254 1 58.90 AAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTT:1 + chr2L 14671826 5' + FB 77 1 71.92 ACCAATAAGTAAACTTAAGAGCACCCTAGATCCTTAAATCCAGCTCAGCATCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACATACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTT:1 - chrX 21556004 5' + F-element 4583 1 73.97 ACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGTTAG:1 + chr4 123975 5' + HB 107 1 49.06 AGAAATCGACAAATACCCGTTCTAAAGTCAAAATCCTCGAGTGCTACATGTGTGCATACATATGTCCGCATTGCGTAGGCATCGCCACCGCCTCCATTATCAATTTAAATTAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCC:1 + chr3R 18399327 5' + Juan 4036 1 34.93 AATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAA:1 - chrX 19980670 5' + X-element 4544 1 67.74 ACAAAATCAACAAATCTTGTTTTTCAATCCCCTTTACCAAATCGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 + chr2L 12134508 5' + jockey 4838 1 71.23 TAGGGCTAAAGATATATACACATAGTGTTTAGCTTGCAATGATATGGACTTCAACAGAAAACAGAAGAGAATGCTATAGTTCCCCGACTATCAGATACT:1 + chr3L 22638900 5' - INE-1 557 1 50.51 AAATTATGTGGTCTACACCATTGCAGACAGGGCAGCAAGCGACAGGGGTAGCGGCGCCAAATGAATTTCTAGAGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTT:1 - chr2R 3480111 5' - Gypsy6A_LTR 229 1 72.73 AAACACACAAAAATCACGTTTTCCCCCCGGTGTTTGCATGTTTCATCGTACTGTGAATGAAAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 + chr2R 5941329 5' - copia 196 2 58.90 AACTTATATACTCTTTACATTCGCGACTCTTATCATTAGTTCTTACATTTTAATATTGTAATCTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAATTAATAGAAAAGAAGGACA:1 + chr3R 1271948 5' + X-element 4662 1 58.59 TTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTT:1 - chr3L 46996 5' + FB 80 1 71.23 AAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 18488392 5' + roo 87 2 78.77 ATGGCATCGGCGGCAACCGGCTTATCTTCCCCTGAGAATCGCATCGCACTCGGAAGTCCCAGCACATGCCACCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAAGCGTAACGCCAGACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3R 20818322 5' + 1360 29 1 59.20 GACGACCATAAGTCACATTACTTTTTCCTGTTACCCGAATATAAATCTGCCAAACGGGGGGAAGTCCACAAAAGCGGTTATATGAAGGTGTAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTT:2 - chrX 8199505 5' + flea 349 1 52.74 CTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 21224652 5' - roo 391 2 65.22 AACATTGTTATTAACCAACGAAATACTTTAGCATATTCTTCGCATCCCTTTGTGAGTTCATCGTCCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTC:1 - chr3R 6601543 5' + 1360 213 1 57.53 ACTAAAAAGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATT:2 - chr3R 17615224 5' - mdg1 7078 10 71.23 CAATTATGTGAACGCAACGCCTTCTTACAACACAAAGCTTCTAAATATATACATATGTACGACATTTCTAGTAATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACCGTAGTCTGGTCGCTGGTAGGAGCGGGGGG:1 - chr2L 22173299 5' + invader1 3734 2 52.80 GATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGAGATGATGTGTAAATGTATGACGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 - chr3L 2544711 5' - Tirant 334 2 59.44 GTTTTTTCCTTCATCTTGCCTGTCCCTGCTGAACTTTTCCCTTTGATGCATTTTTTATCCTTGCTTACACATTTCTTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCT:1 - chrX 725562 5' + hopper 1202 1 50.68 GCTGACATACTTTTCTTTTGGCAAATGGATTAAGTAATTGGGTTCCTTATTTTTAGTAAAAGAATTGACTTGAATTTTTATGTTATGTTTTACCAATTCCATTATGAAGTTGATCCCTCCCCTTTAAGTTTATTATATTATTTAAT:1 + chrX 21963288 5' + transib3 2667 1 60.27 ATTTTCTAATAAATTTTTCAAAGTTTATTTTTGAAAGCCTTGCAGCGTTTTAATATCTGCTGCTTCAGTATATGCCGGGACTCCAGTTACTCGCTCACTCACTCAACTTCCACTCGACTCTACTGCTGCCTTGGGCTCGTTCCTTC:1 - chr2R 21568149 5' - flea 4859 1 75.34 AGGCATGTTGATGGGTAGTTTGTAATATGTAACTCGAAGTTTGAAGGGGCAACATGGGTCAACAAACTTGAGCTGCGTCTTTGTCTCTGAAATCTGAATGCTGAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGT:1 - chr2L 108670 5' - INE-1 143 1 66.44 TGATTTGTATATGAAAGCGGGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACACTTCAATTGGCTTATTAGCATACAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 16970341 5' - roo 397 1 68.38 CATATCTAACTGACTCTATTCTTTAAGAATAAGATCTATTATAACTAAAAACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 1279092 5' + roo 8714 2 62.40 GTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 7795473 5' + roo 22 2 72.60 GGATGCACTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 - chrX 10639170 5' + FB 64 1 60.96 ATTTGAAATAAAACAAAAAAAATGCTTTCATTAAGAAATCTTTAAGTGCTGGCTAGCACGCAAAACCAAACCATCAAAGCAAAGCCAAAATTAGAAAATACAACTAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCTACTAGGACA:1 - chr2L 5601501 5' + I-element 4939 1 71.23 ATGCGAAATGGATAATGACCTTCAGTTGCGTCGCTGCCGACGTCGACATCTCAGTCGGCAGAGGTGGTCGCTGCGTGTGTGTGTTGGTTCCTGGAGTTGGGTGCCCTTTAAT:1 - 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chr3R 29690797 5' - I-element 5301 1 56.16 CAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGGTCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr3L 16437274 5' + F-element 39 1 50.36 GACAAACTTAAGTGGATATTATGAAAGCCCTTACCGAGAGTAGGACAAGCAAAGTAAATTTATGTAGCTCATTTTTGAGTCTAGCTCGCCTTGCCTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAG:1 - chr3L 6556913 5' - accord 153 2 71.74 GGACGGTTGTCCGCGTAATGACGACGAAGCGCAGCGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 19266795 5' - roo 394 1 65.07 AGTATTGCACAAACTGAAAAAATATCTTAGATTTTCTACATTTTTCACTCTTATTTTATTTATGTCTTTGGCGAGCATCAACATTACACTTTTACACCAACTGCTGCGACGCTTTTGTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTCTCATT:1 - chr2L 19159354 5' + INE-1 469 1 72.60 CAGTAGCCGTGTTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGTTCTCCGAGTATCAGATACCCGTTACTT:1 - chr3L 27859913 5' - INE-1 549 1 56.16 ATTAGGCCAACTAACCGAACCTCCAGTATCCTACGAACTAGCCAGTCAAACAAAGGGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 11062736 5' + roo 8727 2 61.81 GAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 - chrX 14722203 5' + diver 66 2 60.96 CATATCATAGGGTATCGGTTCGCAGGCTTGTGTGCGTAATTTGGTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCT:1 + chrX 21993560 5' - gtwin 400 2 71.23 AAAGCTCAGGACTTTACATTTGAAACTGAAAACCCATAGAGATCGTTAGAAAGTGGGTTTCATATATGAAATAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGTAA:1 + chr3L 6111007 5' + jockey 4954 1 51.49 ACACCCACTCCATCACCACCCTCTCCCTCTGAGCCCAACGAGCCGTCAACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAG:1 - chr2R 10042179 5' + mdg3 171 2 66.44 ATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATAT:2 + chrX 292427 5' - G3 4507 1 65.75 ACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCAC:1 - chr2L 21930243 5' - Copia1_DM 80 1 63.01 ATAGAATTTGGGAGCAACATTTGTCAGACGCACAGCTTCCTTTATTATTTATGTACGCGCGCAAATATAACTATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 25616463 5' - roo 9023 2 53.42 GCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAA:1 + chr2R 4188964 5' - S-element 1680 2 57.53 GATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTCATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCC:1 - chr2R 4270285 5' + gypsy9 36 2 51.37 ATTTAGATATTAGCTTGTCCTCAAGCGATTATGTCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 - chr2L 22674856 5' - mdg1 7378 2 76.60 TAGCCATTAAAATCATAAAAAATATCACTGAGTAACGGGTAACTGATAGC:1 + chr2R 6806987 5' + INE-1 548 1 62.00 TCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGCCGGTTTGGGGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCCACATGGGTAAATTAATTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr3R 4322607 5' - 412 471 2 68.49 ATAAATATGGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGA:2 - chr2L 4754958 5' - Stalker 340 4 61.64 ATTAAATATATTTTTACTCTAGAAATATGTTTTGTGTCATTTTAATATTTGCCGCTTACAAATGAAACGGAATTGTTATCTTTATCATCAGATTTTGGACCCCATATAATTGATGATAAAGATAATATTC:1 + chr3L 17870604 5' - Circe 7078 1 62.31 ATGCTCTCGGTAAAAACACACGTATGTGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGC:1 - chr3L 26647386 5' - micropia 424 2 73.75 CTTAAAAAAAATACGCACATCTCTTGACAGAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACCTATGAACAATAACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTG:1 + chrX 20342324 5' + INE-1 578 1 72.17 CACAATCCAACAGTCCGGTTTGGTCCGTCATCTGTCGTTCACGCTTGTGGCCAGCAAATTTGTCAAGAAAAATAAAAAAAATAAAAAG:1 - chr2R 18937412 5' + Doc2-element 222 1 72.73 GTTATTTCAGGTTATTTTATATAAATAATTTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTGGCTGCGGCGG:1 - chr3L 27866067 5' - Max-element 8508 2 60.49 TTATAAAATATTTTAATTTCCTTAATTCACACGTAAAATAATCTTTTTATACCCGTTACTCGTATAGTAAAATGGTATACTAAATTCGATTTCGACCATACAAAGTATATATATTCTTGATCGGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:1 - chrX 14766996 5' + INE-1 98 1 60.27 GATGTTATTGCCTGGGTAAGTATTCTCTAATTTTGACACTGCTGACGGCTTTTGGCTGCCGACTACCAATTAAAAAATATTTAGACGAATTATTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCC:1 + chr3R 23010850 5' + G4 3552 1 57.53 GTGCAAGTAAGTGGGCGGAAAGGAGGGATCGAGAGGTAGCTGGGTGTGAACGAGAGGGAGGAAACGATAAACGAAAGTTCAAACTGACATTGGGACTAAGTCGAGTCGAGTTGAGTTCGCCGACTATCAGATATCAGTTACTCAGC:1 + chr2R 19045991 5' - INE-1 546 1 47.26 GATTTATGGATTTAAAACTGAATACTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 11062837 5' - roo 9015 2 52.74 AGGGAACAATTCCAGTTTTTTTGTCAAATTTATGTTTGGCCCTTCGTAATCAAGTTTGTTTTTTATTGTTTTCCTATTGTCTTGGCGAACCCTTGCCTTTTGAGTCGTCTCAGAGGGTTAGCGGGGATGAGACGTCTTGCAAGAAG:1 - chr3R 7475889 5' - Helena 1282 1 91.78 AGAGGAAGCAAGAAGTAACGAAACGAGAAACTAGCAACAAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACA:1 - chr3L 5798325 5' + mdg3 392 1 69.84 ACTCGAACGTCATAAGAAGTTTCACAATTTCCATCGCGCACTCCGAGGGGATATTGTTGACATGTGCTTATGATGCTATTATTGTTACCGCAACTGTAATAAAGAGAGTTTCTTGACAGTCTTGCGTGTAAACTTGGAATTTGTTG:1 - chr2R 12095956 5' + S-element 1534 1 57.53 TCTATTGGTTTTATTTTTATTAGTTCAATGGGTGTGTACAATGGTGTTAGATTTATTTCGGAATTCAGCTGGTTTTCGTTTAACGTTATTTTTCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 2283717 5' - roo 9045 1 67.81 ATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAA:1 - chr3L 20187403 5' - FB 456 1 63.01 AACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGGCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTCCATTTTGGT:1 + chr3L 19274786 5' - transib2 2766 1 54.11 TTGTACAATTTTTTATACATTCCTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAATAATATATAATCTATTGATTTGTTTGTAATTTTCATCTAAACCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:3 + chr3L 26505838 5' + copia 30 2 65.07 ATCGCAAATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAA:1 + chr3L 11844684 5' - rover 317 2 63.01 CAGACCATAATCAGTGTTCCATTGAACGCACAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTTAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTC:2 + chr3R 19383072 5' + I-element 5144 1 78.77 CCCTGAAAATACGTACTTCCTAGAATTTATTCCATTTGCCGCTGAGCAACAGAATCACTGACCAACCTCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAA:1 - chr3L 17617479 5' + I-element 253 1 53.42 TGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAA:1 + chr3R 9038924 5' + Juan 4067 1 56.16 ATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACG:1 - chr3R 10736110 5' + McClintock 80 2 76.71 ATAATTTCCGGCTGTTTAATTTATCGACTTTTTAAATTATTTGCTAAAGGTCAAATCTACCGAATTATTATAATATTTTGATTAAATATTTAGTTGAACATTTCTTATCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAA:1 + chr2L 18630263 5' + accord 7068 2 73.29 AGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGCATTCT:1 + chr3R 16341980 5' - P-element 2817 1 18.75 AATTAAAAGAAATCAATAAACAATTTCAGGTTACGCAAGTCATATTTATTTTTATTTTCTTGAACATTAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACA:1 - chr2R 16607453 5' + Tirant 8474 2 52.94 GTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 9002914 5' - roo 9008 2 59.59 GAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGAACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTA:1 + chr2L 4123858 5' - transib2 2576 1 50.00 ATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 27986340 5' - roo 9016 2 55.48 TTTGCCTAGCACTTCATTATGTTTCGATGGCTGTTAAACAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGAACTG:1 + chrX 11468082 5' + BS 4670 1 80.80 CATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr2R 22034616 5' - copia 228 1 66.44 TGCATAAACCATCTCCGATTGCCCGAAACATGAGGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATC:1 + chr2R 15009737 5' + BS 5066 1 66.44 CTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAAACTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2L 15076082 5' - 1360 3352 1 60.27 TCATACTTCTTCGCACAGCATTAAAATGAATAACAAAAGAGCGGCAGGAAATTTACATTTTCGGCCATCAAAACCAGCGCACTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAAACATTTTTGGCTGCTCAGGGTTTATAACCA:1 - chr2R 19113783 5' - Cr1a 478 1 53.42 ACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATA:1 - chr2R 20010659 5' + Juan 4182 1 71.23 AAAGCCGCTGACACTTGACAAACTTGCGCGAGTGTCAAAAAAAAAATCTCCGCGAAATGGTCGCCAGTTGAGGCAAAGGGCATGATTCCAAAGGAAAGAGAAAAAAAAAAAGAAATGCAAAAG:1 + chr2L 10114355 5' + gypsy2 407 1 77.24 CTAGCGNCTTTGGCATATGTACATACATATGTAGATAAAGATATAAGGTGACGGACCTTCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr3L 21769121 5' - I-element 5304 1 52.74 AACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:3 - chr2R 8735700 5' + mdg1 7073 2 60.27 AGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr3L 17940197 5' - 1360 3330 1 60.27 ACAGGGAGTTGGCTTAGACCTGGACACTTGACCCGCTCAAATCCGTATTCTACGAGCAGGCACAACAAGATTTAGAGAAAAAGACCTGGGGAGAAATCAGATCAAGATTGGGCTGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAA:1 + chr2L 4754828 5' + Stalker4 10 4 58.90 TGCTAGATGGAAATCAAATGGAGGAGGACGACAACTCCAGCGATGTACCCAGGCCAGCCGATGCAGTTGTCAAATAGAATAGAATAGAAGAGTATGTCACTCCGCCCCACTCTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTG:1 + chr3R 14660759 5' + copia 128 2 69.86 ATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAC:1 + chrX 10319616 5' + mdg1 71 2 67.12 TATTAAGCATTGATAGGCGACATTTACACACAGAAATGAGAGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chrX 6475316 5' + Doc 89 1 69.86 AAACAGCTGTCTGGGTCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTGGTAAGAAACT:1 - chr2L 19924072 5' - roo 9042 1 56.85 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCACATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCCG:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5371 2 65.00 ATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCC:1 - chr3R 27083122 5' + jockey 4594 1 60.96 AACAAAGAACAAATAGACCCTAGATAAGTTTTTGGAGATATTCTTTTTGATTTGGAGATACAAAATTTTAAATAATGTTATTACATAACAGGCTGCAAACGGTTAATAGTACCCCATTCCATGGGCTGACAGCAACGCTTCTACTT:1 - chr3L 7822450 5' - Chouto 5967 1 62.33 AATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:3 + chr3L 2989917 5' - roo 9029 1 55.48 TTTTAATAATGTTAACCTAATTAAGTGATTAATATGCAAAATGTGCGCAGAGATTAAAACGATGAGCGCACTGTGTTTAATTATCGAATTAATTTGCTACCGGCGTGGTCGCTATATACATAGTGTAGTATATACGAACATAATAA:1 - chr2R 19650881 5' + mdg1 2 2 65.07 CCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chrX 19266850 5' - roo 8990 2 72.60 AAGTAGTTTCCCGCAGATAATGCAATTGTTGTGTGTATTTGCGTATTCCGCACCGCCGGCTGGAAAACGCCAAACGGTTAGCAGTATCCCACGCCTCGAATCGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATTAAGCCTTTCCAT:1 + chr3R 12259569 5' - jockey 4655 1 69.66 CATTATGTTCAGCAGAAGAATATTCTGGTACGGTTGCGGACAAGCCGAACCTCAAAAGCCGAATTTTGGAATATATTTATTTTATTTTTCGCACGGGTTCTACGGCCACAACTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTACCGTGT:1 + chr2R 5269445 5' - Cr1a 4407 1 53.79 ACGCGTAGTTACAATATGCATACATTCATATATGTATATACTGGGTATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAATATGTGGATAAGTGCGTACTATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 18549975 5' - roo 396 1 80.56 ATTTCCATCAAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr2L 11357939 5' - blood 360 2 66.95 GAACAGGTTAACTGACACGATCCGCGTTTGTTATAAGGTTAGTTATACCGTTGGTTAGCACTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAGTTCGACTGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCG:1 + chrX 22093353 5' - rover 205 2 75.20 ATTATTTTCTTCAAAACTTCACACTGCAATGTATTGTAATGATGAACTGCCGTTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chr2L 12250921 5' - 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chrX 14450523 5' + hopper 34 1 62.33 TAGCATTAAAATAGTTTTTATGCTAAATATAATTCTATATACTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCTCATGCATTGTGAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGAAGTTCATAGACTTTAAATCTA:1 + chr2L 22255077 5' + 1360 237 1 71.92 AAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 19924032 5' - roo 9043 1 52.38 AAATGACCTGTGGCCCAGAGGACTGGACTGAATTATGGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCCCAAATAGTTTGCAC:1 - chr2R 10161865 5' - transib2 2743 1 72.60 AAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr2L 9636062 5' - 412 7499 2 50.00 AAACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGC:1 - chr3R 12115348 5' - 1360 3313 1 67.81 AATGCTATTCGCCAGATTTTAGCACTTTCAAATACTAAATGTATCGAACGTTTCGGCGAAAGGACCAAACCGATCTGACCCTGTCCGTTTGTCGGTCCGTCCGTATTAACGTCGATATCTCAGGAACT:1 - 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hopper 488 1 67.12 ATACGAAAACACCTTGGAAGACTTTCTATATTGGGAGCTGTTGAAGGTGCCCATGCAGATTCGTGTGACCCATTTGATTGTTATTGTTATTGTTATTGAGGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTGTTATT:1 + chr3L 16281991 5' - mdg1 19 3 73.53 CGGCTCCTCTTTCTCCAACCAATTTTCCCCCGGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGGTT:1 - chr3R 28469280 5' - 412 477 2 57.50 AGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTG:1 + chr2R 12185291 5' - accord 7348 2 58.22 AATGTATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 13158629 5' - roo 9028 1 53.24 GTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTAACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:2 + chr2L 15940200 5' + pogo 50 1 56.85 ACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - 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hopper 1396 1 69.86 ATTCTTATCGCTCATTCTGTTTGACTTTTCCTTGCCCTCGCTTACATCTTATTTTCGCTAGATTTTCCGCTGGCAAGGAGTGGAAATGCGTGGAGCGTACATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTAT:1 - chrX 8028234 5' - Juan 4157 1 73.97 GATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr3L 8959717 5' + 1360 36 1 58.90 CGCGGAAAAGCGATGGGGTTTTTCGGGGGGACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCCAAAAGATATTTTTATTTTATATTTATTCATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chr3R 15054362 5' - copia 246 1 73.97 ATAACACTCATTTCGGGCTCTTTGACTAGGAAATGCTGATCAAAGAAACATTGAAAATTTAAATATCTAGATAAATTATTCTGCCTTTTTGATCTTATATTTTTATTTCTTTTCTTTTTTTTTAGCTTTAAAACTAAAAAACTTTA:1 + chr3L 6837583 5' + 1360 3026 1 50.00 ATAAATTGGACTTTGGAGCCAGTGGGGCGATTCGGCTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACA:1 - chr3L 18997250 5' + Ivk 5055 1 75.34 GATACATTTTTGGGACATTATCCTCTATATCGACTGACTTGCTGATCACAAAGATATTATTAGGTAAATATTATTATATTATAATATTTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCC:1 + chr2L 5776696 5' - mdg1 7030 1 54.79 CAGACAGAAAGCCAGCCAGCGAGAGGCTCGACACCGTTATTTGTTTTTCCTTTTTGAACATTATTACTGCTGCTTCCGTCCAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTGATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGCTTGTTAAATTATT:1 + chr2L 12473972 5' - invader2 408 1 77.40 CATTCTTAAGATGTGATGTCTTTGTCGTTTTATGGCACTTCGAGGGAAATGCTCTTCAGCGACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2R 4362744 5' + F-element 23 1 67.38 GGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACG:1 - chrX 15200942 5' - 17.6 7363 2 60.27 ACCGGTTCTAAGTTCGTGTATTCAATTATTTGTAGTTTTCAATAAATGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCA:1 - chr2L 6654736 5' - diver 151 2 66.44 CAGACGCTTCGATCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr3R 16341908 5' - P-element 2855 1 63.70 GAGTTATCTGCAAAAGATTGGCGAATTTAGTTAGATTAGGACAGGTCTTTCAAATTATGGGTGAGGATGTAAGGTTATTATGGTTTTTCGTTGGTAGTGAAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCG:1 - 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mdg1 7082 2 73.29 GATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 - chr3L 19274889 5' - transib2 2783 1 56.00 AAATTACCCAGTGAATTGCCGAAAAGAAAATTAACTCCCAACTCTTGCGCCCACCCTCGCCCCAATAAATGGTTATAATCTACGTACTGTTTAAATTTAAAAACTCTACCTAAATCCCAATTCATTACCA:2 + chr2L 6812863 5' + I-element 4985 1 78.46 TATGTAGCAATGTAAATCTTGAACCTAAGAACAAATCAAAATACTTTTAGAGTAAAAGGGTATATTAGATTCCTTGTTAAGTATATAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACAATGTAAAGTATATTCTCGATCAGGATCAATGGC:1 - chrX 6691716 5' + INE-1 86 1 73.29 CATTAAGAATATTTACTTTGAAGAATAGGTTTGCATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTGTGCCCTAATTTTTTATTTTATGTAGTTTTTAATATTCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTAT:1 - chr2R 5555336 5' + Cr1a 98 1 76.71 GAGAGAATGTGCAAAAGGGAATAGTACATACATATACACAAAAAAAGAAAACGATTGATTCTTTGGTAGTCCGTAACAAGTGATAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr4 303844 5' - pogo 2069 1 64.38 TCTCGGTTCAGTTCTGTTATTTATTCTTCGGGCCTTTTTTTTTGTATTTTTATTAATCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAGAAAATGATAAAATTTCGTGTTCTCACATCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGAG:1 - 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chr3R 30347451 5' - P-element 2859 1 62.76 TTTAATGATATTAGGCATAGAACCATTACAATTAAAAAGCTCTGTTATTTATTACTTTAATCGCTTGTCTCTTAAAATTCGATTCAACAAAAGCAATTGGTGGCATTTTGCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr3L 258043 5' - hobo 2906 1 74.66 CCCACCCTTTTGAAAAATGTTTTGATATTTTATTTATTTGTTTAAAATTTTTTAATAGGATTGTATATTTCTATAGATTTGCCAAAAAAACTTCATTCCACGCTCATTCTTACGCTCTAAGACCGCCCAAAAC:1 + chrY 692412 5' + INE-1 345 1 40.60 ATTGTGAGTTTCGAGCCAATGAGAAACGATTATTACAGCGATTTGAGGGGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 - chr2L 9038296 5' + I-element 44 1 55.17 AGCAGTCTGCAGCTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2 + chrX 8308396 5' + roo 8724 2 59.59 ATACTAACATCTCCTAGATTTCAAACATTACATGGCGACCGTGACAGTGTTCCCGTGTGCATGAAGTTAACGATTACATATGTATATGTCGGCTCGAAAAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGA:1 - chr3R 1330079 5' + invader4 2879 2 71.32 ACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 20898606 5' - roo 333 2 72.86 ATCGCTGCAGTTAGGGGCCCTAAATTTCTTCCCATTCCCAGAAAAAGACACAAATGTAATCTTAACATAGAGGGGATTGTAATCCATGGATGGGGTACTCGCAATATTATATAATATATTTGACGAAAAATGTATGTACATACAAA:1 - chr3R 28096614 5' - transib4 2464 1 76.71 AAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 - chr2L 16946135 5' - hopper 1358 1 54.11 ATTGGCAACGGGACGAGCTAATATGACTGGCCAGAAGAAGATGCTGCCTGGGAACCGGTTGGAACTGGTTTGGCGCTGGCCCCTCTTAATCAATACGGTAACTACTTGATTAATAATAAAGACAATAAAAGAAAAATCTATAAGGA:1 - chr3L 22191504 5' + Transpac 4769 1 59.59 TAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCTGGCA:1 - chr2R 6482508 5' + gypsy 7073 2 72.60 CTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGACTTAGACCGCCCTTTTTCTCATTATATTCTCCAATATCTATCGGTATGCCAGAAAAATGAATTTCGCGTTCTCACTTCCACCAGCTGCGTAACGGGTATCT:1 - chr2R 1751257 5' + INE-1 542 1 64.38 GAAGAGTGAAGTAACCATTATTTAGCATCTTTTATTATCTTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCC:1 - chrX 14924034 5' - invader2 4664 1 73.29 AAATACGCTTTAAAAAGTCTTAAAAATATATAGTACAATTACATGAAAATACAAACTTTAGAAATGAAGATTTAAAGACCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTT:1 - chr3R 23637549 5' + pogo 1819 1 58.22 ACTTTAGGTACGGAGACGAAAGCGAACAGGTGGCCGAGGAGCAGCTGCCCAACAATGATATTTTATCTCCCCTGGTACGTGACGAACAAGGCAATCGAATGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGG:1 + chrX 21389155 5' + G5 4519 1 50.39 ATTTTGGACTTTTGAAACATCGGTTAGCATTCAGCCTTTAGTGCGCTAGTGCGCACTACCAAAGACACTATAATAACTATCACTGAATGCGTAGAAA:1 - chrX 6757512 5' - 1360 146 1 71.13 ATCTTTTCACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr2R 7244812 5' + diver 51 2 55.88 TTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 14980423 5' + roo 46 2 53.79 TTATGTGTGCAATAATGTACGTTATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 17736892 5' + opus 140 4 73.08 ACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATAGTTTAAATACTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCA:3 + chrX 22564591 5' + Transib5 99 1 69.18 AATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - chr3R 21276639 5' - BS 5048 1 47.95 AAAACAGACGAAGAGCAGCCGACAGGCTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCG:1 - chr3L 15336577 5' - P-element 2837 1 32.38 CTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chrX 9410532 5' - I-element 5279 1 77.52 AATCTGAGTTGCAAACAAAAAAAATAAATATTAAAATATTATATAAAAATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAAT:1 + chr3L 23694821 5' - Quasimodo 7307 2 72.41 TGCTCAAAATGAAATTGCAGAAAAATACTTACTAAGACGACCCGCAGTGGGGATAAACAAAGAGAAAGCGGGGAAAAAACCATTTAATTAGCATATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr3L 12164461 5' - I-element 5316 1 66.44 AAGAAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr2R 1193105 5' + GATE 8269 2 66.44 GTAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2R 13766210 5' - 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chr3R 23491955 5' + transib2 64 1 59.59 GTGAGAGCGAAAAAACCGAAAAAGCATTTCGTCGTTTTTAGCTGGCACGAACAGATCAATGACCTGCACACACAAACACACTTACACACACACACACACACATGTCAGAAACACACACACACACACA:1 + chr3L 18083986 5' + accord 7026 2 51.18 CTTTTCCTGTCTCGAAGCAATTAAAGTTTGTTCTTTGGGCTATCAAACTGATTGCATAACTATTGCTACCCAGTTCTAAGGTCACCGTCTAGACGGCAGTTCGGGGCGATTGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCC:1 - chr2R 20801667 5' + mdg3 447 1 71.83 AGCTAACAAATTTATTCCATTTACCATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chrX 8092529 5' + pogo 3 1 79.84 ATTGGTAACACAGTCGTTTGCACACACAAAGATACACAGATACATAGATACACTTTGGCACTTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGGCACCACATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGC:1 - chrX 8864595 5' + Rt1a 4905 1 54.74 ATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATC:1 + chrX 18817305 5' - transib2 2735 1 77.40 AGTCTCCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTCTAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTG:1 - 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chr3R 14856861 5' + hobo 2475 1 50.00 CTAGAGAGCGGGCAGAGAGTGTGAGTGCGGTGGGGCTCGAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr2R 22514178 5' - P-element 2833 1 34.75 GTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 - chrX 19038450 5' + hopper 61 1 68.50 AATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTT:1 - chrX 22689441 5' - 1360 3364 1 52.48 GCTCGATTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTATCTTGTATGTCGTACATTTGTTGCCGCCGATAAGTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCTCAAACAATTTTATTTTATAGCCGACCGTGAATTTTGTTTGTTAATAACTC:1 - chr2L 14422280 5' - HMS-Beagle 388 1 63.45 TTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAA:1 + chr3L 27356077 5' - Tc3 1640 1 64.38 CTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 15790867 5' + roo 8748 2 76.55 AATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCAC:1 + chr3R 19449912 5' + roo 8650 1 73.81 GTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chrX 10537813 5' + I-element 14 1 72.86 CTTTCATAGGCCCGTTATTCAACGTTCAGTTAGTTCACAGTGTGTCCTCTTTTGTCTAGCCGAACTCGACTTCGTCGTATTGATATGCCAACCCAACGATAATAATTAGGGCCACACAAACTCATATCAGTTGCAATAGTGACTGT:1 + chr3L 26834693 5' + Fw2 3858 1 57.53 GCTAGATGTTACCCTTTACGCTTTCAAATATCAATTGTACCCTACAAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTC:1 + chr3R 1441050 5' + 297 6739 2 68.49 TAGAAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTT:1 + chr3L 20189558 5' - FB 249 1 48.95 TAACAATTACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGC:1 + chr3R 4805609 5' - 1360 3324 1 61.64 GTTTACACTGTTGAAAATAATAATCAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2R 14653109 5' + 297 2 2 62.33 CAGGTGGATTTTCGGAGACTAAAACATTCAGTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr3R 5769038 5' - roo 8983 2 77.93 TATAAAGTGAGATAGCTTGAGGAAAGATATAGATGGGGTCTTCAGGGAGATCAAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAG:1 + chrX 6116249 5' + transib2 65 1 63.01 ATGGGGTTATATAACTCGTTATATAGCACATATGTGCTCCATCTACATATGTACTTGCTTTTCAGCAAACTGGGTGTTGGCGTGGCCCAGAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGTGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr2L 16274904 5' + FB 28 1 66.21 AGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGGTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 - chr2L 23295896 5' + micropia 129 4 53.10 ATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7795609 5' - roo 349 2 60.71 ATAGATCTTCCTTAAATTGTAAGCGATTTTAGTCTTCTACTGCGTCATTAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:2 - chr3L 18931064 5' + I-element 54 1 52.74 AGGGGGGGTAGTACGGGTACGACTATGACTACGGTTAAGAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGACAGGTGCGCAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr3R 9594984 5' - Tirant 8476 2 61.65 AAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATT:1 - chr3L 11257426 5' - 1360 13 1 51.37 ATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTA:1 - chr3R 9238191 5' - P-element 54 1 20.16 ATTTTATTTGTATTTTCTTTTTTTTTTCAATGTTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGC:1 + chrX 14771618 5' + hopper 103 1 77.78 CTATATAAAGTATATATATTCTTGATTAGGAACAATAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACATGAAAAT:1 + chr2L 17268903 5' + G4 3620 1 60.96 GATGGGTTCACGGACAGGCCTAGAATGGTTGGATGCTAGATTGGATGCTGGGAGTCTTAGGGGTGCATAAATAGATTACAGAAATACATATTTATAAAATTATTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATT:2 + chr4 715803 5' - I-element 183 1 73.29 CGACAAAATTATCGGACTACGCGCAAAGATTTAGAAATATGAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 + chr2R 21160675 5' - Transpac 234 2 73.97 AGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCA:1 - chrX 22906780 5' - Transib-N1_DM 28 1 69.86 ATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:1 - chr2L 17005847 5' + Stalker2 19 2 71.23 GACTAAACTACCTTCACACATTAACTAAAGTAATTGAGAACGATAGAAGCAAGGCCACAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACA:2 + chr3R 29486534 5' + I-element 5201 1 60.96 TGTTTAATAAATAAATATAAAGTTTAACAAATATTAAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr2L 7581042 5' - Transpac 5196 2 59.59 AAATTGGCCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGT:1 - chr2R 19941627 5' + hopper 67 1 61.11 GGAAATTTTATTTTTTAAATTACAGTAGTTATAATAATTCCCTTTGTATTTTGTCGTTTTGTTGCAATAGTAAAGTACGGAAATATAAGCGCAAATAGTAATTTGGTTACTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATG:1 + chrX 10212633 5' - 1360 3230 1 72.60 CGGTCACACTGAATTACTATTGGCCAGCCTTGTTGTTGTTGTTTTTCGTGTTCGTAAACTAAGAGGTCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3L 6964830 5' + P-element 27 1 54.62 AAGGATCTTTGATTTGATAGTAGAGTAACTTCTACTCGTCACTCCAAGAGTAAAAGAGATTCGGTGAAAAGTATGTAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCCTATATAAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 + chr4 191424 5' + INE-1 83 1 59.85 GTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAG:1 + chr3R 15790840 5' + roo 58 2 55.48 CCACCATGGCAGGGGCGAACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGATGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTATATTTTTTTGTAAATATATCGTCCTCTAGCAAGTATTTTCT:1 - chr2R 12472122 5' + transib2 60 1 52.74 CCCTGTTGCATGCAAAACTCAAATTAAAAGGCAAATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 + chr2L 6647656 5' - mdg3 5412 2 71.23 ATTATCCTGTTGAGAGTTCTCAGCCTTCAAGGGTTTGCTCGAGATTAACGTTTGAGTTTCATTTGGTACTTCACAACTTCAATTTTGTTTTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCG:2 - chr2R 9052556 5' - Tirant 484 1 66.44 AGAAAATGTGGATGTTTGACTTTTAAAAACTTTGCTTTTAATTTTATCTTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAA:1 + chrX 9577738 5' - HeT-A 5994 1 65.75 CTTCGCCTTTTAGCTTGCTATTCAAGTGCAGCAAGAAGATACATTTGACATCTCAATTAATTATTACAGTAAAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:2 - chr2R 7304122 5' + pogo 59 1 59.59 ATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAATG:1 + chr2R 24427514 5' + jockey 4685 1 76.03 CATAGCCTAGACTTACAGAAGCCCCCGGGTAGAGAGCGCGGATCTGGCACGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTG:1 - chr3R 31613869 5' - TART-B 152 2 54.02 TTACATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 - chr3L 20711682 5' + jockey 4837 1 69.86 ATATGGAATTTGTTCAAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAAT:1 + chrX 19074722 5' + mdg1 7056 2 69.18 GTTCCCCTTTAGTTTCCCATCCCCGGAGAACCACTCATGCATCCGAGCATCCAGCTCGAGCATCCCTTATAGGGGATGCCTTACTTGTTCCTGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGAGTACCTTAAACA:1 + chr3R 22718042 5' + I-element 4879 1 64.58 ATTTATGTGTGGACTTTCATTTCTCATTTCTATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 11189979 5' - roo 9005 2 83.87 TTTTTATTTTTTTTTTATAAAACACTCGAGTGTGTTGTTGTTGCTGATATTTCAGAACTTGTTTTTGGCCTAGAGTTTTGTGTTAACGGGCTCGAACTGATTTGTTTATTGTGTGCGTCTTTTTCTAACAATTTGTACATTTAGCA:2 + chr3L 16093947 5' - hopper2 1278 2 44.52 ATAAGACTTCCCATCGAGTTCCCCGATACTTCCCCATTACTCTATTTGTTTGTGTTCAGGGCCATTGTAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr3R 4964083 5' - roo 357 2 54.11 GTAAACTTAACCGCCTGTCCATGAAGATTCGTCTGCGTTTGGAACTGTTCTTGGCAACGACGGAGAGCAAGAGTTCGCTCTCTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGTTTCCGTTGTTTTTGATTGAAGAGAGCCGACGC:1 - chrX 12033432 5' - Doc4-element 42 1 52.05 AAAGGGAAAGAGATGGGTGTAAGGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 4341227 5' - roo 394 1 73.48 ATTTGACGAGTGTGTTAGAGGTTCATTATCATGGGAATTTCAAGACATGCTGGCTTCAAATTCCAACTTCCATCGCCTCAAATTTTTCGCTGATTGTATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACG:1 + chr3R 25723887 5' - 17.6 61 1 69.86 AGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAGTTTTTGAAATTTGAAAGTTGGAAT:1 + chr3R 17673721 5' + FB 35 1 61.81 GAAGTGAATAGAATCGGTAAATGATCAGATAAAAGACCGCAAAGTTTAGGTTATGTGCGAGCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACCAAAC:1 + chr2R 12880436 5' + Burdock 6135 1 58.22 TATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGGTTTTT:1 + chr2L 4123823 5' + transib2 4 1 78.63 ATTATTCCGAAAGACCTTCCGGAATACCTCCACTTACGCTACAGCGAACAACTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAGCTGTATGTGTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAG:1 + chr2R 4615461 5' + 1360 215 1 71.23 CAATGCCCTAAATATAGTCTATATTAACATAAATTCATTTTACTTAAATACGACCCATTAATATATATCGTTCTGATATTATTATTTTGTTAATATTCGTCTTGCCAGAGATAATTTATATTTAATTTATATTTATTTTTTTATA:1 + chr3L 12731663 5' + S2 100 1 71.72 TTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGC:1 + chr3R 9557540 5' + G2 3053 1 69.18 TTGAATCGTAGTGAAGGTAACCCCATAACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 - chr3R 7317668 5' - I-element 5294 1 58.90 GAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATAAATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTT:1 + chr3L 20189569 5' - FB 249 1 41.67 CTCAGTAACCTGATATATTTTGAGGGACGAAGACGAGGCTCTTTTTTTTCGCACGGGTTCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTG:1 + chr2R 5427739 5' - Cr1a 4408 1 66.35 CGATATCTAATGCCTGTGCAACTTTGTCTACGCTCTCTCTGCTGTCGAACAGGGTGTCCAAAGCAAAGCAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATG:1 - chr2L 11801229 5' + I-element 168 1 53.42 ATTCACTGCCAAGTGAATATCTGTGAACTGATCTGCATAGATAGATAATAGATCTGCACAATTGGAATTAAGAAGCCAAAAAAATAATTGTATATATTATGATATATATATATATATAATTAAATGCTTGCAATATTTATAAGTGA:2 + chr3R 3854735 5' - Idefix 7383 2 33.56 ACACAGAAAACCAAAGTGTTCCCTCTGTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGGGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr3R 25709749 5' - hopper2 1567 2 57.53 AAAAACATTTAGAGATACATATGTTAACTTACGTGTTTGGTATAGGCTTGCCTATCAGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAG:1 - chr2R 15005177 5' + BS 4992 1 71.92 TGTTGTAAAACAAAAGCAAATTAACACAATATCACTTGTTCGTTGTAATCTTAAAACTTAAAGATCCGCTTTATCTCAACTTTATGATTCTGAGTCATTTGTTGAGACCCGTCCGGTCTTCTCAAGGACG:1 + chrX 13282457 5' - R1-2 422 1 72.31 AATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCAATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 20265920 5' - roo 9029 1 54.79 GTCCAATTAATTAACTTTTCGCTGGGACAACGGCAACAAGAACAACACGATCTTCGATCTGTGCAAAAAACAGAAATAGACTTTGTGGAAGAGTAAATACGCAAAATAAAATATTCAAAACAACAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTC:1 - chr3R 17095215 5' - INE-1 574 1 60.27 ATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 14980301 5' - roo 9018 2 55.48 TAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3R 19407870 5' + diver 5918 2 63.45 ATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGA:1 + chr3R 19449956 5' + roo 410 1 52.74 ACATACCTGCATCGTCTTATCCAGTATGAAATTACAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAA:1 + chr2L 7661692 5' + I-element 4986 1 76.03 AGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAG:1 + chr3R 19450004 5' - roo 8648 1 79.21 CATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 + chrX 4808524 5' - mdg3 172 2 65.75 TCGTTCCGGTGGGTGGCAATGTTACTCTTTTGAAAGCTGTGGCTTTTCGGGTTTGGGCTGTGTGGATATTTTTGTGGGAGTCTAACATGGATGTAAGATTGTTTATTAATATTGTTTATTACTAATTTAATTATTAGT:1 - chr3R 11937430 5' - flea 4988 2 60.14 ACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 + chr3R 28901202 5' - transib2 2781 1 55.48 CTAAACAGCTGTGACAGCTTCAGTAGAAATCCCGCAGAAGCCCTCGCATACCGTTCTTACATAACTCAAAACAAAAATCTTTAAGTACACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTC:1 + chr3R 14423120 5' - Chouto 37 1 65.19 CCAAGAGTGTTGTGTGTTGCCTAGTGGCAAATAAGTACCCATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 27160083 5' - 412 7468 2 73.61 AATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAAT:1 - chr2R 12253337 5' + BS 4687 1 52.78 AAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3L 2990011 5' + roo 86 2 78.77 AGGATCTTCAAGGATACGGGTATGATGATAGACATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGC:1 - chr2L 7618610 5' + X-element 4436 1 76.26 AATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGC:1 - chr3R 15790124 5' + flea 4731 1 68.49 ACTACAAAAATACAGCTTAGATTCAAGACTGTAAACCAAATAAATATCTTCCGTTCTGCTGTCTAAAGGCATATTCTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 71286 5' + 412 7095 2 55.63 CTAGAAATAAGATATAAATTGAAATTTTTTTTTGGAGTTTCAAGTAAGACTTAAAATTATAAATGATATCATAAAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 3030319 5' + roo 46 2 51.37 TAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAGTAATTGTTA:1 - chr2L 17766168 5' - Doc 126 1 59.21 ACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTT:1 - chr2L 21930243 5' - Copia1_DM 108 1 54.24 TACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAG:1 + chr3L 19454951 5' + mdg1 7125 2 74.66 ACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr3R 30946602 5' - Transpac 5157 2 67.12 AAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCAT:1 - chr3R 22590584 5' + rover 7002 2 62.14 ACAAACAATAAAACGTATAAAAATTAAAACCTTATTCAAAAGTGTGGCAACATGGGTCAACTTGGGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGAATGTATATGTATCTCAACCTTATAGCTTTAATAGTTCCTGAGCTCTCGACGTTCA:2 + chr2R 5299514 5' - INE-1 140 1 70.55 AAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTTAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTTTTCGAGTGC:1 - 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chr2L 17005841 5' + Stalker2 7273 2 67.12 ATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAA:1 + chr2L 4123824 5' + transib2 33 1 62.33 GCCCCCTTTTATGCTGGGCCCTACATTGACGCTGTTCTCGTTGCTACATTAAGTGTTTTTTGTTTGCAGTTTTCCGCCTGACAGATTTTCCTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTGT:1 + chr3L 7840240 5' - G2 3076 2 76.27 CGGTTAGGTAGTTGTTTTATACATACGTGTAGTGTACACATCAAAAATTAAACCTTAAACAACTCAATAAAAAATTTCATATTACACAGAAAACAAGAGAGAATGCAAAAGTCGAGTTCCCCGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1 + chr4 332244 5' - INE-1 539 1 71.23 AGCTATCTTAAAGCTAACAGCACTGAGCACCTATTAACCCCAAACCCTCTTTTCCACTTTGGCGCATTGTTGACTTTGCCGTCTTGGCCGCTGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTCTGTCA:1 + chr3R 25433254 5' + transib2 32 1 63.70 GTAAAGTAGATTAAGAAGCAATGGAGTAATAGCCACACATTCTCGTTAGAATTAAGCACAACATTGTCATTGTCATCCGATTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGG:1 + chr2R 6359046 5' + X-element 51 1 50.00 TCACTTCCTTAAATCAGTCTTATGAAACATTTTTTCGGACTTTGTTCGTTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTATTAATTGTAATGCATTTTTGCGTTCTTTATATTACTTTT:1 - 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chr3R 24219350 5' - roo 8991 2 71.92 GTTGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCGC:1 + chr2L 809630 5' + jockey 34 1 58.57 CTTCGCTTTTTTACCTCTTTTTAATTGGATAAAAATGGCTTCAACTTGCAGCGAAAGCCAATGGGGGACATACTGCATACTAAAACTTTTAAAATTGTAATAAAATATTTTAAATTAAACTTTTTAGATTAAACTTAGGTTTAG:1 - chr3R 6461291 5' + S-element 1476 1 80.56 CGGTGGGTTAAAATAGGAAGTTTTGTTTGCAGTGCGCACAGCAACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 16540895 5' + hobo 28 1 67.12 ATATACATATATATGTTTACCCGTATATGTAAATTCCAAATGTCTAAAAAAACGAATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTTTTACTGGCTTTTCAACTCACGCTCTCCACTATGTTTGGACTTTAAGGTGCTGTTATACAACACAGT:1 + chr3L 14911698 5' + Doc4-element 2564 1 69.18 GTATTTATTGTTACAAGCTGGGGAAAAATGCTGGGAGTCAGTGAAATGGTATAAAATATTTGCCTAACATGGCAGAATTCACCAGTTTTTTGTCATCAATTTCCATATAAAATAATTATGTCTTATTAATATTTGATTTTTTATAA:1 + chr2R 24267412 5' - Tc1-2 384 1 64.38 AAAACTTTCTGGCAATGATTAAGTAGCCACACGTGAAGCGAATTAAGTCGTGGGCGTAGTGGATCTCCTTAATACCTGATATTAAGTCAGTTCGTTTCTTAACTTAAATCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr2L 2726001 5' + Doc 53 1 52.74 ATTATATACGGTTTGCTTTATGTATAGGCACAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 - 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S-element 135 2 78.26 AAAATGTTCATAAATTCCTTAATAATTAAGGTTACTCGTGACACACTAGATTCGTTGAGTATCTATGTATGTAACAAACAAAAGGAAGCGTTTCGGACTATAAAAAGTACATATTTTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATA:1 + chrX 22784262 5' + INE-1 96 1 55.48 AATGGGGAGTGTTGTATATCCGCTTGTGTATCCAATAACCGCAGCGCAGCCCCCAAATGCTTTTGTTATTTATTATCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr2R 16817859 5' - 412 7537 2 70.91 TTAAAATAGCCAAACAAACACGCGTTTCATATTTTCTAGTGCACACACTCACACCCACATTCGGAACACACACACACACACACA:1 + chr3R 17898356 5' + accord 7028 2 64.29 GCAGCTTTTTAACGGGCTGTCCACGATGATTTTGAGATAAGCTAATGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:2 - chrX 6116335 5' - transib2 2752 1 67.12 ATGCAGGCGAAGCATAAATTTTCTAAGGTTTTAGTTTGTGGAAAATTAATTTTTTTTTGTTGTGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1 - chr2R 20856555 5' - jockey 4923 1 65.73 TTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAATT:1 + chr3L 8748916 5' - 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roo 9027 1 56.85 CATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAAATTTTTGAAAAT:1 - chr3R 8049023 5' + Q-element 135 2 60.96 ATTTGCATTTCCACAGGTTTCCGCGGGAGCAGCAAACGTTGCCCAACCACTTCTACTTCACGGAAGGGAGTGCTATTTAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 23614464 5' + TART-B 10631 2 68.09 TTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAA:1 + chr2L 2436616 5' + F-element 168 1 69.86 ACTACACTTAAAATACAACAAAATACAGCAAACAAAACAGATTTTGGCGAAAAATGGGATCGAGTCGAGTGCTGGAGAATCGGAATCGGAATCGAAATCGGAACCCCACCCACCAACAAACACAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 13665714 5' + G2 3076 1 70.55 ATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTC:1 + chrX 13383540 5' - R1A1-element 5111 1 63.70 GTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCA:1 - 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hobo 2597 1 55.48 TATGCCAAATGTTTAAAAATTGAATTATCTCCCATTACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAA:1 + chr2L 3675804 5' + Juan 4044 1 67.81 TTTATTGCAGCCGTTAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGGTACG:1 + chrX 21948962 5' - 412 7360 2 80.28 ATTACTTCAGCCGAGGCCATGTATCCCCGTTAATTGTTGGTTTTGAATACAATGTATAAATGCTTGAATCATTTAATAATTCTAGTTAAGAAATGATTTATTCGAATCTCAGTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAA:1 - chr3L 21763029 5' + Cr1a 4110 1 75.86 ATATTGTCGAATATGTTTTAATTTTATGTTTAAGTCCAATCATCTTTAAATAAAAAGATTTTCAATTGAAATGAACAAGAAATTAAATATTAAACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACA:1 + chr3L 14088195 5' + 412 209 2 56.85 GGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:3 + chrX 4341251 5' - roo 356 2 52.74 AAAATTATACTCACAAATGCAAAAGCTGTAATTGAATTGAATGCAATCAAATCATAAATAGTGTTCACACATTTACACGAATATATTTTAAGACT:1 - chr3L 2990033 5' + roo 8677 2 64.21 TAAGGGAATCATTTTTCAACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAAT:1 - chr2L 21930261 5' - Copia1_DM 105 1 49.64 CATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAACTCCTAA:1 - chr3R 4679583 5' + hopper 29 1 64.38 GAATAATCCAGTAATTAGTGGTGAATTTCAATTTGTTTACTTATTAATTATATTAGATAAACTAATATATACTTAATGCTAATTGCAATTAATTTATTGGAAAACATATGCGCAATATTTAAATTTTAAAATATATTGTAATTTTA:1 - chrX 12097953 5' - P-element 2601 1 58.90 AAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCAGAGTGGAGATTTTTGTTATTTGATCCAC:1 + chrX 15200859 5' - 17.6 90 2 53.97 TAACATTTTTTTTTTAGGGTTCTTTAAAACCAGCGCACTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGC:1 + chr3R 1708331 5' - Cr1a 497 1 72.29 CATATATTTATAACATCTTACATTATTTTATGAAGCTAAAAAACGGTTAATCACCCCGCGGAAGCTGGAACAATAATTTAATAGTAGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3L 21996131 5' + Transpac 4951 2 68.06 ATAATTTTGAGAAATCAAGTAGACTGGAGTTTCATTGTCTGCTGTACAACACTGGGTTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 - chr3L 13365871 5' - BS 5069 1 62.33 AGAAAGACTTATGTCGCCTAAGGAGTTTAATTTTAATGTCGTTTTGATTGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 - chr2L 22369283 5' + rover 6975 2 69.66 ATTCAACTAGAAGTATATAAATTGATCAGTAGCCGTGTTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGT:1 - chr3L 27859939 5' - INE-1 576 1 74.48 TGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 - chr3R 6625801 5' + flea 22 2 60.95 AAAACTTTCGCTAGCCAAGAAATTAAAGTGAAGTAGGGACTAGACTTCTGGACAATTTACGACCTCCCATGGGATCGCCAACCGTTTTGGTAACCATGTATATAGAAAGGGTGACTTGTTCGCGCATACAGGGTGTCTCGTTCCCA:1 - chr3R 22640804 5' - 3S18 5770 2 69.18 TAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTT:1 - chr2L 13556443 5' + transib2 57 1 57.34 AAGATCAAGAATCGCGCTTCCCATTCCAACATTATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATT:1 + chrX 22641687 5' - G6 1991 2 55.48 AAAAGAGTATCAACTATCAGATACCCCTTGCACTTCGCTTCAATTTTATAATTTCTTAATAAATCTCAAACTTATGAAATCAGTGATCGGAACAAAAAAGTTGATTTAAGAAACCAACTATATATTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGT:1 - chrX 20081285 5' - G2 3076 2 43.84 CCCTTCGCATTTGCAAAGATCACTAGCAAAAAACCAAAAAGGGCATTTTATTAAAATTCATGGATTTTTTTTATTAATATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAACGAG:1 + chr2R 2963699 5' - S2 1559 2 69.18 AACTAAAAAGAAACCATCGTCTTCGCGCAAAAGCTACTACTTTCAAAAGCAACCACGTCCCAAAACCACACCCCGTCGGTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATG:1 - chr2L 8391659 5' + Juan 263 1 58.96 AAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTT:1 + chr3L 17183691 5' + diver 5976 2 76.03 GCAGACAAGACACACAAATAAAGAAATCCAAAACAGTTACCTCTAAATATATAACCCCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAG:1 + chr3R 23911343 5' + 3S18 65 2 58.90 CAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3R 29612011 5' + jockey 72 1 58.22 CTATTCACAAATGCCTTGACCATGTCTAATTTCTCGTTCAGATGCGTGAGCAAAATAATCAGTGCTTACTCTGTTCTTGTCGAGAAACAATGCATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:4 + chr3R 7420168 5' - 1360 3363 1 66.44 ATTTGGCGAATATTCCGAACTTATCTTATTTCGACGCAAATAATAAATCGCACCTTATAGCAGAGACGACGTCGCTCGAGTTGCAGAATTGAGGACCAAGTCTGGAGTAATAATGCGGCCAGTGA:1 - chr2L 22738753 5' + diver2 4448 1 51.20 CTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 - chr2R 21410978 5' + Burdock 52 2 53.42 AGTCTTTTCCCCTGTTGATGGGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCAC:1 - chrX 6513428 5' + hobo 56 1 74.04 TGACTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chr2L 16943880 5' - copia 5083 2 68.53 GTGTAAATTTACATATAAATTAAATTATTCTACGTCCATTTGTTTTATATCATTAAGCTTAGGTGATGAAATTTCGCCTTCGCATTCACAAAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTTACTGGACTATAGCATTCTTTCTT:1 + chr3L 18743734 5' + INE-1 577 1 58.22 ATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3L 18403063 5' - P-element 2837 1 48.15 CTTCGATCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 16341914 5' - P-element 2850 1 60.00 AAGAGAAAAACATTTGTACGTGATGCGTACAAACACATGTTTACACTTTAAGCACTATCACTAAACCACTCAGTATTTGCGCTTATATTCCCGTACTATTGCACAGTGGTTCCCCTTGTATGGAGCAGCGGCCATAAATACTTCCA:1 - chr2L 73059 5' - Transib5 2957 1 56.85 TCCCTCGACCATATACCCACCATATAGCACGTGTACATTTCCATCGACACCAGGTGAAACCTTCAAACAAAAAACAGCCAAACACAAACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTG:1 - chr3L 13905229 5' - roo 7 2 58.90 AAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3R 30347459 5' - P-element 2866 1 65.07 TATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:2 + chr2L 6174055 5' - I-element 5292 1 59.59 AAATTGAGTTGTCTGTTGGGCCTTTATTTTGCCCAAGCGAATTCCTGTCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTCACTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACG:1 - chr2R 2093182 5' - Doc2-element 27 2 66.90 ATGCCCGTTGCGATATTCTTATTGTAAATTCTCGAATTGTCTGCTGATTAAATTTACTTATCATTTTGTCAGTTTCTTAATATAGAATTCATTCATTAAAAATAGGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCC:1 + chr2L 20786503 5' + Quasimodo 420 2 78.08 GTACCTACCACTATTTGCTGAGTGGTTTGGTAAGTGTTACTGCCCCCCCAAAAACCCAATAATTTTGCCGGTGAATCTTTTTTGACCAAGTTATGAAAAAAAACCCGTTTGTAAATATCCGATTTTTGCAAATTTTTATTTTGTTT:1 + chr3L 9266540 5' - HMS-Beagle2 390 1 57.53 GAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACC:1 + chr3L 12315752 5' + transib2 90 1 78.08 ACTTAATTCATATCTGAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATA:1 - chrX 3432004 5' - Ivk 5361 1 67.81 CAAATAAACAACAACACAGAAGGTGGGCTTAAAAGACGGAGGTGCACGTTATATAAGGAGTCCACCGAGCCATGGCCACAAATTAAAAACGGGGAAAAAAACAATATAATAACAGCAACAAAAAATTATTAAAAAACATAAAAAAA:1 - chrX 7568529 5' - hopper 155 1 58.90 AATGTATCATGATAAAAAAAAAACCTGGGTATATGGTATATGTTTAATAAGTTACGAAAGGCAGATCTTCACTTAATTTTCTAATGCCACTCAGCTCAAAACCCCCGTAGCCTTGCTGAGGAGCGAGACCTACCTAAAATCTCTAC:1 - chr2R 13087126 5' - R1A1-element 5108 1 75.34 ATCGATAACATCAAATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2R 22034597 5' - copia 248 1 80.00 TTAGCCAAAATTACTTAGAATATTTTCGTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 + chr3R 19992620 5' + hopper 23 1 63.64 GCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTGTTATTATTATTATTATGATTGATTGAATAGTTTTCAAAACTAGACTAACTTAGAAAGTATAGCATTAGCTTCGG:1 - chr3R 21630316 5' - I-element 5301 1 66.67 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTATTAAGGTATTAAAGGTTTTAATTGAATTTTTCCCAAACGAAGACCAAAAATTCCCTAGTTATGGGTCGCGGCAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAA:1 - chr3R 4571527 5' + Tc1 384 1 78.08 TAGCAGGAGCAAAAGGTTTACAATTTTCCCCTGAAAATATATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGA:1 + chrX 20456739 5' + hobo 2689 1 65.49 TTTGTTTTTCAGTTTCAGTTTTTTTTTAAATTCCAATTTGATATTTTAAAAAATTATTTTATTATATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCG:1 - chr3R 28799265 5' + 1360 3173 1 69.86 TTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3L 6518659 5' - 412 440 2 53.42 ATCAATAATCTGTACTATCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr2R 15326984 5' + copia 25 2 54.48 GGTTGTTGCTGCTGTTGTGGCACGGTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3L 19111625 5' + Doc 16 1 76.32 GATGTAAAGTAAAATTATACTCAGTTTCAAAAATCCTTTCAAGTCTTTGATTTTTTCCCATCAACCTTCAACTTTTTGCCTCCCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAA:1 + chrX 13141903 5' + Doc2-element 234 2 69.44 ACGGGTATTTGAGCGAAGAAAGTTCTACTAATTTGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTT:2 + chr2L 16972407 5' - copia 39 2 76.71 GGGTTTTGGGTTGGCTCATGCTTATTTCCTTTGTACTCTGGATTTTGGACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTATATAATAAAATAGCAATATACAAAGCGATAATAAAACCAATATGACCGTATGGAATAGAACTC:1 + chr3L 18397946 5' + Porto1 4268 1 65.75 ATTATGAAAAAAAAATTTTTTTCAAAAGGGGGGCGTGGCCGTTTTTGGCGGATGTGGGGTCATGCAGCCCCCAAAACTGGGCAGTAGACTAGTCTTTAACTTTTTAATATTGTAATCCGAAGGAGTCAG:1 + chr2R 15511113 5' + diver2 56 2 81.40 TGTAGGGTTTTCTCATTGGGCTTTTGTGGTTCGATTATATAGATAAATACTGCGTTTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATC:1 - chr3L 11844818 5' + rover 7011 2 64.38 CTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:2 + chr2R 22034648 5' - copia 5065 2 60.27 AATTTTACAAATATGTAAGAAAACTTTACCAATGAGGTTTGTGTACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGATACCGTTTTGTCC:1 - chr3R 30946646 5' - Transpac 282 2 66.44 ACTGCATTTGTCCACTTTGATTGTCATAATTGCATTTCTTTGTGTGCGTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 - chrX 19038493 5' + hopper 37 1 60.27 ATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATACTTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTCAAATTGAAACTTCTGTTAAGACACATTAATAT:1 + chr3R 6419865 5' - Tabor 7240 2 72.60 CAGAAGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 15790794 5' + roo 8674 2 68.75 AATAAGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCA:1 + chr3R 30813356 5' + FB 87 1 77.40 TGACTTACTGGAAAACTTATATGATCATAATTAATAATAAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTAATTATCCATTAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAAAATGTTAAAAAATATACAGACAGACGAAGAACACATGAAAA:1 + chr3R 20180740 5' + G4 3619 1 48.28 CAGAAGATATATATATATAAATATATATATATATATATTTTTGCGCGCTTTTGTGGCGGCGTTGTGGGCTGTGTTCGCTCTATCGTTTTTTTGTCTTTTGCCTTTTT:1 - chr3R 16454226 5' - Doc2-element 238 1 34.58 ACATAAACGTTTATGCCGAAAAATTCAAACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCG:1 + chr3L 13739215 5' + BS 5029 1 52.17 ATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTGAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2R 14653150 5' + 297 6624 2 54.11 GCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr2R 12133850 5' + jockey 27 1 61.61 CAATCTTTGAAGGAGGGCTTATAATTTCCAACATACATATTTGCAAAATAAAATTTGTTTTGTTCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCTCTTTTACTTAAGAGACTAGCAATAATTTTTGAAATCTTATTCTCAACTAACTTA:1 + chr2R 5345118 5' - Doc3-element 4652 1 69.18 ATAAGATATGCGAGAATATTAGAAAATCCACTACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAA:1 - chr3L 26324965 5' + 17.6 7115 2 70.48 AGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 + chr3R 31886838 5' + hopper 60 1 60.96 ACAATATATATTTATATATTTATATTTAATATG:1 + chr3R 14206712 5' - Stalker4 7039 4 84.85 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCTACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACT:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 7568 2 68.80 AGTCCTCCGGTTTGCATGCAGACGGACACAGCGAATGCGTCCGCACCAGGATCAGGAGAAACAACCCAAAAGAAGCGCTCGAACAGCTCATTCCAGAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAACTAG:1 + chrX 16304328 5' + Bica 4604 1 71.13 ATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAGAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 19449956 5' - roo 9015 2 57.14 AAAAAAGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:1 - chr3R 27765172 5' + mdg1 77 2 69.86 TGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCTTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGTATTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 19588129 5' - roo 336 2 62.33 AGAAAGAAAGCAACAACCAGAACAACATCCAAAGCAAGAGTCAAAACAACAACCAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTCAGGATATCAGTCATAAAATCATGT:1 - chrX 18607372 5' + Quasimodo 103 2 54.05 TTATATCTGCTGTTGTTTATGTGTGAAGCCATTTTGCAATTCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCT:1 - chr3L 18856919 5' - Bica 410 1 65.66 CGGTCATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 21933273 5' + pogo 30 1 68.49 CGTCCAGAGCTAAAAAAAAAAAGAAAAGAA:1 + chrX 3431128 5' + G-element 4325 1 90.00 CATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAG:1 - chr2R 8157248 5' + mdg1 7125 2 78.08 ATATTATTAACATTAAAAACTTGCACAGCGAAATGTGTAAAGCAAATTGTAACATTTTCTTTTTATTTACATTTCAAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACT:1 - chrX 2479633 5' + mdg3 5267 2 76.03 AATTAATAGCTGTGGCCAAAATCAAATGTTAACTTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chrX 1135433 5' - P-element 2862 1 68.49 CATGTCCATACTCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:1 - 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P-element 2866 1 70.55 TATAGATTCCGGTTATATTCGGCATCTATGTCACAAAGTAAGCGAAGTGGTAGGTAACATTTAATATCCCCGCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCG:1 + chr2R 4028522 5' - diver2 17 2 58.54 ACTCATCTCTACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAA:1 + chr3L 23456044 5' + Tc3 235 1 58.90 GAAGGTTATCTTAAATTATAGTTGAATTGAAAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 20167525 5' - roo 399 1 76.03 CATTAAATACTATCTTGATGATCTTCTAACGACCGCTGATGAATATAATTGTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATATAATTCAAGTTTTGCAAAAACT:1 + chr2L 15942592 5' - pogo 1800 1 60.00 TGTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 21224659 5' - roo 394 1 66.39 AACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3R 12115238 5' + 1360 14 1 68.00 ATCATTTTCTAAACTTACATGAGTATTTTAAAATTTGTAAGCCGTAACTCATGAAATCGAACCAAATAATAACAAGCCAAAAAAACCTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGAATGTTACAGAAAGTGAACATAAAACATTA:1 + chr2L 13282153 5' + I-element 459 1 56.16 TTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:1 - 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hopper 1388 1 65.75 ATATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCGTAATAACGTATTAGAACGCTAAGATGTTTGCTATATATTTATATATATATTCATCAGTGGCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 14310352 5' - roo 9047 1 52.05 GGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 15790800 5' + roo 8682 2 63.70 AAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chrX 10319705 5' - mdg1 7403 2 58.27 CACACGCACACACACCCGCGCCGCGGCTAAGAAGAAGAAGCTGCACTGCCTTGTGGGGCAGTAGAATCCAAAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCA:2 - chr2R 12016290 5' - R2-element 3503 1 59.42 CCTTTAAAAGCAAAGGTATCGAGTCCCATAAGCTCTATTTTACTCATCTGTCCTTTAAATTGCTGGGCACCACATGCCCACCCGGGTTAATTGATTATAATTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 + chr3R 6625657 5' - flea 4998 2 73.97 AGCAGTTCGGCGGTGAGCCAATAGAAAATTACAGCTAGGGCCTATACTATTTGGAACGATTCATGTGGATTATATGGTTTCTGTATGGTCATGATTCAAAAGACGATCTACTCATCCGATAAGCTCAAACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr3L 23091333 5' - Tc3 316 1 73.29 AAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAA:1 + chr2R 10161793 5' + transib2 69 1 64.83 AATTTGAGGGATTTATTTATGCGCCTAATTTGAGTGCTTACGGAGTTTTTGGTGG:1 - chr3R 5764735 5' - Stalker4 7074 4 56.36 AGCTTGGTTACCATGTAAGTCCGAAATCCCGCCAGGATATGATGTAAAGTCACTGTGAAATTGAGCGACAGAATTTAAAACTTTGCGCAAACACAAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTAT:1 - chr3R 31656307 5' - 1360 332 1 62.33 AATTAAAATGAATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3L 11326814 5' + pogo 21 1 67.12 CAAGCTTCGCCTTTTAGCTTGCTATTCAAGTGCAGCAAGAAGATACATTTGACATCTCAATTAATTATTACAGTAAAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chr2R 7304126 5' + pogo 54 1 56.55 ATCTATGTAACAACTCACTTTATACTACTACTACTACTACTACTACTGTATTAATAATTTATGCGTTATATATATAAAACACTACTACCTACTACTACTACCAAACTATACACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATT:2 + chr2R 13811069 5' - copia 4934 2 78.08 GTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTT:1 + chr3R 11040028 5' - Bari1 1672 1 57.53 ACCACTCGGATTATCTTCTGCCGTGAAGCTGAGCACTTCACGCAAATTAAGATGGAATTCCTTCATGAACCGAAATCTCCCGCCGGGATTCTGGGGCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCT:1 + chr2L 14889752 5' - Doc 4641 1 67.39 AAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTTT:1 + chrX 292433 5' - G3 4503 1 69.44 TAACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 18549808 5' + roo 8706 2 55.48 GTGCTTAAAGCTGATTATGTGAGTTTGCACAACAAATGCGGAAAACATACAAAGAAATCGAAAAAAAAAGTCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTT:1 - chr2L 3397685 5' - pogo 1644 1 52.05 AGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr3R 4805621 5' - 1360 3313 1 69.66 CTAATTGTTTAATTGATAACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTTCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 13294840 5' + roo 8682 2 70.34 GGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 24219348 5' - roo 325 2 73.29 TAAAGTTGTTAAAAAGTTAAATAATTTAATAAATAATAAATTAATAAATATACTTGTATAGAACACCTAAAATTAGATAATACAAAGTAGGACTAATAGGTCTTAACTAGATTAATAGATCTTAGATATTTATAAATTAATAAAAT:2 - chrX 16193535 5' + G7 1140 1 79.45 ACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:2 + chr3R 23639135 5' + pogo 55 1 55.48 AAACCCCTACCTATTTTCTACAAATATCTGAAGCAGGTAAATAGCTTTAAAGGTGGGTGGGGTACGTTGATCAAAAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTCTTCAAAGT:1 + chr2L 7400794 5' + hopper2 1219 1 48.63 ATCGCTGCGGGCATATTTCGTGGTTATTAAATTTATTAACTTTCCCTGCTCCGAGTGATGATGGATGATGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGC:1 + chr3R 5436286 5' - gypsy6 125 2 55.48 GAAAATTAATGGAAACACAAAGCAAATTGATGCTGAACTGCAAGTTTGCATTTCTTTAAATATAATTTCAACATTTTTACAGAGCTTAACTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 + chr3R 28904953 5' + mdg1 7070 2 63.70 TGTCCCCTGGTATATCCTTTCCGCTGTGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTCTCCCCGGCCAGCCCACTATGGGGGCTTTGGCCTGTTTTT:1 + chr2L 12984112 5' + hopper 5 2 68.69 GTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTAC:1 + chr2L 19817843 5' - G4 3760 1 72.60 TCATAGCTGCTGCTGAAATATTTCAGGTATTTTGCAAGTATATATATAAAGTATTTGTATATATTTTTGATCAATAGCCGAGTCGATCGGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAACTATAAAATC:1 - chrX 711823 5' + INE-1 149 1 68.09 AGCGAAAGCTCAGCAAGCGCCGTGTTTAAGAATCGGCTTAAACAATAACAAATTTCCAGGGCGATATCTTTCAACCTGCCTAAAAGTATGCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:3 - chrX 19074896 5' - mdg1 390 2 60.96 AGAAAATATCAAAAGTGTGGCGCCAACAGTTTCTGGCAATTTGTGTGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGTTTTATATGTAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTT:1 - chr3L 24934452 5' - HMS-Beagle2 305 2 78.62 TTTTTTTTTTGGCTGTTTCTTATCACTTTTAGGCTTGTTTGTCGTGGGGTGAGTAAACTGAGACCGTGAGCGGGGGCAGCCGATGACGAGGCAGGGCG:1 + chrX 18557130 5' - F-element 453 1 58.16 GTCTTGATTTCCTTTTTGATTTTAAGGCACTTTATCTCTTGCCTAAACTGGTATTCCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCCTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGT:1 - chr3R 19446842 5' - Circe 7119 1 61.64 ATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr2L 16690723 5' - P-element 2827 1 43.15 ACTGTAGCTGAGTTCATGAAGGAGTTCGGGACGAACACCCAGTCAGGAGGGCCGAATGTAGAAATCGGAACCAAGCGTTGGTTTCTGAAGTCGCTGAGAACGGAAGAGTTGAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTG:1 - chr3L 25484226 5' - Porto1 468 1 63.64 AATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTGGGTGACGGCCAAA:1 - chr3L 23287321 5' - 1360 3329 1 57.53 CTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 5532906 5' - roo 9033 1 56.85 GTATATTAAGGTAATTATAAGACAATATTAAATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3R 3920590 5' - roo 348 2 59.59 CTCAACTATTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr2R 12779761 5' + I-element 20 1 72.41 TATTTGATTATATCAGCTTACAACTTAGTTCAGTAAAGATACTCACCAAACGACTGCGGCGCGGGAACAAACTAACTGCAACGCCGGCCGGACCTATTTGTTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCTGCAACAT:1 - chrX 5002973 5' + HeT-A 5651 1 72.93 AGCGACTAAAAGCAGTGTTGTGCGGTTCGTTAGCGGCCCTTATCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAATAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCA:1 - chrX 276128 5' + I-element 159 1 73.79 GTTGCTATATTTGATTGTGGCACACTTTGCGCAATTATTTGATTGCGTTTCTATTAAGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 + chr3R 12242216 5' + transib2 22 1 70.55 TTCAACTCGTTATGCCGTCTCGGCCATAATGGTGGGCACTGTTTAAGTAACCAAATGTGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATT:1 - chr2L 21930247 5' - Copia1_DM 84 1 60.27 GTATCAGCTTAGTTAGCAATATCTCTATAAAATAAACACATGTCGAATGACCGCAAATAAAACGTATAGTTTAGCGCGAGCATATTAGTCAAAACAGTGTATGAAAAATATGAATAACAGGGCATATATATATATATATATATTAG:1 + chr2R 13513265 5' + 1731 4412 1 69.86 GATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTA:1 - chr3L 16973441 5' - S-element 1669 1 71.56 TTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCATTGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGG:1 - chr3L 17709336 5' - Porto1 290 1 73.79 ATTTTTTATACATTCCTTTAATTTGATAAATAAATTTGGCCAACAACACAAAATCTATTGATTAGTTTGTAATTTTCATCTAAACCTCTGTTGGAATATACTATTCAACC:1 + chr3L 26505845 5' + copia 1 2 70.91 GAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr3L 18403027 5' - P-element 2812 1 23.39 ATTTCAAAACGCGTAATTGTTACACCCTGATTACGCGACCGCAACGGACCGCAATTTAAAAAGCAAGAGAAATACGCTACACAGAAAATGTATTCATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr3R 4682846 5' + Burdock 6157 2 68.49 GCTATTTTGAATCAAATTTCAATTCCAATTTCTATATACAATTGGTTTTCTGTGGAGCTATCAGCATGATCACATACATACATACACATG:1 + chr2R 14006710 5' + 1731 75 2 76.67 AACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr3L 21327098 5' - copia 204 2 73.97 AGCATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3R 27986326 5' - roo 9031 1 59.31 AGAACAACCTTCCCATTTAACTTTATTTTCGGTAATGACGTAAGCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAACGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:2 + chr3L 17183633 5' + diver 5913 2 61.64 ATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:2 + chr2L 15950935 5' - mdg1 7422 2 43.84 ATGTTTTAAAAAGCTTAATATTTACAACATCCATCAGCTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:1 - chr2L 13844275 5' + Stalker2 7293 2 54.11 ATTAAATTTACCAATTAGACAGACAAACACTTGAGACACAAAGAAGCGAGCTGGCCCAAAACACAGACTGAAAACGGAAGGTCCTTGAGGGATCCTCCAGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAA:1 - chr3L 17681657 5' + mdg1 471 1 74.82 GATGCCTAACTTAAAGATGGCTACTACTACCTACTAAAGGTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:3 - chr3L 1279193 5' - roo 357 2 56.16 AGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr3R 29084966 5' + 412 7134 2 75.34 TTTATCTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATCGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 + chr2L 7660881 5' - I-element 5325 1 62.07 ACATTCTCCCGAAATTCTGTGTTTTGGTGAAGACCCTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGGTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCACAA:1 + chr2R 4673538 5' - Quasimodo 7332 2 59.59 CTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAG:2 - chr3L 17307313 5' + blood 7075 2 60.27 AATGTTCTATTGTTGCAATCACAATGAAATGTACAGAATGTCAGCTTTTATTATATTCTAAACTAATTTTTCAACTGTTTTTTTAAAGAGCATTTTCGGCATTACTTTGCATAAGCATTTAATCAAGTTCTCGGCTGATCAGTAC:1 - chr2L 15309433 5' + Quasimodo 6972 2 73.79 TGGCATTATCACAATGTCCGATGTTTTTAGCCAGAAGTTCTTACCTGCAACGTCGCCAGAGGCTCCCAGCGAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGGACCTGAAAAGAAACAAATTAAACAATATTAATCCTAAATTTCAAT:1 - chrX 12276641 5' + HeT-A 5781 1 71.92 TATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACCTG:1 + chr2R 19199699 5' + hopper 75 1 79.20 TGAATTAAAAATAATATAAACCATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 19450049 5' + roo 20 2 57.53 ACGTCCAGTAGTACACAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chr3R 10270672 5' - Juan 4161 1 50.68 AGGCAAAGAGCATAATCTTCGAGCTTAAACACATAAGCTAAACATTTGGAAAGTTCCACCTTAAATAAAACTAATTGTTCATACGAAATTGATAAAAGCATCAAAGACACAATACCTTGTTGTTGTTTTTTATGTGTGTTTTTTTT:1 + chrX 19146426 5' - transib1 2139 2 80.14 GAAGAAGATGAAGAGGCGGATGGTTCAGTGGTCTGGCCACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTAAAAAAAAAAATTTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAA:1 + chrX 13710585 5' - FB 116 1 72.60 TGCGAAGCTGGACCTCACTGAAATCGAATCACAATGAAAATTCACACAGTTTGATTTTTGTTCATATATTACACATCATTTTGTCAAAATCCCAATGTATGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCG:1 - 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hopper 1344 1 59.44 CTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACAAGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATTTTTAGGATATTGT:1 - chr2R 9871529 5' + roo 83 2 78.63 CTAAAGTTGATAAGTTGTGATTACATGCTTTTAATTCCTAACTAATTCACTAATCTCTGTCTCTGTTTTTTAGGGTATTATTATTATTAAGTGGGTTTCTGTGTGTACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCGCTTCATGA:1 + chr3L 2164316 5' - baggins 5387 1 48.63 ATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATA:1 - chr2R 22034737 5' + copia 4943 2 66.44 ACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGT:1 - chr3L 13581727 5' + jockey 4832 1 66.44 TGATACAATGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCCATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTG:1 + chr3R 20675815 5' + jockey 4907 1 54.48 GGCCATTGTTATGTGTAGCTATTGTGCAGTTAAAAAATAAATACGATTATTTATGCAATTTGCGCTTATCGAATTTTTATAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 - chr3R 27986468 5' + roo 39 2 58.90 AGAACAATTTCTCAGGAAATAATCGCATACGTTGTAAGTCCATCCAATTGAACTGTTTCCCATCGAACGTAATGGAAAGTTATGAGCATGATTTATTAGGTAGTTTGTAGTTATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:2 + chr3R 29084836 5' - 412 7535 2 73.29 AGAGAAAAACTAACAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAATCACTCACGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGT:1 + chrX 7706711 5' - Cr1a 110 1 77.40 TATTGAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr2L 2157851 5' + Doc 74 1 46.48 AACATTGGCCCAGTCTCAAGGCGATCTTGGCACACTTTGAGCATAAATTTGGATCCATGGCATGAGTGTGTCTGTCTATATCCAGATACTTATTATGTATATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTT:1 + chrX 1263902 5' - Burdock 6380 2 74.10 AATCATCATACGGCAACCGGATGTTTCCTTTTTTAAGGCGCCAAAGGAAAGCATCAAAGCACCTTTCCCAAACAAGATGTACATTGAAATAAAAATTAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 4810519 5' + Doc 4697 1 53.57 AGAATATTGATAAGTTTGAGTGGCTGTTTAATTTTACATCTGGCTAACTATGATTATCTAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCGATGTGTTGGTGATGAGCAGAGCGGGCTAAAATGTTAGAAATGAATTTTAA:1 + chr3L 19182351 5' - FB 666 2 61.38 TTTTTTTGTGCGTTGCTGTGCATTGCAAATTGCATTCTTTGCCTGGATCCCCGAACAATTAAATGTCCTTTGTTTCCTAATTGAAATTTATTGAATTTTTGTTATATGTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 7795462 5' + roo 11 2 80.14 ACCGAAAGCGACAAAAACAACAACTGATATTTTTGGGGGGCAGGAGTGCTCCGACTGCATCACCATCATCAACCGACGGACAGGCAGTTTATATACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTCTGTGTACCTC:2 - chr2R 12701886 5' - invader2 13 2 59.59 ATTAAGCCAAACAACCACCAACGACCATTGGCACGTCCATTCAACCGTTCGGCGAAGCCCACGCAAAACGACACAAAATCTCAAACACAAATCTGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTG:1 + chr2R 8736005 5' - copia 4910 2 63.70 CTCAAACATATCCACCGACACTTAGCTCCAAACGTGGAATCGATACGGACTTGATCAGGACCACCGCAACAAGGGTGACTCGAAAACTGCATCCAACTGCAACTCGAGCGTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAAT:1 - chr2L 6639617 5' + mdg1 7050 2 66.44 CCACACGTTCTGGACAATTAAAGCCCCAGCCTATCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGAGCAAATAAATTCGCTCTTTTAAGCGACGAATTGTCCGACAAAA:1 - chr2L 3773775 5' + G4 71 1 81.25 TCTTTATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 - chr3L 12315855 5' - transib2 2795 1 65.75 TTTGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr3L 8959733 5' + 1360 20 1 68.49 AGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAGGCACTCTAGTAATTTT:1 + chrX 13490639 5' + 297 6635 2 58.22 ATTGCTTCTCTATACTTTAGGTATAAACTTAAACTTATATGAAATGATATAATATGAAATGATGAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 19539471 5' + pogo 51 1 55.48 TGTATATATTCTTGTTCAGGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGAAACTCGACTACAGTATTCTCTCT:1 - chr4 559327 5' + INE-1 576 1 75.34 AAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:4 - chr2L 19675075 5' + 297 6632 2 63.70 TAATAACGTTAAACAATAATGAGAACAGGCTAAGCGGCAACAAGAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAAAAACACAC:2 + chr2L 18212084 5' + Quasimodo 29 2 65.07 TTAACATTATACAACACTATCTGTATTTTTGTTTTCTTTGTAATACCTGAATTTTAGAATTTTGTATCCGAAACGCCTTTTTTGTTTTGATTCCGCATTTTGATTGCGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAATT:2 - chr3R 20302910 5' - Porto1 4295 1 58.90 AAATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAACATC:1 - chr2R 12253338 5' + BS 4688 1 51.37 TCTACACATTCAGCGCTATAACGAAATGACTGCGATAATCGTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr2R 10411451 5' + 297 59 2 64.38 AGCTACAATAATCGTGTGACAAACGTACATGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 + chr2L 11357851 5' + blood 7101 2 79.45 GTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 18046588 5' + roo 46 2 52.41 AATTTATTTAGTGCTATTGTTTTTAGCCTATCTAAATAGTGGCTATGTCATTTTTGGGCAAAATGTCCACAGATACATCCATCTTTCGTTTCTTTATGATTTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 - chr2R 6965629 5' + Transpac 4937 2 73.29 TTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAA:1 - chr3L 16470372 5' + jockey 4727 1 54.79 GGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 27123593 5' - roo 9027 1 54.17 TGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAACTTCTGTTCCGCATCCACAATTT:1 + chr4 1294989 5' - TAHRE 10391 1 67.89 CTGCTATAGGAACCATCAGTCGAAAATCGTGATTTGTTTTTATACAATCCATATCCCAAGCGGGCGATCTCTCTCCTAAAAAAAATATTAACAACAATTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGA:1 + chrX 22894401 5' + 297 290 2 67.44 AACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCATTCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 26178373 5' - 412 431 2 60.27 AAGGACACCTGCAAACATTGATATTTACTTACACCTTTTAACGCTATTTCAAGTGTTTTTGCAAGGCAGCAATTTGATATTTTGGCCAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATT:1 + chr3R 13647977 5' + 297 6906 2 63.70 TGGCAAATTTATAGAAATTTATAGGGCTTATATAAATACGTGGTCAGTACTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTAGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGTTCAGA:1 + chrX 23018587 5' - Tc1 125 1 76.71 TGTTGATGCCATAGTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTT:1 + chr3R 29432373 5' - micropia 5346 2 80.73 GATAAATAAGCGCAGCAGCATCCTATCAAGCAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAA:1 - chr2R 6622634 5' + S-element 84 2 76.71 CATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 - chr3L 22744722 5' + FB 61 1 62.94 ATGTTTGTGTTGTTATTGCCGCTGTCTTGCGTCTTCTGTTTGCTACTTTGTCTCATTAAACATTTGAAAAGAGACGCACACAAAGTACACATTACACACATCCAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTA:1 - chr2R 19101156 5' - invader2 4881 2 76.03 GCCTAAGAGAGACAAGATGGTGCCTGTTCCGCATGTGGCTAAGGAGGGTAATAATATGCTGAACCCCATTTTCATATAATGTCAGCACGATAAGTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTT:1 + chr2R 2866219 5' - frogger 28 2 72.66 ATTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - 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Doc2-element 4617 1 55.46 TTATGATCTTTATTTCGTTGAACAAACGTAAATTTGTGAAATCACTTTATATCTTATATATTACATGTAAGATACATTTATTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGT:1 + chr2L 14523104 5' - HMS-Beagle2 7157 2 48.63 GTGAACTTTCAGTCTAACCAAATGATATAAAAATTTCCAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCAAAAGCCTCGCTTC:1 - chr2L 9038249 5' + I-element 38 1 59.00 TGTTCCACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATCGCAGTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAA:1 - chr3R 4357638 5' + Tc3 1681 1 67.12 ATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 + chr2R 22034661 5' - copia 183 2 69.18 GGTATTTATATTTAAATTGCGTTAAGTCGATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr2L 17809151 5' - jockey 4958 1 58.90 AACATATAAGCTAAAAACAACCTCTTTAGAAACCAATATATCCAGTTTAGAACATGCCTACACACTAATATACACCCTACAATACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATAGTTATATGATCCGCGAGAATGG:1 + chr3L 3752104 5' + Idefix 129 2 65.75 ACATACGGACATATGGAGGGGATGAAGGGAAACCTTACATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTTCCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTCATTTGTAAGCTTATTCGTGGG:1 + chr2R 1596647 5' + Cr1a 4045 1 69.23 GTTGGAGTGAATTAAAGTCATTAACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATT:1 + chr3L 16973311 5' + S-element 1529 1 75.34 ATCAATTGAAACCGCCTTAATTCCCTGAAGTTATGTGTCATCTAGCCGACGCTTTCTTATCGCGGGTATGCCCCATACATATGTAGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 - chr2R 13168784 5' + P-element 23 1 71.92 GTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr2R 6965465 5' - Transpac 293 2 60.00 GATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGTTTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 - chr2R 24170000 5' - transib2 2787 1 45.86 AGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTGTTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGA:1 + chr2R 19199687 5' + hopper 84 1 72.60 AGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 - chr2R 8157298 5' + mdg1 7075 2 60.27 ACAGGTGTACCCTGTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACTACAATAAGTTCGAAGAGATTTTACTGCGTTAGTTCAATAGTTAATTTCTACGGCCTGCGAAGACCTTAGGAAGAATT:1 - chr3R 27083174 5' + jockey 4537 1 76.60 AAGTTTACCCATTACAAGTGATAACTTATATAGTAAAGGAATTTTACCTTCCTCATTATGCACTTATACAAAAGATCGACC:1 - 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chr2L 17005831 5' + Stalker2 35 2 60.27 ATAGGAGGAGAGACTGCTAAAATGAAGTGCAAGAACTAGCTAGATATATGCGTGAATATACCTATTTAAGGCTTCATTATGATCCACATAAATTTTATCTGTTAGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTT:1 + chr2L 9636032 5' - 412 7528 2 69.18 TTCGTTCTAGTACTTCATAATTAACTTTAAACCATTTTATAAGCCATGCTTCAATTAACCCTAGTTGTTGGGGTGATGGGTGGTGCTGGTCCTGGAAAATTCCTAGTTTGCTGAAAAAAAAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2L 16944026 5' - copia 255 1 41.78 ATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 12115277 5' + 1360 48 1 63.33 CGAAAGAGAGGGCGATGCAATTAAGCAAAACCAGTTTAACGGGACTCGCACACACATAAGTACGCACATATGCATGTAGCGGGTGAGGAGCGAGCGATGAAACGGACCATGATGACATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 8437795 5' + P-element 4 2 80.30 AGCCATAAATGTTAAATGTTAATTTCTTAATGATTCAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:2 + chr3L 10731722 5' - 297 6963 2 75.34 GGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATG:3 + chr2R 12185347 5' - accord 7221 2 78.08 GTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAA:1 - chr2R 12185423 5' + accord 56 2 56.85 AGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2R 14653140 5' + 297 33 2 47.26 AATCCGAAAAAAAAACAAAAAAATTAAATAAAAATTTAAAATTTTACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTC:1 - chr3R 16098669 5' + Stalker 6969 4 69.18 TGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 + chr2R 9966973 5' + Bari1 24 1 40.00 CAACTATACGGTGGGAACAATGTCCTTTCCTGGACATCGGGGGCGTATACGGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATA:1 - chr2L 16150382 5' - Stalker2 267 2 65.07 AAAAAAACTACTCTTATTGTGGGTACGGTACCCGGAGTGCGTACTCTAAATTTCATAATTTTTGTGCGATATCGATAGAAAATCTATAGAAAATAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATTTCAACAAGTTTTTCAAAAGTGTGGGCG:1 - chr2L 21814347 5' - INE-1 255 1 74.66 TGTGGCAATGCGTGCGGCCGAAGAAACGAAAACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGCGATATCAGGAACTATAAAATCTAGA:1 - chr3R 3586596 5' + INE-1 153 1 67.16 TATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 + chr3R 25554216 5' + micropia 127 4 56.85 TATACCTACGCTTCAAGTTTTCGTAAACTTTAAAATTGCAAAAAAAAAACGGACTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAA:1 + chr2R 5410916 5' - Tc1 1402 1 63.01 AGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:2 - chr3R 30347373 5' - P-element 2790 1 18.49 AGAAATACAGTTCATATAAAATATATTTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chrX 18009912 5' - 412 453 2 43.84 ATACCCTAACTATAGTATCATATCATATGTTACATATTGTAAACCTGCTGGTTACAGCTGTTTATTAGTTCCATTGAAATTTTAGCTAGTAACTAAATAAAAGGAGTACTAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGCGAGGCCCACC:1 + chrX 13682608 5' + R1A1-element 4905 1 43.15 AGTTACTTGTTGGTTTATTTGTTGTAAATTGTCCCGCAAAAGCG:1 - chr3R 25936321 5' + accord2 7167 1 81.82 TATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:2 + chr3R 4160055 5' - invader2 199 2 51.03 AAGCTTATTCTTGATCCTAAGCTATACGATTGTATACAAATAGTTCTAAATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:2 - chr2L 7581003 5' - Transpac 242 2 66.44 GCCGATTAAGTTAATGCACTTCGAATTAAGTTTTACAATTGCAGAATGCATTCAGGGTTTCAACAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 8047351 5' + 1360 1 2 68.24 ATTTAGTATAATACAGTGAACAACACTGAAATAATAAAGTGTACAGCACCAATTCTACAAAAATACAAAATGCAGCTGTCTGTCTATCTTTATTATTTGACCTTATGCGAGCTACCGCAAGAGAGCAGTCTGCACACTCAGAAATT:1 + chr2L 22676171 5' - Cr1a 333 1 69.18 CATGGAGTCCATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr3R 4860537 5' + Transpac 49 2 55.07 AAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTA:1 + chr3R 8963755 5' + Idefix 7110 2 76.12 TTTTTTCTTTAGTATAATCTGTCTGTTTTGGATCTCCCAAGCTTTTTGGCCAAAACAAATGATAGTCGCATTCGTAAACGGACTTAGCGTTCCTGTGCCCACCCCCGACATATATCAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTTC:1 - chr3R 16021495 5' - S-element 1545 2 69.18 GCTAAATGAAGCACTCCACCAATCTTCGGGAGAATAAAAGAAGATAGAGTATCGAACATATTACAGAAAATAGCTTTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTATCTCGCTCTCTAATAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTA:1 - chr4 365364 5' - 1360 72 1 55.24 ATCGCGGCTTACAGCGCCCCAAGTCCGGACACCATAGGGCGAATTCGTAACCAAACGCCCGAAAGGATCTCCCCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCA:1 - chr2L 6289388 5' + G2 2631 1 62.04 AACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 - chr2R 17878614 5' + Doc 89 1 71.92 CTTTCCCTTGTCCTTCGGCTGACTGTCAGGATCAGGAAATGCCATCGCCAAAATCCAGTTACCTTTCGAGCTCATCTCTCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACG:1 + chrX 17218101 5' - P-element 368 1 42.45 CACACACAAAGGTGGGGTAGTTCGGTTCTACGGTGGTACAAAATGTTGTATATGCAACGGGTGGCAAAAGCGAAAGATCAGGGGTAGTGCGGTTGAAAGTCTTCGGTGTAAGAGACCAAAATGTCATATTAAATGCAGTATTACTC:2 + chr2R 21237857 5' + Gypsy12A_LTR 92 1 52.74 ACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2R 14051732 5' - roo 9029 1 50.68 GGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr2R 13168648 5' - P-element 2849 1 52.85 CTTTGGTTGAAATGGGCAGGAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr2R 6965443 5' - Transpac 5218 2 68.49 TATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr3R 7420310 5' + 1360 51 1 54.86 ATAAAATGTATATAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGG:1 - chr3L 10336131 5' - Cr1a 4398 1 48.20 AACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGGAAACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGGGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:1 - chr3R 11040139 5' + Bari1 48 1 59.29 GATTACACACACATTTAACATGCCAATACTTTTTTGTGGTTTTCTGTTTACGGTCTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTGTTTTGTATTTTATTTATTTTTTTTTTTGAAAGATTTTC:1 - chrX 15960718 5' - TART-B 10627 2 69.83 AAATCAGTTCCTAACGTTTCTTAGTGCTAATTATTCCCTTTGGCAATGGAGTAAAATTTTTGTCGCTTAATAAGTTAAGTTGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr3L 8627354 5' - pogo 2064 1 49.32 ATTCACAATACAGAATACTACTAAAAATAGATAATTATTATTATTATTATAGCTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 3030213 5' - roo 337 2 71.92 AAGGAAGTTAAGGAATTATTCCCTTCGACAATAAAGCACCCATACCTATATCTTCACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATC:1 - chr3L 21738773 5' + I-element 215 1 62.33 CTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3R 4805708 5' + 1360 55 1 56.94 ATAAAGAACTTTAAAACCAACCTGAAAATTGAACAGATATTTCTGGCCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 - chr2R 5479973 5' + F-element 88 1 69.29 GGCAAAATCGAAACAAATGAATACAAATTATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 13158614 5' - roo 9036 1 59.59 AATTGCCCGGCTCTGCCGAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 - chr2R 23780652 5' + Ivk 22 1 69.18 GGCAAATTCTACTAGGTCTAGAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3R 5769104 5' + roo 67 2 69.18 TTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAACATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr3L 2544638 5' + Tirant 8160 2 66.67 TGGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCCACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chr2R 22034744 5' + copia 4905 2 49.57 GAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 11164539 5' + roo 8691 2 67.12 TATTATTATTTTTTTTTTTATTAGATATTCAAGATATTTCAACGTTTCTGCTGAGGCGATTTCAACTCCTTTTCCCTCAGCTGAGGGATTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTATGCTCTCTCTCC:1 - chrX 5557976 5' - Rt1a 4951 1 42.97 TGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCC:1 + chr3R 19992652 5' + hopper 80 1 70.55 ATCGTTTCTTATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 15103768 5' - Transpac 285 2 69.18 TGGCTCACTGGCTGATGCGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCA:1 - chr3R 12681157 5' - accord 215 2 79.27 GTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 11257440 5' + 1360 5 2 77.39 GAACACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAA:3 - chr3R 2520358 5' - Tc1-2 1614 1 64.38 CTGTCGTTGCTAAATGCAAATTAAAACGGCAGCAAGAACAACACTACCTAAATCCCAATACAATACCAACTTGTCCGTTTTGTCAAGTTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAATTCATGCCTATCCCTCCTACAAACCAAACA:1 + chrX 11521370 5' + I-element 5062 1 73.79 ATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1 + chr3L 11913208 5' + BS 5074 1 71.92 ACCATTATGTATGCTAACATTTATTTATCAAAAAGATAAGATTTAATAAACTGTACAGTTTTTAGAAGGTAACCATTAAACCTTATCTGTGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 + chr3R 14980279 5' - roo 9040 1 63.70 ACCACAATGAAGGTTTTTGTCCGATTCTGAATGCATCTGTATATTGCTTTTGGCTGCATTTAATTTTTAATTGAATTATTCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1 + chr3L 11913174 5' + BS 5040 1 55.48 GTGTCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACAT:1 + chr3R 19992647 5' + hopper 74 1 66.90 TGTGTGTGCATAAATGCTCAACAAATTGGCTAAAATCACATTGATTTATGATCCCAAATGGTGGTGGTGGGTTGGGCAAGCAGGGGGGCTTCCTGGTTGGCTGCTCCGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTGTTATTTATGTTGAG:1 - chr2R 12261072 5' - Gypsy6A_LTR 293 1 63.01 ATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAATTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCA:1 + chr2R 22034680 5' - copia 164 2 80.82 GGCACGACGTGCTAACGTAGCATTTTTCCAATATTCTATATTATCTATAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCATTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCC:1 + chr2L 17972003 5' + I-element 5040 1 68.49 AATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGCATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 - chr3L 3501818 5' - Bari1 1646 1 58.90 GCCATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chrX 8200343 5' - flea 239 2 75.34 AAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:2 - chr3R 30347460 5' - P-element 2867 1 68.49 ATTGTGTAATAAATACTCTAGGTATTTAACATATGTAAACGTATTGTTTCACTACTGATACTCTTTATTTCAAAAAGTAATTACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAAGAAAGAAGGAATAAAAAGA:1 - chr2L 17115110 5' - copia 4982 2 47.26 AACAATTCACAACAGTTGCACAACGCAAAAAGTTTTTGTTTTTTGTTTTAAATCTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATT:1 - chr3R 9989916 5' + hobo 2538 1 60.80 TTTTTTTTTCTGGAATCTAATATCAAAGATTGTAGTGGCGCAAACATATAGAAGCCAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTA:1 + chr2L 22249069 5' + Doc 4243 1 76.03 AATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 - 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Porto1 4300 1 65.85 GAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTATATATT:1 - chrX 8027489 5' + Juan 61 1 56.16 ATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCT:1 + chr2R 2590729 5' - HMS-Beagle 158 2 78.77 GCACGCGCGTCTCTCCTGCTGACGTTATAGGTTCTTGTTGTTGCTGCCGTCGATGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTGCCACTGCTGCCAAGTGTAAGAAATTAAAACGTTCAGATATTTATAGCGGCACTCCTGCCGTTATTTCTGT:1 - chr3L 6834485 5' - gypsy9 184 2 73.97 AGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCGACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATGTAATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2R 8157156 5' - mdg1 377 2 54.79 AGCGATTCCCATTTCCCGTCCGGGAATCTATTCCCCATCTCAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 + chr3L 21380532 5' - I-element 5282 1 69.86 AGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGTAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGAGCTTT:1 - chr2L 12250997 5' + 412 7101 2 49.64 GAATACTAAAATGTTGACTGCCAATAAAAAATGTGTAAAAGTGTGGATTAGAGCGTAATATGTGTGTGTAAAATCCCAATTAAGAAGATTTTACTCGTT:1 - chr2L 18549931 5' - roo 397 1 62.63 GTAATTTAAAACCGGTATTACTTAAACGTGTAAGGAACACAAGATCAAAACTTTTAAGCGAGCTGTTAAAATAAACGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTTTAGATTTTGTGTCGGAGAGCGAAAAAGCGAGGGAG:2 - chr3R 17052863 5' - Cr1a 298 1 73.94 CAACAGACAAAATGAATTTATTGTCAGCAACAAGAATCACAGCACGATGGACAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGTATTCATACATACAGACATACTATATATGTATGTATATATATTCTT:1 - chrX 11541620 5' + 1731 4413 1 40.41 ATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGGCTAT:3 - chr2L 23373499 5' - Tc1-2 1534 1 76.71 TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr2L 23069854 5' + HMS-Beagle 34 2 62.33 TAGAGAGAGAGAGAGAGAAATACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTT:1 - chrX 12649910 5' - F-element 238 1 75.93 ACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCC:1 - chrX 19980715 5' + X-element 4521 1 50.68 ATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr3L 16033412 5' + Doc 80 1 67.81 TCTACTTTCACTATCACATGACTTATTTATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr2R 11804760 5' + pogo 30 1 65.07 ATTTGCTCTAGTCCCGCGAAGGATCCTAAATGAAGATGGGTTATCTTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTT:2 + chr2L 15166413 5' - jockey 4744 1 69.18 CCTTTCTCCGAAAATTTCCCACACTTGGAACTCTGATTTCCATTGTTGTTTATTTGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2R 13259243 5' - mdg1 7437 2 68.49 CTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTACTTTGAAGGAAAGAAGGAATAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTG:1 + chrX 666285 5' - copia 44 2 62.33 CAACGAAACGGATTTAAACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 - chr2L 11839739 5' - mdg1 350 2 60.96 AATTAGGCAAATTAAAATGGCAAATTTCCTTTGAAAAAAAAAATGCAAATTTATGTGCAGCACACGCCCATTTCTCCATTTCTCGCTCAAGGATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 11650210 5' - roo 9043 1 64.38 ATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 - chr2L 23295897 5' + micropia 4998 4 54.11 AGTATAAATAAGCAAAATAAACCAACACGGCTATTGATCCTGATTAAGAATATACA:1 + chr3L 27859899 5' - INE-1 81 1 66.07 AAAACGAGCAGCATGTGAGAAGACAGAAAGATAGATTCTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGGTA:1 + chrX 10538360 5' - I-element 4969 1 72.60 GTAAGTTCGATGCACTTCAAGTTTTAAAACACGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3L 1279154 5' - roo 8982 2 81.51 AAATATAATAATGTTTTGATTTTTCTTCGTTTTATTGTTTGTCTTGCCAATTTCTATCGGTAGTCCACAGACACGCCCAGACTTTTGAACAATTTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAA:1 - chrX 5849574 5' + INE-1 500 1 42.76 AATTGTTCACTTAAAGGATAAAATTATAAATTTTCCCTGGATATATAGTCAAGACCAATTAGTCAAGGCCCCAATTAGTTCGGAAAACGGGGAAAACACTAAAAATTAGATATGGGAGGTGGTTGTTGATCGGCGTTTCATAAAAC:1 - chrX 22890766 5' - Q-element 215 2 72.60 ATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCATGGCCTCTACATACATATACAAATATGTCGAAGAGACATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTAGTCTC:1 + chr2R 5617481 5' - invader1 3988 2 54.03 TTCTTTAAAGTGCCATTTTTAATTTTTTTGCAAATTCATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:3 - chr3R 17077176 5' + roo 83 2 76.71 CACACCGATGTAGAACCAACCACCCACACTCACTCACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 26404979 5' + hobo 50 1 51.37 CCGGTATTTAACCGCCCGTTGACAATCGGGCGATAAGGAAAAAATGAAAATGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGCTAGGTCCTGTT:1 - chr2L 11878727 5' + P-element 487 1 36.99 AATCTATTTCACCAGTGAATTTAAGTCTGGTAATTTCTCACTTTTTCTTTATAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGTGGCCCTCGCCACATCAAACTTTATTTATCCTAGGGTTATCCATTCCTGATTCCTGACCTTCGACGTGGG:1 + chr3R 12367487 5' + GATE 8110 1 46.90 GGTTGGGCGGGTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chrX 18817236 5' - transib2 2804 1 71.92 AACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAA:2 + chr2R 18258764 5' - Juan 4173 1 50.00 AAAAGCGACACATTTTTATATACAATAACTTGTTCCACCACCAAAACCACAAGTTTTTTTTGTTGTTTCATTTCGTTTTCTCTGCATTTGTTTTTGGCACTATCCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTAC:1 - chr2L 9825148 5' - 1360 3315 1 63.89 CATATCACGTATACGCAGTGCTTGACGCCAGCCATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - chr2R 22989713 5' - hopper 1377 1 59.59 ATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 - chr2L 9038256 5' + I-element 85 1 71.23 CCCTCGGCTGTTTCATAACTATGTTTTTTTTTTGCTTATAATTCACGTTCAAGCAAAAATGGGGTGAAAATGCCTGTGTTTATGGTTTTTGATTTTTTTTTTGTTTTTGATTTTGATTTT:1 + chr2L 12608945 5' - P-element 2648 1 85.00 GGAAAGCTGGTGATTTTAATATTTTCACTTCGGGTGATTGCTTTTAGTTCGCAAATTCCGTATCGCGTGAGTCCGATTTCTTCGTTGGGCGTCAATTATATGTCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTG:1 - chr3R 803574 5' - mdg3 379 1 74.66 AAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCC:1 + chr3R 19450133 5' - roo 120 2 71.43 GTATATTTATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAAC:1 - chr2L 20118482 5' + S-element 69 1 68.49 ATTATATATTTATTATTTGCTTAATTACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTT:2 - chrX 5323392 5' - Juan 4210 1 35.62 GGAAACTGTTAACTGGGTCCATAAATTCAACTTTGTTGTATATACATACATACATACTGTATGTTCATATAAGTACGTCACTTTAAACATCTGCCTTCGTTTCCTTTAACTAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTTAA:2 + chr3L 21821368 5' + Tc3 316 1 76.03 TCACAGGCTGCCTTTTACCCACAACAGAGATCACTCTTCTTTGTCACTGGAGATAGTAAGTTGTTGGTTGGGGTTTTGGGCTCGATTAGGCTATTCAGACAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTTCAGTCCCTCG:1 - chr2R 625506 5' + mariner2 318 1 70.71 GATCTCGTCCCGACTCAGACTGATCTTCTAAATCTTAATCCTAATCCACTCAACCTCGGCCAGAAGCTTTTCTTTAGGATTCTCTTAAGCTTTTTAATATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 - chr2L 22170091 5' - Juan 4197 1 68.49 ATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr2L 71198 5' - 412 7472 2 72.52 ATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 - chr2R 17878609 5' + Doc 94 1 75.34 GTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 4805712 5' + 1360 53 1 53.42 AGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chrX 8092487 5' + pogo 56 1 62.14 AAAGTAGGCATCTTATAGATAGTTTCAAAACACCACACCATTTCTGGAGATTAATTTTACCAATTGGATAGTGTATGGCCAAAACTCCGTTGAGGAAACAACGAAATTCGTGTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAAAAAAA:1 + chr2R 10580711 5' + F-element 4678 2 72.60 TATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGCATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCT:1 - chr3R 28385627 5' + transib2 60 1 56.94 ATTAATTCTTTGTTTAAAGAAAAATTTTTTTGCCTATAATTTTTATAAATTTTCCTGCCTATTGTTTTTGTATAGCTTTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3L 13696507 5' - 297 6941 2 45.21 AGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCAAGGCACAATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 - chr2L 16946110 5' - hopper 1364 1 65.22 TTTATCGGGGCAATAAAAATGTAAACAAAACTGAAACGAAAACAAAGAGGCTTAAAATACTATTTAAATTAAGAAAATACAGTGCGATTAAGACCTATTTAAAGTATTATAGTATAGTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 - chr3L 13836758 5' + 412 3 2 63.70 GCCCAGTTCAACTTGGTTTTTTATTTGTTACAAATTTGTAATATTAAAAGGATAAGCATTAGAAATTCTTTGAATTTTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAA:1 - chr2L 16036200 5' - copia 5011 2 53.42 GGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCTCTTTTTTGGTGACGGCCTAAAT:1 - chr3L 22400338 5' - 1360 3327 1 65.08 TATTTCTATATATTTCTATTTAAAGGTAATATATCAAGCCCCCTTCTTTTGCCGCCAATCGAACGGGTATCGCATTACGGGATAAGGATAAGGATTGTTCCTGTTGCTCTTTGTTATGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGG:1 + chr3R 12659905 5' - Burdock 281 1 74.48 GTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 + chr2R 24427565 5' + jockey 4736 1 57.53 TATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr2R 14584541 5' - pogo 2053 1 86.00 ACCCATCCGAGGAACAGGGGAAAACCTAACAACGCGTACTTTTCTTATGTCTCCGCGACAACTGCAAACGCAGACAACGAGTGGCCAATAACCTATAACCCCACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCAAGA:1 + chr2R 5396321 5' + F-element 343 1 72.52 ATGTTGTTCGCGCACGCTCTGCATACTCGGAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGGCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGAATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2L 19675105 5' + 297 21 2 64.38 GTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCT:2 - chrX 20999585 5' + BS 63 1 65.07 AAAAACAGCTTTCTCCGATTGCCATTCGATTTCGATTGGAAACCATATAGAAAACCAGCCAAAGAGTGAACAAATACCTAAAAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAAT:1 + chrX 20497590 5' + I-element 4976 1 59.59 AGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 + chr3R 4679451 5' - hopper2 1546 1 58.22 ATTTTTGTTTTTAGGACCTAACCCAACTTTTTTAAATTCAGAGTATGAGATTACTGAATTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr2R 5074632 5' + 1360 11 1 77.40 ATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr3L 12315850 5' - transib2 2790 1 62.33 ACATAAAATAAAATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chr3L 22035711 5' + F-element 19 1 73.97 CAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 + chr2R 12472022 5' - transib2 2761 1 60.96 TAATGTCAGTCTACGAGCTTCTGTTGCCTACATAAAACCAAAGACACTAGAATAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 + chr2R 947046 5' - 1360 3309 1 73.88 AATTGTTTTAACTTTTCAATTTAGTAAATATTGATGACCACACTGCGTATGAGTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:1 + chr3R 18093289 5' - I-element 5290 1 63.70 ATTACATTTGACTCCAACTCCAACAATCAGGTGCTGACAGGAGCAACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18281820 5' + Doc 8 1 78.57 ATATGATACTTTGCCTTTAATTCCTTCACTTGAAAGTTGGCCATTTTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATCAAATA:1 - chr2R 16818010 5' + 412 23 2 66.90 ACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 + chr2R 12185296 5' - accord 497 2 54.79 AGCGACGCACCCACGCAGGCAAAAGGGATGCCAGGACGAAGGACGCAGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 8338125 5' + P-element 27 1 50.00 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATATATAAAGATCTAGCCAAGATCCGCCTGTCTGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCAAGAAGGTTGAGATTCA:1 + chr3L 10795198 5' + INE-1 166 1 65.52 CGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 + chr3L 6964734 5' + P-element 99 1 17.12 CAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGCGAGCGGACGTCTG:1 - chr3L 18126038 5' + Ivk 16 1 67.59 ATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3L 18046618 5' + roo 77 2 72.60 AGCAGAATAGCAGAATCGAATCGGGGCTCTGAATTGGAGGAAGGGCTATGCTGGGTTTAAGGGGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:2 + chrX 661853 5' - 412 436 2 56.85 AACGCATAGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chrX 11661522 5' + pogo 25 1 66.67 CCTGATTCTGCACTTGAAGAAAATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGTACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 18488501 5' - roo 9045 1 63.01 AAAGGGGAACTGCTGTGGGAACAAAAGGCTCAAGGTAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGGCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 + chrX 18336602 5' - mdg3 178 2 66.92 TGTAGATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 + chr3R 3851006 5' + transib2 52 1 53.42 TCTATAGAATTATATGTTAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAA:3 - chrX 12129455 5' - flea 5001 2 76.03 CATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAGTTACTATGTTATATCAA:1 - chr3L 20711679 5' + jockey 4840 1 70.55 AAGAGAGTGACGATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTATGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 3234062 5' - roo 355 2 51.03 AATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGCAATTTTGAAATTT:1 + chr3L 22890324 5' + FB 23 1 66.67 GCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3L 22035659 5' + F-element 50 1 60.00 AAGTACATAAACTTTAAATGGGCATATCAAAAAATATATTTCCAAATAATATGTATATTTTTAGATCTAATTAAATTCGTTATCCTGCAGTATTATGCTGTTTATGGTGTATGTAAAAACCTTTACTATGTACGTGGCACTACCCT:1 + chr2R 11436460 5' + BS 4772 1 29.45 ATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCCGGCCAGCGCTTT:1 - chr2L 7618577 5' + X-element 4441 1 65.77 ATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:3 - chr2R 1916451 5' + Juan 60 1 55.48 TATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr4 373083 5' + pogo 21 1 66.67 AACGTTCCGATCCCCCAAAGACCCACAAACAAGAACAAAAAGGCAAACGAAAAGTTAAAAACAAAAAAAA:1 + chr3R 9647678 5' + TART-C 11095 2 81.43 ATACCCTGGTCGACGAAAGGCAATCATCTGCATGACAATATATGTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr2L 20118474 5' + S-element 77 1 73.97 ATTTGTTCGGTCCGCATCGAGAAAGTTAACCTCAGAGAAGGAAATTCAAGAGAGAGAGCCTCTCGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCC:2 + chr3R 8890014 5' + FB 55 1 55.48 GGGTAANATGAACTTGTGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGA:1 + chr3R 31886818 5' + hopper 40 1 58.90 TATCTTCTTCACTTCTTGACCTATATCTAGCGACTATTAGATAACACAATTTGTACACAATATGTACTACATTTCCTGATCGTTTCGTCCCACTGTGCCATGTGTTGCTCGCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGC:1 - chrX 5518406 5' + Cr1a 293 1 57.75 AAAAGGACGACGACTACGTCATCGTTTTTGGACCGATCCGAATCGAAACGAAACGAAACGAAGCGAAGCTGCTCGTCCTGCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr2L 8338228 5' - P-element 2845 1 57.53 GCCATATAAGCACAACCAGAACCTTACAGAATTGGTTATTACGTAGCCCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAA:1 - chr3R 9375426 5' + I-element 5168 1 66.21 TGGATCGCCACACAAATAAGGATCGCTCCCCATTCAAAGGAAGTCATATGGAACCATCTACACGCAAGGGGAAAGGAACGGAAAGGAATAATGTGCTGACCTATGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGCCTTATCTCAATTAGA:2 + chr2L 16879547 5' + mariner2 526 1 66.44 ACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCGTAAGTACGTGGCGAT:1 + chr2R 21410893 5' - Burdock 168 2 76.71 TTATGTGCGATCACAGTTATCGCCAACTTAATGCATTCCACTAGGTCCCCCCAATCTCTATATATGTATATCCCAGTGCTTGGGGGCACTCAACCTGATTAGAATTCCGGGGGAGCTGTTTTGTCGGACAATTCGTCGCT:1 - chr3L 4146614 5' - G4 71 1 77.86 GTAATATTCGCACGTTTATTTATAGGTTTATTGAGTGTTCGAAATTCCTTTCTCATTACGAGAGAAACTTGCGTTAGCAAACCCGGCCGAAACTTACCAGATTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAG:1 - 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chr3R 11062811 5' - roo 325 2 70.55 ACATTATTTAAATGAAAGAACTTTCCCTTTTGCAGAATCTTATAGTTTCCGACTATATAAAGGATATATATTATTGATCAGGGTCAATAGCCGAGTTTATCTAGCCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGC:2 + chr2R 25131035 5' + INE-1 149 1 69.86 AATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2R 11159334 5' - roo 330 2 71.92 GGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAA:1 - chr3L 5061629 5' + 17.6 7004 2 78.08 ATTTAAATGAATAATTATAATCTTTATTTCGTAGAAAACCGACTAATAATAAATGAGTCGAATAAATAATCAATGCCGAAAAAAATAAAAACTTCGAA:1 + chr2R 5434542 5' - Tom1 329 1 79.59 TTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAACTTGGGAATTATAAAAGTGTGGGAGTCGAGCCAAAATGGCAACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3L 20756367 5' + Transpac 4928 2 45.89 AGCGGCAGCGGCAGCAACCACAACAACAACAG:1 + chr2L 13837727 5' + TART-A 121 2 84.38 TTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:3 - chr3R 18093384 5' + I-element 53 1 52.05 AACAAGTCATACAATTACACCGACCGATGAGCAAGCAAGGACTAAAGAGCACGCAGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATCACATTATAGTTTATGAATCGTACTTGCCACCTACGGAC:1 - chr2L 13185196 5' + Rt1b 5081 1 76.61 TGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAG:1 + chr2L 4003701 5' + mdg1 78 2 71.92 TCCCCATGCCATTTCATATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTT:1 + chr3R 6685106 5' - G4 3514 1 76.19 GGTGCATTGTGTGCGATGTAAAACAAAAGCAAGCTGCCAAAGCTCTCTGGGATTAGCTCGGGGAATATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCC:1 - chrX 18336687 5' + mdg3 5255 1 73.40 TTGTTCAAATATTTGAACAGTTTTATATATTTAATTTAAAATCAAATACATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 8360488 5' + roo 22 2 70.55 GCCACTGGCACTAATCCATAATCGTTGGGTTGACAATTTTCAGCTTGTTTGGTTTTTCGGGCTTTATTATTATGCTTTTCTTTAATTTTATTCGCCCTTTAATGGCATACACTGTTAGATTTTCTTTTTTTTCTTCTAAATTTTCA:1 + chrX 2973483 5' - 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X-element 4658 1 56.85 GAAAAGCTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr3L 11326654 5' - pogo 2056 1 54.11 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCC:1 + chr3R 19450188 5' - roo 8708 2 73.60 TGTTTCGCCAGACTAGAAAGTTTCATCGGCTTGTAATGTACATTTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTTTGGCATAATTTAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGGTTGGGTTTG:1 + chrX 10178238 5' - I-element 5123 1 72.17 CTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2R 9871012 5' - roo 9031 1 57.53 GAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGA:1 - chrX 1799199 5' - invader4 2999 2 77.40 AAATCCCTAGGATTTCTGCATAGCTCGCGAATTTCTAGACTTAGGCAAGTTATAAAAACTTCTAAAATCGAAATAAAGCGTTTAGGCGTGTGTTTGTTATATGTATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGC:1 - chrX 9621810 5' - Stalker2 195 2 69.86 CCCATCATTCATGATCGTATTCATTTAGCTATTTCGGCAGAGTTTCGCGAGCCGAAATCGCAACCCTTAACCCCCTGCTGCCAGCTAGCTAGAATGGGCTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 2504904 5' - roo 9024 2 76.27 TCTTCGATTTCATTCAAAGCCTCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2L 12822816 5' + P-element 9 2 42.86 TGATTTAAGCAGTTATACATATTTATATTTGGCAATTCGCTCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCT:1 + chr2L 22695318 5' - Porto1 236 1 72.60 ATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:1 - chr3L 6447139 5' - transib2 2778 1 54.11 AACCCATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr2R 21116472 5' - mdg1 368 2 56.85 TTTATATAAAGAAGTATATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGGCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr3L 16033446 5' + Doc 46 1 54.11 GTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGTAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATATTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 + chr3R 17673773 5' + FB 82 1 75.54 AGGCGAATGTCGTTTCCTCGACGGGTCGGGTGAATCCCAGAAACAGGGACAAAAAAAAGAGGATTTATAACCACTGTACTCTTTATTTTGAAAATATATATGCTCGATCTTGAGGTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTCTCCTTTTT:1 - chr3L 970505 5' - HeT-A 256 1 74.66 AAATTGCCTTCTATTGTTGCATTTGATTTGTCCGAAAAAGAGGTGGAGATATATGGCATGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chrX 15357762 5' + hopper 59 1 57.53 CATTTCTTTATATTTTCCTATATGATTGCCACAATAACCGCACCGGAAATGCGATATCAACCGATTGTCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:1 - chr3R 8890125 5' + FB 53 1 53.42 GGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGG:1 + chr3R 9038936 5' + Juan 4079 1 64.38 AATATGAATTAGTCACTTATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:2 - chr3L 14366620 5' + roo 8736 2 66.44 GTTTAGCTTAAAAGGTCAATGGGTTTCGTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATATGAAGAGTTTACTCGTTG:1 + chr3L 14366482 5' - roo 396 1 78.08 CTAATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGAT:1 - chrX 19980722 5' + X-element 4503 1 58.52 TAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chrX 19054258 5' + jockey 78 1 65.52 AATATTAATGCTGTAAAAGCATTTAATATATAAATTAGGTTTTAATTATTGTATATATATTATATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 - chr2R 1269010 5' - flea 4996 2 73.97 CATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2R 9544927 5' + roo 70 2 67.12 TGGAGTTCGGTTTTTTTTTTAGAAAAATTGAAAAAAAAAAAGGAATTGCATTAAAGGTTTTAATTGCATTTGTTCCAAACGAAGACCA:1 + chrX 7974401 5' + Tc1 323 1 88.64 GCCAATTTTTGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAA:1 - chr4 1271912 5' - 1360 40 1 75.34 ATTCATTTAGCGCATTCCCAAGAAAAAGTCGCTGCGACTGTGTGTGACTGGCCCTTTTTACAATCGCCATAGGACGGTTGGCCTCAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGG:1 - chr3R 15633859 5' - roo 8713 2 54.79 AGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr3L 23906338 5' - 1360 3367 1 67.12 ACTAACAACGTAATTTAGTCTTTGAGGAAAGTGACAAAACACAAGTGAAGTTCTTAGATAATGCCTATGTTTAATGTTCTTTGTTAATGCTCAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATG:1 - chr2L 8438027 5' - jockey 4819 1 62.33 AATTTAATTTACCATGCCATTAACAATTATAATCGAAATATGAAATATCACATGAAATTTATGAAAACATCTTAAGGGAAGAGCGAATTGGATCATCGAACGCGTCGGTCGTCGCCATGCAGACACATATTATTCAATA:1 - chrX 327425 5' + gypsy7 150 2 57.55 AGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr3R 13972964 5' + 412 7129 2 68.49 ATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chrX 8092382 5' - pogo 2042 1 56.85 CGATATGGTTTTTATAAGCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAA:1 + chrX 22608527 5' + Ivk 343 1 67.27 ATAGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCGACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr3L 16662383 5' - jockey 4930 1 61.11 TTTTTTACAATATTCAATAAAAAAATGGATTAGTTTATTTAAGTCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACC:1 - chr2L 7124724 5' + I-element 493 1 69.86 GTAAATGCATGATCTTCATAATTAATAACGGTAAATTGGCATGCCAGAGGAATACAGTTATGGCTGCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3R 21630358 5' - I-element 5302 1 55.48 AAACTAATAATTAAAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCAC:3 - chr2L 2417786 5' + 17.6 59 1 71.92 AGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGCTCTGTCCTTTAGCTT:1 + chr2R 9158055 5' - mdg3 190 2 56.92 ACCAACGAATTATTCATTATCTATAATTTGGATCCCCTTTTGGCTCATTATACTCGCTTTTCACCCTCGTCTATCAAATGAGACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAAAAAGTTCTTAACTAACAGTTACTATTGCAACTGATATG:1 - chr2R 22503791 5' - Fw2 3856 1 47.95 AAATCGGCATTTTTTTGGATTTTTAACTGACAATAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTT:1 + chr2R 2590727 5' - HMS-Beagle 6967 2 75.56 AATCGAAGTTTAACGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGGGCTACTCGCCACGCACCTCGCGGGT:1 - chrX 20455712 5' + hobo 69 1 60.96 ATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3L 23287320 5' - 1360 3339 1 56.30 ATCTTGTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTAACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 15940195 5' + pogo 44 1 53.10 ATGTGAAGTGACGCAGCAGCAGCAATACACTGCGAAAAATATATTAACCCAAATAAATTACATACCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAA:1 + chr3R 23067423 5' + roo 9012 2 36.30 ATGAAGAGACAGCAAAGTACGTTTGAATATCAACGAAACAAAAAAAAAACAAGATTTCCCAACCCGCCGGCGGGTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTTTTT:1 - chr3L 2383598 5' + Tc3 76 9 49.00 CTAACTCTCCACTCCTCGGAGGGGTTATTCTTCCTTGTATTTACTTAAAACTAAAAAACAAAATAATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGGGCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAA:1 - chr3L 23254049 5' + rover 6908 1 77.40 AGCAGGTCAGTTAAGTCAATCCAACTTGCCACCCACTTCCGGTAAAGCAATAAAACCTTTTATCAATTTCCAACCGAACCGTATTATTATAATTATTATTATTATTGTTGTTATTACTATTATTATTATTATTTTTGTTATTATTA:1 - chr2L 15763108 5' - mdg1 27 2 72.60 GTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 24090542 5' - roo 9013 2 58.22 ATTAAAGAATTGCGTTGTTGTGCGTCGCGCCCGTTTGTCCTTATTGTTGTCGTTAGTGGAGTGCACGAAAAGTAATTGTTCAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTT:1 - chr3L 1730894 5' + transib2 2463 1 57.14 GATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTA:1 + chr3L 24757197 5' - Cr1a 4257 1 54.11 AAATAAAAATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:4 + chr3R 7719673 5' - roo 395 1 76.03 CATTAAAGTTTTTGAAATATTAGAGTGATTTACATAAGCTTTCTACACTGGAAATGAAAACCTTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAATGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2R 21116476 5' - mdg1 364 2 58.22 GGTAGAGAACAACAGCGCAAGACAAAAAACAAGGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAG:1 + chr3R 13778471 5' + P-element 426 1 26.71 AAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 7943738 5' + blood 35 2 53.64 CTAATGTTAATTGATAAATTTATCAGTTGATTGCGGCCAGATGTTTGGCCAAGATCAGCAAAGATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chr3R 17736966 5' - opus 7446 2 57.53 TGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTCGGTGACACTGTGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 19450140 5' + roo 8718 2 54.79 ATAAGTAGAAAGTCAAAAATTCGTTCAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAATTATATTTTAGTCGGTAGAGAACCGCACTGCTCCCAGAAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAAGAAGAAAAAACATATAAGGACATTCA:2 + chrX 15043521 5' + HB 415 1 76.03 ATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chrX 19054262 5' + jockey 82 1 68.28 ATATGCTAAAAAATTGTTCAATTAATATGAGCTGCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 26774088 5' + hobo 85 1 75.17 ATCCTCCACTCCCAAGTGCAGGAGGAGCCCCATCAAGTGGTCGTTACTGTCGGCAGCAGCAGATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTCACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr2L 6161041 5' - I-element 5310 1 51.49 ATACTTCAATTAAAAAGAGATCCAATACATCAAAACATGTTTTGTGCGGTTTGTGGTCGTTATAGTAAGCGTGGCAACATGGATCAAAAAACTTGCGCTCTGTATTTGTNNNNNGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCT:1 + chrX 149194 5' - INE-1 168 1 69.18 AAGTATCATTTTCTCGAGTTTTTGAGTGCACTTAAAATAATTTCGTGTAGCCTGAAAATTAAATCACAAATGTAGCATTTCAGTGCGCCCACACACACACACACTTGAACTACCAGGACGTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTG:1 - chr3L 10654806 5' + baggins 5047 1 74.66 GTTGGCACCTAGTCCGCAATAAATTAACCGCTCCACGACCGTCAGTATAATTCTGGTTTAATGTTCACACATGAACACGAATAGATTTTAAGAGTTACAATCTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 25616604 5' + roo 8710 2 50.00 TATGTTTTCGACATTTCCTCTCTCAGTTTTAACTCATTTATTATATTTTATTTAACCCATTTCTTATTCATATTTTTTTCGGGTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAAACAGAATCTTTCAAAGG:1 - chr2R 4545173 5' - invader1 3538 1 54.79 AGCCGAGCATAATATGATAGATTGACTAAATAATTGCCGACGGAATTTATTTAGAAGCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAG:1 + chr3R 3861074 5' - Cr1a 4164 1 62.33 CAGCTCGCCGGAGATATCGCGATCCTTGAGTATTACGGCGTTTCTGGAGATGTATTACATATATTTTGTATTATTGTATTTTTTCGCTATTTCCCGAATCCTGTCTCCAATTTTTGGCACCTTTTGATCACGTTCGATATCTC:1 + chr3L 9409149 5' - jockey2 3019 1 57.34 CATTATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 + chr2R 15375348 5' + 1360 64 1 54.69 AATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTT:1 - chr2L 15940361 5' + pogo 1936 1 59.59 GCTGTTGTCACTTTCTGGTTTGAAATTTTGTCAGTTTTTGCTAAATCAATTCTCTTTTTGAAGTAACTATTCGGAGTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 2146003 5' - roo 359 2 51.37 ATGAATAGGACATGCAACAAAATATGTTCGCCATTATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTAAT:1 + chr3R 27986329 5' - roo 9039 1 61.94 ATTTCTTTCAAGTCTCTAATTTCACTAACATTATCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 - chrX 20836708 5' + 1360 86 1 76.71 CGTTCCCCACCACTTCATGTATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGGGG:1 - chr3L 18403083 5' + P-element 2 2 79.44 AACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chrX 12986542 5' - roo 336 2 67.81 ACCGGCGCAGCTAACGAGCAGACGCAGAGCAGCTTCGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAACAAACTAA:1 + chr2L 3675840 5' + Juan 4072 1 48.55 CTTAGATTCGACATTGCATAGCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3L 11326660 5' - pogo 2059 1 53.28 AAAGACCGAGAAATTTTATTTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGCAGAAGGAAGTTATGCTGCCACACCCTTTATATTATTGATCAAGATCAATAGACGAGTCG:1 - chr2R 5185457 5' + INE-1 93 1 65.03 ACATACACGCCCAGGTCCTTGCTGTCACGGTGGGTATCTTATCCTTCTGCTTAATTAATTTGGGACATGGAATAAATGTCTGTGGCAAAAAGGTATCTGTACAAGCAAGACCACCACCGGATTCTAAAGTGTGCACCCGCAAG:1 + chr2R 16803577 5' + Gypsy12A_LTR 2213 3 53.15 AAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTTTATCTATTTGT:2 + chrX 292441 5' - G3 4493 1 75.34 AGTGTGGTTGTGTGCCCGGGTCTTTAAAGCTGATCAAGGGGTATATATATTTATTTATATATATATATATACATATTT:1 - chr3L 2927181 5' - G3 4505 1 79.49 TGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 - chr3R 15790993 5' - roo 8997 2 71.23 ATACTATTTTATGATCAAATAATATATTTATTATATTTACTTAATACTTTTGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTT:1 - chrX 14310373 5' + roo 405 1 65.07 AGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAACTCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3L 22890369 5' + FB 29 1 50.51 CAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGTGGGTGGGTGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chr3L 21327147 5' + copia 88 2 76.71 GTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 14366540 5' - roo 337 2 69.18 ATAAGAAACAATTCAACTAATGGTTTTTGATTAAAAGTTTTAACTCAGATATTCAAAAATAAACGAGAAAATTTTAAATGAACAGCATGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chrX 17343507 5' - I-element 5326 1 58.90 GTGGAAATAAAAACGTTGGATGCAAAATCAATAGGTAATGCTATTGAAGATTTCTTAACAAAGCAGATCTCAATCCTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGGAG:1 - chr3R 4569174 5' - Quasimodo 6896 2 59.26 AGAACTCTGATCGATTTTGGTATTCAATTTGATATATTTTTATTAGTTTCGTTTCAAAAAACCCATTGAATAAATTCAAAGACACGATATTTTTTAAATTTCATAAAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 21505595 5' + roo 13 2 75.34 TGACAATGCAAGTGGCGCAGTAAAGGAATTGCATTCGTCAGACTTATGAAAGAAAATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 11810595 5' + roo 8686 2 69.18 AAATCGATGATCAAAATGGTTGGGCGTACGAAAAGTTATTTTGTGATTGTCCTTGCACTTACTTTGCTGGTAGTTTAACTTTAGTTCTTTGTGGTTATTCGTCTCCTTTTTGTTATAACGGCAGCTTGTC:1 - chr2L 20374087 5' - HeT-A 237 1 53.85 ATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGATGTTTTGAG:1 - chr3L 14720909 5' + F-element 54 1 49.60 GTTTCAACGGGCATTGGACTAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGACGATCGCCTATACGAACTCTGTCGTAGATATTTGGG:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 7550 2 65.28 AAGCTAGTAAAAAGAATTAAGTTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGTACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATGCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 20898678 5' - roo 401 1 77.93 GCCTTTATTGGGTGTAAAACGTTTCGCAGGCGGTCGCCGCGGATGGATATGCAGATACAAACTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCTATAG:1 + chrX 12221171 5' + pogo 1680 1 60.96 AAAAACAGGAGGCCCCACCAACTCACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGGTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTT:1 + chr2R 18258745 5' - Juan 4210 1 70.31 CTATCACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 24369116 5' + roo 8714 2 61.29 GCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 18396052 5' - roo 9039 1 54.11 AAAATTGTATAGTCATTAAAAGTTAATCGTCGCAGTAACTTGTTGATGTTCGAAGCAAATATTTAAGTGAAATTTCCTTTACGCCTGTATGCTCGAACATGTGTTTAATTATAATTGTACACATTTGTTGTTGTTCGATTTGCCCG:1 - chr2L 9062984 5' - Bari1 1634 1 74.66 GAGGATCGCTTCACTCCTTATGACTTCGCCACGACAGAACAAATAAGAGAGACTCACCAGTACCTACAAATGCTATTGCAGATGTCTTGGCCTAAATAACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATGTGCCATGCCAC:1 - chrX 22727596 5' + Helena 14 1 64.38 AGTTTTATTGGCATAATTAAAATACGGACTGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAG:1 + chrX 7795382 5' - roo 8855 2 69.70 AAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGGACATTAGTATATTAGTTG:1 + chr3R 19450132 5' - roo 8616 1 53.70 TTCTTCAATTGTTATACTGTTTAGATTTACACAACATTGACACCAAAAAACTTGTCTCTTACTTGTTTCTGAATTTTTGTAGCTTGCGTATATTTATATAACCAACCAGCCGAGGAACGGGTATCTGATAGTC:1 + chrX 20509294 5' + INE-1 549 1 67.67 ATTCCATTGGTCATAAAGGTATCAGCAATTGTGGAAAGTATTTCGCTAGCGTTGCGACAATATCGACATAAAGTTTTACATTTATTATGTACTTATTATTAGTTATAAATAATTATTAGTCATTACTTATTAATTATTAGTCACCA:1 - 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chr3L 24904296 5' - gypsy7 5010 6 63.46 GAGCCATCTGAATCGGGGTTTCAACTTTCCCAGCGAACTGGGGCCGCGTATTATGGATATCTACAAGAAATCGGAGCACCCAGTTAACATGACGCACCTCAGACTAAAAGCAAGAGATTTGCACTGGCTTATAAAAGTTCGCT:1 - chr3L 1791961 5' + Doc3-element 4243 1 67.83 AAGAGACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 + chr3R 24090435 5' + roo 52 2 54.11 AGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2R 14653135 5' + 297 6606 2 52.45 AACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGGGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr2R 17878617 5' + Doc 79 1 66.91 GGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAAAGAATGCTATCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAG:1 - chrX 14770745 5' - INE-1 543 1 63.53 AAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 - chr2L 18347393 5' - transib2 2776 1 52.14 AGGGAATTTTAATGTTAAAAAGTACAAGAGAATATTCCGACTTTTATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 + chr3R 18971678 5' - Juan 4181 1 54.79 CTTAGACTCAAACCTAATGGACAACCTGTGATGAAAGCTTTCATTAAAGATAGCACTGAAGTATGCAAAAATGAAAAGCATTAGCTTTTCAATAAAATGAGTCTTAAAAGTCGATAAATAACGTTAATGGGTATCTGATAGTCGAG:1 + chr2R 7543333 5' + INE-1 552 1 70.55 AGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 - chr3L 18126020 5' + Ivk 32 1 55.94 AATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3L 17940188 5' + 1360 81 1 73.97 ATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACAC:1 + chr2R 20227230 5' + hopper 72 1 68.28 GTACCCTTCCCCCACATGCGAGTATATCAGTTTATGTCTAAGGCTTTAGCTTTCGCTTCAAACGATCATCGCCTATGTATTTAAAGCCCCGAAAAACTTTCGATATCCTTATTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAAC:1 - 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chr2R 8726150 5' + invader1 3808 2 66.44 GATGTGTATTAATACACATGAATTACTGGGATGGGAACTCCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 + chr3R 30946529 5' + Transpac 4998 2 71.23 AGGGGTTACCCCTTGTAAGCCTAAAAATACGTATCGACTTTGGATTAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGGATGGGTGGGCAGATTTTCTAGGTATTTCATTTTCTTCTCAGATAGTACTTCGATTA:1 + chr3R 17880537 5' - Doc 4440 1 65.60 CACCCATAAAAAAAAAACTAAGCAGCTAAAACAGAAACAAGCAGCCAGCTAAAAAAAAAATCCAAAAAAAAAAGAAATATACAGCCACAATCGACTATATAAAAAACCCCAATTTTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAA:1 + chr3R 9442122 5' + Idefix 171 2 61.27 GGAACTGGATGAAAACGGAAGCGGATGGTGGTTGTGCCAGGTTTTTCTGTCTGGTTTTTTCTTTTTCTTATTTTTTGTTTTTTCTTTTTCTCCCCGCTCGTGTGTATTTTTGTGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTCCTTCTTTTTTTT:1 - chr2R 8074932 5' - Doc2-element 251 1 71.92 GCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGCGTGC:1 + chr2R 22287442 5' + jockey 91 1 71.23 TCTAACAAATTGCCAATGTTACACTTGTTAACTCGTTTCGATTTGCTGAGCAAGAAAGTGAACTCCAGCGCTGTAACAAAGACCTTTCGTGTACTTTTTGCGGTAAACAAAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 + chr2L 14671771 5' + FB 12 1 77.40 GTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTT:1 + chr3R 19450173 5' + roo 360 2 67.81 CAGTTCGTAAAGCTAACTCGAAAATGTTCATTTTTCTATTCCACTATCCATTCATTTTTCACCACTTTTACCATATGGGATTTGGTTTTTTTTATTTATTTCGAGTTTCAACCGGACGCGTGTTAGTCCATTTAATTACTTTGAAT:1 + chr3L 2367914 5' - Copia1_DM 247 1 63.70 GTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAT:1 - chr2L 1923994 5' + G2 3042 1 69.86 AACCAAATACAAACTCTTGGCAGCCAAACACTTAAAACAATTAAAATAATCCAATTCCATAGTCGGCTTCATTACGAAGAAAATTACTCACAACGTTTTGACTTCGACCGATTTTCCTTGCTATTACACAGTGTTTTAAACCAGAT:1 - chr3R 17658329 5' - Tc3 497 1 74.66 GTAATAAATATGGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATT:1 - chr2L 4754961 5' - Stalker4 7299 4 59.59 AGATCGCAATAAATTAAAACAATAAAAGGCAGCAGTGAACAGGGTGTACGGGCATAAAATACGAAAAACACAGAAATTAAGCAACACAAAAGAGAGACTGAAATCTACATAAACATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGT:1 - chr2L 20885702 5' + invader2 4868 2 80.14 ATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chrX 12986603 5' + roo 8754 2 80.82 ATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 - chr3L 24131519 5' - Transpac 271 2 58.22 CTGATTGTTGTTGCAAGTTCTTTTGGGGTTAACTTATATTAAGAGAACACGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 2879695 5' + opus 35 4 57.04 AATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 15072674 5' - pogo 2051 1 54.11 TAAGCGACACATAAACCATAATTAAAAGCGCAAAACAGTTGGCCCCAAATCGAAGCCACCGAAAAAAAAAACCAGTAAGCAACACCAAAAATGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3R 9595139 5' + Tirant 8113 2 78.23 ATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTCCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3L 14720905 5' + F-element 47 1 50.00 ATGTCAAGTAGCGAGACATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTT:1 + chr3R 3851011 5' + transib2 58 1 54.79 CTAATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACA:1 - chrX 19980722 5' + X-element 4514 1 54.11 AATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:1 + chr2R 20010173 5' - Juan 4176 1 58.22 ATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr4 373087 5' + pogo 31 1 63.01 ACGTATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATCTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1 - chr2R 4870258 5' + Juan 68 1 60.00 ATTTTTATAGTTTTCACTCTCGCATACATTCATGGGTTCATTCGCATTCATTGTGGGGTGAAAAAATTAATTAAAAGCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATA:1 - chrX 20945584 5' - F-element 4309 1 52.74 GTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3L 3983901 5' - P-element 2851 1 55.20 AGGGACAGCGGCCACAACAACAGGGTACAACATTATTTAATGCTTTTTTAATTAGATGCAGTCAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGGCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAAT:1 - chr3L 8877766 5' - F-element 167 1 55.48 GGGCTTTTTCTATCCATGACAATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 13766339 5' + roo 8688 2 69.86 ATTTTGAAATTCTTTAAAAGATGGTCTAGATATACCTGATGGTTAAGGCCATTTTGGATAGTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr3L 24131347 5' + Transpac 4931 2 74.48 ACTATAGATAAATCAAATTACCACCTACAATCGAGTTCTAACACATTAATACCTCAACACCTCGATTTCATCTATAATGAACTTGTTGCTCTTTGCCTTATTCACCTTAAATACTCTCTTATGTCAACTAGACATAATTAATAAAT:1 - chr2R 20010739 5' + Juan 4102 1 75.34 GGGGGCAGGCCGGTTGAAGGCTGTGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2R 7849972 5' + roo 40 2 48.23 AATAGTCGCAGTCAAAATGGCGCAACAACCAAACGGAAGTGCGCCAAACGCCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr2R 10909212 5' - hobo 2913 1 53.85 ATGTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGAGACTTGGACTTGATTGGGGGATTAGGCACACGAGGACGTGAGAAAGGACAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCCACTCTGC:1 - chr3R 17562307 5' + invader4 2757 1 68.27 ATTCTTAAACTGTTTGATTGCCAACAAAAAAAAAGGGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATT:1 - chr3R 25708765 5' - hopper 1097 1 77.40 TATGTAATTCAAACACAGTGCATTATATCAGTTTTAAATGGGCGAGTACCTTCAAATGGATACGATTAGCTCAATTGAAGCAGAAGCAAAATATAGCACAATAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTTTATCCATCA:2 + chr2L 17323925 5' + 297 6521 1 71.92 GTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 - chr3R 5351455 5' + jockey 4734 1 71.54 TTTTGCTCCTGCTTTCGCTTTTGGCGGCGTTGCGGTTTGCTTGCCAACTGTTGATTTAGCGACAGAGACCGCAACCAAACATCGTTCACCACCCACTGTTCCATTCGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 + chr3L 21327026 5' - copia 253 1 82.22 ATGGCTCAACTATTGCCTGCATTCCAGACCGAAATCCCTTTAGATCTGCCGCTTTTCGGGACATTTGTCTTTAGTGCACATTTGGTGGGAGATCTCTATATAAATCTATTTCTTCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr2R 12779765 5' + I-element 17 1 74.66 AATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATACACATTACATATATATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chrX 11661357 5' - pogo 2079 1 68.57 GAAAATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr2L 19675076 5' + 297 6631 2 63.01 TAATGACGACGAAGCGCAGTGGTGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 19266810 5' - roo 9042 1 56.16 ATGATTTAGTTAAAACATTCACATTTTTTTTGGGAAAACTCTTTTCCTAACAAACAGACACACACACACATACTGCTTAGTTGGCGTTCTTTAACCTTCACGAAGGTCGTATTAATGAGAAAAAACAGAATGGTACATTAGAAACG:1 + chr3L 6260997 5' + Porto1 4365 1 79.45 ACTTGCAGTTGCATTTCAGTCCGCCAGGACGCGTGACTTTGTGACATTTAATGCCAGTTTGTCAGCTGGCTTTCTCGACGGCATCGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 + chrX 585605 5' - Tirant 365 2 62.07 CTAACAGTACTTACTAAAACATAGCATAAGACTCTTTTGGATAAGAGGCAGCAGAATCGAGGAATAAAGATAAAAGATAAAGATAAAGATAAATAAAAAAATAAAGACAGACTTCACCATGCAAGGAAGCATAATCGTATTTGTAG:1 + chr2R 15105990 5' - hopper2 241 1 50.00 CGAACAAATCCAAGCAAATTCATTTCGCATATGAAACAAAGAAACCAAATCTTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 - chr3L 20711790 5' + jockey 4792 1 39.73 AAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGCCATACTTGCTCCAACGTGGAGCTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAACCCCAGCTCAATA:1 - chr2L 21403535 5' + G5 4414 1 77.42 GCTTTCGCGGATCCGTAACCACATCGAGTATGTATATAAAGTCGGAATTTAGGGACGGTCGGTTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACTACGGC:1 + chr3R 13050738 5' - gypsy4 6434 1 48.76 ACTGCGTTTAAAATAATAATTAGGCAAAGAACTATCATAGTATAGTATAGTAGAGTATACTATAGAGTATACAAGACACGTACCCTAGAATGTGAATCACTTTCCCCATACCATTCCAATACAGAACCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr2R 7014127 5' + Burdock 6157 2 70.55 GTTCCAAAGTCAAAGGAAAATTGTTCAATTGCAGAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACACAAAGCTTTTTCTCTTCATGATCAAAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGCCAATCAA:1 + chrX 11442181 5' + Idefix 7253 2 76.71 AAATCTTACTTTGTGTTCGTCATTGGGTTGTTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAA:2 + chr2L 4888693 5' - BS 5065 1 63.70 ACGTGTTTCTATATCCGTACCGGTTTCCCCTTCTCCCTTTCAGCGGTGTGCAAAAAATAGTTTCGCTTTTAGTCATGAGAAAAATGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAA:1 + chr3L 22321634 5' + hobo 2717 1 69.09 ATTTATTGTTCACACTTCCTTTAAAGGTTCAAGAATGCAAATATATTCTTGAACAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:1 + chr2L 21940186 5' + INE-1 163 1 73.33 GTGGGTCGACACAACGCCCACTCCCATTAGCTGGTGGCGAGCCACTCCAACGCTCAACTCCCCCACCACCCACCAGCACCCGGAAAGTTGTGAAATAATTTATTTATCGTAAATAGA:1 + chr2L 3617816 5' + Gypsy12A_LTR 174 1 64.10 ATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:3 + chr2R 14653150 5' + 297 43 2 54.11 ACATAGATTTAAAATATTATGCAACACTATGTTGCGGGGTTGTAAGAGAGAGACGGGAGAGATAGTTCACAAAAGACACCCTAAAAACAATAAAAAAAAAAGATATAAAAGAATAAAAAAAAGGAAAAAA:1 + chr3L 14660232 5' + Doc2-element 248 1 24.62 CAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCC:1 + chr2L 11391475 5' - 1360 46 1 55.40 TAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTT:1 - chr2R 24169988 5' - transib2 2769 1 56.83 CCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:2 - chr3L 5061666 5' + 17.6 40 2 58.22 AAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 - chrX 18409456 5' + jockey 4728 1 62.99 ATACCAAATCATCTAACTATTTTTCACATGTCGGTAAAAATTTGTTTTATATTTTTTACGGTTTTATTGACTTAGTAATAACAGTTGAATATCCAGACCTCATTTAAATTTATTGTAAATATATTTCAAATTCAAATTCAAATTTC:1 + chr3L 14920327 5' + Rt1a 312 1 53.42 ATTCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCGC:1 - chr2R 12185457 5' + accord 20 2 68.75 AATAAAAAAGAATTCACGAAATGCTTAAAAATTACCTTACGAGACTAAAATAAAAGCGTCGCAATTGTTTTTCCTTATCTGATTTCTTCGTTATATTTCAATGCAAGTATCCATAAAGTCTTAGGAATAAAAAATATATAGACAGA:1 - chr3R 6683678 5' + G4 3602 1 71.23 GAAATACGTTAAAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATTCGTTACACATGC:1 + chr3R 15942715 5' + hopper 76 1 66.44 TAGGCAGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCT:1 - chr3L 14720927 5' + F-element 20 1 68.81 GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTCATTT:1 - chr2R 4745228 5' - pogo 2041 1 58.90 TATCACTTTCGGATCTGAGTTATCCAATCCTATGTTTATTCGCCCGATTTTCTATAATTTTATTGACTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 19032707 5' - roo 356 2 56.16 CATTGCAAATAGTTCAAGCGCAACCAGCAACGAAATTCTGATTGCTTTTACTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 8360536 5' + roo 8688 2 55.00 CCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCAACAGACTTGAA:1 - 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pogo 267 1 62.33 CAGTGGGTAATACAAGATATGCGCATGTGATATACAGATGTGTATGATCGACGCAAAGTGGATGCAATTAAAAGTTTACTTGTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAC:1 - chrX 698293 5' - 1360 182 1 56.16 ATTTGTTCAATGGGAATCTTTTGGCTTGCATAATGGCGAAATAATGTCTCCCCAACTTCTGAATTCTGACTCAGCGCAACCCGCCTCACAAAGGAGCCAGATAGGAACATCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGCGCGGCCTGCGG:1 + chrX 4593004 5' - hopper 465 1 69.18 ATATACACACATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr3R 15364063 5' - flea 240 2 76.03 GAAGAGAGCGGTGAAACCCACCCCTACAAAAAAACAAAGTGAAATGCAGCAAATTCAAAAGTTATTTGAGTTCATTGCATTTTCAAGCCACGCAAAAAACAACACCAAACAGCCCTGCAAACAACGCACAAAAGG:1 + chr3R 11776148 5' - Cr1a 225 1 76.30 CCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 + chr3R 27405936 5' + diver 32 2 63.01 GTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 + chr3L 12315712 5' + transib2 46 1 52.48 TGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCACTATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chr2L 4123865 5' + transib2 74 1 67.81 GAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 + chr3R 7666642 5' + I-element 70 1 61.64 CCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGAGTGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3L 22960516 5' + Tirant 40 2 61.90 AGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3L 12004209 5' - P-element 2870 1 73.13 GCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTACATATATATGTACATTTCA:1 - chr3R 9039047 5' - Juan 4183 1 63.01 AAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCA:1 - chr3R 15790987 5' - roo 8992 2 73.79 TTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:3 - chr2L 7593157 5' + jockey 4716 1 57.53 AAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 - chr3L 16470364 5' + jockey 4724 1 57.04 AAACAACCATTTGTTTTAATTGATTAATTTATGGGTTTAAGTTTGCTGCAACAAATTGTATTAAAAATATATTAGGTACCACCAATTTGTTTTCATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGT:2 - chrY 1421341 5' - flea 4988 2 68.49 TATTGTTATATAAATAAATATATTCTTTATGGCATTTTAAAGGTTCAGAACACGTTCAGAATTCCTTACTCATTTTTGATAAAATTGTGAAGGATAATTTTCAAGAACAACACTTTAAAATGCCATAAAGAATATATTTATTTATA:1 - chr2L 20066161 5' - pogo 2003 1 75.34 AGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chrX 959062 5' + 412 75 2 79.69 AAAAGGTAGAGGTGGGGTAGTATGGAGAACAAACGAAAAAAGGAGAGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTAAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATG:1 - chr2R 19162204 5' - I-element 4967 1 69.86 CCAGGGAATCATGAGCAGACCATTATCATCATTTTTTTTTAATAATTCATTCTATTTATGTTGGATTCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTGTCTTT:1 - chr2L 22225082 5' - G5 4745 1 78.08 GGTGTGGGATATAAAGGACCATCGCTGACCGTGCTGATCAGAGCGAGATGGAAATGTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCGCAATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 + chrX 12066053 5' + transib2 2 1 79.86 GAAAATAATAATCAAGTTCAGCTAGAAATATGTATATATTTAAAATGTTATACAAATTCAGTATAAATTTTTAAGCTGGCAATATTTATTAATAATGCACAATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2R 14653121 5' + 297 14 2 60.96 TACTACCAATGCGGCTAAAAATCCATGCACACGAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3L 6964752 5' - P-element 2840 1 36.19 AAACAGATCGCTCGGCGTAAGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATTGGGGTCAACGCTCCA:1 - chr2R 6482525 5' + gypsy 7055 2 60.00 ATGGACCCGAAGTTGATTTGAATGTGGCCCCTGAGTCAGGACCTCTGAGCAGTGCTAACTTCGTTAAATATTACCCCACCCCACCCTTTAATGCATTTTCAAGGTCTTTTTCTTTTTCCTCTTTTTTTT:1 + chr2R 20845723 5' - Doc2-element 233 1 58.14 AAATAGGTTTATGGATAAGTTTAAGAGTTCTAGAAATAAGATATAAATTGAAATTTTTTTTTGGAGTTTCAAGTAAGACTTAAAATTATAAATGATATCATAAAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:5 - chr3L 3030348 5' + roo 17 2 69.86 ACGTATTAATTTGTCAACAGCAGAAAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chrX 7525343 5' + Doc2-element 246 2 75.00 CTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATATCCAAGGCATCTGTGTAAACAAATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTAGTGCACCGTGCATATCTGATGTAAATGAATCGAGTGCGATAATTTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr3R 15790867 5' + roo 85 2 58.22 GAAATCCAACTTAATTATAATGTGTATTTTCCAATAGTTTAGATTTCTAGTGTTTCCCCATAAAAAGTTTCCAGGAAACTTGAGTGGTAACATTTCCTTGCTAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATG:1 - chr2R 19374334 5' + P-element 499 1 72.60 GTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGT:1 + chr2R 9966972 5' + Bari1 54 1 52.05 ATTCATTTTTTAACAAATCACATTTTTTTTTACTTATGGAACAAAAATTTACTTTGTGCACACTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTTTTTGGCAGAAAGGAAAAAAAATATTTGAACGGAATAAAAA:1 - chr3L 24739492 5' + transib1 46 1 68.80 AAATGAACGTGAAGTGCCAGAGAAACGCGGTCGAAAAGAGACACCAACTTTAGGCCAACAAAAAACCGGCTCTATGACATCAAATTTCTCGCTTCACTGTTTGCTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 24090400 5' + roo 8681 2 70.55 GTGATCTATGAACTCAAAATTAAATTTACAAAGCCTTTCGAGTTCAAACTGAATATATAGTTCCTAAGGGGAACCATAAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3R 30675325 5' - 297 357 2 57.93 ACTTTGTTGAATTGCTCATTTTGTTGACATGTTGTTTCCAAGCGCCTTGGTGAAGTGATTTAGTGCGTTCATATGCCAAATCTTCCGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:2 - chr3L 10373952 5' + 297 31 2 64.38 GTCCTTACGTATTTTGTTAGATTATTAATCTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 10167518 5' - roo 396 1 74.66 GTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCT:1 + chr2L 15550649 5' + Bari1 42 1 55.07 ATAGTTGTCCTCGACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr2L 15188487 5' + 297 33 2 63.70 GTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAA:1 - chr3R 28385601 5' + transib2 86 1 75.00 GACTACAACAAAAGCCAAAGGCAACAGAATTTAGCTATATATAGACGAAGACCTAACTGATTTGAAATGGCAGAGAGTAAAATCAAAGCAAAAAGAGACCAAGCCAAGCCTATCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGG:1 - chr3R 15674723 5' + G4 8 1 70.14 TATGAAATATGAAAACCTTTCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTAAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr2L 7593183 5' + jockey 4686 1 74.65 ATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGGAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATTTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 14366563 5' - roo 8985 2 81.29 GGCACACAGATTGGGAGTCTGCAACATGTGTAGTGGGTGTTGTTGGGTTATAATGAAAAAGGTTGCTCTTTGAACGTAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGAATGTTGGGCGCCAGTTAATAGATTTGTGTTTTTATGGATG:1 + chr2L 9111252 5' - gypsy7 5459 2 56.16 TTTTAATGCGAATATAAATGTTGCTTTGTGAACTTGTTATAATTGCGCTGTGATTATTGCTTTATATACAAATTCGTACATTAAGATATAATCCCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 9782034 5' + P-element 27 1 67.12 TTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr3R 20167675 5' + roo 64 2 63.70 AACTACTGTATTGTGTTTAGCGAAATAAAGGACACAGTGGGAGTTCGTAGATGCCTAAGGATTAAAAGTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAA:1 + chr2L 7618447 5' - X-element 4665 1 52.05 GTCAGATTACGACTTAAAAATAAAAATAGTTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 + chr2L 15913258 5' + transib2 84 1 74.66 ATATACAGACCACTATATCGTTGTTTCAGGGTTCAAGTGCAAGTTCCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr3R 19449956 5' + roo 8734 2 68.31 AATGATATGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGGAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 8959738 5' + 1360 3 2 78.36 AAATTGTGCACACACAAAGCGGGTCAGTTGTCCACTGGCCACAAGTTAGAAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTC:1 + chr2L 13768349 5' + G6 1953 1 61.02 ATGTTTCTAGACCTGTGGTATTTTTTTCAAAATACCATCTAACCGCTTTATCCTCCACGAAAAATGTTTAATCAACCCAACTTTTGTAATCAAGCGTAATGCAGCGAAACACCACCCTGCACAAAGACCTAAAAC:1 - chr3L 23224577 5' + X-element 4353 2 77.78 ATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2L 21328281 5' + 297 6619 2 62.33 AATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTC:1 - chr3L 11257425 5' - 1360 12 1 50.68 GGATCTGGGAGCTCTCGAAGTGATCGGCCACCTGCTGGGACTTCTCAAGATACCGCTTGAAGAACAGCATGATGGGGGAGGAGTCGATGGAAGCGATCTTCTAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGTCAGAAAGT:1 - chr3R 28901366 5' + transib2 16 1 74.66 AGTTGAGGAAAGAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTA:3 + chr3L 13365715 5' + BS 5023 1 57.53 GACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3L 17940214 5' - 1360 3369 1 67.74 TTATGCATTTTTTATCTTAAATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 - chr2L 15936906 5' + copia 20 2 71.92 GATTAATCACAGTTAACGATTAAGTTTTTCCATATCAGTTTATAACGTTAAATTCGGCTTATATTGTATTATAGTTCTCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAACTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAA:1 - chr2L 1200508 5' + diver2 299 2 54.11 CTTTAAAATTAAACTACTGAAAAGAAGGTGAATGGGATGACGCGGGAAAAAGACTGAAGATGATATGATTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTAATAGTTTCCTTGACTGTTTGTAT:1 + chr3R 10736969 5' - Porto1 4410 1 53.42 AATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGCTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2R 9871590 5' + roo 4 2 79.65 GCCAAAAGAAACCGAGAGAAGACAGAAGGGGGGCAAGGAGAAAGACAGCAGTAGAAAGAGCTCAAAAAACATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCG:1 + chrX 10931235 5' + gypsy7 274 1 52.05 TTTAGATGTTTTTTTTTTCCTTTTCTTTGG:1 - chr3L 18334314 5' - Doc2-element 217 1 93.33 TTATATATATATATATATATATATTTATTATTATTTATTTAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTATTCTC:1 + chr2R 5663396 5' - Doc3-element 4662 2 67.39 ACTCACACACACACACACACACATACACGGGCACACACA:1 + chr2L 768921 5' - Stalker 445 1 84.62 AAGCATAATCAATATAAAGAAATATACACAAAAAGGCGGCGCCCAACAAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAA:1 + chr3R 24686675 5' + Burdock 6134 1 64.52 AATAATTTCTGATTAAGCAGGGCAGTGAGCCCCAACACCCAAACCCACCCCTTCGCGCCAAGGGAAAATCTCTGACCCCCGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:2 + chr2R 20348933 5' + transib2 39 1 57.53 AAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTT:2 + chr2R 19199693 5' + hopper 90 1 78.08 GAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTA:1 + chr3R 15724311 5' - Juan 4145 1 64.38 CATGTCCATACCCAACATCTTTGTGATGCACGTCAACTACCAAGTTTAAAGCAGAATAAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:1 - 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chr3R 29690788 5' - I-element 5292 1 62.33 TCTACGTAGAAATCCTCTAGCAAAGCAGCCGATTTGTAACGTGTAACAAAATAAAGGGATGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCTGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATAGCGTTGGGGGTGGTGGTCTTGTTTGTA:1 + chr2R 1530581 5' - Gypsy12A_LTR 2168 3 72.60 GCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGTCTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCTTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATTAATTAGATTTAGG:1 + chr2L 22193431 5' + roo 8740 2 65.07 ACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATTAAGTCTAACTTTTTATGTCAATATATCGTCC:1 + chr2L 4123841 5' + transib2 43 1 53.24 TAAAGTGTTTATAAAATTTCTTTATTTATCCCAAAACGGTCACGCCCACACTTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTC:1 + chrX 23066286 5' + INE-1 512 1 70.71 CACATACCCGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chrY 2720405 5' + 297 6600 2 72.14 AATAATTTACGAAATTTCATTCATAGTTCAACATTGAAGCGTTTTGGAACAAAAGCCAGCCAAAACAAACAATGTATGCCATCCACAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 21980794 5' + G2 3075 5 89.52 TGTCAAGTCCTTTTAAATTTTCAATTTCCCACCTTCAGTGTCTGCGAAACGAGGTAACCTGTCCCGAAAATACTATACTGCAGCATGCTTTCAGGCCCTGGCAACACACTGCTGGGCACACACACACAACCACACACACACACAC:1 + chr3R 19752118 5' + gypsy3 418 1 65.52 GAAACAATATATCAAAACATTTATCAGTTTCTATATGCACATCTTTTTGTTTTTTTTTCCTCTCGTTTGGGAGGTATGCCATTTTTTTTATGATTTTTTATTTGCCATTTTTTTTTT:1 + chr2L 1914190 5' - Doc2-element 251 1 73.50 AGCAGTAATCTCTTGCTATCACAGATGCTGCGCAAAATGCAAGACTTGACATCAATGCCAATCCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 24369131 5' + roo 8717 2 55.63 ATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr3L 16470362 5' + jockey 4737 1 61.64 ACAACAAGTTGTAAGCGAAAGCGATAAGAAATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACT:1 - chr3R 22590620 5' + rover 6974 2 69.86 AAAATATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:3 + chr3R 7719678 5' - roo 9053 2 72.60 ATTTCGTTTCTAGGTTTTCAAGTTAAAAAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3L 9809207 5' + 412 7074 2 69.86 TATGGCAAAAGCGCACAAGAAAGAGAAAAAGCGAAATAAAATGGGGCGCCGCCTGGCATTTCGAAATCAATCAACCAAAATTGCCCTCTGTCCGTTCGGTTGCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGT:1 - 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invader2 178 2 65.07 AAGAATTCTTTCTCTCCGTTTATTTGCATTCTTTTTTGGCTTGCCCAGCAGATTTGCAAACAGTTTTTCCTTCTCTCCCTATTACTTTTTTTTTATTAGAGTACAAAATTGTTGGTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTAAAT:1 - chrX 15044465 5' - TART-B 10633 4 70.00 AGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chrX 1135381 5' - P-element 2816 1 34.29 AAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTTTACTCTACATATATATAATTAA:1 - chr2L 17005825 5' + Stalker2 29 2 61.19 GAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3R 22642262 5' + blood 7052 2 56.16 GACCTCCGTGTGCTGACCGTCAACGACTTTATGAGATAGTACGGAACGTCTTCATTGACAACTTTAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGAGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATA:1 + chr3R 4204435 5' + G5A 2591 1 55.28 AGTTTTGTCTAAAAATACTCAGCCACCAATAAAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - 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chr3R 16342029 5' + P-element 67 1 38.36 ACTATTTCAATAGAACGGCAACACAAGGGAAAGATTATGTAGAATTATGAAAAATATTTTAAAATGCTTTTATTGGCTTTATGTGAAGTCTTTTTAGGCACTTTATGCGTTTTTTGCCCACCACTATTATTCTGACCACAGCTGTA:1 + chr2L 13261942 5' + HB 1629 1 46.58 TCCCATATCTACAGAGGCCAACACCCACTACGGTCAGAAATGAATATTTATTGCCAGCAAAAATTCAAACAAATTAAATAATGAAGATTGCATTTTAACGGGCAAACACTGGGATCAACACAACACTTACAAAAACTCAACGAGTA:1 + chr3L 10836792 5' + roo 9046 1 80.14 GTATTATCTGTTCGGCACTCGGTAGTCGGTAGTCGGATGCCGGTTGCCATGGCTGGCACACTTCAATGCCACTCCCGATCCCAACCGCCAACAGTTTGCTTCATTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3R 11469261 5' + Tabor 18 2 73.97 TAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGGATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGGTTT:1 + chr3L 22890388 5' + FB 78 1 73.64 AATATTGAGAACATATTAAACATATAGTACATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTG:1 - chr3L 8346251 5' - micropia 5334 2 79.45 TAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 - chr2L 13556462 5' + transib2 37 1 53.52 ATTTCGAGTCGAACAGTACATGGAGTAAATAACGAGATGCCTTGTTAAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGCAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATA:1 - chr2R 2318228 5' + ZAM 72 2 63.70 GTTGCATATTTTCTTTTATTCGATTCTTGCATACACTTTTAGAAACATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr2L 4123981 5' - transib2 2793 1 61.38 AATGCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGCTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr2R 4606189 5' - 1360 3340 1 52.41 ATAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAA:1 + chr3L 22890322 5' + FB 5 1 77.05 AGCTGCTATTTAATGGACCTATCCGAAAATCCCCTATCGAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 - chr3L 14094743 5' + I-element 2 1 81.51 GAGATGTATGGTTCTAGAATTGCTACTTAGACTATCATTGTGGATGTTTTGCTAACAAACTCCATATCATACCAAATATCCACTTATGAGGAACCTTGCTTATCCGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr3L 19454882 5' + mdg1 7055 2 72.41 AATATGAAAACCTTTCATGCTTTTGTTTAAGCCATATAATTGGCCTACGCTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGCGGT:1 - 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chr2L 14501128 5' - Porto1 4530 1 80.82 GCAAGTTCTTTTGGGGTTAACTTATATTAAGAGAACACGTCGGAAAAACTTGTCATGTTTATATGGAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 2879707 5' + opus 7156 4 53.91 GGTTGAGGTTGCGGGGTCAGTGGATCGGGGAGAGGTGTGTTGTCTATGGTGGGGATGGAGTGTGGGATTTTGTTGGTGACGTACGCGCTGTTATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTG:1 - chr3L 11384686 5' - Gypsy6A_LTR 255 1 28.08 AGTTCCTTTGATGAGACCAATTTCTATTGTTAGGATAAACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGGAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr2L 21328106 5' - 297 6964 2 77.40 AATATAGTATATATATATATCTGTATATATATATATATGTATATACATAGATGTACCGTTTAATGCTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2R 11222921 5' - copia 244 1 55.48 AATAGGAATTGATTAGGTGTAAACAGTAATTAGTCATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTA:3 + chrX 5323221 5' + Juan 4096 1 51.37 AGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTTTACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGACTGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGG:1 + chr3L 20189588 5' - FB 228 1 48.28 AGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chrX 8092487 5' + pogo 40 1 57.26 AATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGNCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTT:1 - chr3L 25482975 5' - accord 464 2 68.49 ATAGCCATGACCGCCCGTATAAGGGTCCCGAGCGCGCGATACACGTTAAGTAAAGGGGATACGAGATTCGTTGAAAAGTATGTATCAGGCAGAAGGAAG:1 - chr4 1228517 5' + INE-1 28 1 51.52 CGCATCGTTAATTTTCACAGCGTGAGCAAATTTTCCATGCATAAACTTAAAATTAGCACAAGGTTCCCTATCGCACACATACAGTTGTTTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGC:1 + chr2R 20723710 5' - 1360 134 1 63.71 ACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chr3R 6419818 5' - Tabor 448 2 58.22 AGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 17077120 5' - roo 324 2 76.71 CCATTCTCATATTGATGATCTTGATAGCGAAAGAATCAACAAATCATATACGATGAAATGATGAAAGTGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGA:1 + chr2L 8430802 5' - 17.6 245 2 60.27 AGGTGAGTGATTGTCGGAAGGCGAAAGATAAATATCGGTGTTTCTCTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGCTGTATGAAAAAAATTTCAACTTTGAAAA:2 + chrX 12433338 5' - hopper2 1231 2 75.34 TTTTAATAACAATATTACATTTATACTAATATTATTTATATTACCGAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATTAATTTTT:1 - chr2L 21220667 5' + Juan 4106 1 58.87 ACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTCCTGTTTTCTTC:1 - chr2L 17180133 5' + Juan 74 1 63.70 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 27391422 5' - 1360 3365 1 64.38 AAGAAAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATTGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGTAATTCAGTCTTATTCCTTTTCTAATAAGTGTGTGTTGTGTCATGCAGCCGCCAAAACT:1 + chr3R 9359386 5' + diver2 4537 2 18.18 TGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr2L 16690720 5' - P-element 2847 1 48.78 ATTGAAAAAGTGCGTGCCGCTGCATCCACATCAACACACACACACATATATACATATGTATTATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCAT:1 - chr3R 22590590 5' + rover 51 2 59.59 GCTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr3R 16630384 5' + FB 38 1 59.59 ATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr2L 6654674 5' + diver 87 2 75.34 CAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr3L 22400267 5' - 1360 3321 1 63.70 AATAAAACGAGAAAGACAGCAAACAAGCCTACCAAACATGAGCGTACTAAAACCGCCTAAAACTGCCACGCCCACATTCTTTAACATTCTTGATCGATATAATTTCATAATTTTATTAATGGTGTACATTTCTATCGATTTGCAAA:1 - chr3R 26892761 5' + INE-1 307 1 68.49 AAAAGAGCGAGCTTAAATCGGGCTAACAAGTGGCGCAGCAACAAGTAGCCGGTGTTTGCGGAGAGCGCTCGAGAGCAAGTTCGTGTTCTGGAGTCTTTCGTTTTGCGAATATGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - 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roo 9015 2 61.15 CACACAAACACTCTGCAAAACCAAGTCGAAAAGCGGAAACGGAAATGGAAACGCACTCGGTAAGCGAAGCCACGCGACTTGTCTTCCGGGCTCATGCCCTTAACCAACAATCATGACACCC:1 - chr3L 11173944 5' + I-element 174 1 73.55 GTGCACTGTGAAAAAACTCTACATTCAATTAAAATACATACATAACATACATAATACACACATAAATCAAGAAAAAAACATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:2 - chr3R 12728095 5' - Juan 4180 1 57.53 CAAAACAAAAAAAAAATAGCAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:2 - chr3R 19992784 5' + hopper 11 2 78.77 ATTATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:3 - chr3R 19073292 5' - roo 355 2 54.79 GGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 25401028 5' + Doc 40 1 48.97 AGTATCTGGTAGCAACGGGCGCTATTACGCAACTCCCAGCACTCATTCCGCTTGGCCAAAAGCCAACGTTGACCTACTCGTAGTGCCAATCGGAGGCTAGTGTAATATTTTTTAATTTCGTTTAGTGAAATTGTTGTCCAGGCTTT:1 + chr2R 7903612 5' - Tc3 1337 1 68.49 TTTTTGAAGTGCTTGGTACTGGTGTTGTTGTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTGG:1 + chr3L 4514050 5' - mdg3 417 1 62.79 ATATCTCGCATCCATTGTTGGCTGCTCCTCGCTTACCTGTTCCAGATCCCAAAATCTGGTGTTCAAACAGAATTTAGCCGACAATTAATACGAGGCTTTTGGGGTTCCTTATTTTATATTTCTTAGTAGAGATACTTTTGAACGGT:1 - chrX 3355204 5' - mdg3 5133 1 76.03 CAGGCAGGAACATCATTTTCATATTGGCCAGCGCGTAGGAAAACATCCCAAGAATGTTTGGGCGATCTGGTTTCACTTGTTTTCGAGTGAGTACTCGAACCTTGATTTGATTCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr2R 8735521 5' - mdg1 7450 2 78.77 AAGTATTCCATGAATTTGGTATTCTCATTAAACAAAATTGTTATTATAATTAAATTTAATTTTATTTAACCCTTTAAGTCAGTTGGAAGAACCTTTTAATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 21505788 5' - roo 392 2 73.29 AAACCATATCGAAAAAGCCGTGGCCAAACGTACACACACACACACACA:1 + chr3L 3454801 5' + accord 7099 2 54.17 TGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGCAAGCCTCATCTGCATCAACATTGGCATATTCATTCCAATTAATTAACAGAAAAAAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3L 16437248 5' + F-element 44 1 43.15 GTAAACAAATGACTTTCGAAGTAACACATATCCTCCGGTCACCATTTTCGTTTCATTACAACATTCACCACTTGCAGATATCGAAAACTGGCATTAAAATGGCACCCAGACAAGAATCCCGACAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1 - chr2R 16205875 5' + I-element 4979 1 80.82 AGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3L 12004243 5' - P-element 2829 1 45.39 GAATCATAGTATAACTGCAGGCGCGGGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCT:1 + chr2R 16929751 5' + jockey 4526 1 63.70 GAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:3 + chr3L 23773165 5' - roo 9038 1 43.15 GACATATTGATGTGAATAATTAAAATGAATTGATGGCTTGTTGCTTGTCGAATTCATTTAATCATTTAACGTATAATATTAACCCTATTCTTTAAATTTTATAAAGAATAAATTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:2 - chr3L 11326831 5' + pogo 4 1 78.77 ATCCCACATAAATACTTATACTTACTTCTATTCAATGGCGTTTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 13973095 5' - 412 477 2 73.29 AAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 + chr3L 16662402 5' - jockey 4910 1 76.03 GCGAGANATTTTTCTCTCTGTCCCACAAATCTCCATATCCTTAGCTTACCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAA:1 + chr3R 3851021 5' + transib2 68 1 62.33 GCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 31653177 5' - roo 9028 1 55.71 GTGCATCCCCAACCCCGAGTTTTACTGACACAGCTCCTAAGATAAAGAGAGCGCCAGAGAGTCTGTCCTGAGAGAGAGATAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAGGACACATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr2R 18515015 5' + P-element 15 1 72.34 GTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGT:2 + chr2L 19817789 5' - G4 3780 1 60.96 GTCTTAAAAGGAGTTTATTATTTGAATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:1 + chrX 17717014 5' + FB 53 1 61.60 CCGTTGTGTGCTGCAAATACAACAAATTAGTTTGTACAAGAGGAGGTCGGAGTTTTTCACAATAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAA:1 + chrX 6526049 5' - blood 7176 2 77.65 AGTTCAGTTCTTTGATCTGATTCAATAATTGATTTAGGGTGGTTTCCGAAAGTTGTGGAGCTGCTTTGAACAGAGAAGTTTATCTAACTAACCATGTCAGGATTATTACACATAAAGACTGTTCGTTCTATGGTTAGCTAGGGATG:1 - chr3R 1208911 5' - Cr1a 4005 1 58.90 ATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3R 13973044 5' - 412 426 2 62.33 ACTTTGATTGGCAGCCTTCTTGGTAAAAGTAGGGGGTATCCCCAGACCACAAGCTGGGGCAAAAGCGTCCTCACTCTGGCAAATAGCAAATAGAGCAAGACAAACAGCAGCAGCAGCCGCCACAGCAACAACAA:1 - chr3R 19729227 5' + Max-element 269 2 53.73 AGATCATATTTATTGTAATAAAATTAAGTCATATCAGTCATGATTGGAAATTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGGGCTCCGCACAAAATCGGTTGATTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chr2R 16510112 5' + F-element 72 1 58.65 ATGCAGTTTTCGAAAGTGCATCAAAGTTGGAAATAACTTTTGGACTCCTACAGTTCTTTTTTCTCATGGGACTTGGTTAGCATTTGCGTTGCTGACGTCAGTATTAATTTTTGGAAAAAAAACAGGCCAAATGCC:1 + chr2L 3180090 5' + hopper 1406 2 73.33 AAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCT:1 - chr3R 9238193 5' - P-element 34 1 15.75 GCCTGGGGGTCACCGCAATTGCAGCCATTATCTTAACGGGGATTCACACACACAGCGATCGACAAGCCCACACACAGATATATGTATCTATATATGTATACATATATACATAT:1 + chr3R 24408205 5' - G3 4507 1 79.65 ATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAA:1 - chr3R 3286202 5' - Gypsy12A_LTR 1942 3 67.18 ATGTTTGGCATGGGTTTTTTTTCGTGAACTTCTTGGAAACGTCGTTTTTGAAAACAATGGAAGTTTGAAGATCTTTTGGTATGATTTCATCCTCCACCAGAGGAAAGAAACGCAGAAGAAAAAACCAGCGCTGCACA:1 - chr2L 14679605 5' + rooA 443 1 64.96 AGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGGGGG:1 - chr3R 11040154 5' + Bari1 57 1 57.66 ATACGCGATATGTGATTCATATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGGAAGGTTGTGTGAG:1 + chrX 18282489 5' + P-element 83 1 21.67 ACACAAGCTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTCATT:1 - 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chr3R 18845919 5' + hopper 151 6 81.73 ATTATCGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 17940037 5' + 1360 14 1 60.00 GTCGGCGAATCGCTGCGTGGCTCTCACGCTGAGCGTTTTAGCTCGAGTGTCGCGTTGGAAAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3R 13875021 5' + P-element 2 2 76.85 ATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAG:1 - chr2L 22684594 5' + transib3 77 1 60.96 AGAAACATTTAAGACATTTTCTCCTTAGTTCTTAGTTTTATAGCCCTTAGCATTAAATCGCTACCTTTCTAGACATAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 9544819 5' - roo 9027 1 55.48 TGGCACGCATCACGTATACGACCCGTGGGCTGCGTGCGTGTTTTTTTTATTGTGCTATTTGTCGGGCATTTTTGTGTTATTCTCGATTTTGGTTTTTCAGCTTTGGTGATTTTATTTTCCTTTTTTTT:1 - chr3L 4984422 5' - Doc2-element 254 1 65.62 ATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2L 71147 5' - 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chrX 1799262 5' - invader4 3062 2 67.12 TATTGCAGTACTGTTCTGCCTTGTGATGGAAAAGAACGCTCAGCTGCAGGACAGCTGTTCTCTCGTCCAAGCCCGCGGCAAAGTCCTTCCAAGTTCGGTTTAATATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr3L 1027938 5' - Juan 4203 1 65.07 TGTAAGTGTAGTAGTTTTTGGGGCTTTTTTTTTATTATTATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCAAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAAT:1 + chr3R 19956119 5' - Idefix 207 2 75.17 TAGAGGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAAGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGG:1 - chrX 22727598 5' + Ivk 5104 1 52.86 AGTGTTCAAGATCAAGAATCGCGCTTCCCATTCCAACATTATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAA:1 + chrX 22641680 5' - G6 2015 1 68.22 CATGATAAAGAGAGAGCATAAAGTAAAAATTATAATCATAAAGGGCAGATCGTCTTCGCTGTCCCAGCTGCTGGGTCAAGTTCAAGGACAAGCTATCAGCAATAATATAGAAGCTAGTATTCAAAATCGAAGGAAGCAAATAAATA:1 + chr3L 14609565 5' - Gypsy12A_LTR 2060 1 73.29 GTGGAAATATAAATTAAATGTCAAGACTGAAATGTATGTGTAAGTTAGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAG:1 - 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pogo 2065 1 56.85 AGCAAAATACGTGAATCGTTAGCCGTAAACAACAAAACAAGACACTTGCGATTTGAGAGTGGCACTCTGGAAAATTCTCAACCTAATTTCCGACAGGAAAAACAGCCTTGAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 12249751 5' + roo 8674 2 76.03 CACGTTTAGCAGCGGAAATTGAGAGGAATAATACGATACCTGAAATCGGACAAGTAGCGCTGGTTATATTAAGTTTATTAATTTTTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 + chr2R 18258768 5' - Juan 4169 1 47.26 CCATTGTTTCTTTTTTCCGCTTTTCCCGCCCAAAGAAAGCACTGCGGGTGGAAACGCAGAGGGGAAAGTGTGAAATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTA:1 - chr3R 30987596 5' + F-element 115 1 51.37 GTTCCTTATACCGCGGTATAATCACATTCTCCCGAAATTCTGTGTTTTGGTGAAGACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAA:1 + chr2R 4673515 5' - Quasimodo 7355 2 76.71 CTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGATTTTTGCTTAAT:1 - chr3L 17568118 5' + S-element 64 1 60.96 GACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3L 17940214 5' - 1360 3347 1 57.53 GTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 18488385 5' + roo 80 2 73.97 AATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr3R 27765102 5' - mdg1 345 2 69.86 CAGCATGTCTTGAAATTCCCATGATAATGAACCTCTAACACACTCGTCAAATGCGTGTCACTCGGGTTCTCTATCTGCGTGTGTGTGAGCGTGTGTGTTAGTCCTTTTGGACATGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTT:1 - chr3R 25723917 5' - hopper 1078 1 78.08 ACTCGCGCCGAGATTCTCCTCGACTATCCTCGCGTACGTACGGTGCGTCCTCTTTGTGCACGCACCACTACCG:1 - chr2L 23332590 5' - gypsy8 4795 2 56.16 TGTTGCGGCCGCATTTGATTTAAGTGCACACTACATGAGGCAGTCACTTGAGAACGTTCCCC:1 + chr2R 6894782 5' + roo 167 2 66.13 ATCTTGTAAGCTCTCTAACTCTGCATTGTTGACAGTTAAATAAATATTTTTAAATATAATTATATAATCTTTTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 15940195 5' + pogo 44 1 53.10 GGGATTTACCCAACTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 - chr3R 16341991 5' + P-element 61 1 19.61 GATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 23067524 5' - roo 9005 2 63.70 AGAGAAAAAAAATATTTATACATGTTTAACGTATTTAGTTTAGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCCCAAAATCGGTT:1 - chr3L 14720922 5' + F-element 46 1 53.85 AAATCAATCAAAAAATATTTAAGTAACAATATATGCAAATATTCATATTTTATTTTTGTTATTTATAGGCAGATACCTAAAGACATATATAAATATATATATATATACATATCTACATAT:1 + chr2L 440081 5' - G3 4507 1 34.17 TGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chr2L 16690718 5' - P-element 2823 1 40.00 ACCTGTTTCCATTTGTTTTCCATTTCAGCTAGCTCCCTTTCTCTTTCCTTTATTTGCTTTTCCTCCTTTTCCTCTTTTAATTTTTCCCGCTTGTAATTTTCTTCCTTCTTTTCGTCTTTATGGTTCTTCGTCTCCTTTT:1 - chr3R 22375284 5' - HeT-A 257 1 67.63 ATGTTTGGGTAGCTGGGAGCAATACTTGGTTCTTTTTTGTGACGAAACGATGTGAAGGTTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 47092 5' + roo 8718 2 59.42 GAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr2L 16540940 5' + hobo 72 1 74.48 ATTATAATTCCACTGGCTGACATTATTCCTAGGACGATTATAATTTTATACGGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTATATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTCCGTAGCAATATGATA:1 - chr3L 25801566 5' - 1360 3113 1 64.38 GAGCCATTTTCGATTTCGTTTTCGGATTACTTTGACAGCAAATTCGACAGCATTTATTTTTAGATGGGTGTTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr2R 13931640 5' + P-element 51 1 52.05 GCTCTTCTAATTTGTTCGGACAAATGAATAAATATATAACAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 + chrX 2479506 5' - mdg3 5418 2 69.18 GCCACAAGGCGAATGACAAAATCACAGAAGTTTGAGCACAAGAAGGTTGAGCTTGGGTAAATGAGTAGAAGTAGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 13972936 5' + 412 48 2 53.42 ATAAAAATTAATTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3L 16470384 5' + jockey 4709 1 58.57 ATTTCTAATTCAATTTGACATGGAATTCTTTTGAGTGGAATATTATTTAAGACATTTTGACATTGGGCTTAATTCTGAAGCTATCTTTACAATTAATCGCGTAGTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:3 + chr2L 17180031 5' - Juan 4196 1 71.92 GGGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTTGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 + chr2R 3338790 5' + Juan 66 1 60.27 TTAGCATATTGCTAGCACAAATCGAAATAGTTAGATAATCGAAACAAATCGTGTGTTGCTGGGCTATGCCGCGTGTGTATATACGGCACAAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGACTGTAGATGGCATGCACGATTCA:1 + chrX 13594078 5' - Rt1b 5078 1 65.75 TAGAGATGAACTCGTGATTTGATCGTAATGCTATTCGCCAGATTTTAGCACTTTCAAATACTAAATGTATCGAACGTTTCGGCGAAAGGACCAAACCGATCTGACCCTGTCCTTTTGTCGGTCCGTCCGTATGAACGTCGATAGCT:1 - chr2R 25107440 5' + INE-1 133 1 62.33 ATAGTTTTCTACTCCGGTTTTCGCAAGCCGGTGGCTTCACAACAAATTACACACAAACTCCGTTAACCATTGTAGGCAAGCCTACTCTCCTAAGCCTGGCTGTAGTGACTACCAGCACGGTTGCCTCTCTCACAACTGCAATCGTA:1 + chr3L 25952952 5' + Doc4-element 291 1 72.60 GCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGAAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2L 19924030 5' - roo 9001 2 64.14 CCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 - chr3R 4860520 5' + Transpac 66 2 67.39 ATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 13406543 5' + pogo 32 1 58.74 AAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3R 15882565 5' + jockey 34 1 57.69 CGACAACTGGATGTGTATGATGGGGGAAATGGATGCATATTTCTATAGTTGGGGGTTGCGGTGGGTGTCACTGCGGGGGGGCAGCGCAAATTCTTCGGTGGCTGGCTTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGG:1 - chr2L 20550049 5' - I-element 4873 1 78.77 GAGTAGAAAATATAAGTGATTTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chr3L 15913829 5' + jockey 4801 1 56.16 GTTATATACTTGTGTTTAAGATACAGTAAAATACTTTCCAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTGCAGTCAGAGC:1 - chr3R 20117749 5' + Doc2-element 4593 1 73.29 AGTCAGTTGTACAAATTGACCCCCACTGATGACCATATGAAAGCAATTAAGAGATAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCC:1 - chr3R 14698605 5' + Idefix 7034 2 61.54 AAGTGTGGCGCCAACAGTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:2 - chr3L 24934440 5' - HMS-Beagle2 292 2 73.97 GAATGCCGAGGCCAATAATTCAGAGACATCGAATATATGGTATACATCACAAATTCCATCTTTTACTTCAAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAGAGCTATATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAG:1 + chr3R 6516316 5' - G4 3417 1 52.74 TGTTTATCTCGAGAAGAACTAGAAGACTTAACAGCTGTCAAGTGAATAACTACTAGGTTCAGGTTGGTTATTCATCTTGTTTAGTCTCCGTCTTTTCAGTTATTTCTTTTTCCTTTTT:1 - chr2R 3939087 5' - invader2 499 1 69.49 GACCTTGGTGGTGATGAATATGTCCTCCCGCTTGATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCG:1 + chr3L 3939717 5' - mdg3 5219 1 78.77 ATCAATCTGTTTACGCTTCTGGATTCGCCAGACGGATTATTTACACAGGGTCAGGTCCGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGGCTCAAAACG:1 - chr3L 19455023 5' - mdg1 7427 2 50.88 TTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAA:1 - chr2L 12798939 5' + I-element 5175 1 69.86 AATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr2R 4606310 5' + 1360 50 1 52.74 ATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGT:1 - chr3R 9039013 5' - Juan 4150 1 64.83 GGAAAATCAAGGAAAATCCGAGCGGCTTGCATAGAGATTGAATCTGAAAGCTCAAACACACAGTCTTATCATTTTTCGTATGCGCAATCATTCGCATCAATCTTATAATGGAAACTCAATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATC:1 - chr3R 19225164 5' - HMS-Beagle 247 1 83.56 ACTGCGGTGGAGCAGCTCTAGCCCATGGACTAGAGTTGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGGCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr3R 23618081 5' - hopper 1398 1 73.97 ATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2R 23180230 5' + roo 8711 2 79.35 ATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1 + chr2R 10417157 5' - 1360 3304 1 76.71 GCCATGTTATCATCATCATCAAACTCTTGGCCCTTGTGCACGGCAATTGTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTG:1 - chr2L 17766213 5' + Doc 180 1 60.96 AGGATGTGTGCTTTTTTATTGTTGTATGCGCACTACACGGGTAAAAAAAATTTAAAAATTTAATTTTTAACAATAAAATGTCATAAGTGGACCCCTCACTTGTGGGTATAGTTACCGACTTTTATAAGCAGCAAATTTTTATTTCC:1 - chr3L 10300221 5' - Burdock 385 1 56.16 GTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACA:2 - chr2L 17005827 5' + Stalker2 7287 2 57.53 GAAATCTATTCCTAGAATGTTTGAGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr3R 3355097 5' + 1360 60 1 59.59 GTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 - chr3L 46998 5' + FB 78 1 69.86 TTAAACGAAACAACACGCTGGAGCTAGGAAAATGGGAAAACTGGGGGAAAACGTCGGCAATGTAGCAGCTCAACGAAGTGGAAATGCTCTTGAGGAATAAAGTGCTCATGCTATAAGACGATTTTCGGTCCGAAATCAATTCTGAT:1 + chrX 3043361 5' - 1360 3179 1 72.60 AAAACTTTGGTGTGCTAAGGCTAAAATGGCTGTGATAATATTCCGCGATTCGATTCGATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTG:1 + chrX 7288938 5' - hopper 1049 1 59.59 CCTCGCAGTGTTTGCACATGTCGGCAAATACTTGAGCAGTGCCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGC:1 - chr2R 19941620 5' + hopper 76 1 66.44 GTCCCTTTGTCACCGTCTCTAGACCACCTGCCTTTCTGAGCACATTCATTCAATTATTATTCGCTTTCGCTCAAAGTCTCATTTTTGCTACTTTGTACTATGGAAAATTTGACCACTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACTCAATAA:1 - chr2R 16582118 5' + Transib-N1_DM 30 1 69.86 CAATGCCCTGATCAGCCTTCAAAATTGCCAAAACAATAGAATTTGTAGAGTATTTACAGAAAAAATTATACCTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chr3L 10731757 5' - 297 347 2 54.11 AAGTAAGCTTATAATTTGTTCATGCAGTTTATTAAGTAATTGCAGGGTATATTTAAAGTGCCAAGTTATAAAATCAAGATAGCAATCTGATGCACTAAAAGTTATAATTAAAACAAATTATGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTT:1 - chr3R 9893609 5' + gypsy4 279 1 79.45 AAGAATATCTTAGTTTTCATAAGTTCATAAAGAAGACACGTATTAAAAAAAACTTCATGCATATCATTTTTAAAATCTGCCCAAACTCACTTCAAGTAGTAGATCTGGCCATCATTGCGGTATAGACGCTAAGAGAGGGTATATTT:2 + chr2R 24067375 5' + Tc1-2 1349 1 76.03 AATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr2L 20265955 5' - roo 331 2 71.92 CATTTTGCAAAATTGTGGGCGTGGCTTGCTATGTGTCTAGAAGCTGCAAGCTAAGTCTTAACATTCCTGAGATCGAGACGTTCATTCATTCATATTGATCCTGATCAAGCCTTCTGCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTA:1 - chr2R 5733418 5' - INE-1 10 1 55.48 AAAAAGGCAGCTGAAGCAAGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTAT:1 + chr2L 9636448 5' - Stalker4 93 4 56.85 AATTGAAAAGAATAGTTTGTAAACAAAGCGAAATTCAATTAAAGTGCACATTGTATCTCGTGCCTTCGGTCGAGCAATTTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chr3L 12004201 5' - P-element 2866 1 72.60 AAAAGGGCACCCTTAACCCCTTGCCGACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGATAA:1 + chrX 9823006 5' + Idefix 151 2 67.90 GTATACCGTTTTACTCTACGAGTAAGGGGTCTAAAAAGAGGTCCTGAGAAGAACCGTTATATTTTTAATTTCGCGTTCGCACTTACACTAGCTGAGCAACGGGTATCTTATAGTCGGGG:1 + chr3L 25245594 5' + INE-1 553 1 55.46 GGCAGGAAAACATCATCAAAGCTGAGAGGAAAACTTTGATAGAGATCACACGACGGCCTTCATTAACAATGGGGAAAAAAGGGAGCAACAGCAGCGGAATCGCTTGGAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGG:1 + chr3R 22225357 5' - Stalker4 7271 4 75.34 AAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTT:2 + chrX 18817274 5' - transib2 2766 1 56.85 GTGTAAACTGTGCGACAAATGTCTGAAATGCTAGAAAAGTTAATGCGAAATCAGAGCGCTGCCTTGGGTTTGTTGGTTTCTTGCTACGTTAAAGTTTAACTGCTAAAATATATTTATATTTTTTCTGTTTTTCTTTTTCTTTTG:1 + chrX 9806801 5' - Doc2-element 217 1 77.78 AAACTAAGCAACCAGCTAACCCAAAAAATGATCAATGTCCCCAACGGACTCAGAGGAAACCGGAGATCGGATGTAAATATTTCCATAAAATTTATTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGT:1 - chrX 12129011 5' - blood 7039 2 63.70 CACCATCTACTGAGGACGGATTTTACCTTCTTAGCTTTATATCCACTAGTTGTAGAGTACAATGCACTATGGGTAAAAAGCCGGGAATTTTGGTATTAATGTAATATTTTTGTGATTGATATTTTAATGCTCCTTTCATTTTTTGA:1 - chr2R 5144559 5' + transib4 62 1 68.49 TTCTATATTATAAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3R 15072686 5' - pogo 2063 1 56.85 ATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr2L 12250977 5' + 412 7130 2 70.55 ATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3R 8075963 5' - 412 417 2 73.19 ATATGGAATTTGTTCAAACTATTTGATTACCCGAAATGAAAGTCACCGCGTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chrX 19074722 5' + mdg1 17 2 69.66 ATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 11257435 5' - 1360 3371 1 68.29 AAAACCATTTGTCCCTGCCGTAGAAATATAATTGAGAGAAGACTGAACCGAAAAAACAACGCTTCAACCTTGTGAGAAGAGATCAATGAATTAATTAAAAAAAAA:1 - chrX 3504807 5' + jockey2 3404 1 67.62 ATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGTCATGA:1 - chr3R 19073273 5' - roo 336 2 65.07 ATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGATCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 - chr2R 1916451 5' + Juan 54 1 52.14 ATTATCTCTGATTTCCGTAGGCTTAGCTTAAGTGCTTTGAGCTAAAGGTATTGCAAGTATTCTGTCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAA:2 + chr2L 15081368 5' - hobo 23 1 63.01 TATAGGNGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 + chr2R 17796528 5' + jockey 4712 1 56.85 ATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTAT:1 + chr3R 2424358 5' - 1360 2963 1 77.93 TGCCACAGAAAGTTTTATTAGTTGCTTGACCAATATCTTTCTTTTTGCTTTCCGCGTTTGGTATGGTTTCGTTACAATTCCCGTGGCAGAAAAACCAGAAATAACAAAGTTTGTCTAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGG:1 - chr3R 7568058 5' + R2-element 3433 1 78.77 AATAGCTATTTTTCTTTTATTTCTATGCCGCTCATTTGATTTGCTTTGAATAATTTATGAATGCTTTTGCCATTTGGCAAATGCAAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATA:1 + chrX 1265170 5' + Burdock 370 1 65.07 TTGTTGCTGCTGTTGTGGCACGGTGGTTGCCATTTGTTAGCGGAAAACAGCACACTAGCCTTTTTAATACAGACACACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr3L 19111623 5' + Doc 50 1 58.22 CCTCAGCCACCCCCACAACTAATACAGCAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGTACCCACGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCGCCCACCCAAACATTTAATTATTGTCCCC:1 + chr3L 5669290 5' + G-element 4273 1 75.34 TGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGGA:1 + chr2R 4673587 5' - Quasimodo 7284 2 80.00 GATGAGCACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr3L 17275389 5' - Transpac 5186 2 55.48 GGGCCAATTTGTGGACCATCATCAAGTGAGAAATTTCCAATTTCCGAAATGTTCAATTGGCCAGTAAAACGGCCCGCAGCCATAGAACAAGACGACTATTGTCATACCCCTGTTCACACATGAACACGAATACAT:1 - chr3L 5390011 5' + roo 4 2 78.52 ACTTGTCGTAGGCATCGGCCGTCTCCTGGCCCTTCAGATAGATCTTTAGATAGCCGTCCGTGCAGTTGGACCTTTAACAGAATTAAAAGTTAATAAATAAAAAAAATTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAAT:1 - chr3R 18971833 5' + Juan 4041 1 67.81 CGAATGCCTTTCATGCTTCAGTAAACCAATGAAAAAATGACATAAAAATGAATCCCGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGATCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAATGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAAC:1 - chr3L 5887884 5' + Bica 474 1 61.64 ATATACATATGTGTGAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTGAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 9871605 5' + roo 8686 2 71.23 GTTTCTGTGTGCACGGGCCTATCCTATTTGACTTTATACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACA:1 + chr2R 20443660 5' - Ivk 4995 1 56.03 CTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:2 + chrX 8092389 5' - pogo 2035 1 61.64 TGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 + chr2L 71188 5' - 412 7467 2 68.49 GATTCGGCTGCAAGGCGACGCGCTTCGGCTGGCTGTCGTTATGCTGGGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3L 3983808 5' + P-element 63 1 38.13 CTGTAATTGGGTGTTTGTTTGCCGAGGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTAGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTAC:1 + chr2L 16540964 5' + hobo 49 1 68.32 ATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chrX 21216793 5' + roo 86 2 78.77 ATGATAAGGCGTGAAGTGCACCACCAGCGCCACTTCAGTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGTTATATTTGATTCCTGTTTTGTCGGGAAATCCGTCGCTTAAGAGAGAGAATATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCA:1 + chr2R 10308764 5' - G4 27 1 72.60 ATGCAAAGGCATCTTGTATTCAAGAGCATTCTAAATACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 - chr2L 15936886 5' + copia 6 2 75.89 ATGAGTAGCTGGGAGCGATGTTGAAAAGTAGGAGGGATCATGATGAAATAACATATAAATAACATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAG:2 - chr2L 9782140 5' - P-element 79 1 26.03 CAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGTCCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCACTAGAATTATCAAATAAATAATAATTACT:1 + chr3L 15913856 5' + jockey 4828 1 61.64 TACAGCACGTGTCTGTGTGAGTGGGTAAAATGAACTTGGGCAAGTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATATAAATTA:1 + chr3R 31886796 5' + hopper 18 1 73.29 TGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chr2L 16943822 5' + copia 75 2 75.56 ATTCGCTGAGAGACTTTTTCACTTATACTATTACAAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTTTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTT:1 - chr2R 5303193 5' - FB 247 1 77.21 GATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTC:1 - chr2L 1924017 5' + G2 3019 1 54.11 AGACGATCAAAAAGAACAGGACAACGCAAGAGTTGAAAAATTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTG:2 - chr3L 27392130 5' + hopper2 1332 1 78.08 CAGCAAGTATAACATGTTAATTAACATTTAATTGCGGGGCGTAATCAGCATAAAATGGGTTAAGTAAATGTTTAAAGTGATTAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:2 + chr3L 18505626 5' - I-element 5312 1 59.59 ACTAAAAAGCGACCAGTAAAATGAATACCCAACAAACTTTCAGTGGTGCACTTACTGTGGCCATTTGCCATTCACAACGAAGCGCTGCTTTCGTTCGGACGAAATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr3R 11214636 5' - mdg3 228 2 73.97 GTTGTTAAAAAGTTAAATAATTTAATAAATAATAAATTAATAAATATACTTGTATAGAACACCTAAAATTAGATAATACAAAGTAGGACTAATAGGTCTTAACTAGATTAATAGATCTTAGATATTTATAAATTAATAAAATAAAA:2 - chrX 16193531 5' + G7 1144 1 78.77 GAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 + chr3R 26504193 5' + HMS-Beagle 40 2 58.22 ATCCGTAGTGAGCCAAAGGCAAATCTATAAAAGAAATGAAACGAAATTCATTCGTTTTCGTTTTCGAGTTCGAATATTTAAGTTATATACTTACGTATTTTACTCTTCGAGTCGAACAAAAGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAAC:1 + chr3L 11844691 5' - rover 7261 2 55.48 AGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATT:1 - chr3R 14505364 5' + F-element 4535 1 67.12 AGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCNCGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAAC:1 + chrX 4808514 5' - mdg3 182 2 58.90 TACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr3L 23287311 5' - 1360 3319 1 65.07 TGTATGGCTGGCGGGGGCATAGTTAATTTAAAAACTTTGACCGAATAAGTCATAATCCGCACTGTCTCATAAATGATTTAAATATTAATATATATTAATAAATAAATATAAATAA:1 + chr2R 15181839 5' + diver2 443 1 60.87 AATCCTTGCAATTCCAGTCCCGAAAACATCCTCTTCGCCTAATGAGAGTCGACATCAAAATTCATGGCAGCACCTACACACGTCTGTTATAAGAAAGAGAGGATCTAGTTTTCATATATTTGCAAATTAGAACTTAAGCTAACTGT:1 + chr3R 12871481 5' + Bari2 189 1 56.85 TTAACGTGTCTTGATACGATTCCAGACAAAAAGCCGAAGCATCCACTGTTTGTTACTTGACCGCGCGCTCTCACTCCCGAACTCCTAATGGTAACGCTTCGACGCACTATCTCCGTCCACGC:1 + chr2R 24100694 5' - gypsy8 400 1 68.85 TATACTAATGTACATCTCTGCTTGCTGGCCCTTTGGAAGAATGTTCAAACATGAACAAGAATTTATTTAAATAATTAGAATTTTGAGCTCCGTTTATATCTTA:1 + chr3R 19450190 5' + roo 41 2 80.58 AACGAAGATGGGGACGACCAGGAGAGACCCAGTCCGGAATAGAGGAGCAAATGCTAATCTTGATAAAAATAAACGCACTCGGGCACGTTGCTACACAGAGAGAAAAGGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2R 21926310 5' - opus 488 2 72.60 AGCTGAGACAGAAAATAAATTTAATTATATTGAGGAATATACTTCTACCTGAATGAATACTTTGAATCTTAAACTTTGAAAAATGTTTACATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCG:1 - chr2L 17737142 5' + INE-1 513 1 55.48 GGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTA:1 - chr2L 12984220 5' + hopper 61 1 58.22 CTGATTTCGAATCGCAATGAAAGGGAGCCGGAGACGGAAATGGATACACATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGGGATAAATTATAT:1 + chrX 8308408 5' + roo 71 2 64.83 ACACACATACACCGACGCACACTGATAAAGTTACACCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATA:2 - chr3R 25433361 5' + transib2 84 1 73.29 ATGCTCAAGCTTATGTGGGTAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCAATAGCCGAGT:1 - chr2R 4886524 5' + INE-1 91 1 61.64 TGTCGCATAGAATATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCCGCAAGTGGGGGG:1 + chr3L 3501712 5' + Bari1 60 1 57.53 AATTATAAAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:2 + chr3R 19073150 5' + roo 28 2 60.96 ATATTTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:2 - chr2L 23381794 5' - flea 250 2 82.19 ACCACGCAACTAATAATGTGAAATAAAAAATCATTTGGAAATTATTATTAAAAATTGATCGAGAACACACAGATACACATATGTTGGCATAGACGGACGGGACGGCAAAACATAGTTCATGAACTCAATTTTTAATAATAATTTC:1 + chrX 7612914 5' - invader2 440 1 60.69 TAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 20167565 5' - roo 9022 2 54.11 TATTCAAAGCTTCTGCGGCATAATACTAAGAGATGGGGAGGTGTGTGGTACGAATCTGGGGCTGATGTTGCTCGTTTGCTGCGTTTTTAGGTAGCCCAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAC:1 - chr3L 5274951 5' + I-element 5124 1 65.75 GTCACTTGGATTTTTACTGAGACACTCTCTCTCTCTCTAACCCAGTTAATATGATTTACTTGGTCCTTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCCTCATAGTTGACATCCATATCTCCATAT:1 + chr2L 22714528 5' - Doc4-element 2596 1 54.48 AACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTT:1 - chr3L 16973445 5' + S-element 80 2 74.66 GATTTGATGATGTTTTTAAGAGCGATGAATTGTGGAACTGCTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTCGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAA:1 + chr4 853675 5' - 1360 3120 1 70.55 CAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrY 2720385 5' + 297 39 2 57.86 TAAATAAAAATTTGAAAAAAGTAAAATTTTTGATTTTCGAACATTTTTAAACTTTATTTGAAAATTCATATCTCAAAATTTGGACGTGCGCAAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACTATTCC:1 + chr2R 22404326 5' - FB 52 1 80.14 ATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGC:1 + chr3R 29534665 5' + Stalker2 155 6 72.87 ACGGGAAGTTCTGTATGTGAAGATTTGCCCAAGAAACCAGGATAGATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 - chr2L 15936850 5' + copia 4945 2 69.86 TTTGTATAATTTAAAATTATACACAATTTTAAATTTATATATTTTATTTTAGTTTTTAAAAAATTTTTTTTTTTGTATTAGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGAT:1 + chr2L 15907918 5' - hopper 393 1 45.89 ACCAAAAAAAAGTGAAGGAAACGAGCGCGAGAAGAAATTAATTTAATTTAACTCCCTCACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACACATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCA:1 + chr2L 18349596 5' + Doc 4532 1 61.64 GTAGTTTATTTTATTGACGTGTTCTTATAGTCCTGACAAGGACCTTGACATGTGATTTGCCTTAATTACAGTGGGACAGGCCCATTTCGGGGGAACACTAAAAACGATATTGCACACAAGTAAAAATGAATATAATATAAATATAT:1 + chr3R 13439539 5' - gypsy7 5067 1 56.85 AGTTGTCCTCGACAGGAAGTCTAACCTAACCCGGGCATATGCCCTGCACGTATTGCCCTTATAAATTGTTGCCAAATGCATATAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2L 15188485 5' + 297 9 2 75.83 TATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3356 1 56.55 CAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGTCGAATGT:1 - chr3R 15790105 5' + flea 4738 1 61.94 AAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2L 20265943 5' - roo 342 2 64.38 CGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATTT:1 - chr2R 11164493 5' + roo 8737 2 70.55 ATCTTTCACTCTTTCTTGTGATTTTCTGTGTATTGTTTTGGGTGTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTA:1 - chrX 4533883 5' - mdg3 5036 1 60.96 CCGTGAGAAGCTGTCTCGTTGATTGCCGGGCGGTCAACTTCACTATCGATATGATACGAACCCCCCACTTTTTCCAACACACCACTTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 8498946 5' - accord 188 2 78.70 ATAATTACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 9002902 5' - roo 356 2 51.37 TATAAAGTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGC:1 + chr3L 19555065 5' + INE-1 149 1 79.61 TTTGGTNTCCGAGCATCCGTTGGCTCAGGTTGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTGGGGGGCATTTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTG:1 + chr3L 16478839 5' - I-element 41 1 57.34 TGTCGATACATGTACATATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCATATTTTGGGCAACCGAGTAAATCACGTATGCTGACATCAGGAAAATGTCTATGTCGTGAAGCTCA:1 - chr2L 15085680 5' - G5A 90 1 76.03 TTTAGGACCTAACCCAACTTTTTTAAATTCAGAGTATGAGATTACTGAATTTGCGGTTGCTGAATTGTTTTATTTTTTTACCTGTTACCCTTCAATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr2R 5074623 5' + 1360 20 1 71.23 CCTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGCAGAGTAAACATATTG:1 - chr3L 5061666 5' + 17.6 6954 1 63.91 GAGAGATTGAGCGAGCTCGCTGATATCAACGAAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 15791042 5' - roo 9053 2 71.22 ACTTTTTATTAATAGTGGCGGCAGGCTCATGTCCCACAAAAATTATATAATGACATATACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 22193519 5' - roo 9013 2 59.59 ATCCGTGTGCCAGTTCGAATGAATCTCAGTTCGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGAC:1 + chr3R 20933051 5' + mdg1 7399 2 78.08 AGTGTGTCAGTCTGGTCACATTATGCAATTAAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:2 - chrX 11661515 5' + pogo 40 1 58.22 ATTCTCTAGCATTACAAAAATGGTTGGCGAATATAGAATATAAATATCCTTTGGAATACCTACATCCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCA:1 - chr2R 16928193 5' + I-element 5114 1 54.79 GGTGCTACAAGCAAAACTTCACACTTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chrX 5944412 5' - pogo 2052 1 55.48 ATACATATGTTTCTTGCTCTCGCGCTGAGTTGTGAAAATTTCCACAAGTTAAAATTAAATGAAAAAAGTGCAAAGGAAGCAGGCGAAATAGCGAATAGTAATAGACTACTTTTCTTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACT:1 + chr3R 31725114 5' + Cr1a 4006 1 69.86 AAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:4 + chr2R 24169967 5' + transib2 58 1 56.85 ATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2R 17796529 5' + jockey 4713 1 56.85 TTACCACCGCACGAGCTTATCTCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCTCACCAATT:1 - chr3L 8453804 5' + FB 72 1 72.09 AGCAGCGGAGAAAATTCATACCAATTGCACAATCCAAAGGTGTTTTTCCGCATTTAATTCAATGGCTGGCAGCAAAACGAAAAAGCAGCGGCATAACAACAAAATCTGAAAATATAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 23983093 5' + TART-C 11095 1 52.71 GATTGCCGTAACGCCCCATTGCCTGGTACATGACTATAATAATGATTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTT:1 - 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chr4 1294990 5' + HeT-A 19 1 46.58 CTACTCAAAGGTTGGTACTTCAATGTTCTCAGGGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2R 21681378 5' + roo 81 2 77.14 TATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGTCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGTGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTG:1 - chr3L 20187388 5' - FB 452 1 68.15 AAAATGTTGAAAAGAGAAAGTACAATTGCTGTTTTTGCTCATCAAGTGTTCTAGTTCGGTATATGTACACCAGTCTTTTGGCAAATAATAATTTTGTTTTCATTTGGGTCAAAATACAACTACATAATTAAGCAAAGAACCCTTAA:1 + chr3R 4534909 5' - S-element 66 1 57.53 TATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATA:1 - chr3L 25482983 5' - accord 472 2 63.70 GCAATTGTGTGGTAGCGCATTAAATGTCGATTTCGTTTTGCACCCGCGGCGCAGATACGCAGCTTGTGATACGGGAAGTACGCAGTGGTGCCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 + chr3R 23491821 5' - transib2 2795 1 65.75 CTTGGCAAATAAACTACAAAGAAATAAGCGAGTCAAAGGTCTTTTACGAGCTGGGCATGGTCTAACTGGCTGGCTGCACAATTCCATTGTTAACTGTTATTAATTTATTGCCGTTAATTGTTATATTTTTATTTGTTTCT:1 + chr2L 12508475 5' + accord2 454 1 76.43 ATTGTTTTTGTGCCGGCTTTCCGCGAAAGCTGTTAAAACGGCACTTTGCCTGTCCTCTCTCTCCTTCGCCTCCTCTTCCTTCTTCGTTTTCGTCCGTTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACACCCACT:1 + chrX 8437619 5' - P-element 2861 1 68.49 TAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTG:1 - chr3L 3501819 5' - Bari1 1647 1 59.59 CGTGGAGAGATAGGAAGGAAACCCAAAATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGGAAGCAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTAATGCACAAATCAGA:1 - chr3L 3716419 5' - Cr1a 151 1 78.77 ATTACAAATGCGTTGGCTACTTTTTGACATTCTCGACTAAATTGGATTTTTTTTTGAAGTGAAGACCATTTTTTCTTGCCATCAGCACTTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCT:1 - chrX 6509250 5' - hobo 468 1 64.83 AGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGACAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCATATTAGGATATAAAGTTAAGGAGTGATTTGGTAAGATTATTTCTTTTTATAAATTGATA:1 - chr3R 6128879 5' - transib3 2678 1 58.22 AGTTGCAAAAAAATAAATTGCAACATTTAATTGCAACCAAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCTGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATAAGC:1 + chr2L 14997053 5' - Porto1 4319 1 71.23 CTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTATAACATGCAGGGAACGATTTTACCAGATAAAACCAGAGAGAATGCCTTAATCGATTTTCCCGACTATCAG:1 - 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jockey 4921 1 65.07 GAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:1 + chr2R 19199686 5' + hopper 83 1 73.97 CTCGTCGAGGTCCTGGCTTCCTCAGCCAAAGGTCCATTGTAGGCAAGCCTACAATCCAAGGGGCCGCCCGAATTCGGTCATGCA:1 - chr2R 20948594 5' + Doc4-element 449 1 58.33 TATAGGTCTTCTAATGTATGTTTAACAAATACCTATTAAGTATAACCCTATAATATAGTATTTATTATACATATTATGTATATAATCCTTGTAAAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCA:1 - chrX 10451781 5' + I-element 4885 1 67.81 TGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr2R 15326832 5' - copia 237 1 51.37 AACTCAAGTATTTCCCATGTGGCTAAAAAACCTTCGGAGTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCACTAGATAGGGTTGCCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:2 - chr3R 4805730 5' + 1360 35 1 61.64 ATTTAAAAAAAAATTCTAAAATCCTTAGTGTAACTTATATGCCAGATTATTATTTTTACGAATATCTCATCTTTGATATATGAATATGTATTAAAACTGAAGTCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCGTGCGAAAAATTCTTG:1 - chr3L 20907161 5' + 1360 277 1 72.60 ATGGGTGGTACATCAGGGTTTGGATTAATTTTAAAAAGGAACAGAATTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:2 - chrX 18010087 5' + 412 7072 2 69.86 AAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 7889558 5' + roo 8679 2 62.00 CCTTTTCTTCGAGTTTTTTTTCCACGGCTGGTTTGACAAACATAAAATAAAAATCGGAGAGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTCG:1 + chr2L 20131878 5' - Cr1a 9 1 73.56 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGTCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 4998 4 55.48 ATTAAGTCAAAATTAATGGTAGTGAACATTAAATGCAACTCCGTTGTTTAAATAAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3L 23320056 5' + roo 67 2 69.18 GGAATATATTTCAAAGTTGTTCCGACGAGGCTTAAAAAATAAGTCAAATATGTGGTTATCTAACTGGGCACATATATCGTTATGTATTCAATCAAAACATTTAATTTTTTTTCTATGCACTTTTAATTAATTAAAACATTTTTTTT:1 - chr3R 15034886 5' - Stalker2 7186 1 78.08 AGGCGGGGGATTGTGCTGGATGTTGGGTTGCATGACCATGGTTCACTGGGTTTTTATGTTAATAATTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 + chr3L 16690883 5' - I-element 5314 1 48.63 CTGAGAAAGAAAGTTGGTTCTTAAGCCGACGCCCCTTCAACGCAAGTTCAGTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chrX 10639163 5' + FB 71 1 65.75 ATATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATA:1 - chrX 6329834 5' + I-element 5229 1 79.45 CAGTTTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTT:1 - chr2L 13556495 5' + transib2 1 1 78.42 ATTTATATTAAACATTAACATAACACACGGGAAATGCGAAATGCGGAATGGAAGACAACGAACGCACTTGGCATGCCCAGCATGTTGTGGCGGAAGTGAATAGGCAAAACAAGGTGGGTAATAAATATAAATTACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 20457827 5' + Doc 4694 1 60.00 GTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCACCGTGGCTCTAGGGTGGCACCATGCGAAAAATTTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATATAT:1 + chr3L 21484240 5' + 1360 316 1 57.24 GTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr3R 12115243 5' + 1360 35 1 56.74 ACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTT:1 - chr3R 11040138 5' + Bari1 82 1 72.60 TCATATACTAATACTAAGTCGTTACTGCTTAAAGAGAAAAATCCAATATCGCAATCATTTTTATTGTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTC:1 + chr2R 21726711 5' + invader4 2763 2 54.79 AGATTCAGTTGGCATATTCAATTTTAAAATATATTGTGGCACTAACTAAATAATTTCTGGCAAAAATGTTACCGAGTTATCCATAGAAATAATTACAGACTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAA:1 + chrX 7503472 5' - I-element 5178 1 62.33 GATGGCAAAAACCAGACTGCCAAAGAAAATGTTGCATTCTTGAAGACAATTTCAGCAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTATAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAAT:1 + chr2L 8565742 5' - Copia1_DM 59 1 60.27 TATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGACATGTCTG:1 + chr2R 5617502 5' - invader1 332 2 67.12 AAGGGGTGTTTTGATGGCTTTTAACTGTATATATTATATATATTATTATTATATATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3L 21969858 5' + opus 7156 4 69.60 TATTACACATCATAAATAATATTTTAATTTTTAATTAAACTTTTCATTTATTACTCTTGATTTTTACTAAGTAACGATTTAAAACGTTTACAGCAAAAATGTATTCATTTCTTACATATGTACATATGTACCATGTAAATTCGTTT:1 + chr3L 13980001 5' + 1360 3152 1 58.90 ATATTTTCGACAGTCTCATGGCATTTTCTGGTTTTGCTGTTTTCTAAATCTCGCAACATGCACTTTACAGTTAGTATAGTTTTTCATTGTTCTTCTTTTGGGATTTAGTTCTTGTAGTTCTTTCTTTTTTTTTGTGTTCTTTTTC:1 + chr4 993728 5' - Doc2-element 222 1 75.86 AATTGTGGCATTGCAGTTTCATATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3L 4219475 5' + jockey 81 1 67.12 TATCAATAGTAGCAAATAATAGCAAATGAAAATCTGAATCGGGAATCGGAAGAATGTTTAAATTCTTCAAATTGATTAAGAAACTAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:2 + chr3L 15103777 5' - Transpac 276 2 63.01 TCTTGCAAGGCATCACCCACCGCATTCAGGGGCAAACACACTCACACACACATATATTCTGCCTGCGACGCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 + chr3R 20140404 5' + jockey 4671 1 79.45 TAATTTAAAGCGACACTAAAACAAACATCACAAAAGCCATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGA:1 + chr2L 11391454 5' - 1360 60 1 67.12 AGCTCCATTCTATTATCTGTCAATGTTTGTTGCTTGGCGGCTGTTTCAGTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGAGTC:1 + chr3R 8062967 5' - jockey 4920 1 62.77 CAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCAC:2 - chrX 22840542 5' - copia 5032 2 79.45 ATAGTTTTTTGTCCGTAACAGTTTTTTGAAGTTCTAATTACTTTGGGTTCGAATCGGCAAGAATTGAAGCAGGCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTAC:1 - chr2R 10496753 5' - I-element 454 1 52.74 ATAATATAACAAATAAAAATTTACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACG:1 + chr3R 19449938 5' + roo 9042 1 69.92 CCTTGCAGGTTTCAGATGGATTCGGTTTTGATGAAGTCGAGCTGCTGCTGGAGGAGGACGATGAGGAGGAACTTTGATTATTATTATTGCTTGATGATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 17156457 5' - Quasimodo 41 2 63.70 GGCACCGAATTGATTGCCTACCTGCAGGCGTCAAAGTTGCGCCAGACAAAACCGCAAGTTAATTTTAAGCTTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:2 - chr3L 13581746 5' + jockey 4813 1 53.42 AATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGCCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGGATTTGGGTGGACCAAACCAGACACTTCTTTTATTTCAAAGAAATAAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr2L 19675073 5' + 297 6634 2 56.85 TGGTGCACAAAATGTTTGCCACAAGCCCAAGGCATTGAAATCCTTTAATGTGCTGTTAACGATAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr3R 30347844 5' + P-element 94 1 46.58 AGCTGGCAAAGTTTTCCACAAGGTGAGGGAAACTCAAACAAGCAGGCGCTGGAAAAGGAACGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTGTATTAAATATAAGTGTTATTGGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAAG:1 - chr3R 4977410 5' - Cr1a 4269 1 63.01 GTATTCCGAATGGGAAACTATTTTGATCAAAAGTAAAACAACTATGGTTTCTTTTCCTTTCCTATTTTTTTTGTATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 + chr3L 16662374 5' - jockey 4946 1 53.42 ATCTGGTTTTGCCTTGAAGTATGCAATATATTCGGCAGACTACATTTTGTTTCTATTCCACCGTTTTCAATATGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chrX 8092504 5' + pogo 44 1 53.79 TTATAAATCTCAATCAACAATAAATTAGGTAAGTCATAAAGTTAAGTACTCTTGCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chrX 18009938 5' - 412 7480 2 61.64 GGGTGTGTTAGCCGTCCGACGTTTTCGAGTTGGCCACATCACATGTGCCTGCTGGAGGCCATCCGCCGCGTCCAGGATGGCCCCCGTACGCCTCCAATCCTCCTCCGGCTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCC:1 + chrX 1399404 5' + 1360 3176 1 79.26 AATAATTAAAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGC:2 + chr3L 20806907 5' + 17.6 64 1 75.34 ATGTGTTAGGAATGTTTTTAAGAGAAAAAAAAATTGAAAAATTTTAAAAT:1 - chr3R 26423685 5' + 1360 3030 1 90.00 GATTTGTATCGGTCGCGCCGCAAATCGGCGGCAAAAAATTCAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 21660061 5' + Doc 4697 1 89.09 GGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGAATAATTCGCTTAGCTGCATCTAGAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 23639106 5' + pogo 22 1 68.31 GACCTGATCTAATTTAAATGAGAGCTCGGCGCATTAATCATCATACGGCAACCGGATGTTTCCTTTTTTAAGGCGCCAAAGGAAAGCATCAAAGCACCTTTCCCAAACAAGAGGTACATTGAAATAAAAATTAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 4810547 5' + Doc 4696 1 59.59 TATTAAATTATTTTTATGCTTGCCAATTTATTATTATTATACGCTTGCCAATTTATGTACTAAATTATAGTATATCTACAAACATAGTTTACTTAAAAACTTAATAATACATATACGAAATCTCCATACCTTTTAATTGCCGGTCT:1 + chr3L 6797599 5' + GATE 353 1 40.41 GTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTTGG:1 + chr2L 17005729 5' - Stalker2 317 2 73.97 GGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACA:1 + chr3R 904964 5' + rover 7024 2 80.14 TATGTATATGAGAAGTCGGTGGTTGCACATCGATTTCTATGCCTTATATTTCAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTTTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTA:1 + chr3L 11824254 5' - INE-1 164 1 49.14 GAACTCGATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAG:1 - chr3L 2544717 5' - Tirant 337 2 60.27 AGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCC:1 + chr3R 19449921 5' - roo 268 2 66.21 ATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chr2R 15376191 5' - 1360 3332 1 57.53 GATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 - chrX 14722250 5' + diver 16 2 67.81 GAAAACGAGCAAGGCGAGCATGCATAAATATTTCAATAGCGTAATTTTCGGCTACGAGCGCCATTTCCAACTCCAGATGCAGTTGTCAGTTTAGCTTGTGGTTCTCCGCTGAGAACTGCAGGGGTGGCATTTTT:1 - chr2L 12987309 5' + hobo 5 1 77.61 CCTTATGCGGCGGGTGTTTGAATGAAAAAGTACAAAAATAAATATTAGCTTGCGGCTCACAGAAGGATTTTGAATAGGATAATGAAAAAATAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCT:1 + chr3R 25755478 5' + Doc 4287 1 63.70 AGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr3R 17673745 5' + FB 61 1 60.96 AAAATCCAATAAGGCCTTTTATTCTAAAACTAAAACTAATGTTTTATTAAAGCCGATCGCATATTAACTAAAAAAAAGACCCATGGGTGGAAAATAAATAAAATTAAAAACAAGAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACT:1 + chr3L 19468146 5' - INE-1 567 1 47.26 CAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTAT:1 - chrX 19980697 5' + X-element 4539 1 54.11 CAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACCATCGC:2 - chr3L 18125992 5' + Ivk 63 1 56.85 TTCTATTTAGGTTCCTAAATTGTAATGATTGTATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGGGAAAGCCAAATAAA:1 - chr3L 23354479 5' + F-element 74 1 68.03 GGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAA:1 - chr2L 4754950 5' - Stalker 332 4 67.12 AACTGAAAACTGAAACTCGCCGCTAAAAAAATATTCAGCTCACTTAAAAAAAAAAAGAGAAAGACAGAATGAGAGAGAGAGAGAGCAGGCGGAAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGC:1 + chrX 9977399 5' - 17.6 187 2 66.90 ATCTAACTTTGAGTCTAGCCAACGTGCCCCCTAAAATAACGCACACAAATAAGAAGATATGGAAGTGCAGATAAACCTGAGAACAAACATACATAAACAGCAATACAAGAAAAAAGAAAACAATAAATTAAAAACCAAAAAAAAAA:1 - 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jockey 4976 1 45.21 GAAGGATCCTGGTTAAGGGTGCATCCTTGTTGGCTTTCGTTTCAATTTCCTATTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTAATAATAAATCTTAA:1 + chr3R 30316883 5' - G4 3795 1 61.64 ACCTAAATACTTAAAACCCATTAGATAAGTTTATCAAGATATATGCAATTATATGCAATCTTATACCAAGAGCATGTGTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2R 21681285 5' - roo 9029 1 56.16 AATTTTCCACATACATAGGCATTGGGGCACTTAAATTGGCTTGTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr3R 26178456 5' + 412 7132 2 70.55 AAAAAGGTCACAAATTGTATTAAAATAAATAAATAAATAATTGGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGG:1 + chr3R 24381321 5' + Juan 4186 1 69.18 GCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTG:1 + chr2L 809677 5' + jockey 88 1 69.86 AGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:2 + chr3R 22642273 5' + blood 52 2 53.42 AAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTA:2 - 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chr2L 4123954 5' - transib2 2765 1 58.22 GGACCAAAGTCTACACTTTCATGTGTTGGAAAAGCTATAAGTATATGGACACAGCTATTCCCACACTTCCGTTTTATATTTTTATTTTCGGCTTTTCTTTCGGTTAACGCCATGAAAAGCGTGCACCCGCCAGTACAGGTTCCCTT:1 - chr3R 24589904 5' + Gypsy12A_LTR 2226 1 67.81 TATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGCCACAAACAGTTGCT:1 - chr3R 11040178 5' + Bari1 42 1 57.53 ACCAGCCAAATCCCACCACAAGCTTGTCTCGCATCCTCAATGCGGCCTGTCTGCAATTTGTGCAAATTGCACGCACATAGAAACCATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 13294858 5' + roo 8699 2 59.72 ATGTAATTAGATCAAGTGCTTATTTTTGTATTTCAAAATTATTAGTGAATTTGCTTTCCTTGTCTTCCATCAATTTATT:1 - chrX 22824662 5' + Gypsy12A_LTR 2244 1 62.03 AATTAAAAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATTTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chrX 21216683 5' - roo 9045 1 67.12 AGTCGGTAGTCGGATGCCGGTTGCCATGGCTGGCACACTTCAATGCCACTCCCGATCCCAACCGCCAACAGCTTGCTTCATTACTGTAATGTGCACACATATCGAAT:1 + chr3R 11469284 5' + Tabor 2 2 77.57 CAAGGTGTTAATTTGGCTAATTTCACTGCGGGCTCGAATATTTCGAATTATTCCATATACAACAATTTGCTACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 + chr3L 12315708 5' + transib2 46 1 53.79 ACTTTTGTTTGAATTTACATTGGTGAACACCTCTAGCACGTGTGCTATTGGGTTATTCCTGTATGCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3L 17275396 5' - Transpac 5180 2 53.79 AAAATGCAAATAGAAAAGGTTAACACACACACACATACACACCAAACAAAAGCCACAAAAAACAAAACCAGAAAATAATCATAAAAAGTTGACAACTTGTTGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAA:1 - chrX 10108502 5' + I-element 213 1 74.13 GTGCGCAATTGCTATAAGCTAACATAAAATATGCAAGTAAAATGCTTTTGTTCAGACTCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:2 + chr3L 2145893 5' + roo 8728 2 67.81 ACGCTTATTTCGAGGAGGACGCCGGTGCAGCCGACTGTAATATACCTGCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACA:1 - chr3L 15190302 5' - Circe 7071 1 67.12 GTATGGCAGCTCCAAACACTTAATGAGTACTTAAATAAAGGCAATATAATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGGTGCAG:1 + chrX 8092360 5' - pogo 2070 1 62.86 CGGTGCACTGAAAGAAATCTATACCAAGTGTGTCGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAA:1 + chr2L 3675877 5' + Juan 4115 1 76.71 ACACAATATGGTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATA:1 + chr2L 20821165 5' - Burdock 247 2 62.33 CGTGGATCTGCAAGCCAAACATTTATACATGGCAGCCACTTGAATGTAACAAGCCAAAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 - chr3L 18126053 5' + Ivk 2 1 76.71 ATTTTCCCAGTGAATATTTAGTTTCCACTTGTATCCGCACTGTCTACTTTGCTTTGAACTCAAAACTTTTATTATCTTAAAACTATGCTCTGCATTTTTGAGGAACACAACTAAAAGTTTGAGTAAACATGAAAATACGCACAAAA:1 - chr3R 26795888 5' - Transib5 384 1 63.70 ATAAAAATGCTTAAATTGAGATTAATTTTGTATAATTTTATTGTAGATTGTCGCTCAAGGGGGTATGTTCGTTTTCCGATTGTATGTTTCGGACATTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTT:1 - chr2R 4896821 5' - I-element 64 1 69.18 CCATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGAAATTTTTATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 + chr2L 21936057 5' + INE-1 14 1 40.41 ATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAA:1 - chr3L 20187413 5' - FB 472 1 55.00 TCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 - chr3L 12315807 5' - transib2 2747 1 69.18 TTAATTCTTTGTTTAAAGAAAAATTTTTTTGCCTATAATTTTTATAAATTTTCCTGCCTATTGTTTTTGTATAGCTTTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGATTAAGG:1 - chr3L 13696506 5' - 297 6940 2 44.52 TACTGTCCACACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 - chrX 5323156 5' - Juan 4185 1 32.88 CAATGCGATGTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr3R 24729526 5' - Juan 4202 1 65.07 AACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr2R 21410984 5' + Burdock 6181 2 53.79 AGTAGTCGTCGTGAATTTTTCCGCTGGGACGTATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGA:1 - chr2R 6482506 5' + gypsy 50 2 67.59 ATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTGGTGATTTTTTTTTGCCGTTTGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCTGCCGTGTTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTGTA:1 + chr2R 5582170 5' + Cr1a 87 1 71.23 AATTTCCATAACAAATCAAATATTTTATGGCCCCAGCCGAATGGCAACCGAAAAATGTTTTTGGCTTTAAAACGAGCAGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - 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chr2L 12299775 5' + Doc2-element 245 1 71.23 CCTCATGCCTACAAAAACATGTTTGATTTCCCCATTATCTCATTTCCAAGACTAGCTTGATTTATAACGCCTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chr2R 8099128 5' + jockey 4809 1 51.37 GAGAAAATAAGCAGATTCCGGTAGATTTCATTATCATTCTATATTCGGTTGTTAGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr2R 15652003 5' + hobo 64 1 59.31 AATTCAAAGGAAAAATATTTATAGTTGAAAACAAAACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCC:1 + chr3R 28090296 5' + G2 2958 1 76.03 CTGGCCAGAAAATCTCGTTGCCTAGTCCATGACTTTGGACTTTTGGCTTATGCGCTCATAGAGTATATATAAACATACATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATTATGAAAAGCCGCATACG:1 - chr3L 5061665 5' + 17.6 41 2 57.53 GGACAGATAGATAATACGAACACATCGGACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3R 28901174 5' - transib2 2809 1 73.29 AGGACCCGGGAACAGCGAACGGCGTACGGAGACAGACGTTACTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:1 - chr2L 10021375 5' - 1360 23 1 70.55 AGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr3L 24131517 5' - Transpac 269 2 56.85 ATTTGGTTTGGTTTATTTGGATTCCATATGGATTATCCTTGTTGTTGTGCTTTTCCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATT:1 + chr2L 13089201 5' - I-element 4995 1 62.33 CCTTTAAAGTTGAATCTCTTGTTAAGTGGCAGGTAACTCACACTGTTTTTTAACCCACTCCGGTAAAGTGCATCAATAATTTCTCACTTTTATTACTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 3233918 5' + roo 8689 2 67.12 CATTGATCTTATAAAATATAAGCAAATAATAATACTTATGATATTATACATATGCTATAATGTTATTATCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3L 8673292 5' + I-element 48 1 54.29 GGAGTGATTGTCGGTTGGGTCTATTCTCTGGCCTATCCGTCCAAGACGTGACTGGCATTCCACCCGGGGATAAGTAACTAGGTTTTTCCTATAGAAATTATAGCAAGTCACAGTAAAATCTTGTAGCCAGAACAACAACAGCAGC:1 + chr2L 11341475 5' + TART-A 125 2 51.72 TGTGTGCACTGTGAAAAAACTCTACATTCAATTAAAATACATACATAACATACATAATACACACATAAATCAAGAAAAAAACATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACGTTTCA:1 - chr3R 12728098 5' - Juan 4183 1 59.59 ATCATATTTTTCCAGTTTTGTTATTGTTGTTTTGGTGGTGTATACAATAAATAAAATAAACATTTTTGAATATTTTTGGAGTATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTCTTTTCTTTGTTTTACAATTGCATCTTAAATTATA:1 - chr3L 2936215 5' - mdg3 5062 1 59.59 ATGCACGGGCACGAGCTCACAAATTAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTGAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGCTC:1 - chr2L 7096801 5' + G6 1879 1 73.39 AGTCGTGAGGAGGCTAAGGAATCACTCCGTGACAAATGTGTTTTCAAAGTTGTAAGCATATAAATAAAAAAGCAATATTCCCTACCCATTGGAACTTGAACAGATGTGAGATTCAACGTTTGCTATATTTTATATTATATATTATT:1 + chr3L 13180442 5' - Tc3 255 1 66.44 AAGCTATTGTCGAGCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCATCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGGAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAC:1 + chr2L 17205145 5' + hopper 31 1 64.38 TAATCTTCTGCAGAGTGAAGTCACCTGACAAAACACAGGGTACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 10167493 5' - roo 9034 1 58.90 GTGAGGTGTCTAAATGTATGCAGTGCATTGTATTTTCCGATTGAAAACATATTGCGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGT:1 + chrX 19074771 5' + mdg1 7105 2 61.64 CAACACCAATCATTTATGCCGGATTATATTCTTTTACTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTATCTACGGGGGCCTTCGACTCG:1 + chr2R 23780544 5' - Ivk 5311 1 69.17 TTAGGGAATTAAACGTCAGCAAATTGTCTGAGCACCCCCAACCATCTTAATGAGAATGGTTCAGCGCACCCGGTTCAATCCGCCGACGCAGCACCCGGAAAAACCCAACCCAACCCCAACCAAACCC:1 + chr2R 19970774 5' + G2 103 1 78.74 ATTGCGCTATAAAAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCT:1 + chr3R 17996136 5' + diver 5909 2 66.91 GGGAGCGCGAAAAATATAATTAAAAACGCAAACAAAACGGGAGCTGAAATGAGAAAACTGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 - chr2L 14074555 5' + 297 6635 2 58.22 CTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGG:1 - chr3L 25008177 5' + X-element 65 1 50.68 CAAGACCTAGAAAATAATGAAGATAAAGCTATTATAATAGAAGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTAC:1 + chr3R 904898 5' + rover 6 2 68.97 CATTAGGATTTCGTCAGACAGGCGAAAAACATGAACAGCCCAAAGGGTAGATGAACATACCAAAGACACTAGAATAACCACCTAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:2 + chr2L 11391491 5' - 1360 23 1 42.47 CATACCACCAGGGTTCAGTTCCCTTCCTCGATTTGTGTCCGACTTTTTTTTTTAATTAACTCGGGGCATATGAAATGTGGTGGGAGTGTGATTGGGTTTATGCCAATCTGTTCGCAGGCTGCACAAAAATTTAATTTGTTAAATGT:1 + chr2L 6826610 5' + HeT-A 5814 1 69.18 CGGAACAAGAAAGCGAGGCGAAACTTTCTGCCTGACGTGTCCTGCCCACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTAC:1 + chr2R 18514848 5' - P-element 369 1 64.38 GGGGGGCCTTGGTGATCGTCTCGCCGTCTGGCGGTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGAATCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCTGCAAGAGACATCCACTTAACGGATGCTTGCAATCAGTGCG:1 + chr3L 18402955 5' - P-element 2837 1 49.66 CCATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAAAGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGG:1 + chrX 22398527 5' - Gypsy6A_LTR 97 1 42.47 CCCAGTTAGCAATAAAACCAGCTGTCAATTTGTTTATATTATAAAAAATAATTAGTCTGTATTCAGCGCCGAAGTCGACGACTCCATCATAGATGTATGTATTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGG:1 + chr2L 7844874 5' - I-element 4928 1 75.34 AAAACTCCCACTTCTGAGAACTCACATTCAGTAGCAATTTATCGACATCTTAGGCAATCACATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2R 22992544 5' + hobo 61 1 58.90 ATGTTTTAATTTAGAACGTGCGAAAGCAAACGCATTCATTGCTAAACGTTAAGCATGCATTTTAATTTTTTTTTTTATTT:1 + chrX 21381164 5' + INE-1 470 2 85.00 CACTTGGAACTCTGATTTCCATTGTTGTTTATTTGACAAGTCGAATTCTTTGCCTGTGAGCTTGGCACGTTCAAGTTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr2R 13259264 5' - mdg1 7432 2 60.77 CAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGGAAGGATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGCTTTTTATTGGACATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAA:1 - chr3L 20187401 5' - FB 460 1 60.71 ACTTCATCTGCCGCCGCATGTTGCAAGGCCTTAATTTATTTTTTTTTCTATTGTCTGCTAGTTAGATCTCAACTTTTTCTTTTGAATTGCTGGTAATTTATTTGTTATTTTCTTTTCAATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 10227592 5' + hopper 143 7 55.00 ACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 - chr2L 21328273 5' + 297 46 2 67.81 ATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr2L 15936782 5' - copia 213 2 68.75 ATCTTGATGGTCAGCATGGGGCTGTCAAAGCATGCTTATGTTTAATTGGAATCCGGCAGAGTATCAACCTAATCAATTCCACTTTTTCAGCTGCGTATTGTTAG:1 - chr2R 6646059 5' - X-element 23 1 75.96 AGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2R 17796531 5' + jockey 4713 1 56.25 AAGAGAAGGTATTTCCTCTTACCGACTTGACAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:2 + chr3R 15942726 5' + hopper 83 1 74.65 CAGCAATTATAGAAACAAAATGGGAAAAAAAAGGCGACCGAACCGAAACGAATGAAAAAGGGCAACAAATTGGCTGGCAATTTGACGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAAC:2 - chr3R 11040185 5' + Bari1 35 1 62.33 AAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATA:1 + chr2R 1320682 5' - diver2 347 2 53.00 GATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTT:1 - chrX 8027480 5' + Juan 70 1 63.70 ACAGGATTGCCCGTAATTGACCGCATATCGAATATGTTAAACATTAAAGCAAATGGAAGGCTATTAGGCTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 - chr2L 14523252 5' + HMS-Beagle2 6935 2 52.74 ATAAAAATAAGATATTTACGCTCATTTAAACAGTGTGTCAAGTAATATGTTTTAAGGCTGATAACTGTCAGTGACGTCTAAAAAATAATTCTTGTTAAAAAT:1 - chr4 532747 5' + NOF 3906 1 56.86 CGGCCCCTCCTGCCACTTAGTTGCCCCATTTCCCGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTT:1 - chr2R 18257629 5' - Juan 3774 1 76.71 ATACATATTTTTATACGGTGCAAAGAGAGTCAAGTTCTGGACCAGGACCAAAAACCGGGGCCACAGACAAAATAGGCAGAGAAGTGGGGAAAATATTGGGATGAGCTGAAGGAGTAAAGTAATAATATTTCTGGGATATCGATAGA:1 + chr2L 12960075 5' - INE-1 501 1 76.71 AATGCACTTGCTTGTCTGTGGCACAGTACCGCTCTACTTAATAAGTATCAAATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCT:1 - chrX 19980720 5' + X-element 4505 1 54.07 AAATAAAATGTTTTTTGAAGAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - 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invader2 199 2 50.68 ACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 - chrX 20999606 5' + BS 42 1 50.68 TAATTTGAATTTTTTTTGTATTATACATAAGTGATAAGAATTCAAAATTACAATCTAGTTACTTTAGAAACACATCGGGCAAGCGGATATCCCACATACACACCCACATACACAC:1 + chr3R 24557749 5' + accord 254 2 74.78 CTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2L 47181 5' - roo 9001 2 65.52 AAAAGCTGCAAAAAGTTTGTGGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr3R 13875080 5' + P-element 84 1 18.32 AATGAATCCCAGATACAAAACTTTAGAGCCAGAGCGAGATGGCGGAGTGAGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGGTGTGTGGGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chrX 15357623 5' - hopper 1385 1 63.01 ATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATG:1 + chrX 15200863 5' + 17.6 63 1 76.92 TCTTAGAAATTTTAAAATATATACGTTGTTGTCAAGGCTTTAAAAAATATATATATATTTTCAAACACCAGAACTACCTTCCTTTTTTTTGTTTTTGAATCGAGAACTTGAGCTACGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATA:1 - chrX 10112309 5' - Quasimodo 208 2 63.70 TGATATTTTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGGGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGGCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGCCGTGGTTCTTTCAAG:1 - chr3L 25401025 5' + Doc 27 1 48.06 ATTAAAATACACTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr3L 24934254 5' + HMS-Beagle2 18 2 71.92 TTAAATGCTCTACCTTTTTACCTTTTTGCAAGGAACATGTAAGTTATATGATAGCTTGCAGCTATGTTTTTTTATATATAAAAAAAACAGTTCAATTAACAATCAAAACAATTAAACAATTAAATAAATTATAAAATAAAAAAAAA:2 + chr3L 15760685 5' + BS 5097 1 61.64 ATTTTCCGATGTTTCGCCTCACAAAAACGAAAAAAAAAGAAATCAAACTAAACGAACCCAAAACATAAATAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAAAAGTCGAGGGATGAAAACGAACAAGAGACGGCAACC:1 - chr3R 13639222 5' + I-element 361 1 52.24 AGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 + chr2R 4362810 5' + F-element 26 1 48.72 TTATTGGTCAAATTAGTTTATTGAAAGTCACTTAAAACTGATACACATAAAAATGCCAGC:1 + chrX 20848292 5' - 1731 4454 1 66.67 GGCAAATTACTATTATGCATGAAGGAGCAACATGAAGACGGTTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2R 23180151 5' + roo 20 2 70.83 TTATTAATTCTCTTGCCAGCCAATTTGTTACTAAATTTTTCTTTTACCAAAGTACATTCGGCTCCCGAATCGAAAAAGAATGGAAAGGGCTCACCCAATTGAAAGATCAGTATATGGCTGGTTTGGAAACACAAAACCGTAACCTC:1 + chr3L 25556528 5' + invader4 406 1 71.23 AAATGTAAAGCAATTAGAATCGTAGGATTTATAAAATAAAAAATTTATAAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:3 + chr3R 17421189 5' + pogo 32 1 59.59 TAGATGAAATGGGTATACTAGATTCATTGAAAGGTATGTAGCAGGCAGAAGAAAGCAATTTCCGAATATATAAAGTATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 + chr2R 6606596 5' + Quasimodo 30 2 64.14 ATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chrX 19054240 5' + jockey 61 1 53.42 CACAGTGGTATAGTGGTAGTGTACGAGGATGGAATGCTTCGCTGGTCTCGGGGGCCAGAAATTGGCAAACAATAAAAGCCGTCAAAAAGTGCAGCCAACAGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTAC:1 + chr3L 10792557 5' + hobo 2886 1 76.98 CCCTTCACTGCATTATGAATTAAAAACGCTGCCAAGTTGCGGCATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr3R 27765054 5' - 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chr3L 16437258 5' + F-element 39 1 44.72 TTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr3R 7420311 5' + 1360 52 1 54.79 AATGAATATTTACCAACTTCGTGCAGCTGCCGGCAATGTAATGCAGTTCTATGTCATTTTCTAAACACCCAAATGATTGTCGAATGCAATATTCTAGACTGGATTTTTATATATATTTTTCAAATTT:1 + chr3L 7443974 5' + copia 4666 1 74.02 AAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2L 22193414 5' + roo 57 2 59.03 CGGTGGTAATGGCCCGGCAAGTAGTGGTTCGGGTAGTAGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGGTATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr3R 22104120 5' - F-element 4384 1 70.37 GTCATGTTGCCTGAGTTTTCAAACACATGCGTTCGCACGCGAAATCAATATCGAAAGCCGAAGCCTTGTGCAAGCCTCTACTGAAACTGTTTACCTTATCTCTGGAAACTTCACAATTCCCTCATATATGGAATGAGTCCTTTGTG:1 + chr2R 17286018 5' + Q-element 45 1 56.85 ACTTCTCTCACGCTGCGAAATAAAAATGAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 21216864 5' + roo 15 2 76.71 ATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATC:2 - chr4 829129 5' - INE-1 150 1 34.93 ACTATAAAAGTTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCGGTTAGTCGGG:1 - chr2R 1751258 5' + INE-1 552 1 72.06 TTAGGCATTTATTAGGAAAATTAAGAAAATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chrX 18396152 5' + roo 8754 2 82.19 CAAGCAAATACTCTAGAATAATGTAGAATGCATGGCCGTTACGCATACTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTACAAGCCTAAACATGTGTTTTGTACAAGTTAACTCAAGCTAACGTCGCTCCCACGGTCGCATGAAATACGACAACAT:1 + chr2R 4133159 5' + gypsy2 30 2 70.55 AAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 + chrX 18817299 5' - transib2 2743 1 73.61 GGTAGCCTTAAGCGGATTGCTCTTACTTGCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 - 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chr3L 3501809 5' - Bari1 1637 1 66.44 CTGTACACGCGAGCCGACTGGAAAATTTGGAAAGCCGTGGGCACGCAATACACTCTAAACAAAGAGCAGCGTGCTGAGCGAGGTACCACCCCACCCCCCAAACCCC:1 - chr3L 22960550 5' + Tirant 7 2 73.58 ATATTGCTCAGACTTGATTTTGAACTAAATATTCGGCTTATCTGGCGATAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGT:1 - chr3L 2544710 5' - Tirant 8437 2 65.07 ATGATGGGGCAGGATCGGCTTGGTCTCCTCAATTAACTCTAAAAGGACTCTCAAAGGAGATGAGATCAATGGGCTTATAAAGTTACGAACTCAGTACGCTGCTCATAGCTCGATACTTGTAACATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 14051697 5' - roo 401 1 74.66 ATAAGGATTTTCCATATCCGTATACAAATTTGTTATAAAATTACATATATTTAATCAGAATAGCAACACATTGTTTAAATCCGATTTTCTCAAATTTTGCACGTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:2 + chr3R 15724254 5' - Juan 4202 1 73.97 TATACCTTATAAGAACTCTCATCATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATAGCATCACGTAGATGGTACGCATGGTAAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 7420338 5' + 1360 23 1 70.83 ATGATCGCACATCTGTCATTGTATACATTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTAT:1 + chr3R 18971723 5' - Juan 4157 1 67.20 ATCCTATTAAAGATTGCATTTTCCTGGTAAGACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCG:2 - chr2R 9967105 5' - Bari1 1619 1 77.40 ATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACA:1 + chr3R 19449909 5' - roo 8605 1 63.70 GGGGGGCTTTTTCTATCCATGACAATGTCGGAGAATGGAGAATCGTTTGAACATTGCCTCTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 13766342 5' + roo 21 2 71.92 CGAAGCTGTCCAAGGTATCTCAATCAAATGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCAAA:1 + chr2L 11652965 5' + opus 7369 2 76.69 CCTGAAAGCAATATAATCTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGTAAATGTTTTTAAATATCGTTTTGGTGCCCCTAATGTATGCTCTTTCATAATACAATTTACAAAATTTTTTGAATTTATGCCA:1 - chr3L 19134759 5' - transib3 27 1 67.12 AATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAG:2 + chr3R 19449932 5' + roo 9049 2 69.18 GAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3L 14094705 5' + I-element 40 1 58.22 AACCAGCGAATTAGATTTATATCTCGAAATAACAACCGTCTTCTTTATAATTTAACTAGTTTTATTACAAAAGGGACCGATTATTACATGCAAGGAAAAATAGTCGGATCAATACGATGAGCGATATTTTCCACAGAGCTATTGAT:2 + chr2L 4137972 5' + transib2 2372 1 54.79 CGATGAGTTTTGAATTTAATTAAGACACAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAAATGAACTGTATTCTTTCT:1 + chr3L 17183696 5' + diver 79 2 75.76 ATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:2 + chrX 18817263 5' - transib2 2777 1 53.42 AACACCAATTCCCACAACCTTCTACATACCACTGGACATCGATTTCGTTTGCAATATTTCCAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAG:1 - chr3R 16518992 5' - Tirant 344 2 53.42 GAAGTGTTGTAAAAAATAAAAGCAAAGCCAAACAAAACAATATATAAAAGCCCGATAAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGATGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGT:1 + chr2R 23785460 5' + Ivk 319 1 59.59 AAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGTAT:1 + chr2L 22121332 5' - I-element 5315 1 65.73 GAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTT:1 - chr3R 2520352 5' - Tc1-2 1608 1 63.01 GTTATCGTTTTTTTTTCCGGCGAATGTCGCGTGCTATTCGTTCGAGCGCTCGGAGGAATCTGACTTCACGCGGCGGCGGAGCGACAGTAACTACTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 6964661 5' + P-element 9 2 69.77 GATGGCTTCTAGAGAAATGAAAACATAAACGCTGCTAGTGTAACAAGAGTACGAATACGAAATACGAATAGTTGGTCACATAATCTTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAA:1 + chrX 11938381 5' - mdg3 56 2 56.85 TTATTGTTTTATTTAATTTGTTATTAATTAATTGTTTTGTTTGTGTAGCCCGTCTGTTGCAGCGCGGCATTACTAGTAGATTGCAGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGA:1 - chr3R 11644515 5' - HeT-A 6025 1 60.27 TGAAAGTTGATATCATATGAGCACTGTTTTGGGAATTGGTTTGTGTTTTATTATTTAGTTAAATGGGAAAGAAAAGTTTGGTTTGTTTAGGATTCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACT:1 + chr3L 14131021 5' - Doc 61 1 68.49 TTACAGTTTGCTTAAGAGAAAAACCAACATTGAAATCATAAAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGAACCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAA:1 - 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chr2L 13556493 5' + transib2 9 1 73.79 ATATAAATGGCCATGTCAACGGCGCCGGGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTGTTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr3R 27765097 5' - mdg1 350 2 65.07 AACAGGTGTTGATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:4 - chr3L 13295001 5' - roo 9029 1 56.85 AAGTTAATTTAAGTGCTAAAATCGACTCACCTATATGACGGCGTGTGTTCTCGATGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTAAAGCTTGACCACTTG:1 + chr2L 3148017 5' - Stalker2 7460 2 67.12 AGATTAAATAGCTTTGCAACCCGCGAACCCATCCCGGAAAGTTCGATCAAAGACACAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTAGTACACGATTTTT:1 + chrX 1514143 5' + 1360 38 1 88.68 AATGTTTTAAATATCCTAAATCCGCGTTAAAGCTGGTGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGTTCACTGACAACCATATTTGGATGATCCTATTCTTCACCCAAACTCAGCTCATTG:1 - chr3L 22035593 5' - 1731 4562 1 59.84 TAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - 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P-element 356 1 54.79 TCCCTGCTTCCCTTTGGTGTTGGTTGCTATTTATTTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 - chr3R 25709910 5' + hopper 22 1 65.75 ATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCACTGTTAT:1 + chr3L 13365728 5' + BS 5036 1 48.63 TGAAGCGATGTACGCTGGTTGGTCATTGCACTGGACGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCGTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAA:1 - chr3R 8787929 5' + mdg1 7395 2 73.97 TTGCACTTTCGCACACGGAAAAGTGTGGGGAAAAAGGTGATAAATGCATAAGCAGGAAAACTTTTGCGCCTCCATTGCTTTCCTTTCGATTTTGCTTTGTATAGAATGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 - chr3R 31886989 5' - hopper 1403 2 77.40 TATTGATTTTTTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATATAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGGTAGCTGC:1 - chr3R 13406558 5' + pogo 16 1 71.13 AAAATAATCGGATTAAAACTTTTGCGAACAAGAATTACTTCCATGGAAATAAATAAGAAATCAAATCCACAAAGAAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACT:1 + chr3R 13241367 5' + I-element 484 1 50.68 TATGGTTACCAGGCCATTAAGCGTCTCCGAGGATGTGGCGCCTCCTGTTGATCCTGTGGCCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAG:1 + chr3R 12144488 5' + accord2 270 1 67.78 GCACATTCGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAA:1 - chrX 9950610 5' + jockey 4724 1 57.35 GGCTCTCCTCCTCGACTGCCCAGATCCTGCGAAAGTTCCGCATACCCAAGGGGACGGCCGTGACGGCCAAGTCGGGGGAGAACTACCTGGCCATGCCGACACCAACTACCGCGCGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGGC:1 - chr2R 13178137 5' - accord2 200 1 75.71 ATGTAAATACAACCTATGCCGAAAAGTATGCATTATGCAAAGTATGCAACAACAATTTTCTTACAAACACCATACATTTATATTTTTGGGTATATTATTGGGTTTGGCTTCAGAAACCTTTTTTTCTCGTCCGCCCAAAGGTT:1 - chr4 941606 5' - Tc1 1169 1 60.14 CGTGTTAACTTAAATTAATTGAAGTTATACTAACAAGAGGTGTATTTTCTTCGAGTGTATGGGTATCTCCGGCCTGACTTCCTGTCACGTACACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACATTAATGTGTTTTTC:1 + chrX 19038332 5' - hopper 1390 1 67.12 AAACCTTTACAATATTGCAGGGACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCT:1 - chr2R 7306533 5' + Max-element 8281 2 74.47 AAATTGAAAATATGGCGAGGTAGTAAAAAAATTAGCCTTTGCGATCTATATTCCAATTACTAAATCATTTCTTTAAGGGGCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3R 7943710 5' + blood 43 2 54.79 AATAATAACTATCATAAAATGAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGCGAATCGCGTATTCCTCTTTTCT:1 + chr3R 7819148 5' - invader3 177 2 50.00 GGTGAGTCAAATGTGGAGATACTTTTGGAAAACGACTAAAAATCGAATCTATGCTATGCTTCAATTTGAATTAAGTCTCAAGAACTTGTGAATAAACTGATAGTTCGCATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTG:1 + chr3R 30799669 5' - Burdock 44 2 76.03 CGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3L 3983863 5' - P-element 2841 1 31.96 TGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2R 15376199 5' - 1360 3340 1 52.05 ATGAAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCACATCAATTGTTATATGGGTCACTACATTC:1 + chrX 21585254 5' + mariner2 274 1 58.99 TTTCCCGTGTTTTTCAAGACTAGATCTTAACCAGTCTAAAAACATTCTTATCATATGAGTACCACATAAATTCCTGAATTTCAAAAACGCATAATAGGTTTAAAAGGTTTTCCATTACAGTTTTCCGGCTGCACCAGTTACCTCCG:1 + chr3L 13031681 5' - ZAM 463 1 60.96 GAAGAGCCATTAAATGGTTCACATCTACATATGGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 5769084 5' + roo 87 2 82.88 AAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATTTTGTTCAATTGTATTGGGAAAGATTATTATATCATCCAA:2 - chr2R 2875182 5' - TLD2_LTR 46 1 67.12 ATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATCAGATATGAACG:1 + chr3R 19449983 5' - roo 8714 2 71.53 GGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTA:1 + chr3R 19407930 5' + diver 5979 2 78.77 AATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 2989971 5' - roo 8999 2 81.15 TATGAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTTTGTGGGCGTTATATCAGGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 - chr3R 20872397 5' + HMS-Beagle2 36 2 60.96 GTGGTTGATTTTAACAAAATGTTAGCAATTAAGGTATTAAAATATTTAAATATGTACACTCCCACTTCTTTACAAAATGTAGGTTCAGTGAAAAAGCCATCATAAATTTAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGA:1 - chr2L 12596831 5' - Tc1-2 339 1 45.21 CCAAAGCCCACACACTCGAACATATTCAAGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATG:2 - chr2R 20382635 5' + I-element 5291 1 75.34 TGAACAGTAGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:2 - chr2L 23400849 5' - S-element 1674 1 56.85 AACGGCGCCGTGGCAGCCTATTAAGTGCTTTTCGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr3R 27765114 5' - mdg1 7397 2 73.33 TTATCCGGTGTTGAATGTCTCCAAGGTTGCAGATGGTAGTTTTAAGGGTACTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 13300869 5' + roo 8686 2 53.19 AAACATACATAAAATAAAATTTTGTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGGGTGAA:1 - chr3L 22035717 5' + F-element 13 1 78.08 AAAACGAAAACTATTTGGGTAAATGTTTGCCCAGAGCTGATTGCGTATACGCAGCGTGTGCCCTAAAAGTTTAGGTGCAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGTTA:1 - chr2L 11702207 5' + Porto1 114 1 54.79 AAGCCCGTAAACTGCAAAACACAAGCAAACAGCAGTCAAAATCGAAATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:2 - chrX 22840563 5' - copia 184 2 65.07 AGATTGAGATACTTATAAAGCTGGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 + chr2L 6174030 5' - I-element 5317 1 55.48 ATTATCATTTGTCTTGCTAATTTGTTTCTTGTTTCTGAATACCCCATAACCCCTAACCGACCAACACTGCCTATTCTTTAAAAAGATGTTTTGAATATTATTTGATTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 4474950 5' - roo 396 1 76.03 GCTTCGATCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 16341913 5' - P-element 2850 1 60.27 AAATATGCATTGCCAAGGGGGCGACTTTGGGGCGGACATCTGACAATTTGCAATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr2R 22034609 5' - copia 236 1 71.72 AGAAAACTTTACCAATGAGGTTTGTGTACAATCTTTCGTTAAGTTAGCCGATACATAAACCGATAGTAATCTACTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3R 30946629 5' - Transpac 265 2 54.79 GATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTTCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATG:1 - chr3R 15790116 5' + flea 4737 1 56.25 ATACGATTCGGTAAAGATTGAGCTTCATAAAAGGTGCACATTTGTTGATTAATTGACGATTCTGATAACCGTTTTCAAAACTTGTACCAAGAAAAATTAATACACACAAAAACCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCG:1 + chr2L 2674468 5' - pogo 267 1 62.33 TTATGTAATCACTAAGCGTACTTACTGTCCACATTAATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr3L 17055384 5' + Tirant 8123 2 74.66 CGGAATACACAATTACGGTGTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 8076004 5' - 412 7505 2 47.22 AGTAGATTCAATTTATATTCATCTGTATGCTTATTTTTCCAGCATTATTTGTACTTTTCTGAACCCCACGACCATCCCAGACGGGCACGTACATACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chrX 1799259 5' - invader4 300 2 67.81 TTATAAATAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 - chr2L 17005853 5' + Stalker2 13 2 75.34 GTGGAAATATACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3L 25411890 5' + 1360 37 1 69.23 CATTCCTTGGTATTTTTAAGTAATTCTAGCGCGGTCACACGGCTCTGGCGCTCTCTTAATTATTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACCTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCG:1 + chr3L 19793624 5' + Chouto 197 1 57.53 AGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr2L 3234024 5' - roo 316 2 78.77 ACATGTAATAATTGATGTGCGGTCCGAAATGAACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTAGGAGTCAAATGCAAAGGCACGCTCTCACTGTTTTAACGCATGATGGCGACTGAACCGTGTCGGGACAAAGCTTTG:1 - chr2R 4802725 5' - mariner2 100 1 78.77 GTTCAGTTTGTGGGTCTATATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:2 - chr3L 22035694 5' + F-element 36 1 62.33 GCCGACGATCTGTAGAATGGTCTTTAGGGGTTAATAGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:2 - chr3L 47034 5' + FB 33 1 61.64 ATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:2 - chr3L 14094662 5' + I-element 83 1 76.71 CTTTCTTGATAAATTACCCAAGAGCGAGCACTCAAAAGCCGAGCAGCCGCAAAGTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGACGACTCAAGCGA:1 - chr2L 7593129 5' + jockey 4738 1 58.57 CAAATGGAAACCCAAAAGAAGAAAAAAAAGAACGGAGCTGCACGCTAATTGAACTCGACTCTGAAAGTTACCCTCAGTTCAACATTTTTATAAGTAATTTTAAAATT:1 - chrX 10279942 5' - Penelope 489 1 82.24 GCATGCGACATACTGAAAAATTAGGCAAAGCAACAAATTCAAGCCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3R 17673891 5' + FB 12 1 75.34 ATACTTTCATGAGACTGGTATAAAATAAACCTCTTTAGTTTTTTTTTTCAGACTTGATCTACGAGCCTGTCTTGGTTTTTTTTTTAACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAA:1 + chr2L 20839402 5' + mdg1 7302 2 62.79 AAAACTGCCCCCAAACTGTTTAAAAAAAAACGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAA:1 + chrX 22488421 5' - FB 99 1 75.96 ATTTAAGCATTTTATTTTTTAACTGGCAGGTGGTTTTCGTGTATCCGACTAAGTAATACCTCTTCATTGGAGAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:4 + chrX 13134840 5' + jockey 4773 1 73.97 GTGTAATGAATTATCATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2L 4063935 5' + roo 62 2 60.96 TTATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTCAACTATTGGAG:1 + chr2R 20227199 5' + hopper 39 1 52.45 CTGTGAGGTGGAGACCAGCAGACCTGGAGGAGTGGCAATCGGTCTGGAAATCCGGGGACAATGCGCGTTTGATGAATTGCATTAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 - chr3R 6625833 5' + flea 4787 2 64.83 CAATATACATATCTACAATTTCATCGGATCAGTGTCAGTGTTAAATATATACTTTGGCAGCTCACGGAGCTGCTCATTGGGTTGATTTCGCTACACAAAATTACAGTTATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGAGCATTTTTGTGCA:1 + chr2R 9966941 5' + Bari1 23 1 46.58 AAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chr3R 15790083 5' + flea 15 2 65.75 GCATTTAACCAAACACAAATATTTGCACGTTGGTTCATTTCCTTTCTTCGTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2L 4003651 5' + mdg1 7066 2 65.07 AGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGGCTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACCA:2 - chrX 12649919 5' + transib2 91 1 78.08 TGGATGATGGCCCACGCCCACATCGGTTTTCTGGGCGGTCAGACAGCTCGTCGACTGCGAAAGGTTGGCAATGCTATCAGCTGCATTGTCTGATGCAGCTGATCTGATTAATTACCAGTTTACT:1 - chr2L 9135219 5' - Rt1a 167 1 63.71 TAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGAT:1 + chr3R 7666646 5' + I-element 74 1 64.38 TTATCCGAAGATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCGGACATATATTT:1 - chr2R 955167 5' - 412 442 2 74.56 AGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2R 13766208 5' - roo 9009 2 64.54 GCTGTTTCAATTCAAGATATATCACCAGATCAAGAATTAACAGATTCAGATTCAAGCACTACCATTCAGGAAATAAAACTCGACACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr2R 4855156 5' + transib2 35 1 61.64 ATTAAACTTTATTCGCAATAAAAATTGCACTTTTTTCCATGTGCTATTGGAGGCTATTTCTATGAATTACAAGCGACACACTCACACACACACACACACACGCACACGAGTTCTGCCTTGTTTTTCCCTTCTTTTTTTTT:1 + chrX 8373983 5' - gypsy2 408 1 62.86 AATTATGTTGTAAATAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTT:1 + chr3L 22890309 5' + FB 16 1 72.60 TCTTAAAAAATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr2L 5582222 5' + pogo 45 1 54.79 TGTGTGCCGTAGGTATAACATTTCTTTGCCATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGTCGTTCCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chrX 20888371 5' + 297 6626 2 53.42 AAACACTATATGGCTTAGTAGCGCCGTCTTAATTAAATAAATATATATATATATTTTTTTTATATTTCTTTACTCATTCATTTCAAATACTAATATACATATTTAAAAGAAAAAACAAAATATTATATACTTGAAAATAACTTCAT:1 + chr3R 1292430 5' + mdg1 6986 1 77.40 GGTCATTACGCTTATATGTGGAGGCCTTTCCTTTTTCGGGATAGTTCCTGAAATAATAGCTTTCAATAGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGG:1 + chr3R 2522282 5' + Tc1-2 111 1 52.74 AGAACGGAGAGCTCTGGGGAAGATCAATTCGGGTCGGTTGCTGGCCAGAGACTGAAAAACGATCGCGTGAACGAAGAATTCCTGATCAGTGATCACGTTTTAGGCGACCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 12004425 5' - P-element 2877 2 64.83 ATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAAT:1 + chr2L 15950935 5' + Juan 4094 1 62.33 GTGCAACACTTGCCACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chr2L 15779668 5' + hopper 39 1 60.69 CTTTCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATC:1 - chr2L 13844238 5' + Stalker2 7330 2 71.23 TTTAAAATTAAATAATGTAAAATTTGTCAAGATCAGATATATACAAATATATATATATATATATAAACCACTTTATTCAACAATTTATTTAACAAAGTATAAAAAAAATA:1 - chr3L 4169892 5' + BS3 1767 1 40.00 GAACTTTTTATGTAAAAGAACCTATTTAAAAAATAATATAATAATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr2R 15326822 5' - copia 247 1 55.48 CCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAAGGGGGGCCAACCAGGTTGGTACGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 - 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pogo 2050 1 60.96 GGTGGGGCATCTGGGAATGACCAAGGAAATGGTTACAAAACACGAAGCTAATGGGGCAAGTATTAGCGAGAATATCAAGTGTTTCCATTGGTGTGTTAGAATGATGATTAAGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAAAATGGATAA:1 + chr2R 11549542 5' - GATE 475 1 76.03 ACGTAGTTGAATAAACGGACATAAGAACGCAATAGGAATGCCACCTGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 + chr3R 4805617 5' - 1360 3316 1 67.12 GGAGCAAAAGAGAAAAACCTGTGAATGTGAGTGAGTGAGAGACGGAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGGTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAG:1 - chrX 5082441 5' - F-element 208 1 62.39 GTATAAGGGAAAAAATTTATCACCAATAAAATTTGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCT:1 - chr3L 25321820 5' - Doc 207 1 64.95 AAATGTAAGGTATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr3R 4679603 5' + hopper 9 2 78.08 CAATATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGAAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTT:1 + chr2L 22121301 5' - I-element 5343 1 49.32 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACAT:1 + chr3R 19450176 5' - roo 62 2 81.51 ATTTTATACCTTTTTTTAGGTGCTACATTTAGTTTCTTTTATTTTTATTACATAACTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAAAAT:1 + chrX 160220 5' + Cr1a 4299 1 57.65 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGGCGTAGGATGACTTGGTGCACAGTTTCGTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - chrX 14317414 5' + FB 67 1 65.07 GAAATAAATCTCTACACCTTTTTTTAATACCCATGACTATTTTCTCTCTCTGCAGCAACAACAACTAAGTAAGTTGTCAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAG:1 + chr3R 29690687 5' + I-element 5243 1 54.11 ACATTAAAATGTGCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTA:2 - chr3L 20187467 5' - FB 857 5 79.45 TAATGACATAAAAATAACCTTTGCAGAGACTGACCTAAATCCTCAGGAATATCGAAACACCTATGAAATACCTATTGAAAAAAACATGAAATACGCTAAACAATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATAC:1 + chrX 15032873 5' + I-element 4923 1 66.44 GGCTGAAGGACACTTGAATCCTTGTGTCCAAGTGTGTCTGCCCCTCTCTTCATCTTCAAAAAAAACAAAAAAAAAGGGG:1 + chr3R 17997564 5' - hopper 140 2 86.08 CACATTCAAGATATTGATTACATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAA:1 - chr2L 1924026 5' + G2 3003 1 56.83 GTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATCCTTACAATT:1 + chr3R 15790809 5' + roo 8684 2 61.87 AACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAAT:1 + chr3L 19274816 5' - transib2 2736 1 79.45 TATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAACTTGGGAATTATAAAAGTGTGGGAGTCGAGCCAAAATGGCAACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:2 + chr3L 20756363 5' + Transpac 4924 2 48.63 GTTTAGAATAAACAAGGATATAAATATGACATTTTATATGCTAATTGGCAGTCCAATAAATATACATTTCTTGGCTTCATTTCGAGTGATATCTAGCATCTTCAACTTGCCCGCCCACGCCACGTAAAACAAGTTTGGAGGGATCC:1 - chr2L 2637674 5' + R1A1-element 5322 1 68.49 AACTTTTAGAACCCCCCTCCATCCCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTG:1 + chr3R 13111774 5' - invader1 58 2 43.37 AAGTTATTTTATAATAAATAACCTTCTAAAAGTCGAACAAAAATATAATTAAGTAAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 18488332 5' + roo 8683 2 64.96 CAGGACAACGCTTCAGGTTACAGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3L 22400395 5' - 1360 3364 1 67.81 GTATCCTCACAAAAAGGCATTGTTATGTTTGTTTTTAACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chr2R 21411020 5' + Burdock 6146 2 78.08 ATCTTCTACTCTAGAAATAACGGTTGTAATAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr4 372934 5' - pogo 2059 1 56.85 ACAACCTGTTTCATCCAGCCACAAATTTACCTAAACTTACTAAACTTGGCAACTGCAACTGAAACTAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACCACAAAGAATCTCTCGCGAAGACAACGGATCTTAAATAATTATGTTTACAAT:1 + chrX 9184409 5' - Cr1a 103 1 54.79 ATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 + chr2L 16539612 5' - Juan 4193 1 71.92 ACTGTTGAAGTGACAGTTTAAGTGCATCTATTACGTCTCCTGCGCCCTAAAAATATAAAATATGCGCCCACAATTTTGAACAATTTTTAAATTTGTTCTCATTTTATTCCCCTTTGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGGTATCTG:1 - chr3L 2470722 5' + INE-1 543 1 56.85 TGGAAAGTTAAGTTCATTAAGTGTTAGTATTTGAACCTCTGGCAGACAGCCTTGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCCTCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTATCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACC:1 + chr3L 15190439 5' - micropia 245 2 61.43 AAGAGCGGCGTGATCAATACCAATCTATTAGACCATGGAGATCGAGTCGATATTAAAAGGAACGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAG:1 - chr2R 5111335 5' - mdg3 26 2 56.52 AGGAAGATCCACTCTTTTAAGAGACTAACAATAAGTATTTAAATCTTAATCTAGCTTTGTTTACTTTCACTTAGTGGTAGTGTTTGTGATTAATGTTCTACTAAGTTTATTGCTGGGC:1 - chr2R 4602688 5' - Doc 4565 1 81.36 AAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 - chr3R 15790091 5' + flea 4758 1 58.57 ACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 19266854 5' - roo 322 2 75.34 TCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAAT:1 - chr2R 8157265 5' + mdg1 63 2 64.75 GAAATCCAAGCGAACGAGCGGTCGAGCGAAGCGGTTGCATTGCGGGTAGAGTGTCAGTGTGTGGGTGTTTTTTGCTGTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTATGTCATTATGTATGTCTTCGTTTCTAATTTA:1 + chr3R 18705686 5' - Porto1 4374 1 53.42 CTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3L 9809283 5' + 412 49 2 77.55 GATATTGCGTGTTTAGTTAACATTAAAACGCAGCCAAATTAATTAATTAAAGCGCTTCGAGCCGCGTACAAATACCCACAATCAAACAGACACACACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 7795650 5' - roo 9048 2 69.18 TCTTTAGGAATTACAATTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:3 + chr3L 5532878 5' - roo 398 1 76.71 ATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGGGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTG:1 - chr2R 15005115 5' + BS 5054 1 58.22 GAGACAGTTCAGACTCCCTGGCATAAGCTGCTGCACAAGCTCTGCGCAAGCTGAGACAAGTGCTTTACTCATTACCATATTTAGCTGTTAAATGAAGACCTAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 47231 5' - roo 387 2 70.55 ATATCTAAAAAAATACTTATTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 18046557 5' + roo 16 2 73.29 ATCAGAATTCGAAAATATCACTTGCGCGAGGATCATTTTAAATTGACATCTTAAACCATTTAAAACAAATTTTGAGTTTAGAAGTGCCTCTACCGTTGTTGAATAATTTAGATAGCAACTTAATTATTTAATTGCGAATTCATCT:1 + chr3L 8085935 5' - invader4 2625 1 77.24 AAATGAGTTTAACACTTGGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCTAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr2L 16946175 5' - hopper 1398 1 71.23 ATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATATAACAAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGA:1 + chr3R 19449915 5' - roo 8597 1 76.71 TAAACATATACGAAGGATTAAGACTTTGGGTGTAGGCAAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTTTTACGATGATGGTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr3L 4219592 5' - jockey 4983 1 61.38 ATAAAATAAAAGTATGGCAGCAAAAGATGAACGATTCGCAGATAGTTTATGGTGCACAGGAACTGTAAAGAAGTATTCTCCATAACTATGAAATTAAAGAAAAGCAAGGGTTATTTGAATATTTTTTTAAAACATTTTTTAATCCA:1 - chr2L 15351070 5' + Juan 3785 1 70.55 TTTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCTTTTGGAACAAATTAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAAT:1 - chr4 987673 5' - Tc1 261 1 78.77 GTAGAGGATTTGATTGTAGTTAAGTTCGTGGAGCGCTGATTTCAATGGCTACAAAAACCGTCCACGTATTAAAAGTTCTGCCTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCG:1 - chr2R 6885627 5' + P-element 7 2 75.86 GGATGTTAGGGATACTTATATGTAAGATATTCAGAACAATTCTCTTATTTGCAGCGGAAGCGGCGGTGATTCGATGAGGAAGCTCTACTATGCCACACAGACTCGTGCCTCTCCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAATTTA:1 - chrX 19588195 5' - roo 403 1 80.14 AACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGAATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGACAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr2R 7090712 5' + I-element 24 1 51.06 CTTTGAGTCCAGTTCGGTTTCATTTACGTGCATACTCACGAACCAAAGACACTATAATAACAAGTTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACGTTTTTTGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 - chr2L 23315382 5' - 1360 3318 1 65.19 TTGTATCTTAGAATGCTATAAAAGTTCTTTATAGGCTTGGAAACGGTACTAATTTTTACCTTTAAGCCCATCTATATATGTAGAATTTCTTATTTTAAAAGTATACAAGAGAAAATAAAAGTTAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 19100662 5' + TAHRE 10441 1 42.45 ATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chr3R 30347368 5' - P-element 2786 1 15.86 ATATGATGTCTGGAAAAAAATTAAATTTAATAGACAGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:5 + chr2R 15326865 5' - copia 5073 2 73.97 AAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:2 + chr2L 22193434 5' + roo 8743 2 72.60 ATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAATTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr3L 18505764 5' + I-element 27 1 64.18 AAAGTATCTATGCATCTCTTAAAGTCAAACCACTCACTTGAGCTTGGACCGATCTCTATACTCCCTCTCCCCCAGATGATTCTCAAACACGCAGTGGAGGGGAAATGCTCTAGATATATGTACAGCTGTGTTAAGAAAAATAGCAG:1 - chrX 3141170 5' + HB 8 1 62.33 AAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTA:1 + chrX 3431842 5' + Ivk 5338 1 57.04 TATATAGAGATAGGTACATATATACATATATACATGGCTATAAGCCTAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTCTACGCCCCGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTA:1 + chr2L 13121998 5' + Cr1a 58 1 64.84 CATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATGAATTCGCTCTCCTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAA:1 - chr3L 23702237 5' + G4 81 1 69.86 CAGGTACTTAGGTTTGTGGAGAACTATGGCACCATACTTTGCCCTGCGATCGGAACATACTGAACTCTTAAACTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 4964207 5' + roo 8686 2 63.03 GATTAGGGAAATGCCGTAACGGGGACTGCGGAAAAGTAAAGTAAGGTGAAAAATCACACAGCAATCCACAATCCCAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTA:1 - chr2L 15550784 5' - Bari1 1665 1 54.11 TTCTAATTCAGAAATAGCACAAAATATTGCAGTAGACGTAGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTT:1 + chrX 12129295 5' - flea 460 1 76.72 GCTCAAGCTTATGTGGGTAAATTTATATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAGGGGTATACTGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCAATAGCCG:1 - chr2R 4886522 5' + INE-1 88 1 66.21 AGACTAATAAAAATATGAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTTTGTGGGCGTTATATCAGGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 + chr2R 5324621 5' + HMS-Beagle2 6906 2 69.86 ATTAATTTTTCACACGCTGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTGGCTAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATCATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAG:1 - chr2L 4036221 5' - 1360 232 1 43.84 ATTTTATTTTATTTGCTCGTGTTCGTTGGCAAATCTTCAACTCCAGACTTTGTAGAGTCATTGACCAACTTCAGTGGGGTTCAGTGTGGTGTAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:2 + chr3R 30347264 5' + P-element 14 1 78.08 AATTATAAAGTTAAATCCCTTGCCATTGCTAAGCTTATAACAAGTCAATTTTATTGTAAAAATCGTAATAAGAGATTATAAAAACCTGTTGAGGGTCTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 19073150 5' + roo 28 2 61.64 CGAAGTGACTTCGGCGGCGGCCGAGTGGCAAAGCGACTGCGGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGT:1 - chr2L 12822858 5' - P-element 2808 1 30.14 ATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 19032588 5' + roo 52 2 56.85 AGATTTTCCAGAGATTTCTGCGCGACACTCCTTAACCTTTTCTATTTGATCCCGTGTACACAGTATTAGTTTGATCTTCACGTTTTTTTCCTGTGTGAGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr3R 28385669 5' + transib2 20 1 71.92 TAAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTTTTCGAGAGCGAGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGA:1 - chr2R 5531170 5' + 1360 142 1 71.92 AAGCAAATGAGTGCATTTGTTGTTGCTCATCGTAATGGATGACGAGTTGTCAGGAATTGAACGATGCCTTCAATTACCTATTGCTGATAAAATATTCAAAAAAATGCAGTACCACTGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr2L 11298176 5' + I-element 19 1 71.92 ATTAACAAAAACTTATATTTCACACGAGGACGTGTGCAGGTCAG:1 - chr3R 15844334 5' + invader6 4463 1 75.00 ACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGATATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3R 9002926 5' - roo 332 2 66.44 CAAAACAGAAGCCAAAGAGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2L 18226872 5' + roo 8727 2 61.64 GGCCGCATCTAATTTGATTCATATATGTATAGGGGTATATGTACGCCTGTGTGACTTTGATTAGGTATTGGGCCAGCGAGTCGCTCTGATAACTGTCGTCCAGATAAGAGACCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2R 17796501 5' + jockey 4685 1 76.03 ACCTCTGCTTTAAAAACACTTATAAAGCTGCTTAAAATTATGCAACCCATAATAGAACGTATTTTTCTCAAAACCACAACTTACTGAAAATAACTAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCAT:1 - chr3L 12232446 5' + Stalker 6913 4 69.86 CTACAAAAAAATTGTAGTAAAAATTAGTATTATAAAAAACTAGTTTAAAATGATAAAATTATCGAAAAACACGTCCGTCGTAAATCAATTCATGCAAGTCACAGTAATAGGGTATACCAGATACGTTGAAATGTACGTAACAGGCA:1 - chr4 898062 5' + INE-1 20 1 58.22 AAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 - chrX 21100296 5' + mdg1 19 2 72.73 TTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGCAACTGCCAATTTTGACATCTTACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAAAAC:1 - 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chr2R 17990117 5' + BS3 399 1 58.90 ATGCATATGAATTGGCAGCAGATAATCGAAAACGCCCACCCAAAGCTGATTATAATTATTATCTGTTTGGGGCAGATGCTGCATGTAGATAATAACATGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 7719683 5' - roo 385 2 69.18 CACTAACACACACACACACATACCAAAAGGACTCCCTTCCTGTCCTTCCATGATGAAATAACATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTG:1 + chr2R 18514894 5' - P-element 325 1 33.33 AAAAATGTCGAAATCGGCGCTGAAACACCTAAAGAGCACCTGCCGCGTATGCGCAAAGTATGCAAGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATA:1 - chr3R 8731565 5' + Chimpo 160 1 63.25 GATGACGATGACGATGGACCAAATGACAGGTGAAACCCGAACGGATCCGGATAAGTGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 3234051 5' - roo 350 2 59.71 ATGCAACATTGTCTTCACCCGAACTTGTGGTAATTTGTCAAGAAGCCACGCCAACGCCCTGAACATAAAATTTAACGTTTGTCTGTATTTGACGAAGGTTTTATTAAACTTCTTTATTCGGATATCAGCTTAAGACTAGAAATCAA:1 - chr3L 2681567 5' - 297 273 2 58.90 TTAACGAATGTGGTCAACCGTTCAAGTGAAAGCTGTCAGCGCCAGAGTTTGTAAAGATTACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATT:1 - 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chr2R 21411003 5' + Burdock 6163 2 66.44 GATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 + chr2L 7125758 5' + I-element 64 1 59.59 AAACATTTAGAGATACATATGTTAACTTACGTGTTTGGTATAGGCTTGCCTATCAGCAAGATACAGCAAACCGACATATTGAAACTGCCTGAATGTTAAATATATAGTAGTAGTAGGTACATATGTAAGTCCTCACATGATTAGTG:1 - chr2R 15005175 5' + BS 4994 1 71.23 GCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGGTATTCAGCT:1 + chrX 22596348 5' - INE-1 545 1 68.28 ATCCTATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTG:1 - chr2L 4123935 5' - transib2 2746 1 71.23 AATACATTCGAAGCTATCAAAAGGTTAAACAATTTGTCTAATGTTGACACTTCCATTGACCAATTACCGCCGCACGAGCTTATCTCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr3L 8453867 5' + FB 26 1 65.07 TGGTGGTGGTATCTCAAGCTCCCTATCGAGAATCTGAGCCAAAGACGGTAATGTTTTTTTTTTACTTTACTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGA:1 + chr3R 2465953 5' - F-element 4604 1 71.72 ATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAG:1 + chr4 123946 5' + HB 111 1 56.12 GATGGTGATGGTGATGATGGTGTCGATGTCGTCAGGCAAACAGATTAAGAAACAATAACGCTGTTTTGTGCTCAGTTTTATTTATTTTATTTTTCGCACGGGTTCTACGGCCACAACTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTAC:1 - chr2L 2007439 5' - Cr1a 4412 1 52.41 AATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 6397750 5' - roo 9046 1 54.37 GGGGAGCACGCTAGCCTTAAGTGACATACAGAGTAGTTTCTGATATTCCTGATTCCATGTGATTTGTGGTGTATTGTTATACGTATGAGAGCAGCTCGTCAAAGTCTTAGTTTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTG:1 - chr3R 15854088 5' - BS 4828 1 76.71 CTTTTAGCTGGCTGCATTTCGAGCTGCTTTTTTGGCCATGGCTTTGGCCAAGGCGTTAGCCAACTTTTGACCATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACG:1 - chr2R 13769371 5' + hobo 379 1 51.03 GTGCATGTGAAGTAGCTTTATTAATCGGCAAATAATTTGGCAAAGTGTTTTATGACAGATAGGACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTT:1 + chr2L 13844156 5' - 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transib2 2759 1 71.09 TTATTGCAGTTTAATCTGCCCGGACCATTGCATACTTCCGACCGAGCTCGCATGAAAAAGCGCCGACATAAATTTGTACGCATTTTGGCGGTATACATACTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3L 21996302 5' - Transpac 5218 2 73.91 GTATTTGGCTCCTTAGCAGTTTTTGCTTACACTCATACGAACATACGGAAATGGCCAGATCACCTCAGCTATTAATCCTGATTAAGAATATATATATTTTATATAGTCGGAAAGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 + chr3R 20374723 5' - INE-1 20 1 75.17 GTCGAATTTATTAATGCCATTTATCATGCTGCCCAGAATGTAGAGCGTAACTACAACATCATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 8075985 5' - 412 440 2 56.93 AGAAGATCCCGGCTAATTTAACGTCTGCGTCGGGGGCTGAAAAAACTTTTCGTTCGCGCCCTCGTTTTTGATTTAACTTTAGCCTAAGTTTATTTTAATTTGCTTAACTTTACTTT:1 - chrX 4088799 5' - TART-A 13132 1 84.48 TTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAATTT:1 - chr2L 4034959 5' - HeT-A 6000 1 78.08 ATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTATTA:1 + chr2R 3275413 5' + gypsy9 5059 2 44.14 ATGGGAAAGCGAAACTCTAAGAGAGGAGAGTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - 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roo 8995 2 73.97 TTTATTAACAAAACTCATCCCTATCCAAGCACAATTCTATACAAATTCATACCTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chr3L 12315853 5' - transib2 2793 1 64.38 ATAACACCGAAAAGGGGCTGTTTACACGCCCCCATATATACAAACACAAAAGTATGCAAATGGTTTTACTGCCCCTTTGTTTTTGTCTTTGTTCTTGTTTTTGGTTTTGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTATGTGTGTGA:1 + chr3R 5897929 5' - Porto1 287 1 75.34 CATTTTCCACACTCGTTAACATAAACATTTAGGAGTTCGACGGCCCTTGAAGTCGACCAGCAATACCTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACA:1 + chr3L 17703149 5' + I-element 184 1 53.52 ATATGCTAAAATGTTAACTTTCTATTTCACATTTTTTCGCACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3L 23287364 5' - 1360 3372 1 74.66 TAAACTAATAATTATTTGCAAATAGTTTAGATAATAATATGAGTGTTCAAATGCAATATTTGCCTCGGTCTTTTAACAATTTTTTATAGCTGCCCACTGGAAACTGGAATTCTATATTCTCTAATTTCCATTCATTTCGCTTTT:1 - chrX 2935065 5' - invader2 424 1 70.83 ACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGATCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGA:1 - 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chr3R 3920578 5' - roo 9000 2 67.81 CAAAGCATTGAAACGATCGGTGGCACACATGAATAATGTTCATTAAATCTCGAACTATTTCCATTTGTAGTTACTTGTTTTTAAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTAC:1 + chrX 19606362 5' - R1A1-element 5019 1 67.48 TAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 + chr3R 17996177 5' + diver 66 2 65.00 CTCCGCTTAGCGAATTGAAATAAAAAATCAAAGTGATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr3L 6518581 5' + 412 87 2 76.71 TGTATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATTCAT:1 - chrX 21772471 5' + springer 7201 2 50.59 GCCCACTGGCAATTAGCCTATGTCAGCATACACACCCAATTGAAAAGATTTCCGTACCGTATGGTCGAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 13168641 5' - P-element 2851 1 56.25 TTACAATAATCAGAGCAACAACGTTGGCAACATTTGGAAACAAACTTGCGCTGCGTCCATGTCTCTGAAAACTGCATTCTCAATATCAACATACCATCTTTTATAGTGCCCGAGATAGAGTCGTTCATACGGACAAACGGACATG:1 + chrX 13945283 5' - INE-1 122 1 76.55 ATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTAA:2 + chr3L 24757198 5' - Cr1a 4256 1 53.42 ATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:2 - chr3R 19992763 5' - hopper 1383 1 64.38 CGCTAGAGGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 17940042 5' + 1360 20 1 56.16 GGGGCGTGGTACTGTCAGTGGCATAGATGGAGGTTTTTGGGGCTGTGGGGTTAATTTGTTATATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGAACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTT:1 - chr3L 14091528 5' - F-element 103 1 57.93 AAGGCCTTTATCCCCGGGAACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:2 - chr3L 24131548 5' - Transpac 5219 2 78.08 ACGCCCACTCTAACGCCCACACTTTTCAACAATTTTTTCTCATTTTATTCCCAAATGTCCATATCCCAGAAAAATGATGAAACTTGCTTGTTCGCATACTCACTAGCTGAGTAACGGGT:1 + chr3L 22511716 5' + INE-1 538 1 66.39 GTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3R 15072558 5' + pogo 60 1 61.64 AAGTGTGTTTTTGAGTGTATGATTTCAAGAATTTGCATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chrX 661999 5' + 412 7073 2 71.92 GTGCCTGTTATCCCCTGTTTTCAGGACACAGGCACACACACACCCACACACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAA:1 - chr3L 14887995 5' - 1360 393 1 61.29 ACTCGTGCACTCACACACGTGCATAAATTGTAGTCAACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAG:1 + chr3R 26405014 5' + hobo 85 1 73.97 TAATAAGAAATAATATTCAGAATATATGGTCTGTATGGTGTGTGTGTATGGTAAGTTCCATTCATCATTATGATAATTTTAAGCTAATTTAATCGTAAAATATAGAATATTTCACGAAAGTCGTTCTATCAGATACCAGTTACTCA:1 + chrX 5711881 5' - INE-1 548 1 20.55 CAAGGGGAAACTTCCTGTGACGGATTCCATGGCATACTTTTCAGGGCTCTCTGGGGCCACTTTGGGCTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAACATGCCCTTCATCTAAGAAGTTCTTAGACTTTAATTCTAT:1 + chr3R 5197795 5' + 1360 238 1 52.05 TATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 15375351 5' + 1360 63 1 55.65 AGAGTAGATTGTGGCCTCAGTATTTAAAATAGTTTCGAAAATACAGAGGATCTCGTCTTGTCCGTATGAAGGCATCGATCTCAGGAACTATGAAAGCT:1 - chr3L 22942311 5' + INE-1 150 1 55.10 GTGTGCNTGTCCGTGTGTGCGCATGTGTTGGTGCCCAGCCTGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCAC:1 - chrX 19038452 5' + hopper 78 1 69.86 GGCATGCGGCGAGCGCGACATGAATGAAACGAAGAGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 18282590 5' - P-element 2843 1 49.61 AACTTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTAAGTTTGCTAAATAAATTGTTCTTAAGTTGAAGAAGTTGTGTGTCTTTGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGG:1 - chr3L 23597302 5' + invader4 2713 1 76.85 AGAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATG:1 + chr3R 904939 5' + rover 6999 2 65.75 ATGAGTGCCGCTTCAGTTTATTCAGCTCAAATATTTGCTTGACATATATATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 5533024 5' + roo 67 2 63.70 CACTTAAACCATTCTTATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:1 - chrX 5323342 5' - Juan 4176 1 39.04 AATTTTATGCTTCTTGGGCTGCAATCATTATGTTTGGCTATATGTCCGCTATAAAGCATATCCGTTGTTCCCTTATATACATAAGAATTGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr3R 27133702 5' - opus 475 2 68.49 AAATTAAGTTACTTGTCAGTTTTTGCTGAACAACTTACTTGTTTATTTATTTTCCGCCCAACATTCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAACAATC:1 - chr3R 20706771 5' + gypsy7 318 1 61.43 ATGAAAATTCGAAAATATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 8360657 5' - roo 9041 1 64.83 AAAAGGGAAAGAGATGGGTGTAAGGGGGGAAATTTCCGAGAGCATTCTCACAATTCATTTGATTATATTACCTCGCATATTATCCACTTAAAGTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 4341226 5' - roo 9044 1 65.75 GTTTGATAGTTTGGTTTCCTCTTGGAATCCGATTCACTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTTTGTTTTACTAATCATTTTTA:1 - chr3R 7588076 5' + Tc1 1484 1 74.66 TAAGCAAAAAAAAAAGAGAGAAAGAAAAATTTCTTCTTAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr3L 6670832 5' - hopper 154 2 76.36 AACCACTTTCAGAACTCTCGATATATTAATCACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:1 - chr3L 18505713 5' + I-element 89 1 80.00 ATTCAAATTAAATATATAAATATATTTATATATTTATATATATAATATATGTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTGAGTTGATTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 + chr3R 11060314 5' - 297 6918 2 78.08 AGGGCATGAATAAAGGAAAATAAAGGAGAGGCGATGCAGATATACATATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAG:1 - chrX 18777571 5' + I-element 475 1 67.13 GTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATC:1 - chr2R 7244888 5' - diver 6027 2 73.97 AAAATGCATAAATTAATTTGCAAAACCAAATTAAAACAGCTTGTACCATTAAATATTTAACAAGGGTTTTTTCTATTACTTCAATTTCCTAACAGTAATTACATTCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 2989889 5' - roo 395 1 75.17 TGTTAATTTCACACCATTTTTCAACGAAAAAAAAGTCTTTTTGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:2 - chr2L 14671899 5' + FB 79 1 76.71 GTTCTTAATTATGGTTTTTATAAATACTTACACGGGTAGGGCGTTAATACAATAATATATGATATAATATATATAATATAAATTTTATAAATATATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:3 - chr2L 21328304 5' + 297 15 2 76.03 GTTTTTTGGACAATATATTTGATGCATCACATGTACTGCTGATGAAATGGTGGTTATTAATCAAATCGAAAATACTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2R 9544951 5' + roo 32 2 60.61 CCAATAAGCCCTTCCTCCAAGAGTTATTATCATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTAC:1 - chr2L 12818384 5' + hobo 9 1 78.08 TTTAAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 + chr3L 15913849 5' + jockey 4821 1 60.96 AAACAAAACCTATTTAAATCACAGCGGATTAAAATTGAACATTTTGGCTAGATTGTGCCTAAGCTAAGACGTATGCAAAGACAACAACAATTACAACATGGAACACATAATTCTAAATCAGTAAGTTATATCTATATTAAGCATAC:1 - chrX 9452273 5' - transib3 290 1 73.97 CTAGAGGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAAGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACAT:1 - chrX 22727599 5' + Ivk 5090 1 58.27 AACTATAGCTGTGTAAATTATCTCGCTTCTCAATGGGAAATGCTGTAGTTAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 - chr2L 11839723 5' - mdg1 7390 2 67.97 AGTGAAATAATTTCATCATAAAGCTTTTATTGCTTTTATTACATTACATTACATTAAAATTACATTATAATAAAATAAAAATTAATTATAACAATTTTAATTTGTATGTATTTTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCC:1 - chr3L 24999029 5' - INE-1 572 1 60.96 AAACAAAATCAAAGAGTCGAGGGTAGCGGAATTACTGGTAGCCGAGTAGGTGATTACGCGTTGAAAAATGAACAAACTGCTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATANNNNNAAAATCCACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAA:1 + chr2R 18916705 5' + Burdock 264 1 52.05 ATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 24934269 5' + HMS-Beagle2 6916 2 63.01 CGTATATATGCCCGGCAGATGGGATTTGCGGAGTGCAGTGCAACCATTTCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:3 - chrX 9950603 5' + jockey 4741 1 65.07 ATTTGCTCTAGTGCTGGCACATCGCTCTCCATCTGGACTAAAATTTAATATTTATTTATTTATTTATTGTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTA:1 - chr2R 21191684 5' - I-element 5283 1 68.49 AATCCTGCGTACGCCACTGGTGGAATTTGTGGCGCGTGCGCCACTTGGTGTGGTGAGTTGGGGTGAGTGGGTGAAATGGCGAATTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGG:1 - chr2R 11450678 5' + R1A1-element 5066 1 76.52 TGGATATATTTTTATGGCATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 + chr2L 4063793 5' - roo 390 2 72.60 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCCCCTGTTGATCCTGATCAATAATATATATATGTCGAAGCGTCATCAGGACGCCCTTCTTCCTCTTCACTATTCTCG:1 + chr2R 1982173 5' - invader1 378 2 48.28 AGAGCTGCGCATATCGATTTAAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGCCA:1 + chr2R 22775381 5' + jockey 4740 1 76.79 CAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 - chr3R 30347385 5' - P-element 2808 1 28.57 AGAGTTCTAGAAATAAGATATAAATTGAAATTTTTTTTTGGAGTTTCAAGTAAGACTTAAAATTATAAATGATATCATAAAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 3030325 5' + roo 40 2 54.11 GAGCAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCAAGTTGGGGTGAAGAATATTTAACTTAAAACTCACGGAATAATTCCTGGAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2L 7125718 5' + I-element 24 1 67.12 TAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCCCGCCCATCGTCAAGGTCATGCAAGCATAAGTGCAGTGGAGAAGTGAACTATGGGGAATTTGGTCTGTTTTTTTTAAAAAAATT:1 + chr2L 17205162 5' + hopper 17 1 59.13 ATATTTGTTTAGAAATCCATGGTAGCATTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAAGTAATTGTGTTCCATCACA:1 + chr3L 4219497 5' + jockey 69 1 73.21 TTAAAAGTTTTAAGCTTTAAGTTTTACTAAATTTTAAATCGTGTGAAAAAAGAGTGCATATTATGTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 + chr2L 15936716 5' - copia 243 1 77.40 AATTTGCTTTTATCATCTTAATTTGATTTGTAGGGTGTTTGCAGAAACGGGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:4 + chr2R 22034660 5' - copia 184 2 68.49 AACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAA:1 + chr3L 20189562 5' - FB 242 1 45.21 CCAAATTCGAAAATGTCTTTGCATTAGCTTCATAGAAAACAAATACTAAGTGGTTCTACACATGTCGAGCGGCATTCCAACAAATTGATCTTGAATGTGGCCAAGAGAACAGATCGTGGGAAATCAACGCTGAGACTGGCAAAGCG:1 - chr3R 22756806 5' - Ivk 225 1 78.08 TTTTGCATTCTCAAAAAACACTTCTCTTATCGTTTCCTCTGCTTTTGGTTATGCATATGTATCGTCTCTTAGGATCGTTCGATTCGGAATTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATTGT:1 + chr3L 15189123 5' + Circe 99 1 67.81 ATACTCGGAAAAAGCCATGCCCTTTTCTCTCTTTCAAGCCATTTTGCTGCGCTTTTCCTTTGGCTGACTGGCGCACTCACACGTACAGCTAAAAGATTTTCCCGGTCGGTAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTT:1 - chr3R 18320179 5' + FB 720 3 76.03 ATAAATGTAAATGTATATGCATATGGCGAAAATCAAGTTGCCAACATGCTCATATGTGTATCCGAATAGGTTGGTGTTTAGGTGTATCCGTAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCT:2 - chr3L 11356712 5' + Circe 7067 1 60.27 TAAAGCAGGCGAATCAGGCATTATGGTGGAAATAATCAGGAAAACAAAGAACCCGGCCAACAAACAAACCATTAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCT:3 - chr2R 11805390 5' - pogo 241 1 56.85 GACTTTTCACTTTTTGTGGGTTTGAAGCAAAGTTGGGATTTGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGGAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAA:1 - chr3L 22801902 5' - rover 29 2 68.49 AGGGCCATCAGTGCATCCAGGTGTCGGCACTCATACGGGCGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGGGGGGATTTTATTAGTTGGTGGTGAAAGAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAAC:1 + chr3L 26026745 5' - accord2 7299 1 61.60 AATCGAAATTCTCTTTCGTAAAACTACAGTGTAAACAGTTGAGTCGAAAAATTGTACATATGTATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCGGGGTAAACACAAGTGCCC:1 - chr3L 22723945 5' + HMS-Beagle2 6933 2 53.90 CTTAATTGTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAATGCTCCGGGGCCACAAAACAACAACTGTCGTTGACAACAGTGGTGAAAGTGGGCGGGGGGTGGGGGGATACTGTGGGAATAGACTCTTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr2L 16943775 5' + copia 4884 2 51.41 AGTACGTTGTGCCCGGATCGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGG:1 - chr3R 10704046 5' + F-element 466 1 68.33 CTTAAGAAAAATATGTTTTATGTGGCTCTAGAGGTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2L 15078677 5' + hopper 8 2 64.38 ATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAA:2 + chr2R 5674660 5' + S-element 84 2 77.40 ATTATTATTATTTACATAAATAATACCTTGTCAGCATAAGTCTACCCTCAGCATACCGACTCAGCATTTCATGTACGCTGAGTATGTATTGCAATTCGACACTAAGGATGGGGTGATGAACTTATATTGGGCGCGTCAGCATTGTT:1 + chr2R 4833189 5' - gtwin 60 2 80.82 CTAAAACAAAAAGTTGTTTGCCATAATTAAGACTTGGCTTTTGGCTTAGGCCCAAGCTTCAGTTAAGTGTTATTAGTTGGAGCGTTTCTTTTTTTCGGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:2 - chr3L 6447164 5' + transib2 21 2 71.23 AATTCGTTGCAATATCTATAATCAATTCTTTATTCCGTTCTACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGT:1 + chr2L 17005724 5' - Stalker2 323 2 70.34 AAAGGTTCCATTTTACATTTGAAAACAGATTAATTTCCATCAAACATGGGAAATTCTCACAATAATTTCCAAACCTTTCCAAAAATAATCCCTAAGTTCGCATGAATTATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr2L 11357971 5' - blood 364 2 76.03 GTTGCGGCTTTGTCTAATATAAATGTATATAGACGTCATTTGTTAAATTTAGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAA:1 + chr2R 5689600 5' - gypsy7 274 1 64.62 AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAT:1 + chr3R 4322609 5' - INE-1 93 1 74.44 TCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1 - 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BS 5046 1 49.32 AACACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAA:1 - chr3R 2520357 5' - Tc1-2 1614 1 63.70 AAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATAGTCTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACC:2 - chr2R 15326932 5' + copia 89 2 80.14 AATTAGAGCTCATTGAATTCGAAGTACAATAGTTAACCGTTCAAGGAAACTAACGCAACAATGTTCAATTGACTAGGAAAATGATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTC:1 + chr2R 7303991 5' - pogo 2077 1 68.66 AATCGTTTTTGGCGCCTTCTTTATCGGTGCGATTGTGTGCCTAGGATTCTCATTCGCTTTTCACACACTGAGCTGTTTTCCTTTTGGTTGGCGCGTTTTTTTACTCTTTAATTTTTTGTGTTTGTATTTAAAAAAAAA:1 - chr3R 22545204 5' + Stalker2 497 1 54.35 AAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAGTTATAATAATAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAC:1 + chr3R 19449953 5' + roo 407 1 54.79 GTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGAAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 - chr2L 17005827 5' + Stalker2 21 2 63.28 AAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 + chr3R 16630241 5' + FB 36 1 58.90 ATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCAT:1 + chrX 10521660 5' + Tabor 92 2 78.08 ACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 20265964 5' - roo 8985 2 78.77 AGACGACGAAACCGAGGACATGAGCGAGGCGAAGCTTCAGCTTTGGCCATACCTTTTGCCCACCCATAGATACACACGCACACACAGAGTCGCCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCC:1 + chr2R 11610357 5' + F-element 4496 1 73.08 GCAAGTCTCGCATAATGACATTGGCGACATTTTACAGCTGCCCTATCTGCTTATAGTCCCACTCACACTGTTACACAAACATAGATAGATGAATGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 8308533 5' - roo 9047 1 69.66 AATTTTAGATATATGTTAGAATTTATACAAAGTACGTAATAGCCACACATGGAGAATGAAAGGGTATGTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 - 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chr2L 16641932 5' + jockey 4999 1 71.92 ATAGCCATTTAATGAAAGGGTATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAACA:1 - chr2R 7090697 5' + I-element 90 1 75.86 ATTACCGAATAAAACATAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACAAACAAAATGCTGAAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:2 + chr2L 20265913 5' - roo 9036 1 60.96 ATATTTGCAAATTCCAATAGCGGCAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAA:1 + chr2L 12341799 5' - BS 5059 1 58.74 AGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAA:1 + chr3L 3501727 5' + Bari1 75 1 69.18 AACAGGAAGAAGGAAGCGTTTCCCACCATATAAAGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACCGCTCGTCCGCTGAC:1 - chr4 633043 5' + gypsy3 15 2 54.43 GAATAAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGTGGGAAAAAAATATGCGCAAAGTAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGATTGGTT:1 + chr3L 13365726 5' + BS 5006 1 61.86 CTCGTACAGCAGTAGATGGGAGTATTAGAGGCAAGAGAACTTATACTCAAGTTTAAACTAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTC:1 - chr3L 21974482 5' + GATE 8288 3 65.52 TTTTCATCGTTTTCGTTGTTGCTCCCTGAAACGCAGTGCAAGAATCGGAGATATTTAGTTGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGAATATAA:1 - chr3R 24617618 5' + Ivk 361 1 79.21 GAGTGGAGGGCAGGAGGGGCTCCGTGGGGATATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATT:1 + chrX 18295750 5' - I-element 4931 1 61.43 CACCTGGCAGTTCAACTTCAAGTTTAACCTGAGGTAAAAGTGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATATTCCACTTAGAAATAAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAG:1 - chr3L 12000761 5' - Bica 159 1 71.92 ATATGTTTACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGTGGGGGGGATGGGGGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTCATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 13294990 5' - roo 9019 2 52.41 TAATTTGGCGCATTTGTCATTGCAGTTTTCGAAAATTTTAAACGGCAAACGGAATTGCGCCGGGCAAGCGAATAAATTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGT:1 + chr3R 7049734 5' - mdg1 7339 2 52.05 ACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCGTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr2R 5531237 5' + 1360 69 1 69.86 ATCGAATGCATCCGTCAGCACAAGCCGAAAAGTTCGAAGGAAGAAAGGGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAG:1 + chr3R 7944769 5' - blood 148 2 59.32 GGTGTGCCTTTGGCAGACTTTTGGGGCTTTGGACTAATGCCGTTTCATAATAATTAATAATCCAAAGAGACTTAAATAAATTGGACGTTAATATTTGGGGTTTGTGGAATTTCAACTTAATAATAATAATAATAATAAGT:1 - chr3L 16163039 5' + mdg1 7081 2 67.14 AGATTACATGGATAAGACGACAATATAGGATGCCAGATGGAAGTTGCAGATAGATCAGTACTCAGTTCGAGGTAGAAGTCGAACAGTATCAGCTTTCTGGACTCCCCGGAGCAGACAACAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGATT:1 - chr2R 2903412 5' + Gypsy6A_LTR 350 1 69.18 TATGCAAAATAAATAACTTAAATCGAGAGTTAAGAAACTTAAAAATTGAAGTCCTACAGGCATGGAATTAAATTCCAAATTGACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chrX 12986507 5' - roo 9036 1 59.31 GTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTAAGAATATGTG:1 - chrX 8185447 5' - Quasimodo 28 2 74.47 TGATGACGGGTTGAAAAAACTTCGACTAGATGCAAAGCAAAACGATAATATAATGCCAAAAATAAGCCACCGACTATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chr2L 22193400 5' + roo 8709 2 56.85 AGAGCAAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCTCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCA:1 - chrX 14722264 5' + diver 5890 2 74.66 AGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTG:1 - chr3L 18403049 5' - P-element 2812 1 34.25 CTGTTGTACTTCCAAATTTGCATTTATTTCAGGCTGAAAAAGCAGCAAAAGAAAAAGAAAAATCAGAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 24090547 5' - roo 9019 2 54.48 TTTTACAATAAATAAAACTTTTTCGCATGGTTTCCATTTAGATTTTTACCAAAACATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:2 - chr3L 5881676 5' - pogo 2037 1 63.70 GAAGCACATAGTCGAGCTCATAGAGGACTAGACGAAAATTACAAATATATATATATATATATATATAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGC:1 + chr3R 904940 5' + rover 49 2 66.44 AGTTTATTGCGCTGCTATTATATAGAGTATGCGATGATAGAGTATTTCATTGGCTGGGGTGTTTATTTTAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATTAATGTACGTTACTTAT:1 + chr2R 11763140 5' - Stalker2 7291 2 65.07 GCAGCGAGCAAAAAGTTAGACATGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATCCCACTTATTTTTGTTAAATG:1 + chr3R 31887758 5' + HB 93 1 82.19 TATATCATCACAAATTATACAAGTTACAAAGTATGGTCCAGCAAGAGAATTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTC:1 + chr2L 17356548 5' - F-element 244 1 66.44 ACATCTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACAAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:2 + chr2L 21328144 5' - 297 6926 2 60.27 ATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTAATCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr2R 22287390 5' + jockey 22 1 66.15 ATAATATACATAATTATGTTCTATTCGAAGGAAATTTTAAAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 - chr2R 24170047 5' - transib2 2821 1 55.48 AACACGAGCAGCAACTTGAGATGCAGGACACCAGACGACGGGAATCCTGCCAAAAGTACGAGTATACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chrX 13490633 5' + 297 6613 2 60.00 GGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGGTTGCCC:1 - chr2L 16275019 5' + FB 65 1 66.18 CAGTATATTCAATATGGAGGTCTTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTG:1 + chr2R 4917987 5' + S-element 442 1 58.18 AATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTA:1 + chr2R 7244822 5' + diver 71 2 65.75 CATGATGAAAAGAACTTAACCCCGAAACCCAGCGAAATGAACGCAGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 - chr3R 12242344 5' - transib2 2751 1 69.86 AGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATGTTAAATAAT:1 + chr3R 9557530 5' + G2 3042 1 60.69 ATGTTATCATCATCATCAAACTCTTGGCCCTTGTGCACGGCAATTGTAATTAATTGTTAATGTGGCTACATAAATATATATAATTTGCTTATTTTGTGCAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGAC:1 - chr2L 17766210 5' + Doc 183 1 59.59 AAAAACACAGCGAACACAAGCACACCCACACCAATAGGAACACCTATAGACACGCCCACGCCCACGGCAATCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTT:1 + chrX 1624381 5' + gypsy4 451 1 59.59 TTTTATAATGAAATTTAGGATTAAGCTTGATTTATGAGAAATTCGATCAAGATATAAATATGGTCATTCCTGACCATCTACTAAGTACTACAGAACTAAAGTTTTATATATGTTTATTTTAAATTTTAAATTTAAATTTTAAATTT:1 + chrX 17052923 5' + 1360 3051 2 39.04 CTGTGCTAATTTAACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 - chr2R 22034764 5' + copia 47 2 52.05 TTCTATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr2L 7580885 5' + Transpac 4961 2 47.26 CCATTGTACGTCAATTGAGTCATCATCATTATCCGTGCACCCGAGTCCAAAAGCCCGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAACATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 - chr2R 16817970 5' + 412 67 2 63.01 CTGCATGTCCTTGCTTCACACCGTTTTAGCTGCTCGCTGGTTCGGCAAAACGTTTTGGCCCCCGTTTATCTGCTTTCCTTTCGTTGACACGCTCTTGTCGATTTGCACAAGTATTACACTAATCAAATGTTCGCTTTTCGCGTGTC:2 - chr2L 3981648 5' - HeT-A 190 1 68.49 GGCTGCTGATAGCCGACTGGAGTGTTGGCCAAGTTGCCCTTCAAAATATCTCCTCAGTCGTTTTTTTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCG:1 - chr3R 22561332 5' - F-element 21 1 56.85 ATAATGAAATGAGAATAATAACAAGAATCACTCCTGGAAAAGAGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCC:1 - chr3L 21468714 5' + Cr1a 299 1 65.87 TGATGTTTGGTTATTGTCCCTTGCGGTATAATTAGGCACCAACTGGGCAGCATTGGAAATCGAGATATTACACCCTAAAAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGA:1 - chr2L 6580339 5' + hopper 945 1 67.12 TCATTATATTTCAAAGGCGGTCTAATCTCAAGTTGTGTCCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAA:2 - chr2L 13844235 5' + Stalker2 7333 2 73.29 CTCTCCTCTCCGTGAAGTTCAAGATGAAGGTTAGTGCCGAAAACTCGAAAAGCTGCGAAGAGAGGCGGCACTCGTCTTGGTCTTTTTGCCGCTGAGCGCGCAATTCGCG:1 + chr3L 7313855 5' - Doc3-element 230 1 54.13 CTTGGCTCCGGTGATCGTGTGGAGTGCTCTGGAATCCGGATTGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGTTATAGTGTGGGAAATGGAGGTTCTTCTATTT:1 - chrX 4611966 5' - 297 6505 1 68.06 AGACGCTGTTCGAGTTCATCGACCAGGCCACAGAAGAGCACGATTCGCAATTCTGGGGGCATTAGAAAAAAAGTGCGGAAATCACGATCAGCTGAAAGTCACTCTATTTACGATAACCAAATTA:1 - chr3L 23768472 5' - Gypsy12A_LTR 174 1 64.52 AGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGTACGATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:1 - chr3R 5351456 5' + jockey 4756 1 75.34 ATATTCATTTTCTCTGAACAAACATTTTTAAATAATCAGCATGGCACATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 + chr2L 6654613 5' + diver 26 2 66.44 AAAAATAAATTTTTTTTTTTAATAATTTATACCACAAAAAGTTAATTTGCACATAATGACGCAACGTAAACTTACATTGTTTAGAACCAAAGACCCTAGAAAAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 3493935 5' - 1360 3362 1 82.96 AGAGTACTTAGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:2 + chr2R 24169944 5' + transib2 35 1 41.10 CAGAAAATCAAAAAACCGAAAAGCGAAAATCGAAACTAGTTAAAATAGTTGTAAAAAATTATTATTAAATCTAATTAATAATTTGTTGCCCTTTGTTGTATTATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATA:1 - chr2R 6166576 5' - Tc1-2 50 1 63.01 TTTTTTTTTTTAATATTTTCAGTGCCCTTCGGCGCTGTCATTTTATTGTACTCTGATTTTTTATAAAATATATAGTTACAATTTATGGCATTTTACAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTG:1 - chr2L 3701147 5' - TART-B 10404 1 80.00 GAGAAAGGATTCCGAGAAATATGACCTCAAAGATGAAGGTGAAGCTGTTGATTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGATATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chrX 20453683 5' + INE-1 545 1 79.45 TTTGTATATAAATATATTTTTCACTTTAAGGATTGTTTTTGTGGGCAGTTGTGAAGGCGTGGTCAGATAAAAAAACAAACAAAATCCGATATTCTATTTAAATCCTAATAATTAATATATAAAAATCAAGTCGCTATCTTTAAAAT:3 + chr3L 17063520 5' + transib4 2595 1 76.71 ATTTAAGAGTGAACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGCAAAACAAATTTAGCCGCCGTTTATAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCGCGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 + chr2R 9158048 5' - mdg3 186 2 56.74 CATTACAGGGTATCCAATGGATTGCCAAATAGACCCACGCCCTTTATCTCCCAAAGATGGAAAAAACAAAAAAGAACGAGACAGTGTAAAAAAAAATAGTGTAAAATTAAATTAAAAATAAACAA:1 + chrX 8373261 5' + flea 4993 2 88.00 GAATGGGGTCTGTGGAATGATCATCAGCGAAATCATATTGAGAACCACAAAATCGCATCTAAATATTGCGTCTGTGCGTGCCGGGCCAGCAAGTCTTTTCCCCTGTTGATGTGACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chrX 6513519 5' + hobo 5 1 68.75 TGATAGGGGGAATCCCCGCAAGTAAGAGCTGTATGTGTGTGTGCGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr3R 24733591 5' - hobo 2936 1 62.86 GTCTATTCCTATACACATTCTTCTTCCTTTCGGGCCCAGTCAGCCGTGTTTTGGCCCGGCCTTTGTTTCACTTGCCACTGGCCTCGAATATATTTTTGCTTTTTTTGTAATTCTCTTCCTTGTTTTGTTTTTTTTTTGTAAATTTT:1 - chr3L 4079922 5' - TART-C 11096 1 66.44 ATGTTTCCGCAGCGCTTTGTTGGGGTTTTGATAAATAATTGGGTCTGAAAATGGCATGGAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATAT:1 - chrX 18742909 5' + invader4 49 2 58.27 ATATTCCACTGATGGCGAGTCGGTCTTGTTGGTGGTCAACCCAATCATGCCCAGCCATCCTGGGCTCGTCTATCGCCATTGACATCGATGCCACGCAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGGACGCTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGG:2 + chrX 18418518 5' - baggins 5093 1 65.75 GAAGTTGGAGGGCGCCAGCCAGGGAATACTCATTTCGTTTGCTACAGAAGAGTTCACAGCAGAAGGTCAGACCATAATATTAATGTGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr2R 6965462 5' - Transpac 5202 2 56.64 GTTTAAAATTCAGAAAAAAGGTCAACAAATGCCCAGGTAACTGGCTCGGTCAGCTACGCAATAACGCAGAATATATGTATATAGTGACGGATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chrX 9530433 5' + 297 6589 2 72.97 TATAGCCATCCCAGGCCCGCCTGCTGTTGTCCTTGCGCCCCGATTTTTTTTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTT:1 - chr3R 17231328 5' + Cr1a 85 1 68.52 CTCCTGACTGCTGGGCGTCTGCAAGCGTTAAAACGAACTCAAGTGGAAAACAATCTAATTTGCTAAAATTCCTTCCGCTCTCGGCCAGCTCAGCTCAGCTCAGGGGATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAGTCCTCTCGCGAA:1 - chr3L 6339939 5' + Doc2-element 4565 1 70.55 ATTAAAACGCAGCAATAACAGCTGATAGATTGTCTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAAT:1 - chrX 14771788 5' - BS 5009 1 74.66 ATTTGTCATAGGTAGATACTATGAAATTGCTGTTTCTCATATGAATAGAAAGAAAGAAAGTAAGAATAAAGTATCTATGAATGTGGAAACTTGCACACCATTTTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr2L 15076064 5' - 1360 3370 1 72.60 TATTATTACTACTTGACGCCCATCCAATAAGCAATAAGCATTATATTTTTAAATAAATAGCAGTTACTTGTCAAAAAAAACCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr3L 22035676 5' + F-element 54 1 54.11 TATATAGCTTTCAAATCCTTTTTTACCTTTGCATATTGTTCACACACGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 14366603 5' + roo 8753 2 76.71 ATTTTTGGTGGCAGGCAAATATTAGTTTATTACCTGCCTGCAAAGTTGGATTATTATATCGTTACGGTATAATACAAAATGGATTCATATTATTATATAAGTCGCGATCGAACACTCGACG:1 + chrX 23431484 5' + G6 2 1 79.34 CATTTGTGATGCATATCCCCAGGCGCCGCTGGCGAGCAAAAGAGACGCGACTGTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTATATTTTAGTATTGGTATATTGGAAA:1 - chr2R 22989681 5' - hopper2 1538 1 59.59 ATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTTATTTGTGGCGAATGTGGCTATGTGGCGAGTATACAGCTGTGTTCATAACACAGCGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTT:1 + chr3L 17244982 5' - HB 1576 1 47.95 AGTATTCTCGGACTCGATTATTATTATTTGCCATTGGCACATTCGTATCTGTATCTCGGTATCTCGGAATGCGAGTCCATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3R 23295630 5' + P-element 5 2 53.10 CGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTCCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3R 15072670 5' - pogo 2089 1 66.35 ATTATATTCAAATTTAATGCACCAACAAACAAGCTTTATGCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 27986364 5' - roo 8993 2 73.10 CCGATGCTTAAGCATGTTCAGCTTACAAACATAAAGCCATACATAAAGTATAAATTACTGTGAGCCCGATAAAAAATGCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 + chrX 15200814 5' + 17.6 6949 1 62.50 CTGAAGATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr2R 11804611 5' - pogo 2062 1 55.07 GAGACGAAGGACCCACACAGGACTCGACCCGGCCTGCACTTGTTGTTTTTTTGCAATTTTCATGAGTGGCACTCGGGTAAAATATAAATGGGGGAAACTTAAAGAAGTTATTGTACAAAATGAAAAAAAAAAACAAGTTGAAAAA:1 - chr3L 5072352 5' - FB 175 1 59.31 CAATAACACTGCCGCCCACAAAAAAAAAAAGAAAACCAAAAAATAACAAAAAACGAGGGCGATAGAGCTGGTGCTGAACGGGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGCAAGGGAAAACTACATAATGAAAAGGGAATGCCAA:1 - chr3L 12668732 5' + micropia 5249 2 58.27 CCCCCACTTGAGGGGCTCCTTGTGGATTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGC:1 - chr2L 20327656 5' - 17.6 190 2 78.69 GGAATTATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 23639096 5' + pogo 16 1 73.29 AAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1 - chr3R 11469399 5' - Tabor 418 2 61.64 AAATAAAATTCATTTACAAAATGTTTTGCGTAGTTTTCTCGGCTCTAAGCTCCGAGACAGAAGGGAAAAAAGGGGGTCAAAAGGAGGTTGTTTCCTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTT:1 + chr3R 30537599 5' - Tom1 203 1 69.11 AATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 + chr3R 23618122 5' - hopper 1357 1 57.53 GGAGGCAAAAAGCGGGATTGCAGCTAGAGATTTGGATGCGACGACAACTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr2L 16275022 5' + FB 50 1 62.10 AAATGCCAGTCCGAAGTGTTTGAATGTATTCTACATCTGTAATGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTTTTTGATTTAAGAGTAGG:1 - chr3L 6518630 5' - 412 7464 2 67.81 GAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 21216837 5' + roo 8706 2 58.22 TATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chrY 2720376 5' + 297 54 2 63.70 ATAATAAACATAACTACATTAAATGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTG:1 + chr2L 20152820 5' + copia 205 2 67.81 ATTCGAAAGCTGAATGGCATGAGCTTGCAAGACATTTATAGATATATTTCTAAAGATATATATGTATATATTATATATATAATAATACTTTATATTTTTAAATATCAAATTGCCATCAAATTTTAAAAAGGTTTTTTTTGGAAATT:1 - chr2R 12230520 5' - INE-1 319 1 55.48 TGTGTTTTGCAATGCCAACTAAACACACATGCAGCTCCACACACACCCACATACATAACCTCATAGGAA:1 + chr3R 28970772 5' + Quasimodo 50 2 68.12 ATATTATATAAGATAGAGAAGAAATGCGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGGGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3L 3983941 5' - P-element 2872 1 74.31 AATTATTAATTTTATTTATTTTTCTTTGAGTTTTCTTTATACTGAAAAATTAAGGCAAAATATAATAAAAAGCAATAGTTAGAGAAATACTTAATTGAGGAACATGGAAATGTTTCAATAATCAACATAAATATAAATATGTAAAA:1 - chr3L 18090182 5' + 1360 2961 1 72.60 GAGCTCTTATCACAGTGGAAATCACAAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAATCAAGACAATTACGCCAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAA:1 - chrX 16901727 5' + Doc2-element 334 1 66.42 AACAGCAAGGAACTTGGTCAGGAAAACATTAAATGCCCTTTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGACTTAGTTTTAAAAATCATTAGAATAATCAAATAA:1 - chr3R 29613284 5' + jockey 4816 1 67.83 CCTCGCGTTTCTTAGTGTCCGACATTTGCCTTTTGCTCTTTCGCCTCGCCAAGGATTTTCGCACGAACGCCCACGACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2R 19199764 5' - hopper 1376 1 43.97 GGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCAAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chr2L 15550664 5' + Bari1 49 1 54.62 AAAACAACACAATCCAAACAACGAATATTTCGCAAGAAATTAACATTAAGAAAGTCGAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:2 - chr2R 17878633 5' + Doc 70 1 58.90 TTTATACAAAAAAAATTGGTTTATATTCTAGGTTAAATTCATTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTA:1 + chrX 20962649 5' - 412 43 2 71.92 ATGAAAAACGAAAGTTCCCCAAACCTCATTAGTCGGTTGACACAGATATACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCAT:1 + chr3L 21655891 5' - HMS-Beagle2 264 2 60.00 ATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 + chrX 8200165 5' + flea 35 2 59.29 TTGTATTATTTTGATTGTTGTGCAGTTTTATTGTTGTGTCAATAATCTGCCTTTATGCCCGCTACCAATAACCCATGCTTCTGGACAAGGCAGAAGCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 6397793 5' - roo 9046 1 67.81 TACAACAAACATTTATATACATATGTGCATATGTATAAACGTTTGTCGAGATAGATTAAATCACCGTCATCCAATTTGAATGGAACTTAATTAATCTGTGATCTACAAAACGAAAAAGAATAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCG:1 - chrX 16443165 5' + HMS-Beagle 253 1 71.92 TATAAAGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr3R 29690799 5' - I-element 5303 1 54.79 AATATGAAAGTGAAATATTTAATTTTTCATGATGTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATTTTTCTCCAAAAATATGAATTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAAT:1 + chrX 3431830 5' + Ivk 5330 1 63.70 ATGAAAATTTCTTTCTTTTTTTGCACGACGGAACTGATAGGATCGGACAACTATATCAAATACATATATGCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAGTTCTTAT:1 - chr2R 5151335 5' + roo 42 2 51.80 TGTCATTTGAATATAAATAAGTATATATCTAGACGTCTGTCTATTTGTCTCCCCTCACAATCGTATATATCTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATA:1 - chrX 18014593 5' - Bari1 1663 1 54.11 AGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACT:2 - chr3R 11469403 5' - Tabor 422 2 58.90 TATGCTCCGCTTCCACCGTTCCGTGGTCATATTTCCTCCTCGTCTTCTTCGCTCGAGAGTAAAGCGAAGGCGTTGTTGGCGAGCTTCTTGCGCAGAGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTC:1 + chr3L 22306456 5' - G6 465 1 75.00 ATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1 - chrX 21587769 5' + INE-1 124 1 50.38 ATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCG:1 - chr3R 14505372 5' + F-element 4527 1 61.64 CAGAGATTTATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCAGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGCGCATATATCGAGTGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACAC:1 + chr3R 22642260 5' + blood 33 2 58.57 ACCACATAATTATACCAGTTAGTCGTAGAGTAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 - chr3R 7317641 5' - I-element 5267 1 77.40 GGAGACTCGACTTGAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAAC:1 - chrX 8027519 5' + Juan 6 1 73.27 CAACGTCGAACGATATTCATAATAATCTCAATAGAACAACATCACCGTGCACGAATTTCTGGAATTTTGCCTGCGGTCGCTTCTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:1 + chr2R 12471994 5' - transib2 2789 1 60.96 ATTAGGATTGGGGATTACGAAACTGGAAACCGAGCCAAGTTACATTGCTAAGATAAAAGGATTTTAATGTAGTTTATACTAAATCTGATCATATCATAACATATTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chrX 19539599 5' - pogo 2092 1 58.87 AAATATTCTATATATTTGCAAACAAACATGATATTTTTATACTACGCGATTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chr2L 17180154 5' + Juan 45 1 47.83 AGAAACAATTTAAGCTAGAAAGCTCTTAGTTACTCTACGGGTGTACTAGACTCGAAGAGAGTATGTAACAGGAAACTTTTCCGACCATATAAAGTATATACATATATGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATG:1 - chr3L 21737370 5' + INE-1 104 1 56.74 TTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr2L 14874151 5' - copia 242 1 47.26 AAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAG:1 + chr2L 15550661 5' + Bari1 62 1 57.53 AAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 19924053 5' - roo 9030 1 48.20 CATAATACCTATTTGCAAATTAGGCTCGAAAGTCTATATCGTCTCGACACTTTGCCAGAGCATTTGGCAAGTCTGGTGGGTTTAGGGAAATGGTGATGTTCTTTTGAAAGAGTCGTTGTCTTTCCTTTTAATAATAATACATTTAG:1 + chr3R 4149754 5' - I-element 251 1 63.01 CTATACCCTTTAAACTTAGAAAGTCGGGTGTGCCTCTATTATTTAATAGCTTAGTTATTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAA:2 + chr2R 5674592 5' - S-element 1700 1 74.66 TTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGGCGGAAATCGAAG:1 + chr3R 15363931 5' + flea 4818 1 66.41 AAAGGAAAAATAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCA:1 + chrX 5569785 5' + Doc2-element 360 1 66.00 AGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 19054259 5' + jockey 20 1 62.07 AATAATAATAATTATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATATATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAACTTACACGCTAAAGAGGATAACACAAAAAGAGA:1 + chr2R 19727745 5' - Dm88 4462 2 64.38 GCATATTAGCATATTTTATGTAGCATACTTTTCAGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 + chrX 19054238 5' + jockey 7 1 76.84 AGATAAATATATTCGCCTTTTAACATTCAAACAATTGTACAGATTTGACTGCTCCCTTTGCTCTCTCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCATGAGCCATGCTCTCCC:1 - chrX 22577351 5' + 17.6 7187 2 58.10 ACAGATCAGAGAGAGATGCGGACAGTGACAGAGAGGAGAAAAGGTTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTCGGTGCGTAAATAGTATGTTGGGCGCCAGTTAATCGATTTCAGTTTTCATGGATGTCGTGGCTATGGCC:1 + chr3L 25397390 5' - gypsy7 210 2 66.21 ACCGGAAGCGCCCACCAATTGTACGGTGGTAAATCAAACGTCCGACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCA:1 + chr3R 11040003 5' - Bari1 1697 1 77.40 GGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 + chr2L 15550655 5' + Bari1 56 1 53.42 AATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTAGACGGTCTAAGGGCGTTAGAGTGGGGGGTGGACAAAATGCTTTTATTTATAACTTATATAACTACAAAAAACAACTTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 + chrX 22902352 5' + F-element 21 1 36.99 TGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 23456269 5' - 1360 3368 1 56.19 AATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTACGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATATATATTGTTTAATTATAT:1 + chr3L 16973391 5' + S-element 1609 2 72.60 AGAAACGATTATTACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chr2L 9038275 5' + I-element 34 1 52.63 TACAATCAAATGACCTAATCCCTACAACGAGTAGCTCCAGTTACCTACTTACATACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGCTGGCAGCGCTGGTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 + chr3R 11937300 5' + flea 52 2 55.40 TCCCTAAAATGCTTCTGGGTTCATTCCCTAAAATGTCTATGTAAGAATTCCCTGAAAGGCTTCTGCATGTAATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCA:1 + chr3L 23249375 5' + rover 7001 2 52.05 GTAAATCGAAGTTTAACGGGGCCCCCAAATTGAATGGCATGGGAAATTAATGTCTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chrX 20455715 5' + hobo 66 1 63.01 TTATCCAAAGTCTACACATCTCAACCCACTGTGCACTGTAGTCATTGCGTTTTGCCGGACCATTTGACGCCTAATAGGAGCCACCGTCGCCGTTTCAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAT:1 - chr2L 20840108 5' + mdg1 7047 2 75.19 TTTGGCCCCGCTTCTCAGGAGTGTTTTTGTATTTTTCAATTGGATAGAGGAGCCAGAGGGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr2R 23180192 5' + roo 63 2 60.96 CTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:3 - chr3R 18093409 5' + I-element 28 1 63.70 TCCTAGTATGGCCTACATTCATTTGAAGTCTTTGATTGAAATTTCTAAAAGCCTTCATCTTTTGTTTTACCACTTGAAACAAATGCTTTGATTTTTGGCAAAATGGAATTCTTACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAG:1 - chr2L 14955462 5' + gypsy4 6660 2 73.29 ATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTTATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr3L 15781845 5' - TAHRE 10425 2 59.59 CTATGAAGAGTTGAAAAACCTGTCGCTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTTATTTATTTTCACACAGTTGAACTACCTTATAAGTGGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAAT:1 + chrX 10319566 5' + mdg1 7059 2 71.23 CTGTGCTAATTTAACCAACTTCGCTTCATTATCGAGCTGGCCTTCCCACCAGCCGCCCCACTTTGCCCACATGGCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr2R 22034764 5' + copia 4913 2 53.15 AACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACA:1 + chr2L 16540951 5' + hobo 84 1 80.82 AAACCCTGAACCCTGGCCTTTTACATTCGCATCGAGATTAATCCAATCCCTTGCGAATCGAGATAACACACACACACAGTAGCGCTATATTTTTGGCTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCT:2 + chr2R 22310924 5' - I-element 372 1 71.23 AATTAATAGCATAAAAACGGAATGATAAAGCCTCACAAATCAATCAGAGAAGGCTTCTTTTGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 18226771 5' - roo 355 2 57.14 AATCAAAAATAAAAAAAATGTTTACGTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCACGGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chr3L 3846446 5' + F-element 65 1 54.11 CGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3L 3983915 5' - P-element 2864 1 65.87 TGTAGGTAGAAGGAAGCGGCTCCGATCTTGCCATGTCCGTATCTCGTGAACTTTAAAAGCTAGACAAGCAGATTCTTTTGGCGGTCTTATATATCTTATCTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - 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chr3L 16963232 5' - Stalker4 48 4 68.49 TGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chr3L 11257380 5' - 1360 2 2 43.24 AAAGTAAAGATCACAAGTTCGTGTTAAATAAATACATTAAAATAGGGAATCCAAGAAAAGCTGGAATCTCAAAATCAAAAGCAGAAAGCACAAACCAAAAAAGTCAACGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTTCAAGACTA:1 + chrX 3724672 5' + G2 2625 1 69.86 AAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3R 29612022 5' + jockey 10 1 62.16 CAGTAGTACACAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 - chr3R 10270667 5' - Juan 4156 1 52.74 TGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr3L 23146458 5' + 1360 48 1 52.74 CATGAAAGGCTCCTCTGTCCCTACAAACCGATGAAAAAAACACTAGAGAAAGAGAGATGGGTAGCTTGCCAGGGAGAGGGACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3R 30347464 5' - P-element 2874 1 72.73 AGAATTGAAGCATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chr2R 13168700 5' + P-element 101 1 15.00 GGCTCTTGCCAAGAACTTAAGTAAAATGTTGATATATAAAAAAAAACATAATAAACTGCACTCCATGGTACCAATCTATTAATAGGAATACCTCACACACATACGATTACCTCAAACAATCTCACACAAAATGGACCAGACTCGAC:1 + chr2L 12378558 5' + I-element 4907 1 71.92 AAGGGAGGTGGTGGCAGGGATGTGTCGAGGTCATAGGGCAGAACAAATCAAAAGTTAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 29084981 5' + 412 7118 2 63.45 GATATACTCTTTAAAAGGATTTTGTATATCACAGAGTGGAATCATAATCATCTTGATTCAGAATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATAT:2 - chr3L 3501862 5' - Bari1 1691 1 67.81 GCATATTAATAGATTTTCCTCGTTTCTTTAATGAGTCATGTTTGGTTTTTTTCCGGGGATTTCTCCTTAACTTACATATAGTCATGTAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAATTCTCAAAAC:1 - chr2L 4003812 5' - mdg1 390 2 60.42 GAAAAAAGAAAATCTCTAAATGTTAATGTGTAAGGCAAAGTTGTGAATACTTTCTATTATTCAAAATATTATAATGTGAGAAATCAATCAATTGATTTATATTACTCATACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3R 18093424 5' + I-element 12 1 74.48 ACTTTTTATTCTCGATAGCCATTTAATGAAAGGGAATACTAACCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 - chr2R 7090711 5' + I-element 77 1 67.81 ATTACGCGCTTGTTTGTGTCGATATTTGCGCTATAAAAACTCAATTGGCATTGAATCCAATGCGCTAGTTCTTTTAAATTCCAGCACACGGGATTTTTGAACGAAAAGTTTAAGTAATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 + chr3R 17996112 5' + diver 5895 2 79.45 ATTTAGAGCATTTCGTTTTACAGAGAAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:2 - chr3R 30675494 5' + 297 17 2 70.55 GGAAGTGTAACCGCAGCTAGCAGGCATATCGATAGTTGCTCAGTGGTGGAGCTGAAAGGGGGTTCTAACGAGTTATTATGCTGAACTAAGCTGTAAAGAAATAAATTAATGGAAGGCAAG:1 - chr3L 9426972 5' - Gypsy12A_LTR 2245 1 62.50 ATCGACGATCAGCGGGTGTTTTGGCCTAATTTATCTATCCGTCATCGGCCGCGACCAATTTGCCTGATACTTTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAAAGT:1 - chr3R 16157394 5' + pogo 9 1 63.64 AATATGAAAAAGTAACATAAATATAAAGTTTGTTATCAGTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGCATCAGTTTTTCATTATGTCAAGGTTTAGAATAATGGAAAATCTTCAAATACACAACTTATACTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTA:1 - chr3R 25427929 5' - BS4 727 2 58.22 TTTGTCTTCTATGAGTCATGCTTTTCACCTTTGCCCAGCTTTATTCGATTATCAGGTTCTTGACTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr3R 13973054 5' - 412 490 2 73.91 AGAGAAGCTCCACCTTCTTGGCCAGTACCTTAAATAAGAAACATCGTCTGGACGATGTTATATGCACCTCTTCCAGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTGCAATATGCATGTCCGGCCAGCGCTGCAAGCAGCCTAT:1 - chr2R 7403136 5' - TAHRE 9969 1 56.85 AAATAATATGATTATTACTGGGATTCCCGAATACAAGTCATGAGCTGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCGGGGGTCGGAAAAATCGAAGTTTTGAAAT:1 + chr3L 22890320 5' + FB 21 1 68.57 GTCCACAAAGACACATAATATGTAATAAAAAGTGGGCAAACCCGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAACGTCTAAAAATTGAG:1 + chrX 18817246 5' - transib2 2796 1 65.97 AACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr4 373068 5' + pogo 50 1 54.11 GTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTA:1 + chr2R 4188994 5' + S-element 66 1 65.75 TAGTCTTACGTAATTATTTAGCATTTAGCATTGTTCTGGGTGTATGTGTGCGTGTGTGTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAG:1 + chr3R 29173349 5' - I-element 5118 1 60.27 GTTGGAAGTGTCCCAATAAGTGAGTTTACATGTTGTCTTAATAAATAATGAATTATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 14366509 5' - roo 9032 1 59.59 CAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 17421322 5' - pogo 2059 1 52.74 AGCAAGGGTTAATGGCAGCCAGAACTAGAAATTTATGTTTGCGGGAAGTTGAACATTTAAATACTATTAATGAGTAAAGCAATTTGAGTATTTTTCAATCGATTATATATTATTTTTGCCTATGTTTTTTATTTTAATTAATTTTT:1 + chr3L 3548632 5' - jockey2 3406 1 73.29 CAGAAATGAACATATCAATGTAACAAATTATTGTCTTATGAAACTTTAAAGTTAACTAAATTATAATTAATATCTATAATAAATGCAGCGTTTCTACAGAAAAAACACGACCGTTCGTGTTTACACTATAAACTTGTGCGTACATT:1 - chrX 3083466 5' - rooA 7593 2 65.07 CTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTC:1 + chr3R 28042946 5' - Stalker2 7582 2 64.83 CAGCACTCGGTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:2 + chr3L 9269862 5' - 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roo 8993 2 83.33 AGGGACAGTGCCATCGGGCTGTTGTGACTTTGGCTGTCTCACATGGGTCATGCATGTGTTTACAAAACATAAAACAGCAACAAACATCGAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGTCATAAAGTCTAAATTTT:1 - chr2L 4713993 5' + transib2 25 1 67.83 ATGGGTAGAGCATGTGTTTGAATGCCACAGAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 11191524 5' + roo 30 2 64.38 TTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGGGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:1 + chrX 18817302 5' - transib2 2738 1 74.66 ATCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACAAATTTTTTTTTATTTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACG:1 + chr2L 5705838 5' - FB 652 3 63.12 AGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2R 11164525 5' + roo 8705 2 57.53 AAATGAATGATATGATATGTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGATTTTTAGGATTTTCCGTTTCCTATGAAATAACTTCCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 - chr2R 24170008 5' - transib2 2783 1 44.83 TATACAGTTTCCTAAAAATGATTTCACAACTTTAAGCTAACACTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTT:2 - chr2L 13556499 5' + transib2 4 1 77.40 AGTCGAATTAAAGATAGAACTTTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr3L 9269877 5' - copia 236 1 51.37 GATGAATCACCTGTGAGGTGGACTGAAGTCAGTAATAGTTTCCTTGATATGATTGTAAAATAGGAATTACGCCGACGTGATAGTGTTAATTTGCATGCATTTATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAG:1 + chr3R 16176229 5' + diver2 468 1 51.03 TAATTGATTTCCTTATTATTTAACAACCGATCGCAGCGACACGAGTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTGCTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTT:1 + chr3L 4292527 5' - Quasimodo 6946 2 63.41 TATCTAATAAAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 + chrX 8027368 5' - Juan 4204 1 71.92 GAATGCTCATTTCATTTGGCCGCACTACAAAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAA:1 - chrX 3431989 5' - Ivk 5346 1 57.53 TAATCTGTGTGGAAACTTAACTTCAATCCTAAAAAGTCACACCAACTGTTCGTTTTTTGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTAGCATTCCTCAACTTCTTCTTCACATGCAAATTCCACCGATTTT:1 - chr2L 1702840 5' - I-element 318 1 64.71 TGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3L 8959593 5' - 1360 3329 1 63.45 ATACAATAGGCACAGGCCTAAGCGTTTGTTTTGGTATCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chr2L 4123930 5' - transib2 2741 1 74.66 CTGTGGAATTTGCTTATTTGCTCACGGGCGTGAAAATATAATTACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 + chr3R 9002865 5' - roo 394 1 76.71 ATTTGAAAAGTGCAATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCG:1 + chr2L 14026125 5' + F-element 449 1 58.27 CTCACTAAATCGTGGTATTTTTACGGAAAATGTAGACCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chr3L 12315801 5' - transib2 2741 1 73.29 AACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATCAACATAA:1 - chr3R 14144904 5' - 412 7139 2 63.16 TAGATAGATATAGATATAGATAGATACGATATAAGATATATAGTAAAATTGTTGATTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 - chr2R 19635565 5' - 297 6927 2 75.45 GCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTTATCATATAAA:1 + chr2L 18347312 5' + transib2 82 1 76.43 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCGACTCGCGAGAAGATAGACGCGGGATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAA:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4343 1 76.92 TTATTGCTCAAAATAGCTAATCAGAAGATTAAAAGAAATTTCGTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGGTTATATTTGTGCGCGTACATAGCCATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAA:1 + chr2L 22340087 5' - 1360 3175 1 66.44 ATAAATGCAAAATTTTTTGCCCCATAAAAATAGCGATGTCTTTTTGATAAATGATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAG:1 + chr2R 18426197 5' - copia 127 2 63.70 AACAGATTGAAGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 18549809 5' + roo 43 2 54.79 GTGTGTGCGTAAATATTTGTACATTATTGCATACGAGCTTCACGATGTCACAACACAACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGG:1 + chr3R 25709775 5' - hopper 1348 1 63.70 AATCAAGCTTATTTCGTTTCTTTTCTTTATTTGCGAGTTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTT:1 - chr2R 20802646 5' - mdg3 5466 2 55.79 CGAGAAGATGACCTTCGGCATGTACAAGTGGTCGCGCCGATGTTGGGCTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTATATATATGTACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTGTAGCTTGACCA:1 + chr2R 21092790 5' - Stalker2 7464 2 76.03 CAAATAAACAATGGAAAATAAGAAAAAGAAGCCCAAGGCGATTTTTTAATACCCTTGAAGCAATAGAAATTAAATTTTAAAGAACTACAATACATAGATATAAATCCTTTAAAATAGTCGAATTAAATATTATTTAAATAATTAAA:1 + chr2L 13076911 5' + S-element 1450 1 78.08 CTTTCTTAAGTTATCTGTAAGTTTTACGGCTATTGCGGTATTGAGCGTCTTGATTTATAGAAGTTCTACTGTATATTTATGGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr2L 7660886 5' - I-element 5319 1 58.22 ATTATATATTATATATTATATATTATATATTATATATTATATATTATATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGA:1 + chrX 3391433 5' + 1731 4388 2 67.12 TTTTTTACCGCTTAGCTTTTGCAATTCAAAATGTCACCGCCAAACGCAGCGTATAAATAGATTACACTGCCAGTATCAATCAGCATTTTTGGTCAACAAACTGCGTCTTAGAATCTGTATGCTGAATCGCAACCTTCTAGCTTTTA:1 + chr3L 16495409 5' - INE-1 164 1 63.70 ATATGTGCCAGTTAATATTAAACAAATATTACGCATACGACACAAGGGAGCAGCTGGAAATCATCAAACGCTTTCGCATTGTGTATGCGTTTGTGGTTGTGTGTGCTTTGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chrX 14450548 5' + hopper 9 2 79.45 GATTCATGTCCATAGCGAAACGGAGGATAATTCAATAGAAAACGATGCCTCCTATCTGGAATCACGTGCTCAGGTCGACTGTCAATCCGCGGGAACAGAAAATCCTTCTCTAATGGTATTTCCTCATTCTATTTATTTGGGATCCA:1 + chr3R 28823516 5' - G5 4822 1 73.29 GACAAAGTCTTTGAGAAAATGATAAGCTCAGCTAAACGTGCGCCGCTGTGGCACGTGATGCAGCTAAGAAAATATAAGAATCGAAATTCGAAAACAAAATAAATAGAAATAAAAATTAAAACGGTTCAAAAGTGTGGCCGTGACAG:1 + chr2L 19858914 5' - INE-1 249 1 64.38 GTATACTAGATTAGCTGAAAAGTATGTAACAAATGGAAGAAAGCGTTTCCGAACATTTAAAGTATAGTATTCTTGATCAGGATCAAAAGCGAGTCGATCTAGCCCTGTCTGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATATGAG:1 + chr3L 21223736 5' + INE-1 136 1 71.94 CATGTGGATTTGTTCATTTGGGTAAGTTGCAAAATGTAATTATAATAAAAACTGCATTACTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCGTTTAT:1 - chr3L 9269986 5' + copia 61 2 58.22 ATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr3L 10373788 5' - 297 381 2 74.62 AAATCAATAATTCAACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:2 + chr3L 15913852 5' + jockey 4824 1 63.01 CATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGGCTA:1 - chr2L 23373500 5' - Tc1-2 1535 1 76.03 GACACTCTGTTATGAGCTGAATGCTAAGAAACCCATTTGGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGT:1 - chr3R 31264126 5' + jockey 4782 1 62.33 ATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 20167679 5' + roo 60 2 60.96 CGGTGGGGGGGATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 13294956 5' - roo 8984 2 77.40 ATTACAAAACAAGTTTTTCCGTTGTTTCAGCCTGCTGAATGCAACGCTTTAGATGGTAGCTTCATGTGGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCAC:1 + chr2R 16091562 5' + blood 7334 1 53.42 AACATGGCTGGATCATTCGTTGAAAAATAGAGTTCTGAATCCAAGAAGATTAGCAGTGATAACAAGACACGTAAATGTTTCAAGTGCGGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGCCTTATCTCAATTAGAGGCAAATTGGAATGGC:1 - chr3L 23868336 5' + mariner2 542 1 60.27 TTAACATACATAGATTCCCAGAGCAGCGAACATGTTCGTCGCCTCGCGACTCCCGACCACTCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chrX 1135400 5' - P-element 2865 1 60.91 ATTAAATCAAGGTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATA:2 - chr3L 3501801 5' - Bari1 1629 1 71.92 GTAGAGTAAAAGGGAATACTAGATTCGTTAAAAAATATGTACAAATGTGGGTAGAAGTAAGCGTTTCCGAACATATTAAGTGTAGATATTCTTGTTCTTCTGTATGAACGTCAAGATATCAGGAACTATAAATGCTAGAA:1 - chr3R 2473817 5' + INE-1 154 1 87.86 ATTGTTATATAATAAGCCTGAAAGTACTAAACCCAATGATAATTGGTACTTTCAGGCTTATTATATAACAATTATCTCATTCTGCAGTCGTTTCGTTATTGTTATAATTGTTT:1 + chr3L 11104050 5' - G4 97 1 57.52 TGCTATTATGTTTGCTATTGAATGCATTACAAACGGTTTAAATGTATTGATAAATACAAAATAGAAGGGCATACACTTTTGTCTGACTCCCATTATATATATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:2 - chr3R 4461171 5' - blood 357 2 76.03 GGGAACAAAATAATACAGATTTCTCAAAAAAAATATTGGTGATTAGGCGACGTGTTGTTGGTGTATGCCACGAACTCCGACGATATTTTGTATTTTAAAATTTTTTTAAAAATGGATATCTTAATGATAAACATGAGTGT:1 + chrX 20351496 5' + accord2 375 1 72.14 AGTGCAGCAGACGGCCTTTCTTCTGCGGCAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr3L 5102195 5' + jockey 4763 1 79.45 GTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2L 4063834 5' - roo 348 2 59.59 ATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 + chr2L 15550668 5' + Bari1 57 1 58.96 GAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATG:2 + chr3L 20189595 5' - FB 209 1 46.58 CTGCAGTTCGTGTGGCAAGTGTCTCGCTATGTTCATACACAGCAAAAAAAAATGTGCAGACTTGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGCCTCTCTGCCGGCGCAGACGGATTGCATTTGGCTAGCTTGGACTCTTCTAGACCAAGTA:1 - chrX 8669741 5' + Tabor 328 2 56.85 TCTTATTTTCACGAACTATCCTACTATCATATGACTGAAAACAATGATGTTATTCCGGACAAAAGGACCACTGGAGTCATGATCTTAAGAAAAGTGGTAATAGGTTGGGTAGCGAAATCCGCGAACACG:1 + chr3L 12626298 5' + Gypsy12A_LTR 1965 3 64.34 AGGATGGAAAACAGCTGTCTGGGTCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACGCGTTG:1 - chr2L 19924080 5' - roo 9059 1 67.15 AATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3L 2544628 5' + Tirant 8145 2 57.80 AAATAAAACAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGCCGTG:1 - chr3L 16437282 5' + F-element 9 1 65.81 AAAACCAAAAAGATGTGATTTAAGCCGCAAAACAGCCAACGAAGAAGGCCAAAATATAATCATAATAATTACATATATCATTTTTTATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 + chrX 8200153 5' + flea 4786 2 65.07 CAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 + chr2R 24427571 5' + jockey 4722 1 55.56 ACTGTAACAGATCTCTCTGTACTTATTTAACATGGGCCAACAAACTTCCGCTGCGTCTATATCTCTAAAATCTGTATGCTGGATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCT:1 - chr3R 3072617 5' - INE-1 149 1 76.27 AAAAGTGGGCTTTTGTGCCCTTTATGCGTTCGTTTAGTTTTGCCGTTTCATTTTTTTTTTAACTTCAGTTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTTGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCT:1 + chrX 16082396 5' - I-element 491 1 73.97 AGGAGAGTACGGGTAGTAGAAAATAGGCGAAAATACGTAGACTGAAACGCAGATTGGCTCAGGCACGTAAAGTGCACACTAAAAATTCTGAGAAAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAAC:1 - chr2R 6115323 5' + I-element 489 1 69.86 TTATGACACTTTTGCGGCTTATCAACGTCAGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chrX 4808485 5' - mdg3 227 2 68.70 TCTTAAATGGGTGTGGGATAGTTGAAAGTTGTAAAACTTATTTAATTTAAAAGTAATAAAGCTTTTAAAAGTAATCCATTCTTAATAATAATTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACG:2 + chrX 19103302 5' + Copia1_DM 33 1 59.59 AGGCGCAAATAAGACGCTATGTTTGGGGATAAGGGTAATCAGTTAGTATGTAAAAGGTAATTAGTTCGCTACTATATGGAAGGAGTCCCAGTACAATACTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chrX 22738497 5' + 297 6599 2 51.03 TTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGAC:1 + chr3R 9557515 5' + G2 3028 2 52.05 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGCAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATG:1 - chr2R 3262652 5' - invader1 3982 2 64.14 GTTTAACTTTGCTCACTTTCTCCACTAGCCTCTCTGTTCGCTCGCACACCAATATGTCCGTCGCTTTTTTGCGGCAGCCTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGAATTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 21224658 5' - roo 9035 1 57.86 ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTTGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGACAACGAACGA:1 - chrX 17501198 5' + Doc3-element 184 1 76.03 CACATTAAATTATGCTGACATGGCATAACGGACAGAGGGTGGGCGCAAAAGCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCCGCACAGAGACCTGAAACTCGC:1 - chr3R 14349065 5' + X-element 4357 1 51.43 CCGCACAAAGTTTCAGCTTTTGTTCTGGTAAAAATCTACGCATGAAGCACATTTTTCTTTTCATTCTCTGCAAAACTATTTTGCAATTTGAATTTATGTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTCCTAAGT:1 - chr3L 10591041 5' - G4 3562 1 75.34 GCAAATCTAAATATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr3R 23639260 5' - pogo 2098 1 70.19 GGTCCCTTCCGCCCTCGCCATCGCCATCACAGTGGCTCTGCCATTAGACTTTTGTGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAA:1 + chr2R 6562814 5' - copia 128 2 62.59 CTGCAACACAAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGCAAGCCGAAGAGTGAGCGTGGAGGACGACGAACAATCGAGAGAGCAGCAGGGATGCAGGTGGAAGGAGGAGATGCGAAGAAAAGTGAAG:1 + chr3L 23678157 5' + Osvaldo 339 1 64.17 ATAAAGTGTTTTTACTGCGACCAAATATGCAAATTAGTTGAGCAGCGCTGGCGATGACAACTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGCATAGCATTAGCTACG:1 - chr3R 29690798 5' - I-element 5302 1 54.11 CCCAGCCCGAACTGTCATGACCCCACTATAGGGAATGTTTTCATATTTCCTGAGATTTTATCGTTCACACGGACGGACAGATGGACGGGCTGGTCCACACGTAGTAAACCCTTTTACCCAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 5738964 5' + 1360 1 2 69.78 AAAAATGATCAAAGGGGATGTACCCCTTATTAATATATTTTAAATTAATTTAAAATTTTTGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGCAAGGACCTACCAACCC:1 - chr3R 14505376 5' + F-element 4523 1 57.53 GCTTACTGTTTGAAGCTCTCTGTGATTCGCTACCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCAT:1 + chr3L 23080077 5' + 17.6 7054 2 77.40 ACAATCATCATTATCGAAATGTCATAAAACCAAATGAGCGGGCATTATTCAATTTTAAACAACGCACACTCGCACACAGACACATTGCGATGCGGATACAGATAGAAAATATAAGGCTTTTA:1 - 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chr3R 3388153 5' + baggins 5218 1 74.66 ATACATACAGAATAAATATTTTATTGGACGACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3L 2544618 5' + Tirant 8148 2 54.10 AATTTACGATTTGTAGGCAAATAGTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chrX 17717038 5' + FB 7 1 56.36 TTCATGGGAAGTAATTTTTGAACTTTTCATTTGGTAGCTAATTTATATCGACCAACTGGTGTATACCGAATGAGAACAATTTTCCGATTATCCCAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 5151188 5' - roo 9045 1 65.75 CCCACAAGCTGAGTAACAGGTACCCGTTACTCAGCTTGTG:1 + chr2L 7232133 5' - INE-1 541 1 65.00 AAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chrX 585736 5' + Tirant 8144 2 54.47 ACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTT:1 - chr3L 16973444 5' - S-element 1635 2 74.66 GAAATGTCGTCAAAACAGAGACAGCCAGAGTTCTCTCTGCTCTCCTACATCCGCCAGCTTTCGGTATGTGTGACAAATGTAAATCAGCGAGGGTAGCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTG:1 + chrX 4761610 5' - HMS-Beagle2 41 2 64.34 AAAATAAACCTTTTTAAAGTTAAAGTCACCGATCGTGGACACCACCTGATCCCGATCCGCACTCTGCACCACACCGC:1 + chr3R 5026334 5' + Chouto 284 1 70.13 CCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATTAAGTTTTTGTTAGTATCTAACTACTGTATAGTTATCAGTTTGGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3L 8959563 5' - 1360 3358 1 64.38 ATATTTCATGTGGAAACGAGTGAGGAGCAACAACAACAACAATGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr2L 4063920 5' + roo 8741 2 71.23 AAGTGCNTTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTG:1 + chr3R 9557504 5' + G2 3017 1 54.79 GACGGGCATATATCAGGGAATGGACTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr3R 30347375 5' - P-element 2799 1 21.58 GAATCCAAACTATATAGACAACCAGATGGAAAATAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 3828440 5' + G2 3076 2 51.52 AAGTCATAAAATACGAAGCTAAGTTGGCCATTTACTTAATTAGTTTCTTTTGGCCGGGGCTTTAAAGCGCATCATTTATAAGTTAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 10931598 5' + 297 6612 2 60.96 AGAAGTCTGGGCGTGCATTCTTTTATATTAGGGATGACATTAGGGCATTCTCATCTGCGAAAAGCAAAGGTGGATTGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAA:1 + chr2L 22339691 5' + Doc2-element 219 1 55.48 CAAGTGTCGAAAGCAACGGCAACAGCTCCTGGAGATGTTCGAAAAGATTCCCAACCAGAATCCCAGTTACGAATACATTTGCAACCATCCTGAAGCCGAAAACTACAACAATCAGATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATCAAA:1 - chr2L 2215863 5' + HeT-A 318 1 80.82 AGAAATTATCTTCTTGTATGAGAAGATAACGGAAATGCTTATTGTTTTACTATTATTTATTTATTTTAAGTTTACTTACTCAATTTAAATAAGAGCGCTTGTAAAATCCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 13432415 5' - roo 385 2 60.00 AGCATGCAACCAAATTGATAAACAGTAGAATGAAAAATTAGACTGAGATTCTAGGACAAGACCACCACACCACATAACTGACAAGGAGCAGCTGGACAGGCATTTCGTTTCTATTGAAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCAAGTT:1 - chr2L 23315576 5' - INE-1 575 1 53.42 AGTGGGGTCCTTTGGTGCGGTCGTCTGCTATAAAATTCTGTGCGGAATGGACATTCGGACTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTC:1 + chr3R 28042937 5' - Stalker2 7624 2 56.25 CTAGATGACCTGAAAAGTATAATCCATTACGACAACTTGATGGAAAACTTATCTCGGCTTGAACGTTTTTATTTGCATACGTCCTTTTCGAACGCACTTAAACAATTACAGCCTTTAAAATGTATTTATAATTCAAATAAATATTG:1 + chr2L 8175550 5' - S-element 118 2 62.33 CGATGTGCAGCAAATTAATAAACTTTTGCTAACTGTGCGAGCATGTAACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1 + chrX 18817288 5' - transib2 2752 1 66.44 TTATTCTTGATAAGGATCTCAAGAACTAAAACTGCTAGTTTCCATATGGGGTTTGCTTGAGTGGAAG:1 - chr3R 4201563 5' - G5A 2361 1 59.70 GAAGAGGTGCATCCACAAGACTACGTGCAGTTGCAAAAGCTGTTGAGCAAAGTCCAGGAGCTAGAGAGATAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACAGCAAATTGAACGAAATT:1 - chrX 1331443 5' - GATE 397 1 52.74 CTGTCAGTATATTCATGTCTCTTTTTATATCCGTTACTCGTAGAGTAGAGATTCGTTAAAAAGTCTGTAACAGGCAGAGGGGAGCGTTTCTGACCATATAAAGTATTTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGC:1 + chr2R 5323885 5' + INE-1 100 1 67.12 CATGAACATAAATTTACCAAAATCAGATCAACGATTCAAAAAAACTTGTTTGAAGAAGGTTGAATTCAAAATTGTCATATCGTGTCAAACATATCGGATATATTGATTAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 + chr3L 16479724 5' + I-element 81 1 73.29 ATGCTGTTTAGGGATATAAAGGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGT:1 + chr2L 15550644 5' + Bari1 38 1 58.27 CAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 809647 5' + jockey 57 1 50.34 AAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 - chr2L 16946128 5' - hopper 1351 1 58.90 TATGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTATGATCATAGACTTAAGTTAAGTTATATTATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr2R 11804733 5' + pogo 57 1 59.59 AGGGCAAACACATGCACTTGAGCCCATCCACGTTACTTTCGCCACTAACCAATTTCACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAAC:1 + chrX 4808514 5' - mdg3 182 2 58.90 ATAAAATTATGAATAATATTGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTGTCTTCTGTTCTCTCTGAGAACATTTTGGCGTACATTAAATAT:1 - chr2R 1916451 5' + Juan 60 1 54.11 ATACTATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 - chr3R 23639248 5' - pogo 2044 1 60.96 AGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 9809255 5' + 412 7121 2 65.52 ATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:2 + chr3L 23287201 5' + 1360 41 1 56.16 ATTTAAACCTGTCTGAATTATCTGAAGATTTATTCCAAGGTAGTATACGTACCTACATTAACTGGAACCAGAACAGTCTCATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr2R 3563069 5' - Transpac 267 2 56.16 ATAAATCAGACACCGAAAATCCCAACTTGTGGCTCAACATTTGTATAATATACGTTCACATGTATGGTAAAACTGCCGAAGAAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 12818353 5' + hobo 40 1 56.85 GATATGATCGTCCGCTCAAAATGCTTGGCTGCTATGTGGACGAACAGCTCGCGTTTGGTTTTCCCTCTCATTTCACTTGCGTCCACCATTTCTGGTGGGATTTATCTATTTATCTTGCAGCAAGTGCCCAACAAAAAAAAGAACCG:1 + chr3L 320563 5' - Tc1 158 1 76.03 ATTATTCTCTTTAATATATTTAAAAAAATGTTAGTGTGCGCTCCGTGATAGTTCAACGACGACTGACTCTTCGTTTATTCAGCACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 + chr2L 16858671 5' - Burdock 6358 2 63.01 GTAGTTGTTGTGCGGTCATTTGGCTATTTTGATTGGGACAACTTCCAGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3R 21933285 5' + pogo 18 1 76.71 TGTTTCAATTCAAGATATATCACCAGATCAAGAATTAACAGATTCAGATTCAAGCACTACCATTCAGGAAATAAAACTCGACACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 + chr2R 4855158 5' + transib2 37 1 60.27 GAATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 - chr2R 23780635 5' + Ivk 39 1 57.53 GGGGTGTTAAATTGACCCATGCTCGCGGCATATGTACATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAGGCT:1 - chr2L 20821275 5' + Burdock 6219 2 76.71 AGAGAAACAATCATAGCATACTTTCAGGCGCAGGCGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 + chrX 2214230 5' + jockey 4799 1 58.22 GAAAATAGGCAAGTATATACACACAATTGATTTAAGCTGCTCGGTTGGGGCCCCTTTTCCTTTTCCTTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTT:1 - chr2R 13625383 5' - Doc 4603 1 54.11 AGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGTGTATGTTAACATAAAATCCAGTGTAATGATGAACTTTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr2L 71183 5' - 412 419 2 65.07 CCCTTTTTTCCTGCTCATAATGCACTATGGTTGTTTTTCTGTATAGGGTATCACCAGATCCATATCGTAAGAAAAGTTCAATTTTTACCACTTTTATATTATCGGCTTTTGTTTTGTCATGTATATAAGTGGCATCTACAGATAAG:1 + chr2L 22951453 5' + rooA 88 2 78.77 TGTATTATATGTTCTATTTTAGGGTTGACTGAAACATGTCTTGGAGCGCCCCTTTTGAAATTAACATCAACTGATTGATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAA:1 + chr3R 20675823 5' + jockey 4916 1 50.68 GCGGGATGCGGAATGGCGGAATATTCAAATGAAGTCGCGCGATAAGCCGCTCCAAATCGGCGAGGAAACAAAAGGAGAAGAGAAGGATTTCATATACGAAACAATACAGTGGGGCAAAATGAGAAAAAATAAAACTTTAAAAGTA:1 + chrX 18589856 5' + P-element 2693 1 58.62 GGCTCGCAATCGAAATAACGGTGTACAAGAAGACGAAGAGAAAAACAAACTGAAAAGCAGAGCAAACGGAAAGCAGAAAGACCAAAAGTCGGACAAAAAAACCAAAAATGTACTGGTTCTTAGGATCCCGCTCTCAATTAAGCCTA:1 - chr3R 27558766 5' + G3 4132 1 67.81 AGGCGCGGGAAAATTGCTTTTTCACTTCATTTGATTATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCT:1 + chr2R 16929769 5' + jockey 4526 1 72.66 AATTATGCGTTTCGAGTAAATGTACCTTAGGGTACCGATTTCGATTTCTATCAATAAAAGTTTTGTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr2L 5582214 5' + pogo 52 1 56.55 GAATTCGGTCTGCTTAAAAGTAAAAACTAAACCAACAGTGAAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGA:1 + chr2R 330080 5' - HMS-Beagle2 7168 2 67.12 GATAGATAATACGAACACATCGGACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr3R 28901179 5' - transib2 2804 1 69.86 TATATATCATATATATTCCATATTACCTGTTGAGGTTGAAAGAATCCTCGGCAACTCTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 13158642 5' - roo 9008 2 61.64 GTGTGTTTACTGTGGGAGTCTGCTGCTGCACATGATTTTTGTTTATTATTTTCTTAGCGCCATCTGCGCAGACTCATGCGCAAGTCATAAATATCAAAACTTACATCTTGTATATTCTTGATCAGGATCAGTAGCCGAGTCG:1 - chr3L 20447148 5' + INE-1 93 1 72.54 ATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 21062361 5' + roo 8730 2 61.64 AAAGCGCTAGATAGATTGAGATACTTATAAAGCTGGTTATGACGGAAAGCTGATGAATTTGACCACTGTACTTTATGCATATCAAACATCCAGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 + chr2L 6174018 5' - I-element 5329 1 63.01 AACGGAATGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAA:1 - chr3L 13739626 5' + BS 5087 1 79.45 ATGGAAGTTGGAAATTAGCATAAACGATCAAACGATCTCGAATTCATTGATCTCGTATTATGGCGTTCTTGTCTACTATATACATCTACTACTATATATATATATGTATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:2 + chrX 10537807 5' + I-element 14 1 73.97 ATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 19449909 5' - roo 324 2 65.35 ACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 + chr3L 17055424 5' + Tirant 56 2 56.16 ATATAAAATGAATGAAGACTTGGCATCTTCTCTCTCTTCCGTAATATTGATAGGAATGTTAACAGGATCATTCTCTTTGGCTTATTTATTGGAAAAATATAAAAATAAGCATTATGAAGTAATAATTGCATCCTCATCTGCAATTT:2 - chr3L 19657431 5' - I-element 437 1 17.12 ATCGAAGTAGGAACGAAACTGAAGACACTCTATAAAGAAGTAAAGTATTGATAATTAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTTATAAGAAAGCTAGACA:2 - chr3R 17548821 5' + Tc1-2 166 1 78.77 GTTAAAGGCCTATCAAACGGAGACTTGAATTCAAAATGCCTGTCGCGGGTGCAAATTTCATTGTGTTATTTTCGCATCCGCCTAGCCCATATAGCGCATGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 585769 5' + Tirant 15 2 74.63 ATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAAGGAGTGCGCAAGGAGCAGTCAACAAGCGCACATCGACTGGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAGAGTATAG:1 + chr2L 15950935 5' + Doc 64 1 37.98 AAAAGTCCCGTAAATCAAAAATCTTTACGCCGTAAAATAGTTGCTTCTTCTTTAAGAAGAAAAGGAAGAACAAGAAGAAAACTTTGAAATGAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:2 + chrX 1341581 5' - 412 7536 2 75.34 TAGTTAAATTCTAAATAAAGTGTATCTAACTAGGCTACTGTTTTCATGAATGTTGCCCTTGGTCAGGGGAATTATGTGGAAACTGTCTTTCTCAATAAG:1 - chr3R 4501621 5' - Fw2 269 1 58.59 ACCGAAAAGCCACAAATATTTTCGTGCAGCAAAGAATTTGGCAGAAGGTGCCCCCGACCTGCGTGTAATCTATTCAATTGAAAATTTTTGGGCCTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chrX 22840440 5' + copia 25 2 65.97 ATAATGCCCGAGTCGCAACCGAAAAAAAATATCAATTTCGTGCGGTCACAAAACGCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCA:1 - chr2L 1924005 5' + G2 3021 1 59.56 AAGCATAACGCTCAGCCTTTCCACCCCATCCACCATCCACCACCCACATTTCCATTCCAGCATTCTAAATATTTTGCAAAAAGCCTAAAACATACATATATACGGATGCGGATACATTGTAAACATATTGTAAATGAATATAGCTG:1 + chr3R 27843092 5' + I-element 5273 1 77.40 AGGAGAATTAAAACGTAATACAACGACGAAAAATTCAATCTTAGTGGACATTTTACTATCCTAAAGACACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:2 + chr2L 18549819 5' + roo 53 2 57.53 TGAGAAAGGCTTAAAAATGTTAACTAACATGCAATATTGCGATTACAGGAAAATCAATTTCAAAAAAAATTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGG:1 - chrX 8767068 5' + Stalker4 6935 2 65.75 ATTATGCTTGATACTAGCATATTTGGAATATAACTAACCTTGTTCACTGAAGTTCAAGCTGATTTTAGCATTTATGTAACGTGTAAGTCTTTCATTTTTTCAGAATTATATCCAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2R 2591056 5' + roo 8694 2 79.45 AAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 14980434 5' + roo 8700 2 60.96 CATAATGGTTAATAGCTAACTATTGTTTTATCCGTAAAGTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAA:1 - chr3L 20711679 5' + jockey 4840 1 71.92 CTAGAGAAATCAGTTGATCAAAGTATCGGCTTGGTAACTATATGGTTTATATGGTATATATTATATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCCCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3R 21933135 5' - pogo 2059 1 57.78 TGAAACGAATAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCTATTACTC:1 + chr3R 11474085 5' + Copia1_DM 76 1 67.81 GATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 11191358 5' - roo 9045 1 65.07 CTCGCATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979310 5' - accord 7026 2 30.84 GTACAAAATAAAATCAATATTTAAGTTAAAGGCTGCACAGCAATCAAATTAATTTTATATTATTTTATAAAGGTAGTTTTTTCTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 14304029 5' + roo 8702 2 51.37 CTCCTCCACCGTCCACAACCAACAATCCACCAACTACACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAAAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTA:1 + chr2R 7296994 5' + Porto1 4562 1 78.77 GTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTAC:1 - chr3L 23597290 5' + invader4 5 2 70.55 ATATCTGATGCAAGGTGTTTTTACTGACTATCACTTGTATCTACACTTTTAGTTAATAGCCACACAATAACCAAAGTTTGCGCCGTACTCGTATTTATTTTTTTATGGTCAGCCGTTTGTTGTTTTTTGCGCCCCGTTTTTTGTTT:1 + chrX 9484405 5' + Cr1a 29 1 51.37 ACCATGGCAAATCACGGCCCTAACGCCAATTTATTCGACGCTGGGAACGATTTCATGGCATTCATATATTGTACATACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATAT:1 - chrX 15200957 5' - 17.6 7378 2 58.22 GTTGGCCGTAACTGTTTCTTGTTGCTGCAGCTGCGTTAGTGCAAGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATAT:1 - chr3R 11099460 5' - HeT-A 5989 1 67.38 GTGTGGGTGTGTCCTTGTCCGCTTGTCAGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTAAGGACATCCCGTGTACTCCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2L 16944887 5' - copia 234 1 53.42 CTAACACCAAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr3R 21276670 5' - BS 5079 1 65.75 AGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAGAA:3 - chrX 22906777 5' - Transib-N1_DM 25 1 69.86 ATTTGGAAGACAAAAATAAATAATAAAACAGTCTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 3170115 5' + 1360 63 1 78.15 AATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTT:1 + chr3R 4160058 5' - invader2 5063 2 51.47 AAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGCCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chrX 22915072 5' + jockey 76 1 64.38 GGAAAGGGAGTTGGAGTTGAGTGAACTCTGGGCGAGAGAAACTTCGGCTCGAATGCAAAGAAAGTGAATTTCCAGTGCACACAGAAATTGGGTCGTACCAAAGACACTCGGATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 17940049 5' - 1360 3381 2 59.06 GTGAGGAAATATAAATTCAAAATGTTTAAATAAAATCATGAAGATTCCCTACTTATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTG:1 - chrX 14722200 5' + diver 69 2 63.01 GTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:2 + chr3R 17673773 5' + FB 88 1 79.31 CTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 + chr3R 6419819 5' - Tabor 447 2 57.53 AATTCCTTAGGCTCATTTGTGCATTAAATTCAATTAGCTGCAGCACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 11810649 5' + roo 58 2 66.41 ATATATATTTTGTATTGTATATACATATATATATCATTTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACT:2 + chr2L 19958707 5' - flea 4933 1 81.51 ATTCATAAATAAAAAGCTTGGTTTTTCGTATGCTGCTTTATAATTAAAATCATTTCAACTTGGTAGGCCACCATAGAGGTGTAACTAGAAGTGACAAATATTACATTAGTGCTGCAAGTCAAGCCCAAGTGCAACCATCAACTAAA:1 - chr2R 14294598 5' + Porto1 79 1 77.40 GAATCGCTCTGCTCGTTGTATTCATTTCATAGTAAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGC:1 - chr3R 13612567 5' + F-element 210 1 70.71 AGAGCCACCAAAAAGTAGTTCCCGATTGGCCCTCTATCTCGGTTTCTCTCTCTCTCGCTTCTCTACACCACGAAACTTCAAACTCAGCATCCCCATGTGCTTTTCGTTTGGCTAAAGTGTGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2L 16690558 5' - P-element 2886 2 82.88 TTTCTCGACTATCAGATACCCTTAACTCAGTTAGTGAGAGGGCGAGGGTGATGCAAAAACTCTTATTTCGAGAATGCTCACAGTGGAGGCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2R 5181951 5' - roo 9036 1 59.59 CATGAATAAACATATACGAAGGATTAAGACTTTGGGTGTAGGCAAAGTCTGATAAAGTTGTTGGCGACATCGAGTAATTTGTTGTGAACGCCTAAATGCTACCATTTTTTTTTTTGTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 - chr3L 4219598 5' - jockey 4988 1 65.07 CAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGTACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 + chr3R 23618121 5' - hopper 1358 1 55.48 CATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 - chr3R 15364054 5' - flea 4990 2 69.86 ACACAATAAACTACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAA:1 + chrX 9530301 5' - 297 342 2 56.85 TTGTATGCAGAATATTATTTGGCTTTCGCTCCCCCGTTTCCATTTGAATTTTTGTTATTTTTTGCTTGACATTGCAATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATAT:1 + chr3R 19202951 5' - 412 7073 2 57.53 ATGAATAATAGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 16476155 5' + hopper 147 103 76.47 ACAACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chrX 10167452 5' - roo 329 2 70.55 AAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAG:1 + chr2L 14874170 5' + copia 138 2 56.99 ATTATTTTAATAATTTTGATTTTAAAGTTATTGCTCCAGTTGTTTTTTGTTTTAGATAGCGTGGCTTGTGTCGGAGCTAAAATTGCGGGAGAGCAAGAGCGCGCTCATTCTTGATTTGTTGG:1 - chr3L 23958882 5' - F-element 351 1 77.05 AAAGGATATGAGTGTGGATGCAATTTTAGGGGGAAAAAAATATGCGCAAAGGAGTTTATTTACTTTTAGAGAAGCTACGTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTAT:1 + chr3L 13365730 5' + BS 5036 1 50.00 ATTCGCAAATTTTCCCATCATTAGCATTCAGGGCAAATGAAACAAATACACTTATAGGGGGTGGATGGCACTTGCCACGCCCATCCTTAGGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGCCTC:1 - chr3R 11475835 5' + Tabor 273 2 64.79 GAATTCCCCCACCGACTCTCTCTGTATCTGTCTATTCATTCATTTGGATGTCTATATCGTGTGGCCAGCAGTTGGTAGGCGGAGGAGGGGAGGGAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGC:1 - chrX 15228198 5' - F-element 373 1 72.26 AGACTGCATAAATCATCGCTACTTTCTTGCAGTGCAATCTTTTGGGAACAAAACCACACTTGACAATTGCCATTATCGCCTTCTTTCGAAAAGTACTTGTGGGGACTTATCTTAAATTATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGA:1 - chr2R 12270758 5' + Cr1a 4161 1 71.92 AATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATG:1 - chr2L 21750457 5' + Stalker4 180 4 76.03 AATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATGTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 11191411 5' - roo 9018 2 68.33 AATAAACTGCATAAATTTATAAACGAGTATATGAGCTTCTGTCGTCATTCATTCACATAACTTATGGCATAATACAACAATAGATTGTACTTAGTAATTAATTAAAGCG:1 + chr3R 24934893 5' + Chimpo 165 1 59.63 GTGATTTCTGTTGGGGTCAAAGTAAAAAAGTTCAAATGGGTTTATGCGAAAAATAAGAGGAACGCTATACAAAAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTTTATGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCG:1 - chr3L 6844546 5' - hopper2 1307 2 47.26 ACTTACCAGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3R 14767384 5' + roo 78 2 71.92 AAGACGAACTAGAGCGACATCGGGAATGTCCAAGATCGGAATCATTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTC:1 + chr3R 19448151 5' + 412 117 2 65.62 AATACAGTCCAGTACTGTTATAAATGCAACTAATATACAAATGTACATCTCAAGTCACTGACTCATGTGTAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATAT:1 + chr3R 19450157 5' - roo 8753 2 57.52 TTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chr2R 11164517 5' + roo 8713 2 55.48 ATGTTATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 - chr2L 19675072 5' + 297 54 2 65.75 CATTTAAGAATTCTTAAACTTAGGCCAGAGGTTAGCGGGAGTGGGCAATGGCAAGATATCGACCAAAGTGAAAATGCCGACAGCAAAAAAAAAAAGAAAAAACAA:1 - chr3R 23305323 5' + R2-element 3585 5 58.10 ATATAATACATATATTGTATATATTATAGGATATAGGTTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACT:1 + chrX 5323256 5' + Juan 4131 1 73.97 ATCAATGGAATCTAGTGCCAATCGGGAATCCCTTACGTACAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 + chr3R 30059376 5' + FB 45 1 54.79 TTATGTGTCAGCAAATAAGAATAGAAACAATACCACATTTTACGGTGAATATAAAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTAT:1 + chr2L 13557706 5' + transib2 2617 1 53.45 AAGATCCATCCGCACCACCACCCACCACCGTTCATGATCTAGTGTATATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAAC:1 - chrX 1264038 5' + Burdock 67 2 71.23 AGTTTTAAGTGCGCAAAATAGCCCAGAGGCCCAGAGAGACCCCTGCTAACCATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATTGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr3R 21933239 5' + pogo 64 1 64.38 ATTCCTTTCACTTGGCTGCTTCCGTGCATTTTCCCTCTTCCCCGGACACGATGTTTGTTTTGCTGATTCGAGCATAAGTTGCATTCGAAATTGATTGTCATGGCTAATTAAGTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGT:1 - chr2R 14793115 5' - F-element 4656 1 76.55 AATTGGGCAACCAAAACAAAAAAACATGTGTTTTGAAAATAAACAATGTAAAGTAGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTACT:2 + chr4 318144 5' - 1360 3323 1 73.29 CAAACCATTTCCAAGAAGGAATTTTTCATAGACCTAAAGCACATCGACTTTGTGGGTGGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGC:1 + chr3L 22723837 5' - HMS-Beagle2 7134 2 58.22 TGGTTTTAGTGCGAGAATTTCATTAGAAACTTTTACGGTGTGTGTTTGTGTGTGAGACTTGCACAATGTGGATTGGTTGTAAAATTTATTACAGAACAACATTTTAAAGAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2L 16564615 5' - roo 399 1 72.22 GAGAGCATATTATGTATTGTTGTTGTCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCAATCTGTAGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGCAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTATTAAATAAATAAATA:1 + chr2L 15936767 5' - copia 229 1 53.85 ATAATAGTATAATATTTGTATTTATTATTTGCCTACATTTAATCCATTCATATAATTACTATATCCTATAATTATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGG:2 - chrX 5323326 5' - Juan 4160 1 50.00 TTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTGTTATCTAA:1 + chr3L 18046631 5' + roo 90 2 80.14 TTAATAAATAATGAATTATCACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTACAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3L 14366546 5' - roo 9029 1 57.98 AATGCACTTGTATACTATCCTCATCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTG:1 + chr2L 14026138 5' + F-element 453 1 51.69 ATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCT:1 + chr2L 4123853 5' + transib2 60 1 60.42 ATTATAAAAAAGTAATAAAATAGTTACCAAATTCCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chrX 8092408 5' - pogo 2035 1 70.87 ATTATGTTAATAAACCAAATATTTATGTAGTTTAAAACTATTTCGCTCCATTGCACTGACGTCGAGCGGTTGGGTTGATGTAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1 + chr2R 5486147 5' + transib2 76 1 45.21 TTCCACATACAAATACAAAAATACAAAATCCTCCAGTAAAATTTAAAACGATATCGTGTTTTGCTTCGCGTAAAATTCGTGAGATGTAATCGCATGCATATGAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAC:1 - chr4 443630 5' - FB 18 1 63.70 GAAAAAATTAAAGTGTTTATTTTCAATGTTTATATACTAGATTCGTTGACGAGTGTGCAACAGATAGAAGGCAGTGTTTACGAACATATAGATTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCAT:1 - chr2R 5968353 5' + INE-1 103 1 76.98 TTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTT:1 + chr2R 3919680 5' + 1360 50 1 69.90 AATGGGGATTTTTGCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 31653075 5' + roo 8735 2 65.75 AGTCTTTATAGGTTTTCGGGAGCAAATATACACAAACATGTTCCTAG:1 - chr2R 17926381 5' - opus 7211 2 72.34 ACTAACCGGCGCACCCTGACCTACGTCGTGGCGAAATATCTCAAAGTTACTTGGAGGACGATTCGTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 - chr3R 5351482 5' + jockey 4684 1 61.00 TACAACTTTGTTATCTAAATCTAATTATCAACATTATGCAGATATTCAAGCTAAGTCAGCATTCCAACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCAGATACACATATATATATACGCTGCTCTTTTGCCGC:1 + chrX 18083206 5' + blood 7209 2 70.55 GATAAGGCGATAAGTGTTGCCCTGAAAAGTAGGCAATGGTTTTTCGCCTGAAAACTAATATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr2L 17809179 5' - jockey 4930 1 58.90 GCTGAGAAGCAAGAGAAAATTCCTAATTACCTCAAACGCATCCATCTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTA:1 - chr2R 10162041 5' + transib2 54 1 54.11 TATCATATATATATATATTCATATATATATATATCATCATATATATTCATATTCATATGTATATATGAATTCATATATCATATATATTCTTAATCCGGATAACAGCAGCGTTGTTCTGACCCTGACCGTCTGTCCGTATGAACGCC:2 - chrX 12190741 5' + INE-1 126 1 47.26 GAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTATCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATG:1 - chr2L 20640293 5' - Stalker4 7163 4 61.38 TGGAGCTCATGCCAAAGCCAACAGGTGGTTGTGGCTGATGTGGCTTGGTTGTTCCCATCAAAAATTTTTTGGCTGATTCCGGTTTTTTGGCCTCCGTATTTTTGCCCAG:1 - 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F-element 4592 1 73.97 GTTACTCGTTTATTTTCTTATTAGGATTGTTTCTGTAAATTTTTTTTCATTTTATTTCTATATTGTGAAATCGATATCGCAGAAAATTTGTAAAATTTCGCGTAAGCATTCACACTATCTGAGTAACGGGTATCGGA:1 - chr2R 3919518 5' + INE-1 544 1 71.53 TTTGTATTACACTTATAAATAAGAATGTGTGTGTACCATGCGAATATTAAGTTAAGTCCATAAGCACATCTTAATACATAACACAGTGGCTATTTTACTTGAAATAAAAAAGTATTATTGTCATACTTTAGGCGTATAAAAAATGA:1 + chrX 15557108 5' + hobo 2689 1 78.77 TCACAAACCAAGTTGGGTGCCTCAAAAATGAAACAACAAAATATGTTCGCAATCATAGATGTTTAGCTTTCAACCAGTCAGTCAATCATTTGATATCACCTATCCAAGTACCCTTGCAAGAAAACTAATCCGAGTATACAGTCAA:1 - chr2L 15728446 5' + Doc 4516 1 67.59 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACACCCAGAAGGAAGCGTTTCCGATCGTATAAAGTATATATATTTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAACTA:2 + chrX 124082 5' + INE-1 142 1 83.56 AGGGTGCAAGAGAAGCCCGAAAATCATAAAAAGGACCTTAGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2L 18226855 5' + roo 43 2 64.22 ATGTTGGAATGGTGCTGGTGGTTCGATTGTGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTTTTACAGTTACCCGGGGCGGTCGTTTGGCGCT:1 + chr3L 6987410 5' - Doc 463 1 71.30 AGCATTGACCGCACTGGAAAAACCGCACTACAATTTACCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chrX 19054271 5' + jockey 92 1 74.66 ACTAAAGCAGCGCAGCGATCGTCTTTCGCGGGAGAATCATACCCTGACCAAGTCCCTTCGAATCATGGAGGATGAGAAGAACAAGCTGCAGACGAGTCTAAAGGTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAATACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 27123623 5' - roo 393 1 74.48 ATACTTTGCGGCATTTCTTTGGAGTCTGCTCCCCTTTTGTGTCTCCAACTTCCAACTTCACTTTGGCGGCACAAATTTGAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 4063811 5' - roo 9042 1 63.31 CTAAGAGAGCAAAGGGAAACTTTTCAGTGTCGCAACAAAGCCGCTGATTATCCAAGTAGCTTCTTGGATATTCCTCTGGCACCTCCTACTTCTCGGAATGGGGGCGCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAA:1 - chr2L 9118953 5' + FB 894 3 71.23 ATAACAACCGATAAGATAAAAAAGAAATCCAGAAAAATTAAAAAGGATGACCTCGATGCATATATACAGCAACTGATTAATGCCCCCCCACCCAAACATGTAATTATTGTCCAGATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGATCGT:1 - chr3L 2059630 5' + G-element 4305 1 54.79 CGGGGGGATAAACCTTCGACTGTCGCACCGCCCGCAGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCCGACCTCCACCGCCTGGAGACCACCTGACACATCCCG:1 + chrX 6483878 5' + gtwin 7371 2 69.66 TATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTT:1 + chr3R 19449942 5' + flea 409 1 77.40 CATGACCCACAACCTAGTAATACCAAAAACCCGTATTTTAATAGGCAGCATAAGTCTCCTACGTCTCACCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCAA:1 - 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Burdock 188 2 68.49 GGCCCACCCACAAATTGCTAGCTTTAGAAACATAAACACTGGGTACGCATAAAAAACTCAACGCGTGCCATTATTAACTTAACTTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chrX 18409489 5' + jockey 4689 1 70.25 ATAAACGGAGGAAAACAGTAACAAGCTGCGTTTATTATGTGTCTGCTGTCGCTGTTGTTGCTCTTGTCTCAAGGGAGCTGTCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 + chr2L 18347262 5' + transib2 3 1 74.77 CATAGAGTCCATGGATCCATTATGCCATTAGATATTTTTGGCGTCAGCGGTTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:2 - chr3R 4860528 5' + Transpac 4985 2 63.70 GAATGAAAAACATGAATATGCGTCTTAAGTAATTATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:3 - chr3R 5523978 5' + FB 86 1 77.40 AGTTAGTTATGCTCGGGGATTGTGCATTTTCCGAGCATTTTTCATAATTGCCCGTTTCAAAGGCAAATGAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTGCAAACCGCTTGTTT:1 + chr2L 17324340 5' - R1A1-element 123 1 50.69 GTATTGTTGTTGCCTTTAAAATATTAGATAATATTAAGTGCGTCTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:2 + chr2L 15936780 5' - copia 213 2 67.81 AAGTTCAAAGCTCAAACTTTTGCCCGCACTTCAAACACCAAAGTGGCAACAATGTTGAGCCCCCCATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACC:1 - chr3L 18125997 5' + Ivk 58 1 53.42 GTGAAAATATAATTACTTGGGTAGTTGTAAAAACAAGCGCATTTTTCGCTCAGTGGCAATGAACTTCTAACGTAATCTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 9002894 5' - roo 9028 1 56.85 ATGCGGGAAACACAGTGAAAGTAAAAGTAAAAACAATGGAAAGTTAATCGAAATCATAATCAGATACATGAAATCGTTTTCAACAGCAAACGAACAAACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1 - chrX 5379071 5' + Quasimodo 72 2 68.49 GAAAGCTCTAAAAACAGCGGTCTAAAAAACCGAAGAGCGAGCACAATCACAGATTCTGACAACCATCACGAAAAGATCAAAAGAGACTTAAATATTCCACCAGCCATTAATGCAATCACAAAACTTATGGAAAAATATCATAGCAA:1 + chr2R 5373856 5' + F-element 4437 1 76.03 ATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGGCATTCGCATGGGAGATGCGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3R 15882563 5' + jockey 34 1 58.33 ACTGTAAGTTGTTACTTCGATCAAGATCAAGGCTTTTTGCCGAAGTGAGTGAGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGTATGTGTTTGCTTATATACTTAAAGGCTCTGTGGACGGCAAAGCAGTTATAGTCGGATATGGTTTTCG:1 - chrX 5063630 5' - Ivk 361 1 56.16 TAAATAAAAAAAAAAACGAAACGGGGTCAGTTCTTCGGACCAGATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGC:1 + chr2R 23784136 5' + Ivk 223 1 63.25 GTACCATCTACTTGAACAGTAGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGAC:1 - chr2L 23400861 5' - S-element 1686 1 65.07 AAATGCAAATTCGAATGCAGAAACCAGTGAGCCAGACATGTGCCCACATGCCACGCCCCGTGTTCCCATTGTGCGGCGATGGTCTACCGATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTA:1 + chr3R 27620604 5' - jockey 4886 1 73.08 ATTATTTGCCTAAGTACTCAAATTAATCTACATAACATCGATTATAAAGTGTCTAAAGAAAAGTAGTAATGTATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3L 11327094 5' - pogo 2099 1 50.49 ATTATTACAGCGATTTGAGGTGAACTTTCAGTCTAACCAAATAAATAAAACAGTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGA:1 - chr2L 9038268 5' + I-element 73 1 63.01 ACCATGTTTTTATGATGGTTTTCTATTGAGGCGAGCACGATATAATGTGATTATCCCAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAAT:1 - chr3R 10214899 5' + P-element 2705 1 41.78 GCAAATAAAGAAACGTGAGAATATTATAATTACTTTTGTAAAATTCAGTTTTATGGATATGGTAAATGTCTTACAAATATTTATTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr3R 13187535 5' - I-element 5314 1 53.10 ATTTTTAATATGATATTAATTCCTGAGAGGTAAGATTATGTATTATACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 + chr2L 6654660 5' + diver 5948 2 62.41 CCTGCTTCCCTTTGGTGTTGGTTGCTATTTATTTCTAGACACTGTAGTGCACTATTCCCCGCACTTGACTGTGCCATGAACACATGTCCCTGAGACTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 - chr3R 25709908 5' + hopper 24 1 64.38 ATACTCGTAGCTCAAATTGAATTGCTCGGCATGAACTCGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 - chr2L 10156233 5' + hopper 37 1 57.24 AATAGCTAATCAGAAGATTAAAAGTAATTTCGTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGGTTATATTTGTGCGCGTACATAGCCATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTT:1 + chr2L 22340098 5' - 1360 3164 1 60.27 TTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTCATATGAATGGCCACACCTTT:1 + chr2L 16943818 5' + copia 58 2 68.03 GAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTACAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 15882545 5' + jockey 30 1 63.70 AGGCGGACAGATAGATAATACGAACACATCGGACCGATCTCATTTAACCACCACCTGCGTTTCCCAATCCTTGTGCTGCCATTGCCAAAATCTGTGCCGTCCGTCTGATCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 + chr3R 28901170 5' - transib2 2813 1 76.03 GTTGTCTTAGTTCATTTTTTCGATGTTGTATAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGC:4 - chr3L 3501790 5' - Bari1 1618 1 79.45 AATTTCCCCACGCTAAAGTGATTATGACAGCTAATGAACCAAGCTTCACCTCTGCTTAATTTAAATCCTTTGCACAAAGGTGTGTATTTAGCTTTTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCC:1 + chr3R 1706096 5' - diver2 337 2 54.14 ATCCGTATGTGCTATCTGAAGGGACTTCCTCGTAACTGGCTGGATTGGAGAGGAATCGCTGCTGGGTAACTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 13300963 5' - roo 352 2 52.74 ATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGG:1 - chr2R 5321210 5' - INE-1 513 1 62.83 ACTTAGTCTGTAAAATATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTTTAATTGCTATACTGAGTGTTCTATTAGGATAATTCCTTCCAAGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chr2R 24169949 5' + transib2 40 1 44.52 ATCTAATATATACAGTTACCAAGATTTATATAACTTCTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTTCTCGAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2L 12818258 5' - hobo 2886 1 62.28 AAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCACGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCTGT:1 - chr2R 5424279 5' + 1360 3360 1 72.22 AGTAAGAGTGCCGATTGAAGAACGAATTCATTGAGTCCAGCAACAAAAGATATCAAATGCCCGAAATGCCGACAAAAAAGGATGACGCGAAAAGGAATGGTCTAAACAGGAACATGGGAACAAAAAACGTTTGGCCAACA:1 - chr3R 21898756 5' + FB 344 1 82.14 GAACAGCCACTAACTTAGGCGCATAAACCATAATTAAATACCAAGTCTAGATGTAAATGTGCAGAAAGTCGACCATTTCGTCAAGCAATCACAAAAAGAAAACTCATTAGTAGGGCTAGCACAGTAATAAAAATTAGAATAAAAAA:1 + chr2R 23760127 5' + Doc 4693 1 62.33 ATGCTAGTGGGTTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 809631 5' + jockey 35 1 59.29 AATTCGCTTTATGTAAGTGGCGTTTCCAGTGGAGACTGCACCGATCCAGAGTCACGAAAATAGCAACAGACCAAACCGAACCGGTTAAGAAAAAAGGCGAAAAAAAAAAACGAAAAAATTCTACAGTTCCCCGACTAACAGATACC:1 + chrX 12891175 5' - INE-1 557 1 79.45 CAGGCAAAAATATTTTCGCCCGAAAGTATGCAATCGCAAATGCACTCGCAGCTGGTCGACACTATATTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACAGAACAGCGCAATT:1 + chr2L 12341822 5' - BS 5044 1 53.33 GTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 5531204 5' + 1360 55 1 70.71 GGTCTGCTATACGGTCGATTAAAAGATTTACTTACATAGCAAGATAGCTAGATACTCCCCTGACGTGAAGACAAACAGTTTATAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATCCCGAAAAGG:1 + chr2R 5524857 5' - HB 71 1 71.43 AACTTCTTCCAGGAAATCTAAATTCTTCGCCTTCCTTCCGTTGTTCACCTAGGCGTATACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTA:1 - chr3L 17568120 5' + S-element 62 1 60.96 ATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGATTCACCCGGTGCT:1 + chr3R 27405933 5' + diver 5899 2 74.22 GATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3L 25401024 5' + Doc 19 1 55.83 CTAATATAAGATTTGGTCACACCGCACAACACTCTAACGCCCTAATACAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACC:1 - chr3L 3070841 5' + I-element 139 1 67.12 TAGCTCGCTGGGATCAGGATTATCGCCGTCGTCCGTCGTCGCATGTCAATGCTGCTGGCCATTGTTGACAATGGGATTTATATTTCAACAGTCTCGACGGGTCCGCTCACATATATATACATATATACATT:1 - chrX 6765894 5' - G3 4508 1 77.86 AAATATCAAGAAACATTTCTCTGTTTGTTAATGTATTAAGGAACCTAATCTTAAGGATTAGAAGTGCATACTAGTGCTTTAGTTGGTTTTGATTCATAGTTATGAGGTTGATTTATGTTACATTATGTATTTATTTTATTTTATTT:3 - chr3L 8333856 5' + transib1 1897 1 76.03 AATAAAATAGCTTTATGTTCACTGTTCTTCAAAACTGCTTGGACAAGCTGAATCCTCTTTATAAGTATCAAAGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:2 + chr3L 11094151 5' - roo 360 2 54.79 CATTTCCGCTCTATTGGCGTATAAACAATTTTTGCGCATTAATTGAATCGCGATGTTTGTGTGTGTGCGTGCCGTGGAGGAGCTTTGAGACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGC:1 + chr3R 19553778 5' - Max-element 8243 2 53.24 AATTACAATTTAATTCGCGTCTTTATTAAATTCAGCCCCTTTACTTCATTGTTTTTCATCTTTGACTCAGAGGGCAACAGCAAAGAGAAATGCACGTATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 5532886 5' - roo 9053 2 70.55 ATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2L 6102929 5' - roo 9012 2 60.96 GTATTTGTACTTGTTTGAAATATTATGAAGCCTCCACGTCGCCAGCCTATCCATTTCTGCTAAGGATTCACTTAGAACTGTGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATT:1 - chr2L 20640319 5' - Stalker4 7188 4 54.79 AAAAGCATTCATGGTCTTCTTAAGTTTGTTAGAATCTTAACGAAAATACACTTAGCATACTGTTGTTCTGTTTTCCTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 9809233 5' + 412 7100 2 53.42 TGATAAGTTGGCTAATAGAAATGGTCAACATAACTGTGTAAATTTCTAAAATCCCACATATATCCTGAGTGTATATTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 17926280 5' - opus 7462 2 56.85 GTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAGTTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 + chr2R 3338790 5' + Juan 66 1 62.33 CGAATGCCGAGGCCAAAGCAAACGCGCCAAATACCAAAGAAAAAATACAAAATAATCATAAAAAAAATAAATGAAATAAATAAACAAATAAAGACACTTTAATAAAATAACCAGTCTTATGTTAATTGGCGCCCAAACGGAAAA:1 - chrX 13272667 5' + Burdock 271 1 58.33 AGTTGATTAAACACAACTGTTTACGATTGCTTCTTGCTGACCACTGCCAAAACGGAGAGAAGAACAAGGTCAGATCGACTCGCCTATTGATTCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAATCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTT:1 - chrX 22843701 5' - INE-1 34 1 58.90 TGTTACTGTTTACATATTTAATGCATTTAATCAATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 - chrX 9410537 5' - I-element 5267 1 76.71 TCCCTCTTGCTATTAATGACCTTTATACCCTTAAAATTTCCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCC:2 + chr2L 14026161 5' + F-element 458 1 60.00 AGCAGAGCAACAAATAAGTCATTTGTCAATAGAATTTTCATTTCACTTGACTCTTTCGCCCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTC:2 + chr2R 10161782 5' + transib2 59 1 57.53 TTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAT:1 - chr3L 19350016 5' + 1360 3254 1 54.79 ATTTGTGTAAGCCAATGAGCGTTTAAGGCATTCCCTGGATATTGTCGGTGCAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGGCCATATGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGTGTAATTGTTTTTAAAAATATAACAGGTA:1 - chr3L 23062707 5' - Stalker4 403 1 75.86 GAACTCATAGCTGAACTACTTTACCTGGAAGAAGTCCGGAGTCCCCACATCGACACAAGGACCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3R 5368688 5' + 1360 59 1 56.85 AGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAA:1 + chr3R 9557524 5' + G6 1997 2 58.22 CTGTGCTCTGTCCAATTACATAACCGATTTAATTAGCATTGCTGACTGGGCAGCCAAGCGTCCTGATCTAAGCCATCCCCACGTACACACCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGTAATTTGACAGCTG:1 + chr3L 8453684 5' + FB 31 1 55.86 AGAACTGGATACAAATTCAACACATATTTTCCTATATTGTACACAATTTGGTTGTAATAATTTCGCTCTTACAAAAGAAATATTTAATTATGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 19032565 5' + roo 29 2 64.38 CCAGATGGCCATTTGGCAGGCCGTAAATGCAAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGT:1 + chr3R 15807378 5' + FB 90 1 78.77 ATCCACAACGAGGGTCGCTATATGGGTAAGTCTAAGAACTTTTTCCAAGATACCAAACATTGTGCCGTCAGATCGATGCTTTAAACCTGTACCCATGAGCAATCCACTCAAGAGGGCATCCAATCCAACAGACATAAAAATGC:1 - chr3R 25356227 5' + Quasimodo 7023 2 65.03 AGTTTAGTTCACTTTCGAACTTTGAGTAAATTTAAAGCGTTTCAAGCTGTAAATGTTTGTACTCATTCTAATTCATTCATTAAGCTATGTAATATCCATTATACATTATTATTATTATTAATTTATTATTATTATTGTTATTATTA:1 - chr3R 27151486 5' - mdg1 7065 2 57.53 ATATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATTATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACG:1 - chrX 22913222 5' + gypsy7 37 2 59.72 TCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 + chrX 10521655 5' + Tabor 6926 2 74.66 AGCAGAGAAGATAGCATGGAGATAAATGTGATCCACCGGGAATACGTCCGCCTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr2R 4606334 5' + 1360 14 1 72.39 TCATTATTCTTTTCATTTCGCCTAGCTTTGTTTCTTTTCATTTTTTAATTGTCCCCCTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGGTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTG:1 + chrX 4967332 5' - F-element 475 1 61.81 CTTTATGTACATTTTAATGCCATTTTTGATTGGGGAAAAAACGGACATTGGCAGACCCATTTTTCAATTTTTTTCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:2 - chr2L 13556457 5' + transib2 46 1 48.63 AAGAAACTTCTCATGTCAAAGCAAGTTATTTTTCTATGCAAAGGCGCCGCAGGCTCCTCCGAGAACATTTATTTACTTAATATTGTGTGCATCACACATACGCCCCATTGCACTGCGGTCCCGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 - chr2L 18347432 5' - transib2 2813 1 77.46 AATATATTATAGTGTGCTATATTATTTGAAACATTGTAAGTATCAAAACTAGCTTTTAGCAGGTTAAGTTTTAACAGCTTATTGAATAAAACACAAGACAGTATAATATCTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCT:1 + chr2L 6915509 5' - 17.6 186 2 73.29 ATATGTATGCATACAGTGCAAAATATCATTTCTTATACTTACGATTACCAATTAAATCGAGCATTTGTGGCGTACCATATATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3R 15325203 5' + 297 40 2 53.10 GTTGCGAAATGTCTTAGTTTCATATAAGCATTATGTATCATAATAATCTGGTTGGTTATGGGGTTTGCTATTTTGGGTGACACATACTGCACTACTGTGGAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGTGTGGAGACGTGTTTCTTTCACGT:1 + chrX 23280396 5' + Doc 28 1 62.33 TACAGAGTGCCTAATGGGCGGCGTTGTCGGAGGGGGTGTTGGGTGGTGAAGGGGCCATGGATGGTGCAAAATCCCAAATAATAAGACTT:1 - chr3L 13294983 5' - roo 405 1 61.80 AATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:1 - chr3L 11257436 5' - 1360 23 1 58.22 AGCCAACGTCGACGTCACGAGCGGCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGGCTG:1 + chrX 18282624 5' - P-element 2798 1 21.43 TCTGCCTCGCAGTGAAATGAATCCTAGCGATTGCCATCGAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 + chr3R 19992650 5' + hopper 77 1 68.97 GGGAGGAGGACGGAATTATCTTCGAGATATCATCTTCAATGCTGTCTGAGACATTCTGCGAAGAGCTGGCGCACAAATACTCACCCTGGCCGTGGACTCGCGCGGCATTCATGTGACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATT:1 + chr3R 9721090 5' + 17.6 320 2 47.95 AATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAG:1 + chr3R 19449932 5' - roo 295 2 64.49 AATCACTGTGGACGGTTGTCCGCGTAATGACGACGAAGCGCAGTGGGGGGAGTCATTTGAGATGGCATTTGAGAGCCCACACGATATTTTGTTTGTTGATTGTGAAGCAACACAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chrX 19266786 5' - roo 403 1 71.23 CGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTANACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTTAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGAT:1 + chr3L 20189594 5' - FB 210 1 44.52 GTCATCACTGGGATTTAGGATTTTGGGGCCGCACCCCTGCTTAATCGTCCGCATGGCATTGGCAGTGACCCAGCACCACTGAACCTTTGCTGCACCACTATAGTGCTATAGCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 - chr3R 23492012 5' + transib2 6 1 79.45 AAACAGGACTTTTAATATAAATATTCAAACTAACTTAAATTATGAAAAAATGGTTCAAAAATGTGGGCGTGTCAGTCTTGGGCGGTTTTAGTGCGTTAGAGTGGGCGTGCCAAGCATTTTTTACATATTTATATTTATGTTGATTA:1 - chr3L 20034225 5' - 1360 2955 1 76.03 GGTTATTTGTTACATTTGGGAGATGCCTTAGAACTGGATTTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACAG:1 - chr2R 12188451 5' - 297 6962 2 80.14 GGGAAAATGTTTGACTTTTGCAGTTGTTTTGCGCTGCGAGTTGTGAAATATTGAGGTATTAGGAAATTGAGGGAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3L 9809361 5' - 412 458 2 57.14 TATAAAATATAGCTTATATTTCAACAATTCATTACTCAATAGCTACTGTGGAAAAACTAGCTTTAGACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 19073290 5' - roo 9036 1 54.33 ACTAACTTGTTTCCTAGTTACAAAATTTAGAATACATTTGTTTCTATCGAACAAAATTACCTTTTTTTTTTATCTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 - chr2R 21410983 5' + Burdock 6 2 73.33 AATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAATACGCAATTGGTATCCGTCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2R 12133814 5' + jockey 86 1 70.90 TTTTCCTTAACTGTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 18046576 5' + roo 8696 2 59.44 GGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:3 + chr3L 24213773 5' - invader2 177 2 65.75 ACATTAGTTCGACTCAAAAATATTACAACTAATTTAACTAAATAAACCTTTTACAAAGAGTTTGCTGAAATTCATCTTCAGGCCACATCTATCCATATACAGCTGGAGGACGACTTTAACCTAACGCG:1 - chr3L 24492659 5' + gypsy4 6543 1 46.88 ATAGAGTATTTTATTGAATTAAAAAAAAAACAGATAATATATAATATAGTTATTTTAAGTTGTTTTTGAAAACGTCTGCAGAGCCTACAACCAGCACAAACCTCACAGATTTTACTTACTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGCG:1 + chr3R 4594504 5' + frogger 2283 1 72.03 GGTTGACCCTGATCTAATGCAAAAGGGTCGCTGGCGGAGGTCGTCATTTAATTAAGAAATGCTTTGACTCCGGTATGCGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr3R 15942823 5' - hopper 1378 1 60.42 ACTGATCCTCGACTCGCTCAAAGTTGTCCACATATTTAGAGGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:2 - chr2R 12472104 5' + transib2 78 1 70.55 AGTTTCTGGCAATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 - chr3L 24934425 5' - HMS-Beagle2 277 2 63.70 TCCACGGCTATGGCTCGAGGATCCACCATCGGTTCACGCTCCAGCACGTCCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGG:1 - chr2L 4965052 5' + F-element 4504 1 54.08 ATTTATAAAAATGACAGACACTTCTATTTCGCCTCGGTCCCTTATATACCATATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr2L 19675067 5' + 297 59 2 69.18 TGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATAATATGCTTCTCAT:1 - chr2L 22369235 5' + rover 6952 2 65.07 AGCTTAACTATAGCATATTCCCATTCTTAAAATTCAATGTAAATGACATCAAGCGCATAGCAATTAGTAAACCAGGCTCATTAGTAACTAACATAAATCGATGGTAATGAAAGCATGAAATGAAAAATAAAAAACAACAAACAAAA:1 + chrX 5377630 5' + gypsy9 401 10 61.64 GGCGCCCTTCATTACTCACAAAACCTTTTTTTTTTTATAGGAAATGAAAAGTTATGTGAATCCTCACCACCCTCATGACCTCCCTACCCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 - chr3R 31264088 5' + jockey 4820 1 55.48 CGAAGTACTTGTATCTTTCGGAAAAATGGAAGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTT:1 + chr3R 22626553 5' - mdg3 107 2 67.37 GGGGAGAAATGCGTTGCATATCGCATTTATGGGCTGCTTATTAAGTGGTGCAACAAACTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACT:1 - chr2L 4640433 5' - Bari1 1362 1 60.96 GAAGAACAACCGAAAAGAACGTGGAAAATCAGGGAAAACCAGGCGAAAAGGTTGCACCCTTAAGTTTGGTAAATAACTGCAGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chr2L 12984242 5' + hopper 39 1 58.22 TACCTTTTACCAAATGCCATGCATTTTGAAAAACGAACTTTCAATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACACAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAA:1 + chr3L 17055444 5' + Tirant 76 2 68.49 TATCACTTTGGCTTACAACATTTGAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTNNNNNNGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3L 14366562 5' - roo 316 2 80.00 CAGATTATCTTTTTATTTCTTAGCGCAGGGTTAATTTTTCCAAACAGCCATCAAAAGTGACTTTACTTACCAGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 14767448 5' + roo 14 2 69.86 TATGACAAACTTTCTCTTTTCAAACGGTTGTGCCTTGTTTTCTTGGGATATCACTTGAAAAATCGATTTCCACACAACGCGATTGCGATAAATACTTTAATTTAATTGCATATATGTATTATATATATGTATATGTATAAATATA:1 - chr2L 17152083 5' + Stalker4 7203 4 66.90 GTTGAATTGAAAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATT:1 + chr3R 20167545 5' + roo 396 1 71.65 AATATATATACGTCGTCGCAGGAGTTTTTGGGCGTTAGAGTAGTAGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGAAAGCTTTTATAGTACTAAGATCTCGACGTTTATAAGGACATACGGACAGACGGACATGGCCAGATCGAC:1 - chrX 22635719 5' - INE-1 111 1 79.45 GTTGTAATTAGAGGCTGAACTTACACAGAGTTTGTGTGACAACCGCCTGTCAGGCAGACTGTTCTTGGCTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3R 4860420 5' - Transpac 261 2 51.72 TGTTGTGACCTGTTGGCGGGCCACTGGGTTGCCAGGTCAAGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTA:1 + chr2L 8338709 5' - P-element 2672 1 30.14 GATAACTAGCACCAGAAAGGAAACAACCTTGTTATCAAGGACCAAGGACACAGTACATCGTTAGCAGCTGAAATTAACATAACAAATCCACGGAAAAATGTAATAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAA:1 + chr2L 20392304 5' + R1A1-element 4889 1 70.55 ATGTATTATTTAATGCTTATTAGTTTATTTTAGATTTAAAATAAATTTAATGTTTTACCTAAGTAAAATATTTCTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAAGGGATTTACTGGCAGTTCC:1 - chrX 2674958 5' - Porto1 4293 1 54.79 ACCTATTTAACTTCTTCGGCTAAAGCTACTTAGTGAGAGAAACTAGACATAGACTGACCACCATCTATAGAACTCGAAAGCAAGCCATCAACTAAAGCCATGATCGTAGAGATAAACACACGATAAGTAAACTTAGGACCACCCTA:1 + chr2L 14714197 5' + mdg1 7135 2 81.51 AGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3R 13406380 5' - pogo 2073 1 66.44 TTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCG:3 + chr3R 4160069 5' - invader2 5042 2 60.96 ATGTCAACGATAATCCACCGGTATTCGATCGTCAAACATATCGTACACAAATCACTGAGGAAGACGATCGCAATCTGCCCAAACGCATTCTGCAGGTTAGTTTTTCAGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 17809311 5' + jockey 15 1 77.70 CATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCTA:1 + chr3R 20140499 5' + jockey 4698 1 55.56 AAAGAAATATTAAATCACCCTCAAAAGCCTGAAGTTATTGCAGATTTAACGGATATCTCCGTATTCAAAATTGTACTACGTAAAGAAAAAGAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 + chr3L 27865968 5' + Max-element 13 2 64.34 AATTGCTGTGAAACCCAAATAAAACAGTGAGAAGGCCTTCTAATTAGAGTTGCCACGAAAACTAGGCGGCTGTTCGGTGGAAAGCTAAAACTAGAATCATTTAAGAGATCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr3L 16437298 5' + F-element 22 1 63.70 ATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGCGC:1 - chr2R 12185418 5' + accord 6907 2 58.90 GTTTTGTTTGCAGTGCGCACAGCAACGAGGAGAGACAAACACAACTGTAACTGTAATTGTGTGTTTGTTTGCTCGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr2L 16540914 5' + hobo 37 1 58.09 AGTTGATATCAATTGCGACTCAAATGGGTGATGGCAACTTTTACATCTCGGTCACCACCCACTAGTTGGAGTTGATTAAAAAAAATAATACAAGAGATATTGCTATAGTCGAGCTCACCGGCTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2L 22114976 5' - INE-1 552 1 64.49 AATTAAACAGTTGACCATATTGTAAAACCAAAATTTCATACCAAACTATTTAAAATAGATTAATTATATTGATTATCGCCGCTGAAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:2 + chr2R 16930771 5' - jockey 4903 1 58.22 CAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 29611981 5' + jockey 25 1 69.23 AATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAC:1 + chr3R 19450179 5' + roo 9030 1 63.70 GTTTATGTTTTCATTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGAT:1 - 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chr3L 2990087 5' + roo 11 2 74.66 AGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCATTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTG:1 - chr3R 10736136 5' + McClintock 52 2 59.03 ATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCT:1 + chr3R 4679433 5' - hopper2 1564 1 54.11 AAAACTTTTAATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 20167554 5' - roo 9033 1 56.16 AATGCTAGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATATAGATCGGTT:1 - chrX 20999644 5' + BS 4 1 76.71 TCCACTCATCGCATATCAGATGTCGTTAAGTTAATACAGTTCATTATCGTTATAATGGGTCGTTAGATTGGGCGTGGCGAAATCGGTCAAGTTGCTGCGTCTATGTCTGTAAAGTGTAAAGAAATAGATTGATGGAAGGCAAGGGA:1 - chrX 21566691 5' - Gypsy12A_LTR 2242 1 58.22 GAAAATATATATGTACACAATATGTATGTACCAACCACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATGTCA:1 - 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roo 38 2 63.64 GTGGTTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 + chr3R 9038931 5' + Juan 4074 1 60.96 AGTGCGGAAATAACTTGTTGTTGTTTTCGGCAATTGAGTGCGTTAAATCTGGTTTAAGATGCATATATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr2R 6964764 5' - Burdock 6350 2 54.07 CTTTAACAGCTCTCCTTTGCCATCCGCCCATTGTGTGTGCGGCACGTGCAGGCGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCT:1 - chr2R 14379197 5' + 17.6 7153 2 78.67 CAGCATATATGACAACAGAACGGAAGGGATTTTTCATATTCAATTGAGCTAAATGATTTATGTCTGTGTATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTAAAATTCCTGTAAACTTGAAAAAGCTAACAATAGT:1 - chr3R 11037023 5' + X-element 4617 1 61.72 GTTATACAGCCACTGACACGAGAATTGCGGACTGAAACCGAAAGCCAAGGCTTTAACCCTCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chrX 12066108 5' + transib2 15 1 60.78 TTATTCAACAGATTTGAGTTTAGTATGGAAAATATATTAAATTTTGGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr3L 9269898 5' - copia 5084 2 65.75 AACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - 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chrX 585753 5' + Tirant 5 2 72.22 ATATAAGTTAGCTAAGAGAAATATAATGCCATCTACTTATCCTAAACAATCCGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACG:1 + chr3R 8137642 5' - F-element 4511 1 57.94 TGTAGCTTGCTGGAACCATCCACACTGAGCTAAAAAAGGAACTTTTTGTGGGACCGCAAAAGCATTGCACCATTTTTTGGGATATCGATAGATTTTGGGAAATGTAATGAGAAAAATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTTG:1 + chr4 819303 5' - INE-1 244 1 67.81 AAAATGCTTAAATTGAGATTAATTTTGTATAATTTTACTGTAGATTGTCGCTCAAGGGGGCATGTAAGTTTTCCGATTGTATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTT:1 - chr2R 4896818 5' - Max-element 283 2 68.85 TCTTTCATTAGGAAAATGAATAATAAGAGTTATTATCGGACATCAAAAAAAGAATTTCGAAACGGCAAATTATCCCAATCATGATAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTCCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCT:1 - chr3R 7665642 5' + I-element 231 1 56.16 GAATGTATTTTGACAGCCAGCTTAATTCTTAAAGCATAACACATAAATTTACAAAAGAACCACGGATTTCCTCGAATATATACGAATATTTTCGCAAATTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAATAGACTTTACTCGT:1 + chrX 18396037 5' - roo 398 1 66.19 ATGAACTCGTCCGGATTTCAATCGATTTTGTTAAAAGGAGTTTCTGGGTAACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTT:3 - chr2L 10156203 5' + hopper 68 1 64.38 CCTAATAATACATTTCATCGATGGGCAATCCGCATCAGCCACATCGTGTAACCCGTAATATGAGCTGTGTCAAGTTGATTGACGGACTTAATTGATTGAAGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 31653208 5' - roo 390 2 73.97 ACAGTGGGCGGAACAGGGAAAATAATTTAGTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTT:1 + chr3L 5881602 5' + pogo 88 1 78.08 ATAAATCTGCCAAACGGGGGGAAGTCCACAAAAGCGGTTTTTCAACTCAATTGTTTGGTAAATAAAAGGCATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTG:1 - chrX 8199465 5' + flea 386 1 53.57 GAGAACAACAACAATCGGAGAAACACTGATAGCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTC:1 - chr3R 5216193 5' + FB 91 1 80.14 AATAATAAACATTAATTAATTTTGGTAATAAATATAACATTTGCATATTAAAGGTATTTATTTCATTATAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 20167563 5' - roo 9024 2 52.74 CTTATCAATGAAAGTTTTTCCTAGAACTTTGCCATAAAATCACTCCAAAAGTCTATAACTTGAGGAACTTTTTTTTAAGTTTTTAACTTTTTTGGTACATAACACTAATATTTATTAGAGTTATTTTACATTATATTAATTTCCTC:1 + chr2R 14338737 5' + Cr1a 4327 1 63.01 ATCGCTTTTTGCGCCGGGTGTACGAGTGGAGAAAAGGAGATAGATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 18403063 5' - P-element 2856 1 56.03 ATCCAAGACAAATAAAATAATTGTGTGATTCCCACAAAAACAATAAAATCCAAGTATCATTTATTGGTTCCAACCTCGTTTGCTATTTCGTTTCACCTAGCAATATCCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGTAC:1 + chr3L 10373772 5' - 297 6964 2 75.69 TATAAGCATTCAAATGCATTATCTTTTTCCCATCACTAACGAAATTTTCATAGCATACTTTTGTGGATACTCGTCAGTGCTCGAACAGGACGGCAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr2R 20227181 5' + hopper 3 2 73.60 AAAGAGCCACAATAATAATAACTTTTCATAGCGTCCACCATTGTTGTTAAGTGCCCCCAAGTGAATGGGGTTGGTATCGTGGAATATTTCGTATAATATGTACATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 + chr3R 19407858 5' + diver 5907 2 71.23 AAAAAACATTTACGGTCGCTCAAAAGTATGCAACAAATTTCATATTAATATGCAGCAAAGAAATAACAATATTAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 5489871 5' + jockey 56 1 47.26 ATATTGCTGTTGAATATGCATAACTATCCGCCAAACTAACAGTTTGATATATGTAACATGGGGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 + chrX 12129318 5' + flea 35 2 56.48 CGTTGCCTTCGCAGCCTTCGAGTACAACCACGACGTCGTCGTCGGAATCCTCGGACTCCTCTTCGTTCGCTTTCTCCTTTGCCTTCTCTCGCTCTTGCTCCTTGTCTGCGTCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTA:1 - chr3R 11372607 5' + HB 22 1 80.82 ATTTCCAGCAACATCGGGTGGTCCACGTCCAGTAGTACACAGAGGAAAAAGGATTTTCTTACTGTAAAAGGTTACAATTTGCAGTAGTTATAGGATATTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 - chr3R 10270696 5' - Juan 4185 1 67.12 GTTATAAAAGAAAAAGAAAACCGTGAACATAAAAAATGGGCAAAAATAAAAGCAAAGTTATATGAAAACATGGTTGGCCAGTGTTCACACATGTACACGAATATATTTAAAGACTTACAAATTTGGGCTCCGTTATTATCTTATGT:1 + chr3L 7889541 5' + roo 44 2 52.74 GTTGAGAGGTCATAACTTTGTAATGATATTGGTTCTAGTCATCATTTCGTGAAACAGCTGTGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 23067548 5' - roo 9029 1 58.90 GCCGAAAAATAAAATTCACACGACGTTGTCGCATTTGAACGTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTCTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAA:1 + chr3R 23638717 5' - pogo 335 1 79.45 AAATGAAAATTTCGGGGAAAATTGCTGTTCTATGAGGTTCACTGGTGTATATAATCGATTTTTTATTATCATTATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:2 + chr2L 4072164 5' + 297 6623 2 51.37 CAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACATGCTTTGATTCAAAATAGAAAATTCAGTAGCAAAAGCAAAATGAAAAAACCCTGGACCGATAAAGTATCATACCAAAGACAATAGAATAACAAGAGGCGTAACGGCC:1 - chr3L 14971177 5' - 1360 3376 1 73.97 ATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATACTTACGTATTATACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTT:1 - chr3L 16731387 5' - rover 272 2 82.88 ATTGCAATTGATTGAATGCCACTTGCGGCATATTAAAATTTCAGAGCACCGCAATTACACGGAATCGCAATAGCAAACGCGGTGAATGGTGAATGGTCATTTCATTCCACGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCA:1 + chr3R 27405918 5' + diver 14 2 75.34 ATTAAATATTTATTTAATTTATTATTTATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTAACTTTGCTGGTTTTTCGTTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 - chr2L 9247305 5' - TAHRE 10432 1 47.95 GCCACAGTAATTGATAGCACGCTAGAGTGATTCGTAGTGCAATTCAAGGCAGCTTTTGCCTTTTTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:2 - chr2L 15779657 5' + hopper 51 1 53.42 ATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATAGGACACTAAACCGGGAAGACGGCAACTGGTAAACC:1 + chr3L 2544651 5' + Tirant 63 2 70.27 AAAAAGTAAATTTCCATGTAAATGTTAAAATGAAAAAAGAAAAGCAAAGTTAAAAATTAATAAAATAAAGCAAAGTTAAAAATTAATAAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTA:1 + chr2R 10229273 5' + X-element 4716 1 44.52 GATGATGATTTTTTCATTAGTTTTGCTCCGGTTGAGGCGGCCAAATAAAAAAAAACAAAGTTATACCCAATCATTTATGGTAT:1 - chr3L 13244607 5' - Stalker4 6987 4 28.92 GTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACC:2 + chr3R 31886857 5' + hopper 79 1 71.92 GTATAGATTTTTGTTCGGTAGGGATGATTGCCAGCTTTCGGGGGGTGGATGGATATGGTGGATATTGGGGGTTGACTGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCAC:1 - chrX 7624923 5' - copia 5032 2 74.29 ATTATAATACAATTAACAAGAAAATATGAACTATTATTTACACAAGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATCG:3 + chr2R 21410878 5' - Burdock 183 2 66.44 TTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAG:1 + chr3L 24213779 5' - invader2 171 2 69.86 AAATTCAGCAGAACTTAAAGCGGATACTTTGGATGGAATGGCAGAGGCGATGGCCAAGTTTGTTATTTGCTCAACGGAAAATATTGAAGATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr3L 19549411 5' + micropia 135 4 68.31 ATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGGTTACTTCTTCTCCATGT:1 + chr2L 12569980 5' + micropia 4991 2 60.27 ATACTGAATGTTTGATCCATCACAGAAATATTTTAAACGGCTTCCAGTAAAAAAATATATTATCAAGTGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 20167686 5' + roo 8717 2 56.16 AATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAATGTACTAAAAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 19449989 5' - roo 326 2 76.55 ATTGCCTTCAAGTGGCATTGGATAGTGTAAATAGGAGAATTTAGGAAAGCATTTCTAATTGCAACTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 6102929 5' - roo 390 2 54.29 TTTAAGGTTTGTTGTTCAAAACGTCGTCGTAGTTCATTAAAGGTCGTTGTTTGGGATTTTTATTTCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCTAAACGTTTCTTTGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACACCTTTTT:1 - chr2L 23023695 5' - Tc1-2 1216 1 52.27 ATGGAAAACAGCTGTCTGGGTCGTAAAACCAAACAACACCCCAGCAAGCAATTACAGTTCAGCTCAGAACCAACTGGGACAAAAAACACCACATTCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 19924077 5' - roo 9047 1 62.33 GAATACCCAAAGGCCTAAGGAAATTCGATATCTTTGCTATTACACAAAAAGCAAGTTATTACAGTCGAGTGGTGCGTTCATAAATATTCCGTTTTTGCTTTGCTGTTGAACGTTCTGCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATT:1 - chr3R 27282614 5' - accord 7026 2 51.37 AGGCAAGAGGAAAGGACGGTTGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 13766208 5' - roo 341 2 65.52 AGACTCCAAGCTGATCAAAGCTAATGAACGATCGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 + chrX 10639103 5' + FB 88 1 76.71 GAACAGAACCCAACCCTCGGATCCAAATGGACGTCTCAGTTTCAGAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2L 19923951 5' + roo 8738 2 68.49 AAGCTCAGTTCATTGTGCGTACAAATAGTTTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 24369018 5' - roo 9019 2 55.86 TGTATTTATCTATAAATTCAATTAAAAGTAGTTAGATTGTGCTAAAATCTTTTTTTTTTTGATTTGAA:1 + chr3L 19218440 5' + Tc3 89 1 73.53 AAAGGATTAAATAAATTCGGTACATTCCGCACTATGAGGAATACAAATAAAATACAATTAATTCAAAAATTTAAAAAAATGTCACAAGAAGAAGTTATTATTTTAGAATTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:2 - chr2L 15940374 5' - pogo 2092 1 79.45 GTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr3R 29612006 5' + jockey 67 1 56.16 ATAAGCAATTTAAGTTTATTCACCTTGTTAATCAACAAAATCTTTTAAGCCAGAATGTCTTTACGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:2 - chr3L 16033429 5' + Doc 63 1 57.53 CAGCGTTAGGCAGTCGAAGTTGTGAAATGCCAACGGCAACTGGAAAATTCGCAGAAGAGGGTGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAAAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 28469200 5' + 412 7094 2 50.00 GATACTTCCTTCTGTTGGGCAGTCGGGAAAACTGCATGACAAATTCCAATTATGGAAGGCCCATTCTTTCGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCAGGGTCAGCATTCACAC:1 - chr2R 15889890 5' + 412 7241 2 52.59 ATATTGATAAGTTTTTTCATATATATTTTTTCAACTTTCAATGCAGGAGACGTAGCCATAACTTTACAAATTTAAAGACTAAATCCACGCAAACGACAATTTCAACTT:1 + chr3R 11937229 5' - flea 482 1 72.22 AACATGGTTGTAAATCAGTCGATTACTCCTTTTGTGGTACAAGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 10167450 5' - roo 327 2 71.92 ATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACCGTGTTGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACGTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr3L 23287312 5' - 1360 3320 1 63.01 AGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr3R 26504206 5' + HMS-Beagle 6842 2 53.24 TCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2R 23180262 5' - roo 8982 2 78.77 ATTCGCAACATTACCACGGCCATCGCGATCGCAGATCACTGTTTGATCGGTTCACCAAGCTCAGTTCATTGTGCGTACAAATAGTTTATTTTTTTAAATTTATCTGATGATCTTGCAACTCTTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr3R 24368962 5' - roo 411 1 79.45 TATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGT:1 - chr2L 23295915 5' + micropia 12 2 72.39 AAATCAAAAAGAAACGAGTGAGTTATAATGAACTTATAATAAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 5140562 5' + Rt1a 5074 2 67.27 ATAGAGCACCAGTGTCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:2 - chr3L 18403020 5' - P-element 2783 1 15.07 ATATGGAACGTTGTATTTTAGGAAACATAGAAACTAAGGTGTTTCTCAGCTGTAATATGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGA:1 - chr2L 4754954 5' - Stalker 7185 4 64.38 AACCATTTGGACCAAATACTGCTTGAGTGGCACAAAAACTTGGCGATACCACATTTGCTAAGCCGATAGACCAGTCGAATTAGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCA:1 + chr3R 29602793 5' - 1360 428 1 57.53 AATAGTGGCGCCACCAACTTAACTTTGTAGGCTCAAAGGTAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGGCCGCAGAAGCTGACG:1 - chrX 19980670 5' + X-element 4534 1 63.16 CCCTTGCAAAGAAGAAAAGAAGCAGAGACAAGTAGAATTCGCTTGCTTGCGTGAGCTTTAAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAA:1 + chr2R 19199634 5' + hopper 30 1 63.70 TGGTGGGGAGTTCGAGTTGGTTTATATGTTGGTTGGTTCATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGGGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGG:1 - chr3L 3834244 5' - G2 90 1 66.67 TAATACAGTGTCTTGTAACAGTATAAGAGAAATTCCTTTTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGC:1 + chr3L 26015718 5' + invader4 102 2 76.61 ATACACGCCCTACAGTTGAGCCCTGTAACCCTTGTACCTCGTACCTCATCCATCGCAAATAGATCGACAATCAGCGCGGGCTATTTATTCTATTTTATTATCTAATCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 17077048 5' - roo 397 1 77.40 CAATAACAAACAAAGAAAAGCGTGAAACCTTTCTAATTTGTGTTCCACGATTCCACAACGTTTCGCGGTGTCATTCACAGTTACTAGCAAACACACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 16690758 5' - P-element 2862 1 67.12 ATGGATGATCAGCCGTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGGGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr2L 4123807 5' + transib3 15 2 74.48 CTGGGACTGGGGTAATTTGCTTATTGGCACTCTCACAAAGCTTTAGACTAATTTGCCTAAACATATAAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:2 - chr2L 15913346 5' - transib2 2773 1 54.11 GCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chr3R 15882609 5' + jockey 95 1 75.34 ACACAATATGGTCTAGACTTCCACCAAATCGAATAAAAAGGTGCCAACGCAAAAACAGGTTTTATTTTGTATTTCAAAGGAAACTGTTTGTTTGAGCTTAAGAAACATACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAT:1 + chr2L 20821165 5' - Burdock 6384 2 62.76 AATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGCAC:3 - chrX 22689441 5' - 1360 3359 1 50.68 CAGACGCTTCGATCTATTTCGATTTTCAGAGAACTTATTTTTGTCACGCTCACAATGACAAATGGCCGACGCAGTATGACCGTTAGTTCGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3R 16341908 5' - P-element 2856 1 64.14 AAGGCTTAGCCCGGCAATTAGTTAGCCATTGGTATTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATAC:1 + chr3R 11186496 5' - BS 5075 1 70.83 GACAATAGCACACACATTTTTTGGGTGCACAAGCGATTTTTTTTAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 + chr2R 4362804 5' + F-element 88 1 68.49 GTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1 + chr2R 20010215 5' - Juan 4134 1 73.29 GGATGCGAAAGGAGTCAAGGGAAGACAGGTTTTTTTCCATGTTTTAATTATTTGTTGAATCTTTCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTAAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGGAGTGATTCGTGCT:1 - chr2R 322783 5' - Doc3-element 4625 1 80.14 AAATCGTAAGTACCTAAATATTTATAAAACTTAACTAAAAAATCTATTAAATGGAAATCTATAAAATTATCCAGCGATTTGGTGTAGAATTGAATATAAATAAATGTCACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATT:1 - chr2L 14358904 5' - diver 210 1 58.22 GAGAGCGAACAAATGAGTGGCGAAAAAAAAAAACTGGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAAC:1 - chr2R 21782176 5' + transib2 2487 1 75.34 AACATGGTTTTTTCGTTTAACTATTTCTGGTTGTATTTACTATAGGAAAATAGGTGCATTCGTGTGTGGTTTTGTATATGTATGTTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGAT:1 - chrX 3388060 5' - Porto1 233 1 70.43 AGCACAAATTTACAAAACCAAACTGTAAGTCTCACTTCTAACCCCCGAACCTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTT:1 + chr3L 24568064 5' - Juan 3859 1 65.07 GGGGCGTATGCAGAGCTACTCCTCCTCGGGCACACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGACAAGCCTATACTTGGGATGGGAT:1 + chr3L 1663257 5' - 297 6543 2 75.34 GAGGGGACAACGCTGCTTCGTAAGTGCCGCCCACAATATCAAAAAACAAACAACAAA:1 - chr3L 3764441 5' + gypsy11 3929 1 89.47 ATCGCCGTCCTCTTCCAACAAGTGCCAGCTGAAGTGTTTGCCAGTGTGTGTATGCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGTAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACC:1 + chr3R 17997672 5' - diver 5745 1 61.64 CAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAA:1 - chr3R 15790105 5' + flea 4750 1 56.85 ACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTC:1 - chr2L 23372629 5' - Gypsy6A_LTR 280 1 52.05 GGATCAAATTCCACTAAAATAACGTGAAGTAGCATTTTTGTGTTTCACTAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTC:1 + chr3L 22531940 5' - Cr1a 4205 1 65.75 TGAACAACCATGTTGGCTCTCCGCTTGTTTGTACTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAA:1 - chr2L 3510060 5' - Bica 4476 1 81.51 CATCACACCACCCAGAACCCATTGAGCATAAAGCACCATCGACATCCAAACGCCCGAGCATTTGGTGCATGTGTCCGCAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGAAACTCC:1 + chr2R 20152792 5' - R1A1-element 4995 1 58.22 ATAAAGGTGGCAATAACATCGTCTTTAACGCGTCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTGCCGCTATTTGTTACATTTTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAAT:1 + chr2L 22328977 5' - invader2 4743 1 55.48 GTATTGTTTCAGTTTCCTTATATCTTATAATCATTTTATCATTTATTAATGTCAATTTGTTGATCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACT:1 - chr3R 10970339 5' + G-element 62 1 58.22 AAATAAATGTAGAAAACCGAAAATAAAGCAGCAAGAAATGAAAGCGATGATACCTCAGCCTTACAAAATAGATTACATTTTACAGAAAAGATGTACAACAACACTCAAAATCCTTATGAGCCGATATCAAAAGTGGGATCTGTGCC:1 - chr2R 6132263 5' + micropia 475 1 67.81 GTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGGGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr2R 24427551 5' + jockey 4681 1 68.57 GTTGGGGGCGTGGTGCGTGCCTGGAATGCTCAAGTGTTGCCAAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGG:1 + chr2L 7839021 5' - Tirant 16 2 59.22 TAGCAAAAGCCACTCGCCAGTAAGCACTTCCTTCCAGTTGCCCTCATCAATGCGGGTAATTAATCCATCTCCATATTCGGCCCACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAA:1 - chr3L 11921804 5' + Quasimodo 88 2 56.16 AGGGTATTTTAACTATCTTACTGGGCTTGATGGGATTTTATTGATAAAAAAAAAGGAAGCTTAAAGTAGGAGATAATCTTTCCATGTGTTATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACT:1 - chr3R 24219401 5' - roo 401 1 75.20 ATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:1 - chr2L 17005821 5' + Stalker2 45 2 53.42 GGGTATGGACATGGCAATAAGTATCCTCGCTGTCTTCGCATCAAAAAGTGAACAGGGATTAAAATGATGAGAATGAGAGACGTTCTGAAAGGAAATGTGATCGATATTTAGTTATAACAATAATAATAATAATAATAATAAATTAA:1 - chrX 8515489 5' + invader3 5062 2 75.34 GTCATCGTGACAATGATGGTTGCCATAGTTGAGCATCACGCATTTTTATGAAATTCAAGCACTTCGATGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGTCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTT:1 + chr2R 10163284 5' + transib2 2711 1 53.85 CTTCGAGACAATTTGCCACTTTAATTGCCGCAATTTTTTGCCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:3 - chr2R 13766283 5' + roo 80 2 75.34 AATCAATAATACCCTAATTAATATGTATATATATAATATATAATAATATATATATATAATATATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3L 21969821 5' - opus 447 2 77.08 GCGGCAAGAGGAAAGGACGGTGGCAAGCCAAGTCGAGTGAATTTGACTTAAAAATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTATGTTACTGTTTTTATTTGGAATTATCTTCTGTT:1 + chr2R 13766207 5' - roo 352 2 51.85 ATGTGTTCTTAAAAATCTGCTCAAGTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:2 + chr2L 7580889 5' + Transpac 46 2 50.00 TTACATGATCCTCAGGCCGTTGTTATACCAAAAAAAATGTATATTTGAAGTGGCCAAACGTGATATTACACCTGCTGATTGTTCGTTAAATTGGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2R 6847875 5' + Doc 34 1 66.90 TATTGCTTGAATCGTTATATATGTGCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTG:1 - chr2R 4870255 5' + Juan 82 1 66.44 GAATAGAGCGAATTAATGCCGATGGTCTGGGTATTTAAGTTTGCCAGGGATTTAAGTTCGACAAGTAAGTGATATGCCATCACATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCG:1 + chrX 3559342 5' + Rt1a 4941 1 52.74 AAATATTATAGCATACTTTTTGGCGCCAGCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGG:1 + chr2R 19199693 5' + hopper 83 1 77.70 TTAAAATTCATTTCATTTATCTACCCATATCCGTCGGCCGGGCTGTCTGGCCCTCTCCATATGAACGTCGAGTTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTG:1 - chrX 21037329 5' + INE-1 159 1 53.92 AACGAAACCAAAGTAACAAGAAAGTAAATAAAGAAATTGTTGCAAAAAGTAACCAAACACACACACAACAAAAAAAAGGAACACGCATGGGGTGAAAAAAAATAGGAACGGAACGCACGCTCACATACATACACACACACACACAC:1 + chrX 2634860 5' + Quasimodo 33 2 60.96 ACAAACAACGTACTCGCTACCACTACTCGATATTATGAAATAAAGAGCACATTTGCATTTTTTCTCTTCATTTTAAAAAAATTATTTTCTCTTCTGATGCAATGTTATGAATTGGCGTTGGTAAAGAAAATAATTTTAAAAAAG:1 + chr2L 3656961 5' - 1360 3091 1 75.69 ACGAAGAGGAAATGTCACGTCACGTCGTGTTTTGCCGCACACCTCCAATTTCCGGTTCAGTGAGCCTATCCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAA:1 - chrX 20637681 5' + I-element 4911 1 74.00 AGTTCAGTTAGCTAACTTTAATACTTCACAAGAAACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAGCGATAAATTATCTTTAGGATTTTGTTT:1 - chr3R 14767377 5' + roo 85 2 73.29 AAGATCCCGTTTACTCCCAAAGTTTTTGCCACCGCTGTCAGTTTCTTTTTTTTACTTTAAATTGTAATAAAAAAAGGGGGAACGACGGTAAATAAAAATTTTAAAATTA:1 + chr2L 12974104 5' + 1360 3052 1 72.48 CTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 + chr3R 16630291 5' + FB 88 1 77.40 AAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 24427545 5' + jockey 4689 1 67.23 AACATTCTTGTGGTTTGGTAGCATGACGTGGATTTTAAATTCCTTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:1 + chr3L 15913865 5' + jockey 4819 1 67.97 TAGGGAAAGAAGTTTCTTTGTAAATATCCAAATTAATAGCTAAATGCGTTTTAAAATGGAGGGCTGAGTATATAGTTCGCGTCCTTTCACTGTTCACAACTGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 - chr2L 17005846 5' + Stalker2 7268 2 70.55 AGCAGCTTCAATGCGCAAGCGCGAAAGGGTTAAATAGGGAGAAGAAGGTTGGGCAAGCTCACGAAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGCAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCG:1 - chr2L 7506264 5' + Idefix 7038 2 54.79 AGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1 + chr3L 19274792 5' + transib2 64 1 61.64 ATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTT:1 - chr3L 25482974 5' - accord 464 2 69.66 GTGAACAAGAAACGATTCATGCTTAAAATGTAATTTTTTTTTATAATAATAATAAGAACTATAATGAACTATAATAATGATTAAGAACTCTAATTACCAACACGCGGAGCCCTTAATATGTATATATAAATATACATATATACATA:1 + chr2R 18858169 5' + Stalker 92 4 31.51 AGAAAGACTTATGTCGCCTAAGGAGTTTAATTTTAATGTCGTTTTGATTGAATGACTCCCACAGCTCTGGACTTGACATATTTTAGGTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAA:1 - chr2L 22369283 5' + rover 25 2 69.18 AATGCACTCAAACAAGTTCTACACCATATTCTACTGCAATAGATTTAAAAAAAAGTAACTTTTTTAATCACTGTATACTTCACATGGAATATTTTTAGAGATTAAAACATTTATTTCTTCATTTTTTTTATTAATTTTTATTTTTT:1 - chr2L 16548702 5' - Doc 4690 1 78.08 TTTATATTTAGTTTTAACTGCTTATTAAATTTCTAAAGTCACATTTTATTGATATATACATATATATGTGTCTGTATATCTCTAAAATTTCAATTTTGTTCTAGTTAGTGTTATTTTAAAAACATAACAAAAAAAATCAAAAAAAA:1 - chr3L 14213026 5' + gypsy7 5003 1 86.99 GGAGAAATATGTACATCCGATATGGGGTCTACTTCACATAGTATGGCGGTTCTGCTGAAGCGAAATTATGATCTGTATTTCTGTATTTCAAATGCTTGCTCAACATACTAAAATTTGTAAATATCATTATTATTACTATTATT:1 - chr2R 14091872 5' - mdg1 7084 2 54.55 TTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 20898638 5' - roo 361 2 53.47 GTTCACGATTCCGTAAGATTGCAGCTACTTTATTTTGCTTTTTCCTTTATTACTCACTTTTGATGATGCTCGTTGTATTATTTCATTGATGTTGCTGTTGCATGCATTGTCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTT:1 - chrX 8407560 5' - Doc4-element 2589 1 59.31 ATCAATTGAGGAACATACAATTAATACAACTTATGTCAACATAACAGTATACTACAATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2R 11804617 5' - pogo 2048 1 58.22 GGGTATATTGGGAAAATGCGAGCAGCTTGAGGTCTTTTGTTTCGATACCCAATCACACCTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGG:1 + chr2L 15550664 5' + Bari1 59 1 57.86 CTCGACTTTGGGTAAACCGAACTGGACTCGTGGCTGTATTGGTCATTGATAGGTAAGTTTTTAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAATATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTTCTTTGCTTTT:1 + chr3R 14505224 5' - F-element 4675 1 73.97 ATGAAGATTTAGGGGCCAAAAGCATTTAGAGCAGAGCGGAAGAAAAGTGCGTGAATTGATGGAAAAAATGTCGAGAACTTGAATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAAG:1 - chr3L 21097315 5' - 1360 3169 1 57.53 CTTTGACCATGAACACATCAAATAAATGTAAAAAAAATTTTAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTTTTTGATTGGTAGCGTTGTAAAATCTCAATATTTGTTGCTGGCTGTACCCCAGAGCTGTATGCCAAAAGTCCACACGGG:1 - chrX 8963008 5' - G4 3423 1 69.86 ACTTGCGAGCATTGAAATTGCCCTTTGTTTGACTGCAAGATGAGTTGGGAGTCGAATAAAAAGCCCGCAAACTGCATTATCTAATTAAAACCGAGGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTA:1 + chr2R 12497848 5' - mdg1 7202 2 70.49 GTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGTAGGCATCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 15790860 5' + roo 8742 2 71.92 CTTCAAAACAAATGAGAGTAGATATGCAATTAACCAGTTTTTATTGCTTTTTAAGTTAACTAATCCATAAAAATAAACACCTTTAATCAGCGTTAACTTAAATAATCGTTTCACTTCGTGCTTACATATTAACTCTACTCTACATA:1 + chr2R 14145226 5' - Stalker3T 54 1 78.08 AACTAGCGAAGCGGAACTAGAAACTATCTACCAATTAAGGAATAATTAGTGCTGCGGTAGTATTCGCATGGATACTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGGAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2R 11159366 5' - roo 9026 1 53.42 AATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCC:1 - chr2L 4034963 5' - HeT-A 6014 1 62.33 CACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGG:1 + chr3R 24729568 5' - Juan 4160 1 56.85 GATGATGCGCTTAGGTGGACGCCGCTCAGCGGAAGAGTAAATTAAAAAAATAAAAATAA:1 + chrX 7271315 5' + HB 319 2 83.05 CTGACCTAACTTACCCCCAGCCCAATTTCCGACATTTATCCGACCTCAATTTCTTCAATATTCCGACGCATCCCCAGAGGATCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 23180313 5' - roo 9033 1 56.85 GCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATCCGTTTGATGGACCTCGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 23398238 5' + 1360 10 2 78.77 GAAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAACAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTC:2 + chrX 22901584 5' + 297 6735 2 67.81 CAGCGGAAATTGTCCCCGTCTAGTTGGAAAATGCAGTTGGCCAGTGGGGGTTGAGAAACTGAGAAAAAAAAAGTGTTTAATATTCGGGAAAAAGTTATGCAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATA:1 + chr3R 22893414 5' - Stalker2 7407 6 65.75 AAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACAC:1 + chrX 14317415 5' + 1360 31 1 71.60 GTTCGTTACAAGACCACTTCGGTCATAAATCGCGGCTTCTCCTTTGTTTTAATCTGATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTC:1 - chr2R 3564139 5' - Tabor 7259 2 60.96 ATTGGAGAGCAGCGAGCTATTTTGATCGTTCTCATCCGGTGTCCTGGCCTGGTTAATCTAATTTAAGGCTATAGTAGATTGTTCAAGATATATTTTTATGTATAACTAGGTACTAATTAACATCAATATTATTATTATTAATATTA:1 + chr3L 2526766 5' - mdg1 7071 4 60.27 GAAATATATTCATGCTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGGGAAAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chrX 17343430 5' + I-element 30 1 77.14 GATACACTTACAGCGTAGGTAAAGTACAATATATATTCGATATATAGCCAATTGGTGTATTTTTCCAGGGAGATTTTGGTTTTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGTGGAATCGTGTTTGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCAC:1 - chr2R 11674721 5' - Gypsy12A_LTR 1951 1 58.90 GTTATGCGACTCCGATAACGACGATGTAGAGTATTTCGAGGAAATGAGCGTGGACATACGACATAGGACCGATCTATGAGGGTAATCCCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chr2L 4123821 5' + transib2 31 1 63.01 AAACACAAATTTTTGGGACATTTTCGAACGATGGGACGCACTGTTATGCACGTGTATATGTTTATTAATTAGATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAAT:1 + chrX 20692988 5' + F-element 164 1 50.68 GTAAGCTATTTTTAGTCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGTAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:2 + chr2R 4854950 5' + 17.6 35 2 60.27 GGGTAGAGCATGTGTTTGAATGCCACATAGCAAATGTGGCCAACACAGTGGTAGGGAATAGGTTAACGAACTACCTTTTGAGAGCAGACATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 11191522 5' + roo 28 2 66.20 AGATAACTGAAAGGGTCATATGCCCCACAACCGGTTGGTGTAATTTTTCAATTAAAAGTGCCATTTTTGTTGCATTTTCCCATCGTAGGAATATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGA:1 - chr3R 8643572 5' - F-element 276 1 62.33 ACCTTTACTTACCTTTAGAAATGTTTAAGTTGATTTAAAACAGCATGAAATGCAGATTGTTGTTTATTTTGTGACACGGTTGCGAGCAAACTACTTAAGTCTTAGAGAGATATTTTGCTTTTAGGGTATCTGATAGTCGAGAAACT:1 + chr2L 4041650 5' + INE-1 557 1 77.40 ATATAAAAATTGGTTGCTCATTTGCTGCTCTTGGTCAGTTTTTCACCCGCTTTTCCCGCTTTTCCACTCGAACCGCTGGTAATTTGCAGCGGCCAATCTTTGCCGCTCCCTTCCCGCCTACATTTACCTAAGATATGAACGGAGCC:1 - chr2R 13317852 5' - roo 8709 2 73.97 GACCTCAGCTTCTTGCAATTAAGCTTATCATACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 9002983 5' + roo 58 2 77.19 AATTGCTGTTAAGGGTGTTCTAGGTTGGTTAAGTGACTTGCAAATATATTTCCTTAAAAAGGATATATAAATAAAGTAAAAGAATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTT:2 - chr2R 23780634 5' + Ivk 40 1 56.85 TGACAGAAGGCAAACACAAGAACTAACTGCTCTTGCAGACATTAGTTACTGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAACTGGAATCGT:1 + chr3L 22890365 5' + FB 38 1 50.89 TATAGAATTATATGTTAACGGTTACTTACCCTTTGATGTTGATATTCAAATAAAATTAAAAAGATGACCAAATAAATATAAACTGCTTAAAAGTAGTCGAAATTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:2 - chrX 12129453 5' - flea 240 2 74.66 TTAACGTTCTGCTGTTCGCTCTGCAATTAAGTTGCTCATTATCATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATACATGTTGTGCTAGAAGCCGATTTTCGGTCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACG:1 + chr2L 22339942 5' - 1360 3169 1 67.81 ATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:2 - chrX 12986651 5' + roo 42 2 57.53 TGACTTTATAATATTTGTTCTATATTCCGTTAATAGTTGATAAACTATAAGATAGGCTATAAAAATAGTCAATACTGTTGGCTTCAACGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 12986661 5' + roo 8696 2 64.38 GAAATAAAAAAAAAGTGCCAGAGCCAAGAAATGCGAACCCATTCATCACCCGATTGTTGGGGGCTAGTAATTTGTAACCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 21216837 5' + roo 42 2 58.22 ACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr2R 2427623 5' + Doc 56 1 58.04 ATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:3 + chr2R 24427539 5' + jockey 4710 1 58.90 CTTAATGCGCCTCGTCCCCTGAGTGTCTCGTTTAACTTCATCCCTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 11062813 5' - roo 8991 2 70.55 CACCGTAAGCGATTCTTATATGAATATTCTTTAAGACTGACATTACTATATCTATGTACATACATATGTATGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr3L 15103923 5' + Transpac 44 2 54.11 GACTACTGTAGCTTAGTGAATTATACTTTCTGTATTTATTGCTGAGATAACTTTTTTGGCCGTGGGCGCTTGTGTTTAAACTGAATTCTTGTTTATTTGGTGTTTGCTTTGGCTAGATAGGTGACATGATAATCGCATCTTAGAGT:1 + chrX 8263727 5' - roo 319 2 76.03 AGTCCCGATACAGTTCAAGAGGTCAACAATCAGAAGCCACTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:1 + chr3R 12242272 5' + transib2 78 1 73.29 GGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrY 311345 5' + 1360 55 1 62.33 AATAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGA:1 - chr2R 4206663 5' + 1360 315 1 76.03 ATATATCCATTAGAATTTGTTAGAATTTCAGTAAGTAAGTATTTACAATTTACAGTGTAAGTATTTACAGTTAAATATTTTTTATCATATATGCAGACATATCTTTTTATTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:2 + chr2L 16539604 5' - Juan 4201 1 73.97 AGTTTCATTGTCTGCTGTACAACACTGGGTTAATTGTTACTTTTATTAAAAATGTGACGTAGCTTCTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 - chr3L 13365844 5' - BS 5042 1 54.79 TGAAATTTCTACGTAGAACGAGTGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr3R 26504192 5' + HMS-Beagle 39 2 58.90 GAGGGGAAATTACTTTTCCTAACTGGCCAGGCTAATTGTTCCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 12249885 5' - roo 8993 2 71.92 AATCCAGCTAGACTGATTGACATACATCATTCATAATCTTTTCTGCATTTGTAATGGCACACTGAACTTACATGAATTTCATTTCTGGGTAACTGCTTAAACTACCGATGCGTGCACTTGTTGATTTGTTGTTTTTTATTTTCTTT:1 + chr2R 15040806 5' - gypsy7 5013 1 76.71 AGAAATCCGATCTGTCCACCTTATTGTGGGGCAAAAGAAACTGGGATTTCTGTGGTCAGTGGATGCGAGCAAACGGAAATGAACAGTGCAACATCAGGAAAGAAAGGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAC:1 + chrX 6883119 5' - INE-1 568 1 50.00 GATTCTGAAACTGAAAACTCGAAAGTTTTCAAATCGGCCATCCCATCGGTCATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAAT:1 + chrX 13037509 5' + Porto1 4303 1 64.83 ATAATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:2 + chr3R 4575719 5' + jockey 59 1 52.74 GGTCACATCACTGCGTCCCGTGGTGGTAATGGTCACCATCTCGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGAGGGGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGA:1 - chr3R 22482878 5' - hopper 1030 1 68.49 TATGGAGCGGTAGGAACCAGGCACTGGCCAACAAAACACAAAGTTCGATTTCGCATGTAACTCTTATTGTTGTTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCT:1 - chr3L 7347844 5' + accord 7137 2 55.71 CAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAAT:2 + chr3R 9557526 5' + G6 1999 2 59.59 AGACCTGCACAGATCGATGATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAGAAACAAAAAAAAAAATTCTATGGAAGTTATGTGTGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGC:1 + chr3L 23354536 5' + gypsy2 50 2 70.00 TTTATGAACAAATGTCTGTGAAGGTCTTTATTATTTATGTCATTTGCAACTATTTATTTTGAACCAACATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:2 - chr3L 16470373 5' + jockey 4726 1 54.11 TCCCATCGTCATCGTCATCGTCATCGTCGTCATCATTTCAGCCGGTCTGCTCAGCCTGTTTTTAATGGCCAACATTTAAGCCGGCTCCGAACAGCAACAAGGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 2930393 5' + roo 8672 2 72.06 CATCAATGGAATCTAGTGCCAATCGGGAATCCCTTACGTACAATGTTTATTCGTTTATTTTCACAAACTGGACACCTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 + chr3R 30059375 5' + FB 44 1 55.48 GATTCCTACAATCCTCATTCTTATTTGTTACCAGCATATACGTAAATTTGTAAACAATGTAACCTCTTTTTACCTCTCAAATATACATTTGCTCATCACTATCAGCTTGTAAACAACTATTAAACTTTTTTTTAAAAAAAAACAAA:1 - chr3L 9094499 5' + transib2 2632 1 69.18 CAAATCNCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTGTGTCCCATGGCAGTTTTCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2L 809647 5' + jockey 58 1 50.68 CAAGAATCTACAAATGAAAACTTCTTGTTTTGACTAGCCATTCCCGTATCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGCTTAATAATAGAACAGTTGGAAAAATAATA:1 + chrX 8107518 5' + F-element 4575 1 71.77 TAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 23639169 5' + pogo 51 1 71.30 GGGTGGAGAAGAAAAGGCGGGCTAGATGGAAACAATGAAGGCGCGAAGTAAATACGAACATAAAAAAAATAAAAATAAAAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chr3R 27765167 5' + mdg1 48 2 50.00 AACCAAGATTAACGCAAACATCAACTCGGAAGAATTTTTTTATCCGAATCTTCTCCAATTCTTTCGTAAAGATAGAGGCTACAGAGGAAAAGGCTTTTCAAAAGTTTTTTTTTTCGCACGGGGCCCACGGCCACACCTCCCGCCCA:1 - chr3R 2158079 5' - Cr1a 4431 1 60.96 AACAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAT:1 - chr3L 25008184 5' + X-element 55 1 44.76 CGTTATGCGACTTAATTGTTAGCTGTAAAGATTTACCATCACAAACGTTCCTTTTTTTGTTCGTTGGCTTGGGTAAGGATACATTTGTAAGAGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 + chr2L 16943765 5' + copia 4898 2 66.44 CACACATCTAGTCACTGCTTATATGATAAGTCATAAACAGACAAACCGGCAATCATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCC:2 - chr3R 29084810 5' + 412 191 2 63.01 CTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGT:1 - chr3R 3179374 5' - S-element 1262 1 64.38 AGGAAAAAGACGTCTAAAAAAACTAAAAGACGCAACTTGCACAAAAATGAAGAAAAAAGTGGTAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTC:1 + chr3R 9298803 5' - hopper2 1305 1 56.85 TTTAATTAATTTCACATGGATACGAAAGCGAATTTAATATGTTCAAAAAATATAGGAATTTTACGCGTATCAATGTATTAATTTTCAACAACCGATAATTAAATTTCGTTACCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 11191340 5' - roo 400 1 77.40 CATTTATTTTAGCTATAAAAATACATTTATTGAAGGAATTGATATATGCCAATTAAATGGTGTATTTTTAATTTCTATCAATAAAAACATAATTGACATTGTTTGGGAACGAGATACCCTG:1 + chrX 23205139 5' + 3S18 5766 2 77.69 GATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAA:2 - chr3R 21276659 5' - BS 5068 1 58.22 TGGTGTTGTTTTGATTACCGACCGTAATCGTTTCGTTTGAGAATTGCACCACAAAGAAACCGACGAGATGATGTTTCTTTGTGTCAAAGGTCACCGATCCGTTAAAATTAGATAGGATAACTTAATAATAATAATAATAATAATA:1 + chrX 21933350 5' + mdg1 37 10 72.41 CTATCATTCTTGGCTGTCCACGAAATTTTGCCTAGCACTTCATTATGTTTCGATGGCTGTTAAACAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAG:1 + chrX 11468056 5' + BS 4665 1 67.12 GTGTATGATTTCAAGAATTTGCATGGACGCTTTGCCGGTTCCGTTTCATCTTGGTCCACACACATTGCCTGCATAAATAGTCAGTGACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:2 - chrX 661985 5' + 412 34 2 62.33 AATTAAATACAAGATGATTACAAGAGAGAACGTTGTAGACAAGTTCCTCGACTGTCAGCTACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr3R 4630991 5' - INE-1 544 1 67.11 AAATATTCAATTGCTCTTCAAGGAGTCGAGTTTAGCAGTTGGAGCGACTCCTCAACACCAATCATTTATGCCGGATTATATTCTTTTACTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAT:1 + chr2R 23780492 5' - Ivk 5350 1 63.70 AAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTT:1 + chr2R 12185328 5' - accord 7244 2 64.08 ACAATTATTGATTGGGGCCAAAATCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3L 2544648 5' + Tirant 39 2 71.11 CGCCACTTCCTCATCCTGACCCCCATCCTGCTGCGTTTCCTTGGCAACTTCCTTCCCTGCGACATCCGCCACCCGAAACGCAGGGATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAACGTCTTAATTTTTATGTCA:1 + chr3L 6446994 5' + transib2 32 1 63.01 ACAATTTCTATGAAAGGTGATACTAATTATACTTGCAAGACCTTAACTATACTACTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTG:1 + chr2R 7244820 5' + diver 5957 2 64.38 TTGCTGAGTAATGAAAATACTCTCTAAAATCAAATATGAAAAGAATTAATATCTTTGTCTATTTTCTTTACAAGAAAAGAATATAAGTCTTAAAGTCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 7666600 5' + I-element 28 1 65.07 ACTAGTCGGTTGGAATTAGAGAAACATTTGGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 7719792 5' + roo 74 2 80.00 CGAACGAACCGAACGTAAGCAACTCTTGAATGCTTATGAGAGTCTTGCGGCCCGAGAGCCCGCTTATAAGGGTGGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3L 3983915 5' - P-element 2844 1 56.85 CCTTTTAATTTGCATACGTATGAGTGTATATGTATATATATTCCCGCTGATTTTTATTTATTTTTCAGTTGTTTTTTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTA:1 + chr3L 10326569 5' - 1360 3156 1 56.16 TATTCTTATTTTACATGAGAAACTTTGTTTTTTGTTGATAATATTT:1 - chr3L 47137 5' - FB 334 1 73.91 TGGCATATTTACGCAGCATTTTTGTATGCTTAAAAACAGGGAAAACCCATAGTCGGGAAGTGGTAGTGGGCAGTGGGTGTGCTTGGGTTTGAGAGTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 11469441 5' - Tabor 7304 2 70.71 TGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 + chr3R 17673772 5' + FB 88 1 78.77 CCTTGGCTTTTGACATTTTGGTGACATACGGGACTGCCACCTAAAAAGACACACATGTAGATGCACAGACAAGGCCAACATATTAGGAACATAGGCTGTTTTTTTTTAAATTTAAATATAAGTATATAAGTATATATAATAATATG:1 + chr2L 5459868 5' + Dm88 23 2 69.18 AGCAAATGAAAATGAAATTTCTACGTAGAACGAGAGCATTGAACTTGGCTGAAAAAAGTTCAGTTTGTTTAGCATCAATTTCTGTGTTTGTTTGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTA:1 + chr3R 26504180 5' + HMS-Beagle 6 2 76.80 AATTCCTAATTCAGGGCCACGTTGAAAGTAATTTAGAAGCCAACTGCTTTTTTGTACGCAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - 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roo 8986 2 79.45 AATTGGCCCGTCCAAAACAGCCACAAGGTTTTGGCTGCCAAAAAACTCGAGAGCCGTTTTGGCCCCCGCTCGAAATGTATATATAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3R 10931760 5' - 297 379 2 70.77 ATTAATTTTCCATTTTTATGAGTTAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGGTGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:2 - chr3L 2921848 5' + Burdock 56 2 55.48 AAGGCGGCGGGTGTTAAGAAAAAAAGCCTACGAATTTGTGCTTTTTTTGGGGCTGCGCTTGAATATAGCGGAAAAAAAAACAAAGGAAAACGAA:1 + chr2L 16618658 5' + Doc2-element 231 1 65.96 CAGAAGCTGGAACTGAAACAGGAGGGCTAGCATCCGCCTTGCGGTATGCAATAAAAAGCAAATGTAACGCAAAATGTTATTACGCATACGCCATGTGTGCCGCTGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 29611963 5' + jockey 18 1 76.60 CAATAAAAATGGCCGCTCCGCAAATGAGAAATTCTTGTGGGTGTGCGTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr3L 22325818 5' - hobo 2931 1 60.76 TTTTAATTTTTATTAATTATTATTTATTATTTATTTTTTATATATATATATATATATATATTTATTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTCTCTTAATTAACTTTC:1 - chr3R 21440850 5' - Doc 4619 1 58.33 GTGACAACGAAATACTTTATTTCTTTTTAAAACTTTAAACAATGAAGGCGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAAT:1 + chr2L 4003700 5' + mdg1 7113 2 68.49 AAGCTTCCGCTCGATCGTCATCATTCTCAACCAAAAATTGCAAACTGTTGTCATCCTGAATGGCCCTTTTTGGCTCCCCTGTCAGTCACAAACTTAACATTATTTGTCCAAGTTACGGGGTTTGTACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 + chr2R 1577535 5' + GATE 30 2 50.00 ATTAAACAATATGTTTGTAAGTCGATATTTCACATTATAATTCATAAAAGTTGAAAAGGAAACAACGAGCCACACTGAAAAAAGAGGAGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - 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Doc2-element 231 1 47.58 ATAATAATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGC:1 + chr3R 4575716 5' + jockey 34 1 45.60 GTTTAAATTAAATTAAAGTACATTTTTATGATAATGCAATAGATTATATAAAGGTAATAAATTCCAGATATTCCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 18046588 5' + roo 47 2 52.05 ATATGTTTACCATTAATAATAATCAAATCTCATAGGGCATCTTAATATTCATATGCCTGATTTCTACAACTTTTTTACATTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr2L 14874146 5' - copia 247 1 43.84 CGTGCTGGACTGAGTATTTCTGGAAGCCTGCATTCATATAAAACCGTAACACAACATTTTTCACAACATTACGGCTATGTATCCGCCTAGTGGCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAAT:1 - chr3L 276863 5' - transib2 2388 1 63.70 AAACCAAAAAAGAAAATTATTCTTTACCCAAAACGGTTACACAATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCA:1 + chr2L 15982317 5' + pogo 204 1 70.55 TCGATTTCCATGCTGTAATTTATACAGTATACAGTACTATATATATTCTGGATCCGGATCAATAGATTCGATCTGGATATGTCCGTCTGTCCATATGAACGACGAGATCTCAGGAACTATAAAAGTTAGAAGGTTGAGATTCAGCA:1 + chrX 10449225 5' + INE-1 169 1 77.40 CAGCGGAAATTGTCCCCGTCTAGTTGGAAAATGCAGTTGGCCAGTGGGGGTTGAGAAACTGAGAAAAAAAAAGGGTTTAATATTCGGGAAAAAGTTATGCAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTC:1 + chr3R 22893414 5' - Stalker4 189 4 74.02 TCTTAGCCTTATAAACTAATTTAGTTGACAAGAAAATGAACCTTGAATAAGTGGAAATGCCCTGGCTGGGTAGTTTCCTTGGGTCCGTACTTGCTTCCCGGGTTAAAGGTTCTTTGGAAAGTATGTCACAGGCAGAAGGAAACG:1 - chrX 20846278 5' + INE-1 30 1 75.69 TGCAAGCATTCGATTATATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTC:1 - chr3R 23067488 5' - roo 8676 2 67.81 AGGGTTTCTAATTGAAAGCAGAATGCACGTGTTGCTCTTGAGGCTGTCGACCATTTGAGCTATTTGGGTAAATAAGCCTAGTGTCTGGCTAAAGGCTATAAACCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr2L 9636218 5' + 412 7072 2 63.01 GTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCA:1 + chr3R 17673771 5' + FB 87 1 78.08 AAAGTCTGCAGCCGAAATTGAAACCCATATTGAGAGCGGTTCAATGGGGCGTATGCGTGATGTGGGCCTCCGGCGCTTACGCATTCAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 21216689 5' - roo 9047 1 65.22 CTTCAAGGAGTCGAGTTTAGCAGTTGGAGCGACTCCTCAACACCAATCATTTATGCCGGATTATATTCTTTTACTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTA:1 + chr2R 23780507 5' - 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chrX 21587771 5' + INE-1 134 1 53.10 GTTGTAAGGTTTAACCAGCGTTTTGTTCAATGGCCAGGGGAACTTTTCATGACTCGGTGATTGTGCTCAATAATTTATAAATAATAATTTATTGCCCTTTACGAATTAATTTAACCAAACCCAC:1 + chrX 8508145 5' - HB 279 1 67.74 TCTCTCGCTCTCACTATCTCGGTCTTTCGCTCTCCCACACATCATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCGGTTATTTTAACAGCTCGCTTT:1 - chrX 7938685 5' + Cr1a 363 1 83.70 AGGGAAGTGGCCACCGAAATAATAAATTACATTGAACGCAATTTTATTGCATACTTGCAGGGGCACTGCAAGATTTCCCCATTGTGTATACAGTTGTGTACCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3R 15882542 5' + jockey 10 1 75.97 ATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTGCATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTAA:1 + chr3L 24757198 5' - Cr1a 4256 1 52.05 AAATATTTTATGGCCCCAGCCGAATGGCAACCGAAAAATGTTTTTGGCTTTAAAACGAGCAGGGCCACATTCACATCTTTTCCCATTGTTGCTGTAGTATGGGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chrX 959122 5' + 412 7086 2 63.01 ATGGGTTTCTTTGTGTAGCTTCTCACTGTTGCTTTTTAGCTGAGTAAAATCAACTGAAGCCTTGTTCAAGCTCTCTTTTAACTCTTGAACAACAATCTCGCAGGCATCGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 15790797 5' + roo 8677 2 66.67 ATAGTAGTTTAAACTGACGGGTGAATTAATTGTATCTTAGGGATTACTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 + chr3L 3501725 5' + Bari1 57 1 63.85 AATAATTTCGAATTGGCAGACAAACTAATTAAAAATTAAAAATGAATCGACTGTGGGTTACTTAATTAACAGTTTGATTGATTGAACTTATTGTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chr2R 20010163 5' - Juan 4186 1 63.70 AGAAATTGTACAATTGGACCCAAGTTATGGTTTTTAGTTAGACTGATTTTACATATAAGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATA:1 - chr2R 7244911 5' - diver 178 2 54.62 CATAAGTCTGGTGAGAACTGCCAAAGAGACAACACGCAGGCGACTTGCTGTGCTAATTAATTGGACGCTCGGCTTCACCGACATATATATATTATATTATATCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAG:1 + chr2R 4188945 5' - S-element 1699 1 69.86 CAGCACGGTGCACTGCACGAAAAGGTTGAGTAGCTACTGGCTAAGCCCAAGTCCATTAATCCGCCTCAGAGGGCCAAATAGTTCAGTTAGTTCTATTAGCTATAGCTTTTTCATTAATATTATTATTATTATAA:1 - chr3R 13671930 5' - mdg1 7074 2 64.18 GTTTTTGATGTCTACTTTTGCAGTCTACCTCTTATTATATTAATACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 + chr3L 24131407 5' + Transpac 4992 2 71.92 AAAATAAGCTTTCTAAAGTAGCAAGAATCATTAGCAGTACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 18488387 5' + roo 82 2 75.34 GTTGGGTAGAACATGTGCATAACTGTGTTCGGGATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr3L 18402988 5' + P-element 84 1 28.08 AGAAAAATGTTAATTAAAACAGAGAGTTGTAATATTAAAAAAAAATTAAAGACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 12175573 5' + Doc 4699 1 90.62 ATTAACATTAAAAACTTGCACAGCGAAATGTGTAAAGCAAATTGTAACATTTTCTTTTTATTTACATTTCAAGCTCTTGCAGAGTCCATTTGTCGAGCATAAATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAG:1 - chrX 2479628 5' + mdg3 20 2 72.60 AGATGTCATTTAATTTTCTGGTCACGCCGTTCAACAGAAATGATCTTGGGGAATGTGATTTGAATTTTGCCGCTTCTGGTCTGAGGTAAGCCCTTTATTTATTATTTTGTATTCATATTTGCAAAAAAGAAAATAAAAAAGGTAAA:1 + chr2L 14431833 5' + Doc2-element 246 1 63.70 ATATTATATTATATTAAATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTACATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2L 15950935 5' - roo 9039 1 61.64 TAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATACCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCA:1 + chr3R 22642283 5' + blood 7073 2 57.53 TGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACA:1 + chrX 20999486 5' - BS 5052 1 54.79 TTTCTACTCATTTTTTTTTGTTTTGTTTGGGTTGAGTTCTAAGCCAGTGGAGCCAAAGAAACTTTCCCAGAAAGCTTAGTAATTCGGGGACAAAAGTAGGGGAATTCCCTTCGAGTAAAACAATAATATTAAATAAAAAAGTCTGA:1 + chr3R 30080834 5' + gypsy6 498 1 65.07 AACAAAACGAAAGTATATTTTCGATGTTTTCTGAATATGTCGGATATTCTCGCAGAAACACAAGCCGCGAACAACGCACATAAGGGAGAATAAACAAAACACAAATATATTGTGTATATGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAA:1 - chr3R 10161276 5' - Cr1a 148 1 54.79 GGCCATTTTTGGCTTGTAAATCGCAACAGACATACAACACCTAAGGAGCTATCGTGAATTATGACACAAAGCATGTAACAAACTCTGAGCGGCTTGAAAACAACAACGGAAAAAAGAAAAAAAAATGCTCAGAATAATCACAAA:1 + chr3L 24264732 5' + Porto1 4342 1 77.78 GCTAGTAAAAAGAATTAAGTTCTACTAAACTAAATTCTTTATATTTCATTTCATGATTAATAATAGATATACTTATGTATTTTCTTGGACGAAGCGTTGGAAAATAAAAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 20898676 5' - roo 398 1 78.77 TGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 21575930 5' + Doc 50 1 42.86 AGCATTTTAAGCATTGTTGTTTTCGTTGTCACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr3L 14720881 5' + F-element 61 1 68.27 ATCTTGGGTCTGCAACCATGCACAAAGCATTGCACTCGGTGCTTCTGATGCATTACGAAATCGTATTGCATTTTTTGTATTACGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAA:1 - chr2L 7618577 5' + X-element 4476 1 50.00 AACTTCGCTGGTCAGAGAATAGCTGAGTAAACACTGGAAAGCGATTAACTGCAGTCCGCTTGGCACAATAATTTCCACTTACCCACTTTTCTTGTTGACTTCAACCTAACTCCCTTTTTAGAAAATATTGACAATTTCG:1 - chr3R 31882363 5' - HB 254 1 78.42 AAAGCAAGAGGAAAACGTCAAGAGAAAATGGTGCTGAAAGGAAAATCTACACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGC:1 - chr2L 9209837 5' - R1A1-element 5211 1 61.72 TGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTAT:1 + chr3R 9557518 5' + G2 3015 1 51.54 AAATAGCAATGGCCTCGAAAAATGTTCAAAAAGCTTTTTTGGTGGATAATTTTCAGACCTCGAGTCCTTGTCAGGCTGAAATGGTCCTCTTGCCGCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:3 - chr3R 19992771 5' - hopper 1391 1 69.86 AGTAAGGGAGCCAGCCAAGAGATAGCAATGCACTGGGAGAAAATCTTCGAATTGGTAATTAATTGGTTTATTTATGGTATCTTTGTCAAGAAAATAGAATAGACCTTAGTTGGTTTATTTTGCGGCTCAATATCAACTAGAACTTC:1 + chr2L 4180057 5' - Bari2 163 1 63.01 ACTTTCTTGTCGCGCACTGTACATAATTATGCGAAGATAACTGTATAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chrX 9530313 5' - 297 330 2 64.38 TTTAATTCCTGTTAGCCAGAGCCCACTGTATCACCAAAACACCACCCCGGGAGAACCTTGCCAAAAATTAATTACACAAAGTAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr2R 10078117 5' + jockey 66 1 59.59 ATGCAGGCAATTCATAAAGCTGACAACATGGCGTATGATTAATATCGCTGCCTGTTCCCTGAATTGCTATTATGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr3R 22642269 5' + blood 48 2 51.37 AAAGTTATATCAATGAGTTGACTGAAACAAAATTGAAGCACTCCCAGGAAATAAAAGATCAAGCAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 15791011 5' - roo 9030 1 54.20 ACTCGCGTAAATATAAAGATTCAATATCAGCACGGCAGACAGCCAGCCTATGTATATACAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 27133576 5' + opus 148 4 55.28 GTAACAACTATTTTTTGAAAACATTATGATCTAGTCTAGTTTAGTATGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATT:1 + chr2L 7580913 5' + Transpac 4989 2 66.44 TATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAG:1 + chrX 12657099 5' + blood 64 2 64.23 GGGTTTTTAGAAAATTTAATTTCTTTAAGACCACTTTTTAAGAGCCCCCATTAGGGCTGACAATAAAAGGGCGCGAATTTGTGGGTTAATTTTATTTGAGTTTGGAATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 12251039 5' + 412 7068 2 71.23 AAATAATAATGGGGATTTTTGCCGGCCGGTCACTGGTGTGTGCATTATGGTTTTAAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:2 + chr3R 31653068 5' + roo 64 2 62.33 GACTAATACAAGAAGTCTCAATACACCCTATAAATCCATGTGCACTAGAGCTGGTTAGCAACAGCGAAGAAGGCTGGCTACTTTTAATTAATTTACCATCCCTAGCTAACGATGCTTTGAACAGTGTTTATTTGTAATCTTATTCG:1 - chr3L 23317850 5' + Cr1a 4041 1 52.74 AAATGATATGGATAATCCAAGGGATTATCGGATTATTAGCGGAGGGACAGGATTTGGTAACTTTATGATTCTATAAAATTGCTGTCAACCCTTTATCTATGACTGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:2 - chr3L 8959739 5' + 1360 14 1 73.97 ACAGATTTTCAAGCTTCTTTATTTGAGGCCCTCACCACATCAAACTCTATTTATCCTAAGGTTATCTAATCCGGATTCCTG:1 + chr3R 12367537 5' + GATE 8096 1 49.38 GTGTCTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCGCACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGG:1 + chr3L 28063316 5' - Stalker 6970 4 76.71 AATGAGTTTAACACTTGGCTTAATAGTTTGGTTTTATGAAAAGCGAAAAAAAACAAGAAAACCCAGCGGGGAAAAAGGCAAGAGGAGCAAAAAGAACACGACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr2L 16946174 5' - hopper 1397 1 71.92 TCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGACCACATCAAAAAG:1 + chr3L 9907417 3' - BS 4997 1 76.55 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATGTTAATGAATTTCAATATGGCG:1 - chr3R 20140484 3' - jockey 4716 1 58.54 TGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAACACCCAATACGGTGTTCGGGAATTAGTTTCTACCATTATGGACGAACGTAGAACGTGA:2 + chr2R 3128895 3' - I-element 5098 1 59.59 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTAGGTTTATTGTGCGCACCGAGAAATTGCGTTTACGTGGAAAATAACACAAAAAC:1 - chr2L 11620041 3' - roo 2 2 65.07 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAA:1 + chr3L 20711710 3' - jockey 4809 1 50.68 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATA:1 - chrX 19074723 3' - mdg1 7057 2 68.49 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACGCGAATTAAATT:1 - chr3L 5532892 3' + roo 9047 1 67.12 ATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACA:2 - chr3R 15724325 3' + Juan 4131 1 73.97 AAATGCAGCGCCGAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCTTCGGCTTACAACCAGGGAAGTTGCCGGTGTTGTTCTTTCATTTGTTTTTGGCTTTTTGCAG:1 + chr3R 18459561 3' - diver2 173 2 61.19 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAG:1 + chr2L 13556463 3' - transib2 39 1 53.10 AGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGGAGATAAATTGGAAGAGTGCCAAAGGAATGATGAGCGACGTAAACTTTCTAAAGAGCT:1 + chr3R 28510909 3' + invader2 208 2 60.27 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGCTTTTTTATTGGTTTCA:1 + chrX 9410564 3' + I-element 5294 1 58.22 ATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTTGTCACCGCTCTTTGAG:1 + chrX 21947774 3' - mdg1 7062 2 72.66 TTTGTGAGTGATATTTTAATGCTTCTTTCATTTTTTGATTCTTAAGTAACAAGATAGAATAGGTGGTGGTTGTGATGGCACGAAAAAAGAAGATGAAGTATAGCAACAATCGTTGTCGAGTCGGGCCGGGCGG:1 - chrX 2137509 3' + transib4 46 1 54.14 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAAGGCCCAAAGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCCCAGAGTGGCC:1 + chr3R 23618188 3' - hopper 68 1 74.78 ATATATTAACTACATACGTTAAAAACAACGTACCTTGGCCTTTATTTTTCCATATTTTACTATGATTTATGGCATGTAAACGAAGTGTACCACAGCACACACACACACACACACACTCATGCACCCGGAA:1 + chr2L 5575912 3' - transib2 301 1 54.62 ACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTATTTCGAGAAGTATCTTATATTGAATCTCAGCGAC:1 + chr3R 31002015 3' + I-element 5104 1 76.71 GAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTAT:1 - chr3R 19450176 3' - roo 9026 1 66.21 CATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTTTTATGTGCATATATATATAACGATTTATCAAAAGAACCTGGCTTTGTCAAAAAA:1 + chr2R 22937392 3' + blood 7164 2 61.64 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCT:1 + chr2R 2427619 3' - Doc 63 1 61.64 TGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTACTTGTCTTAAGTGGATTTCGGGTGTTCCAGGTCTGTTTGTTTGGCATCGGTCGAATGGGAATCCTCTGAGTATTGACGAAAAATCACTTTTAATTAAGATCAGTTGAAAAGA:1 + chr2L 6745789 3' - accord 186 2 52.74 ACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCTGTGTTTTT:1 - chr2L 23008383 3' - transib2 286 1 73.97 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCACGACT:1 + chr3L 3983875 3' + P-element 2833 1 35.04 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTG:1 + chr3R 19992745 3' + hopper 1365 1 52.05 AGATTCAATAATAAACATAGTATTTCCTAGTATTTTAGGTTAACAGTTGTGAAACCTTCTTTATAATCGCCCTTAGGTCAACAGTGCAACTTCAACAATGCCTGAAAGGAAAAGTGTACAAACTAGTTATAGACAAACTCTTACTG:2 - chr2R 4576843 3' - Chouto 5851 1 64.38 TGTACAAAAAGCTGAACAAAAATTTTCCGGGAATTGCCTAAAGTTTACAGGCGTAGCGAGGGAAATATGAACTAAATTGTAAGAGATTCTTAATTCTTA:1 - chr3R 29609293 3' + Juan 3950 1 79.80 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGC:1 + chr2R 9871569 3' - roo 8722 2 58.90 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCA:1 + chr3L 1692099 3' + blood 7307 2 73.97 ATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAACAATTATTAACAGTTTTTGATTTATTCATATTTTTGACAGTCCTTTACTTGGAGGGATTCAGTACTTATATTGTTGATTCATGTTACTTTTTATCAT:1 + chr2R 7769738 3' - BS 5057 1 53.42 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACTGTAAAGGTCCTTGCTAAAAACTTAAAAAATTTATGCA:1 + chr4 935651 3' - 1360 65 1 67.18 ATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAG:1 + chr2L 22224606 3' + Rt1c 5400 1 54.11 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAAT:1 - chr3L 15913847 3' - jockey 4818 1 59.31 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCCGCTCCCGTCGCATTGTAGGCGTCATTTTCGGTGATACGCTTTGTGGAAGTATCAGGAG:1 + chr3R 13186005 3' - I-element 4961 1 77.91 GAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAGATATCTTTATCTTTAAAGATATGTGATGAGAGCAATAGTAGTTAGTGATATTTCTCCGAAATTA:1 + chrX 20996707 3' + INE-1 95 1 64.14 GGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCAGCCAGGCACACAGAGAGTTGGACTGGCACGTGGACAGATGTTGTTATACGCAG:1 + chr2R 23281452 3' - accord 7032 2 86.25 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTAACCATGGACAATGGCTCCCCTTCGTCGCGTGGAGGAGCTTGTTCCGAGGGGATTTTAAAGGCATTAAGC:1 + chrX 6511405 3' + hobo 2887 1 73.74 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATATTG:1 - chr3L 22723813 3' + HMS-Beagle2 275 4 64.38 AGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCATGATCGATGCCATT:1 + chrX 462335 3' - F-element 252 1 65.91 ATAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTG:1 + chrX 21224614 3' + roo 322 2 74.48 CGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAAC:1 + chr3R 4682963 3' + Burdock 170 2 81.51 GGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGCGGCGCCCTGGTTGGTCGGTACTATGTTCGGTT:1 + chrX 19585775 3' - roo 8829 2 69.90 TTATAAATAGTAAAAGTAAGTAAAGCAAGTAAAATTGTCAAGGGGCAGAAGGTGACAGACGGAAATTACACAAAAAAAAAAATAA:1 - chr2R 5988140 3' + Doc2-element 183 1 76.47 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCTCATACTCTGAATTTAAAAAAGTTGGGTTAGGTCCTAAAAACA:1 + chr2R 5074627 3' - 1360 16 1 73.97 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCCATTGACCTTTTAAGCTAAACATT:1 - chr3L 14366479 3' + roo 399 1 80.14 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAAT:2 - chr2L 13556311 3' + transib2 2791 1 63.01 CGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTC:1 + chrX 8200285 3' + flea 4940 1 69.18 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGATTTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCAC:1 - chr3R 28469221 3' - 412 74 2 71.74 CAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGTAACATTTATTTTTCGCTGACGGTCACATTGTCTGCA:1 - chr2L 5043146 3' - 1360 282 1 74.66 ATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACTAAGTAATAAGTGCTATTTAAAATTGTCGCATTGCCGTCTCACTTTTTCATAAGCACACATGAAC:2 - chr2R 14655499 3' - accord 411 2 55.48 AATTAAAATTATAAAAAAAAAAACGATAAGAAGTAATACGGTCAACCCTATTTCATCTAATTTATTAATTTATATAATCACTCTTTTATCGTTCAGATTTAAAAGAGGAATGAACAAAAGCCGCCGTTTAAATGTTGTCCTTTTTT:1 - chr3L 10583717 3' + Doc 4694 1 71.92 TTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAAT:1 + chr2L 7618526 3' - X-element 4527 1 78.77 CGAACATGATCTGAATGTGACAAAAATTGGAGACAGGATTTAGGAAATAGCGAAAAAATACAATGAGAATCTCATCCTAATAGTCTAACTAGACGACTAAGTAAAGTCATCGGACAAGTAGGAGAAGAGACAGGCCATACCAAATA:1 + chrX 22632865 3' + jockey2 3026 1 81.51 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATATACAATACAAAATATATATATAATATATATACAATAATTAAAACCTAATTTAT:1 + chr2R 4695925 3' + flea 208 2 59.59 TATTAAGCTATTATTATTATTAAGCAAAAAAGTGACGTTTTTATTAAGTAAAAATGTGTTAGTCATTTACTTGCATTTGTTTTCATTTTAGAAAAAAAAAACAAGAACACGATCGTGCTCAATGAATCTAATAATTAAGCACAATT:1 - chr2R 12239661 3' - invader3 5064 1 80.14 AATCCCAATTAGGCGAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAGTAATGTTCATCCAAGAAAAGGCAGCCATTAAAAAGAAGTACACGAAAAAACCTTCAAGATACAAAACAGAAACAGTTTGTTTAGGTTTTAGTTACCAAATTG:1 + chr2L 10235835 3' + I-element 233 1 73.97 TTTTTTTTTTATTTTTGTTAAAGCACATATAAACAAAAACAAAATAACAAAAATAAAAGTGAAGCAAAGGGGAAGGGACCTAAGCGGTTTTGAAAATATCTATCTTGGCAAAACGAAAACAAATTTGTTAA:1 + chrX 15024618 3' - TART-C 11100 1 43.51 CAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAA:1 - chr2L 18347296 3' - transib2 72 1 68.49 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCTGATCGAATCGCCCAAGTTC:1 - chrX 8038586 3' - 297 6609 2 63.08 AACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTNNNNAAATCTATGANNNNTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTAT:1 + chrX 3431952 3' + Ivk 5309 1 64.38 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAA:1 + chr2R 23780617 3' - Ivk 57 1 54.11 AATTATAGTAAAATATGGCAAATAAAAGCCAAGGTATGTTGTAGATTTTAGTATATATAGCTATACATATATTCACACCACCCTTTCCAAAATTCTTCATTATTAGGAAAAAAATGAAAGAAAAACTTTTACTTCCAAACGAAAAG:1 - chr3R 10377578 3' + transib2 257 1 78.08 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTT:1 + chr2L 15076182 3' - 1360 84 1 73.29 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGATCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTT:1 - chr3R 29084901 3' + 412 7470 2 66.44 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTT:1 + chrX 12986620 3' - roo 8737 2 69.18 ATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTTGTAAAAA:1 - chr3R 904892 3' - rover 6952 2 72.60 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGGCCCCAGCTTCTTTGTGCTATATAACTCGATTTCTATTCTGCGAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTATTAACCCCTA:1 + chr3L 47010 3' - FB 31 1 48.33 CATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATAT:1 + chr2L 23295852 3' - micropia 5043 1 77.40 GAGTAATTTTCATAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCAGCGACGAAATAAGTTGAGATTGTATGTGACCAAATGGCAAATATTTCTGCCCATTTATCGGTGCAGTGAAAAAAATAAACAAAACGAACTAAAAAACC:1 - chrX 11625482 3' + G5 4545 1 73.97 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGGTTCCACATGAAATA:1 + chr2L 4063919 3' - roo 78 2 71.92 GAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTATGTCCGACCCCATTCGCAGGACTTTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCCAGTTCCAGTTAGGAAAGACCGAAGGAATATCTTCAGATCTAGATCTGG:1 + chr3R 30652484 3' - accord 459 2 69.18 ATCTTCACAATACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTA:1 + chr3R 16518970 3' + Tirant 8429 2 68.49 TCATTTACAATGTTATTATATCTAAATCTAACAACCCAATAAAGATTATTTCATTACTATCTGTTCATAAATAAAGTACATCATATGGTAACTGATATCGTTACGTTATATAACGTTATCTCTGCATTGCCATTTAATTAATTATT:1 + chr3L 2746220 3' - I-element 5264 1 77.40 AATTTGTTTTTATATCTTTTTTTTTTATAATATCTGCTTGCTTATATTTTAATAATTTGACATTGGCATTGAGTATCTATTTTCCCAATGTTTTATTTACTTAGATCAAAAAAAATAAATAAGATTTTGTATAAATATTTATCAGA:1 - chr3R 30212500 3' - Tc3 1576 1 47.26 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGGAGGCCACATCC:1 - chr3L 1691990 3' - blood 25 2 65.47 CGTTCCTAATGTACCATTAGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTTTTTCTTTTTTCCGTTGTTGTTTTCAAGCCGCTCAGAGTTTGTTACATGCTTTGTGTCATAATTCACGATAGCTCCTTAGGTGTTGTATGTCTGTTGCG:1 - chr3L 24264753 3' - Porto1 4365 1 62.33 GTTAATTTAACAGCGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCTCTGGCCCAGAATGTCCCATACTTCTCGACCTGGTTCTAAACAACATTTTCTTAGCCACTTGCTTGGCTCTCCGACCGTTCAATCATCTCAATT:1 - chrX 19363364 3' - hopper2 1484 1 67.81 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACTTC:1 - chr3R 4575728 3' - jockey 68 1 58.90 TTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAACATTCTTTTTTTTAAATTCACCTATAAGTAAAGACT:2 + chr2R 4743601 3' - Transpac 115 2 75.34 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTT:1 + chr3R 20167661 3' - roo 8718 2 68.03 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAAC:1 + chr2R 19199758 3' + hopper 1391 1 45.83 ATCTTAGACTGCCTAAGTCGTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACATTACATTCTTTCCGTAGGGGGTTCTCCGAAAGAACAATCCTAGGAAG:1 - chr2L 3005928 3' - baggins 5036 1 71.23 GTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTCACATAATTTTTGTTATACAAACCTTCGTAACTTGCTTCAGGTTCGATACTTTGGGAATTGCTTTGCAGATAATACTCATTGAGAAATTCCGAAAAGTCCTGATCATCTGAAT:1 - chr2R 4749297 3' + 1360 180 1 77.40 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGCATTA:1 + chr3R 26178504 3' - 412 31 2 61.64 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGG:1 - chr2L 17205197 3' - hopper 83 1 72.60 AAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGTAATTAATAAGAAACTTTTTTGGCAAGTTTACTCGAGAGTTCGACGATGATTTG:1 - chr3L 17775829 3' + invader4 2991 2 62.33 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTA:1 + chr3R 15072640 3' + pogo 2060 1 67.96 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATATTGCATCTTTCATTAAA:1 + chr3R 15942852 3' + hopper 1406 2 80.00 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGGCATTAATAAATTCGACACCGTAATTGTG:1 + chr3R 8075997 3' + 412 444 2 51.03 GGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGACAACGAACGAATCGATCGTTTTAAAATGAGCCAGTCGTTTTCCAGCGCCACGTCAATGCGATATTTCGGGATCTGTCGCACAGAGGCATTGCATTGCCCTATGT:1 - chr2R 1338531 3' + Doc3-element 160 1 43.15 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTA:1 - chr2L 7660903 3' + I-element 5305 1 51.75 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTT:2 - chr2R 13766196 3' + roo 353 2 57.24 CCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTGTGACGGATTTCGTACTGGAGTGCCTCCTTGCCCTTCAGACGGCTGGCTGACTTGGCCTCCTTT:1 + chr3R 19934245 3' - I-element 5186 1 67.31 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACA:1 + chr3L 18126009 3' - Ivk 46 1 47.26 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 - chr2R 11367657 3' - mdg1 59 2 62.33 TTTGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCTGCGAAAAAAATTCTTTTCCTTGAATGGGTGGGATTATGACAAGTAAGTGCAATAGTACGGTATTTAGCTTGGAGGCGGTGCACAATTTCCGCATCCACCATCGTCCGGAGGATCGGT:1 - chr3R 15859449 3' + Cr1a 4430 1 66.44 AATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAACAGCCCAAGGCAAAAGCAAGGTTAAACTCCTATTGCCAACATTATTTACTTTTTTACTTTTGATAGTTATAGTTAACTTGCATTACTTAATTAA:1 + chr2R 18957688 3' + baggins 5404 1 54.11 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTCGCTGG:1 + chrX 4808612 3' - mdg3 62 2 57.53 GTCCTCATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTATAATTTT:1 - chrX 2580244 3' + INE-1 133 1 37.72 GAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGTGTTGGGGTGATGGGGGGTGCTGGTCCTGGAAAATTCCTAGTTTGCTGAAAAAAAAAGAGCACTCGAAAAA:1 + chr3L 18509585 3' - Stalker4 6895 2 51.37 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTG:1 - chr3L 18046624 3' - roo 83 2 76.71 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATT:1 + chr3R 7719813 3' - roo 8733 2 69.18 TTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTGTTTTTTTGTGTTTTTGTCCATTCTTCAGATTGTGGAATCTCGAGTAATAAAGTAATTAAAGCTCCCTGACACTGTTCAATATATCATCTTTTTTTTTTATGTGAACGGTAGATTAAT:1 + chr2R 22144846 3' - mdg1 7079 20 67.12 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTACGATTCAAATTGTTTAA:1 + chr3R 7317677 3' + I-element 5303 1 52.74 AGATCTCGACGTTTTTACGGACGGATATGGCTAGAACGACTCCGCTATTTATCCTGATCAAGAAAATATATACTTTAT:1 + chr2L 14752636 3' - INE-1 133 1 85.90 ACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTATTGGCTTTTTCTCATCGTGTAGCTATATCTCAGCTATATGG:1 + chr2L 14619902 3' + invader2 4773 1 71.72 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTTTT:1 - chr3R 18971670 3' + Juan 4189 1 56.16 ATAACAATAAACAAAATAAAAATGATTTACTACGTATGGTCTACTGTTATGCCATACAAAAACAATATTGTGTACATACAGGAGTTCTCCGTGTTGTTTTCTTGTAATTAAACCCCGTTTTTGCAGGCCATTCGTCATTGTTTTTT:2 - chr2R 8546539 3' + Porto1 188 1 51.37 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTAAAGATCTATCTGAAGGGCCAGGAGACGGCCGA:1 + chr3R 18971819 3' - Juan 4055 1 58.22 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAG:1 - chr2R 22034648 3' + copia 197 2 60.00 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAGATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGA:1 - chr3L 10731756 3' + 297 348 2 53.42 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATCTAT:1 + chr3L 18931064 3' - I-element 45 1 50.36 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTTCATTCTATCCTTGATGTAAGCATCCTATGATAATAAGTTTTATATGTGTTTAGAT:1 + chr2R 17926443 3' - opus 7023 2 71.92 GTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACAAGCAGTTGAAGGTGGGCAAGAAGAAGAACATTAGCACAGACGCCCTGGGCAACACCAAGGGACGT:1 + chr3R 18224720 3' + invader1 3855 2 54.79 GTTCGGCGTTCGTCACGGACATCTCGCGGCCGCCTGGCCGCCAAATCCTAGCTTCGACTGGGTCAGATTGCAGGTTAGTGAGTTGTGGCCTAAGCGCGCGTTATTAACCGCAATTTAT:1 - chrX 6020148 3' + gypsy12 429 2 70.34 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACA:1 - chr3L 1692019 3' - blood 25 2 56.36 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTTTG:1 + chr3R 21276663 3' + BS 5072 1 60.96 ATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAA:1 - chr2L 21299271 3' + roo 375 1 62.33 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAAGCAGTGAAG:3 + chr2L 16539803 3' - Juan 4030 1 78.77 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGA:1 + chr3L 3501816 3' + Bari1 1648 1 60.56 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAA:2 + chrX 21100277 3' - mdg1 7079 2 58.22 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTGGGCAAAACTTTATCAGCGGCA:1 - chrX 6417725 3' - accord 7025 2 69.88 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCC:1 + chr3L 16211602 3' + transib2 2756 1 64.83 TTTTTTTTTATTTTTAACTTTTATTTTCTCTTGTATACTTTTAAAATAAAAAATTCTACCTTAAAGCCCAATTTGTGTGAGAATCATGTT:1 - chr2L 19100836 3' - TART-C 11096 3 42.22 ATGGATATTGAATGTTTTTGTTTTGCTGAAGACATTAAACAGAAGCCAACCCAAGCCAAGCCAACAGTGGAAAATTCCCGGCACGTAGGAG:1 - chr3L 18126283 3' - Ivk 157 1 75.82 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTAT:2 + chr2R 8099220 3' + jockey 4928 1 63.70 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGATAGGCAAGCCTATACCAAACACGTAAGTTAACATATGTATCTC:1 + chr2R 15005166 3' - BS 5002 1 65.52 CGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTAGAGGTTAAACGTTTTTTGCAATTTAAATAAGTGTTGTGGTT:2 + chr3R 10400041 3' - Porto1 4560 1 69.86 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTT:1 + chr3L 21327165 3' - copia 59 2 62.96 ATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATT:1 + chr3L 3501802 3' + Bari1 1630 1 71.23 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCG:1 - chr3R 4682895 3' - Burdock 70 2 67.81 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGTACAATTTGCAATGAA:1 - chr3L 26505827 3' - copia 4888 2 72.60 AGAGTAAACAAAACACAAATCCGTAAATATTGCAACTGCGTTCTTTGATTGTACATATATTCTGTTCCAATCCTCTTAATGTATCAAGCTAACGCTTAAAAATCATTATATATAAAATCTGTCAAT:1 + chr2L 22732316 3' - Cr1a 202 1 61.90 TAATATTTAAATTTAAATTGTAAATTGTAAAAATTACATGAGTTCAAGGCCTCTAAAGAGCGACGCAAACATATCGAACATAAAACAGTTGTCTTATGATAGTGTCCGTGGTGCTCCGGTTAGCGCGATCTGCTC:1 - chr3R 20912994 3' + TART-A 13181 1 77.04 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTT:1 - chrX 19539460 3' - pogo 40 1 47.95 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGT:1 - chr2L 11298044 3' + I-element 5292 1 65.75 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGGTGCCACTGAAGTTTT:1 - chr2L 4713873 3' + transib2 2781 1 60.53 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCAAACA:2 - chr3R 15072534 3' - pogo 36 1 58.90 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTCAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGC:1 + chr2R 6964862 3' - Burdock 6210 2 69.18 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAGTTGAAATAAGC:2 + chr2L 10156250 3' - hopper 21 1 68.49 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTC:1 + chr3R 7420306 3' - 1360 35 1 56.45 TTTGTTTATTATCTGGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTGGAGGGTTTGCAAATGTTGGTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTGTCGTGCGACTATTTTTTGCGCCTTTTTTTTGCG:1 - chr3R 18705147 3' - I-element 5127 1 57.14 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTCGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAAA:1 + chr3L 18403056 3' + P-element 2819 1 39.73 ATATGCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCACTTGGCACCATGCGAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTCAACGTTATTATTATTTAACCACCCAACTGCACTCTTATTGACAAACTTGTCGT:1 - chr3L 6437529 3' + 1360 219 1 76.03 CTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGCCGCAGCAAAGCAACAGCAACACTTGGCAGCCAAGAAAGCGCAACGCAAATGTGTGAACACATGTCTATGCAAATGCAACCCACAGC:1 - chr3R 26899465 3' + INE-1 153 1 60.00 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCAGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACA:1 - chr2L 18347314 3' - transib2 37 1 67.74 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTATCACCTGGCCTG:1 - chr2R 13931577 3' + P-element 2781 1 15.07 CATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAATCCTAATGGCTTTT:1 - chr2L 11391485 3' + 1360 33 1 47.18 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCCCAAATCGCAAG:1 - chr3L 12249795 3' - roo 8717 2 57.93 AAATTATTTATTTATTTTTAGAAGCAATTGTTATCAACGCTCCCAAAATGTTTAGACTATATAGTTACTATGATTGTTTATTTTATGAATTTTTATGGGTGTATTTTATGAATTTTTATGTGATGGTAAGTGTCAAGCTGGTAATT:2 - chr3L 8809277 3' - mariner2 830 1 73.29 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACCCATAAATTAATCAATTAAAACAAATGGTTGT:1 + chrY 1421339 3' + flea 227 2 67.12 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATGAAACA:2 - chr3L 11913154 3' - BS 5020 1 67.81 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCG:1 + chr3R 9039048 3' + Juan 4184 1 63.70 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTATTAATCCAAGTGTTAAA:1 + chr2L 16946168 3' + hopper 1391 1 66.44 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTGATATTAG:2 - chr3R 27160055 3' + 412 441 2 54.79 AGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCCGAGTTTGACTACGTTTTGTTGATTCTCACGGTTTTATCCCTTCGGAAGGGCGATGTAGCGAAGCTTGA:1 - chr2R 24739797 3' - Quasimodo 457 2 62.33 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCT:1 - chr3L 18402995 3' - P-element 91 1 23.29 ATAAATACATATTAAAAAAAAACCTTTTAGTTACATCAAATGCTTCATTATCTTTAATAATTACTATACATAGTCCCAGATTCGCAAAGGAGAGTTGAGCAAAGGAAAAGCAAGCTGCACAAACAAGCCAGAAAATGACACGGCAA:1 - chr3L 11654820 3' + S2 1619 1 40.41 AGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTTCACGCCTTCATGTGACCATTAAAAATAATTTTCTTTTGCGCCCGGCTAAAAGCGCACTTTCCACCACAAAGAGCGACAGCTGAAAATGACAAAATCTG:1 + chr3R 25572856 3' + gypsy5 6940 2 72.66 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCA:1 + chr3L 22035663 3' - F-element 41 1 55.00 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCG:1 + chr2R 9158142 3' - mdg3 58 2 57.55 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATACACTACAGCCGCAATACGGTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTT:1 - chrX 19074760 3' - mdg1 56 2 52.74 GATCATTTATTCGACTCGAAATAGTAACTACGTAATTGGCGCAGTCGGTGTGACTGTATTTATATGTTCCAACTCTTTTCACAGGACATTGATTTCGACGGGTTCCGGCGCTTCCTGGAC:1 - chr2R 7854685 3' + Tom1 374 1 55.83 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTA:1 + chrX 21224633 3' + roo 9021 2 57.36 ATATATAGATAGACTAAGAACACATGAAAATAACCTAGCCTTAAGTTTGGAAAATAATAATGACAACGTCAGAAGACTTAAAGTCGATGTCCTTTCTGGTTTTCGGATTTGGGGATTTTCTGGGTCCCTTGTGGTGTCAATTAAAA:1 + chr3R 20404658 3' + G4 3611 1 56.16 AAAATAGAATTTTCTTGCTTGAGTGAGCAAAACCAGAGACCAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAGACGATTTTCGGGCCGATTTACATATTTGGGGGGAAAAATAATTTTAATGTTCTAAGGTCTGGCCGAGATAG:1 + chr3L 27681547 3' - 1360 3262 1 72.60 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTGCACGCAAT:1 + chrX 14722249 3' - diver 17 2 67.12 TATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGACTCAATTTCTGTATTTTTTTCTTTTCTTGCTCAATAAGATGCAGACTATTGAAAAGGACTCACTTAACATTT:1 - chr2L 18348810 3' + transib2 270 1 54.79 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATACATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGC:1 - chrX 14304060 3' - roo 8733 2 71.23 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGC:1 + chr3R 31653171 3' + roo 9037 1 57.60 TTTATTTGAAAACATAAAAATTTATGAAATGCTGTGTAATTAACTATTTATGACTCGGTTGCCCTCTACAAAGTAAGCGTTTCCATGGGCGGAGCTGTTGAGCATTTTCCTGT:1 - chr3L 18357476 3' + 3S18 348 1 74.34 AATATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCATTAAGTCGCCG:1 + chr3L 11233649 3' + 1360 3039 1 75.86 CAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGTCAAAGAAAAGGAAGTGCCGCAAACATTTCACAAACACAATCTCCAGCACCACCACCACTTCCACTTCCGGTCGAGCCCTTCGCTCACCTGAACTAT:1 - chr3R 15066108 3' + pogo 485 1 60.96 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTT:1 + chr3R 5523997 3' - FB 67 1 64.38 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGTCGAGTGCGCTCA:1 + chr3L 21380661 3' - I-element 22 1 70.34 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAG:1 - chr3R 6419819 3' + Tabor 447 2 57.53 GACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTGCTTGCAACGTAAGCACGTTTTATGGAAAATAGTCGTTGCTGTCTTCAAACTAAGAATGACTTCCTCCATTTTGTACAC:1 - chr4 1187783 3' - gypsy4 6615 2 53.42 AAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGCTGAGTAAGGGGTATGTGATAGTCGACTATCTTTCCTGTTTATATACTTAATATTTCATGTTGTAAAATGTATGATTCATTTGCG:1 - chrX 15655576 3' + I-element 4896 1 56.16 TGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAATTTTATAGATTTCCATTTAATAGATTTTTTAGTTAAGTTTTATAAATATTTAGGTACTTACGATTTACTTA:1 + chr2L 14358909 3' + diver 215 1 61.64 ATATAATAATAATAATTTATAATATATATAAATATAATATAATATAGTTTTCAGTGATATTAGTCCAGTTAAGGGTCCTCCCAAACCATTGCCAATTTGTCACTAAAACCCAACATCAGCAGATCATAACTCGGCCAAAAAC:1 + chrX 7548300 3' - Tc3 273 1 66.90 GACAGAATGCCGGAGTTGTTGGTTCTGCTTAATGCTCCTATATCGCCAGCTCTTTCTTGTGTTCTTGTATTGTTGGGCTTTTTATAAAGTTACAAATTATACCATGATTATGTTCTGATGCTTATTACTTATTACACATGTACTGA:1 + chr3L 16481414 3' - gypsy3 173 2 46.58 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAAT:4 + chrX 1341734 3' - 412 60 2 57.53 GGATTAAAAAATGTTTTAAAAAAATATTCAAATAACCCTTGCTTTTCTTTAATTTCATAGTTATGGAGAATACTTCTTTACAATTCCTGTGCACCATAAACTATCTGCGAATCGTTCATCTTTTGCTGCCATACTTTTATTTTATT:1 + chr2L 15351071 3' - Juan 3784 1 69.86 ATAGAAAAAAAAAATAAATATAAAACGCATGGGGCAAAAAACTTAATAGTTTCGCCTTATCTGCATAGA:1 - chr3L 15204304 3' + invader2 296 1 73.91 TAAATAATTTAATTATATTTTTTTCCATTGCTCTTAGGGTTTCCCAAATTCTAAACTCAATTAT:1 - chr2L 10636119 3' - NOF 3959 1 73.44 AATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCAATTTGTTTTCTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAAACAAAAAGCAGGAGAAAAAAACGGCTTTAGCGAACC:1 - chr3L 9504853 3' - R1A1-element 98 1 72.60 TTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCTGGAAGCAGTGCTTTCCTCTACCCACTTAAATATAATATATTTATTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAAACAAACACACCTTTTAAAAA:1 + chr3R 7052343 3' - HB 392 1 79.86 CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACT:2 - chr3R 27160088 3' + 412 408 2 77.40 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTT:1 + chr2R 17878631 3' - Doc 72 1 60.27 GTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAA:2 + chr2L 18212208 3' + Quasimodo 7296 2 76.03 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCG:1 - chr2L 8338130 3' - P-element 56 1 37.70 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCCCATGAAAAGAGAAGGAAAACTAAA:1 - chr2R 5151170 3' + roo 400 1 78.08 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTCCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGC:1 - chr2R 22034629 3' + copia 5084 2 56.16 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACACTTTCTTCTTGTCTTCT:1 - chr3L 16690855 3' + I-element 5342 1 62.33 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGC:1 + chrX 8437717 3' - P-element 94 1 19.44 ATATCATAACAGGTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACCGCAGGAAACCGAAAAAAACAACAAAATGCTAAATAAAATGGGCGTGAACGGAGTGACCCAGCGAAGCCG:1 - chrX 20266743 3' + hopper 1324 1 54.55 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATACTG:1 + chr3R 26504337 3' + HMS-Beagle 206 2 58.22 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAA:1 - chr3L 19454893 3' - mdg1 29 2 64.38 TATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTGTGTGATTTGTGCGAGTGTGTGTGCGTGTAAGCGGCCACAGTTATGAGGTTTTTGTGTTGTTGCTGCTTTGGG:1 + chr3L 14890674 3' + Cr1a 117 1 58.88 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAAAC:1 - chr3L 19454877 3' - mdg1 9 2 77.46 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGACCGCA:1 + chr3R 21933275 3' - pogo 27 1 70.34 GTATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGT:1 + chrX 20999629 3' - BS 19 1 66.44 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTG:1 + chr3L 3983896 3' + P-element 2825 1 43.84 TATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTAACTTTGCTTTTTTGCTTTGCTGGTGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - TAHRE 45 1 68.00 AGTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCACCGTTAGGAGTATGTCGGGGCTC:1 + chr3R 2689398 3' + diver2 4465 1 37.97 ATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATGGATGGATATCTAAACTAAAGCATCTGGCTGGCGCCCAGTTAACCAGCTCCCTTCTAGAGTTTCCCGCAGCTTTTC:1 + chr2L 10945062 3' - Dm88 4448 2 56.85 ATAAAATAATTAAATAAAACGATTAAAATAAATAAACATATAAATCAACGATTTATTGGCAATTAAATTATGAAAAAGAACATCAAAAAACGATTAACCTTATTATTATTATTATTATTATATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGAC:1 + chr2L 16164092 3' + Doc3-element 82 1 76.03 AGGCAGAAATTCTGGTGTTCACTGAACAAGATAATTAATAATTATTCTGGCTTATCGATAGAATAGAATTTAGGAATAAAATGAGAAGAAATTAAAATGAAATAATTTGTTGGCGTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAA:1 - chrX 22689462 3' - HB 1440 1 66.44 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCC:1 + chr3R 28901329 3' - transib2 53 1 53.42 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTTATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAAT:1 - chr3R 11191371 3' + roo 9032 1 54.79 TTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCCAGTTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGAAATCCAATGTATAAATTATGAATAAACATAAA:1 - chr2L 2515854 3' - invader4 3049 2 44.21 TATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATC:1 + chr2R 6885621 3' - P-element 43 1 56.16 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTAATTATATTTTCACGCCCGTGAGCAAATAAGCAAATTCC:3 - chr3R 9002869 3' + roo 9053 2 73.97 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATAT:1 + chr3R 25428270 3' + 297 348 2 54.79 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGTTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTA:1 - chr3R 19073206 3' - roo 84 2 78.08 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTTGGAGTCAAAGAAAAAAGTTTAAAAAAGTTT:1 + chr3L 5252720 3' + roo 318 2 80.82 CTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATA:1 + chr2L 17766206 3' - Doc 187 1 56.85 AACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATC:1 - chrX 21639644 3' + gypsy5 323 2 77.40 AAGATATTGTTGGGAATTTTTTTTGCGTTTAATATTGCTTACTTCGATTTTTTTAAATTCTATAGGTTTCTCATTTATTAACTTTTTGGAAAAGTCCATCAGCTAACTTGGCTTACGTTTCCACTTAAGGGTTGACTTAGCTATTT:1 - chr3R 18496416 3' + INE-1 385 1 45.89 TTGTATGTTATCTGGATTGGGCGATCGGACAATGGACGATGGACGATGGAGCAACGAGGTTTGCGTGCCAAACTTTTCCAGCTAAATTAAATTATTAAAGAGGCTGCCGG:1 + chr2L 14241658 3' - I-element 5126 1 74.55 TTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTT:1 + chr3L 17568107 3' - S-element 73 1 69.44 AGTTATTTTGTTGTTTTTTTTTCTGCTGCCTATGCGGCGTATGAGTGATGCTGAATTTAGGTCTCACCTCAGCCACTTCCTCGGGGAATTGCAACGCCAGTGATTCACTTGGACATAAATCGATAGCTGACATTTGCCTCGATTTG:1 - chr2R 14414350 3' - gypsy11 3935 1 60.27 GGGAGAGGAGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGAAATCTCATACGCAACAGTTCTTAACTCTTCGATGGCTTAGACACAATCTGCTTTCAGGCTTCCCATTACGTGC:1 - chr3L 24051624 3' + Bica 19 1 54.11 ATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAAATGTATGTGCGGGATAGCTGAACCCAACTTCAGCGCACTTTGGGCGTTCAAATAAAGAACCTCGAACACAGCAGAAGC:1 + chr3L 23398238 3' + invader2 201 2 47.59 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCC:1 - 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mdg1 49 2 52.05 GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCGAATCTAGTATACCCTTTTTACTCTAAGAGGAATGGGTATAATAAATTCCTTTACAACGGATCACGTTTTGTCTAATTAAATTGTGCCA:1 - chr2R 18487159 3' - INE-1 29 1 58.33 GCCCACACTTTTGAAAAACGTTCTGATATTTTTTCACATTTTTATTTGTCTTGTAAATTTTCAAAAAAAAAAAGAAAAACAATAAAACGAAAGTAAGTCAAAACAATCAATACAAAAATAACAAAATTTCAAAATATTTGTATATC:1 + chr2R 3936851 3' + INE-1 256 1 54.79 AGAGGATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTATTAGATACCCGATACTCAACTAGTGAAAATGCGGTTTGTGTCTTCCAGCCCCAACTGATGGTTTCAAAAAGGCCGCCAA:1 + chr2R 24938138 3' - INE-1 574 1 57.80 AGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTTGTTGTACTTTTTTTTTGTTTCCAGGCAGCGTGCTATGAATATTTGAGGCAATTTTATTTGGGTTTCGATGTCTGTGATCGTTCGTGTTTCAGCCGC:1 - chr3L 7823047 3' - Doc 4489 1 73.64 GGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGA:3 - chr3R 4357504 3' + Tc3 1671 1 46.58 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAAT:1 - chr3R 23639166 3' - pogo 85 1 75.86 AACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACGTAAGGACA:1 + chrX 10167519 3' + roo 397 1 75.34 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGC:1 - chr3L 6447026 3' - transib2 40 1 54.10 ATATTTTAATCTCTTTTGAACCAAAGCGTTTTTCCTCATTCTGCAAAATGAGTTTTACTGAGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAATTGAAATCAAGTGGTCATTTACAATCGTGGCGCTT:1 + chr2L 12443002 3' - Transib-N1_DM 286 1 76.26 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCTCTTACAAATGTATCCTTACCCAAGCCAACGAAC:1 - chr2L 16943823 3' - copia 4947 2 76.64 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGT:1 + chr3R 16518969 3' + Tirant 8428 2 70.55 ATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTAT:1 + chr3R 10736162 3' - McClintock 5976 2 65.03 ACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTTGAAATACT:1 - chr2L 4123850 3' + transib3 2847 2 61.17 GCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGCGAGGACAGGCAAAGTGC:1 - chrX 8437659 3' + P-element 2885 2 70.73 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACAATTTCGTTGACAAGCGCAGTCTGCGCTA:1 + chr2R 4601391 3' + copia 243 1 53.42 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCC:1 - chrX 1135318 3' + P-element 2883 2 64.29 AAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTC:1 + chr3R 5368692 3' - 1360 23 1 62.28 TGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGGATTGTGTGGATTTTGCCAT:1 - chr3L 25482888 3' - accord 6909 2 60.96 ATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAAATACATTGCATGGGGTGAGTTTGGTGTTGAACGTGTTGGTATTTTGGCATTGCTTTTGCTTTCGATTTCAAAATACATACAATAAATACAAGTCTCCAATTTAACAATACAAGTAT:1 + chr3L 6169020 3' - HeT-A 5971 1 65.07 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTT:1 + chr2L 17809263 3' - jockey 68 1 58.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTATTAAAAGTTTTCAATTCAAC:1 - chr3R 20167545 3' + roo 9042 1 62.33 GTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATAGTAAAAGTCGACGAAAACGCCGAAAAAACAAACTAAAAGGAGAACATATAGTAACA:1 - chr3L 22792381 3' + I-element 62 1 61.64 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTC:1 - chr3R 20441249 3' + I-element 5279 1 68.97 GACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAA:3 - chr3L 22760397 3' - F-element 177 1 80.82 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGACCAAGCCGA:1 - 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Doc 371 1 57.53 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGCGGATT:1 - chrX 6475257 3' - Doc 26 1 69.86 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCATTAATTACAACAAATAACCGAA:1 + chr3R 17996282 3' + diver 6067 2 53.42 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAAGTTTACCTCTAGCAGTCCCACTT:1 - chr3L 5389895 3' + roo 9001 2 80.65 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATG:1 - chr3L 11913159 3' - BS 5025 1 64.38 AATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAG:1 - chr2L 21299277 3' + roo 369 1 58.22 ACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACATTACTTATAATTTGATTAAAAGTCGGCACGGCCATTGAGGGGATTGATGTATCATTTCCGGCATTTCATAAATTTA:1 - chr2L 1923402 3' - G2 2992 1 60.00 AATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGGTCAAGTGTCCAGGTCTA:1 - chr2L 4754842 3' - Stalker4 24 4 49.32 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCACGCGATCGTTTTTCATTCTCTGGCCAGC:1 + chr3L 12004386 3' - P-element 14 1 73.97 ATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGTGTCTATATGTGTAGGTCAGCAGCTCCCATGTTGGGAACTCGTGGTCTAAGTAGCTGTGCGACATGAACATCTATCGAGGCGGAATATCATTGACTTTTGATATGATAATAA:1 - chr2L 7123571 3' + I-element 321 1 75.34 ATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAAT:1 + chr3R 21630338 3' + I-element 5282 1 67.81 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTAATCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGC:1 - chr2L 7660920 3' + I-element 5285 1 63.01 GTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGG:1 - chr2R 12472038 3' + transib2 2745 1 70.55 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAA:1 - chr3R 18971720 3' + Juan 4172 1 61.06 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGT:1 + chr3R 28469285 3' + 412 7470 2 74.48 CAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCC:1 - chr2R 18316041 3' - HMS-Beagle2 6954 2 64.38 AAGTGTGTGGTGGAAATTATTTATGTAGCCCGTGCTGCCAACAATGTGTTTTTTGTCCGAGCTCCGGTCCTTTTCTTGGTTTTTTTTTTCGGCTGCGGCACTAAACTTTCATGTGTAAAATATTATAGCATACTTTGTCGGG:1 + chr3L 19115851 3' - Transpac 4881 1 58.45 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAATATATATTATATATTATATATATAATATTTTTACATTGTTTTTATCAAATTTCCACTAAATTTGTATGACTAAATTTCGGGATTCCGC:2 + chr3L 23688686 3' - Quasimodo 23 2 66.44 TGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCAATCCATAAACGAAGCAAAGAAAAGCCGTGCGTGCGTCCACTGAATAAACAGTGAAAAAGGATAGCGAAAAGGAGGCATTTGAAAAGCGGGAAATGGTAGAA:1 - chr3L 7955910 3' - G2 226 1 73.29 TATGTGATTGCGTGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGCCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGCAGGAAGAACGAGTCCACGAATATGCTGAAGTTCATCTGGGGACGCACCAAAGCAGCCAGGAG:1 + chr3R 22337538 3' + baggins 5246 1 55.48 AAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTCAACTGCGTTTATGCGTAGGACTTGTTGGCCAAAACTTAGCATTCCTTCTTAAAATGGA:1 + chr3R 18471227 3' + FB 6 1 55.97 ATAGTTCTTCTATTCATCCTCAAACTAAAAATCTACAAACCCCTTTTTAAAATTCTTTTATTTTTTTATATTTAAGGGCAAGACTCCGGCCATTAACAAGTTCTTTGTTCGCGAGGAACATGCAACGCGGCCAACTCTAGCACTGG:1 + chr2L 9435873 3' - micropia 185 2 69.18 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATGAAA:1 - chr3L 11913156 3' - BS 5003 1 76.38 TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGACCCAGAAACACCTATTAACAAAATCGATTGAAATCCGGATG:1 + chr2L 10156196 3' - hopper 69 1 67.86 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGATATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAACATTTTGCTATT:1 + chr3L 14094663 3' - I-element 82 1 74.66 AAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGGAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGGCCAATA:1 + chr3R 5368719 3' - 1360 22 1 68.57 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGCAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACACATTAAATTCGCTTTCGTATC:1 - chr3R 11191358 3' + roo 9047 1 63.19 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGCAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGAC:1 + chr3R 10270676 3' + Juan 4172 1 54.68 ATTAATAGACAACAAATTTAGTATACGCCTCGTTAAAATTGTTCTGGGGGGTTCAAAAGTGATAGCCTAGTTTGTAAATGATACTTTTTAATTTAATTTTAATTTAATTCGAAAATTGCAAAGATATCAGCCTTTTTTTCTTATTA:1 - chrX 6077843 3' - gypsy4 260 2 79.45 AATTTTTCGCACGGTGCCAATTGATCAAAAACAAGGGTAAGAGCAAAGGCAATGC:1 - chr3L 25340934 3' - 1360 273 1 56.36 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGC:1 + chr2L 16539778 3' - Juan 4055 1 61.64 AAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACGCAATCCATATAAAATGTATCGTTCGGGAAGCTTCAATAAAAAGTGGTCGTGTGGTCAAGTAATTATTTTGATAAATACCTTTTTTTTAACAATTAA:1 - chr4 148005 3' + I-element 5079 1 63.70 CATGCATTTATAATTGACTAATGTTTAGTTCTGCATAACAGAAATAAGTATAGATGGCGACACAACAAAGAAATCAGCTGTTGCACGCACAAAAAAAGGTCTTATATTGTAACCTAAGATCAAGGGGATATTTATAATGAATGTCA:1 - chr3R 24029526 3' - Transib-N1_DM 416 1 69.86 ATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCCGTTTGTTTGCGTTTGTTTGATAAGCCATTAGTCAAAATGACAAACGCTT:2 + chr2R 12773891 3' - I-element 450 1 65.75 GTGGAATAAAAAAAAATGAAATATGTTATTTATATGTTATTTCATCATGATCCCTCCTACTTTTCAACATCGCTCCCAGCTACTCATCCCGAGATATCCAGAAGACTAATTCGATCAACTCCGGCTGGTGGTAGCCCC:1 + chr2L 9782191 3' + P-element 138 1 64.49 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAATGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTC:1 - chr3R 15325082 3' - 297 61 2 67.59 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGC:1 - 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roo 90 2 82.07 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCA:1 + chr3L 3983889 3' + P-element 2818 1 39.04 CTTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAATTATACAAATACCCAAAAGACCGCCAACAACTACATAAGCAAGCATTCCAGCGCCCAAGTAATACGATCTGAGAGGCTATACATTGAATGGATTCCCACATGCCTTAAATATATATA:1 - chr3R 27763430 3' + Stalker 6917 4 67.81 AGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTGTACTTAGCCATCGCGTTTCGTT:1 - chr3R 23911303 3' - 3S18 5765 1 79.34 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATTTATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTT:1 - chr2R 3338784 3' - Juan 60 1 57.53 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGGACGTCTTACCCATTTTGGAGTCGAGCGGCCGTCCCCCGTTTAGTCCTTTC:1 - chr2R 22514091 3' + P-element 2879 2 71.84 GTTCTTCTAAAATAAAAAGTTTTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAATTTGTAACAAAAACCTTGCGAGGC:1 - 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Quasimodo 74 2 68.12 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCT:1 - chr2R 4362810 3' - F-element 94 1 72.60 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAA:2 - chr2L 4063804 3' + roo 9042 1 65.07 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACTCGGAACAAAACACTCTCCATCTCTGACTGCAAATGCCCCTTTCTCCACTCCGAACTTTTTGGG:1 - chr3R 15872419 3' + jockey 4960 1 63.55 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTC:1 - chrX 10521638 3' - Tabor 70 2 63.01 AATAATTTAATAACAATAATAAAATCTCACCTGCATATTTTAAAGAGCTTACATTGTAGCCAAGAGCTAAGAGGCAAGAGCCAAGAATCAAGAGCTGGACCACCGCCAACAACAACAACAGGAGGTCATAATGAACGACACTTTAC:1 + chr3R 13824678 3' + invader3 5054 1 79.45 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAG:1 - chrX 6475297 3' - Doc 60 1 57.14 GCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTTGTTAATTTAGTAAGCAAGTCGGCAGGATGAGACGGAAGCGAGATACGTTTGGGAAGACGTCCGGTATACTGCCAGTGACAACGCCTAAGTGGGGCTTAAAAA:1 + chr3L 22327243 3' + hobo 413 1 76.03 TTTTTTTTTTGTTTTTCATAAAAAAAATGATTATTTTTAGAACCAGGGGGCCTAGGAGCAATAGGTTAAAAACAAGATTTCCTTAGTTTTTTAAAGAGCTTGTAAATTTATTACTAAAATTTAAAT:1 + chr2L 5156819 3' - HMS-Beagle2 480 1 82.54 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATT:1 - chr3R 2527710 3' + INE-1 545 1 47.26 ATAATAAAAATCTTAATAATAAATGTTAACTATTTCCCCCTTTAAATCTAAACTTCAAGCTGCAGAG:1 + chr3L 11371026 3' + mdg1 7079 2 56.72 TGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTAGTTGGTTGGTTGGCTGGTTGGCTTGGCGGGCTTGTTATTTTACCCAAAAGCAATTTTATGATTATAACAGCCGAGGCCCGGGCGAGTCCTTTACCACCGCCCAC:1 + chr3L 13619329 3' - Quasimodo 39 2 60.45 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAGGGTGTAACAATTACG:2 - chr3R 4682857 3' - Burdock 32 2 62.33 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATGTTAATGAATTTCAATATGGCGTCGCAGGC:1 - chr3R 20140476 3' - jockey 4717 1 55.30 CTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTTCCGAAATATTCCTCTCGTTGTGGCAATTCAATTGCTGCCCAAAC:1 + chrX 9816526 3' - invader2 345 1 71.23 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTT:1 + chr2R 11159367 3' + roo 9033 1 56.43 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGC:1 + chrX 15357767 3' - hopper 54 1 54.11 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTC:1 + chr3R 22590604 3' - rover 37 2 59.59 GTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCACAATACATAGAACCGAAAACAATTGTAACCTGGAACTTAACCCAAACAATTCTTAACAAAAATTTCCAAAGTATTCTTCTTCGTGCTTCCAGGTCGAAAAAGGGTGAAAATAAAAGAGCAGC:1 + chr3L 10965549 3' - gypsy8 2 2 64.14 GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGTGCTATAGCACTATAGTGGTGCAGCAAAGGTTCAGTGGTGCTGGGTCACTGCCAATGCCATGCGGCCGATTAAG:1 + chr3R 23491973 3' - transib2 9 1 70.00 GTGCCAAAAAATTGTAAGGCGTTACGCATCTTGTTATTATAGTGTCTTTGCCTAGACAGCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCA:1 - chr2R 3919667 3' - 1360 29 1 52.63 CTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGCCATTGCATAACTTCCGATCAGTCGACCCCGCCCTCACCCTCATCATCAGCCGTTCGTTTGGGTTCGGTTTTTCT:1 - chr2R 16038742 3' + Quasimodo 6978 2 59.23 GTATCTGATAGTCGGGAAACTGGACCATAGCATTCTATATTTTTTGTTTTTTTTTTTGGGGAGGCCAGAGCAAGTGACC:1 + chrX 8313182 3' + INE-1 558 1 72.15 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTA:2 + chr2R 18529975 3' + jockey 4941 1 50.68 CATGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGAGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTC:1 - chr3R 15942728 3' - hopper 83 1 72.14 CTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACG:1 - chr3R 10736033 3' + McClintock 412 2 64.38 AAAGTAAATTAAAAAATAAAATGTTTTGAAATTGCCTTTGTTTTAGTTTAAGAGTAAAAAGCGTTATTTTTATAATTATTAGATATAGTCTATTATTCTAAATCTGTAGATCAAAGAATATATTTTATTATTAAATCACTCAGCAT:4 - chr3L 18080982 3' + HeT-A 309 1 59.59 AGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGTCGTTGTAATTCGAGTAGTCGCTGTCACTGAAGTTGTCGTTGTTCTCAATGGTTTGGGAGTT:1 + chrX 1555068 3' - Doc 327 1 57.69 GTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATTAAAGTTTTTGGGAAAAGTGTAATAGTTTGTGTGAGGTTAGTTGTTTTTGGGTTCTTTCTTCTTCCCCTT:1 + chr3L 14216652 3' - I-element 5234 1 59.59 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAA:1 + chr2R 7850040 3' + roo 366 1 50.75 AAATATNTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTA:1 + chr2L 10156226 3' - hopper 45 1 52.05 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTA:1 + chr3R 3920573 3' + roo 8995 2 71.23 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAGCTTGGAATCGAGAGTTGAATCTGGATCTGAATCTGCAGCTGAAACTGAGGCAGCGCCCTCGAATCGATAACTGTCAAAA:1 - chr2L 4002620 3' + mdg1 361 2 59.59 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTGT:1 + chrX 20999631 3' - BS 17 1 67.81 TGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTTTATCCCTTGTGCGCTATTTTCGGCATTTTGTGCTTATTTATTTACCTTTTGGTGGCTTGTTTAT:1 - chr3L 4624506 3' - I-element 289 1 55.48 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATA:1 + chr3R 18093367 3' - I-element 70 1 63.70 TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTAT:1 - chrX 14450390 3' + hopper2 1553 1 55.86 AATATTTTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGG:1 - chr2R 8099159 3' - jockey 4809 1 61.74 TTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGGTAAGTGTATGGGGTTTGTAAGCTATTAATTCTC:1 - chr3R 19224991 3' - HMS-Beagle 60 2 60.00 ATATTTTGGAGATATTTTCACAGTGTTTTTTATTTTTAGCTAATCGAAGTGATAAGGCAAATATTCAATACGAGATGACGCACTCGTTCCCGTTGGCATCCAGATAAACGCGCATGGCATTCTTCTCCAGCAGCGACGGCAGTCGC:1 - chr3R 5528471 3' - Ivk 5234 1 50.00 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACG:1 + chr2R 3564136 3' + Tabor 7276 2 57.14 TATTTTATTAATTTATAAATATCTAAGATCTATTAATCTAGTTAAGACCTATTAGTCCTACTTTGTATTATCTAATTTTAGGTGTTCTATACAAGTATATTTATTAATTTATTATTTATTAAATTATTTAACTTTTTAACAACTTT:2 + chrX 16193534 3' - G7 1141 1 79.45 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACT:2 - chr3R 19073158 3' - roo 36 2 55.48 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCT:1 - chr3R 11810645 3' - roo 8736 2 67.81 CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATAATTAAAAACAACCTGCAAAAAGTTTCTTAGATGATGAGTATACAGATGAGTATACTTAATCCAAACTATAAATGTAATAATACTGAATTTTCATTACTGATAGGAA:1 - chrX 19873152 3' - INE-1 17 1 79.10 AGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGAATTCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTGCTATGTGGTTAGAAGTGGCACGCCCACATAACACCCCGCCTCCCGTCAATTTTCATTT:2 + chrX 16976992 3' - Quasimodo 125 2 59.83 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGCTTTATCAGATGCGTGCTTACCTGATCATTGTTGACGAAATATTGGCCTCTTTTTTCAATGTTTTTTCTAAGCTTTGATTTTTGTGCATAATCAGAACTGATTGAAAATAATCAGGTTAA:1 - chr3L 18218392 3' - Doc 49 1 78.08 GAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATC:1 + chrX 21639690 3' - gypsy5 84 2 77.86 TAAAAAAAAAAGAGAGAAAAGAACGAAACATAAAGAAAGCAGCGGTAATAGCAGCAGGGGAACCAAATGTATCTTGGCCACGGGGAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACGCAATGTACACAATCCACATCCACTAGCTGTGTACA:1 + chr3L 25674476 3' + Bica 339 1 61.64 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATGGTATTTTATTTGTATTCCTCATAGT:1 + chr2L 15940344 3' + pogo 2069 1 60.43 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGT:1 - chr3R 11040047 3' + Bari1 1653 1 55.48 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGA:1 + chr3R 23067539 3' + roo 356 2 53.42 CTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCG:1 + chr3R 2689463 3' + diver2 4475 1 73.88 AAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGATCTTGCGGCGATTGCTTGTTTCTTGGACGGACTAAACCTGTTTCGATTATGCCCTGATCTACCCCAATATAAATGGATTTGACGGCAGACAAATCACTTGCTCAGCG:1 + chr2R 23427476 3' + invader2 499 1 81.56 TACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGT:1 + chr3L 18505751 3' - I-element 24 1 61.86 AGGAAATGAATATAATGTAAAGTACCTCTATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACCAAAAAAGTTAAAATTGATTGGCTTCTTTGGCGGTTTCTCCTGCTCCATTTGCTGGAGGTACTTGATGATGTTCTGCAGAA:1 + chr3L 5661709 3' - Cr1a 4326 1 56.16 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCG:1 - chr3R 24450421 3' - 412 7115 2 58.90 GAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACTATCAGTAATGTTGTATTGTTCTCGAAATGCAGATTGCCTTCGCTTTCGATTTATGTAA:1 - chr3R 28283595 3' + invader4 2968 2 59.59 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGTTGAATG:1 - chr3R 15882571 3' - jockey 29 1 56.30 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGA:1 - chr3R 19992645 3' - hopper 73 1 65.75 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACT:1 + chr3R 11191476 3' - roo 8740 2 72.22 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTTGT:1 + chr3L 17183770 3' + diver 6058 2 54.11 TAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTT:1 + chr2R 4206660 3' - 1360 318 1 73.97 AAGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATTTATGATGCA:1 - chr3L 11257269 3' - 1360 14 1 76.03 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGTTTGA:1 + chr3R 17996251 3' + diver 6036 2 68.49 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAA:1 + chr2L 13158735 3' - roo 66 2 63.70 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGCAATAGAGGAAATTCAATTTCCAACAATCCGTGATTTTGTCGTTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chrX 15192246 3' - hobo 63 1 48.21 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGA:4 - chr3L 9809224 3' - 412 38 2 58.22 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCG:1 - chrX 10319589 3' - mdg1 44 2 55.48 ACTTACACACACACATAAACACATAAGTGAAGAGCATTTCGTTTAGCTACTTACTGCGTTTTTTCGTCCGCGCTGTCACAGTCACACACACACATGGAAACGCACAGATATACGCTTTTTTACTTCGTGGCTTTAAATGTTTCAAA:1 + chr2L 17901961 3' + accord 7100 2 51.37 AAGGTTCAAGTCTGGAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACATTTCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCGGCACATCGGGTT:1 - chrX 18817284 3' + transib2 2779 1 50.41 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTT:2 - chr3L 21996169 3' - Transpac 72 2 64.38 GATAGTCGGGGAACTCGATTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGTTGGTGTCAATGGGACAGCCACAACAGAATTTCAATATCTACACATCAACACGATTGCCATTTGTTTGCATTTTTGTATTTCTCACGTTCGTTAATTATTT:1 + chrX 10256557 3' + INE-1 564 1 51.75 GATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGAAGAGAGAATGCTGTATCAAACACACGTTACTCAGCTAGTGGCTGTTTGAGGAAATGAATATTGGTTTTTATTT:1 + chr3L 17833201 3' + INE-1 15 1 66.67 TATCTGATAGTCGGGGATCTCGACTATAACATTCTCTATTGTTTCTGATCTTACTCGACTGGAGAAGAAAAACACAATGAAGTTTGCTTAATAAATTGAACTAGTTGAACTGGCCCAAAAATCAAGGCATACTGCGATGAAAAAAT:1 - chrX 20668255 3' + INE-1 559 1 71.92 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATG:2 - chr3L 19454917 3' - mdg1 7091 2 52.05 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATT:1 + chr3R 3920567 3' + roo 8989 2 75.34 TATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCAGTGTAGAGCAAATAAATATGTATATATAAATACATTTTTTTTTAAAGAAGACTAT:1 + chr3L 8694528 3' + HMS-Beagle2 4 2 62.33 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAGCAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATT:1 + chrX 8200336 3' + flea 4991 2 70.55 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTACAAATTGGCAGCAGCTGCTCAGACAGAAGGGTGTTTTTCTTTATGTTCAGTCATGCACGATTCAAAAGCAATGATTCTGAGA:1 + chr3R 30813448 3' - FB 40 1 59.59 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAA:2 + chr3L 16970437 3' - roo 8750 2 80.14 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTGGGAGCGTATGAGTGATTCTTTTTCTTTTGGCTCCATCCCCCGGCCGTTTCATTGGGTTTTTCTTCGCTTTTCGTTTGGTTAATGCTGCGA:1 + chr2L 16009346 3' - F-element 4433 1 74.19 GAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGAGCAATAATCATAACCCTTCGACTTTCAAACCCATGTTT:1 + chr2R 13171057 3' + P-element 87 1 31.88 GTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGCCT:2 + chr3R 31976599 3' - TART-B 10183 1 76.03 TAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGT:1 + chr3R 17615224 3' + mdg1 33 2 72.22 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTAT:1 + chr2R 4785317 3' + Juan 4146 1 60.27 GGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGTGAGGCATTAGTATAT:2 - chr2R 20802515 3' - mdg3 5261 1 79.45 AACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATAATAAT:1 - chr2L 12569980 3' - micropia 4992 2 60.96 ATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAGTAATCCCTAAGATACTATTAATTCACCCGTCAGTTTAAACTACTATATTCTATGCGACATGAAATTCATTGCATACTTTGCGGCTGC:1 + chr3R 28746123 3' - Bari1 24 1 57.25 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGG:1 - chr3L 19349915 3' + 1360 3345 1 52.41 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGGGTATCTTATCTGGGAGCCACGT:1 - chr3L 2544588 3' - Tirant 8136 2 64.29 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATCCCTT:1 + chr3L 8959721 3' - 1360 19 1 67.67 ACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGGGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGA:1 - chr2L 15550696 3' - Bari1 64 1 76.11 TCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTA:1 + chr2L 17766172 3' - Doc 229 1 63.70 TTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTCAATGAGAGTTATATTGTTAGGGATTATAAGCCTTTATTGCAATTTAGTCTTGCATAAATTATTGGTAAGCTTAAGTTATTGGGTAAGTCC:1 + chr3R 7961026 3' - I-element 5201 1 64.38 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGCGGTGTCCGGAACCACGGCTTGTTTGTGCTG:1 + chr2R 22873091 3' - Doc 4474 1 71.82 TTAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATTTTCTGCACCATTCAGCATCGATTGTGCAGTATATACACTGCGCGTCATCAGATTAGCGCCCCCAAATGCAGTTTTGACTTTAATTTAGGCCAT:1 + chr2L 21396846 3' + S2 1689 2 69.86 AAAAGGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGGAACTACATACCAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTTAAAGTGTGTAAACTTGGAATTCGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTT:1 + chr3L 23583098 3' + S-element 1390 1 68.49 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCT:1 + chr2L 47206 3' + roo 9044 1 61.42 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATC:1 + chr3R 27160154 3' - 412 7125 2 67.12 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGTCCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGAGCTTGGATAGGGATGAGTTTTGTTA:1 + chr3L 12315848 3' + transib2 2788 1 59.59 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATA:2 - chr3L 16662392 3' + jockey 4919 1 69.18 ACACTTTTTTAGTGACGGCCAAAAGTTCGCATCGATGAGTGGTGAAAAAAAGTGGTTTTAGTTGCAGGTGGAAAATTGAAATTTCATGCAAAAAAATCAAGCAAAGTTTATCCGTTTTTAGTTTGGCTCGAAATG:1 - chr2R 17982916 3' - 1360 3330 1 42.96 GATTTCCCCGTATGCCTTAATAAATTAATTAATTAATACTGACAAAAAAAAAAGAGGACAAATGATTCATTATGGTACTTCCCACTTTGAATAAATATGCATTTCGTAGAACTCAGTTCAGGGGAATAGTTTCATTTCCCAAATGG:1 - chr3R 6237969 3' + X-element 4698 1 70.55 ATTGAAAAAAAAAATAATTTAATTTAATTTAAAAGTCGGTAAGTTGGCAAGCAGAGCTTCATTCATTTCCACAACTTGCACACATACACATACCAGCACACCCCCGCTCTCTGGGAATTAGAGAGTTGG:1 + chr3R 20254080 3' + jockey 4925 1 67.44 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGG:1 + chr2R 23180274 3' + roo 8998 2 69.72 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGG:1 + chrX 10537933 3' + I-element 5281 1 67.12 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACA:1 - chr3R 11191379 3' + roo 361 2 53.10 TTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTATATTTCTACATCAATGATTGATTAGTTATTTCTATATATTCCGCCAAATAATATTTTTCTTTGAAATTATTAACTGAAAAGCA:1 + chr3R 8685522 3' + 297 286 2 57.53 ACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAATTACTCACCAGTTCCTTGGGTATGGACAGCGATTTTCGCTGCTCCAGGGGCAAGTCGAGCAGCTCCGGGATGCGACACCAATAGTCATCCGG:1 + chr2L 20729939 3' + I-element 230 1 64.58 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGA:2 + chr2L 13158728 3' - roo 73 2 68.49 ACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACAAAGCATTTGAAATATAAGCCTTTAGCAAAAAATTCCCTTCAACTCTTTTACTCCTTATCATCTAGAATCAGTTAAAACGTCTAACTTACTTCGAAAGCGTATCGCAGTCCGTCC:1 - chr2R 5539405 3' - G4 3559 1 71.23 TGAGATGAATTCGCAATTAAATAATTAAGTTGCTATCTAAATTATTCAACAACGGTAGAGGCACTTCTAAACTCAAAATTTGTTTTAAATGGTTTAAGATGTCAATTTAAAATGATCCTCGCGCAAGTGATATTTTCGAATTCTGA:1 - chr3L 8085936 3' + invader4 2623 1 77.40 GTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCTTCTCCAAACATCAATTCCCCCTCTAGGACTTTTCGGTCAACCCTCGGAC:1 - chr3L 14300909 3' + P-element 2738 1 39.04 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAA:1 - chr3R 18971684 3' + Juan 4175 1 50.68 ATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATT:1 + chr3R 24729637 3' - Juan 4167 1 78.08 AAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAATATATATACTTTATATAGGCGAAAACGTTTCCTTCTGCCTGTCACATTCTTTTCATCGCTCTCCCTCCCTCTCTCTTTCTCTGTTGCCAGGTGTCACGCACACCTG:1 - chrX 18835256 3' - INE-1 97 1 63.04 GAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTTGCTTCTGTTGCTTGGCTTTTTTTAGGTTGGAAAATATTTCATTACCATGCCTGTATTTTGTTCTGTTCGGAAACGACTGTACTGTTGTT:1 - chr2R 19578203 3' - hopper 1147 1 65.75 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCA:1 - chr2R 22034649 3' + copia 221 1 53.33 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATGAGTCTATTAAAAATATGTAATG:1 - chr4 372911 3' + pogo 2082 1 72.60 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTTTTTTTTATAAATTTTTTATTTTATAAATCCTACGATTCTAATTGCTTTACATTTTTTTTTGTCATAAATCTGTATGTTTT:1 - chr3R 17421160 3' - pogo 6 1 75.34 TATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATT:2 + chr2L 17005848 3' - Stalker2 7266 2 71.92 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAG:1 + chr2R 11164509 3' - roo 57 2 60.96 CCACGTATACTTACACACACACACACACACACATCCCCCATAAAACAGCCAAGGAACCCACTGTCATCAGTCAAAATTTAAAGTTAATTCCATTTGACAATTTTCGAAAATGAAATCACGCGAAATTAATAAACAAAATCACGAA:1 + chrX 8338545 3' + Quasimodo 27 2 77.93 GTACAGACGTTTTTCTTCCCCTAGTGACTTTAGTAAGCCCAGTACTCTGTGGTGACCAACACCACTGAATGTTTCTGGCCCAATTAGATTGTTCCCACGATAGCAAATGTTCTTATCTAAGCGAATCTCT:1 + chr3L 19813767 3' - baggins 4998 1 66.15 GCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTG:1 - chrX 14317414 3' - 1360 164 1 68.49 AAATCATACTGAATCCTAGCAATAAAAGCATGATAATTGAATGTTCAAAATTACAAATTTTTGTATTTATTCAAGAATGAAACTTATGCTGAGAAAATGAAGTATAAAGCTTGCTTTATGTAAAACAATCATGATTTTATCAGGAT:1 + chr3L 11394463 3' - hobo 415 1 54.79 TTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATACCAGTACGCTTGGG:1 - chr2L 7808580 3' + 1731 66 2 61.64 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTAT:1 - chrX 14450397 3' + hopper2 1545 1 60.96 GCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTTTGACCTTTGAGCCACACGCCCTCGAGCTTTTCACGCCGCCGGAGTACTTGCGTGATAAGAACCA:1 - chr2R 7472465 3' - 1360 432 1 80.00 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCA:1 + chrX 8200308 3' + flea 4963 2 53.42 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGTCTAATGTGACCAGACTGATACACTATGCG:1 + chrX 11661520 3' - pogo 35 1 57.53 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTAGGAGACACAAA:1 - chr2L 4063846 3' + roo 9006 2 66.43 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATC:1 + chr3R 29084963 3' - 412 7137 2 77.40 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCATGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGCATGTATACCCGATAC:1 - chr2R 18315979 3' - HMS-Beagle2 6891 2 77.24 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCCGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTTATT:1 + chr2L 12818382 3' - hobo 11 1 75.34 CAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGATTTGGCTGAAATTGAATTTCTATGACTAGATTTTCTGATGAGCTAACTGGAGTTAATAAAAATGCTTTCTATCA:1 - chr2L 1300626 3' - GATE 8272 2 62.07 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGC:2 - chr3R 26504181 3' - HMS-Beagle 28 2 66.44 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGATGGCTTCTAAAT:1 + chrX 18010013 3' - 412 84 2 78.83 AACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATG:2 + chr3L 19350039 3' - 1360 3231 1 50.00 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGACATGAGAA:1 + chr2L 18347425 3' + transib2 2802 1 70.55 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGT:1 - chrX 21087609 3' - mdg3 5311 2 69.40 ACTATAAAAGATAGAAGGTTGAAATTCAGCATTAGTTTCTTTACCACGCCCCAAACACGATTATGCAAAAATGGGTACACATGTTGAATTAATCGATCCAGAGCCGGCACC:1 + chr3R 8016062 3' + INE-1 160 1 77.48 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTAT:2 + chr2L 20266053 3' - roo 8711 2 52.05 TTTTTTTTTTCTTTTTTGTTGGGCCTGGGGCACCCTTGTT:1 - chr3L 6374117 3' - gypsy7 5005 2 85.00 AAAAGTGAAACATTTTTTGAATTGTTTAAAATCAAATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAAAGATTGGAAAATGCCCAGTGTAAATGATCTAATGAGGGAACATCTTTTAATCAAAACCACATTTTTATGACGGTACT:1 - chrX 22457239 3' + HB 1504 1 60.27 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAATAAATAAAATGTTATTATCAACGCCTTTACGATTATTAAATAGTTAACCAACATGGTCCAA:1 + chr3L 8673382 3' + I-element 5292 1 61.81 AGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCGGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTTTGCATAGGTGGAAAAAGGAATGCATGGAGATGTGCG:1 - chr3R 17775848 3' - accord 273 2 72.60 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTT:1 - chr3R 15790797 3' - roo 15 2 65.75 TTTTTTCGACGGTACAATGCTTGCCGCGACCCATAACTAGGGAATATTTGGTCTTGAAATTAATGTGACTTTATAAACGAATATTGTATATAAGGTAACCGTTTTTGAAATTCAATGAACTTGTAGTTTAGTAACTTGCCTGCGTA:1 + chrX 18004418 3' - Tc1 371 1 67.81 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAA:1 - chrX 6475306 3' - Doc 64 1 62.22 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCT:1 + chr3L 3983898 3' + P-element 2827 1 45.21 AGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGGGAACCGTACAAGTAAATACATACATATGTATGTAGAAAACGACATGTAAACTGATCGATACACTGATAAAAATTTATATTCAAGTGAAAAAGCTTA:1 - chr2L 2374227 3' - rover 221 2 66.44 AATATAAATATAAAAATATATATATCGTGTCATATCTGTGTTGTGGCACATCTATTGCATATAGGTAAATTTATGAATTATTTTCTCCGCTCGAGGAGGCGGCATCACTGTCGCCTTGCCGCGA:1 - chr3L 19514466 3' + Stalker 6939 4 54.84 AAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCAATCGAGCAGAAAGTCAATTTGATCCCCGGGCTCGGCAAATTTAGCAACATTCGTCAAA:1 + chr3L 18131575 3' + X-element 4496 1 53.26 AATAAAAAATATAAAAAAAATCAAAAATTAGAACACCAAATTATATATCTAGTGTAAATGAAGTAATGATTCTATATTTGGAAACTATCTGCCGGAGATCACACGCGTCGGAATTCCCGCCACCCGCGA:1 + chr2L 13249863 3' + transib4 2576 1 57.36 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAGAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATG:1 + chr3R 12115329 3' + 1360 3315 1 76.00 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATT:1 - chr3R 26504184 3' - HMS-Beagle 31 2 64.38 TATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAG:1 - chrX 10319610 3' - mdg1 61 2 61.97 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAATCGAAGATATTTCAAAAAAAAATTAGTTACTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTTTTATTTGGGAGTTGACATTAGGTCTTCATTTAACTGCCAAATATGGTAATGAGTAAA:1 + chr2L 47168 3' + roo 328 2 60.28 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAA:2 - chrX 2479504 3' + mdg3 5420 2 67.81 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTGGCTCTT:1 - chr3R 19407859 3' - diver 5908 2 70.55 TATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACG:2 - chr2L 4003699 3' - mdg1 7114 2 70.55 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGTGGCTGTTGTGAATGGTGTGTGG:1 + chr2R 18316173 3' + HMS-Beagle2 292 2 63.45 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCA:1 - chrX 6475294 3' - Doc 63 1 56.85 GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCG:1 - chr3L 9269869 3' + copia 252 1 54.35 AAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAA:1 + chr3L 22744706 3' - FB 80 1 74.66 AAGAAGAGTATAATTTGAAACGGATAATCACTCTTCACTGTTCGGTCTTTACCGACTTCTTTCCCCGCTCTGTCTCACTACCTCCTTCCACCCGCGGCCGAGTTGACTCACTGTCTACTCCTCCTCCAT:1 + chrX 1110215 3' - hopper 1163 1 73.64 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAA:1 + chrX 21100275 3' - mdg1 43 2 56.85 GTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACACACATACATTACCACATAGCAACAGCCATACACAAAAATAGAATGTTGGGTACTTTTACAATATAAATGAGTATAGTTTTATTTTGGAAAA:1 - chr3L 26377912 3' + Quasimodo 2 2 68.49 GTGGGCCAACGAACTAATGGGTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGGCAAG:1 + chrX 21639711 3' - gypsy5 50 2 57.48 CGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATA:1 - chrX 19266858 3' + roo 8989 2 76.26 AGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTGTAGCTTGACTCTGGCCTAAAGTACCAAACGATGGCATAGTCATATTATCCA:1 - chrX 12111687 3' - F-element 4461 1 60.90 ACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGATCATTAATACCAGCATTTCAGAGGGCTTTTTAAAAACGAAAAAACTTGAGTTTTGTAAAATAAATAGAAATTTTGCGTGTAGCAATTGCGTTACCCCAC:1 - chr2L 17236830 3' + R2-element 3482 1 67.81 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACGCGAATTAAATTGTAATTCCTAAAGAAGT:2 - chr3L 5532875 3' + roo 401 1 78.08 AAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGGGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATT:1 + chr2R 20802696 3' + mdg3 5465 2 59.59 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTAATTATAAACATTAAAGATTACAACATACATTAATGTATAGTACTATTATAAACCAAAGACAATAAATGTGCTTTATTGAAATAACTAAGAGAAAGTAAACTC:1 + chr3L 14791634 3' + Transpac 251 2 76.03 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAAATAAGTCGATATGAATGGCG:1 + chr2L 20118532 3' + S-element 1699 1 73.61 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGG:1 - chrX 19074752 3' - mdg1 48 2 50.00 TGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATATAAATAATGTAAATAACAAGAAAAAAATTTTGGAATGTACGATTAAGATAAACGCTAATATAGATGTGACTATGTTACGCTTAAATACAAGTGCAGAAACCTTAG:1 - chr3L 27383471 3' + BS 5063 1 71.72 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTA:1 - chr2R 24427525 3' - jockey 4693 1 69.93 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTACACGATAATTC:1 - chr3R 19073127 3' - roo 5 2 76.71 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACCCTAGCAATTA:2 + chr2R 11159389 3' + roo 386 2 69.18 TTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTT:1 + chr2R 2875237 3' + TLD2_LTR 103 1 65.75 TTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGTTTTTAATCAGATTCTGCTGGGGAAATACTTGCAGCTCTATATAATAAAAGCT:1 + chr2L 19328783 3' - HeT-A 6022 1 63.70 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATAATAAA:1 + chrX 14310347 3' + roo 9042 1 48.63 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATATATACGAATGTGCACACGTGCATGTGGCAGAATGGGATGGAGATAGATGGAGGACCGGCATTAGAGA:1 + chrX 9950664 3' - jockey 4680 1 75.34 CGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCG:2 + chrX 3431969 3' + Ivk 5326 1 54.79 ATCCTTAAAATTGCATTAAAGATTATCTATATTATCTATATCTATCTATAGATCTATATTATCTATATCTATCTATATCTATATTATATCTATATAGATTATCGCTTAATCCAATTATTTCAGATCTAAATCATTTCAGACATTTC:1 + chr3L 23212665 3' - Helena 80 1 53.42 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCANATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGG:1 - chr2L 4063842 3' + roo 340 2 64.38 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAAT:1 + chr3R 26178478 3' - 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chr3R 18971721 3' + Juan 4138 1 70.55 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTATT:2 + chr2L 16946153 3' + hopper 1376 1 57.53 AGTCGTGTAAGAGTTGGAGGACACACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGCTAACGGGTATCTGATTGTCGATGCAGTCGACACAGCGATTTTTCTTGCTTACTTTGGTCTTGCCACAATTGT:1 + chrX 1130898 3' + aurora-element 4188 1 49.31 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTTATTACTCATTAAAATTAATAGATCTGGGAAATAA:1 - chr3L 1279041 3' - roo 8683 2 60.69 ACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTTCCAGCTCGCTTGAAAGTTGAATCTATTTGTGCATTATTGAATATTAACTGTGTACGCTTCGATTGCGCTAACTTCGGCATCAGGGCGACAGC:1 - chr3R 20091493 3' + Cr1a 273 1 52.05 ATTTTGCAAAATTGTGGGCGTGGCTTGCTATGTGTCTAGAAGCTGCAAGCTAAGTCTTAACATTCCTGAGATCGAGACGTTCATTCATTCATATTGATCCTGATCAAGCCTTCTGCCTGTTATATACTTTTCAAC:1 - chr3L 19471447 3' - INE-1 253 1 60.00 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATA:1 + chr2R 330245 3' - 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Doc3-element 4685 1 60.96 GGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAA:1 + chrX 23182913 3' - Idefix 71 2 69.18 GGATTTCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAAGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCATTGGGCTCCCTTCTCTGGAAGGCGGTTCTTTCATGCACAACTAGGACCC:1 - chr3R 21365728 3' - Idefix 7074 2 68.49 CTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGTTTCCGTTGTTTTTGATTGAAGAGAGCCGACGCTCGGAATTCGTTTGGAAGGCCTCTCGAGTTTGCGGAGATTTTCGATTCTCAATTTTGC:1 + chr3R 27619984 3' - Doc4-element 99 1 47.15 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCA:1 + chr3L 20711674 3' - jockey 4845 1 75.34 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGGATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCG:1 - chr2L 3675842 3' - Juan 4038 1 57.84 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACA:1 + chr2L 11257128 3' - 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chr2L 13556302 3' + transib2 2800 1 69.18 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAAT:1 - chr2R 7244803 3' - diver 5940 2 52.74 ACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACTTGAAGCACCAGCAACCAGCAAGAATAACACAGGCTCTGGCTCTGGATCCAAAAATAACAATAACAACACCAATCAAAACCCCAACAGACAGT:1 + chr3R 24231883 3' + G2 106 1 70.97 TATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAATCGATCTAGCTATGTCCGTTTGTCCGTCTGACCGACTGCCCGTCTGTCCTAACACATGTGACGGCCACGGATTATCAACTATTACAATGGCCGCCGGTCAACTGCCAAC:1 - chrX 21778542 3' + INE-1 83 1 58.70 ATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAG:1 + chr3R 19448620 3' + roo 82 2 64.38 GGCGCANAGCGCTGAACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAAT:1 + chrX 21852446 3' - gtwin 6996 2 72.60 ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGC:2 - chrX 21087603 3' - mdg3 5287 2 63.64 ATTTGGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATACAATCATTACAATTTAGGAACCTAAATAGAAAAATTTTATGTTT:1 + chr3L 23354492 3' - F-element 85 1 65.75 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCATGGAGAGCC:1 + chr2R 12472137 3' - transib2 44 1 54.79 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAAAGAATTTCAAAATTA:1 - chr3L 24131345 3' - Transpac 4930 2 75.34 AGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCTAAACTAAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACTAGGAGATAGCCGACCTAAGCCTAGTAGCAGAGCAGTGACAAT:1 + chr2L 1051426 3' + rover 228 2 69.18 AAAAATTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTTTCGGCCATTTTGAGCTCCATTAATTGGT:1 + chr2R 9967159 3' + Bari1 1673 1 62.33 TTTTTTTTATTAACATCTATTTATTCATATGTTTTTTTATCAATATGTAAAACAAAACAAAAAAACAAAACTATTAACAATGAATGAGAAAAACAACTAAATCCAAGAAGTAACCACTTACCAGAAGGATTTGTTTGGAGCAATG:1 - chr3R 26058462 3' - S2 1621 1 73.79 TGCAAAATTCAAGCCCAAGTGAAACCATCATATAAAAGCGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGATAAAAACCTTACATATGTCTGTAAATAAAACAAAAGGAAACAAAAAAAAAACAAATTAAAATCATAAATCTTTAGCC:1 - chrX 2674538 3' + Porto1 65 1 71.23 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTAC:1 - chr3R 25616544 3' + roo 406 1 58.00 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTAT:3 + chr2L 20266024 3' - roo 76 2 71.92 TTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGG:1 - chr2R 8099135 3' - jockey 4816 1 56.16 ATAAAATAATTTTTAAAAATTCACGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTAAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCACTCGAATTAGCTACCTAATTCATTATGAGGCGTGTCGGTCTTTACATTAATTGTAAACTGAGCTCAGGG:1 - chr3L 23245544 3' - 1360 3089 1 61.64 ATGTAGGTACATGTCTAAAGTTTTTCTTCTTTTTTTTCATTTACCGAGCTTTTTTAGTGATTTTTCTTTCTATTTAGTTCACGCCACTTGAAAGAACTTAAATATTTCTCCACACTTTGCCTTGTCGCCATCGCCTTTTACCGAA:1 + chr3R 23561002 3' - mariner2 808 1 85.52 AGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTC:1 - chr3R 27405979 3' - diver 75 2 66.44 TAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCC:1 - chr3L 24131402 3' - Transpac 68 2 68.49 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATTCGCGGTTGAAATGGAAACACGACACGGCGCACACAAAACGAAAAAG:1 + chr2R 7850088 3' + roo 402 1 79.45 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATAAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGT:1 + chr3L 18505751 3' - I-element 52 1 52.05 TTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAATAACTCTCACGCGCAAATTTTATTAAATTCGCCTTGCAAGTTGAAAAATTAAAAATTAAAATCGTCTTCCGGCCGCAAAGTTCGAACCGCGACGATACAAACATTTAATTGACAA:1 - chr3L 11896185 3' + TAHRE 83 1 75.34 GGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5375 1 58.99 AGTACTGTCCTCTACCCACTAAACTATAATTTTTTTAAATTTATTGCCATTTTAAATACACGAATTAACTTAACCAAACTCACTTTTTTAGATATTTTACTTAAAATTGTATATTTCAGGTATAAAAAAAAAAAGAATTCACAAAT:1 - chr2R 7066059 3' - HB 348 1 58.22 GTTGCTGTGTACTTATAGGAACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGCTTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATCGATTTG:1 + chr2L 11878392 3' - blood 7042 2 56.67 GTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCAAAAACAAAAAAAAAGAAGTGGAAAGAGGTTTGCAAGAGAATAGGGTGGTGAACCCATAAATCAACAACGGTTGATGAGCAGAAACCAGTTTGGGGACTTAACCCTTTT:1 - chrX 4569911 3' + Doc2-element 182 1 75.35 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGAACTGTATTTCTCAATTTAT:1 - chrX 18009904 3' + 412 7514 2 41.78 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAATTTCAAT:1 - chr3R 13972915 3' - 412 27 2 67.81 TTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGTTTGTTGTTCTGTGCAAAACTTGTCTTCACTTTCGTCGGCTCATTTCAATAGTACGCTGATTGCTTTAATTTAGCACCCAATTGC:1 + chr3R 9170581 3' - jockey 310 1 75.37 CTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTTGGCAGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGTTTGGGCTAAAAGCAAAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAG:1 + chr2R 22774586 3' + jockey 4795 1 60.84 ATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAAC:1 - chr2L 16858700 3' + Burdock 6330 2 59.59 ATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACACGGAAAAACAAGTGTGCAGCACACACGGATTGAAATGTTTGCCAATGTGTGCGAGCGTCACCTAAATAAACAACAA:1 - chr2L 5799818 3' - micropia 5144 2 51.37 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATC:1 + chr3L 9269980 3' - copia 4936 2 63.70 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAANGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGC:1 + chr3R 21933229 3' - pogo 74 1 69.18 CCTAATCTAGTTAATATCTAATTTGATAATTTGCTTGTCTGATCAACTTTGTGTGCTAGCTATATGTCTGCATAACTTTCATCTTAACTGTGTCTTTTACAAAATATATATAGTATAAACATCTATAAATTGCTTCGCTCCACCAA:1 + chr2R 13865102 3' - I-element 5243 1 78.08 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACAT:1 + chr3L 20898602 3' + roo 331 2 76.81 AAATAAATAAATAAATAGTAAATGAAATCATAAATACCTGCATTAAATAAGCAGCAGAGTGAGTTATTAAAATCTGCTTAGAAACGTAGTTTATGGAACTTTGCTTGGAAGAGTCCTTCGGCCATTTAGAGTGTGCCCGGAAT:1 + chr2L 6176243 3' - copia 224 1 63.64 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGC:1 + chrX 10319720 3' + mdg1 7411 2 52.05 TTTTATGATTTATATTTTATTTATTTTTTTATACTACCTTATTATTTTATCACCTGATTATCATTCAATCTCATTAGATAATAGAAATCCGCAAGGAGTTTGAAAAAAACATATGGATGATATTGTTTT:1 - chr3R 21596965 3' - copia 189 2 64.34 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACG:1 - chr3L 12249774 3' - roo 8697 2 61.64 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCCCATCAGAACTTTGGAAACGGGACTGGGGG:1 - chr2R 16817834 3' + 412 473 2 69.86 CACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATAAAAAGGGGAATGGCATATAAAACAACAATTGAAGCTTAAAAATG:1 - chr2L 19633359 3' + Tirant 397 2 69.66 ACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTTTATATATTAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACCAC:1 + chr2R 4189075 3' + S-element 1698 1 56.47 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGGTTC:1 - chr3L 16662387 3' + jockey 4924 1 65.75 GCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATACATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATTATTCCAGACACAAGATGGGTTTCAAAGTGGGGCAGCTAGAATATTCACTGCGGCAGATTGTACAATAC:1 + chr3L 8729198 3' - accord2 7559 2 54.93 CCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAGAAATCTTGGAATAAAAGTATTTACGAGTCTGTTTATTAATTATTTTGTATGTCTACAGTTATATTCGCCAAGA:1 - chr2L 7715605 3' + F-element 4350 1 49.32 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCTTTTAA:1 - chr3R 6625660 3' + flea 4995 2 71.92 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAA:1 + chr3R 18478718 3' - pogo 48 1 54.79 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGGTTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTG:1 + chrX 18336664 3' - mdg3 5330 2 67.12 TTATAATGAAAATTTAAGTATGGAAATTTAAAATATGGGCAATTTGTATGTATGTACATACATATATTTACATTTTCCCAAATGTGTCTGTGATTTTTTTTTGTATGGAAACGCAGACAGTAGGAAAAACGTAGCCAACAAAAAAG:1 + chrX 14014266 3' - looper1 1648 1 63.70 ATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAACGATCCACCGATATAGCTGCACAATCAAAATCGTG:1 - chr2R 24320770 3' + mdg1 255 2 75.00 AAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTC:1 - chr2L 4003708 3' - mdg1 85 2 76.71 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGGCTTGGTCAGGGTATGATTC:1 + chr3R 27123590 3' + roo 9022 2 51.37 ATGTTTTCATAGCACTGCTATTTCAGTCAACACCAGAATTTCTGCCTTTTAAGTTGTTCTAATCTATATTTTAATGATATTATAAAAACTCTTTTGGTCTGGGAAGTACGCTAAGCATGCGACCAACGACCCACTCGTGCAAGCAC:1 + chr2L 14575285 3' + HB 1415 1 60.27 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTGCATAGTGCAGCTGCGACTCGAGCTGCAGTCATGCAGCAGTCAGAGAAATCAGGCCAGAACAAAAGTCGCAAGAAACATAAAATGAAAACT:1 - chr2R 15651866 3' + hobo 2910 1 52.05 ATTTTATATTATTGATTTAAAATATATTTTGATATATACATATAACAGCCTGTATTACTCAGATTTCAAGTAGCTTAAAAAATCCACAAGTGAGCAATAAGGACGTGCCTGCGGAAATGAAAATCTCTCTTTCATTTTATCGTCAT:1 + chr2R 13104973 3' - G7 1145 1 78.08 AAACTTTCTTTGGCTATTCATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCACAAATATTAATACAATTTCCTTTTAGTTAGTTTGCCTTTGTTATGCGCACATATATCTTGTTTTTAATTATATG:1 - chr3R 28239930 3' + diver2 326 2 50.68 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGC:1 - chrX 21087603 3' - mdg3 5317 2 67.81 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGTCCCCGGAGCATTTGTGGGTTTCTGTTT:1 + chr3L 21327198 3' - copia 35 2 56.25 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGGGGCTGTT:1 + chr2R 18316158 3' + HMS-Beagle2 7170 2 61.48 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCC:1 - chr2L 6654655 3' - diver 5956 2 62.33 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCC:1 - chr3L 18505663 3' + I-element 5320 1 58.42 ACACACACACACACATACTCAGCGTGGTAAAAAATGCAACAAACGGATTAAGTGCGATGATGACGGGTCTTTTTGAAAGAGGGAAAAAGTGAAATTCAATTACGGGGGCACAGAGACAAAAGCAATTACAGCAACAATGCCAAAAA:1 - chr3R 24425494 3' + accord 187 2 71.92 TTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAA:1 + chr3R 26504307 3' + HMS-Beagle 194 2 60.94 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTTCTGTGTGTGCGCTGTTGCTGTTGTTGTCACT:1 - chr3R 25709724 3' + hopper 1399 1 73.29 CTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGTTACTACCATTGACCTAATAAGTAAAACTTTTTTTACTTTCCACATTCATTATAATACTTTTACAAGCTGCTTTTCCAT:1 - chr2R 20100103 3' + P-element 187 1 57.53 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATC:1 + chr2R 6622634 3' + S-element 1632 2 76.71 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGAGATAATTCAATTTTTAAACATTTGGCAT:1 - chr2L 3675805 3' - Juan 4045 1 67.12 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATAATAAATATATTATTTGATCA:1 + chrX 14310362 3' + roo 394 1 58.90 AAGAAAATATAATAAAATAAAATAAAAAATGGGGAAAATAGTGCAACGAATGTCATTCGCATTGCACGCCGATCTTGAAGTTTATGGCGCCCGCAACTTGCTGAAAATTATGAATTATGATGCTGCGGAGTCTTTAATATCATGAA:1 - chrX 14127909 3' - transib1 1901 1 72.60 TAGATACACTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAAAAAAATTTTTTTTTTCATGTTTTTTTATGAATTTTTATTTCATTTTCCGTTACGAGTTTTCTACGATTTTTTACTGCGCCTTTCGCGTAT:1 + chrX 16508685 3' - Stalker2 7240 1 58.22 CAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTTGTTTGTGTGAGATTAGAGTCCGGGAGTATCTGCTTAAAGAGGCAAG:1 - chr2L 15779507 3' + hopper2 1542 1 71.03 TAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTAAGGCAGCCGCAAACAAAGAACATTTGCCGAATGTAA:1 - chr3L 9755927 3' - F-element 4241 1 74.66 TATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGAT:2 + chr3R 24729630 3' - Juan 4174 1 82.88 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAG:1 + chr2R 23780640 3' - Ivk 22 1 66.42 CGACGAGCTGGTAAGTCTGGCGTTGCCAGATCAGCGGTGCGATCGTCATTCGGCCGCGCGCCCGTTGGGCGCGAAATTCAAATTCAAATTCAAATGTTAATTAATTACTAATTATTTAGTAATTATTATTATTTAATTATTATT:1 - chrX 12705585 3' + Rt1a 237 1 65.97 CAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTG:1 - chr3R 20675820 3' - jockey 4907 1 52.86 TTACAATATAATAATAGTGATTAACAAACAATTTTAAGGTGGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCTGTCTCTGGTGAAAGACGTTTTATGTAATTCA:1 + chr3L 10419406 3' - Burdock 458 1 76.71 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTTTTTAAAAGACGA:1 + chr2R 5531234 3' - 1360 72 1 67.81 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCAT:1 - chr3R 9298479 3' - hopper 75 1 68.49 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAGGATGGCAGC:1 - chr3R 30946477 3' - Transpac 27 2 67.12 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGCTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGAGTA:1 + chr2R 10411416 3' - 297 47 2 78.79 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAACAAGGTGGCAATGCCTAAGAAAAG:1 + chr2L 13158759 3' - roo 8706 2 56.85 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCTTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATAT:1 + chr3R 15791020 3' + roo 9024 2 52.74 ATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTT:3 + chr3R 23067496 3' + roo 8684 2 67.81 ATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGA:1 - chr3R 11040036 3' + Bari1 1664 1 56.16 GAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTATAGCTCTATTCAAAGTTGAATTTTTTTTAATTATTTTAATATTTACAGATTTTCTATACACGTAACTT:1 + chr3R 31381212 3' + hopper2 1169 2 67.74 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCG:1 - chr3R 27405983 3' - diver 79 2 69.18 CTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCTCCGAATTTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGTGCTAGAAGCACGAAGGACGTCATT:1 - chr2R 5182951 3' - INE-1 566 1 63.01 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGCGTACACTGTGGAAAAATACGATGATTCTTTTGGCCTCATACAAGTTCATGTACTTGTT:1 + chr2R 22514254 3' + P-element 2881 2 78.77 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCC:1 - chr3L 13836615 3' + 412 7480 2 63.01 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGG:1 - chr3L 1692003 3' - blood 7056 2 53.42 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTC:1 - chr3R 15790852 3' - roo 8734 2 66.44 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACG:1 + chr2L 13158720 3' - roo 8744 2 73.79 ACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTAATAAAATCTCTAACTTTCATAACGACCTATACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATGAACATTTCCTAACAATTCTCAGTTGTTCGCT:1 - chr3R 29234787 3' + gypsy7 384 1 78.77 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCACTGAGAAAAAATGTGTTTGTTTGTAATAAGGCTTGGAAGCTACACTCTTCTGGAAAAGGCAATCAAATAAAGAACTCCCAAGTAAGAATAA:1 + chr3L 13295891 3' - roo 8742 2 54.79 GCCACTATAATCTCCGAAGTCAAAATTGTGTAAATAAGAAAACTGAGCAATATAAAAAACATTTCTAAGAAAAGTGAAAAATTGAACATTGGTTTATTGAATTTAGAGCCAACTTTTGTATCCTTTTGGCCCACATTGAGGTTACA:1 + chr2L 16602724 3' + Osvaldo 1262 2 79.45 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATTT:1 - chrX 18817263 3' + transib2 2783 1 54.29 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAGCATGCTAATGACAAATTGAA:2 + chr3R 7719860 3' - roo 8686 2 70.55 ATTCTTTTATTTATTTAAAAATATAATGATAGTTTTATAATTCGTATACGTTTCCTTCTTGACGCTTGTCCTATTTATTATTACCAGGGCGCTTCTCACTTTTTTTTATTCTTCCCATTTCATTTCGTTCTCAACTTTTCTTTTTC:1 + chr3R 18341005 3' - G7 1143 1 69.86 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGT:1 + chr2L 3234065 3' + roo 9021 2 52.05 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAG:1 + chrX 21224625 3' + roo 9032 1 57.27 AATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAG:1 - chrX 6116264 3' - transib2 80 1 71.92 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAAT:1 + chr3L 21380640 3' - I-element 44 1 55.48 GGAATTTTGATTCGTTTTATTGTTTGTCTTGCCCACTCAAACCGCCCAACCGGTCACGCCCACACTTTTGAACAATTTTTAAATTTTTTTTCATTTTATTTCCCAATATCTC:1 - chr3R 3321689 3' + 17.6 7321 2 71.43 CATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGT:1 - chrX 12066123 3' + transib2 2682 1 49.32 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACCGACCACC:1 - chr3R 11469281 3' - Tabor 6861 2 66.15 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAAAATGGTGTGCAAGTTTCCACATTCATAGATACTTTATTCTTACTTTCTTTCTTTCTATTCATATGAGAAACAGCAATTTCATAGTATCTACCTATGACAAATAAACAGGTAA:1 - chr2L 15076054 3' + 1360 3380 2 78.77 ATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATAT:1 + chr3L 24486374 3' - Quasimodo 98 2 61.64 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATACAATCATTACAATTTAGGAACCTAAATAGAAAAATTTTATGTTTGTTATGTATGCTAT:1 + chr3L 23354506 3' - F-element 71 1 57.53 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAATTGGAAATTT:1 + chr3L 5389981 3' - roo 33 2 58.21 TCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGT:1 - chrX 15200800 3' - 17.6 6942 1 71.11 ATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAA:1 - chrX 3431883 3' - G7 1145 1 63.01 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGC:1 - chr2R 10161777 3' - transib2 53 1 53.79 ATTTGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATT:2 - chr3R 10736043 3' + McClintock 401 2 71.23 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAG:1 - chr2R 15326843 3' + copia 227 1 58.62 AAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGCGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAA:1 + chr3L 20187391 3' + FB 495 1 56.84 TATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGTTTTCTTGTATATA:1 + chr2R 21116633 3' - mdg1 7039 2 32.88 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCT:1 + chr3R 19073280 3' + roo 9007 2 63.01 AAGTGGCTGCATCGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATATTGTCTTTGGTAACGGGTATCCAACAGTCGGAGAACTCGACAAAATCACTCCCTCTTGTTCTTAAATTAATTTACAACATTTACGAGCTAATACTTACAAAA:1 - chr3L 23128367 3' + 1360 3346 1 60.96 GAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGAAAAGTGGAAAGTGGGCGGAGGCGGTACACCCACGTCGTTGCAAAAATATACGACTTTTTT:1 - chr2L 16945784 3' + hopper2 1202 2 58.22 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCTAGTCGTAAACATTTTCGC:1 - chr3L 18930959 3' + I-element 5303 1 54.11 CAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAG:1 - chr2R 18514889 3' + P-element 344 1 40.77 AAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTGTTAAT:1 + chr2L 5460090 3' + Dm88 4386 2 41.78 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACGGACACTGGTGCTCTAACTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAACAAGCGATACAT:1 + chr3L 18403067 3' + P-element 2859 1 52.14 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGATTTGGCTGCAATTGGATTTCTATGACTAGATTTTCTGAT:1 - chr2L 1300661 3' - GATE 38 2 47.75 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTC:1 + chrX 8360606 3' + roo 8989 2 75.34 ACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCTATGCCCAGCCGGAGTTTCCCAATTCCCGTTCCCATTCCAAAGGAAAGAACACCCGAAAACCCATTTCAATGTCAATGCAGCTGTTTGCCATTGACAAA:1 + chrX 4190174 3' + accord 85 2 73.19 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAG:1 - 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P-element 92 1 21.23 GAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGCGAATCTGCTCCTTCCATTTGCTGTTAGTCAAATGGGCATTATTATGCTCGTCAAAAATCGGAATTTTGCCATACC:1 - chr3R 31832282 3' - roo 9026 1 52.05 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTACGAGTAAACGGTATAAATATGTATAATTTGTCAATACTACCGAAGAAAAAGCAAAGATATTAAAAAAGATCACAACAGGATACTTTATTACTCATAAATTAAATGCGCT:1 - chrX 20526807 3' - INE-1 10 1 76.71 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGG:1 - chrX 18396053 3' + roo 9038 1 53.42 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAA:1 - chr3L 2989944 3' + roo 338 2 65.75 TATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAGTCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAATATCAAAAATGTAAAATCAAAATGTTTGTCTAT:1 - chr3R 22027648 3' - Doc 4669 1 75.34 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTT:1 + chr2R 21410984 3' - 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Burdock 14 2 58.33 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAA:1 + chr3R 26178459 3' - 412 76 2 68.49 AATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCTCTGCGTCTCTTTCGGTTTATGTTAATTTGCATATTTTCTTCGTTGGTTCGTTCGTTTTTTTTTCTACGTTCTTATAAATGAAAAATAATTGTTGAGCGTGTCTACAAAAT:1 - chr3L 14320307 3' - Quasimodo 7272 2 77.40 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTACTCCCTTCGCGCGCGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTTATATGGGCGGTGGTGGGCGGGGCAGAACTACCAAGCTGGGAGTAACCATGTATCG:1 - chrX 6513321 3' - hobo 2709 1 79.07 GAAAAGTCCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCAAAAAATGGAGGACCATCCTGCATGCATGTTTCATTACTTTAATTGAAATTATTCCACAATTATATTGAACATATTTGGGTGCAATCA:1 - chr3L 14386777 3' - Cr1a 269 1 56.16 GTTTGTGTGTGTGTGTGTTAGTTAATTGCAGATCCTCGTCCTTGCAGGGCTATTGCGTTTGCAAACAAAA:1 + chr2L 6362778 3' - Quasimodo 35 2 90.00 GAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTT:1 - chr3L 21655901 3' + HMS-Beagle2 233 2 71.92 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGG:1 - chrX 7795511 3' - roo 8710 2 59.09 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCG:2 + chr3L 24208212 3' - Quasimodo 57 2 61.64 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTC:1 - chrX 21632969 3' + mdg1 366 2 56.55 ATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTT:2 + chr2R 2875245 3' + TLD2_LTR 111 1 69.86 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACAGTATATAATTAATTAGAA:1 + chr2L 11839778 3' + mdg1 7445 2 75.00 ATAATATTATACAACTAGTTTCATATGCTCCTTTTTAATTCCGTAATTTAAAATCAAATTTGAAATAAACTCAGTGTATCCAGAAACATACAAATACACCATGGCAGCT:1 + chr3R 1208853 3' + transib1 478 1 71.56 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGCGAAACC:1 - chr2R 8735589 3' + mdg1 7405 2 69.11 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCCCGTTGCTGTACCGTTCCCACTCGCTTGGTCGCGTCGTGGCAACATGCTG:1 + chr2R 20349102 3' + transib2 2809 1 71.92 ACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATCTGATAGATGCACTGGGTGATCTGCTCGGCGC:1 - chr3L 21915372 3' + I-element 5003 1 73.55 AGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGTAGTCTGAACTGTCTCCATGTACTATAATT:1 + chr2L 47245 3' + roo 401 1 78.77 AGAGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACAGAATACTTGCAATACCTTTAGCTCAAAGCACTTAAGCTAAGC:1 - chr2L 15081388 3' + hobo 2 1 50.68 GTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTCTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTATTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTTGTTAGAACAAGGGGGGCGTGGGCATCCGTTTAGGAAAATTAGCTGACGGT:1 - chrX 16201283 3' + Cr1a 159 1 60.77 ATAAATTGTAATTATTTACTTATATAATAAATGTATCTTACATGTAATATATAAGATATAAAGTGATTTCACAAATTTACGTTTGTTCAACGAAATAAAGATCATAATGGATTCACTATTCGCTTTATTTATGGCGTAAGGAAACT:1 - chr2L 14523065 3' + HMS-Beagle2 7196 1 72.60 TTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTT:1 + chr3L 20187433 3' + FB 486 1 56.85 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATT:1 - chr3L 5389869 3' + roo 9014 2 64.23 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATCCTAGTGTCTTTGGTTAGATCGACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATGTATATACTTATTATGGTCAAAAACCTCTGCTTTTGCTTTTGCTTGTGCTGGCTGCTCCGCACCCACATTT:1 - chrX 5157408 3' - 1360 14 1 68.49 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTGCCGCTATTGGAATTTGCAAATA:1 - chr2L 12341800 3' + BS 5055 1 56.85 ATTGTTGGTTTAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTGTTTTGTAAACATTTTATGGTGTCAGCTTACAAGACATGATCGGGGTCGGTCGGGATCGAGTCCTAGGCGATGCTTAAA:1 - chr2L 14637489 3' - I-element 164 1 59.72 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACAT:1 - chrX 18396039 3' + roo 389 2 61.64 TAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGCAACTCGCGCGATCTCGCCCCGAAAAAATATAAACAAATTAGCAATAAGAGATATTTTCACATAATCAGTACTTTCCGAAGAAATA:1 + chr3L 25483005 3' + accord 7362 2 60.48 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAA:1 - chr2L 7660935 3' + I-element 5270 1 74.66 ATTAACTAAATTCAATTTGCTTTTAAATGTACGACTAACATATACAAAATATTTAATTTAAAAATAGGTGAAAAAAAAAACAAGAATAAATTGTTGTCCCTAGGTTC:1 + chrX 6780914 3' - TAHRE 44 1 64.49 ATAAACACACACACACACACACACACATTTTTCGCGCTTGTCATTTCTTGCAATGTTATATAATTTTTT:1 - chrX 11523933 3' + accord 7027 2 75.36 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATCCCTGCCACC:1 + chr3R 29084972 3' - 412 62 2 68.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCCGCTCCAC:1 + chr2R 7850037 3' + roo 398 1 63.64 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCT:1 - chr3L 2989951 3' + roo 331 2 70.55 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTA:1 - chr2R 20010157 3' + Juan 4192 1 67.81 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAA:3 + chr2L 13844254 3' - Stalker2 7314 2 60.27 TTTTCCTTTTTTTTTTTATTTTTGCAGCCCCCCGTTCCGGTCAAAGGTATTCCATTC:1 - chr3R 11316107 3' - Doc2-element 246 1 84.21 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTG:2 + chr3R 10270691 3' + Juan 4180 1 63.70 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGG:1 - chr3L 21327069 3' + copia 234 1 53.79 GGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGGGGTGGTCTGAACTTGAGCAAATTGAATGCCAGACAGAGGCA:1 - chr3L 7530707 3' - Quasimodo 143 2 71.23 GCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCGGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAAGTCACGACGACTAC:1 + chr2R 6482505 3' - gypsy 85 2 73.94 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTA:2 - chr3L 9809217 3' - 412 7084 2 63.01 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATATTTGAACAACTGGCG:1 - chrX 8360482 3' - roo 16 2 74.66 GCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGTGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATTTCTGATTCT:1 + chr2R 20802705 3' + mdg3 222 2 67.12 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATGATATACCTTGC:1 + chr2R 21681417 3' - roo 38 2 56.62 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGTTTGCTTT:1 + chr3R 23881693 3' - FB 36 1 53.08 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGC:3 + chr3L 11326796 3' - pogo 39 1 56.16 GCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGG:1 + chr2L 20640286 3' + Stalker4 201 4 65.97 TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTACTTCAAAATCAAAATCGAGCATGGGAAA:1 + chr2R 10191554 3' + hopper 147 105 87.50 ACTATGACAAAGTGTCACAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAAACTTTGCTGGATGTATAAAATTTAAATTTTAATCGCCAACAGTCGGCAGTTCAACGGAGGGCAA:1 - chr2L 12294042 3' - Stalker 67 4 42.36 GAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACCACCAGCAAAACGAAAAACCAGCAAAGTTAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAAT:1 + chrX 3646354 3' + TAHRE 10405 1 54.11 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTGTTCATTTAAAATTTTCTCGTTT:1 + chrX 17343447 3' + I-element 5266 1 81.51 ATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGGAGTTCAACTGTGCAAAAACTACTTAAATATTAAGCAACTTCGGCAGAACACACTTCCTC:1 + chrX 10319188 3' - mdg1 7038 1 52.13 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTG:5 - chr2L 10156135 3' + hopper 1328 2 77.40 ATTTTGACTGGCTTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCATTTCAATTATTTTTTTCTTACTGCGAGCTTACCTCCAATGGCTTTCAATTGATGTAGCCAATTAACTGAGACGGCAATTACTGCCTAGTCGATAGATAGTCTGCCAAG:1 - chr3R 9422171 3' + baggins 5125 1 72.60 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGACATGAGAAGATTCTT:1 + chr2L 18347432 3' + transib2 2809 1 73.97 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCCCAAATTCTAT:1 - chr3R 25616463 3' + roo 9054 2 73.29 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTTTGTGGTTCCACACAATTTT:1 - chrX 14771679 3' - BS 17 1 65.52 AATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGGCAATAATTGTTAGTTGGGCAAACTTGTTTTACGGTATT:1 + chr2L 8555100 3' - Doc 148 1 74.29 AATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGT:1 + chr2R 18316147 3' + HMS-Beagle2 7191 2 71.84 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTC:1 + chr3R 18488439 3' + roo 8983 2 82.88 CCCTAATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGG:1 + chr2L 22684583 3' - transib3 79 1 66.42 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGCAA:1 + chr3L 26290963 3' + Tabor 7246 2 68.49 GAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAACGTCTGGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCACTTGGGAATTGTGAGATTTCTTGACCTTCTAACTTGTATTTGTATTAATC:1 + chr3L 5403611 3' + GATE 8392 2 60.00 TAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGAAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGGGGTAGCAAAGATGTGGGGCATTTTAATACTGTCATCATCATC:1 - chr3L 5061505 3' + 17.6 470 2 66.90 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAA:3 + chrX 11661524 3' - pogo 31 1 64.38 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACAGACAACCAAAACACCCACCCTTATAAGAAACATAACCGAAACTAACCCAACAGACAACCACAAGCTC:1 - chr3R 3920479 3' - roo 8709 2 53.57 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAAT:1 + chrX 2479569 3' - mdg3 5331 2 69.18 AATCTCAACCTTCTAGATTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGGTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTTTCTTCGGCCGCACGCATTGCCACA:1 + chr3R 3586596 3' - INE-1 164 1 62.07 AGCCAAGGACTTAAGATTGTAAAGATTTATAGGTTTATTTTAATTTGATGTCTTAGTAAGTTTTATCGAAAACGTTAAGTTGGTCACATCTGTTATTGTTTGTAACGTGCATTTTATTTAAAGTATAATTGTCAAATGCG:1 - chr2R 9759260 3' - NOF 3927 1 44.29 AAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCC:1 - chr2R 5410965 3' + Tc1 1353 1 58.62 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATT:1 + chr2L 17005792 3' - Stalker2 76 2 66.44 TTGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTTCAACTCTGTCATCGGTATTTGCCTCAAGTTTGTGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTATTTGTATGGGTTAATAGTGTCCCCACTAGACCGCACTATCCAAACAT:1 - chr2R 13748682 3' - Porto1 4538 1 71.03 AAAGCTATTTCACAAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTAACCCGAAGACAGGCGATATTCAAACGAGATGGAGATTGGGCGACTGGG:1 + chr3R 16727814 3' - copia 360 1 60.83 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGA:1 - chr2R 22034607 3' + copia 238 1 73.10 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCGTCGTCACTCTCTTGGTT:1 + chr2L 3234066 3' + roo 358 2 51.37 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACTT:1 + chr2L 14523289 3' - HMS-Beagle2 15 2 43.15 AGGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCGAGCTATAACGAGCCAGTCAGCAGGGAGGAGAAAGGCTGAGCACTGCATGTACGA:1 - chr2R 16689467 3' + flea 4744 1 61.29 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCT:1 - chr2L 9636069 3' + 412 7493 2 51.03 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCACACAGACACGT:1 - chr3R 31886802 3' - hopper 24 1 70.55 AAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAAT:1 - chr3R 14298643 3' + rover 273 2 70.55 ACTGTATTAAATATTAGTGTTAATAGGATCTAATTATGTTATCAAAAAGTTAATATTGATTGCTATTGAAAATACAAAAGTTACACTTATGCAGTGCGTTTTTTATGATTGATTCTCTTTAGAAGATGTTTATCAGTTACTCACCT:1 + chr3L 6741682 3' - Cr1a 4302 1 67.12 ATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTAAAGTGTTCATATTGAAGTTAAGAATGCCATTTGAATGGAGATAGTAATCACAGTAGTATCTTATTTAATTACGGATAAATTAATTCATTTGATTAAGACTAAGTAGTTCAATTTTAACCAAAT:1 - chr2R 12644666 3' - X-element 333 1 72.60 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTC:1 + chrX 10167467 3' + roo 344 2 60.27 AAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAATATCTTCTTGTCTCGTTTTTTAAAAATAAAATTTGTTACAATTTTTGTCCCAGCTTTAAACTGATTATCATTTACATT:1 + chr3R 12971218 3' + HMS-Beagle2 6862 1 54.55 AAGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTGTAAAAAATCAATATA:1 + chr3R 13406560 3' - pogo 18 1 68.49 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:2 - chr2L 21750457 3' - GATE 34 2 78.08 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCC:1 + chr3L 3983867 3' - P-element 91 1 26.72 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCTGCACAACTTTAAAGGAGCGCTTGTGG:1 + chr3L 23906508 3' - 1360 24 1 49.65 CAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTATATCCCTAAACAGCATA:1 - chr2L 15550643 3' - Bari1 44 1 56.16 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGAC:1 - chr2R 17926303 3' + opus 7439 2 67.12 TTTTTTTTATATTTTATTTTATATTATTAAATTATTTTATATTTAAGATCAAAAGCGTTCTTCTGTTACTTTAAAGCAGATTCGTTGACCTTTATGCTTGAGTTCAACAGATCATCTGACCAACGTGGTTTTCAATTAACCTTCAA:1 - chr3L 18321040 3' - BS4 726 2 78.08 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTT:1 - chrX 19539468 3' - pogo 48 1 53.42 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGG:1 - chr2R 11159262 3' - roo 73 2 69.86 ACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGT:3 + chr2R 2875209 3' + TLD2_LTR 73 1 49.32 CTATTTACTAAAATCATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAA:1 - chr3R 556455 3' + Tc1-2 1543 1 70.55 TTTTTGTTTTTTTTTTTATTTTTGATTCCCGATGTGGGGAAAGATTCTGGCAATGGCTTCAAGGTTATGTCGAAATCTATATG:1 + chr2R 9418882 3' - F-element 4686 3 87.95 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCC:1 + chr2L 10156206 3' - hopper 65 1 62.33 AAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTGATTTAAGGTTGTGGGTAGGTAGATATAGGTATACATAATACATAATTACATATTAAATAATTGCTTTGCTTTTGTCATTTCTTATAAATGGTA:1 - chr3R 29793861 3' - I-element 154 1 69.18 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTT:1 - chr3R 19073191 3' - roo 8733 2 67.81 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCTCATACTCTGAATTTAAAAAAGTTGGGTTAGGTCCTAAAAACAAA:1 + chr2R 5074629 3' - 1360 14 1 75.34 AAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGGCCAATATAGCCA:1 + chr3R 5368725 3' - 1360 22 1 71.23 AAAAAAAAAACCAAATGAAAACATTAACAACAATCAACACGAGCTGCAATTGATAGCAATTAATAATTGCCTATATTTCATGTTCGCTAGTGTGGAAAATCGCAATTGATCGAAATTCGCGTGATTGATGTATGAA:1 - chr2L 7993366 3' + Porto1 171 2 45.59 ATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCCATTCTGACATTTACACGTCCTCGTGTAAGCTTTTGATACCGAGATACCAAGATATCAAGATCACCTACTTTCATCACAAACAATAACTTATGGCATTAGCTATTAACCGACGATTAG:1 + chrX 357482 3' - micropia 3 2 74.66 GGAAAACTCACTCTAATAATATCCATCAGCATTAAAAAAATTTCCACGCCCGCAGATTATAATTTTACAACGACACAAACTTTTCACGACTAAACGACGAATGGCGCGACAAAGCGACGACGACAAAACGACACGACTACCAATA:1 + chrX 12736219 3' - Gypsy12A_LTR 360 1 62.07 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCA:2 - chrX 1263907 3' + Burdock 6368 2 67.12 ATAATAATAATAATGATAATAATAATAATACTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCACAATAATAATAATAATAAAAATAATAAACAAAAGAGGATAGCAAAACATCGAAGGCAGAAAAAACGCACA:1 - chr3L 9554484 3' + mdg1 38 9 65.07 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAG:1 + chr3L 13739639 3' - BS 5074 1 71.92 ATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCG:1 - chr3R 9557501 3' - G2 3012 1 58.33 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTTTTCGTTTTCGGCTTG:1 + chr2L 12984254 3' - hopper 27 1 65.07 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCAC:1 + chr2L 20840078 3' - mdg1 55 2 54.48 AATTTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTCTTTGAATCAAAAAATGTAT:2 - chr2R 5883556 3' + 1360 3041 1 47.26 GACTAGGCTCTTGATCCTGATCAAGAATATATGTAATATGAATGTAATTTTTATTTATTATTTCAAAGCTAAGTTTAAGAGTATTGACTGCTGTTTCGGGGGTTTTTCCTCTTAGAAATCTGAAAATCCGCAATGCAATTTTCTAC:1 + chr2R 17212715 3' - INE-1 92 1 60.27 AGAGTAAACAAAACACAAATCCGTAAATATTGCAACTGCGTTCTTTGATTGTACATATATTCTGTTCCAATCCTCTTAATGTATCAAGCTAACGCTTAAAAATCATTATATATAAAAT:1 + chr2L 22732308 3' - Cr1a 202 1 66.10 GATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAATCAGATCATCAATTTAAATCACATTCTAAATGTGTTCGAGATCAATCACAATGCCCTGGCCACACCTTTCGATG:1 - chr2L 18727517 3' + Stalker 6891 4 51.37 ATTATGTTGAGGTCTGGACCTTGAGGTGGCTAATCCAATGTGTTTACGCAAACATCTTTCAGAAACTTCGTAATCAGTTTGGCCTTATGACCGAGGTTGAAGTGATGGCCGTAGCTGACCCTAATACGGAAGTTGAAGTTTTGG:1 - chrX 20780691 3' - Tc1-2 1167 1 60.42 ATAATATATAGTTAAGTTCAAAATAGAATTTACAAAATTTTTTGACTTTATGCCAAACAAAAAAGGAAATCTGGACCAGTGTGCAGTGGTCAAAATTAATTCACAATGCGACACGGCCTTCCTTCATAGACTCTCTAACCTTCAAA:1 + chr3R 1146228 3' - transib3 60 1 72.60 CAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTAT:2 + chrX 19980669 3' - X-element 4567 1 73.29 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTT:2 + chr3R 8890090 3' - FB 88 1 77.40 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACA:2 + chr3L 18768510 3' + S-element 1634 2 79.45 ATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGA:2 + chrX 3431983 3' + Ivk 5340 1 54.11 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAA:1 - chr2L 17005686 3' + Stalker2 359 2 47.95 ATTATCTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCTAACGCAGCCTTAATTATTGTACTTCCCGAC:1 + chr2L 11580324 3' - invader4 417 1 63.49 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATTTTCGTTAGCCCAAGGCTGATATTGCTACTTTAATAGAATCAATAGCAAACGTTT:1 + chr2R 14653297 3' + 297 6959 2 69.86 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGG:1 + chrX 10521727 3' + Tabor 421 2 60.27 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAATAAATAGCAACCAACACCAAAGGGAAGCAGG:1 + chr3R 25709908 3' - hopper 24 1 64.38 TAGCAGTTTACGACTGACCGGACTCGTATATGTTGAAATTCGCCCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTACATACAAATGTCGCATGTTCTGTGATGTAGCATTTCTTTGTTTGTACACTCC:1 + chr2R 14282154 3' - Rt1a 67 1 54.48 AGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGCATGGTCGCTATATACATAGTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' + R1A1-element 5100 1 69.86 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTT:1 + chr3L 2145981 3' + roo 337 2 64.38 TGTAACAGGCAGAAGGAAGTGTTTCCGAAGTATATAAAGTATATATATCCTTGATCAGGATCAAGAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGGAAAAATCGAGTGAAGTGCTGTCAGCCTCAGAGAATGAACGCGGTCGCCTTTT:1 + chr2R 4756732 3' + INE-1 31 1 67.81 AAACAAGAGAGAATGCTATAGTGGAGTTCCCCGACTATTGGATACCCGTTACTTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTGTAGGTGAAAGATGGGCTTGCCCTAAATTCTCGGATTGCCAGCAGACATGCATGCTTGTGCATCCTTA:1 - chr3R 14674665 3' - INE-1 581 1 48.28 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTATTAAAAGTTTTCAATTCAACTATAATTTAAGATAA:2 - chr3R 20167530 3' + roo 394 1 72.60 GTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCTGCATGCCTAAAAAATCCTCTAAAACTGTTGTATATCTTTCGATAAAATCACTCATTTCTAGTAAG:2 - chrX 13000104 3' - roo 8803 2 54.79 AAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTT:3 - chr2R 7244832 3' - diver 81 2 72.60 ATTTTTTTAATTTTTTTAAGATGCTGCAGTCTATTTTTCGATGCTAAATACCATTTCTTGTTTCAATATTTCAATTCCATTCTTTCGATACAATCAAGATGTATAAAATGAAAATTGCTTTGTTTGTGGCATAAAAACACGTTCTT:1 + chr3R 18991564 3' - HB 320 2 76.71 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGATAAGATATATAAGACCGCCAAAAGAATCTGCTTGTCTAGCTTTTAAAGTTCACGAGATA:1 + chrX 20373675 3' - 297 6639 2 64.38 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACA:2 - chr3R 31886832 3' - hopper 54 1 56.85 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTACGTCTG:1 - chr3L 12315699 3' - transib2 38 1 58.22 ACCTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACTAAACACACCAACAATACCTAAATCTCAATTCATTACCAACTATTTTAACAATTTAACAAAAACAAAAC:1 + chr3R 10119260 3' + I-element 4891 1 81.51 TGATAGGTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGAATTTTGTCCTGACACCTTCTTCTACCGGCGCTGCTTTCTTTTTGGTCACCCT:1 + chrX 14028221 3' - mariner2 757 1 61.76 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTG:1 + chrX 8360627 3' + roo 9010 2 60.96 ATTAATTTTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTAGTTTCTACTACGGCTAGCTTTATCTTTGCGCTTTTACATCCGAGTCGATTCCAGATAGCCATTTATAACCAGACGGGAAATTTTTACGAGGCCGT:1 + chr2L 21296537 3' - HeT-A 35 1 69.93 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTATCTGGGTTTTGCATAAAATTATTTTCATTCACATAA:1 - chr2L 1665491 3' + hopper 1382 1 45.04 GTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTAGAGTGACGGATGCATAATAAAAATTAACGCTCTTCTGCGCCCCCTTCAAAAAAGAAATTCCCGCGTTTGTGTTTGGGTCACAATTTTTCTATT:1 - chrX 18991665 3' - Porto1 252 1 61.31 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGCTATTACT:1 - chrX 661847 3' + 412 442 2 52.74 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGAGGGATGTTGTAAAGATTATGCTTTTTAAAACATCGGTTAAAT:1 + chr2L 13844284 3' - Stalker2 26 2 58.82 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTC:1 + chr3R 25433362 3' - transib2 83 1 72.60 TTGTGATTTGTGCAGTCGTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGTTTGTTGTTGTTTTTTGAAAGTTTCGCTTGAATGTTTTAAAAGAAGAAGGCGATCTTGTCAAAATACTTTGCCGACTAGTAT:1 - chr2R 4887370 3' + Cr1a 150 1 69.86 TGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGGGGCGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAA:1 + chr2R 12185427 3' - accord 52 2 51.37 AACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAA:1 + chr3R 16519004 3' + Tirant 356 2 53.42 AATAGAATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAAAAAAGAGAGGAATACGCAATGCAACTCACACATGGCCACGAATTGTGCAACTAGATGATGACGGAGCAGAAGAAGGGGGGAGAAAAAGATTTGACACTTGATTCTGGCTG:1 - chrX 14996977 3' - 1360 3260 1 74.10 AGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGT:1 + chr3L 3501857 3' + Bari1 1686 1 64.38 AGTGCAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCAAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACAT:1 + chrX 22689440 3' + 1360 3358 1 50.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTT:1 + chr3R 24219352 3' + roo 9054 2 54.12 AAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCAT:1 + chr2R 5532334 3' - G4 3793 1 57.48 ATATTATTATATATATATATATATTATATATTATATATATATATTATATATTATATATATATATATGGTTTGTGTTTTTAAGAGAGTGTAAATAATAATTCATTCGTAGGCAATGCTATATTTAAGATATTATACATTTAGCAATT:1 - chr2L 17295009 3' - Dm88 22 2 61.64 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATT:2 - chr3L 18046625 3' - roo 8748 2 77.40 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCAGACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGAAGAGCATTTACC:1 - chr2R 4362787 3' - F-element 71 1 55.48 TTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGTGTAGATGTAATATTTCTATCGAAAGAGGGGGAAGTAGAAATATTTTATTTTTTATT:1 - chr2L 13907313 3' + baggins 5126 1 39.04 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAA:1 - chr2L 4063846 3' + roo 9000 2 67.81 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTT:1 + chrX 11661485 3' - pogo 69 1 67.81 TAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTAACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAAAACAAAATCTGACAACAAATGGACGCAAATTCACACATGCCGTGGCACATAAATTTATGGTTGG:1 - chr2R 14211688 3' - invader4 2638 1 58.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAATCACGCAATAT:1 + chrX 7795649 3' + roo 9052 2 69.50 TTATATNATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGAT:1 + chr2R 12472100 3' - transib2 81 1 72.41 ACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTTACTTTTGCATCTGCAGACCCGC:1 + chr2L 15763142 3' + mdg1 7073 9 77.46 TTTATGATGAATGGTGACATTCTTTCGAAAGAGTTATTGTCTTTCCTTTTTATATCGGAATTGGAATTGGTATTGGTATGGGAATTCGAATCTGAATCGGAATCTCCACCCGCCACCCACAAAATCGAGTGATTTGTATTCGTTTT:2 + chrX 18674161 3' - I-element 296 1 69.86 GTAGATTCACTAGAAACAATAAACCCCTTACCTTAAAGCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACTAGACTTTATCTTATTATCTTTAATCTTGACTCTCTGCCTGTTTATGTGTACACATTCATTAAAATGTCGAACATCGA:1 + chr3L 5715282 3' + Cr1a 4116 1 56.16 GGGGGGCGGGGGGGGGGAGGAGGGAGTTGCTTGAGTGTATTTTCTTACGAAAATTTAGAGGTTGCTGTTTATAGCTAGTTTTTAAGGTATTGAGTTTCAAGGACAG:1 + chrX 1151068 3' - 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chr3L 11913210 3' - BS 5076 1 73.29 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGTCGCAGTAAAAACACTTTATAAGTGGCCACC:2 + chr3R 29690809 3' + I-element 5313 1 50.68 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAACCAGCAGTTGTTGTAAC:2 - chr2L 11298011 3' + I-element 5325 1 64.38 GTGGGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAATAAA:1 + chr2R 12185469 3' - accord 10 2 76.03 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGG:1 + chr3L 21327188 3' - copia 9 2 72.22 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCGGGTGGCT:1 + chrX 18239429 3' - jockey 67 1 57.53 GAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTA:2 + chr3R 21630340 3' + I-element 5284 1 67.12 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATG:1 + chr3R 31653167 3' + roo 348 2 60.27 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCG:1 - 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chr3R 31886848 3' - hopper 69 1 67.59 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGC:1 - chr3R 4461014 3' - blood 33 2 55.28 AAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGAC:1 - chrX 21639617 3' + gypsy5 7316 2 54.24 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAG:2 - chr2R 22034648 3' + copia 5065 2 60.27 GTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGCAACCGA:1 + chr3R 1844821 3' - Cr1a 199 1 78.77 GTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGA:1 - chr2L 22121319 3' + I-element 5326 1 57.93 ATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCG:1 + chr3R 30987570 3' - F-element 141 1 66.44 AGCAAGTTGTTCAAATTTGTTCATCAAAGGGAACTGGAGCGTGCGTATAATTTTAATAGATAACATTGTTTTCTTTTTTTTAGTATTTT:1 - chrX 13947223 3' - hopper2 1202 2 79.78 ACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATCCCCCTATTTTCAGACATGTGACTAACGATGATTTTTAAACGAAGCCCTCTATATATAACACCATTG:2 + chr2R 6622700 3' + S-element 1698 1 73.29 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTGAAAAAGACACTCCTGCGGTCAACGGCGAGTGAGTGAAAAAAGGT:1 + chr3R 17973868 3' + 1360 3317 1 76.03 TTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATCTGGGGGTTGGCAAATGGACTTTTGCCGGCGTAACCGAAACAAAAACGAACGGTGGA:1 - chr3L 6849250 3' - Stalker 92 4 47.95 TTTGCTTTCGCTGATTTAGTCAGACCGTGAGCGGGAGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCGGCCGGTCCCTCTCCAGCGGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATA:1 - chr2L 14026171 3' - F-element 490 1 68.85 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGGCCAATATAGCCATTTTG:1 + chr3R 5368730 3' + 1360 3379 2 76.26 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCG:1 + chr3L 22723972 3' - HMS-Beagle2 6911 2 65.07 ATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGACCCAATGCTGGGTCAGCACTTTGATATTATGTTTCATGCACTGAGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGTATTTTTTCACACATGCCTTTGCACCCAGACGTTGCCTGTCAAATTA:1 + chr3R 17457417 3' - Gypsy6A_LTR 91 1 67.81 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTG:3 - chr3R 19992608 3' - hopper 36 1 59.59 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGA:1 + chr3R 19032685 3' + roo 335 2 71.03 GATATTATGGGATCCGAAGTATCCTTTGCTCTGTGAAAGAGATCTGCGAAGCTACAAATCCATACGCTACCTGGTAAGTGAAAGGCATAAATATCCGATATGAGGTAAATATATCAAACAATGCTGTGGCTTCCATCTTCTCCTCT:1 + chr2L 18073679 3' + hopper 352 1 62.33 AAAATACAATTTTTTTTCGTTGGGAAGGACAGGCAATGGCAACTACGTAAGAATAACATGAACTGCGCTAAATGCACAGACGTAGCCAGTAGACAGTTACTCACAAAAAACTGCTCCCACCTATGCAAACCCAATCGAACCCA:1 + chrX 1645979 3' - S2 25 2 67.83 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCTTGCTGAGC:1 + chrX 19074889 3' + mdg1 383 2 56.16 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCATT:2 + chr3R 13973062 3' + 412 444 2 52.05 AAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTCAGCAAAGCCCAATTTTCATTATCTTGAGTTTAAAGTGTTGCTATCGCGGGCTGAAAGAATTAGACCCTGAAATTTCATTTGCATACTGTGTTTGGGTT:1 - chr3L 21769318 3' + I-element 5079 1 70.71 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAATGGTGTGAAATTAACATTGGGATTTG:1 + chr2L 14671909 3' - FB 69 1 69.18 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGGTGCAATCGGATT:1 + chr2R 14051902 3' - roo 8673 2 75.17 AACCAACAATAATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACCCAGGTTCCACGTTCAATAAAAGCTTAGAAAAGAGTTGAGCAGAATTTTAAAAGCCCCTTCCACCAGTTGGCCAGCAATTAAGCCAGTTTGTAACAATAAATT:1 + chr3R 25577348 3' + I-element 176 1 73.29 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCA:1 - chr3L 19454931 3' - mdg1 7105 2 61.64 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTATTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGTTTGCTTTTTAGCTAGAAGCGCTTAGTCATTGGAATACACTTTAA:1 + chr3R 23881730 3' - FB 15 1 71.23 GATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTTTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTTAAAATGTTTATCTGTAGGACAGATAAACATTGTTGCCCCCATAACTGAAGTGATAAGT:1 - chr2L 2227494 3' - mdg3 292 1 58.90 ATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCATCATCGGAGCATTGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCGTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGAAATCAAGTCGAAGAAATTGGGCATCTTAATGAGAGAAAAAACGAGTATG:1 - chr2L 22158279 3' + R1A1-element 339 1 71.23 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAA:2 + chr3R 14860209 3' - BS 5072 1 69.86 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGGCATTTTTTTAAATAACATTTTCCGAGTA:1 + chr2L 19675082 3' - 297 44 2 57.53 CGATGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGA:2 + chr3L 18125993 3' - Ivk 62 1 56.16 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTT:1 - chr2R 330103 3' + HMS-Beagle2 262 2 53.42 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGC:1 + chr3R 13973035 3' + 412 7470 2 68.49 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAAT:1 + chr2L 19924027 3' + roo 333 2 66.44 ATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACACACACACACACACACATACACAAGGCACACACGTCGAATCAAGAGCACATAGATACACTAACA:1 + chr3L 5691928 3' + mdg3 5300 2 54.21 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGAAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAAGAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTACTTTGG:1 - chr3L 2989914 3' + roo 397 1 66.10 TCCTACTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGTCTTTTGCATTCCTTTTTACAACGCTTCTATTGCAATTTTTTCACTTTGCTTGTTTGTTTGTCTTGAGTCAACTGCTCTTTGTTTTTTC:1 + chrX 21251288 3' + S-element 244 1 74.48 GGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGACTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAA:1 - chr2R 5106317 3' + 1360 3360 1 55.10 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAATAAATTTTCACGTTTATTTATTT:1 + chr3R 27843280 3' + I-element 5322 1 52.74 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTC:1 - chr2L 18226790 3' + roo 330 2 72.60 AATCTTAACTATAACAGGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATACGCTGCGGTTTTCTAGCATGCATTACCATCAATGCAAGTTTTTCGCCAAATACGCTGCTGCT:1 + chrX 17076977 3' - F-element 4610 1 60.00 CTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTAAGTTAAGAAATCCATTAACCATTTTCCGGCTGTATGTGTGAGTGGGTGTGTGCTAATTTAATCGTGGACAAAACTCTTGAAAAATTATTTACATGGGTTATTCGTTCAGCTTTTTG:1 - chr3R 22960337 3' + accord2 7467 2 72.73 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCC:1 + chr2R 12779707 3' - I-element 75 1 67.81 GATCTTGATAAAGAAGTAAAATATATCAGTTAAATTATATAGTTACCATAACATGAAACTATAGCTCTGTTGTGCAAGCTATATGCTGAATTTAATATTCATAAATTTTAAAAGCTCAGCTTAGGCGATGTATTTTCGCCCATCTC:1 + chr2L 1728004 3' + P-element 2569 1 64.38 TTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACACCAGCTTTAACGCGGATTTAGGATATTTAAAACATTTTATAAGAA:1 + chr3L 22035602 3' + 1731 4554 1 66.67 AATCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTACAACAAACACAAAGAACTTTGTCAAGCGGAACGCAAACTCAAATGCGCAGAACAAAAAAAAGCAGCAGGAAAAGGGGAGGCAACAACCATCAACAACA:1 - chrX 17178378 3' + Doc2-element 297 1 66.44 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGATATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATA:1 + chr2R 4785331 3' + Juan 4160 1 50.68 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGTACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGC:1 - chr2L 809665 3' - jockey 62 1 57.58 ATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAA:1 - chrX 21472693 3' + P-element 197 1 15.75 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGC:1 + chr3L 25401027 3' - Doc 31 1 51.85 ACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTCTATGATCCATGATAGTCCTGAAATATCTTTTTAAGACAGACTTATACTTTCCCA:1 - chr2L 7355075 3' - I-element 5215 1 64.38 CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTA:1 + chr2R 5479972 3' - F-element 95 1 71.23 GTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAATTGATAAACAAACAATAAATTGAACATCGAATCGGTTGTAAAAGCGTTGGTGAAGGATACTC:1 + chr2R 20343523 3' - transib2 284 1 64.38 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAATTTTTTTTTCCTCTGAATCTGTA:1 - chr2R 5941286 3' + copia 238 1 71.92 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTGC:1 - chr3R 19992607 3' - hopper 35 1 60.27 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTTAGAAACTTAAAAAA:1 - chr2R 5941312 3' + copia 5084 2 55.56 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCACATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACGTTC:1 + chr3L 3983905 3' + P-element 2861 1 59.66 AAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGCTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCACCTAGTTCTATTCCATTGCCTGTTCTGGATGGTATTTTGCAAACACATGGAC:1 - chr2R 11973456 3' - HB 70 1 67.81 AAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGCGGGAGGCGGGAGGCGTAAGGCGGTCGGGTGTGTGGAGCGGCGGGGGGG:1 + chr2R 16616425 3' - I-element 4928 1 55.21 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTATTAA:1 - chr3R 20167561 3' + roo 9026 1 51.37 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACAACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCGTGGGGATGG:1 - chr3L 8453756 3' - FB 82 1 72.60 TACATATTTACATATTTATATATATATATATATATTTATATTTGTATATTTCTTGATTGAGATAATGGGCCGGAAAAGTTTGAACAACGAGGACAGGCGAGAAATTGTGGCCATAATGAAAATGGCTAGGAAAATTAGTCAAATAT:1 + chrX 10131971 3' - G3 4500 1 84.93 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTG:1 + chr3R 24450523 3' + 412 440 2 54.29 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAG:1 + chr2R 11804756 3' - pogo 32 1 63.19 GTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTGGCGCAGTCGGTGTGATCAGTGTTAAAGTTCCTTAATGTAAATGGGCCTTGGTTCTCGAGCCCAAGTGCT:1 - chr3R 28154125 3' + 17.6 7364 2 72.60 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCAGCGGCAACTCGAAACTCCCAGTTGGCAGTCCTGGAGTCCGAGGCTGCTGCTTCTGCTTTTATTCAA:1 - chr3R 28385518 3' + transib2 2772 1 54.79 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGG:1 + chrX 18336698 3' - mdg3 44 2 56.16 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCCCAGTTCCCTCGGTAACGACCCGCTCG:1 + chr3L 16211628 3' + transib2 2792 1 62.22 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTT:3 + chrX 7795625 3' + roo 359 2 52.05 CATACACATATATATATATATAGGTGGGCCTAAAGCTGTGTATATGTATATGTACTATGTGCATATAGCTAAATTTATGCGTACGTATTTTTGGCCATGCGCGTCTCCAATTTGAACCAAAAAAAAAAGGCAAGGAAAATAAACCG:2 + chrX 14589975 3' + Stalker2 251 2 55.48 GTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTA:1 + chrX 23182919 3' - Idefix 65 2 65.07 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAA:1 + chr3L 6397768 3' + roo 9039 1 57.81 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCT:1 + chr3R 14860239 3' - BS 5040 1 53.47 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACGTTCGGTTCGTTCGCATTTCTTCT:1 + chr3L 3983925 3' + P-element 2870 1 71.54 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAA:2 - chr2L 13556328 3' + transib2 2774 1 52.74 ATTGGTAAAATAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCAGCAAAAAGCGAAAGGAGAATATTTGAGTGCGAAGGCATCATGAGCTCATATGTGTGTGTTTGTGTCTGGGTGTGGGTGAAAATAAGCACGAAAATTCCGCAAGCATAAA:1 + chr3R 22192843 3' - Tc1 1476 1 75.34 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATAT:1 - chrX 8360496 3' - roo 30 2 65.07 CCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGAT:2 + chr2L 7098192 3' + G6 1958 1 59.59 ACGCAATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCGCACATCTCCACTTTCTCGCTAAGTGACAATATATGTTCGACCATTGAGGCTTAGTCTTCTACTTACTGTGAGTTTGTTTCTTCGGCAGCTTGACCTTG:1 + chr3R 26282861 3' - 1360 6 2 58.62 ATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAA:1 - chr3R 24381312 3' - Juan 4177 1 63.01 GTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAACCGAAAATGGGACTTTTTCTTTCTTGACCATACACAAAACAAGCGCCAATCAAGGAGACATCAAAACCGTAACGAAAAACTCGTTTTTAATTAAAGGCA:1 + chr3L 19200559 3' + accord 352 2 69.86 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGCACTGCACTTTGGCCCAGCTGTGATTTCAGTAATGGTTAATTAAAGTTATCGCACATCGATGTG:1 - chrX 10405202 3' - hobo 56 1 56.85 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGCTAGATGACACATAACTTCAGGGAATTAAGGCGGTTT:1 + chr2R 13168776 3' - P-element 23 1 70.29 GAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGACAAGTACAGGGATATCACGATGCACTCGTGCTTGATAAATTGTAAGCTTTATGGGATGAGCGATGGCTACCATTTACTGCCAAA:1 + chr3L 17940890 3' - 1360 3153 1 63.01 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGTCGAAA:1 + chr2R 16929836 3' + jockey 4973 1 55.86 CAGTGTGTAAACCGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGC:1 + chr3L 16973482 3' + S-element 1708 2 71.17 TATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGTTATTAT:1 - chrX 14722080 3' + diver 6079 2 63.01 AAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTTAGCTTAGTTCGAAAATATACGA:1 - chr2R 24169910 3' - transib2 1 1 52.74 TATTGAAATATCACCTTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGGGTATGAGTTAAAGTCAATGAAATGCGTAGTTTATTTCAGTTGTAAATTGGTTTTCATGTACAATTATTTTTGATGACTTTACGCCAT:1 - chr3R 1006057 3' - I-element 5018 1 61.64 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGG:1 + chrX 8308492 3' + roo 9005 2 65.75 GCACACACACACACACACACATATAATGTAGATGAAGAACAGACAACCCAGAGCCCAGAGTCCAAAGACCAGAACCGAGAACCCAGAAACAGAAACAAAACCATTCAAGAACGATGTCGGCGCTTGAGGTGCGAGGGTCTCACCTC:1 + chrX 4223878 3' + accord 183 2 74.66 GCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTCCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTTGCCTTTTAATTTGAGTTTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTTATT:1 - chr2L 6647645 3' + mdg3 5444 2 59.20 CTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAATGTTCGATTGTGGCTGTGTGGGGAAGGAGGATTCAGTTCGGGGGGGAGTTATTATGTGGTACTAAGTAGCTGTTATATTGTCAAATCATCATGAAATTATTATTCGAATC:1 + chr2L 4835072 3' - Doc 492 1 60.96 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGAGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTTTTTAACTGCACAATAGCTACACATAACAATGGC:1 + chr3R 27986467 3' - roo 8696 2 61.59 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGGCA:1 + chr3R 8075971 3' + 412 7476 2 67.86 TATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGTGCTTTTGATTTGGATTTGGATTTGTTATTTTGCTTTTGATTAGAGCGAAGGGAAAACGAATGCAAATCGATGGAAACCGCCTATTGTTGTTCGGCCGCCAGGGGCAA:1 - chr3R 26916215 3' - hopper2 1324 1 76.55 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAAT:1 + chr3R 3920586 3' + roo 344 2 62.33 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTC:1 + chr2R 9158134 3' - mdg3 5325 2 65.07 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTG:1 + chr2L 21328274 3' - 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hopper 74 1 68.97 AATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAACTAAAGAAAATAAATGCAAAAAAAAAAGGGGGCTACGTATAGCAAATATTGATTAAAACTGAACGTATTTACACTCAATCAT:1 + chr3R 23724510 3' + G2 3009 1 58.90 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAA:3 + chr3R 13973053 3' + 412 7488 2 56.16 TATATATATATATACAAATATATATATAAATATATATAACAGAAATGTGTCGATATTTTTTTAAGTCGATTGGTTTTTGAATGATTACATAACTTGTTAAAGTTTTCAAATAATTTTAAATGAGCCTAATTCTATGGTATTGTTAT:1 + chrX 15869856 3' + Stalker 6937 4 78.08 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAA:1 + chrY 2720338 3' - 297 51 2 80.95 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGCCAGCAATAATTTTGAATTCATTTCTG:1 + chr3L 22325940 3' - hobo 23 1 69.86 GTTTCCAGCTCCAGCCCAACTCAACTACAAGTGCCACAATAATGAAAATTCCCGGGCCCTCGTTTGCGAGTGTGTGTGGTTGTGTGAAATTTTCGTGTAATTGATGCAAAGCATAAGCGAAGGGGGAAAATTCAACTGGGGTCTCT:1 + chrX 10905950 3' - baggins 167 1 40.41 TATGTGTGTGTGTGTGCGTGTAATTGAAACTTGTTTCGCTGTTGTTGTTGGTGTCGAACGCCTGCAGCGCGAAAATCGGTGGCATGTATAAATTGCGTCAAATTAGACAGAAATATTTAATTAATCTCGCCGAAAGTTGC:1 - chr3L 17305015 3' - Quasimodo 38 2 60.71 AATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAAGCCAGTCTATCACTTAATCGGAATAATCTACAATGGCTCAGGTAGTG:1 - chrX 20000616 3' + mdg1 7367 2 64.44 CATGTACCTACATTATAAAAATAACTAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAATAAAAATATAAATATGTCTCTTTGCTCCAAAAATTATTTTATAAAGACGCAATTTGTATACACTT:1 + chr3L 20745234 3' + mariner2 817 1 52.24 GCCTAAATTTGAATCTTTTTTTACTAGACGAGGTGCTACATTTTGCATTTTATGAATTCAAATGTATTTCTGGGGTCGTCCTGGCTGAAGGCTGAAGGAAATTCGACTTAATAACCCAAGCCACCTGCGACCTGTGCCCCCACAG:1 + chr2L 14947736 3' + Tc1 1461 1 53.79 GGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAACAAAAATCATTCAACTTGCATTTAAAAATAAAATGATCGAAAGGATTCATGGTTATTCTTC:1 - chr2L 20781626 3' - I-element 140 1 56.85 GTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATAT:1 + chrX 20999574 3' - BS 74 1 72.60 CTCATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTATCATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTA:2 - chr2L 15004794 3' + INE-1 136 1 54.79 GTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCCGTGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACA:1 - chr3L 25782394 3' - F-element 109 1 83.56 AATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAAAGAATGAAAAGAGGTTCCGTTTCGTTTATCTCATGTTTTGGGTGCATTATATAAAACACTTT:1 + chr3R 16686710 3' + invader2 432 1 61.38 CTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACTTCCCATTTCCCCCAAACCCCCGCGACTCGTTTGCATAAACAAATTTGCAGCGCCATTTGCCGGCCGGTTTCAGTTTGCC:1 - chr3R 26504953 3' + HMS-Beagle 6674 1 70.59 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTTATCAAGTGCATATAAGTAAGATTTT:1 + chr3L 19274935 3' + transib2 2809 1 74.48 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAGCGCTGA:2 - chr2L 71156 3' + 412 446 2 52.74 AAAATGTTTTTTTAGCCCATAAAGAGAACAAAATACTAATAATTGCAAGTGATGTTATTGTAGAATATGGTATAAGTTCCACAGTTGGTTGCTGCTATATGCGTTGTTAAAATGTTAATAAGGCTCATCTCTAGCGATTGAGTTG:1 - chr4 313902 3' + Transib5 2735 1 64.14 AGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 5394 2 60.34 ACGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAATTATAAAATATTAAAAGTATCAAGAAATTACAATATGTATACCTGTTATTTGGCGCGTTAAATACCTAGCTTATATAAAAACAATTACTTTTATGAGTAAGT:1 - chr3L 24365651 3' + INE-1 123 1 71.23 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCGTA:1 - chrX 15357615 3' + hopper 1393 1 68.49 AATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACC:1 - chr2L 11298055 3' + I-element 5281 1 71.92 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTTTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAA:1 + chr3L 18505732 3' - I-element 71 1 67.12 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAA:1 - chr3L 16690905 3' + I-element 5292 1 63.70 AAAATTGTTTTAATTTTTTTTATATTTTTTATTTACAAAGCAAACAGCATGGCTTCAATAGCTTTTATTTTCTCTATATATATGTATATAGCTGGTAATTAAATTGCAATTGATGCATGCTAAAAGTTGATGGCAATGTCGAATGG:1 - chr3R 18003784 3' - HB 323 1 78.77 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACAAATAAGTTAACATTCCAAAGTCA:1 + chrX 1341780 3' - 412 14 2 76.03 ATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCCTATGATATGGGTCTAT:1 - chrX 21993553 3' + gtwin 407 2 66.44 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATT:1 - chr2L 20265930 3' + roo 9019 2 55.48 TGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGGGGGGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTG:1 + chr3L 23224522 3' - X-element 4419 1 64.38 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACT:1 - chrX 12986556 3' + roo 8986 2 77.40 GAATAGATCAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTGTTTATATTCTTTTTTTTTTGTAGTGCGCTCCAATTTGCATTTGTTGCACTCATGTTGTTACGGATATTTCTCCTAATGGCTTTGATCTTGAAT:1 + chr2L 4885790 3' - Tc3 1621 1 56.16 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCATAAAGTAATTAAATGTCGAAAATGAGACGCGCGATTTGAGCCTCTCTTCTGTCTGTCTGTGTGTTTCTCTCTCGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTTCATAATGACGTACAACTTCTTCTGCGTTC:1 + chr3R 10585387 3' - accord 180 2 75.34 AATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAATTTTATAGATTTCCATTTAATAGATTTTTTAGTTAAGTTTTATAAATATTTAGGTACTTACGATTT:1 + chr2L 14358904 3' + diver 210 1 58.22 AAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGCTCATGCAACTCCTAACTATGAGTCTACAACGATTTAAGATAAGGAGCATATAAATTCTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACTAATAATAATAAGCTTACAAATAA:1 - chrX 16677446 3' - Cr1a 4199 1 48.63 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAAAAA:2 + chrX 21100305 3' - mdg1 13 2 77.40 AGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCACAGCAACGTGACTACAGCTGCGGTCAAGATAGTGTAAAC:1 + chr3L 4269938 3' + micropia 249 2 73.29 ATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGTTTTTTAAAATCTAACCATGCTTACACCACTAAATTCAATATTTGTATTACTTCTTTGGTTAACCTTCTTTATTTCCAGTGCATGCCCCTTCCTGTCCCAGAATTAGT:1 - chr3L 15320999 3' - I-element 5190 1 62.33 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAAAATCGTGTTCATGTGTGACCAGCGCGGCTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTT:1 + chr2L 20266010 3' - roo 8731 2 69.92 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATTCAATCT:1 + chr3R 19225127 3' + HMS-Beagle 213 2 60.96 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAG:1 - chr2L 14074432 3' + 297 6929 2 54.48 AAATGTCCAATAAACGAATTAAAAAAAAGATATCTATATATACTAGTTATATTTGCATAGGCAAATTGAAGGAACCACAGGAACCGTTTCATGGTAATAAACTCTGTTTTATTGGCGCCCACTAAAGAATCATTGTGATCATTGGT:1 - chr2L 6867976 3' + Rt1c 5415 1 52.74 ATAGTTCCTCAGATCTCGACGTTCATACGGCTAGATCGAATCGGTTATTGATCCTGATCAAGAGAACACTAAAGAAAAACATTTCATAAAAAGCTGGCAGAAAAGGGGGCCTGCATTCTACCAAAAAAAAAGG:1 - chr3L 21877152 3' - INE-1 143 1 56.39 AAAATTCAAATTAAATTAAAAATTGAATTATTTCGTGTTGTTTGCAGCTGATTCTGAAAAGTTAGAAATATAATAAAAACTTTTTACTTGTCTCACCTTATGCATATATAGGACTTGCTTATTTCGATAGATTTATTTAATCCTTC:1 + chr3L 14568217 3' - Rt1b 125 1 48.63 ATTATTAATATTATTAAGATTATTACTAAAAAAATATATTTGATCTTTTTTAATAACTTCATATACCAGTTGTATTGATGTGTAGAAATGTCATAGAAGAAATATATTTTTTATTAGCCAAAGTAATTTCTTTCACTGCATTCCAT:2 - chr2L 3844945 3' - mdg1 7077 2 73.97 AATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTT:1 + chrX 21087674 3' + mdg3 5480 2 58.10 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAG:1 - chrX 10319600 3' - mdg1 7093 2 56.16 AGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 17183686 3' - diver 5971 2 72.60 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTAAAT:3 + chr2L 23381792 3' + flea 5007 2 80.82 AGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAGATACATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTTACATTTACATACCAGACTCCAAATTTTTAAAAACGGTCAACATTTTATTGGCATATTCATGAAAGTTGGCAAAAAA:1 + chr2L 20559469 3' - HB 66 1 55.48 TATATATATTATCGTTCTTATATGGATAATTGAAA:2 + chr2L 3854300 3' - Helena 51 1 97.14 GTCAACTGACGGGACATTTATTAGACTCAAATAAAAAATATTGTATTGTATTGTATTGTATCTTGTGTTCGTTTTGCAACCCTAACTTACATTACATTACATTAATTCTAGTGCTATTCAGCTCTTATATTTAATTCGATTCGCCT:1 + chrX 12946320 3' + 297 364 2 79.45 AGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGGTAACAATTCTTTGC:2 - chr2L 13585669 3' - Idefix 19 2 70.55 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATA:3 - chr3R 6625692 3' + flea 204 2 56.16 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAGTCCGC:1 - chr3L 22960426 3' + Tirant 8452 2 55.17 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGC:1 - chr2L 18226800 3' + roo 320 2 79.45 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGT:1 + chr3R 22590617 3' - rover 6975 2 68.49 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGGGCATTTGTTGACCTTTTTTCTGAATTT:1 + chrX 9530428 3' - 297 31 2 58.91 CTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAATCGCGAGTCATGGACATAGCCACTGCTCATTATGTAAGAGAGCGGCTCTCTTTTAATTTGGCAAATTTTTCGT:1 - chr3R 31885334 3' + hopper 47 1 55.48 TCATCGCCACGTACTTACGATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTT:1 - chr2R 21410895 3' + Burdock 6302 2 78.08 AAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAAGACGCTAGTTCGATACTTTAACAGTT:1 + chr3R 31398040 3' - Juan 76 1 66.44 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGTTTC:1 + chr2L 14523292 3' - HMS-Beagle2 11 2 46.90 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAA:4 + chr2R 11164495 3' - roo 71 2 70.55 AAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACAGCTTAATTAAAGATACCATTTCTGAGATACATTTAATTTAGCTGTTTA:1 - chrX 19463682 3' + I-element 4964 1 61.72 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTA:2 + chr2L 23381789 3' + flea 245 2 78.77 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAA:2 + chr3L 13365841 3' + BS 5039 1 56.85 GCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCG:1 + chr3R 15790113 3' - flea 4731 1 67.41 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGGAATCAGG:1 - chr3R 4682871 3' - Burdock 46 2 51.37 CAGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTATGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAAACAATTTTTGA:3 - chr2R 4887631 3' - jockey2 3017 1 72.60 AATTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAG:2 - chr3L 17567893 3' + S-element 111 2 72.60 ACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAATGCTCGAGTGCCTATCTGGTTTTTCACTTAGTCAGCATTATGCAAATGCG:2 + chr3R 18960821 3' - accord 257 2 79.45 CATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGATTTTCGCATA:1 + chr2L 7098201 3' + G6 1986 1 48.82 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGA:1 + chr2L 12818355 3' - hobo 38 1 58.22 ATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCACTATTCACTATTCACTATTTATCGCAATTACTATTTGCGCTTATATTTCCGTACTTTACTTTTGCAACAAAAC:1 - chr2R 4582641 3' - 1360 3140 1 57.53 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTT:1 - chr3L 6518572 3' - 412 7131 2 70.55 AATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCATATTTACGCTTCCATTGCGATGCAAAAGTTTTTTCTTGGCTCACATGTATGCATAGTACGAATAAATAGAAAATGCTGAGGGAA:1 + chr2L 1932877 3' - FB 912 3 60.96 TGTGGTTTTTTTTTTTCATTTTTTTTCTTTCTTCGTGATTAGCACGCGCC:1 + chr2R 24947294 3' - gypsy7 5011 1 60.00 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGACAT:1 + chr2L 18347420 3' + transib2 2806 1 71.53 AGAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTATTTA:1 - chr2R 9966920 3' - Bari1 2 1 60.96 TATTTATTTATATTTATAATATTCAATATGTACGAGTAATACGGAATTTGTTGTATAAAATATATAGTAAAAAATGTGGGTGGGAGTGTAATTGTTGTTGTTCGTGCTGCGCTTTAGACAGCAGAGGTACAAATAATAGTGATGAT:1 + chrX 11268373 3' - mariner2 826 1 63.70 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTGTATCGTTATCGTCTT:1 - chr2L 22193375 3' - roo 8684 2 73.97 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAAGGAAGAAAAAAAATT:1 + chr2R 9158122 3' - mdg3 5337 2 73.29 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGATTACACGAACTTAGAACCGGTTTATTTTTTTATATTATATTTAT:1 + chr2L 6654759 3' + diver 6068 2 50.71 AATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTTGGATGGGTGGAGAAACTCAATTAAGGATACATTTGATGGCACACTCTCATCCGTACATATGTATGTATGTACATACTATACCCAAGCA:1 + chrX 19535909 3' + Dm88 382 1 71.92 AAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGTTATATATATTTACAATGTTATTATATCATAATTAAGTCAATTTCTCTTTTCCTACTTGGCCGCTTTGTTGTTGTTTTGGTTTTGGTTTGCTTTTTTT:1 + chr3L 2656805 3' - I-element 5318 1 66.44 GTGGGTGGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGGATTCTACGAAAAGCAAAGCAAATGAGTCAATTATGGAAAATGTTTCAAAGTCGAATCATGAGGAGACTATAAACAAAAGCAGCAAAGAG:1 - chr3L 12845084 3' + HB 351 1 65.75 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTA:1 - chr2L 21299289 3' + roo 357 2 56.16 TTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGCTTGGTTTCGCAAAGTTTTCAGGGTTGCCGGACTAGGGTTTTTGCCAATGCATACTTTGAGGCTATTATTTCAGGCCGCTTTTTTTTCTATTTTTTATTTGCTGCA:1 - chrX 4238750 3' - I-element 5151 1 73.97 AGGGAGTCAGTCGAATACTAAAGCTGAACTCGTGAAGTATCATATAAACCAACCGGTAGTTCTCAACGAATAATAGGACTGCTAAAAATAGACGTGGAATATATCTCTTTTAAAGCCACCCAGAGGGTTAGTTATTTAAAAGCGG:1 - chr3L 7607939 3' + invader2 5012 2 69.66 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGC:1 - chr2L 14074431 3' + 297 6929 2 54.79 AAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTTCCGTACCGAAGTT:1 - chr2R 18514838 3' + P-element 379 1 71.23 TTGTATAATGCAAAAAAATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCTCTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTGAAAGACCTTAAATAGTGGCAAAGACATCTCACAGACTTGGCGCGCTGCATTTGTC:2 + chr2R 19979604 3' - P-element 2482 1 42.47 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTTATC:1 + chr3L 19274913 3' + transib2 2786 1 58.90 AATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAAATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCTCTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTCGACGTATGTAAATGTCAAATTTTCTTTTACTTTGCAGCAAAAT:1 - chrX 2009938 3' - P-element 2494 1 15.07 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTC:1 - chr3R 22287989 3' - transib2 32 1 65.91 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCC:3 - chr2L 7660913 3' + I-element 5292 1 59.59 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCAAACCATATGTATTTGTAATTAATAAAGTTATTTCTTACCCAAAAGCCAGTCA:2 - chr2R 11159200 3' - roo 8675 2 73.29 AAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAGTTAAAATCGAGTTGTTGGAGAAGTGCGGAGAGGGGGTTGGAGAGTAGCGCAATTACCCGCGAATCCGAAAGGCGAGTGCGAATTTGTCAGACTTGCGATTCGCGGC:1 - chrX 7193382 3' - Cr1a 4294 1 69.18 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACTTCAAATATTAT:1 - chr3R 4575719 3' - jockey 59 1 52.74 CTTGAGACAAAAATTAGCAAATTGTTGTGCTTGCTTCCACAAATACGACAGCGATCGGCATTACAATGTCGTAGGTGATGCGCACTTTCACTTTATTGGGTGATTGGGTGACCCTCCATCAAAAGTACTCTGGAATTTCTTGATGC:1 + chr3L 21380808 3' - G3 240 1 61.64 TCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGATGCCTTTGCATT:1 + chr2L 15936887 3' - copia 39 2 58.90 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAA:1 - chrX 17343392 3' - I-element 68 1 65.75 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAA:1 - chrX 10521630 3' - Tabor 6901 2 57.53 AACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAATATTGAACTCCACAAATTAACGAAAATAAATCATATAAATATAGTTTTTCGTAAATAAAAAACCAGTTTTGAGTAGTGTTCGGGTGCACAAAGAGG:1 + chr3L 20342630 3' + Idefix 6919 2 69.86 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTATTTTAACCCACCGCC:1 - chr2L 16540893 3' - hobo 24 1 69.44 TATTTAATTAATTGTTTTATTTTTTGTTAACAATATTCATATGTATATTATTTGCGTCATTTCATTTAACTTGTCTCCAGTGAAAACTTCAAAGGGAACTGATATTTTTTTTTGTTTAAACAATTAGTTATGTTATGTCAAAATA:1 - chr3L 12178142 3' - HeT-A 15 1 81.38 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACG:1 + chr2L 4063936 3' - roo 49 2 56.72 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCATAAGTATTAAGTAAATATAATAAATATATTATTTGATCA:1 + chrX 14310362 3' + roo 394 1 57.53 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTTGCCAT:1 - chr3L 5389836 3' + roo 9038 1 63.01 AGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTAGGCATTTGCATTGGATAGTGACGAATCAAAGCTATATTTATTAATTTGAAA:1 + chr3R 29089102 3' - Ivk 5067 1 63.12 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGCCAACCCC:1 - chrX 8308366 3' - roo 12 2 74.22 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAACGAATGAACAACAAATAGGACTGGGGCTACA:1 - chr2R 7244777 3' - diver 26 2 65.75 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCC:2 - chr2R 5151194 3' + roo 9039 1 61.64 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTA:1 - chrX 2214274 3' - jockey 4842 1 73.79 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAA:1 - chr3L 16970345 3' + roo 9027 1 54.79 GAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTGTTGCCCGACTCACACGCACAACAAATAAAACGCAAATTGTATAGCCAAGTCCTGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 10176088 3' + 3S18 5773 2 55.88 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACAATTGAAAAATTACTATTTACCCAGCAAGTCAAATAAAATCGATAACCATTCAAGAATTCTCGATGTACACGTACTGGCGTTTACGCATATTTGGACAGGCAATCTTGATAATGTTTTGTTGC:1 + chr2R 15193747 3' - accord 7028 2 65.75 AAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATACATATCTGGAGAAGAGAAATTGGGGATCCTTTCGAGGAATTTGGACGAAGCATCTGGTAAATTTAAACATTAATTAACATACGAAAGTGTAAAAACAATAAC:2 + chr3L 8961030 3' + 1360 122 1 73.97 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATGCGAGA:1 + chrX 8308528 3' + roo 9041 1 65.75 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCTTGT:1 - chr3L 16690860 3' + I-element 5337 1 60.27 ACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGAGTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATAT:1 - chr3R 19992639 3' - hopper 67 1 61.64 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACCTC:3 + chr3R 23067543 3' + roo 360 2 55.48 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAA:2 - chrX 2479459 3' + mdg3 214 2 56.85 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTGTAGAATAG:1 + chr2R 10411455 3' - 297 49 2 60.00 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTTTCAATAATATCAATCAAATAACTCCAAAGAAATGTGGAATGTGTTTTTTACAAATCCATTGGATCGCTAACACTGAGTATCTTGTAGTCGTTTC:1 + chr2R 13005546 3' - 412 7113 2 67.12 TTATTAATATTATTAATATTAATATTAATATTTAATCATTTCGCAAAACCAAACACTCACCATAAACCAGCAGGCTGTCGATGGGGCCGCACCAGTAGGTGGGCTGGTAGGCAATGTTCT:1 - chr2R 13301234 3' - mdg1 38 2 58.33 ATAGCAGTGCGAAGGAAACTGAGTAATACAAAGGTATTCTTCCATGTCCCTTTTCGGACTCGACTCTTTTTTACACGTACACTTGCCACGCCTACTTGGCTTGCAGGGCACAATAAATATTT:1 + chrX 9901510 3' + HB 23 1 67.21 TAACAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAGTTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTTGTGTAAGGTTAAACATGTTAAATTTGTTAGTATGATGGGATTGCA:1 + chr3L 23974257 3' + 1360 3007 1 68.49 ATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGAT:1 + chrX 19980674 3' - X-element 4539 1 64.23 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTT:1 + chrX 21100296 3' - mdg1 22 2 71.23 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTTGGCCTAAAGTTGGTGTCTCTTTTCGACCGCGTT:1 - chr3R 24090423 3' - roo 40 2 54.79 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCTGAATTAGAAAATGTTTTCAAAGTCACCCAGCAAATGTTAATTAA:1 - chrX 12129260 3' - flea 15 2 73.97 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCCAAATGCTCGACGACTGCGATCGATAGTAGCGCGGACGATGACGATAACGATAAGTGATAGCCAAGGGGC:1 + chr3L 17055546 3' + Tirant 8460 2 54.17 AAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGATTTTTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGGATTCGAAGGCTGGTGAAAATCCAA:1 + chr3R 1972667 3' + FB 46 1 51.38 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAACAATG:1 - chr2L 6654659 3' - diver 64 2 63.04 ATAGTTACAATTTATGGCATTTTACAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTGGCACGATGCACATGGTTAAATCGTCGTAGAGGACACATTTCTTTTTATAGGGCTTTGTGAAGCGGGATT:1 - chr3L 21344325 3' - TART-B 10552 2 61.86 GTCGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTCTGTTCGGTAATTAGCAAATGCAAAATTACACTGTGCACTATGACAAATAGAAG:1 - chrX 2814247 3' - FB 67 1 62.33 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCACAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGAAAACATGAAACCAG:1 - chr2L 47053 3' - roo 14 2 72.93 GTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGCGCGATAGAGAAACCGAGAGCAAGAGAGAGAAAGAGAGAGGGAGATTTGTAAGAGAGAGAGAAGATTTCAGATTGAAACAGTTGAATTAA:1 + chrX 17950898 3' - Stalker 467 1 67.81 TACATCGAGTGTACTTGGGCAGGGGTTAAGTATGATTAGGAATGTTGAGTAAAGTGTGAGCAGGGAGTTTCTTCGCTCTGGCCAAATTTCGCTTTACTTGTTGTGGCTGCAAT:1 + chr3L 21364468 3' - G2 2974 1 55.75 AGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACAAATCCTAAATTTGGTGGGGCGAACACACAAACTCTATGAGATAG:2 - chr3L 24131736 3' + Transpac 4796 1 69.18 TAGTCTCTTAAGTAAAAGGAAAGATTCAACAAATAATTAAAACATGGAAAAAAACCGCCGGCGTGATGCTCCCGTCAGCAAATATCGTACTCCTTTTCTTCTTTTTTAATTTATTTAATTACAAGTCTATAAATTTCAGTATCAGT:2 + chr2R 5110365 3' + Doc3-element 4688 1 75.34 AAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGGTAAAAATTAAGTGTTCTTTGTTAAATTAAACGCAATTTTTTTTATGAATAATATTTAATTTAATTTTATTAAATAATATTCATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATT:1 - chr2L 12643085 3' + S-element 32 2 91.10 TAATATCTTTTAAGCTACACATCAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTACTGACTAATGAACATGAGACTGACTTTGGAATTTGACTGCGATCTCTGCGGATGATTGGTGTTCTGAGCTGGATGTTGGGCTTACCTG:1 + chr2R 9718408 3' + G5A 2772 1 56.94 ATTTATTGCAATTTTTATTAATATTTCTTCTAACACAAATTTTGTAACTTACTGGCTATAAAGTAAATATGTATTTTGAGTAGTTAACTATTTTAAATATTAACCAACAATTTTTTTGAACTCCAATCATTGATTTTATTACTGAC:1 + chr3L 12576619 3' - Transib5 2604 1 69.18 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAAA:1 - chrX 2479456 3' + mdg3 227 2 63.24 TAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTGGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACACACTGCTTCCAACACCTCCAGTCGAGTTCCCAGGCC:1 - chr3R 8366432 3' + Stalker 26 4 72.14 TTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCTCCTGGGGATA:1 + chr2R 22989668 3' + hopper 1403 2 50.67 TGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTATTCCGACATTAAAGATGTCGTATG:1 + chr2L 21403594 3' - G5 4406 1 65.07 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTCATACAAA:2 - chr3R 4964071 3' + roo 9033 1 59.59 TGGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACTGTTGGCGCCACA:1 + chr3L 24934437 3' + HMS-Beagle2 7172 2 71.92 ACTATATATATGTATATATATACATAATACATAATTAATTAATTTCCAAAAAAAGAATACAAATGTTATGGAGAGCGAGAGCATATATTCTTTTAGCGAGATTCCTCTGTTTGTTTTTGATCAGGAAGGGCATTGGTGTGTATCCA:1 - chrX 7256775 3' + 1731 4410 1 53.42 ATATCTATTGATATCCCAGAAAAATGAAGAAATTTTGAGTTCGCATTTGTACGGGTATCTAATAGCGGGGAACTCGACTGTAGCTTTTTCATTTTGTACTAACGAGTTTGTAATTCTCCCGTTTTAGGACCGTATTTTGTTGATCA:1 - chr2L 7473181 3' + INE-1 498 1 44.52 CAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATAAATCAGACAACCAACAG:1 - chr3R 2522244 3' - Tc1-2 70 1 63.64 GAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCGATGTCTTTTTATCTTCCACTTTTTTCGTACTCATCAAATATTCGC:1 + chr3R 19165713 3' - I-element 5035 1 68.49 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGC:2 - chr2L 17809197 3' + jockey 4912 1 71.23 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGCCTTCACACGTCGGCGTAACATTTTCCAAACCTTTTTTTTTTATCTCATTGAGTATTAATATTAATATTTAAACTAA:1 - chrX 17584297 3' - F-element 83 1 56.85 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATTATGTAAGTAAGGCTAAC:1 + chr3R 4683027 3' + Burdock 233 2 70.55 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGGTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGGCCTTTT:1 + chr2L 8338228 3' + P-element 2861 1 61.54 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAATACTGGAGAAATAAATAATATGGGAAAAAATGGAAAAAATATGAACGAATTCGTTTATATTTTTAAGATTGCATACGATA:1 - chr3L 18920390 3' + mdg1 29 8 67.12 GGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAACAGTTCCGGCTGGGTCAGTACACCTACAAACACTACACCAACAACCCCATCTTAATAATAATAA:1 - chr2R 17483661 3' + baggins 5374 1 87.50 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATATATTTTGTCAGTCCTTTTCGATTTCTTGCACGCGCC:1 - chr2L 14675674 3' - 297 6629 2 70.91 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAA:1 + chr3R 3920576 3' + roo 8998 2 69.18 ATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATAACCTCCTTCATAACAAGTA:2 + chr3L 23071839 3' + mariner2 797 1 76.03 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATAC:2 + chr2R 8099215 3' + jockey 4923 1 67.12 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAA:1 + chr3L 20711705 3' - jockey 4814 1 54.11 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCG:1 - chrX 661874 3' + 412 7468 2 70.55 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAG:1 + chr3R 26178495 3' - 412 7093 2 55.48 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGGGGTAGCAAAGTTTTGGGGCATTTTAATACTGTCATCATCA:1 - chr3L 5061507 3' + 17.6 467 2 67.81 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATTAAAGAAAGTATTAAAATTTAAGAATATTTTTGTTGTAGGAAAATACATGGATTGAGAATTTAA:1 - chr3L 18768385 3' + S-element 1697 1 72.60 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATT:1 - chrX 20999501 3' + BS 5037 1 58.22 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATA:1 - chrX 19054241 3' - jockey 62 1 54.11 GTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAAGTTTTTAAT:1 + chrX 2479622 3' - mdg3 26 2 68.49 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATT:1 + chr3R 17077207 3' - roo 52 2 55.48 GTCAAGATTACAGATAATAGGGTAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACGATGATTTAGATGACGAGGATGATGGGGACGGGGACGAGGAGGACGATGACGATGATGA:1 + chr3R 10298302 3' - Cr1a 4222 1 65.52 ACGTCGGCGATCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGCAACTCTAATTAGAAGG:1 + chr3L 16437263 3' - F-element 8 1 61.86 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTG:1 + chr2L 11357914 3' + blood 7320 1 65.52 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGC:1 - chr3R 23618135 3' + hopper 1344 1 66.44 AAAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTCATTTAGGTGAAGTGAATCAGGTCGAGGCTATTGTACATCTTGATTGGGAAAAAACGTTGAACAAATTTTCTTTGTCTGTGCCATTGTCTTTGATTCGATGATCATGAAGTTGCG:1 - chrX 17229357 3' - 1360 24 1 64.58 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTC:1 + chrX 8027506 3' - Juan 41 1 44.76 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAAATTTAGGATTTGGATTTTAAATATCAACGCGTACA:1 + chr3L 16970502 3' - roo 21 2 67.81 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCAC:1 + chr3L 10373898 3' - 297 45 2 66.04 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCCTGATATAACGCCCACAAACTCTAACGCCCACAAACGGCACAAAACTCCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTT:1 + chr3L 24300788 3' - HMS-Beagle2 6912 2 62.41 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGC:1 - chrX 22840448 3' - copia 35 2 59.59 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATAAAAAATCAAGAACTATGCCATTTAATCTGTAAT:1 - chr2R 3563990 3' - Tabor 6848 2 79.45 AAATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGAAACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACCTA:1 + chr2L 16588586 3' + Doc 4686 1 76.55 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGT:1 + chr3R 4805701 3' - 1360 64 1 62.33 GATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATTGTGTTTAGATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATC:1 - chrY 472560 3' + Bica 80 1 65.00 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTGGGCTCATTAAAATGATC:1 - chr3R 16518832 3' - Tirant 11 2 79.45 ATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGGTTTATTCTGTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATAAACTAACTCTTTTGAGCCGTACACATCACATCAGTTTCCACAGTTTGTCAATAAACATATCAATATGCGCACAAAATTGGTTTA:1 - chr2L 17272631 3' + Cr1a 118 1 53.42 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCA:1 + chrX 8360656 3' + roo 9042 1 65.03 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGGGCA:1 + chr2L 20840077 3' - mdg1 57 2 55.48 AAGTAAGTAGATAATTTTTTAATGGTGCTTAAAATTTAACGCAAGGATTCAACCAGCAAATAATGCATTTGCCTCATCAGTAATGAGCAACAATTGTGTTC:1 + chr3L 14866955 3' + looper1 350 1 68.32 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGA:3 + chr3R 9039049 3' + Juan 4185 1 64.38 AGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTG:2 - chrX 5323244 3' - Juan 4119 1 65.75 ATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCC:1 - chr2L 4888717 3' + BS 5077 1 62.73 ATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAACGAGTTCGAGAAGATCAAGTACCGGGCCCTGGAGATCCCGAAATCAACGGAGGAGCT:1 - chr3L 1770074 3' - Bica 133 1 60.27 AATTTAAAATCTGTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTCCTTCTAATATCACGAGGACATCTCTATTTTGGGGTAGAA:1 - chr3R 21061501 3' - G-element 4291 1 72.60 ATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACCGATGAAAAAACATACAAACAAACAATGCCACGGTGGAGAGAAAATACAGAAGCAATTTTCATGAAA:1 - chr2L 9200132 3' + gypsy4 469 1 60.84 CTAATATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTA:1 - chrX 22906777 3' + transib3 2732 1 73.97 AGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCC:1 + chr3R 4860542 3' - Transpac 4923 2 74.49 TGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGGAAATTTGACAAATATTCTTATATAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGTCTATTTCTAATCTATTTT:1 - chrX 3702250 3' + 1360 175 1 66.39 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATG:1 + chrX 20999605 3' - BS 43 1 51.37 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATG:1 + chr2R 21410949 3' - Burdock 80 2 73.10 AGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTTGATTTAGTTGCTGGCGCTTTGCTTTTATGTTTATAGATGATCGTGAGAATCCGAGTAACCCTTCGATCAAAT:1 + chr3R 29303930 3' - G4 3364 1 69.35 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAAT:4 - chr3L 19454900 3' - mdg1 36 2 59.59 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAATTATGGCAAACAACTTTTTGTTTTAGTTCG:2 + chr3L 6447168 3' + transib2 2807 1 73.97 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAGAT:1 + chr2L 22170090 3' + Juan 4197 1 68.28 ATATAACATGACCATATAACATAGAAGATCAGAACATCAAATTATGGTCTAAAGAATATTTTTAAAATGTAAAATCATGAATATGATTTGGTGTTAAATCCTCCCCCAGCCCGCACCACTCGCAGTGGTTGTGGTTAGAGCGCAGA:1 + chr3L 7803691 3' - Transib5 2779 1 70.55 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATC:1 + chrX 13490761 3' + 297 346 2 58.90 TTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCAATACTTTTCGGAAGCCCTTCCCCC:1 - chr3R 21783362 3' + transib2 421 1 77.06 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTT:1 - chrX 7795488 3' - roo 8701 2 62.33 GTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCACATTTTGTTTCTATAATTGCTG:1 + chr3R 11040185 3' - Bari1 35 1 60.96 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAATAATAATAAAATACAAGCAA:2 + chr3R 7943833 3' + blood 7332 1 58.22 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCA:1 - chr2R 20010216 3' + Juan 4133 1 73.97 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCC:2 + chr3R 30347372 3' + P-element 2789 1 18.49 ATGAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTAGTGTATGGCTGGTACTTTTAGCTTGCTTTTGAAAAAAAGTGTGCGAAATATTTATCTCTTATTATTG:1 - chr2R 2701983 3' - Quasimodo 101 2 48.60 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGG:1 + chr3L 18046691 3' + roo 335 2 67.12 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAA:1 + chr2L 17180140 3' - Juan 67 1 60.27 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGCCTTTGAGGGAGAAGCGGGGGAAAAATGGGGAAAATGGGAGAAAAGAGAAAAAAAGTACAGCATGTAAAA:1 - chr3R 26774016 3' + hobo 2919 1 50.00 CGTTAANTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGAAGCGTCTGA:1 - chr3R 16341907 3' + P-element 2856 1 64.38 ATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAAACATTAAATACG:1 - chrX 6116195 3' - transib2 11 1 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATG:2 + chr3R 11062869 3' + roo 9047 1 65.75 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTC:1 - chrX 4341232 3' + roo 9038 1 61.64 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAG:3 + chr3L 12315801 3' + transib2 2741 1 73.29 ATTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCACTAA:1 + chr3R 11062812 3' + roo 326 2 69.86 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGTG:1 + chr2L 22674863 3' + mdg1 370 2 66.10 ATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGCACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATTTGGCAACTGCAACTGCAACAAAGCGAATTAAAGGG:1 - chr2R 15004690 3' + TART-B 10631 3 58.04 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGACCAAGCCGATCC:1 - chr2R 14051708 3' + roo 9053 2 67.12 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCTATCTAGTTGAAATGCAATTAAATCCAGAGCGAAAAGTCACAGTCAGCATTTTCG:1 + chr3R 5769159 3' - roo 12 2 76.03 TTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGCTTTCTGTCTTAATCATTTTATATGCGAATTTGAAAGGAGTAATAAGTGCAAAGTATTTTCATATTTCG:1 + chr2R 19806711 3' + jockey 4853 1 53.42 CCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTT:1 + chr3R 11040157 3' - Bari1 63 1 59.59 AGGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATAT:1 - chr3R 27405947 3' - diver 38 2 57.45 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGC:2 - chrX 18396052 3' + roo 9039 1 54.11 ATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTTAAAAT:1 - chr2L 4888750 3' + BS 5009 1 76.55 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAACTTTTCGCGCAATTCTCAAATGGCAAACAG:1 - chr3R 23881387 3' - FB 76 1 80.00 AAAACCATATTTATTATTTATTTATTGTATGTATTAGAATTTAAACCATTTTTCACCTTCGAATATTCGTTGACATTTGACAGAGATTCGTATGCATCTCTGCATTTGTCAGTTTCTCCAAGAGAATTCCATTTCGTATTTTTCCT:4 + chr3L 10723560 3' - Juan 4060 1 82.88 ATTTTTATTAATTTCATTTAATTTCATTTTATAGTCATAACTTATTTGTTTGGACTCCTTTGGCCACTCACGAATCATGGCTTCATGCTTTTCAAGCCTCAACTGTTTC:1 + chrX 20992733 3' - Transib5 2594 1 57.80 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCT:1 + chrX 18010045 3' - 412 7114 2 58.22 AATAAATAAAAAAAAAGGAAAAAAATAAATGAGTGTAAGCCACAGCGGCCGGCCGCCGATCAGTTAACACGTTTTTAAT:1 - chr3R 23171674 3' + Bica 337 1 72.15 CAAATTAGTTTCTTTTGCCCACGTCCATTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTTGCACTTTTTGTGCCATTGCTCTAAAAAATCTTCGCAATATCACTGCTGATGACATT:1 + chr2R 5180380 3' + FB 88 1 58.22 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAAT:1 - chr3R 5768999 3' + roo 9021 2 51.37 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAA:1 - chr2R 9870994 3' + roo 9049 2 69.86 CACACACACACACATTGCGTAATATACGATAGCTGAATAAATAATGGAACCAACCAATTCAATCAACAAACGAACAAGGAAGGAACGAGAACTTACAGCAAATAAATGCAAATTTCGCCATGGCAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' + accord 7107 2 73.10 TAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCAT:1 + chr2R 18529968 3' + jockey 4934 1 55.48 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTGTTTTAATGTTATTAGTGATGTTATTCCTAGGAGGGAATTTCACATGCAATTTGCAATCTTTTCTTTTTGC:1 - chr2L 20545481 3' - copia 50 2 52.74 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTG:1 + chr3R 17996242 3' + diver 156 2 72.09 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTTATAAATAAAAGCCAATGCACAAGTCA:1 + chr2R 15376211 3' + 1360 3352 1 59.59 AAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATCAAATAAAAAAAATTTTTTAAAAT:1 + chrX 12441591 3' - 1360 3261 1 65.75 CTTGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAG:1 + chr3R 25709856 3' - hopper 75 1 64.38 TTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGCCAAAACTCTTTATAAGAAATCAAGCACCTATT:1 + chrX 20434740 3' - jockey 4565 1 77.40 GTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGC:1 - 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chr2L 22193432 3' - roo 8741 2 71.23 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTT:2 - chr3L 7889534 3' - roo 37 2 58.90 TATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTAATCTACTTACTATTTAAAAATCTTCACTAGTCGAAAAACTTCATCATAAGGATAACCAGCACACCTTATTG:1 - chr3L 12317283 3' + transib2 2419 1 48.20 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAGGG:1 - chr2R 4606202 3' + 1360 3327 1 62.76 AAAACTTTCACGCCCACACATTTAAAGGCTGTTCGAGTTCTTTCGTTTTATTATATGTCTTGCCATCTAATAAATTCACGCCGGCTAAAACTCTATCGAATTTCGAAATTTCGCGAGTTAAAGCAAAGTCAATCGCAAACCAGTTC:1 + chr3R 4725435 3' + INE-1 245 1 50.00 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTTTTTAATAACACATATTT:2 - chr2R 16510091 3' - F-element 64 1 50.68 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACAAAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGC:1 + chr3L 21996241 3' + Transpac 286 2 53.33 ATAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTATTCACATATATGTGGTTGGCCAGTCGAGATGCTAACAGGATACGATAAACGTAAAATTATCGAAAGACAGAGAAAGTCAAAGATCTCGAAAGAGATCGCGAAAGAGAGTTTCTGCAACG:1 + chr3R 16835304 3' + HMS-Beagle2 483 9 70.83 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTT:1 - chr3L 16662388 3' + jockey 4959 1 55.45 AAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCA:1 - chr3R 11040053 3' + Bari1 1670 1 52.85 AAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAG:1 - chr3R 11186565 3' + BS 5004 1 75.34 CGTTTGTTTGTGTTGTTGTGTGCCTTATGTGTCTCCTTCCGCAGGGTCTGATGCTGCTGGCTTTATCTCCTGTTCCCCAATCCAAATCCCCCATACCCCTTGCTCCGTTTCAAGCCTCCTTTGTAAAGTTGGCCAAAAAGGCAAAG:1 - chrX 3154122 3' - gypsy3 417 1 62.33 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTTAGAGC:1 + chr3L 17940203 3' + 1360 3345 1 53.28 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCACATTTGGTTGTATCTCTGTGAGTCTCTTTGATACAAGTACGGATGTATCTGTAT:1 - chrX 11209807 3' - hobo 20 1 70.55 CACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTA:1 + chrX 12129397 3' + flea 4944 1 66.21 GCAATAAAAAAAAATGAAATAAAAAAATTACGAAAATGACAGCTATTAATTTTCATTGAACGATTCCAACCGTATTTTAAAGTTTTAATTTAATTCGAAAAATTTAAAAATAAAGTTTCCTAAAGTACTAGTACTCCACAGTTTG:1 + chr2L 17368628 3' + P-element 140 1 52.41 CAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGT:1 - chr3L 20189601 3' + FB 203 1 50.68 ATATTTATAAAAAGAAAAAAAAGTACAGGAACAACCTGGGCACGCGTCACTTTGAGAGGAGTCGAACCATTTGA:1 + chr3L 10372674 3' + TART-B 10631 1 87.84 AGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGG:1 - chr2L 4888746 3' + BS 5012 1 73.97 TATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGGGCTTTTTAATTTGAAATTACTCAATTACGACAAGCTAGAAAGCATTAACAACCAAAATATAACGAATTATTACTCATTTCACATTTCCCTATTAAC:1 + chr3L 23853459 3' - I-element 5069 1 67.12 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTA:1 + chr2L 71276 3' - 412 7109 2 54.79 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTT:1 + chr3L 8959681 3' - 1360 72 1 68.49 ACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCACACAAAATATTAAAATAGTTATGGCGTTTTTATTTATATTTAATGTT:1 - chrX 15246961 3' + Burdock 182 2 68.49 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAA:1 - chrX 13134875 3' - jockey 4808 1 51.37 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGG:2 + chr3R 11062804 3' + roo 318 2 76.71 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGATGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGCTTATCCTG:1 + chr3L 20711729 3' - jockey 4790 1 60.27 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGTCGCGAACTATATACTCAGC:1 + chr2L 17005784 3' - Stalker2 82 2 72.60 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAGTAAAGGGGAGTCGAGTGCAAAAGTTGCCAAGAGCGGTTGTTCCTAAATCTACATAAAAAATTTTAGGCAGAAATATTTAAGTAAATGAAAAGGAAAGGGGTGTTTCCGT:1 - chr3L 25624826 3' - 1360 15 1 67.81 ATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCAGCTCTCTCGCACTCGCTTACTCTCTCCCTCAGGCACTCTCTTTGTCACCCCCC:1 - chr2R 10551963 3' - 1360 189 1 69.93 ATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAGATCACGCTCCAGCGATGCGCTGCGGGTTCAACA:1 + chr2R 18661365 3' - roo 256 2 73.44 AAAAGGAAAAAGAATAGAAAAATATAATCAATAGAGTTACAATTTGCTATAAAAAAGATATTATTTATTAAGCTTTAAAGTTCCAGCTCATCATTTTAACATATTACTACGGCTTAAAAATCATCTCATCAGTTATGATTTTAATT:1 - chrX 17044925 3' + Doc2-element 239 1 76.71 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTT:2 - chr3L 15103800 3' + Transpac 5172 2 56.85 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATTAATTATATTCTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAATATTTTTCACTTATACATATAATAAATATTAATTTTC:2 + chr2L 16768546 3' - 412 7090 2 49.32 GCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATAGTACTAAATAGGACACAATATCAGAACAATTGAAAA:1 + chrX 17717075 3' - FB 84 1 73.97 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACA:1 - chr3L 15913873 3' - jockey 4845 1 77.40 AGATCTGCCTGGGAACTGGAAACTGGAAACAACTAG:1 - chr2R 24481617 3' - Tabor 96 2 83.33 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGATCGAAATTATTA:1 - chr3R 19032619 3' - roo 83 2 78.08 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGG:1 - chr2L 7125764 3' - I-element 70 1 63.70 ATCGTACTTATATGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGCCTACCTATCATGTGAAGATTAATTTTCCGATCTCCTTTCATTTGAGCAATAATTTTCCGAATCTCTATCATTTGAACGATCTTTTTCTGAAAATCGGTCATCATCT:1 + chr2R 5237690 3' - rooA 7329 2 69.18 GTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGCGAACGGAGGCAGTAAAATTAATGTTTTGACAATAAAAAAAGCGCGACGCTTTGCTCATGTTATAGGTTATTAAATCATTTC:1 + chr4 1077468 3' - accord 7039 2 50.35 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATAATGTTAGTGAAATTAGAGACTTGAAAGAAATTAGAAGAAAAGGATCGGAATCGCAATTAAAAGCACAGAGGAATAATGAAAAAAGATATAATAATAAGAAAAAAGAA:2 - chr2L 20851869 3' - 1360 10 2 77.40 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAATATGTTATGATATGATCAGATTTAGTATAAACTACATTAAAATCCTTTTATCTTAGCAATGTAACTTGGCTCGGTTTCCAGTTTCGTAATCCCCA:1 + chrX 19539591 3' + pogo 2080 1 51.72 TGGATATTTATATTTATTATAATCAACATAAGTTTATTTGTATTTACATAATTATTTCTGAATATAACATATATTTCAATTTGTAAATGTTCAATGAGATCATATTCGCTGCCTCGTAAATCTTATCAACACCCTAACACAATATG:2 - chr3L 17932604 3' - Stalker 82 4 90.41 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACTAGGTCAGTCAGTCTGACAGGCCACCTGCTTTTGGCCCAAATCAGCTC:2 + chr3L 6518708 3' + 412 7542 2 77.40 CCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGGCAAATATGCGTTGACATCGCAACACGAGC:1 + chrX 8776507 3' + Quasimodo 7005 2 73.00 GAGTCAGCATAATTAGCATGCGCGACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCTGCAACTAGTCTCCGAAGCTTTGAAGTATTTAACGCAATTGAGTA:1 + chr2L 16769761 3' + Tabor 7009 2 68.75 AAAAAGTAAAAAAAAAAACAAATATGTATAAAAGTGTATGAATTCCTGGAAAGTGACCCGCGCGATATGGCCCAGTGATAATATTAACTGTGTGCGATTTACGAGTGCACGAAAGTATTGGGTATACTATAAATATG:1 + chrX 18130328 3' + Doc 4697 1 78.10 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTC:1 + chr3R 27160165 3' - 412 48 2 55.64 GAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTATGCGTGTCCATGCGAAGCTCATCAACTCTGTGTCG:1 + chrX 5371685 3' - I-element 5035 1 71.65 GACATGGAAAAATACCGTTGTATTTCTTAGTTTATCTTGCACTGCTATTTCTTTGAAAATATTAATAAAAGTTCTAGCATATAGGTTAGGATGTATAAGGCATACATTTCAGAGTAACAACTCGATTTGCAAAGCCATCGGCCTTC:1 + chrX 22460301 3' - HB 49 1 61.64 TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATTGCCACTTACCTTTCCGAGTGTCCTTTTTCACTTCGTACTCCTTCAAGGACAAGGAGGCTGGAAAAAATTTGAA:1 + chr2L 1567168 3' + hopper2 1553 1 55.48 AGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTGAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGCCTTCGTCTGCGCCAGCGCAATTAAGAAGGTTTTTCTGTTTTTTATTTG:1 - chr3R 10608431 3' - 297 6805 2 65.07 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCGAATTTGCTGTCAAAGTAATCCGAAAACGAAATCGAAAATGGCTCGCTTTAA:1 + chr2R 13931647 3' - P-element 26 1 64.84 AGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCAACTATCAGATACCCGCCATAGATAAAATGGAAAAATCGGTTGCGTAGTAAACTATTTGCGGCCGCAAATCTTTTCTTTTTCTTTTCATTCCAAAATGACGCTACGTGACCGATTAATTGC:1 - chr2L 136667 3' - INE-1 574 1 75.34 AGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAGGGGTTTCGTTTGTTAATGGCATTATTTCTTTTAAACATGTTTAAAGATACCTCACAAAGAA:1 + chr3L 16479377 3' + jockey 4745 1 56.94 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGC:1 + chr2L 47211 3' + roo 9030 1 56.85 AGTTCCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGAGAAATATCATAATTTTTCTATCATAGAAATTGGTAAAAAAAATTGAAAAAATGTATCGCTTTTGTGCAGATACGAACTAACAAGACGAAGCAAAATACTTATAGTTATACAAA:1 - chrX 21320656 3' - INE-1 557 1 58.22 AATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCACCACCGGCAGCTCATTTATCAAAACGGCGAATTGCCAACCATTCACAGACGCTGTGCATAATTACACACAACTAATGTGTGAG:1 + chrX 1427454 3' + F-element 4426 1 65.41 ACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAACGCGTAGATCG:2 - chr3R 4357492 3' + Tc3 1683 1 54.79 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGGGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTAGAGGATAAGTTCGCCACTGCCATGGGGGAATTCATGGAG:1 + chr2R 12472133 3' - transib2 6 1 64.08 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGC:1 + chr2R 16929839 3' + jockey 4942 1 53.79 ATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCC:1 - chr3L 22760384 3' - F-element 164 1 71.92 AAAAAAAAAAGAAAAACTTCTGCCTGTCGGGCGTCGTCC:1 + chr2L 21967750 3' + HMS-Beagle2 493 1 84.62 AAAAATATTTAAATATTATTTTATGACATAAATTAAAATGGGGGTAGAAAATAAAAATCAATTACAATT:1 + chr3L 20953133 3' - blood 6918 2 34.78 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAGGATGAAAAACAATGAAGTAAA:1 - chr3L 5532925 3' + roo 9048 2 55.36 TAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTA:1 + chr3R 17615225 3' + mdg1 7071 2 71.72 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTTTGATAAAATAAACAATA:1 + chr2L 20840119 3' - mdg1 7050 2 74.13 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCG:1 - chr3R 23618131 3' + hopper 1355 1 61.87 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGGAACTTGCACTTGAACCCTGAAACAAGCAGGCGACCGACCAGAGAAGCACTCGGATGCGTTCGCTCAGAC:1 + chrX 19266941 3' - roo 43 2 56.12 ATATAGTTATTTTACATTATATTCCCATATCGCGTCTATCTTCTCGAGACTCGAGCAGTACGATACGCGGGAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGACGGAAGTAAGCCATGCAGCTCACCCGATCTTGCAGACATTCGATGGTTTTCTG:1 + chr2L 3529685 3' + Cr1a 4317 1 70.55 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTATGCCATTCATGCGGT:1 - chrX 14450376 3' + hopper2 1566 2 54.11 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCA:1 + chr2L 17180157 3' - Juan 42 1 45.65 TAATAGGAAAATGATTAAATCTAATTTTTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTTTGTCCAAAAACTTTCTTTTATTAAGATTAAAAATGACAAAGGCGCAATATTAGGGGAGTTCACGCTCCTT:1 + chr2L 17833847 3' - Bari1 342 1 56.34 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAG:1 - chr2R 20348983 3' + transib2 2751 1 76.92 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCAT:1 + chr3R 15790999 3' + roo 9015 2 64.18 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCATATAAAA:2 - chr2L 22674735 3' - mdg1 7054 2 76.03 ATAACAAACTTAAAAAAAAGAAAAAAATATAAAAAAAAAAATTAGCGGAAGGGCCACACAAAAGTGACAGCGCCAACAGCATG:1 - chrX 3098893 3' + gypsy2 424 1 77.11 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCACACCAGCGACAAATAGGCACATTTGT:1 - chr3R 28042913 3' + Stalker2 7615 2 60.69 TTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTC:1 - chr2L 4123861 3' + transib2 2573 1 50.00 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAA:1 - chr3R 24369004 3' + roo 9032 1 52.05 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTAT:1 + chr3R 4860527 3' - Transpac 67 2 64.38 AGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTCGAGTCTAGTATACCCTTTTTTCGGCTAATAGGGGCGATAAAAATAAACCAAGGAGGCACACATGTAAGGCAATGAAC:1 - chr3R 4741074 3' - F-element 4218 1 49.66 CTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGGCGATAAGTGACATTTGAGTGAAAGCTTTGGCTCGG:2 - chr3R 29362658 3' - Doc 355 1 66.67 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGGCAACTGACGGTGCCACTGTAAACGTGACGCTAGAGGGCGCTAAAATGTTTGTAGCAATAGCCACATAATGTAAAATTAGTCTACCGAATTTTGTAAT:1 - chr2R 11410866 3' - F-element 26 1 43.84 ATAATAATAATAATATAAATAATAATAATAAATAATAATAATAAATAATAATATAAAATATTCCAAATATATTTTCTATAATAAAAGAGTGTAGCATAAGGTGAATGGATTGATTTTGGAACAATGAACTCTTCAAGCAATTAATG:1 + chr2R 12067048 3' + mdg1 7076 2 67.12 TTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTG:1 + chrX 22386790 3' - hobo 90 1 50.75 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATT:1 - chr2L 18226765 3' + roo 355 2 55.48 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTAGTATCGTGTGTGC:1 - chr3R 26404960 3' - hobo 30 1 64.83 TCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGATTTGTAGTTTTTTTTTAACCAATAACATAGAATC:1 + chr3L 7983277 3' + roo 8717 2 76.71 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAG:1 + chr3R 31886920 3' + hopper 1412 2 64.71 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATG:1 + chr3R 28901299 3' - transib2 67 1 70.77 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCG:1 + chrX 18396156 3' - roo 86 2 79.45 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAAGCTGATAATCGAATAA:1 + chr3R 13973014 3' + 412 7505 2 72.22 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAGACAGGGATGGCAAGGATTAAGCGGGTTGGGCGATGTCAATGCAATTGTC:1 + chrX 4341353 3' - roo 8733 2 63.70 AAATCGTATGGCGTTACGCTTCTTGTTATTCTAGTGCTTGTGCTGAATTATAGTTTTGTCGTGGCAGGATAATTAAAGTA:1 - chr2L 9393131 3' - 1360 21 1 61.25 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCC:1 + chr2L 19924082 3' + roo 9060 1 67.39 TAACGGATTCGGAAGCGGATGTTAATGTTTACATTATGGATTTGTTATTGTCACCAGAATGGGGGTTGTATATGCCAACAATAAATTTAATTATCGTTAATCTTCGATAATTTGCCATGAGAAAATGCTCAGTTGGTTCGGTTTGG:1 + chr2L 8749140 3' - Quasimodo 6916 2 60.96 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAG:1 - chrX 21087600 3' - mdg3 5281 2 62.35 ATCTATAGATATCCCAGATAAATGATGAAATTTCGCAAATGATGAATTTCGCATTAACACTAACTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTCGAGAATGCTATCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGAT:1 - chrX 22519013 3' + INE-1 500 1 58.62 CTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATACAGTCATCCATCACAAGCACCAACACACCCATCAGCACAAAAGATCATCCATCATTAACATGCTTGCAGCTAATCCGCAACTCAAGCACTTTTCAAATACTAACTCAAAC:1 + chr3R 7181282 3' + Tc1 1635 1 77.40 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGTGGCTGCC:1 + chr3L 18126023 3' - Ivk 15 1 64.34 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCACGCGATCGTTTTTCAGTCTCTGGCCA:1 + chr3L 12004384 3' - P-element 16 1 73.97 ATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAA:1 + chr3R 31886910 3' + hopper 1324 1 79.45 AGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAGTAAGCAAGTTGTATTTTATTGCCGGGCGCTATAAAAACCTTAATTACAATACATTTCAGTGGAAAAGATAATAGTCAGGCGTAAACCTTCCAGTTATTTGAA:1 + chr2R 17842888 3' + gypsy2 365 1 65.75 GGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGG:1 + chr2L 20640278 3' + Stalker 7044 4 71.13 AGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTCGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAA:1 + chr2L 9010161 3' - G2 2730 1 52.74 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAACTGAAGACTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCACACTGTGGGGAAATTAATTTCTGTTTCCCAAGAGATTTTAAGTCCATCGCTAGCA:1 - chr2R 6885471 3' + P-element 2860 1 68.49 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGA:1 + chr3R 15054300 3' + copia 5053 2 71.92 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGCATTTGAATGCTTATAAAATAC:1 - chr2R 20227175 3' - hopper 16 1 67.36 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGGGACACGCGAAAAAGGCGTCAAGTAGATCCGAATGCAATCTGATGTAC:1 + chrX 11209935 3' + hobo 2909 1 53.85 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATAGGCCCTTATACTGGATCTAACTTATGACCCGATTCGTTCCTTAGTATAACTTTATCTCCTATTTTTAATTGA:1 - chr3R 28395317 3' + Bari1 1660 1 50.68 TGATCCTAATCAAGAATATATATACCTTATATGTTCGGTAACGGTACACAGGTACTCTGAAATTCGCTTACGCTTACGTAGAGAATGGCAATCTTCCAAATCTTTATTTGCAAAACACAGCTGGTGAACGCAGGAGACCATTTCTT:1 - chr3L 7362697 3' - INE-1 81 1 80.14 ACCGTAAGTCGAATAATAATAATAAAAAAACAACAAAAACCTAAACAAAATACAAAACGACACACGAAGCGAAAGGCGCGTGGGTCGGAGGGGTCGCAGGGAACTGACAGCTAAAAAGCGCGCCGGAG:1 - chr3L 22840162 3' + Rt1b 5138 1 76.56 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAG:1 + chr2L 13556463 3' - transib2 38 1 53.47 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTTTTCGCGCTCTCACGTTTTGCG:1 + chr2L 14074565 3' - 297 18 2 66.67 TAGTCTCCCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGTTTTGAAAGTGTCAGTCGGGGGATTAGATTAGGTTTAAGAGTGTCTATAAGCCATTTTTC:1 - chr3L 14510832 3' - Idefix 6986 2 53.38 TAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCTAACTAACAAACTTAAATGCATAACTAATCGAGTGTATGTTTTCTTGAATCGAGAGAGGATTTTCTTTGGATGGGCCAGGAAATCGGTGCATAGACTACAC:1 - chr3L 5744614 3' + Porto1 255 1 64.38 ATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTT:1 - chr3R 3617310 3' + micropia 173 2 74.66 TTTTTTTGATTTTTGGCCTCTTAGCTTTTGTTATTAATTATATGTTTGTTTGGCCCTTTGAAGTTTTTGAGATTCGTGAGGGGCCAGGAAAGTTGGGCGTAAATGTATAAGCTAGCCAAGTTTTGTTTACATGATTAATCATTTCA:1 + chr2R 21884898 3' - Transib5 15 1 78.77 ATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGCGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGACC:1 + chr3R 1844832 3' - Cr1a 157 1 63.48 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCAATTATGTTTTTATTGAAAGAAATTAAAAATACACCATTTAATTGGCATATATCAATTCCTTCAATAAATGTATTTTTATAGCTAAAATAAATGCGAAATGTC:1 - chrX 23205130 3' - 3S18 17 2 71.92 TTAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGTCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAATA:1 + chrY 1654283 3' - INE-1 533 1 43.84 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATTAATTCTTTTCATATTTGATTTTAGAGAGTATTTTCATTACTCAGCA:1 - chr3R 7666601 3' - I-element 29 1 64.38 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTA:1 - chr3R 30946487 3' - Transpac 4956 2 60.27 CTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCGCTTGCTGGTTTTTTAGGAGATCAATGCTGCGCTTATTTAAGCGTACATTTGACCGCACTTATTC:1 + chr2R 17247637 3' + Doc3-element 4455 1 59.59 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTC:1 - chr3R 15724311 3' + Juan 4145 1 64.38 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTCATTTGGTATTTTACAAGCACAGATAAGGGTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTT:1 - chr3R 14980316 3' + roo 361 2 52.42 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAAGAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGG:1 + chr2R 18529944 3' + jockey 4912 1 72.22 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCAA:1 + chr3L 10425905 3' + I-element 5315 1 52.74 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACC:1 - chr3R 23618086 3' + hopper 1402 1 75.18 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAA:1 - chr2L 13556319 3' + transib2 2789 1 60.00 AAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATC:1 - chr3L 24213776 3' + invader2 5032 2 67.81 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCAC:1 - chr3L 16690895 3' + I-element 5302 1 56.85 GGTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATGTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTA:1 - chr3R 20167597 3' + roo 8990 2 73.29 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAG:1 + chr2R 22514191 3' + P-element 2819 1 37.24 TTATTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATG:1 + chr2R 5532318 3' - G4 3832 1 71.23 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACATATATACCTTACAT:1 + chr3R 4679601 3' + hopper 1404 2 76.71 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCATTTGCTCCTCTATTCCGGAC:1 - chr2R 21926341 3' + opus 457 2 53.42 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATGTTTTCAGGTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATT:1 + chr2L 14074538 3' - 297 13 2 60.23 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAA:3 - chr2L 20265953 3' + roo 332 2 71.23 AGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAATTTGTTCTTATTTAAATTTGTTACTGTTACTTAAGCGTATTTTTCTGCC:1 + chr3R 17635118 3' + mdg3 5090 1 65.75 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCC:1 - 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chr2R 16909869 3' + rover 7025 2 52.05 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCA:1 - chr2R 18316000 3' - HMS-Beagle2 30 2 65.07 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGGGTAGCGCAGCTTCTCCTGCTCCTTGACTCGTCTGAGTGTTCTTGTGGCT:1 + chr3R 10490133 3' - jockey 4814 1 60.00 AACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTAGCATTTTCTCTTGATTTGTCTTTTTTTTTCGTGAGAGAGCCACTGAGACTGATGATGACAAAGTGACAGCCACCCCTAAAAAGCAACTAATTGAAAATACTTGGGCGGCTGG:1 + chrX 4191306 3' + INE-1 553 1 51.37 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGCCGCGATGTCGCGTCA:1 - chr3L 2544568 3' - Tirant 11 2 77.46 AGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTT:1 - chr3R 9557485 3' - G2 2998 1 68.49 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTACGCGCTGGCCAAT:1 - chr2R 8735543 3' + mdg1 390 2 63.70 ATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGTCAGAGTGGGCGGCTTAAAGCCGCTCTTCGACATCAGGAATAGGGCGCGCATCGGATGCAAATCGAACATCGGCGG:1 - chr2R 19216760 3' + hopper2 1364 1 53.24 ATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTAT:1 + chr2L 11839719 3' + mdg1 7368 2 74.66 TAATGGCATTGGATACCATTTTGACAGAACATTCAAAGGTTTTTTATAGAAAGAGAGAATTTGGAATCCGTCACCATGTTTTTGGGTTGCATTTGGAAATATTTAACTACGATCTGTTTTCACTACCTTTGTGGGTTAATACGTTC:1 - chrX 15033328 3' - HB 459 1 76.03 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGATTGGGAAACGCAGGTGG:1 - chr3R 28901220 3' + transib2 2764 1 59.31 ATACATATTATATATATATTTTATATTTATATATTAATAACAACTCAAGTTTTAATCCTTAACACAACTTGAAAGAAGTAATGCCCAAACATCTAATTTGCATAAGTTGAGTAATTTCCTGCACAGAAAACTCGAAACAACTTCAA:6 - chr2R 14793268 3' - Dm88 6 2 76.03 ATTTCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCTACGATACACTGGCGTGTCGAGCGGTTGGGTTGATGTTCGTACAAATTGTGCTATTTGTTTTTTTTAACAACAATTGACACTCGTGACGTGGGTGACTTCCCCC:1 - chr3R 2785323 3' + Chimpo 407 1 73.76 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCTCGCCATATTTTCAATTTACATGAAGTTTTATATGGAATTTA:1 - chr3R 7943686 3' - blood 7030 2 71.23 CGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTTCCGAGAGTGCCGTATCAGTCCGCATCCTCCTTAAAAAACCTCGATACTGTTTCGTCGATTTATGGTTCTCTGTTATCTATAGTAGACAATACAAAA:1 + chr2R 3141894 3' - accord 327 2 69.86 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGG:1 - chr3R 11062755 3' - roo 8711 2 66.97 AAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATACATACCGGAAGCTATTGAATGAAAAATTTCAATAATAAACGAACACAAATTCCGAAACTTATTGGTTTATATCAATTTTCAATTTGTAAGGTTGTGACAAA:1 + chr3L 10593821 3' - micropia 20 2 74.66 TTTAAAAAGTATAAAGATTTAACTTCAAGTAAAGTGCAAGAATGAGGTCCTTAAAAATCACTCTGTCGTATAAAAGTTCTTTACGGAAATCAATTAAATGAAATCGATGCCATATATGTAGATTTTATTTATATAAACATTCAATT:1 + chr3L 3625783 3' - Tc1 65 1 63.70 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAA:1 + chrX 9410566 3' + I-element 5296 1 56.85 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATAAAAAGTATGTTCATTGTTGAATAAGATTTC:1 + chr2L 22193543 3' + roo 9037 1 61.64 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACAACAACAAGGCTGGCCAATCGTAATTCAGTGT:1 + chr3L 6964825 3' - P-element 43 1 49.23 AAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGAATCTTTAATAATTATGGTTAAAAAAAAAATAATTAGAAAAGTAATTATTAAAACAACTATGCTGGGTTTCCAAAAACAC:1 - chr3L 23279338 3' - Cr1a 170 1 69.18 AACAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACTTCCACTTTGCCGTAGCAGCGAGTAAATTTGAATTGCGCGCGCTTAGTGTTGCACAGCGTACGCGCACAGAGATGCATGATGAGCGCCGCATGAGGCAACAAAA:1 - chr2L 7194622 3' + mdg1 31 2 73.97 AGTGCAGCCGATTACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGAAGTTTCGTGAGTATCGGTTTTTTCAAAATTTTATTATTGTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 23803461 3' - F-element 457 1 44.66 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACAC:1 - chr3R 25709764 3' + hopper 1369 1 52.94 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGAT:1 - chr3L 11913208 3' - BS 5074 1 71.92 TATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGATGTGTGCGGGCGAATTTTTTTTTGAAAAAATTAACACTTACGTGGGATAAAAAAAAATAAATTTAGCAAATTTT:1 + chr2R 18889157 3' + P-element 52 1 22.69 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAA:1 - chr2R 20227206 3' - hopper 49 1 52.05 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAAATATAAAGAAATGAAATCATATGCAG:1 + chr3R 8890138 3' - FB 40 1 59.59 AAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTATATATGTAGTTACATACTTCCAAGAAGAGTGTGTTTCCTGCAACCCAACCCTTTTACAGGCCACCCCCGT:1 + chr2L 14120631 3' - opus 395 2 54.11 TATCAAATACCCGTTACTCAGCTGCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAGAAAATTTAATCAGACCTTTTGCAAAAATGAAAGAAAACTTTATACCAAACTTCTCTTCTGTTTAAGAATGTTTTGAAC:1 + chr3R 25071308 3' - INE-1 546 1 52.74 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCA:1 + chr3L 13294992 3' + roo 391 2 66.07 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTG:1 - chr2R 20802593 3' - mdg3 81 2 74.29 ATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAG:1 + chr2L 3675914 3' + Juan 4131 1 76.71 TAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGCGG:1 - chr2R 15138067 3' - blood 169 4 88.33 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGT:1 + chr2L 20840085 3' - mdg1 7087 2 50.68 TATTATTATTATTATTATTATTATTATGTTCTGACTATAATGGACTTTATCCTATTATCTCTAATCTTGACTCTTGAGAGCGGCATAAACCACTCAATTCTAACTTTTTTAATACATAATTTTTATATTTATATTTCTTATATTT:1 + chr2L 22983130 3' - mdg1 7075 10 40.69 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTT:1 - chr3L 1692037 3' - blood 46 2 65.49 ATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGTAGCTGTCATGTGCTTTT:1 - chrX 21585233 3' - mariner2 260 1 69.18 AATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGCCCAGCAACAAACTTACGAGGGCATTAATCACAAACACTATCGCTGTTTACTGGGATTCTAATTATAGAGCCCTCGTCA:1 - chr2R 22192793 3' + Doc 4499 1 74.66 AGAGAATGCAATAGTCGAGTTCTTTGTCTATCAGATTTTCTTTCCCGCACTTCCACTGGCTGAGTAATGGGTATCTAAAAGTCGAGCAACTTTATTCAACCTTTGTCTGCACACCTTTGCCTTTCCCAATCGATGGG:1 + chr3L 21427038 3' - INE-1 574 1 64.96 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAAT:1 + chr3L 6447139 3' + transib2 2778 1 54.11 GTTAAATTAACTTTTTCGGGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTT:1 - chrX 14631163 3' + hopper2 1495 1 48.63 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTA:2 - chr2L 18226767 3' + roo 353 2 56.85 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCGCTC:1 + chr3R 10931712 3' + 297 6943 2 68.69 TTTTTTTTTCTTTTTGGTTTTTGGCCACTTTTCCCAAAGTTTGAGGGAAAAACTTTGGCTGTCCGGG:1 - chrX 7035507 3' - Doc2-element 238 3 86.57 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATCTTT:1 + chr3L 1279196 3' + roo 394 1 66.37 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGC:1 - chr2L 4063809 3' + roo 9038 1 62.07 TTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATA:1 + chr3R 556468 3' - Juan 4166 1 66.44 ACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTACAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCGGAGACACGTC:1 - chr3L 22760364 3' - F-element 144 1 58.22 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGT:1 + chr3L 2544715 3' + Tirant 336 2 61.38 TTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAGTAATGAATTGTTGTTAAGCAGTTTGTTGTTGTTTGGTTCGAAGTG:1 + chrX 11969723 3' + flea 4984 2 68.49 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATA:1 - chrX 6116249 3' - transib2 65 1 63.01 GCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAAGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAAA:1 - 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Stalker 84 4 56.34 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCGATA:1 + chr2L 15913325 3' + transib2 2752 1 68.49 CCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACTGCGAGAGTTCGATCGTGACTGACTG:1 - chr2R 6482462 3' + gypsy 373 2 78.32 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCTGCACAACTTTAAAGGAGCGCTTGTGGAGGAAG:1 + chr3L 23906514 3' - 1360 7 2 75.38 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTGCTTGGAACAACAAATC:1 - chrX 2214210 3' - jockey 4779 1 71.92 AGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTGGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCTCGACTGATCAACAAATTGACATTAATAAATGATAAAATGATTATAAGATATAAGGAAA:1 + chr3R 10970327 3' - G-element 62 1 60.45 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTT:1 - chrX 14450392 3' + hopper2 1550 1 57.53 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACA:1 - chr2R 13259286 3' + mdg1 7445 2 62.11 CTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTCACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAG:1 - chr3R 7666665 3' - I-element 93 1 75.34 TTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGAAGTGTTAATGGATGGAATGCGGAGAGTATGGAAGATATGAGAAAGTGAAAG:1 - chr2R 18142411 3' - I-element 249 1 64.14 TGTATAATTAGGAATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCT:1 + chrX 18336701 3' - mdg3 5293 2 58.22 TAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAACTTAAAATAAAAAATTATGCGTAAATTGCCACAACCACACACTGCGGCAATTTGGCCACGGGAGGCAGTTAAGGCAGTCCGAAGGACTCCCTG:1 - chr2L 23234024 3' + Rt1b 5128 1 57.98 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATTGTATTTTATTTGTATTCCTCATAGTG:1 + chr2L 15940345 3' + pogo 2063 1 59.59 AGATCGACTCGGCTATTGATATTGATCAAGAATACCTTTTATATATATATATATATATATATACAATTATACATATATATATATTATGTATATATACATATATATGTACTTTAAAAA:1 - chr2L 3701083 3' - INE-1 97 1 64.10 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCC:1 + chr2R 19941622 3' - hopper 74 1 65.07 AACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATGTACAATGATTTAAAACAAGGCCTGATGCATTGCATAGAAATTACCATAGGGATTTCAGCTGGTCTATTAGCATTTTTGTTTAAAAATTCTCATATAAAATACTTCATTAA:1 + chr4 865083 3' - Cr1a 4174 1 66.90 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAG:1 + chrX 21224634 3' + roo 353 2 58.21 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGT:1 + chr2R 3564156 3' + Tabor 7276 2 52.05 TCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTGAAATTATTTCTTTACATATTGATAAAAAACATATAAACAAATAAAAATCCATTGGCTTGAACAATTTCATTAACGCATACAGATACGCGGTCCAAATCTACGATGAACTTTTGTCGATGACA:1 + chr2R 4940404 3' + S2 1558 2 53.42 GTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAATAGCTCATAATCTGGCCACCAGTCTTCATTTTCATCTTGAAACT:1 + chr3L 7026558 3' - I-element 157 1 69.86 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGCGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCG:1 + chr3R 5351451 3' - jockey 4750 1 75.56 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGAAAGAGATGCGGAATCCA:2 + chrX 8438014 3' + P-element 2825 1 31.51 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTCCACCTTTTTTTCGCTCTTTTTTGAGTGGCACTTGTTACACGCACA:1 + chr3R 27765208 3' - mdg1 7080 2 56.16 AGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAACTTAAAAGCCAGAGAAACTAGGCCC:1 + chr3R 19450093 3' - roo 9027 1 73.23 CGGGGAGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGAGCGAGTGGCGGGCTGCAGATCTCTGGTCAGGGACACTCGAAAATGGCGCCA:1 + chrX 11209908 3' + hobo 2891 1 71.58 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTACAATTTAGTA:1 - chr2L 15936740 3' + copia 253 1 59.59 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAAAAGC:1 + chr2L 4003836 3' + mdg1 412 2 76.03 AAAATTCAAAATAAAAAAAAAAAGGGAAAACAAAACTGGGAAAAAGCAAAACGAAAAACGAACAAATTGAAGCTTGTCTGTAGGATGCTTGTACAACGACCAAAATAA:1 - chrX 15432864 3' + Doc 4698 3 73.15 TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTTTTTTCTGTTAATTAATTGGAATGAATATGCCAATGTTGATGCAGATGAGGCTTGC:1 - chrX 16487175 3' - F-element 73 1 63.01 ACCATTACTCTTACATGTCCATAACGTTGAGTCTTATAATAAAAAAATTCTCTCTTAATTTTAGTTTTAAGATAGGTTAGCTTTTCACTTATACCATAATCAAAGAGCCTTAATTAATAGAGATTTCTTATAGTTACTCCCATTAT:1 + chr3R 15745543 3' - G4 267 1 65.07 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGGTACTG:1 + chr2R 2427632 3' - Doc 49 1 52.41 TTTAATCGCAATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAA:1 + chr2R 5303151 3' + FB 195 1 56.16 AAACAAAGAAAACAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAATGAGAGAAAGAAAT:1 - chr2R 18937270 3' + mdg3 5084 1 72.60 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGG:1 + chrX 8200278 3' + flea 4933 1 73.97 CCTTTTTTTGGGGTATTTTGCGGAAGTTGTATTTTCGAACAAGTTCAATTATTTTGTATACAAAAGTATTCGAGCTTTTCTCTGTATATAAGTGGGGGCTTTGGCGTCATTTTGTCCCCTTCATCAGTGCTGGGGG:1 - chr3L 25552472 3' - Fw3 62 1 71.32 CAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCTACTAAGATATACATATATACAATGCCTGCGAATCCGCCTCCGCACCACGCGCCGCGCACTTGACACGGGGAGCGGCAGAGAAGCCGG:1 - chr2R 6705964 3' - R1A1-element 5214 1 58.90 AGGTAGATGAATGGGTGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGAATCCGGAGGTGTCTTTCCTGGGGGATTGGGTGGTGGTGTCGGGAGGGGAGGGG:1 - chr2L 20671393 3' - transib4 2427 1 81.58 ATATTTTCTAAAATATAAATATATTTCTAAAATTTTAAATTCAGAACATTTAAATTAACATAATTTCTTTTTAAATATTTTTGGTCGCAATAGTAAGTACAATAACGAACTAAATGTAACATATTTGATAGAAATTTCACAGGGTA:1 + chr3L 16689299 3' - FB 250 1 52.74 CTGAACACGGAAAGTAACAAACATGAGTACAAATCAAGTTTTATTATTTTCGAATACATTAATTTTTTTTTTTGTCTATTATGAAAGGGGAGTTTT:1 - chrX 10791886 3' + invader2 5035 2 82.29 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCT:1 - chr2L 18549812 3' - roo 8710 2 52.74 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTT:1 - chr2L 3233983 3' - roo 8754 2 79.45 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTATAAGGGCAATACGTGCAGGGCATATGCCCGGGTTAGGTTAGACTTCCTGTCGAGGACAACTATGCGAGGCCCACGCGTGTGCATACCAA:1 + chr2L 15188513 3' + 297 6936 2 66.44 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAACCGAA:1 + chr3R 17996282 3' + diver 6067 2 54.79 ATATGTACATATGTATATACATACTCTTAAATACATAAAATAACTTATGTGCTCAATGTGAGTTATAATTATGGTATTTTAAAATAATTCCACATCCCCTTGCTTCAAAAATGAGTACGTAAACACTTTCTGGTTAGAAACAAGAT:1 + chr2R 7013945 3' + G3 4507 1 56.85 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGG:1 + chr3R 31653179 3' + roo 9046 1 64.52 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAA:1 + chr3R 10931730 3' + 297 333 2 66.44 ATTGTTTTCATAATTTTATTAGGGAAAAGATTCCAAAATCGGACTGGTAGCAACATAAAAACAATTGTTTTCATGATTGTATTCATAATTTTATTAGGGAAAAGAGGAGACATTGGGGAAAATAATTATTGCCCAGGAAGCTGGGA:1 - chr3L 20705464 3' + INE-1 400 1 69.18 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAA:1 + chr2L 20118512 3' + S-element 1677 1 58.90 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATT:1 - chr2L 14874145 3' + copia 248 1 43.15 TATTTCATTTTATTTTATTTCATACACGGTTTCCTTTTCGTTTCCATTTATTTGACCTCGCCATGTGTGTGGGCGGCTGACTGGGTTAGTCGTCATTAGAAACTCCACTCAGTGAACTGTGTGATCTATGGTGTATGCGGACATTA:1 - chrX 394511 3' - P-element 139 1 58.90 CGGGTGCGTTTTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTATCCAGAATGTTGATGGCCAGGTGGTTGGGGTGGTTTTGGGTTTTTCAGCTCTGTTGCTTTCGGGCCAACGAAGGGTGTG:1 - chr2R 22620142 3' - G2 2915 1 63.03 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTCCTGGAAGAAGTTCATCGGTCTTCCCCCGT:1 + chr3L 17568137 3' + S-element 1671 1 54.79 AAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGA:1 + chr2L 23372625 3' + Gypsy6A_LTR 276 1 54.79 AATTGTCATTATAAAGAAAAATGTTTCATATACTGTGAATTAAAAAAATTACAATCCTTACTACTGTCCAACGTTGCTCACAGGCCACTTTCGGTACCACCCACAGCATACCATCCCATATCCCACCGGAATTTTCCGATTTTCCT:1 - chrX 15645927 3' + looper1 1656 1 70.55 ATGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTC:1 + chrX 8308508 3' + roo 9021 2 53.42 ATTAAAAAATTTCGGATGAAACAACAGCGAACAGAATAACAA:1 - chr2R 10007994 3' + S-element 1466 1 85.71 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTT:1 - chr3R 904923 3' - rover 16 2 57.69 TATTAATTTATTTATTAAGGAATCATCAAAAGTGGATTCTTAATTTGTAAATTAGTAAGCTGACTAAA:1 - chr2L 14700756 3' + copia 229 1 30.88 TATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAATAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGGCGTTCCTACAGCTAAACTCGACTCCTTGAAG:1 - chr2R 23780507 3' + Ivk 5371 1 63.64 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCC:1 - chr2R 22287395 3' - jockey 13 1 71.55 CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCG:1 - chrX 22840494 3' - copia 81 2 72.60 TTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAATGAAAAATTTCTATCTAAAGTGGAGA:1 + chr3L 23249492 3' + rover 7249 2 54.79 ATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATACACTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAAAAAAATTTTTTTTTTCATGTTTTTTTTTGCAATTTTTGTTTTTTTTTTGTATTATAATAT:1 + chr3R 1035837 3' - Stalker4 20 4 79.86 GAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAA:1 - chr3R 17996183 3' - diver 78 2 70.55 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGTTTGCTTTTT:1 + chr3R 23881695 3' - FB 36 1 53.79 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGGGTTGTTTGGTTTTACGAC:1 + chr2L 19924058 3' + roo 9028 1 46.58 AACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATG:1 + chr3R 934284 3' + Rt1b 4734 1 56.55 AAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTACGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGAGGACGCGGGA:1 + chr3L 10425852 3' + I-element 5262 1 81.51 AAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATAAAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTGAACGATTTGTTGTAAATTGAAGAGTGCCAAACCGCACATTTGAATATGG:1 + chrX 7206349 3' - 297 6548 2 57.97 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGG:1 - chrX 21216713 3' + roo 351 2 58.22 AGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTG:5 - chr2L 13585684 3' - Idefix 34 2 60.27 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCG:1 + chr3R 7420286 3' - 1360 72 1 70.92 AAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACAGCAAAGATAAAAAAATTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAAAAGATATTAAAAAAAAATAAA:1 - chr2L 9304982 3' + HeT-A 6018 1 65.75 TAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTA:2 - chrX 2214274 3' - jockey 4843 1 73.97 GAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAAACATGGCG:1 + chr2L 9010169 3' - G2 2706 1 62.31 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCA:1 + chr3R 13973023 3' + 412 7458 2 76.71 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATGCG:1 + chrX 8308525 3' + roo 9038 1 63.70 TATTTCTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACG:1 + chr2L 14675740 3' + 297 6901 2 70.55 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGGTCCTCATAAGAGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAA:1 - chr3L 19454919 3' - mdg1 7050 2 64.08 AGTGGGATTTACTGGCAATTCCGCAGAGTTCCGTTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCACAGAGTTTATGAAACTAATTTGAGTTCATGACATTTTCATACAGTTTACATATGTGCATGAATATATAATAGAATTTAA:1 - chr3L 17285039 3' - Porto1 4293 1 64.14 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGGGTTTCACCAAATAGAAATGGACCCCGAGTCTATCCCCAAAACAGCCTTCAC:1 - chr3L 13759448 3' - roo 69 2 69.86 AAACTAATCCGAGTATACAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAATGACCTCCCAGCCCAGAATTAAACTTATTAGAGAATTAATCACAAACACTATCACTTAGTTAATGTTAAATAAGCTAGATCAAGATTTGAATACTTATTGATAGT:1 - chr3L 3723421 3' + Doc 4514 1 71.23 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTA:1 - chr2L 18226774 3' + roo 347 2 61.38 GCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATTGAGAACATTGTTCTATGGTTACTCTGCTTATTTAAAAGCTGGGGGTCATCAGAATTGCCTTGTTTGTTTGTTCATTTGACTTATTGTTGGAAGCTTGGCGTTTGTT:1 + chr3R 10478981 3' - BS 427 1 65.07 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATTTTCGTTAGCCCAAGG:1 + chr2R 14653258 3' + 297 6922 2 60.42 AAATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATTTTTCCAAAGCTTGTTGGCTCAATGTTTAACCAGAATTATATTCCGAATATATATGTTATATTGAGGTTAAAAGCTTAAT:1 + chr3R 27664221 3' - transib1 1892 1 52.05 AATAAATATCAATATATAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGGACTAAAAATAAATATCAATATATAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAAGGAAGCTATATATTTTCA:1 + chr2R 8397517 3' + Stalker 6935 4 56.16 TATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGCGCAGACTGCCAGACAGGGTCGAGTTCAAATGTGTCCAGGATGCGAAGGCGCAGAATGAGTATTGGGTCCGAG:1 - chr2R 17787828 3' - I-element 5027 1 51.37 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAACGAAAGATTGTACACAAACCTCATTGGTAAAGTTTTCTTACATATTTGTAAAATTATTGTCAATT:1 + chr3R 30946656 3' + Transpac 292 2 73.29 TAATCAGCTAGTGTGAATTCGAACGCAAATTTCATCATTTTTTTTTTGAGATATCCTCAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAGAAATTTATAAATTGTTCAAAGCGTGGGCATCAT:1 + chr3L 20033454 3' - INE-1 532 1 68.10 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAA:1 - chr3L 23287180 3' - 1360 20 1 71.92 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAATAAAAATAGCCCCTTCCCGGATATTATTTGTTTTATTTGCGAGG:1 + chr2L 11873874 3' + Juan 4129 1 72.60 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAAT:1 - chr3R 31886853 3' - hopper 74 1 71.03 AGTATGGCTGCAAGATCCAGCAGGCCGCGTTCCGTACAGCGTGCATTGCAGCTTGAAGCAAAAGACGTTCATTGTGATTCTGCGCGTTCAAACCACTGTTGCCACTCAATATCTAGCCTCTGCCTCTG:1 - chrX 19500996 3' + hopper 448 1 57.81 TAATAATAATATAATAATAATAATATCAGGGAACAATCGGCATAGGTACAGTTATAAAAAAAATCAACCAAACGAATTCATTGTTTTCAAAAAGCAAACTTTCTGAGGCTAAATAAATGTATATTATTTATTTATTATTATTTAAT:1 - chr3R 10981612 3' + invader3 5050 5 36.30 AGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATT:1 + chr3R 19407991 3' + diver 154 2 63.70 CCATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGTGTGTACGTGAGATAAGCTCGTGCGGTGGTAATTGGTCAATGGAAGTGTCAACATTAGACAA:1 + chr3L 8453834 3' - FB 59 1 55.48 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTATTTTAACC:1 - chr2L 16540900 3' - hobo 33 1 63.70 GACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTACCATTGGATTTCATTTCGATCTTTATTGTTGTGTTCTACATCTGCAGCGGCTGCAGCTTGACCAGCTAAATCTCTCCCCTTCCCTCTTT:1 + chr2L 20291919 3' - F-element 177 1 70.15 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGAATGTAGTATATGTTGATGTAATATATGTAGATGTAATTCATGCAATGTATATGTATAAATGGCGGGAAAATATTTAATTAATATTTTCCTTGGAATGGCCAG:1 + chrY 2720395 3' - Quasimodo 16 2 60.69 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATACGATTTGACCAT:1 - chr3R 27133527 3' - opus 9 2 77.40 ATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAAACCCCAACAAAGCGCTGCGGAAACATGCTGCCGCAA:1 + chrX 18742919 3' - invader4 2800 2 55.32 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGC:1 - chrX 19054202 3' - jockey 23 1 73.29 TATCTATCGATATCTCAGAATAGTGATGAAATTTGGCCTATGCATTTTCACTAGCTGAGTAAGGGGTAACTGATAGTCAAGGAAATCGACTATAA:1 - chr2R 8227957 3' + INE-1 499 1 85.26 CTTTATAAAATAATTAATTTAAAATATTTTAGAAATTCACACAGATAAATACAAAACAATTTATGCAACAATTAAATCATAAAATGTAATAAATCAATGAAAAAACCAATTTGCATTGTAAAACCCAATGGATATTAATAGATTTT:1 + chr3R 18066523 3' - NOF 3969 1 75.34 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGT:1 + chr3L 21380649 3' - I-element 25 1 66.18 GATCCTGTTCAAGAATGTACATTATATATGTATATAATTTATATGGGCTTTCTTCAGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTACTTTACCTAACGGGTATAACTATATTTTAAGAGATATTAGTGGTCTTAT:1 + chr4 185495 3' - INE-1 80 1 65.07 TTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGAGAAATTAATGATAAACAAAAAATTAACTTACTTTTGAAGTATATGCCTTTGGTACACGAGAAAATTTTTCAAGAGCATGGCAAAAAGTTTGATG:1 + chrX 21639495 3' + gypsy5 282 2 68.49 CTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGAATGCACGACTTGGCTATAGATCCTGATCAAGAATTTATATAATTTATACGGTCGGAATCGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCGACGAAT:1 - chrX 124082 3' - INE-1 155 1 76.39 AAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAACAAACAAAGCAACAACACACAAAACAAATGTACAAAGTCAATCCAAAATTACAAATATTAATTTAAAACACAAAGAAACAATTAAATGTGCCAACAATATTTACCAAA:1 + chrX 13645310 3' - Cr1a 268 1 77.40 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAATTAATTAAA:1 - chr3R 11191340 3' + roo 400 1 77.40 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATCTTCATCGCACGACGACGAGTG:1 + chrX 13490782 3' + 297 367 2 65.75 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAA:1 - chr2L 47070 3' - roo 8706 2 56.94 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCAT:1 + chr2L 3234029 3' + roo 321 2 76.71 AAAGTGAAGCATTTTTTCCGACCAACAACACAACAAACAAAGCAAAAATATAAAAAAATAAAAATAAAGATAAAAATAATAATAAAAAAGAACTCAAATCTAAAATCTCAATTGCAAAGCAAAAACAAATGCCAGAAGTGCAACAA:1 + chr3R 8697934 3' + gypsy4 459 1 58.90 TAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTTGCCATCATCGTCATCATCGTGCTCAACGCGCCAGTTCGCCAGTCGCCATTGAGGCAACTTGAGCATCTTTTGGAAAATACAGAAAAAC:1 + chrX 11255815 3' - F-element 4221 1 63.70 TGGGCAGCGGAGCCCCAATTCGAGTATATTAACTCTGTACTTTATGAATGAAAAATTTTAAGTTTCACTATTATTTCACTGATAGTGACCAGGACAAAATACGAATACTTAGGTGCAAAAAGACGTAGCGAGAAATAGGTATG:1 - chr3R 18973501 3' - X-element 198 1 62.24 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGGAAGTTATTTCATAGGAAACGGAAAATCCTAAAAATCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATCATATCATTCATTTTAAAATTTCCTTCGAATAGAACATAATTATGTATAT:1 + chr2R 24170044 3' + transib2 2818 1 53.42 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGAATGTATATATGTATTGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTCTTGTTTATTTTAGCACTCTGGCTTATT:1 + chr3R 17421346 3' + pogo 2085 1 57.64 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGAT:1 - chr3R 9038904 3' - Juan 4047 1 56.85 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTC:2 + chr3R 28901305 3' - transib2 77 1 69.86 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTATTAACCCCTAAAGACCATTCTACAAATCGTCGGCGTTAACTTTGCGTTTTATGGT:1 + chr3L 47055 3' - FB 12 1 73.29 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATTTTTATATAATATTTTAATATTTATTTTTTTTGTTTGCAACTCAGATTAATTACCTAGTTCTTGTCTTAAAAGCTTGTGATA:1 - chr3L 23694787 3' + Quasimodo 7341 2 66.90 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGCGAGACGATCACCAAGGCCCCCC:1 - chr3L 18402955 3' - P-element 23 1 62.71 TAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGG:1 + chr2L 6161014 3' + I-element 5271 1 75.34 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTAT:4 - chr2L 6654644 3' - diver 57 2 54.79 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGA:1 + chr2R 7090702 3' - I-element 84 1 73.61 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTC:1 + chr3L 23906480 3' - 1360 49 1 56.52 AAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTT:1 - chr2R 19199693 3' - hopper 90 1 78.08 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTT:2 + chrX 2479558 3' - mdg3 5342 2 76.71 ATGTATAAATAATGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAGCAATCAATGTAGACGAAAATTACATAAGAAAGCAATAAAAGGTTAAGAAAGAGAGTGGGAAATGTTTGTTGTCCAAAGTCAGTAGAAGTATGATGTAAACTCCGCCG:1 + chrX 5041209 3' + invader3 5098 1 65.75 AAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATATAAAAATAAACAAATTTCTCCTAACTTACATATAATTGACT:2 - chr3R 24359685 3' - diver 6062 2 71.92 CTGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCTTGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGGCATAGGTTCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTACGATTAAAATGGTTCTGTGGCTTTACGTTAC:1 + chr3R 31808790 3' - Fw2 3620 1 76.71 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAAATGGA:1 - chrX 23283141 3' - Transpac 37 2 58.90 GTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTTAGCTCGGTATAATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTTATTGTCTAGATTACCATTAAAAATAAATTTGTTTTCCTTTGCCAGGACTTTAATAAGTATTTAAGTATA:1 + chr3L 11579167 3' + gypsy2 6690 2 56.85 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAA:1 + chr3R 19992734 3' + hopper 1393 1 60.75 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGTTTTGAAGGCCGTGAAGCATTAAGCGATTTTTTTTGTTTGTATTATTATTATTATTTGTTCGTATTGGTTATCCGTAAATCAAGGAACAAACAAAGAAAA:1 - chrX 13775264 3' - Tirant 35 2 71.03 ACTATCAGATACCCATTACTCTGCTCGTAGTCATTATTAGAGTCATTATGTGTCACATTAAATTCACCTCCCCCTTTTT:1 - chrX 12249371 3' - INE-1 548 1 63.29 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTC:1 + chr3L 19274863 3' + transib2 2736 1 80.14 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTCGCATAA:1 - chr2L 4123822 3' - transib2 32 1 63.70 ATAAAAAAAATTTTAAAAAATTTTTGAAAGAAGGATATTGAAGGAAAGGTAAAACTAAAATTAAACATATTAGGTTTTGGGTATTTTTTTGTATGAGGGAAATTAAAAAAACAGATTATAGCTTAATATAAGTTTAAAAGGGTTTT:1 + chr3L 8804999 3' + transib4 104 1 16.44 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTG:1 - chrX 12129314 3' - flea 4823 1 66.43 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGGGGGGAAAGGGAGGAAAGGTAAAAAATTGAAATTGAAATTAGTT:1 + chrX 21224678 3' + roo 401 1 43.51 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAA:3 - chr2L 21299278 3' + roo 368 1 57.53 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGT:1 - chr3R 19450106 3' - roo 8696 2 77.40 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGC:2 - chrX 8360553 3' - roo 8751 2 78.77 TTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATGAAAGAGAACCATCAAAAATTGAAAGATTTACATTTCCATCATATTTCCGGACATGCTGGAATAATTATTGCTTTAAT:1 + chr3R 19449794 3' - roo 8597 1 77.30 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGAC:1 - chrX 21639607 3' + gypsy5 366 2 53.24 TATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGGAGATGAGAAA:1 + chrX 15946789 3' - INE-1 565 1 45.14 ATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGCTTTGAAGTTGCC:1 - 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P-element 61 1 42.76 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGAAAGTGAGCAAAGTTAAACAATTGAAATTGAAATTAGTTGGTAAGCG:1 + chrX 21224686 3' + roo 395 1 71.72 AATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTTTTCTTTTTTCATTTTAACTTTGCTTTTTATCTTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr4 1294993 3' - HeT-A 6 1 40.41 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAA:1 + chr2L 10156237 3' - hopper 34 1 59.59 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATG:1 + chr2R 11804744 3' - pogo 46 1 54.11 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGAGGAAATTTCGCAAGAAATCCCAGGGTTTCCGAGGTT:1 - chrX 15029733 3' - blood 7178 2 61.67 CTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAAAACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCA:1 + chr2L 22224612 3' + Rt1c 5406 1 58.22 AAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTT:1 - 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I-element 14 1 68.00 AGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATG:1 + chr3L 3501815 3' + Bari1 1643 1 61.64 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAA:1 - chr3L 13836624 3' + 412 7471 2 69.86 ATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAA:1 - chr3L 22861722 3' + S-element 1702 1 70.55 AACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACAACACATTCTGGTTAACAATTTTTTCTTTTTATATATAGCAATATATCTC:1 + chrX 20364507 3' - micropia 19 2 54.65 AAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGAAAGAGAGCAAAGTTAAACAATTGAAATTGAAATTAGTTGGTAAGCGTAAAATTAG:1 + chrX 21224695 3' + roo 404 1 78.62 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATA:1 + chr3L 21769125 3' + I-element 5308 1 50.00 AGTATTTTTTTCTTTTTTTTTTTAGTATTTTATGGAGATCTATGCGGGGTATTCATCTGTTAAAGTCTTAATGTTAAGTGTGTTTTACGTGATTTAAT:1 - chrX 13947156 3' - HMS-Beagle2 489 1 83.67 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCA:1 + chr2R 16817973 3' - 412 63 2 62.07 AGAATCAAGTATTATGTATGGCTCTGTGTTGTCGCTCCGCTCTACTTTACTATAACGCCCCGTCTCTCTCAGCGGCATGTTGCCCTCTCTATC:1 - chr2R 13701657 3' - gypsy5 7180 2 69.89 CCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAAACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGAGAATTGAACCAAAAATGTGGGGAGTTTATAA:1 - chr3R 11395456 3' - F-element 4541 1 72.58 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACATATATACCTTACATTT:1 + chr3R 4679603 3' + hopper 1406 2 78.08 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTC:2 + chr2R 8157296 3' - mdg1 7077 2 58.90 GTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATA:1 + chr3L 19350032 3' - 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FB 48 1 52.74 AAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTTTTTTTTTTCC:1 + chr3R 20773964 3' - I-element 404 1 78.00 CATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCCACACACACACACACACACAATCAGACACGCGAATTTATATAAATAAATAAATACAAATTACAAACAAGATACTCAAACAACTTCTAGCAGCTAT:1 + chr2L 15254748 3' + accord 210 2 64.08 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAGAC:1 - chr3R 13300885 3' - roo 90 2 79.45 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGA:1 - chr3R 8051144 3' - jockey 4842 1 77.40 ATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCATTAAGTCGCCGGAAT:1 + chr3L 11233653 3' + 1360 3042 1 76.03 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTT:1 - chr2L 18549829 3' - roo 8727 2 63.70 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATA:2 + chrX 12986616 3' - roo 77 2 71.92 GGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCATGGAGAG:1 + chr2R 12472135 3' - transib2 46 1 53.42 AGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGAAAGCCAAGTTGTTTGACGGTAATTAAAACGTGTTTCTTGCCCACTTGAGA:1 - chr3R 26928035 3' + pogo 28 1 65.75 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTT:2 + chr3R 10270650 3' + Juan 4139 1 64.38 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGG:2 - chr3R 19224974 3' - HMS-Beagle 44 2 58.22 AAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAAT:1 - chr3L 8959604 3' + 1360 3317 1 70.55 ATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCTCTTATCTGTGCTAAG:1 - chr3L 22531924 3' + Cr1a 4221 1 54.79 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGAAAACATGAAACCAGAACTTAATAATCA:1 - chr2L 47040 3' - roo 5 2 80.29 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGGGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATA:1 + chr2L 18347406 3' + transib2 2819 1 74.55 CTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTATAATGTATGGTGCTAGTAGAGCCCTTGGGCGAAGACAATTT:1 + chr2L 21580574 3' + INE-1 161 1 68.57 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTC:1 - chr2L 17180047 3' + Juan 4180 1 60.96 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAAC:1 + chr3R 20167677 3' - roo 8726 2 62.33 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAGATT:1 - chr2R 11794956 3' + opus 472 2 58.41 GATCGTTTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTCTGGCTTTTGTTTTTTTTTTCGAGAGCGTTGCGAAAATGTTTCGGCTTTTACATTCTTTTTTACCCCGTTTTGCCATGGCTTCTTTTCTTTTGCATATTTTCCC:1 + chrX 9718793 3' - Doc2-element 309 1 65.97 ACTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGTAAAAAAAATTATTTCGAAATTTTGATGATCAAGAAGAAAATACAAAGATGTCGTCATAAAATTGCAACAAACATTAATATACGATTAAAAATTGTAGAATTAATTTGGAAAGTA:1 - chr3L 8215026 3' + 1360 255 1 75.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCCATCGATGAAATGTATTAT:1 + chr3R 31653204 3' + roo 397 1 77.78 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATAGAAAAA:1 - chr3R 15942670 3' - hopper 31 1 63.01 TTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTACGGTTGGTTGGCGTTAGAGTGTGTTGGGTTTGGTTTGGTTTAGGTCTATGGCTTTGGCTTTAAGTTGTGCTACAGCTTCGGCTTTTGCCGTCACCGCATGTCCTTCGGTGCAA:1 + chr2R 19597711 3' - INE-1 252 1 63.45 GATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTACATAA:1 - chrY 2346864 3' + micropia 412 2 51.54 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCC:1 + chr2R 20349053 3' + transib2 2771 1 58.52 TTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCAGTAAAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACCGTAGTATTATATATATTTATATAATACATATT:1 - chrX 283952 3' - Doc2-element 96 1 75.17 AATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGATATTAGGAAACACTTAAGTTTGCTGTGTTTGTTTTAGGCATGTACGATACTATAGGAACTTAAGTGAACAACCAAAAAGTAAACAGGTTTTTAAAACTTGTTTTGAAA:1 + chr3R 13526571 3' - F-element 4538 1 77.40 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATCCTCTAC:1 + chr2R 6885627 3' - P-element 36 1 60.69 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGAAGCGTAAACA:1 + chr3L 19455016 3' + mdg1 7388 2 64.38 GGTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCTGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATT:1 + chr2L 21930220 3' + Copia1_DM 65 1 74.64 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCCTTTTGCTGGC:1 + chr2L 8338234 3' + P-element 2851 1 61.64 GGATACGCTAATACATTAATAAATTAATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCTTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTAGTCTCAAGGTTGAGCTGTCAAGTGGCGAGGGCTGTGCTTTTAATAGCTGCCCACT:1 - chr2R 15179467 3' - Porto1 4565 1 70.55 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCG:1 - chr3R 27160073 3' + 412 425 2 66.67 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTT:2 + chr2L 3234031 3' + roo 323 2 75.34 AAACAAACAAAACAAAAAAGAAACCAAACCCCACGGGTTGTCAATGTGGGCCAAAACAAAACGAAGTTTCCAAGAGTTTTTATTGTTTAAAATATAAAAATGGTAATAAAATCAAGTTAATGTTGTCAAAGCCAC:1 + chrX 8885318 3' + mdg3 5084 1 72.59 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGATAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTGTGTGGGGGAGAGAGGGAGAGCAAGAGGTAAGCAAGGCAAACAAACAAAGGCGTAGGATACTTTTA:1 + chr2L 19594496 3' - 1360 3254 1 65.75 ACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTTTATTGCATCCCCCTACTTTAAAATAGTTAATTTTTTCAATTTTTTC:1 - chr3L 14020899 3' + blood 7062 2 67.81 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAAT:2 + chr3R 15072680 3' + pogo 2057 1 54.11 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTATTGTTTTCCTCCGTTTATTTTTTCTATGCTATCATTTT:1 - chr2L 18347242 3' - transib2 18 1 71.92 AATCAAATCGGCCGTATTAGCAGCATTTCCTCAGAAGTCCTCAGGGCGCAGGCTCCTGCCTCAAGGTCGCCCTGTAATAAATCAATCC:1 - chr3R 991866 3' - blood 449 1 86.36 ATAGGTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTTTGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTATTTATTGTTTTATTTGATTTTTATATTTTATTTTAAGATTTTGAATTACTATATATATTTG:1 + chr3R 778376 3' - F-element 172 1 63.45 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATAGTACTAAATAGGACACAATATCAGAACAATTGAAAAGTTTATTTTATTAGTAATT:1 + chrX 17717094 3' - FB 65 1 60.96 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAA:1 - chr3R 19073198 3' - roo 8740 2 72.60 AGGCCACACAGCACGAATCACTCCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTTAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGAAAGCTTAAAAATAATAATAACATTGAATCCGAAACAAAACAAAAAAATAAAACA:1 + chr2R 21451708 3' + Doc3-element 4616 1 67.12 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAGTCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCG:1 + chr3R 17077227 3' - roo 8696 2 60.96 GTCTTTTTGTATATTTGTATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTAGTTATTTTCAGTAAGTTGTGGTTTTGAGAAAAATACGTTCTATTATGGGTTGCATAATTTTAAGCAGCT:1 + chr3L 12232421 3' - Stalker 97 4 54.79 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACG:1 - chrX 19074770 3' - mdg1 7101 2 60.14 CGATAACCAAATGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGACCCACATCCTACGAGACAAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACTTAGATCCAGCAACTCGAATTCCAAACTTAGAGACAACTTAAAGACC:1 + chrX 19821334 3' - Circe 59 2 63.64 CTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGTTGTCTCTTCTTAAATCTAAACAATGCATTCAGAATATCGGTGTACTCATCGATTCATATGTAGTTTACCAGCTCTTC:1 + chr4 498051 3' - 1360 3380 2 52.05 ACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTATACTTCCGAGCGTTCCTTATGTTGACTAGCGTAGCCTCCGAGGGCAGCGTGGGATCCGA:1 + chr3R 8983214 3' + 1360 2945 1 59.59 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCT:1 + chr3R 15942786 3' + hopper2 1532 1 71.92 AAATAAAAAAGGAAAATAAAAACCACAAATGATGCCAGGC:1 - chr3L 4908919 3' + Doc2-element 252 1 60.00 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCGTATGCAC:1 - chrX 15357610 3' + hopper 1399 1 72.41 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGTTGGCCTAATTGGATGGATTTAAGGATGTGTTATGTTCATAAATCAGATTGTCTTTGTTTTTT:1 - chr3R 11062683 3' - roo 12 2 76.03 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTC:1 + chrX 6116337 3' + transib2 2754 1 65.75 GACAAGGAGAGGAGTGAGAGCGGAGGCTTTTTTATGTCTCTAAAATATCTTAAAGATCTTGCAGATTTGACGATTCAAACTTAACTTTTAGATTCTAAACGCTGCGCACAGTTGTTCATGAATCGGGGATTATAAAACACTTG:1 - chr2R 5487636 3' + Rt1a 4941 1 72.73 AATATAAAATAAATATATTAAAATATTTGAGTGAGTATTCAGCAGTTAAAATCTATGGTACTGCAAGAAAATTCATAACGTTAAATCTGTTAACACTTTTAAAAATTTTTCATCCATTCAAATCAGTACAGATGTATAATATAATT:3 - chr3R 18544613 3' - Cr1a 4313 1 78.77 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGG:1 + chrX 21947738 3' - mdg1 54 2 55.17 TTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTCGTTTCTTTGCCACGTCTTTGGGTCCGGCTTCTTCTGGTTCTGTTGTTGCTTTCATAACGCAGCCTGTTGTTGTCATCAGGTTGCATTTGCGTTTTACAC:1 - chr3R 23040599 3' - gypsy4 473 1 62.24 GGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTAGATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAAAG:1 + chrX 22576494 3' - Burdock 186 2 57.53 AAATACATACATAATACATACATACATAATACATAATAGGAATCGTCGAAAGAGAGGCAAATAGGACGTAGAAAGAGACGGCGAGTGGCT:1 + chr3R 9422677 3' - Dm88 12 3 75.56 CCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATGTATGTATGTATTTGTACGTAGTCGACGAAGCCTTTCTAGTAAAACAGCAAAACAAAGCATCGTTTTGCCAACTAATTTATTTCCATTTGTTGGGTTGGCTAATCT:1 - chr3R 4615899 3' - Stalker 176 4 53.47 AAGGCACTGTTTTAGCAATATTTAGGATTTGGTATGGCCACCCTTGTTCCCTCACAACGTTTTGACTTCGACCGATTTTCTTGGTAAAGCGTTTAACTTTTATAGAGCCGACTAACTAGTCGGAGAAGATGCTTCGCCTG:1 - chr3L 1811465 3' - Tc3 1444 1 60.00 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGATGACTGCCTTCTGTCAGCTACACTTAAAGAAATGCTTGTATAA:1 + chr2R 15084991 3' - hobo 75 1 68.49 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGATGATCATGCATTTACATGGCT:1 + chr3R 21630364 3' + I-element 5309 1 53.10 GGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTCCCTGCATTACCCATTATTTAA:1 + chr3L 18401759 3' - P-element 111 1 17.81 GAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTCGAGTCTAGTATACCCTTTTTTCGGCGAATAGGGGCTATAAAAATAAACCAATGAGGCACACATGTAAGGCAATGAAC:1 - chr3R 4741074 3' - F-element 4219 1 53.42 GTTGTTGTTGGTGCACGTGCAGATGGATTTGGCGCACATTCTGTCGCTTACCAAAACAAACCAAAAGCCAACCCCTTGAGTTCTCTCTTATCAGCGGGAATTGTGGTCAAGGCCTGCAGC:1 - chr3R 24050912 3' - Porto1 428 1 68.33 GTTATACTATCCTCCGGGAAGGGAGTTCGGTTGGTAATTAATGCAGAGGACTTAGAAAAAATGGCCAGCAGCTTAAGCCGTTT:1 - chr2L 4152767 3' - G5 4666 1 68.67 AAAGATTTTTTCTTTTTTTTTTGAACTCATTTGTCTATTAGGGAATATGTTTCTTTCCCTTGTCATTCGAAAAAGAACCAAATGATAATTTTTTATTACCACACAATCTCTGTCAGGGATTCGAGATTCTGTGGGACTGGTTTTA:1 + chr3R 12928641 3' - HMS-Beagle2 491 1 80.00 TCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAAAAGGGATCAATAGGTTTTGTGGCAAGATGGGGGTGCCTCAGATTTTGGGATGACATCA:1 - chrX 5336091 3' - pogo 279 1 59.15 ATTTACNAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAGGGGGGATGGCAGGACTTAGCCATATTTATTTGTCAAGCTACATACACAGAAATATACGGCAGTGGCAGAACGTATATTATGTACTGAGCAAACTTCGTTAAATGTT:1 + chr2R 6848423 3' + Doc 150 1 74.66 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGAAAGTGAC:2 + chr3L 2145997 3' + roo 353 2 53.42 GAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGGCCGTCACCTTATATCTTTATCTACAT:1 + chr3L 21769093 3' + I-element 5284 1 69.57 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATT:1 - chr2R 20010203 3' + Juan 4146 1 65.07 AAAAGAAGAAATTAAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCAT:1 + chr3R 24450514 3' + 412 7478 2 60.96 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTTGTTTGTGTGAGATTAGAGTCCGGGAGTATCTGCTTAA:2 - chr2L 15779516 3' + hopper2 1532 1 64.38 ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTCACATTCACACTAGCTGAGTAGCTGATATCTGATAGTCGTGAAACCCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTGTTTTTTTAACATGTATACTCTT:1 - chr2R 25172921 3' + INE-1 498 1 79.10 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAGGTTTAAGTGGGCGTGGCTAAAAAAGAGAAAAACAGAAGAGAGTCGAGTTCCCCGGCGATCCATACCCATTACTCAGCTAGAGACTCGAGACAGTGCGAAGTAGAACTT:2 - chr3R 4507821 3' - roo 8677 2 73.97 ACCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTT:1 - chr2L 809628 3' - jockey 38 1 58.90 AGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTTTCTTGGAATCCAAAGTGGTAGCGAGCGTTGCTAAAATGTTGCGAG:1 - chr2L 22966839 3' - 1360 3154 1 76.55 CAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTA:1 - chr3R 19449944 3' - roo 398 1 60.96 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAAT:2 - chr3L 24934281 3' - HMS-Beagle2 6928 2 54.79 TATTATTTTATTTATTTAAAACAACCCGTATTTTTGAGGACGGGGTTGTTGCTGCGTTTTAATGCTGCGATAAGCTTTTTGCCATTATTTCACTTGAATCTGCTTTTTGCCGAGTACTTGAACT:1 - chr2L 2460094 3' - G7 1144 1 67.74 AAATGTTTCAGTTTTATTTGTTCAATAGTTTCGAAAATACACATTACACAAATTAAAATGAAATAATTTGTGGGCGTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATA:1 - chrX 22689424 3' - HB 1497 1 77.24 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCGTATTCGACGTGATATAGCACAGTTTTGATGATGAGTAACGGGTATCTGGCG:1 - chr2R 559255 3' - Ivk 31 1 80.00 AATAATTTGAATTAATAAAAATAAGGATATAAGAAAATTTTCCTTGGGTTTTCCACCCTCTGCTCAAGAAGTAGCGAATCCCCCGACTGGCCATGACAGAGATAATG:1 - chr2R 11110921 3' + Transib5 2594 1 64.49 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTA:3 + chr3R 7317643 3' + I-element 5269 1 76.03 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAATAATAATCAACA:1 + chrX 11661536 3' - pogo 19 1 72.60 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCTATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAG:1 + chr3R 17421332 3' - pogo 32 1 48.63 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAAT:1 - chrX 661885 3' + 412 7497 2 70.75 ACGGACTTAGGGAAATATTTTGTATGTTAGTTTCAGTTTCAAATAATCATTTATTATAAACGATCGCTTGCGATCCTTGCTAGTCCCATTCTTAACGGGAATATCTCTCTCTCGCTCTCGAGAG:1 + chr2L 22497789 3' + HMS-Beagle2 222 2 58.87 AAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGAC:1 - chr2L 22329020 3' + invader2 4699 1 70.55 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCAC:1 - chr2L 16540926 3' - hobo 44 1 61.07 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAGCCGAAGCGTAGCCGAGGACTCAAAAAACAGTTAC:1 + chrX 18282664 3' - P-element 63 1 30.65 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTT:3 - chr3L 7300166 3' - roo 86 2 78.08 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTT:1 - chr3L 10373809 3' + 297 6925 2 56.85 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCCGTGCCCCCCCGGGGGCAACACTCACCTGGCGTGCG:1 - chr3R 22287951 3' - transib2 39 1 49.24 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGG:1 + chr3R 9298558 3' + hopper2 1543 1 62.24 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTC:1 + chr2L 47179 3' + roo 334 2 67.12 TAGATTTGTAGTTCACTAACATTTTGGTGTATGTTATATGTTTTTGTGTAGTTGTATCGTGTTTGTTTATGTGCCTTTTTTACAGTCAACTTAACAAATGTAGCTGTGTTTCACCTCGCTCTTTGCCATGTTTTTCTCGTTTTTG:1 + chr3L 3556023 3' + transib1 294 1 77.24 GTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTACACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTACCTCCCGATATCACGCCCCATCCCGAGCTAACTGGCGAATTCACGAATTAGCGCCCCCCCTTCGCACTCACATG:1 - chr2R 12474819 3' - transib2 2756 1 52.74 AAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCCCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAG:2 - chr2L 22121320 3' + I-element 5324 1 58.90 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATC:1 + chr3L 8959717 3' - 1360 36 1 58.90 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCTCCAGACTGTGTGCCGTATA:1 + chr2R 18530012 3' + jockey 4978 1 76.03 GTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATATGTAGAATATATTTAGAAGTAAACATAAGATGTTTTAAAAGTACATTTACATTTTATTTATTGAAACTTCATT:1 + chrX 16361279 3' - roo 8803 2 54.79 CTTAACCAACAATAATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACCCCAAAATCCAATTTGAAATCAAAGCAGTTGAAGCCCCGACTAATTAACTGAAATTCACAAAGTAAAGTCCATGGCAAATATAAGCAAACCACTTGTTTG:1 + chr2L 17613411 3' + I-element 173 1 61.64 AAGACTCAGCTCGATAGGCTTAGAGTAATACAATAGCTGGGCTCCCCTGGTATATGAGCAACCGAGTCATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGTGGGGCTTGTCTATATTTTGTGTCAATTTAATAATTATATCCGTTACT:1 + chr2R 7995232 3' + G5A 2464 1 65.75 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAAAGCTATACAAAAACAATAGGCAGGAAAATTTATAAAAATTATAGGCAAAAAAATTTTTCTTTAAACAAAGAATTAAT:1 + chr3L 13696507 3' + 297 6941 2 45.21 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACAGTAGTCAAGATTTCCTTAAAATAAGGAAAAATAAAATTGAATTTTTAT:1 - chr2L 3224322 3' + roo 9000 2 67.12 GAGGCAGTCAGTGAGACAGCAAGATCGCACGTGGAAGAAGATAGTGCGTCGGAGCGTTAAAGGGACATACGTTACAGGGTTTTAAATGCTTTCTGTTATATACTTTTAACTTTCATACTTTCATCGAATCAACGAATAGAATAAAA:1 + chr2R 4709797 3' + gypsy8 372 1 58.90 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACANACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCGACTCTATCGCC:1 - chr2R 21116426 3' + mdg1 414 2 58.22 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGCA:1 - chr2L 47114 3' - roo 8748 2 76.71 TGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAA:1 - chr2R 4785211 3' - Juan 4063 1 58.22 TGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCA:2 - chr3L 21655892 3' + HMS-Beagle2 242 2 65.75 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACAACTTAACTTATTAAGCGACAAAAATTTTACTCCATTGCCAAAGGGAATAATTAGCACTAAGAAACGTTAGGAACTGATTTTTCTTTTGTTTGGTCTGTGATATGACAA:1 + chr3L 8627382 3' + pogo 2092 1 38.36 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCCAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGCTGAGCTCTTCCTTCCTTCTTGGTGTTAAGTTTCTTTTATTTTTTG:1 + chr2R 650982 3' - 1360 72 1 68.57 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCAGATTTAACGCACTCAATTTCCGAAAACAACAACAAGCTATTTCC:1 - chr2R 6964769 3' + Burdock 6349 2 56.49 ATTTGTTAGTTTATTATTGATTGATTTAAAAAGAATTCATTAATAATACACGCTAGTAATATGATTAAACATGAGCCCCTGACCACTGCGAGAATTTAAAGGCAAGGGTTTTTATTTTATTTTGAGAGGCTGGGCGTGATGAATCT:1 - chrX 17430340 3' + INE-1 413 1 56.16 TAAGAAGAAATAAAAAGGTAGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGGTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAACCTGAAAGCGAAACACCTTCTGCAGAT:1 + chr3L 1692090 3' + blood 7321 1 69.11 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGT:1 - chr2R 13259272 3' + mdg1 370 2 52.05 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGTATAG:1 + chr2R 8157285 3' - mdg1 7088 2 52.74 CTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTATATCCCTA:1 - chr2L 15550652 3' - Bari1 53 1 51.37 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAGCTGGGAGTTGAGCTACCTTC:3 - chr2R 17926247 3' + opus 7495 2 79.45 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAG:1 - chrX 8437677 3' + P-element 2820 1 32.56 TGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACA:2 + chr3R 19407988 3' + diver 151 2 65.75 AAAAAAAACAAGAGAAAAAAATCCTAGAAAAGCATTTGCAATTTTATTGGACTGCAAACAAACTGGAAAACTTGCCAACTCCCTTTTCTCCAACTCATCTCATCATGCCAAACATCGACACACAAATGCAAACGATCTCGAAAACG:1 + chrX 8508884 3' + Porto1 174 1 58.90 TTTAAAAAAAAAAGAACAAAAAAGGAAGCTCCGCAAAGGATCTGCGAATGAAGGACTCACCTAAGGAATCTTGTGAGCTCCTCGTGATCGTGGTAGACAAAGTCCAGATGCTGGGCATCCGG:1 - chrX 16707873 3' + TART-C 11100 1 80.33 GTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' + R1A1-element 91 1 52.05 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGC:1 + chr3R 31886924 3' + hopper 1350 1 67.16 AATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCTGCGTTGGCTGTCG:1 - chr2L 5582108 3' + pogo 2073 1 52.34 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGAT:1 - chrX 15357628 3' + hopper 1381 1 60.00 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCC:2 - chr3R 23639119 3' - pogo 39 1 57.53 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTTAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATCGACTTACA:1 + chr3R 14980422 3' - roo 48 2 52.74 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTT:1 - chr3R 29084901 3' + 412 7478 2 65.94 ATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACA:1 + chr3R 9298553 3' + hopper2 1537 1 65.97 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCAGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTTATCAAGTGCATATAAGTAAGATTTTC:1 + chr3L 19274936 3' + transib2 2809 1 73.29 AAATTGTCTTCCTCCTTCGTACACTCTCCTGGACAAAAGTCCCCAAATATTTTCAATAATGTTAATGTCAGGGGAGTATGGCGGCCACTTGAGCAATTGGTTTTTAATCTACTGTTTTATAATCCGAGCCGTATGGATTGGAGCGT:1 - chr3R 4357951 3' - Tc3 1282 1 77.40 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTTTTTCATCATGCCTCGAACTGAAGGCTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCACTCTGTGGG:1 - chr2R 6885517 3' + P-element 2860 1 50.00 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACCACACACACTATCGTAA:1 + chr2R 4189089 3' - S-element 65 1 64.38 AGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAGAGACGCAGCTCAAGTTTGTTGATCCATGTTGCCACACCCACTAACAAATATTTCTGTAATTTCTTGTCAAAAAAAAACCCCATATTGTTAGGAAATTTGGGGAAAACTAAAACTCCAAGT:1 + chrX 20672653 3' + INE-1 168 1 50.00 TCGGGACTTTACGTTGGTAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGACTAAAAGTTGTGATTTCGCTTAAGAATGTAAATAAAAAAAGAAAGTAGGAGCAGGAGAGCTTGTTTAATACAAAAGTTTCATTTCCGCTTTTCATT:1 - chr3R 26494652 3' - HB 235 1 62.07 CACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCC:2 + chr3R 1844831 3' - Cr1a 189 1 71.92 CAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAAGT:1 + chrX 2479615 3' - mdg3 5285 2 63.70 AATATATATTTTTAAAAAAAAAGTTACTTTAAGATATTTCCTTCTTTAAGATAAGTTTAATCACTTGGAATTTCATTTCTTCAAGGCTGAAAGCAAATTAAACACTAATTTTTTTGTGTGCATTTTTCGCTACAAAAAGACGAACG:1 + chr2L 12837627 3' + TART-C 11032 4 61.64 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATGTTAATGAAT:1 - chr3R 20140496 3' - jockey 4751 1 73.29 ATGAGCGATTGCTCTTTATTCTTTGAATATCCAAAACGAACTGACTAATGCTAAGCTTGTCATATTTCAACAATCCAACTATCAATTCATTTGAGTTTCAGTAACCGCATAGATTTTGAGAAAGAAAGTTCGAATTTTTTGTAAAA:1 + chr2R 21665911 3' - gypsy3 148 2 71.92 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAG:1 + chr3L 11844830 3' - rover 6998 2 56.55 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATT:1 + chr3R 11937413 3' + flea 4963 2 53.42 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATAGCATGAATATATTTCAATTCATATTAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATA:1 - chrX 17343389 3' - I-element 61 1 62.68 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACA:1 + chrX 10521746 3' + Tabor 440 2 52.05 TGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCACCCTAGTAACAGGTTTGGTCCACTTCCGTGTAAGCCATTTAGTTATAAGCCGGCAACACGAACG:1 - chr3R 18824308 3' - Circe 7177 1 65.69 AAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTATTCTC:4 - chr2L 4025370 3' - copia 5085 2 59.59 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGGCTACCGACT:1 - chr3R 11469284 3' - Tabor 10 2 72.17 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAATTTGGGGGCAGTGGTTGTAACCTG:2 - chr3L 7300102 3' - roo 22 2 69.86 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTAT:1 + chrX 8308481 3' + roo 335 2 72.34 ACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTG:1 - chr2R 7244821 3' - diver 70 2 65.07 AAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATC:1 - chrX 5323231 3' - Juan 4106 1 56.85 GTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACCTTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGCAGATACGAACGAAACACAGATACGAATGTATCTGTTTGAGTGGCCCCCTTGCCACATCCGAATCAAT:1 - chr2L 12376955 3' + F-element 4566 1 50.38 TATCCAATGCCATTAAATATAATTGGAAACCCGAAAACCGAGTCCAGACTGGCCAAGAGTGCCGAGATTAACGTTATTCTGTTCGTGCAGGCAAAATCAATTCAAAGGATGCCAACGCTGGGGAGCAGAAGGGCTTCCTCAACGA:1 + chr2L 8661392 3' + HB 466 1 72.41 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGA:1 + chrX 19588125 3' + roo 8996 2 67.12 TTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCCCACGTGTGCGCACATAGAGAGAGCCTGGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTTCAGCGCTCTGTGCTGAGAC:2 + chr2R 1276179 3' - 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chr2L 14823991 3' + G5A 2644 1 65.75 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAAC:1 - chr3L 9269871 3' + copia 242 1 50.00 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGGGCCAAACCGTCTTCATGTTGCTCCTTCATGCATAATAGTAATTTGCCAAATGC:1 - chr2R 23180145 3' - roo 8680 2 72.60 GAACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTATTAAAGCATCCTTCGTGCCTTTTGGCTGCCTCTTGCCTTTTGTCCGCCAGATGGCTGCCCTACTAGTGCACAGTGAGAAAATGGGTTCACTAAAGTT:1 + chr2R 11569844 3' - mdg1 166 2 63.70 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAAT:2 + chr3R 3920577 3' + roo 8999 2 68.49 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCG:1 + chr3L 22325905 3' - hobo 52 1 54.29 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATGC:1 - chrX 12066129 3' - transib2 43 1 63.30 AGTGGCAAAAAGGTCACCAAAAAACCGAGCAGCTGCTTTACTGTATAAATACTGAGTGGTGATTCACTGATGAAAATAAATTAACGGAACTGCACTATACCTCACTGCCGGTGGCATGTGTATAGTATGTAAGTTATGCACAATTG:1 - chr3R 4552975 3' + S2 1278 1 73.97 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATTGCATCGCCCTCTCTTTCGCAC:2 + chrX 8437798 3' - P-element 15 1 74.66 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGT:1 + chr3R 4461116 3' + blood 303 2 71.23 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATGTTAAT:1 - chr3R 20140500 3' - jockey 4746 1 72.99 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGG:1 - chrX 6475279 3' - Doc 31 1 62.02 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTAATATGCTCATACGCATATAAGAGTTTGTATAAGAGTGTTTGTTTGTTTACATGATCCTCTGTGAGCTTTCAAAGTAAACATATGTTTCAGCGC:1 + chr2R 2590834 3' - HMS-Beagle 6821 2 70.00 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTT:1 + chrX 12986613 3' - roo 80 2 73.97 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTA:4 + chr2L 17005826 3' - Stalker2 7288 2 56.85 ATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCGACTCTATCGCCCAAATAA:1 - chr2R 21116419 3' + mdg1 421 2 63.01 TCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTA:1 + chr3L 3501819 3' - Bari1 61 1 59.59 ATATATTTATCAAATATAAATTTAATGAATTATGATCATTCGAAACGCGAATTCTCCAGCTGAAGTATTTCGATGTTAACTTCTCTTATTGGATGTCTGTTCTGGGTTACTAGGAAAGGTCGTAAGACCGCACGTGTTATATCTTT:1 - chr2L 9215442 3' + copia 4671 1 48.63 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAG:1 + chrX 10319723 3' + mdg1 7414 2 54.11 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAA:1 - 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G2 63 1 75.34 AATATATATACATACATATATAGTATGTCTGTATGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTGACAATAAATTCATTTTGTCTGTTGGCA:2 + chrX 11541623 3' - 1731 4410 1 42.47 GGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAGCCAACTTATCCGTTCCGCAACATCCCCTCCCCCGTGAAGCAACAGCATTCACCACATCCAGAACGGCTAACTTCGAAGCGG:1 - chrY 3617571 3' - aurora-element 4080 1 77.12 GCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAA:1 + chr3R 30987593 3' - F-element 118 1 50.68 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTTACCCTCAGAAAGACCCTTCCAGCAATTTATAAGGAGTGCACCCTGGGGAGCGGCCATATTTTTGTTT:1 - chr2R 14705280 3' - 1360 35 1 60.16 GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGG:2 + chrX 10521717 3' + Tabor 7250 2 67.12 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCT:1 - 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chrX 5323219 3' - Juan 4094 1 52.74 CTATACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGCGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGGAGCAATTCGTTTATTTGTTTCTCTGTTTTAAATTAAATAATTTGAC:1 - chr3L 19450188 3' - R1A1-element 5259 1 70.55 TGGGTTTTTCATGGCAGGTCAGAATCCTCTATAAAATCTAAAACACTTGTCGGTATTTGAAAATCGCAGATATTCTTCATATGGATGGCAATTGCTGCAGTCGTAAAATTAATTTTCAGGAAAGCTGGGGTTAAAA:1 + chr3L 3474650 3' + NOF 230 2 52.94 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGC:1 + chr2R 20349041 3' + transib2 2758 1 67.65 GAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGT:1 + chr2L 23372629 3' + Gypsy6A_LTR 280 1 52.05 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGGGTCAGGATGAGGAAGTGGCGACGG:1 - chr3L 6446990 3' - transib2 23 1 67.38 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAGCACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGC:1 - chrX 6475291 3' - Doc 54 1 51.43 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGCTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTG:1 + chr3R 4964178 3' - roo 78 2 72.60 TAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTTTAAAATGTTTTAATACGAAGCTTATATATTCTTGTATAAAGAGTAGAATGGTGT:1 + chr3L 16662354 3' + jockey 4868 1 56.90 TGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGCTTGATTCATGGACATCCTTGCATCCTTGGCTTGCTAACTTGGTGATAAGTGAACTTTTTCCTTCATGCCTGCTGCTCCTAATCGATGGATGTTTTCAGGCCCACCAAG:1 + chr2L 20439782 3' - I-element 201 1 76.03 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATT:1 - chr3R 556393 3' + Juan 4138 1 70.83 GTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAAAAAAAAAGATCAAAATAAAATAACACAAAATCAGAAGAAAACTCCCCCCCAAAGACAGGCGACTTGTTTACATTCCCACGCCCCAGAACGCACCTTGCTGCATATTCAAA:1 + chr2L 12607359 3' + copia 4728 1 75.17 AAGACCACCACACCAAACGCCATGAGCTAGCGCCGGATTCTAAGTCGTGCACCCACAAGAACTGGTTCCCTCGACTTTTAGCCTTACGCCCAGAACAAATAAGGCGGCAGCGCGTCACATTTATGAATTTTTAATGCACATTTCG:1 + chr2R 9907481 3' + Gypsy12A_LTR 2175 1 55.17 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCTTGCTGAGCTTTCGCTGGC:1 + chrX 19074899 3' + mdg1 396 2 64.34 TGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATATCTGGATAAATGACAGTTGAAAACCATCGCTTAACACT:2 - 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chr2R 20609937 3' - I-element 5175 1 80.82 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAG:1 - chr2L 4063836 3' + roo 9011 2 60.69 AAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTAGGGTATTGCAGTG:1 - chr2R 21410816 3' + Burdock 6380 2 76.71 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATA:2 + chr2L 18549941 3' + roo 9023 2 56.16 AGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTTTTAGAGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTCTACATTCTAATTATGTGATTAAGTGATTTATGAGTTTTTGTGCGAGTTGCAAAGTGGGCGGTGGCGCCACCTCATAT:1 + chr2L 8557290 3' + 1360 75 1 56.55 AAGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTC:1 + chr2R 9158123 3' - mdg3 84 2 71.23 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATA:1 - chr2R 10078145 3' - jockey 94 1 60.96 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTG:1 + chr3R 17996250 3' + diver 6035 2 69.18 GATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCATTTTTCCAGCAATTTCTTTCGTTCAATTCTGTTTCAGCTTCGGTTGAGTTGAACTCCGGTTCAGTTGCATTTA:1 - chr2L 4089128 3' + FB 123 1 60.80 TATTCTAGTGTCTTTGGTCTGACCTTCCATATGAACTGAGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTT:1 + chr3L 22016835 3' + Tc3 316 1 69.23 CTAACANAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTA:1 - chr3L 24131361 3' - Transpac 4946 2 64.38 TATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTTTTATTATTGTTAGAGAATATTCGAATCCC:1 + chr3R 19446065 3' + roo 8608 1 77.14 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCT:2 + chr3R 31653146 3' + roo 8991 2 74.66 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCG:1 + chr2L 12822847 3' + P-element 2820 1 28.46 GTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGTTTAATATAGATTAAAAAATATTTGTTTCGTTTT:1 - chr3L 14609792 3' - R1A1-element 5245 1 76.71 CCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTATATATTTGATTTTTGTTTTTGGTATAAACTGGTAATTTAGGAAACTAACAATCAGTTTCTATGAGTATGAATTTTGTAATGTTACCTAAACTACTTTGCAAGCATATTTATT:1 + chr3L 14092820 3' + I-element 5127 1 77.40 CAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGGAAAAGCACAACAACAAGGATAATCCATATGGAATCCAAATAAACCAAACCAAA:1 - chr2L 13089202 3' + I-element 4994 1 63.01 CATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCG:1 - chr3R 22642314 3' - blood 93 2 78.77 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGG:1 + chr2L 6647702 3' - mdg3 79 2 74.63 AAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGA:3 - chrX 292429 3' + G3 4505 1 67.12 AAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCA:3 - 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chrX 13134888 3' - jockey 4821 1 57.53 CAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATGTCAAACTGTTTGATGGCCAGTTAATCTCCAGGAGCCGCG:1 + chr2L 3862103 3' - mdg1 403 2 73.29 CTGGGGGAATGCTGCATCTTCCCCAGCTTTAATGTGGCGGCGCCTGTGCCGTCGATGCTTGGCGCTCCTTTCGCCTCGTGACTTCAGTTTTTCCAAGTGCACGTGCCATTGAGTTTACCAGTTTCCAGCAACCCTTGCTTCTTCTT:1 - chr3L 19581999 3' - aurora-element 465 1 54.79 TTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACAGCTTTGGGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAAAATTTATGTGTAGATACATTCTGGCCAGACGCTAGATACACAAAATGAAACGCACAAAT:1 - chr3L 8745714 3' + G4 3402 1 59.59 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTGTTCGACTTTTAGAAGGTTATTTATTATAAAATAACTTGAAAATACATGCAGATATGTAAGTTCTA:1 - chr3R 18488304 3' - roo 8664 1 77.40 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTCT:1 + chr3R 16342061 3' - P-element 34 1 59.31 AGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAA:1 + chr3R 21666971 3' + INE-1 96 1 66.97 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGGTTCGTTT:1 - 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chr3L 7300091 3' - roo 11 2 77.40 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCTGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCC:1 - chr2L 13158603 3' + roo 9047 1 67.12 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGGATTCTAGAGACACGCATACACGCAGCTCTAGTTTGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGCCCAC:1 + chr3L 22511714 3' + INE-1 86 1 66.00 GCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTGCGTGGGTGGCTGGTTGGGTGTGTGTGGCAAAGGAGCTTATCAAAATAAAAAATGCTTTCAT:1 + chrX 11234624 3' - I-element 5039 1 59.72 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTTTTGTTTACCGCAAAAAGTACACGAAAGGTCTTTGTTACAGCGCTGGAGTTCACTTTCTTGCTCAG:1 - chr2L 14671816 3' - FB 57 1 57.53 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAAA:1 + chrX 21100303 3' - mdg1 9 2 79.29 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACAACAAACCGCGAATTAATTGTAATTATTTATATATATACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTCTAT:1 + chr2R 3146359 3' + Quasimodo 7300 2 67.81 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTGCAGTTA:1 - 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chr3L 12004195 3' + P-element 2872 1 75.34 CTCTCAGCGTGAGCGAGCGGACAGAGGGCAATTTTGGAGGTCACCAAAAAGAGGCTGGATAAGGCCCAACTTTGCTGGCGCACAGCTTTCTTTTTTTTGCAAACTTGGATAGGATTTTGATTTCAAACATTTTGCAAGCAAAAAC:1 - chr3R 3619577 3' + 1360 3297 1 77.93 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATACGTGTGTTCCTTACGAATGC:1 + chr2R 4870275 3' - Juan 62 1 52.74 CCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACA:1 + chr2R 20010656 3' - Juan 4185 1 73.29 CCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCG:1 - chr2R 5106272 3' + 1360 3362 1 42.55 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTA:1 + chr2R 11159331 3' + roo 327 2 73.97 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTA:1 + chrX 21224633 3' + roo 9038 1 50.89 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAG:1 - chr3R 21276557 3' - BS 5081 1 73.97 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAACAGCAGC:1 + chr3L 19111618 3' - Doc 55 1 54.79 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATAATAAATTACAACAGACTTTCATCCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGATAAACTTAAA:1 - chr2R 5941315 3' + copia 221 1 54.07 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTT:1 + chr3R 28901304 3' - transib2 78 1 70.55 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAA:1 - chr3L 24131360 3' - Transpac 26 2 65.07 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGGGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATACGT:1 + chr2R 17878653 3' - Doc 48 1 53.47 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTACGACCTAAAGACAATCTTAAAAGACTTTTT:1 - chr3R 6481267 3' - jockey 4760 1 78.77 ATACCGCGGTGGGTTCAGGATTTGCACTCCATTACTGTTACATTGTTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAG:1 + chr2L 22224551 3' + Rt1c 5348 1 78.08 CTACATATTCCATTTTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATCCCGAAAAGGGACATGGAAAAATGCCTTCCTATTTGTCTCATACGTAGATAGTGTCTATCTACGTATGAGACAAATAGGAACTTAATTGTCATCACTGCCGT:2 - chr2R 5507381 3' - HB 103 1 52.74 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTGCACGATGGCCATGACTTAG:1 - chr3R 19992589 3' + hopper 1398 1 71.23 CAGAACATTTAAGGGCTTTTTAAATGACCTTATATGTTTTTCCATCCATTCTAAGCTTAAGAATTAACATGCTTTTCCCCTGGTAGTAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAATAAAATGTTTTCAATTTTTTTATTTTATTGTCTTT:1 + chr2L 21142697 3' - HB 435 1 67.12 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGC:2 + chr2R 8099251 3' + jockey 4959 1 56.16 TATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTA:1 - 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chrX 21993556 3' + gtwin 404 2 68.49 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTA:1 - chr3R 24219288 3' - roo 8744 2 73.97 CAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGGTTTGTTTATTTTGGTTTCTCGCTCTTTCGTTTCGTGATCGAGATAGCTAGTAGTTCCTTCTTTTCGTTTTGATTTTCTTGGCATTAATTTTGGGTTT:1 - chr2R 19411729 3' - HeT-A 5984 1 77.69 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTG:1 + chrX 21216813 3' - roo 8730 2 65.07 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCA:2 + chr2R 8735668 3' - mdg1 67 2 64.38 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGC:1 - chr3L 5389859 3' + roo 9015 2 59.59 GTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAG:3 - chr3R 19225003 3' - HMS-Beagle 73 2 68.49 TCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCA:1 + chr3R 13612644 3' - F-element 180 1 69.86 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATT:1 + chr3L 21380593 3' - I-element 53 1 71.30 ATATGGTATTTTTATTTTTTTTTACTTTTTTTATTTTTACTTTTTTTTCTTTCTGTGCAACTTGTTGCTGTTCCAGCTCGAATATGGCACAAATTCAATACTGGTAGATATTCCAATAACTATGTAAATCGACCTCCAATGGCCCA:1 - chrX 11848640 3' - TART-C 416 2 67.81 ATAATCTTCAACCAGATGGCATCCAGTGTAGATGGCTTTTGTAAAGCATTTGATTTTGTCAACCACAATACGTAGTTCGCTCGGACCGCTGTCCACTCTCGACGCATTGAGGCTGCTCTGTG:1 - chr3R 10279332 3' + Q-element 287 2 71.31 ATTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCACCGTGCC:1 + chr3R 15942832 3' + hopper 1385 1 64.38 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACTTCAAATATTATTATTATCA:1 - chr3R 4575711 3' - jockey 8 1 59.62 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTCTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACAT:1 + chr3R 20167679 3' - roo 8715 2 56.93 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTA:1 - chr3R 6419828 3' + Tabor 7277 2 52.74 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACG:1 - chrX 2214264 3' - jockey 4833 1 67.12 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACA:1 - chrX 6475272 3' - Doc 11 1 75.00 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAAACCATGCATAATGCCCCC:1 - chr3R 24450376 3' - 412 17 2 71.23 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCCCTTTTTAT:1 - chrX 18817270 3' + transib2 2770 1 54.11 TTTTAATAAATAAAATAAAATATAATATTCGTAAAAAATAGTTATAATTGTCAATGTAATAGAAAGTGTTGGTATATATATTATTTTTTTTTTTAAAAGCCTAATCAACTTGTCATTTATATCTTATTCTTCTCAGTGTACACAAC:1 + chr3L 12660292 3' + G7 1146 1 53.42 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATT:1 + chr2L 18549909 3' + roo 327 2 71.23 AAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCCCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATTGCGTATTTTCATGCATGCTAATTAAATTAAGCCAAGCCAAAGAATGTGCAAATCTGCAAGAGGAACAAA:1 - chrX 13651695 3' + HeT-A 6011 1 52.05 CTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGCAACTGTAACACTGCACGTAGTAACGTTTTATTATTGTATTAGCAAAAGTT:1 - chr2L 17056303 3' + Doc 406 1 73.08 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTAGTTTTAATTAAACTTTTGTTT:1 + chr2L 71305 3' - 412 27 2 67.12 AATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCCAAATGCAGATAAGAAGTTAAAGCGTT:1 - chr3L 19813036 3' - Tirant 296 2 59.32 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCC:1 + chr2L 11357924 3' + blood 7329 1 58.90 AATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAATTGTTTTTGCTTGAGCAGAGTTTAGAGAAAGAGAGGAAACCGAAGCACT:1 + chr3L 16469733 3' + jockey 4718 1 65.07 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATAT:1 - chr2L 17861775 3' - Doc 94 1 58.90 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCT:1 - chrX 15357647 3' - hopper 6 2 69.39 TATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTAACGGAAACAAACT:1 + chr2L 22674941 3' + mdg1 7458 2 78.77 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACG:1 + chr3L 24208243 3' - Quasimodo 25 2 66.21 TATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTGT:1 - chr2L 20821165 3' + Burdock 6383 2 62.33 ATAAATCAAAATACATTTTCTTAGTATTCAATGCAATCAATTATGTGTGGGCAATTAGCAGTTAGATGGCACGACTGTTCCTTAAATGCTATATAAAATTCCTATAAAACATTGCATTGGTATTCGCTACACGTCTCAGCTTTTTA:1 + chr3R 18672327 3' - invader5 3618 1 43.84 CTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACAAAAAAAAAGAAATGCAACAGCCGCAACAAAAACGTCATAAACTTTTAACAATTGCAAAACCAAATAAACAAAACGTAGGGCGAAACAAAGGGTAAACACT:1 - chr3R 17341094 3' + Porto1 4313 1 58.90 ATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAA:2 - chr3L 8748915 3' + HeT-A 6002 1 73.29 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGC:1 + chr3L 23906475 3' - 1360 54 1 57.97 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTAACGG:1 + chr2L 22674932 3' + mdg1 412 2 73.10 CTCTGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATGTAGTCGGAGCGGTTCCTCCTCTACTACCCACTCATAGTTCGATCTACAATGATGTAAAATTAGGGTATAAATATAAGTGCCAGAAGACGTGGTATCAGTAGCACTG:1 + chr3L 24296903 3' - INE-1 90 1 72.60 TGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCACAAGCATCGTAAAAATATTTATAATAAAGTCCAATTTTGGTGCAAGACCCATAAAGTCTGGTTCAATG:1 + chr2L 8898132 3' + Ivk 5234 1 52.41 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAAGGCGCTTTGAAACAACA:1 + chr3L 10373923 3' - 297 38 2 52.42 AGTAAACTTCAGAGCGCTTACCAAATACCTGAACGATGCCAAGAAAAACTTTTAAACGTACCACCTAAAAAGCAGCAAGGGGCTACTATTTTAATGATATATGCATATGCAGGAACAGGAAGACGAGCTCTGTTCCTGCCTTTG:1 + chrX 19819568 3' + Fw2 349 1 50.00 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAA:1 + chr2R 19199757 3' + hopper 1390 1 45.00 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGTTATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTC:1 - chr3L 5389888 3' + roo 8989 2 76.22 ATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAACTACAACATTTTTAATAATTTTAAAAATCTTCTATCAAAATAAAAACATAGTACATTATGGAATACCTCAAATGAACAAA:1 + chr3L 25610425 3' + G5 4683 1 56.85 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGTCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTT:1 + chr3R 13875105 3' + P-element 2843 1 28.72 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCA:1 - chr2L 7125770 3' - I-element 74 1 67.36 ACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGT:1 - chr2L 4754879 3' - Stalker4 7017 4 58.22 AGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGAATCTCAATGTCTTCCTTCAGGCTTATTAGCTGTGCCATTTGATTGAGCATGTCTCGAGTCTCC:1 - chr3L 16123936 3' - F-element 4244 1 61.54 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACC:2 - chrX 21216726 3' + roo 338 2 67.12 ACCCAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCGCATTCCCACCAGCCAAAGACACTAGAATAACAACATGCG:1 + chr2R 9843317 3' + 1360 3260 1 53.75 CATTAAAGACGATGAATAAAGAGACAAACGCAAATGCATTAGTCGGGTTTGGGCGCTTTTGGTGCTCTGGCTGGCAAGGAGCTGCCTCTGTGAGAGTGTGTGGGTGTAATGATTTTCCATACACAATTTGTGTGGCTCCAATATG:1 + chr3R 29360882 3' + ZAM 299 1 54.48 ATTGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACAAGTACAAATACCTATCCACCGGAAACCCCGAGTTCTACCAG:1 + chr2L 20640349 3' + Stalker 263 4 75.86 TTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGATGA:1 + chr2R 3760474 3' - accord 57 2 66.67 AGGGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCAACTGCCCGCATGAGAACGGAGTGGCCGCAAAATCGTG:1 - chr3R 5792780 3' - roo 8989 2 61.90 TGAATATTATTATTATTTTTTTGTATCATTTTGTTACCTATAACTATGCTATATTATACGATACCATACTAGAATATACTATACTATACTAGGCTTTGAAGTACTGAATTCAAAACAATATCTCAATGCTGACGTCAATCAAGTAA:1 + chr3L 20218219 3' + copia 4820 1 58.22 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTGCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCAC:1 - chr2L 6102940 3' + roo 9001 2 67.81 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCATATACCCATTACCGG:1 + chr3R 19073325 3' + roo 9052 2 71.23 ATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATATTGTTGAAACGCATCTTGGGTGGGGTGAAGGGTAGGCAGCTGTTCGACCTGGGTGACGAATCCTG:1 + chr3L 23447213 3' - HMS-Beagle2 6850 1 59.43 TCGAAGAATATCAAACTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGGTGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAATACCAGATTAATTAATTAATTAATTTTTCATTTTTCATAAATT:1 - chr3L 21910665 3' + Tc1-2 256 1 84.33 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTC:1 + chr3L 21769155 3' + I-element 5338 1 67.12 GAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACT:1 + chr3R 10736127 3' - McClintock 63 2 65.75 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGTAAATATTTTTGCCTGCCGCTAT:1 - chr2L 12341815 3' + BS 5040 1 53.42 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGC:1 - chr2L 4003651 3' - mdg1 7046 2 75.40 ACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTTAAAAGCCATCGAACCGTGGGTG:1 + chr3R 16519022 3' + Tirant 8505 2 77.05 AGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGTCATCTACGAACTC:1 - chr2L 7618487 3' + X-element 4678 1 67.74 AGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAA:1 + chr2R 15005097 3' - BS 5072 1 70.55 AAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAGAAAATAAGGAGGCGCCAAAATGAAAAGCAAGACTGCGAAATGAAGGT:2 + chr3R 27407676 3' - diver 6062 2 67.12 AAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGCTAACCGGATTGCGCCTGCGCACTTTCGACCATTCCATTCGGATTTCGACTTC:1 + chr2L 21956940 3' - 412 448 2 63.70 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCT:1 + chr3R 6419914 3' - Tabor 6927 2 76.39 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGAGTGCGTTCTCAGATTTA:1 - chr2R 11794954 3' + opus 7444 2 66.44 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTT:3 - chrX 4341233 3' + roo 9037 1 60.96 CAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAA:1 + chr3R 28901310 3' - transib2 72 1 66.44 ATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAGTTTAT:1 - chrX 9530306 3' + 297 337 2 60.27 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAA:1 - chr3R 904929 3' - rover 35 2 58.04 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAA:1 - chr3R 27160092 3' + 412 7457 2 80.14 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAA:2 + chr3L 24486372 3' + flea 4981 2 63.01 TGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGG:1 - chr2L 12341841 3' + BS 5014 1 68.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTT:1 - chr3R 11191384 3' + roo 355 2 56.85 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGTATTTATCAATACATTTAAACCGTTTGTAATGCATTCAATAGCAAACATAATAGCA:1 + chr3R 4461171 3' + blood 7369 2 76.03 GCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATGTCAGGAACACGCCTCACTGATTTTTCAGGGCGGCAACGTGCGGGTGTCGGTGTGGCAGGGCATAGGGCACAAGGAAAAGGCAGACGC:1 + chr3L 13768659 3' - I-element 5102 1 77.87 ATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCACGCTGTTCTTCA:1 + chr3R 28901309 3' - transib2 70 1 66.43 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTGTAAGTACTAGC:1 + chrX 20999641 3' - BS 7 1 74.66 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCG:1 + chrX 13490728 3' + 297 313 2 81.51 TATAATAATAATAATTTATAATATATATAAATATAATATAATATAGTTTTCAGTGATATTAGTCCAGTTAAGGGTCCTCCCAAACCATTGCCAATTTGTCACTAAAACCCAACATCAGCAGATCATAACTCGGCCAAAAACAGTCG:1 + chrX 7548305 3' - Tc3 272 1 68.49 GCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTATACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCCTACTTTTGTTTACTTAATTTCTATCTTATATTGTATTTATGTATCTTATGTTTTATCTTATGTGTATTTAAGCACTCGTTTAAAATCCTTT:1 - chr3L 18741973 3' + accord2 172 2 44.52 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATTTCGGTCTGGAATGCAG:1 + chr2R 12779749 3' - I-element 29 1 65.49 GGCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGCAAATTGACCTGCTCATTATGGAATTTG:1 - chr2L 20973147 3' - 1360 3314 1 78.23 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTGAAACCATTCTATTTCCCGATAGA:1 - chr2L 12818190 3' + hobo 2922 1 73.29 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGCTAGATGACACATAACTTCAGGGAATTAAGGCGGTTTCAATT:1 + chr2R 13168781 3' - P-element 26 1 69.86 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACA:1 + chr3R 18093383 3' - I-element 53 1 52.41 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTG:1 + chr3R 27123575 3' + roo 9007 2 61.64 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCTTTGAAGTC:1 + chr3L 10731899 3' - 297 6616 2 56.16 AATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTTATTGTAGTTAAATTTATTACAGGGAATTTTTAATATCGCTTAGAAAATCTGAGGACAGGGTACACCTGTGCGAT:1 + chr3R 27083179 3' - jockey 4537 1 77.40 AATATATTAATATATATTATAAATATTTATTTGTATCTTCAACTTCAAAAGACCTTTAAAGCCCAAATTTTCTTGTTGTAGCTTTAATTTTTGTACAGCACTTAAATCGTTTGCCAATCAATACATATGTCAATTTTTTAACAATC:1 - chr3L 16307199 3' - Tc3 286 1 67.81 TCTTAATTTACTTTCACTTAGTGGAACGTTAAACCCAACGAGCCAATAAACGGATCAATAAACCGAAATACAATACACGATTTCCGCTAACATCTGGCAACGCTGTTCGTTGGCAGCTTGTAACGGTTATTCACGACAATTTACTC:1 + chr2L 9460207 3' - Doc 4612 1 74.66 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTATT:1 - chr3L 23249348 3' - rover 6974 2 70.55 GAAAAAAAAAAACAAATTTCTTAGTGTTATTTTGATTAATTAATCACTATTTTTTTTTTCTTAAATTTACCTACTTTTCCATTTCAATTATGCGTAAGGGAATTACCTTAGCACAACACATTTATGACAAAGGTCGTCAATGGTTT:1 + chrX 8998987 3' + S-element 173 1 67.12 TCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAACCCCGTACACCTGCTAGTCCCTAACGCCCATTTATTTATGCTCCTCCCTCCACCGTTTTGTTGATTTT:1 + chr3L 22243014 3' + accord2 7418 1 72.63 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAACTTTGTTAAGAAAAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTAACCAACAA:1 - chr2R 5401667 3' + 1360 3318 1 68.49 GTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCAAAAACAAAAAAAAAGAAGAGGAAAGAGGTTTGCAAGAGAATAGGGTGGTGAACCCATAAATCAACAACGTTTGATGAGCAGAAACCAGTTTGGCGACGTAACCCTTTTCTCT:1 - chrX 4569907 3' + Doc2-element 182 1 73.29 GAAATAGATTCACAACTTTATTAGCGACAATATACCCAATTATAATTTAAATGTGGTAAATGGCAAGGTTTCCCTTTTCGACCGATAAACGGATTGCATCTGCCTATCGAGCACAACTGTACCTTGTCGACCTTTTGTTTGAATAG:1 - chrX 11051182 3' - 297 304 2 77.40 CAACACACACACACACACACATTCACTTACACACACACAGCTGCTGTGGGTGTTGCA:1 + chr2L 12897007 3' + gypsy3 424 4 54.39 AGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAG:1 + chrX 19980687 3' - X-element 4549 1 60.96 GATTAAAAAATGTTTTAAAAAAATATTCAAATAACCCTTGCTTTTCTTTAATTTCATAGTTATGGAGAATACTTCTTTACAGTTCCTGTGCACCATAAACTATCTGCGAATCGTTCCTCTTTTGCTGCCATACTTTTATTTTATTA:1 + chr2L 15351072 3' - Juan 3783 1 70.55 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAG:1 + chr2R 18514979 3' - P-element 56 1 45.21 CCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGAGCAATGTCAACAAAAAAAAAACTCAGAAATAGGAATAAACAAGAAACTGTTTAGAAAGGGTGTACCAAACTGTCGGGCCAATTCATTATTTTCCAGTCTACTCACTT:1 + chrX 16905596 3' + jockey 4684 1 82.44 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAAATTATACTGAATTTGTATAACATTTTTAATATATACATATTT:1 - chr2R 14653146 3' - 297 39 2 50.00 ATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTT:1 - chr3R 19445961 3' + 1360 22 1 58.22 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATA:1 - chr2L 9782088 3' - P-element 81 1 30.14 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGT:1 + chr2L 47165 3' + roo 8984 2 76.71 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGG:1 + chr2R 12133852 3' - jockey 27 1 62.28 CTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGGGCTCAAGAGATGGGCATGTAGATGATT:1 + chrX 17716811 3' - FB 243 1 59.02 CCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAGGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAAACAACCAAACAAACAACAAAAATAAAACTAAAG:1 - chr2L 20851000 3' - 1360 411 1 77.40 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATTTTTTTATTTAAATCATACGGTGCCACAAACTGTCCATATATTT:1 - chr2L 6102881 3' + roo 397 1 65.52 AGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGCTGGTTTTAGTGGTTTTAGTAGCATATTGGACAGTTACATGGTT:1 + chrX 11247605 3' - F-element 4618 1 68.79 AAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCT:1 - chr3R 904969 3' - rover 78 2 83.56 CATAAGGCCCACGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGGTGCATTCATTTTAATTAAGCTCCGTTCCTCT:1 + chr2R 9386611 3' + invader3 5205 2 77.14 AACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTAATTCTCGAAACGGCAAAAGGGGAAATTCGTTTATTACACATTTAAAAAAGAACAAAATTAAAGAGAATAA:1 - chr2R 2535710 3' - invader2 4939 2 52.05 TGACCATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGAGGGTGATCATGTTTCATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAATATACTTCTTATATGGTTATTAAAGC:1 - chr3L 9489853 3' - 412 7231 2 72.48 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATA:1 - chr2R 18316045 3' - HMS-Beagle2 75 2 67.12 AACTGTTCAAAAAATACCTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTCGTTTTATGAGCCGATGCCTGCGCAGAAAGCGGTGGAAAAAACTTTTTCAA:1 - chr2R 6806680 3' + F-element 4598 1 49.00 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAG:1 + chrX 21224618 3' + roo 8996 2 71.22 CTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTT:1 - chr3R 9595030 3' + Tirant 8418 2 81.38 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCT:1 - chr3R 15724310 3' + Juan 4146 1 63.70 GTATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGTTTCAGTTATCGTCATTGGAGTCTTTGCTTTGCTTTTCTTGTATTTTTTTTTTTCGTTT:1 + chr3R 27815843 3' - I-element 5039 1 58.22 GATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTACATTGTTTTCGATCGTAAGAAAAATCCGATTTGAAAAATGCCTTA:1 + chr3L 11002939 3' - transib2 218 1 69.18 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCAGCTAACAACCGAATATAGAATGATAATGAAATCTACCGGAATCTGCTTATTTTCTCTCTTTTCCTTTGCCCCAT:1 + chr2R 15652021 3' - hobo 47 1 52.05 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAACTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGG:1 - chr3L 5389855 3' + roo 9054 2 63.96 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGA:2 - chr3R 27315103 3' - jockey 4748 1 67.81 GGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTGTTTCAA:2 - chr2L 20821160 3' + Burdock 6388 2 65.75 AATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGGCGATTTTAGCAAACAAAATTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGCAGGCTCAGCTAAACGGAGAACAGC:1 - chr2L 1194427 3' + 1360 2966 1 78.79 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTC:1 + chr2R 13259388 3' - mdg1 7094 2 54.11 ATTTGGTGAAGATAGGTCATCATTTCGAATTTCTGCCAAAAAATAAACACAAAACAATACTTAAATTATATTATACAACTAATAAAACAAAGATGCAAAAAAAATAAGCTGATCACCCAAATTGTGAAAAGAAAAACCATTCGTTA:1 - chr3R 1221535 3' + transib1 2103 1 73.97 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCA:1 + chrX 8308518 3' + roo 9037 1 61.43 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGCTGGT:1 + chr3R 10931745 3' + 297 6929 2 56.16 GTGAGCGTGCAAGGACTGAAGAGCATGCGNAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAACTCCAATAGGGCTGTCCATTATTTTCGCTTCATCATAAATCTTGCTGATAGTGTTGATGAAAATAAGATTTAAAAGG:1 - chr3L 7943965 3' + Rt1b 5005 1 66.67 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGA:1 - chrX 8437684 3' + P-element 2796 1 23.97 AAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATAT:1 - chr3R 4160066 3' + invader2 5045 2 58.90 AAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATATAAAGATCTAGCGAAGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTGAAGCTAGATAGTTGA:1 + chr3L 23341006 3' + Quasimodo 7328 2 53.79 TACATTATATTCATTTTCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTGCTCTCTCCCCGTGTTCTCCAGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGCGTATTTTGATGACGGCACTCAGTTTCCGCCCGCACTGTGATTTTTGG:1 - chr2R 16097285 3' + Cr1a 4329 1 60.96 ATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAA:2 + chr3R 24219384 3' + roo 9026 1 52.74 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAA:1 - chr3R 16341946 3' + P-element 2817 1 37.67 AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTG:1 + chrX 21224636 3' + roo 405 1 69.41 GTGTGTAAGTATATGTGGGCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAGAAAAA:1 + chr2R 4673656 3' - Quasimodo 23 2 37.93 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCAC:1 + chr2L 16943873 3' + copia 5073 2 73.97 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCT:1 - chr3L 17055398 3' - Tirant 30 2 65.07 TATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCG:1 + chr2R 12645522 3' - X-element 56 1 48.63 AACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGACTGGCTTTCGGTGGCGTTGACAATTTGCAT:1 + chrX 1060179 3' + Doc 4465 1 60.96 GGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGTTTTTCTTCATAATTTTTCTTATCTGCATTTTTATTATTTGATACCGAATTCTT:2 - chr3R 934170 3' - Stalker 160 6 58.90 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTAC:1 + chr3R 28469288 3' + 412 427 2 71.01 ATGTATACAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATTGAAGCCAACTCGGTGAACAACAAATTCCAATTGACAGACAGCTCTGCAATGCTGTGAATGGAAATTCGGTAGAGCAGAAAATCGTTGATTTTTAAAACAGCTG:1 - chr2L 11605874 3' + Quasimodo 121 2 76.03 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCGGTGCGTTGTGGCATGGCATGGTGGGAAATTATTTGCAGTCACTTGGGCAG:1 - chr3R 24733518 3' - hobo 44 1 58.20 AATTTGAATTTGAATTTGAAATATATTTACAATAAATTTAAATGAGGTCTGGATATTCAACTGTTATTACTAAGTCAATAAAACCGTAAAAAATATAAAACAAATTTTTACCGACATGTGAAAAATAGTTAGATGATTTGGTATCA:3 - chr3L 14920325 3' - Rt1a 310 2 54.79 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCCTGGCAATGCATATTTGATGTTA:1 - chr2R 22034602 3' + copia 245 1 76.22 ATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGCACACAACTAAATGATGTAACAGGAAATATTCTCTTGTATAC:1 + chr2L 15602634 3' + G2 2776 1 71.23 AATACTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACC:1 + chrY 1421308 3' + flea 4955 2 58.22 AAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGA:1 - chrX 18336556 3' + mdg3 5461 2 60.27 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTGAGTGGTGGGTGCGGCGAGAAAGAGAAGGGAAGCGCACTTTT:1 - chr3R 16715865 3' - blood 166 2 90.62 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATA:1 - chr2R 4673531 3' + Quasimodo 7339 2 65.75 TGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCGCTGTGGTGGATTGGGTATATTGCAACAGTTTGCGCGACAGTTT:1 + chr3L 10572699 3' - roo 112 2 69.18 AATAAGAAATATTAATAAATAAATATAAATATATAAAGAAATATATTATTAATTAGAATGGCTTTGAACAACACTGCGTATGAGTAACGTCTTTACGCCGCTGTACAAATGGTAAGAATCATGTACGAGGTACACGGAAGTTTCTT:1 + chr3R 5761875 3' + gypsy7 351 2 65.75 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTTAGCTTAGTT:1 - chr2R 24169923 3' - transib2 14 1 43.84 CGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCT:1 - chr3R 904906 3' - rover 6958 2 66.67 CGTAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAAT:1 + chr2L 11357907 3' + blood 302 2 68.97 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACG:2 - chr3R 26504203 3' - HMS-Beagle 50 2 53.42 GAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGAATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATAC:1 - chr2L 4888748 3' + BS 5017 1 72.66 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGC:1 + chrX 661965 3' - 412 54 2 53.42 ACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATACTTTTGCAGAAATTCTATATTTTCGAAGGCGTGTTGTCTTCACAACTAGGCTTAATTGTT:1 + chrX 17413207 3' + Tabor 7265 2 56.85 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCGGTATCAGCTTCAGTGGGTAACTGGTGTTGCATGTAAGTGCAGCTGTTGTTGGCGAACGCGAGAAACAAGGACCAACTTCGTT:1 - chr3R 28474968 3' + 412 461 2 62.59 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATATGTATTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTATAAGCTATATTTAAATAATAATAACATTAA:1 - chrX 10778580 3' - pogo 49 1 53.42 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTCATACAAAGGCCTCTGCG:1 - chr3R 4964061 3' + roo 9052 2 70.80 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAA:1 + chr2R 8099209 3' + jockey 4924 1 69.78 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAGACAGGGATGGCAAGGATTAAGCGGGTTGGGCGATGTCAAGGC:1 + chrX 4341346 3' - roo 8740 2 68.49 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAAT:1 + chrX 18010064 3' - 412 7082 2 59.40 AAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATAAAACACA:1 - chrY 2346858 3' + micropia 5387 2 50.68 GGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTTGTGAATTAATAAGTGTAAATCAACGACAAGCTAATTATCTATAATTTAAGCACTGCACACAATCCACTGCCATTTCCACCATTCCATTCTGGAGTTTCTAC:1 - chrX 2479076 3' - mdg3 5114 1 75.34 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAGAACTAA:1 - chr2R 9544843 3' + roo 339 2 65.07 AATAATAATAATATTTTTTAATATTGAGTAAAGCGTCGATGGTAATAAGACTTCACTATTCCCAGAGTCTTAATTAGCATTCAGTTGACAAGCATTGACAAGGATATCTCTGATTGGATTGCAAAGTTTGACTATTTATTAGTTGT:2 + chr2L 20296652 3' - Burdock 499 1 58.22 ATAAATCCTGATCAAGAATATATAAGTATGTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACAAATCTGGTATACCCTTCTACTCCACGGGATACGGGAAGAAGAAAGGAAGATATAACCTTATATACCTTT:1 + chr4 886566 3' - INE-1 83 1 72.60 GTTTAANTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTTTTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - TAHRE 76 1 51.88 AAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTA:2 - chr2L 17005687 3' + Stalker2 358 2 47.26 ATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAGACGACCAACTCAATCCATCTTACTCGATTTCTACAATTATGTGCACAATTAATGTTAATAAC:1 + chr2L 14393655 3' - 1360 3183 1 56.55 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATGGCT:1 - chr3L 10731722 3' + 297 382 2 75.34 AATGCTATAGTCGAGATTCCCGAATATATTTGGTGGAATTAAATATATATTTCAACTTTCTCCATTTTATAAATTCTTCTACAATGCTCTTCTTATAATCTATAATGTATCATATTTTTCTGTAATAATATATCATATTTTTTGGC:1 + chr3R 27024900 3' - INE-1 570 1 23.29 ATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGATAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAAAATACAAAAAATACACACATAAACAAAACCTCAAAATCATATAGAAAAACATATCGAAATAATTTTGATTTAGTCATTGTTGAATGACTTG:1 - chrX 12257406 3' + 1360 2963 1 64.38 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACAT:2 - chr2R 15326831 3' + copia 238 1 50.68 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGA:1 - chr3R 9038892 3' - Juan 4033 1 65.97 TATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAATCAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGCGCGATTCTTGATCTTGAA:1 - chrX 22641684 3' + G6 1994 2 57.53 ACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGGGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCA:1 + chr3R 24450526 3' + 412 459 2 53.23 TACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGTTAAGTCACAGCAACTTCTAGTTTCATTTAAACTACGAAAACGGATTGTCTTGATCGACTCGCCTGGCGG:1 - chr3R 6626231 3' - flea 428 1 55.38 AGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAACAAAAAAATGGATCAAACTTGACTGCAGAGCGAAATAATTAAACATCAATTTGATGAGTTCGGACCGAGAAAAAAATTGCGAACATCAAAGCATGTAGACATAGAG:1 - chr2L 15172966 3' + G2 3045 1 75.86 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCG:1 + chr3R 15942789 3' + hopper2 1535 1 69.86 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGT:1 + chr2L 16943903 3' + copia 246 1 51.49 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGA:1 - chr2R 23180206 3' - roo 77 2 70.55 CATAAGCTTATACACTCATACACCGATGCTCTGAATACCCGTGCA:1 + chrX 2479399 3' + mdg3 5328 2 53.33 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAAGGGACAAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCCTTATGCACCTTTTCCACCTT:1 - chr3R 19447999 3' + roo 327 2 73.29 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGTAGAAT:1 + chr2R 11804762 3' - pogo 28 1 66.44 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTG:1 - chrX 19074736 3' - mdg1 32 2 59.59 TTAAGTAACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCTCCGTAGCCTATTGTATACTACAATATATTTAATTTTGTTAAGT:1 - chr2L 3813589 3' + Ivk 5219 1 69.86 ATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGTGAACGAATTGTGAACGCTAAGAGCGTAAGAAATATGATAATGAAGAAAGGCCATTGATGCGATGCTCAAAGAAGTCAGTGATATAAT:1 + chr2R 23518427 3' - 1360 383 1 64.38 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAA:1 - chr2L 17809172 3' + jockey 4937 1 54.11 GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTA:1 + chr2L 11391587 3' - 1360 60 1 58.22 GTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGG:1 + chrX 21852455 3' - gtwin 6932 2 59.34 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCTGCACACATGGCGTAT:1 - chr3R 29612048 3' - jockey 17 1 60.00 ATGGGTTAATTGCTTCATATAATAAACTCGTCCAGTCCGCTGCAGGATAGAGCTATTCTTTGAGCTCCCGTGCGTGTACTTGACTTAACTACTTATATCTTAAGATGTGTGCTTTAAGTTTCAGACTCATCGTAATATAATTATGA:1 - chr2R 20908231 3' - Ivk 5283 1 50.68 ATTTAATATAGGTTTTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTACTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAACCGTATAAATCTGCAACCTTTTTGTTGCCATGAGCGATATATAAGCCCACAGGGATGATGAC:1 - chr3L 25671466 3' + Cr1a 4312 1 76.71 TCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCCTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACATCATCCTCCCGCCAACGTGCAACGCCGAGTGTCGACGAATGCGAACAATTCGCGTCGACATCTTGTC:1 + chr3R 30714244 3' + gypsy7 275 1 54.11 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATTGCATCGCCCTCTCTTT:1 + chrX 8437793 3' - P-element 14 1 74.29 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACC:1 + chr2R 9158158 3' - mdg3 49 2 52.74 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGTGTGTACGTGAGATAAGCTCGTGCGGCGGTAATTGGTCAATGGAAGTGTCAACATTAGACAAATTGTTTAACCTTTTTATAGCTTCGAATGTATTT:1 + chr3L 8453868 3' - FB 22 1 65.73 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGTGTCTGCATCGATTAGTACCACAATAAGCCCTGTGAAATTTTTGATT:1 + chr3R 9003056 3' - roo 17 2 73.97 ATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTTTCAAATTTAAATGTTCGTGCTATTTCGGCAAAAATCCTCAGGTACTCTGTCTTGAATCA:1 - chr4 328646 3' - 1360 298 1 64.38 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACCACCCACCCCACTCCACTTCACTTCGCAGGTCTGGGCAAAATCGATATTATGGCACACTATGCTGCTGTGCCATTTGCG:1 + chr3R 20818451 3' + 1360 3369 1 65.32 GGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAAT:2 + chrX 14771803 3' + BS 5024 1 64.38 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAA:1 + chr3L 6964786 3' - P-element 97 1 18.62 CTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGA:1 + chr3R 19225092 3' + HMS-Beagle 6980 2 60.96 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTT:1 - chr2R 3338780 3' - Juan 53 1 53.85 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAATGCGATTACCAATGAATATTTATGTTCCCCCTTGGCCCAACTGAATTTTTAATTGA:1 + chr3L 15911762 3' - jockey 4858 1 61.64 AGGAGAGGGCGCAACTCGTGGCGCTCGCTGGGCCACCTCTCAGCCGTTTGGGATGGGCCTCACGTGATCATCATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACA:1 + chrX 17678734 3' + Rt1a 4620 1 54.14 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAG:3 - chr2L 14874119 3' + copia 240 1 48.63 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTTTGTCAAC:1 + chr3R 20441353 3' - I-element 30 1 62.07 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGTAAGTGAGCA:1 + chrX 21224649 3' + roo 9024 2 50.00 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTC:1 + chr2R 13931595 3' - P-element 96 1 21.23 ATAACANTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACG:1 - chr2R 7090660 3' + I-element 5270 1 73.97 GAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGATCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATACAATCATACTTTGAAAAGGAAAATAAAGTTTATAATACCGAAAATAAGAATTGAATTGTCAAGGCAATTGCAAAAATTGGCCAA:1 - chr2L 3103590 3' + 1360 113 1 41.10 CGGATGTTGATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGAAAATTATCTATCCTCTCTTCTCGCTCTGTTGTGTATGTGTGTGTTTGTGTATCTTCTACTTTTTTGAGTCAGCTGTCTGTGCTTTACTTTTTCATCTCCTGCACAGCTTTAAC:1 + chr3R 16281364 3' - Quasimodo 173 2 80.82 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGC:1 + chr3R 30347387 3' + P-element 2817 1 30.08 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTG:1 - chrX 14304043 3' - roo 52 2 60.96 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGCGT:1 + chr2R 22514198 3' + P-element 2825 1 41.78 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATTTTTATATAATATTTTTATATTTATTTTTTTTGT:1 + chrX 13438372 3' + Quasimodo 7300 2 81.88 TGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCC:1 + chr3R 24219348 3' + roo 8989 2 72.60 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATG:1 + chr3L 20898630 3' + roo 351 2 58.90 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTT:1 + chr2L 13844279 3' - Stalker2 41 2 56.85 AGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGATTATTTTTCTCACGCATCTGAACGAGAAAT:1 - chr3R 7420196 3' + 1360 3335 1 55.48 ACCCTTTAAAATTTGTTTTGTAAGATGTGGCGCCAATTCACATATTTTAGGATCGGCGGATAGAAGCACTTACTTATATGATGATGATGAACATACATAGACATAATATGTACATAAAAATATATATACAAAAAATATATATGCAA:1 - chr3R 1972332 3' + FB 1000 1 78.77 AAAAAATAAAATAAAATAAAAAGAAGACAAACAAAAAGCCAAGGCAAATGGTCACTGCCTGACCTAAGGCAAAGCTCAAAATATTTGCCAAATTAATCTTGAATAATTATGTTAGCGCGAATTTGTATGGCAAAGGAGACAACAAT:1 + chr3L 439105 3' - transib1 1900 2 80.82 TGTATTCTTAATTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCAACTTAACGAACCGAATGTTTGTTAAGCACACATTCGCAGAATGGCAACGCAGGCGCGCTGTTAAGTATGCTATAAATTGCCGCATTCATTCATAA:1 - chr3R 18111898 3' - Stalker4 259 4 52.74 AGACTGGACACACTGGAACTTCAGCTCCGCGCGCAGCAAGCTTACGGCATAAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAATAATTTACATAGTAATTACACGCAGTCCTGCGAGAAAGATGAATGCAGACACCCTTCCG:1 + chr3R 31124853 3' + Chimpo 96 1 59.59 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTT:1 - chr3R 30347302 3' - P-element 43 1 55.47 GTAATAATATAAAAAAAAAAATACCAACAAATTTGAAATCCAATATGTCATAAATCTTGCGCAAAATACTATTTATCTATCTATTCGAACATTCTGATTTGGTAACTATCACTATCATAAAATTTAACTGATACAGAACATTCCCT:1 - 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Idefix 36 2 64.66 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAG:1 - chr3L 2989961 3' + roo 321 2 77.40 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTC:1 - chr3L 21327092 3' + copia 5079 2 69.86 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGG:1 - chr3L 5532921 3' + roo 357 2 56.64 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTTTTCGC:1 + chr2L 14074549 3' - 297 44 2 57.69 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGCTTTTGCACAATGCA:1 + chr2R 5674763 3' + S-element 1674 1 58.62 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGCTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAAT:1 - chr3R 4679466 3' + hopper2 1534 1 70.63 AAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGGGCGCAAAAAAACGAGAAACGAGAAAAAATCCATAGAAAGAAAGAAGAAACCAAGCCGAAAAATACGGAAACGTTTGAGCCATGCCGCAAATGAAAGGAAAACATT:1 - chr2L 18898938 3' - Cr1a 56 1 69.18 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAG:1 - chr3L 9809248 3' - 412 62 2 60.96 ATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAGATGTCAGGAACAATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATTGACGGAAACAATAATTTTCAAATCGAAAACACTCCGAGGGTGGCAGGCATCC:1 + chr2R 13071244 3' + INE-1 82 1 70.55 AACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATC:1 + chrX 21994018 3' - McClintock 5966 2 70.97 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAAATAGT:1 - chr3L 17055379 3' - Tirant 11 2 78.08 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTAAATTTCGCAATGCAATGAAC:1 + chr2L 13844301 3' - Stalker2 19 2 70.55 TTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAG:1 - chrX 10319610 3' - mdg1 7103 2 63.01 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGT:2 + chr2L 20840095 3' - mdg1 7077 2 57.53 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGAAGCGTAAAC:1 + chr3L 19455015 3' + mdg1 7409 2 58.87 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGG:1 + chr3L 22400361 3' + 1360 3345 1 55.73 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCGTTGTCCTTGCGCAATAGCGAGCGATTTACTCCGGAAAAGGTTAATAATG:2 + chr2L 6103077 3' - roo 8679 2 69.86 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTC:1 + chr2L 71260 3' - 412 70 2 65.28 GTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTCATTGTAATTGTGTGTGCGAAGAACTGCGCGAATGCCAGCGGATTAGTGGAAGCATCTGAGATGGTTTGGATTC:1 - chr2L 20294407 3' + BS 4998 1 53.42 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGAGACTATTTTTCTTTAAA:1 + chr2R 5151374 3' - roo 10 2 76.03 ATGTTAGAAATTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGGTGTTACACAACACAAAAACAGTTGTCTGATAGAAAAGCTTTTAAGGTTTTAAGTCAACCTCCCATGCTTCTTCCAAATTAAGTGTTAATTCGATATTCAGCGTTAATCT:1 - chr3R 5258391 3' - transib2 370 1 60.27 GGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTTATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAAAAGCACCAGAAAGTGCATTTTGAAATATATATTTTTT:1 + chrX 343304 3' - micropia 126 4 73.29 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTC:1 - chr4 372947 3' + pogo 2046 1 57.53 TTAAAATTAATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTCACCCTATTAAAAATATTTTATATTGCAATATAATATATATGCAAAAAAAAA:1 - 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chr3R 21695782 3' - R2-element 3224 1 67.65 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGACGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGC:1 + chr2R 7850012 3' + roo 357 2 64.35 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGT:1 + chr3L 8959680 3' - 1360 72 1 68.97 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTGCTT:1 - chrX 2214223 3' - jockey 4792 1 63.01 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATAATAAATATAT:2 + chrX 14310352 3' + roo 9047 1 52.05 TTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGACCTCGAAAATTGGGATTTTAAAAACAATAAATCCATGGAAAACCACATACATCCCGCGAAGGAGGGCAAGAAACCTCATCGCGAGCGAA:1 - chr2R 8956369 3' + roo 8690 2 59.59 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCTGCATA:1 - chr3R 8051112 3' - jockey 4810 1 55.48 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCACAATTCAGTCCAGTCCCCTGGGCCACAGGTCATTTGGCCCATCAA:1 + chr2R 10161875 3' + transib2 2779 1 62.50 TCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGCCCGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGGGTGTGTGGGGCGTTGCGCATCTTGTTATTCTAATG:1 + chr2R 4618426 3' - 1360 97 1 94.06 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCA:1 - chr2R 15004752 3' + BS 5045 1 55.00 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGCGGAGTTGATCCGCCGCTGTGGCTGCGGCC:1 + chr3R 11810755 3' + roo 343 2 61.64 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAA:1 + chrX 8092498 3' - pogo 51 1 56.16 TATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATACTTACTTT:2 - chr3R 3922948 3' - Cr1a 82 1 68.49 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTG:1 + chr2R 10411447 3' - 297 6602 2 58.65 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGA:1 - chr3R 11191409 3' + roo 8994 2 73.97 TAATATTAATATTTATAATAATAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTTTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCT:1 + chr3R 8709856 3' + mdg1 42 2 66.92 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTAC:1 + chr3R 23067529 3' + roo 9010 2 60.27 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAATATCTACTCTTAGTCTTTATTAATTTTAT:1 - chr2L 18549777 3' - roo 8675 2 75.34 AGTTAACTAAGCTAGATTAAGATTTGAATACTTAATGCTTTTAATACTAAAATAAAAAGGGAGAAAAAAGAACAGAATTGAAATGGCCACTGGCAATTGACACCACCAATAATCCACCTCGAACAAAGGCAAAA:1 - chr2L 8814964 3' + Doc 4622 1 64.93 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAA:2 - chr2L 13158664 3' + roo 8986 2 76.71 AACGTGACTATAGCATTCTCTCTGTTTTACATTTACATTACATTAGTGAAGTCAGCGCAAGATTTCACTTATTTTCGCCGACAAGCTGAAGCCCGACTCGACTGCAAACAACTAACTCCATTACACTTGTTTTGTTTCTCAATTTC:1 - chr3L 24162576 3' + INE-1 575 1 72.60 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTTCTTT:3 + chr3R 18093420 3' - I-element 17 1 71.23 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTCGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGATAAGATATATAAGACCGCCAAAAGAATCTGCTTGTC:1 + chrX 20373652 3' - 297 6640 2 76.61 ACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTAGTTCTTGCACTTCATTTTCGCAGTCCCCCATTCATTCACCACGC:1 + chr2L 9633791 3' + 412 483 2 61.64 CATCACTTGAACGTTTGATTGTAGCTATGATAACAATTTAAACCAGAAGCAGTTCAATATTAAGAAGTCCAAATGCTCAAACATGACTCGCATTCACAATTGGTCAATC:1 - 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chr3R 22248557 3' - Quasimodo 33 2 69.18 CTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTC:1 - chr2L 22121331 3' + I-element 5313 1 64.38 TAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATT:1 + chr3R 14860258 3' - BS 5023 1 65.75 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCC:1 - chr2L 13585713 3' - Quasimodo 45 2 49.32 ATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTT:1 - chr3R 4357547 3' + Tc3 1643 1 69.47 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCT:1 - chr3L 12249790 3' - roo 8713 2 54.79 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAACACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAA:1 + chr3L 20711710 3' - jockey 4809 1 51.37 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATG:1 - chr3L 21380541 3' + I-element 5273 1 76.03 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGT:1 + chrX 2479582 3' - mdg3 66 2 60.27 GTTATGCGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTTCACACAAATACAATTTATCATCAGACAGGACATCTTAATTGCATTTTGTACAAATTTCTCTTATTGTATTTAAAGCCTA:1 + chr2R 9146845 3' - Quasimodo 40 2 49.07 ATTAAAAAAAAAAACAAATAAAAAATAAAACACATTGTTTTTTTATACCTTGGAATGTTTCATGCTTATCGATATTTTATTACCTATCT:1 + chr2L 5207109 3' + Doc 4701 2 56.18 TATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTAATTTCGGGCTGTGTCCGCGTGAATGATTTTGTCCTTGGGCCTGTAGAAAATGGCGCTATTCACGGACAGCATGGCTGCAATGGTC:1 + chr2L 19124633 3' - Porto1 4377 1 57.93 AAACTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAAGTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACACAAAAAGACAGCAACTGTGGAGTTGACAG:1 + chr3L 13922611 3' - hopper 170 1 65.07 GGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTG:1 - chr3R 24381331 3' - Juan 4196 1 75.34 TAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCCTATGATA:2 - chrX 21993562 3' + gtwin 7314 2 72.60 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCCCAGCAGGTGGCCGATCACTTCGAGAGCTCCCAGATCCCGTGC:1 + chr3R 28901371 3' - transib2 11 1 78.08 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCCAAATTTTA:2 + chr2L 16943918 3' + copia 249 1 56.85 GATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCTGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAACTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAA:1 - chr3R 4357503 3' + Tc3 1672 1 51.37 AGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGATTTTGAAGGTGAAACATAATTCATCCATAACTATTAGTTTGATGAAT:2 - chr3L 9795869 3' + hobo 468 1 67.81 ACTCGGCTATTGATCCCGATCAAGAATATATATACTTTGTATGGTCGAAATCGAATTGAGTATACCATTTTACTATACGAGAAACGGGTATACAAATGAAGATTTTTTCTTTTTCAAATATTGTCTGGTCCAAAT:1 - chrX 14770391 3' - INE-1 91 1 56.30 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGGCAATGGCAACAGTATTGATATTTGCATATGTGCCATGTGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGC:1 + chr2L 13585824 3' + Quasimodo 7359 2 71.43 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATGGCTGTTGAGG:1 - chr3L 10731715 3' + 297 391 2 81.25 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACCACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCGTGGGGATGGCTTAGATCAGGACGCTTGGCTGCC:1 - chr3L 8453732 3' - FB 44 1 53.03 ATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAA:1 + chrX 12657098 3' + Stalker4 99 4 54.11 AAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGGTAATTTCGGAATTAAAAAAGAACCTAAATAAATAATACTTACTT:1 - chr3R 3922949 3' - Cr1a 69 1 65.91 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGA:1 + chr3L 12004320 3' - P-element 80 1 31.51 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAAC:1 - chr3R 19073159 3' - roo 37 2 54.79 CTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACAAGGCTTCAATA:1 + chr2R 5531173 3' - 1360 139 1 69.86 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTGGCTCTGGCACTTTTTTTTTATT:1 + chrX 21216835 3' - roo 44 2 56.85 ATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAACCTCCGTCTCGTTTGGCCGTTGGAGTCAGCGAAA:1 + chrX 1683626 3' - FB 106 1 54.48 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAA:2 - chrX 13134858 3' - jockey 4791 1 63.01 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAAAAAGC:1 + chr2L 3675923 3' + Juan 4163 1 65.04 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGTCTTTGTGGACCCGCC:1 - chrX 18817241 3' + transib2 2799 1 68.49 AAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATT:1 - chr3L 21655841 3' + HMS-Beagle2 7188 2 73.13 AAAAGGCGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTTAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTT:1 + chr2L 11357891 3' + blood 7333 1 71.56 TTTAAATCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTG:1 + chr2L 22091196 3' - G4 3671 1 74.66 TTAAACACTGAATAAATTCGTTTTATCGTTTTATTGAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTCACTGTATAACTTTCAACCTAAGACCGAATTTCGAATGTGAGTTAGATCCGTCCAAGTGCCTCTGGAATGCCAGCATTATTTG:1 + chr2R 16715799 3' - McClintock 6295 2 74.66 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTCGGC:1 - chr2R 22034620 3' + copia 249 1 75.21 TATAAATAAATTATATAAAAAAAAAAGACAGACAATTTTTAACGTTCTTAAAATCCACCCTTCCTGAGCGCAATATAGAATCTTATTTGCTTGCGTGTCT:1 - chr3R 17476715 3' + X-element 4716 1 80.00 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAG:1 + chr2R 5151321 3' - roo 63 2 62.33 CCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAGCCCGCTTACATAAACTAGTCGAAAAGATAGATGTAGCTCCAC:1 - chr3R 16913847 3' + F-element 4480 1 58.65 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAATA:1 + chr2R 7304146 3' - pogo 35 1 58.90 TTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCGCCATGGTGGTGGTGGGTGCGGTGGGCGAGGTGTCGTACGGCTGTGTCCACC:1 + chr2L 2054766 3' - I-element 372 1 56.00 CTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTATTGTTGTACGTCTTTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTCGAGAAAATGCTACCAAAACTTAAAGAAACGGCTGCTCGTGTTGTGGACAGTTGTGTGGAGTGTATTGTATTTCAT:1 + chr3R 1328854 3' - Bica 398 1 45.21 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGTAATTGAAGGCATCGTTCAATTCCTGACAACTCGTCATCCATTACGATGAGCAACAACAA:1 + chr2L 11298160 3' - I-element 30 1 63.12 ATAATCGTTATTAATATTATTAGTGTTTGTTCGCAGGACATACATACATAGATATATTGTATGTATGTCCTGCGAACAAACACTAATAATATTAATAACGA:1 + chrX 18524568 3' - mdg1 45 2 64.36 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAG:2 + chr2L 4003814 3' + mdg1 390 2 60.96 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGCGCGGCGGACGGCTTACCCATTTTGGGGTCGAGCGGCCG:1 - chr2R 22514110 3' - P-element 49 1 40.80 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATT:1 + chr3L 16970434 3' - roo 89 2 82.19 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAGCTGGGAGTTGAGCTACC:1 - chr2R 17926250 3' + opus 489 2 77.40 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTTATATCGTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATATCTTCTCTTATCTAATATAGCGTTTCTCCTGATTGTTTTGTTCATATATATTTTTTGTAAAAGGGTCTTACTTT:1 - chrX 20373528 3' + 297 392 2 69.18 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAA:1 - chrX 2479487 3' + mdg3 5437 2 56.16 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTCTGAGTGTCCCCAAATAGCTAAATATTGTAGATTAGCTCCACGATTAGGATCGCAAGCCCCGGTTTAATTAAATGTTTGTTTTTAACAAAGT:1 - chrX 20455592 3' + hobo 2909 1 59.31 AGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAACTTAAATATTCGAACTCGAAAACGAAAACGAATGAATTTCGTTTCATTTCTTTTATAGATTTGCCTTTGGCTCACTAC:1 - chr3L 11844695 3' + rover 7257 2 56.16 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCA:1 - chr3L 12315721 3' + transib2 2764 1 55.48 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGT:1 - chr3L 18125882 3' + Ivk 5345 1 56.55 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTC:1 - chr3R 4682882 3' - Burdock 12 2 65.35 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTT:1 - chr2R 24169961 3' - transib2 52 1 52.74 AGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCTAAGTCACTAGAAAAATTCAATAATTATTCTAGTGTCTTTGA:1 + chr3L 21773109 3' + 1360 465 1 89.41 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAA:1 - chr3L 3983831 3' - P-element 56 1 31.19 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATT:1 - chr3R 4964082 3' + roo 358 2 53.42 CATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGACTTAGTCTAAGAACTTTTAATATGAAGGACATATTTTGTTGGCGCCACAAAAGCCACTTACAGTGTTGCATGTGCTGGCTACATCTCTCATGTTTTTGCGCCAGCATTCCGTCCA:1 - chrX 17805814 3' - 1360 264 1 51.37 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAACTTTATTCGGGCAG:1 - chrX 19054200 3' - jockey 20 1 73.79 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGTTATGGTGGTCAGTTTT:1 - chrX 8027377 3' + Juan 4195 1 64.38 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGCCACTATAAATATATATTTTAACAACACCCGACGACAGAACAAGA:1 - chrX 8038627 3' - 297 21 2 60.98 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTA:2 + chrX 7795603 3' + roo 337 2 66.44 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCCGCAATTTTAATTTAAA:1 - chr2R 22287379 3' - jockey 27 1 66.44 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCCGCCGGGCATATATACGAATGTGCACACGTGCATGTGGCAG:1 + chrX 9950627 3' - 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412 7115 2 71.67 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCTGG:2 + chr3R 4964208 3' - roo 8712 2 55.48 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGG:1 + chr3R 8075969 3' + 412 7468 2 70.55 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGGGTTTCGGTTTTCATTTCA:1 + chr3L 21327206 3' - copia 29 2 65.75 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGC:2 - chrX 4341268 3' + roo 9003 2 64.38 ATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGGGCTTTTT:1 + chr3L 19350059 3' - 1360 3211 1 63.70 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATT:1 - chr2L 9782074 3' - P-element 31 1 52.73 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGT:1 - chr3R 29084902 3' + 412 437 2 63.20 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGCACTGATACCTTGTATTTTACTCTGACTCTGATTGTGATTTCGATTCGCATTTCCATTCCCATTCCCATTCCGATTCCGATTCTGATTCAGA:1 + chr3R 21972471 3' - Transpac 25 2 68.49 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAA:1 + chr3L 13739664 3' - BS 5022 1 55.46 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCCACAAACTTTTTGCAGCTTTTT:1 - chr3R 13875079 3' - P-element 52 1 25.00 ACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGTAATCCGCTTAAGGCT:1 + chr3L 16973490 3' + S-element 1698 1 65.89 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCG:1 + chr3R 15364020 3' + flea 197 2 58.90 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTT:1 + chr2R 6847844 3' - Doc 66 1 60.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACG:2 - chrX 7795472 3' - roo 21 2 73.29 GTAGGGGAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTCGATGGAATACGAGTGGTTTTGTACCAGACGGGTGGGCGATGGCTCACGTCTCTTTGCCAAATGCCAGTTAGTACGTTCTGGAGGAGGGGGAGGCGTGTG:1 + chr2L 15938137 3' + INE-1 568 1 75.56 GTCTATCCGTATGAACGTCGAAACTAGAAGGTTGAGAATCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCCCGCCCACTCTTACGCCCTAA:1 + chr2L 2545707 3' + INE-1 129 1 81.90 ATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACATACCCATTTGAGAATACAGACTACGACTACGCCGGACCGCTCCTCTTAAAATTGCACAATTACGCATCAGAATTATCTATACAGATAAGCTTCGTGAG:1 + chr3R 2689467 3' - diver2 25 2 71.92 TATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAATTAACAAGCAAGA:1 + chr2R 4545195 3' + invader1 3560 1 69.86 TATCGATATCCCAGAAAAATTAATTTCGCTTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACATTCAGTAGCATTCTGTCTTGTTTTCTTTGTATATTGGAAGTTAGAGAAAATCCAGTTTTTTGT:1 - chr4 498416 3' + INE-1 503 1 60.27 ATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTTTGCGCTTTGAGAATTATTATGTCATAAATTA:2 - chr2L 15379257 3' - Stalker4 7041 4 52.74 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGGCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGA:1 - chr2R 20348985 3' - transib2 44 1 71.72 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGG:1 + chrX 21216799 3' - roo 8744 2 74.66 AAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAAGTTAAAAACAATGCCAATATCATAGTGCTTACATCCAAGACGACATTTAAAAATATGATTGA:1 + chr3L 25607402 3' + F-element 98 1 57.53 ATGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATATATAT:2 - chr2L 16539602 3' + Juan 4203 1 77.40 CAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGGGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACGTAAGGAC:1 + chrX 10167518 3' + roo 396 1 73.29 AATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAAGTTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATTGTAGTATACTGTTATGTTGAC:1 - 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chr3R 19448897 3' - 1360 304 1 76.39 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAA:2 - chr3R 23618150 3' + hopper 1329 1 76.71 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCCTCCTGGCCAAGATTATCGCCACATAATTCACACGGA:1 - chr3L 1692015 3' - blood 11 2 58.00 TCTCAGGACCTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTAAGCATACATATGTAACAGCTGCCCACATTTAGTTAACCCACATACTATCACCTATCATGCATCGCAGGACCCAAAAACAACGCCAAAATGATCGCCGCTGC:1 - chr2R 22700001 3' + INE-1 152 1 71.32 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAACATTTTGCTATTTTGCTAAATTGATTTAGATTCGATTAAT:1 + chr3L 14094691 3' - I-element 54 1 56.85 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGTTTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAACAGTTAAGGAAAATAAGTATTTTTTT:1 - chr3L 18046563 3' - roo 22 2 69.18 ATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAAGTGAATTTACTGCACTTTTAAAGCTAAGAAGTCTAGTCTAGGATAAATATTT:1 - chrX 12162644 3' - roo 418 1 65.75 CCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGTAACCACCGGACTCATTCTGCATTAATGGGTTAACCGTTGCATATATTATCTTTGAGAACCGGT:1 + chrX 3017358 3' + Ivk 4921 1 58.90 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCT:1 - chr2R 18316036 3' - HMS-Beagle2 6949 2 60.96 TTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATATAATATAATATATATATGTCGGTGAAGCCGAGCGTCCAATTAATTAG:1 - chr2R 4188997 3' - S-element 68 1 68.97 TACGATGAGCGATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACAAAATATATACCCAAAACCCAAAACGCTCACAACTGCATTTAACC:1 + chrX 5380497 3' + transib2 2360 1 69.18 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCT:1 - chr2L 4123859 3' - transib2 67 1 64.83 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTACATTTCTAT:1 - chr3R 1845253 3' + INE-1 155 1 68.31 GTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTACTATTCATATTATCACATTAAACTCCCGCGTAAACTTAGAAAGAT:1 + chr2L 23039384 3' + rover 7090 2 68.97 CCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATGAAAACAAAACATAGAAAAAAGTTCACAATCACTGAATGCCCTGGCTGAAATACCCTTTTTTATGGGAATGCCATAGATTCTTTTTTTTTTGGTGGGCTACGAG:1 + chr2R 21794765 3' + R2-element 3246 1 77.08 ATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTACACACATAACTTCCATAGAATTTTTTTTTTTGTTTCTAAATTCCAAT:1 - chr3L 23354568 3' - gypsy2 118 2 67.81 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGT:1 - chr2R 16817896 3' + 412 7464 2 71.92 AAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCAT:2 - chr3R 25554217 3' - micropia 5083 4 56.16 TCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATATATTTTCAAATAATAATAATCCCACTGAGCCAGTGACGTTGCATTCATTTTCTGCAACAGCCATGAAACGAGTTTTT:1 + chr2L 18464078 3' - 1360 381 1 60.27 AAGATAGGCAGATGTGCCCGTATGTTGGGTGGAAAATGGAAAAGCAAATGAAAAAGATCCAGAAAATGCAGAGGATCCAAGAAAGATGCCTAACTTAA:1 - chr3L 1279201 3' + roo 242 2 71.43 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTTTTATAATATTTTTAACTTTATTCGTACTTTAAAACAAAATTTTAGATGGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTA:1 + chr3L 24208241 3' - Quasimodo 27 2 59.31 AAACGCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAATCTTGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAACCACAGAGGAAGCTTGGTTTCCGTAAAGCTAGTTTTTTAAGGTGCACCAGCTATTTGCAAAATAAAACAC:1 - chrX 10939788 3' - INE-1 33 1 47.95 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAAC:1 + chrX 4808599 3' - mdg3 5327 2 66.44 CAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGCCCA:1 + chr2L 17766216 3' - Doc 164 1 68.42 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGA:1 + chr2L 4003762 3' + mdg1 7375 2 73.97 AACTCATTTTTCAAAAGTGCGGGCGTAGCATCTTTGTGCTGTTTGTAGTCCTTGAAGTGGACGTGGCAACATGGGTCAATAAATTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAAAATCTGTATGCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGT:1 + chr2R 1751258 3' - INE-1 258 1 60.96 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATTACTCGATGTCGCCAACAACTTTATCAGACTTTGCCTACACCCAAAGTCTTAATCCTTCGTATATGTTT:1 + chr3L 4219591 3' + jockey 4981 1 60.27 TATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAAACATACAAAAAAAGGAATGGGAAGTACAAGAGGGGAAAATCTGCCTAATTCACAGTGAAGACCAGATTGGGGGCGGGATCAAAGAGGGGCGGGGCAG:1 - chr3R 13586483 3' - Bari1 1602 1 75.54 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGGAACTTGCACTTGAACCCTGAAACAAGCAGGCGACCGACCAGAGAAGCACTCGGATG:2 + chrX 19266928 3' - roo 8727 2 61.64 AAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATG:1 + chr3R 16518968 3' + Tirant 8427 2 71.23 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATATTCGCATTAAAAAAGA:1 - chr2L 9782030 3' - P-element 23 1 69.86 AGTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGCC:2 + chr3R 31976598 3' - TART-B 10184 1 76.03 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATTGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATTT:1 + chr3L 22035706 3' - F-element 24 1 69.18 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTT:1 + chr2R 6847843 3' - Doc 62 1 59.57 GTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAAACCAATCCACTTTGTGTTTCTTCTCGATGAAAAAATGCCTCCAGCCAATCTTCTGAAATTGGGATGGGATTTCGGTTTTCGGCATCACTTTTTTCGCTTC:1 - chr2L 625034 3' - Bica 268 1 70.55 ACTATGCTTGGTACAGTCTTTAAATAGGCGTTAAAATGTGCCTGGAAAAGTCCTGAAATAAACATGCATTGGCGTAGTTGCTACGATAAGCTGGATGTATTTT:1 + chr2R 4950406 3' + Cr1a 4025 1 68.93 CTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAGATATGTTATAACTATATTCCAAAAACTGATTCTTCAATCTAATTCTCCTCGAAGACGTGGTTGTCAGAATTGAGAACCGACAATGTCTATATAGATGCT:1 - chr2R 15815076 3' + invader2 5080 2 81.38 TTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTA:1 - chr3R 3922967 3' - Cr1a 101 1 79.45 ATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATG:1 + chr2L 4713941 3' - transib2 79 1 75.86 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAG:1 + chr3L 6397743 3' + roo 332 2 69.18 AAATCCATGTACATATCATAACAAAACAAATAATAAAAAAAAAAACTGGAAAAAAGTATAGAAGAGGCCAGGAAAAAATGCAGCACCACGGGACTGGGAAAATCCGCGCAAAACGAAGGGGAAAACCCAGCAGGCCGTGGG:1 - chrX 17970000 3' + 1360 349 1 79.43 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAA:1 + chr3R 17077219 3' - roo 8701 2 58.04 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAG:1 - chr3R 15790815 3' - roo 8693 2 54.93 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCC:1 + chr3R 26504314 3' + HMS-Beagle 192 2 58.39 AAATAAAATAAAATAAATACATAATGTAACATAAATCAACCTCATAACTATGAATCAAAACCAACTAAAGCACTAGTATGCACTTCTAATCCTTAAGATTAGGTTCCTTAATACATTAACAAACAGAGAAATGTTTCTTGATATTT:2 + chr3L 8333856 3' - transib1 1897 1 76.03 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCT:1 + chr2R 13766278 3' - roo 84 2 78.62 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATG:1 + chr2R 13259380 3' - mdg1 7102 2 59.59 CTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCACCGCATCACCTGCCGCAAAAAAAAAAAGAAATAACAACAGCCGGAGCAGCGAGAAGACATGGAAACTGAGGCAAGGCGGCAAGCGC:1 - chrX 17746109 3' + R2-element 3350 1 65.71 ATAAGTACGCAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGCGAAAAAGAGCCCCCTAGCTTTGACGTTACTGGCTTAAGTCTGGGATCAGAGTACATG:1 + chr4 751063 3' + accord 451 2 58.10 AGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGAAAAAATTGAGGGTATTCCCACTTCCAGCCATTTATGCCTTTCATGTCTT:1 - chr2L 18751357 3' + mdg1 299 2 63.71 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGG:2 - chr3L 6518559 3' - 412 65 2 61.64 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATT:4 - chr2L 13158639 3' + roo 9011 2 59.59 AAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAAAACCACTTAAGGCTTTTT:1 - chr2L 7618427 3' + X-element 4685 1 59.59 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAA:1 - chr2R 8099155 3' - jockey 4836 1 69.86 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCGGCCAACGGCTTCCTTCATTC:1 + chr2R 8047369 3' + 1360 3352 1 54.68 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATCGTTCGACGTTGCCACGTTGATGTCCACTATTGCCTGG:1 - chr2R 12471968 3' + transib2 2815 1 78.77 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGG:1 - chr3R 23639125 3' - pogo 45 1 53.42 AAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGG:1 - chr2R 18514888 3' + P-element 343 1 40.91 GTTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTTTTATGTTTTATGCGGTTTGTGGCAACATGGGTATGCCTAATCTCAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTGGCAGCATATGTACTCAGGATTTTCAATTGGATTTTTTGCGG:1 + chrX 22904322 3' - INE-1 253 1 50.68 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATGCCCTGTTCATATTTTCAGTTT:1 + chr3R 14860266 3' - BS 5003 1 76.12 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACAT:1 + chr2L 16564558 3' + roo 8995 2 73.97 TTTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTGCATATTTACTGGAAATTAGCAATGAATTGATCAAAAATGTGTTCTAAAACAATACAAAATAATATGTTTCTTTTGAACGTTCCACCATTGTTCATATAGTGTGTTTTTTTG:1 - 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chrX 12986513 3' + roo 9029 1 54.79 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAG:2 + chrX 12986617 3' - roo 8740 2 71.23 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAG:1 - chr2L 4123830 3' - transib2 2 1 78.70 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCAT:4 + chr3L 20898624 3' + roo 345 2 63.01 CTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATAGTTGGTATTTTGAAATACCAT:1 + chr3R 16533735 3' - X-element 4390 1 44.52 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGAGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTTA:1 + chr3R 28901322 3' - transib2 36 1 48.76 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTTGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATAT:1 + chr2L 22674897 3' + mdg1 7415 2 48.97 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAGTGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATTATGTAAGTAAGGCTAACAAATTT:1 + chr3R 4683033 3' + Burdock 239 2 74.66 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATCT:1 - chr2L 18226734 3' + roo 9053 2 69.18 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAA:1 - chr2R 22034667 3' + copia 5046 2 73.29 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGT:1 + chr2L 16943886 3' + copia 217 2 65.07 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGC:4 - chrX 7795493 3' - roo 42 2 58.90 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGGGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCA:1 - chrX 12066133 3' - transib2 43 1 59.05 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTTGTTTGTGTGAGATTAGAGTCCGGGAGTATCTG:1 - chr2L 15779521 3' + hopper2 1527 1 60.96 ATAATACGACTTGGACTAGGACACACAGACATAAGAAAAAGTGAGGAGATTGTGGTTAAAACTAATGAAAATCAAGAAATCCAATTGATATACAGCGACTATTGTTTCCAACCAATTTTAAATATTACAATTCTCATAAAGAATCC:1 - chr3R 14762198 3' + I-element 4938 1 78.08 GAAGATTCCGAAAGATGGAATATGCTCGATCAAAAGGCCCTGGCAAGTTTGTTTTTAAATTTAAAAGCAACGCAGTTAATGCATATAAAGGCATGCACAACAGCAGGAATTCCATGTCTTTGATGTGAAATTTGATTAAGGTGTTT:1 - chr2R 9386455 3' + Copia1_DM 467 1 72.60 AACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTTTGTTTCTGTCTGCAATTAGCTTAGCGTTTTGCATTGTTTCTGTT:1 - chrX 576776 3' + copia 39 2 68.75 ATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATTTTAAAAAAGAAACACAAATGTAGCACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCTTGACTATCCGTTACTCATCTGGAAGTATGATCGAAACTGCGTCTATATC:1 - chr3R 5732793 3' + BS 5067 1 71.23 TTATGTACATACATATGTAAAAAACAAATCATTAAAATGCCAGTTTTATTTGCAATCGTTAAGCGAGCCTACAAGAAATGCAAGTTTTAAAATATTTTTAAATAAAGTAATGGTCTTAATTTTGTACAGGGGGAAATAAAAGAATC:1 + chr2R 14037378 3' - Tom1 177 1 52.74 TTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAATTAACAAGCAAGAGA:1 + chr2R 4545197 3' + invader1 3562 1 71.23 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCCTTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTAT:1 - chr2R 13766182 3' + roo 9032 1 56.25 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAA:1 - chr2L 47095 3' - roo 63 2 63.19 AAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTTTGCCTTTGTTCTTGGTCCTTTGTTTGTTCGGCATTTCATCTCCCTGTCATTCTTTTTTCTTCGCTTTTTTTTCCAGGTGGTTCAAGGAGGAAAACGAGCAAC:1 + chr3L 8265898 3' - F-element 328 1 69.86 AGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGGCTAATCAATCATTGCAAATGGTATGGAAAATGGTAAGTTCCGACTGAAATTAAAGTGTTTTATAGAGTCAAGAACAA:1 - chrX 14313983 3' + I-element 348 1 52.74 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCC:1 + chr3R 31653186 3' + roo 394 1 72.50 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTGTTTGTTTTGTAAGACCCCTACTAGTGAATTGAAGAATTTAATTGATTCGTTGTA:1 - chr3R 26178321 3' + 412 484 2 74.66 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCGGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAAT:1 - chr2L 17809154 3' + jockey 4955 1 55.48 TCGATAGAAATATACAAGACTATTCAAAATATGAAAAAATATCAAAATATTTTTCAAAAGTTAGAGCGTGGAAGTTTTGGGATGTGTTGTGTTGCGTTGGTGCATTCAAAGGGCCCACAATGCTCTGGCATTGCTATTCGACTGTT:1 + chr3R 28486702 3' - INE-1 299 1 59.59 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAA:1 + chr3L 19350016 3' - 1360 3254 1 54.79 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCCAAATGCTCGACGACTGCGATCGATAGTAGCGCGGACGATGACGATAACGATAAGTGATAGCCAAGTGGCT:1 + chr3L 17055547 3' + Tirant 352 2 54.11 CAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCATCCATCAATCAGTCAATCAATCAATGCAAAATGACTTGGAACTTTGTTTTCTTTATTTTTTTTATGTCATATGGCCGTGGTATG:1 + chrX 3100917 3' + Idefix 7118 2 61.64 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAG:1 - chr3L 17055408 3' - Tirant 40 2 58.22 AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCCTTGAGCTTTGGCGACGTGCGTCTCCGGCGCCGAAGGACGCTCGGATGTTCGAATCCCGGGCTGTGG:1 + chr3R 28652870 3' + blood 167 2 69.57 AAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACGTCCTTCGTCTCACATTCTGCTTCTTTTCCACCTAATAGTCTTGTAATACATTTTGAATT:1 + chr2R 3461580 3' + Quasimodo 227 2 58.90 TTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTAGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTAATATCTCATCAGTGGGTGGTCCCTTGGCCTGCGAAGGCATCTCGAATGTCTCCCGATA:1 - chr3R 12544984 3' - Quasimodo 95 2 51.72 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGATATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGCTATTAA:1 + chr3R 21630369 3' + I-element 5313 1 56.16 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAAATAAGTCG:2 + chr2L 20118520 3' - S-element 31 2 64.38 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAA:1 - chr3L 2989901 3' + roo 9045 1 66.44 TTTTTGATCAATAAAAGTACTTTTTTTTTATAAACCCACAAACCGCGAAGGCGTAATTATATATATTAAATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCCAGAAATATG:1 - chr3L 23688533 3' + Quasimodo 7331 2 57.52 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTAT:2 - chr2R 14051773 3' + roo 324 2 75.34 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCG:1 - 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transib2 62 1 58.22 CACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATTAAATCAATATTTCTCTGTGTGCTCTTCCCAAGGCGGGG:1 - chr3L 1690393 3' + blood 7038 2 73.29 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAAGCTGCATATGGAATTCGCTG:1 - chr3R 8051100 3' - jockey 4760 1 77.78 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGACAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATGCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTCTTATATTATA:1 + chr2L 6654754 3' + diver 6060 2 50.35 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCG:1 - chr2L 18549845 3' - roo 79 2 75.34 TTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATTTCTTTTCATGCCTGCGCTTTCTCTTTGCTTTCTTTTCGGCACCTAGTTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGCCTGCAGGTGTTTGCACACGGAATGCAACTG:1 + chrX 10169071 3' - Quasimodo 39 2 79.31 ATAAAGTTATTCGTTTATTATTGATAAATGGCATATTGACAACTACCATTTGTTGAACTAAAAACAATAAGGTTTAAACTTTTGAGCAAAACGCAGTTTACATATTTGCCAGCTAGAGGGCGCCACAGCTAATTTCATTTTATAGC:1 + chrX 5289852 3' + INE-1 409 1 39.04 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGGATATAAGGGACCGAGGCGAAAGAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTT:1 + chr2L 19675074 3' - 297 52 2 61.64 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAA:1 + chrX 661968 3' - 412 7104 2 51.37 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAACTAGGAAACAAA:1 - chrX 7795530 3' - roo 77 2 75.69 CCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGCAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGCTTTTCCATCGGCCAACGTCTATTGACATTAATCATTTGCGGCC:1 + chr3R 27683688 3' - F-element 421 1 64.71 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATA:2 - chr2R 15326844 3' + copia 225 1 59.59 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGG:1 - chr3R 8075893 3' - 412 62 2 58.22 TAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAAATTAATCTAACATTTCACTTGGCGAGGACCAAAAATAAACAGAAACCAGCAACAACATCAGGGCATCAACAAAAA:1 - chr2L 1839540 3' - Cr1a 75 1 55.38 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGACTTATAATGAAATAAATACCGTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTT:1 - chr3R 20167569 3' + roo 9033 1 48.85 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACCACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCGTGGGGATGTCTTAGATCAGG:1 - chr3L 8453745 3' - FB 71 1 66.44 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAA:1 - chrX 23283147 3' - Transpac 43 2 54.79 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTAT:1 - chr3R 17996144 3' - diver 5914 2 63.16 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGTTTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAA:1 + chrX 7795638 3' + roo 9036 1 60.96 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGC:2 - 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1360 120 1 78.79 TATACATACGTACATACCATATATGGCCGGTGGCCATTTCCTTTCTTTTTTTGTGTCGGTTCCTTT:1 + chr3R 24599297 3' - invader3 5083 1 83.33 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGGGCC:1 + chr3R 15942832 3' + hopper 1409 2 77.05 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCGGGGAGCCACGTGCTGCCGCGATGTCGCGTCAAATTC:1 - chr3L 2544563 3' - Tirant 8117 2 77.40 TTCCCTTGTGGGACACCGGATGCGACTCGGATGCGACAAGATAAAGAATTTTTAAAGAGGACTTTCTGCGTCTGCCGGTGACCAAGGCGGAGAAGCATCGCC:1 + chr2L 5759574 3' - Q-element 479 2 56.86 TTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGGTTCAAATGATAGTAATTAGCTAT:1 + chr2R 12645546 3' - X-element 32 1 63.70 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCT:1 + chrX 14450500 3' - hopper 49 1 55.80 ATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCT:1 - 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chr3R 17736825 3' - opus 28 4 65.75 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCTATCTAGTTGAAATGCAATTAAATCCAGAGCGAAAAGTCACAGTCA:1 + chr3R 5769150 3' - roo 21 2 71.23 TGGTTTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGAGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAATATAAACCGAAAACGAATTACAAGCTAGAAAACTCACAAAAACGTTAACAATTAGTGTACAAAATGTGGACGAAACACACA:1 - chr3L 15606375 3' + I-element 326 1 72.22 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGAC:1 - chr3R 17996129 3' - diver 5911 2 68.28 TATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCTAAAGCATTCTCTCTTGTTTTGTGTTGATTTATAATATATGATTTTTCATATATGATGATGCATATTTTGACTGCTTCACATTGGTATTTTT:1 + chr3L 26169309 3' - Stalker 6894 4 65.07 GGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTCTCCTGCATATCCAGCGATTCCGAAAAATGCGAAGCGGCAACTATGAGGTGGCGTACAGCATTATTGCATTAAAGCCGCACTATGGGGTTT:1 - chr3R 17525628 3' - Doc 4473 1 77.60 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCT:1 + chr2L 12984240 3' - 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I-element 37 1 53.49 TAACAACAATAATAATAATAATAATAACAATAACCATAACAACAACAATCTAGGTGCAAAATAGAAAGCAGAATAACGAGAAATGCAAGGCAGCGGAA:1 - chr2L 2917549 3' + mdg1 30 2 56.12 ATTGAGCGCTCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGATACTGGAAAATGCACCGGCCATCC:1 + chr3R 21526796 3' - Quasimodo 7152 2 70.18 TTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATG:1 + chr2R 5532321 3' - G4 3829 1 69.18 CGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTT:1 - chr4 123988 3' - HB 167 1 73.29 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTT:1 - chr3R 19073207 3' - roo 62 2 73.98 TATTGAAATTAAAAATAAATTTTAAAAATATATCGTTATAGGGTCGGAGACGCTGTTTATACCAGTGG:1 + chr2L 16945608 3' - hopper 186 1 60.29 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACC:1 + chr3R 11469379 3' + Tabor 419 2 71.20 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATG:1 - 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chr3L 20141059 3' - 1360 3199 1 48.53 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACA:2 + chr3L 11326793 3' - pogo 42 1 54.11 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCAT:1 + chrX 10521761 3' + Tabor 455 2 62.33 CAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTT:1 - chrX 14771712 3' - BS 47 1 51.41 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATT:1 - chr2R 21116491 3' + mdg1 7387 2 69.86 TTTTCCATTTTTTTTTTATTTTGTGTTATTTATACCTATTTCTTTTGCGCTGTTCCATGTCCTTCCAGAGTTTTCCAAGTGCCTACAAGGATTGGGGCAAATAAAAAAAAATAACGAACAGTC:1 - chrX 8293208 3' - Doc2-element 246 1 76.42 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGAGTAGCTAACCGGAAAAAG:1 + chrX 15357808 3' - hopper 13 1 76.71 TTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTATCTGACCTTTATCATATAATTACTCTGTTGGGTTCAACCAGTCTGTCCA:1 + chr2L 17180211 3' - Juan 16 1 72.60 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGC:1 - chrX 18336551 3' + mdg3 214 2 63.70 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCAATGGCA:1 + chr3R 23295602 3' + P-element 2853 1 33.56 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAG:1 + chr2R 18514991 3' - P-element 44 1 53.42 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACGAATTTCTAAATAAAAACAAAAGCAACGATAAAAGTGCAAAAAAATATAAAAAAAAAAACAAGAAACA:1 - chrX 13991882 3' + 297 6909 2 56.16 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAAT:1 - chrX 2479474 3' + mdg3 5479 2 61.02 AAGTTAAGTAGAATTATTATCTTCAAATGGCGTTTATATTGACTTTTTTTACTTAATTTTTTTCATGTTTATGCAGAGCTAGACTCCTTATATTTTGCTTAAAATTAACCTTTATAAACAAAGCAATCTAT:1 + chr3L 5479471 3' + Transib5 339 1 51.91 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCC:1 - chr2L 4713868 3' + transib2 2754 1 65.75 GTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGGGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCC:1 + chr2L 17005785 3' - Stalker2 7308 2 67.20 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAA:1 + chr2L 6103023 3' - roo 8716 2 62.79 AACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCAT:1 + chr2R 23592060 3' - micropia 4992 2 58.16 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATAGTTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAA:1 + chrX 8437760 3' - P-element 34 1 52.76 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGGAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATCGGATAGGTTCAGGGCGTTGCCCAATGAACACCTAACCCTTACCCC:1 + chr2R 11795055 3' - opus 7049 4 61.29 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGT:1 - chr3L 16690917 3' + I-element 5280 1 71.92 TATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTT:1 - chrX 18396090 3' + roo 337 2 63.01 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTA:2 - chrX 11661379 3' + pogo 2051 1 60.27 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATT:2 + chr3R 18093379 3' - I-element 58 1 55.48 ATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATATGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGGAGGACCTCATGTTAATATA:1 + chr3R 19446180 3' - accord 366 2 79.55 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGGAAGTTATTTCATAGGAAACGGAAAATCCTAAAAATCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATCATATCATTCATTTTAAAATTTCCTTCGAATAGAACATAAT:1 + chr2R 24170035 3' + transib2 2809 1 47.26 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAG:1 + chr3R 17421332 3' - pogo 32 1 48.63 AAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCTACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCATATACCCATTACTGGACCCACTGTGCT:1 + chr3R 19073337 3' + roo 405 1 78.87 GGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATTAATTGTTCGGCAA:1 + chrX 22840610 3' + copia 251 1 76.00 TGTTTCTTTTTTTATTATTCTTAGTGTCTTGTAATTTGTATTAAGTATTCAGTTCTCCTTTTTAAATATTAATATTATTTTTCAATTAAGTTTTGTAGGCGCAACTCGTAAAAGTCTAGACGTGATTGTATCACGATTTCTATCGC:1 - chrX 9713919 3' - mdg3 5155 1 64.38 GAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATA:1 + chr3R 10736111 3' - McClintock 6023 2 74.64 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCATTGAATAGAAGTAAGTATAAGTATTTATGTGGGAT:1 + chr3R 13973095 3' + 412 7530 2 73.29 ATTTGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCACAGATATACCAGCAGGCAGTCCCAGTTCTCCGTGTTGATGCCTGACAATTCTGGCGGCGCCAAGCAGGCATTGACTCCAATTTCGCATCGATTACGAGAGTACTGTCTACGTTTGTCTAC:1 + chr2L 10057030 3' + GATE 273 2 50.68 AGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGTTCTTCTTTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCTGTCAGTCTGAACTGTCTCCAGGTACTATAATTAAATT:1 + chr2L 47250 3' + roo 406 1 75.34 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGGGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATA:1 - chrX 13134915 3' - jockey 4848 1 74.66 AAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAAACTAGTTGTAATCCATTGTTTGAATAAATACTCGTAGTAAGAAAATGTAAAAGGCTTAGGCTTGAAAATATTGTATAATGTT:1 - chr3L 18983085 3' + blood 7000 1 61.64 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAA:1 - chr2R 7244797 3' - diver 5933 2 53.79 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATT:1 - chr3L 17183666 3' - diver 57 2 54.79 TTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAAGAAATATATTGAATATATTTCTTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGCGATCTCTGCGATAATAATTAACTTCGGAGAACT:1 + chr2R 6164643 3' + Tc1-2 1567 1 63.01 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAAC:1 + chr3L 26290985 3' + Tabor 429 2 53.42 AGTTCATTATGGACCCCATATAATTGGACCCCGATACATTTTAAACATTATTTAGTTAAACTGATTTCTCGAATTCGCTCCTGTTTTCGAGAAACGGTGCCCCTGCATTGGCACAAGAAAAAATATGAAAAGAAAAAATCTTATGA:2 + chr2R 11500431 3' - Circe 7100 1 34.93 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTTATATCATC:1 + chr3R 9298613 3' + hopper 1403 2 75.86 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTC:1 - chr3R 6625677 3' + flea 219 2 60.27 AGGAGAGAGAGCATAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAATCCCTCAGCTGAGGGAAAAGGAGTTGAAATCGCCTCAGCAGAAACGTTGTTTTTTTATTTAATTTTTTCTAATTTCGAAGAGTCCTTCCGCAACAACCACTGTAT:1 + chr2L 7971643 3' + Rt1a 4950 1 38.36 ATAGGTTCTTATCATCTAATTATAAATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGTCGCAGTCTACGTTTGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATTTATGTTTGAAAAATTTTAGACATCGTTGGCACAAAAAATCGTTCGACATTTG:1 - chr2R 9734629 3' - rooA 262 2 76.71 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTT:1 + chr3R 24219355 3' + roo 332 2 68.49 AGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATC:1 + chr2L 11391596 3' - 1360 51 1 52.05 CTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTG:1 - chr2L 11391505 3' + 1360 9 2 52.05 TTTATTTAAATAAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTAATCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGATTAAAAAAGTTACTTTTTTTTAAATCTATTGCAGTAGAATATGGTGTAGAACTTGT:2 + chr2L 16548691 3' + transib2 2634 1 70.55 ATGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGCGTCAGGATATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGAGAATATATGCGTGTGAATATGTGTGGTTCAAGGATGCTCGAGTTTCATGTCCTATTTCTCGTGTTTTTT:1 + chrX 6314759 3' - G6 1961 1 71.23 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCA:1 + chr3R 21933230 3' - pogo 73 1 69.18 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGGGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTA:1 + chr3R 13875117 3' + P-element 2819 1 31.54 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAA:2 + chr2L 17005830 3' - Stalker2 36 2 59.59 AGATCGACTGGGTTATTGATCCTTATTAATAATAGATATACTTCATATAGTCATAAACGCTTCCTTCTGCCTTTTACATACTTTTCTACGAATCTAGTATACCCCGTAACCTGTACTCTTTCTAATGTTCAATCAACCAAAAACAT:2 + chr3R 4629829 3' - INE-1 97 1 68.49 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTG:1 + chrX 18336650 3' - mdg3 81 2 76.30 ATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTGTAATTATTATAAATATTATTATAAAATAGTGTAGTCGCATGGGAAGTCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGAGGACTGC:1 + chr4 1234529 3' - mdg1 7080 8 65.49 AGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAATGAAAAATTTCTATCTAAAGTGGAGAAAGTGTTCCTAAAAAATATAC:2 + chr3L 23249513 3' + rover 7270 2 55.48 ATTAATTTCGGCCAGAAAAAGTGGTACAACTTCCCATAGTGAGATGTTCTTAAATCTGATGAGATAAAATTATTTCAGGGCACTTAAAACGCCGTATCAATTAATTTTTTATATTTATGTATATTATTTTATCTGCCTTAGAGCTG:1 - chr2L 22107369 3' - Transib-N1_DM 20 1 58.22 GAAGAAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAATTAAGGACAGCGCGCAAATGTATTTAAAGTAAGATAAGCCCTTTAAGATATACGG:1 + chrX 17432978 3' + HMS-Beagle 374 1 57.66 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATT:1 - chrX 21216731 3' + roo 348 2 67.18 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGC:3 + chrX 21100271 3' - mdg1 47 2 54.11 AAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGTATTTTGAAAAAAATACCACAGGTCT:1 + chr3L 23224569 3' - X-element 4367 1 68.79 ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGG:1 + chrX 21087694 3' + mdg3 5481 2 65.32 AATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGACACAAACAGTTTGCGGATACTGTATTTCTAAATCTTGTT:1 + chrX 12479899 3' + 297 6771 2 73.29 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAA:2 + chrX 5323157 3' + Juan 4186 1 32.88 ACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGGAAAAGGTGCATAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCT:1 + chr3R 19448025 3' + 1360 186 1 68.89 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAG:2 + chr3R 23639245 3' + pogo 2041 1 63.01 GTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGCTACCAAAAGGAAAATACCCGAGCAGAAAGAGACAGCGCC:1 - chr2R 18374251 3' + jockey 4808 1 72.60 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCATTAAAGG:1 + chr2R 4785368 3' + Juan 4197 1 72.60 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCAC:1 - chrX 11209860 3' - hobo 62 1 63.70 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCT:1 - chr3L 17940083 3' + 1360 3320 1 43.84 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAACAAGGTGG:1 + chr2L 13158743 3' - roo 58 2 58.22 GAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAG:1 - chr3R 23618110 3' - hopper 25 1 63.20 ATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGT:1 + chr3R 2520354 3' + Tc1-2 1611 1 64.83 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGTTAGACTGAAAGTTCACCTCAAATCGC:1 + chr2L 9038259 3' - I-element 82 1 69.18 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATT:2 - chr3R 4679470 3' + hopper2 1527 1 71.23 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTGTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCG:1 - chr2L 4063877 3' - roo 84 2 55.07 TTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTC:1 + chr3R 10030778 3' - BS 5078 1 63.01 AATCGATAGAAATGTACAAGAGAATGTAATTAATATGAAAAGGAAGCTGAACCGAATCGGTTAACCCGATCTATAGGTCATACAAATGCGAATCGGTTATAATTTACAGCTACAGTGAAGGTAAACAAATTGGCAAGATGTTGGGT:1 + chr2L 5000985 3' - INE-1 301 1 73.29 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCATGATTTTACTTTTATAGAGAATGTTCAAATAAAAGAAAAAATGTAAATACCAAAAATAATTGCCAGTTATTTAGCGTGAATTTCATATACTTTTCCAAAGGTC:1 - chr2L 20839500 3' + mdg1 7411 2 61.64 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAAT:1 + chr2L 20266061 3' - roo 8703 2 57.53 ATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGTATTTTACTTTCCTTCCGTTCTTGCTACGACTTCAGTGCACAGTTTAATTGGAAGCCATTGCATCCGTTTCTGAGAGTTGTTGGCCATTACTACAAGGATTTAAAG:1 - chr3R 16399681 3' - I-element 255 1 72.60 TTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAATCACTCCTATTAGTTTTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTGGTTAACGCCTCACTCGCCTCGTCGGCTTCCCTAAAGATTGGCCATCGG:1 - chr2R 12909213 3' - Tc1 289 1 75.17 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGAT:1 + chr2R 13259407 3' - mdg1 7075 2 57.53 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAA:2 - chr3L 7300157 3' - roo 8741 2 71.92 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTTGTTTGGTTCTCGGATTTATTTTGGGGTAGTTTGTTGAC:1 - chr3R 16157240 3' + pogo 2082 1 57.24 AATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCAATAAAAAAA:1 + chr3R 23021015 3' - 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pogo 47 1 56.16 CATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAATGAAAAAAAGCAAAGTTAAAATGAAAAAAGAAAAGCAAAGTTAAAAATTAATAAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACA:1 + chr3L 1332295 3' + TAHRE 10415 1 58.33 GTTTTCCAGGCTTGTGGATCATCAAAATAACAGCCATTTTCCACTGTCTTGGGAACACTTGGATCCTTAAAATTGCATTAAAGATTATCTATATTATCTATATCTATCTATAGATCTATATTATCTATATCTATCTATATCTATAT:1 - chr2L 14069057 3' - Helena 142 1 60.96 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGGAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTAC:1 + chr2R 2427625 3' - Doc 57 1 57.53 ATCGATAGAAATGTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1 + chrX 392290 3' - INE-1 300 1 66.44 GTTTCCCTCGCACTGCTCTTTTATGGACTTCGTTAACTTTTTCATATATACATTTATTGAGCTATAATTCCTAACG:1 + chr2L 21795608 3' - HB 20 1 61.84 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGA:1 + chr3R 27123561 3' + roo 8993 2 71.23 CTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCAGTGGAGCAACGACGGCCACCAGTCGCTCG:1 - chr3R 27126204 3' + roo 157 2 67.50 ATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATC:1 + chr3L 19350010 3' - 1360 3257 1 58.04 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTATGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGCATAGATGATTTAT:1 + chr2L 23400817 3' - S-element 74 1 69.18 TGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGT:1 - chr3R 19450170 3' - roo 347 2 75.00 GTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGAAGAAGGTATATAAATCTTGGGAACTGTATATATTAGATAACCCAT:1 - chr2L 12818251 3' + hobo 2873 1 64.18 TAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGA:3 - chr3L 16973384 3' + S-element 114 2 67.81 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTT:1 - 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Quasimodo 88 2 61.54 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTTCGA:1 + chr2L 11391636 3' - 1360 14 1 69.66 CATTAACTTTAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGTGGGTACATTGTTGTGGGTAAGCGTGTGTGTATCTATGTGCAGCGGAGTACGTGTGTAGTGGTGG:1 - chrX 3007694 3' - G-element 4240 1 49.02 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATT:1 - chr3L 14366523 3' + roo 9018 2 57.53 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCTCTGGCTAAC:1 - chr2R 10078127 3' - jockey 76 1 52.74 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAG:3 + chr3L 20898605 3' + roo 8990 2 76.03 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATT:1 + chr3L 4219523 3' + jockey 4931 1 75.78 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTATTGAGAAATTACATAGTCTAC:1 + chrX 18396203 3' - roo 36 2 58.74 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAACGCGAGGTGGAGAAAGGATGCGAGAAAGTACGATAGGGATA:1 + chr2R 19199798 3' + hopper 1410 2 64.54 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCACAAGGCTCAGGGACATGTGTTCATGGC:1 + chr3R 25709835 3' - hopper 63 1 69.03 GGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCTTATTTT:1 - chr3R 15724251 3' + Juan 4205 1 76.03 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGAC:1 - chr3R 28042959 3' + Stalker2 7629 2 55.29 TGCTGAGCTGTTTCCGCCTACACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTTTAGGGGGAGTGGGAAAAAGGAGAGCTACGTGAGAGTTACAAGGGCACGC:1 - chr2R 9247542 3' - gypsy5 7105 2 63.03 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAA:1 - chr2R 20227225 3' - hopper 68 1 65.07 GTTAGGGAGGTCATGTGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGTGCTGCATACTTTTAGGCCAAT:1 - chr3R 8051123 3' - jockey 4762 1 70.11 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTCATGCGAGCTCGGTCGGAAG:1 + chr3L 21996268 3' + Transpac 5185 2 51.09 ATTATAAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTTATCTTAATCTCTCAAGTTCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCACCTAGGCAAAACGTAAAATGTACGCGTCGATTTTTTTAT:1 - chr2R 25089811 3' + HB 1551 1 65.75 GTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGA:1 - chr3R 16157241 3' + pogo 2080 1 67.12 TTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTC:2 - chr2L 4123873 3' - transib2 82 1 73.29 ACAACATATAAACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTCATTCTTGAGAATCTTTTTCTTATCTGGTAACTGTTGGGTTCATCCGGAGTTGTG:1 + chr3L 12290077 3' + Idefix 57 2 72.14 CAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAATG:1 + chr2L 18689253 3' + Gypsy6A_LTR 255 1 72.60 ACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAAAAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCCGCTAATAAAAACCAAAATTAGTTCAAGTTGGATAGAAATATCTTTCCTGGCAGGGAATTTGAAAA:1 + chr3R 2331643 3' + I-element 303 1 67.12 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATATATCGTATGATGTT:2 - chr2L 13556296 3' + transib2 2806 1 73.29 AAGATAAGTTAAGATAAGATAATTTGCTTTTTTAAAAGTATTAAATCAAGAGTTCATCAAGGGTGTTTTTAATAATCATGCCATTAAAAGAAAACGTTTTCAATAAAGTACTTGTTTATTTTTTCGTACTCTTCTCGTTGGTATTA:1 - chr3R 27199459 3' + Stalker3T 203 1 53.42 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGTAAATATAAAAGTAAATATAAACAAAATTAAAAAATAATAATAATGCACCTTTCTACCCGTACTACCCGTAGTAACTATTAGAATATACACACTAT:1 + chr2L 23402956 3' + opus 475 2 67.12 GTCAGGAAGGCCGTGTTGCATTACGGATGTATTCTGACCACTGTACGTGTCTGTCATATTATTAACATGGTTTGACCACTGTGCTTGCAAGACGCAGCTGGGTGCAATAAAAGTAATGAGCAACTTTTTATTGGATTAACCGCTTA:1 - chr2L 17828569 3' + invader6 4480 1 69.86 AAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGA:1 - chr3R 4679464 3' + hopper2 1533 1 67.12 TATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGTACAATTTGCAATGAAAATAAATA:1 - chr3L 26505819 3' - copia 4880 2 78.08 ATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAGATCCAAACTGGTTGGCAGATGGGAGAAAGAAGGCCCCGAGCAATTCCCCTAAGTAAATGGAACCGCAAAAGAAGCTTAGCAT:1 + chr3L 16973077 3' + S-element 112 2 56.85 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCCTGCCATTTTGCAAAGTTCTGGTTAAGTCAC:1 + chr3L 9809391 3' + 412 7529 2 73.10 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTT:1 - chr2L 8338146 3' - P-element 49 1 30.30 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTC:1 + chr3R 15791012 3' + roo 352 2 58.22 ATTGGCATCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAACAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAACCTTTGAATAATAGTTTTAAGTGTTTTTGATTTTTCTTCTTC:1 - chr3R 17291767 3' + 1360 274 1 71.23 TGTACAAGATCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAATGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGCTCAGCGAAAAAAACAGGAATGAACAACAAAGAAAATAA:1 + chr3R 5096159 3' + Bica 421 1 76.03 ACCAAACAAAAATAATACGACAGTGTCTAAACACAAACAAATATACAATGACCGAACAAAATCACAAATTAATTACAATACTAACACAACCCAAACCCAAACTTCCAAATATAAGGGAAAATATAAAAAATTCGTGCATAACACAA:1 - chr3L 25912677 3' + I-element 4927 1 72.60 AGAATATATATACATACATATATAGTATGTCTGTATGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTGACAATAAATTCATTTTGTCTGTTGG:1 + chrX 11541621 3' - 1731 4412 1 41.10 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATT:1 + chrX 8027488 3' - Juan 62 1 58.22 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCA:1 - chr3L 18402983 3' - P-element 73 1 32.86 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGC:1 - chr3L 2544583 3' - Tirant 8137 2 66.44 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGC:1 + chr3L 16973489 3' + S-element 1680 2 58.90 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTTATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAA:1 + chr2R 11164549 3' - roo 8681 2 72.60 AAAGAGAGAATGCTATAAACGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAGCAAGAAATTTCATATTTTTTCTGAAGTATCGATCGGTACTGGGAAATAAAATTTTAAAATGTTTCAAAAGTGTGGG:1 + chr2L 12689009 3' - INE-1 578 1 72.60 CTACCGTACCTATGACCACTTTCATGATCATGGCTCTAGTGACCCCTTAAGTACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGAGTCAGTATTTAAGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAGTATTTTTAGAAATTCATATTTTCAGTATTC:1 - chr2L 2587156 3' - Gypsy12A_LTR 1948 1 80.14 TTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGC:1 - chr3L 17567881 3' - S-element 1593 2 64.38 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATC:1 + chr2L 10156180 3' - hopper 75 1 77.69 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATAATAACATTATAGCATATGTATAATATCATAAGTATTATTATTTGCTTATATTTTATAAGATCAATGAATTCAATTTGTGTGCCATAATCATTCAAAATG:1 - chr3L 8673259 3' - I-element 21 1 65.75 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTG:1 + chr2L 13158727 3' - roo 74 2 69.18 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGGGCTTAACACTTGAGGCTGTGG:1 - chr3L 6518510 3' - 412 12 2 76.06 AACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTC:1 + chr2L 12822857 3' + P-element 2807 1 29.45 CTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACTGTCTCCATGTAC:1 + chr2L 47238 3' + roo 394 1 75.34 AAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAATAAATG:1 + chr2R 12185471 3' - accord 8 2 77.40 CATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCT:1 - chr3R 19992622 3' - hopper 50 1 51.37 TATACAAAATGAAATAATAATTAAGTAAAATTTTTTAATAATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAAT:3 - chr3L 3548095 3' + Tc1-2 385 1 60.27 AAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTC:1 + chr2R 4122854 3' + 1360 3021 1 60.19 ATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATTTAGGATTAAACTTAGTTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACACTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTGTT:1 + chr2L 16553984 3' + S-element 102 2 67.81 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTC:1 - chr2L 6174062 3' + I-element 5285 1 64.38 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTC:1 - 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chr3L 2989884 3' + roo 400 1 78.62 AATGGCGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTAGATCCCAATATTAGTTAAATATTCACTCTGCTTACGAAGGATCAAGCGGATCGGGTATTGAAATGTCTGCACGTT:1 + chr3R 20578184 3' - I-element 287 1 64.52 ATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTACTAAGCCGCCGACAGCTAAGCCATCTACGACTACAACAACCACCACTACTCCTAAGCCAACTACTACTACTACTCCTACTCCAGAGCCTTCTAAACCGAAGGTCAAGC:1 + chr3R 27290996 3' + Porto1 4430 1 77.40 AATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTTTTAAACATGGGTTTTGCTTGGCACATTAGCGGCTATAAATTGTCTTAATGCCCGCAT:1 - chr3L 10968648 3' - 1360 2972 1 65.75 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATTTGCTACTATTGATAAGAAACGATACTTTTT:1 - chr3L 15103761 3' + Transpac 292 2 73.97 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGGAAGAGCAATAAAAACCGTAGCCTACCTTCCGGCTG:1 - chr3L 19349880 3' + 1360 3379 2 76.03 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAACAGCGGTGTAAAATTCAATTAGAAAAGTTAACTGTACTCAACCCCTTGGCTGATTACATCAA:2 + chr3R 24729714 3' - Juan 4091 1 68.49 AAAGAACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAATTGAAAACCAAACGAACAAAAGGCGTAAAATGAATTAGGCTAAACACACAACTTATATGAAATATAAATATTATTACTATTAAAGCCAATAACAAGTAAAGCGCTAATG:1 - chr3L 2872530 3' - Cr1a 242 1 73.97 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAG:2 + chr3L 5061668 3' - 17.6 6965 2 59.59 GTAGTTGAATTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTTAACAGTTTCGTTGACTGTTCCTATGTTTAAATCAATTATGCGTTAAGTTGTAGCTTCTGCACTCTAGAATCGATTCCTGTATTCTTCACCCTAGGTAAGTGATTGTTT:1 - chr3R 30306145 3' - Porto1 4447 1 56.94 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATT:1 + chr2L 17005812 3' - Stalker2 54 2 53.42 AGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATG:1 - chr3L 19454949 3' - mdg1 7122 2 73.10 TGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCATGAACAATACGTGTGCTGTCACTGTATGCGTAGAAATGAGCCAAAA:1 - chrX 3464208 3' - hopper 71 1 65.75 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAGTAAAACTCGGGGTTGGGGAT:1 + chr2R 18515011 3' - P-element 24 1 67.12 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7554 2 67.12 ATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGCAACTTAAAAATGC:1 + chr2R 14580691 3' + 1360 192 1 53.73 AACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAGT:4 - chrX 9530310 3' + 297 6914 2 63.01 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTCGTGTATGGCAAAGAAATGTTATACCTACGGCACACAATACTACAAATTGATAGTGCTCATCCCTTTTT:1 + chrX 20888403 3' - 297 38 2 53.15 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACGTAAG:1 + chrX 10167515 3' + roo 393 1 72.60 CATTTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTTGCGAAAAAAATGCCAAAAACAACAAGGAAATGACTCGCTGGCAAAAACTATGTAAGACCGTTGAGGTTGGAATTTTCGTGCATTTTTTCTTATTTTTT:1 - chrX 16587432 3' + hopper 142 2 25.20 CATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGA:1 + chr2L 10156197 3' - hopper 75 1 67.81 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACT:1 + chrX 21100288 3' - mdg1 30 2 65.75 TTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGGCATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGG:1 - chr3R 3851042 3' - transib2 85 1 73.24 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATTAAATTTATGTGGTTTATAATGAAGCCTTAAATAGGT:1 - chr2L 9636091 3' + 412 417 2 66.44 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCAC:1 + chr3R 11937422 3' + flea 4998 2 72.50 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAATTCTTAACCGCAAGCAAGTGCAGCGAAAAC:1 + chr2L 20821348 3' - Burdock 6138 2 81.68 TTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTT:1 - chr3L 22723835 3' + HMS-Beagle2 253 2 56.85 ATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGGGTCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCGTGGACAGCCAAGAATGATAGTTTTTTTATTTTCTTATT:1 - chrX 9596768 3' - BS 4646 1 53.10 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCCAAATT:1 + chr2L 16943915 3' + copia 246 1 55.48 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGTGGGTAAAATTA:1 - chrX 19539428 3' - pogo 8 1 67.12 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGT:1 + chr2L 14523289 3' - HMS-Beagle2 6898 2 44.52 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCAT:1 + chr3R 23639262 3' + pogo 2058 1 51.37 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGGGTTCCGA:1 + chr3R 13300981 3' + roo 9034 1 56.16 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCCGAACATATGCAATAGTTATA:1 - chrX 2479479 3' + mdg3 193 2 50.68 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTT:2 + chrX 12129406 3' + flea 4952 1 60.27 AAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAATATCACCACGAATAAGCTTATAAATAAGGACTGCTCCAAGCATATTTCTACGGTTAGCTAGGGATAGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTAGTTTTTTTTTTAAATTAATTTATTTATT:1 - chr3L 11064794 3' - Cr1a 4078 1 71.23 ATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTACAAAATATTCTGTGTGTGGAATGAAAAAAAAAAACATTTAGACAACGAACAACGAAATAGAAAAACGAACATCCATCCATAAAAGCAATTCATTATGGCTTATGAATCCAAACATATATT:1 + chr2R 20094193 3' + Doc3-element 120 1 63.70 ATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTAT:1 + chr3L 21769087 3' + I-element 5270 1 74.66 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTCCTGGAAGAAGTTCATCGGTCTTCCCCCGTTTATTCCGCC:1 + chr3L 17568147 3' + S-element 1707 1 75.00 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATAATTA:1 + chrX 2990864 3' + pogo 2057 1 55.17 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAA:1 - chr3R 6419861 3' + Tabor 7245 2 75.17 CTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATAAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTATATCGCTTCTATATCTTCTCGCGAATCCATGAAATTTATATTAAAAGAAAAAGGGGAGCTGGGAACGGGGAGCGGTTAGC:1 + chr3L 14128316 3' + Cr1a 4301 1 63.70 AAGATTNTTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCG:1 - chr2R 5410964 3' + Tc1 1353 1 57.53 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAAT:6 - chr2R 15326791 3' + copia 244 1 76.71 ATGGAAAGATACATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATATGTAGATTGGTTTTTGGTACTACGTGATCTCGAAAACCTTTCTGTTAAAATTATACATTTTATGCTAATCGTAAATCA:1 - chr2L 21673398 3' - HB 46 1 67.12 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTACTTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAATTAATT:1 - chr3R 11191343 3' + roo 397 1 73.97 AACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGA:1 - chr3R 19992671 3' - hopper 68 1 79.13 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTC:3 + chrX 18010044 3' - 412 62 2 58.90 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATCTT:1 + chr3L 1279195 3' + roo 359 2 54.79 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAATGAAATTACGTCTA:1 + chr4 373100 3' - pogo 18 1 71.92 GTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTATGAACATAATGCATTTGAATATCTTCGGTGCCTAGATGAAAATCTTGCT:1 + chr2L 20464119 3' - 1360 3201 1 66.44 AAAATACTGCACTTTGCACATTTCTATGAATTATATATCCCTTTTTTTAGCCTATAAAACTAATTAAAAACTAGTATAATACTAATTTCTTATGAAACTTTTGAAAATTCGACAATTCTTTACATTTCTCCAAGTGTAGCGATTGC:1 + chr2R 8722674 3' - gypsy4 452 1 73.29 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCGAGTCGTAA:1 - chr3L 18930969 3' + I-element 5293 1 60.96 AAAATGTTCAAAAACAAAAAAAATATACCCTAAAAAAGCATAGAATAGAATGATTTAAGAAGCATTCGGCCACATTTTCCACCAATCGCATTTGCCCAAATGTTCAACCAATCTGAACTTGTGTCTTTGGTGCGCTTGTTGGCTTG:1 + chr2R 20377747 3' + TART-A 13403 1 64.38 CAGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGTTATGAAAAGTTAT:1 - chr3R 19407875 3' - diver 5895 2 72.65 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTT:1 + chr2R 21160753 3' - Transpac 70 2 65.75 GTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTAGTGCATCATCAAATTGTGTAATTTCATGTTTGGCAATCAAAAGCAGTTAAAAGAACGCCTGAGACATGTAGGTTTCAGCATCGCAGGAAATTGGG:1 - chr3L 2430935 3' - gypsy7 5007 7 75.20 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGC:2 + chrX 7795597 3' + roo 8995 2 70.55 GCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTAAGTGACGGCCATAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTGCAAATGAAAACGAATGAAAATGTTTAGACTTGCCAAATTGTGAAATTGTGA:1 - chr3R 8475486 3' - 1360 3357 1 63.70 AATTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATTTGCAAAGAAAATAGAATAGACAATAGAAAATCTGCATCCATCATCTTATAAATTTGACATACCTGTTATGTTAAAAATGCCAAGAAATATTCTGAACTTA:1 - chr2R 580269 3' + rover 87 2 69.18 AATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAG:1 + chr3R 23067514 3' + roo 8995 2 69.86 AGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGTTATATTTCAATGTCAAATTAGTTATAATCGTGGAGTGATAAAAAATGAATTATTTTCCACCCGGACACGCAGCTACGGCTG:1 + chr2R 25058743 3' - I-element 5089 1 67.42 TAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGT:1 - chr2R 18514915 3' + P-element 343 1 25.71 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAAT:3 - chr3R 15724293 3' + Juan 4163 1 50.68 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGGGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTTTCCGAGTATGCAGAGCGGGCGCG:1 + chr2L 19675097 3' - 297 6610 2 57.53 GTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGGATGACTTTTTGCTGGAAGAGGAGCTAGATGAAGACTTGTGCTTAGAGGAACTTGAGCTTGAAG:1 - chr3R 27708010 3' - F-element 281 1 55.86 AGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACAGAATTAAGCAGAAATGAGTCTGGCTGAGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGGAAAATGGGTGTGTAAAATGGGCGAAGAATATGGTCGTGGGAGTCTGTGGGTTGTCAGTAACTTGTCT:1 - chr2L 12318556 3' - Quasimodo 153 2 78.77 ATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGA:1 - chr2L 18347303 3' - transib2 79 1 72.60 TCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAA:1 - chr3L 1307195 3' + F-element 456 1 68.13 ATATATATGTATGTATATATATATGTATATACATACATGTATATATATATATATATATATCCGATTTCCGATTGCTAACTTGATCATTGAGTACGGTTAAAAGAGTCTAAGAGCAAGAGAGATATAGGGAGTTGCG:1 + chr3L 3957679 3' + 1731 4409 1 40.44 TCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGAGTAGGGCGAATAATCTAGACAGGGTTTAAAAGAAAAAAAAATATATTTTAAA:2 - chr3L 5728290 3' + HMS-Beagle2 246 2 62.33 CCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGATTTTGATTTGATGTTGTTTCGAATTTCCTTCTTTTTGTCAAGTTCGTTGCCTACGTTTTTCCAGAGGGTATTTTTACGATCTTTAATAT:1 - chr2R 9027938 3' - I-element 430 1 63.01 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGGTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTC:1 - chr2L 7125747 3' - I-element 53 1 52.05 GTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAG:1 - chr3L 23249411 3' - rover 7035 2 72.92 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGCAGGATCTGTTAACC:1 + chr2R 2427612 3' - Doc 26 1 51.96 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAAT:1 + chr3L 2990030 3' - roo 8731 2 65.75 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTC:2 - chr3L 19454898 3' - mdg1 34 2 60.96 CCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATATAAAACGTCTACTAAAACTCGATAAAATTCTCGAATTTGAAATAGGCTCCTATAATTAATCGATAAGCTAATGAAACTAA:1 - chr3R 15363876 3' - flea 21 2 67.12 TTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACAGCAAATTGAACGAAATTGGATGTTCGACCCTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGTATGGACTGCGTGCGGCAGTGTAAGGGAAATGGG:1 - chr2R 5028215 3' - GATE 448 1 80.82 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTTCGGCTGCG:1 + chr2L 19924092 3' + roo 9062 1 72.60 AAACTAATTGGTGGGCAAATATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATT:1 + chr3L 46990 3' - FB 77 1 67.81 AATTAGGATTTAAAAAGTATTTTCTTTTTAAGCACATTCAGCACAAGCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCATATCACATTCAAAATAACGTGTT:1 + chr3L 14473694 3' - transib4 2558 1 53.42 ATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCGAAAG:1 - chr3R 21678306 3' + Idefix 293 2 80.95 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAGGATG:1 - chr3R 30946482 3' - Transpac 4951 2 63.70 ATACAGTGCATTAAACTTCAGGGGGATCCTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAATAATCCAGAATCTGACTTGTCTTATTCACAAACGCTCGATTCTCCTTGCAGAGAAGCATCA:2 + chr3R 22444583 3' + baggins 5353 1 58.22 TATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCC:1 + chr2R 22989651 3' + hopper2 1561 1 70.97 CCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGCTTACTTTCTCCTCCTGCACCTTCTTTTTTTCTTGCTTCCTCGTCGTGTTGTTGTTGCTGCTGTGCTCGTTGTTACATAACAAAAGCTGACGCGTCATCATTATCTATTGTCTCCTACAAGT:1 - chrX 5279736 3' - TAHRE 325 1 77.40 CAGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCT:1 - chr3L 17183633 3' - diver 7 2 71.32 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGAATCGCGATGTGGAACAGTTGAGCAGCAGTGTACCGGGTA:1 - chr2R 16173331 3' + mdg1 7453 2 56.47 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAG:1 + chr3R 23618203 3' - hopper 7 2 60.87 ATTTAAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAATCATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGATGAACAGGATGAAA:1 + chrX 8958651 3' + TART-B 10633 2 78.05 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTAT:1 - chrX 19539482 3' - pogo 62 1 63.01 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAAACAATGTGAAAAATGGTAATGTGTGCGCGGCATCACGTTCCACAGCTCCAAAGTCCGTG:1 - chr2L 19674903 3' + 297 6973 2 76.39 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACA:5 - chr2R 15326871 3' + copia 198 2 78.08 AATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATGGACATTTTTA:1 + chr2L 16604645 3' + INE-1 102 1 75.34 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTT:1 - chr2R 3564060 3' - Tabor 6918 2 69.18 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCA:1 + chr2R 14051843 3' - roo 8733 2 73.29 TACAGAGTATTATGTTGTGACTATAATAGACTTTACTCTATTATCTGTAATCTTGACTCTAGGCCGCTCTCTAGATTACTACTACGGTAAATTTGTTTTCCTTTATTTCAAAATTCTGCGGGTGCGATGTAGGAAATGTTAAGAAA:1 + chr3R 1853590 3' + Cr1a 4187 1 57.53 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAA:1 - chr2R 20802589 3' - mdg3 5333 2 72.22 AACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATCATACCGCTCATCAAAACGTCCCCCATACAAATCAGCAATAGACCGAATAATAGAAAAAG:1 + chr4 195037 3' + I-element 5094 1 61.38 ATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCAATTAAATTAAAGTATTTATCGCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGGCACAACCGTTTGAAAAGAGAAAGTTTGTCATAAATT:1 + chr2L 17152087 3' - Stalker4 244 4 69.18 TTTTATATATATTTTTATAATTTGGTCTCTTTGGACCCGGAAACATTGATGGGTTAATTCCCTTTTGGTGGACACACTTTTTTTTTTGACCCTTTGCTATTTACCTGTTGTCTTGCTGGCTAATTTCTGTTGTCAAATT:1 + chrX 21453453 3' + copia 4665 1 55.40 TAATGAGTACATTTGGCATGATTATTTCTTTTTATTAATTCATATAATAAATTTAAGCTGAATTTTTCTTATGTATCTTTTTAATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACA:1 + chr3R 17562300 3' - transib3 2700 1 64.38 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTAT:1 + chr3L 18505774 3' - I-element 29 1 65.75 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGAGCAATTGAA:1 - chr2R 23780497 3' + Ivk 5345 1 60.27 CTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGTTATGAAACATTTATGCCAGGACTCGTTGGACAGCCCCCACAGCAAAAATAATGAATAAAAACACAACAAAAAATACAATA:1 - chrX 10997932 3' + gypsy5 340 2 41.73 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCC:1 + chr2L 16564554 3' + roo 343 2 73.85 CTCACGCTGAGAACATACGAAATCTAAACATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAA:1 - chrX 6054248 3' - 1360 3288 1 56.16 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGGAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAG:1 - chr3L 12315740 3' - transib2 23 1 53.33 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATT:1 + chr2R 14653235 3' + 297 316 2 76.71 TTGTAGACGTTAGAGTCGGCATGGTATTGCTTTAGAACGAACTTGCGTAGACTTTATTCTTCGGGTTTCTGAATATCTATTTTTATACTTAGTTTCGGCTCGGCTGGTTATTCTGATTAAGAATATAAAAACTTT:1 - chrX 23067466 3' - INE-1 216 1 52.59 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTAT:1 - chr2L 20265933 3' + roo 352 2 57.53 ATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGAGACGGGTTCGTAGGGCCAATGCTTCAAGGAGATTGGCCAGGAAGTTTGTCGCGGAAA:1 - chr2R 12473074 3' - transib2 70 1 59.29 AGTAACAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAACTTAGTTTTCCTTTTGAATACGTTAGGGCATTTGAATTAGGGCATCCAAATCTGAGCCTTAGAGGCTCTCGGCAAAAATAAACTTCGAATGAATTTATGCATACGAGTGAGTTTT:1 + chrX 1149768 3' - HB 1393 1 45.21 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATT:1 + chr3R 15942774 3' + hopper2 1567 2 70.71 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGA:1 + chr2R 9871547 3' - roo 8744 2 73.97 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAGGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTT:1 - chr3L 5389841 3' + roo 9033 1 59.59 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTA:1 - chr3L 5389853 3' + roo 357 2 55.48 TATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTA:1 + chr2L 13844253 3' - Stalker2 7315 2 60.96 ATGCGAAATTTCATAATTTTTCTAGGCTGTCGATAGATATTGGGTTGAAAAATGATTGGACTCACCTGGGTAATGTTTTCATTACTGGAAGCTGAAGCCT:1 + chrX 286962 3' - INE-1 516 1 61.00 GATTCTCTCACATCTTGTGTTTCTTCATTGATTCTGGGGAAACAAAAGTGCCCAAAATGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACGCTCGCACCATTTTCACAATGCTTACTACC:1 + chr2L 22975443 3' + HMS-Beagle 19 2 51.26 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCGCTGCTCTG:1 + chrX 1135382 3' + P-element 2830 1 38.58 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATAACCAGCTTTATAAGTATCTC:1 - chr2L 6174035 3' + I-element 5318 1 54.29 AAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAACGCCGTATGAATGGAATCAAACAAAACAAAACAAAGCAAGGCCCACAAGGAAAACAAAGGACCACACA:1 + chr2R 18717232 3' - FB 174 1 53.42 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTATTATGAC:2 - chr3L 23249343 3' - rover 18 2 73.97 TATTGATATTATAGATACAAAAAGGGACTAAAATCTAAAAATATAAGTGAATATCTTTTGTATTCTTTAAATTTATATGCATTGTATCTCCTATAAGCATGGGTTATTTTAGAGTTGTGCCAAGTAATGGAACCTTGCAACCTGCT:1 + chr3R 19285800 3' - transib1 1916 1 57.53 ACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGT:1 + chr2R 5206898 3' - G4 3769 1 56.85 TTTTATTTAATTGATCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAACTTCTACACATTTACCCAAGCTCAACCTACTTAAGCTCAAAATTCTGTAAATTTATAATACGCCTTGTAGCTTCAAACAAATGACTTTCAATGTCAT:1 - chr3R 13972910 3' - 412 7074 2 51.03 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTCCCTT:1 - chrX 4341228 3' + roo 406 1 78.99 TTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACACCAGCATTAACGCGGATTTAGGATATTTAAAACATTTTATAAGAAGT:1 + chr3L 22035604 3' + 1731 4554 1 65.75 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGG:1 + chr2L 6161012 3' + I-element 5269 1 76.71 TCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGAGTATGCCATAAATTGCTTCGATTTCCCAGGATCCTGGCCTGTGCGTGTGTTGTTTTGTGTGTGCGTTGAGGGGAATAAGGTAAAAAACCATA:1 - chr3L 10592391 3' - Juan 3756 1 71.23 AAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTG:1 - chrX 17125515 3' + Cr1a 121 1 77.40 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCC:1 + chr2R 6965573 3' - Transpac 73 2 67.59 TATCCTATTATCTGTAATCTTAACTCTCTGCCGCTCTTAGAGCATCGGATTATAAGTTTTTTAACAAATAGTTATTTTTAATAATATTTATTTAAATATATAAATAAATATGGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATA:1 + chrX 14625491 3' + Cr1a 4220 1 64.38 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTC:1 + chr2R 21160757 3' - Transpac 4985 2 63.01 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTC:1 + chr3L 12249898 3' + roo 9006 2 63.01 AACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTAGATATATTACGTAATTTCTTTAAAAAGGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACTTCATAATTTATCTACCCTAAATATGTAGAGTAGAGTTAATATTTAAGTAAAGTATATACAT:1 + chr2R 8265465 3' + Stalker4 6892 2 60.96 AGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGAC:1 - chr3R 23639119 3' - pogo 23 1 63.08 AAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTGATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGAGGCAGCTGCCTCCCACAAAGCTGCCGCAGCTAAAAAAACGAA:1 - chr2L 3534463 3' + I-element 275 1 72.54 AAATCAATAATAAATTGTGAAAATTTAAACATTTAGTTTATACTTACCTCTAGCATTCGGTTGCCACCGCCTTGGCGAGCATTGTCTTGCCCGTGCCTGGAGGTCCCACCATTAACACGCCCTTCCACGGTCGCCGG:1 + chr3R 5228810 3' + Fw2 80 1 62.04 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATT:1 + chr2R 7850042 3' + roo 9055 2 63.64 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTC:2 + chr2L 4123940 3' + transib2 2751 1 67.81 ATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTA:2 + chr2R 4270292 3' - gypsy9 29 2 54.79 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTT:2 + chrX 18336667 3' - mdg3 5327 2 66.44 CACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGCTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAATTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGATGAAAAGCGATTACCCTAGAGAAACCGAGCACTACTACTTGAACAAAG:1 - chrX 18227605 3' - R1A1-element 81 1 63.70 TTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACTGTGGAGTTCCCCAACCGCAGATATATGTTTACAGTTGCTTTTGGTTGATACCCCGGACCACGTCTTATCTAAAAAATATTCTAT:1 - chr3R 9363205 3' - S-element 68 1 58.22 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGGGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGGATGCAGCAGGT:1 - chrX 14450401 3' + hopper 1394 1 50.00 ATACAGAAAAAAAAAAAGGAAACACGTACCCCACTGATCTTCAGTGCGTATAAAAAATGGGCAACATAAAGAAATGCTGCGTTCTGAATTCGTGACAAAAAGCCTAACCCCTACGACATTTAGCTATGGATTATTAGCC:1 + chrX 22677484 3' + Doc2-element 245 1 72.66 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGT:1 + chr3L 5881672 3' + pogo 2068 1 55.86 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTT:1 - chr2L 18226784 3' + roo 9000 2 68.49 TAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATATG:1 - chr3R 14505307 3' + F-element 4592 1 73.97 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATACAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCCC:1 + chr3R 31264132 3' - jockey 4775 1 64.14 ATCTCGACGTTCATACGGACAGACCAAAGACACTACGATTTTATTTGCACCCCCACATCCGTTGCTGGCCAGATGGCTTGAGGTGACTGCAGCGGGCTTATCTATCGCCAGCTTCACTCTTTCCCCGGTTTTCCTGACCCCCTTCC:1 + chr3R 19520180 3' - INE-1 131 1 73.97 TTTTTCTTTTTTATGATTATATTGTAAAATTTATGATTGCTTTCAATATCTAAGCCATGAAAATTTTACATTTTAAATACATCAAAATTAT:1 + chr3R 12006327 3' - Rt1a 5071 1 74.73 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGAC:1 + chr3R 15942781 3' + hopper2 1527 1 75.34 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTAATTATAT:1 - chr3R 9002900 3' + roo 9022 2 52.74 TAATAATATAATTAATAATTATTCCTATTTAATGTCGATTCAAAAAATAACATAATGCGTATTTAACCAAATTGTATACTTTTATTGCAACTGTTCTCTAGACCAACGAACGTTTAATGCTTGCAACATTAATATTTGCTTTGCTG:3 - chr2L 13098997 3' + mdg1 7083 2 75.34 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGGGTAAGGAGTAAATATTGACATCCAATAGTTTATTATCTTTCGAAGTAGAGCAAAGTCCG:1 - chr2R 24168120 3' + transib2 2765 1 59.59 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGTTATTATGACCACTT:1 - chrX 14722072 3' + diver 199 2 68.49 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7554 2 69.50 AACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGGAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAGGAATTATCTATGTTCATTACATTTATCTATCTGCAA:1 - chr2L 13333316 3' + R1A1-element 40 1 76.03 AACTATTATAATTTTCCCTATCATTTCAGATGGCGAAACACTATGTCATAGTGGGTGATGGTATTGGTGCGACACGGGATAATATTGCAATTGAAAACAACAAATGGCATGAAAAAACTTCAACACTAGATTGATGATA:1 + chr3R 28792759 3' + jockey 4860 1 65.47 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAAAATAAGCTTCCCCTTTCTGATGTTCTCCACTGAGAAATAG:1 + chr3L 9270028 3' - copia 19 2 56.85 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATATACTTTATATATTCGGAAATTGCTTTCTCCTGCCTGCTACATACCTTTCAATGAATCTAGTATACCCATTTC:1 - chr2R 6606601 3' - Quasimodo 25 2 62.77 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGGTAACTAAACACGCAATAT:1 + chrX 7795649 3' + roo 9047 1 67.12 ATTTTTAGTTTATTACCCATTGAAGAATTTTGCGGGCTTAGTTTTTTATTTATTTGTATGTATCGATCTATACCAGTCTGTATGGTCGATGAACTTTTTTTGATGAGGGTGTTTAAAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chr3L 18038578 3' - Fw2 69 1 81.51 CTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACCCGCATGCTGGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTAAGGCCAATGG:1 + chr3L 22400251 3' - 1360 473 1 56.67 ATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTT:1 + chr2R 4206655 3' - 1360 323 1 70.55 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGC:1 - chr3R 15790855 3' - roo 64 2 66.42 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATAT:2 - chr3R 14860132 3' + BS 5040 1 56.16 CCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGT:1 - chrX 21585250 3' - mariner2 277 1 58.90 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGACTGGGGCTACAAAGG:1 - chr2R 7244773 3' - diver 22 2 69.86 ATCTGATGCTCATTCCAAGTAATTGCGAGTAGTTGCACAGGAATCATAAAAAAATAAAATGCCAACAGCAAGGGAATGTAAACAAGGGAAGAAGTGCTATCTCTCTATTTCACTTAAAATACAGTGAAGCTTCGACAACTAAAACA:1 - chr2R 19144503 3' + G3 304 1 66.44 ATAATACATACATACATACATACAAATACATTAAATACATACATATCAGTGAA:1 - chr2L 20124850 3' + 412 223 2 67.92 ATAAGCACACGATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAAC:2 - chr2L 809684 3' - jockey 95 1 74.66 GTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGTAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGTCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTTTAATAAGTTCATATTGTATACGATATTGCTTACAAATAA:1 + chr2L 12756577 3' - 1360 3137 1 72.60 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAATGTTGTGAATGAGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCATAAACATTTTTCGGTTGCCAT:1 + chrX 959099 3' - 412 31 2 50.41 ACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTTGCGTGTTTTTAAAAACAGATTTGATTTAGTTATACTTTATAATGTTCTAACAGCATC:1 - chr3R 17526221 3' + Stalker2 415 1 65.75 TGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCTGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACTTTTGCGTCTGAAGAAGGGATCTATTTTTGTAACTATCCATGACTTGCACGGGCGG:1 + chr3L 11713460 3' + HMS-Beagle2 169 2 56.80 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGTTGCTCAGTT:2 - chrX 15200791 3' - 17.6 6944 1 71.92 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATCCCCTGGATTATCCATATCA:1 + chr3L 8959736 3' - 1360 13 1 72.54 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTAC:2 - chr3R 19032603 3' - roo 67 2 67.12 TATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGCTTTTGCGCCCACCCTCTGTCCGTTATGCCATGTCAGCATAATTTAATGTGA:1 + chr3R 14349066 3' - X-element 4396 1 64.14 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAATAAATAGCAACCAACACCAAAGGGAAGCAGGGAAAAATCTACGA:1 + chr3R 25709921 3' - hopper 11 2 73.29 ATTCACGGAGTAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGGTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGTGAATTCAAAAGTCCGGCTGCAATGTACTGGCTCTCAAATTGAATT:1 + chr3R 19449482 3' - baggins 5050 1 56.52 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACAC:1 - chr3L 14366516 3' + roo 361 2 54.79 CAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTAATGGAATTGTTCAAGACTAGTATAAACTGATTTTTGTGTCAGTTCGTTTCAGATGCCTTAATCGAAAAGCCAATCAAAAATTAGAAAAAAATAG:1 + chr2L 11652475 3' - Circe 7247 2 67.12 AATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTAATTCTGATCGAAGAAACGAGTTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATCAAATAAAAAAAATTTTTTAAAAT:1 + chrX 12441591 3' - 1360 3260 1 64.83 TTTAAATATCGTTTTGGTATCCCTATTGTATGCTCTTTCGTTAAATGCAGTTCAATTGCAGAGCTTACCAAACTGTAAAGTGCCCAAAAGTATGCTATATTCCATGGACTTCCTACAAACCAATTACATTTTCGACACAACGTTTT:1 - chr2L 2812288 3' - transib3 99 1 60.96 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCG:1 + chrX 21224620 3' + roo 9022 2 63.48 GTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCT:1 - chrX 10445535 3' + INE-1 551 1 86.67 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATT:6 + chrX 8200321 3' + flea 4976 2 60.27 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAGCCTTTACAGCTATCTTTTTGCTAGCTAAATTGTTAAGATTTCA:1 + chrX 9410623 3' + I-element 5344 1 75.34 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCAC:1 - chr3R 23639159 3' - pogo 79 1 71.23 TTGAGACTTTATTAACTACATCTGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACAC:1 + chrX 19074875 3' + mdg1 7431 2 55.74 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTT:3 - chr2L 11298033 3' + I-element 5303 1 58.22 ATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTGC:1 + chrX 23182943 3' - Idefix 23 2 56.25 AAATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATATTTTCAATGGGCTGGAGATTGTTTGATTGATTGTAAATTGTTTTAATATTTGGTAGTACAATAAATGTAACATAAATCT:1 + chr2R 18513954 3' - transib1 1892 1 33.56 GTTCACGTTCTGGCCGTCCATTAGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCATAAATAATGTCATTAATGAAAGAGCATAAACAACGCTGCACTGAATATCTGACGGGTTATTAACTAAGAAAATAAATACCTGTTAAGTACAAGGTA:1 - chr2L 3217542 3' - TART-A 12937 2 71.43 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGAT:1 + chr3L 11326771 3' - pogo 63 1 67.59 TTTATTAATTTATTATTTATTTATTTTTATTATCATGTATTATCCGTGACATTTGTAACTATTTAAAGACAAACGAACTGGTGTTGAAATACGCAAGTAATTATAAAATAACGTGATCAAAGAGATACATTGCTTAACATTGCGTA:1 + chr2L 20029294 3' + INE-1 414 2 77.40 AAAGGTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTATAAAATATAGTTAAACAATTAATTAGAAAAGTTTTTTTTGCTTTCTTTCGGCGCCGTCCTTTGCTCGCCTTTGCTTGCTGTGTAAAAAGCAATTTTAAA:1 + chrX 12924348 3' - S-element 1661 1 60.27 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCATTA:1 + chr2R 4785364 3' + Juan 4193 1 69.86 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAAAAGATTATATAATTATATTTAAAAATATTTATTTAACTGTTAACAATGCAGAGTTAGAGAGCTTACAAGATAAATGGTGAAGAAAATTCCGTCGAAACGAAA:2 - chr2L 15940164 3' - pogo 14 1 72.60 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTC:2 + chr3L 24208238 3' - Quasimodo 31 2 62.33 TTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTCAAAAAAACTAATTGGTGGGCAATCATGGACAAAGGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTGGATTTTTCCGAACCGGGCTTCTTTGAGCTGGAATTTATATTTTTTGTCATTGCTA:1 + chr3L 22751735 3' + FB 370 1 80.82 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTAT:2 - chrX 6116233 3' - transib2 49 1 52.05 ATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACATAAAATGGATCCATATTTTAAAATGTTAACAAAGGGTAATGCGCTTATACAAAGTATG:2 + chr3R 19448385 3' - jockey 4536 1 60.27 AAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCAAGGAATCGCAAGTTCAGGGAGGCCAAAGATGAGTTACGAGAAAGGCAAAAACGGCAAATAGCATTGCGCGATGAAGTATATAATTGTAAT:1 + chr2L 11519475 3' + Bica 212 1 60.27 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCT:1 + chr2L 12818365 3' - hobo 27 1 65.52 TATTACTTTACCGTGAAAGACAATACTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAATTTGAAATTATTGTATTAACCACTTCATATGAACATGCAGCAATCGATTTATCTAAATGTATACAATAAAG:1 - chr2L 4707924 3' - transib2 475 1 50.00 TATAGTCGAGTTCCCCGACTATCACCGACTATACTACACTAGTGGGAGATCACAGGGAAATTTTAACAATTTGTTGGCGTAGAGAAAGGAATACTATAATCGTCTCGGCTGTTTAAACTCATTAGAAATATATATATATATATTCT:1 - chr3R 18030717 3' - INE-1 565 1 69.18 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAA:1 - chrX 22840477 3' - copia 4933 2 62.33 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGCAGCGTTT:1 - chr3R 27765077 3' + mdg1 373 2 51.75 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCT:1 - chr2L 15936766 3' + copia 227 1 58.22 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCT:1 - chr3R 904942 3' - rover 7002 2 67.81 ATTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTATTTGTTGCTTTTTTTTAATAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATATTCGTCTCATTGTATCTTCCATAAGTAGTGGGAGCTCGGTTTTCAGTGTCCGCTTCGAC:1 + chr2R 14614755 3' - Porto1 4459 1 61.64 GTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTAAAACACTCGCCAGTCGGGCGTTACCCGTCCAGCAATCCATAAGTTTCAATTTTCCTATTGATTTTTGT:1 + chrX 13967325 3' - Transpac 5222 2 55.74 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGAAATACTTGAGTTTTTAGAAGCAAGGTCAGCA:3 + chr3R 4805749 3' - 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roo 8704 2 59.15 CGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGGTGCGGAGCCAAAAACCGCATCTCTACCAT:1 + chr3L 11826480 3' + INE-1 136 1 70.55 ATATACATATACTATTATATTAATCAAAATTTTCTACGTCGAAATGCATAGAAAAAAATAAGAAACTTTAATTTTCGCTACGTTAATATTAAGGAAGAGAATAATTAATTAAATAGATTTTTTAATATATTTGAAGCTACTTTTGA:1 - chr4 903462 3' - transib3 2611 1 67.81 GAAAAATAAGTAAGTAAGTAATAAGTAATAATAAGTATACTAGTATACTAGACATTAATATATTTAACTTAAGCTAAACAAAGCTTAATTATTGTAAGGGCTTGACAAAAAGTATATACCATATATACTTTAAGAACACTAAGTGT:3 + chr3R 6786943 3' + looper1 343 1 75.34 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATT:1 - chrX 14722102 3' + diver 172 2 53.15 ATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAATGTTAGTGGTGATTCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTAC:1 + chr3R 17615226 3' + Tc3 309 1 71.85 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCGAA:1 + chr3R 17077229 3' - roo 8668 2 77.50 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACAC:1 - chr2L 12984111 3' + hopper 1365 1 51.72 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAAAAGTAGGCAGCGCGAAAATCGT:1 + chr3L 21763779 3' - jockey 65 1 56.74 GGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTATTCGACATGACTCCC:1 + chr3R 21661346 3' - G2 2957 1 63.71 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGAC:1 + chr3R 21933271 3' - pogo 32 1 67.12 AAGATACCCGTTGCTCAGCTAGGGGAATGCGATCGCAAAATTTAATAATTTTCTTTGAATTTCATAATATTATGAATGCAGAAAAGGCAGTAAATCGTAAATACTTATTTTTGAGCGCTTTATTAAAAAATGCATTTTCTTTACTA:1 + chr3L 16417367 3' - INE-1 543 1 65.75 CAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:1 - chr3R 4160059 3' + invader2 194 2 54.11 GTTTAAGTGCAAAATTCAAGCCCAAGTGAAACCATCAAATAATCACATATCATTCAATTTGTAATAGGGTGAAAAGTCTGAGAACTCAGAATCCAGTGGGCCTAGACAAATTGTTCCAAACACTTTATGTCGAGAAGGTCTAA:1 - chr2L 17013024 3' + Porto1 58 1 75.52 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGAATTAAAGGCAAAG:1 + chr2R 16818002 3' - 412 7086 2 61.81 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGGTGTTCAAGAGTTAAAAGAG:1 - chr3R 15790869 3' - roo 8750 2 75.86 AAAACAAAAAAAAAAGCAACAATATTGGGAAACAATGAAAATTGCTCAACGCTGGATCCGGAGCCAAGTGAGGCCACAGAAACGAAACGAGCGCGCCAATGATCGTACGAAAT:1 + chr3L 9096895 3' + gypsy7 5012 3 52.21 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAAACGTGAGTTGGTGGGGCCTCCTGTTTTTTT:1 - chr2R 18258743 3' + Juan 4194 1 64.38 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAACCCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAA:1 - chr3R 24450394 3' - 412 7088 2 57.53 GCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAA:1 - chr3L 21996156 3' - Transpac 59 2 55.48 GCTGTTCATAAGAATATAAGTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAAGTCCCAAATTGTCAATATTTTCTAAAAAGTAAGGTCATTCGTATATTTAAAAGGGCAATACTTTAAATGGAAACAAACATAAAAAAACACCAACAGAAATAG:1 + chr3R 13654512 3' + HB 207 1 71.03 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGATGGTCGGTTAGGG:1 - chr2L 21299300 3' + roo 347 2 63.45 GCTCGATGTCTGCGTTTGGGATGTCTGTCAATATCTAGGATATTAGTTGTAGATATATCTGATCTATTTGCAGGAATGACCAGTTAACCAGTTATACTATTCCAAGGGCAAAACTTTAAAGTTATTACAGAACATTTTTTTTTTTA:1 + chr3L 18549988 3' - F-element 294 1 58.90 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGGGAAAATAAATACTTTAAGTTGGCTGGTTTGCCGTAAGG:1 + chr2L 4714077 3' + transib2 2772 1 53.42 TATTGTACCGTTAATTCACGGTGCATCCTCTTTGTGCACGCACCGTTACCGGTCGACCTCTGCGCCCTTGGGCAACTCGAATCTAAGGCCCGCTCGAGTCCAAGGGCTAACGGGGGACCGTTAATTCACGGGCTCTCC:1 - chr2L 22601692 3' - gypsy8 4912 2 65.22 AGGGTGCTCCTAAGCTTACTTATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAAT:1 + chrX 21947718 3' - mdg1 96 2 66.44 CATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGATCGTGAGACAATGGGTCATTGTTCCAGATTTAAATGATTGTTTTCGATTGTTTTCGATATGGCTTATTTCGATTGTT:1 - chr2R 2953612 3' - Tirant 8272 2 69.42 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCACATTTGGTTGTATCTCTGTGAGTCTCTTTGATACAAGTACGGATGTAT:1 - chrX 11209813 3' - hobo 26 1 66.44 CATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGCGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCT:1 + chr3R 28385660 3' - transib2 29 1 64.38 AAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACCGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAACAGTTGCATCTCAAGGCGCTGGCCGTGTGAAGAGCTCCC:1 + chr2L 20097069 3' + gypsy4 450 1 56.16 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCT:2 - chr2R 3564065 3' - Tabor 84 2 72.60 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAATTTAAAGCCATGCAG:1 + chr3L 7889699 3' + roo 9052 2 71.72 GTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATGCATAAAAAAGTG:1 + chr3R 905028 3' + rover 7235 2 65.75 ATTGGTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTTTTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTGGAAATCATACACTCAA:1 + chrX 661989 3' - 412 12 2 71.09 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATATAGTAAGGCGGTCGGGGCAACAAGCCAAAAAGACAATTACCGCAA:1 - chr2R 11325095 3' + jockey 4935 1 62.31 GTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCAAATGATCGATCGTTAAATAGAA:1 + chr3L 10425926 3' + I-element 5340 1 69.01 AGAGACCCAACAATTGCTCTCAGCACAGGAGCGCATAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCACAATAAACACACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTTCAAACAAGCGGCGACTCTGC:1 - chr3L 137650 3' + Porto1 374 1 70.34 AAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAAATTTGATTTTATATAGATCAAGCACCGCTTATATATTAGGATGAGTTTTCAGTTAATT:1 - chr3L 8571733 3' + transib2 441 1 71.23 TTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTTTTGGCTTCAATGTGCCTGCGCCATGTGAGTCTGTGTATGGGTGTGCTGTGATGTTGCATGAATCACG:1 + chr3R 19383829 3' - F-element 4209 1 76.03 GTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGTCATTCAATCCCCAGGACAATCCGATCCGATCCGTTCACTCGATTCCGA:1 - chrX 2013699 3' - roo 8798 2 66.44 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGGAGTGCATGCTTATAT:1 + chr2R 6964896 3' - Burdock 40 2 56.85 CGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCAAAT:1 - chr3R 19445919 3' + 1360 64 1 69.86 CGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTACTGCCTGCGATAGCTTTTAGAAAGGTCTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGA:1 - chr3R 6645358 3' - flea 4953 1 69.18 AGATTTAAAATTTCTAAGAACATTTTTGATTTGTTTGGCGGCGGTTAAGCTCGCCATGATTTTTCTAGGGGATTATCGTTCCTCCTTTTCTGTTTTCTGTTTTCCACGGGGTTTTTCGTTTATATTGTTTTAGATTTTGCCTCTGT:1 + chr3R 16543418 3' - TART-B 10355 1 58.90 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATT:1 - chr3R 30347295 3' - P-element 42 1 58.04 CAAGCAAGCAAATTAAATTTTTAGATTTCTTACGCTCGGAAAGAGAGCAATTTTGTTCCCGCAAATTCCTGGAATATCTTAAAGCACCTCTTTCCTCCAACAGTTTGATTGGCGGATCGGATTACAAACTCATCTACAGACACTAT:1 + chr2R 23968327 3' + 1360 3263 1 68.49 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGT:3 + chrX 12129387 3' + flea 4933 1 73.29 AGACAACAATTTTAGTTATTGTGGTTTATTCTCCGACTATGCGCGATCAGATGAGTTCTTAAAACTGAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATAAAGTAGCCCGTCTTCACTTCGATGCAAGATACTGGCTTAAATCAACATCCTTT:1 - chr3R 20406364 3' - gypsy4 6824 2 73.97 AAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCATTAAAATATGCATGGCTGTTTTTCATAGGGGTATGCTGATCATATAAAAAGTTTGCACTACTTATTTCTGTTCATTTCAACACCGGTTAATCAAAATGA:1 + chr3R 19408928 3' - diver 5784 1 70.55 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAACAAG:1 + chr2L 13158739 3' - roo 8722 2 59.86 CTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTAATGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAATAATAAAAATACACTTTT:1 - chr3L 20798525 3' - INE-1 136 1 52.42 GGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGGTGGGGGGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCGAGCATTTTATGTAGCCCTTGGCAGTTGCTTTGCCTAGCTATGTGAAGGGCGCCAGG:1 + chr2L 3136214 3' - F-element 4496 1 52.99 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACCATGTGCAC:1 - chr3L 12004244 3' + P-element 2847 1 50.00 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCGGCCAACGGCTTCCTTCATTCGAGCTAATTAAACTGAATTGCTATT:1 + chr2R 8047394 3' + 1360 3372 1 70.14 TTATGCTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTTAGACATGTATTCTCTTTAAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCTGGGTGTGCTTCGTCAAACTGCCAGGAGTCATTTGTTGACGTA:1 + chr3L 23039111 3' - G5A 2709 1 72.54 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTT:2 + chr2R 8157275 3' - mdg1 60 2 59.59 GAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAAACGTTGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGATTCTAGTTTATTGACCGATATTGCCACCCCCACCTACCACCACCTGTCGATTCAATCGATTGCAACTCACGTTGACTTGTCATTTCCC:1 - chrX 4967545 3' + INE-1 148 1 62.33 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGCAACTCTAATTAGAAGGCCTTCTCA:1 + chr3L 16437271 3' - F-element 49 1 46.58 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGA:2 - chr3R 9038905 3' - Juan 4047 1 56.55 GTTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATATTAAGTGGTGAATGAACAATTGCCGCCATTGGGAATTCGAGTTCTACATTTCATTTTGCGCATTTAAAGAACGGTTTTTGTATTCGTAT:1 + chr3R 16228470 3' + 1360 2983 1 56.85 AATTATTTTATTTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAATTTTAAAGAAAACAGAAAAACTTTGAAGAAGAAAAATGAAAATCCAGTCTTAATCGTAGCACTGATTATTTGTTTTTAAATTGGAAAAAATCAAAATAAAAAA:1 - chr2L 12553264 3' - HeT-A 6 1 71.23 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAG:1 + chr2L 13556470 3' - transib2 26 1 60.43 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTTAAAACCATAATGCACACACCAGTGACCGGCCGGCAAAAATCCCCATTATTATTTGCCCTTTTGCGAGGAGAGTATCTCAATTTCGGCCTAG:1 - chr3R 31653031 3' - roo 27 2 67.12 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGATTATTTTGCTCA:1 - chr3R 7420214 3' + 1360 3317 1 67.12 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAA:1 - chr3R 20441247 3' + I-element 5280 1 67.81 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGAATTTTCCAAACCTAACTACCTTTAT:1 + chr3R 23639243 3' + pogo 2080 1 51.43 ACAGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAATGAACTATGCACAGCGCCAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTCTTGTCAATTCCATTTGTTATTTCTGGATTTTGCCGGAATAATATCAAATTACAATTGTTGAA:1 - 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chr2R 18514904 3' + P-element 313 1 26.03 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTG:2 - chr3R 16157278 3' + pogo 2043 1 58.22 ACATTTGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCACAGATATACCAGCAGGCAGTCCCAGTTCTCCGTGTTGATGCCTGACAATTCTGGCGGCGCCAAGCAGGCATTGACTCCCATTTCGCATCGATTACGAGAGTACTGGCTACGTTTGTC:1 + chr2L 10057027 3' + 3S18 364 1 46.21 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAA:1 + chr3R 24381376 3' + Juan 4134 1 71.23 ACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTGCTTGCTTGTGTGATTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTTAGTTGAGTAGGGCTAGAGAATAGGGACTTCCCAGTAAGTAAGGATATGTAAACTTTTTGTT:1 - chr3R 1137120 3' - 1360 3372 1 57.53 CTCGACTATCAGATACCTGTTACGTAGCAAGTTTGTAGCAAAGTACATGACGACATAAATACGCTTTTTCTATCTTTCACGGTTGCAACACCTGTCGAATTGTGGACATCAGCATAAAATAGAATCCAAATAAAACAGAGCCGGAG:1 + chr2L 9173234 3' - INE-1 552 1 71.92 GTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTT:1 - 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mdg1 7096 2 55.86 TTATGATGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATATACAAGGCACAACAAAAGTCGATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTGGTGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGCATACATAATATGTATACATATAATATAATAA:1 - chrX 22641241 3' + Tc1 1636 1 24.66 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTC:1 - chrX 21632969 3' + mdg1 365 2 56.85 TCTAGTGTCTTTGGTAAAACCTTGTGGTCCAGGCTGAGGGGATCGGTCGCCGTTATATGAGCGGTTTCGATTTCGGCCCGCTTTCGTATCTTTTAAAATGGAGAGAATAAATTAAGACTCAAAAAAGGG:1 + chr4 478887 3' - Tc3 234 1 72.09 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGT:1 - chr3L 16690878 3' + I-element 5319 1 47.95 AGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCAATAAA:1 + chr3R 23021011 3' - INE-1 574 1 45.89 TTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGA:1 + chr3R 4682965 3' + Burdock 180 2 78.99 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACA:2 - 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chrX 19074757 3' - mdg1 53 2 52.05 ATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATGTATGTAAGTAGGTAACTGGAGCTACTCGTTGTAGGGATTAGGTCATTTG:1 - chr3R 11937306 3' - flea 4822 1 64.38 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAGAACTAAGGAGAAAATGTCTTAAATGTTT:1 - chr2R 9544821 3' + roo 361 2 54.11 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAGAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATTATAG:1 - chrX 4484933 3' + roo 9014 2 54.79 ATACATTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCATAAA:1 + chrX 11906360 3' - INE-1 10 1 42.62 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGC:1 - chr3L 6518566 3' - 412 71 2 66.21 CTCTCCTAATTGGGATTGGTATTATTTTGGGGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTTCAGGTCGTCGTCTTATCGGGGGAAATGTGTTTATGTGTTTATAAGTCGCGTTCGGCGACGCAT:1 - chr2R 18564624 3' - I-element 228 1 56.16 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGCCATTATTATTTGCAGTTGAGTTTATGGCCGAA:1 + chr3R 22288050 3' + transib2 2808 1 55.56 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGGTACAAGGGTTACAGGGCTCAACTGTAGGGCGTGTAT:1 - chr3R 17077048 3' + roo 397 1 77.40 AATTATTATTATTATAATTATTATTATAATGAATATTAAAAATATTATCTATCTATTTCTGAAATTTTAAACTATTTTGTATTGCTTATTTTCCCACGCGTAGATCCTTGACCCTGTTTGTGGTGTTAACCTTTT:1 + chr2R 15720917 3' - mdg1 7081 2 77.78 TATGTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATTATATTCG:1 + chr3R 3854497 3' + INE-1 29 1 59.59 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCGAGTGCTGTGTA:1 - chr3L 9269858 3' + copia 255 1 58.90 GAGTTATGCATCGGGAATATACTAGACAAGATGCAACTCTTTATCAGCTGCACAAGGAAAGTTTTGGGATAATTTGGTTGGGTAAACAGTCTTATCTATGAGCCTGAAAAGTCCGTTCAGAGATTCACAATTTTTGACCACAATTG:1 + chr2R 5640946 3' + Gypsy12A_LTR 105 1 54.11 AAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTATGATGATGGCATAAATCATAGGGCCATGCAATATATAAAATTGCACCATTTTTTTAGGGGGGCTTTTTGTTTTTCTGTTGCGGGGCATCAACTTGGGGTCA:1 + chr2L 10042847 3' - 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chr3R 13406407 3' + pogo 2046 1 58.90 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCT:1 - chr3R 18488393 3' - roo 8752 2 79.45 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAA:1 + chr2L 4003799 3' + mdg1 376 2 52.41 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTAC:1 + chr3R 14860241 3' - BS 5039 1 54.48 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCT:1 + chr3L 12249899 3' + roo 343 2 62.33 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGACTATGCGAAAATTCATATATAAATTTTAATTTTATTGTTTACTTTAATATGTATAATTCGGTTTTATGTCTATTTGGATAGTACAGATTAT:3 + chr2R 15326980 3' - copia 30 2 51.37 GGATTGATTAAATAATAAAAGGGATATGATTTTACTTTGCTAAATAAGGATATCTTATCAGTTACTCGAGCATAAAGTACCAAATCTACACTCTCTTTGAACTGCTTTCAGACTTAGGTGTTTTGGGCTTTGGTCATCGTTTAAAT:1 - chr3L 3877379 3' - Tc3 1462 1 65.07 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTA:4 + chr2L 15550781 3' + Bari1 1662 1 52.05 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGGATAACAACGGC:1 + chr2R 6847860 3' - Doc 50 1 54.79 AGGATCACTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAG:1 + chrX 20996643 3' + INE-1 96 1 51.25 GTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCGACTCTATCGCCCAAAT:1 - chr2R 21116421 3' + mdg1 7457 2 61.64 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTG:1 - chr3R 26504182 3' - HMS-Beagle 29 2 65.75 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAACCAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATTATGTATTT:1 + chr3R 19408023 3' + diver 186 2 54.79 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGA:3 + chr3L 3501816 3' + Bari1 1644 1 61.64 TTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGTATTTTGAAAAAAATACCACAGGTCTAGAAACATATCACTGAAAAT:1 + chr3L 23224589 3' - X-element 4352 1 80.14 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTAT:1 + chrX 22460187 3' + HB 1539 1 78.47 ATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAA:1 - chr3R 2424354 3' + 1360 2967 1 75.17 GATAGAGCTTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAGTTGAAGAATAACCTACTAAGCTAATCTCTGATGAAATGTATGGTTTATAGCCAAATTGTTGGGTTTGTGCGGAAGAGAGAGTGTACTCTAGAG:1 + chr2R 3030140 3' - Bica 4514 1 60.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACG:1 - chr3L 5532903 3' + roo 9036 1 59.59 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATT:1 - chr3L 12315744 3' - transib2 83 1 73.29 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGACCAAGCCGATCCTGCC:1 - chr2R 14051704 3' + roo 394 1 69.86 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTGCCAAGCCG:1 - chr3R 22642252 3' - blood 31 2 63.01 ATTTCAATTTATAAGATTTAAATGTAGGTACTTAGCTACTTTTGGGATATGTATAGTTTATTTTATACTACTGTAATCCTTAAGCTCTTCTATACTATATAATTTGATGTACTATCACAATTGAAAGCCGTAGTGATGCCAGTAAT:2 + chr3L 9955318 3' + Tc1-2 1408 1 47.26 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAG:1 + chr2L 18549935 3' + roo 9021 2 53.52 TGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGAC:1 - chr2L 4888711 3' + BS 5057 1 55.15 ATAAACATATAAAAACACACACACACACACATACATTCGCATTAAGGACGCGAACCGAAAAGGGAAAAACAAACACAAAGGAAAAGAAAAGGAAAAAGGAGAGCGCAGCTTTTTCACCCCCTTAGAGATTAAAACAATAGAAATAC:1 + chr3R 26121551 3' + Tc1-2 486 1 76.71 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCC:1 - chr3R 22642274 3' - blood 7055 2 51.09 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGCGGATTTCTTACA:1 - chrX 6475250 3' - Doc 19 1 74.66 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGC:1 - chr3L 3983817 3' - P-element 36 1 44.66 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGATTTTATGGTA:1 + chr2R 13259416 3' - mdg1 7066 2 63.70 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTG:1 + chr3R 31653173 3' + roo 9037 1 58.27 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGT:1 + chrX 10167461 3' + roo 9002 2 64.38 ATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTCCATAATG:1 + chr3L 21769162 3' + mdg1 7076 8 77.78 ACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACTAGGTATTATATATGTATGTACATAAAGAAATACATATGCATGTATGTACATATGTACATGAAGATAAAGGGAGAGCGGAGACAAACGCTAGACCGCCAC:1 - chr2R 10045960 3' - G3 4507 2 65.49 AGCAAATCCTGATCGTCCTCGCGAAGAATTCTTCATGGGATTTGCCCTCCTTAATGTTGTAATGTTATTTTGTAAATAGTTATACATAGTATACTATAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAATGGAAAGCAATCAAGA:1 - chr3R 27717628 3' + Rt1c 5307 1 71.92 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACA:1 + chrX 12217459 3' - rover 6987 2 63.70 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTCCCTTTTTTT:2 - chrX 4341223 3' + roo 9047 1 67.12 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATAATTAA:1 + chr3R 16437387 3' + pogo 2057 1 55.48 GACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATC:1 + chr3R 17736938 3' + opus 7420 2 76.39 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTC:1 + chr3L 8959698 3' - 1360 55 1 58.22 CCCGTTACTCATCTAGTGGGAATGCGGGCGCGAAAATTTATCATTTTTTAGATATATTCTGGATAGAAATAGGGAAAAAACTGAGAAATAATTGAAAAATTGTAAAAA:1 + chr3R 7914679 3' - INE-1 537 1 36.11 TTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGAAAAAAAACATGCCTTTGATAACAGCCTGGCGTGGTAAAAAATGTAAATTATTGAACGAATTAATTCAAAGTTCAAGTCGCACGTTCTACGTGCGGAAAAGACAAAC:1 + chr2L 13083519 3' + G4 3831 1 54.29 TATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCT:2 - chr2R 5106276 3' - Stalker2 73 2 67.81 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATCAAAACATCATCGTAATAAAAACAAAGCAATTTGAGCACTTATATTTTAGAAAATTGCTAGCCAAAAATATTTCAGCACCCTAACCGCCGTCAATCTATATAATTTGAGTTCCTTCGCT:1 - chr3L 15841775 3' + jockey 4970 1 69.18 TCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGT:1 + chr3R 3920593 3' + roo 9018 2 55.94 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTT:2 - chr3L 2989911 3' + roo 9035 1 59.59 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTT:1 + chr3R 15054284 3' + copia 168 2 82.88 AATCGTATTGTTATGTTTTTAAATTGATCCCACGTTATTTAAAAACCCATAGTGGCAACCTAAAGATAACAATTATTATATATTATATACTAGAAATAGTAATACCTACGGAAAATACGATTGGAGGAGAGTCAACTGATCTAATA:1 + chr3L 13300001 3' + copia 4822 1 69.86 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAGGTCAGGGTGCGCCGGTTAGTATGCAGGGCGTTTTGCTTACGCTTTCCAGCCACTCGTGCGTATACACAAC:1 + chr3R 5351532 3' - jockey 4680 1 77.40 GGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGGTCTTTGATTTC:1 + chr3L 25350819 3' + baggins 5394 1 54.62 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATCTTTCTTG:1 + chr3L 1279200 3' + roo 9028 1 54.11 ATGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGAC:1 - chr3R 17673754 3' - FB 70 1 66.44 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACATGTTATTATCTACATGCAGCATCTGCCCCAAACAGATAATAATTATAATCAGCTTTGGGTG:1 - chr3R 7719719 3' + roo 401 1 69.15 TCTATGTTTTAAATTTGCGGGAGACATTTTTGAATTACATTGCGGCAGTTTTGCGCGCCATTGTTCAAGTGTAGTAAAAAGGAACTAGATGATTTAGTACAATAAGAGTTAAAAGAAGCAGCGTTCTTAAATACTTATATCTTGTA:1 + chr2R 12888339 3' - TART-A 13252 1 50.68 AGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGAGAACGCGACTACAGCATTCTCTCGTGTTATTTTTCGATTATTCTTATAAGAGCTATATTATTTATTGGTCCTGCTAGGAATGCTCAACGACCTGTATTACCTATATTGGCCCCAGAAATTTA:1 + chr2L 21723682 3' + INE-1 550 1 64.38 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACAGTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGGCGG:1 + chr3R 16157400 3' - pogo 18 1 64.04 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTTATTT:1 - chr3R 14980266 3' + roo 392 2 73.61 ATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTAAGCTATTTTTTAAAGTTCTCCGAAGCAAATTCCCAAGAAAC:1 - chr2L 1268097 3' - Bari1 1423 1 71.23 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGA:2 - chr3L 5532952 3' + roo 323 2 78.77 ATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGATATCTATGTTGGGAAAGATTTGATAAAAACCGTATGCATATGAAATTATCGAAATTATAAAAT:1 - chrX 15199546 3' + 17.6 7085 2 56.85 CTGAGTAACGGATATCTGATAGTCGAGGAAGTCGACTACAGCGTTCTCTCTTGCTTTAAATACACATGTTTGTGTTTATTGCAAGGGTATCTAAGCTTCGACTTATCAGCTAATTTATTTTAATCAATTAATCCTTCTGTTGTGTA:1 - chr4 660737 3' + INE-1 547 1 71.92 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAATATATATTATATATTATATATATAATATTTTTACATTGTTTTTATCAAATTTCCACTAAATTTGTATGACTAAATTTCGGGATTCCGCTCGCCCGA:2 + chr3L 23688694 3' - Quasimodo 15 2 56.16 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATT:1 + chr2L 11357911 3' + blood 7319 2 67.13 ATTAATAATTAATACCAATATTTATAACTAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTATATCTTTCATGAATAACGGTATAAACCTTGTTTTCTGAATTCGCAAC:1 + chr2R 2260692 3' - Gypsy12A_LTR 1817 3 76.71 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAAATA:1 - chr3L 17055381 3' - Tirant 8120 2 76.71 TTGTAGACGTTAGAGTCGGCATGGTATTGCTTTAGAACGAACTTGCGTAGACTTTATTCTTCGGGTTTCTGAATATCTATTTTTATACTTAGTTTCGGCTCGGCTGGTTATTCTGATTAAGAATATAAAAACTTTATAGGCCTGGA:1 - chrX 23067455 3' - INE-1 216 1 56.16 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTAATAATGCTCTCATCTTCAAGCTTTGCTGGCTTAGCTATTTCCATCAGTGCGTACAAGAATTCATGTAAACTCCATCTTTTTTCTTTTGCCGTC:1 - chr2R 6421450 3' + roo 9026 1 63.70 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGTGAGGCATTAGT:1 - chr2R 20802519 3' - mdg3 5264 1 77.24 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAA:1 + chr2L 20821318 3' - Burdock 6183 2 53.42 AATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTGGCCCGTTCAATCAGATCAGCAGCAGCAGCCATCCGAGCAACAACAAC:1 + chr3R 17966682 3' - copia 4685 1 58.18 AGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAG:1 + chr3L 18931054 3' - I-element 64 1 58.90 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACGTATCTTATGCTTTGGTAGTATATTTTTTAACTGGGAGTAACAATATAC:1 + chr2L 13476643 3' - roo 73 2 74.66 ACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAGAGCCGGGCAATTATTTATCGC:1 + chr2R 23780661 3' - Ivk 13 1 75.34 GGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGGGCTGGCCCCACGATGGGCGCCAATTATAACTGTAACGAACACACACAAATTTGAGCTTAGCAAAATTTTAATACAACCAA:1 - chr3L 15189245 3' - Circe 313 1 74.83 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTA:1 - chr3L 23287223 3' - 1360 63 1 61.64 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTTA:1 + chr3R 9298606 3' + hopper 1395 1 70.55 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACA:1 + chrX 10521705 3' + Tabor 399 2 75.34 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAA:1 + chrX 4808598 3' - mdg3 51 2 60.33 CGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATTCATAAACAGCGCATTTCTGGGTTCATTTTCCGCAGGCAATGTCCACTTGGATTCATTCCGATTCCCCTGGACAGGCAATTG:1 - chr2L 1723423 3' - opus 236 2 72.58 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAAT:1 + chr2L 12251026 3' - 412 22 2 65.00 GCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTCAG:1 - chr3R 556386 3' + Juan 4143 1 66.44 ATATGAATCTTATTTGCAAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGC:1 + chr3R 27406033 3' + diver 181 2 64.58 GCCCATGTATCCTGCACAACTAGCCAAAGCTGAGCCTTAGAAGTCAGGAACCTTTTCGACGCAATAGGTCGGCATTTTATGCCAGCTACACCATAAAAAAGGGTCTTTAAAATGTGGAAAAGATTTGTAAGCCTTAATAGTAAGCT:1 - chr2R 5649256 3' - HB 1232 1 63.01 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGT:1 + chr3R 28385635 3' - 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chr2L 3233901 3' - roo 1 2 78.08 AAAAGAAAATTGATTATAAACAATTTCCAGCAATTTTAAAGCGTTGTTTTTTTTTCTTATTCTCCGCGAAAGCGTACATAAAGAGCGTATCTTTTTTAATACCCCCCACTTTTTACTGTATTTTCCTGCCTGCCCTTTTAGTTGT:1 - chr2L 14996429 3' + Tc1 389 1 81.38 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAAT:1 + chr2L 13844233 3' - Stalker2 7299 2 66.36 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTT:1 - chrX 7795522 3' - roo 8735 2 70.55 ATTCTGTTCCGCATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGGTGCAATATATAGGTACAATTATTTAATTTTTTGTCCGTTTTTTATTTATGTGAATAATTTGTGGGCGACTCGCGTGAGTGTGTATGGGTGGTTCTTGGCG:1 + chr3R 22098946 3' - HeT-A 6023 2 54.11 ACACTCNCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCA:1 - chr2R 13259297 3' + mdg1 345 2 67.12 AATATTATTGTTATTATTTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGCGTGATTATTTGGGGAACGACAGAGCAAGTTAAATAAACAGGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGT:1 + chr2R 21116620 3' - 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P-element 37 1 58.90 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTATA:1 + chr3R 16342062 3' - P-element 34 1 60.96 GCATATCGGCTGCTGGGGAAGTTTATTTGGTTTTTAACAAGTCCAGAGTTTTTCGAGATAAAGTAGTTAAAGATATATATTTCAATCAAAGTTATAGAAGCAGACCCCACAAGCTCGTAAAGGG:1 - chr3R 29345823 3' - G5A 2594 1 66.94 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCTTACGCCAAAAAAAAA:1 + chr3L 12249919 3' + roo 9039 1 58.21 ATATCTATCGATATCGCAGAAAAATGATAAAGTATTGCGTTCGCATTTTCACTAGTTGAGTATCGGGTATCTGATAGTCGGGAAAACTCGACTAAAGCATTCTCTTTTGTTTTAATTTCCTTGTCCGCTCACTT:1 - chrX 22637995 3' + INE-1 498 1 69.40 AATAATAATAATAATAATTAAGCCTGCAAGTCTAGTGTAGTTACCTTTATATATTACTTCGCTAGCTGTTTTAAA:1 + chr3L 15658842 3' + invader6 4388 1 77.33 ATAACAATATTTGATCCGCGACAATTAGCAATTTTAAATGTTTTTCTCATATTATATATATTTAAATAACATCATTATGCTGAAATAAAAGAAACTATAGCTTGAACTACATTCATTTTAGAATTGCGATGTCCGGATTGTCGCAG:2 + chr2L 5952448 3' - aurora-element 4047 1 61.64 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAG:1 - chr2R 11794959 3' + opus 7446 2 68.35 TATATTGCACACACTGTAATCCAAGGCATAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGATAAGCCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAATAAAATAAATTAAACAAATA:1 + chr2L 4034961 3' + HeT-A 5990 1 71.23 AAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGAAA:1 - chr2L 13844151 3' + Stalker2 7597 2 52.74 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTT:1 - chr2R 3338779 3' - Juan 47 1 51.45 ATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGAGAATCAGGAGCATAGGGGGCCAGGCATCAAAAAAGCAAAACTAT:1 - chr3R 26498419 3' - HMS-Beagle 6672 1 65.62 AAGCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAAC:2 + chr2R 4545170 3' + invader1 3535 1 52.74 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTT:1 - 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chr3R 15790820 3' - roo 8701 2 50.34 AGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTCGGTTTTGCCAGGTTTTTTTCTGAATGGGTCTAATGA:1 - chr3R 17933820 3' + Dm88 357 1 74.66 TAATAATATTATATTACTATATTTTCATGGTTGAAAGAAATAAATAAAAAAAAAGTGGAAATAATCTTGATTAATGTATATAAACATTTGAAAAGCGATTACGCTGTTTGGTTTCCATTTGATGCTGATAAATTGTAAGTACGCC:1 + chr2L 17585379 3' - Tc3 293 1 62.76 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTACGCGCTGGCCAATATGAAAATGATGTTCCT:1 - chr2R 8735526 3' + mdg1 7445 2 75.34 AAGAAAAAAAAATAGGAAAATAAAAACAAGTAAAACCCATCCGCCGGCATTCGCTTTCGTTTGTTTTTGCATTTCCTTCCCCTGCTTCTGGAAAACTGGGCGCGC:1 + chr3R 28033256 3' + Doc2-element 248 1 65.71 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAATAACGC:4 - chr2R 15326786 3' + copia 249 1 80.14 AACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAG:3 + chr3R 1844829 3' - Cr1a 191 1 73.29 TGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGAATTATTTATTACTTCCCACCATTCTGGGGAATTTGAATTAATTTCTGGTGCCGCACATTCGGCGATG:1 + chr2R 10691516 3' - invader2 245 2 61.54 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACAC:1 - chr2R 17926276 3' + opus 7466 2 59.59 TCCTTAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGATCTATATGGTCGGAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAACACAGTTGTGGTTTTTTATATATTGTTAAACGTTTTTATT:1 + chrX 22905693 3' - INE-1 138 1 57.75 AAGAGCGGGAGAGTGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGATTTGGCTGAAATTGAATTTCTA:1 - chr2L 1300678 3' - GATE 8287 3 69.86 CATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATAATGTTGTGTCCCCGCTCCCGATGCGGATACCCAGATCCTGCGTCTGGAGTCCGACGTCCAGCCGG:1 + chr3L 6145001 3' - Rt1b 4784 1 56.19 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTAT:1 - 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INE-1 103 1 55.94 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTAGAACTTAATTCTT:2 + chr3L 20898667 3' + roo 389 2 72.60 ATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTC:1 - chrX 292412 3' + G3 4551 1 60.00 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCG:1 - chr3R 8075911 3' - 412 80 2 70.55 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAG:1 + chr3L 18126015 3' - Ivk 40 1 51.37 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTT:1 - chr3L 21996163 3' - Transpac 66 2 60.27 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGT:2 - chr2R 15326814 3' + copia 255 1 60.96 GTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGAC:1 - chr2R 7244787 3' - diver 5924 2 60.27 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACA:1 + chr3L 16033404 3' - Doc 88 1 77.40 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTC:1 - chr2R 24427583 3' - jockey 4754 1 69.86 AATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTCGTATCCATATAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAAACTACGAAAACCTAAGGATCCCATTGATGGAAAATTATACAAGTTTGCCAACAAAATTAGCGCATATTCGAGAATTTA:1 - chr2R 4907349 3' + G4 3522 1 59.59 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGA:1 - chr3R 30946516 3' - Transpac 4985 2 62.33 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAA:1 + chrX 12986647 3' - roo 8710 2 54.79 AGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCAACGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTA:1 - chr2L 3675851 3' - Juan 4085 1 58.57 AAATATAAACATTTATTCATTTAAGATTTTTTCATCGATTTGAGCAGTTACTTACAGTTTTGAGTTGGACGTTACGCAATGCGCAGCAGTTAGTATCAGATCTAAAAACAAGAAATCCATATAACCATCAGGCAATCAATCATATA:1 - chr2L 14768916 3' - Tc1 59 1 42.47 TATTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCATCAGCCGAGATGTTTTTGGCTTTTTTTGCTTCGATGCTGCGGTCGAGTGTGTGTGAAAAGGAAGTTGA:1 + chrX 19231187 3' - Quasimodo 6897 2 65.45 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTTTAAGCAGACCGAATTCAATTTTCTT:1 - chr2R 330071 3' + HMS-Beagle2 7177 2 73.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTGTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAATTTTTCAAGCTACAAAAA:1 - chr2L 20265882 3' + roo 404 1 79.45 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAA:1 + chrX 2479613 3' - 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chrX 12986526 3' + roo 352 2 56.85 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATT:1 + chr3R 19073306 3' + roo 9033 1 58.22 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGA:1 - chr3R 20441239 3' + I-element 5288 1 62.33 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGT:1 + chr3R 7420342 3' - 1360 17 1 74.65 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAA:1 - chr2R 15326792 3' + copia 243 1 76.03 CGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + copia 34 2 61.43 GAATCGTTATCAGGTTCAAATTCGAAATCTGTCGCAGGTATGTCAACCAAAGCCTTAACTCTTTTGAGCCAATTACGGTGACCACTTCTGGTTAAATGGTTTAGTTTTCATTAGGGCTCATGTCCTGACTTTGT:1 - 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chr2L 12818238 3' + hobo 2874 1 59.59 AGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAAGGTAGTGGAAGGGGGGAATATCGAATAAATAATGATGATGCGCCACTTTTTCGGTTTATTTTGCATGCATTTTATGAT:2 - chr3L 13377634 3' + opus 7213 2 57.53 GGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATGTTATTTATATGTTATTTCATCATGATCCCTCCTACTTTTCAACATCGCTCCCAGCTACTCATCC:1 + chr2L 9782142 3' + P-element 97 1 30.77 TAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATA:2 + chr2R 2875233 3' + TLD2_LTR 100 1 64.83 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACC:1 - chrX 13134868 3' - jockey 4801 1 56.16 ATATTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGATAGATACACTACAATATTGTAGTACTTCTGTCTTCTTTAACTATTTCCTTCCTAAATCTACTTGATAGCTTATTCTATCTTACCCTCCACCCTCGATCAGGTG:1 - chrX 9455213 3' - Stalker3T 35 1 78.77 ATGTGAATGATTTTAATTCAGATATTTTTGATACTAAGTCTCAAACTCTTCAGTTTGGAATAAGCCCTTTACATGCGTGGATTCGCTTCTTTGAATTTGTTTTAAAACTTGCTATTATGTTTATTTACCTCAGCATCTGGTATTCT:1 - 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chr2R 547766 3' + jockey 4850 1 60.96 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATACGGGGGGCAAGGTGAAAGGAGAGGCGAGGCAAGGGGGCGGGGCCGTTTCTGGGCGGACCCAGAGTACCCGGAGCACAAACATGAAAACCTAAA:1 - chr3R 19696275 3' + Juan 4163 1 69.40 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCT:1 + chr3L 19274898 3' + transib2 2771 1 56.16 CGTCACTAAAAAAGTGGCTGCACAGTGCTAAACCAATGTATGGCATTACGAATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTTAACCCAACCATGCTTTGTCTTACTGGACCTCAGCTACCTGTGTCGATTCGGATCTTGCTCCT:1 + chr3L 23317425 3' + 1360 3335 1 69.06 ATGTAACAGGTAAAAGGAAGCGTTTCGCATTTTGGCTACTTTTGGGTCGACAACAAAAGTTGGCTCATTG:1 - chrX 3765719 3' + INE-1 30 1 94.29 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCA:1 + chr3R 4964191 3' - roo 65 2 67.12 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGGAAAATC:1 + chr3R 28385668 3' - transib2 21 2 71.23 AAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAAGGAAGTGCCCAACCCCGGCAATAAACGTTTAAACATGTATCGAACACACTCACACTGAGCG:1 - chr3R 2938564 3' + Circe 7146 1 74.44 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 31264063 3' - jockey 4800 1 66.00 CTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATAT:1 + chr3R 16533713 3' - X-element 4412 1 36.30 CATTATTATTATTATTATTATTTGATAATATATAGCAGCAACATCTAACGATCGGCAGCAACATGTTGCAGGCAAACCCAAGACTGCTTCAATTTTTAACATTTTCAATT:1 + chrX 15626685 3' - mdg1 43 12 66.36 TATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGACCACCACCAGAACCACATTAATCTGGAACACGCAGTCGTGCGACACTCGACACCAGCGAAACGGATTAGCC:1 - chr2R 5795475 3' - F-element 4428 1 54.79 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACG:1 - chr3L 14366508 3' + roo 9033 1 60.27 ATTTTTAACTAAATAAATTAAATTTCGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACG:1 + chr3L 23839702 3' + G7 1143 1 56.07 ACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTCATTGAGACATGGTCTGCTGTTAATTTGTTTTGATTATCTTTCA:1 - 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chr2R 14368125 3' + HMS-Beagle2 7098 4 60.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATTGCCTTATAAATTCATT:1 + chr2L 20266078 3' - roo 8685 2 69.66 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTG:1 - chr2R 21926393 3' + opus 436 2 77.39 AACGGCACAATATGTGGACCTTGTACCCGGGCGGGCCTGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGGAGAGTAAGGGCGCAAGTCACGTGGTCTGGGCGCGGTCGCGCCGTCAG:1 - chr3L 23536680 3' + gypsy8 4922 2 55.96 ACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTA:2 - chr3L 6789232 3' + Tc1-2 1596 1 57.53 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTC:1 - chr2R 13766214 3' + roo 334 2 69.86 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAGTTGAAATAAGCTAAGAAGCAATCGTG:1 + chr2L 10156265 3' + hopper 1409 2 78.77 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAATGGTCCATAGAATAGGCGTTTGATTGAGCCACCCCTTTCTCCACCTGATGGCAAAG:2 - 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F-element 152 1 73.97 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGG:1 - chr3L 16970386 3' + roo 8986 2 78.77 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGTGTGGTTTG:1 + chr3R 3920601 3' + roo 359 2 52.05 CACACACACACACACACACATTATTTACAGTTAATCGCCCATAAGGAATACTTCCCTACTAAACCTATAATATTATAATGATGTTACCCAGATATTACTAAAAAAGTTCATTAATATCATTAAATCTGCAGACTTTGGATAGAATG:1 + chr2L 2014240 3' + accord 7030 2 71.92 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTG:1 + chr2L 13556473 3' - transib2 30 1 59.59 GTGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCGCCCCAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTTTATTAACGCCCTACCCGTG:1 + chr2L 21328274 3' - 297 44 2 62.76 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTT:1 - 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chr3R 17079585 3' - roo 8664 1 49.58 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTT:1 - chrX 6116235 3' - transib2 51 1 53.42 AGTAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAA:1 + chr3L 1692105 3' + blood 7313 2 67.81 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGG:1 - chr2L 4003659 3' - mdg1 36 2 59.59 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGTG:1 - chrX 6475279 3' - Doc 46 1 54.17 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGGGTTGTTTGGTTTTACG:1 + chr2L 19924056 3' + roo 9028 1 47.22 TATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCC:1 + chrX 21947743 3' - mdg1 49 2 51.72 TATAATTATTGTTATTATTGTTGTTATTACTATTATTATTATTATTTTTGTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATTATTATTAATCTTTTTCCTATTGTTTTTATAATTTTTTTTAAATTATTATCGTATTA:1 - chr3R 21153560 3' - mdg1 25 2 53.42 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAA:3 + chr2L 8902507 3' + roo 8990 2 73.97 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGTGGCATGTGCTGGGACTTCCGAGTGCGATGCGATTCTCAGGGGAAGATAAGCCGGTTGCCGCCGATGCCATTGGACCCGGCTGCTCGCTTGGAGTTCATGCTTTT:1 - chr3R 20818288 3' - 1360 14 1 72.22 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTT:1 - chr2R 3338779 3' - Juan 52 1 53.15 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGTGTCTGCATCG:1 + chr3R 9003020 3' - roo 8706 2 53.33 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGGAAATG:1 + chr3R 10270697 3' + Juan 4186 1 67.81 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTC:1 - chr2R 22034643 3' + copia 5070 2 56.85 GAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAAATAAATTAAACAAATATTAACAAACAATAAATAAATAATAAATAAAATAA:1 + chrX 13838217 3' + TAHRE 10405 1 56.16 CTATATATTTATTATTATGTTTTGGCGGAATTTTAATTGATTTTTGCCAAGGGAGGAAATGTCCGTCGCCGTCAGCCAGAGGACCATGGATGTACGTGCATAAAATACCACACTTTCAAGAAACTTGTTTGTTTCAAAAGATAATT:1 - chr3R 25065746 3' - G4 3597 1 54.11 TTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCAAGGGTGTGCCCGCTTGCAATTAAATTGCGCCGAATAACAAAAAGTAGAGGCGAAAACCAAAACTCAACTAAAAAGGCATTAAATA:1 - chr3R 26522712 3' - 1360 3252 1 64.38 AGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACCAGAAACTAGAATCCCCAGACACCAACAATCAAACTGATCAGCCTTGGAACCAGTCATACG:1 - chr2R 18679939 3' + Doc 259 1 58.22 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGA:1 - chr3R 24219277 3' - roo 8733 2 66.44 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTG:1 - chr3R 6419805 3' + Tabor 462 2 67.59 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTT:1 + chr2L 19924084 3' + roo 391 2 65.07 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACA:2 + chr2R 8099216 3' + jockey 4924 1 66.44 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGG:1 + chrX 21224630 3' + roo 9029 1 55.93 GAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGATAACGATGATGAAATTGCG:1 + chr3R 26504300 3' + HMS-Beagle 169 2 70.55 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAATCGGG:1 + chr2R 19941641 3' - hopper 41 1 53.03 GCTGTTTCTAATTAAAAGAATTGTATTTTTCAAGAGAGATTTTCATATTAGCTTGTTGTACTTTTTAAGTATATTTGCAGCTTATCACGTTCACAGCAGAAAAATAATCTCAACTTCGTCTGCAGCTTCAGCACCAGGCTCATATA:1 + chr2R 24999083 3' - TLD2_LTR 160 1 57.53 AAAAAAGAAAACAAAAAACTACTAAAAAAA:1 + chr2L 2869684 3' + gypsy7 5010 1 90.00 ACAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTTATTTTACAT:1 - chr3R 14980261 3' + roo 9058 1 76.03 ATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCAAATGCCCACAAAAATACGTAATTTGGTGCTGATGTTGTTGGTGCCAGCATTAATCGCTATTATTTATTCTCGGCCAGAATTAGGCTTGTGTAATTCCTCGAAAG:1 - chr3R 29381147 3' + R1A1-element 5277 1 75.34 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATTA:2 - chr2R 20010154 3' + Juan 4195 1 69.86 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAGAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATCCCCCTAT:1 + chr2R 6622641 3' - S-element 77 1 70.55 CAGGAATAACGGTGCCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTATTCTGCATTTTGCTTATTGCGCGACGTTGGATATAAAACACACCACTTGGGGGCCAAAGA:1 + chr3L 21619951 3' - Chimpo 303 1 71.92 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATT:1 + chr2L 17180153 3' - Juan 54 1 51.37 CTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAAAAATGGTATCCTTGAAGGCAGAGCTCTCAAGGCTCCTTTCGTCGTCGGCCACTTAAAAAATCATAATCATAACCAATTATGATTACGCCAGGCAACCGAG:1 + chrX 2839455 3' + R2-element 3381 1 69.86 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAA:2 - chr2L 17005685 3' + Stalker2 7608 2 48.63 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAA:1 + chr2L 71270 3' - 412 62 2 58.90 ACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTAGTAGTAGTAAATTGCCGTGATATTGCAATCTTTAAACAACAAAAGTGTTAACCCTTAAACACAATTTCTAGCAGTTCCAAGTTTTAACGGAAGCGA:1 + chr2R 9546490 3' + roo 156 2 68.97 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATCTAATTTTGTTGTTTTGTTTGATATGTCAAGGTTAAGCACACGCACGCAATCTCATGGATTTGTGTATCTTTATCGCTCGGTTTTAATCTCTCC:1 + chrX 17966708 3' - blood 7055 2 64.14 ATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGCGTCCTGCATTCAGATAGCTTGAAATCCAGTTAAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAACCGGGTGTCCAGGTGATTAATGTGCAACCAGGTTTGCTTAATTAACTTGCATTT:1 - chr2L 10962519 3' - Q-element 439 2 63.01 GTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAGCATACATTGTGCTTTAGGTTTCATTTTAAGTGTCACTTCCCACACATCACGTATACG:1 + chr2R 16977694 3' + R1A1-element 5293 1 57.39 CTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCATCTGATCAAGAGAGTCTCCTGTCTGTATATCTTTT:1 - chr3R 4929296 3' + R1A1-element 4958 1 70.00 AGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGTGTGTATTTGAGTGTAAGAGTCAGCGAGTGAATGATTTGTATATGCCGCTTAGCCCGACTGAATGCCAACTTGTAGTTGTAAGCTTGGATTTTAAACTATAATTTAACAT:1 + chr3L 1891317 3' - I-element 4988 1 75.34 GCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATA:1 + chrX 20999573 3' - BS 72 1 72.73 AGTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTTCGTATTTTATGACTT:1 - chr3R 10931598 3' - 297 6612 2 60.96 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGG:3 - chr3R 29084894 3' + 412 424 2 63.01 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTGTTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATA:1 + chr2L 18549939 3' + roo 357 2 54.79 AACCCACACACACACACACACACACCATCGCACACGCACTAGCACACTAACACACTGGGGGGAAGAGATGAACACGTGCACAAACACCGCACACATACA:1 + chr3R 21811852 3' + accord 7099 2 72.73 GTACGGTTTCTGAAGACCTTCCTCAAGGGTCGCAAGTTTGCGGTGAAATTTGGTGAAGCCGTTCTAATCTCAAGCAGGAAGCGGGTGGAGACAGCTCGCATCCAAGCGGG:1 - chr2R 4932035 3' + G7 419 1 53.64 AATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACACTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTCTGAACACAGCTGTAGATATGTACGAAATACAAACAAATACGTCAATCTTAAACTCCAGAACTACTGACATTAA:1 + chr3R 5367028 3' + HB 1563 1 61.64 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATA:1 + chr2L 20840112 3' - mdg1 7060 2 69.18 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGG:1 + chr2R 6847866 3' - Doc 42 1 61.11 AATAGCAAAAGGAACATGGAGAAAAAGTAAATAGCGAATTATAACACACCAAAAATGCCCATAATTCTAGTTAAGTGCCCTTGCTCTGGGACATTTTTTCCGGCAATTTTAGACGGCAGCAGAGGTTTTAGCCATTAGCCATTAA:1 + chr3L 7618627 3' - micropia 5090 4 51.72 ATAATAATAATATTTATAATAATAATAATAATAACAATAATAATATTAATAGGACAACCAATAATAACTACCACAACAGCG:1 - chrX 11298094 3' + mdg1 7079 2 80.25 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGACAAGCTAGAT:1 - chr3R 27123497 3' - roo 80 2 71.23 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGTTTTTTATGCGTACCCAGTGTTT:1 + chrX 18409456 3' - jockey 4746 1 67.59 TAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTT:1 - chr2L 22966884 3' - 1360 3192 1 48.55 CATTAACAGCTGATATTATAATGGTGCGCTGTTAAATTAACTTTTGCGGGCTGAAACATAACAGTTTAGAGTATTTCCAATATATTAATACTAAAATACTGCACAAACAATAAATACAAATATAATGGAGATGAGAAGTTTTTCAG:1 + chrX 7061448 3' + hopper2 1465 1 68.49 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAATTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCCACTTTTTTTTTTAGACTGAAGAAAGGGAAC:1 - chr3L 13836584 3' + 412 7534 2 68.85 TATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGTAAAGAAGTGGACCCAAAGTGCAGCATCTCTTGTATTACTTAATGGCTACTG:1 + chr3L 20848980 3' - I-element 5263 1 54.95 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTAAGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTGCTATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATC:1 - chr2R 10417156 3' + 1360 3305 1 73.97 AAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCCTCCATCTCAGACATGTCTACGCCCACTCAGGTGCGAGGGGAATTGCTTCGGGCCATGT:1 + chr3R 30312436 3' + Transpac 5025 2 50.00 GTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGATTA:1 - 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chr3L 22531949 3' + Cr1a 4214 1 67.97 AATTAAAGTTATGCACATGTGTTCATTTGTGAAGCGAAATTGCATGCATTGTAATTTCTGCATTCCAAAAGCAAACTTCAAAGTAGCCCCCGGAAAAGCAACTTGGAGCTCTGTTTGTGTCATTTGGTCCACGAGAGATTTCCGCC:2 - chr3L 3500672 3' + Transib5 147 1 56.85 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCGAATTTGCTGTCAAAGTAATCCGAAAACGAAATCGAAAATGGCTCGCTTTAA:1 + chr2R 13931647 3' - P-element 23 1 66.40 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTA:1 + chrX 21224633 3' + roo 9026 1 55.65 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGGTCCTTCACTGCCTGTTCGCTACT:1 + chr3R 9298589 3' + hopper 1392 1 62.12 GCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGTATAGTCTCGAAAAACAAAGAGCCTAATTATTTGTTCATAGGGCGGGTAAAACTAAATG:1 + chr3L 16672287 3' - F-element 311 1 59.59 GGAACTATAAAAAGTAGAAGGTTGAGATAAGGCAGATTTAAGAGACACAGACGCAGCGCATTTTGACATGCCCACACTAACGAAACGACCACAAACCTCCCAGAAAATGTTTTGATATTTATGGGTCTGGTAAATTTCTATCGATT:1 + chr2L 21761880 3' + INE-1 157 1 56.16 TCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCC:1 - chr3R 3617307 3' + micropia 177 2 77.24 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTC:1 - chr3R 15942715 3' - hopper 54 1 62.90 TTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTA:1 + chr3R 18971787 3' - Juan 4044 1 51.46 ATTAATAAATAAGGTCAAGAATTGAGCATGCTTGCGACAAAAGAGAATAGGAGCTACTATACAAAATCGCAGGAAGAAAATTAATATATTCGGAAGAAGTTTTCTTTTCCGAAAGAGATGCATTTATTAGTTAATTTTCTTATTGT:1 + chr3L 21025629 3' - Gypsy12A_LTR 2124 1 67.81 ATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGTATGGTGGTCAGTTTTTATTAGATAATT:1 - chrX 8027365 3' + Juan 4208 1 74.48 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCTCTGGCTAACAGGAATTAAAT:1 - chr2R 10078116 3' - jockey 65 1 60.27 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTTGGTCAACTGTCTGGTTAACTCCATTCATAATT:1 + chr3R 20441378 3' - I-element 6 1 80.14 CTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTAAAGGAAATTGAAATCCTTCTTTGCACAAAATTGTTGACGTATTTACACACACTCCCACACACAGGCAGG:1 + chrX 20986143 3' - opus 294 2 75.49 TATAGATACACAAATAGATAAAAATATGTAACAACACCATCAGAGAGGCGACTTATTCTACGAACTGCCTCAAATTCTCACCCTTCTGCTGGAAAAATTAAGGAAAAATGTGGTTTAAATGGTAGTGTGCTTCGTCACTACTTAGT:1 - chr3R 5763383 3' + G3 4484 1 72.60 ATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCCCAAG:1 - chr3R 3617303 3' + micropia 5135 2 79.45 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACA:1 + chr2R 21410976 3' - Burdock 6190 2 54.79 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAA:1 + chr2R 23180278 3' + roo 8999 2 67.59 AACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTAT:1 - chr3L 20189597 3' + FB 207 1 47.95 ATATGAGTTTATTTTGTTTTATTGGAAGTGGGACTTGGATCTGCAAGATATCAGTAATTTTATTAAACAATTATACAAATATGTGAATCATCTTGACCAAATAAATTTTACAAAACTATGATTCCTGGGATTCATTTCACCATTC:1 - chr2L 2435312 3' + transib1 1895 1 50.34 ACCTATTTAAACCGAAGTTATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACT:1 - chr2R 9544852 3' + roo 343 2 66.92 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGT:1 + chr3L 18126005 3' - Ivk 49 1 48.97 CAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAACTGACAGTGGTTCTGGTGGCGGTGGTGGTGGTGTTGGTGTTGGTGTTGGTG:1 - chr3R 15657761 3' + I-element 368 1 58.54 ACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGCTATACATC:1 - chr3R 4679474 3' + hopper2 1525 1 73.61 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCATGTCCTATTCATGCT:1 - chr3R 27986326 3' + roo 9030 1 58.90 TGCATATATATATATTGATCACGAGCTACCATCCCAGCATAGCCCCGTCCCCCGCTCCCTAACAACAATCACATCTCACCTGACCAATTTATATATATATAGTGACGTATTAATAT:1 - chr3R 2472935 3' + accord 6935 2 43.97 ATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACGAGGAGCAGAGGAAAAGCGCGAGAGAGAATGGGGAAAATGGAAAAGATGCAGCCACAAAGGAAAACTTCTCGAAAATT:1 + chr2R 13260074 3' + mdg1 7085 2 54.79 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTAGGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCA:1 + chr2R 8735694 3' - mdg1 25 2 63.08 GTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCATCTTGTTATGACAGTTGGCACCAATTTCCGCACACGTTGCAGGTGGCCCATGGCCCGTGGGCGTTGG:1 - chrX 7987038 3' + jockey 487 1 76.60 GAGAAACTTAACTTTGTATTTTTGAATGAAAAGGTTATGATAGTATGAAATAGAGCCTTTGATTCCTCCAGTCGATTCTGCAATAATACGATTTTATTTTTGTTGGCGAATAATTAATAAAATGCCTTCAAGTGATACATCGTTTT:1 - chr2R 12624685 3' - X-element 177 1 74.66 GAAATATAAATTATAAATTACAACACAATCTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTCTACAATTCCGCTTTGTAGACTAGCCTGCATATTCC:1 + chr2L 14872782 3' + copia 252 1 33.56 TGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAAT:2 + chr3L 25008168 3' - X-element 74 1 56.85 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATA:1 - chr2R 14653155 3' - 297 48 2 57.53 CGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTAAGGCCTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGCTTTTAATTACACTATTCCAGTCATTAATTAAAAGGCAATCACAAAGACAGCCGTTG:1 - chr2L 20043323 3' - rooA 7442 2 60.96 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTTCTGAATATCTTACATATAAGTAT:1 + chrX 19588184 3' + roo 392 2 73.97 ATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTTTAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAATGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGA:1 - chr2L 4003698 3' - mdg1 7113 2 68.49 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGAT:1 + chr3R 16157387 3' - pogo 46 1 54.26 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCA:2 + chr3L 11326806 3' - pogo 29 1 59.59 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCTTTTCAAATTTGTA:3 - chrX 12986489 3' + roo 390 2 71.23 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATCTATGAATTTTATTAAGCACTAAAA:1 - chr2R 3338797 3' - Juan 53 1 61.11 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAA:1 - chr3L 14094549 3' + I-element 5335 1 62.96 CAACACACACACACACACACATTCACTTACACACACACAGCTGCTGTGGTTGTTGCACTCGTTTTTTGTTGTCGTCGATGCATTTGCATGCAACACTTTTTTGGGGG:1 + chr2L 12897057 3' + gypsy3 424 4 71.96 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATA:1 - chr2L 7660916 3' + I-element 5289 1 61.64 CAAGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAATGAGAGAAAGAAATGGGTGGG:1 - chr2R 18937263 3' + Doc2-element 219 1 77.40 AATAAAATTAATTTCTTTATTATAAAACATATCATTTATATGTTTTTATTGGTTTTTTATGTGTATTTTAAGTTTAACTTTAATTGGTTTCTTTTATATATGCACTAACAATGCATTTAAATAAATTGGCATTGCTTGCATAAATC:1 - chr2R 14123865 3' - TAHRE 62 1 69.18 TGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACAAAAAAGTCACAAAAATAGGGGACAAAATCCAGAAGATGGCCAAAAAAATCACACGAGAGACTGGATTTACACCCAACGCGGACCTTCGAATTGTTATAATGGTTATC:1 - chr3R 5732862 3' + BS 5074 1 69.86 GGGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATAATTAATTTTTATTTTATTATAATGTAATTTTAATGTAATGTAATGTAATAAAAGCAATAAAAGCTTTATGATGAAATTATTTCACT:1 + chr3L 24999029 3' + INE-1 572 1 60.96 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTTGCTAATCATGTGTT:3 + chr3L 18505792 3' - I-element 11 1 78.08 ATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGCCGGGGATGGTACTCAGGAATTTCGATCGGGATCGGTATGGGATCGGAGTTGGGTTGGGTTGGCTCGGAATGGAGTGGAGTGTGGATCGCTGGAGCCTGGG:1 + chr3R 29838627 3' - Fw2 3669 1 54.74 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTCTGACGAATGCAATTCCTTTA:1 - chr3R 11810615 3' - roo 8706 2 55.48 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTT:1 - chr2L 17809164 3' + jockey 4945 1 50.00 ACTATTNCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACC:1 - chr3R 11040073 3' + Bari1 1627 1 72.60 AAATGACGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAAATTATAATTATTTTTTTTTTGTTTTTGCTATTTTTGTTTTTGTGTTGTTTTTTTTTTTATAATATATATAATTTTATAAAATTGTATTTTGATTTGTTATTTATTTATTTGT:1 + chr3L 28057083 3' - Stalker 6813 3 69.86 CGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCA:1 - chr3R 19445922 3' + 1360 61 1 67.81 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGTTTA:1 + chr4 829134 3' + INE-1 156 1 72.41 TGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAACTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGATTCCGTGTCTAAAAAGCGCAATCCCTGATTCGCGAATGAGT:1 - chr4 853314 3' + 1360 66 1 70.55 AAATACAACTAATTTCGTTAGCCCACCTCTTCAAAATAAAAATTTCCAATAAAAATTGTGCGCCTGTGCCACAGGCAGAATGTAAAAGATGATCGCGATTGCAGGCAAAGAAATCCAAACAGATGAGGGTTTTGCGGGGGTAGAAT:1 + chr3L 51180 3' + FB 443 1 65.75 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTTCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCA:1 - chr2L 13556338 3' + transib2 2764 1 59.59 CCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGGATAACAGTGAAACCATCAGACGTCAGGACAACAGGACAAATTAGTAATTTACACGCAGACCAAATGCGAAATGCCACCCCGTCGACTGCCA:1 + chr3L 8036158 3' + G-element 4116 1 59.17 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATAGCTAAACACCTAAGATTATCTAATGTTTCAATGATAAACAGATTTCAGGCT:1 - chr3R 28928593 3' - jockey 4807 1 63.01 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAA:1 - chr3L 16970344 3' + roo 9033 1 56.74 CAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTTATACGCATGCATTATGCAAGGCATTGAACAAACAATAAACTATTATCAATCAGTTTTACAAGGGT:1 + chr2L 11297030 3' + I-element 5073 1 56.85 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGGGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATGGTAAATGGAATAA:1 + chrX 8092518 3' - pogo 31 1 61.64 ATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAA:2 + chr3R 11062856 3' + roo 9034 1 56.85 GTGGTCTTTTTGTATATATGTATATTTACATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGAATTATGTCTTCTGTACGATACATATAAAAGTAATATTA:1 + chr2R 25208381 3' - Stalker 100 4 70.55 GTGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGGATCTTGAGAAGTCCCAGCAGG:1 + chr3R 28901336 3' - transib2 45 1 53.10 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGATCAATTAGGGTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCA:1 + chrX 21216806 3' - roo 8737 2 65.75 TTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCC:1 - chr2L 15550673 3' - Bari1 74 1 65.75 ATAACAAATAAAATAAAATAAATACCCCTGCCTTTTAAACATTTAAAAAGTTTCTCTTTTTGAGTGTTACATTCTTATATACTTGTTCATTTATGTATTTGCAACTTATGCAAGTTTTGAGTTGAAATTTAAAATTCAAAATTCGT:2 - chr3L 15206230 3' - transib1 1902 1 48.63 ATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCAGTTATCGACCGCGACCCCACAAACATGAAATTGATGTATT:1 - chrX 6123142 3' + I-element 94 1 70.15 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATTAAAGA:1 - chr3L 18768443 3' - S-element 77 1 72.60 ATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGTG:1 + chrX 21087698 3' + mdg3 5486 2 69.11 CGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTGGTTTTTCTCGCGCAACCCAAGGGACAAGGCAGCACTCAACAGAGCCATCAAGGAACTCAAGGACAAGC:1 + chr3L 849053 3' - G2 2649 1 67.54 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGGCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATTTTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCG:1 + chr2L 20118464 3' - S-element 75 1 76.87 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATACGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCC:1 + chr3R 9002994 3' - roo 8737 2 73.57 CAATTAAAATTCAATTAAAATTCAATAACAATTTCAGCACCGAACAGTTACGAAGAGACCTTCGAACTAGATCCC:1 - chrX 14149834 3' - Rt1b 124 1 53.33 GGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGAAATAACTTAAAATTACAAAAAATTTTAAGAAGACGCCTTTGAATTCGCTAGTTCAGTAGCAATCCGTAGCCGGCGACAGCAACAACAAGCCCAAACAGAACCATTAGTCGACC:1 - chr3L 3301081 3' + rover 487 1 56.16 GTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAAGGTAAGTTGAGCTAGAAAGTAAACTCGGAATAGGGTTTCAATGGTTG:1 - chr3R 6677085 3' + Transpac 457 1 68.49 CTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACATTGATTGGATATTGATGAAATATTAAAATAAAATGAATGAAGATAGAAAGTGTTATGTAAAATGTAAAG:1 - chr2R 1369873 3' + copia 5019 2 53.47 AACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAAC:1 - chr3R 4160061 3' + invader2 192 2 55.48 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTAT:1 - chr3R 29084854 3' + 412 7532 2 69.47 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAA:1 + chr2R 21160775 3' - Transpac 4966 2 50.34 TTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCACCAATAAATTTAAAGAGGCGCGTCCCGACGAAGAAAATAGCGATTTAATAGGCGACACCTTGGCAAATGCATGGAACAGCTTCGCAGACGAGTTAAAACATCGGGA:1 + chr2R 5238356 3' - hopper 367 1 61.11 GGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTTATATAATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATAATAATCCAACTTTACAGGCAGGTAATAAACTAATATTTGCCTGCCACCAAAAATTAACGATAATA:1 - chrX 23431473 3' - G6 16 1 74.66 TAGGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAAAATCAATCAATGCTTAATAATTAATAACAATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATGAACCTGCCGGTGGCCAGTATCAATATGGCCAAGATGTGT:1 - chr3L 21439096 3' - gypsy12 9810 2 72.22 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTTGGTCAACT:1 + chr3R 20441354 3' - I-element 30 1 63.70 TTTTTATTTTATTTTATTTTATCACCAGCTTCAGCCACTAGATCGGTATTCTCAGAGTGGAAAAGTTGGACTAAAAGACTCATTCTCCCTTAACTTTGCACATTCCAAGAAATTGGGAATTCATTTTTTTATATTAAAAATAAAAT:1 + chr3L 18396780 3' + transib1 1900 1 67.12 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCA:2 - chrX 19074718 3' - mdg1 14 2 71.92 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATTACTCGATGTCGCCAACAACTTTATCAGACTTT:1 + chr3L 4219555 3' + jockey 4949 1 55.63 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATGGAACCGCTCTCAATATGGGTTT:1 - chrX 21216709 3' + roo 9036 1 54.26 ATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATTTATGATGCA:1 - chr3L 11257269 3' - 1360 14 1 76.03 GTGCTAGATCTCCCTGACAGGTATTAAGGTTATGCATAGAGCATGTAGTAGGGATTAATGGATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGAACTTACTACTTGTTTTATACTTTCCTTTGCTTAGATTTTGGAACCCAAAAGTTG:1 - chrX 5841335 3' + G4 3702 1 47.89 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCACGTTTAAAAAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGATTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTAT:1 - chr3R 15054175 3' - copia 4895 2 63.70 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGGGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTCCCCTTTTT:1 - chrX 4341224 3' + roo 400 1 72.87 TTTAATTTAGTTAATGTCTAATTTCCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTCAAACTTATGGCTGATTTGATTTGCGCGATTGTCACGTTTTTGTTTTGATTATTTAATGCCATAAGAGACAACTTAAAGTCACGGTAGAAAGTTTG:1 + chr2R 25138567 3' - I-element 5243 1 66.44 TAAATANAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGT:1 + chr3R 29690779 3' + I-element 5283 1 67.81 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTATCACTTGTTACGGACTACCAAAGAATCAATCGTTTTCTTTTTTTGTGTATATGTATGTACTATTCCCTTTTGCAC:1 + chr4 303836 3' + pogo 2068 1 61.87 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCT:1 + chr3L 23906458 3' - 1360 79 1 71.23 ATACATAATTATTATTATTATTTATAAATCCAAAATTACTTGTTGTAAAGTCATGCTCGATTATTCATAGATTGCGACCTATTGTTTCGACCCCTGCTGTGGGCCACAAAATGGCACAGGAACAGGGGCAGAAAGTCATTTATGAG:1 - chr2R 9738284 3' - invader6 4391 1 56.85 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCG:1 + chrX 7795622 3' + roo 9052 2 64.04 AGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAATTTGGACCATAGTATATGCGTAGGCAAGGGGAACGATGGCAAACGGCA:1 - chr2L 15563408 3' + Quasimodo 7247 2 67.12 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACACTTAATTCGGTGGACATATTAAAAATTAT:1 + chr3R 19408017 3' + diver 180 2 49.32 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGT:3 - chr2L 22193441 3' - roo 8750 2 77.40 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAATTTTTAATACAATA:1 + chr3L 14366653 3' - roo 39 2 61.64 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCACAGATTTCCTTTATATCTAAGCAATAATTAAATCTGAAATCTT:1 - chr3L 21110267 3' - 297 58 2 70.00 GATTCCAGCCTTTGAACCACGACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCTTATGCAACCGATCACCTCCACCTTGGATGTCTGCCGCCCCCTTTTATGCTCCCTGAATGACATTTTTGCCTGATTTTTCAGCTACTTTTGG:2 + chr3L 5287310 3' + BS3 108 1 51.37 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTA:1 - chr3L 1692036 3' - blood 7089 2 72.60 ATGCTAACAAGAGTCGCGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACACAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCAACTATCAGATTTAATCTTCAAAAAAATATAAATACAACCACCCAAATGAGCACGCGAAGACAGACCAGTCCTCTGAGG:1 - chrX 17202486 3' + mariner2 704 1 71.92 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACAT:1 + chr2R 8099255 3' + jockey 4971 1 62.32 AAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGGGACATTTTTCAAAACT:1 + chr2R 4659353 3' - S-element 1498 1 53.52 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGCCTCACTGTGCGA:1 - chr2R 2590676 3' + HMS-Beagle 211 4 60.27 GTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTCACAATTTCTGCTGAGGCCAGCTGCAATT:1 + chr2L 17380943 3' - gtwin 7383 2 78.77 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCTTATTT:2 + chr3R 9039061 3' + Juan 4197 1 72.60 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTTTAAGCAGACCGAATTCAA:2 - chr2R 330078 3' + HMS-Beagle2 287 2 68.49 AACAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACACAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAAACCAATGCGGAATAATCTTAATGCTGCTATTGATTATCATAAAAGTCAAGAT:1 + chr2L 18418127 3' + HMS-Beagle2 489 2 67.12 GTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCTGATTGTCCGTTCCATGTGATCGGTGGTAGGGTCCCTTGTAGCTGAAATTCAAGAGGGATAAAATAA:1 + chrX 752239 3' - I-element 4983 1 54.11 TTTGTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCG:1 - chr2R 12472045 3' + transib2 2738 1 75.34 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAG:1 - chr2L 19923966 3' - roo 73 2 76.15 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATAATAAATATATTATTTGATCATA:1 + chrX 14310364 3' + roo 396 1 60.27 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGT:1 - chr3R 9002926 3' + roo 8996 2 67.81 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCT:1 - chr2R 8735571 3' + mdg1 362 2 61.64 GACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 10365211 3' - micropia 13 2 73.79 TTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACAATGAAATTTACATA:1 + chr3L 18768524 3' - S-element 68 1 69.86 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCCAAATGCTCGACGACTGCGATCGATAGTAGCGCGGACGATGACGATAACGATAAGTGATAGCCAAGTGGCTCGACAACGATCGTTTCGG:1 + chr3L 17055565 3' + Tirant 372 2 65.28 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCT:1 + chr3R 15364045 3' + flea 222 2 63.70 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTATCACCTGGCCTGTCCCCTTACCATTAATCGACAGCGTCTTGATGAAGTGCTTGGCT:1 - chr2R 13931533 3' + P-element 2825 1 43.84 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTGACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAA:1 - chr3L 2145881 3' - roo 52 2 59.59 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTAT:1 - chr3R 5768978 3' + roo 9042 1 65.07 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGTAAACGTGATTTTTGTGTGCTTTTGAG:1 - chr2R 5941324 3' + copia 226 1 54.55 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATAC:1 + chr3R 13406521 3' - pogo 57 1 57.53 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACT:1 - chrX 18817276 3' + transib2 2764 1 58.22 AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGTCGGCCTCCTGCTTCTATTTTGTTACC:1 + chrX 21947764 3' - mdg1 7069 2 63.97 ATAATAATAATAATATTAACTATAGTAATAATGCTAGTTATTATAGTAAAATAAATATTTCATCATTTCTAGTGATAGATAGTTTTAAATGTTACCGTTTTATTATTAAAAAAAAACTATTTTCAACTAGTGTAAGCTTTCTTTTT:2 + chrX 18478644 3' + mdg1 38 2 54.11 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGNGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGATAGGCAAGCCTATACCAAACACGTAAGTTAACATAT:1 + chr2R 15005159 3' - BS 5010 1 60.27 AGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATAACCATGCCTCTAACCAGATACCACAAAAAGGAAATCCCCCAAAATTGTTCACCAAATAATCACAACACGCAATCAATCCGTTTCGGAACAAATGCATATTCGATCAAAATCAATTTCAGGTC:1 - chr2R 25058769 3' - I-element 5089 1 56.16 ATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATAGGAGCCTGTGTCTGTCAGTATTTCGAATAAGCTGTCACAGACCCACACACCGTGCAGTCTATGTGTTA:1 - chr3R 20403953 3' - I-element 4981 1 50.71 ATTAATATAAGTTATATAATATAATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAAAAGAATTCGTAGACAACCCAATACAAAACGATTCAACATTCCATGCTGGCTCAGTAGGCGGTAGTATTCTG:1 - chr2L 22558161 3' + Doc2-element 4695 1 55.47 ATAAAATATAATATTAATTACTAAGACCATATATCTATATAATATCTATAGATATTACTAAGACCCATAATCGTGGCTTATTCCATTCGGAAGCCAAACATTTAGCTGCCCAAATTCCCCTTGAGCTTCCGCCAATAAGCGCTCTT:1 - chr3L 10743207 3' + Burdock 408 1 53.42 AACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAA:1 - chr3R 4160062 3' + invader2 192 2 55.86 AATAAGTGGAATTAAAAGTCGATGCCGAAAAGGAATACCTTTGTATTGTACCTTAGTTTCCCTCGCACTGATATTTTTATGAACTCAGCTAATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTGCATCATTTTTATCTAATCAAGCATACCC:1 + chr2R 5740032 3' - HB 82 1 53.85 CGAGAATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGAACGATAAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAAACAAATAGTGAGAAATCAAACCCTATCCAAATCGCGAACCAAAATAAAAACACAAACCTTATCTAAGCTACGAACCGACA:1 - chr3R 3374261 3' - rover 166 2 56.85 GCATTCCCTTTTCATTATATAATTTTCCCTTTCTAACCAAGCGGCGCAAGTGGCCACTCGAGAGAAAAGCACACATGACGCCAATTCTTCGGATCGAGAAACGGCCGAAAATTGTCAAGGTTGGCTAGGCCCTTTTATGAAGGTCT:1 - chrX 17345361 3' - micropia 5246 2 64.38 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGT:1 - chr3L 18281856 3' - Doc 64 1 62.33 AAAGAACGGAAAAATAACGGTATGTATGTATGTATGTATTTGTCGAGTTGAAGTGCTGCCACAAGAAGGAAAGTTACCAAACATTTTTGC:1 + chr3L 23249304 3' - rover 7086 2 78.89 TTATTATATACGTCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATTTCATCTAACCTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGCTAAAAACAGTGCAGTATTTGCAATTTAATATACCCATCAATTGCATGCCGCAAGGGAAC:1 + chr2L 5266267 3' - Rt1a 5058 1 53.42 AGTGGATTAAAAAATGTTTTAAAAAAATATTCAAATAACCCTTGCTTTTCTTTAATTTCATAGTTATGGAGAATACTTCTTTACAGTTCCTGTGCACCATAAACTATCTGCGAATCGTTCATCTTTTGCTGCCATACTTTTATTTT:1 + chr2L 15351068 3' - Juan 3787 1 69.18 ATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGC:1 + chrX 21994030 3' - McClintock 24 2 68.49 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGA:1 - chr3R 9298456 3' - hopper 29 1 59.02 AGGCAGAGAAATAAACGGTCCACCTGGGCAGAGATCCGCAGTACCCGGGCTACTCCGTTAGCGACTGGGCTAGTTGTTTCCCGGGACCTCAGCCTGGCAGACTTACGGATACAGGGCAAGATGTAAAGTAACATTTTGGAGGG:1 + chr2R 9576685 3' - baggins 364 1 35.66 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGA:2 + chr3R 13973039 3' + 412 421 2 65.75 ACATACATATTATATATATATTTTATATTTATATATTAATAACAACTCAAGTTTTAATCCTTAACACAACTTGAAAGAAGTAATGCCCAAACATCTAATTTGCATAAGTTGAGTAATTTCCTGCACAGAAAACTCGAAACAA:1 - chr2R 14793274 3' - Dm88 8 2 73.94 ATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTGGTTGGCCAGTAAACTGAGCCGAGCTCAGGCGAATGATAAATGGCTGACATTGTGGATTGTAGGCAACATTAAGCGTCGTTGAAGCG:1 + chrX 4869877 3' + invader1 274 2 79.53 CTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCATTTGCACCTAATAATTTGTTAAGTCTAGAATTTGTTCTTCATATGCACATAAAGACTC:1 - chr2L 16539745 3' + Quasimodo 441 2 63.01 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGGGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATACGATTTGACCATGACTCAGTTT:1 - chr3R 27133517 3' - opus 7115 2 82.88 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATAT:1 + chr3R 17077206 3' - roo 8717 2 56.16 ATTATTATAATTATTATTATTATAATTATAATCTTTTTAAGTTCCTCATCAACAACGTCTAGTTTCCCGGTTTCTATGGCGTTAAGCCAC:1 - chr2R 5351115 3' - mdg1 7068 9 64.44 ATAATAATAAAAAAAAATAAAATAATTTTTAAAATAAATAGAAAAGCTTTTACATTTCCAAATGTCAACACATATGGAATTACCTTTGAAACGATGAGAAATTTTGTGCAAAATATATACATAGATTTTTTTAATAATTCCATCTG:2 + chr3L 17652979 3' + Rt1a 5073 1 82.19 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTC:1 + chrX 10521743 3' + Tabor 7282 2 52.14 ATATGTATGTATATGGAAATGTATATTTATATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGG:1 + chrY 2720359 3' - ZAM 8151 2 56.85 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGATTGCAGCCCAAGAAGCATAAAAT:1 + chr3R 27133701 3' + opus 474 2 67.81 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATT:1 - chr2L 22674745 3' - mdg1 7053 2 74.81 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCATTAATTTTTAATACAATACCTTAAAAT:1 + chr3L 14366662 3' - roo 8677 2 75.19 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCTGCCGC:1 + chr2L 12822874 3' + P-element 2876 1 63.83 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCTTAA:1 - chr3R 17673705 3' - FB 21 1 71.92 CCCTGGTGGGAGTATCGTGGTAGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTTTAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAAACCAAAATCAGCGATCTTCAATTTCATTTGCTGGTC:1 + chr3R 11347738 3' + R1A1-element 4987 1 70.55 GTGGACGTGTGTAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGTATATTCCTTTTTAATTTCAAATTATAACGTACATTTTACTGTTTTGTTTGGGTATTTCTTCTGTATTCATAAAGCTTTTCTGTTTGCACTTTTCCGTTTCTGCTGTTTTCCCT:1 - chr2L 17561867 3' + invader5 3659 1 73.97 TTGGGATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATTTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCT:1 + chrX 18336647 3' - mdg3 5347 2 77.40 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGTGTTG:1 + chr3R 11191482 3' - roo 8735 2 68.28 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATT:4 + chr3L 3501824 3' + Bari1 1652 1 56.16 AAAATGTATTATTAAAAGAAAAAAAATATTACTCTTAATTTCTTTACTTTAAAAAATAGCAGTAATTTAATACCAAAATCTTGAGCGCTTTTAACGCATAAACGAAGAATTTACCCAAATCGTT:1 + chrX 18016132 3' - hopper 162 1 75.00 CATATTATGCTACTTCCCTCCCCTTAAAAGGAAGCTTATGCTTCTATTGGGGTTAACACAAAAATAAACAGAGCAGCATAAAAAACCAAA:1 - chr3R 17320162 3' - rover 6944 1 60.00 AATTGAAATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAACGAAAAAGAATAAACGAAAGAAAACCAACAGAGAAAATAAAGAACCTAAGCCCCAAACCAAAGGCCATAAATAAGCCG:1 + chr3L 18221558 3' + invader2 436 1 55.48 GTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATT:1 - chr2L 22966885 3' - 1360 3201 1 52.05 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACAC:1 + chr2R 11164486 3' - roo 8744 2 76.71 AAACAAAAAAAAAAACAACAAGACAGCGTTCTTCCGTCTCGTTTCTTTGTCTTCGCTTTTCCTTTCATC:1 + chrX 3273248 3' + gypsy7 5013 2 69.57 AATTATTTGTGTATCAACTGCGGTGGTGATCATGCTGTAACTGACAAAAACTGTCCTGTCAGAATTGGAAATAACCCAACGCTTTATATGCATAAATATGATGTTGATTTTTATGATTTCTATAATGTTTCATTATGCTGCGTTTT:1 + chr2L 3937570 3' + jockey2 439 1 54.11 ATAGCGAAAAAATACAACGACTAATATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCTAGCCATCGGCTGAAAAAATGGATGCAGTCGATTTGCCTCA:1 + chr3L 10213030 3' + jockey2 3072 1 68.81 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCA:1 - chr2R 20010205 3' + Juan 4144 1 66.44 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTT:1 + chr2L 19924053 3' + roo 9029 1 47.86 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTAGTTTTAATTAAACTTTTGT:1 + chr2L 71303 3' - 412 7082 2 65.75 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACACTGAAGACCTTTAAGCGGCGACATAACA:1 - chr2L 12984084 3' + hopper 1391 1 65.75 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAATCACACA:1 - chr3L 10373793 3' + 297 6941 2 63.01 AAGCACTTGAGGCTAACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCCGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGG:1 + chr2R 6964875 3' - Burdock 31 2 53.45 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGTGTTGGCCACATT:1 + chr3R 11191490 3' - roo 8725 2 62.24 AGCCAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAA:2 - chr2L 22121339 3' + I-element 5305 1 67.12 TTTTTTTTTTATATTTTTTAGCGGTATTTGTTTGTTAGAATTTATACAATATACAAGAAAAGAATTTCCATTTTAAATTGCTGACTTGTGTTCCATGGCATAGAGATAGAGACAATCCCTAGATTCTTCTATTTTTCTTCTATCGA:2 + chrX 17222568 3' - G-element 4325 1 55.48 AATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGAGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACG:1 - chr3R 11040041 3' + Bari1 1661 1 53.47 AAAGTAGAGTTAATTTGTATGTTAAATTAGTAATGAGTTGTGCTATTATACACAATTTTAGACCAATACCAAGACCATGTTCGATACTAACTGAAACATCACTCTTTTTCCAAAGGTTCGCATCGCGATGAACA:1 + chr2R 19172709 3' + Stalker3T 59 1 57.46 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAACAGTAATAATAGTAATAATATAGTTATCGTTTTTTGATTGTATGTATCGGGTAGAAGGGAAAG:1 - chr4 550477 3' + mdg1 29 8 76.15 GGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGCGTCCGATTTTTAGTGAACTAGAACAATACAAGTGTG:1 + chr2R 17592962 3' + roo 8784 2 76.71 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAG:1 + chr3L 22325886 3' - hobo 77 1 69.18 AAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTG:1 - chr2L 23008388 3' - transib2 280 1 75.56 CAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTTAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGAACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAATCCTTATAACAATGCGTTGAAAAAAGTAGCAATTATTGATTTCCGGTCACGCTTTTGCT:1 - chr2R 6004448 3' + Tc1 1243 1 58.22 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCATGGAGAGCCACT:1 + chr2R 12472140 3' + transib2 2782 1 56.85 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTGCCGGGCTAAGCCT:2 - chr3R 11186497 3' + BS 5072 1 69.18 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGCCGGCGATCGAATGTTCGAAAAATCGAACCAAACATAACGGTAG:1 - chr2R 1907243 3' - F-element 71 1 96.36 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTAT:1 + chr2L 6654740 3' + diver 156 2 63.45 GTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAATAAAAAAAAAAAGGAAAAATATAATGGCATCAGCGAATTGACGACAACAAAATCTGATATGAAATTTAATTAAGGTTGAAAATCTGTTGTTTA:1 + chrX 5155708 3' + Rt1a 5033 1 60.27 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCA:1 - chr3R 4682873 3' - Burdock 6163 2 60.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACGCGAAT:1 - chr3L 5532898 3' + roo 9042 1 62.76 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAG:4 + chrX 21100281 3' - mdg1 37 2 60.96 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATAT:1 - chrX 3797449 3' + 297 6924 2 69.66 AAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTGT:1 + chr2L 5460086 3' + Dm88 26 2 40.14 ATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATAAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCGTGATTTGCCATGGT:1 + chrX 15200957 3' + 17.6 7378 2 56.85 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAAC:1 - chr3L 16690909 3' + I-element 5288 1 66.44 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTT:2 + chr2L 16946136 3' + hopper 1359 1 53.42 ATAGTGTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGTGCGTGTGCGTATGTGTGTCGGCCACAAAAATGTTTCGAGCTGTCTTTCTCAAATCGATTCTTCGGGGAACTATTTGTTACGATTTGCGTTAGCATGCGGAATGGAAATGGACAGGA:1 - chr2L 2071804 3' - hobo 88 1 75.34 AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAATCGAAA:1 - chr3L 24934249 3' - HMS-Beagle2 13 2 76.71 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCG:1 - chr3L 6447053 3' - transib2 34 1 67.42 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTGGAAGTGCGGGCAAATGTTTGAGCTTTGAACTT:1 + chr3L 18125997 3' - Ivk 40 1 48.44 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCCTTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACCGACTACCGAGTGCCG:1 - chr3R 11469273 3' - Tabor 30 2 64.38 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCG:1 + chrX 20999613 3' - BS 35 1 55.48 GAAATGAATATAATGTAAAAAACCTATATTAAATATTACGCGCCAATGACATCACATACTAAAATGAGCATTTCAATAAATCAACGAGCCAATTAAACCATTTGACTGCACTTTACGCATCGCAAAAGGAGGAC:1 + chr2L 13334818 3' - Cr1a 4324 1 76.12 AAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCTGCTCGATTTGTACGTTGGTCTTTTTTGAATTAATTGTATTATTTG:1 + chr2L 15940320 3' + Doc 162 1 69.18 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGTTCTCTGTGTCCTTAACGCTGGTGAAACCTGTTGTCGAGGATTAAA:1 - chr2L 18013894 3' - opus 7053 4 68.49 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAA:1 - chr3R 24450394 3' - 412 7086 2 59.72 CCTAAANATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTC:1 + chrX 21216803 3' - roo 76 2 71.23 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCCCTGCGTTTTTTTCTTCTTTTTTTTCCACCCTCTACGCACTAAACACG:1 - chrX 14723077 3' - diver 5905 2 40.58 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAAC:1 + chr3R 19032709 3' + roo 358 2 54.79 ATGCTTAAATCAAAAGAAAATAAAAACATCTTTATTTAAATTGAAAACTGAAATCAAGTTCAAAATGGATGATATCCATTTACCGAGCAGTACCAATATTATTTTCCTTTTTTGTTTCCAATACTTTTTGC:1 - chr3L 18235344 3' - Bari1 1534 1 79.39 AGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACT:1 - chrX 14722107 3' + diver 166 2 56.94 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAA:1 - chr3L 5532938 3' + roo 337 2 69.18 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAAC:1 + chr2R 23780627 3' - Ivk 47 1 52.05 TCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAA:1 - chr2L 14074454 3' + 297 326 2 67.81 AGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGGGGCGGAGCCAAAAACCGCATCTCCACCATTCTTTGCCACTC:1 + chr3L 11826492 3' + INE-1 156 1 72.46 AATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTTGTAA:1 - chr3R 904895 3' - rover 4 2 70.55 AAACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACAAGTTGGAGAAGCTGAAAGTGGATCTGAAGAAGTATCAGGGCTTCTTGGAGAAGGCCA:1 - chr3L 4325134 3' - R1A1-element 114 1 54.55 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTTGGAACTGTATATATTAGATAACCCCTAGACAA:1 - chr2L 12818245 3' + hobo 2880 1 60.90 ACAAAAAGAAAAAAAAAAACAAACAAAAACAAAAGCAACCAAACAAACAGGATATATCGAACAAAATGAAAGTCGAGTCAAGGTAAATGGGGGAAAAAAATTGGTTTCATTTTTTTTTGGTTTTTTTTTT:1 + chrX 18580435 3' + gypsy7 5009 1 60.00 AAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGATTCTGATTCCATATGGAGTTCCTGTTCTGATAATTGCGATATGGTCTTTGATAGCCTGTAGAGTCTCCCAGATAGAAATTACCTGCCCTGAATGGGT:1 + chr2R 5037682 3' - I-element 5099 1 70.55 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAAT:1 - chr3L 26505845 3' - copia 37 2 60.27 ATTAATTTTTTTTTTCATTTTATTAATTATATTTTTCATTAGATAAAATTAAAATTTTTAAAAAAATTTACACTTGTTTTCGTATGAAGGGCTTTAATTAAAACAACAGTCGTTCGTTTTTTTCATTTCCTTTTTCCATTTCAATT:1 + chr3L 14182729 3' + INE-1 472 1 53.42 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATA:1 - chr2L 13158642 3' + roo 344 2 61.64 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTC:1 + chr2L 3234042 3' + roo 334 2 67.81 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCCCACCCGAAAAAAACACAATGAAATTTGCAACCGCGACAGGCATTTTGA:1 + chrX 585739 3' - Tirant 8111 2 62.37 TTATAAAAATAAAAAAAATTAAATATAAAAATTTCTTTGTAGAAATCTTATTTTACTAGTTTTACTTTTAACCATTGTACACGCAATCATACTTATTCTGTTTTGGTCAAATACGAAATATAATTGCGCTTAATTAGTATATTTCC:1 - chr3R 14694134 3' + transib4 2578 2 73.29 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATCCATTCAGAATT:1 + chr3R 15807469 3' - FB 38 1 59.59 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCA:1 - chr3L 14366529 3' + roo 348 2 61.64 TGTAGTACAGCATTTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAATTATTTGCTTATTCGATCAGTTACATGCGGTTGACCAAAATTTCAATTAATTTT:1 + chr3L 9554664 3' - Doc3-element 126 1 65.62 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAAC:2 + chr3L 7889632 3' + roo 8984 2 78.08 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCTAATGAAGTTTAAGCGCAACTA:1 + chr3L 5881716 3' + pogo 2077 1 69.18 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTC:3 - chr2R 5151207 3' + roo 9026 1 52.74 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGCCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAACATCTGTTCAATTTTCAGGATGGATTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCT:1 + chr2R 5479986 3' - F-element 69 1 58.21 AGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTTATTGTAGTTAAATTTATTACAGGGAAT:1 + chr3R 27083132 3' - jockey 4584 1 54.11 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCTCGCCCAGAGTTC:1 - chr3L 17940071 3' - 1360 49 1 53.42 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTACTC:1 - chr2R 24169945 3' - transib2 36 1 41.78 AAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGGACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTA:1 - chrX 3431868 3' - Ivk 5361 1 51.80 AAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTC:1 - chr3L 24565350 3' - hopper 3 2 54.63 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATA:1 - chr3R 4461024 3' - blood 7077 2 65.07 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATG:1 - chr2L 17180091 3' + Juan 4136 1 68.49 TGTATATATGTATATTTATATATACATATTAAGGGCTCCGCGTGTTGGTAATTAGAGTTCTTAATCATTATTATAGTTCATTATAGTTCTTATTATTATTATAAAAAAAAATTACATTTTAAGCATGAATCGTTTCTTGTTCACTT:2 - chr2R 18858167 3' - Stalker4 90 4 31.51 GCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCTCTCTTCCGCCTTGTTTTTGTGTATTTTTTGTGCAATGTTTGCCAATGGCTGTTCTCGAGACATGGATTTGATGGCTTCGATGCTTTTC:1 - chr3L 20746295 3' + Gypsy12A_LTR 2027 1 68.35 GTATGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGNGTCTTCCCTGGGGGATTTACGTGGTGAAGTGAGCGAAGTTAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAGATAAAAGTCAATAATTTTTTTTTATATTTTATTAAATTTATTG:1 + chr2L 13233648 3' - transib4 2385 1 69.66 GAGCTTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAAAGGTTCAAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTAAGCACAAGACAACGGCACGAGCGTGCTTTGTGATTGCTAGTGTGTGTGAGCGGGAATGATGCGATGGAATAA:1 - chr2R 24232829 3' - 297 6776 2 52.05 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACA:1 - chr2L 15936757 3' + copia 236 1 52.05 GTGTAATCGTGTCCGCGGATTGACGTACCCTACCGATGACCACCAATCCGCAGACTGTGCCAATTTCCAGCGACCAGCGGCCAGCCGATCAGCCGGCCACACACTCCATTAATCACGGCCAGCCG:1 - chr3R 31468012 3' - Gypsy12A_LTR 1972 1 58.40 AAATGTTTCAGTTTTATTTGTTCAATAGTTTCGAAAATACACATTACACAAATTAAAATGAAATAATTTGTGGGCGTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAAT:1 - chrX 22689425 3' - HB 1497 1 77.08 AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAACTCTACATGTAGTTATGTTAGGTTTGGATTCTGCGGGAAAAACAACGGCTTTATAC:1 - chr4 179152 3' - 1360 372 1 61.38 ATTTTCCATTTTTTTTTTATTTTGTGTTATTTATACCTATTTCTTTTGCGCTGTTCCATGTCCTTCCAGAGTTTTCCAAGTGCCTACAAGGATTGGGGCAAATAAAAAAAAATAACGAACAGTCCGCTCGACTCAATTTACAAAA:1 - chrX 8293187 3' - Doc2-element 247 1 79.31 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAAT:3 - chr2R 5151201 3' + roo 9032 1 56.85 TAATCAAAAGTAAAAAAAAAAACAATACTGTAGTATCCTCGAGTGACAGAAAGATATGGTTCATACTTATGCATATCTTTCCGCATAAAAGCAGCACATTGATTGCCTAGACCATTTAATTATAATACAATT:1 + chr3L 25397056 3' + Doc 4693 1 75.00 CAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGGACGAAAACATTTATTGCCAGACTTATGTTATTTCTGTACAATAACAGGATTAGCAAAACATATGATGCGATTCAAATTGGAGTGAGAGTAGGCAGCTTTCA:1 + chr3L 6465301 3' - 17.6 7399 2 72.60 GATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTACTTTTTATGATTTGATTGTGTGTAAAATTAGTATTCTTTTTTGAGCAACAATTC:1 + chrX 14771859 3' + BS 5080 1 72.60 ATTAGCATTAATGAAATGAACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATC:1 + chr3R 10270645 3' + Juan 4172 1 52.78 AACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACTATCTGAAAGCATGCAAATACAGAACTTCACATCCCTAAGAATAATAGG:1 + chr2R 5582009 3' - Cr1a 453 1 66.25 ATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTGTGCTCTCCAGCTGTGAAGGATTTAAGATTGGCTTACTCAAACGTATGATCATGTATTCGT:1 + chr3R 17533228 3' - I-element 5189 1 60.27 AACACACACACACACACAGATGCAGGCAGCGCGGAATGGCGCGAAAAGTGTTGCGCCATCTTAATGCGTGCCCAAAACCGCAATACATGGCCGCAGATTCTTCCTCTGATAAGAAGCAGCAGCATTAGCC:1 - chr3R 20898865 3' + accord 184 3 73.08 AAATAAACATATAAAATAAAAGTGGTATAATAATAAGGAAATTAAATACGTAAACATTTTACATAAAATAAAGACAATATGGGATTTAAGAAACAAAGTGTTAAATAATTTCATATATGCTTTTTAGGCTTACAATAACTGGATGC:2 - chr2R 20431654 3' + HeT-A 314 1 46.58 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGA:1 + chr2R 5151357 3' - roo 8691 2 64.38 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACAC:1 - chr3R 15072550 3' - pogo 39 1 52.63 ATAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATCGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGATGCACAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' + 1360 3098 1 54.79 ATTTTAAAGATAGTTTTAAAAATAATCTATATATCTTTAGAATTTTTACCTCTAGCAAAGCTATCTATTATCCTTAAAATCTATGTAATCAAGCATTTTCCCACGATTTATGCTCTTTAGCTGGGCAAAATGCACGCCGTTTGCAT:1 + chr2L 12075980 3' + pogo 1887 1 60.96 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACA:1 - chr2L 14874149 3' + copia 244 1 45.89 CATTCACACACACACACACACACACCCACCCAGCAGAGATGTTAATATATATAAAACTGTGTATTCTCTATATATATTTTGATAGCGTAGCCCAACCGGAGGGGGGCCTCATGTACACTCAG:1 + chr2R 17371735 3' + accord 7026 2 77.87 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATT:1 - chr2R 9870989 3' + roo 9054 2 73.29 TATAATAATAATAATAAGAACATAGAGAGCACAATTTTGACTTGGCTGAAAACCCGCCTGCATCTGTTCCCCTTTCTTCCCACGATGGGGTTATTTAAAG:1 + chr3L 12929323 3' + mdg1 7054 2 75.00 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTATTTCCTGAGAAATTGTTCTCACAC:2 - chr3R 29084831 3' + 412 7540 2 76.71 GCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGATACACAAAAGAGAACAGGAACCAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAAAGAAAATACAAATTGATCAAAGAAGTCCATACCTGTAAATGTAAATA:1 + chr3R 24817354 3' - Cr1a 4377 1 67.81 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGTCCGCAAGACT:1 + chr3L 3983875 3' + P-element 2804 1 28.08 TACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTATAGC:1 + chrX 22460190 3' + HB 1540 1 78.77 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTCACAGACATTTGTTCATAAATTAATTTTT:2 + chr3L 16470382 3' - 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I-element 33 1 63.01 CGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATTCCATATTTTTCAGGGTTAAAAGTGCGGAATTCGAGGGAGTGACTTATTAGAGTAAGCTCCATATGTGTAGATAAATTACATAAGGTGG:1 - chr2L 1404105 3' - mdg3 128 2 61.64 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTGTAAGTAT:1 + chr2L 21328281 3' - 297 6619 2 60.96 AATAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATA:1 - chr2R 15326793 3' + copia 242 1 75.34 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCA:1 - chr3R 15942695 3' - hopper 56 1 54.11 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAA:1 + chr2L 4123967 3' + transib2 2778 1 51.37 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACAA:1 - chr3L 12004217 3' + P-element 2850 1 61.64 ATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTAT:1 + chr3L 16973461 3' - S-element 64 1 65.07 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCACTTACCGAGAAATTTTATTGATGTAAATTATTTAATTTCCGTATCACTATGGTAATGAAATTAAAACTTATGCCATCCGTAGCTCAAAGCATCTTCCACTTGGCC:1 - chr3R 6532380 3' + INE-1 95 1 73.29 AATGTTATTATATATCTTATATATATATATATATCTTATATATCTTCCAGTGCATACACCTTATCCTATCTTACAATATAATACCTAAAGTACTAAGGTCAAACCGCTTCGTCGTAGGTTTTTTCTCTGTACAACAACCGCAAGG:1 + chr3R 26313826 3' - Doc2-element 4699 2 70.34 CATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTAATATAATATATAATAGAAGCGCATACACCTTATCAGCCGACCGACAAGCCCAAGGTCGACGATCAGGCGAGAG:1 + chr3R 10393495 3' - accord 7077 2 58.90 AAAATACGACCGTTCGCTTTAAAAGCTAATAGATGACTGACTTTTAGTCGAACATTGCAGAATATACCGAAACTGCTCATTACATGTGGATCTCTTTAGACCACTGCCACCCGTTATTTCGAAAAAAAAACATATATTTGTAATT:1 + chr3L 15462234 3' - Cr1a 8 1 17.93 ATAAAAATAAATAAATATTTGAAATCGCTAAACCATTAAAACGGTTTTTAATGACAAATATACACACATAATTTGTGTATGTTTATTATCTATAAATTAATAAAATAGGGTAAAAACTGGTTTTAGTTTCGAGTAAACTTAGCATT:1 + chr2L 10306172 3' + mariner2 831 1 48.63 TAATAATAATAATAATAATAATAATGAACTAAAACTATAACATTGTGCTATATGCCAAACCAAATTCTATATTTTGTTTGTTCACTAGACTTAAGACAACCGACGTCACTGCAGCATGGATTTCATTTGTCTTTTCAC:1 - chr2R 18168766 3' + mdg1 39 8 71.74 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCACCTAAAAGTATGCTAT:1 + chr3R 31264147 3' - jockey 4759 1 77.78 CAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTG:1 + chrX 21994035 3' - McClintock 5971 2 71.92 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTATAAAGTCAAGCATGCTTTGAAATA:1 + chrX 12986677 3' - roo 8680 2 75.34 TATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATAATCGCATGCTAATTTCACGACTTATGTCTTTTGCCATT:1 + chrX 2352285 3' + accord 445 2 60.71 CCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGATTTGGATTTGATGTTGTTTCGAATTTCCTTCTTTTTGTCAAGTTCGTTGCCTACGTTTTTCCAGAGGGTATTTTTACGATCTTTAAT:1 - chr2R 9027940 3' - I-element 430 1 63.89 TAAAGATAATAAGATAAAGTCTAGTCATGCAACTCATCTTGACCAAGCTCTGGACTGGAGATTAATGGTTTTTTCGGTGTTAGTTACTTTTATTCATATAGCCCTAAATATGTC:1 + chr2R 4880048 3' - Cr1a 4214 1 70.18 TATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAA:1 - chrX 16758625 3' + 1360 317 1 61.90 ACAAGGCGATAATAAAACCGATTATGGCCAGTGGATAAGCCCAGCGGATGCCGCACAAACCAAGCTCAAAGCGATTCGCTTCCGGTCCACAGATCTTACGG:1 - chr3L 1890673 3' + Porto1 4246 1 79.21 GACAGCTGATTGTCGATAACATACGTAAGACAAAATTGATGGCAAATCATTTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTTAGAAGAAACGGATGACGTAATCTAGTTGTATTTTGACTGTATCAGAGAATACTTTCAGTTTCTCTATATG:1 - chr3R 4985291 3' + transib1 163 1 54.79 ATTTTGTCAAATTTAAAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTCCGCTCTCTCGCTCTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAAACACCTCTATATTGGCGTGAGTGGCAATCTGTTGATTCTGTCTTAGG:1 + chr3L 27386627 3' - 1360 199 1 73.79 ATTATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGGCA:1 + chrX 21639709 3' - gypsy5 7004 2 62.14 GAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTTGCTGCCTTTAAGCCGATTTCCAAACAACGAGCCAAAAATTTTTCCCTTTCGCGTTACGTTGTCTTTGCTCGACC:1 - chrX 15890766 3' - R1A1-element 4917 1 70.48 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACA:1 + chr3R 25709865 3' - hopper 34 1 50.00 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCG:1 + chrX 18239422 3' - jockey 74 1 62.33 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCAT:1 + chr3L 1279192 3' + roo 9020 2 56.85 ACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCGGCAGCGGAATACATTCGCCCACTTTTAACCGCCATAACTAACTCGGCAATCCAAAATTTCATTCGCCACGCAGCTGGCAACAA:1 - chr2L 1372075 3' - Circe 34 2 62.33 CTTATAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCACTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATAAGAGAAGTTTTATGCTCAAAAAGCTAGAAATATTTTGACCACACTT:1 - chr4 551742 3' + Cr1a 4185 1 64.38 ATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTCAAACGGCGTTAGCTGCTATCCTGGAACGCAGTAGTACTAAAGTTGTAAGGGACAGTCTTCTTATGAAGATTAGGTTGGAGGGTTTACTTCCTCTCTAATCACCGGCC:1 + chr2R 5043935 3' + mdg3 5221 1 77.40 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCTTATTTTTCCC:1 + chr3L 17183728 3' + diver 174 2 75.76 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGAGTTGGAAAACCAACGATAT:1 + chr3R 4682968 3' + Burdock 176 2 77.93 AGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAAGTT:1 + chrX 2479616 3' - mdg3 32 2 64.38 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCTCGCTCTC:1 + chr2L 14074555 3' - 297 6626 2 54.01 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGGGCCAAACCGTCTTCATGTTGCTCC:1 - chr2R 23180174 3' - roo 8693 2 60.77 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACACTGAAGACC:1 - chr2L 12984103 3' + hopper 1393 1 61.60 CAACACGAATCCATCGTTCATCATCTGCAAACAAAAATATTCAACACACAATTAATTAAGTATACATAAAAACACACAATTAATTAAGTTCACGTACACAGATATACACTATTAATTAAATACATACACTTAATTTTTTTTTTTAC:1 - chr3L 25191996 3' + gypsy5 481 1 59.59 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTT:1 + chr3R 19407983 3' + diver 6034 2 69.18 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTC:1 - chrX 19038368 3' + hopper 1354 1 60.96 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATACATATATTATATATATAAATATATAAATATATTTATATATTTAATTTGAATCGGTTCGTGGTGC:1 + chr3R 4217808 3' + 297 6931 2 71.92 ATAGTTTAAAATATTTCACATTTTTTTTTTTAATGCCCTAAATAAGTATGCAATCCCTTGTATACGTATATATTTTGGAAAGGAGTTACCTTTATGTACGTCAATGATATTGAGCCATAATGCAT:1 - chr2L 5607744 3' + G5 4678 1 76.00 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTT:1 - chrX 6116236 3' - transib2 52 1 54.11 TTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGTGCCAGAAACGGGAATCCTTTCTGAATCTGCCCTTCTGGAAGCTATAGACGCCATTAGTTGGTTGGGATCTGGTTTCATTAAGCTAC:1 - chr2L 7175803 3' - I-element 274 1 62.33 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAA:1 - chr2R 5941310 3' + copia 215 2 57.53 ATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTATAATAGATCCGACTGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTATCTTGTTAAACAACATAATAGTCTATAAGCTTGCTTTCCTTTATTGCTTAAAATTTGTTTGACGTTGG:1 + chr2R 5453169 3' + baggins 5378 1 73.29 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGT:1 - chr3R 16341959 3' + P-element 2825 1 33.60 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCT:2 - chrX 1263920 3' + Burdock 6355 2 51.37 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATA:1 + chr3R 27986421 3' - roo 86 2 81.51 TTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATCCCCCTATTTTCAGACATGTGACTAACGATGATTTTTAAACGAAGCCCTCTATATATAACACCATTGTC:1 + chr2R 6622702 3' + S-element 1700 1 74.66 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAAAAGCT:1 + chr2L 4003837 3' + mdg1 413 2 76.71 AACACACATTCAGCAACTACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCTTTGCAACAAAACTAGCGATGCTGGTCGATCGATTACCGAATGAAGTCAAAGGAAAATGAAGTCATGGAA:1 - chrX 12193309 3' + Chouto 357 1 55.00 TTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAAT:1 - chr2R 7244792 3' - diver 35 2 59.29 AAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTT:2 + chr3R 11040131 3' - Bari1 88 1 77.24 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCA:1 - chr3L 24934302 3' - HMS-Beagle2 6949 2 65.07 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAAACAATGTGAAAAATGGTAATGTGTGCGCGGCA:1 - chr2L 19674930 3' + 297 363 2 58.90 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTAT:1 + chr2L 20266018 3' - roo 82 2 76.03 AATAAACAAAACCAAAATATGTTGACATAAAAGCCCATTGAGAGTGACACAAAAAATGCAAACAGCAATAAGGATGCATCTTGAGAGCTGTTTATCAAACTACTAAGAAACTTGTCAAATCAAACTGCACATCGATACAACTAAAA:1 - chr2R 9643694 3' + Porto1 193 1 54.79 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTT:1 + chr3R 7420305 3' - 1360 57 1 58.62 CAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGG:1 - chr2R 23780549 3' + Ivk 5293 1 76.71 GAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAAC:1 + chr3L 17183753 3' + diver 152 2 66.44 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCATGTTTCATGTGTTGGATTCAGTGTGAAAGCAACGAGCATGTTGTGCGGAAAACAATAAATGCGCCAAGAGTTATGGAGCTCCCTTTGTCTGGTGTTAAGGGGCAA:1 - chr2L 9635574 3' - 412 7131 2 76.71 CTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAATTTTTGTGTGTTGTGCTTCGCCTTTTTCTGTTTACACACTCTCCTCTCGCTCTGTTTTAG:1 + chrX 20490975 3' - I-element 5214 1 64.14 ANGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATAT:1 - chr2R 2590721 3' + HMS-Beagle 166 2 72.60 ATATTGTTAATAGTTTTATTTGACATTTAACACAATTTATTTTGTGTTTATTTTTCTTATGCTTAATTTTGTATGAGTTAAAATAGAAACAAATAAATATATTTATATATTTATTTGTTTCTATTTTAACTCATACAAAATTAA:1 + chr2R 19528110 3' + BS3 1641 1 78.47 TGGTTGTGGAGATTTTATTAGTAAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTCCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCACCCACCTCCAAACAGAATGCAAAGCCGCTGAAGAA:1 - 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chrX 17007690 3' + Idefix 7169 2 58.57 ATAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGCATTTGAATGC:1 - chr2R 20227186 3' - hopper 29 1 60.27 ATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTC:1 + chr3R 23067498 3' + roo 22 2 66.44 GTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAACTTCTTTGCTGCACGAAAATATT:1 - chrX 22840454 3' - copia 4869 1 77.14 TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTT:2 - chr3R 6419836 3' + Tabor 7269 2 58.22 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTAT:1 - chrX 11661366 3' + pogo 2089 1 72.73 TTTAGTTAATATCTAATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGGAGATCTGGCTTCTGGGATGTGGGATGCGGAAACCCAGGGGCTGACAAAGGCAAAAGGAAGTGGACGAG:1 - chr3R 24722152 3' - I-element 5238 1 52.74 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATTAATATTTATTATGTGTA:1 + chr2L 14683583 3' - roo 49 2 52.05 TTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAA:1 - chr3L 17567877 3' + S-element 127 2 63.01 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAAC:1 - chr2L 18226761 3' + roo 359 2 52.74 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTCGAGCTCTGATAGCGCGGTACAGTGGGGCAGGCCAAACTAGAA:1 - chr3R 5216153 3' - FB 67 1 70.40 AGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAG:1 - chr3R 22642316 3' - blood 7106 2 80.14 CGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTAT:1 - chr3R 19450191 3' - roo 9042 1 54.79 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACG:2 - chr2L 18549832 3' - roo 8730 2 66.44 ATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGTGGAAGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTATTTCACTCTCGTC:1 + chr3L 9184201 3' - Tirant 8060 1 51.00 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCT:1 + chrX 1341723 3' - 412 7124 2 65.07 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAACTCCTCCACTGTCGTCACACATGCTCAACGGCAATTTCGCTTTCAATTTCAAATGCTATCTATGAGGGAATGCGAAACGAA:1 + chr2L 11251244 3' - rover 16 2 58.22 TAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGT:1 + chrX 19980693 3' - X-element 4543 1 56.85 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAA:1 + chr3L 6447095 3' + transib2 2760 1 75.00 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCCATCGATGAA:1 + chr3R 31653195 3' + roo 9040 1 65.75 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCTGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCC:1 + chr2L 22674911 3' + mdg1 390 2 58.22 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGTTAT:1 + chr3R 24369144 3' - roo 44 2 55.48 TACCACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAATTTAAACATTTTGGAATTTAAACTATAAGTGCTTACCTATGAGGCTAACAATATAATT:1 + chr3L 5654190 3' - hopper 1232 1 60.27 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATT:1 + chr2L 20266019 3' - roo 8745 2 75.34 TAAAAACCTATTCAGTTGAGCGCCACTGTATGCACACACATAAATATCGGCTTAAAAAAGGTTCCTATAATAAGCTAGTGCAAAAAGTCCGGAGAATTCTAGTTAGAATGTCCCTGCGATTTGAAAAAGAAACCTAAGAGCAGCAA:1 + chr2R 6237246 3' - Tc3 7 1 58.22 GCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCTCACTCTCTCTAACATACCATCTCGTGTTCTCTCATTTCGCACCTGTACAACAATGCGTATGCTTGATATCTTCCCCGTATTTC:1 - chr3L 9190214 3' - Rt1a 4996 1 62.14 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACC:2 - chr2L 4003682 3' - mdg1 7097 2 58.90 ACAAAAATAAATAAACAAATAAAATAATATGATATCTAATTTATTTTATAAAAACGTTACAGCTTATATTACACAAATGCTGCAATATAAAGCAGAATTATCGTTGGACTGGCTTCCAGATACAGATGCAGATACAGATACACAAA:1 + chr3R 21441004 3' + HeT-A 306 1 73.97 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCA:1 + chr3R 21630349 3' + I-element 5293 1 61.64 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCAT:1 + chr2R 5674764 3' + S-element 1674 1 60.27 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCTCAAATGGTCGACAGCCTCAAGAGCAACACGTGCATTCTGCTTTCAATTAGAAA:1 + chr2L 9636214 3' - 412 12 2 65.19 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCCCTGCGAGGCAGACA:1 - chr3R 19992648 3' - hopper 74 1 67.36 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGC:1 + chr3R 27406052 3' + diver 6038 2 66.44 TCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGGCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGGGGAATTTGCAGAATATTCACGGAGAAATGTTTT:1 - chr3R 14860089 3' + BS 5083 1 70.55 ACTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCCCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTAAAGTTTGGATAGGATGCCACAGAAGAAATCTAAAGAAATTTAGTTATATGCTAGTTATTTCTGTGAAA:1 - chrX 19330479 3' + INE-1 576 1 54.11 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGTGGTTCGGTT:1 - chr3R 11062748 3' - roo 8717 2 64.75 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCCGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTAT:1 - chr2R 14653125 3' - 297 6599 2 56.85 TATCTATCGATATCCCAAAAAAATGATGAAATTTCGCGTTCACATTTCCACTTGCTGAGTAACGGGTGTCTGATAGTCGGGGCATTCTCTCTTGATTTTTTATTTAATTATGATAAATAATTACCGAAAGGGTATACAATTTTCTG:1 - chr4 939144 3' + INE-1 499 1 56.16 ATGTGTGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTC:1 + chrX 4808607 3' - mdg3 5284 2 54.05 CTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATT:2 - chr3R 19449955 3' - roo 409 1 53.42 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTGCCAGTGG:1 - chr2R 13168643 3' + P-element 2831 1 47.95 CCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATGCGAAAGACAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAGTAGGGAAAATAAAATGAGAATTAAGGCTGGATCCCATGGTTGCGACTAT:1 + chrX 19549748 3' + G2 2972 1 60.14 GTCAGAACATAAAACTCTGTAACATTTATTTTTGAAAAATGGTTGAATATTTTTTCATAATTTTATTAGTCGTGTAGTTAAGAAATCTCGATTGTATAACTTAACATATTTTTAGGCTCTTTTCACACTAGAGGAATCCCTTATAG:1 - chr3R 566941 3' - Cr1a 4186 1 52.05 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCGCCCTTTCATTG:1 - chrX 8308422 3' - roo 86 2 76.03 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAAC:1 - chr2L 9623569 3' - jockey 8 1 79.45 ATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGT:1 - chr3R 20675856 3' - jockey 4949 1 73.29 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGGTTCTCGTATTTATTTT:1 - chr3R 16157256 3' + pogo 2092 1 68.07 TAATTACAATATGAAGTAATTGTATTAGTTGGAAACGGCCCTAGGACCCGTGGATTTAGCAAGGAATTGTCTACACACAGGGATAATGAGAATGAATATGTCGAGAGCACAGATGAGGTGTCTCAGATGTTGAGCTTTACTAGCTA:2 + chr2R 14669017 3' - Doc2-element 4677 1 69.86 GTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAAACATGGCGGGGAT:1 + chr2L 9010174 3' - G2 2711 1 60.00 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAG:1 + chr2L 15936840 3' - copia 4955 2 75.34 TATATACATATACATATATATGTATGCCGATCTCAATCGCACACGCACACACATGCTCCAAATTCAATTATGTATTGTAATTAAGAGGTCAGAGGTCGGAATGTCACTAGGAGAGGTCCCGGCGATTAGACCACAAAGTTATGCTG:1 - chrX 675093 3' - Stalker2 251 2 63.70 CTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGGAGATGAGAAACGGATGCAGTGGTCCAACAA:1 + chrX 15946809 3' - INE-1 547 1 54.11 AGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGTACTGTGCCACAGACAAGCAAGTGC:1 + chrX 19980717 3' - X-element 4508 1 54.81 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATAATCTGCCTC:1 - chr2R 2590685 3' + HMS-Beagle 7002 2 54.23 AATATATATGTATATATAATATATATTTATGTATGTATATGTATTGGCTATGAAATATAGCCAATCTCGAAAACATAGAAGTTTTACACCTATTTGGGTATTAAAACCAATAGGTTGCAATGGAACAAATGAGACAATCTGATATT:2 - chrX 20113090 3' + Dm88 19 2 78.77 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAG:1 - chr3L 12315703 3' - transib2 37 1 58.87 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGGATTTTATTTGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTAT:1 + chr3L 2784659 3' - 297 6640 2 61.64 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATG:1 - chr3R 27986360 3' + roo 332 2 70.55 GATATAACATAGTAATTAGTATTTATTTGATTAGTCTAAGGAATTTTAAAACTAAGCCAACTAATCAAGTATTT:1 - chr3R 5351867 3' - jockey 4838 1 67.57 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTT:1 + chr3L 18505778 3' - I-element 25 1 68.49 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCC:1 + chr2L 16943910 3' + copia 241 1 52.05 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTT:1 + chr2L 19924032 3' + roo 9002 2 64.38 ATCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAA:1 + chr2L 11357906 3' + blood 300 2 70.55 GAGTACTTGGACCTACGCTATACGTCTTTTATACATCAGATATACCCACAAGTAGTTTTGAGATTTCACTTCTATCAGTTAGCAACAGCACAACTCAACTCAATTTTGTACCTTTCAATTTCTCAAGCTCGAATGTTTTGTACGTA:1 - chr3R 12967656 3' + Fw3 2873 1 60.27 ACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATTTAGAACTATTTGTATACAATCGTATAGCTT:1 + chr2L 7580985 3' + Transpac 230 2 77.86 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATCAAAAGCGAGTGGCCTAAATCCATAATTAATAAGCTTAGGATAACCTTAGAGGCAAGTGTAATCAATAGATAGGGATAAGAAAACAAAAGATTTGATTAATTAAGGTAA:2 + chr3L 21362992 3' + I-element 5324 1 77.40 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTT:1 + chrX 12129437 3' + flea 224 2 63.70 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCA:1 - chr2R 18316004 3' - HMS-Beagle2 6916 2 62.76 AACATTATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTATT:1 - chr3R 2169840 3' - gypsy11 104 2 67.81 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCT:1 - 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chr3R 24450404 3' - 412 36 2 52.55 AAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAATAACAACAGAAGTGGTAACTAAGGTGGGGACAAC:1 - chrX 2746108 3' + I-element 5039 1 76.71 TTGCAAAAACCCATGTGTTTAATGGTAAAGCCATAAGAATTTTTGTTACTCATCCCTTTTGAGGCATTTTCCGTTTTCTGACTGTTTGCCTGAGTTCGTGCCGAATAGCAAGTTAGATGTACC:1 - chr2R 5504968 3' - hobo 239 1 72.36 CCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAATTCAGAATCACATGGTCCCTGCTTCGGAGACTCGG:1 - chr3R 14225339 3' - Tabor 333 2 61.70 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAA:1 - chr2R 5941349 3' + copia 5053 2 71.01 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCT:1 + chr3R 6419916 3' - Tabor 87 2 75.17 TTTCAACATCAACAATCAACATCAATACAATAACAAATATTTTGAATGGTGTTTAGTTTGAGGTGTTTTGGCGTTTTAAATACAATATTTTTGGGATTGTAAATAATCCATCCCGATAAAACAAAGCCGTCAAATTGAAATTAGTT:1 - chr2R 10454451 3' + gypsy7 323 1 72.60 GCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTACGGCTTATTTTCCACTTTTTTTTATGGAAACGGTTAATAAAAGAAACAACGAGGAGGGAACATGTATTTAATTAATTAAGTCGCGTCAAGATACAA:1 - chr3R 15553247 3' - Stalker4 7115 6 65.75 CAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAA:1 - chr3R 19407928 3' - diver 5977 2 77.40 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTATTTACATGGCTT:3 - chr2L 10156061 3' - hopper 13 1 73.97 ATTCATAAATGTCTGTAGCTAAAAGGTATTTGTACAATAACTGCACACCTCCAATCAACAATCTCCAACATCCGACATCACATTGAATCGAAACGCCACCATGCGCCATCTAATCAATCGGTTATCAGTCTTGGCATTTCCGTGGG:1 - chr3R 4721373 3' + Gypsy12A_LTR 2136 1 76.03 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGGCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACC:1 + chr3L 22400364 3' + 1360 3347 1 53.79 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGT:1 - chr3R 9038949 3' - Juan 4092 1 73.29 ACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTATTCCATCATTCCTGATGGTACTAAAAATTATAT:1 + chr4 274248 3' + Stalker4 22 4 77.40 AGTATTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTACTTTAAACACGACCTTCCACAAAAAGCACACTTTTTCTGACGAAGGTTTTGGTCGGCAGTATTAACGGTCACACTGGCGCAAACAACACAAACAGCAGC:1 + chr2L 19054104 3' - Cr1a 4287 1 70.55 ACAAGAGTGTCACAGTTACAATACTGTAGACAGTGATACGGTAGATTCAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGGTAAAAACGAAGATGGATCTCCAAAACATTGACTTGTTATTGACTATAAAAAATT:1 + chr2R 3550480 3' - Circe 7327 1 58.90 ACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCCGCGTTTAATGACCAGACAACTTGGCAGGTGCTTCTT:1 + chr3R 30471527 3' + roo 8672 2 66.36 ATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAA:1 - chr3L 27356078 3' + Tc3 1639 1 65.07 ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATA:1 - chr3R 21276537 3' - BS 5061 1 60.27 AAATAAAATATAATTAATTATTAAAGCTCTGAGTTGTAGGATTTTTTTACTATTTCCTGAGCTTGCTACCTAGTTTACATTGTAGTATGCTCTTGGCTTACTTTCCTCATGGAAATGACACTATTTTATTTATAACAACGAACTGT:1 - chr2R 21792845 3' + NOF 3961 1 69.86 GCTCTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCTTTCTCTGTCTCTCTCCATCTCACTAGCACCTACTAACGAAAGATGCCTATTAAATGAATTTATCTTCCTTGATTTTTGAAATTGTTGCGTTATTATTTGCTGGAACATT:1 + chrX 16805764 3' - 1360 106 1 54.61 AAGATGCGTCAATTGCGAGAACATCTTCTCCATCATTCTTTCGACCATGCCTTCAAAGCGAGCAAACATTTGTTGGAAGCTGGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGAGGTGGCCGGTCTGGATTTGGTGGCTTGCTCTGCCTTTGCC:1 - chr2R 5893691 3' - G2 216 1 43.84 ATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAAGCAAGTGTCAAGCGGCCGCAAATGATGATGGCGATGACAAAAGGAGTTGACAGGCAG:1 + chr3R 30845567 3' - mdg1 130 2 60.96 GCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGGCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATG:1 + chr3R 8049023 3' - Q-element 113 2 64.52 GTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACAGCGTCCGCATTTTGACTGGCCTTCTTGCGTGGCATCGATGTCAATGGCGATAGACGAGCCCAGGATGGCTGGG:1 - chrX 18418567 3' + baggins 5051 1 71.22 TTTATAATAATAAATAAATATTAATGAACTTTTTTTCTAGAAAAACTCGCCCTTCATTTTATTAAACAATTTAGAAATTTTGCTGGTTAGACTCCCTCGTTAAATGGCGCGTAATTATTTGAATTTGATTTTGTGGTTTGTCTTGG:1 + chr3L 9010227 3' + mariner2 828 1 37.67 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGGAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAAAAAGGGGCGCTTATTATTATGGCGAGCCGGGC:1 - chr2L 14669519 3' + jockey 4930 1 74.02 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAATCCAA:1 + chrX 18010068 3' - 412 7090 2 57.24 TTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTC:2 - chr2R 5410966 3' + Tc1 1351 1 59.59 AAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTG:4 - chr2L 20821168 3' + Burdock 6380 2 60.27 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGGGTTTCGGTTTTCATTTCATTTCGCCAA:1 + chr3L 21327215 3' - copia 19 2 72.41 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGTATG:1 + chr2L 18549957 3' + roo 9039 1 67.12 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCTACGTCATGCTAC:1 - chr3L 15913882 3' - jockey 4836 1 81.25 ATGTAGATAATCAAATTTAATAATGATGCTATGATGATGCTAATGCTATCCCTTTAATTGAAATAAGAGCTTTGTCTTCAGACTTCAAATTGTTTTGAATTTGAATCAGATAGATTACCTTTTGAACCACTGTACTCAAACGGGCA:1 - chr3L 2869100 3' + Penelope 354 1 31.51 ACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 18329912 3' + Porto1 4556 1 79.26 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTG:2 - chr2R 22034659 3' + copia 185 2 67.81 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTTCGGATTTTATGACTTTACTGGCACAGA:1 - chr3R 10931586 3' - 297 6599 2 66.90 TGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTATAATTATTATTATTA:1 - chr2R 19727744 3' + Dm88 112 2 59.59 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAGAGCCG:1 + chr2R 23780645 3' - Ivk 28 1 64.83 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTTAGAACGGGGATTTGTCGATTTCTGATT:1 - chr3R 18399323 3' - Juan 4032 1 36.30 AAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATAGTTTTCGGAGAGTTTTTTGAGATCACATCCTTATAGTAGGTGTTGATGTAATCATAGAAGGGCTGATGCCGTCGTTGTTGCGGCT:1 - chr3R 28314634 3' - Ivk 386 1 46.40 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATT:1 + chr3R 16342018 3' - P-element 77 1 31.03 AATTAGTTTCTTTTGCCCACGTCCATTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTTGCACTTTTTGTGCCATTGCTCTAAAAAATCTTCGCAATATCAATGCTGATGACATTC:1 + chr2R 5180381 3' + FB 90 1 57.24 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGTAGTATCGGGGAACTCGATG:1 - chr3R 4964094 3' + roo 9026 1 55.38 CACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAATAGTGATATCTTCATAGAGCCCTAGCGAAATCCATAGGGAATAGTGAATATATTTAGAATACCGTAGAGCCTGTTTCGAAATCCGTATGGAATAGTAAAATAGCCGGAGA:1 - chr3L 23848122 3' + R1A1-element 5313 1 77.40 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGGGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGTTT:1 + chrX 18409436 3' - jockey 4750 1 77.52 ATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGC:1 + chr2R 2875186 3' + TLD2_LTR 50 1 65.07 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTT:2 + chrX 12129401 3' + flea 4947 1 63.70 AAAAAATAAAAATAATATAATAGAAGGAGGTGTATATTTCATAAGATAATGTTAATAACCGGACTCAAAATATACCTAATCTTTGAATTATCCCATTAAAAGATAGTAAGGGGTGTATCTTTCTTATAGTATAGTCCGTATGGTCT:3 - chr2L 1303804 3' + invader3 5044 3 47.95 CAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGTTGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAATACCGAGTTGTGTTTTATTTAAATAGTTTAGTGGTAATATAATTGAATGGTAAGTTTATTAATG:1 - chrX 23338829 3' + GATE 376 1 50.68 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTCTTGCTTATAAACTCCAATGCAGCTGCAGCTGGCTGTGAACTATTTTAACGACATTGTGCGGACC:1 - chr2L 46850 3' - roo 8673 2 48.63 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGAAGAGCAT:1 - chr2R 4362792 3' - F-element 76 1 60.27 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTT:1 - chr2L 7660893 3' + I-element 5312 1 53.42 TTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAA:1 - chr2L 21299282 3' + roo 364 1 54.79 AAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCA:1 + chrX 15200916 3' + 17.6 7348 2 76.30 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCG:1 + chrX 8437733 3' - P-element 80 1 30.14 TGGAGCTAACTTTTCTCGTAATACACGGTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAA:1 - chr2R 5062002 3' + Q-element 251 2 77.05 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAA:1 - chrX 6475288 3' - Doc 57 1 51.37 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCGAACGGTTAGATACGACCGACCTTTAA:1 + chr3R 17077253 3' - roo 8670 2 78.77 TTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCATAAAATCTGGCCATTATGGGATTAGTCGAGGGAACTGTCAAAACATTTTAAGCGAGTCCCATCAGACCTTTCTCTCAATTTCATTTTCCTTCCTTGCAGCTC:1 + chr2R 7308528 3' + Max-element 8481 2 75.69 AGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGGGCGCGATAGAAAAAGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATTAAGCCGACCACGAAGAATTTTTATTAACAAATAATCGTCGAGGTTTTTTGTCGTTTTT:1 - chrX 20900217 3' - diver 402 1 67.12 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACC:1 + chr3L 20711673 3' - jockey 4846 1 76.03 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGC:1 + chr2R 7304118 3' - pogo 63 1 62.33 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGG:1 + chr2L 10156193 3' - hopper 41 1 60.55 TAAGCTCAGTGAAAATACTTTTCATCAAGGTATAGTGAATTAATGAAGAAAACATTGGACCTGTTGAAAGTGGCTTAAGTTGTTGAAACCCTTAATTAAATCGAACTGATTTGATTGTGGGGCGGCTCGTTTAATGCAATATTCCC:1 + chr2L 19602064 3' + Bari1 1467 1 63.70 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCATTGAA:1 + chr2R 7244928 3' + diver 179 2 58.22 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCCTGAATT:1 + chr2R 7304130 3' - pogo 35 1 52.31 CAAATCAAAGATAATCTTAGCATCAACGACTTAGTCATTATAAAGGATGATAATCTACCACCAGCTAAACGGACATACTACTCGAAAATATGCACGAAAGTATCACAAGCATTCTTATCATTATTTTTATTAATCTCTCCCCTTCT:1 + chr2L 18368807 3' + diver 5620 1 54.79 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTG:1 - chr2L 17809143 3' + jockey 4967 1 64.83 CCGTAATAAAAAGATCTAGAAATCAAGGTCTTGCAATCGGGTTTTCTTTGAAAACACTTCGGACTCGCGCGCTGCACTACAACAGAGAACAGCAACACAAACACAAAACACACGGAGAACGGAAATCGGAGAACGGACACGGAC:1 + chrX 1622367 3' + gypsy10 403 1 73.61 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCTGCGTTCATTTCGCTGGGTTTCGGGGTTAAGTTCTTTTCATCA:1 + chr3R 12242342 3' + transib2 2749 1 71.23 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGGAGAAGGTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAG:1 - chr2L 12818260 3' + hobo 2853 1 73.10 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTG:1 - chr3R 15942711 3' - hopper 72 1 65.75 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTA:1 - chr3L 23287196 3' - 1360 36 1 59.59 CGTTATTATTATTTGAAAATAGGTTAGAAATAGCCAACGAGGCATTTTATAATAAGCACCGGGAGGAAAACCTATATCGCATTCAGTACCAGACGAGGCGGAATATGTTCAAGATTCTGCGCAGCATTCGATTGCTAATTCGAGTT:1 + chr3R 7422061 3' + 1360 314 1 80.82 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGAAATTTTGCACTGTATGCATA:1 + chr3R 15325198 3' - 297 6619 2 53.62 AGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAA:1 - chr3R 26520639 3' - INE-1 557 1 74.56 AAAAAAAAAAATAATTTAACAAAACAGACAAA:1 - chr3L 1467813 3' - Tc1 1390 1 68.75 GCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATACCGTTAAGGCAATGCAAAAAAAGAATTTGCATGCTATGGCGATAATGTCTATAGATATATAATAGTTTTCCAGCTATTTAGCCGATTTAAGTAAGTCATTGAACATGGTATGACG:2 - chr2L 11570364 3' - 1360 326 1 63.01 ATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCT:1 - chr3L 18125876 3' + Ivk 5350 1 60.27 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCC:1 - chr3L 6518545 3' - 412 7087 2 58.14 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTG:1 - chr3R 24450415 3' - 412 13 2 63.11 TTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAACTACCATTCTTTCTCTACCCAATTTCCTTACTATTTCTTGCTTTGTGCATTTACTTGCAGACTGGTTAATTACATTAGCAAAACGGTTGCGATTCTGCTTTGCCTTTTGCGAATTCCCTT:1 + chr3L 18126666 3' + Ivk 49 1 79.45 GTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTA:3 + chr2L 17005806 3' - Stalker2 7308 2 57.53 TTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCACATCTCAAAAGGGCCTCGGTTTCTTTCCTGAACCATAATAA:1 - chr2R 12402660 3' - 412 401 2 68.89 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGATAGGCAAGCCTATACCAAACACGTAAGTTAACATATGTA:1 + chr2R 15005162 3' - BS 5005 1 63.19 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGAACTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATAATAAGC:1 + chr2R 6964862 3' - Burdock 6210 2 67.81 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTACAATTAAACTCCTTAGGCGACATACGTCT:1 + chr2L 22369279 3' - rover 23 2 64.29 TATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTG:2 + chr3R 4682977 3' + Burdock 184 2 71.92 ATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTTTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGCTAGGTTAAGGGTATGAAACGGGATGTACTATACTACTA:1 - chr3L 558212 3' + hopper2 1315 1 71.92 GTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGTATCAAGGGTGTTACTAGCCAGTAGATTCGGCATGCAATCAACGTTGGCCTGGACATCACTGCCTCCAGCATT:1 + chr2L 15882940 3' + HMS-Beagle 433 1 51.43 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATA:1 + chr3R 20167658 3' - roo 81 2 75.34 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATT:1 + chr2L 6654756 3' + diver 180 2 52.55 ATACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAG:1 - chr3R 29690730 3' - I-element 5285 1 75.17 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAA:1 + chr2L 14523281 3' - HMS-Beagle2 23 2 39.04 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAATTAACCTTTGTCCCAACT:1 - chr2L 17005660 3' + Stalker2 7633 2 64.38 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGT:1 - chr3L 12249794 3' - roo 8717 2 57.53 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGCCATTATTATTTGCAGTTGAGTTTATGGCCGAAGGTC:1 + chr3R 22288054 3' + transib2 2764 1 62.32 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCAATTAAATGTTAATTAACATGTTATACTTGCTGTGGGCTTTTTGTTTGCTT:2 - chr3L 18505608 3' + I-element 5330 1 71.92 CTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTGTTCG:1 + chr3R 2520359 3' + Tc1-2 1617 1 65.28 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCACTGTCTGTGTCTGGAATCTCTGTCTATCTGTTTTT:1 + chr2L 13555800 3' + transib2 2803 2 56.96 TCTAGCACAACACGCACACTAATACTTTGATACATACTTAATTATTTTTGAGTACCATGAGAACACCATGTCAACACC:1 - chr3L 23287285 3' + 1360 3210 1 75.64 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTG:1 + chr3R 14980407 3' - roo 63 2 60.96 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGGTTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATACGT:1 + chr2R 17878653 3' - Doc 50 1 51.37 ATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCT:1 + chr2R 5532366 3' - G4 3780 1 49.32 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTT:1 + chr3L 16970435 3' - roo 16 2 63.51 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGG:2 + chr3R 4964165 3' - roo 91 2 84.93 TGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAA:1 + chr2L 6647699 3' - mdg3 94 2 77.40 TAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCA:1 + chr3L 11257416 3' + 1360 10 2 34.53 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAAT:3 - chrX 12986504 3' + roo 9038 1 60.96 ACCGTGCTGGTTGTTACAGCAGCTAAGCTTGAAAGTGTAGGTTTGGTAGCCGTGATTAGTGGGGCATATCTGCTATAGCACTGACTCCGGTTAAGTACGGCCGGAACAC:1 - chr3L 6198120 3' - Doc4-element 266 1 58.72 AGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATAGTT:3 + chr3R 16533717 3' - X-element 4408 1 33.56 GCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAAAATAATTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATTGTGTGGGCTCAGTCAATTGGCCATGGACAGATATCAACATG:1 - chr2R 9637915 3' + 1360 468 1 71.23 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCC:1 + chr2L 4003759 3' + mdg1 7372 2 76.03 AGTAAAGTTCTCTTTTAATTTTAGAATTAAGATAGGCTAGCATTTCACTTATATTCGTCAAGGAATTCAGGTTTGGTCTCAGGAATTCAGTTTGAGCTCTGGGGTTCGGTTAAGCATTCTCTTTAAATATAGGAATCTATTGAAAG:1 + chr3L 26291396 3' - G4 227 1 68.49 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAAAT:1 - chr3L 17055382 3' - Tirant 8121 2 76.03 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACGCGAATTAAATTGTA:1 - chr3L 5532889 3' + roo 387 2 69.18 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGG:1 + chr2R 8157279 3' - mdg1 49 2 54.68 CTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGTGTTGTGTTGGGTTAAGTTTGAGTTGACTTGTCTGACGCTTGGTAAGAAAAGACCTAGGACGAGTCGACT:1 + chr3L 10015068 3' - HMS-Beagle2 6879 1 52.05 GGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTAAACATTTTCGGGCAAAATACGAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAGAACTACGTAGCGAAAGTGTTTGGCATGCAAAGCGGAATGCCCCCCAG:1 + chrX 9402336 3' - I-element 4973 1 75.20 TTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCAT:1 - chr3R 17996171 3' - diver 66 2 62.33 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGATAATGATCCATTTTTATTATTTAAAATGCACATTAGATTCAGTTGTTTTTCAGTATGTTATTTAAATAACTGACGACTGAA:1 + chr2R 4402686 3' - invader4 2796 2 60.96 AAACTAAAAAAAAAAACAAAAAATACGCGTCATTTCACATTATATCGCTGATAGAGTAATGCATTTTCCCAGCCATTAACAAGCAATTGGCAATAATGAAGAAAGATGAATTGAATAAATCTGAGGGGCATTCAAATGAAAAAAT:1 + chr2L 12795302 3' + Doc 4699 4 62.76 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCT:3 - chr3R 9038944 3' - Juan 4087 1 69.86 GTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAAAAGTTGCCATGGTGCTTTCGTACAGGGGCGGTTCCCA:1 - chr3L 14005133 3' + TART-A 13135 1 67.26 ATTATTATTATTATTATTATTACTGATAATCTGATGTGAATTTTTGAGCGGAACTTATTATAGAATTACCTTTCTTTGGTTCTCGATTTCTACTTGAATTACCATTTGAGTGGGAAAGACTACCAATTTCTGCCCACCGAATGGCC:1 + chrX 13843321 3' - mdg1 30 8 71.92 AAAGAAATATTTATATATATTTTTGTTAGAAACAAAGTTCAAAATATCTTAAAAAAAAAAGTTTTTATGTCCTAAATAAAATCAGATTTTGGCTTTTCGGCGAAATTTGATTCAGAAATACGGCCACACAATGCGCAGCTGTCAAA:1 - chr3L 10267150 3' + copia 4657 1 39.04 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTCACAGACATT:3 + chr3L 16470363 3' - jockey 4736 1 60.96 CAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGTTATTATGACCACTTAACTGGCAAT:1 - chrX 14722062 3' + diver 209 1 75.34 ATTATAAATATGGTTATAAATTCTTTAGCTTACGTTGT:1 + chr3R 19963748 3' + Gypsy12A_LTR 1811 1 81.58 TCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGT:1 - chrX 18817256 3' + transib2 2784 1 58.22 TTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGGTTAAATAACTAA:1 - chr2R 5674642 3' - S-element 63 1 65.03 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAG:1 + chr2R 22514182 3' + P-element 2809 1 30.82 ATTATTATTGTTATTGTTGTTGTTGATGTTGTTTTGGGCATTGGCCATCGATTCCGATTCGGAATCTTCACTGGGCGCAGTGAAGCCTGCAGAAGAGGGGCGTCAGCAGAAGGACATCGATGACATCGACATAG:1 - 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chrX 11661388 3' + pogo 2042 1 66.44 CAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGAGTACATCAAAATCAGGCAGCAGAAACGCTACAAACGTGCCGACGAGATCAAGGAGGCGTGGATAAGGAACTGGTAAGCGCGGGAAGGAGATGGGGGATGTCTGGGAATCGAAA:1 - chr3L 10637601 3' + jockey 26 1 73.97 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAG:1 - chr3L 21327065 3' + copia 251 1 54.55 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCC:1 - chr2R 7090645 3' + I-element 5285 1 64.38 TATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCTAAAGTCATGGACTAGGCAA:1 + chr3L 5061648 3' - 17.6 50 1 63.04 AAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCAAGAAAAGGACTATTCAAATGAGCTCCAAAATTTGGGTCAAA:1 - chr2R 21923995 3' + Cr1a 175 1 71.92 ACTTTACATATTACTTACTTACATATTAACTCCACTGCAGACATTGTTTTAATTTGCAAACTCCGCCCCCCTTTGCGACCACCTCTTTTGGCAGCAAATGTCAAAGTTTTACACAAACCAGTTTCGGTTTAATTCAGCTGCTTTG:1 - chr2L 9630622 3' - Stalker3T 42 1 80.00 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATG:1 + chr3R 21630351 3' + I-element 5295 1 60.27 CTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTTAATATACTTATTCTCTTTTTTTTTCTAACAATTTGAAAGTAAATATTGTTTGATCTGAACAAATTTCTGGAGCACTATATTTACATTATTGAACTTAGAACGAACGAGACA:1 + chrX 17545802 3' + pogo 112 1 78.08 AAATAAAAACTTTAGACATGTACCTAACATTATAAAAATGTAATCCAAATTCGGCAAACCAATGGTATTTCACAAAATTATGATAAAAATGCGTGAATAGAATCTAGAATAGTTCTTCTTGAAGTCCCTAAATAGATCATAAAAT:1 + chr3L 23570168 3' + mariner2 801 1 77.24 CCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCCTCCGCACATTATCTATTAAAAATTTATAGCCAGACAACAGAAACGCCGCCGAAATGTCGACGCCGGCCTGCAGCCAAAAATCCGTAGTCGAAGCCAA:1 + chr3R 13501902 3' + R2-element 3529 1 71.23 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAA:1 + chrX 21100263 3' - mdg1 7093 2 54.11 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGGCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTT:1 + chr3R 27406074 3' + diver 6060 2 51.37 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACATTTGCTTTTA:1 - chr3R 6625661 3' + flea 235 2 69.86 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAAAGTGTTGACGCTGCAACGCTTGTGTCTGACAATTAAAAGTGATGAGCGTGCAGGCGAAAGATTTTCACATTTTATTTAATTTCCACC:1 + chr2R 20464104 3' - accord 184 2 84.30 ATTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 18329912 3' + Porto1 4551 1 80.00 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAG:1 - chrX 17343406 3' - I-element 82 1 75.34 AATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAA:1 - chr3L 16973322 3' - S-element 1540 1 68.49 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACCTTAAGTT:1 + chr2R 9158165 3' - mdg3 42 2 57.53 AATGTGTAAACAGTTTCTTGACAAGCTGAATGTCTAAAATATCGTTTGTGGCATGAAAGGTTGGGGCATATAAGTATTGGCAAATTTCTAGAAATAAAGCATACACATCTTCACAATGTCTACGCTTTGGCTACCATTTAAGAAAG:1 + chr2L 17096976 3' + S-element 1709 2 68.49 AAGCACAATAAATTAAAAATATTTCGGGTTAAAATTGGTACGACAAAAAAAAAAGTGTTACAACAA:1 - chrX 13269606 3' + HB 311 1 68.18 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTC:1 + chr3L 1692111 3' + blood 7323 1 64.79 AATGATAAATTGCAATAAACGGCCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGC:1 - chr2R 2590688 3' + HMS-Beagle 6995 2 52.05 AAGTTTNAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGATTGGGAAACGCAGGTGGGGGTTAAATGAGATCG:1 - chr3R 28901204 3' + transib2 2779 1 52.74 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCA:1 - chrX 14722123 3' + diver 6036 2 67.81 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTA:1 + chr2L 18549907 3' + roo 8989 2 72.60 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCC:1 - chr2L 4713864 3' + transib2 2776 1 57.81 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGTTATTTTTTATTG:2 + chr3R 24381431 3' + Juan 4189 1 77.40 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACATTGCCTTCCAGACCA:1 + chr2R 8099269 3' + jockey 4977 1 68.49 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACG:1 - chr3R 19407889 3' - diver 28 2 58.87 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCA:2 - chr2R 8157167 3' + mdg1 7404 2 56.85 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGT:1 + chr2R 11804751 3' - pogo 39 1 58.90 ATTATACAAATAAAAATAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 58.90 CTGTTGGATTCAAGTGCATCTGCTCTTAGAGTGCTCTTAGATTCATATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGATCCTGATCAGAAAACTCTTGTTTTTGCCTGTTTCATAATTTTCAAGGAATCTAGTATACCCTTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' - Idefix 345 2 52.78 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTG:1 + chrX 4808605 3' - mdg3 51 2 57.03 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGAACACAAATTAGAAAGGTTTCACGCTTTTCTTTGTTTGTTA:1 + chr2L 16690755 3' + P-element 2859 1 65.07 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCTT:1 - chr3R 17673707 3' - FB 23 1 70.55 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGAAAACAT:1 - chr2L 47061 3' - roo 35 2 62.33 GTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATT:3 - chr3R 19450179 3' - roo 9030 1 63.70 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCGGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACAGAAGCCGGCGACTAGGACGAAAAGGAC:1 - chr3R 20140511 3' - jockey 4753 1 78.95 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAG:1 - chr2R 4855157 3' - transib2 26 1 65.44 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCTCGCCCAGAGTTCACTCAACTCCAACTCCCTTTCCTCTAGCGATAA:1 - chr3L 17940038 3' - 1360 16 1 58.90 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGC:1 + chr3L 7889628 3' + roo 9006 2 76.67 GGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGGGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCG:1 + chr3R 10736107 3' - McClintock 6026 2 75.91 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAA:2 - chr3R 11191381 3' + roo 9022 2 54.79 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTACAT:1 - chr3R 4682899 3' - Burdock 70 2 69.72 AAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCC:2 - chr2R 5410986 3' + Tc1 1331 1 73.29 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCATGATTCGTT:1 - chr3L 18281864 3' - Doc 64 1 65.94 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTT:1 + chr2R 21116616 3' - mdg1 7056 2 29.45 ATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGCGTACAATATTTGAACGCTGGCGAAAGCGTAACTATTGTTAACTATTTGTTGGGAATTGATTTTTGTAGTTTTAAGGAAGCAAATCT:1 - chr3L 1912476 3' + Tc1-2 73 1 53.42 ATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCTAATTCAATTTGCCACAAAAATAGCACAAAAATAACTGCAAAATTAATTTTGTGTTTTGCCATTGGCATCTCTCATGTGGCTTATTTACACTGACGGACAAATGAAT:1 + chr2R 22511232 3' - P-element 364 1 78.08 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTG:1 - 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chr2L 17738586 3' + INE-1 572 1 59.03 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGCCGATCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 23372630 3' + 1360 3336 1 71.33 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTAC:2 - chr2R 3338777 3' - Juan 53 1 52.74 TTAACAATAATCAATAATAATAATACGATAATAATTTAAAAAAAATTATAAAAACAATAGGAAAAAGATTAATAATAATAAAAATAAAATAATAATAACAATAATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAA:2 - chr3R 9485830 3' + flea 5001 2 60.27 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTC:1 + chr3R 27123556 3' + roo 332 2 73.19 AAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCA:1 + chr3R 24450526 3' + 412 7491 2 53.10 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGCTTACACTGTGGAAAAATACGATGATTCTT:1 + chr2R 22514225 3' + P-element 2868 1 64.62 TCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGTTCTTTGATAATACTTATATATAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTGTTCATTTTACA:1 - chr2R 15375354 3' - 1360 87 1 62.76 AAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCATCTCCTGACATTCCGAATCGCGGTTGTCGTCTGCCCGCTGCATTTATGGGCCATCAT:1 - chrX 20724673 3' - Bica 16 1 60.40 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTG:1 + chr3R 31653169 3' + roo 350 2 58.90 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAG:1 + chr2L 20640273 3' + Stalker4 208 4 70.97 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAA:2 - chr3L 2989957 3' + roo 325 2 74.66 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGGACAGAGGAGCC:1 + chr3R 30347457 3' + P-element 2864 1 66.44 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCG:2 + chr3L 21380622 3' - I-element 62 1 58.90 CAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGACTTAGACCGCCCTTTTTCTCATTATATTCTCCAATATCTAT:3 + chr3R 4194005 3' + INE-1 101 1 75.34 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACG:1 + chr3R 5351459 3' - jockey 4736 1 69.77 ATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGACAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCC:1 + chr2L 22224604 3' + Rt1c 5410 1 55.97 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGTCAGGGAGTCTG:1 + chr2L 47222 3' + roo 9042 1 63.45 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTAAATGTTTTTTGGAGTATGTGGGGTGGTATTGTAT:1 - chr3L 5489847 3' - jockey 31 1 61.64 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGC:1 + chrX 21224631 3' + roo 9026 1 56.56 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCA:1 + chr3L 22400369 3' + 1360 3374 1 66.36 TGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGGGGAACTTGTACAGGTAGTCGGGGAACTTGCCAATGTCGGTACTGATTTAAAAATATTATAAGTTCAAATTGTATAGAATTGGCTAGAGTGTTTAATTTCAATCAGTGTAAAGTTATTAATA:1 - chrX 190031 3' + INE-1 548 1 63.01 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATG:1 + chr3R 4805680 3' - 1360 84 1 76.55 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAA:1 - chrX 8027413 3' + Juan 4159 1 55.48 CTAAAAGTACTTAAACTATGGCTCGTAAAACGGCCGTCAAAAATATCCAAAAATTGTACTTGCCACAAACTAATTATAAA:1 - chr3R 15633274 3' + TART-B 10212 1 45.00 GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCA:1 + chr3R 22590576 3' - rover 65 2 67.81 CCGTAATTTGTTCTCTAGGCTTAATTGAGAGCGGGGTCCTAAGAGCCAGTACATTTTTTTTGGTTTTTGTCTTTAACTGAGTTTTGCATCGCTTTTAATGCTGCTTCCAAGTAATATTAATAGCAAATGTAAGAAAAAACAAAAAG:1 - chr3L 14329040 3' - G3 4147 1 76.71 ATGGATGGGTGAATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAA:1 + chr2L 6647708 3' - mdg3 85 2 69.86 ATAACTCGTAAAAATGTTCTAAATTTATTTTTATGCTATCTTGTTACTTAATTATAAAAAAAATTAAAGCAGCTTCAAAATATCAATCTTAAAAAAAATATATTAATACCAAAATTTCCTGGCCGGCAATTTCGTGACTGGTTTTC:1 - chrX 22513149 3' - transib4 116 1 74.66 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTTTATGCTAATTTCCAA:1 - chrX 10537814 3' - I-element 21 1 69.18 ATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCTCTTATC:2 - chr3L 22531933 3' + Cr1a 4212 1 60.96 ACTGTAAATACCTAATTATACCACCTGCCAAGCTGGCAACACTTTATGTTTAGTAATTGAATTATGCTAACCATTTAATGGCTA:1 + chr3R 12948599 3' + Juan 4150 1 77.38 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGTTATTTTTTATTGGATTG:1 + chr3R 24381436 3' + Juan 4194 1 80.82 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTATTATGA:1 - chr3L 23249344 3' - rover 18 2 73.79 CCAAATAAATAACTATAAATAAGTATTCCGTTTCTGTGTAAATTAATTAAATGTAAAGTATTTTTTTATCACTCATTTTAAGATGGCTTAAAATGAGTGATAAGAAAATAATTTACAGTTAATTAATTTACACAGAAACGGAATA:1 + chr3R 19513786 3' + Tc1-2 478 1 42.76 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTATTT:1 - chr2L 16540905 3' - hobo 14 1 72.13 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGA:1 + chrX 8308488 3' + roo 9001 2 68.49 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAACAGTGTGAGTTACCTGCCACTTAACAAGAGATTCAACTTTAAA:1 - chr2L 3233920 3' - roo 8691 2 67.12 GTAGTAAGTGGATTAGTATGTAGGCCTATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATAGGTGAAGAGATCTGAATAGGTACATAATAGATCTTCACAATTGTGGACTTATGGAACCAAA:1 + chr3R 3855248 3' - Idefix 40 2 89.23 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACC:1 - chr3L 18402987 3' - P-element 55 1 35.59 AAAATCGTTTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAACTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCTCATAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGAGCTAGTAAGTT:1 + chr2L 15076217 3' - 1360 37 1 52.24 AAATAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAATTGCAAAAAAAGAATATCATAAAAAATTGTGTGCAAAAAAAAATCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCCTTTCGGCCTCTCTCCATTTTTGGCACTTTAAA:1 - chr3R 19740945 3' + Rt1b 5148 2 44.12 ATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGGATT:1 - chr3R 29690712 3' - I-element 5268 1 63.70 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGT:1 - chr3R 16157244 3' + pogo 2077 1 65.07 GCTTCGGCTTTCGACAAGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGCTAGATTACACATAA:1 + chr2R 13168754 3' - P-element 21 1 64.04 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATAT:1 - chr3R 19992615 3' - hopper 43 1 56.16 ATAGGTTAAGTTCAGTGGAAGTGACTGAACGTTTCCTTTTGGATTCAAAATGAATAGAATGATTATTAAAAAAAAAAGAATTTTTATTTTTTCAGTATCTTTTTATTTTACTATCATGAGTTCATTATCTAACAATATTATCATT:1 - chr3L 26773536 3' + G5 4783 1 59.31 TTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTGTTTTGGCTTCGGTTTTTGGTTTTAGCCCGGCTTTTTCGGGTTTTCTGGATGTTGCGGCTTAGTTCTCCCCACCACTCCCCCCTCAAC:1 + chr3L 7649458 3' - G2 3077 7 77.06 AACCTTCTAGCTTATATAGTTCCTGAGATTTCGACTTTCATACGGACAGATGGACATTCCAAAATGTTTACCAATATAGGAGGTTTCAACGAGCTGGACACCGATAGAGCAGCA:1 + chrX 15845126 3' - INE-1 158 1 53.51 AACTATCACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGCAAACATCAAGCAAATAAGCTGAAAGGGCATAGAAAAGCCAGATAAATAC:1 + chr2R 15722572 3' + Doc2-element 4446 1 76.03 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATT:1 + chr3R 13406540 3' - pogo 38 1 55.48 AATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTTGTTCACTGAGTTTGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCG:1 + chr2L 22684596 3' - transib3 75 1 59.59 GTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACAATAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTG:1 + chrX 22840542 3' + copia 5032 2 78.08 AGAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGCCATGGTTCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAAGACAAGCTGGTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGGTTAAATACGACTGCCAGCTTTGAAGTTG:1 - chr3L 17567830 3' - S-element 1532 1 64.71 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTT:1 + chrX 23439050 3' + P-element 2495 1 64.23 CTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAATTCGGTGGCAACAAAA:1 + chr3R 30987623 3' - F-element 69 1 80.31 TAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTACTACGCTAATTCGCTTGGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAACTTAAGCGACTAAAAAAATTATGGAAAAATACTCAACAATTTTGAAAAAATGTGGGCGTGG:1 + chr4 857193 3' - INE-1 563 1 53.57 GATTCCACCTGTGTTTCGCAGTCGACAAAATTCTCAAACCTCTTCTCCAGTTCTAGAACTGTCCTCTTCCGAAGGTATTAATTTGCTTTCTCCGATTTTGTATACTATTGAGAGAACTGTGGGCTATTTATAAACGCCAGTAACGA:1 - chr3R 21190271 3' + gypsy12 9940 2 69.18 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGGTTTTATAGCGCAA:1 - chr3R 17996137 3' - diver 32 2 60.96 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGATCTGATCCATTC:1 + chr3R 15807463 3' - FB 30 1 59.85 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCA:1 + chr3R 9298602 3' + hopper 1391 1 67.81 CTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACGTACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGTCCTATTTTTGGAAATTTTTATGAGGTCAGTCGAGGGGCGAG:1 + chrX 20685059 3' - 1360 225 1 71.03 ATTTATTTATATTATATTAAGTCGATACTTGTAAGGTATAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTAATTTGTTGCCTGGCCCGTTCCCATAGGAATAAGCGATGCTTTGTAGTTGCTCTACACGTGGAGAAAACAGCAGTTCAGTAGTT:1 + chr3R 5921820 3' - TAHRE 431 1 62.33 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTT:1 - chr2R 3338784 3' - Juan 60 1 57.53 ATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAGGATAAAATAAAAATGCTGACACAAGAGGAAGTCACTCCAATAGAACCCGAAAGTTTAGAAACTAAGGGATTGTCTACAGATAAAAACGATAA:1 - chr3R 10800738 3' - BS 5065 1 65.75 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCT:2 - chrX 19054237 3' - jockey 58 1 51.37 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGATGCGCTTTAATTAATTAATTT:1 + chrX 7795615 3' + roo 9039 1 53.33 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTT:1 + chr2R 23780604 3' - Ivk 47 1 56.10 GACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCC:1 + chr2L 15550763 3' + Bari1 1645 1 62.76 ACAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACACAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAAACCAATGCGGAATAATCTTAATGCTGCTATTGATTATCATAAAAGTCAAGA:1 + chr2L 18418126 3' + HMS-Beagle2 490 1 67.36 ACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATTTGTTATATGTGTTTGTTATTTACTGTATTATTATTGTAAAAACCCTGTGGAAAGCTCTGTGGAAAACCCTGAAAAGCG:1 - chr3L 10157886 3' + X-element 4533 1 66.39 AACCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTTAAATCAAATATAACATACACATGTGCATGCATACCCTATCTTCGTTTTAACAATTCTCATTCTTATAAAACAACCGAAGCATGA:1 + chr2L 23049970 3' - Transib5 2847 1 54.11 TCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTGCAAACATAGAAAAAGCAGCGGGGGCAAAAAGGAAATTATAATAAATCTGAA:1 - chr3L 15370568 3' - F-element 106 1 67.81 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTCAACCAGCAGCA:1 + chr2R 5480015 3' - F-element 52 1 60.96 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAA:2 - chr3L 18046590 3' - roo 8713 2 53.42 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAA:1 - chr3L 14366505 3' + roo 9054 2 71.09 AGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATG:1 + chrX 8308506 3' + roo 9019 2 55.48 CAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCGTGATTTGCCATGGTGAGACCAAAAAAAAAA:1 + chrX 15200973 3' + 17.6 7406 2 75.37 TTGTATGTACAGATGTATATATGGGCGGGGTCCTTTTCCTTTTCTCTGGTCCGTGACTGGCGAGGCGTTGGCGTAAATGCAGATTTAAAGAAATCTGCTAAGATTTCTATATCTAAAGATAAGATGGATTTACTTTTTTAGATTC:1 - chr3L 968251 3' + invader3 5086 1 46.90 TGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGA:1 - chr2L 13585706 3' - Quasimodo 32 2 51.43 AGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGAC:1 - chr2L 20821175 3' + Burdock 237 2 55.48 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAG:1 - chr3R 13300887 3' - roo 91 2 80.69 AATAATAATAATAATAATAATAATAATCGATGGATGCAGTCGTTTTCCTTTAATCTTAGAAGAACCTTTTCTTGACAAACAGTCGTGGTGCCGATAGATAGACAA:1 + chr3L 24368145 3' + mdg1 40 10 71.43 TATAATAATATTTTAAATAAATTCTCCAGTACTGAGTCTCAATCTCTATACACTTTGAGCTAACAAGCCTAGCCTTTCATCAAAAACCCCACAAAGTTTCTATGTCATTAAATATTTTAAGACTTTTAAGATATTTTGAATATGTT:1 + chr2R 24139200 3' + I-element 5266 1 77.40 TACTTATAAATCAAAAAACAAAATGTCATTCCAACGATAAAATTTGGAAAAATGACACTGATGGTTTGGG:1 - chr2R 4659345 3' - S-element 1586 2 81.43 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGG:1 + chr3R 15072658 3' + pogo 2051 1 60.77 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCA:1 + chr2R 8099252 3' + jockey 4960 1 56.85 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCC:1 - chrX 661888 3' + 412 444 2 73.08 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCAAAAGCTAAGCTAATG:1 + chr3R 17736997 3' + opus 7489 2 73.88 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAA:1 + chrX 12129422 3' + flea 4968 2 53.42 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGCCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAAACCCCAACAAAGCGCTGCGGAAACATGCTGCCGCAACA:1 + chrX 18742921 3' - invader4 2790 2 60.15 TTAATTGTTCTTAATATTGCATTGGCACATACTACATTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTTATTTTGTCATTCGC:1 - chr3R 13972944 3' - 412 7068 2 62.86 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTTGCT:1 + chr3L 18505781 3' - I-element 21 1 71.03 CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGTCCAGAAAAATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTA:1 + chr2R 5479972 3' - F-element 95 1 74.66 AAAGTAATTAAACAAATGGATTTCTAAACAATTACGGAAGATTAATTTGTAACCAGAACGACAGGC:1 + chr3L 13740789 3' - Tc1 1383 1 87.88 CATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAA:1 + chr3L 18505728 3' - I-element 75 1 69.18 AGCTGAGAGTAATTTTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGCATAAAAAATGTAAATATAATTGTGTTTTGCTTTAGTCCCTACAAT:1 - chrX 15481647 3' - Porto1 377 1 65.69 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCCAGTCGGCGGACAAAAAGTCATTGGAAATGTGACTGA:1 - chr2L 14675638 3' - 297 48 2 54.79 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAAGGAAGTTGAGAAATAACTAACACATT:1 + chr2R 5941442 3' - copia 50 2 52.05 ACTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTGTAGAATAGCGATATGGTTTTCAGTTTTTATGG:1 + chr2R 10411479 3' - 297 6612 2 63.70 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAA:1 + chr3R 21933258 3' - pogo 45 1 58.22 TATTTGATCCACATTAGCATGGGGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTAGGTTTATATATACTCTATTAGCGCATAAGCCAAAAG:1 + chr3L 5061626 3' - 17.6 7007 2 77.40 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGG:1 + chr3R 6419931 3' - Tabor 66 2 63.31 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAA:1 - chr3R 24450394 3' - 412 15 2 68.25 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGGAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCA:1 + chr3R 9039017 3' + Juan 4153 1 62.33 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTC:1 - chr2R 21116489 3' + mdg1 351 2 68.49 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTACTATTTGCCTACAAATCGTAAATTCAAATAATAAACTCCTTTTAAGACGTAAAAAAGTATACAAGTGATTTTTATATTG:1 - chrX 17716983 3' - FB 40 1 53.15 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGC:1 + chr3L 13294966 3' + roo 9019 2 64.46 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTG:1 + chr3L 5389958 3' - roo 8717 2 64.12 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAAC:1 + chr2R 16929846 3' + jockey 4948 1 50.68 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGATTCCGACAGGAATAACGTCTTGGCCGCC:1 - chr2L 8338083 3' + P-element 2861 1 65.47 ACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTCTTACCCCAACAAGCTATTTAAGATTTTGCAATGTGGAAACGTGTATCTTATGTGATTCCCAAAACATGTAAGCT:1 - chr2R 17000206 3' + 297 412 1 51.37 AAAAAATAATACAAATACAACAAAAATCTAAGGGAGAAGTTGGCCGAGGAAAACTTCTGCAAATTGTTTATAGAGAATGTTTTAAATGCTGGCTTTTGCTGAGAATTCTCGTTGCATTCCAGTAGGCGAAATTTTCATGTGG:1 + chr2L 1660998 3' - BS3 1652 1 75.35 CAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGCAATCTTCTACTTTTACCTACTTGTTACAAGTAGTCACAAA:1 + chr2R 23716817 3' - I-element 4990 1 71.92 AGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCCAAGGAAAAAGCGCGTGAAATTTCGAAAAGCAAATGTGGCTATAGCGATTATGTA:2 + chr3L 15846047 3' + Bica 102 1 62.33 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATC:1 - chrX 14722099 3' + diver 172 2 52.05 TGTAAGCATAATATGAGAAGCATATTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGT:1 + chr2L 22369223 3' - rover 13 2 73.29 AACGAAAACACAAGATCAAAACTTTTAAGCCTCTTGTTATGCAAATAACAACACATGGCAAACACCGAAGCGACGGACGGGGCTACGGGGTGGTTCTGATTAGGTTTTTGACCCACAAAATGTCAACAAACCATGGCAAGGGCAGT:1 - chrX 11544177 3' - Cr1a 388 1 75.34 GTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTG:1 + chr2L 11257109 3' - rover 64 2 63.01 GTCGCCTCCTTTTAAATACCTGTTTTTTAAGCGTTTGATGCCAGTGCTGGACTTGGTTGTGAGTCGGGGATCCAGCAGGATGATGCGGCATGA:1 - chr2R 20859267 3' - P-element 333 1 52.69 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTACCGCTCTCGATTCATTAACATAAGATACGAACGGAGCCCAAAATCGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGCATGCCATAAAAATACTGGTAATTTCGAG:1 + chr3R 28146180 3' - roo 91 2 75.34 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCG:1 + chr3R 23295574 3' + P-element 2825 1 14.38 ATATATATTCTTGATCAGGATCATTAAGGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTGATATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGACGATTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGGGCAAGTTTGTTGACCCATATTG:2 + chr2R 5296382 3' + INE-1 80 1 76.71 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCG:1 - chr3L 7300145 3' - roo 65 2 63.70 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAATGGAAGCATTAAGGCGTTCACAACAAATTACTCGAGGTCGCCAACAACTTTATCAGACTTTGCCTACACCCAAA:1 + chr3L 4219568 3' + jockey 4961 1 46.48 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAAGAACACAATGAAATTTGCACCCGC:1 + chrX 585725 3' - Tirant 8126 2 57.45 ATCTGGACCTATGGCGCACAGCTATGGGGCAACACAAGCAAGCGCAAAGGACTAGAAAAGCAAGCAGCGACCAGAATTTAGGAGCCAGGAAATACGGAATTGCAATCAGGAAACAGGAACGGGAACGGGGAAAGCAGCCCAA:1 + chrX 9166361 3' + F-element 4262 1 74.65 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACC:1 - chr3L 16662371 3' + jockey 4940 1 54.79 TAATTATTATTATTATTGTTGTTATTACTATTATTATTATTATTTTTGTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATTATTATTAATCTTTTTCCTATTGTTTTTATAATTTTTTTTAAATTATTATCGTATTATT:1 - chr3R 21153558 3' - invader6 4386 1 59.59 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGC:2 - chr2L 4063809 3' + roo 9037 1 61.64 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCTGCGTTCATTTCGCTTGGTTTCGGGGGTAAGTTCTTTTCATCATGTTTTAAAAGTTG:1 + chr3R 12242356 3' + transib2 2763 1 61.64 GTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCTTTGCATCGGATTGGTTTGGTTTGGTTAGTTAGCGCTGCTTGTTACCAATTTCTGGGGTTTCTGGGGTTTGCGGGGTTCGCGAGGTTTGTGGTTCAA:1 + chr2L 20702109 3' + Cr1a 186 1 65.75 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCAT:1 - chr2L 22674741 3' - mdg1 20 2 75.69 CGTTAAGTGGATGCCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCG:1 - chr3R 16341974 3' + P-element 2856 1 34.18 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTTCGAT:1 + chr2L 11391637 3' - 1360 14 1 69.86 TTACAATCTGTTTTTAAAAAAATAACAATAATTAATCTGTTGTCCGCAAGAGTATTTCAAGTTTTGGATCCATTTATGAAATTCGCGTTTGGCAATTCTCAGTTGCCAAACCCTTGGCAAGTTGGCCAAATTCTGATTGCTGCTTC:1 - chrX 4968982 3' - Porto1 4649 1 65.07 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAA:1 + chr2R 12779696 3' - I-element 63 1 70.73 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTA:1 + chr3L 26290962 3' + Tabor 7245 2 69.18 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCGACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTC:1 - chr3L 16970361 3' + roo 9018 2 58.27 AAACGTGCACTGAATTTAAGAGTATACTTCGGGAAGCTTGGGCGTACGACGGGACCACCTTATTTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCCCTCTCGCGCTCTCTATCTCTCTCTCTGTACAGACTCTCTTGCGCTCTCTTTATCTTAG:1 + chr2R 18514979 3' - P-element 56 1 39.73 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGANNNNTGAAAGGACGCGAACNATNNNNNNNGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATT:1 + chr2L 17005812 3' - Stalker2 54 2 53.42 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGCTGCTGCGCCACTTGTTAGC:1 + chr2R 8735703 3' - mdg1 7070 2 60.96 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCT:1 - chr3L 7889549 3' - roo 48 2 59.15 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAA:1 - chr3R 15790830 3' - roo 8712 2 51.37 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTG:1 - chr2L 13556369 3' + transib2 2764 1 75.65 TACCATTCGGCTTTTGCGATTATTCTGAGCATTTTTGGTTGCGTTCGCTGACTTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTTCTCAGAGTTCTACAGAAATAATAGAATAGAAGACTCCAACTTA:1 - chr3R 5064450 3' - Porto1 4354 1 72.00 CTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATT:1 - chr3R 23067460 3' - roo 9049 2 50.00 ATAATTTAGTTTAATAAATTAAAAAAAAAATACACAGGCTAATCAAATACAAATACTTAATTTTCTAAATTCTT:1 + chr4 1175211 3' + jockey2 3393 1 71.62 ATATTTATACATATACATATACATATGTATATGTCTAACTGGATATATATATATATATATATGGTGCCTTTGTTGCTGCTCGTTCGTTGCTCGTTACGCTTCAGTTTGGAAAATCACGCTTTATTGCATTTCAAAACCGATTTGCT:1 + chrX 10101185 3' - Stalker4 7202 4 71.23 GCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATATATACGAATGTGCACACGTG:1 + chrX 9950617 3' - jockey 4719 1 53.62 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAATTATTTAAAATCAACATATT:1 + chrX 8200315 3' + flea 4970 2 54.79 GTGAGAGTCTTTGGCAAGCGAAGCGTGATTATTTTATTAATTTTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTTACGGTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTATCTTTTTATCTT:1 + chr3L 15588723 3' - HeT-A 68 1 80.00 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGACCGCATTGAATCGGTCCAAAAAAACTTCTTACTTTTT:1 - chr2R 2007459 3' - 1360 28 1 57.02 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAGTGTCCCAAAATAGCTAAATATTGTAGATTAGCTCCACGATTAGGATCGCAAGCACCCGTTTAATT:1 - chrX 20455614 3' + hobo 2898 1 52.24 AGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAG:1 + chrX 1799206 3' + invader4 3006 2 72.60 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTAT:1 + chr2L 16946152 3' + hopper 1376 1 57.24 TAACTCGACTATAGCATACTCTCTTGTTCTTAAATTTATGCAGTGTAAGTTCATATTCTAAAGACCATCCGATTACATGAATTTTTCTAAACTTAAAGTAAAATTGCGCATACGCCGTGTATTATGAGAAAATAGACTCTTAAAAA:1 + chr3L 17828479 3' + INE-1 574 1 73.97 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCAT:1 - chr2R 20010204 3' + Juan 4145 1 65.75 TATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAAAACTACAAACGTGGATGGAAGCACAGCAGCACTA:1 - chr2R 2307597 3' - 1360 342 1 68.00 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAG:1 + chr2L 47204 3' + roo 386 2 63.33 TTTAAATATTGTGATTCAGGGATTTAATACGAAAAACTTATCGAAGTGAAAATGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTC:1 + chr3L 14912224 3' + Dm88 266 1 67.12 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAGGCTGGGCACCAACACATGCGCACACACGGACACGCACACAAAGAAATGCAATTATGACAATCA:1 + chrX 19038476 3' - hopper 54 1 54.79 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCA:1 + chr3R 19073310 3' + roo 9054 2 68.99 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTC:2 + chr3L 3501825 3' + Bari1 1653 1 55.48 AAAAAAAGGAAAAAAAAAAACAGAAACAAAAAAAACGAAAAATATAAATACACATAAATACCCCAAACAATTTTCCACTTTACTCTG:1 + chrX 5088735 3' + gypsy7 5008 1 80.46 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGAC:1 - chr3R 6625706 3' + flea 4950 1 65.52 GTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCCTTTACTGG:1 + chr3L 3501871 3' + Bari1 1700 1 73.97 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATTAATTATATTCTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAATATTTTTCACTTATACATATAATAAATATTAATTTTCATATGT:2 + chrX 15947448 3' - 412 31 2 53.42 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTC:1 + chr3R 11062818 3' + roo 332 2 67.12 GTGCAAATTCTAATGTCATTTTGGACCAAATCTCCGCTATTTCAATGATGGCTCCCTCTCGTTTTCTATTTTTATCAATAGTTCGTTGGTCCAAATTGGATATTGAAACTTTAACGAATTGGTTCACTTGGTTTTATTCCCCTCTT:1 + chr3R 19139547 3' - Bari1 1303 1 60.27 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTATGTAT:1 + chrX 12258321 3' - Quasimodo 59 2 81.63 CTCAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATAT:1 + chrX 23078693 3' + F-element 4573 1 67.81 ATGTGCCTTGTTGGGTGCATCGGTCTGATGGACACAGCTATGCCATGGGGCTTCTGGTCTCCTGCCAGAGGAAAATCCTGCTTGAATGTCTATCGGTATGCCGTACAGTGACCACTGTGGCAATGCATGTGCTTG:1 - chrY 2458675 3' + R1-2 3070 1 65.19 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCTGTGGTTCTTTTGTAAATTT:1 - chrX 18396081 3' + roo 347 2 57.24 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAAT:2 + chr3R 24381409 3' + Juan 4167 1 62.33 TATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCAGCTAACATTCACGTTGCAATTTTACTGATATTGTAACAGCCCGCGAGATCTCTTACGCTGTTACATGAACCGCGGGAAAGCAGAGAGTGAAAGAAGTGTATTATCTCC:1 - chr2R 23426149 3' - R1A1-element 131 1 76.71 AATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTATATCCCTAAACAGCATAATTTTCCACTC:1 - chr2L 15550632 3' - Bari1 15 1 72.66 CATATTATTATTATTATTTATATTCGCATTATCTCGTGTTTCTCATTTCTCGCGTCATTTTCATATTTTGATAATTTTCGTGGCTGTTTACTTTTGTGGGTTGGTTTTGCAACAAGATTTTCATATAGTACATAAAAGCTTTTG:1 + chr2L 16199285 3' - mdg1 7089 2 64.58 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGATTTCGA:2 + chr3L 23320173 3' + roo 9033 1 58.90 ACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATT:1 + chr2L 21570262 3' - Dm88 65 2 62.33 ATTTATAAAAAAAAATTAAAAATGCATTCCGGAAAAGAAAGAATGCCCCGTAAAGAAGGAGATAGGTAAGGCTGCGCTTGGAATTAACTAATTTTACTCCAAAGTAACATTATTGACCTAGTTTCCATTTTCGGGAGCTACTTTCT:1 - chr2L 17232737 3' + HMS-Beagle2 479 1 56.85 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGA:2 - chrX 18009923 3' + 412 7495 2 51.37 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAATCGAAAAC:1 - chr3L 24934247 3' - HMS-Beagle2 6894 2 78.08 AAAACAAAAAACAAAACAAATAAAAACGTATATTTCAATTAATTTCCAAGCTTTAAATACAAGAATGACCAAAAAGTCTTTTCAAAAAATTAATAAACAAACATACAAATAATGATTTTCAATATGTTTAGTGAAACTTTTTCCAA:3 + chr2L 7364391 3' + Porto1 188 1 69.86 TATTGATCCAGATCTAGAATATATGTATATATCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTA:1 + chrX 19192435 3' - INE-1 84 1 77.93 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGAGGATTGACTTTGCTGATTTAACTG:1 + chrX 10319710 3' + mdg1 369 2 55.00 AATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAACAAAGTCATCCGGGTACGGATGAGGAGATAATACTCAAACTTA:1 + chrX 1878639 3' + 297 229 2 70.55 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACT:1 + chr2R 21410968 3' - Burdock 61 2 60.00 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATTATA:1 - chr2R 20010152 3' + Juan 4197 1 71.23 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGTATTTATCA:1 + chr3R 4461124 3' + blood 7322 1 65.75 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCA:1 - chr2L 15936759 3' + copia 234 1 53.42 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTTATTTTA:2 - chr3R 14980264 3' + roo 9055 2 73.97 AATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATAT:1 + chr2L 6654742 3' + diver 157 2 62.33 GTAGACGTTAGAGTCGGCATGGTATTGCTTTAGAACGAACTTGCGTAGACTTTATTCTTCGGGTTTCTGAATATCTATTTTTATACTTAGTTTCGGCTCGGCTGGGTATTCTTATTAAGAATATAAAAACTTTATAGGCCTGGAAG:1 - chrX 23067453 3' - INE-1 214 1 53.42 TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCT:1 + chr3R 19992740 3' + hopper 1360 1 54.11 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATA:1 - chrX 10319567 3' - mdg1 7060 2 70.55 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGTTCCAAGTGTGG:1 - chr2R 13259261 3' + mdg1 7419 2 56.16 CAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAATTACACCACCAACGACCACCCAAACAAAAGCCGCTGGG:2 + chr3R 27406120 3' + diver 218 1 78.08 TGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCA:1 + chr3L 21656010 3' - HMS-Beagle2 32 2 62.33 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1 - chr2R 981617 3' - 1360 39 1 62.76 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCT:1 - chr3R 4964086 3' + roo 357 2 55.24 GTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCA:1 - chrX 20999474 3' + BS 5064 1 61.64 ACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTT:1 - chrX 292441 3' + G3 4493 1 75.34 AAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACAACGTGCCCATTTTTACTGGCCTTCTTACGGGTCATTGCCGGCTTCACAACCATTTGCACTATGACCTTTTCTGGATATGGATACGATACGCAGGCCGATTGTGGTCATG:1 - chr3R 25230230 3' + baggins 5081 1 68.97 AAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGT:1 - chr3R 11040040 3' + Bari1 1660 1 53.42 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAACTGAATTTTACAAAAGTAATTATAATATTCTCACGTTTCTTTATTTG:1 + chr3R 13187534 3' + I-element 5312 1 52.05 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAAT:1 - chr3R 23639142 3' - pogo 62 1 60.27 ACATCCTACCGGCTGGGCCGGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCGTGTGATCAGATGAAGATTCCGATGTTGAGAATGGATGTATCTTTTTAGTTATAAGTTGAGTTTTAGAATTTAAATAA:1 - chr2L 23286562 3' - Tirant 417 1 45.97 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGG:1 - chr3L 14366521 3' + roo 9020 2 56.16 AGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTAC:1 + chr2R 12645497 3' - X-element 81 1 61.64 AAAGAATTTCTTGACAGTGTCAAATCTTCAAAACTTGGATTCAGTTGTTTTTATCGTCCATTATTATTATTATTTTTTTTACATATTGATAAAAAAAATATAAAGAAATAAATGTAATGTTAACTTTGCATTGAAATGCAGAAAAT:1 - chr3R 830504 3' - S2 207 2 79.45 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTACTTTGCGGCTGCTCGGCTTTTGAGTGCTCGCTCTTGGGTAATT:1 + chr2L 7593118 3' - jockey 4699 1 50.00 GAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAG:1 - chrX 21087610 3' - mdg3 71 2 72.41 CTAGCTTGACTATTAGGATGAGATTCTAGTCTGTCAAATGAAACGAAAAAACCTAAGACGACGACAAACGATCATCATGATAATGATAATGATAATGATAATGCACACAAAAAGGAGACGAGGGGCAAGGAGCTATTTGATCATCA:1 + chrX 3358716 3' - jockey2 3103 1 74.66 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTT:1 - chrX 14771698 3' - BS 31 1 55.71 TTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAA:1 - chrX 19038376 3' + hopper 1346 1 66.44 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAAC:1 - chr2L 7580893 3' - Transpac 9 2 40.95 TGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAATGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAAAACAAAAATGGGGATGAAAACAATTACGTAAGATATTTTGAAATTAATTTTAT:1 + chr2L 18449095 3' - copia 4934 2 64.83 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAACCAGCAGTTGTTGTAACATACTTTTA:1 - chr2L 11298002 3' + I-element 5334 1 70.55 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGTTTTTTATGCGTACCCAGTGTTTATGTTTCTAAAGCTAGCAATTTGTGGGTGGG:1 + chrX 18409487 3' - jockey 4708 1 60.14 TACATATTTATAAAAAAACTTAAATTGAGTCAAATTAAGTTAATCAAAAATGCCCGAAAGTTATTATAAACACCTATATTAAGAAACAGCTTACGAGTTTTCCATGTTTTTTCTCCGTGCCAAATCAGCAATGTTGGCCTGCGTCG:1 - chr3L 10279943 3' + S2 1594 1 71.23 CCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGTCCGGGACAAGTTGAAGCAACAAGCGTTTTTGGCCGAATGATAACAATTGCCGACTGCCAACCTTTGCGTTTGCATTTA:1 - chr2L 3304043 3' - F-element 4254 1 57.53 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCG:1 + chr3R 4860548 3' - Transpac 4964 2 54.48 TGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCATTTATGCATTTGCGGGCGGAAAATGTTGATGGGGGGGTGGAAATCAAGTTATCCCCGGCTGTCTTGGCCTGAAATTAT:1 - chrX 19118551 3' - FB 855 2 50.68 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACAC:1 - 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chrX 12986547 3' + roo 331 2 71.23 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAA:1 + chr3R 7719815 3' - roo 8731 2 67.81 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAACGGTACTACAGTCGTGATTAAACTTCGTTTA:1 + chr3L 24756712 3' - BS 5077 1 76.43 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATG:1 + chr3L 11844842 3' - rover 6987 2 57.53 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATC:1 + chr2L 3234051 3' + roo 9007 2 61.64 TTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACC:1 + chr3R 9039037 3' + Juan 4173 1 56.16 ATAATAATAACAATAATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGG:1 + chr2L 15763088 3' + mdg1 7064 2 69.66 CTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTAATAGTATAGCAACTAATCTATAATTAGCATATTAATTGCATAACAATTA:1 - 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chr2R 20227210 3' - hopper 49 1 53.52 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGAGAAAGTGGGGCGGCCGAAAAAGGGGCGGGCCAT:1 + chr3L 10021916 3' - accord 185 2 88.33 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATT:1 - chr3R 23639174 3' - pogo 31 1 68.67 AGTCGAGTGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCT:1 - chr2L 16540941 3' - hobo 18 1 57.78 TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGCGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTATAAACGGCGGCTAAATTTGTTTTGCCAATTCCTAGAGAAGTGTCATAAACATTTTGGTCACGTTCACTCTTAAATGCA:1 - chr2R 9158045 3' + mdg3 5436 2 56.16 TATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTG:1 + chr3R 18971771 3' - Juan 4103 1 68.49 AGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTAT:1 - chr2L 7660942 3' + I-element 5263 1 79.45 TATTAATTAATATTAATATTAATTAATTAATTAATTAATATTAATATTAATTAATTAATTAATATTCTATTTATTAATCATTACTAAAATCTGTATGTCCAATATATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACCA:1 - 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chrX 10537830 3' - I-element 37 1 58.22 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGT:1 + chr3R 9003010 3' - roo 63 2 63.70 TTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAAT:1 + chr3R 19225085 3' + HMS-Beagle 6973 2 65.75 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGCTCAAACCAACTGATATACATCAATT:1 - chr3R 4679470 3' + hopper 1410 2 57.14 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCGTTAATTATGCTGAG:1 - chr3R 8075894 3' - 412 63 2 58.90 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAAAGTGCTCCGGTGATGTGATAAAAATTGCAATA:1 + chr2R 3563234 3' - Transpac 15 2 73.79 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAAT:1 + chr2R 11164466 3' - roo 38 2 83.33 AAAAAAAAAAATAGAAAAATGGCTGCCCCAAAACCTTGAAAACATCGCGGTCCATCCTAATTGAA:1 + chr3R 10595413 3' - hopper 141 1 95.38 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACCCAACGAGAAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACTTATATATTCAAATAATATTCAAACCATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGCCGG:1 - chr2L 21299306 3' + roo 340 2 60.96 AGGGAGGGAGTACGACCTGGCCACACACCCACACACACACACACGGGGGCACTTGCACACTTATGGCAGCATAAGCTCAAACGCGCGCTGTTGATTTTGCGCCTCAGCATTTCCCATTCCC:1 - chr2R 13360495 3' + Rt1b 4940 1 76.03 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCAAACCATATGTATTTGTAATTAATAAAGTTATTTCTT:1 - chr2R 11159216 3' - roo 27 2 62.33 GTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTATTAAGGATTTTTGAAAAATGTCTTTTTGGCTACAAAAAGGTACCATTCAGTCTATAGTGCACTTCGAGAATCGGCATTTTCGGATTG:1 + chr2R 4561528 3' + Cr1a 159 1 67.12 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAAGCAATAAATGATA:1 - chr3L 10373826 3' + 297 6908 2 68.49 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGGT:1 - chr3L 18125881 3' + Ivk 5345 1 55.48 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTAC:1 - chr3L 9269874 3' + copia 239 1 49.32 AAACAAAAAAAAAATAAAGGAACTAATCAAGTGGCGTATTTATAAATTGGTATTGATAGCAGGTACCCCAAAAAAAAAGAAATA:1 + chr3L 9252942 3' + Doc2-element 225 1 80.95 AAAGAAAACAAAAAACAAAAAAAACGTTCTAAAAGAACGTATACATTCCCCACTGCTGGCTAATAAAATGAAACATAACTAATCGAAAACAGAATGCGACGATAGTTACCGGTTATCTGAAAAAGTTGGGTAAGTTCCGACCAACT:1 + chr4 940713 3' + gypsy7 5013 2 41.78 GGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGAT:1 + chr3L 23112566 3' + R2-element 3194 1 55.48 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTGGAAAAATACTTTGGGCTGCCTTGGCTTTTATTTCGGT:2 + chr3L 22400592 3' - 1360 60 1 57.53 ATGTATATGTATATGTATATATATATTTTGCGACACATATATATATATATATATGTATGTGCGAATATCTGTGGAAAATGTATATGTAAGTCTCAACATCTGGCTGGGCGCAAA:1 + chr2L 2680489 3' + Stalker 244 4 64.91 TAATATAAGTTATATAATATAATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTGAAAAAAAAAAGGAAATAAGAAGTGCTTAGTGTTGTCATCGCTGCTAAAAAAGCAAGAAGAAA:1 + chr2L 8084128 3' + Doc2-element 4697 1 80.14 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCCTCTCGCTCTGGCTCTA:1 - 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chr3L 23940661 3' + Cr1a 4036 1 51.79 ACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAACCAT:1 - chr3R 19445934 3' + 1360 49 1 59.59 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAA:1 - chr2R 12472049 3' + transib2 2753 1 77.17 CAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGATTAAGTGAGGGGATTAGCGTGGTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATACTTTCATGCAAGTGACTTAATTTAAACAAGTTTTCTTT:1 - chr4 98832 3' + rooA 84 2 73.97 AGCGAACGCAATCAAAAATGTTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATGCATAATGATTTAAACATAGAAGCAGTTTCCATGCATGGCAAGAACATTAAAAAAAGAGAAAAAACGACAGGTCCAAAC:1 - chr3R 12781274 3' + Porto1 4327 1 64.38 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTTGACAAAAC:1 + chr3L 6518660 3' + 412 7494 2 52.74 TGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTCCCTGCTCCGGGCGATCCAATGTCCGATGTTAAGGACCCTATCGTCCTCTATATAGGTGCACAGAAAGAAATAATCCCTTCAAATATTTCACAAAAAAATAATAATAGTA:1 - 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Juan 4171 1 68.49 ACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTA:1 + chr2R 14653233 3' + 17.6 382 2 60.27 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAGACAGGGATGGCAAGGATTAAGCGGGTTGGGCGATG:1 + chrX 4341339 3' - roo 76 2 71.94 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGATCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAG:1 + chr3R 7719821 3' - roo 8717 2 60.14 TTAAGGCATACGGAGTAGCTGAGAACCCCTTTGTGACGTTGGGGGCTATTACCTCTCATAAAGCCTGCGGACCGGCTAACTAGGGTTGCTATTACAATAATAATGATATGGAATAACAATTAACTTAATCAAAATTATAA:1 - chr2L 15481813 3' - BS3 1749 1 80.71 TATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCCTCTGATAT:1 - chrX 21993561 3' + gtwin 414 2 69.47 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAG:1 - chr3R 19449401 3' + roo 321 2 79.45 AATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCGCCTTTTAAAAATATCAAATTGGAATAAACAAAAAAAAAACTAAATATATTTACTTCGCCTAAATCGAAATTTGTTAGCAAGCATAAAGATTAAAAGAAGACAGGGGATTTTGAAA:1 + chr2L 4726105 3' - 1360 3111 1 56.55 GATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTACCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATTAGCCGAGAACTTGAGCTAAAAGGGAAGACTTTTAAATTATGTTGTTGTGAGATGA:1 - chr2L 9683548 3' - Quasimodo 7022 2 66.67 AGATTTTCTTTGCTTTGAGGTATAACTTGTTTCTGTCTGCTTATAGCAGTGAAAGTAATCGAGCTTATTTAAATTTATT:1 + chr3L 15635385 3' - Ivk 4919 1 51.90 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATG:1 - chrX 13134847 3' - jockey 4779 1 69.66 AATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAAATTTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTGTGTTTTCGCCTCTTTAAATTATATTTACAGGTCAATTT:1 + chrX 12277774 3' + hopper 1003 2 59.59 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAACTTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCACAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATA:1 - 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chr3L 19590627 3' + hopper 171 1 70.55 AAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCA:1 + chr2L 22684606 3' - transib3 59 1 50.71 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGACTGTATAAAAAGCTTATAAGGGATAAAAGTAAGACAAAT:1 - chr3R 4679405 3' + hopper 1410 2 74.81 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAG:1 + chr2L 18549935 3' + roo 9026 1 55.47 AGACACAAACCTTAGCAGTGACCACCCGTTAAAGCCACGCCC:1 + chr2R 19025559 3' - R1A1-element 243 1 61.90 GATAATATAATAATAATAATAATTTAATAAATATATACTGAAAGTGAATTCAAAGTTGCTGAAGTATGTGAATCTTGAGACACAAATAGCTGACATTTGTAACTTACATATTTTAAATTAAATAAAAATATTCACTACACAAGTGA:1 - chrX 18421412 3' + invader3 5054 2 74.66 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGG:1 + chr3L 22035658 3' - F-element 71 1 66.21 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGG:1 + chr3R 15790063 3' - flea 4792 2 79.45 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTAAATTGAAAAGTTAAAAC:1 - chr3R 18093293 3' + I-element 5286 1 66.44 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGG:1 - chr3L 22400281 3' - 1360 51 1 65.22 CTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGTTTATTAAAAA:1 + chr3L 7300263 3' + roo 412 1 80.00 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTGGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAG:1 + chrX 7795596 3' + roo 8994 2 71.23 AAAATTTAATAAAAAAAAATAATAAATACAACTAGCTTACAAAAGTGATTAAATGCAATCTCTGTACTTTATATATGGTTCTTAAAATGCATATGATATAAAATGCAAAATTGTATCCCATATTTTTTCTCTCTGTACAAATACAC:1 - chr3L 11896838 3' + TART-C 11096 1 68.49 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGGCTGAGTGTCCCAAAATAGCTTAATATTGTAGATTAGCTCCACGAGTAGGATCGCAA:1 - chrX 20455628 3' + hobo 2894 1 52.42 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCATATTCG:1 + chr3R 23618242 3' - hopper 45 1 54.11 AGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGGTTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCG:1 - chr2R 5410964 3' + Tc1 1354 1 57.93 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAAT:1 - chr3R 22642306 3' - blood 7096 2 73.29 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAAAGCAGCAGG:1 - chr3L 6447020 3' - transib2 53 1 56.03 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAG:1 + chr3R 19032702 3' + roo 9034 1 53.54 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGC:1 - chr3R 21276552 3' - BS 5076 1 70.55 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACAC:1 - chr2L 7580891 3' - Transpac 45 2 50.35 TGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAAT:1 - chr2L 13585704 3' - Quasimodo 36 2 49.32 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTT:1 - chrX 18817273 3' + transib2 2769 1 55.56 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATA:2 + chr3L 3983881 3' + P-element 2810 1 33.56 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCC:1 - chr2R 3338786 3' - Juan 62 1 58.90 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTACGATTCAAATTGTTTAATAATGAAAAAAAAAATCTACAGATTTTAAATATATTT:2 + chr3R 7317713 3' + I-element 5340 1 72.60 GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGT:1 - chr2R 18316051 3' - HMS-Beagle2 6964 2 71.23 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCAGCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACT:1 - chr2R 8047277 3' - 1360 85 1 75.34 GAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACATAGGGCACCAAAGGCTCCTTAAGACCCATGATCTTAAGGAAAGTAGTCATAGGTAGTCACTACACCGGTATTTCGCTTCTGGTGTAGTAGTATAAGGGCCTCTAATAATTACACTCAACA:1 + chr3L 14530142 3' + Gypsy12A_LTR 1883 1 65.75 CTTACAAAAATTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACC:1 - chrX 21216726 3' + roo 9047 1 54.46 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATG:1 - chrX 4808538 3' + mdg3 170 2 73.13 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCTACTTGGACAAATCCGC:1 + chr3L 2544738 3' + Tirant 374 2 63.08 GCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCC:1 - chr2R 18316042 3' - HMS-Beagle2 72 2 65.07 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTAAGCATCTTGTTATTCTTTGCTTTGAACCAGAAATAGCAAATGGACTGGTAACATTTAAAAAGAAATTTATGCCATTTATAGAAGCAGCTGTAACACTTGCAGGCCTAGC:1 + chrX 10639387 3' + 1360 3355 1 70.29 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTT:1 - chr2R 15326851 3' + copia 5087 2 64.38 ACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGGGGTAGCAAAGTTTTGGGGCATTTTAATACTGTCATCATCATCATAATTG:1 - chr3L 5061498 3' + 17.6 476 2 73.97 GGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGTATTCTAAGTATTCCTTCTGTGATTTCACATTCCGATTAAATTGTAATATTGCGTTTATTTTCAAATGGAGATACGCAAACATGGCCACTCGCCGAGCAACTCTTGAAGACTTTAA:1 + chr3R 16881634 3' + invader4 2751 1 57.24 CATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGAGTTTTTAATAGGCAGTT:1 + chr2R 5424278 3' - 1360 3355 1 72.55 CTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATT:2 + chr3R 4682976 3' + Burdock 6319 2 72.60 TAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAA:2 + chr3L 24934403 3' + HMS-Beagle2 255 2 58.22 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAG:1 + chr2L 47190 3' + roo 9026 1 54.26 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATG:2 - chr2L 6654659 3' - diver 5960 2 65.07 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTT:2 - chr3L 15913835 3' - jockey 4807 1 52.74 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGTCGCA:1 + chr3R 29690783 3' + I-element 5287 1 65.75 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCT:1 + chr2R 8735688 3' - mdg1 47 2 52.05 TTTTTCATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTAGGAATGAAATAAAAGTAGGTAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCTATATAATACACGTTTTTATAGACTTATATGGAGTGATAAAAGCTGC:1 + chr3R 27478564 3' - Tc1-2 372 1 50.68 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATGGCACTGTCCCTGTTTTCC:1 + chr2L 4714000 3' + transib2 2803 2 71.23 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAGCATG:2 + chr3R 7719844 3' - roo 37 2 60.00 ATTAATACTTGTAAGTATGGCGCGCATATCTGCGGCCAAGAAATCCGAAAACACAAAAATACGTAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAACAAAGCTAATATAGAGTAGAAATAAAAAAAAGCTACTAAGAGTCCAA:1 - chr3L 16633160 3' + TART-A 13273 1 63.43 CAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCAGACACACACAAGCACTCGCATACATACAGAGACAGAAAGGACGAAGGACTCAGAACACAGAACTCAGGACTTGTGCGTCTGTTAACAGCCGCATTTAG:1 + chr3R 17559100 3' + F-element 4425 1 70.14 AATAAAATAAATTAAATAAAATACAAGATGCATTTGCCGTCTTTCAACTTACTGTTAGGCAACTTACATACATACATATATATAAAAAATACATGGATTGTTTTTAGAATTAGGCAATAAATATAATTCTAAAGAGCTTATATATG:1 - chr3L 23206283 3' + F-element 90 1 76.03 ACAGAAAAAAAGAATCGGAAAAGAGGAGAAAACCCAAAAGAAACCCCCAAATGGTCGGAAGTGAGAGAGGTGGAGTGTGGGAGTGGGACGGGGGTAGTGTGAGTGTGTATGCCGTGTATGCCATTATAGAGTTTCTTTTGGGTTT:1 + chr2L 16017543 3' - McClintock 6162 2 71.03 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTGGCT:2 - chr3R 19407862 3' - diver 5910 2 68.97 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACA:1 - chr2R 20010214 3' + Juan 4135 1 72.60 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAATATTTGAGCTGAATAAACTGAAGCGGCACTCATTATGTGCAATACTTTTTGCATTATTTGCCAGCGTTGTTCCTTAATTAAAATG:1 + chr3L 5533076 3' - roo 15 2 74.66 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTCGCGGAAAGCCG:1 - chrX 8437632 3' + P-element 2849 1 60.00 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATAATTCGACTTGTCTTATACATTGTGGTGAAAATGTTGTTGCTGTATTTCCTCGTCTTTATTTTTACCATCTTGTGTTT:1 + chr3R 23491599 3' + transib2 2771 1 75.23 CTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATAAACGCAATGAACAATACAGTAAAAAATTTAATTATTAAAAAACTCCAGACAGACTCTACATGCAATTAGCTAGATTTGACATAACAACAATTAGTAAATT:1 - chr3R 2081345 3' - gypsy 21 2 71.23 TATATATATTTGCTTTTATTTTTTGAGAGAGGCTCTGGAGGGCTCTTGCATCTTTATGGCAACGTGTGTGTCGTAGTCAATTTTTAATTAGAAACGAAGAAACAATAAACTACACATCAAACT:1 - chr3L 10569615 3' - HeT-A 326 1 77.24 ATCGACTCGGTTATTGATCCTGATCAAAAATATATATATTTTATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTATCTAATACGTGATTCAAAAAAATATGGGCAAACACTAAGATAATACAATATATATTCCTGTGGACGATAATC:1 - 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chr3L 25406608 3' - 1360 15 1 69.18 ATCGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGGTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATT:1 + chr3R 27406078 3' + diver 219 1 67.96 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATC:1 + chr3L 24208211 3' - Quasimodo 57 2 62.07 ATCAATAGATAAATGATAAAATAATAAAATGAAAAACATTATTCATCAAACCGATATTTGGTAAATTCTTCTCGCATTTGTCAATTAGTTCAATCAGAAGGCGAACACATATCAACTACATGCACCATCCCCAGACGATCCACC:1 + chr3L 22603889 3' - INE-1 488 1 66.67 CACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTAATCTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTG:1 - chr2R 545171 3' - Bari1 1456 1 54.29 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCTACCAAGTAGTCTTAAAGGAATTTATGAATTGTTGAGGAAAGTACACAGAATTGC:1 - chr3R 25432966 3' - transib2 28 1 39.73 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAG:1 - chrX 10319585 3' - mdg1 40 2 58.22 CTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAA:4 + chr3L 19349988 3' - 1360 3282 1 73.97 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGG:2 - chr2R 18315998 3' - HMS-Beagle2 6911 2 65.07 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATA:1 + chr2L 22674898 3' + mdg1 377 2 50.68 TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATAAAAAATCAAGAACTATGCCATTTAATCTGT:1 - chr2R 3563993 3' - Tabor 12 2 77.40 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATATATAATAATAATATATATAATATATACAGTTAAAAGCCATCAAAACACCCCTTACATTTGCATATCCTTATGCCCT:1 + chr3L 21969881 3' - opus 38 4 58.22 CATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGCCACTGAATGTTTCACATTATTTAACCCCCTTTATTTTTTTTTTGTGTGGCACTGGCCAAAGGTCCAAAGGGGCGACATGCTGCAGGGGCGTGGCCTGCAG:1 - 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chr3L 11913188 3' - BS 5054 1 58.22 AAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAACCTGTTGATATTTTGTTTAGATTTTTATTCGTCTTGTTGGTTATCCGAAAGTTGGCAATTTTAGCTGGAAGCTTCTTTCCTTCTTTCATTTCTATGACGCACAGCATTATAAGTGTGT:2 - chr2R 7402057 3' + INE-1 246 1 59.59 ATACTAACACACACACACACACACGCCCACACAGGACCCGGCATTTATGTAAATCCTACCGTTACTTCTTACAA:1 + chr3L 11310723 3' + Quasimodo 33 2 85.14 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATCACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCT:1 + chr2L 16943891 3' + copia 222 1 60.27 AACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAGAAGCTGACCACCCATTCTAACCTTGACTATCCT:1 - chr3L 18285140 3' + Doc 4415 1 78.79 ATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAGATATGAATTAAGTTTAATC:1 + chrX 3432010 3' + Ivk 5367 1 71.92 GAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGCCTT:3 - 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roo 8701 2 60.96 TTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGCTGGATAGGATTGCGACCCTCCTCTATCTGGAAAAAATGTATATTTAAGCGTTAATGGAAAATTGTCGAATTGAAGTCGGTAAAAATGAATTAAACTAAAT:1 - chr2R 8697576 3' - 17.6 84 2 72.60 TCCATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACTTCATCCCACTTGACCTATTCCATTGTATAGTGTGCCATATGGCCAAAAAGTTCATTCAACCATTGTCGTTTTATTTTGGTGGCTTTAGCA:1 - chr3L 17888903 3' - Copia1_DM 464 1 64.38 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGGGGC:1 + chr2L 3234091 3' + roo 9047 1 69.86 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTTTATGAAATTTAAAAAATATCGTGTCTTTGAATTTATTCAATG:1 - chrX 21505658 3' - roo 8740 2 73.97 ACTGTATAATTGTCAGAATTTTGTTGTGGTTCAGGATTTGAGAGGATAGGGCTTGTGCCTGGATGTTAACCCTTCCATCTTAGAGAAGTTAAAGCTAAGTGAAATAGTTGTGGTAGATTATTTCACAGGCAGACAGGTAAAACGAC:1 - chr2L 10667725 3' - baggins 5338 1 65.07 GTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTT:1 - chr3R 904899 3' - rover 6 2 67.81 AATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAACACTAATATATATTAGAGTTATTTTACATTATATTAATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCAAACCAAGTTTTCTTTTTATTTAAATGGGGTGGTGAATTTTATTGAATCTTCTCTTGG:3 + chr2R 5284493 3' + Cr1a 4263 1 60.27 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATT:2 - chr2L 16858670 3' + Burdock 6359 2 63.70 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGG:1 - chr2R 22514141 3' - P-element 74 1 21.85 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATATGTATGTACATTTATT:1 - chr4 60428 3' - transib2 32 1 63.70 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTG:1 - chr2R 13168650 3' + P-element 2824 1 43.15 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTG:1 + chrX 18336664 3' - mdg3 57 2 63.20 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACCGCAGTTGACAA:1 - chr3R 23618075 3' + hopper 1404 2 78.08 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATATGCC:1 - chr3R 27405944 3' - diver 5928 2 57.53 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAA:1 - chr2R 4785211 3' - Juan 4060 1 59.44 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCAT:1 - chr2L 13556359 3' + transib2 2743 1 73.97 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTG:1 - chr3R 19073195 3' - roo 73 2 70.55 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAA:1 - chrX 13134850 3' - jockey 4783 1 67.12 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTT:1 - chr3R 25709757 3' + hopper 1366 1 52.05 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCACGCGATCGTTTTT:1 + chr3L 12004371 3' + P-element 2822 1 28.77 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTTATT:1 - chr3L 1279072 3' - roo 8708 2 51.80 TTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAA:1 + chr3L 13739630 3' - BS 5083 1 78.08 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTGCACGATGGCCATGACTTAGCCATG:1 - chr3R 19992584 3' + hopper 1403 2 74.66 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAGCCTTTACAGCTATCTTTTTGCTAGCTAAATTGTTAAGAT:2 + chrX 9410619 3' + I-element 5340 1 72.60 CCAAAGACACTAGAATAATTATAGAATATTATTCTAGTTATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCACATTTCCGAAATATCTTTGGCAT:1 - chr3L 14638580 3' - Tc3 311 2 58.33 GGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTAGGTGTCGGCGTCTCGAGACTTGGCAAGTGCGTAAGGTGTGCGTTTG:1 - chr3R 9905750 3' - I-element 211 1 67.81 CTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGATTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTA:1 + chr3L 19274887 3' - transib2 133 1 42.03 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCT:1 - chr3R 19407887 3' - diver 5936 2 51.37 ATTCCCTTTTTTTTTTTAATTCTGCACATAAATCCCACCCCATTGTGGATACAGTCTCCAATATCCCCTGGGTTTTGGCCAACCTCTAGCCAGTACTC:1 + chrX 20490328 3' - Bica 336 1 74.49 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACACACTAT:1 - chr3L 12004212 3' + P-element 2855 1 63.70 ACATTTTTTCTTCACTGGATTTTCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTAAGTGTGTGTGCAAAAATTGAAATTGAGAATGGCAAAATAATGAATTGTAAATTGCTTCGAACGCACACATGTAAGTATATTAATTTATTTATT:1 + chrX 18340341 3' + mdg3 480 1 63.01 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATG:1 + chr2L 4713982 3' - transib2 36 1 60.14 ATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGTTTCCTAGACACCGAA:1 + chr2L 14523304 3' - HMS-Beagle2 6883 1 54.79 ACACCACACCCAACGCCATCGAGCTAGATTCTGAAGCGTGCACCCGCCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAGTTTAGTTAGGCATAATAATAATTATAATAATAAGTAATAAGTAATAAG:1 - chr3R 18157447 3' + Gypsy12A_LTR 2179 1 57.93 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATA:3 + chr3L 14366601 3' - roo 91 2 79.45 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCG:1 + chr3R 16157392 3' - pogo 20 1 62.04 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAACAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAA:1 - chr2L 11298042 3' + I-element 5294 1 63.01 CATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCA:1 + chr3L 25482987 3' + accord 487 2 57.78 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCA:1 - chr3L 3983816 3' - P-element 78 1 32.19 TTGTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTATCTGGGGTGTCTCTTTTTTCTGTGTCAACGAAGAAAGGTTGAATTAAACCGAAAAAAATAACCCACTAC:1 + chrX 13847531 3' - gypsy7 5009 1 78.95 AATGTAGACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTG:1 + chrX 10319687 3' + mdg1 340 2 71.23 ATTTTCCATTTTTTTTTTATTTTGTGTTATTTATACCTATTTCTTTTGCGCTGTTCCATGTCCTTCCAGAGTTTTCCAAGTGCCTACAAGGATTGGGGCAAATAAAAAAAAATAACGAACAGTCCGCTCGACTCAATTTACAAA:1 - chrX 8293188 3' - Doc2-element 247 1 79.17 AACATAATATAATATAAATAAATCGTATTTTTATTAATTATATATGTATAGTATTCATATTATACATAGAATCTCTTATATTAAAGCTTTCTTTAGTTCATATTTATCGTATGTTATTAATGCATATATAGAGAACCAATTCCCTG:1 + chrX 17759186 3' + TAHRE 430 1 54.11 TAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTACTTAACCCCCTCCAGCGCTCAACCCACACTTGCCAAACATGCGAC:1 - chr3R 21896831 3' + I-element 5110 1 65.38 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGG:1 - chr3R 11062765 3' - roo 66 2 77.97 ATTCAGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTATGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAAACAATTTT:1 - chr2R 4887634 3' - jockey2 3020 1 74.66 AAATATATAAATATGCATATATATATATATATATTGGGATACTTGGGAATCTGCAACTCCAGTCGCATATGCCTGCGCACTTGGCACTCGAGAAAGTCCTGAACATTCCTCATTTCCG:1 + chr2R 20562569 3' + G3 4505 1 71.19 TAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTAGTCCCTTTCTGCACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGAGTCAGTTTTTAGGTTTTTCTCTCTGTTGTCCTCGGGGCTTTTAATTTTCACCTTGTTTACTTTAACG:1 - chr3L 22493929 3' - gypsy12 9892 3 65.96 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACC:3 - chr3L 16690922 3' + I-element 5275 1 75.34 GTTAGAAGGAAGAAACACCGGAAAAAATATTCTTATATTCTATATATTTTTTTTCTATTATTATATTATAATATTTTTCTATATAAGAATATTCGTGTGAATGTCGATTCAAAGACTTTTTATGAATAAGCTATAGAATGAGTTAG:2 - chr3L 7856048 3' + gypsy8 4574 1 65.07 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATT:1 - chr3R 29612035 3' - jockey 96 1 76.03 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAG:2 - chr3R 4964089 3' + roo 351 2 58.22 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTCTATAGA:1 + chrX 12129455 3' + flea 5001 2 76.03 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAAACGTGAGTTGGTGG:1 - chr2R 18258759 3' + Juan 4178 1 53.42 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAACAGACAACCTGGTCAGACAGAA:1 + chr2R 16929867 3' + jockey 4969 1 65.07 ATACTTCGTTTTTTTCTCAGGTATTACTTCGATTACTCGCAATTAAACTTGCGTAACATCTATTTTCATAAGTGAATTAGAATAATGTTGTCTTGTTTCTTACACTCCGGATTGCTTGGATCGAAGTCACAGCGAATTTTCCAGTT:2 - chrX 9878654 3' - Doc 4453 1 75.34 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGGGTCAGG:1 - chr3L 6447008 3' - transib2 38 1 57.25 TCCTTGGTTTCTCTCATTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCTCATTTTGGCCTTCTTCGCTCTTCGGCTCTCTGGCTGGGGTTTTTTGTTTTGGTATTTCTGTTGACATCGTCTCATTCGCAGCTCCCAAAAAAGTAC:1 + chr3L 18398608 3' - Bica 428 1 67.81 AATTTTGGCCGTCACTGAAAAAGTGGCTGCATATTTATGGCCGTTACGCATGTTGTTTTTCTTGTGTCTTTGGGCAGGCCAACATGGGACCAGCAAG:1 + chr2L 23233881 3' + 1360 3326 1 69.07 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTAT:1 + chr3R 21276635 3' + BS 5044 1 50.68 TTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAA:1 + chr3R 19450004 3' - roo 8787 2 71.93 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCA:1 + chr2R 7850030 3' + roo 9050 2 56.31 GGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTTAACCCTATTCCCTCTTTTTATTAAGACTTTTTCCTGTGTACAACACATCTATTTTTTCCGCAATGTTTGGGAAATTGTTT:1 - chr2L 17196482 3' - Doc 4502 1 51.03 ATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTAGAAATCGACGTCGCATAAAAAATTGATGGCCTCTTCTAAT:1 + chr2R 8383957 3' - hopper 304 1 74.66 AGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAATTACAAACATTTTAAAAATATCTTAAGCAGGATATGAACGAAC:1 - chr3L 8958592 3' - 1360 3191 1 77.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAA:2 - chr3R 5769000 3' + roo 9020 2 52.05 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATT:1 + chr3L 12004318 3' - P-element 55 1 36.97 TAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCACGTTTTATAGATGAGAAAAGCTCCTATTTCCGCCGCAG:1 - chr2R 6964934 3' - Burdock 86 2 67.11 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGAC:1 + chr3R 10270670 3' + Juan 4159 1 50.68 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTT:1 + chr2L 20840102 3' - mdg1 32 2 62.33 AAAATACTTAAAAAAATAAAAAGAACTTTATGCGTGAGATAGTAATGTTCTTAAAAAAATGTTTGGGAATATTATAAATTATTGAAAATAATCTATTTAAATCTTGTTAAATTAACTTTACAAAATAAGTATAATCGGCTCTTTAT:2 - chr2L 15368601 3' + TART-B 10507 2 80.82 CGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAAAAAAGAAAAAAAAAACTGCAGAAAAAGAGCACTACAAACATCCCGCCACAATGACAAATGTTTGGATCGGAGCC:1 - chr3L 2541088 3' + Tirant 237 2 57.14 ACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAGAATGTCAGCAATTTATGAATAATGTAGTGAGAAACACAGGAATCGCAGAAAACGTGATCGGAAAAT:1 - chr2R 8153095 3' + mdg1 454 1 54.11 TGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGCTGCGAGGAAGGACATTCGGGACTGCAGGACATTGGG:1 + chr2L 19689341 3' - G2 3001 1 73.23 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAAC:1 - chrX 2479502 3' + mdg3 170 2 66.44 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTA:1 + chr2L 20266042 3' - roo 8722 2 59.59 CAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATAGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTTTTCTTTTTTGTTTAAACTTGTCAAGATAAATGTGTGAAAG:1 - chr2L 8150877 3' + Stalker4 7174 4 71.92 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTACAACAATGCTCTAGG:1 + chr3R 28469302 3' + 412 447 2 59.09 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCCAGGCGGCGGACAAAAAGTCATTGGAAATG:1 - chr2L 14675645 3' - 297 46 2 56.93 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAATTTAAAGCCATGCAGTGTGTGGAG:1 + chr3L 7889708 3' + roo 397 1 77.40 GGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCACCTAAATCCGACCCAGATTACCAACACTCAACCCAAATAGAGCCCATGTAAATATATATCTTATCTGCTCGAAACCTGTTGATCCCAATCCCAAAAATAAAT:1 - chr3L 15726776 3' + I-element 5025 1 73.97 AAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATTAATATAAGCAACCATTAGCTTACAATTCATAAATTCTTAA:1 + chr2L 14187561 3' + invader2 204 2 79.45 TAAATTAAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAACGAGATAATAATCAGGACAATTAACCTGAAGGAAGACCCCAACAGGAAGTAATCAGCACAACTAGACGGAAGGAAGACTCCAACGGAAAGTATTGTGAG:1 + chr2R 1845578 3' + Doc3-element 217 1 64.83 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAATTTTATTTTCAAAAT:1 + chr2R 1916460 3' - Juan 51 1 49.32 AAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTATTTCTTAACATTTCTGTATTCCTGGCTGGATAAGCAAAAGGATAATGATTAAATAATAAAATGAAAA:1 - chr3L 22604365 3' - P-element 2686 1 15.75 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTA:2 + chrX 11661523 3' - pogo 32 1 63.70 ATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCTGAACATTGCAAATTTATCGTTGTTGTGCTGCCACCTTCATTCAATCTAATCGTAATCGCTGTTTCGTTTTTGTCTGTATCTGTCACGGTTTTTGGTTGTTTT:1 + chr2R 19466074 3' + gypsy4 188 2 66.90 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTGGGGGTAAGTTAGGTCAGTTTCTGCTTTTCTTTTTTGGGTATGGGTCAAC:1 + chr2R 23180347 3' + roo 402 1 75.34 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTTCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTTTGTGT:1 - chrX 14771693 3' - BS 32 1 55.48 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTTTGGCCGAGGTTGGGTGGATGAGGATTAGGATTTAGGAGATCAGTCTGAATCGG:1 - chr2L 22173812 3' + Juan 4195 1 59.71 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAATACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTG:1 + chr2L 13158727 3' - roo 8738 2 69.18 ATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATATATGCACAACGTCCAATGTATATTCATTAATTTCAAGAGTTTCTACTG:1 + chrX 19411464 3' + HeT-A 5993 1 66.19 GGACCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTGGACAGACAGCTTAAACGCCCCCTTC:1 + chr3L 16736475 3' - Tc3 314 1 60.32 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAA:1 + chr2R 14051867 3' - roo 8709 2 56.85 CAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGA:1 + chr2R 3564137 3' + Tabor 418 2 62.33 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCA:1 - chr2R 19199638 3' + hopper 1412 2 77.39 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGTTTCATAAGACTGATTTAAGGAAGTGAAACA:1 + chr2R 3564186 3' + Tabor 467 2 72.60 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACGTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATT:1 - chr3R 23618122 3' + hopper 1357 1 56.16 AATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGCACCGTCATCACCGTCATCAGTCTTTAAATAATTGGCCCTCAACTAGTGGTAAAAACCTCCACACCCCACCCCTTGCTGACGTCACGGGTT:1 - chr2R 8052809 3' + Gypsy6A_LTR 369 1 78.33 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAA:1 - chr2R 22034634 3' + copia 210 2 54.11 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAATCAGGGACTCTAGCTGAACCCCGG:1 + chr3R 18488520 3' + roo 402 1 76.55 ATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAAAAATAGCCAAAAAAATATAATATTTCAAATTACTTTGTAGAGATTTCAAAAAAGAAGAAAAAAAAAACTGGTGACAGCAAGGCATGTCAAAATAAACCTTTTTGAC:1 - chrX 10319810 3' + mdg1 41 2 73.29 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAATT:1 + chrX 6116363 3' + transib2 2780 1 56.16 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCCCATCAGAACTTT:1 - chr2R 16817851 3' + 412 7509 2 59.59 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGC:2 - chrX 2214263 3' - jockey 4832 1 66.44 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCA:2 - chr2L 13556338 3' + transib2 2764 1 59.59 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCTTATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATGGGAGACTTTTGTGGGGAAAATTATT:1 - chrX 19539426 3' - pogo 6 1 71.23 ATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAG:1 + chr2L 22170088 3' + Juan 4208 1 73.48 ATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTT:1 + chr3R 14860259 3' - BS 5019 1 67.83 AATAATCTTCTTTAATTATCATAAATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCC:1 - chr3L 4777116 3' + Cr1a 79 1 81.51 TCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGTACTATTAAAGATAGTAGGTTGAGATTAAGCATTTCTATCGATTTTCCAAACAATATTTTGAGTCAAGTATTAATTATGCCCTATTAATAATCCAGGCGATCATAAGATAGATGTGGTCTC:1 + chr2L 6263035 3' + INE-1 134 1 54.11 ATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGC:1 - chr2L 12341825 3' + BS 5030 1 58.90 ATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAAATGATGTAAA:3 - chr2L 14874104 3' + copia 255 1 58.90 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCC:1 + chr2L 11839730 3' + mdg1 341 2 67.12 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCATATCCTTTATTCTTTCCTCAACTGTCTAC:1 - chr3L 13365709 3' - BS 5017 1 61.64 GCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCCGGCGTTGATAAGCAAAAAGCCATTGAATTGTGTTTCTAAGGCGGTCAATTCATAATATACATATATATACTAT:1 + chr2L 7432536 3' - I-element 5278 1 53.42 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTC:1 - chr3R 23618090 3' + hopper 1395 1 70.71 TTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCCTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCATATATAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAAT:1 - chrX 21534506 3' + 17.6 7182 2 50.00 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATTTCGGTCTGGAATGCAGGCAATAGTTGA:1 + chr2R 12779760 3' - I-element 22 1 71.23 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTTTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGGAGTCTTATTTGTCATACAAAG:1 - chr3R 4964070 3' + roo 9034 1 58.90 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCT:1 - chr3L 18046628 3' - roo 86 2 79.31 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACCACACACACTATCGTAAACAATTACACACACACATCAATGTGTAAGTACGAAATGTAATTAAA:1 + chr2R 4189135 3' + S-element 1697 1 72.60 ATAAAAAACGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCTCTCCTTCCCACTCGATTGCCCCCAAATTGGTTTGTTTAATAGTTTTGAATCGTGTCAGCCGGCTCAGCA:1 + chr3L 7491143 3' + FB 491 1 47.95 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCG:1 + chr2L 15550785 3' + Bari1 1691 1 66.12 ATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGAGTGTATATTCCCCAAGCGAATTTCAGTTGGCGTGACGCAACAACAAAAAAAAAATA:1 + chr3L 8870986 3' - Porto1 349 1 59.70 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGTGTGGTTTGGTGTGTGATGAATACTTTTATTATAGGTTCAATACC:1 + chr3R 3920637 3' + roo 396 1 76.71 TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACTAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATTTGTATTTGGCTATTTTT:1 - chr3R 6419836 3' + Tabor 430 2 58.22 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTAATTATATTTTCACGCCCGTGAG:1 - chr3R 9002885 3' + roo 9037 1 63.01 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCAT:1 - chr3L 7889576 3' - roo 79 2 78.77 ATTCATATCAAATATAAAGAAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAAAATAAGCTTCCCC:1 + chr3L 9270001 3' - copia 46 2 47.95 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAAT:2 - chr2L 4003687 3' - mdg1 7102 2 62.33 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTGGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAG:1 - chr3L 10731764 3' + 297 6921 2 57.53 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGCTGGT:1 + chr3R 10931745 3' + 297 6948 2 59.06 TTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTACAACAGCTGACTTTACAGCTGTTTTTTTTCAACACTATACTGTTAATTTTACACTTGC:1 - chr2R 3338720 3' - Juan 16 1 76.03 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGA:1 - chrX 19074735 3' - mdg1 30 2 60.69 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAG:1 - chr3L 1692007 3' - blood 7060 2 52.74 ACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAAAAAAAGGTGTAGAGATTTATTTCACGTTGAGATGGTAAGAATGTGATAGAA:1 - chr3R 29690659 3' - I-element 5215 1 73.29 AAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAGAAACCCCAAACC:1 - chrX 5110895 3' + gypsy7 5011 1 85.71 CATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCCAATGAATGCCCAATGGACAATCAGCATAAAAAAGGCAAAAAGATTGGCAAAATGAAACGAAAAAATA:1 + chr3L 5392193 3' - diver 6083 2 53.42 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTACTATTACGAAGAGAGCATGCAGCAAAGCCC:1 - chr3L 21769406 3' + Juan 4133 1 70.55 GATGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGAAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAA:1 - chr3L 17055405 3' - Tirant 8118 2 73.33 CGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGTTGGGTCGGTTCAGTTTGGTTTGGTTTTGGCTATCGGTTTGCTTTGACTGGTTTCCCAGCTGCTGCTGGTT:1 - chr3L 13621710 3' - ZAM 30 2 76.09 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAA:1 + chrX 2479579 3' - mdg3 5321 2 62.33 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTG:1 - chr2L 17809143 3' + jockey 4976 1 69.12 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCA:1 + chr2R 19941630 3' + hopper 1408 2 67.82 AATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAA:1 - chrX 6116207 3' - transib2 23 1 67.12 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCC:1 - chr3L 19454923 3' - mdg1 7097 2 56.16 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGTCCT:1 + chr3R 15790071 3' - flea 4768 2 70.77 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATC:2 + chr3L 1279193 3' + roo 9021 2 56.16 CTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGGCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGC:1 + chr2R 5531206 3' - 1360 98 1 46.90 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACA:1 + chr3R 17996269 3' + diver 171 2 55.32 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAGGCGGGGCTTGATCCTGTCCGCTCTCTC:1 - chr3L 5881551 3' - pogo 37 1 56.16 AGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGTGCCCTTCTGGCGTGAACAATTGTACCTGCAATATTGTAAAGGTTTTATAATAACTGAAACAAATTCTACTTAA:1 + chr2R 7306561 3' - Max-element 8305 2 64.38 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATA:3 - chr2R 22034670 3' + copia 174 2 75.34 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGAGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGGTTTGCT:1 - chr2L 22193435 3' - roo 8717 2 67.23 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGT:1 - chr3L 16973334 3' - S-element 1552 2 60.27 GTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACAGCGTCCGCATTTTGACTGGCCTTCTTGCGTGGCATCGATGTCAATGGCGATAGACGAGCCCAGGATGGCTGGGCATGAT:1 - chrX 18418561 3' + baggins 5051 1 68.28 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTC:2 + chr2R 5151309 3' - roo 75 2 70.55 TATATTTTTAAAGTTTATTATAGTATTTTTTTACGTTTAGTATTATAAAATTCATAAATTTGTTGGGCCTTAAATCACCATATTTGAACGCTGCGGATACGGAAAATTAGATTTTTCCGAAACACTCGAAACCCGTCCCACTGTAG:1 - chr3L 13922375 3' + hopper 176 1 70.55 ATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTTATTTTAGTATTATTTAGCAAAACATGTGTGTGTGATTTTAAACATTAATGAGGTTACAAAAATGTGCTCGTGCCAAGTGCTCGTTAATTTG:1 - chr3R 4567342 3' - Quasimodo 93 2 75.40 CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAATTAACCTTTGTCCCAAC:1 - chr2L 17005661 3' + Stalker2 384 2 63.70 AAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGGATTCAAACATAA:1 - chr2R 5070899 3' + Doc2-element 226 1 42.64 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCTCATACTCTGAATTTAAAAAAGTTGGGTTAGGTCCTAAA:3 + chr2R 5074623 3' - 1360 20 1 71.23 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCATGTCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGAAAACT:1 + chr2L 14523276 3' - HMS-Beagle2 6900 2 32.59 GTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATATCTAGACGCAGTTGATTTTGGTTCTCGAGTTTCTAATGAACTGCAATTTGTGGGAAAATATGACAGTGAATGCAGAGAACCATTTGAGCAATATGGAGAA:1 - chr2R 23788551 3' - Ivk 5003 1 71.23 TGTAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGCTGTTGTGGTGGTTGTTTGGGGTTTCTTTCATTTTCTTTGTTGCCTTTTAGCCAGCCATAAAAGATGAAATGGAAATCTGTCGAGCTCTTGCCACTTGCAGAGTATCGACTGTGTG:1 - chrX 6631202 3' - Tirant 8124 2 52.74 GTACCCAAAGACAGCAACATAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATT:1 - chr2L 13844186 3' + Stalker2 313 2 75.34 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGC:1 + chr3R 4860541 3' - Transpac 4972 2 54.79 CTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTATGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAA:1 + chr3R 433129 3' + 1731 231 1 72.60 AACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGAT:1 - chr2R 12185324 3' + accord 398 2 62.33 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATA:1 + chr2L 6654760 3' + diver 6063 2 52.05 GGGTGAGTTTGTGGCTTGGGCGTGGTGGATTAGTTTATAATTAGTATTTTTTCTAGTCTTAGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGGAACATTAACATATTGCAAGGGTTGTTTACGTTTAACAATTTAAATTATTTTACAAAAAA:1 - chr2L 11254920 3' - HeT-A 5928 1 86.30 TTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAA:1 - chr2R 4785221 3' - Juan 4072 1 51.72 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCA:1 + chr2L 18226851 3' - roo 84 2 76.03 ATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGAAAAATGATTCCCTTAGCAGACA:1 + chr2L 21930268 3' + Copia1_DM 105 1 52.05 TGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGG:1 + chrX 10521714 3' + Tabor 408 2 69.18 TATTAATTCTGATCAAGAATATATTTACTTTATGTGGTCGATAACTCTTTCTTCTGCCTGCTTCATACATTCCAACGAATATAGTCCAGCCCCTCTCGAATTTTGTTTGTTTGCTTTGTGTGATCTTTGCATAAATCAAATGAAAG:1 + chr2L 9720722 3' - INE-1 84 1 71.23 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCTCTCGCATTTTTTGTTTTGGTTACTGGTTTTTTTCGGTGGCTTCGATTTGG:1 + chr3R 9595095 3' - Tirant 8118 2 52.44 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCCA:3 + chr3R 31653187 3' + roo 9032 1 60.27 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTT:1 + chrX 12129402 3' + flea 4948 1 63.01 ACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGAGGGCAATCTTCAGGCTCTGTTAGATCGCATCAATCAGGTAATGAGCATGCACACAGGTCGCGAGGTTC:2 + chr2L 6952787 3' - G2 2992 1 52.74 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCC:2 + chr3R 18093391 3' - I-element 46 1 51.37 ATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTAAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAACCCCA:1 + chr2L 12553470 3' + F-element 91 3 73.97 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAATC:1 + chr3L 6397781 3' + roo 9034 1 59.59 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGGGTCAAGAAAGC:1 + chrX 10537944 3' + I-element 5292 1 59.59 GCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACG:1 - chr3R 11040041 3' - Bari1 41 1 55.80 AAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAACCCCAAGCCAGACTTTCAGCTTCCATCGACTAATTTGCGGATTT:1 + chr2R 23587983 3' - hopper 302 1 59.26 AATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCA:1 - chr3R 23639160 3' - pogo 80 1 71.92 TCTATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATT:1 - chr2R 20010155 3' + Juan 4194 1 69.18 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCAAGG:1 - chr2R 19199635 3' - hopper 31 1 63.01 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATACAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTAAT:1 - chr2L 20265956 3' + roo 331 2 70.83 CTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCCTACACCCGTTTTCATCGTTGCTTTTTTGCCTTTTGGCGGTTTCCCTTTTGTTTGT:1 + chr2L 16581996 3' + G5A 2674 1 52.69 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTGTAT:1 + chr3R 15364061 3' + flea 4997 2 74.66 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGTTAGACTGAAAGTTCACCTCAAATCGCTGTAA:4 + chr2L 9038264 3' - I-element 77 1 65.75 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAAT:1 - chr3R 904928 3' - rover 35 2 57.64 ATATCTATTGATATCCCAGAAAAATGAAGAAATTTTGAGTTCGCATTTGTACGGGTATCTAATAGCGGGGAACTCGACTGTAGCTTTTTCTTTTTGTACTAACGAGTTTGTAATTCTCCCGTTTTAGTACCGTATTTTGTTGATCA:1 - chr2L 7473181 3' + INE-1 498 1 44.52 CAGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGTTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGT:1 + chrX 19980685 3' - X-element 4535 1 56.15 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTGATCTGCGATCGCGATGG:1 - chr3R 24368981 3' + roo 392 2 67.81 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACGATATGTTTGACGATCGAATACCGGTGG:1 + chr2L 17809297 3' - jockey 27 1 68.61 GTGGCCATTCATATCAAATACAAAGAAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGGATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACC:1 + chr3L 21327140 3' - copia 4921 2 69.90 CCAAAATGGCAAATCGGTTATCATTGTTGAGCTTATTAAAAAGAAATGCACTACCGATTGATACGCAGTAGCGTAATGGATTCAGTTGTAATTGGAATCTCAGCACTGCTGTTTCTGCTCCCCGTCCCGGGATCATCGCAGTATCT:1 - chr2L 14774906 3' - Fw2 134 1 78.08 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAAGGAAAAATGTTGATTAAATATGCAAACACGCAGACAGTTTAGTTAAAAATGAAAAAACTAAACGCAAAGGTAAAGTAAACCTAAAAGCCATATAATTAAAATGTAG:1 - chr3L 13773752 3' - pogo 83 1 77.08 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAG:1 - chr3R 16630282 3' - FB 61 1 67.19 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTATTAACCCCTAAAGACCATTCTACAGATC:2 + chr3L 47028 3' - FB 39 1 57.53 TTTTTTTTTTTAATTTTGCTGGTTTTTTTGTTTTGTAAACAAGCTGTTGCATAAATAAATTTAATAAATTTATATGTAAAATGTTGGGTTATATGAGTTTAATTTCATTACTTTTTGATAATTGGTGTACAAAAATTAATATTTGA:2 - chr3L 18854100 3' - TAHRE 10436 1 78.77 TAGGAATCAAAAAATGAAAGGAGCATTAAAATATCAATCACAAAAAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCACGGTTTAAACAGGGATCTTTAGATACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATA:1 - chr2R 4547778 3' - transib4 68 1 67.81 ATTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGGGGATTTACGTGGTGAAGTGAGCGAAGTTAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAGATAAAAGTCAATAATTTTTTTTTATATTTTATTAAATTTATTGCT:1 + chr2R 15358401 3' - transib4 2384 1 70.55 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACTGTCCAC:1 + chr3R 15054336 3' + copia 220 1 58.22 TTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGTGATATAGAATTGCTTAAATGTTTATCACTTTTTATAACAATTATGGCGTTTAAAA:1 - chr3L 17321946 3' - invader2 4727 1 61.64 ACTGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAATATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTGAAA:3 + chr2R 4402687 3' + 1360 454 1 45.89 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTA:1 - chr3L 5489881 3' - jockey 65 1 53.79 AACAATATACATGTATATATATATATATATATATATATATATGGGTATCTTTATCCAACACTAACAAACAAGATAACAGCTGAAATATCCTCTATAAAATATA:1 + chrX 3084497 3' - INE-1 70 1 78.64 GAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGGGGGTTCATTTGCGTAGAGCGTAGAAGATTTTCCTGGCACTTAAGCCATGGAGCTAAT:1 + chr2L 4745729 3' - G2 157 1 58.18 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTA:1 + chr3R 4964199 3' - roo 57 2 61.64 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCATGAAAATGTAATAAGAAAAGATACATAATCTGAACTCCATGCCACACACTA:1 + chr2L 17781018 3' - mdg3 5336 2 65.07 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATAT:1 - chr3R 19032598 3' - roo 62 2 63.70 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATATGCCGCAAGTGGCATT:1 - chr3R 27405932 3' - diver 5916 2 65.75 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCC:1 + chr2L 8338224 3' + P-element 2841 1 54.79 ATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACTATGTTATGCCATATTCCATTTAAAAAATATGTTAGATCTAAACTTCTTAGTTTAAATAATGTATCATAGTTATGTAAAGTTCCCATAAAGTTCCCTC:1 - chr2L 19793884 3' + McClintock 143 2 71.23 TATCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAAAGCGAAATTTCATCATTAGCTGGGATATCGATAGATATTGCGGGATAGAATGAGAATAAAAATGTAAATTGTTCCAAAGTTGTAGGCGTAAGAGTGGGCG:1 + chr2R 543212 3' - INE-1 555 1 84.29 GACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATGTATGTAAGTAGGTAACTGGAGCTACTCGTTGTAGGG:1 - chr3R 11937319 3' - flea 4834 1 73.10 ATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTTCAATTCTCAATTATATCAGATAATTTAGCTTTTTAAGAGGTGTACTGAGTGCGTAATGTGTGATTCAA:1 - chr3L 20511516 3' - invader4 2955 2 52.74 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTG:1 - chr2L 22193390 3' - roo 35 2 63.70 CTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGT:1 + chr2L 7098170 3' + G6 1960 1 70.83 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTC:3 - chr3R 11191369 3' + roo 9034 1 57.53 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCAGGGTATGATTCTCCCGCGAAAGACGATCGCTGCGCTGCTTTA:1 + chr3R 27123621 3' + roo 9055 2 73.61 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAA:1 + chr2L 11839726 3' + mdg1 7394 2 65.35 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAG:1 - chr2L 9782057 3' - P-element 50 1 51.37 ATAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTATTCACATATATGTGGTTGGCCAGTCGAGATGCTAACAGGATACGATAAACGTAAAATTATCGAAAGACAGAGAAAGTCAAAGATCTCGAAAGAGATCGCGAAAG:1 + chr3R 16835289 3' + Rt1a 5079 9 68.99 TGCGTTGTAAAGAGAGACGGCGCTCAACATATTCAATAACCATTTCGTCTGCAGCTATGGGCTCCATTGCAATTAATCCCCAATCATGGATCGCAGATTTTGCAAACT:1 - chr3L 25114429 3' - Doc 261 1 73.15 CCTAAGACTAGAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCGACCTGAACCCCGCCCCATGTCACTAGTAATTAATAAAAGAAAGTTCACCATTTTACCCTAAAAAATGTAGAGAAGTGAACA:1 - 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chr3L 5061725 3' - 17.6 161 2 57.93 CTATTGATCCTGATCAAAAATATATACACACTATATATGGTCGAAAACGCTCCAGATCGTAGAGTACAGAAACAAGTAAATAGCTGCTGTACATGTGAGTTTCACACCTGAATGTAATCGAATTTTTATCATTTTACCTCCGCATT:1 + chr3L 21713808 3' - INE-1 85 1 65.07 GGTAGAATTCTTCGCCCGCCGTCACTCAGGACGCCAGATTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCAGTAGGCATAGAGGGCGGTAGTTAAGGGAGTGTGACAAATGGGTTATGCCAGCAATAGT:1 - chrX 12175961 3' - Rt1b 4849 1 73.97 AACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACTCTTATGAAGAGCACTAGGTGAACGGGGCAGAAATGCTAAGCATTCTACCCAAATA:1 - chr2R 24418149 3' + jockey 4702 1 53.33 GGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATATCTGGCAGATATCTATCAGTATCAGTGAGTGGTAAGTGTGGTAAGGGTGGTGTGTGTGTCGCATATTTCCTTCTTTCGCTTTAGTTTTCACTTCTTGCCCGCTTCTTCC:1 + chr2L 244391 3' - Quasimodo 7047 2 75.69 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATATAATATAATATATATATGTCGGTGAAGCCGAGCGTCCAATTAATTAGCACA:1 - chr2R 4188993 3' - S-element 65 1 66.44 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATACA:1 - 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chr2R 19004105 3' + Cr1a 4343 1 63.01 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGT:1 + chrX 4808595 3' - mdg3 54 2 62.81 CATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGTAGTTGTGGAGTTGGTTCTGGTGTGGGGCTTATGGTAATCCTTGCCGAATTGGACTATGGAGTCGTAGCTCAAACTTCCAATTGGGTTCCTGGTCGG:1 + chr2R 8594965 3' - Idefix 6944 2 69.86 AAATTCATTGTTTTATTAATAAGTTCTTGTTTACAAAATTGTATAAATAGGTTTTTTTTTAAGTTGTCCTATGAGCTGCTACCAAAAA:1 + chrX 1392261 3' - TAHRE 58 1 63.64 CTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCAAGGTGTTCGACGCTCGCAGTTCGCCGTTCA:1 + chr3R 24450556 3' + 412 7520 2 65.75 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGTT:2 + chr3R 22590618 3' - rover 6974 2 69.18 AATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTCGG:1 - chr3L 24272053 3' - gypsy11 66 2 62.33 GTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCAT:1 + chr2L 7098180 3' + G6 1946 1 67.81 ACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGGCGACCAGTGACCATAAATCCGAGTAAAATGTATTTTGACATTTTGCACGCAAAGCGTGTGGCAGAAACTAACTAAGCGTGGTCGGAATTCCCACA:1 + chr3R 19944644 3' - BS 4722 1 73.57 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTAC:1 - chr2L 7660902 3' + I-element 5303 1 52.05 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGG:1 + chr2R 7850028 3' + roo 368 1 52.50 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAGTTAATAATTTAACACTTCCGTGCGTTTGTTCTGCCTTGGGAC:1 + chr2L 15076257 3' + 1360 3380 2 79.45 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTT:1 + chr3R 30675451 3' - 297 60 2 62.33 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTTTAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATCGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCC:1 - chr3R 10270579 3' - Juan 4095 1 58.90 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAA:4 + chrX 12129415 3' + flea 4961 2 54.11 GATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCGTTGAAATTGGAAAAATTGTATCAATAGATGGTTGTCTGCGTATGTGTGTGTGTGTATCGGTCGTGGTGTGGG:1 - chr3L 17462344 3' - Quasimodo 99 2 60.83 AGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTC:1 + chrX 2479604 3' - mdg3 5284 2 61.19 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGG:1 - chrX 11209866 3' - hobo 79 1 70.55 AAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGTAAATGCACTGGCGTGGTT:1 - chr2L 23008323 3' - transib2 201 1 71.76 TATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTA:1 + chr2R 20010665 3' - Juan 4176 1 67.12 TATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGTGTGAATGCAAAGACATTATATGTATCTTGTTTGGAGGGAGGGGGACGAGTAATAGGGAAATAACAATAATAGCTAGATTTTTGTGACAAGTAGACGAGATTTTAATTGAGTGCCAGTGTT:1 - chr4 181678 3' - INE-1 546 1 75.34 AAAACAATAATACAAATATAACAATTAACAATATATAAATTTGAGATCATCATAATCTCCTGGCTCTCGTCTTTTATATCGGGCTTAGGCTGCTCTTTGATTTCAGGCTTAACTTCCTCCTTGAGATCCTTGGCTTTCTCTTCTTG:1 + chr3L 3512392 3' - BS3 1653 1 47.26 AACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCAAATGATA:1 + chr2R 12645534 3' - X-element 44 1 56.85 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAA:1 - chr2R 22034656 3' + copia 5058 2 65.52 GTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAG:1 - chr3R 17996142 3' - diver 36 2 59.31 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCAC:1 - chr3R 11937799 3' + flea 4961 2 55.24 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAGACATTCAACACCGGATAACCCATCTGTTCGGTCCAGGTGAGCATCAGTTTCTTGATATCCAAGT:1 - chr3R 13300823 3' - roo 8692 2 66.44 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGT:4 + chr3L 22723960 3' - HMS-Beagle2 6923 2 56.85 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCG:2 + chr2R 11804729 3' - pogo 61 1 62.33 ANTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCC:1 + chr3L 12004302 3' - P-element 90 1 20.29 AATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTAAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTAGTTTGTTTTCAAAATAGCTGAAATTTTCACAAATATATTAACATTATTCATCCAAGCTATTAATAATAAC:1 - chr3L 20499554 3' - Cr1a 4136 1 51.37 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTAGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGG:1 + chr2R 14051890 3' - roo 22 2 65.75 AAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGA:1 - chr2L 17005727 3' + Stalker2 319 2 72.60 ATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTGTCGCTTGCCTGCTTAAAAGTTTAATTGTCCTGCGATTTAGTCTAGGACTCT:1 - chr3R 9103596 3' - Doc 270 1 57.72 ATGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATGTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATGGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGGACCTTATTATAAATGAATTCATAAT:1 + chr2R 12702170 3' + 1360 3305 1 77.78 ATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGT:1 - chr3R 9557494 3' - G2 3007 1 62.33 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGC:1 - chrX 13134846 3' - jockey 4779 1 69.86 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAGTATGCAAAA:1 + chr2R 12133880 3' - jockey 22 1 72.26 TGAAGAGGAAGAAGGGCGTCCTGATGACGCTTCGACATATATATATTATTGATCAGGATCAACAGGGGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + invader1 387 2 52.78 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCGGGTGGCTGAG:1 + chrX 18239432 3' - jockey 63 1 55.17 GGTTATCAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATCACTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGACCGCAAGTCATCAGAAATAATAGGTAAACGATTACGCCAAGTTTTCACGATAGCTTTCATATCGTGAAGTGAATTGTT:1 + chr2R 5185859 3' + mariner2 196 1 51.39 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTT:1 - chr3R 6625668 3' + flea 4987 2 66.44 GAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTT:1 + chr3R 2520351 3' + Tc1-2 1607 1 59.59 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAA:1 + chrX 10521754 3' + Tabor 448 2 57.53 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAG:1 - chr2R 24169956 3' - transib2 46 1 48.97 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATTGTAATTGGTCACATCGATTCATCTGATGCAAGCTGCAATTTGTTCGTTCGTTGTGGTTGCGGGAATGTTCTGTGGTTGCCTCGTTTCAGGG:2 - chr2R 16791493 3' + Stalker2 375 2 54.11 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGAT:1 + chr2R 9158150 3' - mdg3 57 2 54.11 CCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTCTTTCACTGTAACAATTTCGTTTTCTTTCTTTTGACTTTCTTGGTTTCCTTCTCTTATCTCCTTTTTCTGGTTGTTGCTGTTTTGTAAATGGACGTTTTGTTGTTGT:2 + chrX 840360 3' - P-element 480 1 77.40 AGGTATTTAGTCATACTTCCGGTTTGGATCTGATAGCCATCCAATTAAGGGGTTTTTATTTTCGTGCCGCAGCCCATG:1 + chr3R 4497101 3' + Fw2 3677 1 70.51 TATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGAAAAGGAAGACGGCATATGAATATTAAAATCGAATATGTTGCTGTCGATTAAAGGCTTTTCGATT:1 + chr3R 31885566 3' - hopper 295 1 66.44 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAA:1 - chr2L 13556319 3' + transib2 2783 1 57.53 TCTAAATACTTATGCCCTCTAGTGTAGTACTACTACTACATGTTGTAGTAAATTGACCATGGCACTGAGCAACTGCATCGAGGGAACCGCATCCCAGTCAGTAGCTTTCGCAATATAATAATATTAATTAATAATAATAATAATAA:1 - chr3L 21356656 3' - Tc1-2 3 1 73.97 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTGTTCACA:1 - chr2L 15936757 3' + copia 237 1 51.72 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTAT:1 + chr2L 22193508 3' + roo 9002 2 67.12 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAGAGCCGGGCAATTATT:1 + chr2R 23780655 3' - Ivk 15 1 73.24 GGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAAC:1 + chr3R 10736126 3' - McClintock 6016 2 66.44 AAATAAATAAAAAAAAAAACACCGGCAACAAGCAGACCGACCACCATTCCCCAATCAAGCACACCATATTGCCCAAGCCGGAGACTTTCCATTATAGGTAGATATTCGTTATATCGTTTAATAT:1 + chr2L 15960724 3' + Tc1-2 484 2 67.74 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGAC:1 + chr3R 15942797 3' + hopper2 1545 1 62.50 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGATTTT:1 + chr2R 13259410 3' - mdg1 34 2 59.59 ATCTTCTTGGTTTCAACTCTGTCATCGGTATTTGCCTCAAGTTTGTGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTATTTGTGTGTTTTTTGCTGTTTTTTTGCAGTAGGCTTCTCATCTCGCCCCCCCACCGTTTTTGGGGC:1 + chr3L 1107752 3' - Porto1 4507 1 69.17 AATCAGAATCTGAATCTGAATCCAAATACGAGAGTCCTGGCGAGCGGGGATGACGCTGCTTTCTCTACCAACATGAAGTGCAATTTATGCAAGGCAACAAAATGCAAATAATTTCAGTGGAAATTTTTATTTCGCTCATAAAGAGC:1 - chr2R 20495290 3' - transib2 2532 1 63.70 GGCGCAAACCCCAGTGTGGATTTGCAGGTTTTTGTAGCAGTTTACGGCTGACCGGACTCGTATATGTACTTTTTTATAGCATCTTCTACTTTTTCACAAAGCTGGAGATCACAGAGTTCATACCGACGCTGCTCTACCTGGGCTAT:1 + chr2L 13773297 3' - Rt1a 100 1 57.53 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGCAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGAT:1 - chr3L 18281845 3' - Doc 32 1 59.20 ACAACAAAAACAAGAACACCGCCATTTCAACAGGTAACTGACTTTTTCGACAGTCCCCGTTGACGCTCAAAGGTTCGAGAGGTTGTAGGTTCACAGAAACTGTATCGCGGAATATTACTCTTGGCATCCTCAAACGATTGATTTAT:1 + chr3L 2580675 3' + I-element 134 1 61.64 GTAAACATAATTATTAAAGATTCGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGGTGATTTGTGAAGTAGTTAAAACTAACTAAACTAAGTATTTTGCATTATTCGTCCTTACATACAGCTGTAGGAATGCGGTGCCTGTGTCTT:1 - chr2L 17612295 3' + Cr1a 106 1 75.18 AAAAACAAAAAAAAAACATTTGTTTAGC:1 + chr3L 14814131 3' + HMS-Beagle2 493 1 89.29 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCGAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCG:1 + chr2R 19199724 3' + hopper 1392 1 66.67 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTACATATTTTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAAAGTTCAGTATGTTCCAATCGTTTGGCAAAGTATGGAGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCAGGCACACAGAGA:1 + chr3R 4964218 3' - roo 38 2 49.32 ATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGCCCGTTATTCTTGTTATTTTTGTCATTTGTGTTGTTGTGGTTGCTGGTACATTTTTAATGTTTTGGCTCTTT:1 - chrX 14957657 3' - 297 372 2 52.17 AGGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATGCGCATTCCTTCGTTAAAA:1 + chr3L 22744740 3' - FB 46 1 65.75 AATATTATTATTATTATAATTATAAATATTCTATTTTATACTATACCATCTTCTAATGTTAGTTATTTATCAAGTTGCACTATTTGTATATGGTTGTTCG:1 - chr2R 6086800 3' - mdg1 7071 2 66.00 AAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCGGGACTTTCTTTTCTTAGTCAATGATACTTTGGGTTTGTTAATATTTTCTTCCTGATTTGGAAGTAGTACTAGAGGTCGTAGTTTGGTGAGTTTTTG:1 + chr2R 17879302 3' + Doc 313 1 67.12 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGGAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGT:1 - chrX 18396095 3' + roo 332 2 67.81 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCA:2 - chr3L 12249797 3' - roo 55 2 59.31 GTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGAAAAATGATTCCCTTAG:1 + chr2L 21930262 3' + Copia1_DM 99 1 50.00 CCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAAAAAGAAAATGGTAAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTAAACAAATGACTGATCTA:1 + chr3R 4577424 3' + Tc3 1462 1 52.74 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACT:1 - chr3R 5769013 3' + roo 9033 1 52.50 TGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGCACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTA:1 + chr3L 18931027 3' - I-element 90 1 76.55 TCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAAAGCGTAAGAAATCTAAACATAAAAAAAATTGCTTGTGCGAGTAAAAACAAGATAGACTACTGTCTTTCAATATACGGCCACGCAGACAAATTTCACCTCAATCAGCTGAAAACTACTCTTA:1 - 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hopper 42 1 54.11 ATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCCCATTTTACTATACGAGTAACG:1 + chr3L 21858919 3' - invader1 3644 2 61.54 AGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTAGTTTGGCCGTGGAATGCATATTGGGGCAAAACGAAACTTACTAGTATTTCTAACTGTGGGACAATTTTTGGAACATCTATGCGTGTGTTGTTTGTAATATTGCGGGTATTGGCGTGTG:1 - chrX 1639036 3' - I-element 5089 1 78.08 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATTAAAGAAAGTATTAAAAT:1 - chr3L 18768431 3' - S-element 65 1 64.38 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGGAATGCAAATACGAAATAACATAATTTTATTTGTAGCACATGGGAAATGGGACAGCTCAAAAAAAAATTTAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGTGTACCTTAAGGGTCTT:1 + chr2L 21924946 3' - INE-1 547 1 60.28 ATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAATGAGTTGTAACTAGAAAACATGGACCTAAGAAAAAAACCCATCGGAGAAATGGAGATTTTGAACACCAGTGCCGATACAATAAATGGTGTCCTAAGAGTAA:1 + chr2L 22631099 3' + 1360 397 1 73.29 TAGCTCNTTGTCGGCCCTAGCTGGTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAACTAAACAAACTTTCTTCAGCTATTTATTATTTGCAACAGCTATTGAAAGAAGTATAAATTTCTCTAACATTAACCCATTATCAACCG:1 + chr2L 23181802 3' + diver2 4794 2 72.60 TTTTTTTTTTAAATAAAAGTGGTGAAATTTTTTTTTTAAAAA:1 + chrX 5264782 3' - 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chr2L 21367183 3' - Doc 35 1 59.31 AAGAATGAGCAGATAAAAACAAAAGGCACGCTTACAGTTAGCTCTTCAGACAATGGCGAAATTTAAGAGGTTTCACGCTTAATGGCACATTAACTCATCAAAGCAACCGCAGGTTTCCACACCGGATTTTCCCCCGAACAGAA:1 + chr3L 6677816 3' - looper1 72 1 69.23 TCCCAATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGAGGAACTCGACATTTTTAGACTTTACTTCAACATTCCCTCTTTTTTTTTTCAATATCTATCCTATCCTTTTCATAACCAGAATTGAACAGCATTC:1 - chr3L 19425782 3' + INE-1 538 1 55.81 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGA:2 - chr3L 9809247 3' - 412 61 2 60.27 CAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAA:3 - chrX 2479466 3' + mdg3 207 2 52.05 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAA:1 - chr3L 22861786 3' - S-element 64 1 68.94 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAAAGAAAATATGCAA:1 + chr2L 4123980 3' + transib2 2791 1 60.27 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGT:2 + chr2R 21116620 3' - mdg1 7052 2 26.71 ATTGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTA:1 + chrX 1799257 3' + invader4 299 2 66.90 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATACTACCATTATAAATTGTGGTAAGGCGTGCTTGAGGCCATACATCAGCAATTGCCAGGTGAAAAGCACCGGTTACCCCGGAAAAGCGCAGAAAATTGGCCTAA:1 - chrX 993965 3' - 412 7071 2 38.36 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTT:1 + chr2R 4785346 3' + Juan 4175 1 57.53 ATTCTTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAACTTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCTACTTTTTAAGAAATATTATGTCAACAAGTTATGGGAAATACATAAGCCATGCACGTGATTTTT:2 - chr2R 19338651 3' + Tc3 90 1 73.97 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGGTAATAGGTGCTCAGTGCTGTTAGCTGTA:1 - chr3R 25433262 3' + transib2 2787 1 56.64 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAA:2 + chr3L 13836705 3' - 412 7119 2 62.33 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTCTCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTTCG:1 + chr2L 11391635 3' - 1360 16 1 67.12 CTTCTCGCGAATCGAGCCGTAAACAAACCATAAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGCACCATCGTGTATGTAACTAGTT:2 - chr3L 27874959 3' + Cr1a 4382 1 76.03 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTTATTTAAACAACGGAGTTGCATTTAATGTTCACTACCATTAATTTTGACTTAATATAGCACACACAAATTGTTGCCCAAGAACGCA:1 - chr3L 23320024 3' - roo 35 2 60.96 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTTGCTAATCATGTGTTA:1 + chr3L 18505793 3' - I-element 10 1 78.77 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATA:1 + chr2L 18549939 3' + roo 357 2 54.79 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACT:2 + chr3L 6518661 3' + 412 442 2 52.05 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATC:1 - chr2L 18226735 3' + roo 9052 2 68.49 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATATA:1 - chr2L 13556308 3' + transib2 2794 1 65.07 GGACTCCGTTGACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGAATTCGGGCGGCCACTTGGATTGTAGGCTTGCCTACAATGGACCTTTGGCTGAGGAAGCCAGGACCTCGACGAGGCCG:1 + chr2R 20948598 3' - Doc4-element 494 1 71.09 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGAC:1 + chrX 8308508 3' + roo 9053 2 64.91 TCTGTCTGTCAACTTTATTACTCTCTCAGAGAGCAAGATTCACTTGCTCTCATTTGCCACTCAAAGTAGTGAAGCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTGAAAAGTATCTTTAAATTACATTTAGTTGATGAAGAAGTTT:1 + chr3L 21986977 3' - frogger 158 1 71.92 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAAACCCCAACAAAGCGCTGCGGAAACATGCTGCCGCAACATGTTGCT:2 + chrX 18742928 3' - invader4 37 2 59.59 TGAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATG:1 - chr3R 8075899 3' - 412 7120 2 60.69 ATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTTGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATG:1 + chr3R 30987595 3' - F-element 116 1 49.32 AAAACAAAAAAAAAAAGAAAATACAAAACTCGAACTGAAACTGCTAATTAAAATAATGTCAATAAAATTGTTGTCCATTATATGCCAGCCGAAAATTGCATCCGACTAGAAATACGTGAGCGCGATTATTTTTTT:1 + chrX 19026645 3' - hopper 143 7 77.78 ACGTTTGCTTGTTGTGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTTAAAACATTTACCCTTACGTGGGATAAAAAAAAATGAAATATTTCAAATTT:1 - chr3L 18164369 3' + P-element 72 1 30.30 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTG:1 + chr2R 3564125 3' + Tabor 7245 2 70.55 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAACCACATAAATAAAATCCTGGCTAAGGCCAAAAAATCGTTGCCTACTTTTGTGCGCTGCTGTAGTGT:1 - chr3R 12930678 3' - jockey 59 1 52.74 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATTAATTCTTTTCATAT:1 - chr3R 7666633 3' - I-element 61 1 55.48 TTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAAAGAAAATATGCAACGCCCACTTTCCGGATAAAT:1 + chr2L 4124000 3' + transib2 2811 1 73.97 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTTCGTATTTT:1 - chr3R 10931605 3' - 297 38 2 56.16 GTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTACTGTGTTATTTTTTTCTTTTTTGATTCCTGGCCCATTTAAATGGTCAGCATTGTGAGTGTGCACTCCAACTC:1 + chrX 11528188 3' - invader2 361 1 63.87 ATACAAACGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCTCGCCAATCGTTCGCTAATTT:1 - chr2R 5521783 3' + HB 48 1 58.82 CATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCATCTCGTTTTCGTACTTATCGACGTTTTGCCATCACAACAACGTTGTTGTTGTTCCTT:1 - chr3L 6752756 3' - invader1 3789 2 54.76 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAAATATAAAGAAATGAAATCATAAGCAGGA:1 + chr3R 8890140 3' - FB 38 1 59.59 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTCAAAGGCGGCGTGTCAA:1 + chr2R 12133860 3' - jockey 25 1 64.17 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATTGATAATTATAACG:1 + chr3R 16342024 3' - P-element 44 1 41.53 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGC:1 + chr2R 11159374 3' + roo 9037 1 60.14 TCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCTGGGACATTTTAAGCAGCAGCTCCGCATGACTGGGTGTCACTTGAGGCAGTTGAAGATCGGCG:1 + chr3L 11790521 3' - opus 397 2 54.35 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAGTAGGCAAAAC:1 + chr2R 12133881 3' - jockey 8 1 79.03 GTTCACGACGTTCATACGGACAATCAATAAATTGCTTATGGATAAAACAAGCACAATATAATTAAATTTATATATATTATGGACTTTAGGTCCATAAAATACTATTTATAATATATGGTGATTTTGGTTTGGGTTA:1 - chrX 21058163 3' - INE-1 132 1 56.62 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCT:1 + chr3L 23906448 3' - 1360 89 1 78.08 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGCTATT:1 - chrX 661850 3' + 412 7492 2 54.79 AGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAATTAATTAAAACATTTTTTTTTTCTTATATTCATTCAGTTTCGAACTCATTGTTCATTGAGGAAAATTTATTCATCCGGATTGAGTTTTGCATTCAATTTCGTTTCAATTAGATTCC:1 - chr3R 5307671 3' - Stalker2 7214 3 59.59 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAA:1 + chrX 10319715 3' + mdg1 7406 2 53.42 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCCATTGACCTTTTAAGCTAAA:1 - chr3L 14366483 3' + roo 395 1 77.40 AGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATCGCACAACCTCACTGTGACCACCCCAGGA:1 + chr3R 28612036 3' + P-element 429 1 19.86 AAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:1 + chr3R 1977616 3' + micropia 5389 2 63.25 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGG:1 - chrX 19054204 3' - jockey 25 1 71.92 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCAATGGCAAATAATAATAATC:1 + chr3R 23295615 3' + P-element 2866 1 42.47 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATTGTAGTATACTGTTATGTTGACATAAGTTGTATTAATTGTATGTTCCTCAATTGATCTTCAGTTTAT:2 - chr2R 11804606 3' + pogo 2059 1 55.48 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGGTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAGATC:1 + chr2L 22170091 3' + Juan 4197 1 67.12 GAAAAAAATAAAAAAAAAACTTTATACCAGCCCGCTGCAATAA:1 + chrX 6314650 3' + HMS-Beagle2 490 1 93.02 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACAACC:1 + chrX 20455724 3' - hobo 57 1 56.85 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGA:1 - chr2L 13556313 3' + transib2 2789 1 61.64 TATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAAT:2 - chrX 3431870 3' - Ivk 5370 1 55.48 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAAT:1 + chr3L 16033422 3' - Doc 70 1 62.33 TTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATA:1 + chr2L 14358836 3' + diver 143 2 76.03 GGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGAGCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTACTAGTAACTACATAAATTAAACAATACATTAACTACAGCAACTGATTTTCTAAAACTGCTCTAGA:1 + chr3L 5541517 3' + mdg1 7313 2 54.11 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGGACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCC:1 - chr2R 23180209 3' - roo 80 2 71.23 AAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAGCAAACTTAAATTCAATTCCTGATATCCAATGATCCAAAAAGACGGATTTTTTAATAAATATTCATATAAGAGAAATCT:1 + chr3R 19407559 3' - diver 95 2 72.55 AGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTT:1 + chr2R 4103362 3' + invader1 3999 2 63.70 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACT:1 - chr3R 30347319 3' - P-element 56 1 44.36 TAATAATCTTTTCTAATACAATTGAACAACATTACACTGATTTAATTATATGTCGTGTCTTATCAAAAACATTCAATGATTCATGTATTGTATACCTCCCCTTTGTTAATAACAGTTGTTGTTGAAACTCATTTAACGGTTTTCGG:1 - chr2R 615215 3' + TLD2_LTR 56 1 69.18 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAAATA:1 - chr3L 17055381 3' - Tirant 8118 2 77.78 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTTAAAACCATAATGCACACACCAGTGACCGGCCGGCAAAA:1 - chr3R 31653084 3' - roo 8744 2 73.29 TATGTACCCACTGATAAAAATGTTGCAGATGTACTAACGAAAGGCTTGTGTAAGCAAAAGCAACAGAATTTTGCTAAGTAGTTATATGTTTTCTTAGGTATGTCAAAATATGTCATTTTGTTAGTTTATTTGTGTAAAAATTAAAA:1 + chr2R 14739986 3' + Copia1_DM 4193 1 54.11 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATATTCTAGTATCTTTGGTTGAACTAGAAATAATGCTATATCTATATCTAAATGCTATATCTAAAAATCTTTAGCATGTTTGATTACTGCAACCCTTTGAAACAATTATATCAACAATTATA:1 + chrX 20145720 3' + 1360 1 3 36.99 ATATATTATTAAAAAAAAAATTAAAATTTAATGATTTTTATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAGTGTAGTCCTTACACTCTCGCAGGGTCCCGTCCAA:1 - chr3R 12780247 3' - hopper 159 1 59.70 GTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCTTCATACTAAATAATCTAGGAGGTAACCAAATTGATGAACTGTGTGGTGGTGGCAGACTTACTCCTTTCATAAACCCGCCACGGGTGGCGA:1 + chr3L 290587 3' + TART-A 13175 1 63.70 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTT:1 + chr3R 11469408 3' + Tabor 464 2 62.39 ATACGAGTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGGCCACATGCAACTAGGAAGCAAAATGATCTGGCCTGCCAGCACCACCAACTATCGTCCACAAACC:1 + chr3R 18490450 3' + Stalker2 7597 2 52.08 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGAGGCATTTGGTAACTATTTTATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTACTCAT:1 - chrX 8092382 3' + pogo 2042 1 56.85 CTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTAGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTAAAGCGGCAATAGAACTAGATTGTGTTTACACGGACAAAACTGACCTGT:1 - chr2R 14074003 3' - Dm88 4313 1 68.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACA:1 + chr3R 13300966 3' + roo 9019 2 50.68 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGAACACACAGAGGGAAC:1 - chr3R 25709766 3' + hopper 1387 1 56.03 ATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTTTATTTTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTATCTTATTTTAAACATTTTGCTTT:1 - chr3R 19450008 3' + roo 8624 1 58.22 ATGTAAAAATTTTAATTTAAATAAAGCAATTTTTTTTTAATTTTTATTAGTTAATTAGATACAATTTTCTTTTCATTTATATCTCAAGGCAAAAAGTGTTAGTTTCTATACATTTCTTGTTTTGTGTGATTGCTTCCTAGTAACAT:1 - chr2L 16386833 3' - 1360 3050 1 65.75 ATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAAT:2 + chr3L 11844804 3' - rover 7025 2 71.92 ATATAGCTCGTTGTCGGCCCTAGCCGTATACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTA:1 - chr2R 1320705 3' + diver2 4791 2 54.11 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATATAGTCCACA:1 + chrX 16946732 3' - FB 48 1 52.45 ACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGTCACAAACTTGCTTCTATTGAAGTCAACTTAAATAAGAACAACAGATATTTT:1 + chr3R 14401139 3' + G6 1840 1 67.81 AGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGTTCCCTTGGCGCCGCAGATAATCAGTGTTCAGAAGATCCCAGCTCC:1 - chr2L 1978229 3' + R2-element 3295 1 68.06 ATTCTAGTATCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGACATGAGAAAAATGGCATACCCTTAGTAATAATATAGAATTTTTAAAAATTAAGACCCAAATAAAAAGCACCAGCAG:1 + chr3L 11314569 3' + Tc3 317 1 46.58 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCACGTTCAATGCACTCGTTC:1 - chr3R 26504207 3' - HMS-Beagle 6822 2 58.47 TCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCTGTTCAGGATTCTGAGGGGGCGTATCGATCACTTTACCACAGTTATAAGGGAGCCAGGTGCGTATCTTGCATTCTTTATGTTAATTCACCTTGGCAACTTGTGGGCCA:1 - chr3L 9238210 3' - S-element 1256 1 72.60 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGA:1 + chr2L 18347375 3' + transib2 2752 1 65.75 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTTTTCGCGCTCTCACGGTTTGCGGTTGTTAGTTTT:1 + chr2L 14074577 3' - 297 31 2 62.07 CTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATGAAGTTATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTTTTGACGCCAAACACGTAGACAGCTTTTCCACTTTTCCACGTTGCCTCCTTAGCTTTG:1 + chr2L 5696274 3' - Doc2-element 4696 1 52.94 CTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCTATGAGCTGTACTTAGCTGTGCAAATTACTATGGACATCAGATAGCCTAAGATATCGACTATATTTTTGGATTCAAATGTCTTGTTTTTAAGGCACAGGTCTACAGGTT:1 + chr2L 21327259 3' + 297 291 2 78.77 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAACGAAAGATTGTACACAAACCTCATTGGTAAAGTTTTCTTACATATTTGTAAAATTATTG:1 + chr3R 30946650 3' + Transpac 5205 2 69.18 GTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCA:1 - chr2R 22034664 3' + copia 180 2 71.23 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAAAAAGGCAAAAGCTGCCTTGAATTGCACTACGAATCACTCTAGCGT:1 + chr2L 15779639 3' - hopper 67 1 65.28 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGA:2 - chr3L 15913863 3' - jockey 4835 1 70.55 TTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCC:1 + chrX 21947746 3' - mdg1 47 2 50.00 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCAAGTGGTTCGCCCCTTTCGCCACTTTCTTCACCTGGTGGCAGCCATCCATTCATTTGGCTC:1 + chr3R 25433423 3' - transib2 14 1 74.64 ATTTAAAAAAAAAATAGAAAAATATTTAAATATTTTAAAATTACTTTTTGGGCGTATAACAAAACCTAATCAAACAACAATTAAAGCACACACCCAGAACGAACAC:1 + chr2L 12851354 3' + TART-B 10633 2 61.32 CGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAATGTTTTTCGGCAGTTGAGGGCGTCAAAGCGTCGGCCCCGAAAAGCAGACAAAAGTCAATGGGAAGT:1 + chr3R 30091423 3' + jockey 4600 1 57.03 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCT:1 + chr3L 24208239 3' - Quasimodo 30 2 63.01 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAAC:2 + chr2L 20840115 3' - mdg1 19 2 71.23 AGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACTATTCGCACAGACAACAGTTGAGAGATTTAATTCTAATATATGATATAGATTATTTATATCGCCATTAGTAAGCTAGCTCAACAAGTTTT:1 - chr3R 3622970 3' + INE-1 175 1 73.77 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCGTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAA:1 + chr3L 7889653 3' + roo 346 2 62.41 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTTATTCGGGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATGGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTC:1 - chr3R 15790838 3' - roo 8699 2 44.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTGG:1 - chr3L 16970335 3' + roo 9037 1 60.27 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGGTACAAGGGTTACAGGGCTCAACTGTAGGGC:1 - chr3R 17077054 3' + roo 9054 2 73.29 GGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTCCCTTGAAATAAAAATGAGATCGACCTTCGGAATTGAAAGGCAGTGGGTTGCCGCTCCCCAATGCCCTTTTGGTTGCATACAAAATTAAATTTAT:1 + chr2R 17934697 3' - F-element 268 1 63.01 TTTTTTTTATTTTTAACTTTTATTTTCTCTTGTATACTTTTAAAATAAGAAATTCTACATATATAGATGGGCTTAAAGGTAAAAATTAGTACCGTTTCCAAGCCTATAAAGAACTTTTATAGCATTCTAAGATACAACTTCATTTT:1 + chr2L 19100671 3' - Doc 4696 1 69.86 TTTAGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCTACTGCACAACAACTGCAACAGCATCAACATCAACTCTAATGTCTTTAATTTGTTTGAGTTGTGCCACCCCCAACCCACGCCCACTGTTTATATACACAC:1 - chrX 4493940 3' + Doc3-element 481 1 53.08 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCT:1 - chr3L 6518528 3' - 412 34 2 63.01 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTAGTAACGTGAATA:1 - chr2R 24427513 3' - jockey 4684 1 76.71 ATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTTAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACGCCCAGCACTGTGGAAGAATTCAAATAGGAGAAATGTTTGAAAATTATTTGCAAGCCTTCGGTGCAG:1 - chr2L 7162842 3' + mdg3 5033 1 55.73 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATTGCGGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTAGTTATTCTAGCTTCCTTGGGAAAACTATTTCAAGGCCTGCAACCT:1 - chr3L 24327872 3' - 1360 69 1 84.62 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAATAA:2 - chr2L 7660878 3' + I-element 5327 1 60.96 ATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAACAATCGATTAGCATATTCTCGTTTACGATGTG:1 - chr2L 21778482 3' + jockey 4820 1 75.94 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACTTT:1 - chr2L 16946023 3' - hopper 54 1 53.42 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCT:2 + chr3L 21769151 3' + I-element 5334 1 64.38 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATATTTTTTTTTACCACATCCCTATCTCTTGTTCTCACGACTCCTGCTCCTTTTATTTGTCTGTATTGCACATTTTTCATGTCACTAAAAAGGTTTCCT:1 + chrX 4180243 3' + invader4 315 2 72.86 ATGTAGACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGA:1 + chrX 10319682 3' + mdg1 7379 2 73.57 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTAACTATAAATCATAACGCGTATTACTCTTAGTAAGAGGGTCATTCCAGGTTCGCCCCATTTGTC:1 - chr2R 11058444 3' - 297 6633 2 57.93 TTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCACTGCCAGTAGACAATTACGCAATAAGCTTTCGGCTTTCTCCCAGATTT:1 - chr3L 13304172 3' + 297 279 2 64.96 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACG:1 + chr4 373065 3' - pogo 50 1 57.34 TTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAAGTACGGGCACTCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAG:1 + chr2L 14523270 3' - HMS-Beagle2 6893 2 34.43 ATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTTCGAATTTAATTTATATAATTATGATTTTCAGTCCAGGTGATCAAGGTGCTACCACT:1 + chr2L 16692166 3' - P-element 2846 1 50.00 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTAATCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGTCAATCAATTCGGTGCCGCACTAGAGGCAAATAC:1 + chr3L 13581763 3' - jockey 4796 1 56.16 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGAAAGTGACAACAG:2 + chr3L 2146002 3' + roo 358 2 50.68 GATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCGTGAATTTGTGTGACAGCCAGTTGTTTAAAATAGAGCTCTTAGTTTTTGGTATGTCAC:1 - chr2R 17296547 3' + X-element 4671 1 47.95 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTT:1 + chr3R 15942801 3' + hopper2 1547 1 61.64 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGT:1 + chr2L 13556460 3' - transib2 43 1 50.68 CAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAAACATTAAATACGATAT:2 - chrX 6116191 3' - transib2 7 1 78.08 ACGGACAGACGGACATGGCCAGTTCGACTGGGTCAAGAATATATACATATATATATATATGTCCGTCTATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATGTA:1 + chr3R 14750510 3' - INE-1 117 1 54.78 GAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGAAACAAAACAAAAATAATATTGTGCAAAATTTGTGAACGGGCTGC:1 + chr2L 10679603 3' - I-element 146 1 69.18 ATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAATATCAAAAATGACTAGGAGTCCGAAT:1 - chr2R 1571523 3' + 1731 4585 1 56.85 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCGAAAAGCAATTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACT:1 - chr3R 27765088 3' + mdg1 373 2 56.06 ATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTACTTTCTCCCGCCCCCTTTTTTCGAATTCCCTTCCCAAGTGCT:1 + chrX 3036988 3' - roo 9006 2 67.44 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTA:1 - chr2L 22674749 3' - mdg1 7067 2 66.90 AAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTG:1 - chr3R 4682909 3' - Burdock 84 2 77.40 GTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCA:1 + chr3L 5061647 3' - 17.6 59 1 65.75 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAATGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCA:1 - chr2L 7125755 3' - I-element 19 1 60.58 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGTCTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATT:1 - chrX 18009931 3' + 412 434 2 56.85 AATTAGTTTCTTTTGCCCACGTCCATTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTTGCACTTTTTGTGCCATTGCTCTAAAAAATCTTCGCAATATCAATGCTGATGACATTCG:1 + chr2R 5180382 3' + FB 90 1 56.85 TAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACTCCCCGCAAT:1 - chr3L 18505656 3' + I-element 5283 1 66.21 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCTGCC:1 + chr2L 12822872 3' + P-element 2849 1 48.74 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAAAAGTTCTTGTCAGAAGTGGGATTCGAACCCACGCCTACAGAGTAGACTGCGACCTGAACGCAGCGCCTTTAGACCACTCGGCCATCCTGACAGGTAATAGAATTTTGTGACTGCAG:1 - chr3R 25750307 3' - jockey 4679 1 63.01 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATG:1 + chrX 8308523 3' + roo 9037 1 62.76 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGA:2 - chr3R 4964113 3' + roo 327 2 74.66 AGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGTTGTTATT:1 + chr3R 22590624 3' - rover 17 2 73.29 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACACAAA:1 + chr3R 5524007 3' - FB 57 1 57.53 ATAGCTTAACCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAGACTTAAGTATTAAGTATTAAAATATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTATTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATCATAAAATTT:1 + chr4 399111 3' + G4 3640 1 60.27 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTTTGTGCTTCTTCT:1 - chr3R 904936 3' - rover 6987 2 58.52 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACAT:1 - chr2L 13556330 3' + transib2 2772 1 54.11 AATATTGAACTCGTCTGATGTTTATATGGACTTAAAGGCGTCTCTGGGTGTGTCTTCAACAATCCTGCGTATGCAAACTGATCCAATGGGTAATGATAGGGGAAAAATAGAAAATGTTTTTTCTTTTTACTTAATGCTTACAATAT:1 - chrX 22824268 3' + Gypsy12A_LTR 1877 1 78.77 TTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATATTTAGGATTAGGATGGACCTAAGGATCTTACGGTGGACCTAAAGCAGGCGCTGGAGCTGGAGG:1 + chr2R 404417 3' - mdg1 211 2 72.66 AGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCATCTCTTCGCGTAATCCCAAACCCCACCCGCTCCCAAATAACAAATAAATGTTAGAATCCATTGATGTTTAGTAAGTACAATCATTGATAAAGCAAAAAGCAACCAAAATCGGAGAAA:1 + chr2R 13812064 3' + I-element 24 1 68.49 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGTCTAGAGCTGCTC:1 - chr3R 23618090 3' - hopper 26 1 66.44 AAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAGACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCG:1 - chrX 22576296 3' + Burdock 6290 2 46.72 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCAATAAAAATATATCC:1 - chr2L 4063794 3' + roo 9052 2 70.55 ATTATTATTTCAAAATAGATTAAAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCAGAAAATAAACTTCAAAAATGACTTTATATTACAGAAGGATATTTATGTAGGGGTTCAGAGGTATTTCTTCAGCTGGAAGAGCCTTGGAAAAAGC:1 - chr2L 19819855 3' + 1360 318 1 56.85 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCTCGC:1 + chr2L 16564605 3' + roo 387 2 64.38 CGAAGGGTATATTAGAAACGAAGATATACATAATGACCTAAACATAGAAACAGTCAACAAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAAAAACAACACAAATAAACTACTTATACTCCCTTGGCCGCCAGCATCAGCTCGGATAGTTGGACT:1 + chr3R 16481916 3' + Porto1 4367 1 72.60 ATATTATTCTAGTGTCTTTGGTATAATGGTTAAACGAAATTTGTCGCCACGTTGAGAGCACAACCGAACATGATTGAAATACTAACGTATGGTTCTTCAATGATTAGGATTGGCCTAGATTTTAAACTCGAGCATCCTACCTCAAA:1 + chr3R 26140388 3' - Tc3 241 1 73.29 AATTGTTTTCCTCCGTCGTACACTCTACTGGTCAAAAGCCCTTAAATGTTTTCAATAAGGTTGTTGTCAGGGGAGGAAGGCGGCCGCCATTCGA:1 - chr3R 4944184 3' - Tc3 1281 1 82.98 TGTGTCTTTGGTCGAGTGTCTCGGCTGGTAATTGCGCCTTTTTCTTTTCTTATTTTCGTTATTTTGCGCTATTTTCTCTGTTGGTTTGGTAAAAGTTTATGCATGGTGTATGAAAAATCGTCGACGGAAACGGAAATGTTGCACAA:1 + chr3L 10542106 3' + hobo 347 1 74.66 TAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGTTGC:1 - chrX 1263900 3' + Burdock 6376 2 72.41 AGAAATTAATAAAATTAAAAAATATTTTTTTTAGAAGTTCCCATAACATTTCTTCGATTGGGAAAAACTAACGGATGCACTAACGGATATTAAAAAGTACGAGGGAGATGTTAGGTCCAAATTTGCGTTCCTCTGTTAATGCAGTA:1 - chr2L 17702451 3' + HB 318 1 48.63 ACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCTTTCCGCGCTCACTAGAGTGTAC:1 - chr3R 16427926 3' + GATE 8272 2 71.25 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTATGTATATCATCGCATTATAAATGTCTTGCATTTGTAAGAATGCTCCACTTGCA:2 - chr3R 5523912 3' - FB 67 1 64.38 CTGTAAGTGGGATTTACTGGCAATTCCGCAAAATTCCGTTCCATACGTCCATATTGGTTTTAAAACTAATATACAAAGAATGCATTGCTATTCAATAAAAACTCCAACTTGTTGTGTCCAAATCCCTAGGATTTCTGCATAGCTCG:1 - chrX 9621805 3' - Porto1 4298 1 57.53 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATG:3 + chrX 3431977 3' + Ivk 5334 1 50.68 ATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTGGCTGTTTGTTGATGATGGCGATGGCAGCCAGGGAGCCGGGCAGACGATGCGTCTGCGGACTGTTGCCTT:1 + chr3R 28633467 3' - Quasimodo 39 2 73.27 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACAT:1 + chr2L 4713940 3' - transib2 81 1 76.03 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCATTGAATAGAAGTAAGTATAAGTATTTATGTGGG:1 + chr3R 13973093 3' + 412 476 2 72.41 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAACAGTGTGAGTT:1 - chr2L 3233952 3' - roo 8723 2 58.22 ATATATATATATACATATAGTAAATCATAATTCTTTTGAGTAGTTTCCCACCTCGATCATTTTTAAAGTTCAGGATGCATTTTTTGGGGTCATATTTTGGGGTTTTCACATAATTATTTGTATTAAGGCACTAATATAAATCCTGA:1 + chr2L 9463934 3' - 1731 4409 1 82.19 AATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATT:2 + chr2R 18316145 3' + HMS-Beagle2 263 2 54.11 ATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCCTTA:1 + chr3R 1844863 3' - Cr1a 157 1 50.00 AAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGATGTTGTTGCAATTAAAAAAAAAATTGAAAAAAGCGAAATGTTTGATGAAAGAAATTAAAAACGAACATAACAAAACAGATTCAAAACCTGGCTTTTTAATTCCAT:1 - chr3R 9826047 3' - FB 240 1 58.90 TTTTTATTGTTATTATTGTTGTTGACTCTCCTCCTCCCGCTCCACCACATGGCTGTAGCTCAAATTGCATTTGGCCAGG:1 + chr3L 3562048 3' - mdg1 23 2 75.95 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAA:1 + chr3L 20898638 3' + roo 359 2 53.42 ATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTACGTAG:1 + chr3R 17615230 3' + Tc3 309 1 78.42 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTTTGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCACTGATCAGACGGGCGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGATTGGGAAACGCAGGTG:1 - chr3R 28901221 3' + transib2 2787 1 49.59 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATATAATATAATATATATATGTCGGTGAAGCCGAGCGTCCAAT:1 - chr2R 4189004 3' - S-element 76 1 73.97 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTG:1 - chr4 372982 3' + pogo 2048 1 75.23 CCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCAAGGCTTCTTGCTCCTTGGTTGCCGCTCGGTGTGGCGATTACTCCAC:1 - chrX 21369978 3' - F-element 4541 1 62.30 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAATAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGG:1 + chr3R 17077211 3' - roo 8712 2 52.74 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAAAGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATT:1 + chr3R 15325182 3' - 297 6632 2 58.52 CTATGTTATACCCAATCATTTATTGTTTTCTTGGGAGTCCCATTTCCGCCTTTACTTTTTCCAGTGCACCAACATGGATCGTAGGTGGAGCATCTGATAGTTTGAGGGCTCCTAGCAATGATTTGTTATTTGCTCGGAATTAGTTT:1 + chr3R 27384684 3' - Stalker4 6993 4 78.08 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCATTTGCCG:1 + chr3L 21656017 3' - HMS-Beagle2 6908 2 67.12 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGT:1 - chr3R 19992609 3' - hopper 37 1 58.90 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAAAGTTTTCCTGCTTAT:2 + chr3R 31886942 3' + hopper 1356 1 57.53 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAAATTAATCTGTTTTCAAATGTAAAATGGAA:2 + chr2L 11357966 3' + blood 7371 2 72.60 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAA:1 - chr3L 9809261 3' - 412 7128 2 69.86 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACATTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAAT:1 - chr3L 15913861 3' - jockey 4833 1 67.81 AACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTATTCAGAAAATATGCTTATGGTGCTTTTATTGTTACCGCAACTGTATGAAGTGATCGTTATCAAGATGATTGTATTAGTCAGTTGATT:1 - chr4 1156936 3' - Tc1 282 1 55.48 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAACAAAGAATTTTAAGTGCAGATATGGGTGTTCGAAGTCAAGTGATAATTAAACAAAAATCACACTAATCCTGACAATGAAA:1 + chr3R 10145310 3' + Juan 4192 1 77.68 GACTAGAATCTTATCCGAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAAAGCCATCGGAGAATAACGAGAAGAAGATTGAAACGCCACCACCCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAA:1 - chr3R 30890539 3' + jockey2 3094 1 68.49 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTAC:3 + chr3R 21630358 3' + I-element 5302 1 55.48 ATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGATATTTGCTTATCGCACAAACATTTCTCTGCAGTCAGCA:1 - chr3R 29290734 3' - Idefix 196 1 72.60 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGATGTTAT:1 - chr2R 22034601 3' + copia 243 1 76.71 AATACAATCGCGAGCGGCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGATTATTATTACCAGTGCTTTCT:1 + chr3R 14792597 3' + G5A 2490 1 80.00 ATTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATG:1 - chr3L 23456281 3' + Gypsy6A_LTR 245 1 76.03 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAAT:1 + chr3R 21933260 3' + pogo 2063 1 60.28 ATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAGACAAAATTGACCGATTATCTGTATGTTTGGTACTTCTATTTAAAAAAGAAATCGAATAATTGGGTTCAGATCTAG:2 - chr2L 13021797 3' + transib2 48 1 58.22 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCA:1 - chr3R 21575930 3' - Doc 29 1 27.27 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACA:1 + chr3L 24208199 3' - Quasimodo 70 2 70.55 GATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATT:1 - chr3L 23635037 3' - gypsy6 184 2 54.11 TTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAA:1 + chr3L 19274865 3' + transib2 2738 1 78.77 GAACATGACATAAATCCTACTTAATTCAAACCTTCTAAATATTACTGCCTAAACTACCAACCGATGGCGACCTGGGCTGCAGCGATGCATTAAGATAAACAAATGCGGAT:1 - chr2R 23031861 3' + jockey2 3209 1 55.45 TATTTATTCAGTTCTCGATTTTCCTGTAAAATAAACAAACATATGTAGTGTTTATTACTACTGTTAGTGTTATTACTACTTCTTCTTCCTTTACGTTAATCAACGTAAAATTTCTTTACGAAATATATAAATGTAGCCACTTTGAT:2 - chr2L 5079892 3' - invader4 3055 2 76.71 TATGTACCCAACAGATACCAGATAACAATAAGACTGTCTCAGTAAATTTGAAATCCCAATTATTGTGACATTGCCGTTAGCAATTCATTTACATTAAAGATCCGCCTAGATCATATCCAGTCATTATGGAAAAAAGTTGAGCG:1 - chr2R 3174641 3' + Idefix 94 2 75.52 CACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTACAGGACTTATAAAGGTCTTATAAATTATCGAGTGGAAGAACTCAGAGAAGAAAGGCGTCAAGTTTGGTGAAATCGACGGCAGGGAATATTAAATTATTGAT:1 + chr3L 18591833 3' + Cr1a 4123 1 80.69 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATCG:1 - chr2L 19542758 3' - HMS-Beagle2 6957 2 78.74 TATTATAAAAAGAAAAAAAAAATAAAAGAAAATATCTATAAAAAAGAATAGACCTTATTCTCAACTGAAAAGCCAGATAACCATGTCATTTTAATAATTTTTAAGAAACTTCTTATATCGACTGCTGTATCCTAGCAAGTATTTTC:1 + chr3L 18381462 3' - hopper 156 2 76.03 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATT:1 + chr2L 21750457 3' - HMS-Beagle 39 2 58.90 TCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAA:1 - chrX 9530319 3' + 297 6905 2 68.49 AAATAATTACTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAA:1 + chr3R 28901325 3' - transib2 57 1 54.79 ATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTGTGTATGGGTGTGGGCTATGGGGGCTCTTAGTGTGTTGGTTGGAGGCTCGTCTGGTTTGCCAAAAGCAGAAACGTCACCAC:1 + chr2R 11662172 3' - G-element 4283 1 76.36 CTTCAAGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCCCACGTGAACACTGTCACGGTTGCCATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGTCATCCATTATACCAAATAAAATATGAT:1 - chr3R 19448570 3' - Stalker4 467 1 77.42 TTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCAGCTCCTTTGTTCCGCCCCATCGTTGGACGACGGGCGACTCCACTGGATCCTTGACTTTGGTTTTTGTTTCGGGTTTGGTTTCGGGATTGATTCCACAATTCGCTGGAGCGTTTG:1 + chr2R 22037603 3' - Bari1 78 1 75.17 AATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGAC:2 - chr3L 17567885 3' - S-element 1597 2 67.12 ATCATACTGAATCTCTATTTCAACAATAGCAGCACCAGAAGCACATCCAACTCCAGCTCCAACAC:1 - chr2R 19329074 3' + Tabor 440 2 69.23 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGG:2 + chr3L 6518639 3' + 412 7473 2 67.12 AATTTTTGATTTTTTAACATTTTTGATTTTGATGTTGAGCTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAATATGATATCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCGCTGTTTAAAAATATCAAATTGGAATAAAACAAAAAAAAACTGCAA:1 + chrX 12439880 3' - FB 148 1 47.26 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGATTTCG:1 + chr3L 23320172 3' + roo 9033 1 58.62 TTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGGTG:1 - chr3L 12249829 3' - roo 8663 1 57.89 CTATGATATTTTTCCATAAGTTCTGTGATTACATTGATGACTTACGGAATATTAAAGTCTCTTTGGATGTTTTCGTGTAAATAGCATGTTATCAATTTTCGAGATGATTGAATCAAGTGATTTGTGTGCGTGTCAAAAGGGAGTTG:1 - chrX 7486128 3' - F-element 4434 1 48.63 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCCTTGCCACTCGGCC:1 + chr2L 12822840 3' + P-element 2820 1 22.41 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGACAG:1 - chr3L 20196250 3' - FB 85 1 74.66 ACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCCCGCACACACACTTTCCTGCGCTGCTGCACCACCACACACATTGAATCGGGGGGGAAGAGACATATCAACTTTACTCAAGCTATTTTCATTTTTGCATACTTGTACGGCGCGCATCTCGAGCA:1 + chrX 7482550 3' + blood 7179 2 48.63 GTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATATATACGAATGTGCACAC:1 + chrX 9950614 3' - jockey 4730 1 57.53 CCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATG:1 - chrX 292430 3' + G3 4538 1 52.00 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAACATGTATAAATATTTTTTTTCTCTGC:1 + chr3L 14720924 3' - F-element 60 1 49.32 AAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTG:1 - chr3L 5061554 3' + 17.6 420 2 67.12 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTG:1 - chr2L 6102937 3' + roo 9004 2 66.44 AAAAGGAAAAATTGACTTTTTAGGGGG:1 - chrX 5342667 3' - transib1 107 1 92.59 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGA:1 + chr2R 7090702 3' - I-element 86 1 73.97 AGAAAGGAAATATAGATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAATAA:1 - chr2R 15326789 3' + copia 246 1 78.08 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAGTTTTGTTAATAAAGAAGCC:1 + chr3L 12315859 3' + transib2 2799 1 68.49 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTT:1 + chr3R 21933224 3' - pogo 7 1 68.92 ATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTTATTGTAGTTAAATTTATTACAGGGAATTTTTAATATCGCTTAGAAAATCTGAGG:1 + chr3R 27083159 3' - jockey 4557 1 63.70 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAA:2 + chr2L 11391589 3' - 1360 58 1 56.85 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAGCCGGTTA:1 - chrX 18336537 3' + mdg3 228 2 73.29 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGACTGAACTTGCGTTGAAGGGGCGTCGGCTTAAGAACCAACTTTCTTTCTCAGTGCATCCCTC:1 + chrX 10639173 3' - FB 61 1 58.90 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCAATTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGAGGTCTCTTGCCGTCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGCACTAACGGTCATACTGCGTCGG:1 - chr3R 16341973 3' + P-element 2813 1 21.14 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATA:2 - chr2L 20265932 3' + roo 9017 2 56.85 AACGTTGAGATCTCAGGATCTATAAAACCTGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTACAGACATAGACGCAACGGAACACCGGTTTAAGCCAATTTCGGCTCGTTGTTATGTTTATGACCGAAGCCATAAATTGCACAATTTAT:1 - chr3R 8196418 3' + INE-1 142 1 51.37 AACACTTTGTCATAATAAACATATTTATACAATACATAAACCCAAAGGCGCCGTCGCAAACACTTTGCTCACAGAGCACCGCAAAATACCCAATAAGAGCTAGAAAAAATTAGAAAATAAAATATAAACCCAGGGCGGCACTTGAC:1 - chr3L 7100906 3' + Stalker4 7029 4 72.60 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACAACAACAAGGCTG:1 + chr3L 6964806 3' - P-element 78 1 32.19 ATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAAAAAAAAAACATAAGTGAAATAAAAACGAAAAAAGGCAGTTAACCGCATTCCATGGCCCGACGAGA:1 + chr3L 16695630 3' + I-element 4888 1 54.55 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCA:2 + chr3L 10425904 3' + I-element 5314 1 52.05 ACACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTATATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAATTACGTTAGAGGATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATA:1 - chr3R 19450175 3' + I-element 5315 1 54.79 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGAC:1 + chr2L 20266027 3' - roo 73 2 69.86 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAA:3 - chr2R 9870996 3' + roo 9047 1 68.49 AAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAA:1 - chr3R 19992630 3' - hopper 59 1 54.79 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATTTCGGTCTGGAATGCAGGCAATAGTTGAGC:1 + chr2R 12779762 3' - I-element 20 1 72.60 AGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCAAAGGGAGTAAGGGAGAAGGAGCTACTGCTGAAACACTGAAAGAAATAGAGTCTTTTTTAAGGCAAGAATTAAATAAGTTTTTAAGCTA:1 - chr2R 21884309 3' + invader1 142 2 70.40 CAAAGACAATGGCAGATATGACTTTAATTGCCCGCAAGCAAATCGATAAACAATAAACCAAAGTGCACTCAAATTGCAGAAACCAC:1 - chrX 8201144 3' + flea 4599 1 77.91 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGCTATGCACATGTTCTAC:1 - chr3L 18402993 3' - P-element 74 1 25.95 AAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTGGAGCACCGAATCGAGGTCCTTTTTGGGTGGGCGGGTGCGATGTGATGTGGGGAGGTGAGATGAGTGCCAGGATTTTCCGGCGGGCAGAGCGTGTGGTGAGCC:1 - chr3L 12314972 3' + transib2 488 1 74.82 TGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGAT:1 - chr2R 22034671 3' + copia 5042 2 76.03 TGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCTGCCGTGTTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCTCCTATCCTGTTCCTGTTCGTTT:1 + chrX 19647518 3' + Cr1a 39 1 78.08 GGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTATTGGGAATGCAAACGCGAAATATTGGGGGGGTACTAATAAAGTTATAAATAATATCGAACAATTTTTAAAAAATCTAATTTTGTTGTGTTTGTTTTTATTGATCAGTCGACGT:1 - chr3L 19424929 3' - INE-1 549 1 59.29 CAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCTTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGACTAATAGGTGACCAACCATGATGATGAGGGCGA:1 - chr2L 16746823 3' + Quasimodo 375 2 75.86 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAATTTCAATGTCATAACAAAACAA:1 - chr3R 13972900 3' - 412 12 2 78.08 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTGTATTCGGGAATCCCAGTAAT:1 - chr3L 22890333 3' - FB 40 1 56.16 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTAT:1 + chr2L 11357910 3' + blood 307 2 67.83 CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACA:1 - chrX 10319612 3' - mdg1 7104 2 64.14 AATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGGCTAGCGAAATTGTTGTCTGCATTTTGTTGTTGCCTTCATTTATTCTCCATCGTCTACATCTC:1 + chrX 16560934 3' - I-element 221 1 70.55 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCA:1 - chr3R 20441260 3' + I-element 5267 1 76.71 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGTTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACA:1 - chr3L 18125892 3' + Ivk 5334 1 49.32 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACTTTATGTGGTCGGAAACGCCTCCTTCTGACTGTTACATACTTTTCAACGGATACCCTTTTACTCTACTCTAATCAAAAAAATCCTAATGAGTGTGGCTGC:1 + chr4 643215 3' + HMS-Beagle2 7177 2 73.29 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTACAC:2 - chr3R 19073135 3' - roo 8677 2 71.23 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGCCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCC:1 - chrX 11209862 3' - hobo 50 1 61.16 GTTTTATTATATTTTATAAAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCA:1 + chr2L 22150617 3' - S-element 97 2 84.93 CGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTC:1 - chr3R 23911325 3' - 3S18 5765 1 78.79 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAGGTTTAAGTGGGCGTGGCTAAAAAAGAGAAAAACAGAAGAGAGTCGAGTTCCCCGGCGATCCATACCCATTACTCAGCTA:1 + chrX 22850206 3' - roo 8706 2 54.11 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTC:2 + chrX 12129449 3' + flea 4995 2 71.92 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGCATGCCATAAAAATACTGGTAATTTCGAGTTACGAGGCGCAAAAGGACATTTCTGGAGGTTCTATTCAAAGCGACAAGTGGTACG:1 + chr3R 28146236 3' - roo 35 2 56.16 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCGAAGGG:1 - chr3L 3983797 3' - P-element 48 1 47.41 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATATTGCATCTTTC:1 + chr3R 15942846 3' - hopper 11 2 78.01 ATTTTACAGATTTTTATTTATTACTTTTTCAAGGCAAAACAGAGATTACTCGTTTTCGTTGACCTCAAGCAAGCCAGCCATATTGGTCGGGGCATGCAAATTTTCGGCCATAATAATGATGTGATAATGCCAGAAGTACCTTATAT:1 - chr2L 12908899 3' - 412 7400 2 54.11 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATAC:3 - chr2L 13556332 3' + transib2 2770 1 55.48 TTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGC:1 - chr2R 330125 3' + HMS-Beagle2 7123 2 68.49 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGTAGAATC:1 + chr2R 11804763 3' - pogo 27 1 67.12 AATTATATTTCATTATAAAATTTATTTATTAAAAATTTTTTGTTTATTTTTAAAAAAAATTAATTTTATTATATAAATATTTTTTATAAAAATAATACATTTAAGAAATTTTTTAAAAATTTATATTAAATTAATTAAATAATTTA:1 + chr2R 15170444 3' - S-element 93 2 26.03 CTTTATATTAGAATATTTGTCATAAGAGTACTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATAATCAATAATCAAACAAAACCTGAAAATTTCTAGCGATGAATGGGCAATATGAATAAATTATAAAAGCATATATGATGAT:1 - chr2L 3988327 3' + 1360 391 1 65.07 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCCAGGTGGGTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGGTTTTCG:1 - chr2L 11391513 3' + 1360 1 2 57.53 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAAAAATCATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' - micropia 4989 2 60.00 GCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGACTCACGAAACTAGTTTACGCAACATGGGGCAATTTTGCATGC:1 + chr3L 13239061 3' - G2 2901 1 66.67 ATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTGATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:1 - chr3R 2424353 3' + 1360 2967 1 74.66 GTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGCAGGAAAGTGTGAAACAGAAATCTAGACACAATTAATTGCGCGACATTTGT:1 - chrX 3527049 3' - Stalker 6862 4 65.07 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGGGCAGCAGCT:1 + chr2L 47206 3' + roo 9025 2 52.05 ACTAACACACACACACACACACACACACACACCCACACACATTGGGCCACTTGAGCCACTTGAAGCGCAGGCCAAA:1 - chrX 20022221 3' + Quasimodo 35 2 73.68 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTTAGAGCCAGTTAATGTCGTTTATTTTTGGTTTTGGTATTTTGTTTTTTG:1 + chr3L 17940246 3' + 1360 3379 2 78.08 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAGTTT:1 + chr3L 12315843 3' + transib2 2783 1 57.53 AAGTTGAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATATGTGAATGCAAACGTGCAACACACCAGGTGACAGACT:1 + chr2L 4863102 3' - Cr1a 4256 1 74.66 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACGATTTGGTAAAGGGGATTGAAAAACAAGATTTGTTGATTTTGTTTTTATACTATGTAAAATTCAAAACACAATAACAATTACAATTACAACACA:1 - chr3L 24362375 3' - jockey 4787 1 61.64 AGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAACAAAAGCATACTATCCGGTTGAAATTAAATAATTCTTT:1 - chr2R 20405342 3' - Ivk 287 1 71.85 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTT:1 - chr3R 18971672 3' + Juan 4187 1 57.53 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTT:1 + chrX 18336649 3' - mdg3 75 2 75.78 AAAGTATCTGCACAAGCAAGACCACCACCCCCACCCCGACGAGCTAGAGCCAGATTCTAAAAAGTCTACCCGCCAGTACAGGGCCTTTAAAATTTCTATACTTATTTTTAGCTTATGTATTCTTTAAGTTAGCCCTATGATCTCAT:1 - chr3R 11945533 3' + Gypsy12A_LTR 2158 1 60.27 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTT:1 - chr3R 11191364 3' + roo 9039 1 60.96 ATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGA:1 - chr3L 23249399 3' - rover 7025 2 65.07 ATGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATCTATATTTTATATATTTTATTTGCAATCTTGTTATGCCATTCGTACACAAATAGGAATTCAAGCATAGCACCGACC:1 - chr2R 13176459 3' - opus 7039 4 60.96 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCA:1 + chrX 1341740 3' - 412 54 2 53.42 ATCGCAATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTG:1 + chr2R 5303155 3' + FB 199 1 53.42 ATCCGATCTAGATAGCTTTCAAATATGGTGCCGTGATATACGTTAAGCTTAAATGGATCCAATTGTAAAGTTATGACCTTTGTCGTATCAACTCACTCAACACACGGTGCTTAGAGATATTTACCATAATACCAAAAAAGAACA:1 - chrX 334608 3' + Q-element 639 1 73.61 TAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGATCGTTAATACGCTCGGCACAAGTCATGAAGCCAAAGGAA:1 - chr2L 18351350 3' + transib2 159 1 77.12 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCT:2 - chr2R 7090644 3' + I-element 5286 1 63.70 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACA:1 - chrX 6417764 3' - Quasimodo 37 2 62.90 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAATTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTT:1 - chr3R 16518850 3' - Tirant 8135 2 66.21 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTC:1 - chr3L 7889565 3' - roo 8732 2 69.86 ATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATCGCCCACGTGAGTGTCGGTGTACCGGGTGGGAATCATTCTACTGTCCATGCAGGTGAAGAAGACGGCCTTGGGCTAAA:1 - chr3R 8981826 3' + 1360 3166 1 57.93 ATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCC:1 + chr3R 15942791 3' + hopper2 1537 1 68.49 TTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTCTTTGAATCAAAAAATGTATTGATCTTCGGG:1 - chr2R 5883545 3' + hopper 161 1 65.57 GTTTGTAGGAGGGATAGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGAACGCGAGTGGGAGTGAGCCAGCAATAGG:2 + chrX 11817403 3' - I-element 5056 1 78.08 GAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTCGATAGTTGGTTGATTGGTGTTTTGTATTCGTATTCG:1 - chr2R 13809820 3' - I-element 5048 1 68.91 AATTTAAAAAAATTATATTTTATATATATACTTTATGGATTAGAATTGCGTGTCACTCGAAAAGGTTGCAGGTTTATATAAAACCAATTTAGTAATTTTATTCATCACTGTTAATTGTCGATT:1 + chr2R 25178152 3' + HB 329 1 70.73 GGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGCTCGATGCTTTTTATTTGCGCTGGCTTTTTATGATATTTCAAGAGAAAA:1 - chr2L 18258638 3' - roo 8998 2 66.44 AAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGGTAACAATTCTTTGCGCTTTGTTGATC:1 - chr2L 13585657 3' - Idefix 7 2 78.77 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGAACTCGAA:1 - chr3R 30675361 3' + 297 320 2 73.29 CACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAATAAGGGTTTAAGTGGGGACGACACGCCAGCCTTGA:1 - chr3R 28100890 3' + Doc 4611 1 72.80 AGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGACTGTGTTTCTTTATGATAATTGTTATTTGT:1 + chrX 17171611 3' - 297 6547 2 78.77 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAGACATT:1 - chr3R 13300882 3' - roo 87 2 77.40 ATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCAC:1 + chr3R 1844853 3' - Cr1a 159 1 54.35 AAATTATTTAGTTTTAAATGTTGGGCAGATCTGTGGACCTACATTAT:1 + chr3L 27137561 3' - FB 938 4 53.19 GTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCA:1 - chr3R 26504229 3' - HMS-Beagle 75 2 71.03 GGGGCGCCAATTATTAAATGTGGGGGTGCTGCTCCAAGGATGAGGACAGTACGGTGCGGCTATTCATTGATTAACTGCCAGGCCTCACTGGAGACACGTGAA:1 - chrX 13027455 3' - gypsy3 385 1 77.45 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCGGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTT:1 - chr2R 3564060 3' - Tabor 6918 2 69.18 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGG:2 + chr2L 12250992 3' - 412 7115 2 60.27 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTACCAA:2 + chr3L 26291008 3' + Tabor 452 2 60.96 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATACGTGTGTTCCTTACGAA:1 + chr2R 4870272 3' - Juan 65 1 54.79 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCT:1 + chr3R 10931709 3' + 297 344 2 75.44 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTTAGAACGGGTATTTGTCG:1 - chr3R 18399333 3' - Juan 4042 1 30.82 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAAGGAAGTTGAGAAATAACTAA:2 + chr2R 5941436 3' - copia 56 2 54.11 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAAC:1 - chr3L 14366509 3' + roo 9032 1 59.59 GTATCGCAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACACAGATTACAATCGACGATTGTTCTTTTCATTTTTTCGGGTTTTCCTTTTCATTTTTCTGGTGGCCAG:1 + chr3L 22389751 3' + Gypsy6A_LTR 385 1 58.90 TAGCAGCCTATTTAACTTAAGTTAACGCACCAAAATATTAAGAAATAAAACAATTTAGTATGCTTTCCCAATATGTTTAGAGTAAAATTAATCCAATGAAGATGATTACCGAAGAAAATCAAAATGAATGAACATTCCATTCAAGC:4 - chr2R 10560877 3' + pogo 124 1 61.64 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAATTTCTTTCCCTAT:1 + chr2L 17005847 3' - Stalker2 19 2 69.86 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAAAATACCAGCTGCCG:1 - chr2R 5501125 3' + mdg1 28 10 77.46 ATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAAA:1 - chrX 6116206 3' - transib2 22 1 67.81 GAAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACAATGCAAGCAACCTGGAAACGACTTGACTCTAAGCTCTACCCTTGACTCGGCGACCAAGTTGCATGCAACAGCAACAAAGGCAC:1 + chr2L 5585688 3' - Cr1a 204 1 60.84 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGCGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTATAAACGGCGGCTAAATTTGTTTTGCCAATTCCTAGAGAAGTGTCATAAACATTTTGGTCACGTTCACT:1 - chr2R 9158055 3' + mdg3 5426 2 63.01 AACGTCGAGATCTCAAGAACTATAAAATCTAGAAGGTTAAGCTTCAGCATACAAATTCTAGAGACAAAGAAGCAGCGCAAATTCGTTGACCCATGTTGACACGCCCACTCTAACGCCGAGAAGCCGCACAAAACTGCCACGCCCAC:1 + chr3L 19271025 3' + INE-1 142 1 74.66 TGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATA:2 - chr3R 2522261 3' - Tc1-2 90 1 50.68 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATTATTATAATAAACATTTGGCTGGCTATATAAATTCAACCATCGGAATTTTTAGAGTGCAATTTTTGCTTTGTCTGATGTTAGCGACGGTTTGAAAATACA:1 - chrX 21164184 3' + mdg1 7077 8 60.27 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAG:3 + chr2L 16943885 3' + copia 216 2 65.75 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTCAACC:1 + chr2R 5480008 3' - F-element 59 1 56.16 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTT:1 - chrX 12986541 3' + roo 337 2 67.12 AAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATCGAGCAGGACGATTACGTAGAATTGCGAGAAGGAATAGCAGCCATTCCCAAGAA:1 + chr2L 6596394 3' + Doc 107 1 63.01 AATTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAG:1 + chr2R 490329 3' - hopper 125 1 76.42 CGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTG:1 + chr3R 1446146 3' + 1360 3379 2 29.45 ATGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGTCCAAATTAAAATGTGAAGGAAACACTGCTTTAACCCCACGTATGCAATTATCCTTGGCTTTGGTCCGGAGTCATGCCATT:1 + chr2R 24695061 3' - 1360 155 1 54.79 GTATATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCAATTAAATTAAAGTATTTATCGCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGGCACAACCGTTTGAAAAGAGAAAGTTTGTCATA:1 + chr2L 17152083 3' - Stalker4 248 4 66.44 GCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTCTCTTTCTCCCTGCGGAGCAACAACTTGATGACATCACAAATATACAATATCGCAGGAACTGATTATGGACGGGTCTAGATGGAGTG:1 + chr2L 22642556 3' - Idefix 7141 2 60.96 ATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTG:1 - chr2L 12341822 3' + BS 5033 1 57.53 AAATAAATTGAATAAAACAAAAATTATTTTTGAATATTGTTAAAATCATCAATTCTAACCTTTTGCGTTTCTGCCTTTTAAATACAGTTTATCCTAATTATTATTTTAGAACAGCATTGATTGGAATTTCTGCTCGAAAACCTCTA:1 - chr3R 25585324 3' + X-element 4719 1 39.04 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTC:2 - chr2L 21299286 3' + roo 360 2 54.11 ACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGTAGTTTGCAACTGAACAAATCGAAAGTGCGTGCAGTTCGGTGGAAAATTGGGAAAAGCGTACGCAGTTTACATTTAAGTGAAATTAATTTGCTTTCGGTGTTATGGATTTATAT:1 - chr2R 17361525 3' - I-element 434 1 76.03 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATT:1 + chr2L 11357911 3' + blood 305 2 67.81 CTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAAATAGGTGGGCGTGTGCAGAAAGGCCATCCACGGATATCTTCCCAATCGCGCGGGAGTGCCATTTATGATTTTAAAGGATAACCGAGGCACTACAC:1 - chr2R 15695483 3' + I-element 360 1 75.38 AACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGATAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATA:1 + chr3R 11062844 3' + roo 9038 1 47.69 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCACTTTTGTTTCAGT:1 + chr3R 15790991 3' + roo 8995 2 72.60 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATT:1 - chr3L 13836628 3' + 412 7484 2 69.77 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAAT:1 - chr2L 18549851 3' - roo 8749 2 79.45 ACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTCTTCTACGCCTGCAAACATCGCTCGCTTTGCTTCTCACCTCAGACATGGTTCTCTGACTTGATGCGAAAATCGCATATGCACAC:1 - chr3L 19368111 3' - F-element 4546 1 74.80 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTATATATATACCT:1 + chr3R 4679596 3' + hopper 1403 2 73.94 GACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACCAGCCCGAGTCCCAGTTTCACAGTGCCAGTCTTTGATTCGTTAAACAAATTTTATTATTGAACA:1 + chr2L 15459472 3' + transib2 2728 1 56.16 CCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCCGATTTTTTGTTTCTTTTTTTTTCTACACTATTTTTAATTCTCGGTGTATTGGCGCTACGTGATCAGTGCTCTTGTAGTTCTTATATTAAAGACTGATAAAGCCGCCTGGATTGG:1 - chr3L 1169525 3' - invader2 4791 1 79.45 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAACATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTAT:1 + chrX 14310314 3' + roo 9009 2 60.27 AAAATTCTAATTCGTTTAGAACTATTCACTTTAAAAATAAGGTCTCCACAATATTATATCAAAATCATACCCAGAAATCGATACCACATTTTTTTAAACGAATTTATATAACTAATATACGGTCGGATGTGCATCCTTCTGGTAT:1 + chr2R 2954923 3' - Dm88 237 1 79.31 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATTACGCGGACAACCG:1 - chrX 19266798 3' + roo 391 2 64.38 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTTTGCTTAATCTCAACATTCTTTTATAGTTCTTGAGATCGTTCATACGGACAGACGGACG:2 - chr2R 25232262 3' - 412 7113 2 59.59 GTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTCGAGAATGCTATCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTTTTTACACTTAAAAAAATGTAGCTGTTAAGATGACTTTGGTTTGATGGTTGATACCATAT:1 - chrX 22518945 3' + INE-1 551 1 65.75 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAAACTCTCTTAATTTTACGCGAGCCTGGTTACGAAACTCTCGCCTTGTG:1 - chr3L 21279348 3' - 1360 73 1 72.60 TAGAGTATTCAGCTTGCGGCATGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACATCTTATTAAATTTGAATCGAAATTCAGAAAGCCCTGGTGGATTTT:1 + chr2R 15153656 3' + 1360 414 1 69.18 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGG:1 + chr3R 25709849 3' - hopper 82 1 70.55 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTAGAAACGAA:1 - chr3L 9809209 3' - 412 21 2 69.44 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAG:1 + chrX 22840574 3' + copia 195 2 57.53 AAAAGGAAACATAATCAAGATACAATAATTGCATTTTCTTAGAGAATCTTAATAAATTGTTAAGCTTGGTGTGATTTAAAGAATCTAATATCAAAGTTAATTTGTGGGCGAATTAAAAATTCTAAATTTGAATGTATAATTTGAAT:2 - chr2R 20960128 3' - Circe 6960 1 64.38 AAGCTACACATTAGGTTAAGTATAGAAGGAAGTGAACGATTCCTACTGACTAATGAATAATAATAAATGCTGACTTGCAAGTGTATTCATGCCTGTTTCTCTAATTCTTCCAGGACAAGGTCGTGTCAACCAGTTGGGC:1 + chr2R 25063238 3' + G5A 2783 1 53.24 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAG:1 + chr3R 28385642 3' - transib2 46 1 53.79 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGTTTATTAAAAACTTGGCCTACATTCACCC:1 + chr3L 7300281 3' + roo 9053 2 68.97 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAAT:1 - chr3R 904928 3' - rover 6977 2 51.82 CCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTAT:2 - chrX 6116233 3' - transib2 49 1 52.05 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGT:1 + chr2L 14523284 3' - HMS-Beagle2 17 2 41.96 AATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAAATAATAATAAT:1 + chr3R 18873667 3' - micropia 5090 4 52.08 TATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACTGGTAATTAGCTGGCGTCCCCTCTTTGTGGAAGTGTCATTCCATGCCATGGACGAAACGAAACCGAA:1 - chr3R 18658695 3' + 412 224 2 51.59 GTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGAGAAATTCCAATTCCTATTTCAATTCCCAGTCCCACTACCACTCCTTGGCCACGGCCCCGACGCCGTGTTGCAGGCCTCTGCTCCGTCGCC:1 - chr2L 21932131 3' + Copia1_DM 38 1 64.18 GAACATAAATTTCTGTAAGGGTCATGGAACTCATAGTTAGATCTATAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAATATTAAAAATCGTCAGCACTTTTTTTGCAATTTAAATGATTTCTTTGCCTTTTTTTTCGGCTTACTTATTGAAC:1 + chr2L 3354578 3' - Cr1a 4182 1 50.68 CACAACCACACACACACACACACAACATTATAACCATAAAGCTCTACTTTCAAATTGTTTAAGAGTTTTTATAACTCTATATTTTAACGCAATATGGTAAAATTTTTTTAAAATTTTTTAAAGATCTATTTTTCAATTATGATGGC:1 + chr3L 19032423 3' + gypsy3 419 1 77.40 TATGAAATGATTCGTTCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCGGTGGCGAAATGGGATGTGGGCAGGAGAATTTGAGAATTTAGTCAGCAACTGTCGATGACGGCGACTG:1 + chr2L 9119763 3' - Doc3-element 4621 1 53.42 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGAATGTGTGCGAGTGGGGGCACTCAAGCAACAAAAGGTAGCACAG:1 + chr2L 2527773 3' + hopper 1402 1 71.03 AGCATAAAAAAAAATTTATCCAAAAAACTCCAATAGTTTAGGGGGGATTAAATTTTGGAAAAAAAAAAAGCCCAAAGCCCCCTAGGGGAAGGGAGAAAAAAAAGGGTGGAAAAA:1 - chr2L 16946067 3' - hopper 66 1 32.46 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTTGGCCTAAAGTTGGTGTCTCTTTTCGACCGCGTTTCTCTGGCACTTCACGTTCATTTC:1 - chr3R 24090399 3' - roo 8680 2 71.23 TATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCG:1 + chrX 21947737 3' - mdg1 37 2 50.39 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGGTT:1 - chr2R 8099108 3' - jockey 4789 1 64.38 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCGAATCTAAGCTT:1 - chr3L 11326657 3' + pogo 2053 1 54.11 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGTAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGC:1 + chr3R 13973058 3' + 412 440 2 51.37 ATAATATATATATATACATATAAGAATAAAAATAAAATATAATATATAACATTACAAATGCTTTCATGTTTATAACTTCTATAAGCCGTACTAATAATAATCAATATATAATAATTGTTATTCAAGAAATATAATTGATGGCAGCT:1 - chr2L 21803692 3' - 1731 4412 2 57.53 AAAATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAG:1 + chr2R 14793533 3' + Dm88 6 2 83.56 GAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGTGCTTTCATTGGCATGTCGCGTAGCGCCAAACGGCCCGTAAATATGCAACTATATGGCAAACAGGCAAGGAAGTGTTTATATATAATGAGAG:1 + chr3L 4368966 3' - accord2 7365 1 73.60 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCAC:1 + chrX 10167479 3' + roo 356 2 52.05 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTTATTACTCATTAA:1 - chr3L 1279063 3' - roo 42 2 47.95 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACG:1 - chr2R 20802587 3' - mdg3 5331 2 70.83 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACG:3 - chr2L 14074462 3' + 297 318 2 73.29 CTTTACGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTTATCAAGTGCATATAAGTAAGATTTTC:1 + chr3L 19274936 3' + transib2 2809 1 74.66 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATC:1 + chr2R 6964856 3' - Burdock 6216 2 73.29 TTTTTTTTTTTGTTATTATTTCGCGGTCATACATCAAATGTCTAGACAAATTGTGGCAACACACACACACACAATGGCCATAATGTTAAATGGCAAAAACAACAGCTGAGCGGCCAAAACAGGAAGTGGAGTGTCAGTCAGGAGAA:1 - chrX 15617366 3' - Rt1b 5147 2 78.08 CGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCGTGACTTTTCGCGTCTGGCGATTCACACGTTTCGGCCAGAATGGTGGAGCCAATTTCTGGCTTTTCCTC:1 - chr3R 17524519 3' + Doc 428 1 73.47 AAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGCTTAAAGAGCTGATGCTTTCAACACCATAAGTCCTATA:1 - chrX 9899829 3' + F-element 4384 1 73.97 ACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTTCGTTTTGATTTC:1 - chr3R 9557473 3' - G2 2986 1 76.71 GAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTTTGTGTAAATCCCCTCGCAACCCACCAACTTCCACTAACGCCACCCTTCGCATTCACAATTGTCAAGGTTGGGCTTTATTTTATTTC:1 - chr2R 19798402 3' - FB 150 1 60.00 GACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAAAGTAACTCAAAT:2 + chr2L 21570294 3' - Dm88 4393 2 65.75 TAAGGGCCAAAACTTTCCACGAAAGTTCAAACTCCTGTTGTGATCCATACAACCGAACAACCGAACACCCTATTCAGTTTTTCTTTCCCTATGCCGATGGAAACCGAACTGTTGCTCAATTAGAAGTGCCGCAACCCTCTGGCC:1 - chr3R 13174271 3' + Quasimodo 368 2 52.08 CTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTACAATACTATAGGCCATTTTGTTTTTTTGTTTTGTTAAATTTAGCA:1 - chrX 20970583 3' + 297 6866 2 68.49 ACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACCAACCTATTATCAGGGGATTATATATAATACGATATATAATCCCCTGATAATAGGTTGGTTGGCTGAGAGCCTCCGATCAGACCGTTTTAGCTCTCCAAGGTCGCGTTGTCACC:1 - chr3R 28927351 3' + Doc2-element 408 1 63.70 AAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAG:1 - chr3L 23249402 3' - rover 7027 2 66.90 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGC:1 + chr2L 20840076 3' - mdg1 48 2 52.94 AGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCAACAGAAACG:1 + chr3R 13612653 3' - F-element 170 1 76.55 TATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCG:1 - chrX 19074753 3' - mdg1 46 2 50.35 TATATCTGTGAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATTGAAACAAATGCTGAATTATTAGCACACAAATCGCCGGCAGCTGAAGAAGAAGAGGCGGGAGGTTCAGTGGG:1 + chr3L 6404917 3' + Porto1 147 1 70.54 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATTAATTCTTTTCATATTTGATTTTAGAGAGTATTTTCATTACTCAGCAACAGTTTTCAGGA:1 - chr3R 7666588 3' - I-element 16 1 73.29 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGGCAATTGCGCCTGTCACTTGCGCAAAATGATAACA:1 + chr3L 18046725 3' + roo 9034 1 59.31 CCGAGCGAAAGTTCAACGCAGATCGCCAATACGAACTCTGATTAGATTAGATTTACACAGTAAAAGTATTTCATATATGTATATTTTTCATAATCATAATGATAGATTATAAAAAAAAAACGTTTTCAACTGATTAATAAAACACA:1 + chr2L 15056893 3' - accord2 156 2 75.34 AAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCCCTGGACTGAGCATACGGTTATAATTCC:1 - chrX 21639586 3' + gypsy5 380 2 62.33 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAAAAAAAAGGGTTAACAATGAAACGCAAAT:1 - chr2R 7090591 3' + I-element 5343 1 72.73 ATAATAATAACAACATCAGAACACACAAACACACGTAACACACACACACACACACACACACACACACACGGGGACCAGTTCAACAACCTTTTTCTCTGGGATATCAAATACAGAAATCAACTGTCATGTTGTAT:1 - chr2L 14658056 3' + G4 3664 1 61.94 CTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACTGCGAGAGTTCGATCGTGACTGACTGAGCTATCA:1 - chr2R 6482454 3' + gypsy 7365 2 73.29 ATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTACTCGTCATCAATTTCTGCCTGGCGAACAGGAAGTGTAGGCCATTAATGACAGC:1 - chr2L 13493466 3' - 1360 201 1 63.70 GTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATATTTGGCGAATTCTAATGTCGATGTGCTTTTGTTTTTTAGCATAAT:1 + chrX 8687216 3' - I-element 283 1 71.23 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTT:1 + chrX 10167450 3' + roo 8991 2 71.92 CAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGGGGCGATTGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCACAACAACACCAGTACCAAGCACTTC:1 - chr3L 4514055 3' + mdg3 381 1 78.63 GGTCTTCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCC:1 - chr3L 21996190 3' - Transpac 5012 2 77.40 ATCATATATTTTAAACATAAGTATTAAAGGTCTGTTCAATTCTCACTTTCAGAAGCAC:1 - chrX 8531352 3' + Cr1a 96 1 63.79 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATTTGCTACTATTGATAAGAAACGATA:2 - chr3L 15103767 3' + Transpac 286 2 69.86 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTG:1 + chr3L 5389935 3' - roo 8755 2 83.56 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTAT:1 - chr3R 904931 3' - rover 6983 2 57.97 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAAAAG:1 + chr2L 4003835 3' + mdg1 411 2 75.34 GCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTT:1 + chr3R 11040140 3' - Bari1 71 1 69.34 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGGTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCA:1 + chr3L 7889644 3' + roo 9022 2 63.33 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTGCACG:2 + chrX 14722245 3' - diver 5909 2 64.38 GAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGCGTTCAACCAATAAATATGAAATATGAAAACGCAGAGAATATAATATTAGTTTGAACAAAATAAAAATCACTT:1 + chr3R 9150198 3' - hopper 485 1 50.68 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCCTGGCAAAGG:1 + chr3L 1692108 3' + blood 7316 2 67.81 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATTTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTA:1 - chr2L 71181 3' + 412 7497 2 56.91 ACCAGACCACAAGGCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCGAGGGATCCCCCTGCCACCACCAATTTGAATATCTGGGACGGACAAAAGATCTTGAAATTTTGACTCGG:1 + chr4 174288 3' + Gypsy6A_LTR 253 1 74.81 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAA:1 + chrY 2720338 3' - 297 50 2 78.85 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCA:1 + chr3R 25428255 3' + 297 333 2 63.70 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1 - chr3R 29487012 3' + flea 4963 2 55.86 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAA:2 - chr2R 5151212 3' + roo 9021 2 52.05 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCT:1 + chrX 19588137 3' + roo 344 2 59.59 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGATGCCTT:1 + chr2L 15936881 3' - copia 4911 2 55.94 TGCACTCAAATAAATAAGTAAACTGAACGATTTGGTTTGAGATTGCCCTGCTGCCATCCAATTGAACGCAATGAAGCGCTGCACGATGAAAGCTCGTCTCTCTCCCTGTGTATCTCATTTATGTATCTATATCTCTACCCATAAAA:1 - chrX 7009327 3' + Tc1-2 64 1 58.90 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCATTTGACTAATGATATATATTATACTTTCAATCAGCAGAATGGTAGTCTAAGAGAAAAAACTCTTGCACCCAATATTATGACATTCCTCGACCAAAAAATAACAATTTAG:2 + chr2R 8157078 3' + mdg1 7392 2 78.77 ACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTAAACTGAATTATGGTTGATTTAGTGTGTTTTTGTCTATCTTTGCGACCCACAAACGATGGCTTCATTACAATTGCAACAATTATAATGC:1 - chr3L 6513117 3' - pogo 1971 1 65.75 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACT:1 + chr3R 13875119 3' + P-element 2806 1 29.66 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGT:1 + chr3L 1692117 3' + blood 7325 1 61.64 AGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGT:1 - chr3L 19454936 3' - mdg1 72 2 64.38 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGCGGTA:2 - chr2R 4673523 3' + Quasimodo 7347 2 71.23 ATCGTCACAGTTCCCTCATATATGGAAGGGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACCGGATGCAGTCGCATACCTCGACTTTAATATATCCTTTGCTTGCAGTTCTTGAAAGGGAGATGGAACGGCGATTCATTT:1 + chrX 20966037 3' + Q-element 27 2 50.00 ATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTA:1 - chrX 3431878 3' - Ivk 5378 1 60.27 CTAGAAGATGATTTTCGGGCCGAAATCATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCTAATATAAAGTCATTTATGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACACAGATAGATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAA:1 + chr2R 4826124 3' - 1360 3193 1 50.00 GAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCAAAATTGTATAATTTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGTGCTAGAA:1 - chr2R 5182968 3' - INE-1 571 1 59.59 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTTCTTATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTG:1 - chr3L 5532953 3' + roo 9022 2 70.91 CTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAATGTTCGATTGTTCGTGCGCTGTAACTCAAGCGTTAATTGGTGGCGGTTAGGGAAGGAGGATTCAGTTCGGGGGGGAGGTATTATGTGGTACTAAGTAGCTGTTATATTG:1 + chr2L 4835042 3' - Doc 492 1 73.10 AAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGGTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGGCTTTGTGGACCCGC:1 - chrX 18817242 3' + transib2 2821 1 77.24 GTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGGCGGTTTTCAGCTGATGAGCAACAAAGGACAGAGTGCATCGGAGCCATTAATTTAAATTGGGTATTATGAGCGCACTAGCAACACGGACAAAAAGGTTCGTCCCGACATTGTCAT:1 + chr3L 4764622 3' - Doc2-element 4371 1 78.08 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCATTGAAGATA:1 + chr2R 7244932 3' + diver 183 2 60.96 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACG:1 - chr3R 30347281 3' - P-element 31 1 66.44 ACTTAAAAGCCTTATATTTTCTATCTGTATCCGCATCGCAATGTGTCTGTGTGCGAGTGTGCGTTGTTTAAAATTGAATAATGCCCGCTCAT:1 + chr3R 22194244 3' - FB 263 1 44.57 TTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACTATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTT:1 + chr2L 13556421 3' - transib2 81 1 69.86 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGGCATTAATAAACTCGACACCG:1 + chr3R 8075989 3' + 412 7501 2 52.63 AATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAAATGATGTAA:1 - chr2L 14874105 3' + copia 254 1 58.22 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATATGCCGCA:1 - chr3R 27405941 3' - diver 27 2 63.97 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGT:1 + chr3R 10270636 3' + Juan 4133 1 72.46 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGT:2 + chrX 13490731 3' + 297 6897 2 79.45 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTAT:1 - 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I-element 78 1 69.18 GCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACACCACACAGATCACAAATCACAGATCACAAATAATATATAAAGCTTGGATCGCTCGGTAATATCATATAATA:1 - chrX 6232496 3' + accord 229 2 42.86 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAAC:2 - chrX 8360507 3' - roo 8705 2 57.53 GTGTGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGCATTGCCCCGTGAACGGGGCACACTTATTGCAACGCAGTCGG:1 - chr3L 11369166 3' - Tc1-2 484 1 82.61 ATCATATTAAAATGTATATTATTATTGTTATAATTATTATTATTATATTACTACTATTATCTAAATCATGAACATCCAATCTTACGCAGCTGAAAATTAAGAGATGTACTTTTATATCGTGATTCTTCTGTTGGCTTCTTCGCTGT:2 - chr2R 7310713 3' - transib1 1880 1 52.05 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGA:1 - chr3L 13294907 3' - roo 8750 2 77.40 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGATTGG:1 - chrX 1263911 3' + Burdock 6367 2 64.34 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCG:1 + chr2R 7090727 3' - I-element 30 1 56.52 TATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGTAATAGTA:1 + chr2R 5303168 3' + FB 255 1 79.61 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAA:1 - chr2R 15326827 3' + copia 242 1 52.05 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTT:1 - chr2L 20265923 3' + roo 9026 1 54.11 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCG:1 - chr3R 11040045 3' + Bari1 1655 1 54.11 AAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCAT:1 + chr2R 23592060 3' - micropia 4997 4 57.53 GCTGCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTT:1 - chr2R 3593664 3' - gypsy 88 2 77.40 AAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAAAAGAAACGAAACGAAAAAATATAGAGACAGCCTGGACACGCAGACCCGATATATAGCCCCCAACCCCTTGGCCATCCCTCAATTTTAATGCTGGTGGAGGAGCCCCAAAGGAAAA:1 - chr2L 3781048 3' - hopper 147 107 52.82 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTT:3 + chr2R 6847841 3' - Doc 69 1 62.33 CGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTAAGTAATTCAACTAATGTTTATTTTGGGGATGGTTCTTGTCCATTGCATCATTGAATC:1 - chr3R 19515938 3' - Doc 304 1 60.27 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTG:1 + chr2R 23180296 3' + roo 9032 1 52.31 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTG:1 - 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chr3R 6625694 3' + flea 202 2 57.53 AGCAGAGACGCAAAGGAAGCCGCCGACAACGTGCCCAACACCAGAGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTGGAAAATAACTCCCCACCTACCATCCTTTCTCTTTCCGCTGCACAGAGAACAAATTTGCTGACATTTTTACATCATCCTTA:1 + chr3R 20152459 3' + G-element 475 1 50.68 ATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGA:1 + chr3L 19455006 3' + mdg1 421 2 63.08 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCC:1 + chr2R 5479989 3' - F-element 78 1 59.59 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGCAAAGGCGTTTTTAATTATGAGGCATAGTAAAGACATCAAATTGAGATTAAATCTAGTTAAATCCATAAAAAAAATGTAGAAATAATTTGCCTTTATGGA:1 + chr2L 15605332 3' + mdg1 401 2 63.70 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTC:1 + chrX 10167481 3' + roo 9039 1 57.36 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAGCACT:1 + chr3R 17421336 3' + pogo 2073 1 51.37 CATACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTGTACAAGACTAATTAAATTATGAAAAATATCCAAAAAATCTAAAAAAGAGTGTGTGGGTACGAGTGCCTATAACAGTTTCATGTAAATAATATGCGTTGATTT:1 + chrX 13746130 3' - gypsy2 6504 2 66.67 AAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTCAAT:3 - chrX 18396024 3' + roo 404 1 71.92 ATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTG:1 + chr3R 13356681 3' - roo 65 2 63.01 GGGGTGGATGATTTGGCACTCGCGGGCGTCTGACACGACGGTGAAGTATTTTTTTTTTTATTTTTTTTCAATTTAAATTGTATAATTGAAGTTTAAAGCATTTACTACTGGTCAGCCCGGCTGATTGTTTGCTTT:1 - chrX 9030719 3' - Doc3-element 325 1 59.26 AAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTA:1 + chrX 20999591 3' - BS 56 1 60.69 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGG:1 - chr3R 25616501 3' + roo 396 1 66.99 CACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTC:2 + chrX 8200289 3' + flea 4944 1 66.44 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGT:1 - chrX 10319583 3' - mdg1 7076 2 59.59 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATAGAAAAAGGCTGCGAGTTGAAACCGTAAAA:1 - chr3R 15942647 3' - hopper 6 2 77.78 AGCATCGATGACTGTTTTGAGGAAACACTTTCCGATCGGGCCAGTCTAGTCGTGGTCAAGATTGGATAATGTATTCTTCCGAAATAAAAAGTCTTCTCTGCTTGGGAGTTCAAAATCAAGAAAAGTGTAT:1 - chr2L 23028320 3' + mariner2 493 1 78.46 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTGAAATTTATAAG:1 + chr3L 20711740 3' - jockey 4779 1 69.18 AAATTTAAAATTTAAATTTAAAATTTAAAATAAACATATATAAAACTTTAGTTCTGTAGTACTTAGTAGATGGTCAGGAATGACCATATTTATATCTTGATCGAATTTCTCATAAATCAAGCTTAATCCTAAATTTCATTATAA:1 - chrX 17052925 3' + 1360 3041 2 39.58 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCTGCTGCTGCGTCACTTCACATTCGGATCATTTACATACGCAGCACTGCGGAGTGAG:1 - chr3R 23067388 3' - roo 8682 2 68.75 AACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCGTTTGTTAGATCGCAAATCAATCGAATCTTTTCGAATTCAGGAGCAGATAAGCTTTTTCAAGTCATACTATTATCACTATATGTTAATAATTTAATAAATCGTAT:1 + chrX 21046959 3' + Doc 486 1 75.34 AGGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTGTAAAGGTCTTAGGTCATTTGCCCACCCTTATTATAATTACTTGGAATGCAAGTCAGGAACTT:1 - chr3R 30813326 3' - FB 57 1 55.48 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGC:1 - chr3L 10731771 3' + 297 339 2 62.14 CGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTTTCTTGGAATCCAAAGGGGTAGCGAGCGTTGCTAAA:1 - chr2L 22966849 3' - 1360 3157 1 71.74 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTTATAAATT:1 + chr2L 17005856 3' - Stalker2 7258 2 77.40 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGGCCAATATAGCCATTTTGT:1 + chr3R 5368731 3' - 1360 14 1 76.39 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACCTCTC:1 + chr3R 23067545 3' + roo 9026 1 56.85 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTCAACCAGCAGC:1 + chr2R 5480014 3' - F-element 50 1 61.54 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATT:1 + chr2R 7304130 3' - pogo 50 1 53.79 CCAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTTGTTTGTGTGAGATTAGAGTCCGGGAGTATCTGCTTAAAGAGGCAAG:1 - chr2L 15779507 3' + hopper2 1541 1 70.55 CATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGACGAGTGTGAATGTGTCTTATGTGATTTAATGGGGTTTTCTTC:1 - chr3R 20714095 3' - F-element 4274 1 70.55 AAAATGTAAATTAAAATTTTAATAAAATTTCAAAAAAAACACATTAACACATTAATTGTTTAAACAGATTTTTGATGCTTATATGATCGCTTTAAGTACATATATTCCCAATTAGGATCAGACGTACTCGGTATGTTTAAAATAA:1 - chr2L 7579163 3' + 1360 3047 1 62.76 AAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTT:1 - chrX 2479482 3' + mdg3 190 2 52.74 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATAGGGTTAGTGTGTGGAGTCAGTGAGAGACTATGTACCTTGATGCATA:1 + chr2L 14757502 3' + copia 238 1 50.68 CTTTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGT:1 + chr3R 11040149 3' - Bari1 70 1 63.45 AAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAGCCGCTTGTTTTTGAATCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAATCTCTCGCTGGCTGCTCGCAAATGCAAAAATGAGGTAACTTACTAGAGGCCAACGCGAT:1 - chr3R 22803072 3' - R1A1-element 146 1 56.94 GTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTT:1 - chr3R 19450088 3' - roo 8660 1 60.16 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCCTTGTTGCTGTTCGGAGCCGGCTTAAATGTGGGCCATTAAAAACAGGCTGAG:1 - chrX 10167376 3' - roo 67 2 65.75 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGATT:1 + chrX 18336667 3' - mdg3 5327 2 66.44 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGTTTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCGGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTG:1 + chrX 18336664 3' - mdg3 78 2 67.12 CCAGGGTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGGGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCACCTAAAAGTAT:1 + chr3R 31264142 3' - jockey 4766 1 71.92 TGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTCGAGAATGCTATCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTTTTTACACTTAAAAAAATGTAGCTGTTAAGATGACTTTGGTTTGATGTTTGATACCA:1 - chrX 22518948 3' + INE-1 548 1 65.07 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTGGTTCAAGAGGTAAAAGAGAGCTTGAACGAGGCT:1 - chr3R 15790854 3' - roo 63 2 63.50 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTTCTCATGTCCGACATCTTCATGTACTGCAAGATGATCAAGGAACGAGCGCCCAACACCGTTGTGGAA:1 - chr3L 7322229 3' + roo 9043 1 53.49 ATATAACAATAAAACAAAAAAAAAGGCCATAATCATCTGGCCACACGGCGCAAAGAGAGTGTCGGAGTTT:1 + chr2L 15748191 3' + Rt1a 5071 1 77.14 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAG:1 - chr2R 14051744 3' + roo 353 2 55.48 TTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGT:1 - chr3R 19450167 3' - roo 354 2 71.92 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTTATAA:1 + chr2L 17005853 3' - Stalker2 7261 2 75.34 ATGAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTCAAAAAAATATACAAAGTAATAGAGGGGGAACAATAAACAAACACTGATCACTTCGCGCTGGTTGGTTTTTTTCCTGTTTCGATCACAAGTTCG:1 - chrX 2919541 3' + Cr1a 118 1 49.32 ATACAAAAAATAATAATAATAATATTATTATTCTTAATATCGTTATTTTTTAGTTTATTTTTTGTTCTATTAACAATAATAATAATAATACCTTATTTATGCCTTTTAATATTAATTGCTCCAACATTTTTGAATTTGTTGTATTA:1 + chr3R 32047193 3' + HeT-A 5894 1 66.44 AGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGGATGAGGATAGTATACAAGTGCATTGCACTTTTCAAATAAAACGTTATCTAATGCAGATTATTAGTTA:1 - chr2L 14026095 3' - F-element 437 1 71.72 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGG:1 - chrX 18336565 3' + mdg3 247 1 79.80 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACTTAAAACTTTGACAGGAATATACATTTGATTCCTTTTTTTAGCTCTTCATTATATGAGAAAATTGCT:1 - chr2R 8047211 3' - 1360 19 1 68.49 CTATCAGATACCCGTTCCTAAGAAAGTGGGAGTGCGAGGGAGAATTTGGCAATAGAATGCAAAAATAAACAGTGTTAAGTTTGGGAGTTTACGTTTTAGGCGCAACAGAATAAACCTTCTAGTTAATACGTATAAAGTGTGTGTAT:2 + chr2L 21300970 3' - INE-1 547 1 69.18 CTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGCATATTGTTATGAACAAAAGCATATGCAAACCATAACCCCTGCATCTTCCTTCCGCTCCACCATC:1 - chrX 18742789 3' + invader4 278 2 56.16 ATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTTATCTAAG:3 - chrX 10445509 3' + INE-1 536 1 80.14 GCACACACACACACACACATATATAGTCACATGTGGAAGCTGCTCTCGTGCTGCACCTCCAACGCCATCAAAACTCAGGGGAAATATTTTTATGTGTGTG:1 + chr3R 28242153 3' + accord 7029 2 86.00 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCC:1 - chr3R 23618089 3' + hopper 1390 1 68.49 ATTGGACTTCAGGGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTGCAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACATAATAATAATAATCTCCAGGAGGGCCTCTTCACTGGTTTTACACACTCCTTGTGATT:1 + chr3L 22290648 3' + baggins 5362 1 80.58 AGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATTGTATGTATATATTTTCATATACTTTATATAGATTTGCTGTTTATTTCAGTTTTCATTATTTTCTAATTTGACGCTTCAT:2 - chr3L 16540941 3' - I-element 4927 1 56.85 CCGGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAG:2 - chr3R 19992655 3' - hopper 83 1 71.23 AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATA:1 - chr3R 11040061 3' + Bari1 1639 1 65.07 AACATTTCCTCACTTTGTTTATATTTGTTGTTCATATTGATTTAAACATATATTAATATAGGTTT:1 + chr3L 14752007 3' + Transib5 2627 1 61.54 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAG:1 + chrX 21224625 3' + roo 9009 2 64.66 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGGACTGAACAGCATTAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATGCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGCTATAATA:1 - chrX 17343341 3' - I-element 11 1 69.29 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCATACCAACCGGGGCAAGGAGTTCA:1 - 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chr3L 16237348 3' + jockey2 3360 1 74.66 TCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGGATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTC:1 + chr3L 21996238 3' + Transpac 5153 2 73.38 GTTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGAGGGTTTATGTAAGTGCATGGGGGACAGCGTTTATCTCGTGAAGAGGTTGAAAACAACATGGAATTTTTGGGGTTTGTTATACTTGAG:1 + chr4 140968 3' - Stalker2 168 2 51.37 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAAGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTT:1 + chrX 18336648 3' - mdg3 71 2 73.98 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACC:2 + chr3R 4964197 3' - roo 8723 2 63.01 TGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGT:2 + chr2L 11257112 3' - rover 7012 2 63.01 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAAC:4 - chr3R 15790801 3' - roo 19 2 63.01 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAGCAAGACAAATG:2 - chr2L 21299255 3' + roo 9054 2 72.60 ATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTCTTGAGTGAAATCCAATTTTTCTACGTCCAATTTGCGTAATATTTTAATTTTTTTTTTCTGAAAACTGAAACACTCTCTTTACTTTATTTGTTTTCTGTCAAACCTA:1 + chrX 18989975 3' - Porto1 4234 1 69.86 TTCTCATTTCACCTATTTAAACCGATGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCCCGGGGGATGCGTCGGAATATTGTAGAAATT:1 + chr2R 23180266 3' + roo 8997 2 71.11 AATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTAAGCAA:1 + chr3R 11062855 3' + roo 9033 1 54.79 ACTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGC:1 + chrX 11661519 3' - pogo 36 1 60.96 AATAAAGTTTAATAGTTTTTAAAAGCAGTTAAGAATTTAAAAATTTACATAAAAAAAAAGTTGAGTTTGCCTTTTTTGGTCAATTTTTGTAAATGGATTGGGATTTGGTTTGAGGTTTGAAAATAGTTATGTAGTGCACCGGGTGC:3 + chr2R 10049152 3' - Tc3 1527 1 70.55 TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGC:1 - chr2R 18315994 3' - HMS-Beagle2 6907 2 67.81 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATGCGAGACTTGCGCTAATCAG:1 + chrX 8308542 3' + roo 392 2 75.34 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATGGTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTC:1 + chr2L 14074553 3' - 297 6619 2 53.12 CAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCA:1 - chrX 14771724 3' - BS 57 1 59.29 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCGCTTTGGTTT:2 + chr3L 19182818 3' + micropia 5413 2 64.38 GACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCTGAATTAGAA:1 - chrX 12129295 3' - flea 50 2 54.11 GTATGTTGTATGTATGTATATATGTTATGTATAATGTATGTTTTAAGTTACAAAATTAATACTAACAATTCCAGATCGAAACTTTATTTTATTTATAAGTTGAAATATGAATGTACTTAATATATAAATATTAATTACTATTTTCC:4 + chrX 14173036 3' + Dm88 13 2 76.71 CACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGTATGCATATAGCGAGCACAACTCAATCCTAGAAGTACTTCAGGACTTTAAAACGAAATGCAATATGTTCTATCCTGCTGCCTGCCGCCTGTCAATTGTTAT:1 - chrX 10416366 3' + Tabor 138 2 77.61 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATA:1 + chr3L 20898635 3' + roo 356 2 55.48 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAA:1 - chrX 7795496 3' - roo 44 2 57.24 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCCATAACTTCAGGCTTTTGAGGGGGATTTAATATTT:1 - chr3L 27865972 3' - Max-element 34 2 51.37 TGATAGTCGGGGAACTGGACTATAGGTTTCTCTATTTTTTTGTTTCAAAGGTGTCTAATTTAAATTCGCTGTTTCGATTAGAAAGTAACGTTTTTGTTTGACTTATCACGCAAAATCGAAGGGAGAGCTAACGTTTCAAACAGATA:1 - chr2R 5217636 3' + INE-1 563 1 74.66 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAA:1 + chr3R 17077192 3' - roo 8731 2 65.75 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATTGTAGTATACTGTTATGTTGACATAAGTTGTATTAATTGTATGTTCCTCAATTG:1 - chr2R 11804619 3' + pogo 2047 1 59.31 ATTATAGAACTGAGAATATTTGCTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTACAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACTCATCAATGAAACAATCTAAACACAAAAGCACTCACAAGTGTGACACAGAACGTG:1 - chr3L 19071466 3' + gypsy4 398 1 60.69 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTA:1 - chr2L 13556346 3' + transib2 2756 1 65.07 CTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATTCGACTTTCATACGGACACACAGGCAGACGAAATGACTTTGTTCCAGCAGTTAACGAATGCTACAGTAAAACCCAGATATATATATATATCGGACTAGTACGTTAAGCATAAGGCTGCC:1 + chr3L 6549857 3' - INE-1 156 1 58.90 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTG:1 + chr3R 31653173 3' + roo 354 2 56.16 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCGTCTTACTAAGGCGGACGTATTCCCGGTGGATCACATTTATCTCCATGCTATCTTCTCTGCTGTATCTGCTA:1 + chr2R 4606344 3' - 1360 16 1 73.29 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGTCACCTGACAAATACTGTCTTCTTAGCTGTTTTATGGCTACA:1 - chr2R 7889041 3' + hopper 1362 1 63.11 ATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATACTTCAAAAATCGTCACATTTGGCCTCCAAAATGCGGGGAGAAAT:1 - chr2R 13177204 3' + P-element 2576 1 55.32 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGCATGCCAGCT:1 - chr3R 23639115 3' - pogo 35 1 58.90 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATA:1 - chr3R 15724274 3' + Juan 4182 1 60.27 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTGG:1 + chr2R 23180297 3' + roo 9017 2 54.79 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGTACAATTTGCAATGAAAATAAA:1 - chr3L 26505821 3' - copia 4882 2 76.71 CAATATAGCTAGAAGTCTAAGATTTCGTTTTAGGCATCTAATAGAGGTTAAAAAGATTTTTGAGATTGGCTATGTATCTGCCAGAGAAGCAATCATGCCGAATTAGCATAATTTCTGTTTGTGTTCATAACGAATGCAAACAA:1 - chrX 6286584 3' - Transib5 2937 1 51.75 GGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAACCGAAGAAACCAAAAGGGAAAAGAAAGAAAGCGGGGGGGGCAAGCAAAGGAATTGCCGACAGCAACCAAAAGG:1 - chr2L 14932354 3' + Bica 479 1 66.36 TTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGA:1 - chr3L 6447047 3' - transib2 85 1 73.29 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAG:1 - chrX 18396107 3' + roo 320 2 75.34 AATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTCTGCTTTCCGTTTTATTCGAATGTTATTTCTCCGACTAATTTTTTGTGGCG:1 + chr2L 8831322 3' + Tc1-2 76 1 59.65 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGG:1 + chrX 21224630 3' + roo 343 2 62.86 AGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAATTCTCTTTGGCCAAAAGCACTCGGCATTCCTTGATTTGCTTTTGATTATCTTTTGAGCCTTTGCTCAGTCTGCTTCC:1 - chr3R 16340247 3' + Bica 382 2 60.27 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAG:1 + chr3R 17736966 3' + opus 443 2 57.53 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGTAGTCCGATAATTTTGTCGATGAAAGTAGCTCAGCGAA:1 - chr2R 21160656 3' + Transpac 253 2 60.96 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTTTGTACATTTACCTATTGGTGTATGTAATTATTAAGAT:2 - chrX 14303997 3' - roo 8670 2 71.92 AGGACCAGGTGGACTCCATGCCACGTAGGTGTAAGGCTGTGTGTGGATTATCTGTGTGAATGTGATAATTGTAAAGTGTTATGTAAAATTCATTATATAAATTTTTGTTGTTGTATGGAGTGTTTTTATGTTTTTAGTAAAGTTTC:1 + chr4 1081281 3' + Tc1 1281 1 75.34 CTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTTTATACTGTATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAGAAAATAATCTGTGTTTTGGGTGTTTTGGGAGTGACCCTGTTGGGGCCTTTGCCTATGGTTAGTTTA:1 + chrX 10646458 3' + Ivk 5331 1 60.00 TCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGCAATTCCACAACCAACAAAACAACACAAAAAGTTGTAAAAAACAAACACTCGTTGCATTTTACTTGTTTTGTTTTTTTTTTCGCCGCAAAAAGCGCAAAA:1 + chr3L 6447913 3' - transib2 358 1 67.12 GTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTCGGCATTTC:1 - chr3L 24272047 3' - gypsy11 4036 2 66.44 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATC:1 + chr2L 3234045 3' + roo 338 2 65.52 ATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAT:2 + chr3R 2526463 3' - gtwin 6960 2 55.48 TATATGTATATATGTATATATATATATATATGTATGCATATATCTATGTATATATGTATTGTATGCAGCGTGCTTTTTTCCGCCGCCACGACCACATGAAAATATCTACATACGTAGTATGTAGTACGTTGG:1 - chr3L 9922319 3' + G3 4506 1 53.79 TTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGC:1 + chr2R 8735658 3' - mdg1 7115 2 69.86 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAACACGAAAAGCAGGAGAAACGCGTTTAAAACGCGC:1 + chr2L 4180527 3' + jockey 4921 1 73.85 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAG:1 - chr3L 16662391 3' + jockey 4920 1 68.49 AAGATGAATTCTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTATGAAATTTATTTTTGTGATAATACGCGGAAATGCATTTACAAAGACATGGCAAAGTGAACTAATAATTGAATTGATTTTTTTTTCTCAGTAAATAACTTAT:1 + chrX 15260675 3' - 1360 407 1 51.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATT:1 - chrX 18396038 3' + roo 390 2 62.33 GTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGATAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAACGGAAAAATTTCAGTAAATTTTCAAGTTTTAGAACACCAAAAATAGGGCAGCCCAATACAAA:1 - chr2L 10362567 3' - rover 206 2 60.00 AAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTG:1 - chr2R 18514908 3' + P-element 344 1 30.63 ATCTCGACGTTCATACGGACAGACAGACATGGCTAGATCGACTCGGGTCGGGTATTGATCCTGCTAGAGCTGGCTACGAAACATCTTTCAATATAAATTTCAACGGCTT:1 - chrX 22775281 3' - INE-1 131 1 56.88 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGAT:1 - chr2R 10078146 3' - jockey 95 1 61.64 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTA:1 - chr3L 14094553 3' + I-element 5320 1 55.48 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAG:1 - chr3L 6447021 3' - transib2 12 1 66.67 TTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACTATAGAACTATGCTTGGATCAAAGCCGATTTAGGTACAACGGTTCTTATTAAGGGAAGGGTGGTCCACAAGGACACTCTCAAATAAAAAATACGAGAATTTCTTAATTACATTTTGCT:1 + chr3R 1958547 3' + Cr1a 3991 1 73.97 GATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTCGAAGCTGC:1 + chr2R 5321237 3' + INE-1 507 1 65.75 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATG:2 - chr2L 14874156 3' + copia 237 1 50.68 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGGGCTTTTTGGCAGCCAAAACCATGTG:1 + chr3R 10931739 3' + 297 6973 2 63.54 TTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGT:1 + chr4 829131 3' + INE-1 152 1 69.86 AATAAAATAAAATCATATTAAGATGTATATGATGGTCCAAATGATTTTGTCCTGAAATTAAAAAATAAATTTATCATATGTCATTGTTATGCTATTATACTTATTTACTCACTTTGTCAATGTTTTTGTTTTGGTTTAAGGGTGTA:1 + chr3R 16684494 3' - transib1 1891 1 70.55 GGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCTAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTTAAATCCATTCGGATTCTTAGAACGTATCAAACTACGACTCCAATAACTCCATGAGGGCATAA:1 + chrX 7093332 3' - Circe 7257 2 62.33 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCC:1 + chr2R 7850035 3' + roo 360 2 52.59 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTC:1 - chr3L 15913829 3' - jockey 4801 1 56.16 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGT:1 - chr3R 25616490 3' + roo 9027 1 54.79 TTATATATTTATATATTTATATATTTATATATTGCATATTTACTGGAAATTAGCAATGAATTGATCAAAAATGTGTTCTAAAACAATACAAAATAATATGTTTCTTTTGAACGTTCCACCATTGTTCATATAGTGTGTTTTTTTGG:1 - chrX 3764919 3' - Stalker4 7047 4 66.44 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTATTTGTTGTATTTTTATATTCGATAATTGCTAAATAATCATTTGACTTATTAATAATATATGATTCAGCTTTATAGATAAAGTAA:1 - chr3R 19511330 3' - Tirant 8 2 58.22 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAAT:1 + chr3R 7943814 3' + blood 7339 1 65.00 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAA:1 - chr2R 11159266 3' - roo 8741 2 72.60 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGC:1 + chr2R 23180294 3' + roo 350 2 56.85 GTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGTATTAAAAAAACTCTGACCATATTTCTCCCAGTGCATTACTGACCAGCCTAGAACTGCGAAATTTTCGCAGCGCGGAAAATCAAAGCGACGGCGGCCGAA:1 + chr3L 20282960 3' - Quasimodo 7156 2 77.04 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTATTTTCAACAGTGTA:2 - chr2R 14653112 3' - 297 6586 2 67.12 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACT:1 + chr3R 21933239 3' - pogo 64 1 65.75 AAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTT:1 + chr3L 20187440 3' + FB 493 1 60.96 AAGAGTATGAGATTAGTCTAATACGCAGTTTTGTTTATAATATTTGCAAAGTGATTTGAAATGAGAAAAAAAAACAATGGAATTCGGTTGGCAGCCAGTGTAGAGTTGGTCATGACACGTCCAGAAAATCTGCTGTTTTTGTTGTG:1 - chrX 4096482 3' - diver2 31 2 78.08 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCT:1 - chrX 21087602 3' - mdg3 5257 1 54.24 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTA:1 + chr2L 23381789 3' + flea 247 2 79.86 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGC:1 + chr2R 23780630 3' - Ivk 44 1 54.11 AAGCTATCTAGATCGGATTGTAAGTACAAATAACAACAAACCGTAATGCATAATGTCGATTTATTTTTAAAAATGTTGTTTTCATATTTAGTAATTGATAGGTATTCTGTAGCCTTT:1 + chr3L 18276211 3' - Q-element 635 1 67.52 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGAATATCCCGACTTTTTCGTTTTGCTAAAATTCCGAAATCATATCCCACACACACAAACCCTGAGATCTGCACACATATCCCAGCCCTTATTCACGGTATCCTCGAGGCAAGTTGAT:1 + chrX 2748330 3' - INE-1 578 1 55.48 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCAC:1 + chr2L 22193505 3' + roo 336 2 68.97 CATATATATGTATATATAATATATGTATTTTATTTGGTACGGTTATTTGTATTGGTTGGGGTTCTTGATTTTTTTGCACGCTTGATTAATTTGCCTGCTGCGTAGTAATAGCCTCCAATAGCTTTTTGATACGAAATCATAAACAT:1 - chr3L 7906126 3' + Stalker2 7505 2 85.62 CCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCAAGTTCCCTCATTAAAAGTAAGTTTCATGTATTTATTCCTTTGATCTTGCAGCGGCGACCACACAATAACTGCGCAGAACGCTATTGATTATTTT:1 - chr2R 18905476 3' + Idefix 197 1 60.14 CTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAACGCG:1 - chr3R 4357499 3' + Tc3 1684 1 52.90 CCCTAAAACCGCCCAAACCTGCCGCGCCCACATTTTTGAAATTTTTTTTGGATATTTTTTAATAATTTTATTAGTCGTGTAAATTTCTATCGATTTACAATTTTTTTTTTGCCTCCCCTTGACAGACTGCCATTCAATTGTCAAAA:1 + chr2R 14089903 3' + INE-1 348 1 77.40 TATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGGGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGGACATCGAGTGAACTGGGGTAGGGGTTAAGGATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTC:1 + chr2L 1923996 3' - 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roo 85 2 76.71 AAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGCACTTCTCCTACGTCTCACTTTCATCCAAACCGCGTTAAGACAAAGCCAGCAAAA:1 + chr3L 21907792 3' + F-element 179 1 73.97 GTAGTTTACTTATGTATCGCTCTACATTTGACTTTATTTTGTCTATAACAAGGGGAGCCCTGAGAAGTATCTTTGTGTGTTTTTGTTTGTTGTGACCATTGTTTCTTCCGTCTGTTGCTTTGCCAGTTCTTAACGTAATTTCTTGT:1 - chrX 291746 3' - G3 4373 1 67.12 ATTTATGAAAAAAAAACAATGAAAACACTTAAAAAAGATTTATACTTATGCAAATGTATTTCATAAGGATTATTATTATGCTTCTATTCTTTGCTTAAACATAATAAATATGAATAATAATATACCACTAAGCTACCACATATAA:1 + chr3L 10500565 3' + looper1 1693 1 65.52 ACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGG:1 + chr3R 19992706 3' + hopper 1332 1 76.43 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAA:1 - chr2R 16817870 3' + 412 446 2 51.09 ATAAATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTAAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAAC:6 + chr2L 12553466 3' + HeT-A 4 2 71.23 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACAAGGCACTGACAAATGTATGTGAAGGGA:1 - 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chrX 17069569 3' + F-element 4454 1 64.38 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATCCCTTGG:1 + chr3L 8959723 3' - 1360 29 1 63.45 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCTACTTGGACAAATC:1 + chr3L 2544735 3' + Tirant 355 2 54.11 ACACGACTATAGCGTTCTCTCTTGTTGATTCTGCAGCGATCTCCGTTTATGAGCATCGATTTTTATTGCCACCA:1 + chr3L 19528828 3' + INE-1 576 1 66.22 ATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGAC:2 - chr2L 14074443 3' + 297 336 2 60.27 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGG:1 - chr2R 7244789 3' - diver 5926 2 58.90 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGTTTTTAATGA:1 - chrX 21224490 3' - roo 13 2 76.71 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTG:1 + chrX 10319719 3' + mdg1 7410 2 51.37 ACTTGAAAGTCGATTTTAATTATGTTTATGTGTGAGAATATTTTGCAGACGAAGCACGTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTAATTTATTAAATAAGTTTAATTTGTTTGTCATTTATCTTTGCTTTTATTTTATTTTAG:1 + chr2L 17075379 3' - HeT-A 99 1 82.39 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGGAACTTGCACTTGAACCCTGAAACAAGCAGGCGACCGACC:1 + chrX 19266911 3' - roo 8735 2 71.53 ACACACACACACACAGATACTCACGCACACAGACGCAGGCACGCATAAAAGTGAAAAAAAAAAATGGCAAAGAGCGGGACGTTGGCCATAAAACAATGCCAAAGTGCCC:1 - chrX 11273910 3' + accord 7031 2 56.88 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGC:1 - chr2L 17005683 3' + Stalker2 362 2 50.00 CAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATT:1 + chr2L 17005824 3' - Stalker2 42 2 55.48 ATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTGCAAAATA:1 - chr3R 27843161 3' - I-element 5342 1 59.59 AAAACTGATTTTATTTGGAAATATCGTTGTTTAATATAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAAAAAGTTAATTGAGTACAAATTGTT:1 + chr3R 19450028 3' - roo 362 1 76.00 CTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTACACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTACCTCCCGGTTTTGGTATATAAATCGATCATAGATGTAGTTCATGCCCAGGGGTAAATAGGCACGCATATG:1 - chr2R 12472803 3' - transib2 2760 1 53.42 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAA:1 + chrX 2479573 3' - mdg3 5303 2 59.84 TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCA:1 + chr3L 19274864 3' + transib2 2737 1 79.45 TTTTTTTTTTTGTTTTATTATTTTTTTCTTTTGCCACAGAGTGATGTAATATATATTAGCAGCATGTATAGATGATTTAATTCGATGCGAAAGTGAAATTATACTCTCTGATGAAGGACTCAAATGTACGAGCACCATTGCCGTTG:1 - 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Tc1-2 200 1 77.05 GACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGGGAAATTGTCAACATTAAGCGGGTGGCAATGTATGTACCTACATATATATGTACAAGGGAGCGGAGGTGTAGATGGAGGGG:1 - chr3L 17836606 3' + HMS-Beagle2 7085 2 57.53 TGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATAGTTGGT:1 + chr3R 16533720 3' - X-element 4404 1 34.48 ATTTTTAATTTTTCAACTTGAAAGGCGAATTTAATAAAATTTGAGCGAGAGAGTTATTTGCCTACGAAGCGCGATTAATTTTATTAAATAAAATTAATAGTTTTATTAATTAAATTTAATTTTCTTTGATTTAT:1 + chr2L 14390630 3' - TAHRE 148 1 28.36 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGAT:1 + chr2R 12779732 3' - I-element 48 1 52.78 AAATATAACAAAAACGAATATCCCGAAATGAAAATAAACCTAAAAGTAAGTACGTGCAAGTAAAAAACAAAACAGCCATTATTAATTGGCCAAGGAACCTGCCCACGTAATCATCGAATAGCCATAAAAGCGTGTCCTCCGCCAGG:1 - chr2L 20301801 3' + G4 101 1 77.40 TATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTA:1 - 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chr3L 22760390 3' - F-element 170 1 76.03 AAAATTGAAAAAAAAAAATAAATTAAAAATATGTGATATACATATATTGTGATCCAGAAAATAATAGTTTTTGCTGGCATATAATATTTATTTTTGTACACTCTAAATGAAATTGGTTCTACATTTTCTGCTGTGTACCTGAGCTG:1 + chr3L 2865025 3' + Doc 4698 4 54.79 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCT:1 - chr3R 23491873 3' + transib2 2743 1 71.92 TATTTTTTTTTTCTTTTTCTTTAGCCATCCCTTTTTTTGTTTTTGCAACATTGTTGTTGCTTCATTTTGCCGCAAATGCTGGGAAATCCTAGTCAAAGGTCGTTCTAGACGATTTACCGATTTCTTATCCCGTTTAATGAAGA:1 - chr2L 8347754 3' - Doc2-element 219 1 62.24 TGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAA:1 - chr3L 11913198 3' - BS 5064 1 65.07 AGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTTCAAACATAAAACGCTCTATAATTCTATTTATAGATTTAAAAGAAACCTATACAATACGTAA:1 - chr2L 2206501 3' - 412 7279 2 57.53 GAATCACTCGCGAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCTCTCCGATTTTTATTTTATGTTTGTCAAACCAGCCGTGGAAAAAAAACTCGAAGAAAAGGAG:1 - chr2L 20131876 3' - Cr1a 127 1 64.65 AACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGGGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCGATTAATTCTCAT:1 - chr3R 19224989 3' - HMS-Beagle 6854 2 57.24 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCCATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATGATAATTATTTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATT:1 + chrX 20999580 3' - BS 46 1 60.48 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAA:2 + chrX 1341720 3' - 412 74 2 67.12 CAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTTATTAAAAGAATATTTTGGTTTGCGTCTCCAAGACCTACTTCTTCGCATATATCGTAAATGG:2 - chr2L 8442984 3' - I-element 5192 1 57.53 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGACTTTTTAATTATGG:1 - chrX 21216679 3' + roo 397 1 75.56 CACACACACACACACATACATACTTACTTGTCATATAATAAACTTTTATGTTAACGGCTTTCGATGTCTTACCAAAGCGCAAATATTTTCCATTGCCATTCATGCATTTGGCCTGGGAATTTTAATGGGCCACACGCACCAGTCG:1 - chr3L 10147290 3' + Quasimodo 38 2 56.55 AACATATTTTTATTTTTTTTTTATTGATATATAAAATTCATTCTTGGTACTTGAGAACACCTTAAGTTTTTATGCATTATTTTGAGCAAATGTCGTCGCAAATTGAGCCACTAACACACACAGGCAGCAAATCAAACCTTCATTAA:1 + chr3L 7835827 3' + INE-1 465 1 73.97 TAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAACAAATGAAATTAAGTCAAATTAAGCAAACTTAACTATTGCATACTTTTGGATACCTTTATAGGTGTTTAGGTGTTAGCTGCACTAACAT:1 + chrX 18818800 3' + transib2 230 1 62.32 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGC:2 + chr2L 13556439 3' - transib2 64 1 60.96 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGAT:1 + chr2L 15936876 3' - copia 4919 2 52.05 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAATATATATTATATATTATATATATAATATTTTTACATTGTTTTTATCAAATTTCCACTAAATT:1 + chr3L 23688660 3' - Quasimodo 47 2 69.18 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGTTCAATGTAATTTATTATTTCGGTGGCCACTTCCCTGAAT:1 - chr3R 15882538 3' - jockey 23 1 69.86 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGACGTTTTTCCCCAGC:1 - chr2L 4713865 3' + transib2 2776 1 58.27 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGA:2 - chr3R 6625690 3' + flea 206 2 54.79 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTGCCAAGCCGCA:1 - chr3R 22642250 3' - blood 7040 2 64.38 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTAC:1 + chr2L 5582193 3' - pogo 67 1 69.78 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAG:2 + chr3L 18931054 3' - I-element 64 1 59.59 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTTTG:1 - chrX 14771696 3' - BS 34 1 55.17 GCAATAAAAAAAAATGAAATAAAAAAATTACGAAAATGACAGCTATTAATTTTCATTGAACGATTCCAACCGTATTTTAAAGTTTTAATTTAATTCGAAAAATTTAAAAATAAAGTTTCCTAAAGTACTAGTACTCCACAGTTTGT:3 + chr2L 17368629 3' + P-element 140 1 52.74 TTTTTTAGAATCAGCATTTGGGACATTAGTTGACTTTTTAAAAAATTTCTTATATTTTTATTTTCTAATTTTGTAAGAGAAAATGTAAAAGTTTTAGCTGACTGCTGTTTGCTCTAATTTCATTGCTCTTTTGATAGTTGTTTTCT:2 + chr2L 4095377 3' + S2 443 1 65.07 ATTGCACCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACTGGAATGAGCAACCTTCATCCCGATAGGCCAGCTTA:1 + chrX 5181103 3' + Ivk 4986 1 69.33 TTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAGACAAAGCTTAGAAATAGTAATAGACAAATCATCACAAAGATATTATTCGTCTGATTGTGTTGTTC:1 + chrX 22218747 3' + 1360 250 1 78.77 AGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAA:1 + chr3R 1844836 3' - Cr1a 184 1 68.49 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGAC:1 - chrX 21216692 3' + roo 9036 1 60.96 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATATATAT:1 - chr2L 16539602 3' + Juan 4203 1 77.40 TCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAA:1 - chr3L 22861729 3' + S-element 1695 1 65.75 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACCGATCAGGAA:1 + chr3L 12004347 3' - P-element 53 1 47.26 AGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCTCTCGCTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACTATGTGCGTGTTAGTTTCAATAAAAGACAGTTATAGTAT:1 + chr2R 4617662 3' + 1360 3265 1 74.66 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTA:1 + chr3R 25709863 3' - hopper 68 1 60.96 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCGTAA:1 + chr2R 23780626 3' - Ivk 22 1 60.83 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACG:1 + chr2L 11257104 3' - rover 69 2 67.12 AAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAA:1 - chr3R 22590496 3' + rover 7221 2 71.92 CTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTTACCGCTCGTTGAAAGCATGAATTTTCAAATGTTTCAATACTCGTATATGGTTATTCTACATAA:1 - chr2L 11257002 3' + rover 316 2 55.65 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATTACTCGATGTCGCCAACAACTTTATCAG:1 + chr3L 4219550 3' + jockey 4940 1 60.27 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACT:2 + chr3R 22590614 3' - rover 6978 2 66.44 TAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATC:2 - chr3L 24757197 3' + Cr1a 4257 1 54.11 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTAGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCAAACAGAGGCAA:1 - chr3R 15072527 3' - pogo 28 1 62.76 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGGAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGCAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGG:1 - chrX 6475292 3' - Doc 51 1 49.26 GCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGG:1 + chr3L 23678128 3' - Osvaldo 32 1 70.64 TATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAG:1 + chr2L 21930242 3' + Copia1_DM 90 1 60.74 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCCAAACTGCCAGAGTTCGACC:1 + chr3L 1692167 3' + blood 363 2 73.97 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGT:1 + chrX 12129436 3' + flea 226 2 64.34 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGCT:1 - chrX 17343347 3' - I-element 23 1 68.49 ATAAAAAAAAAAACAGGAAAATCGAATGGGGGGGAGGGGGAAAAGGGAAAAGGGGCGAAAGCAGGGGAGAAAGCGAGAGAGCGCAACAACACTTGTTGTAATTACTCGAGCAAGTCTCG:1 + chr2L 12677493 3' + gypsy11 3931 1 74.79 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTTTTTTTTATTATTCTTTATTTTGTTACTCCTCGCGAAAGCAAGCAAGTAAGCGAGCATTTTCTTGAAGGCGCAGTGAAAGGGCATTCGAGGCAGTTGAAACATT:1 + chr3R 22194003 3' - 1360 16 1 72.60 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTA:1 + chr3L 20711685 3' - jockey 4834 1 67.81 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACGAGGTCAG:1 + chr3L 6518668 3' + 412 7510 2 52.90 AGTTAAATTGAAAATTCAATTTTAGGGGCCCCAAATCCAAAACTGCAAAAGTTCTAAGTTCTAAGTTTTACTAAGCCTGTCAAGCG:1 - chr3L 9598374 3' - transib3 51 1 76.74 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGACTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCATCATTGCGGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTAT:1 - chr3R 19450154 3' - roo 63 2 52.48 TCTTATTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAA:1 + chr2R 5532316 3' - G4 3834 1 71.23 AACCCTTATTAGCTTCACCCGAAAAGTTTTGGGGATAATGCGATAATTTGGCTATCGCAAATAAAGTTCCATTAATTACTTGCGTTAGATTTGTAGACAACGGCAGCACATCGGGGGAATTTCTGGC:1 + chr3R 21737212 3' + gypsy12 132 2 49.61 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTG:1 + chr3R 31653173 3' + roo 9028 1 54.41 GACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAATTAACAAGCAAGAGATTTTG:1 + chr2R 4545202 3' + invader1 3568 1 75.17 AACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTAGTATTGACCATCAGCCAAAAGGATTCAGTGAGAAAATAAGAATGCATGTAATTAAAAA:1 - chr3L 23264438 3' + invader2 124 2 59.59 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAG:1 + chr3L 24934420 3' + HMS-Beagle2 7155 2 60.27 GGTCCCCCTTGACGAGAACCAGGATATGATGATGATCTTATAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTGGCATTATTGTTTTGTACATCTAACTCTTGTTAGCCTGGCGCGATATTCAAAACCACTAACTTGACACTCAATTTCCA:1 + chr2R 625560 3' + BS3 1593 1 74.66 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATG:1 - chr2R 21681303 3' + roo 347 2 59.59 GTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCATTATTGTTTAACG:1 - chr2L 18212090 3' - Quasimodo 35 2 60.96 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTC:1 + chrX 6116348 3' + transib2 2765 1 58.22 GGAATAGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTTTTGCGCACGTCCAAATTTTGAGATATGAATTTTCAAATAAAGTTTAAAAATGTTCGAAAATCAAAAATTTTACTTTTTTCAAATTTTTATTTA:1 - chr2R 22404326 3' + FB 52 1 80.14 AGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTAATGCACAAATCACAAAGAATCACCTGAGGCTATAGATTTTTACTCTATGTATTATTAAATGCAT:1 - chr2L 21892140 3' - Cr1a 184 1 60.95 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATTTTATTTGCTTAGGTGTCTTGGGTAATGGAAAATTTGTAATTGCTTTAGTTTTATTTGGATTTGGTTAAGCGATCCATTACCAAAAA:1 - chr3L 20651677 3' + roo 9039 1 50.00 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATAT:1 + chrX 12129444 3' + flea 4990 2 68.49 GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCA:1 - chr3L 23249390 3' - rover 65 2 60.27 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAA:1 + chr2L 4003766 3' + mdg1 7379 2 71.23 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGGGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTTAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCA:1 + chr3R 31264131 3' - jockey 4776 1 63.45 ACACCTAGCTCACTCTCTCACTCGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGATACGCGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTTTTCGGCGTCCACAATATATATTTACTAATTTGCAAA:1 - chr3R 7819184 3' + invader3 5329 2 72.22 GCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTCGTCCTTCGCTTCTAGAGCATTTGTTGGTAATTTGCAAATCGCCAA:1 + chr3R 31650174 3' + I-element 4885 1 68.28 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACT:1 - chr3L 2145892 3' - roo 8727 2 67.12 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAATT:2 + chr2L 12251027 3' - 412 27 2 63.01 GTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTTTTTTTGTACGGATGGGGAGACTGTTATCAGGGTGTCTTATCAAGGCATAAAAAACGGAAGGGCGACGAGGACGAAATA:1 + chrX 9856419 3' - Idefix 332 2 55.48 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAA:1 - chr2R 22775001 3' - jockey 4759 1 88.28 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACA:1 - chr3R 10270544 3' - Juan 4060 1 60.96 TATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATACACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTG:1 - chr3R 11040037 3' + Bari1 1663 1 54.11 ATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGAT:1 - chr3R 9557499 3' - G2 3012 1 58.90 CTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACGCAAACAGCAGCTCTGCATCTGTCGCTTCAAACAACAACTCC:1 + chr3R 1228288 3' + HMS-Beagle2 6961 2 67.69 CTATTTCAGTAAAAGTAATAAAGTAATATTAAATGACGAATTCAGCACGATTTGGTTTTCTGTTGCGAAACACTAATAGCTTCTTTCAAAGTTATAGCAACCAATCATTCAAGAGTATACCCTTCGAAAATAAAGGAAAACAAACT:1 + chr3L 13337304 3' + Tabor 7293 2 52.05 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGG:1 + chrX 21224630 3' + roo 351 2 60.61 AATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGC:1 - chr3R 10736026 3' + McClintock 6371 2 59.59 TTTCTTTTCTTTTTTTTTTTAAATGAGCCAGCTTCCCGG:1 + chr3L 12034194 3' + hopper 151 6 64.10 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGA:1 + chr2R 12133836 3' - jockey 76 1 65.07 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATAT:2 + chr3L 20898636 3' + roo 9021 2 54.79 TGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCAAGTGGT:1 + chr3R 25433369 3' - transib2 76 1 67.81 TTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAATAGTCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGGACAAGGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAATTGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAAT:1 - chr3R 21400026 3' + G4 3834 1 67.12 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAATAATGTTGCAG:1 + chr2R 7304155 3' - pogo 26 1 65.07 AACAAATGTTTAACTTTTATTTATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACATAACTGGCCCAAAGTTATTGCACATGAAATTAACCACAGAAAAACAGAGATGCGTGAAAATGTATGGTAACTCAACTTGCTTTCGTTAC:1 + chrX 10958887 3' - HB 1500 1 66.44 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTA:1 - chrX 14722101 3' + diver 6058 2 53.42 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTG:1 + chr2R 17878624 3' - Doc 79 1 65.07 TATTACTATTATTATTATTATTATTCCTATTACTATTATTATTATTAATGTTTTTCAAGCACTTCACTCTTTGTGAGCATAAGTTAATAAAGTTCTTTCTTGTGTACTTGTCGATAAATTGTCGATTTCCGGCGATTGAATTGACA:1 - chr3R 2690712 3' - mdg1 7075 2 64.38 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGTTAG:1 + chr2R 8735702 3' - mdg1 7071 2 61.64 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAG:1 - chr3R 15790850 3' - roo 8728 2 64.08 GTCGGTGTTCTTCTAAAATAAAAAGTTTTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAATTTGTAACAAAAACCTT:1 - chrX 23182833 3' + Idefix 7321 2 67.59 ATGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTAT:1 - chr3R 19449926 3' - roo 9043 1 73.29 ATATAAGTCATAAATTCAAGTATCCCATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCACCCTTTCCCTCTGACCCTGGCTTCAAACTGTGTGTACTCCATTCATGTCTAACTCAATACGTTGAAATTGGTTTTTCGCACGCT:1 + chrX 21038651 3' + Quasimodo 104 2 57.53 ATCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCAGGGGGGGAGTTTCAGGAAATTATTGTAAAGATAATGTGAGAAATCATATTTTGTACTCACATTAACATATATTGTTCATAAATTAA:1 - chr3L 14465927 3' + R1A1-element 438 1 68.15 CCGACGAAGCGCGTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTGAACTTTTAAAAACTTTGCTTTTAATTTTATCTTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 88 1 38.36 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATC:2 + chr3L 18931061 3' - I-element 57 1 54.79 ATATAAATATATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGAAACTGAAACTGTTAGAGAGTTGTTATGAAAAAAAAACAGT:4 + chrX 3765115 3' + Stalker 6940 4 78.08 CCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGC:1 - chrX 21639648 3' + gypsy5 325 2 78.57 GTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATT:1 - chr3R 19450073 3' - roo 8660 1 53.85 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACT:2 - chr2L 14074428 3' + 297 6932 2 56.85 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACACAAACTTCCAAGAGCAAGTGTAAACATTT:1 + chr3R 5524032 3' - FB 32 1 63.70 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTTTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTAATGTGTGAACACAGATGCCTACGTGTTTGTTGATCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAA:1 - chr3R 15790858 3' - roo 55 2 63.20 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTA:1 + chr3L 26290962 3' + Tabor 407 2 68.97 ACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGCC:1 - chr2R 5617461 3' + invader1 377 2 60.96 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCTGACAAGTCTATTACTGAACTGGGAATAAATTCCCAGGAAATATGTTTTCTGTAAAATAATACTTTAATAAT:1 - chr3R 13406398 3' + pogo 2057 1 53.47 ATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGAATGCGCATGGATACAGATCACTTCCTCCCTTGAGAATAATATCTTTTGAATGCAATCTTCGATATCTTTATAGTCACTTGTGCAGCCCTGATCCTGAC:1 + chr2L 18898662 3' - Quasimodo 450 2 52.74 GTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAA:1 + chr2L 11257118 3' - rover 55 2 60.27 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTTCTTTTTTCCCGAATA:1 + chr3R 18093431 3' - I-element 6 1 78.77 AGATCTCAGGAACTGTAAAAGCTAGAAGGTCGGGATTAAGCATACCGACTGCCCGTTGGTGGGCTTTATAATCCTGAGGTGGGAATGATAACTGTCTAAAATATATAACTAGCATAATTGTTCCCTTTTTAGACCCTTTTTGG:1 + chr2R 22714836 3' + INE-1 149 1 68.53 AGCAGGAAGGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGCTTCAGGAGAAGATTGCTCCTGCTAGCATTTAGATAACTTGGCAAGTCTCCTAACGCAAACGTTGAATTAGGGGCAACGACGACTTGC:1 + chr3R 19959936 3' + Bica 4917 1 71.43 TTAATTTATTTATTAAGGAATCATCAAAAGTGGATTCTTAATTTGTAAATTAGTAAGCTGACTAAAACTGCATACACTGCTGATATAATGTTATCAGGAGATGCAATTGCATATTTAGTTAATCATTCTTTATTGTTCGTCCGGAT:1 - chr2L 14700676 3' - X-element 4708 1 66.44 TTTGTATGTTTATATATATTATAGATACGATGGGTTTTTGACTTGGGTGACTAAGAATGCAGGGCAGTCGGGATGCACAAGTGCT:1 - chr3L 9317445 3' - Stalker 6933 4 52.94 GCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGTCTCTCCAACGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGTTTACATTTTCATCTGGTGACCCGCAAATTGCTT:1 + chr3R 16980443 3' - Porto1 410 1 75.34 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAA:1 - chr2R 11164402 3' + roo 9013 2 58.90 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGC:1 - chr2L 18347286 3' + transib2 2778 1 53.08 ATTTTTATTTTTATATTTATTAAATTTTGTAAGCGCCATTATCAATTAAGAAATCAACTGTTGCAAAGCTTTCATATCCATGATCAACTCTCCTATAATATCCATAATATCCAAACCATCAATGGAAATCAATGAATGCTTCGGAA:1 + chr3L 19319730 3' - Stalker 6934 4 52.74 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGA:1 + chr2L 20266036 3' - roo 8728 2 63.70 TTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAAT:1 + chrX 14771788 3' + BS 5026 1 71.32 GTGCGCTTTGCATATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTGATCTTTATCATCTTATCTTCTTGATTTTATCAACGCGTAAGCGGCTTTATTGTTGTTGTGCGTGTGTTACAGTCCAGCGATTTGCATAT:1 - chr3R 30235179 3' + Ivk 53 1 66.43 GAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTTAATCCGTATTGCACCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACTGGAATGAGCAACCTTCATCCGCCTACGCATCGGGCACACTGAATGGCGATTTATTGGCTTCGAATTC:1 - chrX 9595083 3' + Ivk 4943 1 70.55 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTG:1 - chr2L 22193432 3' - roo 8741 2 71.23 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGC:1 + chrX 18336646 3' - mdg3 75 2 77.60 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATT:1 + chr3L 21380593 3' - I-element 59 1 72.81 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTT:1 + chr2L 14074522 3' - 297 58 2 76.07 TGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTCAG:1 + chr2R 10418556 3' - 1360 3096 1 65.07 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATTTAGTAAAACTTAAAGCTTAAAACTTTTAAG:1 - chr2L 15936715 3' + copia 244 1 78.08 AAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACTCGCACCAAACTGCAAAAAACATCAAGTAAAATTCTATAAAAATATCGGTTAAAA:2 + chr2R 23055587 3' + Ivk 4934 1 62.33 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGGGCCGTTT:1 - chrX 8437654 3' + P-element 2864 1 58.33 CAGACACACACACACACATTCATACGCTGACAGGCCGCTGTTGGCAGCGCATTATGAGGAATTTTGCAAAAAAAAAACAAAATGCAGCAGAAAGAAGTTTACAAATAATTGCAAT:1 + chrX 9949300 3' + accord 186 2 77.39 TCTAGAGCCATGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAGGCATCTTGATATTCTAGTGTCTTTGGTATTAAACTTTGATGCCACACTTTGACTTTACATACCTAAGCGAATTGGACCTCTCATGCGGCCCGTATT:1 + chr3R 802024 3' - 1360 54 1 76.03 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGGTACATT:1 + chr3L 18126011 3' - Ivk 44 1 47.26 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCT:1 - chr2R 11794962 3' + opus 499 1 75.00 ATATAATAATAATAATTTATAATATATATAAATATAATATAATATAGTTTTCAGTGATATTAGTCCAGTTAAGGGTCCTCCCAAACCATTGCCAATTTGTCACTAAAACCCAACATCAGCAGATCATAACTCGGCCAAAAACAGTC:5 + chrX 7548304 3' - Tc3 273 1 67.81 ATGGTGACGCCGCTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGACGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCGACAGATGAGCTCGTTCCTGCGCTGCCCCTGTCTC:1 - chrX 16958217 3' - gypsy4 6411 1 75.22 TAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAATATTTGCTATTGCAGTTCATAAAAAATGATTACATGCAT:1 + chr3L 9069052 3' - 1360 3362 1 76.03 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCGCAACGC:1 - chr3L 21327052 3' + copia 243 1 71.43 CAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAATAAATGTATCTTACATGTAATATATAAGATATAAAGTGATTTCACAAATTTACGTTTGTTCAACGAAATAAAGATCATAATGGATTCACTATTCGCTTTATTTATGGCGTAAGGAAA:1 - chr2L 14523067 3' + HMS-Beagle2 7194 2 71.23 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTAC:1 + chr2R 16817965 3' - 412 72 2 67.81 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAATCTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGATCCTTATGCTTTTTTCGCCTTTTGACTCTGATTTTA:1 + chr3R 12723185 3' - jockey 4849 1 73.29 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCC:1 - chrX 14722110 3' + diver 6049 2 59.59 CATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCACAGACAGACGCACAATGAGACGAACAAGCACTTGTATCCGAATAACTTCCCTCGCAATCAGCCCAAAAAGAACTGACTTGAAGAGATACGGCCTTAAAAGC:1 - chr2R 6963797 3' - Burdock 231 2 72.60 ATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCT:1 + chr2R 2875228 3' + TLD2_LTR 97 1 62.24 CTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCG:1 - chr3L 21655887 3' + HMS-Beagle2 7130 2 63.01 TGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGGGAAAGGTCGTTTAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTGGAATA:1 + chr2R 1621924 3' + Tc3 313 1 50.68 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTT:1 - chr3R 29084871 3' + 412 447 2 50.68 ATAAGTAAAATGAATATTATTTAATAAAATTAAATTAAATATTATTCATAAAAAAAATTGCGTTTAATTTAACAAAGAACACTTAATTTTTACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACA:3 + chrX 15019092 3' + S-element 1601 2 89.73 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAGGAAAAAGTAATGATCCAAATAATAAA:1 - chr3L 46893 3' - FB 45 1 54.79 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGATACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAATCATACACT:1 + chrX 661986 3' - 412 33 2 61.64 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGGCAATTGCG:3 + chr3L 18046699 3' + roo 343 2 61.64 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAACACGAAAAGCAGGAGAAACGCGTTTAAAACGCGCGCCGCGTCGATGATTTAAGT:1 + chr2L 4180547 3' + jockey 4925 1 63.01 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTTCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTATTCCCCGCTGG:1 + chr2L 16946112 3' + hopper 1344 1 66.42 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGAC:1 + chr3R 15942797 3' + hopper2 1543 1 64.38 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTCGGAAAATTTTGGTTTTGGGGATCAAAAACGATTTCGATGTATTTATATATAGTA:1 - chr3R 24219216 3' - roo 8672 2 78.77 AAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTAAAATATTATAAAATATTGCTGAGTGCAACCCATGGCAAAAATGAATCCACCAGTTTTAAAGCACGAT:1 + chr3R 30558260 3' + 17.6 283 2 53.42 ATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGGTCTTATTTCCAATTCTTTTGGGGGCTTTTTATATCTGGCGTCTGCTCTTCTTCTTCTCTTTTGTTGTCTTGTACGCCAGTGTGTGAGTGTATTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 21323694 3' - I-element 239 1 79.86 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATTGCCTTATAAATTCATTCAA:2 + chr2L 20266081 3' - roo 19 2 71.23 TAACTTGCCGTTAAAATTTTTTTTAAGTGGTTTGCCATACAAAAGTTATATTCCACGAAACACAGCTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATACTCACACACTCACACCCACACATGGAACACATAATTTTATTAACT:1 - chr3L 9156743 3' - transib1 441 1 69.18 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGGCATTAATAAATTCGACACCGTAATTGT:1 + chr3R 8075996 3' + 412 442 2 52.05 TTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTAATGACTGTTTCGAAACGAGTGTAAAGGTATTACACTGATTCTTAAACTAGACTTTTGTAGAATTTGTGTTTTATTGTGTTTTTAGTGTTTTATTTTGGTAGTTTAAT:1 + chr2R 10079892 3' - Juan 3876 1 77.40 ATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTATTCTGTATGCTTAATGATTTTCTAGAGTCTAGAGTACACTTCGATGGGAATTTGTTTTCTTGGTTTGAGCATCGAGTTTCCTTTGTTTATACGTTTGCACATTTG:2 + chrX 2886761 3' - I-element 426 1 73.97 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCTGGCACACAGAGAAAAAATATGGATG:1 + chr3R 4964231 3' - roo 18 2 71.22 GAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATT:1 - chr3R 19450058 3' - roo 8648 1 55.48 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTTGTTCTTATG:1 - chrX 12942309 3' - roo 65 2 60.96 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTGTGGTTAGAGGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATA:1 + chr3L 19350020 3' - 1360 3249 1 51.72 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCT:2 + chr3R 22590594 3' - rover 6998 2 56.85 TTAAATTTCAAAATTTTATAATTTTTCTAGGATATCGATAGGTACTGGGAAATAAAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTCAAATAAATATTTGTAAGATCTGCCGCGGAATTTCTTTGCGACTGATGAAGGAAGTAACGAAAATT:1 - chr3L 23984895 3' - 1360 3034 1 56.16 CATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAA:1 + chr3R 556529 3' - Tc1-2 73 1 63.01 AGATTTGTAGTTCACTAACATTTTGGTGTATGTTATATGTTTTTGTGTAGATCGTTAGTATGTGAAATCATTTGATTAACAATTGTACGAACACGGTTGATTTTTTCTTAAGAATTTGCTTGAGCATTGCCATTCCGCTTTCATAG:1 - chr3L 14892440 3' + transib1 295 1 34.25 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCCTTT:1 + chr3L 3501866 3' + Bari1 1695 1 70.55 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGTTCTGTTCGTCATACCCTCGAAGAATGCGTGACTGTCCCATGTTGGTTGGGGG:1 - chr2L 19923906 3' - roo 8686 2 69.06 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTACTATTTGCCTACAAATCGTAAATTCAAATAATAAACTCCTTTTAAGAC:1 - chrX 17717014 3' - FB 71 1 66.43 ATGGAAAAAAAAAAGGGAAAAGCAAATTGTGTAAATATTTTGCGCAAAATGTGAAAACATCTTCAAAATTACATTATATTCTTCAATATCAGGAGCACCACCTTTTCCATATGGGAGCAAACATT:1 + chrX 1199611 3' + Bica 338 1 63.20 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACG:1 - chr3R 19224986 3' - HMS-Beagle 6837 2 55.73 AAAGAAAAAAAAAAACAAGAAACTCATAAATAGAATGGCGAAACGCATGATGAGGTCGTGTAGCGAACACAGATCCAACATTATTATCTGGATATGCAACTCAAATTAATATAAATCTAATCGATTACATACATGTCTAATATTTT:1 - chr2R 11626256 3' + gypsy7 5013 1 81.51 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCACTAGGCACTCTGTAAACATATCAACACCTGTTATGGCGCAT:1 + chr3L 13295010 3' + roo 404 1 76.92 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAG:1 + chr3R 15791027 3' + roo 9050 2 66.14 TAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGTGCGAGTGACTTTAAACGGTGCTTACTGAGCTGCAAGTGATGTTCGCGCTGCCTGCTGCATTTTGCCGGCGACACAAAATGATTAGTTGTGCTCGGAATTAATAATTA:1 + chr3L 381828 3' + Stalker3T 3 1 77.54 CAGTACCACTTCAACCTTCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCCCGCTTCGCGTGAGCCCAAAACCCTTATACGCATATTTATTGGAATTTTTTTTAATTTAAGCAATTTCTATTAGAGCAAACTAATGAATGACTG:1 + chr2R 14690063 3' + I-element 1 1 56.85 TATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAACATTCAATAATTAAAATCGCTGCAAGGTGCTTCTCTTGATTACACGAAAAGATACAAAAATCATATTTAACTTGAATCGAGAAAAAGTCAATGCTGGCTTCA:1 + chr3L 14819995 3' + F-element 4619 1 66.44 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGTGTTGACATGGTGTTCTCATGGTACTCAAAAATAATTAAGTATGTATCAAAGTATTAGTGCGA:1 + chr3L 23287328 3' + 1360 3336 1 54.11 AGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCTAGACTAAGGGGAGAGTTGTAATTAATAAGCCAGTGAAGACGGATGGGATGCAAGAAGAGTCAAGGGCGGTCATGTCG:1 + chr2L 22524500 3' - Doc2-element 4361 1 72.86 AAATATCTAAAAATCCAGATCTTTTTAGCAAAGAGGTAAATACAATTTTGACTTTAAGATTAAATTTGTAGCATCAAAGAATATTTAATAAAGAAAAACTTTTTTTGTTTCGTTTAAACTACTAATAGTTATTTTCTTCTCTGGAA:2 + chr2L 5395548 3' + gypsy10 412 1 73.97 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTC:1 - chr3R 13972969 3' - 412 50 2 64.35 TTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTC:1 - chr3L 5061564 3' + 17.6 410 2 73.97 TTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCACTTTCTTCTCGACACCACCCACGTCCAGCCAAATATTATTACAATTATACAT:1 + chr2R 5808875 3' + hobo 2562 1 67.81 GAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGAGATATCGATAGATATAAAAAAAAATTATAAAAATTTTAAAAAGTATTCTCCTCTTCTTGTCCAGGGGTCCCAACCGGATTTGCTCCGAA:1 - chrX 19816627 3' - INE-1 575 1 65.71 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAACGTGAAGTATACCAGAAATTTATAGCCATGCAG:1 + chr3L 7889699 3' + roo 396 1 71.01 AGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTT:1 - chr2R 5410962 3' + Tc1 1354 1 57.53 GNATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATA:1 + chr4 373033 3' - pogo 85 1 76.71 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTAT:3 - chr2L 5069689 3' - flea 4806 2 58.22 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTTTTTAATAACACATATTTGAAGATAAGCCCTAG:1 - chr2R 16510076 3' - F-element 48 1 48.97 GGGCTGAACGGGGTACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTGTCTCGCCTCCGTGAACCTGGAGAAGTGCCTTTGCACATGTTCTGCTGTTTCTTCAGATTCAGGGCCACAAAGTTTTTC:1 - chr3R 19032782 3' - Rt1b 4684 1 77.59 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAATTTTTTGTTACAGAAAA:1 - chr3L 8959588 3' + 1360 3344 1 57.04 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATATACAATACAAAATATATATATAATATATATACAATAATTAAAACCTAATTTATA:1 + chr2R 4695926 3' + flea 4968 2 57.53 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAG:1 - chr3R 24219287 3' - roo 79 2 73.29 TATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTTATTAGACCGTGAGAGAGTGTATGTGCAAGACTTCGTGTGTGCCTTGTTGTGGGGAGGAAAAACCTTTTGATTTACTTAGAGGCCGCGGCACGTT:1 - chr3R 28271730 3' - Quasimodo 7204 2 69.86 ATGTTCGTCTGTCCGTATGAACGTCAATGAACAATTTTAAAATGTTTTCTCATTTTATTCCGAAATATTTATCGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGGCTTCACACTGGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTC:1 + chr3L 23747150 3' + INE-1 123 1 76.03 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGATTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAAT:1 + chr2L 14074537 3' - 297 43 2 61.54 CACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTATATACAACATGCCGTCTGTGTGCGAGGGAAATCTGTGTGGGTGTGGG:1 + chr2L 14130793 3' - I-element 5007 1 65.07 TTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTAACTACTTATCGATAGCCCTAATTTGGCTC:1 - chr2R 5106228 3' - Stalker2 7277 2 67.12 AGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGAGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAG:1 - chr3R 19450205 3' - roo 392 2 54.48 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATA:1 + chr3L 6397765 3' + roo 9021 2 53.15 AGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAAATTCCTTAAATGAAAGCAAAATAAATAATAGTTCATAAACATAACAAACAAACAATAAAACCAGTGCCATAATATTGTTTAAATACATTTAAAGCC:1 + chr3L 8095527 3' + Idefix 167 2 65.75 TTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTC:1 + chr3R 9298556 3' + hopper2 1538 1 64.38 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGC:1 - chr3L 1692032 3' - blood 22 2 54.26 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTT:1 - chrX 21224504 3' - roo 27 2 67.12 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCG:1 + chr2R 16929833 3' + jockey 4955 1 51.59 TTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCACTTTTTTTGTTGAAGTATTTCTTAACATTTCTGTATTCCTGGCTGGCTAAGCAAAAGGATAATGATTATATAATAAAATTAAAAGAAACAGATAAAAGACAAA:1 + chr2L 9728450 3' - P-element 2667 1 23.29 AAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACACTAGCTTAGTAACGGGAATTTGATAGTCGGGGTACACGACTATAGCATAATCTCTGGTTTTAATGTATAACCCATTCGCTAAACCGAGCCACGCCACAATTCACATACACGATAAGTTT:1 - chr3R 24279332 3' - INE-1 577 1 78.08 TTGCAACATTGTCGGCGGAAACAGCTCAGTAAGTCGTAGACATTCCCAAATCTGATGGTTCAGCAGGTTCGCGATCACCAAGCAGAGTATACATATATTCTAATATAGTAAGTATACAATAATATACTGAACCATTAA:1 + chr3L 18585916 3' + gypsy5 157 2 68.84 ATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAACTTGAAAGTTTTTTAAATTTGAAATAATATACCTTAACAAAATATAGTTCTGGTAAAATATATTCCTATGTATAGTTCTGCAAAGTAAGCAAGAAAAT:2 + chr3L 5324342 3' - 1360 3097 1 47.26 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAAATCTGGATATTCATATTCATATTGAGTGTGAGTGGGTGAGTAAGTGTGGGCTGAGCCAAAGG:1 + chr3L 5815667 3' + pogo 2074 1 52.50 TTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGC:1 - chr3R 9557532 3' - G2 3045 1 63.70 GAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGGGGAACGGTGGAAAATGGTACACTAGGACGTTTTCATACAAATTATGAAATGCCTTGAATGAAAAATATAATGTTAACAATTTCATTTACAAGCGC:1 - chr2R 5090449 3' + copia 252 1 65.75 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCA:1 + chr2L 6647731 3' - mdg3 5314 2 56.85 ANGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTTCGAT:1 + chr2L 11391637 3' - 1360 14 1 69.86 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTACCAATTCTGTGACTTC:1 + chr3L 26291020 3' + Tabor 464 2 69.18 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTC:1 + chr2R 7244895 3' + diver 6035 2 68.97 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTT:1 + chr3L 5881681 3' + pogo 2043 1 60.00 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACT:1 + chrX 20999618 3' - BS 30 1 58.90 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGG:4 - chrX 8437696 3' + P-element 2784 1 15.75 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGATAAAGCAGAATTCAAGAATTTAAATTTAATTTAAACCTGGACTTTTATTTTAAACCT:1 - chr3L 15106667 3' - roo 62 2 60.96 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACAATTTCGTTGACAAGCGCAGTCTGCGC:1 + chr2R 4601389 3' + copia 241 1 52.74 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGTGACGGGACAAGCTAGTTCTCGAATTGGCGCGCCGTTCAGCCGAGCGGGAGGCCAAAAAG:1 - chr3R 27123455 3' - roo 16 2 63.71 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTTAGAGCC:1 + chr3L 17940204 3' + 1360 3361 1 60.66 AAATCAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCTTTTGGTATTTTACACTAAGACAATAAAATTGTTGTAATTTTCATACGGGGATTTTCGCAATATGGAAATCACATTTGAGCCTTACACCGATATTTTCGAATTT:1 + chrX 8360653 3' + roo 9037 1 52.41 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTC:2 - chr3R 13972962 3' - 412 74 2 67.12 AGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTGAAGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCCAATTCCTCCAGAAATGGTTCACTTTATTGGATTACTTAAAGCTTCAAAAACTAAAAATTTTAAACTATTATTTTTAAGCAAA:1 + chr2L 15287748 3' + Q-element 438 2 54.79 ATGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAA:1 + chr3L 18125994 3' - Ivk 60 1 55.17 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGT:1 - chr3R 11062745 3' - roo 8737 2 68.28 ATAGAAGGAAGAACCAGCGATTTCAAAACAGATGTTAGTAGTAGGTGTGAGTATATATTTATGACACTTTTATCGTTGCTTTACCCCTGTTTAGGTGACACATATGCTTTGTCGCAAACCCCAACAGCT:1 + chr3R 21347057 3' + G2 2704 1 75.19 GCAATTACGAAAAGTATAGTGTTCGCTTTTATTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCATCCCCCTACAACACAACATTTTGGTCCTTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAG:2 - chr3R 20005368 3' + GATE 8417 2 67.81 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGGCGATTGGCGG:1 + chr3R 16157400 3' - pogo 48 1 50.69 CTTTAGTCGAGTTCCCCGACTATCCCGTTTATTTTTTGCAAGTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACTCTTTAACTCTACGGGTATAATTACGTGAGCAGTAGTGTATGGGAGGATTTAAAGCCTGAATGGT:1 + chr3R 20126122 3' - INE-1 566 1 59.26 AGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAAAAAAGCTAAGAAGGGAGGAACGAGTTATATACCAGTTGGCAAGTGGAAACCAATTGCGAGTTAGACAACTTCACTTGCCGTTTGGCTTAAAGGC:1 - chr2L 12633906 3' - McClintock 230 2 76.86 GTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGTTATTTGGGGTATTTTTGCTTTCTTTAACCT:1 + chr2L 22997432 3' - diver 225 1 78.77 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCGAGGTTTGACATTTGGCACAATGGTAATTCTATTTGGA:1 + chr2L 5086193 3' - jockey 4858 1 73.97 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGAGATGCATCACAAATGGCTGGCGTCAAGCACTG:1 + chr2R 22989698 3' + hopper 1385 1 56.91 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAAT:1 + chr2L 5582213 3' - pogo 54 1 57.53 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCGAAGGGAAGAGCGAGAGCACTGGAGCGCCAGAGAGCGGAA:1 - chr3L 3983763 3' - P-element 24 1 67.59 TTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATA:1 + chr3R 28385606 3' - transib2 81 1 71.53 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAAT:1 - chr3R 6419865 3' + Tabor 401 2 78.08 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAA:1 + chrX 7795639 3' + roo 9037 1 61.64 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGG:1 + chr3L 1279189 3' + roo 353 2 58.90 AGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATATTTGGGAATAACTCGTTTAAACTAATTTAATTGACAT:1 - 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Doc3-element 4603 1 73.29 AATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATA:1 + chr4 373038 3' - pogo 80 1 73.97 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTT:1 + chr3L 12249902 3' + roo 9010 2 58.90 AAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATGAACTCAGCTGTAATCAATTCGCAATCTCA:1 - chr2L 15562788 3' - pogo 1967 1 69.39 CTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACAGCATACGGAAACAAAATTCTAAGCTACAATCGGAATCCATGGCTTGT:1 - chr3R 20311317 3' + Chouto 434 1 60.17 ATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAAATGTATATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGG:1 + chrY 2720358 3' - ZAM 187 3 74.81 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTA:2 + chrX 8200330 3' + flea 4985 2 66.44 GATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTATAT:2 + chr2R 12253306 3' - BS 4720 1 74.66 TTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGAAGCAAAGGCAACAGTCGAAAGGTTCGACGTTAG:1 + chr2R 14054276 3' - copia 240 1 76.71 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAAGGCGCTTGGAAACAAAATGTCAACAAAATGAGCAATTCAACAAAGATTAGCA:1 + chr3L 10373958 3' - 297 25 2 65.75 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCGCCTGGCTGTCCTCCTGGGATGGCTGATTGCGTTGTCACTGATAGCCAGCTG:1 - chrX 19587983 3' - roo 8669 2 75.34 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATACTGTTAAAG:1 + chr3R 26504343 3' + HMS-Beagle 213 2 62.76 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATGG:1 + chrX 8092506 3' - pogo 36 1 57.55 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTA:1 + chr3L 7889671 3' + roo 359 2 52.05 GGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGCATATGTAAGTTGTTGTCGACTCTAGCTTGCTTTCTTGTTTTATTT:1 - 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F-element 59 1 54.79 ATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAAGAACAAGGATATATAATTATTCCATATTGCAGTCTAGGTTATGG:1 + chr3R 17214637 3' - I-element 286 1 69.86 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATATACACTAGATCATGAACGGTGGTGGGGG:1 + chrX 1264020 3' - Burdock 74 2 82.22 CATTTATCTGGGATATCGATAGATTCAATTTAAATTTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGCTCGTGACCGCATCGACTGCTTTATGGCGTTAGAGTGTGCATGTTTGAGTGGGTCGGCG:1 - chr3R 31447084 3' - INE-1 502 1 76.72 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTT:1 - chr3L 21996142 3' - Transpac 45 2 59.59 TATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTTTCGGTGG:1 - chrX 22840438 3' - copia 4880 2 73.48 AAATTACATGTTTTTGAGCAAAGCAAGGAGCGCGGAGCATCAGCATCAGCAGCAGAGCCGGATTGGCATCCTCGCCTGGGGGCGACAGCCATC:1 + chrX 8308337 3' - roo 8790 2 82.80 TCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTCCTGGCTGACGGGCTAGTCCTGCGAATCGGTGCACACTCTCTTGCCGAGGGTGACAGTTTCGGAAATAAATTTATGGGGTTAAGTGACCACTAAGTTGGGGCTTTGGC:1 - chr3L 10192655 3' - baggins 5346 1 78.08 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACAATGAAATTTACAT:1 + chr3L 18768523 3' - S-element 69 1 70.55 ATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCACATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAG:1 - chr2L 23008369 3' - transib2 272 1 64.38 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATAAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chrX 12723497 3' + 297 6935 2 78.00 TAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTG:1 - chrX 292436 3' + G3 4498 1 71.92 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTATCCGAAGT:2 - chrX 696507 3' - FB 78 1 70.55 TGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTTTTTTCTTTAGGTTGATAGCGAAATCTGAGGTTGATTGACCTTTGAACTTCATGCCATTTTTCATGGAAATAACAGTTATATTAGCGAA:1 - chr3L 14981531 3' + roo 8783 2 65.07 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCAAGGGAATGGAAT:1 - chr2R 19199626 3' - hopper 22 1 69.18 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAA:1 + chr3R 11062812 3' + roo 8991 2 71.03 GAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTAT:1 - chr3R 19450158 3' - roo 9009 2 78.08 CAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAGGAGCAGGAGAAAGCCAACAAATGGCTCC:1 + chr2L 2760108 3' + F-element 263 1 56.72 TCATGCATTGTTAATTTGACAAAATATGCGCTTTACCTTAGAAGTTCTTGGACTTTTGAGGTGACGTCAATCGCTTCTACTTCGGTTGCTAGTCTGTCTATGAAGTAATAGACGTAGTGAGCTTCCGGAATTGTT:1 + chr2R 4624647 3' + 1360 196 1 64.44 AGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGG:1 + chr2L 11257091 3' - rover 81 2 75.86 AAAGGCAATTAAAGAAATGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTTTTGGTAAGATTTTAATTAGATTTCTATAGAGGCCAAACTCTAATCATAAACATATTTTCCTCTTCAGCGACATGGAAATGGCAC:1 + chr2R 14369580 3' + GATE 453 1 60.96 GTTTAAAAACAAAATGCACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGA:1 + chr3L 12315818 3' + transib2 2759 1 60.00 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTT:1 - chr3R 27083053 3' + jockey 4918 1 70.55 ATATATATAAATATGTATATATGTAAATGGATATAGTCGCTTGTACTGGGACAAGATACTTATGAATCACGCACGACTCGGGCCAAGATTGGAGCCACTTCAAAGCGCCACAGTC:1 + chrX 5830302 3' + G3 4505 1 80.00 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTAACGGAAACAA:1 + chr2L 22674938 3' + mdg1 417 2 76.71 ATCTGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAATATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTAAACTATAATTTTTTTAAATTTATTGCCTATCATATTATTATTCCTAAGTATTCTTCCAAAGAATCATCT:1 + chr2L 22085979 3' - HB 404 1 63.70 GTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATAAGCAGTCAATCCACATTAATCCTACTGCTGTCAGAGCTTCATGATTTTATTACTGCCGCAACT:1 + chr3R 22107420 3' - invader2 4886 2 56.16 GAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTTAGAACGGGGATTTGTCGATTTCTGATTTGCGATA:1 - chr3R 18399316 3' - Juan 4025 1 41.10 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGT:1 + chr2R 21116620 3' - mdg1 13 2 26.21 AAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTC:1 - chr2R 10078167 3' - jockey 116 1 76.03 CTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGG:1 - chrX 20999476 3' + BS 5062 1 61.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTG:1 + chr2L 47175 3' + roo 338 2 68.12 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAG:1 - chr2L 6174067 3' + I-element 5281 1 67.59 AAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGCTTTGAAGTTGCCCAACAACTATTTCATTTA:1 - chr3L 17567810 3' + S-element 1637 2 59.59 TGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACAT:1 + chr3L 11844857 3' - rover 6972 2 67.81 AAAAAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGTTAAGGCAAAGTTCCATAATTTCTTCTGGGATATATATATATATTGGGGATAATAAAATAAGAGAAAATTTAAAAATT:1 - chrX 21452476 3' - INE-1 581 1 74.66 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTACCGTTTTAACAGCTTTCGCGGAAAGCCGGCACAAAAACAATCTAAACAAACTAAAAAGA:1 - chrX 8437601 3' + P-element 2879 2 79.45 ATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAAAACGTAGGCTGCTGCAAAAGTGGTCGCAGTCCACGAGAGCTCCAAGGCGTGAGTAGAAGCGCGAAC:1 - chr4 363934 3' - pogo 1923 1 54.79 CATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGCAATGGCTGCTAGATTCATACAGAAAATTGTAAGAACCGTTTAGGCTTAAGCGACTTGACCCGCCCCGCGTCGCGCCTCTTAACCCCAC:1 - 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1360 24 1 67.81 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGTCTCTTATCTGGACGACAGTTATCAGAGCGACTCGCTGGCCCAATACCTAATCAAAGTCACACAGGCGGACATATACCCCTATACATATATGAATCAA:1 - chr2R 17796514 3' - jockey 4693 1 68.09 TGTGTGTGTGTGTGTATGTGTAGGGGGTGCATGGTGGCAGGGGGGAGCATTTGAGCCAAGTTAAGTTATTGACCAAGTTTGTGCTGCCGCTGCTGCTGCTTTGCTCGCCTGTTTGCATATTAGT:1 - chr2L 7094187 3' - Quasimodo 32 2 76.61 GGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCTTGTTACTGGTGTTGTTGGTGATGTTGTTGTTGGTATTGTCGCCTAGTGATTGAAAGCGTATGCGTTGGAAAAAGAAGAAGAAAGAGGAAACACAAA:1 - chr3L 9471081 3' - I-element 4953 1 70.55 AGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTATTAATAATATATTTCATACGGAAATGTGCTGTGCAACAAAGAATGCAAGCAATAACCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTATAAATATCAATAGTAAATAAACAA:1 + chr3R 19449912 3' - roo 8838 2 75.34 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTT:1 - chr3R 8051147 3' - jockey 4845 1 79.45 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATA:1 - chr3R 11191415 3' + roo 8988 2 76.71 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAAGTGTTTTGCATAAAAAACCGACCAAAATGAGTCGGCGG:1 + chr2R 20227361 3' - hopper 13 1 72.86 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTACA:1 + chr3R 28469289 3' + 412 425 2 70.92 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCATATACCCATTACCGGAC:1 + chr3R 19073327 3' + roo 391 2 72.60 ACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGTGGACATTTTTGCAAGACAATCTAGAAAGTTTCCTTAC:1 - chr3L 12003809 3' + R2-element 3113 1 69.35 AAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAAAAGAAGTCGAGGGACACCAAACAAAAAGTGACAAGAACTAAACTAAAACCAAACCAAAGTCAAGCCTGTT:1 - chr3R 24971231 3' + I-element 270 1 61.11 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTTATTG:2 + chr2L 12818383 3' - hobo 10 1 77.40 ATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTCGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCATGGTACCATAGTTCACGACTGGCTAGATCTG:1 + chr2R 3173424 3' - 1360 3267 1 74.80 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTATTAAAAGTTTTCAATTCAACTATAATTT:1 - chr3R 20167537 3' + roo 387 2 67.81 ATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTA:2 - chr3R 19992635 3' - hopper 63 1 58.90 ACTCAGCTAGTGGGAATGCAAATACGAATTAACATAATTTTTTTTGATGTCAATAGATATTGGGGGGAAAAAAATTTAAAAACTGGGCGTGGCCAAAATTTTGTAAATCATTTCCTAAAAGTGTGGGCGTTGCAGTTTTGGGCGGT:1 + chr2L 22017966 3' - INE-1 531 1 65.07 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAATTGGAAATTTCTCACTT:1 + chr3L 5389988 3' - roo 8701 2 58.62 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATA:1 - chr3R 6419826 3' + Tabor 7279 2 52.74 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTA:1 - chr3L 13836627 3' + 412 415 2 71.92 TCTTAATTTACTTTCACTTAGTGGAACGTTAAACCCACAGATTGCCAAGAAAACATCACAGAAATAGCATTGATTTCTATTTCGTTTGCTTCTAAAAATACTATACACGATTTCCGCTAACATCTGGCAACGCTGTTCGTTGGCAG:1 + chr2L 9460177 3' - Doc 4612 1 73.29 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTTAAATATTGGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGT:1 + chr2R 13766276 3' - roo 86 2 77.93 TAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGCGACGACAATATGTAGTTTATATGGTTTA:1 - chr3R 28903526 3' + Porto1 4411 1 79.45 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGCTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTCTCACGTTTT:1 + chr2L 14074562 3' - 297 21 2 64.17 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATC:1 + chrX 8027480 3' - Juan 58 1 60.45 GTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATCCGGGAGTGCAT:1 - chr2L 4888738 3' + BS 5020 1 68.49 TGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTTCCGTTTATATACGTACATAGGTCCCAGTAAGTGTTTGCTGGATGTCCTTTGGGTGCTCTTGGTCCTGGCTTTGTTGGGCCCCCTTTTTTTTATGGCTTTCCAGATGCGAGTTGAA:1 + chr2R 12134043 3' - Ivk 5036 1 71.23 GGAACTGCCAGTAAATCCCACATACAGCTAATTCAGCGAACGAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAAGCCGAGAAAAGGTTAATTTCAGCTAAGTGAAAGCTGTATGCAACTAGCCCAAAAAACAGGTGAAGCCTTGTGAATGTG:1 - chr2R 20591970 3' + Porto1 4293 1 55.17 ATTTCTGCCTATTTATTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAAGAAATAAAAGTGAAACATTTGTTAAATTGTTTGAAATGAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACAT:1 - chrX 10801557 3' + HB 1452 1 60.27 TCAATAACTCAGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCACGTCGTGCCGCTCGCGATTGCATTCCAGCCGGCTTCGCTGTTACTAGGCCGCTTCC:1 - chr3R 2446838 3' - G5A 2534 1 63.27 ATAATATCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTCAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATAGCAACAAGCACTCTTCATCGAATCGTTCTGGGATAAACTTTTCCGGCTCCGGATAAAACTCAG:1 - chr2R 14879076 3' + invader2 26 2 59.54 AGGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAAT:1 + chr2R 9158121 3' - mdg3 5337 2 72.41 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACT:4 + chrX 11661515 3' - pogo 40 1 58.22 AATAATAATAATAAAAATAATAATTTCATTTGCGTTTTCGACGGCGATAGTAGTTGGCTTCCGTTTTCTTCTTACTTTTTTTCTTCTGTTTTTGTTTGCAAGGTTATGGCTTTGCTTTTATTTTGCTGAAGATTTTGTTTATTTTC:1 + chrX 15989224 3' + mdg1 7078 13 65.07 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGT:1 + chr2R 11164497 3' - roo 8733 2 69.18 ATTTTTCCGGCTGTTCTATGTTGTATCTGAATGCAAAGTTTTAAACAGAACTTCAACTACGACTGTTTGAATTCCCCGTTTCAATCTGCAGCTGCCTTTACACTTTTAAATTGGAGACTTATAATACTTAAAAG:1 - chr3L 22775381 3' - F-element 4571 1 73.88 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTC:2 + chr3L 13739633 3' - 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chr2L 12627427 3' + transib1 1737 1 58.90 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAAT:1 - chrX 21216717 3' + roo 9011 2 60.96 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTA:1 - chrX 19539448 3' - pogo 28 1 53.42 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTT:4 + chr2R 21160756 3' - Transpac 4986 2 63.70 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCAC:1 + chrX 18336686 3' - mdg3 5303 2 51.77 TTCATTGTTTTTTTGTTTTGTTTCTGGACTTCCGAGGTGGTAATGAACTTGGGATTTCGGTTTCTTAAAATCTTGAATGAAACGGCTT:1 + chr2L 6538810 3' - transib2 2641 1 35.23 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGA:1 + chrX 15357753 3' - 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chr3L 13738704 3' - BS 5003 1 78.08 ATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACATTACAAAAGCATGAAGTGTTCGTGGCCAAAGAAATAAAAACAATCACTTACCTAGGGTGAAGAATACAGGAATCGATTCTAGAGTG:1 + chr3R 30306172 3' + Stalker4 469 1 71.23 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACCGCACCCTGCATTCGCCTCGCACATCTGTCATTTTTTTGTCCCATTCAAATTTCACCTGTCGCTTTATTGCCTTGCGTAAACTTGTGATTCGTGGGATAATTTT:1 + chrX 10319611 3' - mdg1 24 2 35.17 AGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCTCCAGACT:1 + chr2R 18530000 3' + jockey 4966 1 67.81 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCAC:1 - chrX 7795469 3' - roo 8682 2 75.34 ATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAACGTTCCATATTTATTACG:1 + chr2L 4754962 3' + Stalker4 7300 4 58.90 CCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATCGTTTAGTTTTATCTTAACAAATTTTATGAAAATGTTTATAGC:2 + chr2L 17269342 3' + 1360 476 1 76.03 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTG:2 - 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chr3L 16662333 3' + jockey 4978 1 72.60 GTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACACCAAACACACACACCACCAAAAGCAAAAGACACTGAAAATAAAATTATAAAAAAAAATTGTTCAATATATTTTTA:1 + chr2L 21105804 3' + Idefix 1 2 51.72 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCGGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGG:1 - chr3L 21996130 3' - Transpac 4952 2 66.44 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCC:1 + chr3L 1692148 3' + blood 352 2 65.94 AGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATGGAGATACAAATACGGACACAAACGCAGATACATGGCACAGATACAGATACAAAATGCCGTCTGGCTTGGAGGTGTGTGCGCCATAAAAGTGAAAA:1 - chr3R 14945277 3' + Stalker4 7013 4 69.86 TGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGG:1 + chrX 21639707 3' - gypsy5 7011 2 66.90 TAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCGTGTACCAACGCATTTACATATGCTGGAGCAGGGAATCTTTGCCTCATAGCACTCACAAT:1 - 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chr2L 7620340 3' - X-element 4468 1 38.62 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGGCATTTTTATAAATAACATTTTCCGCGTAT:1 + chr2L 19675083 3' - 297 6598 2 58.33 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATG:1 - chr3L 10731725 3' + 297 6960 2 73.29 AAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGCATAGAAAAAGATGACTGAAATCTAAGCCGTGCAAATTGTTCGCAACGGTAAACATCCTT:1 + chr3L 5614202 3' - S-element 339 1 63.70 AACTACACACAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAGAGGAAAACAGAGAATTGCAACTGCCAATTGCATTGTATAACAAAGACCACATCAGCAACAACCCACAACAAGACAAAACACTTAAGAAAATAAACAGCAACCAGAAGAA:1 + chrX 6332638 3' + Porto1 301 1 77.40 AGAGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCAGACAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCATGTCCAATGTCCAACCACGTTAGTTTACGGTGAGTCCTCTTTATGATCGTCCAAAGTCCGCAACATTGCCGTTCGACCTCTGCGCCCTTG:1 - chr2R 4730084 3' - Q-element 424 2 54.79 CATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATATTTGACGTAGGTAAATGAAAAGGGATTCATGAAAAATGGTAATACATTTGATTTTAATGTTTCAATGTTTTTAATGTTTCACTTAAGTAATAATATAACAATAATATCGTTGTTCG:1 - chr3R 29081515 3' - 412 7482 2 78.77 TGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAACACTCCCTGTGTGTTTGTGTTTGTCTAACTTGTTGCTTTTGCCGGCGCGAAGTGAACTCGCTCCGCTTCGCTGAGAATTATAATTTCAAATGATTGTGCG:1 + chr3R 18777366 3' - accord 186 2 51.09 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGCGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTAAGTTGGTGGGTTAT:1 - chr3R 12115212 3' - 1360 9 2 74.66 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTTTGTGGCCTTTTGCTGTTT:1 - chr2R 22989574 3' - hopper 20 1 65.83 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTG:1 + chr3R 31653173 3' + roo 402 1 74.75 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGAC:1 - chr3R 27123506 3' - roo 88 2 77.24 AAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACATTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATGTGATAGTTAAGCTCTGTAAAAATGTTGA:1 + chr2L 20152851 3' - copia 4962 2 77.40 TAATAAACTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCGCATAGTCGCATAATAAATCGCAATACACAAAATCACTCGGTCTATATTTTTCCCTGGCGCTGCATTGAAATTCATAACACATCTGATGCATAAAAGC:1 + chr3R 11091439 3' + gypsy4 189 2 57.53 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTTTTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCA:1 + chr3R 16342000 3' - P-element 25 1 38.67 AAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATTAGAACCAG:1 - chr3L 21655833 3' + HMS-Beagle2 301 2 72.60 AGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCCAATAATGTGGTGGGTGTATCCGGGCGTTGTGAGTCTCCGTTCCCCGATTCGCCC:1 + chr2R 16194903 3' + opus 77 4 62.07 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGACGATGATT:1 - chr3R 16157233 3' + pogo 2094 1 75.71 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTTTTGTTTACCGCAAAAAGTACACGAAAGGTCTTTG:1 - chr2L 14671847 3' - FB 88 1 78.77 TCATCCAAATATCTCCCGTAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCT:1 + chr3R 4679561 3' - hopper 51 1 50.68 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATAGAAAAAGGC:1 - chr3R 15942667 3' - hopper 26 1 65.97 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGACAAGCTAGATCTCGAATTGGCG:1 - chr3R 27123485 3' - roo 8731 2 62.76 ATAAGTTTTCAAATCTTAATCTACTCACTTATAGAAGTGAATAATAACACGCACCTCCCACAT:1 + chr2L 16857005 3' - Doc3-element 4663 2 58.73 ATATTATTTTATTTTACAAGGTGACATCTTTTACAGCACAAAATAAATATTATATTTTCTTTAGATTTTCTTTTATTGAAATGTCCCTTGAAACAATCAAATATTTTCAAAACGATAGCAACTGGAAGACTACCGTCTGCATATGT:2 + chr2R 14143426 3' - jockey 4923 1 61.64 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGC:1 - chr3L 2145895 3' - roo 66 2 69.18 TATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAGATATGAATTAAGTTTAATCAAT:1 + chrX 3432013 3' + Ivk 5371 1 74.48 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCAATTATGTTTTTATTGAAAGAAATTAAAAATACACCATTTAATTGGCATATATCAATTCCTTCAATAAATGTATTTTTATAGCTAAAATAAATGCGAAATGTCT:1 - chrX 23205129 3' - 3S18 5781 2 72.60 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAGAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAACAGACAACCTG:1 + chr2R 16929856 3' + jockey 4960 1 56.94 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAG:1 - chr2L 18347287 3' - transib2 63 1 62.33 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCATGTCCT:1 - chr3R 27986335 3' + roo 357 2 53.42 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCC:1 + chrX 21947743 3' - mdg1 50 2 52.05 CGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGGTGTTGGAGGGAGCGGGGCTTCTGTCGGAACCAATAGAAATAGAAATCGCGGGAATATGAATCGAAAAAAACAAA:1 + chr3L 26159778 3' - F-element 465 1 94.07 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCGGCCAACGGCTTCCTTCATTCGAGCTAATTAA:1 + chr2R 8047380 3' + 1360 3356 1 59.59 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTTTATGAAATTTAAAAAATATCGTGTCTTTGAATTTATTCAATGGGTTTTTTGA:1 - chrX 21505648 3' - roo 66 2 67.12 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGTTCCAAGTGTGGGAAATTTTCGGAG:1 - chr2R 13259248 3' + mdg1 7432 2 65.07 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGAT:1 + chrX 8360602 3' + roo 8985 2 78.08 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGC:1 + chr3L 25401027 3' - Doc 42 1 47.95 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGGACGGCTTACCC:1 - chr2R 22514130 3' - P-element 90 1 23.97 AAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAAAAAAAACACCTAAGTAAATAGTCAAAAATCCATCGCTTCTCTACTGCAATGAAAATGTTTAAATGCAATCTAGGTAGA:1 + chr3L 10503358 3' + I-element 480 1 54.79 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTACAAGTATACTGGCATAATAACACATGTGC:1 + chr2L 20205355 3' + P-element 2795 1 22.60 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTTATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATG:1 + chrX 20999600 3' - BS 46 1 54.17 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCG:1 + chrX 1135354 3' + P-element 2820 1 19.27 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGCCTGAATAATACTGACGGACGTGGAGCGGTTAATTTATTGCGGACTTGGGGCCAACTGAAATCTGTCATTGTC:1 + chr3R 25616621 3' - roo 8706 2 53.90 TACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCAAAGTGAAATTGTGCTTTGGTGAATCAATGGGTAAGAATTGCCATCGAGGCATTCTGTCTCTACTAAACCTCACTATT:1 + chr2L 2024291 3' - Stalker2 241 6 59.03 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCT:1 + chrX 12986612 3' - roo 81 2 74.66 ATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAGCGGGATCAAGCACTTTGGCTTTGCCACTTTTAGTGTTTCATAATTAAAAATGTTGCCGGTGTCGTGTGGTCGAC:1 + chr2L 19091880 3' + accord 250 2 56.55 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCG:1 - chr2R 16817879 3' + 412 462 2 52.68 AATCAGACCACTGCGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGTGATTGCCGCTGCACAATGCCAATTCCGCAGATACATA:1 - chrX 4194930 3' - Cr1a 403 1 74.66 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCTTGTTACATACTTTTCAACGAAGCTAGTATACCCTTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' + pogo 2050 1 56.85 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATC:1 + chr3R 20167673 3' - roo 8730 2 65.07 ACCTAGTAAAGGGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGTAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTTCCGT:1 - chr2R 18514847 3' + P-element 371 1 64.14 AGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGCCTCCATATATTGTTGGACTTGGACACACGGGATGCCGGCTTTGGCCAAAAGTAAACAAACGCACTTTTTTTTCTTTCACAGTCTTCCCTTTT:1 + chr2R 14797490 3' - I-element 198 1 79.66 AGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGCGATTTATGGCCGCAGTTATCGCGGACGCAGCGGATGGCTAG:1 - chr3L 22960248 3' - Tirant 8058 1 60.00 GGAACACACACACACACACAAAGCTAGTGGGGTGATGGCATAGAGGCCCATGTACAGCACAAAATGCAATAGGTATTTAAATAAGTAAAATAGGTATTTTAAGTAAAAATTAGTAAACTATAAACTATAAACTATATAAACTATAT:1 + chr2L 19109370 3' + accord 182 2 76.71 ATGATCTCTGAAGGTAAAATCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAACGCGCTGATGTTTGTCGAAAAGAACAGCAAGTCAAGATTTCTGTACAATAAATGTATTTAATATTTAATATTAAA:1 + chr3L 7305861 3' + Tc1 410 1 63.01 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGCTTAGTTGTTTAGGATGATTATTTCATTTCTGCCTATGTTTGATACCAG:1 + chr2L 12124262 3' - 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chr3R 21276546 3' - BS 5070 1 66.44 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGTTAGACTGAAAGTTCACCTCAAATCGCTGTAATAATCGTTTCTCATTTGCT:1 + chr2L 9038283 3' - I-element 6 1 71.28 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAA:1 + chr3L 7889684 3' + roo 9036 1 60.96 ACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGAT:2 + chr3R 4860514 3' - Transpac 80 2 73.29 TATTAATATTATTAAGATTATTACTAAAAAAATATATTTGATCTTTTTTAATAACTTCATATACCAGTTGTATTGATGTGTAGAAATGTCATAGAAGAAATATATTTTTTATTAGCCAAAGTAATTTCTTTCACTGCATTCCATCC:2 - chr2L 3844943 3' - mdg1 7075 2 73.97 CCCAGAGTAGCCAGCGAAGGAAGCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTT:1 - chr3R 3590975 3' + Gypsy6A_LTR 329 1 71.72 AACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATATGCAATCGCGTTTTTTCTCGGCCGAAAGAGGACAAAC:1 - chr2L 12824742 3' + P-element 2747 1 30.82 TTATTTNTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAGTTTATTGTGT:1 - chrX 9530301 3' + 297 6923 2 51.37 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTA:1 + chr3L 20898619 3' + roo 9004 2 66.44 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTA:2 + chr2L 71284 3' - 412 48 2 52.74 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAAC:1 + chr3L 22400347 3' + 1360 3316 1 67.12 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTG:1 - chr3R 9298475 3' - hopper 44 1 59.32 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTAC:1 - chr3R 17077088 3' + roo 356 2 54.79 TATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCTATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTAAAACATAAATTCAAATTGCAAAATAGTTTTGCAGAGAATGAAAA:1 + chr3L 10590984 3' + G4 3505 1 71.92 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGC:1 + chr3L 6447109 3' + transib2 2748 1 69.86 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGC:1 - chr3R 17996141 3' - diver 21 2 66.41 CATGTTTTTACCACATTTAAAAAATATTTTTTTATTCAAAGTGTTTATTATGTGTTACAAAATACCAAAATATATATA:1 + chr2R 15824470 3' + Transib5 2715 1 61.54 CAATAAATCAAGAACAATGTTAAACTTGGCTTTGTTGCAGGTGGGGTGTGTGACAAAGGGAACGAGGGGAAAAGCAGAACAGAACAGAACGACGTGGGCCGTTTGTTTGGCATTTGGTTGTTCTCGTTCT:1 - chr3L 7407554 3' + TAHRE 10131 1 77.69 TTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAA:1 - chr3R 18971686 3' + Juan 4173 1 49.32 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGGGCTTATTTATC:1 + chr2R 6622634 3' + S-element 1632 2 76.71 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGAAGCGTAAACAGATT:1 + chr3L 19455020 3' + mdg1 385 2 51.30 AGAAAGGAGGGAAAAACATAAAGGGCAATCAAAAACCCCTGAATATTCTGTCAAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATAGAAGCCGAAAACCGTGATACCAAAATGGAAGTAAACGCCGGTGGACTGGCCCAGCTGACTG:1 - chr3L 14509843 3' + HB 405 1 73.29 ACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCA:2 - chrX 18396035 3' + roo 393 1 64.38 AAAGCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCGCCGAGTCTCTGCTCTCTCGCGAGACGACTCTCGCGACGACTCTTGACTTCGGAGTGCGACTTTGCGGCCGGAGATCCGG:1 + chr2L 6054267 3' + blood 165 2 81.90 AAAAAAAAAAGAAAAAAATGTGCATGAAAATAGAAACAAACAGAAACGCCGGCAATAAAAGTAACGGAAAACTGCTGCCTGGCATCTTTTTACGTATTTCGGTTGTTGATTACCAGGTAAAAGCAAGGTTAAGGTAAAAGGCAAGG:1 + chr3L 18741552 3' - hopper 140 2 74.66 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGT:1 + chr3R 27160143 3' - 412 7136 2 74.66 AGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCAGGTAACATAAGCGTTACTATTTGTTGTGACCGG:1 - chr2R 401576 3' - 1360 49 1 55.17 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCC:1 + chr2L 5582185 3' - pogo 58 1 72.13 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAATATATAAATATATAAGTGGGGAAAATGATGGGAGAATCAACAGCAGCATTTCGCAGAACGGCA:1 + chr3R 13241153 3' - Doc 43 1 57.26 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCG:1 + chr2R 12472095 3' - transib2 39 1 66.33 AGATTCGTTGAAAAGTATGTAACACCCAGAAGGAAGCGTTTCCGATCGTATAAAGTATATATATTTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAAC:1 - chr2L 20223956 3' + INE-1 14 1 84.93 AATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAA:2 - chr3R 11040060 3' + Bari1 1640 1 64.38 ACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATAACAGCTTAGACACGATCGAAGGTCCGATTTCCGGATTCATATGGTAAATCACATC:1 + chr2R 17800017 3' - jockey 4959 1 57.69 ATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAATTAAGGACATTAGCGTCATAAAGAAATAAGTAATGAAAAGAGCAGCCAGTTGGCCATTTTTG:1 - chr2L 15968332 3' + hopper 951 1 57.53 TTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCA:1 + chr3R 22590588 3' - rover 53 2 60.96 GTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCAAAAACAAAAAAAAAGAAGTGGAAAGAGGTTTGCAAGAGAATAGGGTGGTGAACCCATAAATCAACAACGGTTGATGAGCAGAAACCAGTTTGGCGACTTAACCCTTTTCTCT:2 - chrX 4569907 3' + Doc2-element 182 1 77.40 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAACGAAAATGGAATCTATCTATAAATCTATATATATAT:1 + chrX 13314478 3' - mdg1 7075 2 57.53 GGTACACCTGCGGCCAAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGATACAGTTGGCACATTAAAAAATAGGCGGGACGGGGGGCTGAGAGAGATAGGGATGAAGACTGAG:1 + chrX 7923894 3' + Bari1 442 1 70.92 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAACTATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCC:1 + chr2R 6847861 3' - Doc 48 1 55.86 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTCTCCTCG:1 + chr2L 6647741 3' - mdg3 5298 2 51.43 ATTTTTAATAATTATTTCAATTAAAAAGATATTCTTTGCATAAGTAAATATAGGAATCTTTAATTCGATTATAAAAATAGTTTTATATGCTGTAAATTACCCTTTAGTCGTCTTAAAATACTGCATAATAATAAAAATAATACAAT:1 - chr3L 10538831 3' - invader2 436 1 52.05 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCT:1 - chr3R 11191366 3' + roo 9037 1 59.59 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGA:2 + chrX 11661505 3' - pogo 50 1 55.48 GGATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAG:1 - chrX 21087600 3' - mdg3 5261 1 52.31 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAA:1 + chr3R 19032688 3' + roo 9001 2 69.18 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTGGTTTGCAAA:1 + chr2L 17180140 3' - Juan 67 1 60.27 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCT:1 - chrX 661864 3' + 412 7479 2 63.45 GTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCC:1 - chr3R 9038933 3' - Juan 4076 1 62.33 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACA:1 + chr3R 20167678 3' - roo 54 2 59.71 TGATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCG:1 - chr2R 4362803 3' - F-element 87 1 66.44 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGGATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGGCTGTCATTTTT:1 + chr2L 19675061 3' - 297 6626 2 65.87 CAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGCAAAGAGCAGACCAGCTTTCCGGAAAGAGAACGTGTCAGGAGAAAGCC:1 + chr2R 16608685 3' - McClintock 6218 2 67.12 AAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGGTTACACACTTTTGAGACATCACCTGTCCGTGAACAAG:1 + chr3L 16972993 3' - S-element 1546 2 65.62 AATAACAATAATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTT:1 + chr2L 15763086 3' + mdg1 31 2 63.77 AAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTGTTTTGCCTTACCTGCTTTTATCAGTTATTAATTTTTGGTCAAGCCTTACGGCTTTCTTTTAGTTTTTCTGCAACTGCCACAACACCTTGCACCTCG:1 - chr3L 22035481 3' - 1731 4338 2 67.81 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATAT:1 + chr2L 18549948 3' + roo 9042 1 66.42 TAAAATAAAATAAAATAAAATACACTTTCTGGGTAGCGCATCATTTGTGCATCGGTGCATTTGACAGGCCCTCAACGGCATGAATCAATTAATTTCCATCGAATACGTTGAGTGTTTATGGCTGGTTT:1 + chr3R 27402435 3' - transib1 1899 1 78.91 AATTTTTTGACTTAATGCGAAAGGGAAAAGGGGAATCTGGCCCAGTGTGCAGTGGTCAAAATCAGGCAGCATGCAGACAGCATAACCTAAAACATAATTAAATCATTTCAATTTTCGTAACATAACTTAAATTTAATAAATCATAC:1 + chr3R 1146343 3' - transib3 25 1 63.70 TCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGG:1 + chr3R 4682982 3' + Burdock 6326 2 68.28 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTA:1 - chrX 12986546 3' + roo 8996 2 70.55 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTT:1 - chr3L 5389841 3' + roo 9037 1 61.27 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCTGTTGTTGTTGTGTCTCTTTGCCATCGGTTCTTTATAGAGAAGGGGCTAAATCTTGCTGATCTCGTGTCACGATGTAAATTTGCGTTT:1 + chr3L 13032622 3' - Doc 316 1 65.07 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACATGAATTTATG:1 + chr3L 11844866 3' - rover 6963 2 73.97 ATACAGCTGTGGTCAGAATAATAGTGGTGGGCAAAAAACGCATAAAGTGCCTAAAAAGACTTCACATAAAGCCAATAAAAGCATTTTAAAATATTTTTCATAATTCTACATAATCTTTCCCTTGTGTTGCCGTTCTATTGAAATAG:1 - chr2L 13261943 3' - HB 1630 1 47.26 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAAC:2 - chrX 12986535 3' + roo 343 2 63.01 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAG:1 - chrX 6475283 3' - Doc 51 1 52.41 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGC:2 - chr3L 17567840 3' + S-element 164 2 62.33 TAGATTGGTGGCGGCTTAGGGGTCTTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCTAAATCGGCTAAAATGGCAAATCGGTTATCATTGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCG:1 + chr2L 14892234 3' - Fw2 201 1 65.75 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTCCAGCGAACTTAAGATAAGCTCATGGGA:1 + chr3R 27160192 3' - 412 7087 2 62.33 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGT:1 - chr2R 10078149 3' - jockey 98 1 63.70 GTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGATAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAACGGAAAAATTTCAGTAAATTTTCAAGTTTTAGAACACCAAAAATAGGGCAG:1 - chr2L 10362578 3' - rover 7157 2 65.12 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATG:1 - chr3R 30347322 3' - P-element 69 1 39.16 TATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGGGCTCTGCCTATC:1 + chr2R 12645487 3' - X-element 91 1 68.49 AACGCCGTGGATATCACAATATTGACGATCTCTTGAACGGAACCACTAGTGCTCCGCTATTTCATCAACTATATAATGCACGTTAAGGAATACTCGTAGCTCACCAAAGTTTCTCGCTCGTCCCCATGAGTTCCACGATCCGATAT:1 + chr3R 834649 3' - mariner2 383 1 56.16 TATATATTATTAAAAGAAAAAAATAAATATGGTGTCTAAATCTGATATAATCCGTGCCCAACCCTCCCCTTCCCATTTCTTTTTTTTTATCCTTTTTTTGCGTATCTACTCCAGATGAACCATCAACGTTCC:1 - chrX 10418648 3' - hopper 160 1 64.39 TACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAAATAAA:1 - chr3R 21624422 3' + HeT-A 6001 1 69.86 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACTTATATACAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTTTTCATTTTA:1 - chr2R 15375356 3' - 1360 84 1 64.29 AAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTACTTATTATCCACTTAGGTACCCATCTCGCTATG:1 - chr3R 15176277 3' + R2-element 3406 1 77.40 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAGTTTTGTTAAT:3 + chr3L 12315850 3' + transib2 2790 1 62.33 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAG:1 + chr2L 12250983 3' - 412 71 2 66.44 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGA:1 - chr3R 11040043 3' + Bari1 1657 1 52.74 GATAGGNTTAGAGTAATACAATAGCTGGGCTCCCCTGGTATATGAGCAACCGAGTCATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGTGGGGCTTGTCTATATTTTGTGTCAATTTAATAATTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAA:1 + chr2R 2749410 3' + G5A 2476 1 56.85 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAA:1 - chr3R 4964119 3' + roo 8986 2 78.62 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAG:1 - chr4 372942 3' + pogo 2051 1 54.11 GAACACACACACACACACACCTGAGCTCCGGGGCTCTGCACACCTGAGAAACGAGACAAACTCCCACAGTTTCTGTGGCCTAAAACACTATGCTTTAATATGTTTTCCCCCATT:1 + chr2L 17972219 3' + accord 7029 2 54.39 ACAGTTTATTGTTTTTTTTTTTGTGTTTGTCTTGGTTTTGGCAAAACCAAATATTACGCATAAACAACGGTTTGGCTGGTACAATGCGCTGGCCAGG:1 + chr2R 20477665 3' - HMS-Beagle2 7183 2 69.07 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGG:1 + chrX 9530401 3' - 297 6633 2 69.11 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAACG:2 - chr3L 22861716 3' - S-element 8 2 74.66 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTA:1 - chr2L 18226782 3' + roo 9002 2 67.12 CCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACC:1 - chrX 6116239 3' - transib2 49 1 53.57 AAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGTTTATATCTACGGTTCATCCAATTCAGTTAGGACTGGTAGGCAAGACCTCGGCGTTCACAATGTATT:1 + chr2L 12812722 3' - I-element 5030 1 56.16 AATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCG:1 + chr2R 5303118 3' + FB 204 1 70.19 ATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAGGGCGCCGAAAAAGGAAAAGCCAAACAAATAACACCTGAAACAAGGAGCCAGTAAGTTCTGAGGGGGGGATAGCTGTTTGCTATGGCCGGTCCGGATCCC:1 - chrX 17343702 3' + I-element 5142 1 76.34 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAACAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAA:1 - chr2L 16539620 3' + Juan 4186 1 64.83 AGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAA:1 + chr2R 23780610 3' - Ivk 64 1 58.22 TGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGA:2 - chrX 292380 3' + G3 4542 1 65.07 CATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCA:2 + chr3L 5061636 3' - 17.6 6996 2 73.10 TATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATCAGCTGCAAAGTTTGATGTCACCTCGAAAAAAGAGCTCGATTATTTAATAGGGCTATTACCACTTTTCAACCAAATACATTTTTC:1 - chr2R 13248906 3' + mdg3 57 2 63.01 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCACCCACCCACGCGATTCGCTGATAAAAGCCGGAAAAGGTTTTAAAGTGCAAAGTTGGAATGCGGCTGC:1 - chr2R 12779587 3' + I-element 5338 1 71.74 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTTATTCGTGTTTATGTGTGAACACCAGAATGTGGGCAAATTTGAGAATTTGTCATATGCATTAAATACCCGAACAAAGTAAATACTTAAATTTTAAT:1 + chr3L 1914842 3' - roo 8704 2 48.89 GTATGTACATATATAATATGTACATATATAAAACCTAACTAAATGGTTATGTATGAGTGTGAATGTGATTTTCTTTCTCTCAAATTTTACGAGTACGCATCGCATCGCATAAAACGAAATGAAAATGCGCATAAATTGTACAAAG:1 + chr3R 27802686 3' - 412 7273 2 66.21 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAAACAATGTGAAAAATGGTAA:1 - chr2L 19674943 3' + 297 350 2 57.53 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAAC:1 - chr2L 15936785 3' + copia 5077 2 71.23 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCAAGTGGTTCGCCCCTTTCGCCACTTTCTTCACCTGGTGGCAGCCATCCATTCATTTGGCTCTTCCT:1 + chr3R 25433428 3' - transib2 15 1 75.00 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTTAAAACCATAATGCACACACCAGTGACCGGCCGGCAAAAATCCCCATTAT:1 - chr3R 31653073 3' - roo 8713 2 60.32 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTT:1 - chr2R 13766175 3' + roo 9038 1 62.07 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATT:1 - chrX 18009931 3' + 412 7487 2 56.85 TATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCCAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGCATGTAAGGGGATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAA:1 + chr3R 4860509 3' - Transpac 5004 2 71.23 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGAC:1 + chr2L 19924064 3' + roo 9034 1 53.42 AATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTA:1 + chr2L 14025658 3' + HeT-A 6002 1 59.59 ATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCA:2 + chr2R 20010653 3' - Juan 4188 1 75.34 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAATTCGTGGTGTGGCATACTTAA:1 + chrX 6116382 3' + transib2 2799 1 69.18 CTTTATTTTTCCTTAAAAATATATTTCATATTTGTTCACATATAAAGAATACAGAACAAAAGCCTTGAACCTGTGACTCATAAGGCGACCAAGCGTAAGGAAGTCATCAGGATGGCTGCTGCAATTGGTCCTGCGAGTCGTG:1 - chr2R 17211121 3' + pogo 2019 1 83.10 CCTCAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATATATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAG:1 - chr3R 11186569 3' + BS 5000 1 76.71 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTATTATATATATATATTTCTATACAGTTATCTTCGCATAAATATGTACAGTGCG:1 - chrX 9530325 3' + 297 319 2 72.41 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTT:1 - chr2R 5941330 3' + copia 227 1 56.14 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTG:2 + chr2R 9871573 3' - roo 54 2 56.16 ATGAATTGAGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTCTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCGTATTATTTTTATTTTTCATTACACACAATATAACTAATATTAAAAATTATTGAATAATAATTGCAGTTTCGCTTTTTATGTGATTTTT:1 + chr3R 28581342 3' - I-element 4980 1 55.48 GTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTC:1 - 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chr2L 7618429 3' + X-element 4709 1 72.50 ATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7575 2 61.60 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTC:1 + chr3L 25401033 3' - Doc 36 1 52.05 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCACAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGAACAAATGGGGTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGC:1 - chr3L 13294910 3' - roo 84 2 73.76 AATAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATACCTTTCTGTCTTGTTTTTTCTTATTTTGTTTTTCTTTTGACAAACCGGTCAAAATTGCCAAGCCCACACTTATGCAAACTGATATTGATATTTTTTCATAATTTTAT:1 - chrY 1803445 3' + INE-1 550 1 50.69 ATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAATTAGTTTTTAGGTTTAGTGCCTGGCAATGGATGATGGCCCTTTCAAGCTTCAGATATCAATCAGTTTAT:1 - chr3L 13384647 3' + Doc 4500 1 56.83 GGTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTATGATTT:1 + chr3L 20187447 3' + FB 837 3 65.75 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGGCACAGAAAAATCAAAAGAATTCCACTTTT:1 - chrX 7305232 3' + copia 5067 2 77.40 TTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAACTAAACTGACATTTACATACCATTCAACGAATTTAATATACACACAACTGTACGAGCAAATTCAGTAATTTTATCATTTTAACTTTCACA:1 - chr3R 15880958 3' + jockey 135 1 67.81 ACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTTACACCTTCAAGAGAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAAAGCAAAATTACAAATTAGCGCGCTCTTCTAACATAAAAAAAGCAAATGCAAAA:1 - chrX 16562716 3' + Doc2-element 137 1 61.54 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTC:1 - chr2L 4123828 3' - transib2 38 1 59.59 TATGGTTGTTGTTGTTGTTAAGGCATTGCATGTTGTCGGCTCATTTCATTCACACACCCATCAAATTGGATATAATATGATCAATTGATTAACATATTTATCATT:1 - chr3L 6738198 3' - I-element 130 1 80.95 ATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTTCGTGAATAAA:1 + chr2L 22150649 3' - S-element 67 1 86.99 AAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCAACTTGTTTAGTATACTATGATGTTCGATACATATGTGGTTCAGCAACAAACATAAGCAAACATTAGTGAGTG:1 + chrX 19361583 3' - mdg3 5108 1 54.79 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATAT:1 - chr2L 20265931 3' + roo 9018 2 56.16 CAGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTT:1 - chr2R 13766196 3' + roo 396 1 66.99 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAA:1 + chr2L 16539794 3' - Juan 4039 1 72.60 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTA:1 - chr3L 24131361 3' - Transpac 4946 2 64.38 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTATTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCT:1 - chr2R 3338785 3' - Juan 61 1 58.22 AACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATTGTATTTTGAGGTTAGGCGAACGCCTTTTGGGGTCACCGTGTGA:1 + chr3R 13978336 3' - transib2 317 1 69.86 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTTTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGATGTTTTTCCCCAGCC:1 - chr2L 4713864 3' + transib2 2764 1 60.00 ATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAA:1 - chr2R 2591119 3' - roo 66 2 55.46 ACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTATTCGGCGGCTGCGATTGGTATCCCCACTATTCAGTTTCTACTGCGTGTAGTC:1 - chr3L 20189546 3' + FB 258 1 56.16 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATCTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGT:1 + chrX 7795623 3' + roo 9021 2 52.74 AGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGGATGGATTCTCCTTTTTTGATTATTAAAATAAGTAAAT:1 - chrX 19221888 3' + accord 466 2 69.84 GTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATAATTTACATAGAATCCTGAATCATAACTGGCGCAGCCGACGACTACGAACCGGAATGGATCGCTTCTTATTGGTGTTATTGTAAGCATACACATACGTACACAAG:1 - chrX 21939080 3' - X-element 11 1 72.18 GACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGT:1 - chr2R 18514882 3' + P-element 335 1 41.10 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCA:1 - chr3R 28042939 3' + Stalker2 7629 2 59.05 TAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCGTTAGAAGAAACAATCTTGGAAACATTCCAAA:1 - chr3R 20810154 3' + invader4 435 1 61.67 ACCTTTAAAATCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTTTCTTGACAAACTGTAATTAGTTTCTTAGCTTTGAAGCGTAGAAGCCAGTTTACAAAAGGAAGGACAGGAGGGCATGGAGGCCGATGAGTTGGACCACAGCGATAACCGCA:1 + chr2R 12939643 3' + S-element 1677 1 76.03 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGTGTTCCGATTACCTGGGTTG:1 + chr3R 13300993 3' + roo 9047 1 64.83 CTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTATGTATATCATCGCATTATAAATGTCTTGCATTTGTAAGAATGCTCC:2 - 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transib2 81 1 73.10 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGGCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGGCAA:1 + chrX 21639710 3' - gypsy5 6965 2 51.96 AATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATCGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGGT:1 + chr2R 12645524 3' - X-element 30 1 58.20 AAATTTGTATATATATATTTATGCACCTGTGTGCCCACCGCTGGCCTCCAGGGACAACAACATTACTGTTAATTG:1 + chr3R 11666074 3' - Stalker4 87 4 50.67 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTGAAATTTATAAGA:1 + chr3L 20711741 3' - jockey 4778 1 69.86 ATATATGTATATATGTATATATGGTAGCTGATACGCACTAGATGTAAGCTATTCGTATGTATTAGTAATTTATAGATATTTCTAAAGTCTTCCCTTTGTCTTAAAGAAACCCA:1 - chr2R 19023204 3' + G3 4505 1 74.34 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACAT:1 - chr3R 11191412 3' + roo 340 2 73.68 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTCCACCTTTTTTTCGCTCTTTTTTGAGTGG:1 + chr3R 27765191 3' - mdg1 59 2 58.90 TATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATG:1 + chr2L 16539783 3' - Juan 4049 1 65.52 CTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATA:1 + chrX 9950597 3' - jockey 4735 1 66.42 AAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTTGTTTCTATAATTGCTGATGAGCCAATCAATGGCCG:2 + chr3R 11040204 3' - Bari1 16 1 75.34 AAATAAAAGAGACAATTGAAATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCCTCCTCCAAATGTCTTGCGGGGCGGGCCTGGTGTGGGTTAACAAACAACAAAGGCTTCTT:1 + chrX 21087674 3' + mdg3 5461 2 48.39 TATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGAACTCCAGTCACCTTGTAATATCGTAGGCCGCTTTTTGCGTGCAACTATTCTGATCTCGAGAAGATCTGCCAGTTAGACATG:1 - chr3R 9045523 3' - diver 162 2 39.55 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATA:1 + chr2R 5479979 3' - F-element 88 1 66.44 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATA:1 - chr2R 9544857 3' + roo 8989 2 74.66 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTATGGTCGAAGTTGGCCAAA:1 - chr2R 13766156 3' + roo 393 1 74.66 ATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCAACCGAACTCCCTACCCGGAGGATAGTATAACATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGATAAATTTTTCCTTTTCTGTTTTTTACTTTCTTCTTCGTTTTGTTTTT:1 + chrX 7134722 3' + G5 4619 1 79.45 CTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTGGTGGTTGTGGTGATTGTGATGATGATTCGGCTGATGGTGTAGTTGATGTTGAGGGTGCTGTTTCAAGGGCGTCCAGCTCTCGAAGGGGCGTGGT:1 - chrX 19233921 3' - INE-1 530 1 61.43 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACAAA:1 + chrX 1341759 3' - 412 35 2 61.64 TATTGCAACCATTTATTTGCAATTGTCGCAGTCGATGTGATCAGTGTGAATGGTACTGTGATTGCGGGATGCTTTGTTAACGGTTAACTGGCGGACACACCCACGTCCGCTTTTCTAGGAACGCAATATTATTTACACCTTTTA:1 - 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chr3R 25709758 3' + hopper 1365 1 52.05 ATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTGTT:2 + chr3R 2520357 3' + Tc1-2 1613 1 64.38 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGACATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAA:1 + chr3L 22400346 3' + 1360 3383 2 64.10 TTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAAATGAGTATAGTTTTATTTTGGAAAATCGATACATCTGAAAATTCTTTTCAATTGTCAATTGAAAAGAATTTTCAGAT:1 + chr3L 26377883 3' + transib2 480 1 48.41 CTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTG:1 + chr3L 24934400 3' + HMS-Beagle2 7135 2 60.27 AAGGGANAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCTTATT:1 - chr3R 15724253 3' + Juan 4203 1 74.66 GGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCATAAGTCCGCATTCAGGATACATTCGCCATCTCATTTTAATTG:1 + chr2R 2318289 3' - ZAM 11 2 78.08 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATAAGATAAGATATATAAGACCGCCAAAAGAATCTGCTTGTCTAGCTTTTAAAGTTCACGAGATA:1 + chrX 20373675 3' - 297 6602 2 62.39 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATG:2 + chrX 8200327 3' + flea 223 2 64.38 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGGTTTGG:1 + chrX 18336651 3' - mdg3 5335 2 76.09 TTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGGGGTCAATAGATGGAGGAAACACAATAATTAAAATAACTTACT:1 + chr3L 19888764 3' - FB 712 2 70.55 AAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAAAGAGAAGGGAGAAGCATTGTACGAAATGAAATAAACAAAAAACAAGACAATTTCAGTAACGATTGCTA:1 + chr3L 18822991 3' + Stalker 29 4 54.11 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACT:1 - chr3R 5769016 3' + roo 340 2 63.01 AATATAGCCTTTGATTTGACCTTTTTCAAAATCGGATAAAGGTTTTCCGCGGCCCATTTTAGAAAAAGATGATTTAATAGATTAAGTAGGAATGCCTCTGAATTTGTCACATTTTCTTTATGAACGAGCATGAGTTAATGTATCCC:1 + chr2R 8314836 3' - Tc3 473 1 52.74 AATAACTTCATGTTATTACATTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTACTTCCAAATTATTCAGTCATTATTAAGTGGAAACGGAATATGTTTTGAA:1 - chr3R 19940862 3' + mdg1 6997 1 65.07 ATTGGAAAGACACAGACGGCAGCACTCGAAGAGAGAAAGTCGGTGACTGCTTATTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAGTATTTTTGCAATTCACTTAAGCAACCTAGAGCACCCTTAACAGC:1 + chr2R 23780630 3' - Ivk 28 1 50.00 GAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATCATAATAACAATCATAATA:1 + chr2R 5955304 3' - micropia 4993 2 57.53 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGAAAGTGAG:1 + chrX 21224647 3' + roo 397 1 67.31 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATA:1 - chr2L 9782046 3' - P-element 39 1 58.90 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGTAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGGGCCGTTTTAACA:1 - chrX 8437649 3' + P-element 2863 1 57.89 TGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGCTGCGAGGAAGGACATTCGGGACTGCAGGACATTGGGACACAATGGGTGGATGTGC:1 + chr2L 19689360 3' - G2 3001 1 63.70 ATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACACGACACTTAATCGACCGCGCAGTAGAGAGTCCGAAACTCCACCGAAGAACAGCGAAACGTTTAGGTTCAGTCTTAGAGAAT:1 - chr3L 25335092 3' - G3 4505 1 48.63 GGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATATTTAAATGCTGCGCCATACTTTGCACACACTCATGACACTTTTTGATATAATATG:1 + chr3L 23491231 3' - 1360 3342 1 61.64 TAAACACTTTTATTTAAAATAAAAAACGGTCACATTTCTTTTTAAAATGGTATTGCTATCTGGATATTACTTGTGAAAATCCGTTTGTGTGAAGCTTTTATTCGGAAGTTTTAAAATGTTATAGTAAATTGACACATTTAAAAAAG:1 - chr3R 18242484 3' + transib2 2626 1 76.03 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAATTAGAAATATCGA:2 - chr2L 17180026 3' + Juan 4201 1 75.34 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTG:1 - chr2L 8338119 3' - P-element 62 1 41.01 ATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTTTGGTGTTTTGCAAATGGGTCTCCAAGCCGATGCCACGATTCCCAGGCTCTGGGCCTGGCCCAAATTTGAATGGCAACTGCAACTGTCGGAGTACGGAAT:1 + chrX 11758749 3' + copia 4828 1 70.55 ATGTAAAAATTTTAATTTAAATAAAGCAATTTTTTTTTAATTTTTATTAGTTAATTAGATACAATTTTCTTTTCATTTATATCTCAAGGCAAAAAGTGTTAGTTTCTATACATTTCTTGGTTTGTTTGATTGCTTCCTAGTAACAT:1 - chr2L 16386833 3' - 1360 3050 1 65.75 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACC:1 + chr2R 11159379 3' + roo 9039 1 62.33 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAG:1 + chr2L 10156239 3' - hopper 25 1 64.03 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTATATCTATCATAATAAATAAATAAATTAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCA:1 - chr3R 20441260 3' + I-element 5267 1 73.97 AAGCACAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTTTTAAGGAACAATTTACAATAAAAGTCTG:1 - chr3R 18971644 3' + Juan 4211 1 75.34 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGGGCTATTGTCGCTGAAGAGCATT:1 - chr2R 4362791 3' - F-element 46 1 49.57 CATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGG:1 + chr3R 30987580 3' - F-element 117 1 55.30 AGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGTTGGATGGGCAGACGGAGGAGGAAATTGTCACTTTGTTGAAAAATTAACACGTGCC:1 + chr3L 92016 3' + 17.6 266 2 61.38 GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCGGGAAAAATAAGCATACAGTTGAATATAAATTGAATCTACTTCC:1 + chrX 1799262 3' + invader4 304 2 67.59 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGTTGGCCTAATTGGATGGATTTAAGGATGTGT:1 - chr3R 11062715 3' - roo 8694 2 61.36 TTTGTTTATATTTATTTATTTATTTATTTATTATTCTCGTTATTTTATCGGATTTTTGAATTAAATTTTCGTAAAAGTGTTTGTTTTGTAGTAATTTCAGTTTATGCTATTGTTAGATATTAATTCAATATTTATACAATTATATT:2 - chr2R 20211471 3' - Tc1-2 479 1 71.23 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAA:1 + chr3L 10373894 3' - 297 6625 2 70.30 TACTGCACAAATCACAAGGAATCACACGCGAAGCGAACGGATCTTTAACAATTATGTTTAAAATATATGATAACTAAAAATTATTAAAAACAATGAGTCATTTGATGCATTTCTCTATATTTCATGCGAATTTG:1 + chr3L 20268668 3' - Cr1a 145 1 67.16 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAATTTTTTGTTACAGAAAATGTAAGAGATCTTTGAGATAATT:1 - chr3L 8959565 3' + 1360 3356 1 63.01 GGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTGGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTAGGGCCTTCAAGTAGTGGAGCATGTTATAGCCGCAATACTC:1 + chr2R 15458299 3' - HB 1439 1 76.71 AAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGT:1 + chrX 20999595 3' - BS 53 1 58.22 GCAGGCGTCTTAGGGATTGGCAGTGGGCAACATGGTACTCCGGCCGATGGGGCGAGCCGCGCCGCGTCTCCGCCACAAAGACACCACTGACGCCGGCCA:1 + chrX 16596771 3' - G2 2901 1 66.67 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCGTATGTTTCTGCGAGTCTG:1 + chr3R 23618207 3' - hopper 33 1 59.60 TATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCATTAAGTCGCCGGAA:4 + chr3L 11233652 3' + 1360 3041 1 76.03 CAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTATGTTGGAGGTGCAGATCAAATATGAACTTATATCTATTAGTTTCTAAAAGAATTTT:1 - chrX 14808076 3' - gypsy 447 2 67.81 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAATTTTTTGTTACAGAAAATGTAAGAGATC:1 - chr3L 8959577 3' + 1360 3344 1 54.79 GTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGTGCGTGGCAGGTAGCACCCGCACATAAAATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTTTCCGTTTGCCTAGGCTAATTGTAGTGGAAAAACTCAATAAACGGAATTACATAAAAACATGGTG:1 + chr3R 15794326 3' - hobo 83 1 52.90 AAAATAAAGAATTTACTTCTCTCGTTTTTTTAACTGACACTGTTAACTTGAAGCTCAAAATTAACATTACACTGCTCGCTCTTTGCAGTGGACGAGCTTTCGTTAGGGTGAACCAATTTTGGAGAACTAAATGTACTTTCATTGAA:2 - chr3R 20308715 3' - pogo 2006 1 52.74 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTT:2 - chr3R 8075906 3' - 412 7128 2 67.12 ATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGTGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGGGCTTACATAATGTAATGTAATGAATAAAAAATGTTCATTCATGTTATGAAAAACAACACCTATT:1 + chr2R 20360388 3' - G2 54 1 57.53 AAAGGGTCAAAACCTCTTACGCAGCTCAAGTTCAATTGTAGGGGCAACTGAAAAAAATTAATAACTATCAGAATTTTAAGATTATTGTTCGAGGTCAATTTATTAGG:1 - chr3L 24346869 3' + Quasimodo 218 2 65.42 GCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACAACAAATTT:1 - chr3L 27356041 3' + Tc3 1676 1 67.12 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAA:1 + chr3L 19111590 3' - Doc 65 1 70.31 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAA:1 - chr3L 24131389 3' - Transpac 54 2 59.31 TGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATATGCAGCTTTGGCGATAT:1 + chr3R 24729632 3' - Juan 4172 1 81.51 GTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGGCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAA:1 + chrX 23108300 3' - BS3 1450 1 66.99 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCTC:1 + chr2R 18529994 3' + jockey 4960 1 63.70 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGAGACTATT:1 + chr2R 5151364 3' - roo 8684 2 69.18 GTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGACTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAGGAGAAGCAACACTAACGGCAACATCTGCATAATGCGGCAAAACGAAGTTGCTGTCCGCTCACC:1 + chr2L 6395612 3' + X-element 4415 1 56.49 CCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCATTTAGAGATTTCGTTACATGTTATTATGGACAAGTATTT:1 - chr3R 1166866 3' - invader4 336 1 70.90 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCATGGAGAGCC:1 + chr2R 12472137 3' + transib2 2779 1 54.79 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAA:1 + chr3R 19407985 3' + diver 148 2 67.81 ACATTATTATTATTATTATTATTGTTTTGATAATGCATTTCAACTTTTTTAACCAGGAACCGGGAAGCACAACTTTCACAGAAGAGAAAGAGAATTTTCCACATAATAATGAAAACTTTCAGTCAATTGCCTGATGTCAGCCCATT:1 + chr3L 13880265 3' - mdg1 32 4 73.97 CCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGTGTAAGTTCAGCCTCTAATTACAACTGACCATGGTTTTACAATAAATTGCGTGCCCGGCGAGGCCGTTCCGC:1 - chr3R 4860373 3' + Transpac 5228 2 80.56 ATCAAATACCCGTTACTGAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAAGAAAATGTGACAAAATTTTAAAAATTGTTTAAAAATGCACAATGTCAAGCAAGAATTTTGTTCT:1 + chr2R 17811195 3' - INE-1 545 1 71.92 GGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGGGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAAAAACCAATTCAGTTCATTCCTGATCTAATGACATACATAA:1 - chr3R 6217926 3' - R1A1-element 4942 1 65.00 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGGCTCCTCCTGCACTT:1 + chr2L 6161028 3' + I-element 5285 1 65.75 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCG:1 + chr3R 16157389 3' - pogo 61 1 58.22 AAATGGAACATGGAGAAGAAGTACACAGCGACTACACGCCTTTTCATTTTTTTCGCCTTGACCCGGCTTTTTTGACATTTTTTCGTTTT:1 + chr2R 12167023 3' - micropia 129 4 50.56 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTG:1 + chrX 18336658 3' - mdg3 83 2 72.41 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACAAATAAGT:1 + chrX 1341764 3' - 412 30 2 65.07 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAA:2 - chr3L 24934266 3' - HMS-Beagle2 6913 2 65.07 TCTATTAGAAAATAATTGCTGGTATATGTACATCTAACATTGCCCATTCATTTACTCGATAAAATTTGGTCAGATTTGGGGGAAAAATGCATACATATTCGAATTTCAAAATGGTTTTTAATGTCTCTTTAATTTGATTTTACTCA:1 - chr2L 13556907 3' - transib2 66 1 80.82 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAA:1 - chr3L 3983831 3' - P-element 76 1 26.36 CACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACA:1 + chr3L 23839694 3' - 17.6 71 2 80.14 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAATTTGCAGTGTGATTCGTTTTTCCGCGAATTGTGTTTGTTGACACAGTCATTTGGAGCGTGC:1 + chr3L 8685287 3' + I-element 5342 1 73.76 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAG:1 + chrX 21224629 3' + roo 9012 2 61.94 AAAGAAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATTAATGTGCATCGATGTGCATTACAAAAATATATTAAAATGTTCTTGTAAAAAGAACATGAGAAAAATCAAGAAAGGAATCTAGTTTTGGCATGCCGAAGCTTATATACCCTTGCAGT:1 + chr3L 10465831 3' + mariner2 887 1 30.82 AAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCCAGACCAAATGGTAGGCT:1 + chr3R 11062889 3' + roo 404 1 78.08 ATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGTGCCTATGATTTTATCAACCGCAGTTACATTCTCTGGGATTTCTATTTTTGGAAATAATTGGTAAGAATGTGCGGGAATACTGAATATATTTTCATATATT:2 + chr3L 16282682 3' - I-element 220 1 73.97 GTAGAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTCAAATGTACTGAAGTTGCATAGTCAGCAAAGTTTCAAATTCTTCTGACGAGCAGCTGAAGAAACTCAAAATTTCGCAAGTGGCCTAGTGACTACCAATTTTCTGGCAATTAACAT:1 - chr3R 30983068 3' + transib2 2580 1 77.24 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGAT:1 + chr3L 12315831 3' + transib2 2771 1 52.74 ATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATAATTTTAATGTATTATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATGTTATTGTCATTAGCTCTAACATAAACATTTTGGGAAACCATGTAAAAT:1 - chr3L 26719100 3' + Tc1-2 1604 1 59.59 AAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAGAGTAAGAACGGTTTTCGTGTCAAAACACACTCTTATTGAATTGAATTGATTAGCACAGAATTAACCAAATGCATGCA:2 - chr2L 1883291 3' - 17.6 7151 2 55.48 AGCCAAATTTGTCGCATTCAGGCTGCCCAAACCAAAATCGCCAGGACGATTGCCGGCTGTGAATGGTACGTAAGAAACACAACCCTGCACAATCGCACTATCCATCTACCCCGCCCTAGTGCCCGGAC:1 + chr3R 23657920 3' + BS3 1343 1 70.31 CCTTTTTCTTTTTTTTGTTTTTTGGGGGGGATAGGTTTGGTTCTTTCCCGTTTTGTTTTGGTATGTTACTATTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGT:1 - chr2R 15070141 3' - Doc2-element 223 1 51.37 AAAAAGAAAAAAAAAAATATGGGAAATGAAGGAGAGAGCCGGTTTTAGCCCGGCTAAAAAGTCGGACTGGGGCTTGATCTAG:1 - chrX 13227581 3' + Doc2-element 223 2 75.61 AACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATA:1 - chr3R 19224988 3' - HMS-Beagle 6854 2 58.22 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCCCATCAGAACTTTGGAAACGGGACTGGGG:1 - chr2R 16817835 3' + 412 7527 2 70.14 CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCC:1 - chr2L 17809210 3' + jockey 4899 1 80.14 ACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAA:1 - chr2R 3564063 3' - Tabor 6921 2 71.23 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGCAACTCTAA:1 + chr3L 16437255 3' - F-element 49 1 47.69 AAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAG:1 + chr2R 5532342 3' - G4 3793 1 54.07 AAAAATCAGAGGACAATAAATGCCAGCGTCATTAGACGTTGAAAATATTTAAAAAAATCTCTCAAAAAAATTTGAAAAATAATTAAAAACCTATTAAAGTCAGGGGGGCTAACAAAAAAAAAACAGCAAAACAGCACTGGAAAACA:1 - chr3L 11282194 3' + TART-A 13362 1 63.01 AAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTTTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTAGGTATAGAATTCTCGGCGTCGTGTTTCATCGGTCTATGATCGGTGCTCATGCATACAGTAGTCAGGCATCTAAGCAT:1 - chrX 16742093 3' - Porto1 4567 1 58.90 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATATTGCATCTTTCATTAAATC:1 + chr3R 15942854 3' - hopper 8 2 80.82 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCAT:2 - chr3R 18971723 3' + Juan 4136 1 71.92 GGCGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATTGGTCCGGGTGGTTC:1 + chr3R 15807438 3' - FB 68 1 62.07 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATAAAC:1 - chrX 19038371 3' + hopper 1353 1 62.50 TATCAANATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATT:1 - chr3R 7666647 3' - I-element 75 1 64.38 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGT:1 - chr3L 17055407 3' - Tirant 39 2 58.90 AATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCACTAAATACAATTATCAAATGGACTTCAATTTCAGTTCGTTTATTTTGAAGTTAATTGACTTCAATTAACTTCAAAATAAACGAACTGAAATTGAAGTCCATTTGATAATTGTAT:1 + chrX 13726914 3' + S-element 111 2 43.84 AATAATATTAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAAAATAC:1 - chr2R 5501134 3' - Tc3 269 1 69.18 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATAAG:1 - chrX 10537860 3' - I-element 56 1 60.00 ATATTTAAAAAATAAAGAAAAAACAGAGAAGCGAAGAGCGAAGAACATTAAACAAAAAGTCATTGACATGTAAAGTACATAAACATAAACATAAAAGTAAAAGTTTGAAGGAAATGGAGGAATACTCGCTACGAAGAGGGTTTTTC:1 + chr3L 12789908 3' + TART-B 10631 1 80.82 AAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGTTTTGTTACGCTCTGCCACGTTTTTGCAACTACAACGTTTTGCTGTTGACATTTTCAAT:1 + chr3L 14362231 3' + 1360 3200 1 69.18 AGGACTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCATGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCAGCTTACTAGGTGGCGTATATATTTTATTATTCTACAAGCCTTATATTTAATGCATTTTTCTGTTTTAGTATG:1 - chr2R 4727731 3' - rooA 7399 2 50.00 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACGAATTTGTATACGGATATGGAAAA:1 - chr3R 15724261 3' + Juan 4195 1 67.81 CAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAGCCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATG:1 - chrX 4808538 3' + mdg3 158 2 73.97 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCACCGGAACGAGCTACTGACAATGTCAAAATC:1 + chr3R 11937451 3' + flea 242 2 78.08 CTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCACCACGACCTTGCAGAGTACAGAAT:1 - chrX 6117056 3' - invader4 203 2 77.27 GTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCATACTATCCCGTCCTTCTGTCCGTATGAACGTCGATATCTTAGGAACTATAAAAACTAGAGGGTTAAACTGCTGAAAAATAATTCGCCTGTTCTTCAATTTATTGTTCGTCCTGCCAAT:1 - chr3L 24756907 3' + INE-1 32 1 67.83 CTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACAGAAATAGGAAAAGAATTGCAGTAAATTCGTGAGGAAAGTTAGGGGAGTGTAGTGCGTGTAAATGTTTGGA:1 + chr2L 7664158 3' + I-element 5109 1 52.05 TTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCAACGACAAAAAGAGGCCACAGCCTAAACCTAAACAAATCTATATCTAATCTACATCTAAATATAATTCAAAGTTATGAAACAAATATTTCTCGAATATATAA:1 + chrX 12066249 3' + transib2 2804 1 65.97 CAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATTGGATAGTTGAGTTGGTCAACTA:1 + chr3R 10736128 3' - McClintock 6004 2 62.50 TGGTGGGTTCAGATTGTTGGTTGGGCGCCAATTATATAGGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTTTTACTGCATCCATTTGTTTATCGTCGCTTGCGCAAACTTCTGCAGCCATGGCTATTAATTT:1 - chr2R 5896431 3' - gypsy 490 1 57.14 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAA:1 - chr3L 24934320 3' - HMS-Beagle2 84 2 77.40 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCTTA:1 - chr3R 15724255 3' + Juan 4201 1 73.29 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAG:1 - chr3L 18281872 3' - Doc 76 1 72.54 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGCGGATTTCTTACAA:1 - chrX 6475249 3' - Doc 18 1 75.34 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGCTTGCCAT:1 + chr3R 25428256 3' + 297 334 2 63.01 AGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAA:1 - chrX 2479457 3' + mdg3 5468 2 58.22 AAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAG:1 + chr3L 18126015 3' - Ivk 39 1 51.72 GTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATATTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTTTTTTTTGTAACTAACTTGCCAGCGTTTATGCGTGTTGATATTCGTGTATCTAACTAAG:1 + chr3L 5815585 3' - I-element 4955 1 57.86 CTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGAGTGGACGGGTTTCGGTTTGGTTTGTTTTGTATGTTTTGTGTGTATGTTGCTTCCGAAAAACATGTTTTTGTATTGGATTTCGGGAATTGCAATCTCA:2 + chr3R 16710364 3' - I-element 439 1 69.86 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCTCTTACAAATGTATCCTTACCCAAGCCAACGAACAAAAAAAGGAACGTTTGTGATGG:1 - chr2L 16943800 3' - copia 4932 2 62.07 GGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGTTTCTTTTTGTCCACCATTTTGCTGATATTGCCCACTGTTACCATTGCTGTTTGGATCGCCTTCTTTG:1 + chr3R 14511278 3' - F-element 4239 1 54.55 AATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGACTTAGACCGCCCTTTTTCTCATTATATTCTCCAATATCTAT:1 + chr3R 4194005 3' + INE-1 102 1 75.17 GGTCCTAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCA:1 - chr2L 11839672 3' - mdg1 91 2 80.14 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTAC:2 + chr3L 18126008 3' - Ivk 47 1 47.26 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTC:1 + chr3L 18403040 3' + P-element 2803 1 28.77 ACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGTCGTTTCAGCTAGTGCTCAAAATGCTTATATTTGTTGTTATTGTTGGTTAAATCTAAACTTTAAGCCAAAAATGTTGGCTTAAATTTAATGCAAAGGTTGT:1 - chrX 9693615 3' - hobo 69 1 70.55 CCCAAGCCACAAACTCACCCCACGCAATGTAATTCTAAAAAACCAAACGTTGAAAATAGATTTTGCACATGAACGACAAAGGGAAAATAACAAAAAGCGACAACATGATGTTAAGAATAATTTAAGAAGACACACTTTGGCTAATA:1 - chr3R 7857230 3' + HeT-A 5930 1 71.92 CTTATCTAGAAGTCGCAAAGAAACGTTTAGGAAATTCAAAACATAAACACAATAAACAATTTGAGTAGTTGCCGCACACACACACACACACACAGCCCGTGGATTATTACACTAAAAGCGACACTCAATCCAAAAAATCAGCAACA:1 - chr3R 19325554 3' + Tc1-2 1231 1 78.08 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACA:1 + chr3L 22325911 3' - hobo 36 1 56.15 AGAGGATATATAGTACCCCTACACTAGGTAAGTGATTTGCTGCCGTCGGCGACTACAACCACAAAGGGGAAAGTAGTTTCTTCCACAGTTTTTCTTAAGCTTCTGCACCAGCCATTTCAGTTGTTTTGTTTTGCCATTTTTTTTTT:1 - chrX 8862038 3' + invader2 244 2 76.71 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTG:1 + chr3L 16970451 3' - roo 8736 2 70.55 ATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGGGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATT:1 + chr3R 15790133 3' - flea 4722 1 73.29 TATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAGCACACATATGCACGCATATTGACAAATGAAGAGAAGGTTCCTCGTGCCTTTCCCTCCTTTCCCTGC:1 + chrX 7153981 3' - Quasimodo 38 2 44.68 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAAGTGTTTTGCATAAAAAACCGACCAAAATGA:1 + chr2R 20227353 3' + hopper 1388 1 64.38 TATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTTTTTTCGGTTTTTTGAGTATGCATAGTTTGGGGCAGAGGGACGTGGAGAGATCCTCATTGATTCTTCATGGTTGCAATGGGATT:1 + chr3R 6411717 3' - hopper2 1168 2 55.48 ATTTACAAATCCGACAGACTTCATCTAGCGTCAGCGAAAACAGGTGTGCACAAAA:1 + chr3R 4593555 3' - hopper2 272 1 65.45 TTATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATATATATATATATCATAATATATACAATTATTTTTTTGGCTTCTTAATTCCAATTGTGCAGATCTATTATCTATCTATGCAGATCAGTTCACAGATATTCACTTGGCAGTGAATTAAT:2 - chr3R 3854731 3' + Idefix 7387 2 30.82 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACG:1 + chr2L 10156228 3' - hopper 36 1 56.12 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCTGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATAT:1 + chr3R 8890106 3' - FB 72 1 66.44 ATATATATGTATGTATATATATATGTATATACATACATGTATATATATATATATATATATATCCGATTTCCGATTGCTAACTTGATCATTGAGTACGGTTAAAAGAGTCTAAGAGCAAGAGAGATATAGGGAGTTGCG:1 + chr3L 3957679 3' + 1731 4409 1 39.86 CACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGTGAAAGCGATGCAAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACACGAAAAGGGTTGATGAAAAACGCAGAAGAATCCGAAAAACTAACTAAC:1 - chr3L 18185408 3' - Cr1a 325 1 67.81 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGAGCAATTGAATATTTTTAATGAGGC:1 - chr2R 23780482 3' + Ivk 5360 1 70.55 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCC:1 + chr3R 15942799 3' + hopper2 1545 1 63.01 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGTTTCC:1 + chr2L 14523293 3' - HMS-Beagle2 10 2 47.59 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAATTAAT:1 - chr3R 11191344 3' + roo 399 1 76.22 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGAAGTCATAGAGCCGGTTT:1 - chr3R 24090461 3' - roo 79 2 72.60 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGA:1 + chr2L 17809244 3' - jockey 90 1 72.60 AAAGATAAAACCAAACCTCTCTCTAATCATTTGAGGTCTGAATAATTCAATTAAAAATTA:1 - chr3L 11913234 3' - BS 5014 1 66.67 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAACAGTTAAGGAAAATAAGTATTTTTTTAGATATTCATTATAT:1 - chr3L 18046548 3' - roo 7 2 79.45 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAG:1 + chr3R 17421332 3' - pogo 32 1 48.63 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTG:1 - chrX 8437660 3' + P-element 2820 1 40.41 TGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAG:1 + chr3R 15790085 3' - flea 4742 1 55.93 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTT:1 - chrX 18396081 3' + roo 346 2 57.53 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAACCACATAAATAATAACCTTTTTATTTTTAAT:1 - chr3L 23451417 3' - jockey 94 1 76.71 AAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAAAGGAAGGGCGAAG:1 - chrX 6156709 3' + Doc2-element 235 2 58.93 GTGGACATATTGCGAAGTACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGGAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGTTAGACGTTATATCAGAATTACCATAGTATGTATTTTT:1 + chr3R 15584035 3' + R1A1-element 23 1 71.23 AAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTGTC:1 - chrX 4808489 3' + mdg3 5460 2 58.90 CATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGTGTGGGTGTATGCGAATACTTTTTAGACTTTTGGCTAAGAGATTTTCGACACTTTGCCATGGT:1 + chr2L 17070844 3' - 17.6 63 1 56.85 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAGGGCAGGGTGCGCCGGTTAGTATGCAGGGCGT:1 + chr3R 5351493 3' - jockey 4719 1 50.00 AGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTTTTGAATATTGTGAAGAATTGGTTTATATATATGCGATGGGCAAAG:2 - chr3R 24231407 3' - I-element 4933 1 68.49 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGGATTTATTACCTTTTTATAATCTAT:1 - chr3L 18046626 3' - roo 43 2 64.42 ATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTTCTACGGTACCACAGCTGTGCAGCATATCTTTCG:1 + chr4 909007 3' - 1360 343 1 57.53 AAAACGTTAATTATTGGAAATATCGCTGAGAGAGAAAAAAAGGCCAGCTAACTTTTTTTTGCTTGAACAAATTGCCAAATTTGCCGAGTGCAAAAACACAAACTTTTGTGATT:1 + chr3L 2609900 3' - FB 483 1 53.10 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTCACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTT:1 - chr2R 15004755 3' + BS 5037 1 57.24 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGGTTTAATGTT:1 + chrX 7795632 3' + roo 9030 1 55.48 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTGCCAAGCCGCAGAA:1 - chr3R 22642247 3' - blood 18 2 70.29 TTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCC:1 + chr3R 11469385 3' + Tabor 404 2 71.23 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGGATTTTT:1 - chr3L 5389848 3' + roo 9026 1 53.42 GAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTACAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACAATCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTCGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCCGCTTTTCCCCCACTTTTCCCCCCTGTT:1 + chr3L 7308763 3' - S-element 1379 1 76.71 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCT:2 + chr2L 4123941 3' + transib2 2752 1 67.12 TTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTC:1 + chr2R 8157254 3' - mdg1 7119 2 73.97 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTC:1 - chr3L 1692009 3' - blood 35 2 55.38 ATATTAATTGGCACCCAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTCTAGAATTTTAAAATATCCCCGCGCCGCCCCCTCTGTAGGCAGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 6461968 3' + springer 396 1 73.97 GCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAACACACGCAACTTTCCAGCAGACCAGAAAACAAAAAGGAAACAACTTTCTGCAGCTCAAAACAGGCGGAAAAGCGATTAGAAAAAATTATTGCATACGT:1 + chr3L 1045843 3' + I-element 55 1 71.23 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAA:1 + chr2R 13259400 3' - mdg1 7082 2 52.74 GGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATT:1 - chr3L 21655851 3' + HMS-Beagle2 283 2 60.27 AAAAAAGAAGAAAAAAAACTTTCTGTGTTTTCTCATTACCGCAAGGGGTTGGAGTGCTTATGCTGGGAGTGGTGCAGGTGGCGCAGTCGCCTACCACAGCAGCAGTGGCCCAAGGGGGTG:1 + chr3R 16208490 3' + HMS-Beagle2 491 1 47.50 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGAT:1 + chr2R 8157306 3' - mdg1 13 2 72.31 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAA:3 - chr2L 6654675 3' - diver 5976 2 76.03 ATAACAACAATAATACTAATAATCTTAATGTTTCAATTAGAGAAAAAGTATGTAAATTGAAGGCGAAGTGGCTTTGGTCTGAAGGCATCATGGAATAATCGAAACTAAATAATTGCTGATTTATTAATATACGAGCAGCTTAATCC:1 - chr3R 20305522 3' + mdg1 7067 2 45.89 CAGTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTAATTTCCATCTAACTGATGTACTTTACTTTTTGTTCTACTTAAGCCCAAAGATATTCCATTCAACTTTTTTGGGTCTCAAATTTCGTGTTGTGTTAACAACAGTTGGCC:1 - chr3L 15322432 3' + Cr1a 4305 1 72.92 AACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAATTGCTACCACTGACTACTTCTGCTTACAATATCAAAGAGTTGACATTCCTATTGTCTCTTTAAAAGTCACAGTTAGTTCACCCGAAGTGTGTAGATTGGGTTACACAATATCATTCT:1 + chr3R 12594142 3' - diver2 4626 2 50.68 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCA:1 + chr2L 19924061 3' + roo 9031 1 49.32 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATA:1 + chr3L 18505725 3' - I-element 71 1 70.50 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTTTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGGTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCA:1 + chr3R 15790117 3' - flea 4719 1 70.08 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCAC:1 - chrX 13134869 3' - jockey 4802 1 55.48 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGGACAGAGGAGCCTTT:1 + chr3R 30347460 3' - P-element 9 2 74.07 ACCATAAAAGATTCAAGACCCTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCGCATTTAGACTGGCCTTCTTACGGGGCATGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTATGTTTGATTTAACACATTTAACAATTTGATGTG:1 + chr3R 27579848 3' + baggins 5075 1 76.71 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAA:1 - chr3L 18046612 3' - roo 8735 2 68.49 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATC:1 - chr3L 12249800 3' - roo 8708 2 57.25 AAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAA:1 + chrX 8092496 3' - pogo 53 1 56.85 CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTCCACATCTCAACCCACTGTGCACTGTAGTCATTGCGTTTTGCCGGACCATTTGACGCCTAAT:1 - chr2L 20840055 3' - mdg1 66 2 68.97 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGCACGCACACCCACAAGAATTTCTCATTTGCGGAG:1 - chr3L 22325833 3' + hobo 2903 1 66.30 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCTGCTCGAAGCGCTTTA:1 + chrX 7795603 3' + roo 9002 2 66.21 TATGATAAAATAAAATAATTTTTAACTGACTATTATCATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCAATTGAATTTCTGCGAGACCAACATA:1 + chr3R 9342378 3' - 1360 3098 1 77.59 AGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATGGTGTATTTTATTTCCCGCTGCGGTGATCTGAATCCCATACATAGGTACAAATATACACATGTACTTTATTTACCTATTGTCATAACACTG:1 - chr4 132010 3' + pogo 1666 1 67.12 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAAACAAGTCG:1 - chr2R 4785203 3' - Juan 4055 1 63.70 CTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGCCAGCAGAATCCGCTGACGCACAGTGGTCACGATTGGGG:1 - chrX 9615789 3' - diver 5994 2 71.43 ATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATATATATTTAAT:1 - chr2L 16539597 3' + Juan 4208 1 80.82 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGAAGAGCATTTCC:1 - chr2R 4362788 3' - F-element 66 1 55.71 TAATAATAAAATAAAAAAAATATAGTGAAAACAAAATAAACCAACAGCAAAAATAAATATTAAAATTTGTGCAATAAAATGCCGGGCAATAAAACTAAAATAAGTGCGAGAAAACCCAAAATATACAAAAAATAAATGGAAAGCAG:1 - chr3R 20106428 3' + Rt1a 5074 3 82.19 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATACATGCAAATTTGGTAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATATGCTATGACAATGACG:1 + chr3R 24090579 3' + roo 392 2 62.86 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCA:1 - chr2L 22674742 3' - mdg1 23 2 73.97 TTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGCTTTTTTCATTTGAATGCCCCTCAGATTTATTCAATTCATCTTTCTTCATTATTGCCAATTGCTTGTTAATGGCTGG:1 - chr2L 12791625 3' + hopper 200 1 49.32 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACA:1 + chr2R 23780619 3' - Ivk 55 1 52.74 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAGTAAAACTCGGGGTTGGGGATGCACGTG:1 + chr2R 18515018 3' + P-element 2884 2 79.55 CTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAATACTGCGACACATCCAACAGATACCAACTATGTACTAACTACTAAGCCAGCTGACCAGCAAGGAA:1 + chr2L 13744291 3' + 412 7348 2 56.25 AGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGATTTTCGC:1 + chr2L 7098198 3' + G6 1964 1 55.48 TGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTTGTTATGATTGTTCCCATTATCGGTCATCTTGGAACTGTGTATACGGC:1 + chrX 19303923 3' - gypsy7 325 1 57.52 TTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAGTTTATTGT:1 - chrX 9530303 3' + 297 340 2 58.22 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCG:1 + chr3R 15364012 3' + flea 4949 1 64.14 AAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATA:1 - chr3R 11040080 3' - Bari1 88 1 72.60 GTGGCGCAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGAAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACTCGCTATTAAACACCGTCATTTACAGAGCCCTTCTGACTGGGTGT:1 - chr3R 3874281 3' + rover 366 1 63.57 ATAATAACAATAATAATAATAATACGCACTTCCACTGAGAGTTATGTGGCACATAAGCATTCCTTCCGGCCGATCCATTCCAATTAGAGTTTGTTCGCGTTACGCATCGATGGGCGGTTCGATTTAAACATTGTCCCGG:1 + chr3R 28663909 3' + mdg1 29 2 78.42 AAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACTACCTCTTTCGCAGACAGACATAGATCAGACCAACATTTGTACGACAAACAATGGGTGGAAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAATCACTTCTTGGCTAAAAA:1 + chr2R 12265493 3' + F-element 4443 1 79.10 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGTTTGGTTTTAAAGCTCTTTATTATATATA:1 + chr2R 5479981 3' - F-element 86 1 65.07 CTTAATAAACCAAACCTCTCACTCGGCTTGGTTAGAGCCGGAGGTTCTTAATTCCGAAGGACAATATAAGTAACAACTGAAAAAAACACTCGATGTATCCAATT:1 - chr2R 1879417 3' - BS4 647 1 75.96 CTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACAGATCTCTGTGGAAACGCATCTACTTTTGCCTATGAATAA:1 - chrX 15366174 3' - R1A1-element 5184 1 76.09 ATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTATGTTCTCTTTCATATCGCTGTCGTTTCGACGGTAGCGTGTCTGCAACACTTTTGCCAGACTTTTGAGTCTTTGGGGCTCTATCGAGGAAGTTATAT:1 - chr2L 2184478 3' + Cr1a 4317 1 61.65 CTTCGCGTCGAACAAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACCGATCGACTGACTGATAATGCCCACTCGATCCCATTTGATTCGATTTGATTCGATGGGATG:1 + chr2R 13866406 3' - Dm88 466 1 54.78 AAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATAACACTTTTATATTTAAATTAGAATATTTTTAAAGGAAATTAATTATAAAATAGTTTTTTCTATAATTTTAATTGTTTTTAATGAAATTGGCTACAGTTTTGC:1 + chr3L 22464949 3' - HMS-Beagle2 6823 1 71.23 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAGGCTGGGCACCAACACATGCGCACACACGGACACGCACACAAAGAAATGCAATTATGACAATCAAAGTGGACAA:1 + chrX 19038486 3' - hopper 44 1 55.48 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTTAACCGCTCTCAATATGGGGTTCAATTTCGGCTGCAGAC:1 - chrX 21216692 3' + roo 9036 1 58.22 TATTTCTTTTCTAATCGAACCGTCGTAAAGTCAATTCGTGAACATTTTTCCTCCGAATTCAACTGTTTTTTAGAAAATTATACCAGTTTTTCACTTAGTGAAATGCAATGCCAACACACAAACGCATAAATAAATATCGAAGCCAT:2 + chr3L 17997122 3' + Gypsy12A_LTR 257 1 50.00 CATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTTATCCAAGTACATGCATTTTGCATTAATCAAATTGAATGCAAAAAGTTGATT:1 - chrX 20455234 3' - hobo 2546 1 64.38 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATTTTGAATAAAAACTTAAGCGTTTCTAAAACGTTTTTATGGA:1 + chr3L 2990072 3' - roo 8690 2 64.38 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCATATC:1 - chr3L 13365734 3' - BS 5042 1 48.63 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTTAAGCCA:1 - chr3R 23639105 3' - pogo 25 1 67.12 TCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGACCGCCACCACCACCACCAGTTAATCCTGCAGACACTCGGATAG:1 + chr2R 8297193 3' - Burdock 6231 2 69.86 AAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGG:1 - chr3L 24934315 3' - HMS-Beagle2 79 2 73.97 GAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGAATTAGTATTCGTATCGTATTAGTATCGATATCCCAGAATGACTAATTGCTGCTTGTTAACAGGCCCAACCAAAAAGGGGTAATT:2 + chrX 15558279 3' + Tc3 313 1 68.49 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATG:1 - chrX 6475323 3' - Doc 76 1 73.85 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTGCGGTTGCTCTTCTGCCGC:1 + chr2L 12822874 3' + P-element 2862 1 53.70 AAAAAAAAAAAGTAAAAAAACTTCGGAAAAAATAAAAGGCCGTTCCCCGAGGAGGGTGGGAATTTGGGGCCGGAGAATTTCGCGGGCTTTTTAACAAGTCGCTCAGGCAGAAGACA:1 - chrX 7474223 3' + HMS-Beagle2 489 1 81.90 AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAG:1 + chrX 21224634 3' + roo 405 1 68.67 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACTTATATACAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTTTTCATTTTACAATAAT:1 - chr2R 15375349 3' - 1360 27 1 54.29 ATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAAT:1 - chr2R 8099169 3' - jockey 4850 1 79.45 GCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATATAAATTCTAGAGACATAGACTCCGCTGGGCAAGTGCCTTGTCGGACCGACCCACGCCGCCTGCTCCGCTACCTGATGCCTCCTGGGCCAGTTACCTGCAATTCCTCGCCCGTACGAGCTCAG:1 + chr2L 3465798 3' + INE-1 169 1 63.70 CTTATACCATTGACGTCAGATAGAAAGATAGGTGGGGGCTTAGCAAAATCAGTTGCACTGTCTTCATTTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTAGTTCCGGCGATATGGTCGGTGCTGTTGGCGCTGC:1 + chr2R 8521516 3' - G4 180 1 76.03 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTTTTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTT:1 + chrX 22840548 3' + copia 5064 2 68.33 TTTTTTCTTTTTCCATTTTTTCTCGTTGCAAGTTTTTACCTTTTTGGTTACGAGAGTTGCACATTTTATCTGTGCTTCCTTGTGATTCCATCTTTAGTCTGGGCAGTTTTTCTTGTC:1 - chr2L 16420742 3' - Doc2-element 235 1 83.76 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTT:3 - chr2R 3338782 3' - Juan 58 1 56.16 TATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAAATGTATATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGG:1 + chrY 2720347 3' - ZAM 190 2 73.17 TTAATTGAAATAATTATTAAAAATAATACAAGCTTTAAATTTTAAACTGAAACCATTCATTAGTTACTTTCAGTAATCCTGTTCTCTGCATTCGACGGAAGCTTTA:1 + chr3L 10539069 3' + invader2 434 1 62.26 CGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTAT:1 + chr3R 10736105 3' - McClintock 66 2 77.17 TATAAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTC:1 - chrX 19038368 3' + hopper 1354 1 59.59 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATA:1 - chr2R 16817873 3' + 412 441 2 53.96 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTAC:1 - chr3L 17055388 3' - Tirant 14 2 75.00 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACG:2 + chr3R 5351456 3' - jockey 4756 1 75.34 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGGGCAATTGAATATTTTTAATGAGGCT:1 - chr2R 23780481 3' + Ivk 5362 1 70.34 AAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTT:2 - chr4 1294996 3' + HeT-A 6011 1 69.86 GTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGGGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGACCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACCTGTACAATCTTTAGACTTCTTGCCTTCATTGATTTCGTTATGA:1 + chr2L 10393238 3' - 1360 3242 1 70.55 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGGGCGGGGGTGTGCTGCATATAAATTCAATAGAGCAAACA:1 - chr2L 2529616 3' + hopper 1405 2 47.45 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAACAGTGT:1 - chr2L 3233957 3' - roo 8728 2 61.64 GTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTAT:3 + chr2R 13259373 3' - mdg1 7109 2 64.38 TTTTTTTTTTCTTTTTATTCGTTTTCCCTTCGCGCACAGAAAGTAAGCAAACAGTTCTGCGACGAAAGAATGATAAAACAGATGAAGTGATTGTTAAAAAGACAATTGACGGCTT:1 - chrX 22646235 3' - gypsy7 5005 2 53.91 TTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCATCGAC:1 - chr2L 21400697 3' - Doc3-element 64 1 45.21 ATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGGGCATACAGATAATGGAAATTCGATTCAAATTATATGAAGTGGATGCGTATCCATACTTA:1 + chr3R 5668516 3' - 1360 199 1 58.90 GTCAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCGACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAAGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTC:1 + chr3L 23906449 3' - 1360 88 1 76.03 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTCTATA:3 + chrX 12129453 3' + flea 4999 2 74.66 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGT:1 - chr2R 17926312 3' + opus 427 2 73.29 CTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGTGGAGGTGAAGTTGGTTGGTGGTGGTCGCTACCCGGTTGACTGGCAGGTATTT:1 - chr2R 13323408 3' + R1A1-element 4931 1 59.83 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAACAATAATAATAAGAATAATCAGATAAAATCAAACTTGTATCTGTTTTATTTTTTTTT:1 + chr3L 12834725 3' + mdg1 39 8 69.63 GCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGCACACTCACAGAGAGGACAATATAAACTCAATGAATACTGTAACAACATCCTTTATAATGTTTCACGTACACTGA:2 - chr2L 2792956 3' - G-element 4241 1 54.11 AATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCATTCCGCAATCCGAGTTAGCCGTTGTGTGTATGTTTCTGGTTTTATTGTTATTGGGCTCGTGTATTGTATTGTATGTTCAT:1 + chr3R 5098130 3' + FB 26 1 60.00 ATATGCTTCACATATTACGCTTACACAAGCATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACACACCGCATTGTATTGAGCATGACATATTTGTCGATTTGCAAATTTATGTCGGGCTG:1 + chr2L 20243837 3' + rover 10 2 53.33 AATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTT:1 + chr3L 19350001 3' - 1360 3268 1 64.83 CCATAAATACTTCCAGTATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGGTTCAGGTTCCTAATAGATTTTGAGATTGCCAAGTAAGAAAATAAATATTTTTATTTTAATTTGCATTTTTAAAATATTTATGTAAATATTGTATTGTTCCATATT:1 - chr3L 5878129 3' - Transib5 2950 1 56.85 GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACCTTAAGTTTTATAGTTCCC:1 + chr2R 9158176 3' - mdg3 5283 2 65.07 TTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACACGGCGGTATGGCGACCCCGGCATTT:1 - chrX 7575965 3' - Ivk 5228 1 76.99 TAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATTATTATAATAAACATTTGGCTGGCTATATAAATTCAACCATCGGAATTTTTAGAGTGCAATTTTTGCTTTGTCTGATGTTAGCGACGGTTTGAAAATACATTTTTT:1 - chrX 21164178 3' + mdg1 7065 8 64.38 ACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGTTACTTTCACATCCAGGCCACCAAGCCGGATACAATTGG:1 - chr2R 18860840 3' - G2 3018 1 73.10 ATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGAGTATAGCTAGGGTGAAAATGTGCAGCTTAATGTGGCGTAAAATTAAGTTTCAAATGGATCGGTTTATTTTCCAAA:1 - chr2R 21923788 3' - opus 7451 2 51.03 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGAACTGTATTT:1 - chrX 18009914 3' + 412 452 2 44.83 GTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATACATGAACAAATACCCTGCATTAAAAGTCATGTTATTGAAAATGTAGGTATACAAATCAACACTGACTCTAATTCCAGTCTAAAAATTTACTCTATTTACTTTGCTG:1 - chr3R 28156654 3' - Juan 342 1 77.24 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAAT:1 + chr2R 13259402 3' - mdg1 7080 2 54.11 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATTTTGTTATTCTAGTATCTTTGCTCAACCCTTCCACACGACCCCACCAGGGACTCCTAAATTTCAATTAGGAAGG:1 - chr3L 23089267 3' + 1360 3317 1 95.89 TTTCAACATTATTATTTTTTGTAACACAAAAGGAAATACACGCAGATAGACAGCGAAAAAACAAACAAATGAAACAATTAAAATTAAATGCACCCTTGGGAGTCGCAAAATGCCTTTTAAATCTAAAACGAATTTCATTCTTGCG:1 + chrX 8198794 3' - P-element 2500 1 74.48 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAA:1 - chrX 7795484 3' - roo 33 2 65.07 TGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAG:1 + chr3L 21656005 3' - HMS-Beagle2 12 2 71.07 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAA:1 - chr3R 25616498 3' + roo 9019 2 54.11 AATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAAATAATATTAG:1 + chr3R 556481 3' - Juan 4153 1 57.53 ACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTATACACATATACTGATCTTTTGGCACTTAATTGATTATAATCCATCAATAACGAGGGTAATTAAGAGCTATAATGCAACTTCCATTGAATTT:1 - chr3R 25148710 3' + rover 106 2 50.68 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGAA:1 - chrX 18009922 3' + 412 443 2 50.68 AGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACCCTTTC:4 - chr2L 22121310 3' + I-element 5334 1 52.05 ATCTTGTTAGTCTAGTGTCTTTGGCTTTACCATCTGGATGATTTGTACCAAGTACAAGCAAGTATCCTGGCATATGAAAATTGTATTTATTTGTGAGGTTCGTTTCATTATTCGCTTGTTAATACATAGAATGTAAAGTTATATAG:1 + chrX 6121152 3' - 1360 2 2 71.23 ATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTAC:1 - chrY 680448 3' - invader2 41 2 71.23 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATTACGCGGACAACCGTCCACAG:1 - chrX 19266791 3' + roo 398 1 69.18 AAAGTAAAGTAAAGTAAAGTGATGGGATGTGTTTGCTAATGGGGGTGAGTGAGTGTGTATCGCATATAAAGTATATAGGTGTTTAGTACATATACAAGAGAGTTACATATGCAATATCTGTTTGTTTTTCTGGTCTTTCTACGACT:1 - chr2L 2459269 3' + TART-A 13112 10 78.77 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGTTTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGGGATAATTCA:1 - chr2L 3675824 3' - Juan 4032 1 65.79 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCAT:1 - chr2R 17926300 3' + opus 439 2 65.07 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCCTG:2 + chr3L 5061680 3' - 17.6 6953 1 66.44 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGG:1 - chr2L 17205189 3' - hopper 75 1 67.12 TTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATC:1 - chr3R 19224983 3' - HMS-Beagle 53 2 54.79 TCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGTGATTTAATATTTCTTTAATGGCTTCAATATTTCATTT:1 - chr3L 27865947 3' - Max-element 9 2 71.23 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGAGTTTGATAAGCGTGTCTGCATCGAT:1 + chr3R 9003022 3' - roo 8706 2 52.55 GAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCCTTTACTGGTATTT:1 + chr3L 3501876 3' + Bari1 1705 1 77.40 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAA:1 - chr2R 20227207 3' + hopper2 1558 1 52.05 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGGTAC:1 + chr2R 2427630 3' - Doc 52 1 54.11 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGA:2 + chrX 8360601 3' + roo 320 2 78.77 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAATCAGGGACTCTAGCTGAACCCCG:1 + chr3R 18488519 3' + roo 404 1 77.46 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCACTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCAC:1 + chr2L 4063911 3' - roo 8750 2 76.03 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGGCATTTCGTTATAGCGCTGAATTTGGAGAATAGCGATATTGTTTTCAGTTTTTATGG:1 + chr2R 10411479 3' - 297 31 2 58.22 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATT:1 - chr3L 18281844 3' - Doc 25 1 64.71 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATT:1 - chr3R 19450079 3' - roo 5 2 58.90 AATGAACATTTTAGTAGATTTTATTTGTATTACTGTTAGATAAGCCATATACCCCAGAAAAACTCACACACAGACACACACAGATACACACACAGATACACCGAGAGTTTGACAGGAATTGGGCAGCAGCCGCAGTTGCAGTTGCG:1 + chr2L 7905479 3' - Burdock 6390 2 65.75 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAAT:1 + chr3L 8685227 3' + I-element 5277 1 68.49 AGGTCCTTTCGCCGGAGACTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAGAGCTTGCTATGGGTTAAAGGGTTCAGCTCGTTTTTATGGCCACGTCTATTGCCTTGTCGCGGTTATTTTGGCGGCG:1 + chr3L 14607443 3' - F-element 4515 1 56.41 ACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTATTTGATTAAAACATCTCAAAAGTGACAATGAATGTGTAAAATCATAG:1 + chr3L 18252929 3' + Juan 310 1 77.40 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGAAATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGT:1 - chr3R 9002926 3' + roo 332 2 66.44 GCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGACG:1 - chr3L 18930986 3' + I-element 5298 1 67.74 ATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAAATTCTAATAAGTCATTCCAGGCCCTTCTCTCTCATCGAGTATATTTATTTAAAATTTGTTGCATTTACTTCCCTCAAAAGATTTTCCACTTTTTCCAGTTC:1 - chr3L 18280129 3' + Doc 170 1 70.34 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTT:2 + chr2L 20266021 3' - roo 8743 2 73.97 TTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 4915 1 51.75 GTTTATATTTATTTCTGGTATGCAGAACTAAACATTGGTGTGTTATGAATGCATGCATTTAATATTATCTTAATCGGCCGTAGGCAACCACTCAACACTCCCAATGCGAGCATGTAAATGAGACGTTCGGATTGAAGGAGATCGCT:1 + chr3L 21767420 3' + Transib-N1_DM 383 1 53.42 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGCTTTCATACAGTGTT:1 + chr2R 9967118 3' + Bari1 1657 1 61.98 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAA:1 + chr2L 4003765 3' + mdg1 7378 2 71.92 TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTG:1 + chr3R 11469404 3' + Tabor 430 2 56.12 ACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAATAGCCGGGTTAATTTATTATGTTTATTTATACCCTGGTCGACG:1 - chr2L 20118481 3' + F-element 459 1 70.55 AAAATATATATATATTAAGAAATGATTTTATATGCTTAAAGTTAGTACTGAATAAATAGGCATTTATATCTTCATCCTAAAAAAATGTTTAAAACAATTAATTAACTTACCGAGATTAATTTTAGAGTCATTGACAACTAAGC:1 + chr3R 18009718 3' - gypsy7 5060 2 67.83 CACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACAAATGTAACTAATTTTGGTAAAAGTATAAAAATGAAAATAACAGCATTACAAAGATT:3 - chr3L 18797157 3' - 17.6 54 1 60.96 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCTGCATATGGAATTC:1 - chr3R 8051104 3' - jockey 4802 1 56.16 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATTGTATTTTATTTGTATTCCTC:1 + chr2L 15940339 3' + pogo 2057 1 55.48 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACAT:2 - chr3R 15072548 3' - pogo 50 1 54.79 GATCAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGGAAGGGATTTACTTTAAATCATTTTATACGATAGCTTTTAAACGTTTTAGCTTACTACTTTTTTTTTATAAAAATTAGGCACACACGTAAATTGCGAGGAGCCAACCGCAAATAATACCG:1 + chr2R 21573009 3' + R2-element 3582 2 71.92 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCG:1 - chrX 2214258 3' - jockey 4827 1 63.01 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGGATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGTGTTCT:1 - chr2R 11794962 3' + opus 7471 2 63.06 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCT:1 + chr3R 6419922 3' - Tabor 46 2 61.82 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTAGAAGGCATCACTCGTTAATTTGCACGTTCTCACAACTCGTATTTATTTCTCGCAATCCACCCGTTTGCATAACTCTATTCAGACTTCACTG:1 - chrX 21639610 3' + gypsy5 7305 2 44.85 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGCCA:1 + chr2R 22034727 3' - copia 84 2 72.60 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGGAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAA:1 - chr3R 11191349 3' + roo 9054 2 69.86 TTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCC:1 - chr3R 17996158 3' - diver 35 2 54.69 ACGCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACAGAAAAGTCGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGTCGACACTTCCAAGTGTCTCCTTGGCGTTCCTTTATTCGCCCTTAACC:1 + chr2L 4012857 3' + invader2 455 1 65.75 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCG:1 + chr3R 16519011 3' + Tirant 8470 2 58.22 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAAT:3 + chr3R 15790094 3' - flea 4761 1 58.22 AATTATAAATTTCGGTTCGCCTAATTGGGTTTGGTATGCTTTATGGGGGTAGGGCTTCCTCGAACTGGATTTCTCCTGATGACCCAGTCCACATGGACTTGTATC:1 + chr3R 8777600 3' - I-element 243 1 50.48 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAG:1 + chr2R 22514193 3' + P-element 2820 1 38.36 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAA:1 - chr2L 17180045 3' + Juan 4182 1 62.33 GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAACTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTT:1 - chr3R 10270568 3' - Juan 4084 1 52.05 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACCTCTCAACATGCAAGTCA:1 + chr3R 23067558 3' + roo 9039 1 64.38 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCG:1 - chr3R 9298461 3' - hopper 45 1 53.38 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATAAAAAATCAAGAACTATGCCA:1 - chr2R 3564003 3' - Tabor 22 2 70.55 ATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTATTCGGCGGCTGCGATTGGTAGCCCCA:1 - chr3L 20189572 3' + FB 241 1 39.42 ATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATATGTATATATATGTAT:1 + chr3L 16731387 3' - rover 3 2 80.14 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATTATGTAAGTAAGGCTAACAAATTT:1 + chr3R 4683033 3' + Burdock 6375 2 74.66 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTTGTCAGCACAGCAAACGAG:1 + chr3L 17183786 3' + diver 6073 2 58.22 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGAGGCCATTGCTATTTTTTTTT:1 + chr3R 19992777 3' + hopper 1399 1 75.00 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAAGCAGTGA:1 + chr2L 16539801 3' - Juan 4030 1 78.47 TAAATGTATGAAGGTTTTTAAATTTCATCTGATTGCGCTGCAGATTTACGAGGATGGGGATGTGGTGCGTCTGACTTTTATTTGTG:1 + chr3R 16518779 3' - Tirant 8457 2 74.42 AAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAAAGGGGTCGGTATTAGAAATGAAAAACATAAATAGAGTGG:1 - chr3R 20962354 3' + BS 4926 1 72.41 AGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATAATGAGTACCGAAACGTCGGCGAGCGAGACAACACCGCTGCGGCGGCCGGAAAACGAAACACCCGACCATA:1 - chr2R 9409420 3' + I-element 192 1 50.35 TATAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACGGACAGACGGACAGATGGACATGGCTAG:1 - chr3R 8005046 3' - INE-1 144 1 89.47 ATACACATTTATATGTACATACATATATGCTCCACTCGAAATGGTTTCGCTTTTAATCAACCCAACAACTGAGCTAATTCGCGCCTGTCACTGCTGATCTTGGCACTATGTAGTTACCTCCCATCGATCTCTGTTTGTTCCGTTTC:1 + chrX 12507290 3' + Stalker2 252 2 71.92 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGG:1 - chr3L 6518580 3' - 412 86 2 76.03 CCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAAGGGAAGTGAGAGGAGTCCGGAGGAGGTGGTGCTGTTCGTGGAGTGGTAGCAGATTCTGAAAAGTAGGAGGTGAACGAGGAGG:1 - chr2R 15907699 3' - 297 6540 2 72.13 AAACTAAAAAAAAAAACAAAAAATACGCGTCATTTCACATTATATCGCTGATAGAGTAATGCATTTTCCCAGCCATTAACAAGCAATTGGCAATAATGAAGAAAGATGAATTGAATAAATCTGAGGGGCATTCAAATGAAAAAA:1 + chr2L 12795301 3' + Doc 4699 4 63.19 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCG:1 - chr2L 11298031 3' + I-element 5307 1 56.25 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGATAAAGCCTTGGCTTTCGGTATCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGG:1 - chrX 12066117 3' - transib2 22 1 49.00 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAATCGGGAGTGGT:1 + chr2R 19941647 3' - hopper 41 1 55.07 TATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACA:1 - chr3R 9038910 3' - Juan 4053 1 52.74 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTTTGTA:1 - chrX 14304030 3' - roo 8701 2 51.39 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGACAAAAAGAGGCCACAGCCTAAACCTAAACATATCTATA:1 + chr2R 16126311 3' + transib2 2743 1 73.97 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATAT:1 - chr3R 27405947 3' - diver 5931 2 55.48 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCCAAATTTTAAATGTGCAACTTTTGGGTAAGAAGTTT:1 + chr2L 16943945 3' + copia 242 1 74.66 ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGG:1 - chr3L 27865986 3' - Max-element 8265 2 50.78 CTTGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAGAGGAAAAGCTGGAAAAGTAGATTAAGTTTAATTTTGAT:1 - chr3R 23637155 3' + pogo 269 1 78.08 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAA:1 - chr2R 15326827 3' + copia 248 1 54.29 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGC:1 + chr3R 15942790 3' + hopper2 1560 1 63.11 AGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTT:1 - chr3L 21655912 3' + HMS-Beagle2 7105 2 79.45 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATATATTATATATATATATTATTATATATTATATATATACATATTAATTAGGGTATTATTGATTACTGTGGG:1 - chr3L 21969813 3' + opus 7457 2 71.72 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGA:1 - chr3R 15790862 3' - roo 8737 2 71.94 GATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGAAAAGTTCTCATTCTCGGCTGGCACTCAATCTTCTGGTCATTCTTCGCGGAAACATTAAGGGCGAAATGCTCAATTAGAATTG:1 + chr3R 7006514 3' - Doc 4411 1 62.32 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGTGCCTTCTCCCTTCGCGCGCG:1 - chrX 6513409 3' + hobo 2885 1 80.41 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAATAAAAGAAACGCTCCTACTAATAACA:1 + chr3L 6447097 3' + transib2 2767 1 73.04 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAGCCTTTACAGCTATCTTTTTGCTAG:1 + chrX 9410604 3' + I-element 5326 1 62.76 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGGTCA:1 - chr2R 20802567 3' - mdg3 5313 2 57.53 TTCACACTAGCTGAGTAACGGGTTCCTGATAGTCGGGGAATTCGGCTATAGCATTCTGTCTTGTTTTCTTTGTATATTGGAAGTTATAGAAAATCCAGTTTTTTGTCACTCGTCCAATTCATATTTCTTGTGTCTATAAT:1 - chr4 498382 3' + INE-1 537 1 57.14 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACG:1 + chr3R 31653164 3' + roo 9009 2 62.33 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCCTGTGAGACAGCCAAAG:1 + chr2L 4713966 3' - transib2 55 1 59.59 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAA:1 - chr3R 23295547 3' - P-element 55 1 30.51 CATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAGCATATTTAATATTTACCCGGAGCGAAGGGGATTTGATTAAAGCATTTTTGCATGCGCCCACCTTTGTGCATTAATTTTTAATTTTCATTACACAGAATGTTGCGTATC:2 - chr3R 27422725 3' + F-element 4410 1 78.77 AGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTTTTGTCTGTCTGCTTTTAATCTCGCAATGTTTGTTTAATTTTTAAATT:1 - chrX 316797 3' - Doc 4485 1 62.11 GGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAA:1 - chr3R 28146131 3' + roo 8989 2 74.66 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTACATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGC:1 + chr2R 4745228 3' + pogo 2041 1 58.90 TTTCCTGAATCTTGTCTCCAATTTGTGTCACATTCAGATCGCGTTCGATATCTCTGATCCTCATGTACCACGGAGAGCCTGTAATCTTCCTCAGAGTTTTTGCCTGATACCCCAAACACTCCGACGGGCATTCTAGTCAGCAGCTC:1 - chr3R 18518463 3' - jockey2 3051 1 73.29 TATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTT:1 + chr3R 27133650 3' + opus 7426 2 80.82 TATACATATATTCATATTTTTATATGGCTGTGCAGTGGAAACTTT:1 + chr2R 22063216 3' - G3 4502 1 88.89 CTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGCTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGTACTGTGCCACAGACA:1 + chrX 19980708 3' - X-element 4528 1 45.89 AAGAAAACATGACCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTTAGTTTATTATATCAAAGACATCACAATAAGTTCAAACAATTAAGATTGAATTCTAATTTCTTTGTTTGCACTTTATATTC:1 - chr2L 21642813 3' + Q-element 360 2 72.03 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAA:2 - chr3R 24369004 3' + roo 9032 1 52.05 GATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAACCGACGACAGCTGTCAGGTGTCACCGGACTGGTTGAGCTATCCAGTCAGTATCACTTGCTCGCTCAGTCGGTTC:1 - chrX 18437289 3' + Stalker4 6998 4 50.68 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGA:2 - chr2L 18549857 3' - roo 91 2 83.56 TAAAAACAATATTTATAATATATTATAGGTTTGCATGCGTCGGCTTAGGCGTTTTG:1 + chrX 2136095 3' - Gypsy12A_LTR 1808 1 92.86 GGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTATTCCGACATTAAAGATGTCGTATGGGACAATGGAC:1 + chr2L 21403605 3' - G5 4395 1 72.60 TTTTAACAATATTGGTATTTCGTGAGAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCC:1 - chrX 22901649 3' - 297 220 2 70.34 AAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTAAAACTAAATAATCGCAGCTACAAGCGAACAAATATATAACATAAATATTTACCTAAA:1 - chr2L 15823279 3' + Doc 253 1 62.76 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACA:1 + chr3L 11844856 3' - rover 6973 2 67.12 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGTATGCATATT:1 + chr2L 18549963 3' + roo 9045 1 71.23 ATACCAGCTTAAGGAAGACAGAGCATTTAGAGTTGTTATTAAGAATTTGCATAGAGGAGCAAAATGCACGTTGGTTCAGGCAGCATGGAAAAATTTAGCAGCTCGATTCAATTTGCTTTAAAGTATTGTGCATTAAATCTAAACGA:1 + chr3L 1403232 3' + G4 355 1 67.12 TCTTTCTTTTTTTGTAGCCTTTTGGATGCTTCTAGCGGATGTAAGTGGAAACTCTCGGTGCGTGTAAAATGCCTTTTCGGTATGTTGATGTGTTTTTGTTGTGCTGAGTGTGTGTGTGTGGGTTGTGTGCGTATTACAAGAGCAAG:1 - chrX 12094444 3' - G2 3069 1 65.75 AGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCAACCCTGGCCGATAAGAACCTAAGCTCCACCCGCTTATCGCGATCATCATCGGTCCGGGAAAAGGGCAAATAGATGGCACAAACGCTGATAACGA:1 - chr3R 7944905 3' + blood 99 2 70.42 CTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACCCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTC:1 - chr2R 23780533 3' + Ivk 5309 1 64.38 AATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGGATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGATCTTCTAAGGCGAAGGGCATATTTTGTTTAATTTAAAACCATAATAAAATTGCAATTTGCTAAAT:1 + chr3L 16382858 3' - 1360 299 1 75.34 TTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTT:1 + chr3L 17183742 3' + diver 143 2 73.61 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATCTTCATCGCACG:1 + chrX 13490772 3' + 297 6938 2 60.27 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTT:1 - chr2L 18226786 3' + roo 8998 2 69.86 TATACTGTTGTGGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCGCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCACTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAA:1 - chrX 6475325 3' - Doc 63 1 69.57 AGCGTAAGAAATCTAAAAGTAGAATTTGGCTCTAGAGGGGGCTATACAGTGATAGCAGACAACTTGATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGAC:1 - chr2R 4745228 3' - 1360 3277 1 73.08 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATC:2 - chr3R 907902 3' - gypsy11 365 2 30.14 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTTTGTTTTCACTAGAGTTAAGGAATGTAATCGCATTTAACCAAACACAA:1 + chr2L 4003647 3' - mdg1 7075 2 45.39 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCCACTTTTTTTTT:1 - chr3L 13836604 3' + 412 461 2 55.28 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGGTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTTATAAAACCAAACTATTAAGCCA:1 + chr2L 16946159 3' + hopper 1410 2 72.88 AATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCA:1 + chr3R 14860254 3' - BS 5026 1 63.45 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTGAAACTAGCGTAAATTTAAAAA:1 - chr2L 14074406 3' + 297 6954 2 71.92 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGT:1 - chr3R 6419818 3' + Tabor 7287 2 58.22 AAATTTCATAATTTTTCTGGGATAATGATAGATATTGGGGAAATTCACAATTATGAAACAATATCAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGCGGTCGTGGCAA:1 + chr3L 26710193 3' - INE-1 511 1 73.88 CTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATACAGTCATCCATCACAAGCACCAACACACCCATCAGCACAAAAGATCATCCATCATTAACATGCTTGCAGCTAATCCGCAACTCAAGCACTTTTCAAATACTAACTCAAA:1 + chr3R 7181281 3' + Tc1 1635 1 77.24 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAGTCTTAAAGTCTTGCAAAACTTTCGAACGTAGTCTATGATCTAGTAATAGAAAAACTGGGTAATATGTTTCTTATTATTGTCTATGTTTCT:1 + chr3R 7666755 3' + I-element 5334 1 68.61 ATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGGTCATAATCATCATTATCGTTCGAGACCAGCGACCCGAGAGCATTCTTGAGCAAAACGCCCGCAC:2 + chr3L 10976984 3' - Porto1 275 1 59.59 AACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGAAAGAAAATGTAGATTCATACAAAATAATATAATAATATATAGCGATTTT:2 - chr2L 13844104 3' + Stalker2 7644 2 77.40 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCATTTTT:1 - chr3L 2989888 3' + roo 395 1 75.34 ATGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAA:1 + chr2L 6647708 3' - mdg3 85 2 71.23 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAAGATAGTTAAAATACCCTTGAG:1 + chr3R 24219405 3' + roo 9047 1 67.12 AAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGC:1 + chr3L 24368823 3' + invader2 5053 2 64.38 CATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGAT:1 - chr2L 23008371 3' - transib2 273 1 65.52 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTT:3 - chr2L 15936751 3' + copia 242 1 53.42 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAA:1 + chr2R 11164501 3' - roo 8729 2 66.44 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAA:4 + chr3L 26290963 3' + Tabor 7246 2 68.49 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAG:1 + chr2R 16929828 3' + jockey 4931 1 61.38 GGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAATGGGTTAAATCTTTGG:1 + chr2L 1924057 3' - G2 2979 1 73.97 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATATGA:1 + chr2L 13158721 3' - roo 80 2 73.29 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACGAGCAAATAAAATAAAAT:1 - chr3R 30347264 3' - P-element 14 1 78.08 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACT:1 - chr2L 18549861 3' - roo 80 2 84.73 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTACGCAACAATACGATTTTGTTGAGAATTAAA:1 + chrX 10319757 3' + mdg1 410 2 77.40 CTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAAAAATGGTATCCTTGAAGGCAGAGCTCTCAAGGCTCCTTTCGTCGTCGGCCACTTAAAAAATCATAATCATAACCAATTATGATTACGCCATGCAAC:1 + chrX 2839451 3' + R2-element 3381 1 67.61 AAAACTCAACGAGGAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGAAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCA:1 + chr2L 47213 3' + roo 390 2 66.40 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTGCCAAGCCGCAGAATGCATTCTGCTGTTAAA:1 - chr3R 22642230 3' - blood 7020 2 78.08 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATTAATAATAATAATTATTATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATAAAAATAATAAATTACAAGTGTATATCCATTGAAATATCCTATAAGTAA:1 + chr3L 16013354 3' + mdg1 39 8 55.48 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAG:1 - chr2R 5151225 3' + roo 9009 2 60.69 ACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGG:1 - chr3L 22723829 3' + HMS-Beagle2 274 2 59.54 TATATTGTATATATTGTATATAGCTCGATTTGGTCACCAACCCCGAGTTGTTCTGTTTGCTTATACATATTACCTGTTGAATTTGCCCACCTGTCACATCAAATTAAATGGGAGCGAGAATT:1 + chr2R 16778038 3' - Stalker2 7515 2 80.33 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGCTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAAACCATGCATAATGCCCCCAATG:1 - chr3R 24450372 3' - 412 13 2 72.60 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAAC:1 + chr2L 17005799 3' - Stalker2 66 2 62.07 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGG:1 + chr3R 20441340 3' - I-element 44 1 54.11 GAATATACAGGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGTTAAACTCACAAACTCAAATACACACACACACACACACTAAAACGCACAGAAGAAATTCTCTGAAGTAACAAACGATATGTTATATAAATAAAT:1 - chr2L 2790349 3' + Porto1 4240 1 65.07 ACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTTCGTTTT:1 - chr3R 9557479 3' - G2 2992 1 72.60 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATA:1 - chr3R 14980300 3' + roo 355 2 54.79 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAACTAATAAAACGAGAATTTTATGAAAGTATTAAACTTAAAGC:1 + chr2R 8417076 3' + I-element 5277 1 72.41 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGGACAATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTGTATAATGACAGAATTATACAAAAAATGTATGTTGAATTACGATGTTTTTGGATTTATTTTTAACTTTCT:1 + chr2R 1193104 3' - GATE 8270 2 64.38 TAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATAATGTTCCAATGCTGCATATATGTATGTATGTAGATCATTGCACGACCAAATCTACATGCATA:1 + chr4 818883 3' + Juan 3898 1 56.85 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTT:1 - chr3R 8075907 3' - 412 75 2 67.59 ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTG:1 + chr3L 13739652 3' - BS 5061 1 63.01 AAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCCTTTACTGGTATTTTA:2 + chr3L 3501878 3' + Bari1 1707 1 78.77 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTG:1 + chr2L 47175 3' + roo 8995 2 69.66 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCG:1 + chrX 7795622 3' + roo 9021 2 53.10 AATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGAT:1 - chrY 680451 3' - invader2 4902 2 73.29 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATGGAGTTTTTAT:1 - chr3R 17996144 3' - diver 5926 2 56.55 TTTTATAAAAAAAAACAATAAGATAGCATTAAAACATTAAGATTTATAAAAATTATGCCAAAAAAAGGGCAGAAAGCTTATATTGAGATGTTATATGTTATAATGAGCCTCTTAACATTTAAAATTAAGAACATAATTTTGAAAAA:1 - chrX 12248231 3' - Porto1 4639 1 76.71 AATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACGCACACACCGATATACAAATGCCAGTAGTCGACTTGCCAAAACGCAAACACAAACGCTTTCC:1 + chr2R 19669641 3' + 1360 3150 1 59.09 TTTTTTTTTGTTTTAATTTTTTTTTGCCCATTTCCTTTTTTGCGTTTTTTGCCAAAAG:1 + chr3L 2865349 3' - Doc 4696 1 82.76 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTGGGATATGGATAAATATTGGGGAATAAATTTAGTTATATTCGCCAATAAGCCAGCAATTAACTCACTAAAATGTCTGATCGTCGTGGCACAAA:1 - chr3L 13015115 3' - INE-1 545 1 50.68 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTA:1 + chr2L 20266017 3' - roo 8747 2 76.71 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAAC:1 - chr2L 7125768 3' - I-element 74 1 66.44 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGC:1 + chr3R 15791024 3' + roo 408 1 78.64 ATTATAATTATTATTATTTTTATTATTCGGATCGTTTTTGTCTTGTGTTATTCTATCACTCTCCCATACTTCTACATTTTTTTTTGTCTATTTGTTATTCTCCCATACTAGTTACTACATATATTTATTAA:1 + chrX 10963623 3' - mdg1 48 2 46.56 AATAATAATAATAATATTAGTAATAATCATAATTGATGAGAGGAGAAGTTGAAAGAAGAAAAGATCAAGGAGAAGCAAAGAGAGGAAAAACTAAAGGATTGGAGGAGCTGAGCGTTTATGACATGAAGGATCACTCCGATTACCAG:1 - chr3R 23691949 3' + mdg1 7075 2 41.78 AATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATGCCGAAGACGAGGACGAAGTAGTGGTGGATCCACTGGTCAGGTGAAGG:1 + chr3R 19400424 3' - diver 121 2 61.29 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATTTATGACTAAGAGTAACGGTAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAG:1 + chrX 18336654 3' - mdg3 5317 2 67.48 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGATTTCTCCCAGGGTAGTAGGGCCTTGTGCCAAAGCGGGATTTGAGGAGTTTTATTTGCCCGAGACGCCCCTGG:1 - chr3R 6348736 3' + 1360 3333 1 77.00 TTATTATTATTATTAATATTATTATTTTTGTGTGGTTCTCGTTGAGTTTTAGTGCTTATATTTGATAAAATAACCTTACAGGTACGCAATCGCCCATCCCTTGGCGTGATAACTTCTAGCTTTCCGCTTTCTCCACTTTTTGATTT:1 - chr3R 7609705 3' - mdg1 7085 3 67.12 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCG:1 + chr3R 9002984 3' - roo 89 2 81.51 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCAAGGTG:1 + chr3R 24450531 3' + 412 442 2 50.68 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCC:1 + chr3R 15790070 3' - flea 13 2 71.76 ATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGATTAACTTCTAAGCTATTCTATTGTTTCCAATTTTTCA:1 + chr2R 330021 3' + HMS-Beagle2 7196 1 53.23 CAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACACTGTGCCGCGTAAGCTCCAACCGTGAAAACTACGCCACAATAACGAAAAAAGAAAATAATAAAACCCAAATATAACTCAAATAACTCAAATTTAATATTTGAGCGCAC:1 - chr2R 4026375 3' + Doc2-element 403 1 78.08 AAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACG:1 - chr3R 11040041 3' + Bari1 1670 1 57.04 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGACTGAACTTGCGTTGAAGGGGCGTCGGCTTAAGAACCAACTTTCTTTCTCAGTGCATCCC:1 + chrX 10639171 3' - FB 30 1 51.33 ATAATAACAACAATAACAACAACAAAAGCGATCTGCTATTGGGATATGCGTTGGCATGAGTTGTGCTTATAAATACTTATAATGCTTCATCACATGATTAGTAATACTTAATATATATGATAAAAAAAAAACGTTATCTGTCATTA:2 - chr3L 16056160 3' + mdg1 7055 2 68.49 ATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAATGAAAAATTTCTATCTAAAGTGGAGAAAGTGTTCCTAAAAAA:1 + chr3L 23249508 3' + rover 314 2 52.05 AATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATC:2 + chr3L 16973479 3' + S-element 1670 1 52.74 ATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGAGAGTTTCCGCAACATTTTCGCATTGGCAGCGGGAAAGTGCATTTAATTAAATTTCCCTTTGTTCGATGCGAGTGCAAAAA:1 + chr2R 21960724 3' - Idefix 61 2 57.53 CCAGAAGGTAAACAAAAAGCACGCTAGCTAGCC:1 + chr3R 23729817 3' - S2 69 1 90.91 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCAT:1 - chr3L 21996160 3' - Transpac 4966 2 53.08 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTT:1 - chr3R 6419829 3' + Tabor 440 2 52.45 CTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATACAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAA:1 - chr3L 24213779 3' + invader2 5029 2 68.49 ATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGAGCAATTGAATATTT:1 - chr2R 23780492 3' + Ivk 5350 1 63.70 AATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTCGAGTGTCTGTGTTTGAACTTTGAAAAGTGGGTGAATGTACAGTAATGTTTGCTGCAGCATTTCACTTAGAGATCGGTTCTCTGGCTTTTCCAGCCGTTCGTTCTGGCTTTTCTCGTTGTTGCA:1 + chr3L 5613930 3' - gypsy3 425 1 54.11 ATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATT:1 - chrY 680450 3' - invader2 4901 2 72.60 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAATTTGGGGGCAGTGGTTGTAACCTGCACATGTGCCCTAA:1 - chr3L 7300088 3' - roo 8672 2 79.45 CACCAGAGCCTCGGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGACTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAATCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTT:1 + chr3L 7007618 3' - Rt1b 240 1 24.19 CTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGTATTTTGAAAAAAATA:1 + chr3L 23224559 3' - X-element 4382 1 59.59 AGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGTCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGTTATTCAAAATGACAGTATCAATCCTCCCTTGATAGTCGAAGCATTGAAAAC:1 - chr2R 9593547 3' + springer 93 2 62.10 TAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCA:1 - 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chr2L 9223967 3' - 1360 180 1 73.97 AGTTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAAT:1 - chr2R 15326794 3' + copia 241 1 74.66 AACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGCGGCATCATGTTCCTGGCCGGCAATGTTGCGGCACAAC:1 - chr2L 19394699 3' - X-element 4565 1 67.21 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCT:1 - chr2R 8099122 3' - jockey 4803 1 54.79 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTTCT:1 + chr3R 18093418 3' - I-element 19 1 69.86 TGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGC:1 + chr3R 24381374 3' + Juan 4132 1 72.60 CATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAA:1 + chr2R 20010673 3' - Juan 4168 1 61.64 AGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTA:2 + chr2L 21570276 3' - Dm88 51 2 53.42 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCGTGTGTAAGTACTAGCA:1 + chrX 20999642 3' - BS 6 1 73.97 ACGCCGACCGCGAATTTTTTACTAACTCTCGGGAGTTTCTTCGGCACTAAATTAACCAACGAATTTTTTTTTTGTAAAATTTTTT:1 + chrX 16458367 3' - HMS-Beagle2 459 1 83.53 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCA:1 + chr2L 14523279 3' - HMS-Beagle2 18 2 39.57 CTCTTTAAATTAATTTATTATAAAACTTTTTAATTTCCTTAAATTTAAAACAAATCTATTTAAAACACATTTTCATTATTTTTTCGCTTATCTTTGTTCAAGATCTTCCTTGTGATCATTTACCCATATATATATATATAAATATC:2 + chrX 13506470 3' + hopper2 172 1 71.23 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTT:2 + chr3L 13836714 3' - 412 57 2 56.16 ATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATT:2 - chr2L 15913253 3' - transib2 79 1 71.92 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCT:3 + chr3L 10425860 3' + I-element 5270 1 77.40 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCACATTTGGTTG:1 - chrX 11209851 3' - hobo 64 1 60.27 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGAACTC:1 - chr3R 30675364 3' + 297 6898 2 75.34 AATCTTAACTATAACAGGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATACGCTGCGGTTTTCTAGCATGCATTACCCTCAATGCAAGTTTTTCGCCAAATACGCTTCTGCT:1 + chrX 17076977 3' - F-element 4610 1 60.00 TCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAATAAATTTTCACGTTTATTTATTTTTGCACCGCACGTCACTGATAATTAAAAATAAAT:1 + chr3R 27843314 3' + mdg1 39 8 74.48 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACA:1 - chr3L 5532935 3' + roo 9004 2 67.12 TTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGAGACACAATTGCTGTTGTTTTTTTTTGTCGGCAAATTGCTTGCCTGG:1 + chr2R 5627695 3' + TLD2_LTR 97 1 79.45 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCAT:1 - chrX 21216732 3' + roo 8996 2 71.23 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAATCACACCCACTGCCCGCTACCACTTCCC:1 + chr3R 11469386 3' + Tabor 462 2 51.69 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCA:1 - chr3R 15072545 3' - pogo 47 1 52.74 TATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTT:1 + chrX 21947758 3' - mdg1 7066 2 66.93 GACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAAT:1 + chr2L 16539752 3' - Juan 4081 1 48.63 AGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATAT:1 + chr3R 4679580 3' - hopper 32 1 62.33 ATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGACTAAAATTAAAAGCCGAAAATCAAACCAACTTTATTGAATATCAAATTAACATGTTCATAAAAATGCGCACATTAAATTAAAAGCGAGAATGGAGGAGCT:1 + chr3R 11185189 3' + Juan 341 1 65.07 TAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTNCATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTA:1 + chr3R 9039009 3' + Juan 4162 1 62.79 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTATGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCT:1 + chr3L 3030317 3' - roo 8712 2 52.74 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCC:2 - chr2R 22034627 3' + copia 217 2 58.90 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGT:1 + chr2L 13556460 3' - transib2 41 1 51.39 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAATATCTACTCTTAGTCTTTATTAA:1 - chr2L 18549783 3' - roo 17 2 71.23 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTAAAATTAAGCAGCGCAAGTAGCTTTCACGTTGCCACGCCCACAGTTCTGAAAAAATACTTGAAATTTGTTATGGTTGTTGAACTTTCTCTTTGAATTGAATGAATGGATTTAGTTTTGATCT:1 - chr2R 20538254 3' + INE-1 156 1 81.51 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTG:1 + chr2L 16690713 3' + P-element 2818 1 36.55 AATATACGAATTCACTTTACCACGAAACCGCTCGAAAGTAACCGGTTACTGAAAATACTTGAAAGTTTCGTTTTAAGTTCAAATTTTAGGGAGCTATTTAGATTATCTATTCTATTTAGATTATAGGAACAAAGGTGATTACATAT:1 - chr2R 12192285 3' - HB 286 1 60.96 CATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACAATATTTTTAAATCTACAAAATAGATACAATATACAATATACAATACAATATAC:2 - chr3R 2259895 3' + hopper 978 2 63.01 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTGGCACGTTGTCAGCGCTGTCAGTTTATTCAAATTCCCTTGTACGGGCACGCTCGTAAATATATACAGCTCGGGCTAT:1 - chr2R 10679151 3' + 1360 3374 1 78.64 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGC:1 + chr2L 47205 3' + roo 360 2 52.74 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGGTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTAC:1 + chr3L 18126008 3' - Ivk 47 1 47.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGATGCTGAGTTTGAAGTTTCGTGGTGTAGAGAAGCGAGAGAGAGAGAAAACGAGATAGAGGGCCAATCGGGAACTACTTTTTGGTG:1 - chr2L 16690563 3' + P-element 2881 2 80.82 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATC:2 + chr3R 8890102 3' - FB 76 1 69.18 GNTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGTATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTATGTTAAATTAGATAAAATTAGCTCAAAATTAAACATATAGAGCAGC:1 - chrX 8065291 3' - Quasimodo 137 2 67.81 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCAAACATATAATTATGCAAATTATAAA:1 + chr3R 11062863 3' + roo 9041 1 60.27 CAAAAAACTACCCTAATATGTACTACGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCATTCTCGTCTCTTGTCTTTTGAAAACTTGGCAAAACAATGAGGGA:1 - chr3L 16767739 3' + 1360 3136 1 78.77 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTA:2 - chrX 19539459 3' - pogo 39 1 47.26 ATGACGAAGGATGTGGTGATGAGATGGAAAACATTTCTACGGTACTGGCCTTCTGGAAAATACAGTGATTGAAGTATGAGCCCTGACTCTTGCGTTCTGTTGATCGTTCTTCAATTGTCTTTCGCTTTCGTATCATTGTACATATC:1 - chr3L 23570441 3' + looper1 482 1 68.49 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGGGTCAAGAAAGCGGTACCGTTACAATCTGCTCTAAAA:2 + chrX 10537969 3' + I-element 5317 1 58.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGCAATTGCTTGCTGGG:1 + chr2L 19924038 3' + roo 356 2 56.72 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGAGGCATAATTAATAGTTAAATATTGAATTTATTGCACTTTGAACCGCAATTAT:1 - chr3R 20441187 3' + I-element 5340 1 71.92 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCGCCTGGCTGTCCTCCTGGGATGGCTGATTTCGTTGTCACT:1 - chrX 19587995 3' - roo 8664 1 74.42 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGAGGCATAATTAATAGTTAAATATTGAATTTATTGCACTTTG:1 - chr3R 20441199 3' + I-element 5328 1 63.70 GACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGTT:1 - chrX 21639576 3' + gypsy5 390 2 71.92 AGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATACCCAAAAATTGAAAAATAAGCCTCAGGGCAGACACACAACACACACAATACAGTAGCCTCAAAAAACGACATCAGCC:1 + chr3R 5678967 3' + McClintock 440 2 54.79 TTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGT:1 - chr3R 9557536 3' - G2 3049 1 66.44 ACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATACTGTCTTTTCTTCCACTTATTAGTCTGCGTTTTGCAAATATTTGCATACGAGGCA:1 - chr2L 15553980 3' - accord2 198 1 62.33 CAATCCGCGAACACGATTCCATAAATAATTTTCTAAGGAAATAAATTGTAAAATATGTAAAATCAATGGAAGAAACCACGAGATATACCCATAATGCTTAAAAGTGGGGGCAATGTCGATGTCGACTCCGCAATCCCGTCGAGTAC:1 - chrX 6203795 3' + gypsy12 9926 3 67.12 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACGAGCAA:1 - chr3R 30347276 3' - P-element 26 1 69.86 TAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCAACTTGGCTCAGTTCGGCTCAACTTGGTGCAATCGCTGAATGCCAGCCAGCCCAA:1 + chr3L 13251718 3' - flea 4942 1 60.00 ACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGAATTTCGCTTGGCATTAAAACGTACACTCAGGTGGCCCAGTTTCTTTCGCAAAAAAAAAGGGAAAATAATAAAATTCTAACCGGAGGGTGAACAATGCCTGGGGA:1 - chr2R 15177854 3' - roo 387 2 79.45 TTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTCAAAAAAACTAATTGGTGGGCAATCATGGACAAAGGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTGGATTTTTCCGAACCGTGCTTCTTTGAGCTGGAATTTATATTTTTTGTCATTGCTA:1 + chr3L 22751735 3' + FB 370 1 79.45 GCCTCCTTAAATTAATTGATGATATTATAGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTGAAACACATCTGCGAAGCTACAAATACGATTATGCTTCCTTGCATGGTGAAGTCTGTCTTTATTTTTTTATTTATCTTTATCTTTATCTTTT:1 + chr2R 7999139 3' + hopper2 170 1 77.40 ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGGGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTCTCACGTTGTCCTG:1 - chr3L 19274810 3' - transib2 83 1 69.86 TTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACG:1 - chr3R 20140510 3' - jockey 4734 1 78.26 GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATAC:1 - chr3R 19224987 3' - HMS-Beagle 6850 2 56.64 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAA:1 - chr2L 7660881 3' + I-element 5324 1 61.64 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGGG:1 - chr3L 6447013 3' - transib2 5 1 74.00 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTCATTTGGAATTTTACAGTTCCATTAGCGCAGAGAAAGCGCTTTTCCTCGTGCGTCTGCGCTGTGAGCGAAGATAATGTGAGCGAGC:1 + chr2R 18717509 3' + roo 9018 2 67.81 ATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAAATTCCAGTTATTGTCTTTAAAACACACAACACAATCGCCATATAGCGAAAGGTACAATAGATGGGATCCCAAACGAATTCCATTGGAGCAGCCAGGAATG:1 - chr2R 18815910 3' + mdg1 29 8 82.95 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGG:1 + chr3R 31264084 3' - jockey 4824 1 59.59 GCGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACT:1 - chr2L 7125731 3' - I-element 37 1 58.22 AATATTTTAAAAATATTTTATTTTTTATTTTAGTATCTTTTTTTCCCCATTTACACATGTCGAATTTTTGCAGTAGGTGTGGGCTTGAAAAAGTACTGTTGTCATTAATTTGCTTCGCTTATCAAATGTGTTTTGTTTTTATTAAT:1 - chr3L 16533280 3' + 1360 3090 1 70.55 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTTATTACTCATTAAAATTAATAGATCTGGGAAATAAAAGG:1 - chr3L 1279037 3' - roo 16 2 61.64 GATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTAGATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCC:1 + chrX 22576489 3' - Burdock 149 2 79.80 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCTAACTTACACATACATTTCAGTCTTGACATTTAATTTATATTTCCACTCTATTAATTAAT:1 + chr3R 30059489 3' - FB 61 1 60.27 ATTATTGTTATTTTTATTGTCATCACCCAGTGTGACAAGGAAGCCCAGACAAACAAAATGGAAATTAATCATATTAACATGAGCCGCCCGCCAGGCATCAGAGCCGAATGAGTAGTTTGTGAATTTCTCA:1 - chr3R 5195405 3' - mdg1 21 2 57.69 TGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAAAAGGGTTTTGGGCTTAATTTCGATATGTGTGTTTGTTGTGTTTTTAATCCTCGTTTGTTCTGGTACCGTTCCTCGTAGTTGTTGCTTA:1 + chrX 840440 3' - I-element 115 1 53.42 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTATTGTTTTCC:1 - chr2L 18347271 3' + transib2 2778 1 50.34 GTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAA:1 - chr2L 12818239 3' + hobo 2873 1 60.27 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACG:1 + chrX 1341727 3' - 412 67 2 62.33 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 5315 2 67.83 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAG:1 + chr3R 11062813 3' + roo 8991 2 70.55 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAG:1 - chr2R 9544849 3' + roo 356 2 63.41 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCAGCTAACAACCGAATATAGAATGATAATGAAATCTAC:1 + chr2R 15651983 3' - hobo 79 1 73.57 CCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCACCCACCCACGCGATTCGCTGCTAAAAGCCGGAAAAGGT:1 - chr2R 12779616 3' + I-element 5301 1 52.74 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGG:1 + chr3R 9298559 3' + hopper2 1558 1 57.36 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGGAG:1 - chr3L 18281837 3' - Doc 44 1 57.24 AGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCATTTATATGCAAGACTTCTCCTTCAATTCACTTCAGTTTGAGGAATCT:1 - chr3L 19702566 3' + 17.6 36 2 67.12 GTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAG:1 - chr3R 29690734 3' - I-element 5200 1 57.14 TATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAAACTAATTGGTAGGCAAACATGGGCAAAAAAGTCGTTTTTCATCTGCAGCAGGAATTTCACAAAAATAATATATATGTGTATTCGCATGCGATACG:1 + chr3R 13330985 3' - FB 105 1 59.52 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCTCGCCCAGAGTTCACTCAACTCCAACTCCCTTTCCTCTAGCGATAATTTAAA:1 - chr3L 17940032 3' + 1360 3379 2 63.01 CGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTAGTGTAT:1 - chr2R 21410823 3' + Burdock 237 2 68.49 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATG:1 - chrX 6475313 3' - Doc 78 1 69.01 ATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACCATCTGATGGCGGCACTGCAACTCCAAATTCAATTAAGCAAATCGCATGTGAGAAATTCAATTGAAATACGATA:1 + chr2R 20340095 3' + Tirant 453 1 66.96 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACGATTTGGTAAAGGGGATTGAAAAACAAGATTTGTTGATTTTGTT:1 - chr2L 12134507 3' - jockey 4837 1 70.55 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTGCGTAAGCCATACAT:1 - chr2L 17809129 3' + jockey 4980 1 73.97 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAA:1 + chr3R 31264055 3' - jockey 4828 1 75.83 ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTATTCCCATTGTGCGCTTTTTTCGCTGCGCTAGTTTTTTTCCCC:1 + chr2R 9975803 3' - jockey 4862 1 71.23 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCT:1 - chr3R 23618112 3' + hopper 1389 1 62.10 CGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTTTCTAGGGGTCAATTTCTTTATTTGTTAAGGTTCATTTATAATACATAAGATATATACACAATAAATGCCTAACGACTCATAGTTCGACGTAAAGTTCTGGAAA:1 - chr2L 17123284 3' - 297 6781 2 80.82 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGGGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGCTGGCGAACCCTAACGAAAATAT:1 - chr2R 10161755 3' - transib2 31 1 62.76 GTAAGGAACACAACCCTGCACGAAGACCTCAAGCTTGCCACTGTCATCGAAGCTATGAAATCACCAGCCGACCC:1 + chr2L 4086533 3' + BS3 1412 1 67.57 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTA:1 + chrX 14310329 3' + roo 9024 2 51.37 ATACTTTTGTTCTGTTTATTGTACAGATTTTTGACCACTATATAAACGGCATTTAGATCTCCAAAATAGATCCAAATTTATAAATGTTTTACTCACCGTCTAGCATTCAATCCCACATGGTAGATCCTTTTGATATGCTTGTTGGC:1 - chr3L 15980904 3' - Porto1 191 1 52.74 AAGACTTGAACCCTGGGATAGAAAAGCTTTAAGTTCGCCAACAGATGTTTGTGCGATCGCGTGGCAGCTGGGCAGCGAAGCCCCAATTCGAGTAAATTAACTTTAACTGAAAATAAAAACAAATAAAACCAGAGAAAAGCGAAGAA:1 - chrX 15554179 3' - X-element 265 1 76.03 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATCTAAAGACGTTGAAAAT:1 - chr2L 18226719 3' + roo 405 1 79.45 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCGGCGCCTGAAAGTATGCTATGAT:1 - chrX 2214239 3' - jockey 4807 1 51.03 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTGAAACCATTCT:1 - chr2L 12818203 3' + hobo 2909 1 64.38 CTAGGACCTTAGTTTCGTGGATGCTGCCCTTTTTTAGTGGAATTTTTGCAACAAACGGAGCAGAGCATTTAGTTACACACGCGGGTGTGGCCCTATCACCAGTAAATGTCTATCGATAATACCCACACACGGCTATATAC:1 + chr3R 28088031 3' - Fw3 89 1 76.43 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTCTGACGAATGCAATTCCTTTACTGCGCCACTTGCATTGTCATCCGTC:1 - chr3R 11810589 3' - roo 16 2 71.92 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCTCATACTCTGAAT:1 + chr2R 5074597 3' - 1360 46 1 50.68 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTA:1 - chr3R 19073143 3' - roo 8685 2 65.75 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGATGCTGAGTTTGAAGTTTCGTGGTGTAGAGAAGCGAGAGAGAGAGAAAACGAGATAGAGGGCCAATCGGGAACTACTTTTTGGTGG:1 - chr2L 16690562 3' + P-element 2882 2 81.51 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCTGCGCCGCGGGTGCAAAACGAAATCGACATTTAATGCGCTAC:1 - chr3R 23491832 3' + transib2 2809 1 70.25 GCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAAATAATAT:1 + chr3R 556478 3' - Juan 4156 1 59.59 TCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGGTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCG:1 + chr3R 30987570 3' - F-element 127 1 61.36 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCACACACCGGCT:1 + chr2R 8735678 3' - mdg1 7054 2 60.95 CTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGTCCTCCACTACTGAAAACGGGCGCATATCAGTGGCTATGTACTTCATGACAACCGCGTCGAGGTGGTAGTTTGCTGTTGCATCCAGCCGATCGTCTGACAGC:1 + chr3L 10388796 3' - baggins 5352 1 71.88 AACAAAAAGATCAAGGAATGATCGATCATGGTTGATGGTCTTCAATTTATACATTAATAATAAACATATATTAATTACAATAAAAATAAGTTTTTGATATTATTTTTTAATGTAATAATGCAGTATGGGTTATTACGTGGTAATTA:1 - chr2R 13575776 3' - diver2 4673 2 38.36 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGT:1 + chrX 21100259 3' - mdg1 59 2 56.85 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTT:1 + chr3L 7889670 3' + roo 358 2 52.05 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCGAACCGTGGGTGAGAGAGCTAAAGAGTGATTT:1 + chr3R 16519042 3' + Tirant 8501 2 79.45 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGTTATTTTTT:1 + chr3R 24381427 3' + Juan 4185 1 74.66 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACC:1 + chr3R 21630329 3' + I-element 5290 1 72.09 AAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACACACACGCATAGATTTTTGTAAAACGATTTTTATAAGAAACAAAATATTCGATCGTTGAGAACTCTGTTTAATCAC:1 + chr3L 13046511 3' + F-element 4402 1 56.85 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATT:1 - chr2R 13766204 3' + roo 344 2 63.01 ATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGCTAAAGTCTGATAATGTGCTAATCGAGCTGCAGGACGATGCGGCGCCGGTGCTGGTGCTCTCCGACTTTGGCTGT:1 + chrX 6686174 3' + I-element 94 1 50.00 CCCATCCCTCCTACAAACCTACAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATATTTTTCCTCAAAAATACCAAATTATACCAAAAAATCTGAAAACAATTAAAAACGAAATGGGTTTCGAGGCAGGCAGGC:1 - chr3R 9428508 3' + I-element 5060 1 76.03 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCCGCCGCCGCC:1 + chr2L 12822846 3' + P-element 2837 1 30.48 AATAAGGTAAAAGGAAGCGGACCAATGTGAGACCATTGGGGGACACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAGAAAATTTTTAAAGAGGACCTGTTGCTTCCTGCCATTCAGATAGTTTATTATTGTTATTGGCATTGTCTGCTG:1 + chr2L 13583468 3' - Q-element 509 2 81.51 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTAGAACTTAATTCTTTTTAC:1 + chr3L 20898672 3' + roo 394 1 76.03 ATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGCTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGCGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACC:1 + chr2L 15763104 3' + mdg1 7061 3 70.55 CATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGCCGGCAGCCGTATTCCTACAACAACCCCGCGATCTCCATGTCCTCGGTGAACAACCATAGTGGTGGTGGCGGGAATGCCCCACC:1 + chrX 6872858 3' + Doc 4493 1 68.80 CATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATCC:1 - 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chr3R 14980285 3' + roo 9034 1 59.59 ATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTTGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCC:1 + chr2L 17005843 3' - Stalker2 23 2 67.12 CAGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGCTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAATTATGGTTTAGTCCATAAAGCTTCAGCTATGTATAGT:1 + chr3R 11599068 3' + Idefix 181 1 73.29 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTAGTTTA:1 - chr2L 16540903 3' - hobo 32 1 61.97 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCGGCCAACGGC:1 + chr2R 8047358 3' + 1360 3367 1 57.52 ATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAATCCTAAT:1 - chr2L 11391492 3' + 1360 22 1 43.15 GTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCAAGCGATTTCCAGAGAACTGCCCACCTTCGACGGCGACCCCCAGCTGGCCATTGTTTTTATCAGTTAACAGATGAGGACTGAGAGCGCCGCCCATGCTTACG:1 - chr3L 27169436 3' + HMS-Beagle2 124 2 75.59 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCC:1 - chr3R 22642274 3' - blood 7063 2 53.79 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATC:1 + chr3R 19032696 3' + roo 9009 2 62.33 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCAT:1 - chr3L 21655842 3' + HMS-Beagle2 7175 2 66.44 TACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTTGGGCGGTTCCTAAAGGGGCGGAGGGAGTGGGTGGTGGTGGTCCAAAAGCCATAACAATTTG:1 - chr3L 21386827 3' + I-element 4983 1 65.66 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCGCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAA:1 + chr2R 20227311 3' + hopper2 1560 1 60.00 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATATT:2 - chr2L 9782044 3' - P-element 37 1 60.27 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCT:2 + chrX 22840576 3' + copia 5066 2 56.16 GTATCGTACGACTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGAAAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATAACTGTAAAATAACTATTAAATTCCACAGCGCAAGGTAAAAATTTCATTCCGTGGCGAG:2 + chr3L 16023474 3' - Cr1a 4387 1 74.66 AAGTTAAAAAAAAAAACAAATATATATATATTTTTTTTGTTACTTTTCGGTTTTGCTATAAATTGTGTAGGCTACTTTACTGTCAATTCATTAACAGCAACAACAATAGC:1 - chr3L 10339410 3' + TAHRE 10442 1 77.27 TGTCACGCCCACACTTTTGAACATTTTTTTAATTTTTCCTAATTTTATTCGATATTTTGCAATTTACCTTAATAAAAACGTAAGAAGTTAATAATTATATGATTACAGAGTAATGCCTCTTTTGAGGAACTGGATAGGCTGAAGCA:1 + chrX 21134037 3' + INE-1 250 1 63.01 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCA:1 - chr3R 15942680 3' - hopper 24 1 63.57 AATAATAAATAATAAAATAATATTAATACTTAGTGAATAAAATCAATTTAAGCAATAATCAATTGTTTGAACTTAAAATAGTTACTTTCTGGCTAATTGACTTATTGGTTTAAAATATAAAAAAAATATATCATTTAGAAGCTCTT:2 + chr3L 15477393 3' - INE-1 416 2 52.05 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCA:1 + chr3R 27123579 3' + roo 9011 2 58.90 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAGATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGT:1 - chr2R 13766188 3' + roo 9033 1 54.74 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTT:1 + chr2R 9158132 3' - mdg3 5327 2 66.44 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATT:2 + chrX 8308520 3' + roo 9033 1 60.27 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATCTAAAGACGTT:1 - chr2L 18226725 3' + roo 399 1 75.34 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATT:3 + chr3L 22035705 3' - F-element 25 1 69.86 GCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACG:1 + chrX 20999586 3' - BS 62 1 64.38 AGGGGATCATGGAGTATTTGAGAGCAGAGGGGAAATATTGGTATTGGAGCATATATACGAACACGAGGATGTACACGAGGAAGGATTGGGATGATTGGAGTAAGGAATTGGACTCGCTTCAAGTGCCTTTATTAGACCATAGATTC:1 - chrX 11396979 3' + R2-element 2 1 76.71 GAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTGTCCACCTTTTGGAGGGTATTTATTCTTGACATTGT:1 - chr3R 19495246 3' + blood 165 2 80.33 TAAAATACAAAAAAAAATTTATTTTTTATTTGTCAGTATCGGGGTAGTATCGATAGTCGCGCAGAAAACATCGGAAAACATCGAATTAAGTGTATTCAGCGCGGAAAAAAGGCCACAAGCAAAAAATCTCTTAAGTTATTTATTTT:1 - chr2R 15114849 3' - Tc3 382 1 90.41 GGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATTACAGCGCGCCTGCTTGCTGTAGTTGTCGTGCAATTGCATTACCCAGTCGATAAGCA:1 + chr3R 10317440 3' - G-element 4272 1 60.96 CAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCCCCTCCTCCTCCTCCACCACTCTGGCCGACAAAACGAGTCGCTCTCTTTGGGCTTTG:1 + chrX 16092732 3' + Stalker 359 4 54.55 TATCAGATACCTGTTACTCATCTAGTGGAAAGAAGGCAAATGGGAACAAGACCTGGATCAGTAACTGATTTTTTCCACAACAAAACCGAACAGAACCGTTTT:1 - chrX 21565565 3' - INE-1 546 1 74.51 TTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAG:2 + chr2L 17005807 3' - Stalker2 7307 2 56.85 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTATTAAAACCTATTTGGTTTCAATCGATGCAAATAATTAT:1 + chr3R 20167723 3' - roo 8680 2 73.97 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAG:1 + chr2L 18549926 3' + roo 344 2 59.59 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACG:1 + chr3R 15942782 3' + hopper2 1528 1 74.66 ATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGGCTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGTCCACGTGCCCAACATGTACTTCAAGGATGT:1 + chrX 12492761 3' - 297 464 1 73.60 AATAAATGTGAAACATTTGTTGAATTGTTCAAAATTAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCCTCGCAATGCTATTTTTATGAACACAGCTGTACTTAACCCTTCTGCAGGTGAGACTAACACACGCTCAAGTGGGT:1 - chrX 22881997 3' + HB 1501 1 70.80 GGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGGTTCCAGAGACAAAGACGCAGCGCATAGAAACTTCTTTTTCCCGATGTAGCCAATCGACTTATTTAAAGTTCCAAACCAAACACTTTTATTCATTTGAGCTAGACGT:1 - chr2L 22079675 3' + INE-1 157 1 48.63 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATCATTTTCCTAGTCAATTGAACATTGTTGCGTTAGTTTCCTTGAACGGTTAACTATTGTACTTCGAATTCAATGAGCTCTCATTGCACACATATTTGAAGTATTTTCTTGATATTTTC:1 - chr2R 7303956 3' - pogo 2 1 80.82 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTATACTCGTACTTTTGGCAGGATTCCCGTCGTCTGGTGTCCTGCAT:1 - chrX 13490653 3' - 297 6637 2 66.42 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTTGTATGTATGTAATATAATGTATATGTATCCGTTGTAAAACCTTTTTAAATATATTGAG:1 - chr2L 21328148 3' + 297 6922 2 63.01 GGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGACGATCCCGGCCAAATCCACAAGCAGGCGGCAAGCACGCCCAATACCACGCCC:1 - chr2R 24769885 3' + R1A1-element 93 1 73.33 CAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCCACCAGTACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTCCACCTTTAGCAACAACACTCAACACCACACAATCACACATCAGCATCCGAACAGAATAAGTAAATCAATAAAAGGTGTCATGATTTTT:1 + chr2L 12313414 3' + Doc3-element 464 1 52.74 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAA:1 - chr3R 17996162 3' - diver 57 2 56.16 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTT:3 - chr3L 16973333 3' + S-element 165 2 60.96 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCA:1 + chr3R 30347388 3' + P-element 2805 1 28.08 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGC:2 - chrX 14771705 3' - BS 44 1 48.63 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGAGGAGGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAATACGTGATCAAATTGCT:1 - chr3L 12004273 3' + P-element 2828 1 28.57 AATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGC:1 - chr2L 16946058 3' - hopper 89 1 77.40 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGATTTACCACCGTCCAATTGGTGGGCGCT:1 - chr3R 11040009 3' + Bari1 1691 1 71.92 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTGGCATTAAATGTCACAAAGTCACGCGGCCTGGCG:1 - chrX 585626 3' + Tirant 376 2 59.29 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGT:1 - chr3L 17055424 3' - Tirant 56 2 53.42 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATG:1 - chrX 19074716 3' - mdg1 7050 2 72.60 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCACCATGGGCCCCACAAACTTTTTGCAGCTTTTT:1 - chr3R 13875079 3' - P-element 98 1 17.12 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCGAGTCGTAAACATTTTCGCGGATTAATTAGCGAAAAAA:1 - chr3L 18930940 3' + I-element 5335 1 66.17 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAA:1 + chr3R 15791007 3' + roo 347 2 61.64 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCG:1 + chr3L 11326783 3' - pogo 52 1 59.59 TATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCT:1 - chr3L 19454910 3' - mdg1 7084 2 54.11 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCT:1 + chr2L 12818365 3' - hobo 28 1 65.07 AAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACTCTTTACGTAAGTCAGTGGAGCGGGTAAAACGACAGCAACAATAAATATGCCAAGTACGGTGTGTGAGACGAGAAACTTTCTCTGTTAATGGTGTCT:1 - chr3R 26958118 3' + Doc 4602 1 67.81 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGGGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGAGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGGACTCGGGGTACCAACCATCGAC:1 - chrX 10521666 3' - Tabor 87 2 80.00 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCT:1 + chr2L 12818346 3' - hobo 47 1 52.05 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTAT:1 + chrX 11661517 3' - pogo 38 1 59.59 ATTATACATATTTATAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAAGATATTTTTTGTATTTCTATCTAACAACGTATTAACAACTTATTATTCTTTGTTTTAAGAGATTTGTTAATCTGCGAAATGTTCATCTGC:1 - chr3R 23533455 3' - accord2 7522 1 48.61 TAAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTAATCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGATTAAAAAAGTTACTTTTTTTTAAATCTATTGCAGTAGAATATGGTGTAGAACTTGTTTGAGTGCAT:1 + chr2L 16548701 3' + Doc 4689 1 77.40 CAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGTATTTATCAATACATTTAAACC:1 + chr3R 4461137 3' + blood 7335 1 56.16 CAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGC:1 - chrX 14771708 3' - BS 47 1 50.00 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATATATGTTGTGCTAGAAGCCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGTATCTTTCTTCGCAGCACTGGCCATTGAAAGGCGAGGCACAA:1 - chr3R 31708861 3' - 1360 3263 1 71.23 AGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTC:1 - chr2R 12185340 3' + accord 7346 2 65.66 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTATTATCCGCGGAGCCAAGTCCCGTGTTCAAAAAGAACTGAGAAACAAATTTG:1 - chrX 23210459 3' - roo 8731 2 65.07 ATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAATATTATAAGTCCTGAAACAGACAATACCGCACCCCCAAATACCCCTGTATTGTACCCTAATCTAAACGCCTGAGGACAGGCTTTTTTC:1 + chr2R 883241 3' - Cr1a 4026 1 65.75 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTAC:2 - chr3R 31886820 3' - hopper 42 1 58.22 AATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTT:1 + chr3R 2520347 3' + Tc1-2 1610 1 62.59 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTT:1 + chr4 373077 3' - pogo 28 1 61.65 CAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATTCTGTATCACTATTTTTTGTGACTCCTACGTGCCGGGAATTTTCCACTGTTGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTCTGTTTAATGTCT:1 + chr3L 18126318 3' - Juan 380 1 65.71 TTCTGATTAGTCTTTTACATTTCTATCGATTTCCAGCTTACGCCTCTGTTTCACACTCCAAACTCGAATTTTAACCCCTTTTTGTTTTCCACCAACAACGCCGCTTTTCATTGCCTGTCAAAGGCGTATAGTTCCTGGGCACATTG:1 - chrX 17808382 3' + INE-1 292 1 80.82 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTCTTGAGAAATTA:1 + chrX 18396193 3' - roo 41 2 53.62 ATCTGTGTGTTTGTGTGTGTTGTTGTGTGTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATTATTAAATGTGGGGGTGCTGCAGGGGGTCCCACGCTGCAGTTATTTCTACTTCTTTTGCCAGACAGGCAAACTGGTTAATC:1 + chr2R 12604117 3' - gypsy3 424 1 67.94 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCAGGGA:1 + chr2R 12472132 3' - transib2 39 1 54.07 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTGGCTGGGCTTAACCCGGCAAATAATTGA:1 - chr3L 12315672 3' - transib2 11 1 78.08 ATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACGCGTTAAAGACGATGTTATTGCCACCTT:1 - chr2L 22328980 3' + invader2 4740 1 53.42 AAATAAGTTAAATAAAAAAAAACGGGTTGGAGAAAGATGCTCTCAAGATACAAAAGTCACTGCCACCAAATCGATGACAAACCCAAACCCACATAATTTTAAT:1 + chr3L 19682648 3' + X-element 4719 1 64.08 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGAATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGG:1 - chrX 19266849 3' + roo 347 2 65.87 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCAT:1 + chr2R 4785362 3' + Juan 4191 1 68.49 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAATCCTA:1 - chr2L 11391494 3' + 1360 20 1 45.89 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAA:2 - chr3R 6419811 3' + Tabor 7294 2 63.01 ACACCGTGCGCATTTTGACAGGCGGACAGGAGGGCAAGCCAACCAGAAGAAGGTGAGACAAAAGGGGCCAGAAATCGAAAGCCAAGGAAATCTCGGATCCATAAAATTAACCCTACTGATACCCTT:1 - chrX 8298403 3' + baggins 5114 1 79.37 ATAATTGAAATACGCTTTATATAACTATGAGAAAATTATTTATTACTTTATATAAAATCCTTTTATAATCTCATCCTATTGTAATTTTCTCTGAGTGCGAAAGAAATTACAATTAAAAATTCTTAATTAGCATATAAATGGCAGGC:1 + chr3L 9248661 3' + Copia1_DM 16 1 69.18 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTC:3 - chrX 19074754 3' - mdg1 50 2 50.00 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATGGTAAATGGAATAAATTTGTTAGCTTCTTTACG:1 + chrX 8092537 3' - pogo 12 1 76.03 ATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACAAGTACAAATACC:1 + chr2L 20640320 3' + Stalker4 233 6 55.48 AGTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAA:1 + chrX 21100264 3' - mdg1 54 2 52.05 CAATAATAATAATAACAATAATAACCATTACAACAACTACAATAACTATTATAAGAAAAGGAAAGGAGACAAACGGCCCAGGATGACAGGGCTTAGATAGATGGACAAAGGATTAGCGAGCCAGCGGACAAGTTCATTGGTGGGGG:1 - chrX 1990835 3' + mdg1 7074 10 62.33 ATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAACAATACTAAAAAGAATAATCAGCTTTAATCAAAAATGTATCCGTTTTAC:1 + chr3L 21812537 3' + mdg1 29 2 86.30 TGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGAAAAGTAACAGTTGATAACTGACAGAAGAAAGAATTCAATTACAGAGATAAAATTAATCCTATCACATTTATTATTAATATCGCTTAAC:1 - chr3R 30551847 3' - G6 40 1 71.23 AATATTAAATATACAAGAAAATCCAAGTTTATGATGATCGCTATCATCGGTTGATGATAGCGATCATCATAAACTTGGATTTTCTTGTATATTTAATATT:1 + chr3L 23583097 3' - S-element 1559 2 59.00 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGC:1 + chr3L 16437247 3' - F-element 55 1 53.12 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCTTTTAAAGGTG:1 - chr3R 6625655 3' + flea 241 2 75.34 AACCTTATTCGAGTATGCAGCCACAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACATTACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAAGCACTCCTCGTCGGACAACACGGAGCAATCTC:1 - chrX 6126388 3' + Doc3-element 4546 1 71.92 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCC:1 + chr2L 14523249 3' - HMS-Beagle2 55 2 54.79 AAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTAGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTATGTATATACAACAAAGTTGAATTTATGGACCCAGTTAACAGTTTCCTT:3 - chr3L 21821366 3' - Tc3 314 1 77.40 GGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAATGATGGAAACTCACCGATCCATCTCACGCAGGGCGGACAGAACCAGAAGCAGTCCACTGAGCAGGAAGAAGGGGTCCACAGACGTAGTGCGGCTCTGGAGG:1 - chr2L 1228051 3' + 412 7367 2 65.07 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATA:1 + chr2R 6847836 3' - Doc 74 1 65.75 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGGCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCG:1 - chr3R 16341927 3' + P-element 2860 1 59.02 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCGTCTTACTAA:2 + chr2R 4606282 3' - 1360 78 1 71.92 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTC:1 - chr3R 23618133 3' + hopper 1395 1 57.73 ACTAAATATCATTTTATGAAATGATGATTGGATGTGAGGCCAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTTTTCTCTCTATTTCAATTTGTCTGTCCTTTTTTTCCGTCTTTATCTCTCGTATCATCGACATTTGAATCGATCGAATAAATC:1 + chrX 9023933 3' - Doc3-element 4635 1 54.11 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTT:1 + chr3L 1692124 3' + blood 7332 1 56.85 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCC:2 + chr3R 17077217 3' - roo 8706 2 55.48 AATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTGTTAAATC:1 + chr3R 11062829 3' + roo 9033 1 50.83 TGACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTTGATCCAATCCATGGGGTTCGACATGGAAGCTGAAATCTTATGTACTGTCCTATCGCAGTGCGTTTGTGATTGCTTGCGATTAGCCG:1 - chr3R 10330248 3' + gypsy2 296 2 62.76 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTT:1 - chrX 21216709 3' + roo 355 2 55.48 CACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACT:1 + chr2L 23295883 3' - micropia 5097 4 56.55 AAAGTCTTCATTTTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGCTTCGCTTTCCCATGCATGTTTATGTACTGCAATTGCGCCTGGCACTTGCGCAA:1 + chr3L 18046715 3' + roo 404 1 64.71 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCA:1 - chr2L 19674968 3' + 297 331 2 73.57 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCCTTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGTTCCAATTGTA:1 + chr2R 7244903 3' + diver 6059 2 58.91 ATAATAATAATAATAATAATAATAAACCAAGCGGGCGAACAAGCAACAACTAAGCGACTAACAGACTAAAACGTATTGCACAATTAAAGCACCGACAAGGTTTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATAAACCTAATGCGAAACT:1 + chr3R 19447039 3' + mdg1 29 8 71.23 CCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGGGCGCAACAAAAATAAAAAAAAATAGCCAAAAGCACTGCATACTTTCGGGCGCTTTAAGCCCCGCTCGTTTCGTGGG:1 + chrX 20289500 3' - Cr1a 52 1 66.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTT:1 + chrX 19588138 3' + roo 390 2 62.75 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTG:1 + chr3R 16341994 3' - P-element 86 1 17.69 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGGAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGGTGGCCTAATTGGATGGATTTAAGGATGTGTTATGTTCATAAA:1 - chr3R 11062703 3' - roo 32 2 60.96 AAGCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGCAATGTCGAAAAC:1 + chr2R 4545170 3' + invader1 3535 1 51.37 ATCAGATTTCATCTTAAAAAATATATAAATAAAAACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATACCTCTAGGGTGCTCCGGCCGTTGATGATGACGGGGTAGTCCGCGCTAAAGTCG:1 + chr2R 1776725 3' + mariner2 775 1 57.14 ATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATTTGGTGGTCTTAAGCAAACAATACACATTTTAACGAGG:1 + chrX 18238950 3' + jockey 4867 1 57.75 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTT:1 + chr2R 8099240 3' + jockey 4948 1 50.00 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACG:1 + chr2R 13766299 3' - roo 8728 2 64.38 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGGTAATAGGTGCTCAG:1 - chr3R 25433276 3' + transib2 2770 1 55.48 ATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTCAGTATTGTTTTATAATCTGTTCACAGAATAATATACTACAAACAAACACGCGCGTTGAGGCA:1 + chr2R 10418616 3' - 1360 3036 1 73.97 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGCGCATTAACTTAATCGGCCAACGGCTTCCTTCAT:1 + chr2R 8047367 3' + 1360 3364 1 57.60 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAATAATGTTGCAGAATTTAGCTGAGTCATTT:2 + chr2R 7304173 3' - pogo 8 1 77.40 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTTCTTTTTTCCCG:1 + chr3R 18093427 3' - I-element 9 1 76.55 GAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAAT:1 + chr3L 24934414 3' + HMS-Beagle2 7149 2 56.16 AGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTG:1 - chr2R 23780544 3' + Ivk 5306 1 71.74 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCA:1 + chr3R 11062819 3' + roo 9002 2 65.25 GGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAAACGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGGAACAAGGAATGAGCGCTTTACAGATTAATGATCCCCCATAAGTGCAAGCGCTTTTTGTCTTTTTGTTCTAAAGGTCCTG:1 - chr2L 22211614 3' - diver2 197 2 60.96 ACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAAACAATTACACCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCATATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTGCACCGACAATATCCAGGGTATGGCTTAAACGCTCATTGGCTTAC:1 + chr3L 23062701 3' + Stalker4 396 1 68.49 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCT:1 + chr3L 23906448 3' - 1360 70 1 74.80 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAG:1 + chr2L 13844238 3' - Stalker2 82 2 71.23 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAA:3 + chr3R 20167655 3' - roo 8748 2 77.40 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGC:1 - chrX 13134865 3' - jockey 4797 1 58.62 TATTTATATAAAATGAAGAAATGCAAGCGCCTTTTAGGCAGGCATCGCCTTATTTTTCGAGGTAAATGTATCATAGAAATATATACAAAAAATCATCTGAAAAGAATCCACTGAACAACACCGATTTCCCGGTAC:1 + chr2L 10052574 3' + Bari1 1404 1 71.85 ACACGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTTCAGAATGACGTTGCACTAATATGTGCG:1 + chr3R 20565337 3' - transib3 230 1 56.85 CTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAA:1 - chr3R 9557512 3' - G2 3025 1 50.00 CTCCTCCTCTCTCATGCTCCTCCTCCCCTCCACTTTCTTTTTACATTTTTTCCGATTTGTTGCGAAACAATTTCTGCCATTGGTTTAGTTGCCCACTTTTTTTTTTGGTGTATTCTGCTCTTTTGGCTTGAAAACT:1 - chr3L 5727238 3' - Bica 10 1 80.15 AAACATATAACATACACCAAAATGTTAGTGAACTACAAATCTACATACCTGTGCTACTGTTTTCCATGACAACACTCACACACCCAAACAAAGCGAGCACATACATCATTGTCAATGTCAAAGTGTCAAAGCAAACTTTGCAGTGC:1 - chr2R 14642385 3' - transib1 315 1 52.05 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCC:1 + chr3L 9809361 3' + 412 7499 2 52.41 GGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGCGTGGTCAGCTTGGAGAAGCTAACTGGACATCGGCGAGGAGTGAGCGGCAATCAATGCTAAAATTAAGGACAC:1 - chr3L 568502 3' - Idefix 7075 2 75.73 CGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGGAAGAGGCTTGGCGTGGTGTCTTTTTTTGGCTTTGATTTTACTCTCTGCCATTTCAAACTGGGGTGCGAATGCCATGTCTGAACACAAT:1 + chr3L 19503403 3' - G4 31 1 75.89 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGG:1 - chr3R 27315086 3' - jockey 4709 1 53.23 TTTTAATTGTTTTTTCCTTTTTCGCCGACATTTTCACAGCCACAAAATAAATTGATCTGTGGTTTTGGCCTTATAATTTATGAGCCTTTCTTAGGCGGGCGAAAGGGAGTGAAATGCTGAATGCGAAAGTTGACAAATGGCTGAAA:1 - chr2L 18376463 3' - Bari2 916 1 71.92 AAAAAATAAAAAAAAAAACAAAAAGGAGCAAAACAGAAAAAAAAAACTAAAAAAGGGAAA:1 + chr2R 13336405 3' + gypsy7 5010 111 68.33 CGTGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCGTGGGCTCCCGTTTCTTTTTATAATTTATATATTTTTTAGATGGTAATCCGGCGAAAGGCGGGGCTGCTGGAGGAAATCGAGTTCAAGAAGCCGCCTATTATCTATCTG:1 - chr3L 8906640 3' + Rt1b 5030 1 78.08 AGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGAC:2 + chr2R 20802658 3' + mdg3 5427 2 61.64 AAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTA:1 + chr3R 1844835 3' - Cr1a 185 1 69.18 ATACAAAGAATTTTGCATTTTTAGTCTTTGTGTTTTGTTTAATCTTCATTTTGTGCGTTGTTCGCATATCCTATATACTATTAACGATGTCGAACTGCCGGAGGGTCATTTACTCAAGTAATGGCAACCGGCGGCAAGGATTACGC:1 + chrX 6521782 3' + Cr1a 179 1 55.48 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCC:1 + chr3L 12249883 3' + roo 8991 2 73.29 AAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAAAATAAAAATGCACAACGTCACTTACCTGAACTTTCTTGCCACACACCAAATTCAGAAAGTAGTGCCAAACAAATCTTAAAC:1 + chr2R 21464260 3' + TAHRE 10386 1 46.58 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAAC:1 - chr3R 24450439 3' - 412 80 2 71.23 GAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATGTTATTTATATGTTATTTCATCATGATCCCTCCGACTTTTCAACATCGCTCCC:1 + chr2L 9782130 3' + P-element 87 1 21.88 ACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGAAAA:1 - chr2L 23008338 3' - transib2 209 1 65.32 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGA:1 + chr3L 21380599 3' - I-element 85 1 74.66 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAG:1 - chr3L 18402982 3' - P-element 38 1 44.34 ATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAAT:3 + chrX 20999579 3' - BS 69 1 69.18 TCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTG:1 - chr3R 22590476 3' + rover 290 2 58.22 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTG:1 + chr3L 18125992 3' - Ivk 21 1 50.00 ATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGAAATTAATCCGCCATTTTCGGATGACCCCTTCGCCAAGGAAGTGGGCCAAAAGGGCGAAGCTTAGCGATTTATAGCCTTGGGCGCCAGCCATATAG:1 - chrX 12844220 3' + invader2 110 2 65.75 GTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCAAATGATCGATCGTTAAATAGAAAACA:1 + chr3L 10425930 3' + I-element 5340 1 69.86 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTA:1 - chrX 14771711 3' - BS 17 1 57.52 CAAAAGTGTGGGCGTGGTAGTTATGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGCGGGGACATGGGTCAACAAAATCAGCGCTACTTATCAAAATTAGAACAGCAAATCTCGGCAAACAAATTAAATATAGTAAAGCAAACTTTCCCA:1 + chrX 18817700 3' - INE-1 247 1 55.48 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGT:1 - chr3L 2544588 3' - Tirant 10 2 76.03 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTT:1 + chr2L 20266020 3' - roo 80 2 74.66 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAA:1 - chr2R 15004735 3' + BS 5056 1 45.21 ACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATAAAAAAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCAAACATTTATGAAACATGCCATAAACGGTATCG:1 - chr3L 2036942 3' + S-element 131 2 76.03 ACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACCCGATCGAAAGTGAGATGATTACACAACAAATATAATATATTTAACAA:1 + chrX 9590856 3' + transib4 2375 1 62.50 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGCCAAGATCCTGATAATCGAATAATGCTGGGCAAAGGTGAAAAGC:1 + chr3R 13973035 3' + 412 417 2 70.55 ATGAGGNTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCAT:1 + chrX 9950585 3' - jockey 4750 1 75.18 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCT:2 - chr3L 24131392 3' - Transpac 4977 2 61.64 ACCAATGTTTACTTCTGCATACCAAAAAATTGTGGGCGTGGCACCGCCCCTTATATTTAATTATCTGATTTTGTATAGGGATTTCTCTAATTTCGTATGATTTCTTGGTAGTGATTGCATTAAAT:1 + chrX 15553008 3' - Transib-N1_DM 400 1 77.60 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAACGGCAGTTCATCATTACAATACATTGCAGTGTGAAGTTTTGAAGAAAATAATACAGACA:1 - chr2L 12250914 3' + 412 7463 2 70.55 CTATGACATCAACTAACTGGAATGGCGCTCAATTTAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTGTAGATTTTCACGCTCTCAATTTTACGCAAGCGGAGAGAG:1 + chr3L 28011654 3' - mariner2 42 1 75.73 CATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 + chr2R 3262651 3' + invader1 3982 2 65.28 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGA:1 + chr3L 22035654 3' - F-element 76 1 69.18 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGT:2 + chrX 7795623 3' + roo 357 2 52.74 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGC:1 + chr2R 11159374 3' + roo 9034 1 58.90 TGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTAGTGATTTATTTATTAGTTGATTATACATTAGTTGGAGATCAGCACAAAACATGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATGA:2 + chr2R 4368664 3' - Doc4-element 26 1 78.77 ATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCG:1 + chr2R 15005104 3' - BS 5065 1 65.75 AAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGTGTTGACTCCAGCTATCAATGGCTGGCGGCACTCTATATAGCACTGGGGCAAAAGCATGTCTCC:1 + chrX 13758272 3' - roo 444 1 56.16 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATGAAACAAAA:1 - chr3L 11913151 3' - BS 5017 1 69.86 ATTATTCATATTATTATTATTGAGCATTTGCGCTTGAAGCGAATTCTGTGTATGAAAAATTCATATAAAGTTT:1 + chr3L 14858887 3' - mdg1 39 2 89.04 ACTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCA:1 + chrX 21587776 3' - INE-1 130 1 50.00 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAA:1 - chrX 17343398 3' - I-element 74 1 69.86 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAATTTGCAGAATATTCACGGAGA:1 - chr3R 14860097 3' + BS 5075 1 67.81 GAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATTCTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTC:1 + chr2L 15550761 3' + Bari1 1680 1 51.85 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATC:1 - chr2R 12472005 3' + transib2 2778 1 53.42 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGA:1 - chrX 19054269 3' - jockey 90 1 73.29 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTAGAAACCAGCAGTTGTTGTAA:1 - chr2L 11298012 3' + I-element 5324 1 62.33 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCAGCACGGTCAGCGATGGTCCTTT:1 - chrX 12066065 3' - transib2 16 1 70.55 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCA:1 + chrX 12129420 3' + flea 207 2 52.05 ATACACATATATATGTATATATATATATATTGATACGATTTTTTTTTGCAATGCTGATCATTCAGCCTCTTATTATCTCCCAAAGGAGAAAAGAAACTGTAG:1 + chr3L 9865673 3' + Stalker2 252 2 71.57 GTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATA:2 + chr3R 4679581 3' - hopper 31 1 63.01 CAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATTAGCTGAGACAGGTCAAGGATCAACGGAAACAGGAGCAAAAAATCCATCCACGGACATTGAAAAATTAGAA:1 + chr3L 13140346 3' - roo 8772 2 57.53 AATTATTTTCTATTAAAAAATTAAAAATTAAATAATTAAATTAAATAATACAAATTATAATAATAAAAAAGGAACAAGTTACCCCATTTGAGTGCCGAATAAACCTATAAAGCCCGAAATAGATAGGGTCCAAGCTGTCGGCACGC:2 - chr2R 20468961 3' + transib2 71 1 50.68 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACAGCACTCAC:1 + chr2R 22514158 3' + P-element 2806 1 14.40 TTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGAACA:1 - chr2R 2591096 3' - roo 8728 2 54.29 TTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTAATTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAAT:1 - chrX 21472692 3' + P-element 113 1 19.31 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACGCCTAAAGCCGTCCTTTCTCCTCCCACATCCTGCCGTGCATTTTGCCAGCGTAATTGGGCGTTGGGTGTATGCGTTTCAACTCTATAATTCAGCGGTATGGGGAGAATATGTGCCTTTTACAT:1 + chr2R 20587404 3' - accord 7028 2 76.03 AAAGACTCTAGAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTCTAGTGTCTTTGT:1 + chr3L 21253107 3' - Tc3 309 1 79.63 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGCCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAA:1 + chr3L 18505744 3' - I-element 59 1 57.53 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAAAATAAATAAATTCCTGGAAATCGATTTAAATTTTTTAAATTCTTATTAAGCTTTCGTTTATATTAAATTCCCCTTTGGTTTTCAATTAAATGGTTTCCCATTATTTATT:1 + chr2L 7125948 3' + I-element 5340 1 39.04 CAATTATCAAACCTTATACCCTCAAAGAGATAGAGGAGCGAACTATCTTGTCTTGTAAATTCTGGCGGCTTCTAACTCTAAACGAGGAAAAGACATGACCAGCATAGGAGCTACCTTGGACTTTGCAGTAGTAGGTTCACCGGCAT:1 + chr3L 26345229 3' + Porto1 312 1 75.34 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGGAACAGGTAACAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCA:1 + chr2R 5074572 3' - 1360 57 1 68.18 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAG:1 + chr3L 8959679 3' - 1360 15 1 59.77 GTTAAGTTAATTAGTATATTTAAAAGGGCAATACATTAAAAAAAAATAAAATGTTGTTGGTTTCGGTTACATTTTTGAACCAGAAAAGTTCTTAACTTTTACAGGACGCGTTTATACTCTCCGGGACGACAGATAAAAATATTCGT:1 + chr2L 17118051 3' + HB 288 1 66.44 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTAGTTCTTGCACTTC:1 - chr2L 9636055 3' + 412 453 2 54.79 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGA:1 + chrX 18336705 3' - mdg3 5289 2 60.96 ATTAAAACAAACAAAAAAAAAACAACACAAAAATCTAACAATAAAATCGACAAGAGCAACTTGAAAAAATGGACAAAAATCCGAGCAAAAAAATTGTAAAAAAAAACAAAATTGTTCGGTCTGCGTCTAAATGCAATTGGGCGTGT:1 - chr3L 15548469 3' + Doc 4701 2 76.03 ACATTAGAATAACAAGATACGTCACGGCCATATATTGGTTTTGCCAAAGACATTAGAATGAAGCAATTTGAAATTATCTTTTTGTATGTATTATAATATTTCAATTTATGTAGGCACCGTTA:1 + chr4 962196 3' + 1360 6 2 51.64 CTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACATTGATTGATATTGATGAAATATTAAAATAAAATGAATGAAGATAGAAAGTGTTATGTAAAATGTAAAGAAC:1 - chr2R 1369870 3' + copia 150 2 52.74 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGAT:3 - chr2R 22034646 3' + copia 5067 2 58.90 GGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATGTGTAGATCATCGTTCAACGTTTATAAAAAAATATATATAGTATATATGTTTTGCCATGAAGTTTGAACTGTTCTCTCAAGACTTTTGTTGTTTTTGTTTTTTGTT:1 - chr2L 11211586 3' + Juan 4034 1 78.77 AATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTGGAGGTCTTGTTGTTTTTGTTCGCTTTGCCATTGAAAGTACAATCGGAATTTTCATTTCAATATTTTGATTTTGGTTCTATTGTAT:1 + chrX 13480792 3' - I-element 195 1 55.48 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATATACGACATGACCCAC:1 + chr3R 25428284 3' + 297 6949 2 65.71 TATCATGTCTAAACACATATTTAGACAACATTGAAACAAGCTATTTATATATTTAATAATCGGAGTTTTATGGAGGCTGTATCATAATAGCCGATTAATTTTAAACCAGAATTATATATTGGAAAAAATACGTGTGTAA:1 - chr4 289881 3' - rooA 7241 2 76.26 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTAT:1 - chr2L 17809188 3' + jockey 4932 1 62.22 ATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGAATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTTAAGTCAAAGAGAATCAAGGGTGTCGGGTCATGCAGCCGCCAGCAATCCTAAAAATTGTTACT:1 - chr2L 22633119 3' - 1360 312 1 64.38 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATG:1 + chr2R 23180281 3' + roo 9001 2 65.75 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCAAATGATAGTAA:1 + chr2R 12645538 3' - X-element 40 1 59.59 ATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATATTGTTGAAACGCATCTTGGGTGGGGTGAAGGTTAGGCAGCTGTTCGACCTGGTTGACGAATCCTGATAATTT:1 + chr3L 23447220 3' - HMS-Beagle2 6850 1 55.75 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTAAATTGAA:1 - chr3R 18093303 3' + I-element 5276 1 73.29 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGAT:1 + chr2L 20840106 3' - mdg1 28 2 65.07 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCC:1 + chr2R 7850035 3' + roo 405 1 70.00 ACCTGCGACATTGTAATGACGATCGCTGTCGTATTTGTGGAAGTAAGCAACAGCAACAACAACAGCAACACAATCAGCAACAGCAGCAACAGAACACGTACTACGACTTCAACAGCAAGCGGAATGCTCCGCTCAAGACGGAAA:1 - chr3L 20237679 3' + G3 186 1 65.97 GTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTGTTGTGGGGCGCTTAAATTACAAACCTGTGAGAAATTTAGTCGCTGGTTTAGTTGCTTTGTGACTGAGGTGATCCATACACTGTCGATAGTTAGGGG:1 - chr3R 14508225 3' - Transpac 353 1 72.41 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAA:3 + chrX 8308502 3' + roo 9015 2 58.90 AAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAGGATTGGCTGAATAAGATAAACCAAAGCGAGGGCGGCCTGGATGGCTTTTCGACGGCTTACAAGCATTACGGCCTTCACTTCCAGCCGGACAATTCGGTGATTGCCCGC:1 + chr2R 13172653 3' + P-element 177 1 73.97 TTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTATTTTTTAAATAAATTTCCAT:1 + chr3L 8956646 3' + hopper 147 111 65.91 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGGCTGCCGATGTCCTGCTGGGACAGCATCCTGGCCGAGACGTGCTCA:1 - chr3R 8075848 3' - 412 7070 2 74.66 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGGGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAA:1 + chrY 2720352 3' - 297 56 2 75.00 AGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCGGTCGGCATTTATAATTATCCAGGCAAGTCAATCAATCATCCTGTGAAATATATTGCAATCGCATCAAAAAAGCGGCAAATTAAAAGCCAGTGGGAGATCCTGCTGT:2 - chr2R 11066255 3' + HMS-Beagle2 433 1 63.01 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTT:1 - chrX 19539468 3' - pogo 47 1 53.10 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACGTGATGCCTGGCTTTAAGCCATATTTTATGGATACCGTCCGCTCCGTTCCATAGCCACGTTTTGACAGCTTCACGCTC:1 - chr2L 17091117 3' - Quasimodo 35 2 68.55 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCA:1 - chr3R 30946510 3' - Transpac 4953 2 54.17 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCA:1 + chr3R 20167682 3' - roo 56 2 58.62 TAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAAT:1 + chr3L 23839699 3' - 17.6 6993 2 76.71 GAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTTTGCTGG:1 - chr3R 17996192 3' - diver 5962 2 74.44 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAATGTCGTGCTGCGCAGATGTGAGCTGGGCGATGGACCTTTATATTTTATTGACACATAT:1 + chr2R 9871599 3' - roo 8678 2 65.15 ATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCATGGCTAAGGGCACTCAAACTTGCACTGGAACATGGAGGA:1 - chr3R 7754913 3' + Burdock 6330 2 64.38 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGGTCGCTGCTCTGGGAATCTATGTAT:1 + chrX 1135395 3' + P-element 2844 1 47.62 ATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATG:1 - chrX 292426 3' + G3 4509 1 64.83 TTTTTTTTTTATTTTAAATATTTTAATATTTAAATCATAATCAAATAATCCGATTATATTAATGTTTAAACATCGAGAACTTAAACTAACCAGATCGAGTTTGCTAGTGATCCTAATCAAGGATATACTCACTTTATAGGATTTCT:1 - chr2R 11925505 3' - TART-B 10630 1 77.40 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATA:1 - chr2L 7660897 3' + I-element 5308 1 50.68 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAAT:1 - chr2R 8157197 3' + mdg1 7374 2 77.40 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAAT:1 - chr2L 4003643 3' - mdg1 19 2 71.03 ATTGGTAAAATAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCAGCAAAAAGCGAAAGGAGAATATTTGAGTGCGAAGGCATCATGAGCTCATATGTGTGTGTTTGTGTCTGGGTGGGTGTGAAAATAAGCACGAAAATTCCGCAAGCATAAA:1 + chr3R 22192843 3' - Tc1 1476 1 75.34 GCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATAATTTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAATCTTGTATACCCTTTTACTCTACGAG:1 + chr3L 25245594 3' - INE-1 149 1 79.45 ACACACACACACACACGCTGCGCTGCACTCAAAAAGCCGAAAGTAATAACGACAAAAAACAGCCAGCAGCAACAACAAGCTGTAATGATTATTGCTGCAATGTGTTTGCCACA:1 - chr3L 5731039 3' + accord 7104 2 71.68 ATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATATTTTGTGGTGTTAACAATGGGATTTACTTAAAGACTTTATTCATTGATTGCGGCTG:1 + chr3L 3261899 3' - mdg1 7263 2 60.74 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGGTGTGTTTCTAGTAGCG:1 - chrX 21087605 3' - mdg3 5319 2 69.18 AAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGTGGCTGT:1 + chr2R 18316157 3' + HMS-Beagle2 307 2 73.68 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTG:1 + chr3R 27843248 3' + I-element 5291 1 62.76 CAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTT:1 + chr3R 30987560 3' - F-element 150 1 73.10 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTT:1 + chr3R 21933233 3' - pogo 43 1 63.03 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCC:1 + chr2R 7090737 3' - I-element 24 1 63.03 ATGTATGTTCTTGATCAGGATCAATACCCGACGAAATTATCCGACTATCTGCTGCTATCGTGTAGCTGTATCTGCCGTTTGTATTTGTATCTGTATCTGTCTCTGTATCTGCAAACGCGGCTAGTGGGCTTCTGCTGC:1 - chr3R 18505143 3' + INE-1 80 1 74.64 AAAAACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGTC:1 - chr3L 25911964 3' - looper1 1514 1 78.08 CTCCACGTTTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTATCGATCTGATACAGGTTACTCATTCCGGCAATCTTGAGTAGACTCCAAAATCTAACTCGTGATGATTTGACCGCCAAACAAACGCAACGCAGCTCGGCAGGTTTTTAAGTTTA:1 + chrX 18155406 3' - 1731 465 1 62.33 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTCTTTGAGATAAG:1 - chr2R 9871007 3' + roo 9036 1 59.59 ATACGGTAGATTAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTATACCTATTGAAGATGAGGTCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCCCGCTCTCCGAAGAAAGCGAAGAAAGGGGAAGC:1 + chr2R 14348213 3' - Circe 81 1 74.66 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCTCGCACTAAAACCATGCA:1 + chr2L 16564619 3' + roo 401 1 73.97 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATATCTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTGATTTATAAA:1 + chr3L 22723989 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.71 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTGTAAGTATTTATAAAA:1 + chr2L 21328289 3' - 297 6608 2 67.13 TGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTG:1 + chrX 21994035 3' - McClintock 11 2 76.09 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCT:1 - chr3R 6625665 3' + flea 4990 2 68.49 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATGTAAACAGTG:1 + chr2R 6847881 3' - Doc 29 1 70.55 GTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTT:3 - chr3R 6625713 3' + flea 4942 1 70.55 GTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAAT:1 - chr2L 4754874 3' - Stalker 6905 4 54.79 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAACAGCAGCAACAACCGTCAGGAGC:1 + chr3L 19111634 3' - Doc 39 1 65.75 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTT:1 - chr3L 9809233 3' - 412 47 2 53.42 AAATGTACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATAAAAATATATATTTTATAATAATTGTAAGTGTTAGAACTATGTGGCGTGCCTCACATTTG:1 + chr3L 23392874 3' - invader5 3707 2 71.23 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAGTGTCCCAAAATAGCTAAATATTGTAGATTAGCTCCACGATTAGGATCGCAAGCACCCGTTTAATT:1 - chrX 20455614 3' + hobo 2894 1 50.72 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATAT:1 - chr3R 24219294 3' - roo 86 2 78.08 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTG:1 + chr3R 15791016 3' + roo 9020 2 55.48 GTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTTTAATATATTTTACTTTGATTTAAAAGTATAGTTTCTGTAAATGGGTACTATTGAAAGTCCTGTAAGATTCACTTGCAGTTCAAATGTTGTTTGACAACTCTGAAAGTTTATTTTC:1 + chrX 4031480 3' - Bica 351 1 77.40 TAATAATAATAATATTAACTATTACGATTATGAAGCAGAATGCTAAAGGGGCCAAAATGATGTCATGTATGTTAATGTAATGGTTTCTATATCCACCCTTTCTGCCAGCGAAAACTAGTTTCCCC:1 + chrX 8038159 3' + mdg1 7077 2 71.20 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAA:1 + chr3R 2425642 3' + 1360 3317 1 77.40 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTT:1 + chrX 21100297 3' - mdg1 7059 2 71.92 TTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAATTATGGCAAACAACTTATTGTTTTAGT:1 + chr3L 6447165 3' + transib2 2804 1 70.55 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAA:1 - chrX 20999503 3' + BS 5037 1 59.03 ATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGTCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGGAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTGCGTGGACAGCCAAGAATGATAGTTT:1 - chrX 11468053 3' - BS 4661 1 63.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATT:1 - chrX 21216704 3' + roo 9047 1 62.60 ATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACTG:2 - chrX 3431825 3' - Ivk 5325 1 67.12 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATATATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTATTGAGAAATTAAATAGTCTACGATTTGCATTAGTTCTCCGC:1 + chrX 18396223 3' - roo 19 2 71.23 AGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTTTCTTATCAATATCACCACGCCAAAAATACGATAACGACTATCTTCAAATTTCATTCACCAAAATCGGCATCAATGGCAAAACCTTCTATTTGGTCA:1 - chr2R 10422828 3' + INE-1 550 1 58.90 TATTATTTTAACCGCAGCTGGATATATTTCCATATTAGAGTCGTTATG:1 + chr2L 18112973 3' - Tc1 1 1 60.42 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTAAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCA:1 + chr2L 11391601 3' - 1360 46 1 50.00 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATAAAAAGTATGTTCATTGTTGAATAAG:1 + chr2L 22193538 3' + roo 9033 1 58.62 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAAATTTAGGATTTGGATTTTAAATATCAACGCGTACAGTAAACG:1 + chr3L 16970509 3' - roo 14 2 72.60 ATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTGCACCGTGAGAATAATTCTTGTCGATTCAAAATGTCGCATTGCACTAAGAAACCCTAAGAAATCTTATTAAAAGCTACTATAT:1 - chr2L 20031281 3' + hobo 2614 1 56.85 AAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGGGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGGTTATGTCTTTGTTGTCCGCAATAGCCTACATCCCA:1 - chrX 17436185 3' - Quasimodo 7090 2 71.30 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTACGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATG:1 - chr2R 20227211 3' - hopper 28 1 50.83 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTG:1 + chrX 4808594 3' - mdg3 5331 2 69.66 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATACATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAG:1 - chr3R 4461019 3' - blood 4 2 47.19 AGCTTAAAGAAGCTGGGTTCGGAAATATGGAATATTTGGAATTTGAAGCAAGAAAAGTTTGCCCACCAATTGGTTTTTTTGCCCATGTCCAGTTTTGAAAATATCAAATTTCGAAAACTGTCAGAGATGATCATGTTTTATAACAT:1 + chr2R 10795452 3' + FB 1 1 74.66 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGTGATTTAATATTTCTTTAATGGCTTCAATATTTCATTTTT:1 - chr3L 27865945 3' - Max-element 7 2 72.60 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGTGGGGTAGCTTAAATTTTATTTATGGCTGCCA:1 - chr2L 2527657 3' - hopper 74 1 73.64 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTAT:1 - chr2R 14653125 3' - 297 6599 2 58.22 TATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGGGTGTGTGCGAGGCAGTGTGCTAGTGTG:1 + chr2L 2527711 3' + hopper 1343 1 67.61 AAACCGAAGATATGTCCAAATAAAATTAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACTCATACGCCCCATT:1 - chrX 21216731 3' + roo 9015 2 63.28 ATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCACGACACCAATCGCTTAACGGAAACA:1 + chr2L 22674937 3' + mdg1 7459 2 77.30 CAATCCTTGAAAATAAAGGGAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTAGAAAGGTAGATGAATGGGTGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTATATGTGCGGGAGGAGAACAAGGTCAAGGTGTTCACCGTGGAGAAGGATAGTA:2 + chr2L 14929358 3' - transib4 2483 1 65.75 AATAACACTAATAATAACAATAGCTGAATATTATTCCTGAAATTTGTAAATTCTGCGCTGCAGAAATCTAACTTTCTGATTAATAAATGTACCTTCTTTAATTACAGTACGCCCTCATGAAGTTGTTTCCCATGGAGATTCGTACT:1 - chr2L 16853824 3' + mdg1 19 2 56.85 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATA:2 + chr3R 15791004 3' + roo 9008 2 63.70 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGATAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAG:1 - chr2R 20227203 3' - hopper 42 1 48.59 TATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGA:1 - chr2R 10161807 3' - transib2 84 1 73.29 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTA:1 + chr3L 19111586 3' - Doc 87 1 76.71 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCA:1 + chr3R 11062819 3' + roo 333 2 66.44 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTACAAGTATACTGGCATAATA:1 + chr2L 20205345 3' + P-element 2795 1 16.91 GTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGTTGTTGCTGTCGGCTTCTGGCCATGATCCTGTTGACGTTTTGCTCTTGTTGTTGTTGTTTTGGTAGCTAGTCAAGTATCGAGTATCGAG:1 - chrX 9914400 3' - F-element 4335 1 73.81 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTAT:2 - chr3L 2989896 3' + roo 9050 2 69.86 ACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGT:1 + chrX 7795652 3' + roo 9050 2 70.55 ACAGAGACCTAAAAACCAAATTAGTAATCGAAGTACTATCTGAGAAGAAAATGCAAGTGGATTTATTAATGACCGCAATTATTCTTATTATTATTACGAAAAGAAGCTAAAAATCAAAACGGAAAAACACGCGTTGATTTCTTTCG:1 + chr3L 14174639 3' + Doc 4416 1 69.18 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAA:1 - chr3R 16518859 3' - Tirant 8145 2 60.96 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCAACACCTGTTATGGCGC:1 + chr3L 13295008 3' + roo 9036 1 61.64 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTC:1 + chr2L 10156215 3' - hopper 56 1 56.85 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAA:1 - chr2R 8099154 3' - jockey 4835 1 69.18 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAATTCAATTCAAT:1 - chr2L 2157852 3' - Doc 78 1 48.28 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAAT:1 + chrX 10167498 3' + roo 9039 1 62.33 CTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACCACCTGAGCGATTCCCGTTCCCTTCAGCAGAGGCGTCATGCGAAACATGCCAGTGCATCCGGTGCTCGAGAACTGACCGAT:1 - chr2L 7711903 3' - Stalker 7118 4 66.44 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAAATTAATCTGTTTTCAAATGTAAAATGGA:1 + chr2L 11357965 3' + blood 358 2 71.92 GTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAACATAAAGGAATAGTAGTGATAGCGTCAAAAATCTTATATTGAAAAAAGTAAGATAAGTTTCCTTTATTCAT:1 - chr3R 4574866 3' + jockey 166 1 51.37 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGC:1 - chr2R 22034640 3' + copia 215 2 54.07 TTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAATGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAAAACAAATTTTAAAGGG:1 - chr2R 23000263 3' - FB 712 2 82.22 CTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAGGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGGATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAG:1 + chr3L 23702244 3' - G4 74 1 65.07 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAGATCGTGAACA:1 + chr2L 22170098 3' + Juan 4204 1 73.29 GTTACTTAGAAATCAAAAAATGAAAGGAAGGAAAAATATAAAGCCAGATGCATCCGCAGCCAAAGGAACCCATACACAGCGAGAAATGCATTTGCCTCTTCTTATATCATAATACA:1 - chr3L 14325538 3' - transib4 74 1 66.38 CGAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATA:1 + chr2L 11391581 3' - 1360 66 1 58.90 GGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAA:1 + chr2R 9967122 3' + Bari1 1636 1 65.75 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACAC:1 - chr3L 1692018 3' - blood 7042 2 53.85 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGTGTCTGCATCGATTAGTACCACAATAAGCCCTGTGAAATTTTTGA:1 + chr3R 9003054 3' - roo 19 2 72.60 AGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCGAGTACAACATGGAACC:1 + chr2L 15550801 3' + Bari1 1682 1 64.38 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCATAAAGCTAACTTCG:1 + chr3R 23639275 3' + pogo 2082 1 65.19 CACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGCTCTGCTCTTCTCGACCCACAGGGATGCAGATATAATAATTTGCCACATTTTGAGAGTAAATATTAATATATTT:1 + chr3R 24062391 3' - Burdock 6026 1 72.28 AACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGAGGGCAACACCCAGAATATAATGGTGGTTATTTCTAAACG:1 + chr3L 13739712 3' - BS 5001 1 75.34 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATG:1 + chrX 8092505 3' - pogo 32 1 58.96 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGAC:1 + chrX 11661510 3' - pogo 43 1 55.56 CCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCTCTTATCTGTGCTAAGAT:1 - chr3L 22531922 3' + Cr1a 4223 1 53.42 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAAAAGTAGGCAGCGCGAAAATCGTCCAAAAAATTGAGCACAAATGCTGGGAAGTG:1 + chr3L 21763810 3' - jockey 17 1 74.40 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTATTCGCACATGAGTTTTCGCTGGCGG:2 - chrX 11661342 3' + pogo 2089 1 77.24 TATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTG:1 - chr3R 11040037 3' + Bari1 1663 1 55.48 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTT:1 - chr3L 1279075 3' - roo 53 2 55.86 TTATTAATAAAAAAAAATCATGAATTTAAATAAAAGGTCTTTATGTTTTTGCATTTAAAGTCAAAAATACACTGTTTCATTAAATATCCTTGGTGAGCAAAGGGCCATGAAATGGATTCCGATTGACCTTGGCCGCC:1 - chrX 5788677 3' + S2 1627 1 54.01 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACATCTCGAAGTCGCATTCTATAAGAGACTATGTGAGGCATTTTTGGATTCTGGCAAAAATGCTTAACAAATCAATAAC:1 - chr2R 22992428 3' + hobo 2912 1 56.92 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTG:1 - chr3L 21327070 3' + copia 232 1 54.79 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTC:1 + chr3L 3983876 3' + P-element 2805 1 30.14 ACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTG:1 - chrX 20999477 3' + BS 5061 1 60.96 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCCCAGCAGGTGG:1 + chr3R 28901339 3' - transib2 30 1 61.65 ATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAAT:1 - chr2R 10161802 3' - transib2 79 1 70.55 TTTTTTGCTTGCAATGCAAAAGCTGGTAAGGTCGTTGACTGAATCGTTTGAGTTAAAGAGACTGCTGCTGTTGAGTGGCTAGTTGTTGTTGCGAGTCTGCTGGCGCTTTGTTTGTCCGACTGCGG:1 + chr2L 16349426 3' - Doc4-element 377 1 63.20 GGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAG:1 - chr2L 16946040 3' - hopper 71 1 64.38 ATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCACA:1 - chr3R 907899 3' - gypsy11 4338 2 32.19 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCTCAAATGGTCGACAGCCTCAAGAGCAACACGTGCATTCTGCTTTCA:2 + chr2L 9636206 3' - 412 31 2 54.79 CTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTGCCCCTTTCTTCCTTCGAACTTTTC:1 - chr3R 7944795 3' + blood 115 2 74.07 AGTAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTTCAACTTAAAATATTGT:1 + chrX 22824253 3' + Gypsy12A_LTR 2233 1 47.95 ATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAAT:1 + chr2R 4545183 3' + invader1 3548 1 61.64 AGGCCCCCTGGTGGGAGAATCGTGGTTGCTTGCGTTAAGCGTTACATTGGCGAGGATGAGCCCCAGTTAAAACGCCATGCGCTGTGGCATGAGATTTCCGGTATTCTGGGGGAGGAACAGCTAG:1 + chrX 12630769 3' + R1A1-element 4982 1 75.81 CTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATC:1 + chr2L 1924011 3' - G2 3025 1 58.22 ATTATTATAATTATTATTATTATTATTATTATAATTATAATTATTATATTGCGCTTAGCCATGCGGACACCGAGAGCATCACCAGCGACATCGGGCCGCTACC:1 + chrX 11357891 3' - mdg1 30 9 52.43 TAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATGTCATAAGTCAACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGCAGGTACTCGCAGGCAGACATTAAAAATTGCCTC:1 + chr3R 4802639 3' - G4 3472 1 76.71 GATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATACTATCTACATACCCTCTAGCATACTAC:1 + chr3R 1397944 3' - HMS-Beagle 6866 2 78.23 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATTTTGAATAAAAACTTAAGCGTTTCTAAAACGTTTTTATGGATGAATTGTTTAATGTGA:1 + chr3L 2990089 3' - roo 9 2 76.03 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATATGTAT:2 + chr3R 23085629 3' - transib2 43 1 56.16 AAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCAACTGCGATTTATGCCACAACGGCTTTTTCTCCACAAGCCTCTTTCTCTCGCTTTTTATGACTACCATAAAAATGTTCCACGAAGCAA:1 + chr2L 14666221 3' + FB 334 1 64.38 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACT:1 + chr2L 5582200 3' - pogo 67 1 66.44 ATTCGTGTGCCAAAAAATCGTATTCTTTATCGATTGAGCTCGCAACTCGCTTCGCGCAATGTGGCATCTAGCCCGTCTCAACGTTCACAATGAAAACTGTCTGAATTGCCTGTGACGTCTGCTGCTCTTCTTGCACATGAAAACCA:1 + chr2R 4720776 3' - 1360 35 1 62.33 GAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCCACCTCCAACAACAACAGAACCGCCCAGACAATTGAAAGGCACTCAGCC:1 - chr3L 20663915 3' + F-element 363 1 65.35 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTAC:1 - chr2L 22674748 3' - mdg1 29 2 67.12 AATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGTCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAATAAA:1 + chrY 1654285 3' - INE-1 531 1 41.78 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCTCCAGACTGTG:1 + chr2R 18530003 3' + jockey 4969 1 69.86 TGACTTATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGTATATAACTAAGTTAAGTTTCAAAACTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTAAATGATATCGTTCAGCTTTCTTCAGTTGGACG:1 + chr3R 3589860 3' + Tc3 1629 1 71.23 ATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAG:1 + chrX 12657099 3' + Stalker4 7057 4 53.10 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCT:1 - chr2R 10161782 3' - transib2 22 1 60.55 TTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGT:3 - chr3L 21996183 3' - Transpac 86 2 72.60 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACA:1 + chr3L 6397762 3' + roo 352 2 55.86 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCT:1 - chrX 22840472 3' - copia 59 2 58.90 AACTATTGAAGAAATGAAAGTGAAACATTTGATGAATTGTTTGAAATCAAATACCTAATTATATTATACAAAATAGATGATCCTATTTACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACA:1 + chr3R 19446682 3' + HB 1489 1 59.31 AGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTT:2 - chr3R 19225009 3' - HMS-Beagle 6875 2 72.60 CATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATG:2 + chrX 3431982 3' + Ivk 5339 1 54.11 AAAAAAGAAAAGAAGCGGACCTTCCCAGTGCAAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTACTTTTGTTTTTCTTCCATTTCCTCAGGTGGATTGGTGTAGTTTGTTCTACAGGTTCGCCGGTGTGGTTGGCATTT:1 - chr3L 10500276 3' - Porto1 4598 1 50.00 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGA:2 - chr2R 24169955 3' - transib2 46 1 48.63 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTT:1 - chr3R 24450416 3' - 412 38 2 50.39 ATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTTAAAAAAAAAAACACCAGAAAAAAATAAAGTATTAATAATAAGACAATAAAGCACCGATTACA:1 + chr3R 7991502 3' + Doc 4655 1 67.86 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCTTATATTGGGTCTACGAGACTTCTGCGGCGGA:1 + chr2R 6964922 3' - Burdock 14 2 76.03 CATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTTATTTAGGCCAAGACATCTGCAATAGCATTTGTAGGTACTGGTGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGCGATCC:1 + chrX 22727594 3' - Helena 3 1 69.17 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTAC:2 + chr3R 9039036 3' + Juan 4172 1 55.48 TTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAG:1 + chr2R 4545154 3' + invader1 3541 1 49.19 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGA:1 - chr2R 8099167 3' - jockey 4848 1 78.08 TTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGCCAAAGCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTATGTATTATCAATACCGATGAAGTCATATGTACATACATACATACACCCAACTGAACGAGGTGACAAACAA:1 + chrX 22843549 3' - HB 90 1 73.97 AGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCAT:1 + chr2R 12185460 3' - accord 19 2 69.86 TATAAATAAAAAACATATAAAAAACACTCTTTCCCTTAACTAAACATTTTGATTACACAAATATGAGCTGAAGCAATTCTTGATAATTTCAAGCATTTCCTCTATTCCAGATGCCAATCGACCTATTGTCCAGCAATAATCTTTTC:1 + chrX 7797798 3' - Circe 425 1 79.45 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGC:1 + chr3R 15942805 3' + hopper2 1551 1 58.90 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCT:2 + chrX 13490733 3' + 297 318 2 78.08 ATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTATATAATTAGATCCTACTTCTAAAATTGCGGTTGTAAAATGCGAAAGTAACTTACCTTAATTTGAAATCCTTTCATGAAATCAAAATGAA:1 - chr3R 7325441 3' + Cr1a 4229 1 51.37 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGAT:1 + chr3R 20167668 3' - roo 71 2 68.49 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCA:1 - chrX 19074772 3' - mdg1 7106 2 62.33 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTAG:1 - chr2L 17205161 3' - hopper 46 1 53.79 AGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGGAGATG:2 + chrX 15946784 3' - INE-1 572 1 47.95 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGGGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCATATACTCTGGCACATATGCTAATATATATATTTTGGGGTTTAATAAAATATTATACACTTTATTCGTACATTCAAACA:1 + chr3L 24208199 3' - Quasimodo 66 2 66.20 TGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGCTTAAATCAGGGGCCACAGT:1 - chrX 13134827 3' - jockey 4760 1 81.51 GTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATGAACAAGTAGGAAGAGCACGTTCCCGACTATAATATACTTAGCAATCAGGAGAGCACCGATGGTAAATAATGAATGGATAACCTTTTCACTGTTATGCCCGTATAGTA:1 + chr3L 19898953 3' + Stalker 6849 2 76.03 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAAT:1 - chr3L 21996126 3' - Transpac 4948 2 70.55 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTG:1 - chrX 8038619 3' - 297 6635 2 69.11 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAA:1 + chr2L 12251002 3' - 412 7089 2 51.54 AATAATATATTTTTAGATTTTATATTTAAATATTTTATATTGATTCTGTTTCTATTTAGTATCTATGTGTTGGTTTTTGGGACGATCTGTTTCTTTTCTTGTCCTTGTCTGTGTTTTGTACATCTCGTTTGTGTTCTACTGTTTTG:1 + chr2L 12394241 3' + hopper 171 1 62.33 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTA:2 + chr3L 12315796 3' + transib2 2736 1 76.71 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCA:1 + chr3R 23295596 3' + P-element 2847 1 29.45 AAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATG:1 + chr2L 11257096 3' - rover 7028 2 72.60 CGAAGCGAGGCTTTGGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACA:1 + chr3R 18093398 3' - I-element 39 1 56.16 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCATATTTGATGGACTTAAGCAAAAAGAATGAGTCATACACAAATATCTAATAATCACAAAATGCTACTTTGATATGTAACAAT:1 - chr3R 30805292 3' + roo 348 2 58.22 TATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCC:3 + chr3L 3501863 3' + Bari1 1692 1 68.49 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCTGCG:1 - chr2L 5582118 3' + pogo 2045 1 65.60 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGTATGGTGGTCAGTTTTT:1 - chrX 8027376 3' + Juan 4197 1 66.90 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACA:1 - chr3R 25709774 3' + hopper 1349 1 63.01 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAA:1 + chr3L 13836700 3' - 412 71 2 65.75 ATTTATTTATTAAGAAATGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGG:1 - chr2R 5941355 3' + copia 234 1 56.10 AAAGAGTATTATGTTCTGACTAGTAAATAGTACTACAATATATTCTCCATTAAAGAACACGAACGATTACGAGCGCCAAGATAGCCTAAAGAACACTGACGAAAACCATTTTAAGTGTTCGCAAATTCAGAAATGGAAAACCCA:1 + chr2R 4388745 3' + Cr1a 4188 1 69.44 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATATAGTCCACATGGTCACAGA:1 + chrX 16946742 3' - FB 40 1 58.62 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATTTTTTTATTTAAATCATACGGTGCCACAAACTGTCCATAT:1 - chr2L 6102885 3' + roo 9055 2 62.33 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAAGTGTTTTGCATAAAAAACCGACCAAAATGAGTCGGCGGGG:1 + chr2R 20227363 3' + hopper 1411 2 78.20 GTGCGGCAACATAACTTCCCTTTTTAAAATGCGCGTCTTTCAGTTAGATTAAGCGAAGTCCCTACAATCAGCTGCTGATGAAGAAGTTCCATTTGATAATGGATCTCAATGATAGACGTTTTTGCCAGCTCACCTTTGTGCTTAAG:1 - chr3R 22706798 3' + mariner2 5 1 66.44 ACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTATGTAAGACAGTTCGTGTACATGGTGTTGGCGGTTGTCTGTTGGATTCAGCTGGGGCTGCAGCTCAACTGCTGG:1 - chr2L 13954535 3' - I-element 434 1 64.71 GTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTA:2 - chrX 21087601 3' - mdg3 44 2 69.03 GCCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAA:1 - chr2L 12818234 3' + hobo 2906 1 53.39 AGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTCTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTTTTTTTCAATTAGCTAAGATAAGATGAAAGTTCGTCTATATAAATTATCCATATTACCTATCCGCTTTCCCTTTTCTCTCTG:1 + chr3R 31151350 3' - Idefix 7128 2 62.69 AAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAAATTTCTCTCTCGCTCAGACAGAGGCACACACACACACACACACTCAGTCCCGATGCACAGACTAGGATGCACAACCCCCATAGATATACCCCCCAATTTACCTTCAGCC:1 + chrX 9026048 3' + hopper 116 1 59.42 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTCAAC:1 + chr2R 5480007 3' - F-element 60 1 55.48 AGGTCATGAGGGTGGAGTCGCTTGAGTCTTCTTTTAACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCCTCCTTGCTAGGCTGTTGGTGTGAAGGTAGGTTCAAAATAAATAGTTGCACATGACATAAATAA:1 + chr3L 16470343 3' - jockey 4755 1 64.83 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACT:2 + chr2R 16817953 3' - 412 7137 2 76.03 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATCTTCAGATAATTCAGACAG:1 - chr2R 3563077 3' + Transpac 5178 2 50.68 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACTA:1 + chr3R 9039038 3' + Juan 4182 1 58.70 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTCCACTGTGAGCATTCTCGAAATAAGAGTTTTTGCATCACCCTCGCCCTCTCACTAACTGAGTTAAGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTT:1 + chr4 212335 3' + roo 9042 1 63.64 TTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAA:2 - chrX 3431871 3' - Ivk 5371 1 56.16 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAA:1 + chr3R 21933266 3' - pogo 37 1 63.70 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAA:2 + chr3L 9269988 3' - copia 59 2 58.22 AAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAGAAAT:1 - chr3L 24213777 3' + invader2 173 2 68.49 GGAGGAATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCTCCC:1 + chrX 14450503 3' - hopper 26 1 60.17 TAATAATATTATTATTATTATTATAGCACTGGCTGCAGGGCAACATAGCCATTGAACGTCGAGATCTCGGGAACTATAAGACCATAGAGGTATTCTTCTAGTAAAGCATATTTGTTAAAATATTTTAGCATAATCATCTTGCAGCT:1 + chr2R 10930283 3' - mdg1 7075 4 77.40 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATC:2 + chr2L 13556480 3' - transib2 23 1 64.38 TTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTGCGTTACTTGGAAGCTCCTAATCTATTGTAATTTACTAGCACATAACACATACCAACAATTTGTTTTGGTTCCATAATTCCACAAT:1 - chr3R 3855248 3' - Idefix 100 2 71.20 TTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAA:1 - chr2R 5501139 3' + mdg1 7079 9 73.85 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTG:2 - chr3R 19032606 3' - roo 8734 2 69.18 GACTATCAGATACCCCTTACTCCCTGCGAGAAATATGAAGATATGCATGAATGAAGTTATGAAGTTGGGAACGCTTCCTTGTCGCTTGCCGGAGCGTAACTGAAATATTAAAACAAATTTTTCCGCTTTTTTTTTCTAGTTTAGTT:1 - chr2L 11979702 3' - INE-1 549 1 56.16 AGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTACTGGAGTATGAGATTACTCGCTCGCCTCGCTCGGAATGCCGCATAAGGATTGCACCCACATTCTATTTCGCTGTTATTCGGCCTTCCTTACTGACT:1 - chr2R 19658190 3' - Osvaldo 28 1 70.31 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCTACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAA:1 - chrX 6475288 3' - Doc 57 1 51.37 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACA:3 + chrX 1341757 3' - 412 37 2 60.27 ATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTTCTCCATGCATGCCAATTTTTTGGAAAAGGCTGTGAAGTCTGCAATGCTCAACTACTTAGGCCAGCTCCAAGTCCTTCTGACATTTCCCGGAATTTTCCC:1 - chr3L 20849075 3' - baggins 5237 1 61.19 AAATCTAAACATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCTTTTCCTATGTAGAAGTACATTTTCTCTTAAACAACGATATAGTGGAATGTATATTTTTTTTGTTATATAT:1 - chr3L 13469581 3' - 1360 3269 1 53.42 AAATATTTGTTAATTATATCTAATTGTTAGAAAGAATTTAGCAAATATGCTTGTGAAAGAATTCAATTGATTTAACCTTCAATTAAGCTATATAGTACTATGTACAAACTGTATACTTCCCCCCCACAAATTTCGCCCAGTGTACT:1 - chr3R 18029194 3' - Juan 4106 1 42.47 TATGTTTAAAATATATGATACTTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCGTAAAGTCAGTGTTATTGTTCAAATACTCGTTTTGGGCACCTACGGTGCTCGACATCGGAC:1 - chr3R 2532185 3' - Cr1a 93 1 54.13 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGTATTTATCAATACATTTAAACCGTTTGTAATGCATTCAATAGCAA:1 + chr3R 4461160 3' + blood 346 2 68.49 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTTCGGC:1 + chr2L 19924088 3' + roo 9059 1 70.34 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTAGTCTATCTATGATATTAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTAC:1 - chr3L 18931006 3' + I-element 5276 1 79.37 AGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTATATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTAAAGTTGTGGTTGTTGTTGCTTGTGTTTTGCCTGGCCTACCCTT:1 - chr3L 21008372 3' - F-element 4618 1 66.91 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCGCCTGGCTGTCCTCCTGGGATGGCTGATTGCGTT:1 - chrX 19588001 3' - roo 8685 2 63.89 AATGCTCAGAAAAAGCACAAAAGTCTAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAGTAGTAGCCTGTATATAGTCCTTTTTGAATCCATCGAGCTCTATGCACTTGATGCTTTTTTTTAATTATTACTGCCTTACC:1 - chr2R 10156425 3' + Porto1 4343 1 60.00 GTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATT:1 + chrX 22824260 3' + Gypsy12A_LTR 2240 1 54.11 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGAGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGGATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCTTAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAA:1 - chr2R 7244797 3' - diver 46 2 50.68 GGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGAACGTTCGTTTTAGTGTTTAATCACATACTGTTTTTCCCCCATCCGAAAATCGAAGAAAATGTGTG:1 + chr4 697803 3' - roo 9042 1 54.11 TAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGG:1 - chr2R 7090659 3' + I-element 5271 1 73.97 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAATGCTGATGGATGTTGT:1 + chr2L 13844252 3' - Stalker2 7268 2 55.10 ATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAAGTCAACCTACTCCATTACTCATAGCTTATTGATTGCTCAAAAGCCTGCACAGATCGGGG:1 - chr2L 2165688 3' - jockey 4905 1 58.45 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGATTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGGGGCAATATGGGGGCAGTGGATGTAACCTGCA:1 - chr3L 7300100 3' - roo 20 2 65.75 ACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAA:4 + chr3L 10795198 3' + Quasimodo 6992 2 53.42 GGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGCAGGGCTCATGCGTCTGTGAGGCACACGTGTGTGCGAAAGGACTAGCCAC:1 + chrX 20452608 3' - accord 7172 2 60.27 AGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGCCACTTACAATTGATACCAAATTACGCGCCCGATTCACCGATCAATCGCAAATTAATGATTGTTTGCTAACAAGCTGCAATATACTTACTCGTGTTGG:1 + chr3L 14595877 3' + G4 41 1 72.22 ATAAATAATAATAATAAATAATAATAATAAATAATAATATAAAATATTCCAAATATATTTTCTATAATAAAAGAGTGTAGCATAAGGTGAATGGATTGATTTTGGAACAATGAACTCTTCAAGCAATTAATGTTCGGTAATTATGG:2 + chr2R 12067062 3' + flea 5007 2 75.34 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGCATGCCATAAAAATACTGGTAATTTCGAGTTACGAGGCGCAAAAGGACATTTCTGGAGGTTCTATTCAAAGCGACAAGTGGTACGGAAAATCATTATAAATGCTCT:1 + chr3R 28146257 3' - roo 14 2 66.44 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGTAGAATCTGGAAAGT:2 + chr2R 11804771 3' - pogo 19 1 72.60 ACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCACACACATCCAGAGATCTACAATATATTCCCCCCCACTTTGGCGACAGTGATGATTTTA:1 - chrX 1799115 3' - invader4 2814 2 54.79 AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGG:1 - chr3L 23456267 3' + Gypsy6A_LTR 277 1 61.72 ACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTACCAGAA:1 + chr3L 24934422 3' + HMS-Beagle2 7157 2 60.27 AACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAGTACAAAGTGAACAAAATGTGTCAATTCATATATTAACCAAAAAGTGATCGTTTACCAAACAAATGGAGTCTCGGTTAATACGTTTGTGTTT:1 + chr3R 18095913 3' + I-element 419 1 67.81 AGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGCAAAACCCAAATGGAAGAATTCTTCAATCTTACAGATGGTTCGATGTCTTCT:1 + chr3R 22606823 3' + invader2 5093 2 54.78 ATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAATTAGGAACAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAACTTAGTTTTCCTTTTGAATACGTTACTAGTAACATTCAAATTCCTGATATATTTTAGTTTCTTCTGTAGGAGTTCACA:1 - chr2R 9499822 3' - HB 1419 1 59.26 GTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTTTGAAT:1 - chr2R 4193266 3' + 1360 3385 2 74.66 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTGGCTCTTTGTCG:1 - chr3R 19407854 3' - diver 15 2 73.97 GCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGCCGTTAAAAACTCACTAGGATGGAAGACCCACAACAACAGATATATTTTG:1 - chr2L 6358827 3' - HMS-Beagle2 6989 2 65.75 ACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGCAAATAAAAATCCCAAGCAAAGGGAACTTCATTAAAAATATTGTCAACGTAGAAAAGAGAAAACTCATATATGTATGTATGCGAAAG:1 - chr3L 20912586 3' + transib2 428 1 61.64 CACAGAGCCATACATAATATTCATTCGTTTATTTTTCAAAGCTTTTTTTAAGCTTATTGAAAGTCCTGCCCAGTCCA:1 + chrX 21639298 3' + gypsy5 235 2 72.73 GTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATACCTAA:1 + chr3L 23940557 3' + Cr1a 4400 1 71.92 GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTTTGTGCTTCCACA:1 - chrX 14771686 3' - BS 9 1 67.69 AACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCCGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAATCAAAACTCTTGCCATCTGCTGTATATACAAAAATTTGCATACAACAA:1 + chr2R 16991457 3' + F-element 422 1 65.75 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTCCCACCTTAAACGTTAAATATTTATTTCCCTTGATATCACCTGGTTGACGCTAAGAAAAATGAGCAAAATTTAGATATAATTCAATTT:1 + chr2R 7416142 3' - hobo 56 1 59.31 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTATAG:1 + chrX 22460189 3' + HB 1539 1 78.77 TAATAATAAACAATCTTACATTCATATTGAATCATATATCAAGCAAAATGCTAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCATTAGTTTGTCTATTCGTA:1 + chr3R 15364052 3' + flea 256 1 76.47 ATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGCTACCTTTGCTTTT:1 - chr3R 6625662 3' + flea 255 1 80.80 AGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGTCCTATCGGGAATCGGGCTACAACCTGAGACACGTCGCATTAAGACTAGAGAAACGCGCGATTATATTAATTTCGCCACGTTATTACCAAGTTTAGCAATTGACATAATTAACAAGTTCTAA:1 + chr3L 17083450 3' - blood 168 2 56.16 CTAGTTTAGTCTCTTCCGACAGACGAAGAAGTGGTAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAAATAAACGTAATAAAAACTGAACAACAACCGCAGCGGCAACCCAGTCAGC:1 + chr3R 16232788 3' - diver2 4761 2 64.38 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACT:2 - chr3L 15913843 3' - jockey 4815 1 56.85 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAA:1 - chr3R 23639168 3' - pogo 47 1 69.52 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCA:1 - chr3L 10731760 3' + 297 6925 2 56.16 TTTTTTAAATTTTATTAGTTATTTTTTTAAATTATCTTATTTTCGCCCAGTTCAATTGAGTTATTACTTCAAAATGACATTTCGAAATGTTATTTAATAGATGTTTAGAACGTGGCTT:1 + chr3L 12096396 3' - Doc 4688 1 63.56 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTGGAAAAATACTTTGGGCTG:2 + chr3L 22400573 3' - 1360 79 1 70.55 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTG:1 - chr2R 22034652 3' + copia 233 1 58.10 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCG:1 - chr3L 1692004 3' - blood 34 2 57.46 GATAGTCGGGGAACTCGACTAAAGTATTCTCTCTTGTTTTTCTTCTATTTTTTTAAAGGCCAGAGTGATTTTGTTAATTTTGCCAAATAAAATGCCCAATATACAGCAATCAAGGAAACGGAATAAATCACTATCTATTTAAATT:1 - chr3R 20125961 3' + INE-1 564 1 40.69 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTTCAGGCAGACAAATTA:1 - chr3R 16518856 3' - Tirant 5 2 77.59 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACT:1 - chr2L 7125731 3' - I-element 22 1 64.89 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTTAAAAGCTCAAAAAAATCCTAAAGAAAAGCTTTTGGCCGAGGTTGGGTGGATGAGGATTAGGAT:1 - chr2L 22173834 3' + Juan 4166 1 53.42 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTG:1 + chr3R 27160150 3' - 412 7129 2 69.86 ATAAATATGTTCTAATTATGGGCTGCAATTTGAAAAGTCTACGTGGACTACCACATAGTGATACAAAAATAATAATAATAATAGACTGATAAACGAGCTTGTACCTTGAACCAAGAGTGTTT:1 - chr3R 4421649 3' + rooA 40 2 66.39 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGGACGTCTTACCCATTTTGGAG:1 - chr2R 22514121 3' - P-element 34 1 46.46 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTG:1 - chr3R 27160062 3' + 412 434 2 59.59 AGCATATAGATATACAATATCTGCAGATGTATAGCGTTCTTCCTCTTTGTTGTTCATGTGACATGACGTAGTGATCTGCTCCGGTCTCGACTTGACTTCGATAAAAATATCCAC:1 + chrX 7618948 3' + Dm88 4125 1 73.68 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGA:1 - chrY 2346868 3' + micropia 5398 2 52.80 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTA:1 + chr2R 7850021 3' + roo 335 2 65.75 AGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTGCACGCAATCGATCT:1 + chrX 14722255 3' - diver 11 2 71.23 AGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATT:2 + chrX 20999593 3' - BS 55 1 59.59 AAATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAGC:2 + chr2R 14793534 3' + Dm88 4367 2 84.25 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACACAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAG:1 + chr3R 30987555 3' - F-element 90 1 55.00 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCC:1 + chr2L 17005785 3' - Stalker2 7329 2 71.92 AGAAGGCTCCACAGGAGACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCTTCTGGCCCTGTGCTGATGATGACTTAATCGGTGATCGGAGTTTTGGCTTCGGTGGGCGGTATAATGATTTATTATGCCGATTG:1 + chr2L 20019779 3' + BS3 1553 1 67.97 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTAT:1 - chr3L 23249349 3' - rover 24 2 69.86 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTA:1 - chrX 12986525 3' + roo 353 2 56.16 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTCACAGACATTTGTTCATAAATTAATTTTTATTTTTGCCTTTTTACAAAGTGT:1 + chr3L 16470405 3' - jockey 4694 1 69.18 TTATATAAAGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCTGAGGGAAGGGGTCCTTGTTTTGCTATCGAAGGAGCAAAGGAATGCCTGGCTTGGGTAGGCCATTA:1 - chr3L 23149537 3' - Gypsy6A_LTR 397 1 57.85 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGTG:1 + chr3R 13300975 3' + roo 9039 1 57.78 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAA:2 - chr2L 71175 3' + 412 427 2 59.59 TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAGTTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAA:1 + chr3R 13973024 3' + 412 7459 2 74.66 GGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGATCTCCATATCTCTAGCACTTTTCGGCTTGGTAAATTTTCTGTT:1 + chr2R 2015212 3' - I-element 284 1 69.86 ACAAGTTTTATTTGTAAGTCTGTGTATATTCTTCTTGGGTGTTGCAAGTATATGCTGCCTTCCTGAAGTGAGGGAGTCCCTTTTTTTTTTGGTGGGTGTATGTACTTGCCACATGATGACACTTAGGAGTGGGAACGACCGAAAGT:1 - chrX 21005748 3' - Doc3-element 4451 1 76.03 AAAATTCGAGAGAGCTTAGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGTATGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAACATATATTTTTTTATCCCCCCAATTGTTAGGG:1 - chr2R 4426877 3' - 1360 80 1 72.60 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGC:1 - chr3L 3030210 3' + roo 340 2 69.86 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCAGGGCATGATTCTCCCGCGACAGACGATC:1 + chr3R 27123607 3' + roo 9043 1 61.97 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTAC:1 + chr3L 26291005 3' + Tabor 7289 2 59.31 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAAAAATGCTGCGTAAATATGCCAGCAAAAAATTAAAACA:1 - chr2R 16820657 3' + Tabor 475 2 77.40 CAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCTGAATTAGAAAA:1 - chrX 12129293 3' - flea 4805 2 52.74 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATA:1 + chrX 19588150 3' + roo 357 2 51.37 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAAGCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCA:1 - chr3L 18402990 3' - P-element 86 1 25.34 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAGTTGAAATAAGCTAAGAAG:1 + chr2L 10156257 3' - hopper 14 1 73.29 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATA:1 + chr2L 18347398 3' + transib2 2775 1 52.05 AAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAA:1 + chr3R 25709876 3' - hopper 55 1 52.05 ATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGCTTTCCATCATACCTGTGTGGCTT:1 - chr3R 22590449 3' + rover 7283 2 73.28 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATT:1 + chrX 7795606 3' + roo 340 2 64.38 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCG:1 + chrX 1135374 3' + P-element 2806 1 28.67 CTATAGTCGAGTTTCCCGAATATATTTGGTGGAATTAAATATATATTTCAACTTTCTCCATTTTATAAATTCTTCTACAATGCTCTTCTTATAATCTATAATGTATCATATTTTTATGTAATAATATATCATATTTTTTGGCAATG:2 + chr3L 9563916 3' - INE-1 566 1 69.18 AGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAGAGTAAAGAACATTCGTGTGATATTATCCTGCTGGCGCAATAAAATTATAAAGAACTTCAGAACTATTATCTCAGAGCAATTATAGCAC:1 + chr2R 12971567 3' + McClintock 440 2 65.07 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTATTTA:1 - chr2L 10156069 3' + hopper 1395 1 68.97 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGACTATGCGAAAATTCATATATAAATTTTAATTTTATTGTTTACTTTAATATGTATAATTCGGTTTTATGTCTATTTGGATAGTACAGAT:1 + chr2R 15326977 3' - copia 33 2 49.32 TAATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATATAATATAATTCGGGTATTTGTTTTCATCTATTTTAAATGATGATTACTTCGGTGGCGTTCAATTTATGGCCATGTTTGGGAGTACGAGTA:1 - chrX 16917037 3' - I-element 295 1 54.11 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGGGTTGGAACTT:1 + chr2R 9871579 3' - roo 8712 2 53.42 AATTACTAAAATTAATAACATATAAATTACAATGGTCAAATAATAGGATTACCAAAGTGTGAATGAAAGCAAAACCATCTGAGCAAAAGTCCTGCGAGGTGGAGCAGTTGCAGACCAAATGAACCGCGGGACATCAAATCTAATTA:1 + chr3L 18340099 3' + HeT-A 41 1 69.18 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGGCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCC:1 + chr3R 15790070 3' - flea 4761 1 68.03 AGAAGAAAAAAAAACCAAAAAAATGCAAGCATCTGTTATTGATGAATGATTCTCGGGAAGGGAATCAGTAATCAGGGGGAGCCTGTGCCTGCCCAGCAAA:1 - chrX 19379311 3' + mdg3 5102 1 93.00 GTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAAATTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAATATGAAAGGCTGTATCAGGATCCTTATGAAA:1 + chr2R 19945272 3' + hopper 1017 1 77.40 AGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGG:1 + chr3L 18126000 3' - Ivk 55 1 51.37 ATCAAAGGCAAAATAAATTGGGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAATCTAAAACACCAGCAAAGTTAAAATAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATA:1 + chr3R 545849 3' + TAHRE 10377 1 55.48 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTT:1 + chr3L 17183768 3' + diver 167 2 56.16 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAGGTGAGGTTTCTCATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAA:1 + chr3R 31264059 3' - jockey 4770 1 46.97 TAAAAAAAATTATAAAAAAAAAATACTTTCACTCTCGCCACAACGTGGCGGCATCGAGAGG:1 - chr3L 13902016 3' + Doc 4693 4 93.44 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTG:2 + chr2R 8099223 3' + jockey 4931 1 61.64 AATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGGATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAA:1 - chr2L 6654639 3' - diver 5940 2 50.68 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGATGGGGGGCTCAACAAAGATTCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGCTTGAGCATTGAACTTTGGCTTGTTACAT:1 + chr3L 18126010 3' - Ivk 23 1 41.13 CCCACTATTATCAACAATCGGTTATTAAGAGGTCCACAGCTGTGGACAGACCATCGGAACGCCCAGATTTGTTTAT:1 + chrX 18817094 3' + transib2 2402 1 80.26 AAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTTTAACCACCCTTGTTCCCTCACAACGTTTTGACTTCGACCGATTTTCTTGGCTATTACACAGTTTTAAGCCAGATTCCCTAAAGCCTTCGATTTGACCTTTTTCAAAATCGGCCC:1 - chr2R 4715554 3' + Tc3 1443 1 74.66 CACCAANAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGTGTTGACATGGGGTTCTCATGGTACTCAAAAATAATTAAGTATGTATCAAAGTATTAGTGCGAAA:1 + chr3L 23287330 3' + 1360 3338 1 52.05 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTTTCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCAAAATAATAATAATATTAATAATAAAAAGTTGTCATCGTCAGCGCTGCTCGACTAATTCGCATATTTGGTCGCAGTAAA:1 + chr3R 29690788 3' + I-element 5292 1 58.22 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAATTTTTAATACAATACCTTAAAATA:2 + chr3L 14366663 3' - roo 29 2 68.49 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGCCAGCAATAATTTTGAATTCATTTC:1 + chr3L 22325938 3' - hobo 25 1 68.49 TTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACGAAGCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTTGTTATATTGTTTCTCAAAATGTAATTAAAACAGATCCAGAAAAAATTCC:1 - chr3R 2102748 3' - Doc3-element 26 2 55.20 GCTAGTGATCCTGATCAAGAACATATATGCGGTACACTTAACTCTAACACACAATTCAACGAATCTTGCCTAGCCTTTTGCTCTTCTTTTTTTTCATAATTTTTTATTTATGGAAAATGCTTTTCAATGCGCATAAAAATACATG:1 + chr2R 19606606 3' - INE-1 86 1 53.79 ATGTTTAAAATATATGATACTTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCGAAAAGTCAGTGTTATTGTGCAAATACTCGTTTTGGGCAC:1 - chr3R 2532206 3' - Cr1a 92 1 57.47 TGGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTTTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTCCGCATCTTGTTATTCTCGGGTCTGTGATTTTAAAGTTTGTAGAGCATGCACACAATATATTAGATTTTCCAACCAATATGCTTAATC:1 + chr2L 15076202 3' - 1360 64 1 54.11 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCA:1 - chr2L 7660936 3' + I-element 5269 1 75.34 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGGTTGGGGTTAATAGGTGCTCAGTGCTGTTAGCTTTAAGATAGCTATGAAGCAAAGTCA:1 - chr3R 25433240 3' + transib2 2806 1 71.92 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCAC:1 + chr3L 12004359 3' - P-element 34 1 59.71 AATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGGGATCAAGCCCTTAACCAACCTAAATTTACTATTATTAAAGGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAGCATCACCTAAAAACAAAAAAAATAAAAAAAAGAAAC:1 - chr2R 9538611 3' + I-element 121 1 48.63 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTG:1 - chr2R 13766180 3' + roo 9038 1 60.71 AGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTAATATTAGCAACATGATATATTTTTTTTAAATAAGTTCTTATAATAACAGTTCTTTTATTGGGATTTGTGAAAATGCTTAGTATATACTTAACAAAAACAAATAAA:1 - chr2L 18658309 3' - McClintock 5981 2 76.39 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAG:2 - chr3L 5532924 3' + roo 351 2 59.59 ATGTAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTTTTTTCATTTACCGAGCTTTTTTAGTGATTTTTCTTTCTATTTAGTTCACGCCACTTGAAAGAACTTAAATATTTCTTCACACTTTGCCTTGTCGCCATCGCCTTTTACCGA:1 + chr3R 23561001 3' - mariner2 808 1 75.34 TCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACTGTCTCCATG:1 + chr2L 47235 3' + roo 395 1 75.35 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGT:1 - chr3L 16662390 3' + jockey 4921 1 67.81 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTC:1 + chr2R 13766279 3' - roo 8748 2 78.08 AAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAATGGGGGGGGGAAATGGGTGGGTGATGCTATGAACCCGGCGCCCCAATTGCAACTTTGTTTTATTTTT:1 + chrX 6630314 3' + gypsy7 5010 109 76.60 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGCGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATC:1 - 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chr3R 4160058 3' + invader2 5053 2 53.42 AAATATAAATAAAAACTGCAGATTTATGTTGCATTTCGCAAAGCCTTTATGATTGCTTACTAAGTCAGCTTTGGACAGAGTTTGGAAATAATGAAAAAGTATATACTTGGGGCTAGACTACAAATCAAAAGATTAGCCGCTTCAAA:1 - chr2L 19720412 3' + mariner2 795 1 78.77 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTGACCATGTTGGAGTTCAAATAGAACAAATTCATTGGTCAGTCAATTTTGAGGGTAGTTTTACTTTACATCCAGTTCTAAGGCAT:1 - chr3L 13044076 3' + 1360 3352 1 69.86 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCAAATAATTGCGCAAAG:1 - chr3R 12242240 3' - transib2 45 1 54.11 AATGTGAATCATAATAAAAAGTAACACGGGTATAATTATTTGTGTAATAACAAATATGAATTGAATATATATTTTACTAAAACTTAATAGTTAATCACCGTATACACCTATAGTTTCATAACTAAAAATGCACTATTTCCGTTCAG:1 + chrX 13631242 3' + mdg1 67 2 57.53 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTTTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGA:1 - chrX 2479497 3' + mdg3 175 2 63.01 AATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTCAAGATACTGCAGGGAAAGCGGGAAAAAAGGAAGCG:1 + chr2L 4063977 3' - roo 20 2 71.92 GGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTAGCTTCGTAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATAGGGACTTCCGTTCAGCCTTCATTTCGACTGCTTATTGTTTCAATTATGA:1 + chr2R 4511313 3' + 1360 3306 1 64.38 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGATTTCG:1 + chr3L 23320172 3' + roo 9032 1 58.22 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCTGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGAGTAGCTAACCGGAAAAAGAGAA:1 + chrX 15357812 3' - hopper 3 2 81.43 ATAAGATTTGAAAACATATTGGTAGTCCCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAAACTCGCTTGAACACAAAACGTGTTTAAGGCAATTTTTTCCATCGTTTTTATTTCTTTCAGTGATTTGCATAAAAATATTTGTGCTTCTTCT:1 - chr2R 20590282 3' + Doc3-element 4666 1 67.81 GCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTTCGTCCAGGGCACACAGAAACACCTCGGGAGCCATGTAGGGCTTGGTCCCCGACATACTG:1 + chr3R 4412924 3' + 412 7126 2 55.20 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTT:2 + chr2R 4785357 3' + Juan 4186 1 65.07 CATTGTAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCAACTTGACTTTTTCGTTAGAGAGTTATTCGCCCATTTACCTTCTTATATTATTATTTTATATCATGTACACTCCAAAATTATGACTTTAGGTTTCGTGTTTTGTT:1 - chr2R 3599982 3' + Doc2-element 340 1 78.57 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCC:1 + chr3L 12249881 3' + roo 8989 2 74.66 AGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCT:2 - chr3L 24213775 3' + invader2 5033 2 67.12 TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCA:1 - chr3L 19454922 3' - mdg1 7096 2 55.48 AGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGGTGAGTTTTTTATGCG:1 + chrX 18409444 3' - jockey 4746 1 71.43 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGTGGGTAAAA:1 - chrX 19539431 3' - pogo 11 1 65.07 GATATAGCTCGTTGTCGGCCCTAGCCGTATACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCT:1 - chr2R 1320706 3' + diver2 258 2 54.11 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCGCTGCTCTGGGAATCTATGTATGTTAAGTTAACATTTGATTTTGGCCACAGCTATTAA:1 + chrX 1135431 3' + P-element 2860 1 67.12 CTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGA:1 + chr2R 5531176 3' - 1360 98 1 60.87 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGGTTAGAGTGTATTGCGTGCCCACGGCTTTCCAAATTTTCCAGTCGGCTC:1 + chr3L 22960540 3' - Tirant 10 2 68.69 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCA:1 - chr2L 13556355 3' + transib2 2752 1 70.21 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTGATATTAGTCACACGACTATTACACAATAATTCTGATTGTTAATATTCAT:2 - chr3R 27160013 3' + 412 483 2 78.08 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATT:1 + chr3R 20167660 3' - roo 79 2 73.97 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCT:1 + chr2L 18226874 3' - roo 8725 2 60.27 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGC:1 + chrX 18336659 3' - mdg3 5335 2 71.92 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATG:1 + chr3L 11326777 3' - pogo 58 1 63.70 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTACACATCGGGTTTGCCCACTTTTT:1 - chrX 18817272 3' + transib2 2769 1 55.17 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCTAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAA:1 - chr3R 24450397 3' - 412 38 2 55.48 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAAACAATTATAAAGTTAGGACAAATAATAATTATTATTCTTT:1 - chr3R 3080547 3' + copia 208 2 72.60 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTT:1 - chrX 2214268 3' - jockey 4837 1 69.86 AAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGATGAAGATGGGGATGGGCAACTGACAGGGATTCTAGTTTATGCTTGCGAGGACTTTTCAAGAAATAAACTTTTTCCTCTGTCGACATCAGCGAAA:1 - chr3L 8538098 3' + I-element 294 1 68.49 GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATGGCTATGTACGCGCACAAATATAACCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAATAAAAAGACGT:1 - chr2L 22340079 3' + 1360 3183 1 73.29 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGGGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCA:1 + chr3R 16630350 3' - FB 69 1 65.03 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATG:1 - chr3R 24219272 3' - roo 8728 2 63.01 ACGGCAATAATTAAAAACATAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAAACCGGCAAAGGGTAGCCCGAAAACTAAAAACTGAAAAAATAATGCCCAGAGAACCGATGGTTGCCTTTTCTGGGATCGG:1 + chrX 7618540 3' - copia 4832 1 63.11 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCGCAACGCCGCCAAAAGCGAAAGCAGGAGCAAAATCAG:1 - chr3L 21327022 3' + copia 247 1 79.31 TATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCA:1 + chr3R 14860196 3' - BS 5085 1 77.40 TTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAATTGTTCTCAGTGTGTTTCTGCTTGTGCGGTCTCTTGCCTGTCTGTTTGCATGGGTTAGTTTGGGTGTGTAGCTTCTTCGTTCTTTTGACACTTTTCGTATGCA:1 - chr3L 3504385 3' + Bari1 346 1 69.18 TGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGCCT:1 - chr2R 2590686 3' + HMS-Beagle 201 2 53.42 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATT:1 + chr2L 16564559 3' + roo 332 2 73.29 TATAATAATATTTATATTAAATTCCCGATTGATTACGTTGTATATTAGGCTGTAACATTAGTTTGCAGTTGCGAAAAAATATTATTAAAATATATTTTATTTTTTGTATTTTTCCCCACTGTGCTCAGACGGAAAACACAGAAAGA:1 + chr3L 2835315 3' + transib3 2622 1 43.84 GACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATG:1 - chr3L 22723863 3' + HMS-Beagle2 225 2 76.03 AGATGGACTTTGCATTTAAGGCATTTGGTCATCGGCGTTGCAGTTTTGCACAGTCTGCAACGTCTTCTTTCTCCAAAAACTACCCAATGTTCTACTTTACTTCGGATTTTATTTTGCTGCCGAGCAATAACAACACAACACTAC:1 + chrX 5747209 3' - looper1 1588 1 63.19 ATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATTCAAATACAGGAATAAGAATACAGGAAACGGACAAAATGACAGACTCTGCCGCAA:1 - chr3L 25691431 3' + mdg1 7266 2 68.49 AAATTTAATTTACTTATAAATTCTGATAGGAGATACTCTACCTAACTTTAGCTGCTGTAAATAGTCAGCTTTTAACAAAAATTAGGAACTGTGAAGTGTGAATAGATTTGTACAAATATCCTTGTAAATATTCCTGTTTTTCAGTA:1 + chr2L 20293918 3' + S-element 120 2 69.86 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTAT:1 + chr3R 1977617 3' + micropia 5392 2 62.61 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACC:1 + chr3R 16157380 3' - pogo 51 1 59.06 GGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGGCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCACTTTGGGCGGGTTTGTTTATAAGTAATAATAGTGTTTCAAGGATCGGTGG:1 + chr2L 17716437 3' - I-element 4965 1 68.29 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATACGAAAAATTCGAGACCGCAGTGAAATTAGCCAAACTAA:1 - chr3L 12315715 3' - transib2 52 1 53.79 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCG:1 + chr3L 6397734 3' + roo 337 2 72.73 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACA:2 - chr3L 19454920 3' - mdg1 56 2 54.11 AAAAAAAAAGGAGCTTGGGTTATATTGAACTACACTAGGCGGCGACACACTCACCAGCAGCAGCCAGAACAACAGACTGCGGCGGCCAGCAGCGAGATTTATCCCATGAAGATAAGTGCTGCAGACGA:1 - chrX 5165260 3' + TART-A 65 2 57.81 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGC:1 - chr3R 28469209 3' - 412 70 2 65.07 AACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTCACACATGCAGCAAGTGTCAGGACTGGAATCGGCGCACGTTTGCCGCACCGGAAGCACTGC:1 - chr3R 10926266 3' + P-element 2775 1 52.71 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAAC:1 - chr2L 71179 3' + 412 423 2 62.33 ATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGCGTGTATAAGTATTATAGTTTTTCCTCTAGGTATATGAATAGCACTCCATGCTCGAGTCCATGCGGCCTATGTTTTTATTGTATTTGTACCAATCGCC:1 - chr3L 4192702 3' - accord 7070 2 71.53 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGCTTTTAAAATCATGTTTAGTTAAGCAATGTATATTCTATTTACTTGTGTAT:1 - chr2L 18973731 3' - HMS-Beagle 30 2 65.07 GTTCACTTATTTTTTTATTTTTTTTTTGGTTTTGGGCAAAAAATAAAATATGAGAAGGGAGCAAATTAATAGACAGTCATTTGGAACATGTGTTGTTGCTGCTTTGATTGTAATTGATTTAAAATGTGACTTATATATAAGAACAA:1 - chr3L 14709442 3' + Tc1 1392 1 70.55 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTT:1 + chrX 18336661 3' - mdg3 69 2 67.91 CCAACCAAACCCGTCAAACCCCACGTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGAGTAAAAATCTTTGCGACAAATATACATACACATGTACAGTGCAGGTGGAGAGAATAGCACTGAAAATGTAATTACAGTTTTAAGAT:1 - chrX 2293805 3' + G2 113 1 64.38 GTGGACTATAGCATTCTCTCTTGCTTAAAGTTATAAAATTGGTAGCTGTTACTTGGTTTGTTTTACTTTGTGGCACTGGTTTTGGTGGTGGGTGTGCTTAGATAGACTTGTTGGATACCTTTTAGTAAACATTTTGGCCGAGG:1 - chr3L 16911855 3' + INE-1 577 1 67.83 AAGAAGTTAGCTCCAAAAGGTAAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACATGGTGATATAGTTGACCTTCAACAAGAGAGAATTCTATAATCGAGTTCTCTGACTATCCGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr3L 23210710 3' - Q-element 244 2 43.84 ACCCTTTATATTTATTTATATTGCAGCAGTTGTTTCTAGTTTTAACATAAATAAAATTTAAATGAAAATCTCAATTAGGTCAGTGGAAAATACAAACAATTTGTTTATAAAGCATTTGTTTTTTGAAGATATATTGCAGGCATTAT:1 - chr3L 7860454 3' + 3S18 39 2 78.08 ATATATATACATGTATATTGTTTTTACTTAACTTTTGTGGGGCGTTTCTTGGCATTCGCTTATGGGTTATATGTGTATATAACTATAGGGCTTTATAGGTCGCGGATCGGCATTGCCCCTTTGTCTTTGCGCCGCATTTCCCGCCG:1 + chrX 3085051 3' + INE-1 70 1 69.86 AGAAATAAAAGTGAAACATTTGTTGAATTGTTTGAAATTAAATACCTAACGCTGTTAAAAAAAAAATGTTCCATTAGAACTGTAAATACATAAATAGGTACTAGACGTCGCCCAATTGACAAGTGGAACTGATATGTTTA:1 - chr2L 6565060 3' + HB 1498 1 61.43 TGGGCTTAAAATGGGCAAACGATTCCAGGTTTCAAATTTGATAAATTCGATTTTTTCGATCCCAGCTTCTTTGTGCTAATGACGAGACCTCAAACTCACACCAAATTCACTCGAAGAAGGAAATTTTT:1 + chr3L 22744712 3' - FB 56 1 48.44 AATTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGTGGGTGCACGCTTTAGCTAGACACTATAATAATCCTAATTAGGTTATTCGGGAGGTTGTTCAGCGCCTTATCAGCCTTAGAAATCGGAAATTATTCACGTTTGTCCCTTGGCTCT:1 - chr2L 9334385 3' - Gypsy12A_LTR 2240 1 51.37 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGG:1 + chr2L 22674861 3' + mdg1 7378 2 73.97 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAA:2 - chr2L 14874151 3' + copia 242 1 47.26 ATAATAATAATAATAATAATAAAATATGGGAGACGATAAAAGTTAATAATACAGGTTTTTATGCGTTATGGGAAACGATTCTGCTGACGCACACAAAAATTGGCAGCAATGAGCTTCCCACAAAATGATAAAACATTAATTTTAG:1 - chr3R 24836073 3' + mdg1 38 8 71.03 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCTTGC:1 + chrX 19074884 3' + mdg1 7416 2 52.74 CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGTG:1 - chr3L 12315740 3' - transib2 79 1 71.23 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTT:1 + chr3R 17077169 3' - roo 90 2 81.51 AATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACAC:1 - chr3L 22861732 3' + S-element 1692 1 63.70 TCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGACATATTTTGTCAAACTTACAATGCATGAGCATAGGTGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGTGTTGAAAACTTTAAAAACTGTCCAAAAGTATAAGAAGTCCAAGAAACTT:1 + chr2R 23411117 3' - 1360 226 1 65.07 GATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTT:1 - chrX 15200859 3' - 17.6 7002 2 76.71 ATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTGTGCGCTTTGAGAATTAT:1 - chr2L 15379271 3' - Stalker 87 4 45.52 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAACATGAGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTTATTTGGTATAATGGATGAAGAT:1 + chr3R 19448580 3' - mdg1 39 2 65.07 TAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTCTAATTTATATATATAATTTCAGCTTGTTTCAAACAAATCGGAAGGGATTATCAATATGTTCCTGCATTCGGAATAGTTATATACTTAATT:1 - chr4 514586 3' - I-element 459 1 67.81 GGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAATATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATG:1 + chr3L 46981 3' - FB 86 1 73.97 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATATTGCATCTTTCATT:1 + chr3R 15942849 3' - hopper 13 1 77.40 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTG:1 + chr2R 7090751 3' - I-element 37 1 60.96 TTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAAC:1 + chr3R 11937410 3' + flea 4960 2 54.79 AAAACTCAGCTGCATTTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTT:1 + chr2L 23390133 3' + rooA 205 2 61.54 TGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGCATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCTCTGCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCC:1 - chr3L 21011225 3' + Cr1a 151 1 82.88 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAG:1 + chr2L 11839754 3' + mdg1 7403 2 50.68 AAAACAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAATTG:1 - chr3L 11276141 3' - INE-1 579 1 60.27 AGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCACATCCGCTAGCTGTATACAAACAATATCCCAAGCGGG:1 - chr2R 3124012 3' + 297 157 2 74.48 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCGACGGCTACT:1 + chr3R 4860557 3' - Transpac 4956 2 60.27 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTAACTACCGATTTTCCAATAAGCTTTTTTTATCAATGGGAGGTGATCAGAGATGGAGAGACACCTACTCAAATTCCTTGTCCACGAGGAATTCGCAATGCGTTTGCTTTA:1 + chr3R 16685886 3' - Quasimodo 55 2 62.96 AGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGGGCTTTTTAAT:1 + chr3L 19350062 3' - 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chr3R 16463124 3' - jockey 4847 1 54.11 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAATTAG:1 - chr2L 17180035 3' + Juan 4192 1 69.18 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTG:1 - chr2R 8157163 3' + mdg1 7408 2 54.11 GTATACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTTTGTGCCCTGCCTAACAC:1 - chr2R 1320701 3' + diver2 4835 2 63.20 ATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGC:1 - chr3R 19450182 3' - roo 9014 2 70.87 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTT:1 - chr3R 25709755 3' + hopper 1384 1 60.00 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTG:1 + chr3R 15364014 3' + flea 4950 1 63.01 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAAAAGTAGGC:1 + chr3L 21763765 3' - 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chr2R 17926284 3' + opus 455 2 55.48 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCTTTTAAGTCAATTGTAGAAAA:1 + chr3L 10731911 3' - 297 23 2 63.01 GTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATTGGGACAGAAGGACATGGCCAGACCGAATTGGCTGTGGACAAGTTATGCGCGGAAAAACAGCGCAGAAACTAAAAAAAAA:1 - chr3L 16432331 3' - INE-1 170 1 69.17 AAGTATTCAAATCTTAATCTAGCTTATTTAACATTAACTAAGTGATAGTGTTTGTGATTATTCCTTGGAAAGTCTGTAGCATATTGAAGAAAAGTTTTCCGACCCTTACAAGTATATAGGATTTTGATCAGGATCACTAGCCGAGT:1 + chr2R 5250068 3' - Doc 4633 1 64.38 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCT:1 + chr3R 16341992 3' - P-element 104 1 14.38 TGGAACTCTTGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCTGAGTGCAATCAGCTCGTCGGAGTTTCTTATTTCCAAGGAAAATAAAACAAACAGAAC:1 - chr2L 1766728 3' + Porto1 4282 1 57.55 ATATATAAGATATACATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAAACGATGAACCAAAATATTAAAGAAAAATCAA:1 - chrX 21948997 3' + 412 7321 2 71.23 GGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTT:1 + chr3R 16630353 3' - FB 69 1 63.70 GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATCTTGCAGGATGACAATTCTCATCCTTTAATAAAACTATTTGCCCTTCTTCTATATTAGGAATTTCCTTTTTCCATTTATTCCTTTGCTGGAGCGTATGCAAATA:1 - chr3R 19447882 3' + roo 275 2 76.03 ACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTTACACTTGCTTAAAGCTATTTATTTTTTAAATAACACAGCCAGAAGCTCCAAACGTTTTAAAAGAGAGGACAAAAATCGGCATGGCAACAAATATCGCTAAAACAAATAGGATGGCAGA:2 - chr2R 25221961 3' - S-element 1504 1 73.97 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAACATTTAATATTATATTATATATTATAAAAAAATATATTATAAAATATTATATTATATATAAATCGGCCACATCGCATCATCACCAAACAACTGG:1 - chr3R 18629693 3' + mdg1 31 10 55.48 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGTACAATTTGCAATG:2 - chr3L 26505829 3' - copia 21 2 71.23 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGTACATATGTA:1 - chr2L 16274947 3' - FB 66 1 66.43 AGAAAAAAAAAAACAAGAAACTCATAAATAGAATGGCGAAACGCATGATGAGGTCGTGTAGCGAACACAGATCCAACATTATTATCTGGATATGCAACTCAAATTAATATAAATCTAATCGATTACATACATGTCTAAAATTTTTA:1 - chr2R 11626254 3' + gypsy7 5015 1 81.51 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTTCAACACTTCGGACTGGCATTTT:1 + chr3L 6518631 3' + 412 7476 2 70.37 AAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAAAACTCCAATCTCAGCAGCCAGTTCCGGTGATTAAGAACGTAAACCGAAACCAAA:1 - chr3L 8844344 3' - invader1 10 2 71.20 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACT:1 - chrX 13134891 3' - jockey 4824 1 59.59 GTTTAAATTTAATTTTAATTTTTTTTTTAATATTACAACAGTTGTTGAAAACCGTGAAGTGTATTTATTTACAAACTACTTGCCCGCAATTAATTTTGGTCGTTAACAGCAGACGCCACACGA:1 - chr2R 14537630 3' + Rt1b 125 2 69.92 AAAAAGAAATCTTATGTACTACGTGGCTGTGTGCCTGCCGCCTAGTGGCTGGGTTTGGTTACTAAGTGGATGCGCAATATCTAGGGGTTATTGTTGGATAGGACGGG:1 - chr3L 25109509 3' - Tom1 160 1 78.50 CTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAAAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCTC:1 - chr3L 22531938 3' + Cr1a 4207 1 63.01 AACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAG:1 - chrX 21639603 3' + gypsy5 363 2 53.42 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAG:1 - chr3R 16630279 3' - FB 48 1 61.86 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCCAAAAATTTGTTATATATTTATTCATCTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAAAAAAA:1 - chrX 2479452 3' + mdg3 5484 2 65.19 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACT:1 + chr3R 15054330 3' + copia 214 2 54.11 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATAC:2 - chrX 21216739 3' + roo 8989 2 76.03 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAACCTTCCTTGGCCAGATAGAGCAAATGCGGTTCCTTCTGA:1 + chrX 15981792 3' + 412 7467 2 71.92 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCTACTTGGACAAATCCGCCAGCAAAGAC:1 + chr3L 2544748 3' + Tirant 8477 2 63.89 TTTCTATCGATTTGCAAAACAAAATTTTTGCCACTGGCTTTTTCGCTTTCTAATTATGCCATGTAAATGGATAGTTGCTGCCAAACGTCGCCAGGCATTAGTCAACTCGT:1 - chr3R 27397073 3' + INE-1 311 1 71.82 ACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTTTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGGTGGCATGGTTTTGGGGTCTGGCTCTTATTTTTCGGCC:1 - chr3L 17105005 3' - G5 4739 1 73.97 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATGCGAGACTTGCGCTAATC:3 + chrX 8308540 3' + roo 9053 2 73.97 CGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAGTTTATTGTGTTTAGGTGTCTAAAAGTATGCAATGCATGTGTAATAAATGGCTT:2 - chrX 9530258 3' + 297 386 2 67.81 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAACCACAGAAAACATAGAGCCCAATTAACAACGGGCAATCTTA:1 + chr3L 17980495 3' + jockey 4914 1 73.79 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCCCTCGGCCGCCGC:1 + chr2L 12822845 3' + P-element 2817 1 25.00 GTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGCGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAAT:1 + chr2R 4545161 3' + invader1 3553 1 57.14 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCC:1 + chr3R 26178467 3' - 412 7120 2 62.76 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGGGAGTTGCATT:1 + chr3L 21656012 3' - HMS-Beagle2 30 2 62.33 ATTTAATCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGT:1 - chr3R 27986345 3' + roo 347 2 58.90 TTTTCCTTTTTTTTTTTATTTTTGCAGCCCCCCGTTCCGGCCAAAGGTATTCCATTCCGC:1 - chr3R 11316104 3' - Doc2-element 246 1 90.00 TTTAAAGCAATAAAATAAAATAAAAACAAGAGTTTTGCATTTCAGCGTAATTAGTTTAAACAATTCTAAGTTTAATATTTTCTGATGTGTTTAAAAAGCTGAATACCATATAATAAGGCTCAATTTTGGGCTTAACTTTTTTCTAA:1 - chr2R 19699875 3' + G7 1146 1 47.95 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAAC:1 + chr2R 16929846 3' + jockey 4955 1 53.24 GTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATCATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAA:1 - chrX 13383541 3' + invader1 3992 2 70.63 ATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCT:1 - chr2R 12185343 3' + accord 379 2 75.34 ACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAACTAACTAAACAGTGGAGCCGAACGAAATTGAACCCGAAACCCAGGAGGCGTAAATGATGAGAACATAGGGACCGAAAATAAAGGCATATTCAAA:1 - chrX 5086286 3' + gtwin 459 2 67.38 GTTACATACATTTCAAAGAATCTAGTATACCCCTTTACTCCAGGAGTAACGGGTATAAAAAACCATTTGGTTCAGACTAAATTATTTTTCTCTCTGCGAACGTGAAAAAAAATTTGTTGTCAAGTACTT:1 + chr2L 11154343 3' - INE-1 15 1 75.97 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTTAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTACACACATGATTACGAATGTTGCGGTGTACCNNNCGGCGTATGAGTAACGCTAAA:1 - chr3L 2410948 3' + gypsy11 3929 1 56.30 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTTAAT:1 + chrX 8200340 3' + flea 4995 2 73.29 ATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAAAGCGAAATTTCATCATTAGCTGGGATATCGATAGATATTGCGGGATAGAATGAGAATAAAAATGTAAATTGTTCCAAAGTTGTAGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAC:1 - chrX 14770552 3' - INE-1 545 1 86.30 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCT:1 - chr2R 13168655 3' + P-element 2819 1 39.73 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAGCAGGATCGCCAGAAATATTTACTAA:1 - chr2L 22040861 3' - jockey 4821 1 57.53 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTGCTTGGAAC:1 - chrX 2214218 3' - jockey 4787 1 66.44 TGGCATATATTGGTTTATTACACTACTGTATCGTAGTATCGTATGATACTGTATAGTATCAGTAGTAGCTTCTCAATTTACAACAAAAAAATAAAACGGCTAACCAATACACCCAAGAGGGGGAGAAACTGACAAA:1 - chrX 8798791 3' + blood 7389 2 61.76 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTC:1 - chr3R 23618108 3' - hopper 44 1 55.48 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAACGAAAGATTGTACACAAACCTCATTGGTAAAGTTTTCTTACATATTTGTAA:1 + chr3R 30946642 3' + Transpac 5197 2 63.70 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATCGACTTACAAACATATTGTTT:1 + chr3R 14980434 3' - roo 36 2 60.96 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGAGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATT:1 - chr2L 6654646 3' - diver 52 2 52.52 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCATTGAAG:1 + chr2R 7244929 3' + diver 6068 2 58.90 AGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAAAGCACTTGCCAAATAAATAAAAGTCAATAAATTGTTGAAAAGATAA:1 - chr3R 24381266 3' - Juan 4131 1 67.81 AATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCGAAAATCAGCAGCAAAAAAGCA:1 - chr3L 18402912 3' + P-element 2724 1 25.77 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACA:2 + chr3L 7889646 3' + roo 8998 2 68.49 ATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATCGAGGCTGAAAAATACCTAGACAACCATCACGAATGGGGCATCCATTTGATACGCCGTTTGTAGGCAAACCAGCAA:2 + chr3R 13397682 3' + Stalker4 6938 2 47.95 AAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTGCAAACACATTGGCACATTTGCCAGCAGGATGTAGAACTAACAAGCTAATGCCTCTCGGACCC:1 + chr2R 17134029 3' + Bica 171 1 56.85 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCATGTCCTATTCATGCTCT:1 - chr3R 27986324 3' + roo 9032 1 60.27 TTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACT:1 - chrX 5323252 3' - Juan 4127 1 71.23 GGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGAAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCAGCAGTTTGTA:1 + chr2L 1924040 3' - G2 2996 1 62.33 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAATGAAA:1 + chr4 373091 3' - pogo 27 1 65.75 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAGTGTGAGCGAAAACAATGGCTGACGATAAACTGCTACACATGTTAACAAAGTTAGGCAGTTACAGTTACTTCACTGCTGCCCCCATTCAAAAA:1 + chr2R 21443480 3' - jockey 4787 1 71.92 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTA:1 - chrX 12986516 3' + roo 9026 1 52.74 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAGTGGGAGTTTTAGGTCAGCAAGAAAATATTCCTTTTGGCCAAATTACAAA:1 + chr2R 22992583 3' - hobo 22 1 66.44 CATTAGGTGAAGTTCAGAAGAAACTGAACGATTGCTAGTGACTAATGAATAATAAATAATTATAATAATTTGGCACATTTTCTTCATTTTTAAGAACCCATTTCGATTCAATACCTACTGTAGTTCGGAGTTTTACT:1 + chr2L 15202829 3' + G5A 2791 1 70.80 TTATTATTATTATTAATAATATATTTTTTATCATACCTTTTTTAGGTTTTTTTACTCTATATTGTTTCTTAATAAAAAGCAAAAAGTTCGTGATACAAAATACACAATCATTTAATCATTGAATGTATCCTTCAAACTGATATATA:1 + chr2R 5171698 3' - mdg1 7085 3 52.74 AGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTCCTGAGTGCCTCTTCGAATCTCTGAAATCTGTTGAATGAAATACACACC:1 + chr2L 22181416 3' - R1A1-element 5159 1 57.78 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTC:1 + chr3R 30347409 3' + P-element 2877 2 63.16 AATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTG:1 - chrX 292438 3' + G3 4496 1 73.29 AGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTTATGTTAATTTCAATGACCCATGCAATACGATACAACCAAAGCAAAACTTTCCGTGGCCAACATCCTAGCCCCTATCTTCATCGATGGATGCCAACGTCATTTACGATGTGCGAAAATA:1 - chr3L 18492678 3' - accord 258 2 59.59 CCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACCCTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTTGGTGCCCACAAACCAACAAAAGACCACTTGACCATTAGTAATTGCCTAAGTGACCCCAGTTTTCCCACCATACCCAGTGAT:1 + chr2L 9194372 3' - Circe 7187 1 52.05 AAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTACAAGGATTGTGAAAATTAAATTATTTTTAGCTC:1 - chr2L 13556583 3' - transib2 318 1 70.27 CACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTG:1 - chr2L 12341852 3' + BS 5003 1 76.03 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCAGTTCGATTTTTTCCACCCGGCGTTTTTATAAGCGGGGAGGTAAATCTGCATTTTCACCTGCCCCTACCCG:1 - chrX 7093702 3' - jockey 4684 1 57.46 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAACCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACT:1 - chr3L 18046604 3' - roo 8727 2 61.64 CATACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTT:1 - chr2L 23008386 3' - transib2 289 1 76.03 TATTTGCGTTTTGTTTATTGTTTACCTATGATAGATGAACGTATCAGTTTCCAGGTGCTCGGAGTGGGCTGCTCCCTGGCAGATCCTATATACCGGAACGAAGAGGTTCATATACCGAAGCTCGATGGACGCATTGTCGGTG:1 + chr2R 11336953 3' - Porto1 190 1 64.79 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGGTCGTTTCAACCAGCAGCATGCCGTCG:1 + chr2R 5480023 3' - F-element 41 1 66.43 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTT:1 - chr2R 22989592 3' - hopper 26 1 56.48 ATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAATCCTA:1 - chr2L 11391494 3' + 1360 54 1 51.79 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTGAAA:1 - chr2L 12818210 3' + hobo 2904 1 60.42 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCC:1 - chrX 4341253 3' + roo 9030 1 52.99 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAA:2 + chr2L 47160 3' + roo 8979 2 80.14 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCCAAAAATG:1 - chr2L 13158596 3' + roo 9054 2 71.92 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTT:1 + chr3L 20711723 3' - jockey 4796 1 57.53 GGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGTATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGGAAAACATTTAATTAAAAAGCACAAAAGGCTGGCAAATTGCAGCCACAAATAAAGCAACCAATTGAAGCGAGTGGGGCAGGCG:1 + chr3R 16888623 3' + Bica 377 2 59.72 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTTTTATGTCCGTTTATTCAACTACGT:1 - chr3R 4805617 3' + 1360 3316 1 67.12 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTTGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAGTTTTGTTAATAAAGAAGCCATAAAGTAA:1 + chr3L 12315868 3' + transib2 2808 1 73.29 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACTTTTATGCGCAATAGA:1 - chr2L 16946010 3' - hopper 41 1 56.16 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGGCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAG:1 + chr2R 23780629 3' - Ivk 23 1 61.29 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCTCTGGCTAACAGGAATTAAATTAATTATTA:1 - chr2R 10078107 3' - jockey 56 1 66.44 AAACATATAACATACACCAAAATGTTAGTGAACTACAAATCTACATACCTGTGCTACTGTTTTCCATGACAACACTCACACACCCAAACAAAGCGAGCACATACATCATTGTCAATGTCAAAGGGTCAAAGCAAACTTTGCAGTGC:1 - chr2R 14642385 3' - transib1 315 1 52.05 TGGGTAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTCAACTTCTTCTTCTTCTTTGGGGCTTTCCCCCTTTGTTTTTCCGGTTTCTCGGCATTTCTTCTTCTTGCTTTTTTTTTCCTGTTTTCGGTTCCGTTTTT:1 + chrX 12161284 3' - FB 56 1 76.15 AGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGCTTATTAATAAAGTATGGTAGTGTGACTATCAGAATGATGGGCTTCACGCCAATAATAAGATTGCCACTGCGAAAAGGAGTTCGTTAACCGTATAGTG:1 + chr3L 6611374 3' - jockey 4857 1 69.86 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGG:1 + chr2L 20840083 3' - mdg1 51 2 51.37 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCT:1 - chr3R 13972970 3' - 412 7133 2 72.22 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGTTTACGTCATTACC:1 - chr3L 17183663 3' - diver 23 2 52.17 TTATGCAAATAATAATAATTCTAAATAAAAATATTTCAAAAATTATGGACAACTAATTTAACTAAACTTAGTACTTTGTGTAGGCTTTTCAGGTTTGAATATTAACGATCACATTATAACCAATATATTGTAGTAAAATAATATCC:2 - chr3L 5502863 3' + P-element 2496 1 61.64 CTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAACACTGACTTGATTCAGGGAGAGGGACATTACTATACATTACTATACCATACTATACTATATCTGACTGCCGGCCATGGCTATTTGGGTTGGTCGAGG:1 - chr3L 9877926 3' - G2 3025 1 77.27 AAAAATAAGGAAAATAAAAATAAAAGCCAAAATGAATTACGGCTGCCCCAGAAATTTTGCAAAGC:1 - chr3R 21608230 3' + Doc2-element 254 1 61.54 AATACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCACATTGGCCGTCTCTTTATTTAATGACCCGAAGCTTGCGCCGGAAGCCCAAAAGAAGAACAAAAGCAAAGGAGCTGG:1 + chr2L 2894528 3' - accord 7030 2 82.73 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACT:1 - chr2L 14074428 3' + 297 352 2 57.24 ATAAATTTAGGTTCACCTAATTGCGATTGGTATGTTTTTAAAGTAATTTTGTAAACGCCTAGTGCAGACTCGTACTTCAATTGTTTGTCTCCCGGATTGTCATTCTCCTTTTGATGGTATGTCTGCCTGAATCGGGCTATATTTCT:1 - chr2R 19603685 3' - I-element 239 1 63.01 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAAT:1 - chr3R 14860117 3' + BS 5055 1 54.11 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAG:1 - chr3L 17183641 3' - diver 15 2 65.12 ACATAAAAAGTTAGACTGTATGCCAAAGAAAACGTATTCTGGTCGATAGTGGAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCACCCCCATCATGCT:1 + chr3R 28901301 3' - transib2 30 1 43.16 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCA:1 - chr3R 23618117 3' + hopper 1362 1 54.11 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAGTCTTAAAGTCTTGCAAAACTTTCGAACGTAGTCTATGATC:1 + chr3R 7666705 3' + I-element 5275 1 70.55 TTTTGCCCACGTCCATTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTTGCACTTTTTGTGCCATTGCTCTAAAAAATCTTCGCAATATCAATGCTGATGACATTCGAATTTCACCT:2 + chr2R 5180392 3' + FB 100 1 50.00 ATTAGAATATTTGTTATAAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGCAATGTTAATTTTTCAGCTTTCCATTTCAATGAGCTGAATGATATTTTGTTGCGAGGCAATGGCAAAAGTAAACCAGACCAGACCAGACTTAAACGATCCGCTG:1 - chr3R 13729438 3' + 1360 397 1 72.60 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATAT:1 - chr2L 6654667 3' - diver 80 2 70.55 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAAAAAGCCAATGTTGAAGCTACTTTAATACTCTCGATTA:3 + chr2L 3675955 3' + Juan 4172 1 50.68 ATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGCGTGGAGAATTCGATTAGAGCGTCTGTCACTGAAACGATCAGCTCAGAACCCAGAAAGCACAGTCCATGTCCACGAAAGGCGAGAGATG:1 - chr2R 24841551 3' - mdg1 147 2 61.64 AATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAGCCAAGAAAATCGGATAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGAATACAAAAGAATTTAACTCTTTACAACCAC:1 - chr3L 27357511 3' + Tc3 479 1 65.75 ATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTTCCTATATGCGATAAAAAGTC:1 + chr2L 11257159 3' - rover 6965 2 76.03 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAG:1 - chr3L 10731764 3' + 297 6921 2 58.90 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCAC:1 + chr3L 18403038 3' + P-element 2801 1 27.40 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAAAAAGGCAAAAGCTGCCTTGAATTGCACTACGAATCACTCT:1 + chr2L 15779634 3' - hopper 73 1 68.97 ATTGGTTACTTTATAAAATCTCTAACTTTCATAACGACCTTTACATTAAAGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGAGCAGATTTGCCTCAAAGATAAAATAATTGACTCGTGGGCCCCTATAGAGTCAAAGAAAAAACT:1 + chr2R 658181 3' + gypsy7 410 1 55.48 AACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTAT:2 + chrX 3431952 3' + Ivk 5309 1 65.07 AGGAATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGTAGCTTAAATTTTATTTATGGCTGCCACC:1 - chr2L 2527655 3' - hopper 24 1 61.25 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCG:1 + chr2L 22170081 3' + Juan 4187 1 61.64 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTA:1 - chr2R 9871055 3' + roo 8988 2 78.08 ATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCAACTGCAACGCAAAGTTCCTATCACCCAGTGCAAACTACATTTAGTATACAAGTGAAATATATTCACATTTCGCTTTTAACAAATAAAATAATCTACTTAGTATTTCAAA:1 - chr3R 7302958 3' - copia 4835 1 76.71 ATCTTCCTTTTTTTAAATGCGCCATTTAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCTCTAGTGGTCCCGGGGTCAAGAGGGGCTACTGCAATTTGTTATTTTCATTACCAACTGGTATTCAGGCAGAATAAAACCCATACTTCATTCAATT:1 - chr4 1089337 3' + mariner2 17 1 61.64 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCG:1 - chr2L 17809178 3' + jockey 4932 1 57.93 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGCACTCCAAACTTTG:1 + chrX 10521780 3' + Tabor 7313 2 75.34 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAAAAATTGTAAACATTATGAATTCTTTAAGAATATATGAAAAATATGAGTCAAAATT:1 - chrX 18237767 3' - jockey 4779 1 61.64 GTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGAACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAAT:1 - chrX 3431851 3' - Ivk 5349 1 50.00 GGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTCTTGATTTCCAGCCCAATTTCTTCGTTCGCCAGTTTGCGGATG:1 - chr3R 10972546 3' - G-element 281 1 60.81 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGTCTCTTATCTGGACGACAGTTATCAGAGCGACTCGCTGG:1 - chr2R 17796573 3' - jockey 4721 1 68.18 AGATTTAAAATTTCTAAGAACATTTTTGATTTGTTTGGCGGCGGTTAAGCTCGCCATGATTTTTCTAGGGGATTATCGTTCCTCCTTTTCTGTTTTCTGTTTTCCACGGGGTTTTTCGTTTAAATTGTTTTAGATTTTGCCTCTGT:1 + chr3R 16543418 3' - TART-B 10355 1 60.27 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAA:1 - chr2R 21116478 3' + mdg1 362 2 60.96 TCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGGTTCAAAATGGGAATAATATTTCA:1 - chr4 123937 3' - HB 109 1 58.22 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTCAACTTAGCCATCGCG:1 - chr3R 23911310 3' - 3S18 21 2 68.89 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTT:4 + chr3R 3920561 3' + roo 319 2 79.45 AACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGAAAGAAAATGTAGATTCA:1 - chr2L 13844136 3' + Stalker2 364 2 56.85 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAAAAATGCTGCGTAAATATGCCAGCAAAAA:1 + chr3R 11469448 3' + Tabor 7309 2 74.65 ACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAACTTAAATATTCGAACTCGAAAACGAAAACGAATGAATTTCGTTTCATTTCTTTTATAGATTTGCCTT:1 - chr3L 11844706 3' + rover 7247 2 55.86 TATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAGCGCCCCTGCCTCGCCACCCACATGACGTATCCGCCCCGTGGCAAATTCAAT:1 + chr3R 8756914 3' - jockey 4860 1 62.94 ATTTATTTATTTATATTATATTTATTTATTCTTATTCATAATCCATCATAAGTATCCCAATATATTATATTATATACTCACATGGATGGGTGGCGGCGAAGGGGTAGTCGAGGGTGGGCAGGCGCGGCGGGTGGGGGCC:1 - chr2L 3673244 3' - Doc3-element 79 3 76.98 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTTGGAACGTTAA:1 + chr2L 5582239 3' - pogo 28 1 66.44 GTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTTCGCTCCGTACTTGCCTAGCCTTTTAAATTGCAATTGTTAGACCTAACAAAAAAGATAAGGTTG:1 - chr3R 30984244 3' - F-element 4593 1 56.16 GGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTAT:1 - chrX 21772488 3' + springer 7155 2 59.32 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGT:1 - chr3R 4679440 3' + hopper2 1559 1 50.00 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTT:1 + chrX 18336662 3' - mdg3 79 2 69.66 TCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTG:1 - chr3L 22531944 3' + Cr1a 4202 1 68.28 TTTTTTTTTCTTTTGTTATTTACAACGTCTGCAACTTCCACTCTTATCGCTGGCCAAACAAATTGTAACATCCAATTGCTCTGGACATCTGTGACCCCTGGGTTCACGTCACTC:1 + chr2L 11954442 3' - BS 5097 2 59.65 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCC:1 + chr3R 15942824 3' - hopper 37 1 60.69 AGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGGCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCGTGGACAGCC:1 - chrX 11468067 3' - BS 4648 1 66.95 AGACGGATCATTTATTCGACTCGAATTACAAATTTAGAAAGTAAATCAATGCTCCCAAGGAAAAC:1 - chr3L 21585447 3' + Tom1 369 1 61.54 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGC:1 - chrX 19054238 3' - jockey 59 1 52.05 AAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTCGTAGCCAAATGACTTTTCAATTGGATTCGCCGGTAAACGGCAAAGGAAACAAGCGCATAAAGCGTA:1 - chr3R 16226975 3' - Cr1a 3981 1 58.26 GATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGTGGAGCAGGGGCAGGAGCAGAAGCAGGAGGAGGAGCACCGCCGGGGAAGAGGCATTGGGAAAGACAAATGCTTAATGT:1 + chr3L 21996404 3' - Doc2-element 475 1 71.70 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCATAAAAAAAAAAACACCATTTTCCGACCACGAAAATTGTCAACCTGCCCATTTAAAGCCACC:1 + chrX 3836955 3' + transib2 2758 1 58.20 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGACTT:1 - chrX 21216690 3' + roo 387 2 67.91 CAGGGGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGGTGTGGCCTCGGGAACCAATTACGCGCGACTAAATGGAGTTTCGTGAATGGGAGAATCTTATATTAACTAGGAGTCATTATCGTTGC:1 - chr3L 20223880 3' - G2 118 1 72.58 ATTTATTTATTTAGAAGCGATGGTTTTAAATAAATGTATACGCAGGTACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATTCTGTACAGAAAACAAAAGAATTTAGAAAAAATGACATAATTATACTTGAA:1 - chr2L 7937202 3' - BS 5084 1 76.23 CTGTCCCTCTCCAGTTGTTGTTGCTATTGGCTTT:1 - chrX 12591834 3' - F-element 425 1 70.59 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCC:1 - chr3L 14366502 3' + roo 9042 1 65.73 CCACACACAGTGTTGGCAGACCGGAGTCGCGACTTGTTTGTGG:1 + chrX 8300205 3' + R2-element 3529 1 67.44 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATG:2 - chr2R 8099168 3' - jockey 4849 1 78.77 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGA:2 - chr2R 8735566 3' + mdg1 7405 2 58.22 CTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTGAGGTATTAATGTGTTAGAACTCGATTGTAGGTGGTAATTTGATTTAT:1 + chr2R 20010732 3' - Juan 4109 1 70.55 AAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCACCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCGT:1 - chrX 15357616 3' + hopper 1393 1 66.44 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTG:1 - chrX 18336558 3' + mdg3 228 2 68.80 ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTCGGCATTGCCTTAACTTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTATTTCTAAAATTAAACATCGGTTATCCCTAGTTGGTATCCTATACTGCT:1 - chr2L 1823297 3' + 1360 263 1 67.12 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTT:4 + chr2L 15550776 3' + Bari1 1657 1 54.11 CAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGC:1 + chr3L 24934417 3' + HMS-Beagle2 7152 2 58.22 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCC:1 + chrX 21100261 3' - mdg1 7095 2 55.48 TATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGGTTGATCTGGCCGTGTTCGTCCGCCTGTCCGTTCGTCTGAACGTTGAGATCTCAGGAACTACATTATAGTTCCAGAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 + chr3R 4487816 3' + INE-1 81 1 73.02 GCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:1 - chr3R 17660025 3' + micropia 380 2 69.18 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTC:1 - chr2L 18549823 3' - roo 8720 2 59.31 AAAATATATAAATATGTATATGACCGTCTCTTTTTCTCAGGCTCCTACGCACCGAACACGAAGCTCATTGAGA:1 - chr3L 1546962 3' + G3 4504 1 84.93 TGATAGATTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTAAATTGCCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAATATCCAATGTGCATCTGCATCTGTATCTGCATTCGCATCTGCATCCCACGACGCTGAGTTGATGTGGCA:1 + chr3R 21804843 3' + invader2 4625 1 54.48 AGTTCACGACGTTCATACGGACAATCAATAAATTGCTTATGGATAATACAAGCACAATATAATTAAATTTATATATATTATGGACTTTAGGTCCATAAAATAATATTTATAATATATGGTGATTTTGGTTTGGTTTATTGGTTTAA:1 - chrX 21058154 3' - INE-1 133 1 56.85 ATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGAACCTGAGCTGACAATGAGCGCCTAAAGGG:1 + chr3L 18192793 3' + S-element 135 2 80.14 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATG:1 + chrX 16946703 3' - FB 60 1 69.05 AAAACCAAAAAAAAAAACAACACCAATCAGGGAGGGGCAATTCCAGCGAGTTCGGTACTCGGGGCAAATAGGCCTTGTTAATTGG:1 + chr3L 4533686 3' + gypsy7 5011 2 81.18 ACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACAC:1 - chr3R 9038927 3' - Juan 4005 1 74.07 CAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCAATAATATCACTCATACGCAGCGTTGCACTGGCGCAAGCTCAGCCGGCAACGAATGGG:1 + chr2L 2337125 3' + F-element 4391 1 58.87 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTAGACTGTAAAGGGCCTTGCTAAAAACTTAAAAGATTTATGCATTTCTTTTTAGTT:1 + chr4 935664 3' + 1360 3327 1 94.33 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGTGTTGACATGGTGTTCTCATGGTACTCAAAAATAATTAAGTAT:2 + chr3L 23287308 3' + 1360 3316 1 67.12 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAATAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGA:1 - chr2L 16690653 3' - P-element 90 1 23.97 GGATTGGCCACCTCAAAGTCCAGACCTCAACATAATAGAAAAAATCTGGTCATATTTAAAAAGAAAATGGAGTGCAAACTTAACTAAAAGTAGCGAACTATATCCATTTCGAATTGATTAATTTTCCGCGTCTAAAGGAGGTTACT:1 + chr3R 8857152 3' + Tc1-2 1153 1 60.96 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTAAAATTAAACTCCTTAGGCGACATAAGTCTTTCTCA:3 + chr2L 22369285 3' - rover 23 2 70.55 ACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGGCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTA:1 + chr3L 13365827 3' + BS 5061 1 55.45 ACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGTTTTTTTTTGAGGAAAAGTATCAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTTGACTAGCTGCAATCCTATAAATACGTATACGTACTCTATATATATTTATATGT:1 + chr2L 12253060 3' - I-element 5193 1 63.01 ATATTGCTGTTGCTGGCCTGGCGACAGAACGTCTTCAGGAAGCTCTCGCGCTCCTTGAAACAGCAGCAGCACCTGTGCGTACACCTTTGAAATCTGCTGACTGTTTGCTGGATTTCTTCTGGTGGCAATCTGCTCAC:1 + chr3R 6699110 3' - F-element 4290 1 56.20 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATACTCAGTGCCAGAGACGTGGAAATATTAATGGTTAATATATGTGGTTGGCTCACATAGTCGTTTACAATAATTAAAAAAA:1 + chr3L 20806899 3' - HMS-Beagle2 6919 2 63.01 CAGGGGGATCTTTGAGTCATAAAAGGGTAGTACTATAGTCAATATCAACAACCATAACAGATCATGCACCAGCTGAAAAGAAACAAATACACAAATACCAGAAAAGGCCACTAAACCACATAACCGTCTAGGGTTGAAACA:1 + chr2L 15415964 3' + baggins 5371 1 67.38 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACTTGACATCGC:2 - chr3R 24729530 3' + Juan 4198 1 62.33 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATATTCACATTTTCCCAACCTTGGGCATCAACTATTGTACAAATCCAAGTAGTCTATATTTGTTAAATAACTTTAAAGTTTAAGCTAGGAATATATT:1 + chr2R 8706448 3' + jockey 4979 1 71.72 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTCTTGTTAGTATAACTTCAATTAATTTAAGTTAACACGTTTGCTTTCAAA:1 - chrX 19038320 3' + hopper 1402 1 75.34 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCT:1 - chr3L 17183633 3' - diver 5912 2 63.01 GGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGC:1 - 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chr2R 15326832 3' + copia 237 1 51.37 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGT:1 + chr3R 20441299 3' - I-element 85 1 73.29 TTTAATAAATTAATTAAATAATTAGTTTTATTTATATAATTTATGATTCAATATGTATATGTAAAATGGTTAAAATTTAGCGATTTTCACATTGGATGTTTAATATTAGTGCTTGAGAACTCTGTAAAATGCTCCTAACGAATGTT:1 + chr3L 15445498 3' + jockey2 3402 1 52.74 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCACAGTGTCACCGAGTAAAATCGTCTAAGTCTCGCTCCCATTCTTATGAGCTCGAACCGTTAGCCGTATTTAATTAAATTAAACATTTCCGAC:1 - chr3L 25974310 3' - roo 8694 2 67.81 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACACATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCG:1 - chr3R 4964097 3' + roo 360 2 58.91 GTTTGTTTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGATTGTACATTTACATACACCTTTAATCATAAACTTTGAGTAAATTGTTTTAC:1 - chr3R 13639826 3' + Bari1 301 1 65.07 TATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAGAGAGTTTCTTGATAGTCTTAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTA:1 + chr3L 23583101 3' + S-element 121 2 71.92 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGAGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTGGTT:1 - 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chr2L 12910743 3' - G3 4505 1 76.71 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTC:1 - chr3R 23618138 3' + hopper 1366 1 60.33 TCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTAATTAGAATTCGCTGCTGGTCCTCTGGTTCTTCCTCTGTTCGTTGCTCTGATCCTGGTAGTCCTGGTTGCCGTTCTTGCCGTGCTGGCGCTGCTG:1 - chrX 10054468 3' + GATE 73 2 59.31 ACCACCTTATGTTATTTCAACATGGTCCGTTTCATCGCTCGATCCTCACCCGCTACATGCATTTGTG:1 + chrX 8437731 3' - P-element 3 2 52.24 ATTCTGATTCTGATTCGGATTCGAATTCGAGTTCGGACTTGGATTGGTGATGGTGTTCTGGGTTCTGTTGTTGTTTTGGGTTTTTATGTTATATGCTCTCGTTTCGTTTTATTTTTTTGTGATTTTTTGTTTTTTTGTGCTTT:1 + chrX 19782478 3' + transib2 2539 1 52.45 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCCACACCCACACACACACACACACACACACTTATGTATGAATATCCAAAGTTGTTAT:1 + chr2R 10909294 3' - hobo 40 1 52.50 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTG:1 - chr3L 21327088 3' + copia 248 1 57.14 ATAATAATAAAAAAAATACAAAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCAAGTGGGGAAAAAGTAAAAGGATGCAGATGACAGCCACACACAGAGGATTGTCTGTGGTCAGGCTGAGGAAGTTAATTTTTTCTTTTGGAGAATTTC:1 - 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chr3L 14515468 3' + gypsy7 5009 1 70.94 ATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACAATTTATTCATTTCCACTTTTCCAGTAATTTTCGAGTTGCTCAAAAGATATTAAAAACTTGTTGCATTTGAAAATTAAATGGTCTTTGTTCGTTTAAGTTT:1 + chr2L 20919130 3' + Cr1a 4287 1 63.70 AATGTGGGTGTGGCAGTTTTGGACAGTTTTAGGGCGTTAGAAACATAGTTCATCATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTCTTGAGTTCAAATTTAATGTAAAATTATAAGCCAGTCTAAAGCTGTGACTTAGGTTC:1 + chr2L 17955771 3' - INE-1 360 1 61.64 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTA:1 - chr3R 9002907 3' + roo 358 2 52.52 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACCGCAGTT:1 - chr3R 23618080 3' + hopper 1399 1 74.66 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATA:2 - chrX 15935390 3' - transib2 48 1 52.74 AAACATCCGTCCCATAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAAATACTTAAGAACATAACCACTAACCGCTTTAAGAATCTGGAAATAT:1 - chr3R 2336742 3' + Idefix 191 1 69.86 AAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAATAAATAAAACAGAGTTCTCTGTACCGGTTCCATTGGCCAAAACCAGTCAAATTTGTTAT:1 + chr3L 10388968 3' + invader2 419 1 62.33 AAATATATATATATATGGATTAGTAAGTATTATTACCCCTGACATAGAGACACTAAACAAGTTCTTTTCTTTAATTGTAAACTAATGAAATTTTGCCAATATACGCAGGGAACTCTTAGTAGAAACTTATCAGCTAA:1 - chr2L 22126026 3' + G3 4513 1 75.91 ATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTG:1 - chr3R 11040037 3' + Bari1 1664 1 55.86 AAAAAAAGGAAAAGAAAAAAAAACTGAAGGAGAGACAATAACAAGGCAATATATACACTGAAATCTGAATAAATTAAAATTGGCTGACCATAGAAAATGAACAAAATTACACAAAAAGAAAAACCAGCGAGTTATAAGAGAAATAT:1 + chr2R 17840346 3' + Doc2-element 255 4 67.81 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAA:1 + chr2R 14051822 3' - roo 90 2 87.67 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACACTGAAGACCTTTAA:1 - chr2L 12984098 3' + hopper 1379 1 56.94 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCAAGTGGTTCGCCCCTTTCGCCACTTTCTTCACCTGGGGGCAGC:1 + chr3R 25433405 3' - transib2 15 1 68.60 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTAATCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAACTGAATTTTAC:1 + chr3R 13187498 3' + I-element 5276 1 67.12 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATAT:1 - chrX 2479491 3' + mdg3 181 2 58.90 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAA:1 - chr2R 3338797 3' - Juan 61 1 63.43 GATGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCCTGCCATTTTGCAA:1 + chr3L 9809374 3' + 412 7511 2 60.96 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCCT:2 + chr3L 9809362 3' + 412 446 2 52.74 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAAGAAGAAGAAGAAGCTGCTCATTTCAAAGTTTTCTTCTTGTTCTTCCTTTTCTTCTTAAAGAAGAAGCAACTATTTTACGGCGTAAAGATTTTTGATTTACGG:1 - chrX 1341588 3' + 412 476 2 70.55 AGTAACATAACAGCGCAATTAAAATATAAAAGATAAAACCAAACCTTTCACTAATCATGTGAGGAATTAAGACAATATATACTAATAAGCAACAAGCAAGTAAGAAAAACAAATAAATCAAAAAAGAAAATAAATTTATATGTTAA:1 - chr2R 6799517 3' - BS 5042 1 89.04 AGAGTAGAGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACCCTTCGATACATACTTGAAAATAACTTCAAATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGCAGTATATACGAACATAATAACAACAATAATAATAATAATTATGATAA:1 - chrX 13383541 3' + invader1 380 2 65.07 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATATATTATATATATATATTATTATATATTATATATATACATATTAATTAGGGTATTATTGATTACTGTGGGTATGTACGGATA:1 - chr3L 21969801 3' + opus 7468 2 49.32 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAAT:1 - chrX 18396102 3' + roo 327 2 71.53 CACTAGAATATTATTATTAGTATTATTTTTATGAAGTATTAGTATTAGTATTATTAGTACTAGTATTATTTTTATGAAATATTTATTTCTCAACGTAATGTCTTCTTTTTTTTGTACTTCCTTTAAATATTTAGTATATTTATTAA:3 - chr3L 5125985 3' - Tc3 304 1 57.53 GAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTACTATTTTTTTAATATATTGTTAATGTTAGGGAATCTCTTAAAAAACTCTTTATCCAA:1 + chr3R 5846991 3' + I-element 296 1 60.27 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAACCTAATAA:1 + chrY 9415 3' - roo 8740 2 71.23 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAACGGACAGCTTTTCTCC:1 + chr3R 19032724 3' + roo 9037 1 61.64 TAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGTCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCTC:1 + chr3R 30987553 3' - F-element 158 1 76.71 TTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGATTTTTGAGAAATTTCATTTTTTAGGGAGCAGTATCTCGATTTCCAATGCTGCTCTGCCACCGATCGTTGGCTGATGGGCCCATTCAG:1 - chrX 16703879 3' - hopper 956 1 78.08 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAGCTGGGA:1 - chr2R 17926261 3' + opus 478 2 69.86 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTC:1 + chr3L 21380647 3' - I-element 37 1 60.27 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGA:2 + chr3R 30987588 3' - F-element 123 1 54.11 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATATTATAATAGGATAGATGTCAT:1 + chr2R 24170064 3' - transib2 67 1 63.01 CGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATG:2 + chr2R 7850011 3' + roo 325 2 71.92 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTT:1 + chr2R 14051832 3' - roo 66 2 78.79 AGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACC:1 - chr2L 22121315 3' + I-element 5329 1 55.48 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATACTGTTAAAGGA:1 + chr3R 26504345 3' + HMS-Beagle 214 2 63.70 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1 - chrX 21087598 3' - mdg3 5306 2 62.86 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATA:1 - chrX 2479492 3' + mdg3 5432 2 59.59 CGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATCATAAAATCACACTTAATTTCCGCTGCCAGCCAGTAGCTGGCAATTAATTAAATTCGGTACCACT:1 - chr2L 2069793 3' - 1360 3178 1 65.75 ACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCAT:1 - chr3R 4357526 3' + Tc3 1649 1 58.22 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGGACCAATGTTGCACTTGGAATCATTT:1 - chr3L 25406607 3' - 1360 14 1 69.18 TATTTGTGCTTTTAGTTACAATACTTTACTTCAGCACGTGGTCTACATTCAATAGCCATAAATCGATTCTGCATTATTTA:1 + chr3L 5445400 3' - R2-element 235 1 80.00 TCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCA:1 - 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chr3L 17055384 3' - Tirant 12 2 75.35 TATAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATTTTGAATAAAAACTTAAGCGTTTCTAAAACGTTTTTATGGATGAATTGTTTAATGTGA:1 + chr3L 2990089 3' - roo 8673 2 76.03 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAA:1 - chr2R 8157193 3' + mdg1 340 2 74.66 CAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTAATGCGCATCCGTTACGGCGTATGCATCAGGACCTTCACTTGCTCACTCACTGAGTCCACCCAACGACATCGAAAGCCTGGCCAGTATCGGTCACCAGAGAAACTGCCCCGTT:1 + chr4 714463 3' + jockey 4634 1 74.66 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATTCGTCACTATATAAACGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTTAATCACTTCACCAAGGCGCTT:1 + chr3L 10373913 3' - 297 6618 2 54.87 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATTTTAAAC:1 - chr3R 4460968 3' - blood 10 2 78.08 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGA:3 - chr3L 19454894 3' - mdg1 30 2 63.70 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGGCAATACACACATATATGTACATATATGTGAAGAGAGGACTCTCCACCTCAATTTCTGCCAACAACGTGCCCCTTGCCGCCAGGGAATGCGTGCG:1 - chr2L 15188315 3' + 297 6956 2 73.29 CCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCAACGCTATGAATTCGTAAAATTTAAGTAAAT:1 - chr3R 19609631 3' + micropia 5121 2 63.70 TTAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGGTTGGGGTTAATAG:1 - chr3R 25433284 3' + transib2 2762 1 59.59 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATAGA:1 - chrX 10319565 3' - mdg1 20 2 71.92 CTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATACGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTTAGCACTCGAACTGATACAGCCAGTTGGCCCTAAATCGACCACTTTTC:1 + chr3R 18431750 3' - 1360 380 1 67.63 CTTCCACTTCCACTTCCATTTCCATTTTCATAACCATTACCATTACCATTTCCCCAATTGTTATTGCCTTGCCAGTTGCCTGGTCCCATTCCGTTTGGACCACCAGGTGGTCCACCCATTCCATTTCGCCCAC:1 - 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roo 8713 2 54.11 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAA:1 - chr2L 20265952 3' + roo 333 2 70.55 ATATATATTCTTGATCAGGATCAATACTCGGCTATTTATACTTTTAGTGATATAGTACAAGAGTTAAGTCAATTCAGAATCTAAACGACTTATAGAGAATAA:1 - chr3L 164660 3' + INE-1 80 1 59.80 ACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTCGCACCTTTGCGTTTTATGGCTTAAAGCGACCAACTGCCGCGTGCGGCGCCAAAACAATAAACAAAAAGTCGCACAACCCAACGATTTCCCGGCCC:1 + chrX 20939943 3' - hopper 1263 1 71.85 TTATTAACGGGATGCTCGGTTGTCAAATGACAAGTGCTTAATCAGGCATGGGGCTGTCCCGCGATGGGGCGGGAATTATTACTTTAATCAACACACTCATAGAGCGTTGT:1 + chr3R 2916555 3' - Circe 302 1 76.36 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCTGGCTCTCGGGCCGC:1 + chr3L 3983869 3' + P-element 2799 1 24.14 GGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTTCTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAACTTTATTTATCTATCTATCTATATCTACGTGTATTTTTCAATTTAAACTCTATTTT:1 - 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chr2L 16539614 3' + Juan 4191 1 70.55 AGAATGGGGGAAGTCACCTATCAGATTCCATTCCAGCTTTTTTATAGTTCCTGAGACCTCGACGGTCATACGGACAGACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCAATTGAACCTGATCAAAAATATATATACTTTATATGGTCG:1 - chr2L 22136614 3' + mariner2 756 1 78.87 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAAGTATGCATATAAAGTATATATCTATCGATATGCTGGATATTTCGTATCTAATCCCCAATACTGATTTCAGGCTCGTCACAGTTCAGGACTGCGGATACGATCCCATCCCACGC:1 - chrX 15017899 3' + INE-1 11 1 66.19 GTTAAAACTGTATTTTAAAGGAGCTGTGCAAAAATATTGCTTAATATTCAATAGGGAATACCTTATTTTGTATTCTTGCTTTTATAATTGGTAGTAAAAACTCTAAACTTCAATTTTAGATTAAAGATTTGTATTCGCATCCCTTA:3 + chr2L 11488016 3' - FB 662 2 75.34 CTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCT:1 + chr2R 5531207 3' - 1360 98 1 49.32 ACCAAACCGTATGTTCGGAGTAATTAAAAACATAACAAAAAATCGTCATTACTTTTTTTGGCTGAATAGCTTTGACCACTAAAGCAATTTAATAAAGTATACATTTATTAGTATAAAGCAACATTT:1 - chr3R 4577270 3' + Tc3 1390 1 80.16 AATTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAAAATCTAATTGGTTGGGGAGCCGGTCGTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATAT:1 + chr2L 22674897 3' + mdg1 7444 2 56.03 AAAGCAAATTTCAAAGGCATCTCCCAGACATTCGCCAGACATTGATGGTTATTGGATCCGAGTACTCCACGCCCCCGCACTGAGCAAATTTCCTCCAGAACAACAGCATTTCGAGTATCTGTATCTGAGAGATAAGAATTAAGGTT:1 + chr3L 3421401 3' + Transib5 214 1 54.11 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTT:2 + chrX 7795581 3' + roo 315 2 81.51 AGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCG:1 - 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hopper 18 1 71.92 AATGGGATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGG:1 + chr3R 556463 3' - Juan 4153 1 64.06 GCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCATCATCCATCATCACTCGGAGCAGGGAAAGTTAATAAATTTAATAACCACGAAATATGCCCGCAGCGAT:1 - chr3R 5436286 3' + gypsy6 7544 2 55.48 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAG:1 - chrX 4341273 3' + roo 8998 2 67.81 ATTTCTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTC:1 + chr2L 14675728 3' + 297 321 2 76.69 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTA:2 + chr2L 4063932 3' - roo 65 2 63.01 TATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGA:1 - 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Doc 54 1 53.42 TATTATTATTATTATTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGAGGGAGGCATGGTTATTGATAATGATATTGAGGTTGTTGTGATTGAGTTTGTTATTGTTATTATTATTATTATTGCTGTTGCTTCCCTTTTGCATTTTCATT:1 - chr3L 527763 3' - mdg1 31 2 80.71 ATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGGTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAA:1 + chr3R 15790141 3' - flea 4713 1 79.31 GTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAATCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCCGAAAGGAAATGCGGATAAGTGCAA:1 + chr3L 25232919 3' - GATE 55 3 51.15 ACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATCTTCAG:1 - chr2R 3563090 3' + Transpac 5167 2 59.03 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGGTTGCAAAAATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAAT:1 - chr3R 11040067 3' + Bari1 1654 1 60.80 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAG:1 - chrX 15200801 3' - 17.6 6954 1 65.07 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGC:1 + chr2R 8735650 3' - mdg1 85 2 75.34 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAATATTTGAGCTGAATAAACTGAAGCGGCACTCATTATGTGCAATACTTTTTTCATTATTTGCCAGCGTTGTTCCTTAAT:1 + chr3L 5533069 3' - roo 8680 2 71.43 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAAT:1 - chr3R 6625693 3' + flea 4962 2 56.85 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATACAAGAATATATAAGCTT:1 - chr3L 16662339 3' + jockey 4973 1 68.97 CATGCACACACACACACACACACACACACCCATAAAAGCCAACAAAAAAAATGGCTGCGCAGCACCCACAAACACACACACACCCACACACACA:1 + chr3R 28240377 3' + accord 7026 2 65.96 CTCCCTTTTTAGAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAATTAATTAAAACATTTTTTGTTTATTATATAGTTTTGATCGTTTTTGATTCGCAATTCGTTTTGGTGCGGGTAGAAAATTTCAAAGATT:1 + chrX 11969464 3' - Stalker2 7226 1 57.69 GTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTATCATCATCCAACTTCTTATTTATTCTCAAGAAAAAGAGTTTCAACGTTTTGGCGACCGTGACAGAGCTAGTGTTGTTTTTGC:1 - chr2L 22736921 3' + diver2 271 2 58.04 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAAATTAATCTGTTTTCA:1 + chr2L 11357952 3' + blood 345 2 63.01 ATGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAATCACCCCCTTGATTACCATTGTCCGCGTTCCAGGG:1 + chr3R 6040099 3' - Idefix 35 2 43.75 ATCCTACTAATACTAATATTTAATAAAGTTATTATACATAATAATAAATTCTTTGAATTCAGCATAAGAAATTATGTCATATCATTATACTGTAATTCTGTTCGTAGTCGCCTAAAGTTCTGCTTGCAAAACTAATTGGTTTAT:1 + chrY 627091 3' + Cr1a 4295 1 73.61 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTA:2 + chr3L 20898654 3' + roo 9039 1 63.70 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATTGTATTT:1 + chr2L 15940316 3' + pogo 2043 1 58.22 ATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACGCTCTGGGGTACTGCCAGCAACTCGAATATTGAGAGTCTACAACGCTACCAATCAAAAACACACAATTAACAACGTAACAGAATGAAACCTATAGAATAATATTTCATATAGAGC:1 - chr3R 12627208 3' + G4 3414 1 60.27 AGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTCTCAATACAGAGTTGATTTCGATTAAATGTTGTGTTATATTAATGTTACCATAATGTAAACTATTTAATAAAATGCCTAAACAAAATTGTTTGATTTCTGTAATAAAAG:1 - chr2R 2932800 3' - I-element 310 1 76.71 AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATA:1 - chr3R 25554216 3' - micropia 5082 4 56.85 AATATAATTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAAT:1 - chr3L 17567898 3' - S-element 1610 2 76.03 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCT:1 - chrX 11661386 3' + pogo 2044 1 65.07 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAA:2 + chr3L 24208195 3' - Quasimodo 74 2 73.29 AAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCCAGTAACGCTCACGCATACTCCAAGCTCGGTGACAAGCGGCTCTATTGGCATGCAGATAGCGGGGGCAGCGGGTACGGGGG:1 + chr3L 27908279 3' - 1360 246 1 75.22 TAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTA:2 + chr2L 23295878 3' - micropia 5017 4 60.27 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTCTGTTCGGTAATTAGCAAATGCAAAATTACACTGTGCACT:1 - chrX 2814261 3' - FB 81 1 72.60 ATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATGCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAATGAAAATTTAATAAAAATAGAGAAAGAAATAGCTATAGTATTATG:1 - chr3R 4093891 3' - I-element 368 1 68.49 GTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATG:1 - chr2R 9966962 3' - Bari1 31 1 39.85 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTAGAGCTCGACAATAGCCTA:1 - chr2L 17205144 3' - hopper 29 1 64.14 CTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACT:1 + chr2L 17005780 3' - Stalker2 86 2 75.34 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTG:1 - chr2L 8338132 3' - P-element 55 1 36.97 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTT:1 - chr2R 5070919 3' - gypsy5 26 2 26.03 ACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTAT:1 - chrX 21639623 3' + gypsy5 384 2 55.24 ATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAAGAAATATATTGAATATATTTCTTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGC:1 + chr2R 6164610 3' + Tc1-2 1534 1 76.71 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCTAGTCCA:1 - chr3L 3030190 3' + roo 360 2 56.16 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCT:2 + chrX 21224632 3' + roo 360 2 56.80 AATACAAATATTTTTAAAATACTGCTCTTTCTCCTCATATGAATTTCACAGCGTCTTCAGTAATATATTATTAATATAAGCTCTTATAATCGGTCAACTGAA:1 - chr3L 24773390 3' + 297 223 2 78.43 AGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGATGATCCTATTTACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTACAGATAAACTTATACGTATAATAG:1 + chr3R 19446676 3' - roo 9027 1 63.11 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTGTGAAAGAGACGGACTGAAATGCGTAGAAAATAACGACAGTAGAATGGGTGGAGTAATCACAAACGAGGCCCACCAGCGGCGCTTC:1 - chr2L 685601 3' - INE-1 578 1 75.45 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGCGAGACGATCACCAAGGCCC:1 - chr3L 18402958 3' - P-element 54 1 48.63 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCG:1 - chr2R 16817898 3' + 412 441 2 65.79 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACTGATTTCTCTAGACGCAAATGGGGATTGGTTTGCACTTTGG:1 - chr3R 21933106 3' + pogo 2077 1 64.38 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGG:3 - chr3L 2989914 3' + roo 9032 1 57.53 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCGAC:1 + chr3R 4860550 3' - Transpac 4946 2 62.79 TTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTTTTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATTATTAATTTCTTTGCTGGGAGCGTAAGTCGCCAGTGCGAAAGAGGGAGATGC:1 + chr2L 5335742 3' - Doc2-element 4746 1 77.40 AGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAATGGCCTTTGCGG:1 + chr3R 24506374 3' - INE-1 465 1 65.07 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCCAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTC:1 - chr3R 6419802 3' + Tabor 464 2 67.81 GAGAAGTTTAATGTGTTATGTCCATTACATTTTTGTAGTTTATTGTTCCTGATTCAAACGAAATGAATCCTTGATTGTTTATGCTAGGGTTTATTTCGATTGG:1 + chr2R 2009383 3' - I-element 467 1 79.61 AAACCGGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTAATGGCCGTACAAGTGATGACCTAGCAAAGGTAAGTTCAGCGTAAATTGTAATGATGAATCAAAAAATATAAATAAG:1 + chr3R 19445868 3' + Cr1a 486 1 68.49 GAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTTAAAAGTTAAAAGTTTACATTGTTGGGGCTAGAT:1 + chr2L 8751653 3' + transib2 2436 1 76.71 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCTTCGTTTTCGGCTTGGCCAAGTTTTCATTTTCGG:1 + chr2L 12984273 3' + hopper 1407 2 79.45 AGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGG:1 - chr2L 14026162 3' - F-element 469 1 64.55 CAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAA:1 - chr3R 15724328 3' + Juan 4128 1 76.03 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATT:2 - chr2R 13766181 3' + roo 9032 1 57.93 AGACGGTGCGATCCATCTTTATATAATTGGCGCTCAACTAGTGGTAAAAACAACCAGCCCAAACAACAACACATCGCCACATATTTGTCGGAAAAAAGCAAACAAATCCGCTTGAAGAGTGCAACACGC:1 + chr3L 8750378 3' + Gypsy6A_LTR 393 1 55.04 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGC:1 + chr3R 26178500 3' - 412 29 2 61.43 AATAAATAAATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTAAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACCCATTAA:2 + chr2L 12553461 3' + X-element 4716 3 67.81 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCCCCCTCTATCTGGAAAATCGAGAAGCTGGATCAACTTACACTTACTCTTCGCCATCCACGAGTCCTCACGTTTGATCTTG:1 + chr3R 6219635 3' + Tirant 351 2 65.35 ATTTACTTACATATTATTTTTAATATAAGTGTGCAAATTATATTAAATTGATTTGCATTTCGGAGCCACTCATGCTCAAGTTTTTTTTTGGCAGCCAACGAAAATTGATGAAAAACCCTGCTCTAACTATTGTATTTAAATAGTGC:1 - chrX 2899962 3' - blood 6916 1 70.55 TCTCAACGTTCATACGGGCAGACGGACATCCTGTTCAAGAATATATATAATGTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTACTCCTGTTACATACTGTTCAAGGAGTCTTGTATACCCTTTTACTCTAC:1 + chr3R 2473817 3' - INE-1 130 1 59.68 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTT:1 - chr3L 2145887 3' - roo 8722 2 63.70 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCCTTGTTGCTGTTCGGAGCCGGCTTAAATGTTGGCC:1 - chrX 10167393 3' - roo 84 2 77.40 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCCAAAAATGGAT:1 - chr2L 13158593 3' + roo 394 1 73.97 ATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAA:2 - chr3R 4357507 3' + Tc3 1668 1 46.58 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGG:1 - chr3L 1692001 3' - blood 43 2 54.79 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAAC:2 - chr3R 14980336 3' + roo 319 2 79.45 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATT:3 - chr2L 14874163 3' + copia 230 1 55.48 ACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAAGAATGGCCGCAGTAGTTGTTGATCTTATGCG:1 + chr3R 13434934 3' - Tirant 444 1 76.12 CGATAACTTGTAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGACTTCCAATTGCTTTAATGATTAACATATTCGATATGCGTTCGATTACGGGCAAACCTGTTGACTCAATCCAGTTTAGAAAACTTCAAATGTAACGTT:1 + chr2L 14523290 3' - HMS-Beagle2 2 2 43.28 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGAT:1 - chr3R 15790845 3' - roo 63 2 61.64 ATAATTAAATTAATTATAAATACATATAGTCTGTAAACGTGGAAGTTAAAAAATGCTTTGCTAATTTGCTACCTGACGCATTCTCTCCTGGCCAAAATAAGCTTATTTGTAAAAACTTATAGATTAACCAACCCATTATTACGCAA:1 + chrX 21049405 3' + flea 4992 2 56.16 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGTCGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATTATTACACAATGGGTACTTATTTTCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCAC:1 - chr3R 27160076 3' + 412 420 2 66.44 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTTCCTATAT:1 + chr2L 11257146 3' - rover 27 2 67.81 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTACTTTTTATGATTTGATTGTGTGTAAAATTAGTATTCTTTTTTGAGCAACA:1 + chrX 14771855 3' + BS 5076 1 69.86 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGC:1 + chr3L 13581723 3' - jockey 4836 1 69.18 ATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAA:5 + chr2R 23780585 3' - Ivk 101 1 76.03 AAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTATAATGTATGGTGCTAGTAGAGCCCTTGGGCGAAGACAATTTCGCCACATGG:1 + chr2L 21580584 3' + INE-1 165 1 63.01 GAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATTATGTATTTGAATTTAAATA:1 + chr3R 19408034 3' + diver 198 2 64.14 AAAAAAAACAAATAAAAAAATGGTACAAAATAGTTAATTAGGCAACACGAGCATTTGATTTTAAAACTTTTAATTATGTCCGAAATAAACAACAAAGTTTGCACAAATTTCTGTTATTCTCCCCCGTTTTCATTTCCATTAGAAC:1 - chrX 15247016 3' - hopper 142 2 71.72 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTTGTTGCCACCTGGTCGTTATCTGCATT:1 + chr2L 8784813 3' - 1360 25 1 66.67 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCT:3 + chr3R 17077181 3' - roo 8742 2 73.29 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATAT:1 - chr3L 16970349 3' + roo 9023 2 53.42 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATTCAAGTCTCCGTTTGATAGGCCTTTAA:1 + chrX 585768 3' - Tirant 8117 2 77.34 TATTTTATTTTTTTTTTATTTTATAATTTATTTAATTGTTTAATTGTTTTGATTGTTAATTGAACTGTTTTTTTTATATATAAAAAAACATAGCTGCAAGCTATCATATAACTTACATGTTCCTTGCAAAAAGGTAAAAAGGTAGA:1 - chr3L 15760693 3' - F-element 4686 7 65.75 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGT:1 - chr3R 23639135 3' + pogo 2041 1 46.58 GGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAATAACAACCATATAAAATGTGCATAATGGAATATAGT:1 + chrX 12543965 3' - FB 485 1 75.34 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAG:1 - chr3L 22861772 3' - S-element 64 1 62.33 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAAT:1 + chr3L 20898598 3' + roo 319 2 80.82 TGGGAAATTATTTATTTATTTTGTATTTAAGGCCGAAATTAAAATGTGCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACA:1 - chr3L 20187439 3' - mariner2 834 1 74.12 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTT:1 + chrX 14722215 3' - diver 5942 2 52.74 CCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAA:1 + chr3R 18093374 3' - I-element 63 1 58.22 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTGCAGAGTGCAGCTGCGACTCGAGCTGCAGTCATGCAGCAGTCAGAGAAATCAGGC:1 - chr2R 15651913 3' + hobo 2886 1 55.97 ATTAAAAATTAAAAAAGAAAAAAAATATAAGCTAAAAAAAATAATAAATCAAAAAAGTTTTAAAATCGATAAAGAATTTAAAAAACTAGAAAACCGAAACAAATAAAAAATTTAAAAACCTTTTAAAATCGATAGTTAAATTACAA:2 - chr3L 11830978 3' + Doc 4694 1 65.07 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAA:1 + chr3R 15791007 3' + roo 351 2 60.56 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATTCA:1 + chrX 585744 3' - Tirant 8146 2 56.39 CTTTAACAATTTAAAGTATTTTTAGCATTTGTGTGTATCCTACATTTTTGGTTGTCTAAAAATATATTTTAATATATTTTATTGCCTTAGAGACTTATGTACCTCTTAAGTTTTAACATAAGTTATCTCAACATATCTTTTATGTT:1 + chr3L 9873179 3' - HeT-A 5812 1 71.23 ATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTGCCGCTATTGGAATTTGCAAATATTCTTATAAATTATTATATCAA:1 - chr2L 12341778 3' + BS 5077 1 71.92 TAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAG:1 + chr2L 4713960 3' - transib2 61 1 63.70 TCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACA:1 - chr2R 18514885 3' + P-element 332 1 39.04 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAACGGACAGCTTTTCTCCGCTTAT:1 + chr3R 19032730 3' + roo 9043 1 65.75 TAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACACTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTCTGAACACAGCTGTAGATATGTACGAAATACAAACAAATACGTCAATCTTAAACTCCAGAACTACTGACATTATTAGAATCGTCAA:1 + chr3R 5367040 3' + HB 1581 1 70.71 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCAT:1 - chr3L 16970383 3' + roo 8989 2 76.71 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTTCTGCAGGTCTCCGA:1 - chr3R 15790783 3' - roo 8665 2 75.34 GTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTCTTACTTAAAACCATTCCAACTAAACTGCTGAAAACCGGGTTAAAAGAAAATAGCAGGGGTTTGAATGTTTTGTAGTCGA:1 + chr3L 55759 3' - Doc2-element 453 1 43.86 TATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAAACATGGCGG:2 + chr2L 9010170 3' - G2 2685 1 74.55 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCG:1 - chrX 21216701 3' + roo 397 1 70.80 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTG:1 + chr3R 20441300 3' - I-element 84 1 72.60 GCTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTTTTA:1 + chr2L 13556487 3' - transib2 16 1 69.18 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTT:2 + chr2L 12818379 3' - hobo 14 1 74.66 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTGTAAGTATTTATAAAAACC:1 + chr2L 21328292 3' - 297 14 2 74.44 AACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTT:1 - chr2L 23008375 3' - transib2 275 1 67.83 AATGGTGTCTAAATACTTATGACCACTAGTGTATACATATTTAAAGTGAATTTATTTAAAACGGTGGAGAAACTTATAAGTATATACGTTTACTAAAATATTAAATATTCAAATATTCTGCTAGACAAGACAAATATCTGTAATCT:1 + chr4 220976 3' - Tc1-2 10 1 72.60 CATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGATATCGTTGTGAGTATCTGTGTGAGAGAGGTGACCGCAAACATACAAACACTGCTCACGGGAAACCGATGTCGACATTCGCCTCTTGCTTAGAGCGAAACGCATCAATTATGTTGA:1 + chr2L 16096441 3' - G2 63 1 80.69 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGTCGAGTGCGC:2 + chr3L 21380658 3' - I-element 25 1 68.28 CAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGA:2 - chr3L 16973380 3' + S-element 118 2 65.07 AGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGAATCTAGTCAGAGGGTCAGCATTGACCACAGCAGCAGTTCCTAGCTTCCTTTCTAGGCTGTTGGGGAGTACATAAAGCCTTTCCACATATTT:1 + chr2L 5650439 3' - jockey 4751 1 87.10 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTC:1 + chr3R 12728086 3' + Juan 4171 1 51.37 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGAAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGGGTTGGCC:1 + chr3R 11191485 3' - roo 8733 2 66.44 AATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAACTGTTTATTAGATGTAATGAATTCCAGCAAAAAGTGCGCAACTTGCAGGAT:1 - chr2R 14054301 3' - transib2 412 1 65.07 ATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAAGTCTGAGGCGTAATTGAGTTATCTAATGGAAAAGTTGAAGACACTATCCACAATTTAAGATGACTGGCATCCGCTGACATTTAGAATCTAGCGTCTATTGGATAATTA:1 - chrX 3532013 3' - S-element 374 1 79.45 CGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAAATACCGCCACTCTTTTTCGCACAAAATACACGGACATACGTAGTTCTAAACTCTTCTAACACACAAAA:1 - chr3L 5630502 3' + Doc 451 1 56.85 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATT:1 - chr3L 12004237 3' + P-element 2830 1 47.95 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCCCATTCGCACACGCCTACGATCTCACC:1 + chrX 18114851 3' - P-element 28 1 38.24 AATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGTTCACCTTCGGCATGCGACTGGGAAGGGAGCGCATCTC:1 - chr2L 8247071 3' + Stalker4 6995 4 73.97 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACT:1 + chrX 8437737 3' - P-element 76 1 32.88 GCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAAC:1 - chr3L 23249393 3' - rover 68 2 61.64 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGGTTCAAGTTGGACA:1 - chr3L 18125892 3' + Ivk 5334 1 50.68 CAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATAC:1 - chrX 18396032 3' + roo 396 1 66.44 AATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATGGCTGTTGA:1 - chr3L 10731717 3' + 297 395 1 83.33 CTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCGCACACATGTACTCATGTTATAGATGACGCCATTTAGTTTGAATATCTATGGCAGCACATATCCACATCCTTTGCCTCCGC:1 + chr3R 27426142 3' + G6 1834 1 60.71 TACTTATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATG:1 - chr2L 19817753 3' + G4 3815 1 39.04 ATTTTTTTTTTTGGGGTTTTTTTTTGGTTT:1 + chr2L 9727357 3' + mariner2 594 1 90.00 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTAGCATGCGATCGATAAGAGAGAGCGCATACGGCTCTTT:1 - chr3L 4233915 3' + pogo 2067 1 64.08 AAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGCGTTGACATGGTGTTCTCATGGGACTCAAAAATAATTA:1 + chr3L 23287303 3' + 1360 3317 1 69.29 TTATGTTATTTTCAATATATAATTGTGGATAACTTTCTTATGAAGTAATTGTAATTCACAAAGACAATACCGTCCCAAAAAAATGAATTTATTAAGACGAACCTT:1 - chr3L 7848742 3' + transib1 1908 1 83.81 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCTAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACA:1 - chr3L 14366539 3' + roo 9002 2 67.12 ACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTCGATGTCGATGTCGATTGTTTGACTGAGCGAGCAGCCCAAGGGGGGCTGAGGATATGGGGG:1 - chr3L 3888719 3' - Quasimodo 7096 2 56.43 GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTT:1 - chrX 18336583 3' + mdg3 5434 2 58.62 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGGAAGTTATTTCATAGGAAACGGAAAATCCTAAAAATCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATCATATCATTCATTTTAAAA:1 + chr2R 24170013 3' + transib2 2787 1 41.78 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATG:1 - chrX 14722121 3' + diver 150 2 66.44 GATAAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAGACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGA:1 - chrX 22576290 3' + Burdock 6287 2 47.95 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGA:1 - chr3L 12004258 3' + P-element 2809 1 33.56 AGATTTGAAAACTTGTTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGTGTTATAAATGCCAAAAAAAAATGTATATTTAAATTTTATATTAGTAGTAAAATATAATTTAAACTTTAGTAGACATAAACATGAAAATTATTAAAGAACTTTTGGGAT:1 + chr2R 17911598 3' + Doc3-element 4669 1 71.92 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGC:1 + chr2R 8735692 3' - mdg1 43 2 54.79 ATCCGTTTGTCCGTATTAACGTGGTCGTCATGTTTATATTAAGCATGAACATGATGGCAAAATAGAAAGTTAAGAAAGTTTAATTCAATAACGGAATAATACCCATTTACTTTTCATACTTACTGACATGTGTACATTTATACCTG:1 - chr2L 19815969 3' + INE-1 125 1 77.40 AAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATCAAACTCTCCTGCCAACTTACAATTAACGCCCCAATTTTCGCAATCCTCGCATGCATTTACTTTCTGG:1 + chrX 8631628 3' + Porto1 256 1 56.76 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAA:1 + chr2L 16539781 3' - Juan 4052 1 63.70 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGAGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCT:1 + chr3R 15942786 3' + hopper2 1548 1 66.92 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTA:1 - chr3L 18046619 3' - roo 8742 2 73.29 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGG:1 - chrX 22840490 3' - copia 4915 2 63.48 AATCGGAGGAAGCAAATTAATATTTTCGAAAGGAGTAGGATAGCTTGGACAGCGGCTGCCAAAGGGG:1 - chrX 19594990 3' - Gypsy12A_LTR 2060 1 53.73 GTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACTCGAAGAAAAAAGGTATAATTAAATGGGCATAATGATGCCAAAGGGAAAGGCCAACGCACATCCAGCGGAGACTGTTGGCGGAAAGAGGGGATCGGACCAGTG:1 - chr3L 14466146 3' - gypsy 7001 2 64.83 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGATCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGTGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTT:1 - chr3R 24090462 3' - 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TART-B 10183 1 73.08 GTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTAAAATATTAAAAAATGTCTTCTATTTATAAAATAGAAGACATTTTTTAATATTTTAACTTTATCGCCCAAGATGAAAGCAACG:1 + chrX 15379969 3' - 412 394 2 45.52 AGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACA:1 - chr3R 19407902 3' - diver 5951 2 60.96 GGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAATTGTTGTTGCCCCTGGGTTTTATTTTTCTTGTTTTTTGTCGTCTGGTGGGATTTACATTTTGACATTTAAACTTGTTTTTGGCACTTGTTTTTGGCGGC:2 - chrX 22846013 3' - Ivk 413 1 71.23 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 23372630 3' + 1360 3333 1 71.92 CTTACGACGGGACCAACTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAATGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCGAGAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTG:1 - chr3R 30347293 3' - P-element 14 1 65.81 GGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACATGCAGTCGAAAGGGACAAACAATT:1 + chr2L 6647713 3' - 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Osvaldo 26 1 72.09 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTCGCTGGTTTTTCGCAGCTCTTTCATT:1 + chrX 4808632 3' - mdg3 5294 2 58.22 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGT:1 - chrX 19539484 3' - pogo 64 1 64.38 GGCTTACAGCTATATTTATTTACGCTTAGCCAAGTTTTTTTCCCCCCTATTTTGTTTTTATTTGTTACTTATTCCACAGTTTTCGGAGGGCCAGAGTGAGTCGGGGGGCTTGAGTACATTTTTTAACGCTTTTGCAAATTTTCTGG:1 + chr2R 14704227 3' - I-element 5279 1 80.82 ATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGC:1 + chr2R 8735660 3' - mdg1 75 2 68.49 TGCACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTCAGCGCATGATTTGTTTTCGCATCCTATTGTCCTTTTTTTTTGGTCGTTTTGGCGGGACAGCGATAGGTGTCAGTTCAGCATGTTTCCAAGTTATTGA:1 - chr3L 3014359 3' + rover 62 2 55.48 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTATCTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGCCTTAATTATGG:1 + chr3L 6447144 3' + transib2 2783 1 54.79 GTTATTATAACAGTTCATTGATTTTCAATTTTCAATGCATTTCATTAGCCCAATTCCGATGGCTCCCCGTATCTTGATTGCTTGGACAGTGGCACAACAAGAACTGAAGTGTAATCCTGGCTTCC:1 + chrX 1151549 3' + hopper 1283 1 68.00 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCATATCCTTTATTCTTTCCTCAAC:1 - 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chr3R 28146129 3' + roo 8991 2 73.97 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGG:1 - chr2L 16946049 3' - hopper 80 1 71.23 CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGT:2 + chr3R 28385610 3' - transib2 79 1 69.86 ATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCCTGGAAATACTTTTCAATTTTCTGCTCAACAACTTGCAGCGACGTTGACTTGGT:1 - chr2L 2337235 3' - HeT-A 6023 1 63.01 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTC:1 - chrX 8437643 3' + P-element 2868 1 66.09 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAA:2 + chr3L 6397779 3' + roo 9032 1 58.22 CAGAAAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCCATGCACTCCCGATTCGAGCAAGTTATTAGCATATTCCTTTAAAATGGAGTTGTTAAATTTATCCTTGATCTTTTCTAAGCAGACACACTCACCT:1 - chr2L 6730365 3' + Doc3-element 4487 1 67.12 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGGCTTGGAAATGAG:1 - chr2R 8099166 3' - jockey 4803 1 65.69 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGT:1 - chr3R 4964110 3' + roo 8994 2 72.60 AAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGTAATGG:1 - chr3L 16973359 3' + S-element 171 2 53.51 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTCATCTCACACATAAAAGTGGCGCACAGAGGCTAAGCTTTTTGCG:1 + chr3R 6419984 3' - Tabor 10 2 68.97 AAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGATTTACCAC:2 - chr3R 11040028 3' + Bari1 1672 1 57.53 GGACTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGGGTTGTTAAATATGTTTTGCTTGTTATGTTATTATGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTACTCGTTCGACTTTTGGCCCTCTCAGCGTTTGGCAATCCAAGTCTCC:1 - chrX 7599837 3' - I-element 5113 1 66.20 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTT:1 + chr2R 8735697 3' - mdg1 7065 2 62.96 ATATGGGGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTACACTTAGATCGTTAACGATTAGTTCGCCTTTTGTCGTTTTTCGATTTGGTAAATACACATAGTTA:1 - chr3L 6123703 3' - R1A1-element 5239 1 54.11 GAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCTTTCGGAGAAGAAAACAAAAAATGAAATCAGAGAGCCGAAGCCCGAGAAACGTTACATAAATGAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 8751967 3' + Doc 4445 1 57.25 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCC:2 - chr2R 24427579 3' - jockey 4750 1 67.12 GTTGGGCACGTTGTCGGCGGCTTCCTTTGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTGACGTTTTTCTATTTTTATTTGGTTGTTGTATATTCAGCATTCAACAATTGCGATAACCGATTGAGATATA:1 - chr3R 10972620 3' - G-element 492 1 60.80 AAATTAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAAAATTAATTTACGATTCCAGTGAAAATCAAATGAT:1 + chr3L 15192927 3' + transib2 2656 1 75.34 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTGCACCTAGACCTTGTCAAC:1 + chr2L 14675763 3' + 297 348 2 54.61 AGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGG:1 - chr3L 24934315 3' - HMS-Beagle2 6960 2 73.61 ACAGAAGCGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTGAATTCTGTTCTGCGTTTTAACCTTAATTTATTGCTGGTTTATAGCTGTTTTTTCCATATTTTTTACAGAGCATCACTATGCTCATTCT:1 - chrX 8809062 3' - Porto1 4590 1 53.42 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTT:1 - chr3L 17183687 3' - diver 72 2 70.90 AAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTAGTGAAGGCGCTAGATAGTTGTTGTTAGCATGAAGGTGATCGTTGATTTGAATGACAATTGATCTGTTGTCTAACTGAGGGAATGTTGAGGACATTTGCGATGT:1 + chr3L 23854176 3' - I-element 5144 1 74.66 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACG:1 - chr3L 2544589 3' - Tirant 36 2 62.33 AAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTATACCCATAATTG:1 + chr2L 23295919 3' - micropia 4976 2 69.18 TGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGAGAATTATATTTTAATTGAATAAATTACGAAAACACCAAATA:1 - chr2R 10519643 3' - 412 7538 2 71.23 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATG:4 - chr3R 29084896 3' + 412 7475 2 64.38 AATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTACG:4 + chr3R 17615227 3' + mdg1 7072 4 72.60 TATGAGAAGCATATTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAG:1 + chr2L 22369228 3' - rover 2 2 68.57 ATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAAACATGGCGG:1 + chr2L 9010170 3' - G2 2695 1 68.33 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGA:1 - chrX 1135334 3' - P-element 96 1 19.86 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCAT:1 + chr3R 13406543 3' - pogo 35 1 57.53 TAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATT:1 + chr3L 4219523 3' + jockey 4913 1 78.77 ATAATTTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGAGTAAAATGAGAAAAAATGTAAAAATTGTTAAAAGGTGTGGGTGTCACCGTTTTGGGAGTTTTGTAGGTGAAAGTAGGTCGTTGCCACAGTGTTTTTGGCCCAAAGTGGGCGGA:1 + chr3L 23689198 3' - INE-1 504 1 54.79 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGT:1 - chr2R 20010186 3' + Juan 4163 1 53.42 TAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACCAATTAATTTCGGAGCTGTGTGTTTTCACTCTGTTTGGTTTTTAT:1 - chr2R 10764471 3' + accord 6974 2 69.18 ACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCT:1 + chr3R 22590607 3' - rover 29 2 63.83 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTG:1 - chr2L 6174081 3' + I-element 5268 1 77.08 GGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGGAAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACGAAA:1 + chr2R 6271503 3' + rover 6917 1 78.77 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCAT:3 - chr2L 22674741 3' - mdg1 7060 2 74.66 AAATATTATTATTATTTATTAGTCACCATCCTGGTGGTTGGATTGGTCCACAGCACAGGATGACTGATCCCTAGTGCCTTAAGCAACTCGTCGT:1 - chr3L 26375029 3' + Gypsy12A_LTR 1816 1 62.77 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGG:1 - chr3L 21327094 3' + copia 208 2 71.23 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGG:4 + chrX 661951 3' - 412 7121 2 63.01 TAAAAAATTTAACAATTTATCACTTGTTGCTTCATCTTTAAATGAAATCAACTAGGCTCTCTCCAAAAAAAAGAAAATACATACTGCAATGTGTGTAAAAATTCCTATTTCGGAATTTGCTTGAAAGTGAATTTTAAAATATTTAT:1 + chr3L 16988326 3' + NOF 4123 2 76.71 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTTATT:1 - chr3R 14980267 3' + roo 389 2 71.92 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGATTGTATTTA:1 - chr3L 5389867 3' + roo 353 2 61.03 CAAAATCAAATCGATAACTGTAAATATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATTCAATCTCTATGCAAGCCGCTCGGATTTT:1 + chr3R 19225152 3' + HMS-Beagle 7031 2 75.34 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGTGAGG:1 - chr2R 20802526 3' - mdg3 5264 1 76.09 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGCTCTCTCCCACAC:1 - chr3R 23295531 3' - P-element 26 1 49.52 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATA:1 + chr3R 7719805 3' - roo 8741 2 74.66 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGTATGTACATGTGTTGGACGTGGGGAATATGCGG:1 - chr3R 25428127 3' - 297 15 2 69.53 ATATTTTAAATGTTAAAAACATTTCATTCTTATTTTTCAATTTTTTACTTTTTCCCAAATTTAAAAAAAATCTCTCAATTTAATATTATCTGCGGAGTTTTAAGTGTAAGACTACTTTATTTTGGGTGTACGAGATAAACAAAATG:1 - chr3L 2299485 3' - gypsy3 491 1 67.81 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAAT:1 + chr2R 6964855 3' - Burdock 81 2 73.97 GTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCAATCCTTCCGGACAGCCCAACGACGGTCCCATGGGCTTGAGTGAGGCCTTAACGCCGTCCACAACAACGGTGACCA:1 - chr2R 17735975 3' + mdg3 31 2 52.41 GGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGT:1 - chr3L 17183639 3' - diver 4 2 71.67 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAAATATAA:2 + chr3R 8890118 3' - FB 60 1 58.22 GAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCGTGACATCGTAACCACCTGGATAATGTATACATATACGAGTATCGTACTTTCCAGAATCTAAAATCTGAATAATAGTCGACAAG:1 + chr3L 8704221 3' + G5A 2649 1 63.01 ACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACC:1 - chr3R 9038937 3' - Juan 4080 1 65.07 AGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAA:1 + chr3L 22723949 3' - HMS-Beagle2 51 2 53.42 TATATGATCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACTTTAAAGTGGCTAATCCAATGTGTTTACGCAAGCATCTTTCAGAAACTGCGTAATCAGTTTGGCCCTTTGATTTCGTATTTTTCTTGTGCATAACGAGCTCAGAAAT:1 - chr3L 3564458 3' - Tc1-2 1187 1 75.34 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTCAACCAGCAGCATGCCGTCGATGTGGTTTACATTTAC:1 + chr2R 5480040 3' - F-element 27 1 78.08 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTGCAATAAAATATTCTGTCAATATTAGTCAATATTGATTCCAATTCTTTTGGAAACTGGAACTAAGCACTCCGAATTTCTAAACTTT:1 + chrX 18403720 3' + roo 322 2 62.33 GTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAAACAGACTAAGAGACAGTCAGGACAAAAGGGATGGTGGGCTTTTGGTGGGCAATCTATTGATTTCGAGTGACGATATCGAATTTACTGACTCCG:1 - chr3R 19754338 3' - Doc2-element 482 1 74.82 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGACCAAATGACCCATAGTGTTGTGTTGTGACATTGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTA:1 - chr3R 25709794 3' + hopper 1374 2 63.37 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAG:1 - chr2L 7660886 3' + I-element 5320 1 58.62 ATATAATAATAATAATTTATAATATATATAAATATAATATAATATAGTTTTCAGTGATATTAGTCCAGTTAAGGGTCCTCCCAAACCATTGCCAATTTGTCACTAAAACCCAACATCAGCAGATCATAACTCGGCCAA:1 + chrX 7548296 3' - Tc3 273 1 65.94 ACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTAGCTATAAATACAGATGCATTTTAGAGCACAACTAAAGAGTTTCAATCGCATCGTACTAAGTGCAACATCAA:1 - chr2L 19912341 3' + rover 7002 2 48.63 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGA:1 - chr2L 20821176 3' + Burdock 236 2 54.79 AGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAACTAACTTAATAATTGTATAGTTTTTGCAACAATTAATGAAGGTGAAAGATATTCGTAAAGTATAGCTAACATTTGATAACATA:1 - chrX 14767558 3' + accord 300 2 56.85 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCTAACTTACACATACATTTCAGTCTTGACATTTAATTTATATTTCCACTCTATTAATTAATTAATTATCAACATTGATTGATTTTCTTTCGTTGAGGTCCTCATGG:1 + chr3R 30059534 3' - FB 16 1 74.66 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGA:3 + chr2R 13766315 3' - roo 8712 2 53.42 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAAC:1 - chr3L 9269871 3' + copia 243 1 50.34 ATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTTAATTTTCACTATCACTACCTTACCAGTCCCAGAAGACAGGCCTCTTGCGTCCTTACAAGGATATATTCATGAACGAATAGAGTTTGC:1 - chr3L 21762596 3' - jockey 414 1 64.38 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTAAAGATCTATCTGAAGGGCCAGGAGACG:1 + chr3R 18971814 3' - Juan 4060 1 54.79 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATT:1 + chr3L 11326804 3' - pogo 31 1 60.27 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTGGGTTTGGGTGTTGGGGCTCA:1 - 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P-element 102 1 16.44 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTT:1 + chr2L 16943892 3' + copia 223 1 60.96 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAA:3 - chr3L 19454879 3' - mdg1 7053 2 73.97 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAAT:1 - chr2R 5106316 3' - 1360 20 1 61.87 CAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGATCCTTGAAAATTGCTCGAAAATGCCTTCAAGATACAGGATATATTTCTGGGCTCTATCTTGGGCGCTATCCTGTGAGTATAGAACTTAATTGTGAAGCAAAATAAAATAACTTAAGCTTG:1 + chr2R 13357935 3' + Idefix 6928 2 78.77 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTTTTAGGA:1 + chr2L 13556490 3' - transib2 13 1 71.23 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAA:1 - 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chr3R 2207701 3' + roo 8750 2 63.70 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATA:1 - chr3R 5768977 3' + roo 9043 1 65.75 TCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACCTTTCCAGCCAAATTTCAAACTCAATTATACAATTTAAGCTCTAGCTTTCGAGCAGTAAAATTTTT:1 - chr2R 21473283 3' - micropia 5176 1 48.82 GTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCATAAGTCCGCATTCAGGAT:2 + chr2R 2318265 3' - ZAM 7997 2 61.64 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCT:1 - chr3R 16341935 3' + P-element 2864 1 60.00 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGA:2 - chr2R 8157159 3' + mdg1 7413 2 53.10 TTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAACACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAATATAATATTCCGATACATATATTCATATAGTGAAGATTTGGACTAGCGTTTACTGGTAGCAATTTACTTTATATT:2 - chrX 1413605 3' - Circe 7137 1 58.22 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAA:2 + chr3L 20711682 3' - jockey 4837 1 69.86 AACACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACAGTAACGACCTTAGACACATCGACGAACACACCAATGCCAAATATAACTTGCTAATTAAATTTATGTGCTTGCCAATTCTCTAATTGCACGTTAGCATACTTTTTACAGTGTA:1 - chr2R 13507180 3' + I-element 472 1 59.59 CAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACAAAAATTCGCAACGTGCATTTTCTAAAATACCTCGCATAGTTTTCTTTATCAACAACAA:1 + chr3R 11156724 3' + Doc 499 1 62.63 CTAATACAATTACTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGGT:4 + chr2R 3550649 3' + Doc2-element 4671 1 80.14 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGT:2 - chr2R 13766191 3' + roo 357 2 54.11 GGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACGGTTTTACACATTGTTTGTTTTGTAAGACCCCTACTAG:1 - chr3R 26178351 3' + 412 7514 2 56.83 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATTATTTTTAAATTGAAGCTT:2 - chr2R 8157126 3' + mdg1 7445 2 75.34 TTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTATCGATCTGATACAGGTTACTCATTCCGGCAATCTTGAGTAGACTCCAAAATCTAACTCCTGAGTTTCACTACACGTTTCTCATTCTGCAATAGACAGAAACAAAAGAAAGTTCCCGGCCTG:1 + chr3L 22177808 3' - 1731 457 1 72.60 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACC:1 + chr3R 5769090 3' - roo 8745 2 78.77 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTACAAATTGGCAGCAGCTGCTCAGACAGAAGGGTG:1 + chr3R 30813399 3' - FB 76 1 77.44 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAATCAGGGACTCTAGCTGAACCCCGGA:2 + chr3R 18488521 3' + roo 402 1 76.71 ACTCGACTAAAGTATTCTCTCTTGTTTTTCTTCTATTTTTTTAAAGGCCAGAGTGATTTTGTTAATTTTGCCAAATAAAATGCCCAATATACAGCAATCAAGGAAACGGAATAAATCACTATCTATTTAAATTGTGAAGTCTTTTT:1 - chr3R 20125948 3' + INE-1 576 1 49.32 GTTAAGCCGACTAATCAAGTTGGGACTCTCAACTTCACCACGAGTAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCAGCGTTCTACGGGGCACAATATATTGAAGGTGAAAATTAATTTTTCGCATGTCAGCTGGTAATTAAGTCCCCA:1 + chr2R 15174256 3' - Cr1a 4081 1 58.22 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATCGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAAT:1 - chr2L 16539618 3' + Juan 4187 1 66.44 TATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGGGTTCGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACACTCTTGTTTTTAATTAAATTTATAATACCTCTATTGTTTTAGTTACGTT:1 + chr3L 25255801 3' + INE-1 503 1 74.66 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTATTG:1 - chr2L 18347277 3' - transib2 53 1 55.48 AGGAGAGGAATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATAAGCTTTATAGCGGACATATAGCCAA:1 + chr3R 27133669 3' + opus 459 2 53.49 ATAAAAATAATTGAAAAACATTAATGCCATGCCGCCTGAGACTTGCAGCGGTTAATGGCGAGCATTGAACCCAGCTCAGGCGAATGCTACAAAGGATGTGGCCGTAGAAGATGAACCTAACGATGC:1 + chr2R 13985865 3' + transib4 104 1 57.14 ATGTATATATGTATATTTATATATACATATTAAGGGCTCCGCGTGTTGGTAATTAGAGTTCTTAATCATTATTATAGTTCATTATAGTTCTTATTATTATTATAAAAAAAAATTACATTTTAAGCATGAATCGTTTCTTGTTCACT:1 - chr2R 18858168 3' - Stalker 91 4 31.51 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCG:1 + chr2L 12822837 3' + P-element 2806 1 19.69 ATTTAAAAACATTAATGATAAAAAAAATTTAATTTCACCGGGAAAAAGATTGGCGCAAAGGGTTAAGAACACAGAACGGTAAAGAATATAAAGGATTATAATTAAGGAATATAATTAAATATAAATACCCTAATTTATATTACTTA:1 - chr3L 24302215 3' + looper1 1819 1 63.01 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGTGGCTG:2 + chr3R 11810750 3' + roo 9002 2 65.07 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATTTTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTT:1 + chr4 373078 3' - pogo 39 1 55.86 TGTTCACCCAGATGACACAGCTGGTGGCCACCATTCTCAACAGCAAGTCATGCAATTTAAGCTCCACATTTTGGTGTCTGACAAATGTTTCGCTTATCAG:1 + chr2R 21301051 3' + G6 1556 1 65.00 AAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCA:3 + chrX 3431986 3' + Ivk 5343 1 55.48 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATG:2 - chr3R 6419851 3' + Tabor 415 2 68.49 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCT:1 - chrX 12986502 3' + roo 9040 1 62.33 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATG:1 - chr3L 9809238 3' - 412 7104 2 53.79 CCCTCCCCCCCTCCTGCCCTACAAACTGCATTTTCCCCCATTCAGATTTTTCTGCGATTTTCCTGCTGGTTTAT:1 - chrX 12416136 3' + G-element 289 1 86.49 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATT:1 + chr3L 13739670 3' - BS 5043 1 50.68 ATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCAGTTCTAGTACATCACTTAAGCTGGATAAACTAACTATGCGATAAAGAGCAAAAACGAAAGGGGTGCAAAAAATTCTTAGAAGGAAGTAAACTTGCGAAAAAGTAA:1 + chr2L 14874016 3' + copia 4962 2 73.97 AAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTTATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAG:1 + chr3R 1844814 3' - Cr1a 170 1 76.36 AGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGACGAAATCAATTCTGATCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAAT:1 + chr3R 2424360 3' - 1360 3225 1 53.15 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATC:1 - chr2R 7090629 3' + I-element 5301 1 53.42 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAAAGGCCACATGCCCCATAGTGCCATGGGCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTGGCCTTTTTCCCCGCTGG:1 + chr2L 16946112 3' + hopper 1369 1 58.04 TAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGACGATTACGACTGCGTCGTTCTCTCTTCTTTTTTTATTTAAAACCTGAACGAAATATGCGTATTATTTATGGCGAGCATT:1 - chr2L 11553403 3' - Ivk 408 1 62.50 AGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTC:1 + chr3R 15790101 3' - flea 4754 1 54.11 CTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATAAACTCGCTCTGCATCTATGCACCACCCATAGCAATGACATCTAGCACCTCCCAGCAACACTCTGCACCACCCACTCCACCCACCAGGGAAACCATTTCAAACGACACT:1 - chr3R 24736422 3' - invader4 2986 2 73.10 GAGATCTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTTTTATTAATTAATATTTGTTATTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAATAAGTTAAAAGGCAACTGACGCCTAAAGTTATCAAG:1 - chr2R 13823290 3' - gypsy7 410 1 73.97 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGACAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATG:1 + chr3R 13973038 3' + 412 421 2 64.83 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTG:1 - chr2L 21299314 3' + roo 8996 2 73.29 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTA:2 + chr3L 11326773 3' - pogo 62 1 66.44 TATGTATGTATATATATATGTATATACATACATGTATATATATATATATATATATATCCGATTTCCGATTGCTAACTTGATCATTGAGTACGGTTAAAAGAGTCTAAGAGCAAG:1 + chr3L 3957660 3' + 1731 4414 2 41.23 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAACTAAAGCGGAGGGAGGAATGAGAAGGGCAAGCGAGTGAAAAGCGAGACCTAACCAA:1 - chr3R 26395570 3' + Transpac 274 2 61.64 AGAATAATAAGATGCGTAACCCCACACGATTTTTTGGCCAATTCGTATCAATATGATGAAAAAAATTAATAATTAAAAATT:1 - chr3L 7171401 3' + 1360 11 1 59.26 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATA:1 + chr3R 19032671 3' + roo 320 2 80.82 AGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGAATTCGGTTTTAATTACAAGGCGAA:1 - chrX 6952090 3' + G5A 2806 1 60.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAA:1 + chrX 8308503 3' + roo 394 1 67.62 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCGGGGTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGG:1 + chr2L 12984233 3' - hopper 21 1 60.50 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCT:1 + chr2R 9871565 3' - roo 8710 2 56.92 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTACCAATTCTGTGACTTCCTTTTT:1 + chr3L 26291026 3' + Tabor 470 2 73.29 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTT:1 - chr3R 16341939 3' + P-element 2865 1 59.05 TTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCAAAGGTTATTTATATGTTACTATTATAGGCTATGAACTGTTTTTATTTCACTCTGCTTGGG:1 + chr3L 11138416 3' + 297 6592 2 58.22 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACT:1 - chr3R 4575730 3' - jockey 68 1 59.72 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGA:1 + chr2L 18347417 3' + transib2 2795 1 65.52 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAG:1 - chr3L 15103810 3' + Transpac 5162 2 63.70 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCG:1 + chrX 2479605 3' - mdg3 5295 2 56.85 ACCACGAAAACTAATTTCACTTTTTCCACTTTTCAGCTGCGTATTGTTGGACACGAATCCGCAACTATAGGACCCAGCAATGCGTAATTTTTAATGATTTTTCTGGGTCGTAAACTCCGCCTG:1 - 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chr2L 21299291 3' + roo 9019 2 55.48 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGATGCT:1 - chr2L 16690649 3' - P-element 60 1 32.50 ATTGGCACCATTCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATACACATACAAAAATATAGAAAGGACTGATTTAAAATGCAAATGCTTTAATTAAAAG:1 - chrX 5145348 3' + 1360 274 1 66.44 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCA:1 - chr2L 17180051 3' + Juan 4176 1 58.22 CACGTGCAAAATTAAGTAAATAATTTGGCGGGAATTACCTACTCTCAATCAGCTGTTTTACACTTCACCTTTAAAAGAGCATAAAAAGATTTAGTGTAGTTTTTGGTCAATTTTGTTTTTTGTTTTTTT:1 - chr2L 12534746 3' - transib2 210 1 76.74 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAACAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGTTATTTTTTATTGGA:1 + chr3R 24381433 3' + Juan 4191 1 75.34 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCGACGGCTACTGTGAAAA:1 + chr3R 4860564 3' - Transpac 30 2 65.07 GTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCG:1 + chrX 15200943 3' + 17.6 7364 2 59.59 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAAAATAAGCTTCCCCTTTCTGATGTTCTCCACTGAGAAATAGAAA:1 + chr3L 9270031 3' - copia 4885 2 58.90 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCT:1 - chr2L 18226778 3' + roo 9007 2 64.14 CATTAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGTCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAA:1 - chr3L 27282408 3' - INE-1 535 1 41.10 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTCGTGTATGGCAAAGAAATGTTATACCTACGGCACACAATACTACAAATTGATAGTGCTCATCCATTTTTCATTTTTCC:1 + chrX 20888412 3' - 297 11 2 67.20 TTTCACTTATAAATATTGCAAGAATTTGATTATATATATAATATATATAATAAAGTTATAATAATATATATATATAATATAGCGAATATATTATATATTCTATATATTATATATTCGCTATATTATATTATATATATTATATTAGG:1 - chr3R 28788047 3' + Idefix 7381 2 54.79 TAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCATCAAAAAATCTGGAGTTGAGAATTCAAAACTTTAAATTATTATGGCAACCTAAATAAGACATGGCGAC:1 + chr2R 291449 3' + Porto1 4368 1 57.53 TAATAATAATAATATAAAAAATATATATTTCATAGTTACATCTTTTGGTACTACTTTTCTAAGTTAGTTCTACAACTGTGAACGCGTCTGTTGCCGAAATGTATGTGTGTGTTTGTGCGTTTACTATGCGAAGTCACTTAATTTTT:1 + chrX 11627414 3' + mdg1 39 2 54.79 AAGGTAAAAATTAAGGGTTCTTTTCTTAATTAAACGCATGAACGTGGATGGAAAAGGTGTGCAATGAGCAGAGCATAGAAAGACATCTAAGCCAATAGGAACCAACCGTGTTGCTATTCATCTCCT:1 + chr4 421969 3' - S-element 1660 1 72.22 AAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCG:1 + chr3R 10736107 3' - McClintock 6003 2 73.68 GTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTCCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTGTGTGATTTGTTCAGCCTGAGCAGCTCCCGGAGAACCTC:1 + chr3L 11202410 3' + Cr1a 52 1 78.26 GCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTTTTTTTCTGTTGAGGGGGTGGTGTGGGTGGTGGCTCTTCCAGTACCGGCTGCTTGGGTTGCCGGCCACGTTT:1 + chr3L 19594865 3' - I-element 5102 1 73.53 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGGGGTTTAAAATCAAATAAA:1 + chr3L 18505727 3' - I-element 76 1 70.55 TCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGCAATGTACTCTCAAAAATTCAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCCACTTGGCCATAGGCCACATAAGGTAGAAAACTCTGGATTAATTACGTCCCCGACACGTG:1 + chr3L 11573098 3' + TAHRE 10293 1 58.90 CAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTTATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCG:1 - chr3L 3983802 3' - P-element 40 1 48.36 TCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTGACCCTGTCCGTCCTTCTGCCCGTCGAGATCTCAGCTCTTTTACCACCATATAATAAGAACTTTACGGGACATTTCTTTAATTTT:1 + chr3L 19867054 3' + INE-1 94 1 54.55 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAA:1 + chr2L 11839758 3' + mdg1 7407 2 53.42 TTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTTTAAAGCCATTTTGGGTGGTTTTGGTGGGAGAGCGGCGTTCAAATTTTGGATGGTAGGAGTAGAAAACTTTTGATGAGCTGTTCGCTTTTAATGGGGAGGCATAGACCGA:1 - chr3L 21922189 3' - I-element 5233 1 78.77 CTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTTACACCTGCACCGATATATAAAATTTGTGTGGATAAATGGTTAACTTAGCTAATTAAAAAAGTTCCTAAATTAAATCATTGTAGGCAGTATGTCATTTTG:1 + chr2L 13304193 3' - I-element 424 1 74.26 AATAATCTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTTCTTTAAATAATTTTGTCATTTTTCTGTATACCAGGGTGTAAAAGTTTTTCATGTGATTAAAGTATGATT:1 + chr2L 12795536 3' + F-element 95 1 55.48 AAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTT:2 - chr2R 15326878 3' + copia 253 1 62.00 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTT:1 + chr2R 18529933 3' + jockey 4970 1 60.00 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTGCAGTTATCCGA:1 - chr2L 7580852 3' - Transpac 4928 2 56.16 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATAAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCAA:1 + chr3R 17736983 3' + opus 499 1 77.57 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTA:1 + chr2L 20266058 3' - roo 8706 2 55.48 ATAAATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGATAACAACTGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACGATATCTGCATCACGCGTGAGTTATTATGCCAACTGCGTTTT:1 - chr2L 14930993 3' + diver2 447 1 78.77 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGTGTGGTTTGGTGTGTGATGAATACTTTTATT:3 + chr3R 3920623 3' + roo 9046 1 67.59 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAG:1 - chr2L 71162 3' + 412 7493 2 50.68 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCACAAC:1 - chr3L 7889511 3' - roo 14 2 74.66 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAA:1 + chr2L 19675066 3' - 297 6620 2 64.80 AGAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCACACCCAATCCACACATCCTTTTACCATCAATTCTCTAAGCAACAAACAAACACACGCACAAAAATAT:1 + chr3L 17153179 3' + Ivk 4976 1 64.38 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGA:1 - chr2R 20348985 3' - transib2 65 1 76.67 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATCCCTTGGATT:1 + chr3L 8959726 3' - 1360 27 1 65.07 CAGAGATTCCTGTGTAATTGCTTGCATCCTATTCGCTAGCTTCTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACATCATCCATATATGAAAGTTTCCAGAGATGCGTTTCCTCTTTGTTGTTTTGTCCTCGCTAGATACAAAGGAGGCGGCA:1 - chr2L 9109687 3' - Q-element 103 2 66.44 ATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTAATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAGTTAATCGATAGGAAAATTTAACATCGACTTTAAAATCAGCG:1 + chr2L 16201964 3' - 1360 392 1 71.92 CCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTAGATAGGTTCAACCGAAGCGGACGAGACATGGGCAAAAAGTTCGTTTGCAACTTTTG:1 - chr2R 22775640 3' + jockey 4794 1 51.28 CAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTTTTAATTTTTGACATTTTTGTTAAGTCATCAACGCACACGGCGGGACGTCGCCTTCGCTTGGATTTGGATCTGTGCTCGGAGTTTCGAGAGTCTCGTG:1 + chr3L 20555564 3' - I-element 5192 1 71.92 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATGGGGAATTTTTGGACCAAACGTTTATACATTCATATTTATTAGTTTTAAGACCATTTTCATGTTGTAC:1 - chr2R 15376648 3' + 1360 3383 2 68.27 AAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATATAAGGCAAGCAAGTCCGGATTCCTATCGCCAAGTT:1 + chr4 1128553 3' - transib1 1899 1 75.52 AATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCCACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAAATTATTTATATAAAATAACCTGAAATAACAAA:1 + chr3L 27866070 3' + Max-element 210 2 75.34 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGCGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTT:1 - chr3R 23639111 3' - pogo 30 1 62.07 ATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATA:1 - chrX 21087592 3' - mdg3 49 2 61.42 ATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTACTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCACAT:1 - chrX 19817457 3' - invader3 5086 1 74.66 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGATGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAA:1 - chr2R 2591118 3' - roo 8755 2 61.38 CAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCCTTATCAATCGAGCAATTCCTCGTCATTGCTTT:1 - chr2R 3293727 3' - INE-1 259 1 47.79 AAGAGACGCTCTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCAAAAAAAAATCTAGAAAAATTCCGCACCAGCTGCATACCGCGCAGGAGCTCCCATTTTCAG:1 - chr3R 16869693 3' + Doc2-element 116 1 62.86 ATATCATACTAACACTAATATTAATTACAGTTATATTACATCATATTTATTTCCTCGCTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGCCTTATAGGAGATGCAATCCCAGTGGACCTAGGAGCAGTACTATTACAGTTTAGCACAGCCGG:1 - chr3R 2913277 3' + Cr1a 4293 1 56.55 AAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:2 + chr2L 14147250 3' - transib2 2592 1 69.86 TATTACTATTACTATTATTATTACTATTTTTTTCCAAATTCATTGAATTGTATTTTAGTCCAGTTAATCGCATTTGTTGGTTTTGTAATTATAATACCGGGCAATGGAAATGATTTTAGCATTTCAATTTGTACTGGCAACCGCA:1 - chr2L 7641154 3' - mdg1 7075 2 62.07 GGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATA:1 - chr2R 14051772 3' + roo 8989 2 73.97 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCAT:1 - chr2R 13766205 3' + roo 9007 2 63.70 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATC:1 + chrX 12986611 3' - roo 82 2 75.34 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTGGCGCAGTCGGCTTGTACTCCACATCCAT:1 - chr2L 23400701 3' - S-element 36 2 60.96 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTGATTTA:2 + chr3L 22723985 3' - HMS-Beagle2 15 2 73.97 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTCTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCC:1 + chr2L 15550779 3' + Bari1 1660 1 50.68 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACCGTATATAATTAATTAGAACTTTTT:1 + chr2L 11839784 3' + mdg1 395 2 69.86 AATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCTAATGCCAAATATAACACTAGCACTAACACTAAAAATAATAAATAATTTTAGTGTTAGTGCT:1 - chr2R 13928641 3' - P-element 182 1 28.08 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAAT:1 + chrX 7795647 3' + roo 9045 1 67.12 AGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAATCGTAAATGTATCCCAAATTGCGCAGACATAGCAAAACCAATGACCAAATGTTTAA:1 - chr2R 5000110 3' + jockey 4738 1 60.96 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCATA:1 + chr3R 19073312 3' + roo 9039 1 62.33 CATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTGTGAGTTGGGGTGTGGTCTAGGGATGATGTATTATGATGAAGTGGGGATGTTGAACTTTGAATGATATTT:1 - chr3L 23451923 3' - I-element 5038 1 53.42 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGG:1 + chr2R 6847866 3' - Doc 23 1 70.40 TAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAGTCAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAGATTATTTTCATAGTGCTTTTCTATGTTGCCATCGATGGGGGCACTCGGTGACACATGCAAATCATGTGAAAACGTAAAA:1 - chr2R 20890496 3' - Q-element 336 2 51.03 CTGGACTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACGAATTTCACTTTTTTTTTAAATTCTACACACATTCTTCTGTTGATCTTGGGCTTTTGATCCTTTTCTCAAGATTGGTGCTGGCGTTGTTCCTGTAAGGATATTTTTGGTTTT:1 + chrX 8806550 3' - X-element 75 1 73.97 ACTTAAAATTAAATAAAAATTCTAATTATAATTTTACAATAAAAATGAATTTTAAATTAAATGAGGGACCTATGCCTGCAGTTTCTCCATTTTCACGACTAACTCCAATTTTAGAAGTATGCAAATAAGAATTGAGAACATGAC:1 + chr3R 19448756 3' - Rt1b 123 1 65.28 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGAATTAAAGGCAAAGTATCATATCAAGTTCTCC:1 + chr2R 16818020 3' - 412 17 2 71.92 CAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGT:1 - chr3L 21655913 3' + HMS-Beagle2 7104 2 79.45 AGAGTGGCGAGCCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATAGATAAAAATATATGTGCTCTCTTCAGTTCAGTCAGAGGGTT:1 + chr4 102298 3' - mdg3 135 2 52.81 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGGTGAAATAATTTATGCCGAAAGCGTAATTAAATTAATTAGGATTAACTTTGGCTGTGCACGCAT:1 + chr3R 29347213 3' - 1360 27 1 46.04 GTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATGTTTTCATTCGATACAGCAATTTATTGGGCAATCAAATTAGAGAACACCCTACCACTCGTTTATCAACACAATTTGATTTGCATAAACTGGTTCTTGTTTTTTGGTTTGGG:1 + chr3R 16582320 3' + 17.6 7292 2 79.31 AAATTTCAATGTTTTCTGTAAAATAATTTCAATTGTTCAAGTGTAGAATTTAAATTTAAATATTATGTTACTTTACGTTACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTACTTTGTCTT:1 + chrX 20787045 3' + TAHRE 10158 2 72.09 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTC:1 - chr3R 23639129 3' - pogo 48 1 51.03 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCTCAAATGGTCGACAGCCTCAAGAGCAACACGTGCATTCTGCTTTCAA:1 + chr2L 9636207 3' - 412 7083 2 55.48 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTT:1 - chr3L 17567856 3' + S-element 170 2 60.48 CAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATT:1 - chr2L 6654646 3' - diver 5947 2 56.16 CTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGTCTTCTTATGGCCTACCCCCTTCATTTGTCTGATTTTCATTGATATATTCTGCGGAACAACAAAAGAAGTATTATTCTATATTGGGATATGCTTTAGAGTTTTGGTT:2 - chr3R 8086273 3' - I-element 5243 1 71.23 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGTGTAAGTTCAGCCTCTAATTACAACTGACAATGTTTTTACAAT:1 - chr3R 4860402 3' + Transpac 303 2 76.86 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGACTT:1 - chrX 21216690 3' + roo 9047 1 66.42 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCCTCGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAACATAGGCAAGCAA:1 - chr2L 16946056 3' - hopper 25 1 53.57 GTTGTATTTTCGAACAAGTTCAATTATTTTGTATACAAAAGTATTCGAGCTTTTCTCTGTATATAAGTGGGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATCAGTGCTGGGG:1 - chr3L 25552473 3' - Fw3 37 1 66.36 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTT:3 - chr2R 15326837 3' + copia 232 1 54.79 TTTTTTTTGTTTAATTATTATAAATATAGACCAAAGAATATTTAAACAAGATACGCTCGCACGTCCCCAGTGGGCACAACGCTTATAACGCTTTCGACCCAAATTTATCAAGCGATTTTCCAGCGAGAAAATGAAAAGTCGACAG:1 + chr2L 11471182 3' - Rt1a 5072 1 51.03 AAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGAAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAGTGCCAATCCCCGATCCCCTTCTATTCCCCTCGCCTGCCGGCTCCCAAGAGGCCAAAG:1 + chrX 8617035 3' - Doc2-element 499 1 58.90 GAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGGTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATC:1 + chrX 1799255 3' + invader4 3055 2 63.70 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTT:1 + chr3R 18093362 3' - I-element 75 1 67.12 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAA:1 - chrX 11661390 3' + pogo 2040 1 67.81 AAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGAAAAATGATTCCCTTAGCAGACAAGC:1 + chr2L 21930271 3' + Copia1_DM 108 1 54.11 CCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGTAGCTGTCATGTGCTT:1 - chrX 21585235 3' - mariner2 262 1 67.81 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAACTTGAATTAGAAATATCGA:1 - chr2L 17180026 3' + Juan 4201 1 73.97 AGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGGATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAAGCTTTTGTTTTAATGCTAATGGTCCGGAGATGT:1 + chrX 12454098 3' - Idefix 7038 2 76.92 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAAAAGATTATATAATTATATTTAAAAATATTTATTTAACTGTTAACAATGCAGAGTTAGAGAGCTTACAAGATAAATGGTGA:1 - chr2L 15940186 3' - pogo 36 1 57.53 TCTAATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATA:1 - chr2L 11298071 3' + I-element 5266 1 81.38 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTA:2 - chr3R 31886821 3' - hopper 43 1 57.53 ATATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTCTACACGCACCCCAACCCGTAGAACTGATGCTCAACCCGTCGGCTTTAATGGTGGCCAGGGAACTGGAGATCCAATACCCGCTATATCGATTT:1 - chr2L 19733769 3' + F-element 4409 1 58.22 TATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTGTATTGTATTGTATGTAAAAACACAATCCGCCCACTTAATTGTGCATTCGACGTGGTCCTTATGGCGAAGGAGACCGATATCTACGACCATATAATAGACTATTTTCGCACCATGTT:1 + chr2L 7801483 3' + transib1 1899 1 55.48 AAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGAAAATGCACTGGCGTGGTTG:1 - chr2L 23008322 3' - transib2 203 1 72.39 TCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACTTTATGTGGTCGGAAACGCCTCCTTCTGACTGTTACATACTTTTCAACGGATACCCTTTTACTCTACTCTAATCGAAAAAATCCTAATGAGTG:1 + chr4 643208 3' + HMS-Beagle2 295 2 71.01 AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTTGGGTGTTAGAGTGGGTGTGGCAAGAAGTTTTCTTGACTTCTCCGAGCAGGGGAGAGCCGCTCAAATTACTGCAGTTCTTTGAGTGCAAGCATTGAGCAAGAAACTTCAAACT:1 - chr2R 8288834 3' - INE-1 246 1 58.22 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGC:1 + chr2R 7850023 3' + roo 9022 2 58.40 AATAAGAACACGCATAATAGCTAGACTAGTTGCTAAAGTAAATGTAATCGAGCGAAAGAGTGAGAGATACAGAGAAATTCAGATATTAGAGAGATATTAGAGAGAGATGGAGGAAAAAATATTTTTCGTCTTAGTGAGGTGTTAGA:1 + chrX 6122068 3' - micropia 5019 4 64.38 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAA:1 - chr3L 7300137 3' - roo 57 2 58.22 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCT:1 - chr3L 12315710 3' - transib2 49 1 52.05 ACAGTGAACAGCAACACACAAACAAAAATATATAATACAAACAAAAAACAAAACGGGCGTCAGCAATCAGAAGTCAGAGAGATAAACAAGATGTAAGAATGACAAAAAATAATTAATAAATAAGAGCCCTCTTTTGCAGAGGGCGG:1 + chr3R 17786870 3' + gypsy10 484 1 67.12 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGGACGCTTAGTGAT:1 - chr3L 17055391 3' - Tirant 23 2 68.49 AATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTCTGCTTTCCGTTTTATTCGAATGTTATTTCTCCGACTAATTTTTTGTGGCGCTGTCATTTGTTGCAATCAGTGAGAAAATTAA:1 + chr2L 8831354 3' + Tc1-2 76 1 59.59 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCT:1 - chrX 12129304 3' - flea 4804 2 56.72 AGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGGTGGATACTCAGTGGGGGCTTCGGGGATGGGGATATTCGGCAGCCCCGGTCCACAGTTGTTTTACGCA:1 - chr3L 20720349 3' - I-element 4988 1 71.57 CGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGTGGGGCTTGACTATATTTTATGTCAATTTAATAATTATATCCGTTACTCGTAGAGTAA:1 + chr2R 2749408 3' + G5A 2553 1 62.79 ATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAGACGGCTCACCGATCAGCACATCACCACCCTCGTGAGACACA:1 - chrX 137390 3' + Stalker 6867 4 69.57 TGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAAAGAAAAAGGGGATAATTAAAGGTAATACCATATATATGCGAGCAAAGTTATCGCTGAAACTTGAGCTGGAGGA:4 - chr3R 30334078 3' - Doc2-element 483 1 50.00 TATAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACCATCTCCCCTACCATTCTGCTCCCGCCCAAAAACCATGAGAAATCATCGCTGCTTGCCGCTTAACTTTTCTTTCACTGGCTTTTTTGTCCGCTTTGCGTTTTCC:1 - chr3R 6515835 3' + 297 279 2 71.92 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGGAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATCATTTTCCTAGTCAATTGAACATTGTTGCGTTAGTTTCCTTGAACGGTTAACTATTGTACTTCGAATTC:1 - chr2R 7304005 3' + pogo 2052 1 55.17 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGCT:1 - chrX 661853 3' + 412 436 2 56.85 TCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCA:1 - chr2L 15936790 3' + copia 5072 2 74.66 TGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGTGAGACTTCATCTGTTGAAACTGAGACACAAAATGGACAATATCAAGAAGTTTCTATAAGTCTTAATGTA:1 - chr2R 3037503 3' - I-element 4957 1 50.68 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTG:2 + chr3R 15791001 3' + roo 342 2 65.52 TTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAGCCGGTTACT:1 - chrX 18336535 3' + mdg3 5482 2 74.66 TATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACT:1 + chrX 19980677 3' - X-element 4559 1 67.81 TTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGGCATTATTTTTTGCAGTTGAGTTT:1 + chr3R 22288041 3' + transib2 2811 1 51.28 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACC:1 - chr3R 4461002 3' - blood 7055 2 54.79 GAAAACAAAAAACAAAAAAAAACGTTCTAAAAGAACGTATACATTCCCCACTGCTGGCTAATAAAATGAAACATAACTAATCGAAAACAATAATGCAATACCTTAGTCACATCGATTAAGTAGAATTTTTGACAGTGTACTTCGTT:2 - chrX 12719267 3' + Porto1 187 5 74.66 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAACAAGGTGGCAATGCCTAA:2 + chr2L 13158753 3' - roo 48 2 52.74 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACC:2 + chr3R 10270680 3' + Juan 4169 1 56.16 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTTCTGAATATCTTACATATAAGTATCCC:1 + chrX 19588187 3' + roo 395 1 76.03 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGT:1 - chrX 19074739 3' - mdg1 35 2 57.53 ATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGATC:1 + chrX 22386763 3' - hobo 62 1 50.63 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTCAT:1 - chr3R 4964118 3' + roo 8997 2 74.81 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATAT:1 + chr2R 9871584 3' - roo 19 2 69.67 GTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGATTGTGGATAGTTGTTTTGTAGTAATAAGGTGGACTAGTGGTCA:1 + chr2L 5976845 3' - Doc 101 1 69.66 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCATTGAATAGAAGTAAGT:1 + chr3R 13973076 3' + 412 458 2 60.27 ACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCG:1 + chr3R 11040151 3' - Bari1 64 1 62.41 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAATGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGAACATTGGGCAAAAAATTGCGGCAATTACAGTGGCAAATT:1 + chr2R 13766274 3' - roo 8727 2 73.33 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACA:1 - chr3R 11191379 3' + roo 360 2 53.42 TTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGGGGAGTACC:1 - chrX 19074707 3' - mdg1 2 2 78.62 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTACGCGCTGGCCAATATGAAAATGATGTTCCTG:1 - chr2R 8735525 3' + mdg1 7449 2 77.62 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGCGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATGT:1 + chr2R 6847873 3' - Doc 37 1 63.70 TAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCATTCACACTAGCTGAGTAAGGGCTAACTTGTTTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAAAAGTAAACAATTGTCAAAGCAATTTTGTAAAATTCCAACCAAATAATAAA:1 - chr2R 13155893 3' + INE-1 13 1 78.08 AAAGAGAACAGGAACGAGAAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTAGGATCTTTAAGAGCTGCAGAGAGATTTTACAATTCGCAATTTCGCGTTCGCACTTCAGTGTTCGATTAAC:1 - chrX 19751330 3' - Cr1a 4342 1 66.44 CAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGT:1 - chr2L 4713876 3' + transib2 2746 1 71.23 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAATCATACACTCAAAAACACACTTGCA:1 + chrX 662002 3' - 412 7070 2 73.97 AATAATAAATAATAATAATAATAATAATAAATATTATAATATAATAATATTTACCTAATAATATCTTTGTGATCAGCAAGTCAGTCGATATAGAGGATAATGTCCCAAAAATGTATCTGAAATTCTTACTTTATATGGATATTATT:2 - chr2L 5776667 3' + flea 5003 3 69.18 CACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACTAACCACTTTTTTTAAAGGCTCAAATATGAAATACCATATAATCAGAAGA:1 + chr3R 13885157 3' + accord2 7288 1 63.01 CGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTCCGAGCTGGCCAATCTCTGGCGTTGGTGCGTCGGAATGCAGGTCTGTTTGGGTGCTGGCTTCAGCTCCAGAGCGAAGTCACTCTCGTTGGGATCCATGGTGGG:1 - chr3L 21360421 3' - G2 2969 1 72.03 ACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTT:1 + chr2R 4659355 3' - S-element 1479 1 45.60 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATGGGAATCGCGGATTGAAATAGATTATTTTATGGAACGCGAAAGAGTTACCATGCTTGGCCACACAGGATG:1 - chr3L 21380472 3' + I-element 5343 1 72.41 ACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCCAAAATTGCTCTCTTTCCTTTGTACTTGTTGTTTTTAATAGAGTGCGCTGGACACGGAAAAAAAGGTCCAAGAAAGCGCCGGGAAGAAGTTGCGTAAATTTGTTATGTACTTTTTT:1 + chr2R 10608888 3' - 1360 3339 1 70.34 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGGTGCGC:1 + chr2L 3234093 3' + roo 386 2 69.86 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAATATTTGAGCTGAATAAACTGAAGCGGCACTCATTATGTGCAATACTTTTTGCAT:1 + chr3L 5533045 3' - roo 8710 2 53.42 AAAGAAAAAAAAAAACAAGAAACTCATAAATAGAATGGCGAAACGCATGATGAGGTCGGGTAGCGAACACAGATCCAACATTATTATCTGGATATGCAACTCAAATTAATATAAATCTAATCGA:1 - chr2R 11626278 3' + gypsy7 5013 1 76.61 ATTATCTCTAATCTTGACTCTTGAGAGCGGCATAAACCACTCAATTCTAACTTTTTTAATACATAATTTTTATATTTATATTTCTTATATTTATAATTATTATTATTTTTAAGCTCGTTACTCGTAGATTAAGAGGGTATTCTAGA:1 - chr2L 14818494 3' + Cr1a 4226 1 22.60 ACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGTTAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTGTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTT:1 - chr3R 18346608 3' + INE-1 540 1 44.52 AAGTAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAACAAGAGGAAGGGAAATTAAATAGAGTATGGGGGCGCAAACCGGTGTCCTCGCTGAAGAAAATAGTAAAAACGCG:1 - chrX 5354681 3' + Doc2-element 248 1 81.00 TAATCTAAATATTAAAAGCAAACATTATTTCCGGATTAATTCACTGCTCCGCGAAATATTGCATTGTTTTGTGACCGAATAAGAGTGACCGTTCGCGGGGTGGTCGAATATTCCAGGTTGAGTCAAGCGG:1 + chr3R 25661300 3' + looper1 119 1 80.77 GGATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATATGCAAATGACAAGCATTCGCCGTTTGGCATTTCTAACTTTTTCCTCGCTGCGAACAAGGGGT:2 - chr3R 31887747 3' - HB 74 1 80.14 GTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTT:1 - chrX 22840445 3' - copia 4869 1 78.95 TTTTCTTTTTTTTTTGTCTTTTTGTACCCACCTGAAAGAAAACCGCGCCCAA:1 + chr2L 18046193 3' - Doc2-element 246 3 82.69 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGGAGTGCGGGCAAAAGTTGGAGCTTTGAACTTTGGCT:1 + chr3L 18126002 3' - Ivk 47 1 49.29 ACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAAAAGAGTTCATATCGATTTTGCTGAGATATACTCATATCAACTCACCCAAATTATTTGCATTCTCACCCACGCGGACACACAA:1 + chr2R 20551908 3' + Idefix 57 2 56.16 ATTTTTATATAATAATTTAAATATAAAATTTCACTTAATATATTTAATTTTATTATTATTAATAAATTTAATTTAATTAATACTAAAAAAATTTATTTGTATTAATGGTATAACCGCACAACTAGGGCCAATCAATGCGCCTGCCA:3 + chrX 9542484 3' - Bari1 319 1 24.66 ATACAATTGAACAACATTGCATTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAATAGCACACATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATCTCTTATATACATTGCCACCTCTAAACCAACCTAC:1 - chrX 11944702 3' + TLD2_LTR 71 1 76.71 TAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGTCATTGGGCCGAAGTCCATGACAAATTAAACAGGACAGATGGCACCGAAGTGA:1 + chr3L 4658629 3' + rover 379 1 63.70 CGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGAGCTACACTGCAAGAAACTTTGCCACACCACTAAGACAGAGAAACCAGACAACGATGTTAGGTAAACCCAAAGAACGAGGTGTG:1 + chrX 9179979 3' - micropia 73 2 60.69 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAACATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTTTTTA:1 + chr3R 27986438 3' - roo 8730 2 68.53 GTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTCTGATGAATACT:2 + chr3R 3286228 3' + Gypsy12A_LTR 1954 1 78.62 AGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACA:1 + chr3R 4679587 3' - hopper 24 1 67.59 CTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATAC:1 + chr2L 21657041 3' - invader1 84 2 78.08 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTA:1 - chr2L 6654645 3' - diver 57 2 55.17 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCCAAAATGCCAGAGTTCGACCCA:1 + chr3L 1692169 3' + blood 7377 2 76.71 TATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTTTGCGCTTTGAGAATTATTATGTCATAAA:1 - chr2L 15379260 3' - Stalker 6937 4 50.68 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCTCCTGGCTGTCCTCCTGGGATGGCTGATTGCGTTGTCACT:1 - chrX 19587995 3' - roo 8681 2 65.75 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGTACACTTCCAA:1 - chr3L 14366510 3' + roo 9043 1 62.69 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAA:1 - chrX 22840476 3' - copia 4932 2 61.64 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCG:1 - chr3R 23295544 3' - P-element 14 1 48.75 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTG:1 - chr3L 10731769 3' + 297 6916 2 62.33 ATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGACACTGCTAATTTGTAAGAAAGTAATTATTCTGATTCATATTATTTTTTTCTTCGCCACCAAAATGCCGTGAAATTCAAATTAAATGAAACTCAATTATCATAATAAAAGTAT:1 - chr4 814045 3' + Tc1-2 1418 1 65.07 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATTCCTT:1 - chr2L 4003638 3' - mdg1 15 2 73.97 CTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATACAGCAACATCCGCATAAATATACCAAGTACCATTTTCACATTGCATACAAATAAATTTACAAAGAT:1 + chr2R 8078524 3' + Bica 70 1 54.11 CTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGCATATTGTTATGAACAAAAGCATATGCAAACCATAACCCCTGCATC:1 - chrX 18742808 3' + invader4 3018 2 69.18 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCC:1 + chr3L 20711727 3' - jockey 4791 1 60.69 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGC:1 + chr3L 1692098 3' + blood 7306 2 74.66 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACT:1 - chr2L 71183 3' + 412 7472 2 65.07 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATTTTAAA:1 - chr3R 4460969 3' - blood 11 2 77.40 ATTTGTTTAAGCTACTGCAAAAGGACAAGGTAAACTTAACAATTCTGGAAGCAACTTTACATTACACATGTTGTATTGTAAGGAAGTCCCGCACAATTTGCTATCCGTAAAGAAGATAATAGATGCTGGAATGTCCGTCGAGTTTA:1 - chrY 536966 3' - Cr1a 157 1 92.47 GAGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCT:1 + chr3R 26405083 3' + hobo 2911 1 54.63 TTTTATTTTTTTGGTTATTTTGTGCACCTTGGAAACTGATCACCAGTTAGCGCATGTATGCTAATTCCTCGTAAGGAGTTTCACAAATTGTTTAAACTTAAAGTTTGAAGACCGTTTTGCATATTCAACTCATCCGTGACCAATTT:1 + chr2R 22689444 3' + Tc1 1404 1 51.37 AAACCAAATAAAGAAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATT:1 + chrX 19074866 3' + mdg1 7398 2 58.90 ACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATC:1 + chr3L 20187414 3' + FB 467 1 56.16 GGAGTGCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTTCAAACCGCTTGTTTTAGAGGCTATAAAATCTTTTTAACTATATGTACTTATTTATCTTGGTCTTATTTATCTTATCTAATCTACTTAGTTTATATATTTTTATTAAT:1 + chr2R 13571434 3' - R1A1-element 154 1 51.37 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAATTTTGTTTTAGA:1 + chr2L 6647755 3' - mdg3 38 2 60.27 TCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAGGCAGCGGATGAAATGAGTGGGTAACCCGAGACGGAAGAGCCTAATAAAGACCTTGGAGGCCCTTAGAAATCGATCTATC:1 + chrX 5059665 3' + Circe 7092 1 52.05 CCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACAAATGTGAATTTACTGGCCGAGACAGCAACCGCAGCAGAAACCATAGTGTAAAAGTATATTTTAAGCCTTAAATG:1 + chr3L 5254819 3' + I-element 178 1 65.60 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATG:1 - chrX 17678734 3' - flea 32 2 63.70 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGC:1 + chr2L 13556464 3' - transib2 38 1 53.42 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACT:1 - chr3R 31886838 3' - hopper 60 1 60.96 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATATTTGAACAA:1 - chrX 8360488 3' - roo 22 2 70.55 GGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATCCTCACATATATATGTCCTGTGTATTTTTGGACATTTTTCCTCAAGACACAAAATTTCGTTGTTTCGATCGTATACGATGTGATTGGGGACA:1 - chr2L 23052698 3' + diver2 483 1 66.44 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTACATACACTTGTATCATATGCAAGATATTATTCTAATCCCTGGCAGTTGGTTTAAGAAGCCGTTTAGGAAAGC:1 - chr3R 25166130 3' - 1360 322 1 48.55 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAA:1 + chr3R 19407993 3' + diver 6044 2 62.33 CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGAGGAAGAAGAGAAGAGTTTCGAGCCGTCAATCGGTGGCGTGCTCTCGAATAGCAGAGTTTAAATAAAAAGAAAAATAATAAAGCAAGACTCTGCTTCAGTCCTTTACAACATCA:1 - chr3L 23485946 3' + 1360 426 1 76.03 AAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTCCATA:2 + chr3L 21769159 3' + I-element 5342 1 69.86 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACACA:1 + chr3R 5524005 3' - FB 59 1 58.90 CGTAGGTGGCGTGCACGATTCAAAAACTATAATGGGATAATGCCTACTTACTACAACACAAACACCGCAGGACATGCCACATGCTGCTGAAGACGGATCCAACCCATTCTACGA:1 + chr3L 10705699 3' - Rt1b 5078 1 48.25 ATAAAATAAAATGAAATAAAATAAAATGGAATGGAATGAAATGCTAGGCAAACTAGCGACTATTTGAACTAATTTCATTATCTTAATGAGGACGTTATTAAATTA:1 + chr3L 11239239 3' - transib1 1900 1 54.29 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTGGTTCAAGAGTTAAA:1 - chr3R 15790873 3' - roo 89 2 78.47 AGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTTCTTATAAGAAGGTAAAGATTAACCCTGCTTGATCTTAAACTGCTGGTACG:1 + chr3R 5714220 3' - Q-element 422 2 76.34 CACTCCTTATCAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACATTCTTCCCCGCTTAAAAGC:1 - chr3R 7754762 3' + G6 298 1 74.32 ATTTTTTTTTTATTTTTTTTTAAATTTTTTTAAAAAA:1 - chr3L 36423 3' + hopper 143 17 83.78 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCC:1 + chrX 8437715 3' - P-element 59 1 24.30 ACGGGATTTTGCAAAAACGACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGTATGAAGAAAAATCCTTTCGCACCATCACCATCACACGCATTTAAGGGTTTAATCAACCCTAAACTCACGTATGTATGGTA:1 + chr2R 11160690 3' + micropia 213 1 53.42 TATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGACTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTTAAGAGCAGTTAAGTAACTCTTGCGTCCTTTTAAAATATC:1 + chr3R 3921264 3' + Cr1a 117 1 71.23 GAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGGGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTAC:1 + chr2L 15550769 3' + Bari1 1659 1 54.74 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGC:2 - chr3R 15882590 3' - jockey 76 1 62.33 TGAAAAAAAAAAGAAAGGAAAATTAATCAGCTTTCAATCTCTTTTGAAATGCCCTATTTTTCAAGGGTAAAATCGAAGGACCCTCAACGTGCAATTCGA:1 + chr2R 19628432 3' + Doc2-element 227 1 79.80 GTGAGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCACCCTTATCACATACAGCTCTGGCCAC:1 + chr2R 11145195 3' - Cr1a 301 1 84.29 TATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGCCCACACGCCCCGTTGAATGCGG:1 + chr2L 17766235 3' - Doc 156 1 75.00 CAATATAGCGATCTCCACGGCGTTCTGCGCGAAAACACAGATCTGCATGATTAGTTTCCTTGCCCTCCAGTCTTTTGATTTGTTTTTCTATCTTTGTGAAGGGTCTGGAATCTTCGTTGTGGCCTACTTTGATTTTCCTTATTGA:1 - chr2R 15911325 3' + mariner2 381 1 75.17 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGG:1 + chrX 18336690 3' - mdg3 51 2 51.03 TTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAA:1 - chrX 3431883 3' - G7 1144 1 62.76 AATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATACGGCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGCACTGTATGCATACATATAACTATAACTTAAATTCCCCGAG:1 + chr3R 15325226 3' - 297 18 2 71.23 ACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTA:1 - chr3L 23875800 3' - X-element 100 1 74.66 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATGCGCATTCCTTCGTTAAAATTAGAACTATC:1 + chr3L 22744751 3' - FB 35 1 73.29 ACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAATTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGTTTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTT:1 - chr2R 10078179 3' - jockey 120 1 78.99 AAAGTTAAAAAAAAATAAAAAAAACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATTAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAA:2 - chr3R 13735229 3' + TAHRE 10441 1 73.29 GTGTGCCACAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCAAAAATCGATACTCGAAAATATACTTTATATGGTTGGAAACGCTTCATTCTGCCTATTACATACTTTTCAACGAATCTAGTA:1 + chr2L 22211546 3' - 1360 31 1 70.55 ATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAAATGCATGGATAGAAAAACATGGTAATTTCTGACGGTCAATCAAGAAAAGTCTCTCGGGACTCTCTGAATCTCAATCACTTGATCAAATAAAATTCGGAATATTCGATTTGA:1 - chr2L 4003327 3' + mdg1 7441 2 78.08 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGT:1 - chr3L 3030217 3' + roo 8997 2 74.66 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTCAAGTTAGGCATCTTTCTTGGATC:1 + chr3L 1279204 3' + roo 9032 1 53.42 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCATATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTAT:1 - chr3L 14366553 3' + roo 8989 2 75.17 TTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTAATATGCTCATACGCATATAAGAGTTTGTATAAGAGTGTTTGTTTGTTTACATGATCCTCTGTG:1 + chr2R 2590804 3' - HMS-Beagle 60 2 57.93 TATATACATATATATATATTTTATTTCTGGTCGGGGGGCGGCGC:1 + chrX 4671281 3' - G3 4504 1 77.27 AAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATAACCTCCTTCATAACAA:1 + chr3L 23071836 3' + mariner2 795 1 77.24 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCA:1 - chrX 15200812 3' - 17.6 6965 2 57.53 CAGCGCGAACATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGACCCTCGCACAATACTTTAAACACTTCGTGTGCGTCCTGCTATGGTCCTGTTACGGTCGCCATGTGATAGGTTCAACAAGTAGTACG:1 + chr3L 24104299 3' - Stalker 492 1 61.24 AATCTCCCAGGTAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACACACACAAGCAAATTAGCTGCAATTAGCTTAGCATAAATGAATACTAAGTATTAATGTGTAAATAGCAAAATCGTAAATCAAATG:1 + chr3R 11049277 3' + transib4 2360 1 62.33 ATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCATGTTATTTATTATTGTATTGCCCGCTTTCGTTCGTTTTGATATGCATAGCACTTAGTTTGCTTAGTTTGGTTTTGGGGATAGTTGAAGAACGGTT:1 - chr3R 18718275 3' + FB 167 1 50.00 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGAT:1 - chr2L 6654647 3' - diver 57 2 55.94 ATTATTATTAATATTTTTTTTATGAATTGTTATACTCTCATTTTTCATACATATTTGCTTGAAAAGTTAGTTTGTTGATGTTTTAAGAACAATTATATGAATTTTGCAATATTAGGATTATTATGTTACTATCCTTTTAATAACTG:2 - chr2L 14995127 3' - mdg1 42 2 65.75 ATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGTGACGTTTAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGTCTCAAGATTAAAAAGGTAATAAAAGAACTTTAAAGCTCAATATTTCGAAATATTCACGGTGAAT:1 - chr3R 20602581 3' + 1360 405 1 61.11 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAAGCAACAAATCACACGCGAAATCGGAACGGAAGTCGAAAACTACGCCACTGAGGAATAAGAGCGATCG:1 + chr2L 12441103 3' + Bari1 1699 1 47.26 AATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGAC:1 - chr3L 17567847 3' - S-element 1559 2 57.53 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCT:1 - chr3R 8051117 3' - jockey 4813 1 58.33 GTTATTGTTATTATTATTATTATTATTATGCTCGTTGGTTGCCTGCAGAGAAGCAGGCTGCGAATGCATATTCTTTTAATTGTTTTAAATTACCGCC:1 - chr3L 3445613 3' - mdg1 21 2 78.35 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAGTTTATTTCCAAAGATTACCATTACATTTTTTGATTATTTTCATTGTCATTTTGTTATTTCCG:1 + chr3L 18505216 3' + I-element 5320 1 52.31 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGTTTTGCATCTAGTCG:1 - chr2L 22193422 3' - roo 66 2 64.14 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAGGATGCGAGACAAGCTTGTGGTGGGATTTGGCTGGTTATCAATTAAACAATTAGCGG:1 - chr3L 13294837 3' - roo 16 2 73.29 AAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAAATGAATTTTTCACGGCTTCATATATTCTGCGACTGTCGATGTCATAAAAGGTCCATCGCCGACTCCTTAACAACTTTTTAAGGTCCTTGAAATTTTCCTTTCTCCTTT:1 + chr3L 17331257 3' + Doc 4462 1 73.24 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGCTAAAATAAAACATC:1 - chrX 17343334 3' - I-element 10 1 76.71 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAG:1 + chr3R 7719840 3' - roo 8706 2 56.85 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGGAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTT:1 + chr3R 9298591 3' + hopper 1392 1 64.18 CTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAAGTCAAGTTTCCATTATACATAGAATAACTAATCGTTTCCATATATAATCGTTAATATTTTGTGACAGGCAAATAT:1 + chrX 23210603 3' + F-element 493 1 58.27 ACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACAGCGTCCGTTTTTTTTTTCGGCTTTTGCTAAGTAGCTCAGCGGTTTCGCTCGGGGGGTGGCATGCTTAACGCCCCACATTTCGGTCCAACAGCCC:1 + chr2R 19038691 3' + baggins 5075 1 63.97 CTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAAATAGGTGGGCGTGTGCAGAAAGGCCATCCACGGATATCTTCCCAATCGCGCGG:1 - chr2R 15695525 3' + I-element 360 1 68.18 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATGTATATCGGATAGGTTCAGGGCGTTGCCCCATGAACACCTAACCC:1 + chr2R 11795048 3' - opus 7188 4 71.33 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAAC:1 - chr3L 18402988 3' - P-element 48 1 37.27 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTTGCTCGTTTTTGCGATTACTATCGCCGGACATTT:1 + chr3R 26774127 3' - hobo 23 1 63.93 AAAAAATTTTAAAATTTAAAAATGTAGATATAATTTATAAAAATTTATATTCTCATATTTATTTATTATGTGTAATCTCCTCAGCCAATTGGGTAAATAGATAAGAGTACTTGCTGTCCGGATATTTTATTACAACAGGCACTCC:1 - chr2L 22240735 3' + 1360 3037 1 55.17 GACCTTTACATTAACGAAGGCTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCACTGAACTGAATTGTTCGCGATTATTATCATGCCGTT:1 - chr3L 10784551 3' + gypsy7 445 1 60.23 CTAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGTCGGACAGACGGATATGGCCAGATCGATTCGGCTTGTTTTATTGGAGGGAAGGCCATATTGGGGGGGGAAGGGTGACGTTTCCTGGGCCATGACGGTTTCATTTGCATTTTATG:1 + chr2L 22047139 3' - INE-1 136 1 54.61 AATAGAGTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAACAACATGAAACGAGAATGCGTATATGTGTGCGAACTTGTGTAAGAAGATGATTGACTTCAAAGGACGTCGATGCTCTTGTTTTTTCTGGCAAAGAAAAAAGATGAAATCAGTG:1 + chr2L 7889499 3' - 1360 3260 1 47.52 TAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAG:2 + chrX 3431991 3' + Ivk 5348 1 58.90 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAG:1 + chr3L 12315840 3' + transib2 2780 1 55.48 GTGAAAAGTTCGTGTCGTTGTAAAATTATATCCCGCGGGCGTGGAGTTTTTTTAGTCCTGATATATATTATTAGATTGAGTTTTGATCGCCACATAACGGTGCGCAAGAACAAATGTGAAATCCAGTTGGAGCGGCAGGG:1 + chrX 21342122 3' + Gypsy12A_LTR 294 1 67.86 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGC:1 - chr3L 18402985 3' - P-element 33 1 44.90 ATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAA:1 - chrX 4947589 3' + Cr1a 4317 1 75.56 GAGAGAATGCTATAGTCACGTTTCCAGACTATCATACCCGTCATAGATATACCCATATTGGGGAACGAAATCGAAAGATTTTTCACAAATCGAAATAAAAAAAAGACGATTACCGTAGTATGCCTGATTGTGGCAGTTTTGG:1 + chr3L 24159143 3' - INE-1 575 1 54.93 CATTAAAAAATCTTTAACAAAACAAAATAAATATTAAATTGTCGTTTAAATAGGCTCCATAGTTTAGTATTATTTTATTTCATAATGGGCTATGCTCTTTATTATCTGTTAAATTTATTAGCTTTTAGACTGAATTTGTAACAAAA:2 + chr2R 17217215 3' + FB 396 1 52.74 AAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCCCTTTCATATTAAC:1 - chrX 3431827 3' - Ivk 5327 1 64.38 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATTTACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAA:1 - chrX 19074734 3' - mdg1 7068 2 60.96 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATTTCGGTCTGGAATGCAGGCAATAGTTGAGCC:1 + chr2R 12779763 3' - I-element 19 1 73.29 AAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTG:1 - chr2R 20348978 3' - transib2 58 1 70.83 TGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCT:1 + chr2L 17005809 3' - Stalker2 7305 2 55.48 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACTAACGAAACTGCTCGGTGACAAGTTGCCC:1 - chr2L 7125703 3' - I-element 9 1 77.40 GATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGA:1 + chr2L 4713946 3' - transib2 75 1 73.29 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCAAAAAGGCTTTAATTAAAATTAGAAATTGCTTATT:2 + chrX 696561 3' - FB 87 1 74.66 ATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCGCTCCGCTTTGAGTTTCCTTT:1 + chr2R 7171153 3' + R1A1-element 5250 1 72.00 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCAT:1 + chr2L 4063930 3' - roo 67 2 64.38 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGACTATGCGAAAATTCATATATAAATTTTAATTTTATTGTTTACTTTAATATGTATAATTCGGTTTTATGTCTATTTGGATAGTACAGATTATTG:3 + chr2R 15326982 3' - copia 28 2 52.74 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGA:1 + chr3R 17996251 3' + diver 148 2 68.49 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAGGCGGTGCTTGATCCTGT:1 - chr3L 5881561 3' - pogo 41 1 53.57 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCAGGGTATGATTCTCCCGCGAAAGACGAT:1 + chr3R 27123606 3' + roo 9038 1 62.33 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTGGCTCTGGCACTTTTTTTTTATTTCATTTTTATTTCGCAGCGTGAGAGAAG:1 + chrX 21216863 3' - roo 15 2 76.55 CCAACCAAACCCGTCAAACCCCACGTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGAGTAAAAATCTTTGCGACAAATATACATACACATGTACAGTGCAGGTGGAGAGAATAGCACTGAAAATGTAATTACAGTTT:1 - chrX 2293811 3' + G2 113 1 62.86 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTG:1 + chrX 9410558 3' + I-element 5288 1 62.33 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGC:1 - chrX 8200179 3' - flea 31 2 56.56 CTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACACCAGCTTTAACGCGGATTTAGGATATTTAAAACATTTTATAAGAAGTGACAAG:2 + chr3L 22035610 3' + 1731 4560 1 61.64 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTG:1 - chr2L 7580863 3' - Transpac 20 2 48.63 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGG:1 - chr3R 29084879 3' + 412 447 2 50.00 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCATTTGCTCCTCTAT:1 - chr2R 21926348 3' + opus 450 2 51.37 CGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7587 2 60.19 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGCCAAATTATTAAAGAATTCAGTACATTAAACCAATGACAATATGACAAAAGAAAAGCTTTATC:1 + chr2L 22674440 3' - mdg1 67 2 55.47 GGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTA:1 - chr3L 22723865 3' + HMS-Beagle2 7106 2 77.40 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTG:2 - chr3L 15913864 3' - jockey 4836 1 71.23 CGCTGCTGTTGTTGCTGCAGCTGTTGTTGCAGTTTGCAGTTAACATGTTGTTAAGCAGAGCATGGCCTTTACATG:1 + chr3R 24939414 3' - TART-B 153 2 65.33 ACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACACATAAAACCAAATAAATATAACAACTCAAATAGTTTTCAACGAAATTAAGAGATTAAAACTTGTTTTTTTTTAACTTTGAAAAAATT:1 - chr3R 11674109 3' - flea 348 1 64.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTGATCTGCGATCGCGATG:1 - chr3R 24368982 3' + roo 9054 2 67.12 ATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAATCCCCAGATTAAAATTGCTAACTGTAAATAAACTATTAAGTACGTTTTAAATACAATAAGTTTATCGAATTCGGTTT:1 - chr3R 16519089 3' + Tirant 308 2 66.93 AAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAAT:1 - chr3R 22590494 3' + rover 7223 2 71.23 ATATCATACTAACACTAATATTAATTACAGTTATATTACATCATATTTATTTCCTCGCTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGCCTTATAGGAGATGCAATCCCAGTGGACCTAGGAGCAGTACTATTACAGTTTAGCACAGCCG:1 - chr3R 2913278 3' + Cr1a 4293 1 56.94 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTGTGAAGATATTAAATCGGCGACAGAGCCGTCGATTGAAATCTAATGAACTGTTAATTGACTAATCAAATCAAGCACGCTTAAGCGCTCGGAATTCTTAGA:1 + chr3R 7726600 3' + roo 9026 1 71.92 ATAATTTAAAATGGATTATAAAGTAGAATGTGTTTACTTTGTATACAAAAACTAATATGGTCGAAGCTGAAATTGAATTAGAAGAAAAACAAGCAGTGGCCCAAGTGCCATACCGAATTCCTGAACCTAAGCGTGACGTTGTGAAC:1 - chr3R 2874868 3' + Transib5 263 1 67.12 ATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTTAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACAATTATCAAGACAATTTCAATC:1 + chrX 22689424 3' + 1360 3356 1 56.06 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACC:2 - chr3L 19454891 3' - mdg1 27 2 65.75 AATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTATTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTAAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAACCCC:1 + chr2L 12553469 3' + F-element 90 3 73.29 TATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATT:1 + chr2L 10156184 3' - hopper 87 1 77.40 ATCTCGACGTTCATACGGACAGACAGACATGGCTAGATCGACTCGGGTCGGGTATTGATCCTGCTAGAGCTGGCTACGAAACATCTTTCAATATAAATTTCAACGGCTTT:1 - chrX 22775280 3' - INE-1 131 1 56.36 CATACACATATATATATATATAGGTGGGCCTAAAGCTGTGTATATGTATATGTACTATGTGCATATAGCTAAATTTATGCGTACGTATTTTTGGCCATGCGCGTCTCCAATTTGAACCAAAAAAAAAGGCAAGGAAAATAAACCGA:1 + chrX 14589976 3' + Stalker2 251 2 54.79 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGCGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCTAATGATAGTAATTA:1 + chr2R 12645541 3' - X-element 37 1 60.27 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAAATAAGTCGATATGAAT:1 + chr2L 20118528 3' + S-element 1699 1 72.86 AAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTATTTAC:1 - chr2R 9966919 3' - Bari1 1 1 61.64 AAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACC:1 + chr2R 2879456 3' + Stalker 111 4 56.31 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAA:1 + chr3L 11326787 3' - pogo 48 1 56.85 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTT:1 + chr3L 13739644 3' - BS 5069 1 68.49 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCT:1 + chr2R 8099222 3' + jockey 4930 1 62.33 AGGTTAAAAGAAATTATGGATTTATAAACGTATTGAATTAAATCGGGTGTTAGGAACGATAAATTATTAAATAAATAATT:1 + chrX 18273322 3' - G5A 2766 1 80.00 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAGTCGG:1 + chrX 18336712 3' - mdg3 30 2 65.75 GACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCCGGC:1 - chrX 21772477 3' + springer 19 2 66.67 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACTGTCTCCA:1 + chr2L 47233 3' + roo 390 2 72.41 ATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAAAGCGTAATTTCATCATTAGCTGGGATATCGATAGATATTGCGGGATAGAATGAGAATAAAAATGTAAATTGTTCCAAAGTTGTAGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCACTTCTG:1 - chrX 14770547 3' - INE-1 540 1 63.70 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAA:1 + chrX 2479562 3' - mdg3 5338 2 73.97 AAAACGGTCACGCCCACACTTTTAAAAAATTTTTCTCATTACATTTCCCAAAATCTATCGATATCCCAAAAAATGGTGCAATGCTTTTGCGGTCCCACAAAAAGTTCCTTTTTTAGCTCAGTGTGGATGGTTCCAGCAAGC:1 - chr4 819307 3' + INE-1 245 1 69.50 CACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGTGGCTG:1 + chr3L 18126021 3' - Ivk 34 1 55.48 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTC:1 + chr3L 23320141 3' + roo 9001 2 68.49 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACA:3 - chrX 10319612 3' - mdg1 67 2 64.38 ATTTCTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATATCCTTTTTCTTGGCCTCCGCATCGGCATTGGG:1 - chr2L 18704103 3' + 297 6902 2 77.78 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCATGTCCTATTCATGA:1 - chr3R 27986327 3' + roo 9029 1 57.53 CTAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGTCGGACAGACGGATATGTCCAGGGGCCTAAGGTTGGCGTCTCTTCGGTTTGTTTTATTGGAGGTAAGGCCATATTGGGGGGGGAAGGTTGACGTTTCCTGGGCCATGACGATTTCATTT:1 + chr2L 22047129 3' - INE-1 136 1 70.55 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTCTTAACCGTAGTCAGCCTGTGCATTCCGATAAGCGT:1 + chrX 4027641 3' + Tirant 8460 2 52.05 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTAC:1 + chr3R 22590610 3' - rover 31 2 63.70 GCAGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATAACGTACATTATTGCACACATAATTACACACACTTTTCGCACATTTAGCGTTTCGAGTTCCTACATCACGTTTGCCACGGATTTTCCCGGCC:1 - chr3R 17736823 3' - opus 7026 2 68.53 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAA:1 + chr3R 30987607 3' - F-element 78 1 71.67 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACA:1 - chr2R 13168661 3' + P-element 2813 1 35.62 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCG:1 - chrX 19266824 3' + roo 9028 1 46.58 GTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGGGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCAACGGCTCTGAACGCCCGCCTCCGGTCGAACGCGATATCTATTTTAC:1 + chr2R 5002934 3' - F-element 396 1 60.16 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAA:1 + chrX 1341741 3' - 412 7106 2 52.74 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTG:2 + chr3L 21769146 3' + I-element 5329 1 60.96 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGGGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCAGT:1 + chr3L 3983887 3' + P-element 2825 1 37.23 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGT:1 - chrX 21224535 3' - roo 53 2 57.45 GAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTATATTTGGCCCCAAGAAATAGTGCATCCCAGTGGGAAAGAGTCGCACCCATTAA:1 - chr3L 8038228 3' - Circe 7075 1 65.75 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATATAAGGCAAGCAAGTCCGGATTCCTATCGCCAAGTTTTAC:1 + chr4 1128557 3' - transib1 1898 1 76.71 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAA:1 + chrX 661977 3' - 412 7094 2 57.24 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACCTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr3R 4571526 3' + hopper 1359 1 54.79 AGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGACTGGCTGCTCATTGTTGAACTCACTGATATCGAACCAATTTCATTTGCTCTGTCTCTAGTCT:1 + chr3L 13269471 3' - 297 6880 2 57.53 CCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGAGAGCTAAAGTTTGTGCAGTACAATAAGCAAATGTCATGCT:1 - chr2R 15648468 3' - hobo 2558 1 71.92 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGA:1 - chr2L 4063852 3' + roo 8994 2 71.92 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGAT:1 - chrX 13134882 3' - jockey 4815 1 53.42 AACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCT:1 - chr3R 904900 3' - rover 9 2 67.12 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAAC:1 - chr2R 5941320 3' + copia 5074 2 52.74 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATATTAATAATACTTATTACT:1 - chr3L 1279069 3' - roo 8712 2 52.05 TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTA:1 + chr3L 18505735 3' - I-element 67 1 64.83 TATTCTAATGAAATTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGCGAAATACTTTACGGATAAAACAAAAGGTAGCTATTAACAATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAA:1 + chr3L 20711711 3' - jockey 4807 1 45.52 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTAAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGAC:1 + chr3L 23871825 3' - INE-1 578 1 77.50 GCATTATTTAGGATTTGGTATGGCCACCCTTGTTTTTAATTACTTCAAACATTCGGTTTGGTAAGGAATCATAATATTTAATACAGATCCAAACTTAAATACTTACGACA:1 - chr4 269794 3' - Tc3 1430 1 71.82 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAG:2 - chr2R 5106284 3' - Stalker2 7329 2 73.29 CTTATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCC:1 + chrX 21947736 3' - mdg1 57 2 56.85 AGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTTAAATATATTTCTTGATTTATTGTTTACTTCACATTACAAATTATGCGATTAT:1 + chr2L 17353933 3' - 17.6 7184 2 63.70 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAA:2 - chr3L 12315704 3' - transib2 43 1 56.16 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATCGTTCGACGTTGCCACGTTGATGTCCACTAT:1 - chr2R 12471975 3' + transib2 2808 1 73.97 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTTCATTCTATCCTTGATGTAAGCATCCTATGATAATAAGTTTTATATGTGTTTA:1 + chr2R 17926440 3' - opus 23 2 69.86 CAATATACTAATACTAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTT:1 + chr2L 10156200 3' + hopper2 1542 1 56.85 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATA:1 - chr3L 16662375 3' + jockey 4936 1 57.53 AACTAATAAAATTATGAAAAAATATAGAACACATTTTCAAAAATGTGCGCATGTCCGTCTGTTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAG:1 - chrX 392290 3' - INE-1 402 1 45.88 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTT:1 + chr3R 30987561 3' - F-element 81 1 54.55 ATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGCTAATTGTAAAAGTGGATCAGACTTTACGATCGTGCAAGCGAATGAATGGCTTTTGATCTTCGGCCTTGTTTGTTTGAGTTCGTGCCACTCTCGCCCAG:1 - chr2R 17846039 3' - Quasimodo 105 2 69.86 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATATATATGAATTACAAGAGGATTTAACATTTTGCT:1 + chr3L 14094660 3' - I-element 85 1 78.08 GAGGCAGAAATAGTTTCTATCGTAATACTTTGGCTTCCGCACTTGGCTTAAGCTAATTTATAAAGCAAGGCTTGGGAATTCCCATAGGCTAATATCATCGAATTTATGTAAGACATATGGGCTAATTTATATTTTAAATGACATTG:1 - chr3L 6712333 3' + invader5 3790 2 71.92 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACTTTATGTGGTCGGAAACGCCTCCTTCTGACTGTTACATACTTTTCAACGGATACCCTTTTACTCTACTCTAATCAAAAAAATCCTAATGTGTGTGGCTG:1 + chr4 643214 3' + HMS-Beagle2 294 2 71.72 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGATACTCGTACTTTTGGCAGGATTCCCGTCGTCTGGGGTCCTGCATCTCAAGTTGCTGCTCGTGGTGCA:1 - chrX 13490630 3' - 297 45 2 51.37 TGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTGCCGCTATTGGAATTTGCAAATATT:1 - chr2L 12341798 3' + BS 5057 1 58.22 TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATT:1 - chr2R 15004725 3' + BS 5082 1 38.46 TTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTATTTCTTAACATTTCTGTATTCCTGGCTGGATAAGCAAAAGGATAATGATTAAATAATAAAATGAA:4 - chr3L 22604367 3' - P-element 2688 1 15.75 TTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGACGACGAGCTCAAACAAGTCAACAGTCAACTTAATTGTCATAATTTGTGTTTACAAACTTGACGAATGTGCTAAAATAAAAAAAAAACGTGAACTTTGTGTA:1 + chr2L 11752056 3' - hopper 417 1 72.60 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTAT:2 + chr3R 16342061 3' - P-element 35 1 60.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGGGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTTCTGAAT:1 + chrX 19588167 3' + roo 387 2 66.42 ATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCAACAAACACAGAAGGCAGCGGCCAGTCCAGGATGTCCAAGAATTCAACCAATTCGGGACAGTCCAGATAGTCG:1 - chr2R 1450652 3' + Stalker 244 4 50.00 ATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAACGTAATCCATGGAAGGGAGAACTGAGATATTTCTTTTACCTAAGCGCTAAACACAAAATTATTGTTGTACAGAAATTGACAA:1 - chrX 8441078 3' - accord 7270 2 58.90 AGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCG:1 + chr3R 10736107 3' - McClintock 6027 2 77.54 ATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGTGTCATATTTCAGTTGGCTATTTATAAGCATACAGTAAGTTTCTTGATTGCCAAACGCAT:1 - chr3R 30564817 3' - 412 224 2 58.90 TTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGTTGCTCAGCTGTAAAACT:1 - chrX 15200783 3' - 17.6 9 2 76.03 CGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAAAAGTGGATCACTAACTGATTAATCAAGGTAAACGAGCAAAAATGAGAGCATGTAACTGCAACAACAACACCTTGTGTTCATATTTAT:1 + chr3L 24156043 3' - Ivk 205 1 62.33 TGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGT:1 + chr2L 6654736 3' + diver 6039 2 66.44 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGG:2 - chr3R 29084875 3' + 412 7496 2 50.00 CTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCACGGTGCGGCTTTCAAT:1 - chr3R 20675799 3' - jockey 4891 1 65.52 ACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGACAATGAACATCAATAGTCCGTAGAGAGCCAACAGCATGTACTGGTAGCGATGGGAGTCGCCGCATTTGACCAGTATCTCGTCAAAGTCCATGGCCATGTC:1 - chr3R 14799069 3' + roo 8881 2 67.81 TGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAG:1 + chr3R 2689458 3' + diver2 4476 1 73.44 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTGCACCTAGACCTTGTCAACGGGTTCGGTTTGAAAAAGA:2 + chr2L 14675782 3' + 297 6943 2 64.38 GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGACTGGTCTTGG:1 + chrX 18336704 3' - mdg3 31 2 61.87 AAACACAAGTGCCCAAATTGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGAACAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGGAATTGCATCTGTATGTATCGCACTGATCGCGCGTGGGTATTGGTGCGCCGTTG:1 - chr2L 1644498 3' + HMS-Beagle2 6941 2 60.27 TAATCTTCTCTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGAGTGATTCTTTCCCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGAGTCCTTTGGGCTTTTGTGTGTTTCTGTTTGTGTGTGTGGACTTTCATAGGAGCATTCCGCGCCATT:1 + chr3R 7610649 3' + Cr1a 81 1 60.27 ATTTTTTTTTTTAATCGCAATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAA:2 + chr2R 5303142 3' + FB 186 1 60.96 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTAGAGCTCGACAATAGCTTACATA:1 - chr2L 17205140 3' - hopper 26 1 67.81 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAATCCAAA:1 + chrX 18010069 3' - 412 37 2 57.53 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGGCATAAATTATGCGCCCAAAAGTAGGCAG:1 + chr3L 21763767 3' - jockey 75 1 64.75 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTGATATTAGTCACAC:1 - chr3R 27160049 3' + 412 447 2 53.42 CATTAGCTGAGTAATGGGTATCTGAGAGTCGTGGAATTCGAGGTTAGCGTTCTCTCTTGACTTTGTATAAAATGTGGATATATAGTGTTTAAGCCTATCAGAAATTGAAACTTTAACTTGGTAAGCTTAAAAATTAAGCACCTTTT:1 - chr3L 21237814 3' + INE-1 541 1 87.67 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCA:1 + chr2L 16943872 3' + copia 237 1 66.96 TCTCTCTATTCGATTTCTCACTTGACACCGGGTTCCCATATTGGAGGAGCCCAAAACGCCCACAAATAATAAAGCTGATTCTCCCAAAACACCAACAAACGAACTCAAGGAGTCTCCCATCAGTGCTACAAAAATACCTAAGGCCA:1 - chr3L 14511979 3' - invader3 5410 2 77.40 GGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTT:1 + chr2L 1924036 3' - G2 3000 1 60.96 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGACATTGTCATGGAT:1 + chr2R 13766328 3' - roo 35 2 62.33 GGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTTTAGGGGGGTGGGGAATTGGAACTTTTGGAGATCGACGTTTCCGGTTACGCGATCGTGAAGATTGTGGAG:1 + chrX 4800439 3' - gypsy5 7069 2 58.25 ACTTTAACAGCTGTTATTATAATGATGCGCTGTTAAATTAACTTTTTCTCAATCCGTAGCTTATAGCTGTGCCCGCATAGGTGGCGCTGCATTTGTGTAAAATGAATGTAAACTATGAAGGTTTCGTAAGTCAACGCTAGGTGTCC:1 - chr2R 15818635 3' + hopper 1271 1 69.86 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTAGACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGCTATTTCATCATGGCGGAGGCTTTGATTGAAATCGAAGAAGC:1 - chr2L 12822813 3' - P-element 93 1 20.28 CCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCACCACGCCCATCCCATATGACATCCTCGGGGGTTTGGGAGGGTTTTGAACTGATGGGTGGGGGGT:1 - chr2R 19766655 3' + HeT-A 5843 1 62.33 ATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAAGATAGTTA:1 + chr3R 24219392 3' + roo 9034 1 58.22 AAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACACGAAATATGATAATTCATTACAC:1 + chr2L 4063935 3' - roo 8670 2 72.22 ATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCGGCGGTAAAAAATTCCAAAAAAAAAA:1 + chr3L 19441503 3' + diver2 259 2 48.00 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCTCGCCCAGAGTTCACTCAACTCCAACTCCCTTTCCTCTAG:2 - chr3L 17940044 3' - 1360 22 1 54.79 AAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCTGACTCTGATTCTGATTCCGATGCCGACCCCGTTCGTTGTCTT:1 + chr3L 22326406 3' + hobo 2521 1 64.17 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAA:1 + chr2L 4123963 3' + transib2 2774 1 52.05 AATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAACGTTCCATATTTATTAC:1 + chr2L 4754961 3' + Stalker 7192 4 59.59 ATACCCCTTATCTTAAATCAATGTAGCTCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTCTGCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCCTTCATATCGAACGCTTGACACATCAAAGCGTTT:1 - chr3R 8052639 3' + Cr1a 4136 1 76.71 TAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAAAAAAAATATTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTAAATGGCAAGGGCAACAGTATTGAAATTTGCATATGTGCCATA:1 + chr2L 13585797 3' + Quasimodo 7297 2 63.45 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGT:1 - chr2L 4003677 3' - mdg1 7092 2 55.48 ACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCTTGGCGCACAGGGCGACGGGACTTATGACGCATGACGGAAAGAT:1 + chrX 14414661 3' - G2 262 1 69.44 TAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGAT:3 - chr3L 18125937 3' + Ivk 5288 1 78.08 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGGAG:1 + chr3R 16342048 3' - P-element 48 1 50.00 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATATTGTTTGTATGTATGAACGAT:1 - chr3L 22723795 3' + HMS-Beagle2 7176 2 76.71 AGATTCACTAGAAACAATAAACCCCTTACCTTAAAGCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACTAGACTTTATCTTATTATCTTTAATCTTGAAATTGTTGAATCAACCCGCGTGAATGG:1 - chr2R 4886658 3' + Cr1a 4118 1 59.35 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:2 - chr3R 29487012 3' + flea 4962 2 55.48 CCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAACCGAACCTAACAAAATGCCACTCGAAATCACAAGGATAAAATCACAATTTTGTTGGAAATTTCGCATAGTTTTCGGATGAGTTCTCTTTGACTATATCTATGTACTCA:1 - chr2L 9795428 3' + Quasimodo 27 2 76.71 AAGAAACAGAAACAGAAGAAATTGTATAACAAAACAAAATAGTTAAAAGGACACACACAATTTTCCACCCCACTCATCAGCTGCCGCTGGAAAACTAAACAAACGAAGTCCAATTTCTAAGAACGCTCAGCTGTTTACCTAAGCGC:1 + chr3R 31169132 3' + 297 6496 1 63.70 ATTGACTTGCGGCCTGGGACGGGAGCCAACGGGGCTACATAATTAAGAAGACAACGGATCGATTAGGGGGAATAACCGTGG:1 - chr2L 9783888 3' - mariner2 252 1 51.85 AGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTCATTTTGAAGTCGTGTGTGCTTCCCAAAGATCGATGAATGGCCCAACCGAGCATTTGGCAATCGACGTTGTCACTGAATTCACAATTCACAT:2 + chrX 10537657 3' - I-element 463 1 64.58 ATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGTCAACAATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGCTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCTTCTCACCTACAATCCATATCTCAAGCCGCATTTA:1 - chr3R 6084756 3' - Cr1a 498 1 74.66 ACTTTAATTGGCGCCCAGCGTGGGGCGGTATATTTCAAAAGTTAATAAATTAATAAATATAATAATTAATAAATATTAAGGATAATAAGTTATATACAAAACGGAACTAAAAACTCTATAACTCCCAGCGGCAGCATTC:1 - chr2R 5396450 3' + gtwin 487 1 62.59 ATTTGTAAGCTTATTCGTGGCTTAATTTTTCGGTTTAAGCACGTATATATACGTGATATTTTGTACTTACACTGTGCACTTGATAGTTATTGAGTTGTTCAGTCTCATCGTCCACGCCAACGCTGAAAGCGA:1 + chr2L 6680987 3' + Cr1a 4046 1 75.76 TATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAG:1 + chr3R 14860263 3' - BS 5018 1 69.18 CTAACANGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAACCATTATGTATGGCGCCATTTGAGATTTTGATTGACAGCTCTTAGCATCCCTGATGGAT:1 - chr3R 6716861 3' - hobo 400 1 73.29 ATATTATTATATTATTATATTATTATTATTATAATTATTAATCCTCCTTATCTTTATCGCATTATTGCGCATTTAAAGATCTTAAACCACAATTACTAATGATTAGTAAGGTTTTGATTGGCAATCTGCACATTACTTCAATACAT:2 + chr2R 8186786 3' - transib3 2611 2 69.18 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTGTCCATATTTCGCATATATATTATATTTAGACTGACGATGCCAAA:1 - chrX 18118130 3' - accord 185 2 76.71 CACTAGCTAAGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGTAACTCGACTATAGTATTCTCTATTTTTTAAATTTATTATGTATTATTCTATTCTAAGTTCCCTCCGTCTCGTTGCATAAGTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTCTTTGTGATCTA:1 + chr2L 21993486 3' + INE-1 541 1 62.33 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTG:1 - chr3R 11469324 3' - Tabor 6900 2 70.63 CGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGGATTCTAACATAACTTAATCTCATAAGAGGGAATGTAAGGGAATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCAT:1 - chr3R 30946546 3' - Transpac 5015 2 77.40 GGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACTAAGTAAACAGAAATAAATTAAAATAAATTAAATGAAAAAAAAAATCGCAAGAATATTTAAATCAATTTTG:1 + chrX 12949270 3' - accord2 7302 1 59.35 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACT:1 - chr3L 4219489 3' - jockey 95 1 76.71 AAATGGATAATCAATCTACAGGTTCGTTGGGTTTCTGCGCCCTTACGAGGTCATCTGCTTGCTTTCTTCGGCCATTCAAATTTTTTAAATAATATGACGTTTTCTGGAGGCCAACTAATTTCCTTTCCTATTTATTT:1 + chr2L 17404691 3' - hopper2 1350 1 75.91 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCTTATATTGGGTCTACGAGACTTCTGCGGCGGAA:1 + chr2R 6964923 3' - Burdock 6149 2 76.71 CGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTACGCCGAGCGATCTGTTTGGCTACTGAAAATCGAGTGAATAACGGTA:1 + chr2R 6482554 3' - gypsy 6994 2 73.45 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCNNNACTATTCATTGGTGGNNCCNNNNNNNTTTTCAGCTATTCCAATTCTCTTCCTTCGT:1 + chr3L 131169 3' + diver 6036 2 70.55 GCCTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGTCAAACTGGAGAATGCTGAGAAGAAGTCCACTTGAGCTTAGAGCCTGTTAAGTCACACGTCCTTAAGTATTAGTTTCATTTTTATTGTTAATTGAATTTCGCTTAAAATGAGGAAA:1 - chr3R 29735363 3' - 1360 3006 1 78.77 TATAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTGGGCAGCGTTCGATGCTGGTGATAGGGTCCTATATCCTTTCGGAAGCCTCATCCTTTGCACTGGG:1 - chrX 16065539 3' - Doc3-element 126 1 69.00 ACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTAATAGAATTAAGAGGTGAAGAATTCAATTCACGGCAACATTCAGGGACGCCACTTAAATG:1 - chr2R 24426613 3' + jockey 4733 1 62.33 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTTATTTAAACAACGGAGTTGCATTTAATGTTCACTACCATTAAT:1 - chr3L 23320067 3' - roo 71 2 75.54 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAGGCTGGGCACCAACACACTCACGCACAGCTGACTAATTAGCAAAGCAAAACACCAAAAATCAAAACCCCCACTCAAAATCA:1 + chrX 6866586 3' - hopper 21 1 53.85 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGGTTCTCTTCTGCT:1 - chrX 2214224 3' - jockey 4793 1 60.96 CAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACTCATACATATTAACTAATTGTGCGAATTTGATTGGAAATGCGTTTGAATTTCTATGACAACAATTCGAAACTATTCTACGCTTGCGTCCCACGGTGCCTCCCAGAGCATTTTGCGTAT:2 + chrX 5635008 3' - F-element 4623 1 78.08 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATCTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTG:1 - chr3R 24368998 3' + roo 9038 1 56.16 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCGAAAGGTTAGATACG:2 + chr3R 17077241 3' - roo 18 2 71.92 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGAT:1 + chr3R 20167672 3' - roo 8731 2 65.75 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCC:1 + chr3L 5061678 3' - 17.6 6954 1 65.52 TTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGTTTTCATGTATA:1 + chr2R 21116631 3' - mdg1 7040 2 33.10 ACAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAA:1 + chr2L 15940304 3' + pogo 2031 1 65.07 ATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAATTAACAAGCAA:1 + chr2R 4545193 3' + invader1 3558 1 68.49 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGGGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACT:1 + chr3L 6518661 3' + 412 7501 2 50.00 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACGAATATGCTCATACGCATATAAGGGTTTGTATAAGAGGGTTTGTTTGTTTACATGATCCTCTGTGAGCTTTCAAAGCAAACATATGTTTCAGCGC:1 + chr2R 2590834 3' - HMS-Beagle 6809 2 71.88 TTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGTTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTACTGTTTCACCCAATGATTTATGTTTGATCACCCA:1 - chr3R 21655070 3' - Rt1b 5143 1 69.17 TATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAGACCGGTAGTCCTCATAGGCGTGTGTGGGTGTGCCGGCGAGTGTGACAAACGATTTTCATTTTGTTTCCTTACCCAAAATTGGTCGAAAAAGATTGGATTTCGAGTGGAAATGGCGAGGG:1 - chrX 20103165 3' + mdg1 420 2 67.12 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAAT:1 - chr3L 22861749 3' + S-element 1675 1 52.05 ATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCT:1 + chr2L 16539729 3' - Juan 4104 1 64.38 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGAC:1 - chr2R 24169954 3' - transib2 45 1 47.95 TTAATCGTATGGCGTGAGTACAGCCAAGGCTTAAGTTAGTCACATTTTTGATCTGCGAGGTATTGATTAAGCCAATTAGAATCGAACAATATGCG:1 - chr3L 27716238 3' + 3S18 204 2 60.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCAT:1 + chr3L 23320155 3' + roo 9015 2 58.90 ACAGTCCACAAAATATTGGTTCACTCCAAAGAAATCTTGGAGCAAACTAGTTTTCCATCTACAGTATAGTTCGTAAGTCAGCCTCCTGATAAAAGATAACCCTTTCGAGCGAGATCCCCGATAAATAGACAACCACCCAC:1 + chrX 20518973 3' - hopper2 363 1 65.71 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGAC:1 + chrX 11661501 3' - pogo 27 1 59.66 TCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGGCAAATGTACAGCAAAAGCGCGAAAATAACACCTGCAGGCTGCAAACTAATTAAAATCATTGCGGCCATTTT:1 + chr2R 21242453 3' - hopper 1136 1 58.62 TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAAG:1 + chr2R 20227324 3' + hopper2 1553 1 56.55 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAACACGAAAAGCAGGAGAAACGCGTTTAAAACGCGCGCCGCGTCGATGATTTAAGTAACAGCCATGTAATGCACTGAGCGAAATC:1 + chr3R 28928488 3' + jockey 4954 1 43.15 GTGACAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTAT:1 - chr2R 9966923 3' - Bari1 5 1 58.90 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGA:2 - chr2R 12472035 3' + transib2 2748 1 69.86 TAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGGGGGCGGGTCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAA:1 - chr3L 27282408 3' - INE-1 532 1 42.66 TTTGTATTATTAAATTATTCTTATGTATGCCATATTCATTTAAAAATATAATTATTTGCTTACCGAAAGAATACCAAATCGATTAATGTTTGGCGATTTAAATAAGTTGCCATACTGATGAAGCCAAACCACCCAGAAAAGGGACA:1 + chr3R 23591749 3' - gypsy10 327 2 42.47 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAA:1 - chr2L 7660940 3' + I-element 5269 1 77.46 TAATCATTTTAAGTTTGAGTTTATCTTTGTAGAATATATAGATTGAGTAATCTTTGAACTCACCCACGCTTATTCGATCGTTTATATTCCCACCTAATTTATCCAGGTACTCAATGGGTTTTAACGGTGACATTCATCCTGCGGAT:1 - chr3L 17342719 3' + Gypsy6A_LTR 149 1 64.38 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTANNNNNNTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATA:1 + chr3L 20711714 3' - jockey 4805 1 47.95 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTA:2 - chr3R 15724289 3' + Juan 4167 1 50.00 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGA:1 + chr2L 10156182 3' - hopper 46 1 70.87 ATGAAATGTACATATATATCTAAGGGATAATGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTT:1 - chr3R 18971677 3' + Juan 4182 1 55.48 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACGGCTAA:1 - chr3L 12249769 3' - roo 16 2 70.90 AAGGTTGTGATTCAGCATACAGTTTCTAGAGACATAGACGCAGCACAAGGGCAACACCCACTTCATGAGGAAGATACCGCCGGGCGCGGAGGCCAGCAACATTCTCGTGGGCGAGGTTGATTTCCTGGAGCGCACCCTGTCCTGTT:1 - chr2L 7230950 3' + INE-1 174 1 73.29 GTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTATATAAGCGAAAGGATTCGCCATTTATTGGATTGCCCAGCACTGATTGAATTTACTGCGCAGTTGT:1 + chr2R 12702321 3' - roo 117 2 48.84 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGATAAGATATATAAGACCGCCAAAAGAATCTGCTTGTCTAGCTTTTAAAGTTCACGAGATACGGACATGGCAAGAT:1 + chrX 20373690 3' - 297 43 2 56.85 ATATGTACATATATATATATATATATATGTATGTTATTCATATTCATTCTTTGAAGATTGAGAAAATTCTTCTACTATAAAATATATATTTTTCAAAGGAATATTTTGTTAATAATGCTTCTGTTTTATTTTACAACCTTTTAAT:1 - chr3L 18240088 3' + G3 4507 1 35.17 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTGAAACTAGCGTAAATTTAAAAAGA:1 - chr2L 14074404 3' + 297 377 2 74.31 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTCGTGTATGGCAAAGAAATGTTATACCTACGGCACACAATACTACAAATTGATAGTGCTCATCCATTT:1 + chrX 20888401 3' - 297 6624 2 55.48 ATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGG:1 + chr3R 10736166 3' - McClintock 22 2 66.90 CAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGAAACCGATTCATACCACATCCACAATCTCAATTTCTGCCCTCACAACCCTTGACC:1 + chr3L 5294312 3' - roo 8625 1 63.01 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCG:1 + chr2R 7850013 3' + roo 327 2 71.23 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAAACCATGCAT:1 - chr3R 24450385 3' - 412 7068 2 70.37 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTT:1 - chr3R 19992627 3' - hopper 39 1 53.85 GGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCTATAAAATCTGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCCTTTGGCCGTGATTTTGTCTTCTTGCCTTTTTGTTATATGTATTTTTAAAGTCGCGTTCTGTTCGT:1 + chr3R 29258575 3' + roo 8944 2 47.95 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAA:1 - chr3R 4679454 3' + hopper2 1543 1 60.27 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGGAAATGCATTTTTATGCGC:1 + chr3R 10270710 3' + Juan 4199 1 76.71 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCA:1 - chr3R 19992652 3' - hopper 80 1 70.55 TACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAAT:1 + chr2R 21410959 3' - Burdock 71 2 66.44 AAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGAATACTGATGAATAGGGATATACCCTTCTGGATCCTTTGCAAGGACAGGGTATGAAAAAATTCACCG:1 + chr2R 991057 3' + G4 3501 1 54.11 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACGGCGAG:1 - chr3R 19992655 3' - hopper 83 1 72.60 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGGAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATAT:1 - chr2L 13556343 3' + transib2 2764 1 61.70 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCA:2 - chr3L 15913875 3' - jockey 4847 1 78.77 TTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAATAAGCAAGACATTTATTGAGGAAGACAAAAGGATTTATAGATTGGAATACATTGAT:1 - chr3L 27396124 3' + invader2 4634 1 60.96 ATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAA:1 - chr3R 29690710 3' - I-element 5266 1 62.33 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTA:1 - chr2L 21299296 3' + roo 351 2 60.69 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCAC:1 - chr3R 27405999 3' - diver 5956 2 75.63 CTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTTGCTGGCAGCGTGGAAAAAAGTCAACGAGGGAGTGAAATCACGCTTTAGAATCTCTTC:1 - chr3R 15292575 3' + F-element 4270 1 60.27 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAGGATGC:1 - chr3L 13294888 3' - roo 8730 2 64.14 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGG:4 - chr3L 14366520 3' + roo 357 2 55.48 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTATTAAAAGTTTTCAAT:1 - chr3R 20167550 3' + roo 9037 1 58.90 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTGTATTCGGGAATCCCAGTAATAATCATATTATTTA:1 - chr3L 22890319 3' - FB 26 1 65.75 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTCTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACAA:1 + chr3L 6964795 3' - P-element 76 1 27.07 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAACTCACGCATACGCCCCATTGAACCGC:1 - chrX 21216724 3' + roo 9021 2 61.24 TAAATAAATTGAATAAAACAAAAATTATTTTTGAATATTGTTAAAATCATCAATTCTAACCTTTTGCGTTTCTGCCTTTTAAATACAGTTTATCCTAATTATTATTTTAGAACAGCATTGATTGGAATTTCTGCTCGAAAACCTCT:1 - chr3R 25585325 3' + X-element 4718 1 39.04 ATCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGC:1 + chr3R 31653171 3' + roo 9016 2 56.16 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAG:1 + chr3L 11844830 3' - rover 6999 2 56.85 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGG:2 - chr3R 4679423 3' + hopper 1382 1 61.38 TTATACACACACACACACACATGCTCAAAGAATACCCCTCTATTTCCACTGTCTGCCAAAAGGAAAGAAAATTTT:1 + chr2L 1270767 3' + Quasimodo 37 2 82.67 TATTTATTTTTTTTATTATTATTATTTATTATTTTTTTT:1 + chr3L 16655204 3' - Rt1a 5073 1 84.62 TTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGA:1 + chr3L 22035692 3' - F-element 38 1 60.96 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAA:1 + chr2L 22674921 3' + mdg1 402 2 67.36 CATAATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAACTTCAGAAGGAACTGATCGATTCCCACATTACTAAAACAACACCCTTACAATTTCTAATCCTACCTAGAATCACGTCGCATTTGGTCAGTGAAAACGAGCAAACGTCAACTTTT:1 - chrX 19666873 3' + G5A 2770 1 61.64 GCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATAC:1 + chr3L 23940553 3' + Cr1a 4397 1 69.66 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAA:1 - chrX 8027422 3' + Juan 4150 1 61.64 ACTTATTATTAGTTCTTATAAACCTTGTTATTACTAATTACGTACGAAAACAGAACGGGGCTTAAAACCCTCAAAAAATATTCCTCCCATAGAATGTGGTCTCTAACCTTGAACAACCGTCAGGAAGGCGGACTAATCCATAGCCA:1 - chr3L 12185014 3' + F-element 4637 1 63.01 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAATTATGG:1 + chr3L 6447144 3' + transib2 2791 1 60.87 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCC:1 - chr3R 15724258 3' + Juan 4198 1 71.23 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATAT:1 - chrX 19054240 3' - jockey 61 1 53.42 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGTT:1 + chr2R 8735700 3' - mdg1 35 2 60.27 AGGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAA:1 + chr3L 23702270 3' - G4 48 1 50.00 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGCGATACATG:1 + chr3L 18403068 3' + P-element 2831 1 47.95 CGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATCATGAACAGCGGCTGAAAAACTTTAGTTCCTCTTATTGACTAACAGATACCCTGTGAAATTTCTATCAAATATGTTACATTTAGTTCGTTATTGTACTT:1 - chr3L 16689269 3' - I-element 4924 1 78.08 AAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGT:1 - chr2R 19199661 3' - hopper 57 1 58.22 ATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAACTCCGGAAGGTTAATTGGTAGTGGAACTGGTCAAGCAAACGGGCAAACAACTGACG:1 - chr2L 21191766 3' - G-element 4302 1 61.64 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCATTT:1 - chr2R 13168678 3' + P-element 2820 1 27.05 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACT:1 + chr2R 18529980 3' + jockey 4955 1 57.66 GCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGATCCACAAATTGACATTAATAAATGATAAAATGATTATAAGATATAAGGAAACTGTAACAATAC:1 + chr3R 10970339 3' - G-element 58 1 54.93 ATAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCC:1 - chr3R 17996202 3' - diver 90 2 79.86 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATATTTTA:1 + chr2R 330266 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.71 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTG:1 + chr3R 26504298 3' + HMS-Beagle 167 2 71.92 ATTATTATTATTATTGCCATTATCATTCAGTAGACTAATTTTGAAACCAAATTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAATCATAATTAACCCGTAGGTACAGCCTTAGTAATTGAGTTACGCCGTATTTAAATTTAATATT:1 + chrX 21452893 3' - mdg1 30 2 58.22 TTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACT:1 - chrX 20999484 3' + BS 5054 1 54.79 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCTACTGAGCTATAAGTTTAAGAAGTCACACAGTACCAA:1 - chr2L 16564478 3' - roo 57 2 63.01 CATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTTTATT:1 + chrX 20783463 3' - 1360 173 1 61.72 ATGGTATTTTTATTTTTTTTTACTTTTTTTATTTTTACTTTTTTTTCTTTCTGTGCAACTTGTTGCTGTTCCAGCTCGAATATGGCACAAATTCAATACTGGTAGATATTCCAATAACTATGTAAATCGACCTCCAATGGCCCACT:2 - chrX 11848638 3' - TART-C 414 2 69.18 AATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTTCTAAATCAAGTTAAAAAAGTTATTCGAATATCCTAACG:1 + chrX 2516133 3' + 1360 446 1 73.29 AGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCAGCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAATTCGCCATTTCACCCACTCACCCCAACTCACCACACCA:1 + chr2R 11450633 3' - R1A1-element 5107 1 63.96 CAGAAGTGTGGGCGTGGTAGTTATGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGCGGGGACATGGGTCAACAAAATCAGCGCTACTTATCAAAATTAGAACAGCAAATCTCGGCAAACAAATTAAATATAGTAAAGCAAACTTTCCCA:1 + chrX 18817700 3' - INE-1 247 1 55.48 AAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGTGTGTTTTTCTTTGTCTTTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTTTAATGGTAATGTTACATTATATTAGGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAATA:1 - chr3R 25504188 3' - 1360 2999 1 71.23 ATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGATTTAAGGCCGCCCATTAAATTGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTATTACTCGAATTTATCAAAATTTTCGCCAC:1 + chr3L 8014976 3' + P-element 53 1 63.01 GGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAG:1 + chrX 21639693 3' - gypsy5 87 2 76.71 CGTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGAC:1 - chrX 19539445 3' - pogo 25 1 55.48 TCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGA:1 + chr2L 18347400 3' + transib2 2784 1 56.12 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTGGCTCTTTGTCGT:1 - chr3R 19407853 3' - diver 5902 2 74.66 CACACACACACACATACATATTGTGTAAGATTGTAAAACATTTGTTTGTCTTCGATTGGCAATTATCAGCATTACACAGAAATATGAATGATTCAAGGA:1 - chrX 4015797 3' + Quasimodo 40 4 83.84 GTTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGTGGGTAAAATTATTTAA:1 - chrX 19539423 3' - pogo 3 1 69.18 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATA:2 - chr2L 4003670 3' - mdg1 7085 2 53.42 GTAGTTTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGGTCAAGTGTCCAGGTCTAAGCCAACTCCCTGTGGCTACGA:1 - chr2L 4754820 3' - Stalker4 2 4 64.38 TTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAA:1 + chr3R 21276624 3' + BS 5033 1 58.22 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTG:2 - chr3R 25616493 3' + roo 360 2 52.74 AGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACCTAGCTAGAAGAAATCCGAACCCGAAATTGAAATTTAATGTAGCATCATCGGTTGCAGCGGCAACGCAACATCTGCACGGCCATCATTTGCATACGTAT:1 - chr2R 19018165 3' - INE-1 576 1 56.16 TTTATTATTTTTATTATTTATTTATTTATTTATTATATTATTTATTATTTATTTATAAACTATTTTCAATACAGGTTCACAATTTGAAGAGCCCATAATAAAAAACAGATCGAATGTGAAAATAGATTTTCCCAGCACTCGGTGTC:1 - chr2L 15942713 3' - BS 5095 2 61.64 ACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAA:1 + chrX 3431979 3' + Ivk 5336 1 52.05 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGCGGGCGGGAGAAGTAAAAGTGGAAGAA:1 - chr3R 30270334 3' - jockey 4831 1 79.45 CCTAAGAGTCTTTGGCAAGCGAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 69 1 77.40 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTG:1 + chr3L 17183747 3' + diver 146 2 70.55 AGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGGACTGTTGAAATTGTCTTATTTTATGGCACATTGG:1 - chr3L 3502546 3' + Bari1 407 1 79.45 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTA:1 - chr3R 8051130 3' - jockey 4828 1 67.81 ATTGATCCTGGTCAAGAATATATTTACTTGGTATGGTTCCATCGTTTCCTTCTGCCTGTGACATACTTTCCAAAGAATCTAGTATACCCGGCAATGGCTAGTTCAAACTTAACTAACCATGGAGTTTT:1 + chr2L 3872127 3' - INE-1 83 1 87.50 AATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATTAGAACCAGG:2 - chr3L 21655832 3' + HMS-Beagle2 302 2 73.29 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAAC:1 - chr2L 7660895 3' + I-element 5310 1 52.05 GAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCAT:2 - chr2R 18316046 3' - HMS-Beagle2 76 2 67.81 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAATTCGTGGTGTGGCATACTTAAAAAAAAAA:1 + chrX 6116390 3' + transib2 2807 1 74.66 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTT:1 - chr3L 9809234 3' - 412 48 2 52.74 ATCTCAGTAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGAGATAAGACATATAGTTTCCAGAGACATAGACGCATCACCATTTTTCTTTGTTTTCGCTTGTGATTTTCATTAATTAACGAAGGGCCATAGCCGGTCATTCGATATACATATGTAA:1 - chr2R 5860511 3' + INE-1 151 1 56.16 ATTTCTTCGTTTGACTAGTGAAGAAAGGGCAGGATTAAGGCTGCAGGTGCAAGTTGACGAAGAGTAGTTGGCCGATCCTTGCCGCGTCCATCTTTAAATCATATCTTATATACATGTATATATCTAATGCCCAAGCGTTGTTTATT:1 - chr3L 25537997 3' - Chouto 6119 1 55.48 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATA:1 + chr2R 21410997 3' - Burdock 6169 2 62.33 ATTTCTTGGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCA:1 + chrX 13490759 3' + 297 344 2 58.90 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATT:1 - chr3R 23618127 3' + hopper 1352 1 60.96 TAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGCTTCGTGCTGTGTGGCCGGGCTGCTAGAGAAGGGCATCGCAAAATACGACAGTTTTATTAAAGATCTGCACATCAAGTTTAT:1 + chr2L 9652939 3' - Doc3-element 4676 1 59.59 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCATTTG:2 + chr3L 21656014 3' - HMS-Beagle2 6911 2 65.07 TGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAAT:1 - chr3R 11186512 3' + BS 5057 1 56.85 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGA:1 + chr3L 18931059 3' - I-element 57 1 55.56 CTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTTGGTTG:1 + chr2L 1923990 3' - G6 1990 2 69.23 AAGTTTATTACCGTGACAACTAATTTCACTTTATCCACTTTAGGATAAGAACGTATTTCATATTTTTTCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAGTCAGTGTAGATGACATCTGTTTGAA:1 + chr3R 2745084 3' - X-element 61 1 54.11 CATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGACATTAATTACTTATACCAAATTCTGATTTATCTATGCGCATTTCAAAGTTATACAGATACCGAATGACTAATTCGAAATCTAGCTGCTATAACGACATATAT:1 + chrX 13270933 3' + mdg1 31 11 71.03 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAATAAAGACGCGAATTAAATTGTAATT:4 - chr3L 5532886 3' + roo 9053 2 70.55 ACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTTTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGCTGTCTCATTCAGGTTTTCATGACTCAGGCCGAGGCGCTGACAAATC:1 - chr3L 7996354 3' + copia 4943 2 66.44 TTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGATGAGAAAGTCTCGTTGCTATAGTGTGTGTGCTCGTGTAAGTTGAAATCAACAGTTAAATGAGTTGACTAAGCACTCGAAATGAGCCATAGAGG:1 - chr2R 19107209 3' - F-element 4509 1 69.49 TTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTTCAAAATGTAGAAAAGGAAAATAATTTTCAATAGTTAAACT:1 + chr3R 5982260 3' + 1360 316 1 71.92 ATGATCTCTGAAGGTAAAATCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAACGCGCTGATGTTTGTCGAAAAGAACAGCAAGTCAAGATTTCTGTACGATAAATGTATTTAATATTTAATATTAAA:1 + chr3L 7305861 3' + Tc1 410 1 63.01 GAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTATTTACGTATGTTTCTCCCATCTTGACGTGCCATTCCCTTTCCTCGATTTCGTTTTGTTTTGTATATTATTGTGCGGTGTTTTTGTTCGTTACCCAGTAAG:1 - chr2L 2966523 3' - Idefix 7046 2 73.97 AAATTGATTATATAAAAAAAAATCAAATACAAATTTGACCGAAAGCTTCATTAATTCGTTTTTTGAGCTTTTAAAGGTTAGGTGTTAAACTGCTGTTTGTGTGAATCCAATTTCGGCTAAATTATTTGCTTATTTTTGGT:1 + chr3L 22519198 3' + transib2 88 2 78.57 ATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGGGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAA:1 + chrX 12657098 3' + Stalker4 160 6 77.08 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGC:1 + chr2L 12822845 3' + P-element 2795 1 22.60 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGT:2 - chr2R 8735563 3' + mdg1 370 2 56.16 TAAGTACCATATGTTGTCTCTCTAAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGAAATGATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTTCGACAAATTTAGAAA:1 + chr3R 21619592 3' + Tc1 105 1 58.74 AAATAATAAAATTTAAATTAAACAGTTATTTAAAAATTTAATTAATTACCTTGCTGTTAAAATTCTTTGTTCCTTTTCGTTTGGCTTAAATTCACCACGGTGCGAACCCGGTCC:1 + chrX 15001300 3' + 1360 3040 1 52.63 ACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGCCAGTAGTTGTAAAGGCGCTGTTATTTGGCACATTCTGTAAGGCCGTTAGAA:1 + chr3L 4298871 3' - BS 5021 1 56.91 TTTACTTATTAGGTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTTCACCT:1 + chr3R 27765167 3' - mdg1 82 2 71.92 TCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTTACAGGTAGGGTGGGGTTTTAAGTGGATGTGTGACACGAATAGCGATATTATTTGATTG:1 + chrX 2654427 3' + Circe 7109 1 69.66 GCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGGGAATATTTTGTCAAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAACCAACCAACCAACCAACAAGAACGACTTAACGGAGCTAGAAAAGCAGCCGA:1 + chr2L 13484519 3' - 1360 258 1 66.44 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTTCTGCAGGTCTCCGA:1 - chr3R 15790783 3' - roo 8664 1 75.86 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTC:1 + chr2R 4785334 3' + Juan 4163 1 49.32 TGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGGAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAA:1 - chr2R 4785211 3' - Juan 4063 1 58.22 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCAATTATGTTTTTATTGAAAGAAATTAAAATGGCTTAAGTAACGCTAGTCTGCCGCATCCTGCTTTGAATCTGGTCCTCGTTTCGGCCCACGTCCTGCC:1 + chr3L 1133953 3' - 3S18 5787 2 46.58 ATCACACACACACACATACATACCCATATCTATGTATACATATCTACTCCTCCACGTTGTGTTTCATGTTTTAAAAGGCTTGTCAATTCCCATTCGCAGCCAGTGGAACCCCGAGGCGGTAT:1 + chr2R 16064423 3' + Quasimodo 38 2 70.49 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTGCCAAGCCGCAGAATGCATTC:1 - chr3R 22642240 3' - blood 19 2 71.23 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGT:1 - chr3R 10270571 3' - Juan 4087 1 56.85 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGT:1 - chr3R 14980328 3' + roo 327 2 70.55 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCTCCGCCGAA:1 + chr2L 12822849 3' + P-element 2850 1 36.84 AAACAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAAGTCTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCAAAAACACAAAACTAAAATAAAAACAGAAAAAAAAGGAAGATTGACAACGAAGAGCAAACTTCTCGATGATAATGAAACTGCTGACGAT:1 - chr3R 8053443 3' - Cr1a 196 1 61.64 TGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCC:1 - chr3R 904964 3' - rover 73 2 80.14 ACAAAAAAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCTTGGCTTATTTTCCTGCTGACCCTGTTTTTGCCCCTGCG:1 + chr2L 2096306 3' + gypsy7 5005 1 75.36 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAGCCGG:1 - chrX 18336540 3' + mdg3 5481 2 73.24 ATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCAT:1 + chr2L 17005791 3' - Stalker2 75 2 67.81 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTC:1 - chr3R 11810635 3' - roo 62 2 63.01 ACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATACCCTTTTCCTCTATGAGTTATGGCCATAAACACATTCGTTGAAAATTCGTTGAAGAAGGGAGCGTTTTGAACCATATAAAGTCTATGTAATCG:1 - chr3L 25481453 3' + Cr1a 4285 1 62.33 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTC:1 - chrX 21216722 3' + roo 9018 2 61.19 GGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACG:1 - chr2L 22329007 3' + invader2 4720 1 59.71 TTTATAAACCTTTAATTTATTACTTGTAAACCTTTCCTCTAAGAGTCGCTGTACATCGCGTTGGATTCCCTTTACGATAAAAACGCTGAAGCGAAGAACTCGACCAGGAGCTCAGTTGGGAGTTCGACTTAAACCAGGAGCTCA:1 - chr3L 229114 3' - HeT-A 458 1 69.44 ATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATG:1 + chr4 829130 3' + INE-1 151 1 34.93 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAA:1 + chrX 8027496 3' - Juan 54 1 52.74 AACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTACTCGCTGGGTCGCAGACACCGGGGGCGTATAGCCTGGATTTTCGCCATGCGATTGTGCTAAGTCTGTTACTTAAAAG:1 - chr3L 22036174 3' - F-element 4598 1 53.42 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTA:1 - chr3L 2989920 3' + roo 9026 1 53.42 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCC:1 - chr3R 30347291 3' - P-element 41 1 59.59 AAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 5020 4 59.40 TTTATAATGTATGTACATATCTAGTATGTAGTGGCAAAAAGGAAGGGGATCCTAAGCACTGAAATGGGGTCTCCAAATATTCAGCAGGTACTTCCCCCCAAGCGGAAAGTCACCAACTCGACGCCCATTTTTCTAAAGGTCAGTG:1 + chr3L 1940046 3' - mariner2 814 1 79.31 TCTTCCGACAAACGAAGAATTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGAGCAGTGATAAAGTGAAAAACGGCAACGAGCCCGAGGAGTCGGAGGAATCATGCGGCGTGAGGAGCGAATGACAAATGGCTGTGCGAACCGAGAAT:1 - chr2L 11829137 3' - diver2 4750 2 69.18 GATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAG:1 + chr3R 24219381 3' + roo 9023 2 50.68 AATATGATAAAAAAAGATAATTACGTTTTTAAAGAAATATGTAATTTTATTTTATGATCGTATAACATGGTTTCTATGGTATTATACTAATTTAATAATCGCAGGAATATGGGGCACGACCCTTCTCAATGCATTTTAATCCGTCG:1 + chr2L 7285644 3' - 1360 3100 1 48.63 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCC:1 + chr3R 16157381 3' - pogo 31 1 51.85 ACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTTGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCACAGATATACCAGCAGGCAGTCCCAGTTCTCCGTGTTGATGCCTGACAATTCTGGCGGCGCCAAGCAG:1 + chr2L 10056977 3' - GATE 40 2 40.97 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATGGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCTCGCACTAAAACCATGCAG:1 + chr2L 16564620 3' + roo 404 1 74.31 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1 + chrY 311346 3' - 1360 61 1 75.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCTGCTGCTGCGTCACTTCACATTCGTATCATTTACATACGCAGCACTGCGGAGTGAGTCGCTGA:1 - chr3R 23067381 3' - roo 8677 2 73.97 TCATATTCCTACGAAATTGGCCAAAACTCCAAATATGTAAATTCGTTTTTGAATTGATTTCGGACCGAAATTCGTCTTCTAGCACAACTACACCAAAGATGCGATATGCAAAAAATAATCAAAATAAAAACACGTTACAATCTCTT:3 + chr2L 16309674 3' + 1360 3115 1 62.33 ATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGAAACACAAAACACTGTTAAAGCAATTATATTTAATATTTAGGAAATAAAGAGAAGAGCAG:1 + chr2R 15411898 3' + HeT-A 6000 1 57.24 AGACCACCGGACTCATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCTCACAAGCCTGCGAACCGATACCCTA:1 - chrX 21993567 3' + gtwin 7373 2 57.32 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTA:1 - chr2R 21116479 3' + mdg1 7400 2 61.38 GGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAAAACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTATCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGGAATTGCAGGAGAGGAAGAAGAAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCAGGAGCAAGGCGATCCG:1 - chr3R 27316153 3' - Dm88 4482 2 55.48 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGA:1 + chr3R 13300949 3' + roo 338 2 62.33 TATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTA:1 - chr2R 21116441 3' + mdg1 7458 2 56.00 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATGGCA:1 + chr2L 4713985 3' - transib2 36 1 60.96 GTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTT:1 + chr2L 20640302 3' + Stalker4 7214 4 61.17 AGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCGAACGAGCACTGCAGAGACCTGGTCATCCAACGGCGTGTCGGCGAATTCGCATGCTAAATTAAGCTGAAGAAGATGGCTATCAACACCACCAAC:1 + chr2L 4620329 3' - accord 25 2 69.66 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAA:2 + chr3L 22035698 3' - F-element 32 1 65.07 GCCAAAGAGAAAAGAAAACTGAATTATATTTGCACAATAAACTTGGCAGCCGCCGTCTCTCTATATTATTATTCTGCCAGTTGTTTGTTTGTAGTTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATG:1 + chr2L 15833008 3' + invader2 291 1 68.28 TTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCACTTGAGAGAGCATAAGCAACCATAAGAAAAGGACTAACACTGGCTG:1 + chrX 11702987 3' + invader3 5281 2 73.68 GTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATG:1 - chrX 15200843 3' - 17.6 59 1 65.75 ATCTTGAATTTGTTTTTCAATTGCACATTACTAATATACAAATGAGTTGAGCAAAGTACTTTCCATGTGAGCCCGTATGTGAATTTTTGTCAATTATTCACATTTATTTAACAAAATTTTTGAAGAACGTTTAAGATAATATATCC:1 + chr2R 23658963 3' + S-element 1578 2 67.81 TTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAG:1 - chr3L 24131421 3' - Transpac 86 2 78.62 GTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTGCTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGTGTTTGAGGTCCTGCGGCGCATATTAACATTATCAGCTGTGTGCTTTGCGATGTGTGC:1 + chr2R 20907731 3' - Tabor 366 2 58.90 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAA:1 - chr2R 22034663 3' + copia 181 2 70.55 AGTTTGGGTGGCGCGAATAGTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGAGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGG:1 + chr3R 10736102 3' - McClintock 5992 2 70.41 TTCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAGCTGGGAGTTGAGCTACTT:1 - chr2R 17926249 3' + opus 496 2 80.00 ACACACACACACACACAAATTGTGACAAGGTCTCTAAGGATGAGTCGATTTGTGTGTCT:1 + chr3L 13001755 3' + accord 7031 2 86.44 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCTTTTCAAATTT:1 - chrX 12986492 3' + roo 387 2 69.18 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTA:1 - chr2L 20265934 3' + roo 351 2 58.22 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGGTGCAATCGGATTTTG:1 + chr2R 14051905 3' - roo 4 2 78.32 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTACATTCGTCGTATTTTCGTACTGTACTTTAATGTTGAAATCCGAATATAAATTTAGTGACCAAGTACACTAA:1 + chr2R 21926495 3' - opus 7158 4 52.05 CATATGTTGCCTCTTTGAGCAATAAATTTTTAGTCTCTCAATTTAACGGTTCTTTTTGTTTTTTCAGGTTTACATGATGGTCATACAAGTTATTGCTCCAAGTTAAATTATCTTGAATGGAACGGATAATAAAAATTGCAAGAA:1 - chr4 1023604 3' + Tc1 112 1 61.81 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACAC:1 + chr2L 16943867 3' + copia 5067 2 78.08 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGGCAGGCAAAGTG:1 - chrX 8437660 3' + P-element 2820 1 39.04 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTACTATTTGCCTACAAATCGTAAATTCAAATAATAAACTCCTTTTAAGACGTAAAAAAGTATACAAGTGATTTTTATATTGATA:2 - chrX 17716980 3' - FB 40 1 54.11 CGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCAT:2 + chr2R 2318248 3' - ZAM 8014 2 51.37 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCG:1 + chr3L 18403041 3' + P-element 2805 1 29.66 AGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGGGTATCGTGGCTTAAATAGTTTGGTAAATCATTTGATAATAATTCTACTATGACTAAAGCAAGACG:1 + chr3R 32046905 3' + R1A1-element 4918 1 60.00 AATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAA:4 - chr2L 7618445 3' + X-element 4667 1 50.68 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATCTTTAG:1 - chr2R 21410836 3' + Burdock 224 2 61.64 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTA:2 + chrX 11661486 3' - pogo 69 1 68.49 AAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTTCGACATATACAAGATTCCGACGATAACTACAAATATTAATTACTTCGCTCACAGAACCTGTTCCAAGTTGT:1 - chr2L 21656595 3' - invader1 3657 2 55.86 GTAACTGTAGCACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGTCAGCGGCACCAGAGACCAACAAAATCTATCCGCAGTTGCTGTTGCGCATTGGCGGAGAAATTGC:1 - chrX 3472799 3' + Doc 484 1 54.62 CATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTTGCCGAATGGCCAGGAGGAGCGGGAATGGCAGGGGCCAGGTACAAGAA:2 - chr3L 13625744 3' - I-element 256 1 67.12 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCCCCCGCAGCTGGGTGGCTTGGTTAACGCAACAATTTAACACAAAACCAA:1 + chr2L 15013972 3' - jockey 4751 1 61.11 GTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAAATGCGAAACACTAAATAATTGTGACATTGTTTTCCTCGACGGCAGTTGC:1 + chrX 19734597 3' - roo 9030 1 66.44 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACG:1 - chr3L 17055400 3' - Tirant 8116 2 75.61 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTTCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAA:1 + chr3R 19032669 3' + roo 320 2 80.56 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTA:1 - chr2R 3338778 3' - Juan 53 1 53.10 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATT:2 - chr2R 22034610 3' + copia 234 1 70.55 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAATTAGAAATATC:1 - chr2L 17180028 3' + Juan 4199 1 73.97 ATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGGACAGAGAGAAAAATG:1 - chr3R 3851027 3' - transib2 74 1 66.44 AAACAAAAAATCGTCTCAAAATAAAAAAAAATGGCTTTGTTGAAAGATGTCATCAATCTTTTAGATGCACCAAATGTGAAACCTATTAATAATGAACATTTTTGGGAAGCGGTTCTGACTCCCGGATCAACTTACAATATTCAAGC:1 + chr4 913825 3' + transib3 2433 1 76.03 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAATTTTCTAAA:1 + chr2L 12251034 3' - 412 20 2 67.81 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATTGC:1 + chrX 8437779 3' - P-element 34 1 61.64 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGC:2 - chr2R 20010178 3' + Juan 4171 1 54.79 AAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCGTGGCAACGCCTGGAATAATTGTAGCATTGTTTGCCAGCGCTTTTT:1 + chr2R 12780718 3' + I-element 141 1 59.49 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTC:2 - chrX 13134909 3' - jockey 4842 1 71.92 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTACACGATAAT:1 - chr3R 19073129 3' - roo 6 2 75.86 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCAAAACAATTCGCAGAATTAACAAATTCTACCAATTTGATACAT:1 - chrX 20888296 3' + 297 6903 2 73.29 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGG:1 - chrX 10319599 3' - mdg1 54 2 55.48 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTCATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAG:1 - chrX 15200801 3' - 17.6 6954 1 63.70 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAGGATGCGAGACAAGCTTGTGGTG:1 - chr3L 13294871 3' - roo 8683 2 63.48 GTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTATAT:1 + chr2R 12253306 3' - BS 4692 1 68.64 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTAGTTTTAATTAAACTTT:3 + chr2L 71300 3' - 412 32 2 63.70 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAATTTCATTTCGCTATATATATACTATATGTATATATATATATATATATATATATATATATGACATGTATGCCCCATTCATGCACACACTTTTTCATGG:1 - chr2R 18752613 3' - jockey 4788 1 71.19 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAGATC:1 + chr2L 22170091 3' + Juan 4197 1 68.49 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCA:1 + chr3R 19992732 3' + hopper 1352 1 59.59 CAAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAG:1 + chrX 15946778 3' - INE-1 578 1 52.05 AATCCATATATATATATATTTGTATATCTATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGATCGCTTTCTTTGCGCAAACGTGATGGGGAAGATGTTCTATAGAG:1 + chr2L 22124213 3' - G3 4512 1 63.55 AGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAACTGGCGAAAAGAACACCAAGAAGCAAAGAACCAAAACAACAGCA:1 + chr3R 21653534 3' + jockey 4911 1 69.86 TAAAATTTTAAATTTATAACAATAATTGTGTATTTTTTTTGCACTTTATAAACAATTTTTTCATTTACTTAACCAGTTTTTAAATATATCTTCGAAATGGATAGTGTTGTATAGGTTGACTTACCTAAAACGAAAGAAAATTGGAA:1 + chr3L 5255011 3' + 1360 3058 1 81.51 TTTAACAATTTAAAGTATTTTTAGCATTTGTGTGTATCCTACATTTTTGGTTGTCTAAAAATATATTTTAATATATTTTATTGCCTTAGAGACTTATGTACCTCTTAAGTTTTAACATAAGTTATCTCAACATATCTTTTATGTTT:1 + chr3L 9873180 3' - HeT-A 5811 1 69.18 AGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAAAAAAAATCCGAAAGCGAAA:1 + chr2L 19859003 3' + F-element 79 1 93.48 TGTTGTCCCTTTAATACCGGAAAAATATAAGTCGTCTTACTAAAATATTTTTACTTCAAAAGTATTTATATATCACAGATTTCCTCTATATCTAAGCAATAATTAAATCTGAAATCTTGGCATTGATTAAGCTTTCATTTAGGTAC:1 - chr3L 21110239 3' - Transib-N1_DM 174 1 67.81 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGACATTATTGTGA:1 + chr2L 11357915 3' + blood 7320 1 63.70 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGC:1 - chr3R 15790814 3' - roo 8696 2 54.11 ATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAAAAATAAATAAAACTTAATACGATATTGACTTTAATTAAAGCCGTTAATAAACATCTATCATCGCACAAAGACCTGCGGATCCCT:1 + chr3L 10965400 3' + Doc2-element 4724 1 76.71 AATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACATT:1 + chr2L 22224622 3' + Rt1c 5416 1 65.07 AAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTATACAAATTTGTGGGTGTGTCGGTTTGACGTTGAGTGCCCAGACCAGAGGCTCCAAAACTGTAAG:1 + chr2R 18777601 3' - I-element 5140 1 52.71 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAAATGAGCAAAAAGTGAACAAAAAGTGAAAAGTAAGAAAAAGTGAGTGTTTGAAA:1 + chr3L 10858452 3' + hopper 1391 1 40.88 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGTTCCACCGAGTTG:1 + chr2R 8157317 3' - mdg1 18 2 73.29 ACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATAT:1 - chr3R 19992639 3' - hopper 67 1 61.64 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATT:4 - chrX 19074728 3' - mdg1 24 2 65.07 ATTTTAGTTATTTAAGCATTTACCACAAGCCAGTCCAGCGCAATCGCAATCGCCAGCGGAGTAGGAATAGGAATCCGACTTGGACTCGGGTCCACCATTATCACACATCGCATCCTAATTGCCAGCGTAGCTGGGACAGGGAAGTG:1 + chr3R 28314919 3' - HeT-A 31 1 72.60 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGCGAAAAGCATGACTCATAGAAGAC:1 + chr3R 13973051 3' + 412 433 2 57.53 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAATTCGTGGTGTGGCATACTTA:1 + chrX 6116381 3' + transib2 2798 1 68.49 CAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAAT:1 - chr3L 24039755 3' - gypsy6 7599 2 51.37 CGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 48 1 70.55 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGATAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCG:1 + chr3R 28469280 3' + 412 7478 2 76.52 ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAA:1 + chrX 21087665 3' + mdg3 5481 2 54.74 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATG:1 + chrX 8092505 3' - pogo 44 1 54.11 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACA:1 + chr3R 4964193 3' - roo 63 2 65.75 ACACACACACACACACACATATGAAACTCAAAAAGAACAATGATGAGAGTGGGCCAGACCAAGAAAGGCG:1 - chr3R 26582029 3' + accord 7029 4 62.86 CAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAGATACACAAAAAGACCCCCAAAAACCCACGAAGGCGAACAGAGCCAGAAACTCAAGTATCACTTATCAGTTGCGGCTGGGA:1 + chr3L 1968157 3' + Stalker4 62 4 55.28 TTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTA:1 + chr3R 21276617 3' + BS 5026 1 61.64 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAACATTTTGCTATTTTGCTAAATTGATTTAGATTCGATTAATTAAAACTAGGGTTCG:1 + chr3L 14094706 3' - I-element 22 1 66.67 AGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGCCAGAAATTCGTTTGACGTCACATGAAATTCGGGTTAATTTTACAATTGAAAAGAGGAAGGGTCGGGG:1 - chr2R 18014017 3' + R1A1-element 225 1 54.55 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTT:1 + chr3R 21933224 3' - pogo 79 1 73.29 TAATAATAAAAGTAATAATAATAATATCTAATGACTTGACCTTACCTCATCCTTATCGTTATCTCGGCGCATGTCCGCCTGCACGCGGTAACTGTAATTGTCATTATGCCCCCGGGCAGTCAGCC:1 + chr2R 13614558 3' + mdg1 7080 6 64.00 AATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATA:1 - chr3R 14505309 3' + F-element 4593 1 74.83 GTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTT:2 + chrX 12129396 3' + flea 4942 1 67.12 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGTTCCAAGTGTGGGAAATTTTCGGAGAAAGGCCC:2 - 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chr3L 21522604 3' - 1360 3211 1 63.45 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGGGCATTTG:1 + chrX 9530408 3' - 297 34 2 59.82 AATACACATATATATGTATATATATATATATAGATGGATTTTGGTCAAGCTAGTAAACGTTTTTTGGATGACTACTTATCTTTCCTAATTATACATCTGACAGAAAGAGAGATTAAATCGAATTGACGTCTTTTCCACA:1 + chr3L 9865896 3' + Stalker2 7499 2 64.75 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCC:1 + chr3L 16973494 3' - S-element 31 2 62.33 ACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTTGGGATTATTTTTGG:1 + chr2L 11357893 3' + blood 7298 2 80.14 TAAATAATTTAAATTAAAAAAATTAGCTTTTTTTTATTATTCACTATCATGCAAATGTCGGATCTCAGATGACGACGAATCTTCGCACGGCGTTCACATTACAAAGATGGGAAAC:1 + chr2R 16111766 3' + Doc 4689 2 75.65 GAGAATTATAATAGTTGATGTAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTAC:1 - chr3L 15913882 3' - jockey 4854 1 82.19 GTGGCGGGGCTTCTGCCGGAGCTAAGAGAGCGGG:1 + chr3L 13970417 3' - F-element 396 1 88.24 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCC:1 + chr3L 16973450 3' - S-element 74 1 71.03 TTATTATTATTATTATTATTATTATTAAGTTATCCTATCTAATTTTAACGGATCGGTGACCTTTGACACAAAGAAACATCATCTCGTCGGTTTCTTTGTGGTGCAATTC:1 - chr3R 1715457 3' - mdg1 7067 8 65.14 GAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTTCTTGAATAAGTCTAAAATGTAATCTCTTTGATTTTA:1 - chr2L 5619672 3' - 17.6 7143 2 77.40 ATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGTTAATACGCCAACATCTGGAAGAACTTCCGCATATTTCATTTTCAATTTCAAATTCGGAGAACAAAAAACATGCCCACTCATCGTGCACAAATAAATTAATAATAATAAAGTATTGAA:1 - chrX 19172287 3' + R2-element 3255 1 65.75 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTA:1 - chrX 19539467 3' - pogo 47 1 52.74 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCCCAAAAATGACATAGCCACTATTTAGATAGGCTAAAAACAATAGCACTAAATAAATTAAA:1 + chr2R 6965632 3' - Transpac 14 2 75.86 AAGACTCTAGAGTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTATTTACATGGAACTTATTAGGCGTCTAAAACTATCTTAAGCTTACGATCTTAAAGCTTGAGTTATATAAACGGTTATACAGTGTCAAAATCTAAGTTATTAATTCC:1 + chr3L 5391779 3' + 1360 3 2 65.75 GAGAACATAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGGGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAA:1 + chr3L 10590622 3' - 1360 3280 1 65.22 ATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGGCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGGTCAAGTGTTCAGGTCTAAGC:1 - chr2L 4754839 3' - Stalker4 6976 4 50.34 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATTGCCTTATAAATTCATTCA:1 + chr2L 20266080 3' - roo 20 2 70.55 ATATATGTACATATGTACATATATCTATACCTATATAGATATATGTATGTATATATTTTGATATATGTTGAGATATGTGAGCGCATATATGGTCATATGCATGTATGTGTATATTTGTGCAATTTATACACCTGACCCTGTCGCC:2 - chrX 13979921 3' - G3 4507 1 65.52 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCG:1 + chrX 7795593 3' + roo 8998 2 71.94 TATAATTTTAAAGCTTTTTAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTGAACATCATTGCCTAAAAATATTTTATGACCAAAATATTTTTAGGCAATGATGTTCAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATTTTTAATT:1 - chr3R 25540938 3' - 1360 3018 1 29.20 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTTGCCATTTAT:2 - chr3L 5389832 3' + roo 9042 1 65.75 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTACGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAA:1 - chr2L 14874136 3' + copia 257 1 36.99 GAAAGGCAGTACAGAGATTTTGCTCTGTGCCACCAGCTGTGTCATCGAGACGAGGGCGTCGTTCAGGAGCTTCTCCTTGCCCCGGCGCAGGAAGTGATCGATCTCCTCCTGCCGCTTGGCCAGCACCGGACGCAGGATGG:1 - chr2R 23805207 3' - 3S18 5715 1 90.00 CCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAGTTAATAATTTAACACTTC:1 + chr2L 15076233 3' - 1360 33 1 63.01 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCT:1 + chr3R 16630369 3' - FB 30 1 58.54 CAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTC:2 - chr3R 19450036 3' - roo 8625 1 70.55 AAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTTCGAGTCTTGAAATCGTGTTAATCGGGTTTTGTTGATTACA:1 - chr3L 2545845 3' - I-element 5013 1 76.71 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTT:2 - chr3R 31886822 3' - hopper 44 1 56.85 GAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCCATAAGGATCTTGGTCATATTTGGCTTGAATATCATAAAAGATCAACAACTGTTTTCGGCGATAGATAATGTTGTGGGAG:1 - chr2L 9646669 3' - F-element 4219 1 55.48 AGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATT:1 + chr3L 22035700 3' - F-element 30 1 66.44 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTT:1 - chr2L 4003661 3' - mdg1 7076 2 58.22 GATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGGGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCG:1 + chr2R 2318196 3' - ZAM 8013 2 77.42 TAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATTTGGCAACTGCAACTGCAACAAAGCGAA:1 - chr2R 15004698 3' + Tc1-2 479 2 52.74 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTACGCCGAGCGATCTGTTTGGCTACTGAAAATCGAGTGAATAACGGTAACTT:1 + chr2R 6482558 3' - gypsy 36 2 59.59 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATC:1 + chr2L 71267 3' - 412 65 2 60.96 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACCGACTACCGAGTGCCGAACAGATAATACAA:1 - chr3R 11469259 3' - Tabor 11 2 78.01 AACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAAAAGCTAAATACACACCTTTGTGCAAAGGATTTAAATTAAGCAGAGGTGAAGCTTGGTTCATTAGCTGTCATAATCACTTTAGCGTGGGGAAAT:1 - chr3R 1706097 3' + diver2 4855 2 48.63 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGTTATTCCATGTTGC:1 + chr3R 24369154 3' - roo 16 2 71.09 AAACCTTAAAAATATATTATTAAAAAAAAAATCAAGAAAAACAGGCGCTGAAGAAAGAAAAGCATCCCGAGGCGAATGT:1 - chr2L 12984414 3' - hopper 170 1 65.82 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAAAAGCAGGCAGCGCGAAAATCGTCCAAAAAATTGAGCACA:1 + chr3L 21763796 3' - jockey 29 1 62.60 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAAT:3 + chr3L 13836707 3' - 412 7117 2 60.96 AAAAAACATTAATAACATTTAATAAAATGTTATGCATAAACCTATGTTATGTCATCACTATTTGTTTCTCAGTGCACGTAGAAAAGAAAGGAGCAGGATCCGTCCAGTAACCAC:1 + chr3L 13223641 3' - transib4 483 1 52.63 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGGGGGAAGGCCAGCTCGATAA:1 + chr2R 22034736 3' - copia 4944 2 67.12 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAATAAAAATAGCCCCTTCCCGGATATTATTTGTTTT:1 - chr3R 10145646 3' + Juan 4150 1 73.91 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAACGAAA:1 - chr2L 11839649 3' - mdg1 68 2 64.38 CACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGACACAAACAAGC:1 - chr3R 17996119 3' - diver 9 2 77.30 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGTTGTATCTTATCTGG:1 - chr3L 2544597 3' - Tirant 30 2 61.36 GCTACTTTTCAGTTGATAGGTGTAGTAGTTTTTGTTGTTTTCGTTTAAGTATTTGCAAGGGTCCTAAAGCTCTCTTCGGTTTTTACTTGCTTCTTTTTTTTGGGGGGGTTTTGTGTGCCAGCATCGTGCCTATTTTTCAGATTTTT:1 + chrX 15282507 3' - Fw3 166 1 59.59 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAG:1 + chr2R 3563197 3' - Transpac 52 2 50.34 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGCGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATTATGTATT:1 + chr3R 19408022 3' + diver 185 2 55.48 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACTGTTTTATAGATGCAGTTCGCCGCTTTATCTGGCTTTAGAGGCTGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCAGGGCCACCTTCCTTTGCA:1 - chr3R 19449295 3' + roo 399 1 68.49 ATGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCTTATT:1 - chr3R 15724253 3' + Juan 4203 1 74.66 ACCTTATATAGTAACAAAGGTCTTCAACAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACTGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTGAACTCCTTCAATTTTATCCTTCGATAAGCTGAGAACCCTTCTTTACCAC:1 + chr2R 4676059 3' + Bica 4740 1 65.75 GTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACGCGTTAAAGACGATGTTATTGCCACC:1 - chr2L 22328982 3' + invader2 4738 1 52.05 AACGGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTAATTATCAATACTTTACTTCTTTATTTGACTGTACTATGGCTAGGCATTTATTTGCTTTACAATTTTGTTAATTTTC:1 - chrX 9622124 3' - Tc1-2 125 1 69.84 GAGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCAC:1 - chrX 21639612 3' + gypsy5 354 2 54.79 ATTTAGAAGCGATGAATAAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCAGATT:1 - chr3L 13365767 3' - BS 5076 1 70.55 ATATTTTATATATATTATATATTTATATATAATAGTGCTTGAAATATACTTTTAACATTGAATATAAATTCAAAAAAATTCGTAAAGCCTTTATTAAGAACTCAAAGCAACTCCTTACTTCCATCTAAAAGGACAAGAATTACCTG:1 + chrX 7529662 3' - transib1 1922 1 71.23 AATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTTTTGGTTTTTAGTTTTGGACAAGGACATTTTGATTATTTTTGTGGTGTTTGGTT:1 + chr3R 8835870 3' - I-element 221 1 63.01 ATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATATTTCATTACACGAGCTTCAAGATACTGCAGGGAAAGCGGGAAAAAAGGAAGCGG:1 + chr2L 4063978 3' - roo 8683 2 71.23 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCAATCTCTCCGTCATT:1 + chr3R 15791049 3' + roo 393 1 74.13 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGAAATACTTGAGTTTTTAG:1 + chr3R 4805735 3' - 1360 29 1 65.52 ATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGTCGGAAGTTCAGATCGCCAAACCAGAAGACATAGTCGTGATCGTAGATCTCCCTATACCGCTTGACGTGGTAGTGATGGTTCTCCAGTATCTGCTTGTAG:1 + chrX 16597649 3' - G2 2943 1 72.60 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTA:7 - chr3L 19454909 3' - mdg1 7083 2 54.79 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTA:1 - chrX 6475319 3' - Doc 88 1 73.97 CTGCTATTTTTATGAACACAGCTATACGTCTAGTGTTAAAATTGCAAAATAATATAGTAGTACAATTCTGAATTTAAAACTACGCTACAATGTTTTCGATTTTTTCATCCTGTTTGCCCTACGCCTTTGTGTTTTCCTTGTCCTAA:1 - chr3R 28089979 3' - HB 8 1 54.79 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATCGGATAGGTTCAGGGCGTTGCCCAATGAACACCTAACCCTTACCCCTGTCCACGGGATGCATGTAACAAGTAACGCAACCGTTAATTTCTT:1 + chr2R 11795100 3' - opus 23 2 69.86 ATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATGGATGGATATCTAAACTAAAGCATCTGGCGGGCGCCCAGTTAACCAGCCCCCTTC:1 + chr2L 10945041 3' - Dm88 4448 2 56.00 AATGAACATTTTAGTAGATTTTATTTGTATTACTGTTAGATAAGCCATATACCCCAGAAAAACTCACACACAGACACACACAGATACACACACAGATACACCGAGAGCTTGACAGGAATTGGGCAGCAGCCGC:1 + chr2L 7905466 3' - Burdock 254 2 60.90 ATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATCCGGTTATCCAAAAATAAGCTCAAGCGAAAGGCCGAGAAAGGGAAATCTCCAGAGAAGAATCCACTGAGTACGAA:1 - chr3L 9718028 3' + 297 484 1 58.90 AGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTC:1 + chrX 10167477 3' + roo 9019 2 52.41 ATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATATT:1 - chr2L 7581861 3' - I-element 5134 1 66.44 ATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGCATTCAGTTGAGGCCATAAAATTGGTTGCCTCTCAAACGGATTGAGAGGCATGTATTTGCGGCATTTTGGATA:1 + chr3R 24672753 3' - invader2 233 2 52.74 CATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACGTAATACTCTTTAAGTGGTCATTGAAAGTGCCATAGAAGCCGGAGGGAGGATGGACTTGCCACTGCCCTGGAGCAGTTAAGCCGATAGTTTATGGAC:1 - chr3L 4509377 3' - Cr1a 4217 1 65.44 CATTCACACACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCAAAACCAAAAACAAGAACAAAGACAAAAACAAAGGGGCAGTAAAACCATTTGCATACTTTTGTGTTTGTATATATGGGGGCGTGTAAACAGCCCCTTTTCGGTGT:1 - chr3R 5897932 3' + Porto1 284 1 73.29 ACTATAATAGACTTTAGCCTATTATCTTTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGC:2 + chr3L 19471446 3' + Cr1a 4206 1 76.71 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGCATG:1 - chr2R 18315991 3' - HMS-Beagle2 6890 2 77.27 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCGGTTGCCATTCGGCTGGGGCC:1 + chrX 959111 3' - 412 37 2 58.27 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAA:1 - chr3R 20441259 3' + I-element 5268 1 76.03 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGGCTCCTCCTGCACTTGGGAGTGGAGGATGATTGAAAAAAGAGA:2 + chr2L 6161056 3' + I-element 5313 1 57.53 CTGTAGCTCAATTTTTATATTTTATGCCGAAAGCAATAATGCGAATTGTCTTATACATTGGGGTGAAAATGTTGTTGCTGTATTTCCTCGTCTT:1 + chr3R 23491578 3' + transib2 2790 1 70.21 GTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAAGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAAAAAT:1 - chr2L 23373383 3' - Tc1-2 20 1 63.70 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATCCTCTACAGAT:1 + chr2R 6885631 3' - P-element 33 1 63.01 GGGGAACTCGACTATAGCAATCTCTCTTGTTAATATTGATTTATTAATAAACTATATCCTAATTTAAAAGGGGCATTAAAGAAATTTCCAAAAAAAATATATATATGGTATCTTGTTTAAGTACTGGATAATAAGTAGGCGATAAT:2 + chrX 15835993 3' + INE-1 571 1 88.36 TTAATAAAATGTTTTCAAATCTTTAGGCTAGCTTTTCAAGCTGACATATATTATAATATAATTGAACACAAAGAACACATGATATAAATCTTAATTAAAGATTAACAATCCAGTTTACATTTATTTAGGAAAATGTTACTATCAGC:1 + chrX 17678210 3' - TART-C 395 1 58.90 CTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAA:1 - chr3L 21576900 3' + G6 1960 1 61.94 TTGTTTTTGTTTTTTTTTAAAAAAAAGTTTAATAGTTGTTTACAAGCTGATAGTGATGAGCAAATGTATATTTGAGAGGTAAAAAGAGGTTACATTGTTTACAAATTTACGTATATGCTGGTAACAAATAAGAATGAGGATTGTAG:1 + chr3L 9094494 3' - transib2 2637 1 65.75 CGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACGCATTGCCACAAATATTCGACATGACTATGTGTGTGTGGGTGTGGGTATGTGTGGGTGTGTGTGGTGCCATTATGATTACTCATACGCTGCGTTTGCAGCAATCATACGGCACGTTATTA:1 + chr3R 28411636 3' - I-element 5282 1 85.62 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCA:1 - chr2R 11159252 3' - roo 8727 2 63.01 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGTCGGCTTCATCAATTACGTATCTTCTGCT:1 - chr3R 23618134 3' + hopper 1364 1 60.63 CATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATG:1 + chr3L 16212815 3' - transib2 131 1 66.90 ATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTATTTTTCCAAACTTCTAACCATGTAGTCGAATTCCGTACTACCCATAGTGACTGTGTG:1 + chr3R 31537664 3' + 3S18 64 2 70.92 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACG:2 + chr2L 16943870 3' + copia 201 2 76.03 GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACT:2 - chr3L 21655903 3' + HMS-Beagle2 231 2 73.29 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATTATACAAA:1 - chr2R 20010148 3' + Juan 4201 1 73.97 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTC:1 - chr3L 9809264 3' - 412 71 2 70.50 TGACAAATAAATGGTTTAGAATTAAAGAATAGAAAATGCAATATTACTAATGCCACT:1 + chr3L 11046482 3' + HeT-A 121 1 54.39 GAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAG:1 - chr3R 11186565 3' + BS 5004 1 75.34 AAAACGTCTGTCCCTCTGGGAACACCTTAGATTCTCCTCCGTGAATATAACTGCGAAACTGAATAAAACTGCGAAAAATGTACGGAATGAGGGTTTCACCAGGGCATCCGTCCAATCAAGTGGTCCGCCGCCAATGCCGGGTATGC:1 + chr3L 2596616 3' + baggins 5007 1 60.96 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACA:1 - chr2L 13556331 3' + transib2 2771 1 54.79 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTT:1 - chr3R 15724318 3' + Juan 4144 1 66.43 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAAT:1 + chr4 373057 3' - pogo 61 1 61.64 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGATAGCGCGGTACAGTGGGGCAGGCCAAACTAGAACCTATACATTTAAGATGTCTCCAATTT:1 - chr3R 5216126 3' - FB 61 1 57.53 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCT:1 - chr3R 11191393 3' + roo 9037 1 54.62 ATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCTCTTTTGTAATTTGGCTAATTTAATGCTACATTCGGCACACAAAATAG:2 + chr3R 11083398 3' + I-element 4968 1 67.12 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACTTCCAGCGCAGCAATACTGCTGGCGCCTC:1 + chr3R 13875147 3' - P-element 4 2 71.88 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCCGCAAGGGGTTGGTTGT:1 - chr2R 8099106 3' - jockey 4787 1 64.38 ATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGATTTATCAGATACGACTGTCACTGGATCTCCCTGTTTAAATAGACAGCGCAAACAATGGCTTTCGTTTGTATCTTGGCTCGGATTCG:1 + chr3R 23519884 3' - P-element 2846 1 63.31 AGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACCGCACCTTTCCGTTTGAAATATATTATTAAT:1 - chr3R 19449828 3' + roo 8974 2 68.46 AGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAACAAAATAATTGGCTTTCATTTAACCTCGACCTTCAAAGTGTGTGAATCACTTAGTGAGTTCAACTAGTTAGTTCGATTACTTACCACATGCAGCAAGCAACTGAAAAGTG:1 + chr2R 19523050 3' - I-element 5050 1 74.66 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGCAAAGGAAGCGTCAGGTGACGAGCCAAAAACCGAAGGCCAGGTCTTTCAGTGTGG:1 + chr3R 25339283 3' + Juan 4171 1 45.89 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCG:1 + chr2R 2427613 3' - Doc 69 1 65.75 TCCAACAAGCATGGTTAGAGGAACCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACAACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTTCACTTTATTTTTGGAGGCAACGACAAAGGGCAGGACTTAATGCCATATATGCAAAT:1 - chr3L 20857407 3' - R1A1-element 4885 1 58.22 CTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTC:1 - chr3R 10270562 3' - Juan 4078 1 50.68 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAATCGGGAGTGGTGACGACT:1 + chr2R 19941654 3' - hopper 41 1 57.24 TTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGAT:1 - chr3L 24757198 3' + Cr1a 4256 1 53.42 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCACCGG:1 + chr3R 11937425 3' + flea 4976 2 62.07 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTA:2 + chrX 20455702 3' - hobo 79 1 71.92 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAATAAATGTATCTTACATGTAATATATAAGATATAAAGTGATTTCACAAATTTAAGTTTGTTCAACGAAA:1 - chr2L 14523116 3' + HMS-Beagle2 7145 2 52.05 ATTATTTTATTTTATTTATTTATTTATAATTATACAACTATATTGTTTGTAGAAAATCATTGCAATATTGAAAACTTTCAACCAATACTAATTGCATTTTATTATGTTAAAAGTGAGGAAAAGTCCCAATCAGCCCGACCAAAATG:1 - chr2R 18513728 3' - G7 1148 1 78.08 AAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACA:1 - chr2L 7618460 3' + X-element 4653 1 60.69 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGAT:1 - chr3L 21996145 3' - Transpac 48 2 57.53 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATCGGAGTTCATCAATACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAAT:1 - chr3L 13836638 3' + 412 428 2 72.13 ATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCG:1 - chr3L 16973340 3' - S-element 1558 2 56.16 AATTGTTTTATTTTTTTTAATTTCAATACTCATTAAACATACTTAATATTATTTGTAGCCTTGAAAAAAACCTTTTCTTAGAGGTGATACCTCTCATATTGACATACAAATGTATGCACATCGTGTGTCTATTTATAATTAGACGC:1 - chr3L 18138693 3' - HB 321 1 42.47 TACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGA:1 + chrX 3431978 3' + Ivk 5335 1 51.37 AAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTCGACCATTCCCTTTTT:1 - chr2R 1320631 3' + diver2 365 1 78.20 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCG:1 - chr3R 12242277 3' - transib2 83 1 76.71 GTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAACCCACAAACTCCACGTGTAGGCCGATCTGATCCT:1 + chr2L 288063 3' - mdg1 7319 2 76.71 AGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAATTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTATGGCAATAACA:1 + chr3R 10736175 3' - McClintock 9 2 72.34 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTT:1 - chr2R 21410838 3' + Burdock 222 2 61.64 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATAT:1 - chr2L 4063796 3' + roo 9050 2 70.55 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGA:1 - chr3L 12249816 3' - roo 8737 2 72.22 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGA:1 + chr3L 24208209 3' - Quasimodo 57 2 62.94 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTT:1 - chr2L 20821190 3' + Burdock 230 2 47.83 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCC:1 + chr3L 11844844 3' - rover 34 2 58.90 GTATTTATAAAAATAAAAAAAATTAAATATAAAAATTTCTTTGTAGAAATCTTATTTTACTAGTTTTACTTTTAACCATTGTACACGCAATCATACTTATTCTGTTTTGGTCAAATACGAAATATAATTGCGCTTAATTAGTATAT:1 - chr3R 14694138 3' + HMS-Beagle2 477 1 70.55 AACACATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAAGTGTTTTGCATAAAAAACCGACCAAAATGAGTCG:1 + chr2R 20227357 3' + hopper 1394 1 67.59 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCAATA:1 + chr2L 15913325 3' + transib2 2752 1 68.49 AATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTACGCTGCCCATCCAGTGGTGCACCAGATGCTGCCAAGGATTAAGCCAGTGCGAAACATTAGCTACGCCTCCCTGTTCCCAGGACCTCGCAGC:1 + chr3L 16329342 3' + Doc 285 1 66.44 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGG:1 + chrX 18336690 3' - mdg3 5293 2 54.81 CTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACTGTTAGCTTATTTAAGACCAAGAATAAAGACGACGAGCAGAGGAAGAGGTCAGCGAAAACAGAGAAAGCCAGTGTCAGAGGAAGTCGAGCAGAAGGACACAGAGCCG:1 + chrX 21016710 3' + ZAM 8213 2 54.11 ACTAAGTGTTGCTGCGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAA:1 - chr3R 4460999 3' - blood 7049 2 58.04 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACG:1 + chr2L 17005800 3' - Stalker2 66 2 61.64 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAA:1 - chr2L 16946044 3' - hopper 56 1 62.99 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGTACAAT:1 - chr3L 26505837 3' - copia 4898 2 65.75 CGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3L 20988181 3' + Stalker4 192 4 74.66 TGTAAATATTATTATTATTATTATTGCTACTCTCATGCCGAGACTCATAAAAACATAAGTGGCATCGCTTGAACAGTTTCAGGTCTTTATTCACACATTGATTTATCTATTGTATTTT:1 - chrX 14520217 3' - mdg1 7075 3 66.95 GAACACACACACACACACACACACACACACACACACCTTTTGCTGGGCGCACGCCTAGTCAAATTATATGCGCATATTTTATGTATTTTTCCCAACGTCTCTCACTTCGCTTTTCCCCGTTTTTT:1 - chr3R 8490127 3' + accord 183 2 82.40 AAAAATAAATAAATAAATAAAATTTCGAATGAACAACTATACGTTTTTTTTTAGTCAATTTGAAAATCCGGCCTCCATCCCCTGTTCAACGATCGCAGAAATCCGATCAGAGAAAGAGCAAAAAGAGTTTTCCATTACAAAAAATT:1 - chr3L 16755951 3' + Juan 4215 3 50.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATAAGCTATGACAATGACGGCCGACTGTAACCACCGC:1 + chr3R 24090597 3' + roo 404 1 75.34 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTCATCAGCAGTACATGTGATGCATCAAATATATTGTCCAAAAAACAGCCACATTTTTGCGCAGTGCAAAACACATTT:2 + chr2R 9544983 3' - roo 14 2 76.71 TTTTTTTTTAATTAATTAATTAATTAGGAGGCCTTTTATTTATGGGCCATCGCGACCGTTGTGCCGTGGATTTGGAGTAGTCGAACTGGCAATTAGATAAGTATTTATTTTAATTAAATAA:1 + chr2L 4784506 3' - jockey2 3404 1 76.86 AACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATGTTATTTATATGTTATTTCATCATGATCCCTCCTACTTTTCAACATCGCTCCCAGCTACTCATCCCGAGATATCCAGACGACTAATTCGATCAACTCC:1 + chr2L 9782175 3' + P-element 123 1 51.82 AATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCTCAGCTGT:1 + chr3R 23067495 3' + roo 19 2 67.81 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATT:1 + chr3L 2990031 3' - roo 66 2 65.07 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGTGCGCCTTATTGGCCGAAT:1 - chrX 20999454 3' + BS 5084 1 76.71 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATACAAGGCTAAAAGAGGAA:1 - chr2L 13556312 3' + transib2 2790 1 60.96 CCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTAATGGATGACTGCAAATAAAGTTGTTTTGTTTATATATATTATATTATTGCATTAGAAAAATGAGCAGCTTAG:1 + chr3L 9872256 3' - I-element 430 1 50.00 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACT:1 + chr2L 47173 3' + roo 8995 2 70.63 AATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCCGTATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCGAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAGTACCAAGGGGTCATTGCGGTTTTGGCAATGGAAT:1 + chrX 8131946 3' + TLD2_LTR 101 1 76.03 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTT:1 + chrX 12986601 3' - roo 36 2 68.89 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCA:1 - chr2R 7090664 3' + I-element 5267 1 77.24 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGTTTAGAGTGTATTGCGTGCCCACGGCTTTCCAAATTTTCCAGTCGGCTCGCGTGTACAGAAGAGCGGAAAGAGAGCGGAGCAGG:1 + chr3L 22960575 3' - Tirant 8123 2 75.00 AGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCAAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACCTTGAAATGGCTTTTTGTTAGGTGAGGTCATGTCACCCAGATTAAATACTTTTTGTAATTGTATACAATTTACACTTT:1 - chrX 10181055 3' + invader2 4643 1 58.90 AAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCCGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTG:1 - chr2L 22966916 3' - 1360 3232 1 71.92 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATAC:1 - chr2R 18316044 3' - HMS-Beagle2 74 2 66.44 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAAT:1 - chr3R 19224995 3' - HMS-Beagle 50 2 58.78 AAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTTTGTTCGTCCTTCGACGTCTAGTTTGAACTCTTCTCCGATGGTAAATCCGATTTCTTCCCAA:1 + chr3R 30237395 3' - I-element 5141 1 57.53 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGTCTCTTATCTGGACGACAGTTATCAGAGCGACTCGCTGGCCCAATACCTAATCAAAGTCACACAGGCGTACATAGACCCCTATACATATATGAA:1 - chr2R 17796518 3' - jockey 4700 1 63.89 GTTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGGGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTAAGAGGTTCTAAAATTTTTATTTTTAATAT:1 + chr3L 15288463 3' - Stalker2 168 2 74.60 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTAT:1 + chrX 14722190 3' - diver 79 2 69.86 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGAGTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGA:1 + chr3L 2145990 3' + roo 9011 2 56.55 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGAAACAAAAATATTAAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAAAATTAAAACAATATA:1 - chr2L 2552861 3' - 297 6635 2 63.89 GTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTTTTTTCTAGGTCTTGT:1 - chr3R 904897 3' - rover 6957 2 67.81 ATGAAANCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACC:1 - chr2R 20010218 3' + Juan 4131 1 74.66 GATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTCGTATTCCGAGGAGCTAGTCCGCCACTACAGATACTCCGACATGGCAAATTCGCATACGAAATTCACGCCAGCTCTCATCGGGTGGGAGGAAATTGCGTATTTGAAACACGT:1 - chrX 20371301 3' - 297 241 2 78.77 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTTCTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAG:1 - chrX 19588042 3' - roo 8728 2 61.64 GTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATCGGGTATATATGATTCCTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATACTTCAATGTAATTCAATAACCCCTAAAATG:1 - chrX 14722135 3' + diver 137 2 73.10 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAA:1 - chr2L 16274963 3' - FB 46 1 70.19 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAA:1 - chr2R 8735577 3' + mdg1 356 2 65.75 AGTTGTTTTATTTTTCCAACTGTTCTGAGATTAAACGTCTCTAAAAATTTCCTCGCCCGGTTGGTAATGGTAATAGTAACGGTAATGATAATGGTAATGGTAATGGTAGAGGTGAAGGAAAACAATCAAAATAGGAGCGACCAAC:1 - chr2L 2452189 3' - F-element 4580 1 64.14 ATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATT:1 + chr3R 4682987 3' + Burdock 6330 2 65.07 AGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAA:1 - chrX 10319629 3' - mdg1 84 2 76.03 ATACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAAAAGGAAAACCCAAAGAAAATTTACAAACTGAAAACGAAAGCTAAAAGCAAAACAAAATGGTAAAAGAACAAACTAGGCGGACAGAGAGATAATACGAACACA:1 + chr3R 28901176 3' + transib2 2403 1 69.86 AGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTTCCG:1 + chr3L 25482997 3' + accord 7369 2 66.97 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTC:1 - chrX 19054277 3' - jockey 98 1 78.77 ATAATAACTTTAGACATGTACCTAAATAAATAAATAGTTTACAATAGTATTCATTTAGTTATGAAAAAAGGAAATTATCCTGCCGCACCCTGTATATGAGTTTAGTGAGTTTGGTACAGCTTTGGAACAATATCGGAATTTTTTGG:1 - chr2R 2948230 3' + mariner2 803 1 65.07 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGGATG:1 + chr2R 22992520 3' - hobo 85 1 75.34 ATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTGCCCTCAGTGTCATGTTGCTTTTTTTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCG:1 - chrX 11468076 3' - BS 4646 1 66.36 ATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAA:1 - chr3R 4357503 3' + Tc3 1673 1 47.59 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTCTCACCTGGCCTGTCCCATTACCATTAAT:1 - chr2R 13931561 3' + P-element 2806 1 26.28 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGCGG:1 - chr2R 4673525 3' + Quasimodo 7347 2 70.83 ACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGGTGCGGAGCCAAAAACCGCATCTCCACCATTCTTTGCCAATCGGAGTCTCCCTT:1 + chr3L 11826504 3' + INE-1 160 1 65.07 AACCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCATCTTCATCGACTTCAGTTTTTTCCCATTTTCGCATTTCGC:1 - chrX 1132645 3' - Circe 7146 1 64.29 GTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTGTTGCATGTAAAGTCATGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGACTATACATATACCATTAAATAGCTCTTGAAATGCTGCTCATAACCA:1 + chrX 3202300 3' + invader1 195 2 67.12 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGTTTAGAGTGTATTGCGTGCCC:1 + chr3L 22960512 3' - Tirant 8163 2 69.23 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGACAGTGATAACGGACAGCTTTTCTCCGCTTA:1 + chr3R 19032729 3' + roo 9042 1 63.70 TTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTTGTATGTATGTAATATAATGTATATGTATCCGTTGTAAAACCTTTTTAAATATAT:1 - chr2L 21328152 3' + 297 338 2 65.52 ATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACTGCAAAT:2 - chrX 3431820 3' - Ivk 5320 1 70.55 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGCACTCCAAACTTTG:1 + chrX 10521780 3' + Tabor 475 2 75.86 GCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCGGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTAC:2 + chr2R 6482509 3' - gypsy 85 2 71.92 GAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTAAAAACACTCCTAGAATCTTGAAAAAAATTCT:1 + chr3R 21973879 3' - Doc 343 1 78.08 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTT:1 + chr2L 14074534 3' - 297 48 2 64.71 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGA:1 - chr3L 17055392 3' - Tirant 24 2 69.18 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCTGGCACACAGAGAAAAAAAATGGATGAGTATG:1 + chr3R 4964237 3' - roo 19 2 70.55 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCTAACTTACACATACATTTCAGTCTTGACATTTCATTTATATTTCCACTCTATTAATTGATT:1 + chr3R 30059490 3' - FB 59 1 59.31 TATATTTACAATTTACAATTGCTGTTAACTAGAAACTAAATGTTTCATACAAAATAATTTCAGACTCCTAAATCTCTAAGTATCCAAAGAGATTTGTACCTGGGTACTTACTCGTTAGCCGAGTTCCTGCCAATATGTGACGCGTT:1 - chrX 4746283 3' - TAHRE 10186 1 55.48 AGTGAAAACATACAAAGAGACTTAAATATCCCGACAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAATCGTCGAATACACGGACAAAGCGCACGGCGAATTAAAGGCGTGTGAAGAGAAAACTTGCAAAAA:1 - chr3R 18199247 3' + F-element 4379 1 55.56 TAATAATATAATAATAATAATAATATTCCTATAGAGCCACTAATTCGAGTAGCGCTTGTTTTCTAAATCCAATTAGTATCGAGTTTGGCTGATGGATATTTCTAGGAATAACTGGTAAACTATCTATGTACGCACCTCATCGCCGT:1 - chrX 15899064 3' + invader3 5053 4 54.11 CAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCT:1 + chr3L 13739654 3' - BS 5059 1 61.64 ATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTAT:1 + chr3L 16731387 3' + rover 7283 2 76.03 GATAGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCACATTTTAACACAATGTTTACTTACTTGGATTATTGTTGGCCTCACGCCAATGGGCGGCTGCTC:1 + chr2L 8283426 3' - G4 197 1 56.85 GTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTAGTGGGAGAGTGTTTTTGCCATCCTAAATTTTTCGGGTCAACTTGAAAAGAAGCTCGGAAGATAATAGCCTTATCTATTCCCTATAAATAAAGAGCTTTAAAAATTAGTTAAAAAACAATATTT:1 + chr4 1078541 3' - Quasimodo 341 2 76.71 CTGGTCCCTGTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAGTTATTCTTTTTCGTTTTGTAGATCACAGATTAATTAAGTTCCATTCAAATTGGATGACGGTGATTTAATCTATCTCGACAAACGTTTATACATATGCACATATGTATATAA:1 + chrX 16443153 3' - HMS-Beagle 265 2 63.70 AAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACAGAACATAATAACATACATAACTTCGTAAACATTCACTTCGCTGGAACATGGCACAGGTTTTGGCCCATAACTGGATGGCC:1 + chr3L 11717617 3' + frogger 2307 2 63.36 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAA:1 - chr2L 12818240 3' + hobo 2872 1 60.96 TTATCTTAGTTCAAATACGGATTATTTATTCAACTCAACACAAAAACTATTTTACTGAATGTATGTCGAAACACTTTTTTATTTATTTTTGTATGATTCTGTCGCAAGTCGAAGTTAATTACAAATGCGAACATAGTTAGGGATGA:1 + chr3L 1086753 3' + Tom1 355 1 63.70 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTG:1 - chr2R 13766180 3' + roo 9032 1 58.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCC:1 + chr3R 31653185 3' + roo 391 2 70.49 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCCTACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCAC:1 + chr2L 12818325 3' - hobo 62 1 60.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTGGG:1 - chr3L 16970334 3' + roo 392 2 68.99 AACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGGAGGGCTTTTCGCTCTTTAAAATAAACTTGTTAAGATAATTAGCTGTGATTTGCCAATGCAGAAATA:1 - chr3L 18277095 3' + Doc 492 1 55.65 GGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGTCTCTCCAACGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGAAGCTTTTGCTTGTCGGCGTTGTTTTGTGTGCATTACGTAAGCC:1 + chr2L 5149384 3' - Porto1 398 1 77.78 TTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGCTTAATTAGTACACATGACCGACGGGGC:1 - chr3L 12356502 3' - F-element 4237 1 75.86 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCGCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGC:1 + chr2R 22514196 3' + P-element 2865 1 54.81 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGGGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGG:1 + chr3R 12115325 3' + 1360 3321 1 78.26 ACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATCATGTTCTAAAATTGAACCTTCAAGAATTTCACTGTTCACATTTATAT:1 + chr2L 11831233 3' + mdg1 448 1 67.12 GGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGAGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAAAGTAGAGTTTTTTCACAGTGCACACAGCAGAGCCGA:1 + chr3R 12728108 3' + Juan 4205 1 69.40 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAA:1 - chr3R 4679453 3' + hopper2 1544 1 59.59 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGTCTTT:2 - chrX 18817252 3' + transib2 2788 1 60.96 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGAAAG:1 + chr3L 2145993 3' + roo 9016 2 55.24 ACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTG:1 - chr3L 25482914 3' - accord 70 2 75.59 TTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCTCCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATAAAGCTTAGAATGTTAGTTTTGCTGGTATGATTTTTCTTACAGTAATTAACCCGCTATGTAC:1 + chr3L 448562 3' + 1360 249 1 65.75 AAAAATACTAACTACTTTAACATTAACATTAACATTAACTATGTCCAACTCCCAAACGCCCCACGCTCCTCGCACGGAAACTGATTAAAATCGTGTTAGCTTCAACTTACAGGGCCTCAACGCCTACGGACGATAATGTG:1 - chr2R 9760412 3' + TAHRE 10262 1 63.57 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAAGATAGTTAAAAT:1 + chr3R 24219396 3' + roo 397 1 71.77 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCAC:1 - chr2R 19199684 3' - hopper 82 1 73.29 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTT:1 + chr3L 3983899 3' + P-element 2859 1 58.26 CAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAAATTATTTATATAAAATAACCTGAAATAACAAACAGATGCGAAATTTATTATTCCAGATCCATTTTACAAAATGATATAAAATTACTAACAAGTAATCAGGTCGCGAAAA:1 + chr3L 27866147 3' + Max-element 8523 2 73.97 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAAGAAGAAGAAGAAGCTGCTCATTTCAAAGTTTTCTTCTTGTTCTTCCTTTTCTTCTTAAAGAAGAAGCAACTATTTTACGGCGTAAAGATTTTT:1 - chrX 1341597 3' + 412 7520 2 64.38 CATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTCTTTATAAATAGAACTTAAATCGATTCAGTTTCGTTGTAACTTAGGTCAATCATACTTTGAATGGTTTGCACAAATTTTGTGAAATGAAGCGCATT:1 + chr2L 17369913 3' + pogo 21 1 67.81 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAATTAACTATTGAGAAATTAAATAGTCTACGATTTG:1 + chrX 18396209 3' - roo 8696 2 62.07 CTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGCAGGCGAAGTGTTGGCGACAAAGAAAACGGCAAAGG:1 - chr2L 23296250 3' - micropia 5175 1 72.73 TTTAAATCTATATTATTTTTGATTAATGGGCAGTATTCAATTTGCGACGTATGAAAAATTAAGAAGACCGCACTTCGTTTCTCAAGAAATCCCTTTAGCAATAATCAGTTTCCATATTTTTATTCAGTTTATAAATATTAATTTTT:2 - chr2L 16742347 3' + 1360 249 1 52.74 AGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATT:2 - chr2R 20227223 3' - hopper 66 1 63.01 GCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTTTTTAACTCGTTTTCTTTTTATAGTTCATCCTTAGTTTAGAGTTTATATCCGTGAAACTTTAAATGATATCTTAGTCTGAGTAATTAGTTTCTATTCAGTCTTTTATCC:1 + chr3R 10496967 3' - Bica 245 2 65.75 ATCCTTAAAATTGCATTAAAGATTATCTATATTATCTATATCTATCTATAGATCTATATTATCTATATCTATCTATATCTATATTATATCTATATAGATTATCGCTTAATCCAATTATTTCAGATCTAAATCATTTCAGACATTT:1 + chr3L 23212664 3' - Helena 80 1 53.10 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTGATTTATAAAT:1 + chr3L 22723990 3' - HMS-Beagle2 6893 2 77.40 TACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTT:1 + chr3R 11469406 3' + Tabor 7264 2 56.85 ATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGATTTGTAGAGCTATTTGCAGGAATTCCAACT:1 - chr2L 10253941 3' + Bica 4899 1 78.77 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTT:1 + chr2R 21116615 3' - mdg1 7057 2 30.14 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCACAGTGATAATTCAGTATTTATTAAGACAACA:1 - chr3L 14366539 3' + roo 9002 2 68.49 ACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCGGGTACCACGACAGGCTAGAGCGCCACAGTGCTAGTGCGTGCCAGTGCAACTGATTTTGTTGTTATGGCTT:1 + chr3L 13707948 3' + BS3 1451 1 59.62 AGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGCTTATCAGATACCCGTTCATCAACTAGTGTTGAACGCGAAATTTAAAATTATTCTGTGGTATCAATAAATAATGGTGAAATATGCAATTTAAATTAATTAATGCGTGTGTGAGCGGGGG:1 + chr2L 3905675 3' - INE-1 574 1 73.10 ATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATAATTTACATAGAATCCTGAATCATAACTGGCGCAGCCGACGACTACGAACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACACATACGTACACAAGCGATGGATATCTGTG:1 - chrX 21939065 3' - X-element 9 1 77.40 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTATC:1 + chr2L 17180164 3' - Juan 43 1 43.84 GTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAACCCTCTTTAGTTGGCCACAAATTGCCAGACAAGCCAAAACATAAAACAA:1 + chrX 7809357 3' - Ivk 362 1 64.75 ATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACG:1 + chr3L 18768503 3' - S-element 89 2 84.25 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTGATCTGCGATCGCGAT:1 - chr3R 24368983 3' + roo 9053 2 66.44 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGGCCGGGTG:1 + chr3R 15807434 3' - FB 61 1 63.43 TCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTC:1 + chr3R 15790134 3' - flea 4721 1 75.34 ATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAA:2 - chrX 3431854 3' - Ivk 5354 1 47.26 ATAAACATTTAGTGACACGCGAAAAGCGAACATTTGATTAGTGTAATACTTGTGCAAATCGACAAGAGCGTGTCAACGAAAGGAAAGCAGATAAACGGGGGCCAAAACGTTTTGCCGAACCAGCGAGCAGCTAAAACGG:1 + chr2L 3981628 3' + HeT-A 177 1 57.55 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAG:1 + chrX 18336708 3' - mdg3 5286 2 63.01 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATA:1 - chr2R 14051772 3' + roo 325 2 74.66 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAG:1 - chr3L 11913210 3' - BS 5075 1 73.10 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTTATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGCCAGCAATAATTT:1 + chr3L 22325926 3' - hobo 20 1 66.67 TAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTT:1 - chr3L 17183651 3' - diver 5930 2 50.68 GTATGTAACAGTCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCCACCTGTCAGTCCGTCTGTCTGTTCATCTGTATGAACGTCGAGATTTCAGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTAAGA:1 - chr3R 21239789 3' + INE-1 28 1 75.34 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGTGCCATCCATTTGCTTTGTTCA:1 - chr2L 4713836 3' + transib2 2786 1 59.59 ACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTCCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTTGCCTTTTAATTTGAGTTTTGCATG:1 - chr2L 6647664 3' + mdg3 5404 2 76.71 ACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTTCCGTA:1 - chr2R 18514846 3' + P-element 371 1 65.75 AATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCATTTTTCGTAGAGTAATTTCCTTTTTGTGTTGGCTAGGAATCGCGTTTCTTGCCCCTAATTAGTAGCCTTTTTTCGCCGGTTCTCCGGTTT:1 - chr2R 22779849 3' - I-element 5256 1 61.38 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCAT:1 + chr2L 23295897 3' - micropia 129 4 54.11 GTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAATAAGTCGGATAATAAGAAATTAAACAGAAACCCATT:1 + chr4 622035 3' + I-element 5278 1 70.55 ATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGATGACGGC:1 + chr2R 3760478 3' - accord 76 2 69.18 GTGAGCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACTCCCTTCCTTGAGTGTAGTATATGAGGGCTCCGCCTTCCACCCTTTAGTCGCCATTTAAGATAACAGTATACTCACTCTGGCACAGATTCTGCACGGAGTCGTCGGAGTTGTCGCCGC:1 + chr3L 11737606 3' - Rt1b 4955 1 63.01 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGT:1 - chr2L 10156134 3' + hopper2 1522 2 76.71 AAATCGTGGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCATTTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATC:1 + chr3L 8959717 3' - 1360 36 1 57.53 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTATTTGCATAT:1 + chrX 22840624 3' + copia 244 1 76.03 AGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCATAAGTCCGCATTCAGGATACATTCGCCATCTCATTT:3 + chr2R 2318283 3' - ZAM 17 2 73.97 AAAAAAAAAACAAAAAAAAATGTGGAAATTTTTGTCATTAGCTGGGAAATTTTATTTTCGCTTCGTTTCATTTTCGGCGATTTTTTTCCCCATCC:1 - chrX 18941975 3' - hopper 142 2 73.68 AAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACAAACATTTGCTGACCTTACTCGTTTTTCGTTTATATTCGACCT:1 - chr2R 21422331 3' + I-element 4988 1 72.03 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTGAAATT:1 + chr3L 20711734 3' - jockey 4785 1 65.07 AAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAATAAATAAAACAGAGTTCTCTGTACCGGTTCCATTGGCCAAAACCAG:1 + chr3L 10388955 3' + invader2 419 1 68.42 CAGCATTTTATGTACACATATAAATAAATATATAAATAGATAAGTAAGGATGGGCGCAGAAGTCCGAAATAAACAAAACCAACATAAGTGGAAAGCCTTAGGCTTCCGGGTGTAGAAAAAAGAATGCCCTGAAGGAAAATGACTAA:1 + chr3L 14515067 3' + accord2 7204 1 74.66 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAAT:2 - chr3L 10731743 3' + 297 361 2 60.96 TTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTGTTAATATTGTAAATATACAGTGTTAAATAATAAAAAATACAGAAATACATCGAAGTTGTTAAACAAATCGAAATAAAATCGATAAA:1 - chr3R 30270162 3' + jockey 4885 1 56.85 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGA:1 + chr3L 22723934 3' - HMS-Beagle2 6949 2 64.38 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTAAATTTCGGC:1 - chrX 21216699 3' + roo 9050 2 64.00 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGC:1 + chrX 18336652 3' - mdg3 5342 2 76.71 AAACAAACAAAAAAAAAAACAACAAGACAGCGTTCTTCCGTCTCGTTTCTTTGTCTTCGCTTTTCCTTTC:1 + chrX 3273245 3' + gypsy7 5009 1 64.29 CACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCGAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATTAAATCAATATTTCTCTGTGTGCTCTTCCCAAGGCGG:1 - chr3L 1690395 3' + blood 7038 2 72.92 AGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATAGTTTTATTCGTTTTCATGTAGTATGGCCACACTGCGGCCATCGTATAAAAGCCCGCGCTCTCCAAAGC:1 - chr2R 19451602 3' - Ivk 424 1 55.48 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCA:1 - chrX 18817293 3' + transib2 2749 1 69.44 AAATATACAAATATACAAATATACAAATATACAAATATATATTTTTGGGTTTTTTTTTACCGAAAAGTATGTCGATCTATAGACTCAAAGCGGGTGTTTTTTTAATGGCAAGCTATTGAATTATAATATCGGTTTTACGAGGCTT:1 - chr3L 9350248 3' + Stalker 95 4 60.69 GCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGATTTTCATTAAATTCTTACGCCTTTTCTCCACATTGTTGTTGCTCTTGCTCCTGCTGATG:1 - chr2R 13306542 3' + accord 87 2 59.59 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATT:1 - chr3R 27405986 3' - diver 82 2 71.23 TATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCAAAAGAAAAGGCGAATGAAAATAAATAAAACACCAGAG:1 + chr3R 9476610 3' + jockey 4863 1 74.48 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACT:1 + chr3R 11469382 3' + Tabor 7240 2 73.29 TTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAA:1 - chr2L 11839655 3' - mdg1 7112 2 68.49 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCTTGTTACATACTTTTCAACGAAGCTAGAATACCCTTTTACTTTACGAGTAACGG:1 + chrX 17283665 3' + pogo 2072 1 62.32 TATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACGTGAGTCTCCTTTTGGTTATGATTTTGTGCTCTCGATTTGTTACTCCTTATAACTTTT:1 + chr3R 9449234 3' + 1360 394 1 60.27 ACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGTAGCTGTCATGTGCTTTTAAACG:1 - chrX 21585228 3' - mariner2 255 1 72.60 ATAATAAAATAATAATAATAACAATAATAATAATAAATTAATAATAATAATAATGTATAATGGATATTACATAGCTTAATGAATGAATTAGAATGAGTACAAACATTTACAGCTTGAAACGCTTTAAATTTACTCAAAGTTCGAAA:1 + chr3R 27151474 3' + invader3 5055 2 77.40 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAACGAAAGATTGTACACAATCCTCA:1 + chr3R 30946614 3' + Transpac 250 2 58.90 AAAAGAAAGAAAAAAAAAAACATAGCCCATCAAGGGGGTTCCGTTT:1 - chrX 11785275 3' + gypsy7 5008 1 93.48 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCGAAAAGCGATACATGAAGTGGTGGGGAACGGAAAACTGATATGGCG:1 + chr3L 18403099 3' + P-element 2862 1 67.81 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATG:2 - chr2R 12472033 3' + transib2 2750 1 68.49 AAACGAAAAAGTGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAAATTAAAAAAATAAAATAAGGCTAAGCGAAACTGAACCGGCAAATAAAGCCAAAGAAAAGTCATTTAAATGGC:1 - chr3L 14336240 3' + gypsy4 445 1 54.79 CTAATAGGTAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAATATAGCAATATACAAGCTGATTAAAACATTTCAACGAAAGCAATTGAGCCGTATATCTCTAAATCCCTTTCAACCAGCCATACAATGCAATTTTGAATTCAAAAAGCT:1 - chrX 8279675 3' + Porto1 4197 1 62.33 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCA:1 + chrX 11661492 3' - pogo 62 1 64.14 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTTTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGG:1 + chr3R 7420287 3' - 1360 57 1 65.35 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATAATAACATTATAGCATATGTATAATATCATAAGTATTATTATTTGCTTATATTTTATAAGATCAATGAATTC:1 - chr3L 8673287 3' - I-element 49 1 52.74 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAATGGTGTGAAATTAACATTGGGAT:1 + chr2L 14671906 3' - FB 72 1 71.92 AGAATATTAATATTGAAAATTGAAAAACTTACCGCGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 + chr2L 18178219 3' - hopper2 25 1 40.41 GCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATA:1 + chr3R 16533712 3' - X-element 4413 1 36.99 AATTTCGGCCAGAAAAAGTGGTACAACTTCCCATAGTGAGATGTTCTTAAATCTGATGAGATAAAATTATTTCAGGGCACTTAAAACGCCGTATCAATTAATTTTTTATATTTATGTATATTATTTTATCTGCCTTAGAGCTGTAT:1 - chr2L 22107366 3' - Transib-N1_DM 17 1 56.16 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTATT:2 - chr2R 14653124 3' - 297 6598 2 58.90 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGCTAGATGACACA:1 + chr2R 13168751 3' - P-element 35 1 57.60 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAA:1 + chrX 7795639 3' + roo 9045 1 65.22 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTG:1 - chr3L 13836617 3' + 412 425 2 65.07 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAGAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTTGGAAAATTT:1 - chr3R 24219261 3' - roo 8717 2 55.48 AAATAAATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATATTTTCAATGGGCTGGAGATTGTTTGATTGATTGTAAATTGTTTTAATATTTGGTAGTACAATAAATGTAACATAA:5 + chr2R 18513950 3' + G7 1149 1 33.56 GTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTTCTGGTCAAAAAATGATAGAACTCAAGGGAACATAAAGTAAACATTTGAATGCTTTTCATAT:1 + chrX 11223298 3' - roo 466 2 57.53 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATCCCACATTCCTATTCCTATTAATACAATTGAACAACCAACTTTCATAATTTCACCTTACCCCGACTATTATTGCCAAATTATTAAAGAATTCAGT:1 + chr2L 22674399 3' - mdg1 7074 2 67.81 GTATAAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGTTAAAAGACTGAGAGCATGCATATTATTACTAGGGCCTTGAAGAATTTGTCACATTTTAATCATCATCCGGAAATGCCCAGGTAAAAGTTATAAACATAATAGTTCAACGCTC:1 - chrX 3137294 3' + INE-1 137 1 73.29 GCCACTATCTTTAAGGCAATAAACATGCATTCTAGCCAGTACCAAAACAGCCAAAGCACTAACCAGATGTCGCCCCCAGAATGCTCCAAAGGAGACAGCAACAAACACCGCGAAAAAAACATCGCAAGAAATAATAGTTTAAAAAA:1 - chrX 2985422 3' + BS3 1448 1 67.81 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTA:1 - chr2R 24169948 3' - transib2 39 1 43.84 AAAAATAAACGAAGAAATAATTTAGATTATTCTGGATGTGTTTTGAATTAGTTTTTGAACCACCCACGTATATACATATATAGACTCAAGTATATATGCATACACTTGCTTTTAGCTTTCCTAGAACTCTGATTTCCATACTTGAA:1 + chr2L 8671556 3' + invader3 5022 1 56.16 ACTGCATCAAATCAGCTGTTTTTATACAAGATCCTGAAGGAATTTGTTCTGGGCTGATTGGGTTATTTGATCAAGTTTAATGCAAATTAATAGTGCAATATAAACTAGATGTACTGTACTTTTGAGGCAGCTTCTAGAATTTCATC:1 - chr2R 10421286 3' + pogo 143 1 60.96 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATT:1 - chr3R 18488379 3' - roo 74 2 69.86 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCT:1 - chr3L 19454897 3' - mdg1 15 2 70.31 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTTCTGTGTGTGCGCTGTTGCT:2 - chr3R 25709736 3' + hopper 1387 1 65.07 GAACACACACACACACACTTACACTTAGACACACACACACACACATTGACATAGGTAGAAAGGCAAATACGCCTTGACTCTTGGTCAGATATTCTGATTTGTTTGAGTTTCTACTTTTCGAGCTTAACAAATTAAGCGCTCAATCT:1 - chr2R 16479125 3' + accord 7029 2 77.40 ATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGAAACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACCTAGTA:2 + chr2L 16588589 3' + Doc 4688 1 78.08 TTTTTTTTTCTTTTTTTCATTTTCAATTACACAGTTTATAACATGGCCATAAAGAAAAAAACTGCGGTGAGAACACGCTGCGTATACGCAACGCTCGCAGCGACAAGCTCGAAATTTGCATGCCAAAATGAGAAAAACTGGAACA:1 + chrX 9734356 3' - F-element 4687 5 73.79 CAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGCAAGGCCAGTTCGGAAGTTACAGGATCTCCCACTCGCATAAATATAACAAATGTTGATTGCACTTGAGGAAGTTCACCACTA:1 - chr3R 21200410 3' + 412 7114 2 38.40 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGGGTTGTTT:1 + chr2L 19924047 3' + roo 9017 2 54.11 TATTCCCTTTTTTTTTTTAATTCTGCACATATATCCCGAC:1 + chrX 20490269 3' - Bica 337 1 87.50 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATTATACAAA:1 - chr2R 20010148 3' + Juan 4203 1 75.00 CTACATGGGCTTCTTAGTATACGCTCTCCCCTAAGACTAGAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCCGTCGGTAGTAAGAACCTAACACCCAGCAACAAAAATCACAATCATCCACCGTTAAATCCCAGCAGCTTAGAACTTTTAGA:1 - chr3R 9175968 3' + Fw2 3467 1 55.48 AAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAATTTATGATTTCCAATCAGTTCTGGGTGAGAGCTCTCTCTGTCCAAGTTTG:1 + chrX 10636234 3' - 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chrX 18336607 3' + mdg3 193 2 67.27 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAATTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAATGTTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGGTATTATGACCACT:1 - chrX 14722073 3' + diver 6087 2 64.14 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTT:1 + chr2L 14074544 3' - 297 40 2 58.68 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGAATTAA:1 + chr2R 16817994 3' - 412 7096 2 55.48 TAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAACGGCTAATTTTAAGCTCATTTTCAAAGATTTGTTGATTAATGTGCTATAAGTGCTTCAATGAGTAAGTAG:1 + chr3R 28674519 3' + mdg1 468 1 52.55 TTATTATTATTATTATTATTATGCTCGTTGGTTGCCTGCAGAGAAGCAGGCTGCGAATGCATATACTTTTAATTGTTTTAAATTACCGCCGACGAATC:1 - chr3L 3445605 3' - mdg1 7067 8 82.65 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAA:2 - chrX 4341280 3' + roo 8991 2 72.60 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAAC:1 - chr3L 14366504 3' + roo 9043 1 65.71 AATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGTGTTCCATGCACCATCTCATAAACGAGCTTAAGGGAGGTCCACAAATTTACATAACATTTCATGTGCACAAGGATT:1 - chr3R 6658641 3' + mdg1 7078 2 51.37 AATAAATTAAAATAATTAACAAAAGTGCCATAAAAGTCCTCTAGAAGACGCGAGTTACTACATGCCTACACACAAAACGGGTCCTTAAAATGAAGTTTGAATGCTTTTCGTTGTACTGTACAGTGTTAAAAGTAAATGCCTAAATA:1 + chrX 1778554 3' + HB 317 1 82.88 CGCACAAGCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTTGTATGGGCGAAGCGAGATTGTCTAAGAAATGAAGGGTGAAAGGGAACACCCAAGCCTCGTCTTTGGCAATTGACGATTAACCCATTGTGAC:1 - chr2L 20906082 3' - hobo 2746 1 71.43 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACACAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATT:1 + chr3L 22744709 3' - FB 59 1 64.84 GAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACT:1 - 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F-element 4533 1 65.75 ATCAGGATCAATAGCGCAGTCGAATGAAGGATTTTAATTCGGTGTAGGTCCAGTATTATGTATTGATTTTAAGAAAGCAAATTCCTTTTTAAATAACTTTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAACTGCTATGAAATTGCAAGAG:2 + chr2L 12286094 3' + INE-1 93 1 80.14 ACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAGAAAGTTTCCACAATTATGAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCGAAGTCAGACTACTCAAAAACAAAAGACCATTAGGCCAAA:1 - chr2L 6159741 3' + TLD2_LTR 177 1 74.66 AAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCATACGGTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGC:1 + chr2L 12822845 3' - P-element 114 1 22.60 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATGGGAATCGCGGATTGAAATAGATTATTTTATGGAACGCGAAAGAG:1 - chr3L 21380497 3' + I-element 5317 1 51.37 AAATTTAAAATTTTTTAAATTTAAAGCATTAAAGGTTTCCCACTCCTCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTCAGTATTGTTTTATATTCTGT:1 + chr2R 10418574 3' - 1360 3031 1 64.65 GCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTT:1 - chr3R 23849168 3' + invader1 326 2 68.49 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTG:1 + chr3R 4964178 3' - roo 78 2 76.03 AGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTTACGCAACAGCTATTAAAAAAGCTCAATAGCTGAACAGTGTGAATCCTAAAAATGTATTGCTTTTCTAAGCNNNNTAATAATAATTTTTTTTACTTTT:1 + chrX 13287874 3' + diver2 309 2 51.82 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGG:1 - chr3R 8075893 3' - 412 7072 2 62.14 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTC:1 - chr2L 22193404 3' - roo 8712 2 54.48 ATATAAAAAAAAAAATACCAAAAAATTTGAAATCCAATTTGTCATAAATCTTGCGCAAAATAAAATTTATCTATCTATTCGAACATTCTGATTTGGTAACTATCACTATCATAAAATTTAACTGATAC:1 - chrX 13943227 3' + gypsy11 3929 1 29.69 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAAAGAATTTCAA:1 - chr3L 24131350 3' - Transpac 16 2 71.92 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACAATGCACTGAC:1 - chr3R 10270534 3' - Juan 4029 1 77.60 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTG:1 - chr3R 9002927 3' + roo 8995 2 68.49 CTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTATGGGAGAGAGACAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGCAGATGACAGCCGGTTGGAAAAGTACGCGTAAGGTGGAAGTGTGTGAGTGAAAAGTAAATC:1 - chrX 5189966 3' - Cr1a 328 1 68.66 CTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCAGGGTATTTTGTATTCCCAGAAAAGATATCCTTGCTTTTGTAGGGTAAAGTGGTATTATAGAAAATAAGGTTTTCATACTAAGT:1 + chr2L 10936823 3' - HeT-A 5993 1 60.27 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGTGGATGCCCCAGCTTGGCTAAATGCGGAACTTATCGAGGGCGCTCTAAGAGCTTATGA:1 + chr3R 25287564 3' - jockey 4832 1 60.27 ATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATAGAT:1 - chr2L 12910743 3' - G3 4505 1 75.34 CCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGAAATGGAAAGTGGGGGAAATGTGGGTGGATTGGTTGGATGGGGGGATTGTACAGTGACAGAATGGAATTTGATATATTTTCGTGTAGGC:1 + chr2L 1619173 3' - HB 94 1 70.37 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACATTGCCTTCCAGACCAGCATCTCC:1 + chr2R 8099277 3' + jockey 4985 1 73.97 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCG:1 - chr3L 5489883 3' - jockey 68 1 55.48 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATG:1 + chrX 10521722 3' + Tabor 7255 2 63.70 AGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGCTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGACTTATGCGATTTATAAAATATATATTTTGGCCAA:1 - chr3R 9295147 3' + hopper 246 1 75.54 GCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATAT:1 - chr3L 20525229 3' - Max-element 8304 2 63.01 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGA:1 - chr3L 22890357 3' - FB 47 1 54.26 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACACACTCACTCCGCCATCTCGCTCGGGCTCTAAAGTT:1 - chrX 15357641 3' + hopper 1409 2 68.27 GAATCAGTTATTCCCACCAACCCAAATACACCC:1 + chr2R 16617759 3' + Quasimodo 6928 2 63.64 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGAATGGGTGCGAGTGTGGGCACTCAAGCAACAAAAGGTAGCACAGCGC:1 + chr2L 2527776 3' - hopper 11 2 72.60 TTCTAAGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAGTCTGACTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4826124 3' + 1360 147 1 72.60 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTTTGTGGCCTTTTGCTGTTTGTTTGTCAACAGCAGCGACTGCCAACACTTGAG:1 - chr2R 22989541 3' - hopper 13 1 76.71 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCG:1 - 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diver 211 1 63.01 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATTAATTCTTTTCATATTTGATTTTAGAGAGTATTTTCATT:1 - chr3R 7666609 3' - I-element 37 1 58.90 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCG:1 - chrX 8437685 3' + P-element 2796 1 23.45 ATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTTTCTTCTTCTTTTATTTATTTATGGGCCGACAGTATG:1 + chr3R 22063510 3' - Porto1 349 1 74.13 ATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGCTTGAGAAACACAAGATAAAAAATCCGGGGCGAAAAAAAACAACAAAAAATTAAATAAAATAAATGAAAATGCCAACAACAACTGATCGGTGATAATGCTCAGTTTGAAATAAGA:1 - chr2L 12201244 3' - Cr1a 73 1 63.01 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAGCGCTG:1 - chr2L 71157 3' + 412 7498 2 52.05 ATAAAAGAACCATTTAAAAACACAAACGTTTTTGGTTTAATTTATATAGTATTAGTATTATATAAATTCTATGGTTTAAGAAATAGTCGCTTGAGTTCAAAATATTTTGGGATTAAAAGTATGCAAATAAATATT:1 - chr3R 23170727 3' + gypsy10 323 2 57.78 CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGGTTTGTAAGCTATTAATTCTC:1 - chr3R 19224991 3' - HMS-Beagle 6857 2 60.27 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAAC:1 + chr3R 30946592 3' + Transpac 250 2 69.35 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCAC:1 + chr2L 13158714 3' - roo 8751 2 78.08 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCGAGTGCTGTGT:2 - chr3L 9269859 3' + copia 254 1 58.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCAC:1 - chr2L 4063792 3' + roo 391 2 73.29 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTGGCATTAAATGTCACAAAGTCACGCGTCCTGGCGG:1 - chrX 585625 3' + Tirant 8469 2 54.69 ACCGAAGCAAAAGCATTGTGGCCCGTTGCACACGCAATTGGGGGTCTTTCGTT:1 - chr2L 16483748 3' - frogger 275 1 69.81 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATACAAG:1 - chr3L 16662352 3' + jockey 4959 1 59.59 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTA:1 + chrX 10167453 3' + roo 330 2 69.86 GAAGCAGAACTTTAAAAATCAAGTTATCAATCTAATAATGAAGAAGAAAAAGTGGAAGAGGGAGACGAATTCAATTGCCCTAATATATTTTAGAGGAGAAAGTTGAAGAATAGGGTTTGTTCGGCGTTACATCTACAGTTCTGACA:1 + chr2R 5463630 3' + transib4 2159 1 76.03 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAGTCCGCTATAAAGCTT:1 - chr3L 22960416 3' + Tirant 354 2 53.42 GCATTGCCTTAACGTTATGATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCAAAAAATAAATTAAAAAAATGACTTTAAGCGGAATCGAAGAAGCAAAAGAAGGCCAAGGGCAAGAAGATGGTTCCCCTG:1 - chr3L 1555599 3' + 1360 302 1 64.38 TAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTG:1 + chr3L 18125999 3' - Ivk 56 1 52.05 TTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACGCCAGCGTTTTTGTTTTAATTTAACATGCTATTGGTTAATATGTGGTTTGCAAACATTCACATATTTGACATACAAGCTATATGATGATATATTTCTATTGATT:1 - chrX 3701748 3' - Tc1-2 1243 1 72.41 AGATCGACTCGGCTATTGATCTTGATTAAGAATATATATATATATATATATATATATATATACAGGCGGCGGAATAAATCGACGGG:1 - chr2L 18159115 3' - INE-1 97 1 80.23 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACC:1 + chr3L 19111602 3' - Doc 65 1 64.29 ATCTCTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGATTAACTCGTTTACAATGCACCATAAATCAAAGGCAATTTATTGGGGTTTGTGGTTTATGACTAACTTTGGAAGTTTGTC:2 + chr2R 11426965 3' - 1360 143 1 54.11 AATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAAAAAACGTCCGCCGGAAGCTCCAACCCTTTCCCCCAAAACAAGAAAAAATAAACA:1 + chrX 7677057 3' + I-element 101 1 67.01 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATTAAAAGGTTCTTCCAACTGACTTAAAGGGTTAAATAAAATTAAATTTAATTATAATAACAATTTTGTTTAATGAGAATACCAAATTCATGGAATACTTTT:1 + chrX 21505790 3' + roo 394 1 74.66 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGC:1 + chr2R 12472114 3' - transib2 46 1 57.26 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAG:2 + chr2L 19924066 3' + roo 9036 1 52.74 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTT:1 + chrX 10521751 3' + Tabor 445 2 55.48 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAG:1 - chr2L 21299266 3' + roo 380 2 65.75 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTT:1 + chr2R 18514972 3' - P-element 62 1 40.69 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTT:1 - chrX 19074760 3' - mdg1 49 2 51.80 GTAAAAAAAATATATTTTTTATACAGATACATGATAACGTGTCGAATCCAATTTGTTGAAATTTTCTATCCCTATGAGAAAGTCAGTTATGAAAGTAAATCATAAATTTCTCGCGACAATTATCCTTCTCCTCTGGTGGACTTTAG:1 + chrX 7543315 3' - Idefix 7365 2 84.25 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGGGAAAAGCATGACTCAT:1 + chr3R 13973044 3' + 412 432 2 60.71 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTA:2 - chr3L 9809253 3' - 412 67 2 64.38 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTT:1 - chr2R 21116490 3' + mdg1 7388 2 69.18 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAAT:1 - chr3L 5389882 3' + roo 8999 2 74.10 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAAT:1 - chrX 19054274 3' - jockey 95 1 76.71 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAAC:5 - 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hobo 47 1 50.68 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGTA:2 - chrX 8027391 3' + Juan 4181 1 56.16 AATAAAATAAAATAAATACATAATGTAACATAAATCAACCTCATAACTATGAATCAAAACCAACTAAAGCACTAGTATGCACTTCTAATCCTTAAGATTAGGTTCCTTAATACATTAACAAACAGAGAAATGTTTCTTGATATTTT:1 + chr3L 8333857 3' + Doc3-element 76 2 76.03 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCAT:1 + chr2L 22674895 3' + mdg1 375 2 50.34 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAAT:1 - chr2L 13585715 3' - Quasimodo 47 2 49.32 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATAGAAAAAGGCT:1 - chr3R 15942666 3' - hopper 13 1 72.73 AAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTA:2 - 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chrX 14985147 3' - 1731 4263 1 69.18 GCTGGGACAAACACATAATGTGCTTATGATGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATATACAAGGCAAACAATTTTTTTCCGTGTATATTTATAGTCTGCAGTGGAGTGAAGGTGGTGAAGTTGTACATATTATTGCATTTTGT:1 - chrX 17554853 3' + Tc1 1613 1 56.85 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTGTAAAAAATCAATA:1 + chr3R 13406558 3' - pogo 20 1 67.81 ACTTATTAAGCTTAAGTTTTCTCTATTTTCAAGTCTCTCAAATGGGGGGCAAAATCTGGGCAA:1 + chr3R 29742206 3' + gypsy4 6756 2 80.95 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTTATAAATTTAT:1 + chr2L 17005859 3' - Stalker2 7 2 79.45 TTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGACAAGATTACTGTTTAAAATCAAGTGTGAAATATCAAAATCAAAATCGGATTCCGATCGGGAAGTTGTATCCGATT:2 + chrX 358396 3' - Ivk 5372 1 60.27 CAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCAAATTCAAATCCAAAACTATCGATATATCATGATATGTTTGTGGTTCTATGAAAAAAGCCAACTCTTACACCTGTTAATTACCGTTCTGGCAGAATCTTAT:2 - chr3R 21064703 3' - jockey 183 1 67.12 ATTGAAAAAAAAAATAATTTAATTTAATTTAAAAGTCGGTAAGTTGGCAGTTTTTGTTAGGTTGAGGTAACTATTACATTCGTAGGATTTTATGAAATGTAAATTTAAAAAAAGGACAACAGTAATTTGAGTTACAATAGTT:1 - chr3R 20245299 3' + jockey 4925 1 73.24 GAATAAAGTTTAATAGTTTTTAAAAGCAGTTAAGAATTTAAAAATTTACATAAAAAAAAAGTTGAGTTTGCCTTTTTTGGTCAATTTTTGTAAATGGATTGGGATTTGGTTTGAGGTTTGAAAATAGTTATGTAGTGCACCGGGTG:1 + chr2R 10049151 3' - Tc3 1528 1 70.55 ATATAGTTATTTTACATTATATTCCCATATCGCGTCTATCTTCTCGAGACTCGAGCAGTACGATACGCGGGAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGACGGAAGTAAGCCATGCAGCTCACCCGATCTTGCAGACATTCGATGG:1 + chr2L 3529678 3' + Cr1a 4317 1 74.10 GAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGCTAAGCAAGCAATGTAAAAACTAGACGACTGCCTGGCAACAACTATGCACATATTTCCGGCATCATCGAGTATTTTCGCTGTAAACG:1 - chr2L 44389 3' + roo 8676 2 62.33 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGA:2 + chr3L 18931029 3' - I-element 89 1 76.71 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAAAAAT:1 + chrX 21100306 3' - mdg1 12 2 78.08 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTCT:1 - chrX 19038367 3' + hopper 1355 1 60.27 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACATATGCGATTATTTCCTGAGAAATTGTTCTCACACAC:1 - chr3R 29084829 3' + 412 489 2 76.71 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATGTTAATGAATTTCA:2 - chr3R 20140492 3' - jockey 4747 1 70.55 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGA:2 - chr3R 4460979 3' - blood 21 2 70.55 AAATGTTTAAATATCTTTTAAACGACAAAGGTTGAAGGTTTAACAAGATTTATTTTACCGAGAAACATCTATTAATTGGACTAAAAATTTGATTTATGATCATGTTTGAACTTAATGGTTCAAACAGTCGAAAGAAATATTTG:1 - chr3R 24571019 3' - Transib-N1_DM 288 1 77.62 AGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGAGCAGCCAAAATGGCTATATCTTGTGGAAAATGATCGAAAACTAATGGAAGATTGCAA:1 + chrX 9098908 3' + 1360 159 1 60.96 ATAGCAGTGCTATGAAAAATTAGTAACAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAACTTAGTTTTCCTTTTGAATACGTTAGGGCATTTGAATTAGGGCATCCAAATCTGAGCCTTATATAATCCGATTTATGAAGTAGTTGGAACTCGA:3 - chr2R 4917670 3' - HB 1414 1 56.16 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCCAGTCGGCGGACAAAAAGTCATTGGAAATGTG:1 - chr2L 14675643 3' - 297 6628 2 56.43 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAAC:1 - chr3R 18971691 3' + Juan 4164 1 51.37 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAGCCTTTACAGCTATCTTTTTGCTAGCTAAATTGT:1 + chrX 9410613 3' + I-element 5337 1 69.93 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATCGGATAGGTTCAGGGCGTTGCCCAATGAACACCTAACCCTTACCCCTGTCCACGGGATGCATGGAACAAGGAACGCAACCGGTAATTTCTTGATCAAATTAATCCCAGT:1 + chr2R 11795118 3' - opus 5 2 78.08 ATTTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATT:1 + chr2R 11329662 3' + P-element 166 1 16.67 ATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCT:1 - chr2R 1320671 3' + diver2 312 2 50.68 ATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTAGGGTATTGCAGTGTT:2 - chr2R 21410814 3' + Burdock 6382 2 78.08 CAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGT:1 + chr2L 21570275 3' - Dm88 52 2 52.74 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGAC:1 + chr3R 17996252 3' + diver 171 2 62.90 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATA:1 + chr3L 10425898 3' + I-element 5308 1 51.37 AACGCCGTATTTTCAATATTTCGCGCGACAAAACAAAATTCCCTGTGACCGCAAGTTAAAATTCTTTGACGCACTTTCGAAACTTGACGCGTTGATTGTTCAGATTGAAAAGAAGGCACTGTAGTTCCATTTGGAAGCAAGCATCT:1 + chr2R 19597364 3' - gypsy12 342 2 72.60 GCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACAT:1 + chrX 21224605 3' + roo 8976 2 81.51 GTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACAAAATAAAAAACAAAAAAAAACAAATATATGCAAAAGAAGGGGAAGAGTAATGCCGCGTAA:1 - chrX 13484230 3' - accord2 7287 1 55.86 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATATCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGGTATTCCATGTT:1 + chr3R 24369152 3' - roo 8700 2 58.22 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTTTGTGGCCTTTTGCTGTTTGTTTGTCAACAGCAGCGACTGCCA:1 - chr2R 22989550 3' - hopper 22 1 70.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGACTTTTTAATTA:1 - chrX 21216682 3' + roo 9046 1 67.81 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTGAA:1 - chr2L 14074425 3' + 297 6935 2 58.90 TAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGCTCAATTGGTCCGTTATATTTTCCAATTTCC:1 + chr3L 19262467 3' + hobo 2469 1 78.62 ATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGTTGCATAAATCATAAAGTCAATAATCTCAGTTTCAATTTAAAAGTAGAATTATCTATTATTACTTAGTATCAATGCATTTATCCCTTAATATTTTATAAA:1 + chr3R 20211692 3' + 1360 412 1 68.49 CTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTTATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAGTTATATAAACAGCAGCAACCTTTTCAATTTGTATGTACCAGTGGACCCCGAGTAT:1 + chr3R 4806376 3' + 1360 242 1 61.64 GTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTTAAATTTTGCGTACTTAAGAATTAAATTTGGAA:1 + chr2L 14491407 3' - I-element 5130 1 77.40 ATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTATGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCACAAATCAACTAATAACTATTAAATAAGAA:1 - chr3L 17245006 3' + HB 1571 1 51.18 CATCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAATTCTCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATGGCTATGTACGCGCACAAATATAACCTGTATCTATAGGCAATCTT:1 - chr2L 22340140 3' + 1360 3113 1 67.12 TATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATATACACGATACATCACGCTTTACAAAGATTACAACCGCGCCTGAATGGCACAAA:1 - chrX 7716692 3' - Cr1a 4268 1 63.70 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCC:1 + chr3R 14860206 3' - BS 5067 1 70.29 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATCCA:1 + chr3R 15807460 3' - FB 47 1 53.42 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATTGTAGTATACTGTTATGTTGACATAAGTTGTATTAATTGTATGTTCCTCAATTGATCTTCAGTTTATATGTAGTTGGAAACTTC:1 - chr2R 11804589 3' + pogo 2090 1 74.24 CACACACACATACATACACACACTCACCCACTCACCCACTCTCATCCACCCACTCAAAAAGCAAACATCATTGCCCAAAAGGGGGAGAAAAAAGAAACACTGAGTAGCGTTGCGGAGAAGAGAAAGTGTGCCGGAAAGAAAAACCA:1 - chr2L 12299650 3' + Quasimodo 44 2 65.07 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAG:1 + chrX 21224639 3' + roo 9032 1 50.81 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTC:1 - chr3R 29084885 3' + 412 7486 2 56.85 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTG:1 + chr3R 24381380 3' + Juan 4138 1 68.49 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTA:2 - chrX 7795539 3' - roo 8752 2 82.19 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAA:2 - chrX 13134855 3' - jockey 4788 1 63.70 TAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGG:1 + chr2R 2875243 3' + TLD2_LTR 109 1 68.49 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACT:1 - chr2R 24427585 3' - jockey 4756 1 71.23 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAAT:1 + chrX 18010060 3' - 412 45 2 51.72 CAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATA:1 - chrX 5323257 3' - Juan 4132 1 74.66 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATAC:3 - chr3R 6625672 3' + flea 4983 2 63.70 TGGGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGCGGTGCGTTGTGGCATGGCATGGTGGGAAATTATTTGCAGTCACTTGGGCAGGTTGTTTGAGTTT:1 - chr3R 24733505 3' - hobo 22 1 60.18 TGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTTTCTGTAATGTTGTATAATGCATAGGTGTAATCTCTACTTAATTCGTTTCAGTTAGAAATGGGATTGTCCTTTATTTTT:1 - chr3R 9098799 3' - Cr1a 4169 1 56.85 GGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGAGATAATTCAATTTTTAAACATTTGGCATAACAAGCGA:1 - chr2L 3675796 3' - Juan 4036 1 73.29 AGCGCTTCTTGCTTATGCTTTTGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCATTTATTCCTGCCCATTTATGGCCACTTTTTGGTCCGACAGCGTTCGCGGCTGTGTTGCAAGTGCTGATGGTGATGCA:1 + chrX 11603189 3' - Tom1 195 1 59.29 ATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTA:1 + chrX 22840593 3' + copia 5087 2 56.34 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCG:1 - chr3R 7943751 3' - blood 7095 2 72.60 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGAGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAGCGGGTA:1 - 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chr3R 15072582 3' + pogo 2001 1 57.53 AGAAATTAAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTA:1 + chr3R 24450520 3' + 412 7484 2 56.85 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAA:1 - chr3L 23249374 3' - rover 6999 2 53.10 TGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATCTTCTGCGGCTACTGAAACTTTAATAGACCGAATTTCTGGATAATTAACACGCTAAGCGTATGAAAGATGCATGAAAAGGGCCAAAATGCTCCGCTTGACAG:1 + chrX 13429128 3' - I-element 4960 1 75.52 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGGACAGATTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAA:1 - chr3R 14980302 3' + roo 9017 2 56.16 CCCTTCGATTCCGTTAGATTTGCCGGAATCTCTGCCAACTCAAAAAAACAAGACGTCAAAGAAGAACACCGATAACATACGAGCATTTGGGCATATTACATACAGTGGCCCAGAGTCAGCGAGTCAGACTGCAATCTTGCCTTCAA:1 + chr3R 11360747 3' + diver 450 1 72.60 TTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCG:1 - 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roo 20 2 71.92 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGGGCATACTTCGGAAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTACGCTATTTCATCAGGACCCGAACCAATACTTTCAACGTCGC:1 + chr3L 12004301 3' - P-element 58 1 23.81 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCTA:1 - chr3L 17183632 3' - diver 5911 2 63.70 CATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTACTTTTTATGATTTGATTGTGTGTAAAATTAGTATTCTTTTTTGAGCAACAATTCCATC:1 + chrX 14771863 3' + BS 5084 1 75.34 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGAGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTA:1 - chr3R 23618143 3' + hopper 1336 1 70.55 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCG:1 + chr2R 13168724 3' - P-element 39 1 44.12 TATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTATAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTTCGCTTTTCCGACTTTCGTCCGTTTCGATTTTTTCTCTTTTTCTGCATTTTT:1 - chr3R 10982536 3' - Bica 303 1 62.50 GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGC:1 + chr3R 22590575 3' - rover 7016 2 68.28 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGTGTGAT:1 + chrX 21216793 3' - roo 38 2 68.37 GTTTGTTTTTTTTTTAAATATTGAAAAAATTTAGGTGGGTTAATTATTGTTTTCATAAAATAAATTAAATCCAATTTGTATTTTGAGAAACCATCGCAATAAAAAAAGAAAACTCATAGTATATGAGTAATGCACTGAGTCAAAGA:1 - chrX 8206406 3' - TART-B 10509 1 59.59 AAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGCGAAAATGAGTGAGAGAGAGTGGAAGGAGAGTGAGTTTCTGAAGCGAG:1 + chrX 7604813 3' - P-element 2870 1 36.99 AGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGG:1 - chrX 21216712 3' + roo 9019 2 55.94 AATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGGCAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATT:1 + chr3R 19446932 3' + roo 8663 1 61.64 TATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCA:2 - chr2L 22121330 3' + I-element 5314 1 64.38 GAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGCGCAGCGCCGCCCTCGGGATGACCCTGCTGTTCTTCGGTTCCCTGGTGATAATCTCGGATCCTCTTCAGAGCATCCTGGACACGGTGAGAACAATGCCTTTTGG:1 - chr3R 16599631 3' - Doc2-element 4646 1 71.92 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAA:1 - chr2R 13259295 3' + mdg1 7385 2 66.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTAGAA:2 + chr3L 20898657 3' + roo 9042 1 65.75 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCA:1 + chr3R 31886925 3' + hopper 1339 1 69.18 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAA:1 + chr2R 11804734 3' - pogo 56 1 58.90 AAATAATAATAATAATAATAATAATATAGTATACAATTTGATTCAATACATAGATTTGGCAAATATTTTTGTTAACCGATTTGCGTTGATTTAGTCATATCATTTCTTTTTTTTCTGGGTCCTTGCTTTAAAAAATATTT:1 - chrX 12919356 3' + mdg1 27 17 70.00 ATGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTAAAAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTATAATCTAAATTAAGCCACCACATCCCGGGGTCCGTGACTAAGACTTCCGCCCTTATCGC:1 + chr3R 31127284 3' - Tc1 93 1 59.31 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAATAATGTTGCAGAATTTAGC:1 + chr2R 7304163 3' - pogo 18 1 70.55 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGGGTTG:1 - chr3R 27315081 3' - jockey 4693 1 61.06 ACCAGAATTGGGGTTCTTATGGGATACTTGAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTTTATGCAGGGATAACAGGGTTCCTCTTAAAGCAAACTTTTCAATTCAACAGCATAACAAATTTTGTTGTCCTTACCT:1 - chrX 21028992 3' - Quasimodo 128 2 52.05 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACGGTTAGGACCCACAAGTGTGAATATTGCTACTGCGTTAGTTATATTTGTGAAAACTTGCAATCGGAATTCGAGGAATTTTGTAGAACAGTCTATCGGAGGTTCAAATGGTACT:1 + chrX 17683210 3' + hopper 1366 1 81.51 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTT:1 + chr2L 11391633 3' - 1360 18 1 67.12 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTG:1 - chr3L 6397686 3' - roo 90 2 76.71 CGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTTTCTGAACCTAGGCTGCAATGCATTCCGTGGCATTTTTCTCTGTGCAGTTAAAACTGTTAAAGAGTGAGGGGCAAAAC:1 - chr3L 5178598 3' - Doc 4535 1 49.66 AATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTTTTGTGTATATAGGGGTGTATACTGGATAGTTATATGTTCGCATAGTTGTCGCGTAGTCTTGTGGAGTTTTTAGATTGCATAAATAGGTACAAACTATAGTA:1 - chr3L 3184882 3' - Idefix 107 2 72.60 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATA:1 - chr3R 27986368 3' + roo 324 2 73.97 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATGTAAACAGTGGAA:1 + chr2R 6847884 3' - Doc 26 1 72.60 ACTAAGTGTTGCTGAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCTCGCCATATTTTCAATTTACAT:1 - chr3R 7943706 3' - blood 7049 2 57.93 AATCCAATTTACATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATTAAACGAATAAAGACTTTAAAACCTTGTTACATAAACTTTTACAA:1 - chrX 22577404 3' + 297 259 2 64.29 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTTTTTA:1 + chr2R 5531226 3' - 1360 70 1 66.91 AAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATTAGAACCAG:1 - chr3L 21655833 3' + HMS-Beagle2 7188 2 74.65 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTA:1 + chr3L 5389947 3' - roo 79 2 75.34 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAGGTTTT:1 + chr3R 31264069 3' - jockey 4762 1 57.35 AATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAAACATTTGGTTATGTGCCCAGGCCCTACGCGTAAAGAAATGTATCTTATTAATTACGTAAATAATATCTCCTTCTTCTCTACTCCCTCAACAAATC:1 - chrX 19342148 3' - frogger 33 2 63.01 TGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTAAA:1 - chr2L 12355487 3' + HeT-A 6004 2 59.59 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGCACTGTATGCATACATATAACTATAACTTAAATTCCCCGAGT:1 + chr3R 15325227 3' - 297 6598 2 71.92 AGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATTAAAATACGTTTATATGCAAATAAATCTACATAACTTACTTGAACTTCGCCCA:1 + chr2R 9592739 3' + invader4 2967 2 63.70 AACAAACAATAAGTTTAAAAAGTATTGTAAAAATAAAGTTTCAACGGAAAAATGATTTAGTATTTTTATATAAACTTATATATGGAAGATATATATGGATTCCATATCCCAATAACTGATTAAGACACAATTTAATTAGCCTGGT:1 - chr3L 9994052 3' - F-element 4629 1 45.52 ATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTT:2 - chr3L 27356070 3' + Tc3 1647 1 59.59 GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGAATATTTACACTGCATTTGACAACAATAAACTACCATTTCCATATTAATTCTTTCATCGACTGCAGATGGATTACGAAAAT:1 - chr3R 24081159 3' - Tabor 85 2 61.54 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTTTTAATCTAATCTGGTTACAACCATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 2145841 3' - roo 12 2 71.23 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACATAAAAGCAAAGGTGCC:1 - chr3L 18125856 3' + Ivk 5370 1 73.97 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTATTGTTTTCCTCCGTTTATTT:1 - chr2L 18347260 3' - transib2 36 1 59.59 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTA:1 + chrX 11661523 3' - pogo 14 1 72.66 TCCAAGAACCCTACAAGATTTGAAACCAAACCATTTGGTCTACAATTCCTTCCAAAGAACTTAATATTGTTGGATGTACTTCTCTCTGCAATTGCATCACCTTAGAGCAGCGCCCCATGGGCGGGGTTGCTTTAATGGGATTTATT:1 + chr2R 5181687 3' + mariner2 640 1 79.45 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTC:2 - chr2L 20265939 3' + roo 9010 2 61.64 ATATAATATATATAAAATATTTGATATTTATATTGAGTGAACCCTTAATACGCCTTCCTTCCAAGCTACCAAGAAAAAATCCCAAAAACCAAAGCAATCTCTTCCCGATCGGTTAGATCCACTTTCGGGCAATTAAAATTCGATTG:2 - 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chr2R 5410977 3' + Tc1 1352 1 64.18 ACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAAGGGCAA:1 - chr3R 11186530 3' + BS 5061 1 53.23 TTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATTAAAGGCTTTTCACATGCAGTCCAATGCCAACTTTGGCCGGGTGGTAAGAAATTCGTG:1 - chr3R 26404025 3' + hobo 481 1 59.22 CATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTATATGTGAAATTGAAAAGCCTGAAAAAAGCGCAGCTCGACAGCAAGCGAACTTTGTTAGCAATGGATTGATGTGAATGGGGATCTGGTGCC:1 - chr3L 13616618 3' - I-element 427 1 66.44 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGTCCCATTCACCACCCATCCCC:1 + chr3L 13294949 3' + roo 360 2 73.74 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTT:1 - chr3L 7889533 3' - roo 36 2 59.59 ACGAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGG:1 + chrX 21224637 3' + roo 9050 2 57.69 CTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTT:1 + chr2L 15550746 3' + Bari1 1628 1 74.48 ATATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTT:2 + chrX 18336667 3' - mdg3 75 2 65.75 AGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGACTTAGACCGCCCTTTTTCTCATTATATTCTCCAATA:2 + chr2R 4194404 3' + INE-1 96 1 78.77 CTCCACCAGTGGTAAGAAACACAGAAGAAAAAACCAGCGCTTCACAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTTACACTATGAATATGAATTCTACTATCTGCCCCCTGCTGGCTGATGGCCTGGCGACGCCCTTGACAAAATATATGTAAAA:1 - chr4 343340 3' + rooA 419 1 58.22 CTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGGTCAAGTGTCCAGGTCTAAGCCAACTCGCTGTG:1 - chr2L 4754827 3' - Stalker4 8 4 58.62 TAATATCTTTATTTTACATTATTGTAAGGTAGACAATATAGACACACAACAATTTGAAAAGTATTAAGATAATGTAGAATATTAGAAAATCAAATCAAATAGAATTAGCTATTACCAAATCAAATATCTGGCGTTTTCGTTGTTT:1 + chr3L 18092228 3' + Cr1a 4315 1 50.34 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGG:4 - chr3R 4964116 3' + roo 8988 2 76.71 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAAT:1 + chrX 8200326 3' + flea 4981 2 63.70 TGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTG:1 - chr3R 19450166 3' - roo 9011 2 75.71 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATG:1 - chr2L 6102944 3' + roo 333 2 71.23 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAATGCATGGGTA:1 - chr3L 21996117 3' - Transpac 20 2 76.71 TGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTAT:1 - chr2L 15950935 3' + 1731 268 2 48.63 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGAGGTTATGTATGTGTGGGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTTT:1 - chr2L 18212126 3' - Quasimodo 71 2 67.12 GTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGCTTTTATGCAGGGAAATGTGGCTGGAAATGGCAGCGAATGGCTC:1 - chr2R 12778351 3' - I-element 258 1 69.86 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTG:3 + chr2L 11357914 3' + blood 7319 2 65.75 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCAT:1 + chr3R 29690772 3' + I-element 5276 1 73.29 ACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATA:2 + chr3L 19350047 3' - 1360 3223 1 55.48 GTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATTTGGCAACTGCAACTG:1 - chr2R 15004710 3' + BS 5081 1 44.52 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACA:1 + chrX 18336678 3' - mdg3 64 2 58.90 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCTGCGCCGCGGGTG:1 - chr3R 23491861 3' + transib2 2771 1 59.23 TCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTGCGGCCAAAAAAAA:1 + chr2R 12673619 3' + Doc 4506 1 67.44 GTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAAGAGTGAGTAGGGATAACATTAGCCAGTAAAATTTCCCCAG:1 + chr3R 9097862 3' - I-element 138 1 71.92 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAAT:1 - chr2L 6654660 3' - diver 5960 2 65.52 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATG:1 + chr2L 20840092 3' - mdg1 7080 2 55.48 TTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACAT:2 + chr2R 13259379 3' - mdg1 7103 2 60.27 GGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATAAAAATGATGAATGAAGAA:1 + chr2R 9158114 3' - mdg3 5345 2 78.08 CTTTAGTCGAGTTCCCCGACTATCCCGTTTATTTTTTGCAAGTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACTCTTTAACTCTACGGGTATAATTACGTGAGCAGTAGTGTATGGGAGGATTTAAAGCCTGAATGGTCAATATTAA:1 + chr3R 20126131 3' - INE-1 566 1 61.81 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGCTTTGTATC:1 - chrX 15357634 3' + hopper 1390 1 62.50 AACTAACTCACCACGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCGAAACTCAACCCAAAAACCAAAATCGCCAATCGTCTCAAACAATGTTTTA:1 + chr3L 16961316 3' + HeT-A 5915 1 65.75 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTT:1 - chr3L 25406607 3' - 1360 14 1 69.18 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAA:1 - chr3R 19032580 3' - roo 8708 2 54.11 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCA:1 - chrX 13134870 3' - jockey 4788 1 61.07 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTTCGGCTG:2 + chr2L 19924090 3' + roo 9061 1 71.72 TTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTATATTTGTGTGTTTTTTTCTGCTTTTTTTAAAGTTTCGTTGACTGTTTCATTCGGCCGATCAGTCATTCTCGCGTCAATCTCTTCAAGTTTCCTGCTCTTATATAGACGTA:1 - chrX 11513972 3' - Porto1 4477 1 57.53 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGA:1 + chrX 18010040 3' - 412 7119 2 61.64 ATATGTATATATGTATATGTATATAATATGTATATTATAAAATACATAAAAAAACAAAGCATAATTTATTTTATGTGTCCATGAAGCTGTGATTTACAACCACTGAATGGTGCTCAATCAAAA:1 - chr3L 19784777 3' + G3 4507 1 44.72 AATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCT:1 + chr3R 23618198 3' - hopper 89 1 76.71 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGC:1 - chrX 8027403 3' + Juan 4169 1 48.63 ATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTCGGCTTTTGTGTATTTCTGTTTTCATTTTGTTAAGGCGCAAGTGCCTGGTTTCTGTTTATATAAGCGTAGTAAGATCACCGAAAAAAGTTGCTCGGTTTCAAATTAT:1 + chr2R 6969461 3' - I-element 5211 1 73.97 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTGTCAA:1 + chr2R 20227323 3' + hopper2 1551 1 57.53 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAA:1 + chr2R 13766282 3' - roo 81 2 76.03 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTT:2 - chr3L 17183691 3' - diver 5976 2 76.03 AGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGACTGGACGGTATAGTAGTGATACAGCCAGGAGTTGGCCAGCATAATTGAGGCCTCTCGATCGCTGCAAAAATATAATAAAGTGTTTTCATGTTTT:1 + chr3R 26078694 3' - gypsy5 6963 2 66.44 ATAAGTACCATATGTTGTCTCTCTAAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGAAATGATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTTTCGACAAATTTAGAAAA:1 + chr3R 21619593 3' + Tc1 104 1 57.53 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTATTTGCATATTGCG:2 + chrX 22840628 3' + copia 248 1 78.77 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCAT:1 + chr3L 3983880 3' + P-element 2872 1 57.83 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTTTGCGGGGTAAAAGAACT:1 - chr3R 27083011 3' + jockey 4960 1 58.90 TACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAATCTAATTTTGTTAGTTCATATTTTCTTAGTTATTTAAAAGATGGTAAAATATTATTCTCAGTGTCCTGAAGACTTTCTTTAACCGTATTTTATTTGCCGCTATC:1 + chr3R 8189795 3' + F-element 4595 1 73.97 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTG:2 - chr3L 12249793 3' - roo 8716 2 56.85 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTAT:1 - chr3L 3030220 3' + roo 330 2 76.71 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTAACTCACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGACCCAAATACAAGCTGTTGACACGCGGCATATGTGCTAAAAGCACGGTTTA:1 - chr3L 17567855 3' + S-element 165 2 53.85 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTT:1 - chr2L 15936762 3' + copia 236 1 53.90 AAATATAATTAAACATTAATTATTTTACTTGTATATTAAAAAATTTATTTAAAATAT:1 - chr2L 298985 3' + S-element 105 2 71.93 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTTGTATGTATGTAATATAATGTATATGTATCCGTTGTAAAACCTTTTTAAATATAT:1 - chr2L 21328152 3' + 297 6918 2 65.75 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGT:1 + chr2L 19924050 3' + roo 356 2 52.05 AGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAAGTGTCTCTAGATTATGATCAAAATTTCGACGGTGATGAGAATTCAAACGATAATGAATATGAAGAGGATGATGGCAGGGCTACTGCCGCCGG:1 - chr2L 115915 3' - mdg3 5482 2 73.33 GTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAGATATGAA:1 + chrX 3431998 3' + Ivk 5355 1 63.70 CTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATGCATTAAAAATAACCGGCCATCAAGTATGAATCTATTTTGGTTAAAACGCAACTACGGCGCACTTTAATT:1 + chr3L 10314678 3' - roo 9049 2 54.11 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGAGTTATTATACAA:1 - chr2R 20010149 3' + Juan 4200 1 73.29 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATCTTCAGATAATTCAGACAGGTTTAAATCAATTACTAGGTTTGGTGCTTTCAATT:1 - chr2R 3563042 3' + Transpac 5213 2 74.66 TTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGTGCTATAGCACTATAGTGGTGCAGCAAAGGTTCAGTGGTGCTGGGTCACTGC:1 + chr3R 23491951 3' - transib2 68 1 62.33 AACGCTTACTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACAAATCTAGTATACCCTTTCAATCTACGAGTAACGGGTATAATAATGTGTAAGGGATGCGACAAACAAAGAAAGGCGAGGAAAACCAGGGGATGTTCTGAAAAAATTCGCGG:1 - chr2L 179469 3' - INE-1 32 1 62.76 CAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAAC:1 + chr2L 4754945 3' + Stalker4 7311 4 63.56 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGAT:2 - chr3R 28901236 3' + transib2 2747 1 70.55 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAGGTCAGGGTGCGCCGGTTAGTATGCAGGGCGTTTTGCT:1 + chr3R 5351499 3' - jockey 4713 1 54.79 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCA:1 - chr2R 9870991 3' + roo 389 2 71.92 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATTAA:1 - chr3L 18768446 3' - S-element 77 1 74.13 ACAATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATATTGTTGTCTAACTGAGGGAATGTTGAGGACATTTGCGATGTCCACATTTCTCGAATACCAGGGGGGCGC:1 + chr3L 23854204 3' - HMS-Beagle2 6886 2 55.48 GGCAATACTCGAGGCGCTCAGATTGTCGCATAGTAGTTTCAATGGCCCCTTGTCGAACCATCCCATCTCTTGTTAGAGTCTTCTTAAAAACCTCCGAAGAGGCCGCTGCCCTTGGGGTGGGGCGAACACAAATTACAGCTGCTTAT:1 + chr3R 26357193 3' + frogger 426 1 61.64 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTTATGGTT:1 + chr2L 20266048 3' - roo 52 2 55.48 GAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTGGAACCCACAAAAAACTGTTTGC:1 - chr3R 9557532 3' - G2 2999 1 51.00 ATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTAATTCATTTTTGACAATTTGATTGCCATTTCTTTCGAACGTTTAAGTACATAATT:1 + chr3L 17344086 3' - I-element 479 1 69.86 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATCCCTGCC:1 + chr3R 29084969 3' - 412 78 2 73.29 ATAAATATAAATATAAATATATTGCTTATAGCCGATTTTTCTTCCATCATTTGTTTTAGTTTTAGTTGGGATCGATTAAAGCACTAGCGTCTAAGATATCCTCGTTTCGATGGGGTTAGCAAAAATAAATGAGG:1 - chrX 9755995 3' + Stalker 87 4 76.12 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGAATTTTTATCAGTTGCCATTTATTTGCCAGA:1 - chr3L 5389824 3' + roo 387 2 69.86 ATGCCTTTAAAATTTGCTTTTGCATTCATGCTGTTTTGGAATAATGACTTCTCTGGACTTCTGCTTGGACTTTTAAATTTGTTCTAGAATATATTATAAATTGATGTATTTATATATTAACCTTTTTCAAATACACCTATTAACAT:1 + chrX 15443277 3' - Transib5 212 1 52.74 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTTTAAGCAGA:2 - chr2R 330088 3' + HMS-Beagle2 7160 2 61.64 TTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAAAGTAACTCAAATTTT:1 + chr2L 21570297 3' - Dm88 30 2 67.81 GGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCAAATATTTTTGCTAGCGTT:1 - chr3R 19445904 3' + 1360 79 1 79.45 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCC:1 - chr3R 22642274 3' - blood 7064 2 54.11 AACTATATATATGTATATATATATAGATTTATAGATAGATTCCATTTTCGTTTGCTTAAACTTCATATTGAGTATACGCCACGTCGTCAAGATGATTGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 - chr3R 9485833 3' + 1731 4409 1 63.01 AACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTAAATTGCCCCAAATTAAACTAAACTAAAGTAAGGAAGGGAGAGAGAAATGGTTGTGACAAAACTGTTGTAAATAAACTGTTGGAATGGGATCAGCAAT:1 + chr2L 11432997 3' + I-element 5094 1 74.65 AGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATA:1 + chr2R 20802637 3' + mdg3 175 2 72.00 ATGTATATACATACATGTATATATATATATATATATATATATATCCGATTTCCGATTGCTAACTTGATCATTGAGTACGGTTAAAAGAGTCTAAGAGCAAGAGAGATATAGGGAGTTGCGGTAGTGCTATAAGTTCACTAAT:1 + chr3L 3957701 3' + INE-1 66 1 52.82 AGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTATTAATTTTTTCTTTATTATCCAATAGAGTATCCGATTCCTTTGAAGATGCC:1 + chr3R 16461239 3' + Stalker4 7280 4 65.07 CTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGACAACAACGAACTAACCCAGTACATCTAAATGGGTACATATTTTGATAATCCGTA:1 + chr3R 910154 3' + F-element 132 1 58.90 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAGGTCAGGGGGCGCCGGTTAGTATGCAGGGCGTTT:1 + chr3R 5351495 3' - jockey 4717 1 50.68 GCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATATACAAGGCACAACAAAAGTCGATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTGGTGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGCATACATAATATGTATACATATAATATAATAATAATAT:1 - chr2R 10835618 3' + Tc1 1643 1 24.83 TATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATAT:1 - chr2L 4003669 3' - mdg1 46 2 54.11 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGGTG:1 + chr2R 14051892 3' - roo 20 2 67.81 TAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTATATGCAATCCGACTTAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTT:1 + chr3R 3589233 3' + 1360 251 1 44.52 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGTTAGCCCGATTTAAG:1 + chr2R 8735713 3' - mdg1 7060 2 69.18 ACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCG:1 + chr3L 9809330 3' + 412 7467 2 69.18 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTT:1 - chr2R 9871044 3' + roo 9010 2 68.15 CTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1 - chrX 21087598 3' - mdg3 44 2 60.00 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTA:1 + chr2L 22674928 3' + mdg1 7445 2 70.55 ACACAAAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCAATGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGAAAAGGTCTGATCAACCAAAAAAAATAAAAGAAAACCCAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6342456 3' + Porto1 305 1 63.45 CCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTTGGTTTCCGTGTTTCTTTTGCTCTCCACTTTTATCAGTTTCGGTCAAGATATTTGTATTTGATTTTACGCACCAAGGCTTGGCGCACTTTG:1 + chr2L 6647918 3' + mdg3 452 1 74.05 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATCCCTGCCACCACC:1 + chr3R 29084975 3' - 412 7125 2 69.18 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTGCCAGGTCCGAGGGTGGCAGTGTACACACAGTAATCA:1 + chr2L 5189464 3' - P-element 27 1 45.89 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTAAAGATCTATCTGAAGGGCCAGGAGACGGCCGATGCCTACGACAAGTTTG:1 + chr3R 18971836 3' - Juan 4038 1 69.86 AAAACAAACAAAAAAAAAAACAACAAGACAGCGTTCTTCCGTCTCGTTTCTTTGTCTTCGCTTTTCCTTTCATCTTGTCATTCACCTTTTTTGGCCAACAGAGCATGCTTCTTGGTTGAGAGGAATGGGAAAAAAAAACTCCGC:1 + chrX 3273318 3' + gypsy7 5008 2 80.56 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTG:1 + chr2R 12133856 3' - jockey 56 1 51.37 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTT:2 + chr2L 17180134 3' - Juan 73 1 64.38 TTTTCACCTTTTTTTTTTTATTTTTGCCACCTCATGCCATTGCCTCCTAATTAGCAGCACAGAGTAGCCGAAAGTGGCAAGAGCGCAATTCGGTAGCGACTGCTTCTCAA:1 - chrX 10723335 3' - Bica 337 1 75.45 ATTTATGACTTATAGCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTGTATGGCTGTTGCTATGTGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATACTCACATGAGACTGGCACGTAGGGCTGCATTAGCTGCTGATAGGCGGGCGCACCGGGC:1 - chr2R 17362045 3' - Quasimodo 97 2 58.90 ATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAAACGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAATAA:1 + chr2R 5171819 3' - micropia 3 2 76.74 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTT:1 + chr3R 15072664 3' + pogo 2041 1 60.96 AAAACGTCTGTCCCTCTGGGAACACCTTAGATTCTCCTCCGTGAATATAACTGCGAAACTGAATAAAACTGCGAAAAATGTACGGAATGAGGGTTTCACCAGGGCATCCGTCCAATCAAGTGGTCCGCCGCCAATGCCGGGTATG:1 + chr3L 2596615 3' + baggins 5007 1 61.38 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGGTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTCTCACGTTTTGCGGTTGTTAGTTTTATAATTTTGTGCAC:1 + chr2L 14074591 3' - 297 18 2 71.23 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTT:1 + chr2R 5480003 3' - F-element 60 1 54.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATT:1 - chr3R 19073141 3' - roo 8683 2 67.12 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCA:1 - chr3R 13972968 3' - 412 80 2 71.23 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTT:2 + chr3L 21380609 3' - I-element 75 1 67.81 AAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTTGCATCTAATGTCTTATCTGACGCTGTCTGAATTTGGCAGCAATGTGGACTAGTGGGTTAATATGTCTATCACTTTT:1 - chrX 10558707 3' - hobo 2474 1 58.22 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTG:1 - chr2L 4003660 3' - mdg1 37 2 56.85 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTTAAATCGATATGCGCAGCTC:1 - chr2R 22775382 3' - jockey 4699 1 67.14 GGCCAATACGACTCAGGATCAACATCTGGTTTTCCACCCTGGGATGTTAAGTTACAATATGATGTACGGATTATTCACTTAATAAATAATAATAAAAACAAAAACTACTCCCGCAAAACAGATAAGAGCGGAGTTTGTCCAAAG:1 - chr2R 4090209 3' - Helena 170 1 76.39 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGTTCCACCGA:1 + chr2R 8157313 3' - mdg1 7060 2 70.55 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAAT:1 + chr2L 20266039 3' - roo 8725 2 61.64 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAATTTTTTTTTCCTCTGAATCTGT:1 - chr2R 5941287 3' + copia 237 1 71.92 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTATTTCCTGAGAAATT:1 - chr3R 29084841 3' + 412 488 2 75.56 AGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTT:1 + chr2L 17005817 3' - Stalker2 49 2 50.68 TTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGG:1 + chr2R 5532322 3' - G4 3828 1 68.49 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGCGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACA:1 + chr3R 18093398 3' - I-element 17 1 66.13 GTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACTGAGTATTATGTTCTGACTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chr2R 16256876 3' + Cr1a 4158 1 84.25 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGCGCATCGAACTTACCTTTAG:1 + chr3L 1279160 3' + roo 325 2 78.62 AAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGG:1 + chrX 15946779 3' - INE-1 577 1 51.37 ATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAAT:1 + chrX 22840596 3' + copia 5087 2 57.24 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATT:2 + chr2L 6654751 3' + diver 167 2 55.86 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCACGTTTAAAAAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGATTTCTATATTATAAGTTTTTATT:1 - chr3R 15054185 3' - copia 4905 2 56.85 CAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAAC:1 + chr3R 1844825 3' - Cr1a 194 1 75.86 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTCCCCTGTTCCGCCCACTGTG:1 - chr3L 5881601 3' - pogo 49 1 72.22 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTGTAAAGGTCTTAGGTCATTTGCCCACCCTTATTATAATTACTTGGAATGCAAGTCAGGAACTTCAAGCTTCAAAATCAATTCCAGAG:1 - chr3R 30813302 3' - FB 33 1 63.01 ATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGAATGTCAATAATTGGTCTTACTAATTGTTAAATGGATTTCCTCGATCAAGTATAATGCAGCATTGCTAGAAACACTGCACAGAGTCAACTCCAATTGACGAGTGATTGTTGGCC:1 - chr3L 17945041 3' + Bari2 113 1 80.14 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAA:1 - chr3L 16690893 3' + I-element 5305 1 55.17 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGCAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTTGGTTGAGAATTTTTCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTT:1 - chr3L 12249778 3' - roo 8701 2 56.16 AGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGC:1 + chr2L 10156205 3' - hopper 66 1 62.33 CTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTATATCCCTAAACA:1 - chr2L 15550648 3' - Bari1 49 1 52.74 AAACAATATTTATTTTACTTATACATTCCATAAAAAAAGGCTTTAACTTATGGCCAAAGCCCCCATTGGCTTTACTAGATACTAAACCTTTTAAAATTTTAATAAACTAATTATTAAAAATAATAATTAAATAAATAAATAAAATA:1 + chr3R 545849 3' - S-element 1601 2 49.32 AAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTATTTGTAAGTTTTTAATTTAAGTTTGTTGTGTT:1 - chr3R 19979696 3' - rover 7076 2 60.00 AAGTAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGAAAGCGAGCGGACAGAGGGCAATTTTGGCCATCACCATACAAAATACGCCACCTTTTTCTTATTAAATGGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGGCAGACATTGAAAA:1 + chr3R 19445378 3' + 1360 3268 1 65.07 GACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAAGTGCAAAACAAACTAAAAAAATCTAACTACGAGTTTGACGGTCACGGGGACTGGGCTCTTGCTGCGTTGGTCATTTGTTTCATCGTCAGTAAGTGTGATGATGGCATT:1 - chr2R 13208281 3' + gypsy2 375 1 55.48 ATATGTATATATGTATATGTATATAATATGTATATTATAAAATACATAAAAAAACAAAGCATAATTTATTTTGCACTTTCCTGAATGGCTTTGGGAAATT:1 + chr3L 19784673 3' + G3 4507 1 60.00 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCT:1 + chr3L 1692133 3' + blood 329 2 52.05 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGGAGAAGGAGCGGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAA:1 + chrX 4808601 3' - mdg3 5301 2 54.92 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGTCTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGTGGATTGCGCAGTGAAGGAAGTTGCCAAGGAAA:1 - chr3L 6447029 3' - transib2 45 1 55.65 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATAGTACTTAATAGGACACAATATCAGAACAATTGAAAAGTT:1 + chrX 17717078 3' - FB 81 1 74.66 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGCCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCCTGTCTCCCCGTCTCCCTCCCTCCC:1 + chr3L 16480827 3' - 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HB 43 1 65.73 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCT:1 + chr2L 3234059 3' + roo 351 2 56.16 TAAAGCACAAATATATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTATACGTGAGTTGGTGTGGCCTCCTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 18258739 3' + Juan 4209 1 69.63 CGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAA:1 + chr3R 11937386 3' + flea 4936 1 71.23 TATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTTTCTTTGCTGATCTTCTTGATTCGTATGCATACCTAATCATGGGGTTAAAGTCAATAACCCAAATTGAAATCGACCCAATCCAGACTAAATTTAATACGTTAGCTCATTTGACCGCATCG:2 + chr3R 10647626 3' - invader2 3 2 71.23 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACA:1 - chr2R 13259289 3' + mdg1 371 2 58.59 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAATAAAT:1 - chr2L 7660876 3' + I-element 5329 1 65.07 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCT:4 - chr2L 18549819 3' - roo 53 2 57.53 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATCGACTTACAAACATATTGTTTAATTGTATTACTCTTCTCC:1 + chr3R 14980453 3' - roo 8680 2 74.48 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTT:4 + chr3L 2990011 3' - roo 86 2 78.77 TATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCAT:1 - chr3R 22642296 3' - blood 75 2 66.44 ACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCA:2 - chrX 3431840 3' - Ivk 5340 1 56.85 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGGCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGAAGCGTCTGAT:1 - 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chr2L 12818238 3' + hobo 2886 1 55.97 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGGTACTGA:1 + chr2R 2427633 3' - Doc 49 1 52.05 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGAACAAGGTTAGTTATATTCCA:2 - chr2R 2591079 3' - roo 53 2 63.70 CGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCC:2 + chrX 15200942 3' + 17.6 436 2 60.27 TCTTAAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGTAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAACTTAATACACATTAATATTTGACTATTCAAAAATATTTAAT:1 + chr2R 19292386 3' + invader2 4655 1 72.60 GGCTACTGATCCTGATCAAGAATATACAATATATACTTTATTTTACTGTATGAGTAACGGGTGTAAATTTATGGATTTTTTGTTCTGAAGCGCTGGATTTCAGAGCACTGTAAAGTCCCTAACATTATGTTTTGAACTAATGAATG:1 - chrX 149898 3' - INE-1 87 1 78.08 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGAGGCATAATTAATAGTTAAATATTGAATTTATTGCACTTTGAACC:1 - 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chr3L 23235602 3' + HMS-Beagle2 7108 2 95.89 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTT:1 - chr3L 2989911 3' + roo 9042 1 62.59 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATA:1 - chr3R 904927 3' - rover 38 2 55.48 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACG:1 + chr3L 3983902 3' + P-element 2831 1 47.95 AATAGTTTAGGAGGCATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACA:1 + chr2L 10156175 3' - hopper 35 1 70.59 CATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTCTCTAAGTGCATAGCTAATTTTGTAACTGTATCGTCTTTTCTGTATATTTTTCGCTAACATTCAGTGAGTGTATCTGTGATTTTGTGTACT:1 - chr2R 11450072 3' - I-element 256 1 64.83 CCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCCGGAGCAGGAGAGACGCGGTGGTGAGTGGTCAGCGAGAGAGGGAGATTCAGTCAATTGTGAACCACGGGATTG:1 + chr2R 652158 3' + Bica 4855 1 56.52 ACCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTT:1 + chrX 14722215 3' - diver 5942 2 51.37 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATTA:1 - chr3L 21655840 3' + HMS-Beagle2 7177 2 67.81 GGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTAAGACGCCCTGACCATGGCCGCGATGATGGGCAATGTGAAATTCGTGAAGACTCTGCTGTCG:1 - chr2R 20664979 3' - Cr1a 3984 1 61.64 TTTATGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGCGGATATTTGGGATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAAGGATAG:1 - chr3L 19454913 3' - mdg1 7073 2 53.03 AAATTAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAACTAGAACAATTTCAATAGTTTGCTTGCACTAATTTAAGATGACTCTTCACATACCT:1 - chr2L 4888826 3' + jockey 4832 1 55.47 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAAAAAAAAGGGTTAACAATGAAACGCAAATTA:1 - chr2R 7090589 3' + I-element 5342 1 72.60 TAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAAGTATGCATATAAAGTATATATCTATCGATATGCTGGATATTTCGTATCTAATCCCCAATACTGATTTCAGGCTCGTCACAGTTCAGGACTGCGGATACGATCCCATCCCACGCTGCAGTCGG:1 - chrX 15017890 3' + INE-1 13 1 69.18 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTTTTCGAAATGTATTCAAACATAAATTGGCCAGAAGATAGTCTGACCAATGCCTCAATTTGACATTGATGTGCCGAATGTGGAAATTTTCCTCTACTGACCAAAC:1 + chr3R 22269849 3' - Tirant 11 2 42.76 AATAGTATTCTGAGTGTCGTGTATACTGTCGTGAGTGTACTGAGTGTCGTGTATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGG:1 + chr2R 6885570 3' - P-element 2806 1 21.23 CATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTACTAAGTATTACATTTAATAAATAATAATAATATCTTATTTTATATTCCCATTTTAGGA:1 - chr2L 12116021 3' - Bari1 1543 1 59.59 ATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATCATAACGTTAAGGCAATCCACCTCCTCAACAAAGTCCTCCGGTGACAAATGAAGTGGCTGGCCTACGCTTGCCGCGCAATTTCCACGCCTACGGGC:1 + chr2L 5280490 3' - 1360 343 1 60.71 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGG:1 - chr2R 8099110 3' - jockey 4789 1 63.89 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTA:1 + chr3L 20898616 3' + roo 337 2 68.49 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAAATGAATACATTCACTCGCTGGCCCAACACGCACTCAAATTATTCACTAGCTTAATTGAAATTAAAAAATCGGCAC:1 - chr3L 4210207 3' - mdg1 7060 2 53.10 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTAC:2 + chrX 18010016 3' - 412 90 2 78.08 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCA:1 + chr2L 4713943 3' - transib2 78 1 75.34 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATT:2 - chr3R 27986349 3' + roo 9007 2 63.01 AGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGCCGGAGTACCAACTTCGTCCAGCCTTCCAGCCAATCAATCATGGCCATG:1 - chr2L 14253382 3' - accord2 7343 1 66.44 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGC:1 - chrX 8360540 3' - roo 8738 2 69.86 CCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGTTGTAATTTAAGCAATATAAGTTGGTAGGAATGTATACATAAAAAACAGATATTTGTATGATACACATTGTTAGAATGGGTGAGATGTATTTCCGTTACAATATAC:1 - chr4 1187400 3' + INE-1 130 1 73.29 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTC:1 - chr2R 24427583 3' - jockey 4750 1 69.01 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTATTTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAAATACATAATAAAACATGTTCATAACTTTCCATTACGATCGATG:1 - chr3R 29084896 3' + 412 429 2 61.15 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAGCTCACATTTTCACTAACCTATTAAAGTCAGGGGGGCTAACAAAAAAAAAACAGCAAAACAGCACTGGAAAACAACAA:1 - chr3L 11282190 3' - BS 39 1 46.58 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCAT:1 - chr2R 5674660 3' + S-element 1632 2 77.40 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAAAC:1 - chr3R 24450392 3' - 412 7085 2 60.69 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACGAGC:1 - chr3R 30347278 3' + P-element 2872 1 75.19 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCC:2 - chr3L 16690889 3' + I-element 5308 1 52.74 GTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACCGATTTTTAGGTGGTTTTTATGTTCTAACAACAATTTGGGAAAATTTTACGACAGAATAACTCTAGGGGCAAACAACTCTGTTTCCACTTTTATTTTCCGCCATT:1 - chr3R 10627261 3' - 1360 2993 1 76.22 TAGCTGAGTAACGGGTATGTGATAGTTGCGATGATCCACAAACAAGGGTACTGCCTCGGCGCCAACGAAGGGTGCAGTAGTGTAGGAGTCGTGGCAGAGCGACCTATGGAGCTCGCAACCAC:1 - chr3L 22788660 3' + INE-1 544 1 77.05 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCAAAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAACCA:1 - chr2L 11298025 3' + I-element 5311 1 54.79 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCAT:1 + chr3R 15790136 3' - flea 4719 1 76.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCAAACCATATGTATTTGTAATTAATAAAGTTAT:1 - chr2R 11159221 3' - roo 16 2 66.15 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTG:1 + chrX 18336658 3' - mdg3 5336 2 72.60 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACG:2 - chrX 10319604 3' - mdg1 59 2 58.90 ATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGATAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTT:1 - chrX 3431842 3' - Ivk 5342 1 56.85 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGGGGCTCCTCAAT:1 + chr2L 3234099 3' + roo 9055 2 73.97 AAATTAATAAAAAATATACCCTCTCTTAGCGTCTAACACCAAACGTTTTTCGATTTATGTTTTTGTTTAAACTTTCGAACGCATTAACCGTCAATCAATCAATCAAATACTGGTTATAAGAATATTGTCAACATTCACAAACCAAA:2 - chr2R 11449671 3' - Tc1-2 1360 1 69.18 AACATTTGTTAATTTGGTTGAATTGAAGATTAATTTGGATAGCTATAGATATGTTAAAGATACAAGAAATAAACAAGATTTATTTGTTCAACGAGCACTAACCATTCTAACAATAAAACAAAAAATTAGAGAGAAAAACCCATGAA:1 - chr3L 3004555 3' + HB 1512 1 76.03 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCCGAAA:1 + chr3R 30675460 3' - 297 6632 2 56.16 CTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATAAACGAAATTAACACGACTTGATAGGGAGTCCAGAATTTTCAGCAGCCATGGCAACATCAATAACAACGAAACGGCAGAA:1 + chr3L 25332070 3' + F-element 190 1 60.42 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGTTTTTTATGCGTACCCAGTGTTTATGTT:1 + chrX 18409461 3' - jockey 4742 1 64.38 AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATATACAATACAAAATATATATATAATATATATACAATAATTAA:1 + chr3R 21624147 3' + flea 4955 2 66.44 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAATCCGATACTTTGATCAACTGATTTCTCT:1 - chr3R 21933137 3' + pogo 2046 1 63.70 TATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGAAACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCCTTTAGCTATTAATTTGGATATTTACTAAGAAACTTC:1 + chr2L 17005838 3' - Stalker2 22 2 65.00 CTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTATGTTTCGATT:1 - chrX 6233760 3' - gypsy3 422 2 85.71 AATAAGTCTTATGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCAAGTTCAGATTCAGAAAATTATAATGTTGGCTGAAACAAGTGGATGGCTGTCGGGAAAG:1 - chr2L 18348967 3' + transib2 2474 1 74.29 ATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTAGGAACGGGATATTGCAAAAACGAGAGCGAGATAGCTGGACTCAGTGCTAACCGCTGGGTAATTAAAAAACTTTCAGGCATTTGTTTAATTT:1 - chr2R 17328056 3' + micropia 5124 2 50.00 GTTCGCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTA:1 + chr3R 934266 3' + Rt1b 4715 1 43.84 TTTGTTTTTTTTTTAATAATTTAAAATTATTTTTTTTGTTGCAAAAATTCTTGTCACTTCTT:1 - chr2R 6909507 3' + hopper 157 1 83.87 ACAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACCGGCGAAAGGGCTTTCCAACTAATG:1 + chr2L 6303386 3' + G2 3076 4 87.76 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGGGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTC:1 + chrX 22386792 3' - hobo 77 1 48.78 GTGTACATTCTTATCTCTTAACGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAACAATAATATTCTTATTCCTAACGGGGATATGATCATTATTTAACCAGTAATTCCCACCCAACCGATAAGACAAAAAGCGTGAGGTTTGTG:1 + chr3R 14295528 3' - invader3 5311 2 61.15 TTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTTCTGTGGCGTGTTGCACTTTTTTGGTTCTGTTTGTATTTGTGTGGTGTTTTGTTGTGCCTGTTTTT:1 - chr3R 30547119 3' - Quasimodo 112 2 54.48 ATATGTCACGCATAAAAAAAAACATCGCCTGCCCTCTCTGTCTGCCCCAACTCTCTCCCTGTCTCGCTCCCAAACGCTTTTTAAACTGCTGCCATGTATTTTTAAACTGCGTTTTT:1 - chr3L 9124946 3' - hopper 74 1 76.72 GATTACTTTAAGAGCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGCGTATCATTGCCCCCAATACCATTCATTCATTACAAAGCGACGCTTTT:1 - chr3R 24886841 3' - Cr1a 4245 1 63.36 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTATTAACCCCTAA:2 + chr3L 47011 3' - FB 56 1 54.79 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAA:1 - chr2R 21410843 3' + Burdock 6353 2 58.22 CCAATGAATTTTAATTTAATTTCATCTATGTATTTTATTCATGTTGCTTAGTTCTAAGTGGTGTTTTAGGCAGGGATTTGTTTTTTTTTTTGTAATCACTCCAGTAAACACTTTCGCACACAGTTTTCACCGTAGAAGAAAAATT:1 + chr2R 12982560 3' + Rt1b 118 1 71.72 CACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGCAACAATAAAAGCTGTACACAAGCTGAGTGGACTGTGACGAATGAGTGTGTGAATTAAGTGGCAAAGGCAATTCGATTGGGATGAA:1 + chrX 3464076 3' + hopper 1 2 61.64 TCAACCTTCAACCTACAGACGACAACTAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGCATACAGGAATAACCCAATAGCACAC:1 - chr3L 17275435 3' + Transpac 5146 2 78.57 TTGGTGACTAATAATTAATAACAATATTTATTATGACTCATAACAAGTGCAAAATTAATTGAAATAAATTTGATTTGTCCAGATAAGAGTGTCAGATAAAAAAACTTATATAACTTAAAGAAATATAAGAAATTTTTTTTTGGAAA:3 + chrX 15114440 3' - Gypsy12A_LTR 1823 1 30.14 ATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTATAATATTTTTTCTGCGGTTTCTCCATCGCATCGCATCGGGCAAAAGAAGGCCTTTATCGATTTGCAGTTT:1 + chr3R 12242159 3' - transib2 275 1 67.62 AGCTGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCA:1 - chr3R 19445922 3' + 1360 61 1 67.81 GAATAAAATAAAGCAAAATAAAAAATTTAAACATCCTTTAAATTTGTGAAGCAATGCATCGTTTGGCATGACAATAGCTTATTGCTTATTTAATTTTCTCTCGTATAAAAACGATTGATTTTTGATAAAATTAGTAAAGCATTTTC:1 + chr3R 6824031 3' + TAHRE 34 1 75.34 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGC:1 - chr3R 4461011 3' - blood 53 2 56.16 AAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATATAAGGCAAGCAAGTCCGGATTCCTATCGCCAAGTTTTA:2 + chr4 1128556 3' - transib1 1899 1 76.03 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGGCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGC:1 + chr2L 22193495 3' + roo 8989 2 76.03 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTG:1 - chr3L 18281840 3' - Doc 22 1 65.83 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCAATTAAAT:1 - chr3L 18505651 3' + I-element 5287 1 63.01 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTT:1 - chr3L 2989950 3' + roo 8996 2 69.86 GAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCGAGGACAAC:1 + chr2L 15550793 3' + Bari1 1674 1 60.27 TTATTAAAAAAAAATAAACAAAGTTTAAGTCTTTCTTTTTATGAAATTGGTAATTATAGAATAATTTGAAACGTTTATTATGGCAT:1 - chrX 13355496 3' - hopper 154 1 72.09 AATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAAAAATTAAAGATAAAATATCTAACGAATTCCGAGATGCGTCTCGCAAAAAAAGATCTATCTGATCCCAATCTGGC:1 - chrX 13882978 3' + mdg3 5020 1 53.42 GTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTATTAATTTGTAGTTAGTCGTAGCGAGTAAAGGTCATTTTGTAATTTTTGTAGATCTTCTTGG:1 - chr3R 7273901 3' - Juan 460 1 61.64 AAAAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTATT:1 - chr2L 4025373 3' - copia 5088 2 57.53 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACAT:1 + chr3R 27133673 3' + opus 446 2 65.07 TATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTATTGACGAAAAGTTTCGCGGAAAAGCGATGGGGTTTTTCGGGTGGACAGTGGTCAGGACTTTATGCAAGCAAGCTACTCAAGGACAAGTGACCAACAAGCC:1 - chr3R 15054298 3' + copia 4674 1 77.94 ATAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTT:1 - chr3R 11191384 3' + roo 355 2 55.48 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAATTA:1 + chr3R 27406085 3' + diver 6071 2 54.11 CTATAGTCGAGTTCCCCGACTCGAGTTAGCCGTTACTTAGCTAGGGGAATGCGAACACATTGACCGTTTTTGGTGTTTTGTAGGTGAAAAAAAGGCAAAATGATGGCCCAAAGAGCCATT:1 - chrX 6350757 3' - INE-1 566 1 75.00 AATCGATAGAAATGTACAAGAGAATGTAATTAATATGAAAAGGAAGCTGAACCGAATCGGTTAACCCGATCTATAGGTCATACAAATGCGAATCGGTTATAATTTACAGCTACAGTGAAGGTAAACAAATTGTCAAGATGTTGGGT:1 + chr2L 5000985 3' - INE-1 301 1 74.66 TATACAAAATTCCACGGGCAACTGTGTATTACTAAAAAATTAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAAAAAAAACTAAAAAGAACGATGGTTATATATATGAAAACCAGAAAAGATCGTTATGAAACATGAAAAATCAATAAAT:1 - chr2L 18762830 3' + Tc1-2 447 1 67.12 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACC:1 + chr3L 16470351 3' - jockey 4748 1 69.18 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCT:1 - chr3R 25616475 3' + roo 9042 1 65.07 AGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCAGCTAGATTACACAGACACACAGTCATACTTTGAAAAAGAAAATAAAGTTTATAATACCGAAAATAAATAAATAAAAAATGA:3 - chr3R 16286733 3' + Porto1 236 1 57.53 GATCTTGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTTCTGCCTGTTACAATGCTTTTTTAACGAATCTAGTATAACC:1 - chr3R 14437796 3' - INE-1 132 1 75.59 ATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGATT:1 - chr2L 19817748 3' + G4 3820 1 42.47 TAAATATCCCATCAGTTACCAATATAACAGACACTGAAGTGTGCGCGGAAGGGACAGACAAACAACCGTGCGATAACAACAACAAACGGCAGTG:1 - chr2R 18179846 3' + F-element 4401 1 78.72 TCTAAAGTGTGCACTCGCAAGTAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGG:1 + chrX 22824234 3' + gypsy12 10152 2 53.42 TCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCA:1 + chr3R 28385623 3' - transib2 66 1 61.64 AATAAATCGAAAGCTAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACCAAAAAATTTTCTGTGTGTGGAAAAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAACTAAAAAGCAACCTCGAGCATAAAAACCCCAAAAAATAAATACTTTCA:1 - chr3L 19634022 3' + Doc3-element 94 2 66.44 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAAGAC:1 - chr3R 4461003 3' - blood 7024 2 67.54 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCAC:1 - chr2R 8157166 3' + mdg1 369 2 55.56 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGGTATTCCATGTTGCAGGACATGTTGCGAGTGGGTTT:1 + chr3R 24369176 3' - roo 8668 2 78.99 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAA:1 + chr2R 5151350 3' - roo 8698 2 59.59 GCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGGTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGGATTGTGTGTATTTTGCCATT:1 - chr3L 25482887 3' - accord 45 2 51.94 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGC:1 - chr3R 23618092 3' - hopper 28 1 66.44 AGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTGTGGCACGCTTCAAGTCACACAACACGGCAGCAGGAAGCACTACTACAGCAACAGAAACAATAATAAGGACAGGACCTAGG:1 - chr2R 19977127 3' + Cr1a 4192 1 61.64 AGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGAAACAAAGCTAGGCGAAATGAAAAGAATAATGAAATGAATCGGATCG:2 - chrX 4967318 3' + invader2 427 1 68.49 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGC:1 - chr2L 18212112 3' - Quasimodo 57 2 60.27 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATG:1 + chr2R 21411003 3' - Burdock 27 2 66.44 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGGTTCACTTAAAT:1 - chrX 11661389 3' + pogo 2041 1 67.12 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGGGGG:1 + chr2R 22034708 3' - copia 43 2 76.74 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAAT:1 + chrX 8437776 3' - P-element 37 1 59.59 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAA:1 - chrX 13134855 3' - jockey 4768 1 73.81 TTTTGTTTTTGTTTTTTTTTGTCTGTGTTTTAGGATGCCGGACAGGACCACCAGGAATCCCTCGCAATTACATCAAAAGGAAAACTGCTGGCAAAGAGCCCAAGTAATATTTCAAGGGGGCTGTACGACAGACGCTCTAAAATTAA:1 + chrX 13027654 3' - G2 3076 4 78.08 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACT:1 + chr2L 47226 3' + roo 9045 1 67.12 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAAT:1 + chr3L 13739631 3' - BS 5082 1 77.40 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCT:1 - chrX 12986539 3' + roo 339 2 65.75 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGTCTGATCAGGGCATTG:1 - chr3L 10731757 3' + 297 6928 2 54.11 ACAAGAGTGTCACAGTTACAATACTGTAGACAGTGATACGGTAGATTCAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGGTAAAAACGAAGATGGATCTCCAAAACATTGACTTGTTATTGACTATAAAAAAT:1 + chr2R 3550479 3' - Circe 7327 1 59.31 TTCTTGCTTATGCTTATGTGCATACATATGGAAAAATAATTCTTATGTACTACGTGGCTATGTGACGGCGTAGTAGTGGCTGGGTTTTGGTTACAGTTTGATTGGGTCTGGCTTTCTATTGAATGGGGTTCTGTTCCGG:1 - chr3L 12566871 3' - Tom1 190 1 75.54 TCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAA:1 + chr2L 1924009 3' - G2 3027 2 59.59 ATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATAAAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATTGTAATGATCATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATACATA:1 + chr2R 18487357 3' + INE-1 30 1 49.31 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGTTCTGTTCGTCA:1 - chr2L 19923947 3' - roo 8734 2 65.75 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGC:1 + chr2L 18226873 3' - roo 62 2 60.96 GGCAAAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAATATATGTAGGAAATGGAACAGATCAGCATGAATGAAGTGGCAATGGGCATGGGAGTCCAGTACTCACTCGATCAACTTGGAAAATCGAAGGG:1 - chr3L 20701691 3' - Cr1a 4230 1 67.20 AGAGCTTCATAGCGGCCTCTGCCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGAGCGGACGATCAGTTTCAATTTTGTGGAAGAACTAAACCTAAGCT:1 - chr3R 30369322 3' - gypsy3 86 2 76.76 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCACGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTAGTACGCACAATGAA:1 - chr3R 24369026 3' + roo 346 2 60.27 AGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGAGAACTGCTGACCATGCAATTATGTACGTTAGCCCTCAAGTGGGTGCTCGTATTACGTATAC:1 - chr2R 4794625 3' - blood 155 2 64.71 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTANT:1 + chr3L 17183766 3' + diver 6060 2 55.40 TGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACTGTGTGATCTGTATGGATACACATATGGATACATATATGTATCCAGCAGCTATCTGATAGATTTATTTGATCCCGTCATTTCGCCCAGGCATTTTGCAAT:1 + chr2R 12185255 3' + accord 6994 2 39.57 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTGCTGATGGGCTTGA:1 + chr3R 17673853 3' - FB 50 1 52.05 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTG:1 - chrX 18009948 3' + 412 7470 2 68.49 GTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAAATCACACAATCGCAGTGAAACGAACCTCTCTGCACAGTAATCAAA:1 - chr2R 19866695 3' + Stalker2 7248 1 70.55 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGACTATGCGAAAATTCATATATAAATTTTAATTTTATTGTTTACTTTAATATGTATAATTCGGTTTTATGTCTATTTGGATAGTACA:1 + chr2R 15326974 3' - copia 4905 2 47.26 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGG:1 - chr3L 10373803 3' + 297 351 2 56.55 GTTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAA:1 - chr3L 24934265 3' - HMS-Beagle2 11 2 75.00 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAGCCAATGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACAGGCATAAGGATAAAGGCACTGAGTTCTGGGGTATTACCACT:1 - chr2R 4189758 3' + 1360 3339 1 78.77 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGTCGAGAGG:1 - chr2L 17205189 3' - hopper 52 1 61.79 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATAACCAGCTT:1 - chr2L 6174047 3' + I-element 5300 1 54.11 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAAAAAAAAGG:1 - chr2R 7090610 3' + I-element 5320 1 57.53 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTG:1 + chr3R 19992745 3' + hopper 1381 1 58.46 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAAT:1 + chrX 12129447 3' + flea 4993 2 70.55 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATAT:1 - chr2L 16539606 3' + Juan 4200 1 75.17 ATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCC:1 - chr3L 24213772 3' + invader2 5055 2 59.84 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAGGATGGCAGCAT:2 - chr3R 30946475 3' - Transpac 4944 2 68.49 GCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGTTTCCTGATATCTCGGCC:1 + chr2R 5191122 3' - INE-1 86 1 77.40 ATATTATTATTAATATAATACTTAGTAAGTACCATCGTTGAGATTAGGAAGCAATGGATTTGCGCGTGAGCTTTAGGGACAAGCTGAAACTGGGCGCCAAGTGAGTGCGAAATTCGAAGAGGC:1 + chr2R 22550256 3' - Tc3 297 1 77.24 AACACATGAAACCAATTTACATTTTCGCTTAAACTCTGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAACTCTGTATAGTTAGTCTTAAGCTGACATTACTTTAATAAAGACGTTCCCGCCTGGCTGGCTGACTTTTTTATTTGCC:1 + chr3R 5037098 3' + rover 74 2 79.45 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACATTGCATTGTCAGACAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTGGCCACTGAAG:1 - chr2L 4713877 3' + transib2 2747 1 70.14 AGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTG:4 + chrX 23182942 3' - Idefix 26 2 54.79 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACTGCAATGCCACAATTGTGGTGCATACTTTTAGGCCATTTCAACAATGCTCCTCAAACTGTATGATTTAATCT:2 - chr3L 4219418 3' - jockey 23 1 68.49 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTT:1 + chr3R 15790982 3' + roo 322 2 78.77 TGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAACACTCCCTGTGTGTTTGTGTTTGTCTAACTTGTTGCTTTTGCCGGCGCGAAGTGAACTCGCTCCGCTTCGCTGAGAATTATAATTTCAAATGATTGTGCGTACAATCAG:2 + chr3R 18777375 3' - accord 7032 2 54.11 ATAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCAC:1 - chr3R 5769034 3' + roo 322 2 74.66 GTAAGCCCCGAAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTGGTGCTGGTGTCTCTGGGTCAAGAAAGCGG:1 + chrX 10537946 3' + I-element 5294 1 56.85 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCATAAAGCTAACTTCGTA:1 + chr3R 23639277 3' + pogo 2073 1 61.64 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGT:1 + chrX 11661498 3' - pogo 57 1 60.27 GAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTTGGTGAAATCTGGCGCGTCTTTGTTTAAATCGTAAATTATTACATAAATTTAGTTGGGTATGGCACGCGAATCAATTCTAACGTG:1 - chr2R 8939755 3' - I-element 5014 1 65.00 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCA:1 + chrX 22840587 3' + copia 208 2 50.68 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGATAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGAATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGAGTGTGGACCGAGATGAAACGGAACCGGCAAAG:1 + chrX 661956 3' - 412 63 2 56.85 TTTAAAAAGAACCTAAATTAAAAGACATTTCACGAAGGTCGCTTTCAAACCATTTACCTTAGATTTGTTTCCTACATTAAATTTAAAAAATTAAAACATAATACCAACATTTTACTTTAGATTAAAATTCCGGAATGATCCTGAGC:1 + chrX 11261483 3' + looper1 259 1 54.79 TTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTACGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTT:1 + chr3R 11040169 3' - Bari1 34 1 56.59 ACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCGTTAGTTTAAAGTTTTTCCTGGCTTGGGCTGGAAAATGGATAGATGTTTGT:1 + chr2L 1619972 3' + copia 74 2 65.07 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATA:1 - chr2L 13556344 3' + transib2 2758 1 63.70 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATAACGTACATTATTGCACACATAATTACACACACTTTTCGCACATTTAGCGTTTCGAGTTCCTACAT:1 - chr3R 17736849 3' - opus 52 4 56.16 ATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGAC:1 + chr2L 4713947 3' - transib2 74 1 72.60 ATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAG:1 + chrX 22386762 3' - hobo 88 1 63.46 TCAAATAATAAAAACATCATCGTAACCGTAAAACACTAAAGACCACTTGCGGGTCGTTGCTGCTG:1 + chr3R 28662048 3' + jockey 4988 1 64.62 AACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAG:1 + chrX 21994029 3' - McClintock 5966 2 73.33 GTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTCAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCACGGTGCG:1 - chr3R 20675808 3' - jockey 4901 1 58.90 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTAT:1 - chr2L 10156072 3' + hopper 1391 1 66.44 CTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTATATTTACTAAGTGCAAAGCGATAGCACAAAGATGCGGCGGCATGTAATCAGTAAAAATAAACACTTGCGCCTCTAAATAGATAAAAATATCTTCACTTCAAT:1 + chr2L 21931117 3' - Copia1_DM 44 1 71.92 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTTGGTCAACTGTCTG:2 + chr3R 20441359 3' - I-element 23 1 68.06 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGCAG:1 - chrX 19054200 3' - jockey 21 1 74.66 AGGTTGGCGAAAAGGCGCTGAACGTCTTTGAGCAGACCGGACGGGTCTATATTAAGTGGTTCAGTAACTGACTACGCGTTCAGCAGTCGATAGTCCACACACATGCGCCATTGGCCGGTCTTCTTCCGTACTAGGGCTAAGGAGGC:1 + chr2R 5272085 3' + R1-2 400 1 44.52 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATA:2 + chr3L 18505725 3' - I-element 78 1 71.92 TATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGTAGCTGTCATGTGCTTTT:1 - chrX 21585233 3' - mariner2 259 1 69.66 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTT:1 + chr2R 5480002 3' - F-element 65 1 52.05 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGGTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAA:1 - chr3R 4679448 3' + hopper 1388 1 54.39 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATACATATATTATATATATAAATATATAAATATATTTATATATTTAATTTGAATCGGTTCGTGGTGCGTTTCCGTGAGCTTAAA:2 + chr3R 4217825 3' + 297 367 2 67.81 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATA:1 + chr3L 20711714 3' - jockey 4805 1 51.37 GTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATAATATTTTATAAAGTTAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGA:1 - chr3L 23730763 3' + S-element 1537 1 71.23 ACAAACGGTTCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCTTCCGTTTCCCCAGAACAAAAGCAACGGGGGAGGGCTCGACTGCACTCTCTCGCTTTTTCCCCATCAACAATGTGGCCTGCGCCCAGCCTGCTTAGAA:1 - chr3R 26371413 3' + G-element 270 1 69.47 AAATATAGAATTAGCTTGCTTGTGTGAGCAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAACACAACCAATCCCGAACCCATGAAGAAG:1 - chr3L 8733569 3' - 1360 3263 1 79.45 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTTTTTAAAAGACGAGGTTTATTTGTCG:1 + chr2R 5531247 3' - 1360 58 1 77.24 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTG:1 - chr3R 11469330 3' - Tabor 6909 2 75.97 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAA:2 + chrX 7795634 3' + roo 9032 1 58.22 CTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGACATTCTCGTGGTAGGGATGCGCATTACAGGCAATTCTCAAGCGGCAAAAATTCAATAATAATGGTCAGGGTCAGTGTAAATCACTCTCTTGCCA:1 - chr3L 16428790 3' - G6 1766 1 64.38 CAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAAT:1 + chr2R 19727744 3' + invader1 384 2 73.29 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGG:2 + chr2R 8157278 3' - mdg1 57 2 57.53 GGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAA:1 + chr3R 29534665 3' + Stalker 6845 2 77.40 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAGGGTCCCAAAATAGCTAAATATTG:1 - chrX 20455656 3' + hobo 2889 1 72.28 ATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTACCTAATTTAATATCGATCGGTGTCGAGTCACTCTGATGGATGGATGGATGGGATGGTCGATGTATCTTG:1 + chr2L 11465364 3' + Tc1-2 1460 1 53.91 GGTTCCGTTATGTGTCCGTTCAGAGTTCTATGCCTCTTGTTCGTTTCCCTTAAGGTAATCAGAGATCT:1 - chr2R 17923987 3' - opus 328 2 73.53 AAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCTTAATGTAACAATCCTTTGGTAAATTTTAGAATAGATTTCAATGGCATGTAAGTGGTATATTAAATTTACCTTCATTAGTTATTCATCCTAGTTATTTTGAA:1 + chr3L 20762869 3' - I-element 269 1 75.34 GTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCAGCCGACCCGGGTGACAATAGGTCTGCATTTTCTGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGG:1 + chr3R 15790110 3' - flea 4741 1 60.56 TTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCTGCTAGTTGAAGTGCCACCTTTTCACTGACCGGGAATTCGTCTTTCTGCGAATGTAATTAAAAA:1 - chr3R 2136411 3' - I-element 327 1 81.40 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCC:1 - chr2L 12818253 3' + hobo 2906 1 55.56 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAATTATACATTTTTTTTG:1 + chr2R 6847847 3' - Doc 63 1 58.22 AATATAATAATAATAATAATAAAGAAATAAAAAAATAATGTAGTAAGTGTTGGGGGGAGGTCTG:1 + chrX 7167654 3' + mdg1 7052 4 50.00 AGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTT:1 + chr2L 1923982 3' - G2 3054 1 78.08 TTAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTAGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTATGTATATACAACAAAGTTGAATTTATGGACCCAGTTAACAGTTTCC:1 - chr3L 21821368 3' - Tc3 316 1 76.03 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCT:1 - chr3L 18281861 3' - Doc 69 1 65.75 TGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAACCCAAAAATAATTATTTCAAAGTTTATTTTAGGAA:1 + chr3R 24173829 3' - Juan 3899 1 76.03 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTA:1 - chr2R 21410837 3' + Burdock 223 2 62.33 GGATTTAATAACAATAATAATAACTAATACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTTTGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTAAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGG:1 + chr2L 22805226 3' + mdg1 13 2 57.93 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTC:1 + chr3R 15791030 3' + roo 402 1 75.65 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCCAACACGGTGTCATTGGGGACCGTTGAG:1 - chr3R 5368592 3' + 1360 3368 1 57.43 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGC:1 + chr3L 7889636 3' + roo 324 2 75.34 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAA:1 - chr3R 19032580 3' - roo 33 2 58.52 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGAGTACATAAA:1 - chr3L 17055383 3' - Tirant 8122 2 73.97 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCACCGGA:2 + chr3R 11937426 3' + flea 217 2 62.33 ATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAAGTCTAGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTTAAGGTAAGGGGTTTATTGTTTCTAGTCTAATCACAACTCGAACACTATAATCGGT:1 - chr2R 4923789 3' - Cr1a 4248 1 67.12 GTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAAC:1 - chr2L 14074471 3' + 297 6891 2 79.31 GACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGCCTCAATATCATGATTAGATTCCACTGCTTAAGCAAATATAAGTCAATAAGCTAATAAATTGCGTCCATTACCATAGAA:1 + chrX 21511918 3' + pogo 1829 1 56.85 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTAGCTGCAATTAAGTTGG:1 + chrX 8200278 3' + flea 4933 1 73.97 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGC:1 - chr2R 19199655 3' - hopper 49 1 53.47 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGG:1 + chr3L 18126000 3' - Ivk 24 1 52.17 TATCAGATACCTGTTACTTAGCTAGTAGCAAAGAAAGATACAAGTAACTTTAAAAAGGTATACAAGTATGTATACAAATTAACCAGTAAAATATTATGTCAAAAATTGCAGCCACGAAAAATCGAAACTTACCAGAATATTTTTC:1 - chr2L 22146984 3' - INE-1 546 1 78.62 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATCT:1 + chr3L 18931062 3' - I-element 56 1 54.11 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGAC:1 - chr2R 9871021 3' + roo 9022 2 54.79 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTG:1 - chr2L 4003664 3' - mdg1 41 2 56.85 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTTGGCCTAAAGTTGGTGTCTCTTTTCGACCGCGTTTCTCTGGCACTTCACGTGCATTTCGTTAATGT:1 - chr3R 24090391 3' - roo 8672 2 75.34 AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAAT:2 + chr2L 13556479 3' - transib2 24 1 63.70 AACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAAGTGAATTTATCGACCAAGAACTACACTCTCAAC:1 - chr2R 22762446 3' + accord 84 2 76.71 TTTTTTTTTACTTTTTATTATATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAACAACACATTTCTATTTATCTAATTAACAAAATTAAAATCAACAAATGCCACACTGAATAATAAGCGATAATTTAGCAAACAGCAGTCC:1 + chr3L 17921538 3' - Doc 4691 1 66.44 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTTTATGCTAATTTCCAACTTCCATT:1 - chrX 10537806 3' - I-element 13 1 74.66 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGC:1 - chrX 661854 3' + 412 7488 2 57.53 GTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTAT:1 + chr3R 3920569 3' + roo 327 2 73.29 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTGGCTCTGGCACTTTTTTTTTATTTCATTTTTATTTCGCAGCGTGAGAG:1 + chrX 21216860 3' - roo 19 2 73.97 ACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCTCTCTCAACATCACCACGAAAAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTGTGGTTAGCTAAGGACTTAATCGCTTCGATCGAGGAGAGGTTCACCATCTGGCTGCCGGG:1 - chrX 9153547 3' - Cr1a 4089 1 62.33 GGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTTATCCCTTCAGTGTGTTCTTGCTTCATTTAACCAGCTCTCCCGCATCCGTTCACTAAACAGTGTCAACCAAAGC:1 - 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chr3R 9041849 3' + Juan 4111 1 61.64 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTGGCCGCCATT:1 - chr3R 16630226 3' - FB 21 1 69.18 AATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCAAATGATAGTAAATAGCTATTA:1 + chr2R 12645548 3' - X-element 30 1 65.07 AGTCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTATCGTCTTCTATCCCTTTATTTCGTTACACGTTACAAGCGTTATTACCTATATAAACTCATATATGTACATGCATATGTGCTTTGTTTAAGTGTATCACAGCAATAA:1 + chr2L 13048328 3' + gypsy12 10144 2 53.42 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGCGACCCCGGACGTGTTCCCAATTCTT:1 + chr2L 20821323 3' - Burdock 10 2 68.42 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAATTTTTAAA:3 - chr2L 20265892 3' + roo 394 1 75.34 GATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAACCAAATTGCGCACGCACGAGGAACTACAGCTGCGTGTTGGTGACCTCGTCT:1 - chrX 11707140 3' + Stalker4 6998 4 62.22 AAAAACCAAATAATAATATAAGGAGTTGAAAATAGTATTTAAGCGATGTAATTAGTATTTAGAAATAGTGTGCAATGTATCTTCAAACAT:1 + chr2R 7879177 3' - accord2 455 1 77.78 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAAT:1 - chr3R 4460997 3' - blood 4 2 76.58 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGGGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTTTTTAAAAGACG:1 + chr2R 5531233 3' - 1360 66 1 69.06 AATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGG:1 - chr2R 23780549 3' + Ivk 5294 1 76.55 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATG:1 + chrX 8308506 3' + roo 355 2 56.16 GTTATTATTATTATTATTTTACTATCAACAGAACAGTTCCATCGTTTTGGCAACTAGTTGTTTTTGAAGCAAAGCATTTTTCCATCACGCTTCCATTTCTGTTTGCTAGTAATTATGTGCGCCCACTCTGAAATTTGGCTGTTTTT:1 - chr2R 13021895 3' - invader6 4387 2 73.97 CCATATGGACCTATGGCTCCGAGCAGTCCGGAGCAAGATAGTAGGAGCAGCTGATATAGTCCTAGATTTGGACGAGGCACAGTTAAAAT:1 - chr2R 5038155 3' + Doc3-element 4316 1 69.66 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTTTCCGAGTATG:1 + chr2L 19675084 3' - 297 40 2 57.64 CCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTCAAGTTAGATGAGGAATGAACGAAGTCCCTTTTCCTATTCA:1 + chr2L 19931478 3' + McClintock 6061 2 72.60 ATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATATGAAAAGA:1 + chr2L 18212219 3' + Quasimodo 7307 2 68.49 ATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGATTTAATCTTCGTAATTTGTCTTGACATAATTCAGAGCCCATTAAGGTCTTAATCAAATTTAACAAATCCCAGCAAATCGCATAATTCGATTTACACCGCTCCA:1 + chr2R 20064369 3' + 1360 3279 1 63.01 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGGTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGG:1 - chr3L 27865986 3' - Max-element 8252 2 54.78 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCGAGTGCTGTGTATTTAGACTAAAAG:1 - chr3L 9269845 3' + copia 241 1 71.22 ACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAGAAAACCTTACCCCCTCTTCCATGAAGGATAGACCGTCTAAGCACTAAT:1 + chr3R 5457642 3' + transib2 2725 1 68.49 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTG:1 + chr2R 8157276 3' - mdg1 7097 2 58.90 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAG:1 + chr3L 22035665 3' - F-element 64 1 61.38 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGTT:1 + chr3L 7300254 3' + roo 9025 2 53.42 TTTAATTTCAAATTATAACGTCCAGTTAATTAAAAGTTATGAAGTTGCCAACGAACGAAACAACATTATTGTGCATATTTTCGAAAGCTAAAATTATTAAAATCCAAAATCAGATGTAACTGAAGATCCCCTATTGAAGT:1 + chrX 22701847 3' + invader5 16 2 60.00 ACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAACGCTTGTAATGGGTATCGGAT:1 + chr3R 10736110 3' - McClintock 6005 2 72.27 GGAACTCGACTATAGCCTTCTCTATTGTTTTACAATGTGGACACGCCAACTTGCTTGTCTATTTTGAAATGTAAGCATCCTTACTGCATGCT:1 + chr2R 6163107 3' + INE-1 573 1 80.43 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTT:1 + chr3L 22035641 3' - F-element 88 1 77.93 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACC:1 + chrX 12129434 3' + flea 221 2 61.64 CGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAA:1 + chr3L 22744699 3' - FB 87 1 78.77 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCTGGCACACA:1 + chr3R 4964214 3' - roo 21 2 65.60 AGGAACTATAAAAGCTATAAGATTGAGATTCAGAATACAGATTCTAGAGACAAAGACGTAGCGCAAGTTTGCTGAACCATGTTGCTACGCCCACAAGCTGCAAAAACTACCACACCCACACTTTTGGAAAATGTGTTGATATTTTT:1 + chr2R 5466805 3' + INE-1 156 1 71.92 AATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATAATAATTAAAGAAGATCGAAAAGTGCGCAAAAACACTCCCGTTCGCTTTGAAGCCAGGAATGTATAGCGCTATAGAATCCGCTCAAATACA:1 - chr3L 23913831 3' - Cr1a 126 1 63.57 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCC:1 - chr2R 8735558 3' + mdg1 375 2 53.42 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACGTATATAGAAGAAAGGGCGTCCCAAGGCAAGTGTGAGCCACTGAGATGTTGGAAATGAGCAATTTCTTTGGCA:1 - chr3R 23865927 3' - 297 6621 2 57.53 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCT:1 + chr2L 17809250 3' - jockey 84 1 68.49 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAG:1 + chr2R 7090706 3' - I-element 82 1 71.23 ATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAAGCTGATAAAAATTCTTCATCTGAGAGAGCCAGAGTTCCACAGTCTCAAAGTTCACTGCACCGGGGATGTCTTATCAAAACTGTTCACTGC:1 - chr2L 659858 3' - hopper 304 1 50.68 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGC:1 - chr3R 19073171 3' - roo 47 2 53.47 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGGATTTTTATCAGTTGCCATTTATTTGCC:1 - chr3L 5389827 3' + roo 9047 1 67.81 CGTCCCTGCTCGGGCGCCAGTTTCCATCTCCGATGTCAGTGTGTTTGTTTATTATTGATTTTCATTTTTCATTTCGTTTTCGTTTTCGTTGTTTGTTTGACTGCTGCTTTTCCTGCTCCTTGCTGGCCCTTTTTCTAGCCTTCCA:1 - chr3L 14493483 3' - HMS-Beagle 263 2 64.83 GGCCTTATTCTATTCCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCCTTACATACCCTTTGGCGCGTTGCTTTCCGTGGGGCGAATTCTGTAACTATTTACATTCTACT:1 + chr3L 8315406 3' - Circe 7202 1 63.28 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGCCGCGCTG:1 - chr3L 2544576 3' - Tirant 8118 2 76.12 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCGAAGGGAAGAGCGAGAGCACTGGAG:1 - chr3L 3983778 3' - P-element 33 1 59.71 TTGTTATTTAGAATTTTCATTTGAATGGTACTATAATTTAATATGTTGTTATCATGTTGTTATCATATTAAACAATTTAATGATTGGGTAAATATCTTTATTGCATCAAGGTAGCACTAAAGAAAAATACCACTCTCTTAATTGGC:1 + chrX 19070522 3' + G4 387 1 43.15 ACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAATAGGGCAAATCATAAAAGAAATATAAATGCGCTTCATTTAGCAACAAATTGTTGTGACGACAGAATAACAACAAAATTGAATTCTTGTCCGCTTTCAAATGGTTCA:1 + chrX 19460455 3' + Doc 4670 1 75.34 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTA:1 - chr3L 9809270 3' - 412 84 2 76.03 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATT:1 + chr3L 1117397 3' + 297 6934 2 62.33 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCATGATTTTACTTTTATAGAGAATGTTCAAATAAAAGAAATAATGTAAATACCAAAAATAATTGCCAGTTATTTAGCGTGAATTTCATATACTT:1 - chr2L 20839511 3' + mdg1 362 2 56.85 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAATATCTACTCTT:1 - chr2L 18549795 3' - roo 29 2 64.38 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTGAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCC:1 + chr3R 7719828 3' - roo 53 2 57.24 TGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGC:1 - chr2L 17205195 3' - hopper 81 1 71.23 ATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTCCACAGGCATGTAAACAAATTCGTAAGAATTTTACGATATCGATTTGAAATAAAAAAAAAACGGTTCTCCGGTTTTCGAAATCGTAAGAATTTTTCGATTTG:1 + chr2R 2846977 3' + Tc1-2 341 1 67.12 TAGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTTTTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGTAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATT:1 + chr2R 12645510 3' - X-element 51 1 44.19 CTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCAATTAAAAAGAGGTAAAAAAGCGAAGAA:1 + chr3R 6461293 3' - S-element 1476 1 80.82 GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGC:2 - chr3R 6625718 3' + flea 4937 1 73.97 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCATTTTTT:2 - chr3L 2989887 3' + roo 396 1 76.03 TTCATCTCTGACCGGAATTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACCACGGTGCTCCGGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGTTGGTCTTAAAAAGGGATTGTACCTCTTATTCTACTCTTAAAAGTAAGTCTCAT:1 - chr3R 9395649 3' - Fw2 3688 1 65.07 CGGGACAACATGGACGGGCAAGCCCCCCCGTAGTCCACCGTGCCACCT:1 + chr3L 22221296 3' + G-element 313 1 58.33 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGG:2 - chr2R 8099128 3' - jockey 4809 1 51.37 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGTCCTTGAGACGCATTACCCAGTTACACACACACTGTCACAACCCACCCACACAAACACTCATACA:1 + chr3L 22128575 3' + hopper 1399 1 65.74 TCTGTATGCTGAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGAAAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGAATACAAGAATACTTTACATTCGCGGGGCGGCATACTAATTAATTAACCAAC:1 - chr3R 9069546 3' - INE-1 175 1 61.64 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATACACGTAAATGTTAGGGAAAAAAGCCAACATTACTACATTTGCACCTGGAAAAAATACATGTATACTTGAAA:1 + chrX 15639158 3' + mdg1 7411 2 51.37 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATA:1 + chr3R 15791006 3' + roo 9010 2 62.33 AATTAAACGCAATTTTTTTATTGCAGATGAAAGAAAACGACGATAAAGAATATGAAAACGCAATGATTAAACCAAATTTGCATTTGCCAATTAAATACGACAGCGGAAGTGCCGATAGTGTCAATTAGCATTATTGCCACGACGCC:2 + chr2L 22140797 3' + S-element 83 2 73.29 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTATGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACA:1 + chrX 21224624 3' + roo 331 2 69.86 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTT:1 + chr3R 27986434 3' - roo 73 2 72.60 CCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTCAATAAAGGGCAGAGTTCAGAATAATCTAAATGG:1 + chr3L 5181706 3' - 297 6575 1 76.71 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGCCAGCAATAATTTTGAATTCATTTC:1 + chr3L 22325938 3' - hobo 20 1 70.92 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGT:1 - chr2L 4003665 3' - mdg1 7080 2 56.85 TAATTATATTATTTAAAAAAAATATGCCCCGTTTTCTTTATATGATTACTAAA:1 - chrX 8558950 3' + HB 1544 1 66.04 GTCTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTATTGAAAAATTTGTGTTGACATTTCTTGATGTTGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATTATTACTTAACTGCCATCAAAG:1 + chr3L 20925813 3' - HB 1587 1 64.14 TTTTTTTTTTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTG:1 - 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chr3L 6397650 3' - roo 43 2 52.59 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATATGAAAAGAAACAAATAGGCAACTTGAGGCAACTTTCAAGAGTCACACGTACCACCC:1 + chr2L 18212267 3' + Quasimodo 7363 2 81.16 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACC:1 - chr3L 12004268 3' + P-element 2850 1 41.05 ACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGA:1 - chr3R 21276520 3' - BS 5044 1 51.37 TTTTTTTTAATTAATATTTTTTTAAGGTTTTTTTTAATTTTCATTTT:1 - chr2R 19298638 3' - gypsy7 354 3 61.70 TAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCAGGGGGAATGGGGAATGAGGGGAACCAGAGATCGCCCCGTCGCCTCAATAAATTACTGCACACTAGAATGAA:1 - chr3L 736666 3' - I-element 5090 1 60.00 CAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTG:1 - chr3L 22861737 3' + S-element 1696 1 64.23 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTCACATAGATGTAAGAATAACTGTTTTGAGCAGCTAATTATCAGTGCTAACGAT:1 - 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roo 4 2 77.40 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCT:1 - chr2R 19199646 3' - hopper 42 1 55.48 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAA:1 - chr3R 4964101 3' + roo 9026 1 60.16 GTGTGATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATATTTGAAACGTTCTACATAAATGAATTGAATAGAATAGTTATAGAATCCATAAAAAAATTAAAATTAAAAA:1 + chr3R 8013394 3' + Dm88 4488 2 56.25 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGT:1 - chr2L 20265926 3' + roo 359 2 52.74 ATATCTATCGATATCCCAGCAAAATAATGCAAATTTTCTTTAGATGTCTATGAGATAAGGATACCTTAAGGACAGAATAAATATCTTAAGGGAAAAG:1 - chr4 514938 3' + INE-1 498 1 70.10 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACC:1 - 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F-element 85 1 71.92 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTC:2 - chrX 13134911 3' - jockey 4844 1 73.29 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACT:3 + chr3L 24934425 3' + HMS-Beagle2 7160 2 63.70 TGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCTACTCACTCATTTTTTGGTGGTGCAGATTGGCGGTGGGTTTTGCATTTT:1 - chr3L 521561 3' - jockey 4985 1 55.43 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCAT:1 + chr3R 31264115 3' - jockey 4787 1 57.14 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGG:2 + chrX 1341738 3' - 412 7109 2 54.79 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTT:1 - 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chr2R 19199626 3' - hopper 22 1 69.18 ATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCATGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTT:1 + chr3R 2520347 3' + Tc1-2 1604 1 60.00 TCCTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGA:1 - chr3R 4679444 3' + hopper2 1553 1 52.05 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGC:1 + chr3L 10425856 3' + I-element 5266 1 80.14 TATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCT:1 - chrX 21087612 3' - mdg3 74 2 73.97 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGAC:1 + chrX 6116317 3' + transib2 2822 1 62.07 GATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACGCACACATAAGTTGGCAGCGCATGTAGGAATTGCAAATGTATTCA:1 + chr3R 9952718 3' + accord 7015 2 72.14 AGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGCACACATGGATCAAGTGGTGCAGCAAGAAATCACCGTAAAAGTCTTAAGCAAGATCAGGGAGCTTTTGGGCGTTCACGAGTTCGAAGAAATTATGGGCAACGTG:1 - chr2L 152288 3' + Bica 300 1 76.60 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAACCGAAAT:1 + chr3R 17996284 3' + diver 6069 2 56.16 ATAACTTTTCAAGAACATATTGTTGCTGGATCTTATGCCACTCTTCTAGTATAGCAGCTCTTAGTGCTGCTCCGTTGGAGGCCAGTCAGCTGGTGGCGCCATGCCAGTCAATCGGGGATTCATTTCACCACCACCGGTTGGCATGG:1 + chr2R 23816958 3' - S2 1354 1 52.74 GGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTACACACATAACTTCCATAGAATTTTTTTTTTTGTTTCTAAATTTCAATTTT:1 - chr3L 23354565 3' - gypsy2 6590 2 62.41 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATTTTATCGTTATGCGTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTC:1 - chr2L 22193412 3' - roo 54 2 55.94 ATATTTCTTTTTTAAATATATAGGAAAATATATTAACAAAACAAAATTCTACACAATACACGCGATAAATCCAAGCCAACTATTTGGTCTTTTTTGGAAATATAAAGATTCTTGAGCTATTTACATGGTTGGTAAGTTT:1 - chr3L 304931 3' - TART-C 11036 1 58.27 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGA:1 - chr3L 5532931 3' + roo 344 2 64.38 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATA:1 - chr3R 15724301 3' + Juan 4155 1 57.53 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTGTGTTTTCTAAACATGCATTTATTGCCTTCTATTTACACATAGTATTACATACATAGATGAGATAGAGACCC:1 + chr2L 9932322 3' + I-element 5303 1 53.42 ATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATTGGATAAAGCGTATTGAAAAATAATAACGTGCAAGTGGTTGAATAAAACATTTACCATTAATTAAAAATGGAGATTTGAATAATTGCACCGAGAGTAGCT:1 - chrX 7151084 3' - accord2 7353 1 58.22 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAG:2 - chr3L 7300160 3' - roo 8744 2 73.97 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTTTATTCAACTACGTAATTGTTACTTTATTGGATTCGAAGTTTTACTGAGTAAGA:1 - chr3R 4805577 3' + 1360 3356 1 62.33 CTTATTTACTAATATATATACATACATCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTGTTTTGCCTTACCTGCTTTTATCAGTTATTAATTTTTGGTC:2 - chr3L 22035537 3' - 1731 4420 1 53.42 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAGCAAGACAAATGA:2 - chr2L 21299254 3' + roo 392 2 72.60 TACTAAAACTTTTAAAATTTTAATAAAATAATTAAAAAATTTAGAATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAATATGTGTGAGCTCACATTAAGTAGAGCTCGTGTGAAGAAAGGCATAAGGT:1 + chr3R 20492925 3' + S-element 1436 1 69.86 AATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCACCCTCAGCTGAACAGCATTGTGGAT:1 + chr2L 3588633 3' + Tc3 282 1 75.38 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAAAAGATTATATAATTATATTTAAAAATATTTATTTAACTGTTAACAATGCAGAGTTAGAGAGCTTACAAGATAAATGGTGAAGAAA:1 - chr2L 15940181 3' - pogo 30 1 61.38 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGC:3 - chr2R 8099120 3' - jockey 4801 1 56.16 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATTTTAAACAATTA:1 - chr3R 4460963 3' - blood 4 2 82.07 AGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTCTAACCAACCCATCGCTCGAAAGACGCCCGAAC:1 + chrX 13076541 3' - accord 315 2 66.67 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTCGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATAAGCTATGACAATGACGGCCGACTGTAACCACCGC:1 + chr3R 24090597 3' + roo 404 1 75.34 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCT:2 + chr3R 28901301 3' - transib2 81 1 72.60 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTT:1 - chrX 14722125 3' + diver 6034 2 69.18 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGACACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTAGA:1 - chr3L 9809215 3' - 412 7082 2 64.38 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATATATTATATATATATATTATTATATATTATATATATACATATTAATTAGGGTATTATTGATTACTGTGGGTATGTACGGATAAGAAATGCTATCTTGGCACTCT:1 - chr3L 21969779 3' + opus 7491 2 48.28 ATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCGTACCTCTCATTCACCACCATAACAAATGCTAGTGCGGAAAGCGCGTAAAAAATAGTGAAAATACTCATAGAAAAATAGAAAA:1 + chr2R 17802779 3' + Porto1 219 1 58.57 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCCAGACCAAATG:2 + chr3R 11062882 3' + roo 397 1 73.29 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGGAGGCCACATCCGAATTGATTGACTCC:1 - chr3L 1691975 3' - blood 7024 2 74.65 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACA:1 + chr3L 2145975 3' + roo 331 2 68.49 GTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAA:2 + chr2R 10418547 3' - 1360 3105 1 71.23 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:2 + chr3R 21907536 3' + Tabor 7239 2 73.97 TAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTT:1 + chr3R 17615221 3' + Tc3 304 1 75.56 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGGCGGTTC:1 - chr2R 20802568 3' - mdg3 5314 2 58.22 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAAT:1 - chr3L 10731754 3' + 297 6931 2 53.42 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCACAGTGTCACCGAGTAAAATCGTCTAAGTCTCGCTCCCATTCTTATGAGCTCGAACCGTTAGCCGTATTTAATTAAATTAAACA:1 - chr3L 25974318 3' - roo 38 2 62.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGCCAACCCCG:1 - chrX 8308365 3' - roo 8693 2 65.75 AACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCG:1 - chr3L 21996174 3' - Transpac 4996 2 67.81 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAG:1 - chr3R 15790850 3' - roo 8732 2 65.07 ATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCCTGGAGGA:1 + chr2L 22225086 3' + G5 4770 1 80.00 ATTTAACTAATTTTTATTTTATTTTCAAGATTAGATATTTGTTAATGATTATCTCAACTAACTTTATCTATTTCTTTGTTTTCTTTGTAATTTATTAAAATTAAAATCATTAAAATTGAT:1 - chr2L 12627863 3' + blood 6926 1 61.67 AAACTAATTGATGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTTAGGTGTCCAGTTTGTGAAAATAAACGAATAAACATTGTACGTAA:1 - chr3R 30059408 3' - FB 77 1 71.23 TATAATTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATAC:2 - chr3L 17567896 3' - S-element 1608 2 74.66 AATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGGCACTAAT:1 + chrX 21947718 3' - mdg1 7081 2 60.53 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTA:1 + chr3R 11469391 3' + Tabor 410 2 67.12 AGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACCACCTCTGGCCCAGGTTTTGTAGATGCCTTTTACATATCGGATCGGATCTGATATCCCGCAAAAACAGAGAGCTTGGGC:1 - chr2R 18318060 3' + HMS-Beagle2 6727 1 54.11 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGC:1 - chr2R 18316026 3' - HMS-Beagle2 29 2 57.98 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACAACTTAACTTATTAAGCGACAAAAATTTTACTCCATTGCCAAAGGGAATAATTAGCACTAAGAAACGTTAGGAACTGATTTTTCTTTTGTTTGGTCTGTGATAT:1 + chr3L 8627377 3' + pogo 2087 1 34.93 TATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTA:1 + chr2L 11257135 3' - rover 15 2 71.54 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATC:1 + chr3R 28901318 3' - transib2 64 1 60.96 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGG:1 + chr3L 22035658 3' - F-element 72 1 66.44 CACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTACAAAACAAGGCAAACAACAAACAGAAGTCATTCGTAAGCTCAGACGAAAAAATATTAAA:1 - chr3L 18258516 3' - P-element 264 1 39.73 AGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGGTATTTATAGGATAGTATAATACATTCTCGCATACTT:1 + chr2L 2785519 3' + transib2 2494 1 74.66 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAAC:1 - chr2L 21299280 3' + roo 366 1 56.16 ATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGG:1 + chr3R 30987571 3' - F-element 121 1 60.63 TTTCATTTTTTATAAATTGGCGAGTGCTGGGGGCCTGGTTTTGCGTTAAATTTTAATGAGTTTGTTACTAAACAAGGACAAACAAACGAATTTTTGCCTATTTGCAATTTGTGGACAAATCG:1 - chrX 14974674 3' - Tc1-2 377 1 71.31 AAATATCAAAAAATTGTACCTGCCATAAACTAATTCTAACATAATAAAAACGCAAAAAAAAACAGGAAAGAGGGGCAGCCACAAGGAAAGCAGCGATGGCCATAGAAATTCTATAGAATTA:1 - chrX 16508196 3' + TART-B 10252 1 57.85 AACACGAATCCATCGTTCATCATCTGCAAACAAAAATATTCAACACACAATTAATTAAGTATACATAAAAACACACAATTAATTAAGTTCACGTACACAGATATACACTATTAATTAAATACATACACTTAATTTTTTTTTTTAC:1 - chr3L 25191996 3' + gypsy5 482 1 59.31 TGTCATTAATAACCTTCAATAACCTTCGTTAATGTAAAGGTCGTTATGAAAGTTAGAGATTTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTAACACTATATTTTATATTTGCTTAAAGCTATGCAAATGAAATTCCACTTGCGAAAA:1 + chr3L 19381827 3' - gypsy7 465 1 61.38 AGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTT:1 - chr3L 22890382 3' - FB 89 1 76.03 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCAACACCTGTTATGGCGCATGGGCCTGTGCCCAGGTAAGCCCGC:1 + chr3L 13295034 3' + roo 399 1 79.45 ACATGTCTCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCT:2 - chr2R 5617506 3' + invader1 3944 2 68.35 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTT:1 + chr2L 14074534 3' - 297 6609 2 59.60 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGAC:1 + chr3R 27160161 3' - 412 7118 2 62.33 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTC:1 + chrX 7795592 3' + roo 326 2 73.97 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCAC:1 - chrX 6475273 3' - Doc 42 1 58.90 AATTAAGGTATTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAATGATATATCTAGCACCTTTTTTGCTTATTATTTCTAACCTTTATATTGTGTT:1 + chr2R 13980020 3' + Juan 4028 1 63.01 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAATTCTTAACCGCA:1 + chr2L 20821330 3' - Burdock 6168 2 62.24 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATTTAGAACTATTTGTATACAATCGTATAGCTTAGGATCAAGAATAAGCTTAATAT:1 + chr2L 7581008 3' + Transpac 5166 2 63.01 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAG:2 + chrX 9410571 3' + I-element 5301 1 53.42 ATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATGCAT:2 + chr3R 905019 3' + rover 7226 2 71.92 TTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTGTGAGAAATTAAAAGAGGCGTATCGGAAAGGAAAAATAAGTTCTAACAAGTTTGGAGGATAATATAGAAGTTTACTATAAGAATGATATTCCGCCTAAGCT:1 + chr3R 5442792 3' + G4 3790 1 73.97 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGAAAGAAAATGTAGATTCATACAAAATAAT:1 - chr2L 13844125 3' + Stalker2 7623 2 64.38 AATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTCTACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATATAATAAGAACTAGAAATCTCCTTTTTAA:1 - chr3L 25255413 3' - INE-1 301 1 59.59 ATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCGAGCCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAATGTACGCACCAGTTTATAGGGTGAACAATTGTTCTATGTGTGGATTGCAG:1 - chr2R 5330386 3' + rooA 7499 2 93.15 GTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATA:4 + chrX 23182921 3' - Idefix 63 2 63.70 AACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGTCATCATCACTGTCCCATCCCC:1 + chr2R 14278560 3' - flea 4820 1 56.86 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTC:1 - chr2L 5582135 3' + pogo 2051 1 74.51 AGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTTAAACACAGATCTCCAATAAA:1 + chr3R 23021011 3' - INE-1 574 1 44.52 ACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTT:2 + chrX 14771783 3' + BS 5004 1 78.08 ATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAGTACACACTACTGCGCCTGGACCAAGACCATCAAAATAATGCGTGCAGGGCGATCAAATGCCTGGGTGTCCCGATCAT:1 + chrX 3448769 3' + mdg1 7067 8 84.21 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACC:1 + chr2L 9636152 3' - 412 85 2 75.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGGGG:1 + chr2L 3234090 3' + roo 400 1 78.29 ATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTAAAGTTATAA:1 - chr3L 14094526 3' + I-element 5347 1 72.60 ATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACTTCTCCTTGTCCAGATCATGGAATGTCTTATTGCCCACATGAA:1 + chr3R 19863089 3' + mdg1 9 2 70.55 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTGCGTAAGCC:1 - chr2L 17809135 3' + jockey 4975 1 70.34 CGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGAC:1 - chr3L 23146451 3' - 1360 41 1 57.53 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATCGGATAGGTTCAGGGCGTTGCCCAATGAACACCTAACCCTTACCCCTGTCCACGGGATGCATGTAACAAGTAACGCAACCGTTAATTTCTTGATCAAATTAA:1 + chr2R 11795111 3' - opus 9 2 79.02 CCTTAGTCAACTGACAGCACATTAGTTCGACTCAAAAAAATATAACAACAAATTTAACACGGTGAACGAAACACGAATGAAGAAGTTTTTTAAATTCATACGCAAGCAGAACTAAGAGTCGGTAACGATAACGATAACAAATTCGC:1 + chr2R 11812900 3' + 297 6940 2 68.49 AACAAAAAAAAAAACAAAAAATATATAGGTGCGAATATAGGTGTAGCTGGGCGAAAAGCGAAATGAAAGCCATGTGCCGGATTTTGTGGGCGGGAAAAGCTACTGGCTGATACT:1 + chr3L 9919960 3' - hopper 143 8 90.35 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACTAG:1 + chr3L 6518663 3' + 412 7497 2 50.68 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTATCCGAAGTA:1 - 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INE-1 287 1 39.73 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACTTG:1 - chr3R 24729537 3' + Juan 4191 1 57.53 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTT:2 + chrX 8200337 3' + flea 233 2 71.23 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATT:1 + chr3L 5881690 3' + pogo 2051 1 54.11 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAAC:3 - chr3L 19454927 3' - mdg1 7101 2 58.90 TTTTTTATTTTATAATTTATTTAATTGTTTAATTGTTTTGATTGTTAATTGAACTGTTTTTTTTATATATAAAAAAACATAGCTGCAAGCTATCATATAACTTACATGTTCCTTGCAAAAAGGTAAAAAGGTAGAGCATTTAATAT:1 - chr3L 15760682 3' - BS 5094 1 59.59 AGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACAGAATACTTGCAATACCTTTAGCTCAAAGCACTTAAGCTAAG:1 - 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chr2R 14051715 3' + roo 9046 1 62.33 CATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTTTCCGTGCCCATCAATAAATGAAACTTTTGTGTGTTG:1 + chr2R 15165334 3' - Doc3-element 4541 1 74.66 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAAACCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGAT:1 - chr2L 12818226 3' + hobo 2886 1 51.37 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTG:1 - chrX 15357622 3' + hopper 1393 1 66.91 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTT:1 - chr3R 19073140 3' - roo 18 2 67.81 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAG:1 - chrX 10537858 3' - I-element 64 1 61.38 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAACGGCAGTTCATCATTACAATACATTGCAGTGTGAAGTTTTGAAGAAAATAATACAGAC:1 - chr2L 12250915 3' + 412 7463 2 71.03 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATC:1 + chrX 19588123 3' + roo 9025 2 61.74 AAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCG:1 - chr3R 9298461 3' - hopper 57 1 57.24 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCGGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACTTCAAATATTATTAT:1 - chr3R 4575716 3' - jockey 56 1 49.32 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACAC:1 - chr3R 15072550 3' - pogo 52 1 56.16 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTTTATGAAATTTAAAAAATATCGTGTCTTTGAATTTATTCAATGGGTTTTTTGAAACGAAACTAATAA:1 - chrX 21505634 3' - roo 52 2 57.53 AGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGG:8 - 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roo 6 2 78.08 AGTTACATCTACAATGATGTAAGATAAGAGGTATTTATTTACGAATTCAGACCCAGAGATTAGTAAACAAAGAAAAGAAGTAGGTTTTTTTTATGTATTATTAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCT:1 + chr2L 7098160 3' - Cr1a 4148 1 69.86 AAATAAATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATATTTTCAATGGGCTGGAGATTGTTTGATTGATTGTAAATTGGTTTAATATTTGGTAGTACAATAAATGTAACATAA:1 + chr2R 18513950 3' + G7 1149 1 33.56 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCC:1 + chr3L 25401040 3' - Doc 29 1 56.85 CAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTAT:1 - chr3L 17307313 3' + Stalker4 7106 4 74.66 TGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCGTCCATAAATTCAGGCATTTCATACAAAGCCTTTGACTTTGGATTCGTTTATTCGTTAGGTTTCAACC:1 + chrX 18334201 3' - mdg3 5131 1 53.42 CCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGATGCC:1 + chrX 12829953 3' + R1A1-element 89 1 53.42 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATG:3 - chrX 19054247 3' - jockey 68 1 58.22 AAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAAC:1 + chr2R 5532371 3' - G4 3775 1 52.74 AAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGC:1 - chrX 18336553 3' + mdg3 5465 2 62.76 ATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATCTGAATGTCTATTTGTGCTTTTTTTTCAACCAACGTCAA:1 + chr3R 18292434 3' + Juan 3872 1 63.21 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCGCCTGGCTGTCCTCCTG:1 - chrX 19588018 3' - roo 8693 2 55.56 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCT:2 - chrX 8360552 3' - roo 86 2 78.08 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAA:1 + chr3L 18505726 3' - I-element 77 1 71.23 GATGGGTTTAAAATAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGC:1 + chr2R 4284688 3' + Dm88 4270 1 71.33 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTTGGAAAATTTTGGTTTTGGG:1 - chr3R 24219251 3' - roo 42 2 56.55 ATGAAAATCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTTATGGGGTCGGAATACTGACGCGCACTAATGTATAGAATATATTATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATGTTATTGTCATTAGCTCTAACATAAACATT:1 - chr3L 26719119 3' - Tc1-2 40 1 51.37 ATTTCACGTGCTAGATCTCTCTGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATGTTATGTATTGACTATGTAGTAGGGATTAATGGATAATTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTTATTACACTGTCCCCTCTCCACGATACCCATGTTAAG:1 + chr3R 24501548 3' + G4 3695 1 77.93 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAATAATAATAAAATACAAGCAAGTAAGGAGAGCAATTATCTTTGGACCGTAAACTTTTAATATTACT:1 + chr3R 7943878 3' + blood 365 2 76.71 AGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAATGCATCAGAAGCACCGAGTGCAATGCGTTGTGCATGGTTGCAGACCCAAGATGGCTATCATCATACCCGTA:1 + chr2L 7618596 3' - X-element 4457 1 60.27 TTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCC:1 - chrX 10319623 3' - mdg1 77 2 71.72 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAA:1 - chr3R 15790861 3' - roo 8743 2 72.60 AGTGGGTGACTTATCAAGGATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTTTTCTTATCTGGAATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTGGTTTGGGGGATAATAAAGAACGAATGACCATAGATCTCGTT:2 + chr2R 17805348 3' - Idefix 161 2 76.71 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCTAGTCCAAAAATAAAGTCGGCTGGGG:1 - chr3L 3030171 3' + roo 9043 1 65.07 AATAAAAAAAAAAACAGGAAAATCGAATGGGTGGGAGGGGGAAAAGGGAAAAGGGGCGAAAGCAGGGGAGAAAGCGAGAGAGCGCAACAACACTTGTTGTAATTACTCGAGCAAGTCTCGGTTCAATGGCTGCGG:1 + chr2L 12677508 3' + Bica 337 1 77.04 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGCCGCGATGTCGCGTCA:1 - 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I-element 5160 1 61.81 ATATAAAAAAGAGAACAGGAATGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCCAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAGTCGACCGGGGGTTGGGAAACAGAAACACCGCATTAGGGAGGG:1 + chrX 9712861 3' - Cr1a 4349 1 73.61 GACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAACTTGACCAAATAATAGTTTTATTCTGCATTACAAAAAGTCTTTAAATACAATGAATTATTATAAATTATAA:1 + chr3L 6127245 3' + gypsy4 464 1 53.42 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAA:2 + chr3R 26504304 3' + HMS-Beagle 174 2 67.59 CAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGA:2 + chr3L 20187436 3' + FB 489 1 58.22 AATTTAAAAAAATAAAATAAAACCTTTGCTCTTAAAACTTAATTAACTAGCAGTTATTTAGCCGCAATTATAATTAACCAAATATTGCCCATGACGCAAAAATTGTTGGCGAATTTCATTTAATTTTATTAAGATAGGA:1 - chr3R 20136337 3' + TART-C 11098 1 75.54 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATT:1 - chrX 14722093 3' + diver 178 2 54.11 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGAGTAGCTAACCG:2 + chrX 15357801 3' - hopper 20 1 71.92 AATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGAGTTGAGTTTTAGTTGAGAGTTTAGTTGAGTTGAGAGAGGTCTGGCATTCGCTTACACATCAATGATATA:1 + chrX 15407296 3' - I-element 5240 1 52.05 TGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACAT:1 + chr2L 13556453 3' - transib2 50 1 51.37 AAGGAACTAAACGATTCCTACTGACTAATGAATAATAACAAATGATCTGTTAAGTTGAAAAATAAAAACGAGAGGCACAAATCGGAGAACAAAGAATGCAGCTCCCAACAAGACGATAAATCTTTCAGCATGGTATTTGAACAAAA:1 + chr3R 19320280 3' + G5A 2808 1 60.96 AGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACT:1 + chr2R 2318205 3' - ZAM 17 2 66.18 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGG:1 + chr3R 30347446 3' + P-element 2853 1 58.90 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTTGCTTTTTTTTTTCAAAAATCTCTTTGTTTGCCTATGGTATT:1 - chr2L 14414427 3' + Tabor 421 2 71.23 GTAGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAG:1 - chr3R 14980329 3' + roo 326 2 69.18 AACGGAAAAAGAAGAAAAAAAAACGCGATTGCATATGCTTGTTACACTCCAAGATACATTTTCCGAAAAGATACATTTCCATTTTCC:1 + chr2L 12824811 3' + Doc2-element 240 1 80.46 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGA:1 - chr2L 13556316 3' + transib2 2786 1 59.59 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTT:1 + chr2R 21410961 3' - Burdock 59 2 62.50 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTTTGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGAGTAACCTCGATATATGCACTTACTACACATCATAATAGCAATTCAGGGAA:1 - chr3R 22642323 3' - blood 87 2 77.10 CTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAAAGTTTGATATAATTTAGCGAAAAAATGGAAAGAGAACGCTGTTATTCTTGCAGGAAAAATCCATAATCATAGCTTTCTATGAAACCGGCAGAAATCGCCAA:1 + chr4 148350 3' - I-element 5055 1 73.97 CTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTGCACATAACTACAAGGCAAACAGCAGAACAAATGCGAAGTAAGCGCAGGCAAATCGACAGA:1 - chr2L 4714906 3' - transib2 390 1 61.64 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGG:1 - chr2R 22034621 3' + copia 223 1 63.01 GTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCATAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTT:2 + chrX 16578166 3' + Tc1 1236 1 78.77 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATATGTATGTACATTTATTGAAAAAATGTATGCAATTTTT:3 - chr2L 15913183 3' - transib2 11 1 78.08 CTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAACCACATAACATACATCAACAACATATAC:1 - chr3L 25077270 3' - 1360 55 1 76.58 CTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTC:1 - chr2R 12185340 3' + accord 382 2 73.29 ATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGGTCAATTGGTACATTTGCACATTTCATTAACGTCGAACCCAATGGCG:1 - chr2L 14948384 3' + 1360 198 1 66.39 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGT:1 + chr2R 11804757 3' - pogo 32 1 63.45 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGC:1 + chr3L 1692129 3' + blood 336 2 53.33 AGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATTAAAAATAATTTAATAACTTTTTGGCCAGACAGAATGGATCTGTTCAATACAGGCGGGCCGAAGAAGGGATTGACAAGGCGGAAAACATTTTGCCTGGCAAGGCCTAAAAC:1 + chr2R 22990024 3' - hopper 207 1 74.47 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTATTTAAAATTAATCCAA:1 + chrX 18010068 3' - 412 37 2 55.86 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATA:3 - chr3L 19454888 3' - mdg1 7062 2 67.81 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTTTATGAAATTTAAAAAATATCGTGTCTTTGAATTTATTCAATGGGTTTTTTGAAA:1 - chrX 21505646 3' - roo 64 2 65.75 AATTTAAATTTAAAATTTAAAATAAACATATATAAAACTTTAGTTCTGTAGTACTTAGTAGATGGTCAGGAATGACCATATTTATATCTTGATCGAATTTCTCATAAATCAAGCTTAATCCTAAATTTCATTATAAAAGCGACAAT:1 - chrX 17052915 3' + 1360 3049 3 39.73 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTTCATTCTATCCTTGATGTAAG:1 + chr2R 17926408 3' - opus 37 4 54.69 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGTATGCATATTGTA:1 + chr2L 18549966 3' + roo 9048 2 73.29 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTG:1 - chr3R 13972960 3' - 412 7125 2 65.75 AATACACAAGGAGCTTGGAATGCCATGCGTAGCAGCCTCAGTGAGAGATACACAAAAAGACTGAAGAACCACCAAAACCATTTGGCCATAAACCTCCAAGCGGTGTCTAACGGTTCTTTTTGAAATGTATCTATAAGATGCCTGAA:1 - chr3R 21348269 3' + G-element 4032 1 67.81 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATC:1 + chr3L 9269980 3' - copia 59 2 61.59 AGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCTTTCTTTCTTGTTTTGTTTGTTGACCAGCTTTTGAAAATGAAAATTTAATTTTAAAATATTTTTCTTGTAAAAGGGGAAAAGATATGCATCCTCTTATTTCTTTAGTATTTAA:1 + chr3L 22850624 3' + INE-1 556 1 62.33 TACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACTATATATTTTTTTGTGCTTTCATATTGTTCCGGAAGCACTTATAAAAAGTTTTACAACAGAATCTTTTGCGCAAACTTTTTTTGTTTATATAACCGTTG:1 + chr2R 1772307 3' - Burdock 6078 1 75.37 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATCCCCCTATTTTCAGACATGTGACTAACGATGATTTTTAAA:1 + chr2R 6622673 3' + S-element 1671 1 54.79 AATAAATAAACAAATAAAATAAAATAAAATGATATAAAGGGGCGCCTGAAACAACAGACGCGAGTCGTGCGCATCAAAACCTATACTAAACAATTCGAAACCATTCCATTCCACACGACTTTTGTCCGCCACTTTCGCTTAATGCC:1 - chrX 6511417 3' + HeT-A 311 1 74.66 AAAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCAATGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGAAAAGGTCTGATCAACCAAAAAAAATAAAAGAAAACCCAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6342457 3' + Porto1 309 1 62.86 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTT:1 - chr2R 14051737 3' + roo 360 2 50.68 TGCGAGTGAAAGGAATAGAATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGAATGACGATTAACCCTTAGCATGTCCGTTGGGTTTGAATTAACTAATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTT:1 - chr3L 17667614 3' - P-element 2819 1 15.75 CCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGGA:1 - chr3L 1692000 3' - blood 7013 2 76.42 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGGGGGTATATTTTTTATTAATTGTTTCA:1 + chr2R 4785328 3' + Juan 4157 1 52.74 AAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATATTTTCGTTAAACAACTTTCGATTGTTTACACAACCCACAGCCACGGAAACCGAGTTATACATTTCGATATGGAA:1 + chrX 15027627 3' + jockey 4895 1 65.83 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGGTTCATCGCTCTCTCCTCACCCGCTCCATGCATATGTG:1 + chrX 8437731 3' - P-element 36 1 36.00 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCAA:4 + chr3L 25401042 3' - Doc 27 1 58.22 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGA:1 + chr2R 3563201 3' - Transpac 49 2 50.68 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAA:1 + chr2R 7304143 3' - pogo 38 1 56.85 TGTTTTCCCTTTTTTTTGTTTAGTTGCGTATAAAGTAAGTTGTAGTTGTTTTGTTGCTGTTCTTGTGGTTGTTTTCGGCGGTACATGTGTTTGTTTGTGTGCATTTTCCGTACACACCTCGCGACCAAACAATTTCGCACGCACCA:1 + chr3L 9188646 3' - Bica 339 1 63.70 ACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGGAGATGAGAAACGGATGCAGTGGTCCAACAATGGTTGGAA:1 + chrX 15946818 3' - INE-1 538 1 60.27 AACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACATACAATCGGAAAACTTACATGCCCCCTTGAGCGACAATCTACAGGAAAAATATACAAAATTAATCTCAATTTAAGCATTTT:1 + chr2R 4896818 3' + Max-element 8518 2 65.57 ACTTAACTCTTCGGAGGTAGAAGAGGTACTGATTTCCAGGAATTATACCGTGAGTTTTAAGTTAATTATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCAACACCGTC:1 - chr2L 7125747 3' - I-element 10 1 63.11 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAAAAACACTT:1 + chr3L 6447100 3' + transib2 2767 1 70.34 GAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCAAAGCACGACTGAATATCAATTAGCGGGCCATTATTACCACTAAATGTTTGATTAAAAAAACTAACATTTTGTATGAAAGATTTTCTACCTTGAAATATTCAAAAACTTATTCTTCGTTATT:1 + chr3L 3544416 3' + Doc2-element 218 2 41.78 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCAACACCTGTTA:1 + chr3L 13295002 3' + roo 9030 1 57.53 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGCTA:1 - chrX 17343346 3' - I-element 22 1 69.18 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTCAACTTAGCCATCGCG:1 - chr3R 23911310 3' - 3S18 31 2 64.14 GTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCCTAATCGAACCTTCACTGTAAATACGTTTAACAAAAA:1 + chr3R 14858318 3' + hobo 2861 1 76.26 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAG:1 + chr2L 10156230 3' - hopper 20 1 64.00 ATAATTATATAATGCAGCGCTTGTCAAACTTCCACTTTTCTCCGTTCGCCACTGTCACAGTCACTGTCACTGCCAATGTCAATTGTCACCGAGTTGTGGCGCCCTAGGGCGGGCATTGACATTATGGCACTTTGGGG:1 - chr2R 22351781 3' - rooA 7482 2 73.72 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAATATATATTATATATTATATATATAATATTTTTACATTGTTTTTATCAAATTTCCACTAAATTTG:2 + chr3L 23688662 3' - Quasimodo 45 2 67.81 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGTTTTTA:1 - chrX 21224494 3' - roo 17 2 73.97 CAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTAAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATAATTTC:1 + chr3R 6894857 3' - INE-1 577 1 40.41 AGCTCAGTAAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACTACTCTACATATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTTTTTCATTTCTTTTTAGTTTTTTCTCCAGATTCATGTAACGAGCTATCGCTTGTTTCTTTGAATCTCCTAAGGTGACATC:1 - chr3R 19445038 3' - Stalker 473 1 70.55 TGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTCCAAACAGTACACCTTCAAGCCCATTACTTTTAGTAACAAAATTTGATTTTACACTCGCCGACACACGCACATTAAACA:2 + chr2R 21723848 3' + baggins 5364 1 63.01 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTTTCAAGTGTTAAGTTCATAATTTATGCCCATTTCAACATATTGCCAAAAACGCTTTCAGCTCTTAGG:1 + chr3R 10836680 3' + 297 381 2 54.11 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATT:1 - chr3R 4964082 3' + roo 404 1 75.25 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAG:1 - chrX 14771710 3' - BS 32 1 51.16 AGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCCCATTGGGATTGGTATGTTCTAGTAAGCATTTTAAATAGTTTGTGGGATTCAAGGAAATTCCCAGAACTCTTACAATTTGGCTAAACACATATCCTTCGATCG:1 + chr3L 2836994 3' - I-element 265 1 48.63 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGGTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGCATTACTTAGTCGGATA:1 - chrX 13134881 3' - jockey 4791 1 54.47 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAAT:2 + chrX 11661488 3' - pogo 67 1 67.12 AAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGC:1 - chrX 21216754 3' - roo 8790 2 66.44 GTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTG:1 - chr2R 12472043 3' + transib2 2741 1 73.79 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCACGTTTAAAAAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGATTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATATATAGTTGCACTTTTTC:1 - chr3R 15054155 3' - copia 4875 2 76.71 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCAC:1 + chrX 18336686 3' - mdg3 5280 2 59.32 TATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTATGGTCGGAAACACTTCCTTCTGCCTGTTACATAACTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCT:1 - chrX 16541454 3' - INE-1 84 1 71.92 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCTCATACTCTGAATTTAA:1 + chr2R 5074601 3' - 1360 42 1 47.95 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAG:5 + chr2L 10156239 3' - hopper 32 1 60.96 AAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAAAAAGAAAAGAAAAACATATGAACACAGCTGTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGCACGCA:1 - chrX 21626885 3' + HB 382 1 65.60 TATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTCCATTTTCCACCCACTCCCCCTTTTCCAACTCTAGCTCGCCATTCAGGGTTGCATTTAGAGACGGTCTAAATTTGTTGGGTG:1 + chr3L 413171 3' + hopper2 192 2 57.53 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGGGGCGCCAAACAAATGAAT:1 - chr3R 13972921 3' - 412 7084 2 63.19 ATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAACCATTCAAGGGAAATCTGCCCAGCGTGATCTGTTCATTATAAAGTGGAGAGAATGGGGGGAAACTGACATTCCGAACTC:1 - chrX 5975590 3' - jockey 4905 1 55.17 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGA:2 - chr3L 24131371 3' - Transpac 4956 2 57.53 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACATGTTATTATCTACATGCAGCATCTGCCCCAAACAGATAATAATTATAATCAGCTTTGGGTGGGCGTTTTCGATTATCTGCTGCCAATTCAT:1 - chr3R 7719689 3' + roo 9042 1 65.07 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTA:1 - chrX 19054236 3' - jockey 57 1 51.37 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGC:1 - chrX 14304060 3' - roo 8733 2 72.60 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAAT:1 - chrX 13134853 3' - jockey 4786 1 65.07 ACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGT:1 - chr2L 10156136 3' + hopper2 1520 1 78.08 TATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGAACATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATACTGGGGAATAAAATGGTCGTGTGAAAACATTTATTTATTATTTGCTAATA:1 - chr3R 23890206 3' - INE-1 565 1 75.86 TAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAACAAATGAAATTAAGTCAAATTAAGCAAACTTAACTATTGCATACTTTTGGATACCTTTATAGGTGTTTAGGTGTTAGCTGCACTAACATTCATTCC:1 + chrX 18818807 3' + transib2 230 1 63.45 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGGAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATCATTTTCCTAGTCAATTGAACATTGTTGCGTTAGTTTCCTTGAACGGTTAACTATT:1 - chr2R 7304018 3' + pogo 2038 1 63.70 CTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGCAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTC:1 - chr2R 12185340 3' + accord 7228 2 71.92 ACAAAAGCTTTTTTTTTTTATTGCATTCCTTTTTTATAATATCTCTGATTACCCCGCAATAAAGT:1 - chr2L 2006509 3' - HMS-Beagle2 494 1 33.85 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAAT:1 + chr3R 24381416 3' + Juan 4175 1 67.59 ATATTTAAAATAAAATAAAAAAATTAAACATATGCCACAGCTGGTTTTGCGTGTTTTTCATATTCATTTGAGACATCTGTACACAATAATTCCCTCGCAAATTTTCTGATCGTTTAGCATTGTGTGC:1 + chr2R 11925739 3' + TART-B 10631 1 70.87 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTT:1 - chr2L 14074436 3' + 297 343 2 56.85 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCCAAAGAAAACTTAAGCG:1 - chr2L 71160 3' + 412 7495 2 49.32 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCCCATGAAAAGAGAAGGAAAACTAA:1 - chr2R 5151171 3' + roo 402 1 79.02 GTCCGTATGAACTTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCATAGAAAAATATGGAGTGACCGAATTTAACATCTTTATTCGGCAAGGCACTTGAAACATCGCCTTTGGTCAATGTTTTAAAACAAATAAAAACAATAAAAATTTTGAT:1 - chr2L 21678147 3' + INE-1 133 1 73.97 CATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAACGAATAAGAAACATCACGTGATATTGTGGTTGTATTCAAAAAGAGCACGAAAACCAGAATACCATA:1 + chr3L 14781386 3' + Quasimodo 6 2 54.11 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCC:1 + chr2R 5479988 3' - F-element 71 1 57.97 ATAATCGTTATTAATATTATTAGTGTTTGTTCGCAGGACATACATACATAGATATATTGTATGTATGTCCTGCGAACAAACACTAATAATATTAATAA:1 + chrX 18524565 3' - mdg1 45 2 66.33 ACAAGATCAAAACATTTAAGCGAGCTGCTAAAAGAACCTCACGAGCGCATTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTAGAGATAGAGATATAGTGAGAGCGAAAAAGGAGTAGTGAATGCAAAAGTAGGAGACAGAAAAACTGTAGCG:1 - chrX 5303135 3' - Cr1a 379 1 71.23 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAG:1 + chr2R 7850031 3' + roo 346 2 58.62 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATA:1 - chr2L 6174055 3' + I-element 5292 1 59.59 ATGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTT:1 - chr3L 17183691 3' - diver 88 2 74.66 ATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTATTTATAACAAACATATATTAGCTATAGCTATACGAATGATAAAAGACAAGCATTCTCAGTTTATGCCAATACAATAAACTACGTATAAACATTCTT:1 - chr2L 6645009 3' - mdg3 5193 1 70.55 AGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAGACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGC:1 - chrX 22576286 3' + Burdock 6291 2 50.68 CTATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTT:1 + chr3R 17615220 3' + mdg1 36 6 69.18 GAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCATTACAGTATTTCAGAAATTATGTTCGTGAGTAAATATCATTAAAGCTCTATAAAATCCATTTAACGTCAGAATCCAAGGAAATATTTTTTTTATTT:1 + chr3L 20174961 3' + Bari1 86 1 67.81 AACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATGCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCAC:1 - chr3R 28042951 3' + Stalker2 7576 2 68.49 AACTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTGTTTTATGTGAGCGGAGATGTCACCAAAAAGTGGCTGCATATCGCAAAATGACCCTTGATGGTAGCTAAAGCATCCAAGTAGATCGATGAATGATTTCTATCGATTTAAATTTCTATC:1 - chr2R 5667280 3' + 1360 3273 1 58.22 GTTAGCTAGGGACGGAAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTGAGATGCTGACAAAAGGTGGTAACAATGGATGCAATACCGTATCCGATTCGCGAACTTCCAGGGCATACTTTAAAAATCCGCC:1 - chr2R 5767362 3' - Cr1a 3997 1 60.27 AATCAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATATACAATACAAAATATATATATAATATATATACAATAATTAAAACCTAATTTATATATTAAATGCTTTTACAGCATTAATA:1 + chr2R 1269008 3' + flea 4994 2 72.60 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTATTTACATGG:1 - chr2L 10156064 3' + hopper 1411 2 78.36 CTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATTTTTATGTGTAGCGAATATTATGGAAAACAAAATTTACACAATTAACAGTAAACAACACAATTATACATAGCTCGATAATAATAACAAATT:1 + chrX 9179705 3' + Tabor 335 2 60.96 ATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACG:1 - chr3L 24213783 3' + invader2 5026 2 72.41 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCA:1 + chr3R 5368677 3' - 1360 70 1 64.38 CTTAGCTCAATTTTTAGACTTTAGTCCAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTATATTGTTAAATTTATATTTGGCCGTCTGTTTTTTGTTTGGCTAATGAATCAGCGTCCTTTTTTGGTCACTGTCTATTGGCATTGTTTTTTAAA:1 - chrX 16409623 3' + transib2 2791 1 60.27 AGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGATCATCAAACGCGTCGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGTTTAAATATAATCTAAATATATTT:1 - chr3L 10394223 3' + Burdock 114 2 72.50 ATAATTATTAATAATAATATCTTTAATAATACCTTTTACATATCGGTTTAAAATATTTCTTGCAGTGCATACACCCCAAAGGCTTGCCACCGAGCATCGAACACGTCAATTGGCCGCGAAATTAACGCATTTCGCGCTTT:1 + chr2R 11534985 3' + gypsy9 299 2 60.00 AGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTA:1 - chr3L 10731734 3' + 297 370 2 67.12 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGC:2 + chr3R 15791028 3' + roo 9032 1 58.22 GTTTATTTTACGATACTGTATACGGCTAGGGCCGAACCCAGAATAACCACGAATAACTATGAACCACGTAGCCCCAGTAATAAAGGGAGCTCTACTTTTGATCCA:1 - 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chr3L 16412073 3' - Doc 4702 4 67.06 AACGGGTATCTGAGAGTCGAGAGACTCGACTGTAGAGTTTTCACTTGCCTTGTATAAAATAAGAAACAAGTGAGTCGGCTGTTAAATACCCACTACACTACGACCGCAAGAAAATGAGCATGGATTTGTAAGTGGGAGAATCGGTG:1 + chr2L 21791602 3' + INE-1 553 1 65.75 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTAGAAA:3 - chr3L 9809213 3' - 412 7080 2 65.75 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGA:1 + chr2L 3234077 3' + roo 9033 1 60.27 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGCCCAACCAAAAACGTCACTATATATATTGAAAGATACAAATGCTCGATTTAATTGGGAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGCACTGT:1 + chr3R 15325191 3' - 297 6613 2 48.80 AAAAAATAAAATAAAAAAAAATATAGAAGAATGGCACAAGAAA:1 + chrX 14126682 3' - hopper 143 8 72.09 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATT:1 + chr3R 27406078 3' + diver 176 2 49.32 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCG:3 + chr3L 26290996 3' + Tabor 440 2 52.74 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTACCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCA:1 - 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Juan 4085 1 51.37 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCAAATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACAT:1 + chr2L 18549921 3' + roo 9005 2 62.50 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTT:1 + chrX 13490734 3' + 297 6901 2 77.24 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGGTCGTAGGATACT:1 - chr3R 11062760 3' - roo 67 2 75.00 TTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGACGAACACAAAGTA:1 - chr2L 4888699 3' + BS 5059 1 59.59 TTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCNAGTTTACACACTTTTGANNNNNNCATGTTGCTTACANNNTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCT:1 - chr3L 17567891 3' - S-element 1603 2 65.07 CACCAACAACAAATTACACACAAACTCCGTTTCAATTGTTTCTGTTCACTTAGCACTCGTTTCGAATTCCTTTCCAACCATTCACCAATCGTCGTCCACTCGATTTTCATTACCTCTTCCCGATTTTCCCGTTC:1 + chrX 3545207 3' + Doc4-element 200 1 78.36 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACGGCTAA:1 - 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chr3R 12115223 3' - 1360 20 1 67.12 ATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGATATGCATCACAAATGGCTGGCG:1 + chr2R 22989688 3' + hopper2 1552 1 53.96 CCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACTTGGAAAGAGTGGGCTGAAGAGCCCGCAGAACAAAATGTATAATATACAATAAAAACGAGCAAAACATGAATGAACGGTACGTATCGATTTCACGCGCATGTTGAAGGAAGCG:1 + chr2L 12462276 3' + Tirant 461 1 78.17 ATATTTCAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGCAAAACGGCACTCTAAATACCCTCTAAAGGCAGCTCCTTTCCAAAGTTTATGTACTTTACGAATGAATTCTTCTTGTGCTTCACTTACTTACTAAACCTTTAATTTGTTTAATGTTTT:1 + chrX 5717095 3' + TART-B 10631 1 80.14 CTCTCAATCAGCTGTTTAACACTTAACCTTTAAAAGGCAACAAAACTACGAAAGCGCCCAAAAGGAAAATCCGGTTTTACAACTTCTCTCTTCACACACTAAACACACACATACACAACACTCTACACACACACACTCACACCAGC:1 - chr2L 1970711 3' - transib2 169 1 69.18 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATCCCCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTCAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAATTTTCTAA:1 + chr2L 12251033 3' - 412 20 2 63.45 GGGTACCTGATAGTCGGGGAACTTGTACAGGTAGTCGGGGAACTTGCCAATGTCGGTACTGATTTAAAAATATTATAAGTTCAAATTGTATAG:1 - 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Cr1a 4154 1 80.49 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGC:2 + chr3R 26504299 3' + HMS-Beagle 6964 2 71.23 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGAT:1 - chr2L 16690652 3' - P-element 78 1 26.67 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATGAAACAAAATAGTAGA:1 - chr3L 11913144 3' - BS 5010 1 74.66 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCGCGCACCTGTCTTTTTT:1 - chr3R 9595040 3' + Tirant 351 2 82.11 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGGGGGGGCTTTTGTTTT:1 - chr3R 16157274 3' + pogo 2047 1 55.48 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCT:1 + chr2L 12984240 3' - hopper 40 1 57.24 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGACATTGTCATGGATAGAAA:1 + chr2R 13766333 3' - roo 30 2 65.75 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATG:1 + chr3R 31653176 3' + roo 358 2 53.79 ACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACC:1 - chr3R 11040073 3' + Bari1 1627 1 73.29 TTTGTAGCTTCGCAGATCTCTTTCACAGAGCAAAGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATTAATTTAAGGAGGCACGTCCGACGTGCCTTTTCCCCTTGAACTCATGGATAACAAGTCAGCCGGATCTGCTCTACAGGAGTT:1 + chr2L 7800519 3' - hopper2 226 1 53.42 AGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGAACGACTTTCGTGAAATATTCTATATTTTACGATTAAATTAGCTTAAAATTATCATAATGATGAATGGAACTTACCATACACACACACCATACAGACCATATATTCTGAATATTATTTCTT:1 - chrX 5711885 3' + INE-1 545 1 17.93 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTGGCCGTGTTTGGCATACTGCATTGTGACGCCTCC:1 - 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roo 71 2 67.12 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGCTAAATTTTTGGGAAACCAATATATCTACAACAATAATCCTCTGGCAAAAGAAA:1 + chr3L 2324475 3' - 1360 24 1 63.01 GAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGTTAAAATAT:1 - chrX 21639569 3' + gypsy5 397 2 76.03 CGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGAGACCGTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAGAGGCGCAGGACGAAGGAGGTTCGGGAATGAGCACAAATTGAAAACAATAAGATTTGTTTGATTTACACACCAGCTTAAAAT:1 - chr3R 28992438 3' + Tc3 1285 1 60.27 ATTGGGATTTGGGTAGTGTTGGTGGGTTCTGTTTGTGTGTGCAAGTTAGTTTAAAGTGACGGGCGAATGTTGGGCTGCCATTGTGCGTTGAATTGGATTATCAAATTCTCAATGAAAAGACGGCAATCGAATCTGTAGCTGTCAAT:1 - chrX 15430950 3' - I-element 4976 1 71.92 TTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCAGATTTAACGCACTCAATTGCCGAAA:1 - chr2R 6964788 3' + Burdock 180 2 73.97 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTCACGGGGAGCATTTTC:1 - 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chr2L 5104682 3' + TAHRE 10348 1 73.97 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTT:1 - chr3L 21655862 3' + HMS-Beagle2 7155 2 52.74 ATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATT:2 + chr2L 6654743 3' + diver 158 2 61.64 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGTTATTTCCTCAAAGTACTCTCGTGGTTTTTGTTCTTCATGCGGGGTTGCAATGTATCAAATAA:1 + chr2R 5151121 3' + roo 346 2 55.07 ATTATAAATATTGGTAATAATTCAAGTAAAGTAATTTCTTCTTAGCTCCACCACTCACGTGCTCCTCGAAGTCAATATTTTCTTGATGTGTAACTAAAATATAATTGAGTGGCTA:1 + chr2L 773092 3' + Gypsy12A_LTR 1811 1 65.22 AATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTTTATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTGCAATTTGCCT:1 + chr3R 6014083 3' + hopper2 1559 1 68.49 ATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCTGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTAGAAATAAGTCCCATAAAACCGAGGCATTTGTCAAGGTAACTACAAGTAACT:1 - chr3R 11046886 3' + 3S18 5868 2 64.83 CGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTAGTAGCATTCTTTTCTTGTAGATAGGGCAACATATACATACACACACACA:1 + chrX 988463 3' + Quasimodo 7316 2 59.84 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTCTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTT:1 - chr2L 22674751 3' - mdg1 21 2 68.89 AAATTTATGAAAAAAATTCCCAACAATTTTTTACAAATGTGGGTGTCGGAGTTTTGGGTGTTTTGTAATTGTTAGGAGGGGCCGAAGTGTTTTTGGCTTACCATAAACATTGACATCAAATTAAATAAAATCAAA:1 + chr2R 10289569 3' - INE-1 395 1 62.22 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGT:3 - chr3L 5389872 3' + roo 338 2 68.49 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAAT:1 + chr3L 7889685 3' + roo 9037 1 61.64 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGCCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAA:1 + chr3L 19350016 3' - 1360 3254 1 54.79 TACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAATAAATAACTTAAGACTGTAAATGATTTATGTTTTTTTAACGCGTTCTACGAATCTTGTTTATTGACATATGCTTGATT:1 + chr3R 27191194 3' + Doc 73 1 58.46 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGCGGATTT:1 - chrX 6475256 3' - Doc 25 1 70.55 GTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTAACTTACTTATACTTATAATGTAACAAATAAATTTCATCTGTAAACAAGCTTACTTTATTATA:1 - chr3L 25752842 3' - Quasimodo 7094 2 56.85 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAAC:1 + chr2L 14523287 3' - HMS-Beagle2 17 2 43.15 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAA:1 + chr3R 13187485 3' + I-element 5286 1 73.17 CTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATACCCACGAAAAAAAAAAATGAACAAAAAATGGCTGAAATTCAAAACCCGAAAGAGCAAAAGAAGCTCAAATCCTCAAAGAAGCCAAGACAAAGGAAT:1 - chrX 3430757 3' - Cr1a 4095 1 45.21 ATTTTAACATTAGTTCTTGATAATGAGTTACTACCTACTTTTATTTTATTGATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAAATGAACGAAATTAAAAAAAAA:1 + chr3L 18851967 3' + Tc1-2 290 1 70.48 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGGTACAAGGGTT:1 - chr3R 17077074 3' + roo 9034 1 59.59 TTTTTTATCGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGTTTCCTTATATGTGTGTATGAATTTTTTTTCTTGGT:1 - chr2L 18320567 3' - G-element 4312 1 73.97 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACACAT:1 + chr3R 17996275 3' + diver 172 2 52.74 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATATACACTAGATCATGAACGGTGGTGGGTGGTGGTG:1 + chrX 1264026 3' - Burdock 78 2 79.31 ATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAATAAATAAAATGTTATTATCAACGCCTTTACGATTATTAAATAGTTAACCAACA:1 + chr3L 8673374 3' + I-element 5282 1 67.81 TTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTTTTGCTGGGCTGGGAGGGCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTTAAATTCAGGAAAGCAGTCAATGAAAAAGTTATTAATGAAATATTAACATTTTATA:1 - chr2L 17765928 3' - Doc 4595 1 56.20 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGCCCCCAAATATATAAATTAAAAAACCATAACGATTATCGCAGTCATT:1 + chr2R 10411427 3' - 297 47 2 64.55 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCTCTGGCTAACAG:1 - chr2R 10078125 3' - jockey 74 1 54.11 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGAACAAGGTTAG:1 - chr2R 2591089 3' - roo 35 2 70.34 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGGGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATCCATTCAGAATTAAA:1 + chr3R 15807472 3' - FB 35 1 60.27 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCATATCCTTTATTCTTTCCTCAACTGTCT:1 - chr3L 13365711 3' - BS 5019 1 60.27 TCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCT:1 - chr2L 3675848 3' - Juan 4088 1 58.22 AAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGGGGATTACGAACACCCAC:1 - chr2R 3593614 3' - gypsy 7011 2 64.39 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTA:1 - chr2L 22674749 3' - mdg1 7068 2 66.44 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGAT:2 + chr3R 7420318 3' - 1360 45 1 56.16 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCA:1 - chr3L 2989893 3' + roo 390 2 71.92 GTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTT:1 - chr3R 19407906 3' - diver 67 2 63.70 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAA:2 + chr2L 19924026 3' + roo 332 2 67.12 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCTGACTATATAAA:1 - chr2R 1461347 3' + 17.6 485 2 66.67 AGGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGATCAAAACTGTCACGTCCACACTTTTGAAATGCGTTTTAATATTTATCTTTGGAAACTTCAAACAAACCACCTAAAACTGTCAAGCCCACACTTTTCAGTAATTTTAAATTTTT:1 - chr2L 10281265 3' + INE-1 216 1 57.14 CTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATC:1 - chr3L 24131413 3' - Transpac 4998 2 74.66 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGTGGGTAAAATT:2 - chrX 19539429 3' - pogo 9 1 56.16 TTCACCGATGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATGTTCTCTAAATTCATAATTAAGCTGGCGCGACATATTAGAAGGGGGAGAGTTATCCAACCCGTAAATATAGCACTCTAAACATATTTTAAGCTCCAATCTCAGCAG:1 + chr4 1155866 3' - invader4 231 2 66.44 TAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAGTCGGATTTGACATC:1 + chrX 18336722 3' - mdg3 5265 1 76.26 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGGCGGGCGGTCTTT:1 + chr3R 16157409 3' - pogo 31 1 60.29 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCGTATGC:1 - chrX 15357612 3' + hopper 1402 1 73.57 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGAACTCGAAA:1 - chr3R 30675360 3' + 297 6902 2 72.60 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCAATCAATTCGGTGCCGCACTAGAGG:1 + chr3L 13581756 3' - jockey 4765 1 76.85 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATA:1 + chr3L 24486371 3' + flea 4980 2 62.33 ATGTATATATGTATATTTATATATACATATTAAGGGCTCCGCGTGTTGGTAATTAGAGTTCTTAATCATTATTATAGTTCATTATAGTTCTTATTATTATTATAAAAAAAAATTACATTTTAAGCATGAATCGTTTCT:1 - chr2R 18858176 3' - Stalker4 7047 4 33.33 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAAT:2 + chr3L 12315809 3' + transib2 2749 1 67.81 AAAGTTAAAAATAAAAAAAAAACAGTACAGATTTTGAAATCCTAAAATATAAATGTATTTGCCATTTTTTATAAAAGGGAATATTCCTTGTGTTATTTGGGTTTTATTAATGATTCATAAAGAAATACACAACTTTTTAAAATATT:2 - chr2L 19100422 3' + TAHRE 10441 1 39.04 ATATTCTTGATCAGGATCAATAATCAAATCGATCTGACTTCGGTTTGGTCAAATTGACCGGCATTTTGGGTTTGTTCGTGGGCACTGGAGGTTTGGGTTTCGGTTTTGGCAGTGGCGTAGGAGCCGTCTTGACCTTTTCCTGG:1 + chr3L 14508305 3' + INE-1 84 1 75.52 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAA:1 + chr3L 18505769 3' - I-element 34 1 62.33 CGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACC:1 - chr3R 9038934 3' - Juan 4028 1 54.64 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACATTGCCTTCCAGACCAGCATC:3 + chr2R 8099274 3' + jockey 4982 1 71.92 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTTTCATATTTTTTGTATATATGGATGTATATGTATATGGACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTTCAT:1 + chr3R 4679588 3' - hopper 17 1 61.15 TTATGGACAAGTCCAGAATACTGGCACATATCGTAAATAGCGACCCCCCAGTGAAATAATAGTGAAACTTAAACATTTTCATTCAAAAAAGGCGTCGCTCATTAAGCGAGAAGTGAGTAGGCTAAACGAAAAAATAAACAACCATT:1 + chr3R 16059697 3' + X-element 81 1 63.70 AACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCCTTTCTTTCCGTTCTCTTTTTATATTGATTTTCATTTTATTTCGTGGTACAATTTTTATAATTTTTTTATTTTAGTGGGAAATACTATAGCTAATATTTATATTAAGTATTGGTTTCTT:1 - chr3R 31971794 3' + INE-1 553 1 87.67 ATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGTTGCATAAATCATAAAGTCAATAATCTCAGTTTCAATTTAAAAGTAGAATTATCTATTATTACTTAGTATCAATGCATTTATCCCTTAATATTTTAT:1 + chr3R 20211689 3' + 1360 412 1 67.83 TAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTT:1 + chr2R 4206659 3' - 1360 318 1 73.79 GAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCATAGTTTATCCACCCCCCACCCCCCTGCCCG:1 + chr2R 10561388 3' + jockey 4636 1 56.67 ACGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAAATTATAATTATTTTTTTTTTGTTTTTGCTATTTTTGTTTTTGTGTTGTTTTTTTTTTTATAATATATATAATTTTATAAAATTGTATTTTGATTTGTTATTTATTTATATGTGTGTA:1 + chr3R 2259876 3' - Stalker2 7207 1 66.44 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTT:1 - chr3R 18399350 3' - Juan 4041 1 28.91 TTTTATTATAATCCTTAACATCTTTAATAAGAACTCGGTTGTGGTTCTGCATATAATTGTTATTAAAATAACCATATTAAAAAAAAACAATATATTTATATATTTACTTCCTTGTCACAACTAATGGGTTAATTCTGGTTGGGG:1 + chrX 14123328 3' - Stalker4 459 1 81.25 GGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAAAACCACTTAAGG:1 - chr2L 7618433 3' + X-element 4679 1 56.85 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTACGCG:2 - chr2R 8735552 3' + mdg1 381 2 57.53 GAAGAAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTACAAAATCTAATCAAAGGACCCCGAGGCGCCAATGACAACAACAGCAACAAATAGGACAGCGTGTAATTACATCAGGAAAACTGCACAGAGCCAACAAAA:1 + chr3L 14504093 3' + HMS-Beagle 374 1 70.55 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGT:1 + chr2L 20118506 3' + S-element 1671 1 54.79 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCT:1 + chr2L 18226863 3' - roo 8736 2 67.81 AATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATAAATTGCAAGCGATTTGAGGGAATAATTTGATGATGTTCTCGTAACGTTTAAATCCTCAGCTCGTAGGAAGATTTCAAAGCACGTCTCACAAAT:1 - 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chrX 17343349 3' - I-element 25 1 67.12 TTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACGACTTGTCTTGTTGTTATTGCAGTTATACATTCGTAATATAAGATAGCTGATTATCTTACAAGATTGTC:1 - chr2R 7804972 3' + copia 142 2 52.41 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATT:1 + chr2R 10411415 3' - 297 15 2 75.76 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATTTTAATAACATGCCAACAATTCATCCCCGTTTA:1 - chr2R 5674651 3' - S-element 74 1 74.48 AAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTATT:1 - chr2R 9966922 3' - Bari1 2 1 60.42 AGATATAATCCATTTGTTGAATTCTGTTTTTATTTTTTTTTTAGACTTCAATAACTTGAACTATAGCTGGGCCAAAAGGAGACCGGG:1 + chr2R 3130167 3' + Tc1 1377 1 49.43 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCT:1 + chr3L 12249904 3' + roo 9037 1 52.07 TATAATAATAATAATTAATTATAATAATAACATAAATCTCCCAAGTATTTCAAATCAATTAATACCCATTATTAATTATGAAACCATTTGTTTACAATTAATTGGTTATGCTATGTCCTGCCAATATTAACGTCTATATTGCCTTA:1 - chr2R 15720672 3' - Tc3 272 1 76.71 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAAT:1 - chr3R 25616506 3' + roo 347 2 59.59 TTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTTGT:1 - chr3L 947588 3' + Burdock 180 2 71.92 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCTAGATAG:1 - chr3L 17183627 3' - diver 5905 2 67.59 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAA:2 - chr3L 18046589 3' - roo 48 2 52.74 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGGGACGGTGTGATTTTATACTTCACCGGACCAGCG:1 - chr2R 4830317 3' - 1360 79 1 93.15 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTAT:1 - 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HMS-Beagle2 6951 2 65.75 GATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCATTTTTCCAGCAATTTCTTTCGTTCAATTCTGTTTCAGCTTCGGTTGAGTTGAACTCCGGTTCAGTTGCATTTACTACTGCTGGCAGAAGCATCT:1 - chr2L 4089107 3' + FB 123 1 66.44 CATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTTATCTATGC:1 - chrX 10445508 3' + INE-1 541 1 81.69 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTG:1 + chr3L 6518638 3' + 412 429 2 65.44 GTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTAT:1 - chr2R 9966923 3' - Bari1 5 1 58.90 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTTTCTGTGGCCAAAAGCTAAGCTAAT:1 + chr3R 17736996 3' + opus 492 2 75.59 GGGAGTGAGAACGCGCGGACAAGTCGGAAAGGAATAAACAGTGTCGGGCTGCAAGATGCCCAAAGGACACGGAAGGACGATCACCATGGGCCAACCATAAATTACCCGTTTAATGGACTCGACGC:1 + chr2R 15841694 3' + gypsy8 444 1 68.80 AATTCGTTCAATAAGCGTTATACTTACAATATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCTGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTATATAAAATATAATATTAATT:1 + chrX 7480425 3' - Burdock 481 1 76.55 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAG:2 - chr3L 1692040 3' - blood 82 2 75.34 TATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGA:3 + chr2R 3564121 3' + Tabor 402 2 73.29 AATTCAATTAAAACCTTTAATACAACTCACCATAAGAACCCTAGAAAGGGTATTTGTATGTAAAAACCAAAGCTTTCAGTGACTTTCACTGAAACTAAGAGACAACGATTAAGAGAACCTCTCAAGACGG:1 + chr2L 18113560 3' - Tc1 305 1 71.54 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTT:3 + chr2R 8157295 3' - mdg1 40 2 58.22 TTTGTGATTCTGTTAAAAATACACCACGTGTCCAAATATTTACAAATAAAATGGAACATCAAGGTCAAGGTGATTAATATGGATTCTATATAATATATTTAACGTAGGCCCTGTGTGTACACACTGTTACATTAG:1 + chr3L 22879272 3' + transib3 221 1 74.81 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATATAGTCCACATGGTCACAGAATTGGG:1 + chrX 16946748 3' - FB 35 1 62.33 GTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTCGTGTTCATTAGCCAGAAACTCTCCAGCTCCCCCTCTTCTTTTATGTATTATTTTTTGGTCTCTT:1 + chrX 15195562 3' - Tirant 392 2 57.53 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGACTGAACTTGCGTTGAAGGGGCGTCGGCTTAAGAACCAACTTTCTTTCTCAGTGCATCCCTTCTGGTTACTTGGCTAATTATCTATTTTAGCG:1 + chrX 10639204 3' - FB 30 1 62.33 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAAT:3 + chrX 7795613 3' + roo 9011 2 59.59 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAANTNCGCACNCNTGCCCAAAAGGAAAATCAAATAATA:1 - chr2R 15326790 3' + copia 246 1 73.79 TATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGCTTGTTGATGGGATTGTGTGCTGGCTGTTGGTTCTCACAGTTGTGTGTCTTTTTCCTAGTTTTTACTTGGCCCCTGTTACCCCGTTTC:1 + chr2R 12999112 3' - I-element 5135 1 62.33 TAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCTTCATGTTTTCTGTGGGTACATAATTAACTTTAAATAAATTTTGTCTTTTAAGTGCTTACCAAGAAATTATCCAAACAAATTCCCCAAAACTATATTATAAATATAATTCT:2 + chr3L 6778549 3' - Dm88 4226 1 60.27 AGAGTGCATTGGACTTCAGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTT:3 + chr3L 25350809 3' + baggins 5355 1 66.44 GGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGCATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACCATTCGATCCGCACATCGGGCGAAATAAAGCCACATTAATGTCATTAAGTCATTAAGTTGTCTTAGC:1 + chr2L 12474060 3' + I-element 324 1 54.11 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGCCGCTTGAGTGGCTCCTGATTCCGACAGTAATAACGTCTTGGCCGCCC:1 - chr2L 8338082 3' + P-element 2881 2 76.67 TATATACATATGTATATATATGTGTATATAATACTATATAGAGGGTGGTAAAAATTGTAAACATAAACCATAAAAAACAACAACTTGGCCAGCAGAGCGGACACATCAATTAATTGTCAA:1 - chr3R 13870802 3' + G3 4508 1 52.50 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTATATGCATTTGGCAACAATTTATAAGGGCAATACGTGCAGGGCATATGCCC:1 + chr2L 15188453 3' - 297 18 2 60.82 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGCGGCTGCGGCCAAAGATTACTTATG:1 + chr3R 11810769 3' + roo 9039 1 45.31 AATAATAATAATAACAATAATGAGCAACTTACGTCAGAGGGATGCGTTGCACAATGCAATGCATTCGCAGCATTTTCAGGCTGGCAGAAAGCGCCGGGGGAAAACTTTGTCTTGATAACACACACACACACACACACAACATGTC:1 - chr2L 10036739 3' + mdg1 7060 3 73.79 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCAAAAGCTAAGCTAATGAGGTTGTCG:1 + chr3R 17737006 3' + opus 486 2 75.52 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCGCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACC:1 - chrX 13134871 3' - jockey 4804 1 52.74 GTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGCTGGCATTGTTGAAGTGATAGATGGGATACTTGTTGGTAATGGCTTTTTGTGTGGTCTCTGCGGTCTGGAAGGCTTTTGAGGTACCACAAT:1 - chr2R 5925961 3' - F-element 4456 1 47.95 TAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGGTGTAGC:1 + chr2R 9500084 3' - roo 188 2 69.86 AACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTG:1 - chr3R 15724309 3' + Juan 4147 1 63.01 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGGCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGG:1 + chr3R 21630362 3' + I-element 5306 1 52.74 GTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTTTGGGTTCTTTAATTTTTTATTTTCACGTCTCATCGTCGAGTATTTGTTGTTGCCCCTGTGG:1 - 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Juan 4030 1 78.77 AACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATTCAATCTCTATGCAAGCCGCTCGGATTTTCCTTGATTTTCCGAC:1 + chr3R 19225167 3' + HMS-Beagle2 7199 1 85.62 TATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTT:2 - chr2R 5410959 3' + Tc1 1358 1 54.79 TATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGGTTTCTT:1 + chr2L 16946120 3' + hopper 1343 1 64.38 CATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAATG:1 - chr3R 460073 3' - F-element 117 1 59.69 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTT:1 - chr3L 23287205 3' - 1360 45 1 53.42 AGTTAATATCTAATTTCCTAACTAATTCCTGGCTTGTTATGTACAATTGCTTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTATTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGCTAATTTCTGAGATGGCGTTATTCGATCCGG:1 + chr3R 25542498 3' - I-element 5235 1 73.97 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTTATATCGTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATATCTTCTCTTATCTAATATAGCGTTTCTCCTGATTGTTTTGTTCATATATATTTTT:1 - chrX 20373546 3' + 297 6954 2 58.90 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTACAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTAC:1 + chr3L 24208242 3' - Quasimodo 27 2 61.64 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTATCCGAAGTATCGCGCCTGCAGATAGTTCTCTGGTTGTCCGCCAGTCATCGCCACAATTTTG:1 - chrX 696454 3' - FB 21 1 69.72 AACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAAGTTTTTAATGTTAATAATATGTT:1 + chrX 2479636 3' - mdg3 5264 1 78.08 ACACACACACACATATATATTCGATTTATCAACTTTTACGGCTTTTTTCTTGCTCTTCTTCGATATTATATTAAATTTTATTTAGCCGTATCGCATTCGAGCAGCTTTAATCACAAACTCGGGAGACTCCACCACATTCAACAAGT:1 + chr2R 16209515 3' + accord 7031 2 55.48 CACCTACACACACACACACACACACACACACACACATACACACGGAACTACGGGCATATGCATAA:1 + chr2R 16398350 3' + accord 7099 2 58.46 AATAGCCGAGTCGATCTAGCCGTGTCAGTCTATCCGTATGAACGTCGAAACTAGAAGGTTGAGAATCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCCCGCCCACTCTTACGCCCTA:1 + chr2L 2545706 3' + INE-1 102 1 77.46 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAATTAAGCAAATAAT:1 + chrX 5323170 3' + Juan 4199 1 35.62 TATATTAACTAATATTAATCTTGTTTTCTTCTAAACAATGTGGTGTAATTCTACACACACACTCACCTACATACACATACATATATAAAGATATATGCT:1 + chr3R 14739652 3' + Rt1c 5393 1 51.52 AGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTA:1 - chr3R 20167568 3' + roo 355 2 55.48 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCAAAAGCTAAGCTAATGAGGTTGTCGCGTT:1 + chr3R 17737010 3' + opus 7491 2 77.24 TTATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGAATGTCAATAATTGGTCTTACTAATTGTTAAATGGATTTCCTCGATCAAGTATAATGCAGCATTGCTAGAAACACTGCACAGAGTCAACTCCAATTGACGAGCGATTGTTGT:1 - chr3L 17945043 3' + Bari2 111 1 80.82 AATCGATAGAAATTTACAAGACTAATTAACTAATTTTCGTAATATCTAATTTCGCGTGCATCTTCCAGTCCAAGCAAAAATAATCATTTCGCG:1 - chrX 22958159 3' - INE-1 301 1 72.04 AGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGCTTTTGCTTTTGTTGCTAAAGATCGGCTCGGGTCAGCAATTTGCATTTCTGATTCGAAATAAGAGGAAAAC:1 - chr2R 21496703 3' + INE-1 567 1 67.31 CAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCACACACATCCAGAGATCTACAATATATTCCCCCCCACTTTGGCGACAGTGATGATTTTAAA:1 - chrX 1799113 3' - invader4 2810 2 52.78 AATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAAAAAAACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAAATAAATTAAACAAATATT:1 + chr2L 4034963 3' + TAHRE 10392 1 72.60 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCGTTGGCAGCTTGCTT:1 + chrX 18336661 3' - 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chrX 19074763 3' - mdg1 59 2 56.16 CATACACATATATATATATATAGGTGGGCCTAAAGCTGTGTATATGTATATGTACTATGTGCATATAGCTAAATTTATGCGTACGTATTTTTTGGCCATGCGCGTCTCCAATTTGAACCAAAAAAAAAAGGCAAGGAAAATAAAC:1 + chrX 14589973 3' + Stalker2 251 2 53.79 GGTTTATATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCTCTCAACAAGTTGTTGGTGGTTTTTTATTTTTTATTTTTTGCAAAGAGTGGAGAGAGGGGTTTTTTGGGGAGGGGTGAGGGGCAATGCTTAGGGGCAGATTCTC:1 + chr3R 11868629 3' - I-element 375 1 67.59 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTGATCTGCGATCGCGATGGCCG:1 - chr3R 24368978 3' + roo 400 1 72.34 ATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTTATTGCTTCCACTTCACTTTACCCGCACAGCCGCTTGACAACATTTTTCCACCCGTCCTAA:1 - chr3R 25549190 3' - F-element 141 1 56.85 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAA:3 + chr2L 20266038 3' - roo 62 2 62.33 ATATTGTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACATAGTGCAAACCACTGAATCGTAACGAATAAATCATATCGGAAACCGCAAATTGATCGAAGTTTGATGACATTCGG:1 - chr2L 13864851 3' + diver2 55 2 62.18 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATTTGCTACTATTGATAAGAAACGATACT:1 - chr3L 15103765 3' + Transpac 5207 2 71.23 TATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGAT:1 - chr2L 19817749 3' + G4 3819 1 41.78 AAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAACGCGTAGATCGCCA:1 - chr3R 4357489 3' + Tc3 1686 1 56.85 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGCTT:3 + chr3L 16033427 3' - Doc 65 1 61.64 ATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAAT:2 + chr2L 22224616 3' + Rt1c 5410 1 60.96 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCC:2 - chr3L 6518545 3' - 412 7104 2 52.05 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGG:1 + chr3R 25428243 3' + 297 321 2 71.92 GAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAA:1 + chr3L 19350016 3' - 1360 3221 1 44.25 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTGGCTC:1 - chr3R 19407861 3' - diver 5910 2 69.18 CCTAATGATATTATACAAAAAAATTGACCAATAAAACTATAAAACATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAACACAACTGTAAGTAATTTCCGTCTGCCCAATCAGTGAGCTTTGAAACCTCGCGAACCTTAAGGGACTATGCCT:1 - chrX 21631163 3' + HB 1542 1 64.38 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAAGCAATGATATTGTTTGCGACACT:1 - chr3R 16630243 3' - FB 17 1 65.60 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAATGCA:2 - chr3L 21996123 3' - Transpac 4945 2 72.60 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGC:1 + chr2R 13766287 3' - roo 8740 2 72.60 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATAGAAATAC:1 - chrX 10319560 3' - mdg1 15 2 75.34 AAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAAAACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACGCACTAACGCCCGTGCAAAAATTGTAGCAAAGGCAACAACC:1 - chrX 3761388 3' - hopper 139 1 57.55 GTTTATGTTGCAACTTTGTATTGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCTTACTCAGACTACGTGGTGGTTTACCTACGTTTGATCACCTCGGGAAAACTGCAAGAGGAGGCCGACTTTTACCAAAATTTCATAGAAGGCGACCTCAC:1 + chr2L 10307727 3' - ZAM 90 2 63.70 AAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTCAGTATTGTTTTATAATCTGTTCAC:1 + chr2R 10418578 3' - 1360 3073 1 49.66 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGACAGCGGCATCGGGGGTACACCTCACAGGAACTCCATGCACCCAGCCATCAATCACCTATACAGTCTAGCTTTTATAAGTCG:1 - chr3L 20196172 3' - FB 7 1 78.08 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCC:1 + chrX 9950583 3' - jockey 4759 1 77.08 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAATTTGTATTTCATTGCAAGTATCTAAGTGCCACTTTCTGTTT:1 - chr3L 4669879 3' - BS 5034 1 71.23 AATAAAATGAAAAAAAAAATTAATAAAATGAATAATCTAATATTAAGAATATTTTTTGATTTCATTACAAAGGAGTATTCACTTTGCAATTGTAAATAATCATGTGAATAAGATCTCAACAGGAGAACGATTACTTTCCATAGAAG:1 - chr3L 14182582 3' - INE-1 474 1 50.68 AAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGT:2 + chr3L 19350007 3' - 1360 3263 1 59.59 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAG:1 - chr3R 20441246 3' + I-element 5281 1 67.12 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGAATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAA:1 - chr2R 19199680 3' - hopper 77 1 70.55 GTCTTTGTATTTCGTTTACTCTCGCTTTCGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTATTCTTTTTGTATGCACTGTTCTCTCCCACACGCGTGCAGTCTGCTCTCTTAAGCCTGCGGACTGAGAAACCCAACTCATTTCCGTCTTG:1 - chr3R 29438339 3' + Cr1a 202 1 75.17 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCACAATGAAATTTGATAGATATATATAACT:1 - chr2L 16562129 3' - jockey 4830 1 63.70 TATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCTATTATAGTATTATATAGTATTATAGTATATAGTATTATATAAATAT:1 + chr3L 18490487 3' - Juan 4053 1 67.12 TATTATTCGTTTAATTATTAGTTAATAACCTCTAACTACGTAATTTTCAATAATATCAATCAAATAACTCCAAAGTAATGTGGAATGTGTTTTTTACAAATCCATTGGATCGCTAACACTGAGTATCTTGTAGTCGTTTCATTGC:1 + chr2R 13005551 3' - flea 4988 2 69.66 TTTGTTTTATTTATTTAAAACTTGAAGTATTCGACATTTATAATTGATAATTTTGCTTTCTAACCCTGTATTTCCCTGTTTAACATACCATTCATTCATTTAAGTATTGTATTTCAACCTGAATAA:1 + chr3L 15460421 3' - G7 1143 1 73.81 ATTTAAAACAAAAAGAAAACAAATGCATCTTGTACATGTCTCCAGTGGCAATATGGAGCATCGTGCCAGCCGTAGTATTAGTAATTTCTACTTTAGTGACCAGAAATACACAACACACACCCCACTTCGCCATCACACTAGAGGGG:1 + chr3L 4557541 3' + transib2 2637 1 69.18 TAGGTCATATTCAAGCGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTGCAGTCATAAGCTGTTGTCGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCCTGATTAAAATTTCCATTGGGGATATCTTGGTTCTTTGTT:1 - chrX 186364 3' - S-element 1345 1 72.60 AAAAATACAATTTATTATCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATGTACAACTTCTGAACGCTTTTAGAATAAATTACGAAACCAGCGACAAAACACACAAAGCAACAAAAGCAACAATAGCGGCTATAGCCGACGATCTG:1 - chr2R 14484371 3' + S2 1689 1 42.47 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1 + chr2L 5069689 3' + flea 211 2 58.22 AATAAAATAAAATCATATTAAGATGTATATGATGGTCCAAATGATTTTGTCCTGAAATTAAAAAATAAATTTATCATATGTCATTGTTATGCTATTATACTTATTTACTCACTTTGTCAATGTTTTTGTTTTGGTTTAAGGGTGT:1 + chr3R 16684493 3' - transib1 1891 1 71.03 GAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTAATTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGTTCGAGCCGTTGCTTAGTAACTTCTTCATCATATTTTCGGCACACGGAATTTTGAATCGCAATCATGTGTGAG:1 + chr2R 21882468 3' - 412 227 2 53.10 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGC:1 + chr3R 16630333 3' - FB 88 1 77.93 ATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTGCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTTGCATGTGACTCTGTGACGAGAATTGTCCGTGTGCTGTGGGG:1 + chr3R 10588953 3' - transib2 2508 1 69.86 TCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGC:1 - chr2L 3675849 3' - Juan 4088 1 58.62 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCCTTTTCGGCTGCACCTTTGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTCGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGA:1 + chr3R 15790114 3' - flea 4719 1 62.90 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTGGCCGCCATTTTCCAA:1 - chr3R 16630220 3' - FB 15 1 73.29 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAA:1 + chr3L 18505743 3' - I-element 60 1 59.59 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTA:1 - chr2R 8157195 3' + mdg1 354 2 73.08 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTC:1 - chr3R 31886827 3' - hopper 49 1 53.42 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACTTCCAGCGCAGCAATACTGCTGGCGGCTCGCTCGCACAC:1 + chr3R 13875157 3' + P-element 2843 1 54.11 CTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATG:1 - chr2R 18514912 3' + P-element 316 1 22.22 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGAACACAAATTAGAAAGGTTTCACGCTTTTCTTTGT:1 + chr2L 16690749 3' + P-element 2853 1 60.96 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTT:1 - chr2L 14874125 3' + copia 240 1 47.14 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGCCTGAATAATACTGACGGACGTGGAGCGGTTAATTTATGGCGGACTTGGTGCCAACTGAGATCT:1 + chr3R 25616612 3' - roo 56 2 58.22 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGCACACTCTTCTTTCATTAAATAGTAATAATTTCGGTAGCTCTGGGGAATTTTA:1 - chr3L 9120659 3' - roo 76 2 77.40 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTATTTGCATATTGCG:1 + chrX 22840628 3' + copia 249 1 79.31 CTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGT:1 + chrX 21100259 3' - mdg1 7097 2 56.16 TTTATTTATTTATAATTTCTGTGTATATAAATATGGATCAGGAACCTGTTTAAAATAAAGTTCTGTTTTGTACCCATATCTTGTTTCAACTTACTTGTATTTCAGTTTAAGAACCACAAAATGAGTGGGTCCAAAAGGGAGAGCT:1 + chr2R 11608272 3' - G3 340 1 80.00 GGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACCAAGTGTCACATTTATTAACAACTAATATTTCCACGTCTCCGCTACTGAGTATATATATATTCAGCTGCAAAAAAAAATAAATTTTTTTTAATGAAAGAATATAACA:1 - chr3L 25782394 3' - Stalker4 98 4 67.81 ATATATTAATACTAAAATACTGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAAACACACACATTGAGCTCAAGTAAGGCACGCAGAGGTGTCCCTATTATAGCGACAT:1 - chr3L 18613066 3' + hopper2 1544 1 60.00 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAAC:1 + chr2R 8735671 3' - mdg1 7102 2 62.33 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGT:2 - chr2R 13766176 3' + roo 9038 1 61.81 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACACCTTGTTGTTATTT:1 + chr3R 22590625 3' - rover 16 2 72.60 ATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGAGGAAGGACTTCAAGAGGAAAGGAATTGGTAGTGGCCGGCGGAAAACAAAATATTCATGAACACAGCAGTCTTATAAATAAATTTCAGACCCAACACAGGA:1 - chr3L 13835549 3' - 412 424 2 72.41 TATAAGTAAAAAAAATACTGTTTAATTATATTTTATACAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTAATTTTTAGCTTTAATGTGCGAGCGAAGAATAAACTTAATGCTCGGGTGCGTGGGCGTGGCTCAATGCATTTG:1 - chr3L 2040123 3' + S-element 1600 2 56.64 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGCCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGACGCGTCTGATTTAA:1 - chr3R 16341902 3' + P-element 2863 1 65.97 GCTACTTTTGCTGCTGTTGTTGCTACTACGCAGTGGCTGGCTTTTTGTTTTTGTTAGCCGCTATAATTTCTCCAGCATTTTACAGACATTTGTTGTTGCAAAGCCAGTGCTTTCCTGCCCCCGAGAATTTATCAGGGAATTTTGT:1 + chr2L 7264156 3' - TART-A 134 3 63.45 AAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCATCTCCTGACATTCCGAATCGCGGTTGTCGTCTGCCCGCTGCATTTATGGGCCATCATAAAAGCGTTTTGTGCTCTCATAACTGGTAACTTGTCTTAGCCTTC:1 - chrX 20724628 3' - Bica 16 1 64.38 AGTTAGATCTACAATGATTTAAAATAAGGGGTGTATAGTGAATCTAGTAGAATATACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCAAAACCTCTGTCAAGCGCCGAGCGCCAGGAGTATAATGCATTTTTAATTTCCCCATTTCTAAATTGTG:1 + chr3R 17289692 3' - Cr1a 4148 1 53.42 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACA:2 + chr3R 21630359 3' + I-element 5303 1 54.79 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAA:2 + chrX 11661495 3' - pogo 60 1 62.33 CACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGAC:1 + chr2L 14523256 3' - HMS-Beagle2 6930 2 49.66 AACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGCTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - 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chr3L 11447312 3' - invader4 2951 2 60.96 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAGCAA:1 - chr2L 21299263 3' + roo 9046 1 67.81 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAAT:1 + chr3R 13300969 3' + roo 9036 1 54.55 AAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTT:3 - chr3L 16973324 3' - S-element 1542 1 67.12 GATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAAAAGTCAGATATGGCCAGATCGACTCGACTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTT:1 - chr2L 22758838 3' - Doc 198 1 53.42 ACTAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTC:1 - chr3L 25008289 3' - 297 6944 2 76.03 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACG:1 - 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chr2L 11357849 3' - blood 7099 2 78.08 AATACATTCTAGCTCTTTTAACTTCTCTTGAAATTTTTCGGTCGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTCGACGTATGTAAATGTCAAATTTTCTTTTTCTTTTCATCAAAATTTGCATTATTTCATTTTTTTTT:1 + chr2L 16646739 3' - P-element 2466 1 20.71 CAGATAAATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGATAACAACTGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACGATATCTGCATCACGCGTGAGTTATTATGCCAACTGCGT:1 - chr2L 14930996 3' + Tc1-2 479 1 76.71 ATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATTGCTTAAGAATATTTCGGTATGCCTTAATTTCCGTTAAGGCAAGTGGTAATATATTGTTATCCGTTTAGGAAAATGGTTTGATCTAAAGATTTATGCCTAACTGC:1 - chr3L 12951620 3' + Circe 101 1 68.49 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTGTATCGTTATCGTCTT:1 - chr2L 22193375 3' - roo 16 2 76.06 ATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCA:2 - chrX 3431859 3' - Ivk 5359 1 47.95 TGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAAATTATTTTATTAACTTTCATAATTGTGTGTATTAACGCTCGATATTTGTGGCAGCGCTTTTTTTGTTTT:1 + chr3L 10185356 3' - Juan 3773 1 69.72 GGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTAATAAATGTTTGAGGGTGTTATGTTTGTGTATATCGGGGAGTGTTATCAAT:1 + chrX 10206493 3' - 17.6 7019 2 65.75 TAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGATTTAACTGACCTGCT:1 + chr2L 15763108 3' + mdg1 27 2 71.23 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACA:1 - chr3R 19449853 3' + roo 9055 2 72.60 AGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATTCTTCAATTCACTAGGAGGGGTCTTACAAAACAAACAATGTGTAAAACAGTTTCTAAAAGTTTGTGGCTTAAAGACCACAATAATGCCA:1 + chr3R 26178407 3' + 412 4 2 72.58 GTATTGTATTTATATAAAATAAAGAAATTCTTATGTTTAGAGAAAAAGTTTTGTAATAAATGTTTGATTGCATTCAGCGCTTTGGAATTGTATTCAGTTGATTTCGAGAATTTGAGCACTCGCAGCTCTGGCCACACCGCACGTC:1 - chr2R 9965056 3' + Bari1 1398 1 71.03 CCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGATCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTG:1 - chr2R 16817905 3' + 412 402 2 76.71 TAAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTGTAGGGAAATAACGAAATACTAATGCTGGGCACTTAAAAAATTGAGTTTTTATATTCCGATTCAGACGTAGTCAGGATTGATCCCTACGCAAAAGAATTGATTGCAAGCATAAGAAAC:1 + chr3L 22700391 3' + INE-1 171 1 76.03 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTG:1 - chr3R 9038906 3' - Juan 4047 1 56.25 ATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACAAGTACAAATACCCATCCACCGGA:1 + chr2L 20640331 3' + Stalker4 7200 4 61.64 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCTTTGCAACTTTTTAATTGGTATGTGTAGTAGTTTTTACCAGCATCATTTAGGTATTTAGTCACTATACGGTGGTCTGCTTCTGTTTCGTGTTAATTTTTGATTTCCTCCG:2 + chrX 2884371 3' - Tabor 6852 2 60.27 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCAT:1 - chr3L 15103802 3' + Transpac 254 2 57.34 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATC:1 - chrX 10537855 3' - I-element 62 1 59.59 GTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTG:1 + chr3L 18125999 3' - Ivk 54 1 52.08 TATTAATCATGATCAAGAATATATATTCTTTATATATTCGGAAACGCTTCCTTCAGCATGTTACATCTTTTTTAACGAATCTCCACGAGTAACGGGTATAATTTGCTAGATCAGCTTGCAAACAGCATCTTCCAATCATAGACACA:1 - chr2L 21711587 3' - INE-1 84 1 69.86 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTG:2 - chr2R 13766211 3' + roo 9001 2 67.81 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCAAAACAATTCGCAGAATTAACAAATTCTACCAATTTGATACATTTTGTGGATTTTCACTGCACTCTGTATTCACCTTCATCATATGTCCTTTAATTTCCTGCACCTTTACG:1 - chrX 20888220 3' + 297 390 2 79.45 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCC:1 + chr3L 22400373 3' + 1360 3387 2 76.24 GTGTGTGTGTGTGTTTTTGTGTCCCCCTCCTTCCTCGCTCTTTCGCCTTCTTGTCACCTTTCCTTTTCGGCCTGGTACACGCCTCCGGGCACCGCCTGCTCATTCCATTGTCTTGCTGCCAC:1 - chr3L 15196426 3' - gypsy3 418 2 54.92 CTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCCCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTAAAGTTTGGATAGGATGCCACAGAAGAAATCTAAAGAAATTTAGTTATATGCTAGTTATTTCTGTGAAAT:1 - chrX 19330478 3' + INE-1 577 1 54.11 GGCAATAAAAAAAAATGAAATAAAAAAATTACGAAAATGACAGCTATTAATTTTCATTGAACGATTCCAACCGTATTTTAAAGTTTTAATTTAATTCGAAAAATTTAAAAATAAAGTTTCCTAAAGTACTAGTACTCCACAGTTTG:1 + chr2L 17368628 3' + P-element 139 1 52.05 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCCCATGAAAAGAGAAGG:1 - chr2R 5151179 3' + roo 9054 2 71.92 ACATATATAAATATGTATATATATATCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAGATGCTGCTC:1 + chr2R 10594207 3' + G3 4505 1 61.64 AGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGCTAAATATCATTCAATGGAACATTAAATTTTATA:2 - chr2L 22255046 3' - 1360 206 1 50.68 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCT:1 + chr3R 3920582 3' + roo 9004 2 65.07 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAAC:1 - chr3R 25616510 3' + roo 343 2 62.33 CATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTT:1 - chr2L 11298063 3' + I-element 5274 1 77.24 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATT:1 - chr3R 11191411 3' + roo 9008 2 70.77 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTAAA:1 - chr3L 14094533 3' + I-element 5340 1 67.81 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCA:1 + chr3R 10270678 3' + Juan 4167 1 54.79 TTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCAAAGGTTATTTATATGTTACTATTATAGGCTATGAACTGGTTTTATTTCACTCTGCTTGG:1 + chr3L 11138415 3' + 297 11 2 58.62 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCACACAGACA:1 - chr3R 31886805 3' - hopper 27 1 68.49 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACA:1 - chrX 20499715 3' - transib2 54 1 55.48 TCATTTACCATTGCGAGATTTTGGGTTTGTTATAATTTTTTTTTGTTT:1 + chrX 6320464 3' - G4 117 1 50.00 ATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAA:2 + chr2R 12185429 3' - accord 50 2 52.74 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACT:1 - chr2L 7660894 3' + I-element 5311 1 52.74 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGGCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGAAGCGGCTGATTTAAACTGGAGAA:1 - chr3R 16341893 3' + P-element 2884 2 78.79 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAAAGTTTTCCTGCTTATGCATTTATCACCTTTTTCCCCACACTTTTCCG:1 + chr3R 31886974 3' + hopper 1399 1 72.59 TACCAAATATATATATATAAAAAAAAACAAAACAATGTGGAGGCGAAATGAAGCGAAGCGAAAATGAAGTCAGTAAACTAGCAGGCAACTACCTAGAAATTTGGCTCAAATATAGTGCCT:1 + chr3R 11526369 3' + Tc1-2 476 1 74.17 AAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAATGACCCGATTATTCAGTAACGTAACGCACTTTATGGCTTTCGGTTGAAGTCAGTTTATTACCAATATTTCTGACAATAATTACTCAACCTCACCAGTTGTCA:1 + chr3L 25481713 3' - Cr1a 4199 1 75.91 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTAT:1 - chr3R 29084862 3' + 412 7536 2 69.75 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAATATTTGAGCTGAATAAACTGAAGCGGCACTCATTATGTGCA:1 + chr3L 5533032 3' - roo 8723 2 58.22 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACC:1 - chr2L 3233979 3' - roo 86 2 76.71 TTATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGA:1 - chr2L 19817750 3' + G4 3818 1 41.10 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGAGTATGTGCTTCTTCTAT:1 - chr3R 904934 3' - rover 6994 2 62.33 AATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAATTTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTTGTTTGTGTGAGATTAGAGTCCGGGAGTATCTGCTTAAAGAGGCAAGGGACTCTTGG:1 - 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chr3R 9002893 3' + roo 9029 1 57.53 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTAATT:2 - chr2L 16858666 3' + Burdock 227 2 66.44 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTCATACAAAGGCCTCTGCGC:1 - chr3R 4964060 3' + roo 387 2 70.00 AGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCAACCCTGGCCGATAAGAACCTAAGCTCCACCCGCTTATCGCGATCATCATCGGTCCGGGAAAAGGGCAAATAGATGGCACAAACGCTGATAACG:1 - chr3R 7944906 3' + blood 7110 2 70.21 TAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCATGCTCTACACTCATATATTAAATACACTTTCGACCATGCTCCGCATAAGTGTGAGCCAAAAAAATGCCAGACATATAATTGAATTAATCCCAACTCTTGTTTTGCCTTTTTTT:1 - chr2L 2248927 3' + Quasimodo 114 2 72.60 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCAC:1 - chrX 21216745 3' + roo 360 2 70.48 AGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACG:2 - 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chr3R 21543441 3' + jockey 4604 1 54.79 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGAAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACA:1 + chr2R 9158129 3' - mdg3 5327 2 66.43 AACCATATTTATTATTTATTTATTGTATGTATTAGAATTTAAACCATTTTTCACCTTCGAATATTCGTTGACATTTGACAGAGATTCGTATGCATCTCTGCATTTGTCAGTTTCTCCAAGAGAATTCCATTTCGTATTTTTCCTCT:1 + chr3L 10723562 3' - Juan 4058 1 84.93 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCC:1 + chr2L 15913321 3' + transib2 2748 1 71.23 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGCAATCCGGACGAGTTCAT:1 + chr2L 10156203 3' - hopper 43 1 57.85 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCTAACTTACACATACATTTCAGTCTTGACATTTAATTTATATTT:1 + chr3R 30059472 3' - FB 78 1 71.92 AAATTTAAATGTTTTTTTTTTTATTCTCCGCCTGACTCTTACTCTCTCCCTCTCTCTCCTCCGCTCTCTCTCTCCTCCTCTCTCTCTCTTTGCTCCGTGTATATATCTTCTGTATATATTCTATAAATATGCCGATTCTGTTAGGT:1 + chr3R 21626629 3' - transib2 2645 2 80.82 TTTAATAATAATAAATTTAGGTTCTCCTAATTGGCATTGCTCTTGTTTCTTTTAAAATTGCTGATAAAATGTTGGGGTATTATTGTTGTTATTTTCTTTATCGTACATATGCCCCATCTTCTTGCTTTTCGCTCTTTAGTGTTAGT:1 - chr3L 11284648 3' - I-element 249 1 76.03 CCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGGTTTTCTCTGTTCATTTGTTGCCCGCGGGGTTTGGCG:1 + chr3L 534724 3' - invader1 380 2 57.95 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCT:1 + chr2R 8735688 3' - mdg1 31 2 58.46 GAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATATAATTGTTCTAATCATCCTGTGATAGAAATGTTGTCCTTATTATTATTTCAAAACTCATTTC:1 - chrX 22901584 3' - 297 6735 2 66.44 AGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTAT:1 - chr2R 5106274 3' - Stalker2 7254 2 70.13 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACC:2 - chrX 13134871 3' - jockey 4803 1 54.48 ATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAA:1 + chr3R 30987590 3' - 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chr3L 14557191 3' - hopper 141 1 71.03 GTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATA:3 - chr2L 13585703 3' - Quasimodo 35 2 49.32 TTAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGA:1 - chr3R 9298473 3' - hopper 63 1 61.15 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACTCGGAACAAAACACTCTCCATCTCTGACTGCAAATGCCCCTTTCTCCACTCCGAACTTTTTGGGGAGACCAGCAGCTCAAGTCTG:1 - chr3R 15872398 3' + jockey 4960 1 67.97 ATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCCTTTTTGTGGTGACCCTTCTT:1 - chr2L 12967561 3' - X-element 4551 1 62.33 TCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATC:1 + chr2L 17809246 3' - jockey 83 1 70.21 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTA:1 - 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Rt1b 131 1 47.26 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTA:1 + chr3L 17940181 3' + 1360 3335 1 66.40 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTATAACGATAGCTATATCTGAAGTCTTTGGTGTCTTGAGCGTTTGAACAT:1 + chrX 20365440 3' + 297 6908 2 67.81 GTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATTGTAAGTCCAAATGGCGAGATATGTCCTTGTGCTGGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATCTTCATTATCGTTGATGAATGAAGAATT:1 - chr3L 23052375 3' - Cr1a 4168 1 58.22 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTG:1 - chr3R 16518849 3' - Tirant 28 2 67.81 CTTAGTTCAAATACGGGTCATTTATTCGATTCAAAACAAAAACCAATTTTTCTGGCGCAGTCGGTGGAAGGGAAACGTACCTGTTCGGACTTCTGGTCTTATTATGTAATGCCATGGTATGACATAAATACATTTTCAAT:1 + chr3L 17709147 3' + Tom1 359 1 55.71 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAATCAAAATAATACAAGATT:1 + chr3L 6397797 3' + roo 387 2 70.55 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGT:1 - chr3R 24450414 3' - 412 7091 2 51.16 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAAT:2 - chr3R 30946520 3' - Transpac 70 2 65.07 AAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGGTTTTT:1 + chrX 18409439 3' - jockey 4760 1 78.17 TTATTTTATTTCATTTTATTTTTTTTTTTCATACCGCCACCACCATCAACGACAACGACATTGATATTAATTCCCACGCTGTTGCTGCGAAAGTG:1 - chr3L 19039251 3' + transib1 1898 1 60.00 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCA:1 + chr3L 21327138 3' - copia 63 2 79.46 GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTAT:1 + chr3R 11469392 3' + Tabor 7250 2 66.44 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATAAGCTATGACAATGACGGCCGACTG:1 + chr3R 24090587 3' + roo 394 1 68.49 CTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGAAAAAAAAATATATATATGCAACAGAAATAAACTAAATCAAGAACCAATTTCATTTTTCAA:1 + chr3R 19757528 3' + F-element 4600 1 74.66 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCA:1 + chr3L 3983879 3' + P-element 2808 1 32.19 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTT:1 - chr3R 14980270 3' + roo 9050 2 70.34 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCG:1 - chr3R 4682879 3' - Burdock 54 2 56.85 TTATATATATTTTTATTTCAAAATCAACTTGCATCGTATAAAACAAGCGTCTTAAATTAAAGCAAGCGTTTACTCCCTGTTAAATATTTTAAATAACTACGAAAGGATTGTTTATAGACTGAGTTTTATTCTTATACAGCGTACTC:1 - chr3R 18617024 3' - G7 1168 1 49.32 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGAACACAAATTAG:2 + chr2L 16690726 3' + P-element 2830 1 45.21 TTAGTTAATTATTTATTATTAACAGGTTTTGCTTGCTTATTTTGTAGCTAGAGTTCGTCTTCTTTTTATAAAGTATAGAATAGTAGCATTGTGAATTTTTTTATAATCGAAAATCTGATCTTAGATACTTTAATCAAAAATGGAAA:1 + chr2L 6130991 3' + INE-1 418 1 71.92 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATATGAAAAGAAACAAATAGGCAACTTGAGGCAACTTTCAAGAGTCACACGTACCACCCG:1 + chr2L 18212268 3' + Quasimodo 7357 2 77.93 GTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTGCCGGC:1 - chr3R 11186505 3' + BS 5064 1 63.01 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGG:1 - chr3R 19224981 3' - HMS-Beagle 6811 2 70.91 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATTTAGAACTATTTGTATACAATCGTATAGCTTAGGATCAAGAATAAGCTTAATATTTGTTAAACTTTATATTTATTTAT:1 + chr2L 7581036 3' + Transpac 271 2 55.48 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAGTATGCAAAACATTTAGA:1 + chr2R 12133888 3' - jockey 23 1 73.29 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTT:1 + chr2R 17878628 3' - Doc 74 1 62.07 TAATAATTATAATAATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATAATTAATAATATAATACATTATATATTAAAAATTAATAATGTTACAGATTGGGCAACCCGCTTTAAAAATCGCATTGTACCCAAAAATTTATATATTTAT:1 - chr2R 8186625 3' + mdg1 7077 8 47.95 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATAT:1 + chr3R 31653151 3' + roo 332 2 71.23 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTC:1 + chr3R 15791034 3' + roo 9038 1 62.33 TAAATAATTATTAATAATAATATCTTTAATAATACCTTTTACATATCGGTTTAAAATATTTCTTGCAGTGCATACACCCCAAAGGCTTGCCACCGAGCATCGAACACGTCAATTGGCCGCGAAATTAAC:1 + chr2R 11534971 3' + gypsy9 296 2 54.26 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATTTTATGTAT:1 + chr3L 22035713 3' - F-element 17 1 75.34 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGAGCACCCCAATACGTCACTATATACCTTTAAATCCAATCAA:1 + chr3L 10731831 3' - 297 6630 2 80.43 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATTACTCGATGTCGCCAACAACTTTATCAGACTTTGCCTACACCCAAAGTCTTAATCCTTCGTATATGTTTAT:2 + chr3L 4219593 3' + jockey 4983 1 61.64 ATTTACTTATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAATATGGTTGTGTCTTTGCTCTACACTTCCGCCGTACATTTCTATATT:1 + chr2L 19817367 3' + G4 3812 1 50.50 TCCCATTAAAACTTTGAATCATAGGATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGACCCAAGCACTGTTATTTTTATGAACACAGCAGTATGTTTATTGTGTAAAGACCAACCTTTGACATATGTACATATCATGACCGAAAACAGTTGGGTT:2 + chr3R 4224427 3' + HB 1567 1 61.64 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTA:1 - chrX 14722092 3' + diver 6067 2 54.79 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATA:1 + chr2L 6654762 3' + diver 6065 2 53.42 GTAGTACAGCATTTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCATCTCCTTTGCAAGGTTTTTTAAGTCATGACTAAAAAAACTCAAACTTAAGCGGCAGATATCCCACGATAGTCGTATTCTAAGAAATGTCCCAAATTATCTGCCC:1 - chr2R 2093390 3' - Doc3-element 125 1 74.66 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAG:1 + chr2R 22992534 3' - hobo 71 1 64.83 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTGATTGGCATCCTGTTCGGCTACTTCCTTCACACCAACCGGGGCAAGGAGTTCAAGCTAAACCGCCTGGCTGTCCTCCTGGG:1 - chrX 19588016 3' - roo 8702 2 52.74 TAGTGAATCTACTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATGAGCTTACAAATAAAACAATCCTTGGTTCACCGGCTGTGCTAAACTGTAATAGTACTGCTCCTAGGTCCACTGGGA:1 + chr3R 2913301 3' - Cr1a 4106 1 58.22 AGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTT:1 - chr2R 15005053 3' + BS 5018 1 73.24 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAATA:1 - chr2L 18549804 3' - roo 8702 2 58.22 TATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTT:1 - chr3R 9557535 3' - G2 3047 1 65.52 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTG:2 + chr3L 5389950 3' - roo 76 2 73.29 AAGAACGGCTAAGTGCCGCTGCCAAAGAATTCTTTATTACAAACGGATGCTGCGCAGCTGGGATACATTATGGAAATCACTTAAGTTCATTACTGTTTATAGTTATTTGAAATAATTTAAGAGAAATGGCTAAACGAAAGGAATG:1 + chrX 22745912 3' - 17.6 184 2 78.62 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTACGATTCAAATTGTT:1 + chr3R 7317674 3' + I-element 5301 1 54.48 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCAATAAGCAAATTACCCCAGTCCCAGACCCCC:1 + chr2L 15913352 3' + transib2 2779 1 54.79 TACAACGCAACAATGCATACTTTTTTTTCGCATCACTGTGGCCAATGGGTTTTCGGCGCCCTGATTTACCTTTCGACCCGGCAACTTAACAACAGAACGTTGACAA:1 - chr2L 8552518 3' + Doc 274 1 66.98 ACTGTGCTCGCTGGATAATGTTAAGTTTATGGTCTAATTTCATTAAAGTATTGTGTAACAACATATTTAAACATAACATTACCAGCGCAGTCTAAGAAACCATAAACTTATATTGTTCAGTCAAGTCTCCGCACAGAATTTATTCC:1 - chr3R 6796361 3' - Doc 4337 1 58.22 TATTAAGCTATTATTATTATTAAGCAAAAAAGTGACGTTTTTATTAAGTAAAAATGTGTTAGTCATTTACTTGCATTTGTTTTCATTTTAGAAAAAAAAAACAAGAACACGAACGTGCTCAATGAATCTAATAATTAAGCACA:1 - chr2R 12239664 3' - invader3 5064 1 78.32 TAATAAATAATAAATAAATAAAAATAAATATATATATTTATTGTAACAAATAATAGCGAATTTATAATATCTAAAGTAAATAAAAATCCATTCAAACATTTAAAATATCCAATTCTTTTGGTTATAAATTACATCCTTTAGTTAGT:2 - chr2R 8255966 3' - INE-1 414 1 66.44 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGGTAACTTGGATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACA:1 + chr2L 20821271 3' - Burdock 63 2 72.95 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTG:1 - chr3L 16970336 3' + roo 9053 2 67.44 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAA:1 + chr2R 5151351 3' - roo 8696 2 60.69 AATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGATTTGTTGTTGGTTTGCTGGACTTCCAAGGGGCAGTGCATACATTTGTCTTGATTAATTGTTCTCGAACAGCGAAGGATGGCAAAT:1 + chr3L 20851189 3' - I-element 5224 1 63.01 TGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACCAATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGC:1 + chr2R 22989659 3' + hopper2 1516 1 74.66 GTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGAATTGGAATTAACTACAGTATTTCCCATTGAGAAGCGAGATA:1 + chr2L 11839705 3' + mdg1 316 2 82.19 TGGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATC:1 + chr2L 15076202 3' - 1360 64 1 59.59 GTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGTG:1 - chr3L 27865983 3' - Max-element 38 2 48.92 AAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGAGGAACAGGATGAAAATAAACC:1 + chrX 8958658 3' + HB 319 2 78.95 ATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCG:1 - chr2R 10078164 3' - jockey 113 1 73.97 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGCATTCA:1 - chr2R 5070906 3' - Tirant 8107 1 32.88 CTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAA:2 - chr3L 24213779 3' + invader2 5029 2 69.86 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAG:1 - chr3L 21996166 3' - Transpac 69 2 62.33 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATA:4 - chr2R 8099163 3' - jockey 4844 1 75.34 TTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAA:1 + chr3L 24934387 3' + HMS-Beagle2 239 2 69.18 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGC:1 - chr3L 12249812 3' - roo 8733 2 69.44 ATAAAGGCGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATTTTCGGAAGGAGACAGTTCTAGCAGAGAAAGAAAATGCCGCAGAAAGTAAATATGATTGATTATATAAGATAGATGGAGACCAATTTATATACACTTT:1 + chr2L 14284647 3' - Gypsy12A_LTR 2080 1 55.32 GTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACATAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGTTTTGTACTTTCCTGATAATCCTCTGTTAATTGGTAAAA:1 - chr3R 23673446 3' + Circe 6959 1 71.23 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGG:1 + chr3L 23906466 3' - 1360 65 1 64.29 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCAGTGGAAATTAACTTTCTTTGCATTCGAGCTGAAGTTTCTCTCG:1 - chr3L 17940081 3' - 1360 45 1 56.06 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTA:3 - chr2L 20265911 3' + roo 9038 1 62.33 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGG:1 + chr3R 10270692 3' + Juan 4188 1 67.63 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATAA:1 + chrX 14310343 3' + roo 9038 1 45.89 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGAGACTATTTTTCTTTA:1 + chr2R 5151372 3' - roo 12 2 74.66 TACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAATTAACCTTTGTCTCAACTTTTGATTGT:1 - chr2L 17005651 3' + Stalker2 394 2 69.18 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCG:1 + chrX 21994025 3' - McClintock 26 2 66.43 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAATGGTGTGAAATTAACATTGGGATTTGAATGAGAAAGG:1 + chr2L 14671920 3' - FB 50 1 60.14 CCAGCANAGTTAAAAAAAAATAAAAAAAACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATTAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAA:1 - chr3L 21847134 3' + TAHRE 10436 1 67.81 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGGAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGG:1 - chr2R 20802571 3' - mdg3 65 2 58.90 TTAAGATTAAGATTAATTATAAGATTTAAGTGGAAGAAAACCATCTTGGCCTTCGGGTTCCGGCCGAACCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' - 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chr2R 4191672 3' + 1360 332 1 57.53 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACC:2 + chr3L 20711689 3' - jockey 4830 1 65.07 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGGAAGAGCAATAAAAACCGTAGCCTACCTTCC:1 - chr3L 19349885 3' + 1360 3380 2 75.71 TTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTGTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGATTTCCCATATTTCGTTGCTCACGTTGCTTATT:1 + chr2R 13943912 3' - I-element 442 1 69.57 GACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGAGAAGCATCTTATCGGGCTCAAACATTTGGCATTGCAT:1 + chr3R 30091184 3' + jockey 4601 1 61.90 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAAT:1 - chr3L 7300125 3' - roo 8709 2 54.11 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATAT:3 - chr3L 16731387 3' - rover 7020 2 69.18 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATGGTGCAATTTTATATATTGCATGGCCCTATGATTTATGCCATCATCATAATAA:1 - chr2L 10042762 3' + jockey 4928 1 62.76 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCT:1 + chr2L 11391586 3' - 1360 61 1 58.90 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAA:1 - chr3R 9557511 3' - G2 3023 1 51.03 TNAATAAATAAAATAAAATATAATATTCGTAAAAAATAGTTATAATTGTCAATGTAATAGAAAGTGTTGGTATATATATTATTTTTTTTTTTAAAAGCCTAATCAACTTGTCATTTATAACTTATTCTTCTCAGTGTACACAACCT:1 + chr3L 12660294 3' + G7 1148 1 51.37 ACACACACACACACACATTATGGCCAGACTCACACACACGTGCACACTAGTGCGGTATTACCCTCTCCTTCCCGCCTTGCCCCTCTCGCTCAC:1 + chr2R 8375485 3' + gypsy3 428 1 69.89 AGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAT:1 + chr2R 5206900 3' - G4 3767 1 58.22 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACTCTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAAAAGAAACTTTACCAACTT:1 + chr3R 9039042 3' + Juan 4194 1 63.85 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTC:1 - chr3L 15913834 3' - jockey 4806 1 53.42 AGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCAAGCCGAACTGAACCTAAATTAAATGAAATTGTAATGGCAATTCGCGGGCGAAAAAAATACAACAAAAACAAGAGGGAAGGAA:2 + chrX 1148639 3' - Stalker 464 1 56.16 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTGTTGTT:1 + chr2R 7090756 3' - I-element 32 1 64.38 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTATGACCTAATCATATTTATTTATAAAATATGCTAGCCTTACATTTTCGTGAGAAAACTTGTG:2 + chr3R 14047799 3' - roo 57 2 61.64 AATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTATTTAAACGCAATTTTTTATAAAATATAGCCGCAGATGCCATGAAATTGAATAGGCGGCAAACAAAACTGCAATGCCGCCACATGCAGAATGCTCT:1 - chr2L 991037 3' - S-element 1683 2 52.05 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTTCGATGTTA:1 + chr2L 11391641 3' + 1360 3379 2 71.23 TACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGAAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGT:1 + chrX 19074849 3' + mdg1 344 2 68.97 AATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGATTTTTGGGGTCGATTGTCGGAGTGTTTTGTACTCTTTGTATTGTTCACAATATGTTACTTCATATTGGAAAAGCTTATAATTGAAATTGATTGG:1 - chr3R 23630242 3' - I-element 5158 1 68.49 TATTTAAAAAAAAAAATTAAAACTTAATTGTTGACCTATGCGTATTTTGGTATTAACAATTGAAATAAATATTTGTTGTTTTTCAAAAATTATACTAAAATTATACCTGAAATGTTGTCCTAACAATATGGAATTTAGTTTTCAAT:2 + chrX 16555244 3' + TART-B 10632 1 69.18 AAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTAAGTGCCGCTGCCATAGAATTCTTGAATAGAAACGGATGTTGCGCAGCTGAAATAATTGAAGTGGCCGGTTTGGACCACCCAAA:1 - chr3R 846563 3' - 297 6738 2 72.86 ATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCAAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTTTGTCATTCCAAAACGCCCAAAACTGTA:1 + chrX 22689470 3' - 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diver2 4554 2 73.29 AGCTGCTGCCTTTGTGTGTTTTCCAAAGTCGTTAAAACTTTTCATATTGTTTCCCAATTCCTCTTCTATATCGCTTATGTAGGTACAAATGTTGGTATATATAGTACTCACATAGTACGCACATTTTTACATTTATATGTACTATA:1 + chr2L 9522319 3' + invader2 213 2 51.37 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATC:2 + chr3R 9298545 3' + hopper2 1527 1 71.92 CGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGTTGTTTCTGTTTTTCCATTTTTTTGGTGGGCTTTTCCAGAAGTGGAAC:1 + chr3R 15618213 3' - I-element 5053 1 66.44 GTTTAACTTTCACTATACCGTTGTAGTTTTAGAACTTGCTATCCGTAGCTGAAAAAGAAACACGTCTGCACTCGCCGACCAACGTCAGTGTATACAAAAACCAAAAACAAATCCAACTCAGGCGTGTACATATATAGAAAAACTTA:2 - chrX 7695515 3' - Doc 76 1 57.53 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCT:2 - chrX 10521610 3' - Tabor 42 2 55.48 AGTTATATTTTGTTAATATTTTGTTACGTAGCAAGTTTGTAGCAAAGTACATGACGACATAAATACGCTTTTTCTATCTTTCACGGTTGCAACACCTGTCGAATTGTGGACATCAGCATAAAATAGAATCCAAATAAAACAGAGCC:1 + chr2L 9173230 3' + HB 1398 1 69.18 ATAGGTTTCATTGAGTTCTAAAAAAAGGAAATTTTGCTGTCGCACCCTGTAGTTGGGTTAGTTGTTGGGGTTTTATACTTTATTACGCTGAACTTGGACGGAATTACAGTTTATGCTAGTATTTAGTTGGTTACACTTTGTAAGAC:1 + chrX 1662527 3' + mariner2 864 1 52.74 ATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGGCATGGGTATTAAAAAAAGGTGTAGAGATTTATTTCACGTTGAGATGGTAAGAATG:1 - 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hopper 36 1 58.22 AGGGGAGTGGCCTAGCAACAGACGCGATGCACAGGGGTCGAACGGTAACGGTGCGGAATTGGGACAGCCTCTTCTACGTGGAAAGCGCGGG:1 - chr2R 5374141 3' + gypsy8 4686 2 62.64 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCAAGGGAATGGAATCAGTACAAAATGG:1 - chr2R 19199613 3' + hopper 1406 2 78.08 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCAATC:2 + chr3R 15791038 3' + roo 9042 1 65.07 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACTTAAAACTTTGACAGGAATATACATTTGATTCCTTTTTTTAGCTCTTCATTATATGAGAAAATTGCTCTTAC:1 - chr2R 8047206 3' - 1360 14 1 72.60 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGCCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAAAATCACTATACACGTTTGGCACTACACACATATATGTACATATATGTAAAGAG:1 - chr2L 14307627 3' + 297 6899 2 69.93 AAAATATAATAAAATAAAATAAAAAATGGGGAAAATAGTGCAACGAATGTCATTCGCATTGCACGCCGATCTTGAAGTTTATGGCGCCCGCAACTTGCTGAAAATTATGAATTATGATGCTGCGGAGTCTTTAATATCATGAATTG:1 - chrX 14127906 3' + TAHRE 28 2 70.55 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTA:1 - chr3R 24219291 3' - roo 8707 2 66.98 AGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGTCGAATGTGAAATGTGGGGCATAAATCAAATGTTATATTCGGCCGGGTGGAGTACCCTTAGCCTGAACGGCAGGCAGGCAG:1 + chr3L 2698044 3' + Quasimodo 133 2 58.22 CCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGCTATTACTCGATTGAGAATTC:1 - chrX 661834 3' + 412 7509 2 58.62 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGT:1 - chr2L 4713857 3' + transib2 2765 1 58.22 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAG:2 + chr2L 47192 3' + roo 347 2 58.22 AGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTA:1 + chr2L 21400810 3' + Doc3-element 4669 1 46.58 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTATACACCTTTGCGCAGCTCCCTTGCAATCTGCACCTTTCCATCTACATCTATCACACAATGCACAACGAGAGCAAAACAATTCACT:1 - chrX 11643609 3' - accord 184 2 79.17 AACCTTCTCCTGCTGGTTAACTCCAGGGAATTAAGTGACAATGAAAAACACGGTTTTCCGATCGACAAGCAATTACAATACATCATATGCAACTCACACAAAGGTTACCGAGGTCAAGAGCAATGGCCAAAAAGGGGTGGCCATTA:1 - chr2L 18868659 3' + Ivk 456 1 72.60 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGAAATACTTGCGTTTTTAGAAGCAAGGTC:1 + chr3R 4805745 3' - 1360 20 1 70.55 ATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTAAGATTAATAATGAGCTCAACTAATATGCGCACTCAGTCTTTTGTAGTTC:1 - chr3L 17453648 3' - I-element 194 1 64.38 TATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATAT:1 - chr2L 13585702 3' - Quasimodo 34 2 49.32 CTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATATACCAGAATAAAGTGAAGTTGTCACCATATAGTTGTAGTCGTTTTAATTTCCTTGTTTTTTTTTCGGACAATTTGACGCTTTATTTAAAT:1 - chr2L 20077912 3' + Gypsy6A_LTR 126 1 69.86 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACG:2 + chr2L 19924056 3' + roo 9026 1 47.95 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATCAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACCACACACACTATCGTAAACAATTACACACACACATCAATG:1 + chr2R 4189112 3' + S-element 1674 1 49.32 CTATACCCTTTAGAACGACTTGAAGGCCCTTCCTACTTTTCAGTTGGAGGTGTAGTAGTTTTTGCTGTTTTGTAATTTGATTTCTTTTTTGCCGCCCGCCTCCCGCTGATGCATCA:1 - chr3L 5691838 3' - Fw3 197 1 57.76 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATG:1 - chrX 4341269 3' + roo 338 2 65.07 AATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAACAACCCCCACGAAAGTAAGCAAAAGAAATGGCTTCAATTAATTGAGTTGGGGAAAAATTGAAGAGAGTACAATTGCTGTTTAAAGTGGCATACTTTTGGGCATTGCCAA:1 - chr2L 16553523 3' + Quasimodo 6903 2 75.91 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATTCTTCTTTCATCTGAATCTATCCTTGCGTCCAAGT:1 - chr3R 28146067 3' + roo 9054 2 69.18 GCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAA:1 - chr3R 9557540 3' - G2 3053 1 69.18 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAG:2 + chr2L 12818370 3' - hobo 23 1 68.49 TTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAACTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAACCTTTTAATCTTAATCTTAATTTTAACCCTTAAGTCCGAAAAATATAACTTTTTGCGTAACAACTAAGCTCAAACCGGAA:1 - chr3L 18240017 3' - jockey 4970 1 64.38 TACTCCGACTAAACGTCGTAAAAGACATGTTTATTACTTACTACCTTCAACATTGCAAGGGAGTTCTATTATCCAAATAACCCAACACA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 209 1 87.64 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCC:1 - chr3L 18281859 3' - Doc 66 1 64.14 GTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTC:2 - chrX 21087613 3' - mdg3 75 2 74.66 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGGTCTGTTCGTCATACCCTCGAAGAATGCGTGACTGTCCCATGTTGGTTGGGGGTGGGTGTCGG:1 - chr2L 19923896 3' - roo 8683 2 69.86 CCGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAG:1 + chr3L 18931025 3' - I-element 93 1 78.08 GGCGATACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACTTAAAACTTTGACAGGAATATACATTTGATTCCTTTTTTTAGCTCTTCATTATATGAGAAAATTGCTCTTACGC:1 - 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roo 8752 2 78.77 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGG:1 + chr3L 18126000 3' - Ivk 47 1 50.00 AGAGGCCACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCAACGACCAGCTACAGCGGAAAGAATGCTGAGCTACTTAATCTAGCTAAGAACTAGCTAAATTATGTTCAGCTCTGTGCAGTGGGAGCAAGCGAGATAGCGCG:1 - chrX 12480426 3' - HMS-Beagle2 138 2 50.34 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCG:1 - chr3R 9002940 3' + roo 8985 2 76.92 ATAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTGAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATGCGGAGAGGGCAGGATGAGGTGGTTGAGGTGGTAGAACAGAGCCACCCAAGAACTCCCAGACAT:1 - chr2R 14435725 3' - Cr1a 4262 1 49.21 AACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTT:2 + chr2R 15005107 3' - BS 5062 1 63.70 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCT:1 - chr3R 27405962 3' - diver 57 2 54.48 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATTTATAACCCCAATTTCGATAATTTACGATAAATGTTAATACATTCAAAAGGTAAATTAACAGCATTAAAAAGAACAAATTTCTATGGCATAAATGA:1 + chr2L 6455033 3' + BS 5056 1 37.67 GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTACTTCCT:2 + chrX 1799263 3' + invader4 3063 2 70.55 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAAT:2 - chr2L 17809154 3' + jockey 4955 1 56.85 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTCCTGGAAGAAGTTCATCGGGCT:1 + chr3L 17568129 3' + S-element 1699 1 63.64 TATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGG:3 - chr3L 23249377 3' - rover 7003 2 52.74 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCGTTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCATCATGTAAAAT:1 + chrX 8360667 3' + roo 9050 2 71.23 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATACATATATTATATATATAAATATATAAATATATTTATATATTTAATTTGAATCGGTTCGTGGTGCGTTTCCGTGAGCTTAAATATTCAATTAT:1 + chr3R 4217836 3' + 297 6959 2 75.34 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGCTACTGAGCTATAAGTTTAAGAAGTCACACAGTACCAAACGATAATG:1 - chr2L 16564469 3' - roo 48 2 56.85 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTT:1 + chr2L 12984235 3' - hopper 21 1 64.46 GTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACA:1 + chr2L 20640308 3' + Stalker 252 4 60.00 ACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGA:1 - chr2R 23780506 3' + Ivk 5336 1 54.11 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGGGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGATTTTTCAACCCGTCATCACTTAGT:1 - chr2L 22193394 3' - roo 8669 2 75.89 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAAC:1 + chr3L 9809336 3' + 412 7473 2 65.75 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCAT:1 + chrX 21216807 3' - roo 8736 2 69.18 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTTA:1 + chr2L 17005850 3' - Stalker2 7264 2 73.29 GCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGGATGAG:1 - chr2L 14026157 3' - F-element 495 1 68.79 GATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTAACTCCAAGCGGAATATACTCATTTCGAAAGAGATATTATGATAAGATTGGACAGACTGGGTGAACCCAACAGAGTAATTATATGATAAA:1 - chr2L 17180191 3' - Juan 403 1 70.40 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATTCGCCCAAAAGTAGGCAGCGCGAAA:1 + chr3L 21763774 3' - jockey 20 1 59.78 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTAAAAGTTCAACACAAAGTTTTGCCTCGTCGCAGAAGGATGGCTATAATGTTGTGAAAAACGTAGGCAGTCTTGTCATTTTCTACATT:1 - chr3R 13613753 3' - F-element 4429 1 63.01 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTTT:1 + chr2L 19675075 3' - 297 6632 2 62.33 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAG:1 - chr3R 23618142 3' + hopper 1344 1 69.78 ACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGATAACGTTTCTGCGCCCGCCGCTTTTAAGATATTTAAATATATATATGTTCTCGACAAGGATCAGTAGCTTCGCTTGTCGAACTTGCCA:1 - chr2R 6045076 3' - Tc1-2 184 1 65.52 AATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCACACACATCCAGAGATCTACAATATATTCCCCCCCACTTTGGCGACAGTGATGATTTTAAACTT:1 - chrX 1799110 3' - invader4 50 2 51.37 ACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCTAATGAGGATCTATTGGCAGCATGAGGACACTGGGGGGAAGTAGGGGAGAGCG:1 - chrX 10471938 3' - 1360 3285 1 57.60 AACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGCCATTTCATTATGAATCACCGAGAAAATCCTCAGAACAAGTTCGCCAAACGATCTCAGACACCTTCCC:1 + chr2L 18893660 3' + 412 7081 2 52.78 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCACTTTCT:1 + chr3R 22590594 3' - rover 47 2 56.85 GCTAGAAGGTTAAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGATATTGATATTTTTTCAAATTTTTATTAGTAGAAAATATGCGTGTTTTAAATGCAAGTGATATTCAGAATATGTGCTACTTTCTTAACATTAAATTTTTTAAGA:1 + chr3L 9237639 3' + INE-1 169 1 28.08 ATATGAGAAGCATATTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTG:1 + chr2L 22369224 3' - rover 3 2 70.80 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATT:1 + chrX 7795571 3' + roo 9026 1 80.90 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCACCTAAAAGTA:1 + chr3R 31264141 3' - jockey 4760 1 76.26 AAGGCGAATTTAATTAAATTTGCGCGTGAGAGTTTTTTGCCGACGAAGCGCGTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:2 + chr4 1294995 3' - TAHRE 127 1 54.11 GTGTGTGTGTGTGTGTGTCGGTGTGAGCTGTAGGTTGGAAAAACAGCGGAAAAATCAACAAAGAACAAAAGGAGAAAAGAAAAACAGTAGACCCAACAGACAACACTTAGATATTGAGAGTTTGTGAAATGAAAAGTATAAATAAT:1 + chrX 18969179 3' - accord 254 2 67.12 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAA:1 - chr3R 27765090 3' + mdg1 381 2 54.10 CCGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTNGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAG:1 + chr3L 18931025 3' - I-element 93 1 77.40 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAG:1 + chrX 4808602 3' - mdg3 5324 2 64.38 ACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGTTTTTATTCGTTTGAAAATTAGTTGGATGCCTTTTGGTTGGGTTCAAATGGGTTTAAATCGTAATGCGACTTAAT:1 + chrX 17358527 3' - 1360 185 1 63.77 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAATCATACACTCAAA:1 + chrX 661990 3' - 412 29 2 65.75 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCG:1 - chrX 9530323 3' + 297 321 2 71.03 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATG:1 - chr2R 22034616 3' + copia 235 1 69.78 GGGCGGACGTGAAAAAAAGGGTTTCTGAAGCCAAACCCAATACTAACGATGGTCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCTTCCTTCGAAGAAGTACCCCAAATAACACACAAAATAAGCT:1 - chr2L 4617338 3' + Tc1 1176 1 71.92 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACGAGGTCCATCAAACGGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAG:1 + chr3L 23398234 3' - 1360 14 1 76.03 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCGAAAGGGTGGGGGGAGGGGTAGATAGTTTTGGAAATAGTGTTCGTTATGTTACGCAAGGATCTACGGTTTCGGGGACGCTATGTG:1 + chr3R 7858532 3' - I-element 4954 1 59.31 AATTAAAAGTCGATGCCGAAAAGGAATACCTTTGTATTGTACCTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTCATTGAACACAGCTAATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTGCATCATTTTTATCTAATCAAGCATACCCTACATACAACTT:1 + chr2R 5740044 3' - HB 73 1 55.48 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACCTTGTCATTGAGCTATCTTCCGTCTCTGTCGCACTTCCCTCGGTTTTTTTTTTTATTGAAATT:1 - chr3L 19461950 3' - accord 7028 2 76.74 AAAATAATAATAATAATAATAAATATGTAAATATTTAAATATCAGCCAAAAAATGTAAATATTTACTAAACTGGATATTTATTTCAAAATTCATATTTAAATCATTTTCCCAGTAATTTAGTGCCAATCCTGTCCCGTTGTTTCTA:1 - chr2L 4136619 3' + mdg1 29 20 65.07 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAAATATAAAGAAATGAAATCATATGCAGGAAAGAGCG:1 + chr3R 8890147 3' - FB 31 1 65.75 TTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCTGTAATATGTTACTTACTTATTTATTAATCTGTCTTCAGTCAGCGAATTAGAACGTCGTTAAATATTTATGAAAAGTCCCTTTGGCATTG:1 - chr3R 15034688 3' - F-element 4455 1 73.60 CGGGTCACACGGCTACACCTCCCGCCAACCGACTGAGGGGCGGTGCCGTGTATCGTACAGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGATATAGAAAAGAGATTTCTCTGAAGAATCAGAGTCCGAACCAAATATTCTTTTGGAGGATA:1 - chr3L 25798622 3' - Cr1a 4437 1 67.81 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGG:1 + chr2L 19924037 3' + roo 343 2 60.96 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTTCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTCTCACGTTTT:1 + chr2L 14074562 3' - 297 6622 2 55.00 AGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCTCTTGGTATATATGT:1 + chr3R 4679584 3' - hopper 27 1 64.14 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATA:1 - chr3L 9269899 3' + copia 5083 2 66.44 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCG:1 - chr3L 18930977 3' + I-element 5286 1 66.21 AAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATCTTTTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTAATTTATAAGATCCCGGGGTCAGGTAGTTAGGTGTTGCCCAAAATACAAT:1 + chrX 4454142 3' - S-element 216 1 72.60 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTG:1 + chr3R 17077190 3' - roo 69 2 67.12 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCC:1 + chr2R 7850007 3' + roo 9025 2 66.04 GCTAGTCTCTTAAGTAAAAGAGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGAACAAAACAAATTATTATGATATTATGATACATATATATACGTAACTAAAAACCTCAAAGCTGCTAACTGACTTTAACTAAGATAACCTTTGTGTT:1 - chr2L 8223705 3' + Doc3-element 4686 1 63.19 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATAT:1 - chr2L 9636087 3' + 412 7474 2 63.70 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCAT:3 + chrX 8200320 3' + flea 4975 2 59.59 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAAACGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGAC:1 + chrX 20999617 3' - BS 31 1 58.22 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGGAAATATT:1 + chrY 2720367 3' - 297 56 2 68.35 ATATATTTTTATATTTATATTTATACTTCTGCAACTGTAAGTTATCAGATATTGATAAGCAATATAGTAAAAAAAATATATTAATTTTAGCTTCATTAAAACTAAAAGCTCAAGCTAAAGTTATTTTAAAAATCTTAAGAAACACA:2 + chr3L 19514627 3' - Stalker4 89 4 73.97 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGCTAAAATAAAA:1 - chrX 17343338 3' - I-element 13 1 75.17 CCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTGCA:1 + chr2L 14675747 3' + 297 6908 2 65.75 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTC:2 - chrX 6116222 3' - transib2 38 1 58.22 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTT:2 - chr2R 8735560 3' + mdg1 7411 2 54.11 TATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTGTGACTATTTATTTACAATAATAATAATAATCGTAATCCTCAACTGAAGCGTAATAAATTCTTAGCTGAGCACTACAATCACAGCACGTGGGCACTTG:1 - chrX 11470074 3' + BS 5029 1 71.92 AAATATTTTCAAATAAAATCAGAAAGTAATTGGCATACTCTTATTATTTCAATCATTAATTTCTTTACGTACTTGTTGATCAGAATTACTAAATAGACATTTCGAACTATATGTTTTAAACATGTTTAAAACATGTTTTAAACCTT:2 + chr3L 15547093 3' + roo 358 2 60.96 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAA:1 + chr3L 11844809 3' - rover 69 2 68.49 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCA:1 + chr2R 8099206 3' + jockey 4914 1 73.29 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATT:1 - chr2R 22034679 3' + copia 245 1 59.09 GAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTGTGCGGATGGACAAAATATGCCTAGCGTTTGGTATATATT:1 - chr2L 4826634 3' - F-element 363 1 70.34 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGAGGCACAGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAATCG:1 + chr2R 19941639 3' - hopper 34 1 52.03 ATAATTATTTTTTTGTTTTTGTAATAATTATATATATTTCTTAAGTCCTAGTTTTCTGAATCGGAACATCGATATGTGAGCTGACTCTTTGTCAACCTTTAGTCATTCAATGCCAACGATGCGTGTCCACATTCGATT:1 - chr3L 10292652 3' - gypsy11 3937 1 76.81 GATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATCTACTCCCCCTCGTGGCCTGTACTCCGAGGAGAAGGAGATCGAGGTAAGCTGACAATATGTGA:1 - chr3R 22635626 3' - Chimpo 61 1 65.07 ATTTCGCTTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCTTGAATTTTGCTTTTTTTTTATCGCACTCTTTGCGTATGCAAATGACTAGGACTCGGAATCGGATTCAGATTCGTATTCGGATGCCTTCAATTTCAATTGTTGTTTACTTAGCC:1 - chr2R 17829583 3' - Porto1 87 1 69.18 GGTTCTTTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTAAACAAACCATAAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATT:1 - chr3L 27874985 3' + Cr1a 4354 1 76.03 GGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCAACTACTTCTACTACTACCACTGGCATGCATAAATCTGCAATGGCGAAGAATCTCTGG:1 - chr3R 30529065 3' - roo 346 2 60.27 ACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACGCCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCAAGTCAGCTTTGGAAGATTTGTCGCCTATTTTGTGTGTGCCTCGCAGCGATTTCTTTCG:1 + chr3L 21806267 3' + baggins 5075 1 58.90 CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 168 2 67.74 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTTAGAACGGG:1 - chr3R 18399342 3' - Juan 4048 1 30.77 AAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTATG:1 + chr3L 20187443 3' + FB 496 1 63.01 AATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTT:1 + chr3R 14860223 3' - BS 5058 1 60.27 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTATACTCGTACTTTTGGCAGG:1 - chrX 13490678 3' - 297 6610 2 73.17 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTTTTAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGT:1 - chr3R 19449930 3' + roo 359 2 52.74 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGG:1 - chr3L 5389855 3' + roo 9025 2 55.00 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTAC:1 + chrX 1799258 3' + invader4 299 2 67.12 ACGGACTTAGGGAAATATTTTGTATGTTAGTTTCAGTTTCAAATAATCATTTATTATAAACGATCGCTTGCGATCCTTGCTAGTCCCATTCTTAACGGGAATATCTCTCTCTCGCTCTCGAGAGACTACGTTCGGCAGAAACAGTT:1 + chr2L 22497809 3' + HMS-Beagle2 7105 2 50.00 TTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAATATATTAATTTAGTACAGTTTAGAGTAGAGTAGTAAATGCAACCT:1 + chr2L 7655034 3' + I-element 5050 1 69.18 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGC:1 + chr3R 24369102 3' - roo 8750 2 76.71 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCA:1 + chrX 9410564 3' + I-element 5294 1 58.22 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGG:1 - chrX 21216712 3' + roo 352 2 57.53 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAA:1 + chr2L 16564578 3' + roo 9017 2 57.64 CGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGGCTGGCATGATGAGGCTGAACAAAAAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACTCCT:1 + chrX 21087713 3' + mdg3 5489 2 68.15 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTCCTGGAAGAAGTTCATCGGTCTTCCCCC:1 + chr3L 17568135 3' - TART-B 10199 1 53.79 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGAC:1 - chrX 12986557 3' + roo 8985 2 78.08 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTT:2 - chr2L 18549829 3' - roo 8727 2 64.38 ACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCTTGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGAAGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGGGTTTCCATTTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCA:1 + chr3L 13727326 3' - P-element 2770 1 19.18 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCA:2 - chrX 12986553 3' + roo 325 2 75.34 ACGAGTNAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAGAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAGATAGAGAGCAAAGAGCGTTAAAAACAGAACAAAAATCGTGAGTCTCGAACAGGCGAGTG:1 - chr2L 12288636 3' + Bica 219 1 56.85 GCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACCAATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCG:1 + chr2R 22989655 3' + hopper2 1514 1 77.08 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGTATGCATATTGT:1 + chr2L 18549965 3' + roo 9047 1 72.60 ATATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTATATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGATACCTTTTTGTTTTTTGCTTTGTATCGC:1 + chrX 3018544 3' + G4 3737 1 80.82 ATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGA:2 - chr3L 16973338 3' - S-element 1556 2 57.53 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCA:1 - chr3R 20167585 3' + roo 9002 2 67.81 TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACT:2 - chrX 19074762 3' - mdg1 7096 2 55.48 AAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCCTATCTTAAATCATTGTAGATCTGGTCTTCACGCATAGCTC:1 + chr3L 25671336 3' + Cr1a 4114 1 74.29 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGG:1 - chr3R 11469335 3' - Tabor 88 2 80.28 AACCTTCACACACACACACACAGCCATACACGCACAGCCGCACACACCCTCGCACTGGGGAAAAGCGGCAAACGCAGAC:1 + chr3L 2827455 3' + accord 7099 2 81.01 TATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGCATTGACGATTGAAAATTGAAAGAGCAACTGAACAGAAATGCAATAAAACAAAATAAATGCTTTACGCTTTTGGCAATCGAACAGAAA:2 - chr2R 1733764 3' + HB 302 1 66.44 CACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAATAAAATATAATAAAATAGTAGTTGGTACAGTCTTAAATAAAGAAAAATACGAACTCTTATAATTGAATTGTCAGAGCGGAAGCGTTTCTCGCTCTGATTTC:1 - chr2R 17610413 3' - copia 147 2 39.04 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCCAAGCGGAGGGG:1 - chr3L 6518578 3' - 412 7137 2 74.66 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGCCACTCTCTTGGTTGACTTTAT:1 + chr2L 3234074 3' + roo 9038 1 57.25 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGACACAA:1 - chr3R 17996125 3' - diver 5902 2 73.57 GAAAATATTTTTTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGTTATGCCAATAAAAATTTTATAGTATGCAAGTTTCCAACCCATAAATTAGCACTCTGCTCCAGTTGATAAACAAATTTAAAACTCCTATCTCAACAACATTGCC:1 + chr2R 2674090 3' - mariner2 831 1 63.70 TTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTT:1 - chr2R 10078153 3' - jockey 102 1 66.44 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGACCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGGTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCCTTC:1 + chr3R 31653189 3' + roo 9039 1 60.99 AGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTTAGTTGCTTAAAATTATTGTGCCCATAAAAAAGCTAGGTAGATTTTATAATAAATTAAAAATAAAATTAAAATAATGGTGTAAATGGTGTCAGTGCTTAAAGACAA:1 + chr3R 15881133 3' + jockey 102 1 76.71 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTT:1 + chrX 19588161 3' + roo 9032 1 58.22 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCT:1 - chr3L 18281858 3' - Doc 50 1 57.69 CTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGCAAACAAAA:1 + chr2R 16328051 3' + F-element 461 1 69.41 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTTGGAAAATTTTGGTTTTGGGGATCAAAAACGATTTCGATGTATTTA:1 - chr3R 24219225 3' - roo 8681 2 73.97 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAA:3 + chr3L 18505717 3' - I-element 86 1 77.40 GGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAAT:1 + chr2R 19727744 3' + invader1 385 2 73.79 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCC:3 + chr3R 11062872 3' + roo 9050 2 67.81 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGTCTTTTTATGAAAGGGATCACATCTCAATTTACCTCTTGGCTGTTCCGCCATCCTTGCATAGAGCTAGCTCCAAC:1 + chr2R 5362648 3' - Burdock 6138 2 61.24 CGTTAGGTTAAAGTCGACCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTTAACTCGTTGCTTAGAAATGCTGCATAAAAGGACAAAGACGGTGCGGAGCCC:1 - chrX 6158368 3' - gypsy4 6541 1 45.74 AAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTAAGATTAAGTTGTTTAAAAGCTAAATGTTGAAAATTTTCTTCAAAATTAAAA:1 - chr3R 7081449 3' - G4 3631 1 55.79 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTT:2 + chr3L 21380613 3' - I-element 71 1 65.07 GTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGTGTATTACGAACACCCACTTTGAGGCCATCAAATAAATGCAT:1 - chr2R 3593590 3' - gypsy 7001 2 74.66 CATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGTGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGGTTGTAATGGG:1 + chr2L 1924045 3' - G2 2991 1 63.01 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTT:1 - chrX 11661373 3' + pogo 2057 1 56.16 TTATCACAATAATAATAACAATAATAGTGGCAGCAAGTACAATTATATGGGTGTGAATGGGTCAGGTGGAGCTGGCAGCGGAGGTGTTGGGTCCAACGCAAATGGAGCTTCCTAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAA:1 + chr3R 19448820 3' + mdg1 7056 2 72.60 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGT:1 + chr3L 17940180 3' + 1360 3387 2 69.44 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATGGGAATCGCGGATTGAAATAGATTATTTTATGGAACGCGAAAGAGTTA:1 - chr3L 21380494 3' + I-element 5320 1 56.85 ACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTG:1 - chr3L 5061554 3' + 17.6 7410 2 65.06 ATCCAAATTAGCTGAGTTGTATAAAATATCACGTAAAATACTGTGTACACTTTAGTTAAAAAAAAATAAAAAACTGAAAACTAGCTTCTTAATTTGTAAGTAACCAAATGTTATTATATTAATATATTTACATTGACGACACTATT:1 - chrX 22563242 3' + Bari2 329 1 62.33 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATC:3 - chr2L 9782085 3' - P-element 78 1 32.19 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTT:1 + chr3L 22723925 3' - HMS-Beagle2 6958 2 70.55 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGACCGCACAACAACT:1 + chr3R 21933283 3' - pogo 20 1 75.34 AATAATTCAACAAATGAATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGATATACACAGGATGGAGACCAAGTTGAAGATAAAGAAGGAGGCCAACTTCATTCCACCCAACTATACCAGTTGGCTTGAG:2 - chr3R 4831015 3' - Tc1 1381 1 54.11 GTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCGCCTTAGAACAAAATAATGTAAATTGCCTAACCAGCTGGACTTCGAAAAGATCCGGGGAGCAGGAGTTCA:1 + chr3L 4348859 3' - G2 359 1 52.05 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTT:2 + chr3R 15791011 3' + roo 9015 2 58.90 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATA:1 + chr3L 8959714 3' - 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chr3R 5768983 3' + roo 9037 1 61.64 AATTTAAAAAAAAAAAGGAAAAAATAAATACGGCAAAA:1 + chrX 19149568 3' + TART-C 11098 1 81.58 TTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTG:1 - chr3R 4682887 3' - Burdock 6198 2 62.33 AAAACGTACGCATCGGTGGCGTCATAATCATTTGAAGCGTCTGAACTGAAACAACAAAATAAACTAAAGGCATATGAATTCAAACACGACTAGGAAAATATAATCCAATAATTCTAAAGGACGACAACTTTGGTAATGTTAACTAC:1 + chr3L 26695593 3' + 3S18 263 2 53.42 GAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCGAGATCGGTTTATCACCGATTAATTAGAGTTTGATAAATACGCGCACGCCG:1 + chr2R 25141405 3' - baggins 5350 1 60.98 AATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAA:1 - chr3R 9557542 3' - G6 1993 2 65.32 CTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCT:1 - chr3R 2527713 3' + INE-1 543 1 47.59 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATT:1 + chr2R 12779733 3' - I-element 49 1 52.74 GATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATAT:1 - chr3L 16731387 3' - rover 39 2 61.64 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAA:1 + chr2L 3675912 3' + Juan 4129 1 78.08 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGGGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAG:1 - chr3L 5881578 3' - pogo 38 1 55.83 CATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGACGAACACAAAGTAAGATTTACGACT:1 - chr2L 4888687 3' + BS 5071 1 67.81 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGC:1 + chr3R 31653171 3' + roo 9016 2 57.53 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGCTCAGTATCAACATTATTTTCCAGCAACTGCTCGTAAATTTGTTGTTAAAATAAGCACTTAAGC:1 + chr3R 5758933 3' - jockey 4839 1 56.16 TTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTC:1 + chr2R 8157273 3' - mdg1 62 2 60.96 GATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAG:1 + chr2R 2875185 3' + TLD2_LTR 49 1 65.75 ATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAA:1 - chr3R 3617313 3' + micropia 170 2 72.60 CTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAG:1 - chr2L 22966913 3' - 1360 3193 1 61.82 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTA:1 - chr3L 5389871 3' + roo 339 2 67.81 TATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACGACTACACCAAGAGACGG:1 + chr3L 5482408 3' - flea 4944 1 77.94 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAACATGTATAAATATTTTTTTTCTCTG:1 + chr3L 14720923 3' - F-element 61 1 48.63 AAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAACAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATT:1 - chr3R 10270604 3' - Juan 4120 1 78.08 TTTTTTTTTTTAATTTTTCATAACTTTTTTTTGTTATTACTTTTTATTGTTACTTATATTTATTTATTTATTTTTTTTTCTTTCTTAGCCAAATTGCACTTGTCATGCTGCTGCCAAGAATCATTCGAATCGGACCATTCAATTGA:1 - chrX 3394850 3' - Doc 4693 1 43.84 ACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGC:2 - chr3R 17996195 3' - diver 5978 2 77.40 TCTATTTGTTTTTTAGTTTTACTTAATTATTCCATACACAGAACATTTTATAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCATCTCTTTCCCTATGTGCATTTTTGATTATTAACGATGTTAAATTACACGTATCTAGAATTTCGTAT:1 - chr3R 3581541 3' - Doc3-element 174 1 60.27 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTC:1 + chr3R 15790997 3' + roo 338 2 68.28 TATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGACGAACACAAAGTAAGATTTA:1 - chr2L 4888692 3' + BS 5066 1 64.38 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAA:1 - chr2R 7090618 3' + I-element 5312 1 53.42 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAG:1 - chr3R 23639117 3' - pogo 37 1 58.90 AAAAAAAATTGCGTTTAAGTAAGCAAAAAACACTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACCTTTTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTTTTCTAAAGTCAAATGGGCAGGATATTTGAAAATA:1 - chr2L 6101087 3' + S-element 1635 2 92.47 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGT:1 - chr3R 14980295 3' + roo 9024 2 52.74 TGAGATCTCGACTTTCATACAGACAGACGGACATGGCTAAAACGATTTTATTTAATCGATAAATATTGGCCTTGGCAAGAATATATATATTTTATATATTC:1 + chr4 1198444 3' - INE-1 135 1 57.43 AGTATATATGTGTGTATGTATTTTGTGGATTTAAGAGAAACGAAATATTAGAATGTAAAGTGCTTGCTTTTAATGGTTTCAAAAATGTAGCAGTGGAAGTTTGTGCCTCTGATCAAGAGGCTGATGAAGAAATACGATGCGACCCC:2 - 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ZAM 8050 2 74.66 AATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTT:1 - chrX 14304034 3' - roo 8707 2 54.11 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTT:1 - chr2R 8099140 3' - jockey 4818 1 58.74 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGGACGTCTTACCCATTTTGGAGTCGAGCGGCCGTCCGCCG:1 - chr2R 22514103 3' - P-element 50 1 48.12 GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCT:1 + chrX 1799256 3' + invader4 304 2 69.06 TATTTAAAATGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGATTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCT:1 - chr2R 13766202 3' + roo 346 2 58.90 TTTAATTTAATTTTAATTTAAATTTTTAATTTATCAAAGCTTAAATGTAATAAATCTAATTTTCTCTCTGCTATATTAAGGAATAATAAAGCATAAATTATACGTGACTTGAAGCGGATGATTATTTTATTTGTGGTAACTATGGT:2 + chr3L 13468034 3' + Rt1b 127 1 76.71 AGCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTT:1 - 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Tirant 8120 2 78.08 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCGATGATAGGAAAGTGATTTTATTTTACCAA:1 - chr3L 15913796 3' - jockey 4768 1 78.08 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATG:1 - chr3L 16690919 3' + I-element 5278 1 73.29 GAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACA:2 + chr3R 11062842 3' + roo 9020 2 50.68 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGCAGCGTTTTTAATTCAT:1 - chr3R 27765068 3' + mdg1 381 2 56.25 GGTTGGCACGACAAAAGGTCATAACTTTACACTTGGAGCCTTTTAAGTCTAAGTCACGGCAACATAACTTAAACTGGCGACTTAAATTTCACGTCACCATAGCATCCATTTGGGGCAATTATAA:1 + chr2L 14869733 3' - Q-element 683 2 52.42 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACA:2 + chr3L 6518656 3' + 412 7490 2 55.48 GCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGAACGGAAAGGTCACTCCGAGTGGAGGAGCCACAACAACTGCACAGCCAGCAGTTAACCAAAAAG:1 + chr2R 23836855 3' - Quasimodo 7228 2 56.16 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACA:1 - chr3R 27160090 3' + 412 427 2 75.20 AAATATGTATATATATGTATAGGTAAGTATTTGTAAGTACTTGGTTCTTTCCTGCGAAATTGAGCACTTAATCATCGCTCGCAGATTTAATTAAATGCAGCTGTAATAAATCGATCCATGCCCTGTATGTCCTGTAGTTGAATAGT:1 + chr3R 970358 3' + G3 4513 1 63.01 CACAGCATATTTGCGAGGCCGCGATGAACATTAATCCGCAACGATCTTTGTTGCGGTTTCACTTGCAGCCACTTGTCCTCAGTCTTAATTTTGCATTTGACAGCGG:1 - chr2R 1955917 3' + Gypsy6A_LTR 105 1 86.79 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGCTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAATGAA:1 + chr3R 15072660 3' + pogo 2037 1 63.70 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAAT:1 + chrX 1341754 3' - 412 40 2 58.22 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGCTTATATACT:1 + chr3L 16033434 3' - Doc 58 1 54.11 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGATT:3 + chr2R 13259408 3' - mdg1 36 2 58.22 AAAATCAAATGTAAATTGGTTTTGAGAAGAAGGCACAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGTTTCTTAAGATTAGGAAAAGATTCAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACCCAAATACTTCACTATATACATATATGTACAT:1 + chr3R 14473542 3' - 297 259 2 76.71 CAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTATTGGGGTGTACATTATCTTGATTTGATCAACAAGCGCACACTA:1 + chr2R 10798480 3' - jockey 4760 1 78.47 CCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCCTGTGG:1 - chr3L 18125929 3' + Ivk 5301 1 71.63 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGTTTTATGTGCTTATGCGCTTTA:1 + chr3R 17421314 3' + pogo 2051 1 58.22 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAAT:1 - chr3L 12315727 3' - transib2 65 1 61.81 AATCTCAACCTTCTAGCTATTATAGTCCCATAGACTTCAAAGTAAATGTAGTGATAATGGGTTGAAAAGTACTTTTAATACAATGAACAACATTATTTGTTAATTAAACAGTAACTTACAATGTTAT:1 - chr2R 5779384 3' - INE-1 164 1 74.80 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTTCTGGCCAATTGAACATTTCGG:1 + chr3L 5389968 3' - roo 6 2 67.02 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGACGCCTTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGGCG:1 + chr3R 27843251 3' + I-element 5310 1 55.81 CTTCACTGGCAGTCCCGGTGAGTAAGCAAGGACTGAAGAGCACGCGGGGTATCGCAAGGTACCTAATAGGTACAACTTCAGCAGAAACAGCAAAAATTGCATGATTCGAATTCGTTTAGCATTCCGTTTTATTATT:1 + chr2L 16968257 3' + Rt1b 4988 1 69.85 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAG:1 - chrX 19074740 3' - mdg1 7074 2 56.85 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTAC:4 + chrX 2479597 3' - mdg3 5303 2 51.37 GCTCTCTAACAAAAGTTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAAAGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' - 1360 91 1 77.27 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATG:2 - chr2R 18316016 3' - HMS-Beagle2 46 2 54.11 AGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCAGCGACCAGACTACGGTGCCAAGCAGAAACACGCAATGACTAGAAATGTCGTACATATGAATATATTTAGAAGCATTGTGTTGTAAGAAGGCGTTGCGTTCACATAATTGATACATT:1 + chr2L 22173306 3' - invader1 139 2 52.78 ACGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTACAATAAAAGCTAGTGAGATTTCTCTCAGTGTAGCGATCCTTGGCTCGAAAAAAATTGCATGAAGCGGCGCATTATGTTTATGGCCTTT:1 + chr3L 818058 3' - Transpac 355 1 78.26 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCGATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGCAGCATTTG:1 - chrX 19054194 3' - jockey 15 1 77.40 GATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATC:1 - chr3R 4357544 3' + Tc3 1672 1 60.95 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCCGAAATTTTCATTT:1 - chr2L 4072164 3' - 297 38 2 50.70 TGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGG:2 - chr3L 17567879 3' - S-element 1591 2 63.01 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCCGTGCCCCCCCGGGGGCAACACTCACCTGGC:1 - chr3R 22287956 3' - transib2 55 1 56.64 GCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTGGCAAAAAGTTGCGGGCTTGGCCGTTTTGGACGGTTTTAGGGGGTTAGAGTGGGCGTCTGTAATGGGAACACAAATCG:1 + chr3L 16074923 3' - INE-1 348 1 75.73 AAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACACTTGAAATACAACTAATTTCGTTAGCCCACCTTTTAAGTGAACTCAAGTTTATAAATTGTGCAGCAAGTACAACACACACACATATGTATACTCCTCTATTTACTCAG:1 + chrX 459750 3' + FB 401 1 54.79 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGT:4 + chr3R 28385643 3' - transib2 46 1 54.11 TTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTT:1 + chr3L 16973458 3' - S-element 67 1 67.12 CGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTA:1 + chrX 21994016 3' - McClintock 5979 2 63.70 TATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTG:1 + chr2L 5460085 3' + Dm88 21 3 38.36 AAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTAT:1 + chrX 20999592 3' - BS 56 1 60.27 CCTGGCCTCACATTCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACTGCCAGTCCCAGTGAGCGTCCACGGACTGAAGAGCACGCGGAGTAAGTTAAATAAATAAAAATAGCGAACAATCAACGAAAATAAAAAAGAAGTAGGCACAACTAAG:1 - chrX 17565288 3' + Rt1b 4955 1 62.33 ACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCCCTCCCAGCACATGTGGTTTTTGTGGCTCCTTGTTATTGTTGGTTTTGGACTGCAATTTGG:1 - chrX 13702771 3' - Bari1 112 1 56.30 AAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATGAGCTGGACGCATATGATATTGTCCCTATCATATAATTAATATATAAAGAATTTAAAGAATTTTATCAAGAGTAGCCAAACACCTCGTCATTAAC:1 + chrX 23431006 3' - R2-element 3315 1 57.53 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACAT:2 - chr2L 22674746 3' - mdg1 27 2 68.49 AAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGGAGTCAAATGCGGCTGCGGATGTTTATGACAAATTGGATTAGCAGAGGGGGTTGGAAGTGGTAAAGTTGACCTCCCAGCTCTTTGTGCTTATTTTTTCAAA:1 + chrX 10667393 3' - Quasimodo 362 2 53.42 AAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTAAAGTTACCCAAATCACAAAAACAGAATAAGTAACCTCCCTAACTATTGAACGCTTCAGAGGCAGGTGCAACTAAATTCTGAGCGAGGGTCACTAGGTGGGACACCTGCTCATTTCTCCA:1 + chr3L 22989629 3' + S-element 402 1 75.34 AATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACATGTAGCGCGCCCCTGGAGTTGCCACGCCCACTA:1 + chrX 10345368 3' + 1360 3165 1 68.37 GAGGAGACACCGGAGCGGAGGACCGCCGGTATCATTATCTTTTTCAAGACTTCAAAAGGAAGGGGGAGATGTGAGGAGTCTTAAAACTCTACAAATATGGGCAGGAAAAGAAGAAAGAAAAAAGTACAAGTTACATAACTCGCTGA:1 - chrX 19744028 3' + gypsy8 4582 1 70.55 AGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGGGGGGAATATCGAATAAATAATGATGATGCGCCACTTTTTCGGTTTATTTTGCATGCATTTTATGATTC:1 - chr3L 13377632 3' + opus 210 2 52.74 CCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCGGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTACG:1 + chr2R 6482510 3' - gypsy 7071 2 71.23 TTTTGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTATCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACCATGCACCAAGAAAGCCCCTAAGGAATATAAAACATTTTACAATTGCCTATCAT:2 + chr2L 15080213 3' + R1A1-element 264 1 60.27 ATCGATATCCCAGAAAAATGATGAATTTTCGCAATTCACACTAGATGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGCGGAATTCCATATACGACTATATCTGTACGACTATAGCATTCTCTCTTGTTAAACATAAAATTGAATAAACTTACCA:1 - chrX 14001010 3' + INE-1 504 1 70.55 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTT:1 - chr3R 904923 3' - rover 32 2 54.79 GTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATGCATAAAAAAG:1 + chr3R 905026 3' + rover 282 2 67.12 GAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTGTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACT:1 - chrX 14771741 3' - BS 76 1 71.83 GCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAATATATTAAATTATAACTTCTTTGCACTCAGTCTTGAAACAATGAATTGAT:1 - chr3L 19453241 3' + mdg1 7314 2 65.75 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCG:1 - chrX 18817288 3' + transib2 2752 1 66.44 CATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTACTTTTTATGATTTGATTGTGTGTAAAATTAGTATTCTTTTTTGAG:1 + chrX 14771850 3' + BS 5071 1 66.44 ATTATTNTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACCGCAGTT:1 - chr3R 23618080 3' + hopper 1399 1 74.66 CATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTACGACGACGACTACAATTGAACTATCAACATCAACAAATGCGGCA:1 + chrX 12968665 3' + Burdock 6329 2 65.07 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGTGTTGACATGGTGTTCTCATGGTACTCAAAAATAATTAAGTATGTATCAAAGTATTAGTGCGAAAAAATGTGAAATAGAAAGTTAACATTTTAGCATAT:1 + chr3L 23287364 3' + 1360 3372 1 74.66 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAG:1 + chr2L 8338215 3' + P-element 2849 1 55.04 CTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTTTCTTGATTGAATAT:2 + chr2R 13259735 3' + mdg1 7242 2 65.07 GTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTGTGGCCCTGCGCATGTTAACTTTAGCTACATATTTCTCCCCTTTAATGAAATGAGAGTCATACTTGACTTGCTTTACCGATGATCTCATTTTCTGATATGCTTTCGTCAGAATTTTTAACT:1 + chr3R 2998716 3' - gypsy4 6593 2 71.53 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCT:1 + chr3R 7420303 3' - 1360 60 1 60.27 ATAAATTTTTTTATATTTTATCAAGTCTTCTTCCTCCTCTAAAAATATATTAAGGCAATTGAATTTGTCTTCCACTTCTTCTACAGGCAGCGCAGAGTCTAGATCTTGATCAGAAAAGCTCTATATACGCTGTGCTTAA:1 + chr2L 22539699 3' - transib4 2279 1 58.99 ACATGCACTCCAGCCGGTACCACGACAGGCTAGAGCGCCACAGCAATCGCCTAGCCAAGGCAGCCTTGGCTAAATTTGTACTCTGAAAAGTGACTTTAAGCAGGTGTCCTATGACCAGCCATCACATTATACCCACCAAATCTA:1 - chr2R 12394510 3' + BS3 1470 1 58.33 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGCCTCACTGGGCGACGTGTAGTCAAA:1 - chr2R 2590664 3' + HMS-Beagle 223 2 67.12 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCTAATGAAGTTTAAGCGCA:1 + chr3L 5881712 3' - pogo 28 1 66.44 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGG:1 + chr2L 12818332 3' - hobo 52 1 55.47 AGTTTCTTTTGCCCACGTCCATTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTTGCACTTTTTGTGCCATTGCTCTAAAAAATCTTCGCAATATCAATGCTGATGACATTCGAATT:1 + chr2R 5180386 3' + FB 94 1 54.11 CTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACATACACTGAAAATTAA:2 + chr2R 4545186 3' + invader1 3551 1 63.70 GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTACTTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCT:1 + chr3R 18971786 3' - Juan 4084 1 57.04 AACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:2 + chr2L 5069689 3' + flea 5010 2 85.62 GTTACTCAGCTATTGGGAATGCAAACGCGAAATATTGGGGGGGTACTAATAAAGTTATAAATAATATCGAACAATTTTTAAAAAATCTAATTTTGTTGTGTTTGTTTTTATTGATCAGTCGACGTTCTTACAGAAGAACTAGCGCT:1 - chr3L 19424908 3' - INE-1 534 1 71.23 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGTTCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATTTATTTATCAATTAA:1 + chrX 13149471 3' + opus 495 2 65.91 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATTTTGCGTTACATTTGCTTTTT:1 - chr3R 29612015 3' - jockey 76 1 62.33 ATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCA:1 - chr3R 11186566 3' + BS 5006 1 76.92 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGA:3 - chr3R 4964102 3' + roo 9002 2 67.12 CCGCGACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTGCCGTTGCAAGTTGCTAGTTGCTGCTGGAATCGGTTTCGGCTGGCTTCACGCTCCGCTGGCATGCAAATCAGTTGGCC:1 - chr3L 9736301 3' + Doc2-element 376 1 65.12 GTCGTGCCGGTGCTGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTTTGGGAATGAGTGCTTCAGCACTTAGCCAAATTGATTTGGGTGGTAAGGTTGGAAAACATTTTACTATCGAAACTAAAGTCATAA:1 + chr3L 9992731 3' - Doc3-element 4569 1 57.53 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGGTTTCTTGTTTTTTTT:1 + chr2L 16946129 3' + hopper 1355 1 57.34 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTT:1 - chr3R 15790848 3' - roo 66 2 63.70 TATGTATGTATGTATGTAATGTATGTATGTATATATTATTTATACAAAAAAAATGTATAAATATGAATAATTTTTTACTTGCAAAAATCCTTAAATCCACTTGAACACAATTTTATTTCGTTATTTAAAAACTAGATTTCTTTTTA:1 - chr3L 14284463 3' - 412 7276 2 76.71 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAA:2 - chr2R 9871033 3' + roo 346 2 63.01 AGGATCAATAGCCCAGTCGATCTAGCCATGGTTCGTCTGTCCGTCAGTCCGTATGAACGACGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGTAGAATTGAATTGCACCTTCAACTCTAGAAATATTACATTTGGGACAAATAT:1 + chr4 619404 3' + INE-1 96 1 67.81 CTAATATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCTCACTACCGAGTGCCG:1 + chr3L 25980807 3' - 1360 319 1 70.91 CCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACGATATGTTTGACGATCGAATACCGGTGGATTATCGTTGACATCGCGAAC:1 + chr2L 17809318 3' - jockey 15 1 78.77 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTG:1 - chr2L 4063863 3' + roo 8989 2 78.57 GTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGGGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTAATTACTTAGGCCTCTGCTTTTCTGCCTTTTTGACATTCATTTGTTTGTAAATTTGTCATTTT:1 - chrX 8360276 3' + roo 8893 2 60.48 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTAT:1 + chr3R 19073299 3' + roo 9026 1 53.42 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTC:1 + chr3R 11810699 3' + roo 352 2 77.14 CCACACACACACACACTTATTCACTTGCATTGGTTTCGCGTTTTTGGGTTTTACTGCTTTTGTTGTGTTTAAGTAGCGATTTAGTGGCAGGTATTGAACGGG:1 - chr2L 9317325 3' + accord 185 2 51.96 AACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGAAAAATGATTCCCTTAGCAGACAAGCCGGCA:1 + chr2L 21930276 3' + Copia1_DM 116 1 58.74 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCT:1 + chr2L 6647720 3' - mdg3 5325 2 64.38 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAACCTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTT:1 + chr3R 20441346 3' - I-element 38 1 56.85 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAA:1 + chr3R 11937386 3' + flea 217 2 60.38 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATC:1 - chr2L 20265949 3' + roo 9001 2 68.28 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTT:4 + chr2R 14051859 3' - roo 8717 2 62.33 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCTGCATATGGAATTCGCTGATGGCCAAAAGCAATCGATTTT:1 - chr3R 8051078 3' - jockey 4776 1 73.97 ATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCG:1 + chr3R 13612636 3' - F-element 182 1 67.86 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAAATCTGATTGGACACCGACACT:1 + chr2R 21160796 3' - Transpac 27 2 62.33 CATTTCCTCACTTTGTTTATATTTGTTTCTGGTTATGGTGGATTTTGGGGTTTCCCTGGGGGAGGTATATTTAGTTTTATATATATATGTATATATAGATCTCAATGCCTCCCATTGCTCGCTAAAAAAATAACTATCAAAAAAAC:1 + chrX 13861155 3' + Transib5 2629 1 54.79 AAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTCGTTTTGTTTTGCAACCAATTTTCAGGCTTCCTCCTGGAAGGAGTCACGCCAACGGCACCACCGGATG:1 - chr3L 22340600 3' - hobo 2542 1 66.35 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTCGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAATTTAAAGCCATGCAGTGTGTGG:1 + chr3L 7889706 3' + roo 396 1 75.17 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAATCACACAA:1 - chr3L 10373792 3' + 297 6942 2 63.70 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCCTTTTGCTGGCAATTGCCTTCGC:1 + chr2L 8338246 3' + P-element 2871 1 73.91 ATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAATGGACGCGGAGTTCTGGATTCTGGGAGACGTTTTCATCGGTCGATATTACACCGCCTT:1 + chr3R 17412298 3' - pogo 1803 1 63.01 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTA:1 + chrX 9410555 3' + I-element 5285 1 64.38 AAGAGAATGCTATAGTCGAATTACCCGACTATCAGATACCCCTTACACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAACATCATCATTTATATGGGATATCGAAAGTGATATTTGATAAGTGATTAATTTAAAACGTAACAGTCATCAG:1 + chr2R 6221851 3' - INE-1 575 1 71.92 CTTAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGCACTCACCTCTTT:1 - chr3L 5881588 3' - pogo 55 1 63.78 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGT:1 + chr2R 21681403 3' - roo 62 2 60.96 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCTTGTTATGACGTATTGACGTATTTGATCATGTTTTGGTTCCCATTTTAATAATTTGTTTTAACATGTAAGCCCATAAAGCGATTTCCGATGCAGAACTTGCC:1 - chr3L 12859921 3' + roo 390 2 60.27 CATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGAACGTTTTTTGTGCGTCTCATTCTTATTTTTATGCACAATTTTATTCTTTTTCCTTTGGCTGCTGC:1 + chr2L 15297458 3' - F-element 122 1 68.00 TCAAAAACATGTAATATAAGTACATATATACCAAGGATGTGCTGTATATAAAAGTTAATTTATGGAATTTCCTGTAAGGCTGCGTTCTAGGTAAGTAATGCCA:1 - chr2R 23180569 3' + roo 131 2 83.50 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTA:1 - chr2L 9782110 3' - P-element 103 1 15.07 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTC:1 + chr2L 3234060 3' + roo 352 2 55.48 ACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAACACAATAGACTGCCAGCCACACAAAACTCGACCAAAACCACCCACCTCCATGGCATCGTCACCATCCATCCCCTTTTTGGAGAAGGGGG:1 + chr2R 22517383 3' - P-element 234 1 73.60 GTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTCAATCTA:1 - chrX 18396021 3' + roo 407 1 73.97 TATAGCATTCTCTCTTGTTTAAATTGTGGATTCCGCAGAGAACGTGACGGTCCTCTAAAGAATTATCATTCATAGAGCACACCTCACCAGCTAACTGTTAACAGCGTGGTATTATTATAGTGTAGTAAATAAAATTGAAAGTG:1 - chr3L 19465570 3' + INE-1 583 1 74.83 AAATAACTAATTATAGCATTAGCATTAATGAATTGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAATTAACCCACAGTCGATTGATTTTT:1 - chr2R 20010200 3' + Juan 4155 1 55.71 AGGAACTATAAAAGCTAGAAGGATGAGATTCAGCATACAAATGGATACGTTCTTGTATTTTGGAACGTCAATAAAGAACTTTTAGTTTTGAATGCAATTAGAAATACTGTTCCATTCACAGAAATACCTATATGGAGGACACCAGG:1 + chrX 21007044 3' + INE-1 156 1 71.23 CTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGGCTATTATTTGTAGTTTTTGAATTTATTTTTTGCTTTTTCTGCTTGTTTTCCAACTTGAAGTTTGTTATTTTGCTTTTATAATACATCTAAATTTCATATTCACTT:1 + chr3R 12550700 3' - I-element 378 1 78.77 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGG:2 + chr2R 6847848 3' - Doc 62 1 57.53 CAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGGAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTT:1 + chr3R 15325183 3' - 297 6600 2 56.73 TACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATC:1 + chr3R 15790116 3' - flea 4739 1 64.38 TAAATAAATAATAAAAAATAAAAGCCCATAGACCAAGAACTTTTCGTTCAACATTAAATAAACACTTACAGCATTA:1 + chr3L 23295342 3' + BS 5093 1 78.95 AACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGGATCGCCCGCAGTTCTTAGCTTATAGTCCTCTAAGTCATGTGCAGCATTTACCTAAATCTATTACTTAT:1 + chr3R 27082268 3' - invader4 234 2 60.48 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTTTGTTTTTTGCATTTTTTCTAGCTATGCTGCTGCAGCATGCCACAAAATGTT:1 + chrX 7615932 3' - I-element 5111 1 64.38 AATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGAGCAATTGAATATT:1 - chr2R 23780493 3' + Ivk 5349 1 63.01 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGGGGTAGGCCTGTGAGGGTCGTTTCTTTTTTTTTTTGGCCACACCTTCCATTCTCGCCGGGGTGACT:1 + chr3L 10272185 3' - jockey 4811 1 57.76 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTG:1 + chr3L 22723980 3' - HMS-Beagle2 19 2 71.03 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCC:1 - chrX 21224526 3' - roo 8706 2 54.68 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCCC:1 + chr3R 31653186 3' + roo 9032 1 60.00 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCAC:1 + chr3L 19111609 3' - Doc 57 1 58.99 ATAATCAAAATAATAATAATAATAATAATAATACCGCTGCTAATATATATGCATGCTGCTGTTAAGAGGCTTGCGCTCTCCTGGTCTCAAAAGGGCCCCCAAGTCGTATGACATTA:1 - chr2R 20467039 3' + mdg1 29 3 81.03 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTT:1 - chr3R 15724279 3' + Juan 4177 1 56.85 AAGTTTTTTTTTTTGTTTTTATATTGAGTAATGCCATTGGGTTCGGCAATCCGAATGGCGTTTATACATACATGCAGATATATCTGCCAGTTTATGTCAAGTGTCAAAAATGTCGGAATGTTTGACAATTTTGCT:1 - chrX 6911466 3' - HMS-Beagle2 490 1 57.78 ACCGACACACACACACACACACACAGGCGCAATCCTCCCCTGAAAATTGCCTCCGAAACCCTTCACGCTTTATCAATTCGCTTTTTTGGTGCCTTTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 - chr3R 27499989 3' + accord 7100 2 67.50 AAATAAATAAATAATTTCCGATGCCTAAAATAATTTTCATTGAGTTCTGAAAAAAAAAAAGAAAATTATGCCTCACCCTGTAGTTGCGCTTGATGCAAAAAATTACTCATCCGACGCAACAGAAATTAATTAAAGTCAAAAAGGAA:1 - chr3R 8379837 3' + mariner2 835 1 76.71 ACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGTTGAGTTTGGAATATTTATAATTGTGGGAACTCGTGAATAT:1 - chr3R 30850474 3' - R2-element 3257 1 71.92 ATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGATCATACCAACATACGGGCAGACGGACAGGCGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGGCCCTCATCACCATCACCGTCACCACCCCCTGTTT:1 + chr2R 21201074 3' - INE-1 176 1 73.38 ATTCGTAGCGGCCATGCAAATAAACAAAGTTTGCCAGCTACGTAATGACGTCCGGCATAATGCTTACACTGCAGAAGCACAGGGATTTTTAAAGAGGGACCCGCTAAGATAAGTCCTTGTGATGTTAATGTAGTAGCTGCTTCAGC:1 + chr3R 4702464 3' - gypsy2 111 2 67.81 AATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGGCTGGCGAACCCGGCGCTGGCGATGCGGGATT:1 - chr2L 12435309 3' + R1A1-element 71 1 56.25 TCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCCCCCTGCGTCCTAATCAAAAGGAATTTTATCGCCGCGGCAACCTTACGCTAAACCACCACCACACCCTCCTC:1 - chr2L 12806212 3' - hobo 2911 1 52.71 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAA:1 - chr3R 19073200 3' - roo 78 2 73.97 ATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGCCTGTGCCAACCTTTTCGGACCTCCAACTATAATTGATGTTGCTAATGAACCCTTTTTCATGCAATATGTGCACTTTTCCGCTGCTTTAGATATATGTTACTGCTTTTCCA:1 + chr2R 14813857 3' - Idefix 7108 2 76.03 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTT:1 - chr3L 15103805 3' + Transpac 5169 2 59.72 GTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATT:1 + chr3R 13612639 3' - F-element 185 1 66.44 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAA:1 - chr3L 19454928 3' - mdg1 64 2 59.59 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATAAAAAGTATGTTCATTGTTGAATAAGAT:1 + chr2L 22193540 3' + roo 9034 1 59.59 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGT:1 - chr3R 15072571 3' - pogo 52 1 65.60 CATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGG:1 - chr2R 23780541 3' + Ivk 5302 1 71.03 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTG:1 - chrX 13134866 3' - jockey 4783 1 64.62 AATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATT:1 - chr3L 12315717 3' - transib2 56 1 56.16 AGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAGTATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGACAATTGACTCATTTTTTTTAGCTTTATAAGACAAATTCCTACATTTCATTTCAGGATCTT:1 - chr2R 17780464 3' - Cr1a 3994 1 60.96 AAAAAAAAAAATAAAGAAAAATCAATACATTTATTGTTATTATTAACTTATAGCTGGCAAAACAAATTTTACCCTGTAGTAACCTGACTGTGGACCATTGATAAATTTATTTACAGGTTGCAAAACAGTCCAACTGGCGCTTGCTT:1 - chr2L 12601130 3' - hopper 143 9 67.81 GGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTGCTGCTG:1 + chr3L 13872470 3' - 17.6 40 2 60.14 TTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACATTACACTGATGTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCCTAATAAATATTAATTATTAGCCTAAACAAATCCAGCTCTCTTTACGACCTTTACAGGTGATAAATCTA:1 - chrX 16617284 3' + TLD2_LTR 41 1 54.11 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGG:1 + chr3R 10931723 3' + 297 6934 2 64.71 ATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACATATGTAAAATCCATGCTCGACAGCGACACGACAACTTGGACTGACGCTGATGCTGATGTTTTTTTACGACTTGACACAGAGTTTCCGAGGACAGACGTGGATGAGGATGAGCA:1 - chr2R 25055962 3' - G5A 2751 1 78.62 AAAGGAAAATAAATAATAAAATAAGACGAAAAAAAAAGAGGAAAAAAACATTAAAAGCGTAAAAAAGTCATAAAAAAATAGAACACAAGAAACAAAACCGACAAATATCTCAAAGGGCCAAGGAGCAAAGTCGGCGAGGCCATGTC:1 + chr2L 16918981 3' + copia 5116 1 56.85 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCA:3 - 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P-element 9 2 76.30 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTATTATTCTAGTGTCTTTTGCCTGACTCACTGAAATTAAGTTGCCTTTCATTTCA:1 - chr2R 4167442 3' - 1360 79 1 95.59 AAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGTTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACAT:1 - chr3L 23249413 3' - rover 7039 2 73.29 CTAATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTGAGGAAAAAGTACGCAGTCGAAGCAAACGAAAAAATTTCACTCACCATTCACGTCACGGTTTATTACTATTCCGTT:1 + chr3L 10564752 3' - I-element 5214 1 55.63 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAA:2 - chr2R 9870995 3' + roo 9048 2 69.18 GCTGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAA:1 + chr3R 10270641 3' + Juan 4130 1 69.18 AACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGTCGAC:1 - chr3L 25911961 3' - looper1 1511 1 76.03 GTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAGTATCCGAATAAAGAACCTTCGAGTGGAAACATTTCCCAACATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGACTATAATTCCAATCCAATAAAAA:1 + chr3R 15394262 3' + 297 6935 2 54.11 GGGACCNCCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCTG:1 + chr2L 12822870 3' + P-element 2881 2 65.88 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGA:1 + chr3R 30675441 3' - 297 19 2 56.84 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACA:1 + chrX 8437721 3' - P-element 80 1 23.88 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCACATTTGGTTGTATCTCTGTGAGT:1 - chrX 11209838 3' - hobo 50 1 51.03 AAATTATAAAACTGTTCAAAAACCAAGCATTCCGATTACGTAGCTGCTGCATTCCTATTAAACATATTGCAAATTAAAATGATGTACAGATTCTCGACCACTGCGTTCTC:1 + chr2L 16186509 3' + F-element 4589 1 73.64 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGTTATCACCTGGCCTGTCCC:1 - chr2R 13931573 3' + P-element 2806 1 19.20 TATTATTATTGTTTATTTTTATTTGGGAAACATAAGGCCAACCCCAGTAGATGGAATACAAACTGACTTATACCCATTATGTGATTATACTAAAATTTAATTTTTAATTAGATA:1 - chr3R 11170566 3' - flea 5001 2 66.67 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTTT:1 + chr2L 11391633 3' - 1360 16 1 68.06 TTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTG:1 - chr3L 17567871 3' + S-element 133 2 58.90 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTATTTA:1 + chr3R 14860271 3' - BS 5010 1 74.66 AGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACACTTACCAGAGTGTAGAAGTTTTTAGCCAGTGCTTAAAATTTA:1 + chr3R 6029978 3' - Doc 273 1 76.03 CACATAGATATAAGCAATATATGTGCGGCTTAGTTGAACCCAACATCAGCACACATTGGGCATTCAACTAAAGAACCTCAATCAGAGCAACGCATTTGTGGATGTGAGAAAGAAATTAAATAACCGAAACAAACAGAGCGAACGCG:1 + chr3L 8248781 3' + Stalker 277 4 58.90 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAGTAATCCCTAAGATACAATTAATTCACCCGTCAGTTTAAACTACTATATTC:1 - chr3L 3501721 3' - Bari1 69 1 65.07 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTT:1 - chr3R 4217687 3' - 297 6639 2 74.10 ATAAAATAATAAAAAAATAAAAAGAAAATTTTAAATAAATTTGAATTTCCTTTTGGCGCAATGCACGCGCCATTTTACATGATGGGTGGCAGTGCCACGCCCACAT:1 + chr2R 23270039 3' + Rt1a 5071 1 66.04 CAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGACGATCTTAGCTAAAACGTAACTATGTTCGTGATTCAGTTTAATAGGTGTGCTGAGTGTATATATAGTACATAGTAGTCGACTTCACACACTTTCCTGGTAGGTATGTAAGCTTTC:1 - chr2L 38816 3' + jockey 4717 1 43.84 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGGCTCCTCCTGCACTTGGGAGTGGAGGATGATTGAAAAAAGAGAAACACTGCCACCA:1 + chr2L 6161069 3' + I-element 5326 1 65.07 AGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTA:1 - chr3L 23146461 3' - 1360 51 1 52.74 TAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTATTTATGGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACAAGCGATATGCGGAGAGGACTTACCAACCCAATGTGGCCTTGGCACCCAGAAAGAGTATACTCTCC:1 - chr2L 7896185 3' + rooA 5 2 55.48 CAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTG:1 + chr2R 10418551 3' - 1360 3101 1 68.49 ATTTTAGTTTGATTTTTTTTTTTGCCCATAAGCCTGGTTTATGGTTATGCACAAAAAAAAAGAAGGCTTATAATGGTGGCAGCATACATTTGCGTTTTGTATAATCAACATAGGTGCTGGATAGCGTTTAAGATCAAAGTCTC:1 - chr3L 12939598 3' - gypsy2 437 1 55.24 TTATGCGAAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATTTCCTGTTGGCTACCAGAGGGGTGGGGGGGTTCAAATAGAAGGACCTACAGACACATACACACACATC:1 + chrX 14544136 3' - invader1 256 2 52.63 AAATGTGTGGGCGTGACAGTTTTAAAAGGTTTGAGGGCATTAGAGTGGGAGAGGCATTCTTTTACAAGAAACTTGTACAAAATTTGTGTTGATTACTTATTTTCTTGAAGTAACTATCAGCGACGCCGCAGATGTCG:1 + chrX 22663956 3' - INE-1 246 1 75.18 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATGATATACCTTGCTGGAACCCTTGAGTTTGCTTATCGTTCTA:1 + chr2R 21681446 3' - roo 19 2 72.60 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATC:2 + chr2R 12472101 3' - transib2 81 1 72.60 CTTACTTATAAGCTAGCGTTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGATTGCACGCACAGTTGCACATTCGTGAAAATGGAAAAGAGAGAGTTGTCGTGTGACAGGAAAAGGATGCTAAAGAGC:1 - chr3R 4608998 3' + invader3 108 2 61.19 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGG:4 - chr3L 23249376 3' - rover 51 2 52.05 AAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGT:1 - chr2R 18514915 3' + P-element 344 1 25.96 ACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTGCTTTCGGTGTACTCTTGAATAATTGAAGCAACATATATCCACGCGCATATATGTATGTATAGCTCTC:1 - chr2R 10277779 3' + Ivk 5172 1 73.83 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAA:2 + chrX 8308504 3' + roo 353 2 57.53 CATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGTCGCAGTAAAAACACTTTATAAGTGGCCACCCAGGGCAGCAGCC:1 + chr3R 29690822 3' + mdg1 7069 11 76.32 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTTG:4 + chr3L 18505779 3' - I-element 24 1 69.18 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGC:1 - chr2R 22034658 3' + copia 5055 2 67.12 AAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAATCACAAATCACTCTCAAGTGGAAATCCAAGCGCATTCTGAAGTTGTTCATATAAAAAATTTACGAGTTTCTTTCGACATC:1 - chr3L 3798428 3' - Cr1a 193 1 52.05 ATATGAGTTTATTTTGTTTTATTGGAAGTGGGACTTGGATCTGCAAGATATCAGTAATTTTATTAAACAATTATACAAATATGTGAATCATCTTGACCAAATAAATTTTACAAAACTATGATTCCTGGGATTCATTTCACCATTCT:2 - chr2L 2435311 3' + transib1 1895 1 50.68 GCCACAAGAGCCCAGCTCTGATCAGTATATGGGCAGCACTGTTTCTATAAGCTCACACATACCACAAAGAACGTGGCAACACAATTACAAACGCCCCCGCACACAGCTGGACACATGTGA:1 - chr2R 15057659 3' + invader4 367 1 75.00 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAAT:1 - chrX 10521629 3' - Tabor 61 2 56.85 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGA:1 + chr2L 18549950 3' + roo 9032 1 62.33 GTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCCACTGTCTGAAGTTTTCACTGTCTGCGGCGAGATTGGAAACGCTCTTCTGCGAAATCAAA:1 + chr3L 15324380 3' + R2-element 3296 1 61.64 AGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCT:1 - chr3R 23911345 3' - 3S18 5832 2 60.27 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAA:3 - chr2L 17809155 3' + jockey 4954 1 56.16 ACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAGAAAATAAAGTCATCAATTGGGGTGAATAGAAGTGTATTTCCATGAAAAGTAAACGAGATGTGGAAAGTCATAGAAATTTCATTAAAAATTTTCTATCA:1 + chrX 11087367 3' + Quasimodo 43 2 73.29 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTATGAGCGAGTCGAGGATCA:1 + chr2R 12472102 3' - transib2 63 1 68.22 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTGCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAACCACATAAATAAAATCCTGGCTAAGGCCATAAAATCGTTGCCTACTTTTGTGCTCTGCTGT:1 - chr3R 12930683 3' - jockey 61 1 53.85 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCTCAAAACCAAACTGACATGCATTACG:1 + chr2R 12133817 3' - jockey 57 1 70.37 TTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCTTGTGGTCCAGGCTGAGGGGAGAGCCAGCGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCATGTGTATGTGTGTATCCGTGTGTGTTTGCATGTTTATGGATTTGGTGCATATTTAAAGATTTAAGGT:1 + chr2R 21697924 3' - Tc3 235 1 54.79 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAA:1 - chr3L 12249825 3' - roo 8699 2 68.04 ACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGAAAATGCACTGGCGT:1 - chr2L 23008327 3' - transib2 220 1 63.01 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACA:1 + chr2L 4713971 3' - transib2 43 1 53.96 GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATTTTCGGTATGTAGATCCAATGCACCAAGGAGGAGCAGTTGCCCCCAGCACCACCACCAGCCAGTGGGGGCTCCTCCATCCTGCCCATGAGACCTCTGCTTCGGGGCTACAACTCA:1 + chr2L 19910121 3' - INE-1 29 1 61.64 ATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATCTCTGTTACTCGTGCTCCTTACCTCCTAACTTACTTGCCTCTCCCATCAATCCGAACTCTTCTGTCTGTCTCTCCAACTCGTGTTTGTTTAGTTCA:1 + chrX 2669472 3' + 297 296 2 59.59 GCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACACTTGTCGCACTGCCTCAGATGCGTCAAGCGATTTCCGTGCAAATATAGCTCCTTGAGATTGCGCAAAAAGGACATGTCCGAAATGCTGCCAATGCTATTAGCCGCCAG:1 - chr2L 3868808 3' - FB 699 2 78.08 AAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTAT:1 + chr2L 17180163 3' - Juan 44 1 44.52 AATCACTTAAAATATAAATCATAAAAATCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGACATATAAATTATAAATTACCACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCT:1 + chrX 22840540 3' + copia 5054 2 70.49 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTT:1 + chr3L 18505777 3' - I-element 26 1 67.81 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCT:4 - chr2R 8157164 3' + mdg1 369 2 54.79 TCTGTGAACACGTCCTTTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCA:1 + chr2R 12133812 3' - jockey 28 1 58.67 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACAATGAAATTTACATAAAACTA:1 + chr3L 18768530 3' - S-element 62 1 65.75 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTT:1 - chr2R 13168685 3' + P-element 2796 1 20.14 GGTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTGTGAGAAATTAAAAGAGGCGTATCGGAAAGGAAAAATAAGTTCTAACAAGGTTGGAGGATAATATAGAAGTTTACTTTAAGAATGATATT:1 + chr3R 5442781 3' + G4 3789 1 69.85 ATAAAATAAACTTAAAAAAAAAGAAAGAAGTGCCTCAGAAAATTTGAGGGAAACGAGGAAAGCACTGAGAACGTGTTTGTGTGTGTGCATTACAATT:1 + chr2R 12591345 3' + F-element 91 1 52.58 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGCAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTT:1 - chr3L 21996142 3' - Transpac 45 2 59.59 ATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTT:1 + chr2L 1924019 3' - G2 3012 1 51.06 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGC:1 - chr2R 9871005 3' + roo 9038 1 62.33 CAATCTCAAAAATCGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTAAGGCGCTGCCGAATAGAGCGTTTCAATGGCACGGTGACGGTG:1 - chrX 20610706 3' + Transib5 2878 1 59.40 AAATATTTTATATATATTATATATTTATATATAATAGGGCTTGAAATATACTTTTAACATTGAATATAAATTCAAAAAAATTCGTAAAGCCTTTATTAAGAACTCAAAGCAACTCCTTACTTCCATCTATAAGGACAAGAATTAC:1 + chrX 7529659 3' - transib1 1924 1 65.52 TATTCCAGATGCTTAATACTGCATTTAATATGACCCCAAATAAGAATTCAAGTACTTGTTGTTTATCCATTATGATTGGTATTGTTTCGGCTTTTGAAAGTGTA:1 + chr2R 17612704 3' - Gypsy12A_LTR 102 1 54.81 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAA:2 - chr3R 29084891 3' + 412 7480 2 60.96 ATAAAAATAATAATAATAATAATAATAATATAGTATACAATTTGATTCAATACATAGATTTGGCAAATATTTTTGTTAACCGATTTGCGTAGATTTAGTCATATCATTTCTTTTTTTGCTGGGTCCTTGCTTTAAAAAATATTTC:1 - chrX 12919355 3' + mdg1 32 15 71.03 CTAAGTTTACTTATTAGACGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAAT:1 - chr2L 11839670 3' - mdg1 7125 2 77.08 GACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCAAATAGGTTTGTGACCTTCCCAC:1 - chr3R 9038938 3' - Juan 4081 1 65.75 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATGCCTTTTTGTGAGGA:1 + chr2R 21411017 3' - Burdock 13 2 76.03 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTG:2 - chr2R 20010183 3' + Juan 4166 1 51.37 GTACCGATGTGGTTATACGGGATCGAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATTTATTTATAAACGTATTCATGTAACGCAAAATCCCGAACTACGACAAATAAACAACTGTCCCTGGTATACATATACGCAACTCGACCATAAAGTGGG:1 - chrX 21639990 3' + Helena 1060 1 78.77 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCG:2 - chr3R 6419822 3' + Tabor 444 2 55.48 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGC:1 + chrX 8437717 3' - P-element 93 1 19.58 TAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTGTGCAAGTTTTTAATGTTAATA:1 + chrX 2479629 3' - mdg3 19 2 73.29 TTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCT:1 + chr2R 8735653 3' - mdg1 82 2 73.29 CGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCGCCAAATTTGCAGTGTGATTCGTTTTTCCGCG:1 + chr3L 8685252 3' + I-element 5302 1 51.37 CAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACAGCAACATTTAAATAATACAACGAGCATAATAAAACATCCTGCAAACAAGCGTGACCTGCCACGCAGCAGAGCGACTTTGACGCACAGAAGCTGCACTTCGA:1 - chr2L 19019581 3' + Doc4-element 2594 1 62.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGT:1 - chr3R 19032584 3' - roo 8712 2 54.11 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAATTTTGTTTTAGAATAAA:1 + chr2L 6647760 3' - mdg3 5284 2 64.14 TACCCAATCATTTATTGTATTGGTAGAGTAGATTTCTACAATATGCTACATTTCTGCCTCGCCAGTGTTTGTGTGCGGGTGCTTAAGTGTGTTCGTGTTGTGTCTAGACAGGATTCC:1 - chr2L 7421262 3' - Stalker4 6985 4 53.85 ACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAGTGACGACAACACGGAGCGAAAAAGTGCATGCAAAAAAGGAAATACTTATTTTCTTTATGTCGTTTTCTTGGAATTGTTGTAAATAGTTATTAAAA:1 + chr2L 762603 3' + hopper 1068 2 67.12 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTAC:1 + chr3R 24090542 3' + roo 9013 2 58.22 GTCCTTAGTCAACTGATGGGCCATTAGTTCGACTCAATAATATACAAAACATCCCGACAGGACACGAGCCCACTTGTGAACAGGACACACGGATACGGACGTGGACATGGTCATAGCGACGCCG:1 + chr3R 31664424 3' + 297 6938 2 69.35 TTATTATTCCATAAACTTACAAGCTCAAATTTAATCTACAATAAATATATGTAATTCGTAGGCCATAGCCACGACATATGTACATGAAAACACACATCTATTAACTTGTTTCAGATATATTAATGTTACAAGAGCCAATGCATACT:1 - chr2L 16306404 3' + gypsy7 159 2 74.66 ACACTAGCTGAGTAACGGGGATCTGATAGTCGCATCAATCTGTTAGCTGTACTCATAA:1 - chr3L 22442997 3' + INE-1 540 1 62.07 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAG:1 - chr3R 30946509 3' - Transpac 4974 2 56.34 GAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGAAAAGTTTTATTTGTATGTTTCTGGAGCTCCCTCTTCCTGCCATCGTCTTCGTCTGCTTCTCTCGTCATTTTT:1 - chr2L 675505 3' - Doc3-element 4516 1 64.49 ATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGCATTATTTAGTATTTGGTATGGCCACCCTTTTCCAGAGTTTTGTGAGATTTATGGTCATATTCAATAGACGTACCAACATGACAACGTGCCCATCCATACGGCTCGG:1 + chr3R 4944122 3' - Tc3 1460 1 57.97 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTC:1 + chr2R 13766294 3' - roo 69 2 67.81 ATTGACATCATACAGCGAGCACAATCACAGATTCTGACAACCATCACGAAAAGATCAAAAGAGACTTAAATATTATGAAAATACTAAATACAGTGGAATAATACCCTATTATTACTTAGACGAATTTTTTATAAGAGAGAAAAGCA:2 - chr3R 21171847 3' + F-element 4310 1 54.11 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACG:2 + chr3R 13973057 3' + 412 7492 2 53.42 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCGAGAGCTGCTCCACC:1 - chr3R 23618086 3' + hopper 1393 1 69.18 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCA:2 - chr2R 13259276 3' + mdg1 366 2 54.79 AATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATAT:1 - chr3R 10270589 3' - Juan 4105 1 69.18 AGGAGGAATGGGCATGAGTTTAATTTATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTCATTTTTGTTGTTGTATAAATAGAATTGTTTTGCGTTACATTGTTTGAGATGTCCATGAAACC:1 - chr3R 16567750 3' - I-element 5050 1 56.85 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGTTGGCCTAATTGGATGGATTTAAGGATGTGTTATGTTCATAAATCAGATTTTCTTTGT:1 - chr3R 11062688 3' - roo 17 2 73.97 ATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATAATCAAATGAAGTGAAAAAGCAATTTTCCCGCGCCTGCAGTTAT:1 - chr2R 16929761 3' - jockey 4536 1 70.55 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAATACTGGAGAAATAAATAATATGGGAAAAAAATGGAAAAAATATGAATGAATTCGTTTATATTTTTAAGATTGCAT:2 - chr3L 18920396 3' + mdg1 27 8 69.86 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTTTTTAATAACACAT:1 - chr2R 16510095 3' - F-element 68 1 53.42 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAG:1 + chr3R 31264120 3' - jockey 4788 1 58.22 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGTCCTTGAGACGCTTTACCCAGTTACACACACACTGTCACAACCCACCCACACAAACATTCATACACTAGGTGAAAGTTCCCGGGCGGCCAATTCAGGG:1 - chr2R 19941494 3' - hopper 5 2 75.38 TTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAAAAAAAGGTGTAGAGATTTATTTCACGTT:1 - chr3R 29690682 3' - I-element 5238 1 57.53 AAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCAGCACGGTCAGCGATGGGCCTTTATATCCCACACC:1 - chrX 12066053 3' - transib2 4 1 77.40 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAGGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGCACT:1 + chr3R 15325189 3' - 297 6635 2 58.62 GGCCATACATTGGTTTTTCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTTTTTTAACAAAATCGATTATTTATTATCATTATTGTTTTCATTCTTCAAAAGGTTTTTCGTATCAAAGTTCGTATCTTGTTCGAAAAAGATTATCTTAGCCTGTT:1 + chr3R 4080090 3' - 1360 3358 1 72.60 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGT:1 + chr3L 2990025 3' - roo 72 2 69.18 ACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGCATCATTAAAACATTTGAGATTGACTTAATTTAAATAGTAATCAAATTTACTATTACTATTTCTGATTTACACAGTTTTAT:1 + chr2L 18804178 3' + Transpac 4973 2 68.35 TTATTANTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAA:1 - chrX 19074730 3' - mdg1 26 2 63.70 AGCCCTAAACCAACAATTATGACAGGCCCACCAAACATTTAGAAAATTACCCCAAAATAATATCTATTCAGCGTTCTCTATTACACGGG:1 + chr2R 3675848 3' + I-element 169 1 69.66 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCTTTTTAGAGTTAATTGAGGAGA:1 - chr2R 14051720 3' + roo 9042 1 57.93 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATAT:1 + chr3R 19408007 3' + diver 170 2 52.74 AATATTCTAATATAAAGACATTTTTGAAATTTATTTTCTGAAATTATGTACATAGATTCGGCAATTTCTAAGCTAGATTTAAATAATAATAACGTTGAGGCAATGCAAAACAAGGGCGGGGTCATGGCAATGAATTGCGCAAAAG:1 + chrX 4759000 3' - 1360 386 1 77.24 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATCTATAGGCAGATAGTAAAATAAGTATAAAATATAAT:2 + chr2L 10548648 3' - I-element 22 1 68.49 AGAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAAT:1 - chr3R 11040062 3' + Bari1 1652 1 60.61 TAATATACTAATGTACATCTCCCGCTTTTCCCCCTTTGGCAATAAACGGTTAT:1 + chr3L 14366420 3' + roo 8620 1 66.04 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAG:1 + chr3R 10931726 3' + 297 6911 2 68.97 AGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATA:1 - chr3R 27133539 3' - opus 21 2 69.18 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGC:1 - chr3L 18402977 3' - P-element 62 1 38.52 ATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTGATATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTTGTATATTGACAGAATAATACATGAAGTTCTCCGATCTGACCGAGAAAGAGGGTAAGTATAGATAGC:1 - chr2R 18437560 3' - Stalker4 6878 2 67.81 CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGCCAGCT:1 + chr2R 22034730 3' - copia 4950 2 70.55 TTGACATCATACAGTGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTAGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATAAAATAAGTGAACGTGCTAGCCAAGTG:1 - chrX 5821709 3' + F-element 4311 1 71.72 TGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCC:1 - chr2R 4606228 3' + 1360 3306 1 78.57 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGCAGCATT:1 - chrX 19054196 3' - jockey 17 1 77.40 TAATTAAATTTTTTCCAAACTAAATCTGGATTTCCCTTGACCAAAAGTTGAACTACAGTTACTAAACGGGATAAAGGGACAAGCGCCAAGCCAAGGATATTTCTATATAACGGCGCTCACATAAATAAATATCAATGAA:1 + chrX 6596769 3' + Tc1 317 1 79.86 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATTACGCGGACA:1 - chrX 19266802 3' + roo 9050 2 61.64 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTAGGAAGGTTGAAGCATTAAAAATAGAAACATTTATTCTATTCAGCTTGGAGGTATGTGGAAATGTAATGGTATTAAA:1 + chr3R 10973535 3' - transib2 46 1 56.85 ATTCTTGATCAGAATCACTAGCCCAGTCATTCTGTCAATGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGCTGTGATCTGCTTTATAAAATTGTACTATTAAAACTAAATTCATTGGGATGCTAAGAAATTCATTCAATTATAGCGTTCTAC:1 - chr2R 12391727 3' + INE-1 86 1 68.49 AGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTT:1 - chr2R 5410984 3' + Tc1 1333 1 71.92 AGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATACAATCATAAAGCTATTATCTAT:1 - chr2R 20634089 3' - invader1 3698 2 78.26 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTA:1 - chr3R 30347355 3' - P-element 99 1 16.43 GGCCAAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAACAAATTTCCTAATGACAATTCGTTGAAGCGCAGTAACACGAGAGAGTAAATTGATA:1 + chr3R 14943850 3' - 1360 3176 1 65.07 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCC:1 + chrX 9530391 3' - 297 54 2 75.65 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGA:1 + chr3R 15791002 3' + roo 9006 2 65.07 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTCATCTCACACATAAAAGAGGCGCACAGA:1 + chr3R 6419968 3' - Tabor 27 2 56.16 TAGGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAAAATCAATCAATGCTTAATAATTAATAACAATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATGAACCTGCCGGTGGCCAGTATCAATATGGCCAAGATGTGTGT:1 - chr3L 21439094 3' - gypsy12 9810 2 71.23 AAGTACGTTGGTTCTTAATTGTAGTATTTGGAAGAACATTTTAACCTTGTAAATATATGTGGAAAAGAAAAAAACAAAAGATCTGCCAAGTTTAGCTAATCGGAAATAGGGAACCAAACATATTATAACATATCTCTAAAGTCTGA:1 + chrX 8649734 3' - Tirant 8306 2 45.89 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGAACACAAATTAGAAAGGTTTCACGCTTTTCTTTGTTTGTTATTGTTG:1 + chr2L 16690761 3' + P-element 2865 1 69.18 TAAAGAAGATTATTAAAAACCGCCAACATGCCAGCGAATCCCTCTTCGAAAAAACAAAAAACTGAAAACCCAGAGCCCAAGATCCGAGTTCCCAGATCCCAGATCCTTTGACTGCCCCACCAGACATAA:1 + chr3R 9955426 3' - Cr1a 71 1 80.62 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAG:1 - chr3L 19454895 3' - mdg1 7069 2 63.01 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCGGTTGCCATTCGGCTGGGGCCATAAAATATTTGATTTGTTATGGAA:2 + chrX 959136 3' - 412 19 2 72.60 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCTTATATTGGGTCTACGAGAC:1 + chr2R 6964910 3' - Burdock 26 2 67.81 CTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTGTTTTGCCTTACCTGCTTTTATCAGTTATTAATTTTTGGTCAAGCCTTACGGCTTTCTTTTAGTTTTT:1 - chr3L 22035510 3' - 1731 4367 2 53.42 GCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAAAAATTGGGATGGGAATTCGAGGGCCTGCTAGACGAGGATCCCGAGGACCAGCCTGTAGTCATCGAACTTCCGGAAGCCTAGGAGAAGTGCGCTACGCATGTGAA:1 - chr3R 18251537 3' + Bica 265 1 73.97 TGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAA:1 - chrX 8027420 3' + Juan 4152 1 60.27 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTA:3 + chr2L 13556467 3' - transib2 36 1 55.48 CGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTAGGGATTTGTAAACATATGCGGGGGATGCCCGAAGGAAGCGGTTTTGGATGTGCAACAAAACTAATTTGATTGTCATG:1 - chr3L 12252057 3' - I-element 490 1 53.42 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGC:1 - 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HMS-Beagle2 52 2 54.79 CAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGACAAATATAAAACTCGAACATTGTAATATGCATTATTAATGCAAAGAATTCTACACGTTAATATTAATAAATCTCTAATAGTTTCATGTATGGCTATGGTCCC:1 + chr4 311150 3' + R1A1-element 148 1 69.86 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAAGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGC:1 - chr3L 19454903 3' - mdg1 7077 2 56.16 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCAC:1 + chrX 20455718 3' - hobo 63 1 60.96 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGG:1 + chrX 10319711 3' + mdg1 364 2 56.16 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGGTCAATGTAATTT:1 - chr3R 15882565 3' - jockey 24 1 60.83 AATGCTATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGAATAAAATTAGACAAAATTTATAAATTGCCTATTGCGTTAGAGTGGAAAAAAAAATGGGCAAGAAAAAAAGTACAGTTAAAAAGAAATTCAAAATATTTTTCAAAATTGAGGTAAA:1 - 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chr3R 1035905 3' - BS 38 1 52.34 TAAATAATTATTAATAATAATATCTTTAATAATACCTTTTACATATCGGTTTAAAATATTTCTTGCAGTGCATACACCCCAAAGGCTTGCCACCGAGCATCGAACACGTCAATTGGCCGCGAAATGAACGCA:1 + chr2R 11534974 3' + gypsy9 296 2 53.79 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGATACCCTTTACTCAGCTAGTAGAAATGCGAGAAATTTATTAGTTTTTGGACATATCGATAGATTATGGGGAATAAAATGAGAAAATTTTTAAAAATTGTTT:1 + chr3R 31401819 3' + mdg1 401 2 71.23 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATT:1 + chr3L 21769139 3' + I-element 5322 1 56.16 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGAT:1 - chr3R 20441243 3' + I-element 5284 1 65.07 AAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCGCGGGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGTACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTC:1 - chr3R 2522302 3' - Tc1-2 131 1 65.07 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGGAGTTGGAGTCAAATG:1 - chr3L 18281824 3' - Doc 32 1 65.07 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTGAGAGCCAGT:1 + chr3L 17940207 3' + 1360 3380 2 70.75 CGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTTGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGGGCTTTTTAATGCTAAT:1 + chr3L 19350068 3' - 1360 3202 1 68.49 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAATATGTTATGATATGATCAGATTTAGTATAAACTACATTAAAATCCTTTTATCTTAGCAATGTAACTTGGCTCGGTTTCCAGTTTCGTAATCCCCAATC:4 + chrX 19539594 3' + pogo 2082 1 53.42 TATTGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCAGATAGAAGAACATTTGATGCTGACAGC:1 - chr3L 18022301 3' + HeT-A 5806 1 72.66 AAATTAAGCAAATTAGATTTAAACTATCCAAACAAACAAAGGCAGTCACCCACACAAATAAACGGACGTATATCCCAC:1 + chr3R 12874368 3' + TAHRE 39 1 67.95 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTC:1 - chr3R 27405979 3' - 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Doc 4701 2 61.38 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATTGTATTTTATTTGTATTCCTCATAGTGCGGAAT:1 + chr2L 15940351 3' + pogo 2069 1 63.70 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCAATAAAATGAGGGAAATTCGCCAGAAGGAA:1 - chr3R 27315048 3' - jockey 4693 1 71.23 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAACGGCAGTTCATCATTACAATACATTGCAGTGTGAAGTTTTGAAGAAAATAATACAGACAC:1 - chr2L 12250913 3' + 412 411 2 69.86 TTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAG:1 + chr3L 18931031 3' - I-element 87 1 75.34 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACAT:1 - chr3R 4679475 3' + hopper2 1522 2 74.66 GTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGCACATTAATTAAAGACCAAGATTAAGCGAATGA:1 + chr3R 14685593 3' - Doc 427 1 77.40 AAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCTAAAACAACTTTAAAGATGTATTTAATTTTATGACAAGAAATTTATATTTTAAAGAAACTTTTTA:1 - chr3L 12784579 3' + I-element 141 1 58.90 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCAGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAA:1 + chr3L 23456283 3' + 1360 3377 1 48.57 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAATTTTCTA:1 + chr2L 12251032 3' - 412 22 2 66.44 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTA:1 - chr2L 4123847 3' - transib2 49 1 54.68 ACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTAGTATTGAAGTGAAGTATTTTTTCCGACACAGAACACGACCCATTCATCACTTTCAATTAAAATAAAGCACGGCTTTTCCGCCCCATCCATAAACAAGC:1 + chr2L 18413105 3' + gypsy4 310 1 54.79 ATTCCCAACAATTTTTTACAAATGTGGGTGTCGGAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTGGCAAAAAGTTTTTTTTTAGAAATCGATAGAAATGTAAAAGACTATGCTAGGAATTAAGCCAATTAGTTTGTGATGAAATCTAGAAAT:1 + chr3L 1033252 3' - INE-1 380 1 70.55 ATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTTGATTTTATAAGGTCACTTCGAATTTTGCTCG:1 - chrX 8437214 3' - P-element 2671 1 30.82 CAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGTCTCTTCCAGACGAAGAAGTGGTAATTAGCTGGCTACAAACAAACAAATTATCGAGTTTCTAACAA:1 - chr2L 10767913 3' - diver2 4795 2 65.14 AAGAAAAAAAAAAAGGTAAATCTTCAGCAGTTTTAAGTAATTATCATAAAGAAGAGAAAAGGGGTTTGTAAAGCCATAAACATTTAATACAGAGCCAATAGCAAAATGTTAGACATATATATCTATAATAG:1 + chrX 14594495 3' + Doc2-element 248 1 78.63 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTTGGACCAACGATTCTTGGGCGAAATTATTTCAATTTATGTGGCTTATTAAGACTTAATTTCTTGCTAATTAGCACAAAGAGTTCACTAAGGGCATCGCATTCCATTG:1 - chr3L 7793371 3' - transib2 30 1 71.92 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAAT:1 + chr3R 17996275 3' + diver 172 2 52.74 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTG:1 + chr3L 20711729 3' - 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I-element 5350 1 73.11 AAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTATGAATAAACATCTTACCCTGATAATATCTCAATATAATAGAAGGTAACTTGGGAATAAGCTATCTTAGAATTTGTTTCTTCAGTAGT:1 + chr3L 12436186 3' + 17.6 7146 2 60.27 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACAC:1 - chr3R 25709764 3' + hopper 1359 1 56.16 AGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCCATATACTTACACACACACCTGTAACATTTTTTCAGGTCGGCCATTGTATTCCTCTATAACAGAATATCTAAGTTTTTAGCAAAGTATCGCATCAGCTTCCTCTGGTTCATGACTGCA:1 + chr2R 25011726 3' + Quasimodo 1 2 72.60 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATA:1 + chr3L 13836708 3' - 412 7116 2 60.27 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGTTTC:1 + chr2R 3564159 3' + Tabor 440 2 54.11 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATGTACGCTCCACGCATTTCCACTCCTTGCCAGCGGAAAATCTAGCGAAAATAAGATGTAAGCGAGGGCAAGGAAAAGTCAAAC:1 + chrX 8028216 3' + Juan 4139 1 61.64 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGGCTG:1 + chr2R 20227319 3' + hopper2 1547 1 60.27 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGA:1 + chrX 8308477 3' + roo 8990 2 76.03 AAAGGGAGGGTAAACAAAACACTAAGAAGAAAATTGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAACTACTACACAAATCACATAGAATCACAGGAAACCCCCAACGAATGTCGTGAGGACTGTTTGCGACACGACCCTCATT:1 - 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chr3L 19454876 3' - mdg1 7050 2 76.03 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTACAAGTATACTGGCATAATAACACATGTGCGACGGAATA:1 + chr2L 20205364 3' + P-element 2804 1 28.77 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTGCTTGGAACAACAAATC:1 - chrX 2214210 3' - jockey 4778 1 72.41 ACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACAT:2 - chr3L 24131414 3' - Transpac 4999 2 75.34 CACCTCTGGAGGATTCCGGACGACGACGATCGCAAGACGGTGCGATCCATCTTTAAATAATGGCATAGAAAGAATTAACACCCAGTCAAATTCTTTATAATTACAACAATTAATATTTAACATTGAACATTTTACCGACGAACATT:1 + chr2L 22674173 3' + Gypsy6A_LTR 357 1 41.78 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTC:2 - chr3L 7889565 3' - roo 68 2 71.23 ATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTGTGAGAAATTAAAAGAGGCGTATCGGAAAGGAAAAATAAGTTCT:1 + chr3R 5442735 3' + G4 3793 1 61.63 ATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAAGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAAAAATAAAAAAAAAAT:2 + chr3L 6457341 3' - 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chrX 19054214 3' - jockey 35 1 65.07 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTTGCTTCATATTTATTTATTAATTGACGATCGAAAATAAGTTGATATGCAAGAACAT:1 - chr3R 4217632 3' - 297 6591 2 79.45 TTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATT:1 - chr3R 9557527 3' - G6 1998 2 59.72 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGCCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACGAGCAA:1 - chr3R 30347276 3' - P-element 26 1 68.49 CGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCATTCGCATTTCCACTAGCTGATTGATGAGAATTTAAAAATGCATATGCATATTTATTTTCAATAATTGCATTATCAATCGACTGTAATGCCAGTGATCGTATCGTATCTTCGAACC:1 + chrX 22517583 3' + INE-1 506 1 80.82 GACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGGGTGCCAAAACAAATGGCACAAAATACGATCGCTTGTGTGTATTGATTAAAATAGCAAAATATTTTTAAAAGAGGAAATGGTAATTTTCT:1 + chr2R 15029261 3' + Bari1 1645 1 63.70 ATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATATGTGTGTTGGTATGTACTGGTGTCTATCTTTTAGATATTTATATATATGATGGATGTTCATTTACATAGATCGATCGTATGTTTGTATTTAGAGGTGAGTAAGC:1 + chrX 17950236 3' - Idefix 127 2 73.29 TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTC:1 + chrX 10521759 3' + Tabor 7292 2 60.96 GGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGT:1 + chr2L 9010156 3' - G2 2732 1 55.24 AGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATTGAATAAGCGTTAGATTGTATTACTGGGGCGCTGGTGTTTTTTGGGTATTTGTATTTT:1 + chr3R 17886019 3' - Stalker 7031 4 80.22 TGAACATTATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTA:1 - chr3R 2169842 3' - gypsy11 106 2 66.44 AGGTTGAAATTCAGCATACAGACTCCAGGGACGAAGACGCAGCAGAAGTTTGTTGACCCATGTTTCCAACGTGAAGGAACCCTCCGGGCGCTGTATCGTCTTGTACACCTTTATAGCCAGGGACGCGAATGATTTGTCTGTGG:1 + chr2R 17724377 3' + INE-1 175 1 50.35 ATAATAATAATAATAATAATAATAATGAATGAATTTGAAGATTACGTTTGTCAATGTGGCTGCAATATAAATATAATTATCAATTAAATAATATTAGATTTTGAAAGCTATGCTACTGACCTAACACTCTGCTTGATTTCTTC:1 + chr2L 8003526 3' + mdg1 7076 8 63.64 ATAACATACAAAAACTCATACTTTTTCTCAAAAAAACCAAATTAAACGAAAAAATAAACAACCATTAACTGGGGTATTTCAATCAGAAGCGGGACATGTCACCAAATCGCTTGCAGCATCTCCAGGCAAAGCTGGCTCAAATCAAG:1 + chr3R 16059777 3' + I-element 5137 1 71.23 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGT:1 - chr3R 4805631 3' + 1360 3302 1 76.71 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCA:1 - chr2R 20802539 3' - mdg3 5264 1 73.60 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGGGACTGATGCCTATGAAAGCTGGCTGGAGGCACCTATCCCCATTTACCTGAGCTTTTACATGTTCAATTGGACGAATCCCGAGGACATAAGGAACCCGGACATTAAGCC:1 - chr2L 450413 3' + 412 422 2 78.77 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTAATCCTCGCGATGATTTGGCGCTTTCAACTCTTTTGGGTTAACTCTTTTGCAGCTGGGGATTTCGAATTGAGGACAG:1 + chr3L 18197804 3' - I-element 5144 1 58.22 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGTTATTAAAATAACTATTGAGAAATTAAATAGTCTACGATTTGCATTAGTTCTCCTC:1 + chrX 18396223 3' - roo 7 2 76.12 ATATAACCATAAAAGGTTCAAGGTTTGTGGGTGGTAATTGGGTGTTTTTTTTTGTGGTAAAGTCCTTCAAACCAATTAATTTTTTCGGGGAAAAAATTTGCTGACCAGGAAACCTTGGTTATGGTCCATAAATGTTTACTGCTTG:1 - chr2L 7214572 3' + baggins 5070 1 80.00 TTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTG:3 + chr2L 13844251 3' - Stalker2 69 2 62.33 CACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTGTAATCGGTAGACAGGGAACACCACGGTGAGGCCATTACAATTGTAATAGGGGGGTGAAGACGAATCCTGGTAAAGTTCATCAGGAATATTTAAGCGACCAGT:1 - chr2R 1780019 3' - 1360 3340 1 64.38 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTAAAT:2 + chr2L 13844284 3' - Stalker2 36 2 60.27 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAA:1 - chr2L 7580879 3' - Transpac 36 2 43.15 GCTTATTGAATCTTCCCTTTTACTCGTATGCGCCAATTTGCAAGCCATTGTTCTACACGTGCTAGTTGCATCGTAGCTTTTACTGGGCATCTGGATCGACTTATGTAGGTACCGTAATAAAAGAGAAATCAGAGAAGTCAGCCAAG:2 - chr3R 23954295 3' - Doc3-element 4700 1 54.11 AGTATGTAAATGATTCTTGAATGTATCTTTTAGGTGGGAACCCATCGACAAAGATCCTATTTAGTAAGTTATTTAGTCGCTCGGGACAAATGGCCTATTTGGCGGCATTTGCATTGCACAATTCCCTCGACTTGGCCGAAAAGGAA:1 + chr2R 18646643 3' + transib4 288 1 73.29 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCG:1 - chr2L 19923968 3' - roo 80 2 78.52 GGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCG:1 - chr2R 11794982 3' + opus 7462 2 78.00 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCG:1 + chr3R 13406497 3' - pogo 64 1 70.54 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCA:1 - chr3L 7889515 3' - roo 18 2 71.92 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAATATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGTTTTCCAGCGGGGACGCCAACGACGCAGCGGATTCGAGTGGGACAGTGG:1 - chr2L 23189366 3' - 1360 49 1 91.43 CATATATTGTATATACATACATATGCATTGTAGATACATGCAGGCAGGGAGTATCTGATGGATGCAGGGGGTTCGAGGGGCTAAAGTATCTGCCAGTGATTGATTGCAACAAAGGCTGCCCAGTTAGCTGCC:1 - chr2L 10470210 3' + INE-1 60 1 73.48 GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGT:1 - chrX 2214269 3' - jockey 4838 1 70.55 GTAAACAGTTTCTTTACAAACTGTTTATGGAAAACAGAAATTATATATAGTCGTATATGTGCTATAGTATAAGTACACATATACATACACACACACATAT:1 - chr2R 10980130 3' + S-element 1714 2 82.00 CTGTTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTT:1 + chr2L 15550747 3' + Bari1 1628 1 72.60 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCT:1 + chr2L 22170027 3' + Juan 4133 1 76.03 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATG:1 - chr2L 17205198 3' - hopper 53 1 66.96 AAAAATTTCGATTTTTTCAAATTTTTTTTTTTAATCGCAATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAA:1 + chr2R 5303122 3' + FB 163 1 74.66 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTAT:1 - chr2L 18347279 3' - transib2 55 1 56.85 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAGCGGG:1 - chr2R 4855153 3' - transib2 31 1 64.14 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACAAATTGCGGTATATAGTCTTGCCTACACGTCGGTAGTCTAGTCTAAAATATAGCATAGTAACAAATCCAGATATATATCAGATTTCGCCTGATTTGCAAAT:1 + chr2R 10808494 3' + mdg1 31 10 74.44 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCACACAGACACGTG:1 - chr3R 31886801 3' - hopper 23 1 71.23 ATTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGAATTCTCTCTTGTTTTGATGTCAATCGCATAGTTACCCCTTACCGGACTAGGAGTTTTCTGAAAGAAAAAAATTAATTTTAGATTTTGAAATAG:1 - chr4 515546 3' + INE-1 536 1 52.74 AATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTTTAAGCCTCTTTGTTTTCGTTTCAGTTTTGTTTACATTTTTATTGCCCCGATAAA:1 + chr3L 13836758 3' - 412 3 2 63.70 TTATTGGTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCT:1 + chr2R 8735688 3' - mdg1 7046 2 71.03 ATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTTGTCAGAACAGCAAACGAGATGGCAATTCACTGGAAAACAGAGA:1 + chr3L 17183811 3' + diver 211 1 77.24 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACTGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAGACATTCAACACCGGATAACCCATCTGTTCGGTCCAGGTGAGCATCAGTTTCTT:1 - chr3R 13300834 3' - roo 17 2 69.35 TTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTTTCAGCTTACTGGAACTCTTGGTTT:1 + chr3R 31708407 3' - jockey 4565 1 67.11 AATAGATAAGAAGGTCACAAATCAACAAAATTCGTGTGGCGCAGTCGCAAATCTTGCGTGAACTATCTAGAGCGGCT:1 + chr3L 25007963 3' + X-element 4667 1 84.42 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCTTA:1 - chr3R 14980269 3' + roo 387 2 70.55 GTTTAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTAACTCTACTTTACATATTACTTACTTACATATTGAGGGTAGATACACGACACCTCCCTTTTTAAAGAAAT:1 + chr2R 2745201 3' - Stalker3T 124 1 74.66 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGGCAATACACACATATATGTACATATATGTGAAGAGAGGACTCTCCACCTCAATTTCTGCCAACAACGTGCCCC:1 - chr2L 15188337 3' + 297 357 2 59.86 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGACG:1 - chr3R 16157239 3' + pogo 2082 1 68.49 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGGTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCGAACCGTGGGTGAG:1 + chr3R 16519024 3' + Tirant 387 2 71.11 CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 168 2 60.61 ATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGCCAATTCGTGGCGAAATTCCCAATGAAGGCACCAAAAATACACCGTTTCCGATGAAAATCTTTCCGTTCC:1 - chr2R 11189682 3' - F-element 4265 1 49.32 GGTAACGGGTATCTGATAGACGAAGAACTCGACTGTAGAGTTTTCTCTTGTTTCTCTTGACTTTTAATGATCATTCGGTCAGCATGTCCATTCTAATAGTCCTTTGGCTAACAAAAGGAGGGCTAAGCCGCCGACTAA:1 + chr2L 15534632 3' + INE-1 550 1 78.26 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTAT:1 + chrX 11661517 3' - pogo 37 1 60.00 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCTCCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTGGGATCATTAAAA:1 - chr3R 16518837 3' - Tirant 8123 2 73.29 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGGGTCTGATTTATGATAATAACTCTTG:1 + chr2L 12818367 3' - hobo 26 1 65.07 TAATCTATATTATTTTTTATCAATTCTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCTTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCAATTTCAATGCCTT:1 + chr3L 16047749 3' + 1360 252 1 29.45 ATATCTATATTAATCATACCTTTACCTTTATGTTTCATTTTATTTGTAAATATTTGGACACGTGCTATATTTTTAACATGCATGATTTATCTTGGCGCGTTTTAAAACACACTCGAGAGGTTCATTAATTCTTGCGTCGCACACTG:1 - chr3L 6675290 3' - transib3 287 1 53.42 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTGTTCGACTTTTAGAAGGTTATTTATTATAAAATAACTTGAAAATACATGCAGATATGTAAGTTC:2 - chr3R 18488306 3' - roo 2 2 76.03 GCATCAGGTCCAGTTTCCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTGGAAAGGTAGTTTTTAGGTAGAGAAACAGTGAAGACCTGTGCTGGTTATG:1 - chr2L 22748557 3' - gypsy5 436 1 65.75 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAG:1 - chr3R 30946486 3' - Transpac 4955 2 60.96 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAA:1 - chr2R 13259285 3' + mdg1 7396 2 60.69 AATTTCTTGACAGTGTCGAATCTGTGCAAACTTGGATTTAGTAGTTTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTGTTAATGCCGTAAAACGAAAATAATGGAGAAAAGGAAAATAATAAAACGGAAAAAAACGCAAAATTAAATTTTTT:1 - chr2R 2959935 3' - S2 203 2 52.05 TAGACATGACAGACATATTAATATTGTCCTCATATTAAAAATGAGCTGGATGTCAACGCCTGTTATTTCGGAAAATGCCTTATAGTTATTAAACTGCCGCTGATTCTCCTCGGTGTGCATCACCAGGGTGCGAAAGGCACGGCGCA:1 - chr2R 17731767 3' + hopper2 475 1 63.70 ACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGCTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTTCCTCTCTGCTAGCCGAAGACATCCTGGCC:1 + chrX 13492200 3' - 297 215 2 68.00 GTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTTCGTGGAAACAAAAAAAATGAAATAATGCAAATTT:1 - chr2L 16646735 3' + P-element 28 1 19.58 CAATTGGCATCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAACAAATTGAATATACGTATAAGATAAACATTATATACACTTGGGGCTGACAAAAACCAAAAGAAAATAGCTGGTCGTAAACAATTA:1 + chr2R 17102694 3' + 1360 272 1 56.85 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACCGACTACCGAGTGCCG:1 - chr3R 11469273 3' - Tabor 6868 2 66.21 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATG:1 - chrX 4808524 3' + mdg3 193 2 60.00 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGA:1 + chr3R 5769088 3' - roo 83 2 80.14 AGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAAAATGGTTTCTATCGATATGCTCATTAATGGTGGCATTCCCGCTAGATCTGAGGCGCTCGCAAAGTTTCAAGGCAAACCAGGCAGTTAATGGGCCAGTGGACACCTGGGTAA:1 - chr3L 15115537 3' + INE-1 14 1 46.43 AAAAAAAAACGAAAACCAAACAAAAAACTTAACATAAACAAATTTCACCCACAATGCAAATTAGAGTTAATCGAATCTAAACGAAGCTTGCGCTACGACTTTT:1 + chr3L 9097373 3' - Circe 7278 2 59.22 GGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGATGTGGCACCAGGGGAAGCTGG:1 + chr3R 7380360 3' - G-element 4208 1 61.40 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTAAATGCATTTGGCAACAATTTTTTGAGCGAGGCGTTGTCAGGCAAACCAATTTAAAAGGTAGT:1 - chr2L 15196464 3' - 297 14 2 43.81 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAATTTCGGCTGCAGACTTTT:1 - chrX 21216688 3' + roo 397 1 73.81 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGGGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTTTGAGGAAA:1 + chr2L 13556492 3' - transib2 11 1 69.86 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTTTTTAATAACACATATTTGAAGATAAGCCCT:1 - chr2R 16510078 3' - F-element 51 1 47.26 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAGTGGGAGTTTTAGGGCAGCAAGAAAATATTCCTTTTGGCCAAATTACAAAGCAAAA:1 + chr2R 22992589 3' - hobo 12 1 71.13 AGCGGGGTAGGAGAGGCAGTCTCTTCACTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGAAGTTCACCCGGTCGCAGGTGTTCGCCGTTAGTCCGGAGGCCGCCATGTAAGTG:1 + chr3L 16504890 3' - Doc 433 1 58.52 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGGGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGA:1 + chr2R 6847867 3' - Doc 43 1 59.59 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCA:1 - chrX 8437665 3' + P-element 2852 1 49.54 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGGCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCAC:1 - chrX 22840463 3' - copia 50 2 52.74 AGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTAT:1 - chr3R 27405987 3' - diver 5971 2 71.92 AATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTTTGCGTTATGTTTAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATTTGATAAAATAAAAAATGTAT:1 + chr2R 7635937 3' - 1360 3260 1 46.58 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATACTATATATCTACTATATAGACACCGTATCCGCTTTTCTGCTTGCATATCTCCAACTCCTTCGCCCTTTAGATGAGTACCGGGTATCTAGTAGTCGAGG:1 - chr3R 7317312 3' - opus 7026 2 68.49 CAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGCACAAGCGGAGCGGAACCTGTTTGCCAGGATTAGCTGCACGAGATTTCCATATTTAATTTAAATGAGACGAGACGGAGAGATGTCCCATACAAAAGTATACA:1 + chr2L 653650 3' - Tc1-2 355 1 67.63 TTATTGATGAACTCATTTTCACTTCGATAAGTTGTTCGTATTAAATCGATACCACATTTTTTTAAAAGAATTTATATACCTAATATACGGGCGGATGTGCATCCTGCTGGTATATCTTCTTACTCCTGAAAAGTAAACTCGTAAAA:1 + chr2R 2954956 3' - Dm88 311 1 67.12 AAATCCTAAATATAATTGATCGCGCTCGATTCATTTACAAAAGAAATGAACGGAGCCCAAAATTGTCAGTCTTTAAATATATTCGTGATCATGTGTGAACAGAATGCGCTCTCCTTTTCTTCTTTTAGTCC:1 + chr2R 9871532 3' - roo 8744 2 70.99 CATTAACTGGCGCCCGAACAGCGAGCCGCCCGTTAACAGAAAACGAGCTGACGGCTTCACAGCTCAAAA:1 + chr3L 25850846 3' + HMS-Beagle 259 2 85.51 AGACATGTCTCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAA:2 - chr2R 5617501 3' + invader1 3942 2 66.44 ATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGTCGAGAGGGGATAGATGAACTGGGGGTAATAAAGCAAAT:1 - chrX 21501028 3' - G2 2626 1 62.86 AAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTAGATCCTTTTAAGACCTAAGTTTTTCGTTTTACAGATCGCAATGCAGTCAACCCAAAGTAAGAGTGATCGATCTCCAATACGCACAGCCTCCACCTCACGCTGTCGTGGGTCCAG:1 - chrX 197910 3' + INE-1 574 1 71.92 CTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAG:1 - chr3L 16973366 3' + S-element 132 2 56.85 AGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAA:1 + chr3R 13187485 3' + I-element 5263 1 77.40 TATAATTTTTTTTTTTGTTTTTTTCGGCTACTCTCTTTCCTTTTTTACTGGGATCTTGTAGACTCGATACGATTCGATTCGATATTTTCGATTTATCAATATCAAACGATCGCTTAGCCCAAGAATCAGTGGTATCGT:1 + chrX 4141401 3' + Tc3 85 3 71.74 TGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCA:1 - chr2R 17926280 3' + opus 459 2 56.85 CCTAATTATAAATATAAAAAAAAACATGACCCCTTTTCTTTAATAAGTTTTAAACATCCTCATCTATTTTTTAGACATTGATC:1 + chr2R 5461251 3' + transib4 2573 1 59.04 TTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTT:1 - chrX 10319608 3' - mdg1 62 2 61.38 CTTTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCC:1 + chr2L 12822843 3' + P-element 2824 1 26.96 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGATATGCATCACAAATGGCT:1 + chr2R 22989684 3' - hopper 49 1 60.16 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTTTAAG:1 - chr2R 21681294 3' + roo 356 2 53.42 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCATTG:1 + chr2R 7244926 3' + diver 6065 2 56.85 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTGTTGTTCAGCGGCTAGC:1 + chr2R 7090767 3' - I-element 21 1 70.55 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCTATTTGAAATCCTCTGAACTACGAGTACAGAAATTGACATTGGGCGCCATAAATCTGAATGAAATGTAGAAA:1 - chr3L 1075570 3' + roo 360 2 53.42 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACA:1 + chrX 7795641 3' + roo 9039 1 63.01 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATAC:1 - chr3R 6625672 3' + flea 230 2 66.43 ACTATAGCATTCTTTCTTTTTTTGCTGTGTTAATATATTCCTTTCTTGAACTGGGAACACATTTTCCAGGACATGGCTCGAACCGGGCTCGATTGGCATTGGAGGGGAATCCCAAATATTCTGTGGCCGGGGGCTAGGTCACCATT:1 + chr3R 12340304 3' + INE-1 581 1 65.07 CAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAACTGAAACCGATGTCTCCGGTCAATGTCAGGTGCAGTATGCACTGGAAGACACTGACAGTTCCTATGTCCCGATACGCAAGACCAAGGACATCAACTCCTGCCG:1 + chr2L 9642525 3' + F-element 403 1 77.44 AGCAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCAGATTGGCTTCACCATTAGAAAAAGTATATAAACTCTTGAATCCATCGAGGAAAACAAATTTGAATTAAGTTTAGTGGTTTATAAAAACTCGGGCATAGGACAGCCT:1 + chrX 530126 3' - transib2 196 1 73.29 ACAAGCATAGAGGCAGATCGCGAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTGGGAGTGAACTCTAGATGATAGGTAAAATTATTTAAAAATTATAAAGCTCTGCTTTTTTAAACATACCGGATAAAAAAACTTGGAAAATGTGATCGTT:1 + chr2R 4902040 3' + invader2 125 2 67.81 ATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGC:1 + chr3R 30987553 3' - F-element 141 1 75.19 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATAATTTACATAGAATCCTGAATCATAACTGGCGCAGCCGACGACTACGAACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACACATACGTACACAA:1 - chrX 21939081 3' - X-element 25 1 67.81 ATTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAATTGTGT:2 - chr3R 7873589 3' + Porto1 4551 1 80.14 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGGGCCATC:1 - chr2L 4713851 3' + transib2 2776 1 52.48 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGT:2 + chrX 4808595 3' - mdg3 79 2 69.18 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATC:2 + chrX 13490752 3' + 297 6918 2 65.07 AGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCA:1 + chr2R 23780631 3' - Ivk 43 1 54.79 AGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACT:1 - chr2L 11839674 3' - mdg1 96 2 80.82 GTATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTTTGCGCTTTGAGAATTATTATGTCATAA:1 - chr2L 15379261 3' - Stalker 89 4 50.00 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTG:2 + chr3R 11937414 3' + flea 205 2 54.11 AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCTGCGCCGCGGGGGCA:1 - chr3R 23491859 3' - transib2 24 1 54.37 ACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGAGTTAAGTGTATTGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTC:1 - chr3R 19224991 3' - HMS-Beagle 6853 2 59.15 AAACACNTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGGAGGTGGAGTCAAATGTAATTTCTAGTAC:1 - chr3L 18281811 3' - Doc 19 1 71.23 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTT:1 + chrX 10167476 3' + roo 9017 2 54.11 TACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATTTCAGTATGTT:1 - chr4 123930 3' - HB 102 1 64.38 TTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTC:2 + chr2R 13391910 3' - transib2 2602 1 69.86 CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCTCACTTTATCTTATACTTCCGGCGGTAATGTGGCAATAAAAAATGAGGAAAGCGAATTTATACAGCTGTGTGCTCTCAGAAAAAGTG:1 - chr2R 11145070 3' + Cr1a 292 1 91.23 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAAAATAAATAAATTCCTGGAAATCGATTTAAATTTTTTAAATTCTTATTAAGCTTTCGTTTATATTAA:1 + chr2L 7125905 3' + I-element 5297 1 56.16 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTT:2 + chr3R 24090534 3' + roo 9005 2 63.70 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTGGGCT:1 - chr3R 16518845 3' - Tirant 8131 2 70.55 TAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATT:1 + chr3R 21630335 3' + I-element 5279 1 69.86 ACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGGGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGCATATTGTTATGAACAAAAGCATATGCAAACCATAACCCCTGCATCTTCCTTCCGCTCCAC:1 - chrX 18742793 3' + invader4 3036 2 56.64 GGGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGT:1 + chr2L 21570275 3' - Dm88 52 2 52.74 TTTTGACCTTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAAGAAGTTGGGGTTCTAATAATTGTTTATCTTATGTGCTAAGGCATTCTTGGTTCTCTGTTCT:1 + chrX 22000053 3' - Quasimodo 208 2 65.75 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTTCTC:1 - chr2L 809625 3' - jockey 26 1 64.96 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTT:1 - chr2L 18549828 3' - roo 8726 2 63.70 AGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCCCGAAAACTTTTAAATTGCTTGAATAAAAAGAAG:1 + chrX 2093921 3' - roo 325 2 76.71 AAAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATAACCTCCTTCATAACAA:1 + chr3L 23071836 3' + mariner2 794 1 76.71 TCTTTAAAAATAAAATTAGATTCATTAAACTACTAAATATTATTTGGAAACAATGTCGCGGCAAGATAAAATATTACGAAATAAGAATGAAATATAAAATCAACGTTGAGGAGAGTAAAGCTTGTAGTACGATAGTCAGCCATTCA:1 - chr3L 1789226 3' + NOF 3954 1 76.71 TTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCCCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCAACAGAAACGGAG:1 + chr3R 13612656 3' - F-element 168 1 76.71 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATC:1 + chr3L 3501862 3' + Bari1 1691 1 67.81 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATGTATGTAAGTAGGTAACTGGAGCTACTCGTTGTAGGGATT:1 - chr3R 11937316 3' - flea 4831 1 71.03 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATA:1 - chr3R 27986363 3' + roo 329 2 72.60 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGGGTCA:1 + chrX 10537937 3' + I-element 5285 1 64.38 ATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGCTGCAATCTACTAGTAATGCCGCGCTGCAACAGACGGGCTACACAAACTCCAGCCGGCGATGCCTTAGTGGCAGCTCCTC:1 + chrX 13120703 3' + HeT-A 6043 1 40.98 AGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCA:1 - chr3L 18125934 3' + Ivk 5291 1 76.03 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTA:2 - chr2L 16858669 3' + Burdock 224 2 64.38 CTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGAT:1 + chr3L 5061654 3' - 17.6 52 1 60.96 AAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGGGTATTACGAACACCCACTTTGAGGCCATCA:1 - chr2R 3593601 3' - gypsy 7012 2 68.49 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTCCGAGTACTCACTCGCAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAAC:1 - chr2R 8735576 3' + mdg1 403 2 56.00 ATCCTTATGACTACACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTTGATCGGTTCGCAGGATCGCCGACTTTATCTCACGTATTGGGGCAGACATAAAAA:1 + chr2L 6246651 3' + Doc3-element 398 1 77.24 TTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAAGCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATCAGTGTGCCTGCGACTTTTGTCTGCGAGCTGCGCTTCAAACAAAGTACACGCCTCCTGCGGGGGCAGCGT:1 + chrX 19385565 3' - Tc1-2 1260 1 56.78 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCA:3 - chr3L 11913181 3' - BS 5047 1 53.42 TTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACATATACACAATATATTTGTGTTTTGTTTATTCTCCCTTATGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTGAAGTGGTTGATGCTGCGGGTGTGGTGCAGGAGTAGGTGCT:1 + chr3L 14027422 3' + Cr1a 150 1 67.97 TGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATA:1 + chr2R 7244886 3' + diver 6033 2 73.91 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTC:1 - chrX 19074727 3' - mdg1 7061 2 65.75 GATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCAGGGGACACACATGTCTTTCAAAACTTGGTGCAT:1 - chr2L 809675 3' - jockey 85 1 68.28 TTATCTTGTTTTTAAGTTTTAATATTTTACTTCGTTTTAGGGATTTTAAACATAAAAAACGAGAGAGAAAGCTTTGACAAGGGAATGTTTTTATACCCTTGCAGTACTTAGGGATACATT:1 - chrX 144120 3' - rover 6828 1 57.50 TTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCATTGTTGTTGTAGACAGCAGCGAGTTTTTTGTTGTTTGTTTTGGGAAAGGAGTAAAAATTGTAAATAAGTCACATAAAGGCCTAAACTAGGGTT:1 + chr3L 7365042 3' - F-element 4425 1 65.75 CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGGTTTT:1 + chr3L 13739646 3' - BS 5067 1 67.12 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCAGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACAAAACTATACGAAAAGCACACAGGAATAACCCAATAGCACACGTGCCA:1 - chr3L 17275429 3' + Transpac 5162 2 70.77 GTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGTATTTTTAAAAAAATACCACAGGTCTTGAAACATAT:1 + chr3L 23224579 3' - X-element 4360 1 71.53 CCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGC:1 + chrX 3431968 3' + Ivk 5325 1 55.48 CGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGAGTGTGTGAGTGGAGGAGATAATCACATTGGTCGAACATGCATTTAATTTCAATTTTAACGCTTTTGCAAATTATGTGGGATATGATTTCTCTT:1 - chr3L 16690102 3' - accord 7147 2 67.12 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTTTTA:1 - chr3R 18971669 3' + Juan 4190 1 59.59 AATTACTTATTACTTATTACATATTCCCCTCTGTATTAGCCTGATGTGGTGCCGATGCGGAGCGGCGTTTGGGGCCATGTTGGGGGGCT:1 - chr3R 16611706 3' + Stalker2 404 1 66.29 ATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACA:1 - chr3L 4001107 3' + hopper 1326 1 78.08 TATAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAACTATTTACTAAAAAAAAGTTAAAATTGATGGCTTTAATGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGGTTAAAGATGGGAAATTTTTTCTAGGAGCTACGAGACAAAGAACAA:1 - chr3R 19584539 3' - Cr1a 4300 1 70.55 ACAAAAAAAAAGAAAACAAAAAAAGAAAAGCGGAGGAAACTGTCGAAATAGAAAAATCCCGTCGGCCGTCGG:1 - chr2L 6835723 3' + gypsy7 5005 1 69.44 AGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACTATATCAGCATTATATGCTTTTACTAATTCTTACTTGCGGCTGTTTTAGT:1 + chr2R 672771 3' - mdg1 7110 2 68.49 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTA:1 + chrX 20999620 3' - BS 28 1 60.27 CATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTAAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTTATCTAAGCTGCA:1 - chrX 10445504 3' + INE-1 541 1 82.19 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGGCTGAACTGTCTCC:1 + chr2L 47232 3' + roo 9052 2 70.34 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAAAAGATTATATAATTATATTTAAAAATATTTATTTAACT:1 - chr2L 15940226 3' - pogo 67 1 71.85 TCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGGACTTAATTCTAAAATTACTTTTATTTTTAAA:1 - chr3R 20684198 3' - P-element 2716 1 21.58 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTTGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTC:1 - chr3R 23618090 3' + hopper 1391 1 67.36 AATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTTACTTTTGCATCTGCAGACCCGCCGACCTGTC:1 + chr2L 15763151 3' + mdg1 7063 11 69.86 TAATAATAATTATAATAATAATAATTAATTATAATAATAACATAAATCTCCCAAGTATTTCAAATCAATTAATACCCATTATTAATTATGAAACCATTTGTTTACAATTAATTGGTTATGCTATGTCCTGCCAATATTAACGTCTA:1 - chr2R 15720682 3' + mdg1 7077 10 69.86 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACATC:1 - chr2R 13259287 3' + mdg1 7393 2 61.64 ATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTTAAGCAATTTGGTAACTGTGTAAAAAGTGTTACCTTCTTTTT:1 + chrX 6509708 3' + hopper 314 1 71.23 CTATAGCATTCTCTCTTGTTTAAATTGTGGATTCCGCAGAGAACGTGACGGTCCTCTAAAGAATTATCATTCATAGAGCACACCTCACCAGCTAACTGTTAACAGCGTGGTATTATTATAGTGTAGTAAATAAAATTGAAAGTGAA:1 - chr3L 19465568 3' + INE-1 582 1 75.34 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAA:2 - chr2L 4063825 3' + roo 357 2 53.42 TAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAAAACGGAGCCGCCACCGGATATAATTGAGTA:1 - chr3L 7336817 3' - Ivk 408 1 76.00 GTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGGCGTCCACTAAAATATTTATTCTGTATGTATAATT:1 - chr3L 2544614 3' - Tirant 60 2 55.86 CTCAACAAGCAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGCTTTAGTCTCCGAACAACCAACTGCCACACATCTATGAAATGGACTAGTAAAGCAGAATAAATATGTAACTATGTCC:1 - chr3R 5768985 3' + roo 9057 1 51.61 TATAAAAAAAATAAAAAAAAAATAAAGAAAAAATCAAATAAAACAGAAAATAAAGCAAGGCAAGCGTCGAAAATCTGTACAGACCATTGCCCAAAGGGCAAACACTTCAGTTGTGTGGGAGGTTTCAATTGACTGGCATTCCTTTG:1 + chr3L 2577713 3' + HMS-Beagle2 482 2 71.92 ACTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAGCGTTTCCGACAATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGGATTCTAGAGACACGCATACACGCAGCTCTAGTTTGTTGACCCATGTTGTCACGCCCAC:1 + chrX 14770553 3' + INE-1 11 1 54.79 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCTGCGCCGCGGGTGCAAAACGAAATCGAC:2 - chr3R 23491846 3' + transib2 2770 1 53.42 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAG:1 - chr2L 17104610 3' + transib4 2577 1 27.08 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACTAGG:1 + chr3L 6518664 3' + 412 7498 2 50.00 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATT:1 + chr2L 4003829 3' + mdg1 7452 2 75.91 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTC:1 + chr3L 21996249 3' + Transpac 5166 2 64.96 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTT:1 + chr3R 31264128 3' - jockey 4780 1 63.70 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTCACAGGGCACACAGCAGAGCCGA:1 + chr3R 12728108 3' + Juan 4193 1 65.07 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCA:1 + chr2R 5074578 3' - 1360 65 1 63.70 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAGGTCCGGGAATTATCAGTGGCCATGTTATTCGAGCTGTGCAATT:1 - chr3L 16970575 3' - roo 73 2 53.01 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCATTATTGTTTAACGTTATTATTACGTTGCAT:1 - chr2L 18212073 3' - Quasimodo 18 2 72.60 CCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTTTGTGCAAGCGCGAATAAGCTTAAAAAAAAAATACTGTTT:1 - chr3L 9687826 3' - Cr1a 4075 1 66.18 GTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACA:1 + chr3L 21769092 3' + I-element 5278 1 69.18 ATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGGACCGGAGGGGCAGACGCAATC:1 - chr3R 4884796 3' + I-element 310 1 62.71 CAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTCTTGTGGTTCCTGAATTATACGAAAGGACAGACAG:1 + chr2L 20935317 3' - INE-1 543 1 51.13 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTT:1 - chr2L 20265935 3' + roo 9014 2 58.90 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTT:1 - chr2L 18212128 3' - Quasimodo 71 2 70.55 AGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGCATCCGAAAAATCAACATTCGAGTGTGAAGCACAAATCAAACATCAAATAATTGATAGAATATCGAAGCGAAGACAGCCAGCAAAATGCAAAGCAGCGGCGGCCTTTCACC:1 - chr2R 17622714 3' + R1A1-element 5304 1 73.29 AGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGTTTCTAAAAATTATTTAACTAGCAAATAAGTTTATGTTGCAAATAAAAAGTGTACGGCGTTATTCGATACAGGCAGTAAGTTCAATATCATACGGAAAGATTTTTATTG:1 - chr2R 1340194 3' - Quasimodo 153 2 78.08 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTA:1 - chr3R 8051130 3' - jockey 4797 1 59.13 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCA:1 - chrX 1263951 3' + Burdock 6325 2 68.49 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAGAACTAAGGAGAAAATGTCTTAAATGT:2 - chr2R 9544823 3' + roo 359 2 52.74 TGAGTAGAACTAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTG:1 - chr3L 25008297 3' - 297 371 2 77.40 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACT:2 - chr2R 21116482 3' + mdg1 7396 2 63.70 ATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACCCCCCCAATGCCACCATGCCATCAACTTTCGCCCAGCCACGCCCCCTTTGCTCTCGGTTATTTCAGCACACACGACA:1 + chr2R 23448813 3' - Ivk 5210 1 53.42 GATGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTG:1 + chrX 18336664 3' - mdg3 78 2 67.12 ATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGACATTTTAAATGTTATTTAATGGTGACCGGAA:1 + chrX 5126326 3' - micropia 375 2 78.77 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGG:1 + chr3L 8685219 3' + I-element 5269 1 73.97 GGATTTAATAACAATAATAATAACTAATACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTTTGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTAAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGGC:1 + chr2L 22805227 3' + mdg1 13 2 57.53 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGG:1 - chr3R 24450409 3' - 412 8 2 68.27 TGCAACAACAACAAAATGAAGGGGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATTTTTCTAAAACCCTATGAACGTATTTTGTAACTTCGTCAAAAT:1 - chr3R 18716446 3' - gypsy12 10049 2 72.60 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGGAAATGCATTTTTAT:1 + chr3R 10270706 3' + Juan 4195 1 73.97 ACATAAATAAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAGTGAAAATCTTCTCACTTTATCTGTCATATATCAATTCCATAGTCTTAGGGATAACCAAAAAACACCTCCAAAGCGCCAAAGAGATCATAAATCTTGAATAGGAAACC:1 + chrX 7317248 3' - HB 87 1 70.55 ATATGACCAAATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTGTTGGGGTTGGGGGGTCTGAGAAAATACGCTGGAAATAGAGGAAATCGAGGAAATGGAGTCC:1 - chrX 14439779 3' + 1360 495 1 67.81 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGGCTCGAGGTCTGAAAATTAGCCACCAAAA:1 + chr3R 19992735 3' + hopper 1399 1 60.78 GCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTAGAATTGGTTTTGCTTGCGCGTTTGTTAATTTCAGTGGTTACCTGAAACTTGAATTGCATTTCAGCCATTTA:1 - chr3R 24027298 3' - I-element 5187 1 52.74 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGAGG:1 + chr3R 19992759 3' + hopper 1395 1 69.23 AATAGCATATTAACTTATGGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGAC:1 - chr3R 28469212 3' + 412 7094 2 53.79 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGA:1 + chr3L 18931059 3' - I-element 59 1 56.16 ATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACA:1 + chr2L 11839712 3' + mdg1 7361 2 79.45 ATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGCATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGC:1 - chr2R 19199678 3' - hopper 74 1 68.97 AATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCAATCAAACAATAGCGAAAAACACGGATCTCATTTTGCAATAGACAGATAGAAAACCGCCACAGAAAATGCGAAAACAACCA:1 + chrX 14764549 3' + micropia 5252 2 58.22 CTCTCCTAATTGGGATTGGTATTATTTTGGGGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTTCAGGTCGTCGTCTTATCGGGTGAATTGTGTTTATGTGTTTATAAGTCGCGTTCGGCGACG:1 - chr2R 18564627 3' - I-element 228 1 57.34 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGA:1 - chr3R 17996152 3' - diver 47 2 52.05 TTCTGATTCTGATTCTGATTCGACATACCAAATGCAGTTTTTTTTTTATTAAAAGTATTGTATCTTACACATTTCCATTTATAACTTATAAAAAATATAATGAACTAAAGCCC:1 - chr3R 10965442 3' + transib2 2534 1 61.95 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAACCGAAA:2 + chr3R 17996283 3' + diver 6068 2 55.48 ATTACAAAAAAAAATTAAGTTAAGTTAATCGTTTTAATATTATTATTAATTTATTCAAATTTATTCTTGGGCTTATTTTTAAAATTTTAGCAAATGTAAAATGTTACTAGAGTTTGTGAGGTTCGAAGCCGAATTTGATTTCCGGT:1 - chr3L 6071655 3' + pogo 2030 1 72.60 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAATTGGAAATTTCTCACTTGATGATGGTC:1 + chr3L 5389998 3' - roo 26 2 65.97 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGGAGGCCACATCCGAATTGATT:1 - chr3L 1691981 3' - blood 7034 2 68.49 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACTTATATACAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTTTTCATTTTACA:1 - chr2R 15375354 3' - 1360 88 1 64.38 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCG:1 + chr3R 17736933 3' + opus 459 2 70.10 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTTGGCATTGACTTTTAAGCTAAACTCATTCTGGATTGAATCAAACTAAACAGTCACCGAGAATTGGCAAGACTTCGGTTTTG:1 + chr2R 21159108 3' + Transpac 266 2 60.27 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTT:1 - chrX 17343403 3' - I-element 79 1 73.29 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCCTTGTTGCTGTTCGGAGCCGGCTTAAATGTTGGCCATTAAAAACAGGCT:1 - chrX 10167379 3' - roo 70 2 67.81 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTC:1 - chr3R 9038925 3' - Juan 4055 1 52.63 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAG:1 + chr3R 28385642 3' - transib2 41 1 55.71 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGGCAATGGCAACAGTATTGATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAA:1 + chr2L 13585842 3' + Quasimodo 7359 2 77.24 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATT:1 + chrX 8437777 3' - P-element 14 1 70.97 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTC:1 - chr3R 18971681 3' + Juan 4178 1 52.74 CGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACGGGTCAATTTTGGTGTTTTTTTTTATATTTTTTTTTTCCTTTTTTGTT:1 + chrX 4540376 3' - G-element 21 1 51.72 TAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACTGTCACGGTCGCCATGTAATGTTTGAAATCTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGCTCT:1 - chrY 3648936 3' + Stalker 7116 4 74.62 ACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCGAATTCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTTCCACGGTGGCGTTAAACAATACCGGTTTAGAACAAAAATGGGAGAT:1 + chrX 2042601 3' + I-element 4943 1 66.13 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACACATATTTACGCACACACAG:1 - chr3R 25709773 3' + hopper 1350 1 62.33 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATTA:1 - chr2R 8157143 3' + mdg1 7428 2 63.70 ATTACTTCTAAATAAATAATAAAAGACAAATGGTTTTCTAATTGTACTTTTAATACAAAATATACACATATGTATATATTCTTGATCTGTCCGTCCGTATAAACGTGGAAATCTTGGGACTATGT:1 + chr2L 21378475 3' + BS 5085 1 67.20 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAAATTTTAATATGCCGCAAGTG:1 - chr3R 27405937 3' - diver 33 2 62.33 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAATAATAATCAACAA:1 + chrX 11661537 3' - pogo 18 1 73.29 ACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAACCTAGTGAAGTTATTTTGATTATTAAATGCTTATTAAGTTTATTCTTATTTGTTATGCTTTTATGTGTATTGAATTGTTTTGCTGATTATACAGTTAATTCGATTTGCTTTTATTG:1 - chr2L 16603980 3' - mdg1 7020 2 66.44 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATCTTTCTTGGATCC:1 + chr3L 1279205 3' + roo 9033 1 57.53 AAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTGGGCGGGTTTTTAGAAACCTTGTTGAGCGAAC:1 + chr3L 14750616 3' - I-element 269 1 78.08 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCAGAGAAAATGAATATTTA:1 - chr2L 6654610 3' - diver 23 2 67.81 AAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGC:1 - chr2R 5532365 3' - Doc4-element 56 1 58.22 GCATTAATCGTGGAGAAGCCAAGGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATTATTTACACTTATTATTTATTTCGTTCGTTCGATTCGATTGTTTCATTGTTTGATTATGCATTACACACATGCATTACACACAT:1 + chr2L 1605025 3' + micropia 330 2 62.33 GTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATATATTGCTTGTCTTTCTCATTTTTATCTGAATACAAAACTCTATGGCCACGCCCAAAACGGTCACACCGTTAAAACAATTTAAACAATATTTAAATTTTTTATCATTTTT:1 - chrX 6165652 3' + Tc1 1632 1 77.40 ATATTTTAATATAAATAAAATATTAGCCCAGATTAAAAAAGAAAAATAGCTCAGATCACAACCAGACTGGTTGGGTTCAAGGCTAGATCTATGTATGTAAAATTCGTCGTAGAATCAATGTATAATTCATACAGAGAAGAGAATGT:1 + chr2L 18714346 3' + G7 1141 1 69.86 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTTTTTCGGTGGCTTCGATTTGGGGCCAACTGGTTTGCGCTTTTAATTATTGTTTATGT:1 + chr3R 9595131 3' - Tirant 8141 2 60.42 TGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCA:1 - chr2L 5447872 3' - F-element 4443 1 73.33 TTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACGATAATTATTCTTTTAGGTTTTAACATATCTAAATCGGTTCACCATATCTTAAAGATGTCATATGAAAAATTTTAAAGCTACCTCTCTTGTTTTTTAAAGGTATTTTAAAGCA:1 + chr3L 13601781 3' - Doc 4628 1 75.34 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAAC:1 - chr3R 25709766 3' + hopper 1357 1 57.53 ACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTATTTTTTTTTTGGGTTCGACGTTTGCTTTTTTGGGGGCGTGGCCCTCGAGCGCGTTCAACAAGTTTATTTCTGCTTTGGGTT:1 - chr3L 6790540 3' - I-element 5215 1 60.80 ATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATG:1 + chr3L 21769096 3' + I-element 5282 1 67.83 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTT:1 - chr3R 8203651 3' + P-element 2799 1 26.03 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAAC:1 - chr3L 10373838 3' + 297 315 2 76.71 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGG:1 - chr2R 10078158 3' - jockey 95 1 67.16 GTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATGTCTGTCTGTCCGTGTGAACGCTGTGATCTTGGGAACTATAAAAGGTACAAGGCTAAAATATACGAAGAGGAAATGCGTTTTAGAAGAATCTTGGGCGTGGTAATGTGCT:1 + chr4 75663 3' + R1A1-element 5321 1 75.34 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAAGGCCAAATGCCCCATAGGGCACAAGGCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTC:1 + chr3R 25709841 3' - hopper 82 1 71.01 AGTCGAACCAGAGACAGCTCTGCAGAAACCCGATAACGGCCCTCACTTAACTAAGGGAAGAGTTATCATAAGTAAGGTCAAGGTAAAGGCGGAATTTGCGGTTACTGTAAAGGGACAAGTCGTAAAATTTTAACCCGTCTTTTTCG:1 + chr2L 10266237 3' + gypsy9 4954 1 78.08 GTGATTAAGATATGAAAAGATACAAATAATTTAATAGAATAATACATTCCATTTGGATTAACTAGGAGCATTTCCTTCCTGTAAAACAAATATATATCTTTAAGGAAATCCTAAACTTAAACTACAACTTAATAATTTCTAGATCT:2 + chr3L 13437603 3' + Stalker3T 197 1 44.52 GTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGGGGGAGGCAACT:1 + chr3R 8049040 3' - Q-element 118 2 65.07 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATGACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATG:1 - chrX 7795482 3' - roo 31 2 65.07 ACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGAGACTTGCATTTGAAATATAAAATGGTGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGTAACGAAGGTGCTGAAGGTGCCAGCTCGAGTCTAGACTACGCTGACAGCAG:1 - chr3R 5442609 3' - G4 3559 1 62.77 CATATACATACATATGTACATATACATATATGCTCGTTTATGTGTCAGTTGATCTTTGACACATTTTGGGGTGCGGCTCCTCCAGCTCCTCCTGTGATATTATTTTGTTGGTTTTCTGCTTTTTCGGCTG:1 + chr3R 30295330 3' - G3 4508 1 64.62 TTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTG:1 + chr3L 21656003 3' - HMS-Beagle2 39 2 57.53 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCAT:1 + chr3R 14860219 3' - BS 5062 1 63.01 TAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGTTATGGACATCCTCCAGTACTTCGAGCAGCAACTCGAAGATCTGGGTGGCCATACCCTCACTAC:1 + chr2R 24516248 3' - R1A1-element 24 1 76.29 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTG:1 - chr2R 12472043 3' + transib2 2748 1 73.91 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAA:1 - chr2L 13556327 3' + transib2 2775 1 52.05 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTT:2 - chr3L 9809232 3' - 412 7099 2 54.11 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTTCTGCA:1 - chr3R 15790792 3' - roo 8666 2 73.19 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGTAGTCCGATAATTTTGNCGATGAAAGTAGCTCAGCGAAAATTGCGAAACAT:1 - chr2R 21160643 3' + Transpac 5185 2 53.42 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGC:1 - chr3R 27765084 3' + mdg1 375 2 53.73 TATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTG:1 - chr3L 25482908 3' - accord 79 2 73.94 TTATGTATGTGTGTGAGTGCGTTATTTGTTGGTCAACTGCTCAAAGGGTTCGGTAAGCCAAAGAGATGGGTAAAAAAAATAATAGTTTGACAAGTGCAATATCCAAAAG:1 - chr3L 5611378 3' - Quasimodo 39 2 71.56 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAACT:1 + chr3R 13187489 3' + I-element 5267 1 74.66 TTTTTTATTTTTTTAACTTTGTCATCTGAATATCTAGCCCCCTCCATTTTAAGTTGGCACGCCTCTGGTTTACACATATTTTGGTATCTCAGCTTACTTTGTGTATATTGTGACTTTAGGTCGAACTTTAATCAAAGTAAACTTTT:1 + chr3L 10548954 3' - TAHRE 10439 1 71.23 AATGATGCGCTGTTAAATTAACTTTTTCGGGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATGCAGCAACGTGTTGACCTTTAGCACACTTTCCGTAGCAATCCTTCTCACTGTCACTTCGTTTGCCCCC:1 - chr3R 15943152 3' + hopper2 1484 1 56.85 CAGCATAGCAAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGTTAAATAACAAAATAAATTAAACTTATTTAATAAATCAATCATTTAGAATTTTGCGTTGTTTTTCGAAATGTTTTTGTTTTCAGTTCATTTTT:1 - chr2L 1652951 3' + HeT-A 299 1 60.74 ATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCAAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATAC:3 + chrX 22689438 3' + 1360 3356 1 50.68 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGG:2 + chr3R 31653156 3' + roo 337 2 67.81 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTGTTTGTTTTGTAAGACCCCTACTA:1 - chr3R 26178352 3' + 412 7506 2 54.79 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGGGTTTCGGTTTTCATTTCATTTCGCCAAAA:1 + chr3L 21327217 3' - copia 18 2 73.29 AAGTATTATGTTCTGACTATAATATACTTTATCCTATTATCGGTATCTTGTCTCTCTGCACATATATTTAGACTCATAACTTTAAAGCTCCCATCTTATCTGCATGTTATCAATATAACTGGCAGATCTTTCTTCCATTTCAAGC:1 - chr3R 15284278 3' + Cr1a 4191 1 55.86 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGT:3 + chr2L 4123937 3' + transib2 2748 1 69.86 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAG:1 + chr3R 24369104 3' - roo 8748 2 75.34 ATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAAT:1 + chr2R 12185405 3' - accord 6920 2 69.18 TTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACA:1 - chr3L 22861776 3' - S-element 68 1 65.07 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTT:1 + chr3L 13836698 3' - 412 7126 2 67.12 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGGTGCCAAG:1 - chr3L 6447033 3' - transib2 15 1 57.78 GTTATGAAAGTTAGAGATTTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTCTTAATTACCGTGCTTGACAACACATTATTTTCTTTGATCTTGCTGTTTAAGCAAGAAAATGCTATATGAATCA:1 + chr3L 18843723 3' - gypsy7 423 1 54.11 AATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTAAGGTCATGTTTATTCAATCGATAATTCAGAGATT:1 - chr3R 4293604 3' + Dm88 4187 1 76.03 TATTGCGATCTCCACGGCGTTCTGCGCGCAAACACCCATCTGCCCTTGGACTCTTCGATCGTTCTGTGAGGAGAATTCTTCATGATGATCTTCAATTTCATCCGCCAAGGGCTGGGCAGCAAACATCCTC:1 - chr2L 6041911 3' + mariner2 384 1 80.00 CTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATTATTGGCATTTCGATTCCGGGAGAATACGATGGACATTGGACGAGTCATTTACT:1 - chr2R 15270694 3' - gtwin 6980 2 61.64 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAA:1 - chr2L 4003644 3' - mdg1 21 2 69.86 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGGTTCGTTTC:1 + chr2R 5480004 3' - F-element 50 1 58.65 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACACATTAATATTATGGTCTGACCTTCTGCTGTGAACTCTTCTGTAGCAAACGAAATGAGTATTCCCTGGCTGGCGCCCTCCAACTTCCTGCCCATTTCAACCAAAGCA:1 - chr2R 6965441 3' + Transpac 302 2 70.34 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGAC:1 - chr3L 7889518 3' - roo 8685 2 69.86 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGTGTCTGCATCGATTAGTACCACAATAAGCCCTGTGAAATTTT:1 + chr3R 9003051 3' - roo 8679 2 74.10 TGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTATCACCTGTATTTTTCCACCATTTGTCATATAATATTTGAATA:1 - chr4 1135378 3' - rover 7036 2 71.92 AGGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTGTAT:1 - chr3L 22890350 3' - FB 57 1 53.42 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATT:1 + chr3R 18093400 3' - I-element 37 1 57.53 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGC:1 + chr3R 20441311 3' - I-element 71 1 64.58 ATTGGAAACTACAAATTATTAGCTCGCGCACTAAAATCAGAATAAATATTCAACAACTACCCAGCCAAATCGAATCAATCAAAATGAATGAGGCAAAAAGTTTGTTCACCACCTTCCTCATCCTGGCCTTCC:1 + chr2L 16840323 3' + P-element 2674 1 53.79 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAG:2 - chr2L 14874140 3' + copia 253 1 39.73 CTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATAAACCGACACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAAATCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCTTCAATTGTTTCCACTTTATTCTCGCACTTGTAAAT:1 - chr3L 25186297 3' + Max-element 317 1 75.34 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATATTA:2 + chr2L 6654765 3' + diver 180 2 55.48 GTATAGTTGAGCGATGACTTGGTATCCAGCGATGAGACTATAGCTGATGGCGGCGAGGATGAGCAGTTACCATCGACCGATGAGATGGATAAAACCGATGATGTTTTCCAAGACTCAGGTTCCCACACACCGTCGCAGCTAACAAA:1 + chr3R 26035680 3' - TART-A 13046 1 54.79 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATTTTTTTATTTAAATCATACGGTGCCACAAACTGTCCATATATTTGACT:1 - chr2L 6102877 3' + roo 400 1 67.81 ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGGACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTATTGCTTTTGAATTTGT:1 + chr2L 5460086 3' - Tc3 283 3 37.67 TAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTGAAATA:1 - chr3R 10736013 3' + McClintock 6384 2 54.11 ACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACAGTGAAATTAATTAAATAAGAAAAAAGGTAAACCGAGAAGTTAAATATAAAACAGGAA:1 - chr2L 17209477 3' + I-element 108 1 60.27 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGAT:1 - chr3R 23618128 3' + hopper 1382 1 53.04 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGGGGCAATTTGGGGGCAGGGGTTGTAACCTGCACATGT:1 - chr3L 7300095 3' - roo 4 2 77.78 TTTAGATGTTTTTCTGGAGCATAGCTCCGTTTATTTTTATCGTGAAGCTCGTATCACAATATTCCTCTTAGGCTTGAAGTGCGCCTTAGCTGCCTGGTGAAAACGTCAGAGAAGCGGCTTTTATATATTATATTATATACTTATGT:1 - chr3L 16697261 3' - gypsy11 4390 2 61.64 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGAACAAGGTTAGTTATATT:1 - chr2R 2591082 3' - roo 56 2 61.64 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATACGTTCTTAG:2 + chr2R 17878659 3' - Doc 44 1 56.85 ATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTGCGTGTGTGTATTCAATAATCGTTTATAATTAGCATAATAATTAGTTTTAGGTCGATTATAATAAGCTATAGAA:1 - chrX 2676248 3' - mdg3 5209 1 58.22 AAAAAGATCCTCTCAAAAATTAAGAGCACAAAAAATAATTCCGCTGCCATTTGGCCGGGTTTTGTGGATTGC:1 - chr2L 5501318 3' + Ivk 263 1 55.56 GGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTA:1 - chrX 21772489 3' + springer 7155 2 58.62 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTT:1 - chr3R 19224971 3' - HMS-Beagle 6814 2 71.54 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAA:1 + chrX 7795608 3' + roo 342 2 63.01 TTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACACTAACACCACCCCCAACACCCTACATGCAAAAAAAAACAAAAAAAAACACCCATTCACCACCACCCACATGCAACATCAAACTATATTCTATAACCAAATTCTAAC:1 - chrX 10790210 3' - Dm88 30 2 73.97 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGTTGCTC:1 - chrX 15200795 3' - 17.6 6948 1 69.18 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATGCGCAT:1 + chr3L 22744727 3' - FB 59 1 60.27 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGAAAACATGAAACCA:1 - chr2L 47054 3' - roo 8669 2 79.67 AAGTTAAGCCGACTTATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATTTGCTTACTATGCAACAACTGTTATCTTATTTTAAGTAAAACGACC:1 + chr3L 25670935 3' - Cr1a 4083 1 54.84 TAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACTGCAA:2 - chrX 3431822 3' - Ivk 5322 1 69.18 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACT:1 + chrX 11661507 3' - pogo 46 1 53.47 CATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 5295 2 63.41 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTTATGTGG:1 - chr2R 15301523 3' - rover 75 2 73.79 TTATGAATGCATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGAATTTCATTGAACGTTGCCACAAATTGAGGAGGCGAAACGCAGACGGGCGGCTACCTTGGCTCACACACACACGTGTCCCGCCTGCCAAATCAGAGTCAATCCCAGA:1 - chr3R 19348339 3' + Transib-N1_DM 425 1 74.48 CTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGGTTTTTGTTTGATTAGCAAAACCACGATGTTTTTTTAGCTTTAAATACAAAGTGTTACCATTTATGGCCACAGTGCGTATGAG:1 - chr3L 19112086 3' - Doc 4518 1 60.96 TTTTTTTTTTTATAAATAACGATTTCAGTTTTTTTGTTTTGGTGTGTCTCCATAGTATACTCCACCCACATGGCCAAGAACCAACTCTCCGTCTCCTTCTTGCT:1 - chr2L 701610 3' - HMS-Beagle2 474 1 92.31 CACACACACACACACACACTGCATCGATTTGTGTCCAGGTACACGCAAAAAAACTTTCAGATCCGCTTTCAAAAAATATCAAGTATACGTTGGCATATGCATACATACGAGTATATTCTATGGATTTTGTTTTCGTTTGTACGGCT:1 + chr3R 11037672 3' + accord 257 2 53.42 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGGAAAATCTGTAAA:2 + chr3R 28385674 3' - transib2 15 1 75.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATT:1 + chr3R 19073293 3' + roo 356 2 54.11 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAG:1 + chr3L 26290999 3' + Tabor 7282 2 54.79 ATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTGCAGCATCTGCTGATGTTTGCTTAATGAATTGAATCTTCTATTTATATACTTCATTTTTTATTTCAACATTATTA:1 - chr2R 13613627 3' - I-element 5189 1 56.16 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAAAC:1 - chr2L 12818236 3' + hobo 2893 1 51.16 AAAATTATAATAACAAGGGCGCGAATTTTTTAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGAAAACTTAAAACGAAGATGTTAAAACTACTACCTAGCCGATAACTGAAGTCTGCACTCGGCATTAATAAAAATAAGTC:1 - chr3R 7599706 3' + 1360 3067 1 52.05 CCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCAC:1 + chr3R 15790103 3' - flea 4752 1 55.48 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACCCGACTTTCTAAGTTTAAAGGGTATAGAATG:2 - chr2R 5674588 3' + S-element 1704 1 77.40 AGCGAACTTTTATAAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGG:1 - chr3R 20953885 3' - Doc3-element 4243 1 78.43 AAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTAATCTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTA:1 - chr2R 545174 3' - Bari1 1465 1 51.37 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACGTTCGGTTCGTTCGCATTTCTT:1 + chr3L 3983923 3' + P-element 2852 1 62.33 GTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTGCAATGGGCTGAGTGGAAATCAATACACGCACTTAGTGGGGGTTCATGTCCCGGTAATTGAGTTTATTAAATAATCACAAATATCGATTGGATTCGGTTCATTTCTGCT:1 - chr3R 20436262 3' - I-element 4926 1 78.08 AATGATNTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATATTATTATCAGCAATCATTTTAATAACCAGCTTA:1 + chr2L 6654795 3' + diver 210 1 76.03 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCATATTTGTGCCGCCAAAGGGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAA:1 - chr2L 4063847 3' + roo 9016 2 62.02 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATT:2 + chr3L 22035644 3' - F-element 86 1 76.03 ATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGAGAGCGAAAGGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAA:1 - chr4 1265527 3' + Cr1a 80 1 64.65 AGTTAATAACGTGCCGTTAAAATTTTTTTGAACAACTTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACATAAACACGCTCTCACGTCTATAAATACATATACAGGCACACTCA:1 + chr2R 6240169 3' - transib1 447 1 68.33 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCT:1 - chr2R 18258778 3' + Juan 4159 1 52.74 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAAT:2 - chr2R 15326794 3' + copia 241 1 74.66 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAAGGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTCTGTTT:1 - chr3R 15325077 3' - 297 54 2 60.14 CTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACGCAGAAACATGGCTGGCTAAAAACAGGGCTACACCAATATCAACCAATTGATTTATCGTGTTTACAGCAGTTATCGTTGCTCTCTACACTGTAACTTATTTAG:1 + chr2L 10272281 3' + Juan 4041 1 73.97 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCTAATGAAGTTTAAGCGCAACTACTTCAAGA:1 + chr3L 5881724 3' + pogo 2085 1 74.66 CTGTGAGTTCTACACGTACGATACTAGATCAAACAAGCCATACAAAGCCATTTTATCCGGGCTGGATAAACTACCAATTGAAACTGTCAAATCCATGCACAACAATTATTTTTATTTGGCTGTCAACATTTTATATTCACCGTAAA:1 - chr2L 13557744 3' + Juan 499 1 69.18 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGT:1 - chr3L 23249351 3' - rover 26 2 68.49 AGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTGAATATCGTGTGAAATTTCTTTTTTCTCGGCTTATCACCAAAAAGTCTATGAAGTTTATTACAAAATAATAATAATCATAATCGTATAATTGGTTTACAAAATGGTGTATATCAGT:1 - chrX 6667538 3' - INE-1 562 1 46.58 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGGACAGAGGAGCCTTTC:1 + chr3R 30347461 3' + P-element 2868 1 69.18 TTCTTGATCAGAATCACTAGCCCAGTCATTCTGTCAATGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGCTGTGATCTGCTTTATAAAATTGTACTATTAAAACTAAATTCATTGGGATGCTAAGAAATTCATTCAATTATAGCGTTCTACC:1 - chr2R 12391726 3' + INE-1 87 1 69.18 AATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACA:1 + chr3L 1332295 3' + TAHRE 10392 1 85.52 CTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTCAATTCTAAGTTTTCTCTCATCTGACAATTTTTTTAAAAGCGACTTATTTTTTAAACTGATTTCGAACGCATGCAACTTTTAGTGAGTTAGTTTAGTGAGTCTCACTA:1 + chrX 9987263 3' - 1360 2976 1 62.33 AAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATATGGAACATTGATAATTTTAAATTATAAACTTACCTATCAATGACCAATACAGCCACGAGTCCAGTTCGGTTTACCCAAAGTCGAG:4 - chr3R 14505224 3' + F-element 4675 1 76.71 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATT:1 + chr3R 24381372 3' + Juan 4130 1 73.97 AAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGGAAGTGGAAAAAGAAGAGGGATAATAGTGTCACACAAAACGCTCAG:1 - chr3L 17674774 3' + invader2 453 1 68.49 GGAAACGAGGAAATGAATATAATGTACAATAACTGTAATAAATATTTGTGTTAGTAGGATCTCCGTGACCAACTTGCAACTTTTCAATGCACCGCAGGAAATTGTGTCTTTAAATTGGGGTTATGTAATTACAATTGATTTAGGG:1 - chr3R 22315962 3' - Cr1a 4333 1 58.62 TTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCCCAGTTC:1 + chr3L 16211608 3' + transib2 2761 1 60.96 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGAT:1 - chr2R 5941341 3' + copia 5053 2 67.12 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCAATAA:1 - chr3R 27315073 3' - jockey 4693 1 65.29 AATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGAAAGAAGACTGGATTAGTTTCTCCCCTTCTAATACATTTTGTGTGTCGAAATGCATCAGGCGGCGACACACTCACCAGCAACAGCAGCAACAACAC:1 - chrX 2052503 3' + HeT-A 6042 1 31.69 TTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACCCTTTCAATA:1 - chr2L 22121306 3' + I-element 5338 1 49.32 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACATCTCGAAGTCGCATTCTATAAGAGACTATGTGAGGCCTTTTTGGATTCTGGCAAAAATGCTTAACAAATCAATAACTG:1 - chr2R 22992426 3' + hobo 2899 1 51.03 ACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAACCCATCTCGTCCTTGTACCCTTGCCCACCGCCCACCGCCCACCTAGCA:1 - chr2R 13635500 3' - transib2 329 1 51.52 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGG:1 - chr3L 6518580 3' - 412 7106 2 69.03 GAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCCATAAGGATCTTGGTCATATTTGGCTTGAATATCATAAAAGATCAACAACTGTTTTCGGCGATAGATAATGTTGAGGG:1 - chr2L 9646671 3' - F-element 4219 1 56.25 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGCCAACCCCGCGGGCGGATGGCTGT:1 - chrX 8308350 3' - roo 14 2 76.03 ATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAACAGCGG:2 + chr3R 24729657 3' - Juan 4147 1 64.38 AGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACT:1 - chr2L 23295813 3' + micropia 5347 2 77.40 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAACAGTTAAGGAAAATAAGTATT:1 - chr3L 18046568 3' - roo 27 2 65.75 CTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAA:1 + chr3L 3501800 3' + Bari1 1628 1 72.60 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCA:1 - chrX 7795475 3' - roo 17 2 74.82 GCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCATGGAGCCAACATTCTGGGTCTGTTCACCAGCCTGAGTCCGTCGCACTTGGCCATCCAG:1 + chr2L 6225174 3' - roo 109 2 60.27 AGAATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACGCAGATAGTGTGAGTGCAAACGCGAAATTTAATAATTTTTTCTGGGGGTTTTATGGTTAGCTTTTAAGTTTGTGCCTCAGTTCTAAATGCATCAGATTTATCG:2 - chrX 12896240 3' - INE-1 572 1 56.16 TATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTT:1 + chr2R 6622627 3' + S-element 1626 2 81.38 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGAAGCGTAAACAGATTGATTGGACGGGTGATCAGGCGGAAAACCCTCCGGACCAC:1 + chr3L 19455059 3' + mdg1 7431 2 64.38 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGAGATAATTCAATTTTTAAACATTTGGCATAACAAGCGAAACC:2 - chr2L 3675792 3' - Juan 4032 1 76.03 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCATATACCCATTACCGGACCCA:1 + chr3R 19073330 3' + roo 394 1 74.66 GTTACAAACAAATATATTGAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTACTGTATGTATGCAGTAAAATAGTTGTTATATTTTTGAGTCGAGCCCCTAATGGGGCTGGGTC:1 + chr2R 18964771 3' + Tc1-2 1589 1 53.04 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGTTGGCCTA:1 - chr3R 11062738 3' - roo 8731 2 63.70 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACC:1 - chr3R 30347341 3' - P-element 91 1 25.34 AAGCGATGATAGCGACTCGGATTCGGATTACGATGATCCATTTTCTATGCATTTGGACGTAGAAAGTTTTGATTAATATAATGGTATAATTATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTAT:1 - chr3L 10795198 3' + transib3 2538 1 67.81 AAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAACCTTTTTCGCACGCCTTTTCCATTCTCCTGCCGAAATCTTTCTTCCTCTTGTCGTCTTTTAAAGTTTTGCCATGTCGTTAGCTTCTCTTCTTCGTCGT:1 + chr3L 23770150 3' + Transib5 2859 1 75.97 ATATTTTAATTTTTTTTTTAATATAATTTTAAAATATTCATTCAACAAGGTCTTGGATAAGCTGAAAACAATCAAAAACATCCAAAAATTATAAAAATTACAAATTACAACTTAT:1 + chr2R 1231024 3' + INE-1 468 1 60.87 TTATTTATATTTATTTATCTGGGCATAAGGGTATGTAAGGATCTCAAATGAAGTCAACCATATTTGCAAATTTCAGTTTTCCTAATTCTTTGTTTTAGTAAGTAAACCCTTGTTATTGGTTTTGAATGATTGTAAGCTCT:1 + chr2L 14931234 3' - Tc1-2 478 1 80.00 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGCAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTA:1 - chr3R 11062767 3' - roo 40 2 71.11 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATAC:4 + chrX 1341756 3' - 412 7091 2 59.59 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATAT:1 + chrX 14722192 3' - diver 77 2 68.49 TGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAA:1 + chr3L 16470339 3' - jockey 4760 1 76.03 ATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACCCACACAAGCAAGCAAATTCTCCACCCACTTGGGTTGTTGTTGGTAGCTGTGGAACGGCTTGCATGTCGGTGCACACGAGTAGAACCTG:1 - chrX 17958166 3' + 1360 3203 1 51.39 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCA:1 + chr3L 12004358 3' - P-element 42 1 56.16 TATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAATTAACCTTTGTCCCAACTTTTGATTGTACGGTCAAGG:2 - chr2L 17005641 3' + Stalker2 404 1 77.40 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCCAGCCCTGGGGAGTCCTGACGAAGCGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTCACATATAACGCACACTATGGCACACATAATTACACACACTTATCGCA:1 - chr3R 17736874 3' - opus 7066 4 60.61 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCG:1 - chr2R 13766224 3' + roo 405 1 62.12 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATACCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATTGCCTT:1 + chr2L 20266067 3' - roo 33 2 60.27 AAGAATACTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAA:1 + chrY 1421305 3' + flea 4952 1 60.27 TGTTGTTGAGACGCATCGTTGGTGGGCTGATTCGTGGTGATTTTGCACCGCATTAATGGGTTGGATGCCAGGTGTGTCGATTTGAAGAATCTCCTTTTTTTTTTGTAATCTCAGTTTGTCGTTTCACTAATTTCAAGTATGTA:1 - chr2L 9293226 3' - HMS-Beagle 6724 2 53.85 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTTTGATCAATTGGCACAATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4826124 3' - pogo 43 1 54.79 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCATTTTAATTA:1 + chr3L 11326815 3' - pogo 20 1 67.81 AATTAATAATAGGTAAAAGCTGTGGCTTTTTTTTTCCTAAAAACATTGTTGATGAAACTGGTTTCAACATTTTATATTAAAATATGATATTTCACCGCCTTTTTCGCTTCAATTGAAGAAGACGAAAATAAAACCGCACCG:1 - chr3R 16094890 3' + diver 285 1 62.41 TATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTCGGCAT:1 - chr3L 24272050 3' - gypsy11 63 2 64.38 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAAAGCATGTTTAGTTCCATAAAACTTT:1 - chr3R 4217687 3' - 297 48 2 72.09 AATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGCAGGGATTTGGTAATATCACACCCTCATTTCGTTGGCATAGTTGAAGAACGAGTAATAGAGACTCTCCTGCTGCTGAAACTTATCGATCACCTCGTCCATATTGCTAGATTCCGTATACT:1 + chr3R 23286970 3' + P-element 2741 1 66.44 GTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCTTTGAAGTCAA:1 + chr3L 10731901 3' - 297 11 2 67.74 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGG:1 + chr3R 25709834 3' - hopper 34 1 68.67 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTG:1 + chr3L 1692119 3' + blood 7348 2 53.60 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTAGCATGCGATCGATAAGAGAGAGCGCATACGGCTCTTTCTCTGCCA:1 - chr3L 4233907 3' + pogo 2034 1 68.75 CGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTC:1 - chr3R 23618138 3' + hopper 1341 1 68.49 ATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAAATTATTTTATTAACTTTCATAATTGCATTCGCAGCGGAGAAAAGTGAAAGAATAGCGCGAGAAAATTCCATTGACTGGCGAAAAGTGCT:2 + chr2R 9504010 3' - Juan 3757 1 54.79 AATAATAATAATATTTTTTAATATTGAGTAAAGCGTCGATGGTAATAAGACTTCACTATTCCCAGAGTCTTAATTAGCATTCAGTTGACAAGCATTGACAAGGATATCTCTGATTGGATTGCAACGTTTGACTATTTATTAGTTGT:1 + chr2L 20296652 3' - Burdock 499 1 56.85 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAG:1 - chrX 6475281 3' - Doc 47 1 54.55 GGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCAGTCTTCTTTTTACGCTCATTTGAGCTTTTTAATTTGTTGTTGTCTTCCATTCATGCTCGCTTTAGTTGCG:1 - chr3R 21628082 3' - Doc 4502 1 54.41 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGG:1 - chrX 13134898 3' - jockey 4831 1 64.38 AGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATG:1 - chr3L 23456270 3' + Gypsy6A_LTR 256 1 68.49 ACCATGCCAAGAAAAACTTTTGCCCAAAGAGGGGGAACACGCTACACTTTTGTGAGTTTCAACATAAATGTAAACAATAAATTTGTAGAAAATTGTT:1 - chr3R 28934069 3' + Fw2 381 1 85.57 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCCACAAACTTTTTGCAGCTTTTTCCAACGCGACACTCGAGCTA:1 - chr3R 13875059 3' - P-element 78 1 30.82 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAA:1 + chr2R 7304144 3' - pogo 37 1 57.53 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGATACTTGAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAATCTGACAAAATTTCAAACCAGAAAGTGACAACAGCGC:1 + chr3L 2146005 3' + roo 361 2 48.63 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCG:1 + chrX 959091 3' - 412 7115 2 61.81 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTATGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCTAGAACTCTTAAACTTATCCATAAACCTATTTCTGTGACCGCAT:1 + chr3L 3030360 3' - roo 8669 2 76.71 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCA:1 - chr2R 21926361 3' + opus 7440 2 60.27 AACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTACTTAACATACACATATATACTATCCATTTAATTCGTCGGCC:1 + chr3R 5351042 3' + jockey 4860 1 54.35 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCA:1 - chr2L 18347305 3' - transib2 81 1 73.97 ATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTT:1 - chr3L 21655863 3' + HMS-Beagle2 7154 2 52.05 ATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCA:1 - chr3L 23249384 3' - rover 7010 2 57.53 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGTTGCGTCCTTCTCTGTCCC:1 + chr3R 6419921 3' - Tabor 83 2 71.92 AAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATGCCCGTTACTCAGCTAGTGGGAGGGCAAATAAGAAAGTTCAACATTCTTTTTGGCATATCGATGGATATTAGTAAGAAAGACATTAAATATGGGCGTTAGAGTGG:1 - chr3L 22940041 3' - INE-1 579 1 57.53 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGG:1 + chr2R 23180293 3' + roo 349 2 57.53 GGGCCTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCAAGTTCATCGGCCTGATTTTCTTGCTCTTGGTTCTGCCGAAGCTGAAAAACATTTTCAAGGATGATATGATGTCCGGATCTGGTGAG:1 + chr3R 25047154 3' - Fw2 181 1 72.22 ATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAAAGTAAAGTATATACATTGTGACACTTTGTCACATATATTATAATAAACCAGCAAAAAACTTCGGCACACATGGTGGATTGCTAATGGACGCA:1 - chr2R 6522598 3' + Stalker4 6930 2 69.86 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAAC:1 - chr3R 30347342 3' - P-element 86 1 25.71 GCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCTCTCTCCGCCGTGAACCTGGAGCAGTGCATTAGCAAATATTCTGCGACACACTTTCACCACCACACACTTTTCACTATGTGCG:1 + chr2R 13424689 3' - Rt1b 4699 1 64.71 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAA:1 - chr3R 23618150 3' + hopper 1329 1 75.34 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAAT:1 - chr3R 13972921 3' - 412 7075 2 68.89 AGAATAATATTCTAGTGTCTTTGATTATACTCACTTTATTTGAAATCGATACAAACAGCAGTTTCCTCATCTAATATTTTATTTATTTCAAACCTTTCACACAGTCCCGAT:1 - 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Juan 88 1 74.66 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGG:1 - chr3L 6447014 3' - transib2 52 1 53.42 AGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGATCGGCAGCTCGTCAACTCCGAATAAGCGTCGTAAAACATATTCTTATTACTTACTGTGCCAGACCACAAGGCTGTAAGTTAAAAGATTATTCAAAAGATTAATTATTTTTTATAA:1 + chr3R 18245515 3' + Gypsy6A_LTR 166 1 73.10 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACT:1 - chr3R 11469291 3' - Tabor 48 2 53.42 ATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTATACACTTACATACACTTAAGAATTTTAAGTGCTACTTCAAGACGAGCTGGAAAATCGTATAAATT:1 + chr2R 10413099 3' + 1360 3170 1 57.24 GAGAAGTTTAATATTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTCAGTCAATTTTGATCTCAATCAAATTAATGTACTAGTTGAACCAAATTGCT:1 - chr2L 17937990 3' - I-element 467 1 65.07 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATCGTTCGACG:1 - 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FB 61 1 60.96 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAA:1 + chr3L 6447107 3' + transib2 2747 1 71.03 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1 + chr2L 5069689 3' + flea 5000 2 78.77 TCTTGAGTTATTAATTTCGGCCAGAAAAAGTGGTACAACTTCCCATAGTGAGATGTTCTTAAATCTGATGAGATAAAATTATTTCAGGGCACTTAAAACGCCGTATCAATTAATTTTTTATATTTATGTATATTATTTTATCTGCC:2 - chr2L 22107378 3' - Transib-N1_DM 29 1 64.38 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGGACAATTT:1 + chr2R 7244909 3' + diver 6048 2 60.96 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACG:1 + chr3R 17077210 3' - roo 8712 2 53.10 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAAAATTAATAATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTT:1 + chr3R 25774423 3' + Juan 4166 1 52.74 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTACG:1 + chr3R 7317662 3' + I-element 5288 1 63.01 AAAATAATAGTTTACGGCTGCGGTCCCTTTTTCGGGCGTAATGTGGCTGGAACTGTGTGTT:1 + chr2L 19974228 3' - gtwin 7212 2 77.05 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCT:1 - chrX 4341267 3' + roo 9004 2 63.70 GGAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTT:1 + chrX 14722188 3' - diver 5969 2 69.86 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAA:1 - chr3R 19073160 3' - roo 37 2 54.48 TTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTT:1 + chr2L 17005841 3' - Stalker2 25 2 67.12 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGC:1 + chrX 21100282 3' - mdg1 36 2 61.64 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCTT:1 - 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chr3R 6625667 3' + flea 4988 2 67.12 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAAGTGGAA:1 + chr3L 5389977 3' - roo 5 2 70.59 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTCTATAGAC:3 + chrX 12129456 3' + flea 243 2 76.71 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGCCCTTGAGGGGGAAGCGGGGGAAAAATGGGGAAAATGG:1 - chr3R 31638188 3' + hobo 2871 1 71.54 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCC:1 + chr2R 11164524 3' - roo 8706 2 56.85 GTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGCTCGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCGG:1 - chr3L 19271024 3' - INE-1 351 1 85.45 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGAAAGGCCGCCGC:1 - chr3R 4461011 3' - blood 7017 2 69.70 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGGATCTTGAGAAGTCCCAGCAGGGGGCCGATCACTTCGAG:1 + chr3R 28901353 3' - 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mdg1 7080 2 53.28 ATAATAAAAGAGTTGAGTTCAGCTGCGGAAACTTGCGGATGTGCTTGAAATATTGAATATACTATTTTTGGGTTAAGTTTGTCCAGTGAAGTCCCTTTGTGTCTTTGTTTATTCTTTTTGCCATTTTCGTTACG:1 - chrX 8602009 3' + Transib5 458 1 76.12 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCG:1 + chr3R 19992756 3' + hopper 1376 1 59.59 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGTATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATC:1 - chrX 18396101 3' + roo 326 2 71.23 GCCATAAGTTAATATGCTTATTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCGTAGGCACATACTACACTACGACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCATACTTCTGTGATTTTGTCA:1 - chr3R 13972949 3' - 412 7093 2 48.80 AACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTT:1 - chrX 21772482 3' + gypsy3 5 4 52.56 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATC:1 + chr3R 20167673 3' - roo 65 2 64.83 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAATAAATTTTTTTTT:2 - chr2L 7660868 3' + I-element 5337 1 70.55 CTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGTGGTAGCAAAGTTTTGG:1 - chr3L 5061531 3' + 17.6 443 2 52.74 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTA:1 + chrX 21224633 3' + roo 398 1 62.92 GGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCCTGCCAACTTGAAAAAAATTTTAAAAATTCATTTATTTGT:1 + chr3R 24865098 3' - invader4 181 2 72.59 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACTGTCCACCCGAAAAAC:2 + chr3R 15054345 3' + copia 229 1 64.38 ATAATATATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGC:1 - chrX 14304060 3' - roo 8733 2 71.23 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCCGTTCCGCCCACTGTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAGG:1 - chr3L 5881577 3' - pogo 42 1 56.80 TGATCCTGATCAAGAATATATACACATTTGTAGGATTTGTATTGTGTGCGCAGCGATCTGGGCA:1 + chr2R 5320257 3' - INE-1 81 1 62.50 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTTATTTAAACAACGGAGTTGCATTTAATGTTCAC:1 - chr3L 23320077 3' - roo 88 2 83.56 GTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATCAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCA:1 + chr2R 5532369 3' - G4 3777 1 51.37 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTAC:1 - chrX 11661378 3' + pogo 2072 1 60.32 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCAAAAGTGATAA:1 + chr3R 19032708 3' + roo 357 2 55.48 TCCAGCTCAACTTTGAAGAGTAGTTGTGGTTTTCTGTCTTTGACAGAATGTTAAAGACGGGTTTTGTCTTAAAACCCTTATCATTTGCGTTATCTCTGCGTTTTGATTTATTTGCTCAGCTGTGGAGTTTTGTTTACTTTTCATC:1 + chr3R 7302747 3' - Fw3 320 1 70.34 TTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCAGATTTAACGCACTCAATTGCCGAAAACAACAACAAGTTAT:1 - chr2R 6964773 3' + Burdock 6331 2 63.70 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAAAATAAAACAATTCAGCAACCGCAAATTCAGTAATCT:1 + chr2R 5074585 3' - 1360 57 1 58.62 ATATTTAAATTTAAATTGTAAATTGTAAAAATTACATGAGTTCAAGGCCTCTAAAGAGCGACGCAAACATATCGAACATAAAACAGTTGTCTTATGATAGTGTCCGTGGTGCTCCGGTTAGCTCGATCTGCTCTATGCACCACCAA:2 - chr3R 20912981 3' + TART-A 13183 1 78.08 AGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCC:1 - chrX 21772480 3' + gypsy3 10 4 57.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGTTCTGCAACCT:1 + chrX 7795662 3' + roo 397 1 77.40 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCAT:1 - chr3L 16690920 3' + I-element 5277 1 73.97 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCTTTTCAAATTTGTAAGCCTTT:2 - chrX 12986482 3' + roo 397 1 76.03 AATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATATAAGGCAAGCAAGTCCGGAGTCCTATCGCCAAGT:1 + chr4 1128552 3' - transib1 1903 3 71.92 GCGTTGTTTTTGAGTGAAGAGAGCTGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTTACTGATTTTGTGATTT:1 - chrX 23155938 3' - Doc4-element 50 1 81.82 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCG:1 - chr2L 8338130 3' - P-element 80 1 31.51 ACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGCTTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTA:1 + chr2L 15550768 3' + Bari1 1649 1 59.59 GCAATGGTGTGTGTGTGTTTATGCATTTCTATGTGGAACTCTCCTTTGCGTGGCTGACTTTTCCTATCGATTTGGATTTCCTCTTGCCCGACGAGAACAACACATGGTACCGAAAAAAGTTTCCCATGGCTACGGCTACGAG:1 - 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chr3R 23618129 3' + hopper 1350 1 62.33 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTT:1 + chr2R 2427620 3' - Doc 58 1 59.86 AAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGACTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATG:1 + chr3L 19350042 3' - 1360 3228 1 52.05 AAATAAACATATAAAATAAAAGTGGTATAATAATAAGGAAATTAAATACGTAAACATTTTACATAAAATAAAGACAATATGGGATTTAAGAAACAAAGTGTTAAATAATTTCATATATGCTTTTTAGGCTTACAATAACTGGATG:1 - chr2R 20431655 3' + HeT-A 314 1 46.21 AAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTGCATGAAACTTACTAGGCGTACAAAGTTGATTATATATGAATTTAATATTCCTTAACTTGAGTTAAAGTAAAA:1 - chr3R 6294800 3' + Tc1-2 75 1 53.42 CACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGC:1 + chr2L 17766213 3' - Doc 180 1 60.96 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAAC:1 + chr3L 11326792 3' - 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chr3R 27160053 3' + 412 443 2 53.42 TTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTAC:1 + chrX 14771806 3' + BS 5027 1 62.33 TGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTTGGTGGAAAACCAGAAGGGGGAAATTAGCAAGCTAACCAACTTAGCAGTAAAAAACAAAAACAACA:1 - chr3L 8043911 3' - Doc 4543 1 54.17 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCTTGTTATGACGTATTGACGTATTTGATCATGT:1 - chr3L 26160454 3' + roo 8983 2 81.51 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTACTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCG:1 - chr3R 8075914 3' - 412 7135 2 71.03 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGCTGGCGAACCCTAACGAA:1 - chr2R 10161760 3' - transib2 37 1 60.27 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGC:4 + chr2L 71272 3' - 412 7113 2 57.53 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCAT:1 - chr3R 9557517 3' - G2 3023 1 51.08 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGAACAAGGTGGCAATG:2 + chr2L 13158748 3' - roo 53 2 54.79 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATAACGTACATTATTGCACACATAATTACACACACTTTTCGCACATTTAGCGTTTCGAGTTCCTACATCACGTTTGCCACGGATTTTCCCGGCCTAT:1 - chr3R 17736820 3' - opus 7026 2 67.81 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTATACTCGTACTTTTGGCAGGATTCCCGTCGTCTGGTGTCCTGCATCTCAAGGTGCTGCTCGTGTTGCAGAATTT:1 - chrX 13490624 3' - 297 6601 2 66.93 GTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCACTAGGTATTACCGAATAAAGTATTATTGAAGTAGAAAGTATGTCGTTGGAAAAGGGTTTGGTCATTT:1 + chr2L 17591281 3' - Stalker 6959 4 54.11 ACATATTCGAGTTCATGTGTGAACACGGAAACCGAACAAAAACAATTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTTTTAAT:1 - chr3L 2145870 3' - roo 8668 2 58.72 TCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGCTTTCCATCATACCTGTGTGGC:1 - chr3R 22590451 3' + rover 7266 2 64.38 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAATCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTG:1 + chr3R 10270688 3' + Juan 4177 1 61.64 ACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAAAAGTCAGATATGGCCAGATCGACTCGACTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATAT:1 - chr2R 8443974 3' - Doc 212 1 56.85 ACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGTATCCATGATTATGGTTTATTTTCGTGGCGTTCTTTAAAGATTGTTTTTATTTTCCCAAGATTCTGGTCAGTTTTGTGTGT:1 - chrX 7308399 3' - roo 410 1 55.48 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCATTTTTTCCT:2 - chr3L 2989884 3' + roo 399 1 78.08 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCGTAT:1 - chrX 15357614 3' + hopper 1394 1 69.18 TATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATT:1 - chr2R 15004725 3' + BS 5066 1 38.36 GTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTGTTCGCGGATTGCCCTACCGTACCTATTTCGTTAAGGAGCATTAGCCGAGTTCAGTATTTAAATTTTTAGATGTTCATTTCTGTATTAATTTTGGTGACTAATAATTAATAACAATAT:4 - chr2R 4774815 3' - Gypsy12A_LTR 1990 1 44.52 ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTGT:1 + chr2L 5460086 3' - Tc3 283 3 39.04 CACAAAACACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCAATTAAAAAGAGGTAAAAA:1 + chr3R 6461284 3' - S-element 1485 1 80.82 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCCTTGTTGCTGTTCGGAGCCGGCTTAAATGTTGGCCATTAAAAACAGGCTGAGCAGA:1 - chrX 10167372 3' - roo 63 2 63.01 AGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATAAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTCTAAGTAGCCAAAACCTGAATCATTCAAGGCTTTTTTATTTACCCACAAAAATGTTGTAGAACCCAAAAAAGTTTAC:1 + chr3L 22753397 3' + FB 303 1 54.79 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTGGGTTTGGGTGTTGGGGCTCACTGC:1 - chr2R 20348954 3' - transib2 60 1 59.59 CTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACACATTAATATTATGGCCTGACCTTCTGCTGTGAACTCTTCTGTAGCAAACGAAATGAGTATTCCCTGGCTGGCGCCCTCCAACTTCCTGCCCATTTCAAC:1 - chr2R 6965448 3' + Transpac 310 1 71.54 TAGGTANAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATT:1 - chr3R 4460974 3' - blood 7027 2 73.97 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAA:2 - chrX 18009937 3' + 412 428 2 60.96 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTACA:1 - chr3R 19073136 3' - roo 8677 2 71.03 ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAACATGATGACCAGATATAACTGGTTACCTTATCATTACGATAGTAATATTATAAAAGGATGTATATTTAATAGCTAAGGAGAAGCAGCATTTCTATAGTA:1 + chr2R 10809304 3' - mdg1 7077 8 82.88 AGAAAAAAAGGAAAAAGAAAACAAAACATTGCTCCCAAAAGACGAACAAACAACAAATAGAAATTACAAAACATACCAAGTGAATCAAAATATGCAATTAATTACATTAGTTCAAGTAGGAATATTTTAATTAAAGCCGGAAATG:1 + chr3R 5640590 3' + Doc2-element 234 1 68.97 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCA:1 - chr2R 21116488 3' + mdg1 7390 2 67.81 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAATTACA:1 + chr3R 27406087 3' + diver 185 2 55.48 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTAT:1 - chr3R 18488377 3' - roo 8735 2 68.28 CAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCT:1 + chrX 2479557 3' - mdg3 86 2 75.89 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTGCTTGATAGGATGCTGCTGCGCTTATTTATCCCCCTATTTTCAGACATGTGACTAACGATGATTTTTAAACGAAGCCCT:1 + chr2R 6622682 3' + S-element 1680 2 60.96 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTAC:1 - chr3L 3030206 3' + roo 9024 2 63.08 CTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATT:1 + chr2L 17766167 3' - Doc 234 1 67.12 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATAGAAATGAGAAATGAAAGTCCACACATAAATAAATTATTCAAAATTAAACCGCAATACAAAGATCAAAAT:1 - chr3R 11189940 3' + roo 9022 2 59.59 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAAATTTAT:1 - chrX 18009984 3' + 412 435 2 77.67 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACAACAACAAGGCTGGCCAATAGTAATTCAGTGTGACCGC:1 + chr3L 6964831 3' + P-element 2884 2 75.00 AAAAAAAAAAACAACAAAAAAATCATCGACCGACCGTTTCACCCCTTTCCCCCCATTTCGGCCCCTTTTGGGCAACTGAAAACCCCC:1 - chrX 401241 3' + gypsy11 3933 2 80.46 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGGTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATA:1 - chrX 17343370 3' - I-element 37 1 56.20 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAACTGAAGACTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCACACTGTGGGGAAATTAATTTCT:1 - chr2R 6885504 3' + P-element 2827 1 45.89 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTACCAGAGAGATATATGAAAAGAGATAAATTTTAAATTTATCATCAAGATGCAAATGATTTAACTTATATTTGGTTAAACA:1 + chrX 23431710 3' - 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INE-1 175 1 68.49 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATTAAAAGGTTCTTCCATCTGACTTAAAGGG:1 + chrX 21505719 3' + roo 323 2 79.31 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATTCTTCTTTCATCTGAATCTATCCTTGCGTC:1 - chr3R 28146072 3' + roo 397 1 71.11 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTG:1 - chr2R 10078148 3' - jockey 90 1 61.15 GATTAATTCGGTTTTTGTGCCATATCGCATTTTGCCAAAAATGGCTGTGACATGCGTGCAGAC:1 - chrX 18336798 3' - mdg3 376 1 69.84 AAATAGTTTGTAATTTAAAGAAAATATAAATCGCTTTAGTTTGATTATGTTTGTATAGTTAGGAGTAAAAATACAAACCTGAGCATTTTCTAACTTATAAATCAGTAAAATAGTTCAAGAAATTCACTTTTTGGTAGATTTAAAAA:1 - chr2L 12137708 3' + Porto1 4658 1 80.82 CCCTCCGAAGGCTGAAGAGGTTACACCCCACTCTTAGTCATCGAAAGGTTTGAAGAAACAAACAGAAATTAAATGCCTTGGACACACATTTTTTTCTATTTAGTACAATGGTGCAACACTACTATTCTAACTTTGAGTTGTGGTTT:1 + chrX 1250095 3' + G5 4628 1 76.71 TTATAATTAAATTAATTATAAATCAGGAAATCAGTAATCAGGATTGACCCTCGATTACCAACCTCCTTTAAAGAATACAGTTTTAAAGGAATACAATAAAGTTGCGTTTATGTAAATTAAATAAATTTGTTTATTACTTTCATTTT:2 + chr2L 16793905 3' + flea 231 2 58.22 AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAG:1 + chr2R 9967102 3' + Bari1 1639 1 75.61 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGATTGCAGCCCAAGAAG:1 + chr3R 27133693 3' + opus 466 2 62.33 TCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTATACATTTTTCGTGGAGGTTAAAGCGGTTAG:1 + chr3L 23224539 3' - 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S-element 58 1 67.12 AGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACC:1 + chrX 18336687 3' - mdg3 17 2 65.74 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGAG:1 + chr2R 15718975 3' - blood 7179 2 87.23 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCACTAGGCACTCTGTAAACATATCAACAC:1 + chr3L 13294996 3' + roo 9042 1 59.38 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGGGCATTTGTTGACCTTTTTTCTGAATTTTAAACGCCATTCGCCGCAGGTGCG:1 + chrX 9530452 3' - 297 18 2 71.43 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCA:1 - chr2R 13766228 3' + roo 9032 1 69.39 TTAGAGATCTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTTTTATTAATTAATATTTGTTATTGTATCCACACTATATTCTGTTGCTGTTATAGTCTGAGCGGTAGTGTCATAAACAGTAGTCA:2 + chr4 167826 3' - gypsy7 413 1 59.59 ATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGATGAAGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGCT:1 - 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roo 8716 2 54.79 AGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGAC:1 + chr3L 5061641 3' - 17.6 6992 2 69.86 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGGTTTAATGTTAACTAA:1 + chrX 7795638 3' + roo 9036 1 59.59 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTCTCACGTTTTGCG:1 + chr2L 14074565 3' - 297 22 2 66.13 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAG:1 - chr2R 7244790 3' - diver 39 2 58.22 GTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAAGCTAGATGGTTGTGAATCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGGCGTGACACGGCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATAATTTTTCTAATTGAGTTTTAATA:1 + chr2R 5212105 3' + INE-1 125 1 75.34 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATTTTAAACAA:1 - chr3R 4460966 3' - blood 8 2 79.45 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGCGGGTGCG:1 - chr2L 8338130 3' - P-element 59 1 35.20 AAATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATGAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTA:1 - chr3L 16973393 3' + S-element 105 2 72.60 AGGCTATAAACCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATAGTGCATACCATTATGGCCGTACAACTGATGACCTAGCAAAGGGTAAAAATCTAAATTGGAAGGGTTCTAGAAAGTAGATGATGAAAGTTGGCT:1 - chr2L 14343723 3' + Cr1a 478 1 75.34 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGT:1 - chr2L 13556340 3' + transib2 2763 1 60.69 AGTTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTGTGCGTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTTTGGATGTTGAGAGTCCTGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGCACACTAAAAGAAAACTTTTTTATTTTTTC:1 - chr2L 14895085 3' + Cr1a 3994 1 77.93 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTA:1 - chr3L 24131405 3' - Transpac 70 2 70.34 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAATCCAAACCCTGATGTACCAC:1 + chrX 18010083 3' - 412 23 2 67.12 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATT:1 - chrX 18396082 3' + roo 9009 2 58.22 TTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCTCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATAC:1 - chrX 19038394 3' + hopper 1346 1 74.22 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCT:1 + chr3R 15072636 3' - pogo 52 1 74.55 GATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTGTTAAATATTTGCTCAATGTTTTATTTATACTTATGTATATGCTGAAAAAACACAATGAACTTCAAGTTGAGAGCAGTGGCCCTCAAAAGTAGGCAATGTTTTTTGTTCCACTC:1 + chrX 6466762 3' - Quasimodo 142 2 76.03 CAGCGGACCAAAATGGCTCCCTTGTGGGAGATGGCTGATTGATTTGATTTGATTTAATTTGATTGAGTATGAGTAGTGTATGAGTCTAGTGGGCTGTGAATCTGTGCGAGTTGTTGGCGAATCTCCGTGTACTGAAAAGGAAGGA:1 + chrX 2741984 3' - Q-element 495 2 71.03 TTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGA:1 + chr3L 24208219 3' - Quasimodo 50 2 56.85 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGCGACAGTGCGAAGGATAATGAAAAAGAAATTACGTTTTATTAGTTGGAAATTGAAATTTCCTAATCGAATTTTGGTCGCTCCT:1 - chr2R 11027142 3' - Quasimodo 79 2 67.81 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATACGTGTGTT:1 + chr2R 4870263 3' - Juan 62 1 57.46 GTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCCCTTCAGTTTGGCTGACTTTGGGGAAAGTGAAGGCATCGCTAATGGAAATTTATGTAGTAAAAAGGAAGAGTCTG:1 - chr3R 25373367 3' - Stalker2 416 1 55.17 TATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTCTGAGGAGAATGCCAAACTAAAACGACTGCAAGCGGAGTCCCCGAGGACTTCAGCTGCAATCAAACCCACTGCTCTTTCTCTGAGCAAACCCCA:1 - chr3L 3191013 3' - Quasimodo 7119 2 73.97 CCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGTCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCGTGGACAGCCAAGA:1 - chrX 11468063 3' - BS 4672 1 71.92 AATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCTCATGTGTGTGAGGTATTCGTATTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTTTTCTTTATTTTAATTTTAATTTTTTGTCCGTTTTTTATTTATGTGAATAATTTGTGGG:1 + chr3R 22098911 3' - I-element 4893 1 66.44 AAAAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTC:1 - chr3L 24565352 3' + hopper 1409 2 52.29 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGGCGG:1 + chr3R 16157400 3' - pogo 28 1 60.48 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTA:2 + chr3R 3920579 3' + roo 9001 2 67.12 CTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAAT:1 - chr2R 5106289 3' - Stalker2 7334 2 76.71 AGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATGTTTCCTTATGAGCATTTTTTAT:1 - chr3R 19447006 3' + roo 8907 2 55.48 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTT:1 + chrX 2479594 3' - mdg3 5306 2 52.05 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCG:1 + chr2R 13766280 3' - roo 8747 2 77.40 AACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTTCGGCTATCCGATATTTCCCATCTCGGCTTCTATCCATCTAATTGATTTCGTTGTGTGTCCAGACTAGCATGTATGTTACTTA:1 - chr2L 5470102 3' - G2 2987 1 56.16 TGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAACTCCAGTCTACT:1 + chr3L 13365854 3' + BS 5052 1 52.05 ATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTCACGATTTGGAAATGTTGTGCTAAGGAATTTCATTCTGGCTAATATGTTTAGTCAGTTTGGATGCACTTTGCTGGGGAGGAAACATGTGCTTTTC:1 - chr2L 17537605 3' - ZAM 8033 2 69.86 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTA:1 - chrX 13134893 3' - jockey 4826 1 60.96 GTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATAAATCAGACAACCAACAGTCTTACTCT:1 - chr3R 2522235 3' - Tc1-2 65 1 67.12 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTCCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGAA:1 + chr3L 2145991 3' + roo 9011 2 56.85 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGG:1 - chr3R 28901248 3' + transib2 2764 1 73.50 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTTCTCCGTTTCGATACACA:1 - chr2L 809611 3' - jockey 21 1 70.55 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCA:3 + chr2R 20227304 3' + hopper2 1532 1 70.55 AGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTT:1 - chr2L 22966920 3' - 1360 3220 1 73.08 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGAGGAATTTGGTAACTATTTTATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTACTCATTAAGTGTTTGGAGCTGCCATACGCAAATATATTTCTAATTTGAAATTGA:1 - chrX 8092333 3' + pogo 2091 1 78.77 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTAT:1 - chr3L 14366524 3' + roo 353 2 58.22 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTCTGTTCGGTAATTAGCAAATGCAAAATTACACTGTGCACTATGACAAATAGAAG:1 - chrX 2814247 3' - FB 57 1 61.03 GAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGTTGTCGTTGATTTTACTTACCATTGAGCACATGTACTGTAACGCTTTTGGGCTTTGCATTTGATGGATTAC:1 + chr3R 15061488 3' - I-element 4929 1 54.11 GAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATATAATTGTTCTAATCATCCTG:1 - chrX 22901623 3' - 17.6 256 2 52.74 AGAAAAGTACGCATTGTTACGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACCCTGAGCGCGAGTGTTGTTCGTGATCATATTTTTATTATTTAAGTATATATATTATTTTAAGATAATGAATTACAATATATATTTGA:1 + chr3R 778377 3' - Doc 278 1 58.22 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGCTTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATC:2 + chr2L 4906675 3' - blood 7074 2 60.96 AAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTAGGTAAGTCTAGTCGTGTCCGTTCTGGCTTTGGCTTATACCCATGTGTGTTGCCTGCATTTAAAGATATCATACCTAAGTTGGTCTGC:1 + chr2R 21566943 3' + HMS-Beagle 442 1 65.28 TACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCCTGCCGTGTTG:1 + chr3L 5061688 3' - 17.6 6945 1 71.92 TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAGCAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTG:1 - chr3R 25433308 3' + transib2 2737 1 75.34 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCC:2 + chr3L 13739634 3' - BS 5079 1 75.34 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCC:1 + chrX 9530391 3' - 297 53 2 73.68 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCATTTGCCGTCT:1 + chr3L 21656020 3' - HMS-Beagle2 16 2 72.14 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGA:1 + chr3R 28385653 3' - transib2 36 1 60.96 AGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTC:2 + chr3R 26504317 3' + HMS-Beagle 186 2 58.90 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTGGCTCTTCGTTTCAGTCATGTCGCGCTCGCCG:1 - chrX 18282596 3' + P-element 2881 2 65.88 TTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTTATATCATGCATTCTGCAAAACTTGCCATATCTGAGCCCTAGACGTCGGGGAGTTCTTCGACACATATTGCATATGTCATTAATAGTTACATCTAGAAGGCGTT:1 + chr2L 21687527 3' - FB 473 1 46.58 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCACCCACCCACGCGATTCGC:1 - chr2R 12779636 3' + I-element 5281 1 66.44 ATTTATTTGACTAGCGTACTATTATCCTTCTTGGAAAACTTAATATATAATCGGTATCATTTTAACTATTCTTATTATCTAAGTTGTTATTTACAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTCACTAACATTGCCAAGAGC:1 - chr3R 4504005 3' - jockey2 3368 1 71.03 AAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTTGTTTCTATAATTGCTGATGA:1 + chr3R 11040189 3' - Bari1 18 1 71.43 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAGTTAAGTTAATAATGGCACGCGTTGAGTTTTTTATGCGTACCCAGTGTTT:1 + chrX 18409456 3' - jockey 4747 1 67.81 ATGTGGTGAGTTTGGGAGTTGGACATAGTTAATGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGAATGGAATAATAAGCTATATATTCATATAGGATAGTCATGTTTCATAGGGTTGTTTTGCTTTGTCAGTAGTTGTACTTCTTTTTAATTAAG:1 - chr2L 19382424 3' - TAHRE 10300 1 69.18 ATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTTGTTTTCGTAGTCTAAAGACTTGTATATATTGTTATTGTTTTTATACCCG:1 + chr2L 5325774 3' - I-element 5157 1 67.81 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAA:2 - chr3L 4219491 3' - jockey 97 1 78.08 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAA:1 - chr3L 8959605 3' + 1360 3316 1 71.23 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATG:1 - chr2R 16510116 3' - F-element 89 1 67.81 AATGATAAAATTTAAATTAAAATTTAAATT:1 - chr3R 10676417 3' + 1360 3041 1 83.33 ACAGAGACTTACAAACAAAACTTGTCATCGAGACAATATCAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCTCTTGCAAGAAACCTTATTCGAGTATGCAGCCACAGCCGACTGCACAAAAAACGACTAACAATCACTTA:1 - chr2L 12998679 3' + Doc3-element 4448 1 74.66 GACTAGAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCGACCTGGACCCATCTAGCATCCACTACGCAGTTTCTCGAGGTCAAGGCACCATGAACTCTCAAAGGCGAGGTGTGTAGGTAG:1 + chr3R 4496919 3' + Fw2 3501 1 60.00 AGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAATTCAAGTATCCCATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATCCACAACTCTGCCTAGGAGCACTCCACTTACCTACGTATGCACACCACTC:1 + chrX 21038872 3' + Quasimodo 91 2 64.14 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTAATAATGCTCTCATCTTCAAGCTTTGCTGGCTTAGCTATTTCCATCAGTGCGTACAAGAATTCATGTAAACTCCATCTTTTTTCTTTTGC:2 - chr2R 6421454 3' + roo 358 2 60.96 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTATGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCTAGAACT:3 + chr3L 3030323 3' - roo 42 2 52.74 TGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGATCTCCAAATGGAAGTTGTGTTTACTTTAAGTTTGGTTGTTTATCGGGTGGCTAAGTGTTGGCGACAAAAACAAGGGCAAAGGAAATGCTGCTGAGATTAA:1 - chr2R 4344623 3' - I-element 190 1 73.29 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTA:1 + chr3R 17077171 3' - roo 8752 2 80.14 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGCGCATTTTCGAAATGTATTCA:1 - chr2R 5070906 3' - Tirant 8107 1 32.88 TGAATTTACATTGTACATATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGC:1 + chr3R 28666930 3' - 1360 3149 1 54.11 GGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCCACTCGCTGTGGAGATCCGGTGGCGGAGCCCGGAATGGAATGTTGCTGCTGTTGCTGGGAGTTGTT:1 + chr3L 2525662 3' - accord 6957 2 59.32 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCCGGTAACCTGAAG:1 + chr3L 22400385 3' + 1360 3355 1 60.00 AATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATAAAAAAATTAACCCTCATTACTAAAATTATGGCGTTTGCGAAGACTTCCTTCTGGATGTATTCTATGTATGTAGATATAATATTCTATGTAGATGTAATATATCTTTGTAAGAGG:1 + chr3L 26710923 3' - Tc1-2 69 1 78.08 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGTCGGCGTGTCAAGG:1 + chr2R 12133862 3' - jockey 26 1 64.23 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGCTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATA:1 + chr3L 8959714 3' - 1360 39 1 55.48 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGAGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTG:1 - chr3R 23911348 3' - 3S18 5813 2 55.65 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTATTGAGAA:2 + chrX 18396189 3' - roo 53 2 56.85 GAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACCGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGC:1 - chr2L 20360648 3' - micropia 5100 4 52.90 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTT:1 - chr3R 6419829 3' + Tabor 7277 2 53.10 TTTTATTTTGGCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGGCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACATTATATGAATGCCATTAAATCGTTCC:1 + chrX 15200914 3' + 17.6 408 2 78.08 TAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTACTTTCTGTTGACAATTTGTTTGCTCGAACAAATCAACTAAAAGGCAACTGCTAAGTGGCAA:1 + chrX 2962590 3' - FB 986 4 58.22 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGC:1 + chrX 18336652 3' - mdg3 79 2 74.81 AAAAAAAAAAACAAACAAAAATGAGAGAGAACACAATTTGCGTTTGTTTGTTTGCCATAGTTTTTTGTTCGGGTGAGCTACCAACTTTCGTCAAGCGGGCCAAAAGGGCAGGGTGGTAACAGGATTCACAGATGGCGAGCTAGGTC:1 - chr2R 21247723 3' - hopper 143 9 71.23 TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGATTTTTTCGTTTTTGTTGTTGATTTTCGCTTCGTCTGCCCGGTTTCGGCAATCCATGGTCGGGGATGCTGAGGATTGGAAATACGTTGGCGGGGATGATGATCC:1 - chrX 4453647 3' + hopper 144 105 70.08 CAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAAAGCCCGGACATAAAAGGACTTCTGGCTGCCAAATTCAGTAGGCGAATGCAAATCCCAATC:1 + chr3L 14721167 3' + F-element 260 1 56.15 ATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAATTTTATAGATTTCCATTTAATAGATTTTTTAGTTAAGTTTTATAAATATTTAGGTACTTACGATTTACTT:1 + chr2L 14358908 3' + diver 214 1 60.96 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCGGTTGC:1 - chrX 1135297 3' - P-element 43 1 46.15 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTTGCTCGTTTTTGCGATTACTAT:1 + chr3R 26774115 3' - hobo 47 1 52.99 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAAT:3 + chr3R 18873667 3' - micropia 5092 4 52.74 TTTAAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGATCGTGTTTTTAATAAAATTTCTTTTTTCGACGGCACAAAATGCAAAATATTACGCGGCTCTGGCTGAGAATCTAGATGCACTGAAGGAAATGGGGG:1 + chr3R 29094238 3' - Tc1 444 1 58.90 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGC:1 - chr3R 23295543 3' - P-element 38 1 37.14 AAAAGCGAAATGAATGGAAATTAGAGAATATAGAATTCCAGTTTCCAGTGGGCAGCTATAAAAAATTGTTAAAAGACCGAGGCAAATATTGCATTTGAACACTCATATTATTATCTAAACTATTTGCAAATAATTATTAGTTTAAA:1 + chrX 2935067 3' + invader2 424 1 71.23 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATT:1 + chr3R 19408015 3' + diver 178 2 50.68 ATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCC:1 + chr3R 1844860 3' - Cr1a 159 1 51.72 TTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGC:1 - chr3L 11913219 3' - BS 5083 1 79.17 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGAT:1 + chr2L 12818356 3' - hobo 28 1 62.77 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGGATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTCTAAAA:1 + chr3R 11062864 3' + roo 9055 2 65.41 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTA:2 + chrX 7795611 3' + roo 9009 2 60.96 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGC:1 - chr3L 3030203 3' + roo 9011 2 65.07 TATTAAAAATATTATTATTATTATAAAATATTAAAAAAATACAAACGTGATATGAAATTATCACTCCGTGAAAATGTGTGGGCGTTCAGGGCAGTAAAGTCCGGTAGATACTAAAATGGATTTATGAAAGCTTACGTATGATTTAT:1 - chr3L 6694861 3' + Burdock 499 1 67.12 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATG:1 + chr3R 15807450 3' - FB 47 1 52.21 AGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAA:1 + chr3L 25008171 3' - X-element 60 1 51.11 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATC:1 - chr3R 14980313 3' + roo 9006 2 63.70 GCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAAATATACTCAAGGAATTCTACACTTAATATTATCTATTAAAATACAAACGAGAATTAATTTCGAGTTGGTAACATAATCTAATGTTATGTGAGCAAACA:1 + chr2R 15843917 3' - 1360 432 1 69.18 GTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAAT:1 + chr2R 12645490 3' - X-element 88 1 66.44 ATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAACAAGAACCAAAACTCCCTTACAGCAAAAATTATGTAACGCCCATCATCGACGTTGT:1 - chrX 7088795 3' + I-element 4883 1 60.96 TCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTGCACCCACTCCTATATAGCATAACAATTCCAATAAC:1 + chr2L 8925001 3' + copia 4733 1 57.65 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGA:1 - chr2R 9966964 3' - Bari1 46 1 46.58 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTAT:1 - chr3R 16157263 3' + pogo 2058 1 52.05 ACTAAGGCTCTTTTAATAAAAGCCATATTAGGTCCAACCGTACCAAAAAAAAATCAACGTACAAGCTAGGAGCAACAATGACAACCGATTTTGCATCTTAGCAGAACTCGAATACTATGGCATTGATTTCGTTTAATCCTTCAGGA:1 + chr2R 5484744 3' + G5A 2389 1 72.60 AACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTTTTGTGGGGTTATTGTATGACTCATTAGGCCGAAGC:1 + chr3R 16290797 3' - I-element 4996 1 74.66 CTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCCACATCCCATTCCCCAAGAGTCCAGAGGGCAAGCCATATGAGAGCCACATTATGGCCAATGTGTAGGTCTATTTAAAGCCAATT:1 + chr3R 14338279 3' - pogo 1674 1 60.96 TATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTACCAAAAC:1 - chr3L 19454927 3' - mdg1 7039 2 71.43 ACCATCATATAAAAGCGAAAAGACGGTAACACATATTTACATGTGTTAAAAATAAAAATAAACAAGTGAAAACAATAAGCACAACAACAAGAACAACCAGCGCGGCAAGGACAACACGGATATTCCATAAAACTATAGCAATGTTA:1 - chr3R 10991143 3' + Porto1 88 1 59.59 TCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATG:1 + chr3R 11469393 3' + Tabor 7251 2 65.75 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCCCGTGCCCAGGATTCGT:1 - chr3L 18281865 3' - Doc 72 1 68.28 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAA:1 - chr3R 17996184 3' - diver 5967 2 71.23 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCTATTATAGTATTATATAGTATTATAGTATATAGTATTAT:1 - chrX 5323196 3' - Juan 4061 1 67.12 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAA:2 + chrX 21100293 3' - mdg1 7063 2 69.18 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATAGAA:1 - chr3R 15942673 3' - hopper 34 1 60.96 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGCCATGCAACCCAACATCCAGCACAACCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCT:1 - chr3L 16690863 3' + I-element 5334 1 55.48 GGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGAGTTTGTGGTGTGGTGTGGGCCGGGAGAAAAGAGAAAGCCGGAAATACATATACATTAAAACACTTACGATACAC:1 - chr3L 8274046 3' - accord 7104 2 78.45 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGCTCTCTCCCACAC:1 - chr3R 23295531 3' - P-element 42 1 42.98 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGG:2 - chr3R 29084879 3' + 412 7492 2 52.74 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTA:1 - chr3L 19454896 3' - mdg1 7053 2 70.54 AAGAACAAAAGTTAAACCCACCTGCAAAGTAAAAATTTAAAAGTTCAAACAAATTACAAAATAAACCAAATAATAATAACAGTGTAACCAAGTGAAAACTAAATAAACTTAATTACAACTAATTGAACCATAATAATAACAGCTAA:1 - chrY 3649170 3' + HeT-A 278 1 58.22 CACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATAGGACCAGACTCAACAACAATATTCAACAACGTCATCAATCAGAATCAACAAAAGAAAGGAGAGTAAAGACGACAAGTAGCAGTGGTGTGCAAATGGGTTACCCCCTTTT:1 + chrX 5288073 3' + I-element 4878 1 69.86 AATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAT:1 - chr3L 16973392 3' - S-element 1610 2 73.29 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGT:1 - chr3R 9038949 3' - Juan 4091 1 73.10 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATA:3 + chrX 11661494 3' - pogo 61 1 63.01 TGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTATTTATACTTTTCTTTTCCTATATGTAGCTAATTAAAATGTTGTATTCGTTTCTGTGTAATTCGGACGCGCCTACAAAAGTTTGCATACTCGTTTAGTCTCAATA:1 + chr2R 15843437 3' - Idefix 7142 2 69.23 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGA:1 + chr3R 19032694 3' + roo 359 2 60.77 TTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAGCTGTGGCAGTGGGACAATGATTAGATTGATAAATTGGTAAAGTTTGAATGCATTTGATGCTCACCTTTCAGCGGCGGCA:1 + chr3R 27567409 3' - HMS-Beagle2 247 2 63.70 AACGGGTATCTGAGAGTCGAGAGACTCGACTGTAGAGTTTTCACTTGCCTTGTATAAAATAAGAAACAAGTGAGTCGGCTGTTAAATACCCACTACACTACGACCGCAAGAAAATGAGCATGGATTTGTAAGTG:1 + chr2L 21791590 3' + INE-1 553 1 71.64 GCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTAAGCACGGTGAGAGAGGGTTACCCCCTGAGGGGGGAGCACG:1 + chrX 20584208 3' - I-element 5208 1 70.55 AAAAATAAAAGAAAATTAATTATCGCCGCTTTTCAATGCCAAATGCAAACGCCTTTCTGACCAT:1 + chr3L 13877777 3' + NOF 3959 1 53.12 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCACCTAAAAGTATGCTATA:1 + chr3R 31264148 3' - jockey 4759 1 77.93 GAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTA:1 - chr2L 12818261 3' + hobo 2852 1 75.17 TATGTTTTTTTTTGCTTTTTCTGCACTTGTGCTTTTTTGCCCTTCTTGTATCGGACTCCCGAAATATTACTTTTTGTGTGTGTGTTTGTAATGTAATCAATTGATTACTAATTGATAATTATGGCATACGTAATGCGAGTCGTG:1 + chrX 13895601 3' - Penelope 549 1 52.78 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTC:1 + chr3L 11326805 3' - pogo 30 1 60.96 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTC:1 + chr2L 12822836 3' - P-element 9 2 44.44 ATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATACGGAATTGACTTTTTGGCCACAGCGCTTCGCAAGCAATCGAATGGCAGCGAAACAGAGAGGAGAAAAAGCGAAATGTGTTTGGCCACAATGGGTTAGGATGTCA:1 + chr3R 7666456 3' + I-element 228 1 71.53 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATAT:1 + chr3R 15942836 3' + hopper 1389 1 68.49 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTGTGATTGTTTCTCTTCTGCTTGGAACAACAA:1 - chrX 2214213 3' - jockey 4782 1 68.49 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGC:1 + chrX 13490727 3' + 297 312 2 82.19 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTAAATGGTTT:1 - chr3L 5489873 3' - jockey 58 1 48.63 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCG:1 - chrX 6475263 3' - Doc 32 1 65.75 ATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTTTTGTAAAGTTTATTCCGGGCTTCACTCGCATTTTCGCCTAGGCATCCAAGCGCAACAAATTATTAAATTGCTTACTTTTACTTTTCCACGT:1 - chr2L 13885462 3' - transib2 2351 1 71.92 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATATATTTAAGTTGGCTTGATTTGGAATGGTACAAATTGTAAACATAATTAGCTTAATTATTAAGAGCTGCATTTAATTATTAGACCATTGTGTATT:1 + chrX 18238909 3' + jockey 4919 1 76.74 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCT:1 - chr3L 19454910 3' - mdg1 45 2 54.48 ATATTTGGACACGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTTCAGAATGACGTTGCAC:1 + chr3R 20565326 3' - transib3 238 1 63.64 GTTTAAGACTTATTGAACTTCACTGTATAACTTTCAACATAAGACCGAATTTCGAATGTGAGTTAGATTGAGGAGGTGCACCTTCGTCAAATGAAGGAGTTTCTGTCCACGTATCTAGAAATGCTGCAAAACAATCACGATATGG:1 + chr3R 9522109 3' - McClintock 6252 2 55.86 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTT:1 - chr2R 8099143 3' - jockey 4824 1 61.64 AATAATAATAATATTTTTTAATATTGAGTAAAGCGTCGATGGTAATAAGACTTCACTATTCCCAGAGTCTTAATTAGCATTCAGTTGACAAGCATTGACAAGGATATCTCTGATTGGATTGCAAAGTTTGACTATTTATTAGTTG:1 + chr2L 20296651 3' - Burdock 499 1 57.93 CGCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTG:1 + chr2R 14051854 3' - roo 58 2 64.38 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACT:1 - chr3R 21933146 3' + pogo 2037 1 69.86 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGCAAGGAAAGTGGTTGGGGCAGGGCCCTAAAACACT:1 - chrX 959018 3' + 412 448 2 65.71 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTC:1 + chr2R 12472127 3' - transib2 28 1 58.82 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAATGGTACGGGGAGCTCTCGTTGCTGCAAACACTGGCTCTGGTCTGGTGCATAATCAAATTCCAACCAAAAACCTGCGCTGTGCTCACCACCACCCAGGGGAGTCAGT:1 - chr3R 19074631 3' + roo 9047 1 75.34 GAGTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGGTTTTTTAATTAATTTACTTTTATTATCATATATTGTAAACATAATTATTTAAGATCCGTTATCGCTGAGAAGTCTGTTGATTCTTTTGATCTCTGTAGATTTAAGTTTACATTTGGG:1 - chr2L 21153907 3' + Cr1a 40 1 60.96 TTATTAATTTTATTATTTTTATATCCAAATAGCTTATACTAGAGTTTGACATTGAAGATGTTATGGAGATTATTAAATCTTTGGATATAGTGAATTAATTTTAGTAATTTATAAAAATATAATATTTTATTATTACAATGAAAATG:6 + chr3L 17988452 3' - mdg1 38 2 19.18 TATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAAT:1 - chrX 14722089 3' + diver 6070 2 56.85 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTAT:1 + chr3R 18093378 3' - I-element 59 1 56.16 TTATTCTTATCTGGAATCTGTTGAATTATCGGACAAAGAAACAACGCATAATCTAAAACAAATTTCAAATCAAATAAAAGATTTCGAAAACAAGATTATTGTTGAAA:1 + chr3R 1683864 3' - Idefix 103 2 82.24 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGTTCCAAG:1 - chr2R 13259266 3' + mdg1 7414 2 52.74 TTATTAATATTATTAAGATTATTACTAAAAAAATATATTTGATCTTTTTTAATAACTTCATATACCAGTTGTATTGATGTGTAGAAATGTCATAGAAGAAATATATTTTTTATTAGCCAAAGTAATTTCTTTCACTGCATTCCATC:1 - chr2L 3844944 3' - mdg1 38 2 73.97 AATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCCAATTTGGACAGGAACCTTAGCCCAAGGGACATAGTATTTGTGGTCGGCAAATCGCA:1 + chr3R 14163479 3' - F-element 4622 1 59.29 GACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGTCTAGTATTGAACTCAATTAAAATCGAAAATATCAATACTTATCTCAAACTATTGATAACGCTGAACCCAATGCATTATGTCTACTTTATTTGCTCTGCTCTGCTGAAA:1 + chr2L 12649816 3' - invader4 2615 1 75.34 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGGAATGAGTAAAGCACTTGTCTC:1 + chr2L 47179 3' + roo 8998 2 67.12 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAAC:1 - chr3L 4219490 3' - jockey 96 1 77.40 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTTTTTCGGTGGCTTCGATTTGGGGCCAACTGTTTTGCGCTTTTAATTATGGTTTTTGTGTCGCTTACGACGAACACCGATCGC:1 + chr3R 9595156 3' - Tirant 8118 2 78.08 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAGTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGAT:1 - chr3L 15103821 3' + Transpac 5151 2 71.92 CTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATTATTGTAATTGGTCACATCGATTTAACTAAGAATTAAGCTATACTTGGAGCGTCAGATCAGTTCGTCTGACGATATCCAAGAGTGAGGGAAGGGAAACT:1 + chr2R 5106398 3' + Stalker2 379 2 67.12 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGCGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAA:1 - chr2L 18226758 3' + roo 9026 1 52.05 AGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTG:1 - chr3R 11186551 3' + BS 5018 1 67.12 GTTCGGGTTTATTTCGTGCAGCATTGGTGAGCAATACCGCGATCGTTTGCATTCAAACGTAGGTCAATGACCGGGTGGATGATTTGGCACTCGCGGTCACATCATTAGCCATTGACTGCTCCAGCAG:1 + chr3R 23705147 3' - Doc3-element 407 1 75.59 ACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCGGAGAAGAACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGATGGC:1 + chr3L 13739677 3' - BS 5005 1 60.00 AAAATAAAATAAAATAACATAAAATAAAATAAGTAGAAAACGCCGTGGAGTAGACAAGCAAGTGCAAACAAAAAATGTGCAACAATCAAGGAAGAATTTAATACAATTGTATGAGCCATAAGTTGAAGATATTGTGCAGTGTATA:1 - chrX 5147652 3' - transib1 1898 1 51.72 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCACCCACCC:3 - chr2R 12779647 3' + I-element 5270 1 73.97 GTAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAAATTCCAGTTATTGTCTTTAAAACACACAACACAATCGCCATATAGCGAAAGGTACAATAGATGGGATCCCAAACGAATTCCATTGGAG:1 - chr2R 18815922 3' + mdg1 26 8 80.83 ACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATAT:2 + chrX 12129412 3' + flea 4958 2 56.16 ATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAACTCCAAAAGTCCCAAAATAACAAGTCAGTTCTTGCGGTTTTAATTGTAAAAAATGC:1 + chr3R 15257940 3' + BS 5030 1 61.38 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAG:1 - chr3R 30946517 3' - Transpac 4972 2 59.09 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAG:1 + chr3L 18505770 3' - I-element 33 1 63.01 GACTGTGCAAAACTGGTACACCGGTGACCAAATGCCTAAAATGCAACGTCCATCTGTGTTGCACTAACCATACAAACTGTTTTTTGTCTTACCACCCTTCAAATGTCATGTAATAGACCAATATTTCATATTCTGTGTATTA:1 + chrX 10006885 3' + looper1 1555 1 72.54 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGGTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCCGCAATTTTAATTTAAAAGTTTGCGATAACA:1 - chr2R 22287365 3' - jockey 9 1 76.76 ATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGAC:1 + chrX 10521702 3' + Tabor 396 2 77.40 TATGACGTGGACTGCCTATTTACGATTACGGTAAAATGATATGGTTACCGATTTCGGCGACGTCGGCGTTGTTGTTGATAAGGTCGAATCTAATCTAAATATATTATTATCTATATTTAGATACAATAACTTATTATTTATATGCA:1 + chr3R 16425318 3' - Helitron 94 1 54.79 ATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACGTGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAACCATTTTTTCTTTTTGCAAGTGTACATAGTGAAAACAGTGG:1 + chrX 13798962 3' - 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Gypsy6A_LTR 261 1 68.33 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTTGAAATTCTCTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTTCTCTCGCCCAGAGTTCACTCAACTCCAACTCCCTT:1 - chr3L 17940052 3' - 1360 24 1 47.86 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAACATTCTATAACTACGCCGTAGATGACGAGTTAAGAGAATCATAAAGTAGTGAAGCGAATTCATGTCTGTGAAATAAT:1 + chr3R 23403676 3' + I-element 5290 1 74.66 AAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAACCAGCAGTTGTTGTAACATACTTTTAGGTAAAAA:2 - chr2L 11297994 3' + I-element 5342 1 76.03 CGCGTCAACATCCTGGGGACTGGTGAGGTTTTAGTTTATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATATATGTTTATGTATGTTTATGTATATATATATGTTTATGTCATTGTATTAAAGAGTTTCTTGAGGTAAAAA:1 - chr2L 22187432 3' - BS3 130 1 82.19 AAAAAAAAAATACAATATATCAGCAGAGAATTGAGGAACATTTGAGTTACCAATGAGAAAAATTAAAAGGATATTCGGTATATCTCTATTTTCATCGCACTCTGCTGCGTTGATTATTTCGCTTGACTGCGGCGCAAACTCATCAA:1 - chr3R 9134558 3' + S-element 142 2 48.63 GTTAATCAGCTAGTGTGAATTCGAACGCAAATTTCATCATTTTTTTTTTGAGATATCCTCAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAGAAATTTATAAATTGTTCAAAGCGTGGGCATCATGTCCATCGATCTTCCTCGAAGGTAGCTA:1 + chr3L 20033482 3' - INE-1 534 1 54.79 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCTATTTTGTGCTGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGACTTTTCGGTCAGTGAGTTTTTTCAG:1 - chr3R 24764871 3' - F-element 83 1 78.07 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGAAGGAAAGCCATCTTGC:1 - chr3L 11905280 3' + roo 345 2 80.00 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACTGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGG:1 - chr2R 16817897 3' + 412 425 2 67.94 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCC:3 - chrX 4341251 3' + roo 356 2 52.74 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGCAACTCTAATTAGA:1 + chr3L 16437260 3' - F-element 60 1 50.00 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCATTGCTGAAAAGTATG:1 - chrX 19054261 3' - jockey 62 1 62.70 ACTCTTATAGAACTCACAATGTTCGTTAACCACCCAAAAAATTACAAAAAAACGGGAAGGAAAACAAGGAAAGCAGCGAAAATAAAAAGGGAAATAAATAAACGTGAACTGAAATCCAGGGCCCAACTTTACCTATGAGTTTGAG:1 + chr2R 11177943 3' + gypsy4 295 1 77.24 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACT:1 + chr3L 6447104 3' + transib2 2743 1 73.29 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAAT:1 + chr2L 5582225 3' - pogo 42 1 56.85 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGTTTCATAA:1 + chr2R 3564163 3' + Tabor 445 2 57.24 CTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGATTCCAAGGTCCAGTGCGGTACCGTTAATTCACGGTCTCTCCGCTTTGCCCTGCACCGCGGCTATAGCTAGGCGACTCTTATAATTAGTTCTTACATTCTAATACTGCAATACGGTTTATACTA:1 - chr2L 23180011 3' - gypsy8 4767 2 68.49 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATG:1 + chr2L 12250991 3' - 412 63 2 60.96 ATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCGTGATTTGCCATGGTG:1 + chrX 15200958 3' + 17.6 7380 2 59.31 ATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACACGACACTTAATCGACCGCGCAGTAGAGAGTCCGAAACTCCACCGAAGAACAGCGAAACGTTTAGGTTCAGTCTTAGAGAATAAC:1 - chr3L 25335089 3' - G3 4505 1 52.48 GCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGTTATCTGGCAAATAGTTAACAGTACACGACTGTGGTTCACAGT:1 + chr2R 10151168 3' - hopper 83 1 69.18 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTG:1 + chr2R 23180291 3' + roo 356 2 56.20 TTATTATAATTTTAATATTTGACTTTTAAGTGGATGTTTTTTTTATACTCTATGCTACCAAATTTTTGCAACTTTTGTGGCAACTTTTTGCCACATACACTCGG:1 + chr2R 17930062 3' - 1360 3058 1 61.54 AAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACCACTTCCAGCTTTGAAGTTGCCCAA:1 - chr3L 17567825 3' - S-element 1537 1 71.23 TTTATAAATTATTTTCGACCACGTGGCACGGAATGCTGTAAAAACAATACTCATGGTGAATAGAAATGTGATGGATTTGAAGATGCTGAAGATTAACTATTAAATTGTTTTATAATAACACTATGTATTTGGTAATAGCTGAAGTT:1 + chrX 21070476 3' + Juan 239 1 63.70 AACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATTATAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACTTTCAGACTATTATGCGCACACAATGCCAACGGTAAACGCAGAGGGAAACTGGTGGAAAACTAAAAGCCCCAAG:1 - chr3R 10976890 3' + I-element 5006 1 50.68 TAATAAAAATAAAGAAAAAAAAAAATGTCATTGTCATCGAAACCCCACCATCCGGGGATCGCGTTGAATAATTGACAGCGATAAGGTATCACATTGCGCTGACATGTTTCAGGCATTACAAAG:1 + chr3L 20551690 3' + gypsy7 5003 7 73.98 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGAC:2 - chr3R 7666656 3' - I-element 84 1 71.23 TGTAACGCATAAAAAAAAATGCATCCAAATATCTCCAATAGGTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAAAAAGGCAAAAGCTGCCTTGAATTGCACTACGAA:1 + chr2L 15779627 3' - hopper 71 1 69.12 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAA:1 - chr2L 4003673 3' - mdg1 7075 2 56.39 AAGAATGTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGAGGATCACCGTGGAGGAGCCGCACAAACGTATCAATCCAGTTCAAATAAAGTAGTAAATAGTTCAAAATATGTAAAGCATTCCACAAACTATCACTTAATAAGCACTATGCTAG:1 + chr2L 12674837 3' + I-element 294 1 47.95 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATTAAAAGGTTCTTCCAACTGACTTAAAGGGTTAAATAAAATTAAATTTAATTATAATAACAATTTTGTTTAATGAGAATACCAAATTCATGGAATACTTTTAAAAGC:1 + chrX 21505796 3' + roo 400 1 78.77 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGCACAATGGCTAACCATTAAATCCACGCCATCTGGAATCGCTCGGCATTTTCCTTTGGACCAAATGGTCCTCTGCGACT:1 - chr2L 12331038 3' + roo 9032 1 56.94 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCCTGTGAGA:1 + chr2L 4713957 3' - transib2 64 1 65.75 GGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGTAACGGGTATCTGCTAATCGGGAAACACGACATTTTCATTCTATCATGTTTTATTTTACTATTTTCTTTCCTTTTCTGTGTAATCATTTACTTTCACCT:1 + chr3L 23986144 3' - F-element 4239 1 74.66 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAA:1 - chr2L 14874136 3' + copia 257 1 38.36 GCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATATATTTTAAGCGCGGATTTATAAATTTGTTAAGAAGAAAAT:1 - chr3L 15007006 3' + 17.6 418 2 74.66 TAATTAAAACATTTTTTTTTTCTTATATTATTTCTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCACACCAGCGACAAAAAGGCACATTTGTTCCACCCCAAAGC:1 - chr3R 28042900 3' - Stalker2 7183 1 69.72 ACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCTCAGCCTCTCGAGTGCTTTATTAAGCGCTTGTATCCAATTTCGCAGCGG:1 + chr3R 28166103 3' + roo 156 2 63.70 ATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTAAAAAATGCTCGATTCGGTAGCCCTGGCAAAGGATTACATCATATTTAATCAGAGTCATTATTTATAATGATACCGCTTGCATGAGGCATTATAGCCACTGCT:1 - chr2L 14877302 3' - copia 4703 1 70.55 ATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGCTTTAAAATGTGCACTATGCCCAGTTTCAATTGGAGTACGCCCAGGCGACTACCAATACAGCCCTGTGGACCTGCTCCA:1 - chr2R 12192058 3' + accord 7232 2 76.92 AAATCAATATTTGCAATAAAAACCGTTACAGTACAATCAAAATGCAAAAATAGAATTTTTGTGTTCGAAACTTCGCTAAAAGAAGCCAGTAAGATTTGTTTTTGTTTTTTTATACGAAAATTCTGGGCAGGAATTTTGATGCTGAA:2 + chrX 17827783 3' + FB 476 1 62.33 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGCGATACATGAAGTGGTGGGG:1 + chr3L 18403079 3' + P-element 2857 1 61.83 AATTAAAAAAGATTTTTTTAGATTTAAATATATTTTTTTTAATATTATTAGATAAATGAAAATTATTATCGGTTTTATGGCATAGTTATAAACAATTATTTTATTTTTTTCTAAAGAAATTAGTAATGATATTTTAAGAGCTAT:1 - chr2R 12959281 3' + Transib5 2729 1 84.03 ATATATACATATATATATTTCAGCGTAAATTCTGCAGCTTTTGTATGCGCACCGTCGTGCGGAAGTGTTGATAAACCCACCTACTG:1 - chr3R 9184496 3' - 1731 4407 1 79.07 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTG:1 - chr2R 20227214 3' + hopper 1413 2 65.93 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGCATAGATAAAATGATAATGCGCCCAGGCTGATTTGTATATGAAAGCGTGAAAGATAATGCCCTCCTATATATGCCTTACATAACAATTCA:1 + chr3L 16970381 3' + roo 316 2 70.15 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCT:1 + chr2L 6647722 3' - mdg3 5323 2 63.01 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGT:1 - chr2L 19923963 3' - roo 86 2 76.71 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGC:3 + chr2L 6647719 3' - mdg3 5326 2 65.07 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACA:1 + chr2L 4713971 3' - transib2 49 1 55.86 AAATCGTGTTGTCCCTTTAATACCGGAAAAATATAAGTCGTCTTACTAAAATATTTTTGTGAGAAAGTAATAAGTCAAAGTCTAGGCGTGATAAATAATCTCCAGAGGGAAATGGAAGGGGTAGTG:1 + chr2R 19251118 3' - Transib-N1_DM 180 1 63.49 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAG:1 - chr3L 16970374 3' + roo 334 2 70.55 ACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATATGTTGTCTAAATTGTGTCCGCGAAAATACTGTTGCGGCAGTTCC:1 + chr3R 1831788 3' - HeT-A 6007 1 63.41 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGGAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGCG:1 + chr3R 11191479 3' - roo 8717 2 65.32 AAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATG:2 - chrX 12217459 3' + rover 269 2 84.25 GATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAACCTCAACAACAAAAACAACAATACACACTAACCCACACAAAACACAACACAAAAGACACACCCCAAAAACAAAAAAACAAAAAAAAACTCCCACCAAAACAAACTATGTA:1 + chr2L 17401926 3' + I-element 93 1 56.16 AAAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCATTGAGAGTTTTTTATAAGACACGACATATAATCGAATATGACACACCAGAAAATTTAGTAGAAATATTAACGATGGAGGTAACAAACAGAAATTGACATGCACTCTTATGGTCGAATATCTC:1 - chr2R 15010108 3' - transib3 1 2 64.38 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATGATATACCTTGC:1 + chr2R 21681417 3' - roo 48 2 52.74 ATGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGCATGTATACCCGATAC:1 - chr2R 18315979 3' - HMS-Beagle2 6891 2 78.62 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGACTTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTTATTGTATTTCATTTGTATTCCTCATAGTG:1 + chr2L 15940345 3' + pogo 2077 1 62.88 ATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTTACCGCTCGTTGAAAGCATGAATTTTCAAATGGTTCAATACTCGAATATGGATATTCT:1 - chr2L 11257008 3' + rover 288 2 59.59 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGAAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGC:1 + chr3L 22325914 3' - hobo 48 1 52.41 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTTTTTAAAAGACGAGGTTTATT:1 + chr2R 5531242 3' - 1360 64 1 73.29 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAA:1 - chr3R 26178391 3' + 412 7469 2 68.75 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCTGCGTTGGCTGTCGATGAAGGCAAATCCTGTTGCAAATG:1 - chr2L 5582083 3' + pogo 2060 1 55.86 AGTTAATATCTAATTTCCTAACTAATTCCTGGCTTGTTATGTACAATTGCTTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTATTTTTTTGAGGAAAAGAATGGTTTACTATGTACTAGGATTTTACTATACATGATTAATATAAA:1 - chr2L 10843030 3' - I-element 5235 1 63.01 CATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTT:1 + chr3R 21276661 3' + BS 5071 1 60.00 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAAT:1 - chr3R 15882582 3' - jockey 67 1 56.55 AAGTAAACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTTTGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCTCTCCACACACAAATGAATACATTCCCGCCCATTTTGGTAACCATA:1 - chr3R 12059995 3' - micropia 111 1 65.28 CTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATT:2 - chr3R 19450032 3' - roo 8621 1 73.29 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGC:1 - chr3L 14094565 3' + I-element 5308 1 49.32 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTAT:2 + chr3R 11937402 3' + flea 4952 1 60.27 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCA:1 - chrX 20999493 3' + BS 5045 1 52.74 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGTTTATT:1 + chr3L 7300258 3' + roo 9029 1 54.11 AGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACCCTTT:1 - chr2L 22121311 3' + I-element 5334 1 52.41 GTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCT:1 + chr2L 17005787 3' - Stalker2 79 2 70.55 ACACACAATTCAACTACTTAGCCACCAAAACTTAAACTTGAGACGTGTACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACTACAAAACTGCCTGCAGACAACCAGAGTATAGAAAAAAGAAACGAATCCATAAATTTAAATAA:1 + chr3R 28473645 3' + Porto1 4452 1 56.85 TATTTTCCGATGCCGACAATAGTTTTAATTGAGTTCTGAAAAAATAAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATTTACCGATTGTAGTGAAAAGTGATTTCTCAGCCAGGATGAATCTCCAGCTGCCGGCTGATTAATCGCAGATCGTGA:1 + chr3R 30259915 3' + mariner2 846 1 54.11 AAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCC:1 - chr3R 23618107 3' - hopper 90 1 56.16 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAACAGTGTGAGTTACCTGCCACTTAACAAGAGATT:1 - chr2L 3233930 3' - roo 8701 2 60.27 ACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGTATATTGTATTTGATTGATTAGAATTTAATTCGATTTAGCAATTCAATTACCTCGTG:1 + chrX 6670069 3' - I-element 305 1 60.96 TATACTACCACACACACACACACAAACCCAGGCTCACGGGCTCACAGCACAG:1 + chr2L 11584130 3' + Quasimodo 32 2 78.85 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAA:2 + chr3L 22723951 3' - HMS-Beagle2 49 2 52.74 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCT:1 - chr3R 6419806 3' + Tabor 460 2 66.44 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATAC:1 + chr2L 20118482 3' - S-element 69 1 68.49 ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGGGATTTAATATTTCTTT:1 - chr3L 27865968 3' - Max-element 30 2 55.48 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCACATTTG:1 + chr3R 24090535 3' + roo 9007 2 62.76 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATA:1 + chr3L 20898603 3' + roo 9010 2 73.39 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGTTATTCCATGTTGCAGGAC:1 + chr3R 24369159 3' - roo 8693 2 65.75 GTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGTGCACGCAGCGCTGCTAATTGCTTGCATGCGAAACGTAACGTAACGGAACGAAATGAG:1 - chr3L 8242759 3' + 412 7242 2 60.27 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAGTAAAACTCGGG:1 + chr2R 18515002 3' - P-element 33 1 60.96 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACA:1 - chrX 10319586 3' - mdg1 41 2 57.53 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACG:1 - chr3L 6397681 3' - roo 8749 2 73.29 TGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAG:1 + chr3L 13739641 3' - BS 5064 1 68.84 TAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATAA:1 + chr3R 24090564 3' + roo 371 1 52.74 ATAATTAGGATTTAAATAGAATTTCGATTTTTCTTCAAGCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATTTATTTATATACAAATGAAAGCTGTTTTAAAGGGAGATGGATGGGTGGCATTGTGTCGGACAAGATTGTCGCCAAGATGGGCAT:1 + chrX 6754773 3' - 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chr2R 5941317 3' + copia 5077 2 52.74 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTATCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCA:1 + chr3L 19111600 3' - Doc 61 1 62.69 AGAGGTGATGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTTCTTGGCTAGGAACATTTGATAAACTCATCCAATTTCATTTCCTGTTGATTTACAATACAATACATTAAGTGAAAA:1 - chr2L 20608057 3' - accord2 7366 1 70.09 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCT:1 + chr2R 6964891 3' - Burdock 44 2 55.17 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATT:2 + chrX 8200336 3' + flea 4991 2 70.55 AGGGACATGGAAAATTACCTTTTGATATTATAAAAAAAAAATTCCCCTTAAAATTGTATATTATAGGAATTTTTTTATCTT:1 - chr2L 13257645 3' - HB 52 1 58.02 CAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCATTATAACAATGTTTCAATTATAATTGAAAAAAATGCACTCAATTTTATCTGA:1 - 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mdg1 29 4 54.79 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATG:1 - chr3R 4964094 3' + roo 9010 2 61.64 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGTTCTGCAACC:1 + chrX 7795661 3' + roo 396 1 76.71 CCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCAATTAAGAGTACAATAAGATCTAGCTGGCGTTTTTATCGTGTGTTAATATTTACCTCGCAAAGTAT:1 - chr3L 22016251 3' + 1731 42 2 49.32 TTTCGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCCACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAAATTATTTATATAAAATAACCTGAAATAACAAACAGATGCGAAATTTATTATTCCAGATCCATTTTACAAAATGA:1 + chr3L 27866112 3' + Max-element 8488 2 51.37 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTT:1 - chr3L 12249777 3' - roo 8689 2 64.44 AAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCATGGCTAAACGGATAAATAAAGCTGTTTGGGGAAAAGTTTTCATTTAATTTGTTTAGAAATGCGCCAATGGGAGTTGTAAATATTTAAGTACATTCTTATGTCATCA:1 + chr2L 9196924 3' - I-element 5139 1 76.71 GTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACTGCAAATAGCA:1 - chrX 3431816 3' - Ivk 5316 1 71.92 GTGTTTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGCTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATCTTTCGCTTTTGTTTTATTTGCATTGTTCTGGGCTGCCAGGACTTTGTGGAAGGAGTTTATTTGCTCTTCGGCTTTTATGTGCGCAAATTG:1 + chr2L 15568098 3' + Cr1a 142 1 60.27 CGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAATAATAATTCGTGG:1 + chrX 6116368 3' + transib2 2791 1 60.71 CTTATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATATATATATATATCATAATATATACAATTATTTTTTTGGCTTCTTAATTCCAATTGTGCAGATCTATTATCTATCTATGCAGATCAGTTCACAGATATTCACTTGGCAGTGAATTAA:1 - chr3R 3854732 3' + Idefix 7386 2 31.51 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTGGCCG:1 - chr3R 16630231 3' - FB 26 1 65.75 AATTTAAAAAAAAAAAGGAAAAAATAAATACGGCAAAATAAATAAATAATTGTCGTTCGCGAAATCCAACGAAAGTTCTATTCTCAAGCGGGGAACCGGTTTGGCAAAGTTTATAACAAAAATCAAAAA:1 + chrX 19149468 3' + TART-C 11098 1 49.61 AACGATCTCAAGTGACTAACTCATTGAAAATATGTGCTTCAAAGGGGCAACAAGGGTTTTTTATTTTTTCCGTTTTTGACTGCCAACCAAGTAAACATGTCGCCACTTGAGTGACAGCTGACTTGCCTC:1 + chr2L 18899143 3' - roo 8827 2 72.87 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGAGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGCACAACCAAATCGATAT:1 - chr3R 15942686 3' - hopper 42 1 52.48 ATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTTCAGCTTTTAATTCAATTGAACCAATTGTAATTTAATGCCCACACTTACAACTAAACTACAACTTTGAAATGTTAACAGGACTCCAAACAACTAGGCGAATGGATAATATTTGCTGAGTAAC:1 + chrX 19810452 3' - INE-1 176 1 78.08 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATCAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACAC:1 - chrX 13134878 3' - jockey 4811 1 50.68 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGA:1 + chr2L 17809238 3' - jockey 95 1 76.55 GTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCA:1 - chr3R 14860147 3' + BS 5025 1 65.07 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGGAT:1 + chr3R 27986428 3' - roo 48 2 68.70 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGTGATCAATTTTAATCCACCAC:1 - chrX 10256842 3' - hopper 26 1 48.85 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTC:1 - chr2R 5151237 3' + roo 332 2 69.18 CTCTACCGACTAAAATATAATTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTGAATATACGAATTTACTTAACCAAAAACACACTTTTTAGAAAATATTGATAATTTTCATTTTTTTTCCTATCTACATATTT:1 + chrX 12065446 3' - HB 339 1 80.80 AAGACACATTGTAAAATAATAAGTTTTTTACCACTAATTTCGTATCATTTTAATTCAGGCTAAAATAATAACCTATATAATTTTTATTGGTTAGTATTCTAGGTATTGTAAAAGACATTCGTCACCACGCGCCAGATTCTAGTCCC:1 - chr3L 11591489 3' + jockey 4918 1 66.44 AGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAA:1 - chr2R 18514873 3' + P-element 345 1 47.59 AAAAAAAAAAACAACAAAAATGTCATATAATGGTTTTTAAAATACAGCATTTAGAGATGAAGTCAGAGAGCCACAGTTACAGGCGTTGCCGCCGCGCCATC:1 + chrX 4767585 3' - hopper 142 3 49.50 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGTCGAGTGC:1 + chr3L 21380656 3' - I-element 28 1 66.44 GATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTAACTCCAAGCGTAATATACTCATTTCGAAAGAGATATTCTGATAAGATTGGACAGACTGGATGAACCCAACAGAGTAATTATATGATAAAG:1 - chr2L 17180190 3' - Juan 403 1 73.81 CATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAG:1 + chr3R 15790118 3' - flea 4737 1 65.75 AACAACAAAAACAAGAACACCGCCATTTCAACAGGTAACTGACTTTTTCGACAGTCCCCGTTGACGCTCAAAGGTTCGAGAGGTTGTAGGTTCACAGAAACTGTATCGCGGAATATTACTCTTGGCATCCTCAAACGATTGATTT:2 + chr3L 2580673 3' + I-element 133 1 62.76 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCCCCCTAAAGGAAAATGAAATGAGCCGAAAAGGGACGGACATAGCTTTGGTTTATCGTTATA:1 - chr3L 24723840 3' + INE-1 500 1 56.07 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGACATTGTCATGGA:1 + chr2R 13766327 3' - roo 8700 2 61.64 ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGAC:1 - chr2R 10161806 3' - transib2 83 1 71.92 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCCACTTTTTTTTTTAGCCTGAAGAAAGGGAACTTACATT:1 - chr3L 13836577 3' + 412 491 2 69.75 GGAGGAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTGGGTTCACTCAACCGTGACGATGCACACCTCGCAGCCCCTCC:1 + chr2L 2727385 3' + gypsy4 6566 1 58.67 CGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGTAACATAAATAATATTGCTATCAAAAGCAACGTCGTTACTAGCATAAGCAGCAGTAC:1 - chr3L 14405433 3' + F-element 243 1 60.96 AATAATAATAATATAAAAAATATATATTTCATAGTTACATCTTTTGGTACTACTTTTCTAAGTTAGTTCTACAACTGTGAACGCGTCTGTTGCCGAAATGTATGTGTGTGTTTGTGCGTTTACTATGCGAAGTCACTTAATTTTTA:1 + chrX 11627415 3' + mdg1 40 2 54.79 AACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTTACTTTTGCATCTGCAGAC:1 + chr2L 15763138 3' + mdg1 34 9 76.26 GTCGTTTGCCCAGTCTGCGTCGGCGAAGCCCATTACCTGTTCGCCGGACTTGCTGTATGTGATTTTGAGATCAACCGTGTCTGAAAGGTATCTCAAAACATGTTTCGCTTTTATCGGTTTGCCACTTTGGCATTCTGAGGATTTTT:1 + chr3L 5514331 3' - Copia1_DM 3841 1 74.66 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGTTTGCATGT:1 + chr2R 21116628 3' - mdg1 7044 2 29.45 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTAATAGCAGTGAGGCATCACCACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTAGA:1 + chr3R 17996251 3' + diver 6069 2 54.87 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAAC:2 + chrX 12129440 3' + flea 4986 2 65.75 TAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCCTAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATAT:1 - chr2R 19199695 3' - hopper 92 1 77.40 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAA:1 + chr3L 21380639 3' - I-element 24 1 64.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAAAC:1 - chr3L 19454877 3' - mdg1 7051 2 75.34 TCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGTCTATATCGACTCGGCTATTATTGAGCAGCTTCTTTAGAGCAAAAGTACAGACAATATTCCTTGCTTAGTCTACCCTACGCG:1 + chr3R 3186385 3' - INE-1 153 1 49.63 ACGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTGTGAACTTTGTTGTTGGCTACGTCGCGCCACGTGCCAGTGTCATTTAATTACT:1 - chrX 4215574 3' - I-element 5026 1 62.33 GACCGGCATGCTCAGGAAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGGTGGACAGCGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATTGGCGCCCAACGTGGGGCCAGTCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTAC:1 - chr3R 491840 3' - Circe 7374 1 85.93 TATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTAAAGTTATAAAGCCCTGA:2 - chr3L 14094518 3' - copia 229 2 74.66 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGGCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTC:1 + chrX 13490757 3' + 297 354 2 58.21 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTT:1 + chr2L 18226871 3' - roo 37 2 53.78 TAACTAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTCTTTAATTTATTTTTGATCCAGCTTTAATAACTATTAATTTATTATTCCTATAACTTGTACGTTGAATGGGCATAGGTAATTTTCTTGAAATATGAAATATTTA:1 + chr3L 21821561 3' - Tc3 314 1 76.71 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTT:1 - chr3R 18971677 3' + Juan 4182 1 55.48 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTG:3 + chr3L 26291002 3' + Tabor 7285 2 56.85 TATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTAACTACTTATCGATAGCCCTAATTTGGCTCG:1 - chr2R 5106227 3' - Stalker2 7276 2 67.81 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAGCGCT:1 - chr2L 71158 3' + 412 7497 2 51.37 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAGAGCCAACTTTCAAAACCCGAAACTTTCATACCCTGGCATTAATAGAATACTATTGACTAGTCGACCAATAAAGTGCGATGTATGCATAAAAGACCTTTACTTA:1 + chr2L 15936697 3' + copia 242 1 73.97 CAACAAGTCCTCTTTAAAAATTTTCTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATCCAGTGTCCCACAAGGGAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATAGATCGGAAGAGCGTCGTGTTTATGTACTTGCAGAACGCCCATTGATTC:1 - chr2L 6738143 3' + Q-element 433 2 66.44 ACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAAAGTTAAACAAAGTTAATAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATCAATTAAATGTGAACAATTAAGTGACAAAGCGAAACTG:1 + chr3L 10875370 3' + HeT-A 6060 2 75.36 TTAAATTTCAAAATTTTATAATTTTTCTAGGATATCGATAGGTACTGGGAAATAAAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTCAAATAAATATTTGTAAGATCTGCCGCGGAATTTCTTTGCGACTGATGAAGGAAGTAACGAAAAT:1 - chr3L 23984896 3' - 1360 3034 1 56.55 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATGGGAA:1 - chr3L 21380537 3' + I-element 5277 1 73.29 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAGTGTCCCAAAATAGCTAAATATTGTAGATTAGCTCCACGATTAGGATCGCAAGCAC:1 - chrX 20455624 3' + hobo 2933 1 69.66 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTACGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATAT:1 - chr3L 16731387 3' - rover 7020 2 67.81 ATAAACTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAAGTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACAAAAAAAGACAGCAACTGTGGAGTTGAC:2 + chr3L 13922609 3' - hopper 172 1 65.75 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGATTATTTTGCTCACGCATCTGAACGAGAAATTAGACATGGTCAAGGCATTTGTGAATAGAC:1 - chr3R 7420166 3' + 1360 3365 1 67.81 ATGCCTCGCTCAAGCGCCATTAAAAGTCGGCGTGTTGAGGACTGCCTAAGGGAAAAATCAAAAACTAATAAAAGCCCAAGTGAATTTCAAACTGTTTTTATGGGCGAACATGTTAACCGCAGGTTAGTATTAGTTTTTGTAACAAT:1 + chr3L 3616423 3' + invader1 3946 2 39.73 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCC:1 - chr2R 22034627 3' + copia 229 1 64.18 GGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTCATACGACTTTTGCAATATAAAGGTTGCATATTTTATTTATTTTATAAATATTACCTTTGATCATTGTACGTTTAGATTGTTTTTATTAAATATATTTTTAGAACGT:1 + chr2R 18565082 3' + 1360 498 1 64.38 GAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAG:1 + chr2R 4545156 3' + invader1 3543 1 50.81 GTTAATTTTGTCCCTTATAAAATGATATTTGACATTAATGTGTTTTGTACGCTTGTGATTAATTGGATTCTTGGCAAAGGCGAAATGGAGATGAAAGGAAGGGGAGAGCTGGTGGTCAGACGGTAGCTGCTAATTTGGCATCCTCG:1 - chr3R 8861205 3' + frogger 354 1 52.74 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATT:1 + chrX 21224608 3' + roo 8979 2 79.45 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTAAGTTGGTGGGTTAT:1 - chr3R 12115212 3' + 1360 3380 2 76.03 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTAAATATATAAAAATATGGTATATAAAGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTTTCATTTTTATAAATAACATTTTCCGATGATGCAGAGCTTGCGCGAACAACATC:1 + chr2L 19675106 3' - 297 20 2 60.27 CTTATGNATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCCCCCTAATTAACCAATTTTGCAGGCTTTGTTAGAAGGGAGAAGTTCACACGTTCCACCGCTGCTTGTGTCCT:1 + chr3L 17156499 3' + Rt1b 5074 1 50.00 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATTCCTTAACT:1 - chr2L 4003634 3' - mdg1 7049 2 76.71 GTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATAAATCAGACAACCAACAGTCTTACTC:1 - chr3R 2522236 3' - Tc1-2 65 1 67.81 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGT:1 + chr2L 17809267 3' - jockey 64 1 55.94 TTTGTTTTTTTTTTCTTGTTCTTTTTTTTTTATTTTCTGTTTTCCAATTGCCTGCTGCTGTTGGTCAGGGAACATGTGCACAATCCTTGAGCAAATAAAACTCAATAAAACCCAACTGTC:1 - chr3L 13679520 3' - Doc2-element 221 1 62.50 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGTGGCTGCGGCCAAAGATTACTT:1 + chr3R 11810766 3' + roo 9035 1 48.06 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCGAATCTA:1 - chr3L 11326662 3' + pogo 2054 1 55.71 GGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTC:1 - chr2R 5484776 3' - mdg1 7129 2 78.77 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCG:1 + chr3L 21763752 3' - jockey 97 1 76.71 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTATATTCGCTGACTTGTTATTGGCAAAGTGATAAATTGTTTAGTTAAGGCTATT:1 + chr2L 107049 3' - Tirant 8122 2 33.09 GCGACTCCCACCAGATGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCACAATCCACTCAAGAGAGTGCCTATATAAAATCAGAAGGAAAAGACGAAATTAAT:1 + chr3L 24162768 3' + Quasimodo 329 2 74.66 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAA:1 + chr2L 12250989 3' - 412 7118 2 62.33 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTG:1 - chr3L 11913176 3' - BS 5041 1 54.48 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGA:1 + chr3R 19992757 3' + hopper 1377 1 60.27 AAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGAAGGGCTACATACATACATACATACAGAAAGTAACGAGACTACAGTTAGAATGCAGCGTAGAAGCAGAGAACTGGGAAGTGCTGTGAG:1 - chr3L 27390773 3' + Idefix 287 2 57.53 ATATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAGACAAACAGAACGGCACACGCCAGCTGAGAAAGAGATTGACCGATAA:1 - chr3L 2787223 3' + Idefix 334 2 62.03 GTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTAAAGAGCCCAGAAACGAGGAAATAAATAAA:1 + chr3L 24132057 3' - F-element 187 1 80.14 TATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGG:1 - chr3L 25482907 3' - accord 6925 2 73.43 TGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGTAATAGTATAA:1 + chr2R 5303171 3' + FB 226 1 62.96 TAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGCGATCCCAACAAGTATG:1 + chr3R 17615210 3' + mdg1 33 2 68.46 ATTAATTCATATAATAAATTTAAGCTGAATTTTTCTTATGTATCTTTTTAATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACACACCCTACACACACACACAAACACACACCGCTGCAAACACAGATGCGAAAGGGAA:1 - chr3L 17680498 3' - transib3 2667 1 41.78 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTGTCTTCATCAATTTGAAGAATTTAAACATT:1 - chr3L 15103829 3' + Transpac 5191 2 65.31 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGAC:1 + chr3L 21327155 3' - copia 52 2 66.10 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACC:3 - chr3R 31886819 3' - hopper 41 1 58.90 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGTTAATAGGTGCTCAGAGCTGTTAGCTTTAAGATAGCTATGAAGCAAAGTCA:1 - chr3R 25433240 3' + transib2 2806 1 71.92 GGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAA:1 + chr2L 9010147 3' - G2 2744 1 62.33 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAACAGACAACCTGGTCAGACAG:1 + chr2R 16929865 3' + jockey 4967 1 63.70 AAAGAGCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATACCAGCATTTTTTTTGGGTTTCCGGGCTGCAATTATTTCCAGCTGCTTCCCTTTAATTGCCCACCATTCGATCATCGCAGTGCAAAAACTAACGATA:1 - chr2R 16754375 3' - baggins 5362 1 56.06 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGCGGCGAAAAGCCAGAAACAG:1 + chr2R 16929848 3' + jockey 4950 1 52.05 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGT:1 - chr2L 13556348 3' + transib2 2754 1 66.44 AACTAACAATTATTGACTATAGTAATAATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACTTACACGTATCTCTTGAACCCCTGACTCTCCGAACTCCCAACCT:1 - chrX 6122549 3' + Doc 123 1 69.86 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGACTATTAAGCGTACTACACTTACGATTTGACAAACGTATGTAAGCAAATGTA:1 + chr2R 15326491 3' + copia 253 1 55.65 TAATCAGCTAGTGTGAATTCGAACGCAAATTTCATCATTTTTTTTTTGAGATATCCTCAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAGAAATTTATAAATTGTTCAAAGCGTGGGCATCATGTCCATCGATCTTCCTCGAAGGTAGCTAAA:1 + chr3L 20033484 3' - INE-1 532 1 54.11 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACCTTCAGCTCGAACTTCTGTGGATTGAAACAATTTTCGAGGATGGAGGGGGGTTAAATCAGTGCC:1 - chrX 12528138 3' - jockey 4858 1 54.93 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGTTATAACAACGG:1 + chr2R 6847859 3' - Doc 37 1 59.85 TTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACAAAAAAAACCAATCGTTTCCCCTGTGAAAACAAAACGCTCACCAGCTAAAACCATTGAATCTTCAATAAAATCAAGCTCATCTCCTGTGAAGCCTACGGAAT:1 + chr3L 21431397 3' + Porto1 4314 1 67.12 AACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAGGGACCTAAAACACGACAACAGCTTATGACTGTAATAGTCGAAGAGTGTGAAACATGTAGAAGAATATATTTTTATTATATATATTTATATTTTTGAT:1 + chr2R 13979972 3' + S-element 1241 1 69.18 AAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAATAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTATTCT:1 - chr2L 4025371 3' - copia 5086 2 58.90 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCGATGATAGGAAAGTGATTTT:1 - chr3L 15913806 3' - jockey 4778 1 71.23 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTT:1 + chr2R 11159368 3' + roo 400 1 72.07 AAATGTTTTTTTTTTTAAATTGGGTTTTATTTTGTTGAAAGTTTTTGCCTTAAATTAACTAAATTCTTAGAGGGTTTCGGTGTGTGGGCATCGCTGATGTTCGTTTTTTTTTATCAATATATTGTATTGAACCCTAAAGAAGATCG:1 + chr3L 6116792 3' + FB 181 1 76.03 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAA:1 - chr3L 24291983 3' - 1360 73 1 69.86 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATT:1 - chr3R 17673751 3' - FB 67 1 65.07 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCAC:1 - chr2R 8157166 3' + mdg1 7405 2 56.16 GGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGCAGGTCATTCATGGGGCAAGCACTCGCCGCACTGGGGTACATGTTCGCGTTGAAGGGCTC:1 - chr2L 6297646 3' - F-element 257 1 55.28 GTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCC:1 - chr3R 3617307 3' + micropia 5131 2 76.71 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTT:3 - chr3L 5389848 3' + roo 9026 1 54.79 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCG:1 + chr2L 16690711 3' + P-element 2815 1 34.93 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCGAGTCGTAAACATTTTCGCGGATTAATTAGCGAAAAAACCCGATTCAACGCCTCAG:2 - chr3L 18930922 3' + I-element 5340 1 71.23 AGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAA:2 - chr3L 22723832 3' + HMS-Beagle2 7139 2 54.79 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGCCTGAATAATACTGACGGACGTGGAGCGGTTAATTTATTGCGGACTTGGTGCCAACTGAAATCTGTCATTGTCTTCCACTGCCTCTACTTTCCCCCAGTTCAAA:1 + chr3R 25616652 3' - roo 16 2 71.92 ATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGATTGCGTGCAGCGAGAGAAGAGATATTTTTAAAAAAAAACTATTCACAAGAAGTGAGGAAATACAAATTCAAAA:1 - chrX 14722200 3' - diver 172 2 47.86 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAAAAAGCCAATGTTGAAGCTACTTTAATACT:1 + chr2L 3675947 3' + Juan 4164 1 54.11 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTTTATTCAACTACG:1 - chr3R 4805618 3' - 1360 66 1 52.05 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATCTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAACATCGAACTTATTCGATTATATTATG:1 - chr2L 20265927 3' + roo 358 2 50.68 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACTTGACATCGCATTGGC:1 - chr3R 24729524 3' + Juan 4204 1 66.44 ATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATATTTAAAATTACTTTGAGGAGATTTAAAAAAAGAAGAAAAAA:1 - chrX 10319853 3' + mdg1 7070 2 56.84 AAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGGCATATCGAAAGTTTCAACTTAAAAGGGATAAGGTAACTGCATGCATAAGTATCGATTATGGGAGAAAGTATTGAATGGGG:1 - chr3R 24676698 3' - Idefix 7183 2 71.55 ACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCCATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAATAATAACATTCATGGAAACATATCAAATGCAAACTGTAA:1 + chrX 21556393 3' + Copia1_DM 11 1 73.29 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAAGGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTCTGTTT:1 - chr3R 15325077 3' - 297 6612 2 57.50 ACCCCATCGTCACGCTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATGGTAAATAATAACAATTATTAGAACCACTTAAAAGCCACATAAGGTGGTGAAATCTTTGATCCATATTTTTCCAAGGGGATGTCG:1 + chr2R 8066447 3' + Idefix 234 2 64.38 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTT:1 + chr3L 16970435 3' - roo 86 2 81.25 GGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTAAAATCACTTCAAAATTAAATCAT:1 + chr2R 4122894 3' + rover 368 1 77.40 TAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCATTGGATATTCAAATAGTTTTGCGTCAATGTAAGCAACATCGCACCCCAACTGTTTTCACTGATTA:1 - chr3R 14859002 3' - BS 4991 1 74.29 AAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACATGTTATTATCTACATGCAGCATCTGCCCCAAACAGATAATAATTATAATCAGCTTTGGGTGGGCGTTTTCGATTATCTGCTGCCAA:1 - chr3R 7719694 3' + roo 9037 1 61.64 ACCAGACCACAAGGCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCGAGGGATCCCCCTGCCACCACCAATTTGAATATCTGGGACGGACAAAAGATCTTGAAATTTTGACTCGGAGGTTGATACT:1 + chr4 174299 3' + Gypsy6A_LTR 253 1 69.18 GTGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATACGTAAAGAATATACAACATGGCAAAAGAAAGTGTAATGACA:1 + chr2R 13176571 3' + opus 7462 2 64.10 AACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTT:2 - chr2L 10156132 3' + hopper 1331 2 75.34 GGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCCACAATCGGAATTACTTTAGTCCTTGCCGGTTTATTAACTCTGAACTGAATGTCCTTCAGGGCCTATTTGGGCCTAAT:1 + chr2L 8977520 3' + Gypsy12A_LTR 2006 1 59.84 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAA:5 - chr2L 17005678 3' + Stalker2 367 2 53.42 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTT:1 - chr3L 7889546 3' - roo 8712 2 57.93 ATGCATAAACACACACACATCATTGCTATCGTGTGTAAACAGTTTGGTTACCGGTGCAAATACAGTGCTTGTAAAACTGTTTACCGGATCCTTCGTTTGACTTGGCTCACGATTCCCTGGAGGAACTGTATCTCAG:1 - chr3L 25412365 3' + G3 42 1 50.00 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGC:1 + chr3R 25709835 3' - hopper 24 1 63.51 CTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAATAAATGTATCTTACATGTAATATATAAGATATAAAGTGATTTCACAAATTTAGGTTT:1 - chr2L 14523127 3' + HMS-Beagle2 252 2 59.31 GCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGTACCCAAACTAAAAATTTTAATTTCTATACCTTTACTTCTTTTGATACCCGAA:1 + chr3R 24231631 3' - jockey 4545 1 63.70 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTGTAAGTATTT:1 + chr2L 21328283 3' - 297 35 2 62.07 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTAT:1 - chr3R 27160079 3' + 412 417 2 71.23 CTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCATCTGGCAGAATAA:1 + chr2L 22224618 3' + Rt1c 5412 1 60.96 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTAC:1 - chr2R 16510126 3' - F-element 99 1 73.97 GTGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGTATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATCTTTC:1 + chr3L 21380647 3' - I-element 37 1 55.48 TAATAATAAAAAAAAATAAAATAATTTTTAAAATAAATAGAAAAGCTTTTACATTTCCAAATGTCAACACATATGGAATTACCTTTGAAACGATGAGAAATTTTGTGCAAAATATATACATAGATTTTTTTAATAATTCCATCTGG:1 + chr3L 17652980 3' + Rt1a 5074 2 82.88 GGGAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGTGAG:1 - chr2R 20802527 3' - mdg3 5261 1 77.61 ACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTT:1 - chr3R 19450006 3' + roo 8626 1 56.85 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAA:1 - chr3L 18046610 3' - roo 8733 2 67.12 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCGTTTGTTT:1 + chrX 18336667 3' - mdg3 75 2 66.44 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGGTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAA:1 + chr3L 18505743 3' - I-element 60 1 59.59 TACATACATATCACATACATATATGTTCACAAAGTTCTTATTTAAACAAACAAGCTAAGCAACA:1 - chr3R 5402531 3' - Dm88 9 2 84.38 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCCAAGTAT:1 - chr2L 4063811 3' + roo 9036 1 59.31 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGTACCAACCTGGTTGGCCCCCCTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTTACAAATTGATG:1 + chr3L 17940192 3' + 1360 3369 1 58.82 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAACTAATCGTATTTATTTTTTAACTGCACAATAGCTACACATAACAATGACCGCAA:1 + chr3R 27986472 3' - roo 35 2 58.90 GCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAATCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTT:1 + chr3R 15790091 3' - flea 4764 1 58.90 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAATTTTTTT:1 - chr2R 5941303 3' + copia 227 1 63.83 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGC:1 + chrX 1341708 3' - 412 86 2 75.34 AAAATTAAGGGTTCTTCGATTAATTAAACGGAATTTTTTTATGAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAAGAAATTAAAAATATTAAATATACAAGCTGGTCTCTTACAATGACTAACACTCGCCACTAA:1 - chr2L 20103197 3' - S-element 1654 1 76.71 GTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCGTTCAGTCACACACACACACACGC:1 - chr2R 20442667 3' + R1A1-element 5269 1 65.45 GGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTACTTTCAACTTTTAAACCTACTCGCACTCGTGTGGTTTAACACCAGAATGGAATTTCATGTGCTCGGGGAGACGCGCCTGAGTCGG:1 + chr3R 20030292 3' - I-element 162 1 59.59 AAATCGACTCGGCTATTGATCCTGAATACAAGAATACTTTATATGGTCGGACGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTAGAACGAATCTAGTATTTACGAAATGTATTAATTCAAAAATCGGCCAACAATGGTCAATATATCTTC:1 + chrX 22519290 3' - INE-1 97 1 52.74 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGAATGTGTGCGAGTGTGGGCACTCAAGCAACAAAAGGTAGCACAGC:1 + chr2L 2527774 3' + hopper 1402 1 72.60 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATATTTT:1 + chr2R 330265 3' - HMS-Beagle2 6895 2 76.03 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGAACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTAC:1 - chr2R 3338777 3' - Juan 53 1 52.74 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACC:1 + chr2R 11164522 3' - roo 44 2 55.48 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACA:1 + chr3L 18126009 3' - Ivk 46 1 47.26 AAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAAAAAAACGGAAGG:1 - chr3L 18255252 3' + Doc2-element 251 1 82.86 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGTGGCTGCCATGTATAA:1 + chr3L 18126031 3' - Ivk 24 1 62.33 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGGTATATAAATCTTGGGAACTGTATATATTAGATAACCCAAAGACAAAGGAAAACCA:1 - chr2L 12818235 3' + hobo 2877 1 57.53 CACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTACAAAACAAGGCAAACAACAAACAGAAGTCATTCGTAAGCTCAGACGAAAAAATATTAA:1 - chr3L 18258517 3' - P-element 264 1 39.31 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTATATGCATTTGGCAACAATTT:1 + chr2L 15188423 3' - 297 6632 2 83.00 TCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTTTAAG:1 - chr2R 330092 3' + HMS-Beagle2 295 2 69.35 AATATATTATTAAAAAAAAAATTAAAATTTAATGATATATAGTATAGTGTTTCTTAAATTATAAATCATATATTTTAGTACCGTTAAATGTTACAACTTTAATTACATGTCCAATAACACAGCCCCCTATACATTATAGCGCTTG:1 + chr3R 12778562 3' - hopper 160 1 75.86 CATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATATTTTATATATATATAAGTAATTAAAGTTGTGGGTGGCAGGGGGGAGTGGGAAGGGAGAATACTTTATAGAGGAGACAGCGGGGTGCCGTCGTTTGGTTTCGTTCAGTCTGCGGCA:1 - chr3R 22196606 3' - Q-element 568 2 52.05 CCAGGTTCTTGGGTTCCTTATCGCACCTTGCTTGCCTCCGGTTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGTCTTCGCCCTTTCCTCGGTATCCTCCAGGTCCAACATGCCCATCGAA:1 + chr2R 20252614 3' + G3 437 1 57.14 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAA:2 - chrX 4341285 3' + roo 8986 2 76.03 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCCTTATTGTTTAACGTT:1 - chr2L 18212088 3' - Quasimodo 16 2 68.99 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAGCATGCTAATGACA:1 + chr3R 7719853 3' - roo 8693 2 65.75 TTTTTTTTTTATTTTTATTATTTTATTTTTGCTCTTCTTCGGCCAGACTTTATTTTAATGCCCATCTATCTGTTGTCTGTTTTATCTTCTCTCCCTTAACACAATACCCATCAACTGCTAACTGAACTGTGATCCACAACACGAAT:1 + chr2R 19175836 3' - Doc 4691 4 54.11 AATAAACTGAGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAATGG:2 + chr3R 24506365 3' - INE-1 474 1 73.29 TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACCTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTTGCCTGTTCTC:1 - chr2L 18212104 3' - Quasimodo 5 2 69.61 AAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGC:1 - chr3R 19450209 3' - roo 397 1 56.16 CTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAAAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3L 22511717 3' - INE-1 566 1 70.55 ATAAAAAAAAATGTAAAAACATAATTCCAATGTTGTTTGTAGCAGTTCATTTGGTATACGTATTACGCTTTTTTTTACCTTTTTAACTTGATTAAGTAATTGATTGATTGTTAAGTAAATTAGTAGATAGATTGCGATGGATTTTT:2 + chrX 17972882 3' + looper1 1809 1 50.68 AGAGCAAAATCAAAATTTTGGTAAAAAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAATTGCGTGGTTTTAAAAAATATCAAATTGGATTAAAAATAAAAAATAAAACTGAAAAACAACTGAATGAACAAAATAAAAATTTTATAAA:1 - chr3R 26023164 3' + HMS-Beagle 324 1 65.07 ATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCCTATGATATGGGTCTATGCT:1 - chrX 21993550 3' + gtwin 410 2 64.38 CTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGTTTATTATGCATTTGAAGTTTGTGCAACATGGAGT:1 + chr3L 19932782 3' + R1A1-element 282 1 76.03 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAATTCGTGGTGTGGC:1 + chrX 6116374 3' + transib2 2791 1 63.70 CTTAGCCGTAAGTTTGGTAAATAAGTTCTAACAAGTTTGGAGGATAATATAGAAGTTTACTATAAGAATGATATTCCGCCTAATCTGGATAAGAGGGCTCTATCATAAGTTTCAATGAAAATCGTACCATTCGGCGCTTAATCATT:1 + chr3R 5442869 3' + G4 3644 1 58.90 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTTTGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACACGTACACCAGGCGCAAAAAGCGATACCTGAAGTGG:1 + chr3L 18403074 3' + P-element 2850 1 52.63 ACTATGGGACAATGCATGCAACAGCAACATCAATGAAATAATACACAAATTGTAATTATCTCAAAACGTCCACACGTGAAAATGATTTGCAACTAAGATGAAAATCTAATAAAATCAATGTAAATTTTTAACGCAACAAAAGGAAA:1 + chr2L 1653177 3' + Doc4-element 2616 1 80.82 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTATTCTTTTTGCATTGCATACTTTTA:1 - chrX 14771711 3' - BS 33 1 48.84 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGTTTTGAAGGCCGTGAAGCATTAAGCGATTTTTTTTGTTTGTATTATTATTATTATTTGTTCGTATTGGTTATCCGTAAATCAAGGAACAAACAAAGAAAAG:1 - chrX 13775263 3' - Tirant 35 2 69.18 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGT:3 + chr2R 13766292 3' - roo 8735 2 69.18 CAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAAATAAAATGGGTAAAATTTTACTCATAGTGCACTGTGGCCACGCCCCTCATTTTACCAACAAAACGACCAAAACGGGAACGGCAACACTTTTAAACAATTTTTAAATTTT:1 + chrX 21452468 3' + transib4 2597 1 43.84 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAACGCCAGCTGACAAACT:1 - chrX 585660 3' + Tirant 8474 2 64.77 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGG:2 + chrX 21100270 3' - mdg1 7086 2 53.42 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTC:1 + chrX 4808596 3' - mdg3 5330 2 68.49 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTGTAT:1 - chr3L 22890350 3' - FB 16 1 61.90 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGTTCCAC:1 + chr2R 8157310 3' - mdg1 25 2 68.49 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTGTTCATTTAAAATTTTCTCGTTTATTTTTGAATATCT:4 + chrX 17343461 3' + I-element 5280 1 71.92 TGTTGAAGGTTTTCAATTGGCACGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGTTAATAATAATGGTCATCTAGGTCCCAGTTGCAAACAAACGAACTTTAAATTGTAAGGCGG:1 + chr2L 4114262 3' + invader2 4646 1 55.63 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATG:1 + chr3R 9039045 3' + Juan 4181 1 61.64 TGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCA:1 - chr3L 24934309 3' - HMS-Beagle2 6956 2 69.86 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAA:1 + chr2L 10156238 3' - hopper 25 1 63.77 ATATAGNTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTA:1 + chr3R 7317660 3' + I-element 5286 1 63.70 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACAA:1 - chr3L 24228591 3' + copia 229 1 63.91 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCAT:1 - chr2L 4123864 3' - transib2 67 1 67.14 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGATATAATGGGGAAATCAAA:1 - chr2R 8099149 3' - jockey 4824 1 64.29 AAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTC:1 - 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copia 52 2 56.39 ACTATAGTCGAGTTCCCCGACTCAGATACCCATTTCCAGTCGAAATACTTGCGAAAACAGATACTATTCTATTCTCTGAAAATACGTTTATTATAACAAAATTTCTTCTATATGTAAATTTTGCTTACTCTCCGGATTAGAATG:1 + chr4 964166 3' - INE-1 567 1 76.39 CACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAA:1 + chr2R 330224 3' - HMS-Beagle2 47 2 53.57 GCTTGCTCACCGGGAGTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGGGAGCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACCCTTCCCATCGAATAACCGAAGCCTTAAGAAGCAACCGTAGACCCTGCGATGTGCATTTAATTTAATTAAGCACGCGGG:1 + chr3L 25965291 3' - Rt1b 4993 1 57.24 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTC:3 + chr3L 17568108 3' - S-element 74 1 69.18 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCC:1 - chr3L 7889578 3' - roo 81 2 80.14 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAAT:1 + chr2R 7244899 3' + diver 150 2 66.44 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTCA:1 + chr2L 4063943 3' - roo 8718 2 55.48 CTTACCAAACCGTATGTTTGAAGTAAGTAAAAAAAAAGGGGGTCCATACCAAACACATTAGACTCATATGTAGCTCCAATTTTAAATCTTTTTCCAAA:1 - chr2L 22750735 3' + Tc3 1387 1 48.98 AAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGGTTGGCTCATTCAACTTAGCCATCGCGTT:1 - chr3R 23911308 3' - 3S18 30 2 63.70 ATTATATTTTATTATATTGCTAAACTTATTTATAAATTTGAAAAGTATTGTATAGCACTATAACTATTTCAACTATTCTCTGTTAAGAATTCGAATTAGAGCGTTCGACCAATTTTTACAACACTCAATTCCTGCGCCTGGAAGCA:3 - chr2L 5307345 3' + 1360 3104 1 50.00 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAGTTTTTATTTCCAACACTTATATTTCCATTCACAATACGATTCCTGAAATCGA:1 + chr2L 13158734 3' - roo 8730 2 64.14 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAA:2 - chrX 19539458 3' - pogo 38 1 46.58 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAATCCAGAAGCGTAAACAGATTGATTGGACGGGTGATCAGGCGGAAAACCCTCCGGACCACACACTT:1 + chr3L 19455065 3' + mdg1 399 2 68.49 CCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAAATAATTAGCATTTAATGAAATCATTTTTGTTTTCTAAAGCAAAAACAACTGATCATCTTGTTATGGTGGTTGCTGTAGTCTCTATATATTTGCCCCGAG:1 - 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roo 8925 2 56.55 GTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATG:1 - chr3R 19450070 3' - roo 8660 1 52.74 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAG:1 + chr3R 15942815 3' + hopper 1391 1 64.23 GGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGC:1 + chr2L 20640275 3' + Stalker 7044 4 72.66 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAG:2 + chrX 20999615 3' - BS 33 1 56.85 TTTCAATTTAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGAAAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGAC:1 + chr2R 5627645 3' + TLD2_LTR 97 1 70.53 TAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCATTTTGGGTGGTGTTGTTCAATCTGAGGGTGGTTAACT:1 + chrX 13677188 3' - I-element 4967 1 74.11 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATT:1 + chr2L 71248 3' - 412 7137 2 73.97 GAGTAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATG:1 + chrX 1058847 3' + Stalker 150 4 93.91 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTT:1 + chrX 7795602 3' + roo 336 2 67.12 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATT:1 - chr2R 4785218 3' - Juan 4070 1 53.42 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTAC:1 + chr3L 19274894 3' + transib2 2786 1 52.76 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGGGGC:1 + chr2L 3234091 3' + roo 387 2 71.33 CAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAAAGGAAGGGCTAA:1 - chrX 6156710 3' + G2 3077 7 59.65 AGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGGAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 46 2 67.86 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAG:1 + chrX 18336708 3' - mdg3 30 2 64.79 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGCATTAAT:1 + chr3R 26178506 3' - 412 7082 2 63.01 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCG:1 + chrX 8360639 3' + roo 358 2 52.74 ACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAATTCAACTACTTAGCCACCAAAACTTAAACTTGAGACGTGTACCGATTGCCCCACATCCTTCGGTCCTAAAACCCTCGAAGGCTCCTTCTGAAATATTCATG:1 + chr2L 799638 3' + Porto1 4416 1 62.33 ATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATTTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGGATGTATCGCGGACTCGAAAAATCCGGCTAAATTGTGATTGCATTTGGGGTCATAAATTTAATGGTAATAAATATAAAATATCTAGGATTTGC:1 - chr3R 12534095 3' - Max-element 376 1 56.16 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTCTTTGCATTCGAGCCGAAGTTT:1 - chr3L 17940087 3' - 1360 64 1 64.14 GGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTT:1 - chr3R 10270603 3' - Juan 4118 1 78.62 ATGAACGTCGGGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCATACCCATGCAGGCCAAGTATCTCAGTGGAAGATGCCGAGGGGGTAGAGG:1 + chr3R 901847 3' + INE-1 139 1 65.35 TATGGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATGTTGATTACAGTAAATTGACAATTTGTTGTTGTTGCTATCTCGCTTTTTGGGTTTATGTTTTTGCACGTGTCTGATTGGAATCCTGTACCGGCTCCTTTTAGAC:2 + chrX 13995511 3' + BS 5076 1 75.34 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTT:1 - chr3L 12004225 3' + P-element 2842 1 56.16 TGTAAAGCTTGCTACGGTATTTCAAGAATGTTTATGATGTATCTACTTAGTACATATATATTATATTGATTGCGTAGGAAAATAATGTTTAAGCTTTTCTCGTGTACTGTTATTTCACCGTTGTGCCCATATCAAAATCGTAATCC:1 + chr2L 14837045 3' - F-element 4445 1 71.23 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTG:1 + chrX 11661508 3' - pogo 47 1 53.42 ATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACT:1 - chrX 2479462 3' + mdg3 5463 2 54.79 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAA:2 + chr3R 19032708 3' + roo 357 2 55.48 ATATAAATATATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGAAACTGAAACAGTTAGAGAGTTGT:1 + chrX 3765098 3' + Stalker4 7047 4 73.64 TATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACACCAAGCGCTCTCCGACACACAAATGGTAACCATACACAGTAGTTTAACATGTCAGAAAAAAAATTTCCTCTTTTAATTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 19162113 3' - accord2 7523 1 64.29 ATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGGGCTTAGAGCGGGCATGGGATACTTATAGAAATTGGCAAGACAGTTAATAAAATCAAAAAAATTCAAAACATTTTT:1 - chr3L 23118906 3' + INE-1 504 1 75.70 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAAT:3 + chrX 21100294 3' - mdg1 7062 2 69.86 CAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTGCTGACTGACGGACAGCGGCAAATACAATGAGCATTGCGGAATTCCAGCGATCAAATTATCAAGAAGTTGGCCAGTTAACTACCT:1 - chr2L 11272068 3' - X-element 4592 1 62.33 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATATACAATACAAAATATATATATAATATATATACAAT:1 + chr3R 21624141 3' + flea 4949 1 70.55 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCA:1 + chr2L 16539738 3' - Juan 4095 1 58.22 ATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGGTACGCAGAATGAGCCTCGCTTGGTTTGACTTCTCTTTGTCTCGGCTATTTTGGATGGGCG:1 - chr3R 16106250 3' + Tirant 474 1 58.22 TCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGTGAAAGTCGGCTTTGGAAAAATTGTAACCCCTCAGCAAGAAACGCCCGGCGCCAACCAACCAA:1 - chrX 10134861 3' + Quasimodo 6939 2 69.15 TTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGAC:1 + chr3R 27406045 3' + diver 143 2 71.23 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGGCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAG:1 - chr2L 4754877 3' - Stalker4 59 4 56.85 TCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAGCATCACCCCCCTAAGCCGCAGAAATTTGGATTTGGATTCGGAAGCAGAGACCGGAGACCAGAATCCGAAC:1 + chr3R 7666085 3' - I-element 383 1 65.60 ATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTGGCATTTATTAAAATGTTATAAAA:3 - chr3R 7942729 3' - Tc1-2 1535 1 63.01 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATAGGGG:1 - chrX 21216712 3' + roo 9032 1 52.31 ACATTGTAAATAAATATATCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTACTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATA:1 + chr3R 13187478 3' + I-element 5273 1 76.74 CTTTGCGTTTATTTTTAAATATGGATACCTTTTCATAACAAAAATCAAACCAGCTCGGAAA:1 - chr2L 10397442 3' + transib4 250 1 85.25 GTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTTCGCTCCGTACTTGCCTAGCCTTTTAAATTGCAATTGTTAGACCTAACAAAAA:1 - chr3R 30984255 3' - F-element 4593 1 60.74 TGTATTTTCTGCCTTTCAATGCAAAATTATAGGGCTTTTTGTTATCTATTATGCATTTTTTTATTTATAAAAAGAATAACAAAACTATTAGCAATGAACGATAAAAACAACTGAATCCAAGTTTATATTTTATATATTTTTATTTA:2 + chr3L 25763070 3' + S2 39 1 64.38 GGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGCCAGTGTAAGTTGTTCAACTTCTCCTTCTTTTTGATTCTTTTTGTATCTGTTTTTTTTTGTTTTATATGTGCTGCACATGATTCTTGTTGGCCGG:1 + chr2L 9180185 3' - F-element 4249 1 56.16 TTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAAAAAAA:1 - chr3R 29690705 3' - I-element 5252 1 56.20 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTATGCCATT:1 - chrX 14450384 3' + hopper2 1558 1 52.05 GCTCAACTGAATAGGATTTACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATAGGCCATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAAAGCAGGCGTTATGGAAATATGTGTAATTTTTGCCTAAATGAGAAAGCGC:1 - chr3L 7177402 3' - Tc3 1715 1 66.44 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTCGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACTTATATACAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTTTTCATTT:1 - chr2R 15375358 3' - 1360 51 1 54.29 ATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATATAATCCTTTTTAAGTATCTTCCACAAGAAAATTCACGTGTTACACTTTTCCAAGAAAGTAGTAAAATATTCTTCTAGCGATTACTCACAATCAGCCTGATGATGACCTCGATGAAGAACC:1 + chr2L 9380825 3' + S-element 1548 2 73.97 ACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATA:1 + chrX 20999566 3' - BS 82 1 77.40 CGATTCATTTACATAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTTTGGCTTTT:1 - chr3R 19450093 3' - roo 8718 2 80.85 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTT:1 - chr2L 4003667 3' - mdg1 44 2 55.48 TACTATGGAAAATTTGACCACTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACTCAATAACTCCAACTCTTTTGGCATTGCCTTACACTAGCCCATATCTTTAATGATATATAATATACATTTTGAAGTTTGCAGATAGTCATTCAATTAACTTT:1 + chr2R 16581816 3' + Transib-N1_DM 1 1 80.82 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTA:1 + chr3R 21630340 3' + I-element 5285 1 67.59 GATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCAGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTGAAATAGTAGCTGTAGCTTA:1 - chr3R 10735999 3' + McClintock 6398 2 63.70 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTC:1 + chr2R 20349051 3' + transib2 2776 1 57.81 GTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAAACCAAACAACATAATATACTCAAAATGCCAAATATCTTGTGTTCGTCCACACATTAC:1 - chr3R 8835781 3' + mdg1 7317 2 60.96 TATAATAATAATAATAAGAACATAGAGAGCACAATTTTGACTTGGCTGAAAACCCGCCTGCATCTGTTCCCCTTTCTTCCCACGATTGGGTTAT:1 + chr3L 12929317 3' + mdg1 7054 2 75.53 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTG:1 - chrX 8360556 3' - roo 8754 2 80.82 TTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGC:1 + chr3R 24381381 3' + Juan 4165 1 60.83 AAATATTTTATATATATTATATATTTATATATAATAGTGCTTGAAATATACTTTTAACATTGAATATAAATTCAAAAAAATTCGTAAAGCCTTTATTAAGAACTCAAAGCAACTCCTTACTTCCATCTAAAAGGACAAGAATTACC:1 + chrX 7529660 3' - transib1 1924 1 69.86 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACT:1 - chrX 19266827 3' + roo 361 2 48.63 GCCCGGAGCCACCTCTAGAGCGAAGAAATCGTGTGCAAAACCAATCTATGGCCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGACCGTGATGACCATATAATTCTTATAACTACCGCAAACTATGCAACTGCATGGTACA:1 + chr3L 25983261 3' - 1360 67 1 75.86 ATTTTTCTGGGATATCTATAGATTGGGAAATACATACATACATTGTTTTATTCAACCTTTTAAAAAAGTTCACGAAATTTACCTAAAATCCTGTTTGTATGCCACAAAATAAAGTGTTTCGAACTCGAAATTCTGACGCCAAGAAG:1 + chr3R 12363731 3' - INE-1 501 1 73.29 TGAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTGTAAGATGTGGCGCCAAAAGCACAGTTAGTTACAAGAGAA:1 + chr3R 1972147 3' + FB 759 3 71.23 GTACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGACACAAACAAGCGCG:1 - chr3R 17996116 3' - diver 10 2 77.24 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGATACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAAAATGGTGTGCAAGTTTCCACATTCATAGATACTTTGTTCTTACTTTCTTTCTTTCTATTCATATGAGAAACAGCCATTTCATAGTATC:1 - 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1360 15 1 69.18 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCAATCAATTCGGGGCCGCACTAGAGGCA:1 + chr3L 13581758 3' - jockey 4770 1 72.17 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACA:1 + chr3L 1692145 3' + blood 7359 2 62.86 ACAAGAGAGAATGCTATAGACGAGTTTCCCGAATATCAGTAACCCAGTAACTGACCTAGTGCGAATGCGAACGCGAAATTACAAGTGGAAACCATAAATTAAAGGTTATTAAATATAATATAATATAAGAATATAAAT:1 + chr2R 2044192 3' - INE-1 579 1 82.61 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCC:1 - chr3R 23618107 3' - hopper 36 1 58.99 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGAT:1 - chr3R 23618128 3' + hopper 1352 1 61.38 GTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAAAAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAAACTACAGAAACAAAACCTGAAACATGAAATTCCTGC:1 + chr2L 7354717 3' + F-element 487 1 71.43 ACACACACACACACACGCTGCGCTGCACTCAAAAATCCGAAAGTAAAAACGACAAAAAACAGCCAGCAGCAACAACAAGC:1 - chr3L 5731072 3' + accord 7104 2 61.25 TTTCTATCGATTTGCAAAACAAAATTTTTGCCACTGGCTTTTTCGCTTTCTAATTATGCCATGTAAATGGATAGTTGCTGCCAAACGTCGCCAGGCATTAGTCAACTCGTGCATAACCGACTCGACTTCC:1 - chr3R 27397053 3' + INE-1 311 1 76.15 ATATTTATATATTTATATTTATGAGCAATCTGCCTCTTAAGACTTTATAAAGGACCTGCAAGGGCCGCCCATACCATCAGTCTGTCCG:1 + chr3R 28628449 3' - Stalker4 87 4 60.23 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAA:1 - chr2R 13259279 3' + mdg1 364 2 56.55 ACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACAATCCAAAATGTAACTAAAACCATTGTGAAAACAGATACAAGCCACTTATCCTAACAAACGCCAGGCTACACTGAGAAAATAA:1 + chr3R 14793469 3' + I-element 4946 1 65.07 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATTCAAGTCTCCGTTTGATAGGCCTTTAACGAAGCATGTGATGGAC:1 + chrX 585785 3' - Tirant 10 2 80.00 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAA:1 + chr3R 8890112 3' - FB 66 1 62.33 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCAACGAATTTAATTATTATAAATAAAAAACAATTGGAAAATGATTACATTTTAACAAATTAATAGGGATCGATTTTTACTTAAAAGACGAC:3 - chr2L 21367184 3' - Doc 37 1 58.22 CTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAA:2 - chr3L 22723861 3' + HMS-Beagle2 227 2 74.66 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTAT:1 - chr3R 14980277 3' + roo 9042 1 65.07 AACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGAT:1 - chr3R 11040035 3' + Bari1 1666 1 57.24 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGCTG:1 + chr3L 9907403 3' - BS 5012 1 67.81 CAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAAATTTTGGTGGTTCTTATGGGGATTCCCGTTCATATTTGCTTACCTTAACCTGCGACTCGGACATTCCTAAGGCGTAAGCGAGCTTGGCACGCTCTGGTCCGG:1 + chr3L 14590038 3' + hopper 101 1 67.81 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGAGGCATAATTAATAGTTAAATATTGAATTTATTGCACTTTGAACCGCAATTATAT:1 - chr3R 20441185 3' + I-element 5342 1 73.29 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATA:3 - chr3R 7943756 3' - blood 89 2 76.03 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATG:1 + chr3R 23295591 3' + P-element 2853 1 28.15 TTGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGTAGTCCGATAATTTTGTCGATGAAAGTAGCTCAGCGAAAATTGCGAAAC:1 - chr2R 21160645 3' + Transpac 264 2 52.74 ATACTTTATTCGGCTATTTATTATTTGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACAGCCCGTCTTAATCTAAAAATGGGTTTAATCCTAATATTTTTGTATCAATTAAATTCAATTTTAATTGTAATCCCTGTACAATTGAA:1 + chr2R 4369196 3' + diver2 4858 2 77.40 GGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAAAAAACGATAACTGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGAAAAAGAAATGAAGGAAAACCTAAACTATCGTATAGAT:1 + chr3R 3286202 3' + Gypsy12A_LTR 1959 1 70.18 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTAT:1 - chr3R 17996144 3' - diver 39 2 57.53 GCCAAGGACTTAAGATTGTAAAGATTTATAGGTTTATTTTAATTTGATGTCTTAGTAAGTTTTATCGAAAACGTTAAGTTGGTCACATCTGTTATTGTTTGTAACGTGCATTTTATTTAAAGTATAATTGTCAAATGCGTTTTTGC:1 - chr2R 9759253 3' - NOF 3926 1 43.84 CATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCG:1 + chr3R 21630330 3' + I-element 5274 1 73.29 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACCTTAA:1 + chr2R 9158162 3' - mdg3 45 2 55.48 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTAT:1 - chr2R 13766173 3' + roo 9042 1 64.34 CTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGTACAACTT:1 + chr3L 23839743 3' - 17.6 6959 1 70.55 AGACATCTGCGAAGCTACTAATGCTTTCTGCCTTGGCTGGGTTTAACAAAAAAGTTTCAAGTCCCAGCCAACAATATTCTAACTACCCAGAAGAAGTTCCGTTTTCATTCCTCAATTGCACACGGAGAAAAA:1 - chr2R 19196056 3' + hopper 389 1 63.64 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGGGAGGTTCGTTTCAACCAGCAGCATG:1 + chr2R 5480017 3' - F-element 22 1 75.42 CTTAGATAACAAAATCCTATATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTA:1 + chrX 18396151 3' - roo 8755 2 81.51 CACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTAGTTCAAAATAGATAGATATTCTTTCTAGTTCAAAATAGATAGATACTTGAAAGAAAACAGCGTACCATAAAGGGGAATATGGTACAAA:2 - chrX 22596351 3' + INE-1 541 1 71.23 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGAT:1 - chrX 12986528 3' + roo 9014 2 58.22 AGGAATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGTTTCAATCGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCAATTAGTGTTTGTGGTTTGAACACCGCCACTTCGAGGCGGTAACCATCC:1 + chr4 652394 3' + INE-1 26 1 64.79 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATGTCTTGGCTCTGGCACTT:1 + chrX 21216825 3' - roo 8696 2 57.26 TATTTAGAGTTAATGTGGGACAGCTACGCCTATTAAAAGTGACTGGACGTTATTTAGCGTTAATGGGGGACAGCTACGCCTATTAAATGTGACTGTTTGCGATCGTAAGAAAAAGTCCTTTAGTGCTGCTTAACACTGTAACACT:1 - chr2R 4366720 3' - Doc4-element 2377 1 67.59 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAAATG:1 - chr2L 14874111 3' + copia 248 1 54.11 ATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTACTAAGTGTTTTGACTAATTTTCTGAATTCTTCAATACTTTTAACCATTACTCTTACATGTCCATTACGTTGAGTCTTATAATCAAAAGTTGTTGCACGTCTGACCGTTG:1 - chr3L 14142856 3' - G4 499 1 80.14 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGCTCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAACATGTATAAATATATTTTTTCT:1 + chr3L 14720920 3' - F-element 41 1 53.66 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGT:1 + chr3R 31264123 3' - jockey 4785 1 60.27 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTCTTAACCGTAGTCATAGTCGTACCCGTACTACCCCCCCTTATTGGCC:1 - chr3R 9594976 3' + Tirant 375 2 66.67 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATT:1 - chr2L 18226791 3' + roo 332 2 72.73 ATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACATCCACCAGTTGTTCACTTTCACAATCACTCTGTGGTTTCGGATATGTTGTTGGTTTACAAACAGTTTTTTTTTTCTTTCTTTT:1 + chr3R 17846954 3' + HeT-A 6000 1 47.95 AAGCCTTAGCTAAACACTGTACTTTCGACTGGTTGAATGGAGCTAGCTGGAAAAAAGGCGCAACTTCCGCATAAATATGCATT:1 - chr3R 12728298 3' + Juan 4135 1 77.11 ATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTGTGGTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGT:1 + chr2L 22063436 3' + INE-1 123 1 57.53 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATT:1 + chrX 8092480 3' - pogo 36 1 59.29 ACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGG:1 - chr3R 15072585 3' - pogo 87 1 80.14 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATA:3 + chr2R 8157290 3' - mdg1 7083 2 54.79 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACGAAACTGTGCACCAAGACATCCTACGTCCTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chrX 14317414 3' - FB 56 1 62.22 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTTCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTAACGAAAGAT:1 + chr3R 30946599 3' + Transpac 271 2 57.27 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGATGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAACAATATG:1 + chr3R 11062869 3' + roo 9047 1 63.01 ATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGACATCACTAAGAAACTTATATATATTTAATTAATATTAAT:1 - chr2L 1702692 3' - G2 326 1 72.60 TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCA:2 + chrX 6116338 3' + transib2 2755 1 65.07 GGAATCATTCGATCTGTGGAAATGGATCGGTAGCGGGGAAGGAAACTTCAAGCGAAATACGCAAAGAAAACGGCTAT:1 - chr3R 11764351 3' - transib2 2375 1 84.42 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATTTGCTACTAT:1 - chr3L 15103782 3' + Transpac 271 2 59.59 GAATGATACAATATTGAAATTAAAAATAAACCTTAAAAATATATTATTAAAAAAAAATGGGGAAATTACGAAAACAAAAACGCTTTAAAAACGCAGCCGATACAGAAAGTGCCAGCGTGTGAGTGTGCATATGTGTACGTAGTTGT:1 - chr3L 11092632 3' - hopper 197 1 54.11 TATTTTAAATATTGTTATTAATTGAGGACAATATGGAATTTGTTGTTTACTCTCTTACCATTCTTTTTATGAATAAGCGCTCAGATCAAAAACTAATTTCTAGCATTTGGAATATCCGCTG:1 + chrX 1838671 3' + Gypsy12A_LTR 1810 1 60.33 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAG:1 + chr2L 18347379 3' + transib2 2756 1 63.01 GAGAAAAAAAAAAATGGAAAAATGAAAAAAAAAATAAAAATAAAAGACAGGACGAAAGAAAGCTGGGAAAATAAATAAATAAAGGATGCCAGGAGACAAGAAATGG:1 + chrX 12425294 3' + Doc2-element 228 1 55.66 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGAT:1 - chr2L 12818226 3' + hobo 2889 1 50.35 AATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTAC:1 + chr2R 10418540 3' - 1360 3111 1 75.86 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGAAATAATAAAATTGTTGCATAC:2 - chr2R 18316044 3' - HMS-Beagle2 74 2 66.44 AAAAGTCACTCTATTTACGATAAATAAATTATTTCAAAACTTTCCGGGTGTGACATTGGTTCGGATTTGGTTACATTGTGTTAAGTAAGTATTGTATTGTTGAATACTAATAGACATTGTAATTTGTTTTAATTCTGCTGTGAAG:1 - chr2L 22674520 3' - Gypsy12A_LTR 183 1 66.90 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTAC:1 - chrX 10319605 3' - mdg1 60 2 59.59 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAA:1 + chr2R 23780626 3' - Ivk 48 1 51.37 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAATATCTACTCTTAGTCTTTATTAATTT:2 - chr2L 18549780 3' - roo 14 2 73.29 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCT:1 + chr3L 18931043 3' - I-element 74 1 66.90 ACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGAACTTGAATGGGTATTTATGTGGGGATTGGGTTCGCTTTTAGCCGGGCAAAGGGAAACATGGGTAAAGCAGGTGATTAGAAAGGGAATA:1 - chr3L 5423533 3' + invader4 2649 1 63.01 ACATATTGTTATTAATTATTATTTATGTATTTCGAGTGAAGAATTCACGGTCGCATCGTCGGTAGACGTGAAGTGAAGTAGATGATGCTTAACATCCAGAAACGCATAAATAGATAAAGATTGACGTGCATTT:1 + chr2R 24290494 3' + Gypsy12A_LTR 1816 3 75.19 AAGAGAGCCTGGAGCCACCGCTAAAGCCAAGGCGAAAAGCGAACGGCGAACGGTAACGGTGCGGGCTTGGACGAGCAAAAAGCGAATTTCCGTGTCGTCTGTCAGCGGATTTGATGCGCCCTCTCAGCGATTCGCGAATCC:1 - chr2L 11459449 3' - 1360 73 1 58.16 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAATGGTGTGAAATTAACATTGGGATTTGAATG:1 + chr2L 14671913 3' - FB 65 1 67.12 GTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAACCACAACCTCGACTACACAGCCACCTTTTACAGATAACCAATTAAAGCGATTGAGGGCTTTAAGGAACAGGGGAAAGAATTCCAGG:1 - chr2L 7251878 3' - copia 207 2 65.75 GTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTATAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCAAGTTGCCACGCCCACTTTAACGCCAACAAAACTTTGGGCGGCACCCATAGCCTCGGGTTGATCTGGAACTTGAGCCTCTGCTATGCTCTAA:1 + chr3L 98127 3' + INE-1 145 1 60.27 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGGTTATTATTTATGCCATTCATGCGG:1 - chrX 14450377 3' - hopper 25 1 59.38 ATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGGACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAAAAAAAGGTGTAGAGATTTATTTCACGTT:1 - chr3R 29690682 3' - I-element 5223 1 64.12 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCA:1 + chr2R 9871535 3' - roo 92 2 82.19 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACAAACTAT:1 - chr3L 12004212 3' + P-element 2855 1 65.07 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACT:1 + chr2R 17926381 3' - opus 162 4 72.57 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTTCTGCTCAATTGTCATTA:1 - chr3R 6419791 3' + Tabor 476 2 75.86 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATT:1 + chr2L 6654756 3' + diver 171 2 52.74 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTGATCTGCGATCGCGATGGCC:1 - chr3R 24368979 3' + roo 394 1 69.18 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAAT:1 - chr2L 4003671 3' - mdg1 7086 2 52.74 AAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACAT:2 - chr3L 23249407 3' - rover 7033 2 70.55 TTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATAAATCGTATGATG:1 - chr2L 13556298 3' + transib2 2804 1 70.55 ACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACT:1 - chr2R 12185330 3' + accord 392 2 66.44 AGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAGCAGTGCTATTTATTTGATAGCTTTGAGCATTATTAAACGGTTTGGATAACACACACAATTTAGAAAAATATT:1 - chr3L 9341819 3' + Tc1 1369 1 57.53 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGT:1 + chrX 10319724 3' + mdg1 7415 2 54.79 GAACAATAGCCGAGTCGATCTGGCCACGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTGTCGATCATATAACGATAGGGCACGGCTTAGGACTTGTCTTAGCCGACTAGAGTTTTTGT:1 - chr2R 5067506 3' + INE-1 98 1 55.22 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCT:1 + chr3L 5881695 3' + pogo 2056 1 54.79 TAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCG:2 - chr3R 9557501 3' - G2 3014 1 57.53 CTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGG:2 - chr3L 21996184 3' - Transpac 87 2 73.29 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAATA:1 - chr3R 15790829 3' - roo 8707 2 49.30 AGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTAAAATCAAAAAGGAAATCAAGACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATC:1 + chr3R 19446868 3' + roo 78 2 54.14 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACGATATGTTTGACGATCGAATACCGG:1 + chr2L 17809294 3' - jockey 19 1 72.22 AGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGGTGCGGAGCCAAAAACCGCA:1 + chr3L 11826470 3' + INE-1 144 1 72.66 TTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGG:1 - chr2R 18316010 3' - HMS-Beagle2 6922 2 58.62 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGG:1 - chr3L 18281839 3' - Doc 31 1 61.54 AACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTTTATTCACAGCTTGGTATAGAAGCTAAGAGAGGGTTCATTTTTTTTTTTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAAT:1 + chr3L 9955182 3' + Tc1-2 1270 1 76.12 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGT:1 - chr4 372953 3' + pogo 2040 1 61.64 AATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTACGCCGAGCGATCTGTTTGGCTACTGAAAATCGAGTGAATAACGGTAACTTCAACACATGCAAATGC:1 + chr2R 6482574 3' - gypsy 1 2 79.53 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACAC:1 - chr3R 23295552 3' - P-element 87 1 21.38 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTT:1 - chr2L 12818214 3' + hobo 2924 1 69.17 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCC:1 + chr3R 9298601 3' + hopper 1412 2 79.03 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTA:1 - chr3R 29084863 3' + 412 7508 2 56.16 ATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTAACTACTTATCGATAGCCCTAATTTGGCTCGATCGC:2 - chr2R 5106222 3' - Stalker2 7271 2 71.23 TTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTT:1 - chr3R 4357535 3' + Tc3 1640 1 64.38 ATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTCGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCATGGTACCATAGTTCACGACTGGCTAGATCTGCATTGTTGTGGTCTGAACG:1 + chr2R 3173443 3' - 1360 3267 1 65.07 CGAAGAAATGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTTATTATTCCAAACAATATATCGTTAAAATACGTTATCAATTCACGAATACAATTTTACACCACTCAAATCTTAACAATTTTATTGTGGAGCAGG:1 - chr2L 22168926 3' - 1360 3157 1 64.38 AATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGAACAAGG:2 - chr2R 2591093 3' - roo 67 2 54.11 AATATAATAATAATAATAATAAATAAATAAAAAAATAATGTAGTAAGTGTTCGGGGGAGGTCTGCGATGTGACAATCTCTTGGAGTCGGACCATGTGACACATGTGTGTCCAT:1 + chrX 7167703 3' + mdg1 14 4 69.91 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTT:1 - chrX 2214275 3' - jockey 4844 1 74.66 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAG:1 + chr2R 11159364 3' + roo 9032 1 55.07 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCCAAAAAT:1 - chr2L 13158597 3' + roo 9053 2 71.23 GTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAG:1 - chr3L 25482916 3' - accord 65 2 75.83 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGT:1 - chrX 19266852 3' + roo 8988 2 73.97 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGC:1 + chrX 22840586 3' + copia 208 2 50.34 AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGGGGAGAAAGGGAGCAAAGTTAAACAATTGAAATTGAAATTAGTTGGTAAGCGTAAAATTAGTT:1 + chrX 21224697 3' + roo 405 1 78.08 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCC:1 - chr3L 18505663 3' + I-element 5275 1 71.23 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTT:1 + chr3R 11062824 3' + roo 9002 2 63.01 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTAT:2 + chr3L 20898614 3' + roo 8999 2 69.86 ATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTTGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTAATTTAGCGTTATCCAAACCATATTATTGCAGTCTCAGTCATTTTT:1 - chr3R 8675257 3' - I-element 432 1 53.12 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTTGTCAGAACAGC:1 + chr3L 17183779 3' + diver 178 2 54.79 CACATGAAACCAATTTGCATTTTTAGGCACA:1 + chr3L 3417601 3' + rover 76 2 70.97 TGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGC:1 + chr2R 12779690 3' - I-element 92 1 79.45 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCTATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAAT:1 + chrX 8200332 3' + flea 245 2 75.19 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTAT:1 - chr2L 10156092 3' + hopper 1384 1 57.89 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTG:1 + chr3R 16157385 3' - pogo 65 1 60.96 ATTTTTCAAAACTGTGGGCGTTCGAGTGGGCGTGCCAACAGGGGTCAACAAACTTGCGCTGCTTCTATGTCTCTAGAACCTGTACTTCGAAATGCCTAATAAAGAGTATATCCAATGTTTTCGACAATGGAATGAGATTTTAAAAC:1 + chr2R 11817654 3' - INE-1 253 1 53.42 AAAAAATAGCTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGACTTAAAGTGGCCCACACCCAGAAACG:1 - chr3R 15560670 3' - 297 6903 2 76.27 TTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATATACTTGAAAATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATA:1 - chrX 14768478 3' - mdg1 65 2 63.70 ATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAA:2 + chr3L 11844819 3' - rover 59 2 64.38 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGAA:1 + chr2L 2527731 3' + hopper 1359 1 54.79 ATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCAAGCTTGTGTGAGGAGGAGTACATAGATGGAAAAGGATTAACAAATTTGTTCAAGGCAGATGTTGTGAAAGGGACGTAAAGTAAGA:1 - chr2R 11795568 3' - opus 7438 2 61.38 GTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATAGTTTTTATTTTGAGTCGAATTAAGATCAACGCCGAAATAAAACAAAAACCCTCCACTTGAAACGGTGCTTGATCAAATAAGAGCGTTTTAATTTCCTTGTAGTGCGACAAAGTCCTGG:1 - chr3L 12180375 3' - 297 412 1 58.90 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCA:1 - chr2L 13556335 3' + transib2 2770 1 56.64 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATCACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACA:1 - chr3R 29084868 3' + 412 450 2 51.37 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTGTTTGTTTTGTAAGACCCCTACTAGTGAATTGAAGA:3 - chr3R 26178340 3' + 412 465 2 61.64 GTATACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGGTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAAC:1 - chr2R 1320689 3' + diver2 303 2 57.66 TACCATTCGGCTTTTGCGATTATTCTGAGCATTTTTGGTTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTTCCCAGAGTTCTACAGAAATAATACAATAGAAGACTCCAACTTACACGATGCCT:1 - chr3R 5064440 3' - Porto1 4354 1 69.63 AAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGA:1 + chrX 12082244 3' - Cr1a 243 1 77.40 GGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTTATCATTTATTTGTTTCATAAGGCACTGCGGCATGCAACTAACGCTAAGATAG:1 + chr3R 18045259 3' + 1360 3332 1 71.22 ATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGGAACTTGGTCAGGAAAACATTAAATGCCCTTTTGAGTCAAAATAAAGCATATAAAATTAAAGCAGATGAGAACTAAGTAAATTTGAC:1 - chr3R 29613210 3' + jockey 4855 1 58.22 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTA:1 + chr3L 20711709 3' - jockey 4810 1 51.37 GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATC:2 + chrX 12129391 3' + flea 4937 1 70.55 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGG:1 + chr3R 19407998 3' + diver 6049 2 58.90 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACG:1 + chr3R 31653155 3' + roo 336 2 68.49 ATATATGTATGTATAAGTGAGAATTACATTTAATTTAAGTAATAAAGTTTCAGTTTATGGGCGAGTTCAAAGTAAAAATCCCAGCTATTTGAAGAGCAGCAGGTAAATTAGCCTAATGAAAACTGAATTTTCTCACTTCATCTAGC:1 + chrX 8300564 3' - blood 180 2 39.04 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACGGGGATCATTGCTTATACTCTTGGCTGTCTATTTAAACAAAGCGT:1 + chr3L 24162138 3' + 1360 3335 1 95.28 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAATT:1 - chr3L 7300124 3' - roo 8708 2 54.79 TATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGTTTTAATTGCAACATTACCTACATTTTTTATTTTTCAACAAAATCACAATTTCATTTAAAGTGACAGCGTATCGTCCTCTTAATTTGTTGTCAATATTTTTTAAAGTTTTTT:1 - chr3L 5495547 3' - G4 3422 1 74.31 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAA:1 - chrX 8360518 3' - roo 52 2 54.79 TATATAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACGTATTGTTAGTCTCTAAAGTAAAAGGAAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGGAAAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAAC:1 - chr2L 21760369 3' + Doc3-element 4649 1 66.44 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGA:1 - chr2L 47067 3' - roo 8678 2 71.43 CCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGGGATGCCAGCACTGGGCTCTCAATGTCACTGGGAAAAAAGAACAAAATTCGTACCAAAAAAATGGAAAAAAAAAGGAAAA:1 - chr4 62069 3' + I-element 51 1 53.42 AGACAGAATGCTATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAAATTAATTGTTTAAAAGTGTTCGGAATAAACAATTAATGGGAAAATAATAGTGTAAGTTTTTTATAATTATAATGTTTCGTTGTTTCTAAAC:1 + chrX 22504674 3' - INE-1 576 1 50.68 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAATTTGTATCCAGTTCTTATAATAAGTACCT:1 - chr3R 19032551 3' - roo 8679 2 73.97 GTAACGCGAACATCCACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAGAACTGAAATTGTTCAGCAGAAGGCTAAATATAAACTGGACTGCAGCGAAGTGGCCAGGCTGAATGATATGGTAAGTACCACCTGGCCATGTCAGG:1 - chr3L 11690872 3' + Doc4-element 2711 1 53.62 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTATTTTGTATTTATCAATACATTTAAACCGTTTGTAATGCATTCAATAGCAAA:1 + chr3R 4461161 3' + blood 350 2 70.63 AACATAAACATAGCAACATAGGGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTGGGTTTTGGACTCGGGTGCTCGGGTAATGATGATGACTCAATTTACGTACAATG:1 + chr2R 16817969 3' - 412 7118 2 61.54 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGAAAGAAAATGTAGATTCATACAAAATAATATAATA:1 - chr2L 13844119 3' + Stalker2 7629 2 68.49 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCC:1 - chr3R 28469208 3' - 412 7119 2 63.64 GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACT:1 - chr2R 330122 3' + HMS-Beagle2 7126 2 66.44 GTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGCTGCATAAAAGGCACTCAGAAAACTTGCATAGTCAAGGTAATAAGTATGTGAACTTGGCACAAAATTACGTAAATTTAAATAATTAAAACGTTTAAATAAATGAAATTCGTCAAAA:1 - chr3L 14781834 3' - Bari1 1575 1 79.45 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCCGGTTGGCCCTTTGG:1 + chr3R 15790075 3' - flea 23 2 71.23 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTCATAC:1 - chr3R 4964074 3' + roo 9030 1 57.53 AAATATAAGATGTGGGACAATAACTTATATGGCAATAACTTACATAAACACACACACAACAATTAGATACGCAAAACCACACACACAAAACATTACCAACACACCCACACCCAGGCAGGAATAAAAGGGGCCAAACATAGTAAAAC:1 + chrX 18235159 3' - HMS-Beagle2 6902 2 56.16 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCTTACGCCAAAA:1 + chr3L 12249914 3' + roo 9022 2 52.05 AAAAAAAAATAAAATACTGCAATATGATTTAAAAGTTATTAGGGGCAATCATAAACTGCGTTAACGACGGGCGCTCTGCCAACGAGAATAAGATCCGATAAACAAAGG:1 + chrX 2572578 3' + P-element 145 1 63.89 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACA:1 + chrX 12217459 3' - rover 45 2 57.24 ATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATACTATTGTATACTATTGTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGG:1 + chr3L 19471445 3' - 1360 3350 1 60.27 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAATTTTT:3 - chr2L 20265895 3' + roo 391 2 73.29 CATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGGTTTTTCGAATTTAGAT:1 - chr2L 23008371 3' - transib2 273 1 65.52 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATT:1 - chr3L 11913179 3' - BS 5045 1 52.05 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGTAATTGAAGGCATCGTACAAT:1 + chr2L 11298121 3' - I-element 74 1 63.70 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAA:3 - chr3R 4461006 3' - blood 48 2 52.74 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTCGCACGGGGGAAAAAGGGAAAAGGGTTGGCCGCCCACATTTTGTGGACAATGAAGGAAATATGGTTTGGATTTTGCTACTTT:1 - chr3R 30642423 3' - accord 7030 2 81.51 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATA:1 + chr3R 15364029 3' + flea 206 2 52.74 AGACATATTAATATTGTCCTCATATTAAAAAATGAGCTGGATGTCAACGCCTGTTATTTCGGAAAACTCCTTATAGTTATTTAATGCATTTTCTCTCCTCAATGTTTTCATTTCAGTGTCCCTACTGTGAGTTGGACTTGTGCATT:1 + chrX 9789424 3' + hopper2 485 1 58.90 TTTTACGAAAAAATAAAGAATTTACTTCTCTCGTTTTTTTAACTGACACTGTTAACTTGAAGCTCAAAATTAACATTACACTGCTCGCTCTTTGCAGTGGACGAGCTTTCGTTAGGGTGAACCAATTTTGGAGAACTAAATGTACT:1 - chr3R 20308724 3' - pogo 2015 1 46.58 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACC:1 - chr2R 5674618 3' + S-element 1674 1 56.85 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTAAACCAGAATAAGCCTTTAGACAGCAGAACGGAGG:1 + chr2L 71239 3' - 412 7105 2 70.48 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATATACACTAGATCATGAACGGTGGTGGGTGGTGGTGCGGATGGAACTTGTTGGGCGCCGCCTTTTTGTGGTG:1 + chrX 1264062 3' - Burdock 6171 2 56.52 ATTTTATGAAATGATTCGTTCTGTGTGGTCTAACAAATTTACACTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGATAACTGGATAACTGGGATAACAAGGATCTTTTGTCACTAGATTGATATTTTTAAACAACTCGCACAATTTTTTATATATA:1 - chr2R 2144532 3' - Doc3-element 4625 1 58.90 GGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGCTAACTTTCTATTGTACAATGCGATCCAGTCACTTGTTTTTG:1 - chr3L 2802468 3' + invader4 2715 1 67.19 CGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGTAAAAGTTAGCAATCA:1 - chr2R 3919667 3' - 1360 100 1 58.52 GACTGGGTCAGATTGCAGGTTAGTGAGTTGCGAAATATTGGTGAACCGTAGTTTGATACAGGAATATAATCGTAGCCGAAATTGAAGCCCGGCCACAGAGCACTCATACCCCCCAATCCTCCTGCTTCTTACAGATGAGGAGGATT:1 - chr3R 4413495 3' + gypsy12 484 2 63.01 AAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATTTGGCAACTGCAACTGCAACAAAGCG:1 - chr2R 15004700 3' + TART-B 10508 5 55.56 TTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATTTTCAATTTTTGTAAGTTTTAGGAGTTTTACGGCAGAAAAAAGTTTTAGTAGGATAATTGAAAACAATTTTTTT:1 + chr3R 7665732 3' - I-element 454 1 50.96 TCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTAAATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATG:1 - chr3R 18971732 3' + Juan 4127 1 76.71 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAAAA:1 + chr3R 11469421 3' + Tabor 7279 2 55.48 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCC:1 + chr3R 4860542 3' - Transpac 43 2 53.28 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGAT:1 + chrX 1341729 3' - 412 65 2 60.96 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACA:1 - chrX 19038387 3' + hopper 1335 1 73.97 TATCGATATCCCAGAAAAAATATGATATTTCGCGTTCGCATTCGCACTAAAAGTCGTATATAGTATTCTCTCTTGTTTGTTGTTGTTATCCTTGTCACCAGAGGAGCGAAAATAAGAAGAGGAAAGTGCGCGTCTTTTATGACTTC:1 + chrX 22695733 3' + INE-1 503 1 50.68 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCG:6 + chrX 11661520 3' - pogo 35 1 61.64 TTAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGTGCTGAATTTAATAAAGA:1 - chr3L 5532905 3' + roo 9034 1 56.16 GGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGTCTAGTATCTGGGGATTACGTAGGCGCTTCGATTCCGGCGGAGGCTGCGTG:1 - chr2R 15670639 3' + baggins 4963 1 60.16 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCGAATTTGCTGTCAAAGTAATCCGAAAACGAAAT:1 + chr2R 13931628 3' - P-element 63 1 43.84 AGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACG:2 - chrX 21639597 3' + gypsy5 7308 2 57.53 ATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAAT:1 + chr3R 18873667 3' - micropia 47 4 51.75 TTTACAATTTAAATTTAAATATTAAAAATTAAATATTTTAAAAATTTTTACCAAATAGAACCGGATGTTTCGTTAATTTCTTTCAATGCAAGGGAAAAAATTGTATTAGGACTATTTT:1 + chr3R 20913184 3' - TART-A 13183 1 24.58 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATCAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTT:1 + chrX 12129402 3' + flea 4948 1 61.64 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATATAATATAATATATATATGTCGGTGAAGCCGAGCGTCCAATT:1 - chr2R 4189003 3' - S-element 75 1 73.29 TTTGTTGATTTTTTTTTTATTTTTTTAGAAATGCTTGGGTCTGACCAAGTTCTGGACTT:1 - chr3R 23536352 3' - gypsy11 3929 2 93.22 GACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACGAAAATTAAATGCAAAACAAACAAACAAAATAC:1 + chrX 578369 3' + Tirant 8369 2 77.40 TAGGATAAAGTCTATTATAGTCCGAACATAAAAGTTTGTAAGGGTCGTGCAACTCATAGTTATGTCTAAGGTAAATTAATTAAAATTAGCCATAATGGTGTGTATGTAAAATGGTTTGACAATAAGCCTGTTCAACTAATATATTC:1 + chr3L 25911588 3' - Cr1a 4205 1 58.22 CCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCCACCT:1 - chr3R 2689356 3' - diver2 4475 1 50.00 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAATTAATTTACCCATGTGGCCACGCCCACTCTTACGCCACCAAACCGTCCAAAACTGCCAC:1 - chr3L 24159152 3' + 412 476 2 67.72 TATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAGGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGTTAGTGGTATTACTTCTTTGAAATGCTCATTAATGAAACAAACTTATTC:1 + chr2R 9062257 3' + Circe 7090 1 64.75 TCTCTCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAA:1 - chrX 21949014 3' + 412 7304 2 80.82 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTT:1 + chr3L 21380646 3' - I-element 37 1 60.00 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGGCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCTCAACTGCGGAAGC:1 - chrX 10521597 3' - Tabor 6868 2 63.01 AATAATAATAATATTTTTTAATATTGAGTAAAGCGTCGATGGTAATAAGACTTCACTATTCCCAGAGTCTTAATTAGCATTCAGTTGACAAGCATTGACAAGGATATCTCTGATTGGATTGCAAAGTTTGACTATTTATTAGTT:1 + chr2L 20296650 3' - Burdock 499 1 57.64 TAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAA:1 - chr3R 9557542 3' - G2 3055 1 70.55 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTAATTTAGTTGCATCGAATACGGCATACAATAAAAAAGATAACAAAAAAATAAAAAAAATTCTAAACATAGAGAAAGACAGAGAGTCTTTGAGTTCCATATG:1 - chrY 1421161 3' - flea 4773 2 75.17 ATATGTTCTAATTATGGGCTGCAATAAACAGATCACCCAAGCAGAACTACAGCCGCGACCACGATGGACACCGCGCCCGATAGATAGCGCAAGGGCATCACTC:1 + chr3L 23453244 3' + rooA 7279 2 70.87 TTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAA:1 + chr2L 17005798 3' - Stalker2 7316 2 63.01 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCT:3 - chrX 19539469 3' - pogo 49 1 54.11 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTG:1 - chr3R 26405021 3' - hobo 56 1 73.64 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAA:2 - chr2R 15326795 3' + copia 240 1 73.97 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGG:1 - chr3L 6397675 3' - roo 8743 2 69.18 AGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGA:1 - chr3R 21276543 3' - BS 5067 1 63.70 AAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGTGGCTGTTGTGAATGTTGTGTGGCTC:1 + chr2R 18316176 3' + HMS-Beagle2 7184 2 74.10 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTG:1 - chr3R 13972940 3' - 412 7104 2 51.72 TTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGCGCTTCTTTTGGGGTTCCTGGATTCTTGTCAATAAAAATGTCAAAAAAGTTTCGGCTAAGCATTAAGCACAAAG:1 - chr3L 13595478 3' - invader2 400 1 66.93 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCG:1 - chr3L 21327058 3' + copia 244 1 54.11 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGGTTAATGGCTACCTTCTAAAAACTGTACAGGTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTA:1 - chr3R 14980293 3' + roo 9026 1 50.00 AATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTCTTTGAATCAAAAAATGTATTGATCTTCGGGTAT:2 - chr2R 5883542 3' - HeT-A 379 1 56.85 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTGTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAG:1 + chr2R 9871538 3' - roo 69 2 76.98 GTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTA:1 - chrX 20999518 3' + BS 5020 1 69.86 AATGAACAAACACACACACACACACACACACAAAATCCAAGAGAGAAAAAAGGG:1 + chr3L 10760918 3' + accord 7026 3 79.63 ATGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAAC:5 + chr3L 18125995 3' - Ivk 60 1 54.79 AATAAAAATAAAAATACAAATAAAACAAAAACTGTTAAAGAAAACTATTTGAAATTTTTGCAAACTGGCAAAGTTTATATAGACACGCTACACGAACACACTCTCATACGCACAAACTGAAAAATAAAGCCATATAGCCAAGGAAA:1 - chr2R 12273367 3' + Stalker4 7042 4 76.71 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATAT:4 + chr3L 20898610 3' + roo 8995 2 72.60 ATTTTATTAATTTTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTTACGGTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTATCTTTTTATCTTTGGAGGTAAGTATTATATTTGTTTTATTTGATTTATTTATTTGCAT:1 + chr2L 19721280 3' - HeT-A 40 1 50.68 ATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATTTGCAATTTTTGTTAGTAGTTTTGGTTAAATTATATACATTGCACTTTAATGTCAAAGAGAAAAGAGAGACTACAAAAGTCAGTTTTGATAAATGATAAATTAAGTAAAAAAAAACGTAT:1 - chr3R 16294788 3' - I-element 450 1 77.40 AGCAGATTAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATAAACCATTCTA:1 - chr3L 16662365 3' + jockey 4946 1 49.32 ATAATAATGGTTGGCCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTTGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGTCGAAGTGGAAAAGGCAAATTAAATTATTTCTCATGAAAATGCAAGAC:1 + chr3R 17520699 3' - FB 352 1 65.75 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAAAGTTTTCCTTCTTATGCATTTATCACCTTTTTCCCCACACCTTTCCGT:1 + chr3R 31886975 3' + hopper 1392 1 66.43 ACACACACACACACATATATTATGTAGATGAAACACAAAAAGACGGAGCATATAAAGGCGAAGAAAAAAAATAGACGCTGAGTGAAATAGAAAATACAC:1 - chrX 4226380 3' + accord 185 4 86.87 ATAACGTTCCATCTAACGCAGCTGGTCAGTGGACACGGTTGCTTTCGCAGATATGTGAAGCGCTTTGGACATGAGGAGGCGAATGATTGCCCATGGTGCAGAAGTGGTTAAATATTCATTTCTATTTTTAACATTCTTTTGCAAAT:1 - chrX 7051675 3' + Rt1c 4984 1 71.92 AATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATTTTGTGTTTCGTGTTAATTTTTGATTTCCTCCGTGCGAACTGCCTTTGTAAAATTTGCTGTTACAGCGTTAGATTTGT:1 + chrX 2884416 3' - Stalker4 6946 2 52.74 AGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACC:1 + chr3R 11469379 3' + Tabor 7316 2 58.21 TTGTAATTTATAATTTATTTGAATGTTGTGTATTTTTTTTTTTCCTTGCCCCTTTTTTCTTATTTTCCCCCCCAGCCGCCTGGCAGAAGAAAAGGGTTTGCCCCCAAAAACCCCCCCC:1 - chr3R 24771003 3' - copia 5120 1 79.66 TTGGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGATTGGGAA:1 - chr3R 28901230 3' + transib2 2753 1 65.07 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCAT:1 + chr2R 7244924 3' + diver 6063 2 55.48 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGA:1 + chr2R 330259 3' - HMS-Beagle2 18 2 71.92 GAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATAT:3 + chrX 8200299 3' + flea 4954 1 59.59 GTATATGTGTGCGTATTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTAAATCAATTCTAATCCAAGAAACGCATTTACATACTATGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCGATGAAAAACTGAATATAAAAAAC:1 - chrX 12592426 3' - 1360 3213 1 73.29 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACAC:1 + chr2L 16564576 3' + roo 349 2 61.64 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCAC:1 - chr3R 25709779 3' + hopper 1365 1 60.80 CATCGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCACACAAC:1 - chr2L 4063787 3' + roo 396 1 76.71 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTT:1 - chr2L 13158617 3' + roo 9033 1 58.90 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCG:1 - chr3L 3983828 3' - P-element 90 1 23.97 CTTAGGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACT:2 + chr3L 23702267 3' - G4 51 1 50.68 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTC:1 - chr3R 13972962 3' - 412 7101 2 60.00 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAA:1 + chr3R 15072686 3' + pogo 2063 1 56.85 ACTCTAACGTCCACAAACCGCCAAAACCATCCAACCGGCTACGCCTGTCCCTATGAAAACATCGATCATTAGTTAGTTATAGTTTTTAGCGTATAGTTCAGAGGAAACAGATATTTGGGGCGAAAAGGCGACATGCTACAAA:1 - chr2R 19238060 3' + INE-1 222 1 60.56 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGGCAATACACACATATATGTACATATATGTGAAGAGAGGACTCTCCACCTCAATTTCTGCCA:1 - chr2L 15188349 3' + 297 341 2 63.70 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAATA:3 + chrY 9414 3' - roo 8741 2 71.92 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTT:2 + chrX 8200316 3' + flea 212 2 56.85 TAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGA:1 - chrX 10319618 3' - mdg1 7111 2 68.49 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATC:1 - chr3R 18971725 3' + Juan 4136 1 72.92 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAG:1 + chrX 7795596 3' + roo 9024 2 63.79 ATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTTCTCCACAATTGCCGCCGTCTTGGTTGATAAGCGTCGTAGATAAGCATCGAATGCCGGGCGCGCTG:1 + chr3R 1295637 3' - hopper2 1468 1 68.00 TTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAA:1 + chr2R 10418536 3' - 1360 3116 1 78.77 ATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTGTATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTCCGTCTATGACCTCCTGACGTTGGCTACTGTGCGCTGGGGGCTCGTCCAGCTATTAA:1 - chr2R 6212465 3' + 1360 363 1 55.30 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTTT:1 - chr2R 13766173 3' + roo 407 1 78.26 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGACGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGATGTTATTGAT:1 - chr2R 22034597 3' + copia 247 1 76.71 ATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:1 - chr3R 2424353 3' + 1360 2967 1 74.66 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGTTTAT:1 + chrX 18396162 3' - roo 80 2 75.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACCCTAGCAATTAATTTGTTT:1 + chr2R 11159397 3' + roo 394 1 74.66 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAAGTACACCACCAACGACCACCCAAACAAAAGCCGCTGGG:1 + chr3R 27406120 3' + diver 220 1 77.78 TGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTTCGTGA:1 + chr2L 22150644 3' - S-element 72 1 86.30 TAAAAATAACTAAATAAAAAATTCTGAACTTTTGGGCTGGGTGATGTGGACAGACACACCTATACACTAGTATATACACA:1 + chr3L 6349181 3' + F-element 92 2 80.00 AGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAAT:1 + chr3L 24934398 3' + HMS-Beagle2 250 2 61.64 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAA:2 - chr3R 15942693 3' - hopper 54 1 53.42 AGCTTTCATAGTTCCTGAGATCGATGCCTTCATACGGACAAGACTAGATCCTCTGTATTTTCGAAACTATTTTAAATACTGAGGCCACAATCTAATCTAATCTTGCAGACCTTGGTGTCGACTCGAATCTTATATCTTTAGCAGTT:1 + chr3L 22942359 3' - INE-1 150 1 60.27 ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGGCTTCACCAAAAC:1 - chr2R 4673558 3' + Quasimodo 7320 2 59.42 AGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTC:2 - chrX 18396027 3' + roo 401 1 69.86 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGCCCCCGTTACG:1 + chr2L 15550770 3' + Bari1 1652 1 57.93 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATT:1 + chr3R 24381417 3' + Juan 4175 1 67.81 AAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAA:2 + chrX 15200927 3' + 17.6 421 2 70.55 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAA:1 + chr3L 21763757 3' - jockey 86 1 72.14 AGAGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCATCACCAAAAAAGTGGCTTCATAATGCCAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCTACTTATTTAATGACGACAAACCGTTTCCACTATTCGAGCCGCTA:1 - chr3L 17871202 3' + 1360 3312 1 66.44 TTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTGAAGTTCCAATGAAACTTAAACCATGTGTAAAATTGGTTGTGGGCGTTTTTGAGTGACCAAAGCTGGTTGCG:1 - chr3L 3759833 3' + FB 387 1 53.52 TTTTTTAATATATTTTTTTAATTTCTAAATTACAATTCGCCTTCTTTTAATTATTAAAAAGAAGTGATTGTTACTTCTACTATTTTGCAGCGAATTGTAGGAAACCCATATGCTTGCATACATTTGCAACTCTTGGAATTTAATAA:1 - chr3L 10303539 3' - BS4 725 1 47.26 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCG:2 - chr3L 22400253 3' + 1360 3327 1 48.63 GTAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCTTTCCGCGCCAAGGAAGTTGCAAGTCCTGTCCCGACTCTTTGGCTTCTGTGT:1 - chr2R 12970665 3' - accord 7032 2 62.65 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTG:1 - chr3L 12315699 3' - transib2 38 1 59.59 TAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAACTTAAATATTCGAACTCGAAAACGAAAACGAATGAATTTCGTTTCATTTCTTTTATAGATTTGCCTTTGGCTCAC:2 - chr3L 11844698 3' + rover 303 2 54.79 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGTC:1 - chrX 6475290 3' - Doc 21 1 62.04 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAA:1 + chr2L 12818361 3' - hobo 32 1 62.33 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGGTCGGTTAGTTGGCCTAATTGGATGGATTTAAGGATGTGTTAT:1 - chr3R 11062712 3' - roo 8704 2 56.55 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGGTTGT:3 - chr2R 8099106 3' - jockey 4787 1 65.75 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCG:2 - chr2L 20265948 3' + roo 337 2 67.81 TGTGTCTTTGGTCGAGTGTCTCGGCTGGTAATTGCGCCTTTTTCTTTTCTTATTTTCGTTATTTTGCGCTATTTTCTCTGTTGGTTTGGTAAAAGTTTATGCATGGTGTATGAAAAATCGTCGACGG:1 + chr3L 10542087 3' + hobo 347 1 70.87 AATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAAATAATATTAGTATAAATGTAACCTTAATAAATTTGGAAAAGTTTACGTTAAACACAAA:1 + chr3R 556529 3' - Juan 4105 1 75.34 AGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACCGACCGAAGCTAATTAATTATGCACTTTGCCCGCCAGACCCAAATCCCAATTTGTCCTACAAAATCATTAATGCAGGGCTCCCTAATGA:1 + chr2L 1295257 3' - flea 210 2 65.75 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCGAAAGGTTAG:1 + chr3R 17077236 3' - roo 19 2 70.42 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATAT:1 + chr2R 13259404 3' - mdg1 7078 2 55.48 ATAATTTTTAAATTTTAATTTAATATGTAAATTAAAAAGTTTGTCGGTCAGGAAATTCAAAGGGGAGATGAAAGGATTACGAAACATACAGACAGTACAGTGGTTATTAGGTGAAGAGTACGTTTTT:1 + chr2R 10204934 3' - 1360 3053 1 68.50 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGC:1 + chr2R 22514171 3' + P-element 2811 1 27.07 ACCCATAAGTATCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTATTTATTATTTTATAATTTTGTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTATTTTATTAT:1 - chrX 12877032 3' + Ivk 5299 1 60.27 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGGAAAATCTGTAAAGCTCTTCAA:1 + chr3R 28385683 3' - transib2 6 1 81.51 TACTATATATATGTATATATATACATAATACATAATTAATTAATTTCCAAAAAAAGAATACAAATGTTATGGAGAGCGAGAGCATATATTCTTTTAGCGAGATTCCTCTGTTTGTTTTTGATCAGGAAGGGCATTGGTGTGTATCC:1 - chrX 7256776 3' + 1731 4409 1 52.74 CATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGAACTACTTAATTAAATATTCATGTTCATGTATATTCTATTGCTAACAACATTTGGCTTCTTGTTTCCTTTGGTTTTTCTATGTTTTCTAT:1 + chr3L 21184446 3' - F-element 122 1 60.96 TTAGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTATCACTCTCTCGCTTTTTCGCTCTCCCACACAAGATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGATTAAATAGCATACTCCTAATTTCTTTCCTCTCCCCCCAATTTCATA:1 - chr3R 1424117 3' + Cr1a 252 1 68.28 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTA:1 + chr3R 26504328 3' + HMS-Beagle 6996 2 53.15 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTAT:1 - chr3R 14860141 3' + BS 5040 1 59.85 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTCGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAAAAATTCGA:1 + chrX 21100310 3' - mdg1 8 2 79.45 AGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTGGCAAATTGAAAACGAAAACGAAGGAAATCAATTGAGGTGCAGGG:1 - chr3R 16517937 3' - R1A1-element 4911 1 68.97 AGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGTAATAG:1 + chr2R 5303166 3' + FB 210 1 54.79 GTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATGCCTTTTTGTGAGGATACGAAA:1 + chr2R 21411024 3' - Burdock 6 2 80.82 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCGGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACCCTAGCAATTAATTTGTTT:1 + chr2R 11159397 3' + roo 394 1 73.29 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGATTCGATTCTGCTATTCTGCTATTACTCGAT:1 - chrX 661843 3' + 412 446 2 52.05 AAGGTTGAGATGCAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAGTTTATTGACCCATGATGCCACGCGCACTCTAACGAAAAGCAAAGACGAAACTAGAATATTTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTT:4 - chr3R 22232287 3' + INE-1 174 1 66.44 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCT:4 - chrX 6116230 3' - transib2 46 1 53.42 AATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCCCTTTATTAGGGCAA:1 + chr3R 10736170 3' - McClintock 18 2 68.28 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCC:1 - chr2L 14675674 3' - 297 43 2 71.43 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTT:1 - chr2L 20265936 3' + roo 9026 1 55.64 AACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTGTTTGCCAATTTCGCCCATTTGCGCGCTGTCAATAAATTCGATTTTTGATTTGTGATTCGCGATTTATGCGGGCGCATAGTTTTTATGTCACACCCCCTTAAAC:1 + chr3L 4661816 3' + pogo 125 1 73.61 CCTCAACAACCACCTCCGCCTATGGAGCACCTTTGGCATACTGGGCGCTTTTTTTTAAGCCGATTTTCATCTTTCGCTCTCGGGGTTTTCCTTTTGCC:1 + chr3R 14046627 3' + accord 26 2 69.39 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAA:1 + chr2R 12779685 3' - I-element 89 1 81.88 ATAAATTCCAATTTTAAAATAAGTCGAGGGTCTCATTTGAAACTTAAACTTATATTTAGTTTAAAATATCGACCATTATATTACCGAAGTATGATATTTTGAATATTTATAGTAGCAATATCTTT:1 + chr4 394451 3' - P-element 2595 1 84.00 ATGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAACTCCAGTCTACTTGATTTCTCAAAATTA:1 + chr3L 13365870 3' + BS 5068 1 61.64 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTG:3 - chr2R 10078148 3' - jockey 97 1 63.01 TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACA:1 + chr3R 16157378 3' - pogo 72 1 65.75 CAATATTAATAATAATAATAATAACATTAATAGCCAAGTGACCGATATTGCGTATCGCTGACCTTCGCATCGGTGTCAGAGGATCTTTAAATAAAGTTTGGAACTACAAAGGTATTTATTTATATTTTTTTTGGGACTAATTCTGC:1 + chrX 10838546 3' + mdg1 7074 6 52.74 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTA:1 - chr2L 15913255 3' - transib2 81 1 72.60 ATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGATTTTTCGGTGTGTGCTTGTGATTTTCTGATTTTGTGGCTT:1 + chr3L 3687168 3' + copia 62 2 69.17 ATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGTTTAGAGTGTATTGCGTGCCC:1 + chr3L 22960512 3' - Tirant 8192 2 73.97 TCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAATCAGATATTAATTAAATATAATTATCTCTAACGCGAAGGAAACGAACAAATAAAAGGCACAGCCCGCAATCATTGCGGTAAACAAAAGACAACTGCAGGGTTCACGAGGA:1 + chr3L 13772561 3' + Dm88 4524 2 50.00 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCTATTATAG:1 - chrX 5323217 3' - Juan 4092 1 54.11 CCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCCAAAAAAAAATGAAACACACAACACTCAAGCAACAAAGGCCCAATCCCAAATCAACCATTATAAAAAAAGAACTGAAAAATACTTTTTATATATTTTGGCGTTTAAGT:1 - chr2L 4549182 3' + Doc 4388 1 73.79 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATT:1 + chr3L 27391407 3' + 1360 3354 1 55.63 GTTTGCTAAGATGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTGGTTGCTGCTGCCAGTGTTTGTAGCAGCAATAGGAATTTTGTGTAACTAACATTGGCTTGCTG:1 + chr3R 21579863 3' - I-element 5106 1 63.64 CTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATAAACGCAATGAACAATAAAGTAAAAAATTTAATTATTAAAAAACTCCAGACAGACTCTACATGCAATTAGCTAGATTTGACATAACAACAATTAGTAAATT:1 - chr3R 2081345 3' - gypsy 21 2 69.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAAT:1 - chrX 4341270 3' + roo 9002 2 65.52 TAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTA:1 - chr3R 4160063 3' + invader2 198 2 54.35 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCAAGGTGTTCGACGCTCGCAGTTCGCCGTTCAG:1 + chr3R 24450557 3' + 412 489 2 77.60 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTCCACTGTGAGCATTCTCGAGATAAGAGTTTTTGCATCACCCTCGCCCTCTCACTAACTGAGTTAAGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTT:1 + chr4 212335 3' + roo 9039 1 60.96 ATACAGAAAAAAAAAAAGGAAACACGTACCCCCCTGATCTTCACTGCGAATAAAAAACGGGCAACATAAAGAAATACTGCGTTCGGAATTCGTGCCAAAAAGCCATCAAAATTCAGAAAACAATC:1 + chr3R 25956795 3' + Doc2-element 245 1 86.40 TATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTGTT:1 + chr2L 5460087 3' + Dm88 4383 2 39.73 AATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTTATCGCTTTTAATCGACGGCGGTCATTTCATTAGTTGTTTTCGTTGTTGTTGCTGACGCTGTTTAAATGCAACTAATTAATGGTA:1 + chrX 17344839 3' - I-element 5158 1 62.50 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGTGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAA:1 + chr3R 31264058 3' - jockey 4830 1 72.80 GGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGG:1 - chr2L 23295817 3' + micropia 5350 2 79.14 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTCGCATAACGGCTGATCA:1 - chr2L 4123812 3' - transib2 21 2 70.55 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAA:1 - chrX 19054267 3' - jockey 87 1 71.72 CATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTCTGGGGTGCTTCCAGGTGGACGAGAACATTGAAGATGCCTGTGGCCCTTCGATGACTCAGTACATATCGGACAAGGAGAAACTCATAG:1 + chr3L 21566139 3' + copia 4803 1 62.33 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCTTAACACTTG:1 - chr3L 6518519 3' - 412 7078 2 69.18 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAAAGAATTT:1 - chr3L 24131353 3' - Transpac 19 2 69.86 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCA:1 + chr3L 13294992 3' + roo 9047 1 62.18 CACACACACACACACACATTCGCCGGAGAGTGTGCCCGCCACCACCACCGTTGCTGTTGTTGCTGCTGTCGACTGCTTTCGCTGAGCGTGGCTACAACA:1 + chr2L 11803661 3' + accord 186 2 52.53 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCG:1 + chr3R 25709848 3' - hopper 83 1 71.23 AGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCTTATTT:1 - chr3R 15724252 3' + Juan 4204 1 75.34 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGAGCAAAGGGCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGTTTTAGGGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGAT:1 + chr3L 12315831 3' + transib2 2805 1 58.93 ATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTT:1 - chr3L 16690869 3' + Juan 4215 1 75.96 ACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTTGTCCCCCGCTACCTGAAACTCAGTTTCCCAAATATGCGGTATTCATCTTAAAACTTTATGTTTAAACACTATTCAC:1 + chr2L 18561643 3' + accord 6914 2 58.62 TCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAAT:1 + chrX 3431981 3' + Ivk 5338 1 53.42 ACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAAATTAGCTACTCAGAATAGTTATTCATAAAAGTTTTTCATGATTTTTAGCTGAGTTATGATGATTTTATACATTAACACCTATCACTTAAAGTTATCTAGATACCCGAGTTGTATA:1 - chrX 9869884 3' + 412 7285 2 78.08 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACCGCAGGTG:1 - chr3R 23618079 3' + hopper 1411 2 80.00 AATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTG:1 + chr2L 15763112 3' + mdg1 31 2 54.79 CAAATCACAACGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACTTACCATTTACCACCCACCAAAAGCACTATCTTTAACGATGCCAATGTCAAGTCAA:1 + chr2R 6255023 3' - 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chrX 1341667 3' + 412 7473 2 76.42 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCC:1 - chr3L 18402991 3' + P-element 2806 1 27.14 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCCAACACGGTGTCATTGGTGACCGTTGAGCAATTGC:1 - chr3R 5368585 3' + 1360 3374 1 65.69 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCG:2 + chr3R 19032698 3' + roo 9011 2 62.33 TAAATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGATAACAACTGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACGATATCTGCATCACGCGTGAGTTATTATGCCAACTGCGTTTTG:4 - chr2L 14930992 3' + diver2 448 1 79.45 AAATAAAATAAAAGCAATTTCACTACACACAACAAGAGTTCCGTAAAAATATATATATGTATGGTCCATCTCTGGAGAGTTAACAGTTAAATTTTCTACG:1 - chr3R 7370073 3' + HeT-A 322 1 73.00 TCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAACTTAAATATTCGAACTCGAAAACGAAAACGAATGAATTTCGTTTCATTTCTTTTATAGATTTGCCTTTGG:1 - chr3L 11844703 3' + rover 7250 2 53.79 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTCATCAGCAGTACATGTGATGCATCAAATATATTGTCCAAAAAACAGCCACATTTTTGCGCAGTGCAAAACACATTTTG:1 + chr2R 9544985 3' - roo 12 2 78.08 CGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCACACACATCCAGAGATCTACAATATATTCCACCCCACTTTGGCGACAGCGATGATTTTAAACTTGTGATGTCTTTGC:1 - chrX 1799097 3' - invader4 2758 1 77.78 AGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATT:1 + chr2L 11357908 3' + blood 7313 2 69.18 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAACTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGCACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTTTAGCCTATCTTA:1 + chrX 12986614 3' - roo 79 2 72.60 ACACACACACACACACATATGCATATGCGGCGAAAATATGCAAGAGCCAAGCTGCACACACAAGTGTTCAGACAGCGCGCCAGA:1 - chr3R 25179550 3' + accord 185 2 34.52 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGTTGCTAGGAAGAAGTAATGATCCAAATA:1 - chr3L 46898 3' - FB 33 1 53.49 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCTAATGAAGTTTAAGCGCAACTACTTCAAGAT:1 + chr3L 5881725 3' + pogo 2086 1 75.34 ATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCC:1 + chr2R 5321238 3' + INE-1 508 1 67.81 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCAT:1 + chr3R 4964182 3' - roo 8738 2 73.29 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTT:2 - chr2L 4063857 3' + roo 8989 2 75.34 ATAACATGTTTTAATACGTAAAACCTTTCGGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTAAAGTCTTCTGACGTTGTTAAAAATGCTCCCTTTGTTCATCATCTTTGTGCAGCTCTG:1 - chr3R 14602452 3' - G4 3724 1 66.37 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACACTTGTGGTGCTCCAGAACGATGAGCAACTGCTCACCGGTTGGCGATTCCATTTGGACACTCTCACTGACCTCCAGGTGTACATCAT:1 + chr3L 11065687 3' - hopper 58 1 65.07 GCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTTTTTTTGATGAAAAGTATGAGTTCTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCATCGCGTTGTCAGTTCCAGTTGCGTACTTCAT:1 + chr3L 8995446 3' - I-element 5204 1 78.08 ATGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGGGTAGACATGCCTTACTGCGCTGCATATTAAATTA:1 + chrX 6939678 3' - accord 7037 2 90.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTT:1 + chr3R 15791015 3' + roo 9019 2 56.16 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTCCACTGTGAGCATTCTCGAAATAAGAGTTTTTGCATCACCCTCGCCCTCTCACTAACTGAGTTAAGGGTATCTGATAGT:1 - chr3L 14402161 3' + roo 9030 1 55.86 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTCAATTGTCATT:1 - chr3R 6419792 3' + Tabor 7313 2 76.03 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATTCGCGGTTGAAATGGAAACACGACACGGCGCACAC:1 + chr2R 7850076 3' + roo 390 2 71.23 GGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGAGATAAGTCAATTTTTAAACATTT:1 - chr2L 3675810 3' - Juan 4027 1 73.98 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTATAAAGTCAAGCATGCTTCGAAATAAATC:1 + chrX 12986681 3' - roo 12 2 76.71 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCC:1 - chr3R 27765105 3' + mdg1 7393 2 69.17 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCAT:1 + chr3L 12249887 3' + roo 8995 2 70.55 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATAATGCACTGCAC:2 - chr3R 5768966 3' + roo 9054 2 73.29 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAGGATGCGAGACAAGCTTGTGGTGGGATTTGGCTGGTTATCAATTAAA:1 - chr3L 13294847 3' - roo 5 2 77.60 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAATCCAAACCCTGATGTACCACCCATGA:3 + chrX 18010089 3' - 412 17 2 71.23 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATT:1 - chr3L 25406608 3' - 1360 15 1 69.86 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAATTCTTA:1 + chr2L 20821324 3' - Burdock 6176 2 57.24 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTG:1 + chr3L 23320148 3' + roo 9008 2 63.70 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGT:1 - chr3L 26505854 3' - copia 4915 2 55.48 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGT:2 - chr2R 21116473 3' + mdg1 367 2 57.53 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCAC:1 + chr2L 20840078 3' - mdg1 7088 2 52.86 TCTTGTTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTAACTGTCTGTTTGTCTGGCGGTCTGTGCGGTTTGAGAATTTTTCATATTTTCTATGAAAATTACCAAAGACATATGGCGGTCGTCCTGCT:1 + chrX 2761644 3' - gypsy2 397 1 84.38 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCAT:1 - chr3L 13294897 3' - roo 8740 2 70.55 GTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGAT:1 - chr2L 22121318 3' + I-element 5326 1 57.53 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTAAAGTACACAGAAATCGATTTC:1 - chr3R 19224949 3' - HMS-Beagle 19 2 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATA:1 + chrX 7795648 3' + roo 9047 1 68.28 TATTATTATTATTATTGCTGTTGTTGTTGTTGTTCTTGAGGGAGGCATGGTTATTGATAATGATATTGAGATTGTTGTGATTGAGTATGTTATTGTTATTATTATTATTATTGCTGTTGCATGTTTTCTGTGGCAGATGCGCAGCT:1 - chr3R 18692710 3' - mdg1 31 2 79.45 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCATCATGT:1 + chrX 8360662 3' + roo 390 2 71.74 ACAGCTGCGGCCAAAATAATAGCTGCAATTACTCTACTCTCTTACTCTCGAAACTGAGGATAGAGAGTTTCTTGTAGTTATTTTGTAGAAATTAAGTCAAATATTCCAATCTTTAAATAAGTTTTAAATAATAGTTCTACATATT:1 - chrX 5989533 3' + Tc1 2 1 30.34 AGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGAATCATTGTGCATCGGCTTAATCAACTAATTCATATTGCTTACACATCCAAATCGCAGCTCAATTATTTACCTCT:1 - chr3L 21607304 3' + F-element 404 1 59.59 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCCAACAC:1 - chr3R 5368614 3' + 1360 3316 1 77.10 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCGTGATTTGCCATGGTGAGACCAAAAAAAAAA:1 + chrX 15200973 3' + 17.6 7394 2 69.18 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGGGACGAGATCGTGA:2 + chr2L 22170095 3' + Juan 4201 1 71.23 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCAATCTCTC:1 + chr3R 15791042 3' + roo 9046 1 67.81 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAAATCTGATTGGACACCGAC:2 + chr2R 21160793 3' - Transpac 30 2 60.27 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATAAAAAGTATGTTCATTGTTGAATAAGATTTCGATCGGCATTAACGCGCCACGCCTAA:1 + chr2L 22193569 3' + roo 400 1 79.45 CTGATTTATTACCAGTTTACTGGATCACTCGTGAATTCCGAAACGACACCGTGACGCTCAGAAACGCGGCGCAAACCCCAGAGTGGATTTCGCTGATTTGGCATTTGGCCACTCCCACGCCCACGCTAACGCTC:1 - chrX 18575261 3' - Rt1a 166 1 67.16 ATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATAGGACTTTACATTTCCAGGTAGGGCACATCAAATGCATTGCGAAACCATTGCCGAGTTGATTGCACAACACCAAATTTTGTTGAATGTCACGATCCCGGGAACTCTCCTGTTC:2 + chr2R 6253429 3' + Chimpo 174 1 69.86 CACTGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCTCACCTGGATGGCAGTTGGGATTAAGTTGTGAGCACAAATTGGGACTAACTAATTGGTTGTTACTAATATTTACATTTCATTGAAGCTGGACGACAAATTAAACTTG:2 - chr2L 20609650 3' - G5 4423 1 65.07 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTAA:1 + chr2L 23381790 3' + flea 247 2 80.00 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTATCGCACCCATCGTTCCAATGCCTCA:1 + chr2L 16997383 3' - hopper 23 1 50.35 AACTAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTCTTTAATTTATTTTTGATCCAGCTTTAATAACTATTAATTTATTATTCCTATAACTTGTACGTTGAATGGGCATAGGTAATTTTCTTGAAATATGAAATATTTAA:2 + chr3L 21821562 3' - Tc3 313 1 77.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAAAAGAA:1 + chr2L 18226887 3' - roo 8712 2 51.37 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGT:2 + chrX 10521741 3' + Tabor 7274 2 50.68 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTT:1 + chr2L 12984196 3' - hopper 27 1 59.09 AGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAGAGACGCAGCTCAAGTTTGTTGATCCATGTTGCCACACCCACTAACAAATATTTCTGTAATTTCTTGTCAAAAAAAAACCCCATATTGTTAGGAAATTTGGTGAAAACTAAAACTCCAAGT:1 + chrX 20672653 3' + INE-1 168 1 51.37 CAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTTGTATTAAGCTGTGACGGGGGATTGCCCTCAGCTCTTCCTTTCTTCTTGGTGTTGAATTTTTTTTTTGGTT:1 + chr3R 19325660 3' + 17.6 7239 2 67.89 CCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGGCGTACAACATCTCTGTAAACATTTTTACGAGCACTAAAATCATCTTCAGAATG:1 + chr2L 6279416 3' + Bica 158 1 69.86 AGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTAGCAACAT:2 - chrX 15903138 3' - INE-1 97 1 73.29 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATTGCATCGCCCTCTCTTTCGCACGTAACGG:1 + chrX 8437805 3' - P-element 8 2 79.45 ATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCT:1 - chr2R 5410981 3' + Tc1 1348 1 67.16 CGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGGGATGAAGAGAAGTGGAGGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGGTCACAGCAAATGGATGTCAAAACACAAACAAGTAACTTGCGGGATACTTTGCAAACCAGCAAAAAGCTAAGACAGAGG:1 - chr2R 19326947 3' + R2-element 460 1 71.03 ATTTTATTTTATTTTTTTTATATTTCAATTTTCATCAGGAAAAATAACAAATAAATAAGTAATGGTAGTTTTCTTAGATTATAATTTTATTTAAGTTATTATAGTTATTATATCGAATTATAATATCTATATTTATTGTATTGTAC:2 + chrX 20759786 3' + transib1 1905 2 52.74 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCC:1 + chr2L 18226854 3' - roo 81 2 73.97 AACGCTTCTACTTCGGCCTTGCATTCATTTGTTTTCATCGAGGTATGATATCCGGTCGGTGTCGATGTGGTTCTTGTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTCTTACACTTAAACTAAACTTTTCAACTGCTATTTTCTGATG:1 - chr3R 17836993 3' - Chouto 5958 1 57.53 CATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTGACAAAAAGTATACTAAGCGATTGATGCGGTTGGTTGGCTTCCCAAAGAAAGACTATTGATGAACCAAAAAGGGGCAGGCATTAAAGAAGTC:1 + chrX 6516156 3' + hobo 2514 1 70.42 GCTGTGGATCCTGATCAAGAATATATAAGCTTTATATAGTCGGAATCGCTTCCTTCTGCCTGTTACACACTTTTCAACGAATCTAGTTTACCCTCCTACTTGACGAGTATACGACGGGTATAGAAAAAACTATACCTTTATGGGTA:1 - chr2L 21998822 3' - INE-1 86 1 62.33 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATT:1 + chr3L 18126011 3' - Ivk 40 1 50.00 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGT:3 - chr3L 19454906 3' - mdg1 7080 2 55.48 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTC:1 - chr2L 10156130 3' + hopper2 1526 1 73.97 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGGCGCAGTAAAAACACTTTATAAGTGGC:1 + chr3R 29690805 3' + I-element 5309 1 50.68 CAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTGAACATATTGAAAAGCCGCATCTGAATATAACTGAACCATCAATGTTTTTCGATGCTGGGTCCATGAATGTGACACT:1 - chr4 640552 3' + 297 6552 2 60.69 CATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTTTTTCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGCGATAAAGTGCCGCCACGCCCCTGCCGCCCCTTTTCCCCC:1 + chr3R 31010233 3' + copia 4954 2 67.15 AGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTATC:3 + chr2R 4659358 3' - S-element 1497 1 51.37 TTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCGAGGACAAC:1 + chr2L 15550793 3' - Bari1 34 1 60.27 TATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTGCAA:1 - chr3R 27843165 3' - I-element 5346 1 62.33 CCGGAAGCCCGTGCATAGCTGGCAAACACTACCCGTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTATTCGATTTAATTCCTTTCAAAAAGGGCTAAAACAGTTTACGTTGGAGGACTTCTTGGCTATTGCATTGGAATGGCGTTGA:1 - chr3L 25303722 3' + gypsy6 7501 2 56.16 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCA:1 - chr2R 9871036 3' + roo 9007 2 65.07 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGG:3 - chr3R 4461018 3' - blood 7071 2 60.96 GTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCT:1 + chr3R 4679572 3' - hopper 23 1 64.34 TTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTGAAAATGAGTAATTGGTAAGTGATATTCCATAGCCATTAGTTGTTAATTGTTTATCAGGGGCGTATAACCAAACGTGAGTTTCG:1 + chr2L 737440 3' + R2-element 39 1 61.64 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAATTCGGTGGCAACAA:1 + chr3R 30987621 3' - F-element 83 1 71.94 GCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTGTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAA:1 - chr3R 18346602 3' + INE-1 546 1 52.74 GAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGGGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAA:1 - chr3L 24934266 3' - HMS-Beagle2 6913 2 63.70 CATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGGGTATTACGAACACCCACTTTGAGGC:1 - chr2R 3593606 3' - gypsy 30 2 65.07 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTC:1 - chr2R 14051742 3' + roo 9019 2 54.11 AAACAATCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTTAAACAGGGATCTTTAGATACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAAGAATATGAAAATACCATTGATAAAATTAACCACCAAGCC:1 - chr2R 4547736 3' - transib4 2486 1 64.38 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCA:2 + chr2L 16943880 3' + copia 5080 2 69.18 AACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTTATTTCTAAGTGGAATATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAATATTAATCTTGCATATTCGGCGAGCTTATAAAAGCGGTAGCCAACCAGGGGGTGCCATTTATTGGCCAAA:1 - chr3R 9330327 3' + Bica 156 1 52.74 ATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGTTGCTGCCGGACATC:1 - chrX 1263889 3' + Burdock 250 2 72.60 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATTTTA:1 + chr3L 22035708 3' - F-element 22 1 71.92 GGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGAGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGCTAACTTTCTATTGTACAATGCGATCCAGTCACTTGATTTTGGCCCCATTGCG:1 - chr3L 2802457 3' + invader4 2715 1 60.43 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCA:1 - chr2R 18316004 3' - HMS-Beagle2 6908 2 66.42 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGAGGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGCACTCCAAACTTTGCA:1 + chrX 10521782 3' + Tabor 7315 2 75.34 AAGTAATTATTATTTATTTGTTAAAATGGCAAGGGAGTGATTGTTTAATGTAATCGACCCGTTAATTGTTCATTTGTTCTGGCTAATTTTATAAGACTTCAAGATAGCCGTAATAAACTCATCTATGTAATGTGATTTCTCCGA:1 - chr3L 7607798 3' - jockey 4829 1 79.86 GTTTTCAATTAGCGCGAAATCCATATCAAGATGTCTGGACATGACAAGAACAACAAACAGAGAAAGTTGGTGGGATATTTTTTTGGATTTCATGGGGTTACTCCCCACACAGACAAACGGAATGTGGGCTTCAAA:1 + chr3R 17893762 3' + invader2 4654 1 42.22 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGACACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCAT:1 + chr2R 23592060 3' - micropia 129 4 55.48 CCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCAATTTTAAGTCATTCAATTCTAACACTCAAGCAACCTAAATAATTTCCGATAATTTTTTACTATTTCGCTCCGGAGCTATTAGCTTTCCTAGCTAGTTCCGTTACTCGTG:1 - chr3L 23703108 3' + Cr1a 4140 1 62.22 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCACGACTTATCTCTTCGGTGGTTGAAGTGGTACTCTCCTTTATAAATCTAATTTTTTTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTG:1 - chr2R 4029381 3' - I-element 76 1 65.75 GAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGCTAAATATCATGAGGGTTGCTCGAGGCT:1 + chr3L 27412941 3' + 17.6 6947 1 80.14 AAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATAC:1 + chr3R 19225078 3' + HMS-Beagle 170 2 70.55 GCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAAAGCAAATGAACGTAAGTCAACTGACCTGTGCAATGCCAAAATAGA:1 - chrX 11597089 3' + invader1 3935 2 53.61 ATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATTGTTTTTTTTGCAGTGTATCTATAAGTATTGGGGAATGTATGACTAGATGGATGAAGTGTGTAAAAATTAAAATACGCGGAAAACTATTGATAAATGTCATCAC:1 - chr2L 7842190 3' + transib3 305 1 39.73 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGTTATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTGCTGCCTTGTCCAGAAGCAGGGGTTA:1 + chr3L 6397725 3' + roo 314 2 78.08 CGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGGGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGACTATTCTAAGGACTTGCCAAGTGCCTTATTAACTCGATGGCGAATCCGATTCCTATTCTTGCCAAATAAATCGCCATCTGCGCGAGC:1 - chr2R 10091747 3' - mdg3 103 2 53.42 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGT:1 + chrX 18396169 3' - roo 8737 2 70.55 TTATTTNGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATG:1 + chr3R 14860203 3' - BS 5078 1 71.92 TTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGTTTTACGGAATTTATCTCTGTGCAGCAGCTAGCATATTGCGATTGGGCTAAAAAATTTCTAACTGGAGCAGTTTCATGGAAA:1 - chr2L 11387316 3' - gypsy5 367 2 59.59 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTG:2 - chr2R 18315995 3' - HMS-Beagle2 25 2 67.12 CTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCCAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGGTTCTTTCTTATTTTATCGCCTATTAGAACTACGTATTTTATGCTCA:1 + chr2R 13337584 3' + mdg3 38 2 66.44 CTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCGAGGCAACAACCAAACAAGCCGCACACACACACACATAATACTATTCCATCCCGAGGCGAGGAAAACTCCCTCCGCAATCCGCTATGCGCCCCTAGTTTTCCCCTTT:1 - chr2R 21925459 3' - opus 280 2 73.79 ATATATTTTTTTCTGACTTTCTTTGAGCATGCCTTTCCATTTCAATTCACTTGCCGGCGGGACTTTGCCTTTTTCTTTAACACATTCATAGATCTCCTTAGTATTTCAACACAGCTGATTAAATTTCAAAGTAAATGAAATGAA:1 - chr3R 4456047 3' - transib1 32 1 57.64 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAGAGCCGGGCAATTATTTATCG:1 + chr2R 23780660 3' - Ivk 14 1 74.66 ACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATGATTCGTTCAAAGGAGCTGGTACTTTCCCAGATCGGCATCCCTGCCGTTCATCAAATATGCGTTGATGGCAATCTGGCTGAGCACCTGCACGC:1 - chrX 13726546 3' + Ivk 5369 1 67.81 ACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACAAAAGAAAGTTCAATGAACCGGTGTGCCAACGCGTTCGTCGCT:1 - chr2R 9548179 3' - roo 145 2 73.29 AGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATA:2 + chrX 20999573 3' - BS 75 1 73.29 AACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCTGCTTT:2 - chr2R 12185286 3' + accord 7353 2 61.64 ATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTTACTTTACTCGCTTATCTCTAATAGAGTCATAAAAAAAACCCACACACATTTTGA:1 + chr2L 14256244 3' + 1360 458 1 64.38 AAAAAAAAGAAAAAAAAAATTATTCACATATATGTGGTTGGCCAGTCGAGATGCTAACAGGATACGATAAACGTAAAATTATCGAAAGACAGAGAAAGTCAAATATCTCGAAAGAG:1 + chr3R 16835279 3' + gypsy7 5008 9 78.45 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATG:1 + chr3R 31653176 3' + roo 9037 1 59.23 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTATTGAGAAATTAAATAGTCTACGATTTGCATTAGTTCTCCGCAAC:1 + chrX 18396226 3' - roo 16 2 74.66 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCC:1 - chr2R 22034627 3' + copia 221 1 60.56 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGAACTCGAAAGGCTTTGTAAAT:1 - chr3R 30675348 3' + 297 6914 2 64.38 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGAATTATCTTTAATGCTCATTCAATTTTAATGACATGTAA:2 + chr3R 19453797 3' - 412 7135 2 75.34 GCACACACACACACACGCATATCCAGTCAGACATACAACCAGACGTGCCACGCCCACTTCGAGCACATGTATTATTCATGAGGCAGCACACACGCAATATGCCTGTCTTTGTCCCTGTCGGAGTTTCTGTTTCCGCTGCAGCTATA:1 + chr3R 20419913 3' + accord 183 2 67.12 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGGGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCC:1 - chr3R 11040054 3' + Bari1 1654 1 57.97 ACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGAAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTA:1 - chr2R 2492932 3' + invader2 183 2 58.22 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATATTGTTTGTATGTATGAACGATT:1 - chr3L 22723794 3' + HMS-Beagle2 7177 2 77.40 AGTGCGACCTTGCCTCACAACCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGATTGGCAGTCCTGGTGAGCGAGCAAGGAATGAAGACACGCGGAGGTTTAGGCGAGTTGAGTTCCTTGTAAACAATGCATCCTCGCTGTTGGCTGTGTG:1 - chrX 1911111 3' + Rt1b 4948 1 63.38 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGGTAAGTGTTACTACTTAAACATATGTAAATAATAGAAATAGAAATAGAATAAAGTTCATAGAAACATGAACTTTAACTTTTAAAAGACTATGGGTGAT:1 - chr3L 20898485 3' - roo 8685 2 71.92 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTG:1 - chr3R 30347307 3' - P-element 23 1 63.39 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAA:1 + chr2R 17878643 3' - Doc 60 1 52.05 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTTGCCATTTTGGCTCGACTCCCACACTTTTATAATTCCCAAGTTCTCGACGTTCATAGGGACAGACGGACATGGCTATATCAACTCGGCTATTAATCCTGATCAAG:1 - chr3L 20756369 3' - Transpac 4930 2 45.89 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAG:1 + chr2L 47201 3' + roo 361 2 51.77 ATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCACCCTCAGCTGAACAGCATTGTGGATACTTTGCGGTTTT:1 + chr2L 3588646 3' + Tc3 283 1 74.65 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAA:1 - chr2R 20227205 3' - hopper 48 1 51.37 TGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACT:1 + chr3L 18125996 3' - Ivk 59 1 54.11 AAGGCACGCTCCTCACTATTTCAACGCATGTTGGCGACTGAACCGTGTAGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAACGTGGCAATTTTCTTTCGGAACTCGCGCTTCGATCTCTTGGATTCTCAAATCCTGCATTTGGGGTC:1 + chr2L 12209240 3' - mariner2 141 1 58.90 GGATGTCATGATTAGTCATATACCATGGAGCCCCTGTGATTGTTCTTAGCGTCATAGACTGGTATCTCTGGAATATTTCAATTGTCGTTGTCATTGTCTGTCTCACAATCAATAATATATTCAATATAATATAAATGATTTT:1 - chrX 295444 3' - G3 4301 1 56.34 ATATTTGTATATTTGTATATTTGTATATTTGTATATTTGTATATGACAAACACACCTCTGTGTAAATACATATGTTCCTATCATGTAAAAATAAAATAACGCGTAAATTTAAAAGGTTATCAGTTATGTCGACCTAAAAATTCGTA:3 - chr3L 9357209 3' - Stalker4 7051 4 78.77 TATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGATGAAGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGC:1 - chr2L 22255079 3' - 1360 239 1 73.29 ATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCACAACTTCCCCACTTTTCTGGTAGCCGGCTTT:1 - chr3R 12902293 3' - 1360 3354 1 77.46 TCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGAATGGATTCGTTGAAATGTATGTA:1 - chr4 281582 3' + Cr1a 4246 1 74.00 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1 - chrX 21087598 3' - mdg3 60 2 64.38 TATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAA:1 + chr3L 28092983 3' - gtwin 6935 2 72.60 GGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCACTAATTTTTAGATTTTTTAATTGCAGGTGCGATTTTGTGGGTTTCTTTTTTCTCTAGACGGAAATAAACTTTAGCAGCCGCCGGACAT:1 - chr3L 19101624 3' - Doc 4547 1 64.38 GAATACAGTTCAGTTCAGTTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTTTTGCTAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAA:1 - chr2R 7244825 3' - diver 5962 2 66.44 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACC:3 - chr2R 24427580 3' - jockey 4751 1 67.81 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATTTTATGTAT:2 + chr3L 22035713 3' - F-element 16 1 75.86 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGGAAAT:1 + chr3R 10270696 3' + Juan 4185 1 67.12 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTG:1 + chr3R 16342044 3' - P-element 23 1 60.68 ATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGATGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTTTATTGCTCCACGTTCCTTTTCTGTGTTGCCTGATAATTTCAGCATTGT:1 - chr3L 22387936 3' + Bari1 188 1 65.07 ACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGCCGACAAGATGAAAAAAATTAATTAAACATGCAATTTGTTTTAGTAAACGACGCGGAGCCAT:1 - chr2L 16247169 3' + jockey 4861 1 53.66 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTA:1 + chr3R 7420314 3' - 1360 49 1 53.42 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTC:1 + chr3R 20167662 3' - roo 77 2 72.60 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGGTTTTAATG:1 - chrX 21224491 3' - roo 13 2 75.17 CGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTACACATCTCAA:1 - 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chr3L 26160453 3' + roo 8984 2 80.82 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCA:2 - chr3L 23249360 3' - rover 6986 2 62.33 CGGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATACTCAGCACGCTGCAGGACCAGGACCACGGGAGCCTGCCAGAGCAGCGCCCTTGGCAGGTCACTCACCCAACCACCTAGGAACCCG:1 + chr4 714213 3' + jockey 4621 1 71.19 AAAAAAAAAAACAAGAGAAAAAAATCCTAGAAAAGCATTTGCAATTTTATTGGACTGCAAACAAACTGGAAAACTTGCCAACTCCCTTTTCTCCAACTCATCTCATCATGCCAAACATCGACACACAAATGCAAACGATCTCGAAA:1 + chrX 8508881 3' + Porto1 171 3 56.85 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGGAACTTGCACTTGAACCCTGAAACAAGCAGGCGACCGACCAGAGAAGCACTCGGATGCGTTCGCTCAG:1 + chrX 19266939 3' - roo 8669 2 76.77 AAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAATCCATTATCATAGAAGTTGATGCAATAGATATGGGGGC:1 - chr2L 14328545 3' + I-element 64 1 73.97 ATACATATGTAAATAATAGGAGTACAGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTCCGAAGCGATGGAGAAGCTAAAGGCAGGCTAAAAAT:1 + chr3R 25263034 3' - Transpac 4850 1 75.34 TCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACACGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGGCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTG:1 + chr3L 19350003 3' - 1360 3266 1 62.07 AGTAAGAATTCATAGGTATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACACAACTTCAGCATACTTTGAGCATTCAAGTAATGCTAAAATTCAGGCAAACAGGAGCAGAAATGGGAAGGGACCAAGTAGAAGAAGAAGCAGGAGAGTG:1 + chr3R 25635752 3' + Stalker 269 4 56.85 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGA:1 - chrX 10521646 3' - Tabor 6917 2 68.49 TAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGGCATGCAACCAACAACACATGAGTGAAACATAATACACTGAGAACTATAAGAAACGATATTTTAAAAATAATATTAAACTATTTTAGCAACTTGTTGGTTTCCTTCAATAGATGTTTCT:1 - chr2R 20024476 3' - Cr1a 4188 1 78.08 GTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATCATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGT:1 - chr3R 24381330 3' - Juan 4195 1 73.97 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAACAT:1 + chr3L 14720901 3' - F-element 82 1 63.45 GCTTTTTTAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACTAATTGAGCTTAAATTTTTGGGGCTCCAACTTTTTAAGAGAAATTGCAAACACTGCTGGTTGATCGTCATTTCCCGCTTTGAAAATATGAGT:1 + chr3L 24162224 3' - 1360 3006 1 75.34 ATAGAAATGTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAAC:1 - chr4 260886 3' - INE-1 296 1 68.97 ATTTTTATTAAATAAAAATAATATTTAAACAAATAAAATAAATGGTTTTGAATGTATAGAATGCTCATCCCAACATCCATTGACGCCTCAACGTCTGGGTTTAGATACCCAGTGACTCAGAGCCCTAAAA:1 - chr2R 20068241 3' - TAHRE 72 1 70.77 GTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCTTGCGTGTGTGAAAGATAGCAGCTTCATATGCGATGCTCTTAATGTTATTTGCATACGTATCCTGCAGGCTACAATATTTACA:1 - chr3R 11270624 3' - accord 179 2 53.33 TGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAACAACAAAAGCAAGGCGAAATGCCGTCAGCAAATCCAAAGCCAATCAATAGATATGCAACG:1 + chr3R 21612793 3' + Stalker4 6997 4 58.90 AATAAATATTTGTTAATTATATCTAATTGTTAGAAAGAATTTAGCAAATATGCTTGTGAAAGAATTCAATTGATTTAACCTTCAATTAAGCTATATAGTACTATGTACAAACTGTATACTTCCCCCCACAAATTTCGCCCAGTGTA:1 - 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chr3L 15913852 3' - jockey 4824 1 63.01 AAAATAAATTTAAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTATGAAAGAAACAATATAATGATCGGTGACACATTGTG:1 - chr2R 3899825 3' + 1360 371 1 73.97 ATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTCTAGAAAGACTCTAGAAAGCGGTAGCGGACAAGAACCAAAACAAAACAAAAAACTTTG:1 + chrX 13509559 3' + Doc3-element 191 1 70.37 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTAC:1 - chrX 11661378 3' + pogo 2052 1 59.59 ACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCT:2 - chr3L 22531939 3' + Cr1a 4206 1 65.07 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAAT:1 + chr3L 18505729 3' - I-element 74 1 69.18 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTTCAATGATGTCAAAGAAGTGAGGAATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAATCTCTGGCGC:1 + chr3R 17996226 3' + diver 171 2 73.47 AGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGGATGAGGATAGTATACAAGTGCATTGCACTTTTCAAATAAAACGTTATCTA:1 - 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I-element 5226 1 76.03 ATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTG:1 - chr2L 11391509 3' + 1360 14 1 51.82 ATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCAAGTGACCCACGAAGATGGCACAGCATAAAACGGTT:1 + chrX 8313210 3' + Stalker 7125 4 77.40 TAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTCCAGATGCCCTTTTAAGGATAATAGTTCGGTG:1 + chrX 15304931 3' - Transpac 5076 2 75.00 GGTTTTGACCTTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATCAACATTTTTGCAACCGACATAAAACGGCTCGTAATTCACAAATTGTTTGGCCGTAAAG:1 - chr3L 9952423 3' - Quasimodo 6938 2 56.20 AAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAAC:1 + chr2L 17766208 3' - Doc 185 1 58.22 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAA:1 + chr3R 31264062 3' - jockey 4835 1 73.88 AAAACATATTTTTATTTTTTTTTTATTGATATATAAAATTCATTCTTGGTACTTGAGAACACCTTAAGTTTTTATGCATTATTTTGAGCAAATGTCGTCGCAAATTGAGCCACTAACACACACAGGCAGCAAATCAAACCTTCATT:1 + chr3L 7835825 3' + INE-1 463 1 72.60 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCTAAGCTTGAATTAAA:1 + chr2R 7304133 3' - pogo 48 1 52.05 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGC:1 - chrX 8308373 3' - roo 37 2 60.27 AAATGTGTGTGTGTGTGTGTTATGGGATTAATAATGTCGAAATGCAGATAAGAGGCATATACGCTTGTCAAGATTTGCTTTGATGTCATTTTCATGTGCCCGACTTGGGTGCGGCCAGCTCCATGTCCAATGCTACATCACTGCAC:1 - chr3L 19055389 3' - accord 183 2 70.55 AAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTTTAATGTATGGTGCTAGGAGAGCCCTTGGGCG:1 + chr2L 21580564 3' + INE-1 167 1 74.19 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATAT:1 + chr3R 3920566 3' + roo 8988 2 76.03 ATAATAATATAATAATAATAATAATATTCCTATAGAGCCACTAATTCGAGTAGCGCTTGTTTTCTAAATCCAATTAGTATCGAGTTTGGCTGATGGATATTTCTAGGAATAACTGGTAAACTATCTATGTACGCACCTCATCGCCG:3 - chrX 15899065 3' + invader3 5052 5 42.47 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCC:1 - chr3R 30347340 3' - P-element 90 1 26.03 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGTGATTTAATATTTCTTTAA:1 - chr3L 27865966 3' - Max-element 7 2 68.00 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAG:1 + chr2L 20266014 3' - roo 8750 2 78.77 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATAATGTG:1 + chr2L 15076207 3' - 1360 58 1 57.24 ATGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGG:1 - chr3R 19992654 3' - hopper 82 1 71.23 TAATAGTTTTGTTATTATTTTTTACATATTGATGAAAAACATATGAATAAATAGATATTAATAAAAAAAATGGAGAAAAGGAAAATAATAAAACGGAAAAAAACGCAAAATTAAATTTTTTTGTATTTTATATTTATTAAGTGAAG:1 - chr2R 2959910 3' + S2 1571 2 55.48 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGTTTT:2 - chrX 21224496 3' - roo 19 2 72.60 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGAGGAATTTGGTAACTATTTTATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTACTCATT:1 - chrX 8092381 3' + pogo 2043 1 56.16 TTTTTTCTTTGTTTTTTTTTTATGTTGCCCTTTTTTT:1 - chrX 10089880 3' + hopper 150 11 75.68 ATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGG:1 + chr2L 1923998 3' - G6 1992 2 65.71 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCGAGTGCTGTGTATT:1 - chr3L 9269856 3' + copia 257 1 60.27 AACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGG:2 + chr3L 19350052 3' - 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chr2L 442395 3' - S-element 1546 2 67.59 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAA:2 - chr2R 15326826 3' + copia 243 1 52.74 ATAAATATAGCTGTAAGCCCCATAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTGTTCATTTAAAATTTTCTCGTTTATTTTTGAATATCTGA:1 + chrX 17343463 3' + I-element 5282 1 69.18 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTACTTCCTGA:1 + chrX 1799265 3' + invader4 3065 2 71.92 ATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGAC:1 - chr3R 460080 3' - F-element 141 1 50.00 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGT:1 + chr2L 47219 3' + roo 9038 1 62.33 AAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACATGGCTGTTATAGGAAAATATCTTAAATGGTTTAAATTA:1 - chr2L 17811881 3' + jockey 4659 1 73.29 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCG:1 + chr2R 4606273 3' - 1360 86 1 77.93 GCTCACACTTTTGAAAAATGTTTACATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGA:1 + chr2R 5321184 3' + INE-1 256 1 54.79 AATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTC:1 - chrX 21639614 3' + gypsy5 7291 2 57.53 GTGGCTGGCTAGCTGGGGACAAAGTTGCAGTGCGAATTTTTAGTAATGTCAGCAATCGGCGGCTGCTGTACGGGAAAGTCCAAGGGGAAGGGAAACCGCATTCTCACCTATAAGGGTTAGAAATTTTGTT:1 + chr3R 8809669 3' - Tirant 8256 2 46.92 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCA:2 + chr2R 16817973 3' - 412 64 2 60.96 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGT:1 - 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chr2L 16539682 3' + Juan 4123 1 77.40 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGTGCCTACTCCCTTCGCGCGCGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGTTTT:1 - chr2L 12500629 3' + hobo 2907 1 51.85 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTT:1 + chr3L 21327162 3' - copia 4942 2 67.81 CTCCCTTTTTAGAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAATTAATTAAAACATTTTTTGTTTATTATATAGTTTTGATCGTTTTTGATTCGCAATTCGTTTTGGTGCGGGTAGAAAATTTCAAAGATTTTTGTTCAGGTTTCAA:1 + chrX 11969480 3' - Stalker2 7226 1 62.33 ATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATTCGTACTTTGGAGTACGAAATGCGTCGTTTAGAGCAGCATTTTAAAACCAAGTGCAGTGAAGTGCATT:1 - chrX 12304643 3' + P-element 468 1 19.86 AAACACACTCACACACACATATATTCTGCCTGCGACGCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTCCTCGTCGCCGGCTTCT:1 + chr3R 20140517 3' + accord 183 2 91.11 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCTTGTTACATACTTTTCAACGAAGCTAGTATACCCTTTTACTTTACGA:2 - chrX 22651470 3' + pogo 2057 1 55.48 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTT:1 - chrX 22840484 3' - copia 4923 2 62.79 AGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGTTGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAATACCGAGTTGTGTTTTATTTAAATAGTTTAGTGGTAATATAATTGAATGGTAAGTTTATTAATGA:1 - chrX 23338828 3' + GATE 377 1 51.37 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAA:1 + chr2R 11164527 3' - roo 6 2 76.11 GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTA:1 - chr3L 24934256 3' - HMS-Beagle2 6903 2 71.92 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGG:1 - chr2R 16817897 3' + 412 7463 2 72.60 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTA:1 - chr2L 9636068 3' + 412 440 2 50.68 TATTTAGAAGCGATGAACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGT:2 + chr2R 15005092 3' - BS 5077 1 73.97 TTTGTTTTTTTTTTTAATAAATAAGTACCTGATTTTCCAACCGCCACTTTATGGCCACTGCATAAAAATACACTGTATTTTAGG:1 - chrX 12290251 3' - HMS-Beagle2 479 1 66.67 GCTGAGTAACTGGTATCTGATAGAACGACTTTCGTGAAATATTCTATATTTTACGATTAAATTAGCTTAAAATTATCATAATGATGAATGGAACTTACCATACACACACACCATACAGACCATATATTCTGAATATTATTTCTTAT:1 - chrX 5711883 3' + INE-1 546 1 19.18 ATAAGTAAGTAAGTAATAAGTAATAATAAGTATACTAGTATACTAGACATTAATATATTTAACTTAAGCTAAACAAAGCTTAATTATTGTAAGGGCTTGACAAAAAGTATATACCATATATACTTTAAGAACACTAAGTGTTCCAT:1 + chr3R 6786948 3' + Stalker3T 38 1 78.77 GTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCTGTGGATACTGAAAAAAAAACAGGGAGGGGGTGGAGCAATAATAATTGAGCGGACGAAGGGCGGGCTGATTATCGAGTTACTAATAATCGCATG:1 + chr2L 7974974 3' + transib2 2668 1 62.94 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAAAAAGGCAAAAGCTGCCTTGAATTGCACTACGAATCACTCTAGCGTGCTATCAATTACTGTGGCAAGTG:1 + chr2L 15779662 3' - hopper 21 1 67.77 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTT:1 - chr2R 16510108 3' - F-element 81 1 62.33 GAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGA:1 - chr2L 11219885 3' + 1360 401 1 43.15 AATCAAAATCAAATGCACGCACCGATTGCGATTGTCGTGGGTGGGGGGATGTGGGGGCAGTCTCGAAATGGGGGTAAATTGTTGTGGGGTGCAGAACGAAGAACG:1 + chrX 18560890 3' - 3S18 404 1 61.90 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAAT:1 - chrX 6475314 3' - Doc 83 1 70.55 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTNCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATTCGCGGTTGAAATGGAAACACGACACGGCGCAC:1 + chr2R 7850074 3' + roo 405 1 78.29 TCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGT:1 + chr2R 4206658 3' - 1360 320 1 72.60 TTTCGCTCTCCCATACAAAATCTAAATTTTTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTTGCTAATCTATATAATTTTCAAATTATATT:1 - chrX 18251282 3' + Cr1a 309 1 75.18 ATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAA:2 + chr3R 10270642 3' + Juan 4131 1 69.86 CAATAGCCGAGTCGATCTGGACATGTTTTGCCATATTTTTTTTTTGGGTTTAGGGTTTTTTTTTAAGGGTTTGTCTAGTTAATAGCTTAATTGTTCTATTTTTTCTATTAGAGGATAGTGTAATAATTTTCTGTTTTT:1 - chr2R 4709817 3' + INE-1 101 1 52.90 AAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTG:1 - chr3R 26178375 3' + 412 441 2 55.56 ATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTT:1 + chrX 21639696 3' - gypsy5 7001 2 68.55 TTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTCTTTTATACATCGCTTTCCGATTTTATTGCTCCAATGATTTTAATTGCCATCGGAGTGGAGTGCGGTGCGAGTGGGTATACATATGCTTACA:1 + chr3R 22857997 3' + FB 633 3 66.43 TATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCCTGGTTTTCAGAGACATTTGACAAGTAGCAAAGGAGATGAGAAACGGATGCAGTGGTCCAACCA:1 + chrX 15946809 3' - INE-1 546 1 53.10 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAACGTAAAATTCTGATCAAGTAGACCAGCTGAATGATTATGTCTATCCTTAAGCTGACTTAAGCCCCTGATGGATTGACTAAAAT:1 + chrX 586823 3' + Tirant 322 2 77.78 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGGAGTTAGTT:1 - chr3R 16157243 3' + pogo 2089 1 69.63 AATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCTGCTGCTGCGTCACTTCACATTCGTATCATTTACATACGCA:1 - chr3R 23067403 3' - roo 8992 2 58.90 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATATTGAAATTTCGCGTTCGCATTTTCACAAGCTGATTACTGAGTATCATATAGTCGGAAAACTCGACTATAGCATTCTTGTTTGGAAGTTTTCACAACAAAATGTGGAGATTATCATGTAGAG:1 - chr3R 4137727 3' + INE-1 499 1 72.60 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCACCGACTATACTACACTAGTGGGAGATCACAGGGAAATTTTAACAATTTGTTGGCGTAGAGAAAGGAATACTATAATCGTCTCGGCTGTTTAAACTCATTAGAAATATATATATATAT:1 - chr2L 1432067 3' - INE-1 569 1 72.41 CGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACAT:1 + chrX 2479601 3' - mdg3 5299 2 54.11 ACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATT:1 - chr3R 19445989 3' + 1360 17 1 73.17 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAAT:1 + chr3R 18093366 3' - I-element 71 1 64.38 AATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCGCCAATTGTAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACGCACTCTGGCTACTATTT:1 - chr3R 3415687 3' + Circe 7114 1 70.83 CCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAATCAGTAACACCGCTGCTAAACAATGCGCCTGCTATATACGCCC:1 - chr2L 45486 3' - HMS-Beagle 260 1 67.18 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAA:1 + chr2R 21410977 3' - Burdock 6189 2 54.11 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGC:1 + chr3L 1692140 3' + blood 337 2 57.24 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAA:1 - chrX 17343350 3' - I-element 26 1 66.44 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGG:1 - chr3R 6625708 3' + flea 4947 1 67.12 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATA:1 - chr2L 9782088 3' - P-element 66 1 33.59 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTATTATCCGCGGAGCCAAGTCCCGTGTTCAAAAAGAACTGAGAAACAAATT:1 - chrX 23210461 3' - roo 8733 2 66.44 ATAATAATAATAAGAATAATAATAATAATGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGATGAAGAAGTAAAAGTATAAAAATGCGGATGAAGAAGCCCTTCTGCAGCTGCGCTTAATTGTGGTCGTCGTGGTCGGGAAAATCTC:1 + chr3R 22061071 3' + mdg1 38 11 62.33 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAAAGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCA:1 + chr2R 4785328 3' + Juan 4157 1 52.74 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTC:1 - chr3L 23249356 3' - rover 24 2 68.35 TAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCT:1 - chr3R 904906 3' - rover 11 2 64.79 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCCGATCGTGACGTCGACGTTGGCTCTTCGTTT:1 - chrX 18282616 3' + P-element 2857 1 35.96 TTCACTTTTATTTCTTCAACATTTTAGAACATATAGATTAAAACAACAGCAGGCAGAAATTCTGGTGTTCATTTCAGTGAATTGATATATTTCTGTGATACCTTTAAATGACTGATTCGTAATGTAACCCAAAATTGACTGAAAT:1 - chr2L 15600326 3' - HB 1491 1 53.79 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTA:2 + chr3R 15364016 3' + flea 4952 1 61.64 TAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAA:2 - chr2L 11839654 3' - mdg1 73 2 67.81 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTT:1 + chr3L 21996247 3' + Transpac 5155 2 68.49 ATATTTTGATAATATTCGAAAAGGGGAAATGAAAGTGGCAAATGCACTTTCGGATTCAAAGGGAATGGAAAATAAGTTGGGAGGGGAGGCGGGTGTTAGTGAAAATTCCTAAGCTGCCAACGGAAATTTAATTGCATCGTGCGAAG:1 - chr3L 5368787 3' - S-element 1445 1 43.15 ATTTAAAAAAAATACAAAAAAAACTCAATAATAAATGATTGTTGTTTTGCAGACCAATCTCAAGAAGAAGCTAGATATACAGCAGAAATCCCTAAAGCAATACTACCAACTACAATGTCCATTGTAGCGACCATTCAAAGAGGCAG:1 - chr3L 1950178 3' + TART-C 11099 2 67.12 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAA:1 + chrX 8200309 3' + flea 4965 2 52.41 TTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTTTTGGTTCTGTTTGCAAAGTAACATACATTTAATTC:1 + chr2R 5485273 3' - I-element 412 1 71.92 TTATAAATCAGGATTAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGA:1 + chr2L 11839703 3' + mdg1 7355 2 83.92 TGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATTTTGGTTTGATTCAGTAGGGGAATACAATAATAACATTACTAGGCCATGGCCATAAACGAGCCAAACGAAATCAAGGAATAGTTTACACAACATTTTTAAGTGATAGTATT:1 - chr3L 23715539 3' - Porto1 4281 1 76.03 CAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAAT:1 + chrX 15200925 3' + 17.6 419 2 71.92 TCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGTTGCTCAGTTGT:1 - chrX 15200789 3' - 17.6 6942 1 73.29 ATTAATATTTATTTTTAAGCCCCTCCTGTCCTTGTAATGCAAACTTTTTCAGCAAACTTTTTTTTCTGCATCATTTGGAAGTTCGTTTCATTTTTATTTCTCAGTAATCATTTCCTAAAACAGCAAAGCCAGCCAAATGATTGCGA:1 - chr3L 21055316 3' + NOF 3870 1 40.41 ACCACGTTCAAAAGTAAGCAGATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCC:1 - chr2L 23008351 3' - transib2 212 1 59.65 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTGAAATTGTGAA:1 + chr3R 16519002 3' + Tirant 8461 2 50.68 AGATACCCATTACTCAGCTAGTGGGAATGCAAATACGAAATAACATAATTTTTTTTGATGTCAATAGATATTGGGGGGAAAAAAATTTAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGTGTACCTTAAGGGTCTTAGAGTAGGCG:1 + chr2L 21924956 3' - INE-1 542 1 69.29 TTATAACTTATTATAATAACTTATTTACTCTTTTTACCATGCTTAATTTAATTTGCTTATGACATCCTTAATTTTGCCATATCCCGACTGTACACTTTCGGCTAATTTATTGGTGAACTTGGTAACCTCATCCTCCG:1 - chr3R 10851389 3' - S2 1450 1 78.10 AAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTC:2 - 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chr3R 11040065 3' + Bari1 1635 1 67.81 AAAAAACTAATTCGGGACCATAGTGCGGTGGTGCTTTAGCACTATAGTGGGGCAGCAAAGGGTCAGTGGTGCTGGGTCACTGCCAATGCCATGCGGTCGATTAAG:1 + chr3R 23491973 3' - transib2 4 1 67.62 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAGATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCTCTTACAAATGTATCCTTACCCAAGCCAACGAACAAAAAAAGG:1 - chr2L 16943814 3' - copia 4947 2 70.55 AATAACAAAACAAAAAAAAAAACCGCAATGAGAGTACTTTTCTTTTTGCATAATTCCATTGACAAAAGGGAAAGCTATATATCTAGGTGTAAGTCGCACCACGCC:1 + chr2L 3081631 3' + gypsy7 5001 11 75.24 ATAATAATAATAAAAAAAAAATGACTCTTTTTCCCGCGGCTTTCTTTTTTAGAAATTTTAACTTGCATCTCTTTTCATGTTTTTTTTTTCTTTTCGGAGTAGACTGTCCTAATTT:1 - chr3R 13992124 3' + Rt1a 5073 2 79.13 TTAAGACTAACTATACAGAGTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACAGAGTTTAAGCGAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGCGAGGTGGAAACTATTATGCGGGGATAACATAATTATTGGATA:1 + chr2L 19332789 3' - rover 7169 2 70.55 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCC:1 + chr2L 18347381 3' + transib2 2758 1 61.64 AAAGCTTTTCAAATAATATCAACCTTTTCACCATTTTTCTGACTTTTAATTTTGCTGCCATTCGGCATTGGCTCTTGTTGTTGCAGCTCTGCGAATTGACGTTTTAATGCCATTTACCTTTTAATTAAAAGTAAAAGGATGCAGAA:1 - 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chr2R 5374113 3' - F-element 4583 1 60.27 AACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTAAATTGCCCCAAATTAAACTAAACTAAAGAAAGGAAGGGAGAGAGAAATGGTTGTGACAAAACTGTTGTAAATAAACTGTTGGAATGG:1 + chr2L 11432987 3' + I-element 5094 1 71.21 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAG:1 + chr3R 5351462 3' - jockey 4750 1 71.23 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCA:1 + chr3L 18126013 3' - Ivk 42 1 50.00 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGCGGTACAT:1 + chr3L 18403067 3' + P-element 2849 1 52.76 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTACCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAG:1 - chr2L 47068 3' - roo 42 2 57.53 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATTTAGTAAAACTTAAAGCTTAAAACTTT:1 - chr2L 15936719 3' + copia 240 1 73.29 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAGATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCT:1 - chrX 4341249 3' + roo 358 2 51.37 GTTATTATTATTATTATTATTATGCTCGTTGGTTGCCTGCAGAGAAGCAGGCTGCGAATGCATATACTTTTAATTGTTTTAAATTACCGCCGACGAATCTCACTC:1 - chr3L 3445599 3' - mdg1 39 8 82.86 CCAATGAATTTTAATTTAATTTCATCTATGTATTTTATTCATGTTGCTTAGTTCTAAGTGGTGTTTTAGGCAGGGATTTGTTTTTTTTTTTGTAATCACTCCAGTAAACACTTTCGCACACAGTTTTCACCGTAGAAGAAAAATTC:1 + chr2R 12982561 3' + Rt1b 118 1 71.92 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATT:1 - chr2R 20010207 3' + Juan 4145 1 67.13 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGA:1 + chr2L 10156236 3' - hopper 35 1 58.90 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTCAATTGTCATTA:1 - chr3R 6419791 3' + Tabor 475 2 76.71 TTTAATTTATTTCGAGGTTGATAATTTGCCAATATATAGTTCCTTCACTTCCGC:1 - chr2R 10348195 3' + McClintock 360 2 88.89 ATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTA:1 - chr3R 14860163 3' + BS 5009 1 76.03 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAG:1 - chr3L 21655859 3' + HMS-Beagle 7008 4 55.17 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACACTGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAAGTCAACTTAAGCTTTCTCTCTCGTTTTAATGTCTGGATGGGAGGATAAAGG:1 - chr3L 23906354 3' + 1360 3356 1 61.70 ATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGCTTGTACGGACAACTGTCAGCAACACGCACGCAATCAATGTCAACACGCACACACT:1 - chr3R 31004883 3' - F-element 4230 1 61.38 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAA:1 + chrX 10521755 3' + Tabor 7288 2 58.22 AAATATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGATGAAGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAA:1 - chr2L 22255082 3' - 1360 242 1 75.34 AGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTGAACTCCGGTCTATGTATGATTTATGATAGTTCTATATGAAAGTTTAGGAAGAG:1 - chr2L 18552139 3' + roo 355 2 51.37 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAATCAGGGACTCTAGCTGA:2 + chr3R 18488513 3' + roo 394 1 71.92 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGCCAGATAAGCGAA:1 + chr3R 16630387 3' - FB 35 1 61.64 AATATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGATTAAAACGGGGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAAAC:1 - chr3R 30946519 3' - Transpac 4944 2 45.10 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGCATTAATTAACCGGACTTAAC:1 + chr3R 26178520 3' - 412 7068 2 72.60 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGGACAGAGAGAAAAATGTCTCGCTACTTGACATCTACATAAGAGTTAACCCGGTGCACCTGCTTCCCTCT:1 - chr3R 3850974 3' + transib2 2803 2 70.55 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACAC:1 - chr3R 30946532 3' - Transpac 5001 2 73.29 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTC:1 - chr3R 16630240 3' - FB 13 1 70.16 CTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGTTTCCGTTGTTTGTTTGTTTGCTCTGCCTTCGATCGAGTCATTCGCCAGGAGCTGCGGGTTTTGTGTTTTGTGTTCGTGTTTTGCGTCCCTGCCACTTGCCCACACTGGTCGG:1 + chr3R 27619730 3' - Doc4-element 99 1 71.03 TTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGAGTATGCTGGTTTTGAACTAGTAGCTGTAGCTTAAGT:1 - chr3R 10735996 3' + McClintock 450 2 59.31 GTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCCTCTTTTCCTAAATTCCTAAAGGTTCCGTCATTACTT:1 + chr3L 7428570 3' - Tirant 8417 2 73.72 ATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAG:1 + chr2R 2875211 3' + TLD2_LTR 76 1 50.34 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAG:1 + chr2L 19924062 3' + roo 9032 1 50.00 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAGCCGAAGCGTAGCCGAGAACTCAAAAAACAGTTACGAGAGAGCGGCGCGAGCGTTCGACTTGATTTTCACT:1 + chrX 18282700 3' - P-element 49 1 50.68 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATA:1 - chr3L 16970378 3' + roo 8994 2 73.29 CGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCC:1 + chr2L 15550762 3' + Bari1 1643 1 63.70 GCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCAT:1 - chr2R 7090632 3' + I-element 5298 1 55.48 AGTTAGTAATAATTTAAAATTAGACATAAAATACTCCAAGTCATAATATATTCTAAATTCATTCTTAATACAAATTTTAAAC:1 - chr3L 16399095 3' - TAHRE 10274 1 71.95 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAG:1 - chrX 8437675 3' + P-element 2805 1 30.14 TCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACTCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGTAACATCTAAATTGATTAAAAATAAATTTGAAGAACAAGTGAGCGTTTATG:1 + chr3R 23504868 3' - roo 266 2 63.45 CTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGAAAGCAAATATGAGACAAATAAAACGCAAACAGGCTTGACATTTCTCCAGCTTTCT:1 - chrX 21432830 3' - Doc 4512 1 62.33 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCAT:1 + chr2L 16943896 3' + copia 227 1 58.22 GTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACAAAAAAACTTAATCCAACCAAGTGGCTCAAGCAACCTCTGCAACCTGCCAAACTACTTGGCCACGAAATCCGCTGACCCAAAAGGGGTTCGAGTTCCTTTGGTTTGGCCC:1 - chr3L 18279539 3' + Doc 37 1 76.03 TTATTATTATTATTGTTGTTGTTATTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGCCAGCCCGGACATTCCTTGTGTCCTTGTTGCATTTTAAATGCATTTCCATTCACCACAAAGGGCGAAAAAGTGAAAAGCATTAAAAATTCATTAGCAT:1 + chr3R 24432564 3' - mdg1 29 3 69.18 AAATCTTAACTATACCAATTATTTTTTGAAATGTTGTTTAATTTTTACAAACGATAGATTATCTCGCCGCTTGGGTAAATTATGTTTGCATTTAGTGCCAGATTATGG:1 + chr3R 18837902 3' - F-element 4611 1 52.78 AGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCC:1 + chrX 3431972 3' + Ivk 5329 1 52.74 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACTGTCCACCCGAAAAACCC:1 + chr3R 15054347 3' + copia 231 1 65.75 AGGACTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCATGGTCATATCTCTTGGCACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCAGCTTACTAGGTGGCGTATATATTTTATTATTCTACAAGCCTTATATTTAATGCATTTTTCTGTTTTAGTATG:1 - chr2R 4727731 3' - rooA 7399 2 50.00 GTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGGTCGCCGTGTCTCTGGTTTTGTTTCTAGTCTCTGCTTG:1 - chr3R 10598129 3' + Juan 3993 1 73.97 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTC:1 - chr2R 8735572 3' + mdg1 361 2 62.33 AGGAAACCAGTTTGGGATTAGACAGTCATTCGGTGAAGAGCAGCACATTTGCAGATGATTCACAACATTTGTATGAATTCGAATGCTAATGCACCTCTTTGAAGTTATATCTGCAAAGTGTGTCATGTATGGA:1 + chr2R 25002027 3' - Rt1b 4822 1 71.43 TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATAC:1 + chr3R 26504335 3' + HMS-Beagle 7000 2 56.85 AGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTATGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAAACAATTTTTGAC:1 - chr2R 4887630 3' - jockey2 3016 1 71.92 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAG:1 - chrX 17343349 3' - I-element 25 1 67.12 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGT:1 - chr2R 16731999 3' - 297 6640 2 72.14 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAATTTCATTTCGCTATATATATACTATATGTATATATATATATATATATATATATATATATACGACATGTATGCCCCATTCATGCACACACATTTTCATG:1 - chr2R 18752614 3' - jockey 4809 1 62.14 CGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACAAAAACTGAAACTGAACTGGAGGAAATGGGCACAGATAGTTCCACACTCGACTTAACGCTTCCATGGCCCCAATTATATAAGACCAGGGAG:1 - chrX 16945308 3' + pogo 40 1 65.75 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCT:2 - chr2L 22674755 3' - mdg1 7074 2 65.07 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTTCTGA:2 + chrX 19588165 3' + roo 9036 1 60.96 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCAT:1 + chr2L 13556482 3' + transib2 2803 2 65.75 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATACAATCATTACAATTTAGGAACCTAAATAGAAAAATTTTATGTTTGTTATGTATGCTATGTGTGAACAGACCTGCACAGATCGATGATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAGAAACA:1 + chr3L 23354563 3' - F-element 14 1 71.92 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTA:1 + chr2R 6964882 3' - Burdock 6190 2 55.48 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGT:1 + chrX 10319724 3' + mdg1 7415 2 54.79 AACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGTTCCAAAGCCATTTATTATTAAAACGGAGTCCCTGTTTGTGCAAGAACAGCGAG:1 - chr3R 23891794 3' - FB 727 2 62.76 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTTTAAGCCTCTTTGGTTTCGTTTCAGTTTTG:1 + chr3L 10360957 3' - 412 7081 2 45.21 GCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATT:1 + chr3R 15790124 3' - flea 4731 1 68.49 GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTGTAAGTACTA:1 + chrX 20999639 3' - BS 9 1 73.29 TATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTC:2 + chr2R 10418554 3' - 1360 3098 1 66.44 AACAGAATCTTTCAAAGTCTTATTTTTTTTTTCAAAATTTAAAGCTATACTTCATTCTTTATTACTTTAATTCAAACCATTACAAATATTTAAAACATTTCA:1 - chr3R 9284442 3' - invader1 3534 1 86.27 TAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTATTTTTCTCCAATGTTTTTAGACTATAAAATGGTTGAATTAGACTAATATGATT:1 + chr2R 9956178 3' - Bari1 1447 1 63.01 CAGAGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACAGAATACTTGCAATACCTTTAGCTCAAAGCACTTAAGCTAAG:2 - chr2L 15081389 3' + hobo 1 1 50.00 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCCCAGTTCCCTCG:1 + chr3L 16211613 3' + transib2 2778 1 53.73 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGGTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTGATATTGTCAGCATACATAAAATGCTAAAAGAGGAATATATCGTGTGA:1 - chr2L 13556300 3' + transib2 2802 1 65.07 TCTAACATAACTTAATCTAACAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAGGATGGCAG:1 - chr3R 30946478 3' - Transpac 28 2 66.44 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTTTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAG:1 + chr2R 21410970 3' - Burdock 60 2 58.90 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTGTGTTCAATGGTTAACATACGTATCTTATGCTTTGGTAGTATATTTTTTAACTGGGAGTAACAATATACTTAAA:1 + chr2L 13476648 3' - roo 8737 2 56.55 TTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCC:1 - chr3R 9557531 3' - G2 3044 1 63.01 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTA:1 + chr2R 12133844 3' - jockey 68 1 59.59 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAATGAAAAATTA:1 - chr3L 23287170 3' - 1360 10 2 78.77 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGATTT:1 + chr2R 13259409 3' - mdg1 7073 2 58.90 ATAAAAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTA:2 - chr2L 4025375 3' - copia 5090 1 56.16 ATGTACATACACACACACACATACGATTGTCCCAAAGTCAAGG:1 + chr2R 16741048 3' + accord 181 2 95.35 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCA:1 + chrX 13490759 3' + 297 6926 2 60.00 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACTTCCAGCGCAGCAATACTGCTGGCGTCTCGCTCGCACACGTGGCTCG:1 + chr3R 13875165 3' + P-element 2851 1 60.96 AAATACTGAACTCGGCTAATGCTCCTTAACGAAATAGGTACGGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAAAT:1 - chrX 7082215 3' + Gypsy12A_LTR 1876 1 40.28 TTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAACGCGCTCCTGCTCTTGGAAAATATAGCTTTCATATAATTCCCCTCGTAAGAGGTACTATCAATGAGATTGGACGACTGATGGAGGTAGCACATCACTTTGAAACGCATCGTCTTTGTGC:1 + chr2L 14513655 3' + F-element 343 1 61.64 AGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTGAAAGCCACCCCAAATGTGAGCGGGTGCACACAGACTCCCCCAAAAACTCCTAAACCGAATCAATTAAATTCAATTAGGCTCGG:1 + chr2L 16400969 3' + ZAM 1 2 58.22 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCA:2 - chr2L 4063830 3' + roo 358 2 55.00 GAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGGGGTTGAAGGGGGACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGAC:1 + chr3L 18931033 3' - I-element 26 1 44.83 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGTGCCAAACCGTCTTCATGTTGCTCCTTCATGCATAATAGTAATTTGCCAA:1 - chr2R 23180149 3' - roo 20 2 69.86 ATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAATTGAGAAAGAAATAAACTAAAAAAACTGAAAAGATATAAAAAACAGGTTGTTAAGGAAAACTTAGCTAACAAAATAATAATCAATAGTAGAAACAGAAC:1 + chr2R 5398408 3' + Doc2-element 4710 1 56.52 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAAACG:1 - 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hopper 63 1 57.53 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGGCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAG:1 - chr3R 14980275 3' + roo 9044 1 66.44 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAAT:1 - chr2R 13259308 3' + mdg1 334 2 75.34 CTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATTCTTAAAAAGCGCGCATCAGGCCGGTGTAATAATTGATAAAAAAGTTTAAAAAAATCCCAGATTCC:1 + chr3L 16780212 3' + Doc2-element 4336 1 54.79 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTGGCTCTTCGTTTCATTCATGTC:1 - chrX 18282606 3' + P-element 2864 1 52.17 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTT:1 + chrX 18336668 3' - mdg3 71 2 65.03 AATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAAT:1 - 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chr3L 24934254 3' - HMS-Beagle2 18 2 73.29 GTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTTGGAAAATTGTCATCGCCTTTTGTCTCTGTATGTTTGCGAAGCTAATTTCATTTTCCGTCAGCCTTGTCG:1 - chr2L 14671555 3' + FB 900 3 63.48 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATAAACCTCCCTGTGAGG:2 + chr2R 5479996 3' - F-element 71 1 54.79 GGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGTTGCCCACACTCCATCTTAGCTGTCATGTGTCATTCTATCTGCATATATATATATTACATTTATCTCTCTGTCAATCCGCA:1 - chr2R 20683286 3' - FB 670 2 55.86 AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCG:1 + chr2R 7850027 3' + roo 374 1 50.44 AATATAAATATAAAAATATATATATCGTGTCATATCTGTGTTGTGGCACATCTATTGCATATAGGTAAATTTATGTATTATTTTCTCCGCTCGAGGAGGCG:1 - chr3L 19514489 3' + Stalker 6939 4 48.51 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCCTTTTGCTGGCAA:1 + chr2L 8338236 3' + P-element 2868 1 70.23 TGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTAGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTACCCCGGGCCCATGACCCCCTGAAAGCCCGTACCCCGATCCACGAAAACCGACAGGTTCACCCTGGGAGAGTAGGCTTGGCTG:1 - chr3L 13544496 3' - Q-element 120 2 54.79 AAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGG:2 - chr2L 22966918 3' - 1360 3234 1 74.66 TATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTATTCATCTACTCACATATAGATGGTAATCGTGCGATAAACCTAATATTACGATAATGG:1 + chr4 697237 3' - Stalker4 88 4 60.96 CTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGATGAGAAGGATGATGAGGATGAGAATGGTGGAACACTTAACAATCTAATTTAACACAGTTCTAGAGCGATTTATGGTTTA:1 + chr2R 15463493 3' + R2-element 425 1 56.85 AAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTA:1 + chr2R 4659356 3' - S-element 1498 1 52.41 GCTCACACAATTGGAAAGACACAGACAGTCGGCCGCAGCTGGAGATTCTCACACACATGTGAAAAAATCGCGAGTTGCATGAAAAAAAACAATAGAGCAAGATGCACTTAAGATGCTGCGTGCTACAAGGGGAGAGACGAAACATA:1 + chr2L 7596952 3' - Ivk 37 1 47.26 CATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTAAGCTGGCATTGCAGATGCACTGCATTTTGTTCTTGTGCATCGCTTACGCATAACA:1 + chr3L 17588954 3' - 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Dm88 4378 2 53.42 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGATTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATG:1 - chr3R 11040066 3' + Bari1 1635 1 66.90 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATA:2 + chrX 8308482 3' + roo 331 2 72.60 TATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACAT:1 + chr3R 21276650 3' + BS 5066 1 54.68 TAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAAAAAGCTCCACTGCAAAAAGCCGCAAAAAGTCAGGGTCAGCTCTCCGCATGTAAAAATCTACAGTCGAAGTCAGTCGATTATAACACCAGGTTTGAATACTT:1 - chrX 22487976 3' + FB 262 1 66.44 GATCATATAACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTAGTACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGCTTCTTGTTTTGCCATTGTTATGGCTTTCAGAT:1 + chr2L 17555607 3' - gypsy11 4102 2 73.81 TGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGTGGAAA:1 + chr2R 20802666 3' + mdg3 184 2 55.86 AAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATTCACAATTGTCGCAAGCTACCTCTTTCCACTGCTACAGTAAAGCATTCCAAACTCTTTTCGCTCAACACTAACAAGATCAATATTCCGTTGCCTTAGTTTTAATCATAAAT:1 + chr2L 16521914 3' + Doc 4461 1 78.08 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCTATCTAGTTGAAATGCAATTAAATTCAGAG:1 + chr3R 5769134 3' - roo 8701 2 58.90 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCGAA:1 - chr3L 3983800 3' - P-element 39 1 49.59 AGAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCG:1 - chr2L 11219886 3' + 1360 400 1 43.84 TAACACTATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTACTTCACTTTTCCCACTGCCAACGGCAGGGAGCACTGG:1 - chr3L 12672198 3' - diver2 390 1 52.05 AAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGG:1 - chr3L 5061553 3' + 17.6 7348 2 66.44 GGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATT:1 + chr2L 6647713 3' - mdg3 5332 2 68.49 TAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTAAGGCAGCCGCAAACAAAGAACATTTGCCGAATGT:1 - chr3L 9755929 3' - F-element 4241 1 75.69 CTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGCAAATAAACGCAAAATATTTCCAATCAAAGAAAGGGGAATCAGGAATGAAAGCCACAGCAAACAAAGTTCAAATTGTGGCAACAGTTGCGGCCAATACAATAACAATAA:1 - chr3L 5199824 3' + Tirant 440 1 78.08 GTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAATGAAAAATTTCTATCTAAAGTGGAGAAAGGGTTCCTAA:1 + chr3L 23249504 3' + rover 7261 2 47.95 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGAGATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAG:1 - chr2L 13556349 3' + transib2 2759 1 65.71 CATTTCATTTAGTTTAATAATTAATTTACACACATGATAAATTTCAATTGTTTAGGAAACTGATTGTCTATACTATCTGTCCTCATAAATTAATTAGTCACTTGTTACAAAGTCTTACCAATAGCTTTGGGTTAAATAATAAAATT:1 + chr3L 7949608 3' - S-element 385 1 80.14 AGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAA:1 - chr3R 4160069 3' + invader2 5042 2 60.27 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCA:1 + chrX 8200334 3' + flea 4989 2 69.18 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCAT:1 + chr2R 13766308 3' - roo 42 2 54.14 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGA:1 - chr2R 7244805 3' - diver 5936 2 52.14 AGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCAATAAAAA:2 + chr3R 23021013 3' - INE-1 572 1 47.26 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGT:1 + chr3L 26291003 3' + Tabor 7286 2 57.53 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGAT:1 - chr2L 4003648 3' - mdg1 25 2 67.12 AATTATATATATAAAAAAAATATATATATATATCAAAATTTTGTGCAACTGGCAACTGCTTCATGTCTACTGCTTTATGGTCAACTGCTTGCCAAAAAAGACAGGCGCGCATGCGCACTTTAATATTTCTGCTTAGCTTTTACATT:1 + chrX 16565629 3' + transib4 2576 1 67.12 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACTTTTATGCGCAATAGAAAACTTGCAAATCGCTTTTTGTTTTCAT:1 - 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Tirant 10 2 72.12 ATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAAATCTGATTGGACACCGACACTAAATAATAAACCAATCGCCGCAAGGTG:1 + chr2R 21160841 3' - Transpac 4918 1 63.45 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTG:1 - chr2R 16817905 3' + 412 7472 2 75.19 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAA:1 + chr2R 3563180 3' - Transpac 70 2 62.33 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAG:1 + chr3L 23456281 3' + 1360 3369 1 47.26 TTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTT:1 - chr3R 19450067 3' - roo 8657 1 50.68 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGAATAAATATGTGCGAGTAATTTGCATATGCATACAAAGAGATAGATAGGCGATATGCGAATGGGATAGTATATCCTACTATATATGTACGATTAATGCAGATAAGTTTGATTTTAAGATTAAAAGTG:1 - chrX 15065220 3' - accord 7027 2 73.97 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGGAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATT:1 + chr3R 16342018 3' - P-element 73 1 30.50 AGATACCCGTTACTCAGCTATTCAGAATGCCAAAATTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGGCAAATGAAAATGTGAAAATATTAACATATTTTTGAAATGTGCGGGCGTGGCAGTTTTGTGCG:1 - chr3L 19271025 3' - INE-1 542 1 47.50 CAAGTANAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTGAACATATTGAAAAGCCGCATCTGAATATAACTGAACCATCAATGTTTTTCGATGCTGGGTCCATGAATGTGACACTT:1 - chr4 640551 3' + 297 6552 2 59.59 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGGGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGGTAAAATCGGA:1 + chrX 22386818 3' - hobo 74 1 57.53 ATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGCTCGAAGGACCTGTATCCTGTCCCATGCGTCCTTGGGCAAAACAACAATTGCTCACCGGGTGAAATAATGAT:1 + chrX 14543386 3' - G-element 4275 1 52.05 GAACTCGACTATAGCAATCTCTCTTGTTAATATTGATTTATTAATAAACTATATCCTAATTTAAAAGGGGCATTAAAGAAATTTCCAAAAAAAATATATATATGGTATCTTGTTTAAGTACTGGATAATAAGTAGGCGATAATTTT:2 + chrX 15835996 3' + INE-1 574 1 86.30 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAAACCGGACGAGTTCATG:1 + chr2L 10156204 3' - 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hobo 21 1 67.12 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGT:1 - chr3R 24219271 3' - roo 8727 2 62.33 TAATTAAAACCTCTTTTTTCTTCCCCATTCGTGAATCGCATTAATCGAATCGATTTAAATACCTATACCTATACCTATACCTTGCCGCTTCGAAAAGGGAG:1 + chr2L 7122903 3' - Stalker2 7183 1 78.22 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGGGCCAAACCGTCTTCATGTTGCTCCTTCATGCATAATAGTAATTTGCCAAAGGCCGA:1 - chr2R 23180142 3' - roo 12 2 76.55 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAAGTACAACAGAAATGGTTAAAAGATAAGCTATGACAATGACGGCCG:1 + chr3R 24090583 3' + roo 396 1 68.57 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTTCTGTGTGTGCGCTGTTGCTGTTGTTGTCACTTTC:1 - chr3R 25709721 3' + hopper 1402 1 75.34 AGTTTCCCGACTTTCAGATACCCATTGTCACGTCTTTTCGGTCAGATCACAGTTCTTCGCGATTTTTTTGAGATTGTCTGCGAGACGGTTTTGGATGGAAGACATTAGAAGTGGCTTCGGTATATAAAAAAATATTCCAAAAGCTT:1 + chr2L 22176153 3' - INE-1 557 1 57.53 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAGTAGCCATCTTTAAGTTAGGCATCT:1 + chr3L 1279194 3' + roo 358 2 55.48 TGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGA:1 + chr2R 3564117 3' + Tabor 7237 2 76.03 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAATTCGGTGGCAA:1 + chr3R 30987618 3' - F-element 93 1 66.44 CTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTAGTCAAGTTTTACACTATGGTACACTATGGTATGCTACTATATATATGTTATTTGTCTCTTAATTTT:1 + chr2R 3032540 3' - I-element 5101 1 54.11 TTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCTGCGTTCATTTCGCTGGGTTTCGGGGTTAAGTTCTTTTCATCATGTTTTAAAAGT:1 + chr3R 12242354 3' + transib2 2761 1 63.01 ATGGGGCAACGCATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACCTGCGTATGCTTAATTTATTTGCAATTTGGATTTCGGATTTTTATGAGC:1 - chrX 3177972 3' + Doc3-element 4341 1 66.44 TATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATAAAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATTGTAATGATCATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAA:5 + chr2R 18487358 3' + INE-1 29 1 50.68 TTATTATTATTATTATTATTATTATTAAGTTATCCTATCTAACTTTAACGGATCGGTGACCTTTGACACAAAGAAACATCATCTCGTCGGTTCCTTTGTGGTGCAATTCTCAAACGAAACGATTACGGTCGGTAATCAAAACAACA:1 - chrX 21933353 3' - mdg1 7076 8 72.60 CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAA:2 - chr3L 24934270 3' - HMS-Beagle2 6917 2 62.33 TCTTTATATATTTATATTTATTTATTAATATTTCTTATTAATATATTGTTTATTTCCTGGACTCCACTAATTGTTCTGCCTTCTCCACTTCATTGCAGTTCATTAGCTGGAAGAGCGACGAGGTGGCCCAGTCGGCTGAGAGCTT:1 - chr3R 5761671 3' - Stalker4 7042 4 79.31 ATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGAGAAAATAAATTTACAGTACAGTTTTCTGAAGTTAAAGATAAGGTACCCGGCCAAACAAAAAAGTTCACATTTCCGTTCATCAAACCCC:1 + chr2L 14964189 3' + pogo 38 1 72.66 GTTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTT:1 + chr3L 18046682 3' + roo 8990 2 71.92 AGTAAAGCATTTGACTCTGTTAAGCACCGAGTTCTCGGCAACCACTAAAGCGCCGCAG:1 - chr2R 2521239 3' + Q-element 322 2 56.90 CTGTAAGGCTCATGCAACTCCTAACTATGAGTCTACAACGATTTAAGATAAGGAGCATATAAATTCTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACTAATAATAATAAGCTTACAAAGTAAATACCAGTTTACCATCAAAAACACTACG:1 + chr3L 15864468 3' - Cr1a 4170 1 29.45 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACG:1 + chrX 22840558 3' + copia 5048 2 68.49 AAAAAAGGCGAATAAAAAAAGATAGAAACCAAAACAAAAGTCTAAGCAAATTAACTTGGCCCATTCGTTGTATTGCGAGTATTGTTCTAGTGGTTATATTATGTTTGGGGTGTAAGCTTCAATATCGTGTATTTGGCATTGCGTGA:1 + chr2L 14039281 3' + Doc2-element 256 1 74.66 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCAACACCTGT:1 + chr3L 13295000 3' + roo 9039 1 60.74 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAA:1 + chr2R 8047346 3' + 1360 3338 1 60.00 TTTTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGATACCGACGAGTCTTTTCGATGTAATTCCATCCATTGAGCATAGAAAATTGTATATCGAGGTCATGAGAACAAATTATTTCAA:1 + chr3L 18349811 3' + F-element 4251 1 64.39 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACAATGAAATTTACATAAAACTATAATTATTATAAAAAAAAGA:1 + chr3L 16770579 3' + S-element 1674 1 56.85 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTA:1 - chrX 14450398 3' + hopper2 1544 1 61.64 TCTTATCTTTAATTATACATGTTTAGGTATGTTTAGGTATTAGCTTTCTAGCAACTCCTCCTGTACTATCGAAATTCTTATCTTTATTTATTTGGTGAACCATTTTTCGAC:1 - chr3L 15062870 3' - invader2 4734 1 72.07 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCAAATGA:1 + chr3L 10425909 3' + I-element 5319 1 55.48 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGGAAAA:1 + chr3R 28385666 3' - transib2 23 1 69.86 TATGTGTGCGTGTTGTGCTAAAAGACTATTGCCGAAATCAATTCTGATCTAAAAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGCCCAAGTCGTAGCCAAAAGGCTCACAGTGGCAATCCAAACAGTAACAGCAACACCAGCAACAC:1 - chr2L 20698311 3' - 1360 3210 1 61.64 AAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTT:2 + chr2L 15763120 3' + mdg1 7074 2 75.34 CATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTAAAAATAACAATATATAAACAACTTTAAATGAGTAGCAAAAAATTTGCACACTAAA:2 + chr3L 5377322 3' + blood 7118 2 58.90 CAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTGCAAAATATTTAGAATGCTGGAATGGAAATGTGGGTGGTGGATGGTGGATGGGGTGGAAAGGCTGAGCGTTATGCTT:1 - chr3R 27843092 3' - I-element 5273 1 77.40 CTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCTTTTTGAACAGAAGCTAATGAACTTGAAAGAGTCTTGAAATGGTGAAGACTCAAGACTGCT:1 - chr3L 21053447 3' - I-element 439 1 58.22 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGGATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTG:1 - chr2R 8157160 3' + mdg1 7413 2 52.78 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGCTAGCAGGGGGCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTTCGCACTTAAAACTGG:1 + chr3R 21933241 3' - pogo 36 1 55.83 TTATTATTATTATCGTTATTGTTTAAACAACTGACCACGCGTTTATTGGAATTTTTTGGCATTGT:1 + chr3L 15696048 3' - mdg1 29 2 70.77 TTTATTAATTTATTTATTAAGGAATCATCAAAAGTGGATTCTTAATTTGTAAATTAGTAAGCTGACTAAAACTGCATACACTGCTGATATAATGTTATCAGGAGATGCAATTGCATATTTAGTTAATCATTCTTTATTGTTCGTCC:1 - chr2L 14700680 3' - X-element 4712 1 63.70 AAAACAAAAAAAAAATCTTTTGCCAAATTAGAACCGATCTCCCACAATCCAACTTGGTGCGACGCATGCTGCCTAA:1 - chr3R 32009567 3' + HMS-Beagle2 493 1 50.00 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTT:1 - chr3L 17183635 3' - diver 25 2 62.07 CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCCACCTGTCGCCATGAATAAGTGACTCCTCCGCTCGAGTTTCAATTTAAATTGCACAAATTCTGCGCATCAACTTGAGAGCCCCTCGAGATC:1 - chr3L 12251393 3' + roo 8718 2 66.44 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCA:1 - chr3R 11191356 3' + roo 9047 1 66.44 CGTACCGATGTGGTTATACGGGATCGAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATTTATTTATAAACGTATTCATGTAACGCAAAATCCCGAACTACGACAAATAAACAACTGTCCCTGGTATACATATACGCAACTCGACCATAAAGTGG:1 - chrX 21639991 3' + Helena 1059 1 79.45 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGAGCCAAGATCGCCTTG:1 - chrX 1263918 3' + Burdock 6357 2 58.22 GTACATATGTATACACTATAATTAAGGAAAAAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTAAGTTCAGAAGGAATAAAAATGGACGCTACAAGCGCAGAAAAACGGAAAAAATGAGCAAAGTACCTTAAATATTGGTAAAG:1 - chrX 2424882 3' + G5A 2734 1 52.74 CACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAA:1 + chr3R 1977619 3' + micropia 381 2 64.38 AGCGGGGCTTGTGTCGGAGCTAGAAGTGCGGGAGCGCTCTTGCTCTCTTCATGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGTTTTGGGTTGGATTTTATTGTTTTTTTGGTGAA:1 + chr3L 4656802 3' - F-element 394 1 77.19 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATTATTTTTA:3 - chr2R 8157137 3' + mdg1 7434 2 67.81 TGTACATTTTGTTGTTAAGTCACTGCTAGTTCGCTTTTCAAATATCATTATAGCACCCAATTAACATTCCAAAGCAAATA:1 - chr3L 17745050 3' - transib2 2757 1 72.50 TAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTAGAAA:1 + chr3L 19462675 3' + Stalker4 7109 4 75.34 ACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGGATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAGATAAAAAA:1 + chr2L 14971200 3' - micropia 9 2 74.66 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATAT:1 - chrX 18009925 3' + 412 7497 2 51.41 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAA:1 - chr2L 16946045 3' - hopper 74 1 68.06 TTGTATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTTTGCGCTTTGAGAATTATTATGTCAT:2 - chr2L 15379263 3' - Stalker 6940 4 48.63 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTT:5 + chrX 7795624 3' + roo 9022 2 52.05 ACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACTTTTTCTATACTTAATAACTAACAAGGAGATGTTTGGGCTGATGTGGGCTACATTT:1 - chr2L 53537 3' - accord 137 2 55.20 AGAGGGCGATTATTTTTAAAACAAACATTTTCGAGATATCCGCCGGAGTAGAGCCACGCGAGTCTT:1 + chr3R 28385451 3' + transib2 2597 1 69.70 GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTCAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGACGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTACTGATTTTATTTACAACTCTGGCTAAATGAATTTTAATTGAACCATAAACGCCA:1 - chr3L 6784495 3' + HMS-Beagle2 7114 2 63.01 CCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACTCAAAATTCTCTGGAACCGAAAACTTTCGGCTACTGTGCACGCATATTGAAAACTTAGAAAAAATAATGAGAGAATCAGGAATGATATGGCATTCAATATATCAAAATCAGAAA:1 - chr3R 29523622 3' - copia 151 2 76.03 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGA:1 + chr3L 17568104 3' + S-element 1680 2 60.58 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGTGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACG:1 + chr2L 15550770 3' + Bari1 1652 1 57.93 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAAAAGCTTA:1 + chr2L 4003839 3' + mdg1 7453 2 78.08 AGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGAGACGGCAATGCAAACGAATCATTTGAAACACCTCATTTGGATGAAATGAAAATGGCAATTTTCGGACTGC:1 - chr2R 18214491 3' + Tirant 479 1 54.11 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTC:1 + chrX 959090 3' - 412 7118 2 63.01 ATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTTATGCATAAAAAAAGCGATCAAATTCCCCATTTTGAATTGTTAAGCGAAAATCTTTGTTGCTGGTATGCTCAAT:1 - chrX 19056661 3' + jockey 4857 1 55.48 ATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGGGGTGAGTTTTTTATATAGTCGATTGTGGCTGTATATTTCTTTTTTTTTTGGATTTTTTTTTTTGCTGGCTGCTTGTTTCTGTTTT:1 - chr3R 9442149 3' - HeT-A 5980 1 45.99 CGACAATGAATAGCTAAATTTCCCACTACTTCCCATTTGCCCTGTCTGTCTGAATGCCTGCCTTTCTGTGGATGCCTGTTCTTTGGCGCAAATTTCATTTCAACTTTGTCTCCTCTCCGTTGGCT:1 + chrX 11020969 3' - aurora-element 4171 1 72.80 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATATTTTATTCACACATATGTATATATG:1 + chr2R 9871608 3' - roo 8683 2 73.29 CTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAAAAAAAGGAAGTCAACTAGCTGAGCCCAGTTTTTGCTGGTTTAATTCATATAAGTTTGTGCATCATCTTGTATTTTTCTTGAATCATTTTTCTTGTAACTGTAACTATGC:1 - chrX 8544259 3' + Bica 98 1 76.71 CTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATTATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGCAATCGATGTCCATTGGTATGTAGAAGGTTGTGGTAAT:1 + chr3R 16518985 3' + Tirant 337 2 58.22 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGA:1 - chr3R 11191382 3' + roo 9021 2 55.48 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATAT:1 + chr3R 30347366 3' - P-element 104 1 14.38 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCGGTTGC:1 + chrX 959096 3' - 412 57 2 58.33 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAA:2 - chr3R 24450397 3' - 412 7091 2 56.85 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTC:1 + chr3L 21996238 3' + Transpac 249 2 70.16 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTTGATTTGCGGCACATGAAGGGATCGTTTATCATTAAGATCGGACAATGTTCTTTCTGAATGGTGTGATGTTAGGTTTTAGGATATACAATACATGGTATGTTGGGACTAGTTAACACT:1 + chr3L 20466228 3' - I-element 5136 1 77.40 TATTAAAAAAAAAAACAAATAAAAAATAAAACACATTGTTTTTTTATACCTTGGAATGTTTCAGGCTTATCGATATTTTATTACCTATCTTGTTTAATTGACTTGATCGAGCGCTACGAGATTAATGCAATCAGACTAAAAAAA:1 + chr2L 5207165 3' - hopper 153 1 58.33 TTTATTTAAAAATAAAATAAAAAAAAAATTGAAAAAATTATATCTGCTTGTTTGAATTGGGGCATGGACAATATGGGGTTTTAGCTAATGATATCAGATTTCCCAAATAAATAACAACACTTTTCGTTTTTCTTTATCTTTATTGT:1 - chrX 11801566 3' + transib2 2634 1 52.74 GTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACAT:2 - chr3L 18125871 3' + Ivk 5355 1 63.70 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTA:1 - chr3R 904905 3' - rover 6963 2 64.58 ACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTCGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTTTGA:1 - chr2R 4193268 3' + 1360 3383 2 71.92 GGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAA:1 - chrX 15200808 3' - 17.6 6961 2 60.27 GATCTCGACGCTCATACGGACAGACGGGCATGGCTAGATCGACTAGGCTATTGATTCTCTCTTGGTAATATTTTGATCCTTTAAATTCTCTTTATATCAATTTGTATGATTCTTAAGCTTAATCAGCAAATGTGAGCTTTTATCGG:1 - chr2R 6946895 3' - INE-1 132 1 69.86 TTTTTTTTTTTCTTTTTTTAAAATTTTTGAATTTT:1 - chr3L 7957138 3' - TART-C 11100 1 82.86 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAAT:1 - chr3L 11913216 3' - BS 5082 1 77.40 ATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAATGGGT:1 + chr2L 1924046 3' - G2 2990 1 67.81 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATT:1 + chrX 8360625 3' + roo 9010 2 61.81 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTT:2 + chr2R 13259396 3' - mdg1 48 2 50.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCC:1 + chr2L 18549933 3' + roo 351 2 54.79 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGA:3 + chr2L 16539746 3' - Juan 4087 1 52.74 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGAGGAGTGGAGAATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAA:1 - chr3R 31886841 3' - hopper 28 1 54.05 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGATCGGCGAAAAGCCAGAAACAGACAACCTGGTCAGACAGAAGAATTAAACT:1 + chr2R 16929877 3' + jockey 4985 1 72.14 TTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGAGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTT:1 + chr3L 6447100 3' + transib2 2739 1 73.29 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATAACTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCTT:2 - chrX 16541453 3' - INE-1 83 1 73.29 GTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGTTCGATGAGGTCCAATGACTCGCGACTTATCAAATGAGGCGTACTTAATTGAATGTAAGAGACAGTGGATCCCAGGGACCA:1 - chrX 3483500 3' + blood 273 2 62.33 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGAATAACTAAAACCAAACAGCCTCCAATGCCAGTTGGTTGCAAGAAACCCCATATT:1 - chr3L 14943050 3' - transib2 36 1 53.66 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAA:1 + chr3R 30675448 3' - 297 52 2 62.96 AATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTT:2 - chr3R 11040039 3' + Bari1 1661 1 54.11 ATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTTAATGGTCACATGAAGGCGTGAAGTGTCCTCCAACTCGTCCTCCCATTTTGGATATTGATACGTAAGCCCTTTGCCGCAGCACTTAAACTGTATTT:2 - chr3R 25572705 3' - F-element 121 1 69.18 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAA:1 + chr2R 23180279 3' + roo 335 2 67.12 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCCGCAATTTTAATT:1 - chr2R 22287383 3' - jockey 31 1 63.70 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTG:1 - chr3R 27133606 3' - opus 7188 4 80.77 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATT:1 - chrX 19266811 3' + roo 9044 1 56.64 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTTGTATGTATGTAATATAATGTATATGTATCCGTTGTAAAACCTTTTTAAATATATTGAGATGTTTATCCTAACAATA:3 - chr2L 21328130 3' + 297 359 2 60.96 AACGCAGACTGCGGCGTCTTAAAAGAGCTGCATTATATAATTTGGTGGGAACTAGACTGTAACTGAACAGCAATCGTTAGGCTTTCTCACATTTTTAATGGCATTTGTATAGTCGATTCGATAACTGAACAAATCCTATACCATTC:1 - chr2R 11752649 3' + rooA 225 2 69.86 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAGAATTGTTCTGAATATC:1 + chrX 19588170 3' + roo 9041 1 64.38 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAATAAC:1 - chr2R 15326788 3' + copia 247 1 78.77 TGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATATATCGTATGATGTTAAAAAGCA:1 - chr2L 13556288 3' + transib2 2814 1 78.77 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGT:1 + chr2R 2427623 3' - Doc 59 1 58.90 TACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCAAGAATAATTAAGAACAATTTTGTCGTCGTATTG:1 + chr2R 4023355 3' + gypsy5 245 2 78.08 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAGT:1 + chrX 18336709 3' - mdg3 33 2 63.70 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTC:1 - chrX 14722124 3' + diver 167 2 64.29 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTTCAAGTTTTTATTTTTATTTAGCATTT:1 + chr3L 10731884 3' - 297 44 2 52.14 CCCGTATGCCTTAAAAAATAAATTTAATTATCAAAAAAAAAAACCAGTCGCTTTATTTGCAGTTACCCAACGGTAGCCA:1 - chr3R 26932470 3' + X-element 4704 1 56.96 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACC:1 + chrX 20455716 3' - hobo 38 1 53.78 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCACGTAAGAGCAATCC:1 + chr3L 16973480 3' + S-element 1671 1 52.05 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCCTCTTGTGCTCAAACTTCTG:1 - chr3R 13972960 3' - 412 72 2 65.75 GTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAA:1 + chr2R 12185428 3' - accord 11 2 66.04 TAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTA:1 + chr2L 11257135 3' - rover 6970 2 69.29 AGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAAAATGGCCAGAATCGGGCAACCGATGCTCTGAATACCCGTGCAGATCCACATGTATAGTACCACATATTATATTTTTTT:1 + chrX 2479435 3' + mdg3 5023 1 68.18 ATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTTTCTTGGAATCCAAAGTGGTAGCGAGCGTTGCTAAA:1 - chr2L 22966849 3' - 1360 3165 1 69.18 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGGGTCTGTCATTTTT:1 + chr2L 19675061 3' - 297 6625 2 68.80 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGGTTGCTTTTTAGCTAAAAGGGCTGAGTCATTGGAATACACTT:1 + chr3R 23881727 3' - FB 7 1 70.37 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGT:1 - chr2L 10156090 3' + hopper 1377 1 55.63 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGTAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATTTGGTACCATGAATGCAGATTTTTTTTAGATTTTGTACCACTT:1 - chr2R 5070933 3' - Tirant 8107 1 22.69 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGC:1 + chrX 21224631 3' + roo 9038 1 51.82 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGGGGCTCCGATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGGGGGTTGAGATGAGTAGACTTTGGATAAAAAAAATAATATTACGTAAAAT:1 + chr3L 10373708 3' - mdg1 4 2 71.92 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTTAATGTTTACTTCTTTATACGTTTTTATAGCTG:1 + chr3L 13831284 3' + 412 7487 2 60.69 TATATATGTATATCTATATTTACATATAATGTCTTCTTCATAAATGGTGAACTGTGTATAAAAGAAGTTTTTTAGTAATTTTTCTTTAAGTGATTTAGAAAATAGTTGTCAGAATTATTTTCAAAATCATTTTCCTCGAAT:1 + chrX 22641935 3' - Stalker4 88 4 82.98 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGG:1 - chr2L 10156122 3' + hopper2 1534 1 68.49 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACCG:1 + chr2L 11839761 3' + mdg1 372 2 54.11 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCT:1 - chr2R 7090654 3' + I-element 5276 1 70.55 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATAACCAGCTTTATAAGTATCTCAATCTATCTAGCGCTTTACTATCTGGAA:1 - chr2L 6174007 3' + I-element 5340 1 69.86 TATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTGTGAACGACGAACTTTAAGTGCCCTGAGTTCAGAGTGGAAATCAATGCCAATTGAACTCG:1 - chr3R 10207717 3' + roo 21 2 58.62 AGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCATGCAGAAAGTTTCGCC:1 - chr2R 18514864 3' + P-element 380 1 63.87 GGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTTCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGGGCACCACTTCAATCTATGCAATTTCGTTTCGAAGCAGAATGCACATTTTAAAGTGTGTAGACAGCGACTAATACCC:1 - chr2R 6609810 3' - R1A1-element 149 1 51.05 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGAAG:1 - chr3R 16341914 3' + P-element 2849 1 59.59 TACATACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTG:1 - chr2L 23008388 3' - transib2 291 1 77.40 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAGGGTGTA:1 - chr3R 4682866 3' - Burdock 39 2 56.94 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTC:1 - chr3R 27133552 3' - opus 147 4 60.27 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTCGAGAGGCTCTCTCTCTTGAATTTCCTTCTCTGAGGTTAACTTTCTCGATGCGGACCGAACAAATGGCAAGCTGAGCTCCC:1 - chr3R 8889998 3' - FB 12 1 65.55 TAATAATTACAATAATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATAATTAATAATATAATACATTATATATTAAAAATTAATAATGTTACAGATTGGGCAACCAGCTTTAAAAATCGCATTGTACCCAAACATTTATATATTTAT:1 - chr2R 8186625 3' + mdg1 27 2 45.21 GGAAAATTGACAATAATTTATTTGATTTGGCAGCTGGCAGTGTGAGGTAACTTTCCAGTCGCAGCGTCACTGGATGGGGATAATATTATTTTAATGCGCTCAATTTATAGGTGTACACGATATACACACCACTTGCAACTTTTG:1 - chr2L 4299001 3' - R1A1-element 149 1 78.47 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACTTTATGTGGTCGGAAACGCCTCCTTCTGACTGTTACATACTTTTCAACGGATACCCTTTTACTCTACTCTAATCAAAAAAATCCTAATGAGTGTGGCTGCG:1 + chr4 643216 3' + HMS-Beagle2 7186 2 78.26 ATGATCTGTGACACGGCCATCCTGATCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAGTAATCCCTTAATATCGATCATCGTTATTAATTCATTAAGTTATTGTTTGGGCCTTTGGTTAGCAATAATAATCGTAATAATCATATGCAAGTAAAT:1 - chrX 8554821 3' - invader1 3601 1 64.38 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCAC:1 - chrX 22840463 3' - copia 4919 2 52.74 ATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTG:3 - chr3R 22590478 3' + rover 7239 2 58.22 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATT:1 - chr3R 19450051 3' + hopper 1392 1 43.45 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATA:1 + chr2L 4123965 3' + transib2 2776 1 50.68 GTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTTCTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTATCTGAC:1 + chr2L 17180168 3' - Juan 39 1 41.78 AGACCAGAGAGCGCACTCGTGCTTTCCGTCGTTGCCAAGCACAGTTCCAAAATCTTTAAGTGAAGAGTGCGCTTCCCCAACCCCGCAACCAAAAGCAAATTACACACACATACTCCAGGGTACACGCGATGCAATAAACTTGAAAA:1 - chr3L 11387183 3' + Doc4-element 114 1 73.97 TTTTTTTTGTTTATATTGTTCGCTTTAAAAAGGCAACTTATGGACCAAATATTTCTCAAGGAGGGTTTCTATCTCACTGGAAACCAAAACCACTGAATTTTTTGAATTTTTTAAAAAG:1 - chr2L 21174062 3' - Porto1 155 1 70.34 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGTTTCATG:1 + chr3R 3320507 3' - 1360 77 1 77.44 GTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCAACGGCTCTGAACGCCCGCCTCCGGTCTAACGCG:1 + chr2R 5002921 3' - F-element 396 1 66.96 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGGTTGAGTGTGCGGCGGACGTCTTACCCATTTTG:1 - chr2R 22514124 3' - P-element 38 1 41.00 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGTGTGCCATGTTTTCAAAGCTATACTATTTTCATTATTATATATACCCAAATCCCGAAGAGCATCCGCAAGCCACCACAAACTCAAACCTATTCCCACATTGTTCCC:1 - chr3L 8625745 3' + jockey 4932 1 69.18 ATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAG:4 - chr2R 23780539 3' + Ivk 5303 1 69.86 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGA:1 + chr2R 16929827 3' + jockey 4929 1 62.33 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATAAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGG:1 + chrX 12129386 3' + flea 4933 1 74.48 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGG:1 + chr3L 22035653 3' - F-element 76 1 69.66 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAATC:1 + chrX 661979 3' - 412 40 2 58.22 CGCTGATATTTTCGTTTTGTTTATTGTTTTCACTAGTTTCTTTTGTTTATCTTGTTCACAGGTTTTTAACACATATAAATATGTGTTAGCGTCTTTTCTTTTTTTTTTGTTACACACTCACAGCATTTGGCTTAAAACATTTCACT:1 - chrX 1942609 3' - Porto1 196 1 76.03 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTGTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACCTAATAATAATAAAATACAAG:1 + chr3R 7943830 3' + blood 7336 1 58.27 AATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAA:1 - chr3R 2522309 3' - Tc1-2 138 1 71.23 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGT:1 + chr2L 16946122 3' + hopper 1351 1 61.43 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATG:1 - chr3L 24934263 3' - HMS-Beagle2 6910 2 67.12 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTA:1 - chr3R 14980293 3' + roo 9026 1 54.11 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGG:1 + chrX 1341715 3' - 412 69 2 68.38 CCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCG:1 - chr3L 15103816 3' + Transpac 238 2 67.59 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCTCTTTTTCAATTT:1 + chr3R 22590592 3' - rover 48 2 57.93 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCA:1 - chr3L 2145894 3' - roo 8716 2 65.41 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAATAAAAATAGCCCCTTCCCGGATATTATTTGTTTTATTTG:1 - chr3R 10145641 3' + Juan 4130 1 75.00 ATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATA:1 - chr3R 19449957 3' - roo 395 1 58.46 CTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTTAAAGCTGGAATCGTTTGTGCATTTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTCAATCTCGCACACACTCGCACATTAGCCTAGACAAATATGCAGGTGTATAGCATAGCATATCTTTCTG:3 + chrX 12314084 3' + FB 13 1 54.79 CGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCGCCTGCACGGGCCGCACACACAACGGGCGGATGGCAAAGGA:1 + chr2R 14379185 3' - 17.6 7233 2 70.63 ATATCCTCTTAGTTAATTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGAGCTCAAAGTATCTCGCGATTCTAATACCATTTTACATAGTTTCCGTTTTTCGTTTGGCTTCGTCGGAGCTTATTTTTGTAGGTATTTTGGTGTTT:1 + chr3R 9891564 3' - invader2 5089 2 67.12 ACGTCTCTCCGTTGTTAAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGTCGCGATGCGCTCTTTATTGTATCAATAAAACTGAGCTCTGATAAGGTGAGAAA:1 + chr2L 14960932 3' - gypsy6 7681 2 72.86 AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCT:2 + chr2R 15005111 3' - BS 5058 1 62.33 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATA:2 - chr2R 15326793 3' + copia 242 1 75.34 CTGGGCAGCGGAGCCCCAGTTCGAGAAACTTACCAGCAAATTTTCGCCGTTTATAGTTGGGAATGTGCGACATCTTGATCACATCGTTGTCTGGAACCGGCAGAGGATTATACGGATTACTCGAGTGACAAGCC:1 - chr2R 12658107 3' - X-element 199 1 79.85 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCTACTTG:2 + chr3L 2544727 3' + Tirant 347 2 53.42 ATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTGTTTTCCAGTGCAGTTATTCGAGACTGC:1 - chr2L 7580846 3' - Transpac 4918 1 59.15 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGG:1 - chr2R 9871006 3' + roo 9047 1 66.18 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGC:1 + chr3R 24381386 3' + Juan 4144 1 64.38 ATGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAAGTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAA:1 + chr2L 6647708 3' - mdg3 5337 2 71.23 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAATTT:1 - chr3L 7300123 3' - roo 8707 2 55.48 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGGAGGCTTTGATTGAAATCGAAGAAGCTCAGTTCAGTTCAAGTCGATGTACGCTGCCGAGCGGTTGAAAGGATTATATTACACA:1 + chr2L 12823003 3' - P-element 39 1 46.58 ATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAATTCATAGGCGGATTCAATAAAATATAAATAATTAAATCAATTATAATACGAGTATTTAAATATGTTG:1 + chr3R 6573793 3' - Idefix 6928 2 54.11 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAA:1 + chr3R 19408013 3' + diver 176 2 49.32 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGA:1 - chr2L 18549853 3' - roo 8751 2 80.82 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAATTCAATTCAAT:1 - chr2L 2157852 3' - Doc 79 1 48.63 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATATTATTATCAGCAATCATT:1 + chr2L 6654780 3' + diver 6083 2 65.75 ATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGAAAATGCAC:1 - chr2L 23008333 3' - transib2 217 1 62.77 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATC:1 + chr2R 8047348 3' + 1360 3328 1 63.38 ATAAAATAAAATAATTAAATAAAACGATTAAAATAAATAAACATATAAATCAACGATTTATTGGCAATTAAATTATGAAAAAGAACATCAAAAAACGATTAACCTTATTATTATTATTATTATTATTATATTAGAAAAGATCAACT:2 + chr2L 16164084 3' + Doc3-element 77 1 60.27 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTTGCCA:1 - chr3L 5389837 3' + roo 9037 1 62.33 TAGGATGATTACGTTGGGAAGATGACTGTCTTAATTTGGCTGGCCTAGAGAATCGCAAATTTTGGCACCGAACGGGCATCGCGCAGAAGGAAAAAACGC:1 - chr2L 22035802 3' - gypsy3 260 2 70.71 TTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAG:1 + chr3R 4682973 3' + Burdock 180 2 74.66 AGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTAT:1 + chr2R 8157251 3' - mdg1 7122 2 76.03 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTATTAAGCCAAGTGTTAAACTCATTTAGCGCGGATTTAT:1 + chr2L 16946188 3' - hopper 4 2 81.51 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTTTCGACTGCCACTTTGCTACTGTTTCCTCGAAGCATGGAGAAATTCTCATTTGCATTTCGCGTAATCCTAATAGACAGATAAATGTTCAACCGAAAGGCAATTAGCAAGA:1 - chr3R 15056573 3' - copia 4920 2 73.79 AAATGTTTAAATATCTTTTAAACGACAAAGGTTGAAGGTTTAACAAGATTTATTTTACCGAGAAACATCTATTAATTGGACTAAAAATTTGATTTATGATCATGTTTGAACTTAATGGTTCAAACAGTCGAAAGAAATATTTGTAG:3 - chr3R 24571016 3' - Transib-N1_DM 288 1 78.08 AAACGAAGATATACATAATGACTTAAACATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAGCAGCAAAATACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTTCAACGCGATATGATCTGGCATAATGATTGCACGCC:1 - chr2L 7096377 3' + Porto1 4382 1 75.17 TTACTCTAAGATGCGATTATCATGTCACCTATCTAGCCAAAGCAAACACCAAATAAACAAGAATTCAGTTTAAACACAAGCGCCCACGGCCAAAAAAGTTATCTCAGCAATAAATACAAAAAGTATAATTCACTAAGCTACAGTAG:1 - chrX 8263729 3' + roo 8981 2 76.03 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGTTCTG:1 + chrX 7795656 3' + roo 391 2 73.29 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCAC:1 - chr3R 5769041 3' + roo 315 2 80.14 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTT:1 + chr2R 20227293 3' + hopper 1328 2 78.08 TATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACAGCAAAGATAAAAAAATTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTA:2 - chr4 1294995 3' + HeT-A 5988 1 80.14 TTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAG:1 + chr2R 20010651 3' - Juan 4190 1 76.71 CATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATT:2 - chrX 1263947 3' + Burdock 6329 2 65.75 TTTTGCTTCCAAAATGGCGGTAGCTTGATGGTGGCAACCGACTCAACGACAGGAATAACGGTGCCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGTGTCAGGCGTTGGGGCGCTGCTATTTGTTTGAGTT:1 + chr3R 13846506 3' - Chimpo 352 1 78.29 CATTGTGCAAAGTACTCGAGACAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTATTCGCACATGAGTTTTCG:1 - chrX 11661349 3' + pogo 2081 1 71.92 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGAACATATG:1 - chr2L 16274949 3' - FB 72 1 68.75 GCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCGATTTTCAGTTTGCTGTTTGCCTTTCATACTCGTTCCCTTCGCTGGGCATTACACTTTTGATTAGCGCTTTCCAAGAAAGCCAAGAAATTAGCAGGGAGCAAGAGT:1 + chr3R 21725530 3' - gypsy3 341 2 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATA:1 - chr2L 4063799 3' + roo 9047 1 68.49 ATTTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCGACGAAGAGGCACCCGAACTGGTCGTAG:1 + chr3R 23814645 3' - I-element 5117 1 65.85 GGGGCTTAGGGGGAGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGCTCGCTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTACTTTTTATTAAACAACAAGCAAATTAATGTGGACAGTAAGTAC:1 - chr3L 17055401 3' - Tirant 7 4 68.33 TATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACATGAATTT:1 + chr3L 11844863 3' - rover 6966 2 71.92 ATGGTGTCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTTAAGGGCATATTTGGTCATTAAAATAAAAGACATCTATAGAATATGCAGTTATCGTACATAAATAGATACACTTATTTTGAGAGATATTGA:1 + chrX 17249728 3' - 1360 263 1 50.00 ACCACTATAGGCGAAGGAACGCCGTATTTTCAATATTTCGCGCGACAAAACAAATTTTCACTTTAATATGAGACCGAGTTGACCTTGGGTTGAGTTGAAAACTTGCGCACACTTCTGCCAACTGCTGCTGTCT:1 + chr3L 10136454 3' - gypsy12 359 2 65.41 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATG:3 - chr2R 24427576 3' - jockey 4747 1 65.07 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTC:1 - chr2L 21299308 3' + roo 9002 2 69.18 CATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAAACTTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGATTTTAC:1 - chr2L 19817744 3' + G4 3825 1 42.76 AACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTCGCTTTTATCCACGTCATTTGTGTTTCATTGTCCCACATTGGCTTCGTCTATGGTTCTAAGGACGAGTTATGGCCCATTGGTG:1 - chr3L 19463444 3' + Cr1a 109 1 80.70 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAA:2 + chr3L 11326802 3' - pogo 33 1 59.59 CCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCAGTCCCGATGCACAGACTAGGATGCACAACCCCCATAGATATACCACCCAATTTACCTTCAG:1 + chrX 9026046 3' + I-element 4976 1 57.34 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCT:1 + chr3L 12004314 3' - P-element 86 1 27.40 TATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTT:1 - chr2L 15379304 3' - Stalker4 88 4 60.78 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATAGTACTAAATAGGACACAATATCAGAACAATTGAAAAGTTTATTT:1 + chrX 17717083 3' - FB 76 1 68.49 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAAT:1 + chrX 14722211 3' - diver 5945 2 55.17 AGAACATATTTATAGTTTGCATACTTATCATGTCTAAACACATATTTAGACACTCTTCATTAGAGACATTCCCCCCCAACTCACTACAAGGAAAAGCAAACGATCCTGCCAAACCCAATTAGCCACGACGA:1 - chr2L 18835957 3' - rooA 31 2 61.07 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACCCATAAATTAATCAATTAAAACAAATGGTTGTTT:1 + chrY 1421341 3' + flea 4988 2 68.49 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTT:1 - chrX 19074738 3' - mdg1 7071 2 58.62 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAAAAGAAAAAATAAAATTATT:1 + chr2L 18226901 3' - roo 8681 2 68.99 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCT:1 - chr2L 5582121 3' + pogo 2042 1 68.00 TATTATNATTATTATTAATATTATTATTATTACTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAA:1 - chr2L 4003672 3' - mdg1 7087 2 52.05 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAA:1 - chrX 21216718 3' + roo 398 1 66.32 GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAAT:1 - chr3L 22723857 3' + HMS-Beagle2 231 2 71.92 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGCCGAAGAGCGTAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCG:1 + chr2R 17926365 3' - opus 7193 4 84.80 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGAACTGTATTTCTCAATTTAA:1 - chrX 18009904 3' + 412 461 2 42.47 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTCATCGTCACTCTCTTGGTTGACTTTATTGATGGACAGCCGG:1 + chr2L 3234088 3' + roo 9044 1 67.81 AAAATAATATATAAGTCATTTTACAACTGGCCTGCAACTGCTGCCTCTTCAGCTGCCGTTGATGAGTTACTGCCACGTTGTTGAAGTACCTGGTCAAATAGTTGAC:1 - chr2L 15132799 3' + blood 6918 1 72.64 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGTTGTTATTTTTGT:1 + chr3R 22590629 3' - rover 12 2 76.71 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACAT:1 - chrX 6106828 3' + 297 6929 2 66.67 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGT:1 + chr2R 12472104 3' - transib2 78 1 70.55 ACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTC:1 - chrX 3431835 3' - Ivk 5335 1 60.27 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAAC:2 - chr3R 23618115 3' + hopper 1364 1 52.74 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAATTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCT:1 - chrX 8308433 3' - roo 8750 2 82.22 AAGTTCGAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATTAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACGCAAGTTCTAATTTCTTATTATTAGGCGCGGCT:1 + chr3L 22424862 3' + G4 3 1 72.27 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCACACAA:1 - chr2L 4063788 3' + roo 395 1 76.03 TTCAAAACAAACAAAAAAAAATCGTCATGCAACTGTGGTACTTCAGGCCGGAGCTTTCCTTATAGAAGCTGAAAAACTATAAACTAACTATAATTTATTTAACTAACTTTTAACTTATTTTTTTCCGTGCATCCGATTT:1 + chr2L 8601675 3' - Tc3 89 1 77.70 TATGCAATATGTACATTATGTACTCGTGCGGCACATGAGTTTTCCTAACAAAATATGCAAATAAATGGGATACAGATGCATGTGCTCGATTGGCTGGGATTGGAGTGGCTCCGCTTAAGCCGAGCTACACATTGTAGGCAGAGCGC:1 + chr2L 16812169 3' + Stalker2 269 2 63.01 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCATTTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATGGAGGATGCGAGACAAGCTTGTG:1 - chr3L 13294874 3' - roo 8696 2 52.80 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCT:1 + chr3R 13875113 3' + P-element 2799 1 25.34 ACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACACTAACAATGACAACACACAACAAGAAAAATCAACAAACAAAACACAACACCAAGAAAGTGAAAACAGAAACAGAAAAATATAAGCGAAAAAAAACGAGAATAACAAAA:1 - chrX 6695902 3' + Quasimodo 6957 2 77.40 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCG:1 + chr2L 12822858 3' + P-element 2808 1 30.14 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTCATAAGCAGTACATGTGATGCATCAAATATATTGTCCAAAAAACAGCCACATTTTTGCGCA:1 + chr2R 9544968 3' - roo 2 2 79.83 ACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGAT:1 + chrX 19980674 3' - X-element 4562 1 69.86 GACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGATTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTATCTGACCTTTATCATATAATTACTCT:1 + chr2L 17180188 3' - Juan 2 1 76.15 GATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTATGAACCGAAAAGTGAAAGAATAACGAAGAAAGTTACGTTAACAAAACGCAACAACAAATTGACTGCAAGCAACAACAACACGCTCAACATGAA:1 - chr3L 1381922 3' - Cr1a 4133 1 64.18 ACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAATGCGCCAATTAAAACAGGAAAAATATGCACGACAACAACAATGTGGAAAGGGGGGGGGGCGGCATTTAGAGTGGG:1 + chr2L 7967102 3' + diver2 4823 2 61.06 AATATAATTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTATAAATAATATTTTCGCCAAGT:1 + chr3L 17567450 3' - S-element 1610 2 80.00 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGG:1 + chr2R 12133841 3' - jockey 71 1 61.64 ACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAACTAAAAGAATTCACTATTTAAAAGCCAATTCAAGTTCAATCAATTTA:1 - chr2R 21849912 3' + Doc3-element 16 1 32.88 CTGTTCTCTGTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCAAATCGAGCCGTACGGTTTGGCGGGAGGTGAGTCCGTTGGAACGGTTAGAGAAAAAAAAATAATAAAATATATTT:1 - chr2R 6606735 3' + Cr1a 4353 1 57.27 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAATTTTGAACTTCTTATTGCACTCATTTCTCATAAGATTTAGGTATTCAGATTAAAACGATCTTGACTCTCTGCATG:1 - chrX 16946610 3' - FB 46 1 54.79 TTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGACTAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACATTAAAATAAAATCAAGTGCAAACAAAAGCTTAAAAAAGAAATAATTGTTAAACGAA:1 + chrX 159761 3' + 1360 459 1 60.14 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAGAAAAC:2 - chr2L 47063 3' - roo 37 2 60.96 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGG:1 - chr2L 14074439 3' + 297 340 2 58.90 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAA:1 - chr2L 4063860 3' + roo 339 2 74.42 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCA:3 - chrX 19074758 3' - mdg1 54 2 52.74 TTCAATAAATAAAAGCAAAGAAAAAAAAATATATATATGCAACATTTCTCCAACGTATGAAGGTATAGGGGTATTTCCTAATTCATGTTTCTTAGGGTAAAAACGTTTGTCAAGCGGTTTACGGTGCTGTTGGCCAAGTTTAGAGA:1 + chr3L 3079406 3' + F-element 4665 1 64.38 CGTATATTCCTTTTTAATTTCAAATTATAACGTCCAGTTAATTAAAAGTTATGAAGTTGCCAACGAACGAAACAACATTATTGTGAATATTTTCG:1 + chrX 22701790 3' + invader5 4 2 40.00 TATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCACATTTTTGGTCGGCTTAATTGCTGATCTATTAAATGGTTTTG:1 + chrX 14450034 3' + hopper 1159 2 62.86 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGTCGCAGTTGACACCTTGTATGAACTAATTAGGGA:1 - chr3R 25616500 3' + roo 9017 2 55.48 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATGTATGCACGTGTGTGAGGGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTG:1 - chr3R 26404999 3' - hobo 50 1 59.52 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGGAACGGTGCCCATTGCTTACACTCTTGGCTGTCGATGTAAA:1 + chr3L 24162130 3' + 1360 3374 1 87.50 TATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGACCACCACCAGAACCACATTAATCTGGAACACGCAGTCGTGCGACACTCG:1 - chr2R 5795497 3' - F-element 4428 1 60.48 AGTCCCCAGGATGTTGACGCGAATCACGACCAGCTGTCCCAAGCACTCCAAATGCCACATTAAATTACATCAAAGTCAAAGAAAAGGAAAAGAAATTCCCCCCAAACTTGCAATTGAAATTTGTTTGCCAACTCAAACACGAACAT:1 - chr2R 18734350 3' + BS3 131 1 65.75 AGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCAC:1 - chr2R 3593641 3' - gypsy 65 2 61.64 GTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATTATATTCGTTT:1 + chr3R 3854500 3' + INE-1 32 1 61.64 TGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTTCCC:1 - chr2L 23020624 3' + Transib5 2946 1 52.74 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAA:1 + chr3R 18488463 3' + roo 9007 2 66.44 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGG:1 + chrX 21224637 3' + roo 9022 2 55.30 TAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTG:3 - chrX 14771726 3' - BS 65 1 62.33 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGT:1 + chr2L 21328273 3' - 297 6627 2 67.81 CACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACTTTAGCCAAACGAAAAGCACATGGGGA:1 - chr2L 16690653 3' + P-element 2812 1 23.97 AAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAAT:1 - chr3L 24213777 3' + invader2 173 2 68.49 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATTTAGTAAA:1 - chr2L 15936738 3' + copia 255 1 62.33 TGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTT:1 - chrX 20999482 3' + BS 5057 1 55.86 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACAT:1 + chr2L 18549901 3' + roo 319 2 76.71 TATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATTCAAGAAAAAATAAATTTAGCTTTAACTAACAACAATAACCAGGTCATTCTTAATAGTGTTATCATTGGAAAGTAAATAAAATCAATCTGGCCAATAGAAATT:1 + chr2R 943962 3' - 1360 342 1 78.08 TTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGCAGCGATTTCTTTTCAGCACTAATTTGGTCTGATACTGATCACGCAA:1 - chr2L 6460732 3' - roo 8922 2 67.81 ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTCTTGCGCTGAACGGAGTGT:1 + chrX 21087699 3' + mdg3 229 2 65.12 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCCCCTGGAAATTTAATTTCACCTCTTATCTGCCTGAGCTCTTCTCTCGTCAGCCATTTTATCATCCAAGTCCGGCAATTAGCCTG:1 + chr3L 18631823 3' + P-element 2828 1 65.67 TAGTTATTTTGTTGTTTTTTTTTCTGCTGCCTATGCGGCGTATGAGTGATGCTGCATTTAGGTCTTACCTCAGCCACTT:1 - chr2R 14414428 3' - gypsy11 3936 1 88.61 TGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGCTTTTCACCATTCTGACTTTTTTTTTTGCATTAAACCAATTGCCATAAT:1 - chrX 8291612 3' + Ivk 38 1 66.44 AATATAGAAAAATGTATTGACTTTTATTTCATAATAATGGTTCATTGGATGGTTTGTATTGCAATAGAACAGAACATTAACCGATTATTACATCTTGTCATGGATTCTAACGTAGGCAATATGTAGTTTCATGGAAAATACCCTAA:1 + chr2R 5463112 3' + transib4 2284 1 72.60 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATCAAATAAAAAAAATTTTTTAAA:2 + chrX 12441589 3' - 1360 3263 1 64.38 ATACGTGGTCAGTGTTATTTTTGCTACCGCCTAGTTTCGCACGCTTTTGCAGCAAGTGCACAAAAACAAAAAGAACCGTTATATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGTG:1 + chrX 2676123 3' - Tc1 214 1 84.21 ATTTACAAATAAAATGGAACATAAAGGCTAAGGTATGATTAATATAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGGCAATTGTTGCTAGTTCGATCCGCTGTCTGACCCGTAAACCCTCGGCTG:1 - chr3R 26296604 3' + transib3 258 1 67.91 GAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGCGGCTTTTACGCCGGTTTCCGCAAGCCGGGGGCCGCACACTAAATACATGACGGAGTAAATTT:1 - chr2R 4133479 3' - gypsy2 326 2 51.09 GATAATGATAATGAATTCTTTGTTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTTTGAGTTTTGAGAGGGACTTGTGGTCTT:1 + chr3L 6393152 3' + accord2 7505 2 76.71 GAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTT:1 - chr3L 17183687 3' - diver 5972 2 73.29 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGG:1 - chr3R 5769019 3' + roo 9001 2 65.07 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTCGTGTATGGCAAAGAAATGTTATACCTACGGCACACAATACTACCAATTGATAGTGCTCATCCATTTTTCCTTTTTC:1 + chrX 20888411 3' - 297 6614 2 50.68 ATGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACTAACGAAACTGCTCGG:1 - chr2L 7125716 3' - I-element 22 1 68.49 ATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGT:1 + chr3R 21630331 3' + I-element 5275 1 72.60 AAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCAC:1 - 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F-element 28 1 76.26 TATGTTATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATGTATGTTATATATGTACATGGGTAACACATGGGATAGATTCGAGAAAGTACAGGATGGGCTCAAGAACAAAGTAACAAAGTAGATGAATCATATAAAAGGATTAACTTCT:1 + chr2R 7882473 3' + Dm88 4374 2 67.81 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACTTAAAACTTTGACAGGAATATACATTTGATTCC:1 - chr2R 8047245 3' + 1360 3336 1 55.48 ATGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGTCGAGTGCGCTCAA:1 + chr3L 21380662 3' - I-element 22 1 70.55 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAG:1 - chrX 18336544 3' + mdg3 5473 2 68.49 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTGTAGAATAGCGATATGGTTTTCAGTTTTT:1 + chr2R 10411475 3' - 297 6612 2 62.68 ATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCCCCGCTTCATTATGAATTTCGGTTAAAGGCTCTTTTAATTCTGTTAAAAATTCTTTCTTAGTATTTGATTTTTCTACTTCTGGTTGGTTTT:1 + chr3R 4139768 3' + Cr1a 4209 1 72.31 ACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGGAAAACCCCCGTGAAAACTGGCGAAAATGGAGCGCCCTTAAGCCTTTGCCATGGCAATTTGTTTCGCAACAGTTGAACAAATTTAATGCAATAAGCTAGCACGGCG:1 + chrX 3199295 3' - Doc3-element 4538 1 78.08 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGTTAGCCCGATTTAAGCTCGCTCT:1 + chr2R 8735721 3' - mdg1 7052 2 74.66 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGG:1 - chr3R 23618102 3' + hopper 1377 1 59.59 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATGAGTCTATTAAAAATATGT:1 - chr4 372915 3' + pogo 2078 1 69.86 AAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTGTTCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTAAAATTTT:1 + chrX 9451160 3' + FB 700 2 67.69 AAGTAAAATAAAATAAAAAATAGTCAAATTATTATTATTATTTTAAAAATAATTAAACTATATTTGAGCGGAATGAAGAAATAGGTAATATATATATTTTAAAGCTGAATGTTAGAATTGCAGTTTTATGTATTTATGTAATTTTC:2 + chr3R 19369537 3' + F-element 4682 1 79.45 TATCTGTTGGGTATATCCGGAGTAGTGTAGGGTGTATTTGGTTATGTTATTAATGTTATGTTATATTATGTTATATTTTTGGTTTTATAGAGCACGTGTTGTTTTCTTTCGTATTTATGTTTTTAAGTAGTTATTTCTCATGTAG:1 - 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chr3L 17183635 3' - diver 26 2 61.64 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCAGACGCAACAACGTCATCGCGAACATCATCATGGTGTTCTGTGCTCTTTA:1 - chr2L 7933065 3' - 412 15 2 71.05 AAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAAAAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGATGCATCGATCCGTACTGTAATAATCCCCAGCTGACATCC:1 + chr2R 19245382 3' + invader2 353 1 73.29 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACA:1 - chr2L 4888721 3' + BS 5037 1 56.85 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCGGGTGGCTGAGAGGCTATTGCATACTTTTGGGCGGCAAGTGCTGGCTGACA:1 + chrX 18239472 3' - jockey 23 1 72.60 ACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTTACCGCTCGTTGAAAGCATGAATTTTCAAATGTTTCAATACTCGTAT:1 - chr2L 11257019 3' + rover 277 2 67.12 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTCCAGCGAACTTAAGATAAGCTCATGGGATTAC:1 + chr3R 27160196 3' - 412 7083 2 65.07 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAA:1 - chr3R 24219284 3' - roo 76 2 71.23 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACATGTCAACAAAATGAGCAATTCAACAAAGTTTAGCAGCCAAGAAATATAGCT:1 + chr3L 10373974 3' + 297 312 2 65.07 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGCGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTC:1 - chr2L 8338115 3' - P-element 55 1 43.38 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAAAAATGCTGCGTAAATATGCCAGCAAAAA:1 + chr3R 11469448 3' + Tabor 7305 2 72.60 CTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTAC:1 - chr3R 24381319 3' - Juan 4184 1 67.81 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGGGTCAGGATGAGGAAGTGGCGACGGCGGCGGAG:1 - chr3L 6446982 3' - transib2 12 1 74.64 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGG:1 - chr2L 3233972 3' - roo 8743 2 71.92 TTTCCCTAAGTCTCTAGCAATCAAGTGAAGTCGAGGCAGCTGGGCGGAAAAAAGGTGGCCAATGTGGAGCTTGGCACATAGGAGATGCCTGGCATATTAG:1 + chr3R 26506155 3' - HMS-Beagle2 215 4 74.00 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCA:1 - chr2R 19199638 3' - hopper 26 1 64.49 CTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTTTTA:3 - chr3L 20265018 3' + Bica 98 1 53.42 TAAGAAAGGCAATATAAATTATAAATTACTACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGACGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAGGCAAACCGCAACGCCGCCA:1 - chr3L 21327047 3' + copia 244 1 69.92 GTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGGATAGAGGTGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTTTGTGAATAAAATCAACAAAACTGAAA:1 + chr2L 22150665 3' + S-element 1686 1 84.00 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAAAAAGCCAATGTTGAAGCTACTTTAATACTCTCGATTAAAATATTTTCATACC:2 + chr2L 3675970 3' + Juan 4187 1 59.59 TATCATTATTTTTATTATTATTATTATTATTTCCACTCGCAAAGGGGCCCCAAACCCAAATCGATACCCAAGCCAAAACCAAAGACGAAAAACAATTAAAGATTAAATACAAAAAAAAATATATAAAAAAACATATGTAAATATTA:1 - chr3L 6811745 3' - mdg1 25 2 61.64 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCATAGCTAATGCTATACCATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTAC:1 - chr2R 7090656 3' + I-element 5274 1 69.18 ACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTA:1 + chr3L 3501799 3' + Bari1 1627 1 73.29 AGTTCGACTCATAAATAAAACAAATTTGCAAATCATCAAATATAAATTCTAAACAAATTACAAACGAACTGCCGCAGC:1 - chr2R 14653821 3' + 297 6963 2 75.64 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGCACTGTATGCATAC:2 + chr3R 15325199 3' - 297 45 2 52.74 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCAT:1 - chr3R 27765103 3' + mdg1 367 2 65.04 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCTATTGATTGATTTCTCACATTAT:1 + chr3R 18093354 3' - I-element 82 1 72.41 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACAAAGGGTGTAGTATTTATCAGGATCTCTTGTCAAAAAAATCAGCTACCAATCGAAAATCACTGAATAGCAATAAAGACCTGAGTAAAAATGAAATAAGCCAGTATTTGATTAATACA:1 - chr3L 5957108 3' + 1360 3384 2 58.90 AAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTC:1 - chr4 123973 3' - HB 151 1 63.01 ATAAGCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAAT:1 + chr2R 4545161 3' + invader1 3533 1 48.92 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAAGGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTCTGTTTGGATCGCTTAGGCAGATTAACCATAGACTAAAATACACTGCGCA:1 - chr3R 15325033 3' - 297 6594 2 77.40 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGGAGATAAG:1 + chrX 21087706 3' + mdg3 5494 2 73.98 TTTTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTGTGTATTGCGTTAGGTCACGGTATTTGTTGATAATACTCGTATACTTGGGTCTATGAGTTTTAGATT:1 + chr3R 16291516 3' + rover 7240 2 53.42 TTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGT:1 + chr3L 24208213 3' - Quasimodo 50 2 59.29 AGCTGAGTCGATCTAGCCATATCCGTCCGTAAAAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTGAAAGGTTAAAATTGCTTCCACAAGCAGCCCAAAACTGCTACGCCCACAATTTTGAAAATTTTTTAAAAATATTTTATATATT:1 - chr2R 12850611 3' + INE-1 105 1 54.79 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGT:1 - chr2R 5941331 3' + copia 194 2 60.27 TAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCATAACACGCACACACAGATGCATAGACACATAAACCGCTACACTGAACAAAAACTGACATACACAGAACTGACATACACAGAAATAAGTGAAT:1 + chr3L 10568985 3' + 1360 3163 1 61.64 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGTGGCTGCGGCCAAAGATTACTTAT:1 + chr3R 11810768 3' + roo 402 1 41.58 ATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACTCTATCATCGCATACTCTATATAATAGCAGCGCAATA:2 - chr2R 11763144 3' + Stalker2 39 2 74.66 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTAATTGTTAAAGAGACAGAC:1 - chr2L 16858651 3' + Burdock 242 2 76.71 AAAAAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCATTGGTACGGCTGAAGATATTTTATTGAAGTTTTATATATCGTGCGAGAGAATTCGAATCGAAAATGCACTCGGTTCAATGCATTCGGTGGGGTGCTGTGAATAAAATAAACAAAAGGCCA:1 + chr2L 4302238 3' + transib3 2860 2 54.11 TATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTAACTTTGCTTTTTTGCTTTGCTGGTGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 + chr4 1294989 3' - TAHRE 67 1 45.89 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGTGCCATCCATTTGCTTTGTTCATTTT:1 - chr2L 4713832 3' + transib2 2792 1 63.19 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAA:1 - chr2R 8099149 3' - jockey 4830 1 65.75 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATGATATACCTTGCTGGAACCCTTG:1 + chr2R 21681428 3' - roo 8701 2 60.27 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGGACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTT:1 - chr3R 15882611 3' - jockey 76 1 72.80 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGA:2 + chr2R 14051846 3' - roo 66 2 71.23 CCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTATAGCGATCTTCTTGTATA:1 + chr3R 30362861 3' - P-element 233 1 19.31 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATT:1 + chr3R 4683010 3' + Burdock 217 2 59.31 ACCCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACCACTTTGTAACATTAATTTTACCATATATATTTATTTACGCCCAGTTTGAGTGCCAAAACAGAAACCA:1 + chrX 1392044 3' + Stalker3T 298 1 57.60 GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTAATATGCTCATACGCATATAAGAGTTTGTATAAGAGTGTTTGTTTGTTTACATGATCCTCTGTGAGCTTTC:1 + chr2R 2590811 3' - HMS-Beagle 6850 2 53.42 CGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTC:1 + chrX 8360606 3' + roo 325 2 74.66 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTATTCGCACATGAGTTTTCGCTG:1 - chrX 11661346 3' + pogo 2084 1 73.97 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGC:1 - chr2R 4673527 3' + Quasimodo 7343 2 68.49 GACTGCATGGCGTTTTCCATCAGGAGGAACACACTCCTGGGCACGTATGTAGTCCCACGGTAAACAATTGCATGTCTGATAATAAAGGTGTGTGAACAGAATTAAAAGAATTGGCAATAAATTTTCGCCCGATCATTAAATACAAT:1 + chr3L 17879322 3' + baggins 5251 1 50.68 TAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATA:1 + chrX 7978953 3' + hopper 1330 1 75.34 TTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGAT:1 + chr3L 20187403 3' + FB 456 1 63.01 ACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACTGAGTAATTGAAGGAGCTAATTGAAAACGAAGGGATATAGGGATAACGGAGCTCAGGATACAGAGAGAAACGTTA:1 - chrX 21394181 3' + HMS-Beagle 6658 1 50.00 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGGTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGCGAGACGATCACC:1 - chr3L 18402965 3' - P-element 50 1 45.93 TTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTGCGTGGACGGCCATCTGCGTTGG:1 - chr2L 5582114 3' + pogo 2083 1 50.55 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGG:1 + chr2L 4003815 3' + mdg1 391 2 61.64 TAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTTATGATAAATCATTATAAATCACATATGCTTGGAAAATAAATAACACAAAACGGCCGCTGAAAAAACAGTCAGTGTGTATATGTAAATTTATGTATGTCTTC:1 - chr2L 13260244 3' + 1360 311 1 74.66 TAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTATTTTTCCAAACTTCTAACTCCAGCCAGGATGCTTGGTATTGTTTTCCACGAGCTCGGTTTTTGTTGGG:1 - chr2R 9933852 3' + 3S18 106 2 55.45 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACAAAACAAAATATTTTTGAAAAGC:1 + chr2R 5674928 3' - S-element 75 1 72.41 CAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACACCAGCTTTAACGCGGATTTAGGATATTTAAAACATTTTATAAGAAGTGACAAGTT:1 + chr3L 22035612 3' + 1731 4562 1 60.27 AAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACCCGCTTCCAAATAGATTACTGATAAGTAATGCTGATAAATTTAACTATTAATTAACTTTAATAAAAAATTTTCATAGAATTGACCCAGCACTGAAGCTCTA:1 - chr3L 18625378 3' + Bica 277 1 70.55 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATTCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCC:1 - chr3R 9298488 3' - hopper 25 1 56.98 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTG:1 - chr3R 4679483 3' + hopper2 1545 1 74.78 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGGGTGAGGTCAGCCCCTAATTACAACTGACAATGTTTTTACAATA:1 - chr3R 4860401 3' + Transpac 5205 2 61.87 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTAGTTCTTGCAC:1 - chr2L 9636058 3' + 412 450 2 52.74 AAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTTTGTTGTTTCCGTTTTTCTTTTTAAATTTTATGAATTCTT:1 + chr2R 4852799 3' - 17.6 468 2 78.77 GACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGCATTATATGGTTCATTTGGCTGAACTTTCAGACGTGAATGCGATTGGCCTG:1 - chr2L 22299120 3' - Quasimodo 354 2 60.16 ATTAAAGAAGAAAACAGAAAATACTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATACG:1 + chr2R 4870257 3' - Juan 80 1 63.70 AATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACATCAGCGCACACATTGGACATTCAATTAAAAACGCCATTTGGCCGGCCTGCAATTGCAGTTCAAAAACGAAACCGCTCGCCTGGAGGAGTTATGATTCTGATTGCTG:1 + chr2L 11441567 3' + Stalker 7141 4 63.24 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCTAGTCCAAAAATAA:1 - chr3L 3030183 3' + roo 9031 1 56.85 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACT:1 - chr3R 24729539 3' + Juan 4190 1 56.55 AAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTATCGT:1 + chr2R 4659360 3' - S-element 1495 1 50.00 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTT:1 - chr2L 20265943 3' + roo 342 2 64.38 ACAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATACTATTGTATACTATTGTAGATTCGTTGAAAAGT:1 + chr2R 5737683 3' - 1360 3360 1 54.11 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGTATAAATAAGTCATGTGATA:1 + chr2R 11804749 3' - pogo 20 1 65.60 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAAT:1 + chr2L 4123959 3' + transib2 2770 1 54.79 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAAACAAATGA:4 - chr3L 19454871 3' - mdg1 7 2 79.45 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCAATGGCAAATAATAATAATCGAGTCCGAGAACACTT:1 + chr3R 23295631 3' - P-element 5 2 52.05 GTTTAATAATATTTTATAAAAAAAATTGCGTTTAAGTAAGCAAAAAACACTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACCTTTTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTTTTCTAAAGTCAAATGGG:1 - chr2L 6101104 3' + S-element 1619 2 90.41 AGGAAAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATAACAAGCCAAAAAAATGAAAATGAAAATGAAAATGGAGTGGGAGAATCCAGTGGGTTCACCTTGTCCGC:1 + chrX 18422031 3' + I-element 342 1 59.70 GAAGGACGGAAGCACCGATTCGCTGGGAGCCTCTGGAGACGTTGCAGGTAAGTTGTTGTTGTACTTGGGCTGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAACATCAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTCTGTAAAATAATTTAAAT:1 + chr2L 11254920 3' - HeT-A 5726 1 51.37 AGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTGTGTGGGTCCTAGCTGCTGTGTCCTTTTGTAGCTTTTTCTTTGTTTTCCTGACCGG:1 + chr2L 12892279 3' - I-element 5047 1 68.49 GGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAAT:1 - chr2L 7618456 3' + X-element 4657 1 57.93 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTGCCGGGCTAAGCCTTCATGCA:1 - chr3R 11186490 3' + BS 5079 1 71.92 TCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGA:1 + chr3R 15364007 3' + flea 4943 1 67.81 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCAATAAGCAAATTACCCCAGTCCC:1 + chr2L 15913344 3' + transib2 2771 1 55.48 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCT:1 + chr3R 5769091 3' - roo 8744 2 78.08 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAGCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGC:1 + chr3R 15791028 3' + roo 9032 1 58.22 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTT:1 + chr3R 21276629 3' + BS 5039 1 56.16 CCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATTTTGGATATTTATTGCAAAATGCAGTGACTGTA:2 + chr2R 16507629 3' + copia 75 2 77.40 TTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAA:1 + chr2L 14358837 3' + diver 144 2 75.34 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATCCATTCAGAATTAAACTTTTATGCGGAG:1 + chr3R 15807485 3' - FB 22 1 70.55 TAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTA:1 - chr3L 20189598 3' + FB 206 1 48.63 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTT:1 + chr3R 24219357 3' + roo 8998 2 67.12 CGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTT:2 - chr3R 17421247 3' - pogo 86 1 75.34 GGTTAGCTAGGGACGCTAAATTAATTAAAAGTAGTCTGCTGGAATAATGAGATAATAAACCGTATATTAGGTTTTAAACATTATGAAATACTTAGAAATCCATAATATACGGGATATCAATTTATTATATACCATAATCAACAAGT:1 + chr2R 16509421 3' - Cr1a 3998 1 50.68 AGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCAT:1 - chr2R 5070922 3' - Tirant 8123 2 28.08 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGCCAAGGGCCATGCAGTA:1 + chr2R 12133873 3' - jockey 31 1 64.75 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGGTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGCTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGC:1 + chrX 1341716 3' - 412 69 2 66.42 CGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTCGCGCCTA:1 - chrX 292364 3' + G3 4558 1 76.03 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAA:5 - chr3R 29084892 3' + 412 7479 2 61.64 TTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATTCAATATAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAACAAATTAAAAATATTAAATTTACACACCAGGAAAAAGGAAAACAAATATAAAAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGCAGAG:1 - chrX 3577642 3' + S-element 76 1 63.01 GGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGTATTCTAAGTATTCCTTCTGTGATTTCACATTCCGATTAAATTGTAATATTGCGTTTATTTTCAAATGGAGATACGCAAACATGGCCACTCGCCGAGCAACTCTTGAAGACTTTAAG:1 + chr3R 16881635 3' + invader4 2751 1 56.85 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGA:1 - chrX 10537859 3' - I-element 66 1 62.33 CATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chrX 20783463 3' - 1360 159 1 62.79 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGAAATT:1 + chr3L 7889686 3' + roo 9038 1 62.33 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTGTATATG:1 + chr3R 15364064 3' + flea 5000 2 76.71 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAA:1 + chr2R 21116618 3' - mdg1 16 2 28.08 AAAAGTTTAAAAAGAACCTAAATTAAAAGACATTTCACGAAGGTCGCTTTCAAACCATTTACCTTAGATTTGTTTCCTACATTAAATTTAAAAAATTAAAACATAATACCAACATTTTACTTTAGATTAAAATTCCGGAATGATCC:1 + chrX 11261478 3' + looper1 254 1 51.37 TAAACAAATATACAAAGCATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCTCTGCACTCTCTCAGAATAAATATATATAGGGAAAGAAAGAAGGTCC:1 + chr2L 15632964 3' + Cr1a 170 1 65.75 GAAATAATAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAGCGGTAAATATAAAAACACACACATATGCACTCACACTCACACACAGCAGGGTGTTAAAATGCCTGTTTGTGTGTGCTCAAATATTTATTAACCCATCAACACATG:1 - chrX 5600294 3' + Rt1b 5147 3 75.71 ACCCATATTTATATGTATTAAAAAATTAGCCGTAATTATTTGCATAATTTAAAATTATTATATAGGCAATCGAAGCGCAGTGTTGCTTTACTTATTTCCACTATTTTATATTATTAACTATTTCTAGCGCTGATTTATGACTCTGA:1 + chrX 16898623 3' + Porto1 116 1 54.11 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCA:1 - chr3L 18930992 3' + I-element 5270 1 76.71 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGC:1 - chr3R 27765084 3' + mdg1 7402 2 57.24 CGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACA:1 - chr2R 12185350 3' - accord 39 2 50.71 AAGTATTTAGACATCACATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTGTGGATTCTCGTACGTTGGGGACTCTGGCCTTGATCTGCAGGACCCCCCATTGCCGCCCCTTCTCGTTTCTC:1 + chr4 802765 3' + Tc1-2 211 1 50.70 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAGCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGG:1 - chr2R 16817890 3' + 412 7481 2 63.70 AAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTTGTCCTCTGGGTTGTGCCGTTTGTAAGTGTTTTGGCATCGACACACTCGCGAACCGCAAAATATTTGGGCCAAGTAAGTG:1 - chr2R 20078486 3' - rover 77 2 66.13 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACT:1 + chr2L 47226 3' + roo 9045 1 67.12 ATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATGAAGGGATGGATGGAGGGATGGGCAGATGCAGGCGCCTCATCTCGAGTGCTCCAAAGTCCAAGTTGTCAATTCCGTTCATGGCTCC:1 + chr2L 2802823 3' - Quasimodo 7033 2 64.49 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACTAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCA:1 + chr3L 7889680 3' + roo 9039 1 59.71 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACT:1 + chr2R 18529980 3' + jockey 4946 1 54.11 TCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTCAATCAATCGGAAAACTTCTTCGGCCCGATGATGAAATGTGTAAAAACCTTACTCATGCGCCTTAAATTGAAACTTTTTAAAGGTCACCCGCTGCCAAATTGATTA:1 + chr2R 10166807 3' - I-element 428 1 77.40 CATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTGCTTGGTAATA:2 + chrX 23182952 3' - Idefix 16 2 61.64 ATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTATGAGGTGTGGGAAAAGTTAGTTCAAGACCCTTTTTTTTACAGACGTAGTAAAAACAAAAATGTTTCGTTGTGC:1 - chrX 19361809 3' + F-element 4554 1 51.37 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGAGTGTTTGAGTGTGCGGCGGACGTCTTACCCATTTTGGAGTCGAGCGGCCG:1 - chr2R 22514110 3' - P-element 69 1 39.31 ATATTTTGGAGATATTTTCACAGTGTTTTTTATTTTTAGCTAATCGAAGTGATAAGGCAGATATTCAATACGAGATGACGCACTCGTTCCCGTTGGCATCCAGATAAACGCGCATGGCATTCTTCTCCAGCAGCGACGGCAGTCGC:1 - chr3R 5528471 3' - Ivk 5234 1 48.63 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCCTTTCGGGTAATCAAATAGTTTGACCAAATTCC:1 - chrX 19074726 3' - mdg1 20 2 64.58 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAAC:1 + chr2R 18529988 3' + jockey 4954 1 59.59 TTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGATATGCATCACAAATGGCTGGCGTCAAGCAC:1 + chr2R 22989696 3' - hopper 13 1 67.31 TATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTTTTATTTATTTGCGCTTGCTTTTGGGCTAGACTTTGCCACTCGAATTTC:1 + chr3L 19863629 3' + Cr1a 4197 1 45.88 GTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAAGTTTGTTTTAGAATAAATACACAA:1 + chr2L 6647767 3' - mdg3 5266 1 73.13 AAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACG:1 - chr2L 4888747 3' + BS 5011 1 73.97 AGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGGGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCACAGGT:1 - chr3R 907896 3' - gypsy11 4335 2 34.25 TAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGGGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCAT:1 - chr3R 19224989 3' - HMS-Beagle 6855 2 58.90 CAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAAT:1 - chr2R 9967064 3' + Bari1 1610 1 78.77 AAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCC:1 + chr3R 24219379 3' + roo 9021 2 51.37 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGT:1 + chrX 2479565 3' - mdg3 83 2 71.92 AACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACTTTTTCCTAGGGTGTGTCACGCCACAAAATGCATTGTAAGTAGCTGTCCGGTTCCTTGACACGTACAAAACGGTACATCTTGCAGATGTCCCCAG:1 + chr3L 24862741 3' + copia 4959 2 69.86 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGT:1 + chr2L 47176 3' + roo 331 2 69.18 TAATTTAAAATCTGTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCAATGGATTCACTCCAGACTTGATGTGTCGAAGTTGCCAATGCCTGGTGACAATTGCAGTGATAAAGGGGAGAGGGGTGGCACTCCAC:1 - chr3L 16758974 3' - G-element 4292 1 63.77 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGGC:1 + chr2L 6161015 3' + I-element 5272 1 74.66 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTAATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAAAAAGGCGAAAAAATAGCACCACTA:1 + chrX 21100289 3' - mdg1 7056 2 68.89 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCT:1 + chr2L 19924035 3' + roo 341 2 62.33 ATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAATA:1 + chr3R 25709878 3' - hopper 53 1 50.68 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATC:1 - chrX 18817289 3' + transib2 2751 1 67.12 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAG:1 - chr3R 17996182 3' - diver 5965 2 69.86 GGAACAGTCTTTATTTGTAAGTCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTACACAAATACACACAAATACACACAAACGGACGCAGACACACGCACTTGCTGAATCGCAGATATGGTTCGTATGTAGGT:1 + chr3R 22505403 3' + Cr1a 4034 1 54.11 ATAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATATGTTTTCAGGTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTT:1 + chr2L 14074526 3' - 297 47 2 66.36 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGT:2 - chr3L 7889560 3' - roo 8727 2 67.81 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCT:1 - chr3R 13972961 3' - 412 73 2 66.44 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTT:1 - chr3L 2989923 3' + roo 359 2 51.37 ATAATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAA:3 + chr3R 21630323 3' + I-element 5267 1 78.08 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTGCACGATGGCCATGACT:1 - chr3R 19992592 3' - hopper 20 1 69.18 ATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTATGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCACAAATAAACTAATAACTATTAAATAAGAAACTGGGCCAATAAACAAAG:1 - chr3L 17244987 3' + HB 1571 1 44.52 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGGCTGCGCCGAG:1 - chr3R 26504168 3' - HMS-Beagle 15 2 75.34 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATT:1 + chr2L 20266062 3' - roo 38 2 58.22 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAAT:1 + chr3R 23067521 3' + roo 338 2 65.75 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATATTGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGCATTAAAGGCAAAGTATCATATCAAGTT:1 + chr2R 16818016 3' - 412 7070 2 68.31 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTT:1 - chr3L 6397692 3' - roo 78 2 78.12 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTG:1 - chr3R 18971730 3' + Juan 4129 1 76.71 AAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCT:1 - chr3R 17996194 3' - diver 89 2 76.03 ACAACAACAATAATAATATTAACAACAACAACAGCAACGAGCAGCGCCAACAAAACCGACAGCGAACAACAACAACATTTACAGCCAACAATTTGCTTTCAAAAGCAACAAAAGGTGAGAA:1 + chr3L 10559402 3' + mdg1 35 2 59.50 ATGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAACAAAGCTTAGAAATAGTAATAGACGAATCATTATATCACGTAAACAAGAATTCATTGTCCTTGTAATTAACGAGTGGTAGATG:1 - chr2L 12239148 3' + 1360 275 1 69.29 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTT:1 + chr2R 17926388 3' - opus 186 4 73.61 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGAT:1 - chr2L 16539608 3' + Juan 4197 1 73.97 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATGGTGTGACAAGATTCTGAGTGCTGATGTATGGCAGAATGTAGTAACAAACTTGTTG:1 + chr2L 16726432 3' - rover 37 2 49.32 TACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGA:1 - chr3R 17996181 3' - diver 71 2 68.09 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACCCAAATGCTCGATTTAATTTGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTT:1 + chr3R 15325183 3' - 297 22 2 53.27 AAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACA:1 - chr3R 17421250 3' - pogo 89 1 77.40 GCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGATAAGATACTTTCAACCGCTTGGTTTCAAGAAAGCTATTCAAGCGTGG:1 + chr2R 12245431 3' - F-element 118 1 63.97 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCC:1 - chr3L 15103824 3' + Transpac 232 2 72.73 TGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGA:1 - chr3R 6419858 3' + Tabor 408 2 73.29 TGAGAAGCATATTATGTTATGTAAGTGCGNGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAA:1 + chr2L 22369236 3' - rover 6951 1 67.12 GTTCGCGTTACGGATATACCAAGGCGCACCAATTATTGTTCGCTCGCTCTTAAACATGTGCCTCGGCATCGTTTTCGTCTTCTTCTTTAAGTTGGTTTCTTCAGTGTACTGTGCGCACTCGATACAATGAGCGCTTCAGAAGCAAT:1 - chrX 12735092 3' - Doc4-element 2700 1 73.29 TCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGATGGTCGGTTAGGGGTTATGG:1 - chr2L 21299293 3' + roo 353 2 58.22 AAGGGAGGTCATGAGGGAGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGTCTCTTATCTGGACGACAGGTATCAGAGCGACTCGC:1 - chr2R 17796576 3' - jockey 4760 1 71.23 AAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTGCCGCTATTGGAATTTGCAAATATTCTTATAAATTATTATATCAAAGTGCGGCATT:1 - chr2L 12341767 3' + Tc1-2 480 1 81.43 ATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCAGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCC:1 - chrX 21993569 3' + gtwin 418 2 71.43 ATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATTTATATGTATATATATATATATATATACATATACACATATATATATATATACAT:1 - chr3R 15470276 3' + G3 4507 2 79.82 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCT:1 - chr2R 8157164 3' + mdg1 7408 2 54.48 ACACACACACATACAGAAGCACTGAGAAGATTTGGCAGGATGCGGGTCGTATCGGAACAGATAGAGGACTGCATTTGCCGTCTATTTAACGGTTCGGCGCTTTATTGTCACGTCCCAAAGGAGAGGCAGCATCAACAATGCCAAAC:1 + chr2L 17868710 3' + Quasimodo 43 2 56.16 AATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAA:1 + chr3L 3501784 3' - Bari1 96 1 78.08 GTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGGAAAAAAAAAAACCTTGGATTTGGTTCGCAGGGTCTTGCAATATTTTTATAGGTCCCTTATTCTTAAAGGTTTGGGGTTGGATTGTGTTAATGTTGGAATTTTTTTGGGGT:1 - chr2R 676960 3' + Doc3-element 4699 1 66.44 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGT:1 - chrX 19539439 3' - pogo 19 1 59.59 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTC:1 + chrX 1135353 3' + P-element 2811 1 17.09 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCAT:2 - chrX 13134916 3' - jockey 4849 1 76.71 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTG:1 - chr3L 16690879 3' + I-element 5318 1 47.26 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGAGTC:1 + chr3L 21769131 3' + I-element 5314 1 49.32 GTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTTGTAGTGGTCGCCATGTAGTTGTAGTCGTTTTAATTTCTTTAATGCAATTGGTTTTCGTCT:1 + chr3R 1295814 3' + roo 141 2 53.79 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTC:1 - chrX 21224527 3' - roo 8701 2 56.39 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATA:1 - chr3L 16662375 3' + jockey 4937 1 57.24 TGTTATTGTTGTTGTTTTTGTTTATTTATTTTTATTTGTTTCCAACTTTATTTGCTTTTGTGTTGTTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTGTGTTTGCGCGATTTCTGCCAAGTGAGTCGTCCGTGGCGCCCACTGTCCATGTGGGTG:1 - chr3L 21118681 3' + transib3 341 2 56.94 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCAAATAAGAG:1 + chrX 19588154 3' + roo 361 2 53.42 ATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTAACGGAAA:1 + chr2L 22674935 3' + mdg1 7459 2 78.42 ACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCGAATGCTCAGTGTAAGAAACATAAATAAATGCAATAGCAGGCTTTAAGTCTAGG:1 + chr3R 17354373 3' - roo 102 2 62.33 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTG:1 - chrX 21224558 3' - roo 79 2 74.31 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCAGCGGCAACTCGAAACTCCCAGTTGGCAGTCCTGGAGTCCGAGGCTGCTGCTGC:1 - chr3R 28385531 3' + transib2 2790 1 53.91 ACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAATCTATCAACGCACCGCTGAAATTTCTTAACTACTCTCAAGCTAGCGCAAGAAATTACCAAACACGTAGGCTGTGACCGCTTGAGAACCAAAGCCCAATGCTTACTTACCA:1 - chr3R 24457410 3' + 412 240 2 73.97 AGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAG:1 + chr3R 30987555 3' - F-element 156 1 76.71 AATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGA:3 - chr3R 4357508 3' + Tc3 1667 1 47.26 AGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATAATAGTTGGAAGCCATACATATATATTTTATTTGCGAAATATGTT:1 - chrX 16233687 3' - I-element 5047 1 69.18 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCCTGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGTAATTAGGCTGAGAATTTTCCAGATTGCCACTCTCAAATCGC:1 - chr3L 12249798 3' - roo 8703 2 53.12 ACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTG:1 - chr3R 10736018 3' + McClintock 6386 2 53.24 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTT:1 + chr2L 14074522 3' - 297 61 2 75.00 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGATGCCGACAGTAATAACG:1 - chr2L 8338094 3' - P-element 43 1 55.17 TATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTAGGGCATTGGCATACATGCTAGAAGCTTTGCCGCGCTCGTCAGGCACCGTGGTGGAGGCGGTTCC:1 - chr3R 4794350 3' - 1360 239 1 56.92 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTCTTGTTTTTGGGGTGTTTGGGGCTATTAGGTAGAGACCGCTATTTGCGGCGTTTTGTTTGCTTATTCATAATTGTTATTAGAGCACATTTTTCATCGTAATTTCTTTCACGCG:1 + chrX 16170457 3' - I-element 5111 1 80.14 AACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTT:1 - chr3L 24213770 3' + invader2 5038 2 63.70 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCGAACC:1 + chr3R 16519015 3' + Tirant 8476 2 61.81 TGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGGTTGTTTGGGGGGAAG:1 - chr2R 8099095 3' - jockey 4759 1 82.95 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAG:3 - chr2L 4063844 3' + roo 338 2 66.44 AAGAGCGTCGAGATCTCAGGAAATATAGAAGCAAGAATGTGCAAGTTTTTTGTTCAGAATTATGTAAAGGTAAAGGAAAGTTTTCAAATAAGTGGCTACTTATAGCGATAATTGCATACTTCCAGGCACCATTTTCAAATAGCTAT:1 - chr2R 8713023 3' + INE-1 139 1 65.07 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGTGGGCACCATGGATCCGGGAAACTAGCGG:1 - chr2L 4724179 3' - Tirant 77 2 81.51 TATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTATAGTTCGTGTTGTGTTGTGTTCTGTCATAGATGAAATGAGTTTCTCGGCATTTTCCAGTTGATGTGCTTAATGGTGTTTGCTTTTACAACTTTCTATTTG:1 - chr3R 12939203 3' + R1A1-element 5258 1 75.34 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTT:1 - chr3R 9038897 3' - Juan 4033 1 64.75 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTATTAATGGTAATGTTTGAAAGTTACATCTTTAATTTAATATCGGTCACCTCCTTAAGAAGTTTTCATA:1 + chr2L 21298851 3' + roo 407 1 54.03 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGGAACTTGCACTTGAACCCTGAAACAAGCAGGCGACCGACCAGAGAAGCACTCGGATGCGTTCGCTCAG:1 + chrX 19266939 3' - roo 52 2 54.11 AAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAAT:1 - chrX 21639589 3' + gypsy5 7316 2 63.01 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTA:2 - chrX 18396080 3' + roo 347 2 56.85 AAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACATTACAAAAGCATGAAGTGTTCGTGGCCAAAGAAATAAAAACAATAAATTCAACCATTACTTATGCTAATATAAATGTATTCTTATAACATATAAATAGCCAAA:1 + chr2R 18115735 3' + Stalker4 486 1 68.49 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACAGATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGAATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAAAT:1 + chr2L 20118514 3' + S-element 1679 2 57.53 GAGCAAAATGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGTTAGGCCTCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGGTGGGGTTTCGTTCGTCGAGGCATTTT:1 + chr2R 22457151 3' + R1A1-element 4905 1 75.00 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTATTTGCATATTGCGC:1 + chrX 22840629 3' + copia 249 1 79.45 ATATAACTTAATCTTAATCTTAAGACAAATGAAATGCTAAACGATATTTCTGTAAGTTCACAAATTCTAATTTTTTAAGAATAACTATTCATTTTAGCTTTATTGAATTTCCTTTGCTTTTAACATTTTTGATTGATTTTATAAAC:3 - chr3L 10777560 3' + Rt1c 5394 1 78.08 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCG:1 - chr3L 11326668 3' + pogo 2042 1 61.64 ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCAT:1 + chr3R 6419935 3' - Tabor 6908 2 62.33 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGCATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTTTGCGG:1 - chr3R 27083023 3' + jockey 4967 1 56.69 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCTATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTAGATATGTGTGCACATTACACCACACACTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTC:1 + chr3R 6419923 3' - Tabor 79 2 67.36 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTA:2 + chr3R 22590609 3' - rover 32 2 63.01 AGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGCTACCCATATGTGGACACAAAGAAGCTACCTGAATTATCCAAGTGGCCTTCTAATTGCGTTTGGTT:1 + chrX 16107681 3' + transib2 2433 1 54.48 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGG:1 + chr3L 12004325 3' + P-element 2812 1 33.56 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACA:1 + chr3L 16470336 3' - jockey 4763 1 79.45 CTGAGTAAAGGGCATCTGATAGTCGAGTCGACACACTTTTGTCTTCGCCTTTTATATTTTTCTTTTTGGCTGTTTTATCTGCACATTTCGTGGTCCTTTGTTTGGTTGAAGGATAATGGAAGGGGACAGGGAACGAAGGCCGAATG:1 + chrX 3638726 3' + INE-1 547 1 78.08 TAACCTGTGGCTGCCCCAGTCGAAACTTGGGGTCTGGGCGGTGGCGTACCCTTTTGGGAATCCTGTTGAGCGATCTGCCCGATTGAATAATCCCTGTTCGCTCTGCGATTTCTCCTAAATGGCCTGG:1 + chr3L 23614715 3' - Gypsy12A_LTR 430 1 69.29 GCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAAT:1 + chr3R 15790123 3' - flea 4731 1 68.28 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATCTTCATCGCACGACGACGAGTGGTTTTTTC:1 + chrX 13490790 3' + 297 375 2 71.23 CTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAAC:1 - chr3R 9557539 3' - G2 3051 1 68.28 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGACACA:1 - chr3R 17996126 3' - diver 5 2 78.46 GAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCTAATTAACCTTTGTCCCAACTTTTGATTGTACGGTC:2 - chr2L 17005645 3' + Stalker2 7648 2 74.66 TAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGATTT:1 + chr2L 7098194 3' + G6 1967 1 56.12 AAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGCTGAAACTATGGATGGACATATAG:1 + chr3R 25103533 3' + roo 8799 2 25.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTCGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCACACAACC:1 - chr2L 4063786 3' + roo 397 1 74.66 ATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCT:1 + chr2R 15005111 3' - BS 5057 1 62.07 TATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTG:1 - chr3R 27843168 3' - I-element 5349 1 64.38 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGT:1 + chr3R 19992715 3' + hopper 1336 1 71.03 GTGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATAACGTACATTATTGCACACATAATTACACACACTTTTCGCACATTTAGCGTTTCGAGTTCCTACATCACGTTTGCCACGGATTT:1 - chr3R 17736831 3' - opus 147 4 61.64 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTG:1 + chr2R 7090713 3' - I-element 75 1 66.44 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACAAGTCTGAGTCAGAGCTGAGACCTGACTTTTCCACAAATGAGTTCATAACGTTCAACGGTTCGGGAAGAGAGGAAAACACGAAAAGAGAAAAACTTTCA:1 - chr3R 9598454 3' + Tirant 8474 2 67.81 TATATTNACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAATCATCAATTTAACTGTCTCT:1 - chr2L 4713541 3' - transib2 37 1 46.58 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGATTCTTTCATATATATTTTAATATGATTTTATTTTTTCATTAAAACAGGCATATTTGCATATTCAATAAACTT:1 + chr2L 4086826 3' - Doc 64 1 50.69 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGATTCCGACAGTAATAACGTCTTGGCCGCC:1 - chr2L 8338083 3' + P-element 2883 2 79.49 ATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATC:1 - chrX 20999487 3' + BS 5077 1 65.83 TAATAAAAATAATAATAATAATTAAGGAATACATAAAAAATGCACAATTTACAACAAAAATAAATATAACATGCATCCAATTAAAATTTCTATTGGGAAAGCTCCTATTCCAACTAAAAAAAGAAAAAGAGAAAAAGAGAAAATG:1 - chr3L 10174117 3' + mdg1 30 2 70.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGACCAAATCACGCATACGCCCCATTGAAACGCTCTCAATATGGGTT:1 - chrX 21216710 3' + roo 9020 2 55.56 AAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACAGAACATAATAACATACATAACTTCGTAAACATTCATTTCGCTGGAACATGGCACAGGTTTTGGCCCATAACT:1 + chr3L 11717609 3' + frogger 2307 2 64.23 TGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGGGAGGGGGGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGATTTATGGACCTCGTTGGTTGAGGAGTCTCGGG:1 - chrX 12113036 3' + Bica 4902 1 77.40 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTT:1 + chr2L 13556484 3' - transib2 19 1 67.12 GGCTGCTTATTTACTAATATATATACATACATCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTGTTTTGCCTTACCTGCTTTTATCAGTTATTAATTTT:1 - chr3L 22035542 3' - 1731 4425 1 53.42 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTTAATGGCC:2 + chrX 8200344 3' + flea 240 2 76.03 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACGGCTAACGATTCACG:1 - chr3L 12249760 3' - roo 8668 2 77.86 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTT:1 + chr2R 6847820 3' - Doc 78 1 74.63 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAAC:1 - chr3R 27083038 3' + jockey 4933 1 60.27 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGCAGTTG:1 + chr3R 21933247 3' - pogo 17 1 67.29 CAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAACCTGTTGATATTTTTTTTAGTTTTTTGCTTGTGTTTCGGCTTTTTTCATATACATATACATAAATTGAATTTTGTATATTTCGAATTTTGTCTCCCGACGTATATAATTCCGCTCC:1 - chr2R 16624242 3' + INE-1 244 1 71.92 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAAAGTGCTCCGGTGATGTGATAAAAAT:3 + chr2R 3563227 3' - Transpac 23 2 68.49 AGATAAATCCAAATAAAATCAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCATATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCAAAAGACCGACTTCC:1 + chr3R 11810700 3' + roo 358 2 65.00 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACA:1 + chr2R 7090717 3' - I-element 69 1 61.81 GGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACTAAACCTGTCCGTCCGTTGTCCGTTTGTCCGTTTGCATGTCCTTATGAACGCTGCGAGCTCCACA:1 + chr2L 20435347 3' + opus 7268 2 56.06 AATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTTCAGAGAGAGAAAATAGTCATTGGTATTAAAAA:1 - chr3R 29690707 3' - I-element 5231 1 49.12 TATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTAATGGGGTCTTATATTTACTGATAAGACTATCTCATATAGCGGTGGCAATTGCCTCCTCTTT:1 - chr2R 23000816 3' - 1360 2928 1 65.32 AATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAACGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCTCAACAAAAATTCTAAATATAATACCGAGAATAATCATCAACCATCA:1 + chrX 4268917 3' + Stalker2 7209 3 68.49 ATTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATGCTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAG:1 - chr3L 22531953 3' + Cr1a 4192 1 71.92 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGTAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATT:1 + chr3L 5881690 3' + pogo 2051 1 54.11 GGCTTTNACTGCATACTAGGATTAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGGATATATGTGCTAATTGCATATTTTCTTGTGTCTCTCTGCATATATATATTGTTGGAAAACTTTCGCCTATCGAGTGGAAGTGCATTAACGCCTGCGATCT:1 - chr4 639888 3' - Doc 4520 1 71.23 ATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTNGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTCTCCCAGGCCTAAATGTCATTTCGATGAATTTATAATTGGAAATTACGTG:1 - chr3L 18289003 3' - Doc 4276 1 65.07 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTG:1 + chr3R 27406075 3' + diver 180 2 49.64 AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAA:2 + chrX 12129409 3' + flea 4955 2 58.22 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTAAA:1 + chr2L 23381791 3' + flea 5006 2 80.14 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGGGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAA:1 - chrX 6475288 3' - Doc 57 1 54.79 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACAACCC:1 + chrX 20455725 3' - hobo 56 1 56.16 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTT:1 - chr3R 556391 3' + Juan 4138 1 69.86 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACATCGCGACCAGACCAACTGAC:1 + chrX 17093453 3' - 412 7121 2 66.44 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTA:2 + chr2L 20266031 3' - roo 8733 2 67.12 AGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTATAC:2 + chr2L 23295910 3' - micropia 4985 2 63.01 CTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATGGCAGGCAACAAAAGGGGCGAGAATGAAATTCGCCGAAAGAAAGACAACTCCTCGACCGATTTCCCGGCTTTTCCG:1 - chr3R 22847973 3' + X-element 4459 1 72.07 AGTCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGGTTGCCTAACTCTATTCAGACTTC:1 - chrX 21639614 3' + gypsy5 352 2 56.16 AACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAATATTGAACTCCACAAATTAACGAAAATAAATCATATAAATATAGTTTTTCGTAAATAAAAAACCAGTTTTGAGTAGTGTTCGGGTGCACA:1 + chr3L 20342624 3' + Idefix 6919 2 68.57 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTG:1 - chrX 15357622 3' + hopper 1386 1 63.70 CTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGAAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAG:1 + chr2L 20640288 3' + Stalker2 248 6 50.47 GTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGACGCCGCTTGATTAACTAGCCCAAGGAAGGGGAAAGTGGAAATGGGAATTAATAGAATAACAAGGG:1 - chrX 14444845 3' - 1360 370 1 54.48 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGTTCTGTTCGTCATACCCTC:1 - chr2L 19923940 3' - roo 62 2 60.69 ACTTATATATATATATACATATAGTAAATCATAATTCTTTTGAGTAGTTTCCCACCTCGATCATTTTTAAAGTTCAGGATGCATTTTTTGGGGTCATATTTTGGGGTTTTCACATAATTATTTGTATTAAGGCACTAATATAAATC:1 + chr2L 9463930 3' - 1731 4413 2 81.51 TCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGA:1 - chr2R 7244801 3' - diver 5938 2 51.37 TATATAATATATATAAAATATTTGATATTTATATTGAGTGAACCCTTAATACGCCTTCCTTCCAAGCTACCAAGAAAAAATCCCAAAAACCAAAGCAATCTCTTCCCGATCGGTTAGATCCACTTTCGGGCAATTAAAATTCGATT:1 - chrX 7529404 3' + transib1 1923 1 80.82 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCGGAGCGACACTTTTTCACGATCCTCCAGGCGAAAATTGTACGCC:1 + chr2L 4860409 3' - invader4 31 2 69.44 ATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACTGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAA:1 - chrX 3431854 3' - Ivk 5354 1 47.26 GAACAGGAACGAGGAAATGAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAGGTTACAATCGATTGCTTTAAGTGTGTTTGCCAGACAGCTGCAATGCTATAGCTGCCTGCTACG:1 + chrX 13214319 3' - Cr1a 4337 1 71.23 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTA:1 + chr3R 15364052 3' + flea 230 2 68.97 AGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAAGTTCAATATATTTTTTAAACAAGTTTCCAGACCCGTATGTGTGCCGTTTTCTATATGTTTTCGCCTCACAGACAAAGTCAGCC:1 - chr3R 29774277 3' + P-element 2608 1 64.38 AGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCA:1 - chr3R 19450035 3' - roo 8623 1 71.72 AATGATNTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAG:1 - chr2R 18315999 3' - HMS-Beagle2 29 2 65.07 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTC:1 - chr2R 22034650 3' + copia 5064 2 61.38 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGTGTTGGCCACATTTGCTATGTGGCATTCAAACACATGCGC:1 + chr3R 11191517 3' - roo 8700 2 60.00 ATGTATGGAGAATGGGGGTCGTCAACTATCAGATTTAATCTTCAAAAAAATATAAATACCAACATGCGACATGGTGGCGACGAACGTGATTTTACTCGCACCTGGCGTCTTCACA:1 - chr3R 10326836 3' + mariner2 748 1 49.57 CTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCGAAGTTCAGCACAATCTGCAGATGGTTGTTGGGAAAGAGGTCCGTCTTCACGCAA:1 + chr2R 23608555 3' + gypsy6 7548 2 73.75 TGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTT:1 + chr3L 22723925 3' - HMS-Beagle2 6946 2 67.91 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCA:1 - chrX 10319569 3' - mdg1 24 2 69.18 ATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTTACTTT:2 + chr2L 15763125 3' + mdg1 7055 4 63.70 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATATACACTAGATCATGAACGGTGGTGGGTGGTGGTGCGGATGGAGCTTGTTGGGCGCCG:1 + chrX 1264049 3' - Burdock 6190 2 63.19 CATAGATTTGGCTATTTCTGATTAGCCCACAAATT:1 - chr2L 8610347 3' - 1360 336 1 62.86 AGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGCAAGGGGGCGTGTGGAGCATTGAGATGGAGATG:1 - chr2L 700774 3' - FB 706 2 74.62 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCAT:1 - chr2L 7125754 3' - I-element 60 1 56.85 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGACC:1 + chr3R 21933272 3' - pogo 20 1 73.33 GGTGCAGCCGATGAGGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGGATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGGATGAGGATAGTATACAAGTGCATTGCACTTTTCAAATAAAACGTTATC:1 - chr2L 14026114 3' - F-element 457 1 56.85 TTTTTTTTAAAATTAAAATATAACTCTAAAATGTTTTGATATTTGTGCTTTTATGAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAACAACTTTTTGGTTTATTTTGTTTAGGGTTTCTTCGTTTTGTTGTTTGTCTTGCCAATTTTT:1 - chr2L 22211289 3' + P-element 2594 1 75.17 ATTGATCCTGATCAAGTATATATATACATACTTTAAATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCAGTTACATTTTTTTTTTAACTTTTTTTTTCAATAGTTCATTTACCAGCTGTGCGATTTTGTACTACCCTTTTACTCTAAGTGTA:1 - chr3L 22884340 3' - INE-1 83 1 48.28 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAATCGA:1 - chr3L 24934251 3' - HMS-Beagle2 6898 2 75.34 CTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTA:2 + chr2R 5479962 3' - F-element 105 1 78.08 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTT:1 - chrX 15357640 3' + hopper 1368 1 51.37 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGA:1 + chr2R 16929825 3' + jockey 4929 1 63.19 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1 + chr2L 5069689 3' + flea 231 2 71.92 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGTTTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCAAAAAGGCATTAATTAAAATTAGAAATTGCTTATTACGTAGTACTTGAATACAATGACCTAATTG:1 + chrX 696591 3' - FB 57 1 52.74 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCGAAAGGTTAGATACGACCGACC:2 + chr3R 17077248 3' - roo 8675 2 76.71 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAA:1 + chr3L 18505736 3' - I-element 61 1 62.86 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATAT:1 - chr3R 22642310 3' - blood 89 2 76.03 GTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACTTACGCCGAGCGATCTGTTTGGCTACTGAAAATCGAGTGAATAACGG:1 + chr2R 6482552 3' - gypsy 7029 2 55.48 ATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCGGCACGAAATGAAAGTTGC:3 - chrX 15200797 3' - 17.6 6950 1 67.81 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTC:1 + chr2L 17809249 3' - jockey 85 1 69.18 GCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAACA:1 + chr2R 4545171 3' + invader1 3537 1 53.79 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGAC:1 - chr2R 14051719 3' + roo 9046 1 61.27 TTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGA:1 - chr3L 6447043 3' - transib2 81 1 70.55 TGTTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTCCACCTTTTTTTCGCTCTTTTTTGAGTGGCAC:1 + chr3R 27765194 3' - mdg1 13 2 66.02 GTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATGTATTCTGATCGAAGAAACGATCGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAATCAATTATATTCGCACTTTCCCACCAAGATCTG:1 - chrX 15638792 3' - 1360 3207 1 74.42 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCACATCTCGAAGTCGCATTCTATAAGAGACTATGTGAGGCATTTTTGGATTCTGGCAAAAATGCTTAACAAATCAATAACTGAGTTAAAAGG:1 - chr2R 22992416 3' + hobo 2909 1 59.31 AATTAAAAAAGCCTGGGCAACAATTTCACTAAATGAAATTAAAAAATACTCTTGGTGTGTGACCTAAAAAGTCGTACTGTTTAATGCCTATGATACTTCACATTAAACTTTTGAAACAACAAACTTGCTTAGCCTTACACTAGACT:2 - chr3R 4375879 3' + Tc3 1330 1 73.97 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGAGGCCATTGCTATTTTT:1 + chr3R 19992773 3' + hopper 1393 1 71.23 TTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCAATCGACTTCAATGGCAATGTGTACGTTTAATGAAGCA:1 + chr3R 31563635 3' - I-element 452 1 78.77 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATCCTCTACAGATAATTAAGGTAACT:1 + chr2R 6885644 3' - P-element 20 1 71.92 AAATATTTTTGTCGCGTAAAAAAGTTAAGGGGAATACGGAAAAAATGTGAGTAGAGGCGTACCAATTGAAAATTCAAAATAAAAGTGAGCCGTGGAAAAAATGGCTTAAATGTATTGATAATAATTGAGAATCCATCAACTTCATG:1 - chrX 13014102 3' - Bari2 95 2 70.55 TAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCCAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATTTACATATTTTTATCTATTT:1 + chr3R 25186432 3' + invader4 2671 1 53.79 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAA:2 - chr2L 11298028 3' + I-element 5308 1 54.79 CCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCACTTAAATAGCTCTAAGCTAATCCGCTTTTGTTTAAGAGCTTGGTTTTCTATTGCGTAAGCACTAAAAACAGAGCAATGGAATTGCTGATTCATAATTTGGAT:1 + chr3R 22672233 3' - I-element 472 1 69.18 CTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAA:3 - chr3R 556455 3' + Tc1-2 1543 1 71.92 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAATTTTTAATACA:1 + chr3L 14366650 3' - roo 8706 2 59.59 CAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATCAATCGCCTTAACGGTTTTCGATTCGAGCGAGCCATTTAAGCAGCGCCAAACATCAACATATTAT:1 - chrX 15789876 3' + jockey 4741 1 55.48 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGG:2 - chrX 8437690 3' + P-element 2791 1 20.00 AAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGCTTTTTTATTTAGCTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGG:1 + chr3R 30987567 3' - F-element 133 1 62.96 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACACATTAATATTATGGTCTGACCTTCTGCTGTGAACTCTTCTGTAGCAAACGAAATGAGTATTCCCTGGCTGGCGCCCTCCAACTTCCTGCCC:1 - chr2R 6965456 3' + Transpac 292 2 62.14 TTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTCTGAAA:1 - chr3L 22723860 3' + HMS-Beagle2 7111 2 73.97 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTAATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCT:1 + chrX 12986608 3' - roo 64 2 72.00 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAAT:1 + chr3L 10373895 3' - 297 36 2 67.02 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTTAGCTGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTT:1 - chr2L 7580870 3' - Transpac 27 2 41.10 AGATACACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCATTCATGCCCATGCCAAACTGAATTGAAGGAAACTATTTCAGCATGGCTTTATGAATACAGAAGATGCTATGTCCATTACATTTTTG:1 + chr2R 2009314 3' - invader5 168 2 81.20 ATTAATATTTGATTTTTTATAAGATACTTAGCGCGATTACAAATCATCCATTCGCATATCTTTGGTAATTTCAATATGTTATCAATAATTCGTATTTGAATTTTCCCGCTCTACTTCGATACATTACGCCGATTACAGATAATCAC:2 - chr2R 24265417 3' - Tc1-2 384 1 78.77 TTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCAC:1 - 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X-element 4400 1 36.30 AATGAATTTTCATACAAATTTTATGTAAATTCAACATGACAAGTTTCTCCTTTTTATTTCATTTTTTAACAAAGCTATTCACACAAAAACAAACAAAATTTAATCTCATCCGCACGTGGCAACAAAACTCTGGACTTTGGGATTAT:1 + chr3R 12296663 3' - pogo 84 1 65.75 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCTTTTCAAATTTGTAAGC:1 - chrX 12986486 3' + roo 394 1 73.79 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGC:1 + chr3L 12315825 3' + transib2 2765 1 56.85 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAAT:1 + chr3L 20711713 3' - jockey 4806 1 50.68 TTATAAATGCAACTAATATACAAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCACTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATAGATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCAGCGCTTGTTAATTATTAATAAAAGAAAGTTAACAATTAAA:1 - chr3L 20091680 3' + roo 8607 1 71.92 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGTACATATGTAGATGGAGCACATATGTGCTATATAAC:1 - chr2L 16274921 3' - FB 46 1 54.11 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATC:1 - chrX 13874132 3' - P-element 97 1 17.12 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCACAGGTTCGTTGATATTCATAAATTTGGCACAGTGGACCAAAAAAGCAAAGCTAATTTGATGGCCAATTGCCAAAAGGAGGCCAGCCAAAGCGCGCAACAATA:1 - chr3R 31656822 3' + roo 353 2 68.49 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGGAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGCTTATATACTTCTTTATATAAAT:1 + chr3L 16033447 3' - Doc 41 1 56.34 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAAC:1 - chrX 21087597 3' - mdg3 5305 2 62.14 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCCTAAAGATACAGTA:1 + chr2R 8099219 3' + jockey 4943 1 60.00 GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGGCAAAACACAGAGGTTGGGGATAATGCTGCTGCTGCTGCCGTTGCCGTTGCAGCAATCAATTGCATGCTTCAATGGA:1 + chr2R 18302734 3' - jockey 4841 1 52.74 AAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTAGGTTGGGCTGGTTGTCCGTGATAGTAGGAGCTACCAAAGCTGCGATGGTGGCAACAA:1 + chr3L 25396414 3' - I-element 268 1 60.27 ATAGGTTCTTATCATCTAATTATAAATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGTCGCAGTCTGCGTTTGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATTTATGTTTGAAAAATTTTAGACATCGTTGGCACAAAAAATCGTTCGACATTTG:1 - chr2R 9734629 3' - rooA 262 2 78.08 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGAT:1 + chrX 8360641 3' + roo 360 2 53.42 AGCTATATGTATATATATATATATAGCTCTGGATCTGGATCTGAATCAGAGTCTGGTTGGTGTCTGTCTGAGTGGGCGTTGGCAGACGGAGTAGATCTATGTGTGCATGTCGAGTGCTTTATTTTTCAGCCTTTGC:1 - chr3L 4716779 3' + 1731 4409 1 65.44 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGGATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCAGCA:1 - chrX 12066084 3' - transib2 35 1 56.16 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTC:1 - 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chr2L 23048099 3' - baggins 5270 1 72.60 CCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGACCCTTAACCCCTCATTCCTCACAGGAGCTGCTGTTATGCGATATGCCCTTAAAAACGACCCCAAGCGACCAGCAAGCGACCGCATTTGTTTGCTTTGGC:1 + chr3L 10181620 3' - R1A1-element 5067 1 70.34 AATTATGCGTAGTTCTTAACTCTACACGCATTACCAACACATTTCTAGCAATTGCGCGTTTCTG:1 - chr3R 3985687 3' - invader1 3867 2 68.75 ATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAATAAATTTTCACGTTTATTTATTTTTGCACCGCACGTCACTGATAATTAAAAATAAATCAA:1 + chr3R 27843317 3' + mdg1 7064 12 76.03 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATG:1 + chr2L 18549949 3' + roo 9031 1 61.64 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCTGCATATGGAATTCG:1 - chr3R 8051103 3' - jockey 4797 1 58.45 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTT:1 - chr2R 5941330 3' + copia 5064 2 59.59 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAATTTCAATGTCAT:2 - chr3R 13972910 3' - 412 22 2 71.23 TTTACTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGTTGTATTCTCTATATTTTCCACATCCACTTTTATTTTGCACTTTTCTCTTCCATAAGGTCAATGGCACGCCAGGCTGGGGC:1 - chr3L 11043636 3' - Idefix 286 2 67.57 AAATTAAAAAAGAAAAAAAATATAAGCTAAAAAAAATAATAAATCAAAAAAGTTTTAAAATCGATAAAGAATTTAAAAAACTAGAAAACCGAAACAAATAAAAAATTTAAAAACCTTTTAAAATCGATAGTTAAATTACAAAACTC:2 - chr3L 11830973 3' + Doc 4699 1 68.49 TATTAACAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGACAATTGGTCCACGCTAACATGCACTTATGTACACTG:2 + chr3R 5694742 3' + invader2 448 1 74.66 ATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGATATGCATCACAAATGG:1 + chr2R 22989682 3' + hopper2 1552 1 56.39 TAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTACTTAACCCCCTCCAGCGCTCAACCCACACCTGCCAAACATGCGACACATGGTAAAGGCTGC:1 - chr3R 21896815 3' + I-element 5110 1 58.22 CATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATTTTCTGCACCATTCAGCATCGATTGTGCAGTATATACACTGCGCGTCATCAGATTAGCGCCCCCAAATGCAGTTTTGAATTTAATTTAGGCCATGGGAAGAAGAAGAACGTT:1 + chr2L 21396864 3' - S2 8 2 57.53 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGGCTGCCGATGTCCTGCTGGGACAGCATCCTGGCC:1 - chr3R 8075860 3' - 412 29 2 66.44 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAA:1 + chr2L 22674905 3' + mdg1 7422 2 55.48 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAA:1 + chr3L 5881685 3' + pogo 2047 1 57.24 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAA:1 - chr3L 24131389 3' - Transpac 4974 2 59.59 AAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGAAAGCGAGCGGACAGAGGGCAATTTTGGCCATCACCATACAAAATACGCCACCTTTTTCTTATTAAATGGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGG:1 + chr3R 19445365 3' + 1360 3268 1 72.93 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCTGAATTAGAAGGCGTGCAAAGGAGTTTCCCTTCATATATCGA:1 - chrX 5418536 3' - flea 4768 2 53.24 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGAAGAGCATTTCCCTCGAAGTGCCATAAAACGACAAAGACAT:1 - chr2R 4362759 3' - F-element 42 1 55.17 TTCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTAGATGGCAAAAACTTGTATAATTTTACTCGGCTCACTCTTTGTGGCCGCC:1 + chrX 19413428 3' + roo 9029 1 44.52 AAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCTTTTGGCAACTGCAACTGCAACAAAGCGAATT:1 - chr2R 15004696 3' + TART-B 10508 5 55.40 TTATTATTGTTTATTATTATTTTTTTTTATTTTTATGCTCAACCTTTCCCCGGCTTTATATATATATATATATATATAAATATTGTCTTATTCCATTTCCGTCATATTCGATTCCATATATCCCATTTAATTGGTTTTTCAATGAT:1 + chrX 19402172 3' - flea 240 2 88.36 CACTAAGGAAGAAGATTGACCAGGTGATGATTCCTGTGAAACTACTCGTCGTCCGTGTCAAGGAGCAATCAGGACCACGGAGGCAAGGCGTTGCAGGAAAAACCGCGCAGGGGCAGCGAGATCGCCGGAGGTATTATCTATAAGAC:1 - chr3L 26023133 3' - G3 371 1 68.49 GATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGTCCAAAAAAACTCCAAGTGCATTCTGTGGCCTCGGGCCAAAGTCATTAAATGGCTAATCAGTTGGAACAAT:1 + chr3L 17898020 3' + Stalker 42 4 56.85 GGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCTCACCGAGAACGTGGCCGCCTTCAGGGTGATATAATGTAGCAATGAATATAATT:1 - chr3L 7783016 3' - G2 357 1 62.50 TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATATA:1 + chr2R 5479981 3' - F-element 84 1 64.58 GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGGATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTTTCCGAGGATGCAGAGCGTG:1 + chr2L 19675093 3' - 297 15 2 68.75 ACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTTATATAGATAATAGTTTTTAAATTTGCTGTTC:1 - chrX 3448261 3' + P-element 2580 1 23.29 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGG:1 + chrY 2720347 3' - 297 45 2 75.93 AGCCTGGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTT:1 + chr2L 15076182 3' - 1360 68 1 70.00 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGAAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATGACAACTTATAAGTAGGATAGAGATGATCTTATAATTCTTATATCTACCGTAA:1 - chr2R 5043488 3' + jockey 4928 1 61.15 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGGATTGCC:1 + chr3R 31653185 3' + roo 394 1 72.27 GCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACTCAAAGATATTTCTTCGGAATGCTGAGCCTTTTCTTAGCTTCCCCTCTGACTCACCGCTAGTCAG:1 + chr3R 4981078 3' + R1A1-element 5193 1 53.28 ACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAGCTGGATATCTTTCGGATTTATATCTGATGAAAACACACCC:1 + chr3L 3725626 3' + P-element 2757 1 30.34 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTTAATGGCCA:3 + chrX 8200345 3' + flea 241 2 76.71 TGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGT:1 + chr3L 21327145 3' - copia 90 2 78.08 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTTTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTA:1 + chrX 7795603 3' + roo 9001 2 66.44 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGATGCCTTTGCATTTAAG:1 + chr2L 15936891 3' - copia 4904 2 61.64 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTCTA:1 + chrX 12129451 3' + flea 4999 2 74.31 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTC:2 - chr2L 10156087 3' + hopper 1376 1 56.16 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCG:1 - chrX 19266819 3' + roo 9033 1 50.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGATATTTCTCAGATTGAAAAAGGCTGCG:1 - chr3R 15942663 3' + hopper 1410 2 76.38 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAA:1 - chrX 21224509 3' - roo 32 2 63.70 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGT:4 + chr3L 20898648 3' + roo 9033 1 59.59 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCCACACCCACACACACACACACACACACACTTATGTATGAATATCCAAAGTTGTTATTA:1 + chr2R 10909296 3' - 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chr2L 12341803 3' + BS 5052 1 54.79 TGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAA:1 - chrX 8027421 3' + Juan 4152 1 60.69 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACGCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTT:1 - chr2R 17926319 3' + opus 7424 2 77.93 CCAAAAGCTGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAGCTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAAATTCTTTTATAAAAGCAAAAATTGTGAGCGTGG:1 + chrX 22913205 3' - gypsy7 56 2 71.92 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCT:1 - chr3L 16690863 3' + I-element 5345 1 62.96 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAA:1 + chr3R 11062826 3' + roo 9004 2 61.64 GAGGAGAGGGCGCAACTCGTGGCGCTCGCTGGGCCTCCTCTCAGCCGTTTGGGATGGGCCTCACGTTATCATCATACATATACATATATATACATATATATATATACATATATATACATATACATAAATA:1 + chr3R 5010527 3' + Rt1a 4619 1 53.08 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTTTGTACATTTACC:1 - chrX 14304022 3' - roo 31 2 56.16 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTCCTGCCAAATT:1 - chrX 22840474 3' - copia 61 2 60.27 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATC:2 - chr3L 19454924 3' - mdg1 7098 2 56.85 CATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGCCC:2 + chr2L 17766215 3' - Doc 178 1 61.64 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTATAAAGTCAAGC:2 + chrX 12986664 3' - roo 8693 2 66.44 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTT:1 - chrX 19539461 3' - pogo 41 1 48.63 AAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGGGAAACAGGGAGAATGCCACCCAAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTTAAGGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTAC:1 - chr2R 1234688 3' + invader2 4728 1 73.29 TAATTTAATTTTAATTTAAATTTTTAATTTATCAAAGCTTAAATGTAATAAATCTAATTTTCTCTCTGCTATATTAAGGAATAATAAAGCATAAATTATACGTGACTTGAAGCGGATGATTATTTTATTTGTGGTAACTATGGTTT:1 + chr3L 13468036 3' + Rt1b 129 1 77.40 GTAACGGTGCGTGCACACAGAGATCGCACCGTGAACTAATGGTACAACAGGCTCTGGCCATCGCCACCGGCGTCCCCATTTCCATTCCATTGACCCAGAAACCATGCCATATCCAAAACATA:1 - chr3L 8742018 3' + gypsy8 4797 4 60.66 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGGCAATGCT:1 - chrX 19054271 3' - jockey 92 1 74.66 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCCAT:2 - chr3L 14366500 3' + roo 9041 1 65.75 AAGAATNCTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTT:1 + chrX 12129406 3' + flea 4952 1 59.59 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAGGGTGTAACAATTA:1 - chr3R 4682859 3' - Burdock 34 2 60.96 ACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGGTTACCCTCATAGATCGGTCCTATG:1 - chr2L 4123882 3' - transib3 16 2 60.56 AATATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCATTAAGTCGCCGG:1 + chr3L 11233650 3' + 1360 3039 1 76.03 GTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 40 2 70.75 ACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTG:1 - chrX 14771721 3' - BS 60 1 58.90 TTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCAACAGAAACGGAGG:1 + chr3R 13612657 3' - F-element 166 1 79.31 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCAT:1 + chr3L 20711675 3' - jockey 4844 1 74.66 AGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGATGAAGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGCTAA:1 - chr2L 22255076 3' - 1360 236 1 71.23 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGT:1 + chr3L 22035669 3' - F-element 61 1 58.90 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTTTGGTGT:1 + chr3R 21276667 3' + BS 5076 1 63.70 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAA:1 - chr3R 19073199 3' - roo 65 2 70.90 ATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAAGATAGTTA:1 + chr3R 24219392 3' + roo 9034 1 58.22 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTA:2 + chrX 18336669 3' - mdg3 5325 2 65.07 TAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTAACACCAGTAGCTGTCTGACGGCTTGACGTTGTTGTTTGTTTCTTCGTTTTTATTTGTTTTATGCTGGGTTTTTGTTCGATTTTCTTCG:1 + chr3R 20257504 3' - Porto1 4533 1 71.65 TTTTTATTTTTTGTTATTATTTAAAACAACAGTTCTTTATAATTTCAACAACGGAGTCAAAACAGCCATGTGTGAAGATCTGAACTTTCTGATCTGAAATCTTCATGGAGAGTTGAAAGTTGGATAGTAGTAGTACTACTTGATCA:1 + chr2R 9493898 3' - BS 5098 2 80.14 ATAACAAGGTGCGTAACGGCCATAGATTGGTTTTGCATTATGCAGCCACTTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCATGCGTGATAGCGGCAACTGCTCCGCCGAGGCCTTCATCTCGCTCACC:1 + chr3L 25996809 3' - 1360 3375 1 62.69 ATACATGAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTAGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGGATATGGGTTTTGTTAGCCCAGTTTAGTTGGTAATTGATTTATCA:1 - chrX 8432438 3' - Quasimodo 105 2 74.66 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATATTCGCATTAAAAAA:1 - chr2L 9782032 3' - P-element 25 1 68.49 GCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAATACTGACACTGATCCG:1 - chr2R 9966965 3' - Bari1 47 1 47.26 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACC:1 + chrX 10167455 3' + roo 332 2 68.49 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAA:1 + chr2R 10411443 3' - 297 6640 2 68.12 TTAGAGTTATTTTACATTATATTAATATCCTCTATCTTCTCGCGAATACCAGAACTGTGCTGACGCTGATACGGGGGCAGCAGCGGCGGGCAGGCAGGAAACGCCCCACTTGCAGATCGTTGACCAGTTCATCCGTAAC:1 + chr3L 27327800 3' + Cr1a 4317 1 67.63 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTCATGGAGAGCCACTTGGGGG:1 + chr2R 12472146 3' - transib2 22 1 65.91 AGTCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTATTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTACTATCAAAATGGATTGTTACTTCGTTTGAGATTCA:1 + chr4 347742 3' + Tc1-2 1536 1 76.71 AATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGAACCGCAAATCGAAAATCAATTGTTACATGGGGACTACATTCAGGCAAACTGCACCCCGTGTCCCGTGTTCCATGGTCCATGTGCACATGTGACTGACTTT:1 + chr3R 30761175 3' + mariner2 216 1 67.81 AAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGTTAAAATAAATACGAATTCCAATTTAATAATATTCTATTGCATGTAAGCTGGC:1 + chr3R 23828065 3' + jockey 4894 1 67.12 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGG:1 + chr2L 12250994 3' - 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chr3R 24065652 3' + gypsy2 444 1 66.21 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAGGTTTAAGTGGGCGTGGCTAAAAAAGAGAAAAACAGAAGAGAGTCGAGTTCCCCGGCGATCCATACCCATTACTCAGCTAGAGACTCGAGACAGTGCGAAGTA:1 - chr3R 4507827 3' - roo 8683 2 69.86 AATAAACGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATATAATAATAATAATAACAGATTAATATTGTATGTACATATGTATAAATAAGATAAATCGAAGAAGCACCCGCAGCGCATCCAATGAAAAGAGTGCCACACAAAGACGATCG:1 + chr3L 22718589 3' + invader3 5025 1 60.96 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGT:1 - chr3R 24450417 3' - 412 7110 2 55.86 ATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGGAGGTTAAGAGAGTTATACCTGTGATAGAGTCGGCTGTTACGGAAAACACAAGCGATGACGATGAAACCTATTTGACTCCATGTTCAAC:1 + chr3L 12757708 3' + Bari1 325 1 63.70 TTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGT:1 - chr3R 20675819 3' - jockey 4912 1 51.37 TTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTT:1 + chr2R 5303159 3' + FB 254 1 76.84 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCGTAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGAGTAGCTAACC:1 + chrX 15357800 3' - hopper 21 1 71.23 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGGAAATGGCGGGGAAATATTTAATTAATATTTTCCTT:1 + chrY 2720384 3' - 297 39 2 56.12 ATATTTATAAATAGGGTTTAAATATTACAAACTAATAAACGAAAAAAAACCTTAAAAGTGACTCTCTCTTCATATTGCAAGGATCAAGCATAATAAATTGTTAGATTAGGGACTCGTTCTACGAAAATCTGCTTATCGATTTAATC:1 - chr3L 14758573 3' - transib4 2566 1 58.90 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTT:2 + chr3L 24208246 3' - Quasimodo 23 2 67.81 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCGTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATT:1 + chr3R 15072674 3' + pogo 2051 1 52.74 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAA:1 + chr2R 21410987 3' - Burdock 43 2 55.48 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTAAATGTTTTTTGGAGTATGTGGGGTGGTATTGTA:2 - chr3L 5489848 3' - jockey 32 1 60.96 CATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGTTACTGTTATCGTCGTTGTCGTCGCGAATGTTGCTGATTTGAGTCGCTTTCATTGCTATTTCGGTTGTGCTGGCGGCGGTG:1 - chr3R 11669527 3' + Rt1a 4733 1 70.00 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCTATCTAGTTGAAATGCAATTAAATCCAGAGCGAAAAGTCACAGTCAGCATTTTCGA:1 + chr3R 5769160 3' - roo 11 2 76.71 ATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGC:2 - chr3L 16973376 3' - S-element 1594 2 62.33 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAANGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATA:1 - chr3L 26505851 3' - copia 43 2 56.16 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATA:2 - chrX 2479479 3' + mdg3 5445 2 50.68 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTGTTTTTAC:1 - chr2R 3338777 3' - Juan 53 1 52.74 TGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAA:1 + chr3L 17183752 3' + diver 151 2 67.12 AATTCTTTGGCAACGGCACTTAGCCGTTCTAGTAATCAAATCCTAAAGCTTAAGCACCAAAGAGCAATGCTCTCCCGAAATACAATAATCTTAAAGACTTAGTGTTATTTTTATCTGCACACGATACTTT:1 - chr3L 25800547 3' + 17.6 7102 2 73.85 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTAC:2 + chr3R 4964204 3' - roo 52 2 58.22 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGAT:1 + chrX 10521721 3' + Tabor 7254 2 64.38 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGC:1 + chr2L 47170 3' + roo 325 2 73.29 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAGGGGAAGTTATTTCATAGGAAACGGAAAATCCTAAAAATCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATCATATCATTCAT:1 + chr2R 24170006 3' + transib2 2780 1 46.58 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAA:1 + chr3L 16470346 3' - jockey 4747 1 71.43 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTGAAATAGTAGCTGTAGC:2 - chr3R 10736002 3' + McClintock 6395 2 61.64 GCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGCGACAAATGAATTTCCAGGACCTCGTTAAGCTGGCTATTTTTCAATA:1 - chr2L 11091371 3' - F-element 4464 1 68.49 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAA:1 - chr3L 16690910 3' + I-element 5287 1 67.12 AGTAACTCCTAATCTTTTATTGTCACGGCTCCGCCTGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCCCGTTGATCTGATTAGGACGGAACATGAGGGCCCAATGCCGCCGCTGTTCGTCGGTCTGCGCAGCATGAATATCAGC:1 - chrX 7955198 3' + gypsy2 6749 2 56.52 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTAT:2 - chr3R 6419827 3' + Tabor 7278 2 52.05 TATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTCTTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGTTATAATTTGGTCTTCGTGGGTCACAGATGGCGAGTTAGCCAAATATGCTTTTCACTCAT:1 - chr2R 19111569 3' - I-element 5248 1 69.18 AATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAA:1 - chrX 3431872 3' - Ivk 5355 1 51.16 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTGGGGGTAAGTTAGGTCAGT:1 + chr2R 23180314 3' + roo 9034 1 57.53 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTC:2 - chr3L 19454911 3' - mdg1 7085 2 53.42 AAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTCCCGCTGCTAAA:1 - chr2R 18258772 3' + Juan 4210 1 62.38 TTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCACTTCCTGTCTTGGATTCATGCAGGCCCTTTTTTGGCCCATTAGACTAGATGTTTTTGAATGTGTTTTCAAGCTGTAGATCCT:1 + chr2L 8228462 3' - Quasimodo 7202 2 56.16 CGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGCTTTCCATCATACCTGTGTGGC:1 - chr3R 22590451 3' + rover 329 2 71.21 ATGCAGNTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTA:1 - chrX 19539455 3' - pogo 35 1 48.63 AATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTTTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGATGAGTTAAATCAAACTTACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTG:1 + chr3R 6422878 3' - 17.6 409 2 72.60 CATGAACTTTTCACGACTTGACTCAGTCGCAAGCTATACCCGAACCCTGAGGCCACCAGAAAGCGACAACTAATTAAACGTTTTTTTTTTACGAAACTTATCGTATTTTTTTAAATTTGTATTTTTACTTCCTATTTCCTCCGGCA:1 + chr2R 7019438 3' - Gypsy12A_LTR 286 1 56.85 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACG:1 + chr3R 5351456 3' - jockey 4719 1 66.97 AACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGT:1 - chrX 21772490 3' + springer 7151 2 54.10 AGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTGCGACGCATACACTTTTGAAAAATATGTTGACATTTTCTCACATTTTTACAATTTACAAGACTTAGTAAATTTCTATCGATAAGCAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 25231735 3' + INE-1 149 1 37.67 GAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAA:1 - chr3L 13727325 3' + P-element 87 1 17.12 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCG:1 + chr2L 12822858 3' + P-element 2848 1 41.51 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTTCATAGGAAAAGTTTTCTCGGGTTTTTGGTCAACTGTCTGGTTAACTCCATTCAT:1 + chr3R 20441374 3' - I-element 10 1 77.40 TTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAATTTTATTTT:1 + chr2R 1916454 3' - Juan 56 1 53.10 AGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAATGCATCAGAAGCACCGAGTGCAATTTCCTTTTTTTTACTTGCCCCCAAATGACGGCACAG:1 - chr2L 7620339 3' - X-element 4468 1 38.36 TTAAATAGTGGATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTT:1 + chr3L 17183767 3' + diver 6056 2 54.86 CTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATAGCTAGATCGACACGGCTATTGATCCGAATCAATGAATTTCCAGCTCTGTCAAGAATGGTGGAAAAAGAACCACGAGTTATTAGCCGGCCCC:1 - chr2L 6504283 3' - INE-1 152 1 58.74 TTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTCCGTATATAGTTAAGCGGCAAGTCATATTTTAATTATATCTTTCTGTTTATTAATAAATAACAATTATCAAAAATGCATGGGGCTCAG:1 - chr4 836796 3' + FB 678 4 41.78 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTC:2 - chrX 20453683 3' - INE-1 545 1 79.45 ATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGAGGAAGGACTTCAAGAGGAAAGGAATTGGTAGTGGCCGGCGGAAAACAAAATATTCATGAACACAGCAGTCTTATAAATAAATTTCAGACCCAACACAGGAC:1 - chr3L 13835548 3' - 412 424 2 72.60 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCATATAA:5 - chr2L 22674737 3' - mdg1 18 2 74.66 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCT:1 - chr2R 13766213 3' + roo 8999 2 69.18 TATGTTTGTGTGTGTGTATGTATGTGCTGGCATTGCCGTTTGTGCTTATTGAATACGCAAAACATGAACAGCACAACAAAGCAACAAGAAACTATTGAGAATGGATTTGTTCGGCGTAACAACCTAAGCTCCACATTGGCCAACCA:1 - chr3L 19881319 3' - Quasimodo 34 4 55.48 ATGTTAGTTGACGCGAAGGCTCTAACTGTTTAGGGGGGCAGAAAGAGAGAAAATAACTTGGCTTTCCTTTGTTTATTTCCCTAGTGCTGCAATTTCCATTTACCTTGGTCCATCAAATGGGCATTTTGTGTGTGTGCTGCGGC:1 - chr2R 11490602 3' + Gypsy12A_LTR 470 1 60.84 CAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAGGAAACATTCATCCAGCTCAACCGAAAACGCAAATCCGGAATCGGAGGAGGACGAGGAATCCACGGAGCCACCAAACG:1 - chr3R 18302561 3' + F-element 4331 1 55.71 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACGATATGTTTGACGATCGAATACCGGTGGATTATCGTT:1 + chr2L 17809306 3' - jockey 27 1 70.55 CACACACACACACACACATATGCGCATACATGGAAAACCAGCAGCTGACGAAAGATGAAAAATGGGAAATGAAAATGAGTGGTTAAGGGAGAGGGAGAGGGATGGTCAACATTTTCAATGCAAATATATACGCATTTTTCGTGCG:1 - chr2L 1629162 3' + accord 184 2 61.38 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATT:1 - chr2R 18258784 3' + Juan 4153 1 56.85 ACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTG:1 - chrX 18396054 3' + roo 393 1 59.06 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATTTATCAGCCTGCTCCACACCCA:1 + chr3L 25401041 3' - Doc 6 1 66.13 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGATGTTATCGATTCC:1 - chr2R 22034594 3' + copia 250 1 81.51 CTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAATTATAATTTTTTTTTTTGTTTTTGCTATTTTTGGATTTATGTTTAACTTTCTTAGTAGGAAACATAATTAAAATTTTTTTTGTGTTTTTTT:1 + chrX 13139126 3' - Stalker4 6940 2 58.62 GGGCTAGTCAATTAAATAAAATAATTTCTTTAATAAAATTAAAGGACAACTAAACGGAAGGAAAATATCGTGAGCAGAAAATAATATTAAGTCTTTAAAAGAATTAATAAAATAATAGCAAGATACAGGGAATACTATAGAGTTTT:1 + chr3R 904671 3' + jockey2 3373 1 45.21 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACA:1 - chr3R 7666655 3' - I-element 82 1 70.34 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATGGCTGTT:1 - chr3L 10731719 3' + 297 6969 2 79.02 ATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTT:2 - chr3L 19454939 3' - mdg1 7113 2 66.44 TTTAATTATTTAAATAATATTTAATTCGACTATTTTAAAGGATTTATATCTATGTATTGTAGTTCTTTAAAATTTAATTTCTATTGCTTCAAGGGTATTAAAAAATCGCCTTGGGCTTCTTTTTCTTATTTTCCATTGTTTATTTG:3 - chr2L 13076911 3' - S-element 1450 1 78.08 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTA:1 - chr3R 19073161 3' - roo 8703 2 53.42 ATTATGGTCTTGAACCTATTATGGTTACATTCTCGGAGGAGAATCTTAGACTACCTAAGTCCTGGTAGCTGTTCCCAAAAGGACTGCACAATTTGGGAGGATTATGCCGGCGACGTTTTGGCTCAGATTGACTGTCGCCAGGGG:1 - chrX 4210130 3' - baggins 5078 1 58.33 ATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCAAATTAACAAAACGAAGTGAAGAGAAGAGAAACTGCGCTCAAGTAAATAAAACTGCCCCACTTGGCCATGGCGAGGCCGA:1 + chr3R 23641294 3' - pogo 1678 1 56.85 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAAT:1 - 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chr2L 12503724 3' - P-element 2598 1 56.55 ATTTTTTATAACTATTTTATTTTACAAAAAAAAATCTATATTTTGAAATGATAAGCATGTTCTAACAATATAAGAAAAGTATAGTTGATATAAAATAACTCCTTAGTAATTCTGAATAATATTTGTGTGCCTTCCTGCTAAAGCTC:4 + chr3L 16476962 3' + 1360 3091 1 67.81 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTCAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGACTTACAACCGAGTGCTGTGTA:1 - chr3L 9269858 3' + copia 255 1 58.90 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTC:2 + chr2R 17878639 3' - Doc 64 1 54.79 CCAAATTCATCTGCACGTACACTCAAATCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCCCCCACTCTAAACTCTTCTGCTCTCAGCAACTTCAGAAACTAACACCCAAATACTAAATAATTGTAAATATAAAGGTCACATAACAA:1 + chr2L 5922213 3' + Porto1 418 1 72.60 TATGTAGTCATTGAGTTGTCAATATTAATATTGTGTTTTTCACAATGCAAATAGCATTTTTTAGATTTTTTATTTAATAATCAGGGTCTATACTATGTATGTATCAAAAGCTGATAATGTAGCTTTACTTTTTATTCAAAGAATTT:1 + chrX 19240907 3' - Stalker 6800 2 76.03 AATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTTGCAAGGTTCTCCC:1 - chr2R 10078165 3' - jockey 114 1 74.66 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATG:5 + chr2R 7850011 3' + roo 325 2 72.60 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAA:1 - chr3L 19454908 3' - mdg1 7080 2 55.56 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGTGGCATGTGCTGGGACTTCCGAGTGCGATGCGATTCTCAGGGGAAGATAAGCCG:1 - chr3R 20818339 3' - 1360 49 1 58.59 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTGAGGGGGTGGGGTGGGAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCCCCCGCGGCAGGCATTTTGAATTCAAGTCTC:1 + chrX 585750 3' - Tirant 27 2 60.63 AGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAAAA:1 - chrX 2479455 3' + mdg3 218 2 59.59 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACA:1 + chrX 10167442 3' + roo 319 2 77.40 TAATAATAATAATAATAAATATGTAAATATTTAAATATCAGCCAAAAAATGTAAATATTTACTAAACTGGATATTTATTTCAAAATTCATATTTAAATCATTTTCCCAGTAATTTAGTGCCAATCCTGTCCCGTTGTTTCTACTGC:1 - chr2L 4136615 3' + mdg1 7083 2 67.81 ATAATATTAAAAAAAAAGAAAATGCAACTGCGCTAGAAAATTTTAAGCTAAATATTCAGTAAACCAGTTGGAAGATAGGAACTCCCCAGAGCCACAAGAAAAAACCCAAATAGATTACCATTTTATGCGA:1 - chrX 8865362 3' + Rt1a 5073 2 61.54 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTA:1 + chr2L 18549937 3' + roo 355 2 53.42 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCGATGCCGGCGGTTTCATAGTTTTAGCTATTGTGCCGCTTAGCTGTAAACTTCTTTCTTTTCCTCTCTTTGCTTCTCCTTGATCTTTTCTTCTTTCAACTTCTCCTCTCGTT:1 - chrX 11830955 3' - S-element 8 2 66.44 TCATTATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGTAGTTTAGCGTGCGATTGACTTGTGCAACAAAAAGTTGCAGGGAAACGTTTGCATTTATTGCTATTAAATTAATTAATTTGGATATTTCATTTGTGTGTG:1 - chrX 13609217 3' - Porto1 4381 1 70.34 ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTGAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 51 1 72.60 AGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAAGCAGTGAAGAG:1 + chr2L 16539805 3' - Juan 4028 1 80.14 AATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATAGTATATAGTAGCATATAGATATATTCACTCAAGTGATCAGAAAATTAAAT:1 - chrX 4595886 3' + Quasimodo 7306 2 76.71 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGG:1 - chr3R 9038954 3' - Juan 4043 1 63.04 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTTACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTTGCTTCATATTTATTTATTAATT:1 - chr3R 4217665 3' - 297 38 2 58.87 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAA:1 - chr3R 4860450 3' + Transpac 5200 2 60.00 GTCAGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTCCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTTGCCTTTTAATTTGAGTTTTGCATGCAACAGGGCGC:1 - chr2L 6647653 3' + mdg3 172 2 67.15 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGAC:1 - chr3L 20196252 3' - FB 61 1 70.83 AATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAGCCAAAAATATAGCGCTACTGTGTGTGTGTGTTATCTCG:1 - chr2R 22310982 3' + I-element 320 1 75.71 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAAT:3 - chr3R 9557510 3' - G2 3023 1 51.37 AAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTG:2 - chr3R 26178375 3' + 412 430 2 58.22 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTAC:1 - chr3L 15913831 3' - jockey 4803 1 55.48 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGCCGCGATGTCGC:1 - chr3L 2544572 3' - Tirant 8117 2 77.37 GAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATAACGTACATTATTGCACACATAATTACACACCCATTTCGCACATTTAGCGTTTCGAGGTCCTACATCACG:1 - chr3R 17736845 3' - opus 7 2 67.62 TAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACAGCGTAGAGAGATTGCTGTATGCGGAAAAATCCAAATGACATTTTCCATAACCCA:1 - chr2R 16931610 3' + jockey 4835 1 63.01 ACTCGGCTATTGATTCTGATCAAGAATAAATATTAAATCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACCAATCTAGTATATCCTCACGCGTCTTAAAATTGTAGGAGTGGCCGGGTTGTAAAATTTGCAGCGTGCTT:1 + chr2L 21285142 3' - INE-1 91 1 67.59 TAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGGTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTGTGAAAGCCAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAA:1 - chr3R 3922966 3' - Cr1a 100 1 77.40 TAATAAAATTATGAAAAAATTTCGAAACATTTTGCAAAAATGTGGGCGTGGCAGCTTTGGTTGTTTTTAGGGAGTAATAGTGGGCGTGACAAAAAGATTTGTCTTCCGTTTGTTTGTTTGTTTGGGTTCTGGACTTAACGATTAAT:1 + chr3L 2872504 3' - INE-1 399 1 68.49 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACTAGTTTAAACTTGAGTATAAGTTCTCTTGCCTCTAATACTCCCATCTACTGCTGTACGAGTACCAGGTATAAGTCAAACAAAAAATGTCGTGTAA:2 + chr3L 21974517 3' - GATE 38 2 64.38 TGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTA:1 + chr2L 13844281 3' - Stalker2 7287 2 58.22 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGCTTAAATCAG:1 - chrX 13134837 3' - jockey 4764 1 79.29 TATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTT:1 - chr3R 24381324 3' - Juan 4189 1 71.23 GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTT:1 + chr3L 13581714 3' - jockey 4838 1 74.10 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGTTTCATAAGACTGATTTAAG:1 + chr2R 3564175 3' + Tabor 457 2 65.52 GTGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGT:1 - chrX 21639596 3' + gypsy5 7309 2 58.22 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTTGCTTCATATTTATTTATTAATTGACGATCGAAAA:1 - chr3R 4217653 3' - 297 20 2 70.37 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCTTAACAC:1 - chr3L 6518522 3' - 412 28 2 67.12 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGA:1 + chr3R 21933242 3' - pogo 60 1 63.45 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCG:1 - chr3L 23287225 3' - 1360 53 1 60.45 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGC:1 + chr3R 4860541 3' - Transpac 4925 2 72.73 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATG:1 + chr3L 12315838 3' + transib2 2779 1 54.48 TAAGTAACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCTCCGTAGCCTATTGTATACTACAATATATTTAATTTTGTTAAGTA:1 - chr2L 3813588 3' + Ivk 5220 1 69.18 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTT:2 - chrX 15357641 3' + hopper 1367 1 50.68 GGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGACTGGATTAA:1 + chr3L 23112569 3' + R2-element 3197 1 53.42 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGC:1 - chr3R 27765095 3' + mdg1 7390 2 65.07 ATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGCTAAATATCATTCAATGGAACAT:1 - chr2L 22255057 3' - 1360 201 1 53.08 CTCTTAGTCATACATTCCTAATTAAACACGCACCCCCAATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTACCGTTTGAAATTCGAGTTGCAAAGTCACACACACACACACACACACACATA:1 + chrX 7978953 3' + mdg3 35 2 45.38 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCTCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTCAT:1 + chr3L 21996251 3' + Transpac 5168 2 63.50 CTGGAATAAACCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTTATATTTACGGCAGTTATTTTACAATAACGTTTCTTTATTTCGGCTATCAGTTCAGAACTAAGCTTCTTTGTTCAATCTAAACAATATGTT:1 - chr2R 22424318 3' - Chouto 208 1 78.12 ATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTT:1 - chrX 15200858 3' - 17.6 74 2 76.03 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTG:1 - chrX 11661372 3' + pogo 2058 1 56.16 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCTCGCACCAAAACC:1 + chr2L 16564614 3' + roo 396 1 69.18 GGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAA:1 - chr2R 5070914 3' - Tirant 8115 2 28.77 TATGAGTTTTTGTATGTTATGTTTAATTTAGTAATGAACAGCTTCCTTTCGCC:1 - chr3R 11307740 3' - I-element 5135 1 43.40 ATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTA:1 + chr3R 17615225 3' + Tc3 303 2 74.29 AGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAATCCGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTTCCAAACGTTTTTATATATGACGATATATAAGGACGCATCCGATAAAA:1 + chr2L 22693240 3' - Cr1a 4112 1 69.18 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTTTAGTTATAATAGATCTTATTCTTAAAGAATAGAGTCAGTTAGATATGGAATAATAATAATACTTATTACTCATTAAAATTAATAGATC:1 - chr3L 1279051 3' - roo 30 2 53.42 GAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATC:1 - chr2L 6654671 3' - diver 5972 2 73.29 CTATATGTCTCAGAACGTTTACTTGGGCCATAGCTGAAACTGCGGCTTTCTTCTTTGATGTTCCGATATTGTTGAATAATTAAATTATAGAAAACAAAATCCGTCCGGTTTCTTGTTCATATTTGAGTTAATGGGGCGTATGGCAG:1 + chr3R 21571713 3' - gypsy10 5507 1 54.79 TAAGTCTCTCGCATGCCTGTTCGGATGGGCGGGCACGTAGTTTGTTGCGATATTTTTTCACTTCTTTTTTTCGTACACGCTCGTAGCTATAAATTTTAAATTAAATCAAACTTTATTTTAATAAATACAATGATTGACTTTCCCGT:1 - chr3R 4506367 3' - Fw2 3757 1 63.01 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGAGGTCTTAAAGAAATTAAATT:1 + chr2L 12251027 3' - 412 7080 2 61.64 AACCGGATCAAAAGAACTCACGACGGAAAAGTTCAAACAAATTTATTAAAAAGTACTAACAAAACGAAAAATTTATTTTAGTCGTGCAAGTGAACACTCTTCCCAAATGGGTACTAATTAAAAAACATTTTAAGTATCTTTGCGTG:1 - chr3L 20245604 3' + gypsy9 366 1 60.96 ATGTGTGTGTGTGTCTGTGCATAATGTCCGCCGTTGTTGTTTGTGTTGTTGTTGTTTCTGGACGTTTCTGTATCGCACATTCGGTTTTATTGTTGTAAAATAAACTTGTTTTTAATTGCTTGCTGATACGAGAGCGAGCAA:1 - chr3L 1119368 3' - accord 7027 2 65.25 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chrX 20783463 3' - 1360 73 1 63.04 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATTTTCGTTAGCCCAAGGCTGATATTGCTACTTTAATAGAATCAATAGCAAACGATTTTAA:1 + chr2R 14653301 3' + 297 6963 2 71.23 TCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTTAATAACGGTGCCAGGACATGTGAACGTTGCAATTGGCGAGACGCGGACAATAAATGGCCACATGACAAAACATACGTTTCATGTACAAATGTATGTGTGTCATAAATTTTGATT:1 - chrX 22900442 3' + Tc1 1237 1 68.49 CAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGATGCTACGGATTGCACTCAACTTGGCTTGCTCTTGGTAATTGGGTA:1 - chr2R 9032073 3' + hopper 1293 1 68.75 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTAT:1 - chr2L 5069689 3' - flea 4831 1 78.01 ATGGAAGCAACAAGCTGGGTCATCTGAGCGAACATCTTCTCCATCATTCTCTCGATCATGCCTTCAAATCGGGTGATCATAGCCTATATATGGCTGGGTTGTGGGGCTTCTTAAATAATCTCCTACAGTACGTTGTAAACCAACG:1 + chr2L 17551919 3' - G2 227 2 75.86 TTACGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTTTTATTTCATAGCAATTTTTCCCTCCTTTCCCAAGTTTTCCACGTTGGCGATTTTTC:1 - chrX 16751963 3' + blood 164 2 52.27 CTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAATAAATGTATCTTACATGTAATATATAAGATATAAAGAGATTTCACAAATTTACGTTTG:1 - chr2L 14523126 3' + HMS-Beagle2 7135 2 58.90 TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACT:1 - chr3R 25709763 3' + hopper 1360 1 55.48 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATAAAAGTAA:1 - chr3R 4679412 3' + hopper 1392 1 68.49 TGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGA:1 + chr3L 23839733 3' - 17.6 41 2 64.14 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAGGAAAAAGTAATGATCCAAATAATAAAGAAGG:1 - chr3L 46888 3' - FB 40 1 58.22 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGC:1 - chr3R 23618141 3' + hopper 1354 1 66.92 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAATCAAAATAATACAA:1 + chr3L 6397793 3' + roo 9046 1 67.81 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACC:1 - chr3L 17183663 3' - diver 5942 2 52.74 GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGAT:1 - chr3R 6419857 3' + Tabor 409 2 72.60 AATTATTATTTTATTATTAATAGTAGTTACTTTTTTCTAAATTTTGAATATATAATATTGAATATTTTCGGGTCACTTTTAAAGAGACTTCACTGTAAAAGGAATCGCGGCGGGAACTTT:1 - chr3R 19328170 3' - gypsy9 5320 3 44.17 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCA:5 - chr3L 2989907 3' + roo 9039 1 62.33 TATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTT:1 - chr2R 330121 3' + HMS-Beagle2 244 2 65.75 AAAAGAGCTGTTCGCTGAAGAGTCGACAGAAGATTTACAGCTTCTTAGGGAAGTCTAATTTTTAATTACATATACCCGTCGGTTATTATATATGGGAATGGGCCAATGCTGGAAATTGGTTACAAGAAAATGTCAAATAAAATGG:1 - chr2L 7612467 3' - 1360 127 1 54.48 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGANGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTA:1 + chr3R 18093377 3' - I-element 60 1 56.16 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTTTTTAACTGCACAATAGCTACACATAACAATGGCCGCAAAA:1 + chr3R 27986474 3' - roo 8697 2 63.01 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGATTGCAGCCCAAGAAGCATAAAATTCAAATCCCCCAGCGAA:2 + chr3R 27133718 3' + opus 491 2 79.45 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAAC:1 - chr2R 13766226 3' + roo 8986 2 78.08 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACT:1 - chr3R 15790839 3' - roo 57 2 57.53 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGG:1 + chr3R 9039011 3' + Juan 4155 1 64.49 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTA:1 + chr3R 11062825 3' + roo 9003 2 62.33 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTTTCGGTGGAATTTTT:1 - chrX 22840431 3' - copia 18 2 71.23 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTT:3 - chr3L 7889566 3' - roo 8733 2 71.92 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAACTCCA:1 + chr3L 13365847 3' + BS 5045 1 52.74 TAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAA:2 + chr2L 1924022 3' - G2 3014 1 51.37 ATATATTTTTTTCTGACTTTCTTTGAGCATGCCTTTCCATTTCAATTCACTTGCCGGCGGGACTTTGCCTTTTTCTTTAACACATTCATAGATCTCCTTAGTATTTCAACACAGCTGATTAAATTTCAAAGTAAATGAAATGAAAT:1 - chr3R 4456045 3' - transib1 32 1 56.85 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGT:1 - chr3R 15790821 3' - roo 8703 2 49.32 ATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGTG:1 - chrX 20999471 3' + BS 5067 1 63.01 GGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTT:1 - chrX 20999519 3' + BS 5019 1 70.55 GAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAATCATTTCATAAAATGATATCATGTTGCTTCAGCTTCTGTGGGTTTCCACTGTTGTGCTCTCCCAAATCCTGATGATCCTTATCCCGA:1 - chrX 7729126 3' + Doc3-element 4438 1 53.42 ATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAAT:1 - chrX 292427 3' + G3 4507 1 65.75 TATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACTTTAGAACG:1 - chr3R 18399344 3' - Juan 4053 1 33.56 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTTAGCTTAGTTCGAAAATAT:1 - chr2R 24169914 3' - transib2 5 1 50.00 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGC:1 + chr3L 24934417 3' + HMS-Beagle2 7153 2 58.62 AAAAAAAAGGAAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAATGAAGGGCTAGGAAAAATGCGGGGAAAGCTGTGGAAGAAAGCCTGGGCTGATTGAGTGCTGCTATATTGGCATATATGTACATATGTGGTCTTGGTGTCAGTTTTATGGTTTT:1 - chr2L 11560258 3' - hopper 142 3 50.00 CAGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGGTGTTCTAGATAGCAACAACCTAT:1 - chr3L 17183616 3' - diver 5895 2 73.29 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCA:1 - chrX 8027427 3' + Juan 4145 1 65.07 ATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGAAGCTGACGCTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGACGAAGGACCGTATAGCAGTGGCGCCAAAAATCGTCCCAGTGAAGCCA:1 + chrX 23448988 3' + Chimpo 4084 1 66.20 AATACAGATGCAAAAAAATTTTTTTTTTTGGTA:1 - chrX 12441586 3' + transib1 1951 1 87.88 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAATTTTT:2 + chr3L 14366644 3' - roo 48 2 55.48 TAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAATAATAATAAAATACAAGCA:1 + chr3R 7943832 3' + blood 7331 1 58.90 CTGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAAT:1 - chr3R 17996135 3' - diver 5918 2 63.70 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGGGAGGCCACATCCGAATTGATTGACTCCC:1 - chr3L 1691974 3' - blood 16 2 73.29 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACCACCCACCCCACTCCACTTCACTTCGCAGGTCTGGGCAAAATCGATATTATGGCACACTATGCTGCTGTGCTATTTGCGCAATGCAAATATGCG:1 + chr3R 20818466 3' - 1360 5 2 79.03 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGGGGAGT:1 - chrX 19074710 3' - mdg1 6 2 76.03 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGG:1 - chr3R 27315095 3' - jockey 4714 1 51.67 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAA:1 + chr4 373086 3' - pogo 31 1 62.76 ATTCACACTAGGTGTGTAACGGATATATGATAATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTATTGCTTTAGTATGTTTCCGAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAGACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCGCATAAAAA:1 - chr3L 27579 3' + INE-1 536 1 50.00 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:2 - chr2R 11367658 3' - mdg1 7098 2 61.64 GAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATTCAAATACAGGAATAAGAATACAGGAAACGGACAAAATGACAGACTCTGCCGCAACA:2 - chr3L 25691429 3' + mdg1 230 2 67.12 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAGCAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACAGCGAAATAATAAAAAATTGAAACCACGCCGAGGGAAAGCCGAGCACAAGGAAGAGCTTGGAGGGCATAAAAAAGCCACAGGGCTCGGTTCTGTGACCC:1 - chr2R 15721625 3' + jockey 4956 1 71.23 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGAACGAGATACAATGTGCACTTTATTTGAATTTCGCTTT:1 - chr3L 12004225 3' + P-element 2853 1 57.78 ATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGCATTATAATG:1 - chr3R 556453 3' + Tc1-2 1545 1 70.55 AAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAA:1 + chrX 19980683 3' - X-element 4553 1 63.70 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCG:1 + chr3R 11937383 3' + flea 4933 1 73.29 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAG:1 + chrX 1135358 3' + P-element 2787 1 17.12 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGT:1 - chr3R 24369015 3' + roo 357 2 52.74 AAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTTACGCAACAGCTATTAAAAAAGCTCAATAGCTGAACAGTGTGAATCCTAAAAATGTATTGCTTTTCTAAGCGAACTAATAATAATTTTTTTTACTTTT:2 + chrX 13287874 3' + diver2 300 2 54.79 ATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAAAGTAACTCAAATTTTTAA:1 + chr2L 21570300 3' - Dm88 4387 2 69.86 TAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAAT:1 + chr3R 26504296 3' + HMS-Beagle 165 2 73.29 CCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACTCAATTAAGAAACTATAACCACAAGTTGTTTCAATCAATCCGTACTAGAATACATTTTAAGTGCAGAGAACAAAAATTTGCATGACTTTGGGAATTATATGCATAAATCTGTAAGTG:1 + chrX 13759100 3' + S-element 407 1 65.75 AATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGACGTAGGCAGCTGGAGTGCACATATATGCATATAT:1 - chr3R 12570300 3' - 1360 344 1 76.71 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTT:1 + chrY 2720368 3' - 297 6629 2 64.39 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCA:2 + chr2L 14523264 3' - HMS-Beagle2 6923 2 44.52 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAA:1 + chr3L 6447102 3' + transib2 2779 1 65.74 ATTCTATCTATCATAATATTAATAATAATAAAAGTCTTAAAGACTTGCAAAACTATCGAAAGTAGTCTATGATCTAGTATTAGAAAAACTGGGTTATATGTTTCTTATTATTGTCTATGGTTC:1 + chr3R 7666754 3' + I-element 5347 1 69.11 CAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGCCAAATTCAGTAGGCGAATGCAAATCCCATTCACACGGTT:1 + chr3L 14721175 3' + F-element 427 1 61.90 GAGTAGAACTAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGA:1 - chr3L 25008296 3' - 297 370 2 77.40 GGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATGCATAAAAAAGTGTACAATTTGCAACGAAAATAAATATAACAGGCATTCAATTAAAATT:3 + chr3R 905074 3' + rover 7281 2 72.60 CCCCGTTCCAAACGGTGTCAAGCTCTTCAGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCGACTGCAACTACACATTAAAACTTCAAAATATAAGAACATCAATGTATACACATTAACATT:1 + chr2L 18235669 3' + Doc3-element 456 1 59.48 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGT:1 + chrX 12129430 3' + flea 4976 2 58.90 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATCC:1 + chr2R 6885622 3' - P-element 35 1 59.71 CTTTCANTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGC:1 - chr3L 18281862 3' - Doc 70 1 65.75 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGGACTTCCAGCGCAGCAATACTG:1 + chr3R 13875137 3' + P-element 2828 1 41.84 GAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGA:1 + chr2L 13844242 3' - Stalker2 7325 2 68.28 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGC:1 - chr3R 23639116 3' + pogo 2065 1 59.59 TACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAACCTAGTGAAGTTATTTTGATTATTAAATGCAAATTATTTTATTTTTGTTTTTATATTGTTTGTGTTTGCGCAGTAGCTTTAATTACTTGATCCATAAATGGATATTTTTGTTAGT:1 - chr3R 12857113 3' - mdg1 7021 2 64.38 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGCTTAATTGCCTCGCCCT:1 + chrX 8437787 3' + P-element 2872 1 71.11 CCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGTGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGCGTCGTATTGAGCCTGCGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGC:1 + chrX 9909334 3' - P-element 2862 1 17.07 AAAAAAAATTATTAATTGTTTTTTATTTTA:1 - chr3R 11809573 3' + Tc1 54 1 76.67 ATTTAAAAAATATATATAAAAAAAATTAAAACTAAATTAAAAATCAAGTTATTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAATTCCC:1 + chr3R 19445658 3' - copia 4664 1 76.03 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAA:1 - chr3L 10731744 3' + 297 360 2 60.27 ATGCATGCATTTAATATTATCTTAATCGAACGACTTTCATAAAATGGGTTTAGGCAAAAAAAAAGGGGGTACATTTCCATAATGAAACAAGGCGAAACTTTCATGCTCTCGGTGCGAAACGGAAAAGTTTTCGGAAAGCGTGTTG:1 + chr2L 1260904 3' + Transib-N1_DM 431 1 56.55 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCGAATTTGCTGTCAAAGTAATCCGAAAACGAAATCGAAAATGGCTCG:1 + chr2R 13931641 3' - P-element 50 1 52.74 AGTTCTTGGACTTTAAACCTATATTATTTTTGATCAATTGCCACCCGATAAATAACAAAACTTAAAGTAAACACAAGTCAGAAATGTGAATTTCACAATGCTGTGAAATATAGCTTTACTCATAAAAATATTTAAAAGTTCAAAAA:1 - chr2R 4269701 3' + 1360 238 1 72.60 ACAAATTTTGTATATCGTTTAAAAGGTTTGTTTTTCTTGTTCGAAGAGTGTGCTTTATAAGGTCCAAATAAAGTGCAACATTATATATGAATATTATATTTAAAAAGCAATGAAAACTGATAATAATTTTCACAGTACATTTAGTT:1 - chr2L 17925326 3' - Juan 351 1 70.55 GTGGAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCT:1 - chr3R 904936 3' - rover 6996 2 62.33 GGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAAAAAATAAATTTAATTATAAGAAAAAAAAAATGCACTGAATCTGTCAGCCTAAAAGTATGCTTCATTTTCGCACAACCATAATTGGTAAAAGTAAAAAAAAAGTTCTGAT:1 + chr2R 16626847 3' + X-element 4688 1 71.22 CTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGA:1 + chr3R 21276623 3' + BS 5032 1 58.90 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCATTTTAATTATTCACATCAATA:1 + chr3L 11326827 3' - pogo 8 1 76.03 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTT:1 - chr2R 21681298 3' + roo 352 2 56.16 CTCAAAACAAAATAATCGCTTTTCCGAAAGAAGTCATGAATCTTTTAGATGCATCAAATGTAGAACATATTAATAATGAACCATTTTTGGGGTATCGGAATGAATATGTGGTGGCTTACGTCGGGAATGTTTACGTGGGACATGGG:1 + chr2L 7193582 3' + transib3 2447 1 62.33 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAA:1 - chrX 6475300 3' - Doc 69 1 60.96 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGCTGTTGCCAGCCTTCAGCCCTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTT:1 + chrX 20851798 3' - flea 49 2 66.39 AAGCCTCGGTATTGAGCTTTTCCAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCGTATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTTTTATTTTAGAGCATTTGCTTTTATAATTTCGAGAAAAAGGTGTCAGAAATAT:1 - chr3R 16966847 3' - Idefix 7240 2 69.18 TAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTACTCTCCGTTATTTTTTTTTCGCCCAGTTTTTTCCCAACTTTTGCCTCAGTGGCATATTTATGAAAATTGTTTTGCTCTTTGCTTGTTTTTAAATTTTTCATC:1 + chr3R 25520217 3' - invader2 4783 1 69.86 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTG:2 + chr3R 15364025 3' + flea 4961 2 55.48 TGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTG:1 + chr3R 21276643 3' + BS 5052 1 47.26 AATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTTATGAGTGAGTGGTCAAACTGAGGGAAAATATATTCGTTTGCCAGACTTTCAAATTAGAAATTTTACTGCTTA:1 + chr3L 11671150 3' + accord 174 2 51.37 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGCATTAATTATCCGGACTTAA:1 + chr3R 26178519 3' - 412 7069 2 68.49 ATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCC:1 + chr3R 19992698 3' - hopper 49 1 74.49 ATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGG:1 + chr3R 10736167 3' - McClintock 22 2 67.12 TGTGTGCGTGTTGTGATAGAAGACGATAATCCAATTACACCAATCAATCTCGATCGCAATCGCTTCTATTCGATTAGTCTCGAAACGAAGCCTATCGAACCGCCACT:1 + chrX 14999813 3' - 1360 3208 1 76.64 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACAT:1 + chr2R 6847839 3' - Doc 71 1 63.70 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCAT:1 + chr3L 11326799 3' - pogo 36 1 58.22 AGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATTAAAGAAAGTATTAAAATTTAAGAATATTTTTGTTGTAGGAAAATACATGGA:1 - chr3L 18768397 3' + S-element 1685 2 64.38 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGAC:2 + chrX 1341726 3' - 412 68 2 63.01 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTA:2 - chr2L 6654641 3' - diver 54 2 52.74 AAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAATGG:1 - chr3R 460072 3' - F-element 133 1 52.74 TTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGGCGTTGCGGTGCAGCCGACTTTGACTGCATACTCGGGTTAGTTCTCTTTCGAGGGGATGTGTGTGAGTGACAATGGTGGCCGACAAA:1 + chr3L 19340949 3' - Doc 4577 1 69.53 AACGGGTATCTGATAGTCGGCAACTCGACCGTAGTATTCTCCCTTACCAATCTTTGTGGGGCTTTGTCAACAAACTTTCAGAACGAAGCATTAAAAATGTAACTACTTTATTCGGGGGCACATTTAAAAGAGCTACACGTATGT:1 + chrX 4206626 3' + INE-1 553 1 66.67 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAA:1 + chr2L 16946142 3' + hopper 1365 1 50.00 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGGGGGACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGGAATTGAAGGCATCGTTCAATTCCTGACAACTCGTCATCCATTACGATGAGCAAC:1 + chr2L 11298155 3' - I-element 37 1 57.34 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGGTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACC:1 + chr3L 16470351 3' - jockey 4748 1 69.18 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGGCAATTGCGCCTGTCA:1 + chr3L 18046706 3' + roo 351 2 56.55 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGTTTCAGCAAGG:1 + chrX 21100258 3' - mdg1 7098 2 57.53 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAGTTAATAATT:1 + chr2L 15076224 3' - 1360 42 1 56.85 TGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAAATTTGGAAGTTTGTTGGCGTTGCCTTGTGAAACATCGCACTAATTTGTTAATTTCTGACGCGTAACCGAAGGCGCAATGTTT:2 - chr3L 3264002 3' - copia 4781 1 54.79 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCCTAACGCTGGGCAAAAACCGACCACAAATTTAGTGAATGAGATGTTTCCGGTGCGGTT:1 - chr3R 28469151 3' - 412 12 2 77.40 TTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCC:1 - chr2R 15004737 3' + BS 5054 1 46.58 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGG:1 + chrX 21224630 3' + roo 9030 1 55.56 AATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAATTTGCAGTGTGATTCGTTTTTCCGCGAATTGTG:1 + chr3L 8685259 3' + I-element 5309 1 52.05 CGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTC:1 + chr2R 4270289 3' - gypsy9 32 2 52.74 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGCCAGCTCGATAATGAAGCGAAGTTGGTTAAATTAGCACAGCATTCAATTATTCAGCTCGGTTGGGAG:1 + chr2R 22034791 3' - copia 4888 2 71.03 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCACACAGACACGTGC:1 - chr3R 31886800 3' - hopper 22 1 71.92 ATCTTTTAGGCTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAAGAACTGAACGATTCCTACTGACTAATGAACAATAATAAATGATTTAAACTGTAAAAAAGAAAAACTCCAATCTTTTCTGTAATTTTCACGCGGAAACTACAGCGAAATGAT:1 - chr3L 20188572 3' + G5A 2776 1 73.97 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCACGCACACCCACAAGAATTTCTCATTTGCGGAGCAGCCATTTTTATTGCCACCGGCCACCGGC:1 - chr3L 22325803 3' + hobo 2916 1 57.80 ATAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATCGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGATGGACAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' + 1360 3098 1 53.42 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACT:1 + chrX 7795636 3' + roo 9034 1 59.59 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATT:1 + chr2R 7850042 3' + roo 356 2 51.37 GGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTG:1 - chrX 21639610 3' + gypsy5 7295 2 54.79 GACATCACATCCATCTCTAATCTTCGCGATGGTAACCTTTTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAGTAAGTGACAAATTTATCAAAGTGTTTTTTCTGGCCCCCAAAATCTCTTGCAAATCTCACTCAAAAGTAACGAATTTCTTGGC:2 + chrX 17062403 3' + Ivk 423 1 59.59 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATTTTTTTATTTAAATCATACGGTGCCACAAACTGTCCATATATTTGACTTCA:1 - chr2L 6102874 3' + roo 403 1 69.18 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCCTTTTGCTGGCAATTGCCTTCGCCAA:1 + chr2L 8338249 3' + P-element 2866 1 71.92 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTACATACATATGTATGTACATAGATATAGTAATGTCAGTCTTAAAGAATATTCATATAAGAATCGCTTACGGTGATTATGC:1 + chr3L 15103930 3' - Transpac 4954 2 59.72 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCCCGTTGCTGTACCGT:1 + chr2R 20349067 3' + transib2 2774 1 52.05 GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCATAATAGATCAGGCCTTGGGCAAAAAGACCTAAGAATGTGTAAACAAAAATTT:1 + chr3L 5640567 3' - jockey 4660 1 63.70 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAACTC:1 + chr3L 13365845 3' + BS 5043 1 54.11 ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGGCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGT:1 + chrX 21087682 3' + mdg3 229 2 59.82 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACCCATAAATTAA:1 + chrY 1421318 3' + flea 206 2 52.74 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTGGCTCTTCGTTTCAT:1 - chrX 18282613 3' + P-element 2859 1 45.56 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAA:1 + chr2L 20118477 3' - S-element 74 1 71.92 AAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTATGTTCATTGAGGGATTTGTGGTCTTGGTCTTCAAAGTGATTTTTAAAAAGCAGAGCATTAAAACTTTAAGAATGCATAAAGATTTAAATC:1 + chr3L 14224104 3' - Porto1 208 1 63.89 ATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAG:1 + chr2R 7850022 3' + roo 370 1 54.46 TATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCCAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCACGGGGGACTGACGACTTTGTTCTCATTCGTTGCCAGA:1 + chr3R 6397669 3' + F-element 191 1 72.41 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCG:2 - chr3L 15913825 3' - jockey 4797 1 58.22 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAAT:1 - chrX 4341283 3' + roo 324 2 74.66 ATAATAATAATAATAATAATAATAATGAATGAATTTGAAGATTACGTTTGTCAATGTTTAGTAGCGGTTTTGTAAGAAAACTTATCCTTGTTAAACTGAAATTTTTATAATTTGTTAATAAAAAT:1 - chr3R 15021688 3' + mdg1 7076 8 28.80 TTTACAGAAGGTAATATTCTAATACAATTTTTCGTGTTATTGCTTCATTTTAATTCGAATCATATGGCTTTTGGATTTT:1 - chrX 4808897 3' - mdg3 5487 2 64.56 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATATCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATAC:1 + chr3R 23295580 3' + P-element 2831 1 18.49 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCC:2 - chr2R 22034642 3' + copia 5071 2 56.16 AATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGTATACCCTCTTACTCTACGAATAA:1 + chr2L 14818501 3' + G3 4504 1 87.38 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGGGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTT:1 - chr3R 23639111 3' - pogo 31 1 61.64 TGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTAATCGCATTTCGGCCGAAAACCCAACGAAATTGGGTCAAAAATTTTCACTCGAAAACTTGTGCCTCTAATTTGACAGACGAGCGACCGCAT:1 - chr3R 13996309 3' - I-element 282 1 65.07 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCCTGCCATTTTGCAAAGTTCTGGTTAA:1 + chr3L 9809386 3' + 412 7523 2 69.18 GGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCAATTATGTTTTTATTGAAAGAAATTAAAAATACACCATTTAATTGGCATATATCAATTCCTTCAATAAATGTATTTTTATAGCTAAAATAAA:1 - chrX 23205141 3' - 3S18 28 2 64.38 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTT:1 - chr3L 21996170 3' - Transpac 45 2 55.08 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTT:1 - chr3R 24090461 3' - roo 79 2 72.60 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAA:1 - chr2L 4063860 3' + roo 8986 2 77.40 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTGGTTAATT:1 + chrX 8437777 3' - P-element 26 1 63.24 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGT:1 - chr2L 6174059 3' + I-element 5288 1 62.33 ATTTAATAACAATAATAATAACTAATACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTTTGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTAAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGGCGT:1 + chr2L 22805229 3' + mdg1 15 2 56.16 TAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGAATACTTTATATGGTCGGACGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTAGAACGAATCTAGTATTTACGAAATGTATTAATTCAAAAATCGGCCAACAATGGTCAATATATCTTC:1 + chrX 22519290 3' + INE-1 164 1 50.00 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAG:1 - chr3R 17996151 3' - diver 5926 2 55.80 ATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCAGATTTAACGCACTCAATTGCCGAAA:1 - chr2R 6964788 3' + Burdock 185 2 73.05 ATATAACAAAAAGAAGGTGAAGTTTGCAATTATTGTGCGTTGCGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATAAAACATGGAAAAAATGAACTAAGACAA:1 + chr3L 3501789 3' + Bari1 1662 1 65.35 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGA:1 + chr2L 47217 3' + roo 9036 1 60.96 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGTATATAGATCGCAAAGGCTACTTTTTTTACTACCTCGCCATTTTTTCAATTT:1 - chr3R 7943710 3' - blood 7046 2 53.62 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCT:1 - chr2R 3338785 3' - Juan 61 1 58.22 TTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCA:1 - chrX 6116266 3' - transib2 82 1 73.29 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATTATGTATTTGAATTTAAATAGC:1 + chr3R 19408036 3' + diver 6087 2 65.07 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTGCCCTTGGCGC:1 - chr2R 20348987 3' - transib2 46 1 73.74 TTTTCCCTTTTTTTTGTTTAGTTGCGTATAAAGTAAGTTGTAGTTGTTTTGTTTCGTGCTGACTAGTTCGGTGTTCTGGCCAATGTGTAAATGCAAATGATGTAAATTGTCGTGTGATATATAGTTCGGTGTTTTCCCACGTTCAG:1 - chr3R 24127991 3' - Bica 337 1 68.49 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGGGCATTTGT:1 + chrX 9530409 3' - 297 6637 2 65.93 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCACTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCT:1 + chr3L 3501792 3' + Bari1 1621 1 76.55 CTGGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTTCCTTCCGATTTTGAAGAAATTATTTTTGCAATAAGTTAGGTTTTGCCTCAGTGTTCGTGTGATATTCCATGCA:1 + chr2L 21646969 3' + Gypsy12A_LTR 2004 1 54.79 ATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTG:1 - chr3R 9557533 3' - G2 3046 1 64.38 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGCCAACGAACACGAGCAAATAAAATAA:2 - chr3R 30347267 3' - P-element 17 1 76.03 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTT:1 - chr3R 14980294 3' + roo 9026 1 53.79 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCA:1 + chr3L 25401025 3' - Doc 44 1 46.58 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCGGAGACACGTCCCAGTGAGAATGGGGAGAATTGGTCGAGGAACTTGAATTCCCTGAAC:1 - chr3L 22760317 3' - F-element 97 1 68.49 AATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGT:2 + chr3R 2520354 3' + Tc1-2 1610 1 64.38 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGGCT:1 - chr3R 26504176 3' - HMS-Beagle 23 2 69.86 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTC:1 + chrX 8080707 3' - P-element 81 1 19.35 CTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAG:2 + chr3L 17307313 3' - blood 7075 2 60.27 AAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAGAGGGCAATTTCGGCAGTCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTATTATTCTTGTGTCTTTGGTCTGACATAGGTAAGCAATAATTCTCTAAAATAGGTCGAT:1 - chr3L 27148524 3' - 1360 246 1 71.23 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAAGGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTCTGGTTGGATCGCTTAGG:1 - chr3R 15325065 3' - 297 6595 2 68.70 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACGGCGTCGGCCATTTGTCATTGGGAGCGGGACAAAAATAAGATCTCTGAAAATCGAAATAGA:1 - chr3R 16341920 3' + P-element 2860 1 56.59 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATACAATATATCTCCCTATATATAGCCTCACCTGACGCGTTGTTTACAGCACTTACGAATG:1 + chr3R 12949124 3' - Juan 43 1 44.52 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCTGCC:2 + chr2L 12822872 3' + P-element 2843 1 46.40 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGAGACTA:1 + chr2R 5151362 3' - roo 22 2 67.81 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGAATTAAATTAA:1 + chr2L 23381790 3' + flea 5005 2 79.45 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCTCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTA:1 + chr3L 7889671 3' + roo 9024 2 51.03 GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCAT:1 - chr3L 21655891 3' + HMS-Beagle2 7126 2 65.75 CTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATTTT:1 - chr3R 2527708 3' + INE-1 547 1 48.63 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTTTATGCTAATTTCCAACTTCCATTTCATT:1 - chrX 10537801 3' - I-element 8 1 78.08 AAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTAGATGCACTGAAAAATAAGATGTTTCTGTGCTAGAGACGGAATATATTCAAACACATAGTCAGTACAATATTATGGG:1 + chr3R 31592668 3' + micropia 257 2 55.48 AAACAAAAAAAAAATAACAAGGAATATTTAAGGTTTTTTCCCGAGGGCAACCGGGCAGCGATTTCAACAATCGTTCAAAACTTTTAATTTTTTCTCTGTTTTTCCC:1 - chr2R 10131188 3' + Porto1 165 1 84.91 AACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAAAATAAGCACTGTTTAAAGAAATAAGAA:1 + chr3L 25008198 3' - X-element 44 1 45.21 TATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTCCAAATAAAGCAGTTGAGTTAGTTATGCGCAGCTTGCGGTTTCGCTTTGACTATTTTTGCGTGCAGAAATGCGAAATGCCAGCGGGAGGGCAACGCGTTTGGTAGAGCC:1 + chr3R 31376749 3' - I-element 4913 1 77.40 AACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGA:1 + chr3L 20187402 3' + FB 793 3 64.38 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATCTAT:1 + chr3L 18931064 3' - I-element 54 1 52.74 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATT:1 + chr3L 9809356 3' + 412 7493 2 52.05 TTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTGCAAAATAT:1 - chr3R 27843160 3' - I-element 5341 1 58.90 AAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATTCTGTGTTCGACGACTGCGCACGGGTTTCCGGCAAAGTGGCTATAGTTATGAAAATAGAGCATCGTTTACCCACCTTTTAAATGGCAATTTGACTGCTCCTG:1 + chr3R 25126173 3' - Gypsy6A_LTR 116 1 54.26 GGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTTCTTGCCGGGCAGGAGTGCTTGCCCTTGCTGAATTTCAGTGCTAATTAAAGACGGCGAATCGAAGCCAGCTCAGAATGCT:1 - chr2L 13137703 3' - R1A1-element 5200 1 54.74 ATACATAAAGAAAATTCAGCTTCAATTTATTATATTAATTAATAAAAATAAAAATCACAAAGTGCCATCGCAAAACAAACATAAACTCCAAAACGTGCTAAAAATCGTAAAAAAAAGATCGACAGCGAAAAAGAATTTGCGGCG:1 - chr2R 13922052 3' + transib3 2646 1 72.22 ATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTCCCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGGCGGTATGGAACGAAATAAGTATTCCG:1 - chrX 22802728 3' - 1360 298 1 77.31 GGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAAT:1 + chr3L 3501808 3' + Bari1 1636 1 67.12 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATCAAAACATCATCGTAAAAATAGCCCAAAAGTGCCCGAAGAATTTGTTAAATGCCAGGACTTTCTCCTTCCAAGAAAAAGTTTTG:1 - chr3R 25750375 3' + jockey 4968 1 66.37 TATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGTGTAACAAAGTACAGAACAAAACTAACACCCACATAG:1 - chr3L 6633417 3' + R1A1-element 156 1 73.79 ATTTTGGCGAAGAGGCAGCAGAATCCAGAAATATAAGTTACAAATCCGACAGACTTCAACATGCCAGAAAGCACAGTCG:1 - chr3R 4593812 3' - hopper2 307 1 92.41 TGCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAACGGACAGCTTTTCTCCGCTTATTG:1 + chr3R 19032732 3' + roo 9045 1 67.12 GTTTATTATATAAAGCAATTAACCAATAAATCTCGAGTCGAAGGCCCCCTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGATTTAGTATTGTATACTATATCTAATTTGGTTAATTAGATCGACACGGATCTGGGTACATACATCGCGAC:1 - chr2R 22597346 3' + Ivk 5278 1 77.40 ATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGT:2 + chr3R 1844845 3' - Cr1a 175 1 62.33 AAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGCTTTGAAATTAACTTAAGGATCAGTTTAAAAGGCTTCAAACTCAATCGCCACAACACGA:1 - chrX 4022213 3' + gypsy4 459 1 59.59 AAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTTTACTTGATGCCGGTTTTCAACTAATTTGTTAAACTTCATCTTAAACTCCTTGCTTAAGCCCCTAAATATATTTCACAAAATAAAAAACATA:1 + chrX 8312159 3' - blood 166 2 79.23 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATCTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCTTTTAAAGG:1 - chr3R 6625657 3' + flea 239 2 72.60 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGCCCCACATTTGGGTGTATCTCTGTGAGTC:1 - chrX 11209837 3' - hobo 28 1 58.87 TATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGC:2 - 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chr3R 6169129 3' - F-element 4623 1 58.90 CTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTGATATCAATTGTAATTAATTGCAATTGAAAGATTATTACCGTTTATATCCCCCAAAATAGTGGGACTCCCAAGAATAATACTTGCAA:1 + chr3R 22772369 3' - invader4 2947 2 60.96 ATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATG:1 - chr3R 22642295 3' - blood 7085 2 65.75 CAATACGCATGACTTACACTCTAAGTGGGTGCTCCTTGGACAGAATAACACGAGTTGATGATCTTGGTGTTGTTCAGATCATGGATCATTTAATAAAGGAAAGGGGAAATTTATCGCAAGAAAATAATATTTCCGAAAGAATTTT:1 - chr4 1174401 3' + Q-element 705 1 51.03 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAG:1 - chr3R 23618098 3' + hopper 1382 1 62.76 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGCTAAGGCTA:1 - chr2R 9871003 3' + roo 9040 1 62.33 GTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTA:1 + chr3L 18505715 3' - I-element 88 1 78.77 ACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAATTCAATTCTTTAAGTCCCAGTTACATTACCCATAAAAATCAGTACGTTCAAGATTTTCTC:1 + chr3R 22076299 3' + I-element 190 1 56.85 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCATAATTCTAG:1 - chr3L 23146476 3' - 1360 16 1 59.38 ATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGGGG:1 - chr3L 25482913 3' - accord 6928 2 77.14 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATGAGTCTATTAAA:1 - chr4 372922 3' + pogo 2071 1 65.07 AAATTGTCCAGCAGAAGGCTAAATACCTAAAGCGAATTGCAACGCATCTAAATCAGTTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATCATCTATTTCATCTACATCCACATTCACCTATATTGTCCGTCGCTGAACTGCTGTTCATT:1 - chr3R 1221661 3' + Doc4-element 2759 1 63.01 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTCAAATCTCTTTCTCTGCACGCATAAATGCCCAAGTGTTTTAGCAATCCTACGATAA:1 - chr3R 5351762 3' - jockey 4849 1 53.33 ATCTCAGGAACTATAAAAGCCAGAAGGTTGACTTTTGAAAAATATTTTAATATTTTGATATTTGTATTACTCTTGTAAATTTCTGACAATTTGTCAACAAACTTATTGTGTCATGCAATGTACATACATACATGTACATATGTTTG:1 + chrX 18702612 3' + INE-1 151 1 72.60 GAGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGGATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCAC:1 - chrX 21639612 3' + gypsy5 354 2 54.79 ATACCATTTGGGCAGAACATTCAACGATTTTTTAAATGTCCCTGTATGTTTTAGTTTGCTGGCTTAGTAATTAGAAATTACATTTTTATAATCTTGGAAAGACGGATTAGTGAGATGAAAGGGATTTTCAGGGAAGTGCTGCAAGG:1 - chr3L 20514468 3' - HB 447 1 43.15 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAAT:1 - chr2R 20802579 3' - mdg3 5325 2 65.75 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTT:1 + chr2L 18226875 3' - roo 8717 2 57.55 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTT:1 + chr3R 18093416 3' - I-element 20 1 68.97 AAAAAAAAACAAGAGAAAAAAATCCTAGAAAAGCATTTGCAATTTTATTGGACTGCAAACAAACTGGAAAACTTGCCAACTCCCTTTTCTCCAACTCATCTCATCATGCCAAACATCGACACACAAATGCAAACGATCTCGAAAAC:1 + chrX 8508883 3' + Porto1 173 3 58.22 ATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGG:1 - chr3L 16973339 3' + S-element 160 2 57.24 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATAC:1 - chrX 10537861 3' - I-element 66 1 63.19 GTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTCATGAGCTAACTGTCTCGCATCGCGTGTGAAAAGTTACAAACAACACAAAAACAATTGCCAAC:1 - chr2L 1118749 3' - jockey 4956 1 56.85 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTCCA:2 + chr3L 21769157 3' + I-element 5340 1 68.49 AAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTTTAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGCGAACGAATGAAAGCCAACAGCCAAGAAAACTGCAAGAAAATTAAGGC:1 + chr3R 18099063 3' + F-element 4587 1 65.75 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGGACAGAGGAGCCTTTCATGTCTGTTTAACTT:2 + chr3R 30347476 3' - P-element 4 2 79.45 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACAATTTCGTTGACAAGCGCAGTCTGCGCTAAATGAGTATTCA:2 - chr2R 5090426 3' + copia 255 1 61.64 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGAGAGTGTGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTAGTATCGTGTGTGCATTCACTCATTT:1 - chr3R 26404948 3' - hobo 19 1 71.23 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTCTGAA:1 - chr3R 27405957 3' - diver 5941 2 51.37 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGGCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAA:1 - chr3R 16341932 3' + P-element 2849 1 52.34 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTG:1 - chrX 1135316 3' - P-element 78 1 32.19 ACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACTGCGAGAGTTCGATCGTGACTGACTGAGCTA:1 - 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chrX 5935531 3' + Porto1 4435 1 76.70 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTATGGTCGAA:1 - chr2R 13766166 3' + roo 9046 1 67.81 TTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAA:1 + chr3R 30987586 3' - F-element 125 1 55.48 ATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACA:1 - chr3L 16973387 3' - S-element 1604 2 69.66 TTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGT:1 + chr3R 10270636 3' + Juan 4125 1 73.97 AACTAATAGAAAGAAATAATCATTAGAATGAAACGATATTGCATAGGGGCTTGGACTTTGAAATGCCCTGGATTCCCAGACCTTTTATACGATCCAACCAATAAACTCTAGTTTTTTTTAGATGTTTATTTTTACATATATCTAAT:1 - chr2L 7807290 3' + transib3 2682 1 75.34 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTTTGGTGTTAGTTCTAT:2 + chr3R 21276676 3' + BS 5085 1 69.86 TGAATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGCGGCATTCTGCGCTCGTATGCGTGTTGTAATTATTAAGCTGACAATGCAGATGCGGCTCTTCCCGCTGATTTGAGTTGCAGGGTTG:1 + chr2L 2267670 3' - accord 7032 2 70.97 GCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATGCAACTAACCAACTCGTTTCTCTTTAATTTTTATTTCATGTGATCTAATCTTAAACCATCCCACAATTACCCAACCAAAATGAACACAAATATGTAT:1 + chr3L 5645151 3' + G5 4562 1 70.55 ACCTACTTTTATTTCATGCATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGAGAATTCCACGGGCAACCATTAAGCTCATTACTTAAGAGCTCTTAATTAAGCGACTTGTTTTATCACTTATCTAATCGCGAATCAGAGT:1 - chr2L 14272980 3' + Tc1-2 322 1 50.68 GTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAATCAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGCGCGATTCTTGATCTTGAACACT:1 - chrX 22641680 3' + G2 3038 2 60.27 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGTTAGCCC:1 + chr2R 8735705 3' - mdg1 30 2 63.70 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCCGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGGTTTTCGGGGTCTGATTTATGATAATAAC:1 + chr2L 12818362 3' - hobo 4 1 73.95 AATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGGGACGAAGAAAGGGCTCACAGACAATTCCCGGGGCTAGATCTGCTTTTGTCAGCTAGCCACAGACATTGGCTCCGCATTGCC:1 + chr2R 13705345 3' + invader2 442 1 60.96 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAA:2 - chr3R 11040079 3' + Bari1 1621 1 77.40 ACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACGTATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGGTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGA:1 + chr2R 15005123 3' - BS 5044 1 51.39 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCT:1 + chr3R 9039056 3' + Juan 4194 1 70.14 ATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTA:1 + chr3L 21769090 3' + I-element 5270 1 74.66 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGG:1 + chr3R 16157397 3' - pogo 26 1 60.50 CGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAA:1 + chr2R 17878645 3' - Doc 58 1 50.00 AAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTTGTAAGAAAATCTTGTTAAAAATATTCAGGTGTTTTGTATACGTAAACTTGTTATTGCAAGTCGTTGATAATAAAAATTTTTAAACAT:1 - chr2R 24928748 3' - I-element 5138 1 64.83 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTATAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCACTTTCCTAATACCTCA:1 + chr3L 9809310 3' + 412 420 2 78.33 AAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCGGATTTGGAAGAATCAACACGAGGTATTTTTACTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACTCAACGTACAGAGGTTTTTGGTCTTGAGCATTTTCGAATAAAACAACACCTT:1 - chrX 6081255 3' - rover 7248 2 78.08 ATTCGTGTGCCAAAAAATCGTATTCTTTATCGATTGAGCTCGCAACTCGCTTCGCGCAATGTGGCATCTAGCCCGTCTCAACGTTCACAATGAAAACTGTCTGAATTGCCTGTGACGTCTGCTGCTCTTCTTGCACATGAAAATCA:1 + chr2R 4720776 3' - 1360 35 1 62.33 ATAAACAGCACGCGCATCACAATAATTATTGTTTCGATATTGTCTCGGTGGAACTTGTGAAATTAGTAATTTACTTTTATGATAATTTAAAACGAACCTAAAGTATAAACAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTA:2 - chr2R 5259040 3' + looper1 178 1 77.40 AACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCAATTTTGTTGTCTTATTTCTCTTTGCATCTTCCGATGCGAATTATAATTTTAAGGTTTCTTACGA:1 - chr2L 23173180 3' - diver2 132 2 67.00 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAACATGTTTTCGGGGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATTACGGCTCATTTGCGCTGCACACGGCTGCTGTTGT:1 + chr3R 26405111 3' + hobo 2933 1 74.56 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTAAAATTAAACTCCTTAGGCGACATAAGTCTTTCTCACGATCGA:2 + chr2L 22369292 3' - rover 6967 2 75.34 AAAAGAAAGTAATGTAAAGTAAAAAAAACCAGAAGTGAGCAACAGCAGAACCAAA:1 - chr2L 18327672 3' + TART-A 13117 1 87.27 GGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTTTTTTATCCAAGTCTTGTGTATTTTCATTGTGTATGCAT:1 - chr3L 22706849 3' - I-element 5049 1 73.29 TTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAAT:1 - chr3R 460074 3' - F-element 135 1 52.05 TTAAAATTGTAATTAATTCCAAAATTTCCGCCTTTTTACCATAGGGCAGTAGTTGGACGCGTTCATAATCTCTGCTTCTTCTT:1 + chr2R 5461327 3' + transib4 2610 1 53.01 AGGGAGGGAAGCTTCAAAAAAAAAGAAATAAGTTTGGGGTATGAAATGAGAATTACAAAAGATAGTGTGGGTCTCGTAAGATGATATGGGGGCTTGGTCTTCGGCCCAGCTCATTTGGTTGCTATCCATAAATTTGAAGGTGCTTG:1 + chr2R 21905205 3' + accord2 25 2 61.64 ATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAATCCTAATGGCTTTTGTGATGTTTATCATTAAATGCATGT:1 + chr2L 11392926 3' + 1360 54 1 52.05 GAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCAACAAACAAAATGGATGGGCAGGAGAGCGAAGACAGAAGTCATTGCC:1 - chrX 4339924 3' - roo 8978 2 55.95 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGGGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAAT:1 - chr2L 6654636 3' - diver 49 2 50.68 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGGTGCAATCG:1 + chr2R 14051898 3' - roo 8677 2 72.41 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTG:1 + chrX 11661508 3' - pogo 46 1 53.79 AGCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATCAATTAATGTT:1 - chr3R 20167570 3' + roo 353 2 56.16 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCAAACCATATGTATTTGTAATTAATAAAGTTATTTCTTACCCAAAA:1 - chr2R 11159208 3' - roo 19 2 67.81 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTT:1 - chr2L 4003662 3' - mdg1 7077 2 57.53 AGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTCAACGGAAAGAACTACGTGATGGAGGAGGCCATCTTTGCAGACTTTGCCTTTGTCAAGGCCCAAAA:1 + chr3L 1965672 3' - gypsy7 303 1 67.65 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAG:1 + chr2L 12818374 3' - hobo 19 1 71.23 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGAC:1 - chr3L 9809246 3' - 412 7113 2 59.59 AAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGG:1 - chr3R 10736023 3' + McClintock 422 2 57.53 TGTTGTTTTTTATTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGCTTGTTTAGCTTCTTTATTTTAATTTTAATTTTTATTTTCACTTTATTTTTGGCTCGGTTGTTCTTGTCAATTTAGGTTTTGTCGGAGTTAACATTAAACTG:1 + chr3R 12848025 3' - gypsy7 5011 1 59.59 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAAT:1 + chr3L 18931049 3' - I-element 61 1 60.87 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTCGCTAGGCTGTTGGGGACGTTAAGTTAATAATGGCACGCGGTGAGTT:1 + chrX 18409435 3' - jockey 4768 1 77.40 GTGATCAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGGCAGGGATTTGCTTTAAATCATTTTATACGAAAGCTTTTAAACGGTGTAGCTTACTGCTTTCTTTATATAAAAATTAGGCACACACGTAAACTGCGAGGAGC:1 + chr2R 21572991 3' + R2-element 3580 1 17.69 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTT:1 + chr2L 12251000 3' - 412 7080 2 54.62 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTT:4 + chr3L 11844846 3' - rover 6983 2 60.27 AAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAAT:1 + chrX 22840596 3' + copia 5089 1 58.04 AAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTGAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAAATAATAATAAATATATATATATATATATATATAAAAAATAAATAATAAATAATAATT:1 - chr3R 27192016 3' + Doc 4603 1 66.44 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAAGGAAGTTGAGAAATA:2 + chr2R 5941431 3' - copia 4930 2 57.53 TCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAG:1 + chr3R 15054319 3' + copia 5072 2 58.90 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGAGG:1 + chr3R 19992759 3' - hopper 5 2 78.26 ATTTATTTAATTTATTTATTAATTTATATATTAAGTAATATATTTTATCGTTTACTGTTTATTACCAGGACACAGAGAAAAAGTTAATGATGTTGCCAGCTAGCTGGGAGCACACATCTTTCAACATTTACGTTTGTAATTAAATT:1 - chr3L 2357211 3' - X-element 4714 1 46.58 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTT:1 - chr3R 10270567 3' - Juan 4040 1 64.08 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAATTTTATAGATTTCCATTTAATAGATTTTTTAGTTAAGTTTTATAAATATTTAGGTACTTAC:1 + chr2L 14358899 3' + diver 205 1 54.79 CATTTCAATTGGAATAAAAATAATTGTTTGCAGCAGTCTCAGCAACAGAAGCGCCTCTACCTC:1 + chr2L 9325222 3' + Juan 421 1 87.30 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCGAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAA:1 - chr3L 5532911 3' + roo 9028 1 52.05 ACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTTTTAGATTCTTTCTATTTCAATTCCTGAGCGTATTAGATATTCCTCAGCTTGGGAACCTGGAAAGGAAAGCCCTTTTTGTAATCTCATAA:1 + chr3R 6740186 3' - HB 369 1 65.07 ACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGGTT:1 - chr3R 19445977 3' + 1360 6 2 69.18 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTACAACAAT:1 + chr3R 28469294 3' + 412 7478 2 68.49 TATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCC:1 - chrX 21993569 3' + gtwin 7330 2 73.98 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGG:1 - chr3R 16157253 3' + pogo 2069 1 59.31 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACT:2 - chr2R 9871020 3' + roo 359 2 54.11 GTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTTTTGGATTAGTGTCAAATCGGTCTTAAACTGCAGTTAGTACTTCACTATAATTGATTTTCATTCGTTTTTAGCTTCCTTTAT:1 + chr2R 10513242 3' - I-element 4907 1 64.18 ATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATATATATATATATCATAATATATACAATTATTTTTTTGGCTTCTTAATTCCAATTGTGCAGATCTATTATCTATCTATGCAGATCAGTTCACAGATATTCACTTGGCAGTGAATTAATAT:1 - chr3R 3854729 3' + Idefix 7389 2 31.51 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCAATTAAATGTTAATTAACATGTTATACTTGCTGTGGGCTTT:3 - chr3L 18505618 3' + I-element 5320 1 65.07 ACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTA:1 + chr2L 23295885 3' - micropia 54 4 55.48 CGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTACTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACATGAATTTATGTATTT:1 + chr3L 11844871 3' - rover 7 2 76.03 ATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGTCGGAAGTTCAGATCGCCAAACCAGGAGACATAGTCGTGATCGTAGATCTCCCTATACCGCTTGACGTGGTAGTGATGGTTCTCCAGTATCTGCTTGTA:1 + chrX 16597648 3' - G2 2943 1 71.03 ACTGCCTAAGTCGTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGTTAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGATTTTAGTTAGCCCCGTACTCTGTGGTGACAACACCACAGAACCCACTTGAGGGATATCCCAATAAAGCTGTGTGTAAGCGGTTGGTAA:1 - chr3L 22187313 3' - baggins 5029 1 67.81 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTTTTTTTTATAAATTTTTTATTTTATAAATCCTACGATTCTAATTGCTTTACATTTTTTTTTGCCATAA:1 - chr3L 17273592 3' - pogo 19 1 63.70 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTAGTATGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCA:1 - chrX 21852450 3' - mdg1 7075 2 60.40 AGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAATGTGCGCCACCCAAGCAATTAGTGGATCCTTCCTACACGACCTAGCCCACTAAGCACTGAGCAAGTCGAGCTGGCCAAATTGACAGCAATTC:1 + chr2R 8293576 3' + Doc2-element 4492 1 70.00 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAAT:4 - chrX 19074729 3' - mdg1 25 2 64.38 CAGTGTGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGTCGCCACAATTGAAATAATTATTTATTATTGCTATAATAGCCAT:1 - chr3L 16787108 3' - Chimpo 89 1 91.10 CTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTCCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCGTGAGCAGCTAAG:1 + chr3R 2689475 3' + diver2 4475 1 74.66 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTG:2 - chr3L 18281843 3' - Doc 51 1 53.42 AGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAA:2 + chr3L 19349993 3' - 1360 3277 1 70.55 GGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGC:1 + chr3L 24934380 3' + HMS-Beagle2 232 2 73.97 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAA:1 + chr3L 16970467 3' - roo 8708 2 55.97 GCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATGGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCA:1 - chr2R 5070936 3' - gypsy5 6964 2 28.91 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGG:1 + chr2L 12984233 3' - hopper 48 1 52.05 ACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCACAGACTTACAAATAAAACAATTGTCAATGCGTCAATTTGAATGGATTCCAGATACAGCAGAAGATGCAGCCTCAGAAGATAAAAACATCAACA:1 - chr3R 25790629 3' + Doc3-element 4370 1 56.16 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGGTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTGTCATAAAAAATATGCAACTACCAAGGCG:1 - chrX 4808463 3' + mdg3 234 2 75.34 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTC:1 - chr3R 14860128 3' + BS 5044 1 53.42 GTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACCAACTATAACCTTTCAGCCGCCAGAGTTTCAGCGTATGTAATTGATGTGAAAGTGAAATTTCGTTC:1 - chrX 1971196 3' - aurora-element 4188 1 54.79 AGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGGGGAGGCTTCATAATATTTCAA:1 + chr2L 20640305 3' + Stalker 7074 4 51.08 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTTATAAATAAAAGCCAATGCACAAGTCAAAAGCA:1 + chr2R 15376217 3' + 1360 3358 1 62.33 TTCTTCAGTGATTGGATTAGAGCACTTCAGCCCGGCCATTAATTTGTGAGCCACCAGGTCAGCGAAACCTGTCAG:1 + chr3L 12236305 3' + Bari1 267 1 78.67 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGTTTCCCTTTGGCCATCGTCGCTTTGCACAATGTGTT:1 + chr3R 26178831 3' + blood 365 2 75.34 CACCAAAAAATAAATAAATAAATACACAAGAAGCAGGAGCAAAAACATTTACAAAATACTGTTAAAGACATGATAAAAACGTATATAACAGGGAATAATGCATACGTATGGATAGATAACTAGTTCAATAAAATGTATCAAGGCCG:1 + chr2L 7226680 3' + Juan 4214 1 72.60 CTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATAGTTGGT:1 + chr3R 16533720 3' - X-element 4405 1 34.25 AAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTATTTCTTAACATTTCTGTATTCCTGGCTGGATAAGCAAAAGGATAATGATTAAATAA:2 + chr2L 11884888 3' - P-element 2697 1 24.66 AACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATG:1 + chr3R 31886917 3' + hopper 1331 1 74.66 ACCGGCCACACCTTTCAGCAAACCCTGCACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACTCATAACAAAGGCAAATATGAAGGGCAAACAGTA:2 - chr2R 13723423 3' + G2 6 1 75.34 TTTAATCGCAATAACAGCGTTTGCCTAGGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTGTCAAATCCGAGATAAGCAATTCAA:1 + chr2R 5303151 3' + FB 195 1 54.79 GGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTTTGTAATTTATTTTAGACTTATTTAGAATTTATTATTCACTTGCTCATGTGCAGGTGAAGTCCACCCCGAGGGCATTGGAAATGAACTTTAGCTCTGACTAGGAAACTAGTTCGCTGGG:1 + chr3L 22936998 3' + INE-1 572 1 65.07 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTG:3 + chr2R 23180291 3' + roo 347 2 58.90 CTTATTCTTGATCAGGATCAATAGCGCAGTCGAATGAAGGATTTTAATTCGGTGTAGGTCCAGTATTATGTATTGATTTTAAGAAAGCAAATTCCTTTTTAAATAACTTTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAACTGCTATG:1 + chr2L 12286082 3' + INE-1 83 1 79.86 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATC:1 - chr2R 16510113 3' - F-element 86 1 65.75 GGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCCTTGCTCCGGCTCTCAACTACACTTTGCAATTACCCAAGTACAGCTACAGTTTCTGGAATTGGTGAAGATTTAGATCAGATGAATGTACGGTAAATATTAATCTCAAAT:1 - chr3L 25936813 3' + accord 7373 2 78.77 GGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAAT:1 + chr3R 30872894 3' - micropia 4994 4 58.22 ATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTT:1 - chr2R 5410961 3' + Tc1 1356 1 56.16 GCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCA:1 - chr2L 4713883 3' + transib2 2745 1 73.57 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTC:1 - chr3L 23249356 3' - rover 6982 2 65.07 CATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTACTGCAATGATGGGTGATAAAACCACAAAGCGATAAGATCACAGGGAAAAAACGTAAGAATAATAGGGCAGGTTTTAGGAACAAAGTCTAACTAAGATCTTTTAATCTAA:2 + chr2L 1123876 3' - Q-element 201 2 77.40 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGA:1 - chr3L 15103822 3' + Transpac 5150 2 71.92 AATTTCAGCAGCCGCCGCAGCCACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAAATTATTTATATAAAATAACCTGAAATAACAAACAGATGCGAAATTTATTATTCCAGATCCATTTTACAAAATGATATAAAAT:1 + chr3L 27866120 3' + Max-element 8497 2 57.24 CAGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGCAGATAACTCATTGAGAATCAAATTAAAATAGAATAAAATTCTTGGCAAGTTGTTAGTGGCTTA:1 - chr3R 14722989 3' - FB 57 1 53.42 AAAAGAAAAAAAAAATAAAAGAAAATATCTATAAAAAAGAATAGACCTTATTCTCAACTGAAAAGCCAGATAACCATGTCATTTTAATAATTTTTAAGAAACTTCTTATATCGACTGCTGTATCCTAGCAAGTATTTTCATAAATC:1 + chr3L 18381469 3' + Doc2-element 224 3 80.82 TGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTTTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTTCACAAAAACTTTCGTTTTGCTTATATAAGCAAGGTCGTCGGTGCAATTTAAGGTCACCTTCGA:1 + chr2L 22755403 3' - I-element 282 1 56.16 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGCG:1 - chr2R 4673526 3' + Quasimodo 7344 2 67.81 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGACTGGGGCTACAAAGGCTGTT:1 - chr2R 7244768 3' - diver 17 2 73.29 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATCTAAA:1 - chr2L 18226731 3' + roo 393 1 71.23 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTG:2 + chr3R 15790984 3' + roo 8988 2 77.40 ACCTATAAAAGCTATAAGGTTTAATAACGCCCACAAACCGCATAAAACTGCCACGCCAACACTTTTGAAGAATGTTTTGATATTT:1 + chr3L 23054957 3' + INE-1 159 1 69.41 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGGTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGAC:1 - chr3R 29084873 3' + 412 445 2 49.32 CATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAATTCTCTTGCTGGACCATACTTTGTAACTTGTATAAT:1 - chr2L 17356561 3' + F-element 231 1 75.34 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGC:2 + chr2R 8735687 3' - mdg1 48 2 51.37 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAGTTAATAATTTAACACTTCCGTGCGTTTGTTCTGCCTT:1 + chr2L 15076252 3' - 1360 14 1 76.03 ACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGGGTGAGTGGCTCACACCCTTGTCAGCTGTCATTTTTTGTATATATAGAGATTCGAGTGTACCTTATTTTTTAGCCCATGATGGAAGTGCCGGAGC:1 + chr3R 13870945 3' - hobo 2786 1 71.20 AAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTTCTA:1 + chr2R 2875258 3' + TLD2_LTR 124 1 78.77 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTT:1 + chr3R 26178484 3' - 412 7104 2 51.37 AAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCAAGAAAAGGACTATTCAAATGAGCTCCAAAATTTGGGTCAA:1 - 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P-element 66 1 27.20 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCAAGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGTGTAGAA:1 + chr3R 7420348 3' - 1360 14 1 75.86 TATTAATTTTTTTTTTCATTTTATTAATTATATTTTTCATTAGATAAAATTAAAATTTTTAAAAAAATTTACACTTGTTTTCGTATGAAGGGCTTTAATTAAAACAACAGTCGTTCGTTTTTTTCATTTCCTTTTTCCATTTCATT:1 + chr3L 14182728 3' + INE-1 471 1 51.37 GACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTATTTTCAACAGTGTAAACCGA:1 - chr2R 14653106 3' - 297 6580 1 71.23 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACA:1 + chr3R 18093404 3' - I-element 33 1 60.27 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCAAATGA:1 + chr2R 12645532 3' - X-element 46 1 55.48 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCC:1 - chr3R 11191357 3' + roo 9046 1 65.75 ATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACCAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACT:1 + chr2R 2318214 3' - ZAM 86 2 74.66 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCTATTTTGTGCTGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGACTTTTCGGTCAGTGAGTTTTTTCAGCGGCATTTGGAATTCGCTGTAAGTTGTGATAT:1 - chr3R 24764839 3' - F-element 83 1 60.96 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCT:1 - chr2L 8338141 3' - P-element 76 1 26.72 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTCTTGTTAGTATAACTTCAATTAATTTAAGTTAACACGTTTGC:1 - chrX 19038327 3' + hopper 1395 1 70.55 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATT:1 - chrX 19054207 3' - jockey 28 1 69.86 AGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAATGCATCAGAAGCACCGAGTGCAATGCTTTGTGCATGGTTGCAGACCCAAGATGTCTATCATCATACCCGTATCCTTA:1 + chr2L 7618602 3' - X-element 4451 1 66.44 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGT:1 - chrX 18396087 3' + roo 9004 2 61.64 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATT:1 - chr3L 2989940 3' + roo 9006 2 63.01 AGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCTCTCAACACTTTGAAATTGTCACATCATTTATACATTAATCCCACTTCAGTTGTTTTGTTTTAA:1 + chr3L 15865493 3' + invader2 5064 2 45.89 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCC:1 + chr3R 9002994 3' - roo 8743 2 74.66 CTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGG:1 - chr2L 4754859 3' - Stalker4 37 4 42.96 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTA:1 - chr3L 15913851 3' - jockey 4823 1 62.33 TGTTATTGCGATTTAAAAAAAAATTGAAAAAAATTGAAACTAATTGGTGGGCAAACAATTAAAGCTTTTCAATTTCAAAAATTCGATTTTACCGAACCCAGCTTCTATGAGCTCATCTCATTGGCTTCTCCCAAA:1 - chrX 19502453 3' - FB 189 1 76.30 CTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATCTATCTATCTATTATCTATCTTCCGCTATCCACAGCTTTTTTTATCTCGGACGAGATTAGACTCCTCTTCTCTTCTGTTCATAATTTTGTATTTTTATGGT:1 - chr3L 14706252 3' - hobo 2491 1 40.41 CACCTAGTCGTCTGGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGCATGTTTGACTGGGGCGCACAGGCCATATCTAACATACTGGAGCAGGACAGCAATTTCGGACTTCAT:1 + chr2L 5094603 3' + G6 1620 1 54.11 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTG:1 + chr2L 12250979 3' - 412 75 2 69.18 GATAGTCAGGAAACTCGACTATAACATTCTCTTTTGTTTTGTTTTCGCCCCATACATTTCAGTATTGATATTTTTGTATATTTTTATTAGGCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAACTTTTTGCCACGACCGCTCTAACGC:1 - chr3L 26710194 3' + INE-1 564 1 65.07 CCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTAACACGAAAACAAAATGTAAATATGTACGTTATTCCGTGAATGAAAAATGCGTGTGGT:1 - chr3L 17047820 3' + 1360 231 1 65.75 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAA:1 + chrX 10521755 3' + Tabor 451 2 59.03 GATAAGAAGAAATAAGAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTG:1 + chr2L 11357914 3' + blood 7319 2 64.38 AACCTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAG:1 + chr3R 3286147 3' + gypsy12 9826 2 76.71 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATGGCAACACTTATTGCCGCTTTTTGGTTATTAACCAAAATCCAATTAGACAACTGAAACACGAGCCCATGAAAATGGTCACA:1 - chr2L 2075686 3' - hopper 17 1 67.19 ACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGATCTGTTGAATTCGGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTGCGAAAAAAAAGACCCACC:1 + chr3R 2944488 3' - 1360 57 1 82.88 TGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGACTTGAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAACCTCCGCCCTTCGACTTTCGATTTTTCGGGACATGGGAACGGAACGTTGCATGAACATCTTTGACT:1 + chr2R 15352377 3' + McClintock 6330 2 54.79 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATC:3 - chr3R 31886852 3' - hopper 74 1 70.55 TTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCAATTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTAAGAGCCCAAAAACACTGCGATTTCCCATCACCCGAA:1 - chr2L 17073769 3' - HMS-Beagle2 6985 2 73.97 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCATAATTCAGTCCAGTCCTCTGGGCCACAGGGCATTTTGCCCATC:1 + chr2R 10161873 3' + transib2 2751 1 71.23 CTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGAAGAATTTACACGCGCTTTTCAACACTGCCAGACATTAACCCCC:1 + chr3R 22025528 3' + accord 317 2 68.84 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAAGTGGAAATTTCTCACTTGATGATGGTCCACAAATTGGCCCACA:1 + chr3L 5390014 3' - roo 10 2 75.69 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCTCAAATGGTCGACAGCCTCAAGAGCAACACGTGCATTCTG:1 + chr2L 9636200 3' - 412 37 2 50.68 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATTCTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTATGCCGATTCTTAAACACGTCGCTTGCTGAGCTTTCGCTGGCGTGAAATAGATACATT:1 + chrX 19074915 3' + mdg1 418 2 72.99 TATACATTTATACATATACATATATACAATCCGCTCATCCGACCCTTCCGAGAACAACGATCTAAATCTCAAAATTTCGAAAAAAAAAAGAATTAAAAATAACCAAACAAGCATTGCTATTTAATTACTCGCCGTCTTTATTTTGG:1 - 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chr2L 18844891 3' + mdg1 7067 8 50.68 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAA:1 + chr3R 28385655 3' - transib2 34 1 62.33 ACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGGCTCATTATTCTATTCATATTAATTAGAAAGCCCATATTTTGGATGTGCGAGTTGTGTGTGCGCGACAGCCCGAAAGGGGAA:1 + chr2L 12730547 3' + Quasimodo 47 2 53.42 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAAAAGAAAAAATAAAATTATTATGCCCAAACAAAAAAT:1 + chr2L 18226918 3' - roo 17 2 72.60 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGACTGAACTTGCGTTGAAGGGGCGTCGGCTTAAGAACCAACTTTCTTTCTCAGTGCATCCCTTCTGGTTACTTGGCTAATTATCT:1 + chrX 10639195 3' - FB 33 1 58.57 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAG:1 - chr3L 3983830 3' + P-element 2872 1 49.28 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACC:2 + chrX 661933 3' - 412 7139 2 75.34 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAACAGC:1 + chr3L 19111615 3' - Doc 57 1 56.55 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAG:2 - chr2L 4063836 3' + roo 9010 2 60.96 GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCTAGAAATATGTATTTTCGTGTTGGAATAACGGTGGC:1 - chr3L 23688507 3' + Quasimodo 7324 2 56.16 TATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTATTATTATTGTTATTATTATTATTATCATTATTATAATTATTATTTAATGAGGGGAGAATCCCGTCGATCCAGATGTAAAAA:1 - chrX 22755507 3' - F-element 140 1 45.39 ATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATATGGAACATTGATAATTTTAAATTATAAACTTACCTATCAATGACCAATACAGCCACGAGTCCAGTTCGGTTTACCCAAA:1 - chr3R 14505230 3' + F-element 4669 1 72.60 AACTAAAATGTTTATAATATTATACAACTAGTTTCATATGCTCCTTTTTGTTCCTTTTTGAAATAAACTCAGTGTATCCAGAAACATACAAATACAC:1 + chr3R 1208843 3' + transib1 465 1 64.95 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAAC:1 - chr3R 29084890 3' + 412 7481 2 60.27 CTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCTAC:1 + chr3L 2544724 3' + Tirant 344 2 55.48 AAGAGAGAATACTGTAGTCGAGTTTCCCGGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCCTGAACAAGAATATATAC:4 + chr4 559326 3' - INE-1 577 1 76.03 TAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAG:2 - chr3R 4357509 3' + Tc3 1666 1 47.26 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGCATGGTGGTCAGTTTTTA:1 - chrX 8027375 3' + Juan 4197 1 65.75 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAACGAAAATGGAATCTATCTATAAATCTATATATATATACATATATATAGTTG:1 + chr2R 20328008 3' - mdg1 22 2 63.70 ATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTC:1 - chr3R 9557502 3' - G2 3015 1 56.85 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGG:1 + chr3R 27123570 3' + roo 9002 2 65.07 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGGTTTACATTTCATATAA:1 - chr2L 22674737 3' - mdg1 7056 2 73.29 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCAT:1 + chrX 8437726 3' - P-element 82 1 26.24 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAA:1 - chrX 19074731 3' - mdg1 27 2 63.01 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATT:1 + chrX 585742 3' - Tirant 8153 2 52.90 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCATTTGCCGTCTTTG:1 + chr3L 21656023 3' - HMS-Beagle2 6902 2 71.23 ACCCTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAACCCATGGTCGGCAATCCGACTCACCCACATAAGAGTGTGCGACGCAGCATTTAGCTATAACACTTACACATGTAGTATTAAGACACTATGTATTTCCTATGCACTTTTCTCAGC:1 - chrX 21939328 3' - gtwin 7114 2 74.83 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGTTTCTTGTGAAGTATTAAAGTTAGCTAACTGAACTGGTAAGTAAAGTCACTTTTGATGGCTGTTTGGAAAAATTAACCCTGCGCTAAGAAATAAAAAGATA:1 + chr3R 14767443 3' - roo 19 2 66.44 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGAATCATAGAAGACAAAACGCCATTGA:1 + chr3R 13973064 3' + 412 7499 2 52.05 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTG:1 + chr2R 12472113 3' - transib2 41 1 56.78 ATAAAAAAAAAAGGAAAAAGGAAAAACAGGAAAAGG:1 - chr3R 10945339 3' + Doc2-element 231 1 72.22 GGAACAGTCTTTATTTGTAATCCTATTCGTGATTAAGTTGATTGTCCCGACTCGGTTAGTCGGCTAAGCTTCTCTTCAGATTCAATAGAAATTACAACCCACAATAAACTGAACAAAAAGTAAACAACAAATTTAAAGATTCGGCG:1 - chr3L 24030060 3' + Cr1a 4034 1 66.44 CAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACCACCTTTTTGAATTAAGACTTTTCTCTTAGAGTTTATTGTGT:1 + chr2R 3104513 3' + Gypsy6A_LTR 383 1 60.96 TTTTTATTTTATTATTTTACTTGTTAAATTCTTTGGATATTCGCACTCCCGCTAGCTGAGTGATCTAATAAGTCATTAAGTTGAAGTACATATCTACTTTACTACCATACCATATTAACAACGCTTTACAAATAATGATAACTTAT:2 + chr2L 7410792 3' - F-element 4682 2 50.00 TTTAGTCTTCAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAATGACAGCAAAAAAAAAGTTCAGCTCATGTGTGTCGTTGTGAAGACAAAA:1 - chr2L 16926687 3' + Bica 4476 1 71.23 AGATTGACTCGGCTATTGACCCTAATCAAGAATATGTATACTTTATATGGTCGGAAAAGCTTCCTCGTATCTGTTCCATAGTTTTTTACACATTGACTTACACTTGACCAAAGACACTAGAATAAACTAGAATTCTAGTGTCTTTG:1 + chr2R 5878437 3' - INE-1 97 1 65.07 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTT:1 + chr3L 3501793 3' + Bari1 1621 1 77.40 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTG:1 - chrX 7795517 3' - roo 66 2 67.12 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTTGGAAAATTTTGGTTTTGGGGAT:1 - chr3R 24219248 3' - roo 8704 2 58.22 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAATATTTTAAACAATT:2 - chr3R 4460964 3' - blood 7015 2 81.94 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCCCAGATCCCTCGGT:1 + chr3L 16211615 3' + transib2 2791 1 56.10 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTATAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGTTTTGCGAAATGCGCTCCTAAACTCTATTGTATGATTACAAA:2 - chr2L 18176995 3' + INE-1 545 1 76.71 GTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTT:1 - chr3L 23249405 3' - rover 80 2 69.18 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTTTAAGCCTCTTTGTTTTCGTTTCAGTTTTGTTTACAT:1 + chr3L 13836740 3' - 412 7074 2 51.37 TAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATG:2 - chr2R 22034645 3' + copia 5068 2 58.22 GATGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAA:5 + chr3L 18125994 3' - Ivk 61 1 55.48 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTT:1 - chr2R 21926381 3' + opus 428 2 71.85 GTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACACCGACCGCCCTCAAGAATCTCGCTAACTCCCCTGTAGAACTTGAACGTAG:1 - chr4 742833 3' + Doc 35 1 65.75 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCCT:1 + chr3L 5061679 3' - 17.6 6954 1 65.75 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCCTCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACTTC:1 + chr3R 13875121 3' + P-element 2818 1 33.33 AAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGC:1 + chrX 19074880 3' + mdg1 7412 2 50.00 TAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGGTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGGGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTG:1 + chr2L 15763112 3' + mdg1 7059 8 54.17 GTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAA:2 - chr2L 4003694 3' - mdg1 7109 2 67.12 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATTATTTTTAAATTG:2 - chr2R 8157132 3' + mdg1 401 2 71.23 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCT:1 + chr2L 14523267 3' - HMS-Beagle2 12 2 35.54 AAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTATACAAATCTACCAAATAAATTCAAAGGCAATGGAATTTTCGACTGAAAGCATAAGATAAGCTTAATTAGCGGGGCAGACAAAA:1 + chr3R 19092123 3' - 1360 3261 1 60.96 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATTC:1 - chr3R 28146099 3' + roo 357 2 53.42 ATAGTATTCTGAGTGTCGTGTATACTGTCGTGAGTGTACTGAGTGTCGTGTATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGG:1 + chr2R 6885570 3' - P-element 2805 1 21.38 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGA:2 + chr3R 23067515 3' + roo 8996 2 69.86 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCC:1 + chr3R 30675456 3' - 297 6617 2 54.33 TACTGAATCCTAAAATGCTAGTAATTGCATAGCAAAAAACAAAAAAGGCGCAATTACCAGCCGAGACACTCGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTGCCTTATTATTTTTTGTTCTTACTGTTCAATAAATATTTTATTAA:2 + chr2R 1372992 3' - hobo 409 1 73.97 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCC:1 + chr2L 15550755 3' + Bari1 1648 1 65.67 AAAGAAAAGGAAAAAGAAATAAAACTGAATATAAATAAAGAAAGAAGAAAGGGCCACCACCACCCACATGAGGTGACCAAGAAAAAGAACATCCCAGCTAGCAACACCACTAGGGAACACCAGAGACGACACCATCAACTTTCCA:1 - chrX 3751898 3' + Doc2-element 235 1 48.28 AAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAA:1 - chrX 2479465 3' + mdg3 209 2 55.86 CTTGAATTCATTTGTTTTCATCGAGGTGTGATATCCGGTCGGTGTGCGCTTTTCAACTTATCTACCATACAAACTAAAATTAATTGTACAAATGAGTTATTTCTTTATATTCACTTTACATCTCCATCTCTGCATAATTAATATAT:2 + chr3R 10480243 3' - Chouto 5941 1 62.33 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAA:1 - 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chrX 3431848 3' - Ivk 5347 1 51.72 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTA:1 + chr3L 26290982 3' + Tabor 443 2 49.61 GAATCGTTATCAGGTTCAAATTCGAAATCTGTCGCAGGTATGTCAACCAAAGCCTTAACTCTTTTGAGCCAATTACGGTGACCACTTCTGGTTAAATGGTTTAGTTTTCATTAGGGCTCATGTCCTGACTTTGTTGTTAAAAAAGG:1 - chr3R 4848869 3' + hopper 256 1 66.44 CAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGA:1 - chr3L 17567886 3' + S-element 118 2 67.81 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGATTTACCACCGTACAATTGGTGG:1 - chr3R 11040014 3' + Bari1 1689 1 71.33 TTATAAAATAACAATAAGTAATAACAATATCTTTTTTTCGCAAGCAATATGTTTTCAATATGTACTTAACAACTAATTAGAATAAGTTTGTGAATAATATTGATAGGGAGTTAAAATTCATAAAAAATGATATGATGGCATCTCAA:1 + chr3R 21588700 3' - Porto1 4635 1 67.81 TAATAATAATAATATAAATAATAATAATAAATAATAATAATAAATAATAATATAAAATATTCCAAATATATTTTCTATAATAAAAGAGTGTAGCATAAGGTGAATGGATTGATTTTGGAACAATGAACTCTTCAAGCAATTAATGT:1 + chr2R 12067049 3' + mdg1 39 2 67.81 ATATATTTCTAAAAAAGGAAAAAATGTTCACTATAAAATAAATTAAATAAGCCACCTGTGCGGCACTTGAAAAAAATCGACGTAAAAAGGAAATTTGCATAGAAAAATCATAAAAATTTCTGGGTTTAATTGCTTTATCCTTTTAC:1 + chr3L 428425 3' + TART-C 11035 1 76.03 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAACGCGCAAAACCAAACTGACAGGCATTACGTATTTATA:1 + chr2R 12133825 3' - 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gypsy2 6490 2 56.16 TTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGCTGCTTGTGAACGGGCTGCGTATTTGCTCAAATCTATGCGTGACTTGAAGGAAATCTGC:1 - chr3L 5772528 3' - F-element 4241 1 57.85 TTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGAGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAA:1 + chr2L 4713934 3' - transib2 86 1 78.62 AGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTAGCGACTAGGCTCCGACAATCCGCACCAACAATAAATCAAAATCTAATAAAAATAATACGAAAATTGGTTGCATGTGCTAATGTTTCTGCACG:1 - chr2R 22148658 3' + Idefix 7359 2 66.44 ACACAGCACGAATCATTTCATAAAATTATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTAGAAAACCTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAACAGAAGATATGGCCAACAGATGTTGCATATCAGCAAGATGGGTGGGCAGGG:1 + chr3L 6306658 3' + Doc3-element 4621 1 65.19 AATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACA:3 - chr2R 7244809 3' - diver 58 2 56.85 CAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATAT:1 - chrX 3431844 3' - Ivk 5344 1 54.11 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAAC:1 + chr3L 13365843 3' + BS 5041 1 55.48 ATATATAAATATGTATATATATATCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAGATGC:1 + chr2R 10594202 3' + G3 4507 1 61.15 AACTGAATAGGTTTGACTATCTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTT:1 + chr3L 27357337 3' - Tc3 1711 1 89.16 CTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTACATTTTGTCGTAAATGCTTGACAATCGTTTTTGTAACAAATAGAACGTTTTGTTTTGGCTTTCACATAAGAACATTATTTATTTTGCACTGTTTCCCATTTATTTGTTATCATGT:1 + chrX 21036879 3' - INE-1 85 1 73.29 CGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 51 2 64.12 ATTCTAGTATCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGACATGAGAAAAATGGCATACCCTTAGTAATAATATAGAATTTTTAAAAATTAAGAACCAAATAAAAAGCACCAGC:1 + chr3L 11314567 3' + Tc3 317 1 44.44 ACACACACACACATATTCATGCATGAGCCAAGCTGGGAAATAAAGAGAAAATAATGGGGAGCGTATTTATTTTTCCACGAACAAAAATAGCGAATACAATGCAAAAACCGGCGGTGGAACGGTTTGTCTGGCTAGCAAAA:1 - chr3R 29408226 3' + accord 7035 2 66.43 AATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCT:1 + chrX 18336660 3' - mdg3 82 2 70.55 GTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTTCGCCTTCTTCAATCAATGAGTGTAGCTGTTTCGTAATCATAAAGAATTTTATTGATTCCTTATAAACATAATAATTTTCTTTAAGAACTTCTGTCA:1 - chr3R 19448774 3' - I-element 462 1 71.23 TTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAGTGCGGTATCCCAAAGGCAGAGCCAAATAAATAATAATAAAAAAACAAAAAAACAAAAGGCCCTAGAAATGCGAGAAATGTTCGAAAAACT:1 + chrX 6511905 3' + F-element 4618 1 62.33 GTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGGGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACA:1 - chr3L 18125872 3' + Ivk 5355 1 62.07 CGACTCGGATCTTGATCCTGATCAAGAATATATCAACTTCATATGGTCGGAAACGCTCTCTTCTGCTTGTTACACACTTTTCAACGAATCTAAAATTCCCTTTGCTTTTCCCGACTTTTTTGCTGTCGGTGGGGCATTCGTTCGTT:2 + chrX 683526 3' - INE-1 93 1 70.55 ACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAAAGCAAAGTTAAATACCTCCACCAGCAAAGATAAAA:1 - chr4 1294992 3' + TAHRE 10369 1 71.03 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTAT:1 - chrX 696514 3' - FB 85 1 75.34 CCCATTACTCAGCTAGTGTAAATGCGAACGGAAAATTTTATTTTAATACACGGTTTTTTTTCTATTTATAACCACAGCGCATTTAATTATATTTATTGAATTTTTCTCAAATTGTTCTAATTGTATTTTGCACGTACAGTATTTTA:1 + chr3L 15852861 3' - INE-1 537 1 78.08 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAA:1 - chr3L 16662395 3' + jockey 4916 1 71.23 TCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTTGGAGTTAGGAGGGGCGCGAATAATGTGTTTTTGGTATACTTATTGCAATTGTATCGAGCGACTAGGGAATAAAAAATGTGTAAAATGAATACCTGACG:1 - chr3L 25516769 3' - G-element 4301 1 68.49 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTT:2 + chr2L 6654757 3' + diver 172 2 52.05 ATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTA:1 + chr2R 23780614 3' - Ivk 60 1 56.16 CTATAATTTTTATTAATATTATTATTATTATTTTTATAGCAGGAGTTGGGTGTGGGAGAGATCCTAAAATATAGTTTAAAGCGT:1 - chr3L 17214787 3' - mdg1 47 2 66.67 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGGAT:1 + chr2L 15936852 3' - copia 74 2 68.49 ATATTTTAAAAATAATTGGTAAAATAAAAAAAACTTTCAAATTTAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAGTTTGTTTTTCTTTTGAGTCGAATAAATGATTCGCATTTGAACT:1 - chrX 14521053 3' - Tc1 1490 1 87.29 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTT:1 - chr3R 17996148 3' - diver 43 2 54.79 ACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGACGATCCAGTGTCGACTATACATCGGTATCTGTAATTGTTGAGCATGATGTCATGGTGGGCTCCATTGGAAAATT:1 - chr2R 2957784 3' + Dm88 4448 2 81.82 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAA:2 + chrX 2479567 3' - mdg3 5333 2 70.55 ATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTAAAGGTTTCCCACTCCCCCCACCAAAGCAAACTACTCCACAATCTGTTCAGTATTGTTTTATAATCTGTTCACAGAATAATATACTACAAACAAACA:3 + chr2R 10418602 3' - 1360 3050 1 65.75 GATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAA:1 + chr3R 28385604 3' - transib2 75 1 72.79 TTATATTCCAGTCTTAGGGGAGAGCGTATACTAAAAAGCCAACGTAGATTATTGGTTTTTAGTTTGAGGTGTGTTCTTTTTCCCTAGATGTGTCTACGCCAAGTGGGTCACTTGCGATTTCATGACCGAGTTTTTGTTGTTGG:1 + chr3R 8972092 3' - Fw2 3492 1 73.43 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAAAAAAAAGGGTTAACAATGAAACGCAAA:1 - chr2R 7090592 3' + I-element 5339 1 70.55 AAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGGGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGGCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTT:1 + chr3L 19350013 3' - 1360 3234 1 47.15 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGCAACCATAATCTGTGCCAAGTGATATAATAGTTGTTTCCGAGTGCGAATTAACAAATCCAGCGC:1 - chr3L 11696659 3' - roo 8731 2 60.96 TGTACACTCGCTTAATAAAAGCCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTG:1 - chr2R 13259300 3' + mdg1 342 2 68.49 TTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATAAACCAAACTCATTATTTTTTGCGCACTTTTCAAAATCGAAATAA:1 - chr2L 12606562 3' + P-element 2632 1 30.82 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAA:2 - chrX 13134856 3' - jockey 4789 1 64.38 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATA:1 - chr3L 2145882 3' - roo 8717 2 60.27 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAG:1 - chr3L 7300151 3' - roo 8735 2 67.81 AATAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATCGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGATGCACAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 3097 1 54.11 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGAAATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTA:1 - chrX 12986546 3' + roo 8996 2 69.18 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAATATGTTATGATATGATCAGATTTAGTATAAACTACATTAAAATCCTTTTATCT:1 + chrX 19539549 3' + pogo 2037 1 63.01 TAATAATAATAATAATTATAATAATAATAATAATTTAGTTATAATAATATTAATATTAATAATAATAATAATAATTTCTTGAATTATTGTAGAACGCATATAATTATAAATACGGAATTCAAACTATGTGTTTTAAGAGTATTTAA:1 + chr3L 18394242 3' + mdg1 7086 2 61.64 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGGTCAAAATTGGGTGGTGGCCAATATAGCCAGTTTGTCAATTTGCAG:1 + chr3R 5368741 3' + 1360 3383 2 78.08 ATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTCTAAAGGGTTGCGGGGAAAGGCTTAATGAAAATGGAAATGCCGACGTGCATA:1 + chr3L 3398926 3' + 1360 198 1 64.38 ACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAA:3 + chrX 8200303 3' + flea 199 2 56.85 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGTGGGTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTGAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATC:1 - chr2L 7125758 3' - I-element 31 1 51.33 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATC:1 - chr2L 7125753 3' - I-element 59 1 56.16 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCAATATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTATATTTTTCGCGCTCTCAC:1 + chr2L 14074557 3' - 297 6612 2 60.00 TTTATTAAATAAGTTTAATTTATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATGGATTGGCGAATAATCCAAATAGTCTTTGGACATTTGCGTCAATTGCAAGAATCGCATGGAACGGCACGCACAAATTTATTTCCGAGAAGTAAATGAAG:1 + chr3L 8100797 3' - HeT-A 354 1 73.97 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATT:1 + chr3R 18093360 3' - I-element 77 1 68.49 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCAGAGAAAATGAATATTT:2 - chr2L 6654611 3' - diver 24 2 67.81 GGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGGGTTTGAAGTGCGGGTAAAAGTTTGAGCTTTGAACTT:1 + chr3L 18125997 3' - Ivk 58 1 53.42 CGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAAAACACAGAAACAGGCATAAATAATTAGTCCCTTGTACGAGATGGCTAAGTCCATATATCGTTTGACGAACACATCGACACCGAGCTTGAGTATATGCTATGGATTATATG:1 + chr3L 9167555 3' + 1360 2982 1 80.14 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAATTTTGAACTTCTTATTGCACTCATTTCTCATAAGATTTAGGTATTCAGATTAAAACGATCTTGACTCTCTG:1 - chrX 16946614 3' - FB 49 1 52.41 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTAC:1 + chr2L 10156227 3' - hopper 4 2 72.64 AGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGCACATATCAGTTTCTTGGTGAATCGAATCAGAGGGTTAG:1 + chr3R 18970225 3' + hopper 958 1 41.10 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCTGGGAGCAATAATATCAACATCAGCAACCTTAACACACCTTTACACACTTGATGTG:1 - chr3R 13636122 3' + Transpac 5169 2 60.00 GTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAGGCAATAAAAACGAACGAACAAGTCAAATAAGAAGCGCAAAATGTATGTATATTTTTTAAATGGGGTTCACATGGTATGTTTCTTA:1 - chrX 11389235 3' - pogo 329 1 65.07 ATTTCTGCCGACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGA:1 + chr3L 6518621 3' + 412 404 2 77.78 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAG:1 - chr2L 11298037 3' + I-element 5300 1 60.69 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGCATT:1 - chr2R 20227193 3' - hopper 36 1 55.48 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATATTTGAACAA:1 - chrX 8360488 3' - roo 21 2 71.03 TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAACACGAAATTAGTTGCTTCCAC:1 + chr2R 18529937 3' + jockey 4909 1 79.29 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCGTTGTCCTTGCGCAATAGCGAGCGATTTACTCCGGAAAAG:1 + chr2L 6103067 3' - 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I-element 5245 1 73.61 GGAGGTAAATTGCCAGCTATTGCAGCCCGCTTAAGGGTATAATTTTGGTCAAGTTGTATATTTTGATGGCGGTCCCGTAAAATGAAAAAAAAATATGGGAGGTAAATTG:1 - chr3L 14839440 3' - BS 408 1 77.98 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAAT:1 + chrX 20999604 3' - BS 6 1 66.67 AAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCAGCAAACCCATCCTTAAAAGTCTTCTTTTTACTCTCGCCATATCTTCGAATCGTTTATTCGTATTTGTCGAGGAAAATGCTTTTT:1 - chr3L 10378271 3' - pogo 1785 1 52.17 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGGAAGTTGCCAAGGAAACGCAGCAGGATGGGGGTCAGGATGAGGA:1 - chr3L 6447001 3' - transib2 39 1 58.90 TATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCA:1 + chr2R 12472102 3' - transib2 80 1 71.92 TTAATAAAATGTCTGGAAAGAGATTAAGTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATATTTTTGTTAGAAACTCGGTCATATTATTTTTTCAGAATTTGTAGGCAA:1 + chrX 22562768 3' + S-element 396 1 65.75 ATTAAAAACAATATGTAAGTAAGTAAGTAGCAGGTAAGGTAAGTAGCAAGTAGTTTAACCATTTAATTTACTTTCTGATCATGAAAGAAACGTGTTTACCATAAATGCTATGAATATTTCCTGTTCCCTTAGCGGATGTTCACTGT:1 + chr3R 14549001 3' + blood 6914 1 68.49 CTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTTC:3 - chr2L 23020626 3' + Transib5 2944 1 51.37 TATTATTATTATTATCATTATTATAATTATTATTTAATGAGGAGAGGTGTTGAAATTAAGTACAATAATACCATTTTAAACGTATGTTCAACGAACGAAATAATAAAATAATGTATGTTTAGAGAACTGAGAGACGGAGAGAAC:1 + chrX 22755391 3' - mdg1 25 10 70.14 ATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATT:1 + chr3R 19225121 3' + HMS-Beagle 7003 2 56.85 AAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAGATATGTTATAACTATATTCCAAAAACTGATTCTTCACACATTCAGCTCCACAATGAGACGCACTTCGCGGGGA:1 - chr2R 13865393 3' + invader2 195 2 74.66 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTG:2 - chr2L 18549839 3' - roo 8737 2 71.23 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTAT:1 + chr3L 21763749 3' - jockey 89 1 77.04 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTT:1 + chr3L 21327136 3' - copia 4882 2 65.00 AAACAAAGAGCCCTTAATTTTGTAATTAAATACAACTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATTTTCTGCACCATTCAGCATCGATTGTGCAGTATATACACTGCGCGTCATCAGATTAGCGCCCCCAAATG:1 + chr2L 21396821 3' - S2 60 1 69.86 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGC:1 - chr3L 12249798 3' - roo 8721 2 60.27 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCGGGACTCCTGGCAACAGCAATTAGGGAATCGTCGGCCTTCTACGCCGGTGACTACAGCCGGTCTCCTTCCGCACTCCTTTTCTACTTC:1 + chr2R 3186080 3' - 1360 19 1 62.41 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCCTTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCG:1 + chr3L 21380598 3' - I-element 82 1 74.65 TTGCTTTCTTGTGTGAGTAAAAACAATAAACGAAAACGTTTATGGGGTAGGCAATATCTTGTATATTTGTTAGTCCTACAATTTTGAATATTTACGATTGAATATAATGGCGG:1 - chr2R 5668082 3' - 1360 3252 1 63.72 AAAACATTTTTCAAAAGTTTGGTCGTGTCAGTTATGTATGTGTGTTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGGGTGGTGCTAAAAATGGGGAGATGTCATGACTGCAAGTGTCAGTCGACTAGAACTTCGACTTTGTGTTCCTCT:1 + chr3R 20243347 3' - INE-1 258 1 55.80 GACAAACGGACATGGCAAGATCGGCTTGGCTGGGGGGTCTGTTGTTTTCATTATTTACATGCATATGAAATGGGAAAGCGG:1 - chr2R 22023249 3' - INE-1 114 1 61.73 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACA:1 + chr2L 6647710 3' - mdg3 83 2 71.23 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATG:1 - chr2R 11164400 3' + roo 356 2 56.03 TTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGATGTTGATGCAGGCGGCTTCAATCAGCAGAAACTGCGGCGGC:1 - chr3L 5866045 3' - Doc 4620 1 68.18 AATGTGTTTCGCTTTCATCCTAATCGCTTTTCCTCTAACCCCTCTCTCTCTGTCTGCCATTTGCTTTCTAATTTGGGCGCACGCTCCTCGCTTGAAAAGAGGAAACACAAAGAGGGAAAAGTGGAAGGAACAC:1 - chr2R 19818058 3' + gypsy2 146 2 71.43 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAA:1 + chrX 8308503 3' + roo 353 2 57.93 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTCTTAACCGTAGTCATAGTCGTACCCGTACTACCCCCCC:1 - chr3R 9594985 3' + Tirant 8462 2 55.48 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAATAATAATCAACAAACTTAC:1 + chrX 11661543 3' - pogo 12 1 77.40 GAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTAT:2 + chrX 14722190 3' - diver 78 2 69.66 GATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGT:1 + chr3L 23839736 3' - 17.6 6966 2 65.75 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTC:1 - chr3L 18281880 3' - Doc 78 1 77.21 TATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCTATCGTTATCTTTATTGTATGTTGAAAATGGGCTATTATTTGAGCCGTACCACGGGTCATTTAACGAATCTCCAGCATTACCCTCATATCCGTCTATTTCCAGTTTA:1 - chr2R 1772076 3' + I-element 264 1 78.77 CTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCGGTTTTTTGAGAAATATTATGTTTTAGGAAGCAATATCTCGATTACCGAATTGAATTTGAAATCCGCCCTCGCCAGGAATGTCAACTCTGAACTTTTTGCAATTAACCCA:2 + chrX 17552635 3' - hopper2 1143 1 54.79 TTTTAAAACCAACTTTAAAATATACGGTTAAAAAATCAAAAGTTTATTCTGCACAAAATTGATCAAATTGTTTTCGCTCAACCATAAAACGCACACACATCGTTTTTTATTTGCTGGTTTCGATTTTTCAGTGACTTATTTCTGTT:2 + chr2L 2261432 3' - pogo 1886 1 73.97 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATAT:1 - chrX 19074722 3' - mdg1 7056 2 69.18 AAAAATAAAAAACAAAAACAAAAGGAGCGCGAGAAATGAAAAAGCAAACAAAATGTAAGCGTGATGATAATTAAAAATAAATACAAAGAAGAAAAACCGGCAATCTCCCCAAGAGTTGTCGTCATACATTTTTGAGCTTTATGTTC:1 + chr2L 10680153 3' + transib2 99 3 65.75 TATTATATACATACATATATATATATACATATATATATATATAGAATACAAATATGAATAATCGAAATTTTTAGGTGATTTTTGCGTTAATGAAGACAAATACCCACACAAAGCTACGGATACTTGCAAAACAGGATAATTGAAAA:1 - chr3L 21279851 3' + INE-1 66 1 72.60 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACCACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCG:1 - chr3L 8453765 3' - FB 85 1 79.29 ATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGATTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTCTTATCTCTAATCCTGACTGTCTTCCGGTCTCTCTTTCCCAACTTGTATACCCTTTTCCTCTATGAGTTATGGCCATAAACACATTCGTT:1 - chr3L 25481506 3' + Cr1a 4170 1 56.85 AAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAACTCCACGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATAAATATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGCTGACGCAGGC:1 - chr3R 2520495 3' + Tc1-2 396 1 67.81 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCACAACTCGA:1 - chr3L 7889507 3' - roo 8674 2 77.40 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATA:1 + chr4 373083 3' - pogo 35 1 60.27 GTAAACTAAACATTATCCCTAAACTGTTATTTCATAAGGAACAAATAATAATATAAGATAGATAATAAGCAAGCAAAATGTAGCTTTAGCATTAGATATATCGTTTATATTAATGAAGCATTAAAGTTAAAATAGCTCAATAAAC:1 + chrX 8745855 3' - accord2 490 1 75.86 ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTA:1 - chrX 21087608 3' - mdg3 35 2 71.08 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCGACGGCTACTGTGAAAATAGGTGTAATGCGGTATAC:1 + chr3R 4860583 3' - Transpac 4930 2 76.71 ATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAA:1 + chr3R 556530 3' - Tc1-2 72 1 62.33 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCAAACAGAG:1 - chr3R 15072531 3' - pogo 33 1 60.96 GTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTCAGCTTGGTTTGTGTTTGTTGTTCGTTTCGCTGTTTGCTTTTGCTTGCCACAGCAATGTCCTGTGTTTGTGTGAGTTT:1 - chr2R 22752022 3' + Cr1a 167 1 67.74 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCA:1 + chr3R 8890099 3' - FB 79 1 71.23 TATTATTTTATTTTACAAGGTGACATCTTTTACAGCACAAAATAAATATTATATTTTCTTTAGATTTTCTTTTATTGAAATGTCCCTTGAAACAATCAAATATTTTCAAAACGATAGCAACTGGAAGACTACCGTCTGCATATGTG:1 + chr2R 14143427 3' - jockey 4922 1 62.33 AGAGAATGCTATAGTGGAGTTTCCCGACTATTGGATACTCTTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCACAATTTTTCTATGATACCGATAGATATTTTGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGTTTAACATG:1 - chr3L 14620787 3' - INE-1 574 1 90.41 ATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTTCGAATTTAATTTATATAATTATGATTTTCAGTCCAGGTGATCAAGGTGCTACCACTTTATTCGACTTTTCTAAGCAAG:1 + chr2L 16692188 3' - P-element 2846 1 57.53 TTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAAATGAGTATAGTTTTATTTTGGAAAATCGATACATCTGAAAATTCTTTTCAATTGTCAATTGAAAAGAATTTTCAG:1 + chr3L 26377881 3' + transib2 480 1 49.19 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGTTTAGAGTGTATTGCGTGCCCACGGCTTTCCAAATTTTCCAGTCGGCTCGCGTG:1 + chr3L 22960545 3' - Tirant 24 2 63.56 ATTTTAATTAATAACATTAAACGTTCATTATTTCGTGTAAGGCATAGCTGAGCTTCCGCCCAACCTCTTTATTTATCGCCGAAATGTGACAGACATCACGTTATGGCCGCACACGCTTTT:1 - chr3R 20070565 3' + TAHRE 76 1 89.17 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTAT:2 + chr3R 3920574 3' + roo 8996 2 70.55 CTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCACTTATGCATTACGTCTCACTTTTATCGAAGGCAGCACGCAAGGCAATTTGGCCACACCTCCAAGG:2 - chr2L 10601622 3' - roo 8621 1 55.48 GTAGCTNATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACA:1 + chr3R 21630359 3' + I-element 5303 1 54.11 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAAT:1 - chrX 19074742 3' - mdg1 38 2 55.48 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCATGTTGGAAAATTTTGGTTTTGGGGATCAAAAACGATTTCGATGTAT:1 - chr3R 24219228 3' - roo 8680 2 73.94 AATATTTTTAAATTATTTTATTCACTCGGAATAAACAGGGTTTCTTTGTTTCAAATTGTAAATAAATATTTGTATAACCCAATATTGCTAGAACAACATTTTGAAGCAAACTATTTAACTACAATCAAATTACCATCACTTTTGGT:3 - chr2R 16548730 3' + 1360 3090 1 62.33 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAATAGATTGATCGATCTAGGCAAAAAGATTTTCGCAAGTGCGAAA:1 + chrX 6629164 3' - 297 51 2 53.52 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAG:1 + chr2R 21116619 3' - mdg1 15 2 27.40 AATCAGACCACTTTGGACGAAAACACAAAATGAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACACGGAGAGGCGATTCAGGTTCGTCTGTCGTGCCACCAGTCCGGATCCGAGTTCCGTCCGAATTGGCCTGCCCAAGGAGGA:1 - chr3L 12069273 3' - Cr1a 403 1 58.22 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAAT:1 - chrX 19266840 3' + roo 9000 2 65.75 CTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACA:1 + chr3L 19274895 3' - transib2 133 1 46.58 AAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGAAAATTATTGCCAAAGAACGATATATTGACATAAATACTTAGACTGCCCAAAAAAAAACGAAGTGCGTCTGTGTGGGGTTTATTGGTTCTAAAATTGATTGCTAACTTCTAG:1 - chr3L 21423678 3' - transib2 127 1 70.55 TAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTAT:2 + chr2L 7098186 3' + G6 1952 1 63.70 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGT:1 - chr3R 4964088 3' + roo 352 2 57.53 ATGTTACACTCCACAAAAACAGCCAGAAAAAGGTGCCACGTTTATGCGCATAATATAAATACAGCTAGCTCCTTTGAACACAACATATTTCATAAAATATCACTTGTTTTCAAAATTGTTAAAACATTTGTAAGTCCTTCAACATG:1 + chrX 15112371 3' - transib2 334 1 73.29 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCA:1 - chr3L 13294909 3' - roo 86 2 78.47 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATAT:3 + chr3R 4682968 3' + Burdock 6311 2 78.08 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCAT:1 + chr3R 19225076 3' + HMS-Beagle 6964 2 71.92 ANATGTATATATATATAATAATGAGTCGTTTAACTTTAAGCTGCCATCTCCAGTTATGTATATGTATATCTTTATAGGGTTTATTTTCCACCCTTATAGGGTCTACATATCCGATTTCGCTATCAAAAAGAAAACGTACAATTTGC:1 - chrX 3477757 3' + Dm88 20 2 60.96 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATTTTGCGTTACATTTGCTTTTTATTGCAT:1 - 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Doc 162 1 69.53 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCT:1 + chr2R 2427619 3' - Doc 57 1 60.00 TTAATAGTTTTGTTATTATTTTTTTTACATATTAATCAAATTACACTTGAGACAACATGCCCAACCAAATAATCATTACTTAAGTAGCTTGAATTTTAGCTAGTGAAGGTTAATAATTCTGCATTTCTTTTTAGTATCTGCAGGGT:1 + chrX 20287952 3' + S2 1570 2 76.71 CGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGCATATTGTTATGAACAAAAGCATATGCAAACCATAACCCCTGCATCTTCCTTCCGCTC:1 - chrX 18742796 3' + invader4 273 2 60.42 AGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGCAGAATGGGCCTGATAAAGATTTGCTTTAATTGCTAGCCATTATTCCAA:1 - chr3L 2799969 3' + R2-element 402 1 66.44 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCATT:1 + chr2L 12822835 3' + P-element 2831 1 21.00 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCCATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATG:1 - 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mdg1 51 2 52.74 TACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACT:1 - chrX 3431826 3' - Ivk 5315 1 71.85 TAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATGAGATGAAGATAGCAGCGATGAAGTTAAGGAGAGGCAATGCAAATCATAGAAGTATCCCAAAAAAGAAGAACAACCGAACCTACCCGAAAAACTGAAGAACGA:1 - chr3R 21784458 3' + Burdock 37 2 78.36 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCC:1 + chr2L 12822846 3' + P-element 2840 1 33.33 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAA:1 - chr3R 27083034 3' + jockey 4937 1 57.53 TAGATCGTATTACTCGGACGCTGGAATGCTTATGTAGTCATTGGTGGTCTTTTGGGTATTTGTATATTTACGTTTGTATTTTAATTTAGCATCTTCAAATTGCTACAGGAAATTGCTTTAATTTCCATTGAGTGTTTTCTTCTTGT:1 + chrX 12218228 3' - Stalker4 143 4 52.05 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAAACGTGAGTTGGTGGGGCCTCCTGTT:1 - chr2R 18258748 3' + Juan 4189 1 60.96 TATCTGGATTGCGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGATGAGCTGCTCAATCTGACTGGCAACTGTCATCAAATTGCACTCAGCTTGTCATTACTTACAGCTTTGTGGCTAA:1 - chr2L 16417339 3' - I-element 5118 1 57.53 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGAGGTCAAATAAATGTTTTGA:1 + chr2R 5674787 3' + S-element 1697 1 76.03 CCGATGCAACCGATCACCCCCAGCGATATTGCCAACGTCATCGCCAAACAAAACCCACGGGTAACTGGGCTTCTCCCCCCGGTGATCTAATCAGCAAGGCGAGGTAATTGTCTGATCTTGAAAAGGAGCAGGGCATACATAGGTAT:1 + chrX 17360459 3' + BS3 191 1 60.96 TAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCTTCATCTGAGAAATCCTAACATATTTACAATTTATTGGTATGCGTATAAAATTTTTTTGTAGTATTTAACCGGCACTCCTCGTGCTGCTCCAGCTCCTGCACCCAGATCACTTAGC:1 + chr3R 19151546 3' + Tc3 310 1 66.44 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTCTTGTGGTTCCTGAATTATACGAAAGGACAGACAGACTGACG:1 + chr2L 20935324 3' - INE-1 547 1 52.08 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATCATTTTCCTAGTCAATTGAACATTGTTGCGTTAGTTTCCTTGAACGGTTAACTATTGTACTTCGAATTCAATGAGCTCTAATTGCAAACATATTTGAAGTATTTTCTTG:1 - chr2R 7303964 3' + pogo 2092 1 80.69 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGT:1 + chr3R 19407977 3' + diver 167 2 67.23 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAAAATGGTGTGCAAGTTTCCACATTCATAGATACTTTATTCTTACTTTCTTTCTTTCTATTCATATGAGAAACAGCAATTTCATAGTATCTACCTATGACAAAT:3 - chr2L 15076064 3' + 1360 3370 1 72.60 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACTAGGT:1 + chr3L 6518665 3' + 412 7499 2 49.32 ATCAGAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAGGCTTTCTTTGAGTGTTCTTTGTGCTCTCCCCTTCAAAGTTACCTCCCTTTTTCACCGCCCACACATGCGCA:1 + chrX 7565248 3' + Doc2-element 218 2 80.20 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCATATAAACATCACCCTTTACTGATAGGTTTTAAGTGTATGTGTTTCTTAAACTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTTAAGTACAC:1 - chr3R 19224962 3' - HMS-Beagle 13 2 62.20 ATTAATTTTAATTAATTGCATTTAATATTTGTGACAATTGATTTTACATATTTTAATTGAATTTATAACAATAATTCTTGAATACGAATATTCGGTCTATGTGTCATGGCTGCGATCGGTTGAAAATTTCCAAATTTTTTATCAAT:2 - chr3L 4518687 3' + HeT-A 379 1 51.37 CTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCGACCTGGACCAGATCCGTAAGCAAGCTTAGCCGAAACGACCAGTCCAGCTTGATCTCATCCATGATA:1 + chr3R 4496991 3' + Fw2 3517 1 64.89 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGAATTAAAGGCAAAGTATCATATCAAGTTCTCCCCATT:1 + chr2R 16818025 3' - 412 12 2 75.34 ATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTGTGCAGCAAATGGGGGGGGGGAAAAAACTGGATAAAGTGGGGGTCTCCCAGCTGCGATTCAAGTGCGGCACCACTACTATATAATATCAA:1 - chr3R 23630509 3' + pogo 1719 1 64.17 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATGAGTCTATTAAAAA:1 - chr4 372920 3' + pogo 2074 1 66.90 CTGTCATGTCTATTACCTATAGACCTTGAAAAATATGAGCAGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTAGATTGTAGTTTTAGAACTTAAGACCCTGCCAGCAAGGGAAGTGAAAAACGTTCTCCCTTTAATTCTTGTGAAAT:1 - chr3R 7146241 3' - hopper2 465 1 52.74 CTCAGGGAAAATGGGCGTGGGCTTTGTGGGAGGGGCAGGGACAGGGACAGGGACAACGCGCGCGCAAAAAACTAACTGCGTACTTAACAAGACATATTCA:1 - chrX 4168768 3' - Circe 7364 2 68.00 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACATAAAA:1 - chr3L 18125867 3' + Ivk 5360 1 66.90 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAG:1 - chr2R 10078142 3' - jockey 74 1 53.49 GTTAAATAGAGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAAC:1 + chr2R 7244888 3' + diver 167 2 67.80 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGT:1 + chr3L 21327169 3' - copia 4909 2 55.00 CTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGAGCAGGATAAAGCTTATTGCTCGGGCCATAACTGGCGCTGCTTTTGGTAAGACTTAAGCAGTTCGCAGGTGTGGCAACGAAATTGCAGTTTATCTAG:1 + chr3L 22251297 3' - G2 44 1 77.34 GAATATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTG:2 + chr3R 23067494 3' + roo 18 2 67.81 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAA:1 - chr3L 21996128 3' - Transpac 31 2 69.18 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCA:1 - chr3R 30946510 3' - Transpac 4979 2 58.22 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGGGTCAGTA:1 + chr2R 18514993 3' - P-element 42 1 53.42 TTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCATGTTGTTGTTGGTTGGTTGCTGCTATATATTTCGTATTTGTCTTTTTATTTACGCTGGTTCAGGCGTTTCACACGTCCTGGAA:1 - chr3R 30577173 3' - I-element 234 1 61.38 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGGTTTTAATTATATTTT:1 + chr2L 14074545 3' - 297 6621 2 56.56 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTATTAAG:1 + chr2L 16946156 3' + hopper 1405 2 72.50 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACC:1 + chr3R 11191473 3' - roo 81 2 74.66 TCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTAAACAAACCATAAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGCACCATCGTGTATGTAAC:1 - chr3L 27874964 3' + Cr1a 4377 1 76.03 GCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTT:1 - chrX 21585257 3' - mariner2 278 1 57.14 AAGTCACCGACTGGTAGACTAAACATCCGTTGCCTAATTCGCCGATCCTGGATAGCTAGTTGTATAGCGTATCCTTCAATGGATCAGTACCGTACTAAAGGGACTGTTTATTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAATAAT:1 + chrY 495742 3' + Idefix 6987 2 75.34 CTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAAT:2 + chr3R 15790127 3' - flea 4728 1 70.55 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATAT:1 + chr3R 20167659 3' - roo 8744 2 74.66 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGACTGGGGCTACAAAGGCT:1 - chr2R 7244771 3' - diver 5908 2 71.23 GTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGCTCCTAAACAAACATCCTGGACATGAC:1 + chr2R 13101514 3' - I-element 229 1 73.00 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCA:1 + chr3R 4964181 3' - roo 8738 2 73.79 TATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATACAGAGATGTAAGATAAATGTCATTCATTTATTTAT:1 + chrX 7356914 3' + Circe 7102 1 76.03 ATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGCGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAATAAGTTCTATTTGTCAGTTATAATTGAGCCGCCAG:1 - chr3L 15099515 3' + G4 3807 1 73.29 ACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCA:1 - chrX 21639647 3' + gypsy5 321 2 78.62 TTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAATTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTAGCGCAAAGTCGAGCTTGACGGGTTTTTAGAAACCTACAGTACAAAATATATAGA:1 + chr3R 31384159 3' + R1A1-element 9 1 65.28 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTG:1 + chr3R 7420297 3' - 1360 66 1 64.38 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACACTAGCTTAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGTACACGACTATAGCATAATCTCTGGTTTTAATGTATAACCCATTCGCTAAACCGAGCCACGCCACAATTCACATACACGATAAGT:2 - chr3R 24279334 3' - INE-1 579 1 79.45 CTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAACGCAACAGAAACAGCAACAATAACACACCAAATTACACACACCCACTAAACTCACCCACACACACACGGATAGGCGACGAGGCCGAAAGAATAAAAAA:1 - chr2L 17557875 3' + Porto1 4287 1 65.28 AGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGT:1 + chr3L 22723923 3' - HMS-Beagle2 6960 2 71.92 AATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTNGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTG:1 - chr3L 22861782 3' - S-element 74 1 67.81 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTC:1 - chr3L 5389879 3' + roo 331 2 73.29 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTTTTTTTTATAAATTTTTTATTTTATAAATCCTACGATTC:1 - chr3R 17421205 3' - pogo 48 1 52.74 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAGGCGGTGCTTGATC:1 - chr3L 5881565 3' - pogo 50 1 54.48 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTATTAAAACCTATTTGGTTTCAATCGATGCAAATAATTATTT:2 + chr3R 20167725 3' - roo 8678 2 75.34 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCA:2 - chr2L 13158613 3' + roo 9037 1 61.64 ATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTTAATTGTGTAAGACGTGAGTTAGGGCTTTTAGGTATTTTCTTTAATTTTAGTTTT:1 + chrX 1873547 3' + Quasimodo 7198 2 73.97 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCTCTTACAAATGTATCCTTACCCAAGCCAACGAACAAAAAAAGGAACGTTTGTGATGGT:1 - chr2L 16943799 3' - copia 4932 2 61.64 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCG:1 + chr2L 4713979 3' - transib2 41 1 57.24 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATGCGCATTCC:1 + chr3L 22744730 3' - FB 56 1 58.90 TTTTTTTTTTAATTATTATATATTTATAAATTTATATTTAATTCAATATATATATATATATATAAATTAAATTATTTAAT:1 + chr2L 4467026 3' - Rt1a 5070 1 50.00 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACTTACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGATGCCTTTGCATTTAAGATAAAAA:1 + chr2L 15936898 3' - copia 28 2 65.07 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAA:1 + chr3L 21380600 3' - I-element 84 1 73.97 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTCATCAGCAGTACATGTGATGCAT:1 + chr2R 9544930 3' - roo 8731 2 65.07 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAA:1 + chr3R 31886927 3' + hopper 1342 1 67.59 CTATGAGTTGCATGACCCTTATTATCTGTTATCTTGACACACTTGAGGGATCCCCCCCTCGATGTGAAAAGCTGCTCCGCACACATTGTATCCGCATGCGAGCGGATGAGATGGTGACATATCCAACAGAACTTGCCACC:1 - chr3R 26932300 3' + Cr1a 4168 1 68.57 AATCAATTCTGATCCAAGAATTTATATACAATATATATTTGGAGTTTTGGCCAATTTCGTATTAATATGATGAAATAAAATATTAATTAAAAATTAATTAATTAATTCACGGCGTGACTATTATAATTTTAAAGTTTTTTAATATT:3 + chr4 184233 3' - 1360 3170 1 67.81 AAACTATTGTCTCCAGGATTTAATCTGTGGCAAGTGAAATAATGAGATCTGATTTGATATAATAAAAGGCAAATACTTTTCATTTTGGACAGACAAAAATTACCTTCTTACAAATCGAAATATTCTTACGAGGTAGAAAGCCGGA:1 - chr3L 24975187 3' + jockey2 360 1 75.86 ACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAG:1 - chr3R 19450205 3' - roo 387 2 52.86 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTT:1 + chr2L 13556466 3' - transib2 37 1 54.79 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATCCGTTA:1 + chr3R 17996263 3' + diver 160 2 60.96 ATATATNCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAGATGTCAGGAACAATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATTGACGGAAACAATAATTTTCAAATCGAAAACACTCCGAGGGTGGCAGGCATCC:1 + chr2R 13071244 3' + INE-1 82 1 69.86 TGACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAA:1 + chr3L 16033405 3' - Doc 87 1 75.34 AAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAAT:1 + chr3R 22590590 3' - rover 41 2 56.62 AAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACA:1 - chr3R 14505311 3' + F-element 4588 1 76.71 TATGGCCGTTACGCATCTGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAAGGGTGATTGATGAGATTCATTGAAATCGTTTTTTTTTTGTTTTGCAGTGCCGTTACTACGGTCGGCCTTAT:1 + chr3R 2446157 3' + 1360 3373 1 85.96 AAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTA:1 - chr2R 23780524 3' + Ivk 5318 1 59.59 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTA:2 + chr2L 15940307 3' + pogo 2034 1 64.38 GCATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATATCAAAAATTCGAATTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTACAGTTCGGTAATTAGCAAAAGCAAAATTACA:1 - chrX 2814270 3' - FB 59 1 66.96 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGAGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCAGCTAGCATGGGTCAATTTAACACCC:1 + chr2L 20821274 3' - Burdock 6182 2 69.44 AATAATAATAATAATAATAATAAAGAAATTCCAGTTATTGTCTTTAAAACACACAACACAATCGCCATATAGCGAAAGGTACAATAGATGGGATCCCAAACGAATTCCATT:1 - chr2R 18815926 3' + mdg1 7069 10 83.78 TATGTATGTATGTATGTAATGTATGTATGTATATATTATTTATACAAAAAAAATGTATAAATATGAATAATTTTTTACTTGCAAAAATCCTTAAATCCACTTGAACACAATTTTATTTCGTTATTTAAAAACTAGATTTC:1 - chr3L 14284469 3' - 412 223 2 75.71 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTGC:1 - chr3R 30347292 3' - P-element 42 1 58.90 GTGATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGCCAGAAATATCTGTTCAATTTTCAGGTTGGTTTTAAAGTTCTTTATTATATA:1 + chr2R 5479979 3' - F-element 88 1 64.38 TTAATTTATTTTAATTTCTATAAAGTATTTGAACTCATTAATAAGATATTTGAACCCTGAAAATATCCTATATAA:1 - chr3R 27979114 3' + transib1 1903 1 84.00 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATG:1 + chr3R 10270685 3' + Juan 4204 1 75.00 CAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGAGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGGGGCGAAGGCGAACCAAGACAGCTGGCAGATGTGGCCGTATCAGCAGCAAATAGTCATCGATTCATTCCGCCTCGTCAACGATGCAAATTTCC:1 + chr3R 23279531 3' - F-element 414 1 68.49 ACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGTTATTATGACCACTTAACTGGCA:1 - chrX 14722064 3' + diver 208 1 74.48 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGACAAGCTAGATCTCGAATTGGCGCGCCGTTCAGCCGAGCGGGATGCCAAAAAGAAGGCTG:1 - chr3R 27123448 3' - roo 8695 2 63.01 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATAC:1 - chr3L 16662355 3' + jockey 4956 1 57.53 AACACTAATATTTAATACAGTTATTTTCCATTATATTTATTTCCTCGTTTCTCTTTTCAGAACATCCTTTGCAAACAACCGAAGGCA:1 - chr2R 3345763 3' + Cr1a 4303 1 59.77 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAG:1 - chr3L 18402982 3' - P-element 78 1 32.19 TTCAGCTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCGGTTAAGACAGATGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACT:1 - chr3R 19407907 3' - diver 66 2 59.72 CATATTAGTTTTATTAACGCCTTGTTTTTGTTTTAATTTTTGCCAGGCATGCCATTAATATTGGCAT:1 + chr3L 2801655 3' - Porto1 4249 1 67.16 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACT:1 - chr2L 16946025 3' - hopper 56 1 54.79 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGCAGCGGTTTT:1 - chr3R 27765075 3' + mdg1 381 2 52.55 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGAATGGTGCCATAGTTCTCC:1 + chr3R 4964190 3' - roo 65 2 67.59 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGATACCCTTTACTCAGCTGGTAAAAACAATACTAGAA:1 + chrX 21096920 3' + mdg1 7374 2 76.71 AAATATTTTATTCATATTACATTTTATTTATGATATTAAAATAATGTTACATGAAGTTTGAAGTACGTTGTAATAAACGGTTAATGTTTAGTTAACCTATAATTCTCAAAATAAACTTTCATGCGTCCGTTTATAATATTACTTTA:1 - chr2L 8888017 3' - transib1 1924 1 78.77 AACCAAATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAA:1 - chr2R 5410975 3' + Tc1 1342 1 65.75 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTACCAATTCTGTGACTTCCTTTT:2 + chr3L 26291025 3' + Tabor 469 2 72.60 TTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTT:1 + chr3L 13739626 3' - BS 5087 1 79.45 CGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAACAATGAAACACTTTACAAAACAAAGGCTTGACACAATTTATTC:1 - chr2L 9778111 3' + G2 124 1 70.55 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCTGTTTTAGCCCAACTCTTTTATTTTTCCTGCAGAGCCAACGAAACTTTCCTTGCAAATTCTTTG:1 - chrX 10117537 3' - FB 57 1 57.93 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTGTTCGACTTTTAGAAGGTTATTTATTATAAAATAACTTGAAAATACATGC:1 - chr3R 18488320 3' - roo 8680 2 67.81 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGAGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGG:1 + chr2L 18347377 3' + transib2 2760 1 61.43 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCA:1 - chr3R 19992662 3' - hopper 80 1 75.74 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAG:1 + chr2L 12818321 3' - hobo 47 1 58.68 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAAT:2 + chrX 12129410 3' + flea 197 2 57.53 AGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCAAGAAGATAGACGCGATATAAAAACAAAAACATCGACAAGCCGTAAGAAAGAAATGTCATAAAACTTATTTACTTAGCACCAGCGAAATGGTCCTTGCAGAAGCCAAAGTC:1 - chr3L 18957872 3' - Cr1a 4401 1 57.53 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTTTCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGA:1 - chr3L 16690925 3' + I-element 5276 1 73.24 ATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATTTTT:1 - chr2L 22966884 3' - 1360 3159 1 60.95 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATT:1 - chr2R 22287416 3' - jockey 65 1 54.79 CTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACGTTTATTCATTAATTAAATTTCTAATTCATATTCACAGCTTCATGCAATGGCCAATCGCGA:1 + chr3L 23071921 3' + 17.6 243 2 58.22 GTTAATATCGAAGTTTAAAAGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGAAATAACGCTTACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTTACTTGGCAAATGTGACTGAATGCGTCGAAATGTGACTAAATGGCAAAG:1 - chr2L 4139622 3' + Porto1 46 1 67.81 ATTGGCACTGTTAAATTGCTATACTACAAAATTTTCTTTGTGTGCAATAATAAAGAAAACCATAAAAATCTTCCCGAATATTATGCATGTAAAAAAGGAAACGGCTAAGTCAAAAAGCAAAAAAAATTAGCAAGAAGTCTGTTGTC:1 - chr2L 9793504 3' + Doc3-element 120 1 62.33 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCAT:1 + chr2L 18347397 3' + transib2 2775 1 51.72 TTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTT:1 - chr3R 9557535 3' - G2 3048 1 65.75 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCT:1 + chr3L 7889650 3' + roo 338 2 65.75 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTATGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGCATAGATGATT:1 + chr2L 23400814 3' - S-element 76 1 71.03 ATAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTT:1 + chrX 10167476 3' + roo 9017 2 52.05 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACAGCCTTCAACCGGCCTGCCCCCAGAAACGCGCCGCGTTGACAGGCAGAGCAAAAAAAAA:1 - chr2R 7849935 3' - roo 8727 2 60.96 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAA:1 + chrX 8360613 3' + roo 8996 2 70.55 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTATGTTTGCTA:4 + chr3L 18505782 3' - I-element 21 1 71.23 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACAACCCGCCTACTCC:1 + chrX 20455734 3' - hobo 18 1 66.67 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTCGGACGTTTGATTTACCACCGTACAATTGGTGGGCGCTTC:1 - chr3R 11040007 3' + Bari1 1693 1 74.66 ACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAAGGTGCCAAGAAAACGAAGAAGAAGTCCGCGATGATAAAGTCGGAAATCGAGGAAGCGGCGCGTGCC:1 + chr2L 7595993 3' + jockey 4703 1 60.00 AAAGGAAGAAAAGAAAACCAAAAAGAGAACGACGCCAAATTCAAATCGCGAACTGCTTAAAACTGAACAACAAATGAAATTCCCATAGGGGCCGGACGTTTGGCGCGACTGCAGGCATT:1 + chr2R 17241776 3' + mdg3 5099 1 65.55 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACG:1 + chr3R 18971779 3' - Juan 4095 1 63.01 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACG:1 + chr3R 5351459 3' - jockey 4742 1 71.11 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTT:1 - chr2L 12818229 3' + hobo 2886 1 52.45 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGAGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTAGGTGTGTATATGTAAT:1 + chr3R 15364068 3' + flea 245 2 76.71 ATTATTATAAATATTATTATAAATCAAAAAGTGTCGTAAACGTAACTTCCTTTTGATCTAACGGGTTTATACCCGTTATACACATATATATATGTTCCTTATTTCCATTTCCGACTGTTTCTAATAGCACAAGTAATTTCTTGTAA:1 - chr4 1234923 3' - mdg1 7080 2 69.18 TAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGCCT:1 + chr3R 31976599 3' - TART-B 10182 1 75.86 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTC:2 + chrX 10521743 3' + Tabor 7276 2 50.00 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCA:2 - chr3L 19454881 3' - mdg1 17 2 72.60 TTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCGAGTTCTTCAGCAATTTTTGCTTTGTTTGTCAACACTGGTAATTTTGTGCAGGGAAATTCGTCTTTACCTTTAGTAGATTTGT:1 - chr3L 20751314 3' - I-element 234 1 59.59 TCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATTAAGTAAAAAGAAAAAA:1 + chrX 22824276 3' + Gypsy12A_LTR 2256 1 65.07 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACT:1 - chr3R 19992660 3' - hopper 88 1 76.03 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCATAT:1 - chr2L 22674739 3' - mdg1 7056 2 77.08 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAA:1 - chr2L 17809195 3' + jockey 4914 1 69.86 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAG:3 - chr2R 18315999 3' - HMS-Beagle2 6912 2 65.07 ATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAACGAAATATAAAATTACATTAAATTACCGGATGTAATTGCGGTGTTCGTGCCAGTCGCCTCTCTCATCCCGGTCAATGAATCAC:1 - chr2L 11957646 3' + invader2 443 1 56.94 TGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGT:2 - chr3L 22723823 3' + HMS-Beagle2 7148 2 57.53 AAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCTGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGGCTGGAAAAAATAAGCGAGGTGGAGCTGGGCCACAGGTGCTCAAGGGGCTAGGTCGAACATGTTTGA:1 + chr2L 12119944 3' + Stalker4 7067 4 52.74 GGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGACATGTTTTGCCATATTTTTATTTAGGGTTTAGGGTTTTTTTTTAAGGGTTTGTCTAGTTAATAGCTTAATTGTTCTATTTTTTCTATTTAATTAATCTATGCAGGGCAGGAGTTGGTGAAC:2 + chr2R 10689685 3' + INE-1 97 1 30.82 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCAGTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCA:1 + chr3R 11469374 3' + Tabor 7240 2 76.09 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTT:2 + chr3L 21769145 3' + I-element 5329 1 60.69 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGTATTTAGAATGCTCTTGAATACAAGATGCCTTTGCATT:1 + chr2L 15936887 3' - copia 4902 2 61.43 ATAAAATAAAACTAAAAAATAAACCTAAGGTAGCATTTAATTTATGGTGTTGAGCTAAATCATAGTTTTTTTTTTAACTAGTTGTGTTAAGCTGGAATTCCTTATTTGATCTTTGAAATTTAAAAATACTTTCCTCTTTAATTTGT:2 + chr2R 22230462 3' + Doc3-element 169 1 80.82 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATA:1 - chr3L 2989942 3' + roo 9004 2 64.38 AAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGCTACCCATATGTGGACACAAAGAAGCTACCTGAATTATCCAAGTGTCCTTCTAATTGCGTTTGGTT:2 + chrX 16107681 3' + transib2 2432 1 54.79 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACAAGCTAGAAAGTTGAAATTAAGCATACAGTTTCGAGAGACATGGACGCACCGTAATGGCGTCTTTGGCTCGTGTATTCGCTAAGAGTTTTGTAAACGTAAAATAATAAAGAGAAATCAA:1 - chrX 337071 3' + INE-1 140 1 54.11 TATTTAAAAAAAAAAATACAAAATCCCATCTCTAGTAAAAACTGAAATATCAAAGGAAAATAAAGAATACGACCATTCTGGACAAAAACTAAAACATTAAACTTATTTAATGTTGTTTTCGAGTTTT:1 + chr3L 11830958 3' + TART-B 10632 1 60.63 TAGTTTATTTGTGTGTTATTTGTTGCTTTTTTTTAATAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGCGACATTTCCCATTTCCTCGAGAAAATTTGCTACCTGTATTGCCGTACATTGCCTCTTCTTTTACTCT:1 + chrX 3654489 3' - Porto1 4446 1 53.42 GTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAAT:1 - chr3R 11186512 3' + BS 5064 1 59.71 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATTGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTC:1 + chr3R 31264129 3' - jockey 4779 1 63.01 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGT:2 - chrX 21224499 3' - roo 22 2 70.55 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCGTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATAAGACTTAATTTTATTACAATAAATATGATCTGCTTTT:1 - chr2R 16510106 3' - F-element 52 1 50.42 GGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGTTTAT:1 + chr4 829135 3' + INE-1 157 1 73.10 TCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTT:1 + chr2L 16946123 3' + hopper 1347 1 62.33 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTGTTCATTTAAAATTTTCTCGTTTATTTTTG:2 + chrX 17343454 3' + I-element 5273 1 76.71 AAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCACAGTAGCTGAAATTTGTCGTAACAAGATTTGCTTTTGATTTGGACTCGCGTCCAACGTCTCCATTTCCCGGCTCTTTTGC:1 + chrX 4852631 3' - mdg1 488 1 67.12 AAATAATATTTATTTTGAAATTATTTCCATATTTGAATGTGTGGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGACGCCTGCAAGTATGCTTCATAAATTTTGCGGGGGCGCCAAAGGATGCCTGTGCGTGTATGTGTGGCAGGATTAAACGTG:1 - chr2L 17694262 3' + P-element 2502 1 59.59 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAATTCAGAAGGTCTAAAGCCAAGTCAGAAGAAAATTGACGCAATTTGTAAGATAAATTTACCGAACTAAACAGATATCCAGATATCAGATCTACGGATCCATTTGTTTAGCA:1 + chrX 9040434 3' + roo 401 1 47.95 CGCCAGCACACAATGGCAACACACAACAGGAGGCGCTCCAAATGGCGATGGTGCTGCGGCAATATCGGTTGTCTGCGTCATCGATGGGACGTTTGTTATTCGATAGACTCAGAAACCAGCTTAATGAATAGTTATGTCAATCGGT:1 + chrX 16637548 3' - gypsy2 6376 1 75.86 ATACTTAAAACCTGTCGGGGATATCTAGCACGAGAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTTGTCATTATTATTTTCCAAACTTAAGGCTAGGTTATTTTCATGGACCTAGTACCCCACTTTGGTACGTAATCAAGGGGTATAACAGGG:1 - chr2L 21713984 3' - G4 3711 1 68.97 GTGTCAGGTTGATCTTCCTGTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTAAAGTTACATTTCGATAAAATTG:1 - chrX 3460108 3' - Bica 144 1 50.79 CATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCGCATGATTTGTTGTGCATCCAAAGGCGTTCCAATCAAAGCGCTCGTCACCACAGCGGATCCATTCACATGACCACCGCTACTTCATTACTCCATGGCGACCCTTG:1 + chr2R 20978579 3' + rover 7017 2 60.28 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGG:1 + chrX 21224630 3' + roo 337 2 64.38 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGC:2 + chrX 8360608 3' + roo 327 2 73.97 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACTTGACATCG:1 - chr3R 24729531 3' + Juan 4197 1 61.64 CATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCCAGCCAAGCACAAACGGAACTACAAAACTAGTTTCAGCTGTGCCTTTGGGCTGA:1 + chr2R 24584575 3' + Transpac 485 1 58.25 CGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAACTTATTTTTATTTGTTTTTGCAGGGTATCAAAATTATTTTTTAGCCGAACTAACCCGTGATTGGTATTATATATTAGATTTACTTTT:2 + chr3L 20698984 3' + 412 7439 2 59.59 TAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCAAGTGCGCAGTTGTGTGTGTGTGTTCGGACAGCCTCTCTTTTTAAAAACGCATAAATGTTGAT:1 + chrX 13995413 3' + copia 4956 2 60.27 TACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGAAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTGGCTATTTTCGCATATTCAAAATTCTTGAAATAACCCAT:1 + chrX 13947355 3' - hopper 153 6 46.48 GTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAAAGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTGCGTTTTTGATTGTAGTCTGTGTGTGGGCTTGCACTTGAAGAAAATGTGGAATCAAAGTATAATTTT:1 - chr3L 18063210 3' - Porto1 378 1 50.71 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCTGCATCCGTATTAGTGGCTGCAGCTGCATTAGTGCCTGTCGCTATGGGGGATATATTCTCTCTTCGCAGACACCCTATCAAATTC:1 + chr3L 16266126 3' + I-element 5320 1 46.58 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTTTAAGCCTCTTTGTTTTCGTTTCAGTTTTGTTT:1 + chr3L 13836736 3' - 412 7078 2 48.63 GCCAGATCGACTCGGCTAATGATCCAGATCAAGAATAAATATACTTTATATGTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTT:1 + chr3L 22721117 3' - INE-1 100 1 81.51 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAA:1 + chr3R 21933236 3' - pogo 67 1 67.81 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGGACAATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTGTATAATGACAGAATTATACAAAAAATGTATGTTGAATTACGATGTTTTTGGATTTATGTTTAACTTTCT:2 + chr2R 1193104 3' - GATE 35 2 65.75 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAATGAAAA:1 - chr3L 23287174 3' - 1360 14 1 76.03 TTTTTTTTAATTTTCTAAATTTAAATAAATAAATAATTAAATATTTTTTATAATTTGAAGTTATGATAAGACTAGACCAACACAAATGTCATTTGGTTCGTTTCGAAAGTGGGTTCACCCATTAT:1 + chr2L 8976215 3' - Bari2 402 1 77.60 ATCGAGTTTCTCGACTATCAGACACCGGAAATGCGGTAAGGCGTGCGATCACTTTTAAAAACTGCGTAAAGAAACACTCTATATATGGATTGATCACA:1 - chr2R 3066182 3' - INE-1 561 1 72.45 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTATAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCG:1 + chrX 2479605 3' - mdg3 43 2 54.79 GTAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGA:1 + chr2R 5531176 3' - 1360 128 1 64.49 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAATAAAGATTTCGAAACCAGCAGTT:1 - chr2L 11298019 3' + I-element 5317 1 58.90 TCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTC:1 + chr2L 15936846 3' - copia 80 2 71.23 CTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAAACTTTGGCGAGAGACCAGAACTTTTATGGCATAATTGAACTCTGCGTCGGTTAAGTTTTGGTTTCGGGTTCGCACCAGTGAAGCAAAGTTTTTAATGTCAAC:1 + chr3R 30984808 3' + F-element 4343 1 74.66 TGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGC:1 - chr3R 11186562 3' + BS 5007 1 74.66 AGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTT:1 - chrX 18396028 3' + roo 401 1 69.66 TAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCCAAGCAAGCAAAGTTTGTCGAGTGAAAGCCTAGCATTTTATCAGCCTCGAAATACGCGGCTTACCTCGATTAGAAAGCAAGCGTTTGAGGCCTTA:4 + chr3R 13736147 3' + 1360 3212 1 58.22 CAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGGTGATGGCAGCGGGAATCGCTCTGTGACGTTTTCAGCGTTTTTGTTTTACA:1 + chr3L 9216910 3' - HMS-Beagle 6876 2 54.55 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCTTGTCTTCTCTCA:1 - chr3L 16690851 3' + I-element 5346 1 66.44 ATGACCGCAAAATGACAAGAGCAACATCTAAACTATCTAATTGTGAAACCAACCC:1 + chr3R 17995773 3' - diver 5992 2 78.18 ATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATACACTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAAAAAAATTTTTTTTTTCATGTTTTTTTTTGCAATTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr3R 1035824 3' - Stalker4 20 4 77.86 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATT:2 - chr2L 20265912 3' + roo 9037 1 61.64 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTT:1 + chr2L 14074544 3' - 297 6619 2 57.98 AATTATACTTTCTATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTTCTCAAATTATACTTTCTATTTTGTAGACTCTTAATTTCTCTTTTTATTAAACAATGCATTGACAGACGTGTTCACATTTATTTC:1 + chr2L 8693680 3' - mdg3 5047 3 70.55 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATA:1 - chr2L 7660883 3' + I-element 5345 1 71.54 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACGCTCGATGACTTCATTAGGGCAGTGCGATGTGTGTGCAGCGAAAAGATACACCCCTGCCTCGCGCCG:2 - chr3R 27655067 3' - mdg1 54 2 56.85 CTTTAAAGTCAAAAATTCAGCTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTATGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGCATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCTACTGTTCAAGTAG:1 + chr2L 23400854 3' - S-element 37 2 60.27 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGTGCCATCCAATTGCTTTGTTCATTTTCC:1 - chr2L 4713830 3' + transib2 2792 1 62.33 ATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATAA:1 - chrX 21087591 3' - mdg3 5290 2 62.39 AAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTGAGGTATTAATGTGTTAGAACTCGATTGTAGGTGGTA:1 + chr2R 20010721 3' - Juan 4120 1 64.38 AACAAGAGAAAAAAAAAAACAACAAAAAACAAAACTAAAAACAGAATAAAAATAAAATAAAAAGTCGAAAACCAAAAAAAAATATATATATACAATACATATATACATTCCCAGATTAATGCTGAAATGCCTGCAATTAGCTTGAA:1 + chr3R 28571988 3' + gypsy7 5009 1 71.23 ACCATTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGGGGATCATGACGAAATGGTGGTGGTCAAGGATATTGAAATGTTCTCCATGGGCGAGCATCATCTGGTGCCCTTCTACGGCAAAGTTCCCATCGGTTATTTGC:1 + chr2R 21181527 3' - Idefix 164 2 66.44 ACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTAATTTTTTTAACTCACATAGGAAAAACTTAACAAAAGAAAAGCCGTCAA:1 + chr3R 6486216 3' - P-element 2718 1 41.10 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAA:2 + chr3L 21769126 3' + I-element 5309 1 49.32 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCCCAAAAATGACATAGCCACTATTTAGATAGGCTAAAAACAATAGCACTAAATAAATTAAAT:1 + chr2R 6965633 3' - Transpac 4933 2 76.03 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAA:4 + chr2R 9158126 3' - mdg3 5333 2 70.55 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGGCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACG:1 + chr2R 13766299 3' - roo 8721 2 62.59 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTC:1 - chr3R 15072546 3' - pogo 48 1 53.42 TATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAAACGCCAAAAATAAGACCTAAATAAATAATTGAAACTGCCAACTTCCGCTTACGTAGTCAGCGTTCCATCAGCCATCCATCAGATCCAAAAAGTCCCCATTGAGTCAGCGAGAC:1 - chr3L 10540360 3' - micropia 175 2 78.08 ATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACCATCTGATGGCGGCACTGCAACTCCAAATTCAATTATGCAAATCGCATGTGAGAAATTCAATTGAAATACGATAATTTCACAGGAATTGAGCCGGAGCCGTGG:1 + chr2R 20340124 3' + Tirant 453 1 73.61 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTTGCCCCGGAGCATTTGTGGGTTT:1 + chr3L 21327192 3' - copia 4911 2 55.17 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCCGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTT:1 + chr3R 17421330 3' + pogo 2068 1 47.59 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGG:1 + chrX 12129386 3' + flea 4933 1 73.79 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTTTTTTTCAGCAAACTAGGAATTTTCCAGGACCAGCACAACAACAGGAATAACTGGCAACAATGGCAACCTAACCGCA:1 - chr2R 17497938 3' + copia 249 1 43.06 TTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTC:1 - chrX 5323226 3' - Juan 4101 1 53.42 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGTGTGGTT:2 + chr3R 3920599 3' + roo 9021 2 53.42 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGCAGCA:1 - chrX 19054198 3' - jockey 19 1 76.03 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGAT:1 - chrX 17343409 3' - I-element 85 1 77.40 ATTAGGGTTGGATGGATTTGTTTTTCTATGTTGTAGTCGTGGTTGTATTTAAGGCATTTTTTTTTGCTTTTGTATAGAGATGCCAAGGTGTGTACTGCCTATGTCAGCCCTTTATTCTAAACTGAATCACAAAATTTT:1 - chr3R 18902214 3' - Quasimodo 156 2 80.43 TTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGG:1 + chr3L 23906437 3' + 1360 3281 1 58.22 ACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTTCCGAAAGGTGCAAGCCCTTTAAAGGTGATTTGATTTCCGGAGCCTCCGTGACAT:1 + chrX 1556647 3' + jockey 4764 1 62.33 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCG:1 - chrX 19054205 3' - jockey 26 1 71.23 GTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATTGGGACAGAAGGACATGGCCAGACCGAATTGGCTGTGGACAAGTTATGCGCGGAAAAACAGCGCAGAAACTAAAAAAAAAATTGTAACACCGC:1 - 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jockey 4749 1 70.83 GATACCCGTTACTCAGCTATTGGGAATGCAAACGCGAAATATTGGGGGGGTACTAATAAAGTTATAAATAATATCGAACAATTTTTAAAAAATCTATTTTTGTTGTGTTTGTTTTTATTGATCAGTCG:1 - chr3L 19424933 3' - INE-1 541 1 60.16 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATGCCTTTTTGTGAGGAT:1 + chr2R 21411018 3' - Burdock 6148 2 76.71 GCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCAC:1 - chr3R 9557546 3' - G2 3053 1 72.14 ATCTATAGAAATGTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1 + chrX 392290 3' - INE-1 300 1 66.44 AACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAGTGCTAACCAACGGTATAACTAACCTTATAACAAACGCGGATCGTGTCAGTTAGAAAGTAATATATATATAAAAGCTAAGAAAATTAGAATGCCAAACCACTTTGCTATCCACCCCTG:1 - chr2R 20525848 3' + rover 447 1 55.48 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGC:1 - chr3L 18403004 3' - P-element 53 1 25.25 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTG:1 - chr3L 6518530 3' - 412 7071 2 70.31 ATTTTTCTGAGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGACAAAAAAATTAATAATAGTTAATACTATTTAATAACCAAGCTGCCCATCGAGGATCTCGACATGCAGGGCAAGAAGCTGCTGGCCAAGATCAATGCGATGGCTCCG:1 - chr3L 1029092 3' - INE-1 501 1 51.37 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCA:1 + chr3R 11937421 3' + flea 4971 2 58.90 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCA:1 + chr2L 12822833 3' + P-element 2783 1 14.38 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTC:1 - chrX 8308416 3' - roo 8744 2 73.29 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGC:1 - 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Doc 148 1 72.95 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCAC:2 - chr3R 31886812 3' - hopper 34 1 63.70 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAAATTAATCTGTTTTCAAATGTAA:1 + chr2L 11357959 3' + blood 352 2 67.81 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGG:1 + chrY 2720359 3' - 297 6639 2 72.93 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGGTGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAA:1 - chr2R 5941316 3' + copia 209 2 52.05 AGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCTGAGGGAAAACATCCCTAAATAGACCTCAGACCTCCTGCTCATAATCACAATTTCCGCGACCCTGACCCAGCTGTGAAGTTATGTTGACATTGACC:1 - chr3L 10255147 3' + F-element 4327 1 53.42 AAATTAAACTTAAAATTGAATCATCATCTTAAGCACACGTATAAGGAGATTTTACTATATATAAAATCTTTTAACATGTTGCCCAAGAAGAGAGTGTGTATTTATCGAATGGCGGAAAGAATATGGCAAGCGATAAGATAAGCCA:1 - 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transib2 67 1 63.01 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCAT:1 - chr3R 23618123 3' + hopper 1357 1 57.93 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTAACCGTGTTGACCAAATTTGGCTCTCAAATGAATCGCGGCCCGAAA:1 - chr3R 29777105 3' + P-element 2853 1 52.73 TATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTTTCTT:2 + chr2R 13259725 3' + INE-1 81 1 64.38 AACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTA:1 + chrX 3431951 3' + Ivk 5309 1 65.52 GTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGAGCGTGGCAAAAAGGTTTTTGGCATATTTATAGAAATTTACAAGACTA:1 + chr2L 23066893 3' - INE-1 534 1 39.73 TAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAACCAAAAACCAAAAAAAAACATATACAAACCAACGAATTACCCATCCTCTCCCCATAATTACGAAAC:1 - 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chrX 21097370 3' + Tc3 314 2 68.00 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAA:1 + chr2R 13168732 3' - P-element 75 1 36.30 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGG:1 - chr2R 14051723 3' + roo 9038 1 56.85 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTT:1 - chr3L 12249821 3' - roo 8743 2 75.86 GAGCAACTTTGTCATACAACTGGACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCCATTTGGCCTTTGTACATGTGCAAAATGGCGGGGATTGGATTGGAGGCATGGG:1 + chrX 19552260 3' - hopper2 429 1 52.29 GTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGG:1 + chrX 22840559 3' + copia 5049 2 67.81 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGTTCGGCCGACTTGGACAAATCCGCCAGCCAAG:1 + chr3L 2544746 3' + Tirant 367 2 60.69 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCTTGCTGAGCTTTCGCGGGCGTGAAATAAATACAT:1 + chrX 19074914 3' + mdg1 417 2 76.64 AATTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGGTAGTCAACCCTCCGCCTTTAATGGAGGGTGAAGCACTTGTGAGTCGCATTTTGGAAATGTCACCTGGTGACGGAATGTTTTTAAGGTAAACTGG:1 - chr4 118546 3' - G5 4668 1 74.60 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAG:1 - chr2R 8157152 3' + mdg1 381 2 57.53 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTTCGGCTGCGTT:1 + chr2L 19924094 3' + roo 9064 1 71.92 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGG:1 + chrX 21100258 3' - mdg1 7098 2 57.53 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAA:2 - chr3R 19032612 3' - roo 8740 2 73.29 GGTAGTGGTGCGTGCACAAAGAGGACGCACCGTACGTACGCGAGGATAGTCGAGGAGAATCTCGGCGCGAGTCGC:1 + chr2L 23332593 3' + gypsy8 145 2 58.67 ACACACACACACACTTACTCACACCCACGCCCATAACTCGCTATGGGATAATCAAGGAATTTGGAATCTTAGACATTGTTAAAAGCA:1 + chrX 19791869 3' + accord 7033 2 27.59 CTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAAATAATAACAAACACACAGAACATGCAACAGAAATCCGCCGCTAGGCAAATAAACAACAGAGTGAGTTTTATGGGACACACGAAAAGAA:2 + chr2R 18350516 3' + F-element 4638 1 58.90 GTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTACTTAACTTTGACGTTTTGCTCTGTGCCTCTCTTTCTCTGTCTGTCTGTG:1 - chr3L 14272275 3' - Tabor 322 2 71.11 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAA:1 + chr3R 20441306 3' - I-element 78 1 68.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCT:3 - chr3L 2989926 3' + roo 356 2 53.42 AATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGATAACAACTGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACGATATCTGCATCACGCGTGAGGTATTATGCCAACTGCGTTTTGG:1 - chr2L 14930991 3' + diver2 450 1 78.62 AAAAAGTAATTTTTGCTAAATCGCAAAAAAATCAAACAAGATCATGATCGGACGGATGACGATAATGATGGCCATGGTCATGATGGCCAGTCAGTCGGACAAGCGAATGACGAATTTTCTCCTTCATTTGTTTTGCTTTTTTCCGC:1 + chr3L 3466460 3' + Tc1-2 1467 1 77.40 GGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGCTGCCTGACAAATCAATATCAACAGGCCGAAAATGGTTCTCAAAC:1 - chr2R 16915570 3' - BS 4952 1 69.18 CAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCATCTTCAACACGTTGGGCCATCTTCAAACTTTTTGAAGTGTTTTCACAAAATCATAAAACCAAAAATT:1 + chr3R 16117520 3' + transib2 2381 1 56.16 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATCTGCTGCTGCCGACAGTAACGACCACTTGATGGGGCTCCTCCTGCACTTGGGAGTGGAGGATGACTG:1 + chr2L 6161046 3' + I-element 5328 1 58.06 ATTATTAAAAATATTATTATTATTATAAAATATTAAAAAAATACAAACGTGATATGAAATTATCACTCCGTGAAAATGTGTGGGCGTTCAGGGCAGTAAAGTCCGGTAGATACTAAAATGGATTTATGAAAGCTTACGTATGATTT:1 - chr3L 6694863 3' - mdg1 7077 4 65.75 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCC:1 + chr3R 30347371 3' + P-element 2834 1 26.00 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAA:1 - chr3L 22960446 3' + Tirant 333 2 67.15 TCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAACAGATCTATGTCTATGTCCAAAACTCCCCCACCAACCGACCTCTGTACTCTGCTCCCCGAAAACCAATCCAACCAACCAGCTGTGAACTAACACCGAAGAATGA:1 + chr3R 30577524 3' + mdg3 75 2 71.92 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTT:1 - chr2L 11298048 3' + I-element 5288 1 68.49 TAGCTTAATTAATTAGAATAAGAATTATTTTCGTGGCGGAGACTGAATTAAATATTTCTTAAGATACAAATGTACTACCATTATTTCGGATACGATATCTTGCAATTAGTTTTCTGTCTAGTTAAAATTCAGAAGGAAATAGAAAA:1 + chr2R 16642759 3' + GATE 8345 2 67.81 AGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTTCCTATATGCGATAAAAA:1 + chr2L 11257156 3' - rover 17 2 74.66 GTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTTACCGCTCGTTGAAAGCATGAATTTTCAAATGTTTCAATACTCGTATATG:1 - chr2L 11257016 3' + rover 7233 2 64.58 AGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCATGAAAAA:1 + chrX 23108351 3' - BS3 1436 1 55.00 ATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCAATCTCCCAAGACACCAATCGCTTAACGGAAACAAACTT:2 + chr2L 22674942 3' + mdg1 7459 2 79.45 TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGG:1 - chr3R 23618130 3' + hopper 1360 1 60.00 AAAATTACTTCAAAAATATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAGCTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAACCGATGAAAATGGATGTTATTGCTCGGGAACAAAT:1 + chr3L 11252901 3' + I-element 211 1 71.92 CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGGCAAATGGTCCGGCA:1 + chr2L 20840056 3' - mdg1 7104 2 67.16 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAGCATGCTAATGACAAATTGAAA:1 + chr3R 7719861 3' - roo 8685 2 71.23 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATGTTCTTGTTTGAAACGCATTTTTATAT:1 - chr2R 16974376 3' + Juan 4188 1 50.00 TTTTAATTTAATTTTTAATTTGCCTGAACTCTAATTTCTATACCTGTATTTTCATAGAAATAAAATAGTTTTTTAACTCTTAGACAGCCTACCCATTTGATAACTTCTCCCTCTGCGATTCAACTTAACTATTTGCAAATTAATTG:1 - chr2R 11682164 3' + Rt1b 126 1 52.74 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACA:1 - chr2R 24169957 3' - transib2 48 1 50.00 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATAGAA:1 - chrX 10319564 3' - mdg1 7057 2 72.60 AAAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCCTG:3 + chr2L 22225081 3' + G5 4744 1 81.51 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTTGGCCTAAAGTTGGTGTCTCTTTTCGACCG:1 - chr3R 24090427 3' - roo 8708 2 52.05 AGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAACGGTAATGGGTGAAGGATGTTTATATATTGTAGATCAAAAAGGGGAATAAATGAGTTAGGCACTGTTTGGAAACGGGTAGCTG:1 - chrX 22933883 3' + roo 298 2 66.21 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATG:1 - chr2R 5151215 3' + roo 9023 2 52.48 CTTCTTGGTTCCAATTCTGTCATCGATATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTTGAGCTCTCGAGAGAGCCGGGGATTCCATGGGTCTGAAGGAGCTGCTCGAGTTGGAGGCTCACGTCGAACGG:1 + chrX 916066 3' - Porto1 4505 1 57.93 AAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTTATATCGTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATATCTTCTCTTATCTAATATAGCGTTTCTCCTGATTGTTTTGTTCATATATATTTTTTGTAAAAGGGTCTTACTTTCT:1 - chrX 20373526 3' + 297 394 1 70.55 ATGCTATAGTCGAGTTTCCCGAATATATTTGGTGGAATTAAATATATATTTCAACTTTCTCCATTTTATAAATTCTTCTACAATGCTCTTCTTATAATCTATAATGTATCATATTTTTATGTAATAATATATCATATTTTTTGGCA:1 + chr3R 27024901 3' - INE-1 569 1 69.18 CTTGGCAGCTATTAATTCAGCCCCCAGCCTAGTCTACGGTCTACATGTGTCACCTGAATATGACACTAAGAAGGATTTCTGAGGCTCTTTGTTACATCAGAACCAGGGACATCGAAATCGAATCGACCCCCGACCGGGGTTTGATA:1 - chr4 413913 3' - BS3 1712 1 56.85 AAATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAA:1 - chr3R 6625695 3' + flea 4963 2 55.94 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCAC:1 + chr2R 20349049 3' + transib2 2756 1 64.38 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTATTTACATGGCTTTCA:1 - chr2L 10156058 3' + hopper 1405 2 75.34 CGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGTGCTCTTTTATTTGGGGTGAAATGTATAAGCTCAAAACGAATTGGCGAAAGTTAATGTTCTAATGACAAAGGAAGTCTACAAACAACTCACAG:1 + chr3R 7267163 3' - Idefix 122 2 71.11 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGAAAAACAAAAACCACAAAAAACTACAAAAAACAGCCAAAACATTTAGAAAAGCATAACAAGTAAAACTTATCATAAACTATCATTAAAACGTTAGC:1 - chr3L 2719334 3' + jockey 4968 1 65.07 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTA:1 - chr2R 21410829 3' + Burdock 231 2 67.81 TTATTATTATTATTATTATTATGTGACCCGTTTGAATCGTTTCTTGTTGTGTCCAGTGTGTCGAAGCGTCTGCTTGACTTACTTCAGTGTTACGCTACGATTGTCCTGTTGCTGAACTGCAGCGGCCAGGAGCGGCAAGGAGCGA:1 - chr2L 19255472 3' - mdg1 29 8 54.48 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAA:1 - chr3R 24450397 3' - 412 7090 2 57.24 AAAAAAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTAGATGTTAGGCAAATGGTTTAAAGTTAATTATGAAGTA:1 + chr2L 16944016 3' - hopper 133 1 63.74 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCC:1 - chrX 13134864 3' - jockey 4797 1 58.90 TGGGCTCCCCTGGTATATGAGCAACCGAGTCATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGTGGGGCTTGTCTATATTTTGTGTCAATTTAATAATTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTACATTCG:1 + chr2R 4618504 3' + G5A 2520 1 55.47 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTT:1 + chr2L 5582229 3' - pogo 38 1 59.59 TGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAGGCGATATGTTGTTGCTGTTATAAGTATTCTCTTCAGCAATTATAAATCTAATTTAAG:1 + chr2L 14707801 3' - hopper2 1317 1 58.90 GTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACATGGAGGGATTACACCGTCAGAAATATAGCACCCTATTGACCAT:1 + chr2R 17803481 3' - Cr1a 4196 1 71.92 AATAATAATAATAATAATAATAATCTTTCATATTTGGTGATACTTGCACGCTGGCTGAATGCCCTTGCCAAAGGTCACGCATGACCAGCTCATTTTCGCGGTAGGACATTCAGATTT:1 + chrX 6125838 3' + mdg1 7075 10 74.36 GTAAGCTTACAAATCAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGAATGTAAATTAATTGAAAGTAGTTTACTGGACAAAAGTAAAAAGAATCACAAGTTTCGCTAGCCAAATTGTTGACAAATTTCAAGGCGCACCTG:1 + chr2L 18418369 3' - Cr1a 4038 1 56.85 ATATATATACATATATATATTTTTGATTTATCGATAGGCCAAGCAGTGCGATAAATGTTCAAAATTTGTATTGAAAAAATGGTTCTTTTGAATTTGAACAAATAAGTTG:1 - chr3L 10690937 3' - 1731 4409 1 74.31 ATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGAAAATGAATTTATTTTCGGATTTACGCCGAGCAAGCCACGTAAATGCAATCAATTTAAGTAATAATAAATTAAAAATCGACGTTTTCTCCTTCATATGCTGCAAATATTTTT:1 + chr2R 8414047 3' - I-element 5157 1 77.40 AAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATAATCAAATGAAGTGAAAAAGCAATTTTCCCGCGCCTGCAGTT:1 - chr2R 16929763 3' - jockey 4538 1 71.92 TTTGATTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTACAAACAGTACACCTACAAGCCCATCTTAATAATAATAAATAAAAGGTGCATTTGTGCCAGCCAAAAAGTTTGGCAAAGGT:1 + chr2R 14457308 3' + baggins 5381 1 65.75 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTCTTGTTAGTATAACTTCAATTAA:1 - chrX 19038346 3' + hopper 1376 1 58.90 AAATCGCAAAGCAAAATAAAATGCACCGCGCTTGAATTATCCATTTTATGGACAAAAAAAACCTTCATCCCGGAAACTCGCTTTATGACCAGCAGCAGGACATCAAAGGTGTTTGCGATAGAGAAAGGA:1 - chr2R 24040057 3' + HMS-Beagle2 382 1 52.71 TATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATAACCTCCTTCATAACAAGTAA:2 + chr3L 23071840 3' + mariner2 798 1 75.34 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTC:1 - chr2R 15326822 3' + copia 247 1 55.48 GGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTTTTGAGCGGCTGTAAGTCACTTTCCATGGATTGAGTTACGTAACGGCCAACGTTTCTGAGCCGCAATTGCTG:1 + chrX 4740357 3' - Quasimodo 447 2 65.42 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAACGGCAGTTCATCATTACAATACATTGCAGTGTGAAGTTTTGAAGAAAATAATACAGACA:1 - chr2L 12250914 3' + 412 7464 2 70.34 TATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCTGGCCAGCATTCAGGT:1 + chr2R 16166825 3' + accord2 129 2 65.75 CATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCAACAGAAA:1 + chr3R 13612651 3' - F-element 173 1 74.66 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTT:1 - chr3L 2989910 3' + roo 392 2 69.29 GCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGATGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAATACCGAGTTGTGTTTTATTTAAATAGTTTAGTGGTAATATAATTGAA:1 - chrX 23338846 3' + GATE 378 1 45.67 CTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGG:2 - chr3L 21655907 3' + HMS-Beagle2 7110 2 76.03 TAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATTCCTATTTGTTCCTGAAGTTACAACCATATTACAATGCCGATA:2 + chr3L 18930227 3' + I-element 5261 1 70.55 TCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCG:2 - chr3R 19224982 3' - HMS-Beagle 6848 2 54.11 AGGGAATTAAAAAACTTTAAAGAATTTAAACAATTTCATGATCAATATTTAAGTCTGAAATTATCTTAATTAATCAAAGAAAATATATA:1 + chr3L 9758453 3' + transib1 241 1 80.90 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACA:1 - chr3L 16970346 3' + roo 9027 1 54.48 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGCGATACGAAAAATATCAATTTAAGCAATCAGTGACAAATAAGCGATTCAAGTGTTTAATTTGCAATTAAACAAATTGA:1 + chr2R 18922506 3' + Juan 4138 1 53.42 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAAT:2 + chr3L 20898621 3' + roo 9006 2 65.07 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCT:2 + chrX 21224632 3' + roo 9039 1 50.91 GTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAA:1 - chr3R 9557543 3' - G2 3056 1 71.23 TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTA:1 - chr3R 23639156 3' - pogo 76 1 69.18 TAACATTTACATATTGCAAAGCCGAACAGTGCGTTTCTTATGAGGATCATCTCAGTATAAGTTAGGTATGAAAATGCATTTCTTATAGCAAGTGATATCAGCTATTCTTATTGGCTTTTCTCGGTTAGCCAATTGAATTCGTAACC:1 + chr2L 8609083 3' - HeT-A 5842 1 65.07 GTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAAAAGTGGCCATGGTGCTTTCGTACAGGGGCGGTTCCAAGGGGGTTCATTTGGGATATACATATGCGCCAAAATCTAATTCATTATA:1 - chr3L 14005085 3' + TART-A 13150 1 59.59 ACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCACGGTGCGGCTTTCAAT:1 - chr3R 20675799 3' - jockey 4892 1 65.07 CTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTTTATTATTATATATTTTATTATTATATATTATTATTATGCTATATATTATTTTAGATATATTTGTTACTTGTTGTTGCACAATTAATCTGAGTGTGGCAAC:1 - chr2R 8584906 3' - mdg1 7116 2 52.05 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAG:2 + chrX 8308487 3' + roo 336 2 69.18 GTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAACTATTTATTAATTATGTCTAGTTGTCATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCA:1 + chr2R 20010646 3' - Juan 4195 1 77.40 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCC:1 - chr3L 1692005 3' - blood 35 2 56.72 ATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTGGAAGTTCTTAGACTTTTTGTTGGATATAATAAGTAGATAAGATTAAATAGTAGATAAAATTTCGTTTCTATTAAAAAGTATAATAAGTTTAAGCAAGCTGTTACCACTTACA:1 + chr3L 26014987 3' + 1360 202 1 65.75 ATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATT:2 - chr3L 16973391 3' + S-element 107 2 72.60 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTTTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATTCATGTGAAAGTATATTATACGAATGTTGAGCCACAAGTTGGGAGTTTCG:1 + chr2L 12818340 3' - hobo 52 1 51.03 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCTATT:1 - chrX 5323221 3' - Juan 4096 1 51.37 AGTAATATTCCACAGAGTACTAGAACGTTTGTTCGTAAACAATTGAAAATACTCACAAGCAATACATTGGACAATTCAATTTGCCGCAAACTCTGGAGGATTCCGTCTCTCGTTCTCAGGAGTCTCATTAGCAACACAATTATGTG:1 - chr2R 10172644 3' - transib4 399 1 54.11 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAATTCATAAATCGTTTGATAAGCACATTTAATTATAATTTAATATCAATCCCA:2 + chr3L 24131491 3' + Transpac 243 2 63.70 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTTGCTCGTTTTTGCGATTACTATCGCCGGACATTTTTACTCGTTTTTTTTTCTC:1 + chr3R 26774146 3' - hobo 28 1 66.44 TTTTTGGCTGCTCATGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGATCAAATTTCGCCGACACGTACACGAACCATTTTTGGAAGTCCAGCATTCTTATCCTTGACCTTCCAGCTTGACAAAG:1 - chr2L 88820 3' - Cr1a 483 1 61.72 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTGATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAGCTCT:1 - chr3R 14980271 3' + roo 385 2 69.18 TCTTTATACTTATGCCGTTTAATGCAATTGATATTAATTTAACGTGTACTTTAGCTTGCCCTTTTTTCTGTGTGT:1 + chr3R 12930430 3' - jockey 312 1 52.00 AGTTCACACTGGCTTTAGTATAGCTTTGCATAAACGGACTTTATTTAAAGGGCAAATGGCCCAAATGCGTTATTTTTTTACCTA:1 - chr2L 21932816 3' - G4 3413 1 50.00 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATAT:1 - chr3R 27986367 3' + roo 8989 2 73.97 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAACATGATGACCAGATATAACTG:1 + chr2R 10809220 3' - mdg1 7066 10 82.46 TGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAAAGCTGGTGAAAACAAAGGAACAAAGGAACACTGGACTGGAAGAAGGGGGCCCTCTGCGTATTTGCATTTGCCG:1 - chr3L 12798554 3' + 412 498 1 78.79 TAACTTTTGTGAGAAATTGTCAGAAAATAAGTTATAATCCACGAAACACAGCCAAACATTTTCATCCCACGAAACGAGTGGAAAATATCATTCTGGGTAAATCAAAGCCGATTTGCAGTTGATCGGTGAGAGCGGGGCAATTGCA:1 - chr3L 10730952 3' - transib2 426 1 77.24 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGG:1 + chr3L 7889662 3' + roo 350 2 57.53 CTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTCTTTATGATGAAACGTGCAATAACTAGATTATCTTTGGTTTCCAATTAATTTTTCCCATTTTTTT:1 + chr2L 4125177 3' - transib2 2707 1 55.71 AGAAATAGAGAGAAAAAACAGGGTGTCGGCTATTGCTATACCCTGGAAAACATAATTGGTATTTCACATGGCGTGTATTTTCATTATTGATTTGAAAAGAGCCCCGATCTAATGAGCTGCTAGTCCTGGTATTTGGTATTCGGTAT:1 + chr2R 13272429 3' + transib2 2429 1 60.96 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAAGCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAGCCGG:1 - chrX 18336540 3' + mdg3 232 2 73.38 AAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCT:1 - chr3R 19992636 3' - hopper 59 1 57.14 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAG:1 + chrX 11661504 3' - pogo 49 1 55.56 AGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAAGCACTACTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACAAAAAACACAAATAAAAACAAACCAAATCTATACCCAAAAATGTTAAAAATAAGAAAATCAACACCAAGAAGGA:1 + chr2R 1845409 3' + Doc3-element 113 1 56.55 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTTGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTT:1 + chr2R 9871579 3' - roo 48 2 53.42 CAAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGTCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTCGATGCGATTGCGGTATTTTTCCCACCTTAACCACGCTGAACAGCAGAATCACATGGATGAGCATCAAA:1 - chr3L 2244764 3' - 1360 3157 1 52.74 CTGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGATTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTTTCTTCGGCCGCACGC:2 + chr3R 3586587 3' - INE-1 174 1 55.48 GAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGT:1 - chrX 21087609 3' - mdg3 71 2 71.92 ATAATTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTGCCTCTACTTTCGGTAAGCTATAATTATGGGTAATCAAAGTGTTTTATTTGATGCTCTAACTTAAGATGTAAGCGAAAAGCAGCTCTTTGCTGCTT:1 - chr3R 11403054 3' + Tc3 86 3 60.48 ACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTTTGA:1 - chr2R 4193268 3' - 1360 6 2 73.29 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAAT:1 - chrX 19074742 3' - mdg1 20 2 63.28 AACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCG:1 + chrX 20383271 3' + 3S18 174 2 76.38 GGCTATTGATCCAGATCTAGAATATATGTATATATCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCAT:1 + chrX 19192433 3' - INE-1 87 1 78.08 ATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGC:1 - chr3L 17567840 3' + S-element 167 2 63.64 AAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTCACAGTGCACACAGCAGCGCCGAACCCAA:1 + chr3R 12728114 3' + Juan 4203 1 71.13 GGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCCGAGCTGGGCTAAATAAAGATGAGCTGCATAAATTAAAGACAAGACAAGGCGCTTG:1 - chr3R 15804902 3' + F-element 4287 1 61.64 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGT:1 + chr3L 12004355 3' - P-element 25 1 62.70 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACGCGAACTTAGAA:1 + chr2L 6654731 3' + diver 146 2 69.86 ATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTTGTAAA:2 - chr3R 904894 3' - rover 6954 2 71.23 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGATTTTGGCCCCAATCAATAATTGTCGTCCAATAAAATATTTATTCTGTATGTATAATTTGGTGTATCTTATCTGGGAGCCACGTGCTGCCGCGATGTCGCGTCAAATT:1 - chr3L 2544564 3' - Tirant 8118 2 78.08 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCGCAC:1 + chr3L 1692113 3' + blood 7322 1 64.14 AGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTAC:1 + chrX 18336670 3' - mdg3 5324 2 63.70 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTGGAAGTTGTATTTAGTTTTCCTAAATGTGATCCCTGGGTTCAGTGGGTTAGCATTTGTTTTTTGGTGTTCGTTATGTGGTGAT:1 + chr2L 1419283 3' - F-element 46 1 56.85 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTG:1 - chr3R 17996169 3' - diver 5952 2 60.96 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAAAAAAAA:2 - chrX 2479451 3' + mdg3 222 2 62.33 ATGCACACACACACACACACACACACACACACGCACGCAGGCAGACCGACACGTT:1 + chrX 18341435 3' + accord 181 2 83.64 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCATTATTGTTTAACGTTATTATTACGTTGCATACTTTT:1 - chr2L 18212067 3' - Quasimodo 12 2 76.71 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATA:1 + chr3R 16342040 3' - P-element 49 1 48.20 TAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGTATCCTAGAAATTTAGAATTTAAAGAATAGCGCTTAGATCTCCAATTGATTCTTCTTCTTTTGCTCCTCTAGAATATAGCAACG:1 - chr3L 4832166 3' - Cr1a 100 1 62.33 GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAA:1 + chr2L 17005796 3' - Stalker2 7318 2 64.38 AAGAATATATATACATACATATATAGGATGACTGTATGTATGAATACATAAATCGGCAAACAAATCGCAATGTCGTTTGCAGTCTCAGAATTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTT:1 + chrX 11541589 3' - 1731 4413 1 43.48 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTG:1 + chr3R 28385611 3' - transib2 78 1 69.86 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAATAAATT:2 - chr3L 18768448 3' + S-element 1634 2 74.66 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCTATCAGTGTTTCTCCGATTGTTGTTGTTCTCTTGCGGTGTGCAAGACAACAACAA:1 + chr3R 5216217 3' - FB 67 1 63.70 GTTAATAAATAAAATAAATAAAGTTAAAGTTAAAAGTTAAAGTTAAATAAAGTTAATATATAAATATGCTATTCCAATATTAAATATATAACATATAAAATATTTTTGAATTTATTATTTCTCATATCCTAATTTAAATGACACTT:3 - chrX 16189255 3' + X-element 4713 1 60.27 TTCATTCTTACATAGGTTCTTATTATCTAATTGTATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCATTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTGTATTCTTAAATCATCGATGGGCTTCTTTTTGGGCACCAGCAAACTGTTTCTGCCCCG:1 - chr3L 17053007 3' - rooA 273 2 67.81 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGGCAATACACACATATATGTACATATATGTGAAGAGAGGACTCTCCACCTCAAT:1 - chr2L 15188357 3' + 297 374 2 61.90 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAATTTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTTCGG:1 + chr3R 26178490 3' - 412 7 2 66.67 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCCGAAATTTTCATTTCTCTGTAAAACGAAATG:1 + chr3R 30675486 3' - 297 6606 2 65.07 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTT:1 - chr2R 3338781 3' - Juan 57 1 55.48 GCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGA:1 - chr3R 26504239 3' - HMS-Beagle 64 2 74.19 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCA:1 - chr2L 47097 3' - roo 8731 2 65.07 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAA:1 - chr3R 27986365 3' + roo 327 2 72.60 AATAATAATCATAATAATAATAATAATCATAATCTTTAAAATATCTTTTGTTTTATCCATCCTGGTGAACGGTTGTCATAACACATAGAAAACAACAAGAAATACT:1 + chr4 83094 3' + mdg1 7069 11 66.04 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAATTTTATTTT:2 + chr2R 1916454 3' - Juan 57 1 53.42 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTTGCT:1 + chr3R 26774097 3' - hobo 77 1 69.18 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTT:2 + chr3R 21276661 3' + BS 5070 1 59.59 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGTCGATTTTATACCTTCGATAAGCCAATGAAGTGTGAGAAAATATGTATCTATTTCGTCATTTGTTTGT:2 + chr3R 11766194 3' + roo 9067 1 52.74 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTATTAAAACCTATTTGGTTTCAATCGATGCAAATAATTATTT:2 + chr3R 20167725 3' - roo 8677 2 75.86 AAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAA:1 + chr2L 22684611 3' - transib3 60 1 50.68 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCACACCAGCGACAAATAGGCACATTTGTT:1 - chr3R 28042912 3' + Stalker2 367 2 60.96 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACATTTAAAGCTGTCATCGACAGCAATCGTCAATTGGTCAACATATAGTCAAATTATTGGC:1 - chr3L 18642860 3' - jockey 4777 1 60.27 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAATAATAATCAAC:4 + chrX 11661535 3' - pogo 20 1 71.92 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTGTTCATTTAAAATTTTCTCGTTTATTTTTGAATATCTGAGTT:1 + chrX 17343466 3' + I-element 5285 1 68.49 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCA:1 + chr2L 14523279 3' - HMS-Beagle2 25 2 37.67 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAAT:1 - chr3R 4682899 3' - Burdock 6210 2 70.55 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCG:2 - chrX 8308420 3' - roo 84 2 76.03 TAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGGTAGTCTTAAGTAACCAATTTTCCAAATTTGCGGTCAATGCTCG:1 + chr2R 8092764 3' + jockey 4822 1 77.60 AAAGACACTAGAATAAAAAGATGGTTAACAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCGTACTAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATAC:1 + chr2R 5424285 3' + 1360 2 2 70.92 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGG:1 - chr3R 25709770 3' + hopper 1353 1 60.27 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGT:1 + chr3R 11469396 3' + Tabor 415 2 63.70 AATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAG:1 - chr3L 17567864 3' - S-element 1540 1 60.91 ATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAAGAGATTTTAACTTTTTTTAATCCATAATTAGATCCTACTAACAATAATATTTATTAGAGTTTTTATGTTGATGGTTAATTTAGGTTTGCATAAATTAAGTTT:1 - chr3R 5017915 3' + Cr1a 4221 1 74.66 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTACACGATAATTCAA:2 - chr3R 19073125 3' - roo 8667 2 78.08 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAATTTGTATCCAGT:1 - chr3R 19032568 3' - roo 32 2 62.33 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGTTCTGCAACC:1 + chrX 7795661 3' + roo 398 1 77.78 GCGCGTTCTCACTCCCGAACTCCTTCCGTTAACGCTCCGACGCACTATCTTCTTCCACGCGCGATCTGGCTGCCTGCCTGATTCGGCTCACAATTTTAACACGTACCTGAGAATATAACGATAAACCAAAGCTATGTCCGTCCCTT:1 + chr3L 24723851 3' - gypsy8 438 1 54.79 ATCAGTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCAAAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGTAAATTGCAGCTGCCAAGCAAACACATGCAAAAGCCGCATCCGCCACTTTCG:1 + chr2L 10787186 3' + Doc2-element 4450 1 58.87 ATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 5410954 3' + Tc1 1367 1 50.00 TTATCATATTGCTACGAAATCGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGATGCACAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTATGCAAA:1 + chr3L 27266089 3' + 1360 3112 1 63.12 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTA:1 + chr3L 18505773 3' - I-element 30 1 65.07 GTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTTGGAGCGCGACTCTTCGCATTCTAGGAATTCCTTCTGTGATTTCACATTCTGATGAAATTGTAATATTGCTTGGTTGTTAACGTGTACATGGAAATATTAAGGAAAAGGTGAGAAGGAATA:1 + chr3L 23595126 3' + invader4 2738 1 65.07 TAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACTAGAAGTGGCCAAACACAGATTTCTTTCATTTTCCAATTGGCAAATTTAACGCACTCCAGGTAACTTTTCTGAACAAATTGTAATATCGTTAGAATTCTCACAATACTCATAATCAT:3 - chrX 20145321 3' - 1360 1 3 71.23 GATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTATTATGTTGTAACAGAGCTTTTGACAATCATTGATTGACCAGCAGCATATTTTATTGAAAGACAATCGAGGGAGTGTCAATGAAAAAAA:1 - chr3R 6565105 3' - Cr1a 4217 1 50.71 TCTAACAAAAATTCGAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTTT:1 - chr3R 4805629 3' - 1360 87 1 63.70 TTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAAACATTAAAT:2 - chrX 6116198 3' - transib2 14 1 73.29 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGCTCA:1 + chr2R 12645504 3' - X-element 52 1 49.19 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCCAAAATGCCAGAGTTCGA:1 + chr3L 1692165 3' + blood 367 2 77.14 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGCTTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGA:1 + chrX 8360616 3' + roo 336 2 66.90 AAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTAT:1 + chr2R 4659357 3' - S-element 1498 1 52.05 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCT:1 - chrX 19038369 3' + hopper 1353 1 61.64 GAAAAGCAAATTTCAAAGGCATTTCCCAGACATTCGCCAGACATTGTTGTTCACCACGCCTCCTCCTTCGTTTTCCCTGAGTCCTGCACAGCTGCGCCT:1 + chr3R 30355065 3' + Transib5 212 1 58.59 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAAT:1 + chr3R 18488497 3' + roo 9047 1 64.29 AGACGCTCTGTGCGATGCATCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGTAAAAAAAGCAACGCGACGAACAAATTGTTTTGCAGGCATTTGGCATGCCAAAAAGGACGAACAAGGATAACAGGCCA:1 - chr3R 22228208 3' + Doc2-element 119 1 55.80 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGAGATTTGACTTTGAT:1 - chr2R 14457763 3' + pogo 2084 1 59.59 AACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGATCGCAGAAACGAATTTACATTGTACATATTGGGATAGTTTTTGCCGATTTCGTAGCAATATGATATTTATAATAAAATAATTTTTAAA:1 + chr4 1248514 3' - 1360 3231 1 73.73 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACT:3 - chr3L 15913830 3' - jockey 4802 1 56.16 GAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTT:1 - chr3R 27843169 3' - I-element 5329 1 60.80 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGAC:1 - chr3L 23146447 3' - 1360 37 1 60.27 GGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTTAGCTACTACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCCTTGCAACAACGGTGCATATTTTAATCTATCATAATTGAGTTGAAAAAAATTCAAAGGTTTTTAAAAGTTTTGCAAAACT:1 - chrX 20844878 3' + Chouto 482 1 56.85 ATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTATATATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAATCTTCACTTTTAAAAA:1 + chr3R 15054202 3' - copia 5045 2 72.03 GATCCTGATCAAGAATATATACTTTATATATTCGAAAACGCCTGTTACATACCTTTCAGGATTTTTAAATCGATTTGGTTTTTTTTTTATAATTTGATCGTTTTGTGTCGTTTTATAGTGTGTGATAATATTTGATTGTTGTGTGA:1 + chr2R 13900559 3' - INE-1 80 1 62.33 TTCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTTCATACTGCTTTGTGACGCCTCC:1 - chrX 21224526 3' - roo 45 2 50.70 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACTGTAATTTTTGATTTTAAAATAATTTGACCGTTTATTGTGTGTGAGTTTGTTTGTCTGTATTTGTTTTTGTTTTATTTTTCAATTTATCGCATTCAAATATAAATTTCATAATC:1 - chr2R 16624527 3' + 1360 3385 2 53.42 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGTTTTCATG:1 + chr2R 21116627 3' - mdg1 7 2 30.14 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATATGAAAAGAAACAAATAGGCAACTTGAGGCAACTTTCAAGAGTCACACGTACCACCCGCAA:1 + chr2L 18212271 3' + Quasimodo 7362 2 81.12 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAACTGAAGACTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCACACTGTGGGGAAATTAATTTCTGTTTCCCAAGAGATTTTAAGTC:1 - chr2R 6885482 3' + P-element 2849 1 60.96 AGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATATATAATAATAATATATATAATATATACAGTTAAAAGCCATCAAAACACCCCTTACATTTGCATATCCTTATGCCCTTATATAATCGAATC:1 + chr3L 21969895 3' - opus 137 4 45.21 CAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATG:1 + chr3L 19350039 3' - 1360 3229 1 50.69 CACACACACACATATCCTCACATCACACACACTCGCTCACAGTGACAGGCTCACTTACCCACACACCCACACACACACACACACACAAAGTCGCACACCCGCACATCATATATTACCAGCTTGGTGGGAAGAAGGAGC:1 + chrX 20109018 3' + accord 190 2 57.25 ATCGCAATTTTTAGGCTGTTCATAAGAATAGCAGTGCCTGGTTTGAAATGATCATTATTTTCTAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGGTAATTCATATATTTAAAAGAGCAATAAATAAAAAAATCTATTTTAGTGGGTAGAGGACAGC:1 + chr2L 21252401 3' + HB 193 1 68.28 CGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGC:1 - chr3L 24934318 3' - HMS-Beagle2 82 2 76.03 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATC:1 + chr2R 14051839 3' - roo 8737 2 76.03 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCAT:1 - chrX 19074717 3' - mdg1 7051 2 72.60 AAAATAAGAATTTTTCGCATGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGATCTTCAAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCACATTTAAAATGCACGAGCATCCGTGTGCACACATACAGTTGTGTGCTATCACTGTATGCGTAGAA:1 - chrX 3464219 3' - 1360 281 1 86.99 CGTCACTAAAAAAGTGGCTGCACAGTGCTAAACCAATGTATGGCCGTTACGAATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTTAACCCAACCATGCTTTGTCTTACTGGACCTCAGCTACCTGTGTCGATTCGGATCTTGCTCCTTGTTAA:1 + chr3L 23317431 3' + 1360 3335 1 65.75 ATAATAATATTAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAA:1 - chr2R 5501139 3' - Tc3 271 1 65.75 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGT:1 + chrX 661959 3' - 412 8 2 69.15 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAGTCTAGTGTCTTTGGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCATG:1 - chr2R 3919665 3' - 1360 77 1 69.18 TAATTTCTAGTGAATCTGCTTGGCACAGAGAAGTTTAGCCGACTAATTAAGTCTTTCAACTTCACAACGAATAAGCTTACACACAAAGACTGTTCCAAGAAAAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATGAATTAAAAGTAGTC:1 - chr2L 18927265 3' - Cr1a 4113 1 78.77 AAATTGTATTTTCTGCCTTTCAATGCAAAATTATAGGGCTTTTTGTTATCTATTATGCATTTTTTTATTTATAAAAAGAATAACAAAACTATTAGCAATGAACGATAAAAACAACTGAATCCAAGTTTATATTTTATATATTTTTA:1 - chr3R 4080221 3' + S2 35 1 62.33 ATTTGTAGTTAGTTCGTAATAGACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAGAACCATTTAATAATGCAAACGTATTTGGTTAAGTGTCGTAATAACGTAAAATCCGTAATCTTCGCATGCGTAAGCTGCTGAAATTGTCCAA:2 - chr3R 11493924 3' + gypsy10 275 2 78.08 TTATGAAGGTGTGTGTGTGTGTGAGGTAAGGAGTATGTAAAACAAAAACGATGGATTTAAAATTTTATGAAACATAACTTAAATGCCAGTTTCACAATGATAGCATTTTGAAAAGAGAAAGATATGAATATATAGAGAGGCAGAGA:1 - chr3R 24684582 3' - Quasimodo 39 2 67.12 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTC:1 - chr3L 18281855 3' - Doc 63 1 61.64 TTATTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGCAGGAGTTAATGTCGTTATTTGAGTTCCTTGGCTCATAAATCAGTTTGTTGCCTTTTTAATCCGTTTTAATTGCTGTTCGTTGCTCGTTG:1 + chr2L 5512896 3' - Quasimodo 39 2 65.55 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTA:1 - chr3L 14366550 3' + roo 327 2 76.03 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCTGCGTTGGCTGTCGATGAAGGCAAATC:1 - chr2L 5582095 3' + pogo 2077 1 59.48 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGA:1 + chrX 8360616 3' + roo 335 2 68.49 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTC:1 - chr2R 19199686 3' - hopper 83 1 73.97 GTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGCCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTATGTACGTATTATGTGTGTGCCCTTATTCAGGGACAATATACCATGCGTTTAGCCCAATCGAAAACCCT:1 + chr2L 13025676 3' - accord 7096 2 56.16 AAATAAGTTAAATTTTTGACTTTAAAGGTAAAAATAAGTTAAATTTTTGACTTTAAAGGTAAAAATTAAGGGTTCTTTGATTCATTAAACGCAATTTTTTTATTCAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTAAAAATCAAAAA:1 - chr3L 13558133 3' - S-element 1684 2 77.40 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAG:1 + chrX 21224634 3' + roo 389 2 57.58 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGAACACAAATTA:1 + chr2L 16690725 3' + P-element 2843 1 49.24 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAG:1 - chr3L 10731747 3' + 297 357 2 58.22 ATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCATTATTGTT:1 - chr2L 18212095 3' - Quasimodo 37 2 58.74 ATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTAGATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAAAGCTCCGATACTCTTACATTAAGGCGGGCATAAGCAATATGTAAG:2 + chr3R 15139364 3' - Burdock 148 2 76.71 ATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGGGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAA:1 + chrX 14722176 3' - diver 93 2 76.71 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTG:1 + chr3L 5389950 3' - roo 8727 2 70.68 AAATTTGTCGCATTCAGGCTGCCCAAACCAACTGCCAGGGATTAGAATAATATCTTGCATATGATACAAGTGTATGTACCATGCGAAATTAATGTTAATTATTATTAGTATGCATACAAATTATAAAACATTACTTGCATTAGATG:1 + chr3R 25166264 3' + BS3 1347 1 58.90 GGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTTTTTGTGCAGGCATTTTTCGCTTTGAATGCTTTT:1 + chr3L 13249003 3' - Doc 4484 1 58.75 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTACTCGGATTTGGCAAACTGTTGT:1 - chr3R 15072568 3' - pogo 38 1 59.65 ATACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGTAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTGGCTATTTTCGCATATTCAAAATCCTTGAAATAACCCATAA:1 + chrX 13947357 3' + Rt1b 5150 4 49.66 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGGAGTTGGAGTCAAATGTAATTTCTAGTACC:2 - chr3L 18281810 3' - Doc 17 1 73.79 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGTATGTACATGTGTTGGACGTGGGAAATATGCGGTTTAAATGACAAACTAAATAAAAT:2 - chr3R 25428103 3' - 297 9 2 76.03 AATAACAGGCCAAATGCCCCATAGTTCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCAAGGCATAGTCACGAGCGGGGAATAGTGCACTACAGTG:1 + chr3R 25709868 3' + hopper 1410 2 57.95 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGGTTCCGACCGTAATAACGTCTTGGCCGCCC:1 - chr2L 8338082 3' - P-element 31 1 62.07 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTA:1 + chr2L 47159 3' + roo 340 2 76.67 ATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTAAAAGTTGAAGGTGCAAAGGTTGAATGAAAGTCTACCAAATGAGAATGCTACCTGCAAAATGTGGCAATAGTTTGTTTGAGTGCAATTCAGCCTGTGCTCTTCGTCCTTCAGCC:2 - chrX 4515811 3' - Quasimodo 39 2 60.27 ATATAATATAAATATATTCAAAACAAATAGTTTTGTTACTTTGTAGCAGTTTGTTTTTCTTAATTTAAATAACAATTTTCATTTAAAGGTTTTTCTCTTTATTTTGTATTCCAATTATGTAATGAAAATTCCCACTGATATGATTT:1 - chr3R 13438224 3' - gypsy7 5062 1 59.59 AATTGAATACAAAATAAAAGAAGTAGTAAAAGACAATTAAAATCGGTAAAATCATTTACATATCAAGATGATGATATATAGAGAGACTACAATTTACATCAGGATGGAAATATTAAAAAAAAGCACAAATGGGTCAAGAATTACTA:1 - chrX 17038483 3' - gypsy2 183 2 62.33 AAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAAAAAGCACTGTGGAAAATGCGCAGGGGGAATATGTGGAAAAAGGGGGAAAAGGCAAGCAGTAACACTCTGGGAAATATTG:1 + chrX 17296713 3' + I-element 473 1 57.93 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCAC:2 + chr2L 4063911 3' - roo 86 2 77.40 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTATACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAA:1 - chr3L 10731745 3' + 297 359 2 58.22 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGG:1 + chrX 8360628 3' + roo 347 2 60.27 CTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTG:1 - chr3R 14860121 3' + BS 5051 1 51.37 TTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTACTACGAAGTTAACTACAAAAGCGGTCTGTGGGAAAGTGAACTTGG:1 + chr3L 7480881 3' - P-element 292 1 29.45 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAGGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATC:1 - chr3L 16690901 3' + I-element 5296 1 59.59 AAGCTGACGTTTTTAACTTTTGTCTGAAATCGTCATAAAATGAGTTATAATCCCCGAAACACAGGGGGACATGTTAGAAATTTCTGTTAAAATACACATAACAGGCGCAGGCACAGCACACACAATGGGCATTAACTAATTTAGTG:1 + chr3R 27276919 3' - transib2 439 1 69.18 TACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGAAAAACTTCTGGCACAAACAGTCAACAGTCAACTGGTAATACGGGTGGCACTAGTCCGACCTTGAAAAAAAAGGGCG:1 - chr2L 15811709 3' - Quasimodo 7200 2 56.16 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGGGCCATGCTGATTATTTAA:1 - chr2L 6654640 3' - diver 53 2 52.05 TGGAAAGTTCATTTCCTAAAAAAAATTATATATTTCTGGGGCTCTGGTTCCGTCTTGAGAGATTCTCTTT:1 - chr2L 18114205 3' + Tc1 36 1 52.86 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGGTTAGCATACATAATAATAATAAAATACAAGC:1 + chr3R 7943831 3' + blood 7330 1 59.59 TACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATTGGGGGAGCATGTTTTTTCGCTATTCGCTTTGTTGTGCAAATTCTGCTGCTTCTCA:1 + chr3R 20782723 3' - Quasimodo 104 2 58.22 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGGCTGATGCGG:1 + chr3R 31653179 3' + roo 397 1 72.73 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTTATCGGTTTGTAGGGACAG:1 + chr3R 30347450 3' + P-element 2857 1 60.27 GTATGTATGTATTATGTATGTATTTCGCTGGACAGAAAATTCCTCTAGATTATTGCTTATTGTTATTTGCTTAGCCCTCCTTTGTTTTCATTTATTGCTGATGCTTCTGGTGTTTTTATGCGATTTCGTTCGCTGATGCCAATAAA:1 - chrX 2557886 3' + Dm88 4369 2 71.92 TACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAA:2 - chr3L 22861718 3' + S-element 1706 1 73.29 CTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAAAAAAAATATTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGGCAATGGCAACAGTATTGATATTTGCAT:1 + chr2L 13585787 3' + Quasimodo 7286 2 72.60 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTGCTTGGA:1 - chrX 2214220 3' - jockey 4789 1 65.07 TTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATATACACTAGATCATGAACGGGGGTGGGTGGTGGTGCGGATGG:1 + chrX 1264033 3' - Burdock 6208 2 74.66 TGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGCGCGGCCTGAGTAAAATCCAATGCCGCAAATA:1 + chr2L 14914620 3' - I-element 5036 1 57.14 TAATTCATCTGTTCATCCTCACACATTGACAATAATTAGGAACACGCATAACAGAAGAATGAACATGGAGACTGTCATTTGTCATTTACCTGTCGGTCTTCTGCTTCTCGCTCTCCAGATCGCGGAATGTCTGCTGCAGCTTGTCG:1 - chr3R 31154141 3' - micropia 184 2 51.37 CTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTCCATAATG:1 + chr3L 21769162 3' + I-element 5345 1 71.92 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTC:1 + chr3R 15364044 3' + flea 4980 2 63.01 AAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGTGGAACCAGTGATGAGGTGCCGGTGGCCTCCGTGCACGGAAGCCAA:1 - chrX 23090203 3' - FB 769 3 68.49 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTTCGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTAATTATATTTTCACGCCCGTGAGCAAATAAGCAAATTCCACA:1 - chr3R 9002866 3' + roo 393 1 74.66 TTCATAACGACCTTTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATGAAAGTGAGTCATTTAAATTTAAGGAAAATAAAGATCTCATTTTTGCACAGCTTTTTGAAATATGCTGTATGTAAGTGAACTTCG:1 - chr2R 13658652 3' + gypsy7 437 1 50.68 TGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAACCTGAACTTAGGGTGCGATCTGGACTTCCTAATTAACAAAAACAATGCACATGTGTGATGTATGTATGGGTGATG:1 - chr2R 20091988 3' - pogo 305 1 54.79 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCT:1 - chr2R 10078136 3' - jockey 84 1 54.48 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCAAGGTGTTCGAC:1 + chr3R 24450537 3' + 412 7501 2 52.74 AGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATA:1 - chr2R 18316061 3' - HMS-Beagle2 70 2 74.40 ATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGA:4 - chr2R 5410969 3' + Tc1 1348 1 61.64 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGCCATTATTATTTGCAGTTGAGTTTATGGCCGAAGGGCCGACACGTCGAAGGTGGCGCATTAATAAGTAAACCGGTGCCGCCGCTTTAGTG:1 + chr3R 22288107 3' + transib2 2809 1 73.29 AGAGAGTAAAGATTACAGATAAAATCTATGTATATGTATTTATTAT:1 + chr3R 24088059 3' - Cr1a 4227 1 67.39 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATATATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGTATTAACGCCCTACCCGTGTAAGTATTTATAAAAACCATAATTAA:2 + chr2L 21328300 3' - 297 6599 2 73.79 AAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTATTGTCTAAATACTTATGCCCACTAGTGTACTATCAAAATGGATTGTTACTTCGTTTGAGATTCAGATATGGTTTGCATCCA:1 + chr4 347759 3' + Tc1-2 1553 1 63.70 CTTAAATGTCTAATGAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGAAAGGAAA:1 + chr2L 22224591 3' + Rt1c 5412 1 52.10 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCTTCGTTTTCGGCTTGGCC:1 + chr2L 12984257 3' - hopper 24 1 68.49 AACAGGTATAGATGTAATAGATTAAATAAATTGTAAAAACAAATTTACGAATAAAGATCCAGGGCAGGTGGAATATAGATAGTATACAGTCAGTCCTTTAATCAAGCAAGTATTTCTTAATTTTCAATATATGCTTATTATGCAAA:1 + chrX 16874125 3' - Stalker4 389 1 76.03 AGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTC:2 + chr3L 18126012 3' - Ivk 43 1 49.32 ATCAGATACCCGTTACTCAGTTAATGCGAATGCGAACGAAAAAATTTAAAAATTGCTCTCTGTGCTCAAGTTCTATTTGCGTTTGCTCAGAAACTCAAAATCCAACGACGGCAACGCGGC:1 + chrX 276191 3' - INE-1 545 1 55.00 AGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATATCTACATTCCGTTGGTATTTGATTTGACTTATAATTAAGTTTTATATCTTCAATGTATTCGGTAAAGTGTTGTAAATTAAATATTAAAAGT:1 - chr3R 9294375 3' + Dm88 4201 1 75.00 ACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGA:1 + chr3R 26504293 3' + HMS-Beagle 6958 2 75.34 AGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTACATTCGTCGTATTTTCGTACTGTACTTTAATGTTGAAATCCGAATATAAATTTAGTGACCAAGTACACTAACTTACCAATATTTGTTCACTGT:1 + chr2R 21926517 3' - opus 20 2 52.05 GTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATTGTTTTTATTTCGACAAGTCAATTGGGGGCCAATGGGGAATATTTATGTATGCAATTAAATGCAATTCATTTTCAATGACTGAATTATGGTTGGTTAATAGTTGAG:1 + chr3L 14261273 3' - roo 8598 1 75.34 CCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCA:1 - chr3R 9038936 3' - Juan 4079 1 64.38 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATATTTTATTCACACATATGTATATAT:1 + chr2R 9871607 3' - roo 8683 2 73.10 AAATTCAGATTGAATTTATTATTGAATCTTGAAATTAAATATATTTATGAACTTCCTTATACATATCTGAATGCTAAATCTCAGATTCAATTGATCTTCCTAACTGCGGTAGTGCATTTATCCTTGTACCCAAGTGAAAGCATTTC:1 + chrX 14682789 3' + transib3 2657 1 48.63 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAATTACACCAC:1 + chr3R 27406091 3' + diver 220 1 73.91 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACAT:1 - chr3L 7889539 3' - roo 42 2 55.48 TATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACATAAAAGCAAAGGTGCC:1 - chr3L 18125856 3' + Ivk 5371 1 74.48 ATGTAACAGGAAGAAGGAAGCGGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAAGCCTAGTCGATGTAACCCTGTCCTCGCCTACTCTTCGCAGATCATAGATAATGATGTCACCGCTTTAAATACAACTTTTCAATCAATTTA:1 + chr2R 5421962 3' + INE-1 30 1 57.53 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAACAAAGTCCGAAAAAATGTTTCATAAGACTGATTTAAGGAAGTGAA:1 + chr2R 3564183 3' + Tabor 7303 2 70.55 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTGGCATTAAATGTC:2 - chrX 585647 3' + Tirant 322 2 69.86 ATAGTTCCTGAGACCTCGACGTTCATACGAATGGACAGACGGACAGGGCCATATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTAACATGGGCAGAAATGTTTTTGTGGGATCTTTACATTTAAATATTATCCGGAA:1 - chr2L 18812231 3' - INE-1 143 1 73.29 TATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCA:1 + chr3R 23067499 3' + roo 8687 2 68.49 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGG:1 - chr2L 14874155 3' + copia 238 1 50.00 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGC:1 - chr2R 19199655 3' - hopper 51 1 54.11 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAGTAAAGCG:1 - chrX 10319589 3' - mdg1 7071 2 58.52 AGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGACGCCGCTGCTTAAGCCTATTGTGTGTATTTTGTTTTTATTTCATTACTTTATTTTTTTAGTTTGTGTAATGACTTTGAATTTTTTTGCTTTG:1 + chrX 8550982 3' - 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chr2L 10156098 3' + hopper 1384 1 55.91 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAATTATGGCAAACAAC:1 + chr3L 6447152 3' + transib2 2791 1 63.01 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCG:1 - chr3L 6518556 3' - 412 62 2 59.59 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGC:1 - chr3L 11913206 3' - BS 5072 1 70.55 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATAT:1 - chr2R 21681325 3' + roo 8989 2 74.66 AATAATAATAATTTTAATGATAAGAAACGAGTATACTTTCTTTCCACGAGTGCAATTGTATTCCACGTTCCTAAACGTCTTATCAAGACAGTCGAGTCGCTATA:1 - chr3R 29309989 3' + mdg1 7078 2 84.62 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTGCGTAAGCCATACATTCAA:1 - chr2L 17809125 3' + jockey 4985 1 77.24 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTG:1 + chr2L 71274 3' - 412 7109 2 55.56 TTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATT:1 + chr3L 24208204 3' - Quasimodo 65 2 67.12 AGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGCGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGGGGTGGGCATGAGTTTAATAATGAAAAAAATCACTAGATAACCATTT:1 + chr3R 9508835 3' - I-element 5131 1 78.20 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATC:1 - chr3R 15882613 3' - jockey 57 1 69.23 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTACTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCC:1 - chr3R 23618118 3' + hopper 1361 1 54.11 TAGACATTCCCGTTTCCCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGTTCTAACGAATCGAAAATGGGGCCGACATTTCCCTCTCCCTTACATCGTCGACATT:1 + chr2L 3241012 3' + rover 176 2 62.94 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCA:1 + chr2R 6847830 3' - Doc 76 1 69.01 TGGATTATTTTTTTATTATTTTGTTAATCAGTTTTTAATAGCTTCTTCTGCGCCTTTATCGACCATGGGAGCTTAAAGTCTACCTTAATTGATCCGTT:1 - chr3R 20613288 3' + Tc1 1394 2 53.06 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGGTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAAGGAAGTTGAGAAATA:1 + chr2R 5941431 3' - copia 29 2 55.26 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTA:1 - chr2R 14051736 3' + roo 9025 2 50.00 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGG:3 + chr2L 4003761 3' + mdg1 336 2 74.66 TTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTACCGTTATTTTCGCTTTTTCATGGGCCTCCCTCCGACTGCCTTTGTTACATTACTTTTTTTATGATATTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGAGATTTATTATTGTTTTCGTCA:1 - chr2L 2926100 3' - Bica 406 1 70.55 GATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTT:1 + chrX 20999619 3' - 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chr2L 18212101 3' - Quasimodo 40 2 55.71 ATGTATGTTCTTGATCAGGATCAATACCCGAGTTGTTCTGACCCTGTGCGTCCGTCTGTCCATCTGTCTGTCTGTCCGCTCGCATGAACGTCGACTCTTTGGCCGCCGGCTGAAAACGGTGGCACTTACAGTTGCACTTGCGGATT:1 - chr3R 18504825 3' + INE-1 80 1 65.07 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATT:3 - chr3L 15913853 3' - jockey 4825 1 63.70 TTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTTTTCATGAAGATTTTTCCACTTG:1 - chrX 14722105 3' + diver 6075 2 52.00 TATTTCATTTTTTATACACTCGAAATCTTAAAAGGTTAATCTTTTCAATCCGTCATCTTCATCCCTACAGTTTCTGGTCAAGACCTCAATATGACTTCCTTACCTCCTGTCCTCATCATTCATGCACAACCGCGTGAAGTTTTCAT:1 - chr3L 10224390 3' - Tc1-2 379 1 72.60 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAAACTGTTAGTTTGGCGGATAGTTATGCATATTCAACAGCAATATTTTGTGCTATTTCTGAATTAGAAGGCGTGCAAAGTAGTTTCCCTTCATATATCGAGCAGTCG:1 - chrX 5418529 3' - flea 4768 2 50.68 ATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCG:1 - 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mdg1 400 2 75.34 GGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGACTTAGACCGCCCTTTTTCTCATTATATTCTCCAATAT:1 + chr2R 4194405 3' + INE-1 97 1 78.08 AATTTCAAAAATGACTTTATAATAGAATATTTGCTGAATTTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCTATGATTGTTAGTGCTTGTGTCCGCACTGCGTGCCTCAACATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATATTT:1 + chr3L 21484244 3' + 1360 377 1 84.93 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCCCGTTGCTGTACCGTTCCCACTCGC:1 + chr2R 20349077 3' + transib2 2818 1 73.21 TTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAGGGTTTTTTTTTTCCCTTGTTTTCTTTATTAATTATTAATTTTTGT:1 + chr3R 22999090 3' + Juan 3994 1 67.06 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGTATAG:1 - chr3R 14980275 3' + roo 9044 1 66.44 ATATATACATACATATATTCCAGGACCCCTTCATGTCCCAAAATCGTTAAATGAACTAAATAATCGCATTATTCTCCGTGCAGGGTGACAATCCCCAAATAAAAGTGATTGTTCCCTTTAGTCTCAAAACAAAAAATGGAAGAAAA:1 + chr3L 8657101 3' - 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Porto1 4447 1 53.24 ATAAAAAAATAAATATAAATTAAATTTAAATTATCTCTGGCAAGACGAATATTAACAAAATAATAATATCAGAACGATATATATTAATGGGTCGTATTTAAGTAAAATGAATTTATGTTAATATAGACTATATTTAGGGCATTGCA:1 - chr3L 12731661 3' - S2 99 1 72.60 ATATATATATGTATATATATTATATATATTTACCAATGATTCTAATGAAAAGCAGAAGTCTTTGTTTCGTTAAATATTCATGGACTTTAAGGCAAAAGTTTGCTTTAGATAATTAGACCAGTTACAAATCTAAGGCACAAGATCCC:1 - chr3R 9838058 3' + 1731 4411 1 66.44 AAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAAACCAGCCATACGTCAAGAATTCTTGACGTATGGCTGGGTTCCTTTTTTTT:1 - chr3L 6047257 3' - Tc1 1340 1 47.37 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTA:1 + chr3R 15072665 3' + pogo 2042 1 60.27 TGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAA:1 - chr3L 23249398 3' - rover 7024 2 64.38 ATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTA:1 + chr2R 12645499 3' - X-element 78 1 60.00 CTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCCAGAAATTCGAGCTCAAAGCAAAGGATCTGTCCATTTTGAAGGGTGCACTTGCCCTACCCCTTCGGCAAAGAAATAAACTTGCTTATTG:1 - chrX 22798630 3' + 1360 3211 1 63.70 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTAGTTTTAATTAAACTTTT:1 + chr2L 71301 3' - 412 28 2 65.73 ATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAAGTAGGTAACATGCATATTACACACGCTCTCTCATTTAGCCTCACTCTCAATTTTTGCACATACGTATTAATTCGGCCCCAATGCCA:1 + chr2R 15730358 3' + G4 33 1 61.64 AAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGCTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAAAAAACAGCCGCAAACATTTTTTTAAAACGAATGATTAAAAAGGTTTCGCCAGCAAAGAAAAAACAAGCAAAACC:1 - chr2R 9350952 3' + invader2 317 1 53.96 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGATTT:1 + chr3L 23320170 3' + roo 394 1 69.75 GGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTAGCTTGTCGAACAAAACCAACCATAACAACAACAAAAAAAAAACGGCAAAAATCAAGAACACAAAGGAAAAAATCCCACACCGCCCC:1 - 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chr2R 8099135 3' - jockey 4787 1 57.26 CCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGTT:1 + chr3R 11040149 3' - Bari1 58 1 61.65 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACCGTATATAATT:1 + chr2L 11839770 3' + mdg1 7419 2 60.27 TTATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCG:1 + chrX 21947737 3' - mdg1 56 2 56.16 TTTTAACAATATTGGTATTTCGTGAGAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCA:1 - chrX 22901648 3' - 297 220 2 69.86 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGAT:1 + chr3L 6397724 3' + roo 402 1 56.90 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTA:2 - 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chr2L 21367185 3' - Doc 37 1 57.93 GGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAAT:1 + chr3R 15790123 3' - flea 4732 1 67.81 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTA:1 + chr2R 14051850 3' - roo 8726 2 68.49 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCAT:1 + chr3R 15072673 3' + pogo 2050 1 54.79 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGA:1 - chrX 4341281 3' + roo 327 2 73.10 TATGCCTACGTACTAAAACAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAATCAAGGGTTTTTGATTAATGCTTTTTCCGTTTTCATTTTGTCGCATATTTTTAAATGACTATTTTTAGCAAACGGCCT:1 + chr2L 1635267 3' - Rt1b 5040 1 50.68 TGTTATTGTTATTATTATTATTATTGTTGTCCACGCCGTCCCGAATCCTCGCGAGTCTTCTCCCCTCTTCT:1 + chr2R 8639911 3' - mdg1 7060 4 57.75 AAAGAAGAAGTGGAAAAAATAACTGTTTATTGGCTAAAAATAGAAGCATTGAACTGATCCTTGTCTGTTGTCAAAAGTATTTACACACAATTTTTACGCGTTCTCTGCTGCGATTCTCCTACTTTTATTTATTTCTTTTTTGTTTT:1 - chr3L 14465510 3' + Bari2 5 2 69.18 AGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAG:1 + chrX 22824256 3' + Gypsy12A_LTR 2236 1 51.37 AGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATA:1 - chr3L 23249412 3' - rover 87 2 73.97 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGTGGCTGCCATGTATAAA:1 + chr3L 18126032 3' - Ivk 23 1 63.01 AGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAAAACCACTTAAGGTTTTTTCG:1 - chr2L 7618425 3' + X-element 4687 1 62.33 CAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAGACCCAAACAAAAAAATTCAGGGCAACTAAACTAAAGGAAGACTCCAACGGAAAG:1 - chr2R 649668 3' + F-element 250 1 62.07 TATCACTGTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCAACGTCCTTGAGAAATTACTAATATGAAATTAACA:1 - chrX 5298667 3' - 1360 144 1 74.44 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTTTTAA:1 - chr3L 2145871 3' - roo 8706 2 52.74 GATAGCNACTCGGATTCGGATTACGATGATCCATTTTCTATGCATTTGGACGTAGAAAGTTTTGATTAATATAATGGTATAATTATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAA:1 + chr2R 21757921 3' + transib3 2545 1 62.33 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACA:1 + chr2R 8157292 3' - mdg1 7081 2 56.16 AATAGCTGAGTCGATCTAGCCATCTGATCCGCCTGTCCGTATAAACTTCGAGATCTCAGCATCTATAAAAGTTTTCCAGCTGAGACTCAGCATACAGATTCTAGCGCAAGTTTGTTATAACATATTGCCACGCCCATTCTAACGCC:1 - chrX 14148352 3' + INE-1 102 1 64.38 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATA:3 + chr3L 20898637 3' + roo 358 2 54.11 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCA:1 - 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chr3L 27383357 3' + BS 5061 1 56.85 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTCATCTCACACATAAAAGTGGCGCACAGAGGCT:1 + chr3R 6419972 3' - Tabor 15 2 63.77 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCACACCAGCGACAAAGAGGCACATTT:1 - chr3R 28042915 3' + Stalker2 7629 2 65.12 TAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTC:1 - chr3L 15913889 3' - jockey 4829 1 85.09 CAGAATGTGAATCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTATTATAATTAGACTGTAAAGACCAAAAGACTTATTACTTATTACTTTATCCAGTTTTTCCTGGGGAAAAAAGGTATAAGCAAGCTTATTCGGTTATTTCAACTCTTC:1 - chrX 17696892 3' - transib2 2523 1 69.86 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTG:1 + chr3R 28385661 3' - transib2 15 1 72.93 GAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAAAAGATAAAAAGCAAAGTTAAAATGAAAAAAGAAAAGCAAAGTTAAAAATTAATAAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAA:1 - 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chr2R 15004719 3' + BS 5072 1 38.36 GAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTACCTCACCCCTCATGCGTTCTATTTTCGGCAACGTTACTGC:1 + chr3R 11790440 3' + jockey 31 1 75.81 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAATTTCATTTCGCTATATATATACTATATGTATATATATATATATATATATATATATATACGACATGTATGCCCCATTCATGCACACACATTTTCATGGCCTGCTGCACAGCAAAATGCGTGCTGT:1 - chr2R 18752586 3' - jockey 4789 1 77.40 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAATATACC:1 + chr2R 11164555 3' - roo 11 2 78.08 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACCTTAAGTTTTATAGTTC:1 + chr2R 9158174 3' - mdg3 33 2 63.70 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTGAGGTATTAATGTGTTAGAACTCGATTGTAGGTGG:1 + chr2R 20010719 3' - Juan 4121 1 63.45 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCTTTGAAGTCAATTGTAGAAAAT:1 + chr3L 10731912 3' - 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Juan 86 1 73.29 AAAACATACACAGACACCTGAAAATCAAATTAGAAATCGAAGTAACAACTAAGAAGAAAATGAAATTGTGAAACGCTGACGACAACTTCCGACAGAAGCAGAACACCAGGATACGCAGCCCACGC:1 - chr3L 15854758 3' + Doc 4407 1 52.80 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGAGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAAACAAG:1 - chr2R 4785206 3' - Juan 4057 1 60.69 AAAAAAAAAGAGGAAAGTAAAAAAAAGAAAAAAAAGTTAATTAGGGGGGCAGCAGTCCTT:1 - chr2R 7371038 3' + Doc2-element 251 1 46.67 TACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAG:2 + chr2R 330190 3' - HMS-Beagle2 87 2 78.08 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACAGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATT:1 - chr2R 13766181 3' + roo 9032 1 56.55 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGGGTCTGGCATTTTTATAAATAACATTTT:1 + chr2L 19675075 3' - 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chr2R 12779641 3' + I-element 5276 1 69.86 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGCTAGAAACAAATGTAT:1 + chr2R 21410952 3' - Burdock 78 2 71.23 GTCAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCAGCAGGCGTCGGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAAATATAAAGTAACGTACAAAAGTC:1 - chr2R 17622136 3' + HMS-Beagle 6873 2 54.11 TAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAG:1 - chr2R 7244806 3' - diver 55 2 54.79 TTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGCTTTTCTGGCCGGCTTTAAATTAATGTCTTCGCC:1 - chr2L 16647213 3' - HMS-Beagle2 6878 1 66.00 GCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTT:1 - chr3R 4805630 3' + 1360 3303 1 73.97 GTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTC:1 - chr3L 15103828 3' + Transpac 225 2 76.03 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCT:1 - chr3R 15790834 3' - roo 8716 2 54.11 AAAGACACTAGAATATTATTCTAGTTAGTTATTTTAGTGTCTTTGATGGTACCGTCTTAAACTTTCAAGCAATTCTTTCAAGATTGGATTTTATTTATAGCGATAAAAGACCAATCCATATACTCGACTCAGAATGAAGCATCCTT:1 - chr3R 908406 3' - Tc3 309 1 77.40 CTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTTTCTTGGA:1 - chr2L 22966877 3' - 1360 3193 1 50.00 CTTAAGATGGCTGTTCCAATGTCACACCTTCAAATTGTATTGCTGGTGTAGCAACCAAGGTTTTTGAACTTCTCCTTGTGCGTCATGGGTAGCACCACTGCCTCGATGAGCTCCTGTATCTGCTTGTCCAAACCTCCA:1 - chr3R 23753608 3' - BS4 379 1 59.42 GACTCANCGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGC:1 - chr2R 18514865 3' + P-element 352 1 52.74 TAATCGACAAACGAAAAGCGAACAGTTATACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAAGAACCAAAGATTAAAGTTATGCCACATCAAATATTTCAATAACAGCAAATTAAACATAAAACTGCTTTG:1 - 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G2 3034 2 64.38 AAAAATAAAATAATTTTTAAAATAAATAGAAAAGCTTTTACTTTTCCAAATGTCAACACATATGGGCTTACCTTTGAAACGATGTGAAATTTTGTGCAAAATATATACCTAGATTTTTTTAATAATTCCATCTGGATTTGTAATT:1 + chr3L 17652990 3' - 1360 3093 1 83.45 ACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAA:1 + chr3R 22590612 3' - rover 6980 2 65.07 AAAATATATTTTAAATTTAAAAAAATAAAACAATATAACATGTAATTATATTTGGGTTCTCCACGCTTTAATTGCCAACTATACACTAGTTTTTCTATGACATACTTGTGGTAGCCCAAATATTGGGGGATAATACCAAAGACCAC:1 - chr2L 12503723 3' - P-element 2598 1 56.85 ATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAAAACTTATGCCCACTAGTGTATATTACTTTCATACTGTAAACCCTGCATTAGCTCCATTTTAATTAATAACGGCCT:1 + chr2R 12319485 3' - Tc1-2 68 1 67.12 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAAAAAGAAAATGTTACAATTTGCTTTACACATTTCGCTG:1 + chrX 2479608 3' - mdg3 5292 2 58.90 GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATA:1 - chr2R 18316058 3' - HMS-Beagle2 6964 2 74.82 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGAC:2 - chr3L 6397679 3' - roo 83 2 71.92 AGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTT:3 - chr2L 17809205 3' + jockey 4904 1 76.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAGTAAGATGTTTTAATCTAATCGGGTTACAACCA:1 - chr3L 2145852 3' - roo 8680 2 64.75 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTTGTAAATCAAAATACATACGAAAGATTTATTTTCAAATTTGACATAGTAGAGAACCAAATAAAACCGTTCGTACATTTCAAAAGTAAAAATGTCACCGAGCATTCTTTTAATTACTGCATGAT:1 + chr2L 13556185 3' + transib2 2790 1 80.14 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTT:1 + chr3R 23639240 3' + pogo 2048 1 63.43 TACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACTGCGCAGGACACTACCGAAACGACTTTGATTCGGACCGACAATTCGGGTTGAGGATCCAACAACTATGAACTGTGTCTGT:1 + chrX 2441654 3' + gypsy4 182 2 63.16 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAA:1 + chr3L 20898597 3' + roo 319 2 81.38 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAGATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATAAAAGTAAG:1 - chr3R 4679411 3' + hopper 1393 1 69.18 ATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATTCTAAGCAAATAAATAACAAATTTTCGCGTAATGAGACGAAAGAACAATAAACAAGCGCAGACCCCATAGAACACGCTGTCATAAATTAATCGTAAAGCA:1 + chr3R 16157062 3' + pogo 1961 1 79.23 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCTTGCAGCCGAATCGAGCCGAAG:1 - chr3L 3983799 3' - P-element 23 1 57.41 ACTCAGCTTTTGTGAATGCGAAGGCGAAATTTCATCACCATTTTTCTTTGATATCGATAGATATTGAGGAATGAAATGAGAAAATATTTAATAACCCAAAAGGGAATGCTTCGAAATTTCATAAACTACCAATAAATACTTCCAAA:1 - chr3L 21090463 3' - INE-1 531 1 60.96 TAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATATGAAAAGAAACAAATAGGCAACTTGAGGCAACTTTCAAGAGTC:1 + chr2L 18212254 3' + Quasimodo 7342 2 69.18 TCAACAACTCCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCTAGATAACACGGGAGAAAGTCATTTAGTTAATTACCAGACTTAAGGAAGTTGACAACTATGGTTTCGTCCACTTCATAGCACAGGATTTTATTCCTTAGATCTT:1 - chr3L 9356979 3' + I-element 5092 1 65.07 ACTTTAGTAAAGCATTTGACTTTCTCATCTAGCAAGGAAACTTTCCTAGTTGATCTTCTAAATTGGTTATTAAGTTATTAGACTCCTTCGCCCTTTGGTTAGTCGTGAAATTTGACTCGCTTGTGGCATTTCTGATCCCACGT:1 + chr3R 12251153 3' + Q-element 317 2 54.55 TTATGGAAAATTAATAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGTCCACCCAAAAACGCCTCTCAATATACAAAATGATAATAAAAAATTGATTATATACACC:1 + chr3R 30675426 3' - 297 60 2 56.20 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGCGAGACGATCACCAAGGCCCCCCGCCCTCCCCACCAT:1 - chr3L 18402941 3' - P-element 23 1 66.67 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACTG:1 + chr2L 15550771 3' + Bari1 1654 1 56.94 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCC:1 + chr3R 4964180 3' - roo 8740 2 74.66 AAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCTGGTCGAGTTGCAGTCGAAGGTGGAGCAAGAAGAGGCCCACAAGCAACGTCTGGAGAGTCAGCTGCAGC:1 + chr2L 6653229 3' + mdg3 5026 1 64.17 ATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAA:2 - chr2L 7660940 3' + I-element 5265 1 78.08 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGACGAA:2 - chr2L 4888708 3' + BS 5050 1 53.42 ATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCT:1 + chrX 20999597 3' - BS 51 1 56.85 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGA:1 - chr2L 47089 3' - roo 8723 2 59.59 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTA:1 + chr3L 18505735 3' - I-element 63 1 63.83 TTATACAAAATGAAATAATAATTAAGTAAAATTTTTTAATAATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAA:1 - chr3L 3548096 3' + Tc1-2 384 1 59.59 AACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGC:2 - chr2R 5617462 3' + invader1 376 2 60.27 CATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACAGGTCAGGTAGGATTGAAAGTAAAAAAAAAAGAACAAGAGT:1 + chr2R 21431703 3' + I-element 227 1 71.72 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAA:3 - chrX 13134914 3' - jockey 4847 1 75.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCAT:1 - chrX 12986508 3' + roo 9034 1 58.22 TGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCCATGCGTGTGTTCGTTACAGATTCCAGTGCCATTCCTTTTGTCTTTTGA:1 + chr2L 23488928 3' + Circe 126 2 97.26 GATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAAACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTG:1 + chr3L 11826442 3' + INE-1 98 1 69.18 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCCAAAAATGGATTA:1 - chr2L 13158591 3' + roo 397 1 75.86 TATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAAACAAGTCGCC:1 - chr2R 4785201 3' - Juan 4053 1 65.07 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGTTCCACC:1 + chr2R 8157311 3' - mdg1 24 2 69.18 ATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTG:2 + chr2R 15005112 3' - BS 5057 1 61.64 TTGTACAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACAACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTGCGGTGATGCGGCCAAGAATCCATTTAGAGGGCGGTAGTCAGTTGGCCATAAGCCACCGAAAGCCGCGTGACAAGAGCTG:1 + chrX 4759652 3' - 3S18 5681 1 71.23 TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGAATATTAGGTTGGAAATATACATAAATAAATTGAGAGTCCAATGTGCTTTTAAAAA:1 - chr2L 5885596 3' - I-element 5145 1 61.64 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCGTTGTCCTTGCGCAATAGTGAGCGATTTACTCCGGAAAAGGTTAATAA:1 + chr2L 6103075 3' - roo 17 2 67.12 ATTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTCGGTTATCAGATTTCAGTTTTCAGTTTTCGGCATCGTCTT:1 - chrX 9061939 3' - Doc 4700 2 84.38 ATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTAGGGCCGTGATTTGCCATGG:1 + chrX 15200956 3' + 17.6 7378 2 57.93 AATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGC:1 - chr3R 30347357 3' - P-element 107 1 14.38 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACG:1 - chr2R 12472039 3' + transib2 2747 1 72.03 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCATAA:2 + chr3R 23639264 3' + pogo 2060 1 52.74 ACAATGTTTTTACATTTATTTTTTCATTTTTTTTTTTCATTTGTTGGCTGTGGAGGTTTTTCCTTAAATTTTTTTGAACACAGCCGTGG:1 + chr3L 3390581 3' - looper1 1812 1 78.65 TCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTTCTGCAACCGTTCTGAATGTGCCGTGGCGTACTTCAACCACATTATTGTTATGGAGGGCATGAAGGATGAGCCACCAGCCGTTTAAATGCCCTTCGAGCGAGGGTAGTT:1 - chr3L 18932418 3' - I-element 431 1 76.55 AATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCCGTGCCCCCCCGGGGGCAACACTCACCTGGCGT:1 - chr3R 22287954 3' - transib2 56 1 56.16 ATCATGTCTAAACACATATTTAGACACATACTTCAGAGGAGAAGCAGAGACAAGGATGCCAGACGGGTTTCGATATCTATTTCAGAACTTAAACCGGCGAGGTGGCCGCTGGGGACGGACCGTGTACCGCCTTTCCAGGTCAGCG:1 - chr3L 23452523 3' - rooA 7240 2 76.55 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTGACAACAGCTTTAAAAAAGAGAAGGAAGTCAAAAAGTCAAAGGAGCCTCTACCAGCAGCAGAAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGAAGCAGCAACAGCAGTAGCAACAGCAGCAG:1 - chrX 1794484 3' - roo 8670 2 70.55 GGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTGTTATTTGAAAATAGAATATAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACATTACACATTTTTACAGACAATAAGAATAATGGATGGTTT:1 + chr3L 15187041 3' + 1360 277 1 69.63 CTCTGCTATCGATCCTGATCAAGAATATATATACCTTATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTCCATACTATTCAACGAATCTCGTGTTCCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTCCACATGTACAATATGCAAGTAAAGGCCAAAAT:1 - chr2L 2650906 3' - INE-1 90 1 56.94 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGT:2 + chr3R 15364055 3' + flea 4991 2 70.55 ACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTAATGATTTAATAATGAACAATCGCTGACGACAAAATCCTCATACGGGAACTAAAAAAAAACC:1 + chr2R 4784871 3' - Juan 4080 1 65.96 AGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTG:1 - 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roo 8604 1 80.82 AAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGGACAATGAAGCACCAAGGTTAAAGTTGTATGTTTTTATCAAATGGTATTAATGTTTACGAAACATTTTATGTTGTAGGTGTGTATGATAGGTATTATTGGCCATTT:1 + chr3R 21250607 3' + transib4 391 1 46.90 ATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGATACCACCAATTGGTGCAATGTGTTCACACGTCGATCAGCGCAGACCATTATACTTCGATCGCATCTACTTTCGAGA:1 + chr3L 5636356 3' - I-element 4970 1 54.11 ATAAAGTAGAAATAAATAAATAAGCACAGCGAAATTCCGAAACTGGGAAAATAATCCGTTGAATTAAAATAAGGTGTGTGTGGGTGCCT:1 - chr3R 17373544 3' + Juan 4208 1 41.57 TTATTTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAATTTTAAAGAAAACAGAAAAACTTTGAAGAAGAAAAATGAAAATCCAGTCTTAATCGTAGCACTGATTATTTGTTTTTAAATTGGAAAAAATCAAAATAAAAAACATGCTT:1 - chr2L 12553257 3' - HeT-A 4 2 76.03 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAAC:1 + chrX 12129433 3' + flea 220 2 60.96 ATTGGATGTTACACAACACAAAAATATAGTACAACTACACATATATTAACTACATACGTTAAAAACAACTACCAAATCGCGTACAAGATACCAAACCAATATAACCGAGAGGCCCG:1 - chr3L 17238004 3' - transib2 339 1 62.07 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGTATGGTGGTCAGTTTTTATT:2 - chrX 8027373 3' + Juan 4199 1 68.49 TTTATTATTATTATTTATTATCGATCCCGAATATCGTTACCTCCGCAAGGATTCTCATTTTTAATATTTAATTGAAAATAACTTGAAAAATATTTTCGGG:1 - chr3L 12185998 3' - flea 5003 2 79.00 GTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATGGCCAAATGCATATGAATTATTTTTTTTTAAATGAAATACATTTGTTTAATGATGTTATTTTTAACATATTCTCCACACAATAGTATAATATAAATAATGTTAAGTGATTTTTGAA:1 + chr3R 16987167 3' + 1360 315 1 62.33 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATTTTGAATAAAAACTTAAGCGTTTCTAAAACGTTTTTATGGATGAATTGTTTAATGTGAT:1 + chr3L 2990090 3' - roo 8672 2 76.71 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAGTTGAAATAAGCT:1 + chr2L 10156251 3' - hopper 20 1 69.18 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTGTTCGACTTTTAGAAGGTTATTTATTATAAAATAACTTGAAAATACATGCA:3 - chr3R 18488319 3' - roo 8679 2 68.49 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACC:1 - chr2R 4673529 3' + Quasimodo 7343 2 68.06 GTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATT:3 - chr3L 23249382 3' - rover 57 2 56.16 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATA:1 - chr2L 13158644 3' + roo 9006 2 63.01 AACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGTTAATAGG:1 - chr3R 25433283 3' + transib2 2766 1 59.44 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTATGCCATTCATGCG:1 - chrX 14450378 3' + hopper2 1564 1 52.74 AAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTTTGTGTTTTTATGCGTTTGGTGCTTGCT:1 + chr2R 1005252 3' - BS 64 1 68.66 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATATCTTTATCTTCATTCTTTTC:1 - chrY 1069597 3' - rover 6967 2 59.59 AAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTGTATACTGTCGTGAGTGTACTGAGTGTCGTGTATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGG:1 + chr2R 6885566 3' - P-element 2810 1 18.49 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGCATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAACCAATGTGAAAAATGGTAATGTGTGCGCGGCATCAC:1 - chr2L 19674926 3' + 297 6974 2 73.33 AACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTA:1 - chr3R 2522270 3' - Tc1-2 99 1 44.52 ATTTGACTCTGTTAATCAATACATTACAAGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCGTGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAATATTTTATGCCCTTTGGTTTAAATAACGCCC:1 - chr3L 25059048 3' + Q-element 330 2 67.12 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTC:2 - chr3R 6419802 3' + Tabor 464 2 69.18 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTGTAAAAAATCAATAT:1 + chr3R 13406559 3' - pogo 18 1 68.97 TAATTAGTTTGTTTTTTTTTTTCATGTTTCAGAAAACGTATAATTTGATTTTACTAAAAGTTCGCAGTATGAAAAATAAAATGGCTGTTGCTATTCTCTTATAAATAATGCTTAGTGAATTATCC:1 - chr3R 18336787 3' - gypsy11 3936 1 31.20 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGTTTCTTGTGAAGTATTAAAGTTAGCTAACTGAACTGGTAAGTAAAGTCACTTTTGATGGCTGTTTGGAAAAATTAACCCTGCGCTAAGAAATAAAAA:1 + chr3R 14767439 3' - roo 22 2 64.14 AAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCA:1 + chr3R 4682990 3' + Burdock 197 2 63.01 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATCACCGCCGCTTCCGCTGCCAATAAGAGAATTGTACTGAATATCTTACATATAAGTATCCCTAAC:1 + chrX 19588191 3' + roo 400 1 76.55 GTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTT:1 - chr3L 23249380 3' - rover 55 2 54.79 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTGGCCGCCATTTTCCAATG:1 - chr3R 16630218 3' - FB 13 1 74.66 AAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTTTTGGTGTCCATATAAGCTAAAAAAAATTTGTGATTTCGTTGATTTCAAGTCCGAAATTTAAGAAAACATATTTTTAGGACCGTATC:1 - chr2L 396527 3' + 1360 2 2 64.29 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACAAATAAGTTAACATTC:1 + chrX 1341772 3' - 412 21 2 71.03 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGTATGCATATTGTAACTACGC:1 + chr2L 18549973 3' + roo 9055 2 78.08 AAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCATACTGCTTA:1 + chr2L 21400817 3' + Doc3-element 4676 1 41.78 GTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAAAGCACTTGCCAAATAAATAAAAGTCAATAAATTGTTGA:1 - chr3R 24381274 3' - Juan 4139 1 62.33 AAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGGGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAAT:1 - chr3L 24213777 3' + invader2 5031 2 67.12 ACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCGAGTCGTTAACGCCGAGCGGATAAAATTTTGTTAAAAA:1 - chr3L 9182083 3' - I-element 5006 1 73.79 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTCGGTGAAACGAAATAGCAAAC:1 - chr3L 10373849 3' + 297 6922 2 78.90 TCCATCTATATACATATATACATATATATATAGACGTACCTGTAGTTTGTCCCCTTATCTTTGCCAGTACGTGAGCCCACGTATGCGCATTCGTTAGCCAAACAAGTCACGCGGCTATCTCGAATTTCAACTCCTTAAGGCTTTTC:1 - chr2L 2601923 3' - G3 4510 1 70.55 AAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAAGCAAGAAACAACGGTAAAAGTTAAAAAAAAGGGTATACATAACATGGTATCGTATTAGCGAAGGACTTTACTATCGTTTGCTTTCCATGGCCAAGAAGAATAATA:1 + chr2R 11152759 3' + Bica 475 1 55.48 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCATATTAATTTATGCATT:1 - chr3L 2989891 3' + roo 9055 2 71.92 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAA:1 + chr3L 7889665 3' + roo 353 2 55.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCATAAAGC:2 + chr3R 23639267 3' + pogo 2063 1 54.79 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCCTAACG:1 - chr3R 28469203 3' - 412 62 2 60.42 CGCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTTATCT:1 - chrX 10445512 3' + INE-1 533 1 78.08 AATACTTAAAAAGAAAAAAAAAACGAAAATAAAAATAAAAACAGCAGCAGAAAAAAACGACAAGACAAAGGAGCCCTTGGAAATCAACATTTATACGCCCCCTTGTGCCG:1 - chr3L 18936507 3' + TART-B 10630 1 52.73 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGC:1 - chr3R 27405984 3' - diver 5933 2 60.36 GTCTTCTTATTTGGCATTTTGCCATATTTAATCGAAGCAAAGAGAA:1 + chr3R 27985843 3' + roo 407 1 69.57 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAG:1 + chr2L 19924062 3' + roo 9038 1 52.14 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAGTCCGCTATAAAGCTTTTAT:1 - chr3L 22960412 3' + Tirant 358 2 56.16 CTGCAGGTGCTAGGTCATTGACCGGGTGGATGATTTGGTGTTTTTCCGGTGCGAAGGGAGTCGGCGCTCGGCTTGGTATTTTTGCCGCTGAGCGCTTGTTCGTTTTTCTTTTTCGTTGTTCGTT:1 - chr2R 11517659 3' - Doc3-element 347 1 64.52 GCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTTCATTAGATTAGATTAAGCAAAAGAATTACGAGTAACTGACAGGTGCTGAGGGC:1 + chr3L 2665211 3' - G2 328 1 63.01 ATAAATAAATATAAAAAAACATAAAAATATAAATTAATTCAGATTATTAAATTTTCCCAATCGACCTTTGTATATTTTTAACAGCCTACTTTAACCTATAAATACATTGGGTGCATTCTACTGAACAGTCTGAAAGAAAAATTAAA:1 - chr2L 9077096 3' + Tc1-2 482 1 80.14 AAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCACACCTTATTTAACGGATCAAGAGTATATATTATACACACGTATATTTAAGCGTTTTTTGCTAACACATTAATT:1 - chrX 9324891 3' - 1360 290 1 79.21 GCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATTTTTCGCCTGCGAATTATTCAAGAAGGTCGTATAAAATAATAAATGAATTAAATAAATGAAAAACG:1 + chr3R 2681993 3' - gypsy12 10026 2 64.38 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGAGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACC:1 - chr3R 11469288 3' - Tabor 45 2 54.11 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGT:1 + chr3R 19992715 3' + hopper 1335 1 71.23 CCATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATAT:1 + chrX 16946724 3' - FB 59 1 58.22 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGCTTAAATC:1 - chrX 13134839 3' - jockey 4762 1 80.15 GGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGGTGACTGGTGCCAAC:1 - chr3R 19445937 3' + 1360 46 1 57.53 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCTCAACTG:1 - chrX 10521604 3' - Tabor 6848 2 73.11 CGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTGATTGTTAAAAATGATTTAAAGGAATACATCATCGTCCTTTTACCCACTTAATATACAGTTTGTCAAGAAACT:1 + chr3L 23233852 3' - invader1 3687 2 56.16 AGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTTCAGAATGACGTTGCACTAATATGTGCGCAGTGAGCTCAGTTTTAGCTGGTACTGGGG:1 + chr3R 20565367 3' - transib3 200 1 60.27 TATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTAACTACTTATCGATAGCCCTAATTTGGCTCGAT:1 - chr2R 5106225 3' - Stalker2 26 2 69.18 TTTACATTTTTGCTTTCACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGTATCTGTCCGTTCATTTGTCCGTTTGGCGTTTTGTTTTTTTGTTATTTGTTTCTACTTCCTATCGATAGGCAAAAAAAAGTTGAACGACGACGCTAAT:1 + chr3R 7178026 3' + rover 89 2 62.32 AAAAATTAAAAACAAAATAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAATTCAGCGCAGGAAAAACTGCAGCT:1 + chr3R 10426741 3' + Doc 4697 1 84.13 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGA:1 - chr3R 29084898 3' + 412 7473 2 65.75 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATAT:1 + chr2R 17878609 3' - Doc 94 1 75.34 AGCCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCAGAGAAAATGAATATTTATCAATTCCACAGTA:1 - chr2L 6654596 3' - diver 5897 2 76.71 GGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAAATGATG:1 - chr2L 14874108 3' + copia 251 1 56.16 GTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCACTTA:1 - chr3L 25008284 3' - 297 352 2 79.29 ATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTAT:1 - chr2R 3262651 3' - mdg1 7273 2 60.69 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATCCAAGATAACCG:1 + chr3R 17077227 3' - roo 8696 2 62.33 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATT:1 + chr2R 13766274 3' - roo 8750 2 81.12 CCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGATTTTCAACAACTTCCTGGCAACATTACTCAACTCCCCTCCACTCCCCGCAATCCACAGTCGGGCAATTAGCGACAGTTGCAGCGG:1 - chr3R 5097176 3' - jockey 4602 1 76.19 TCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAA:1 + chr3R 30987584 3' - F-element 127 1 56.85 AAATATGCTTATGGTGCTTTTATTGTTACCGCAACTGTATGAAGTGATCTTTTTCCCCAGTATTTTCCATGACTATAAGCAGGTGTTTGCTGTTTAAATCATTCAAATTTTTGCAATGCAACCACGTTCATCGCCTTCCAATGAAA:1 + chr4 1163704 3' + Tc1 1628 1 75.34 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATATAGGTAAA:2 + chr3R 15072697 3' + pogo 2074 1 64.38 ATTATTATTATTATATTATTACTCTGCTGCCTTGTTGCCTTTGATTCTCGTTTGATATCCAAGTCTTGAGTTCCGTTTTGAGTTGTCTTTTCGTGTAAAGTTGCATTGTTGGGACATCTTTTCCGTTTCTCGCCTAATTTG:1 - chr3L 9111499 3' - invader3 5052 6 78.01 TTTTATTTTTTTTTTTAAATTAATTTTTTCCCTTTTTTTTTGG:1 - chr2R 23111368 3' - TART-C 11097 1 76.74 AAATATAAATATAATAATATACTCATAGTGACTTCATTGATATTGAAAGGTTTCGATTCATGTTAGTAAGCTATCATGGAATAACCAAATCTATAGATATTTAGTTAAATAACCATAAAGCCTTATGATCTATCGCATGTCTGACG:1 - chr2L 5753518 3' + Stalker 6938 4 59.59 TTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 18329912 3' + Porto1 4552 1 79.86 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTTGGAACGT:1 + chr2L 5582236 3' - pogo 30 1 64.83 ATTTTTATTTATTATGTTATTTTATAGAAAAAGTATATTTTATTAAATCTTAATCACCACTTTTGGAGCTATGGCGTACTGCAAGTTTTTCGGTTGTGAAGGATGTAAATTAGTTGAACTGACCATTTCTCACGCGAGGTTTTGTG:1 + chr2L 2648435 3' - HeT-A 343 2 51.37 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAACTGTTTGATAT:1 - chr2L 13556372 3' + transib2 2772 1 75.96 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGTGCGC:1 - chrX 20999468 3' + BS 5070 1 67.12 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAG:1 - chr3R 4682872 3' - Burdock 47 2 52.05 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATAAATCAATTGAATGACATTGCAAAA:1 - chr3R 4679454 3' + hopper2 1547 1 59.15 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCC:1 - chr3L 16690900 3' + I-element 5297 1 60.27 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTT:1 + chrX 8360604 3' + roo 323 2 76.71 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTC:1 + chr3L 21655986 3' - HMS-Beagle2 6938 2 55.86 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAACGAAAATGGAATCTATCTATAAATCTATATATATATACATATATATAGTTGT:1 + chrX 18861272 3' - mdg1 21 2 64.38 AAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCTTTCAATCAGCTCAAGTCTCAGTTGATACTAAATAGTTTCCTAGTTCGATTAG:1 - chrX 19557895 3' + Idefix 7163 2 64.83 GTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGTGCACCATTGGGTTGGTTGCCTTCACTTTTTGGCTGCCATTGCCTGTAGGAATTTCCAATTAGCTTTGGGGTATCGCACAATTTT:1 + chr3L 16822641 3' - I-element 397 1 76.85 AACGGGTATCTAATAGTCGGGGAAATCGACTTGTTATTTATTTAATTTAATAAATGGAATATATTAAAAATTTTTTAAGGTATTTGTTTACCTTTAAAAGTAGATTTTAATAACTGTTTAATTCAACTATCGATAAGCCGATAAAG:1 - chrX 21387954 3' + INE-1 553 1 71.92 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGGAGTCCGATAATTT:1 - chr2R 21160680 3' + Transpac 5166 2 74.22 GCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTG:1 - chrX 18817295 3' + transib2 2745 1 71.23 ATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACA:1 - chr3R 19992648 3' - hopper 63 1 64.66 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAAT:1 - chr2R 18316054 3' - HMS-Beagle2 84 2 73.29 GTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTTAAGATTACTGATAATAGGACCTTTTAATTTAACTAATAGAAATATCTTGTTCTCTGCGAAAAAATCAGTCACTTGGTCAG:1 + chr3R 8412920 3' - Cr1a 4284 1 55.48 CAAAAGCTGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAGCTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTTTAATAGCAAAAATTGTGAGCGTGG:1 + chrX 22913205 3' - gypsy7 55 2 71.72 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGC:1 + chr2L 12822845 3' + P-element 2850 1 36.26 AATAAATATAATAATATTAATTACACAATAAGTAAGTTAGCAAGGCCATCTGTTAACCATATAATTTCAGATTGTATTGTATTAACACACTTGTACAATTTTTGTTTAACCAAATATAAGTTAAATCATTTGCATCTTGATGATAA:1 - chrX 23431688 3' - Tc3 278 1 54.79 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGCGAATGGAAAACCAATTAGGAAACGTA:1 + chr2L 2596504 3' + hopper 1385 1 44.63 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAAAATTTGAGATGTATATACTCAAGAGGCACTCATTATGTGCAATACTTTTT:1 + chr3L 5533041 3' - roo 38 2 47.76 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGCCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCACAGTGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAACAAT:1 + chr2L 20840118 3' - mdg1 15 2 72.41 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTG:2 + chr3L 13581722 3' - jockey 4837 1 69.86 TAAATATATATATACATATATATATATATAAATATATATATATACATGCTTGCGGAGTGCGGCGGAGTGATTTTAATATACATATACTTCACTCTTTTTATTGTGCCATTTTAATTGGCTCACATTCGCGATCTGGTTTCCCATCT:1 - chrX 9417205 3' + Stalker 6937 4 58.22 AAATAATTATTAATAATAATATCTTTAATAATACCTTTTACATATCGGTTTAAAATATTTCTTGCAGTGCATACACCCCAAAGGCTTGCCACCGAGCATCGAACACGTCAATTGGCCGCGAAAT:1 + chr2R 11534967 3' + gypsy9 5310 2 53.23 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAAT:4 + chrX 8200297 3' + flea 4952 1 60.96 TTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTT:1 - chr2R 21926376 3' + opus 422 2 70.55 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTTTTTTCTGTTAATTAATTGGAATGAATATGCCAATGTTGATGCAGATGAGGCGT:1 - chrX 16487177 3' - F-element 48 1 56.30 CTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACAAACAGCGGTTCGATAAATAGAGAAATGAAAGAGTTCTGGGGAAAGTGGGGTCCTAAG:1 + chr3R 30091569 3' + jockey 4664 1 60.27 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAG:1 + chr3R 30347390 3' + P-element 2842 1 38.74 AGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTACAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTT:1 - chr3L 21655912 3' + HMS-Beagle2 222 2 78.08 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTG:1 + chr2L 47198 3' + roo 9017 2 54.11 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGCGAA:1 + chr2R 11804754 3' - pogo 36 1 59.59 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGG:1 - chr2L 4003691 3' - mdg1 68 2 65.07 CCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAATGGAGTGGGACTGGGTCAATTGCGGAAACCAGTTGAACGAGCCTCTTTAGAAG:1 - chr3R 23788237 3' + I-element 5106 1 63.70 ATATTAATAATAATTATAATATGAATAAGTTAGCGTTTTCGGTTTTGGAGAATTGGATTTTTTCTACCCCACTACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGCGTCTTGCATTCACTTGTTTAAGTAAGTCAAGGC:1 + chrX 21945949 3' + mdg1 50 2 78.26 GAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAAAAAAGAAACTAAACTGAACTGAACTGAACGGCAAAGAGAAATGGGAAAGGCGAAGCCAAAGGATAGAGAAAGAAACGTAAACG:1 + chr3R 21338542 3' + Doc 4647 1 63.01 AACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAAATACACAAATCCCTATTTGCTTTATTTGTTTGCTTGGTTAAACTACGATGACACCGCATCAGTAATTATC:1 + chrX 11270964 3' + I-element 4978 1 53.42 ATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTTCCTATATGCGATAAAAAGTA:3 + chr2L 11257159 3' - rover 6965 2 76.71 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGCTTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATCGATTTGATTTGATTTCAGTTCGGT:2 + chr3R 29194510 3' - blood 39 2 58.90 TGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGT:2 - chrX 15200842 3' - 17.6 58 1 65.07 TTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGATCAACAAATTGACATTAATAAATGATAAAATGATTATAAGATATAAGGAAACTGAAA:1 + chr3R 10970333 3' - G-element 68 1 62.33 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCAAACGAAAATGGA:2 - chr2L 11839644 3' - mdg1 7101 2 60.96 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCC:1 + chr2R 14051882 3' - roo 8694 2 62.33 ATAGTCGAGTTCCCGGACTATCAGATACGCAATACGAATGCGAAATTTCATTTTTTATAATTTTTCTGGTTCCGCGATAATGCCGGCATACCGCTCTATAGGTGAGTCCTAGAGGACGACATCTCAATTGGACTATTGTCTCGG:1 - chr2L 14941475 3' - INE-1 564 1 55.56 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTA:1 - chrX 11661367 3' + pogo 2063 1 59.59 ATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCTGTATTATTTTTTTTCGTCTCATTTTTATTTTTACGCATTTCTTGCGTGTCGTCTCTG:1 - chr2L 9131002 3' - Doc 4500 1 52.85 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAATAAATTTTTT:1 - chr2L 7660871 3' + I-element 5334 1 68.49 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGG:2 - chr2R 9871006 3' + roo 9037 1 61.64 AAAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTCGCTCCGGGTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCT:1 - chr2R 3292698 3' + hopper 1410 2 62.33 AAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTC:1 + chr2L 22170080 3' + Juan 4210 1 72.95 TGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGAT:1 + chr3R 15790115 3' - flea 4724 1 71.54 CATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTCTTTATAAATAGAACTTAAATCGATTCAGTTTCGTTGTAACTTAGGTCAATCATACTTTGAATGGTTTGCACAAATTTAGTGAAATGAAGCGCATT:1 + chr2L 17369913 3' + pogo 21 1 69.18 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAA:1 + chr2L 15936842 3' - copia 84 2 73.97 GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACA:1 + chr3R 10736175 3' - McClintock 5953 2 79.70 TCTCACGAATCGAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGTT:1 + chr3L 23940541 3' + Cr1a 4384 1 59.59 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATACGTGTTCATGTGTGCACACCATCTATAAAAATACGATAAGCGCAAATTGCACAAATA:1 + chr3R 27986421 3' - roo 86 2 77.40 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGTTATGAACGGAGCCCATAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGC:1 - chr3L 13294899 3' - roo 78 2 69.18 ATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTCAATTCTAAGTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTTAAAAGCGTATTATATTGGACCAAACACTTTAAGCTAATTAAAGTTTAAAATC:1 + chr3L 24764725 3' - 1360 2997 1 76.03 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCAC:1 + chr2L 4713970 3' - transib2 51 1 56.85 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAG:1 + chr3L 6518653 3' + 412 7487 2 57.53 GTCGAGTTCCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTATTGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - INE-1 561 1 69.44 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAATTTGTAT:2 - chr3R 19032573 3' - roo 8701 2 58.90 AATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTCGTTAACTATTTTCAAGTGATCGGAAGCAAACGCAGAGGCATTTCTAATTTGTGCGTTGCGCGACTTTCAGAGATCGTAGACT:1 + chrX 308177 3' + Stalker4 275 4 63.01 ATATATAAATATGTATATATATATCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAG:1 + chr2R 10594198 3' + G3 4507 1 60.00 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAA:1 - chr2L 15936783 3' + copia 210 2 69.86 ATTGTAAGTCTTTATATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTCGTTGTTTGCCTTGTTTTGCAGACTGCATTGTGA:1 - chrX 21224533 3' - roo 8683 2 57.80 TTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTG:1 + chr3R 25433358 3' - transib2 87 1 75.34 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATCGTTCGACGTTGCCACGTTGATGGCCAC:1 - chr2R 12471978 3' + transib2 2805 1 68.49 AGAATGCTATGGTCCAGTTTCCCGACTATCAGATACCCTAGCGTGAGCTAGTGTGAATGCGAATGCGAAATTTCGTCATCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATAAGAAAAAATTCGAAAAATTATAAAAAAAATTCTT:1 - chr3R 13700778 3' - INE-1 572 1 78.77 TAGCGCTCCGATCTGACATCAAATGACTGGATGGCGCGCAGTTGAAAAAACAGAAGCAATCCAGCGGCACCCAATCATAAAATTTACAAATGTCGAAAAGAAACAAAAACAAACTGCACATCACAACAATCTCAT:1 + chrX 22819337 3' - mariner2 52 1 76.30 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAAT:1 - chrX 17343371 3' - I-element 47 1 53.42 CGGTGGGCAAATATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGCAAAAA:1 + chr3L 46970 3' - FB 69 1 76.27 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCT:1 + chr2R 23780613 3' - Ivk 61 1 56.85 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGTCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGT:1 + chr3R 17077199 3' - roo 52 2 58.70 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGA:1 + chr2R 330193 3' - HMS-Beagle2 84 2 76.71 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAGTCTGAACTGTCTCCATG:1 + chr2L 47235 3' + roo 9054 2 73.29 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGGAGGGAGTTCGCAAAACTTTAAAGTCGAGCAATTTAATTGGCCGT:1 - chrX 18734552 3' + hopper2 1564 1 47.95 AGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCT:1 - chr3R 23067443 3' - roo 9027 1 37.59 GAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCG:1 + chr3R 11040142 3' - Bari1 3 1 67.61 GTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTC:1 + chr3R 19450144 3' + flea 496 1 59.38 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCAAACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCTCC:1 + chrX 14450502 3' - hopper 55 1 56.85 TATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCGCGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGTTAGACTGAAAG:1 + chr2L 9038244 3' - I-element 83 1 75.76 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGGTAGTTTGGCATGGTTACTTCAGAGTACACATCAATTAGGTATGCCGTATGCCGGCAGCCAGAC:1 + chr3L 2732291 3' + roo 9046 1 52.42 TCCATGTTACTGGGTTGCGGATAGTGCGAAAGACGGGTAAACGCAAACTGGCTGCCATTTTGGCACTGGACTTGTTTTTGGTTGGAGACGATACGGTATGCTAATCTATTATCTAATCGATAAATATAGTAATATTTAAT:1 - chr2R 10450934 3' - G2 143 1 75.71 ATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGTAACCTATTATAAATTGTTTGGTTTAAATGATTCGCA:1 - chr3L 20716054 3' + R1A1-element 5202 1 74.66 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCT:1 + chr2L 15076209 3' - 1360 57 1 56.16 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGCGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGACAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAG:1 - chr2L 9636093 3' + 412 7478 2 63.97 AAGCAAATTAATATATTCGGACGAAGACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCATGAGAATTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTAGAGATAGAAGTTCACGGCGTTGGTGCTGATGCGGCCCTCCATCTGGGCTCC:1 + chr3R 27021118 3' - Gypsy12A_LTR 2051 1 61.48 TTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGACCGAATAGGTAATGAGCAAAGGAAGTGTTTTATAGCTTGGAGTTTCAAATTTGTTTATCTACTGGGGCAGATTGCAATATTTGTGGGTTGGAAATTAAAATTTGGAGTATT:2 - chr3R 4063695 3' - diver2 4877 2 51.37 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAA:1 - chr2R 3564036 3' - Tabor 6894 2 52.74 CTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATAATAATTCCAAAATAATAGGTGTTTCCAAAAAAATTGATAATAATAAGAGTGTCATAACTGTAATAATATTCATACAAATAATTCAT:1 + chrX 13851173 3' + Idefix 7218 2 63.01 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAAAGTTTTCCTGCTTAT:1 + chr3R 31886942 3' + hopper 1357 1 57.24 AGGTCGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTTTGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGGGAAAAAATTTGAAAAATGGGTCTGTCAATG:1 + chr2L 13556411 3' - transib2 44 1 64.65 TATGTAACAGGCAGAAGGAAGTGTTTCGGACTATAAAAAGTACATATTTTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATATAGCAGGCTTTGCAACATGCAACACTCTCAACTTTCAACTATTTAACGCCACAAAAACAACAGAAAA:2 + chr2R 19875645 3' + INE-1 29 1 52.74 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGA:1 + chrX 8360649 3' + roo 9033 1 59.31 TTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTGAGCCTGTTCTCATTAT:1 - chr2L 18212099 3' - Quasimodo 3 2 74.29 ATAAATATAAATATATTAATATATTAGTATAGAGTTAAAAAATCTTATTGCAATTTTTGACGTTGGTGAAAATGACACTTACACACTTGGTACACCATTTGTTGCGGAACGAATTAAAACTCTATCGATATTGCCGAGAATTTTTA:1 - chr2R 21522065 3' + Stalker4 7043 4 67.81 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATA:1 - chr3R 19032599 3' - roo 63 2 64.38 AGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTGTTCCCGTCTCC:1 + chr3R 6147346 3' + Bica 22 1 61.19 GCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTATCCGAAGTATCGCGCCTGCAGAT:1 - chrX 696492 3' - FB 63 1 60.27 CTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTTGGTTAAAAATCTTGACGAAGAAGTAAGTAAAGTTTAAGATTTTTTATAATACACTTTTTTTAAATGAAAATATTGAAATAATACTGGAAAGAGGA:1 + chr3R 1588590 3' + Doc3-element 4468 1 68.49 GTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGGGTCATCAGATAGGGCATAAGGGAAATATTT:1 - chr3R 22066711 3' + Stalker2 7498 2 61.61 AATAAAACAACAATTTTACTATATATCTTATATCGTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATATCTTCTCTTATCTAATATAGCGTTTCTCCTGATTGTTTTGTTCATATATATTTTTTGTAAAAGGGTCTTACTTTCTT:1 - chrX 20373525 3' + 297 395 1 71.23 AAATGTTTGGGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCCTGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGC:1 + chr2R 12133832 3' - jockey 76 1 64.08 TAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATAAGGCCCTATTTATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCC:1 - chr3R 10931653 3' - 297 19 2 41.77 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCT:1 - chr3R 23618134 3' + hopper 1369 1 59.02 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGC:1 + chr3R 10270689 3' + Juan 4178 1 62.33 GTGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATG:1 - chr3L 6447056 3' - transib2 45 1 71.13 ATAATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTATTGCTTTAGTATGTTTCCGAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAGACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCGCATAAAAAGTGTAACGCTTGCATTTTTGAAAAAT:1 - chr3L 27553 3' + INE-1 565 1 69.78 AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCAAATTTGGGTGGGATTGTTTAGCGTATTTCATGTTTTTTTCAATAGGTATTTCATAGGTGTTT:1 - chrX 15032927 3' - I-element 4977 1 70.55 TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTTGGTACTTATCCCTCTTT:1 + chr3R 10736160 3' - McClintock 5 2 74.59 AAGTATAATAATAATAATATTATTATTAATGCTTTTTAAGATTCAAATAGAAACCTTATTTATAAATAAAAGAATTCAATACATCTTGCGTTACTTTGTCTAAAAAAATGTGTAAAGAAATTATCTATGAAAACCAAATTTAGAT:1 + chr2L 10975482 3' + mdg1 34 3 80.69 GCAAATCATTTGTTACATGGGTCACTACATTCAGACAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTTCAGTCCCTCGACCTGTGAGAGAGAAGATTCGTCTGTAATAATATCTAACTTAGGGAAGTCAAAATATTTCTCAACAATTG:1 + chr3R 1705169 3' + mariner2 264 1 60.96 CGAGATCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGGGTTCATGTGAACGCGATATTAGATCGGAAGAGCGTTCTGCATCTTTAGCCGTCTGTAACATAAATATTCGCACAGCCAAATGGGCGTGGCAATCGCGGAAC:1 + chrX 3450637 3' - INE-1 559 1 45.71 ATCATTCTATATACATACATATAATGAGCTCAAGTGATGGAAATGTGGGCGTGGCAGGGGGAAAACAAAGCGCGGGGAGCAAAGACAATAATAAAATCAAATGAAACTAATTTAGTTGTGAAAATAATGTTGGGGACG:1 + chrX 17501563 3' - Dm88 4380 2 80.43 GAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGCGATTGCATGGCGCTTTCCATCAAGTCCCACGGGAAACAATTTAAGTGCGATATAAATAATTTGGCAGTTACCAGGTAGAATTGTCGCTGACTTTGATGGAGAATCGAAAGGAAAGG:1 + chr3L 15289496 3' + baggins 5221 1 54.79 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCTCCCTTGTGTCGTATGCGTAATATTTGTTTAATATTA:2 + chrX 14450536 3' - hopper 21 1 71.23 AATATTTAGAAAAGAAAAAAACAAAATGTAAATATTGATAATGGTTTCTAATCTTGATTCATTTTTTAGTTACATATACAGTTCTTAGACCAGCAAAGCAGTAAATTTAAGCTATCTATGAATCTGATTAATAATATCACATATTT:3 - chr2R 20950349 3' + TART-B 10509 1 71.23 ACTCAGAATATTTGTTCACCATCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAATAAAGATCAAGAAAATAAGAAACGCCTAAAAAAGGAGGAATTCGCA:1 + chr2L 23299100 3' + gypsy4 406 1 67.12 AATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAA:1 + chr3R 3286153 3' + gypsy12 9832 2 72.60 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAG:1 - chr3R 15790871 3' - roo 73 2 76.92 ATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGA:1 - chr3R 15072584 3' + pogo 1998 1 56.85 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAA:1 - chr2L 4003673 3' - mdg1 7088 2 52.74 AGGGGGGGGTAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGTATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGTTTATTAATTTAATGCCTAATATAGTTGGACCAAACTAACG:1 + chr2L 13608653 3' + gypsy2 6479 1 71.92 GAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCCAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCCACATTTATAGACTAGAT:1 + chr2L 10151743 3' + Bica 19 1 72.73 CGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTATATTTGTCGACTAGGATGATTAACTATCATGGTGGGCATACATAATGGCAGTTGAATGGATATTTAAGTTGGGGTTGCAGGGTGTTTTAAATGTGAATAAAACGA:1 + chr3R 8688036 3' - Porto1 4482 1 69.86 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAAGG:1 + chr3L 10373908 3' - 297 5 2 65.79 AGAAACATCAGACGAGTTCAATATTTAAGTTTTTAGAAATTCATTTTTTTTAATTCATGGTGCTGACTCGTAATTAATAACAATATTTATAACTGATAACAATAAGTACATAATAAATTAAAGAAGTACATAAATAAATACAAAC:1 + chr3L 26265110 3' - Gypsy12A_LTR 1880 1 78.62 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGCGGGCGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATT:1 - chr3L 15913837 3' - jockey 4809 1 51.37 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTTTATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCCCATGATTCCTAAGTACATTCATAGAAGGTCGAAAAGATGTGAGAATCTATTACTGAAGCGAAAAG:1 - chr3R 21627272 3' - roo 8736 2 52.74 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTGTGACT:1 - chr3R 18399352 3' - Juan 4061 1 39.04 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTC:1 - chr2L 4123828 3' - transib2 36 1 60.00 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGGACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTT:1 - chr2L 4713872 3' + transib2 2750 1 67.12 ACCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAAT:1 + chr3R 27843258 3' + I-element 5300 1 55.48 TTATTATTAATTATTATTATTTTTTTTTGTTTTATTTATAGGGAAATAAACAAAAACTAAGCAAACAAACAGCAAAGCGCAGATAATCAGATGCGGCAGATAATGTGGAAATGAGCCCGACTTTTTGGAAGAACCGAAA:1 + chr3L 6916542 3' - gypsy9 297 3 66.91 TATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAA:1 - chr3L 22531948 3' + Cr1a 4197 1 71.23 ACCCATGTCGCCTTCGATAACAAAATCCTAAATATATTTTATCCCCCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAACTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCA:1 + chr3R 24369085 3' - roo 102 2 78.62 AGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCA:1 - chr2R 24427578 3' - jockey 4749 1 65.75 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACA:2 - 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I-element 81 1 71.23 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATGGCACTGTCCCTGTTTTCCATAAA:1 + chr2L 4714005 3' - transib2 16 1 74.66 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCC:1 - chr2L 4713864 3' + transib2 2758 1 63.01 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTGTCATAAAA:1 - chrX 4808483 3' + mdg3 5466 2 63.01 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAATTAAGCAAATA:1 + chrX 5323168 3' + Juan 4197 1 32.88 GAGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGGGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATTTCTGATTCT:1 + chr2R 20802705 3' + mdg3 5474 2 65.75 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGTGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCC:1 + chr3R 11062830 3' + roo 345 2 58.62 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAA:1 - chr3R 7666654 3' - I-element 82 1 69.86 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAATTATTAACGGAATATTGAACAAATATTATAAAGTCAAGCATGCTTTGAAATAA:1 + chrX 12986678 3' - roo 15 2 73.29 ATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGA:5 - chr3L 24213782 3' + invader2 168 2 71.92 AATATTTAAATTTAAATTGTAAATTGTAAAAATTACATGAGTTCAAGGCCTCTAAAGAGCGACGCAAACATATCGAACATAAAACAGTTGTCTTATGATAGTGTCCGTGGTGCTCCGGTTAGCTCGATCTGCTCTATGCACCACCA:1 - chr3R 20912982 3' + TART-A 13182 1 77.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTA:2 - chr3L 7889545 3' - roo 8712 2 57.53 GCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGTACTGTGCCACAGAC:1 + chrX 19980707 3' - X-element 4529 1 47.26 AATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGTTGCTG:2 - chrX 1263898 3' + Burdock 241 2 73.29 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGTG:1 - chr3R 4860443 3' + Transpac 5205 2 53.61 TTTATAATAATAAATAAATATTAATGAACTTTTTTTCTAGAAAAACTCGCCCTTCATTTTATTAAACAATTTAGAAATTTTGCTGGTTAGACTCCCTCGTTAAATGGCGCGTAATTATTTGAATTTGATTTTGTGGTTTGTCTTG:1 + chr3L 9010226 3' + mariner2 828 1 37.24 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAA:1 + chrX 12986644 3' - roo 48 2 53.10 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATACGATT:1 - chr3R 27133534 3' - opus 10 2 75.71 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACA:1 - chr3R 11191413 3' + roo 326 2 76.71 TAATAAAAATTAAAAAAATATAAGTTTATTTACTGGTAATACTTTAAAATTGCGCAATAATTTGCATGTTTATTTAATAGCCGGTCGCATAGAGCGCCCAAAGGACCTGCCGC:1 + chr2L 16028157 3' + Doc 4693 1 58.41 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTATTTGCAT:1 + chrX 22840622 3' + copia 242 1 74.66 ATAAATACAACATAAAAAAAAACATACAAGAAATCAGTGGCAAAAACAATGGGAACAATAAACCGAATTGGAAATGAAAAAACTGAATCTTTTCCAGGATCCGAGTCTTAAATTCTCTTCCACAGCGAATGATTCCGTGTCTTCTA:2 + chr3L 5250801 3' + jockey 4995 1 44.52 TAGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTC:1 + chr2L 11391541 3' - 1360 65 1 83.81 TTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACT:1 - chr3R 19450162 3' - roo 349 2 75.34 CGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGATTGCAGCTAATTTTGCTTGCAATGCAAATGCAGGTGAGCTCGTTGTTGGTTGTTGAATTTTTGAA:1 - chr3L 22241452 3' + 1360 3335 1 55.48 CGATTATCAGATACCTGTTACTTAACTACAGGTAGTGCTAGGAAGTATAATAATTCTTTTAAATAGATGGAATTTTTCCTTCTATCCGCCTAATCTAATTATCAAATTGTCATTCAAAAAATTTTAGAACCATCAATTTAACATAA:1 - chr3R 6672372 3' - INE-1 550 1 66.44 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAACATTTTGCTATTT:1 + chr3L 14094664 3' - I-element 59 1 69.35 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGA:1 - chr3R 30347297 3' - P-element 47 1 55.48 CTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTATACAGAATCTACGAGTAATGGTTATAAAAATATACAGAGATAGAT:1 - chrX 15408715 3' - INE-1 525 1 43.45 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTT:1 - chr2L 20265958 3' + roo 327 2 74.66 CGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAATGCTTTAAATTGTCCCTATCTACGCGCATG:1 + chrX 23406393 3' + R1A1-element 5221 1 77.61 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAATTAATTTACCCATGTGGCCACGCCCACTCTTACGCC:1 + chr2L 21333313 3' + 412 434 2 56.16 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAGCTGAACTTGATTATTAT:1 - chr2R 14653125 3' - 297 18 2 58.22 AGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGGTGCGGTCCAGGGGACATGGGTGATCGCAAACAGCAGCTCGTAATTTAATATTTCATGGCGCCAGCAGCACTATAAAAAAACGCAGCAGCC:1 + chr3R 4883126 3' - 297 6511 1 73.13 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTAC:1 + chr3R 7317652 3' + I-element 5278 1 69.86 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTCAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCT:1 + chr2L 16564602 3' + roo 9047 1 60.96 ATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGA:1 + chr2L 20640270 3' + Stalker4 244 4 61.18 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATT:1 - chr2L 4003642 3' - mdg1 7057 2 71.23 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGTAAAAGCGTATGTGGTATATATACATACATATATAGGGGAATATATATATAGAAAACGCTTTGGGGGCTTAGCTCATAAAAGC:1 + chr3R 23786891 3' - transib2 22 1 55.48 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGGTCTTGTAACGAA:1 + chr2R 3564138 3' + Tabor 7258 2 61.64 AAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATAGGTAACTGCCTGACAACAAAACATACTTCAAATGATATAATGACGACATATCATATTGGCAGCGAATAATAATAATTACA:1 - chr3R 7542547 3' + Juan 329 1 49.32 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATCTTCATCGCACGACGACG:1 + chrX 13490778 3' + 297 6944 2 64.38 ACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGGAAACCTGCATCCTGGCATCTAGCATCTGAGTCCTTCCTTCGGGCTGCTCGCGAATTCGTTGCACAATCCTTTA:1 + chr3R 5725625 3' - G2 64 1 54.86 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAA:1 - chrX 4341260 3' + roo 9011 2 58.90 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGC:1 - chr3R 4460988 3' - blood 7040 2 64.83 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGCTAT:1 + chr3R 21630366 3' + I-element 5312 1 56.25 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCTAGAAGCTATAGAAATCCCCACTTGCCTCGGATAAAATGAATGAAAATATGGGGGTTGTATTTATGGTTTGATTTTGAAATTTCATTTTATTGAACTCGAACG:1 - chr3R 13302295 3' + roo 325 2 75.34 AAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTCAACGAATCTAGTATAATGAGCTCCGATTCTTACAGCCAATGGTGTGTCTGCAATATTGACCCTAATTTTCTACATTTCCTAATTCCCTACATCCTAAACGATTCCATCGCCCTTC:1 + chr3L 18848079 3' - INE-1 35 1 44.20 ATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAGATATGAATTAAGTTTAATCAATGC:1 + chrX 3432015 3' + Ivk 5372 1 75.34 TAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCCAGCGAGAGAACTTAACGGCTGCTAACTTTGGCCTAACTGTTTATCACCAGCCAAGTTTT:1 - chr2L 20142094 3' + rover 6959 2 56.83 AACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTGTTCATGTTTTTCGCCTGTCTGACGAAAT:1 - chr2L 11391498 3' + 1360 16 1 47.26 AATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACAC:1 - chrX 292377 3' + G3 4550 1 69.50 TACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTC:1 - chr2R 15004731 3' + BS 5060 1 42.47 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATGCAAATTCTTGAAATCATACACTCAAAAAC:1 + chrX 661993 3' - 412 26 2 67.81 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTGTATGAAAGCGAAAAAGCCAATGTTGAAGCTACTTTAATACTCTCGATTAAAATATTTTCATACC:1 + chr2L 3675970 3' + Juan 4187 1 58.22 TAACAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTGGTTGTCTTGCAGCAAACCCAATTTGTCTCGTAACTCCACCACTTGTGTCAATACTTATCGGGTGATATTAACGTTAC:1 + chrX 5168530 3' - copia 4691 1 72.60 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAATTAGAAATATCGAAT:1 - chr2L 17180024 3' + Juan 4203 1 76.71 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGTTATACA:1 - chr3R 4679476 3' + hopper 1328 2 75.34 AAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGA:1 + chr2L 21930246 3' + Copia1_DM 83 1 60.96 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATTATGTA:1 + chr3R 19408020 3' + diver 6071 2 54.11 TTATTCGATATGTGGGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTCATCTCACACATAAAAGTGGCGCACAGAGGCGAAG:1 + chr3R 6419975 3' - Tabor 4 2 68.46 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGTGTAAGTTCAGCCTCTAATTACAACTGACAATGGTTTTACAATAAATTGCG:1 - chr3R 4860394 3' + Transpac 286 2 67.81 AGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGAGAAAAGCAGAATCTTTTCATCGTTTGTTTAAACAGTTAAATTTTATTGCGCTGTATATAAGAAAGAGAAGTAGA:1 + chrX 19085135 3' - accord 190 2 89.11 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGC:1 + chrY 2720356 3' - 297 6625 2 69.83 CGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAATGTTTTTCGGCAGTTGAGGGCGTCAAAGCGTCGGCCCCGAAAAGCAGACAAAAGTCAATGGGAAGTGAGGAAAACACGCCAACT:1 + chr3R 30091441 3' + jockey 4600 1 62.33 TAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTAAATTGAAAAGTTAA:1 - chr3R 18093296 3' + I-element 5283 1 68.49 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGTATGTACATGTGTTGGACGTGGGAAATATGCGGTTTAAATGACAAACTAAA:1 - chr3R 25428109 3' - 297 9 2 75.00 AAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTGGAGCACCGAATCGAGGTCCTTTTTGGGTGGGCGGGTGCGATGTGATGTGGTGAGGTGAGATGAGTGCCAGGATTTTCCGGCGGGCAGAGCGTGTG:1 - chr3L 12314979 3' + transib2 488 1 75.00 TTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCTAGAAATATGTATTTTCGTGTTGGAATAACGGTGGCCTTTT:1 - chr3L 23688502 3' + Quasimodo 7350 2 70.16 AGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTAT:2 - chr3R 19450176 3' - roo 9027 1 65.75 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTT:1 + chr2R 9871580 3' - roo 8710 2 55.86 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAACCCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATACAAGAATATATAA:1 - chr3L 16662343 3' + jockey 4968 1 64.38 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAGGGCTGTTGCTGCATTTTAAGTTGCACACACCCCTTTAGGGCGGCCGTG:1 - chr2R 4606156 3' + 1360 3372 1 72.60 CCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATNGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATTTCAG:1 - chr4 123936 3' - HB 108 1 60.27 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTC:1 + chr2R 8735664 3' - mdg1 7098 2 64.44 AGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACCCTATGATATGGGTC:1 - chrX 21993556 3' + gtwin 7356 2 60.00 GGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTCACATGCAGTTGCGGAAAACAAATTTACTGGCATGCCACAGATTCAGCTGCAAGCTGCCTTCGCTTTCAGCT:1 + chr2R 11495434 3' - Quasimodo 7001 2 51.43 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATACGCCTAGGTGAACAACGGAAGGAAGGCGAAGAATTTAGATTTCCTGGAAGAAGTTCATCGGTCTTCCCCCGTTTATTCCGC:1 + chr3L 17568146 3' + S-element 1680 2 60.96 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGTGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACACAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAA:1 + chr3R 31264060 3' - jockey 4828 1 71.20 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTT:2 - chr2R 5941339 3' + copia 186 2 65.75 ATTAATAATTAAATTAATTATAAATACATATAGTCTGTAAACGTGGAAGTTAAAAAATGCTTTGCTAATTTGCTACCTGACGCATTCTCTCCTGGCCAAAATAAGCTTATTTGTAAAAACTTATAGATTAACCAACCCATTATTAC:2 + chrX 21049401 3' + flea 4988 2 53.42 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCACA:1 - chrX 7795468 3' - roo 8681 2 76.03 GTATAATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGCGTGGGATTGTTTTGGGTAATCGCATTTGTGCGAAGTATTGCTTGTATGTTCATACGAGAGACAAGAAGGCTCAAATATTGGCCATCGAATTGCGGGTGGGATTTTTGTT:1 - chr3R 18861875 3' - I-element 4923 1 55.48 TTTATATCACGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGACGGTTGGGCGGTCGGTGTGGGAGTGGGGTCCGTGCGAAACTAAAAAAAAAAAGGGGG:1 - chr3R 19907007 3' + Cr1a 4364 1 80.83 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGT:3 - chr2L 6654634 3' - diver 47 2 52.05 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGAGTATTTAATAAGAGTGATAATCCCAGGAGTCTAGTCGATAGCTTGAAAAAAAATCGTATTAAACTATAAAGTGGCG:1 - chr3R 4111269 3' - Burdock 44 2 64.84 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAAATACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACAT:1 + chr2L 11839750 3' + mdg1 7403 2 50.70 TTTTTTTTGCAAAATATTTTTTAAAAATTTAGGAAAGCCGATGCTTAGTTTTGAACTGCGTGAATGTGCTATTT:1 - chr2L 8130790 3' - HMS-Beagle2 395 1 83.78 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTC:1 - chr3R 25616489 3' + roo 9045 1 62.79 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAATAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATAC:1 - chr2L 16539642 3' + Juan 4203 1 68.87 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATG:1 + chrX 8308506 3' + roo 356 2 55.86 CCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCATACTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGGGTCACAGCTACAATACTGTAGACACTATCTCTCGCCTATCTTTCTGTTTGCCCAGCGAAA:1 - chr3R 15088242 3' - Circe 7398 2 72.66 GCTGTTGTTGTTGGAGGCAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTGACAGCTCGTTTAGACCTATGGTTGAGTGTGAATTCTGTCTTCCTCTTCCTCTCTTTCGTCAGAAGTATTTGCGCATCAGACAATCTAGTAGCAGATTTTTCTCTAG:1 + chr3L 23213297 3' - F-element 412 1 72.60 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTG:1 - chr3R 13972960 3' - 412 7104 2 60.00 CTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATATACAAGGCACAACAAAAGTCGATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTGGTGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGCATACATAATATGTATACATATAATATAATAATAATATAA:1 + chrX 19819762 3' + Tc1 1644 1 26.03 ATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACT:1 + chrX 23108341 3' - BS3 1452 1 50.00 AATAACAATAATAACAACAACAGCAGCAGGAGAAACGTGTTTTTGTTTTGTTTGTTTCATAAATGTTTGACAATTACACTGTACAAAAGAAAGAAAAGTAATTCGTGACAAGCATGTACTTTACTTACTATCTTATCTAACCATAA:1 - chr3L 13169940 3' + mdg1 7057 3 73.97 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATACAGTGGGCTCTGGCTAACAGGAATTAA:1 - chr2R 10078118 3' - jockey 67 1 58.90 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAAGCAGTGAA:1 + chr2L 16539802 3' - Juan 4031 1 78.08 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTAT:1 - chrX 18817270 3' + transib2 2770 1 54.11 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGACTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCC:1 + chr3L 16211591 3' + transib2 2750 1 70.00 TATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGCTTTCCGATAGCTCCATTTGGACGCATGCCTTTCCTTGTTAACGGCATTATTATTG:1 - chr2L 12202519 3' + P-element 52 1 36.99 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAAC:1 + chr2L 6654732 3' + diver 6035 2 69.18 AGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGT:1 - chr3L 10373844 3' + 297 6890 2 80.82 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAA:1 + chr2R 3563181 3' - Transpac 69 2 61.64 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATA:1 + chr3R 4683008 3' + Burdock 214 2 57.53 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGAAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTAACTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCATGCTTTTCATTTAAAATTTTCTCGTT:1 + chrX 17343446 3' + I-element 5267 1 79.17 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTT:1 - chr2R 4785244 3' - Juan 4096 1 63.70 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGAGAGC:1 + chr2R 16929829 3' + jockey 4931 1 60.96 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTG:1 + chr2L 6103000 3' - roo 92 2 82.88 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGGCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATG:1 - chrX 19054247 3' - jockey 68 1 58.22 AGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAA:1 - chr3R 19450034 3' - roo 8623 1 71.92 ATTGTCTTTTTTATGCGTATTTTATTGTTTACTTAAACATTTGGTTGTGTTCCTCAAAAATGCGGAGCTAGACTCCTTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTACACAACGTGCTTTTTTTTCAATTGTCAACTT:1 + chr3L 23976919 3' + Transib5 376 1 56.72 CTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCA:1 - chr2R 330118 3' + HMS-Beagle2 7130 2 63.70 ATCTACTCGGAACAGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAAGTTGGGACTATCAACTTCACTACGAATAAGCTATCAAATAAAGTAAGAAATTCCAATTACTACCTTATCTATGAAATATGTTTTCTTGGAACTAAGCCATTCTTCGTGT:1 - chr3R 16194418 3' - Cr1a 4100 1 54.79 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTATTTATT:2 + chr3R 14860273 3' - BS 5008 1 76.03 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCCGTGATCGGATGTTTTTTTTAATGACAGCATATAACAATTCTTATCTTCATTAG:1 - chr3L 25782377 3' - F-element 87 1 60.99 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCCCAAATTCTATTTGCT:1 - chr3R 25616458 3' + roo 396 1 76.71 CAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTGCTTACGTAATTGCAGGCTTAGTGCTGCTCAAGTCTTGTTGAAAGGTAAATATCTTGTATCTGAAAGATGGATCT:2 + chr3L 21459777 3' - Ivk 210 1 48.63 CTTCTTATTTGTGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGGCCAAGCCGGTTGGAAGTACAGTGAACATCAATCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGA:1 + chr3R 18488495 3' + roo 409 1 65.49 AGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTATATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTAAAGTTGTGGTTGTTGTTGCTTGTGTTTTGCCTGGCC:1 - chr3L 21008379 3' - F-element 4618 1 70.45 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATTTTCGTTAGCCCAA:1 + chr2R 14653256 3' + 297 6918 2 62.33 CATGGACTACATTGAAGGAAGGGAGTGCGACTTAGCCTTACATCCTGCTCATCAAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGTGCAAGGAGCGCGTGTGTGACTGCAAACTGGTCAAGATTAACCACTTAGTATATGAACC:1 + chr2R 17359989 3' + Rt1b 4925 1 65.07 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTT:1 + chr2R 6847842 3' - Doc 68 1 61.64 ATTTGANATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGCAACTAGAATTTTATCGTCGGTTCTTGCCGTACAATATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTT:1 - chr3R 19449494 3' + roo 172 2 70.77 GTAAAATAAAAAAAAATATAAAAAAAAAAGAGGAGAAGGAAAAATGGATGGGGCAGACAAAGGAG:1 - chr3L 12558566 3' + F-element 4684 1 86.15 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTCTTACAATCAGTCATTGA:1 + chr2R 7244927 3' + diver 178 2 57.53 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGGCACCACTGCGTACTTCCCGTATCACAAGCTGCGTATCTGCGCCGCGGGTGCAAAACGAAATCGACATTTAATGCGCT:1 - chr3R 23491834 3' + transib2 2783 1 57.24 TATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCC:2 + chr3R 1844860 3' - Cr1a 160 1 52.05 ATATATACATATATACATATATACATATATACATATTACATAGTTAGCTGTTATAGTGCAGTCATCATCACTTGACCCCCGCCATAACACTTCTCGTCCCTGCGAGTTAGCTGTTATAGTGCAGTCACTGTTGGTTTGGTAAAAGT:1 + chr3L 10542056 3' - G3 4505 1 58.90 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTATAT:1 + chr3R 16342063 3' - P-element 33 1 61.64 CAATAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATGTTTTGTTGTCTCTCCGCGAAACGAGGCATATAATCCCGAAAGCGCAGGATTGGGCACGCCTGTGTAGAAAGTCTCGAATTACGTTGAGAAGTCGTACAGGCGATCGATAAGCC:1 + chr2L 22688401 3' + Cr1a 442 1 66.43 TATCAGATACCCTTTACACAGCTAGTGTGAATGCAATCGCGAAATTTCATCATTTATCCCAGAAAAATGGATATTGGAGAATAAAAATTGTTCAAAATGATGAAAAAATATCCAACAATTTTTCAAA:1 - chr2R 1652249 3' - INE-1 546 1 43.31 AGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATATAATACTATCCTCCGGGTAAGGATATAGACTGGGGTGTCTGGGGGCGCTGGTTAACTGACTGGTTTTGTCTTTGGGATAGATGGAATAAAGGGCGCAAC:1 + chr3R 12909011 3' - G5 4693 1 62.20 TAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCT:1 - chr3R 2522271 3' - Tc1-2 100 1 45.21 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCCCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAG:1 - chr2R 7244827 3' - diver 5921 2 54.37 CATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCAGCA:1 - chr3R 23618151 3' + hopper 1328 1 77.40 ATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGC:1 - chr3L 11837734 3' + G5A 2738 1 54.74 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAAT:1 - chr3R 23639142 3' - pogo 58 1 59.15 ATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGG:1 - chr2R 10078161 3' - jockey 109 1 71.72 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTTTTAATCTAATCTGGTTACAACCATAAA:1 - chr3L 2145848 3' - roo 19 2 67.12 ATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCTGATCTAAGCCGCCGAGCAGCTGATGCCAAGCCATAGCCTTGAAAACTCAGTATCAATTAGCATTTCCTGCAAGTTGCAAGAAATTTTTCAAGATATGCGACATGCAGCAAA:2 - chr2L 10035831 3' + jockey 4651 1 76.71 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACAGCCTTCAACCGGCCTGCCCCCAGAAACGCGCCGCGTTGACAGGCAGAGCAAAAAAAAA:1 - chr2R 7849935 3' - roo 14 2 63.92 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAGATTTATGACCGCACATG:1 - chr2R 11794942 3' + opus 7462 2 57.14 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAA:1 + chr3R 27133670 3' + opus 7446 2 67.12 AATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAG:1 - chr2R 9966933 3' - Bari1 15 1 52.05 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGCTCTCTCCCACACA:1 - chr3R 23295530 3' + P-element 2880 2 60.92 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTT:2 - chr2L 4713872 3' + transib2 2750 1 68.49 ATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTG:1 + chr3R 30987557 3' - F-element 154 1 75.34 AAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCAATCATCTCGCTTTTGGCCTGCTTAAATTAGTAAATTCCGTGAGCCGGCCAAGCGCTTGGGAAGCAATAATTAAATACTAATTAAGCGTATAATTAGCTA:1 - chr3R 23430227 3' + gypsy2 6738 2 74.07 TATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCA:1 - chrX 12066133 3' - transib2 84 1 73.97 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTT:1 - chr2L 18549818 3' - roo 8716 2 56.85 AATAATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGGGATTACCATTTGTTGTTTCTGTTGTTGTGGCAGTCATTATCCTTAATGCCCGTGATGAGGACATGAGTGTGCATCTGTGTGTTTTAAGTGGCTG:1 - chr3R 15900773 3' - I-element 243 1 71.22 AGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCCGCCGCCTTTGAGGGAGAAGCGGG:1 - chr3R 26774057 3' + hobo 2891 1 72.53 GCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAGTATTATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGTATTAAGAGATAAGTATGAGAATTGTGCAGAAATAGGGAATGTATAT:1 + chr3R 2185629 3' + invader3 5232 2 73.60 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATAC:1 + chr2R 17878651 3' - Doc 52 1 51.37 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTCCGTTCACTTTGTATCCCTGTCAGCAGTTCTTAA:1 - chr3L 8213604 3' - blood 7088 2 76.71 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGC:1 + chr3L 1692098 3' + blood 301 2 73.57 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGATAGG:1 + chr2R 15005127 3' - BS 5042 1 51.37 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAAAGTGCTCCGGTGATGTGATAA:1 + chr2R 3563223 3' - Transpac 24 2 67.13 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAATCACACAATTATTTTATTTGTC:1 - chr3L 10373778 3' + 297 375 2 73.29 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCG:1 - chr2R 22034630 3' + copia 250 1 75.45 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCCCAAATTCTA:1 - chr3R 25616464 3' + roo 9053 2 72.60 AAATTTAAAAATAAATTAAAATATTCCCTATTAAAAAATAACGTTTATTAGTTAATTTTGTATGCACTGAGTAGTATAGTTTACTTATAAGTAATCACTTCATATGAATTTAATAATAGGTCCTTAACAGAAAATAGCTCTTGGCT:1 - chr3L 10271534 3' - Rt1b 125 1 78.08 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATCGACTTACAAACATATTGTTTAATTGTATT:1 + chr3R 14980443 3' - roo 8691 2 67.12 AACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCG:1 + chr3L 18403049 3' + P-element 2812 1 34.93 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACCACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCGTGGGGATGGCTTAGATCAGGACGCTTGGCTGCCC:1 - chr3L 8453731 3' - FB 55 1 56.25 TTTATAAACCTTTAATTTATTACTTGTAAACCTTTCCTCTAAGAGTCGCTGTACATCGCGTTGGATTCCCTTTACGAAAAAAACGCTGAAGCGAAGAACTCGACCAGGAGCTCAGTTGGGAGTTCGACTTAAACCAGGAGCTCA:1 - chr3L 229114 3' - HeT-A 458 1 68.06 ACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACGAAGAAGTTTATAAACGTAAATAAATAAATGAAACAAATAAGAAGAAAGGAATTTAAAATTTAATCAACA:1 - chr3L 22801537 3' + mdg1 232 2 58.22 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACGGC:1 - chr3L 12249772 3' - roo 14 2 71.32 ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTG:1 - chr3L 19274810 3' - transib2 83 1 71.23 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTT:1 - chr3L 5389841 3' + roo 9033 1 59.59 AATCTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCA:1 + chr2R 5151314 3' - roo 8731 2 65.03 CTCAAATTAGAATGTTCTTTTTTTTAACAATAATGTTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAGGATTAAACGTAGTTTATAGATCGCAAATGCACATAAACAGATTACACACTTGGGTTACTTGTTTACTTAAGTGAATGTACGTA:1 + chrX 15731759 3' - Circe 480 1 63.01 AAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATTTTTTTATTTTAAAATT:1 + chr3L 23038361 3' + P-element 32 1 19.29 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTCGAGGCCATTGCTATTTTTTT:1 + chr3R 19992775 3' + hopper 1395 1 72.60 TATCGCTCTCGTTTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAACAAAGCTGATAAATGAAATAAATGGGTAAATGCTAACCCGGATGA:1 + chrX 4463330 3' - roo 8727 2 75.34 ACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGTACTTGGCTTGTTCTGCTTTAATAAATATATTGGTTTACAG:1 - chr2R 20542099 3' + mdg3 60 2 71.92 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAAAT:1 - chrX 10537847 3' - I-element 54 1 54.11 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCT:1 - chr3R 11040056 3' + Bari1 1644 1 61.64 TGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGAGTTTGTTGATTTTTATCCAGCTTTTTGTTTGCATTTCACGTTATTCCACTGCAGTTGAAATTATCAATATTGTTGTTGCCCTAGTT:2 - chr3L 7859859 3' - 297 6527 1 60.27 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCC:1 + chr2L 12984211 3' - hopper 70 1 65.07 TGATAGTCGGGGCACTCGACTATAGCACTCTCTTAAGTTTTAAATAAATTTTGGATTACATGATTACATTGCGAAAAGTACATTAATTATAAACGAAACAAACAACTATTTTCAACGAAATAAAAAATTTGTTATTTAAGATAACA:1 + chr2R 5122163 3' + INE-1 563 1 60.27 AAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAGAACCAAAAAATCAATCACTTTTTATATATAAGCTTCTGTAACATGTAAATAAA:1 + chr2L 16681507 3' + pogo 1873 1 63.01 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACAAGGCACTGACAAATGTATG:1 - chr3R 10270525 3' - Juan 4041 1 73.97 ATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTTGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAATGGAAAAAATGTTTTTTTGCGTGCGATTTGTAGGATAATAAAGCCAGTTCTTTTCA:1 - chr2L 22930067 3' + INE-1 80 1 60.96 CTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGGTTTTAAAACAGCCAGGCACAAG:1 - chr2R 3593638 3' - gypsy 49 2 57.14 ATTTTTTGCTCAGAAAGCCAACATATGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATGAACTTTCCACATGCTGCGTTTTAGTTGCTCATTAATTAATTGCATTTGATTTA:2 + chrX 9484956 3' - Tc1 117 1 70.55 CGCGAGTGTCGTTCCGGATCATAGTGTCTTTTTTTATTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTCTTCTCCTTGTCGCCGGATAGGTACTTCTTGAGGTACTCCTTCTGGTCGATGACTTTGGCCTTTTGCATGG:1 + chr3R 24585055 3' - Doc2-element 282 1 62.33 TAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAA:1 + chrX 8200296 3' + flea 4951 1 61.64 ACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGT:1 - chr2R 22989618 3' + hopper2 1554 1 67.27 AAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCTGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGACACAAA:1 - chr3R 17996124 3' - diver 12 2 74.82 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAATAAT:2 + chrX 11661528 3' - pogo 27 1 67.12 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCAC:1 - chr3L 1692029 3' - blood 34 2 56.88 GTTTCTCGATAATATTTGTATAGTAAGGATGGGTGTCATCGTTATCAGTGATGCAGCTTTCAGCTTGCTTTGCTATTGTTGTCAATTGTCAAGC:1 + chr3R 4531068 3' - mdg3 5361 2 64.89 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAG:1 + chr3R 16342003 3' - P-element 93 1 20.55 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGA:1 - chr3R 17673741 3' - FB 57 1 58.22 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCAAAAGCTAAGCTAATGA:1 + chr3R 17736998 3' + opus 7492 2 75.76 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCCCATGAAAAGAGAAGGAAAACTA:1 - chr2R 5151172 3' + roo 404 1 80.00 TATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATTTTGTTGTTGAAGAAACTTTCTGATGCACGCTCCTGCTGTTAATTGCTAATTGGAGCGGATCGCAAAAAATATTTACAATTAATATACAATGGCGCG:1 + chr3L 6330006 3' - Chimpo 186 1 67.81 GTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAAATTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAAAAAACTTATAAATTATAGAAGAATTCAATCATTTATTTAAGGG:1 + chr4 130257 3' - hopper 1226 1 62.18 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACTGAT:1 - chr3R 21933143 3' + pogo 2047 1 66.19 AAGGGAAATATTTTTATGGCATATTGGCCAGATCGGTTATATGGCAGCTATATGAAAAGTGACCAAAACACTTGGAAATTTTTAAAACATCTTTGGGGGAGGAAAAGGGAAAACAAACCAAAAAT:1 - chr3R 15649509 3' + transib1 1982 1 64.80 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCCGTGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTCATT:1 - chr3L 25782379 3' - F-element 94 1 71.92 TAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACCAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCCCGTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGAACCCAAATAAATAATACTTACT:1 - chr3R 3922950 3' - Cr1a 71 1 63.16 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTG:1 + chr2R 8735698 3' - mdg1 7075 2 58.90 CGGTATGGCTCCGGAACTCTCCAGAGACCATAAATTCCAGGATGGAATATGAAATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAACATCGATGCCGCCATCGATGCTGACAATCGGCCTATTGAGTACTTG:1 + chr2R 8156691 3' - Circe 388 1 67.81 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGC:1 - chrX 9530324 3' + 297 319 2 71.92 CCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTGGCAGGAAGCTCAAGTTCAAAACTTAACAAACTTGCCGAGCA:1 + chr3R 26653334 3' + F-element 4477 1 68.35 TATTTTAAATAAAAAATAAAAGGATATTTTAAAGGCCACAAGAGCCCTGTAATAATAATAATAATATATCTTATGTGTGTACTAACCATCATGATAGTACAAGTTTGTTTGTCTAGTAAGAAAACCATGTTGAGATATATTGT:1 - chr2R 13283107 3' + G2 3051 1 76.92 GCTGCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCGGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATACGTCCCAGCGGAAAAATTCACGACGACTACT:1 + chr2R 6482506 3' - gypsy 7075 2 73.97 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTT:1 - chr3R 9595030 3' + Tirant 8443 2 77.50 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAA:1 - chr3R 9038913 3' - Juan 4030 1 61.67 CCCTACCCGGAGGATAGTATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAAATTTTTTTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTATTTTCCTTTTTTTTAAGTTCTTT:1 + chr3R 7281038 3' + G5 4665 1 60.00 ATTCTCTTCAGACGTCGAAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACATGTTTGGGTGGTCTCTAAGTCTGTGGGCATATGTATAACGGATACCATTCATAAAGTGACCTAAACCTACACAAGAGATGAACCACTGCATTTG:1 - chr3L 11837550 3' - G5A 2672 1 56.16 GCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCTTTCACTGCTTTAAAGCAGCTAACGAACCGACAAAAAATATTTGTCATATGTCAGGGCAGCGGCAAT:1 - chr2R 18322377 3' + HMS-Beagle2 6852 1 56.16 ATTATTGTCATATTGTTCATTATCATTAATTTAAATTAATAAAAATTGCAACAATTTAACATTTCCTCACTTTCTTTTTATTTTTAAACAATTTTTGGTAAAGTTTCATTAAGATATTGTAGTTTTAAGAGGGAGAGACTTGATTG:2 - chr2L 20430998 3' + Transib5 2570 1 52.05 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAAGGC:1 + chr3L 10373909 3' - 297 15 2 58.62 AAAAAAAAAATAAACAAAAAATTAAATGAAAAACGACCTATGGTGGGGGGGGACAAAGGAACGGGATAGGAAAGGTGGCAAA:1 + chrX 17498968 3' - hopper 143 8 87.80 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCA:1 + chr3L 24934419 3' + HMS-Beagle2 272 2 60.00 AATTGGAAACAGCATTTCTTGGGTATAATGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAAGAATCAACATTTTATGCTATGGAAAATTTTACGCATGCAATAAATAAATGTAATTCGAAAAACGGAAAATATGTTGGAGTTTGTATCTTAAT:1 + chr2R 18754683 3' + TLD2_LTR 169 1 66.44 AAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTCGCTCCGGTTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCTTG:1 - chr2R 3292696 3' + hopper 1412 2 65.07 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATT:1 + chr3L 27391407 3' + 1360 3350 1 54.11 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAATTTTTTGTTACAGAAAATGTAAGAGATCTTTGAGATAATTGGATAAA:1 - chr3L 8959558 3' + 1360 3366 1 68.53 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTATTTTAACTCA:1 - chr2L 16540898 3' - hobo 31 1 63.70 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACG:1 + chr3L 3983902 3' - P-element 57 1 51.85 AAGAGCATGCTCAGCATTCACACGCTCCGCGATGGGCTTATTAATTGTATAAGTTATTATATGTGTGTTTTCATGATTGTCGATACGATGTCCTACTAATTACATATATTTATTGAAGAATA:1 - chr3L 16677390 3' + 412 7240 8 76.23 AAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAGCAAAGTTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAA:1 + chr3L 14351999 3' + TAHRE 10381 1 55.48 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCC:1 + chrX 12986607 3' - roo 8750 2 78.08 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTTGCTCGTTTTTGCGATTACTATCGCCGGACATTTTTACTCGTTTTTTTTTCTCTCC:1 + chr3R 26774149 3' - hobo 20 1 70.92 ATACCTGTTATATTTTTAAAAACAATTACACCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCATATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTGCACCGACAATATCCAGGGAATGCCTTAAACGCTCATTGGCTTACACAAAT:1 + chr3L 23062707 3' + Stalker4 402 1 75.34 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAAAACTGGGAGACTATTTTTC:1 + chr2R 5151368 3' - roo 16 2 71.92 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATA:1 - chr3R 27986366 3' + roo 326 2 73.29 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGAATACAATTCCAAAGCGCTGAATGCAATCAAACATTTATTACAAAAC:1 + chr2R 9965132 3' + mdg1 7448 2 45.21 GGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGG:1 - chr3R 11469329 3' - Tabor 6925 2 78.08 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTTAAATTGCC:1 + chr2L 20266065 3' - roo 8699 2 60.27 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGGGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAA:1 + chr3L 18505728 3' - I-element 75 1 69.86 GGCAAAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAATATATGTAGGAAATGAACCAGATCAGCGAACTAAAATGATCGATAACACAGAGAGAAAAAAGGGTTAGGAATAATCGTTGGTATAAAAGTTTAAGTAAGCACAGATCAAGTTA:1 - chr3L 20701474 3' - Cr1a 4230 1 60.27 AATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATATGGGCGCTTTTAAGTAAAATGTATTTGCGGGCTGTTTCGACCGAAAACCCGGCAGTGATTTGATCGCATTTCCAGGCAATTGATATGC:1 - chrX 4572881 3' - FB 165 1 58.90 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATAAATTTTATATTTCTTTCATATAATAATATGAATCCATTTT:3 - chrX 23431559 3' + 297 359 2 62.33 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTC:1 - chr2R 13259306 3' + mdg1 7379 2 73.05 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCAC:1 - chr3R 4461033 3' - blood 7086 2 71.23 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGA:1 + chrX 8360649 3' + roo 9032 1 58.90 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTAT:4 - chrX 13134895 3' - jockey 4828 1 62.33 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTATGG:1 - chr2R 13766171 3' + roo 9047 1 67.14 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCACAAGTAGGCA:1 + chr3L 21763766 3' - jockey 56 1 59.66 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCA:1 - chr3L 18505658 3' + I-element 5280 1 67.81 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAGAACTAAGGAGA:1 - chr2R 9544838 3' + roo 344 2 61.64 GTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATA:1 + chrX 20999566 3' - BS 74 1 76.81 GAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAA:1 - chrX 14722119 3' + diver 152 2 65.07 ATCTTTAGGTATTTCATTTCAAACAATTCAACAAATGTTTCACTTTTATTTGTTCAATAGTTTCGATAATATAGATTAAAGCAACATAAACTCGCAGGAAATATCCAATCAATTTGTACCTAAGTACAGACATATGTACGTCTG:1 - chr2L 21910020 3' - HB 1529 1 62.50 AAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAG:1 - chr3R 904967 3' - rover 7027 2 82.19 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAA:1 - 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chr3L 24131384 3' - Transpac 50 2 56.16 AGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGTTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAACCAAAAAAAAGAAATATAACAAAAATGAGGGAGAGGTTGAAAAAGTGGGGTGCTGGTGCATTTTTGGTGGT:2 - chr2L 16270284 3' + R1A1-element 90 1 49.32 ATTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGACA:1 - chr2R 11794978 3' + opus 7428 2 81.16 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTGGTTGGTTCTACATCGGTGTGAGTTTA:1 - chr3R 26404973 3' - hobo 44 1 55.48 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTTCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATG:1 - chrX 19054247 3' - jockey 68 1 58.22 TATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGACGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATGTGTGTTGTTAATGTTTCTATTTATAAAGAGAATA:1 + chr3R 851880 3' - Cr1a 4117 1 76.03 ATGGTTAAAATATTTTAATTCCATTTTTAATGACTTAAATCGGAATCAGTCTCGTACCCAGATAAGTTGGGTCAAGAGTTCAATACAAAACAAGAGGGAATAGTC:1 + chr2L 9634738 3' - Juan 431 1 67.62 ATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTGTTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATGTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAATAGGCTTAATGGGATACCAGCTAAATGGGTTACAAAAGTGACT:1 - chr3L 5016890 3' - G5 4744 1 69.86 CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAGAAATAACCTGGTGCCATTTAGAAAGGCTATTAAAATATAAAGCAGCAGGGAAAGAGTGATGCAATAAACACAATATGCCTTCA:1 + chr3R 4180048 3' - INE-1 17 1 74.83 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTA:3 - chr3R 18971687 3' + Juan 4172 1 48.63 ACCCGTTACTAAGCTAGTGTGAATGCAAACGCGAAGTTTCACAATTTTACTGGGATTTAAAAATGAGAATAAAATAAGACAAAATAAAATAAAAGAGCCAGCGAACGACAACGGATGATTTGCTGCGGACGATGTACTA:1 + chr3R 28847138 3' - INE-1 538 1 61.15 GTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACCAACTATAACCTTTCAGCCGCCAGAGTTTCAGCGTATGTAATTGATGTGAAAGTGAAATTTCGTT:1 - chrX 1971197 3' - aurora-element 4188 1 55.17 TAATATTTTATTTTATTTTTTTACTTTTGCTTTTTTTTTGCTTTGCTTTTGCCTTTTTTTTTATTGAATCTTCTCAAATTTGATACTAACAGTTCGCAGAATCTTTGATTGACATATTCTATAATGTCTATGTTGGGGCTCGCGTT:1 + chr2R 4570966 3' - G7 1149 2 58.90 GTCAATCCGTTTAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATT:1 + chr3L 23112567 3' + R2-element 3212 1 49.61 TAGAAACAGTTAACGAAACTATTTTAAAAAAGCAGCAAAAAACACGACACCACTGGACAGACCCCTGCACACATATTTCTCTACGCTGGACAACCAATATTAGATACCCAACAAAACAAAGAAAACAAAATAAACAAAATAAATAA:1 + chr3L 11255462 3' + Porto1 4411 1 73.29 GGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTCCAAGTCCGGTGCGGCATCCAAGTTGGAGCAGCAAGAAGAACTATGCAAC:1 + chr3R 27374224 3' - Doc 4502 1 65.52 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATTACGCGG:1 - chrX 19266805 3' + roo 9047 1 59.59 CTTGCGTCGAAATCTTCTTCCGCGCTTTTTAATAATAATTTCGGGAATCTTTGGAGCTTTTAACTGCCACCTCTGTGCTCTTGGCCACATGTTCTTGCCAATTGGCTTTTGCACCACCAAAAACGGTTAGCTCTCCTGATTCATT:1 + chr3R 18772928 3' - invader2 460 1 75.17 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTCAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGTTGATTGTTACAAAGCCCGAGCATTAATTACTGCTGTCTAGTCAAATTAA:1 - chr3R 4480704 3' - S-element 69 1 67.12 AAGTTATTTTGTAAATATTAAGATAATGAATGAGAAACCTGCTTTTGAAGAACGTGACAATGGCGGTGCAAAAGCAAAAGTGCTTTGACCTTACTCAAGAGATGGAAAAA:1 + chr2L 19440259 3' + BS 303 1 71.82 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTG:1 + chr2L 16690705 3' + P-element 2809 1 30.82 ATATAATTTTTATTTCACTAAATAATTACAAAACTTTTTGTTTGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAAACTTCTAAGCGTGCGGACAGACCAAATATCATCCTCTGTCGTCGTCTAG:1 - chr3L 27600791 3' - Idefix 7356 2 73.29 CATATTTAAAAAAAAAAAGTAGGTTAACAACAACGTATATTCACAGTTCTTATAAATAAATTCAAAATATTACGAGAGATTTACAAAATTCAGATTTTCCTTAAACATAAAACCAAAAACCAAAAAATGTTTAAAAAAAATTTTAT:1 + chrX 12557700 3' + Tc1-2 1203 1 52.05 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGAATTGTGTTCATTAAAAAGTCTTAAACAACGTAGTATTA:1 - chr3L 14372392 3' - hobo 81 1 73.97 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACGAATCGGACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCAC:1 + chr3R 5351455 3' - 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chr3R 21330799 3' + INE-1 549 1 73.97 GTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTTAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTCGTCCAAATAATCCTCTCTATCCAGCTGAAATTCTGAATTTAAATCGGAAACTTCCATTTCAAGCATTTTA:1 - chr4 1166209 3' + 1360 2984 1 51.37 AAAGTGTCACAATGCATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGCTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCAAAATATGAAAACCCTCTATTTTACTCTCAAAATCTTCGT:1 - chr2L 7233397 3' - Stalker 6908 4 65.57 TGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGTCTCAAGATATGAGAAAAATATATGGCAGTGAAAGGGATGTCAACAAATCTATGTATCTTTTTGGTG:1 - chr2R 4322571 3' + 1360 460 1 54.74 TATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCT:2 + chr3L 23513839 3' - Juan 87 1 73.97 TGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAATCTAGGCAAGATAAGAAAAAAATTTATTGACATTTATATTAAAGTTATCCCAGAAAGAAAAGTTTTTATATAAATTTTATGCTATATTTT:1 - chr3R 13639668 3' + BS 5063 1 66.44 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAATGGTCCATAGAATAGGCGTTTGATTGAGCCACCCCTTTCTCCACCTGATGGCAAAGCGATG:1 - chr3L 6397604 3' - roo 8674 2 73.79 AAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGGCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCCAGTCGGCGGACAAA:1 - chr2L 14675660 3' - 297 22 2 54.08 GTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTT:1 - chr2L 18212107 3' - Quasimodo 27 2 59.50 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGA:2 - chr3R 26504199 3' - HMS-Beagle 6842 2 54.11 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAAAGCTATACCATCTAAGTTAGACAAGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACAATTACTTAACCCATTTTA:1 - chr3L 18505676 3' + I-element 5286 1 68.03 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTTATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTT:1 - chr3R 23639132 3' - pogo 31 1 55.20 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGTACACCCTATTCTCGAGTGGATCGGTGAAGTGATCAGC:1 + chr3R 28901660 3' + transib2 2787 1 46.67 GTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATTAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTATATGCGCTATTTAAAGGCACCACTTCGGGAAAAAGTATTTGAGAATTATAAAACCTCAACCGAAC:1 + chrX 3546170 3' - ZAM 8215 2 53.42 AGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAG:2 + chr3L 13365820 3' + BS 5018 1 71.23 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAA:1 - chr2L 17809155 3' + jockey 4955 1 56.55 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAATTTTATTT:1 + chr2R 1916453 3' - Juan 58 1 54.11 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTAT:1 - chr3L 15913858 3' - jockey 4830 1 67.12 AACTAAGAATACTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAAC:1 + chrY 1421301 3' + flea 4948 1 63.01 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGG:1 + chrX 8308492 3' + roo 9006 2 65.52 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCT:1 + chr3L 18931043 3' - I-element 75 1 67.12 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATATACGCTATTTTAGATAATATCGTTGAAACAAAAGTCAAGTTTCTATTATACATAGAATAACAAATCGTTTCCATATATTATCGTTAATTTTTGGTGGCAGGCAAA:1 + chrX 23431481 3' + roo 397 1 77.78 AAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGATAAGATATATAAGACCGCCAAAAGAATCTGCTTGTCTAGCTTTTAAAGTTCACGAGATACGGACATGGCAAGATCGGAG:1 + chrX 20373695 3' - 297 6603 2 67.69 CTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAAGACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCA:1 + chr3L 12004311 3' + P-element 2814 1 24.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCG:1 + chr2L 8338221 3' + P-element 2838 1 52.74 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACTGCAATGCCACAATTGAGGTGCAT:1 - chr3L 4219466 3' - jockey 72 1 60.96 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTT:1 + chr3L 12249902 3' + roo 346 2 60.27 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATC:1 - chrX 10521669 3' - Tabor 44 2 74.16 CTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAGCCGGATTTG:1 + chrX 18336717 3' - mdg3 5272 2 70.21 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCC:1 + chr2R 6847824 3' - Doc 80 1 71.43 ATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTC:1 - chr2R 1320646 3' + diver2 345 2 64.49 TTTATAGTTCCTGTGATTTCGAAGTTTAACGGTCAGACATAAAGTTCCGGATTAAAAATATATATACGTTT:1 - chr3L 6838705 3' - INE-1 146 1 81.69 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAGC:1 - chr2R 4855156 3' - transib2 35 1 61.64 ACAACACGTACACATATACGCGGAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 3216 1 79.82 AAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTTGTTTGGTTTTTTGATATGTTGTCGTTGCGGTCCTCTGGGGAAAAGGGGC:1 + chr3R 30221390 3' - Ivk 5019 1 59.49 AATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTCTATATATAAATTTATCTATTTATAAAATTTATATTATATATATTATATCATATATTATTGT:1 + chr3L 18497501 3' - 297 6602 2 54.81 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAG:1 + chr2L 47204 3' + roo 9023 2 52.05 ATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTAACTTTGCTTTTTTGCTTTGCTGGTGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - TAHRE 61 1 61.64 AGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGCTCGACTAGATTGGGATTGCGACAAGGAAGGTCGCTGTGGCTTACCAGTTTTCCATATCCACATCCTGTTCGCGTTTGGCTGG:1 + chr2R 8417640 3' - I-element 5172 1 60.29 AGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTT:2 + chr2L 71253 3' - 412 7132 2 69.86 CTATACCTGTTATATTTTTAAAAACAATTACACCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCATATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTGCACCGACAATATCCAGGGAATGCCTTAAACGCTCATTGGCTTACACAA:1 + chr3L 23062705 3' + Stalker4 400 1 73.97 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTATTAACCCCTAAAGACCATTCTACAGATCGTCG:1 + chr3L 47032 3' - FB 35 1 60.27 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGCAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATAT:1 - chr2R 2590721 3' + HMS-Beagle 167 2 71.72 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAG:2 + chr3L 7889647 3' + roo 335 2 67.81 TTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTT:1 + chr2R 20227302 3' + hopper2 1530 1 71.92 TAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATGCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCGTATATAGTCGGCAGTCAGCACATTTTTGTTGATTCGATCAAAATTAGTACACAAATGTAATATGAAAAGA:1 - chr3R 4096651 3' - I-element 387 1 51.37 ATAATAATAATAATAACAACAACGACAACAATAACAGCAGCAAT:1 - chr3L 10987207 3' + mdg1 7058 4 84.09 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCTTTTTATGCTGAT:1 - chr3L 18505669 3' + I-element 5310 1 65.71 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACTGTCCACCCGAAAAACCCCATCGCTTTTCCGCGA:1 + chr3R 15054363 3' + copia 247 1 75.34 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATT:1 - chr3R 26504195 3' - HMS-Beagle 6838 2 56.85 CATCATAAATATAAATATACCATAAGAAACCCCTATCTTATTGTGCTAATGAGGCAAGTGTCAAGCAAAATGTACAAATGCCTCATTAGCACAATAAGATAGG:1 + chr2L 19906311 3' + Stalker4 7039 4 54.37 ATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAGATTTAATTTTTCAAATATACAAGCTCTAAGTTGCATACTCGCTGCTGCGTGAGAAATACATATGTATATAAAA:1 - chr2L 8113383 3' - FB 625 3 50.68 CATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATTAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATTTGCACAACTCGCCCAATCCCCAGCTGTCTGTGGATTGTCCGAATCCGCTGCTAATT:1 - chrX 20777156 3' + Doc3-element 4421 1 60.96 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACCACCCACCCCACTCCACTTCACTTCGCAGGTCTGGGCAAAATCGATATTATGGCACACTATGCTGCTGTGCTATTTGCGCAATGCA:1 + chr3R 20818458 3' + 1360 3354 1 61.64 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGC:1 + chrX 21224631 3' + roo 9015 2 60.15 CAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCACTCTGGCTGTAGGCCGGACCCTCGGTAACCGATAAGGCCTGGCCC:1 - chr2R 8393681 3' - 17.6 7145 2 68.31 GGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATGCAGACAGCTCATCGCTTATTCCATCTTTATGATTACCGAAGCGACCCAAAGCCAACA:1 - chr3R 29347418 3' + Porto1 4291 1 60.27 AGTACATTTGGCATGATTATTTCTTTTTATTAATTCATATAATAAATTTAAGCTGAATTTTTCTTATGTATCTTTTTAATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACC:1 - chr3R 22496254 3' - transib3 2695 1 60.96 AAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTAGGGGAATGGAAAGGGGAATGAGAATGGGGTTAGCCGAGCTCTGGTCCCTGCGGTAAATCGCAACCGAGCGGCTAAACAAAACTTGATTATTTGGTGCGGTCTATGTGCGA:1 - chr2L 15136816 3' - 297 6543 2 80.14 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGACAAGCTAGATCTCGAATTGGC:1 - chr3R 27123486 3' - roo 8733 2 63.70 CAAAACAAAAAAAAAAACTTTTATAAATAAAAAAGCGGTTTTGGGAATTTTGGAGCATAACAAAAGGCTCATTGACTAAACA:1 - chr3R 27626771 3' + HMS-Beagle2 492 3 79.27 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCA:2 - chr3L 10373836 3' + 297 317 2 75.34 ATTATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATTATTATTAATCTTTTTCCTATTGTTTTTATAATTTTTTTTAAATTATTATCGTATTATTATTATTGATTATTGTTAACTTAAAGGAATTTCCATCTTAACACTAGCACTTTTTTA:1 - chr2L 15762856 3' - mdg1 7062 2 41.78 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTGAATTAAGTAACCCACA:1 - chr2R 20010214 3' + Juan 4135 1 72.60 ATATATAATATGAATATAATATATGAATATTATTGATAAGATACTAAACAAAAATGTGTTCTTGTTCTATAAACTATAGTTAAATTCTCAAAAAATTAAGTTTAAATAATAAGTTTCGTCTAAAAATCTGTAATATCCTTTCTAT:1 - chr3L 10321085 3' + transib1 1922 1 66.90 ATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACTCTTGGAAGGCCTGTCGGAATTAGTATGTATGTATGTATGTATTTGTCGAGTTGAAGTGCTGC:1 + chr3L 23249273 3' - rover 6965 2 62.86 CAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAG:1 - chr2R 18514889 3' + P-element 333 1 37.59 AAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATACATATCTGGAGAAGAGAAATTGGGGATCCTTTCGAGGTATTTGGACGAAGCATCTGGTAAATTTAAACATTAATTAACATACG:1 + chr3L 8961011 3' + 1360 122 1 68.50 GTCTACCATTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTAGTTTATATTGTATGATGCGGCCCCATCGCGTCTAGGCTATGAAATCTGTTACCTTTATTTACGAAAATGCAGACACATGCGGACCAATGAAATACCTTAGTCTGGTAA:1 - chrX 13650357 3' - Idefix 6984 2 77.40 GTTTTTGTATTTAATTTATTTAATTTATATGAATTTAAAAGCATACTTTTAGGCAGACGTTAGGAAATGCAAAATTTTCTTGGTATTTTATAACACTAATTTTGTGGAAGAATACACCCCCAATAAGTTGGGCATATTTTCGGATA:1 - chr2R 13558164 3' - X-element 4718 1 80.82 TTTAAAGAAAAAAACAGAAAATAAACTAATGGAAATCTGGTTTAATAACACAAGTTTCCAGAGTGTGCGATATTTTTGTATTTGAATGGAAATGAATAAATGACAGAGTTTGCCAACAAAAAATAAAATATTCTCCCTGAAGTTTG:1 + chr3R 26294461 3' - Juan 80 1 71.92 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAA:2 + chr3L 7889672 3' + roo 360 2 52.74 AAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTCACAGTGCACACAGCAGAGCCGAACCCAACTTT:2 + chr3R 12728118 3' + Juan 4203 1 73.29 GTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTCTGATGAATACTC:1 + chr3R 3286229 3' + Gypsy12A_LTR 1954 1 78.77 AATACGAAAAACTTATCGAAGGGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATGAGAACTCTTTGGATTTCGTAGATCAGGTTTGAAATTATATTATAGGGTTTATTTCTTGGAAAAATTCCGCTTCCATCAAG:1 - chr2L 7697226 3' + Dm88 291 1 50.68 TGGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAAT:1 + chr2L 15076201 3' - 1360 64 1 58.62 AGCCACGGCAAAAACTATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATCTATTATATTGTGTGCATGCTGT:1 - chr2L 15076177 3' - hopper 405 1 80.95 AATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAA:1 + chr3R 24729651 3' - Juan 4153 1 68.49 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTATGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCTAGAACTCTTAA:1 + chr3L 3030328 3' - roo 37 2 56.16 CTATACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCTGGATACCCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGTTTATTTGTTTCTCTGTTTTAAATTAAATAATTTGAC:1 - chr3L 19450188 3' - R1A1-element 5259 1 71.92 TACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGATTTCAGATTCCTAATTATGCGTTTGATTGTGGTTTTTTCGCAGACTATCCAGATTCCCCCAAAGAATTTGTACATTTATATA:1 - chr3R 25108250 3' - Doc 4452 1 52.74 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGATTGCAGCC:3 + chr3R 27133686 3' + opus 459 2 57.53 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATG:1 + chr2R 6847872 3' - Doc 37 1 64.83 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTAAATTGTGGTTAGTACAAATGAATGCTCTGCGCAAATCTGCAGATCTGCAGCAGTCCGCCGGCTTACCTGATCAGTTATAAAGCGAATTTCCTTTAAGATTAAACCTATTTCATATTCAGTTG:1 - chr2L 14088806 3' - I-element 5136 1 78.08 AATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGTCTCTTATCTGGACGACAGTTATCAGAGCGACTCGCTGGCCC:1 - chr2R 17796570 3' - jockey 4751 1 72.73 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGG:1 - chr2R 5941351 3' + copia 174 2 73.97 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTCACAGTGCACA:2 + chr3R 12728096 3' + Juan 4181 1 58.22 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATT:1 - chr3R 6419856 3' + Tabor 421 2 69.63 CCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGA:1 - chr3L 23933569 3' + Cr1a 224 1 78.70 TGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATCTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCAC:1 - chr2R 19199684 3' - hopper 81 1 71.92 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGC:4 + chr3L 3983866 3' + P-element 2795 1 23.29 AATTATTAAACTAAATGAAATGATAGTGATAATAAACAAGTTACCTTTCCTGACAAATTTTTATAGTGTAACGTTATTAGTAAATAAACTTTATCTATTTTTTGATCACACATAATAAGTTTTTCAGGCCTTATTAATATGCTTTT:1 - chr3L 7949348 3' + S-element 385 1 57.53 CTAGTCAATTAAATAAAATAATTTCTTTAATAAAATTAAAGGACAACTAAACGGAAGGAAAATATCGTGAGCAGAAAATAATATTAAGTCTTTAAAAGAATTAATAAAATAATAGCAAGATACAGGGAATACTATAGAGTTTTAAA:1 + chr3R 904674 3' + jockey2 3376 1 47.95 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTACTATTTGCCTACAAATCGTAAATTCAAATAATAAACTCCTTTTAAGACGTAAAAAAGTATACAAGTGATTTTTATATTGA:1 - chrX 17716982 3' - FB 41 1 53.10 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTGAGGGTGTATGCTTTGATAATTGTTTGTGTGGTTTGATATGCGGGTGGGGGATGTTAGCACAAATTGTGCTCGTTGTTTTCTGTTTTAACAACAATT:1 - chr3L 24911502 3' - 1360 23 1 64.14 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTCGAAATTATTGA:1 - chr2R 20010161 3' + Juan 4188 1 65.07 GATAACATACGTAAGACAAAATTGATGGCAAATCATTTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTAGAGGTGTGCAGAGTAGTAAGTATCTTAACTCAGTTCTAAGGGTACCTGCATGTCGGAATCGGAATAGGCCGGAAATGAGCTATA:1 - chr3L 24735492 3' + transib1 177 1 60.96 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTT:1 - chr2R 5941329 3' + copia 196 2 58.90 TTATACATACATATATACGCTAGTATTTATATTTAAGCTGCATGAGCTCCGAACTCTGGCTGTGGACTTTCGGAGGGTTAATGTGATTGAAATCCTGCCAAAGGATAATCCGCTTTTCTTCTTGTCAAAAATGTGATATTCCTAAA:1 + chr3L 977948 3' + blood 7197 2 65.07 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTAGAAACG:2 - chr3L 9809211 3' - 412 7078 2 67.12 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCTGCTGCTGCGTCACTTCACATTCGTATCATTTACATACGCAGCACTGCGGAGTGA:1 - chr3R 23067389 3' - roo 20 2 68.97 GAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTTAAATGTGACAACAGAGTCTAGAAATCAATCAGAATGGAGGTCTATTTAAGCAGGCCGAGGCTTAAAGCG:1 - chr3L 23942025 3' - 1360 3153 1 54.79 ACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTTTGGCCGCAGGTGTACCGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCTCTTAAATGCGCCATGAAGGTATTCCAATGACACGTCGTCATTTTCCTTTAGCCACTGCATCAC:1 + chr4 875262 3' - Bari1 473 1 56.16 AATTTACAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGCTTGGTACCTTTTTTCATGAAGAGGAATCACAAAGGCCTCCTGAAAAGATGGTGGAATGGTTTGGAGAATACCCAACTCGGGCGCTGGTGCGACAGATACGTCGACTGGAA:1 + chr3L 25725527 3' - Q-element 107 2 52.74 TATACATACGTACATACCATATATGGCCGGTGGCCATTTCCTTGCATTTTTTGTGTCTTCTTCATTGCAGAAACCGCCGGCGAACTTGGATGGGCATTCACCCTAATCATAGTTTCAATCATATCGGCTCTAATAGG:1 + chr3L 6476588 3' - invader3 5083 1 63.50 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATACGTTCTTAGAAT:1 + chr2R 17878662 3' - Doc 41 1 58.90 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTGGGCGCATTATCATTTTAT:1 - chr3L 16970318 3' + roo 391 2 71.92 TCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGTTACTTTAATGTGTAAAACAGCTGTTTTACTATAATTGGAACTTTAATAGATAAATAA:1 - chr3L 11581189 3' + jockey 4803 1 60.27 AAAACAGCGGTTTGCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTACAATATTAAAGAGTATCAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTTGGCATACTGGCTCTGAAAACATTAACCTTAAGACTTCAAA:1 - chr2L 22217607 3' - diver2 4628 2 70.29 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATAATATATATTATATATTATATATATAATATTTTTACATTGTTTTTATCAAATTTCCACTAAATTTGTATGACTAAATTTCGGGATTCCGCTCGCC:1 + chr3L 23688691 3' - Quasimodo 18 2 71.92 TGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATAGTGTCCTCGATAAGTCCTTGGGCTGGAGAACCGTTCCTAGTTTTAGTACATGTAGTGTTGGACGGTTACCTTGCTC:1 + chr2R 8148357 3' - I-element 5164 1 60.61 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAG:1 - chr3L 13294893 3' - roo 50 2 62.10 ATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTC:1 + chr3R 25709870 3' - hopper 43 1 50.00 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCT:1 - chr3R 22642261 3' - blood 7050 2 57.24 ATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTATTTATACTTTTCTTTTCCTATATGTAGCTAATTAAAATGTTGTATTCGTTTCTGTGTAATTCGGACGCGCCTACAAAAGTTTGCATACTCGTTTAGTCTCAATA:1 + chr2R 15843437 3' - Idefix 7145 2 67.81 ATAAAACTATGAGTCAGAAAGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAAATAGTTCAAATAGTACGTCTCCAACTGCTCGAGACAATCAAACTGCACACATATTACAACAAGAAG:1 - chrX 8969875 3' + F-element 184 1 54.48 TTTTTTAATGTCCTTATATGTTTTTCCTTCGTTTCTTAGCATACGAATTAACATTCTGTTCTCCTCGGAGCAGTGCTGTCCTCTACTTTACAGCCATTCCCGATGGCATATTCTCGCAGAGCGGCAGTACGGCCGTGATGTTTACA:1 - chr2R 13597874 3' - HB 419 1 58.90 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCA:1 - chrX 21632968 3' + mdg1 366 2 56.16 AAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAA:1 + chr3L 19350037 3' - 1360 3232 1 48.97 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGTAG:1 + chr2R 11804759 3' - pogo 31 1 64.38 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTA:1 + chr2L 11357909 3' + blood 303 2 69.18 GCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGA:1 + chr3L 6447106 3' + transib2 2745 1 71.92 TTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTGAGGTATTAATGTGTTAGAACTCGATTGTAGGTGGTAATTTG:1 + chr2R 20010726 3' - Juan 4115 1 64.38 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACA:1 + chr3L 19350030 3' - 1360 3240 1 43.84 AATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATCCCCTCTTGCGGGCGAGCGTACGGGGTGCGAGGGCAGGCA:1 - chr2R 6591193 3' - 1360 344 1 71.92 AGAAAAATATTTCATATTCTGTGATTTATAAAAAAAAAACAATGCTTACACATCACTACTGCCCGAAGAGTCTCTAAAAATGAATTAGGCTCAATGAAGCGATTTGCTAATAAATTAACAATTAAAGCCGTCAACTTAATGAAGT:1 + chrX 11274433 3' + looper1 1670 1 53.10 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAACAG:1 + chr3L 19111614 3' - Doc 11 1 77.55 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGC:1 - chr3R 9298484 3' - hopper 80 1 69.86 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGATGGCAACACCCAGAATATAATGGTG:1 + chr3L 13739698 3' - BS 5015 1 68.49 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACCGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTGT:1 + chr2L 16943901 3' + copia 246 1 50.00 AACAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTTACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTT:1 + chr3R 11040131 3' - Bari1 86 1 74.13 ATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCCTTTGCATCTGTATCCGAATCGTACGCTCACTAAACTTTCGTTTAATTTAGCCAAGTTCAAA:1 - chr2R 14267064 3' - F-element 4386 1 60.27 AAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCCGTCAACATATAGCTTTGTTTACCTTGATGTATCTTGTGATCTCAATGGGATTCAAAGCCCGATC:1 - chrX 21581707 3' + Juan 174 1 55.48 ATTGCCTTAACGTTATTATTATCTAAATATAGCTTAGAAATAGTAATAGCTGAATCATAATATCACAAAATAAATTTTAAACTTGCAACTGTGTGCGGGCATCCGTGTGGGTGTTTCTGC:1 - chr3R 12854783 3' + 1360 304 1 67.50 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTTTTGATATTTTGATTCTT:1 - chr2L 19404848 3' - Juan 4043 1 57.53 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACTAACG:1 - chr2L 7125727 3' - I-element 33 1 60.96 CTTTAAAACTAAAACTACTTAAACTACTTAAACTATGGCGACAAAAACGGACAATGGAAATGCTGCTAGGATTGGAGTTTGAAATTTGTTTATCAACTGGGGCAATTTGCTATATTTACGGGTTGGATAGCTTGTATGTTG:1 + chr4 1270206 3' + TART-B 10204 1 75.18 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGCGATACATGAAGTGGTGGGGAACGGAAAACTGATATGGC:1 + chr3L 18403098 3' + P-element 2861 1 68.49 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATTTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTT:1 + chr2L 14074534 3' - 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Tc1 151 1 50.68 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGTGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCT:1 + chr2L 19924083 3' + roo 390 2 63.01 ATTGCTAGAGGACGATATATTACAAAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTT:1 - chr3L 19274816 3' - transib2 52 1 67.89 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGCCACTGATGAATATATATATAAATATATAGCAAACATCTTAGCGTTCTAATACGTTATTACGAATCAAAAGTATTAAGTAAATATA:1 + chrX 14310342 3' + roo 9037 1 45.21 GGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAAC:1 + chr3L 23112570 3' + R2-element 3198 1 52.74 AGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGCCGAAAGGGACA:1 + chr2L 6647706 3' - mdg3 80 2 71.94 AAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATGAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGAT:1 + chr3R 24729646 3' - Juan 4158 1 71.92 GGGTTGGGCAGCTATCCAGGACTAAAATCAAGTGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGATTATAAGAAAGAAGATTATAAATTTCTATTTTAAAAGCATTATTTAATTGAAATAAACTGGATACTTCCGTGCCTCGCCCAGGCGAG:1 + chr2L 14777858 3' + R1A1-element 4947 1 65.49 TCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACA:1 - chr3R 23295551 3' - P-element 70 1 24.81 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAAT:1 + chr2L 13556479 3' + transib2 2803 2 65.03 ATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTTATCTAA:1 - chrX 10445510 3' + INE-1 536 1 80.00 CAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1 - chr3R 29487012 3' + flea 253 2 86.99 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTCGCTGGTTTTTCGCAGCTCTTTCATTATGCCAGCT:1 + chrX 4808641 3' - mdg3 28 2 66.67 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAA:1 + chr3L 11326791 3' - pogo 44 1 54.11 AGGGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAATAAAT:1 + chr2R 12185470 3' - accord 9 2 76.71 CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCC:1 - chr3R 22287987 3' - transib2 79 1 76.64 ACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGGG:1 - chr3L 25482914 3' - accord 6916 2 75.59 ATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTAAGCATGCAGTTTCCAGAGACAAATGTTGCCAAGCCCACACTACCGCCCACAAGCCGTCCGAAACTGCCACGCCGACGCTTTTGAAAAAAGTGTCGTATTTTCATACGTTTATTAGTTTTGTA:1 - chrY 9423 3' + INE-1 163 1 46.58 GATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTCTATGTACTTAGCATTTACGGTTACAATCTTGTTTCTTGTTTCTTGTTTCTTTTTTGTTTTTTG:1 + chr2R 9307990 3' + BS 5008 1 47.97 CAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCAC:2 - chr3R 20675814 3' - jockey 4907 1 54.79 GTGGGATTGTTTTGGGTAATCGCATTTGTGCGAAGTATTGCTATTAATTGATGGATACCATTGACTGCAGTTTATTATGTTTTCTGATTCCTCGAGTAGCGATTGCCACGCGCGTTCCCCAGCCAGACATCGGAGTTGTGGTCGGC:1 + chr2L 10700619 3' - I-element 4886 1 58.22 ATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTCTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 14 1 52.05 AATTGTGTGCGTTGTTCTTTCTTGAAATTTTTTTTCTTTTCTTTTCGTTTTTTTCTTTCTTCTTCTTTCTGCTTGTCTTGGCGTTTTGGCAAGTGAGTTAAAAGTTCTCTCAGACGAGTCTGTC:1 - chr3L 4962843 3' - ZAM 173 2 73.39 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATAAGATAAT:1 + chr2L 4063926 3' - roo 8735 2 67.12 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTTTTAGGAAA:1 + chr2L 13556492 3' - transib2 11 1 72.60 ATAATAAAAAAAACGAAAAAAAATATCAATACATTTTTCAAAAGTGTGGACAACTTTTAGCTTTCATACGGACAGACTGACATGGCCAGATCAACTCGGCTATTGGTTCTGATCAAGAATATATATACTTTATAATAATAAATAAA:1 + chr3L 25841310 3' + BS 5100 4 71.23 TAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATAAATCAGACAACCAACAG:1 - chr3R 2522244 3' - Tc1-2 67 1 65.00 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGG:1 - chrX 12986559 3' + roo 8983 2 79.45 TTTCATTAAAGCTCAAGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAA:1 + chr2R 20010674 3' - Juan 4166 1 57.93 CAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGATTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACT:1 + chr2R 20227292 3' + hopper2 1542 1 75.00 ATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAAACCCCAACAAAGCGCTGCGGAAACATGCTGCCGCAACATGTTGCTACTTGGGGCG:1 + chrX 18742938 3' - invader4 2770 2 74.62 GCCGAAGATATTTCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGACCGATAGCCGACCAGCAT:1 - chr2L 3811832 3' + roo 9017 2 73.04 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGT:1 - chrX 7795516 3' - roo 65 2 66.44 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGTCCTTGAGACGCATTACCCAGTTACACACACACTGTCACAACCCACCCACACAAACACTCATACACTAGGTGAGAGTTCCCGGGCGGCCAAATCAGGGG:1 - chr2R 19941493 3' + hopper 1395 1 70.55 ATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAA:3 + chr3L 20187392 3' + FB 445 1 70.55 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTG:1 + chr3L 21327187 3' - copia 4917 2 52.74 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAA:1 - chr2R 15326829 3' + copia 240 1 50.68 AATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGTCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCCATCAACTGAGGCAATGATTAATACCACAATTTT:1 + chr3R 16745712 3' - 1360 3376 1 75.34 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGT:3 - chrX 1263903 3' + Burdock 6372 2 69.86 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTG:1 - chr3R 9298482 3' - hopper 78 1 69.18 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGC:4 - chr3R 17996159 3' - diver 54 2 54.11 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACCCGCTGCTGGGCTATAATGCGAGTGTAGAGCTCCTCAGAATCCAGGGGCAACAACAAGTTGGTGACTCCGATCCGTCGCTTGGCCT:1 - chr2R 6000799 3' + I-element 5286 1 59.59 AAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGA:2 - chrX 3431856 3' - Ivk 5356 1 45.89 TAATATAAAATAAATATATTAAAATATTTGAGTGAGTATTCAGCAGTTAAAATCTATGGTACTGCAAGAAAATTCATAACGTTAAATCTGTTAACACTTTTAAAAATTTTTCATCCATTCAAATCAGTACAGATGTATAATATAAT:1 - chr3R 18544614 3' - Cr1a 4314 1 78.77 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCA:2 + chr2L 13556440 3' - transib2 63 1 60.27 GTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGG:1 + chrX 21087694 3' + mdg3 232 2 66.94 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGG:1 - chrX 8437681 3' + P-element 2802 1 26.57 ACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACACGGAAAGAAGATACAGTGACGTAGGCATGGGGCTTCAAACCCACTTTCTTTGCAA:1 - chrX 15406484 3' + Stalker2 7520 2 61.64 AACAAAAAGGAGACGAAGAACCACAAAGAACTAAAGCTAAATTCTTCAGCAAAGCTAAAGTTCAAAGCAAGCTATAAAATAAATTAAATAAATTAAACGAATAAAATAAAACACTAGCATATCGATTTAAGCACTAATAAATGCTC:1 + chr3L 13158639 3' + HeT-A 253 1 75.34 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTGGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTG:1 - chr2R 18258777 3' + Juan 4160 1 52.05 CGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCGCCTGCACGTGCCGCACACACAATGGGCGGAT:1 + chr2R 14379176 3' - 17.6 7233 2 75.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAA:1 - chr3R 14980299 3' + roo 356 2 54.11 AATGCAGATATCTTGCCGTAGCAGCTAACTCTCTAGTTAGCTACGCGAATTAGAGTGTACCAAAAATTTATTCTTTATTAAAATTAAAGAATATGGTTAATATTA:1 + chr3L 11326758 3' - pogo 36 1 42.86 ATTTCAAAACTATATATAAAAAAACAATGGTTATTATAATGCAACAAATTAAGAGATATAAGGTCTGATATTTGTTTTAAATTGTTTTGTCTTTCAATTTTCGCTGGATTTTTGTTTCGAGTGTAGGGAAAATAACAAAAACTAAT:1 + chr3R 23345338 3' - copia 4664 1 73.97 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATAATCAGAAAAACAATCGACTT:1 - chrX 21087540 3' - mdg3 29 2 47.79 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCG:1 + chr3R 10931713 3' + 297 332 2 75.38 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGC:1 + chr3R 15942831 3' + hopper 1384 1 65.07 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCC:1 + chr3R 4964190 3' - roo 66 2 67.81 GTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAG:3 - chr2R 19199675 3' - hopper 72 1 67.12 ATGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGGGCACG:1 - chr3R 26405017 3' - hobo 85 1 74.83 CCCTGGAATAAAGTGAAGGCCACATTGATGGAGTGGTCGAAGCGTAATTTAACGGGAGCTCTGCCGAGGCGGGCAGATCAAAATACAAGCTACACATATGGTAAAAAATGCAAACAAAATGTAGATTGTGTAAACGTAGGTTGTTG:1 + chr2R 5400865 3' - gypsy5 6911 1 49.32 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTATATGCATTTGGCAACAATTTATAAGGGCAATACGTGC:1 + chr2L 15188440 3' - 297 22 2 63.64 AGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGGCGCCGGCGGCTCAGGAGACTTCGAGGAATAAACAAAAAAAAAACAAGCAAAAAAATAAAATATTATTAAAATCATTAAATGGGTAATACGAATT:1 - chrX 11152172 3' + Osvaldo 1471 1 55.83 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAA:3 - chrX 19054243 3' - jockey 64 1 55.48 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATCTATATTTTATATATTTTATTTGCAATCTTGTTATGCCATTCGTACACAAATAGGAATTCAAGCATAGCACCGACCCATACTTTAGACTAAAGTATTTTTTTAAC:2 - chr2R 13176430 3' - opus 7 2 79.45 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAA:3 + chrX 8200331 3' + flea 4986 2 67.12 AGGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGTGGGTATAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGACTGAAGAA:1 + chr2R 9158114 3' - mdg3 5337 2 73.19 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCC:1 + chr3L 21763754 3' - jockey 95 1 75.34 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAAATCCT:1 - chr3R 15724257 3' + Juan 4199 1 71.92 ATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATATAGCATACAAAAGAATTTACGATATATATTTGCTGTTATATATATATTTATATATATTTTAAGTTGCGTGCACTTGAAGCTAGT:1 - chr3R 18009345 3' + Bica 4847 1 68.22 TTTTTTTTTAAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACGATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAAGTAGCGGTAGCAAAAGGCTACTAACATGTTTATGCTACTTTTATGAGGTGGCAATAAAA:1 - chrX 18301101 3' - Doc 4692 1 57.93 ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGAGATTAGATAAATACCCGATCATGGCAATGTCAAGTGCAGCAGAAGCAGAGCTCTTTATCTACATGCAATGTTTGTCTT:1 + chrX 11697040 3' - TLD2_LTR 97 1 57.93 GAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGATATGTATATTGTATTGTAGTTGCCACTATTT:1 - chr2R 9966921 3' - Bari1 3 1 60.27 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGC:2 - chr2L 13585727 3' - Quasimodo 59 2 49.32 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTG:1 - chr2L 22193437 3' - roo 8745 2 74.48 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGGT:1 - chr2R 8099109 3' - jockey 4790 1 63.70 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATAC:2 - chr3R 20441241 3' + I-element 5286 1 63.70 GACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCGGGTACCACGACAGGCTAGAGCGCCACAGAAATCGCCTATTCTGTTTTTTTCTCCTTTGCTTAAGTTTCCCCAAACATATCATAAATCGTATTCCAAT:1 - chr2L 4623656 3' + BS3 1436 1 59.59 TTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAGGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGCCGAAAACATACACTGAAAATTAACA:1 + chr2R 4545188 3' + invader1 3573 1 72.22 AAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGGTATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACG:1 - chr3L 24213783 3' + invader2 5062 2 61.47 GTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATGCCGGGCAGGGTCCAGATAAACATATGACTCCCAAACCAGG:1 - chr3L 14344245 3' + I-element 62 1 74.10 ATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCG:1 + chr2L 1923997 3' - G6 1992 2 66.19 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTC:1 + chr2R 6847829 3' - Doc 81 1 70.55 GGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAATCAATGTA:1 + chr2R 12185473 3' - accord 6 2 77.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGTTTGTTGTATATTAAATGTGTTATGGAGAGTCTGGTTAGTAATGTTTTTGGTCAGAGAAATGTTTAAATAAATTTTCGATTATCGCGCACATTAAAGCAATAAA:1 + chr3L 6674150 3' - roo 8680 2 71.92 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCT:1 + chr3R 5769105 3' - roo 8729 2 68.28 TAAATTTAAATGTTTTTTTTTTTATTTTCCGCATACTCTCTGTCTTTGCCTTTGCCTGTCTCTCTTTCTGGCAGCGACAGCAGGTATATATATACATATATATATATATATATATATATATATGTTAATACCAGCTGGCACAGAAA:1 + chrX 3281783 3' + Tc1 1464 1 60.27 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTT:1 + chrX 7795615 3' + roo 9016 2 57.34 TATATGTACATATGTATATATATATATATGTGAGATGACTTGGTTAGACAGACACCAGCAACCCTCTTCGCTCGCCCCAGCCTCTCTGCCACGCCCCCTTGCCTCCTCTCTACAACAACACTCCTCTCGCCC:1 - chr2R 14030536 3' + invader3 5087 2 61.36 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCC:3 - chrX 18396100 3' + roo 8991 2 70.55 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATT:1 + chr3L 5389957 3' - roo 8733 2 68.49 TAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGCGCCGTGTCAGAGAATTTGTGTCTGTGTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCG:1 + chrX 21947726 3' - mdg1 32 9 47.47 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGC:1 + chr2L 16943871 3' + copia 202 2 75.34 ACACAAAACACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCAATTAAAAAGAGGTAAAA:2 + chr3R 6461283 3' - S-element 1486 1 80.82 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCATGATTTTACTTTTATAGAGAATGTTCAAATAAAAGAAATAATGTAAATACCAAAAATAATTGCCAGTTATTTAGCGTGAAT:1 - chr2L 20839522 3' + mdg1 351 2 49.32 AGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGCCACAGCAAATGCTTACTTAACAGCAGCAATATGAACATTAGTCTCATACCCCCACACACACCCAC:1 + chr4 626077 3' - copia 4973 2 54.79 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTAAGTACCTGGCACACAGAGAAAAAATATGGATGAGTATGATTAGT:1 + chr3R 4964243 3' - roo 8677 2 76.03 AATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGGGTGATCTCATGTTTGT:1 + chr3L 20187424 3' + FB 477 1 50.00 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGGTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGCTTAGAGGCCAGGAG:1 - chr3L 6518560 3' - 412 66 2 60.96 AATACAATTTCTTCAAATTGTATGCTTTACAACGAAAATAGAAAAATATTTTGCAGTTTTGTTTTTTTTTCAAAAATTTTAAACACTTTTTGAACGG:1 + chrX 1830451 3' + Doc2-element 4673 1 74.23 ATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCAATCATCTTGACGACGTGGCGTATACTCAATATGAAGTTTAAGCA:1 - chr2L 11839656 3' - mdg1 7113 2 69.18 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACC:1 - chr3R 7943728 3' - blood 61 2 56.85 ATATTCTAGTATCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGACATGAGAAAAATGGCATACCCTTAGTAATAATATAGAATTTTTAAAAATTAAGACCCAAATAAAAAGCACCAGC:2 + chr3L 11314567 3' + Tc3 315 1 45.21 CAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAACGTTCCATATTTATTACGGAAAA:1 + chr2L 4754967 3' + Stalker 349 4 55.48 AAATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGAAACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACCTAG:1 + chr2L 16588587 3' + Doc 4686 1 76.71 ATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGTTGGAAGTCTAGACCATATTGTG:1 - chr2L 20821166 3' + Burdock 6382 2 60.27 ATAAACNTAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTA:1 + chrX 1341732 3' - 412 62 2 58.22 AATATCCATTAGATCTGTTACTATTTTTGTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAATATATAAAATTCGATGATTTGCACACTGAGCAAAAATTTCGATTGAACGAACGGGTACCCAAAATTTGTATTCCCTTTA:1 + chrX 20480850 3' + Tc1 1507 1 57.53 ATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTTACGGTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTATCTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTATTTAACTTTGCTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr4 1294993 3' - HeT-A 9 1 43.84 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAA:1 - chrX 19266842 3' + roo 334 2 67.12 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCT:1 + chr2R 18529993 3' + jockey 4959 1 63.01 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTAAAGTACACAG:1 - chr3R 19224960 3' - HMS-Beagle 30 2 67.81 AGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTT:1 - chrX 2479482 3' + mdg3 191 2 52.41 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATAT:3 + chr3R 18093359 3' - I-element 78 1 69.18 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTG:1 - chr2L 9782102 3' - P-element 95 1 20.55 TAAATAAATAATAAATAAAAAATAAATAATTTAAAATGATAATTTTTGTATTTACTGTATTCAATTTAACTCAAATACATTTTGGCAATAAGATAGAACGACCTTTTTCGACTTTCTGATCT:1 - chr2L 15106893 3' + BS 5093 1 45.90 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGT:1 + chr3L 20898606 3' + roo 8991 2 75.34 AGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAGAATGATTTAAGATAAGGGGTGGTAGTTATTTATGTACACGATGAATGGTGTTCGTTTTCGCTTTTATTTATGTGGTATTGAAATT:1 + chr3R 21693692 3' - Cr1a 4197 1 56.85 ATTAGGATTTAAAAAGTATTTTCTTTTTAAGCACATTCAGCACAAGCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCATATCACATTCAAAATAACGTGTTT:1 + chr3L 14473695 3' - transib4 2557 1 52.74 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGT:2 - chr3L 7300168 3' - roo 8752 2 79.45 AATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACTATTTTAATATATAAGTTCTGCTACATGCTAAAACAATCTATCTTTCTTATTTCTATTGTATAATTTCTCTTGAGAATTGTCATCAACATGTCAAATTGTAATCCATTGA:1 + chr3L 21484767 3' - Cr1a 84 1 78.77 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGC:1 - chr3R 19407888 3' - diver 49 2 51.37 GAGATGGCCGTGACGAACGCCGATCTTTTCGGCTGTATATCGCCGGGAAACACAAGCCGGAATTATTTCGCGCCTAATTCGGTTAGACGCGCTTCTACACTGCCAAT:1 + chr3R 22900802 3' - gypsy12 432 2 68.22 GAATATACAGGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGTTAAACTCACAAACTCAAATACACACACACACACACACTAAAACGCACAGAAGAAATTCTCTGAAGTAACAAACGATAAGTTATATAAATAAAT:2 - chr2L 2790349 3' + Porto1 4240 1 66.44 AGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTGATTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCATTAAAGAAAAAGGAAAGTGACTAAGTTTCTAATTTGTACTATATGCATTTTTTAGCATGTAATGTATAGCATAACTAT:1 - chrX 8704981 3' - X-element 4672 1 58.22 ATATCTTAATTTAGTTTATATCTAATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGGCTTACTTCCTTCGGTCCGTGAGACAGCTCGAATAATATGCGACAT:1 + chr2R 8417344 3' - I-element 5247 1 68.09 ACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATTGTCGAACATATTCTCTATCTTTCTCAATTTGGTCTGGCATTTTGGTTTCGTTGTTTTTTATTTCAATGTCTTCTGGTAACGACTCAATATCGCTTTCGATTTCAATGT:1 + chrY 3630446 3' + Doc 210 1 79.45 TAGGCGATTTCTGTGGCGCTCTAGCCTGAAGTGGTACGGGCTGGAGTGCATGTTTATTGCCTCGGAGACAGTGGCTATCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGTGTTTCTTACGTACTAACGATAAAGCTACTCCTATTGGAATTAAA:1 - chr3R 4111360 3' - BS3 1501 1 78.77 AGTGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTT:1 - chr3R 26504188 3' - HMS-Beagle 35 2 61.64 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAATTAGAAATATCG:1 - chr2L 17180027 3' + Juan 4200 1 74.66 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCG:1 - chr2L 7125757 3' - I-element 38 1 50.41 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTAAAGTTATA:1 - chr3L 14094527 3' + I-element 5346 1 71.92 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCAATCTCT:1 + chr3R 15791041 3' + roo 9045 1 67.12 ACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTATGCGCTAGCGAGAGCGCCACTTATAAA:1 + chr3L 23694037 3' + Quasimodo 305 2 78.12 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGAAAAAGCTCACTTAGTGCGGCTGATTAGCGTGGCAATCAATCAGTTTTCATCGACTG:1 - chr3L 8685162 3' - I-element 44 1 53.28 CTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTG:1 + chr2L 14675745 3' + 297 325 2 67.12 CGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTGCACGCAATCGATCTCCTTG:1 + chrX 14722260 3' - diver 5894 2 74.66 GTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCAATTATGTTTTTATTGAAAGAAATTAAAAATACACCATTTAATTGGCATATATCAATTCCTTCAATAAATGTATTTTTATAGCTAAAATAAATGCGAAATG:2 - chrX 23205132 3' - 3S18 5784 2 70.55 CAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGG:1 + chr3R 31886918 3' + hopper 1333 1 73.79 GTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATGTGTGGTCCAGTCGAGAGGTGCACGCCACGCAGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATCAATTCGATTTCCTGGAATGTCTGGATTTTCGTTTTTTATCT:1 - chr3R 805167 3' + G5 4404 1 71.92 ACCTATNTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCT:1 - chr2R 14051754 3' + roo 343 2 61.64 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAA:2 + chr2R 13766297 3' - roo 8730 2 65.75 ACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGCAGAGTAGAACCAACAACAGTACAACCTAACAGCACAATTTTCAGAAAA:1 + chr3L 18146241 3' + Doc 4416 1 66.44 GAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAA:1 - chr2R 2590718 3' + HMS-Beagle 6965 2 71.23 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:66 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 ATCAGGATCAATACCCGACTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGAGGTCTCAATTTTTTCTGCAAATCGATAAAACATTGTGAGCGGGGGAATTTTTAGTGGGCTTATTCAGAATAAATCTTTGGGTTATATTCTACTTATTCGA:1 + chr3L 21595448 3' + INE-1 93 1 52.05 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACTGATTTCTCTAGACGCAAATGGGGATTGGTTTGCACTT:1 - chr3R 21933109 3' + pogo 2074 1 62.33 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACACATTAATATTATGGTCTGACCTTCTGCTGTGAACTCTTCTGTAGCAAACGAAATGAGTATTCCCTGGCTGGCGCCCTCCAACTTCCTGCCC:1 - chr2R 6965456 3' + Transpac 5209 2 61.27 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATT:2 - chr2L 15936745 3' + copia 248 1 57.53 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGCAACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTC:1 - chrX 8027396 3' + Juan 4177 1 50.34 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAAGAAGAAGAAGAAGCTGCTCATTTCAAAGTTTTCTTCTTGTTCTTCCTTTTCTTCTTAAAGAAGAAGCAACTATTTTACGGCGTAAA:1 - chrX 1341604 3' + 412 460 2 59.59 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAATAAATAGCAACCAACACCAAAGGGAAGCAGGG:1 + chr3R 25709909 3' - hopper 15 1 68.84 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCG:1 + chr2R 8047349 3' + 1360 3363 1 51.85 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAG:2 - chr2R 22034666 3' + copia 5047 2 72.60 ACCGCGGTCGGTCTTTTGTATAAGTGAATTATAAGAAAGGCATAGTTACTTTACTATATATATATATACTCAGTACCAGATACGTGGAAATATAAGTTGTTAATAAATGTGGTGGGCTCACATATTAGTTTATAATGAAAAAAAAA:1 - chr3L 8064855 3' - Tom1 34 1 49.32 GTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGAAAAATGGGAAAACTACGCATGAATGCCGGCAATCGATGGGCTATAAAACTGCGTCCTTTTCCTT:1 + chr2L 17796989 3' - I-element 5162 1 54.48 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTT:1 + chr3R 17996249 3' + diver 6034 2 69.86 AAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAATTCCACAGCAGCCAATATGCCGACAGACTTAGTGCCCACCCGAAAAGGGGTAAACTTTGCACACGGCAGCGTCTTAAGCGATTTTCT:1 - chr3R 17268900 3' + G5A 2555 1 66.14 GTTTAAACAAATATATAAAGTATTTTGCAATTTTCTTGGTAGTAAATGGGCACGTTTTATGAACGCTTTTGTGGGGTGTTTATGGGGTGGTCCTGATGCCCAGC:1 + chr3R 10535100 3' + Cr1a 167 1 75.00 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAA:1 + chr2L 11357937 3' + blood 7342 2 52.74 GTAATTTAGTAAAAACCAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTAGCATCAAATCTATGGTGGCCTGTCGATACGAGTCCTTAAATCG:2 - chr3R 21525540 3' + HMS-Beagle 6574 1 73.97 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCATATTCGGGGCCGAAACAACACTGAAACAAAG:1 + chr3R 23618267 3' - hopper 20 1 71.23 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGCGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCAT:1 + chrX 8308519 3' + roo 9032 1 58.22 GTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTCTGATGAATA:1 + chr3R 3286226 3' + Gypsy12A_LTR 1951 1 76.71 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAAT:1 - chr2R 8157192 3' + mdg1 341 2 73.97 TTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTCGAATTAAATACAATACACTCCACACAACTGTCCACAACACGAACAACCTTTTCTTTAAGTTTTGGTATGAAGTCAGATTT:1 + chr2R 3052656 3' + gypsy4 6756 2 77.98 ACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTT:1 + chr2R 9967131 3' + Bari1 1646 1 59.31 ATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGCCCA:1 + chr2L 17766216 3' - Doc 177 1 62.33 TTTATTAGTTAATATAATATATATTAAAACAATAAATATGGGTATTTAGCTCTATCCCCCTATTGGATCCTAC:1 + chr2R 19658982 3' - transib3 2670 1 72.60 CCAAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAGCAAAGAGTGCGCTTTCCCAATGCCGCAACCAATGCACACAACCACCTGTTATCCAGAACCACTCCAACTCCTTGTCCATTAAGAGGGGAAAATCTATCC:1 - chrX 23155616 3' + Doc4-element 148 1 59.20 GAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTAGAGTCGAGTGGAAGTCAGGGAGAGTAAATGGAAAATAAATTGAAACTGGCATTTAATTAAGTTAAACCG:1 - chr2R 11802142 3' + flea 4859 1 60.00 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTG:1 - chr2L 20821189 3' + Burdock 223 2 45.89 GAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACCTTAATTAAAAACGAAAAAAAATTTAAAAAAAAAACACTTTGAAAGAAATACAAAATTAGATCTAAATTGAAACGTTTGATACCATCCATAACAATGTTTATAACAATATTAATGTA:1 - chr3R 11992348 3' + Juan 317 1 72.60 AGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTATCATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAACTAAACATGGAG:1 - chr2L 15004781 3' + INE-1 149 1 63.70 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCTG:1 + chr2L 12822870 3' + P-element 2865 1 55.45 ACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTAATTCAATCAAAACGACATTAAAAT:1 + chr2L 22369254 3' - rover 6959 2 70.00 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAGATTTATGACCGCACATGATGAGCAATAAAATGTTTTATGGCCATGGTCC:1 - chr2R 11794910 3' + opus 7488 2 76.71 AGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTCAAGATACTGCAGGGAAAGCGGGAAAAAAGGAAGCGGCAGGAA:1 + chr2L 4063984 3' - roo 13 2 76.71 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGC:1 - chrX 1135324 3' - P-element 86 1 26.71 TCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGCCTAAGTAGTTTATTTGGTTGCTGTTTTACTTTATAATCCCTTGTTGTTGGACTTTTTTTTTGTTTAATTTAAATTTATGTAGATATGCAGCTACATATGTATGTATATAATCGTATATATATGT:1 - chrX 6853218 3' - Porto1 4473 1 77.40 GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAG:2 - chrX 2214272 3' - jockey 4841 1 72.60 ATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGGGAGGGGGGATTTGTTTGGTGTAAGCCCCATTGCTTCAAAACTTGAACTTAGTGTAATATACCGTTTGCTTCAAATTGTTTTAG:1 - chr3L 2589210 3' + Bica 4901 1 51.37 ATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCTGGGTTAACGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTCGAATTTTGGTGAGTACCCTCCACATTGGACGTCGTCCATTTATCATTTATGAGCCCCCTTCTTCGTA:1 + chr3R 24669917 3' - I-element 164 1 53.42 ATCAACAATCAACATCAATACACAGAATAATATTAATTAAGGAAAAAAAGGATTAACTTCCCTTGTGGTCGCAAAACAAAGATTCTCCCTACGAAATTTGGTGTGGGTCGAATATATTAATGTTTCAAGAAATAAATCCCAAAAAA:1 - chrX 14077040 3' + gypsy7 330 1 60.27 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAAAG:2 - chr2L 47068 3' - roo 42 2 57.53 CTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTC:1 - chr2L 7618487 3' + X-element 4632 1 78.42 ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAG:1 - chr2L 18347307 3' - transib2 83 1 75.34 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTAT:2 + chr2L 16946152 3' + hopper 1375 1 56.85 GTGGGATTGTTTAAGGGAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCAGGAACAAGTAAGGCATCACCTATAAGGGATGCTCGAGCTGGATGCTCGGATGCATGAGTGGTTCTCCGGGGATGG:1 - chr3R 22718058 3' - I-element 4886 1 58.52 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATT:2 - chr3L 15103791 3' + Transpac 5181 2 53.42 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAAATGATATATATATGTATANACAATNNNNAATATATNNNNNNNNTATATACAATAATTAAAACCTAATTTA:1 + chr2R 4695924 3' + flea 4966 2 58.22 GTGCGAAAGTGGACGGTGCGAAACCCCAGAGCACGTACTCTTCTCGTGCGAAAAAAATGCTATTTACACGGTGATAAACCCAAAGGCCATTACAATGGGTCAGCTGTATGGGCAATTTGATGCAGTGTCCCACGATTGGAG:1 + chr2L 17509005 3' + Rt1c 5079 1 54.61 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTA:1 + chr2R 8099241 3' + jockey 4955 1 51.43 AATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAAAATAACGAACGCGAAATGTGCATGCTGTTGGGTTGGCGGGGAGGG:1 + chr3L 10804882 3' + invader2 442 1 68.06 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCC:1 + chr2R 6885598 3' - P-element 36 1 50.86 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGAAACGGCGACGGTGGCTCCTATTAGGCGTCAAATGGTCCGGCAAAACGCAATGACTACAGTGCA:1 + chr2L 20840077 3' - mdg1 7095 2 55.48 ACTAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATAGAGATACATGTCCATATGTCGAGGTCAGTTCGTTGCCTC:1 - chr3R 22590502 3' + rover 267 2 72.73 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCCAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGA:1 - chr2R 8099130 3' - jockey 4811 1 51.37 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGGAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATCATTTTCCTAGTCAATTGAACATTGTTGCGTTAGTTTCCTTGAACGGTTAACTATTGTACTTCGA:1 - chr2R 7304009 3' + pogo 2047 1 57.53 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAAC:1 + chr3R 17736961 3' + opus 452 2 56.82 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATAT:1 + chr2L 17180145 3' - Juan 47 1 51.91 TTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATATTATTATCAGCAATCATTTTAATAACCA:1 + chr2L 6654790 3' + diver 206 1 73.10 TGAATATAGCTGTAAGACCCGTAGCTAATGCTAAACTATCTAAGTTAGACTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGACACCTTATATCTTTATCTACATATGTAT:1 + chr3L 21769099 3' + I-element 5283 1 62.07 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAA:1 - chr2L 4063845 3' + roo 9001 2 67.12 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTG:2 + chr2R 11804752 3' - pogo 38 1 59.59 GAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAGAATGACCTTCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAA:1 + chr3R 27406057 3' + diver 6043 2 63.01 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTCTAAGGTATA:1 + chr3R 7420338 3' - 1360 19 1 71.43 AATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCGCCCAGAGACAACACACCTTGGAGCTGTGCAGCGAGACTGAACTGAGAAGCACGCGAGAGGTTCTGGGCATCTCCAGCAGTG:1 - chr2L 6561276 3' - hobo 414 1 64.49 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCATATCCTTTATTCTTTCCTCAACTGTCTA:1 - chr3L 13365710 3' - BS 5018 1 60.96 ACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 23181432 3' + Tc3 1419 1 74.19 AAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATGCTTTCTCGGCGCAAAGAGATAAACATCCATCGCGGCCTAGACGGCACTTGCCCGGTAATAACGTCTAAAGGTATTGACACAGAAATCGCACAAACAGCCAATC:1 + chr3L 22886754 3' - FB 258 1 81.06 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGATGGCAACACCCAGAATATAATGG:3 + chr3L 13739696 3' - BS 5017 1 67.12 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATA:1 - chr3L 10373826 3' + 297 6908 2 68.49 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATG:1 + chr2R 21681406 3' - roo 58 2 58.62 ACATTTTGTATATATTGTATATGAATGTATGTATCTTTTGCTGCTCGCGTGTCGTGGCCTCAAAACGTGACTGTTTTTTTTTGATTAGAGGTCGAAGCT:1 - chr2R 10850760 3' - Stalker2 268 2 79.80 GGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCATAGATGGAAGGACCATTTCGGAAGTGTAAAAGCTACTGGT:1 + chr2R 22663383 3' - micropia 146 4 72.41 CCCCCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTGCCCGAAGGCAGAACAACTT:1 - chr3L 5217549 3' + hopper 139 1 65.96 TAATAATTAAATTATAAATAAATTGCATTTCAATAGCTTTTAGAGGGATGTTGAAAATTTGCGCTTTTTGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTGCTGGTTCACCTCTCTCTTTCCGCGATCGGCAATCTATATCTTCCCTG:1 - chr2R 23759430 3' + flea 4990 2 54.17 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAG:1 - chr3L 10373846 3' + 297 6900 2 80.60 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGGGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTC:1 - chr3L 12004230 3' + P-element 2853 1 57.69 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGATGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAAAGGGGGGAAAACAGA:1 + chr2R 16929825 3' + jockey 4927 1 63.70 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTT:1 + chr3R 7317642 3' + I-element 5269 1 76.55 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGGCCAACTGCACGGACGGC:1 + chr3R 18971781 3' - Juan 4089 1 60.56 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTATTCGCACATGAGTT:1 - chrX 11661353 3' + pogo 2077 1 69.18 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAAC:1 + chr3R 19407987 3' + diver 6038 2 66.44 AGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACAATTTATTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAACT:2 + chr3L 23597301 3' - invader4 2753 1 70.55 ATGACCCTTACTGAGTATTATGTTCTGACTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAATAAAAAAATATGCAAAAATA:1 - chr3R 19451837 3' + Cr1a 4179 1 74.45 AAAAAAAAAACAAACCTTTTGTCGCCTTTAATTTTTGCCACTGCTTTGGGTTTTTTTTTTTGCGATTACGAGGGGAAATAATAGTCACTGTGATAAAGAAATTTATTCGCGCGTCGTAG:1 + chr3R 14068770 3' + HMS-Beagle2 494 1 80.67 ATATTTTATATTATATATTATTATTTCGATTGTTGAAAATTTATTTTCCTATTTTTAAAAATTTTTGAATTGAATCGCTTGTAAGCTTAGTTCACATGCAAGCTGGATTATTTTGAAGCATACAGTGAACTCTAGTACCACCTCTA:2 + chr3L 13180643 3' - Tc3 255 1 72.60 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAG:1 + chr3L 22325892 3' - hobo 28 1 52.43 ACTTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCT:1 - chr2R 10161785 3' - transib2 53 1 55.47 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAA:4 + chrX 7795604 3' + roo 338 2 65.75 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGAAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAAAAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACA:1 + chrX 585729 3' - Tirant 8127 2 58.59 GCCTTAACGTTATTATTATTTAGACAAAGCTTAGAAATAGTAATAGACAAATCATCACAAAGATATTATTCGTCTGATTGTGTTGTTCGATTATTTCTTTTGTCTGAATGTATTAGTGGTTCAAGTTTTGATACATTATTGTTTAG:1 + chrX 22218805 3' + 1360 307 1 56.16 AAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGA:1 - chr2L 4754876 3' - Stalker4 58 4 56.16 AATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAACAAAATGTACAAAGTTACGTTACGTTTCTGTGGTCATTAAAAAGCATTTCCAAGGATTTTACAATGCTGAAGTC:1 + chr3R 25442039 3' + transib2 2695 1 59.59 TTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTATTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTACTATCAAAATGGATTGTTACTTCGTTTGAGATTCAGATATGGTTT:1 + chr4 347752 3' + Tc1-2 1546 1 69.86 ATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAA:1 + chr2L 23295849 3' - micropia 5046 1 79.45 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACAT:1 + chr3R 29084962 3' - 412 7137 2 77.93 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAG:1 + chr3R 7420289 3' - 1360 73 1 69.66 TTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATAAGACGTAGATTTCATGTGTGCAAAAAAGTGAATTTAACTGGAGAAATAAACTGAAGATAAATCGTGCATATATGATTTGTGTTTGCGAACTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTGTG:1 + chr2L 23135986 3' + diver 5996 2 77.40 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGACGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTC:1 + chr2L 12822865 3' + P-element 2861 1 49.00 ACATAAACACACACACACACACACACACATTTTTCGCGCTTTTCTTTTTTTGCAATGTTATTTTATTTTTTCCTGCCCGCGCGCTTT:1 - chrX 11523917 3' + accord 179 2 68.97 AAAGTCAATACATTTTTCTATATTTTATTAAGCTTATTGCTATTCTTCAACTTTCTCCTCTAAAATATCAGGCATTGAGGATATGAACGAGCACGAGTTAGGGGTTACAAACTACATTTGAAAAACATAATCTGTCGGGTCCTCC:1 - chr2R 5460995 3' - transib4 2286 1 60.00 GCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTCTCTTTCTCCCTGCGGAGCAACAACTTGATGACATCACAAATATACAATATCGCAGGAACT:1 + chr2L 22642530 3' - Idefix 7141 2 54.17 ATGGAGCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTGATGGACAAGACGATGTGCAGCTGCATTAATGAATAAGAATAGCTCACGATCCCACACTATATTTACTATCACTTTGGAACAATCTCCATTTTTAAATAGTATTGGATCG:1 + chr4 1165250 3' + Tc1 1252 1 63.01 ATTAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAA:1 - chr2L 7618445 3' + X-element 4667 1 49.32 ATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACTTATAGTCCAATTAGCAAACTTTGTGAGTCCAAAACATGCATAGTATTTGTATAAAAGGTCTCG:2 + chr3R 10716681 3' + Doc2-element 4486 1 56.16 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGG:1 + chr2R 7304117 3' - pogo 63 1 62.76 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCT:1 + chr2R 2427619 3' - Doc 18 1 61.39 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCGCTGCTCTGGGAATCTATGTATGTTAAGTTAACATTTGATTTTGGCCAC:1 + chrX 1135422 3' + P-element 2864 1 66.92 TCTGTAATCTTAACTCTCTGCCGCTCTTAGAGCATCGGATTATAAGTTTTTTAACAAATAGTTATTTTTAATAATATTTATTTATATCATATTTTATTAATTTAGTGAAAGTTGTTAATTAATATGATTTTATCGTAGATAAAGTA:1 + chr2R 5508517 3' + Cr1a 4230 1 64.38 ATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGTTGC:1 - chrX 1263900 3' + Burdock 6384 2 76.64 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTT:1 + chr3R 10270649 3' + Juan 4138 1 65.07 GGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGT:1 - chrX 21639577 3' + gypsy5 7328 2 71.23 GTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAAGATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGC:1 + chrX 3431968 3' + Ivk 5327 1 54.86 AATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGTCAAATGTGGATGGTGTT:1 - chr3L 20189600 3' + FB 204 1 50.00 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGG:2 + chr3R 19992714 3' + hopper 1334 1 71.92 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAAC:1 + chr3L 16033403 3' - Doc 89 1 78.08 GTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTC:1 - chr2L 22966891 3' - 1360 3207 1 56.16 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTCGAAT:1 - chr3R 4460977 3' - blood 19 2 71.92 TCTGGGGAACTGCCAGTAAATCACACTGAGAGCAAATAAAATAAAAGCAATTGAGTTTGCTCATTCATACAAGCAGGCAAAGGCCATTCGAAATAATAAAAATTAATAAAAAATCCAGCAGGTAAAACAGATTACATT:1 - chr3R 14906725 3' + Porto1 4288 1 70.29 GTTGAACCCAATTCTGGCACGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAA:1 + chrY 2720338 3' - gypsy 62 2 60.96 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGATGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAG:1 - chr2R 18316002 3' - HMS-Beagle2 31 2 64.14 TCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTCAATCAATCGGAAAACTTCTTCGGCCCGATGATGAAATGTGTAAAAACCTTACTCATGCGCCTTAAATTGAAACTTTTTAAAGGTCACCTGCTGCCAAA:1 + chr2R 10166800 3' - I-element 428 1 74.82 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAGG:1 - chr2L 17104609 3' + transib4 2577 1 27.59 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATA:1 + chr2R 330227 3' - HMS-Beagle2 6933 2 53.42 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTAGG:1 - chr2R 21410827 3' + Burdock 6369 2 69.18 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTT:1 + chr3R 15790987 3' + roo 327 2 75.34 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGTACAACCAAATCGA:2 - chr3R 15942689 3' - hopper 50 1 52.05 GTCCAAGAACCCTACAAGATTTGAAAACCAACATTCAAGAAGAGGGACGTGGGACGTGACGAAAAACCACGCTGTGGGAAAAGCGAAAGACTACGTCCGCGTGTGGAGTGCGTTTCGGCG:1 - chrX 21582945 3' + mariner2 639 1 70.00 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAACCCTATGAACCCACCCGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGACTTAGATTTATAG:1 + chrX 22460189 3' + HB 1539 1 69.18 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATG:1 - chrX 19074796 3' - mdg1 20 2 58.11 AGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGGGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGG:1 + chr3R 10736102 3' - McClintock 6022 2 78.12 CCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCTTAAGGCAAGAAGCCGCAATGGCCACCTCA:1 - chrX 18349200 3' - R1A1-element 5260 1 78.42 ACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGT:1 - chrX 15200854 3' - 17.6 70 2 73.29 ATATTTCTGTATTTATATTTATTAAATATATTATTTTTCTGTGCACTTTGTGGTCATGTGGGTCATGTGGACAAGCCATTGTCTGTGACCGCGCTGCATTTTACGAGCGGCTTTGTTTGCGCTTTGAGAATTATTATGTCATAAAT:2 - chr2L 15379259 3' - Stalker4 7043 4 51.37 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCACTTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGTT:1 + chr3R 22590618 3' - rover 23 2 67.81 AAATCTTGATAAACAAAAATCAACCACAAAGGAAAAAATACAAAAAAAAATTAAATCTAAGGCACTACAAAAAAAAACAACAAACGAAAAAATCCAGGAAAAAAATCAAAACAATGGCGGAGAGACGCGTGTTGCTTTAGTGGCAT:1 + chr2R 14680946 3' + I-element 86 1 41.78 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTACTTATTC:1 + chr2R 11159327 3' + roo 8988 2 76.55 CAGCGCGAACATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGACCCTCGCACAATACTTTAAACACTTCGTGTGCGTCCTGCAATGGTCCTGTTACGGTCGCCATGTGATAGGTTCAACAAGTAGTACGGTATTTTGGTAGTTGAT:1 + chr3L 24104316 3' - Stalker 492 1 67.12 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACCACCCACCCCACTCCACTTCACTTCGCAGGTCTGGGCAAAATCGATATTATGGCACACTATGCTG:1 + chr3R 20818437 3' + 1360 3333 1 56.85 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCA:1 - chr2R 15004752 3' + BS 5039 1 56.85 AATATAAGCAAAGTGGGGAAATGTTAAATTGTTGCAATTATTATAAGTTTAAGTAAATGATAATAAACAATATCATAATAATTATTATCCCTCCTCTTGCGGCTGTGTGACCCGACGGCTGTTACCCCGGTTATCTATTTGCCTTA:1 - chr2R 5019448 3' - Transib5 2630 1 66.44 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTATATCG:1 + chr3R 16342065 3' - P-element 31 1 63.01 ACGTGAAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGTTGCAGGTCGTTGATCGGGTGGATGATTTGGCACACTACTTCGAATATAAGATCTGATCTATACGCACAGTACTGGAGCGCAGAGTTGCT:1 - chrX 2018188 3' - Doc3-element 394 1 62.33 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAACACGTCCCTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTTCGTATTTTATGACTT:1 - chr3R 10931598 3' - 297 6601 2 65.93 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAA:1 - chr2L 4063847 3' + roo 8999 2 68.49 TATTCATATTTTTCTTTATCAAACTTTAATTAGATTTTTTGATATTCTTTTTTCTGGTTCAAGCTAAAAAATTTACTGAACAAGGTAAGTTTACTGTTTTCTATCCCAAATATTTTTTAAAATTGGTATATTGATCTCTATCAATA:2 - chr3R 18855485 3' - S2 1600 1 54.79 CACAACACGCACACATATACGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACACACACACACACACAAATAAAAAAATAGAAAAAAAAAAAGAAAAA:1 - chr3L 7184905 3' + 1360 3215 1 53.19 ACAATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTGAGGTGTACATTGCGTGTGTATAACTATTAATGGGGCCTAGAGAGGAAGTGAAGGGGAGACCACGGGG:1 - chr2L 15168026 3' - TAHRE 10376 1 59.69 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGGATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCAAATAATTGCGCAAA:1 - chr3R 12242241 3' - transib2 5 1 73.08 AAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTAT:1 + chr3L 19350009 3' - 1360 3261 1 58.22 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGAC:2 - chr3R 19073193 3' - roo 8735 2 69.18 TTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGGCATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTTCGAAACGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAT:1 - chrX 16116153 3' - INE-1 146 1 94.52 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGGCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAAC:1 + chr2R 23780611 3' - Ivk 54 1 54.01 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTATAAA:1 + chrX 12986657 3' - roo 36 2 61.64 TGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGA:1 - chr2R 20227228 3' - hopper 71 1 67.12 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCT:1 + chr3L 6447110 3' + transib2 2749 1 69.18 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGTGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTTCATTCTATCCTTGATGTAAGCATCCTAT:1 + chr2R 17926416 3' - opus 160 4 53.42 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGC:1 + chr2L 18347389 3' + transib2 2818 1 71.28 GGATGGTTGAGAGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGATATAAAAAGTCGTGTACAAAAAGACAAAAGCATAAACAAAAACATATTAAAGGGGCAAT:1 + chr2R 6613856 3' + invader2 345 1 53.85 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAA:1 - chr2L 47096 3' - roo 53 2 60.90 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGGATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCATTAAAGGCTTG:1 + chr2R 4785372 3' + Juan 4201 1 73.97 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCTATTTAGCGAAAAGGTGTGCCCGGCAGCTGTACTGGCGATTTTAAATCTGAGTTGGCGACTTACTCGAGCGAATTGTTGCTGCAACTTCC:1 - chr3R 20780802 3' + 1360 3358 1 64.38 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTAATTGTATT:1 - chr2L 10156071 3' + hopper 1392 1 67.12 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCG:1 + chr3L 22744697 3' - FB 89 1 80.82 ATCTTATCTCTGGAATTTTCACAGTTCCCTCATATATGGAAGGAGACCTTTGTGATGCCTTTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGAATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGGCGATTGTATTGTGTTTAGCCGGG:1 - chr2L 18280794 3' + Q-element 13 2 79.31 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAA:2 + chr2R 11804754 3' - pogo 36 1 60.96 TATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGG:1 - chr3R 11186533 3' + BS 5036 1 54.79 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCGGTTATTGTGGCAATCATATAGGAAAATATAAAGAA:1 + chr3R 8890122 3' - FB 56 1 55.48 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTT:1 + chrX 18239419 3' - jockey 29 1 55.56 AATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATC:2 - chrX 3431860 3' - Ivk 5360 1 48.63 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGGGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATT:1 - chr3R 7943764 3' - blood 7090 2 77.34 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCAT:1 - chrX 21224538 3' - roo 61 2 60.96 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACA:2 - chr3R 6625705 3' + flea 4950 1 65.07 TCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTGTGGTACGTGCTGGTATTTAAAACGCGGTCATCGGCTATCAAC:1 + chr3L 13150905 3' + HB 1213 1 72.66 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTCTCTGCTAGTTCTAA:1 + chr2R 8099233 3' + jockey 4941 1 54.79 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTT:1 + chr2L 5582218 3' - pogo 47 1 53.47 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTAGAACTT:1 + chr3L 20898660 3' + roo 9047 1 68.75 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGTGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTA:1 - chr2R 17926292 3' + opus 447 2 58.22 ATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAAAT:1 - chr2R 16510119 3' - F-element 92 1 69.18 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCT:3 + chrX 20999623 3' - BS 25 1 62.33 TTTTTTTTATAATATATATTTATATATATATATATTAACTTATGATTTGTTTTATAATTACCGTATTTGTAATCAGATCATCCAACAAGCGTATAATTCACTTATACACTTATTGAACTAAAACCTCT:1 - chr2L 8843168 3' + hopper 164 1 88.28 AGAGAGAATGCTTTAGTTGAGTTCCTCGACTATCAGGTATCCGTTACCCAGCTAATGTGAATGCGAGACTACAAGGTAAAGAGGAGCTCAGATATCGAAGAAGCACAGCTGTAAAGTTTACCTGCATATCCAAAGTTGGCATGATT:1 + chr2R 3780829 3' - INE-1 576 1 57.53 AATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTT:2 + chr2L 7098184 3' + G6 1950 1 65.07 AGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGAAAGCTGAAAAAGCTAAAAACAAAGGGAAAGCGGCAAAACAAAGAAAAAAAAAACTGGAAAAAACATAAAAAGTAAGGGGATTG:1 + chrX 4758255 3' + invader2 290 1 60.71 AACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTTTATCTTAAATAAGACCACTGTGCACGAAAACACAGGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGGGCGAGCGAGCGAGCAGGATAGTATTTTTTTTACAATTTAAAATT:1 + chrX 6718810 3' - Cr1a 453 1 74.66 AAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAAAATAACACAAGAAATATCTGATTTTAAGCAAAACATAAAT:1 + chr3R 3695992 3' + G4 15 1 72.87 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCA:2 + chr3R 15791035 3' + roo 9039 1 63.01 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTT:1 + chr3R 15325184 3' - 297 49 2 60.74 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTCACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTA:1 - chr3R 14980293 3' + roo 9026 1 54.11 TATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGCCGTGGAGGCTTCATA:1 + chr2L 20640296 3' + Stalker4 7209 4 53.92 TTTTTTTTTTGTTTAATTTTTATTTCAATGTACATCTTGTTTGGGAAAGGTGCTTTGATGCTTTCCTTTGGCGCCTTAAAAAAGGAAACATCCGGTTGCCGTATGATGATTAATGCGCCGAGCTCTCATTTAAATTAGATCAGGTC:1 + chrX 4810547 3' - Doc 4696 1 59.59 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAAT:3 - chr3R 14980297 3' + roo 358 2 52.74 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAA:1 - chrX 8437664 3' + P-element 2825 1 40.15 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAA:1 - chr2R 13259288 3' + mdg1 7409 2 58.14 ATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAA:1 - chr3L 23875797 3' - X-element 97 1 72.60 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACT:1 - chr3L 15913830 3' - jockey 4801 1 56.55 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCTCCCTTGTGTCGT:1 + chrX 14450512 3' - hopper 45 1 54.79 TATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGTACCTTTGGAACAAACTACTAAATG:1 - chr2R 11665796 3' + micropia 156 2 52.74 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAAT:1 + chr2L 12250990 3' - 412 64 2 61.64 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAGGGATTTAACTTTATAATTACTATTATTTTAC:1 - chr3R 19073137 3' - roo 8679 2 69.86 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACG:1 - chr2R 18316007 3' - HMS-Beagle2 30 2 63.31 CAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAAGT:1 - chrX 18124266 3' - INE-1 575 1 59.57 AATAAAAACAATATTTATAATAAATTATAGGTATGCATGCGTCGGCTTAGGCGTTTTGTTTTTGTTTTCGGCGGCGGCGGTAGACATTCGAGTGTACACACATAAAACTGG:1 - chrX 2137478 3' - Gypsy12A_LTR 1810 1 75.68 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTA:1 + chr3R 5351461 3' - jockey 4749 1 71.53 CATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCTAGAAATATGTATTTTCGTGTTGGAATAACG:1 - chr3L 23688512 3' + Quasimodo 7319 2 58.90 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTAT:1 + chr3R 9039044 3' + Juan 4180 1 60.96 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATG:1 + chr3L 22325880 3' - hobo 83 1 73.29 ACCGAAATACCAGAATTATACTTAATTATTATTTCATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTCCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGCAATCAAAGAGCCGTATCCACATCACAAAAATGCACTACGTGC:1 - chr3L 19276171 3' - Tc1-2 408 1 69.18 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGC:1 - 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jockey 4760 1 76.03 CTTTGCTGGTGGATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 285 1 77.14 GGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGATATGGAGCTACCCACAGATAGTGACTGCATATGTATGTACATGTGTGCACTGAGAAAACAACTTTTA:1 + chr2L 12183662 3' - hobo 2705 1 54.79 CTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAAAGGAACACGGAAAATCCTACGTACAACATCAAAATGTAAACTGTTTAAATTGGATTTAAATCATAAC:1 - chrX 6940833 3' - McClintock 263 2 56.16 GTGTATTCATGATCAGGATCAATAGCCGATCTGGCCACGTCCTCTCCGGCCACCAGTCCATCCGCTCAATACTGTCACGTTAACACTTTTGGAAAATATTTAGAATTTCTTCTTTCGCCGGCCCGTTTCGACCTATCGTCTGCAAA:1 + chr3R 9869554 3' + INE-1 82 1 73.97 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTAT:1 + chr2R 12133820 3' - jockey 92 1 76.03 ATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGGGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGGACAGAGAGAAAAATGTCTC:1 - 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chr2L 18549835 3' - roo 69 2 68.49 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTAT:1 - chr2R 15326859 3' + copia 210 2 69.86 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCAT:1 + chr2R 14653239 3' + 297 6901 2 73.97 AAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGACAAAAAAAAAGGCAAATGGCAATGGGATTGCTTGTTGGCGGGCTGGCAGCCAAAATCTAA:1 - chrX 12827289 3' + Bica 395 2 65.47 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTACTATTTGCCTACAAATCGTAAATTCAAATAATAAACTCCTTTTAAGACGTAAAAAAGTATA:1 - chrX 17717001 3' - FB 60 1 57.93 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGC:1 + chr3R 21630363 3' + I-element 5307 1 53.42 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCATCATGTAAAATCT:1 + chrX 8360669 3' + roo 389 2 72.60 AAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGCAATATCGCCAAAAAAGCATCTATTCGACTGCACAAC:1 + chr2R 9393494 3' - 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F-element 71 1 66.67 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTT:2 + chrX 18336663 3' - mdg3 79 2 69.18 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCC:1 + chr2R 20349039 3' + transib2 2747 1 71.03 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTGGC:1 - chr3L 12315697 3' - transib2 35 1 61.38 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAGTAATAATAATGTAGTCACAGAAAGATATTGCTCGTATAATACAATGATTATATATGTATGTATGTACAGTTGCCTAAACATATAGTCAAAGATATATTT:1 + chr3R 6743229 3' + I-element 5320 1 71.92 ATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGTTTTTGTTGTGTTGCCCTTGCTGTTGTTGCTTTGTTTTTGCTGTTGTTGTGTTGCCCTTGCT:1 + chrX 12572158 3' - I-element 426 1 58.77 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATATATATAATGGGAGTCAGACAAAAGTGTATGCCCTTCTAT:2 + chr3R 4461111 3' + blood 298 2 74.66 ATAGAAATGTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACA:1 - chr4 260885 3' - INE-1 296 1 69.18 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGGGGTGCC:1 - chr3R 6625722 3' + flea 4933 1 76.71 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGTAACAAAAAGTACCTAAAAGCATGCTACATTTTTTTACT:1 - chr3R 4575730 3' - jockey 65 1 58.87 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAATCAAAATAATACAAGAT:1 + chr3L 6397796 3' + roo 9049 2 69.86 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTCCAGCGAACTTAAGATAAGCTCATGGG:1 + chr3R 27160191 3' - 412 7087 2 62.07 CTGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGCCTTCAATTACGCACAAGCCCGCCTC:1 - chr2R 8786797 3' + Stalker 7036 4 77.24 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTGATGGGAGATAATTCAATTTTTAAATTTGTTAATCAGTTACGGCCCGAA:1 - chr3L 15756755 3' - Juan 4031 1 58.90 ATATTTAGTTGTTTTTTTTTTTGATTACTTGTTCTAAAAATTATAAAAAAGAGAGTAAAGAGAATGCATTTAATTACTTACCATTAATATGTGATTTCCTTAATAACCAATTAAATAAAAATATTAAGCTATTTTTAGTGTGGGGA:1 + chrX 14164370 3' - gypsy11 3933 3 63.70 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCACAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTTAGTTGGCCTAATTGGATGGAGTTA:1 - chr3R 11062724 3' - roo 8717 2 52.74 AACTACGATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATACTTCCGCCAAGATTAAATTTGATTTACACTTTTCTCTGTGCTCGTTGAAGGAATATGCG:1 - chr2R 19861267 3' + Tc1-2 1527 1 59.59 ATAGAAATTTAAAAGACTAATATATTATGAAAAAAATAAACTACAATTTTTCAAAAACATGGGCGCGACATTTTTTGGGAAATAATGGGATTCAGTCTAATTTAACCATCGACAGCGGCCTAGGAGTAAATTAGGACAGCGGCGTG:1 + chr3L 230343 3' - INE-1 296 1 62.33 TTTTTTTTATTTTTTATAACTTAAGGCGAACGTTCGCCTTTAAATAGATTCTAAGTTTGAAGAGCGAAAGACAGAGCCCTTTCCACTGCATTTAACCATTGCCCACTAGCCACATCGCTCGTTTTAATTTTCGCCTTAGTTTCGTT:1 + chrX 3086566 3' - TAHRE 10442 1 71.23 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATACGTAAAGAATATACAACATGGCAAAAGAAAGTGTAATGACAAAGG:1 + chr2R 13176575 3' + opus 434 2 68.49 GCTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTGTACTATGACGTTCTCTCTTTTTTTTAGTTAATATGCGATCGGCTTTAATAAAACATTAGTTTTAGTTTTAGAATAAAAGGCCTTATTGGATTCT:1 - chr3L 19468146 3' + INE-1 530 1 56.94 GTGTAAGCTTTGATAATCGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATTTAATCTATACTCGGACCACAGAATTTGAGCCACTGTTGATGCAAAGAGCTTTGCGATTAAGTCCTTAAAAATATGGTAATCATAATAATGTTTTTGAGT:1 - chr3L 4707180 3' - Porto1 309 1 65.07 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGG:1 - chr3R 6419859 3' + Tabor 407 2 73.97 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCAAAAGTTTTCCTGCT:1 + chr3R 31886939 3' + hopper 1353 1 59.59 TATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTGT:1 + chr3R 2520356 3' + Tc1-2 1612 1 64.38 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTT:1 + chr2R 13259397 3' - mdg1 7085 2 50.68 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGACCGCACAACAACTACA:1 + chr3R 21933286 3' - pogo 17 1 77.40 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGATTCCGACAGTAATAACGTCTTGGCC:1 - chr2L 8338086 3' - P-element 27 1 65.69 TGTGATAGTCGGGGAACTCGACAACAGCAGATAGATTTTGATTTGGTTAAGGCCTTTCGTTGAGTTAATTGTTGTAAACATACATGCGTTTGGTTTCCGCCGTAGCTTCACCAGTGAGGATATCATTGTCCTCCACCCGAGGAGTG:1 - chr2R 13775107 3' + INE-1 561 1 53.42 ATAACAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAAACTACTAAATCCAAGTTTGCACAGATTCGACACTGTCAAGAAATTGCTTGCACAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTAATGGGAGGGTGAGTAGCCAATTTTAATGGCCCACTA:3 - chr2R 2964359 3' - S2 1564 2 75.34 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACAGACAACCAAAACACCCACCCTTATAAGAAAC:1 - chr3R 3920515 3' - roo 87 2 78.08 AGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCTATCACTTTGTGTGTTGGCGCTTTGAATTTTTCATGCGACACGTCAATTATGGCCATTACTCCATTTATTTTTTTATTTTCCTATTTAT:1 - chr3L 3513045 3' - Porto1 379 1 52.74 AAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATACGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGTGGTAGCAAAGTTTTGGGGCATTTTAATACTGTCATCATCATCATAATTGAAAT:1 - chr3L 5061494 3' + 17.6 7407 2 76.71 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTATAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCT:1 + chrX 18336660 3' - mdg3 82 2 69.86 CATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTGGCATTTATTAAAATGTTATAAAATGTTATTTAAATGTTATAAATTGAAAAGAAAAAAAGTCAACTAAAAAATTATAACAAATTAATAAA:1 - chr3L 20029233 3' - Tc1-2 1477 1 69.18 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACAAAGGAGGTAGGCTTAAAATGTTAAAATCTAAAG:3 - chr2L 18226730 3' + roo 394 1 71.92 ATTTTTGTAAAATGGAATGTGTGATTCATAAAATCCGTTTGATATTCAACTTTTATTTTATAGTAATGAATTTTTTAGTGCCTTATAATAAATATAATAATAAATGTTCGATTCCATTCAAACTCAACTGAACTCAACTAGTTGTC:1 + chr3R 31126436 3' + HB 101 1 73.29 AAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCA:1 - chrX 2479460 3' + mdg3 5465 2 56.16 ATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAGACCTTTTCAAACCGAATACGCCAACTAAAAGCTAGA:1 + chr3L 15916912 3' + gypsy4 315 2 78.08 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACT:2 - chr3R 23618114 3' + hopper 1365 1 52.05 CGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTATCAGATCGTTTGTGTTTCGTTCTTTTT:1 + chr3L 17033632 3' - I-element 180 1 78.62 GGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGTTAAAAATTATTTTATTTTAGTTAGTGGTATTGGTAGTTTCAAATCATATCATTCTTTTTGTGCGTGGTTTCCTG:1 + chr3R 16686950 3' + 1360 2983 1 60.71 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTATAGTTTATTAAATC:1 - chr3R 14980318 3' + roo 9001 2 63.70 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACA:1 - chr3R 30946533 3' - Transpac 82 2 73.79 ATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTGTTTTGCCTTACCTGCTTTTATCAGTTATTAATTTTTGGTCAAGCCTTACGGCTTTCTTTTAGTTTTTCTGCAACTGCCACAACA:1 - chr3L 22035493 3' - 1731 38 2 59.59 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGGTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTT:1 - chr3R 4682904 3' - Burdock 6183 2 64.91 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGAGCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGT:1 + chr3L 24208237 3' - Quasimodo 32 2 60.27 TTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGACGTGGATTGTGGAATGGAATGTGCACTGATACAGGTAAAGAATAAAGTAG:1 - chr2L 5494151 3' + Stalker2 7641 2 64.83 AGCTGATTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAAGAGGGATGAGGATAGTATACAAGTGCAT:1 - chr2L 14026139 3' - F-element 482 1 55.48 ACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGTTATGTTTTGAAATGGTACAATCTAAGTGCGATGGTTTTAGCAGTCCTAAACCTTAACCGTTGGATGGTCAAGGTGTCGCATTACCCAGGACGTCC:1 - chr3L 25662925 3' + Cr1a 488 1 53.23 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGTAGCTTAAATTTTATTTATGGCTG:1 - chr2L 2527660 3' - hopper 52 1 76.70 AAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGT:1 + chr2L 16539727 3' - Juan 4106 1 65.75 ANATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCT:1 - chr3R 19992636 3' - hopper 43 1 53.60 AGTTAGTTCGTATATTTAAAAGGTCAATAAATTAAAAAAAAAAATTGGTTTTTAGTGGGTAGCACTGCTGCCATGAGAAAAAAATGTTGATTCTTAAGCAAAAACAGGACGGATGCCTCTAATTTGCTGCTCATTTTGTTTGATG:1 + chr3L 15714081 3' + HB 292 1 77.93 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGACAATCGGTTGATATCGCATTTCCGGTGCAGTTATTGTGGCA:1 + chr3R 8890099 3' - FB 79 1 71.23 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTGGCT:1 - chr3L 12315696 3' - transib2 35 1 61.64 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATA:1 + chr3R 23067522 3' + roo 339 2 65.07 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTT:1 - chr2R 17926311 3' + opus 428 2 72.60 TCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGTCGTAGCTCCAGAATTCTCTGCATGTCCGGTTGGTTTTTGAGGGATTAAGTTTCCGGATCCCGGATACCGAATTCCCGTTAACGGG:1 - chrX 14798631 3' - I-element 227 1 79.82 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTA:1 + chr2R 8047345 3' + 1360 3321 1 65.07 AAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTATGGTGAAGGGCATAAACAACTTGTCCACTGCACGTCTTGTCTCTCCT:1 - chr2R 1089301 3' - 1360 246 1 59.26 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACA:1 + chrX 1451801 3' + hopper 1399 1 63.08 ACAGCGACAGTCCACAAAATATTGGTTCACTTCAAAGATATCTTGGAGCAAACAGTTCTCGTTCTCTCCGGCAATTTCATAATCTGAACAAAGTGCTCGACCACAGGTAAAAATGCTCGAGCACGGCGCACACAGAGCCAAAAATC:1 + chr3L 20395633 3' - hopper2 369 1 64.38 CATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAAGCGCTTACACACGCAAAATGCCCGAAAGCAGCTGAATAGACCAAGAAATGCTAG:1 - chr3R 28897898 3' + baggins 5388 1 50.00 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGCTTGAAAACTCAAAA:1 - chrX 2479457 3' + mdg3 241 2 68.60 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAAT:1 + chr2L 4063926 3' - roo 8735 2 67.12 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATGGAAATTAATCTGTTTTCAAATGTAAAATG:1 + chr2L 11357963 3' + blood 7368 2 70.55 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAATTTG:1 + chr3L 8685230 3' + I-element 5280 1 66.44 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAAT:1 - chr2R 22287417 3' - jockey 66 1 55.48 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATCGA:1 - chr3R 17996130 3' - diver 25 2 67.12 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATAACCAGCTTTATAAGTATCTCAATCTATCTAGCGCTTTACTATCTG:1 - chr2L 6174010 3' + I-element 5337 1 67.81 ATAATTTCCTGCTACTTCTGCCGCTGTTGTTGTTCTGGCTGCTGCTGGTGAGTGTGTCGCCGCCTAGTGTAGTTAGATTCCCGACTATGGCAACGAGAGCCTGGACTATCCCAACTA:1 + chrX 5478925 3' - TART-A 144 2 63.25 GTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCAATTCATACCGAACATATACCTCTATTAGAGGGAAAGTACAAAACACGTGAAAAATAGTTCCACTTTTTTTTACACATGTTTATGTTAAATAGGATTTGA:1 + chr3R 9097712 3' - I-element 138 1 69.86 ACTATANTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTT:1 + chr2R 17878638 3' - Doc 65 1 54.79 TTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGG:2 - chr2R 3563103 3' + Transpac 5152 2 68.49 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAAAAGAAAAAATA:2 + chr2L 18226893 3' - roo 8706 2 55.48 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAA:2 + chrX 8308513 3' + roo 9026 1 55.48 ATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTGACTTTGGCTCGTGGCCAGCAAAAGAGGATGGAAGTTG:1 + chr3L 431636 3' + I-element 5057 1 73.97 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCA:1 - chr3L 16690896 3' + I-element 5301 1 57.53 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGC:1 + chrX 8308494 3' + roo 9007 2 64.38 AATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGAACATATTCTTGCGTTTCAAAA:1 + chr2L 21639661 3' + R1A1-element 78 1 53.19 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAAT:2 + chr3R 19073305 3' + roo 9032 1 57.53 TAATAATAAAAATAATAATAATAGTACACACTACTGAAACCTGATAACAAGTTCGTGATCTCACGCTCGGAAGCAGTGTGTCCAAAAATAAATGATTTTCATATCTGCAATTACCAATTTCCCATAACTCGTGCCCAAAAAAACTA:1 - chrX 3448910 3' + mdg1 7065 2 78.08 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCCACTTTTTTTTTTAGACTGAAGAAAGGGAACTTACATTTGGCATTGCCTACAC:1 - chr3L 13836562 3' + 412 480 2 73.10 TATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAG:1 - chr2L 4888729 3' + BS 5029 1 62.33 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAG:1 - chr3R 15790828 3' - roo 8710 2 50.00 TAATAATAATAATAGTAATAACAGTAATAATAGTAATAATATAGTTATCATTTTTTGAATGTATGTATCGGGTAGAAGGGAAAGTTTACTTATAAATATATTATTAGCTACGGTCTTTGTATACC:1 - chr4 550436 3' + mdg1 7077 2 60.80 GAATTACCAAATAACTAAATATTATTGCTTGATTACCGACTGGAGGGTTGGCTGTTATGCTGATTTGCATTTCATGGAGTGACACAATGGCACAGTGGTTTCTGGTTTCTGGTTGATTACTGTCCTAATCCTAGCTAATCCCTGAA:1 + chr2R 21460798 3' + Tc1-2 472 1 43.84 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACAGGTGAGAAGGTGGCAAGCAAGAAAGTTTTGGTCATGCCTCGCATT:1 - chr2L 18546481 3' + roo 9047 1 41.78 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACA:1 - chrX 19038372 3' + hopper 1356 1 63.57 ATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTCCTACCCCCTCCAAACTTCCCAGCAGAAAACCCTCCTGGAAACAAAGACAAGCAAAAATATTTTGCCGTTTTTAGTTGTCGCAAAAAGTTTGCTTTG:1 - chr3R 13739449 3' - Ivk 261 1 66.44 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCCGAGGGTCTGAACGATGCCCAGAGACGGGACAAGCTAGATCTCGAATTTGCG:1 - chr3R 27123485 3' - roo 68 2 63.01 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGGAAATGCATTTTTATGCG:1 + chr3R 10270709 3' + Juan 4198 1 76.03 ATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATATATAGATTGCGATATGTACTTTTATGACATGTT:1 + chr2L 12659721 3' - F-element 4644 1 76.71 TAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACAAAAAAGCTCAACATACGAAGGAGGAAAATTCAATAAATTGCTTGGCTCGACATAAAATAATGCTGCATTATAGACTTTGGCCGCCCGCGGCAAAGTAACCGCCAAATG:1 - chr2R 19052613 3' + jockey 4886 1 78.08 TAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCGAAGCGCTGGAGAAGAGCTGCAGGGATCCCAAAGATCCACCTGCA:1 - chr2L 328636 3' - G2 2948 1 53.19 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATATAGGTAA:1 + chr3R 15072696 3' + pogo 2073 1 63.70 GTTACATACATTTCAAAGAATCTAGTATACCCCTTTACTCCAGGAGTAACGGGTATAAAAAACCATTTGGTTCAGACTAAATTATTTTTCTCTCTGCGAACGTGAAAAAAAATTTGTTGTCAAGTACTTATTTTCTGACCCTTGCA:2 + chr2L 11154360 3' - INE-1 15 1 78.77 ATCAAGTCCAAGCCCCACAACTTAATGACAATGAGTGGAGCACTTTTGCCAAGTGAACAGTGTCCCTGTTTGTGAGTGTGTGAGTGAGTGCGGTTCTTGGGCAAGTGGGGGTGTGTGTGTGCCAGTGCTGGCTGTGCTTTACCAAG:1 - chr3L 13894083 3' - invader4 2692 1 72.60 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAG:1 - chr3L 6518563 3' - 412 7122 2 64.38 AGGAATAAAAAAAAAAAGAAAACAGGCTAAGGTCATCAGCTAAAGTTACCCAGTTTGCACATATAATAGATGACCAGGTTTTCAGGCTACCAAGGCCAATTGTGCGTGTGTGTGCAAAGTGTTTAAGAATTGCCAGGCGACTAAAT:1 - chrX 9019150 3' + Osvaldo 1520 1 66.44 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTT:5 + chrX 8200301 3' + flea 197 2 58.22 CGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATT:1 + chr2R 9158122 3' - mdg3 5336 2 72.41 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGGCGAAGACGATGCAAAATATTTATCAATTAA:1 + chrX 8027465 3' - Juan 68 1 68.99 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATAT:2 - chr2L 15550668 3' - Bari1 69 1 62.33 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTTGCATTAAATGTCACAAAGTCAC:1 - chrX 585637 3' + Tirant 374 2 53.85 TCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGC:2 + chr2L 22224611 3' + Rt1c 5405 1 57.53 ATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGC:1 + chrX 15200933 3' + 17.6 428 2 66.21 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACA:2 - chr3L 18125892 3' + Ivk 5334 1 49.32 TCTCTTTCGCTTTCACATTTTTTTTATAATATTACTCCTTTTTTTACCTTTGGTTTCTT:1 - chr2L 16695168 3' - F-element 108 1 64.41 TGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGAC:2 - chr3R 2522273 3' - Tc1-2 102 1 46.58 GTCCATGGAGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGACGCCTCTTTCGACGAGCCGGGAACGCTGAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTAAACTCGGTCGTCGTGTTAATTACAT:1 + chrX 12871702 3' - Rt1b 4910 1 76.15 ATCAGGATCAATAGCCGAGTCCGTCGCTCCTTAGGTAAAAGCCTATAAAATAATAACCGAAAATAATTT:1 - chr4 1035383 3' + INE-1 93 1 60.87 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTG:1 - chr2R 20227255 3' - hopper 56 1 77.88 TTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTGTGAGTGACAATGGTGGCCAACAAAGTAGTTACAGCATTTTTA:1 + chr3L 19340967 3' - Doc 4577 1 70.55 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGG:4 - chr3R 15724265 3' + Juan 4191 1 66.44 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCC:1 - chr3L 24934310 3' - HMS-Beagle2 74 2 70.55 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTG:1 + chrX 9410545 3' + I-element 5275 1 71.23 ATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTATTATTTTCAAATGCATAAAATGCTTGCTGTATGACCCCTGGTACTGAAATGCAGACTCATCAGTCCATAAAATATTAAACCAAAAGTCAAGAGAAATTGTTTCATAATTAAATT:1 + chr2L 4321759 3' - Bari1 1423 1 63.70 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATAGTACTAAATAGGACACAATATCAGAACAATTGAAAAGTTTATTTTATTAGTAA:2 + chrX 17717092 3' - FB 67 1 62.33 TCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAA:2 - chr2L 22674808 3' - mdg1 89 2 80.82 GGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACA:1 + chr2L 17766158 3' - Doc 243 1 73.29 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTAC:1 - chrX 9530331 3' + 297 6893 2 76.71 TAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGAATAATTAGACGACTTTTAACGAAATATGCCCCTTACTAACCGCAAA:1 + chr3L 22067889 3' - I-element 5051 1 67.81 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGAAAACCCTTCGAAACATTGATCGACATCTCGACTCTCTCTCTCTCTCTATAATAGATATCATATCATAAAAAATATTTCATTGATAAATATCTGGATCTGCTTCGG:1 + chrX 3520711 3' + I-element 5301 1 73.29 CAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACATTACAAAGCGACAAGTGTGGAGTGTGGAGTGCATACCGTACCACGCAGAGATAATAATTCGGACTGTGAAGAGTCGAGAGCCAAACAAATGAATCGCAAATAA:1 + chr2R 24258197 3' + Stalker4 499 1 77.44 AATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAGG:1 - chr2L 17104609 3' + transib4 2576 1 27.40 ATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTGTGTGGAAGGGGTGCTGGCTGGCCACGATCAGAATATCTAGCTAGGAG:1 + chr3L 22758404 3' - F-element 4600 1 65.71 TGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTAAAATTAAACTCCTTAGGCGACATAAGTCTTTCTCACG:2 + chr2L 22369287 3' - rover 21 2 71.92 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGCCGAGC:1 + chr2R 9871549 3' - roo 52 2 66.67 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTA:1 + chrX 11661486 3' - pogo 67 1 68.06 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTGTGTGCACTGGAAATTCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTT:1 + chr3L 17940198 3' - 1360 58 1 59.59 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTTTCG:1 - chrX 15357617 3' + hopper 1391 1 67.12 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGC:1 - chr3L 3983835 3' - P-element 31 1 37.50 AACGCAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTAGCCTCAGGCACTTGTTCTGGAAAGCGCTCAATGGGTCCATGGGCACGAAACTCGTGTGTTCCAAATTCCGAGGCCACCAAGGATGAGCAGCGCCAGCTGAGTTGACCA:1 + chrX 18532094 3' - G-element 4011 1 58.90 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTA:1 - chr3L 19454896 3' - mdg1 32 2 62.33 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACTAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAACATTTAATATTATATTATATATTATAAAAAAATATATT:1 - chr3L 27177462 3' + mdg1 38 8 84.25 CTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAAC:1 - chr3L 21996176 3' - Transpac 79 2 69.18 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTACGATTAACGGGTACAATAAAGTGAATATTAAGATATTTTTT:1 - 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Stalker4 121 4 65.75 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTATTTTAACCCACC:1 - chr2L 16540896 3' - hobo 18 1 71.85 TTTACTTAAATAAAATAAAATAAATACATAATGTAACATAAATCAACCTCATAACTATGAATCAAAACCAACTAAAGCACTAGTATGCACTTCTAATCCTTAAGATTAGGTTCCTTAATACATTAACAAACAGAGAAATGTTTCTT:1 + chr3L 8333849 3' + G7 1146 1 75.34 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACA:1 - chr3L 3983841 3' - P-element 81 1 19.35 TTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGGTTA:1 - chrX 14722084 3' + diver 187 2 60.27 TACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTGACATTTATTTATATTCAATTCTACACCAAATCGCTGGATAATTTTATAGATTTCCATTTAATAGATTTTTTAGTTAAGTTTTATAAATATTTAGGTACTTACG:1 + chr2L 14358900 3' + diver 207 1 55.86 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAAC:1 + chr3L 19111612 3' - Doc 61 1 58.90 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACAGACAACCAAAACACCCACCCTTATAAGAAACA:1 - chr3R 3920514 3' - roo 81 2 76.60 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCAT:1 + chrX 9950585 3' - jockey 4759 1 77.40 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGCAGTTGGTC:1 - chr3R 30347326 3' - P-element 76 1 34.25 AGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACTAGCAATTGGGGGTAGCACTTGGGTAACAGATGAGATGACTGCGATATAAATTGTGGATAAAACTGCTGCTGCACCGTTT:1 + chr2L 19713438 3' + Quasimodo 1 2 67.65 TGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACT:1 + chr3L 18125996 3' - Ivk 59 1 52.74 TTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAG:1 + chr3L 22723935 3' - 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INE-1 311 1 53.79 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTAAAGATCTATCTGAAGGGCCAGGAGACGGCCGATGCCTACGACAAGT:1 + chr3R 18971833 3' - Juan 4041 1 67.81 TTGTAATCCCTTTAGTGTGGAACACGCCACGGAAAGAGCTACACCAATAATTCCGAAAATACCCCTTACTTATCCACAACTGCCTCGATCTGCCGGTAGATGGCACTCCTCGACCTTCTACGCAGGACTGCTGGAGCCACAGGATG:1 + chr3R 24386654 3' + R1A1-element 5291 1 73.29 TCTATCGATATTCCAGAAAATTATTAAATTTTGCGATCGCATTCCCCTAGCTGAGCAACGGGGATCTTATGGTCGGGGCCTTCGACTATGGCATACAATTTAAAGTGACTCAATCGCTATCCGTCCC:1 - chr3L 26663045 3' + INE-1 501 1 70.87 GAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAATATAATATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTAATCACTATTATTATATTGTAAGTATAACGCTTATTGAACATTCTGCGCTGGGCAAGGGTCGTCAGCATTGCTA:2 + chr3R 26743086 3' + Burdock 386 1 76.71 CTTTGATAATTGTTTGTGTGGTTTGATATGTGGGTGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTTGTTTTGTCTGCTAGCTGTATATGGCTTTCCATTAAATTAGTCTATGTTTTCATTTAATTAAATTAAACTTGACTTGACGCTATGAATTTC:1 + chr2R 24695977 3' - Porto1 302 1 65.07 AGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATTAGAATACAAGAAAATAAGACTTTGCGCGTAATAAATGTCGATGTGTAAATTTTCTCCTTCTTTAGTTGGAACAGGAATATTCCATTAGGAATTTTAATA:1 + chr3L 26505785 3' + Max-element 295 2 63.45 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATCGTACTCCAAGGAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGCAGGTCAGG:1 + chr3R 5351468 3' - 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chr3L 13380751 3' - GATE 8303 2 56.85 GTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCACAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGG:1 - chr3L 27865986 3' - Max-element 8273 2 47.79 ATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCCTGC:1 + chr3L 5061681 3' - 17.6 6952 1 67.12 CAATAATAATAAACAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCATTTTAAATTGTAGCACAGCCATTTCATTGTTCTTTTCGCGCTCAAGTTCAATCAATTCGGTTTCCTTTCTTT:1 + chr3R 15790262 3' + flea 253 2 58.90 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCG:1 + chr2R 4673649 3' - Quasimodo 31 2 43.84 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCAGTTTGGGTGTACGGATCGAACTCCAAGTAACTTTGAGATATTTCGCCACGACGTAG:1 + chr3R 5351462 3' - jockey 4750 1 67.81 ATTTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTTTCTTTGAATCAAAAAATGTATT:1 - chr2R 5883555 3' + 1360 3042 1 46.58 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACGTATAACATTTGAAGGAAATATAAATCCAAACCAACTATATTCTGCCATAAAATCTACAAGAAAAAAGAAAAACATCAAAAACATCGGTTGCCATAAATTACA:1 - chr2L 2138994 3' + hopper 1354 1 75.34 ATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTTAAAATGGATCGACTAGTGAAAGAAAGAGTTATATAAAGGCAAAGATCGAGGGGAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAAATTTAGAAATTAAAACTTTCGTTTCAGTT:1 + chrX 6116927 3' - transib2 2752 1 73.97 AACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGT:1 + chr3R 934285 3' + Rt1b 4734 1 56.85 AATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGAGTCTCCTTTCGTTTTATCTACGGAATAGAATACCGG:1 + chrX 8027549 3' - Juan 21 1 71.23 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAGGATCCCTGGATGCGCCTTGCAGCCGGTTACTC:1 - chrX 18336534 3' + mdg3 5484 2 75.86 AGAAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCT:1 - chr2R 5532367 3' - Doc4-element 58 1 59.59 AAGCAAGTCATTGTTAGTTGTTTTCGTCTTTTTTATTAAAATTATTATATTATTATATTATATTCTTATAAAAATAAGCATTCTTTATATAAACTATAATGAAAAATGGGAGAAAATCAACTAAAGCTACTAGGATAATTTACGAA:2 + chr3R 17094887 3' - gypsy 5 2 81.51 CGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTCCTAATGCAATTCATCAAACGCGCATTGTCCCC:1 + chr3R 6625780 3' - flea 4838 2 75.52 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACA:1 - chr3L 4001107 3' + hopper 1353 1 73.11 AGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGGCCACGACAAACAATTAAAACGCTTTGCTAGCATGACAGGCCAGCTGAGTGTT:1 - chr2L 12985928 3' - hopper2 1208 2 63.45 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGT:1 - chr3L 46943 3' - FB 69 1 77.50 TAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGAATACGTATGTATGTTTAATTAACAAATATTTAATCTACATAAATGAGACTATTT:2 + chr2R 11464790 3' + Stalker4 26 4 63.01 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGCTCTCAGATTTATGACCGCACATGA:1 - chr2R 11794941 3' + opus 490 2 71.82 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGCATTTGAATGCTTA:2 - chr2R 20227183 3' - hopper 26 1 62.33 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAAT:1 + chr2R 7304145 3' - pogo 36 1 58.22 AAATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGGGTAGATAAGCACTCTTA:1 + chrX 21087714 3' + mdg3 227 2 67.81 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGCTAGATGACACATAACTTCAGGGAATTAAGGCGGTTTCAAT:1 + chr2R 13168780 3' - P-element 27 1 69.18 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTT:1 + chr3L 19274891 3' + transib2 2764 1 60.96 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACATATGCCTACTATTTTTATGAGGCACTCCTGTCGATCTCGTCCGCAATCGATTTCCGAAT:1 + chr2L 22279436 3' + 412 434 2 55.48 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAACTATTTAAACAAACTCTAAGAAAACAACTGGAAACTAGATTTAACATTATTAAATTTCTATCATCTAAATATTCTTACATGCAT:1 - 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chrX 20098029 3' + mdg1 40 2 73.53 AAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATAAAACGTTGAGCAAAATAAGGCCAATTAGAGCAGGGTGTAAACATATTTATTTTAAAAATA:1 + chr2R 10506660 3' + blood 165 2 86.02 GGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTCATACTTGATGGCCGGTTATTTTTAATGCATTCTCATAAAGCGCTTCG:1 - chr3L 10314611 3' - jockey 204 1 67.12 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGAT:1 - chr2R 11794970 3' + opus 7475 2 66.67 ATACTAAGAATACTTTATATAATTACCCCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTT:1 + chrX 12129401 3' + flea 4947 1 60.96 AGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCTTAAACTAAGCTAAAAGCTGCAGTGGCTTTCGGCTG:1 - chr4 805821 3' + Tc1-2 1588 1 57.14 ACTGCAACTAAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGTTCACATTTTCATTCATCGCAATCTTCGCCATGAAGTGTTGCAAAGGCCCCAAGATAAGATATAGGATGCACTTGGA:1 + chr3R 13687136 3' - accord2 7597 2 52.74 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCACTTTTTTTTTATATTCTTGCCGCCTGCCAACTTTGTGCCTGTTCAGCTAAATGCTGTTAAACTTTCATCTTGGGCTCAGCA:1 - chr3R 11941917 3' + flea 250 2 58.22 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGTTGTT:2 + chr3R 22590621 3' - rover 6971 2 71.23 CCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAATGCTTACGGAATATTCCTTTTTGAATTTAAAATGCTGCCTTTGACAGCCAAAATCACTGGGGATTTTGAAAACAGATAGCCCCCTAGGATTTACACTGCGTGCTTTTC:1 + chrX 7119316 3' - INE-1 553 1 74.66 TTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTATAATTGTTATGCCCA:1 - chr3L 22760383 3' - F-element 163 1 71.23 CCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTAACCGAAGTAGTTGTGCAATTGGCAGGCCAAGAAAAGGCGTTAGTTATATTTCCAACTGG:1 + chr2R 13396168 3' + F-element 114 2 57.25 AAACTAAAGAAAAAAAAAAACAATTTCTAAAGCTAACAAGTATTATTATCAATAATTATCAATAAAATATATGCATTCGTAAACTGATTGTTGATCAATTATATTTTAGTACCCAAATAGCTGTGCCAGTTTATCATCATCCTAAA:2 + chrX 8658682 3' + gypsy7 5008 1 78.08 TATTATTCTAGTGTCTTTGGTATAATGGTTAAACGAAATTTGTCGCCACGTTGAGAGCACAACCGAACATGATTGAAATACTAACGTATGGTTCTTCAATGATTAGGATTGGCCTAGATTTTAAACTCGAGCATCCTACCTCAAAT:3 + chr3R 26140389 3' - Tc3 240 1 73.97 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAG:1 + chr3L 13836709 3' - 412 7115 2 59.59 AATATAAGTGAAACATTTATTATTTGCTTTCTGAATATAATCCAACTTAAGAGAAATTCG:1 + chr2L 4031201 3' + HB 1501 1 83.33 TCATTAAATTTAATTAGGGTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCT:1 + chrX 3431936 3' + Ivk 5338 1 65.35 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCACCGCAGTG:1 - chr3R 23618080 3' + hopper 1399 1 73.97 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTAAAAAAAAAG:1 - chr2R 7090611 3' + I-element 5319 1 56.85 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTG:2 - chr2L 14074427 3' + 297 6933 2 57.53 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCTTG:1 + chr2L 71263 3' - 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McClintock 52 2 73.91 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGGGTCTTCCAC:1 + chr3R 31264132 3' - jockey 4776 1 65.07 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGATGA:1 + chr3R 15791017 3' + roo 9021 2 54.79 CCTTTCTTTTTTTTTTCGTTTTTTCAATGAAAATCTTTCGAACCAAACCAACTTTTATCGTCTTGTTTAAACTTCTCGCCACGATTCTTTTCAAGTT:1 + chrX 6616181 3' - Doc2-element 223 1 73.20 ATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGTTGTAATTCTTAAAAATATCTCTTTAGTAATCTAATGCTTATCTAATCAGAATATATATACACATTTAATAGACCACTAAGCGTGCCATTTGTGGCGTCT:1 - chr2L 9123251 3' - I-element 245 1 71.23 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGGGGGAAGGCCAGCTCGATCATGAAGCGAAGTTGGTTAAATTAGCAC:1 + chr2R 22034762 3' - copia 41 2 50.72 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTATTAAAA:1 + chr3R 20167691 3' - roo 48 2 52.74 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGCTCTCTCCCACACA:1 - chr3R 23295530 3' + P-element 2877 2 58.89 TATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCGGCCAAATGAAATGAGCATTCAGATATGAATTAAGTTTAAT:1 + chrX 3432009 3' + Ivk 5366 1 71.23 AATTTTTCTGGGATATCGATGTAAATTTGAGAATAAAATGAGAATTTTTCTTAATTGTATTTGTTGTTGTTGCTGCCGCTGGCACTAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCGAGGTCGATGGATTTGATGTACCTGAGGCCCA:1 - chr2L 9234016 3' - INE-1 502 1 61.64 ATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTAATTGTTAAAAAACATATATGTACTTAATGCATAGGTATTT:1 - chr2L 13555307 3' + Doc 4520 1 73.97 GGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGA:1 - chr2L 4888744 3' + BS 5019 1 71.63 AAATAAAAAAAATAAAAAAACTTGGTGCCGTGGCAAGGAGGCTAATGCCACAGATAAAGCTGAAAGCCAGATCAGGCTAAAAAAAAAGAGAAAATAAAGTCCAGACTCAAAGGAGGAGCAGGAAAAGCTGCACATGCAGCCAATGT:1 - chrX 17539261 3' + HMS-Beagle2 489 1 76.71 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTACAAAGATAAAAAAAACGCATCCCAGGGAGTCGCGATCAATTAAATAACATT:1 + chr2L 23029612 3' - pogo 46 1 51.37 AAGCCTTAGCTAAATACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCC:1 - chr2L 17180096 3' + Juan 4135 1 69.72 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGTTAAGCTCTGTAAAAATGTTGAAATTATATTTAAAGAAATGCAAACTTGCAGTTCAGCATCAATTTGCTTTGTGTTTCCATTAATTTTCAAAGTTAAAAAATTATGCG:1 - chr2L 10146325 3' - mdg1 7051 2 76.71 CAAATATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAAATTGTCCGGTTTGCATGCACATTGAATGTATGATACATATTGTACATACGTTTTTAAGCGGCAAAGAAATG:1 - chrX 4262381 3' + I-element 4933 1 60.96 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTA:1 + chr3L 20898613 3' + roo 8998 2 70.55 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGT:1 - chr2L 4003663 3' - mdg1 7078 2 56.85 AAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGGATTATTCTAAAATATTTGTAACTTTAAAATGTACTTC:1 + chr3R 11766335 3' - I-element 5030 1 77.40 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTTGTTGAGTAACTAAATTAAAAAGAA:1 + chr2L 14268252 3' - roo 86 2 77.40 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAAAAGAAAAAATAAAATTAT:1 + chr2L 18226900 3' - roo 8699 2 60.27 GATGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGC:1 - chrX 22840468 3' - copia 4924 2 54.79 GTATGTTTGAGGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGTGCCAGTTAACAACAGCAAACGGCGATCAACAAATCCCACCGGCAAAATCAACAAATTTTTAAATCGCAATCAACAAGGAGCAA:1 + chr3R 14058047 3' + Tc3 1398 1 65.07 GGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAAAG:1 + chr3L 25350827 3' + baggins 5375 1 56.16 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCAGTTCGATTTTTTCCACCCGGCGTTTTTA:1 - chrX 7093744 3' - jockey 4684 1 69.57 AAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGA:1 - chr3R 9557496 3' - G2 3009 1 60.96 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTTTATGAAATTTAAAAAATATCGTGTCTTTGAATTTATTCAATGGGTTTTTTGAAACGAAACTA:1 - chrX 21505638 3' - roo 8720 2 60.27 TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATT:1 + chr3L 24916725 3' - Porto1 148 1 38.36 TGGATATGTGTGTGTGTGAGTGAAAGAGGGCCTCACAAATGGCTAAGCTATCTGTGTGTGTGTGTGTCTCAACATTCATCTTCCTGCAAAAGGGGCCACGTACACATGCTCACAACACTTGCAGACGAGTTTTTATTTCTGGCATA:1 + chr2R 20442995 3' - accord 7032 2 79.45 ACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTATTCAATCACTTATTGGGGTATAAATTATATAGCATTTGGTTAGCTGAAATATCAGTCACGAAAATGGATCAGAGAATTATCCGGCCTTGGATTCA:1 + chr3R 27982944 3' + hobo 326 1 72.79 ACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGAACTTGAATGGGTATTTATGTGGGGATTGGGTTCGCTTTTAGCCGGGCAAAGGTAAACATGGG:1 - chr3L 5423559 3' + invader4 2649 1 58.33 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTA:2 + chrX 12129403 3' + flea 4949 1 62.33 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGAC:1 - chr2R 18316008 3' - HMS-Beagle2 6908 2 65.41 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACAATAATCCGACCTAATAGTGCGGAAGCTACGCATTTAGATATTTTAAGCTGGGATCGCAGAAAGGATAGTT:1 - chrX 326119 3' + Tabor 7307 2 55.48 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACG:1 - chr3L 16970358 3' + roo 350 2 59.59 GCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGCGACAACGAAAGTGGAAAAAATTAATGAAAATAGTGCTCAAAGACGGCGACAAATATGTGGACAAGTGTACAAATTTATTAAACCA:1 + chrX 1334321 3' + Doc2-element 335 1 60.96 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATATAGAGGATTCAGCTTGGCCAAGCAGTTTTGAAGA:1 + chr3R 18488455 3' + roo 336 2 67.59 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGGATTA:1 - chrX 13134893 3' - jockey 4788 1 50.93 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTG:1 - chr3R 26504179 3' - HMS-Beagle 6822 2 67.81 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTT:1 + chr2R 15376184 3' + 1360 3327 1 61.81 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGGTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGCGTT:1 - chr3R 30347302 3' - P-element 33 1 56.69 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGA:1 + chr3L 1692089 3' + blood 7318 2 77.60 ACAACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCCACTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTTCTGCAGGTCTCCGAACTGC:1 - chr3R 15790778 3' - S-element 1535 1 64.14 AGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTTGTTTCGTTT:1 - chrX 11661398 3' + pogo 2032 1 71.92 GGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGC:1 - chr2R 19199639 3' - hopper 27 1 63.77 ATCTATTATTATTATTATTATCTCAAGCTGCATCATAATCATCATATTTGGATGATCCAACCAAACCCGCTGAATTAAA:1 - chr3L 9710347 3' - invader3 5059 1 69.62 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGGCCTT:1 + chr3R 15054298 3' + copia 196 2 70.45 AGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAACCTACATAATCGTATGTATGTGAAATGTTGGGCATTCTATAAAAAAAAAACTCTTGATCATCCAACTTAATCAACATTTAATTCAAGTTGA:1 - chr3L 10676365 3' + jockey 4887 1 61.64 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTTAAGCCATATAAT:1 - chr3R 23639099 3' - pogo 19 1 71.23 TTTTTTTTTTTATTTATTATAAGTTCATTATAACTCACTCGTTTCTTTTTGATTTAAGGCAAAAATAAAAATATTTTAAATCTGCAGCATGGGATTTAGAAATTGTTTGCCAGCGTATTCTTGTTTATATTTCGATTTTAAT:1 + chrX 5140649 3' - Rt1a 5074 2 81.69 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGTGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTGGGTGGTTCTACATCGGTGTG:1 - chr3R 26404979 3' - hobo 48 1 50.69 TTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGC:1 + chr3L 17183762 3' + diver 168 2 58.27 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGATCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGAC:1 - chrX 10319587 3' - mdg1 7059 2 64.80 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGCCTGAATAATACTGACGGACGTGGAGCGGTTAATTTATTGCGGACTTGGTGCCAACTGAAATCT:1 + chr3R 25616612 3' - roo 8720 2 58.22 GGAGATCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCAAGGAAATAATAAACAGTGGAAGCGTCGGTCGGCAAGAGGCTCACAGGACACGGAAGGACGTGCAGTGCAAGGGGAGAGTGATCCGTGGAGTGAAGGA:1 + chr3L 23895010 3' + gypsy8 437 1 60.77 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATACAATCATTACAATTTAGGAACCTAAATAGAAAAATTTTATGTTTGTTATGTATGCTATGTGTGAACAGACCTGCACAGATCGATGATAGATCTGCAAAATTGGAATTTAG:1 + chr3L 23354558 3' - F-element 19 1 68.49 GTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAAAAAAAATATTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATAGGGCAATGGCAACAGTATTGATATTTGCATATGTTCCATA:1 + chr2L 13585797 3' + Quasimodo 7296 2 65.07 ATTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTTTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAG:1 - chr3L 5881578 3' - pogo 36 1 53.39 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATA:1 - chr2R 5151231 3' + roo 9002 2 65.07 CTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAATACGAGGACGCCGACAGCGAAGCCAACTGCGACGTCGACTGACCCCCCAAAACAGAAACAACAACAGCGGATGTGTCTTACGGCGAAAGGT:1 - chr2L 5404092 3' + I-element 90 1 70.34 AATATTAAATATTAATTATTATTAGCCGCCGACATTTGGCAATTGCTCAGCCGATCTTTTCATTACGATTGATGATGATCGATTTGCCGGCGAG:1 - chr2R 23792849 3' + Tc3 265 1 60.64 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAACTGCAAAAGTCAAACATTTTCCCTGCCA:1 + chr3L 9809366 3' + 412 7503 2 55.48 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTC:1 + chr3L 16470354 3' - jockey 4745 1 67.12 TGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAA:1 + chr3L 24208195 3' - Quasimodo 56 2 69.53 CATACATTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCATAAATAAAAGGCTTTCCCATAAATAAA:2 + chrX 11906383 3' - INE-1 11 1 51.37 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGA:1 - chr3L 6518569 3' - 412 7112 2 64.62 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGG:1 + chr2L 12818368 3' - hobo 18 1 70.50 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCACCCGATGTTGCTGG:1 + chr3R 10270692 3' + Juan 4181 1 64.38 TTTTATTTTTTTCTTATTTATTTTTTTTTTTGTTGGTCGGGGGGGGGTGGTATTACTGCTAGTGGTTTTAAAGTGGCCAATTACTAGAGGTCAGGAGTATCCATTACAATGCTATTAGGTTCGATATGAAAGTGC:1 - chr3R 5036811 3' - BS 5095 3 73.33 ATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAGAAAATAGTCATGGGTATTAAAAAAAGGTGTAGAGATTTATTTCACGTTGAG:1 - chr3R 29690679 3' - I-element 5197 1 80.56 GAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAA:1 - chr2R 23780530 3' + Ivk 5312 1 63.70 TATTGATCCTGATCAAGAAAATATCAATGGAAATAAAAAGCCAAAACGAAATTTGTGTGCCAGCAAGGATGAGATGAATGCGTTGAAGCAGCTACTTGCACCCTTTTCCGATGTCTT:1 - chr3L 22974160 3' - INE-1 84 1 76.92 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAA:1 - chrX 10521645 3' - Tabor 6916 2 67.81 AATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCG:1 + chr3R 27843239 3' + I-element 5281 1 67.81 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGTTATAAGCTTAGCAATGGCAAG:1 - chr3R 19073168 3' - roo 46 2 52.05 GCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGTTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCAATGTTGCTAATGTTGCTTGTGTTCCCACCTATAAACCGTCA:1 + chr2L 3491774 3' + R1A1-element 5261 1 69.18 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATA:2 - chr3L 2989962 3' + roo 321 2 77.93 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAAATAAATTAAACAAATATTAACAAACAATAAATAAATAATAAATAAAATAAATATTTAATAA:1 + chrX 9456586 3' + HeT-A 6057 2 76.03 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGGAATTTCC:1 + chr3L 12249881 3' + roo 325 2 74.66 AAAAATATTGTTAAATTCAAAATCCACTCTTAAGTTGGGTCAATTTTTGTTCGGAATAGGTTTCTGGCTTTCTCGGTTAGTTTGCCCCCTATTTTCCGAGTTTTCCGCCCCTGGGCTTTATCA:1 + chr3L 10496706 3' - accord2 339 1 65.85 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAATCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTAC:1 - chr2L 3233980 3' - roo 86 2 75.86 ATATACACACACACACACACACATAGGGCGTCCAACTTTGTGGTTTTTTAAAAGAGTGTCTGCATTATTTGCGGCTGTT:1 + chr2R 13341537 3' + Quasimodo 31 2 88.61 AGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTGGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCTCGCGGAATAGGTGGCGTATACGTAACG:1 + chr3R 18356007 3' - Doc2-element 422 1 78.12 ACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTGGCTAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGCGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGC:1 + chr2R 4745228 3' - 1360 389 1 41.78 CAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCAACCGCAATCCTCAATGCAATATACCGACAACTTCTACAACAATTTCCAAACACTGCCCAAAACGTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATA:1 - chr3L 17560393 3' + Doc 499 1 76.03 TAATAAGCCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCTATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTAAAGTCCTGTCTTTGGATGTA:1 + chr3R 31630884 3' + transib2 2473 1 54.11 GGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGAACTGTCGAGAACTTGAGCTACGTAAGCGGTTTTTACCCTTTGGTGGGAATAACGTTCTTTTTCACCTAGTTGCTGCTTTAATATTCATTCTGATTTTGAAACCTATTCTAC:1 - chr3R 6326301 3' - Quasimodo 7000 2 55.48 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATTCAAGTCTCCGTTTGATAGGCCTTTAACGAAGCATGTG:1 + chrX 585779 3' - Tirant 10 2 79.14 ANCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7582 2 61.06 AGTCAGTAGAGAAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATTTTCGAACCAGAGGCTGGGTACATCGCGATATTTATGTCGAGGTGGGGTCCATTGGTACCGGGGAACTGTGGGAG:1 + chrX 7313211 3' + baggins 4991 1 69.12 TGTAGACGTTAGAGTCGGCATGGTATTGCTTTAGAACGAACTTGCGTAGACTTTATTCTTCGGGTTTCTGAATATCTATTTTTATACTTAGTTTCGGCTCGGCTGGGTTATCTGATTAAGAATATAAAAACTTTATAGGCCTGGAA:1 - chrX 23067454 3' - INE-1 215 1 52.05 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAGTGGGAGTTTTAGGTCAGCAAGAAAATATTCCTTTTGGCCAAATTACAAAGCAAAAATATT:1 + chr2R 22992594 3' - hobo 11 1 73.97 GGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCACCAGGGTCTTTCCGGATCCCGTCTTGGCAATGCCGACGAAGTTCGAGCCACTC:1 + chr3R 6004592 3' - jockey 4856 1 63.70 TTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTTATCCATGCCAATTGTTTGCGCAGCCATCAAGTTGGATATCCAAATCGATTCGAGAGCTTGTCGA:1 + chr3R 25003117 3' - transib2 248 1 55.48 AGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTTTATTCCATATGTTCATATTGGTTTTATTATCGTCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGCGATAATAATAAAGGACCAAATTAAGGCGAAACCCGAGCC:1 - chr3R 30521615 3' - Porto1 4293 1 72.60 TACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATTGTTGTTGTCTTTGCTTATTTCCTAGTTTAGGCAAAATATAACCAAAGTGTTCGGCTATTACGAACGCCAATGTAAACTGAATTTGTATTTAAGCTATGGATAGTTTGAG:1 + chr2L 9024259 3' + transib3 313 1 63.89 AAATAAATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATATTTTCAATGGGCTGGAGATTGTTTGATTGATTGTAAATTGTTTTAATATTTGGTAGTACAATAAATGTAACATA:1 + chr2R 18513949 3' + G7 1149 1 33.79 TTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAG:1 + chr2R 13259362 3' - mdg1 81 2 71.72 ATTTATACATATACATATACATATGTATATGTCTAACTGGATATATATATATATATATATATGGTGCCTTTGTTGCTGCTCGTTCGTTGCTCGTTACGCTTCAGTTTGGAAAATCACGCTTTATTGCATTTCAAAACCGATTTGCT:1 + chrX 10101185 3' - Stalker 244 4 72.60 CCCGTTTATAGATAATTCATCTGTTCATCCTCACATATGTTGTCAACGGCAACGCGAAAAGGCGACGTAATATTGCAAACGGACATTTGCGTATTAAAATTGATCACAAAAAATTGACGTTTTGTTTGTGCCTGAAATGAAAGAAA:1 + chr2R 4262562 3' - micropia 196 2 78.77 CTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGGGATCGGAGGGAAAGTCCTCGATTTTGGCCAAAGAGGAGGTCATATTGGTGGGTCCTTTAAGCGAAAA:1 + chrX 8273210 3' + roo 322 2 54.11 AAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGTGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATT:1 + chr2R 20802696 3' + mdg3 213 2 60.96 ACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATAT:1 - chr3L 16731387 3' - rover 29 2 68.49 ATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGTCGAATGCCTTCTGCGAAGCTGTTACATTTGCCAACAGCGTCTGTATGCGACCCTTGAGCTC:1 + chr3R 15364729 3' - flea 4722 1 60.95 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAA:1 - chr2L 15234316 3' - micropia 52 4 54.11 AAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCTCTGTGCTTTTAATTGCTGACAGACTTTGGTCATGACCAGGAATAACCCA:1 - chrX 2779010 3' - Ivk 5019 1 60.67 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCT:1 + chrX 20999626 3' - BS 17 1 66.67 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTCTGACGAATGCAATTCCTTTACTGCGCCACTTGCATTGTCATCC:1 - chr3R 11810592 3' - roo 8680 2 72.03 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAA:1 - chr3R 9002937 3' + roo 8985 2 75.34 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTTGGAAAATTGAATTTGGC:1 - chr2R 22774989 3' - jockey 4748 1 86.99 TTCTAACTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGTCGTTCATATGGACAGACGGACATATCCAGATCGAATCTATTGATCCGGATCCAGAATATATATATACTTTATACTTCTGCCTCAAAAGTATTCAATAGTATACCCTTTTACTCAAC:2 - chrX 22651472 3' - INE-1 154 1 75.34 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATGACTTTTT:1 + chr2R 21411010 3' - Burdock 19 2 66.90 TTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCAT:1 + chr2R 12185460 3' - accord 10 2 74.45 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGAGGCGGGTTAAATTCCTTGTTGTGGCGACGACAATTAAGCGATTTTCCGCGACGAGCTGCTGGCATGAATAATGAAGATATTTCAAGAATT:1 + chr2L 19897852 3' + P-element 2829 1 61.64 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGA:1 - chr3R 15790870 3' - roo 8752 2 78.77 GATTTGTGCATTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTTGCATTTTGGGTTTCCTTCCTATCTCTCCACGAG:1 + chr3L 3716421 3' + Cr1a 154 1 80.00 TATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAATTTCAAACTTTAATCTCAGCAGCATTTCCTTTGCCCTTGTTTTTGTCGCCAACACTTAGCCACCCGATAAACAACCAA:1 + chr2R 4344670 3' - Stalker4 7042 4 75.18 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGC:1 - chrX 11661387 3' + pogo 2043 1 65.75 TTTTAAATTTTAAAATTTTTTATTTAAATTATTAGATATATAATAATATATTAAATATTTATATATATATAAATATCTATTAATTTATAAGAACGTACGTATGTATGTTTTTATGGGGGGGATGGAGCGAGTGTATTAGAATTCTT:1 + chr2R 14175028 3' - 1360 3036 1 38.36 ATATAAAATAAATATATTAAAATATTTGAGTGAGTATTCAGCAGTTAAAATCTATGGTACTGCAAGAAAATTCATAACGTTAAATCTGTTAACACTTTTAAAAATTTTTCATCCATTCAAATCAGTACAGATGTATAATATAATTA:1 - chr3R 18544612 3' - gypsy7 5062 1 78.77 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTAT:1 + chrX 8308522 3' + roo 9035 1 61.64 AACATTGTATATAAATATAGATTTTAAACTCACGTTATAAACTATACTTTCATCTCAAATAAGTAAATAAATAGAACAATATATTTTATATAATGGTAAACATTTTTGCCTGGTAATAGTGAAGTATCACATTTTATACGATTTAT:1 + chr3L 18296098 3' + I-element 5272 1 47.95 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTATTATTTTTTAAAGTTGCGGTAATAGGCAGCAATTATCAGATGTTTTCTGGTTAGGCTTGTTTACTGCTTACTGCTTTACCGCTAGTTGAGGAAGTAC:1 + chr2L 22672966 3' - mdg1 7101 2 68.49 GTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCAGCTGCTGCAGCTCACACACTCC:1 + chr2R 15491426 3' + roo 8929 2 78.85 TATTATTTATTTATTTATTTATTATATTATTTATTATTTATTTATAAACTATTTTCAATACAGGTTCACAATTTGAAGAGCCCATAATAAAAAACAGATCGAATGTGAAAATAGATTTTCCCAGCACTCGGTGTCTTATGGAAAGT:2 - chr2L 15942702 3' - Juan 4215 2 69.18 CTACGTNAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTATTTTTACTCCGTGTTCACGAGCATACTCAATCGGTCTTGAACTTGTCTAAAACGTATAGGACTTTGGAATTGCATAATAGATTCTAATATT:1 - chr3R 31825387 3' + diver2 169 2 45.21 TCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGGTTCTGATCAAATGAGAGAGAGAGCTTTTAGCAAGGAATGTTTGAATTAGGCAACGGAAGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAGTGAGTTACATCAGTTAAGTTTAGCTGACAA:1 - chr2L 11383717 3' - Idefix 403 2 77.40 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTTCTCCGTTTCGA:1 - chr2L 809617 3' - jockey 27 1 66.44 AGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAAA:2 - chr2L 9778710 3' + F-element 4581 1 65.75 AAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGC:2 - chrX 21216754 3' - roo 8790 2 67.81 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCG:1 - chr3R 27160073 3' + 412 7477 2 66.90 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTGAAACCATTCTCTTT:1 - chr2L 12818199 3' + hobo 2932 1 75.59 AGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGA:2 - chr3R 19450204 3' - roo 392 2 54.11 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTT:2 - chr3R 13972954 3' - 412 66 2 61.64 ACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGA:1 - 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Burdock 82 2 74.66 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTTTAAACTATTTTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTA:1 - chr3R 18093310 3' + I-element 5305 1 67.27 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACAAAAAAGTCACAAAAATAGGGGACAAAATCCAGAAGATGGCCAAAAAAATCACACGAGAGACTGGATTTACACCCAACGCGGACCTTCGAATTGTTATAATG:1 - chr3R 5732868 3' + BS 5081 1 72.18 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGTTTAT:1 + chr4 829135 3' + INE-1 156 1 72.60 ATATAAATATATATACATACATTGATATAGTAGGCTTACAAATATGAGAAAAATAAACGTCTTCATAAGTTTCGCGATGTGTTTGTGTTTTTTTTTGTTT:1 - chrX 22836319 3' - Dm88 4382 2 65.00 ACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCCATTCGATAGGCCACAGCATTCATGCCGAAGTAGCCATCCTGGCACTCGTGGCATTTGGCACCCATAACGCCCTCCTTACAATGGCATTGTCCAGTGTGGGGATCA:1 - chr2L 14288747 3' + pogo 1880 1 74.66 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAA:1 + chr2L 6654731 3' + diver 146 2 69.86 TTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGGGATAAAACCGCTCCGATAGCTACATCTGACGCGTCTGTTGTCAAAGTGATTTTTTTGTTATAATCGGGGTGAACTAATTCAACTTGTGCTATTAAATTAGCTTTAAGTTCGTT:1 + chr3R 2649389 3' - mdg3 5360 2 73.29 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTG:1 - chr2L 12818213 3' + hobo 2899 1 57.53 AAAAAATGCAAAAAAAAAACAAAAAATTAATGATGAAAATGAAAAAAAAACAAGATATTGTTGCATACTTTTGAGCACCTTTATAACTTAATTCACGTTTTTTGAGCTTTGATAGAGATTCAATGCACTTCTACC:1 - chrX 13347011 3' + gypsy7 5009 1 56.30 AAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTAGGTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTTCATCTACCCTTTGGGCTG:1 - chr2L 11391526 3' + 1360 2 2 62.88 GGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 AAAAAATGAAAAAATAATCCAGAAGTGCAAGTGCTTAACCCATACCCTGGCATCCTAATTTCCCAGCTATTTTGGTCCTGTTTCCTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 17822785 3' - pogo 51 1 79.00 TGTACTCATAAAATTTGTATGGGTGGCGGTCGTGACGGTCTAAGAAATGAAGGGTGAACGAGAATCAATGGGGGCCACCCATTTCGAACACAAAAAATATTTGAAATTAAAGACGACATTTGTTGATTTTTTAATAAAAAATAGG:1 - chr2L 13803041 3' - hobo 2681 1 44.14 GATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCAGTGTAATCGGTTCTTGGCAGACATCGAAACCAAACTCGTTTTCCTCGCTTGGCCAACACAGAACCGC:1 + chrX 16930391 3' - Circe 12 2 52.90 TATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAATGACGAACACAA:1 - chr2L 4888703 3' + BS 5055 1 56.85 ACTGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGAATGTAAATTAATTGAAAGTAGTTTACTGGAATAAGGAGGTAATCCCAATTTAGGCGCCGCTTCAATTGTTTATACTGCCTTGTTGTGTCTGCCTCTCTGGCTAGCGCAC:1 - chr2R 9427935 3' - Cr1a 4020 1 65.97 AGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAGTATGGCAATATTGCTGTTGCTGTCCTTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTCTGCAGCTACGAGGAATTGAAGCTTGAATCGAACTTAATCTTTATCTTTAGGTAGACGC:1 - chrX 2894267 3' - F-element 4323 1 59.59 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTCCACCTTTTTTTCGCTCTTTTTTGAGTGGCACTTGTT:1 + chr3R 27765199 3' - mdg1 7089 2 53.42 ATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTGTTTC:1 - 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P-element 41 1 48.41 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTGTACGTGACAGGAAGTCAGGCCGGAGATACCCATACACTCGAAGAAAATACACCTCTTG:1 - chrX 19038365 3' + hopper 1357 1 58.90 AAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAACCCATCCGATCGCATCGGATCGG:1 - chr2R 12384581 3' + P-element 156 1 15.75 ATAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTTCGTTTTGAT:1 - chr3R 9557476 3' - G2 2984 1 77.30 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACA:1 + chrX 4808591 3' - mdg3 5335 2 71.92 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATT:1 - chr2R 22034653 3' + copia 248 1 67.42 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAA:1 - 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roo 8751 2 78.77 ATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGAGGACACAAGGCGACTTTTGAAC:1 - chr2L 11730753 3' + P-element 2759 1 20.55 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCTGTAAACATATCAACAC:1 + chr3L 13294996 3' + roo 399 1 72.22 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGC:1 - chr3R 4460988 3' - blood 7015 2 78.33 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCC:1 - chr3R 4461013 3' - blood 7050 2 53.08 ACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAGCTGGATATCTTTCGGATTTATATCTGATGAAAACACACCCA:1 + chr3L 3725627 3' + P-element 2757 1 30.82 TCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGCGCAACGCACTTGATGCAGATGAGATATATCCCTGAATGGCGGGAAAAATAGCAGTA:1 - chrX 9545646 3' - I-element 173 1 60.96 ATTTTGATTAATTTAATTTAATTTCGGTTGTGGCCCGCCTTTCAAAGACCAAAAGGACCATTTTTCGAGCGATTCCCTATGATTTCGGGTAAGGAAGAGGAAGGGTCTATCGATGGGACCTCCGAGCAGC:1 + chr3L 22370378 3' - Transib5 2594 1 69.23 AGTGTCGATGTCGCGCTTGACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGTTCAAAACACCTAAATATTTACTGGCGTTTCTTGTGTCAAAAAAAAACATAAAATTCGTTGCAAAATGGCGCG:1 - chr3L 5550800 3' - HMS-Beagle 76 2 49.32 AATGAATAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAATGAAAGACAATAAAAGTAATGCACGGCAGCTACATAATCGTCAGGTACTAC:1 - chr2R 23841445 3' + G4 3769 1 72.46 ATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTAT:2 + chr3R 9485830 3' + mdg1 29 2 62.33 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGG:1 - chr3R 19224974 3' - HMS-Beagle 32 2 63.43 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGATGCAGTCGAAATAGACCGCAAACAAGCCAGCAATAATTTTGAATTCATTTCTGTG:1 + chr3L 22325942 3' - 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transib2 54 1 54.11 ACAAAGTTGCAACATAAACACCAGCGAACACCAACTTTGCGTACTGGAATTTCTAATACGCTAGCTTTCAAGCTGAAGACAGTTTAACTTTAACTTTTGCTAAACAAAGGCGAGGAAACTTTTGCAGCAAGCATCAACTTTACATG:1 + chr2L 17857147 3' + ZAM 93 2 54.79 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTA:1 - chr2R 8735556 3' + mdg1 7416 2 55.17 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGCGGTTTGT:1 - chrX 14771695 3' - BS 28 1 57.86 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTAC:1 + chr3R 13300932 3' + roo 8985 2 73.97 TTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTGAAACTAGCGTAAATTTAAAAAGAAACCA:1 - chr2L 14074399 3' + 297 380 2 76.71 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGGG:1 - chrX 19074714 3' - mdg1 7048 2 73.29 ATAACGAGGAACTTTGGGGTGTTGTCAAGGATTCATGGAGTAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACGATGCGCTTAGCAATTTCTTTCTCCTTTAGATTGTAGAAAATATGAGTTTGTAAAGTTTATTTCTATCT:1 - chr4 232234 3' + Tc1 1218 1 57.53 TTGACCATATTCTCGACGCTTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCAATTATTTAGTATATCTTTCTCGTAGTATAATTTTCATTTGTCACTGCTATGGTTTTACCCTTTATAAAGAGTATATCCAC:1 + chr3R 7176713 3' + Ivk 5139 1 52.71 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTAAAGTTA:1 - chr3L 14094529 3' + I-element 5344 1 67.12 ACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTACACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAACAAACAAACAAACAAACAAGCACATTAAACATGAAAATCTGATCTAAGGTGGCAACAGCGAAGCCTTACCCCATA:1 - chrX 10111354 3' + F-element 4613 1 57.53 GTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTATGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCACAAATAAACTAATAACTATTAAA:1 - chr3R 23385917 3' + HB 1580 1 50.89 TAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTAGATAAGGGACCGAGGCGAAAGAGAAGTGTCTGTCATTTTTTTAAATAACATTTTCCGATTATGCAGAGCGTGCGCGAACAACATAT:1 + chr2L 19675107 3' - 297 19 2 65.75 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGTTGAAACCATTCTATTTCCCGATAGAA:2 - chr2L 12818189 3' + hobo 2929 1 77.14 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGTTCAATGT:1 - chr3R 15882570 3' - jockey 56 1 48.63 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTTCCTATATGCGAT:1 + chr2L 11257151 3' - rover 22 2 71.23 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1 - chrX 21087598 3' - mdg3 5254 1 60.00 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAATATTTTTTTCCTCTGAAT:1 - chr2R 5941291 3' + copia 237 1 68.53 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCG:2 + chr2L 16946131 3' + hopper 1355 1 56.55 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGAC:1 - chr3R 25616485 3' + roo 9032 1 58.22 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGTTAGACTGAAAGTTCACCTCAAATCGCTGTAATAATCGTTTCTCATTGGCTCGAAACTCACAATGGGCTCAGTGCCCCTAACGGACCGAAGG:1 + chr2L 9038324 3' - I-element 17 1 73.97 ATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGATTTTACGA:1 - chr2L 19817742 3' + G4 3826 1 46.58 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCA:3 - chr3R 27986341 3' + roo 9015 2 57.53 ACAGAAGCGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTGAATTCTGTTCTGCGTTTTAACCTTAATTTATTGCTGGTTTATAGCTTTTTTTTCCATATTTTTTACAGAGCATCACTATGCTCATTCT:1 - chrX 8809062 3' - Porto1 4590 1 53.42 AATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTATAATTCAAATAATCTATCACAATTTTCTATGTGCCTTTGGCCAAGCAGCTAACAAAAAA:2 - chr2R 10082053 3' + jockey 4843 1 65.07 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTTGGA:1 + chr2L 5582232 3' - pogo 35 1 61.64 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAGG:1 - chr3L 46918 3' - FB 69 1 64.14 AAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGCCTTGAAAAAGTTGAAAGAATGTCAAGGTGGAATTAAGTCAAT:1 + chr3L 6928948 3' + Gypsy6A_LTR 349 1 47.83 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCC:1 - chr3R 5368619 3' + 1360 3339 1 77.67 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGG:1 - chr3L 6518540 3' - 412 7099 2 54.79 GTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTAAATTTCGCA:1 + chr2L 13844290 3' - Stalker2 7278 2 63.01 TTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGGAATTGAAGGCATCGTTCAATTCCTGACAACTCGTCATCCATTACGATGAGCAACAACAAATGCACTCATTTGCTTGCAGGTGTCTA:1 + chr2L 11298187 3' - I-element 8 1 78.08 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTAGCGAAGAATAAACCATGCATAATGCCCC:1 - chr3R 24450377 3' - 412 17 2 71.03 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACC:1 + chr3R 15942823 3' - hopper 37 1 60.42 CAGCCAAAGCTGAAGGCAGTCACAATTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATAAATGAATTATTGATAGTTTTCATGGCTCTCGTACAACTTG:1 + chr2R 16394810 3' + 3S18 224 2 70.55 ATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGCCCAACGCGCTGGGGGAGAAGAACATGGCCAAGCTGTACCGCA:1 + chr3L 22725228 3' + HMS-Beagle2 6977 2 67.18 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTC:1 + chr2L 3234035 3' + roo 8991 2 72.60 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAAATATC:1 - chr3R 17996132 3' - diver 5915 2 65.75 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAA:1 - chrX 8360509 3' - roo 43 2 56.16 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATG:1 + chr3L 9269986 3' - copia 61 2 59.59 AATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAAC:1 - chr3R 9298493 3' - hopper 89 1 76.03 TATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTTAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAAGATTTTGCTAT:1 + chr3L 14094662 3' - I-element 83 1 75.34 AAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTGTGTGAGGAAAAGAGAAGAGTTGATTGCATTATATCGAGAAGAAGCCGGCTGATCTCGAAAAA:1 + chrX 11524027 3' - accord 7031 2 73.68 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTATGT:2 + chr2R 9121372 3' + Juan 4145 1 62.33 TGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTTGCTTTTACATACATGGCATGATTTCAATTATATTTCGGTTATAAGTTATTCTTAAAATTACCATGGACTTTCAAGTGCGGACCAATACAATA:1 + chr2R 25122758 3' + Dm88 371 1 66.44 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGC:1 + chr2R 11804730 3' - pogo 60 1 61.64 ATTTTAATCTTAGATGTCTAATAAACGAATAAAAAAAAGTTAGTCTATGCCAAAGTAGGACAATATATTCGGAAGAAGATAATTCAGGAAGAGGAGGAAAATGCAGAAGAAGAGGCTCCAAAAGGCGGCAAATCGCTGCATGTGTG:1 + chr2R 10559656 3' + Rt1c 5404 1 65.75 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACGTAAGG:2 + chrX 10167516 3' + roo 394 1 73.29 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATCAGGCCAAAACACC:1 + chr3R 16157380 3' - pogo 60 1 61.76 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGTTTAAATTCCTT:1 - chr2L 4003638 3' - mdg1 7053 2 72.60 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCACGC:1 + chr3L 12004361 3' - P-element 25 1 64.39 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATGAACTGTATTT:1 - chrX 18009914 3' + 412 453 2 44.44 CTATTTTAACTGCCAGCCTTGTGATCTTGCAGAGGTTGGAATAAGAATATATTTTACGTCGCTTTGTCGCTAGTTGATGAGCCGTGGGGATTTGGCTTCAACGAGTT:1 + chr2R 17952515 3' - Gypsy6A_LTR 261 1 63.55 TATTGATCCTGATCGATAATATGGCATCGACATAGGGTCGAAAACGCTTCCTTTTGTTTGTTACATACATAGATACTCAACGAATCTAGTGTGTCACGAGTAACCTTAATTATTAAGGAATTTATGAACATTTTAAAAAATGTTTA:1 - chrX 22784250 3' - INE-1 84 1 63.70 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTCGGCAGAGCC:1 + chr2R 23780644 3' - Ivk 22 1 67.39 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGGTAAGTGTTACTACTTAAACATATGTAAATAATAGAAATAGAAATAGAATAAAGTTCATAGAAACATGAACTTTAACTTTTAAAAGA:2 - chr3L 20898496 3' - roo 8696 2 64.38 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCT:2 - chrX 19054271 3' - jockey 92 1 74.66 ACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTATGGTTACAAGGAGGTAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTATAGAAGAAGATGAAATCTAAGTAGTTTATTTCGATTTCAAA:1 + chrX 9172211 3' - Cr1a 4057 1 68.49 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAG:2 - chr3L 12249827 3' - roo 8750 2 80.14 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCTTTTA:3 - chr3R 6625661 3' + flea 235 2 71.23 ACACATACACACACATACATACACACACATACACACCCCTTTCCTTTTGCACCCATTAGTTGGGCTTGAAGCGATATTAGCTGCGGGTTAATGGCACTCCAATTGGGAGCCCCAATTTCTGGGACACAATTCCCC:1 + chrX 6460802 3' + Quasimodo 39 2 71.11 AGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGCCCGATGCGTAGACGGATGAACGACTTAAAGGGGAAACTTTTCGAGAAAATGATGCAGCCTAAATAAGCCATTAGTGAATTATATATTGGGCTTAGTTTAAGCCGGGGGTCATAAGATTAG:1 + chr2L 14655983 3' - Ivk 5067 1 71.23 TATTATATTATTATTTATTATATATATATATATACAATTTTGTTAAGTTCTAACTAACTAGACATGACTGGATACTAACTGCCTATTTTATTACAGCTTTTAAATTGTAGTAAGTGAACGTAGCAGCTTTCTGAAAAACTTTAAGC:1 - chrX 11042979 3' + INE-1 416 1 24.66 TATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCAACAACAACT:1 - chr2R 2666301 3' - Rt1a 41 1 53.42 CATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACGTAATACTCTTTAAGTGGACATTGAAAGTGCCATAGAAGCCGGAGGGAGGATGGACTTGCCACTGCCCTGGAGCAGTTAAGCCGATA:1 - chr3L 4509387 3' - Cr1a 4217 1 61.11 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGAGGCGGAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCG:1 + chrX 585726 3' - Tirant 68 2 61.11 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGG:1 + chr2L 12818333 3' - hobo 60 1 57.53 AAACAATTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGACGTTCGCGTCACTTACTCTTTCTTTCTATTGCCCTTGGAATCATACAGTGGATCGTAATTCCTACAATACGATATACGATAC:1 + chrX 4154431 3' - Ivk 5199 1 60.27 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGAGTAAAGGAAGTGTTTTCCTA:1 - chr2L 10156127 3' + hopper2 1552 1 66.67 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGCGCATTTAAACAATTAATTCGGTGGATATATTAAAAATT:1 + chr3R 19408015 3' + diver 178 2 49.32 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCCGTGCCCCCCCGGGGGCAACACTCACCTGGCGTG:1 - chr3R 22287953 3' + transib2 2769 1 53.42 AACTAAAGAAAAAAAAAAACAATTTCTAAAGCTAACAAGTATTATTATCAATAATTATCAATAAAATATATGCATTCGTAAACTGATTGTTGATCAATTATATTTTAGTACCCAAATAGCTGTGCCAGTTTATCATCATCCTAAAC:2 + chrX 8658683 3' + gypsy7 5009 1 78.77 AATATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTG:1 - chrX 22906785 3' + transib3 2734 1 77.94 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACT:1 + chr2L 12818363 3' - hobo 30 1 63.70 CAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGCTGGGTCGACCTGGCAGACTGGAAGTGTGTGATCGCGTTTCACCGGAGAAACAATAAATTTGTTGTCG:1 - chr3L 7820696 3' + F-element 499 1 69.86 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTGTGTACTACTGGACGTGGACCA:1 + chr3R 10270678 3' + Juan 4169 1 55.56 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTGAAT:1 - chr2L 17180038 3' + Juan 4189 1 67.12 GTTATTATAAAGATAAATATTTTACATTTTTTACCAAAACGTATATGAAACAATTTACAATTTACAATTTTTTTAATATTTTCGTATATAATGCAAGTAAAATATTTAAAAGGATTACTTTATGAAAATAAGAACAGAAATATATA:2 + chr3L 10167928 3' + looper1 1660 1 75.34 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGGGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCCCCCTTGCAGTTCTCTGAAATGCAGCTCATATTAATTGAACAATTTTTTAGCATATTTTTTT:1 + chr3R 26774094 3' - hobo 71 1 67.88 CATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTTGAGAACACCAAAATATAAGAGGAGTTTGGGAAAAATTA:1 - chr3R 28825056 3' + I-element 305 1 73.10 TCTCTCATATACACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAGCGCAGTCGACAGCGTTCTTATGTAATTAAGACGTCAACCACGAACC:1 + chr2R 962681 3' + blood 7191 2 76.00 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTTTC:1 - chrX 22840443 3' - copia 30 2 63.01 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATATATGTTGTGCTAGAAGCCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGTATCTTTCTTCGCAGCACTGGCCATTGAAATTCGAGGCACAA:1 - chr3R 31708861 3' - 1360 3263 1 71.23 TTTAATGGGAAATTTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCGCTTTTATTTCTTTAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAATATCAATTGTTATCCCCTTTTATTAGTTCTTAAATG:2 - chr3R 5351195 3' - HB 1555 1 75.34 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTA:1 - chr2R 3564064 3' - Tabor 6922 2 71.92 GGGAGAGTAAACAAAACACAAAGATGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATGACTCGCGAAGCGATTTTTTGTTTGATCTATCATATTTTATTTTTAGTTCTCGGTGTCTTTTA:1 + chr2L 14996797 3' - Cr1a 205 1 66.44 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGC:1 + chr2L 19924034 3' + roo 340 2 63.01 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTG:1 - chr3R 13972974 3' - 412 86 2 75.34 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTT:1 - chr2L 18226769 3' + roo 351 2 58.22 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGGAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGGGAGATTTGGCAGGTTGCTTTTGTTTTACATCGCACACAATG:1 + chrX 18336683 3' - mdg3 54 2 52.48 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTGGGTTTGGGTGTTGGGGCTCACTGCCCTGCTTAGTCAGA:1 - chr2R 20348940 3' - transib2 46 1 51.37 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGGGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGA:1 - chr2L 8338111 3' - P-element 59 1 43.75 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACGATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCAGTCATTTTTATAAATAACA:1 + chr2L 19675071 3' - 297 6612 2 58.20 TATTAAATTAAGCATAGTTTTAAGATAATAAAAGTTTTGAGTTCTGCTGCTGAAACTTGTGGTTGTGCTTGTAATATAAAACGCCCATTTTTGTTATTTTTGGGATAGTTTCCGATTTGTTTGGTCTTGCTTTTTTAACGCTTGCT:1 - chr3L 61843 3' + Transib5 434 1 71.23 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCC:1 - chr3R 27765117 3' + mdg1 7404 2 73.64 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGCCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCG:1 - chr3R 23618131 3' + hopper 1354 1 62.14 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAAAAAATTGT:1 - chr3L 26505842 3' - copia 4903 2 62.33 ATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCATACTACAT:2 + chr2R 2650889 3' - gtwin 37 2 60.27 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCA:1 + chr3R 31264089 3' - jockey 4819 1 56.16 CATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTC:1 - chr2L 11298062 3' + I-element 5274 1 76.71 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGTGCAAAAGTTTTCCTGCT:1 + chr3R 31886939 3' + hopper 1358 1 56.74 GAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTTTTAAA:2 - chr2L 18707931 3' + Bica 100 1 52.74 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTAT:1 + chr3L 13836712 3' - 412 59 2 57.53 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCCAAATTTTAAATGTG:3 + chr2L 16943924 3' + copia 255 1 60.27 TAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAA:1 + chrX 22824255 3' + Gypsy12A_LTR 2235 1 50.68 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTC:1 + chr2L 6647721 3' - mdg3 72 2 63.70 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGACACACTTGGTATAGATTTCTTTCAGTGCACCGAAGCTGCTCTGCGTCTGCTCGTTAGCTGCGCCGGTAATGGGAGATAATGCAATTTTTAAACATTTGGCATA:1 - chr2L 3675804 3' - Juan 4043 1 66.90 TTATTTGGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATACAATCATTACAATTTAGGAACCTAAATAGAAAAATTTT:1 + chr3L 23354486 3' - F-element 87 1 69.01 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGG:1 - chr2L 4063843 3' + roo 339 2 65.75 GGAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTAAACTATAATTTTTTTAAATTTATTGCCATTTTAAATTCTACTTATTTGATAAGGAGCAGTAGTTCTAATATATGCGAAAATGTAATGCAGTAATAGGTTTCTGTAGTTTTATCAATGTTA:1 + chr3L 15860462 3' - HB 353 1 61.64 AAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGG:1 + chr3R 5368713 3' - 1360 22 1 68.66 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCAGCGGCAACTCGAAACTCCCAGTTGGCAGTCCTGGAGTCCGAGGCTGCTGCTGCTGCTTTTATTCAAAAGTTTAGGCAGC:1 - chr3R 28385505 3' + transib2 2822 1 77.06 AAAATATTTATTTATTGTAATACAAAGATATTTTGATATTTGAATTCAGCCTTTAACTCAGAGATGAACGAAAATTATTATAACATTATTATTGTAAAATGCTATAGGGTTAAAGGAACCCCACATGAAAACTGGGAAAACTTTTG:2 + chr2L 7283657 3' - mariner2 830 1 27.40 TATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGGAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAAC:1 + chr2L 17005799 3' - Stalker2 7272 2 56.31 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCC:1 - chr3R 31886843 3' - hopper 44 1 58.40 AAATCCNAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCAT:1 + chr3L 2990017 3' - roo 80 2 73.97 ATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTTAGTTAGGGTATTGCAGTGTTCG:1 - chr2R 21410812 3' + Burdock 248 2 79.45 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTC:1 + chr2L 4063942 3' - roo 8719 2 56.16 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCGTTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACCGTATAT:1 + chr2L 11839766 3' + mdg1 7415 2 55.48 TGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTAACCTTAAGTTTTATAGTTCCCGATC:1 + chr2R 9158180 3' - mdg3 5279 2 67.81 AAATTAATTTATTTAATTGATTATGGATAAAAGGTCTTATAAACTTAATTTCAAATTTATGTCGCGATGTTGCACCAAAAATCTTTAGTTGGAACACAATGTCTTGTATGTTGCAGCAATTAGCTTTCAACAGTGGTCAGTATTCA:1 + chr2L 15118202 3' - jockey2 3378 1 78.77 CATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGCTGGCAATTTCAAGCATACACACTTATTCATGCACCAAAAAAAATCTA:1 - chr2L 7167349 3' + copia 4954 2 66.44 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTT:1 + chr3R 23881655 3' - FB 35 1 65.93 AAATTAAAAAAAAAACAAGAAATGCTGCCAAAAAAATTCAAGTCGCAAAGTGAAATAAATGTATCAAATTTATAGTCTGGCTATGAATTGCAACTGGTTTTCTATGGCGTTCTTTGAATGTATTGAAAATTAAACACGAACGAAAT:1 - chr3R 28316212 3' + Doc 4699 1 62.33 GTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTTTAGTTTTTGGAGCACGCGCGTTGATCTTTGTTTATCTTATGAATTAGTAACTCAAACTC:1 - chr2L 8531599 3' - Tc1-2 1304 1 61.64 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATA:1 + chr2L 22193513 3' + roo 9007 2 63.70 ATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAGGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGTGTCTGTGAGAATGTAAGCCAATCCAG:1 - chr2R 12277232 3' + invader4 2646 1 71.00 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGG:2 + chr2R 330232 3' - HMS-Beagle2 6928 2 54.11 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCTCGCCATATTTTCAATTTACATGAAGTTTTATATGGAATTTAAATTTT:1 - chr3R 7943680 3' - blood 7024 2 75.34 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAA:2 - chr3L 17055384 3' - Tirant 8123 2 74.66 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGACATG:1 + chr2L 18347421 3' - transib2 26 1 67.81 AGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGGGAAAGTGGGGAAAGTTAAACAATTGAAATTGAAATTAGTTGGTAAGCGTAAAATTAGTTT:1 + chrX 21224698 3' + roo 406 1 77.40 CCACAATAATTAAAATTGTTGTCTCTTAATTTATCAAGAAGGAGACTTCTAAAAGAAATCGATGTGGTCAAGGGAAGAAAAACGTATAAATCCCATCATGAAATTTGCATGCAACAAGAGAAGAACTGCAGGTTTTTCTTTCTGAC:1 - chr2L 17839838 3' + gypsy4 252 2 76.71 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTATCGCACACTTTCTGGCCCTCTCTTTCTTTTCGTCC:1 - chr2L 18416781 3' - Tabor 19 2 43.15 TGACTATGATTGTTATGTTTTTTTCTGCTTTCGCCTAAACCCCTTCTCTTTCCACTCCATCTCCATCTATCTCTTTCGCCGGAGCCCCACTTTCCTCACTATCCCCTCTAATTGTAAAACACAAGGCAGCAACAAACAT:1 - chr2L 9093463 3' + copia 4820 1 46.76 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAA:2 - chr3L 5389883 3' + roo 8991 2 76.03 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACGATTTGGTAAAGGGGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGACACATTGCAATGCAGAAGGGAACGCCAGGACTGATGCTCATCTCCCAGTTGGCCGGGACATTCCCTTTGTTTATGTGCCAAG:1 - chrX 21567903 3' - jockey 4761 1 60.96 AGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGCATGTGTGTGTGTAAGCGTGTGTGTTGGTACTTGTAAATACGACAACGTTTATTGTCATTGGAATTATTACTGTCATATGCGATGCGAGTGGCAGGC:1 - chr3L 22456885 3' - accord 7137 2 71.94 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCATTTT:1 + chr3L 11326810 3' - pogo 25 1 64.38 GTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTAAAATTAAA:1 + chr2L 22369258 3' - rover 7067 2 58.90 ATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAACAATTGATTAACATATTTATCATTGTTATTGTAAATTTTTGTACCCACCCGCAAAAAAACAAACGATAAAAAACATTCCGACTGTTG:1 - chr3L 6738135 3' + Stalker4 6987 4 60.42 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGGCAATTGCG:1 + chr3L 18046699 3' + roo 9037 1 51.72 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAATGGTGTGAAATTAACATTGG:1 + chr2L 14671903 3' - FB 75 1 73.97 AGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCAAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATTGAATTTTCTTGCATTTAATTAAAAGCT:2 + chr2L 15881582 3' + gypsy5 238 2 78.08 AAATAAATTTCAAAAATGATTTTATATTACGATATTTGTCATTAGTGTATTCAGCTTGAGAACAACAATAGCTGAAATACACCGGAAAAGTCGTCTCTATAGGAATTTTATCTTAAAAATGTAGTAATTTCGATTAGACCTTCTTT:2 + chr2R 8840479 3' + 1360 372 1 63.70 ATTACTGTTAGTAGGATCTAATCATGAAATAAAAAAAGGTAAAATCAATTGCTTTGTGATTAATCTATCCAAGGGGAAAAAAAATCTCCGAATTGTATTTTATTATATTGATTTAAAGGATTAATGATATCACATATCCAAGTCAC:2 - chr4 929052 3' - Cr1a 4290 1 54.79 TTCTATGATTTGGTGTATGGCTGTTGCTATGTAGTAAAGTATGTGTGTGTGTGTACGTCGTCTGCTACTTTGTTGTTGGATGGCC:1 - chr3L 5313109 3' - Quasimodo 73 2 64.71 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGG:1 + chr2L 17809233 3' - jockey 84 1 77.52 ATTGATTTTTAAATATTTTTATGACTCTCTGTAGCTACTAGTAGATAGTATATCAGTTATAGAATGCTGATAAGAGCGGCTTCTTATCAGCGGACCAAAACAAAAACTCGTTTATGTGGTCTACGAAGTTCTACAAGGTACTGG:1 - chr3R 26014564 3' - gypsy10 408 1 91.67 TTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTTTGCTTAGTGTATATAATAAGATATTTTATATAA:2 - chr2R 11445124 3' - I-element 4911 1 76.71 AAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGGTGGAGGTGAGTTATGAAGAGGGCGCGCGATTTGAAAAGTTTGTATATAAAAAATATATCCCGGTGTTTTATGTAG:1 + chrX 2790470 3' + Dm88 358 1 56.55 TACATATTATTATATATATTTATTTGCATAGTGCTAAGTTACGTTATGTATATATTTAAATTTCTGATTGTAAGAAGCGCACAAATTTTTTCGCTTGCGGATGTGTGTGGCATTATTACATGGCGTATAAACCAAATTTACGACAA:1 + chr3R 16385584 3' - Dm88 4385 2 71.92 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAATTCGGTGGCAACAAAAAGAGGCAAT:2 + chr3R 30987632 3' - F-element 78 1 76.55 AACTGAGAATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTTTATTATCCATATGTACATATGTATATGCACAAACAATATTCATACAGCAGAATGAAAGGGAATGGAATGGTTTCGCATTGTTTAGTATAGGTGTTGATGCGCACGACTCGCG:1 - chrX 6510572 3' - hobo 498 1 81.51 ATATGTATATATGTATGTATATATGTATATTTATATATACATATTAAGGGCTCCGCGTGTTGGTAATTAGAGTTCTTAATCATTATTATAGTTCATTATAGTTCTTATTATTATTATAAAAAAAAATTACATTTTAAGCATGAATC:1 - chr2R 18858182 3' + G3 4507 1 31.51 CTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACCGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCAAATATTT:1 - chr3R 19445915 3' + 1360 71 1 74.13 AAACATTGAAATTTAGGACTAATATTGTTTAATTTCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCCGAGGTATGAAATTCCAGTTTATTTCAGCGTCGAAGGTCCTTGGTAGGCGAATGTGGGGGTGTCTCTCAATGTCCTTTTGCGTGGTGGTG:1 + chrX 3427971 3' - HeT-A 5785 1 65.07 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATTAAATGGTCTAGGCAATCAATGTGCTGCTTTTATGCGGAAAGATATGCATAAGTATGAACCATATCTTTCTGTCACTCGAGGATACTACAGTATTG:1 - chr3L 25397003 3' + Juan 4157 1 72.36 AAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGT:1 + chr3L 16973444 3' + S-element 1635 2 74.66 ATGGGGAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAAATTTAATGACCTCACGGATCCCCAATTTAATTTTTCCCTTTCCTTTTCAGATTTAACCTG:1 + chr2R 5366457 3' + jockey 4969 1 55.56 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAA:2 - chr3R 11191350 3' + roo 9053 2 70.55 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGG:1 + chr2L 3234033 3' + roo 325 2 73.97 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATTATTTTT:1 - chr2R 8157138 3' + mdg1 7433 2 67.12 AAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAAACATTTGGTTCAGCGTTAATTTTATGTGTCAGCAAATAAGAAT:1 + chr2L 13557706 3' - transib2 151 1 69.93 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTC:1 + chr2L 4713968 3' - transib2 30 1 58.54 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGG:1 - chr3L 23249400 3' - rover 7026 2 65.75 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAAC:1 + chr2R 5674724 3' - S-element 82 2 71.23 AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGA:1 - chr3L 23249395 3' - rover 70 2 62.33 GTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATGCCGGGCAGGGTCCAGATAAACATATGACTCCCAAACCAGGTCGGTT:1 - chr3L 14344239 3' + I-element 62 1 71.03 CACACACACACACACAGACTCACAAAAGTGTAGTGGTAGAACACACACACACAGGCAGCAAAATAACGGTTACTGTCGAAAATATTACTGGGAAAAGTCACGACATCCATGGCGTATACGTAACTTTCCCGCGACGAAGAAC:1 - 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roo 8717 2 56.16 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAAAAGCTTAT:1 + chr2L 4003840 3' + mdg1 416 2 78.77 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTTATTT:1 - chrX 14304039 3' - roo 48 2 58.22 GACTCATAGTTTTATTTTTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAA:1 - chr3L 22760397 3' - F-element 177 1 79.45 TTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAGTCTTAACTATAACAAGCCAGCAAATCGTCCAAACGGATGACCATAAATGTCC:1 + chr3R 17454406 3' - F-element 4680 1 69.35 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGAATGAATATTAACGATACTACAAAAATAATAATTGCGAAATACAATATAAAT:2 - chr2L 20875856 3' - Doc 89 1 64.38 AGGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTT:1 + chr2L 15550753 3' + Bari1 1634 1 68.49 ACTTGGATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCT:1 + chr2R 2875180 3' + TLD2_LTR 44 1 67.12 TTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAAC:1 - 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chr3R 11191384 3' + roo 9022 2 55.94 GAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATGATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATATAATTGTTCTAATCATCCTGTGATAGAAATGTTGTACTTATTATTATTTCAAAACTCATTTCAG:1 - chrX 22901582 3' - 297 152 2 67.81 AATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATACGCTTTTATATTAGCAGTCTTTAAA:1 + chr2R 5531228 3' - 1360 78 1 62.33 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATTAATAATAATAATTATTATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATAAAAATAATAAATTACAAGTGTATATCCATTGAAATATCCTATAA:2 + chr3L 16013350 3' + mdg1 29 8 56.85 AACACAAGAGCGAGACTCTCCCGAAATACAAATATTATTCAAATACTGAGACTTTTCCTCAATCCAATTTGCATGATTTATAATAATATTAATTTTACTAGCTTTAGAGTTGGATTTTAATTCTTGCGTTGACATTTATTGAATTT:1 + chr3R 28581096 3' + 297 199 2 54.11 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGCTTGCCCTGTTTTTAAGCATACAAAAATGCTGCGGAAATATGCCAGC:1 + chr3R 11469443 3' + Tabor 7306 2 67.86 CCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCATGCTGCTTGTTTTTGAATCGAAAATTTGCGCACCACTAGTACGCAAAGAAAATGCCAACCAAAACGCAAAGTTACAAATGAGTGAGCGAA:1 + chrX 12136782 3' - R1A1-element 169 1 60.27 TACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGT:1 + chr2L 22224599 3' + Rt1c 5393 1 49.32 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCACTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGCCAGATAAGCGAA:1 + chr3R 16630387 3' - FB 35 1 60.27 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGA:1 + chr3R 16342033 3' - P-element 63 1 41.10 CTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACCATGGAGGTGGAGGTCTACCAGC:1 - chr3L 2666157 3' + Gypsy12A_LTR 2202 1 75.73 AAGGGTTAAAAGTATTGAAGAATTCAGAAAATTAGTCAAAACACTTAGTAATGATTGTGTGAAGTACCACACATACCAGCTTAAGGAAAACAGAGCATTTAGTCGGCTGTTGGCTTTTGTCTTTTGTGTTCGCGCAGTG:1 - chrX 3557599 3' + G4 283 1 73.38 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGACAGCGG:1 - 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chr2R 21410848 3' + Burdock 6348 2 54.79 TAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAATAATAATAATAATATAAGTTTAAAGAGTAGTGCATACCAAGTACTGAAGAATGTTCCAGGAATGC:1 + chr2R 17157552 3' + mdg1 7068 8 60.96 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTAATTAATATTTTCCTTG:1 + chrY 2720385 3' - 297 6590 2 73.64 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATCCCTGCCACCACCTC:1 + chr3R 29084977 3' - 412 70 2 67.81 ATATAANTTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTCGTCTTGCATTGTTTGTTAGTGCCAAATTTTAAATGTG:1 + chr2L 16943924 3' + copia 255 1 60.27 AAGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTACGAAAAGTACGCGTTGTTTTGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGGTGTCGCTGGACGGGGGTTTTGTTCCGGCGTTTTTTTTTGTTTTTT:1 - chr3L 7865066 3' - Doc2-element 392 1 82.76 TAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGACCCGATTGAGCCGCTTAATAAGTTTATAAGCACCAACA:1 - chr3L 9551625 3' - invader4 141 2 68.07 AACAACAATAATAACAATAATAATAGCAAACGGCCACGAGAGCGCGAATCAAAGGGGGATGTGCAGCAAATTGCGCTGGATGCTGGTTTGGGTGGAGCAGTGTGTCCCATCCGCCACCGACGCGCACCATTACGTGGGAACGAAGG:2 - chrX 6648187 3' + mdg1 7060 2 69.86 GACAAATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTAATTTAATTATTTCAAAGATTTCTTCTATCCTTTTTGGCTCAATAGCCCACGACAGAACAAATAAGAGAGACTCATTTGTGCACTTAATGCATTGCTCAACAACA:2 + chr4 905653 3' - Helena 7 1 71.23 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTGTGAATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGC:1 - chrX 21087606 3' - mdg3 5303 2 65.89 ATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTATGCCAGCTGGCAGAAT:2 + chr2L 22224616 3' + Rt1c 5410 1 59.59 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGAT:1 - chr2R 20802547 3' - mdg3 5292 2 57.93 TTGTTTTTTGCATTTTTTTTTTGCTCTTTTTTATTTTCAAAAGTTGCACGTCACTGCAATTTCTTTTTTTACGATATTCCGAAAATGCAATTCCATTT:1 - 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chrX 1746729 3' - transib3 2764 1 71.84 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCA:1 - chr3R 9298453 3' - hopper 50 1 51.37 CAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACC:1 - chr2R 12185347 3' + accord 499 2 70.97 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCCCAGCAGGGGGCCG:1 + chr3R 28901342 3' - transib2 33 1 59.71 AAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATATCCTTTACTGGTATTTT:2 + chr3L 3501877 3' + Bari1 1706 1 78.08 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGA:2 - chr3R 25709768 3' + hopper 1355 1 58.90 ATTTTGCTTGCAATGCAAATGCAGGTGAGGTCGTTGACACAACGGTTGACGCTGAAGACACTGTTTCTGCATAAATAAGTTGCCCGCATTTTGTTGTTATCGCTAAATTCTAGTGTATGTGT:1 + chrX 8412970 3' - Doc4-element 376 1 53.28 TTTATTTTCATTTTTTTTTTTCTGTTTTTTTTTCCCCCACACCCCCTAAACCATCCCCC:1 + chrX 9699191 3' - Doc2-element 250 1 61.02 ATAAAATAAAATAATATAAAATATATGATTAAGTAAAATATATGATTTAATGTGGTAATATTATATTTTCAATGGGCTGGAGATTGTTTGATTGATTGTAAATTGTTTTAATATTTGGTAGTACAATAAATGTAACATAAATCTAT:3 + chr2R 18513956 3' - transib1 1900 1 33.56 TAAAAGTAAATAAATTTTTATATTTTTATATTTATTTTTAAGATAGACATGAGATCTTAATGGATTTTGTTATGGCTTAAAATAAAATATATGCACGATCGTATGTGAAAAATCCTAGTTATATTACCACAACTGTGTTTGCATAG:1 + chr3R 28108837 3' - transib4 2288 1 74.66 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCC:1 + chr3L 18403036 3' + P-element 2799 1 26.03 AAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTTGGCTCCTGGCAAAATGTAAACAAAGGCCGAACGAACAA:1 - chrX 8063201 3' - 1360 191 1 73.29 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTATTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAATTGGAAATTTCTC:1 + chr3L 5389984 3' - roo 8706 2 54.11 CATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGCCCGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAGTCTACGAGTTACGGGTATAAAAAATATTTAAAACTACTTATAAAAACTTCATAAAA:1 + chr3L 23325185 3' + INE-1 81 1 67.12 ACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACCAATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGGGATA:1 + chr2R 22989668 3' + hopper2 1525 1 68.49 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGATTGGGACTATAAGCAGATAGGGC:1 + chrX 8308494 3' + roo 9014 2 62.59 AAAATTGAAATTTGTTGCTTATTATAACTATAAAAATTACTGTTTTAAACCAAGTATTTACACATTAACATTCTAAAAACCTATTCCATTTTCCAACTATTTCCATTACTGCCACCAGTAAATTCCTAGTCACCATTTCAAACCAT:1 + chr2L 14202507 3' + S-element 1539 1 56.85 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAAT:1 + chr3R 15790980 3' + roo 320 2 80.14 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGTGTTTTGGTGATAC:2 - chr2R 10078144 3' - jockey 93 1 60.27 GTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTC:1 + chr2R 8735664 3' - mdg1 71 2 65.75 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAAACGTGAGTTGGTGGGGCCTCCTGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 18258740 3' + Juan 4197 1 66.44 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAAAGAATTTCAAAATTAG:2 - chr3L 24131344 3' - Transpac 10 2 76.03 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGGGTAATATCACGTTTGGCCACTTCTAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGG:1 + chr2R 6847866 3' - Doc 23 1 67.20 AGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTGAATTTTTGTATAAATTTGCAACAGTTTTTTCGCCTCTGGGTTGAGCCATGATTGC:1 - chr3L 16693602 3' - I-element 4903 1 61.38 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCTAGTCCAAA:1 - chr3L 3030188 3' + roo 9026 1 54.79 TGACAGACCCGCCAAACATTTACAAAATTATCCCAAAAACAAATTGGGCAAACCGACAAAAAATAAGGGTAAACCAAAACCAAATAGCAAAAAATAAATAGCGGACCGAAACCGCATGTTAATTAAAAATCAAACTAATTTCCTAA:1 - chr3L 18422002 3' + I-element 188 1 76.03 AGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTTTAGCCCGTCAGATTGCTTGTAAATTTATGCTCCGATTTTTT:1 + chr2L 17806776 3' + jockey 4807 1 71.23 GTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTACTTGTCTTAAGTGGATTTCGGGTGTTCCAGGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTATATATTGCTGTAATTTGAATTTGTTCAAATGTACTTGGGGTATAGAGCCACCTA:1 + chr3L 21604434 3' - accord 7031 2 62.07 ATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTTGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGT:1 + chrX 19980685 3' - X-element 4551 1 62.33 AAATAAATATTTTTTATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTTTCTAAGTATTACGAGAATATATGAACACTTCATTTT:1 + chrX 23283822 3' - Transib5 2726 1 65.17 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAAAGGAAGAGGGGAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACG:1 - chr2R 20802587 3' - mdg3 5333 2 68.49 ATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAA:1 - chr3R 1135319 3' + Cr1a 4319 1 78.40 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAAT:1 + chr2L 4063926 3' - roo 57 2 63.64 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGTGCCATCCATTTGCTTTGTTCAT:1 - chr2L 4713835 3' + transib2 2787 1 60.27 AAAATTGTTTTAATTTTTTTTATATTTTTTATTTACAAAGCAAACAGCATGGCTTCAATAGCTTTTATTTTCTCTATATATATGTATATAGCTGGTAATTAAATTGCAATTGATGCATGCTAAAAGTT:1 - chr3R 18003802 3' - HB 323 1 75.78 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACA:1 - chr3L 19454920 3' - mdg1 7093 2 53.79 ATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAGTAGTTGATGGCTATCACCATTACACGGAGCAGCTGCGTCCTGGCCAAGAAAGCTGAGAG:1 + chr2R 9224527 3' + copia 451 1 65.73 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAACGCG:1 + chr2R 19199761 3' + hopper 1377 1 44.53 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGTTAGGGCAGCTGTAAAATGTC:1 + chrX 8308508 3' + roo 9021 2 54.79 TAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATAT:1 + chr3L 25482974 3' + accord 7309 2 69.86 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAA:2 + chr4 373056 3' - 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Doc 41 1 64.38 ATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTT:1 - chrX 21585260 3' - mariner2 260 1 65.55 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGA:2 - chr3L 2989960 3' + roo 322 2 76.71 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATTCTGCGTTATTGCGTAGCTGACCGAGCCAGTTACCTGGGCATTTGTTGACCTTTTTTCTGAATTTTTAACGCC:1 + chrX 9530436 3' - 297 40 2 56.16 ATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTA:1 + chr3R 2520348 3' + Tc1-2 1604 1 59.59 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATGG:1 + chr2L 4713983 3' - transib2 38 1 59.59 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAATTTTATTTTAT:1 + chr3L 22035709 3' - F-element 21 1 72.60 GAATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAA:1 + chr3R 23618221 3' - hopper 65 1 60.00 AGAGAANTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGATGCATTATTGGGGTTGCTGTGTCATCGAGACTAATCGATTTGAAT:1 + chr2L 2801432 3' + Dm88 4154 1 68.49 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAAGCCACGTCATGCTACC:1 - chr3L 15913881 3' - jockey 4837 1 83.08 AGTTAAATTAGGTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGTCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATCTGATAAGCAAATTTTTATTTATTTACTTCGAATGTTT:1 + chr4 805480 3' - Tc1-2 1509 1 73.97 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTTAA:1 + chrX 8200339 3' + flea 4994 2 72.60 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTAAAGTACACAGAAATCGATTTCTACT:1 - chr3R 19224945 3' - HMS-Beagle 15 2 78.08 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTTCCACTTCCCGAC:1 + chr3R 11469389 3' + Tabor 429 2 63.20 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACA:2 - chr3L 14366539 3' + roo 338 2 68.49 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATTCTTCTTTCATCTGAATCTATCCTTGCGTCCAAGTGGTCAT:1 - chr3R 28146061 3' + roo 397 1 73.29 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGT:1 + chr3R 4964172 3' - roo 8748 2 80.14 AGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGGCATAAATA:3 + chr2L 18212211 3' + Quasimodo 7299 2 73.97 ATTTGTTTTTTGATTTATAGGTAAAATAAATATTGTTTAATTACATTTTATAAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCTTTAATTTAAGCTTCGGTGACACGTACAAATAAACTGGAGGCAGCTCGCCAAGATGCCCCCAG:1 + chr3R 11006523 3' + S-element 1585 2 62.33 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATTCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGGCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGC:1 - chrX 6475262 3' - Doc 31 1 63.70 TGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTTGCTGT:1 + chr3R 22590620 3' - rover 21 2 69.18 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAAACAATTCTTGATC:1 - chr2L 12818225 3' + hobo 2887 1 50.68 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGCCGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCCTACACCCGGCGCAAA:1 + chr3L 18403056 3' + P-element 2819 1 38.36 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCAT:1 + chr3R 16342001 3' - P-element 56 1 27.10 TAATTCTTTTTTTGTATTCTAAAAAACGTTTAATTGTCGTTTTTGATTGATTGATTGATTTATTAAATTAATTTAATTTTTTAATTTTTATGAGCCACTACATTATTATATTTTACTTATTTGATGCATGTAACTATGGAAGTATA:1 + chr2R 23075027 3' + Tc3 383 1 58.90 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTA:1 - chrX 19074749 3' - mdg1 45 2 52.05 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAAATACAAATGCATGCATAAATAGTATTATTGTTTAATGAATGGAAATTCTTGTTTATTTGTGAAA:1 + chr2L 12978483 3' + hopper 1404 2 59.59 GTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATAATCAAATGAAGCGAAAAAGCAATTTTCCCGCGCCTGC:1 - chr2R 16929767 3' - jockey 4524 1 71.09 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCACACAACCGAG:1 - chr2L 4063783 3' + roo 400 1 79.45 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGTCTTTGTG:2 - chrX 18817249 3' + transib2 2791 1 63.01 TCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACACCAAAAATAAGCCATTGCTCGAAGGTCCTTGCAAATCTTCAGGATCTAAGCCGGCACATAGTAACGCACAAA:1 - chr3L 21488960 3' + Tirant 259 2 54.11 CAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAA:1 - chr2L 22121336 3' + I-element 5308 1 67.12 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTT:1 - chr3R 18488383 3' - roo 78 2 72.60 AGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAATATATAGTAGTACACATAGGTGTCCCTGTACGTGTGCCAGCCGCCAACAAACCACCCACACACAT:1 - chr2R 21160011 3' - Transpac 219 2 54.23 TCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTGTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACATTAGCTTATATGGCGATCGGGGCGAATCGTCCGAATCGGTATTATTCTGGTTAGGTGGTAAATAGTTAAACAGCAA:1 - chr3R 9787651 3' - G5 4728 1 59.59 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCC:1 - chr3R 25616473 3' + roo 9044 1 66.44 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCT:1 + chr2L 15550780 3' + Bari1 1662 1 51.72 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTTACAACTT:1 + chr3R 22590615 3' - rover 26 2 67.12 CATACTTAAATTTTCATTATAAATGACTAATCATCGTAACAAAAAAATATTCCATTTAATGGCAACCATATCTAAGTTTATTTTCGCCTAAAATGCTTTCGGAATTGAATGATAAAATTTCTACGTATAAGGTAATGAATATAATG:1 - chrX 14013993 3' + looper1 1648 1 45.21 CTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCAAAGTCTTGACTTTGAAGTCAAAAAAATTAGGGCGAAATTCAATAAAGTTTGTGTTCTGGAATTTCATACGCGTGCATGTCA:1 - chr2R 6848050 3' + Doc 271 1 55.48 AAAAAAAAAAGGAAAAAAGAAACAAGTATTCAATCTCCAGGGCGGAGTTTACACCTGTACTATTTGAACATCACATTAACTTCTTTTTCAATTCTATTAGTTACAGTTTTATATTATTTTCTATATTTATATATATAAGCATATTT:1 + chr3L 10608330 3' + Doc2-element 252 6 80.82 TGTCACAATTACGGCGCGGACCACCGTTGGTGGCGCGTTGATCCTCTTGTAATACCTACTGGCGTGGTGGCCATTGCCTTAAATTAGTATACCAAAACTTGAGAGCAAAGCAAGAAAATACAAAAAGAAGGCCAAGCCTGAGCCTG:1 - chr2L 20349156 3' - baggins 51 1 73.97 AATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAGAACCGGTTTATATTTTTATATTATATTTATATATTATTATCAGCAATCATTTTAATAACCAGCTTA:2 + chr2L 6654795 3' + diver 210 1 76.03 CCGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTT:1 + chrX 8437758 3' - P-element 54 1 47.59 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGT:3 + chr3L 7300253 3' + roo 360 2 50.68 ATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTTTTCTTTTTTCATTTTAACTTTGCTTTTTATCTTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAG:2 + chr4 1294990 3' - HeT-A 9 1 53.42 ACACACACACACACACTTATACAGATTTTCCCGGCAGTCGGACGTTTGTTTTTCCTCTGCCGTTCCGCACACACACTGTGCAAAAAAGGTTTTTTAAATTATTAATAATTAACACAAGGTTACAACGCATTAAGCTCACCCATTTG:1 - chr2L 8198076 3' + accord 185 2 61.64 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCATA:1 - chr2L 22674740 3' - mdg1 7052 2 79.14 GTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATAACCCAAAATCAACAAGTAGACGATTTTAGAACCGGTTGGGATGCCGATGTCGGCAGGGGACT:1 + chr3L 24862176 3' - diver2 4559 2 90.20 GCTACTTTTCAGTTGATAGGTGTAGTAGTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGCCACTTTGGGTACATTGTGTGCGTCTGTTTTTGGGGGCCGTGCCAAGTCATGGTTGGCTTAGTTGCGTCTTGT:1 - chr3R 8974266 3' - Fw3 166 1 73.55 TATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACAAGGCACTGACAAAT:1 - chr3R 10270530 3' - Juan 4046 1 70.55 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAAAAGATTATATAATTATATTTAAAAATATTTATTTAACTGTTAACAATGCAGAGTTAGAGAGCTTACAAGATAAATG:1 - chr2L 15940190 3' - pogo 38 1 55.56 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATT:1 - chr3R 26504184 3' - HMS-Beagle 6824 2 65.73 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGC:2 - chr3L 19454932 3' - mdg1 7106 2 62.33 TATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAA:1 + chr3R 22590589 3' - rover 52 2 60.27 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGCTTCGATTTTGCCA:1 - chr2L 13158613 3' + roo 9037 1 60.27 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAAATG:1 - chrX 23283143 3' - Transpac 39 2 57.53 GGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAATGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAATATTTATAATGTGAGTTCTTTGTTTTCATCGCCGCCTCTCTCTCTACACA:1 - chr3R 21853197 3' + copia 4864 1 64.38 ACAAATAGTTTGCACACAAAATTTTCCAGTCTTCAGTTGGCGTAAATCCGGCAGATTGCTCAGTAGGTAATCAAGCGGAATGTGATCTGTAGATGGGTGGGGAATTTCGAATATGTCATACCCTCGTTAATTTGATAAATATTCCG:1 - chr3R 17628021 3' - transib2 2736 1 76.71 GATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTACCACGATACTATGTTCAAATGATGGACCACTTGTTGGAATAT:1 + chr3L 22016890 3' + INE-1 148 1 68.49 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTT:1 + chr3R 7420328 3' - 1360 35 1 63.01 ATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGAGGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGAC:1 + chr2L 4713947 3' - transib2 74 1 71.92 AAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTAATCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGATTAAAAAAGTTACTTTTTTTTAAATCTATTGCAGTAGAATATGGTGTAGAACTTGTTTGAGTGCATT:2 + chr2L 16548702 3' + Doc 4690 1 78.08 AGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCCGCTGGGGCGGAATGTTCGTCGCTCTATCTCC:1 + chrX 16924910 3' + micropia 5142 2 72.17 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCCCAGC:2 + chr3R 28901333 3' - transib2 49 1 52.05 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTATTTTTAGACAAAACTAGGTCAGTCAGTCTG:1 + chr3L 6518676 3' + 412 7531 2 66.40 ATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCATGCGTTGATTTAGTGATGAATATTAACTGTGCGATTAGAGCGCAAATATTTGACTAATTAGCT:1 + chr3R 5420588 3' + I-element 88 1 56.85 TGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAAAAACAGGAACAGAAATAAAACTGAAACAGAAACAAATCATGAACAAACCAATTACATGCCGTGCCAACCTTCTGGCCAAGAGAGAG:1 + chr3L 5629983 3' - Cr1a 4285 1 77.12 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAA:1 + chr3R 20167676 3' - roo 8723 2 61.97 ACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGCTTACATCCGGCTGAATAATTCTGGCCAAAACGCGGATGAGTCTGCTGGCACGTCGCATATGCAAGATAATTTTAATCG:1 + chr2L 3240681 3' - HeT-A 6055 2 56.85 ATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTTCGCTT:1 + chr3R 22590608 3' - rover 33 2 62.33 AGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGA:1 - chrX 10537857 3' - I-element 64 1 60.27 GTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTACACACATAACTTCCATAGAATTTTTTTTTTTGTTTCTAAATTCCAATTTTGCAGATCTATCATCGATCTGTGCAGGTCTG:1 - chr3L 23354535 3' - gypsy2 70 2 59.54 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAAT:4 + chr2R 11164550 3' - roo 8680 2 74.66 GTGCAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACTAAAAGGATAAGAACTACAAAGCCGAATCGAGCAGAGACAGCAAATGAAATACAAAACAAACGAAACTTACGTTGTCAACAGTGCCAAGGTCATTTTCTTTGTGTTG:1 + chr3R 19218698 3' + HeT-A 228 1 74.07 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGT:1 - chr3R 16157251 3' + pogo 2078 1 63.77 GACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAGAGGTTTCTAATAGTTCTGCCATGTTTCCAATAATTGGTGAGGCAGGAATTTTCGGAGTGCGCATCAGTTCCCTTAGCCCTTTAAAGCGGGGTGTGCTGCAGCTTT:1 + chr3R 16466256 3' + HB 1288 1 73.97 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGAT:1 - chrX 18009950 3' + 412 446 2 61.74 GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATG:1 + chr3L 22744722 3' - FB 64 1 63.70 ATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGT:2 + chr3R 17996261 3' + diver 158 2 62.33 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCT:1 + chr3L 6518641 3' + 412 7478 2 65.03 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGT:2 + chrX 8308473 3' + roo 8986 2 78.77 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCCCTGACCCTGAATCCGGCCCCACACTCCATGCAAATGTCTGTGGC:1 - 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chr3R 24450391 3' - 412 7083 2 61.81 GTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCATCGCTAGGAAGGAAAACAAAACAAACACTTTTT:1 + chr3L 10664728 3' + P-element 100 1 27.40 ATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAAAGATTCAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACCCAAATACTTCACTATATACATATATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAATTTGAATGG:1 + chrX 3663208 3' - 297 212 2 77.61 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCATT:1 + chr3L 11326808 3' - pogo 27 1 59.59 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACA:1 + chr3L 4219519 3' + jockey 4941 1 76.32 CTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTAC:3 - chrX 21639641 3' + gypsy5 326 2 74.66 CTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCACGGTGC:1 - chr3R 20675809 3' - jockey 4891 1 62.96 ACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGT:1 + chr2L 47197 3' + roo 398 1 68.32 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAATCGGG:1 + chr2R 19941641 3' - hopper 55 1 54.79 ACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGAAACCAAAAACTGACTTGAATTTGTTGATTTTTCG:1 + chrX 17110005 3' - BS 4799 1 76.03 GGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAA:2 + chr2R 9158114 3' - mdg3 5345 2 78.08 CTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAACTCTTGCATGGTTTTTCTCTTTTTTCTTTTTCGTTCTTTTTTGCAT:1 - chr3L 16406026 3' + jockey 4862 1 68.49 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTTATCAAGACACGAACGCTATATGCTATATAGCACCACTA:1 + chrX 7702654 3' - jockey 4839 1 73.29 GCACTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGATAGTGTTCTCTCTTGTTTCGGATTAAGGCAATACCGCGAAACCACATGCCCAGACAAATGTTCACTCTCTAATTAGTTGTTATCAGTCTCCCTTTTCCCCCCAATGGCCTTTT:1 + chr2R 13227647 3' + INE-1 540 1 60.27 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAG:1 - chr3R 29084888 3' + 412 7483 2 58.90 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGGCTGCGCC:1 - chr3R 26504171 3' - HMS-Beagle 6808 2 76.43 GGTAGTAACACGTTATCAAGAACAAATGTTCAATTTTTCTAAACAAAAAGTCAAAAGTTTGATATTCTTTGAACAACAGATCAATTCGAAGCGCTACTAATGCACAACCACAAGTCATCTCATTTC:1 - chr3R 15431076 3' - Tc1-2 303 1 68.25 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGCACACACACATACAGCTCTTACTTGCGGG:1 + chr3R 24733577 3' + hobo 2899 1 74.19 AGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGA:1 + chr3R 13612595 3' - F-element 228 1 60.69 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTGGGGGTAAGTTAGGTCAGTTT:2 + chr2R 23180316 3' + roo 9036 1 58.90 CAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAATATCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAGTCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCGCCATGTCGCGTTAAGTGCAGTTAATA:1 + chr3L 12263763 3' - Stalker2 419 1 78.77 ACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATGTCCAAATTTTAGTAGACCATGAAAACGCATTTGAGGCGCCATTAAGAATTAAAT:1 - chr3R 25450118 3' - transib2 347 1 62.33 CATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTATTCGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACGG:1 - chr3R 19445951 3' + 1360 33 1 51.03 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAAAT:1 + chr2R 17878646 3' - Doc 57 1 50.00 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTG:1 + chr2R 6847821 3' - Doc 89 1 76.03 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCTTAA:2 - chr3L 6518525 3' - 412 7084 2 65.07 ATTTTTAAAAAAAATAACATTCAATAACTGTATACGTATAAAAATGAAATCGAATTCATTATCATATACCTTATTTAAATAACTCCCTGAATGTTTATACAAATTTTATGAGAATAGGCACACTTTACTTTTATCAATTAGAAAAT:1 - chr3L 12471111 3' + Circe 471 1 78.77 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGTTCTGTTCGTCATACCC:1 - chr2L 19923942 3' - roo 3 2 69.05 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAAC:1 + chr3R 17996278 3' + diver 6063 2 52.05 AAAAACAAAGATACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGAGTATTTAATGGTCGTATAACTCCCACTTATTGTTTGACTGACACT:1 - chr3L 11314352 3' - Tc3 315 1 60.96 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTT:1 + chr2L 18226859 3' - roo 8738 2 70.14 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAA:1 + chr3R 17996270 3' + diver 6065 2 52.94 AAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAATCGTGCTGTGATGATAGAAGTTCGATTGTTAAACGAAATGATAGGAAATAAAACTGAAAGAATTTCTTGATTTAAGGAAAACGGCAACTCAGGGCAAAACCAAAATTATATTTAT:1 - chr3R 7197739 3' - Doc3-element 4641 1 77.40 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGACACGGCTTAAAGCACTGAAACTAGCGTA:3 - chr2L 14074416 3' + 297 363 2 65.07 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCTTAGACAGAGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTA:1 - chr3R 23618143 3' - hopper 10 2 46.75 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCATAGTTAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGTTAAATAACAAAATAAATAAAACTTATTTAATAAATCAATTAATTTTATTTAATAAAA:1 + chrX 8976036 3' + HeT-A 6057 2 76.03 CTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCA:1 - 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chr3L 15913886 3' - jockey 4858 1 84.93 ACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTAATAACAGTTATTACCGCGACTAGGGAAATATTTTTGCAGAAAAATTACGCGGCAAGTAGTGGAATTATATTTACAA:1 + chr2R 22034295 3' + copia 4977 2 72.48 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATT:1 - chr2R 17926299 3' + opus 7443 2 64.38 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAG:1 - chr3R 4461023 3' - blood 65 2 64.38 CTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGACATATTTTATTTTATAATATCAATTAGTGTGTATAAAT:3 + chr2R 7130299 3' - Quasimodo 499 2 73.97 AAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGA:1 - chr2R 3338794 3' - Juan 70 1 64.38 GAAAAAACAAAAAAAAAAGGAAAAATAGCAAAAAAAAAGCGTATAATTCAATGTCGTTTGAAAACAAAATTGAAAAACGCCCCAGACCCAAAACAGCGC:1 - chr2R 14489870 3' + Doc2-element 244 1 76.77 TCCTTCTTTTTTTTTTTCTTTAAAACTTGTCAACTGCTAATTAGGTTGGGGGTTTTGAATATCC:1 + chr3R 22911715 3' - Doc2-element 224 1 85.94 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTG:1 + chr2R 8099236 3' + jockey 4946 1 52.08 ATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTATTTTATTT:1 - chrX 17446519 3' - gypsy11 98 2 71.92 AGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTATGGCATTTCTCATCATTTTATCTGACGTTTTTCATCTCGCTGCATGGGACTAACATTCTCCCCTCTGTTTTGCTCTTCTCTCCCCTGGA:1 + chr3R 12928817 3' - jockey 156 1 63.70 TAATAATTTTTATAATAATTATACATATTGCTTATTTAATTTTTTAGAATTTATTATTTTCATATTAAGGGATTTGAAATGTGCTATATTAACGCCTTTACTGAAGAGTTACTTTTCCGATAGTAAAACTACACTACTTTAACATG:1 + chr2L 18597735 3' + mdg1 45 2 68.49 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTT:1 + chr3R 16342050 3' - P-element 46 1 52.74 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATT:1 + chr3R 15072674 3' + pogo 2051 1 54.11 AATTGTTTTTGTTTTTTTTTAAAAAAAAGTTTAATAGTTGTTTACAAGCTGATAGTGATGAGCAAATGTATATTTGAGAGGTAAAAAGAGGTTACATTGTTTACAAATTTACGTATATGCTGGTAACAAATAAGAATGAGGATTGT:1 + chr3L 9094492 3' - transib2 2639 1 64.38 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTGATTTATAA:1 + chr3L 22723988 3' - HMS-Beagle2 6895 2 76.03 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAA:1 - chr3L 24934294 3' - HMS-Beagle2 6941 2 59.59 GAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATAATTAAACATATATATAATCTATCTAATATAATCTATAATCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAATGGCTGCT:1 + chrX 22810014 3' - F-element 4584 1 71.32 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAA:1 - 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chr3L 5061498 3' + 17.6 7403 2 75.34 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTT:1 - chr2L 16858693 3' + Burdock 216 2 53.85 ATTAAAATACAAAAAAAAATTTATTTTTTATTTGTCAGTATCGGGGTAGTATCGATAGTCGCGCAGAAAACATCGGAAAACATCGAATTAAGTGTATTCAGCGCGGAAAAAAGGCCACAAGCAAAAAATCTCTTAAGTTATTTATT:1 - chr2R 15114851 3' - Tc3 384 1 90.41 ATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTCTTCGAGTGTCGCTTGTTTCGTACGCAGTTAAAGTCCGGCTCAAAGGGGGA:1 + chr3R 28757544 3' - Stalker4 7107 4 53.64 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGGGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCAT:1 - chrX 6475309 3' - Doc 11 1 60.76 ATAATAATATAATAATAATAATAATATATTGTATATATAGTTTTAAGTTAAAGTGAAAAAAACTTCCTAGTCTACGTTTTTTATCTGTCGTTATAAATCCACTGACTTACTTGGTAAAATAAATCAATTTTGCTCATTTCACAT:1 - chr2L 11744737 3' + invader3 5052 5 74.31 ACTGACGGGACATTAGTTAGACACATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATATTCGTTAGCCCAAG:1 + chr2R 14653257 3' + 297 6949 2 56.90 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCA:1 - chr2L 4063830 3' + roo 9016 2 56.85 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGAAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAATGGTTGCTCAACTAGACGACTCTATCGCCC:1 - chr2R 21116425 3' + mdg1 415 2 56.16 ATTTATTTGTTTGGCTTATATTTAAATTTATACGTACAACCTTAAAGGGAACTTAAAACAAGACTTTGGTGCTTAAGGTTTTCTATTGATAGTTATTTTCGCATTTTTGGTGAACTTAGCTTTCATAGATACCCCCCTTTTCTCTC:1 + chr3R 14389590 3' - Doc2-element 85 1 21.23 GTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATATACATACTTATGTACATCTGAATAGAGCGAGTAAAGAGCAGTATACAGATACTCGCTGTTTTTTGTTTGTTATTTTTTGCTGTA:1 - chrX 7097445 3' + HB 1591 1 55.48 TGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAG:1 - chr3R 904904 3' - rover 6964 2 64.38 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAA:3 - chr3L 2989945 3' + roo 337 2 66.44 ATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' - 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transib4 2576 1 80.82 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGAT:1 + chr3R 27133679 3' + opus 7462 2 58.99 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCGTTGCAT:1 + chr2L 18347397 3' + transib2 2774 1 51.37 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTAT:1 + chrX 21100290 3' - mdg1 28 2 67.12 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACAGTCATAGATAAAGGGTTGACAGCAATTTTATAGAATCATAAAGTTACCAAATCCTGTCCCTCCGCTAATAATCCGATAATCCCTTGGATTATCCATAT:2 + chr3L 8959734 3' - 1360 19 1 70.55 CATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCACCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAAAGCCCAGGAAATTCTCTCGCTGGACCATCCTTTGTAACTTGTATAAT:1 - chr2L 17356561 3' + F-element 231 1 72.60 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCATCA:2 + chrX 8360659 3' + roo 9042 1 65.75 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTC:1 + chr2L 10156215 3' - hopper 36 1 51.59 AGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGGCCACTAAAACACATTACCGAGATATTAAAAGGTGAACCTACTAATTAGAAAGCCAACA:1 - chr2R 8273596 3' - Doc 4485 1 58.74 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTT:2 + chr2L 20266057 3' - roo 43 2 54.79 ACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAAAGTAACTCAAATTTTTAAATC:1 + chr2L 21570303 3' - Dm88 4384 2 71.92 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGC:1 - chr3R 4461017 3' - blood 59 2 60.27 TAGAAAGGCTTAGTTTTAAAATTAATTAGAATAAACAAATAAATAAAAATTGTACTTTATTAATAACTTTGCTCTATTTTCATTTCTGTGCCAAGTAATTTAATAGAACGATCACGTGGCGC:1 + chrX 20632111 3' + jockey 4796 1 54.92 TTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTG:1 - chr3L 21655881 3' + HMS-Beagle2 253 2 58.90 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATATAGTCCACATGGTCACAGAATTGGGTAATTG:1 + chrX 16946754 3' - FB 29 1 66.44 AAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGATTTTTAAAGGATGGGCAAACGAAGTTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAGTTGCCAGTCGTCAGATCTAAGTGCTGTTTTAA:1 - chr2L 7668170 3' - FB 692 2 69.92 ATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAG:1 + chr2L 21738001 3' - INE-1 253 1 57.53 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTC:1 - chr2L 15913252 3' - transib2 78 1 71.92 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTG:1 - chr2L 18549811 3' - roo 45 2 53.42 TCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTGGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCACGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCA:1 + chr3R 25428240 3' + 297 6905 2 71.43 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCCCTTTGTTTGACTGGCTAGTTCGTAGGATACTGGAGGTTCGGTT:1 - chr3R 11062748 3' - roo 8738 2 69.93 TTCACATTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATGCAATGTGGAAGTAATAATAGGAATTGGTAGTCGGATTCATATTACTTTATGTTTTAAATATAATGTGCAACACAGAAAATACA:1 + chr2L 22992826 3' + INE-1 537 1 77.19 TATTGTTAGTCTCTTAATTAAAAGGGAAGATTCGATAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATGAAGGCTAGTTTTCCCAATGTGTGTTTGGGTCCGGAAAGTCCCGCAGCGACTATTTGCCTGCAAATGACTTTGAAAGTGCGC:1 + chr2L 16576517 3' + Doc3-element 4682 1 54.23 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGAGTTGCTTACGTTCGGTTCGTTCGCATTTCTTCTCTATCTTATA:1 + chr3L 3983935 3' + P-element 2864 1 70.55 ATTTATNTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGCTTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATCGATTTG:1 + chr2L 11878392 3' - blood 56 2 55.86 TATTGCTACGAAATTGGCAAACTCGAACCTGCGTTGAACATCCGAATCACCAGTTTGGGGTCTTGAAAAG:1 + chr3R 7420068 3' + 1360 3118 1 77.14 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCT:1 + chr3R 30347392 3' + P-element 2819 1 33.09 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATATTGTCATGCAGATGATTGCCTTTCGTCGACCAGGGTATAAATATACATAATAAATTAACACGGCTATTGTAACAAAATAAGGC:1 + chr2L 20118519 3' + S-element 1685 2 62.76 CTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAGTCTGACTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTAGCCAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCAGCGTGTGAAAAATTAAT:1 + chr2L 4036221 3' + 1360 232 1 43.84 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACA:2 - chr2L 4063850 3' + roo 8996 2 70.55 TAATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTGGCATTTATTAAAATGTTATAA:1 - chr3R 7942731 3' - Tc1-2 1537 1 64.38 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATGGGGGGAAATGTGATGCAAAATGAAATGAGAGAAGACAAGAAGAAAATGTGGCACAAGGGGCG:1 + chr3L 16690866 3' + I-element 5313 1 47.95 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGG:1 - chrX 13134898 3' - jockey 4830 1 64.14 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCT:1 - chrX 4341265 3' + roo 342 2 62.33 GTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACACCTAGAGTGTGCCCATCGGTGGTCACAAACAATTGGCCACTGCAAATATTGCCACCGAAGGGGGACGAAAACAAA:1 + chr2R 15494303 3' + Doc 490 1 65.60 CTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTGACCACTTTTGTTGCAGTTTTAGTTTGGCTTTCGGCTTGTCAC:1 - chr3L 5313753 3' - I-element 439 1 59.43 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGC:1 - chr3R 6625688 3' + flea 4967 2 53.42 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTT:1 - chr3R 26504194 3' - HMS-Beagle 6835 2 58.33 ATATATAATATGAATATAATATATGAATATTATTGATAAGATACTAAACAAAAATGTGTTCTTGTTCTATAAACTATAGTTAAATTCTCAAAAAATTAAGTTTAAATAATAAGTTTCGTCTAAAAATCTGTAATATCCTTTC:1 - chr3L 10321088 3' + transib1 1922 1 66.20 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATATATTATATATATATATTATTATATATTATATATATACATATTAATTAGGGTATTATTGATTACTGTGGGTATGTACGGATAA:1 - chr3L 21969800 3' + opus 466 2 63.01 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAAT:1 - chr2R 7244792 3' - diver 41 2 56.85 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATT:1 - 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chr2L 4025374 3' - copia 5085 2 58.45 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTA:1 + chr3R 7317660 3' + I-element 5286 1 64.38 TTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGTGTACCTTGATTTTTTCATAGCAAAAGAAGCCCCAAGCCAATATGGTATATGCAGCTGGAGATCCCAGGAAAACTAA:1 + chr3L 22246347 3' - G2 318 1 63.01 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCGAATC:2 - chr3L 11326664 3' + pogo 2046 1 58.90 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGG:1 - chr3R 17077084 3' + roo 360 2 52.74 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGACAGCGGCATCGGGGGTACACCTCACAGGAACTC:1 - chr3L 20196220 3' - FB 55 1 54.11 GTATTACCAAAGACACTAGAATAATTATAGAATATTATTCTAGTTATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATACCTTCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCAAGAGAATGAGTAACCACATGTCCGAAATAT:1 - chr3L 14638589 3' + Tc3 236 2 46.10 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGA:1 - chrX 21087599 3' - mdg3 49 2 58.21 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACG:1 + chr3R 11062801 3' + roo 315 2 78.77 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTAACTCCTTTTCTACACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGCGATACATCAAGTGGTGGGG:1 + chr3L 18403079 3' - P-element 18 1 63.03 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAAC:1 - chr3L 22861777 3' - S-element 69 1 65.75 CTCACATCCAAATCCTTTTGCAAGAAGACTTATTCGAGTATGTAGCCAAAGCCGTACTTCTTCCGTTTGTCGGCACTTGTTAGAGCCCAGAATAACGGGGTCCAGAAAACTAACCAA:1 + chr3L 20082108 3' + Doc3-element 4521 1 68.38 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTCCTGTAAACGGCGGCTAAACAATTTGCCTTTTAATTTGAGTTTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTT:1 - chr2L 6647648 3' + mdg3 168 2 65.75 AGTTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTC:1 + chr3L 10425859 3' + I-element 5274 1 75.89 ATGCAGCTTGTAACCAACTCAAGGAACATAACTGTGAGTTCTACACGTACGATACTAGATACAAAGCCAGCCAGCAAATTATTAAATTATTTGATTGCAAATACTAGAAGCCACAAAAAATCCAAAAACAAAACACAA:1 - chr3R 21621366 3' + Juan 468 1 59.42 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCTAGGACAACATGG:1 + chr2L 15550797 3' + Bari1 1691 1 67.67 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTTTATTTTTCGCGCGCTCACGTTTTGCGGTTGT:1 + chr2L 14074570 3' - 297 6620 2 55.48 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAG:1 - chr2L 4713866 3' + transib2 2756 1 64.38 AGGAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCAATGCTAACC:1 + chr3R 7943793 3' + blood 7326 1 79.46 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATC:1 + chr2L 3234045 3' + roo 337 2 65.75 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTGCCAGTGGGCGAAAAATGTGCAACCACGCCCTTCTC:1 - chr2R 13168615 3' + P-element 2859 1 67.12 AGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTTTTTCACATACTAACTTACATACTTAAGAAATCGTCTA:1 - chrX 19332430 3' + hopper 958 1 73.79 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAA:2 - chrX 8437664 3' + P-element 2817 1 37.93 AAAGGACAAAGTTAACAAAAGTTAGCAATATCAGGATAATATAACAGGCTACAAGATGACAAACATATATTGACTTTTTATTTAAATTACATTTACTTATCTATTAAGTGTTTTTATTGCCATAACTATAGATTTCAACTTAAAAT:1 + chr3R 17550501 3' - frogger 348 1 57.53 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTTATGATTTGATTGCATTCAATTCAATTACAGCTTTTGCATTTGTGAGTATAATTTTGAATAAAAACTTAAGCGTTTCTAAAACGTTTTTATGGATGAA:1 + chr3L 2990076 3' - roo 8686 2 67.12 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGG:1 + chr3R 16157397 3' - pogo 16 1 66.06 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAATAAT:1 + chr3R 7943817 3' + blood 7316 2 69.18 ACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGCTTTCCATCATACCTGTGTGGCTT:1 - chr3R 22590449 3' + rover 328 2 71.11 CACAAAAAAATGAAATAATAATTTTGATATGATTGCATGCACTCACCGCTAGGTGGTGCCTCATTTGACATTTACATTCAACATCATACATTTTACACGACGTAGATGTCGCTACGCAAAAGGAGACGCAATATATTGTGTAAAAT:1 - chr3R 17616703 3' - pogo 55 1 80.82 TTTTATTTCGTTCATAATTTTGATGCTTCAAACTGTGGCAAAAACGATTCACCAAATGCACTTCCACCGCACGGCGGAATGTCCATGGAAATGTCAGTCAGAATTAGTTGCTATCTAGAAGGTAAGATTTAAATAATATTATAAC:1 + chr2R 22402913 3' + Tc1-2 328 1 78.62 GCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAAATACTATAAGCATAAAGAGTACACTCTAATCTTTTAACATTTGAAATGCCGCTTAAGAAATATATTAAGCTTTATTGCAAGGCGCTAATAAGCCATATCCATTTTCGC:1 + chr2L 20026937 3' + INE-1 120 1 72.60 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTT:1 + chr2L 11357930 3' + blood 345 2 56.45 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTGCAGTTATCCG:1 - chr2L 7580853 3' - Transpac 10 2 55.48 GTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTT:1 - chr2L 23008382 3' - transib2 284 1 73.10 TCTTAATTAAAATATTTATTATTTCATTTTTATATCATATTACAACAAGATTTATGTATATTTCTGACATACTTCTTAATTTTATTGGCTCTCCACTTGCCAATATGTTTACTTTTTGTCTTAGCTGGGTCAGTGAACTCGAAGTG:1 - chr2R 16799045 3' + NOF 343 1 63.01 ACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATC:1 - chr2R 3563095 3' + Transpac 5160 2 63.01 AGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATCCCAAATAATCTTC:2 - chr3R 19449654 3' + roo 8661 1 72.60 TTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGG:2 - chr3R 27843175 3' - mdg1 7067 8 69.18 TTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATATGGATTGTGGCTCGCGTGGGAAGCGTTAAGTTAAAAGGACCTTTGCGGCAACCGCTTTTGTTGGG:1 + chrX 8310081 3' - I-element 5150 1 66.34 AGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAAATTTTAAGGGTATAAAGGTCATTAATAGCAATAGGGATGAGGATAGTATACAAGTGCATTGCACTTTTCAAATAAAACGTTATCTAA:1 - chr2L 14026111 3' - F-element 452 1 59.72 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAACTGAACAAAA:1 + chr3L 22035698 3' - F-element 31 1 65.52 TAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTAT:1 - chr3R 4160056 3' + invader2 198 2 51.72 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTCGCTTTTCATAAAACCAAACTA:1 + chr2L 16946151 3' + hopper2 1567 2 56.16 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCA:1 - chr3L 5389886 3' + roo 324 2 78.08 GTTCTTAACTAACAGTTACTATTGCAACTGATATGAGTTGGTGGGGCCCGGCTTTTCGCTGCAATTTATTTGATTTTCATTGCATTAAATTTGCGCCGTCTCACTCTTTGCTTTTGTTTCCTGGCGGTGCGTTG:1 + chrX 2458895 3' - Fw2 3869 1 73.13 AAACTCTTCTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTGAATACAGCTTGCGCGAGTAGGATATTTGATATAAGAGGCTACAATCGTATTCAATACTTAAAGTCAATATAGTTTCAAGCTATCGCACCGAATATTGGTGTGAAGGTC:1 + chr3L 23785570 3' + INE-1 574 1 52.14 ATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGG:1 - chr3L 25482907 3' - accord 82 2 73.97 AAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACACCAAATTACGCACACAAGCCTGCGAACCGATACC:1 - chrX 21993570 3' + gtwin 390 2 78.08 AGTTAACTGAGTCAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCAAATTGCTGAAATTGCTGAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATA:1 + chrX 21772473 3' + springer 7138 4 80.41 AATGTACACACTTTTATTTTAAAAAAAAATTAACTGAAATATGGAACACCAAAGAGACCCACCATTATGATTGTACCATTTCCAAATAACTTCTTCAAGGGTATATGCCGAAAGCAATAAT:1 + chr3R 23491524 3' + transib2 2622 1 76.86 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTCGCATA:2 - chr2L 4123823 3' - transib2 32 1 63.01 ATCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCACCGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATAAATACAAAAAACACACACAACCGAAAATATTGCATTCGAAATCAATAAAATGTGCACTGGCAGCTC:1 + chrX 20818755 3' + Tc1-2 415 1 67.86 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGTTTCTGTTCGTCATACCCTCGAAGAATGCGTGACTGTCC:1 - chr2L 19923921 3' - roo 8666 2 75.96 CAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCATTTATAGCGAGGCTATCTCTACACAGAACGAAAAGTATAGGGCTTGTGGAATTTA:1 - chr3R 6404455 3' - 412 478 2 62.33 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACT:1 + chr3L 23320136 3' + roo 8996 2 71.92 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATCATGTCATAA:1 - chrX 6475307 3' - Doc 76 1 65.75 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAATATGTTATGATATGATCAGATTTAGTATAAACTACATTAAAATCCTTTTATCTTAGCAATGTAACTTGGCTCGGTTTCCAGTTTCGTAATCCCCAATCCTAATCCCAA:1 + chrX 19539604 3' + pogo 2092 1 60.27 AACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAATGGGTTAA:1 + chr2L 1924049 3' - G2 2987 1 69.86 GAGTGCGTTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTTTAAATAACATTTT:1 + chr2L 19675075 3' - 297 6625 2 58.99 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGAGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCT:1 + chr3L 18126002 3' - Ivk 44 1 46.72 AGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGAAAGAATGGTGCATACTAAGGTCGCTGGTTTTAATGGCCGTAGAAGTGATGACCTAGCTGATGGGCACAATCATACGTAGAAATGCCGCCAGCAAAGGATGCG:1 + chr2R 5432216 3' + Cr1a 493 1 63.16 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAAC:1 - chr3L 12315714 3' - transib2 53 1 54.11 TGATACATACATTTCAACGAATTAAGTATATCCTTTTACTTTATGAGTAACGGGTGTATAAATTTGGGCTTAAATTCCATAAATTAAAAAAGATGTTATTACCAAACAAGAATTGATTGGGTGGCTCAAGGGCAATATTTCATGGA:1 + chr3L 19956342 3' - INE-1 16 1 56.85 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGGCCAGTTCGAGTGTGCTTCTTCTTCCTTTGCTTGTACTTCCAGCGCAGCAATACT:1 + chr3R 13875136 3' + P-element 2843 1 48.00 ATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTG:1 + chr3L 23839732 3' - 17.6 6952 1 71.88 ATTAATTTTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTTACGGTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTATCTTTTTATCTTTGCTGGTGGATGTATTTAACTTTGCTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 35 1 55.48 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTT:3 - chrX 13134890 3' - jockey 4823 1 58.90 AATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTAAATATAACATTAGATAGTGTTTGTCTTATGAGCTGAGCTGTGTCCACCTACGCT:1 - chr3L 3233361 3' - I-element 5012 1 63.01 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGGATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTT:1 - chr2L 6654633 3' - diver 46 2 51.37 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAATAGACAAAGATATTAATTCTTTTCATATTTGATTTTAGAGAGTATTTTCATTACT:1 - chr3R 7666606 3' - I-element 34 1 60.96 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTAATAATGCTCTCATCTTCAAGCTTTGCTGGCTTAGCTATTTCCATCAGTGCGTACAAGAATTCATGTAAACTCCATCTTTTTTCTTTTGCC:1 - chr2R 6421453 3' + roo 359 2 61.64 AAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCA:2 - chr3L 23249366 3' - rover 41 2 58.22 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCCCCTTAAACCCAGCATAGCCCTTCCTCCAATTCAGAGCCCCGACTCGATTCTGCTAT:1 - chrX 661859 3' + 412 7500 2 55.81 CAAAGACACTAGAATAAAAAGATGGTTAACAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATACTATT:1 + chr2R 5424289 3' - 1360 3388 2 73.29 ATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAAATTTAGGATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGAGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATAT:1 + chr3L 23583089 3' + S-element 112 2 72.60 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCT:1 - chr3L 10731770 3' + 297 6915 2 63.01 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAAT:1 - chr3L 9269900 3' + copia 5082 2 67.12 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACG:1 + chrX 10521749 3' + Tabor 7282 2 54.11 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAA:2 - chr2L 10156104 3' + hopper2 1552 1 56.16 CTCCAGCTTTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAATAGCGCAGAATGCGCGTCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCAATAAACACACCCTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chrX 14317414 3' + Porto1 362 1 72.93 CGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCAAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTT:1 - chr2L 23008382 3' - transib2 285 1 71.92 ACTCAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGTAAGATTCATTTTTATGTTCAGTTGATTTTTGAAATTAATAATTTCTTCTCCGCCTCCTTCGTTCGCTTTTGTTGTCCTTTGCCTATTTTGTTACGCTTTTGT:1 - chrX 5114608 3' + Gypsy6A_LTR 104 1 54.11 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATA:1 + chr2L 19675068 3' - 297 6616 2 62.60 GTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGTTGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAATACCGAGTTGTGTTTTATTTAAATAGTTT:1 - chrX 23351988 3' + GATE 341 1 40.41 TATGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCTTAGGGGAAAACTTTAATGTTTATAGCAGCTTGGGTTTGAATCTTTGAATCTAAAGCTCATAAGAGCTTTAGTGAACTTTTAATCCTGTGATATATTGAGGACTTTTTATAAGTTAACAGAA:1 - chr2R 21417477 3' - Quasimodo 38 2 60.96 AATGCTTTTGTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATTGTGCGAGGACTTAAGGTAGGAATGTACTCGTTTTAGTAAGTATTTGAACTGGGGCTTCTGGACATCTGCAGGTTCTGATGGGAGGATG:1 + chr3R 9814414 3' - Idefix 7091 2 56.85 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTG:3 - chr2R 7244819 3' - diver 5956 2 63.70 ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGACGATAAAAAC:1 - chr3R 23020766 3' + INE-1 581 1 71.92 GGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGAC:1 - chr3R 23020775 3' + INE-1 572 1 69.18 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTT:1 - chr2L 6174063 3' + I-element 5284 1 65.07 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTACTTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGG:1 - chr2L 4888728 3' + BS 5030 1 61.64 ATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAACTTAAATATTCGAACTCGAAAACGAAAACGAATGAATTTCGTTTCATTTCTTTTATAGATTTGCCTTTGGCTCACTACGGATTTGCGATTCTCCATTTAATTTTATT:1 - chr3L 11844666 3' + rover 7286 2 75.34 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCC:1 + chr3R 14860236 3' - BS 5045 1 51.37 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCAT:1 + chr2R 14653239 3' + 297 328 2 72.46 ATGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACA:1 - chr3R 17673772 3' - FB 88 1 78.08 AATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTG:1 - chr3R 30486950 3' + Cr1a 114 1 74.66 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCACAGTGTCACCGAGTAAAATCGTCTAAGTCTCGCTCCCATTCTTATGAGCTCGAACCGTTAGCCGTATTTAATTAAATTAAACATTTCC:1 - chr3L 25974313 3' - roo 33 2 65.75 CTGAGATCTCGACGTTTATACGGACGGACATGACCAGTTCGGCTCGGCTATCGATCCTGATCAAGGTTATATATACCTTATGTGGTCGGAAACGCTTTCTTCTACCTTACATTTTGTAAAACGAGACTCTTAATGTGAACTTTAT:1 + chr3R 18067798 3' - INE-1 136 1 76.55 ATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 66 1 45.59 AAAAGTAAAAAAAAAAATAAAATGTTGAAAGGATTTTTTCTTACAAGAAATAAATATATATCTACATACCGGCTT:1 + chr2R 13874218 3' + Doc 4698 3 34.67 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGT:2 - chr3L 5532950 3' + roo 325 2 77.40 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAA:1 - chr3R 15790858 3' - roo 76 2 70.55 TAAGAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAG:1 - chr2L 11219888 3' + 1360 398 1 43.84 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATC:1 - chr3R 7943752 3' - blood 7095 2 73.10 AATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTG:3 + chr2R 5303160 3' + FB 204 1 50.68 TTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTA:1 - chrY 680446 3' - invader2 4897 2 69.86 TATATTTAAAGACTTACAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTT:1 + chr3R 23067497 3' + roo 21 2 67.81 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGGTGCACTGCACTCCGCAAAGCCCA:1 + chrX 9950584 3' - jockey 4760 1 78.08 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCG:1 - chrX 1263923 3' + Burdock 6352 2 56.16 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTC:1 + chr3R 10931712 3' + 297 343 2 73.73 GTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTNATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGC:1 - chr2L 18212117 3' - Quasimodo 31 2 53.91 CAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTAAGTTCTTAAATTAAATACATTTGAATTTGG:1 - chr2R 17872183 3' + Rt1a 4949 1 77.86 ACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAACAGAAAACACAACTTGAGCACAATTTGTTAATTAAAGTCAACCAATAGAAATTATGAAAACTGTTATGTAAATACATGCAGCCATTTCAAGTGTTGAATA:1 + chr3R 18003567 3' - diver 6005 2 74.66 TATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTGCAAGATTGGGGAACCGAAGTCCAAGAACGACTGAGGAGGAAATGAAAATTCCTACGACATCAAGGAATAACTTAATT:1 + chr3R 24566313 3' - 3S18 342 1 64.96 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACC:1 - chr3L 16690908 3' + I-element 5292 1 65.03 GGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTTGATCATTCTCTCTTGTTTCGGTTTTCGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCATTTCTGCGCTGCTTTATGTTAATGTTAATGCAATAAATTTAATTACCATCTCACAGGCTGCAGTAACTATT:1 - chr2R 14586562 3' + INE-1 557 1 53.42 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGG:2 + chrX 8308493 3' + roo 342 2 65.07 ATACACACACACACACATACACAAAGAAATATAGAGTATTTCTGATTTCTCGCAAATATCATACATATTACTTGTGTACGTACATCAGTGAGTTTTGAAATTTAATTACATTTGTTTATGCCGAAGCCGCTTTCAACAATCCCCGG:1 + chrX 5216281 3' + Quasimodo 37 2 79.45 TATGATACTTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCGAAAAGTCAGTGTTATTGTTCAAATACTCGTTTTGGGCACCTACGGTGCTCGACATCGGACCCGTG:1 - chr3R 2532180 3' - Cr1a 80 1 65.35 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCTTGAGAAGTCCCAGCAGGTGGCCGATCACTTCGAGAGCGCCC:1 + chr3R 28901360 3' - transib2 20 1 70.14 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAG:1 - chr3R 4682872 3' - Burdock 31 2 58.46 ATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTAGTGGACTCCATGCCAAGGCGATGCGCAGTTGTCATGTCCTGTTGGTTCTGCTGCTAATGATCCGTGGATCGCTTTGTGTGCCAGCTTTGGACGCAGCTCCTCCGGCTGCCACACCCCAC:1 - chr3R 12382547 3' + Tc1 1262 1 60.96 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTA:1 - chr2R 20010192 3' + Juan 4157 1 57.53 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAATTAAGCAAATAATAAAT:1 + chrX 5323174 3' + Juan 4203 1 35.62 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCATTAAAGGCTT:1 + chr2R 4785371 3' + Juan 4201 1 75.17 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGC:1 + chr3R 24381381 3' + Juan 4139 1 67.81 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACACT:2 - chr3R 9038885 3' - Juan 4028 1 69.86 TTTAACAATATTTATATTTCGGGAAAGCATTGCTTCTGTGTCTTACAATTTTTTTTGTCTTACAAACAAACTTCTTACTACTCAATTAAGTCCGGAAAGGGTAAGAATAAATTTCGCATCGATAGCCAAAGGGGCCATATACATAT:1 + chr3L 20013174 3' - 297 219 2 52.74 TATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAAGTACATATGTATGTATTACTTTTGACCAGTATCAAAAGCAGAGTCGATCTACCTATGTCCGTATGAGCGTTGAGATCTATAGGAACTATAAAATCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 1751259 3' + INE-1 29 1 59.85 TTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGATTTTCGCATAGTAATAATATGTTTTGTTTTATTAGT:2 - chr3L 4400170 3' + G6 1993 2 60.27 AAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGTGGCGATTTTAACAAACAAATTTTAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAAATGGAAATGGGTAAGCGGCTGAGCCCGCGAATTGCAGCGCGGACGTATTTAATTTTATTCC:1 + chr2L 9845710 3' + 1360 2971 1 56.85 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGA:1 - chr2R 8157181 3' + mdg1 7390 2 66.44 CAATAAATTAAAAAATTTATAATGTATGTACATATCTAGTATGTAGTGGCAAAAAGGAAGGGGATCCTAAGCACTGAAATGGGGTCTCCAAATATTCAGCAGGTACTTCCCCCCAAGCGGAAAGTCACCAACTCGACGCCCATTTT:1 + chr3L 1940032 3' + HB 316 1 77.40 TTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTAGCTAAATTGCCCTATTTGCCAATCGCATAGCCGAATGCCTCCATTCTCTTTAAATGCCAGTACGATGGGAGAGACCCATAAACTTG:1 + chr3L 25729796 3' - TLD2_LTR 50 1 63.01 CCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTCATTGTGGTCACTGGTTGGTCGTTCAGGCGATTAATTCGATTCATTTTAAATT:1 + chr3R 15790144 3' - flea 4707 1 80.28 AAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACAGTACCCCCCATAGTTCCTTACTAACCGACCTCTGCCGACAATTAAAGGCATGAAATTATTTGATTACCAACGTTTTGTCGCTGTCTCAAACGCA:1 + chr3L 10204533 3' - Dm88 453 1 53.42 CAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGCCCAGCAACAAACTTTGGACGAAGCGAAACCATTCGAGAGGAGCATGGGGTACGTAGTTGGGGGAAAACGGGTTTT:1 + chr2L 19783871 3' + Doc 4497 1 57.93 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAA:1 - chr3R 8051124 3' - jockey 4822 1 63.70 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGATGAGTAAAATAGAGCTTATGGGACTCGATACCTTTGCTTTTAAAGGGGTAGTTAAT:1 - chr3R 6625647 3' + flea 5008 2 79.45 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGTGTAGAAA:1 + chr3R 7420349 3' - 1360 14 1 77.40 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATTATGTAAGTAA:2 + chr3R 4683020 3' + Burdock 6362 2 65.75 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACCCGACTTTCT:1 - chr2R 5674609 3' - S-element 33 2 63.01 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATA:1 - chr3R 11186528 3' + BS 5041 1 51.37 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTCACAGACATTTGTTCATAAATTAATTTTTATTTTTGCCTTTTTA:1 + chrX 15869655 3' - jockey 4701 1 64.14 ATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTTGACCCTCTTCCAACGACGTCACTCTTGGCCTCGT:1 - chr2R 15330483 3' + I-element 5001 1 80.00 TCTGGTCAAATTTAAAAAGAAAAGAGTCGTCTCTACAGCTTGCACAACTGTCGCACTTCAGTT:1 + chr3R 4191731 3' + Tc1-2 1197 1 63.49 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCACT:1 + chrX 21087710 3' + mdg3 242 2 76.38 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGCTATTAATTATATACG:1 + chr3R 21630378 3' + I-element 5322 1 63.70 GTGAGCGGAAAGACAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCAT:1 - chr2L 23372624 3' + 1360 3309 1 71.92 ATATAATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTGTGTTTTCTAAACATGCATTTATTGCCTTCTATT:1 + chr2L 9932284 3' + I-element 5265 1 78.08 CTATGCCTGACACTAAATGGAATCAATTCTCAGTGCCCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAGGTCTTCGATGCCAGACTTCCGGCACAAAATCGAAATTAGTTCAATGACATGACCCATCCGAACTGTACAGTAGATAATGCCAAAGG:1 + chr2L 20903701 3' + invader3 322 1 60.96 AGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAAATTTGATTTTATATAGGCAAGTTCGAGTTCTCACATAGCGACCTCCTGGACATTTGGAGGCGTAACAATAGACATACTTCGAAACATAAAAATGGAAATATCATGAG:1 - chr3L 18543371 3' + transib2 490 1 77.40 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAA:1 - chr3L 21327080 3' + copia 222 1 61.64 CTCCAACAGAATTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAA:1 + chr2L 12636389 3' + Porto1 4541 1 81.51 AAATATACAAAGTCTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTATTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTTCTTCGTGCTGGAGGCTCTGCAGTCGTCAGTAACGTTCGTATTGGCTGACCCGTTATCTC:1 - 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chr3R 15790858 3' - roo 8737 2 69.93 TATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAAGAAGTTTAGCCAAAAAACAAATCTCAACTTTTCTATCTATTACTATAAGTGAAA:1 + chr3L 9269796 3' + copia 9 2 51.38 GGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTCTTTATTTGTTCATTCACAAATTTAATTCCGGTCGCCTCTCAACAAATTGTATTTATTTTAGGAACTTCCCAAATTAACTAACA:1 - chr3L 163874 3' - Porto1 4346 1 73.64 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTGTAAAAAAT:1 + chr3R 13406553 3' - pogo 25 1 64.38 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTATTA:1 + chr3R 20167688 3' - roo 8715 2 54.79 ACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCG:1 - chr2R 5410964 3' + Tc1 1365 1 54.48 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACA:1 + chr3L 22744719 3' - FB 67 1 65.75 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTTTACTGTAATAATTAATTGAGATGTCAAATGTATCTTCTTGCTGCACTTGAATAGCAAGCTAAAAGGCGAAGCTTGAATTAAATGTTGAAAAAATAATGTTGCA:1 + chr2R 7304154 3' - pogo 27 1 64.38 ATATGTGTACATAAAATGCTGACTAGTTAGTGGAAAAATTTGCTAAACCTGACTTCGCCGTCGATTTGTGGCTGCCTTTCGTTGATAATCTAAGCCAAAACACATCAATAGATACAAAGATACTATACGCAGG:1 + chr2L 2728220 3' - accord2 7203 1 60.90 TCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATG:1 - chr3L 22723842 3' + HMS-Beagle2 7129 2 61.64 ACCACTTCTCGCGGCGCACAAGCGTAGGCAGGTACTCCATGAGCCATCTCCTTCAGAAACGGTCTCGCAGTATGCGAGCAATCCTCCACCGCTTTCTTGTAGAACCCTCCTTGTCTTAAATGCAATAGCTTATAATTT:1 + chr3L 1735942 3' - aurora-element 3789 1 79.71 CTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAATTTCTATAGATTTGCCAAAAAACTTTTTGACACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGTCTACGAACCGGTCACGTCCACACTTTGGAACAATTTTAAAATATTTTCTTATT:1 + chr3R 14993045 3' + I-element 5313 1 62.14 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATTCATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTG:1 - chr3R 11191383 3' + roo 358 2 55.56 TGTAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCACCACGCCCACTTTTCCGCCGAACAATGAGCTGACATTTCACTTTAAGTGCTCTG:1 + chr3R 12645353 3' + HeT-A 5833 1 69.18 ATGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTAGACTTTTGTGCTATCCTGTTTATCTGAAGGACATGTAGTGAAAAGTTCCTGCCTCCCTTCGGTTTCCCCCTCCTTGGGTTTTCTTTGGCCGCCTTGACCAGT:2 - chr3L 2894458 3' - Porto1 4390 1 67.12 CCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTACTTACCGGGGAGGACAACTGTGTGTATTACATTGTTCCACCGACGCCTCCGGACGATTAGTAACGCTGCAGAGCGTATCATCGACATCGGCG:1 - chr2L 21710607 3' - HMS-Beagle 6852 2 68.75 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAATCATTCTTGGGATGTTT:1 - chr2R 8735561 3' + mdg1 390 2 57.03 ATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTAACTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGGACCGAAAAGAGGCTAGGAAAAGAAGATCATAACTAGATCAA:1 + chr3L 14876007 3' - R1A1-element 5025 1 78.77 TCATGCATTGTAAATTTCACAAAATATGAAAACTGTTTATTGCAGAAGGCATATCAAAGACACCAGAATTATTCTATTTGGGTTATTATATGTCTATAAAAAAA:1 - 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chrX 19539471 3' - pogo 51 1 55.48 ATTCTTTGGCAGCGGCACTCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCTCTCTTTGAACCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAATTTCGTTTTATTATTGGAAAATAAAAAGCCATCCCAAAG:1 - chr3L 15593877 3' + 17.6 176 2 72.60 AAATTATAAAATTTTAAAAATTAGGTAATAATAGCACATATCAGATTATTAAAAATGTTTTTCATTACAAATTATAAATAGTTTGCAGCCTTAATTTCTTTTCTAAAAAGTATATTAAGAGAAATGTAATTTAATTATGTACAATT:1 - chr3L 18245194 3' + 1360 3032 1 27.40 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAGCAAGACAAAT:1 - chr2L 21299256 3' + roo 390 2 72.60 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGTAGGTAGTAG:1 + chr3L 1279170 3' + roo 8998 2 71.92 AGAAAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGGGGTGGCACATTTTCATAGATGCTGTTACTTACGAGTTTCGAGCAATATCCCTTCAATGGCCT:1 + chr2L 20251332 3' + Dm88 340 1 56.85 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTGAAAAAGAGGAAAAGGCATTAAAATAAAAGGCATGCCGGTGGAG:1 + chr3L 21990430 3' - Transpac 69 2 62.33 AGTTTTNGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAA:1 + chr3L 21380618 3' - I-element 54 1 57.46 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAG:1 - chr2L 13556317 3' + transib2 2785 1 58.90 ATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTAAATTGAAAAGTTAAAACAATTACGCATAAACCCTATATACTATATTATATACATATATACATATATACACGATTTAAAATAGTTAATAGCTGATAG:1 - chr3R 18093219 3' + mdg1 7076 2 76.03 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTT:1 - chr2L 18226786 3' + roo 9010 2 67.16 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATC:1 + chr3R 11062837 3' + roo 351 2 54.11 AATTTTAATATAAAAATATTTTTGTAATGGTTTTTTTAAGTGTTTTTTATATTTATAAACTAATAAATTGTTTAAAAAACAATAGAAAGATGTTATATTATGATCTCTAAATATTAAGTAGTAAAGTTGTATAGCT:1 - 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I-element 5037 1 67.20 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATATCCATTTCTATTTGATTTCTTTTCCTTGGCCTTTGTTAACGAATTTGTT:1 - chr3L 7843856 3' - mdg1 7060 2 40.41 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAA:2 - chr2R 7244808 3' - diver 5945 2 56.16 AAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCGAATAATAATAAAAACAATAAAAAGAAGGTAGAAATAAATAAAAAATAAATTAAGTTCGTAAATTACTTGACAACGGCCACAATGCTCACGAATTTTATAATCACTCGTTTTGTAGCCC:1 - chr3R 18472647 3' + Rt1b 5121 1 76.03 TATTTACTTAAAACTAAAAAACAAAATAATCATTGAATCACAAGAATCAAATCAAAACCACCACTTTATATGGGCTCCCACGAATATCGAATATATTGAGCATTCAAGTGAATACATACACATAGAGGAATCAAAGCAAATAAG:1 + chr3L 19063800 3' + rover 6821 1 71.53 ATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTT:1 + chr3L 13220196 3' + pogo 2016 1 79.29 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGCTTATGGCTTATAGTGAATACTACCTATCCATTGTGGGTACATCTTACATGTCGTATATCATTTATAAATA:1 + chr2L 17179639 3' + Juan 4180 1 72.73 ATTTAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAACATTTTTTTTTTTGTTTTTAAATGATATTGGTTTTTCTAATTAATTTTTAGCAATGCCGTTTCTCATTTTGAATTTATTTAATTTTTTTTGTTTTGTGTGTGTGTTTTTTTT:2 - chr3L 7829291 3' - Stalker4 6898 2 60.96 TATATATACATATTTACAGATACATATTAAAATTGAAGCGGACATAAATTAATATATTATCTATATATTTTCGAGTGTTCTACTTGTAACTGTCTTCATAAGTTTTT:1 - chrX 18882434 3' - G3 4506 1 51.40 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTGACT:1 - chr3R 18399352 3' - Juan 4061 1 39.04 TAACTAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACGAAAATTAGATAGCAGGTGGAGTGGGGGAGTTCTAATTCAATTTCCGTCGGACCCGACGTCGTCTGC:1 + chrX 5465316 3' + gypsy7 5003 1 88.17 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTATATCGATAGCTACCCTGTA:1 + chr3R 16342079 3' + P-element 2870 1 72.60 GTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCCTCTTTTCATAAATTCCTAAAGTTTCCGTCTTTACTTAAGCCCTT:1 + chr3L 7428578 3' - Tirant 8417 2 69.66 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTGGGGGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGG:1 + chr3L 3983864 3' + P-element 2796 1 20.98 AAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGAGTCCTTTTTGCTGTTTGGCCTAGTATCGAGCCTCGGCCTGGCAGCAACTGTCACTGGGGTATGTGAGTGGGTTAAGCTTGAAACTG:1 - chr2L 1205675 3' - I-element 5139 1 60.96 GATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCTACTAATTTGC:1 + chr3R 29690770 3' + I-element 5274 1 73.97 AAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGT:1 - chr2R 330131 3' + HMS-Beagle2 7117 2 72.60 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTG:1 - chr3R 27405985 3' - diver 5968 2 70.34 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATT:1 - chr2L 14874166 3' + copia 227 1 57.53 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAATTAAGCAAATAATAAATA:1 + chrX 5323175 3' + Juan 4204 1 35.62 AGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGCGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGTCAGTAAATCAAAACGATGGCTAACCCATCAATGGGGCGCTGCAGTAGG:1 + chr2R 9517923 3' + Porto1 4202 1 71.92 ACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACACACATACACACATATACGAAACGCTAGCAGTATAACCCACATAATTG:1 - chr3L 17156164 3' + F-element 4386 1 64.18 AAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTACACACACACATTGAATAACATACTAAATATATAGCTATTTAAATATACGAAAAGCATGATGATATACATAATTAAATTAGTGGACTTCTTACAGCAATAACCAAAG:1 + chrX 4626873 3' + Ivk 4978 1 71.92 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTT:1 + chr2L 12822867 3' + P-element 2879 2 63.10 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATA:2 + chr2R 12133825 3' - jockey 87 1 72.60 GTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGTATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATAT:1 + chr3L 21655981 3' - HMS-Beagle2 6944 2 59.59 ACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGGGGGCGTAACGGGATTTAGTCTATGGAAGACAAAC:1 + chr3R 15567423 3' - F-element 444 1 74.66 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCGCAGTCGAATGAAGGATTTTAATTCGGTGTAGGTCCAGTATTATGTATTGATTTTAAGAAAGCAAATTCCTTTTTAAATAACTTTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAACTGCTATGAAAT:1 + chr2L 12286086 3' + INE-1 86 1 80.00 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAG:1 - chr2L 13556325 3' + transib2 2777 1 53.42 AAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAAAGCCGTAGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATAAGAGCCCCCATTCAAAGCGGTT:1 + chr2L 5259808 3' - Doc 275 1 80.00 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGCTTATATACTTCTT:2 + chr3L 16033438 3' - Doc 54 1 54.11 AGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTCCACTTAGCCATCGCG:1 - chr3R 23911310 3' - 3S18 5774 2 73.98 TATAATAATATTAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAAAA:1 - chr2R 5501137 3' - Tc3 272 1 67.12 ATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAA:1 - chr3R 3922965 3' - Cr1a 98 1 77.93 ACTCAAACATAAAATTGACTATTTATTTGTTTATTAAGAAAGGTAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAA:1 - chr2R 5941316 3' + copia 5079 2 53.79 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTCAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGTTGATTGTTACAAATCCCGAGCATTAATTACTGCTGTTTAGTCAAATTAA:1 - chr3R 4480704 3' - S-element 69 1 67.12 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAATTCTAAAATAATAACTTCTTCTTGTGACATTTTTTTAAATTTTTGAATTAATTGTAT:1 + chr2L 15940314 3' + pogo 2041 1 59.59 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTC:1 - chrX 10319573 3' - mdg1 7066 2 66.44 AAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATATTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTT:1 + chr3L 13220196 3' + pogo 2010 1 79.31 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTG:1 + chrX 14722241 3' - diver 25 2 61.64 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCATTGAATAGAAGTAAGTATAAGTATTTAT:2 + chr3R 13973088 3' + 412 7523 2 68.49 GAAACCCGTGCGCAGCCGGGAAACACAGCATATTTGCGTGGCCTCGGCAGCAGTCTGTAGAAGAACCTGTCTTAATAAATACGGTATTAA:1 + chr3R 19446601 3' + Gypsy6A_LTR 82 1 57.78 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCA:1 - chr3L 24131383 3' - Transpac 4968 2 55.48 AAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTTTAAATGTGAACCAAGCACTCAGTTTGGAAGAATTTGAACGAAGCATTCAACATTCCTCAGGCG:1 - chr4 951853 3' - 1360 191 1 56.25 TTTTTAAAAAAACAAAAAAAAAGCAGCTTGACTTCTTGTTACCTGCTAATGATGTCATTTCGGAGTATATATATATTTCATTATAATCACAAAACTGTAGAGTACGAACCTTATAAATGTTGAGCGTTAACTTTCTCAGTAACTGA:1 + chr2L 19846375 3' - hopper 154 3 43.84 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGT:2 - chr2R 3564047 3' - Tabor 6905 2 60.27 AGGGACCAGCGAATAACGCGTATGACAGACAAAATCTAAGTCGCGGAGAAAATAAAAATTTTTTAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' + HMS-Beagle2 344 1 63.83 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACC:1 + chr3L 22035682 3' - F-element 48 1 54.11 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCAC:1 + chr2L 12822834 3' + P-element 2813 1 18.80 TATATTTATTATTATTATTATTAATAAGGTGTTGTCTGTCTATTGATTCCTATTTGAAATGTATTGCAGTCCCTTTCTAAGGCGACCCATGAAACAGAACAAATATTTATACATACAAGTAACTAAAAATAAAAAGCAATCATGGC:1 + chr2L 9607871 3' - mdg1 7084 2 45.89 AAATTTAAATTTTAAAATATTTGTAGCAACATTAGGAATGCTCAAGTTCCCCACAAATACAATTGCAAATACTTTAATTTTTAATATTAAATATTATTATTCCCAGCTCTTTTTGCGCTGCTGTTTTACATTCTCGTGCAGGAAAG:1 - chr2L 675450 3' - 1360 3038 2 62.33 TCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGAT:1 + chr2L 17766205 3' - Doc 188 1 56.16 ATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCAATGCCTATAATAGTTTCCATTGAGTTCTGAAAAAAGAAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATTAATGTGCATCGATGTGCTTAGCGTACTCGGTGGCATGATCAGTCGCATCAATAAGAC:2 + chrX 23045224 3' + mariner2 828 1 61.64 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAAT:1 + chr3R 5769099 3' - roo 8736 2 72.60 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAGTCAATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTTTTTTATTTTTTTAATTATTTAATTATTATTATTTAATTGTTATTATTTAACTTACACATTTCTAAACATTTCATGGACTGTAATCTTAAAAT:1 + chr4 55734 3' + INE-1 86 1 64.38 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAG:1 - chr3R 23618096 3' + hopper 1391 1 67.39 TCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAA:1 + chrX 21587763 3' - INE-1 137 1 57.14 TAAAAAAAGGATAGCATGAAAAACTAACGGGATTTTTTTTTTCCTATCTACACATTCAATTTGCTCGTTTATTTCTGTACACTGCAGCATTCTCAATTGACACATTAATGGGAAAGTTTTATTGTGAGCTG:1 - chr3R 25525508 3' - HB 153 1 59.54 GGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGCACAAGTTGGTATTGAATTGGTATTTAGGTATGCAAAATAGGTTTATGTTCGAATTTTCTTAAAGAATGTAAGAATGTAAGTTATAATT:1 + chr3L 6841958 3' - I-element 5049 1 60.27 ATTCATAATATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAGTACGGATTCCGAAAAGGATTCCGACGTTGAACGCGATCTCCACGGTCACCAACTGTAGTATATACGA:1 - chr3R 3706247 3' - mdg1 54 2 54.79 CAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTTTTTATATGTAGAGTAGTGTTATAGTGAGGGCAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATTATGAAAGCTGATG:1 + chr2L 13844244 3' - Stalker2 7300 2 54.10 TAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAAGTTTAGAATTTAAATGCTATACAACATTTGAAGT:1 + chr2R 13522228 3' + 17.6 7134 2 76.71 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCACAACTTAACCC:1 - 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Ivk 15 1 73.97 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGT:1 + chr3R 10931738 3' + 297 6922 2 60.96 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAAAGAAAATATGCAAC:1 + chr2L 4123981 3' + transib2 2792 1 60.96 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTC:1 + chrX 8360637 3' + roo 9020 2 54.11 GAGATGAATTCGCAATTAAATAATTAAGTTGCTATCTAAATTATTCAACAACGGTAGAGGCACTTCTAAACTCAAAATTTGTTTTAAATGGTTTAAGATGTCAATTTAAAATGATCCTCGCGCAAGTGATATTTTCGAATTCTGAT:1 - chr3L 8085935 3' + invader4 2624 1 77.40 AGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACA:1 + chr3L 3501788 3' + Bari1 1617 1 80.69 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCATTCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGTGTTCCGATTACCCGGT:1 + chr3R 13300990 3' + roo 385 2 63.12 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTAC:1 + chrX 8027469 3' - 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F-element 4522 1 55.40 ATGAAATGATCATATATATATATAAAAAAAAAACAGGGGAAAACAAGACAAAGTTACCTGTATAATTTATGCATTTCAATTAACGCTAGGCAATTAATTATTGGAGCTTTGTCTTGTT:1 - chrX 6991677 3' + Juan 4182 1 59.32 AGAGAGAATGCCACCCAAAAGCGAAAAATGACTTAAATATAATGTTTATATACAATTTTGATATGCCTAACTTAAGTACAATGTGTAAACTTCCCGGAAATCAAAATCGCGTTAAAGAAAATATGATCCAAAATACCAAAACTGCC:1 - chr3L 3115202 3' - invader2 78 2 60.96 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTGATTATCGTTATTAAATGG:1 - chrX 14722087 3' + diver 6074 2 59.03 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTC:2 - chrX 12986531 3' + roo 9011 2 60.27 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGATTTCTTGCACGCGCCAGTCGGCGGACAAAAA:1 - chr2L 14675658 3' - 297 6597 2 60.64 TGAAGGCCCTTCCTACTTTTCAGTTGTAGGTGTAGTAGTTTTTGTTGTTTTCGTTTAAGTATTTTTATGGGGTCGGGTTCAGTCGCAATTTACCTGTTGGTGAAGAGGAGGGGGGAACATGAACATACATACATGTGTAT:1 + chrX 6669907 3' - Fw3 177 1 57.14 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTACTATATTACGGATATC:1 + chr3R 17077216 3' - roo 42 2 55.17 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTGCACCTATACCT:1 + chr2L 14675756 3' + 297 6942 2 54.55 GTTATGTGGTTTTGTATGGGAATATTTCACTATATAAGCATTTTTTATCGGGCTC:1 - chrX 15200875 3' - 17.6 10 2 61.82 ATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAAT:1 - chr3R 25709797 3' + hopper 1326 1 78.77 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTG:6 - chr3R 9038917 3' - Juan 4060 1 51.37 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGGGGCAAATTGTCTCGAAGAG:1 + chr2R 13766285 3' - roo 8742 2 73.97 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTCATGCGAGCTCGGTCGGAAGTATGCAATGGGCCGGGCAGATTAAACTG:1 + chr3L 21996296 3' + Transpac 305 2 74.60 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAAGCAAACAGTGAAGCGAGAAATTTGATGTCATAGAGCCGGTTTTTTGTTGGCCTAAAGTTGGTGTCTCTTTTCGACCGCGTTTCTCTGGCACTTCACGTTCATTTCGTTAAT:1 - chr3R 24090393 3' - roo 10 2 75.34 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAAT:1 - chr3R 13972921 3' - 412 33 2 63.70 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAA:1 - chr3L 23287209 3' - 1360 49 1 52.74 GTAATTATTATTAATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATC:1 - chr2R 8099152 3' - jockey 4827 1 65.00 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTGCAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATTCCTTAACT:1 - 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P-element 82 1 31.51 GGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTG:1 - chr3L 22890379 3' - FB 86 1 74.66 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTG:1 + chr2L 22170031 3' + Juan 4139 1 72.92 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCAATCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAATTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGA:1 - chr2L 71206 3' + 412 7497 2 65.31 ATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGGGAGGGCTTAAGCAAGGAATTCTTTTATATCTTTCTCCTACTTTACAGTTTGGATTGGTACATTTACGACCGTAAACTAGAAGGGGAGCGG:1 + chr2L 23177005 3' - Idefix 255 2 54.89 TACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATC:1 - chr2R 7244838 3' - diver 5959 2 73.85 ATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCG:1 + chr3L 23224534 3' - 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chr3L 11913158 3' - BS 5024 1 65.07 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGG:1 - chrX 10319584 3' - mdg1 7077 2 58.90 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGCTCTTCTAGACCTAGTAGAATTTGCCTA:2 + chr3R 5769106 3' - roo 65 2 67.81 GTAAATAAAAAAAAACACACACACACACTAGAAAAACGAAAAACAACTTAGCTAAACGAGAAAAAAATAAAGCTAAACGAAAGGAGATGAATGGAAAAGATTAAGGAATCGAGGAGAGCGTTAG:1 + chrX 11553740 3' + Tc1-2 486 1 82.26 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGTTTGTGTTGTTTTGCTTTCCGAAA:1 + chr2R 17878644 3' - Doc 59 1 51.37 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAAT:1 + chr3L 16973456 3' - S-element 69 1 68.49 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCTGCCACTAATTCTTTTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGATTTCGAGTGGAT:1 + chr3L 23320179 3' + roo 9039 1 63.01 TTTTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGGCTGCGGTTGAGGGACTCCCTTTATTTGTCATAATTGGTTTATGACCTTGCCAAGGCAAGAACTTCGGACATTTGTCTTCCAGCTCGTCATCCTAATCGAAT:1 - 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roo 8677 2 76.03 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTGAATCTACGAGTAACGGGTAAAGCACCATTGAGGACCATTTGCCGCATAATAAATGCAACAACCCGTTCTGGAATTGCAATATTATTCGTGTAGAAAATTGTAACTATAAT:1 + chr3L 9431472 3' - INE-1 15 1 65.75 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACA:1 - chr3L 5389865 3' + roo 345 2 63.70 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTCACTACGATTCAAATTGTTT:2 + chr3R 7317675 3' + I-element 5301 1 54.11 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATT:1 + chr3L 12315794 3' + transib2 2736 1 77.78 GACTAATCTACCCTAAAAATACAAACATTCTTTGGATCTGAAACTTTTGAAAGTATTACCTATAGTTGGTGATGGATAATTACATGTAAACGTAATTACAATCATTATTTAAGTGAGAATTATTTTTGTATCTAAAGCATTGCAG:1 + chr2R 11998873 3' + Stalker 13 4 71.72 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAACAGTTAAGGAAAATAAGTATTTTTTTAGATATTC:1 - chr3L 18046555 3' - roo 14 2 74.66 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACAGTGGGGGGGAATATTCATAAGTACGGGCATCCGTTGAATTGATGAAAGCCAAAAGGTCGAAGGATCCGA:1 - chr3L 21332256 3' + copia 5043 2 57.89 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTATCACTTGTTACGGACTACCAAAGAATCTAGAAAACTGTCAGGCGTAGCAAATGGGTAAACAAGATGCTAACCGGCTGATGGCTGATATGGGACAAA:1 + chr2R 12106482 3' + pogo 2082 1 47.26 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCAC:1 - chr3L 7889563 3' - roo 66 2 69.86 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTCGAGAGGCTCTCTCTCTTGAATTTCCTTCTCTGAGGTTAACTTTCTCGATG:1 - chr3R 8890028 3' - FB 69 1 65.07 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGG:1 - chr3R 907920 3' - gypsy11 365 2 25.00 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGTTATGGGGTATTCAGAAACAAGAAACAAATTAGC:1 - 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chr2R 7244828 3' - diver 5965 2 69.86 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGATTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATC:1 - chr3R 907902 3' - gypsy11 365 2 30.14 AACCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGTTAAAAACCATATATATCTCTGTAAACAAGATAAACAAAAAAAAAATAGCAGAGAAAACAATGCAAAGACAAAGCCTTAGAGCCACGGAGTTGCTTAGTT:1 - chr3L 14336459 3' + Porto1 87 1 67.12 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTA:2 + chr2L 13556443 3' - transib2 60 1 58.22 ATTTATTTATTTATTTATTTGTACATTGGAGACATCCTAAGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGTGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATAAGTAATCTATA:1 + chr2L 6894571 3' - Juan 4215 1 73.29 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGC:1 + chrX 21224615 3' + roo 9028 1 64.42 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTT:2 - chrX 6116237 3' - transib2 53 1 54.79 ATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATATTAATTTTTAGCAAAACGTGTGTTTGTGATTTTAAACTTTAATGAGTTTACAAAAATGTGTGGTTCATGTGTTACGCTTG:1 + chr3R 1443465 3' - 1360 2997 1 47.95 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGAATTATCTTTAATGCTCATTCAATTTTAATGACATGTAATATAATTGTTTTACTTATTAGGTTTCCTAATTTTATTTCTAATTTTTGTTT:3 - chrY 541476 3' - 412 7084 2 64.38 AAAGGAAAAATAATCAAGATAGGAATGCAAATACTGGTATTTAAGTTTACATTAATGCTTTTGTTATTAATATATATTGTATTATATTATATTATATTATATAACTTGTATTTCAAGAGCATATGTGCAGCACAGTGACATCAATT:2 + chrX 12038251 3' - Circe 6959 1 52.05 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCTTCACAGACATTTGTTCATAAATTAATTTT:1 + chr3L 16470381 3' - jockey 4702 1 60.77 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATTTTGCGTTACATT:1 - chr3R 29612023 3' - jockey 84 1 67.81 CAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTT:2 - chrX 292440 3' + G3 4494 1 74.66 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCC:1 - chr3L 12315722 3' - transib2 41 1 51.59 ATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTAC:1 + chrX 1799258 3' + invader4 311 2 73.13 TAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTC:2 - chrX 21639621 3' + gypsy5 7284 2 62.33 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAAT:1 + chr3R 13300969 3' + roo 9022 2 49.32 GTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGGCAGTACACCTACAAGCCCATCTTTATAATAATAAATAAAA:1 - chrX 22096199 3' + baggins 5358 1 86.41 ACACGGCCATCCTGACCTATTACACGTCCTCGTGTGCTAGTAATCCCTTAATATCGATCATCGTTATTAATTCATTAAGTTATTTTTCATTTTTCATGACTTCCCAGCGAAAAACCAATACACCCCGAGCAACAAACAGCTGCTCA:1 - chrX 4371173 3' - invader1 3591 1 76.71 AACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATTGTTTGTTTTGTAAGACCCCTACTAGTGAATTGAAGAATTTAA:2 - chr3R 26178334 3' + 412 7524 2 65.75 GTAAGCTTACAAATCAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGAATGTAAATTAATTGAAAGTAGTTTACTGGACACAAGTAAAAAGAATCACAAGTTTCGCTAGCCAAATTGTTGACAAATTTCCAGGCGCACCTG:1 + chr2L 18418369 3' - Cr1a 4038 1 56.85 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTA:1 + chr2R 9871581 3' - roo 46 2 56.16 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCCCAAAAATGACATAGCCACT:1 + chr2R 6965592 3' - Transpac 55 2 54.79 CTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTGAAGAAGTACTTCCGCATAATGGATAAATCAGTTC:1 + chr2R 3926358 3' - P-element 2797 1 26.71 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCT:1 - chr3L 19454883 3' - mdg1 7057 2 71.23 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTGAAGATTTG:1 - chr3R 30347293 3' - P-element 43 1 58.22 TTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACATTCCCGGCGAGAGTTCAGAGCTCTTCGG:1 + chr2L 17078795 3' - Doc 4311 1 75.83 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTTATGAAACAAGTCGCCCAACCCATTGT:1 - chr2R 4785190 3' - Juan 4042 1 72.60 GAGCGGGAGAGTGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTCCATGGCGATTTGGCTGAAATTGAATTTCTATG:1 - chr2L 1300676 3' - GATE 8285 3 68.49 GGTAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAG:1 + chr3L 18931058 3' - I-element 60 1 55.48 GTCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTTTATGCTAATTTC:1 - chrX 10537817 3' - I-element 24 1 67.12 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCAGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCAA:1 - chr3R 17996137 3' - diver 25 2 65.47 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCACAAAAA:1 - chrX 7795464 3' - roo 8677 2 78.77 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAA:1 + chr3L 16470340 3' - jockey 4759 1 72.60 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACT:1 - chr2L 16539637 3' + Juan 4168 1 54.79 GCCAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAA:1 - chr2L 22121339 3' + I-element 5306 1 67.59 TAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACA:2 + chr2L 22224620 3' + Rt1c 5414 1 63.70 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGA:1 + chr2R 14051855 3' - roo 57 2 65.07 GTAAACGATAGCTAATTCGAGCAGCATTTTAACAAACGAATATTAAAAAACTTTAAAATTATAATAGTCACGCCGTGAATTAATTAATTAATTTTTAATTAATATTTTATTTCATCATATTAATACGAAATTGGCCAAAACTCCAA:1 + chrX 3703811 3' + 1360 2977 1 73.97 TAAATCATTATAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTTATCTTGTCTCTCATAAATTTCCCCCTCAATATTTTTCCACATTTCCCACCTCGTTTTAT:1 + chr2R 9941822 3' + Cr1a 4149 1 66.44 ATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTAAAAAAAATGGCAAGGGAAAAGGAAAAGAAAAACGAAGGCGTTG:1 + chr2L 12544019 3' - P-element 2805 1 35.48 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGCATTATGTGTCCGAAAGTA:2 - chr2L 10156079 3' + hopper 1384 1 61.64 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTT:1 - chr3L 10373823 3' + 297 6911 2 66.44 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACA:1 + chr3R 11469418 3' + Tabor 437 2 53.42 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATACAATATATCTCCCTATATATAGCCTCACCTGACGCGTTGTTTA:1 + chr3R 12949109 3' - Juan 58 1 54.79 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCGGGTGGCTGAGAGGCTATTGCATACTTTTGGGCGGCAAGTGCTGGC:1 + chrX 18239467 3' - jockey 27 1 69.66 CTATCGATATTCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCATTCAAATTAACTGAGTTTGGGTATCCAATAGTCAATTTTAGATAAAATCTGTATAAGAATTAAATGTTGTGTTAACTTAACTTAAGTTAACTTAGAGGATACAAT:1 + chr2R 4640947 3' + INE-1 502 1 50.00 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGTGTGTACGTGAGATAAGCTCGTGCGGTGGTAATTGGTCAATGGAAGTGTCAACATTAGACAA:1 + chr3L 8453834 3' - FB 59 1 56.16 TTAAAACTGTTTTTTTTTCATAACAACTCTCTAACAGTTTCAGTTTCCAGTTTCACAAATAGGACAACCTCGGCATAAATTCGAGATTTTCTTTCTACGGTAACTGGCGATAACTTTATATTTATATATTTATATATTTATATATT:1 + chr2R 5663397 3' + looper1 1625 1 81.51 GTGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGACCAAATATTTGCCCACTCACGCTCACATCCACAGTTGCCCACATGCACACACACACACAC:1 - chr3R 28988473 3' - accord 179 2 76.19 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCT:1 - chr3L 12249806 3' - roo 65 2 65.75 ATTTAATATGTATGTATATATGTATGTAATATCTTGGCACAAATTTGAGCTACCAAGACTAGGGTGTTTAATTTCGTGGAATTGGAGTGGTAAAAAATGGAGTCATCTGTGAAAATGAAAAAGTACAGTTGAAGCTGCGAGTTTC:2 - chrX 7167446 3' + Dm88 4375 2 51.03 AAAAAAAAAAACAAAAAAAGGGGCAGTCAAGCGGTAAAGCACAACGTCTGTCGCCCCCCCCCGACACCAACAAAACTTTGGCCGGCTATACCTTTAC:1 - chrX 8543205 3' - hopper 140 2 65.98 TGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATCGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGG:1 + chr2R 13259375 3' - mdg1 69 2 61.64 TTATTAGAAACATAAGTAATATTACGCCACTGAACATGTTTTACGTAGAGAGAGAATATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGGAAGAGGCTTGGCGTGGTGTCTTTTTTTGGCT:1 - chr3L 26293206 3' + G4 459 1 68.49 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCGGAGACACGTCCCAGTGAGAATGGGGAGAATTGGTCGAGGAACTTGAATTCCCTGAA:1 - chr3L 22760318 3' - F-element 98 1 67.81 AAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAGGTAACAACAATAAAAACCCCGGAGAGAACAAAGAAGGCTGCAGATGTTCAAAACCGTCAAGAGAA:1 - chrX 18754109 3' + Doc2-element 251 4 90.91 AAAAAAAAAGTAAGAAGAAAAAGGAATCGGCTTGCTTAGTAAATGAAATGACTTATAGAGTTAACACATGTCAAATTTAATATAGTAATGGCTACTTAAAAGCAAAAACTTGAATGAATATAAAAATTAA:1 - chr2R 17618280 3' + Doc2-element 234 1 86.15 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTGTGCGAATGTGTGCGAGTGTGGGCACTCAAGCAACAAAAG:1 + chr2L 2527764 3' + hopper 1395 1 68.53 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTACGCAACAATAC:1 + chrX 10319738 3' + mdg1 7429 2 64.38 AACTTAAAAATATAATAAATAAAATCTTAAAATTTTTGATATGTTTGATATTTTCGCAAAACATGGAATTCTTTTGTATTTAAGCTTTTGGAAGCAGTTTGTAAAAATCCAAAAGTCCAAGAATGCAAGGCGTGATTGGAAGGTGT:1 + chr3L 7065057 3' - INE-1 426 1 79.45 CATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCCAATTACAACAGCATTAAATAGTTTCAAAATTGAGGAAAAGGCA:2 + chr2R 19601579 3' + 17.6 6953 1 69.86 AAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAA:1 - 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Cr1a 303 1 73.60 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCT:1 - chr3L 22861746 3' + S-element 1679 2 54.48 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCC:1 - chr3R 22287988 3' - transib2 43 1 69.00 AGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTATACTCTTGT:1 - chrX 14771736 3' - BS 75 1 69.18 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGAC:1 - chr3L 24131416 3' - Transpac 4980 2 74.40 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGGACAGAGAGAAAAATGTCTCGCTACTTGACATCTACATAAG:1 - chr3R 3851002 3' - transib2 49 1 52.74 TGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGA:1 + chr2R 9158113 3' - mdg3 94 2 78.77 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGAGTTGGCTGAAATTTAATTTCTATGACTAGATTT:1 - chr2L 1300667 3' - GATE 38 2 48.57 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTAC:1 - chr3R 18971699 3' + Juan 4160 1 55.48 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAA:1 + chr3R 9039039 3' + Juan 4175 1 57.53 AGCAAAATCAATTAAAATTATTATTAACAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAGGGGCGACGGAAAGTGGAACGGGGACAAGAACTCGAAGTGGTAAATATTGGGGATAATCGA:1 + chr3L 4341466 3' + invader2 427 1 57.34 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATC:1 - chr3L 1692034 3' - blood 7086 2 71.03 CATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAAATAGACAAGTTATGCAACTTGAATTAGGCAGGACAATAAGCATCTACTTAAATACAAATTTAAACG:1 - chr2R 11101319 3' + 297 391 2 57.53 AAAGTATTTGTTGTTAAATATTTGCTATTCTGCGTAGATCAGTAAATTATATGAATATTCAAAAATTTTTTAAAATGTCAGTCCGTTTAATTTGTC:1 + chr3R 10900834 3' + NOF 3907 1 68.75 AATATAAGTGAAACATTTATTATTTGCTTTCTGAATATAAT:1 + chr2L 4031182 3' + HB 1501 1 80.49 TTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATT:1 - chr3R 19450196 3' - roo 9047 1 51.37 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTG:1 - chr3R 19992610 3' - hopper 37 1 58.62 TGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACGCGTTAAAGACGATGTTATTGCCAC:1 - chr2L 22328983 3' + invader2 4737 1 51.37 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGAGGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAA:1 - chr2L 6654638 3' - diver 51 2 50.68 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATATATGCATCTTAAACCAGATTTAACGCACTCAATTGCCGAAAACAACAACAAGTTATTTCCGCACTGCAAAGGAAACT:1 - chr2R 6964752 3' + Burdock 6351 2 58.22 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACCTCTCAACATGAAAGTC:2 + chr3R 23067557 3' + roo 9038 1 65.07 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGTCAAATCTATTT:1 + chrX 22840618 3' + copia 242 1 72.54 ACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATGTGTCTTTTTTTCTTGTGGATTTTTCCGTTGTTTCCTTTTCCCCAATTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chrX 13605444 3' - P-element 466 1 43.84 CTTGACCTAGAACTAAGTTAGTTTTTCTTTTTATACCTGCCCATACATCCTCCACAACTTCCAATCTTCTAAAGCTACTTGTAATTGCACTGGCTGTGCGGAGTTTTAAGTCGAGATGCCAGTTAATGTGGGCTTAGCATTTGGCC:1 + chrX 425368 3' - HB 1378 1 63.70 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAAC:1 + chr3R 15364031 3' + flea 208 2 54.11 AGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGAAGGTAAACCTGTGATCGTTATGAAGCAAAGCGATTTGGGAAAGGAAGGCTGATTGCGACACGTTGAGGTGGCATACAATGGGATATCCTTCATCGGCTT:1 - chr3L 21095539 3' - I-element 5298 1 71.92 GGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCATCACCGTCACTGGTTTTCCTAACTAACGAAACTGC:1 - chr2L 7125720 3' - I-element 24 1 66.67 TTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGC:1 - chr3R 22642299 3' - blood 78 2 68.49 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGA:3 - chr3R 15790868 3' - roo 86 2 77.40 TATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCACTGGGATCGGAGTCGGAGCGATGATGGTCGTCGGTGGGGTTATGGTCGCTGGTGCTCCGCCG:1 + chr2L 6864275 3' - accord 75 2 62.50 TTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAGTGTAACGTTTC:1 + chr2L 14523292 3' - HMS-Beagle2 10 2 45.83 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAA:1 + chr3R 21933267 3' - pogo 36 1 64.38 TATTAATATTATTATTTTGATTATTGGGCCACTCGTTTGATGGTAATAAAATGACCAGGTTACCTGTGAACATCAAACGCCATTCCGGCCATGCGTACTAGAAAGATTGTTAAGTTCGTATAAT:1 - chr2R 18073534 3' - mdg1 37 2 88.71 GTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTGAAATAGTAGCTGTAGCTTAAGTTGGC:2 - chr3R 10735992 3' + McClintock 6338 4 68.49 TAATAATATAATAATAATAATAATATATTGTATATATAGTTTTAAGTTAAAGTGAAAAAAACTTCCTAGTCTACGTTTTTTATCTGTCGTTATAAATCCACTGACTTACTTGGTAAAATAAATCAATTTTGCTCATTTCACATGCA:1 - chr2L 11744734 3' + invader3 5053 4 75.34 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATC:1 - chr3L 16970365 3' + roo 9007 2 64.38 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATGCCATAAAAATATATCCACACAAC:1 - chr2L 4063787 3' + roo 396 1 76.71 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCACAACTCGAAAAT:1 - chr3L 7889503 3' - roo 8670 2 78.77 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACACAAACTTCCAAGAGCAAGTGTAAACATTTAATTAAATTG:1 + chr3R 5524042 3' - FB 22 1 69.86 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAACCTAGAACACCCTTAACAGCAATTC:1 + chr2R 23780635 3' - Ivk 21 1 65.62 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAGAATCAAATGAT:2 + chr3L 10425910 3' + I-element 5320 1 56.16 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTTAAAACCATAATGCACACACCAGTGACCGGCCGG:1 - chr3R 31653089 3' - roo 84 2 76.55 GTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTGTTAATGTAGTATATTTTTTTTCTATAATATTTTCTTTACTTGTTTTTGCCTATTTTGTGGGCTCTTTTCGCTGGCCGCTCGCCGC:1 - chr3R 7523788 3' + gypsy2 156 2 66.90 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTTACTATATATGCATAATGATAATAAAAAAT:1 + chr3R 30675412 3' - 297 43 2 82.22 AATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTTTTATATAATTGGTTGGCGAAGTACTTACATTCGAATTTTAATGTTTAATAAAATAGAAACCATTTTGCATTTGCCTTTT:1 - chr3R 8990715 3' - Burdock 343 1 67.16 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTAT:1 + chrX 12986622 3' - roo 8730 2 66.67 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACACCACTAGCGCCACGCCCTCCCGCACA:1 + chr2L 20592670 3' + 412 7478 2 73.39 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACA:1 + chrX 17678734 3' + flea 224 2 67.12 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTATCTCGAA:1 + chr2R 13766282 3' - roo 81 2 76.03 CTTAATAAATTTGATTTGTAATTAGTTCGTAACAGACCAGAATTTAAGAAATATAGAGACGGTTCTTTCTGTTTGCCTGAAAGAAATGCACTTAGATTGTTTTTTTCTTTATATTCCTCCTCT:1 - chr2R 5153133 3' + gypsy10 5904 2 69.92 AGCGTGCATTTCGGTATCGCTTTAATTTAGCACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAA:1 - chr3L 27866013 3' + mariner2 210 1 37.04 ATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAG:1 - chr3L 22960431 3' + Tirant 8446 2 58.90 TCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGTCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCGTGGACAGCCAAGAATGAT:1 - chrX 11468058 3' - BS 4666 1 68.28 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTG:1 - chr3L 6397690 3' - roo 8747 2 77.78 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTACGACTTTCTAGGTCAATACCTGGTTAGGTCGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGTTGCATACAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTC:1 - chrX 13134909 3' - jockey 4821 1 59.20 CACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACAGTGCAACTGTTAAAGTTCAGAGCCATCGCAAAAAGATACAAACGCGAAGCTCTAAACAAACATTAAACTGAATACCAAATGAGACAACAAAAGGAGGAAGCACAATAAA:1 + chr2R 10674616 3' + Porto1 437 1 78.77 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTAT:1 + chrX 12986615 3' - roo 8742 2 72.60 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCAGCACGGTCAGCGATGGTCCTTTATAT:1 - chrX 12066061 3' - transib2 12 1 73.29 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAAATAAATTTTTTTTTT:1 - chr2L 7660867 3' + I-element 5339 1 71.72 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATG:1 + chr2L 11357927 3' + blood 7332 1 56.85 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCAAACCGTATATAATTAATTAGAACTT:1 + chr2L 11839781 3' + mdg1 7430 2 67.81 TGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTC:1 - chr3R 3617308 3' + micropia 5130 2 76.03 AGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTATGAATTAATCGGTAATTTCCTTTCGTCCCATTGAAGGAACGACAATTTCTGGTCACCGCACTGACGCTGGAGTTCCTGGTATCGTCCAGCTTCTACTTTCTGCGCTTTGTCT:1 + chr2L 4872553 3' - 297 6736 2 74.66 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAACA:1 - chr2L 18226760 3' + roo 9024 2 52.05 TTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATTAGTCACTATACTAAGTAAATCTCATATGCAGCAAATCAAAATCCTACCATGAAATTGTTTAAAAAGCTACGGCAGGCAAGTAAAAAATAATATAAATT:1 + chr3L 20711531 3' + jockey 4817 1 56.83 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGG:1 + chrX 8360598 3' + roo 317 2 80.82 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAGTCCATG:1 - chr3R 23618104 3' + hopper 1402 1 71.43 ATTTATTTATATTTATTTATTTAAAACAAAAATCAAAAACTCCTCAAATGAACCATGAATGGCGGCATATTTAATAATAAAATATTGTCAAATATTTTACTGCTTCTTCTAAGTGTAAGAACGCCATTTCTTAAATGCAAATACAT:1 - chr3R 6698081 3' - Tc1-2 480 2 76.71 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAAT:1 - chr3R 19032624 3' - roo 8752 2 81.51 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTA:1 + chr3R 31264076 3' - jockey 4832 1 65.07 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTA:1 - chr2L 13158665 3' + roo 321 2 77.40 ATGGCGNTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGTGTAGAAA:1 + chr3R 7420349 3' - 1360 14 1 77.40 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGGACTGGACTGGGCTACACCAC:1 - chr3R 30347349 3' - P-element 99 1 18.49 CATCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCTCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATGGCTATGTACGCGCACAAATATAACCTGTATCTATAGGCAATCTT:1 - chr2L 22340140 3' + 1360 3113 1 68.49 AACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCT:1 + chr3L 21769089 3' + I-element 5272 1 73.29 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGGCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGGCAATCGGT:1 - chr3R 15942702 3' - hopper 27 1 52.73 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTC:1 - chr3R 4964078 3' + roo 9026 1 54.79 TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTG:1 - chr2R 4362800 3' - F-element 84 1 65.75 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGACTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCAGCTATGAGTTCAGTCGGGTTCAAAATTGGTTGGTGGCCAATATAGCCATTTTGTCA:1 + chr3R 5368733 3' - 1360 14 1 76.71 TATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTTTGCTTTCATTTGCGTTTACGTTTGGTTTGGTTTTGGCCATTGCCTTCAGCTGGAAGTCCCAGCCCACGTGGGCCCAG:1 - chr2L 16382279 3' + roo 8725 2 61.64 GTACCCCAGAGCTGTATGCCAAAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGGGTGATTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGTTCATCATTTTGCCGTGCGTGCTGACGCCTTTTTGGGGTGG:1 + chr2L 11247168 3' - G4 3436 1 70.55 AAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGATATAATTCTGAAAAAATGAAAGACTTACACGTTACATAAATGCTAAAATCAGCTTGAACTTCAGTGA:1 - chr2R 2591099 3' - roo 8737 2 50.00 GTCGGCNATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGC:1 - chr2R 1320656 3' + diver2 334 2 56.83 ATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAA:2 + chr3R 13187487 3' + I-element 5265 1 76.03 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAA:1 - chrX 12986552 3' + roo 8990 2 74.66 ATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAAGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCAAATATTTTAATTCAGTTATTGTATTTTATTTTTGGAGCCCGTATAAGCAAAGTACCCTATACTTAATGTTTTGGCTCTATG:1 + chr2L 8948824 3' - Ivk 5162 1 58.62 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAATTAAT:1 - chr3R 11191344 3' + roo 396 1 74.66 TATATAATATATATAAAATATTTGATATTNATATTGAGTGAACCCTTAATACGCCTTCCTTCCAAGCTACCAAGAAAAAATCCCAAAAACCAAAGCAATCTCTTCCCGATCGGTTAGATCCACTTTCGGGCAATTAAAATTCGATT:1 - chrX 7529404 3' + transib1 1923 1 80.14 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACTTCATTTGTTGGGAAAACAAAAAACGGGAAATACCCAA:1 + chr2R 16929810 3' + jockey 4987 1 50.70 AGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGACAAACTTTTCACACCAATGTAAAATGTAAAATGTTTAAAAAATATTTATGTCGAAATTGTATATGCTCTTCCGCCTAAC:1 - chrX 16614627 3' + roo 111 2 54.79 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGGGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAA:1 - chr3R 19407898 3' - diver 5934 2 52.63 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTT:1 + chr3L 26290976 3' + Tabor 434 2 55.30 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAA:1 + chr3L 5389955 3' - roo 8735 2 69.86 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCCAAAATGCCAGA:1 + chr3L 1692159 3' + blood 7367 2 69.86 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTGGGTCCAATTGTACAATTTC:1 + chr2R 7244910 3' + diver 161 2 60.27 ACAGCAGAAAGTATGAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCATTTTGTGGCGAAATGCGTGCGATGTTTCTTTGGCGCTCGAGTTTTTATTTTTTTGTTGTTTATGTATCTATTTTGGTCGCTGAGAAGACAAGCCCCCCCCCC:1 + chr3R 14017596 3' - ZAM 8175 2 71.92 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGGTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTATATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGCGCAGCAGTTATCATCTGTTCGTCCCGC:1 + chr2R 20349041 3' + transib2 2751 1 66.43 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGCCATTATTATTTGCAGTTGAGTTTATGGCCGAAGGGCCGACACGTCGAAGGTGGCGCATTAATAAG:1 + chr3R 22288083 3' + transib2 2785 1 56.85 AAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTAAATTACAAATATCATTAAATAAAAATGAGCTTAGTAACTACATTTTTTTCCTATGTAGACCA:1 - chr3R 13622080 3' + transib2 2428 1 56.85 ATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGG:1 + chr3R 18971763 3' - Juan 4111 1 73.97 AAACTATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAATTAGTATATTAGTATAATTATGTAATCAGGATCAGTGGACGAGTCGATTAAACCGTGTCCTTCAGTTTCGTTGACGTTTCGCAGCCGGAGCCAATCTAAA:1 - chrX 22754818 3' + S-element 445 1 41.78 TCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTCGCACAACAAAGTTCTAAAGATATAAGGAATTTAATCAAAATGTTTTGGTATGCTCAAGGTGATGCACGCGGTCGC:1 + chr2L 5920859 3' - Idefix 99 2 60.96 ATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGCCCATCGGTAATTCGATTTTGTGTGCGT:1 + chr2R 21116389 3' + mdg1 7459 2 50.00 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGT:1 - chr3L 12249831 3' - roo 8754 2 82.88 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCACCCTTCATATAAATGCA:1 + chr2L 22674904 3' + mdg1 7422 2 55.17 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATGA:1 - chr2R 24427575 3' - jockey 4746 1 64.38 ACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACATCTATATTTATTTACAATGTTATTATATTTTAATTTATTGAAGGTTCTTAACCGAGCTATTTGGATCGTTGTTTTTCTTTCTATACCACCCTCAACGTCACCGGATT:1 + chr3L 27084973 3' - I-element 5310 1 54.11 GATGAGTAACGCCATACGATTTTTTTGCTAGGGAGTTTATCCAGCTAACCACTATACAAAGCTTAATTACATACTGTCAAACG:1 + chr2L 21745382 3' + 1360 21 1 73.49 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGT:2 + chr2R 7850020 3' + roo 334 2 66.44 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAATGGTCCATAGAATAGGCGTTTGATTGAGCCACCCCTTTCTCCACCTGATGGCAAAGCGATGT:1 - chr3L 6397603 3' - roo 8673 2 74.48 AAAGAAGGAAAAAAAAAAACAAAGAATATGAACAGAATTAAAAGGCAGCAGCTTGGAGGCTAGGCTACCAAAAAATAAATATTAAAAAAAAACCC:1 - chr3R 12561539 3' + gypsy7 5009 1 75.79 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAAGACAAAACGCCAT:2 + chr3R 13973061 3' + 412 7496 2 51.37 ATATATATAATATGTATGTATATGTGTGTGTATTTCCGTTTATATTTGTAAATGTTGTTGTTGTTCGCTGTCGGTTTTGTTGGCGCTGACTGGATTTTCTGATTTGCCTGAGCGGCGACCGTTGAAATGTAATTTATACGTGGCCC:1 - chr3L 10559286 3' + Dm88 4371 2 65.75 CAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGGCCAAACCCCGTAACTTGAACAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTGGTCCGTGTGGTCTGAGTGGTCTGTGTTTTTTTTTTTGT:1 + chrX 12663238 3' - GATE 8271 2 40.35 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAG:1 - chr3L 5532929 3' + roo 346 2 63.01 ACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTTGTTTCT:2 + chr3R 11040175 3' - Bari1 45 1 55.48 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCAGCGGCAACTCGAAACTCCCAGTTGGCAGTCCTGGAG:1 - chr3R 28385548 3' + transib2 2772 1 68.97 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGCAAGAGTACTTAACTTTATGACTTACCTAATTTATTGTTGATTGAGATTTATAAATATATTTTATATG:1 - chrX 18009924 3' + 412 441 2 52.05 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCTAG:1 - chr2R 14653142 3' - 297 6616 2 48.63 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCCTGATATAACGCCCACAAACTCTAACGCCCACAAACGGCACAAAACTCCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTCATATTTTTATTAGTC:1 - chr2R 5324622 3' - HMS-Beagle2 6901 2 72.14 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATTCTTCTTTCATCTGAATCTATCCTTGCGTCCAAGTGGTCA:1 - chr3R 28146062 3' + roo 396 1 72.60 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAAC:1 - chr3L 18046588 3' - roo 46 2 52.41 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAA:1 - chr3L 23249394 3' - rover 7020 2 61.64 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAA:2 - chr3L 21996148 3' - Transpac 51 2 55.48 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTGATATT:1 - chr3R 27160057 3' + 412 7492 2 56.16 ATATGCCTTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTCAATCAAACATTTTTGTAATACAAAATGCTCGTACTGTACATACATTTGCAATAAAATACTATCTAT:1 - chr3L 24735805 3' + 1360 219 1 53.42 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTG:1 - chr3R 17673749 3' - FB 65 1 63.70 TAGATCGACTCGGTTATTGATCCTGATCAAAAATATATATATTTTATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTATCTAATACGTGATTCAAAAAAATATGGGCAAACACTAAGATAATACAATATATATTCCTGTGGACGATAA:1 - chr2R 5744231 3' - INE-1 98 1 50.00 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTATGGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGC:1 + chr3L 19111606 3' - Doc 65 1 62.50 AAATTATCAGTTCCTTCTATTTCTAAGATAGTGTATCTGCATTCACATGCCTCATTAGCACGACTGATGAAATCTGGGGTTCCATTCCAGAGTAGGAGAATCCTGTACAGATACCCAAACTAGGCAAAAAAGTCAATGT:1 - chr3L 22766948 3' + pogo 1971 1 75.54 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGTGTTCCG:1 + chr3R 13300980 3' + roo 9033 1 56.85 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTA:1 + chr3L 3501858 3' + Bari1 1687 1 65.07 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTT:1 - chr3R 23911366 3' - 3S18 48 2 66.98 CTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCCCATCAGAACTTTGGAAACGGGACTGGGGG:1 - 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I-element 75 1 66.44 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTAATT:1 + chrY 2720372 3' - 297 6632 2 63.31 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATTTTGCGTTACATTTGCTTTT:1 - chr3R 29612016 3' - jockey 76 1 62.76 ATATATATACATATATATAGATGCAAAATCCCAATGCGAAAAAATACAAATTAGCCATGTCCCTGGAGTAAGTGAAAAGTGTGGAAAAATCATGGAGTCTTCCTGCAAATCCTGGCTGTTGTTCAGCATCCTGGTGCTTGTGGCCT:1 + chr3L 4429685 3' - 1731 4409 1 80.14 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGA:3 - chr3R 30675368 3' + 297 313 2 78.08 TACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACCCAAT:1 - chr2L 4888714 3' + BS 5060 1 55.38 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAAT:1 - 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chr3R 19084519 3' + Cr1a 41 1 50.00 ACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATGCATA:1 + chr3R 905020 3' + rover 277 2 71.03 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATTGACTTACAAACATATTGTTTAATTGTATTACTCTT:1 + chr3R 14980449 3' - roo 21 2 69.86 TTCTACCTGTTACATTTATTTCACCGAATAAATACATAAATATCTAAGAAAACGTAACGTAAAAGACAAAATAAACATACATACCGTCGCGACTTTATTGTTGTTCAGTTATTTTAAATCTTAGATTGCTGCCAACTCCAGGTTTT:1 + chr2R 12989058 3' - INE-1 23 1 39.73 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACAC:1 + chr2L 16690691 3' + P-element 2795 1 22.60 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAA:1 - chr3L 6518548 3' - 412 48 2 52.14 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGCAGACACGAAAATATTCTAAGTAATTTTGGCTAAAATATTTGTGTGCACGATGGCCATGACTTAGCCATGTGG:1 - 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297 6596 2 72.99 GGCAGAAATTCTGGTGTTCACTGAACAAGATAATTAATAATTATTCTGGCTTATCGTTTGTTGAAAGTAGAAGAAAACAGAAGAAATTGTAAGTACTGTGTTGGCAGCTCGTAAGGATTTCATGTTTG:1 - chr3L 3860548 3' - HB 1439 1 57.81 ATTTTAAAATTTTTCAATTTTTCCAATTTTGCCTGCTTGCCCTATCGGTCTCTCCTTTTGG:1 - chr2R 10486525 3' - 1360 3030 1 81.97 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAACGTTTTGTATCTGG:1 - chrX 15357631 3' + hopper 1379 1 56.94 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGCATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATA:1 + chrX 12986616 3' - roo 76 2 71.72 AATAAAAAAAAAATTGAAAAAATTATATCTGCTTGTTTGAATTGGGGCATGGACAATATGGGGTTTTAGCTAATGATATCAGATTTCCCAAATAAATAACAACACTTTTCGTTTTTCTTCATCTTTATTGTTTTCTCCTCATTCG:1 - chrX 11801552 3' - FB 174 1 51.03 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAAAG:1 + chr2L 4123969 3' + transib2 2780 1 52.74 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTAT:1 - chr3R 4805637 3' + 1360 3312 1 78.46 AATTAGNTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGC:1 + chr2L 19924067 3' + roo 9038 1 53.79 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAAT:1 - chr2L 20265899 3' + roo 387 2 70.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAA:1 + chrX 10167505 3' + roo 9046 1 65.75 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGATATAATATAATATATATATGTCGGTGAAGCCGAGCGTCCAATTAATTAGCACAGCAAGTCGCCTGCGTGTTGTCTCT:1 - chr2R 4188969 3' + S-element 1675 1 54.11 AGAGCAGTCTGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGGGAAAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGTTTAAGGTCAACAGAGTTTATTGCTTAAAACAGGCAAGTTGGAACTGGGACTGGAACTGGGAGAAGGGTTGCCCATGGCAG:1 + chr2L 6262847 3' - Cr1a 336 1 58.22 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGGCGG:2 + chr3R 16157400 3' - pogo 29 1 60.00 TAGATCAGAGTTGATTTCGGCCAAAAAATAGTCATCTAGCACAACACGCACACATATACACGTTTTCGTTTTTTTTTTTACTTTTGTTTAACACTTTGTTTTCCATTACCTAAACCGAAGTATTTGTTTCATATA:1 - chr3L 25396936 3' + 1360 3176 1 57.04 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAATTCTTAACCGCAAGCAAGTG:1 + chr2L 20821338 3' - Burdock 27 2 66.44 CATTGTTTTTTTTTCATAAATTCCAATTCATTGGAAAAAGTATAATTATAACAATTTATAACAATTTTTTTTTAAATTTTTTTTACACCTCCGAAGGGTATAAACCACATTTAATTACTTTTGTTTTTCTTCCATTTCCTCAGGTG:1 - chr3L 10500322 3' - looper1 1692 1 63.70 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCT:1 + chr3R 7719801 3' - roo 75 2 76.43 GTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATGTCGAGAACTAAAAACATAGTTCG:1 - chr3L 23181680 3' - 1360 3319 1 72.73 ATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTGAATGCAGCTGGGCCAGCGTCGCGCTCGTGTTCACTTTCGTGAGTTTCGCAGAGCGCTCTTTCACTTCCCATCGCCC:1 + chr3L 13435306 3' - opus 367 2 58.78 AGGGCTGAATTAATAGAGACCAAGGTAAAGGAGCTTCCCCGTATGCCTTAATAAAGTATAAATAACAAAAAAAAAGGGTGGATTGAAACTTTTCGACTTATTTTGGCCACATTAGTGTGCCCGACGTACTTTTGGTCATTGTGACC:1 - chr2R 5085908 3' + BS3 1710 1 67.12 ATCTAAATTCAAGGCACTTGACAGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCTTCTTCTGTGACCGTTGGTATGGGCTCAACGTGCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTACTTGGGATTTCTACAGACCTAATGGTGGCAGTTTGCTCTTCAGC:1 - chr2R 11962553 3' - G7 189 1 69.86 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTGGAAGTTGTATTTAGTTTTCCCAAATGTGATCCCTGGGTTCAGTGGGTTAGCATTTGTTTTTTGGTGTTCGTTATG:1 + chr2L 1419276 3' - F-element 46 1 56.12 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGTACATATGTAGATGTAGCACATATG:1 - chr2L 16274932 3' - FB 57 1 57.53 ACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATAGAATATGAGAAAGGCAAATAAGATTTATTTGCACAACACCCTAAGCAAAGTTCAAT:1 + chr3R 2682085 3' - gypsy12 10081 2 53.33 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACAT:1 - chr3L 16690871 3' + I-element 5326 1 52.74 ACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGG:1 - chr2L 6654681 3' - diver 5958 2 76.23 AGGGTATGTAAGGGCATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTGCAGTTATCCGAGACTG:1 - chr2L 7580847 3' - Transpac 4 2 59.59 AATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCG:2 + chr2L 22684596 3' - transib3 75 1 59.59 GTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCT:1 - chr2L 13585708 3' - Quasimodo 40 2 49.32 TATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAA:1 + chr2L 12636390 3' + Porto1 4574 1 79.13 AAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTTATTGTAGTTAAATTTATTACAGGGAATTTTTAATATCGCTTAG:1 + chr3R 27083148 3' - jockey 4550 1 64.06 ACTGAATATAAAAGAATATAAAAGAAAATATGGGTATATTGTGGTAAGAAAGATTATTTTTAATAAATACTATTTTTGTTACTATTTAAAAAACTTACTAAAACTCACTAAAAGAGTGACTTAACATTCAAATTGAACATTATTTA:1 - chrX 16879328 3' - gtwin 231 2 62.33 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACTGCAATGCCACAATTGTG:1 - chr3L 4219472 3' - jockey 78 1 65.07 ATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTAGAGGGCTGTTGCGTCGCTGCTGCTGCTGCGCATGCGCCGCATGTTGTTGTTGCTTCTGTTCTTGTTGTTGGGCGCAGCGGACGCAGGCGGCGG:1 + chr2R 15482389 3' - I-element 5117 1 72.95 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGGACTTTATATTTTAT:1 + chr2R 9871589 3' - roo 17 2 70.40 CTAAGAGTCTTTGGCAAGCGAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 68 1 78.08 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGGCTATTCGTATGTGTGTATATGTA:1 + chr3R 15364066 3' + flea 243 2 76.71 AAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTATAGCTATTTTTTGAGCAATGAGTTTGGCATACATGTCGAGCAACCCTCGCTGAGCGTGAAAATCACTTACACGTTCATCAATAAACAATGAACTTAACCTCCGAG:1 + chr3L 5127269 3' - jockey 4865 1 69.86 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATAATTCATTTAAATTACTTTTTATGAT:1 + chrX 14771816 3' + BS 5037 1 56.85 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGA:1 + chr3R 18488455 3' + roo 335 2 71.92 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTAT:2 - chr3L 16662357 3' + jockey 4954 1 56.16 GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATTACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACA:1 + chr2L 16539749 3' - Juan 4084 1 50.68 ACCTCAATATTCACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGACATACAAGTCGATACAGTGGCAGATTACTGAGCCATAGCAGTCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCGCATCGAAATGTTTTTGGTCAAACGATAGACATG:1 + chr3R 26100789 3' + Helena 1202 1 78.99 AACGGAGGCATTCCCCAAATCCGCTGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATCGATATCGATTGCGCTCCAATGGACTAAAAACTAAAACACAAATCAACAAAAGCAAAAATTGAAGTGAAAATATA:1 + chr2R 18277480 3' + gypsy5 189 2 54.79 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAAT:1 - chrX 10537852 3' - I-element 59 1 57.53 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTT:1 - chr3L 14366551 3' + roo 8991 2 76.55 CATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTT:1 - chr2R 5410955 3' + Tc1 1366 1 50.70 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACAAATTGCGTAAAAATGCAAAGTTGAATATAAGATAAAATAAGTTTTGCCAACATCCAACCTGAATAAATACAAA:1 - chr2R 10809119 3' + mdg1 27 8 77.60 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACAACACATACATAAAAGACACAAATACAAATGCATGCATAAATAGTATTATTGTTTAATGAATGGAAATTCTTGTTTATTTGTGAAA:1 + chr2L 12978483 3' + hopper 1404 2 63.70 ATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCACGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACACTGGTCATCTCCAGACTGCCTTACTTGGGCATG:1 + chr2R 20290974 3' + roo 8940 2 76.03 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATGGTAAATG:1 + chrX 8092512 3' - pogo 37 1 58.90 AGTAATAGTAACATAACAGCGCAATCAACAAGTAAATAATAAAATCCAACCATCTTATTATGTACTATTTGCGTATTTATGTAACTGCACATATAAACGTATTCTTTAAATAAAAAGTAATAAGTTAATAAAGTAATGCTTATTGT:1 - chrX 20264081 3' - BS 5048 1 43.84 ATCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTGCCGGGC:1 - chr3R 11186504 3' + BS 5082 1 72.87 CTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGACCCTACTTCCTCTTTTGAACGTTCAATGTGTCTTGATAAGTATCTGTGTCTGCCTTGAATGAAAAGCCATCTAATCAATGTGCGCTCGATGTT:1 + chr2L 5360562 3' + diver2 223 2 60.96 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAAACCACAGACAAAGGAAAACCAAATCTTGATCCGACTATTGTTGAAA:1 - chr2L 12818210 3' + hobo 2903 1 55.86 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTG:1 - chrX 18396097 3' + roo 330 2 68.49 GCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTG:1 + chr2R 20010685 3' - Juan 4156 1 53.42 AAAAAAAAGAAAAACAAAAACACGCGCTGTCAATCAATGTACTTTTGAGAATACAGTATACT:1 - chr2R 9070053 3' + gypsy7 5008 1 61.29 GTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTGGACTGCATATTTTTATTTGTTATATTATT:1 - chr3R 19449937 3' + roo 8929 2 79.45 ATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATG:1 - chr3L 20189605 3' + FB 199 1 53.42 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGAAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCTTTATTACAACCGTTAT:1 - chr4 372950 3' + pogo 2043 1 59.59 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTAAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAA:1 + chr3L 23456275 3' + 1360 3333 1 58.22 AAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACAT:1 - chr3L 23249413 3' - rover 88 2 74.66 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTTTGTGGCCTTTTGCTGTTTGTTTGTCAACAGCAGCGACTGCC:1 - chr2R 22989551 3' - hopper 23 1 69.86 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTTTATGCTAATTTCCAACTTC:1 - chrX 10537810 3' - I-element 17 1 71.92 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATATACGACATGACC:1 + chr3R 25428281 3' + 297 6940 2 60.96 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTT:1 - chr3R 10931618 3' - 297 49 2 56.94 CTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGAATCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATTATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCGAATAGCGACTAAAGATTACTACATATATACGAAACAGCAA:1 - chrX 10237646 3' + rooA 7444 2 70.71 CTGATCCCGATCAAGAATATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTCAACCGCCCCCCGCCCCCCTGCGCAAACACGGACCAAGTCAAAATCGCGCTCAATGACCCCCAAC:1 - chrX 2285754 3' - INE-1 82 1 61.40 ATGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAGGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTACATTCGTCGTATTTTCGTACTGTACTTTAATGTTGAAATCCGAATATAAATTTAGTGACCAAGTACACTAACTTACC:1 + chr2R 21926501 3' - opus 7152 4 45.21 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAA:1 - chr2R 22034635 3' + copia 5079 2 53.79 CTGGGGAGAACTCTTCCTTGAAATTGTTGACGTACAATTCCTCCATTTCTTTGTTCATTGTCTGGATCATTTATAATTGGACAAGGACAATAAGGACTTTGGCTTGTTACATTGGGAGCTTGTCTTTCTGAATTTGAGGTATTTAT:1 + chr2L 16334705 3' - R1-2 300 1 70.55 AGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGGTTGGAAAGACTTTACAAAGGACATCTCAGTAAGACAGCAACCAAACGCTGGCTGA:1 + chr2R 2946078 3' + 1360 3321 1 72.41 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGATTGTTTGCCATT:1 + chr3R 25428257 3' + 297 388 2 69.89 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGGTACAAGGGTTACAGGGCTCAACTGTAGGGCG:1 - chr3R 17077053 3' + roo 9055 2 73.97 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGC:1 + chr2L 16943883 3' + copia 5083 2 67.12 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAAT:1 - chr3L 12004238 3' + P-element 2841 1 51.49 TAATCATTTAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATGGTCCATCCGGGGTTTCTGATTTTTGATAGGCTTGTTTATGTGGGTTTCTGTCATATTTCAAAATTT:1 + chr2L 23374341 3' + Idefix 7350 2 55.47 GAAGTCATTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGG:1 + chr2L 21930233 3' + Copia1_DM 71 1 69.66 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAATTTTTAATACAATACCTTAAAATACGATACTTTTATT:1 + chr3L 14366676 3' - roo 8680 2 77.40 AGTAAAAGGGAAGATTCAATATAGAAGTAAAAAATGGAAAAAAAAACGGAAAATAACACAGAAGCACCACAAACCCTCGACGAGGCTATATAAGTTGCGG:1 + chr3L 12179843 3' + Doc3-element 4698 1 71.00 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGCTTAAATCAGGTGCCA:2 - 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chrX 661885 3' + 412 7480 2 73.98 AATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTC:1 + chr2R 2875230 3' + TLD2_LTR 101 1 64.54 CAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACT:1 + chrX 23182941 3' - Idefix 27 2 54.11 ACCCAAAATAAATAGAATAATTTACTGACCACCGATTCCCCTTGCCATTTACATTGACATTGCTATTCTCTTATTTTATCGCATCATGTTTGATTATACACCGTAATAAATTAATGGTTCAAGCAAAATTATTATATGTGCGTATA:1 + chr3L 5187678 3' + G5 4825 1 78.77 TTTTGTCTTTTCTTTTTTTTTGTTAATCAAACGGGGATGGGTATGAGGATACTCAAAGCGTGAAGTTTTCAAATCCAACCCAAGTCAATCAAGCTGTACTAATTGCCAATATCCCGTTTCGTCCTTT:1 - chr3L 7931880 3' - gypsy7 5006 2 80.31 ATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAA:1 + chr2R 12185403 3' - accord 76 2 70.55 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAGGA:1 - chr2L 17104608 3' + transib4 2577 1 28.08 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACATCCCTGCCACCACCTC:1 + chr3R 29084977 3' - 412 7085 2 56.48 TTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTCTTAGACTAATATAAGGTATGATGCAGATATCTGTTTTCTGGATATAAGGCAATGGATACGTGTGCGTGTGGCGTTATGTGTGTGGGTACAATATATGTTAGTGT:1 - chrX 1451599 3' - I-element 5260 1 73.29 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCNCCATAGTGCATTCCATTCTANNNNNAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAATGGAGGCGCA:1 + chr3R 31886925 3' + hopper 1339 1 68.49 CCAGACCCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAATAAGGTGTTGAAAAATCTCTAGAACCTACTAG:1 - chr3L 18449960 3' + I-element 4918 1 75.54 CGTGGGGTGAGTTTGGGGATTGGACATAGATATAGAGTCAATTTTATTGATTTTTGCTTTTTTACATGGCAATTTAATAATCTGTATCTGTGGGGGAGCGTGTGGCTATGATATGGACGGAGGAATTGAGTTG:1 - chr3R 26492912 3' - HeT-A 5932 1 77.44 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGTGAGCGGGCATAAAGGCAGGTTATTGACACAACA:1 + chr3L 6397762 3' + roo 9022 2 53.96 TTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCAC:1 - chr3R 9038923 3' - Juan 4066 1 55.48 ACGAAAACATTTTCAATTAAAATTTTGGCCCAAAAAGCCATCAAATACAAATGCCGAAAGCCTAGTGCATCTCGCTCTCTTAACCGCTCACACCAGCAACACTCAGAACAACACACACCGAAACACAATATTCACGCCCATCCGCA:1 + chrX 2577886 3' + X-element 158 1 76.71 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCC:1 - chr2R 22034626 3' + copia 5087 2 59.59 TATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACA:2 + chr2L 4713937 3' - transib2 84 1 78.08 AATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTTCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTG:1 + chrX 23280917 3' + R1A1-element 5325 1 45.71 TTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGA:1 - chr3L 12315741 3' - transib2 81 1 70.55 GACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATAGGAAGTTAGCCACCCGAACACCGACACTTATCCACCCGATCCCCGCG:1 + chr3R 29733794 3' + Tirant 8228 2 60.00 AGTGTAAGGATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAG:1 - chr3L 23249389 3' - rover 23 2 59.05 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGC:1 + chr2L 4713976 3' - transib2 45 1 54.79 TTATTCTTGATCAGGATCAATAGCGCAGTCGAATGAAGGATTTTAATTCGGTGTAGGTCCAGTATTATGTATTGATTTTAAGAAAGCAAATTCCTTTTTAAATAACTTTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAACTGCTATGAAA:1 + chr2L 12286085 3' + INE-1 84 1 80.14 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTTAAGCCATATAATT:1 - chr3R 23639098 3' - pogo 18 1 71.92 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGTCGAGTGCG:1 + chr3L 21380657 3' - I-element 8 1 77.17 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATC:1 + chr2R 8099221 3' + jockey 4929 1 63.01 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCC:1 + chr3R 15790070 3' - flea 4762 1 69.92 CAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGA:1 - chr3L 21655906 3' + HMS-Beagle2 229 2 74.48 CTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCC:3 - chr3L 24213773 3' + invader2 5035 2 65.75 CTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTG:1 - chr3R 460083 3' - F-element 143 1 51.72 GAGTTGAGAGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTCATTCAAAATGTGCACATTAACGAGCGGAATAACAACCCATAAAGTAATACTAGAGGAATTCGACCGGAAGACATAAGGTTCTTGGTGCTATTTCCAGTAGC:1 - chr2L 2751539 3' - Porto1 460 1 75.00 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTA:1 - chr3L 6518571 3' - 412 7087 2 57.28 GATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAAATTTTTTTCGCATGTTTTCATAAGCTCTATTAGAGCCTTTCAAAGAAACTTTATGGGCTGCAATTCTATTATGTCTATGTGCGGAAGCCACAGGATTGGTTTTAGCATATAAAAGT:1 + chr2R 5020595 3' + Transib5 2860 1 58.22 TATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGA:2 - 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roo 8723 2 60.27 TAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAGGTCCAACTGCACGGACGGCTATCTAAAGATCTATCTGAAGGGCCAGGAGACGGCCGATGCCTACGACAAGTTTGACTACGAGT:1 + chr3R 18971845 3' - Juan 4029 1 76.03 GACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGATAAAGGAGGTTGAACTCACAGCAAATATAATCAAACAAATTAACGTTATTAGCAGCAACAAATAAAACAGTTGCCATAACTAATCTAAACTA:1 + chrX 18765577 3' + R2-element 458 1 52.05 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATAATGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATC:1 + chr3L 1692127 3' + blood 7341 2 51.43 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTACTTTCCTATTAGGTTTTTTTTTCAGTGTATTTCGCAAGACAAGGCACTGACAAATGTA:1 - chr3R 10270527 3' - Juan 4043 1 72.60 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATAC:1 + chr2R 4870256 3' - Juan 65 1 61.54 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCA:1 + chrX 8308495 3' + roo 9008 2 63.70 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTTCTGTGTGTGCGCT:1 - chr3R 25709742 3' + hopper 1381 1 62.33 TATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTTGAATTGCAATTGACAAATTATTTATTTGTAGCACATGGGAAATGGGACAGCTCAAAAAAAAATTTAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGGGTACATTAAGGGACTTAGAGTAGGCGTG:1 + chr2L 21924958 3' - INE-1 546 1 78.77 TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTT:4 - chr2L 13556347 3' + transib2 2755 1 65.75 TATTATAAATATTGTAATTAATTATTAATCACCAACATGAATACATGAATTTTTAAATATTTGAATACTGAACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGCACCTACTTCCCGCATCGTTTGTGGAACAAATGCGAGATGCTGTGC:1 + chr2L 21640869 3' + Gypsy12A_LTR 1810 1 72.60 GACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTT:1 - chrX 21772482 3' + springer 7156 2 64.06 ATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGAACAGGA:1 - chrX 6952085 3' + G5A 2776 1 64.38 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAATTATGGCAAACAACTTTT:1 + chr3L 6447156 3' + transib2 2795 1 65.75 TCTTGAGCGGTGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACCTTTTAGGAGTCGCTTTTGGTATGTGTATGTTGTAGGGGCCATCTCTAATTTAACTTAATCTTGCTAAAATACTGCACACAACTTAACATGTTTTGCAAACA:1 - chrX 11580642 3' - roo 224 2 63.01 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAATTGACTTGT:1 - chr3R 19073189 3' - roo 67 2 66.44 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATA:1 - chr2R 3564023 3' - Tabor 42 2 56.85 AAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATTAATTTTAAAGGATGGGCTTCGATTTTCAATGGTCTCTTCTCTCTTCAATGCGTTCTAATCAATCCGTGTTTACATACGGGCTGTGTGTCT:1 + chrX 16944017 3' - FB 708 2 52.74 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGG:1 + chr2L 1923987 3' - G2 3023 1 69.17 AATTGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCACTATCTAAATAACGTCGGGGAAGGCGACTTGTTTAATTTGGGATGCACTAAATAT:1 - chr3L 22957575 3' - Tirant 8493 2 59.59 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTC:1 + chr2R 9544908 3' - roo 89 2 80.14 CAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACATGAAACCAATTCACATTTTTGTTTACACTTAAGTGCCTCATTTTTACTGGCAACTCAAAAAAAAAACCCCCCCTATTTAGCAAAATACTTATTTACTTATTAATAAGAGCATTCA:1 - chrX 3303252 3' + rover 7007 2 53.42 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTG:1 - chr2L 18212121 3' - Quasimodo 66 2 66.44 TTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTGTGTCAGATCCTCTTTGGACCCACAAACACACACACTCACACATTCG:1 + chr2R 18510193 3' + hopper 146 111 79.71 CATACACATATATATATATATAGGTGGGCCTAAAGCTGTGTATATGTATATGTACTATGTGCATATAGCTAAATTTATGCGTACGTATTTTTGGCCATGCGCGTCTCCAATTTGAACCAAAAAAAAAAGGCAAGGAAAATAAAC:1 + chrX 14589973 3' + Stalker2 251 2 54.86 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTA:2 + chr3R 18093377 3' - I-element 60 1 56.85 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAAT:4 + chr3R 22590590 3' - rover 7002 2 59.59 GGATGGAAGGAGGAGCCCACATGGCCTACACTTAAGGAAGGGAGTGCGTCCTGGCTCCACATCGGTGAGCGAGAATGAACGAGAAGCTGCTCCGGGAATGCAGACTTTCAAATTTATGGCCCAACCAAGTCC:1 - chrX 1987777 3' + Rt1b 4906 1 56.82 TTTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAATTTGTAACAAAAACCTTGCGAGGCCAAGTGGCTTTCCGAGGAG:2 - chrX 23182807 3' + Idefix 7346 2 55.17 TTCTACTCGAGACTTATGGGTTAATTATTGTACTTTATATAATAAACTGAGCTTTTCGGCAATAATAATAATATTCATCGGTGGCAAAGATAAGCAATTCGTTTGTCCTAGCAAATCAATAATGTTTATTGTTGTATAAAAATAGC:1 + chr3L 18548685 3' - Ivk 5298 1 63.01 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCGAACCAATACTTTCAACTTCGCCAGTTGTTCAGCTAATTGAGCTGGTCGTGTGATCACTGATCAGGAATTCTTCGTTCACGCGA:1 + chr3L 12004363 3' - P-element 37 1 59.59 GTGTTGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGGGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATATGTACGACTTCACATGGGACCAAAAAGGACCGAAAAGCACGCTACATTTTTTTACTT:1 - chr3R 4575729 3' - jockey 68 1 56.55 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCTTGAACTTATGTGTGCAAGTTATCCAAACCGTAAATATAGAACTCTGACCTAGTTGACAAAGAAATTTAAAGCTTCAATATCAGCATCATTTCCTTTGTCGGTTTTGTCGGCACCC:1 + chr3L 25333145 3' - 1360 204 1 66.90 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATG:1 - chr3R 8051165 3' - jockey 4785 1 82.35 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGTGGCATGTGCTGGGACTTCCGAGTGCGATGCGATTCTCAGGGGAAGATAAGCCGGTTGCCGCCGATGCCATTGGACCCGGCTGCTCGCTT:1 - chr3R 20818303 3' + 1360 3379 2 72.80 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTCTCCTTCAATCTGTTAAAT:1 - chr2L 18549805 3' - roo 8703 2 57.53 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTTTGATTTTACATTGTTTTATTGTTATTATTTTGTTG:1 - chr3R 21187896 3' - roo 83 2 76.71 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACCCTAGCAA:2 + chr2R 11159386 3' + roo 9046 1 67.12 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCC:1 + chr3R 4805695 3' - 1360 70 1 66.44 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGAGTGGTCGGGAGTCGCGAGGCGACGAACATGTTCGCTGCTCTGGGAATCT:1 + chrX 1135389 3' + P-element 2818 1 38.36 GCTTATATATATAGATACATACAAACAGAGATATCCGGACACATATTTACATGCATACATACATACCTATATAAATATATACATATATACAGATATACATATATATATATGTACATATATACATATATAC:1 - chrX 5802868 3' - 1731 101 1 49.23 ACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAATAGTAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATATTTTTGTTTTTTTTTAATCTAAGATACTATTTATATATATTGGCGTAAAACACGCCAAAAAAGAGCGTTACGGAAGTGG:1 + chr2L 18896747 3' - Tc1 1540 1 44.76 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGA:1 - chr3R 25709768 3' + hopper 1356 1 58.62 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGATTGGC:1 + chr3R 16157398 3' - pogo 12 1 68.87 ATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTG:3 - chr2L 20821166 3' + Burdock 6382 2 61.64 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATAT:1 + chr3L 9809314 3' + 412 7506 2 69.23 TTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACTTG:1 + chr2R 7244891 3' + diver 6031 2 71.72 ATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTGGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGCGGGTCGTTCCGGATCATAGTGGCTTTTTTTATTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTT:1 - chr3R 29477654 3' - Doc2-element 392 1 49.31 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAG:1 + chr2L 15076215 3' - 1360 49 1 51.39 GAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGAGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGCTGTCGGCAGAGTCTCGTTACTTTCGACACTTGTGTCGTCATCAGATTGCGCTGCCAG:1 - chr3L 10683214 3' - ZAM 8136 2 53.45 AAAAGAAAATTTTACAAAAAAATCTATTCTTTCTCTTCATGCAAATTAGACGGGTTATGCAATAACTTTAGTATTAAAAGCGCCAGACGGCCCTCTTTGCCTTGTTGGCTAGACTTTTATTTCATTATTTATTGTTTTTTGTGTTT:1 + chr3L 18942904 3' + HMS-Beagle2 394 1 56.16 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAAATGAAAAGTTCAAAAATTACTTCCCA:1 - chr2R 5151192 3' + roo 399 1 73.60 CAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACG:2 + chr3R 1844826 3' - Cr1a 194 1 75.34 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTC:1 + chrX 13490757 3' + 297 6923 2 61.64 AAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAA:1 - chr3R 9557521 3' - G2 3034 2 56.16 GACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTGGTTTTTTTGGGAGGAGCAGCATCCTTACGTGGGAGGAGCAACCAGTGAGCCAGATATTTGTGCCGCCACACG:1 + chrX 5176273 3' - 17.6 7273 2 60.96 TTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTG:1 - chr3R 11186510 3' + BS 5059 1 58.22 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGT:1 + chr2R 21410983 3' - Burdock 6183 2 52.74 GTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCA:1 - chr2R 12472041 3' + transib2 2743 1 72.41 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAGGTTGTAA:3 - chr3L 25406595 3' + 1360 3387 2 60.96 TTTCTGACACTTTTTCATCATTTCACTCACTAAACTTAAATACAACAATAATAACGTAAAGACCAGGGGCAAAGTTTCCTAAACAGCAACAGCAACCGTAACGACAAGCTGAACTAAAAGAGATGAATGAAAATGCTAGCGAGC:1 + chr2L 6730857 3' - Tc1 1581 1 69.44 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAA:2 - chr2L 4003680 3' - mdg1 57 2 57.53 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTT:1 + chrX 10319725 3' + mdg1 378 2 55.48 AGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTG:1 - 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Quasimodo 148 2 62.07 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCCACAAACTTTTTGCAGCTTTTTCCAACGCGACACTCGAGCTAAAACGCTCAGCGTGAGAGCCAC:1 - chr3R 13875037 3' - P-element 56 1 45.89 ATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTT:1 + chr2L 20640302 3' + Stalker4 256 4 60.00 ACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAACACAGACAATTCTATTTGATTAAGAATCATTTATGGGTTTACCGCTCCACTGTCAGCCCCTTATTACCATCCCACACTCATTAA:1 - chr3L 8530410 3' + I-element 5172 1 62.41 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGC:1 + chr2L 13556464 3' - transib2 39 1 53.42 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATATATGTCAAGCAAATATTTGAGCTGAATAAACTGAAGCGGCACTCATTATGTGCAATACTTTTTGCATTATTTGCCAGCGTT:1 + chr3L 5533059 3' - roo 32 2 63.01 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATATTGTTTGTATGTATG:2 - chr3L 22723801 3' + HMS-Beagle2 7170 2 72.60 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGA:1 - chr2R 9871053 3' + roo 327 2 76.55 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTCTGACGAATGCAATTCCTTTACTGCG:1 - chr3R 11810610 3' - roo 8701 2 58.90 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTC:1 + chr3R 24381401 3' + Juan 4159 1 56.85 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTCTGTTCGGTAATTAGCAAATGCAAAATTACACTGTGCACTATGACAAATAGAAG:1 - chrX 2814247 3' - FB 67 1 63.70 ATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAAT:1 - chr3L 27356064 3' + Tc3 1653 1 55.48 GAAGTGNTTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTGTAGGAGTTTGTTATTCGTTAGTAAATGATGTGCACAGTTTGTTGCGGTCGAATTGCATATTAGATTTAATGCGATTTGCATTCGCCGCTGCCTGCATCG:1 - 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chr3R 17077125 3' + roo 319 2 80.14 TTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCCACAATCATTGCCCATACAAAAATAAAACACTTGTAGAGGTGCAGAGAAGCCAAGTGTAGCAAAACCTTTTCATACTGTTACGTTTTT:1 + chr2L 13284170 3' - 1360 499 1 53.79 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGAT:2 - chr3L 5532943 3' + roo 332 2 72.60 GATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATACCTAAACAC:1 + chr3L 23940561 3' + Cr1a 4404 1 74.66 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATG:2 - chr3R 29084876 3' + 412 7495 2 50.68 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTG:1 + chrX 9410558 3' + I-element 5289 1 62.07 AAGCTGTGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATATCGGATTCGGCAGCGGATGTTTTGAGAGCAAATATTCGATACTATCGATAGTATCGTTTTTTGTACGTAACTTTAAAATAATAAAAATATTAGCAATTTTAAATATTTT:1 - chrX 21963453 3' - Quasimodo 6951 4 63.01 TATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTC:1 - chr2L 10156120 3' + hopper2 1536 1 67.12 ATAACATTTATTTAATTTTTTTATTTTGTTTTTTGAATGATAAAAAGGAATTTATATATTCATTAGTAAGAGACTGATGATTAAATTTAATTCGTTTTTAATTAGCCCCATAACAATTACGCTCGACCAGTTTCGAAGGCAACAAG:1 + chr3R 6885950 3' - HB 325 1 61.64 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATAATACATATGTATATATGTGTGTGTGTGTTGATGTGGATGCAGCGGCACGCACTTTTTCAATTTCTTATCGCTTT:1 + chr3R 22590603 3' - rover 6988 2 59.31 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGCTCTGTTCTGTGGGTGGATTTCTGAAGGTCCCCGATGTGGGGTACAATGTCGTCGTCTACAGCGAGTGC:1 - chr2L 16058662 3' - jockey 4830 1 52.74 AATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAG:2 + chrX 21994029 3' - McClintock 25 2 67.81 AGGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTAT:1 + chr3R 14860268 3' - BS 5013 1 72.60 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTTGAACATTTTTC:2 + chr3R 19992755 3' + hopper 1375 1 58.90 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCCCAAAAATGACATAGCCACTATTTA:1 + chr2R 6965597 3' - Transpac 4969 2 51.37 ACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTTTTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAAT:1 + chrX 14395049 3' + Porto1 4556 1 78.15 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATATTCGCATTAAAAAAGAAATGATAATAATA:1 - chr2L 9782017 3' - P-element 9 2 79.31 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGTA:1 - chrX 15357620 3' - hopper 24 1 65.73 TATCATAATAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATG:1 - chr2R 3275417 3' - gypsy9 51 2 46.58 TCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATA:1 + chr3R 16533714 3' - X-element 4411 1 35.62 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGTCCTTGAGACGCATTACCCAGTTACACACACACTGTCACAACCCACCCACACAAACACTCATACACTA:1 + chr3L 22128578 3' + hopper 1394 1 63.79 TTTTCAAATAAAATGGAATATAAAGGTCAAGGTATACTTAATATCTTCTTTCCTCTTTCTTTCGTTACCATGTTGCTTTTGCATTATTATCATAACTATGATCATTCTCCATCACACACATATACTCGTACATATATAAATATTGC:1 + chrX 14585609 3' + transib3 259 1 65.75 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAG:1 - chr3R 27160071 3' + 412 7479 2 65.52 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATA:1 - chr2L 15936777 3' + copia 5085 2 65.75 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAAC:1 + chr2R 11164503 3' - roo 63 2 65.07 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGA:1 + chr3L 27391421 3' + 1360 3365 1 64.14 GTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAACGCGGTCATTATTTCGTCCAGTGTACCTCTCGAGATGGCATGGCGGCTGGAGTTCAACTGAAAGTTGGGTTCTAAAAGGCATAAGCAGAGCAAATAGTTATTAAAAG:1 - chrX 11458194 3' - flea 232 2 77.46 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTGGCTGGGCT:1 - chr3L 12315691 3' - transib2 30 1 65.07 GGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTCGTTAAAAAGCAACCGAAAAGATGCGAAATAAGAAAATATTTTTTAATTCGATTTGATATTATTATCGGG:1 + chr3R 13670068 3' - Porto1 310 1 52.74 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTT:1 - chr2R 20802569 3' - mdg3 5313 2 58.33 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAG:3 - chr3R 6419860 3' + Tabor 406 2 74.66 TTGGAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGGTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCGTATAAGGTGTAAAAGTAAGACAAATTATT:1 - chr3R 4679401 3' + hopper 1403 2 71.92 AGAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACGGGAGTACTCCTTGTCTAGTTAGCCCCTGTTACTTGGCCTTCGTATTGGACGGTATGTTGGTG:1 + chr2R 1956820 3' - Rt1a 4837 1 62.99 AATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGCGGAGAACCAGCAGAAGAAGAGGAGAAAGATTTTTATTATATTTATGCGAGTACCAGTCGGAATAATAGAAACAAAA:1 - chr3R 9230113 3' + blood 7177 2 77.10 AGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAA:2 - chr3L 24213788 3' + invader2 162 2 76.03 GTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTT:1 + chrX 14722202 3' - diver 67 2 61.64 CTTTTCTTCATTTTACTCACTACTGATATATATTTTTTGATGAACTTAAATATGAAAGCTGCCTTTCTTATCTTATCTATAATATATAAGAAGGGTAAGGGTAATTTGAATACCCTTTCAAGGAAAACAGATGACCAGATGGCCA:1 - chr3R 13945873 3' - Tc1 1571 1 69.66 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGAGGAATTTGGTAACTATTTTATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTACTCATTAAGTGTTTGGAGCTGC:1 - chrX 8092365 3' + pogo 2059 1 56.85 AGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTTGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAA:1 + chr3L 16470339 3' - jockey 4760 1 74.66 TCTCGCTCTCCCACACAAAAACTTAAGTTCTGAGCGGGCCGACTGCTTTCATACGGTACATTTAAGAAGATGATTGCATGTTTTGATATTGCGTTTTTGTACAGAGACCCGAAAACCGTTAAATCAGTTCCAACAACAACTGTTAT:1 + chrY 20637 3' + Cr1a 309 1 68.49 TCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGCTTGAACTAATGCTATTTTGAGTGCAGGTCCCCAATATAATGTCTTAAT:1 - chr2R 10131330 3' - jockey 4752 1 66.44 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGC:1 + chr3L 6447128 3' + transib2 2767 1 56.85 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGTCAAATGTCGGACACTAAGAAA:1 + chr2R 19199757 3' + hopper 1381 1 44.19 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCTATTTACTA:1 - chr2R 7090620 3' + I-element 5310 1 52.05 TGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAA:1 - chr3R 9557544 3' - G2 3057 1 71.92 TAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGCAACTAGTATATTCACACACAGCCGGCTGTGTGTGCGTGCTGTTGGGCGCACCGTG:1 - chrX 3175145 3' + hopper 48 1 50.00 TCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAAGCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATCAGTCAGCAAATTTCATTTTCACAATGCTGGGAAATAACTTCAGCATAAAGCTTTTATCCTAATCATAACTTAAAGTTCAAAAAGTTCAAATCAAAA:1 + chr2R 1579751 3' - Tc1-2 1259 1 67.36 TATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGCCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTT:1 + chr3L 19350012 3' - 1360 3258 1 57.53 ACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTACTTTGTCTTATGGAAAAGGAGAAAATAGTTTTGGTGAGTAATTTTAAGGTATAGTTGAGCGATGACTTGGTATCCAGGAAAAATAAGTTTAATTAATTATCTCAT:1 - chr2L 18563908 3' - TART-A 13145 1 46.58 ATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCA:3 - chr3L 16973389 3' + S-element 109 2 71.23 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTTGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTG:1 - chr2R 8099121 3' - jockey 4802 1 55.48 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTCGCGGAAAGCCGGCAC:1 - chrX 8437628 3' + P-element 2852 1 62.33 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAAAGCACTTGCCAAATAAATAAAAGTCAATAAATTGTTGAAAAGATAAAAGCATTTTGCTGTT:1 - chr3R 24381251 3' - Juan 4116 1 78.08 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATATATACGAATGTGCACACGTGCATGTGGCAG:1 + chrX 9950627 3' - jockey 4677 1 70.75 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCAC:1 + chrX 10521745 3' + Tabor 439 2 51.37 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGTAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTT:1 - chr3L 13365763 3' - BS 5072 1 69.18 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGNNNCACNNNNNNNNNGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTA:1 - chr2L 4063812 3' + roo 9034 1 51.37 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGATAATAACATTATAGCATATGTATAATATCATAAGTATTATTATTTGCTTATATTTTATAAGATCAATGAATTCAATTTGTGTGCCATAA:1 - chr3L 8673271 3' - I-element 33 1 57.53 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCATTCTATACAAAGCAAAATCGAAAGGAAAGCAAT:1 + chr3R 31886916 3' + hopper 1412 2 62.50 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTGTTGTTCAGCGGCTAGCAG:1 + chr2R 7090769 3' - I-element 9 1 77.21 GGTTCTTTTTGTTTTTGGGAACTTGCTGCAAAAGCGCGCGAAATGAACTGTGTGAGCTCTTGTGTATGCCGTGAAACGCCATTTGCGTTCCACAGAGATATCCGTAGGGAAGCCATTATGTGTCTCGCTCCGGCGGAAGTTGTCGT:1 + chr3R 30848973 3' + Tc1 159 1 54.79 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATT:1 - chr3R 26504184 3' - HMS-Beagle 25 2 67.14 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAGTCCGCTATAAAGCTTTTATCTGAGAGTTTGGTTT:2 - chr3L 22960397 3' + Tirant 373 2 66.44 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAA:1 - chr3L 10731774 3' + 297 6912 2 65.52 ATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTGTGAGGTGTTTGTCTAAAGTAATATTTTTATATCCTAAGTA:1 + chr2L 172356 3' + hobo 2589 1 71.92 ATATACACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGACATACAAGTCGATATAGTGACAGATTACTTAGCCATATCAGTCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCGCTCGACCTCTGAGGCATCGTCACTCATTAGCAGGCGAAATGGCTTTC:1 - chr2R 22464568 3' + Helena 1208 1 76.71 AATTATTTATTTATTTTTAGAAGCAATTGTTATCAACGCTCCCAAAATGTTTAGACTATATAGTTACTATGATTGTTTATTTTATGAATTTTTATGGGTGTATTTTATGAATTTTTATGTGATGGTAAGTGTCAAGCTGGTAATTC:4 - chr3L 8809276 3' - mariner2 829 1 73.29 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAAA:1 + chr2R 3563203 3' - Transpac 4928 2 70.37 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTATGT:1 - chr3R 12115223 3' - 1360 14 1 70.00 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAAATATTTAGTT:1 - chr2R 21410834 3' + Burdock 227 2 64.83 ATTGCAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTTCAATATACGTTTTCGTAATATTAT:1 + chr3R 4683012 3' + Burdock 218 2 60.27 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTCCCTTT:1 - chrX 4341227 3' + roo 9043 1 65.07 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGGCACTGCTCAAGTATTTGCCGACATGTGCAAACACTGCGAGGCCAATTTGCATTATAA:1 + chr2R 19941636 3' - hopper 39 1 52.00 CCAATATACCAATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTG:1 + chr2R 22989662 3' + hopper2 1541 1 67.74 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATT:1 + chr2L 20266040 3' - roo 8722 2 59.03 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGA:1 + chr2L 2527722 3' + hopper 1350 1 60.96 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAA:1 + chr3L 18931048 3' - I-element 70 1 63.70 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATG:4 + chr3L 7889668 3' + roo 9020 2 53.42 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGTT:1 + chr2L 11257139 3' - rover 34 2 63.01 AACTCGGCCATCCTGACTAGCTGATCCCCTGATCATGGTTTACATTGATTGCTTAGTTGTACACTTTGGTTTTAATTATTTGTATATCTTAATTTGCTTCAGCAATCAAATTGTGGTCTATTAATTAATTTTAAGATACATTCCTA:2 - chrX 3651837 3' - invader3 5166 1 63.01 TTATATTTGTATTTAATTAAATTAAAGGAAGTCATGCAAACTTTTGATTTTTTTTAGTTTGCCAACGGTATTTTTGCAATCGATTAAATGCCATCGCCAGCTGAGCGCGCTTTGTTTTTTTTGCACAGCATTTGCGAAATTCTATT:1 + chr2L 3160006 3' - transib1 1942 1 81.51 ATGTATGTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAA:2 - chr3L 23583099 3' - 1731 97 1 54.79 AACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCAATCTGCACTTGGGTGGATTTCAGGTGCCAACTTCCCAAATAAATTAGAAGACCAACGTTATTTGCTCGTGTCCAAAC:1 - chr2L 23048313 3' + McClintock 98 2 53.42 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCGAATCTA:1 - chr3L 11326662 3' + pogo 2048 1 57.53 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAACACGAAAAGCAGGAGAAACGCGTTTAAAACGCGCGCCGC:1 + chr2L 4180532 3' + jockey 4978 1 51.28 GCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTCGTCCTTCGCTTCAAGAGCATTTGTTGGTAATTTGCAAATCGCCAAA:1 + chr3R 31650175 3' + I-element 4885 1 67.81 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACG:1 - chr2R 3338789 3' - Juan 65 1 60.96 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAA:1 + chrX 15357759 3' - hopper 21 1 60.00 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCTTTGAAGTCAATTG:1 + chr3L 10731904 3' - 297 6611 2 59.59 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGC:1 + chrX 18336652 3' - mdg3 64 2 71.67 TGTAGAGCAAGACCTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTCTGTTTTATGTCTGCGTGCTGTAGCTTTTAATTACCGAATTAAATGCGGAAATT:1 - chr2L 18330334 3' - F-element 4223 1 61.64 AAGGCTCTTTTAATAAAAGCCATATTAGTTCCAACACTGACCTACGCCATCCATGTGTGGGGGAGATATATAAATTAACTTATTTTTATTCACATCGATATGCGAATCTAAAGATAATTAGTTTATGTCGTCTAAAATGATTCCCA:2 + chr3L 25877477 3' + G5A 2392 1 58.22 AGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCAAGAAGATAGACGCGATATAAAAACAAAAACATCGACAAGCCGTAAGAAAGAAATGTCATAAAACTTATTTACTTAGCACCTGCGAAACGGTCCTTGCAGAAGCCAAAGTC:1 - chr3L 18957872 3' - Cr1a 4401 1 54.79 TGAGTGAAGGAAAAGAACCATCAAATGGCACCAAACAATAAGAGGGCAGCACTAGTTTTGCTATCCCCGATTTCTAACCGTGTACGCACTTGCATCCGACATCC:1 - chrX 19848590 3' + invader2 352 1 58.65 GCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACCAGGAGAAATTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAGACGATCTAAACTGGAGGTAAAGAAGCAGGTGAAGAAGGAGATCGCTAAAACGC:1 + chr3R 7063757 3' + TAHRE 274 1 54.11 TACTTATATATATATATACATATAGTAAATCATAATTCTTTTGAGTAGTTTCCCACCTCGATCATTTTTAAAGTTCAGGATGCATTTTTTGGGGTCATATTTTGGGGTTTTCACATAATTATTTGTATTAAGGCACTAATATAAAT:3 + chr2L 9463929 3' - 1731 4414 1 81.51 CTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCAT:1 - chr2R 10417157 3' + 1360 3340 1 68.18 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAATACCAGCGAACAGGTAGAACGCCACGCCCCCCCCGCCGCAAACGCCCACTTTTTTGGGGTGCTGCAGCGAATTAACAACTCCAGTGGCT:1 + chr2R 16928871 3' - jockey 4807 1 67.19 AAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGGGAAAGCGAAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATGGCTGTGCGTGAAGCGGGCTATAAACA:1 - chr2R 11184259 3' - Cr1a 383 1 78.08 TTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACTGTTGGCGCCACA:1 + chr3L 24934437 3' + HMS-Beagle2 289 2 71.92 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTTTTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGATGTCCCATTCAAAATAGCCAAAT:1 + chr3R 21933268 3' - pogo 13 1 71.77 AGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATATATATTTAATTGTT:2 - chr2L 16539593 3' + Juan 4212 1 83.56 ATAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGGCTAAATTTAAGGATTATAAGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGT:1 - chr3R 6419809 3' + Tabor 477 2 73.02 AAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGAT:1 + chr3R 24729646 3' - Juan 4158 1 71.92 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGTCTTGGGCAGTTTTC:1 - chr3R 4460981 3' - blood 16 2 72.66 GAATATATATACATACATATATAGTATGTCTGTATGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTGACAATAAATTCATTTTGTCTGTTGGC:1 + chrX 11541622 3' - 1731 4411 1 41.78 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAACTGAAGACTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCAC:1 - chr2R 6885525 3' + P-element 2820 1 34.85 AATTGTATTTATTTAATTATTTAATAATTGCTGGGGAATATATTTAAATTTATATTATATATAAAGATGTGTGGATGTTATCCTAGGTACGCATTTTTTGAGCATTGTGAATTTG:1 + chr2R 22285909 3' - HeT-A 32 1 65.22 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTTCGGGTG:1 + chrX 18239426 3' - jockey 25 1 58.82 GTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCAACAATATCACCTCTGCACCCGTGTGCCGTGTGTAACCCCGCACTTTCACTCCAAAATATATATATAAAAA:1 - chrX 13599537 3' + mdg1 7040 2 52.05 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTT:1 - chr3R 14980309 3' + roo 9044 1 56.25 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCG:1 - chr2L 17205167 3' - hopper 53 1 52.74 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTC:1 - chrX 14722124 3' + diver 147 2 68.49 CCTCAAGGTGCCCAAATTATGCGACAAGCTCCGGAACATCGCCCAACAATATATGGAAAGGTTTAATGGACA:1 - chr2L 10802853 3' + jockey 4603 1 83.33 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAAA:5 - chr2L 18226762 3' + roo 358 2 53.42 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCCGAAGCGCGTCGCCCTGCAGCCGAATCGAGCCGAAGGG:1 - chr3L 3983797 3' - P-element 56 1 43.36 GTAAATAAAATAAAATAAAATAAAATATAACGTAACGAAGCGAAATGTTTTACCAACTACTCGGGCGACACGGCCAGCCAGGTGGATGAGCACTTTTCCCGCGCCCTCAACTACAACAACAAGGATTCTAAAGGTAA:1 + chr2R 12893034 3' - transib1 1899 1 61.31 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTAT:1 - chr2L 15550659 3' - Bari1 17 1 64.08 GGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCGTTTTGTTTATTGTTTTCCTTTTCCCTTGTTTCTTCGGCGGCGGTTTATGGCTCCTGTTTCC:1 - chr3L 19898814 3' - Porto1 255 1 67.16 GTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTTGGTCTACCCGCTGGATGATCTCCAAATTAGCCATACGG:1 - chr3L 17413556 3' - Stalker4 137 4 73.29 GGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTAT:1 + chr2L 21403571 3' - G5 4429 1 50.68 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:1 - chr2R 981626 3' - 1360 78 1 75.44 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACG:1 + chr3R 25428242 3' + 297 322 2 72.22 TAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTTGGTGTCTGGCTTTGGGAATCGAGCGGGCACCATAA:1 - chr3R 10523706 3' - F-element 395 1 78.57 ACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATG:1 + chr3L 3501821 3' + Bari1 1649 1 58.22 AACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAATAACATAAAACAAAAAAGTATCTCAGAGATAAATGAGAGTTCAATGTGTTATGAGTGTACGATGGCTTTAGTGGGTTACCAAACAACAGCA:1 - chrX 10535611 3' + I-element 72 1 66.44 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTG:1 - chrX 8308422 3' - roo 8744 2 76.43 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGT:1 - chr2R 18316051 3' - HMS-Beagle2 6963 2 71.03 CACACACACACAAACACAACCAAATAGAACAAAGCGATAAAAAACAAGTTTGCCAACTAGATTAACTAACTAATCAAAGAACTACGTGGCATAGAAGACTATAAAAGGTCTGAAGACCTTTAACTATGTAAGAAATTTAATGAATT:1 - chr2R 10060532 3' + Quasimodo 42 2 63.70 CCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGT:1 - chr3R 19449946 3' - roo 400 1 59.59 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGGCGTTTAAAATATTTCTTTGATGGATCAAACATTCAGTATTTAAACCTATTTG:1 + chr3R 20167699 3' - roo 40 2 53.42 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCC:1 - chr2L 17180052 3' + Juan 4175 1 57.53 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAAACCAGAAAGTGACAACAGC:1 + chr3L 2146003 3' + roo 9039 1 57.69 ATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATACATCTACATCTACATCTCCCTCCTGTTTTCAACTGAATCGTATCTCCTCTATCCTTCCTATCAGCCCCTTCTTTTTGTAATTATCGCATG:2 - chr3R 8836439 3' - mdg1 39 2 47.95 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATC:2 + chrX 8200307 3' + flea 203 2 54.11 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTGGGTTTGGGGGTTGGGGCTCACTGCCCTGCTTAATCAGAAATTATTTGAAAATGTAAAGTCGACATG:1 - chr2R 20348912 3' - transib2 18 1 70.55 ACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATAC:1 - chr3R 19224987 3' - HMS-Beagle 57 2 57.53 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGC:1 + chrX 9950589 3' - jockey 4755 1 74.66 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTT:1 + chr3R 23639258 3' + pogo 2063 1 51.82 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCGTTTTT:1 + chr3R 24219353 3' + roo 9004 2 66.18 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACACTGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAAGTCAACTTAAGCTTTCTCTCTCGTTTTAATGTCTGGATGGGAGGATAAAGGATGTAGTAATGCT:1 - chr3L 23906341 3' + 1360 3364 1 67.12 GAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGGGGGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTC:1 + chr2L 15936832 3' - copia 93 2 77.93 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAATGCTTTTTTAACTTGAAAACCTAGAA:1 - chr3L 9809214 3' - 412 28 2 65.07 TTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGA:1 - chrX 3431876 3' - Ivk 5376 1 59.59 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAACTGGTTTTG:1 + chrX 8437770 3' - P-element 27 1 62.31 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCACAACTCGAAAA:1 - chr3L 7889504 3' - roo 7 2 78.77 TTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGTAATATGCGACATATAATATAAGCCAGCCCAGGGTTGACAGGTTCTGTCAAAAATTCTAATGCCGGTTGGGAACTTTT:1 - chr2R 1638646 3' - HB 398 1 77.45 ATTTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCC:1 - chr2L 8338142 3' - P-element 91 1 23.45 AGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAGGCCGAGCGAATCTGTGCGAAATGACCGATGAAGTGAGCGAAGCGGGAGAAGAGCAGGGATCCGGAAACTGG:1 - chr2R 24459583 3' + jockey 4586 1 50.68 GGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGGTGTGTGGTAGCAAAGTTTTGGGGCATTTTAATACT:1 - chr3L 5061517 3' + 17.6 7384 2 62.33 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTGCGCACCTGTCTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTCTTAACCGTAGTC:1 - chr3R 9595010 3' + Tirant 8437 2 67.81 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGTTTAAGAGTTCAGTATGTTCCGATCGCAGGGCAAAGTATGGTGCCATAGTTCTCCACAAACCTACGTACCTGGCACACAGAGAAAA:1 + chr3R 4964221 3' - roo 35 2 59.59 ATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATACAGATTGCTAGACTATTTCCTCGCGAACGGTAATTTTTATGGTCCTGAGCAAAA:1 - chr3L 2661519 3' - gypsy12 10101 2 64.38 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGAAATACTTGAGTTTTTAGAAGCAAGGTCAGCATA:1 + chr3R 4805751 3' - 1360 14 1 76.03 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTAC:2 + chr2L 13556451 3' - transib2 52 1 52.74 TAAGTGTTTTAAAAATAAAACAGTAGCAGTGCGGAAACTCAGTTAATGGAATATAACCTAAAATAGATGAAGGCCAAAAAGAAATGGTCCAAACAACAATGAACACATG:1 - chr2R 18142288 3' - Stalker4 407 1 74.31 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTG:1 + chr3R 18488451 3' + roo 331 2 74.66 ACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCAATTAAAAAGAGGTAAAAAAGCGAAGA:2 + chr3R 6461292 3' - S-element 1477 1 80.82 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCATGCGCTATATGGGCTAGGCGGATGCGAAAATAACACAATGAAATTTGCACCCGCGACAGGCATTTTGAATTCAAGTCTCCGTTTGATAGGCCTTTAACGAAG:1 + chrX 585773 3' - Tirant 10 2 78.20 GGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTGCATCTATGTAAGCAGATTTCTGTGTTTTTATTATCTTCTGGGATTTACTGTGCTTCTTGAATCAAATCAG:1 - chrX 3391134 3' + Circe 7220 2 58.22 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCCCGTAACCTGAAGCGTTGTCCGGCCGCTC:1 + chr3L 22400401 3' + 1360 3370 1 69.18 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCTATGGACTCCATGACGCCCTGCCGACGGCTACTGTGAAAATAGGTGTATTGCGGGATA:1 + chr3R 4860582 3' - Transpac 12 2 76.03 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCC:1 - chr2L 47098 3' - roo 8706 2 58.33 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACATTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAA:1 - chrX 19054268 3' - jockey 89 1 71.23 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTA:2 + chr2R 4785348 3' + Juan 4177 1 58.90 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGG:1 - chr3L 18281871 3' - Doc 70 1 70.80 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAAT:2 + chr3R 11062828 3' + roo 342 2 60.27 TCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAAGTTATTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCA:1 - chrX 13231968 3' - BS 4848 1 77.40 CAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACC:1 - chr3R 28042955 3' + Stalker2 7572 2 71.23 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGT:2 - chrX 2214236 3' - jockey 4805 1 54.11 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAAAGCACTTGCCAAATAAATAAAAGTCAATAAATTGTTGAAAAGATAAAAGCATTTTG:1 - chr3R 24381256 3' - Juan 4121 1 74.66 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATACTCAGTGCCAGAGACGTGGAAATATTAATGGTTAATATATGTGGTTGGCTCACATAGTCGTTTACAATAATTAAAA:1 + chr3L 20806896 3' - HMS-Beagle2 8 2 77.39 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGT:1 + chr2L 22674859 3' + mdg1 7379 2 74.83 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACCCACACTTTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTGGTTGGTTTATTAAAATCGAACTTAT:1 - chr2L 20265941 3' + roo 358 2 56.82 GGGCGAAATCAATTTTGATCTATGAAACGAAGTTAATTACTTAGAGTTTTGTATAATTTCGTTTATTTACATCGACTTTGGGTCGCCTTTTATGTTCCTAATGTCGCATAAACAGTGCTTAATAATGCACTAACCTTGGCGCAACG:1 + chr2R 14816906 3' - 1360 3176 1 57.53 AAATTTAACTTATTTTCCACTTGAAGGTTAATTTTTCGGATACTTTTTGAATCCTACCAACTGCGCTATTAAAATTGTTGTTATATTTTTTTGTGCGACTTAATGATGTCGACCACTCCCGACGCGCACCACTTTATATGGGGCGT:1 - chr2L 10054179 3' - 297 461 1 65.07 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGA:1 + chr2L 17809238 3' - jockey 96 1 76.71 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATT:1 - chr3R 11186539 3' + BS 5030 1 58.90 TAATGTAATTTTTAAAATTTATTTTTTATATATTTATTTATCATCAATATCAATAGTTGATGCTTGGGTGTTTCTTGCTGTTGTTGCTTCTTCTGGTTGATGTTGCTTTTGTAGCTTTATTTTTATGGCGTACTCTTGGTGGTTTT:1 + chr3L 1281553 3' - 1360 374 1 76.71 TATGTGTGCACACGGATGCTCTAATTTTAAACATACATTTTCCAAAAGGAAGACATTACATTGAGAAATAAATATTTCATAAAAAAACAATAAGCAGTAGAAAACATAAAAACAACAACATATATAAAATAAATAAAAATATGAA:1 - chr2L 17663024 3' + 1360 177 1 61.38 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCC:1 - chrX 21216752 3' + roo 335 2 82.11 GACACGATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTAGGATAAATAAAGTTTGATGTGGTGAGGGCGGCGTACTGCTGACCCTTCAACAGAGTATTGAACAT:1 + chr3R 12366462 3' - GATE 8152 1 60.96 CAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTT:1 + chr3R 14860223 3' - BS 5054 1 59.15 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGGGTTTCGGTTTTCATTTCATTTCGCCAAA:1 + chr3L 21327216 3' - copia 4888 2 72.60 TGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAACCGAAATAATGCAAATTAAATTGTGCGAAAAACACAGAGTTTGGGGCAACGA:4 + chr3R 17996331 3' + diver 226 1 65.75 GAGATTATGCTATCTTACGTGTAAGATTTCTGATGTTGCATTTCTTTTTGTCAGGGTATCGAGTCCTATTATTGGTCTAGAAGAAGAAAGAACTTTATTAAATATTTTT:1 - chr3R 2449071 3' - G5A 2713 1 77.06 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCC:1 - chr2L 8338142 3' - P-element 84 1 24.64 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGA:1 - chr2L 13556316 3' + transib2 2786 1 59.59 GGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCCACTGCTAAGACAGCCTGAGCAGATCAACATGTTTAAACGTGAAATGTACATTGATATATAAAAGATGATGGTACATACTCTTAGGC:1 + chr2L 21083593 3' - Doc 4520 1 62.33 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTCCAAAAACTTTAATGGGT:1 - chr2R 21116473 3' + mdg1 7405 2 57.53 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACATTTAGAGATTTTCTTTTTTCCCGAATACA:1 + chr3R 18093433 3' - I-element 4 1 80.14 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGAGTTGGCATATGAACGCACTAAA:1 + chr3L 10373894 3' - 297 6639 2 73.91 AATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGGGGGTTACGAAGGGGACACCTCTATCTTATCAACACTAAGAAATTGCTTCACAGCTTGACACAGCGTTTTTATTTAATGGATAGCTAA:1 + chr3R 21629382 3' - I-element 5012 1 56.16 TGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATAAAAATTTCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTACGCT:1 - chr2L 21936064 3' - INE-1 20 1 44.83 GTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACA:1 + chrX 4808582 3' - mdg3 5344 2 78.08 TTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTTGCAATTTTAAAGTTTACGAAAACTTGAAGCGTAGGTATATA:1 - 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chr3R 19450056 3' - roo 8646 1 56.85 GATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGC:1 - chr3L 23249385 3' - rover 60 2 57.53 GGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGCAACTAATTTATAACAATTTTAGAAACATCAAGGAGGTACAAA:1 + chr3R 19515826 3' - mdg1 343 2 68.31 AGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGG:1 + chrX 23182917 3' - Idefix 66 2 66.21 CGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCATGGCTCTAGAGATGAGTAATTGCGACGATTTGCCGGCTCACGT:1 - chr3L 872658 3' + 1360 30 1 59.49 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTG:2 - chr2R 3564048 3' - Tabor 6906 2 60.96 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGAGA:1 + chrX 8308490 3' + roo 9006 2 66.43 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGGTTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCG:1 - chr3R 4682895 3' - Burdock 63 2 64.75 TTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGAACTCTTGAACTGTA:1 - chr3R 12242280 3' - transib2 85 1 78.62 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCA:2 + chr2R 23780609 3' - Ivk 65 1 59.59 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAG:1 - chr3L 10731764 3' + 297 344 2 57.75 AATTGTTCGCTTTTCGCGTGTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTTTGTCTTTGCAGCCGGAAGACAATTTTAAACTATTTATTTGATCACTTGAAAGTTGATTTTGTTGTTGCCCCATAGGCAGATGCTGAACTGTTGTTG:1 + chr3L 19017049 3' - HeT-A 190 1 70.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTG:1 - chr3L 5389877 3' + roo 9047 1 57.29 ACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAATCAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGCGCGATTCT:1 - chrX 22641694 3' + G6 1984 1 50.68 CAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAAGGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAACATAGTCATGGGCCAGGCAATGGCGGTGAAGACTAAGCTTAGATAATCGCAGGCGCACGAAAGGCATGAACA:1 + chr2R 20449159 3' + Bica 431 1 60.00 TAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGTGTAGTACAGTGCAGAGTAGCTTTAGTGGATTAGCCGCCTTGAAGTGTGCCCTGCTTTTGTGACCCGTGTT:1 + chr2L 5363228 3' + G2 2849 1 65.25 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTA:1 - chr2R 24427525 3' - jockey 4696 1 68.49 ACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGGGTGGAATTTAAACATACAAAAATAAAATGACAAACGCGAGAAGCAGTCACAAAAACGAAA:1 + chr2R 20616485 3' - 297 401 1 51.20 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCCAAGTCGCCCCC:1 - chr2R 22034625 3' + copia 239 1 68.25 AGCTACTTTGGATTTGGAGACATGGTACCGATAGAGGGTACAATAAATCATTTAGAGTTGGGTGTTTGTTATTGATAGCCGTGAGTTAAATATTTTTTAAATCCAAATTAAAAAAGAGAGTGAACAGAGTACTAAAGTCTGCATGC:1 + chr4 909926 3' + Bari2 797 1 72.60 AATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAACAGCCCAAGGCAAAAGCAAGGTTAAACTCCTATTGCCAACATTATTTACTTTTTTACTTTTGATAGTTATAGTTAACTTGCATTACTTA:1 + chr2R 18957683 3' + baggins 5404 1 56.03 AAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAA:1 - chr2L 17005726 3' + Stalker2 320 2 71.92 ATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCGGAGACA:1 - chr3L 22760368 3' - F-element 148 1 60.96 TTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCGCAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACTATGACTGTATACGTCAAATTGCCTGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCAT:1 + chr3R 11040134 3' - Bari1 68 1 68.75 TTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCATTTATTGAAAACTACAAATAATTGAATACACGAACTTAG:1 + chr2L 6654729 3' + diver 144 2 71.23 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCG:2 + chr3L 18931041 3' - I-element 77 1 68.49 TATAATGAAAATTTAAGTATGGAAATTTAAAATATGGGCAATTTGTATGTATGTACATACATATATTTACATTTTCCCAAATGTGTCTGTGATTTTTTTTTGTATGGAAACGCAGACAGTAGGAAAAACGTAGGCAACAAAAAAGG:1 + chrX 14014267 3' - looper1 1647 1 63.01 CGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAATGAAAATCGAAGAATAGCAGAAGCGAAAGGAAAACTCAGGCCAAATACA:1 + chr3R 20230834 3' + P-element 368 1 40.41 CCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATTAA:1 + chrX 22824262 3' + Gypsy12A_LTR 2244 1 56.25 TTTTTATTTTAATTTTAATTTTTTGTCCGTTTTTTATTTAAATACAAACAAATAAATATATACAAAAAAAAATTTGAGAAATGTACATTAAGTATACAGAGGCGAGCACTCATCCAAAGTGAGGCGAAATTCTATTTCCACTCGAA:1 + chr3R 13509248 3' + Rt1b 125 1 73.29 AGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTGGAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGTCATTGTGTCTAGGATATATCATCCATTAACCGAAATCAAATTAATTTCTTGGATT:1 - chr3L 4778073 3' + Chimpo 72 1 53.33 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGTCACTTAACCAAACT:1 + chr2R 23780613 3' - Ivk 29 1 52.63 AATAATAATAAAAAAAAAAATATACAAATGATAAAAAAAAACAAAACACGTGCGCCCTATAAACAGAAGCTGCGCGTGAGATCTTTTGCCAAGGGATT:1 + chr2L 5440364 3' + Rt1a 5075 5 84.69 ATACTTACACACACACACACACGCAAAAAAAAAATATATTTTTCGGCGAAAGTTTTTGTTTTTTTTTTATTGAATGCTAATAGTTGCT:1 - chrX 12902983 3' + Quasimodo 33 2 85.23 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAGAGTCCGCTATAAAGCTTTTATCTGAGAGTTTGGTTTGGCAGCCGCTTTCCTTCCTTA:1 - chr3L 22960376 3' + Tirant 394 2 80.82 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGG:1 + chr3R 15054286 3' + copia 178 2 80.43 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGAC:2 + chrX 8308478 3' + roo 8991 2 75.34 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAA:1 - chr3L 22400285 3' - 1360 86 1 75.34 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGTACTATGAAATAAC:1 + chr3R 25428238 3' + 297 318 2 75.00 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGGCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAATATATTTGCAAGGCACTTAACCA:1 + chr2R 23780609 3' - Ivk 65 1 58.22 CAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTACTCTTTCTTGCACATTTCCAACCGGCGAAATACATATAAATATGTAGAAGTACAAATAATACGAGAGA:1 + chrX 21045472 3' + roo 132 2 53.42 GGGGTCCTAAGAGCCAGTACATTTTTTTGGCTTTTGTCAGCTGGCTTTTGCGCCCAGTCACGCTCCTGATTTATGACCGTCATTTGCCTTTGAGCGGCTTAAAGCCACACAACTTTAA:1 + chr3L 7196288 3' - G3 4115 1 73.73 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACCAAGGAATTTAACCATACAGTAACTTTAAATGTTGAGTATTAAAAATGTCTGCCACTTTTTTTT:1 - chr3L 13836605 3' + 412 7490 2 58.22 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAAC:1 + chr3R 31264118 3' - jockey 4782 1 60.14 AGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTG:3 + chrX 12129407 3' + flea 4953 1 59.59 GAGAGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAATATGAACCGAAAACGGCAAAAACACATAATATTACAATCGGATTCGATGTGAAAGCTGCGGGCCCGAAAAGATAAACACACAAAACTTATCCGCACACAATAGAATCG:1 - chr2R 20844974 3' + I-element 352 1 68.97 TTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCTAGACTAGTGATTATGGGCGTGTGAAAGGCGATGAAGAAAGTAAGTGATTGAGTGAGTGTGAGTGGTTGTGTTTTAGCCATACCTAATTTCACCTCAATGACGTAA:1 - chr2R 7638350 3' - diver2 85 2 76.71 AAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACATCGCCATCGCCATCCTTTGTCTTTGTCTTGGGCTCTGTGGCCCTGGCCCATTGGATTTGTGTAAAGCTGTCGTGCAGCATTAAATACCCGTACTCTTAT:1 - chr3L 20045716 3' + 297 156 2 69.86 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTTCTCCGT:1 - chr2L 809622 3' - jockey 32 1 63.01 AACAAATTTGAACAAATTGTTGCAGCACTCACCACCACTACACCCACAACATCGAGCCGATTTAATGAAAGATGCAATATGGCACGATGGGTT:1 - chr3R 15942841 3' + hopper 999 2 78.49 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCACAGCCTGCCGTGTTGT:2 + chr3L 5061689 3' - 17.6 6944 1 72.60 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGT:1 - chr3R 19032586 3' - roo 49 2 55.17 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCT:1 - chr2R 13766202 3' + roo 9010 2 61.64 TAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTAACTACTTATCGATAGCCCTAATTTGGCTCGATCACTAGTCCTCACCGAA:1 - chr2R 5106208 3' - Stalker2 7257 2 79.45 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCC:1 - chr2R 16817863 3' + 412 7497 2 51.37 TAGCAATATGATAAAATAAAAAAAAATTTAAAAATTCGCGCCTTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCAGTGGGTAAAAAACTTAATACAAATGAGGCGGGTTTCAAGTTAAATCAACCAAAGC:1 + chr2R 21451809 3' - 1360 3104 1 61.64 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAAC:1 - chr3R 15724326 3' + Juan 4130 1 74.66 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAAT:1 - chr2R 5106289 3' - Stalker2 7324 2 75.00 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAATTCATAAATCGTTTGATAAGCACATTTAATTATAATTTAATATCAATCCCACTTTATTTTGATATATTTTT:1 + chr3L 24131511 3' + Transpac 263 2 52.74 TAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACTGTAAAATTTCAACTTGCAACAATTTGACGAATATGAATTTAATAATAGTA:1 + chr2R 5860719 3' + rover 6959 2 67.12 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCA:1 + chr2L 17809256 3' - jockey 67 1 61.48 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCAAAAAAATATATATATTCCAACAAAACATATATATTTTCTTATACCTAATGTTTGGTAAT:1 - chr2L 11298041 3' + I-element 5295 1 63.70 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATATACGACATGACCCA:1 + chr3R 25428283 3' + 297 361 2 62.33 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAA:1 - chr2L 47070 3' - roo 8708 2 56.16 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGAAGTGATTAATATATCGAGAGATCTGAAGGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTAC:1 + chr3L 18505755 3' - I-element 29 1 57.48 CTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTTCCGTACC:1 - chr2R 18514844 3' + P-element 373 1 67.12 GTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCAAAAATCGCCTTCTATCACAACACCCAAACATACACGAGTGCTCGTCTCTTGTGTTTACTCACACTAAAAATCATATTATATTTTAAGATTTTTAA:1 + chr3R 26658630 3' + 1360 3162 1 75.94 GCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTATGAAAAAGTACTGACCCT:1 + chr2R 12253298 3' - BS 4714 1 78.03 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGG:1 + chr2L 22674862 3' + mdg1 7379 2 73.29 ATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCGGTCCCGCCCACTTCGGCAATAGGCCGGTGCAAACGTACTTATCTGTAGTTGCCAATTATGCAACGAGCTCATTCTGTTAATGTTGTTTCAACTATTCAGTTC:1 - chr2L 21608208 3' - rooA 183 2 65.94 ACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAAAAGATTAAAAAGAATAAGATGACTAAGATGGACGCCCGCATTCTTGGGTTTTCAGTAACGGCTGCCGAGGGTCGCATAA:1 - chr4 855545 3' + I-element 4872 1 59.59 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGTGGCCCCGTTAAACT:1 + chrX 20455706 3' - hobo 75 1 69.18 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGTAAGTATAAGAAATGATATTTTGC:1 + chr3R 15325186 3' - 297 58 2 62.33 AGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCA:1 - chr2R 12779654 3' + I-element 5263 1 78.77 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTAGTAGTTACTGTCGCTCCGCCGCCGCGTGAAGTCAGATTCCTCCGAGCGCTCGAACGAATAGCACGCGACATTCGCCGGA:1 - chr3L 6964676 3' - P-element 41 1 52.74 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGG:1 - chr2R 9544863 3' + roo 8983 2 78.77 ATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTT:1 - chrX 292439 3' + G3 4497 1 73.61 CTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCCCAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTAC:1 - chrX 21639641 3' + gypsy5 326 2 74.66 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATCCATTCAGAATTAAACTTTTATGCGGAGAGGTGCTG:1 + chr3R 15807493 3' - FB 14 1 76.03 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATACATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGCGGACATATAGCCAAACATAATGATTGCAGCCCAAGAAGCATAAAATTCAAATCCCCCAGCGAAAA:1 + chr3R 27133720 3' + opus 7496 2 78.08 CATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATACGTATGCTTATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTGAATGAACCCCCGACCGCCGTCATAGCAAATTTGTCTTGTACTGTAAACT:1 + chr4 48712 3' + 1360 154 1 63.01 TATGTATATGTATAAATGTATAAATATATGCTTGATTTTGTTTCAATATCATGGATATTCCATGGGCTGTAGTGGTTGAAGTTGAAAGCGAATCTTATATTGAAATTGAAAGCGCGTTTCTCGCTGTCACTCTAAACACCT:1 + chr2L 3703183 3' + Stalker 7098 4 78.01 ATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGCGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGTGGGTACATTGTTGTGGGTTATTAACATGTGGACGGTTGGGGGTGTGCGAAATTTGTTTCCTGGGG:1 - chr2L 10408672 3' - G-element 4283 1 65.75 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCGGGTTGCGCTTGAACTATTT:1 - chrX 8360542 3' - roo 76 2 71.23 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTG:1 - chr2R 20802575 3' - mdg3 5319 2 62.50 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCTTCGTTTTCGGCTTGGC:1 + chr2L 12984256 3' - hopper 25 1 67.81 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTAAAGTACAC:2 - chr3R 19224962 3' - HMS-Beagle 32 2 66.44 ATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGC:1 + chr2L 15763107 3' + mdg1 7064 2 71.92 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACACT:1 - chr2L 12984110 3' + hopper 1365 1 51.37 AAAATAATTTAATAACATTTTTTAAAAATTTCTCGAATTTTTAAAAGTTGGCTACAGGAGAGGATTAAAACGAATTTTCTTACCCCGTATCTGAAACTATAACTAGGCTGAACTAGGCTAACACATTTGGTAATGGCAAGCAAAAA:1 - chr3R 11175994 3' + transib4 107 1 27.40 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACTGATTTCTCTAGACGCAA:1 - chr3R 21933129 3' + pogo 2055 1 57.93 ATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATGGCTATGTACGCGCACAAATATAACCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTT:1 - chr2L 22340096 3' + 1360 3166 1 61.64 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAA:1 + chr2L 12251004 3' - 412 50 2 52.05 CAACAACGCGTATTTCTCCTACGTCTCACCGATCCATGTAACCCAACCATTGGTTAACAATTGCTCGACCAAGGTAGCATCGCTTCCCTTCTACAACACAATCTACGGCAAGTTGCAGTACCCTT:1 + chr3L 14016868 3' + F-element 260 1 78.40 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATC:1 + chr2R 5151300 3' - roo 8748 2 76.71 AATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAAGATGAGCGCCGACTCTCTTTGCACCAGAACAACAGTTGGCGTAGCGAGTAGGTGTCCTTGAAAATCGGCGAAAAGTGTAGCATACTTAAGTGGGTAAAGGTTGGTGGATAG:1 - chrX 2499147 3' + Doc3-element 234 1 58.57 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGTTTTCCATCGTCCTTCGGCTGCGTTC:1 + chr2L 19924095 3' + roo 9065 1 72.60 TTTTTTTTTAATTTTTTTTTGAAGTTCTTTTGTTTTTGAGTTATTGTTGCGCTATTTGAAGTTTTTCAATATTTTCCGGGAATTTCT:1 + chrX 8449684 3' - R2-element 3584 1 77.01 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAAAAAATAAATAAAATGTTATTATCAACGCCTTTACGATTATTAAATAGTTAACCAACATGGTCCAAAATGAT:1 + chr3L 8673388 3' + I-element 5296 1 56.85 AACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTG:1 - chrY 1798753 3' + hopper 1413 2 29.69 ATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATATAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACACAACAACTACATCAATATCAAGAAATACAA:1 - chr2R 12209673 3' + F-element 148 1 73.39 AGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGAC:1 + chr3L 16470350 3' - jockey 4749 1 69.18 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATT:1 + chr2L 6647713 3' - mdg3 5332 2 69.18 TATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAA:1 - chrX 20999503 3' + BS 5036 1 58.90 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGCCCGTCTCCATGGGAAATAAATTATGGCTTAATTTAATTTGAGGTGCCTGCCCGGTCACCGCCTGCAACTGTGGCAAAATCTGTCTGTGGTTGCTGG:1 + chr3R 6607543 3' + flea 4997 2 68.28 TTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTAATGTTTTCTGCACCAACAGACTGCGACTGCTTTCACTTTTCACTCTTTTTCGCCCAGCCATATTTTTTATAGCTT:1 - chr2L 12246454 3' + transib1 1897 3 74.51 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCGTTGTTTACAAAC:1 - chr3L 12004215 3' + P-element 2852 1 61.64 AGATTTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGATTTTGGTTCCCTTTCTCGAGGATTTGGCTCCTCGTGGCACACGCAACATTTTGTATTATAAGCGCATTTGG:1 + chr3L 22144912 3' - Tc1-2 1178 1 77.00 TATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTG:1 + chr2L 22684580 3' - transib3 54 1 60.55 AGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCAAATTAAATATAGTACAATTTTACACTTAGTGAACTAAGCACTGTTTAATCTCCAGCGGGTCTCATTTTCGTCTCTGGCGGTATGAATATTGCGTGGAGCATTGGATTCA:1 - chr3L 10094157 3' - R1A1-element 253 1 76.71 ATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACATATCAATTCCGCCTTTTATATTTACTTATAAGCCATTTTTAATAAACAAATGAACTTGCTTTTTTAACTGATTAGATACACGTGGGCAAGAAGGGAATTATTTTGTTTACTTCAGAAAT:1 + chr2R 13046646 3' - S-element 1326 1 75.34 TAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGACTCGGCTATTGGTCCTGATCAAGAATATATACACTTTATATAGTCGGAAACGCTT:1 + chr2R 1461346 3' - Cr1a 4279 1 68.13 AAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAA:2 + chr2L 13556445 3' - transib2 58 1 56.85 AACAAAACAAAACAAAAAAAAAAAGCGGCAGGCGACACGAGGGGAATGTGAAACACGCTTGCATGGCAAATTTTCCTGCCGG:1 + chrX 19381543 3' + gypsy7 5004 1 85.37 GATATATTTAAATGTTTTTTTTTCACATTAGTGTGCATTAATATTATTAAAACGAAACGAGCATCGGGAGCATCGAAGTCGGGCGCGTGCATTGCATAGTTAATTGTGCAAATGTTTTCAGTCTTCAGTTGCTAGTTGGTAGTTGA:1 + chr3R 31548084 3' - Transib5 30 1 67.12 ACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTAGAACGGAATAAAGAATTGATTATAGATATTGCAACGAATTGCTTTAAAACTCTCTTTTCAAGAAAATCCAAATTTAAAGCTCT:1 - chr2L 17005680 3' + Stalker2 365 2 52.05 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGG:1 + chr2L 6103011 3' - roo 81 2 75.34 GTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTCTACTGATTAGGTTTGTTTGCTTAGGCTGAATAAAG:1 + chr3R 27136578 3' - opus 7472 2 75.34 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTAATTTTATTTTTCGCGCTCTCACGT:1 + chr2L 14074559 3' - 297 50 2 54.11 AAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:1 - chr3R 4160059 3' + invader2 195 2 53.79 TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGGTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCC:1 - chr3L 16662385 3' + jockey 4926 1 64.38 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCCGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATCTTCAGATAATTCAGACAGGTTTAAATCAATTACTAGGTTTGGTGCTTTCAATTGCCGGAAT:1 - chr2R 3563034 3' + Transpac 302 2 78.77 TAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGGGCTTGCGTGCCGTGGAGGAGCTTTGAGACAAGCATAGGATTCGGGAAAGAAGTGG:1 + chrX 513940 3' - Max-element 8334 2 74.44 GTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGGCACCGCCAGTGCTAATATCACCGAATGCATTGGCTGTGGCCAAG:1 + chr3R 10295541 3' + F-element 269 1 68.75 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTTTTAAGGAACAATT:1 - chr3R 18971659 3' + Juan 4200 1 66.44 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCGGTTGCGACGAGCAA:1 - chrX 1135288 3' - P-element 3 2 73.74 TTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGA:1 - chr3L 21655886 3' + HMS-Beagle2 7131 2 62.33 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGACACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGG:1 + chrX 661930 3' - 412 68 2 73.60 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTAT:2 - chr2R 17926309 3' + opus 430 2 71.23 AATTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGTCCGGCCCAAAAACAGTTCAAAATTATCGAAGGTGATGTGATGTGGTGTCGTTTTTGCCGAATTTTCACACGAAAACCCTTTTTCGAATGCCTTGGCTTTCA:1 + chr3R 27688253 3' + Porto1 4463 1 68.49 AAATCGTATGGCGTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCG:1 - chr3L 24152587 3' - 1360 21 1 77.40 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTAAATTGTGCTAAAAAATTGTTTAGAAAACTTAAAAATTCCCATGAAATTCAACTATTTTTGATTAACATTTTGGAAGCCA:1 + chr2R 6240294 3' + copia 251 1 58.22 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAG:1 - chr3R 7420238 3' + 1360 3352 1 72.41 TACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATAAATCACAAAA:1 - chr3L 25951922 3' - G4 3729 1 76.03 AGAGGGAGTGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTCCGCCCCCTTGCAATCACTGGGGGAAGCTAAACATTAATGTCTAGCTTGCACCCTCGCTAGCAACGCTCCGTATATCGGGCAAGCATTCGAGTGCAT:1 - chr3R 15190137 3' - GATE 8270 2 50.68 ATAAATAATAAAAAAAAAACAAACAAGAAAATGCATTTCGCGGGAGATAAGAAAATATAATGCGCTGGATGAAGAAAAACTGAATAATGGGTCTCTTATTTAATAGTAATAGTAATAGATTCACATTTTCTTTGATCAATGCCTCT:1 + chr3L 14333727 3' + BS 5096 1 53.42 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAATCG:1 - chr3L 24934252 3' - HMS-Beagle2 6899 2 74.66 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCC:1 + chr2L 10156191 3' - hopper 80 1 72.60 ATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTGAGGGGCGTGGCCAGGGGGTTGCAGATTGCTCGGCAGCTGCGTTTGCATACTAAATTTGCTGCCGT:1 + chr3R 27977807 3' + roo 8686 2 54.79 ATGTTGGCCGCGCCGATCTCATAAGTACGTGTTGATTTGTGGATTGGGTGGGCATTTATAAGTACTAATGAGTCTCTCTTATTTAATCTGTCTTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGAGATCCT:1 + chrX 22727595 3' - Ivk 5090 1 52.03 TCTCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAG:1 - chr2R 5617494 3' + invader1 340 2 61.64 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTC:1 + chr3R 22000485 3' + hopper 1337 1 70.55 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCG:2 - chr2R 13766192 3' + roo 356 2 54.79 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACATTCTTGGGATGTTTTCCTACGCGCTGGCCAATATGAAAA:1 - chr2R 8735536 3' + mdg1 404 2 71.94 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCA:2 - chr3R 29084884 3' + 412 7487 2 56.16 TATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTGGGCTCACATAAAAGCAAAGG:1 - chr3L 18125860 3' + Ivk 5366 1 71.23 AAAAAGCAAAAAAAAAAGGAAAATGAAAAATTTCCTTTTCCAATCGCCCTCCGAAAGATATAATTTCGTTTCCAACTGGGTCAATCTTAAAACATTTTTCGGACCGCTTGTCGCTGCCAATTTGT:1 + chr3R 25525267 3' + Doc2-element 245 1 74.40 CTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTAGTGGCCGTCGTGGCTTAATTTACCTTTGCGTTCGGTTATTGCTCCTGAGGCTTAGCTTTAG:1 - chr3R 16964069 3' - F-element 143 1 57.14 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCATATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTG:1 + chr2R 7850025 3' + roo 340 2 61.38 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAA:1 - chr3R 6419866 3' + Tabor 7239 2 78.77 AACAACAACAATAATAATATTAACAACAACAACAGCAACGAGCAGTGCTCCAAAAACAAAAACCCCCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTAC:1 + chr2R 18882690 3' + mdg1 7072 2 66.44 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGA:2 + chr3R 21630346 3' + I-element 5290 1 63.70 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGCTCACTCCCCCTTTTCAAGATTCCAACTCCAACTCCATGCCTCCTGTCATGCATAC:1 - chr3R 23318793 3' + P-element 2822 1 41.10 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTG:1 + chr2L 3234032 3' + roo 324 2 74.66 TAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAGTATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTG:1 + chr3L 19274899 3' - transib2 129 1 47.95 TTCTGATTCTGATTCTGATTCGGATTCTCATTCCCATTCACATTCCCATCGTAGTCGCGGCTGCAATTATTATTATGTATTTTTTGTTTTATTTTGTTTGATTGCATTTTTTTTGTGGTTTACTCATTTCTCATGGAATT:1 + chr3R 21785685 3' + transib2 2534 1 56.43 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAGGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTCAACTTTTATGAATTATAAT:1 + chr3R 14980404 3' - roo 63 2 60.84 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACAATTTCAACCTGACAAGGACTCG:1 + chr3R 19992711 3' + hopper 1352 1 69.60 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACCAGCGATTTAATGGCAATACCAATGGCTAACTAATTGCCGGGCTAAGCCTTCATGCATGCTT:1 - chr3R 11186485 3' + BS 5084 1 77.40 GTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTCATATTCTTATAATTTGTTTATTGACATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTATGGGTGCTGGGTTCCGAGTCATAAAGCAATAATTAGCTGGCTTACAGCTAAGCAAGATAGCTGA:1 - chr3R 9957649 3' - Idefix 7149 2 56.85 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCA:1 - chrX 11661384 3' + pogo 2046 1 63.70 GAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGATAAGCA:1 + chrX 21087708 3' + mdg3 5490 2 73.64 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTG:1 + chr3R 25433358 3' - transib2 83 1 74.65 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCC:1 - chr3L 3983838 3' - P-element 78 1 21.77 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGCCAGTAAAACTCGGGGTTGGGG:1 + chr2R 18515009 3' - P-element 15 1 69.63 ACGTGCACTGAATTTAAGTGCATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTGCGGAGGCTTTGATTGAAATCGTA:1 - chr2L 12822818 3' - P-element 54 1 23.23 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAA:2 + chr3R 26504329 3' + HMS-Beagle 6994 2 52.74 TTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGTAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCT:1 + chr3R 9298546 3' + hopper2 1530 1 70.83 ATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTCAAAAGTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCC:1 + chr2L 23244251 3' + Cr1a 4319 1 62.67 ATAGCGAGGCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTTTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTTTTATCTGCTCTAGGATTTTGTGCTTTTACAGCC:1 - chr2R 9543991 3' - accord 289 2 61.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTATGTCTAGAAAGGTAGCGATTTAATGCTAAGGGCTATAAAACTAAGAACTAAGGAGAAAATGTCTTAAATGTTTCTTACTCAAGCAATTAGAATCCTGATAGCCTGCG:1 - chr2R 9544787 3' + roo 396 1 77.40 ACCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTT:1 + chr2R 15005107 3' - BS 5061 1 63.45 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACCTCTCA:1 + chr3R 23067546 3' + roo 9038 1 62.22 AAGAGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACTCAACCCTTTATCCTGTGTGCTCGTTTCGGCACTTGGTTTTTTGTCATAATTGTTCTATTTTGTGCACTATTGAATTTTTATTT:1 + chr3L 19644284 3' + McClintock 5952 1 61.87 AACTCAGCTGTATTGCAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTT:1 + chr3R 21933233 3' + pogo 1853 1 59.03 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTTAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTT:1 + chr3L 17183767 3' + diver 167 2 55.17 TTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGGGGAGTACCA:1 - chrX 19074706 3' - mdg1 2 2 78.77 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCCTAACGCTGGGCAAAAACCGACCACAA:1 - chr3R 28469182 3' - 412 43 2 56.16 TTTAATNAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATG:1 - chr2L 17180049 3' + Juan 4178 1 59.59 ATGTAAGCATAATATGAGAAGCATATTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTG:1 + chr2L 22369222 3' - rover 6965 2 73.97 TGGTGACTGCACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTATCCCCTCTGGAACGGCGAAACTGCTCCAGAGAATCCAAGAGTGATAGTGCTGGCCTAACGAAAGTGAAAGCCCATTCA:1 + chr3R 10149881 3' - mariner2 110 1 54.78 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGCCTTGGGCAGTTTTCGAAT:1 - chr3R 4460977 3' - blood 19 2 70.55 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTTTTCCATA:1 + chr3L 21769159 3' + I-element 5343 1 70.34 AATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTTCAATATAGTAGCAGTATGATTGGTATTCTCTGCAAACTAAG:1 + chr3L 9972266 3' + Bari1 1415 1 71.23 AGATACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGGAGAGGCCATTACAATTGTATAAAATTAACATGTGCTGTGAAACAAGTATTGCTCGCAGTTCA:2 - chr3L 18900747 3' - 1360 2968 1 67.81 GTATGTGTGTGTGTATGCAAGTGTATGCGTGTGTGTGCATGCGTGAACATTCGTGTATGATGAACATATCAAATACATATACGTGCTCTTGTATGTGTGTATGAGTGTATGAGCTCCCTTTGACTGGCACTTTGTTTAGTTTTGG:1 - chrX 21221476 3' - Quasimodo 35 2 74.48 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGCATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCCTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAAAATGTATAAATATTTTTTTTCTCTGCCT:1 + chr3L 14720926 3' - F-element 42 1 53.85 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGCTTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATCGATTTG:2 + chr2L 11878392 3' - blood 7067 2 56.55 AATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACT:1 - chr3R 17996178 3' - diver 73 2 67.12 GAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATATTTAGGAAAAGAA:1 - chr3L 24213785 3' + invader2 5024 2 72.41 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGACG:1 + chr3R 9039048 3' + Juan 4190 1 65.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTATAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATA:1 - chr3R 14980304 3' + roo 351 2 54.11 CGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTTCCAAATAAATAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAACAGATACTATAAGATATAAATTCACAGTGGTCACTGCAGAAAAATATTGGAGGTT:1 + chr2L 11219757 3' + Tc1-2 426 1 60.96 TGAATACACACACACACACATCCAAAAAAAAACATACAACGGGAATAAAACTAGAGCTGATTTATTTAAATTGTTTATTTTTTTTAAAACCTATTTTATCATCTGGTTTT:1 - chrX 7739932 3' + accord 7028 2 78.18 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTG:1 - chr2R 18258777 3' + Juan 4160 1 52.05 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAACTTAAGAAAGATAA:1 - chr2L 7660882 3' + I-element 5323 1 60.96 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTATT:1 + chr3R 14860269 3' - BS 5008 1 75.35 TATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAG:1 + chr3R 9298554 3' + hopper2 1536 1 65.75 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGC:1 + chrX 8437717 3' - P-element 80 1 21.54 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATAT:1 - chr3L 21996134 3' - Transpac 4956 2 65.07 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGA:1 + chr3R 4805718 3' - 1360 47 1 53.42 ACCAGATAAGAAAAAGACTGTTATACGATCCTCGAGAATAGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTCTCATTCTACGTTTGGAAATTAAAAGGAAAAATAAAGGCACCATAAACTATGGTAGAAATTGTAAAAATT:1 - chr3R 3815393 3' + Idefix 6926 2 52.05 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACATTGCCTTCCAGACCAGCAT:1 + chr2R 8099273 3' + jockey 4983 1 72.22 AGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTGACAACATAAGACGAGAACGCGTATATGTGTAGTTGTATATGCGTATATGCGTAGTTGTGCTAGAAGACGTTTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCCAAGAATTTATATACAATATATATTT:1 + chr3R 25873467 3' - 1360 3257 1 66.44 CCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGCCTCTTCGTGAGCGATTGAAAATTAGAGTCAAATCAT:1 + chr2L 3008049 3' - I-element 5005 1 74.66 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGGAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTCGCATAACGGCTGATCATCCATGCTGTTTCTTTT:1 - chr2L 4123795 3' - transib2 5 1 80.82 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGGGGATGGGCTCAAGGGCATGGGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTG:1 - chrX 4808491 3' + mdg3 5473 2 59.54 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGC:1 - chr3L 21327084 3' + copia 218 2 64.38 AATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATGAGTAACTTTCGGTTAATGATAACATTGCGTTTAAACTTTCCCAAGAACTCTGTCTAGCTGATATTAAGCAAATTAAAATATTCCGATAATTTAAGCTGC:1 - chr3R 23295838 3' + P-element 2622 1 80.00 TATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAATTCCCCCACTTGTTTCCCTTATCAAAATC:1 - chrX 20731133 3' + jockey 301 1 78.99 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTATGTATATCATCGCATTATAAATGTCTTGCATTTGTAAGAATGCTCCACT:1 - chr3R 5523916 3' - FB 71 1 67.12 AAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGTTTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACATATATATACATATATATACATATATATACATATATAT:1 - chr3L 16731387 3' - rover 7028 2 74.31 TAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTAC:1 + chr3R 17615226 3' + mdg1 33 2 71.92 ATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTGATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATT:1 - chr3L 23249358 3' - rover 33 2 63.70 AATAAATATCAATATAAAAATATTATTTCTGGTTAGTGAACATTGATGCTGCTCTGTACACCTTTACATTCGATTTATTCATATGTGCTCCATTGCAATCTCCTGCTAATTTTGTTTCAGATATATTCACGTTTGCCATTACACT:1 - chrX 2519676 3' + Stalker 6935 4 73.10 ATAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCACAAAGCAGATGTTCTGATC:1 + chr3R 15807458 3' - FB 49 1 52.05 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGTATG:2 - chr2L 4063810 3' + roo 9036 1 60.96 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATATGTATGTACATTTATTG:1 - chr4 60427 3' - transib2 31 1 64.38 ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTG:1 - chr2R 3564050 3' - Tabor 69 2 62.33 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGT:1 + chr3L 18126016 3' - Ivk 22 1 58.91 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCGAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGA:1 + chr3R 19992719 3' + hopper 1339 1 68.49 CGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTTGTATTGATGTATGCGGACTGGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGATACAGCGCCATAATCGATGATGGCATCGATGTTTCACCACCACTAGTCGAAACACATGCGGTGCTGCGGAAAAGTG:1 - chr3L 21135990 3' + invader1 177 2 50.68 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTACAACAATGCTCTAGGCAACGGAAATTCG:1 + chr3R 28469315 3' + 412 446 2 54.11 GGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGCTTGCCTGTCAATTAGTACGTTAAGCTTCTGTTGTTTTGCATTCGGTAGAGGGGATTCGAATTGGAATTACAAGTACCAAGGACTGTAGGCTTTTGAAGGACTTT:1 - chr2L 1675731 3' - I-element 5205 1 72.60 GTTGGGGCACGCCCACTTTTCTACAACTATTTTGTCATTGCCGCTCTCTTCGCTCTTCCCGCATTCCGCCTCGTTCATTCATTCATTAGCCGCGCTCTTTCT:1 - chr3L 5184902 3' - hopper 113 1 79.41 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATA:1 - chr2L 13158646 3' + roo 340 2 64.38 TGTACCGATGGGTCGGTAACTCACGCGTCGTATTGGCACCGACCTTGAAATTTTTCTGGACATTCAAAAGTTGAGATAGCAAAACATTAAAACTGTTTCCGCCCTCATATACGTCACTTCGTTGTTGTTGAATTTTTAACTCGATC:1 + chr3R 1268605 3' - ZAM 7962 1 73.97 AGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCGGGACTATAAAAGCTATTAATAAGGTTGTCACAACCACTCGTAACTTACCTTCTTTTGTAGTTGCACATAGCATAAGTGGACATATTTTCAAAGGCATTATGTGTACTA:1 + chr3L 5519639 3' + INE-1 119 1 56.85 TTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTATGTTCTGTGTAGTGTGAATGTGTACTAAGTCATGGAGTGCTCTGATAAAAATATGCTATATTACTTTTGAATTTTTTTT:1 - chr3L 10215602 3' - Quasimodo 95 2 60.45 TAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTT:1 - chr3L 19454938 3' - mdg1 73 2 65.52 GTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGC:1 - chr2R 12472042 3' + transib2 2741 1 73.29 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAAACATCCTCCAGACTG:1 + chr2R 18530001 3' + jockey 4983 1 76.92 TAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTACATTTCTATCGATGTGCAAAAA:1 + chrX 16116193 3' + INE-1 164 1 61.64 AGGGACCAGCGAATAACGCGTATGACAGACAAAATCTAAGTCGCGGAGAAAATAAAAATTTTTTAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 + chr3L 4132693 3' + HMS-Beagle2 344 1 61.64 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTATCGCCAGATAAGCCGAATATTTAGTTCAAAATCAAGTCTGAGCAATATCGAGT:1 + chr3L 2544715 3' + Tirant 8442 2 61.64 CTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAAAAAAGAAAACACAATTTTTAAACTACCAACGTATTGATGTGTATTTGATAACAAAATCAAAATTGTAATGAATTGAA:1 - chrX 13846767 3' + I-element 5163 1 52.74 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTC:2 - chr3L 14366530 3' + roo 347 2 62.33 GAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGCCAAGTTCTGGCCAAGTTGTCGTCGCCATCGTCTGGCGGCTGCAAACGTTTTATGGTCTGCGCCCTGGTCAAGTGATGCA:1 - chr3R 26101556 3' + invader2 478 1 55.48 CACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTTCAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGATAACATGGC:1 + chr2L 17766213 3' - Doc 180 1 36.30 GTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:1 - chr2L 21750457 3' - F-element 427 1 80.82 CATAGTACAAAGCTTAAAGCAAATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTACCCCTTGTGTACAAATTTAAATACGATTTAATCCAATTACCC:1 + chrX 5911549 3' - Bari1 1543 1 58.22 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTG:1 + chr2L 3234032 3' + roo 347 2 69.92 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATTCTTCACCCCAACTTGGGAGATCGCA:1 - chr2L 7125755 3' - I-element 61 1 57.53 CACATATACTTACACACACACACGCATGAGTCCCAACGAGCGAGAAGTTTTCCCTGGAAAGGAAAAGCCCAGCACACACCCAATGGCAACACAACATCAGAAAGTCTGATTAGATTTCCGTGGCAATTACGTGAG:1 - chr3R 29393604 3' + Quasimodo 28 2 81.48 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAACGCGA:1 + chr2R 19199762 3' + hopper2 1562 1 46.58 TTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGTTGTGACATCGTGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAAT:1 - chr3R 25709789 3' + hopper 1346 1 70.90 TATTTATTTAGAAGCGATGGTTTTAAATAAATGGATACGCAGGGACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATTCTGTACAGAAAACAAAAGCAGTTAGAAAAAATGACATCATTATACTTGAAGGCACTTTTA:1 - chr2L 7937192 3' - BS 5081 1 76.74 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCAGCACGGTCAG:1 - chrX 12066077 3' - transib2 28 1 62.33 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTTCTTTTATAACATCATTTTTTCAAAGACTTTGACCCACAACTCGAA:4 - chr3L 7889506 3' - roo 8673 2 78.08 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGT:1 - chr2R 8735595 3' + mdg1 338 2 78.08 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGT:1 + chr3R 28385612 3' - transib2 77 1 69.18 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACAGAAAGCTTTGC:1 - chr2L 10156097 3' + hopper2 1559 1 51.37 CGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTGTAAGTACT:1 + chrX 20999638 3' - BS 10 1 72.60 ATGCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGACGGTTTTATGAGGAAGCCC:1 - chr2R 16034086 3' + F-element 4319 1 61.22 TTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAAGTAGGGTTTATGTGCATAGGATTTTCAATGCCTCCGTTCCCT:1 + chr3L 22149660 3' + transib2 370 1 70.63 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCCA:1 + chr3R 11062873 3' + roo 399 1 74.07 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGATTATTTTGCT:1 - chr3R 7420216 3' + 1360 3315 1 68.49 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGAT:1 - chr3L 10731767 3' + 297 6918 2 60.96 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCGAA:1 + chr3R 16519013 3' + Tirant 382 2 67.44 ATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTG:1 + chr3L 20187401 3' + FB 454 1 64.38 CGATAACCAAATGGTTAAGAACCAGCCAATCAACAGTCAATGCCGTTTCTGCAATATTGACACCATGACAATGACCCACATCCTACGAGACAAGACGATTGCATCGCCCTC:1 + chrX 19821280 3' - Circe 59 2 73.87 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTTT:1 + chr3R 19487049 3' - roo 8699 2 65.14 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGGCGTGTGATTGGTCGCATGATGGTCAGTTCTTTGTGACG:1 + chr2R 10648150 3' - hopper 83 1 75.86 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGGTCCTTCACTGCCTGCGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTTATA:1 + chr3R 9298608 3' + hopper 1397 1 69.18 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTGTTCTAACGTTGAGTTCTTCTTTGAAAACAAAAAAAAATGTCGAGCTACCATTAATTGACTTGGGTTATTCTTATCT:1 + chrX 12186983 3' + jockey 4950 1 55.07 ATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCGAAAAGAAACTTTGCATATACATACATATATTTTTACTTAATTGAGTAGATTCCCCCGCCCTC:1 - chr3L 8920052 3' + Burdock 6034 1 56.85 CTGTTATTATTATTTTTATAATATTTGTTCTTGCTGTTGTTCAGCTTGCAGTCGGGTTTATATGCAAATGGCGTTCAAGGATCTGACCAAGGAGGAGGAGGAGCTCGAGAGGCGCAT:1 - chr2R 11524618 3' - invader3 5057 1 70.09 AAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATTGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGCTCAATATCAACGCCGTCATATGTGGCATTGCTCCTGCTCTCTTTGTCATGAATT:1 + chr3R 31885503 3' - FB 697 2 62.33 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCAC:1 - chr2R 20010215 3' + Juan 4134 1 73.29 TGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAGTAATCCCTAAGATACAATTAATTCACCCGTCAGTTTAAACTACTATATTCTATGCGACATGAAATTCATTGCATACTTTGCGGCTGCAAGCCTGCAATAAATGAGGAAAAGCGCG:1 - chr3L 3501666 3' - Bari1 4 1 71.92 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTG:1 + chr2R 9871573 3' - roo 48 2 54.29 ATGTTATTTAAATTTGTTTTAAGGCACATGGCTAAAAAAAACCGATACTAAGGCTAACGACTTTAAGGTGTGATCATTTTTAAATTGACGTGTTTGCAGTATATTTTGTTAAACTACCATTATTTCTATTCAGCACATACTAAACA:1 - chrX 16105530 3' - HeT-A 330 1 86.30 ATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCACTTGCCACACTTAATTTCGCCTTCTCCATTGCATTTATGTGACATTTATTCTGAAAATAAAGCACAACATTAAATGCAATTTAT:1 + chr2L 16033324 3' - roo 8823 2 60.27 ACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTAA:1 - chrY 680440 3' - invader2 4891 2 65.75 GATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTTTTCTGTTGAGTTTTGTTGTTGTTGTTGCCTGTCAAAGGCAAACAAAGGCATCGAAGGTTGTTAATGCTGAAATATTAAT:1 - chrX 4338848 3' - I-element 165 1 73.33 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTC:1 + chr2L 4713968 3' - transib2 52 1 57.93 AGATGTGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAGAAAAATTTAATTATTTTATTTAAAAACTAATCTAAATCATAATTAAAACTTAAAAGTTCGAAAAAGTTGGTTTAGTTCGTAAGATCTCTATAAAGACGTTCCAGATATCGTCTG:1 - chr2R 1778752 3' + I-element 444 1 81.51 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTA:2 - chrX 6116261 3' - transib2 77 1 71.23 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTCCACTCTGTGATATACAAAATCCTTTTAAAGAGTATA:2 + chr3L 3501860 3' + Bari1 1689 1 66.44 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGA:2 + chr2R 13259381 3' - mdg1 7101 2 58.90 GAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGAT:1 - chrX 14722116 3' + diver 6043 2 63.01 GCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTATTCCGACATTAAAGATGTCGTATGGGACAATGGACA:2 + chr2L 21403606 3' - G5 4394 1 73.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATT:1 + chr2R 7850042 3' + roo 404 1 71.43 CCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCAT:1 + chr3R 27986416 3' - roo 24 2 69.62 AGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCAAAAACAATCTATGTGGACTATTTGAGAACAAAAAGTCCCAGTGATAAAGAGTTTATGACATTTTTCCTCTGCACTGCCCAC:1 - chr2R 11105075 3' + roo 251 2 60.96 GTATCTGGTTGTGTGTGTTTTTTGTGTGTAGTGTGACTTCTTGACTGTATTAGGCCGGAATATTTTGCTCAGCCCACTTCATATTTGTTTATAATACACTTACCATAAGCCAATCAGGCGAAGTTGTGTTGCTTGTTCTGTT:1 + chr2L 12190539 3' - Tc1-2 496 1 69.01 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCTTA:1 + chr3L 12249906 3' + roo 350 2 57.53 AGTATTTGACTCTGTTAATCAATACCTTCTAGTAAGGAAACTTGATCCTTTTGGTTTCCCTGTTGGTCTTCTAAGTTGGATTTCAAGCTTTCTGTATGCCTGGTACGAACCTGTAATTTA:1 - chr3L 13592509 3' + Q-element 327 2 71.67 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGC:1 + chr3R 23618229 3' - hopper 20 1 61.11 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAG:3 - chr3L 23249362 3' - rover 6988 2 60.96 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGA:1 - chr3L 10731756 3' + 297 348 2 53.42 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGC:1 + chr2R 13259394 3' - mdg1 50 2 50.00 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGC:1 - chr3R 27083048 3' + jockey 4923 1 67.12 ACGAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGT:1 - chr2R 7244841 3' - diver 5978 2 76.03 TAACGGCATAAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATAGGACTTTACATTTCTTAGGTGTGTCAACTCTTTATTAAACCAAGGAGGTAGCAAATTAAGTAAGTGGCTGGTGCTG:1 - chr3R 15291533 3' + Chimpo 138 1 80.14 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAGTGTCCCAAAATAGCTAAATATTGTAGATTAGCTCCACGATTAGGATCGCAAGCACCTGTTTAATTAAATGGTTGTTTTTAA:1 - chrX 20455598 3' + hobo 2927 1 72.73 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCACGTTTGTGCGGATTCCGAAAAGAAATAAATAAATAAATGAAAACCCACCACTTGATGAATGCATCGGGCATTTAACGCATCTTGT:1 + chr2R 11082731 3' - INE-1 550 1 76.79 AGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAAGAACGGATTGCTGACAAAATTAAGAGTGCCCAAGACGCG:1 + chr2L 22657949 3' - 17.6 7150 2 72.60 TCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCGAACAACATTTAACACTTTTGATATCATCCTTACTTTCATTAGGGAGCAGGGAGTGGGAGTTTGGCAAGGGCTTTGAGGGTTTCGAGCGGGTGGG:1 + chr3R 28925228 3' + Rt1b 5114 1 63.57 AATATAATTTTTTTATTTTTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCACTTCCGTTCAGAATGTCTTTCGCCTGCTGCTTTTATGGGAAGTTTGGCCATGCACTTCGGGTATCTGCAGTCACCACCATC:1 + chr3R 16116932 3' - HB 326 1 54.11 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGTACATATGTAGATGGAGCACATATGGGCTATATAACGAGTTA:1 - chr2L 16274915 3' - FB 39 1 57.24 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTACAAATTGGCAGCAGCTGCTCAGACAGAAGGGGGTTTTTCT:1 + chr3R 30813406 3' - FB 82 1 74.66 TAATAATAATAATGTTAATGATAACGTCCAAGTGCACGTTTGTCTGCCAGTGTGTACAAGTGTGTGTGAGCTTATAGCTATAATTACGTTTAATTTAGGTGTAATTAAATACAATAAATTACGGTTAAAGAAGGGCTTGCATTACC:1 + chr3L 5814166 3' + mdg1 7077 2 63.01 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGGCTGCC:1 - chr3R 8075888 3' - 412 7103 2 52.52 TCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGACTTGCGGGGGTTCCAATTTACCCACAGCTAAGACCCGG:1 + chr3R 13893744 3' + opus 207 2 71.32 CATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTTAATTAGTTTTACATTTTGTTTTGCTGCGCTTTTTGTCAAACGATATAAATGGTCTGATAAAT:1 + chr2R 17611674 3' + copia 4961 2 56.85 AGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGACGCCGCTGCTTAAGCCTATTGTGTGTATTTTGTTTTTATTTCATTACTTTATTTTTTTAGTTTGTGTAATGACTTTGAATTTTT:1 + chrX 8550974 3' - gypsy4 6458 1 50.72 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACCTGCT:2 - chr2R 8157161 3' + mdg1 7410 2 52.74 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCC:1 - chr3L 16690883 3' + I-element 5320 1 47.14 GTTGGTATTGAATTGGTATTTAGGTAGTGTTAGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGCCTGTTGATCTTCACAGCATCATTATTTAAAC:1 - chrX 7318492 3' - I-element 4987 1 78.08 TTTCTGTTTTTTTTTATTATTTTTGGGGGCGGAATGATAAAATCCAGGAAACGGCCAGCGGATGTACACATTTTGGGCTATTTATCAAGGTCAGGGTCACAAGTCCGGCGATTTGGTGGGGAAACCTTATAAAACACATACTAAAT:1 - chr3L 2012590 3' - Rt1b 5148 2 78.77 AACTATCGATATCTCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTTTCACTTCCTCAAAGCCGCGTAAAGTTAAAATGTCTGTGCAGATTTCCTCGCTATTATTCATTTT:1 - chr2L 22927575 3' + INE-1 500 1 54.81 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCG:1 + chr2R 8735675 3' - mdg1 60 2 59.59 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGATGT:1 - chr2R 22034604 3' + copia 240 1 74.66 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACAGCTCATCGTCGTCATTACGCGGCCAACCGTC:1 - chrX 19266796 3' + roo 405 1 65.67 ATATTGTTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTTTTCTAGTTCTACATTATAAATTTCCGAATCTGAACTCGAATCAAAACCGGAATGTGAATCCAATATTTGTACACGCGATGGATTTGTTCACTGTAGATGAGCTTCGGGAAG:1 + chr2R 4512016 3' - transib2 2605 1 70.55 ATAATTAGCTTTGCACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCACTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGAGAGTTCTATAAGAGTGTTTAATAATTATGAAAGGTATACTTAGTATTAGTTTT:1 - chr4 717604 3' - gypsy4 381 1 73.29 ATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAA:1 - chr3R 1135318 3' + Cr1a 4310 1 80.00 CATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTTATTAAATGCAATTTTATTATGCTTATAAGCAGCGAG:1 + chrX 16932135 3' + I-element 5056 1 76.03 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGT:1 - chr2R 20010182 3' + Juan 4167 1 52.05 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATGGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGAACTCACTCGAAAACAAGCGAAACCAGATCGCC:1 - chr2R 8735581 3' + mdg1 7398 2 65.22 AATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGAGACTCCGCACATAATCCGTACATGATGCATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTATTATCATATTAAAAATGTGCTATGCTGATTA:1 - chr2L 6654645 3' - diver 5946 2 52.74 AAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTTTAAAATATTTATTCGGACTTGGTTTCACATTCTTGCGGGTATTAACTTTTTTTTGGAGTGACATGTTGGTAAGTTATCTGT:2 - chr3L 16331385 3' + Tc1 1439 1 52.05 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACTTGTGTAAATAATAGTTCATATTTTCTTGTTAATTGTATTATAATATTTTGTAGATATGGAGTGCTTATGATTATCAAA:1 - chr2R 21410844 3' + Burdock 216 2 57.53 GCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCTGGAGAGCTGCCAGGAGCAACTAGTGGATGCCAATGCAAAGATAGCACTACTTACCTCCGCCCCTGAAAACAATGGTAGTTAAGATTAACATGGCACCCTAAAATTTTTTTTAAAAA:1 - chr2L 3529496 3' + HMS-Beagle 6979 2 77.40 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTCAAAGAT:1 + chr3L 11257433 3' + 1360 20 1 56.16 AAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAAAACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACACGCACTAACGCAAGTGCAAAAATTGTAGCAAAGGCAACAACCAAAAT:1 - chrX 3761383 3' - hopper 139 1 62.33 GTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTA:1 - chr3R 23020789 3' + INE-1 558 1 65.07 ACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGAGCTTTAAGACTGAGAGTAGTTTGCATAGGAACGGAAGA:1 + chr2R 4410930 3' + 1360 3219 1 73.10 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACA:2 - chr3L 24228592 3' + copia 5084 2 67.81 ATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTACTTCCTGAGCGAG:1 + chrX 1799270 3' + invader4 3070 2 75.34 ATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCTCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATGGCTATGTACGCGCACAAATATAACCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGT:3 - chr2L 22340136 3' + 1360 3117 1 65.75 GATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAGCGAGTGTAGAGGTAAGGATCAGGGCTATATGGCTGTGTAATTTATTTACGGGCTTTGCACGTACGGCCGGGCAC:1 - chr3L 2237851 3' + jockey 58 1 63.93 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAGTGCAGAATCAGG:1 + chr3R 18488501 3' + roo 9045 1 64.38 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTA:1 + chrX 12986631 3' - roo 62 2 61.64 CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGCCAAATTATTAAAGAATTCAGTACATTAAACCAATGACAATATGACAAAAGAAAAGCTTTATCACTATT:1 + chr2L 22674446 3' - mdg1 7104 2 57.89 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGGGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGTCATTGTCATGGATAGAAA:1 + chr2R 13766333 3' - roo 4 2 76.67 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGGTAAGTGTTACTACTTAAACATATGTAAATAATAGAAATAGAAATAGAATAAAGTTCATAGAAACATGAACTTTAACTTTTAAAAGACTATG:1 - chr3L 20898491 3' - roo 27 2 67.81 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACCCTTTTGCATTAGATCAGGGTCAACCCATCGTGCCATATTGC:1 + chr3R 15942839 3' + hopper 1392 1 70.55 ATATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGTAACTGAAACTGTTAGAGAGTTGTTATGAAAAAAAAACAGTTTT:1 + chrX 3765118 3' + Stalker 6940 4 81.56 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAAT:2 - chrX 10319595 3' - mdg1 50 2 52.74 AACAAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGACTACTTTAACCAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTACTATTAAAAGTTTGCGAGAGCGAGAGAGTGCTAC:1 - chr2L 2886752 3' + invader2 367 1 69.30 GGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTTGCAAAATATTTAGAATGCTGGAATGGAAATGTGGGTGGTGGATGGTGGATAATTGAAAGTGGG:1 + chr3R 27842459 3' - I-element 5281 1 61.43 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGATTCTTACAAAAACTCAACGAGTACAGTCTTCTTATTTGGGCATTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACACCT:1 - chr3R 9002916 3' + roo 343 2 56.55 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGCACGCACACCCACAAGAATTTTTCATTTGCGGAGCAGCCATTTTTATTTCCACCGGCAACCGGCTG:1 - chr3L 22325801 3' + hobo 2922 1 60.00 AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGCTCTGTGCTAAAAATGTTTTTTCTCACAATTATAAACTCTTAATTTAAACATATTGTGA:1 - chr4 1262870 3' + 1360 454 1 57.53 AGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAACGGACAGAGAGCAATTTTAGCCGTCACAGTTTTATAGAGTGTTTCATTCTAACTATATATAGTGTGGAAGAGAGTGGTTTAATCTAGAGTATTACCAATTATTATTTAAATGTCTTC:3 + chr4 1099209 3' + 1360 3285 1 65.07 ATTTCGCATTTTGCAAATTTTTAAATGCTTTTGATGACATTTTTATTTATACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTATGGGGGGTTTGCCTTATTTATGTGCGGGATTTCTTTTCTCAGCTTTTC:1 - chr2L 4136944 3' + FB 167 1 57.50 AGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAGACAATCTATCAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATATA:1 + chrX 14771791 3' + BS 5012 1 72.60 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCCATTG:1 - chr3L 14366498 3' + roo 9043 1 67.12 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAA:1 + chr3R 28901310 3' - transib2 65 1 64.75 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATTC:1 - chr2L 4003641 3' - mdg1 7056 2 71.92 CTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCCCCCTAATTAACCAATTTTGCAGGCTTTGTTAGAAGGGAGAAGTTCACACGTTCCACCGCTGCTTGTGTCCT:2 + chr3L 17156499 3' + Rt1b 5074 1 50.68 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAG:1 - chr2R 20227216 3' - hopper 49 1 55.88 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGTCTCCCACAAGAAGCTTAAATCGTTCAAATGTAAATGGATGTTCTAACGAAGAGGCGGTCTATCCACTC:1 + chr2R 5148565 3' + roo 385 2 50.68 AGGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGC:1 + chr2L 13844239 3' - Stalker2 81 2 69.18 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGTTTGATCGTT:1 - chrX 10537829 3' - I-element 36 1 58.90 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTATAGAGAAGCAATCTTATTAGTTTAATTAAATAGTAGACTTTTGTGGGTAAAATTATTTAAT:1 - chrX 19539422 3' - pogo 2 1 69.86 GGTGGAGGTTTAGGGGGAGGGGTGGGAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGAATTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 ACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGGG:1 - chr3L 5061552 3' + 17.6 423 2 65.52 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCAT:4 - chr3L 2989892 3' + roo 9054 2 72.60 AAACTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCGATTTGGTTAGATGATCAGATGGCATTATATATTGTAAGTTGAAACTTAAAAAAATAATGGTATGACAGCCTCGGTTTCAGTTAGGAGTTTCGATTTTTCATAGAAAAATTTCAACTGATTG:1 + chrX 5637478 3' - accord 7030 3 57.53 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATT:1 + chr2R 13766309 3' - roo 54 2 57.53 ACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACGATGTACAATAAAAAAAGGAAAAAAGAAATATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTT:2 + chr3R 23638159 3' - pogo 140 1 67.12 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGGTTTCCC:1 + chr3R 11469402 3' + Tabor 7260 2 59.59 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCG:1 - chrX 8437657 3' + P-element 2823 1 42.47 ACGCCGCAAGCTGAATACTCTTATGCCAAATTTTCTAATATAGCCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGTAAGGAACATAGATTTGGCTATTTTTATTCTATTTTCAAATAAAATTAACGTTAAG:1 - chr3L 6318626 3' - 1360 414 1 80.00 ATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTAT:1 - chr3R 19450064 3' - roo 8654 1 51.37 GGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATA:1 + chr2L 13844231 3' - Stalker2 89 2 76.03 GATTTAATTTTAGTTAATTTTTAGTGTAATTTTTATCATTAGCTCAGTCGCTTAACTTATTGTACAATTTTAAACACTAATTATTTAAAATGTTAAAAAT:1 - chr2L 3484888 3' - Penelope 311 1 74.00 TATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAAATCTGATTGGACACCGACACTAAATAATAAACCAATCGCCGCAAGGTG:1 + chr2R 21160841 3' - Transpac 4919 1 63.01 ACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAGCACATTCCGGTTATTTACACGACTGATAAGCAGTTGCATTTGAAAAAGAAAGGGAGCCATGGGGAATTACAGACTGTG:1 + chr2L 18540842 3' + S-element 117 2 56.16 ATATGTAAATATATATATTTATAATCTATATATTAAATGTTTTGGGTATTAAAATAACATGTACTCACGCTTTTCAATATGTGGCTACCATTGTGCATTTTTCCTTATCTGAAAATAACAAATATTAAAATAAAAGGTTTAATAAT:1 + chrX 7439107 3' + G3 4507 1 74.66 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTACAGCAGACAATGAAACTCC:1 + chr3L 13365846 3' + BS 5044 1 53.42 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTG:1 + chr2R 13259385 3' - mdg1 59 2 56.16 TAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCGCGGCATAAAGCAGAGGCTGGCAA:1 + chr3L 9314806 3' - blood 167 4 84.44 AACGCAGGGAAGGAAGCCCAGGCTGCCCAACTCGTAGTTCGACAAAAACTGTGCGCAAGCGCGTCCGTAAACCAAAGCAACAGGACAGCGATGAGCCCGAGTATGAGCCGCGCAAGAAAAAAGG:1 - chr2R 11287769 3' + Osvaldo 1101 1 65.32 GGCACACGATTTCTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGACCAAAGTGCTCTTGAGATGCCATATAACGATGCTCTTTGAAATTGTTTTCGAATGGGGCAAAATATTGTCGACATTTTCGTTAGCACCGTATGTT:1 - chr3R 3745675 3' + 1360 46 1 65.75 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTTGTATGTATGTAATATAATGTATATGTATCCGTTGTAAAACCTTTTTAAATATATTGAGATGTTTATCCTAACAATAGAAATTGGTCTCATC:1 - chr2L 21328115 3' + 297 6955 2 71.23 GATCTAGATAGCTTTCAAATATGGTGCCGTGATAACGTTTTAAATATAAAACTGAATTTGGCAAGTTGACCGATAAATAATCAAATTTTGACACCAATATCAATTTAGACTGTTCACATCTGGGAGTTTGGCAAAACAATCAAATT:1 - chr2L 22345509 3' + Q-element 643 1 67.81 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTAGTCTAGTCCGAGTTAAATTTTGTTGACATTTAATATTATCTTATAATTACCTTAATATACAGTGTGGTTTGGTGTGTGATGAATACTTTTATTATAGGT:1 + chr3R 3920629 3' + roo 388 2 71.23 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGTTCA:1 + chr3R 15807439 3' - FB 68 1 63.01 ATTTTCATATATATTTTTCAGATATAAACATCGAGTCACCTGAGTGCCAAAGAGCTTTTTTTATACACATTGAGCTATTTATAAGTTAGCCGTGTTTTTGGCGCACAAACGTGGTAATGAC:1 + chr3L 12406744 3' + copia 4663 1 79.34 TATTATTATTGTTATTTTTTTTTTTACAAAATATGTAAATGCACCATCTTATTTCGCACTCCGCTTCGTTCTTCGCCTCGTTTTTTTGCTCCACCTTGCTGTCGCTGGCAACAATCTTAATGCAATCAGCACACTATTAATC:1 + chr2R 23802745 3' - mdg1 7063 4 74.65 AGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAATCATACATGTTGTTGACGGCAATGTTATCGAATGTCGCCCTGCTTAAACGATAATTTTTGCAGCTGGAGCATACCCAAAAATCGAAATCTCACGGACCCACAGTTTCATCGTCCTCAGC:1 + chr2R 4721069 3' + INE-1 149 1 73.29 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTA:1 + chrX 8308501 3' + roo 9014 2 59.59 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGTAAATATTTAATTAATATTTTCCTTGGAATGGCCAG:1 + chrY 2720395 3' - 297 6590 2 74.17 CAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAATAAAGAAGAGAATCGTAGTTTTTTGGGCCTCGTCACCTACGTTGGCAAATTCATACCAGATTTAGCTAATCGTACCG:1 + chr2R 3914472 3' - diver2 4693 2 79.05 TAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAACAAAGCTTAGAAATAGTAAGCCCGGGTTTGCCGGCAAATTGCACTGAAACCCGAACCA:1 + chr3R 29978339 3' + 1360 244 1 73.29 ATAAAAGTTAAAAATAAAAAAAAAACAGTACAGATTTTGAAATCCTAAAATATAAATGTATTTGCCATTTTTTATAAAAGGGAATATTCCTTGTGTTATTTGGGTTTTATTAATGATTCATAAAGAAATACACAACTTTTTAAAAT:1 + chr3R 6063960 3' + Doc 4695 2 39.04 AAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGATACAGTTGGCACATTAAAAAATAAAAAAAGATCAGGCCGAAAATGCTAAGCAAATACACACTTCCTGCAGCAAGGACTAAAATAAGTTACTTCCTGGGTCTGA:1 - chrX 412098 3' + Bari1 476 1 58.90 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAAACCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTTATCCGACTATTGTTGAAAC:1 - chr2L 12818209 3' + hobo 2903 1 57.53 CAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATTTTGTTGGGCAAGTGCTTTACACATAGGATATATGATCGCATTTTACGGATATTACGACTAACAAGAGCTGACTGC:1 + chrX 8137953 3' - I-element 5257 1 57.53 AAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTGTATACTGTCGTGAGTGTACTGAGTGTCGTGTATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTG:1 + chr2R 6885565 3' - P-element 2811 1 17.81 TCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTTTTCTCGAATTTTCTGTGACTCCACTCTCTGTGCA:1 + chr3L 26511420 3' - ZAM 8197 2 76.03 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATGTGG:1 + chr3R 31653170 3' + roo 351 2 58.22 CGGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTTAAAAATAAAAACCAAATTGTTCGATTTAAAATGAGCCAACGAGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGATTCGCATGCGCAAACTGGCCGGACAACATATGCTGACCAGGATCGGGTCC:1 - chr2R 15027425 3' + Doc3-element 155 1 65.75 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAA:1 + chr3L 16033405 3' - Doc 87 1 76.71 GTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAATTCTATACAAGCCCCTATCACAATAGAGATGTTATTTAACG:1 - chr3R 16446337 3' - roo 8781 2 71.92 AGGTGCTACCCGCCACGCACATTGCGGGTACTTACAAACACACCGCATAAATCTGCAAATGCAGATCAATACGGTACTCTGCGTCTCGAGCGCCGATAACACTCGGCACTCATAA:1 + chr3R 1465943 3' + hobo 62 1 51.30 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGG:1 - chr2L 8338154 3' - P-element 104 1 15.07 TATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTTGCCGCTTAGCCTGTTCTCATT:2 - chr2L 18212101 3' - Quasimodo 46 2 53.42 TAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAG:1 + chrX 22840566 3' + copia 187 2 63.01 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAGATTTATGACCGCACATGATGAGCAATA:1 - chr2R 11794932 3' + opus 490 2 75.63 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAATTTGCAGTGTGATTCGTTTTTCCGCGAATTGTGTTTGTTGACACAGTCATTTGGAGCGT:1 + chr3L 8685285 3' + I-element 5343 1 73.91 GCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGATGCAGGCGTAGAGGCCACCTGGCCTCCAAATCTAAGATGGTCTTTTATGTATTATAATCCAA:1 - chr2R 16948678 3' + R1A1-element 364 1 76.71 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACA:1 - chrX 18396040 3' + roo 9051 2 60.96 TTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGTCGCATAACGGCTGATCATCCATGC:1 - chr2L 4123805 3' - transib3 14 2 75.34 CCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAACAAAGCTTAGAAATAGTAATAGACGAATCATTATATCACGAAAAACTCTATTATGGCGCGTCAGCATTGTTTATGCGAGGCTACTTAGTTGCTA:1 - chrY 475866 3' + 1360 281 1 64.83 CTCCTCACTGAAAGTATGATGCCTTTGAAGTTTGCTTTTATTTTTATTTTATTTCACTTTGTCCGCTCACTTGTTCGCTCGCTATTCTATACTTTTTTTTTATACGCTGATCAATAAATTACGATTCGTT:1 - chrX 1270053 3' - Transib5 230 1 74.62 TGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGCATTTTTTATCGGGCTCACAGTAATTTATACTTTATGTATGGCTTTATGTATGTAAGCTGAACATGCTTAAGCATCG:2 - chrX 15200815 3' - 17.6 6968 2 55.48 ATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAGTGTGAGAAGGGGAAAGCGCTCAAACAACTTTGACCGTTTCAATACTAATGAGG:1 + chr2R 20227316 3' + hopper2 1546 1 61.81 ATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGGTTATGGGGTTACCTTC:2 + chr3R 7317656 3' + I-element 5282 1 67.12 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATG:1 - chrX 2214246 3' - jockey 4803 1 51.49 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTG:1 - chr3R 30347329 3' - P-element 79 1 33.56 GTATATGAAACATTTTTCTTTATAATGACAATTTAGGGGGGGTAAGAAAAAAAACATTTTTTATTGTTGCTTGGGAATATTACCTACAAAAGC:1 + chr3L 23282646 3' - looper1 1667 1 60.22 CGATGGGTTTTCCCCTTGCTTGCCGATATCTGATTTTGATTTTTTTTTCACCTCGCACTGGAGTTTCTACTAATTGCTGGCTGCGTTCGTGTGGAAGAAAGCGCCTCAAAGTGATG:1 + chrX 12083425 3' - X-element 480 1 68.97 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGG:1 - chr3R 5769009 3' + roo 347 2 58.22 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAA:1 + chr3L 18126014 3' - Ivk 35 1 52.86 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGTGAGGCATTAGTA:1 - chr2R 20802518 3' - mdg3 5264 1 77.40 ATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCATCGAAACTGAAACGATATGGCATCGTACTGAACGTCATCAGTTTGAATGGCAGCGATAACGAGCAGTCCTCGTTGGGTAGTAA:1 + chrX 17739848 3' + blood 7087 2 63.01 ATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGAGATAGCTGGACTCAGTGCTAACCGCTGGTTAATTAAAAAACTTTCAGGCATTTGTTTAATTTTCATATTTTACAAT:1 - chr2R 17328042 3' + micropia 169 2 54.79 CCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCCATATCCATATATCTCCCGCTTTTTTACACCCCGACCTGTGACCATTTGCATTCCGTTTCAGGGACGCTATCTATTATTTATAAAACTATTTTACCG:1 - chr3L 17071799 3' + P-element 2750 1 69.86 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTTTCGGCCATGTTGAGCTCCATTAATTGGTAAATTTTTGTTACCCCCC:1 + chr2R 9967177 3' + Bari1 1691 1 71.92 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAG:1 - chrX 13134899 3' - jockey 4832 1 65.07 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGTGGCTG:1 + chr3R 11810750 3' + roo 9035 1 54.87 TTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCATTATTTTTCCTTCTAAGAAAGTTAAACATAAATCCA:1 - chr2R 1193105 3' + rover 6981 2 80.14 ATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGGGGAGGCTTCATAA:1 + chr2L 20640297 3' + Stalker 7082 6 51.22 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCGAATTTGCTGTCAAAGTAAT:1 + chr2R 13931615 3' - P-element 76 1 34.93 GATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTG:1 + chr3R 17996242 3' + diver 139 2 74.66 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAA:1 - chr2R 5941316 3' + copia 209 2 53.42 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGCACTGTCTCACGAACAACCTTCTGGTAGTCGACCACAGCCTTAGACGT:1 - chr2L 110799 3' - G2 3023 1 67.12 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAGGATTCGTTGCTCCTGTCAGCACCTGATTGTTGGAGTTGGAGTCAAATG:1 - chr3L 18281824 3' - Doc 7 1 78.51 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAATTACAACAAATAACCG:1 + chr3R 17996280 3' + diver 177 2 53.42 AACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGCCAATCTCTTTCCAGGCATTTCATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTAGATCAACAAAATTGCATATAAAAATCTAATTATTATTATTGTTTGTGACGAT:1 + chr2L 13780513 3' - S-element 441 1 73.29 GACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATTAGGCTTAAGGGTGTGTGTTTTTTTCAAAATTTTTGGGGTCATTTTCCCTTCGGTTGTTGGGTGTTTTTAGTTCATGCTTATCGCTTTTTTTTTGGGTTTCATTTTG:1 + chr3R 26914064 3' - I-element 330 1 67.12 ACTCGGCTATTGATACTGATCAATAATATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACATTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAA:1 + chr2R 9285311 3' - INE-1 91 1 73.29 TTAATATTATTAAATAAAGTAAAAACTTGTCCGTTTAAGAGAGATTTGACTTATTTTAGATGGCAGAACCTTATGTTTTTTTTTTTCAAATTCCCATTACTCAGTTATTTTTCTGGTGCTTATTCAGGAGAAAAAGACACCCAGAC:1 + chr3L 10959257 3' + Tc3 280 1 56.16 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTT:1 + chr2L 3672973 3' + P-element 2799 1 26.03 AGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGGAGAAAAAGCCATTAAGGTAATCTTATTTT:1 + chr3R 23020990 3' - INE-1 572 1 45.53 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATG:1 - chr3R 25616480 3' + roo 9037 1 61.64 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGA:2 - chrX 13134903 3' - jockey 4836 1 67.81 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCTATATCGTTCT:1 + chrX 7795655 3' + roo 9053 2 71.23 GAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGT:1 - chrX 21639596 3' + gypsy5 370 2 58.22 AGGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTT:1 + chr3L 18505766 3' - I-element 37 1 60.27 TACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAGTACAGTGGTCAAATTCATCAGCTTTCCGTCATAACCAGCTTTATAAGTATCTCAATC:1 - chr2L 6174031 3' + I-element 5316 1 54.79 GAATAAGCTTACAAATAAAGACCGTTCCAAGAATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACTTAAAGTTAATTAAAAGTAGTCTACTGGATATACAATTTAACAAATTAGAAAAACCTAGCAGGTCC:1 - chr3L 19065807 3' - Cr1a 4040 1 68.03 ATTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTTTAAGTATTTAGGATGGAGTTTAAGATCTAACTGAAGCTT:1 - chr2R 21681259 3' + roo 393 1 73.10 GTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGACAACCTTGAGGAGGAGGAGAAGGAAGAGGCGCAGGATAAGTACACTGAAAAATATATTAAATAAGTTACAAAGTCTTATTAATGCCAAGCAATATTTGCAATTAT:1 - chr3R 6779184 3' + I-element 338 1 76.03 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAAT:2 - chr2L 16858674 3' + Burdock 6355 2 60.96 CATACCGCGGTGGGTTCAGGATTTGCACTCCATTACTGTTACATTGTTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTA:1 + chr2L 22224550 3' + Rt1c 5347 1 78.77 GAAAAAAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCCAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTGGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGCAAAGGACAATCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTATA:1 - chr3L 16184094 3' + Porto1 170 1 56.85 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCCACCA:1 - chr3R 9298438 3' - hopper 35 1 61.64 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAAT:1 - chr2L 20265909 3' + roo 9040 1 63.70 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCT:1 - chr3R 18971675 3' + Juan 4184 1 56.16 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACGATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGA:1 - chr3R 20441252 3' + I-element 5275 1 69.86 TATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGCTTTTACTCACACACTGAGATCCAGAGAAAAAAAAGGACCTTAGAAG:1 - chr3R 22851392 3' + 1360 3152 1 77.40 TTTTTTTTTTTCCTTTTTCTTACCCATCCCCATCCCAATTTTCCCCCCTTTGTGCCAACTCTTTTGCAGCAAGTGCAATTTAATGTCCAAAACCAGAGTGCGTAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr2L 3704269 3' - Doc2-element 219 3 78.15 TTTAAAATAATTATTTTAATTTCCTCATAAGCATATTTAGATACGGATGACTCAATCTTATGGAGAAATACTTGTCCTGAGGGAAGTGCGATATGTATGCTTACCAAAGTTCACAGGTGAAATAACCCATATAAAATTGAAAGTGA:1 + chr2R 2017826 3' - NOF 3966 1 67.81 AGTAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGT:1 + chrX 22824253 3' + Gypsy12A_LTR 2233 1 49.32 CTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTATGATGTTTCGAAGACCTCCCAAATAATATCAGTTGTCAGCTACATATATAGTACATATATAGTATAGATAAGGAGC:1 + chr3R 7318518 3' - I-element 5270 1 54.79 ATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAAC:1 + chr3L 20187438 3' + FB 491 1 59.59 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAG:1 + chr3L 20898647 3' + roo 9032 1 58.90 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' - P-element 76 1 22.56 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCAC:1 - chrX 18817277 3' + transib2 2763 1 58.90 GTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACC:2 + chr3L 19349996 3' - 1360 3274 1 67.12 TCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTACCCAGCTACAAGCTGTTGGCTGAAAGCTTTTTAAAATGACAGCTTAGCCCTGTACTCTTTTTGTCTTCCTCTCGCGTTTTCTCACTCC:1 - chr3L 17533088 3' - roo 194 2 60.27 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGC:1 - chr2R 13766210 3' + roo 360 2 61.29 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAA:1 - chr3L 18930987 3' + I-element 5280 1 72.34 ATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGAGATTATACGGAAAATATTTTCTATTTTTCTAGTACTAGTTAGATTTAGATTTGAAAACTATCATT:1 - chr2R 3593351 3' + gypsy 343 2 54.79 ATGTTATAAATTGAAAAAAAAGTCAACTACAAAATTATGACAAATTAATAAAAAAAATACACCCACCCATAGCCGTACACATAAAGGAATTAGCTTAAATACAAAAACAACATGTGGTAATAGGAATAATAAAATAAGCCAGAGAC:1 + chr3R 31883498 3' - Tc1-2 1403 1 61.64 TTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 321 1 71.72 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGG:1 + chr3R 14860228 3' - BS 5047 1 55.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAATAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTC:1 + chr2L 47177 3' + roo 387 2 51.09 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATTTTAAGCCTCTTTGTTTTCGTTTCAGTTTTGTTTACATTTTTATTGCCCCG:1 + chr3L 13836753 3' - 412 8 2 60.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAG:1 + chrX 21224639 3' + roo 9022 2 54.48 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTTCATTGTTTCCATCTAGCCCGCCTTTTCTTCTCCACCTTTTTTTCGCTCTTTTTTGAGTGGCACTTGTTACACG:1 + chr3R 27765204 3' - mdg1 7063 2 62.40 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACAGATTGCTTTCTCAGATTTATGACCGCAC:1 - chr2R 11794945 3' + opus 7489 2 66.36 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTTGGAACGTTAATGGAAAGATT:1 + chr2L 5582249 3' - pogo 16 1 74.31 AATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGGTTGACTTTGTTGAATCGAGAGAAATTGTTGAATGATGGGGACGCAAGAGATGGCTGGTTAAAATTAATGTAACGAAAAGTGGGAAAAAGTTGCAGCTGCCCCGCACAAACCCCCCTT:1 + chr2L 17194060 3' + Dm88 4308 1 71.23 AGGGGAGAGTTGTAATTAATAAGCCAGTGAAGATTGGCTGCTTTAAGCTTCATATGAGTCCTCTTAGATCCTACAGCACTTCATCCTCCATACACGTTCTCTTCGGTCCCAACTAACTGGGCATTCTGCGCACCTACTCGGTG:1 + chrX 21593415 3' - Doc2-element 4292 1 52.45 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATACGATTTGACCATG:1 - chr3R 27133526 3' - opus 7 2 78.62 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGACGATGATTGTT:1 - chr3R 16157230 3' + pogo 2094 1 76.22 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGACTAGACAGAGTCATCCGTGACAAAATACCGGGCATTGGGGATATCTGCGAGAATACCTTAGACTCTGGAGAGAGAGAGATTATTATAGATATAGAAGTGGGCGACAA:1 - chr2R 3681688 3' - mdg3 5335 2 69.18 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGGTTAGAGTGTATT:1 + chr3L 22960504 3' - Tirant 29 2 65.85 ATAATATAAATATATTTAAAAACTTTTTAATTCTTATAAATAAGTTTTTTATTTAAAAAATAATAGTACATTAACAGAGAGTAAGCACACTTTTTCAAATAAAATATCTTTAAATATGTTTTAAAACTTTAATTTTACTCACAAAA:1 - chr3L 19222382 3' - gypsy7 5060 1 57.53 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCATTACGCGGACAACCGTCCACAGTGAT:1 - chrX 19266787 3' + roo 402 1 71.92 TATAAAATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAA:1 - chr3L 16973397 3' + S-element 101 2 76.71 ATTGTTAATATTTTGTTTTTTGACGGGTGAAACGCAATCCCCAGAGAGGAGGGAG:1 + chr2L 10008222 3' - Juan 3966 1 67.27 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGGAATTCTCTACACATTTTGCTTTCCTACTTTGTTTTGATCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTCTCCGTTTTTTTTTGCAATCAAGTTAGGTTT:1 + chrX 22550387 3' + S-element 170 2 80.14 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATC:1 - chr3L 16690901 3' + I-element 5296 1 60.96 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCACACTTTTA:1 - chr3R 8051130 3' - jockey 4828 1 67.81 TAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTCTGTTGTGTAGTGGGTGTAATTTGTGGTGTAATTATGTAAGTATTCGCTTCTCATACATGTAATTGCATTACTAATAACGCCAAAGTAACTTC:1 + chr2R 19525939 3' - Quasimodo 80 2 67.12 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGG:1 - chr3R 23618130 3' + hopper 1364 1 58.78 AGGAGACAGCCGAAGGACCTTATCCTACGCTCCCCCTGACTAGATGTAACATAATTGAAAACAAAATATTATACAAGCCAAGCCAAGTGTTTGGTGATAGCTCAATGGAATAAAAGAAACCTCATACGAGGAATTGCGAACTATAA:1 + chrX 22733251 3' + BS3 1565 1 56.85 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTTAAT:2 + chrX 11661525 3' - pogo 30 1 65.07 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCCATCTCTCTTTCTCTAGTGTTTTTTTCATCGGTTTGTAGGGACAGAGGAGTCTTTCATGTCTGTTTAA:1 + chr3R 30347473 3' - P-element 7 2 76.03 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACAAAAAAGTCACAAAAATAGGGGACAAAATCCAGAAGATGGCCAAAAAAATCACACGAGAGACTGGATTTACACCCAACGCGGACCTTCGAATGGTTATAATGGTTATCT:1 - chr3R 5732861 3' + BS 5076 1 68.97 CTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAGTGGAATTTGATCCTC:3 - chr3L 22531938 3' + Cr1a 4207 1 64.38 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGGGATTTCGGTCTGGAATGCAGGCAAT:2 + chr2R 12779754 3' - I-element 28 1 67.12 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTATAATGAAATAAATACCTTTAATATGCAAATGTTATATTTATTACCAAAATTAATTAATGTTTATTAT:2 - chr3R 20167564 3' + roo 9023 2 53.42 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTC:1 - chrX 4341232 3' + roo 408 1 79.65 GGTGGGTGTGGTCCGATTTACTTAAAATTTTAAGTACGTATTTTAAATGTCAAATGCACCAATTCTAAAAAATTCAACTCTCTAGCTTTATTATTTGACTTAGCGCCAAATTATGGTCATTCCGCAGCTGTTTTAGCATTTTGCCA:1 - chr2R 2521505 3' + transib3 2749 1 71.23 ACAAAAATAAAAATTTGAAAAAATGTGGGCGTGACCGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGCTAGAATGGGCGTGGCAAAACAAACTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCGCTTATACGGACAGATGACTAT:1 - chr2R 5720601 3' - FB 175 1 65.75 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAAACAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAACTTTGCCTTACACATTAACA:1 + chr3R 18093404 3' - I-element 33 1 60.27 ATATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAA:2 - chr2R 2590715 3' + HMS-Beagle 6968 2 67.81 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGAGTTTTCCTATTAGG:1 - chr2L 10156122 3' + hopper2 1534 1 68.49 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGG:1 - chr3R 904903 3' - rover 6963 2 65.07 ATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGTCATGGTGCCTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTTCGTGGACAGCCAAGAATGATAGTTTTTTAATTTTCTTATTA:1 - chrX 11468037 3' - BS 4646 1 52.74 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAATAAATAAAATGTTATTATCAACGCCTTTACGATTATTAAATAGTTAACCAACATGGTCCAAAATGATTCGAAATACCTTCAAGGGGTTCTTTATC:1 + chr3L 8673416 3' + I-element 5324 1 60.27 GTAACGGAAGAGGGTAGAAGGATCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTTCTTTTGTTTTACATCGCACACAATG:1 + chrX 18336683 3' - mdg3 5266 1 64.36 CTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCTGTATATTGATCCTCTAAAGAAATAATTCTTTCAAATTTGGAAACTAGTTTACCTAGAAACGG:3 + chr4 1179530 3' + F-element 176 1 56.85 GACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAACATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGA:1 - chr3R 28042957 3' + Stalker2 322 2 71.23 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACTGTAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAACACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATA:1 - 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S-element 199 1 78.77 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAG:1 + chrY 311460 3' + 1360 3385 2 53.42 AAACGCAAAGCTCTTTCTCTTCATGATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCGTTGAACACGTTGTCAAAGGTCGAGAAGATGTCCCACTCTTTCTGCAATAACCCCCAA:1 + chr2L 3964721 3' + Idefix 7184 2 58.04 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCCTTGTTGCTGTTCGGAGCCGGCTTAAATGTTGGCCAT:1 - chrX 10167391 3' - roo 66 2 73.08 GTATATAGTTTCTAATAAATCTACTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCATGTAGGGACTCTCAACTCCACCAAGAATAAACTTACAAATAAGCCAAGATGCTCCGACTTCCCAAGGAAGCGGCGACGAAAAATATTTAAGC:1 - chr2L 1691392 3' - Cr1a 4118 1 65.75 GAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCC:1 + chr2L 17005789 3' - Stalker2 77 2 69.18 AGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCTATTATAGTATTATA:2 - chrX 5323210 3' - Juan 4085 1 58.90 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTCAA:1 + chr2L 4063944 3' - roo 8717 2 54.79 ACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATCTATCGCCAATATCCAAAATGCAATAACACTGAAGATAAAATCTTAAATAACTT:1 + chr2R 12956950 3' + Tirant 8384 2 63.01 TTTTGAATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTCTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACATGTCAAGGTCCTTGTCAGGACTATAAGAACACGTCAATAAAATA:1 - chr3R 13439545 3' + gypsy7 5061 1 51.37 AAAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATCAACACGTTTTTCGAAAATGCTTCCTTCTGCCTGTTACATATTTTTCAACGAATCTAATATACCTTTTTACTCTTCAAAATATAGGAGATGTACAAAAAAATGAAAATTTTGTGTTA:1 + chrX 3741385 3' - INE-1 286 1 39.73 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAAATTTAGGATTTGG:2 + chr3L 16970480 3' - roo 8706 2 54.48 AAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTT:1 + chr3R 19073286 3' + roo 391 2 60.00 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTGCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCCTAACGCTGGGCAA:1 - chr3R 28469195 3' - 412 56 2 55.48 CTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTCCCCATTCTTTCATTTAACCCAATCTATAACTGACCTACCCGCACAAATATTTAATAATAGCCTGCGGGACTGGCTGAAGTGGAATGGATGGGCTATCG:1 + chr2L 7198973 3' - micropia 5268 2 69.86 TATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCGTTTCGTTGTCCAATAAAAACGCGCATTAGAAAGGTAACAATTGCCTGGTCAAGATTAAAAAACCAGAACG:1 - chr3L 21781691 3' + G7 1166 1 58.62 TTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCC:1 + chrX 21947735 3' - mdg1 5 2 68.89 ATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAG:2 + chr3R 10270635 3' + Juan 4124 1 74.66 ACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAA:1 + chr3L 23839695 3' - 17.6 70 2 79.45 TTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTT:1 - chr2R 5410957 3' + Tc1 1360 1 53.42 AAAAGCGAAATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTACTCCACGCTCTTGTTTGCATTCAAAAAACGTAAACATTTTTATTTTCTCTT:1 - chr3L 15495085 3' + invader2 424 1 58.42 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTAATTAATAT:1 + chrY 2720377 3' - 297 53 2 63.01 TTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCTAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTT:1 - chr2R 15004732 3' + BS 5059 1 43.15 GTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTT:1 + chr2L 11257108 3' - rover 64 2 63.45 CCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGACAACAGTAGGCGTTAAGTTGGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTT:1 + chrX 13642875 3' - accord2 7408 1 58.91 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTCTAGGATTTTAGCGAAAGGACTTATTTTTACAGAATCGTATTGGTAACTTTGAAGACAACTTAAAAAAAAA:1 - chr3L 13846695 3' - 412 91 2 53.10 GATGTAATCGTGTTCGCGGATTTCTCTACCCAACCTATTACCACTTTTCTTAAGATCATGACTCCAGTGGTCCTTTTGTCCGGAATAACATCATTGTTTTCAGTCATATGATAGTAGGATAGTTCG:1 - chr3L 12626309 3' - Gypsy12A_LTR 1973 1 73.81 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGG:1 - chr2R 5070929 3' - Tirant 8109 2 23.20 TCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGA:1 + chr3L 24934394 3' + HMS-Beagle2 246 2 64.38 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACA:1 + chrX 10521705 3' + Tabor 7239 2 75.17 ATTCATCATAAATAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAAAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATAACAAGCCACTTCCCCGCTGCTATTCTCCATTTCTCACACATTCT:1 + chr2L 7935223 3' + I-element 306 1 75.34 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATGGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATACTTTGATCAACTGATTTCTCTAGACGCAAA:1 - chr3R 21933128 3' + pogo 2055 1 56.16 AAAGATTTAAAAATGAAAAGTGCTTTTACCTATTTACAAAGATTTTAAATAGATTACTGAGAAGGTAAGAACCGTTCACAATTACCTACGGCATACAATTTTAAACACATTCACTAAAAATTTAATACTTCACAATTGATAATAA:1 - chr2L 9982576 3' + Dm88 4239 1 60.69 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATA:1 - chrY 2720332 3' + 297 6918 2 73.29 GTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATTCTGTTGGACTGCTGCAATCTGGAACGCATCACATAGCATACTTTC:2 + chr3R 14733490 3' - I-element 157 1 68.49 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCA:1 + chr3R 15072655 3' + pogo 2038 1 65.71 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGC:1 + chrX 7795590 3' + roo 8988 2 75.34 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCACCGGCTCCGACGCTT:1 - chrX 21224572 3' - roo 8669 2 58.93 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACCGATATACATCAATT:1 - chr3R 4679470 3' + hopper2 1528 1 71.03 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTCGCGGAAAGCCGGCACAAAAACAATC:1 - chrX 8437618 3' + P-element 2866 1 71.13 AAAACAAAAAAAAAAACAGCAACCAAAAAACCAAAAAAAGTTTAAACCAAAACGAA:1 + chrX 18882766 3' + gypsy7 5012 3 91.07 AGCTATACCTATAAGAAACTGTACCTTGTTATTAGTAGATTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTCAGTCGATTTTGGGAGTTTAGCAGAACAGAGTTAAAATGAGTGAGTGAAAGTTGCACCAGAGCTGCGGA:1 + chrX 19127540 3' + Burdock 6206 2 67.12 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGGGCCGTTTTACTGGCCAATTGAACATTTCGGAAATTGGAAATTTCTC:1 + chr3L 5389984 3' - roo 8666 2 76.42 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTT:1 + chr2L 17005849 3' - Stalker2 16 2 73.10 TCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCTACATATGTATGTACATATGCCAAAGACGCTAGAATAAGTGTCTTTGCATTCTTTTTGATTCTT:1 + chr3L 21769152 3' + mdg1 7065 8 76.61 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGCATGTATACC:2 - chr2R 18315985 3' - HMS-Beagle2 6898 2 73.97 AGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTAGTCATCACGGATTCGGTCAACATATGGCCACGTACAATGTAGAGGTGAGTCCGCCCCCACCCCTCGAGCGAACCAAGTGCGTTGTATGACCGCCCCACCC:1 - chr3R 15369657 3' + flea 346 1 74.29 AGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTTTTAAAAT:1 - chr2L 18707929 3' + Bica 102 1 54.11 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGGGAAATACTTGAGTTTTTAGAAGCAAGGGCAGCAT:1 + chr3R 4805750 3' - 1360 15 1 73.97 ATTTTTTTTTTGTAGGCTTTTAAATTTCTATTGAATGCAAAAACCATTTTCTGGGTTCTACTTTCTTCAAAACACGCAAATGCAATATTAAAGACATTTTTTACCT:1 + chr3L 24735018 3' - G2 3067 1 77.36 TTAAACATAGTTTTTAAGATATAATCCGTTTGTCCCAGTGTTTCTGTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAAA:1 - chr2L 17760280 3' + Tc1 1361 1 76.42 ATTTGCTTTGATTTTTTTTGTTGAGTTTTGTTGTTGTTGCTAGTGGCTTAGGTCAGGTTGGAATGTTTCGGTAATGGCCGTAAATTGCCGTCGCTTCAACTGCTTCTTCTTTTTGCTGCTGCTGCTGCAGCTCTG:1 + chr3R 10107317 3' - HeT-A 319 1 51.85 GTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGTGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCGGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTAAAATTCGCAATGCAATGAACAAAAAAA:1 + chr2L 13844308 3' - Stalker2 7247 1 78.20 CCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTCCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTACGGATTACAGTTTCAAATGCACTTTTGGTGCACGTATTGGTTGCACA:1 + chrX 18119682 3' + gypsy12 9947 2 67.12 AAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAAT:1 - chr2L 23008377 3' - transib2 280 1 69.86 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTG:1 + chrX 1341749 3' - 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chrX 13134897 3' - jockey 4830 1 63.70 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGT:2 - chr2L 16539655 3' + Juan 4150 1 60.27 CTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAAAGA:1 - chrX 14979253 3' - micropia 4967 2 75.17 CTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGCCGCGATCGGCCTGATGAGCCTGATTCACGTGCAGCAGCC:1 - chr3L 5433122 3' - G2 166 1 71.83 CAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTCTAGCAAGGGACTTGGAAAACTTGGCCAGTATTTCTTTCTTAAAATGACATAAATCAAACGATTCAAATGTCAG:1 - chr2L 9267490 3' + G2 103 1 49.32 CGACTAAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATTCATAAATAGATAATAATATATAAATATGTATATACATGGATTGAGCTCACTGGAGAGCAGGATACATTGAAAATGATTCTGCGGCCTTATAATCATGCATCAACA:1 + chr2R 5246327 3' + G3 4451 1 67.12 AATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTAATTTTTTTCAATTCAAAACTTTAATTCAATAAATATTCACTTCATGTTCGTTAACTGTATTTATTGTGATATTTTTTATTGGCATATTTCCAAGCATTTATC:1 - 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chr2L 15936744 3' + copia 249 1 58.22 TAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTATATACATATTTGCATCATTGTATTTAATTATTATATCATTATGTTGTTATTATTAGTAATTATTCCCAATACAGTATTGTCTTGCAGATGATTGATT:1 - chr3L 23249635 3' + rover 6959 2 70.21 GTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATAT:1 - chr2R 18483899 3' + Juan 67 1 78.77 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGTGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGT:1 - chr3R 19407878 3' - diver 39 2 56.16 ACATTTTCCTAAAGTGTGGGCGCGGCTGTTTTGGGCGGTTGAAGGGCGTTAAAGCGGCCGTGGCAAAAAGATTTTGCCAAATCGATAGAAACTTACAAGACAATGCACATACATTTTTTAAATTTAAGTTCTAACTT:1 - chr2R 5119899 3' - INE-1 255 1 51.82 ANTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTGGGTTCCTGCAGTTAACACTCATCTCAAACTGACAGCGGCATCGGGGGGACACCTCACAGGAACTCCATGCA:1 - chr3L 20196214 3' - FB 21 1 61.02 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGTGGCATGTGCTGGGACTTCCGAGTGCGATGCGATTCTCAGGGGAAGATAAGCCGGTTGCCGCCGA:1 - chr3R 20818328 3' - 1360 19 1 62.39 TAGTAGTTAAATTAGGTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTACAAACAGGGTAGAAAGGCGCAGAAAGAAAAAGTAAAAGTAAAAAAGAAATTACAGCATTAGATACAAATTATTAGA:1 - chr2R 11185500 3' - Tc1-2 1513 1 51.37 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGGCCTTTCCTCTTGCCGCAT:1 - chr2R 13766205 3' + roo 9011 2 62.68 GTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTCCATTAACTTTTTTCTTCGTTTCTGTTGTCACATTTTGTTTTCCTAACTCCCGCTTCTTCAGCACAAGTCCCTTTCAGACATA:1 - chr3R 12094978 3' - Bica 396 2 57.53 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAATAAAAAT:1 + chrY 9419 3' - roo 72 2 73.97 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATGTAATT:1 + chr3R 15072668 3' + pogo 2047 1 57.64 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTG:1 + chrX 8308499 3' + roo 348 2 60.96 TTTTTTTTCTCCTTTTTTTTTGCGTGGATCTTTAGTGATGGTGGTGGGGCTGCTGCTGCATTACAGATTGCTGAACCGGCTCCAGCGTGTCAGAAGACACAATCTGTATCTTGCCCATCTGACCATTTCCCATAA:1 + chr2L 22167855 3' - gypsy7 5006 1 61.48 ATTTATTAAGAAAGGAAATATCTCTTACTTGACTACACAATTAAGTGGCAGGGCGTTTGCCAGGGTGGAGGTCGCATGTGGGGTGGCTTAAAATTAAATTTCTCATGCTTAGTG:1 + chr2L 14873762 3' + copia 238 1 81.58 AAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTA:1 + chr2L 11839710 3' + mdg1 321 2 80.82 TATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCG:3 + chrX 10521708 3' + Tabor 7241 2 73.29 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATT:1 + chrX 8092480 3' - pogo 69 1 68.49 TATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAAATGATGTAAAT:2 - chr2L 14874103 3' + copia 256 1 59.59 ATAAAGTTTAATAGTTTTTAAAAGCAGTTAAGAATTTAAAAATTTACATAAAAAAAAAGTTGAGTTTGCCTTTTTTGGTCAATTTTTGTAAATGGATTGGGATTTGGTTTGAGGTTTGAAAATAGTTATGTAGTGCACCGGGTGCC:1 + chr2R 10049153 3' - Tc3 1526 1 67.81 CTTTCGGTCAATTTTGTCTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAATCATTAATATGATTAAGCGAGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAG:1 + chrX 11847718 3' - transib2 111 1 60.00 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGT:1 + chrX 20455700 3' - hobo 81 1 73.29 CTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGCCCACCCTACGAATTCTCATCTATTACTCATCTATCGTCGATCAAGTATGCCTCTTCAGAAATTATCCAACCAAAACTCGAGTCCCTGCCCATCTGCAACATTCA:1 - chr2L 3592975 3' + mdg1 260 2 71.92 AAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATGCGAACTATCAGTTTATTCACAAGTTCTTGAGACTTAATTCAAATTGAAGCATAGCATAGATTCGATTTTTAGTCGTTTTCCAAAAGTATCTCCAC:1 - chr3R 30799681 3' + Burdock 38 2 70.71 CTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAA:1 + chr2L 22224591 3' + Rt1c 5412 1 53.78 GCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTC:1 - chrX 20999490 3' + BS 5048 1 52.05 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCT:1 + chr2R 13766311 3' - roo 52 2 56.16 AGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGACTGGCTGCTCATTGTTGAACTCACTGATATCGAACCAATTTCATTTGCTCTGTCTCTCGTCT:1 + chr3L 13269471 3' - 297 6880 2 57.53 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCT:1 + chr2L 4063940 3' - roo 57 2 57.53 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATATGTGTTGAATTTGTATCCAGTTCTTATAATAAG:1 - chr3R 19032556 3' - roo 20 2 70.55 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCA:1 - chr3R 23639140 3' - pogo 60 1 58.90 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCAC:1 - 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chr3L 19454882 3' - mdg1 18 2 71.92 TGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATCGAGAGAAATTGTTGAATGATGGGGACGCAAGAGATGGCTGGTTAAAATTAATGTAACGAAAAGTGGGAAAAAGTTGCAGCTGCCCC:1 + chr2L 17194045 3' - hopper2 1269 2 56.16 TATGAACGTCGGTATCTCAGGAACTATAAAATCTAGAAGGTTGAGATTCAACATGATTCTATAGACAAGCTGACTACTTTTTTTCTCCCCCTTCGCAACCAAAGTACATCTCCTTGCCGTAGAAGTTTCATGCATTTGATTTCGG:1 + chrX 4469806 3' + INE-1 138 1 58.62 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATATTTTTA:1 - chr2L 21299328 3' + roo 347 2 78.63 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGCTATTTCATCATGGGCCCCACAAACTTTTTGCAGCTTTTTCCAACGCGTCACTCGAGCTAAAACG:1 - chr3R 13875054 3' - P-element 34 1 44.86 ATCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTTCTGCAATGCCAATTTGTACAAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCAACAGCTAATAGATTTTCATCTGATGTTTCCTTTCTGCACCTTTCC:1 + chrX 10764069 3' - baggins 5202 1 63.16 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGGGC:1 - chr3L 12004246 3' + P-element 2859 1 54.63 TTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGCGTCGAATAAATTGGCGTTA:1 + chrX 15200937 3' + 17.6 431 2 63.70 GCAATAACAATTAAAACTGTTTTTTGTCATACCACACTTAAATTGTCATTATAAAGAAAAATATTTCATATTCTGTGATTTATAAAAAAAAAACAATGCTTACACATCACTACTGCCCGCTTTTAATCAAATTAAAATAGTTATCC:2 + chr2L 16762948 3' + looper1 1615 1 79.45 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGGGCCGCAAGACTCTCATAAGCATTCAAGA:1 + chr3L 3983892 3' + P-element 2822 1 41.38 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCC:1 - chr3R 31886818 3' - hopper 35 1 61.70 ATTTATATATTATGAAAGGAAATACATTTTAAAGCCGCTGGCAGAAATGGAATATGTTAGCGAATTTCAAAACCTATAAATTATGTTTTGAAATTGGAAAAGTATCTCTTCGTTTGAAACTTTGCGTCTCAATTGATGTAATA:1 - chr2R 14111143 3' + copia 234 1 60.14 AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATC:2 + chr3R 14860232 3' - BS 5048 1 53.79 CCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAAACTAAGACTTTGACGAGCTGCTCTCATACGTATAACAATACACCACAAATC:1 + chr3R 15854028 3' + BS 4768 1 69.18 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTT:1 + chr3R 19073268 3' + roo 8995 2 71.23 ACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTGGCTAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGC:1 + chr2R 4745228 3' - 1360 389 1 43.15 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCCAAATGCTCGACGACTGCGATCGATAGTAGCGCGGACGATGACGATAACGATAAGTGATAGCCAAGTGGCTCG:1 + chr3L 17055549 3' + Tirant 8505 2 76.47 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATTAAAAGGTTCTTCCAACTGACTTAAAGGGTTAAATAAAATTAAATTTAATTATAATAACAATTTTGTTTAATGAGAATACCAAATTCATGGAATACTTTTAAAAG:1 + chrX 21505795 3' + roo 400 1 78.62 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGGGTC:3 + chrX 10537936 3' + I-element 5284 1 65.07 AAAGAAAATATAATAAAATAAAATAAAAAATGGGGAAAATAGTGCAACGAATGTCATTCGCATTGCACGCCGATCTTGAAGTTTATGGCGCCCGCAACTTGCTGAAAATTATGAATTATGATGCTGCGGAGTCTTTAATATCATGA:1 - chrX 14127910 3' - transib1 1902 1 73.29 TACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTAGACCCGTACTCGGTCCCGTACTCG:1 + chr3L 16047628 3' - Stalker 6878 4 57.32 TTTATTTTATCATATTGCTACGGAATTGGCAAAAACTACCCTAATATATACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCAGCTCAAAGGTTAGACAAACGCATTAAAATGACATACACTAAAATTGACAGCAAGGA:1 + chr3R 20732292 3' + 1360 3106 1 60.96 ACTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAATCAATTAGACCCTGTCCGTCGGGGTTCGTCCGTATGATTATCGAGATCTCATAGAGATCTTTATCTCTTTTTAAGATTAAACAAAAACCTAATGAAACAGATAACTTTCAGCTCAGTAAT:1 + chr2L 3430855 3' + INE-1 86 1 69.18 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAACTTAATCGGCCAACGG:1 + chr2R 8047357 3' + 1360 3333 1 58.22 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCCATTGCGGGACTGGTGAGTGCATACCAATGCGTCAGGAGTGCGATAATATCTACGATTGCAACGATTATTCCG:1 - chrX 2500252 3' - jockey 4800 1 59.35 AGAAACATCCTAATCGAAGTTTAAAGCCCGTTTGTCTTCGTTAGACAAACCTTTCACTTTCGGTCTCAACATTACTTGACAAGTCGATATTAGTCATTTCCTTCACTTCTTATACTAATGTCGTTTTTTGCTTAAAGCTATTGATT:1 + chr3L 24298210 3' - looper1 459 1 52.05 GGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGAC:1 + chr3L 22400363 3' + 1360 3338 1 54.29 AAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA:1 - chr4 1294992 3' + HeT-A 6018 1 94.74 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAATGAA:1 - chr3L 23287176 3' - 1360 16 1 74.66 TTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAG:1 - chrX 3431877 3' - Ivk 5371 1 58.57 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAA:1 + chr2L 17005829 3' - Stalker2 36 2 59.31 ATTTTTCAAAAGTGTGAGCATGATAGTCTTGTGCGGGAATGGGAAGTATCAGAGAAGGTGTTGGAGCTAAAATTGCTAAAAATTTAAATGCAAATTTTGCGGTCAGTTGGTCACGTTCTGCG:1 - chrX 17429409 3' - INE-1 253 1 76.23 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCGCCTCACCCGCTACATGCATATGT:1 + chrX 8437730 3' - P-element 80 1 27.27 TGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr3R 29534664 3' - GATE 8267 2 79.45 ACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGATGGCCTTGTACAGGGTCGAGGGCATCCAGCTGGCTTTGAATGATGGCTGATGCTTCTTGGGGGTCTGAGGCGAAGTTTAGCTTTTCCTTTCAGC:1 - chr2L 5837699 3' - G-element 3911 1 46.15 AGTATGTAAATGATTCTTGAATGTATCTTTTAGGTGGGAACCCATCGACAAAGATCCTATTTAGTAAGTTATTTAGTCGCTCGGGACAAATGGCCTATTTGGCGGCATTTGCATTGCGCAATTCCCTCGACTTGGCCGAAAAGGAA:1 + chr2R 18646643 3' + transib4 288 1 71.92 TTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATG:1 - chr2L 13844159 3' + Stalker2 7589 2 58.22 ATTAGAATTTGCACAAACTTTGGTAAGGTCAATACCAAAAAGACTTCAAGCAGTTATTGATGCCAAAGTCTACTATATCACAAACACATGTCGTCGTCTCGTTCTCACGCATGTTTTGCATTCAATTTAGCACGACTGCATTGA:1 + chr3R 20284863 3' + Bari1 1311 1 50.00 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAAAAATGCTGCGTAAATATGCCAG:1 + chr3R 11469442 3' + Tabor 460 2 68.49 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTAT:1 - chrX 11661366 3' + pogo 2064 1 60.27 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTT:1 - chr3L 16970362 3' + roo 9010 2 62.33 AATTATGAAAAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGATATTATTGTTACCGCAACTGTACGTGAGAAAACCTCAAGTGCAGGGTCTTTTCCTACATTTTATGC:1 + chr3L 18495026 3' + Tc1 1581 1 81.54 AAAAAAAAAAGGAAAAAAAACTAAAAGGATTTAAAACCTAAAACACTAAAA:1 - chr2L 3957886 3' + HMS-Beagle2 489 1 94.12 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAAAAAGGCTTCAGTT:1 - chr3R 15790848 3' - roo 8698 2 53.51 CAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAA:1 - chr3R 9038913 3' - Juan 4056 1 50.68 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGTTTGCTTTTTAGCTAGAAGCGCTTAGTCATTGGAATACA:1 + chr3R 23881724 3' - FB 21 1 68.49 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACAT:1 + chrX 12129418 3' + flea 4964 2 52.05 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTG:1 + chr3L 12315824 3' + transib2 2764 1 57.53 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTA:1 + chr3L 5881692 3' + pogo 2053 1 52.74 TAATACAGGTATTTTACATTATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTAAATATATTTTTTTTTTGCGCACTGGTCC:1 + chr2L 23244250 3' + Cr1a 4315 1 71.28 AGCATTCCACACACAGAAAATTTTGCAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTATCTTTCGATTTCGATTTATTTATTATTTATTTATTTATTTATTTCGATTATTTATTATTATTATTATTTATTGATTATTATTTTATGTT:1 + chrX 4077394 3' - Doc3-element 149 1 52.05 TCTAATCAAATCGACGTGAAGTCAAGTCGTGAAAAGTTCGTTTTGTTGTAAAATTATAACCTGCGGGCGTGAATTTTTTTGTCAGTGCGGAAATATATTATTATGAGTTTTTTCTGCGTTCAAATAATTTCCCTCGTTCATTTT:1 - chrX 14699618 3' + Gypsy12A_LTR 266 1 75.00 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGGGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAG:1 + chr2L 11357916 3' + blood 7335 1 59.09 AATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGACCATTTGATTTATAA:1 + chr3L 22723988 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.55 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGCTTATATACTTCTTTATATAAA:3 + chr3L 16033446 3' - Doc 46 1 54.11 ATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATC:1 - chrX 3431860 3' - Ivk 5359 1 48.28 CATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGAATAAAGAGTTGTGCCCAAGTCTCGTGACTCCACTCCACTCGGAGTGGCA:1 - chrX 13163896 3' + springer 7216 2 71.92 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAAATATAAAATAAAAATATCTTTTGGCTTGTTGGTCACTTGTCCTTGAGTAGCTTGCTTGCATAAAGTCCTGACCACTGTCCACCCGAAAAACCCCATCGCTTTTCCG:1 + chr3R 15054360 3' + copia 244 1 74.66 AAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTATTATTATAACTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTT:1 - chr3R 19449936 3' - roo 9053 2 66.44 AGAAGATTTCGACGGAAGAAGCAATAATAAGTCCAGCATATAAAAAGAACCGAATAAGTGGCATTGAGGGCTTCCTCCGAATGGGAGATAAACTCTTCTCGGCGTTCGCGGAATGGCAGCCAAA:1 + chr3R 31048110 3' + invader2 464 1 78.23 AATCTAAAAAAAAAAATAAAAACAAAAATACCCACCTGGGGGGGGCTACGACCACTGTTGACCTATAACTGATTT:1 - chr2L 12542551 3' + TART-C 11098 1 76.00 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCCCAGCATAACGACAGCCAGCC:1 - chr3L 3983834 3' - P-element 96 1 21.23 ATTTAAAAAAAATTACGTTTTTTAATTGCAAACCATTTATATTATTGCTGTGGCAAAAATGTCTGTAATTACGGCAATGGCCATGGAAACTGCGACAGAGGGTTGCACTCGCATTCTTGACTGCATTTCC:1 - chr2L 1429702 3' - Tc1-2 1466 1 61.54 ACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACCAACCTATTATCAGGGG:1 + chr3R 28927402 3' + Doc2-element 408 1 65.31 CAGGGTAGAGAGGTCATGAGGGTGGGAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCC:1 + chr3L 13581720 3' - jockey 4765 1 63.89 AGTGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGACCAAGAACGCAGCGAACCAGTGTAACGCGAAAGAAAACACGAAAAATGCATGCGAAATATTTTTAAAGTTCTCTGATTGGGAGATTCGTTATTTGAAGTTTCTAATTGGAATGTTTTTTT:2 + chrX 2354533 3' + gypsy4 454 1 67.81 ACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTTCGGTTT:1 - 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chr4 967091 3' - INE-1 253 1 58.90 GGTCAATTTTGTTTTTGGGTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATTATCCTCCGGATCTGAGCTACATCGTGTCGGCCCG:1 + chr3L 5361825 3' - transib2 106 1 71.97 TAATCATTTAGTGAAATAAGAATTATATTTTTTTCACTTATAAAGATTGTCTGGCATTAAATTGCCATTGCCTGGAAAACGCTGAAAATGAAAGTAACACAAAAAAAACCCCAAGTCGAGCTCACGATTTTGAATGCACAAAAAGC:1 - chr2L 12486222 3' + Idefix 7350 2 64.38 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTG:1 + chrX 7795574 3' + roo 9026 1 78.26 TATTAATGTTTATTATTTATTTTTTTGAATTTTATAGATTTTTTTATATTTTATTTATTCTCCGCAAGTAGTTTTCTGATTAAAAGCAGTAGTACTTATCTCGCTGCACTTCCAATTCTAATATTGTCGATCTGTTCGTTCCGCTT:3 - chr2L 7029240 3' - flea 239 2 60.96 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGA:5 + chr2L 4003793 3' + mdg1 7407 2 52.05 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACATATTTCT:1 - 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chr3R 14505309 3' + F-element 4590 1 75.34 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATCTATCCTGGTTTCTTGGGCAAATCTTCACATACAGAACTTCCCGGATTTAGAATGCTCTTGA:1 + chr2L 15936867 3' - copia 4911 2 52.71 GCGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCT:1 - chr3R 904936 3' - rover 45 2 62.33 TTCCATATGGAGTTTGCTTGAGTGGAAAACCCAGTCCAGCTTTTTCAGTTTCCAGGAGCCGTGATATGGGCTTTCCAACTCAGCGTCCGATCAAGGTGACCTCCGGAACAAGAATATATATACTTTATATGGTTGGAAACGCTTCC:1 + chr2L 5568625 3' - G5A 2367 1 67.81 TGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTTGCAATTTTAAAGTTTACGAAAACTTGAA:1 - chr2R 5410927 3' + Tc1 1391 1 55.48 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACATTCAAATGCTAATAAGAGCAAACGTGGCACAAAAGC:1 - chrX 17343348 3' - I-element 24 1 67.81 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGGAAGTGAGCAAAGCTAAACAATTGAAATT:1 + chrX 21224668 3' + roo 397 1 69.60 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGACCAAG:1 - chr2R 14051715 3' + roo 389 2 65.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGCCA:2 - chrX 8308371 3' - roo 35 2 61.64 TTTTTTTTGTTTTTTAAATTTCCTGTTTGATGCCACTTTATGATGTCCTTGTCCCTTTAGAGTTTTCCTACTTAGCCAAACATGTTTCCTAATTGAAAGATGCCACCAGCAACGAAAGTAGGTTGACTTTCATTAGCTAAAAAGTT:1 + chr3L 399277 3' - TART-C 11096 1 79.45 ATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGT:1 + chr2R 5303161 3' + FB 205 1 51.37 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTGGCATTAAATGTCACAAAGTCACGCGTCCTGGC:1 - chrX 585627 3' + Tirant 388 2 68.00 TACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACACATTTGGTTACTTAAACAGTGCCCACCATTATGGCCGAGACGGCATAACGAGTTGAAAAATGATTCCCT:1 + chr2L 21930259 3' + Copia1_DM 119 1 54.47 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACAGTGTTTTTGCTGTATCTCCTTCCTCGAACGTTGCAAGGTAACTACTTCGCCGTTTGTGTAAACCTAATTCCTCGTAGTTGTACCAATTCTGTGACT:1 + chr3L 26291018 3' + Tabor 7301 2 67.81 AATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGCTTGCGCAGTTTTTATTTTGTGTGTTTTGTTTATTGTG:1 - chrX 17778636 3' - I-element 5212 1 75.86 AGAAAAAAAGGAAAAAGAAAACAAAACATTGCGCCCAAAAGACGAACAAACAACAAATAGAAATTACAAAACATACCAAGTGAATCAAAATATGCAATTAATTACATTAGTTCAAGTAGGAATATTTTAATTAAAGCCGGAAATGT:1 + chr3R 5640591 3' + Doc2-element 234 1 69.86 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGC:1 + chr3R 16630375 3' - FB 47 1 53.42 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGC:1 + chrX 21994026 3' - McClintock 5978 2 66.67 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACCCACTTCTGCGAATTTTCCAGTTTCCGTTGGCATTTCACAACTTCGACTGCC:1 - chr3R 28469208 3' - 412 36 2 53.98 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTCATATATTTCAAGGCTGATGCTAATCCCTTTCTTAAGTAAGAACTTAATATTTCTGTTTGGATCGCTTAGGCAGATTAACCATAGACTAAAA:1 - chr3R 15325044 3' - 297 19 2 72.34 ATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCTGGGTTAACGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTCTGGTTGTTTGTTTGCTGCCCTTGCGTTTGAGGGATTTG:1 + chr3R 13641240 3' - I-element 194 1 80.28 GTTTCGTTTCGTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTTCAGGGGCGAAATGGAAGTAAGGTGGCTTGTCGGACTCTCAAGCTTCAGCTACTTTATACATACTTAATAATTCTCTACAGAAT:1 - chrX 2482389 3' - Penelope 652 1 52.78 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGG:1 + chr2L 12251009 3' - 412 7098 2 50.68 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAAAGTCAGGCCAAGCGAGAGGGTAGCACAACAAACGCGCGGATTTC:1 - chrX 6475255 3' - Doc 24 1 71.23 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTGTGCCTATACATAAAGCA:2 + chr2L 11839756 3' + mdg1 367 2 52.05 TCTTAATATTTACAAAATAGCTTGCTTAACTGACCACAAATCAAATCAAGTACCGTTGTCCTCAAGCACACACATACATATATATGTCTCTATATCTGGCCATAAGTATCTGTGCACATGGATAG:1 - chr2L 15355161 3' - BS 304 1 70.40 ATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGA:2 - chr3L 18125886 3' + Ivk 5340 1 53.42 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGTTAATAGGTGCTCAGTGCTGTTAGCTTTAAGATAGCTATGAAGCAAAGTCAAATG:1 - chr3R 25433236 3' + transib2 2810 1 76.03 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGGGACACTCGAAAATGGCGGCAAGTAGATCC:1 + chrX 11209917 3' + hobo 2910 1 64.71 TGGTGACTGCACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTATCCCCTCTGGAACGGCGAAACTGCTCCAGAGAATCCAAGAGGGAGAGTGCTGGCCAAACGAAAGTGAAAGCCCATACACAAACGCCC:1 + chr3R 10149890 3' - mariner2 110 1 59.68 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCTGCGTTGGCTGTCG:1 - chr2L 5582108 3' + pogo 2044 1 61.03 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCT:1 - chr3R 7943727 3' - blood 60 2 56.16 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGA:1 - chr3R 7420226 3' + 1360 3305 1 75.34 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTT:1 - chr3L 2989898 3' + roo 9048 2 68.49 AATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATACATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTCGG:1 - chr3L 24272053 3' - gypsy11 66 2 64.38 TGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGG:1 + chr2L 6647702 3' - mdg3 5335 2 74.64 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATT:1 - chr2L 6102925 3' + roo 9016 2 58.22 ATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTGTAAGAGAATAATTATGTACGCAACTAACTTGCAAAAGACGGCTTTTTATTTTAGTCTAGATTTCGCGTTGCCTTACTTTCCTCTCCATCAAATTAGG:1 + chr3R 19034203 3' - roo 402 1 78.52 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCATTGTGGTTAAAGTTTACAAATGAAACAAAATAGCAGAG:1 - chr3L 11913143 3' - BS 5006 1 75.52 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGTAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCATGATAAATGGCATTAATAAATTCGACACCGTAATTGTGTATTCCGTAAACGACT:1 + chr3R 8076013 3' + 412 7529 2 59.69 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAA:1 - chr3L 12249796 3' - roo 55 2 58.90 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAAACAAA:1 - chr3L 19454874 3' - mdg1 10 2 77.40 ATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGGGTAGCTTAAATTTTATTTATGGCTGCCACCGTT:1 - chr2L 2527652 3' - hopper 20 1 55.70 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTT:2 - chrX 10521651 3' - Tabor 83 2 71.92 ATGTAACAGACAGAAGGCAGCGTTTCCGACTATATAAAGCATATATATTCTTGATGACGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGAAATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTCGAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGC:1 - chr2R 3919672 3' + INE-1 30 1 76.03 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGA:1 + chr3R 19073262 3' + roo 325 2 75.34 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGACGTGCTGCTCAATT:1 - chr3R 6419798 3' + Tabor 468 2 70.55 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCC:2 - chr2L 18226789 3' + roo 8995 2 71.92 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATTCTAGAGACATAGACGCAGCGCAAATTAATTTACCCATGTGGCCACGCCCACTCTTACGCCA:1 + chr2L 21333314 3' + 412 435 2 55.48 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGCATACACAATGGGGAAATCTTGC:1 - chr3R 15882609 3' - jockey 89 1 74.29 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTG:1 + chr3R 24381418 3' + Juan 4176 1 68.49 TGTATATGAAGAAATAAATGTAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACTTATATGTAAAATCAGTCTAACTAAAAACCATAACT:1 + chr2R 7244889 3' + diver 6033 2 70.92 AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACAAAATGCCTTTCCTTTCACATGAATTTATGTA:1 + chr3L 11844868 3' - rover 10 2 75.34 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTTT:1 + chr3R 19992744 3' + hopper 1374 2 55.15 CAATTGCCGAGTCGATCTAGCCATGCCCGTCTGTTCGTATGAGATTCAGCACACAGATTTAAGAGACAAGTTTTTGGCACATGTTGCCACGCCCATTCTAACGCCTACATACCGCACAAAACTGTCACTCCCACACTTTTGAAAAA:1 - chr3L 22997583 3' + INE-1 101 1 71.23 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGCTGT:1 + chr2L 19924070 3' + roo 9047 1 60.43 AAATCGTGTTGTCCCTTTAATACCGGAAAAATATAAGTCGTCTTACTAAAATATTTTTGTGAGAAAGTCATAAGTCAAAGTCTAGGCGTGATAAATAATCTCCAGAGGGAAATGGAAGGG:1 + chr2R 19251112 3' - Transib-N1_DM 180 1 68.33 GTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCTCTTACAAATGTATCCTTACCCAAGCCAACGAA:1 - chr2L 16943824 3' - copia 88 2 77.40 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAGCTGGGAGTTGAGCTACCTTCT:1 - chr2R 17926246 3' + opus 7496 2 80.14 AAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACTTTTAAAATACACCCAAGCCCTCCCAATAAAAAGCAAACCAACCCGGAAAAAC:1 - chr3R 17674382 3' + FB 401 1 60.00 ATGAGCCACAAAGATGCGCTCATGTCTATCCAAGTGCCACAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAAGATCCGCAACCCAAGCTGACAAATTGACTTCCGTTTCCGCTAATTGAAAAACAAAATGAAATTT:1 - chrX 14687103 3' + G2 61 1 63.45 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATTTATGCTCGACAAATGGACTCTGCAAGAGCTTGAAATGTAAATAA:1 + chrX 2479571 3' - mdg3 5329 2 67.81 TAATATTAATGAATTCAATTAAAGGAGAAAGTGAGCGAAATGGGAAAAAACTGAGCAAAATCGTAAGGTGTAATGTAGTAGCAATCCAGTGAAAAGTAATTATAAAAAACTCTCCAACCGATGACATTTAAAGCCAAACGTTTAAT:1 - chr2L 1505534 3' + HeT-A 381 1 50.68 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGATACCCTTTACTCAGCTAGTAGAAATGCGAGAAATTTATTAGTTTTTGGACATATCGATAGATTATGGGGAATAAAATGAGAAAATTTTTAAAAATTGTT:2 + chr3R 31401818 3' + mdg1 400 2 70.55 AAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACAATTTATGCTGAGCATCACA:1 + chr3L 11844837 3' - rover 6992 2 54.11 TTTTTTTTTTATTGTTATATAAAATTCATTCTTGGTACTTGAGAACACCTTAAGTTTTTATGCATTTTTTTGAGCAAATGTCGTCGCAAATTGAGCCACTAACACCCACAGGCAGCAAATCAAACCT:1 + chr3L 7835820 3' - Rt1a 5069 1 77.95 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGAATTCTTGCACGCGCC:1 - chr2L 14675674 3' - 297 6628 2 70.64 TTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTGTAAATATATATTTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAAT:1 - chr3R 25504189 3' - 1360 2996 1 96.58 GTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGTATTTTGTATGTTATCTGAATTGGGTTTGATGAGTTCGAGTTTGGAGCCTCGGGAGATATTTCTCGTCGGCCATTTAGTGGTAATTGTAATCGTACTATATAATTTCAATTA:1 + chr3R 18799461 3' - I-element 5165 1 61.64 GAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAACGTTCCATAAAAACACATTTTGAAACATTAGCCTT:1 - chr2L 21914428 3' + Stalker4 7317 4 47.26 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAA:1 + chr2R 11804719 3' - pogo 71 1 67.12 CAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACG:1 + chr3R 24729644 3' - Juan 4159 1 72.41 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTT:1 - chr2L 13158628 3' + roo 9022 2 52.05 TATAATAAGAAGGGCGCGAGTTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATTTAACCTTCTATTAAAGAATTTCTATTTTTAGTATCTTGGTATCATTTCCAGCACTTATGGAG:1 + chr2R 5072448 3' + 1360 3072 1 56.55 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATA:1 + chr3R 25428269 3' + 297 347 2 54.11 TAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCAATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACT:1 - chrX 6116254 3' - transib2 61 1 64.23 CCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAGGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCA:2 + chr3L 23702243 3' - G4 75 1 67.12 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGGCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGTAGTCCGATAATTTTGTCGATGTAAG:1 - chr2R 21160668 3' + Transpac 254 2 64.66 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGGCTGCGCCGAGACG:3 - chr3R 26504165 3' - HMS-Beagle 12 2 77.40 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAAA:1 + chr2L 3675919 3' + Juan 4136 1 73.29 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGC:1 - chr2L 13556323 3' + transib2 2779 1 54.79 GGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAG:1 + chr2R 9158112 3' - mdg3 5345 2 79.17 CTATACCTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCGCAAAATCGCCATTTTTCCGAACTTTTATTTTTTATTTACTATTGATATTTATATTACTGGCAACG:1 - chr3R 19449896 3' + invader1 440 1 66.09 GCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTT:1 - chr3L 24031860 3' - rover 92 2 77.40 ACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAGCCGTTCGTTCGTAACCAACTGTAAAAATCGATGGGTTAGTT:1 + chr3R 20444126 3' + I-element 143 1 66.40 TTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCC:1 + chr3R 30987551 3' - F-element 160 1 79.45 AGCGCTGCAAGCAGCCTATTATAGGTGAGTGTATCTCGCGCCGATGTTATTTTGTAGGTATATATTTTAATCTCAGTGGTAGCTGATTGTGGTTGTTTGTT:1 - chr2L 3196517 3' - TAHRE 9966 1 78.22 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATG:1 + chrX 5323333 3' + Juan 4167 1 45.21 GGGCCTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCAAGTTCATCGGCCTGATTTTCTTGCTCTTGGTTCTGCCGAAGCTGAAAAACATTTTCAAGGATGATATGATGTCCGGATCTGGTGAGAGCGATGGCATGGAAAGCAA:1 + chr3R 25047174 3' - Fw2 181 1 76.03 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCTACATAATGTTTGCATTGCTAACCACTTGGTTTAGCATACATAATAATAATAAAATACAAGCAAGTAA:1 + chr3R 7943837 3' + blood 7336 1 55.48 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAGT:1 + chr2R 18514992 3' - P-element 43 1 54.11 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGGTGCATACCCCTGGCTCTGAAT:1 - chr2R 18316030 3' - HMS-Beagle2 6923 2 50.00 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATAT:2 + chrX 12986651 3' - roo 8706 2 57.53 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGGGCTGGCCGGGGAGACTCATACACACACACACACATACACAAAGACACAGCGGAAAGGATATACCAGGGGACA:1 - chr2L 12984112 3' + hopper 1399 1 61.82 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGAGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTTATTGGTT:1 + chr2L 12818386 3' - hobo 7 1 78.08 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCTATTTCTATATAAATCTCCCACGACCACCCACCCACGCGATCCGCTGATAAAAGCCGGAA:1 - chr2R 12779621 3' + I-element 5296 1 56.16 CGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTG:1 - chr2R 18316052 3' - HMS-Beagle2 6965 2 71.92 AAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGCATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTACATTTCTATCGATGTGCAAAAAAA:1 - chr2R 5667266 3' + INE-1 166 1 58.90 AAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCTTTGGTTAGATGACCTAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAACTTAAAAATAATTTAATAGCACAAGTGGAATTAGTTC:1 + chr2R 2880160 3' + 1360 3345 1 68.81 ATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGGGAAGGGTATATTTTGTTGGTTAATTCTCTGTGTAATTTGATTTTTATTTTTCTTAACA:1 + chr2R 5401691 3' - 1360 250 1 56.00 TAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTCCAAATACATAAGTTAAATGCGCCACCTTTTGCTCGACTTTGTAAAAGCGCCTTCATTTTAAATATGTGCTTGTGATTTTAAATGCATAGATAAGGATAAAATGAGGCATT:1 - chr3L 8373749 3' + Tc3 307 1 71.92 TAATAACCAAAAAAAAGAAAAACCAAAAAGTAGGAGGAGAAAAGTTATTGCCATAGTTCGTACAATAATTTGATTTTCAATTTTATATTTCGTAAACACACTTGGGGCTGGGGTAAGAAAACTCACTTAAGTGCAAAATTGTTGCC:1 - chrX 4181545 3' + gypsy7 5000 1 65.07 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGT:3 - chr2L 18549844 3' - roo 8742 2 74.66 AGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAATTATGCATTACGTGCCTGTTTTAAGGGACTAAGTGCGTCTGTTTCAATCTACATGCA:1 + chr2R 13257706 3' + mdg1 7042 2 60.27 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGGAAG:1 - chr3R 24219283 3' - roo 75 2 70.55 GAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCACCCTTAGCACATACAGCTCTGGCCACATAACCCCCGCTGGGCCAATTGATTCAACGATCCCACAGCTTAGCTCCCCCATCACTTTTGGCC:1 + chr2R 11145259 3' - Cr1a 297 1 81.54 TTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGAAATGAGTTAGAAGTCAAAACATCAGCTTAGATATTGAGAAAAACTAGGATAC:1 - chr2L 13914237 3' - flea 230 2 64.38 TCTATATTATTTTTTATCAATTCTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCTTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCAATTTCAATGCCTTATT:3 + chr3L 16047752 3' + 1360 255 1 31.51 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCACTTATCCGGATCCGTTCGGGTTTCACCTGTCATTTGGTCCATCGTCATCGTC:1 + chr2L 3234048 3' + roo 340 2 63.70 CTATTATCTCTAATCTTGACTCTTGAGAGCGGCATAAACCACTCAATTCTAACTTTTTTAATACATAATTTTTATATTTATATTTCTTATATTTATAATTATTATTATTTTTAAGCTCGTTACTCGTAGATTAAGAGGGTATTCTA:1 - chr2L 14818496 3' + Cr1a 4224 1 24.66 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGC:1 - chr2R 15004762 3' + BS 5034 1 62.41 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATG:1 + chr3R 25428248 3' + 297 6914 2 66.91 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATAATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAGTA:1 - chrX 19539483 3' - pogo 63 1 63.70 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTAGCCTAAACGATAAGATGTTGAATGAATTTTATGTGAGTTATTTTTGATGTT:1 + chrX 9180674 3' + Tirant 8469 2 67.12 TATAATAATATTTATATTAAATTCCCGATTGATTACGTTGTATATTAGGCTGTAACATTAGTTTGCAGTTGCGAAAAAATATTATTAAAATATATTTTATTTTTTGTATTTTTCCCCACTGTGCTCAGACGGAAAACACA:1 + chr3L 2835309 3' + transib3 2622 1 45.71 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAACTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGG:1 + chr3R 4805716 3' - 1360 43 1 54.29 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAG:1 - chr3L 18930984 3' + I-element 5278 1 71.23 AACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGCTGTTG:1 + chr3L 24368828 3' + invader2 5058 2 60.96 ATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATATGG:1 - chr3R 14505306 3' + F-element 4594 1 73.10 GCTTTCATATGTTTTTTTTTTCTATCAGTTCGGTAATAATCGAACATTATTGTTAAAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTTAAAGTATTTCTCTAACTATTCACTCTTCTTGCATT:2 - chr2R 22268640 3' + Circe 423 1 77.40 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAG:1 + chr3R 15791027 3' + roo 9038 1 60.43 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACTCCGAATAGTTACTTCAAAAAGAGAATTGATTTAGCAAAAACTGACAAAATTTCAA:1 + chr3L 2145984 3' + roo 9004 2 62.33 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAG:1 + chrX 8092502 3' - pogo 47 1 53.42 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCGACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAAAATAAGCTTCCCCTTTCTGATGTTCTCCACTGAGAAATAGAAAATAATTCAG:1 + chr3L 9270040 3' - copia 7 2 65.07 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTT:1 - chrX 15357639 3' + hopper 1380 1 56.30 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTG:1 - chr3R 5769025 3' + roo 331 2 69.18 AAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGTCCTTTATATTTGTCGGTGGGTGTTTTATTTGCTTG:1 + chr3R 10931448 3' - 297 329 2 72.88 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGACTTTAAGACTTATATTCTTTTCTTGTAAAGAAAA:2 - chr3R 7666661 3' - I-element 89 1 74.66 AAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACACGCACACACACAAGCCATATTGAATACTGTCATCAAGCAAAGCTCAAAAAAATAA:1 - chr2R 9994534 3' - copia 220 1 62.33 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAACGCCGCCCATTAGGCACTCT:1 + chr3L 13294980 3' + roo 344 2 60.96 TGTTCAAATGTGTTAGAAAAGATTATAAAGATATTATCATCCGACTTGTTCTCTCAATATGTCATCCATTGCTCTTTGAAATATTCTAGGGGCCCAGAACAACTTCTGTTTGCTGTGCGCCATTTGTTTATAAATTTAATTTGTCT:1 - chr3R 30957190 3' - TLD2_LTR 62 1 63.70 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAAAATAAATAAATTCCTGGAAATCGATTTAAATTTTTTAAATTCTTATTAAGCTTTCGTTTATATTAAATTCCCCTTTGGT:2 + chr2L 7125918 3' + I-element 5310 1 50.68 TTAGTTTATAATTAGAATTTTTGTAATTTAGGCTTATGACAGAAATATGGTCTGGAAACATAATCATATTGTACGGTTTGTTTACGATTTAACAATTGAAAAATTTTTACAAA:1 - chr3R 15452866 3' - HeT-A 5899 1 76.11 ACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGCATACAGGAATAACCCAATAGCACACGTGCTAGAGGTGTTCACCAATGTAAAT:1 - chr3L 17275408 3' + Transpac 5167 2 62.33 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAAATTAAATTTTCTAAAAAC:1 + chr2L 12251037 3' - 412 17 2 69.86 CGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGC:1 - chr3L 5881600 3' - pogo 86 1 76.71 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAA:4 + chr3L 16470340 3' - jockey 4759 1 76.71 CATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGC:1 - chr3R 4357529 3' + Tc3 1646 1 60.27 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTTT:1 + chr2L 14074545 3' - 297 53 2 60.74 ACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCATCTTCTCTTCTATTGTTATAGAAATTAACATTTACCGTGACAGTGCATTCTCCTCAAGGAAAAGAAAGCAGGAAGAAAGGGCTGCAAGAGAGTTTATGG:1 + chr2R 10771939 3' + Stalker4 319 4 61.64 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGAGGTACTGAAGGGATGAATATATCGAGATTTCTGAAAGAGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAAT:1 + chr3L 18505737 3' - I-element 52 1 59.09 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTACTGCTAATGATTCTTGCTACTTTAGAAAGCTTATTTTACTTAATTATATTTTTGTTCGACTTTTAGAAGGTTATTTATTATAAAATAACTTGAAAATAC:3 - chr3R 18488324 3' - roo 20 2 65.07 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGATGCCTA:1 + chr2R 9158155 3' - mdg3 52 2 50.68 TATTTATTTATTATTATTCAATGAAGTCCTTTGACAAATTCAACACCTTCGACAGCATAATGATTGCCGTAAATCGTGACCCCATAGAGCTGCACTATCTGTCCCATCTCCTCTTAGATATTATGCAAAGCACTTAAATGAATGCA:2 - chr3R 10981427 3' - Burdock 307 1 68.49 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCA:1 + chr3L 13581732 3' - jockey 4827 1 63.01 AGACTAAAAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGCTTCGTGCTGTGTGGCCGTGACTGCACTTTTTTTATCACGCAGTGCGACGGC:1 - chr2L 6000202 3' - Doc3-element 4672 1 67.86 ACCTAATTGAGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCTGGGTTAACGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAACTCTGTCCCGCAACAGTGTAAGCGCACTG:1 + chr2L 9312916 3' - I-element 225 1 79.45 AAGATGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGAAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAATTCCGGGGGATGAAAAAGTGAAACTCTTATTAGAATTTCAA:1 + chr3R 25402623 3' - Q-element 230 2 71.92 CCCCAATCTCCGAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTGCCTAGGACTGGGACAACAACAACCTCTGCAACATAGCTGGCAACTACAACAAGCGTCAACAACTAC:1 + chrX 9135118 3' + Doc2-element 489 1 63.16 AAACTAAATTGTATTTTATGCCTCATCTTCCTGCTTATAAAATGTGCTTTAAATTAAATTTAAAGTACCCTATGAATCCCCCGAACATTCCGTTTGCTGATGTGCTATCAAATTGAATTCAAGTCATCGCAATATTTTCGCTGCGT:2 + chr3L 12325428 3' + S2 30 1 73.97 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAAGCATTTCGGGGTAT:1 - chr3L 23249349 3' - rover 23 2 70.34 AAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATATATTATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGTAATG:1 + chr3R 905016 3' + rover 272 2 73.97 TATAAATATATAAATATATAAATATAAAGTTATCGCCAGTTACCGTAGAAAGAAAATCTCGAATTTATGCCGAGGTTGTCCTATTTGTGAAACTGGAAACTGAAACTGTTAGAGAGGTGTTATGAAAAAAAAACAGTTTT:1 + chrX 3765118 3' + Stalker4 7048 4 82.14 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCC:1 + chr3L 22035683 3' - F-element 46 1 55.17 ACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTTC:1 + chr2R 2875256 3' + TLD2_LTR 122 1 77.40 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGATATTACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGA:1 + chr3L 20898641 3' + roo 9027 1 52.41 ATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACAATGCAAAGCACTTGCCAAATA:1 - chr3R 24381297 3' - Juan 4162 1 52.74 ATTTTATTAGTTCAAGTATTTTTATTATTTAAGTATATACATGGGCAACCTTGAAACGATTGTTCTCTCAAGATCAAGAGTGAACCACCCTGCCTTGTTGTGTCAAGGGGCATGCACATGCATCATGCAACATGCAACAGC:1 + chr3R 30255764 3' - G7 1162 1 79.43 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCTCGCCATATTTTCAATTTAC:1 - chr3R 7943708 3' - blood 41 2 56.16 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCC:3 - chr2L 4063831 3' + roo 9015 2 57.53 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATT:1 - chr3R 21276518 3' - BS 5042 1 52.74 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTTGCATTATTCGCACATGAGTTTTC:1 - chrX 11661350 3' + pogo 2082 1 72.22 AACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACGGAAAAAAAAAGACGTCAAATATTACAGCCATGGTGCATCACGTATGCACGTAA:1 + chr2L 23315359 3' + Bica 441 1 69.86 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAAT:3 - chr2L 16539618 3' + Juan 4187 1 67.81 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTTTGCGGGGTAAAAGAACTTGTCCATAATTACACATATAAAA:2 - chr3R 27082988 3' + jockey 4983 1 74.66 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTAAAACCCAAACTGATAACTATACAGTAGTTAGATACTAACAAAAACTTAATTTTTTGTTACAGAAAATGTA:1 - chr3L 8959584 3' - 1360 52 1 54.11 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTCTGTTTAGCAGGCATCCATCCAAATTGTTCAGGCTTATTCCGGTGCCAATTCGA:1 + chr3R 19449141 3' - roo 8731 2 56.85 TCCAATGCGCTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTCCTGGCTGACGGGCTAGTCCTGCGAATCGGTGCACACTCTCTTGCCGAGGGTGACAGTTTCGGAAATCAATTTATGGGGTTAAGTGACCACTAAGTTGGGGCTTTGGC:1 - chr3L 10192655 3' - baggins 5346 1 76.71 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATGCCGCAACTTGGCAGCGTTTTTAATTCATAA:1 - chr3R 27765066 3' + mdg1 381 2 56.85 ATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGTAAACAACATGACAAATACAAACACACACCTACCATAAGCGACATATGTAAGTGGATATATGTAT:1 - chr3L 5502711 3' - micropia 5137 2 55.17 TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGGTTTTGGGGATGTTTGGGGTGCTAGGCCAGCACAGTTGGGTT:1 - chrX 11419692 3' + hopper 148 105 56.92 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCAAATAATTGCGCAAA:1 - chr3R 12242241 3' - transib2 46 1 53.79 TTATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACAAAACTATTAAAAAAAAGCTGCAAAAACACACAAATAACAATAATAATAATAATTATGATAACAATATTAATAATAATTATAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCT:1 - chrX 21555999 3' + Porto1 4390 1 53.42 TGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCCATATTTTTTCCCATTTTCTTTCTGTGTATTTTTTAAATCTTTTCCTTTTGTTGGTTATTTTGTAC:1 - chr3R 18919798 3' - Doc 4653 1 54.79 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTT:1 - chr3L 9809275 3' - 412 7142 2 79.45 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAA:1 - chr2L 13556326 3' + transib2 2776 1 52.74 TTTAAAAATAAAATAAAAAAAAAATTGAAAAAATTATATCTGCTTGTTTGAATTGGGGCATGGACAATATGGGGTTTTAGCTAATGATATCAGATTTCCCAAATAAATAACAACACTTTTCGTTTTTCTTCATCTTTATTGTTTTC:1 - chrX 11801562 3' + TART-C 11100 1 50.00 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCC:1 - chr3L 12315738 3' - transib2 77 1 70.55 AAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGAC:1 + chr2R 20802653 3' + mdg3 190 2 61.11 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAAGGCGCTTGGGAACAACATGTCAACAAAATGAG:1 + chr3L 10373938 3' - 297 24 2 62.40 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATA:1 - chr3L 22723816 3' + HMS-Beagle2 7155 2 62.33 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAGGCATGGAATTCTTTTCCGCATAAATAAGTCATGTGATAGTGAAAGTAGAATCTGGAAAG:1 + chr2R 11804770 3' - pogo 19 1 72.41 TTTTTTTCTTTCTTCTTTTTTGCGTCTCTCCTTTGTTGTTTTCTTCGCTCGTTTGACGTTGTTTTGTGGTCTTTCTTGTCTGTGATTGGCAAGGATTCCATTTCGTTGCCATCCGCGACATGCTGTTCCTTGACCTGGCCAGGCG:1 - chrX 2015114 3' - gypsy7 5006 1 57.24 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCTTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTGCAAACCATATGTATTTGTAATTAATAAAGTTATTTCTTACCCAAAAGCC:1 - chr2R 11159205 3' - roo 16 2 69.86 ACAAAGACATTAAGAAGACCCCTAAGCCGCCACCAATCTATTGTACATGGACCTTATTAGAAAAGACAGTTTCCACATAATTCCACTGACCAAGTCAAATGAAATTTCTGAGTGATATTTTTCGTGTAGCAGATTTGTGCCAAATA:1 + chr3L 12995210 3' + Fw2 183 1 64.38 TTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTACCCCAAACCAGGAAAAGATAAACTTGGCCAGTTATGAGATAAAAGTAACTAAACAAATATTTTTCTTAATTTTCTCCCGCAGAGCTGTGAAGCGTCGGCTGGC:1 + chr3L 16784877 3' - Chimpo 162 1 76.43 TAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGTTCTGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACACACCCAGACACACATAGATTTCGATTTAAAT:1 + chr3R 22730182 3' + Porto1 342 1 77.04 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCG:1 - chr3L 9269880 3' + copia 233 1 53.42 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGTTATTT:1 + chr3R 24381424 3' + Juan 4182 1 72.60 ATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATA:3 + chr3L 23839697 3' - 17.6 6995 2 78.08 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCACAAAACTTTTATTGATAGAAATCGAAATCGGTACCCTAAGGTACATTTACTCGAAACGCATAATTTTTTAAGAAATTTTTGGAACGT:1 + chr2L 5582236 3' - pogo 31 1 64.38 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGCGGCAAGAGGACCATTTCAGCCTGACAAGGACTCGAGGTCTGAAAATTATCCACCAAAAAAGCTTTT:1 + chr3R 19992743 3' + hopper 1363 1 52.05 ATATCCTAAAAAAGAGAAACCAAGCCAACCAGCGCCTCAAGAAATATTATAGGCTAATAGGAAGAAGATCGAAGTTACCGACTTCGTTTAAGCTTCTTATATAAATTATTTACTCGTGCTCGTACTTTGTCTGGTTGTCGTAGGAT:1 + chr3L 2791725 3' + G7 733 1 75.34 ATAAACATGTTCTTACTACATTTTAAAAATATACCATAAGCTATGATTTTATCAGTCTTGTATGATGTATGGTCATTTGATTTAAAAAATGCTGCATACTTCTACGGGGGGAAGAATATATTGTTTGCCAAAAAAATTGGGTTGG:1 - chr2L 22983957 3' + Transib5 2710 1 89.66 TAATAAACTTACGCAAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGTGACT:1 - chrX 1263913 3' + Burdock 6362 2 61.64 AATATATAAATATATATATATATATATATATATATCTATATACATGGCATATATCGCTGAAGAATATTTTCGTTGATAAAACAATGCATATAAGCAAATAAATTATAAGTTATCATATACCACATCATATCGAAAACAAACATTTC:1 + chr3L 21932335 3' + G3 4506 1 77.40 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGA:1 - chr3R 15790846 3' - roo 64 2 62.33 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCG:1 + chr3R 17736969 3' + opus 7490 2 67.62 CGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACC:2 + chr3L 3501791 3' + Bari1 1619 1 78.77 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTATAAATTAGGATGGCAGCATCCGATATCCTTAT:1 - chr3R 30946462 3' - Transpac 12 2 77.40 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTA:2 + chr2L 14523285 3' - HMS-Beagle2 19 2 41.78 ACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAAACCCCAACAAAGCGCTGCGGAAACATGCTGCCGCAACA:1 + chrX 18742921 3' - invader4 44 2 54.79 AAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCA:2 - chr3R 19992662 3' - hopper 90 1 77.40 AAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAACATAGCCAAATGACCGCACAACAACTACAAACAAC:1 + chr3R 21933292 3' + pogo 2090 1 80.14 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATACGCTAAGCGGAGGGGGAGTTT:1 - chr3L 6518572 3' - 412 78 2 70.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAAGAATGCCATAAAAA:1 - chr2L 4063801 3' + roo 9046 1 66.21 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAATCACACAATT:1 - chr3L 10373790 3' + 297 363 2 65.07 ATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTAAT:2 + chr3R 17996265 3' + diver 6050 2 59.59 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCCAACACGGT:1 - chr3R 5368611 3' + 1360 3370 1 61.25 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGG:1 - chr3R 27160102 3' + 412 7496 2 80.41 TTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTTATTAAAATGGGGAATTAACAAGGTAAATACAATTAAGGATA:1 - chr2L 16357338 3' - invader2 4904 2 69.78 ACACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTG:1 - chr2R 13168677 3' + P-element 2806 1 26.28 AACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAATAGACAGCACTGCCACCAACAACAGGAACAACAACAAAGAAATTTAAATTAAAATCCAAAAACTCCCACACATAAAAAGTCGAGAAAGAAACGCCAAAATA:1 + chr3R 23428142 3' + I-element 72 1 72.60 GTATGTGTGTGTGTGTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAAAGGCAATAATCATAAAGAACCGTCAAGCGCTTTGCTTTT:1 + chrX 5216832 3' - Quasimodo 35 2 72.22 AATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAA:1 - chr2R 7244825 3' - diver 73 2 67.59 CAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATATGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGGTCGTATTACTGTGGCGCT:1 + chr3R 26315212 3' - Stalker 7070 4 71.64 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGTCGTCCTCGTGGCTAACTGGCTTTCCGGCAA:1 + chr3L 24187138 3' + mdg1 7076 8 78.79 AGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCTACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACAACAAAAAGCTGAGGAACCAAATACAGCGAAAGGAGAGGCGAAAAGTACGAACCATAAAAACAAAAAGCGGCGGCGGCAA:1 + chr3R 10087602 3' + I-element 491 1 52.05 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAA:2 + chr2R 5941416 3' - copia 76 2 67.81 TGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCAGCAAGGATAACACAGAAGGAAGGACCAACAAAAACTGACAAAATGAAATTGAGAAGAGGAACTAAGCACACAA:1 - chr3L 13374588 3' + BS 5063 1 53.47 ATTACTTCACTTCACAACCTTGAAAGTTCCCGAGACTCCAATCATTTTCGAATTTAATTCTTTAC:1 + chr3R 10735851 3' + McClintock 173 2 75.38 AAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTTCGTTTTTTTTGGGTTTTTGAGTAATGTTTGTTCGCCGCTGTGGTCAACATGGCGTG:1 - chr3L 3643243 3' - 297 6572 1 60.96 GCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAA:1 - chr3L 24213780 3' + invader2 5028 2 70.55 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCAATTTGCGCAAGGGAATGACCTCAATGGAATGCAGAAAGGTGAATTAAGAGTGTTGGTGGAGGTGGGGGTAGGACTAGCTACC:1 + chrX 7095961 3' + mdg1 7448 2 64.66 AAGTGATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCTATGCGGAAACGACGTGGTAAATGATAAAGTTCTTCCTAGAAGTCCATTATTCAATTA:1 - chr3L 13288477 3' - 1360 372 1 62.33 GTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACG:1 - chr3R 907908 3' - gypsy11 355 2 29.23 TAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCAT:1 - chr3R 19224989 3' - HMS-Beagle 6855 2 58.90 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCA:1 + chr3R 25428255 3' + 297 6940 2 55.83 GGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACTGTACATGCCTGTGAACCTACCCCGACTAAACCTGAACTATATG:1 + chr2L 6209723 3' + accord 7066 2 69.86 GGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTGTGAATAGTTTTTTTTTAAAAATATCTCTTCTCTCGCTGCACGCAATCGATCTCCTTGCT:1 + chrX 14722262 3' - diver 5892 2 76.03 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATG:1 - chrX 4341282 3' + roo 8989 2 73.97 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACA:2 + chrX 12129417 3' + flea 4963 2 52.74 GTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTATAAACCGGGAAAAGAAAATTTGGTTGCTCCCCGCCTCCGATTAGCATAACATCAACTGGACTTGGACTTGGACTTGGATTTGGA:1 + chr3L 20625874 3' - Chouto 39 1 61.64 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTGGGCTCATTAAAATGATCTC:1 - chr3R 16518830 3' - Tirant 8116 2 80.82 ACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATA:1 + chr3L 23839697 3' - 17.6 6997 2 78.08 GTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCATCTAAAGTGAACCTTGGCACAAAATAAAAACTAAATAAATTGCTAACTCATAATATTTTTAGGTTTGTCAATTCTTCTTACTGAGTATAAAAATTAAACTTTTAGTCAA:1 - chr2L 19155712 3' - G5A 2695 1 73.29 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTTCTGGCCAGGAGAAGCAC:1 + chr3L 5061674 3' - 17.6 6953 1 62.14 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGTTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATCCTCTACA:2 + chr2R 6885628 3' - P-element 36 1 60.96 AATATTAATAAAAATTATTTTTTTGTTTATTTTTTTATTATTTAGTTACATATAATTTTATTTTGATCGATTTCTTTGTAATTTTT:1 - chr3L 146471 3' - gypsy9 5308 2 72.09 AACATTGTAAATGAATAGAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGGTCCGTCACCTTATATCTTTATCT:1 + chr3L 21769089 3' + I-element 5272 1 71.92 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGAAGTCACTTCGGTTGCTCTTCT:1 + chr2L 12822869 3' + P-element 2882 2 66.27 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTG:1 + chr3L 12315824 3' + transib2 2771 1 55.40 AGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACAAATCCTAAATTTGGTGGGGCGAACACACAAACTCTATGAGATA:1 - chr3L 24131737 3' + Transpac 4796 1 69.66 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGC:1 - chr2L 9636070 3' + 412 7491 2 52.05 TAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAGATTGCTGGCGCCCGATGAGAACTACCTTTGTCGGGAAAAATTGGTGAGGGC:1 + chr3L 10295919 3' - P-element 201 1 53.77 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGC:1 - chrX 8437686 3' + P-element 2805 1 24.44 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTTCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATG:1 + chr2R 23180281 3' + roo 337 2 64.38 AAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACAAGTACAAATACCTATCCACCGGAAACCCCG:1 + chr2L 20640338 3' + Stalker4 262 4 73.33 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTCGTGGGCGTTCGTGCGAAAATCCTTGGCGAGGCGAAAGAGCAAAAGGCAAATGTCGGACACTAAGAAACGCGAGG:1 + chr2R 19199764 3' + hopper2 1564 1 45.21 ATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAATTTATGACTTGGCACTTTTGGATATTTAGGTAGTGATCCCATGCCATGCAGGTGAAAAGGTCACCTAT:1 + chrX 14628795 3' - transib2 101 1 53.42 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAATTTAA:1 - chr3L 5532911 3' + roo 9028 1 53.42 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTT:2 + chr2L 4063906 3' - roo 91 2 80.82 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTTACCCAGAAACTCCTTTTAACAAAATCGATTGAAATCCGGACGAGTTCATGCCGAGCAATTCAATTTGAGCTACGAGTATGGAAAGTTGAAATA:1 + chr2L 10156247 3' - hopper 23 1 66.90 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTGTCTTACAAGTCGTCCTATATCTCCGGATTTTCCCACAGGGCTCGCA:1 - chr2L 16565107 3' + roo 343 2 57.65 GAGAAACATCAGACGAGTTCAATATTTAAGTTTTTAGAAATTCATTTTTTTTAATTCATGGTGCTGACTCGTAATTAATAACAATATTTATAACTGATAACAATAAGTACATAATAAATTAAAGAAGTACATAAATAAATACAAAC:1 + chr3L 26265110 3' - Gypsy12A_LTR 1881 1 78.77 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATTTGGTTTACAGTCT:1 + chr2L 71261 3' - 412 71 2 65.07 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGGTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAA:1 + chr3L 18505744 3' - I-element 59 1 58.90 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAGACAGGGATGGCAAGGATTAAGCGGGTTGGGCGATGTCAATGCAATTGTCTCTTTCCCTCCTCC:1 + chrX 4341367 3' - roo 53 2 53.47 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGGTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTGTATTCGGGAATC:1 - chr3L 22890341 3' - FB 48 1 49.32 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAGAAGCGACCGCAGGCAAAATTCCAGAAATTCGTGCACGGTGATGTTGTTCTATTGAGATTATTATGAATATCGTTCGACGTTGCCACGTTGATGTCCACTAT:1 - chr2R 12471975 3' + transib2 2809 1 74.48 TATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGATAAAAATGATTTGTTGTGATAGAATGGTGGATTCCCAAAGGGTTAAAATTTAAATTACTGTTGTGATGGTTGCCTTGTGTTTACGTTCCGGACATCTATAGTTCACTTG:1 + chr3R 5552493 3' + Cr1a 462 1 40.41 AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCGCTCACCCCCGATGTGGGTTCGAAAAGCCCAAAAAAAAAAACCCAA:1 + chrX 4437823 3' + blood 7178 2 77.33 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTATTTAACTACATGGCGACCGTGACAGGACCGTCATAAGTGCAAGCACTGAACGCGAGAGGATCAGCATGCCTGGCATTCGATGCTT:1 - chr3L 27654226 3' + mdg1 7437 2 72.27 TGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACTGTGTGATCTGTATGGATACACATATGGATACATATATGTATCCAGCAGCTATCTGATAGATTTATTTGATCCCGTCATTTCGCCCAGGCATTTTGCAATTGTTTCT:1 + chr2R 12185262 3' + accord 6994 2 42.47 ATATATTTAGTTGTTTTTTTTTTTGATTACTTGTTCTAAAAATTATAAAAAAGAGAGTAAAGAGAATGCATTTAATTACTTACCATTAATATGTGATTTCCTTAATAACCAATTAAATAAAAATATTAAGCTATTTTTAGTGTGGG:3 + chrX 14164368 3' - Transib5 29 1 62.33 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACA:2 - chr2R 8099147 3' - jockey 4828 1 64.38 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATA:1 + chrX 8360612 3' + roo 331 2 71.23 ATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGACTAGACTACATTGCTCTTCAAAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTTTCCTCATACTTTGTATAAGCGCATTACCCTTTGTTAACATTT:1 - chr3R 19448369 3' + roo 55 2 66.44 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAA:1 + chr2L 4003768 3' + mdg1 343 2 69.86 ATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTACCACGATACTATGTTCAAATGATGGACCACTTGTTGGAATATTAA:1 + chr3L 22016893 3' + INE-1 151 1 70.55 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCG:1 - chrX 18396099 3' + roo 328 2 69.86 GGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTAT:1 - chr3L 22723864 3' + HMS-Beagle2 224 2 76.71 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACT:2 + chr2L 20266028 3' - roo 8736 2 69.18 TTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACT:2 + chr3L 15099661 3' - G4 3833 1 46.58 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAAAATGGTGTGCAAGTTTCCACATTCATAGATACTTTATTCTTACTTTCTTTCTTTCTATTCATATGAGAAACAGCAATTTCATAGTATCTACCTATGACAAATAA:1 - chr2L 15076062 3' + 1360 3372 1 73.97 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTAT:1 + chr3R 16342039 3' - P-element 56 1 45.52 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCTGCAGTTATTTACCAAACTTAAGGGTGCAACCTTTTCGCCTGGTTTTCCCTGATTTTCCACGTTCTTTTCGGTTGTTCTTCGTTTTTGGCTTGGCCAAGTTTTCATT:1 + chr2L 12984268 3' - hopper 5 2 78.99 AAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACAGCTAAATTAAATGTATCTCAGAAATGGTATCTTTAATTAATGTTTCTTTGAACGGAGTTTGATACA:1 + chrX 19463732 3' + I-element 4964 1 54.11 ATAGTTCCTTAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGATCTATATGGTCGGAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAACACAGTTGTG:1 + chrX 22905663 3' - INE-1 143 1 52.14 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAAT:1 - chr2L 17809160 3' + jockey 4950 1 53.10 GTGTACCTCCAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACCCGCGGCAACCTTGGCACCGATTTGTTTGCTTTACTTTGCCCAACTTGGTATTTTGTTTATTT:1 - chrX 16868655 3' - invader2 4858 1 53.33 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATT:2 - chrX 17343408 3' - I-element 84 1 76.71 GAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATA:1 + chr3L 19350049 3' - 1360 3221 1 56.85 GTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTTTAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCGGTG:1 - chr2R 5106269 3' - Stalker2 38 2 52.54 CAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTA:1 + chr2L 17005810 3' - Stalker2 42 2 50.76 AGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCATAAGTCCGCATTCAGGATACATT:1 + chr2R 2318270 3' - ZAM 30 2 65.07 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAG:1 + chrX 12129429 3' + flea 4975 2 58.22 AGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGACTGGGGCTACAAAGGCTGTTTATACA:4 - chr2R 7244762 3' - diver 11 2 77.40 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAATAAACTTAAG:1 - chr3L 9809251 3' - 412 47 2 57.81 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCG:2 + chr2L 16539785 3' - Juan 4048 1 66.44 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAAGGTAAAAAAGGATTTGAAAGCTATATAAGTGACTAATTCATATTGACTTATAACTTTCAATAA:6 + chr3L 14366639 3' - roo 8717 2 53.42 GGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAAATGCATACATACATTTTTTCTAACCAAATCAGAAAAGCTATAATTCA:1 - chr2L 23373100 3' + Gypsy12A_LTR 1969 1 34.72 GCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAAATGAAATCTTATTTATTGGAAAAGCAGCGATAAATGGAGCTGCACTCGAAGATTTGCAAAGAGGATAGTAAAACACACA:1 - chr3R 9070761 3' + Bica 45 1 58.22 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACTGTTGGCGCCACACTTT:1 + chr3L 24934441 3' + HMS-Beagle2 7176 2 74.66 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATCTATAGGCAGATAGTAAAATAAGTATAAAATATAA:1 + chr2L 10548647 3' - I-element 23 1 67.81 TGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTAGGTAACCAGATGGTTGCTGCTGATATGCCAGTGGATGTTGAGGCGTCTGGGACTGGGAATACCCGGTG:1 + chr3L 14772280 3' - F-element 4436 1 60.95 TAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAAAGCCGCTCCCCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGGCGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACAATGTAA:1 - chrX 21949030 3' + 412 7312 2 85.25 GGTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAG:1 + chr3L 22744715 3' - FB 71 1 67.12 AGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTT:1 + chr3R 27083105 3' - jockey 4611 1 72.60 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGTTTCTTGTGAAGTATTAAAGTTAGCTAACTGAACTGGTAAGTAAAGTCACTTTTGATGGCTGTTTGGAAAAATTAACCCTGCGCTAAGAAATAAAAAGATAATC:1 + chr3R 14767446 3' - roo 16 2 68.49 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGCAATCAAGCATTAAACTTTTGTTTCGTATTGGCCGCAAAAATAAGTTAACAAAATGTTCACTCGTA:2 - chr3L 14094535 3' + I-element 5338 1 66.44 CAGTCCGAAGAGAAGGCCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTCTTTGTTTCCCGGTGCTTAGTATATGTCGTTCTTGTAGTGCTGCTGTGCGTCTATTCACCTTTGTATTTTTTTTTTGTGTT:1 - chr3R 19101428 3' + accord2 245 1 49.32 AAAAGGAAAAAGAATAGAAAAATATAATCAATAGAGATACAATTTGCTATAAAAAAGATATTATTTATTAAGCTTTAAAGTTCCAGCTCATCATTTTAACATATTACTACGGCTTAAAAATCATCTCATCAGTTATGATTTTAATT:2 - chrX 17044925 3' + Doc2-element 239 1 78.08 ATTTTGTGGTATAAATTGGTTTTTTTTTTTGAGGAAGAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGAGATCCGGCTAACATTTCGATGTGCCCTTTCTTCTTATTCTTAACTCTTAGATTGTCGATTAATGTTTGGGATTTCTTAACTT:2 + chr3L 27716769 3' - I-element 5170 1 61.64 CTAAAAATCAAATTAGTAACCGAAGTAATACCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGGAAAATAAGGTGAAAACAAGATTTAAAATA:1 - chr3R 23355960 3' + Doc 4424 1 76.71 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGCTTTGAA:1 - chr3L 17567834 3' + S-element 170 2 66.44 ACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTTACTATGAAATGAATACAACGAGCAGAGCGATTCGTATTAACTGTCTGGCTAAGCGCTATGAGCAACAACAATAAAGCTGCTCCATAATAATAACCAAAACCGATTAGGCAACA:1 + chr3R 13612647 3' - F-element 176 1 72.41 ATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGAGTTATAGAGGTTCTACTCGAAACGGACCGGAACGGAACAAAGCATATGCAAACTCGTGTTGGCGCTTTTTCTTGGCCGAAATCAGTCATAACTTATTTG:1 + chrX 12965255 3' - I-element 5122 1 67.59 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATAATGCACTGCAC:1 - chr3R 5768966 3' + roo 9060 1 76.43 TTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAATTTGTAACAAAAACCTTGCGAGGCCAAGTGGCTTTCCGAGGAGTCACTCGCATAC:1 - chrX 23182795 3' + Idefix 7357 2 62.33 ATATACATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGAAAAATCAAATAAAAAC:1 - chrX 21948989 3' + 412 7330 2 70.34 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTGTTGTTCAGCGGCTAGCAGCCGGTTCTGG:1 + chr2R 7090779 3' - I-element 9 1 78.77 AAATACTAAAGCTTTTCAAATCAATGGCACCAAAAAGGTAGGTGGTGCAGGGGGGGGTGTGAAGGGGGGATGTGAATTCGCACGTGCATGAATGGCACCGAAATAATTAAAAATGCTGCTGTTGATGCTTAACTAGTTTTTAATA:1 + chr3L 22113194 3' + S-element 1433 1 75.86 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACGACCCAATTTCTTACCACTTTTTCCTTGGTGTAACAAATTGATGGCGCTTAGAGCCAGTTAATGTCGTTTATTTTTGG:1 + chr3L 17940226 3' - 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flea 4741 1 61.70 TATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATATGTTTACAATGTATCCGCATCCGTATATATGTATGTTTTAGGCTTTTT:1 - chr3R 27843169 3' - I-element 5343 1 63.31 TTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTTTCCTTTGTTTAATCAACTCTCTTTTTTTCTTTCTTGTTATTTACTTGAACAGTCAGAGTGTTGAGTTATGCATAAGCACACACAATTGTTTCTCCCTTCTT:1 + chrX 5126699 3' - I-element 205 1 76.71 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATT:1 + chrX 1341735 3' - 412 7112 2 56.85 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTT:1 + chr2R 6847846 3' - Doc 64 1 58.90 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATGACTAATTACTGTTTACACCTAATCAATTCCT:1 - chrX 5323224 3' - Juan 4099 1 52.05 TTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAATAAATTTTCACGTTTATTTATTTTTGCACCGCACGTCACTGATAATTAA:1 + chr3R 27843306 3' + I-element 5348 1 68.49 ACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATAAAAATATATATTTTATAATAATTGTAAGTGTTAGAACTATGTGGCGTGCCTCACATTTGCGAAAA:1 + chr3L 23392880 3' - 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mdg1 47 2 53.47 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCT:1 + chr3R 27123555 3' + roo 8999 2 73.13 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGAAGAAACTTCTATAAATGAACTTAGTATTACATATGTGTGATTATTTGGGGAACGACAAAGCAAGTTAAATAAACAAGTTGCTTTCAAATCAACATTGATTTTAAGTTTTCA:2 + chr2R 21116625 3' - mdg1 7047 2 28.77 ACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGTTGAGTTTCAGAATTT:1 - chr2L 23286568 3' - Tirant 417 1 51.69 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAACGTGCAAAATTTGAGAAAATCGGATTTAAACAATGTGTTGCTATTCTGATTAAATATATGTAATTTTATAACAAATTTGTATACGGATATGGAAA:1 - chr3R 15724262 3' + Juan 4194 1 68.49 TCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTTGTGTTTTCATGTGTTGTTTTTGTTTTTTGAGTGCTTTTTATATTGCGCCGCTTGTGCTTTCTCCTCTTCTTTATACGCGGATTCTT:1 + chrX 13753423 3' - Porto1 4471 1 63.70 AGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGAAGCACTTTCTGCTGAAAGGAGTTGAAGGAAGTGCCAAGTGTTACAAAGGATTG:1 - 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chr2L 4063791 3' + roo 411 1 81.89 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAAC:1 - chrX 10319575 3' - mdg1 7068 2 65.07 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGGCAAAGGAAAACC:1 - chr2L 12818236 3' + hobo 2898 1 50.81 AAAAACACACATAAAAAACAACAACAAGGTATTGTGTCTTTGATGCTTTTATCAATTTCGTATGAACAATTAGTTTTATTTAAGGTGGAACTTTCCAAATGTTTAGCTTATGTGTTTAAGCTCGAAGATTATGCTCTTTGCCTAAA:1 - chrX 19146423 3' + transib1 2142 1 80.14 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGTTCCACCGAG:1 + chr2R 8157314 3' - mdg1 7059 2 71.23 TTTTTCTTTTTTGTTTTTAATTAAATTAAATGGACGTTTAAGTAACTATAATATTATCATGCCCACTTTTCTACTAACTTAATTAAATAATTAATGAACTATGCAGGCATAACTTAAAGTATAATTCTGATTTAACACATGTTGTT:1 + chrX 14155267 3' - Doc 4700 2 72.60 ATAAAAGTGAAACATTTGTTGAATTGTTTGAAATTAAATACCTAATGATATTTAAAATTATCCAAAAAAATGTATATCCGTTGTTTTGGTTCATAAATTGTTCTAATTCTTCTGAATATAGAATAAAATTGCGCAATTAATAATAA:1 - chr4 847022 3' + HB 1502 1 63.01 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGC:1 + chr2L 9636160 3' - 412 7130 2 69.86 ACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAAGGTCGAAA:1 + chr2R 4545168 3' + invader1 3578 1 72.28 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGTTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGATCGGTTTCTGGCTTAAAGTA:1 - chr3R 19224965 3' - HMS-Beagle 6831 2 64.38 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGGCCGCCCCAAAGTCGCCC:1 - chr2R 22034627 3' + copia 5086 2 57.53 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGCATATTGTTATGAACAAAAGCATATGCAAACCATAACCCCTGCATCTTCCTTCCGCTCCACCATCGAAACCTTGGGTTACTATT:1 - chrX 18742770 3' + invader4 297 2 66.44 ATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACACACAAACACACACACGTATACTTTTAAATGGCGAGTGTAAGTGAACATACGTTTCGAGCAATTTATTGGACTTCCATCCGTTTTCGGGTA:1 + chrX 1341477 3' + 412 7238 2 67.36 GACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCTAGATAGCAACAA:1 - chr3L 17183621 3' - diver 5889 2 77.04 CGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGAGGGGTTTCAGCTCGAACGGCAGGGCAGGGTAACGGGT:1 - chr2R 18874760 3' - Doc2-element 4416 1 77.19 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTCGCTGGTTTTTCGCAGCTCTTTCATTATGCCAGCTGGCTGG:1 + chrX 4808647 3' - mdg3 5259 1 79.37 AATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATTTCCCAGGGGCGTGTTAGATGTGCACACAGCAGAAGTGAAGAAAATAGCACTAAGAATAAACAGCACTTCAATAAAACTTAAATCTGTTGTAAGT:1 + chr3L 16870774 3' + flea 257 1 68.49 AAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCCAGACCAAATGGTAGGCTC:1 + chr3R 11062890 3' + roo 405 1 78.77 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCT:1 - chr3L 6397687 3' - roo 91 2 77.40 GTCGGAAAAAGTTGAACAAATGTGCAGCGTAAACATTGTCTTCATAGCAAATTTGGAGTTTATTTTTAATAATGGAAAAATGGAACGCTTCCTCCATTTTCACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAACGAATTAAAATAATTGTAAA:1 + chr3R 4947817 3' + transib4 200 1 57.53 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATTTG:1 + chr2L 18549949 3' + roo 9033 1 61.11 ATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAACCTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAAC:1 + chr3R 25428227 3' + 297 305 2 81.51 CTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACGTTCTCCTTTCATTAAGTAGTGCGTTTATGCATTTCATTCCGAAAAGTA:1 + chrX 5769308 3' + GATE 413 1 73.97 AATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAG:1 + chr3L 24934383 3' + HMS-Beagle2 235 2 71.92 TCAAGGCAACCTCTGCAGGAGACGAGCCGCAGAGGGAGTGCGAAGGAAATACACACAAAATATAACCTTCCCGAAAAACCAATCCTGTT:1 - chr2R 8053911 3' + Osvaldo 251 2 50.56 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCC:1 - chr3L 18281882 3' - Doc 90 1 80.14 ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATG:1 + chr3R 28901299 3' - transib2 83 1 73.97 CATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGCCGGCAATGAAGGGGTACACAAAGCTGTCAATCTGCACGAAGTTCTTTCG:1 - chr3L 68380 3' - I-element 5027 1 59.20 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAA:1 - chr3R 27315091 3' - jockey 4693 1 59.22 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGATAAATGTCGGAAATTGGGCTGGGGGTAAGTTAGGTCA:1 + chr2R 23180312 3' + roo 9032 1 56.16 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCG:1 + chr3R 15325162 3' - 297 60 2 73.39 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTG:2 + chr2L 12818367 3' - hobo 26 1 66.44 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCGACTCTATCGCC:1 - chr2R 21116426 3' + mdg1 7452 2 58.22 TACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGAACGCCAATAGCAACTCCAACGCACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACAC:1 + chrX 20361964 3' - accord2 195 1 56.67 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTACTCTACGACTAACTGGTATAATTATGTGG:1 + chr3R 7317640 3' + I-element 5269 1 77.62 AAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAA:1 + chr3L 20187389 3' + FB 442 1 72.60 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCAAG:1 - chr2R 19199636 3' - hopper 32 1 62.33 GTACAACAAAACGGCAAGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGATCAAAGATCTGAAAACTGTGTCAATTTGGTCGGGACAAACGAAGAGTCCCACAAAGCCAGAGATCTAACAATGAATATTTGCATATCGTTCAATGGAAATGCAA:1 + chr2L 14179991 3' + Bica 252 2 68.49 AAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAACCCCCATTCTCTAATTAGGTTAACAAGTCCGGTTTCTAAAAGCAATTAGCATTGTATTCGTATATTACATGTTATAA:1 + chrX 15850051 3' + Doc2-element 239 2 75.00 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATAC:1 + chr2R 15593231 3' - transib2 54 1 55.86 TATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTT:3 + chr3L 19350012 3' - 1360 3258 1 57.53 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACAT:2 + chrX 10521706 3' + Tabor 400 2 74.66 ATGTGCAAAAGTAAGCAAATAATATGTCTTCATTTGCACACACCCATTTGAGCGAGGGGTATTTCAAAAG:1 + chr2R 4511833 3' - transib2 209 1 71.43 TAATAATATTAATAATAACAATAATAATTATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAACAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATAATAAAATTAATAATAACAATAACAATAATAATTATAATAATAATAACAATA:1 - chr3R 9485828 3' + mdg1 18 5 83.56 TTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCA:1 + chr3R 1844852 3' - Cr1a 152 1 53.85 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAA:1 + chr2R 5151319 3' - roo 8729 2 63.70 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACA:1 + chr2R 6847838 3' - Doc 72 1 64.38 CCTAATATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGAGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGT:1 - chrX 22906778 3' + transib3 2731 1 73.29 AACAATATGCCCAGCTTCTAGCAAATATAAAATGTACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATAAAAATATATATTTTATAATAATTGTAAGTG:1 + chr3L 23392845 3' - invader5 3736 2 51.37 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGATAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTT:1 - chr3R 4217687 3' - 297 6626 2 69.84 AAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAAT:1 - chr3L 21996152 3' + Transpac 4804 1 78.08 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACAT:1 + chr3R 18488466 3' + roo 9010 2 64.38 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCT:1 - chr2R 20010180 3' + Juan 4169 1 53.42 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATAATGCACTGCACAAT:1 - chr3R 5768963 3' + roo 9057 1 75.34 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAAT:2 - chr2L 7660917 3' + I-element 5288 1 62.33 GTTTCTGCCATTATTGTGACCCTTTTCTTTGGCTTCGAAATCATACTGAATCCTAACATGCTAGTAAGTGCAGCATCAATTTCAAATGAAGGAACAATGTCAGCCGGATCATGGATCCTATCATCATTTTCAGAAATCTGTACATA:1 - chr3L 12774371 3' - hobo 452 1 52.74 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCAGGGTATGATTCTCCCGCGAAAGACGATCGCTGCGCTGCTTT:1 + chr3R 27123620 3' + roo 389 2 71.92 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGTTTTTATAGCGCACATATCG:1 - chr3R 17996131 3' - diver 5914 2 65.07 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATAA:1 - chr2R 3564022 3' - Tabor 41 2 57.53 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAA:1 - chrX 8027407 3' + Juan 4197 1 57.89 GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCATCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTAAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATTCGAAATTTTTGTTTAGTTTTTAAGGATTTTGCGCCTGTTATAAAAGAATTGTTT:1 + chr4 211543 3' + 1360 194 1 66.44 TAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAA:1 - chr3L 24131408 3' - Transpac 4993 2 72.60 CAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAAGGGCGAGGAAAAGCAAAAGGCAACATAGTCATGGGCCAGGCAATGGAGGTGAAGACTAAGCTTAGATAATCGCAGGCGCACGAAAGGCAAGAACAAGAACAAGAAGCAGATGAT:1 + chr2R 20449178 3' + Bica 431 1 68.06 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTAT:1 + chr3R 15364047 3' + flea 4983 2 65.07 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGAGCTTTTGTCCCGTGCCCGTCAGTGTGCGGCTCCAAA:1 + chr3L 8685226 3' + I-element 5287 1 66.67 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGC:1 + chr3R 12115331 3' + 1360 3322 1 75.83 GTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAAAGTACACGACCCATACAACAAACAATCGAATATAAGGTGGATCTATTTCCACAAGCCCTT:1 + chr3R 20971867 3' + I-element 62 1 58.62 GTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCAATTGGAATTGGAACTGAAATCAAGAGTGCTCTGCCTATCAATGATGTACTAGTTCATTGATTTAAGGCAGCTCGTTTCAAATGATAGTAATTAGCTATTATGCGAATCTATATCT:2 + chr2R 12645563 3' - X-element 15 1 76.71 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCTGACAAGTCTATTACTGAACTGGGAATAAATTCCCATGAAATATGTTTTCTGTAAAATAA:1 - chr3R 13406410 3' + pogo 2043 1 60.96 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGC:1 - chr3R 9002932 3' + roo 9029 1 61.68 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGTCTCTTAAAAAGTGGT:1 + chr2L 12251010 3' - 412 44 2 50.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGT:1 - chr3R 11191361 3' + roo 9042 1 63.01 AAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACAT:1 + chr3R 11062843 3' + roo 357 2 50.00 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTCCCCCGCGACGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACCTTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTATGGAACA:1 - chr3L 23249372 3' - rover 6998 2 51.37 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATATTTTAGATT:1 + chr2R 330270 3' - HMS-Beagle2 7 2 79.45 GATACCTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACACTCTATTTACTTTATTTGTTTTCTGTCAAACCTAGTGGTCGACAAAAAATGCATT:1 + chrX 18989996 3' + Chouto 174 1 58.52 TTTGGTTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGGGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATTAAAAAGATACATAAGAAAAATTCAGCTTAAATTTATTATATGAATTAA:1 - chr3L 16651658 3' - Quasimodo 70 2 63.01 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACT:1 + chr2R 13259384 3' - mdg1 7098 2 56.85 AAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCCAATTGACTACATAGGAGTACTTATATCAAATGCTAGTTCTTAAGTAGTTGTATTTCCCAGAAGTGTACACTAAC:1 + chr2R 21395393 3' + Quasimodo 7159 2 50.34 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGCGGTATAAGGAACA:1 - chr2R 4673514 3' + Quasimodo 7357 2 77.93 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCGATGATAGG:1 - chr3L 15913817 3' - jockey 4789 1 63.70 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATATGTGTATATTTGCTCCCGAAAACCTATAAAGACTTGAGCTTCATT:1 + chr2R 17926392 3' - opus 71 4 71.23 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCCGGCCGTCGCTTTTGACGTTGCAA:1 + chr3R 27843257 3' + I-element 5302 1 55.94 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCACAAA:3 - chrX 7795466 3' - roo 15 2 77.40 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAACTTTTCGCGCAATTCTCAAATGGCAAACAGACTA:2 - chr3R 23881383 3' - FB 88 1 79.45 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAA:1 + chr4 373086 3' - pogo 32 1 62.33 GTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTTGTATTTCACTTTCATTAGAAAGGTAGAGATGGAGAGAGAGAGTTCTCCGTTTTCGGGCCTACGACAACAAATTTATTGTTTCTCCGGTGAAACGCG:2 + chr3L 7820709 3' - I-element 5130 1 63.70 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATATATACAATGACAGATGTG:1 - chr3R 18971730 3' + Juan 4129 1 76.71 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACGGTTTACTTTTT:4 - chr3L 7889551 3' - roo 8718 2 61.64 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTG:4 - chrX 15357632 3' + hopper 1376 1 56.85 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGACATTGTCATGGATAG:1 + chr2R 13766330 3' - roo 33 2 63.70 ATATATTTTTATATTTATATTTTACAAGGAAATTTTCAGCTAATTTTTCCCTTTTTTTTAGGAGTTTTTTTTTTGTGTCGTTGGTCAAACAGTGGCCAAGAAA:1 + chrX 7995905 3' - Stalker 89 4 53.40 AATATAATTATACTATTATATTAATCAAAATTTTCTACGTCCAAATGCATAGAAAATGGATCATCATCATCCGAATCCGAGTCGGTTCTTCCTTTATTGGAATTAATAAAATCATTAAATAAAAAAAAAATGTTATCTTTTTTAT:1 + chr2R 676097 3' - transib3 2612 1 57.24 ATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAAGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTAC:1 + chr2R 2318213 3' - ZAM 8048 2 75.17 ACTGTGTCTTTCCAATTATGTGCGCTTTGCTTATCGCGGAATTACCATCGCCCAGACGACGGTGATGGGCGAATGGGAAGTTGGCCAAGAAGCCCCAAGTAATAAGAACTCAAATTACAATTGCCGAGTTCCATGTTGTTTCGTAT:1 - chrX 5499685 3' + Ivk 34 1 45.89 ATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGTTAGCCATAACTGATGCCGTTTTTCTTTCGTCCTAAAGGTCCGCATCTCTCTCCCTCCTGCCTCGCC:1 - chrX 12143081 3' + Quasimodo 6986 2 53.96 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGATTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAAATAATCGAGCATGCTAATGACAA:1 + chr3R 7719854 3' - roo 8670 2 75.00 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATT:1 - chrX 7795523 3' - roo 8736 2 71.23 AAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGCTGGTTTAGTTTTTACTTTTA:1 - chr2R 330094 3' + HMS-Beagle2 301 2 70.69 GGGCACCGTGGTACGTTCTGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCGCCATATTAAATGTGTATTTATGTTTTAAATAAAGGTTTTCTAA:1 + chr2R 9972754 3' + F-element 4359 1 68.49 AGCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACCGTTCCAAGAATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACATAAAGTTAATTAAACACATTACACACAACAACACGGAAGAGGCAGAATTGCCCTGTCTCTTTCCTTCTTTCGCCTTAGACAGC:1 + chr3L 13902975 3' - Cr1a 4046 1 52.74 CTAACTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTCGAGAATGCTATCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTTTTTACACTTAAAAAAATGTAGCTGTTAAGATGACTTTGGTTTGATGTTTGA:1 - chrX 22518953 3' + INE-1 543 1 61.64 TTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTTTCGGCCATTTTGAGCTCCATTAATTGGTCAATT:1 + chr2R 9967164 3' + Bari1 1678 1 65.75 ATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCA:1 - chr3L 24272063 3' - gypsy11 76 2 56.16 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAAATTGAGGTCGGA:1 + chr2R 23180275 3' + roo 331 2 69.86 AGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACACGAGTTACCACATCAGCAATTTGCACTACGATCCGCCACGCCCCCCTGATTAAATACAGCTCCCAATAGGTTTCTAAAAAGTCTCCTTATCAAAATTGAGACACGCGTC:1 + chr3L 9502898 3' + jockey2 44 1 43.84 ATAGTATATAAATATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTCATATATTTTTCTTCACTTGCAGGTAAGTGGCACCTATCCCCAGAAGGGTGAGTACCGTTTATT:1 - chr3L 22547898 3' + invader2 4908 2 77.40 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAA:1 + chr2R 11164520 3' - roo 46 2 54.11 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAAACAATGTGAAAAATGGTAATGTGAGCGCGGCATCACGTTC:1 - chr2L 19674922 3' + 297 6952 2 60.96 GTATATTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGACTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGATTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTG:1 - chr2R 2146570 3' - I-element 210 1 65.67 AAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTT:1 + chr2R 4103361 3' + invader1 3998 2 63.01 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACAACCCGCCTACTCCGTGGGAGAAAGCGAACGAAAGTTTTTCCCCACACAAATGCGAA:1 + chrX 20455777 3' - hobo 4 1 80.14 ACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGGTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGT:1 - chr2R 7244841 3' - diver 90 2 76.03 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAATACTGGAGAAATAAATAATATGGGAAAAAATGGAAAAAATATGAATGAATTCGTTTATATTTTTAAGATTGCATACGATAAAT:1 - chr3L 18920387 3' + mdg1 7079 8 73.29 AATAGGGCTTATGAATCTTGCATGCCCCCTACGGACTGTAGGTGTTTTCTTTAGAAGATTTTCATTTTCCTACTGAAATTCAAATAATAAAAAAAAA:1 + chrX 7830564 3' + Rt1b 5067 1 81.44 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGTGCTATAGCACTATAGTGGTGCAG:1 + chr3R 23491920 3' - transib2 81 1 79.39 GAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGTAGATCGCCAATATGAACCCATGCGTAAGCCAGCTC:1 - chr3L 16162319 3' - accord2 7588 2 61.02 AAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAATTCCACAGCAGCCAATATGCCGACAGACTTAGTGCCCACCCGAAAAGGGGTAAACTTTGCACACGGCA:1 - chr3R 17268919 3' + G5A 2555 1 77.78 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTA:2 + chrX 21100300 3' - mdg1 18 2 73.97 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTTTTAATCTAATCTGG:2 - chr3L 2145861 3' - roo 32 2 58.22 AAAGTGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAGATACATAGAAGATTGCTGGCAAAAAGTGCCAATTAGTTGTTGGCCTGCAAAGGGATAATGCTGCTGCTGCCTGCTTTCAAAG:1 - chrX 8628103 3' - Tc3 322 1 60.27 CACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGCCCAAAAACGATGACGTAGTCGTCGTCCTT:1 + chr2L 8338226 3' - P-element 1 2 77.67 AAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGCTACTCATTGTGTGGCTAAGGACATTTATGTAGCTATTTTTACGTTTTTCAACTTGCTGCTCGGTTGGTTCTAGCCATAATGTGGGCTTAATGTTGCTGAACAGGAAGAAATTT:1 + chr3L 2413047 3' - F-element 4441 1 78.77 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAATAAAAT:1 - chr3R 19073197 3' - roo 75 2 71.92 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAA:1 + chr3R 13187486 3' + I-element 5264 1 76.71 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGGGAAGGTTGTTCTAGA:1 - chr3L 17183630 3' - diver 5910 2 63.70 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACACATTAATATTATGGTCTGACCTTCTGCTGTGAACTCTTCTGTAGCAAACGAAATGAGTATTCCCTGGCTGGCGCCCTCC:2 - chr2R 6965468 3' + Transpac 274 2 51.37 AGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATC:3 - chr2R 7244838 3' - diver 5975 2 73.97 ATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATCAAAATCAAATTTATTTTGTTAATTTGGAAT:1 - chr3L 18768453 3' - S-element 87 2 78.77 ACTTTTTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTTTTTTCCGATATTGTTTCGGTAATCTAACAAAAAAATTTTTTTTGAGCAGTGAAACTCAAAAGAGCTGACTGACCAACATATTTTTTGGCAA:1 + chr3R 8893270 3' + Tc1-2 1402 1 47.26 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTT:2 + chrX 7795632 3' + roo 9030 1 56.85 AGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTCGGTTCTGTTCTATTTCTTTTGTCGTAGCTCCAGAATTCTCTGCATGTCCGGTTGGTTTTTGAGGGATTAAGTTTCCGGATCCCGGATACCGAA:1 - chrX 14798645 3' - G2 71 1 67.12 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTG:2 - chrX 21224565 3' - roo 88 2 79.45 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGAC:1 - chr2R 18316008 3' - HMS-Beagle2 8 2 75.00 ATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTG:2 + chr3R 24381373 3' + Juan 4131 1 73.29 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATAGTTATATTTGCGCGCGTACATAAATAATAAAGGAAGCT:1 + chr3L 23320130 3' + roo 326 2 76.03 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAACACGGTGTTGACATGGTGTTCTCATGGTACTCAAAAATAATTAAGTATGTATCAAAGTATTAGTGCGAAAAAATGTGAAATAGAAAGTTAACATTTTAGCATATAGGAATAC:1 + chr3L 23287372 3' - 1360 9 2 80.14 GCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTATGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACCACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCAC:1 + chr3R 433137 3' + 1731 239 1 67.12 AACGGGTATCTAATAGTCGGGGATCTCGACTATAGCATTCGCTCTTCTGTTTTACTGTGGACAGAGAACTCGCGTTTTAATCTCATTTTATGAAATTAAAATTTTTCAATTTTTCGACTAAAGATAAACTTTTTCTGCTTGAATGC:1 - chr2R 25132053 3' + INE-1 553 1 55.48 CTAAGANTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAGTGTGAGCGAAAACAATGGCTGACGATAAACTGCTACACATGTTAACAAAGTTAGGCAGTTACAGTTACTTCACTGCTGCCCCCATTCAAAAA:1 + chr2R 21443480 3' - jockey 4787 1 71.92 TCATAAGAAATTATAATAACTTGAGGTAATTCTAATACTTTGTATGCATACATACATACATACATACAGATGCGTACATATATTATTATTTAGTATAACCATGCATTCTCATGCCTCGTTCTTTTGTGTTTTTAATTTTGTTT:1 + chr3R 18917402 3' - S2 1450 1 69.93 TCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGCTCCGATAAGGATATTTATTTCTGCATTCTACGAAACACACATTTAATGCCCATAAATCTTTCTTTTAA:1 + chr3R 20273471 3' - 1360 226 1 53.42 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGATTAAACATGATCTATTAAGATTAAAGGAAGTGTTTTCCTATTAGGTCATTAGTCGTACA:1 - chr2L 10156108 3' + hopper2 1548 1 58.90 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCT:1 + chr2R 11164546 3' - roo 20 2 71.92 TGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAAT:1 - chr2L 7618456 3' + X-element 4656 1 58.22 AAAATGTATAATTTAGAAAATATATGACATAAAGCGTTTGACCATCGCTTACAACTCATATATCAAATACTGGTGCACCTGTTCTGAACTGTCAACCACTCGCAAGTCCACACCTGTTAGTAGTTTTGAACGGTGACACTTTTG:1 + chr3R 1438677 3' + FB 249 1 64.58 CAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCGAAAGCATTCATTGTGAAATTGCCACTCAAAATTGAAACAGCGCGGACAAACGGTTGAAGAAACGCAAAGCCCCGTGCGAAAAGAATTTCATAAGCAAAAGTTAATCGGGTGCTAAA:1 + chr2R 7249254 3' + I-element 368 1 80.14 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCGGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCA:1 + chr3L 13739668 3' - BS 5017 1 57.63 ATTTATTTTATTTAAAAAAATTGTGGGACCAAAAGTAGGCAACCTTCTATATCAAAAAATATTGATTTTATTATATAGATTCTGGAAAAAAGCATATCGTATATCAAATTGCCTTTAGTTTGAGTTTAAATTGTGGGACGCCTTTC:2 + chr4 97362 3' - Ivk 5378 1 69.86 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTTCGAATATTTTTCGT:1 + chr3L 21380649 3' - I-element 32 1 62.94 GTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGGGGAGTCCGAATGGATTTTACAGGTAGGGTGGGTTTTTAAGTGGATGAGTGACACGAATAGCGTTATTATTTGATTG:1 + chrX 2654427 3' + Circe 7108 1 68.49 AACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTATCGTT:1 + chr2R 4659361 3' - S-element 1494 1 49.32 AGAAAGAATGCTATATTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAAAAGTGTGGTCCAGACAGCGGCGCGCAAAAGTTTCGTTGAGAGAGAGCGTTCAAAAAGTAGAGAGAAAGTTGTAAATGAAACGGAAGAAGAGGACA:1 + chrX 16519166 3' - INE-1 576 1 60.27 ATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATTTTTCCGCAAGGTCTTCAGCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCGATGTTAGGTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCGTGAATAA:1 + chr3L 25186295 3' - Max-element 376 1 73.21 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCG:2 + chrX 21224620 3' + roo 327 2 71.23 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGCGAATTGATTCGATCTCTTAAATGATTCTAGTTTTAGCTTTCCACCGAACAGCCGCCTAGTTTTCGTGGCAACTCCAATTAGAAGGCC:1 + chr3L 16437265 3' - F-element 48 1 43.17 AACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGTACCTGTCAACGCCTTTACCTGCTCCCTCTCCGCCGAAAACCTGGAGCAGTGCATTAGTACATGCTCTGTTTCCTCACAATCGTCGCCGAAACAACATTAGTCGAAGCTGCTGCAGCGGCA:1 + chr2R 5660913 3' - Rt1b 4696 1 72.60 CGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTAGTATTGATGTATGCGGACTGGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTGTGCGGCGGAGAAGTGTGATTATTAATTGGATTTCGACGTTTTGAAGGCAGCGGATCGCCAAATTT:1 - chr3L 21135940 3' + invader1 177 2 54.79 AATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAATGGCATTTTTGGGTGGCTTTTTTGGGCGACTCGGTCGGTGG:1 - chrX 2835179 3' - S-element 370 1 71.92 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAA:1 - chrX 13134906 3' - jockey 4807 1 59.65 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGA:1 - chrX 13134900 3' - jockey 4830 1 65.03 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCCAAATATATATTTATTAGGAAGTTTAGAGCA:1 - 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Idefix 324 2 62.33 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAG:1 + chr3L 3983853 3' + P-element 2782 1 14.38 GTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTAAATGGTTGCATTTAATATAATTTATAAAATTTCAGAATGCTACAATGCCAC:1 + chr3R 7318314 3' - I-element 4897 1 64.38 AATTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATTTGCAAAGAAAATAGAATAGACAATAGAAAATCTGCATCCATCATCTTATAAATTGCCATACACACGTCTAGAAAAAAAAAACCGAAAAACAAAGCCCGGC:1 - chr2L 18755496 3' + rover 7038 2 37.67 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTA:1 + chrX 1341732 3' - 412 7115 2 58.90 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCTTACGC:1 + chr3L 12249909 3' + roo 9017 2 55.48 TATCTATCGATATTCCAGGAAAACACCTATGGACCGCCGGCTGAGGGCCCAGTGGACCAGGCCCCTGCCGCCGATCCCGTGCCCGCCGG:1 - 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roo 8692 2 66.44 ATTTGTTTTCCGTATTTGAAAGAAATCCAGTTGATATGACAAGCCAACTGAAGCACAATCGAAAGAAAAGGAAATTAAAAACATAAATAAAAGCAACCCTCTCACACGCAAGGGTTAAGGCCCAGTTGACCCATTCTCCTGCAACA:2 + chr3R 7429178 3' + R1A1-element 42 1 77.40 AAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAGGAAATT:1 + chr3L 22744709 3' - FB 77 1 72.60 TAACAAGTGACACGACAAACGCCAGAAATGGGAGACGTCACCTATCAGATTTAATCTTTAAAAAAAATATATAAAAACAAACTTTAGACATGTACCTACATTATAAAAATAACTAAATATTTTTCGATGCAACAGTTTGGTCCCCT:1 - chrX 21589345 3' + mariner2 708 1 80.82 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAAT:1 - chr3R 23618149 3' - hopper 22 1 55.42 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGATCGGGAGTGGCATTGAAGTGTGCCAGCCATGGCAACCGGCATCCGACTACCGACTACCGAGTGCC:1 - chr3R 11469274 3' - Tabor 27 2 66.90 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCAGAACGACGACAGCTTGTGTGTGTGCGAGTCAGTGTGCTAGTGTGTTGGTGTTGGAGTG:1 + chr2L 2527725 3' + hopper 1353 1 58.90 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAGCATTTTAGGGAACAAACGCAGAA:1 - chr3L 23249363 3' - rover 38 2 60.27 CATACGGATAGACGGACATGGCCAGATCCTATTCAAGAATATATATAATTTATGTGGTTGGAAATGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATACGTA:1 - chr2R 5780164 3' - INE-1 120 1 63.01 TATTAATAAATAAATATAAATATATAAAGAAATATATTATTAATTAGAATGGCTTTGAACAACACTGCGTATGAGTAACGTCTTTACGCCGCTGTACAAATGGTAAGAATCATGTACGAGGTACACGGAAGTTTCTTATATTTTG:1 + chr3R 5761883 3' + diver2 442 2 71.72 ACTCCCTTCCAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCG:1 + chrX 20383271 3' + 3S18 164 2 70.80 TTAGAAATATATATTGACAATTTTTCATTGGACAATATTAAAATAATACAAATAACTGGCATAACATTTTGTTTTTACATTTTATTCAAGCAAAAGCACACTGTGCCTACTTTCAGCTAATTCATTTTCCTGTTCCCTTCCGCTTT:2 + chr2L 7401132 3' - TART-A 13338 1 73.29 AGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCC:1 + chrX 8437715 3' - P-element 87 1 19.26 TTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGGTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTACTGCTAATGGCTGGTAATATCAGGGCTGGGGACACATAAAGTGGACATTT:1 + chr3L 7131968 3' - HMS-Beagle2 7178 2 64.38 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTTGACATTTCTTCGTAAGTCAAAATAGTGTCGCCGATTATACGCT:2 - chr3R 19447616 3' + roo 405 1 47.26 AGCGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCCCCACCAGCAGCTGCCAAACCCACTGAACTCCTGCCAAATTG:1 - chr3L 4718945 3' + F-element 4394 1 66.67 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGAGGAGCTAACCGGAAAAAGAGAAA:1 + chrX 15357813 3' + hopper 1412 2 81.56 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATGTAAACAGTGGAAGT:1 + chr2R 6847886 3' - Doc 24 1 73.97 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACG:1 + chrX 10167511 3' + roo 389 2 69.86 AGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAATATAAATTTCCCAAAAAATGAAAATATTAAGACATATTAAAATAATTTCTTGCAAATAATACAAACACACATAGTTAAAAGTTAAAATTTATAAAATAAATAAAAA:1 + chr2L 21745535 3' + 1360 334 1 38.36 AATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTAT:1 - 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chr3R 15363874 3' - flea 4775 2 71.72 TTTTTTTTCTTTTTTTTTCGAACCATCGGCATGTAAAATTTGTGAAGAGGAGTCGCGTTCGGGATTTTAGGATCCGCAGCACCATATGGCATCTTGGTTGACAAAGAGCGATGTTAAGGGTTTTGTCTCCCCGCCTGAGCAACCGA:1 - chr3R 25939668 3' - Doc2-element 215 4 70.55 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTATATTCCGCAACTT:1 - chr3R 27765087 3' + mdg1 418 2 68.18 ATCTCTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGATTAACTCGTTTACAATGCACCATAAATCAAAGGCAATTTATTGGGGTTTGTGGGTTATGACTAACTTTGGAAGTTTGTC:1 + chr2R 11426965 3' - 1360 143 1 52.74 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAA:1 - chr3L 5532940 3' + roo 8999 2 70.55 GGGCCTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCAAGTTCATCGGCCTGATTTTCTTGCTCTTGGTTCTGCCGAAGCTGAAAAACATTTTCAAGGATGATATGATGTCCGGATCTGGTGAGAGCGATGGCATG:1 + chr3R 25047166 3' - Fw2 181 1 74.64 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTAT:2 + chrX 12986654 3' - roo 39 2 59.59 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAA:2 - chr2L 7660909 3' + I-element 5296 1 56.85 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCATTTGCTCCTCTATTCCGGACT:1 - chr2R 21926340 3' + opus 458 2 54.11 CTCGGCTATAGATCCTGATCAAGAATATATATACTTATTATTTATTTGAAAGTGCTTCCTTCGACATACTATTCAACGAATTTAGTATATTCTTCTAGTCAATGAGTACCGGATATAAAATAAAGACTTCAGGTTTTTATATAATG:1 + chr3L 27331845 3' - INE-1 90 1 78.77 ATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACAATATACAAATATAAGAACTAATTTATCTAAAATTTTTATTTATATGATGACCCAGATGAA:1 + chr3L 23198351 3' - invader1 53 2 95.71 TATATTATTTATATTATATATAATATAATATATTATAATATATCATATATATATATAATATATTATAATATATCATATATATATATAATATATAAAAAATATATAAAATATATATTATATTTCTTGTAATAATATCAGCTGATAAA:1 - chr2R 24098718 3' - transib1 1921 1 75.34 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATG:1 + chr3R 11810744 3' + roo 332 2 69.18 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCC:1 - chrX 2214256 3' - jockey 4825 1 61.64 TTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTATTATAACAGAACTGAATGATCGGGAAGTCGGGGGGGTTCGGTTGCCTCATTGCCAAGGAATGATATGTGGGATGATTTATTTGCTTTCGGGGCTGGG:1 + chr3L 3410542 3' - S-element 1268 1 70.55 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATACTGTTAAA:1 + chr3R 26504342 3' + HMS-Beagle 7007 4 61.64 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCGATGATAGGAAAGTGATTTTATTTTACCA:1 - chr3L 15913797 3' - jockey 4769 1 77.40 TATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACCCTTTCAA:1 - chr2L 22121308 3' + I-element 5336 1 50.68 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGTGAAAAAAAAAGCCCAACCGAATGAAAGAAATGCTGTAATAAGCGCCACTGAAATTGTGCAGGGCTGCAGAATGAAAACGAAACGTGACGCAAAGAGGGAAAAAATGTTATTA:1 + chr2R 11330717 3' + jockey 4985 1 75.34 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTAT:1 + chrX 18396162 3' - roo 8744 2 75.34 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGA:1 - chr2L 7660933 3' + I-element 5288 1 70.00 TTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTATTTATTTATTATTCTTACTTTTAATACGTTTTAATTTTCGCTTATTAATTTATTATTTATATT:2 - chr3L 14291951 3' + 17.6 7182 2 59.59 GGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAAT:2 - chr3R 4160068 3' + invader2 5043 2 60.27 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCC:1 + chr2L 15550764 3' + Bari1 1648 1 61.54 TTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGATAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGTCGTATATAATAATAAAAAAAAAAACAAACAAAAATGAAACGGGGAAGCGCTGATAAAGGGGAAAACTAAGAGAATAAGACCA:1 + chr2L 13554944 3' + Rt1a 5005 1 61.64 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTTTACCTAAAAACCTTTAGCGAAACCTTAAAGCCAACG:1 - chr3R 26315525 3' + Tabor 466 2 47.59 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGAAGGGACTTGGTCAGGGGATGATTCTCCCGCGAAAG:1 + chr3R 27123601 3' + roo 406 1 76.36 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCA:2 - chr3R 20441263 3' + I-element 5264 1 78.77 AACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTAACTTTCGGTTAATGATAACATTGCGTTTAAACTTTCCCAAGAACTCTGTCTAG:1 - chr3R 23295880 3' + P-element 2680 1 52.63 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCA:1 - chr2L 47097 3' - roo 8729 2 64.58 AACATAAATATAAATATGTAAAAAATATTTGGCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACGGCCCAAAACTGCCACATCTACACTTTTGAAAAATGTGTTTACATTTTTT:1 + chr3L 23004085 3' + 1360 2960 1 71.03 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAAATAAAAGGAAGTTGAGAAATAACTAACACATTAGCCATTTATTATTCAATTTTACCG:1 + chr2R 5941467 3' - copia 4894 2 69.18 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGGCTCA:1 + chr2L 16564571 3' + roo 391 2 55.00 CAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAAAAAAAACAACAAAAAAAGAAAAAACAATTGATATT:1 + chrX 578147 3' + F-element 499 1 74.19 GGTCGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCT:1 - chrX 12066092 3' - transib2 43 1 53.42 ATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTT:1 + chr3R 10736143 3' - McClintock 5976 2 60.98 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGG:1 + chr2L 47216 3' + roo 389 2 68.22 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGC:1 + chr3R 21933229 3' - pogo 74 1 69.86 ATTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATGGCTATGGCCATTGCTGCTGGCACTACGTACTATAATTGCAATTAAACAAACACCAAATGGAACTGTTTGTGCATAAATATTTTTAAGAAAAGCCACAAGCTGTGCAGCAAAAAAAT:1 + chrX 3190280 3' - mdg1 18 2 69.86 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAACATGTTTTCGGTGCTTAGAACTCGACGCTAAATTAGAATTATGCAATT:1 + chr3R 26405077 3' + hobo 2906 1 54.21 GACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATACACTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAATTATAATTTTTTTTTTTGTTTTTGCTATTTTTGTTTTTGTGTTG:1 + chrY 3625961 3' - Stalker 6890 4 71.23 CATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCCGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACCCAAAAATATAAAAAAAAAAATCCAACCATTTATCCCCTGCCTCGTAATACTCATATAAAAATAAA:1 + chrX 8300168 3' + Doc2-element 4503 1 50.38 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCA:1 - chrX 7795470 3' - roo 19 2 74.66 AATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTACGCTCTCAGCTCTCCCACTCTCAACTCTTCCGCCCTCAGCAAAATTTAAAGTTAATCCCAACGAACATTTGTGCGGTACAAGAAATTCAAAATTTAAAAAGCCTCTCT:1 + chrX 16991200 3' + Porto1 462 1 54.79 TAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACAGTCCACACAGCCCACGTAAACACCATGATGTTTTAAAGACTCCGTTTAGAAGTCTGGAATAGAATTGTTTTACACCTGCCAAAGGCTTGAAGAG:1 - chr2L 13538136 3' - R1A1-element 100 1 55.00 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTATATGAAATGCAAACATCGAATTCGGCTTGACTTCGAAACTTTGCCATATGATTTGATATTTTCGAACACTCGCGAAGAAA:1 + chrX 17247829 3' - INE-1 33 1 80.14 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGATATTTCCGATGTTGTGTTCAAAATACCATTTATTTTGGACAAAAAATGGGAATATTCAGTG:1 + chr3L 3872288 3' - roo 36 2 43.84 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTT:1 - chr3R 11191365 3' + roo 9038 1 60.27 CATTCGGCCGCGCGTTCGTTGGGCGCGAAATTCGAACTCAAATGCAAATTTGAATTAATTAAGTTGAACTAAAATTTGAAACAAACCATCAAACATTGATAAACTAAGATTATAGCCGGTCAAAAA:1 - chr3R 18281259 3' + Rt1a 282 1 57.94 CTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAACGCAGAACGCAGAACACAAAAGACAAACAAACAGACAAACATAAACAAACAAAAAAAAACAATGACCCCAAAGCATAACAAAGAATAGCGAGCTTT:1 - chrX 18870356 3' - Cr1a 103 1 68.49 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCAATTAAATGTTAATTAACATGTTATACTTGCTG:1 - chr3L 18505626 3' + I-element 5313 1 60.00 CTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGA:1 - chrX 21087599 3' - mdg3 44 2 60.47 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTATGCAATGTCGAATCTAAGCTTTTCTTCCGGGAAATTCTTTGGAAATCCTCCAATCCATTCGA:1 - chr3L 11326616 3' + pogo 2094 1 80.14 TATTGATACTGATCAATAATATCTAAACTTTATATGGTCGGAAAAGCGCTGTTCTATTTTGAAAACAAACAAAAACTTGTAAATGCAAACTACG:1 - chr4 699549 3' - INE-1 84 1 52.13 ACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCATTGTTTTGATGCTCATACAACTATTCAATAATATGAATAAAGTCATATTTTAAGGCTCACCATATAGTTTAT:1 - chr3R 11810239 3' - P-element 356 1 56.85 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGCTTCTTTTCTTCTTTGCAAGGGAATGGAA:1 - chr2R 19199627 3' - hopper 22 1 68.97 AATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAG:1 + chrX 19980684 3' - X-element 4552 1 63.01 AGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTAT:1 + chr3L 21996235 3' + Transpac 5143 2 76.03 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAAAATGGTGTGCAAGTTTCCACATTCATAGATACTTTATTCTTACTTTCTTTCTTTCTATTCATATGAGAAACAGCAATTTCATAGTATCTACCTATGACA:1 - chr2L 15076067 3' + 1360 3367 1 70.55 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAA:2 - chr2L 17180060 3' + Juan 4167 1 52.05 ATACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCAATTGTTCAAGCAAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAATGAACGAAACACGGCGAAGGCTGCCGGGCAATAGCTGCATTTGTACGGCCGCTTTC:1 - chr3R 20033386 3' + Tc1 430 1 70.87 GTATATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAAACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATTGAAGAATCTAAGTCCTCACATGATTAGAAACATTAATGTGGGCAAAAACAAATGAAAAAACAACTTTCTAGCTGAAGGTCACTTATTGG:1 - chr3R 18356624 3' - 1360 3213 1 43.15 CCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGTTAAAAACCATATATATCCTGCATATATGAATAAATATATGTGGAAATGTTTCGCACGCTTAATGCGTTTAAGTGCCAATTAAATGTTGGGCCAAAAAGGAG:1 - chr2R 13712478 3' + Porto1 89 1 65.75 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAATGGTCCATAGAATAGGCGTTTGATTGAGC:1 - chr3L 6397639 3' - roo 8684 2 65.04 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTC:1 - chr3L 5532949 3' + roo 326 2 76.71 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATACATTACTACTTTTCTTTAGACACTTTATAATCGATGTTATGTAGCTAT:1 - chr3L 11326677 3' + pogo 2033 1 67.81 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGA:1 + chrX 10521720 3' + Tabor 415 2 64.83 AATAAATAAACAAAATCTAAAATAATTGAATCAGCAAAAAACTCG:1 - chr3R 30068928 3' + transib4 2539 1 88.89 GTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAGTGTCTTATTAAATTTCGTGGGAATTAACTGACAGACATTGCCTTTATAGATCCAAGATAATTAAAGCT:1 + chr3L 9391687 3' + G-element 34 1 52.59 GGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGGGGGTTGAGGGTTTCGAGAAGCAGGGGGATTTCCGTGCCAGGACTTTAGGGGTTCATG:2 - chr3R 5957963 3' - Cr1a 4230 1 60.27 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACCCCGAGATAACAGAAATTGTTAACAAATTGGAGGCAGATGAGTTGCCCGAAAGTTCAACTTCATTTTTTTTTCTCC:1 - chr2R 18588285 3' + copia 211 2 55.17 ACATAGATATAAGCAATCGATGGGCTTATATCCTACCCTGTTCTCAAAGGCGTCCAGTATG:1 + chr2R 3130247 3' + Stalker4 7234 4 67.21 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATGTGGAATTTTTGGACCAAACGTTTATACATTCATATTTATTAGTTTTAAGACCATTTTCATGTTGTACCACGGTGA:1 - chr2R 15376640 3' + 1360 3383 2 70.54 TCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACC:1 + chr2L 20821278 3' - Burdock 6200 2 73.08 CTTTTGCTCTTATCTGCTCATTCTTTATTATAACGGTTCTTTTATGTGTCCACGGCAAAACACACAAGAATACAAGAATACACACGAAAAACCCAAACACTTCTAATGGGGGGCGTGTGCCTTTGCGCATTTATTATTTATGTATT:2 - chr2L 10084306 3' + looper1 69 1 64.38 GGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTTGATCATTCTCTCTTGTTTCGGTTTTCGGTTTTTGTTTTTTTTTTTCATTTCTGCGCCGCTTTATGTTAATGTTAATGCAATAAATTTAATTACCATCTCACAGGCTGCAGTAACTATT:1 - chr2R 14586562 3' + INE-1 557 1 52.05 ATAAATTACTTAAAAAAAATAATTTTTAATTTTTTATATTTTTATTGGTGTTAAACTTTTCAACTTATCACTTTACGAGAACACAATAATAAAAAATCAGAACTCAACTACAAACCCAATTAAAACCAAACAAATTAAAAAATAAA:1 + chr3R 3347123 3' + jockey2 3406 1 51.37 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATAT:1 + chr3R 30675421 3' - 297 38 2 71.28 GGCGCCATGGTTAATAAATTTATAGATATGGCAGAGAGATAGTCATATGAAATGAATTTCAATTGTGAAAAATTGCTTTCGAATGTGTGTGTGAAAAACGGAAATGCTGTGTTA:1 + chr2R 19818042 3' - Ivk 178 1 72.81 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAGATCAATGAATTCGAGATCGT:1 - chrX 10537838 3' - I-element 45 1 53.42 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAAAAGAACTAGCGCATTGGATTCAATGCCAATTGAGT:1 - chr3R 17996150 3' - diver 45 2 53.42 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAAAAGCGGAAAAAAGAAACAATGGCAACAGGGAAATTCGGTGGCAACAAAAAGAGGCAATCAA:1 + chr3R 30987635 3' - F-element 76 1 78.08 GAATGGTGAAGTTCTTTCGAAATGGTTGTCGTTGTAATTCGAGTAGTCGCTGTCACTGAAGTTGTCGTTGTTCTCAATGGTTTGGGAGTTCTATTTGGTTCTTCTGTGCTTAGTG:1 + chrX 1555093 3' - I-element 288 1 82.61 AGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGCGTGGGCGCTATATACATAGTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' + R1A1-element 5102 1 69.44 AGGTTTGACCAGCTGTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGCGAAACTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACACAAAGTGTTCAAATATTTTCAAATAAAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAACACAGTTGTGGT:1 + chrX 22905665 3' + transib3 168 1 72.60 AATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTTTCCATTTTAGCCTTAACGTGTGAAACATTATCGAAGCCTTAAAGTTATTTAAAACTACGAAATTTCAATAAAAACAAATAAGAACGCTATCATTTATT:1 - chr2L 833577 3' - 297 246 2 58.62 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATACTTCTAGGTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAACTTGGCGGGCACAGAAAACAATGTGAAAAATGGTAATGTG:1 - chr2L 19674939 3' + 297 354 2 54.79 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCG:2 + chr3L 20711694 3' - jockey 4825 1 61.64 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTATTGCATATCT:1 - chr2R 7090628 3' + I-element 5302 1 52.74 AAATGATAACTCGTAAAAATTTTCTAAAATTATTTGTATGCTATCTTGTTACTTAGGAATAAAAACATGAAAGCAATCACTCACAAAAACCAGCAGGAGGACAAGACCATGGATGTGCCAGTTAATGACT:1 + chr3L 22265675 3' - transib4 121 1 65.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCG:1 + chr2R 11159360 3' + roo 356 2 54.11 TTGCATTTCTTTTTTTTTTTCTCTTTCCTTTGGAATCATGCCCTTTGCCTCAACTGGCGACCATTTCGCGGAGATTTTTTTTTTGACACTCGCGCAAGTTTGTCAAGTGTCAGCGGCTTTGTTATCGCTTCCCCC:1 - chr2L 10114340 3' - gypsy2 404 1 77.78 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATCAGATTAAAACAAAGGAGAAGCCGCGATTTATGACCGAAGTGG:2 + chr2R 3564126 3' + Tabor 7246 2 69.86 CACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCGAATCGACGGAGGGTCATTGGGGGGAAAACTGGGGCTACTTCTCGGTATCAATTCAATTGATAAATGGTGGAAAAATATGTCAAAGTTCTAATGA:1 - chr3L 8734873 3' + invader2 286 1 72.39 ATTTTAATAAGATTTTATTTTAATAGGCTAAGTGATTTCCTTAATTTCCTTATTTAATTTCCTTAATTAAGTTTCTACGCAACAAAACATATATTTCATGTTCTGCCACATCTTATGTCGCCAAAAACAAATTAACTCAAGGAGAA:1 - chr3R 23405057 3' + transib1 1889 1 73.29 TGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGGCAACCCTAATCAGCGCGCGGCGCACTTGTGTTCGACGTTAGACGTCAATTAGGTGGCCGTGTACCCATC:1 - chr2L 12839585 3' + P-element 154 1 52.74 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACAGCCTTCAACCGGCCTGCCCCCAGAAACGCGCCGCGTTGACAGGCAGAGCAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 7849933 3' - roo 8683 2 61.54 ATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAATCTCGTGTGAGTAGAAATAGTTTGACACTTGCAATGCACATAAATTTTGGACACTGTCACTGCTGCTGACCGACCTCGTGACCCCCGAACTATCCCAA:1 - chrX 4045204 3' + I-element 5048 1 67.12 CAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCAGCTGCAGCTTATGATGGAAGTGGTTGGCAGGGAGCGAGGAAGTTCGTT:1 + chr2R 16219125 3' + Bica 4 1 69.14 ATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCGGAGACACGTCCCAGTGAGAATGGGGAGAATTGGTCGA:1 - chr3L 22760337 3' - F-element 116 1 55.17 AGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAAAAACCGGAAATTAGCAGCAGCAGGCGATGCAATGCAGCTGTCGCTCCCTCTCTTTCCC:1 - chr2L 19154964 3' - hopper 314 1 57.04 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAA:1 + chr3R 15072666 3' + pogo 2043 1 59.59 TATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAG:3 - chr3L 16973377 3' - S-element 1595 2 63.01 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTT:1 - chr2R 13766196 3' + roo 9016 2 57.53 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATTTCCTTTTTGATTTTAA:1 - chr3R 19446839 3' - roo 8697 2 66.29 AAAAAGAACAAAAAAAAAAACACAAAAATTGTCTCTTCCCCAAAAGTATTTTCAT:1 - chr3R 24005556 3' + gypsy7 5011 3 92.73 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGG:1 + chr2R 8157277 3' - mdg1 7090 2 56.43 ATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAATAATAATTTTGGAAAAAAACGAATATTGTTAAATTATAGCTGCCTTAA:1 + chrX 20973984 3' + jockey 4850 1 67.12 TTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTG:1 + chrX 3431926 3' + Ivk 5351 1 70.51 ATGGCCAGATCGAATCGGCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGT:1 + chr2R 5191105 3' - INE-1 103 1 65.75 ATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTAGAAGATTTCATTCGCATTCGCGACTCCCACCAGCGGGTCAAATGCTTCATTTATTAACCCAGACTTCGTACCCCTAAGCACACAACAAAATTTACAGCAGCCAATGCAAGTTGAAACAATT:1 - chr2R 4634041 3' + Rt1a 5023 1 62.33 ACATGAGCACATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGCTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGGGCTTGCTGCGCCTTTGCCTTTTTAAATTTTGTGTAACCTATATCCAACACCGAA:1 + chr2L 12076518 3' - G2 64 1 76.71 GATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGAGAAAACCCTACA:1 + chr3L 11844818 3' - rover 60 2 64.38 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTACCATATAAATAATTTCCTAGTATTTATAGTGCAGACTAAAAATAGCT:1 - chr2R 4854953 3' - 17.6 6965 2 58.90 CTGGATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGCCAATAAAATATGAACACATTGCATTTATGGACATTGTTTTGATC:1 - chr2R 8059611 3' + Quasimodo 7136 2 57.00 AAAACACCGTGCGCATTATAACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTTGAAGAGCTGGGTGGAAACTATAAGGAAGCTCTACAGCAGATAAGGTAAACTGCTTGGTTAACAGTATCATAGATTATGTATATTGATTAACATAT:1 - chr2R 12304077 3' + baggins 5111 1 71.92 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACA:3 - chr3R 25616484 3' + roo 9033 1 58.90 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTTTGGGAAT:1 - chr3L 10373799 3' + 297 6935 2 57.53 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTTATGGTTCCCCTTAGGAACTATATATTCAGTTTGAACTCGAAAGGCTTTGTAAATTTAATTTTGAGTTCATAGATC:2 - chr3R 30675327 3' + 297 354 2 56.16 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTATCACCTGGCCTGTCCCATTACCATTAATCGACAGCGTCTTGATGAAGTGCTTGGCT:1 - chr2R 13931533 3' + P-element 2825 1 45.21 TGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTAT:1 + chrX 23182920 3' - Idefix 64 2 64.38 ACTCTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTAAATCTCAACTTAGTATAAATTAGGGTAAATCGTATATGCGTTCGCGGGGTTTTTTTTCCCATTTATTACTCATATAGCTCCGGATTTTCGAGGATTA:1 - chr3R 11406385 3' - rooA 7595 2 70.34 CGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTGCCTATGCGTCTGGAACTCCCTTCACGAAATATTCTACTGAGCTTTCTTCGTCTAGGTTGAGGTAGGACTTGACTTTGGAAATTTGTGGCTAAGGGGGATGGACAGCTACTACTACTATGTA:1 + chrX 8213262 3' + INE-1 579 1 58.22 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGCCAGCTCGATAATGAAGCGAAGTTGGTTAAATTAGCACAG:1 + chr2R 22034764 3' - copia 4915 2 52.41 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTA:1 - 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chr3R 29481548 3' + roo 8694 2 76.09 TCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTCAATCTAG:4 - chrX 18396020 3' + roo 408 1 74.66 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGT:1 - chrX 9530328 3' + 297 6896 2 74.66 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGTAATTGAAGG:1 + chr2L 11298110 3' - I-element 84 1 71.03 AAAGAGGAATACGCGATACGCGCGGCATTCGGGGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTTTTCGGCGTCCACAATATATATTTACTAATTTGCAAATATATGTCAGACATTCATTTTATGATAGTTATTATTACT:1 - chr3R 7819145 3' + invader3 5366 2 52.05 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTGAAATTTATAAGAT:1 + chr3L 20711742 3' - jockey 4777 1 70.55 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTT:1 + chr3R 29690768 3' + I-element 5272 1 76.03 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTTCTGTCAGCTCATGACTTG:1 - chr3L 22890353 3' - FB 48 1 52.99 AAAATAAAATTTTTTTGAATTTTTTTTTTTATAGTATAAATTAAA:1 - chr3L 6026263 3' - HB 328 1 57.78 ACATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATT:1 - chrX 6688961 3' + INE-1 121 1 63.45 ATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTC:1 - chrX 292371 3' + G3 4551 1 71.23 TCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTTCACATATATCAGATACCCT:2 - chr2L 22121313 3' + I-element 5331 1 54.11 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTATCCATGTGAAA:3 - chr3R 11191349 3' + roo 391 2 71.23 GTCCTCAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGC:1 - chr3R 11186571 3' + BS 4998 1 79.45 CCATAATGAACCCCCGACCAATCTATAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCCACCCAAACATGTAATTATTGTCCAGATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGATCGTTAAAATCAAAAATATACACTCACACAGTCCA:1 - chrX 10821721 3' + G-element 4211 1 80.82 ATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGATCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCTCACAAAGCCATTAAG:1 + chr3L 11233643 3' + 1360 3042 1 72.79 AAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTTGGCCCTCTCATTGCCAGCTTTTTCGACTTTCTTCCTTTTTTGACTGCTTACATTCTTTTCTCTTCTTTACAATCAGTTTCTCTTTGGCGGCCTGGCTTT:1 + chr2L 18211222 3' - Tabor 6904 2 70.55 AGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCA:1 - chr3L 23583082 3' + S-element 2 2 66.90 AGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGG:2 - chr2R 10078162 3' - jockey 111 1 72.60 AGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGAATTGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAAAAAAACAAAAAAGAAAGGGAGACGGAAAGGAAGTGGCCGCAATTCGTTAATTAATTT:1 + chr3R 17861586 3' + Bica 427 1 70.34 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGTATATAAGGGACCGAGGCGAAATAGAAGTGTCTGTCATTTTTATAAATAACATTTTCCGAGTATGCAGAGCGTGCGCGAACAACATCTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 19675118 3' - 297 8 2 73.97 CTTTGCGCTTGACTTCCCCAGGCTCTGACTCCGAGTTGTTGTTACTTTCTGCCGTATTTCCCTTGAAGCTGCCCGTTGCTGTTTATACTT:1 - chr2R 24580292 3' - G-element 448 1 64.44 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTAGTTTCTTAATCAATTTGAAGAATTTAAACATTCTTCCGATTCCCGATTCAGATTTTCATTTGCTATTATTTGCTACTATTGA:2 - chr3L 15103779 3' + Transpac 5193 2 61.64 TGTGGTGAGTTCGGACCAGCATGTATCAAGCGAGATAGAGCGATGTTGAAATGTACACGGGGCACTTATGTTTGAAAACTCTGAGAAAGCAGACGGGGAGCAAAAAGTGAGCAGGCATCGACAGCCGGACGGATCCTGGCAATCCT:1 + chr3R 12871465 3' + invader6 214 2 65.07 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGA:2 - chr2R 8099130 3' - jockey 4811 1 52.74 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGT:1 + chr3R 9298604 3' + hopper 1393 1 69.18 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGTAATGGAAGGCATCGTTCAAT:1 + chr2L 11298121 3' - I-element 70 1 62.68 AATTAAAACAAATTAATAAAAAATATACCCTCTCTTATCGCCCTTCCTGTTATTAAAAAAAAAGTCTTCTAGCACTTATCATCGTTTGAAATAGAGGCA:1 + chr3L 8397003 3' - Tc1-2 1369 1 63.64 CCATATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGAAGCTGACGCTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGACGAAGGACCGCATAGCAGCGGCGCCAAAAAACGTC:1 + chrX 23448976 3' + Chimpo 4080 1 73.13 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTCATGGCCCATTCACCACCCATCCCCCCCACCGACAAAGCCGCCCATTAGGAACTCTGTAAACATATCAACACCTG:1 + chr3L 13294999 3' + roo 9042 1 58.78 AAATATTCACTATTAATATGTTTTAGTCTGCACCCAACTCTAATTGAAA:1 - chr3R 16857370 3' - transib3 2510 1 61.22 CGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGAACGACTTTCGTGAAATATTCTATATTTTACGATTAAATTAGCTTAAAATTATCATAATGATGAATGGAACTTACCATACACACACACCATACAGACCATATATTCTGAATATTATTTCTTA:1 - chrX 5711884 3' + INE-1 545 1 18.49 GCCATTCCACCTCCCCCTGCAGCACGAATGAGACTTGATTGTCCACATTCGGTCTGCTACCAAGTATGGCTTCGGGTGTAGACCACACTCAGACAATTTA:1 + chr2R 11799131 3' - Rt1c 5209 1 62.00 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCGGTATGCATCGATCTTCGTTGGCGGCTTTCCGGCTTTAGGCTTTTGCCTTGGAAAGAGCCCTAGCCTTAGCATGGCATTAAATATTTTTACTAATGCTAG:1 + chrX 19832644 3' - 3S18 22 2 66.44 TTATTGCAATTTTTATTAATATTTCTTCTAACACAAATTTTGTAACTTACTGGCTATAAAGTAAATATGTATTTTGAGTAGTTAACTATTTTAAATATTAACCAACAATTTTTTTGAACTCCAATCATTGATTTTATTACTGACAG:1 + chr3L 12576621 3' - Transib5 2602 1 69.18 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCG:1 - chr2R 20010210 3' + Juan 4139 1 69.86 GGTGCTTCGCCTAGGTAACCTTAGGCCATCATTCAGTTGGAAAAGGAGTGGGGGGAGTAGCAGTGAAACAAATAAGCGCGATCCGTAGCCGCTACAGCATCTACCTGCTTAGTCTCAACTTGCAAGACAGATGGACTTTTGCGTCC:1 - chr2L 22161108 3' + Rt1b 344 1 70.55 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTTG:1 + chr3R 21933217 3' - pogo 85 1 77.93 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAAGTGATATTAGTCACACGACTATTACACAATAATTCTGATTGTTAA:1 - chr3R 27160020 3' + 412 476 2 73.29 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGC:1 - chr2L 8338126 3' - P-element 55 1 40.00 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGCCTATAAGCAG:1 + chrX 8308487 3' + roo 338 2 68.75 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGCTCCATTCTTCACCGCCCCCTTTGTCACATTATTTACATTGTCAACAAGCTGTCGCTGGTTTTTCGCAG:1 + chrX 4808622 3' - mdg3 5304 2 51.37 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGC:1 + chr3L 22035646 3' - F-element 85 1 75.34 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGA:2 - chr2R 4362799 3' - F-element 83 1 65.07 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTAACTTTTGATTTGTTCTGCCCTATGACCTCGACACA:1 + chr3R 29084961 3' - 412 7139 2 78.77 TATGGCTCCGGAACTCTCCAGAGACCATAAATTCCAGGATGGAATATGAAATACCTAACTGAAAATGCTTACGCTTTGTTTGCCAATGTGGTGGGTGCTCATCCGTGTGTCGGCCCGTTTTTATTTGCTTTTTTT:1 + chr3R 19495441 3' - Circe 385 1 50.37 TTTTTTTTTAATTAATTTGTCACTTATCTGGTAATTCCTTAATAAATGTTTTCAAACCAACGGGAAAAAAATAGTTTTAAGGTTTTTTTTAGTGATATTTGTGATATGTTGTATATTTATACGTACATACATCGGTATGTGTGGTG:1 - chr4 540501 3' - jockey2 3404 1 74.66 ATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCAT:1 - chr2L 18212139 3' - Quasimodo 84 2 78.77 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTATCACTTGTTACGGACTACCAAAGAATCAATCGTTTTCTTTTTTTGTGTATATGTATGTACTATTCCCTTTTGCACAT:1 + chr4 303838 3' + pogo 2063 1 60.27 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGGACCTTAATTAAAATGCAACAGTGCGTATGGGCAAAGGTGCAAAAAGTCAAATGGCCAGCCGAAATAAAAGGG:1 - chr3L 943828 3' + hobo 2899 1 53.24 GGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAGTCCTTAATGGGCTTGTCATTTGGTTTGTCGCACCCGCGTGAATTTGTTTTTATTCCAGCATTGCATTTTATGAGTCGGGCGG:1 + chrX 12395458 3' - F-element 389 1 63.01 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGTGCTGAATT:1 - chr3L 5532914 3' + roo 9025 2 52.74 AGTCGAGTTCCCCGACTATCACCGACTATACTACACTAGTGGGAGATCACAGGGAAATTTTAACAATTTGTTGGCGTAGAGAAAGGAATACTATAATCGTCTCGGCTGTTTATTACAGGCAATGAGGGTCCATTGTTATTATGATT:1 + chr3L 19037874 3' - INE-1 562 1 67.12 AAAGAAGAAATTAAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATT:1 + chr3R 24450515 3' + 412 7479 2 60.27 ATTTTTTTATAAAATATAATTAAACATTATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAATAAATTAAAAATATTAAATATTCAAGAAATATAAAGTTTCCAATCATTGATACATGACCCATACAAGGACTTTCATGAGCTTATGTGGTATT:1 - chr2R 14404048 3' - S-element 1622 2 58.22 CACTGGGGCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCTACGAGACAAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACTTAGATCCAGCAACTCGAATTCCAAACTTAGAGACAACTTAAAGACCCTCAACACACCTGAAAGTCTCCGACA:1 + chrX 19821360 3' + F-element 4354 1 73.97 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCGTTAACATATAATTCTATAG:1 + chrX 12129454 3' + flea 241 2 75.34 TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAA:3 - chr3R 6419861 3' + Tabor 405 2 75.34 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAANGNNNNAATCATAGCGCAATTATAACAA:1 - chr2L 9782067 3' - P-element 60 1 39.73 GAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTA:1 - chrX 2479513 3' + mdg3 160 2 73.79 ATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATG:1 - chrX 17678734 3' - flea 4829 1 73.97 AAAAAAAAAAACAAAAAAAGGGCCAAAAATGGCAACTGGTATAATGTACAAACAAAAAACAGCAAACAAGATATTCCAAAAGTCCCTGCGAGGCGAGAACAAAAGTGACAAATTAGTCAGGGG:1 - chrX 12071615 3' - hopper 141 2 52.03 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTTTG:1 - chr2L 20265927 3' + roo 9038 1 56.15 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCACACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCG:1 - chr3R 24450418 3' - 412 7110 2 56.25 TAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGGTAACAATTCTTTGCGCTTTGTTGAT:1 - chr2L 13585658 3' - Idefix 8 2 78.08 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCACTTGT:3 + chr2R 8735699 3' - mdg1 7074 2 59.59 CACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGCTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAATTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGATGAAAAGCGATTACCCTAGAGAAACCGAGCACTACTACTTGAACAAA:1 - chrX 18227606 3' - R1A1-element 81 1 64.14 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAG:1 - chr3L 6518560 3' - 412 7087 2 52.63 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACT:2 - chr3R 21276523 3' - BS 5047 1 50.68 GGAACCTCGACTAAAGCATTCTTCCGATCTTAAACATGTATTTACATATGAGTATGTCCCCTTGGCGATTGTAGATGCAGTGCTCTCCCACTTTTCAATCCTTTCT:1 - chr2R 9275098 3' + INE-1 572 1 73.58 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTTTTTAACTGCACAATAGCTACACATAACAATGGCCGCAACATA:1 + chr3R 27986476 3' - roo 31 2 63.01 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACAGCAACGCACAAAA:5 - chrX 7795465 3' - roo 8678 2 78.08 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCC:1 - chr2L 8338149 3' - P-element 99 1 18.49 CCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTACACCCACGTCATCGAGGAACAGTGAAGCACTTTGCGTTAAT:1 - chr3R 16534397 3' - X-element 4478 1 64.10 ATAATTNTTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTG:1 + chrX 21947748 3' - mdg1 7083 2 51.37 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTT:3 + chr2L 11357930 3' + blood 7335 1 54.79 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGG:1 + chr2L 11257097 3' - rover 7026 2 71.72 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAA:1 + chrX 6116339 3' + transib2 2789 1 52.21 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCT:1 - chrX 10319572 3' - mdg1 7065 2 67.12 ATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAAATAATAACAAACACACAGAACATGCAACAAGTAATGGCTGGAGCTGGCTTCATTTT:1 - chr2R 19107443 3' + F-element 4629 1 76.42 ATATGTACATATATATATATATGTATTTATGTACATAAAAGCCGGTCAGATACGAATACACGATATCAACTCTCGTATGAAAAGTTGCAGCCGCTTGTTGCCAGTTGAGAGTT:1 - chr2R 11047665 3' + G3 4507 1 92.92 AGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGTGAATTATATTGTATTGTATATAATATATACCATATAAACCATATAGTTACCAAGCCGATAATTTGATCAACTGTTTTCTCTAGACGCAAATGGGGATTGGTTTGCACTT:1 - chr3R 21933109 3' + pogo 2078 1 61.27 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATG:1 + chr3L 20711679 3' - jockey 4839 1 71.72 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGGAGTGCATTAAACACAGGTTTAACAACC:2 - chr2L 4888718 3' + BS 5040 1 54.79 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACAACCCGCCTACTCCGTGGGAGAAAGCGAACGAA:1 + chrX 20455753 3' - hobo 26 1 65.97 AGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAACGAAACGCGATTAGCTTCTAAGAGGTGTGCTCTTCCCTCAGTTGTGATTTTTGTTGGATAGGAAATCGATT:1 - chr3R 1202971 3' - Cr1a 206 1 69.79 AAAAAAAAAACAAAACAATGCAGTTCAATATACGTATGTTTTTAACAGCA:1 + chr3L 4171918 3' + transib2 2641 1 88.00 AGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTTGG:1 - chr2R 22774990 3' - jockey 4749 1 87.67 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGATCAGACGGACGGCACAGATTTTGGCAATGGCAGCACAAGGATTGGGAAACGCAGGTGG:1 - chr3R 28901220 3' + transib2 2763 1 59.59 TAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAATTATTTGCCGATTAATAAAGCTACTTCACATGCACAGA:1 - chr2L 13844153 3' + Stalker2 7595 2 54.11 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAAC:1 + chr3R 27133639 3' + opus 453 2 78.10 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCC:1 - chr2R 14051752 3' + roo 9009 2 60.96 CTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTACACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTACCTCCCGGTTTTGGTATATAAATCGATCATAGATGTAGTTCATGCCCAGGGGGAAATAGGCACG:1 - chr2R 12472809 3' - transib2 2760 1 55.71 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATATGTTAATGTGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGTCCTGCTCGTTTT:1 + chrX 959071 3' - 412 62 2 68.55 TTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACG:1 - chr3R 9557558 3' - G2 3050 1 78.40 TAGTTATTTTGTTGTTTTTTTTTCTGCTGCCTATGCGGCGTATGAGTGATGCTGAATTTAGGTCTCACCTCAGCCACTTCCTCGGGGAATTGCAACGCCAGTGATTCACTTGGACATAAATCGATAGCTGACATTTGCCTCGATTT:1 - 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chr3R 23315556 3' + Idefix 81 2 79.29 AAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGATTGTTCCTAGATAAAAAAATGGCAAGGTGGATGTAATGCATCAA:2 + chr2R 21569064 3' - G2 3035 2 69.18 AGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGTATATAGTATGGGAAATGGAAATTTCTTCTATTTCTATTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGTTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACAGTCGCTCTCACAGCGAAAAAGCAAATA:1 - chr3L 13612295 3' - 297 6545 2 74.66 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGA:1 + chr3R 7420288 3' - 1360 68 1 69.06 TCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATACCCTAACGCAGCAAAGGGTCCACTTCAATTGTAATTCAACT:1 + chrX 7068580 3' + Quasimodo 211 2 71.23 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCCATATGTAGATGTGAACCATTTAATGGC:1 + chr3R 5769079 3' - roo 8740 2 84.62 ATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGATGAAGATATGCCAATGCGAGGAGACACCAAAGCGGAGGACCGCCGGAAACAGGGGGGGAATGTGAA:1 + chr2R 979678 3' + Porto1 4356 1 73.47 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTTAAGCCATATAATTCCATTTT:2 - chr3R 23639091 3' - pogo 11 1 76.71 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATGTCTGCTCTCAAAAGGTAGTTCGTTAACCTATTCCCTACCACTGTGTTGGCCACATTTGCTATGTGGCATTCAAACACATGCTCTACCCATGGAAAAACTTGT:1 + chr3R 11191536 3' - roo 8682 2 73.97 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAATGACATTTAATTGTTC:1 - chrX 7795514 3' - roo 8727 2 65.07 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAA:1 + chrX 8200309 3' + flea 4964 2 52.74 CTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAATTAGAAATGCTTTCCTAAATTCTCCTATTTACACTATCCAATGCCACTTGAAGGCAATTATTTTTTTATTTAAATCATACGGTGCCACAAACTGTCCATATATTTGACTTCACTTTATATG:1 - chr2L 6102865 3' + roo 412 1 74.66 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTT:2 + chr3L 20711722 3' - jockey 4797 1 56.85 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGT:1 - chr3R 31886850 3' - hopper 72 1 69.18 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAATTTCATATAAAAATTAAAACCAGAATGCCTTACGTCTATGAAACGCAGATAAAACGTATATAGTC:1 + chrX 16946728 3' - FB 55 1 56.16 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTCCAGCGAACTTAAGATAAGCTC:1 + chr3R 27160186 3' - 412 7093 2 58.22 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGAAATGGTTGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCC:1 + chrX 9950590 3' - jockey 4742 1 71.64 GTCGTCAAAGCAGTGAGGCATCTCAACTATTCTGTAATCATTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTGGAACGG:1 + chr3R 17996247 3' + diver 213 1 51.95 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATATCCTAAGTTAAACGCATGTTTAGTTCCATACAACTTTGCTTCATATTTATTTATT:1 - chr3R 4217669 3' - 297 47 2 63.01 AGTAACTCCTAATCTTTTATTGTCACGGCTCCGCCTGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCCCGTTGATCTGATTAGGACGGAACATGAGGGCCCAATGCCGCCGCTGTTCGTCGGTCTG:1 - chrX 7955216 3' + gypsy2 6749 2 53.33 CTCTAGAGCCACGGCGAATAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAGGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACACACTGTGGTGAGTTTTCCATGGAGTCCTTGACGCCGCATTCGCCGTAGG:1 + chr3L 12291055 3' - 1360 55 1 74.42 GATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAAGTTTAAAACTAAGACGTGCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAAT:1 - chr3R 8051162 3' - jockey 4860 1 85.62 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGATCCTCTGGGGATGCGTCGGAATATTGAAGAA:2 + chr2R 23180263 3' + roo 8983 2 78.08 TTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAATTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAG:1 - chr3L 16973366 3' - S-element 1583 2 56.55 GTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATTGCCTTATTAATTTTTCACTGATTAGCTTACTCACCAGTAATTTCACGATGAGCTGCATTTTGGAACTGAAAATGATTTTGATTTAAATAGCTTATATAT:1 + chr2R 15376493 3' - 1360 481 1 60.69 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGG:1 + chr3L 19111594 3' - Doc 78 1 71.03 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATGCCATTGGCCAACTCTAGTCCATGGGCTAGAGCTGCTCCAC:1 - chr3R 23618087 3' - hopper 22 1 68.97 AAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGC:1 - chr2R 18316048 3' - HMS-Beagle2 6961 2 69.18 TAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAG:1 + chr2L 11357916 3' + blood 7321 1 64.38 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTCCCCCCTTACACCCATCTCTTTCC:4 - chrX 4341231 3' + roo 9039 1 62.33 TCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCACGACAAAATAAAGGAAAAATAATTAAGATAGGAATGCTAAATATTTGTGTTACAAGAACTCCATTGGAGGTGTTTAAGACCGCCTGATTTTCTTGATTTGTATTATATAGACGTATGT:1 - chr2L 7030837 3' - Circe 6996 1 58.22 AGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTA:1 + chr2R 3104463 3' + Gypsy6A_LTR 334 1 69.86 AATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTTACCGCTCGTTGAAAGCATGAATTTTCAAATGTTTCAATACTCG:2 - chr2L 11257022 3' + rover 7225 2 69.18 TGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAGGCATCTTGATATTCTAGTGTCTTTGGTGCTCTGAACCGCTGCACAAAAGCGTGCAGCTTTAAATTAATATAATAGTAATAATAATA:1 - chr2R 11367664 3' - 1360 64 1 67.12 ATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGTAATACATATGTAAATAATAGGAGTACAGAAATGTCCAGCCCGTTGGCCGTCAAGTGGACCTGGCCTAATCGAATGAATG:2 - chr3L 12171685 3' - Transpac 4918 1 69.18 GATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAACTGCAATCTTTAATAGGATT:1 + chr2R 9967106 3' + Bari1 1620 1 76.71 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTGAAAGTATGCTATGATTGTTTCTCTTCTG:1 - chrX 2214226 3' - jockey 4795 1 60.96 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAATCAAATAATATTCAAAACATCTTTTTAAAGAATAGGCAGTGTTGGTCGGTTAGGGGT:2 - chr2L 21299298 3' + roo 9012 2 62.33 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTT:2 - chr3R 17673743 3' - FB 57 1 59.03 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCG:1 + chrX 18336674 3' - mdg3 59 2 57.66 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCT:1 + chr2L 4003802 3' + mdg1 7416 2 54.11 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGC:1 - chr2R 20227196 3' - hopper 39 1 53.42 AGAGAGCAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAAGGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAAGGAAGAATCGCACCACCAACTCGGTG:1 - chrX 17799796 3' - Cr1a 4340 1 80.42 ATATATTATAAAAATAAATAAATAATCCAAAATCAAAAATGGCTCAAGAACCGTATGCCTTTTAGAATAGAGTGTGGGGAGTATTGTTTTTGCACAAATATACGTAGTCCAAAGGATGCACAGATCTACAGTTTTGTTGTGGGAAG:2 + chr3R 29709128 3' + mariner2 824 1 47.26 TTATATATTTATATTTATTTATTAATATTTCTTATTAATATATTGTTTATTTCCTGGACTCCACTAATTGTTCTGCCTTCTCCACTTCATTGCAGTTCATTAGCTGGAAGAGCGACGAGGTGGCCCCGTCGG:1 - chr3R 5761681 3' - diver2 447 1 78.03 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATGGTTTTTGTGGGAATCACACAATTATTT:1 - chr3L 10373786 3' + 297 367 2 66.44 AAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCAATATACCCTTTATATCCCTAAACAGCATAATTTTCCACTCACTCATCCATGTTGA:1 - chr2L 15550617 3' - Bari1 18 1 73.97 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACA:1 + chr3L 6964794 3' - P-element 90 1 23.97 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAG:1 + chr2L 47214 3' + roo 9033 1 58.90 AAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTTGCCTGCCGACCCGGGAGCAGATAGCACAGCAACCCAAGTATTGTTTTTGCTCAATTACTATGAATCGTACCGTACTGTCGCCGGAATTGATGTCAGTTTATACTCGC:1 - chrX 2339335 3' - blood 167 2 70.90 TGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACACTCG:1 - chr3R 9038883 3' - Juan 4026 1 71.23 AATTAATTGATGATATTATAGGATCCGAAGTATCCATTGCTTATTAAAACATACCACGACAACCTCGTACTTTAACTGTATTTGCACTCAGAAAAACATTTCATCTTAATTCGGCTCGTAAACTCCAACTTAGGGTATACCAATTG:1 + chr3R 20530498 3' + hopper 341 2 77.40 AGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATT:1 - chr3L 24934312 3' - HMS-Beagle2 6953 2 70.71 CAACATACCTTGGCTTTTATTTTCAATATATTTTCAATAAATACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAG:1 - chr2L 23008373 3' - transib2 276 1 67.12 TTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATAAAAAAGCAAGAAAGTTTAGTTTACTTTCAAATATGGTGAGTTCGTCGTACGTGCTTAAAGGTTCCAGTATCTGATAGTCGATTAAAACATGCTTTCTTGTTTT:1 - chr3L 17860596 3' - Chimpo 20 1 82.19 ACACACACACACACACACATTATAAAAACCTCTTTGGGGCGCACTCACACAGTCACACGAAAGCGGCACGTTCATGTGGCGCAAAGATTTTTTATTAAGCCGACGAAGGAAAAATTAGAAATCAATACCCAGCAAG:1 + chr3R 5412440 3' + accord 185 5 59.56 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTT:1 - chrX 18396090 3' + roo 337 2 63.70 ATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCACCAAAGGACCCCACACCAG:2 - chr3R 28042933 3' + Stalker2 346 2 56.16 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGAAGATATATAAATCTTGGGAACTGTATATATTAGATAA:1 - chr2L 12818256 3' + hobo 2856 1 71.92 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGGCGTTTAACGCTGCCCATAAAATGTGGCCGTCGTCTTGGAATTGCAGTTGTT:1 + chr3L 740912 3' - mdg1 7076 2 53.51 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATTATGCGCCCAAAAG:1 + chr3L 21763760 3' - jockey 89 1 71.23 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCATTTGCTCC:1 - chr2R 21926353 3' + opus 7455 2 52.52 GCATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAA:1 + chr2R 11804705 3' - pogo 85 1 75.34 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAATTGTTCGGCAAATCTAT:1 + chrX 22840616 3' + copia 241 1 73.05 AGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTTATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATTCAAT:1 - chr3L 25482919 3' - accord 68 2 76.67 GTGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACACTCAGTTTTGGTGGGTTTTCGATTTTAGGTCCGCGTCCGA:1 - chr3R 21948461 3' + Bica 19 1 71.23 AAGGAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGT:1 - chr2R 15326824 3' + copia 245 1 54.11 CAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAAAGAAAGTTTAATGACTGCCATAAAATTTGTTCACTCTGCTCGTACAGACAGACAGACGAAAGTGTGTACTGTGCACGCTGCCATCCGAAGGATGTTTGTTGTGG:1 + chr2L 2941184 3' - G2 118 1 76.03 ACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGCACAAAATCCAAAAACTATTTCATCAAAAATGCATAAAATAATAATAAAATCGTACGCGAAAAAAATAGACAACCGAAAATAGAAAAAGTTGAATTA:1 - chr2L 14131628 3' + F-element 4537 1 69.86 GCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAAAAATTGGGATGGGAATTCGAGGGCCTGCTAGACGAGGATCCCGAGGACCAGCCTGTAGTCATCGAACTTCCGGAAGCCTAGGAGAAGTGCGCTACGCATGTG:1 - chr3R 18251539 3' + Bica 265 1 73.61 TACTGAACAAATTTGAACAAATTGATGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGTTTAAAATTCATGAATTTCTTTCTGAAAATCACAAAA:1 - chrX 18012550 3' + hopper2 1198 2 71.92 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTTTAAGTATTTAGGTTGGAGTT:1 - chr2R 21681278 3' + roo 9036 1 60.96 ATGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCGCTTTTAAGGAACAATTT:1 - chr3R 18971658 3' + Juan 4203 1 68.06 GAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTTGTAAAAATA:2 - chr3R 904890 3' - rover 6950 1 73.97 GAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATATCCAAATAAACAGTAGGTTCTCCCATCGAGTTATACTTATTTGCG:1 - chr3R 21413781 3' - 412 7284 2 69.18 GGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGATAAATAATTAATATCATCTTTTTCTAAATAAGACTTCAATATACATTAACTTATGAGTTTTCTGAAAAAGACACTCCATACCAATTAAATATAGTTGGTATTTTGA:1 + chr3R 16533727 3' - X-element 4398 1 39.04 GTTGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTAGCTTGCGAGGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGAGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCAAACCGAGATTTTCCGTAAATTTTCCAACTCGCTCCTCCGCGGTGAAAGTGG:1 + chrX 15562038 3' + 1360 77 1 64.14 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTC:1 - chr3L 24934311 3' - HMS-Beagle2 75 2 71.23 AGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGA:1 - chrX 6952091 3' + G5A 2806 1 60.87 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAA:1 + chrY 2720352 3' - 297 6596 2 65.06 AAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATG:2 - chr3L 19454949 3' - mdg1 7123 2 73.29 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGATTTCCAGCTGCTCCCTTGTGTCGTATGCGTAATATTTGTTTAATATTAACT:1 + chrX 14450539 3' - hopper 18 1 73.29 CTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTT:1 + chr2L 15550747 3' + Bari1 1628 1 73.97 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCC:1 + chr2R 7850035 3' + roo 379 1 54.31 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATT:1 + chr3R 24381410 3' + Juan 4168 1 63.01 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATG:1 - chr3R 19407896 3' - diver 5945 2 56.85 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTCGAGTTTTCCGTGATACCCGTAACTCAGCTAGGGGAAAAGCGAACGGAAAATTTCAACAGTTTTTGGCATTGGGAAATAAAAAAAGAAAAATTTTAAATTGTTCAAAGGCATGGTCGCGACC:1 - chr4 500022 3' - INE-1 569 1 64.38 CTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAA:1 + chr2R 12779685 3' - I-element 97 1 82.88 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATGTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACA:2 + chr3R 5524003 3' - FB 61 1 60.27 AAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGGCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATGCTGGAAAAATAAGCATACAGATGAATATAAATTGAATCTACTTCCTGAGCGAGCA:1 + chrX 1799272 3' + invader4 3072 2 75.34 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTC:1 + chr2R 8099230 3' + jockey 4938 1 56.85 GAACATTATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTAT:1 - chr3R 2169841 3' - gypsy11 105 2 67.12 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTG:1 - chr3L 12004275 3' + P-element 2808 1 24.62 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGAATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACACTATGCGTT:1 + chrX 11661522 3' - pogo 33 1 61.64 GGTCACGCAACCAAATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCC:1 - chr2R 5410986 3' + Tc1 1334 1 72.73 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGC:1 - chr3R 25616476 3' + roo 9041 1 64.38 AAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTAGCGAGGGATTGTTCTCAGCTCTTCCTTCCTTCTTGGCGTTGATTTTTTTATTTTTGGAATATTTTTTGTTTATAGATTTTGATTTGGTTTTTTTTCTTTGTTT:1 - chr2L 21605702 3' - I-element 154 1 77.40 CACTAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCA:1 - chr3R 31886842 3' - hopper 64 1 60.96 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACT:1 - chrX 1263913 3' + Burdock 6362 2 63.01 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAATGATTAAAAAACCGTATTTTTCCCTCAGCGTATCGTTTTGTTGGAAAACGCAAATTGCTATTTTGTCAG:1 + chr3L 17183773 3' + diver 172 2 52.74 AATATATTCAATATTTTTTTTTAAAAGTTATTCTACAATAAATGAACACATTGGCAACGCAAAAAATTAAGATGGAGGATGTTACCATAAGATATTGCATAAATTTAAAATATGCGCTATCTATTCGGGGTATGCCTATGTAAATC:2 + chr3R 7495638 3' - Tc1-2 1594 1 79.45 TATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAA:1 - chr2L 4003684 3' - mdg1 7099 2 60.27 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCG:1 + chr3R 23618219 3' - hopper 68 1 63.01 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTTCTATT:2 - chr3R 28146100 3' + roo 356 2 54.11 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGCTGGCGAACCCTAACGAAAATATTTTCAAACTATGC:1 - chr2R 10161742 3' - transib2 19 1 72.60 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGATACCCTTTACTCAGCTAGTAGAAATGCGAGAAATTTATTAGTTTTTGGACATATCGATAGATTATGGGGAATAAAATGAGAAAATTTTTAAAAATTGTTTAAAAGTGTG:1 + chr3L 24073179 3' + mdg1 410 2 77.40 AAGTCATTCAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTAATAAAAATTCTTCCGTTGGCAAACATTTAATTATTTATATTAGTTTAATTTCGAAAACTAATTGTGTATTAAAAAGAATTAGGTGTATATTGCACATCATATAGTTAAAA:1 - chr2L 17885725 3' - hopper2 112 2 66.44 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTGGCTTTGTGGCAACCCTATCTAGTGGGTGTTGGTGGAAGTAGACATGCAACAATTTAACTCCGAAGGTTTTTTAGCCACATGCGAAATACTTGAGTTTT:1 + chr3R 4805732 3' - 1360 14 1 69.29 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGGGTCTTGTTTTGTTGTTT:1 - chr3L 12249777 3' - roo 36 2 58.22 GAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACATACAATAGGCGTTTATTGCAGTGCGCTTTAGTAAAGTGCATTTAAACA:1 + chr3R 19407988 3' + diver 6040 2 65.52 TGATAATATAATAATAATAATAATTTAATAAATATATACTGAAAGTGAATTCAAAGTTGCTGAAGTATGTGAATCTTGAGACACAAATAGCTGACATTTGTAACTTACATATTTTAAATTAAATAAAAATATTCACTACACAAGTG:1 - chrX 18421413 3' + invader3 5053 5 73.97 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCT:3 - chr3R 18971706 3' + Juan 4153 1 60.27 ATTATATATTATTGTAATTAAAAATAAACTTTAAAATTATATTATTGAAAAAAATTTATAATATAATAT:1 - chr2R 5648639 3' - hopper 195 1 82.61 GATTCGTTGAAAAGTATGTAACACCCAGAAGGAAGCGTTTCCGATCGTATAAAGTATATATATTTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAACT:1 - chr2L 20223955 3' + INE-1 15 1 84.25 ATTATGTTCGTATATACTACAGTAGTATAGTTTTGACTTCTTTCCTAAGGCATTTATGTGAAATATGCAAAGTGCATGAAATTTTATAACGTTAAATGAAGTAAAAGTATTAGATTACCGCACCGCACAAAGGAGATTCCTCAACC:1 + chr3R 18810405 3' - mdg1 7038 1 68.49 TGGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTTTTTGATGTGCGTGCAAAAGTTTGAGCTTTGAAC:1 + chr3L 18125995 3' - Ivk 59 1 54.48 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATAATGCACTGCACA:1 - chr3R 5768965 3' + roo 392 2 73.97 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTG:1 + chr3R 15364014 3' + flea 235 2 60.78 GTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATATTAACCACTTAATTTTTAAGCTTATTCAAAATACGGG:2 - chr2L 4888745 3' + BS 5013 1 73.29 GTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTG:1 - chr2L 13585699 3' - Quasimodo 31 2 50.00 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAACAAAAAAAAAAATGGTAGCATTTAGGCGTTCACAACAAATTACTCGATGTCGCCAACAACTTTATCAGACTTTGCCTACACCCAAAGTCTTAATCCTTCGTATAT:1 + chr3L 4219587 3' + jockey 4978 1 57.93 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCG:1 + chr2R 13766280 3' - roo 64 2 74.02 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTACGAATTTGTATATAAAGCAATAATCACAGCGCAATTATAACAAGTTCACAAAGCAACATTTATATTCGC:1 - chr2L 9782041 3' - P-element 34 1 62.33 AGATCGACCCTGCTATTGATCCTAATTAATAATAAATATACTTCATAGGTCCGGAAATATGATGGAAATGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATG:1 - chr3R 19449694 3' - INE-1 97 1 66.90 CAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:2 - chr2L 21750457 3' + Stalker4 6949 2 76.71 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAGCATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGGGATTTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATT:1 - chr3R 19450084 3' - roo 9 2 57.93 TTTTTTTTTCTTTTTAATTATTTCCGAGTGTGTAGGCAATTAAAACTTTAATCAATAAATGTGCTCATGATAAGTGTGTAAAGTCAACCAACCAATGGACCACCTTGACGATCCCCTTCCCCC:1 + chr2R 18194081 3' - Doc 4697 6 78.05 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACA:1 - chr2R 16817883 3' + 412 7477 2 63.01 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTGTACAATTCGTCGCT:1 + chr3L 21380627 3' - I-element 57 1 55.48 GGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTTATATTAAAAATTGTGCTTTATTGATGTGGTTTATATACATGTGGCCGGCCGGCGTCCTTTTGCACCTTTTGTAAGCGGCAGTGGTTTAGTTATTTTTTTCAC:1 - chr2L 20548639 3' - I-element 5057 1 72.60 ACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATACAAGCTGTTGACACGCGGAATATGTGCTAAAAGCACGGTTTAAATACGACTTCCAGCTTTGAAGTTGCCCAACA:1 - chr3L 17567823 3' - S-element 1535 1 73.97 AATCCAAGGCATAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGATAAGCCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAAT:1 + chr3R 29355134 3' + HeT-A 6007 1 60.96 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCGTCCATTTGTTCTAAATATACT:1 + chr3R 26504336 3' + HMS-Beagle 7001 2 57.53 TTATTATTATTATTATTATTATGTGACCCGTTTGAATCGTTTCTTGTTGTGTCCAGTGTGTCGAAGCGTCTGCTTGACTTACTTCAGTGTTACGCTACGATTGTCCTGTTGCTGAACTGCAGCGGCCAGGAGCGGCAAGG:1 - chr2L 19255477 3' - mdg1 7067 8 56.43 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTTCCACAACAGCAGCAACAACCGTCAG:1 + chr3L 19111630 3' - Doc 43 1 61.64 CTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGC:1 + chr2R 12185421 3' - accord 58 2 58.22 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCT:1 - chrX 10521641 3' - Tabor 6911 2 64.83 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTTAAATGCGATTAAATTCCT:1 - chr2L 4003639 3' - mdg1 15 2 73.79 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAACGGAC:2 + chr3R 19032713 3' + roo 9026 1 54.11 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACAT:3 - chr2L 14874148 3' + copia 245 1 45.21 TAAAAAAAAAACAACAACAAAAAAATGTAATAGATAAAAACAAAAGCTATCAAACAGCAATTATAAACAACACCATTAATATAAATAATACCAATATTTGTTCACAGCCCTAGGAAATGTGTACTCGAAACAAAAACAAACTGAAA:1 - chr3R 14068531 3' + gypsy11 3930 2 64.38 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAA:1 - chrX 19054266 3' - jockey 87 1 71.23 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTT:1 - chr3L 2989912 3' + roo 9034 1 58.90 AAATTTAAAAATAAAAAAAGAACCTTAAATTTCTGACGGTACAGAAAAAGATTAAATACTCGGTTGCAACTCGGTTAGAAGCCATGAAGCCAAAAAGAACTATTGAGAAAGGATATTTAAGGATAACTTCAGCTGCCACTGCAAAT:1 + chr2L 10899803 3' + TART-C 11097 1 71.92 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGC:1 + chr2R 22034725 3' - copia 4932 2 69.92 AAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACGCGTTAAAGACGATGT:2 - chr2L 22328992 3' + invader2 4728 1 51.37 CTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGTG:1 - chr3L 27865983 3' - Max-element 44 2 48.97 TTTATCATAAAATTTACTTATTTCGATTGAAAATACTATTCTTAAAATCATTTTCCATGTTCTTCATATTTCAAAACGAAAGATCCAAAATCGTATTAGCTGACCCATTTTCTTGCCCGCGTTTGTCTGAAGCAGATTGCAAGGCC:3 - chr3R 16533536 3' + G4 3801 1 70.55 AATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTATAAAATATTATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAACTAAAAATATTACAATGGATACGTGTGCGTGTGGCGTTATGTGTGTGGGTACAATATAT:1 - chrX 1451607 3' + S-element 64 1 66.44 ATGGACAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTGATTTAAACATGTTTACTTCCATGTCTCTATAGGGGTTTGTATTTAAAGTCGAAAGCAATAAATGCAACCGCTGCTGTG:1 - chr3L 23000845 3' - FB 46 1 76.71 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAATTTTGTGTAGCGAAATCAACCCAATGAGCAGCTCCGTGAGCTGCCAAAGTATATATTTAACACTGACACTGATCCGATGAAATTGTAGAGATGTATATTGTATTGT:1 - chr2R 9966935 3' - Bari1 17 1 49.32 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCCAATTC:1 - chr2R 20010172 3' + Juan 4177 1 58.90 TTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCG:1 - 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chr2R 10517889 3' - Cr1a 243 1 79.41 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTGTATC:1 - chr2L 22193386 3' - roo 8683 2 72.39 AACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCCTGCCTCGCCGACATATGTATATTTAAGTCTGTATTTTTTTATGTGCACCGAGGGAGCAGCAAATGTTGTCAAGTTGACTGCGTCGGAT:1 - chr3L 13917832 3' + invader4 276 2 60.96 AAAAAAAAGCAATGAAAGTTCGAGCTTAGATATGACGTTAAATATAACCGACTAACATAAGTTACTCCTATTTTGCAGGTTTAATTTAAAACAATTAAAGCATACCGCAATTAAACTAGCTTAAGCTATACTTATAACAATTTGTA:1 + chr2L 12760358 3' + transib2 2647 1 31.51 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGGCCGCATTGAGGATGCGAGACAAGCTTGTGGTG:1 - chr3L 13294871 3' - roo 8664 1 76.04 ACACAAAGAAAACAAATAAGAATCCTGGTACTTCAATACTGTTTTGCAATTAAATTGCTTTTTGTCGACTCTTTATACTCCAATGCACTTCTATACGAGTTGTTAGAGCAAACACTTTCCATGACAAATTCGAGGTGCTCATATAC:1 - chr2R 18902615 3' + mdg3 5084 1 55.48 ATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAG:1 + chr2R 20010668 3' - Juan 4173 1 65.07 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTTCCCTGTTTTTAAGCATACAA:2 + chr3R 11469419 3' + Tabor 443 2 56.03 ATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCCCATTTT:1 + chr2L 21794180 3' - invader1 53 2 57.53 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCCGAAATTTTCATTTCTCTGTAAAACGAAATGCTCTAAATGTTATCAAATGCG:3 + chr3R 30675507 3' - 297 4 2 79.45 CATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGTGCCTTTTCATCGGAGAAAACCACCGTCTTCCACTCCTTGTTCCACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATCGCAGTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACT:1 - chr3R 4357587 3' + Tc3 1430 1 73.29 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTGGCAAAAGTATTGCAAATACAAATAAGTTAACATTCCAA:1 + chrX 1341775 3' - 412 7072 2 72.60 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTATGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCTAGAACTCTT:1 + chr3L 3030326 3' - roo 39 2 54.79 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGCAGATAACTCATTGAGAATCAAATTAAAATAGAATAAAATTCTTGGCAAGTTGTTAGTTGCTTAAGAAGG:1 - chr3R 14722983 3' - FB 40 1 54.07 ACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGC:1 - chr2R 5617462 3' + invader1 3986 2 60.69 CTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAACATTGTTGTTGTTGTTGCTCCTCACTCGTTTCCACATGAAATATGATAATTCATTACACGAGCTTCAAGATACTGCAGGGAAAGCGGGAAAAAAGGAAGCGGCAGGAAAGG:1 + chr2L 4063987 3' - roo 10 2 78.77 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATAAATAATAAAGACCT:1 + chr3L 16470352 3' - jockey 4746 1 68.28 AATAAAAATTCAATTAAAATTCAACAAACAAAACTGATGAAGGATACCCACACGTTCGTGGGGCGTTGCCTCGGAAACAGGAAGAAGAAAGCGGCGAAAAGCGCCAGACGTTGACAGGCATAAGTAATGCAAAAAAATTACTTTAT:1 - chr2L 14511730 3' - Rt1b 123 1 73.97 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTTCCCGCTGAAATCGAGACTCTCCTTACCGAT:1 + chr3R 28790761 3' - roo 79 2 73.95 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAAC:1 - chr3L 4219490 3' - jockey 95 1 77.24 TGGAATGTACACTCGTTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAAAAGAACAACCGAGAAAACTGACAATGAAACCGCACACTGGACGAAAAGCGGTTGCTATTTTCAAGTCAAGAGAAA:1 - chr2R 14689139 3' + mdg1 337 2 50.00 GAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGGCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGCCCGGCAAAACTGAAAGGCTT:1 + chr3R 28592437 3' - HMS-Beagle 125 2 68.92 GGTATTATTATTGTTATTATGTACGTATATACTACACCCACTAATAAGGTAGTTCAACTGCGTGAAAATAAATAAAATAATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATAGAAATAC:1 - chrX 10319560 3' - mdg1 7053 2 71.23 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATC:1 - chrX 18396101 3' + roo 8990 2 71.23 AAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAAAGTAGTTATATCTACACTTGGATTTTCAGTACAAAAGCG:1 + chr2R 8940227 3' - copia 220 1 72.60 GTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGCCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGATATTGCGAAAATAAAT:1 + chr3R 26504309 3' + HMS-Beagle 6975 2 62.76 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAATACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATA:1 + chr3R 31653150 3' + roo 331 2 70.55 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATATACAACACTCCCCA:1 - chr2R 16817861 3' + 412 7499 2 52.74 ACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGTTTTTATTCGTTTGAAAATTAGTTGGATGCCTTTTGGTTGGGTTCAAATGGGTTTAAATCGTAATGCGACTTAATGGATGGAA:1 + chrX 17358535 3' - 1360 185 1 65.75 GAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGATATGGCTCCAGGCTCTCACTGATTGCAGACAACTGTATGTGTGCAAACGTATGCTCTTGCATTGTAAATTTGACAAAATATG:1 + chr3R 4571525 3' + 1360 12 1 54.79 TGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCCATGAGCTGCC:1 - chr2R 24427569 3' - jockey 4740 1 60.27 AAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAGAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAAAAGATATGCCAGCTCCTTTATATACGTCCATTTGCT:1 - chr3R 28266283 3' - pogo 143 1 76.06 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATT:1 - chrX 4341257 3' + roo 9024 2 53.68 TTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCGGCCGAACAATGCAAATTTTTATTAGCCATGAAGTCAGCCATAAAAGCCATTTCAAACCGCTCAAAATTGTTGCCCTGCACACGAGTAC:1 + chr3R 16754432 3' + 1360 3111 1 76.80 ATACATACATAATACATACATACATAATACATAATAGGAATCGTCGAAAGAGAGGCAAATAGGACGTAGAAAGAGACGGCGAGTGGCTGGGACATTTCTGCAGGTGAGGATAGCAAAA:1 + chr3R 9422711 3' - Dm88 10 2 81.36 ACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAACAATCAACCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGACCTCTTATTTAAATA:1 - chrY 2346865 3' + gypsy7 270 1 54.48 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGCGTACACTGTG:1 + chr2R 22514206 3' + P-element 2855 1 55.65 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTGCGCTCAGTTTAATTGGCCCGGAGCCTCAAATTATGCAATAGTTGCAGTCGAAATTGACCGCAAACAAGCCAGCAATAA:1 + chr3L 22325923 3' - hobo 40 1 58.22 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTAC:1 + chr2L 6647725 3' - mdg3 5320 2 60.96 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATG:1 + chrX 23439048 3' + P-element 2495 1 65.19 ATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTT:1 - chr2L 4754866 3' - Stalker 6897 4 49.32 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGTAT:1 - chr2R 16731997 3' - 297 63 2 67.12 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACTTGTCAAATAAACAACAATGGAAATCAGAGTTCCAAGTGTGGGAAATTTTCG:1 - chr2R 13259251 3' + mdg1 7429 2 63.01 CTATTTNAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAAC:1 - chr3L 14366532 3' + roo 345 2 63.01 GAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGGTTGATT:1 + chr2R 20802646 3' + mdg3 189 2 64.17 GGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATG:2 - chr2R 22034673 3' + copia 5040 2 77.40 CGTTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGTCTCTCCCTTTTTCCCCTTCCCCATCTGCACACTTTTCTCGAGCTTTGAGCGGATTTCGGATTTTGATTGC:1 - chrX 4072418 3' - transib3 476 1 51.08 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTCAAATGCCATCTCAAATGACTCCCACCACTGCGCTTCGTCGTCA:1 - chrX 19266813 3' + roo 9039 1 54.11 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTGCTGCAGCTAATTGAATTTAATGCACAAATGAGCCTAAGGAATTTTCTTTCATAAGTCTGACGAATGCAATTCCTT:1 - chr3R 11810617 3' - roo 8706 2 54.86 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAACTAATTTGCATATTTGGTCGCAGTAAAAACACTTTATAAGTGG:1 + chr3R 29690804 3' + I-element 5310 1 50.69 ATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATGTATTGTGTAGATTTAAAAATATTGTGTCTCTTTGTAAATTCGTAAATTCATGAAATTTTTGTATTTTTTTTATTTTTGTATATTATT:2 + chr3L 28057169 3' - 297 6501 1 62.33 CCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAAT:1 - chrX 10319633 3' - mdg1 88 2 78.77 AAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACG:2 + chr3R 1844850 3' - Cr1a 170 1 58.90 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACA:1 + chr3L 22400348 3' + 1360 3343 1 62.50 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTT:1 - chr3R 23911335 3' - 3S18 5819 2 53.85 TAATAATAAAATAAAAAAATAAATAAATCTTTAAAAATGTGACAGCTTGTTTCGGGAAAACATGTAACTTCCTGACACCACATTGATGTTGGGGTAAATAGCAGTTCTGCTTGACTTAACGTGATATACACAAGATTCTTCTCCTC:1 - chr2L 23002718 3' + Rt1a 5074 1 72.60 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAG:1 - chr4 372969 3' + pogo 2042 1 68.75 ATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATTAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTC:1 + chr3R 27083096 3' - jockey 4620 1 78.77 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTTTTATCCGAAGTATCGCGCCTGCAGATAGTTCTCTGGTTGTCCGCCAG:1 - chrX 696471 3' - FB 42 1 56.85 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCATTATAGATGAAATCGAGGTGTTGAGGTATTAATGTGTTAGAACTCGATTGTAGGTG:1 + chr2R 20010718 3' - Juan 4121 1 63.19 GTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGTCGATGCTAAAATGGTGGATCAGGAGGTGGCCAACTGCCACAAGTATCGC:1 - chr3R 15382714 3' + roo 9070 1 65.75 ATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAACACGCATTCCGCGTTTTTCGCCCACAACTTTTGTTAAGTTCG:1 - chr3R 2239342 3' + 1360 3117 1 73.94 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTTGCCTTC:2 + chr3R 3320525 3' - 1360 72 1 67.12 TTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCA:1 - chr2R 330124 3' + HMS-Beagle2 7124 2 67.81 ATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGC:1 + chr3R 27406033 3' + diver 6046 2 74.79 TGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTATTTTTATTTTCTTTTTTTTCACTCGTAGCGGTCACACCTTTTATTTAGCTGGCTTCACACTGTCTTT:1 - chr3L 25414253 3' - I-element 184 1 60.27 AATTAAAATAAAAAAAAAATAATAAAACGAAACGAAAGGAAAAACAATGCACACGCACGCACATTTAATAAATCATTTTCCAAATTAACTAACAAAATGAAAAGCGTATCACTGAATAATAATTGATATTATTGATATTAATAATT:1 + chrX 9451607 3' + Doc 4700 3 56.85 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGCTATTAATTATATACGTTGTTAT:1 + chr3R 21630385 3' + I-element 5329 1 68.49 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACTTTGACGACACTTCCACCGTTCAATATGTATCTCAAAGTGAAACTGGACACAGTG:1 - chr2R 11159254 3' - roo 65 2 63.70 ATGTGTGCACGCGTATGCTCTTGCATTGTAAATTTTTTTTTATATGCCCTTCACCTCAGATGTTCTTAGATTTTAAATCTTTATTATTTTTGATCAATTGGCTCGATGCGAATAATTCTTGTTTTGCATTG:1 + chr3L 4074154 3' + 1360 178 1 81.68 GATAGTCGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTCGTTTTAAATGTATTAAAAAAAATCGAAGTATAAAAATCACAGACTGCTTATTCTTCACACTTAAAAGACTGTATAATTGCTCATCTAATCGGACATATATATTTTGGTTTATA:1 - chr2R 4821030 3' + INE-1 564 1 66.44 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACC:1 - chr3R 13972980 3' - 412 7100 2 70.30 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCAGCTAACAACCGAATATAGAATGATAATGAAATCTACCGGAATCT:1 + chr2R 15651991 3' - hobo 77 1 69.18 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTGGGCGCATTATCATTTTATCTATGCTTCG:1 - chr3L 16970308 3' + roo 401 1 78.77 GTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATAGTTTTTATTTTAAGTCGAATTAAGATCAACGCCGAAATAAAACAAAAACCCTCCACTTGAAACGGGGCTTGATCAAATAAGAGCGTTTTAATTTCCTTGTAGTGCGACAAAGGCCTGG:1 - chr3L 12180375 3' - 297 412 1 56.16 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGT:1 + chr2R 5151311 3' - roo 8737 2 69.18 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGCCAGATAAGCGAAAACAGTTCGAGAGCGATAT:1 + chr3R 16630406 3' - FB 16 1 73.29 TATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGAGAAGACAAACACACAACGCTTGATTGCCGGGCAAACTTCTTTCGTTAACC:1 + chr2L 18620245 3' + HeT-A 5990 1 65.07 CATGAAGGGGTAGAACAATAGATCAGACTGGGACGCAGAACACATAGAAACCCACTAATAATAATATAACGTTTAATGGAAGCTGTACGCCTCTC:1 + chr2R 5216665 3' + baggins 5388 1 92.63 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCAAAA:1 - chrX 6475299 3' - Doc 68 1 60.27 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGCACTAACCAAACTGTTGCGCTTGAAACCGGCCGCTACGCCTGCGCACGCGTCTGCGGTTGCGACGAGCAACAACAAGGCGCTTGG:1 - chrX 1135273 3' - P-element 23 1 65.67 CGAGATCTTACGAACTATAAAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCCCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTAAAGTTTGGATAGGATGCCACA:2 - chrX 19330534 3' + INE-1 147 1 54.79 AAATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTAAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAACCC:2 + chr2L 12553468 3' + F-element 89 1 72.60 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTT:1 - chrX 21216710 3' + roo 9018 2 56.16 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTAT:1 + chr2L 23295908 3' - micropia 31 2 61.64 GGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGCTGTGCTGGATATTTCGACTTCAAAAGAGCTGACAATTTTTCGGTACACCATTTAATCTGTTCTTTACAGATACTTA:1 - chr3R 18925798 3' - Idefix 7067 2 58.90 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAA:1 + chr3L 16970438 3' - roo 85 2 79.45 CTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGATTTATCTCGTTAATAAAATTCAATTCATTCGTTTGAGTAATAAAATGCAAATTATGGATGGTTAAAAG:1 + chr3L 16509591 3' + F-element 4238 1 53.10 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGAT:1 + chr3R 7719804 3' - roo 8742 2 75.34 AGGAAGGCTGTTGAATATAAGCAATGCCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 - chr2L 10450247 3' + 1731 4305 1 65.75 TTTTTGTTAGCTCTAGGAGTTTTTTTGCTCGGTTTGGCCCGCAGAGGAGGTCACGGCGGCTAATTACGTAAATAATTGAGTCTGGGGGAACTGAGGAATTGAGGAAGTCGCTGGGGGGCTAATGTCTTTGGCAGACTTTTGGGT:1 - chr2L 3340954 3' - I-element 418 1 78.47 ATATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGATGAAGGGCATATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATG:1 - chr2L 22255080 3' - 1360 240 1 73.97 ATTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAA:1 + chr3R 11062812 3' + roo 8990 2 69.86 GGATGTGGTGATGAGATGGAAAACATTTCTACGGTACTGGCCTTCTGGAAAATACAGTGATTGAAGTATGAGCCCTGACTCTTGCTGACAGGTGTTGGATCTGCTCAGCGAAGCGAAGTAGCAAAAAAGAGGAAATATATATATA:1 - chrX 6795494 3' + looper1 490 1 58.62 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCAAAGCACACACAACCACAAACGCATACACAATGCGAAAGCGTTTGATGAGTTCCAGCTGCTCCCTTG:1 + chrX 14450506 3' - hopper 4 2 72.73 TGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTAATGGAATTATTCGACTCTGCCTATTCAACGAACGACTCGAATGATTTATAGGTACACCGGGTACGCCATGGCAAGGTATATGTATGTATATGTATATGTATATGTATTTAT:1 + chrX 4229546 3' - Quasimodo 138 2 68.57 CTTTACNCTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGC:1 + chr3L 19111584 3' - Doc 89 1 77.40 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGAGCAAACATTCAGTATTAAAACCTATTTGGTTTC:1 + chr3R 20167704 3' - roo 8699 2 59.59 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGTTCAA:1 - chr3R 15882573 3' - jockey 59 1 50.68 AGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGCTGCCCTTATTTTATTTATTTTATTCTCCTCTCCGCTGTAGTTTTTGTTTTCTTTATGCTTTGTTTTATTTGCATTTTGTCTGAAACTCCATTTAGCATATTTT:2 - chrX 13017806 3' + diver2 4604 2 74.66 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTACATGCATATGTGCGTACTTATGTGTGTGCGAGTCCCGTTAAA:1 + chrX 8437761 3' - P-element 52 1 49.32 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAA:1 - chr3R 15790803 3' - roo 21 2 61.64 AAAAAGGGAAAAGAGGAACTGTAACTAAGCGTACACTGATAAATAAATTGCCAAGTTATAGCATAGCATTATGATACAGATTCGCCTTAAAAAGGGAGATATATACACTAAGTTTCCCTTACTTAACTTAAGATAGAATACATACA:1 - chr2R 18267408 3' + Bica 347 1 52.74 TTAATACCAATATTTATAACTAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTATATCTTTCATGAATAACGGTATAAACCTTGTTTTCTGAATTCGCAACAAAAACAA:1 + chr2R 2260700 3' - gypsy12 9763 2 82.19 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGACCTTTTCTCTCTGTGTAGCAACGTGCCCGAGTGCGTTTATTTTTATCAAGATTAGCATTTGCTCCTCTATTCCGGACTGGGTCTCTCCTGGTCGTCCCCATCTTCGTTTCC:1 - chr2R 21926307 3' + opus 7494 2 76.71 AAATAAACTAACAAATAAACTAAACTAACCTTACAGATTAAATTGCTGTCTGAAAATTAAATTATTAATATTCTTTTGGTAATCACGGGTAATTGTTGCCCATCAATTCCGTTGAGTACTCTCTCCTTGGGAGCCCTTACCTTCTT:1 - chr3R 21290437 3' + HeT-A 310 1 59.59 ATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGTAATAACCTCCTTCATAACAAGTA:1 + chr3L 23071839 3' + mariner2 797 1 76.03 GTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGG:1 - chr2L 13585683 3' - Idefix 33 2 60.96 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCTTTCGTAT:1 - chr3R 11191359 3' + roo 9044 1 64.38 CTTAAAGATAAAAATAATTAATTATATATACAAACAATCTAATCATGGTTCGTGTGATTTACAATTCCAAAGTGTATGTGTCGTCACATTGATTTTATAAAATCTTTTAATTTTAATCTTGCAATAACAAACAGGTGCTCAACCAA:1 - chr3R 11268918 3' + gypsy9 286 2 67.12 GTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTTAAAATGTATGGCATTTGGTAAAAGGTGATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTCGTG:1 - chr3L 17055393 3' - Tirant 8111 2 73.60 AGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAATAGTTTCGTTAATAAAAAAAAAGAAAATAAGTAATCTAGACGACATTCGAGAAAGAGGAAGATCCAGCCGCAAGTGCAAAACTGAAAACATGATTTATCTCATGCGT:1 - chr2L 9530901 3' + jockey2 3350 1 64.38 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTTCGTGGTCAATATACGACATGACCCACAT:1 + chr3R 25428286 3' + 297 6949 2 66.20 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGTCGCTTTGCCACTCGGCCG:1 + chr2L 12822841 3' + P-element 2817 1 24.17 CTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAGTCCGACAGAATGTGTATAAATTCGTTCCAGGATGCCAACTACCAGAAAGTACATGAACAA:1 + chr2L 11365360 3' - roo 386 2 58.22 TAAAGAATTCATTATCATTCTAATTTCCAACCTGCCAAGTTTTT:1 - chr3L 6649100 3' - accord2 74 2 59.09 GGAGTCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAGTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCA:1 + chr2L 15076203 3' - 1360 63 1 57.53 TGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTAGTTCTTGCACTTCATTTTAGCAGTCTCTCCTCCTTTCCACTGGT:1 - chr2L 9636024 3' + 412 7539 2 76.22 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGGCTGCGCCGAGAC:1 - chr3R 26504166 3' - HMS-Beagle 6809 2 76.71 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAA:1 + chr3R 13973032 3' + 412 427 2 67.67 TAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTATGATTC:1 + chr3L 3501825 3' + Bari1 1671 1 50.78 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAATTAGCCAGTTGTGAGGGCTTAAAGCGCAGCCAGGGCAAAGGCGATTGCAACC:1 - chr3R 11186546 3' + BS 5024 1 63.45 AAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGC:2 + chrX 23362226 3' - 1360 3261 1 77.40 AAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATTCATATTTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACA:1 - chrX 3431862 3' - Ivk 5362 1 50.00 CTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCAATCAGTTGATGTTAATTTCAAAAGGGGCGCTCCAAGACATGTTTCAGTCAACCCTAAAATAGAACATATAATACATTGTATCACGGTGCGGC:1 - chr3R 20675806 3' - jockey 4899 1 60.27 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACAGATGTAGAATACATTCAAACACTTCGGACTGGCATTTTATTGGTGGCTGAGTA:1 + chr3L 6518646 3' + 412 427 2 62.33 GATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACCCAGAAG:2 - chr3L 23249386 3' - rover 7011 2 57.93 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTGAGAATTTTCCAGAGTGCCACTCTCAAATCGCAAGTGTCTTGTTTTGTTGTTTACGGCTAACGATTCACGTATT:1 - chr3L 12249756 3' - roo 15 2 72.60 CGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATTTGGACAGACGTTCTACTTTAAGTTGTGCGTGATCCAGATGAAAGTCGATAAAGCAGCGAATGATGCGCTAACGCACGGGTAAGGCAAACATACGGTGCTAACGAA:1 + chr3R 3745672 3' + Tc1 1592 1 69.86 ATACAAATATTGTTAAAACACTGAGTCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTGATTTTTAGTCCTAAGCTGATATCCGAAAAAAGAAGGGCAATAACTCCCTCGAAGATCTTCTCTCCTCTCCATTTCCATCCCACCGCCATTG:1 + chr3L 11301219 3' + 297 6805 2 65.03 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTA:1 + chrX 10319727 3' + mdg1 7418 2 56.85 GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAATGAAGCAAACTGTTGGCGGTTGGGGTCGG:1 - chr3R 11469335 3' - Tabor 85 2 81.29 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAGTATATACATATATGAATGT:1 + chr2L 18549954 3' + roo 9036 1 65.07 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAATCGCTGACGCCAAAAATATCTAA:1 + chr3R 4860501 3' - Transpac 53 2 75.47 ATTAAATCTAATATTTATTCGAGTTCGTTTGTATGTATTTTAGCAGTGCAGGTAAATGGCATAACGCGGGGGTAGGTGGAAAGGTAACTCCAAAACAGTAAAACA:1 - chr3L 6340065 3' - Bari1 329 1 90.48 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTG:1 + chr2L 12818331 3' - hobo 62 1 57.53 CTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGAC:1 - chr2R 4260422 3' - micropia 5214 1 46.58 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCTTAGAAAAGACCTGTTCGCTGTAGCGCTCGCCGCTCTCTCTCTCTCTTTCACACGCTTTTTTCATGGTCCAAGGTATATCC:1 + chrX 9023591 3' - 1360 172 1 68.03 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTCGTGTATGGCAAAGAAATGTTATACCTACGGCACACAATA:1 + chrX 20888374 3' - 297 61 2 72.26 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGC:1 + chr3L 6447121 3' + transib2 2760 1 61.64 ATCTGGATTGGGTTTACTACGAATGATCCACCTCTATCCCATGACCAACTCTCGTATGTTCGCCCCATGCTATTCATCCCTTAGTCTTTTCAC:1 + chr3L 2387625 3' - I-element 5117 1 77.42 ATATTAAAAAGAAAAACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTCGTTCTCAATTTTTCTAGATGTGAAGTACGCCTACGAAGGAGAAAGA:1 - chr3R 7141084 3' + HB 1363 1 55.43 GTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAAAAGTGGCCATGGTGCTTTCGTACAGGGGCGGTTCCAAGGGGGTTCATTTGGGAGATACATATGCGCCAAA:1 - chr3L 14005100 3' + TART-A 13135 1 52.05 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCTTCATAGAAATACAAG:1 - chrX 10319557 3' - mdg1 7050 2 77.40 GGGAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATTTTCTTTCTTGGCTTTTTGCTGCATTTGGCTTAATTGGAAACGAACCTAATTTTGTCGGTTCATTTAAATTTTCAACTTTGATGACGGGCACACATGTGGGAGGCATTAGTATAT:1 - chr2R 20802515 3' - mdg3 5261 1 78.08 AAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTA:1 - chr3R 19450177 3' - roo 9028 1 65.07 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCG:1 - chr2R 20348986 3' - transib2 47 1 73.27 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCG:1 + chr3R 16157392 3' - pogo 32 1 55.83 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGC:1 + chr3L 22035659 3' - F-element 71 1 65.75 AATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAG:2 - chrX 12066120 3' - transib2 71 1 66.44 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAACACCGGGGGGAAAACGTGATTTTTGTGTGTTTTTGAGAAACTTAAAAAAAATTTTTTTTTCCTCTGAATCTGTC:1 - chr2R 5941286 3' + copia 238 1 72.60 AAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCAT:2 + chr3L 20187429 3' + FB 482 1 54.79 GGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATACATATGTACAATTTTTCGACTCAACTGTTTACACTGTAGTTTTACGAAAGAGAATTTCGATTAAAAAAATTTTTAGTTTTCGATGGTCGA:1 + chr3L 22723973 3' - HMS-Beagle2 27 2 65.75 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAAAGTGCTCCGGTG:1 + chr2R 3563214 3' - Transpac 4955 2 59.59 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTGAGAGTTAATTGAGGAGACCAA:1 - chr2R 14051716 3' + roo 397 1 67.18 AACTACACATATATTAACTACATACGTTAAAAACAACGTACCTTGCCCTTTATTTTATTATTATTCACCAAAGATGCTGATATTGCCCTTAACTATTT:1 + chr3R 25872324 3' - transib2 309 1 56.12 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTAC:1 + chr2L 11257136 3' - rover 34 2 62.24 GACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGGTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTG:1 - chr3R 23911355 3' - 3S18 49 2 61.02 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACNTAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAAT:1 - chr3L 6397667 3' - roo 71 2 63.01 AGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTTTGTAATCGAATAAGACGATCTGACCTATAAGTGGAAGGAAGTGCAATG:1 + chr3L 7599474 3' - F-element 4228 1 68.49 AGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACC:2 - chr3R 19407926 3' - diver 87 2 74.66 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAATTCTCGCACTAAAACCATG:1 + chr2L 16564617 3' + roo 403 1 74.65 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTG:1 - chrX 18396054 3' + roo 9037 1 52.74 AAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTAG:2 - chrX 9530311 3' + 297 332 2 63.70 AGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGC:1 - chr2L 12341839 3' + BS 5016 1 67.12 AATCATGACAGACCCACCAAACATTTAAAATATCAACAAAAAATACAAACAACAAATTTTCAGGAAACTTGGAAACATTTATTTTTCGAAATCTTACTTTTAATACTACAAAAGAATACTTAAATAATGTTTAATTAAATTGTGCA:1 + chrX 13487663 3' + I-element 183 1 60.96 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAAT:1 - chr3R 28146130 3' + roo 326 2 74.66 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTTATAAATAAAAGCCAATGCACAA:1 + chr2R 15376207 3' + 1360 3348 1 56.85 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGTATTTTCGATTTGATTAATAACCACCATTTCATCAGCAGTACATGTGATGCATCAAATATATTGTCCAAAAAACAGCCACATTTTTGCGCAGTGCAAAAC:1 + chr2R 9544977 3' - roo 8684 2 72.60 TCCTAATATATTTTTAAAGTTTATTATAGTATTTTTTTTCGTTTAGTATTATAAAATTCATAAATTTGTTGGGCCTTAAATCACCATATTTGAACGCTGCGGATACGGAAAATTAGATTTTTCCGAAACACTCGAAACCCGTCCCA:1 - chr3L 13922381 3' + hopper 170 1 87.67 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGATCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGTTAATAGGTGCTCAGTGCTGTTAGCTTTAAGATAGC:1 - chr3R 25433255 3' + transib2 2791 1 63.01 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAA:1 + chrX 10319694 3' + mdg1 347 2 67.81 TAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCTTTTGACATGTTTTGAATTCAATTAACCGGCCTAGACCGCCGACGCTGTTTATTATCATATCGGGCCAAAACTCAATTAGT:1 - chr3R 10524953 3' + hobo 419 1 60.96 ATAAATTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACAGCCTTAATAAATGTGGAAAATGTTAAGTATACCAGA:1 + chr3L 7889682 3' + roo 9034 1 59.59 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGCCTACTCCCTTCGCGCGCGGGGGAGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGG:1 - chr3R 27499990 3' + hobo 2932 1 49.37 AAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCGCAACGCCGCCAAAAGCGAAAGCAGGTGCAAAATCAGCGGACCG:1 - chr3L 21327015 3' + copia 253 1 82.19 TACATACATTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCATAAATAAAAGGCTTTCCCATAAATA:3 + chrX 11906381 3' - INE-1 13 1 50.00 TGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGCACCGTTTTACATGAAATAGAACCTAGGCTTAAACTAAAACAAAAATAATCGATTATCGGACTGCCACCAAG:1 + chrX 11770319 3' + invader4 2651 1 50.68 CGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATTTATGATGCATTAT:1 - chr3L 11257265 3' - 1360 10 2 78.77 GTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGTTCACAATCATTCACAAACACCCATCACACAATTAAAACACGATTGTAAATCA:1 + chrX 4953976 3' - P-element 375 1 36.30 ATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTT:1 + chr3L 9764440 3' + P-element 126 1 19.86 CGACAATATAATTTAATTTTTTATTGCAACATATCCAGTGACTAGGCATAAATGTATATGAGTATATGAGAGGGTCTTCCCTTTATCCTCCATACACGTTACCTCCACCTCCGCTAACTTCATCCCATTCCCCACCTTTCGCATTT:1 - chr3L 16758356 3' + INE-1 461 1 54.11 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTAGAACAATTTATGATGTCATCAACTAGCATATACTGAAATATACTACTACTCTACTTGCAAATATGCTTAGAAAGCTAAAATTGAACAGAATGCAAAATGGGCGGCGAG:1 + chr3R 26746636 3' - Tabor 14 2 71.92 AAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGAAAGTAAAGTTCCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCTGCCCCCCCAAAACGTCAAACTGAGTTTTCAATTACCACCTTTCGAACTTTCAAATTCAAATTAATT:1 - chr2L 7283835 3' + Gypsy6A_LTR 228 1 57.53 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAAC:1 - chr2L 3233962 3' - roo 8733 2 65.07 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCATACGGTACCTATGTAAGCCTGAATTA:3 - chr2R 7090638 3' + I-element 5292 1 59.59 AAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTTAAAAGCTCAAAAAAATCCTAAAGAAAAGCTTTTGGCCGAGGTTGGGTGGATGAGGATTAGGATTTAGGAGATCAGTCTGAATCGGGACAAGATCGTGAACAGCTTTAA:1 - chr2L 22173789 3' + Juan 4211 1 78.08 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTAATATGCTAACTTATCTTTTGGTCATTGAAATTTATTCGGGCAGCATTTG:1 - 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chrX 8200182 3' - flea 4801 2 60.61 AATAAACAATCATAATAAATAAATAAAGACTTGAGCTTAACGTACACATAAAATAACAAAAACATCAACCATGATTTGATCCGCTATACTCGTTTATGCATATATATATTTTTTTGTAATTACCAGGCAACCGATTTTTCGATTGA:1 - chr2L 10886461 3' + flea 5006 2 56.16 AAACTTGCATTTAGTTTTTTTTTTATCTATAACTGCTATGAAATAGGGCCCTAAGTATTATCGGACAAATACCCCACAGCGCAAGATATAAAAACGTAAAATATAACCCCCTATTTGCTTTACGCAAACAATCATCCCAT:1 - chr3R 16997220 3' - S2 176 2 77.14 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACAACCGCTGACGCCAAAAATATCTAATGGCATAATGGATCCATGGACTCT:1 + chr3R 4860525 3' - Transpac 4986 2 65.28 ATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATAGAAAATCGGACATTACGCAAAATAAATGAAATAGCTCGAATGGGAAATCGATTACAAAA:1 + chrX 7696189 3' - X-element 4644 1 59.59 TTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAA:1 - chr3L 22723860 3' + HMS-Beagle2 228 2 73.97 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTT:1 + chr2L 47184 3' + roo 9003 2 63.70 GCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCT:1 + chr2L 22684603 3' - transib3 68 1 54.79 AAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGTAAATCGAAAACAACAAATGGTGAATTAGAAAACAACCCCGATATTTAATCAACCAGTGTGGATTTCCCGTGTAA:1 + chr3L 19815550 3' - micropia 200 2 51.72 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAA:1 + chrX 21100274 3' - mdg1 44 2 56.16 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTATACTCGTACTTTTGGCAGGATTCCCGTCGTCTGGGGTCCTGCATCTCAAGTTGCT:1 - chrX 13490642 3' - 297 44 2 57.89 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACA:1 + chr2L 6647706 3' - mdg3 87 2 73.97 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCTGAAGAGCATTTCCCTCGAAGTGCCATAAAACGACAAAGACATCACATCTTAAGAATGTTTCTGTGCTG:1 - chr2R 4362733 3' - F-element 16 1 73.10 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGGTGGTCAATGACTCTACAAAGTCTGGAGTTG:1 - chr3R 30347301 3' - P-element 42 1 54.74 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTT:1 + chr3L 1279158 3' + roo 348 2 75.83 ATACACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATT:2 - chr3R 2527719 3' + INE-1 536 1 50.68 GAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTGTGCATATTG:1 + chrX 21994044 3' - McClintock 10 2 78.08 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTT:1 + chr3R 20167661 3' - roo 8742 2 73.29 TGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGGTGGGCTCTCAGGGGTCCTCGCGGATGAAAAACGATTACGCAATCTGGCCCGTGCCATGTCCACTAAAGCAAGTGGAACA:1 - chr3R 22897443 3' - HeT-A 6045 1 59.03 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACCTGACGAGCGAAT:1 - chr3R 12115260 3' - 1360 57 1 58.22 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTTCACTCGTACACCCGGCGCAAAAAGC:1 + chr3L 18403060 3' - P-element 76 1 41.10 AGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATATTTTAGAT:1 + chr2R 330269 3' - HMS-Beagle2 7 2 79.31 CTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCAC:1 - chr3R 9038935 3' - Juan 4078 1 63.70 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCT:1 + chr2L 9636161 3' - 412 7129 2 69.18 AAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTTCTTTTTGCAAAGTCAGATGCACGACGAGCAGTCCGACTCTAAAATCTCTACAAATTGTATTGCACT:1 - chr2R 17519572 3' + 17.6 7031 2 54.11 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAACTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAATGGT:1 - chr3R 14980279 3' + roo 9040 1 63.70 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGT:1 - chr3L 5389842 3' + roo 9032 1 58.90 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAAAAGGTTTTGTGAGTAATGAAGGGCGCCAAATGGGTTTCTTAGCATTCAGCTCATAACAGAGTGTCTTCCACCTAAAAGTATGCTATAC:1 + chr3R 31264149 3' - jockey 4759 1 78.08 CCTTTTTCTTTTTTTTGTTTTTTGGGGGGGATAGGTTTGGTTCTTTCCCGTTTTGTTTTGGTATGTTACTATTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTAT:1 - chr2R 15070153 3' - Doc2-element 223 1 51.49 GAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTATCATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAACTAAACATGGA:1 - chr2L 15004782 3' + INE-1 148 1 63.01 AATCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTCCTCGTTATGTGTTGTGATTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGTATTAT:1 + chr2L 5271749 3' - Rt1a 30 1 50.00 GAGCACAGTCAAGACTTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATATACAATGACCGAACAAAGTCAGAAATTAATTACAATACTAACACAACCCAACCACAAACTTCCAAATATAAAGGGGAATAT:1 - chr3R 3388148 3' + Doc 4350 1 61.64 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCTGCGTTCATTTCGCTGGGTTTCGGGGTTAAGTTCTTTTCATCATGTTTTAAAAGTTGTGAAAAAAT:1 + chr3R 12242365 3' + transib2 2772 1 55.48 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCTTAACACTTGAGGCTG:1 - chr3L 6518513 3' - 412 7072 2 73.29 ACTGAGGTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCCAAAAGTGTTTAAAAATGTGGTCGTGACCGGTTTGGCGGCTTTAGGGCGTTAGTGGGGGCGTGGCAAAAAGGTTTGTTTTGAAAATCGATAGAAATTTAAGAA:1 - chrY 3652613 3' - INE-1 531 1 54.79 TTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTGGGTATCGAAACATAAGAACTCAAGCTGCTCGCATT:1 - chr2L 15550678 3' - Bari1 68 1 66.67 AGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAGTGGAGGGTTTTGCATTGGTTTCAATATTTTCTTGGAATCCA:1 - chr2L 22966872 3' - 1360 3188 1 53.42 GTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTAAGTTTTTTGAAGAGCATAAAGATATTAAGATGTTTTCTCAAACATTTAT:1 - 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mdg1 47 2 52.74 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCGGTTGCCATTCGGCTGGG:1 + chrX 959108 3' - 412 47 2 53.42 AGGATCGCTAGCCGAGTCGATCTAACCGTCGGTCCGTCCATATTATCGTCGGTTTCTCTTGTTAAAAAAAAATCATAAAATAAATACAATTTTCCAAAAGAAAATGCTGACAAGTTCTTAAAATATTCATAAGCACACCTA:1 + chr2L 7274022 3' + INE-1 96 1 53.19 AACAAAGTGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACTTTTACCAGCACACATCATGTTCTGCTTCATCACCTATTACTATACTATACCTATAACACATAGAAATGGGCAAAAGAAAACAACAGCAAGAATATATTAAAT:1 + chr3R 16103211 3' + gypsy4 494 1 74.66 GGATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTTTTTTACATCGCACACAATGCACCTGGAGGATTGGTCTTGGAAAGGCGGATTTGACATCTAGTTTTTG:1 + chrX 18336731 3' - mdg3 5261 1 75.69 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAAT:1 - chr3R 21276507 3' - BS 5031 1 58.90 ACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTATTTTCAGCGCTCTGCCTGTGTAGTTCTTGTTGTTCCTCATTTTCGTC:1 - 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chr2R 7244831 3' - diver 80 2 71.92 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGTTATAGGATATGTATATAAATTGGATTTAGTTTGTGATATATGCTAC:1 - chr3R 10270584 3' - Juan 4089 1 62.96 TAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAGGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTT:1 - chr2L 13556347 3' + transib2 2762 1 62.59 CGGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAA:1 + chr3L 23702270 3' - G4 48 1 50.00 ATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTA:1 - chrY 680449 3' - invader2 4899 2 71.72 GTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATTATAATACTAAATCCGAGT:1 - chr2R 5106283 3' - Stalker2 7327 2 72.41 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCG:1 + chr2L 11257093 3' - rover 6991 2 68.87 GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTA:1 - chr3R 6419855 3' + Tabor 411 2 71.23 ATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGAGTTTTTTCAGCTCCGGTT:1 - chr3L 25729511 3' + Cr1a 4295 1 82.50 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACGTTGTCGCATAAAAATAGATGCCAAACACGAACCCTAAACTGAAAACCCTCCTCGTCGCCGTTGTTGCGGCTTACCGAAGAA:1 - chr3R 24450397 3' - 412 7091 2 55.48 CCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATATCATTAATGGATATCTTAATAGATGATAAAACAACATTATTCCCGTTCTATATAGTAAATTTAAATAAGT:1 - chr2R 12643678 3' - X-element 4670 1 51.37 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAA:6 + chrX 8200295 3' + flea 4950 1 62.33 CCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACATAGGAAAACAATCAAATGGAATGTAGCTTAATAA:1 - chr3L 12310970 3' + transib2 2508 1 76.71 TCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGTGGCAGATCGGAAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTACCAAAATAATATGTGTAATTAACAACAGATGCCACTTTTATCCGAAAATA:1 - chr2L 21886007 3' + invader2 4955 2 69.18 CATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGG:1 - chr3L 18125928 3' + Ivk 5302 1 70.92 TCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGGATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1 - chr3L 25232774 3' + accord2 137 2 66.15 GATACAGGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGCGTCAAAATACAAGAATAGAAGATGAAAAAGCTGCGAGTTAAAGTAACTAATTATTTTGAAGTCGGTAGAAAATTTCTTTTGAATTAGGCAACCAACA:1 - chr2R 7368077 3' + Cr1a 4404 1 64.38 CGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAGGAATGTCAAACTCTGAACGGATGATGTGCACAAAAGAGAGCAAGGAAACATTG:2 - chr3R 22258528 3' - accord 7360 2 63.01 ATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCCATTCGTTCGTTTTCCATGTTTTTTTGTTTTGTTTGTTTAACTAAAGAAAATCAGCCTTTTCTTGCTATACACATTAAATACATATATCG:1 - chr3L 15607407 3' - Porto1 277 1 74.66 GGAAAANTAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGA:1 - chr3R 23639124 3' - pogo 44 1 54.11 TTTATTACAAAAGAAGTTAGCTCCAAAAGGTAAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACATGGTGATATAGTTGACCTTCAACAAGAGAGAATTCTATAATCGAGTTCTCTGACTATCCGATACCCGTTACTCAG:1 - chr3R 20403671 3' - Q-element 254 2 52.05 GAATTTATTTTGGGAGATGTTTGCGCCACGGAAAATAATAAAACTGATTTTATTTAT:1 + chrX 13490578 3' - 297 499 1 70.18 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACT:1 - chr3R 4461032 3' - blood 74 2 70.55 TATTACAATAAATAAATATTTTTATTGTGAAAGAAAAGGGACAGTTTCTTCGATGTAGATGTGAGATCGCTACTAAGGGTTAAACCCATCGGTGGTACCACCTGACGTATACGCAATGGCCAGGAATTGTTCTTCACCTCGCTTTT:1 - chr2L 7283432 3' + mariner2 830 1 56.85 TTAAACAAAAAAAAAAAGAAAAGGGGAACCGAACCAGGTTGGTATGGCTTC:1 - chr3L 1690198 3' - hopper 151 4 76.47 CTCATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTATTTTACTCATTTTTTGTGGTATTTGTTTGCCGCTTATCTCGGG:1 + chr2L 2489284 3' + 1360 3228 1 65.35 ATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGGCCTTTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATATTTAGGATTAGGAACCTCTGCTGGCTAACCAGCTAATTATGATTGAGACTGCTCCAAGACAGATAAGATAG:1 - chr3R 30442561 3' - mdg1 7259 2 60.27 ACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCG:2 + chr2L 13844277 3' - Stalker2 7291 2 55.48 CGAAAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAAAACAAGGAAAAAATATGAATCCAATTGCCATTGCGCAATTAAGAATGAAAATAAATACTAATT:1 + chr2R 16431412 3' - diver2 4745 2 61.11 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTTAAGGAAGATC:1 + chr3L 18931061 3' - I-element 56 1 54.48 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTT:1 - chr3R 27083028 3' + jockey 4945 1 52.78 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAACCTGCAAGGGGTTGGTTGTTTGGGGGG:1 - chr2R 8099098 3' - jockey 4779 1 71.23 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCCATGATTCGACGGGACTTGGTCAG:1 + chr3R 27123580 3' + roo 352 2 57.04 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGTCATAAATGATGCGCC:1 + chr3L 21763754 3' - jockey 95 1 75.34 CGTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATATATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTTATGTTTTGCATTGCCTAAACGGAAGACGAACAAACTTAATAAAGTTAAATAATTATAACAATGTTCACACAGTTAA:1 - chr3R 25344744 3' + 1360 226 1 58.22 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCC:5 - chr2L 71177 3' + 412 425 2 60.96 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAATCACACA:1 - chr3L 10373793 3' + 297 361 2 63.45 CGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGGTATATAAATCTTGGGAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAA:1 - chr2L 12818244 3' + hobo 2868 1 63.70 TTTATTTAAATAAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTATTCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGCTTAAAAAAGTTACTTTTTTTTAAATCTATTGCAGTAGAATATGGTGTAGAACTTGT:1 + chr2L 16548691 3' + transib2 2634 1 67.81 TTTTAATTGTTTTTTCCTTTTTCGCCGACATTTTCACAGCCACAAAATAAATTGATCTGTGGTTTTGGCCTTATAATTTATGAGCCTTTCTTAGGCGGGCGAAAGGGAGTGAAATGCTGAATGCGAAATTTGACAAATGGCTGAAA:1 - chr2L 18376463 3' - Bari2 916 1 73.29 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTA:1 - chr3R 19450078 3' - roo 8668 2 58.22 GTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGTGGCTTTGGGGCAATCGCTGCAGCTGTCTGGAGGCC:1 - chr2R 23505874 3' - accord 7039 2 69.75 TAAGACTAGTCTGTATTTCCAAAAGACTTAGTACTGCCATCGGATGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTTTCTTTCTTTTAAACATTTTGTTGATATTA:1 + chr3L 7733014 3' - transib2 2484 1 85.86 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATAT:1 - chr2L 14874146 3' + copia 247 1 43.84 ATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTCTACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATATAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAAT:1 - chr3L 25255412 3' - INE-1 300 1 65.75 AAACAAACATTTCTCGATACTGCGCATCCAATCAAACTGTAACCAAAACCCAGCCAACAAACTAACGATCTTGCAATTCATAATCACCCAGAAGCCAGATGTGCAGCGTATCTAGTAATTAAGCATACCACGTAGTCACTAAAAA:1 + chr2R 19482289 3' + Tom1 84 1 68.97 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATATATAATAATAATATATATAATATATACAGTTAAAAGCCATCAAAACACCCCTTACATTTGCATATCCTTATGCCCTCATATAATCGAATCCCCAAGTTTCTTGGTGGCATAA:1 + chr3L 21969917 3' - opus 110 2 60.99 ATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATG:1 - chr3L 9218281 3' + Stalker4 155 6 76.71 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCA:1 - chr3L 6518534 3' - 412 40 2 58.90 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGCGGCTTAAATCA:1 - chrX 8200168 3' - flea 43 2 55.17 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTATTTATTTGCCCATGCCACACACATTTGAACTATGAAATAACCACGGGAATGTTTGCCATTT:1 + chr3R 25428258 3' + 297 337 2 61.38 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCCAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTTCGTATTTT:1 - chr3R 10931605 3' - 297 17 2 64.00 GTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1 - chrX 21087598 3' - mdg3 44 2 67.24 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCAAAAGGGATTGGCCAGGGGATGGGGGACACAATAAATGGGTCCGGGTGGT:1 + chr3R 15807436 3' - FB 71 1 65.07 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCTTTGCTGCAATTCACAACTGTCGCTGTCCTTGATTATAGCTTTTCTTTGCTTTGCTTTGCTTTACTTTAGGGGCTCTCTTCGTCCAATTTGTTGTT:1 - chrX 8092645 3' - pogo 48 1 77.60 TAAAAAACAAAACAAAAAAAAAACAACAGCATCAGCAACTACAGCACCTGAAAAGAACAACTCTTGAAAAACTGGCGAACTATTAAACTATATACTCAGTGAACAGATCGAAAAAAGAAAGGCGTTGCGTTTGCTCAGATTTCAAT:1 - chrX 1098270 3' - hopper 150 11 52.05 AAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATACACAGACACACAAGAACACACACACACACGTACACATACAAGTATAAACGTACACTTAAGGATATATAGTCAGCCCCCAAAAACTTGTATTTATTTTTATTTGTATATTTGCAGA:1 - chr2R 12089275 3' + Porto1 4214 1 76.03 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCATAATTTTCGTTAGCCCAAGGCTGATATTGCTACTTTAATAGAATCAATAGCAAACGTTTTTAACAGTG:1 + chr2R 14653306 3' + 297 387 2 76.03 TCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTCCTGGCTGACGGGCTAGTCCTGCGAATCGGTGCACACTCTCTTGCCGAGGGTGACAGTTTCGGAAATAAATTTATGGGGCTAAGTGACCACTAAGTTGGGGCTTTGGC:1 - chr3L 10192655 3' - baggins 5346 1 76.71 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGGGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTA:1 + chr3R 28385637 3' - transib2 49 1 52.45 GGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGTGTAGATGTAATATTTCTATCGAAAGAGGTGGAAGTAGAAATATTTTATTTTTTATTTTATATAATTACAAGTCTA:1 - chr4 798424 3' + baggins 5145 1 26.03 TCCAAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGC:1 - chr3R 28042963 3' + Stalker2 316 2 76.03 CTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTACAAGTTAAAAAACATGAATATTGGGTATGATGGTCGATCGGTAATAAACACCATTTAAGGAGTGGGTTG:1 + chrX 1074367 3' - Idefix 93 2 78.08 AAAACAAAGATACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGAGTATTTAATGGTCGTATAACTCCCACTTATTGTTTGACTGACACTG:3 - chr3L 11314351 3' - Tc3 314 2 61.64 ATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTACAAATAAATTATTTGATTTCAAAACCAGTATTAGTATACAGTAAACAAATATTGG:1 - chr3L 22890947 3' + FB 953 3 61.82 ACACACACACACACACATAATTTCACCAGCTTTAGCCATTGTCTGCCCGCTGGCCATGCGGTTGGGTTGTTTGGCGTCATCTCAATATAAACT:1 - chr2R 8375966 3' + accord 7031 2 48.39 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAATGCAT:1 - chr3L 21996122 3' - Transpac 4944 2 73.29 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAA:3 - chr3L 15913849 3' - jockey 4821 1 60.96 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGATTTGGCTGAAATTGAATTTCTATGACTAGATTTTCTGATGAGCTAACTGGAGTTAATAAAAATGCTTTC:1 - chr2L 1300631 3' - GATE 38 2 60.28 CTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGTACATATGTACATATGTACATATGTATGTATGTAAATGTAATGAAAAATTTCTATCTAAAGTGGAGAAA:1 + chr3L 23249494 3' + rover 7251 2 53.42 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGCTTTGTTTTGTGACTGTAGATGTCATATCTTCAGTGTTTGTTATGGTAAGGAGAAGAGTGCTTGTAAATCGAGGGCAGAGCTGTATAAATATAAGAGTTGAATAAACAAAAAG:1 + chr2L 14253522 3' - Burdock 34 2 73.97 ATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGTAGAGCGCTTTGCATGGGGGCAATGAGGGGAAAGTGGGGAAATGTGTGTGGAAAATCGCGTG:1 - chrX 20631003 3' - I-element 5037 1 57.76 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTA:1 + chr2L 16564592 3' + roo 9037 1 55.48 AGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' + 412 7314 2 77.00 ATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTTTTCTTTTCCTCATTTTTTATTGCTCAGTTTTT:1 + chr2L 17809078 3' + jockey 4841 1 65.98 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCGATGCCGTCGAGAAAGCCAGCTGACAAACTGGCATTAACTGTCACAAAGTCACG:1 - chrX 585636 3' + Tirant 8456 2 57.69 GGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGGGAGGGAGGGGGTCCATCGCTATGAATGGAAGGGTCCAGAAGGGGTTGGGG:1 - chrX 19684139 3' + invader4 97 2 60.98 GTTTTTTTTTTTATTTTTTGTTGGCCAAGAAAAGTTGTAACTTTTGGCAGAAATATGCAAGCATACATTGAGGCACACACAGAACAGCCATGAACCCACAAAAAGTGTGTGTGTAGGGTTAACAAATTATTTTTTAT:1 + chr3R 23653531 3' - HMS-Beagle2 488 8 58.39 AGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGTACTGTGC:1 + chrX 19980700 3' - X-element 4536 1 52.05 AGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTTCCGTACCGA:1 - chr2R 18514842 3' + P-element 375 1 68.49 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAATAGACCCTCAACAGGTTTTTATCATCTCTTATTACGATTTTT:1 - chr3R 19073207 3' - roo 8749 2 73.29 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAGACAGC:2 + chr2L 19924067 3' + roo 9037 1 53.42 TAAGCAAGAAGCGCTCTCGCCTTACTTAATGTTATTATTAGGCTGCTGATGAGATCCACTGTT:1 - chr3R 1540868 3' + Tom1 202 1 66.67 TGTTAATGCGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTTAGTTTGTATTTTGTATTTTGTATTTCAGATATGAACACACACATTTTATTCGGTATTACCTCTGCTTATTTTCGCCTCGCGCACTGATTTAATTCGAGTTGCTT:1 + chrX 21423128 3' - gypsy2 492 1 73.29 AGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATTTGAGCGGGTCAAGTGTCCAGGTCTAAG:1 - chr2L 4754840 3' - Stalker 6854 4 57.36 AATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCTGCATTACGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGTATTTTGAAAAAAATACCA:1 + chr3L 23224562 3' - X-element 4366 1 67.67 TTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGCACATATATAACGATTCAAGCAATACG:2 + chr2R 4870257 3' - Juan 79 1 64.83 ATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCTGGGCTATTTTGCGCACTTAAAACTGGAAGTTGTCCCAATCAAAATAGCCAAATGACCGCACAACAACTA:1 + chr3R 21933284 3' + pogo 2082 1 76.03 ATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTAAGAGTAATGAAATTCATGGAAATCGTTCCGTTATTGAGTAAAAATCCTTTGTGTATGTATTCAAATGAGCATGGCGCCAGTTGTTGTTTTGGTA:1 + chr2L 22171159 3' - Juan 3877 1 69.86 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGG:1 - 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F-element 4301 1 79.45 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCG:1 - chrX 7795513 3' - roo 8726 2 64.38 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGT:1 + chr3R 16518991 3' + Tirant 8450 2 55.48 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTT:1 - chr2L 22193433 3' - roo 8742 2 71.92 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAG:2 + chr2R 4673647 3' - Quasimodo 33 2 45.21 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAAATGAAACGTAAATACGGGCAAGGCGAGGACAATATTTTTGCTGCTCCTCCGATTGCTA:1 - chr3L 10170130 3' + Juan 4178 1 54.78 AGAAAAGAAAACTAAAAAAAAGCAGAATGAGGCGAAGAAGCAAAATCAGCAGAGCAGCCG:1 + chr2R 19092296 3' + mdg3 5105 1 58.33 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAAT:1 - chrX 7795490 3' - roo 39 2 60.96 CTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGGGGGTAAACTCTACCAATTCACTATTGTTGTTGTTTTTCTGCGGTAGATGGCGTGTTGACGTGGTCGCTTTTAGGATTCCGATTTTCAGGTTACACGGTT:1 - chr2L 6173134 3' - Doc 123 1 70.55 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTATGTATATCATCGCATTATAAATGTCTTGCATTTGTAAGAATGCTCCA:1 - chr3R 5523918 3' - FB 67 1 67.14 AAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAAAGTA:4 - chrX 9530312 3' + 297 331 2 64.38 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCA:2 - chr2L 7580906 3' - Transpac 63 2 61.64 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGTGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTG:1 + chr2L 22674860 3' + mdg1 339 2 73.29 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATCTTTGCTGATCTTGGCCAAACATCTGGCCGCAATCAACTGATAAATTTATCAATTAACATTAGCCGCTATCTGTGGCCA:1 + chr3R 17736982 3' + opus 7462 2 57.53 ACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTAGCGTTTGTCATTGAGAGGTGTCAAGTGGCTGGCAAACACACGCAGACACACACAGCTGGAGTGCTAAAAAAGGAG:1 - chr2L 7104885 3' - mariner2 748 1 63.48 GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGTTTGTTTGTCTTGCATGTCATTTTGTTGTCCACACAGATTTCGAACTTAATGCGCTCACAATTTTCTATT:1 + chr3R 18576232 3' - jockey 4855 1 47.95 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAACATGAAGTTCTGTGAAGAATTGAGTCTAAATACGAGTCCCTTTTG:1 + chrX 14083733 3' - mdg1 50 2 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCATTATGCGAGACTTGC:1 + chrX 8308533 3' + roo 9047 1 69.66 TTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATGTAGCACTCGAGGATTTTG:1 - chr3R 18399355 3' - Juan 4064 1 41.10 ACCAATTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTTAACTTCATACTCTGATCTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTTCACAAATTGACGTTGTTCTTGTTGCCGCTGATGTTCTCTGTTGCTTGATGGCTGTGTAAG:1 - chr3R 29089352 3' - Idefix 7300 2 56.25 CTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAAATTAATCGATTGTTTGATGTTTGTTAAGCCCAGTTAGGAATCTTTCCCTTAAGTCAGCTTGAATTTTCTGCGAAGTAATGGCTTCTGAGGAATAGCAGAATTCCCGTTTCTTGTTC:1 - chrX 159254 3' - Cr1a 4056 1 78.77 ACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCCAAATGCTCGACGACTGCGATCGATAGTAGCGCGGACGATGACGATA:1 + chr3L 17055523 3' + Tirant 328 2 70.55 ATTATAATTTTAAAATTTTCTTTTATTTCAAAGTTGCATGCGTGGTTTCT:1 + chr2L 11520452 3' - 1360 3056 1 82.00 AGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATT:1 + chr2L 6647713 3' - mdg3 5332 2 68.49 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGTTCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACAA:1 - chr3L 12004217 3' + P-element 2852 1 61.11 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTTAAATTGC:1 + chr3L 16033425 3' - Doc 46 1 53.60 ATTTATTTATTTTATGTTATGAACTATATGCTTCACTATGCTTTAAGCAGCTGGCAAATTATTATTTGGTCTTCTAGTTTTCCTATCATGATACTTTAAATAAATATTTGACACAACTTAGCAACAATTGGAACGTTTTTAAAATG:1 - chr3L 259164 3' - Doc3-element 75 1 73.97 AAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGC:1 - chr3R 22590472 3' + rover 7245 2 56.85 CAAGCAACGATGGGCGCGAAAGGGTTAAGAACACAGAACGGTAAAGTATATAAAGGATTATAATTAAGGAAGATTAAACGTTTTTTTTTTCCGTGTGCCAAGTTCTGTAAGCCTTCTCGATTGCATATCACATCATGTGCCCTTCC:1 - chr2R 19990090 3' - looper1 7 1 51.37 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGTAGACATCAAAAACTATCCAAAATGGCCTTAACCATCAGGTATATCTAGACCATCTTTTAAAGAATTTCAAAATTAGG:2 - chr3L 24131343 3' - Transpac 4928 2 76.71 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACG:1 + chr2L 17809270 3' - jockey 64 1 54.79 ATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTCTGACCTACTGAACGACTTAGTGGCCTCCTTTCGGCCGGCGGTCGTGCTGAATCTGCAGGGTGTGATAAGTGAGCGGGCAAACGAACAGCA:1 - chr2L 10180443 3' - I-element 5160 1 76.00 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTAAAGCCTAAAAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATTTTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTAGACTAATTCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGT:1 + chr2L 14523289 3' - HMS-Beagle2 6898 2 41.78 TTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAAATATTCTAAGTAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTTAACTATGGCTAAACCTATATAGATCTTGCAGTTGGTTCTCTAGTCTATACTCC:1 - chr3L 20008969 3' + HMS-Beagle 258 1 62.22 GCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCNTTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATAAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTT:1 - chr3R 556389 3' + Juan 4143 1 67.13 CGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTTTGTGGCAGGGGATGGTTTATGTGGGGCATTAAGCTGGCCAGGAAACCCGGCGAGATCG:1 + chr2R 20097606 3' - accord 7360 2 68.48 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATC:1 - chr2R 10417156 3' + 1360 3305 1 76.03 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTAGGAAGGTTGAAGCATTAAAAATAGAAACATTTATTCTATTCAGCTTGGAGGTATGTGGAAATGTAATGGTATTAA:1 + chr3R 10973534 3' - transib2 46 1 56.55 ATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTAAATTGGGATTTAGGTAGTGTTTTTGATTTATACTCGTGTGCATATTAATATGGCGTTAAAATATGATGCCAAAATTTATGTGTGAAAAACAGGGCGGTGCAGCAGCTGAAGCC:1 + chrX 12285056 3' - I-element 5009 1 65.52 GCCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATAATGATAATAAAAAATCGATTATATACACCAGTGAACCTCATAGAACAGCAATTTTCCCCGAAATTTTCATTTCTCTGTAAAACGAAATGCTCTAAATGTTATCAA:1 + chr3R 30675502 3' - 297 9 2 76.03 AGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTATAATACGTAAGTATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATG:1 - chrX 12217459 3' + rover 7270 2 67.12 AAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTA:1 - chr3L 16973323 3' - S-element 1541 1 67.81 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATTTTCTTAATTTTCCTAATAAATGCCTAACTCGGGTTATTACCGGTATTAAAATAACTATTGAGAAATTAAATAGT:1 + chrX 18396199 3' - roo 8707 2 56.16 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACAGCGGCACACATGGCGTATGCGTAATAACATTTTGCGTTACATTTGCTTTTTATTGCATAC:1 - chr3R 29612006 3' - jockey 67 1 56.16 CATTGGGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCCGGCTAATATTGTATCATGAGGCGCAACTGCATCAGAACTCAACACAGCTTCGTGGTTCTTGGGAACAGAAGCAGGCCTAGCC:1 + chr2L 22210030 3' + Doc3-element 4473 1 58.90 ATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATACCCTCCTTCATAACAAGTA:1 + chr3L 23071839 3' + mariner2 797 1 76.03 GTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTCCAGTTGCCTGCACCACCAGAAAACAAAATAAAAAAAAGACAAGAAAA:1 + chr2L 3197982 3' - accord 254 2 63.01 CTAATGTAATATAATTAAATATGGTACTCTAATAAATCATATTTTGTGACTTTTCGATTTTATTATCTAAATTGCTTAATGGATGCAACCGTTGGGCAGGAAAGTCCTGATGAAAGGATATTCTGACGCACACACAAGTCGACTCA:1 + chr2R 14650046 3' + TAHRE 433 1 61.64 AAGCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCACCCGAAAAAAATATGAATAAGAAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGAAATGTCGAAAA:1 + chr2R 4545169 3' + invader1 3535 1 52.41 CACTCCTTATCAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACATTCTTCCCCGCTTAAATGCTCAGA:1 - chr3R 7754757 3' + G6 298 1 69.62 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTAATTATGAAGATCATGCATTTACATGGCTATTAATTATATAC:1 + chr3R 21630377 3' + I-element 5321 1 63.01 TTTTTTTTTGTTTAATTTTTTTTATTTGCAGCACAATCCGAATTCATTATCAAAATTTGAGCCGTTTAT:1 + chrX 10584210 3' - Doc 4695 2 57.97 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAAT:1 + chr2R 13931585 3' - P-element 96 1 15.44 TCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAG:1 + chrX 21224629 3' + roo 408 1 69.33 AGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTA:1 + chr3L 15099686 3' - G4 3809 1 56.16 TTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCAACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTATAATGATTGCCTGTTCGGTATATATAGAAGAGAGTTATATTAATATATGTATAAGGTAAGAGATAACAAGTTAAAATCTGGAATTGTT:1 + chr3R 24220400 3' + transib2 20 1 69.18 AGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGCATTCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTAAATTTCGGTTATCCATCTTAATAAAACCAATTTTCCGCATTATTGTTTGTAC:1 - chr3L 646845 3' - Stalker2 352 2 63.01 TCTTAAATAAGCTAACAGTGAATATGTATGTATGAGTTACAATGTTAAAGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATAATTAAATTAGGCAAAATATCTTAAGTGACTTTCGAAATTTATCAACAGAATT:1 - chrX 3063246 3' - ZAM 8248 1 60.96 CAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGCTGCATCCTTGAATGGCGTTTGTTTAGACGGAGTGTTTACACTAA:1 - chr3R 10030433 3' - I-element 5192 1 68.75 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGCTAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTTCT:1 + chr3R 16342058 3' - P-element 38 1 55.48 AAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGA:1 + chr2R 12472123 3' - transib2 58 1 57.24 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCAATCAATTCGGTGCCGCACTAG:1 + chr3L 13581753 3' - jockey 4806 1 54.79 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATACATAA:1 - chr3R 14980283 3' + roo 9036 1 60.96 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGT:1 - chrX 15357642 3' + hopper 1366 1 50.68 ATATTTATTATTATTATTATTATTATTTATTATTATAATATTTATTGTTTAACACGAATTCCGTCCCGGGGATTATTGATTGCAGCAGAGCTAAAGGTCAACAGTCTCTTAACTGCCAATAATATGTCATTGCATGCCATTATGTC:2 + chr2L 5776850 3' - mdg1 45 2 79.45 ATATATTGACATAAAATTTTAGACTTTATGCTAAAAAACTTACTGGACTGCTACGTTTCGTTAAGGACTAAAATGTGATTTGGACTGTTTTTTCATTGGTTTGGAAGACTTCGATTTTTGTTGGGTTTTCTGTTTGCTTTATTGAG:1 + chr3L 15863005 3' - transib2 38 1 76.71 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGTAGCTTTCGTTTGTTTATCAAGCTCATTTATTTATATACGATTTGACCATGAC:2 - chr3R 27133524 3' - opus 6 2 79.45 ATAAAAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGC:1 - chr2L 14052099 3' + hopper 1329 2 73.29 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCAGGGGCAAACACACTCACACACACATATATTCTGCCTGCGACGCCATATTGAAATTCATTAACATGGCGTCCTTTTCGTTCTCGTCG:1 + chr3R 20140508 3' - jockey 4808 1 40.34 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTTTCATCGCTCGCTCCTCACCCGCTAC:1 + chrX 8437720 3' - P-element 93 1 21.23 GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTA:2 + chr3L 24934391 3' + HMS-Beagle2 243 2 66.44 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGAA:1 - chr3L 5532916 3' + roo 359 2 54.11 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAATTT:1 + chr2L 6647746 3' - mdg3 5299 2 54.11 TGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCGGATGTCGCAGGGAAGG:1 - chr3L 6447044 3' - transib2 76 1 71.43 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAAGTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCA:1 + chrX 8027507 3' - Juan 43 1 45.21 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGAATATAGAACAAATATTATAAAGTCAAGCATGCTTTGAAA:1 + chrX 12986675 3' - roo 8682 2 73.97 ATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTTTA:2 - chr2R 330094 3' + HMS-Beagle2 7154 2 57.53 TGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTAGCTGCATACTGAATGAATGAGAGGCTGCCTGGTGACAAATACACTGAACGGCG:1 - chr3R 17492069 3' - Doc3-element 4575 1 55.42 GGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTTATCCCTTCAGTGTGTTCTTGCTTCATTTAACCAGCTCTCCCGCATCCGTTCACTAAACAGTGTCAAACAAAGC:1 - chr3L 21863390 3' + R1A1-element 5223 1 59.59 ATATGTTCATAATTATTTATATATTATTTATCTTGCTGTATGTTAATATATTTATACTTGTGCTTTCGTAATACATAAATAACATACATATAGTATAACAAAAATATTGAGATAGACGACCTTTGCCCAGATCCAATTGGATGTCA:1 + chr3L 1033570 3' - 1360 2945 1 79.45 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAATTCATAAATCGTTTGATAAGCACATTTAATTATAATTTAATATCAATCCCACTTTATTTTGATATATTTTTCTTTCTATACATTGTTGTTCCCGGGGATAAAGGCCTTAC:1 + chr3L 24131550 3' + Transpac 302 2 79.45 AGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATG:1 - chr3R 20140505 3' - jockey 4760 1 78.08 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTGACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGTGCGAGA:1 + chr2R 9158149 3' - mdg3 58 2 53.42 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTATATGTCATTATATAATTTTTGTGGGACATGAGCCTGCCGCCACTATTAATAAAAAGTATGTTCATTGTTGAAT:1 + chr2L 22193535 3' + roo 9029 1 56.16 TATATATATTTAGTTGTTTTTTTTTTTGATTACTTGTTCTAAAAATTATAAAAAAGAGAGTAAAGAGAATGCATTTAATTACTTACCATTAATATGTGATTTCCTTAATAACCAATTAAATAAAAATATTAAGCTATTTTTAGTGT:1 + chrX 14164365 3' - Transib5 32 1 60.27 CTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAGTAATCCCTAAGATACAATTAATTCACCCGTCAGTTTAAACTACTATATTCTATGCGACATGAAATTCATTGCATACTTTGCGGCTGCAAGCCTGCAATAAATGAGGAAAA:1 - chr3L 3501671 3' - Bari1 9 1 68.49 AGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGA:2 - chr2R 7244826 3' - diver 75 2 68.49 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCT:2 - chr3R 904936 3' - rover 45 2 63.70 ATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACAGATTCCAACCAAGAAGAAGTATTAAAGATAATACTATAATAATTTTAAACCGAAAAAAAAATAAATATTTTTTAACCCTAGTAATCAAGCTGCCATGTCAAAAGCTGCAA:1 + chr2R 3194628 3' + McClintock 44 2 77.40 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAAACCTCCAGCGAGTC:3 - chr3R 11040046 3' + Bari1 1654 1 54.79 ATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCGAACGTGTCGCAACATAATTAAACATGAAAACGAGTACAACAACAAAAACTTACCTCACTTCCAGTCGAACGTAATTCCAATTAACTGCTCA:1 - chrX 10087371 3' + Quasimodo 6930 2 70.55 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCC:1 - chr3R 9038900 3' - Juan 4043 1 59.59 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACAAACAAACACAGAAATTGATGCTAAACAAACTGAACTTTTTTCAGCCAAGTTCAATGCACTCGTTCTACGTAGAAATTTCATTTTCATTTGCTGG:1 - chr3R 26504178 3' - HMS-Beagle 6821 2 68.49 ATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACC:1 - chr3L 22861731 3' + S-element 1693 1 64.38 CCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCACATCCACATACATAAGACCCATGGCGCAGAAGAATC:1 - chr2R 24673150 3' + I-element 4892 1 73.38 AAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCT:1 - chrX 21639579 3' + gypsy5 7326 2 69.86 AAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATACGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTCAATC:1 - chrX 18396023 3' + roo 405 1 71.23 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAG:2 + chrX 10521716 3' + Tabor 410 2 67.81 ACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGCAGATTTCCGCTACTCTGCAAAAGATTTTCATCA:1 - chrX 7878704 3' + Doc 154 1 76.71 ATACACCTAGCTCACTCTCTCACTCGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGATACGCGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTTTTCGGCGTCCACAATATATATTTACTAATTTGCAAA:1 - chr3R 7819184 3' + invader3 5327 2 72.60 CCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATAT:1 - chr2R 1355077 3' + 297 202 2 58.33 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGCTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCT:1 - chr2L 22674755 3' - mdg1 7074 2 63.70 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTCCCTCAATTTCCTAATACCTCAATATTTCACAACTCGCAGCGCAAAACAA:1 + chr3L 9809338 3' + 412 422 2 64.38 AAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAAATTAATAAACATAGAAAAAAAAAACCTTTGCAATGCATATTTCATCACTCGGGATGATTCCTGCCTAATTACA:1 - chr2R 19109632 3' + Doc 4630 1 62.07 ACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTA:1 + chrX 19980668 3' - X-element 4568 1 73.97 TATATTTATACATATACATATACATATGTATATGTCTAACTGGATATATATATATATATATATATGGTGCCTTTGTTGCTGCTCGTTCG:1 + chrX 10101125 3' - Stalker 247 4 51.69 AAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATACATATCTGGAGAAGAGAAATTGGGGATCCTTTCGAGGAATTTGGACGAAGCATCTG:1 + chr3L 8960984 3' + 1360 122 1 62.00 TTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTAGTAATCCCTAAGATACAATTAATTCACCCGTCAGGTTAAACTACTATATTC:1 - chr3L 3501721 3' - Bari1 68 1 64.83 TGGAATATATGTATGTATATATTACATGTGTTCTTAAAAATATTTTGTTCAATTCACAATGTGAATTCACGATGTGAACTAGATTTGTTAGCCTAGTCATAGTCATCTTGCCTTTGTTATGTTTTTTTTTAGCTCATTCTTAGGAA:1 - chr3L 8656878 3' + 1731 4407 1 73.29 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCA:3 - chr2R 5070906 3' - Tirant 8107 1 34.25 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAATGCATTGTTTCTCGACAAGAACAGAGTAAGCACTGATTATTTTGCTCACGCATCTGAACGAGAAATTAGACATGGTCAAGGCATTT:1 - chr3R 7420176 3' + 1360 3355 1 63.70 TTAATATAAATTAATAAAAATAAATGATCACCACAATTTTTGCCCATCGTGTTACCTTCTACCAACGGGATTACTGCGTCACGTCCAAAGCAAGGACCTCCGATTGCAACCTGTCTCTCATCAC:1 - chr3L 14245550 3' + Transib5 2595 1 59.68 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACCCATAAATTAATCAATTAAAACAAATGGTTGTTTTAAAAACATTTTT:1 + chrY 1421354 3' + flea 5001 2 77.40 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAA:1 + chr2R 21410988 3' - Burdock 6178 2 56.16 GAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGCTTTTGAGCTTCTGTAGCGTGTTCTACTTGAGTATCTAATTTGTTGACTTCGCGTGAGGTTTTCTTTTATTTTAATTATTTTTTTA:1 - chr2R 941058 3' + Porto1 4330 1 58.90 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTTGCCATTTATTTGCCAGATGCT:1 - chr3L 5389820 3' + roo 391 2 73.97 AAAATTAACTAAAATTAAATCTAAAATTAACTAAATTAACTAAAAATTTAGTTAGGCAATAAAATGTCTGTGGTAGAAATTGCAATGCATTAGTTAAGCTATCTTTATATATTCCCATAAAAAATCCATTAACTATCCTATGGCCA:1 + chr2L 3485076 3' + Penelope 312 1 73.97 TATAATGCAGCGCTTATAAGACATCCACTAAAACATCCTCACCGAATCCTAAAAGATATATCAAACCTCCAGCATTGACTCTCACACACATTTTTTATTGTCTGCAAAGAGATTATTATTATGAAGCCG:1 + chr3R 15961627 3' - rooA 240 2 73.64 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGT:1 + chr2L 15550766 3' + Bari1 1647 1 60.96 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAGGGCTGCTATTGATTAAGTCGCTC:1 + chr2R 4606538 3' + 1360 3350 1 47.55 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGGAAAATCTGTAAAG:1 + chr3R 28385675 3' - transib2 14 1 76.03 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCAT:1 + chr2R 23592060 3' - micropia 5084 4 56.85 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCAGAGAAAATGAATATT:1 - chr2L 6654612 3' - diver 25 2 67.12 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATTATTCCTTTGTTTACAATTCGTCGCTGCCATTTT:1 + chr3L 21380635 3' - I-element 49 1 52.05 CATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATCTTAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAGACAAAAAAGAAA:1 + chr3R 27835757 3' - micropia 4 2 78.08 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATTATTATAATAAACATTTGGCTGGCTATATAAATTCAACCATCGGAATTTTTAGAGTGCAATTTTTGCTTTGTCTGATGTTAGCGACGGTTTGAAAATACATTTTT:1 - chrX 21164179 3' + mdg1 7067 8 63.70 AACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGATGGCAACACCCAGAATATAATGGTGTTTATTTCTAAACG:1 + chr3L 13739712 3' - BS 5001 1 78.08 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTC:1 + chr2L 17005781 3' - Stalker2 7281 2 60.64 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACC:1 - chrX 21216726 3' + roo 9038 1 56.36 ACCGATGTGGTTATACGGGATCGAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATTTATTTATAAACGTATTCATGTAACGCAAAATCCCGAACTACGACAAATAAACAACTGTCCCTGGTATACATATACGCAACTCGACCATAAAGTTGGCA:1 - chrX 21639988 3' + Helena 1062 1 77.40 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCC:1 - chr3R 23639128 3' - pogo 48 1 51.37 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAATATCCTATAACTACTGCAAATTGTAACCTTTTACAGTAAGAAAATCCTTTTTCCTCTG:1 + chr3R 10270657 3' + Juan 4146 1 59.59 TAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCATTGCATGTCAAAGTGGCATTAGAATTAAATGCTAAT:1 + chr2L 12572973 3' + R1A1-element 456 1 75.86 AACTTATAGGGCAATAACTTATAGCCTAATAGCCTTCCATTTGCTTTAATGTTTAACATATTCGATATGCGGTCAATTACGGGCAATCCTGTTGACTAAATCCAGCTTAGTAAACTTCAAATGTAACGTTTCCTAGACACCGAATT:1 + chr2L 14523306 3' - HMS-Beagle2 6881 1 56.16 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCAGACATTAATTTCCCATGCCATTCAATTTGGGGGCCCCGTTAAACTTCGATTTACCACACA:1 + chrX 20455721 3' - hobo 40 1 52.38 CTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGGGGCTGTT:1 + chr2R 18316158 3' + HMS-Beagle2 7179 2 65.87 ATATATTAATAACAACGCATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTCACTCTTTAACATAAAACATGTTCAGTTGGGTCATTAAAAGGTATCTTCTTGGAATTAATAAATATAATAAATATTT:1 + chr3L 5125985 3' + hopper 1118 1 52.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGACCCTA:1 + chr2R 11159382 3' + roo 9042 1 64.38 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAACAATGGGAAAAGATGTGAATGTGGCCCTGCTCGTTTTAAAGCCAAAAACATTTTTCGGTTGCCATTCGGCTGGGG:1 + chrX 959109 3' - 412 7085 2 59.85 TGTTTACATTAGGGTAGGCTGCATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGATGTCCTTTGCTGCCGCATTCAATCCATTTATAGCCACCCGCCATCTTCTTAACTCTGAGCCACTCGGCCGACCATTCATGTCCACTTAGTAATCCATCA:1 + chr3L 7947440 3' - Quasimodo 6891 2 67.12 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTC:2 - chrX 19266844 3' + roo 8996 2 68.49 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGGGGAGAAAGGGAGCAAAGTTAAACAATTGAAA:1 + chrX 21224666 3' + roo 9038 1 58.62 TGACAGCAAATTGAACGAAATTGGATGTTCGACCCATGGCTGCACCGGATGCCAGTTAACATCCAGCACACCAAACTCATCGCGTTTCTCGTGTGTTTGCAGCTTCTTGAGAGGCCCAATCAAAGGGTTTTGCAGCAGGCCACTAA:1 - chr2R 17792200 3' - GATE 397 1 76.71 CAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATAAGAACAAGTGCACTGTGTGCGATCCTTGCGAACCGCTGGCCATTCAGTGCAAGGAAATATGTCCAATGGAAGAACCCGAACCCATTTGCCTGTCTGACAACAATGAGTA:1 - chr3L 20529455 3' - Cr1a 436 1 76.71 TTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGGTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGGTGGTC:1 + chr3R 15790112 3' - flea 4740 1 60.14 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTTTATCGT:1 - chr2L 22193384 3' - roo 8693 2 67.12 AATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTT:1 + chrX 21087683 3' + mdg3 228 2 61.40 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACT:1 + chr3R 15364032 3' + flea 4968 2 54.79 TTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAATTAACCCAGTGTTGTA:1 + chr3L 13365827 3' + BS 5035 1 63.97 AATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGCACCGTCATCACCGTCATCAGTCTTTAAATAATTGGCCCTCAACTAGTGGTAAAAACCTCCACACCCCACCCCTCGCTGACGTCACGGGTTGTATGCAGCCAACATGGCGC:1 - chr2R 8052789 3' + Gypsy6A_LTR 369 1 67.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACG:1 + chr3R 23295587 3' + P-element 2838 1 23.29 CTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCCGTAGGTTAGCCGTTCTAGCCGTACTAACGGTTCTAGCCATACCCATCTATACATTCTAGTCTTAATTGGAGCTTTAGTTGATG:1 - chr3R 24282330 3' - pogo 1680 1 61.64 CAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGCCCGTATGTCCATCTGTCCGCATGAAAGCCAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAGATTCTAGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACACCCACAAGACACACGAAAC:2 + chr2R 22418843 3' + INE-1 101 1 46.58 TTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATTATAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCTACAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCTAGTACAACATAAAAAAAATAAACCACCCAAATTAAAAGAATATAATTTT:1 - chr2R 4521547 3' + I-element 5009 1 65.75 GGGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAATAAGGGGACATGGAAAGCCGTTTGGC:1 + chr2L 10438602 3' + I-element 352 1 78.79 AAGAAAAAAAAAAATAACAAAAAATATTTACAACTAAGAAAATT:1 - chrX 8484624 3' + gypsy7 5014 1 86.36 GTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATATAGTGTCGACCAGCTGCGAGTGCATTTGCGATTGCATACTTTCGGGCGAAAATATTTTTGCCTGCCGCTATTGGAATTTGCAAATATTCTTATAA:1 - chr2L 12341791 3' + BS 5064 1 63.01 AAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAAAACCACTTAAGGTTTTTTCGAA:1 - chr2L 7618423 3' + X-element 4696 1 66.91 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACCACACACACTATCGTAAACAATTACACACACACATCAATG:1 + chr2R 4189112 3' + S-element 1674 1 50.68 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAA:1 - chr3L 19454880 3' - mdg1 15 2 73.79 GATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCAAGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGATCAAAGAGAGAAACCAAGGAATAAGAAGAAGCGCGAACCAGGTAATCAGCACTACCAAAATGGCACAGTGGATCAAAACAAAATTAAAA:1 - chrX 10088554 3' + Bica 237 2 53.42 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTT:1 + chr2R 17878600 3' - Doc 57 1 73.00 AATCGGCTGGCCAGCGCTATTAACAGACCACGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGGCGAGGGTCCCTGGCATTTGGGTGTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGTGGC:1 + chr2R 18482515 3' + X-element 4443 1 69.72 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCACAACAGCAGCAACAACCGTC:1 + chr3L 19111628 3' - Doc 45 1 61.64 TGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTAGTACATCACTTAAGCTGGATAAACTAACTATGCGATAAAGAGCAAAAACGAAAGGGGTGCAAAAAATTCTTAGAAGGAAGTAAACTTGCGAAAAAGTAACTCAAT:1 + chr2L 14874022 3' + copia 4966 2 73.97 AACTAAAAAAAAAAATAAAAAAATCCGTGGAAAAAAACAATAACGACTACCATAATGCTCAATTTTGTTGTAAGTGAGTAAA:1 - chrX 323598 3' + Doc 4700 6 87.80 ATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAATAAATGTAAGCCAACAAGACAAGCCCAAA:1 - chr2R 16338885 3' + Quasimodo 130 2 80.14 ATAAGTAAAATAAATATTGTTTTATTATATTTTATAAAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATG:2 + chr3R 20119940 3' + S-element 1601 2 84.93 AGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGAAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGGGGGATACAAATTTATTTCTAAGTGGAAGTTGTGAAAAAATAGCAGACGCCACAAA:1 - chr2R 14450137 3' + Bica 85 1 80.69 CTTTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATGAAAGTGAATAGGTGGCGAGAGCATTTACAAAACCAAAGTGTGGGAAGTGGGAGACAAGAAGGCGAACAAGTAAGCGAACAAAGTTGCAAAAGGA:1 + chrX 19053885 3' + gypsy7 448 1 40.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTTTGTACATTTACCTATTGGTGTATGTAATTA:1 - 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mdg3 5333 2 70.55 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGG:1 + chr3R 10931740 3' + 297 359 2 55.38 AGTGGCGTGCTGCAGTTTTCTGGCTTGCACATCATTTTGTGTGAACATTATGTTGCCTACTTTTGTATGTTTATCACCATTTCGCATAAAAGCCGCAAACAGATGAAACCAACAGGGAAAGCCAAAAATGTAAGCCAGAAATGA:1 - chr3R 25436142 3' + hobo 2938 1 60.42 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAACAACCAATATAATAATAATCTTCCGCTAAAAATTATATATTAACCATCACATTAAAAAATAGTTGTTAAAAACCATCTAAAGCATATACCTTGAA:1 + chr3R 17270680 3' - 412 13 2 68.28 TTTATTTATTATTAATTTAATTTATATAAATAATATAATAATTTAATTAATTATTATATATTTATAAATTTATATATTATTGAATATTTATATAATATATATATATATATATAGAAAAATAAAATTATTTAAATAATTATACATAA:1 + chrX 13060935 3' - flea 4994 2 38.36 TTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATA:1 + chr3R 26504306 3' + HMS-Beagle 6971 2 66.44 ATCTGCNCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCT:1 + chr2L 17809250 3' - jockey 84 1 67.81 GCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTA:1 + chr3R 24729648 3' - Juan 4156 1 70.55 AATCTCACCCTTCTAGCTTTTAAAGCACTTCGTTCCAGCATTGCAATCTTTCTTCATGTGTTCAGACGATCCACAATTATAATGCTGTTGCTGAATTTAAATTAGATTTTAAATTAGTAGCGCATTTAATTTATGAGTA:1 + chrX 20526806 3' - INE-1 164 1 45.32 ACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATC:1 - chrX 10319624 3' - mdg1 79 2 72.60 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTA:1 - chr3L 22861742 3' - S-element 34 2 56.85 AATATAAATATACAAATACACAGTATACAAATACAAAAATACGAATAGAAATATAATGCTGTATAAAGTAATCACAACTTAAAATAAATAAAATCTTAAATAAACAACTTAATAGAAAAATCACGTGTCATAACTTCAAATCACGT:2 - chr2L 21750066 3' + Stalker 6939 4 56.85 TAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGAT:2 + chr3R 26504288 3' + HMS-Beagle 157 2 78.77 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTATAATACATAATCTTACCTCTCAGGAATTAATATCATATTAAAAATGTGCCATGCTGATTATTTAAAAATGTTTGTTCAGAGAAAAT:2 - chr2L 6654619 3' - diver 32 2 62.33 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCATTAGCTTATCTCAAAATCATCGTGGACAGCCCGTTAAAAAGCTGCTCAAACTGATTTCGTTTAAACAATAA:1 + chrX 6116361 3' + transib2 2778 1 54.79 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTGACCGAA:1 + chr2L 18226882 3' - roo 8717 2 54.79 GTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTA:1 - chr3L 24934297 3' - HMS-Beagle2 6944 2 61.64 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGTGGCATGTGCTGGGACTTCCGAGTGCGATGCGATTCTCAGGGGAAGATAAGCCGGTGGC:1 - chr3R 20818334 3' - 1360 35 1 52.94 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTACGCAACAATA:1 + chrX 10319737 3' + mdg1 390 2 63.70 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTGG:1 - chr2R 22774991 3' - jockey 4750 1 86.99 AATCAAAATCAAATGCACGCACCGCCGCCGCCTTCGTTCTTCGTTCTGCACCCCACAACAATTT:1 - chrX 18560882 3' - 3S18 404 1 59.38 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATGATGTTGAAGTTACGCTCTACATTCTGGGCAGCAT:1 + chr3R 8075960 3' + 412 422 2 71.54 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAACCTTCACATCGTTTCGTCACAAAAAAGAACCAAGTATTGCTCCCAGCTACCCAAACATAGAATCACGAACAATCAA:1 - chr2L 47070 3' - roo 32 2 61.19 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCAATCAATTCGGTGCCGCACTAGAGGCAACTACCCCGCCG:1 + chr3L 13581770 3' - jockey 4789 1 66.44 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGGAATTTG:1 - chr3L 23146463 3' - 1360 53 1 54.11 AAAAAAAAGTAAAAATAAAAAAAGTAAAAAAAAATAAAAATACCATATCTAGTAGTTATCTAGTTAATCTTATCTTATATGTATGTACACGTATCTATGTATATTTTATATTTCTTATGCTTGTGCAAGAAGAAACTTATTATTTA:1 + chrX 11848855 3' + Doc2-element 235 2 70.55 CGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGTTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCAATTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGGTCCACAAACCGTGACTTCCCATGGCCAGTCATCGAAGCT:1 - chrX 16094497 3' - HMS-Beagle2 7011 2 69.86 TATAAAAAAATAAATATAAATTAAATTTAAATTATCTCTGGCAAGACGAATATTAACAAAATAATAATATCAGAACGATATATATTAATGGGTCGTATTTAAGTAAAATGAATTTATGTTAATATAGACTATATTTAGGGCATTGC:1 - chr3L 12731662 3' - S2 100 1 72.60 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAG:1 - chr2R 20227203 3' - hopper 44 1 49.31 TATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAAAATATTCTTTCTAAAGAATATAGTAAACCCCTTTATTCTACAAC:1 + chr2R 542946 3' - Stalker 78 4 55.48 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAATAACAATATTACATTTTCCATTATGAAAATTCCACTTACTAATCATCACGAGTTACTTGAATTTTCCTACAAATCCGATTATCTGCCCCAACCGGTGCAATCGGATTTTGTGAGC:1 + chr2R 14051910 3' - roo 2 2 80.14 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGATCTCATTATTTGCCTGGCCAA:1 + chr2L 21299361 3' - roo 8669 2 69.23 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAATTTT:1 - chr2L 20265896 3' + roo 9053 2 72.60 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTACATTCGTCGTATTTTCGTACTGTACTTTAATGTTGAAATCCGAATATAAATTTAGTGACCAAGTACACTAACTTACCAA:1 + chr2R 21926503 3' - opus 147 4 46.58 ATTTTGGCAAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCAGC:1 + chrX 15200918 3' + 17.6 412 2 76.71 AAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCAGCTTATGTAGCGCATTTTTAAATGAA:2 + chrX 22840599 3' + copia 5089 1 58.90 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAACTGAAGCTTGGGCCTAAGCCAAAAGCCAAGTCTTAA:2 + chr3L 6447138 3' - transib2 47 1 53.42 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAATA:1 + chr2R 11164551 3' - roo 8679 2 75.34 ACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGT:1 - chr2R 12185301 3' + accord 7338 2 51.37 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTGCATAGTGCAGCTGCGACTCGAGCTGCAGTCATGCAGCAGTCAGAGAAATCAGGGCAGAA:1 - chr2R 15651908 3' + hobo 2933 1 68.48 AGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAATTAAGATAACATTGTTGGGCTTTTTTTTTGTGTTCACTTTCATATTTATTTGGATTTTCG:1 + chr2L 7098197 3' + G6 1964 1 55.86 TTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATAGCATATGTACCATAGTATAGCTCTTGACTACATATCTATAACAACACACACACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 + chr2L 9019833 3' - Quasimodo 3 2 67.12 AGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTCAATTGTCATTAAT:1 - chr3R 6419789 3' + Tabor 7316 2 78.08 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAAAAATTC:3 + chrX 21100308 3' - mdg1 10 2 79.45 TTTTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCAACAATTTTTTATTTCTAAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAATATTATCACGTTGCCGACGAATGGCAAATG:1 - chr2L 485415 3' + 297 6859 2 75.34 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTATGGTCGAAGTTGGCCAAAAGGGTG:1 - chr2R 13766150 3' + roo 399 1 78.77 TCTTGTTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTATATTTTGAAAGGAAATACCAGAGCTATACCAAAGACACTAGAATAA:1 - chr2R 6947360 3' + 1360 3246 1 62.82 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTAATATGCTCATACGCATATAAGAGTTTGTATAAGAGTGTTTGTTTGTTTACATGATCCTCTGTGAGCTTTCAAAGGAAACATATGTTGCAGCGCGTGGTCCGC:1 + chr2R 2590843 3' - HMS-Beagle 15 2 74.10 GCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAACACACGCAACTTTCCAGCAGACCAGAAAACAAAAAGGAAACAACTTTCTGCAGCTCAAAACAGGCGGAAAAGCGATTAGAAAAAATTAT:1 + chr3L 1045834 3' + I-element 55 1 69.34 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGATAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAG:1 - chr2R 14051724 3' + roo 9037 1 54.79 ATAGTTCCTCAGATCTCGACGTTCATACGGCTAGATCGAATCGGTTATTGGTCCTGATCAAGAGAACACTAAAGAAAAACATTTCATAAAAAGCTGGCAGAAAAGGGGGCCTGCATTCTACCAAAAAAAAAGGGGGCAAAACTGCA:1 - chr3L 21877139 3' - INE-1 143 1 60.27 TAATATCTAATTTCTTAACTAATTGCTGCCTTGGTTATTTTTTTTGCTGTTTTTTTGAGTTTTTTTGTTTTTGCAATATTTCTGCGCCTGCTTCCGTGCCAAACAAATGTCATTCTGGTACGAAAAAAGTGGATGGCAATGAAA:1 - chr2L 15736233 3' - I-element 5232 1 72.22 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATTTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACAC:1 - chr3R 17673771 3' - FB 87 1 78.08 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGT:1 + chr2L 12818329 3' - hobo 64 1 60.27 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCAAACAGAGGCAA:1 - chr3R 15072527 3' - pogo 29 1 63.70 TTTTTTTATTTTACCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTTGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAATATTATTTTATGTTTTTCTAGCGACTAACAAAGCACCCAACTGT:1 - chr2R 24589554 3' + Tc1 1480 1 68.97 GTGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTTTTATTTTTAATCGCCTTCCTTTTTTCAGGCTGAACGCTCCAAGACCAAGGGCAAGGGATGGTTTAATCTGCCCGCCACAGAGATCACCGACGAGATGCGAAAC:1 - chr3R 7472773 3' - X-element 4330 1 73.97 GTTGGCCAAACGTTTTTTGTTCCCATGTTCCTGTTTAGACCATTCCTTTTCGCGTCATCCTTTTTTGTCGGCATTTCGGGCATTTGATATCTTTTGTTGCTGGACTCAATGAATTCGTTCTTCAATCGGCACTCTTACTGTCACTC:2 + chr3R 21898763 3' - FB 343 1 83.56 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGTGTGCCAATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCAAATATCTTAAGATATTTTAAGATTGGCGTTTTATTTCATAAGGTGTCTTCTTT:1 - chr3R 3282454 3' - 1360 86 1 62.33 TAGACGATGGGTTTTCCCCTTGCTTGCCGATATCTGATTTTGATTTTTTTCTGTCAGTCTCCGAAGAAGCACGAGACTATGTATGTTTCTCATTTTGTTTTTTGTTGTTTTTCCATCATTCTTTTTGTAATAAT:1 - chr2L 6927411 3' - X-element 484 1 56.72 AAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCACGTTAATTGGATGGTGAAACTGACCTGCAGTAGGTTCGACAGGTCGCTCTAATGGCGCGTAAATTACTTGATTCCAATTACACCACCAACGACCACCCAAACAAAAGCC:1 + chr3R 27406114 3' + diver 219 1 77.70 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATAT:1 - chr2L 13556309 3' + transib2 2793 1 64.38 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTT:1 - chrX 10319579 3' - mdg1 34 2 62.33 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGG:1 + chr3R 9298559 3' + hopper2 1554 1 58.65 AGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTCAGTAAAACTCGGGGTTGGGGATGCACGTGGACTTCC:1 + chr2R 18515025 3' + P-element 2877 2 76.71 GCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTC:1 + chr3R 14860253 3' - BS 5028 1 62.33 ATTTTTGTGGGATATCGATATATATTGGTGAATAATATTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 16775685 3' - INE-1 501 1 92.00 AGGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGTACAATGATGCCTCCGGGGGTAGGGGCCGGCATTTGGTGCAG:1 - chr2L 22966913 3' - 1360 3228 1 69.66 GTTTATACGGACAGACGGATAGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGTATACCCTCTTACTCTACGAA:2 + chr2L 14818498 3' - INE-1 123 1 77.40 TGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAA:1 + chr2R 12185414 3' - accord 63 2 62.50 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCTTTGTACTTTATACTTATGTGTTGAGAATAAGCCGAAATCAAAT:1 + chr3R 24697376 3' - HMS-Beagle2 6949 2 69.86 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAATTT:1 + chr2L 6647746 3' - mdg3 43 2 55.63 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCT:1 - chr3R 27405962 3' - diver 5928 2 51.56 TTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAATACTAATCACCAAATATTGTAACCAAATTTTTACAAGTCCCGCTAAAGCAGGGAGATGCGCA:1 - chr3L 11177325 3' - mdg1 59 2 58.22 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTCATATTTCTAAATCTTTGCGCGTAGTCCGATAATTTTGTCGATGAAAGTAGCTCAGCGAAAATTGCGAAACATT:1 - chr2R 21160642 3' + Transpac 294 2 67.23 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAAT:1 - chr2L 9636107 3' + 412 438 2 69.72 TTATATGATTATGATTATTCAAAATGTCCTTTGTCTTGGCAACCAAAGCCAGCACATTGAAAGGGGATTGAATGTATAGTCGTG:1 + chr3R 9192945 3' - jockey2 3273 1 51.19 CTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCCTTACGCT:1 + chr3R 1844867 3' - Cr1a 153 1 51.37 ATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATGCAATAA:1 - chr3R 11040060 3' + Bari1 1641 1 64.14 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGT:2 - chr3R 24368999 3' + roo 9037 1 55.48 ATTATTTTTAAGAGTGGGCAAACGATAAAAACAAATAAAAATGGTTAATGATGATATTTACTAAAATTCCGAATGCAGTATTACAACTCTACATCTCCGCTGAATCCGCAAGAACATATATTTCTTTAAACTACGCGTCCGA:1 - chr4 583145 3' - FB 747 3 64.79 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGG:1 + chrX 21224637 3' + roo 360 2 54.62 TATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTCAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCGCAAC:1 - chr3L 21327054 3' + copia 256 1 58.70 GTGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCG:1 - chr3R 5368622 3' + 1360 3320 1 78.15 CTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGTATTAGTGTTCATAATATCCGTGGTGAACGTTATCATATCCGG:1 + chr3R 12696842 3' - Idefix 6968 2 76.71 ATATCTGAATATGAAATTGTACCTTAGTTTTAAACAGAACTCAAAAGTGGTCAGTCGTATTCTGATGCACTTAAAAAAGAATAATAATTATTATTTGTCCTAACTTTATAATTGTTTATGTTGTAATTTTTTATTTATATTTCCTT:1 + chr2L 3783816 3' + gypsy9 214 2 71.92 TTTTAATAATTATTTCAATTAAAAAGATATTCTTTGCATAAGTAAATATAGGAATCTTTAATTCGATTATAAAAATAGTTTTATATGCTGTAAATTACCCTTTAGTCGTCTTAAAATACTGCATAATAATAAAAATAATACAATTA:1 - chr3L 10538829 3' - invader2 434 1 53.42 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACACCTTTAGACTCGTCTGCAGCTTGTTCTTCTCATCCTCC:2 + chr3R 27123557 3' + roo 325 2 73.97 AGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACCCCTACAAACAGTACACCTACTAGCCCATGTTAATAATAATAAATAAAAGCTGGAGTTAACTGACAAGGAGGATTCATGCGGAATGCTTGGGCGAGGTGAGGAAAGA:1 + chr2L 382842 3' + baggins 5399 1 57.78 ACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGTGGCTGTTGTGAATGTTGTGTGGCT:1 + chr2R 18316175 3' + HMS-Beagle2 298 2 72.34 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTTAAATAGTATT:1 + chr3L 13836713 3' - 412 58 2 56.85 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGCCTCCAAAACAATTATCATGACGAAATATTAAAATGTGAGCTCAGCTCGCCCGAATGTGCGGAATATGACAGCACGTGTGT:1 + chr3R 20556096 3' + mdg1 361 2 54.11 ATCGGCTCGAAGGGAGGCGCGAGAAACGGGAAAGGCTTAACAGGATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAAAA:1 - chrX 19498616 3' - rover 192 2 81.08 CAATTGTAAAAAGTCTGTGGACATAACTCGCTAGTGTGGGGGGGGGGCTTAGATAGAGAATGTTAATGGCACAGCTGAGCTGCCGCTAAATT:1 - chr3L 25262942 3' + Burdock 6092 1 47.83 GTCGGCGTGGGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGAAGCCTTCAAGTGTACGATCATGTTACATCCGCCTTGGGCCTTATTGGTAATGGTAAACTCTTGAAACTTTATACATATAGTGAAGACTC:1 + chr3L 9966025 3' - 412 7247 2 66.14 AAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACGTATGTTATAAACATGGCGGGTATCATTTATTGGAA:1 + chr2L 9010186 3' - G2 2705 1 67.12 AATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACT:2 + chr2L 23295876 3' - micropia 5019 4 61.64 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGACACATGCTCTTGGTATAAGATTGCATATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTTTAAGTATTTAG:1 - chr2R 21681287 3' + roo 9027 1 54.79 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGCACCTTTTACTGATAGGTGTTAAGTGTATGGGGTTTGTAAGCTATTAATTCTCATACGAT:1 - chr3R 19224984 3' - HMS-Beagle 13 2 69.52 ACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTTTTAAATTAAAAAATTGATTCAACTTAT:1 - chrX 14771744 3' - BS 82 1 74.48 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGTCTTTG:1 - chrX 18817251 3' + transib2 2790 1 62.07 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGTGTAGAA:4 + chr3R 7420348 3' - 1360 15 1 76.71 AAGAAAAATTACAAAAAAAAAAATATATTGGAATTTTTAAAAATGTGGACAGAACTCGATTGATTAAAAAAGCTAGGAAATTTGAAACAAAAGGGCAACGAAAACAATGCTATGAAAATGGGAAGTTTTTATTAGCCAAACTATTT:1 - chrX 17066401 3' + Doc 4694 1 56.85 GTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAGCATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGTTGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAAAACTAAGGGGGCTCTGCATGCATTTGCATGGAAATGGATGTGGAAG:1 - chr3R 15864699 3' + R2-element 3387 1 64.79 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGG:1 + chr2L 13556438 3' + transib2 2760 1 60.69 ACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTT:1 + chr3R 11040169 3' - Bari1 20 1 65.22 CACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAAAAATAAATAAAACTTAATACGATATTGACTTTAATTAAAGCCAGGAAAGAAGTCAAAACTACACTACACTACACGATATTTTAAAGTTTATTTTTAAATAT:1 + chr2L 23050102 3' + Doc2-element 4741 1 58.22 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTACACAAGCAGTTTGCCACAGGAGCAGGACCAGAAGCAGACAGGCGACAGGACGAACAGGATTGCAAATTTCCATTGTCGGTG:1 + chr2R 18316152 3' + HMS-Beagle2 7176 2 64.23 ATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGAGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGCTTAAGGTGGAAGAGGGGGGGTGGGAAGAGAAGGGCCTTACCGGACCGGACTTGATATAAGCTGGTTACCAGGAT:1 - chr3R 15518145 3' + Bari1 239 1 50.68 GTTTCGTTAACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATCTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGGTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTGATGCTGTTGTTGGCTGGTTGG:1 - chr3R 9441836 3' - Porto1 4408 1 76.03 ACTAGCTGAGTAACGGGGATCTGATAGTCTGAAAACTCGATTATAGCTTTCTCTCTTTTTTTTCAAAGAGCCTCTCTGTCCGAATGAGGGCTCC:1 + chr2R 1891936 3' + INE-1 542 1 82.98 ATTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTAGTGAAACACAAAAATGCTACTTCACGTTATTTTAG:7 - chr3L 22531953 3' + Cr1a 4192 1 74.66 ACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTTGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTAATTTTTTTACTACCTCGCCATATTTTCATTTTACATGAAGTTTTATATGGAATTTAAATTTTTAAAAGACT:1 - chr3R 7943671 3' - blood 7015 2 78.77 ATTCATGATCAGGATCAATAGCCGATCTGGCCACGTCCTCTCCGGCCACCAGTCCATCCGCTCAATACTGTCACGTTAACACTTTTGGAAAATATTTAGAATTTCTTCTTTCGCCGGCCCGTTTCGACCTATCGTCTGCAAATGTA:1 + chr3R 9869558 3' + INE-1 86 1 71.23 CTTGAACGCACACACACACACACGCACACACTGGCACACTCACTCACACTCGCGAACGCGGCTGCACAACAAACAATATTGGCAAAAAGATAAATGCATATATCACAGGTGATCTTAAGCAGATGCTTAACCAAAAAACAACACGA:1 + chrX 13761403 3' + accord 180 2 61.64 TTAATAAATAAAATAAATAAAGTTAAAGTTAAAAGTTAAAGTTAAATAAAGTTAATATATAAATATGCTATTCCAATATTAAATATATAACATATAAAATATTTTTGAATTTATTATTTCTCATATCCTAATTTAAATGACACTTT:2 - chrX 16189254 3' + X-element 4714 1 60.96 TGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCCCTGG:1 - chr3R 15942710 3' - hopper 71 1 65.07 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATACACACACATGCACACACGCCATTGTTGAGGTCGCCGTTTGCC:1 + chr3R 27843234 3' + I-element 5292 1 69.23 GCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTATTATTTTACGAACTTGAAAGGGTATTCACCGTGTGTCAGT:1 - chr3R 29689925 3' + I-element 5224 1 72.60 GGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCAGATCAGAATTGAGACATCGGCTTATGCTGGAGAGATTTGCTAAAAGTCCCTGGTATGCGTTTTGAGAGGGATGACTGAAAAGTTGCCATGGGATTGGGA:1 - chrX 11024771 3' - I-element 5049 1 71.23 AAATTTAAATATAATAATAAATAAATAATACAATAACTTCTTTCCAGATATTGAGAAGTGCAGCATGTTTTACTTTAGTTCGCTTTTAATGCACACGTTCCTCCATTGGGAACTTATCCGAAATAAACTCGACTTCCCTGAAGTTC:1 - chr2L 7339907 3' + HeT-A 337 1 67.12 TGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTAGGCTGTCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGCGGTTTGGCTGCTTGAGGGCGTAAAAGTGGGCGTGACACGCATATTGTAATCCTTGGAATACCTGAGTGGTCTCCCTGATTATTG:1 + chrX 290362 3' - INE-1 521 1 67.81 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGGAAAACTCGGTGGGGAAGCGAAGCGGGGGGATAGCGGCGGGAA:1 + chr2L 1253819 3' - GATE 38 2 72.31 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATGAAGTAAATAAAT:1 + chr2L 18347366 3' + transib2 2743 1 71.92 TTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTGCACAAAATAAGCAAATTATATATATTTATGTAGCCACATTAACAATTAATTACAATTGCCGTGCACAAGGGCCAAGAGTTTGATGATGATGA:2 + chr2L 17766204 3' - Doc 189 1 55.48 GTATTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTATTCCACACACAGAAAATTTTGCAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGATTTCGATTTATTTATTATTTATTTATTTATTTATTTCGATTATTTATTATTATTATT:2 + chr3R 4080019 3' - Doc3-element 173 1 66.44 TATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGTGCTTTTGATTTGGATTTGGATTTGTTATTTTGCTTTTGATTAGAGCGAAGGGAAAACGAATGCAAATCGATGGAAACCGCCTATTGTTGT:1 - chr3R 26916232 3' - hopper2 1324 1 73.44 ATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAA:2 - chr3L 16973386 3' + S-element 112 2 69.18 TGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCATAACTTGGAGCATACTTTCAGGCACC:1 - chr2L 809662 3' - jockey 73 1 60.96 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTGGATATCAGCGAGCTCGCTCGATCTCTCCG:1 + chr3R 15791044 3' + roo 393 1 70.29 CGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCGCTCTGCCGTCAAATGCAATTAACAAAACACGCTCCTAGCATAAAGTCATTAGTTATTCCATTTCATGAATATCCCTCTCTCGATTCGAACGCTT:1 - chr3R 31627165 3' + F-element 236 1 69.18 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGCAACACTTGCTTTCTTCGATGCTTCATGTCGTGCC:1 - chr3L 26290905 3' - Tabor 6926 2 74.66 AGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTCATTTCACTGCGAGGC:1 - chr3R 19992653 3' - hopper 81 1 70.55 TTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGGAAAACCGACGCCGAGATGAAGTTCCGTGGCAATGGAAAGCTTTTGTG:1 - chr3R 6373309 3' - F-element 4316 1 67.81 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAATGA:1 + chr4 373089 3' - pogo 29 1 64.38 TATATCGACTTGTATGTCTCTCAATTCGTGTCTCAACTGTGTGAATTGATAATAATAATATTTGAAGTAAAAAAATGTAGCATGCTTTTAGGTACTTTTTGTTCCCATGTGAAGTCGTACATATCTTCATTCGCATGGGAGATGAG:1 - chrX 14321914 3' - Helena 1234 1 72.60 CAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTCCATGCCATTTTCAGACCCAATTATTTATCAAA:1 + chrX 18742883 3' - invader4 2793 2 67.35 ATTATTATTATTATTACTATTATATAAATTTAAAACAGCCGCAAAAGCACCAAAGCCCAGCTGAAAAGAATGAGAGAGCA:1 - chrX 8193140 3' - mdg1 42 10 55.00 ATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTCAAGAGGATTCGATCACCGAAATAAAATTCGGTTGGTGTACAATTACTTTGGATTACCTACAAAAAATATATGATTCACTTCCCAGACGAATGTGTCAAGTC:1 - chr3L 23143686 3' - 17.6 6950 1 77.40 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCTC:1 + chr2R 8099205 3' + jockey 4949 1 65.45 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCA:1 - chr2R 5151244 3' + roo 325 2 73.97 CAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACATATTTTTTCAAAGTCTGTAAACGGATCATATTATTA:2 + chr2R 22225577 3' + 1360 453 1 73.97 ACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTG:1 - chr3R 17996196 3' - diver 5978 2 77.93 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGAGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGGCGGTGCGTTGTGGCATGGTATGGTG:1 - chr3R 24733545 3' - hobo 65 1 75.86 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGACACAACTTGAGATTAGACCGCCTTTGAAATATAATGAAAGCTGATGGATGTTGTAAATATTAAGCTTTTTAAAACATCGTTTAAATTTCGCAATGCA:1 + chr2L 13844295 3' - Stalker2 19 2 69.29 TTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTAAATGGGTAGAGCA:1 + chrX 3022351 3' + hopper 147 109 74.36 ACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAGAATACAAGCTGTT:1 - chr3L 17567888 3' + S-element 117 2 68.97 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCCCAAATTCTATT:1 - chr3R 25616462 3' + roo 392 2 73.97 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATG:1 + chr3R 15364054 3' + flea 231 2 69.86 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCTTAAATG:1 - chrX 19266839 3' + roo 339 2 64.58 ACATATAAAGAAATTCAAAAAAGCCTTCAGTGTTCTGCCAAAATGTAATCCAATTCCATTAAACCATTAATATTCAAGCCATTACGTGTGGCACAAACAAATTTAGAAATCCAAAAAATCACCGAACAGTCAAGGTGAACTGCACA:1 + chr2R 10229146 3' + HB 420 1 53.42 CTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAATATTGTTTGTATGTATGAACGATTTG:1 - chr3L 22723792 3' + HMS-Beagle2 7179 2 78.77 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGAT:4 + chr2L 17809239 3' - jockey 95 1 76.03 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGA:1 + chr2R 9158110 3' - mdg3 5303 2 73.00 TAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAAACTGCAGAATGCAAATACTTTTGCAAAATACTATA:1 - chr3L 13701764 3' + mdg1 7083 3 73.29 GGAAAAACCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATACATTGCTTAAGCCTCAGCCCACCGATCTATTGTACATAAACAGAAGCATTAAAAG:1 + chr2L 496238 3' + Idefix 149 2 66.40 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTCGAGAGGCTCTCTCTCTTGAATTTCCTTCTCTGAGGTTAACTTTCTCGATGCGGACCGAACAAATGGCAAGCTGAGCTCCCAGGGTTTTGGGTA:1 - chr3R 8889985 3' - FB 26 1 60.96 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATTTAGTAAAACTTAAAGCTTAAAACTTT:1 - chr2L 15936719 3' + copia 240 1 75.34 ACATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGACTAGATCGGCAGGACAGTGGAAACGAGCCCATCCAGCTTGAGCAACGATCGTCTTTTCGTAGGCGGCTAGCTA:1 - chr2R 4674798 3' - Quasimodo 7170 2 62.96 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCG:2 - chr2R 15326821 3' + copia 248 1 56.16 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTGTATATACATAGGCTGGCTGTCTGCCGTGCTGATATTGAATCTTTATATTTACGCGAGGAGCTTTCGTTTG:1 - chr3R 27133564 3' - opus 7162 4 54.11 AAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGTTTACTCCTAAATTTTTAAATTATTTTATTAAAATTTAAAAAGTTTTAGTATGTAGTATGTGCAATGTACGCACTTTAATTCAATATTCCACCGCGAGCCTAAGCCGCAGTTCGAA:1 + chr2L 14800784 3' - S-element 1495 1 71.23 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGAT:1 + chr3R 15791003 3' + roo 9007 2 64.38 ATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCCTACATATTTGTCCTTTTCAATTACGGCATTATAGCAAAG:1 + chr3L 22185254 3' + Juan 4072 1 72.60 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCAAATTGATGCGCAACAACAACGATTTCCTAACACTTAAAACTTTGACAGGAATATACATTTGA:1 - chr2R 8047249 3' - 1360 57 1 57.53 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTT:1 + chr2R 21160752 3' - Transpac 4949 2 53.33 CCCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCACCATGAATAAAATTCTACGCACCCCCAATTTACGAGCGTAACCAGTTTTATCAGATAATAAACAGG:1 - chr4 852556 3' + I-element 4906 1 51.80 AGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGC:2 + chrX 18336659 3' - mdg3 83 2 71.23 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATCCTTTAAATGTGCAAAAACTACTTAAATATCAAGCAACTTCGGCAGAACACACTTCCTCAATCAAACGACCA:1 + chrX 10319201 3' - mdg1 7071 2 62.50 ACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTGGGGTTGATGCACTTATCGCTAGCCGCGATGGGAGC:1 + chr3R 23952355 3' + micropia 5184 1 55.56 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTTTTTTTTATAAATTTTTTATTTTATAAATCCTACGATTCTA:1 - chr3R 17421203 3' - pogo 46 1 51.37 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACA:1 - chr3R 15790859 3' - roo 8741 2 71.23 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATA:1 - chr2R 22034612 3' + copia 232 1 69.18 ACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCTCATCTGCCTATCTTGTTAACTTGTAAGTCTCCCTTTACTCAA:1 - chr2R 12158190 3' - roo 8984 2 77.34 TATTGATTCTGATCAAGAATAAATATTAAATCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACCAATCTAGTATATCCTCACGCGTCTTAAAATTGTAGGAGTGGCCGGTTTGTAAAATTTGCA:1 + chr2L 21285134 3' - INE-1 84 1 70.00 ATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAAGTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAAT:1 - chr3L 27356064 3' + Tc3 1653 1 55.48 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGAGTTTATCCTGAAATTTATAA:1 + chr3L 20711739 3' - jockey 4780 1 68.49 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTC:1 - chr3R 27160074 3' + 412 429 2 66.19 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATGAAAACAAATTGGTGGTACCTAATATATTTTTAATACAATTTGTTGCAGCAAACTTAAACCCATAAATTAATCAATTAAAACAAATGGTTGTTTTAA:1 + chrY 1421344 3' + flea 232 2 70.55 AAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCAAAGCACGACCGAATATCAATTAGCGGGCCATTATTACCACTAAATGTTTGATTAAAAAATCTAACATTTTGTATGAAAGATTTTATACCTTGAAATATTCAAAGACTTATTCTTCGT:1 + chr3L 3544412 3' + Doc2-element 220 1 41.78 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAATCAGGGTGTAACAATTACGCGTTTTGAATTGCGCCGAT:2 - chr3R 4682838 3' - Burdock 13 2 75.34 AATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAA:1 - chr2R 7244824 3' - diver 73 2 67.12 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTTG:1 + chrX 1341737 3' - 412 57 2 55.48 ATGAAGGGGAAGTACAATAGATCCTACTGGGACAATTCACCTCCAAACAGTACACAATCAAGCCCATCTTAATAATAATAAATAAACTGTGACAGGCAATGTCGTTTCACAAGCAAAAAAAAACTTTATG:1 - chrX 22137944 3' + baggins 5389 1 56.92 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTGATAACGGACAGCTTT:1 + chr3R 19032719 3' + roo 9038 1 60.71 TAACAATGGAACTTACTCAGTTGCCAAAAAACATCGCCCGCCGAAAGAAAAGTGGGCAAATAAAACGAA:1 + chr2L 20487085 3' + hobo 498 1 55.07 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGTCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTGTTATGGTCGAAGTTGGCCAAAAGGG:2 - chr2R 13766152 3' + roo 397 1 77.40 AAATTTNTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTTGAGTGAAGAGATTTGACAGGATTGAGATCG:1 + chr3R 22165303 3' - hopper2 1190 2 74.40 AAAAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTTTTCAATTATTTCCTCCTAGGTATTTGGTTAGAGGTTTGGCAATTTTTGCATAATTTCGGACAAATTTACGGTAATAGCCGGTGAGGCCTAGAAAACTTCGAAGC:1 - chr2R 2879970 3' + TLD2_LTR 124 1 74.48 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTTATCCAGCATTTATCCATTGCTAATATACTACATTT:1 + chr2L 11391632 3' - 1360 19 1 66.44 TTATAGTTTTTTTTTTATTCTATTCTATTAAACTGTTCACTTTAGTTTTTTTTGCACATTCGCAAGCCTTAAAAGCTTATTCTTATTTTTTGACCCGTAGCTTTTAGTACATATATGTATATGGTTTAAGCAATTTCTACTTCTTT:1 - chr2R 11793020 3' + Circe 75 1 26.03 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATGCTTCAATTCTACATATGTATGGGGCATACCCGCGATAAGAAAGCGTCGGC:2 + chr2R 13168740 3' - P-element 27 1 57.55 AGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACGCCGAGTGTACTTAGGTAGGGGCTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTTTATTTATTCCATTAATATTGCCGTAATTGATAATTAAGATTTTCTTTACATTTA:1 + chr3L 5210288 3' - G2 3001 1 60.27 ATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCGACTCT:1 - chr2R 21116432 3' + mdg1 421 2 59.40 GTTTACGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATACTATCCTTTTCGATTTTCATGTCCTAAAGGCCATGTTATGGTAGTCCATGTGGTCAACAATTTTTCGGTACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCCAACCTTGT:1 - chr2R 6486740 3' + Circe 7047 1 70.55 AAAGTAAATTAAAAAAAAACAACAAATTAATGGGGTTTCTCTTACTTGAATCTCTGATTTCAAACAGTGCTTCTTTTCGCTACAGATCTTTCGACTGACCGGCTTAAGTTCGGCTCGAAATCCGCCTTT:1 + chr2L 10294536 3' + F-element 4681 1 71.32 ATTTAAGATATGGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCTGGCCACGTTCAACCAGAGACAATAACAAACAACGCCTTGGAGGGAAACTTTTAAACAAGGCCCACAAATCATATTAGACATCAGCGCCAGCAGCATAAC:1 - chr2L 17776695 3' - Bari2 850 1 68.49 CCTGAGAGTCTTTGGCAAGCAAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTTATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAATTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:3 + chr4 1294990 3' - HeT-A 69 1 75.34 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAA:1 - chr3R 31886855 3' - hopper 49 1 64.41 AATAATAATAATAATAATAATGAATGAATTTGAAGATTACGTTTGTCAATGTTTAGTAGCGGTTTTGTAAGAAAACTTATCCTTGTTAAACTGAAATTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATTTGTCGCAAAGAT:1 + chrX 2293863 3' + mdg1 7075 12 21.23 GAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAGAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGCCTAATCACGGGGTCCCGAGCCTCTATGTTTCGCATAAAATGTATACAAATTATGCGTATTTATC:1 - chr2R 19971062 3' - diver 391 1 56.55 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTGGGATAATCGGAAAATTGTTCTCATTCGGTATACACCAGTTGGTCGATATAAATTAGCTACCAA:1 - chr2R 5151218 3' + roo 9015 2 56.16 AATACAATCGCGAGCGGCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGATTATTATTACCATTGCTTTCTTTGTAATTAATTTA:1 + chr3R 14792611 3' + G5A 2490 1 71.32 AAATCAGCGAAATTTGCGGTTACGGTGGATTCCCGACAAACAAAATAACGGTAAAAATCGTAAAAACGTAAAACAAAAAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAAGCGAGTGAAAAACAAAAACCACTTGCAATTTGTACTAA:1 + chr2R 15458615 3' + gypsy9 5085 2 40.00 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGC:1 + chr2L 4123953 3' + transib2 2765 1 58.62 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCGC:1 + chr2R 2427618 3' - Doc 64 1 62.33 AATGTAGACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGATAG:1 + chrX 10319685 3' + mdg1 7378 2 70.83 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCCGTTTTACCATACATGTGAACGGATATTATACAAATGTTGAGCCACA:1 + chr2L 12818326 3' - hobo 50 1 57.36 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAA:1 - chr2L 16946045 3' - hopper 76 1 68.49 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAG:1 + chr2L 4123932 3' + transib2 2743 1 73.29 AGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAACACTTTTAATCCTTAGGCATCTACGAACTCCCACTGTGTCCTTTATTTCGCTAAACACAATACAGTAGTTAAAACCACTTAAG:1 - chr2L 7618434 3' + X-element 4678 1 56.16 ATTAATTTATTTTTTTTTTTAAAATTCCCC:1 - chr3L 18704841 3' - NOF 3957 1 86.67 ATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTCGTGGTGCTTCGGTAATCTGGAGGACTGTGGC:1 + chrX 16176363 3' - G-element 4290 1 78.03 ACCTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCTAACAGATAAAATTTATGTGGATCATAATGAAGCCTTAAATAGGTATATTCACGCATATATCTAGCTAGTTCTTGCACTTCATTTT:1 - chr2L 9636050 3' + 412 7524 2 64.39 TAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTTTTTTTGATGAAAAGTATGAGTTCTTGTATGTTATCTGGATTGGTGGGAATGGGAGGACGCACTCTTGGTAAAGTTTGTTGCG:1 + chr3R 23379622 3' - I-element 5213 1 73.29 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAGTGTTAGCTTAAAGTTGTGAAATCATTTTTAGGAAACTGTATAC:1 + chr2L 13556500 3' - transib2 3 1 78.08 GTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACT:1 + chr2L 17005836 3' - Stalker2 7278 2 63.70 AGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAAGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAAAAATAAAAAA:1 - chr2L 23373377 3' - Tc1-2 14 1 67.12 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATTGGGATTGTGGATTGCTGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTCCGCAGTCCCCGTTACGGCATTTCCCTAATCGAGGACAACATGGAACCGCC:1 + chr2L 15550804 3' + Bari1 1689 1 69.72 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGACATAATCGCTTGAGGACAAGCTAATATCTAAATGGTGGGGCAGCCGATCTTTTGGAAAGCTTCAC:1 - chrX 21632967 3' + mdg1 367 2 55.48 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCC:1 - chr3R 5769036 3' + roo 8985 2 76.55 ATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATTTTTGTGGAAATCGTTTAACTAGTATTATGCTTGTTGGTTGGTATTGTTTAGGAG:1 - chr3R 18909621 3' + invader2 4826 1 60.43 CAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAA:1 + chr3R 28959226 3' + TAHRE 10379 1 68.49 TCTAAGGAAGATCACAGGCGCTGCTTGGTACATGAGGACCAGAGATATCGAACATGATCTGAATGTGACAAAAATTGGAGACAGGATTTAGGAAATATTTGTTTATTCAATTTACAAGATGCCAACATCTCAGATTCATAGAAGTA:1 + chr3L 9074425 3' + jockey2 2978 1 62.33 ATTATTGTTATAAATATTGTTATTTCACAAAATACTGCATAAGGACTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACTTTGAAAATCCGAATTTCTGATTAGGTTTAAGCCTACTTTAGGAAGAAACTGAACCCCAATCACAGAAAAA:1 - chrX 7711064 3' - mdg1 21 2 73.29 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCATAATTAAATATTTCTTTTGTAAGAGCGAAATTATTACAACCAAATTGTGTACAATATAGGAAAATA:1 - chr3R 19032589 3' - roo 53 2 57.53 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTTTATAATCTATTGCATTATCATAAA:1 - chr3L 18046612 3' - roo 54 2 64.34 AAAATAAAATAACATAAAATAAAATAAGTAGAAAACGCCTTGATTTCATCTTTAATTTAGGCATCGTCTGAATGTCCATTCGTCTATCCGTTTGCCGGTTTTATGGCT:1 + chr3R 24738063 3' - transib1 1898 1 66.67 CAGCATTTTATGTACACATATAAATAAATATATAAATAGATAAGTAAGGATGGGCGCAGAAGTCCGAAATAAACAAAACCAACATAAGTGGAAAGCCTTAGGCTTCCGGGTGTAGAAAAAAGAATGCCCTGAAGGAAAATGACTA:1 + chr3L 14515066 3' + accord2 7204 1 74.48 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAAAATATGATTTTATGGT:1 + chr2R 13259415 3' - mdg1 7067 2 63.01 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTATGCAAGAATCGAATAAAAGAAAATATG:1 + chr2L 4123977 3' + transib2 2788 1 58.22 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTATGCCATTC:1 - chrX 14450383 3' + hopper2 1559 1 51.37 ATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGGGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAACTTACATACCTGATACCTGAGATAAAAATCCAATTATTGCGTGT:1 - chrX 18409393 3' - roo 225 2 71.72 AAAAAAAATAAAGGGAAAAAGAATTATTAGATAGATTTTACTAAATATAATAAAAATATGAATAGAGAAACTTAGTTGCATATAAAATTTTCGATTTTTTTTGTTTTATTTTAGCCAACCTTTCATGCTTTTGTCACCTGTCGAGC:1 + chr3L 2627649 3' + Doc2-element 230 1 47.95 ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATT:2 - chr2R 4673550 3' + Quasimodo 7320 2 56.16 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAATCTATTAATATGCAGGCTCAAATTTGAATTGAA:1 + chr2L 4003832 3' + mdg1 408 2 73.29 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTTCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGG:1 - chr3R 29084894 3' + 412 7477 2 61.64 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAAT:2 - chr2L 17180055 3' + Juan 4172 1 55.48 AAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACTTCTTTCAGTATCTTTCAGTATCTCATCTTCAAAAAAGTTAGTGCTCTGAGCCGTCGAATT:1 - chr3R 23224345 3' + FB 25 1 60.96 ATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTTTTCTTTTTTCATTTTAACTTTGCTTTTTATCTTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - HeT-A 5 1 58.22 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTTT:1 - chr3R 4682905 3' - Burdock 6216 2 74.66 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATATTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAA:1 + chr3L 11326787 3' - pogo 48 1 55.48 AAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACAGATTTTATAGGCCTACGCAGAGCCATTGGAGGATTGTGACTGCAGGAGATGCACCGAAA:1 + chr2R 11360870 3' - roo 444 1 63.70 AGCATCGATGACTGTTTTGAGGAAACACTTTCCATAGGGCCAGTCTAGTCGTGGTCAAGATTGGATAATGTATTCTTCCGAAATAAAAAGTCTTCTCTGCTTGGGAGTTCAAAATCAAGAAAAGTGTATTTATGTCTTCAATATGT:2 - chr2L 23028303 3' + mariner2 493 1 75.34 TGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAGAAGCTACGTCACATTTTTAATAAAAGTAACAA:1 + chr3L 13365811 3' + BS 5023 1 75.00 GCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGATCAACAAATTGACATTAATAAATGATAAAATGATTATAAGATATAAGGAAACTGAAACA:1 + chr3R 10970335 3' - G-element 58 1 58.70 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTGGATATATGTATGCATATATATATCGGCGATACTAAAGGGTGGGGCTGGGCCATATTTCTCCTCTTTACTTTCGGGTGAGTTGCAT:1 + chr3L 21656011 3' - HMS-Beagle2 31 2 61.64 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTCATGCGAGCTCGGTCGGAAGTATGCAATGGTCCGGGCAGATTAAACTG:1 + chr3L 21996296 3' + Transpac 5205 2 66.21 CAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCGCATTTTCTGCAACCGCCCACTTTGCGTGGATATCCTGTCCCTTCTTTCTGCCAATTTTCACCTCCACCTCGACGTCCTCCTCTTCCTTGCTGTCTGTTA:1 - chr3L 22156603 3' + I-element 191 1 69.86 ATTGTGACATAAGAAGACAGAAAACTAACATGCCCAACAATTATAACACTATATGTTAGCTTATGCAAATGTTCATAAGGTAATCATCGAAAGTCAAGTGCAGAAACTTATGGCTGG:1 + chr2L 21780655 3' + Fw2 93 1 64.10 ACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCCGGCC:1 - chrX 21772476 3' + springer 20 2 69.57 AGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACGTGACTAACATAGTTTTTATTTTTAATGTGTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATTGCCTTTTTCGATTTATGTTTTTGTTTAAACTTTCGAACGCATTAACCGTCAATCA:2 - chr2R 11449720 3' - HB 1409 1 66.44 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCGG:1 + chr3L 3983864 3' + P-element 2806 1 24.06 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGCCACACAATATGGGTAACAAGTTGCACCATCCTGGCCAAGTTTATCGCCACATAATTCACACGGAGCCCTCAGCCGGG:1 - chr3L 1692002 3' - blood 7055 2 54.11 ATTATTCGTTTAATTATTAGTTAATAACCTCTAACTACGTAATTTTCAATAATATCAATCAAATAACTCCAAAGAAATGTGGAATGTGTTTTTTACAAATCCATTGGATCGCTAACACTGAGTATCTTGTAGTCGTTTCATTGCA:1 + chr2R 13005552 3' - flea 4987 2 71.72 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTGTGCATTATTAATAAATATTGCCAGCTTAAAAATTTATACTGAATTTGTATAACATTTTAAATATATACAT:1 - chr2R 14653150 3' - 297 6624 2 54.11 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGGAAATATTTAATTAATATTTTCCTTGGAATTGCCAGCGGGTAT:1 + chrY 2720402 3' - 297 26 2 65.28 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGG:1 - chr3R 23911332 3' - 3S18 33 2 56.80 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGTTAAAAAACAGTGTGAGTTACCTGCCACTTAACAAGAGATTCAACTTTAA:1 - chr2L 3233921 3' - roo 28 2 66.44 ATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGG:1 - chr2R 5410971 3' + Tc1 1348 1 62.50 AGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGAGTGTCACGTTGACTGTCTTTTTGCTTTCC:1 - chr3L 15625119 3' - mdg1 137 2 60.00 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAG:1 - chr3R 15790867 3' - roo 73 2 74.63 AAATTANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGGTAACGAAATTTAATTATCGGTTGTTGAAAATTAATACATTGATACGCGTAAAATTCCTATATTTTTTGAACATATTAAATTCGCT:1 - chr3R 11191366 3' + roo 9037 1 59.59 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTGGCTCTGGCACTTT:1 + chrX 21216826 3' - roo 53 2 56.16 ATATTCTTGATCAGGATCGATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGCCCGTCTTCAACTAAAAAAAGCTAGAAGATTGAGATTAAGCATACACTTTTCAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCTATGTTGCCACGCCCACACT:1 - chr3L 9304017 3' + INE-1 84 1 65.75 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAAT:2 + chrX 20999604 3' - BS 44 1 52.05 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCTT:1 + chr2R 6964892 3' - Burdock 44 2 55.48 ATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAAAAAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATTAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAA:1 + chr3R 545850 3' + TAHRE 10377 1 78.08 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCTCAGAAAAGACCTGTTCGCTGTAGCGCTCGCCGCTCTCTCTCTCTCTTTCACACGCTTTTTTCATGGTCCACGGTATATCCTCCATCTTTCACACACTCGCCCT:1 + chrX 9023614 3' - 1360 172 1 55.86 CAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCAACCATCCAACCATTCAACCATCCAACCATCAACACCAACCACCCACTTTTATCGCCTTCGACCTCAACGGGGCAAAAGTGCTGTTTTGTCTGAGGCCATAAAAAGGGAA:1 - chrX 19384494 3' + gypsy4 6636 2 65.07 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGTGCTATAGCACTATAGTGGTGCAGCAAAGGTTCAGTGGTGCTGGGTCACTGCCAATGCCATGC:1 + chr3R 23491962 3' - transib2 57 1 54.79 ACACACACACACACATTTTCACCACTTGCCCCTTGGCTCCTAATT:1 - chr2L 3688960 3' + accord 7033 2 62.22 ATAAACAATATATTAATAAGAAATATTAATAAATAAATATAAATATATAAAGAAATATATTATTAATTAGAATGGCTTTGAACAACACTGCGTATGAGTAACGTCTTTACGCCGCTGTACAAATGGTAAGAATCATGTACGAGGTA:2 + chr3R 5761861 3' + hopper 1111 1 56.16 AAGGAGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTATATGTTTTTCTTGCGGGCAAAAGTCACGATGAAGCGGGCA:1 - chrX 13371015 3' + Tc1-2 1219 1 72.60 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAGAATAAATATGTAACTATGTCCCAATTATAATGCAC:1 - chr3R 5768971 3' + roo 387 2 70.34 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATACATATATATATATAGTAGTAGATGTATATAGTAGACAAGAACGCCATAATACGAG:1 - chrX 10537858 3' - I-element 65 1 61.64 TGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATCAAAATGAATCTATCGAACTGGACCAAAAGAATTTAGTTTAGAACTAAATGTTTGGG:1 + chr3R 17499649 3' - Juan 3847 1 60.96 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCCAAAATTTAATATATTTTCCATACTAAACTCAAATCTGTTGAATAAAGTTCTATCTTTAATTCGAC:1 - chr3L 9269878 3' + copia 237 1 51.39 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAAT:1 + chr2R 1916446 3' - Juan 65 1 58.90 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTATTTCCTGAGAAATTGT:1 - chr3R 29084839 3' + 412 7532 2 71.23 ATATATTCTTGATCAGGATCATTAAGGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTGATAGACTGGCGTTCAAATATAGTCTCTGGTCATATCGATATTATCGATGATGTGTGAATTTGGCATCGATAGGTTATTGAACGAGCTTTATGG:1 + chrX 20000746 3' + INE-1 82 1 49.32 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAGTATGGTTAAAGCTTAGTAGTGTGTGCCATCAATAACAGATTCAAGGATACGAGGCATAAT:1 - chr3R 20441231 3' + I-element 5296 1 56.85 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCT:1 + chr3L 25401032 3' - Doc 37 1 51.37 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAATATCAACATCAAAGGGTAAGTAACCG:1 + chrX 12129435 3' + flea 4981 2 62.33 AAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTCGCTCTTGGTCTGATGGAATTGCATCATCGCTTC:1 - chr3R 14931101 3' - accord 7198 2 75.36 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTACCTTCTATCTTGTTTTTTATTGCTCTTAACAAGAACTGACCATACGGAGTTTTATCCGTGCCTCTAATGAGAAGAAGAATTTCCTCGATATTATTTATAAATTCGTTTAG:1 + chr2R 18862157 3' - mdg1 7048 2 78.77 AGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGT:5 - chr2R 5410963 3' + Tc1 1354 1 57.53 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGATTGGATTCGCTTCATGGCGATTTGGCTGAAATTGAATTTCTATGACTAGATTTTCTGATGAGCTAACTGGAGTTAATAAAAATGCTTTCTATCA:1 - chr2L 1300626 3' - GATE 8273 2 61.64 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGAATGTAATTACTGTTAGGAAATTGAAGTAATAGAAAAAACCCTTGTTAAATATTTAATGGTACAAGCTGTTTTAATTTGGTTTTGCAAATTAATTTATGCATTTTTTCCTA:1 - chr3L 2989883 3' + roo 400 1 78.77 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGAATGTGGTGTTTTTTGTCCCAGTTGGTTCTGAGCTGAACTGTAATTGCTTGCTGGGGTGTTGTTTGGTTTTACGACCCAG:1 + chr2L 19924062 3' + roo 387 2 57.03 ATTATTTATTTTAGTAAAAAGTCAGATATGGCCAGATCGATTCGACAATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTC:1 - chr4 836650 3' - Doc 147 1 79.00 GTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAACACGATACAACTACACAAAAAGTCGAATTTTTTCAAGCTAACAATTGCAATTATTTCAACATTAAAAGTTATTTGGCGGCTGCAAAAATTAATTCGATTTTAATTTGGCGCG:1 + chrX 3675370 3' - transib1 368 1 70.55 ATAAAAATAATTATTAATGATAGCCATCGCGACAACTTGTTCTAGCCAGGCTCTTAGAATTAATCAAAGTCGCTGCATTACAACGCAATGCCA:1 + chr2L 14217221 3' + gypsy9 293 2 89.25 AGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGTTCCATTGGCGCCGCAGATAATCAGTGTTCAGAAGATCCCAGCTCCGT:1 - chr2L 1978227 3' + R2-element 3295 1 67.12 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAACAAAAATTATTTATGAGACGGCTTAAAGC:1 - chr2L 14074431 3' + 297 6929 2 53.42 ACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGGGGTGTTGAGTCGAGTCAAGACAAGGTGAGAGATCTCCTCTCCCAGGCCTAAATGTCATTTCGATGAATTTATAATTGGAAATTACGCGA:1 - chr3L 18289002 3' - HeT-A 5985 1 62.33 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATATATATGTAATGTGTATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTA:1 - chrX 11661392 3' + pogo 2038 1 69.18 AAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGAC:1 - chrX 21639607 3' + gypsy5 7298 2 52.74 GAAGACGATTTTCGGGACGAAGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGACAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCTTTGACAAATATCAATACAGATATATAAAAAAAAAATACAACA:1 - chr2L 9728358 3' - 1360 3190 1 81.95 TATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCGTTGGGAGTTGGCAGTGGAAGCCTTTTGCATTTGGGG:1 + chr2R 14115602 3' - mdg1 484 1 74.66 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATACTACGCGATTAATTGTAAAGATAGCTTCAGAATTAAGCCCAATGTCAAAATGTCTTAAATAATATTCCACTCAAAAGAATTCCATGTCAAATTG:1 - chr2L 17180041 3' + Juan 4186 1 65.07 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTTTAAGATATCATTTATAATTTTAAGTCTTACTTGAAACTCCAAAAAAAAATTTCAATTTATATCTTATTTCTAGAACTCTTAAACTTATCCATAAACCTATTTCTGTGACCGCATTTGT:1 + chr3L 3030364 3' - roo 8664 1 78.62 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGGTAAGCTAAGGATATGGAGATTTGTGGGACAGAGAGAAAAATGTCTCGCTACTTGACATCTACATAAGAGTTAACCC:1 - chr3R 3850993 3' - transib2 40 1 58.90 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAATTTGCAGCAAAAAGGATACAAATAAATGCGA:1 + chrX 15357790 3' - hopper 31 1 64.38 ATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTCGACTTCTATTTATGTTCATTGAGGGATTTGTGGTCTTGGTCTTCAAAGTGATTTTTAAAAAGCAGAGCATTAAAACTTTAAGAATGCATAAAGATTTAAAT:1 + chr3L 14224103 3' - I-element 245 1 71.23 AATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCATAGATTGTAGATCATTAGAACCAGGTCTGTC:4 - chr3L 21655826 3' + HMS-Beagle2 7191 2 77.40 CAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCCAGTGCAATGAGCCTGATTACTTTAATGTCCTTTGTTTAATGAGCAGCCTCAAAGAATAAAACATAAAAGATGGCCAGTCTACTTGGTTAGTCG:1 - chr3R 8541082 3' - F-element 4324 1 68.97 TTTCACTTATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATATATATATATATCATAATATATACAATTATTTTTTTGGCTTCTTAATTCCAATTGTGCAGATCTATTATCTATCTATGCAGATCAGTTCACAGATATTCACTTGGCAGTGA:1 - chr3R 3854737 3' + Idefix 7381 2 34.93 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGACAGCTCCCTTGAGACAAGAGCAACAACAGCGACAGCAGACACATAATAAACGCAGCTTGTTATTGTTTTCC:1 - chr2L 18347271 3' + transib2 2778 1 52.41 AGATATTGTTGGGAATTTTTTTTGCGTTTAATATTGCTTACTTCGATTTTTTTAAATTCTATAGGTTTCTCATTTATTAACTTTTTGGAAAAGTCACATCGCTAGATATTAATGGTATGCCTGCTAATTTAATCACAATTCAGTGA:1 - chr3R 24455907 3' + INE-1 386 1 39.04 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATAAATTTTATATTTCTTTCATAT:1 - chrX 23431578 3' + 297 6921 2 58.22 TGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGTATCAAATGTCTCCCCAGAGTGATATATATCAAGGAATACGCATTC:1 - chr2L 5688713 3' + Transpac 207 2 71.92 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAAACAAATGAATTTCA:1 - chr3R 13972917 3' - 412 29 2 66.44 ATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCT:2 - chr3R 904924 3' - rover 6984 2 55.48 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAA:1 - chr2R 5106312 3' - 1360 23 1 60.96 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAAGACATAAAAATTGTTGTAATTTTCAAACGGGGATTTTCGCAATAAGGAAATAACATTTGGGCCTTACTCCGATATTTTCGAATTTTCATCATGTAA:2 + chrX 8360664 3' + roo 9047 1 69.18 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTGAGATGGGGAATAGATTCCCGGACGGGAAATGGGAATCGCGGATTGAAATAGATTATTTTATG:1 - chr3L 21380510 3' + I-element 5304 1 54.79 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTC:1 - chrX 6116267 3' + transib2 2741 1 73.97 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTTTCGGCCATTTTGAGCTCCATTAATTGGTAAATTTTTGTTACCCCCCTT:1 + chr2R 9967179 3' + Bari1 1693 1 74.66 ATTATCTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCTAACGCAGCCTTAATTATTGTACTTCCCGACAAAGGAGAATTTTCTTGTGTGATGCCTCTCCTTCTATCGAAATGAGT:1 - chr2L 11580611 3' - invader4 417 1 40.91 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATCTTC:1 - chr3R 6419823 3' + Tabor 7282 2 53.42 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTT:1 + chr3R 28385636 3' - transib2 53 1 54.11 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCTCGCTCAATCTCTCCGTCATTTG:1 + chr3R 15791051 3' + roo 392 2 73.97 AGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATAGACATAAAACCGAATTATACATATTAAAGTAAACAATAAAATTAAAATTTATATATGAATTTTCGCATA:1 - chr2R 15326923 3' - copia 485 1 60.64 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTG:1 + chrX 5323342 3' + Juan 4176 1 39.04 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCGGACCTGACCCTGTGTAAATAATCCGTCTGGCGAAT:1 + chr3L 19455001 3' + mdg1 7379 2 73.57 GACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAACCAACTCAAGACCGAACATACAGCTGCGATTAAATCAATACTAAGAGCAGCGGGTGCATTTCGTGAAGAAACTCGTATTTTATAATAA:1 + chr3R 3846851 3' - transib2 2476 1 76.00 CCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCC:1 - chrX 21772480 3' + springer 7153 2 62.32 GGTTTTTTTTTATTATTTATTTTTGTTTTGAAATATACAGATTTAATAATTGTAGTGTTTTGAACAGGCCTTCTATAATTTTATTTCGTTTTTACTTCGACACCACACATGCAAACAAACAATGACACAGGACACAAAGGACGAAG:1 - chr3R 29656245 3' - BS 5094 1 55.48 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCTCCTCTTTTTTCAGTGTGGCTCGTTGTTTCCTTTTTAACTTTTATGAATTATAATGTGAAATATCGA:1 + chr3R 14980416 3' - roo 8717 2 54.48 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAAAGGCTA:2 - chr3R 7943742 3' - blood 75 2 66.44 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTA:1 + chr3R 23881681 3' - FB 16 1 58.16 TGTGACTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCTATCAATTACAGAAGAATCTCTAAATTTTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACAATGCATTTCCTCAACGCCAGGCACTTCGGAAACGCACTCCAAT:1 + chr3L 2565488 3' + Q-element 63 2 71.92 AAAAAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAATGGGGAATGAAGTGAAGGGAAATGTAAAGCGTGCAAACCGAGAGAAAGCA:1 + chrX 9013569 3' + gypsy7 5011 1 75.53 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAG:1 + chr3R 9298550 3' + hopper2 1532 1 68.49 AGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGTGTGTCAATTACCAAACGCTCTAAGTGAGTACTTTTTAGGTGGAAAACAAACATTCGAGTTGAAATGCTTGCGGTTATTTCTCTTCGGTTATCTTTTTGGAAGA:1 - chrX 6865049 3' - Quasimodo 7088 2 76.71 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTACAGTAGGGCTCGGAATAATAGAGTAGTTACAAATATTGCTGTTATCTAAAAATACAGTTGGTCAGAATATTTTGTATTTTTCAGTTGCTGTTATCTAAAAATACAGTTGGTCAGAATATTT:1 + chr2L 1074656 3' - accord 7025 2 76.71 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAG:1 - chrX 8437697 3' + P-element 2805 1 15.32 TTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTAGATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCC:1 + chrX 22576488 3' - Burdock 192 2 53.42 TCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCA:1 + chr3L 20187417 3' + FB 470 1 54.11 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCTGAAAAACTAACCTGCAGAATGCGTTTGGGCAGATTGCGATCGTCTTCCTCAGTGATTTGTGTACGAT:1 + chr2L 17809272 3' - jockey 62 1 53.42 TATAGCATTCTCTCTTGTTTAAATTGTGGATTCCGCAGAGAACGTGACGGTCCTCTAAAGAATTATCATTCATAGAGCACACCTCACCAGCTAACTGTTAACAGCGTGGTATTATTATAGTGTAGTAAATAAAATTGAAAGTGAAT:2 - chr3L 19465567 3' + INE-1 583 1 75.34 ATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGCTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTC:1 - chr3R 6419863 3' + Tabor 403 2 76.71 TAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAATTATAATAGGTATAACTATAAAAAAAATTTTACAACATCAGCAAACATTTCCCCAATGAATTTGCATTGTCAATCATGCGCAGCTTATTTATTCGCCTCATTCGAT:1 + chr3R 23563949 3' + FB 296 1 56.16 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGA:1 + chr2R 5151326 3' - roo 8722 2 58.90 ATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGTTGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAA:1 + chr2R 23780585 3' - Ivk 101 1 74.66 TTTTTATATTTATTTTTAAAATAGTTTTAACCAAGATGAAACAATACTCTCTTGTGACTTAGACTTCAAACAAGAGTGGAATTTAAATGAAGCCATTAGAAAATATCAAAATTACCATCCAATACTGGCGACACATGTAAATTTCT:1 - chr2R 16686381 3' + copia 4664 1 74.66 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTG:1 - chr3R 23618121 3' + hopper 1358 1 56.85 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTATATGATAAAAATTCAAAAGCTTAATATTAACAATTTATTGCA:1 + chr2R 14653238 3' + 297 319 2 74.66 TGGTAGATTATCATCCTTTATAATGACTAAGTCGTTGATGCTAAGATTATCTTTGATTTGGCACCACTTTGGCCGAGTTTGCATCAAGAGCTGGTCAGAAAGGAATTTGCTCACAAAAATATCCTGCAGAGGACTTGCCATTTACG:1 + chr2L 407171 3' - diver 5658 1 56.85 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTGCCAG:1 - chr2R 13168646 3' + P-element 2828 1 45.89 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAATCATACGCCATGTTGTCAGCTTTATGAATTGCCTGCATAAATCTCTG:2 - chr3R 22642260 3' - blood 7050 2 57.53 ATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACTGTAGAGGGTTCTTAGTAGGTCCCCTCCATAAGGGGGACATTTGCGGGGGATTAAAGAAAGGGAAGGGGAACGAGGCGAATATGTGTGGGTGTGGCCATTTTG:1 - chr3L 5260729 3' + I-element 5063 1 54.79 AAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTCACAAACAATTTCTGTTCACTTCGGCTTTCATTCTAAAAATAGCTCTATTATTTAGATACAAAAATTAAATTGTAACGCATTAAGTAAGCTAGTGGCAGTAAAATTATCTTAC:1 - chr3L 4839421 3' - hopper 397 1 72.41 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTATATGTATGAGCTCTGTGTGGGCCATATAACTCACCTTCAATG:1 - chr3R 11040066 3' + Bari1 1635 1 68.28 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATT:1 - chrX 12986518 3' + roo 360 2 51.37 CAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACAATAATAAAAAGAAATATATAAAAGTTAAAATGCCACAGCAACAATTGTAATGATGAAATAAAAGTCAAGTGAATACAATGGCTTC:1 + chr3L 13792154 3' + Tabor 483 2 64.38 GTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTTTTTTTTTATTGT:1 + chr3L 15263657 3' - Chouto 25 1 76.36 ATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGATAATTATTAATGGCAACATATTGATCTTAATTTTATAGATGGTTTATTATTGGTTTAGATTTAAAACTTTGACTTTTTATCATTATCAT:1 - chr3L 1421138 3' - I-element 301 1 61.64 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGATCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAA:1 + chr3L 18505723 3' - I-element 62 1 69.53 CATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCACAATATTTTAAACACAAATACTCTAATAATAGATACTATT:1 + chr3L 20555098 3' + jockey 4769 1 71.92 GATCAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGGAAGGGATTTACTTTAAATCATTTTATACGATAGCTTTTAAACGTTTTAGCTTACTACTTTTTTTTTATAAAAATTAGGCACACACGTAAATTGCGAGGAG:1 + chr2R 21572990 3' + R2-element 3582 2 69.29 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTGTGAAATGACGTA:1 + chr3R 17077200 3' - roo 59 2 60.27 ATGAATTTCTAAAAATTTAAATACTGAATCCGGCGCTAGCTCATGGCGTTTGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTTTTCGCTACAGACATTAATGAATAAGA:1 + chr2R 5580521 3' + gypsy12 9813 2 76.85 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAATATGTTTTTTTCTTGATTTATGTGTGTATTATGTATGTTATGTTTGTATTTTAATTGAATGTAGAGTTTTTTCACAGTGCACACAGCAGAGCCGAACCCAAC:1 + chr3R 12728115 3' + Juan 4200 1 69.86 GGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGAGACAGTCCAAACCACGTAACTTGAACAATCCCCAAAAATTTAACAATATCCCTCTTAAGAAATATTATATTTTTTATTTTTT:1 + chr2L 9435800 3' - GATE 46 2 50.44 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATCGAAATAGATCGAAGCGTCTGATTTAAACTGGAG:1 - chr3R 16341895 3' + P-element 2868 1 72.60 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTGGAAAAATACTTTGGGCTGCCTTGGC:1 + chr3L 22400580 3' - 1360 72 1 65.75 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAAGGCGTTATAAATCAAGCTAGTCTTGGAAATGAGATAATGGGGAAATCAAACATGTTTTTGTAGGCATGAGGCAA:1 - chr2R 8099125 3' - jockey 4806 1 52.74 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATTTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACA:1 - chr3L 19454886 3' - mdg1 22 2 69.18 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTT:1 + chr3R 11040161 3' + Bari1 1648 1 45.89 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGCCGAAGTACACACGAAGCGCTCTCTCCC:1 - chr3R 23295535 3' - P-element 48 1 39.02 TATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCAAACGCGGAATTTTTAACATCTTTCAAGAATATCGATTGAACTTGGGAAAAAAGTTAATTTTAATTCCCTAAGGTGTGGGCGGGATAGATTTGGGCGTGTTTTATGGTTCAA:1 + chr4 250473 3' - INE-1 546 1 71.92 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTAAGTATTCAGTTTTAAATCCATAAATCACACATATAATTATGCAAATTATAAAAATATGCCCAGACCAAATGGTA:1 + chr3R 11062885 3' + roo 400 1 75.34 CGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCATCTTTCCGAAATAAATTCATTTTTAATCAACAGTTGTTTTTTCTGGTACTCAAATATTGAGCGGTTCTTGTATAAAAATTATTCTCGCTTCAATAATTTC:1 - chr2L 9163836 3' - Bica 434 1 69.18 GTTTTGTTGTTTTGTTTTATATCTATTACTAGATGTTACACTAAATATATATATATATATATATATATGGATGTAAAAAAACCAGCATGCAAAATGCACA:1 + chr2R 15363312 3' - gypsy9 449 1 64.00 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATT:1 - chr2L 22674745 3' - mdg1 7064 2 69.18 CGTGTTTTTTTCTTGTTGCCTATAGTTGATTTTGTTTAGCGAAAAATGTCTTTCACTATTAATTAATATTAATATTACGATTACTGCGTATTTGTATAAGTGCAAACTGAACAGAGAAACCTTGTAGCCCAACTTTTAGCATAGCA:2 + chrX 15326965 3' - invader3 5011 1 39.04 TAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGTTGGTATTTTCGCGTTTGTAGCGAACCTTCTCACTGAAGTGA:1 + chr2R 17573480 3' - Bari1 1439 1 76.03 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAACCGGCAAAGCGTCCATG:1 + chrX 661964 3' - 412 7107 2 53.79 TTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCACATACCACTCGCAGCCGATGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATGCTGAGCTACAAGCTGGACTTAGATTTCATCTCTAATAATGAAAACATTGTTTCAAAATGTAACTTG:1 - chr2R 10226867 3' - X-element 4352 1 52.41 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGG:1 - chr3L 16690918 3' + I-element 5279 1 72.60 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTACATGACTATATGTAAGTTAAGGAGAAATCCCCGGAAAAAAACCAAACATGACTCATTAAAGAAACGAGGAAAA:1 + chr2L 4003799 3' + mdg1 7413 2 52.05 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAACGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATA:1 + chr2L 17180123 3' - Juan 67 1 68.22 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATGGTTTTCAGCA:1 - chr3L 21655857 3' + HMS-Beagle2 277 2 56.16 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTG:1 - chr3R 31886846 3' - hopper 68 1 66.44 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAGCGCTGAATAA:1 - chr2L 71152 3' + 412 7503 2 55.48 GCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACGACGGCTGGTCTGCGATCAGCACTGTTTAATTGGCCGTGATAGGCA:1 - chr3R 31045656 3' - INE-1 86 1 79.45 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATA:2 + chr2L 8902505 3' + roo 8988 2 75.34 GATTTCNTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCCAAAGAAACTAATTAAGTAAATGGCCAACTTAGCTT:1 - chr3R 10931613 3' - 297 32 2 54.55 ATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATACACCTTCAGGACCAGATACACCAGAACCCGTTTGGCCATCACCCTCTTTTGTGTTGTGTGTGCCGCCTCCACCGCCAGTGCCCCCTTCTCCGACTCCATATTCATCT:1 + chr2L 331137 3' + G2 2807 1 78.08 AAAGAAAAAAAAAAACAAGAAAAATATAAATAGA:1 - chr2L 15264545 3' + gypsy7 5013 1 85.29 TTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCCCTGTTGT:1 + chr3L 21327148 3' - copia 70 2 74.42 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACT:1 + chrX 13490756 3' + 297 341 2 62.33 ACTGAAGATCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGAAAAATACGTTAAGTACAATTGCTCTCAGAAGATAATAATAGGATATAGAGTTGGCGTTCTCTCTTAAAAGGGCTCTTCTGTTAAAACCTCTCTCTCAATACAGAGT:1 - chr2R 2932896 3' + Rt1b 5019 1 71.23 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTTT:1 + chr3L 5061657 3' - 17.6 49 1 58.90 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCG:1 - chr2R 8735583 3' + mdg1 350 2 69.86 GATTTAATAACAATAATAATAACTAATACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTTTGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTAAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGGCG:1 + chr2L 22805228 3' + mdg1 7052 2 56.85 TTAAAAATAAATTATTTCGATCGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTATGATTTATACAAGCACATT:1 + chr3L 20187460 3' + FB 850 3 74.66 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATT:2 + chrX 8200292 3' + flea 4947 1 64.38 ATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGAATCAGAATTGCTCTTACCCACAAGAGTAAAAAGTGAAAGTAATTGTTAAAAAAC:1 - chr2L 13555334 3' - transib2 2617 1 68.49 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAA:1 - chr3L 2145881 3' - roo 52 2 59.59 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGAATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGGCGCCAAGAAGTATGCAGCAGGTTTATTATTTATGCC:1 - chrX 14450387 3' + hopper2 1558 1 53.15 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAAT:1 + chr2R 12472125 3' - transib2 35 1 54.84 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAAATGAAATAATACA:1 - chrX 17343384 3' - I-element 60 1 60.27 TAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACTTTCCAGATGGATTAGAGATTATCGAAAGCTAAACAACAGGTCAGAAG:1 - chr3R 9422040 3' + 3S18 106 2 63.91 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGACAAGCCAATTTAAGTGCCCCAATGCCTATGTATGTGGAAAATTTAAATTTCCCCATTTGCAGAATTGTTTTTTCCGGTTAAGGGCGCATTA:1 + chr3R 26178504 3' - 412 30 2 62.07 ATTTAATGAGAACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGTTTTACTAAATATAAAATACATATCTTTGGAGAAAAATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAA:1 - chrX 3431874 3' - Ivk 5325 1 48.45 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACGGCTCACTTTTCCTC:1 + chr2L 6647740 3' - mdg3 5280 2 58.68 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCAGGATAAAAACTTCCCATTACGTTCGATGGGAAACA:1 - chr3R 29084889 3' + 412 435 2 57.86 GTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGCGACTCTGTGTGTGCGTGTGTATCTATGGGTGGGCAAAAGGGATGGCCAAAGCTGAAGCTTCTCCTCGCTCATGTCCTCGGGTTCGTCGTC:1 - chr2R 11610358 3' - F-element 4513 1 60.27 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTG:1 - chr3L 6397674 3' - roo 8742 2 68.49 AAATATATGATAGTTAAAGAATTACAATTAATATTGAACTTGTGTTTATTCGCAGGTATAGGGTCCAATCTGCGAATAAACACAAGGTCAATATTAATTGTAATTCTTTAACTATCATATATTT:1 - chr3R 24309746 3' - Cr1a 85 1 58.87 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAG:2 + chrX 8027509 3' - Juan 41 1 43.84 AACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTT:1 + chr3L 3501798 3' + Bari1 1626 1 73.97 AAACTTAAAAAAAAAAATAAAATTAACCAGAATCCCAAACTTGAAATTAGCCAAAAGCACCGAGCTCTTTTCCCTTAAGCCCTATTAA:1 + chrX 12391614 3' + Doc 4698 3 82.95 ATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACACTGGTCATCTCCAGACTGCCTTACTTGGGCATG:1 + chr2R 20290974 3' + roo 8940 2 77.40 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTCTAAAGCTAGTTTTTCCACAGTAGCTATTGAGTAATGAATTGTTGAAATATAAGCTATATTTTATAATTGCGTATAACAATTATCA:1 + chr3R 19073310 3' + roo 9037 1 60.96 GTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTTCCC:1 - chr2L 23020624 3' + Transib5 2947 1 53.10 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTCTGATTTTTCTTTTTCTTTTGCTGCTTTTTCAGCCTGAAATAAATGCAAATTTGGAA:1 + chr3R 24090538 3' + roo 9009 2 60.96 CTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATTACATGCAGAAGCCTTTCAGGGAATTCTTACATAGACATTTTAGGGAATGAACC:1 - chr3L 23249392 3' - rover 67 2 61.64 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACATCTCAAAACAAAT:1 - chr3L 19454873 3' - mdg1 7047 2 78.08 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTG:1 + chr2R 6964846 3' - Burdock 6197 2 75.21 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAGATACAATGTGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACAAACTATT:1 - chr3L 12004211 3' + P-element 2857 1 66.21 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTTTCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACTGGATGTTTGATATGCATAAAG:1 - chr2L 6174088 3' + I-element 5294 1 74.77 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACGAGGAAGTCCCTTCAGATAGCACATACGGATACAAATGGAGTGTTCCGATTA:1 + chr3R 13300984 3' + roo 9037 1 59.59 CGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTT:1 + chr2L 16946101 3' - hopper 117 1 63.01 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACTTTGATACTTATAAAGAGGATTCAGCTTGTCCAAGCAGTTTTGAAGAACAGTGAACATAAAGCTATTTTATTTTCTTCAAG:2 + chr3R 18488489 3' + roo 9033 1 56.16 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGAAGAAATAGATTTATATAGAGATCTCCCACCAAATGTGCACTAAAGACAAATGTCCCGAAAAGCGGCAGATCTAAAGG:1 + chr2R 12779729 3' - I-element 53 1 51.37 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTAT:1 - chr3R 4964108 3' + roo 8996 2 71.23 TTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAGCACATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCATATAAAGTGGGTGGAATTTGAATCGTAAAGCTTT:1 - chr2L 5423912 3' - X-element 395 1 78.12 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGACACTGGTGCTCTATCTATCTCCTTTTCTCCACTCGTACACCC:1 + chr3L 18403048 3' + P-element 2819 1 36.23 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATCGGGGAACTCGATGGGAAGTCTTATTTGTCATACAAAGGCCTCTGCGCCGATTC:1 - chr3R 4964054 3' + roo 387 2 71.23 GAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATCGGACGAATTTGTTATTGTCACCAAGAAGTTGGGGTTCTAATAATTGTTTATCTTATGTGCTAAGGCATTC:1 + chrX 22000038 3' - Quasimodo 229 2 62.33 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTA:1 + chr3L 6447101 3' + transib2 2741 1 75.17 AGAGGGAGAGAGCGAAGAGAGCGATCACGTCACGTCATCACCCCACCCAAAACGCCCAACCACCACCCACCGCCGCCGTTCCCTTTCCTCCATCGTCGAGAATTTCGAGTTCAGAGCAGCGCGACCGAAATGAAAAGAAACAATTT:1 + chr3R 14056290 3' + 1360 108 1 76.03 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTAAATGTTT:1 - chr3L 5489874 3' - jockey 59 1 49.32 TTTATAAAAAAAAAAAGAAAAATGAACTTTAAGAGAAATTGAAAGAAAGTCGTTG:1 + chr3L 5062203 3' + HMS-Beagle2 480 1 90.91 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGATG:2 + chr2L 11357934 3' + blood 7339 1 52.05 CATACACACACACACATATCCACACGTACACTTGGCTCACACATGTACACACGCAGTCATGGAGAGGGAAAATTATTTAAAATTATTTATTTCACAACAATTTTCACTAGGTGGCCAACTGCAAT:1 - chr3L 6620534 3' + accord 186 2 66.40 GTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACACCGCGTTTCAAAGTCACATTCCGTTCGGTTTCCCGATTATAATG:1 + chr2L 10301658 3' - F-element 4459 1 69.18 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGC:1 + chr3R 10931724 3' + 297 334 2 69.06 AAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTCGATCGAGTCTCTCGGTTCGTT:2 - chr3R 9557481 3' - G2 2994 1 71.23 ATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGGATGTTACACTTTTTA:1 + chr3R 17615222 3' + mdg1 29 8 69.18 TTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGTTTGGTGTTGTTGTTTTT:1 + chr3R 23295169 3' + Cr1a 130 1 82.61 AAAAAAAAAATAAAAAAAATCGAAAAAAAAAAACAGAAGACTTTGGCAGTGGGATCTTTTGCTGCTGGTTGGCGGCCTGTTGGC:1 + chrX 18225980 3' - hopper 141 2 89.29 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGCTGGCGCCAAAAAGTATGCTATAATATTTAAAGCTCACGCAAGCAAGCGAATTCTACTTGTCTCTGC:1 - chr2R 19199655 3' - hopper 46 1 52.48 GCTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGTACATGGCAAAAAGTTTTTTGGCGAATCGATAGAAATTTACACAACTATATATATTTACATAAGAAAATAAGTTGTTGTCCTGCTTAATTAAGTTTTTTATTATCACGAAACTATTT:1 + chr3L 9769335 3' - INE-1 345 1 54.11 TTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATGCATAGGTATATTATTTATTAATTAGCCACTTTAAATTCTTGCGCGCTCGAATTAAATAAGAGCTATTATTCAGCTTGTACTTTAATCTTGCGTTAAGCTCAAAG:1 + chr3R 5763750 3' + Stalker4 7194 6 69.66 GTGATCAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGGAAGGGATTTACTTTAAATCATTTTATACGATAGCTTTTAAACGTTTTAGCTTACTACTTTTTTTTTATAAAAATTAGGCACACACGTAAATTGCGAGGAGCCAACTGCAAATAATAC:2 + chr2R 21573007 3' + R2-element 3580 1 71.92 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAA:1 + chr3L 10373894 3' - 297 31 2 63.64 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAACATTTCCATCTCGCTCTGATCA:1 - chrX 12066087 3' - transib2 38 1 55.48 AGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAAT:1 + chr3R 30872894 3' - micropia 16 2 68.55 GCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCCGGTTTTGACAGTTGAAATTAAACAATTTAACAATTAACGTCAACAAGTTGGAGCTCGCGGTCCTGACGAGTCACGCAGGAGCCATAGGCTGTGCAC:1 + chr2L 20686505 3' - I-element 5208 1 73.68 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCTAGTCCAAAAATAAAGTCGGCTGGGGAACA:3 - chr3L 3030167 3' + roo 9047 1 67.81 TTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAA:1 + chr4 829116 3' + INE-1 152 1 66.41 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCA:2 - chrX 13134870 3' - jockey 4803 1 54.79 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTATTTACCCAAATAGCTCAAATGGTCGACAGCCTCAAGAGCAACACGTGCATTCTGCTTTCAATTAGAAACCCTATAAGCA:1 + chr2L 9636225 3' - 412 12 2 66.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGCTGATTGTCGATCTATTTGCGATGGATGAGGTACGAGGTACAAGGGTTACAGGGCT:1 - chr3R 17077066 3' + roo 9042 1 65.07 GCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTCGC:1 - chrX 8437641 3' + P-element 2885 2 78.00 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATTAGTTGCTGGGTCTTGAAATAAATATGAATTTCTAATTTACCGACCATCAAACCATAATTAAACATATTTAGCCAATTGTAATTCGCGAAAATAGGTTAACTGTA:1 + chrX 13592956 3' - mdg1 28 10 50.00 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAATGCATGGGTAT:1 - chr3L 21996116 3' - Transpac 4938 2 77.40 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGAAGGAATTATCCTAATAGAACACTCAGTATAGCAATTAAAACTTATCCTTTATATCCTTTTATATTTTACAGACTAAGTAC:1 - chr2R 24169947 3' - transib2 38 1 43.15 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTATAAAAATTCGATAAGCGCAAATTGCATAAATAATCGTATTTATTTTTTAACTGCACAATAGCTACACATAACAATGGCCGCAAAATA:1 + chr3R 27986476 3' - roo 30 2 64.83 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTC:1 - chr2L 22674743 3' - mdg1 7062 2 73.29 AATATTGATATTTTCGGGACTTTACGTTGGATTTCGTGATCTTTTTCATATATACATTTATCGAGCTATAATTCCTAACGGTTAAGGTCT:1 + chr2L 21795618 3' - HB 248 1 68.89 GTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGGGTATTACGAACACCCACTTTGAGGCCATCAAATAAATGCAT:1 - chr2R 3593590 3' - gypsy 7001 2 76.03 AATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAGCCACTATTCCCATGATCAAAACTACTAGAGATAACACGAAAACGAAGATCCAG:1 + chr2L 1946089 3' + F-element 4590 1 63.01 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAAAAAGGCAAAAGCTGCCTTGAATTGCACTACG:1 + chr2L 15779625 3' - hopper 83 1 74.66 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAATAACG:1 - chr2R 15326787 3' + copia 249 1 80.00 CTGTTACTATTTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAAAATAGAAACGGCTTTTGGGGCCTTCAAATGTTGGCTTGACTCGGGTGCATATAGTAAATTGCA:1 + chr2R 10852252 3' + Tc1 1521 1 60.96 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCAGAAAGTTTGGCTCTGTCATTGCCAAGTTGCCACTGAAGTTTTTCCCCAGCCTCACGGTGCCATCCATTTGCTTTGTTCATTTTCCG:1 - chr2L 4713829 3' + transib2 2793 1 64.38 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGG:1 + chr2L 11257091 3' - rover 27 2 65.93 AATGGTGGCCAGCAGCTGTCTCAAATCCAGCCCATTGGGAATTCAGCTCCAAGAATACTTGGCCCAGTGCGTGGTCTATTCAGATATTGGACTCTGCCGGCCGAGGGGAAAATTTAGGCTCATGTTTTCCACTGGTCCCAAGAGA:1 - chr3R 13942513 3' - G6 1569 1 55.86 GTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAACTTTATTAGAAAAGGATTATGTTGGGTCCGCATTTTTTTGAATTTAGCCAGAATAAAATCACATAAAATAACACACTTAAGATGCGTGTTTACTG:1 - chrX 21274319 3' + P-element 283 1 74.02 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCAAAAAGGCTTTAATTAAAATTAGAAATTGCTTATTAAGTAGTACTTGAATACAATGACCTAATTGAC:1 + chrX 696593 3' - FB 55 1 52.74 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGCTGGATTTTCTTGTAAGGCCTCTTGCAGCGTCGGCAAGTCCCTCTGTTTGGTGGGCACAGTCCATATTATTATTATTATTATTAAATATT:1 + chr3L 24346893 3' + hopper 1392 1 68.57 ATTTTCAAAAATTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATG:1 + chr3R 8049023 3' - Q-element 135 2 60.96 TTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCACATACCACTCGCAGCCGATGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATGCTGAGCTACAAGCTGGACTTAGATTTCATCTCTAATAATGAAAACATTGTTTCAAAATGTAACTT:1 - chr2R 10226868 3' - X-element 4352 1 52.78 ATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGAGTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACGAATGTTACGTGAGCAGAGTGCCAGAGCA:1 + chrX 5435023 3' - Doc 4553 1 76.69 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATG:1 - chr3L 16690913 3' + I-element 5284 1 69.18 TGTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTTTTTTACAGATTGTGGGCTCATCAGATAGGGCATA:1 - chr3R 22066723 3' + Stalker2 249 2 66.34 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCACTCTCCTCTCTTAGAGTTTCGCTTTCCCATGAATGTTTATGTGCGGCAATTGCGCCTGTCACTTGCGCA:1 + chr3L 18046714 3' + roo 9022 2 51.37 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGC:1 - chr3R 23639116 3' - pogo 36 1 59.59 GTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTATGTGCAGTCTTTGGGAGGAGGCGAAATGGGAGGAGTAGCTGGGGTTCGATGGTTACGCTCCTCTTCAAAATGTGCGCACGTGCTTCAACCGGAAATGG:2 - chr3R 23297330 3' + P-element 51 1 66.44 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAAAGTAACGGACTTACTACAAAAAGTTATTTGTGCCAAAGGAGGGTATATATTTTATTAATTGTTTCAATACTCCTAATGTACGTTTAACCTTTTTTGGCATTAAAGGCTTG:1 + chr2R 4785372 3' + Juan 4201 1 75.34 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTACGTATACTACCTTGGAATAAATCTTCAGATAATTCAGACAGGTTTAAATCAATT:1 - chr2R 3563064 3' + Transpac 272 2 59.59 CTTTATCGGGATCAATAGCCGAGTCGAGCTGGCCATGTCCGTCTGTCCATATGAACGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGTCTCAATGGCTTAAGCACATCCTTGGTCACATCGATGCGGTTTAGGTCGAGGCCATGT:1 - chr3L 8329714 3' + INE-1 89 1 64.38 AAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTTCTAT:2 + chr2R 2875259 3' + TLD2_LTR 125 1 79.45 ATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCAATATGAACATGTTCGTCTGTTCGTCCGTCTATCCGTACGAAGATCGAAATCTCGGGAACAATAAAAGGTATGAGGTGGGATTGTTTATGCATATTCCAGAGGCGGACACAGCGG:1 + chr4 700832 3' + INE-1 86 1 58.04 AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAATCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATTTGAA:1 + chrX 12129409 3' + flea 4955 2 58.22 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCTAGAAGATCGCTTCCATCGACTCCTCCCCCATCATGCTGTTCTTCAAGCGGTATCT:1 + chr3R 28901319 3' - transib2 63 1 60.27 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTTTGTTTTACATCGCAC:2 + chrX 18336677 3' - mdg3 5317 2 59.59 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCTCAACAGGTTTTTATAATCTCTTATTACGATTTTTACAA:1 - chr3R 19073203 3' - roo 8737 2 74.64 ACAAGTTTCATTTGTAAGTCTCGGTGGTATAATTGGCACTGCCACCTTACTGAGAATAAAGCTTTTATTTTAATTCAGAGCATAAAAGTTTTT:1 + chr2L 22009094 3' - Doc3-element 4451 1 76.34 AGTAATATCTTTTGCCTATTTTTGCTCGTTTTCCTAAAATTTGATTTTATATAGGCAAGTTCGAGTTCAGACATAGCGACCTCATGGACATTTGGAGTCTCGTATCAAAAAATACCAATTACAAAAATTTCTCACAACAGCGGACT:1 + chrX 15139681 3' + transib2 490 1 66.44 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGT:1 - chr3R 16341953 3' + P-element 2810 1 32.88 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTTTAATTATGCTGAGGCTGCCGATGTCCTGCTGGGACAGCATCCTGGCC:1 - chr3R 8075860 3' - 412 7069 2 72.93 AGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAG:1 + chr3R 8049026 3' - Q-element 114 2 66.41 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTCGAGCACCACCGCACTCACACTCTCTGCCCGCTCTCTAGGCAGAACAGCGAGAGAGCGTACACTGTGGAGAAATACGATG:1 + chr2R 22514219 3' + P-element 2855 1 58.39 ATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTCTCCCAGGCCTAAATGTCATTTCGATGAATTTATAATTGGAAATTACGTG:3 - chr3L 18289003 3' - Doc 4276 1 65.75 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCAATGCTGAAAAGTATGCTACATAAAATATGCTA:1 - chrX 19054244 3' - jockey 64 1 55.86 AAAGGGCAAACGATTCCAGCTTTCGATTTAAATATAGATTTTAAATACATTTCATGGGAAATTAATAGTATGAAGTGCCACTTACTTATTACCCCAACCCTTT:1 - chr2L 9364892 3' - FB 47 1 75.73 ATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTG:1 + chr2L 15763109 3' + mdg1 7067 2 53.10 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTTGTCACGAAGAAAGGAAATGAACCAACGTGCAAATATTTGTGTTTGGTT:1 - chr2L 4003657 3' - mdg1 34 2 60.96 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAGTAGATTACTATCGGTTTATGTATCGGCTAACTTTACGAAA:1 + chr3R 30946596 3' + Transpac 5151 2 71.23 AGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTTTGCATCAGAACTAAGATCTGTGAAAACTGTT:2 - chrX 696518 3' - FB 89 1 77.40 ATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTGTGATTTCTAAACATGCATTTATTTCCTTCTATTTACACATA:1 + chr2L 9932292 3' + I-element 5275 1 69.44 TTTTGCCTTTCTTTTTTTTTTTAAAAACAATTTTGACTTTTTATGCTGACTGCTGGGCAATAAGAGAGGGAAATTATTTACCTCTCGG:1 - chr2R 16069226 3' - gypsy2 406 1 57.95 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGAATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAATTTGTGAAAAGCCATCGAACCGTGGGTGA:1 + chr3R 16519023 3' + Tirant 8482 2 63.70 ACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTATGGTTACAAGGAGGTAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTATAGAAGAAGATGAAATCTAAGTAGTTTATTTCGATTTCAA:1 + chrX 9172210 3' - Cr1a 4057 1 68.97 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACG:1 + chr3R 11062801 3' + roo 8998 2 75.59 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACAT:1 + chr2R 21681387 3' - roo 78 2 71.92 TATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTGAAGAAATACTTGACGTGCCAGCTCATGATACTCATGATCGATGGCTCTTGGGAAACGTCGTG:1 - chr3L 19696862 3' + copia 4845 1 56.55 TTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTAAAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTTATTTTTTGATTTATGAACCAGTAATATAAGAACAATGAGAAGGTGCCCAACTC:1 + chr4 453679 3' - mdg3 5093 1 65.75 ATTTATTTTATTTATATTTATTTATCTGGGCATAAGGGTATGTAAGGATCTCAAATGAAGTCAACCATATTTGCAAATTTCAGTTTTCCTAATTCTTTGTTTTAGTAAGTAAACCCTTGTTATTGGTTTTGAATGATTGTAAGCTC:4 + chr2L 14931233 3' - diver2 450 1 76.03 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACACGAAACATTGACCCAGTTAACTGGCTGCATTTAAATCATAAGCCCAAACTGGTTGGACAAGTAGTGCATGCTTATATTGGGTCTACGAGACTTCTGC:1 + chr2R 6964916 3' - Burdock 20 2 71.92 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAAAGAGTTGCAAGATCATCAGATAAATTTAAAAAAATAAACTATTTGTACGCACAATGAACTGAGCTTGGTGAACCGATCAAACAGTG:1 - chr3R 24368998 3' + roo 9038 1 56.16 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCAT:3 - chr2R 22034613 3' + copia 231 1 68.49 CAAATCAGAATAACTATGAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTGCTTCTCAACTAAAAAGTTTTGTAAACATTTAGTGAAATAAAAATATATATATACATATTTATATTTTATATTTATATATATAAAAATAT:1 - chr2L 23016165 3' + Idefix 455 2 72.60 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCC:1 + chr3R 23021005 3' - INE-1 580 1 41.78 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGGGGACAGGAACGGAACGAAACGGAACAGAACGTGCGTTGTCTTGTCGCAAAGTTTTTAAGACTTGCTT:1 - chr3L 17183972 3' + diver 6087 2 79.35 AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACATTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGT:1 + chr3L 13739651 3' - BS 5062 1 63.70 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGGAAAACAGAACAACAGTATGCTAAGTGTATTTTCGTTAAGATTCTAACAAACTTAAGAAGACCATGAA:1 - chr3L 9809240 3' - 412 7107 2 55.48 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGTGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATTTCTGATTCTGTGGAC:1 + chr2R 20802711 3' + mdg3 228 2 71.23 TTTATATTACTTAATTTGTAATTTAATTTAATTTGAGTGAACTTATCAGTTCAGTTAATGACCTAAGTATGGTATTAATAATATGCATTGTTGGAGCTCCATTATAGATCTCAACATATGTCATCCATACTACTTATAAGAACAAG:1 - chr3L 18125645 3' - gtwin 6956 2 67.81 TTAAAAGTAGGACGCTCATTATCCTGCTAATCACACTCCACACCCTCTACATCCTACATCCGCATTTATGCACACACACACATACATATCCATATATCCGCCATGTTTGTCGCAAATAATCTGATAGACGTGAAGATGGCTGGCAT:1 + chrX 6486006 3' - pogo 1719 1 78.77 ATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGACTATTTTTTTTTCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTA:1 + chr2R 13858881 3' + pogo 2023 1 71.72 GAATTGTTTTCGGCCCAAAAATCGTCTTCTAGGACAACACGCTCACATATACGTGTTCTTGTCTCTTGTTTTCACTCAATTCTAAAATCAAACACAACAGCACGAACAACTAGCCGAAACCATTCGTCAGATTCTGATCGAACAAC:1 - chr3L 27285818 3' + 1360 3183 1 53.42 GATGTAGTATATACGAACATAATAATAATAATAATAATAATAAATAAATAAAAAAATAATGTAGTAAGTGTTCGGGGGAGGTCTGCGATGTGACAATCTCTTGGAGTCGGACCATGTGACACATGTGTGTCCATTTGG:1 + chrX 7167707 3' + mdg1 7037 1 60.14 CCATGATAATGTCCTAGCACTAGGACTACAAGATGACACCAACAACCAATATTAAATACCCGTGTGTGTGTATGTGTGTTAGAAGTTATTCAAATTGAAATTGAACTCAAAATCAAAATCAGAGATTTCAGAGTGCACGAAACAGA:1 - chrX 6781541 3' + G3 4399 1 72.60 CACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACCACCCTTATAAGCGGGCTCTCG:1 + chr3L 3983863 3' + P-element 2794 1 21.53 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGGTTAGTATACCCTTTCATTAAATGGCTATCGAGAATAAAAAGTTGAACAAAGTTGGCCGAGGAGAACCCAATTTAAGTTGCTGTTGTTCAGCGGCTAGCAGCCGG:1 + chr2R 7090773 3' - I-element 7 1 78.99 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTA:1 - chrX 21087601 3' - mdg3 18 2 58.90 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTC:1 - chr3R 31886814 3' - hopper 36 1 62.33 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATTCAAT:1 + chr3R 19225125 3' + HMS-Beagle 7007 4 59.59 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATAATTACTTAAGACGCATATTCATTTTTTTCATTCTTCAAAAAACATTTTATTTTTTACA:1 + chr3R 5524003 3' - FB 59 1 59.72 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAATTTTCGTTGAT:1 + chr3R 15791018 3' + roo 398 1 68.22 AAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGACTTCGGGTCTTACGCGATGGATGCTGCTGTCGCGGGTGGTGGGCTCCTCCTCTGGGAAGCTCTCGAGGATCGCCTGCTCGTGG:1 - chr3R 17865235 3' - 297 157 2 71.30 TTACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCGGGCATAAATCGATAGAAATTTGTACGACTAATAAAATTTTTCTGCCTGTTACATACTCTTTAACGAATCTAATATACCCTTTTACTCTACTCAAATATCTCTATTTATGTTTTGCTT:1 - chr3R 3695999 3' - invader3 336 1 76.71 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATT:1 - chrX 8308423 3' - roo 8751 2 78.08 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTA:1 + chrX 5323156 3' + Juan 4185 1 32.88 TTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTTATTTAGTTTATATTCGATTTCGGGCAACGCTAGGCCCCAACAGAAATAA:1 + chr2L 19793537 3' - Idefix 390 2 65.75 CTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCTGCTTTAT:1 - chr2R 12185284 3' + accord 7355 2 63.01 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGGTTTTATTTT:1 + chr3R 12115344 3' + 1360 3321 1 68.66 AAAAATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCCCA:1 + chr2L 21794176 3' - invader1 57 2 60.27 TTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGC:1 - chr2R 18316021 3' - HMS-Beagle2 6927 2 53.24 TGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGATAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACCTAAAACTATGAAAAGGCAACCGTATGGGATAG:1 + chr3R 8180106 3' - rover 207 2 74.29 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTAATATTAAAAAGCTTAAGAGAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTTGAGTGGATTAGGATTAAGATTTAGAAGATCAGTCTGAGTCGG:1 + chr2L 22170082 3' + Juan 4188 1 62.33 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCTTTCACTTGAACGGTTGACCACATTCGTTA:1 + chr3R 17996263 3' + diver 161 2 60.69 GTTATTCCCACCAAAGGGTGAGATACTAGATATAAACAAGCACCATTGGTAAAAAGTAAAACAACTAAGCCATTTAAGAAAACAAATAAAGACACTTTACTAAAATACAATAAATAAAAAAATAATAACAAATAAATAAACAAAAA:1 - chr3R 1529339 3' + Quasimodo 206 2 57.53 GTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATCTGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGG:1 + chr2L 17005819 3' - Stalker2 46 2 52.41 ATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAAGTCCGAATGTCCATTCCGCACAGAATTTTATAGCAGACGACCGCAC:1 - chr3R 28042951 3' + Stalker2 7602 2 61.67 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAAGAAGAAGAAGAAGCTGCTCATTTCAAAGTTTTCTTCTTGTTCTTCCTTTTCTTCTTAAAGAAGAAGCAACTATTTTACGGCGTAAAGATTTTTGATTTACGGGACTTTT:1 - chrX 1341581 3' + 412 7536 2 75.34 TATTATTATTATTATTATTATTAAGTTATCCTATCTAACTTTAACGGATCGGTGACCTTTGACACAAAGAAACATCATCTCGTCGGTTCCTTTGTGGTGCAATTCTCAAACGAAACGATTACGGTCGGTAATCAAAACAACACCAG:1 - chrX 21933349 3' - mdg1 7069 10 75.34 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTACCGGAGTGGGT:1 - chr2L 3233970 3' - roo 77 2 70.55 CTCTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATGGCTGATGGGCTAATGGATGGGCGAGATGGCTTGGATGGAGTTGGATGGAGGGGGATCTACTTGGCCGCTCATTGGTTATGACTCG:1 - chr3R 10682941 3' - accord 258 2 71.67 CAATACACGATACATAATCACAATACACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTGACTAGCGCCCAAAATCAAACGGCTAAAATCGGCGACGACGAAAAAG:1 + chrX 14504612 3' - Stalker2 477 1 65.94 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTATTTACATTTAGCGAGGTATTTTTATCAGTTGCCATTTATTTGCCAGATGCTT:1 - chr3L 5389819 3' + roo 9055 2 74.66 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTAAT:1 - chr2L 16858667 3' + Burdock 226 2 65.75 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGATTCCTCTCCAATCCAGCCAGTTACG:1 + chr3R 13300933 3' + roo 322 2 73.29 CATTGGGAAATTTTGAAAATTAGACATTGCCATCCCTT:1 + chrX 19885000 3' + Bari2 395 1 78.95 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACA:3 - chr3R 14980330 3' + roo 325 2 73.29 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTT:1 - chr3L 3030199 3' + roo 9015 2 62.33 TTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGGGTTAA:1 + chr3L 2227519 3' + Cr1a 4333 1 60.96 GTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACCAATACTAAAATATAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCC:1 + chr2R 22989660 3' + hopper2 1517 1 73.97 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTT:1 + chr2L 11839723 3' + mdg1 7372 2 71.92 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGCTTTTAAAATCATGTTTAGTTAAGCAATGTATATTCTATTTACTT:1 - chr2L 18973737 3' - HMS-Beagle 30 2 67.86 AAGATCTCAAGAACTATAAAAGCTGAAGGGTTGAGTTGCGGTGTTGATGGGTTTCTTGGCCAAAATGGCATCGATGGAGAAGTTGCTCTTGAATTCCATTTCACTTTTCACCATTTTTCTGATTCGGATATCTTTAGATTTTTGTT:1 - chr2L 3825752 3' + INE-1 148 1 80.14 TGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTGTTTCA:1 - chr2L 20821161 3' + Burdock 6387 2 65.07 GCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGATCAACAAATTGACATTAATAAATGATAAAATGATTATAAGATATAAGGAAACTGA:1 + chr3R 10970331 3' - G-element 58 1 60.45 TTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTATATTTGTGTGTTTTTTTCTGCTTTTTTTAAAGTTTCGTTGACTGTTTCATTCGGCCGATCAGTCATTCTCGCGTCAATCTCTTCAAGTTTCCTGCTCTTATATA:1 - chrX 11513978 3' - Porto1 4477 1 60.00 GTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATT:1 - chr3R 19450061 3' - roo 8650 1 53.79 AAAATTAAAATTAAAAATCAAAAATTAAAAACTAAAACAATTGTTTCCTTTGAACTTCAATGTGAGGATTATAAAAGATTAAACAGAATGAACATTACATAGCTAGCTCTATTCATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATC:1 + chr2R 13121967 3' + P-element 2641 1 78.08 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATACCAAGTGTTAATAAATCGACTCGTAGTATATGAAAGCGAA:1 + chr2L 3675918 3' + Juan 4135 1 73.97 CATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCGAATCGCATATACCATATAGCCTGTAGTCACACTAACGCTTCAATATACACACACACAAAACTCACACACACACTTGCCAAAGGCCGTTTCGGGGCGTTGATTTCCGCTAACTGAAT:1 - chr3R 31139104 3' + Stalker 174 7 72.60 TTATAAATAATTGGTAAGACAAGCAACTCACTAACCATTTAATAAGACCATAATGATGACTCGAAAAAATCGATTTCATCTCTTCTTCTCTATGCGCACTGCGCACTTTCAAACGTCAAAGACCCAATAACGAGTTTTGTATTCAA:1 + chr3R 29304654 3' - Tc1 1485 1 60.96 AGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTT:1 + chr3R 21276640 3' + BS 5049 1 46.58 AAAATAATTTAAGCAGCTCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTC:1 + chr2R 8099194 3' + jockey 4935 1 72.57 TGAGAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATATAATTGTTCTAATCATC:2 - chrX 22901626 3' - 17.6 259 2 54.79 CCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCAAAAGTGTCATAAAAAATA:1 - chrX 4808479 3' - mdg3 5157 1 58.22 TACACACTTTTATTTTAATAAATAATTAATTTTCTTTTTGTCTTCAGTATTGTAATTAGAACTGTTTGTATGTTTTATCTCTTTTTTTTTTTGTAAAAAGTGTTT:1 - chr3L 19275158 3' + transib2 2626 1 80.00 AAAGAGTTAACCAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGAAATAACTTAAAATTACAAACACTGTTAGGAAATTCCAGCCCAGAACTTCAATACTCGCAGACAAGAACACACGCAAGCTTTTCCACCCGCTAACACT:1 - chr3L 4980667 3' + rover 472 1 48.97 CCTAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGT:1 - chr3L 19454952 3' - mdg1 88 2 75.34 ATACTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATCAACGAATCTAGTATACGCGTCTTTTGTTTTTCTTGTTTTTTTTTTTATTCTATTCAAACTAGTTTAAACAACGTGGGCTTTAAATGCCCATTAAGAAAGAAGCAAATA:1 + chrX 1819111 3' - INE-1 31 1 59.42 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCCCCTCTGCAGTGACCCTGGACGTGTTCCCAATTCTTAACCGCAAGC:1 + chr2L 20821333 3' - Burdock 6168 2 63.01 TATTTTATCAAATTCACAATGCATGAGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATAAGCAGAAAAGTATATAGAATTATATTTAGCATAAAAACTATTTTAATGCTAAATATCATTCAATGGAACATTAAATTTTATAGAAACA:1 - chr2L 22255040 3' - 1360 200 1 51.37 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATTAAAAGGTTCTTCCAACTGACTTAA:1 + chrX 21505715 3' + roo 8982 2 82.19 TTGCACTATGGGCACCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCTAGACTAGTGATTATGGGCGTGCGAAAGGCGATGAAGAAAGTAAGTGATTGAGTGAGTGTGAGTGGTTGTGTTTTAGCCATACCTAATTTCACCTCAATGACG:1 - 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chr2L 13585701 3' - Quasimodo 33 2 49.32 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCACGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTGGCTCTTCGTTTCATTCATG:1 - chrX 18282608 3' + P-element 2840 1 40.35 TTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGATAACAGGGGACGACCCTG:1 + chrX 7667781 3' - gypsy7 5005 2 67.50 CTAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAGAAAAATAAAATAAAAAGGCAAAGGGAAAAATGC:1 - chr3R 15825608 3' + I-element 4963 1 75.34 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCACTTGATAATATATTTTTTTACTGGAAGCCGTTTAAAATATTTCTGTGATGGATCAAACATTCAGTAT:1 + chr3R 20167686 3' - roo 8717 2 56.16 TTTTACTTTTATTATTTATTTATGTAAAAAGTTGGATTACAATTTGTTTTTCACAATTTTTGAGAAGACAATTTTTCTTATATACATGTATGTATCTTCGCTGTTGTCTAGCACAGTTTAGAACACGACGGATGTAAAAAAACGAC:2 - chr2L 21653181 3' - BS 5093 1 57.53 CTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTT:1 + chr3R 10736114 3' - 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Doc 46 1 56.16 GTTTTTGCACAGACAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAAAGAAGAAACCGAAAATGAAAAAAAAAACAAAAAGTAGCTAGGGCGAAAAGTGCAGCGACTTATGTACACACAATAATGCACCGAAATCACCAAATTT:1 - chr3L 25439377 3' - G3 10 1 71.94 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGGAATATCTGGAATTTATTACCTTTATATAATCTATTGCATTATCATAAAAATGTACTTTAATTTAAT:3 - chr3L 18046594 3' - roo 53 2 56.16 GTCACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAATTAC:1 - chr2L 7570112 3' - Rt1b 242 1 31.34 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGAGGATATTTGGTATGATATGTAGTTTGTTAGCAAAACATCCACA:1 - chr3L 19454920 3' - mdg1 7060 2 58.04 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAACTAGAGTTTAACGGGAAGTGTGAGTCCCGAAAATAGTTTTGTTATTATAATTGACCAATGACAAGTA:1 - chr3L 21974380 3' - GATE 8268 2 57.52 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGCCAAATTATTAAAGAATTCAGTACATTAAACCAATGACAATATGACAAAAGAAAAGCTTTATCACTATTGT:1 + chr2L 22674448 3' - mdg1 67 2 58.09 TTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACTTGTTTAAAGTTTTAAAAAGAAATAAAGTATTTCGTT:1 - chr2L 4003705 3' - mdg1 7120 2 74.66 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATT:4 - chr2L 20265940 3' + roo 9009 2 62.33 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCA:1 - chrX 21216707 3' + roo 9047 1 61.67 ATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCAATAAATATTCAAAGGTCAATAGAACTGAAATACGAAGAACCAAAACAAATATAT:1 + chr2R 22979714 3' + Quasimodo 21 2 65.52 TTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCAAAAGTGGCAGCAAAAACTTTAGGCACTGTCTGGTCAATGCACTGGGGAAAAAGGGAAA:1 - chrX 390703 3' + FB 409 1 55.05 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATGTGATAAAATAAAATAATTATTAAAAATTCACGC:1 + chr4 1267799 3' + 1360 3339 1 87.67 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATAATATAACTTAACTTAAGTCTATGATCATAAACTAAG:1 + chr2R 11804711 3' - 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chr3L 23287237 3' - 1360 69 1 68.84 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAAC:1 + chrX 661948 3' - 412 51 2 59.52 CTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGG:1 - chr3L 22723841 3' + HMS-Beagle2 247 2 60.96 ATTTTAAAGCTTTTTAATTTTGTTTGCTAAAATCGCCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTTTGCCGTAAACTTAATTTCCGCCTGACGACGCCGCGGCC:1 - chr3L 12250252 3' - 1360 3014 1 66.04 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATTACTTAAACTTTTCGTTCAAAAATCCCGTGTGCTGGAATTTAA:1 - chr3R 17996185 3' - diver 64 2 68.46 TAACAGATACCCGTTACTCAACTGGGGGCCAGCAGGGAACAAGATTTTCGGGACTCACAA:1 - chr3R 23891897 3' - INE-1 546 1 65.00 AAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTTATTA:7 + chr3R 21630336 3' + I-element 5280 1 69.18 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCA:1 + chr2R 11164499 3' - 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roo 8717 2 54.79 TATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCC:1 - chr3L 22760385 3' - F-element 165 1 72.60 GGTGTCAAGTTTTTTACCTACCAGTACAGCAATCACGACATCTATATTATTTAGCCCCAGCTAGGAGCATGTATTTTGCATGCCTCACCACCCAGCTCTGGGAAAGACGGATCCTTTGAAGACGCCATCGG:1 - chr3R 2724379 3' + Doc3-element 469 1 66.41 ATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTTCAGTGTGTCCAGTCTGACGATATCAGGGACCCCAAAAACTTTAAAACCAGTTAAGGATCA:1 - chrX 264172 3' - Chimpo 175 1 76.39 TAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTAGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTATGTATATACAACAAAGTTGAATTTATGGACCCAGTTAACAGTTTCCT:1 - chr3L 21821367 3' - Tc3 315 1 76.71 TTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTAATCATAATAAATGCACTTTC:1 - chr3R 9557502 3' - G2 3004 1 61.48 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGATGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACTGA:1 - 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Ivk 5123 1 63.37 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:2 - chr3R 29487012 3' + flea 4952 1 62.33 ATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCAGAGAAAGGGGCTGAGTTTGGTGGAGAAAGCTTGAGTGCATGTTAGATACGGACGGATACATGCAATTTGTGTGTTAATTACGCTACTACTTT:1 + chrX 10125136 3' - roo 9006 2 66.44 TTTTAATGGGAAATTTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCGCTTTTATTTCTTTAATAGTTTCGAAAACGACGTGTTCGCAGGCATATTTGACAAGTCTG:1 - chr2L 17522120 3' - HB 1556 1 75.00 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTAATGCCTTCTCTTCTTACGCCAAAA:1 + chr3L 12249914 3' + roo 9032 1 53.68 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGTCCTTGTGTCGATGTGGGGTCTCCGGACTTCTTCCAGGTAAAGTAGTTCA:1 + chr3R 5368677 3' - 1360 70 1 64.38 GCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGATTGGAGCAGAAAGGGAAATGCACTCACTTAAATGCAATAATGATGGCAGATATAGCCACATGCTGTTTGGTATTCAACGAAATTGACGTGTTTCATGACAA:1 - 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chr3L 24131397 3' - Transpac 63 2 65.07 TTGATCCTCATCAAGAATATATATACATTATATAGTCGGAAACGCTTACTTCTATTTGTTACATTTTGTAACTGTTTTTGGACTAAAGAGAAACGGGGATAATGAACGAAAATGAAATTAATGAAAAATTCAA:1 - chr4 1103273 3' - INE-1 82 1 63.16 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATACATTTTCTGTGTAGCGTATTTCTCTTGCTT:1 - chr3R 4682906 3' - Burdock 81 2 75.34 GTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGANTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTGGGTTTGTAGGAGGGATGGGAATGANNNNNATATGTGACTTATTGAAATATCACCTTGGCAA:1 - chr3L 23909058 3' - F-element 4579 1 58.22 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTT:1 - chrX 4341256 3' + roo 357 2 54.29 TAGAACTAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTGTGTGAATA:1 - chr3L 25008293 3' - 297 367 2 76.03 AACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACCTTTGGAGGAATGTAAATAGAAAGCATATGATGAACAGAAAAAAA:1 - chr3R 7418843 3' - 1360 3277 1 52.13 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGACTGGGATGGTCGTGGGGATCAGAAAAGAACAAATAATGCAGGAAAAATAAGCATACAGATGATTATAAATTGAATCTACTTCCTGAGCGAGCAAGAAGGAAA:1 + chrX 1799281 3' + invader4 3081 2 74.66 GTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAACCTATATCCTATAATATATACAATATATGTATTATATG:1 - chrX 5323255 3' - Juan 4130 1 73.29 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGCCATGTGGGCAAAGTGGGGCGGCTGGTGGGAAGGCCAGCTCGATAATGAAGCGAAGTTGGTTAAATTAGCACAGCATTCAATTATTCAGCTC:1 + chr2R 22034782 3' - copia 4898 2 64.38 GACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCGATTAATCCTGATCAAGAATAAAAATAC:1 - chrY 104334 3' - INE-1 549 1 61.64 TTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTGTGATGGACTGGATTTCGATTTTTTTTATCTTTTGAGAATGAAGCTAATCTATAATCTACAATAGCACATGAATTACATCTATCGATAGCAAGTGTTTATTCATATATGACAATATTTC:1 - chr3R 13975835 3' - 412 345 2 78.08 AATAAAAACTTTAGACATGTACCTATATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAACGAAATTATGCTGACGCACCCTGTATTAGGAATAACCTCCTTCATAACAAGTAAAACA:2 + chr3L 23071844 3' + mariner2 802 1 78.08 GTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCGGATCATTGCACTTGGCATGCGGCCGTTCTGGCCAAACTTTTCTCGCATTTCCACTCGCCTTT:1 - 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chrX 979247 3' + roo 93 2 65.07 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGGGCCAAACCGTCTTCAT:1 - chr2R 23180182 3' - roo 53 2 54.11 GGGCAAAAAAAACTAATTGGAGGGCAAACAGGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCGTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCTGACCCCAGCTTCTTTGCGCTGTTTAATTTACGATAAAATG:1 - chr3R 17673789 3' - FB 86 1 79.53 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGATACAGTATCTGCTAGTTCTAATTGGGTTAGTCTGTGGGCACATTGCCTTCCAGACCA:1 + chr2R 8099269 3' + jockey 4982 1 70.92 GGTTATCAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATCACTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGACCGCAAGTCATCAGAAATAATAGGTAAACGATTACGCCAAGTTTTCACGATAGCTTTCATATCGTGAAGTGAAT:1 + chr2R 5185855 3' + mariner2 196 1 52.86 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACGCACTAAATCACTTCACCAA:1 + chr3L 10373906 3' - 297 6622 2 61.82 TGTATTTACTTAAAACTAAAAAACAAAATAATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGGGCATCAACACCAATAGAAGTCTGGGGTAGTGAGTAAGAGCATTCTTTATTCGCAATGGAGGAAAAGCA:1 + chr3L 22182412 3' + rover 6819 1 66.44 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACT:1 + chr3R 15791009 3' + roo 349 2 60.27 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGTGTATCCATTTCCGTCTCCGGCTCCCTTTCATTGCGATTCGAAATCAGCTGCAGACTGCTGGCTGATCCGAGCCAGACTAAGCCAACCCCGCGGGCGG:1 - chrX 8308358 3' - roo 8686 2 70.55 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCTTGTCTTC:1 - chr3L 16690856 3' + I-element 5341 1 63.01 CTGTCTTTCTCAATAAGGACCATTATTTGTTTACGTGGGCGTGCTTTAAAGGCTCATTAATTTATCGTTGAGGTGAAGAGTTGCTTTTGTCAGTGAACTATATCATTTGTTTGGATTGGTGAAACTCATTGGATTGCAACTA:1 + chr2R 19587208 3' - Fw2 264 1 76.06 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGCAAAGTGGCATACCAGACAGTCTGACGCTGTTGGAGCCCACGAATGGCCCCAGTTCCCTCGGTAACGACCC:1 + chr3L 16211623 3' - transib2 39 1 57.66 TTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTAACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAGGTGTGATTTTTCACCTTACTTTACTTTTC:1 + chr2L 15550754 3' - Bari1 94 1 78.08 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTGCTGCGCCAC:1 + chr2R 8735695 3' - mdg1 7066 2 61.94 GACACTGAGACCCTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAACAATTTCACTAAATGGATTGAAGTGCACAAGTAAAACCATATATTTTAATATCAGTGTTTATTGGGTAAGTTAAAAACCACCAGTTGTCTTCGCAATTATTTT:1 - chr3R 4353459 3' + Tc3 1307 1 63.70 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTGAT:1 + chr2L 11357933 3' + blood 7338 1 52.74 AAAAAAGGGAGAATGCTATAGTCGACTTCCAAGGCTTTTTGATACTCAGCTAGTGGAAAAGCGATTGGGGAATAAAATGAGCAAATATTGAAAAATTGTTCAAAATTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGG:1 + chr3L 9208276 3' - INE-1 581 1 48.85 ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTATTCTGCTTTAAACTTGGTAGTTGACGTGCATCACAAAGATGTTGGGTATGGACATGAACTGCTCAAAGGCTTTAA:3 + chr2R 13259399 3' - mdg1 7083 2 52.05 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTTCATTCAAGTGGCTGCC:1 + chr3L 18126023 3' - Ivk 30 1 56.25 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAGCTATAATAATAATAATAATTATCTATTTTTAGTAGTATTCTGTATTGTGAATAGCTTACCGCATTTGCT:1 - chr3L 3030196 3' + roo 355 2 60.00 CTGTAGTGTATCTACCCTCACTTAACATTGAAAACAAAAAAAAATGCAAACACAAAACAAAATATACAAGAAATATTCTTAACAAAATGAAAAAAAATACCATAAATTGTGCGCTGGCGACGACGGTTG:1 + chrX 3342851 3' + Stalker2 7248 1 72.09 TATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTGCCAATTATTTATTTATTTATTTTAATACAATTTGTGACCTTTTTACA:1 - chr3R 24381318 3' - Juan 4182 1 66.90 ATAGTCGGATCAATACGATGAGCGATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATGAAATTATATTGAATTTTTTGTGTTTTATTCCCTGTTGTGATCATTTTGTAAGATCTTTAAATTCCGATTTATTACCACT:1 - chrX 12076935 3' + transib2 2347 1 57.53 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCAT:1 - chr3L 10731751 3' + 297 6934 2 55.48 AATATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATTATTATTATTATGCAGTGTTTCATTCGGGGATGCCATTATGCCACCAACAAAAATAATAATACCATATTTTCTTAATTCTTACCTGGAATGTGGCGCCCACTCGTTGGGT:1 - chrX 3783533 3' - mdg1 33 2 51.72 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTAATGGTAAAGTAATAA:1 - chr3L 22723818 3' + HMS-Beagle2 7153 2 60.96 GTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTAT:1 - chr3R 19450191 3' - roo 9041 1 55.17 AATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACTGTGTGTTTGAGCTTTCAGATTCAATCTCTATGCAAGCCGCTCGGATTTTCCT:1 + chr3R 19225155 3' + HMS-Beagle 238 2 77.40 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCGTTGAAGCCAACAGTATTGACTATTTTTATAGCCTATCTTATAGTTTATCAACTATTAACGGA:1 + chrX 12986636 3' - roo 8721 2 58.22 TGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCATAC:1 + chr3R 2526465 3' - gtwin 6958 2 56.85 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAAAAAAAATGTGAAGAAATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTGGGCTTGACAGTTTTGTGTGGTGTGTGGGCGTTAGAGTTTGCGTGGCAACACAATCAGTTTATCATACACGCTAGAAGTC:1 - chr2R 5122421 3' - INE-1 302 1 78.77 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACAAAAAGACTTTTTTTTCGTTGAAAAAT:1 + chr2L 14671884 3' - FB 67 1 84.03 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGAGTTGCCGAGGATTCTTTCAACCTCAACAGGTAATATGGAATATATATGATATATAATTTGTATACATTTGTTTCGATTTTGCCAGCAGAAAGCCAAAAATGGATTAT:1 - chr2L 13158590 3' + roo 397 1 76.03 CCCGTGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTATGGCGCATGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTATATTTAAATGATCTGCGACATATATATTCTTCTAAGAAAGTTAAACATAAAACACAACAAA:1 + chr3R 3953136 3' - invader1 112 2 70.55 AGGGATGCTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTGCTCTCCAGCTGTGAAGGATTTAAGATTGGCTTACTCAAACGT:1 + chr3R 17533212 3' + I-element 353 1 70.55 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACACCACTAGGTCCAAGGTTTAGCTTTGTTCGTGGGGATGGCTTAGATCAGGACGCTTGGCTGCCCAG:1 - chr3L 8453729 3' - FB 55 1 55.48 GTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGAC:1 + chr2L 20640282 3' + Stalker4 7222 4 57.33 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTATTTCCTGAGAAAT:1 - chr3R 29084842 3' + 412 477 2 69.66 AATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTGACATGAAAAAAATAATAATAATA:1 + chr2L 15622432 3' - micropia 34 2 54.69 ACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATGTACGTGCCCGTCTGGGATGGTCGTGGGGTTCAGAAAAGTACAAATAATACTTGAAAAATACCCAATCAACAACCGCACACA:1 - chr3L 5544235 3' + invader4 3049 2 43.84 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTTCATTGGTTCGACTATTTCTAAAGGTGGTCTTCCAATTAAAAAATGACCTGGTGTTAAAACTTCTT:1 - chr3R 19447733 3' + roo 352 2 54.11 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCCGTTTTAACAGCTTTC:1 - chrX 8437643 3' + P-element 2837 1 52.05 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCCAAACTTGCACAAGTTCATTTTACCCACTCACACAGACACGTGCT:1 - chr3R 31886799 3' - hopper 21 1 72.60 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTGGCCGCTTCGTATTTTCATGTTCATTTCCCTGTTTGCATAATGTTATTTTTTCTCTGTTTGCTTCGCTTTGT:1 - chr3R 21629622 3' + P-element 2860 1 50.00 TTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAACGCATACAGCCAGGCTAGAGATCCTGATTGAGATTCTGTATTGTTTATATGGTTGGTAGCGAGTACCAATATATTGTTTTTTTGTTTTTTGAGATTTCTATATCTATATGTGTTGATTGCAAG:1 - chr4 818789 3' - INE-1 155 1 69.86 GGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTG:1 - chr3L 27865989 3' - Max-element 8286 2 53.42 ACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACAACAAATTTTTTTATG:1 - chr3L 27356034 3' + Tc3 1683 1 77.40 TTTGTAAACTATTCTATCTATCACATTAAAAAAAAATTCCACATCGTAAGAGGATACAAAAGTAGCCTGCTTTCCAGCCGCGCCCCATTGCTTATTCAATTAAAGAACTCCTTCA:1 - chr3L 10426329 3' + I-element 5337 1 80.00 TTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTCAGCACATGTCTTATGTGGTCCTTGGGTTATTTACCTATTAATTTC:1 - chr2R 1749816 3' + Cr1a 150 1 60.27 TATAATTTAAGAAACTCTTTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAACTACAAAACAAACAAAATACAAAACCATACAGAAAGGCACATTCAATAGAGAGCAAAAGTTTTCGCGTGTC:1 - chrX 7002148 3' + mdg3 5029 1 55.48 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGAGGATCATGTAAACAGTGGAAG:1 + chr2R 6847885 3' - Doc 25 1 73.29 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTAGCAAATTGTTGTATATGGAATAATTCGAAATATTCGAGCCCGCAGTGAAATTAGCCAAATTAACACCTTGCTAAGTCTGGCTGGGCGTAACCCGGC:1 - chr3L 12315682 3' - transib2 15 1 72.86 ATAAACTGAGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAA:1 + chr3R 24506362 3' - INE-1 473 1 72.54 GGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTATGTTTCTTAAGCTCAAACAAACAGTTTCCTTTGAAATACAAAATAAAACCTGTTTTTGCGTTGGCACCTTTTTATTCGATTTGGTGGAAGTCTAGACCATATTGTGTTTCA:1 - chr2L 20821161 3' + Burdock 6388 2 65.52 ATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACT:1 + chrX 19980677 3' - X-element 4546 1 64.66 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGATTAGATAATAAAATAGAATAAATAGCCCGCGC:1 - chr3R 17077121 3' + roo 326 2 76.92 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATGTTCTACCCAACCGCCAGACGGCGAGACGATCACCAAGGCCCCCCGCCCTC:1 - chr3L 18402949 3' - P-element 45 1 54.79 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCACTATACAGATGCATTCAG:1 - chr3L 11913200 3' - BS 5066 1 66.44 ATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTAC:2 - chr3R 22590491 3' + rover 7226 2 69.18 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATG:1 + chr2R 330254 3' - HMS-Beagle2 23 2 68.49 AAGAAAAATTACAAAAAAAAAATATATTGGAATTTTTAAAAATGTGGACAGTACTCGATTGATTAAAAAAGCTAGGAAATTTGAAACAAAAGTGCAACGAACACAATGCTATGAAAATGTGAAGTTCTTATTAGCCAAACTATTTA:1 - chrX 17066400 3' + Doc 4694 1 63.70 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGC:2 - chr2R 15326820 3' + copia 249 1 56.85 AAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCGGAACTCTCCAGAGACCATAAATTCCAGGATGGAATATGAGTGCTAGAAAATTCAAGGAACAATTG:1 - chr3R 13565777 3' - Circe 416 1 75.47 ATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTT:2 - chrX 14722125 3' + diver 158 2 67.16 TTAAGAAAGGAATTATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTATAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATAGTCAGATGT:1 - chr2R 22034644 3' + copia 243 1 63.11 AGCTCTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGACTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAA:1 + chr3R 9039039 3' + Juan 4175 1 56.16 CAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACGATCGTAGGCGGTCGACAGCTGTTCTAAGAATAAGTTAATATGTCTGCAACCGATTTAATTATATATGTGCAATTTATAATCCTTTTGATTTGCCTTTTAGTTGC:1 - chr3R 11768253 3' + Idefix 7268 2 76.39 AATATTGTATGTACATATGTATGCACATCCTAACGCAATCATTAATTCATAAATCTTTGTAATGTTAAATATACTAGTGGTTTATATTTCTTACCAATTATTTAAATTTTTTCTATCGCAGACAATTTTACTGTTTTAGTTTTAGT:1 + chr2L 3506588 3' + invader3 5082 1 60.27 CAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACTCTCAAACCCAAGCACACCCACTGCCCACTACCACTTCCCGACTATGGGTTTT:1 + chr3R 11469399 3' + Tabor 418 2 61.64 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATT:1 + chrX 8027498 3' - Juan 52 1 51.37 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGCTAATTTAATGCCGGGCGGGCATAAATTATGCGCCCAAAAGTAGGCAGCGC:1 + chr3L 21763770 3' - jockey 75 1 63.38 TCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTTACCTTCTAACTTTTATACATACATACAACGTCTCTCTATCTATATATATATATATAT:3 + chr3L 16725550 3' - invader2 4828 1 62.33 AACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAATTTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTAAATTTGTTTGTAGACCTAAATTGTCTCATTTTAAATAGAAATTCAGT:1 - chr3R 1311426 3' + S-element 1485 1 73.97 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGTGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTTAAAGGACAGAT:1 - chr3R 6625702 3' + flea 4982 2 53.85 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTCTTTTAATTAGTGTTTAATTGAATTGCAAACTGGAATTTTAATCGAAAATTGCAGCGGGTCGACTTTTCCGC:1 + chr3R 6625268 3' + flea 229 2 62.30 TCAAGCTTTTCCTCCTTTTCTAGAACTGTCCCCTTCAGGAGGTATTAACTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTAAGCACGCTCAATTTCTTGGTCTTATTCATTATTGTGTTCACTTAAAGAAATATTAGTCACTTTGCAAAAGCAT:1 - chrX 16901199 3' + Gypsy12A_LTR 2018 1 75.34 GAAGTTATGTTGCCGCACCCTGTATTACTTATGTATATGCTTTTGGACAGCTGCTGTACAATCAGCCAAAAATCAGTCCCTGCTATTCGTCTCATTTAATTTACACCAATTACACCAATATAAACCTCCCGTCATCCTGGAAAACG:2 - chr2R 1780165 3' - mariner2 1 1 73.97 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGAATCTCCATTCTCCGACAATGTCAAGGATAGAAAAAGCCCCCCTTCTGCCACTTT:1 + chr2R 13766354 3' - roo 3 2 77.86 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTGAAACCCTGAATGCATTCTGCAATTGTAAAACTTAATTCGAAGTGCATTAAC:2 + chr2R 8047342 3' + 1360 3318 1 68.49 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCA:6 + chr2R 5674732 3' - S-element 74 1 65.75 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAA:4 + chr3L 11326775 3' - pogo 60 1 65.07 CGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTTTTCGGCGTCCACAATATATATTTACTAATTTGCAAATATATGTCAGACATTCATTTTATGATAGTTATTATTACTTCCTTATCAAACAACGCAAGAA:1 - chr3R 7819123 3' + invader3 5386 2 67.12 GGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTTTTTTATCCAAGTCTTGTGGATTTTCATTGTGTATGCAT:1 - chr3L 22706849 3' - I-element 5049 1 73.29 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTAT:1 - chr3R 556394 3' + Juan 4135 1 71.92 AGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTAACCCATGCTACCACGCCCACTCTAATGTTCTAAAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCACATTTTTAACCATTTTTCGATATTT:1 + chr3L 20554 3' - 1360 49 1 63.77 AGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGTATGTTTTCCAGATGTCTTTGCGCTGGGGAGCGGTTTGTGGAGTGCTGTGGTTTT:1 + chr2L 18753394 3' - I-element 5172 1 50.96 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATATCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTTAGTAGAACT:1 + chr3L 20898659 3' + roo 9044 1 67.12 TTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGCAGCCATAACTGTATTCCTCTGGCATGCCAATTTACCGTT:1 + chr3R 21630332 3' + I-element 5276 1 71.92 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAGAGGAATATATCGTATGATGTTAAAAAG:2 - chr2L 13556290 3' + transib2 2812 1 77.40 TGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAGACACATACATATAGTATTATAGTATTTTATAGCCTTGTTTTGTCTCACATATAAAACG:1 + chr2L 9010151 3' - G2 2740 1 59.59 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAA:1 - chr3R 15790830 3' - roo 47 2 51.03 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATATAATCGAATGCTTGCACAGCTGTTTCACGAAATGATGACTAGAACCAATATCATTACAAAGTTATGACC:1 + chr3R 23067541 3' + roo 9022 2 54.11 TGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATGAGACTGTTCTGGTTCCAGTTAATGTAGGTAC:1 - chr2R 3563117 3' + Transpac 5138 2 78.08 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGT:2 - chr2R 15326841 3' + copia 228 1 57.53 TTCTTAGACTTTAAATCTTTATTATTTTCATTCCGTATATGCTAGGCACAATTGTTTATTGAACAGAAAACCAACGGAAAAAAAAGAAGAAATCATTTTCCTTTTTGGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 1679933 3' + 1360 240 1 78.99 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGC:3 + chr3L 11326789 3' - pogo 46 1 55.48 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCAC:1 + chr3R 25709837 3' - hopper 77 1 75.97 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTCATCACAAGAGTAGCCCTGCGTTTAAATTTCAACAATGCATATTTTAAAATAAAAACATAAAGGGTAAAAGAGGAA:1 + chr2R 3563202 3' - Transpac 48 2 51.37 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAAGAAAAAACTACCTTTATAAAATAATATAAAATTAATTTGATTGCTGTGCAGCCTTTAACTTAAATATTGATTTTATTTTGTACATTTAC:2 - chrX 14304023 3' - roo 8695 2 55.86 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTGTTGGCCCAATTTATCCTCCTTTTGCTAGCCCCATGTTTCTCGCCAAAAAGAAGAACGGAAAGGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAAAATACCAGC:1 - chr2R 5501130 3' + mdg1 39 8 77.78 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCTACTCTTCGATGATAGGAAA:1 - chr3L 15913814 3' - jockey 4786 1 65.75 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGCCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGA:1 + chr3L 22400354 3' + 1360 3344 1 59.20 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGGTGATATCAGCGAGCTC:1 + chr3R 15791030 3' + roo 9053 2 66.93 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGTAAAGACATTCTGGCTTAAAAGATTTTGTTGATTAACAAGGTGAATAAACTT:2 + chr3L 16033418 3' - Doc 74 1 65.07 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAA:2 - chr2L 4123854 3' - transib2 63 1 61.64 AAAAAAAAAAGGAAAAACACAAAAGGCGAGCGCAAAGTTTTTCGGCTTCGCAGG:1 - chr3R 27827324 3' + Doc2-element 233 1 92.59 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTACTTTGCGGCTGCTCGGCTTTTGAGTGCTCGCTCTTGGGTAATTTATCAAGAAAGCGGAGGCCAATTATATGGCTTAA:1 + chr2L 7593152 3' - jockey 4721 1 52.74 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCACAATAAATAAATAAATAAATATTAAATTTTAGTCAAGTGGACGCGGGAGAGCTTCTAGTAAAAGCCAGATGCCAGCACGAAATGGAAACTTATAG:2 + chr3L 10425899 3' + I-element 5309 1 50.68 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGACGCGCTTTAATTA:1 + chrX 7795607 3' + roo 342 2 60.69 GAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAATGAAATTAAAGCTGCTTAGCATTGCGGGGAAGCGAAGATCCTAAAGTCCTAAGT:1 + chr3R 29965878 3' + flea 435 1 63.01 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGAAAACTGTTATACGTTGCAGGACAAGGCAAATGTTAATAACAGCCAGCTGATGTTAATATTTT:1 - 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chr3L 15745906 3' - Ivk 4948 1 75.34 GATCATATAACTATCTTATTCTTATATTTGGAAGTTCGAGGGTGGGTTGTCGTATCTAACGACGGGGTAGTTCTT:1 + chr3L 24238930 3' - Idefix 6934 2 74.67 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGG:3 - chrX 19074715 3' - mdg1 7049 2 72.60 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTCGACCATACGGTACGGAAATCTTTTCAATTGGGTGTGTATGCTGACATAGGCTAATTGCCAGTGGGCGAAAAATGTG:1 - chr2R 13168631 3' + P-element 2852 1 59.85 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCGGAAGATTTGGCATATGAACG:1 + chr3L 10373887 3' - 297 18 2 66.18 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTAGTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGC:1 + chr2R 11159356 3' + roo 359 2 54.68 AGCAGCCAAAAATGATTTGTTGCTGGTTTTAATATCCGAACCAGTGATGACTTAGCAAAGGGTAAAAATCTAAATTACTGTTGTGATGCTTGCCTTGTGGTTGCGAACTAGATGATATTTGCTGCAAGAATGAGACGGGGCTTAGT:1 + chr3R 24203552 3' + Cr1a 493 1 78.77 GGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAAAAAATGTATACAATGACAGATGTGCGATCATAAAAGTCGGAATATTCTCTTGTACTTTTTAACATTAAAATTCCCTTCTCTTTTAAGGAACAATTTACAAT:1 - chr3R 18971653 3' + Juan 4206 1 70.55 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAA:2 - chr2R 7244794 3' - diver 5931 2 55.48 TCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCCGCTGATGACCACTGCTTCGCTGCCGACGCCGTGGATGTCAGCCCGGAGGGTGAGCTGCGCTACTATCGCCATCCCCAGACCTGCA:1 - chr2L 5762862 3' + HMS-Beagle2 6979 2 62.33 ACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGCGATTTTACGATA:1 - chr2L 19817740 3' + G4 3828 1 47.95 CTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCCGCAGCCGCTTTGCCACTCGGCCGCCGCCGCAG:1 + chr2L 12822850 3' - P-element 73 1 30.91 ATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGATGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGTTTGGTATGTTTTGGAAGTGTTTTTGACAATGTTGGGTGATCTTGGTCTGCCGGCACAGATCCTCGCGGG:1 - chr3R 25867386 3' - I-element 290 1 72.60 AATAACTAAAATTCATAATTTATAAAAGTCCAAAAATATTTTATTTTGATTTATACAAAATAGTACTTAACTTTTGGCCCTAAGTAGATCTGTTATGGATTTTCTCCGATTTTCGAGTGTCGACTGTACTTCTCTCT:1 - 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chrX 2424768 3' + G5A 2743 1 54.79 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCA:2 + chrX 8027507 3' - Juan 43 1 45.21 GTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAA:1 + chrX 10521729 3' + Tabor 423 2 58.90 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCT:2 - chr3R 4461010 3' - blood 52 2 55.48 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGC:1 - chr2L 18212133 3' - Quasimodo 78 2 74.66 AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAG:1 - chrX 20453680 3' - INE-1 542 1 79.45 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCGTAATTTTACCTCCAGCAGTCCCACTTCTCAGTCCACAATTTCTGTTTGTACGCCGGTAGCCACATGAATACAA:1 + chr2R 18439465 3' + roo 9026 1 50.68 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTTGACTACAATTTATGCACGTGTGTGAGGGCACGAGTGAGTGAGTGTGGGTGG:1 - chr3R 26404998 3' - hobo 56 1 60.90 AAGAAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATTATACATAAATTAAAGTACAACGGTATATTCTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 20715488 3' + baggins 5221 1 51.81 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATCGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCT:1 + chrX 7795600 3' + roo 8998 2 68.49 AGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAATAAATGT:4 + chr2R 12185472 3' - accord 7 2 78.08 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAGTGGGAGTTTTAGGTCAGCAAGAAAATATTCCTT:1 + chr2R 22992567 3' - hobo 11 1 68.07 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTCACACTCACTTTAAGTGGATAATATGCGAGGTAATATAATCAAATGAATTGTGAGAATGCTCTCGGAAATTTC:1 - chrX 4341255 3' + roo 9016 2 54.11 GGGCGTCAGACACGACGGTGAATGCATATGCATTGTTCCGGTGCAAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGCTCTTTTTGCCGCTGGGCGCGTAATTCGCGTTGGCTCATTTTAATCGCTGGGGAAGATTTAAAGGGGATTTCC:1 - chr3R 23718931 3' - Doc3-element 302 1 77.14 TTAGAAGATTATAATTAAGTAAGTTTTATGTGAAGTCTCGGTTAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTCAATCTTCTTCTCGTTATTCTCCGACGGCGATGGTGGGTCAGCAGGTCTGCAAGGTGAGTCATAAGACGGACCC:1 - chr3R 23490136 3' - jockey2 3225 1 65.97 ATCGGATTGCAAATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTTAGTTTAGCGGCAATGTATATTTCATCATTAATTTATTGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCAT:1 - chr3L 27356067 3' + Tc3 1668 1 53.12 ACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAA:1 + chr3R 4682971 3' + Burdock 178 2 76.03 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGAT:1 - chrX 18336580 3' + mdg3 5493 2 73.33 CTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGCACAAGGACATTTCGCGCCATTTGGACTTACCATCCGACCCAAAACGAACGATGGCAAGCACTTGACAGCTGCACTATAGTCAGTCTTGCGTCTTCAAGTCCC:1 + chr2L 14318532 3' + Q-element 571 2 53.24 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGCACAGATAAGGTTTAATGGTTACCTTCTAAAAACTGTACAGTTTATTAAATCTTATCTTTTTGATAAATAAATGTTAGCATA:1 - chr3R 14980288 3' + roo 9032 1 57.93 GTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTGGACGGGGTGCAGAAAAACTTTGTTCACCAAATG:1 - chr3L 13123244 3' - HMS-Beagle2 6925 2 68.52 CAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGTTTGAGCCGCAATCAATCGCCATTCGAACTTTGAACTGTAAAACCCAGCGGAATTAGTC:1 - chr3R 5117593 3' + I-element 238 1 59.59 AAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTCCATTTTCCCATTTTCCATTTTCCCATTTTCCAGTTTCCCATTTTCCCATTTCCATCTCGCTTCAATTTGTGTGCTAACTTTTACTCCGCTCCATTTTACGTTAACTAGTTTGTTTTGGT:1 + chrX 15948029 3' + invader3 5446 2 80.82 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGG:1 - chr2L 13556324 3' + transib2 2778 1 54.11 GAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGTGGGGTAGCTTAAATTTTATTTATGGC:1 - chr2L 2527662 3' - hopper 28 1 63.64 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCT:2 + chr2L 18226857 3' - roo 8742 2 71.92 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGGTGCAAATGACATAAATAATAAA:1 + chr3L 16470347 3' - jockey 4751 1 71.72 ATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCAAGGCAAGGCAAATCGAATCAATCATCAAATCAGTGGGATGGGGTACTGCTTTT:1 + chrX 5106201 3' + gypsy12 10018 2 51.82 GAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAA:1 + chr2L 1924041 3' - G2 2995 1 64.38 ATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATAC:1 + chr3L 14720892 3' - F-element 92 1 69.18 AACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGTTGACCCTAAGAACACAGTTTACAGGGCCATAAAGGCAGCGAAAGTTTGTTTTTGAAATCCAGGTTTAGAGAATTCCTTAAGCGGGTGAAAAATGTGAAAACAATCAGTG:1 + chr2L 22000993 3' + INE-1 142 1 60.27 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTAATCTTTACAAACTCTGGCGCTGACAGCCTTCACTTGAAC:1 + chr3R 17996245 3' + diver 148 2 71.43 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTCATCATTTCATATTATATCATTTCATATAAGTTTAAGTTTATACCTAAAG:1 - chrX 19539485 3' - pogo 65 1 65.07 TATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTGTTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTATTTTAACTTTGCTTTTTTGCTTTGCTGGTGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 + chr4 1294989 3' - TAHRE 67 1 48.63 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAA:3 - chr2R 5674650 3' - S-element 74 1 71.23 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGCATAAAGCTTGTTTGTTGGTGCATTAAATTTGAATATAATAATGGCGAACATATTTTGTTGCATGTCCTA:1 - chr3R 27986334 3' + roo 358 2 53.42 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGACATCGAAATGGATGCACTGCACTCCGCAAATCCCATCTGCCGGGCATATATACGAATGGGCACGCGTGCATGTGTCTGAATGGGATGGAGATAGATGGATGA:1 + chrX 9950651 3' - jockey 4690 1 65.03 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGT:3 - chr3R 6419850 3' + Tabor 416 2 67.81 CAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTATATTATTACA:1 + chr2R 12253313 3' - BS 4713 1 69.86 GAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGACGCAGACAAGGAGCAAGAGCGAGAGAAGGCAAAGGAGAAAGCGAACGAAGAGGAGACCGAGGATTCC:1 + chr3R 11372564 3' - HB 43 1 58.87 AGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTATGGCATGGTGTGGTGTTGTGACTCTGGAATGGAATGGAATGGAATAAATTGGTGGTTCGAAGTGGCTGAAAACCCAAGACAGCTGTTGCCCC:1 + chr3R 9155185 3' - mdg1 332 2 65.75 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAACTCTTAGTTTACGAACACGAAAAACAACAACAACAAGG:1 + chr3L 6964803 3' - P-element 81 1 30.14 TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACGCCTCATTTACGGGTGTTTACTGAGTCAGATTCGCCCTTTGAAGCCCG:2 - chr3R 27771285 3' - mdg1 7114 2 67.12 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACACTGTAACGGGTATCTGCAAGTCGGG:1 - chrX 19714213 3' + 1360 3358 1 69.41 AGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATTGCCTCGGCCATAGTTTCCGCTGTTGTTTACCTAGCTAAGTTTTCTCCTATCTATCTTTTTTTTTCTTTCCAGGCTTTTCTGTCATGCAAACTTTC:1 + chr2R 11428319 3' + Doc2-element 4716 1 66.44 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTAACCATGACGTGTTCCTTGTAACAGCCCAT:1 - chr2R 7090663 3' + I-element 5267 1 76.71 TTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAATAAAATGAACTTCTATATATGAAAAGAGAAAAATATACGAGAGATACAATTTCAACCAGCTTTTGCAATACT:1 - chr3R 21783381 3' + transib2 421 1 54.11 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGT:1 - chr3R 4805631 3' + 1360 3302 1 75.34 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGACGTTTTTTCAACCCGTCA:1 - chr2L 22193403 3' - roo 48 2 53.42 GGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATC:1 + chr2L 1924032 3' - G2 2998 1 60.71 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGAGCAAAAAAGTATGATATAC:1 + chr2R 21681412 3' - roo 8717 2 54.79 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGG:1 - chr3L 10373845 3' + 297 6898 2 80.29 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCC:1 - chrX 8027438 3' + Juan 4134 1 72.60 CTGTTACATACTTTTCAACGAATGTTTCATACCATTTTCCTCTATACACCCAGCTTTGATATAATCCTATACTTTAACTATTAAATAATATGTAGAGTGCAAGGCATTTACTATGTTTCCATATTAACAAGACCCACTGTGCCACT:1 + chr3R 22352175 3' - INE-1 17 1 73.29 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACACTGTTTTATTTATTTGGGTAGACTGAAAGTTCACCTCACATCGCTGTAATAA:1 + chr2L 9038267 3' - I-element 33 1 49.52 GGTCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAATCAATCCAGTCCCGTAGTTGAATAGTCTTTCCGTCTAGATTCCTAATGAACTTTATGGGGAAATAGAGAGATTCTTTGACAAACTGACCTATCGCGTGGTCTCTTC:1 - chr3L 20965996 3' - blood 406 1 55.56 GGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAATAACAACCATATAAAATGTGCATAATGGAATATAG:1 + chrX 12543964 3' - FB 485 1 75.86 ATGAACGTCGAGATCTCATAAAAGCTAGAAGGTCGCGATTCAGCATACATCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCACGAAAGCCAATTCGCATTTGGTAACAACTAAAAAGCACAAGGACTTGCCTGATTTCCCATTTCATATC:1 - chr3R 8392182 3' + INE-1 139 1 52.05 GGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGACCACCCAAGATAAATGTGCTAGTTCCAAAGATCTTAATTAATGCAATCGAGCACGTAACG:1 - chrX 15395779 3' - jockey 4594 1 58.90 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTT:1 + chr2L 14074522 3' - 297 40 2 71.72 CATATACAAACACACACACACACTCACACACTCACACTCACACACTCACACTCACACACACACACAGCTCACTTGGCTATGCAAACAGCTTTCCCTGCAGAAAGTAGCCATTCAAAATGATTCCTATTTCCGTGACTTGTTCTGGT:1 - chr2R 10460518 3' + Quasimodo 30 2 77.40 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATT:1 - chrX 13134894 3' - jockey 4827 1 61.64 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAGTCACGCAGTC:1 + chr2L 16943887 3' + copia 218 2 64.38 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTC:1 + chrX 8308508 3' + roo 357 2 54.79 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTC:1 + chr3R 15364044 3' + flea 4980 2 60.27 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACTGCCATGGTGGAATTC:1 + chr2R 12472127 3' - transib2 55 1 54.79 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTTTTTCGGT:1 + chr3R 9595082 3' - Tirant 10 2 59.15 ATTTAAACGAATCTGAATATCTAAGTTATTTACAAAGATTATATGATTATGAGTATTCAAGAAGTGGAATGTGAGGCTATAATATTTAGAAAATATATCAATATTTAAATACGAGTAAAAAAATCAAAATATAATTTAAAAAAGAT:1 - chr4 626739 3' - jockey2 3311 1 62.33 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCAATGGCAAATA:1 + chr3R 23295606 3' + P-element 2857 1 36.30 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGGTC:1 - chrX 14722124 3' + diver 147 2 68.49 TTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCTTCACCTTTTATCCTAGGTGTTCCTGGTTATCTCAAAAAC:1 - chrX 6116205 3' - transib2 21 2 68.49 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAAC:3 - chr2R 7244796 3' - diver 5933 2 54.11 AGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGATTAAAAATATTCTTTACTTTATGTACAACTTGCAGATGTTTTGGGATTACTTAGAAATACGTT:1 - chrX 9303063 3' + Cr1a 4160 1 56.85 GATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGTGCAATTTGCAATTTGCACGAAAAACCTGGCAAAATGAATATTGTTTTTAATATTTATGATATTCGATTTGGCATGATTTAT:1 - chr2L 2595998 3' + 412 257 2 49.32 AATAACAAAATATTTAAATTTATTTAATATTATTTAATATTTATTAATATTTATTTAAAAGTATAACAATTTCTTTAAGTGTTTCTATGGACGAGCTCAATGCAGTAGTTACATGACAGCGAAACATGGACAGTAATGAGTGGAAA:2 + chr2L 17057003 3' + TART-A 13174 1 74.66 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGA:1 - chr2R 5070916 3' - Tirant 10 4 27.40 GAGCCCTAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACTTAGTCGGTGGTTTATTTTTGGCATT:1 - chr2L 22193451 3' - roo 8692 2 66.67 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATGAACGCTTTGGGTTAGGAAACTTACAACAATTATTACGT:3 + chr2L 11257138 3' - rover 6986 2 62.33 AATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTTTGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCCCAAATAAACTAATAACTATTAAATAAGAA:1 - chr3L 17245006 3' + HB 1583 1 45.22 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCCTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCTCTCTCAGGACAGACTCTCTGGCGCTCTCTTTATCTTAGGAGCTGTGTC:1 + chr2R 18514989 3' - P-element 25 1 60.80 CAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATACCAATGTGTATTTCAAA:1 + chr3L 11257430 3' + 1360 19 1 53.47 AAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTT:1 + chr2R 2875229 3' + TLD2_LTR 126 1 78.26 TACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCCTCGAGTCAGAAAATAATAAAAAGAAATTTGCACACAAATATCTGGGAATCCAAAGTGCAATATTTGCCAGACATGCAAA:1 + chr3R 13931833 3' + accord 6961 2 58.90 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCA:1 + chr2R 330237 3' - HMS-Beagle2 40 2 56.85 GCTAACGTCTTAGTTTAGGCAAAATCTAACCAAAGTGTTCGTCTATTGTGGAGTGAGAAATGATTTGTGCCAAAAACTAATAACTGAAGAGTTTACTCAAAACAAACAGCTCGGCCAAGAGCCATCCTAAACGACAGGCGGTG:1 - chr3R 29212038 3' + transib3 360 1 72.03 CTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACGCTTAATTAGATGGCTGCTCGTCTCCATTCGGCCTCAAGGAATTATCATCATCTTC:1 - chr2R 12084441 3' + roo 232 2 61.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACAGTTACCCAGCAGCGAGGCCGTTCCACTTAGCCAGTCGGTGATGTCAGCTTCGTTTCTGGATAGCCATTCGATGTTGGACTTGATGGTTTCCACGGCC:1 - chr3R 13302120 3' + roo 9043 1 59.59 AGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGTGTTTT:1 + chr2L 19616737 3' - diver 5951 2 61.43 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATT:1 + chr3L 21380602 3' - I-element 36 1 60.00 ATAATATATAATAATAATTATTCAATAATAAATGTAAAGCAAAACAAAAATAAGAAAATAACCAGCAAGGCAGAGCAAGTGAAACGGACAGAAAAAACTTTCATTTTCAATGTCAAGCAACAATAAAAACGTCTGCCGGTTGGGGG:1 - chr3L 15099324 3' + Tc3 256 1 76.03 TTTAGACATGATAAGTAGGTAAACTATAAATAAGTTCTATTTATGGGCTGCAATAAACATGTCACTAGACAGCATAAGTGGCAACTACATACAAGTACGATTGCAGCCCATAAATAGAACTTATTTATAGTTTACCTACTTATCAT:1 - chr2L 13476689 3' + rooA 7250 2 71.92 GACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATTTTTTATGAGCGCCTAATAGTATGCAGTATGTATTACGTATACGCCCCATTTTGTAGTGTCAAGGTGTTCGACGCTCGCAG:1 + chr3R 24450545 3' + 412 7511 2 59.03 GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAAT:1 + chr3R 15364001 3' + flea 4937 1 71.92 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTT:1 - chr3L 14366551 3' + roo 326 2 76.71 ATATAATATTTAAATAAATACATTAATATTTTACCTACTTTCTGTAAGTATACGTGTAAAAATACATTATTAAATTAGTGAGTATTTATACAAAAAAAATAGGTAACAGCCCTCTTTTCCACCTTGGCCATCGGCAACAAAGAAAA:1 + chr2L 14245057 3' + transib1 1935 1 47.26 ACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAG:1 - chr3L 25482916 3' - accord 59 2 74.56 AGGTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCAGACAAATTACATTTTGGGCTCATTAAAATG:1 - chr3R 16518835 3' - Tirant 8121 2 77.40 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCACCGGAACGAGCTACTGACA:1 + chr3R 11937440 3' + flea 4990 2 71.92 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGTCAAGTCGGTAAGAGGAAATACCTTCTCTTTAACGTATTTCC:1 - chr3R 15942714 3' - hopper 55 1 61.90 CTATTGAAGAAATAAAAGTGAAACATTTGTTGAGTTGTTTGAAGATATATATTATGATATGATTTGACTTACATGACTTACATTAAAACCCCCAGCATTTTTACCTCTTCCGACTCCACACTCCCACCGGCGGAACTTG:1 + chr3R 19577917 3' + HB 1491 1 64.03 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGCACGCACACCCACAAGAATTTCTCATTTGCGGCGCAGCCATTTTTAT:1 - chr3L 22325820 3' + hobo 2913 1 53.68 GTTAAAACTGTATTTTAAAGGAGCTGTGCAAAAATATTGCTTAATATTCAATAGGGAATACCTTATTTTGTATTCTTGCTTTTATAATTGGTAGTAAAAACTCTAAACTTCAATTTTAGATTAAAGATTTGTATTCGCATCCCTT:1 + chr2L 11488015 3' - FB 970 2 75.17 TTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTT:1 - chr2R 5410955 3' + Tc1 1403 1 53.33 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGCATACATAAAAGGCTAAAAG:1 - chr2L 13556317 3' + transib2 2790 1 60.99 GATAAGAAAAGTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCAATTTTGGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGACGCG:1 - chr2L 22329005 3' + invader2 4749 1 48.21 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTGATTAAATGCATTAAATATGTAAACAGTAACACTTGATTGAGTTTTTTTATTGGTTTCAAAATTAGCCTTTACAGCTATCTTTTTGCTAGCTAAATTGTTAAGA:1 + chrX 9410618 3' + I-element 5339 1 71.92 CATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACAGTTCTAAGTGAATCCTTAGCAGAAATGGATAGGCTGGCGACGTGGAGGCTTCATAATATTTCAAACAAGTACAAATACCTATCCACCGGAAAC:1 + chr2L 20640334 3' + Stalker 247 4 65.07 ATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCCGCAACGCCCTGCGTGTTGTTTATTATGCTCATTAATTTTCGCCGCTGTCGCTTG:1 - chr2L 12574150 3' + TAHRE 10389 1 52.50 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTTTATATGCATAATGATAATAAAAAA:1 + chr3R 30675411 3' - 297 14 2 71.67 CTTCAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATGGCAGACAACTGTATGTGTGCACATGTATGCTCGTGCATTGTAAATTTGACTGAAGCTGCTGGTTATTTTATTTCGTGTGCCTGGCATACAAAAGCAGCAACAATAAACT:2 + chr3L 7098841 3' + 1360 129 1 60.27 AAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCAAAGCACGACTGAATATCAATTAGCGGGCCATTATTACCACTAAATGTTTGATTAAAAAATCTAACATTTTGTATGAAAGATTTTATACCTTGAAATATTCAAAGACTTATTCTTCGT:3 + chr3L 3544412 3' + Doc2-element 220 1 41.78 CCATAAGCACATTGCGTGTTTGTCCCAGCGATTCTCTATTTTCTGACACTTTATTATAATATTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTCTTAAGAACTCGAAAACCGTGGCACCGATTTTGCGATCTCAATTCGAAATTGTA:1 - chr4 473911 3' - Tc1 1620 1 61.64 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGCAAGTATGCAATAAAATTGCGTTCAATGTAATTTATTATTTCGGTGGCCACTTCCCTG:1 - chr3R 15882541 3' - jockey 26 1 67.81 CACGCTGAGAAATTTAGATTTAGAGATAGAGATATAGTGAGAGCGAAAAAGGCAGTCTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACGACGCACAATCTGTATGGAAATTAGCAATGATTTTTACATTGGCATGAC:1 - chr3R 3345242 3' - Cr1a 325 1 72.60 ATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTGGATGCGTATACCCATTGCATTGGAAATCGTCTTGTGGCACCCTGGTCTT:1 - chr3R 13558441 3' - I-element 255 1 65.75 ATTGTANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCTGGTTATTCCATGTTGCAGGACATGTTGCG:1 + chr3R 24369167 3' - roo 8683 2 72.22 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTCCCATTCGGAATACACCATTCTACTCTTTATACAA:1 - chr3L 16662353 3' + jockey 4958 1 58.90 TATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATTTATGATGC:2 - chr3L 11257270 3' - 1360 15 1 75.34 TTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAATACCAGAATTATACTTAATTATTATTTCAACTCCTGGTTCTGTTTAAAAGTCCACCTTCACTCATGGTCAATTACGAAGAGTACACAAACATAACATCGGTAGTCAAAATCATA:1 - chr3L 12781372 3' - Tc1-2 433 1 61.64 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCAACCATGTTTTCATATAACTTTGCTTTTATTTTTGCCCATTTTTTATGTTCACG:1 - chr3L 7889562 3' - roo 65 2 69.18 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACAGTTGTGAACAGTGAAAGGACGCGAACTATATACTCAGCCCTCCATTTTAAAACGCATTTAGCTATTAATTTGGATATTTACAAAGAAACTTCTTTCCCTATTTATAAA:1 + chr2L 17005854 3' - Stalker2 12 2 76.03 TTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCA:2 + chr3R 24729639 3' - Juan 4165 1 76.71 AATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAACTCAACTGTTCAACTGCTCCCAGTGAGAGTCCGTTGTGGCATGCCATTTTCCGAGGGCATTGAACATGACATTTAACGATTGCCCATTGATAAGG:1 - chr3R 11001350 3' - 1360 3100 1 65.07 AAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTTGTTTCTAT:1 + chr3R 11040177 3' - Bari1 43 1 56.85 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATG:1 - chr3L 5532942 3' + roo 8997 2 71.92 ATAGTTCCTTAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGATCTATATGGTCGGAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAACACAGTTGTGGTTTTTTTTATATTGTTAAACGTTTTTAT:1 + chrX 22905692 3' - INE-1 143 1 54.11 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGT:1 - chr2R 20227219 3' + hopper 1405 2 58.51 TATATGTATGTATATATACTATATATATTTTAATATATGTGTAGAAAAAGAAGACAACAAACTAATAAGGAAAACCCAACTGGAAAACAATTATTATGTTAAACTAAACAATAAAAACATAAGAGGAAGGCGAAACAATTTTTTAT:1 + chrX 5403972 3' + 1731 4412 1 63.70 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTTAAAGTTTGTACAGCATGCACACAATATAATAGATTTTCCAACCAATACGCTTAATCATGTGCTAGTAAGTTAATAATTTAACACTTCCGTGCGTTTGTTC:1 + chr2L 15076246 3' - 1360 20 1 71.92 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGCCA:1 + chr3R 16630377 3' - FB 45 1 54.79 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCCCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAACTGAAGACTGATTTTCTTTCTGGCCCTACAACGGCACACTGTGGGGAAATTAATTTCTGTTTCCCAAGAGATTTTAAGT:1 - chr2R 6885483 3' + P-element 2848 1 60.27 CAGGATCAATAGCCGAGTCGACCTGGCTGTGTCCGTCGGTCCGTATAAACGTCGAAATATCAGGGAAGAGGAACGCTGTTATCTGATAGTCCGGGAACTAGAAGCATTTCGGTTGGATCCTAAAGCTTTAAAA:1 + chrX 722111 3' + INE-1 95 1 59.40 TGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGAGCGTGGCAAAAAGGTTTTTGGCATATTTATAGAAATTTACAAGACT:1 + chrX 22586088 3' - INE-1 535 1 39.73 TTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAGACAAAGCTTAGAAATAGTAATAGACAAATCATCACAAAGATATTATTCGTCTGATTGTGTTGTT:1 + chrX 22218746 3' + 1360 249 1 79.45 AGAAAAAAAAAAACTATTAAAGAAGTTACCTTGTGGCAAAGAACAAGGGGAAAAAAATGTAAAAAAAAAAATAGAAGCGAAGTGAACTGAGGGACATGGACACGAAACTAAACTGACACTTCAAACGACACCAGC:1 - chrX 8826802 3' - FB 879 1 72.59 GTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGGTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTT:1 + chr2R 12185398 3' - accord 48 2 64.60 GCTATTACTTCGATTACTAATTTTCATTCAGTTTGTTATTGTTCTCCAAGGAATGCGACCGCCGCTTGGGGCTAGAAATCGGTTTCGATTTGACCGGGCCAACTGTCAACGAGACTCAATCCGCAATCCGCCAATCCAG:1 + chr2R 18887940 3' - Doc 4434 1 79.14 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTATCACCTGGCCTGTCCCATTACCATTAATCGACAGCGCCTTGATGAAGTGCTTGGCTCGTTATCGCTTTATCGTTATCGAA:1 - chr2R 13931509 3' + P-element 2849 1 60.27 AGATAAAGGGTGACTTGTTTGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATTTTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTTTTTGTGTGTCT:1 - chr3R 23911350 3' - 3S18 28 2 52.94 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTAC:1 + chr2R 2427625 3' - Doc 57 1 57.53 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAA:1 + chr2L 20266037 3' - roo 63 2 63.01 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCT:1 + chrX 19074881 3' + mdg1 7413 2 50.68 TAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTT:1 + chr3R 24381396 3' + Juan 4154 1 57.53 TAACTTAACCAAACTCACTTTTTTTTTAGAAAATATTTATAATTTCGGGACTTTACGTTGGTGAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGTCTTCGATATATCGATAGGCAGTGCCCTGAAATCGAAGTCTGTTTATTATAAA:1 - chr2L 13783450 3' - HB 275 1 63.01 GGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGACGCTAAGAGAGGGTATATTTTTTTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAACATTTTATAACATTTTAA:1 - 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P-element 84 1 29.45 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGGATTCACATAACTTTTCATTTCCTATAAAAAAAAA:1 + chr3R 31264062 3' - jockey 4847 1 75.34 CACAGAAAACTTAATCTTAATAAATTCTTAAGAGGTAACTCCTTAACTACTCACCTAATTCATAATAGAAACTACAATATTTGAGATTAAATTGTGTTGTTAATAAGCACATTGAGCACTCGATATGAGGGAAACATGGACCGAAA:1 + chrX 19364251 3' - gypsy4 189 2 69.86 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAACTTGAACGTGCCAAGCTCACAGGCAAAGAATTCGACT:1 - chr2R 13259302 3' + mdg1 341 2 71.03 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATT:1 + chr3R 23881680 3' - FB 57 1 59.42 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCA:1 + chr3R 15942792 3' + hopper2 1560 1 62.10 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTGAATACCAAAATGT:1 - chr3R 4460995 3' - blood 7048 2 59.59 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGAAAAAAATTGAAAAATGGGTCTGCCAATGTCCGTTTTTTCCCCAATCAAAAATGGCATTAAAATGTACATAAAG:1 + chr2L 13556457 3' - transib2 46 1 48.63 GAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTACGATTAACGGGTACAATAAAGTGAATATTAAGATATTTTTTTATATT:1 - chr2R 4750341 3' + 1360 3322 1 73.97 ATCAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAACTAAAAAAAAAACTGGAAGGCCTGCTGGTGGCTGGGTTTTT:1 + chrX 14334777 3' + R2-element 3583 1 83.33 ATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTCTACATTCCAGATCTATTCAAAATAACAAAATTTACACACAACGCTCTGAGAAATGAAAAAAGAAAAGGCAAGAAATTTCCAACGGTACATGAGCTGCTGGCCGGGCCTGAATCAATGTTTATA:1 + chr3R 13816527 3' - mdg1 347 2 72.60 TTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACGTTATCAAGAACAAATGTTCAAATGATATACGTAACGTGGCATATCTCTAACAGTGACGTCCCCCGCA:1 - chr3R 28429534 3' - Tc1-2 370 1 71.92 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTACCTTGAGCCTTTTGTTCCCACAGCAGTTCCCCTTTGCTTGAAACACAATGCCTTGATGCAAATCGAGCGAG:1 - chrX 18336566 3' + mdg3 5466 2 59.54 AGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCTGGGGGTTTGGTGATTGGGTGGTGTGGGGGAGTCAGCGGCTCTTAATTATTAGCTGGGCTTTTTT:1 + chr2R 19894681 3' - G6 1946 1 64.00 TGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATTTTTCTAAAACCCTATGAACGTATTTTGTAACTTCGTCAAAAT:1 - chr3R 18716446 3' - gypsy12 10049 2 73.97 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCTATTATCATTAATGATTTACATACATACATACATATACTTCTT:1 - chr3R 12450602 3' + Juan 4195 1 41.78 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTGGAAATTTTTATATCATTTAATGACGCAGTAGAAGACTAAAATCGCTTACAATTT:1 + chr3L 18931051 3' - I-element 25 1 54.81 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATAC:1 + chr3L 19274877 3' + transib2 2750 1 70.55 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAA:1 - chr3L 18931000 3' + I-element 5325 1 71.08 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACTTTTATGCGCAATAGAAAACTTGCAAATCG:1 - chr2L 16945996 3' - hopper 27 1 65.75 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTG:1 + chr2L 12251008 3' - 412 7088 2 54.07 ACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTTTCGCTGGCCTTGGGTTTGTCCTTTGCTTTTGGGGGGGCACGCTGCTCGGTTTCGTCATCGCTCTGGTTTAACATAAGAC:1 - chr3R 13163143 3' - Quasimodo 326 2 56.55 AATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTAACTACAGCATTTCCCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTA:2 + chr2L 11839718 3' + mdg1 7367 2 75.34 AATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAAATTCAAAACTGACTTTATAATGTATGGTAAAGGACAGATAAGACAATCTTAAATGATGGTCTGTCCATACGACACAGCTTGAACTTTACAATCTCCGC:1 - chr3R 3745780 3' + 1360 331 1 54.11 GGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTTAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCTCTCCTTTTTTCGTTTGTTCTCCATACTACCCCAC:1 + chr2R 19162193 3' + I-element 4956 1 77.40 GGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGATCTTTTATGTACCAGGAGTTTACATAAGCAAATACACCCGTCCCTCTCTTTCATTTCCATTTCTCGATCTGGCATCATTTATATTATGGGAT:1 + chr3L 14150605 3' - G4 486 1 65.07 GTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCTTTACACTTGATAAACTTTTTATTGCTTCCAAACAATTTAAAATCGAGAGCGAGTG:1 - chr3R 28788497 3' + F-element 4415 1 61.64 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCGTCCATCGATATCCTTGCCGCCCACACTCAACGCTCTGTCACTTTGGGCGCAAATTTCGCCATTTCCACCCTC:1 - chr2L 5448411 3' - Transpac 5 2 77.88 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAGCGGG:2 - chr2R 4855153 3' - transib2 30 1 64.58 GCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTG:1 - chr4 123987 3' - HB 166 1 72.60 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACCGTGATACGAAC:1 - chr2L 14074459 3' + 297 6902 2 71.23 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTCGATGTTTGTTGCTGTTTTATGTTTTGTAAACACATGCATGACCCATGTGAGACAGCCAAAGTCACAACAGCCCGATGGCACTGTCCCTGTTTTCCATAAAG:1 + chr2L 4714006 3' - transib2 14 1 75.86 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGCTGGCGAA:1 - chr2R 10161770 3' - transib2 47 1 53.42 ATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCG:1 + chrX 21947740 3' - mdg1 7038 1 74.44 CTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTATGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTTACATATTTTTTTTATTTTTATATATTTTTATTTTCTGTTTACTGTCGACGTCTCATCAGCGTTTTGTTGCG:2 + chr3L 12968555 3' + 1360 489 1 74.48 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGGCCTTTTGAAATGGCAACTACAGACCATCCTCCCACCTCCCTGATCCCTAATGACGCCAC:1 - chr2R 18530981 3' + jockey 4969 1 41.10 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCC:1 - chrX 21216736 3' + roo 9038 1 62.00 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAG:1 - chr2L 13556337 3' + transib2 2765 1 58.90 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCCTCTAAATATGTGGACAACTTTGAGCGAGTCGAGGATCAGTTCGCCACCGCCATGGTG:1 + chr2R 12472121 3' - transib2 36 1 51.24 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAACCACATAAATAAAATCCTGGCTAAGGCCAAAAAATCGTTGCCTACTTTTGTGCGCTGCTGT:1 - chr3R 12930683 3' - jockey 64 1 56.16 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATATAGGTAAACAAAAAAACCTATAA:1 + chr3R 15072712 3' + pogo 2089 1 74.66 CAATAANCGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGCCTCACTGTGCGA:1 - chr2R 2590676 3' + HMS-Beagle 211 4 60.27 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGT:1 - chr3R 27405976 3' - diver 5960 2 64.38 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGAATGGCCGGGGGAAAATTGGTTGGAGAAAGAGGAGCCGTTAGTTACAACAATGCTCTAGGCAACGGCAATTCGGCATGACATAATACG:1 + chr3R 28469330 3' + 412 7514 2 60.27 TGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATATAGCCTAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCCTGTTATTCAATGATCTTTGCTCAAACCCTCCACACAACCCCAGCAGGGACTCCTAACT:1 - 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chrX 19266826 3' + roo 9026 1 47.95 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCCCTGAGAACATTGAAGTACCAACCTTTGAGTAGCCCTTACATATATGA:1 + chr2R 21681393 3' - roo 8736 2 67.81 TTAAAAATAAAATAAAAAAAAAATTGAAAAAATTATATCTGCTTGTTTGAATTGGGGCATGGACAATATGGGGTTTTAGCTAATGATATCAGATTTCCCAAATAAATAACAACACTTTTCGTTTTTCTTCATCTTTAT:1 - chrX 11801569 3' + TART-C 11101 4 52.17 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCTTGAAAATAGTTTT:1 + chr2R 5151347 3' - roo 8701 2 56.16 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTGTTTTCCGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGGTTTGTTTGCGTTTT:1 + chr2L 14074533 3' - 297 60 2 66.92 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATTTTTAAGTCAAATTCACTCGACTTGGCTTGCAACCGCCCTTTCCTCTTGCCGCATTCTGTTGTTATCGTTGTTGTTATTGCTTTT:1 - chr2R 13766175 3' + roo 404 1 74.14 CCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACTAATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGGATCCAAGAAATCATACGCGGCGGTGACGGTGTCATCAGAGTAGCTATGCTCCGT:1 - chr2R 5621103 3' + diver2 96 2 60.96 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGCGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACCCAACTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGGTGCGTAAACCGTAATAAGAACAAAAGAAAATGTATAACCACCCATGTTGAACGCCAAAATCCATTCAA:1 - chr2L 22629756 3' + 1360 3335 1 80.69 GGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGGAGGCAAC:1 + chr3R 8049039 3' - Q-element 119 2 66.44 CACACACACACACACATTGCGTATACGCAACGGGTGTGTGGGGGTGCGCCCTACTTTGTCTGGTCCTTTAAAATTTCAATCCTGCTC:1 + chr2L 15138239 3' + accord 7105 2 67.82 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTC:1 - chr3R 19407920 3' - diver 80 2 73.10 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATGAAGAGGTATTACTTAGTCGGATACACGAAAACCACCTGCCAGTTAAAAAATAAAATGCTTAAATCAGGTGCCAC:1 - chrX 13134830 3' - jockey 4763 1 80.82 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGT:2 - chr2R 22034651 3' + copia 5062 2 62.33 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAAC:1 - chr3L 7300156 3' - roo 8740 2 71.23 ATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAACATTTAATTTGCATGAAACGTATTGTATACACAATTCGTATTCGGTTAGAAGTGAATTCCAAGGCGACTGACTCAATTGCAAGTGCTCCATTCATTCATTGGTT:1 + chr2R 11046156 3' + F-element 4654 1 75.34 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGCCAAGAACAGTCTGCCTGACAGGCGGTTGTCACACAAACTCTGTGTAAGTTCAGCCTCTAATTACAACTGACAATGTTTTTACAATAAATTGCGTGCCCGGCGAGGCTGG:1 - chr3R 4860378 3' + Transpac 5222 2 80.00 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGTCATATCCTGTTTATTAATACATCTATATTATCAACTTCGAATAGTTATT:1 + chr3R 5036668 3' + diver 6069 2 59.66 AATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGATTTGTTGTTGGTTTGCTGGACTTCCAAGGGGCAGTGCATACATTTGTCTTGATTAATTGTTCTCGAACAGCGAAGGGTGGCAAAT:1 + chr3L 20851189 3' - I-element 5224 1 61.64 ATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTCTTTGGCATTTGCTTTGCTGCGCTTTCAGTT:1 + chr3L 22483250 3' - BS 4794 1 71.56 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTCAAT:1 - chrX 21216705 3' + roo 360 2 52.41 AATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATGCATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTATTAAAATATTCTGATTTATGACAAACTTTCACCGCCCGTTTGCAACTTTTCGCAGTTGCCATTTGGCAC:1 - chr2R 23498922 3' + Stalker 7081 4 52.74 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAGCAATTCTAGAACCATACAT:2 - chr3L 19454885 3' - mdg1 21 2 69.86 CACGGTGCCCCAGTGATGGTTCGGAGGATTTTTGATTGTCCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGT:1 - chr2L 21637282 3' - F-element 4347 1 73.13 GTACCCGCGATGGGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGATGGAAAACCGTAGTTTCCGTGGAG:1 + chrX 22386762 3' - hobo 71 1 54.02 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTACACGGGATCAAATAGAAAAGGTTAAGGAGTGTCGCGCAGAAATCTCTGG:1 + chr3R 28385662 3' - transib2 15 1 73.13 CTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACAAACGATATTAAAGATT:1 + chr3R 4682976 3' + Burdock 6319 2 72.60 GGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTAATGAAATATTACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGCAATGAATTGAGATTTAGGTAGTGTCGTCTGTTTTTTGTCTGGCAGTCCGTTAGTCCGTATGTTGCGTAATTGGTCC:1 + chr2R 2878296 3' - I-element 5049 1 62.50 GTATTTGTAGCTTCGCAGATGTGTTTCACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCTATAATATCATCAATTAATTTAAGGAGGCGCGTTCGCCTGAGTGCGCAGAAGTCGAACGATCACACATCGCATCCTAATTGCCAGCTT:1 + chr3R 28314901 3' - hopper2 229 1 62.86 ACGCTAGAATAATAAGATGCGTAACCCCACACGATTTTTTGGCACACGTTATTACATATAACAAAATAAATTTCAAAAATGACATTGCAGTTGGCATCATTTATTTAAATGCAACAGCTGAAGCTCGCTTCTCATTTACCATGTTA:1 - chrX 13212068 3' + 1360 6 2 56.85 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATGGGTACTTATTTGCCACTAGGCAACACACAACACTCTTGGTTATCACTCGAGATTTAA:1 - chr3R 27160065 3' + 412 431 2 61.64 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTGTGTCTTAATTAAATTCAAAACTCATCGTTTTTTTTTTTCTTTTGGAGTTTTGCTTACGTCATTACCGAAAATAAAGTTAAATGG:1 - chr3L 17183645 3' - diver 5910 2 60.61 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCGGTTGTTGATTGCCATTATTATTTGCAGTTGAGTTTATGGCCGAAGGGCCGACACGTCGAAGGT:1 + chr3R 22288069 3' + transib2 2780 1 51.09 GGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTAC:2 + chr3R 4679586 3' - hopper 26 1 66.44 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTAGTAGTTACTGTCGCTCCGCCGCCGC:1 - chr3L 6964730 3' - P-element 78 1 22.48 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGGT:1 + chr2R 2427628 3' - Doc 54 1 55.48 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATACTCATAGATAATGCATGTCCCGACTTTTTCCCCACTGGCTCTTTAGACCCCATTAAAAGTTTGCTTTTTAGCTAGAAGCGCTTAGTCATTGGAATACACTTTA:1 + chr3R 23881729 3' - FB 12 1 73.94 GTGAACACTCAGAATAATGTCTTACTTGTCAGATAGATTAAGTTGCCTTAATTGAGTTAAAAATGTCTGGACATGGTAAAAATCTCACCATGATTTCTTCTCGAAATGCACACCGCATGAACCTTGCCTATGCCACCTTAATATTC:1 + chr2L 3437292 3' - frogger 308 1 47.95 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGG:1 - chr3R 9038916 3' - Juan 4057 1 50.00 TACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGCCACACAGAGACACATAGAAATGGGGTGTTGGGCAATTGTTGGCTTACCCGTGTGCTCCTCCTCCTGCTG:1 + chrX 6252415 3' + jockey 4846 1 54.11 ACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCGTACATTCCTGGCCCTTGTTTGCCGGCACTGTTGTTGCAATTAAGAGTGTTTACGCTGCCTGT:1 - chr3R 9322534 3' + 1360 3256 1 56.85 GGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATATATATATATATATATAAATATATGCAAAGTAGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGTA:1 + chr3L 23839737 3' - 17.6 40 2 65.07 TAGTCTCCCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGTTTTGAAAGTGTCAGTCGGGGGATTAGATTAGGTTTAAGAGTGTCTATAAGCCATTTTTCGAACCCCTTCAGC:1 - chr3L 14510819 3' - Idefix 170 2 51.37 AAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTAT:2 + chr3L 20187442 3' + FB 495 1 62.33 CTTCCTTTCTTTTTCGCATCTAGTCAACCATTTACTTATTGTTATTAAAAAAGAAAAAAAAACAGATTGTAATTTAAAGTTTAGCAGATTTTGTTTAACTTATTAGGAGACTAACTGGAAAATATCTATTCAAATTCTCATAAGGA:1 + chrX 12069465 3' + Porto1 4605 1 54.11 TTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGATATACACACACACAGCAGGACATACACGTGTGTGTTGGTGTCGCGC:1 - chr2L 3718684 3' + Cr1a 4143 1 68.49 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAATTTTTGTGTAAAATGGCAAAAAAATTTCCCATAAAAAATCAAGAACTATGCCATTT:1 - chr2R 3564000 3' - Tabor 6858 2 72.60 TGATCGCACCGTTGATCTGGCAACGCATCCCTCTCCAGTCTCCTGCTGAAGTTATGAGCTCTAAAGATTTTTTTTGGGGATGCAGGAATTTTTGAATTGGTTAATAAGTGCACTATATTACACTAT:1 - chr2L 11767771 3' - Rt1b 43 1 71.43 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCGCTCGTGACGTCGACGTTTGCTCTTCG:1 - chrX 18282619 3' + P-element 2838 1 31.43 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCG:1 + chr3L 9907366 3' - BS 5049 1 54.79 TAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCAT:1 - chr3R 23020797 3' + INE-1 552 1 60.42 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGATGGGAAACAGTTCAATTGGATGGACTTACAACGTATGCGATTATTTC:1 - chr3R 29084851 3' + 412 467 2 64.38 TATGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTGGTGGTCCACCGTTGACGTCATTCTAGTTTCGAGAATTTTGCTGGTAAATGGCCTCTTCGATCACTTTGGGT:1 - chr3L 12737186 3' - accord 182 3 47.92 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTGGTATATATTCGAGGAAATCCGTGGTTCTTTTGTAA:1 - chrX 18396085 3' + roo 9006 2 59.59 AAACACGTCCGTCGGGGTTGAACTTCAAATTGAACAGCTTTTTTACATTTGCAAATGTAAAAAAGCTGTTCAATTTGAAGTTCTT:1 + chrX 7122216 3' - Porto1 10 1 49.41 AAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTATTCT:1 - chr2L 4025371 3' - copia 217 2 58.90 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGCTG:1 + chr3R 10931743 3' + 297 6938 2 55.56 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGTCTACATTTTCCGTAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAATTGTGCTTGGATAGGGATGAGTTTTGTTA:3 + chr3L 12315848 3' + transib2 2788 1 60.96 AAACTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAAGTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACAAAAAAAGACAGCAACTGTGGAGTTGACAG:1 + chr3L 13922611 3' - hopper 170 1 66.44 ACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGTAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTAGCTATTTTCGCATATTCAAAATCCTTGAAATAACCCATAAACT:1 + chrX 13947360 3' + G2 3076 10 47.95 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATTTATTGTCAGTTAAAAATCCAAAAAAATGCCGATTTAAATATTAAAAAATTTTTTTCGCTAGAAAAATCATCTGCCTCACTGTGCGACG:1 - chr2R 2590674 3' + HMS-Beagle 7009 2 61.64 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGGTTTTTTTTGACAAGTAACTGCTATTTATTTAAAAATATAATGCTTATTGCTTATTGGATGGGCGTCAAGTAGTAATAATATAGACCCACAAAC:1 + chr3L 22035689 3' - F-element 41 1 58.90 GCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGATTGGCGGCGATGGATG:1 + chr2L 11257100 3' - rover 49 2 67.21 AATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGCCCAATCTTGATCTGATTTCTCCCCAGGTCTTTTTCTCTAAATCTTGTTGTGCCTGCTCGTAGAATACGGATT:1 - chr2L 4754867 3' - Stalker 6898 4 50.00 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTA:2 + chr3R 24381388 3' + Juan 4146 1 63.01 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGACTGAACTTGCGTTGAAGGGGCGTCGGCTTAAGAACCAACTTTCTTTCTCAGCGCATCC:1 + chrX 10639170 3' - FB 61 1 60.14 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTACTCATACGCAGTGTGGTCATCAATATTTACTAAATTGAAAAGTTAAAACA:1 - chr3R 18093292 3' + I-element 5287 1 65.75 AGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGTACACGACTATAGCATAATCTCTGGTTTTAATGTATAACCCATTCGCTAAACCGAGCCACGCCACAATTCACATACACGATAAGTTTAATTCAAGCTACAACATTTTATCTTTGAATTAGT:1 - chr3R 24279298 3' + INE-1 550 1 76.71 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTT:2 + chr2L 20266056 3' - roo 44 2 54.11 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTAAAATCCAATCAACTAATGGGAATTTTATTCGCTTTTTTACAAGTTTTTATTTTTATTGAGCATTTCCATCCCTTGAAGTCAATTGTAG:1 + chr3L 10731907 3' - 297 6608 2 60.27 ATACAAAGTATTTTGCGTTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGACAGACTGTATGTTTTCGTAGTAGCGTCGGAG:1 + chr2R 3287397 3' + Cr1a 179 1 60.71 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTA:1 - chr2R 8157195 3' + mdg1 7376 2 76.03 ACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTGCTTTAACCCACACACAAAACATGTTCACATCCTGCTAACCCACCATCGCTCTCTCTGCTTCC:1 + chr3L 16614032 3' + I-element 4971 1 57.48 CCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTG:2 + chr2R 15005109 3' - BS 5060 1 63.01 CCAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGAC:1 - chr3R 9038888 3' - Juan 4031 1 67.81 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGCATGCCATAAAAATACTGGTAATTTCGAGTTACGAGGCGCAAAAGGACATTTCTGGAGGTTCTATTCAAAGCGACAAGTGGTACGGAAAATC:1 + chr3R 28146243 3' - roo 28 2 60.96 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTAGAGCTTCCTCATCGAATC:1 + chrX 19588128 3' + roo 335 2 65.75 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAA:1 - chrX 6475307 3' - Doc 76 1 65.75 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTTCTATTAGCCAACTTATCAACACGGAATCAAG:1 - chr2R 17926267 3' + opus 7475 2 65.75 AAATCAGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAACT:1 + chr2R 7850042 3' + roo 373 1 52.71 GTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATGATCAGTCATTTGTTAAATATCAAAGTTTCTGATCTCTTCTCTTCAGACTGCGATTTGCCTGAGAACACATGACGTGGAA:1 + chr3R 4357636 3' - Tc3 1683 1 68.49 TCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATAACTATGGTTAGGTTACTCTGTTGCAATGTTTACGTTTTTAAAACAGCCAGGCACAAGTGCATGGGTATTACGAACACCCACTTTGAGG:1 - chr2R 3593607 3' - gypsy 31 2 64.38 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCCTGCAGGTAGGCAAT:1 + chr3L 13581734 3' - jockey 4825 1 61.64 TTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAATGCATCAGAAGCACCGAGTGCAATGCTTTGTGCATGGTTGCAGACCC:1 + chr2L 7618572 3' - X-element 4481 1 47.26 CCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTC:1 + chr3R 11040132 3' - Bari1 58 1 70.69 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGT:1 - chr2L 4467869 3' - HMS-Beagle2 6906 2 76.03 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCGTT:1 + chr2L 6103030 3' - roo 8726 2 62.33 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTGCTGATGGGCTTGAATTT:1 + chr3R 17673857 3' - FB 46 1 54.79 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGT:1 - chr2R 8157179 3' + mdg1 7392 2 65.07 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACTACTTCTACTCATTTACCCAAGCTCAACCTTCTTGTGCTCAAACTTCTGTGATTTTGTCATTCGCCTTGTGGCGCCAA:1 - chr3R 13972931 3' - 412 43 2 56.85 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTC:1 - chr2L 7660928 3' + I-element 5277 1 69.86 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGTTGACACCTTGAATGAACTAATTAGGGAAACTGTGCGTCTGACAAATGTTGCTCCCAAATTCTATTGGCTG:1 - chr3R 25616457 3' + roo 397 1 76.03 TTTGTATTTTTTTTTTAAATTTTTAATTGGTTCTT:1 + chr3L 25287005 3' - TART-C 11097 1 94.29 TAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTCCACCTCAGATGATAGTACAGC:1 + chr3R 9557108 3' - G2 3014 1 55.10 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAGTATTGTACTGGGACTCCTTCCATATAGTAGATATGTATATATGTTTGTATGTATGTACATGTGTTGGACGTGGGAAATATGCGGTTTAAATGACAAACTAAATAAAA:1 - chr3R 25428104 3' - 297 4 2 78.57 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGATACCAAAACAAACGCTTAGGCCTGTGCCTATTGTATAGGATGTTTCTAAAAGTGTA:1 + chr2L 4123950 3' + transib2 2763 1 60.42 TTTCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGAGTCTGAACAAAAGCATTTTACTTGCATATTTTATGTTAGCTTATAGCAATTGCGCACTAGCTTTAATAAGATGTT:1 - chr3L 2145875 3' - roo 46 2 54.11 TAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAGCCCAAACTATTGCCAACAATTCCCTTTTTAATTGTGGCATAAAGTTGTTCGGTTTTATTTAATGTTTTGGATATGAAAGTAATTGGTTTATTATCCTGTGAT:1 - chrY 3572625 3' - copia 224 1 74.66 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACACGCACACAG:1 + chr2L 16943877 3' + copia 5078 2 71.03 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTATTGTTACCATATCCACTCCATCTTCATCGCACGACGACGAGTGGTTTTTTCC:2 + chrX 13490791 3' + 297 6957 2 71.92 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATTCAAGGCTGTTTTTCCTGTCGGAAATTAGGTTG:1 - chr3L 12249829 3' - roo 88 2 81.51 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCG:1 - chr3R 29084899 3' + 412 419 2 66.44 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTGGAAATATTGCAAACGAAATCGATGTCCAGTGGTATGTAGAAGGTTGTGGGAATTGGTGTTAAATTGTGAAAAGCCATCGAACCGTGGG:1 + chr3R 16519020 3' + Tirant 378 2 67.14 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATTATGTTTTATTCGGTAATTAATTTACGAAAATTTTTAAAGCT:1 - chr2L 20265889 3' + roo 397 1 77.40 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCAGATTCCATTGG:1 - chr3R 23618120 3' + hopper 1359 1 56.16 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATACACTCAGGATATATGTGGGATTTTTGAAATTTACA:1 - chr2R 17926316 3' + opus 7443 2 72.87 GCAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTAAAAAAAAACAACGAGTAAGGGCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCACTTATCCGGATCCGATCGGGGTTCACTTGGCATTTGGTCCATCGTCATCGTCAT:1 + chr2L 3234050 3' + roo 350 2 52.90 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCGTTTCTCTTTGCGGTTGTCCTCTGTGTCAAAGATGAAAAA:1 - chr3L 5532937 3' + roo 385 2 54.00 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAG:2 + chr3R 16630343 3' - FB 79 1 71.23 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGAT:1 - chr3L 19454915 3' - mdg1 51 2 50.68 TTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTTTATTTTAAGGTATTTTAAACTCCACGTGCGGACGCAATCGGACGTACTTGGCATT:1 - chr3L 9270237 3' - copia 225 1 57.28 ATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTTGACCCTCTTCCAACGACGTCACTCTTGGCCTC:1 - chr2R 15330485 3' + I-element 5001 1 81.12 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTTTTTTTTTCTGTTAATTAATTGGAATGAATATGCCAATGTTGATGCAGATGAGGCTTG:1 - chrX 16487176 3' - F-element 36 1 50.93 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTACTTTGTGTAATTAATTTTTGGCAAGGTTCTCCCGGGGTGGGGTTTTGGGGATACAGTGGGCTCTGGCTAAC:1 - chr2R 10078127 3' - jockey 76 1 50.00 AAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACATATTACAGCTGAGAAACACCTTAGTTTCTATGTTTCCTAAAATACAACGTTCCATATTTATTACGGAAAAATTTCAAAAAGATACACGTCAAAGCAAAAGGAA:1 + chr2L 4755000 3' + Stalker4 7338 2 49.32 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATCCCGAACACAGTTATGCACATG:1 - chr3L 18402999 3' - P-element 74 1 24.00 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCG:1 - chr2L 18549842 3' - roo 8740 2 73.29 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGCAAAAAATTGCGGCAATTAAAGTGGCAAATTGTCTCGAAGAGGCAATGTTCAAACGATTCTCCATTCTCCGACATTGTCATGGATAGAA:1 + chr2R 13766332 3' - roo 8680 2 72.52 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATACACACACACACACGCAACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGG:1 - chr3R 27315098 3' - jockey 4745 1 65.75 TTATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTAACTATGCTGGTGGATTTTGCAGTTTTAGTTAATGTTTAGCCAGCGCTATTTTGGCCCAAAGAATGTCGCGTGGAGGAGCCAAATACTTTGACAACAT:1 + chr3R 10970663 3' - HeT-A 335 1 57.53 AGGGAACGGTTGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAGTTGGGGATTTTCCACTCTCGAGGATCATATGACAATCTTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTTGTCATCGCCAGCGCTGCTCAA:1 + chr3R 29690761 3' - Idefix 7000 2 61.64 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGCCATAAAAATATAACTTTTGAGCGCTCTTGAATTTAAATGAACTCACCCAGCTAACAGGCTTAAAAGATTCCAGGCATCCAAATTACAGTCAACAACGAAAACATC:1 + chrX 22463961 3' - Tirant 9 2 64.29 ATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTATTTTTTTATTTAGTTTATAATAATAATAAGTATTAAAATTGTTATGCCCAAGTTATGCG:1 - chr3L 22760374 3' - F-element 154 1 65.07 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATTACATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTCGATTTTAACCACC:1 - chr2R 8157165 3' + mdg1 370 2 54.86 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGG:1 - chr2L 4063862 3' + roo 8984 2 78.77 ATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACATAAGAGAGTATTTAAGGTGAATAAGGCAAAGAGCAACAAGTTCA:1 + chr2R 20010662 3' - Juan 4179 1 69.18 ATATATACATATACATATACATATACACGGGCAAAAATCGAAGTTGAAAAATAAATGGGAGACAATTTCGTCAGGACCAAAAAAGGAAAAGTGTGGGAACTACACTGAGAGAAAAAATATAAGTAATCAAGGAAGCATGAAATGAT:1 + chr3L 10293942 3' - Stalker4 244 4 77.40 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAATATATGCCTTCAGGATTAAATTA:1 + chr2L 23381789 3' + flea 5004 2 77.40 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGCGTACAAAAAAGCAGTTGGCTTCTAAATTACTTTCAACGTGGCCCTGAATTAGGAATTCTGTTCCTTTTTAAAATTAATCCAAACCCTGATG:1 + chrX 18010077 3' - 412 7082 2 63.01 CGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTATCTCTTAATTGCTTTCATATGGTCATCAGTGGGGGTCAATTTGTACAACTGAC:2 + chr3R 14698604 3' - Idefix 7038 2 63.01 AAGACACAGACGTCCGCACTTGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTATACATTTGATATTTTCTTACATTATTTGTTTTCTTGTGTAAACTGTTATTTTTCAAGGAGGTG:1 + chr3L 18442571 3' - Ivk 22 1 69.44 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGCATATATGTATTTGATATAGTTGTCCGATCCTATCAGTTCCGTCGTGCAAAAAAAGAAAGAAATTTTCATGAAAATAGTTTTAA:1 + chr2R 5151349 3' - roo 8698 2 59.31 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGGACAATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTGTATAATGACAGAATTATACAAAAAATGTATGTTGAATTACGATGTTTTTGGATTTATGTTTAACTTTCTT:1 + chr2R 1193105 3' - GATE 32 2 67.36 AAGCAAAATTGGCGCGAAGCTTTTACTCAACTTTGTGATTCTATTTACAAATAAAATGGAACATAAAGGTCAAGGTATGAATAATATATCTATAACGTACTGATTTAGCTGCTCTTCGTGCCTCATCTCCTGCCATCGATGATGAG:1 + chrX 4998137 3' + transib3 190 1 73.97 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTTAATGTTAACTAAACACGCAATATCGTTCTGCA:2 + chrX 7795658 3' + roo 393 1 74.66 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCAGTTTTCTCATTTCAGCTCCCGTTTTGTTTGCGTTTTTTATTATATTTTTCGCGCTCTCAC:1 + chr2L 14074557 3' - 297 14 2 66.67 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGCAAAATAAATG:1 + chr3L 20711707 3' - jockey 4812 1 52.74 ATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGGTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGTTAAAA:1 + chrX 22386813 3' - hobo 62 1 62.79 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTAT:1 + chr3R 7420337 3' - 1360 9 2 78.29 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGT:9 - chr2R 15326824 3' + copia 245 1 54.11 GACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACATTATTTTTTCCGGTTTCGTATTCCCTCTCGCTCTTTCACAGGGGTGTTGTTGGGCTTCCGTGTGTCTAGTCATT:1 - chrX 21231513 3' + Cr1a 3984 1 53.85 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCGAAAAGCACTTAATAGGCTGCCACGGCGCCGTTGACATGGCCATTTAGATG:1 - chr3R 27765096 3' + mdg1 7398 2 63.50 TTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACGCCAGCGTTTTTGTTTTAATTTAACATGCTATTGGTTAATATGTGGGTTGCAAACATT:1 - chrX 3701794 3' - Tc1-2 1243 1 57.58 ACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAACGAACAAAAAATAGTAATGGTAAATATAAGCACATAAAAGGCGGAAGTGGAGCACTTTTTGTGAATTGTTTTGTGGGTCGAAATAAATTGGG:1 - chrX 17359447 3' + invader4 277 2 81.97 TGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTTATGTTGCTTTCGTGTTTTGCAAGATTTATGACCAAATTCTCAGTCCAAAGTTTTCTCCGAAGGCGTGAATATATATTTTT:1 - chr3L 10534926 3' - I-element 5164 1 60.96 GGCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTGAATATGTTGGCTTTGACTTTTGGTTTATTTTT:1 - chr3R 17706585 3' - accord 185 4 66.67 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATAGTACGCACTTATCCACATATTTACACATTTTTTATTGGCAGTCAACATTTTAGTATACCCAG:3 + chr2L 18549935 3' + roo 353 2 53.42 TTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTGAAAATGAGTAATTGGTAAGTGATATTCCATAGCCATTAGTTGCTAATTGTTTATCAGGGGCGTATAACCAAACGTGAGTTTCG:1 + chr2L 737440 3' + R2-element 39 1 60.27 AAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTACTTACTGAAATTCTAACAAATTCTAATGGATATATATTTAATTG:1 - chr2L 16539595 3' + Juan 4210 1 82.19 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGTTTTGGTAAAAATCTAAATGGAAACCATGCGAAAAAGTTTTATTTATTGTAAAATATTTGAAAACATTTACCTAATGAAGTTTAAGCGCAA:1 + chr3L 5881713 3' + pogo 2074 1 67.12 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACCGTGCCAC:1 + chr3L 19111609 3' - Doc 64 1 60.96 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGGTACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGC:1 - chr3R 15882604 3' - jockey 76 1 68.94 TTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCTATACAGTTATCTTCGCATAATTATGTACAGTGCGCGACAAGAA:1 - chrX 9530316 3' + 297 6921 2 63.91 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATTGAAAGTTCGTTTTTCAAAATGCATGGCATTTGGTAAAAGGTAATTTTTATTCAACAACAAGTAAATTAATGTGGACAGTAAGTACGCTTAGTGATTACATAAATAGT:1 - chr3L 17055379 3' - Tirant 10 2 78.62 CCCATCCTTAAAAGTAGGACGCACAGCTTCGGTATGTAAGTGCCTTATGTGATAGCAGCACCTACACACATATACACAGCTCCTTGTCG:1 + chrX 16218030 3' - pogo 1726 1 77.53 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTATCACCTTTCATAGAAATTGTGAAAAGATACAAAGAATGAACAACAAATAGGACTGGG:2 - chr2R 7244783 3' - diver 32 2 63.01 ATTTTTATTAAGATGTAGAAAATATTTTCATAATACTTTTATCATATTACCTTATATTTTTGGTATCTTAAAGTATTGAGAAACTTAACAAATATTAACTTGTTAAAAAGTTAACAACGAAATTACAACTATATTTCAAAATTAGC:1 - chr2R 10150477 3' + Penelope 342 1 55.48 GACTAAAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTTCTTTATTTTCCTCTGAAATCTTTCTAACAATTTACTAATTCAATTTGGTAAGTAAATTAGTAG:1 - chr3R 17129040 3' + jockey 4732 1 55.17 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTTTCGGTG:1 - chrX 22840439 3' - copia 4895 2 65.75 TTTAAATAATTTAAAATAAATTTCCTTTCATTGGAGTGCTAAAGTTTTTG:1 + chr2L 4088208 3' + Transib5 258 1 68.00 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCAAATAATTGCGCAAAG:1 - chr3R 12242240 3' - transib2 46 1 54.11 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGAAAACTGCCATGGGACACACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCCACTAGCATCTTCTCCGTTTCGATACAC:1 - chr2L 809612 3' - jockey 22 1 69.86 ATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGGTTGCTTATCT:1 - chrX 10445512 3' + INE-1 536 1 78.32 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACTAGGAATGCATACCCCCAAAATGCGTACAAATTTATGGCGGCGCTTTT:1 + chr3L 21996247 3' + Transpac 292 2 43.33 AAGTGCAGGACGAATTCAATTGTCCACAGAACGTCAACAAAGCGG:1 + chr3L 7808661 3' + transib4 2214 1 86.67 GATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTAAATATAGTAACCGTTATTATCCTTGGTATTTATAGATGCTCTGGGTGATCACTTACAACAACTCCTTTACTGTAGA:1 + chr3R 10196303 3' - I-element 4882 1 54.79 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGTCATTGCAAAA:1 - chr3R 4679454 3' + hopper 1376 1 53.33 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCA:1 - chr3R 24729573 3' + Juan 4155 1 60.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTAT:1 - chr2R 9871017 3' + roo 9026 1 54.11 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCG:1 + chrX 7795593 3' + roo 327 2 73.29 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAATG:1 - chrX 13134904 3' - jockey 4837 1 68.49 ACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTGACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTTAAAATAATCTAAACAAGTCGCCACATTTTCATTTTTCATTTTAGAGCGGCA:1 - chrX 11251735 3' - Burdock 179 2 67.81 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCATGCCATATATCTCCACCTCTTTTTCGGACAAATCAAATGCAACAATAGAAGGCAAAACACAGAACGAGGGA:1 - chrX 15355760 3' - hopper 45 1 48.28 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTTTCAATTTCTCCGGCTCCGACGCTTATTGTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGCATACTGCATTGTGACGCCTCCCTCCCTCACTATTTTAACCCTTTGGGTTT:1 - chrX 21224497 3' - roo 20 2 71.92 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACG:1 + chr2L 16690700 3' + P-element 2825 1 32.00 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTG:1 + chr2R 6847847 3' - Doc 63 1 58.22 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAATAGGAAAGGAAAAGAAACCATAGTTGTTTTACTTTTGATCAAAATAGTTTC:1 - chr3L 16662387 3' + jockey 4924 1 65.75 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTAAAAAAAATCGCTTGTGCACCCAAAAAATGTGTGTGCTATTGTCGCT:1 - chr2R 4362801 3' - F-element 85 1 66.44 CTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACGACGGCTGGTCTGCGATCAGCACTGTTTAATTGGTC:1 - chr3R 31045666 3' - INE-1 85 1 77.78 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAGTCTTAAAGTCTTGCAAAACTTTCGAACGTAGTCTATGATCTAGTAATAGAAAAACTGGGTAATATGTTTCTTATTAT:1 + chr3R 7666742 3' + I-element 5338 1 69.17 GAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTGGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCGTTTATTTAGAATGTGCTTGTTGACAGTGGTTGAATAGAATTGAAGCGAATTGTAGGTTATGCTGTTATGATTTTAATTGAAGAACAAATG:1 + chr2L 14793281 3' - Porto1 4192 1 54.79 AGTTTTGGTCGGTTGTAGGGCGTTTATTGGCAAAGCAATACAAATTTACAATTACCACTCTTAATAAAATCCAAATTGGAAAACTTACAGAGCTGTGTAATTCCCTATATCGAATCATAAATCAATCGCCTGCATTGCGTGAAACA:1 + chr2L 11943430 3' - INE-1 346 1 67.81 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATGTGATTGCCTAAGATGTCGATAAATTGCTACTGAATGTGAGTTCTCAGAAGTGGGAGTTTTAGGTC:2 + chr2R 22992549 3' - hobo 56 1 55.48 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACAACTTAACTTATTAAGCGACAAAAATTTTACTCCATTGCCAAAGGGAATAATTAGCACTAAGAAACGTTAGGAACTGATTTTTC:1 + chr3L 8627357 3' + pogo 2082 1 41.22 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTAGGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAAACACGGCGCTTGCTGAGCTTTCGCTGG:1 + chrX 19074898 3' + mdg1 392 2 62.33 CAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTCCGTGTGCTCCTCCCATTCATTTCGGGCTTATCAGCGAGGAAGCAAAGGGCATTTGTGTGCGGGAGCGAAGCCCG:1 - chr3R 7586971 3' - I-element 485 1 53.42 ATAAGCATGAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGACAACTACATTGAAGGAAGAACTCCCACGGAAAGTATCGCGAGCAGATAAAAAGTCTTTAAATAGAATCTAAAAATTAAGATCAAGATGCCGAGAGTACTACAAGCTTT:1 - chr3R 908951 3' + Tom1 195 1 74.66 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAACAATAAAATTAAAATGATGAATGAAGAAAAAAAATTCTAAACATTTTCAGCGGGCGAG:1 + chr2R 9158144 3' - mdg3 5307 2 55.80 GTAAAGGGTATCTGATGGTCGGTGATCTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGATCAGGATTACCTTCCAAACTAGAAAATTTCGTCTTTTAACTGAGAGAAAGAAACAATTTA:1 + chrX 20527477 3' + INE-1 551 1 74.78 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCA:1 - chr2R 15326819 3' + copia 250 1 57.53 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAGATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATTCAGAATCGGACAAAAACCTTCA:1 - chr3L 11913181 3' - BS 5047 1 52.05 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATGAATCCATTTTCTGAGAAGCGTATTTCTCTTGCTTTTTAAATTGCGGTCCGTTGCGGTCGCGTAAT:1 - chr3R 4682875 3' - Burdock 3 2 67.68 AGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCCACCCACAAAGTCGATGTGCTTTAGGTCTATGAAAAATTCCTTCTTGGAAATGGTTTGTTTA:1 - chr3L 22723833 3' + HMS-Beagle2 7139 2 55.17 GGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAAT:1 + chr2L 23295901 3' - micropia 38 4 56.85 ATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTGCTTGGTAATAA:5 + chrX 23182953 3' - Idefix 15 2 62.33 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATGCAATTTGCAATGCACA:1 - chrX 7795478 3' - roo 8691 2 69.18 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGGTTAGCAGGGGTCTCTCTGGGCCTCGGGG:1 + chr3R 21933218 3' - pogo 85 1 77.40 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTT:1 - chr2L 16539680 3' + Juan 4129 1 74.66 TGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTACCCACTCTTACACCTACAAACCTCAATAAGTTTTCAAGCCCACAATTCAA:1 - chr2L 21682712 3' + FB 656 3 71.03 AATGCGCAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTGGGAAATTGAAAAATATTTGAACAAATTTGACCTTTGTACTAATAGTTGTAATACAAAAGTTTTAATAAATTTGCAAA:1 - chrX 4843088 3' - FB 47 1 45.89 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTCTTTTTCTTTACGTAGTACAATTTTGAATACGGAGATATCCGTTAAATCTGCAATAACTTCAGGCTTTTGAGGGGGATTTAATATTTCTT:1 - chr3L 27865969 3' - Max-element 31 2 54.79 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGTAATAAAAGTGAGAAATTATTGATGCACTTTAC:1 - chr2L 3233980 3' - roo 8751 2 77.40 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATTGCTAGGTGAAACGAAATAGCAAACGAGGTTGGAACCAATAAATGATACTTGGATTTTATTGTTTTTGTGGGAAT:2 - chr3L 10373799 3' + 297 354 2 58.90 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGTAGCTGCATAAAATAAATAACCCATCAAATCATAATTCTCCAA:2 - chrX 13134906 3' - jockey 4839 1 69.86 AAGTGAAATGTTTGATTTTCGATGATTCAATATATTATTTATATTTGCGTATGCCCCATAGAAATGATTTTTGTAAAATTATGAACTCTGAATTATGTGAAATATAGTGGTCAGATGCTGAGTAAAAAACGTGCCGTAGTCCATTA:1 - chrX 8433900 3' - FB 154 1 65.75 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAACATTTAATATTATATTATATATTATAAAAAAATATATTATAAAATATTATATTATATATAAATAAAATAATAATAATATAAAATATAAAATAAAATAATAAAA:1 + chrX 12877027 3' + mdg1 7068 8 68.84 TATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGTAATACAAAAAATGCAATACGATTTCGTAATGCATCAGAAGCACCGAGTGCAATGCTTTGTGCATGGTTGCAGACCCAAGATGTC:1 + chr2L 7618580 3' - X-element 4473 1 52.05 ACCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAACTATAGGTGGAAGTTTCGTTGCTTATATCGATAGCTACCCTGTAAGTAC:1 + chr3R 16342084 3' + P-element 2875 1 76.03 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAACTGAATTTTACAAAAGTAATTATAATATTCTCACGTTTCTTTATTTGCTCTAAAAATTT:1 + chr3R 13187546 3' + I-element 5324 1 59.59 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAAACTTTTAGTCTAAATACACAGCACTCGGTTGTAAGTCGAATTAAAGATAGAACTT:1 + chr3L 9269877 3' + copia 5067 2 56.35 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGTGTAACTTTATCAGTGTGCGTCGGTGTATGTGTGTCAAGT:1 + chr3R 25433366 3' - transib2 78 1 69.66 TGTATGTGTGTGTTTTTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTCTTGTT:1 - chr2L 18212122 3' - Quasimodo 36 2 58.26 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCAAATAATTGCGCAAAGTGTGCCA:1 - chr3R 12242233 3' - transib2 33 1 61.43 TTATCCATCATCCTTTCGGCCAACATTTTCCCAGGGG:1 + chr2L 12263781 3' - G2 191 1 89.19 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTTTTCCAGTGCAGTTATCCGAGACTG:1 - chr2L 7580847 3' - Transpac 4923 2 59.59 ATGTACAAATGCCTGTTTTGTTGACAACTTACTTAGTTGTTGTTGCTGCAGAGAGAG:1 - chr3R 29690730 3' - I-element 5197 1 63.16 TTATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATATATTATATATATATATTATTATATATTATATATATACATATTAATTAGGGTATTATTGATTACTGTGGG:1 - chr3L 21969813 3' + opus 453 2 71.23 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAAATTTAGGATTTGG:1 + chr3L 16970480 3' - roo 43 2 54.11 AAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCG:1 - chr3R 2522290 3' - Tc1-2 119 1 58.22 ACGCTTACTTCTGCCTGTTACTTACTTTTACTCTACGAGTAACGGGTAAAAAAAACCGAAGTCGCCCGATTAACCCACTCCCTTGCCACCAAATAACATCAATGCCAAAG:1 - chr3L 10796617 3' - INE-1 31 1 60.91 AGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTATAAGGGTCTGCTCTGAATATGTTGGCTTAAATTTGAGACGTTTTAAATATCCATCATAATT:1 - chr3L 12978398 3' + transib2 2679 1 58.22 GAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCA:1 - chr2R 23780531 3' + Ivk 5312 1 64.14 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCGGGGGTCAGAGATTTTCCCTTGGCGCGAAGGGGTGGGTTTGGGTGTTGGGGCTCACTGCCCTGC:1 - chr2R 20348949 3' - transib2 37 1 53.12 ACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTCTTTTAAGTCTCTTTATCTGTCTACATCAACATCTTTCGCAATTATTTTGTCTTTGACGTTTCTTTGCT:1 + chr3L 14211765 3' - 17.6 6997 2 52.74 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTCACAA:1 + chr3R 18093384 3' - I-element 53 1 52.05 AATTGCTAGAGGACGATATATTACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGTTCTATAGCACTATAGTGGTGCAGCAAAGGATCAGTGGAGCTGGGTCACTGCCAATGCCATGCGGAC:1 + chr3R 23491966 3' - transib2 53 1 52.05 GGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTCTCACAACTCGCATTTAGTTTTCG:1 - chrX 21639649 3' + gypsy5 356 2 74.77 AGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCAACAAAACTTGTATAACTTGTATAAAGAAAATCAGCTAATTGTATATGTATAAATATATTAATGTTTTTGCCTTTTTGAGAAATC:1 + chr2L 16189995 3' + Quasimodo 4 2 60.96 AAATATGTAAATATATATTTATATAACCATACATAAAACAAAAATGAATTTCACAAGAAGCCGTTCCGAATACGACTTACATACATGTGCTGTCGCCATAAGTCAGTTGCCTAAATATTCTTTCGGTTTGGTGTTGGATT:1 - chr2R 9970762 3' + G3 4505 1 70.71 TAAATTTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTCTTTGAATCAAAAAATGT:1 - chr2R 5883558 3' + 1360 3039 1 45.89 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTG:1 - chrX 10521656 3' - Tabor 88 2 75.34 AAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTGCTTTCCATCATACCTGTGTGGCTTGTGT:1 - chr3R 22590445 3' + rover 323 2 69.44 TTATTATTAGTATTATTATTAGCACGGGCATGCATTGTGGCGCAGAAGCCGAGCGATGCGATGGCTCACCCTTAGATCTATATATAAACAGCAGAGGTCACTATCCTAGCAGTCCAAAG:1 - chrX 2164399 3' - mdg1 41 2 74.79 ACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAATATACAAATTCCAGATATATAGTAAATAAGTTTTAATAAAATGTAAGCAAATCTGATATATTTTTTGTTTATTTCGTATGTAATGCATTGTTGTA:1 - chr2L 10209891 3' - S-element 1585 2 67.12 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACACTAGCTTAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGTACACGACTATAGCATAATCTCTGGTTTTAATGTATAACCCATTCGCTAAACCGAGCCACGCCACAATTCACATACACGATAAGTT:1 - chr3R 24279333 3' - INE-1 578 1 79.45 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGTTGGGTAAATCCCTTGGGTGCATAGTAGTTATCGATAATTATAACGTTGATACGAAAC:1 + chr3R 16342036 3' - P-element 60 1 43.15 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCAATAAGCAAATTACCCCAGTCC:1 + chr2L 15913343 3' + transib2 2770 1 56.16 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGC:1 + chr3R 10931741 3' + 297 344 2 58.90 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGGGAGAAGTTATATAAATCTTGGGAACTGTATATAT:1 - chr2L 12818263 3' + hobo 2892 1 65.05 GTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGTTCGGAGCAAGAGTTAGGCGTAAAATGATCTTACCGCTATTATAGAAACGGGTTGTTATAT:1 - chr2L 15960600 3' - Idefix 265 2 58.22 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATGTATCTATCTGTATAATATCGTTTTGTGCTGTTGTCTCTGGGTCAAGAAAGCGGTACCGTTACAATCTGCTCTAAAAAGATATTCAATTTATCT:1 + chrX 10537986 3' + I-element 5334 1 69.86 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTC:1 + chr3L 18505767 3' - I-element 36 1 60.96 TCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACATTTTTA:2 + chr2L 22224626 3' + Rt1c 5420 1 67.81 TTAATTTATTATTTTATATAAAATTAACTTTTATTCCAGCAAATCCTTTAGTAACACCTGCCCATATTCAACCAGAATGATATTTTTTATTTTCTTATGCTAT:1 + chr3R 26934385 3' - HeT-A 340 1 22.33 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGGAGAAGCACGAGTCTGTGTGGCATAGTA:1 + chrX 19588110 3' + roo 325 2 76.81 TTATTGTTTTCTTTTTTTTTTATATTTTTTTTTGCATTTTTTGTTGTATTTCTCACCACCCATCGGCCAACGCCTTTTGTGCGTGCGTGTTCTTCCGATTTGATTTTCCATTTTTTATGCGCATCTCG:1 - chrX 8327733 3' - transib2 2640 2 76.56 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGTCG:1 + chr2R 13931596 3' - P-element 95 1 21.92 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATATATACATTTCGAGCGGGGGCCAAAACGGCTCTCGAGTTTTTTGGCAGCCAAAACCTTGTGGCTG:1 + chr3R 10931743 3' + 297 383 2 68.81 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATCATTCCGTTTTTATGCTATTAATTTTTATTAA:1 - 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chr3R 15363892 3' - flea 13 2 70.49 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATTCCAAACTCAAATAAAATTAACCCACAAATTCGCGCCCTTTTATTGTCAGCCCTAATGGGGGCTCTTAAAAAGTGGTCTTAAAGAA:2 + chr2L 12251019 3' - 412 7088 2 57.53 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTCGAGTGGCGG:1 + chr3R 16157400 3' - pogo 18 1 64.04 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCCACACCCACACACACACACACACACACACTTATGTATGAATATCCAAAGTTGTTATTAGTATTTTAGTTTTGG:1 + chr2R 10909311 3' - hobo 7 1 69.23 GTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCACCGTGGCTCTAGGGTGGCACCATGCGAAAAATTTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATATAT:1 - chr2R 4826124 3' - Tc3 317 1 57.24 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGTGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGGCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACTCT:1 - chrX 10319572 3' - mdg1 7060 2 69.50 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTTCTGCCTTGTCCAGAAGCATGGGTTATTGGTAGCGGGCATAAAGGCAGATTATTGACACAACAATAAAACTGCACAACAATCAAAAT:1 + chr3L 6397786 3' + roo 9039 1 63.01 AAAATAAAGAAATTATTTTTTTATTATAAAATAAAGCAACTCGGATATTACCTATTATCATTTTATAGCTAAACTAAGTACCTTCCTTTAAACGTGTACTTACTAAAAGACGATCATGAGTTCACCACCTT:1 + chr3L 24034919 3' - pogo 2006 1 79.39 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCCATTGAACCGCTCTCAATATGGGTTTC:1 - chrX 21216708 3' + roo 9020 2 54.79 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAAATTTATTCTTTATAAAATTTAAAGAATAGGGTTAATATTATACGTTAAATGATTAAATGAATTCGACAAGCAACAAGCCATCAATTCATTTTAATTAT:1 + chr3L 11326816 3' - pogo 19 1 68.49 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAACCCGTCATCACTTAGTGCTGTATCGTTATCGTCTT:1 - chr2L 22193375 3' - roo 8683 2 74.48 CATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTCAGTTTATTTTGTTTAGGTCGTGTTCGATGT:1 - chr3R 556358 3' + Juan 4171 1 54.11 GTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAGTCCGTTACTGAATCCACCAAATTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGTAACTAAATTTT:1 - chr2R 4785216 3' - Juan 4062 1 57.14 CAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGT:1 + chrX 21994034 3' - McClintock 5971 2 71.72 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGTTTCTAATGAAAT:1 + chr2L 16564599 3' + roo 9044 1 60.27 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCC:1 - chr2R 11794979 3' + opus 449 2 78.76 CGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTCCAGTGTCTTTGATCTGAGTAACAGGTATGAAATATT:1 + chr3R 3748712 3' + 1360 3335 1 96.00 TTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAAAAATCACTTTTGCTGTTCTTATACTAAATAACTTTTTTAATTTTCACTTCTTGTCCTTGGCCTGCTGCTTCTTTTTGCTTATCATCAGTTGATG:1 + chr3L 4634465 3' - I-element 436 1 68.49 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTGATTAATATATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCA:2 + chr3L 18505721 3' - I-element 82 1 74.66 CAGTTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATTACTTTCATACTGTAAACCCTGCATTAGCTTTATCATGGCACTGGAAAACGAGAATGGTG:1 + chr2R 12314669 3' + Tc1-2 1564 1 79.45 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTGTCAGTCATTTTCGGTTTCTTGCACGCGCCAGTCGGCGGACAAAAAGTCATTGGAAATGTGACTGAAGTGAA:1 - chr2L 14675632 3' - 297 6612 2 60.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAAGAAACCCTTCT:1 - chr3R 15790795 3' - roo 13 2 67.12 CAGGCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGCGAAATTGGATTAGAATATTAACTTCTATAAACGGCGGCTAAATTTGTTTTGCCAATTCCTAGAGAAGTGTCATGAACATT:1 - chr2R 9158070 3' + mdg3 5422 2 68.15 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGAGAAAAAAAAGGATGGAAAAATAGGCAAGCAAGCGGAGGAAAAAATAGGTTCCATAGCATACTTTTATGCGCAATA:1 - chr2L 16946012 3' - hopper 32 1 59.26 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCATTCATCTATCTATGTTTGTGTAACAGTGTGAGTGGGACTATAAGCAGATAGGGCAGCTGTAAAATGTCGCCAATGTCAT:2 + chrX 8308519 3' + roo 9032 1 59.59 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATAACACCCATCTAAAAATAAATGCTGGCGAATTTGCTGTCAAAGTAATCCGAAAACGAAATCGAAA:1 + chr2R 13931633 3' - P-element 27 1 58.26 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGCGAGGACAG:1 - chrX 8437668 3' + P-element 2852 1 46.23 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACGATTTGGTAAAGGGGATTGAAAAACAAGATTTGTTGATTTTGTTTTTATAC:1 - chr2L 12134500 3' - jockey 4830 1 65.75 TGGATTAAAAAATGTTTTAAAAAAATATTCAAATAACCCTTGCTTTTCTTTAATTTCATAGTTATGGAGAATACTTCTTTACAGTTCCTGTGCACCATAAACTATCTGCGAATCGTTCATCTTTTGCTGCCATACTTTTATTTTAT:1 + chr2L 15351070 3' - Juan 3785 1 70.55 GGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTTTCATTCACAGTACGATGAAACATGCAAAC:1 - chr2R 5941360 3' + copia 5034 2 80.14 GCAATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAAGCAGACACTGACATAGCCAAAAACAAAAACTTAACTACATAA:1 - chrX 16280400 3' - Gypsy12A_LTR 2173 1 56.25 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTTGATCTCCCTGAAGACCCCATCTATATCTTTCCTCAAGCTATCTCACTTTATAAGGCT:3 - chrX 6116244 3' - transib2 60 1 59.59 ACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTCTCTGCGCTTTTTATTTTAAGCCGTGCTTGCGTTGCTGTATCTCTCTTCCCTACACACCAAAA:1 + chr3R 6726691 3' - hobo 2547 1 56.55 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTTA:1 + chr2L 12818380 3' - hobo 13 1 75.34 GTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTATACTTGATGCAGGTTTTCAACTAATTTGTTAAACTTCATCTTAAACTCCTTGCTT:1 + chrX 8312123 3' - blood 7179 2 75.00 AAATAAAGAAAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGCATACTTTTTTGCAGGTTGAAAGATATCGCCCTGGAAATTTGTTATTGTTTAAGCCGATTCTTAA:1 + chrX 19074871 3' + mdg1 7403 2 55.48 TTCATCATCATCTAATTGACCGTGGCAAGCCTCATCTGCATCAACATTGGCATATTCATTCCAATTAATAATCGATATAGAATCACGATATATAAAAAAGGATACAAATAAAAGGTCACAATGGTAAATAACTTAGGAACTACAAT:1 + chr4 300108 3' - pogo 1624 1 53.42 AAACAAAAAAATAAAAAATTAAATTGTGTCATTCCCAAAGCATCTAGGCAAGTGCTGGAAAAGCAGATAAAACAATGGCAAACAACTCAATTAACCCTTTCCTGCCCAAACCCCAAA:1 - chr3R 17593930 3' - Tc1 1398 1 57.26 ATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGACGATTCATTGACACCCGAATTAATCGAGGGCATGCAGTTGGTTAGTTGCTAGCTGATATGAACTTGATAAATTTGAACAACTCTTTAATCAGGAATCAGAATTTTA:1 + chr3R 6769730 3' - mdg1 7077 2 77.40 AACAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGCTTTCATATACAAATCAGCCTGGGC:1 - chr3L 16970333 3' + roo 9039 1 61.64 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATATGCATATGCATATATATACTTCTACCGACCATAAAAGCCACTAACCGATAGATAGGCCGCCGCTTG:1 - chr3R 4461008 3' - blood 7060 2 53.79 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGG:1 - chr2R 20227210 3' - hopper 53 1 54.79 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCCTGA:1 + chr2R 6847864 3' - Doc 37 1 62.77 ATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTCGATGGCAATCGCTAGGATTAATT:1 - chr3R 19992665 3' - hopper 63 1 74.14 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCA:1 - chr3R 5769035 3' + roo 321 2 76.03 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACTGCAATGCCACAATTGTGGTGCATACTTTTAGGCCAT:1 - chr3L 4219453 3' - jockey 59 1 52.05 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATCA:1 - chrX 6475302 3' - Doc 65 1 60.71 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACG:1 - chr3L 12004286 3' + P-element 2822 1 20.00 GCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGGGAATATTTTGTCAAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAACCAACCAACCAACCAACAAGAACGACTTAACGGAGCTAGAAAAGCAGCCG:1 + chr2L 13484518 3' - 1360 258 1 66.90 AAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTATGATTTATACAAGCACATTTTA:1 + chr3L 20187463 3' + FB 853 3 76.71 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGCTACCC:1 + chr3R 30347396 3' + P-element 2813 1 33.56 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCAC:1 + chr3L 24934410 3' + HMS-Beagle2 262 2 53.42 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCTCTCATTTCTGTGTGTAAATGTCGCCTATCAATGCTTAATAATGTCATAAAATC:1 - chrX 6475303 3' - Doc 72 1 63.01 CTTCGCNTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATAATCAAATGAAGTGAAAAAGCAATTTTCCCGCGCCTGCAGTTATACTATGATTCTGTT:1 - chr2R 16929747 3' - jockey 4522 1 60.27 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCAGTGGTACTGCATTTTTTTGAATATTTTATCAGCAATAGGTAATTGAAGGCATCGTTCAATTC:1 + chr2L 11298123 3' - I-element 37 1 50.45 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGT:1 - chr2L 4123838 3' - transib2 46 1 53.10 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACTTA:1 - chr2L 16539639 3' + Juan 4166 1 53.42 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAGATAA:3 - chr2L 7660896 3' + I-element 5309 1 51.37 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCGCATACCGGAGTCAAAGCATTTCTTAATTAAATGACGACCTCCGCCAGCGACC:1 + chr3R 15942798 3' + hopper2 1544 1 63.70 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTAATTGTTAAAGAGACA:1 - chr2L 16858654 3' + Burdock 6375 2 74.66 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAACTCACATTTAGCCACGTTTACACCCATCAAGCCGCAGT:1 - chr3R 25616527 3' + roo 326 2 73.97 ATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTGCTGGGGCTATTATTCAATATTTATTTTAGGCACACATGATTTCTTGTTTATCTA:1 - chr2L 11919029 3' - I-element 293 1 61.81 AAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTACGTTTGAGTTATTGTATGAATGAGAACTAGGTTCCAGGACT:1 - chr2L 12921050 3' - I-element 312 1 73.97 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCAGCACTCTGCTCTTTGTTTAGAGTGTATTGCGTGCCCACGGCGTTCCAAATTTTCCAGT:1 + chr3L 22960534 3' - Tirant 48 2 54.20 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTAATAATGCTCTCATCTTCAAGCTTTGCTGGCTTAGCTATTTCCATCAGTGCGTACAAGAATTCATGTAAACTCCATCTTTTTTCTTTTGCCGT:1 - chr2R 6421451 3' + roo 9025 2 63.01 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAAACAAGTGAAACCAGATCGCCCAAACA:1 - chr2R 8735575 3' + mdg1 358 2 64.38 ATTTATTGCAACCATTTATTTGTAATTGTATATATGTAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGCCACTATCACCGATTATATATTTCGGTAACCATCAAAGTTCATTGCACGACAACTGGAAGAAATGAGATTTAAAGAAATCAAAACT:1 - chr4 1242159 3' + 17.6 7413 2 54.79 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCCGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATT:1 + chr2L 12818336 3' - hobo 57 1 54.11 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTCGGTGTGATTGGGTATCGAAACAAAAGACCTCAAGCTGCTCGCATTTTCCCACTATACCCTTTATATCCCTAAACAGCATAATTTTCCACTCACTCATCCAGGTTG:1 - chr2L 15550618 3' - Bari1 17 1 70.14 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTCTTTAAAATGTTGTTCTGTAATAAATTTTACAACCAATCCACATTGTGCAAGTCTCACACACAAACACACACCGTAAAAGATTCTAATGAAATTCTC:1 + chr2L 16564603 3' + roo 9048 2 61.64 ATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGT:3 - chrX 292437 3' + G3 4497 1 72.60 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCT:1 - chrX 15357647 3' + hopper 1361 1 54.11 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAGGTATAATTTTTTCTGTAAATACTCTACAAATTCTATTGTTTTGGCAATTTTGAAGGCTGATCAGGGCATTGAATCATTAAGAAATTAACATTTAACATTTATGTC:1 - chr3L 10731723 3' + 297 6973 2 79.26 TATATGTATGTATACATATTATATTAATGTATATCTATGCCGGGGAAATGTTCATATAAACTGTGATATCGTATTTTAGAAAAATCCTGAGCAAAAGTACTTGGCATTGTGTATTAAG:1 + chr3L 13429353 3' + 1731 4412 1 89.83 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCCATAAATATACAGTAGAACTTCTATAAATCAAGACGCTCAATACCGCAATAGCCGTAAAACTTACAG:1 - chr2L 7660900 3' + I-element 5305 1 50.68 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCGAGTCGT:1 - chr3L 18930971 3' + I-element 5291 1 62.33 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAG:1 - chr3L 19454907 3' - mdg1 7081 2 54.79 ACATTTTCCTAAAGTGTGGGCGCGGCTGTTTTGGGCGGTTGTAGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCAAAAAGTTTTTGCCAAATCGATAGAAATTTACAAGA:1 - chrX 4797164 3' - INE-1 255 1 75.00 AAAATGAAATTAACAATGGAACTTACTCAGTTGCCAATAAACATCGCACCCGAATCAATACGGTACTCTGCGTCGCGAGCGCCGATCACACTCGGCACTCATAACGGAGG:1 + chr3L 23164938 3' + hobo 488 1 60.00 CCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACATTAAACAAGAAAATAATAAATAGACATCCGACCACATATACCCACGCAAAAGTAAAACAATAGCATACTAGTTCGTACAACTAGGGTATTTTATACATAACTCGCTA:1 - chrX 16091239 3' + I-element 75 1 73.97 CTCCACCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAACATCAACGACAAGAGGTAATAAAAAGACCAACCCCCAAAATGGTATGGGTGCTAAACTTGGAAGTAAAAA:1 - chr3L 6759886 3' + TART-B 149 2 79.53 ACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATGCTTAAATCAGGTGCCACAGTTCGATATGTTTGTGCTGTTTATTTCGACAGA:1 - chrX 13134796 3' + jockey 4847 1 64.38 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAAC:2 - chr3L 24228593 3' + copia 5083 2 68.49 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACG:1 - chr3R 23618145 3' + hopper 1334 1 73.29 ATTTATCCTGATCAAGAATATATATCTACGACTGTGGTATACCCTTTTACTCTACAAATAACGGGTATAATGATTTATTCCTTGTTTAAATGTATCATCATTTTACCAAGTGAGTGTGTTAGTGTGAGTATGGTTGTTTTGTGCGG:1 + chr2R 4387447 3' - INE-1 83 1 75.34 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCAAGACGGCAAAGTCAACAATGCGCCAAAGTGGAAAAGAGGGTTTGGGGTTAATAGGTGCTCAGTGCTGTTAGCTTTAAGATAGCTATGAAGCAAAGTCA:1 - chr3R 25433240 3' + transib2 2806 1 73.29 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGT:1 - chr2L 20265937 3' + roo 348 2 60.27 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACAATTCTTATGTATATAAGGGAACAACGGATATGCTTTATAGC:1 + chr3R 27133655 3' + opus 7471 2 68.87 CGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATAAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATACAAACAACCAACCGTCTGGTCAGCAAATTCGCATGCTAGGCCAGCAAATTCAGTTGGCC:1 - chr4 655154 3' + Bica 4508 1 60.96 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTG:1 + chr2L 12818347 3' - hobo 46 1 52.74 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGTAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGAAAGTATTC:1 + chr3R 18093380 3' - I-element 57 1 54.79 ATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACCGATGAAAAAACATACAAACAAACAATGCCACGGTGGAGAGAAAATACAGAAGCAATTTTCATGAAATTT:1 - chr2L 9200129 3' + gypsy4 469 1 59.59 AAAAGTTCAACAAACAATACAATAGAGTCCTAATTGTTATAGTTGCTAATTTGGTAAATATAACATAGATAATGGATGTTAAATGAGGAAGATACAAAGAGGGAAATCAT:1 + chr3R 15724146 3' + Juan 3956 1 80.91 ACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCACAAGCATGGAAAATAAAAATAATAGTGACAGCTGTTA:1 - chr3R 21644333 3' + X-element 4438 1 72.41 ATTAATTGATTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTGTTTTTCTCCCGTTCGGCAATCCATAAACGCACATAAATTTCACCTCTATCCGTTTGG:1 + chr3L 20092957 3' - TAHRE 56 1 41.78 AAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCAACTCGAAGGACGGCGCTTAGTGCCATTCCGTTTTCGCCTTTCTCGCTCACTTCCGGTCGCAGGAAGTGGAAGTCAAG:1 - chrX 9531440 3' + F-element 4393 1 46.58 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTAT:1 - chr2R 16817893 3' + 412 438 2 63.93 GACACAAGAACTCAGTAATCATTGCCTTTGTAGTTTTTTACAAGTCGCAAGCTCTAATGACAATATTGTAATATAAAGTCATTTTTGTAATTTATTTTCGGCCATTGTTAAATATTATATAAGCTATATTTAAATAATAATAATG:1 + chr2L 9008695 3' - hobo 331 1 66.90 AAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAAAAATTGTGAAATGAAAGAAAAAAGCGGAAAAGCTGAGGAAAAAACTGAGGAGCAGCCATAGAAAACTATTGGAAATGCGAGGGCCGAGACGAACTCAACTGTGTTGCA:1 + chr2L 11492684 3' + invader2 453 1 74.66 ACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACC:1 + chr3R 1844838 3' - Cr1a 182 1 67.12 GAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACACTCGCTGGTT:1 - chr3R 9038877 3' - Juan 4020 1 75.34 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTCATATTCAAATCAGTTGTCCAACTGCTCCATCTCGGCTGACAAACGGGCTGCACCTAGACCTTGTCAACGGGTTCGGTT:1 + chr2L 14675773 3' + 297 6934 2 58.22 AATAAATAAATAAATAAAATTAACAAGTGTATTTTACAAATTGACCGATTTACATTGACAGATTTTATATATAATGATTTTTAAGCGTTAGCTTGATACATTAAGAGGATTGGAACAGAATATATGTACAATCAAAGAACGCAGTT:1 - chr2L 22732201 3' + HeT-A 33 2 58.22 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGCTGATCTTATCG:1 + chr3L 1692128 3' + blood 7337 1 53.79 ACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAGACCAGCAAGAACTTCGTGTACATATTCCAGTGATAGTTGATAAGCCGTGGTCGTCACACGAGCTAGGACAGCCAGCATTGCCATCAAATGGGTAGTGGAATAGCTG:1 + chrX 21933330 3' + Stalker 6925 4 64.38 TGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAACGCATAAATATGAAAAATGTAACGGAAATCTTTACAAGAAGCGAAATAGGTGTCTTCTATATAATAAATAAACGCCAACA:1 - chrX 7922159 3' + F-element 4381 1 60.96 TTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCAGTAAAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACCGTAGTATTATATATATTTATATAATACATATTT:1 - chrX 283951 3' - Doc2-element 96 1 74.66 AGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCATCGCTGCCCCCGATCCCCTGACAGTGTCCAACCGGGGGTCAGTCAAGTGAG:1 - chr2R 22519744 3' + P-element 208 1 41.18 GGCTCGAAGGACCATAATGTTTATTCTGTGTTTCTTACCACTGGTGGGGAAACAACAGAATCACTCGAAAACTTAGCTTACTGCTTACACTTGACTTAAATGCAATGCTATTTTGAGAGAATTCCACGAAATTAGACATCTCTCGC:1 + chr2R 1340772 3' - GATE 268 1 57.53 ATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGGAAAAACGAGTGACTTTCTCGCATGCAGCAC:1 + chr3R 16892885 3' + 412 277 2 76.07 AGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGGTGTCTATCTTTCCATTTGCTGGGCAGCAAAGAGGACTATT:1 + chrX 14350184 3' - I-element 5050 1 74.66 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGA:1 - chr2R 20227202 3' - hopper 45 1 49.32 TGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATATGTGACATGAGAATCGTTTCGCAATCGTATAGTGTTTATTATTTTAAGGATTTTCCCTTATTGTGTGATTTTTATCT:1 + chr2R 13642901 3' - roo 9057 1 58.22 GGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAATGGGTTAAATCTTTG:1 + chr2L 1924056 3' - G2 2980 1 73.29 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACAGATTACGTTAGAAGTTCATTGCCACTGAGCGAAAAATGCGCTTGTTTTTACAACTACCCAAGTAA:1 - chr3R 9002906 3' + roo 9024 2 51.45 AAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAA:2 - chr4 1294990 3' + HeT-A 6017 1 65.75 AGTAAAATACTTTTTAAGATTTGTAAACTTATTTAGCGGTTTACTGGGCTAACGCATTACATTTTCAAAACTACTTTCAGCAGGATGATGTGTATTTAGACCTGAGCTTGATTGTTCTACATCGTTTTTTGTAATATTATAT:1 + chr3L 25828211 3' + Fw2 3881 1 78.87 AGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTCCTATCTGTCATAAAACACTTTGCCAAAT:1 - chr2L 13844190 3' + Stalker2 7557 2 78.08 ACATGTATTTGTGGCGGGGTTTTTTTTGGTTTTCTTTTTT:1 - chrX 12668915 3' - G6 1926 1 52.50 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTGAATGCGTAAGCGCCGGAGGCCCAAATCACGCATACGCCCC:1 - chrX 21216734 3' + roo 398 1 59.49 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGACTAGACAGAGTCATCCGTGACAAAATACCGGGCATTGGGGATATCTGCGAGAATACCTTAGACTCTGGAGAGAGAGATATTATTATAGATATAGAAGTGGG:1 - chr2R 3681694 3' - mdg3 5340 2 66.90 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGAAATCCGTGG:1 - chrX 18396096 3' + roo 331 2 67.81 TGTTAGTTAATAACTTGCCGTTTAAATTCGTTTGAAGTAGTTTGCCATACAATGTTAAATCCAACAAGAACAACACAGTGAACAACACAGTCAACAACACGAACAACAGCAGTAACAACAGAAACAACAACCTCGGGCTGCCC:1 + chrX 13943882 3' - transib1 451 1 58.04 CCTTCTATACTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGACACCGCTTCTGTCGTGTTCCTTGTCGGCATCGTTTGTGTTTTGTCCTTGAGGCGAAAAGGTGCTATACGAGAATATATTTATATGATTCTTCGCCGTC:1 - chr2R 25050815 3' - G5A 2790 1 77.44 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACATATAT:1 + chr3R 4679592 3' - hopper 20 1 70.55 AGAATATATATACATACATATATAGTATGTCTGTATGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGTTTCTTGTTGCTGACAATAAATTCATTTTGTCTGTTGG:1 + chrX 11541621 3' - 1731 4412 1 39.73 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGTGTTTTAAAACTTGAAGTGCATCGAACTTACCTTTAGGAGGTAGTAGTAGCCATCT:1 + chr3L 1279179 3' + roo 343 2 65.75 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCCGTCCTGTTCGAGCACTGACGAGTATCCACAAAAGTATGCTATGAAAATTTCGTTAGTGATGGGAAAAAGATAATGCATTTG:1 - chr2R 20227191 3' - hopper 34 1 56.85 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTTCTAAATTAGG:1 - chr3R 30946485 3' - Transpac 4953 2 60.69 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTAGACACCCACAAAAATATCCACTCAGCCCCAACCCGAAAAGCCACAGCTTTCTATAGAGTAACATTGCCACCCACCGGAACGAGCTACTGA:1 + chr3R 11937438 3' + flea 229 2 70.55 TACTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAAACTGAAAGTGCAGCTACATCACAAATAAAGTGCGATACACC:1 + chrX 12445614 3' + Doc2-element 4681 1 72.60 AAAGAAAATATAATAAAATAAAATAAAAAATGGGGAAAATAGTGCAACGAATGTCATTCGCATTGCACGCCGATCTTGAAGTTTATGGCGCCCGCAACTTGCTGAAAATTATGAATTATGATGCTGCGGAGTCTT:1 - chrX 14127921 3' - transib1 1902 1 79.26 AAGCGTTCGCTTTGCATATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACTAGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAATTCAAGGTTCTGGTTTGCTTCGGATGCTTCTAATGTGCCAAG:1 + chr3R 20543699 3' + Quasimodo 7246 2 69.23 GTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGTTTCATTTTAAATTGTAGCAC:1 + chr3R 15790151 3' - flea 4741 1 44.52 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTAC:1 + chr2R 8735680 3' - mdg1 7085 2 53.62 TTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAATCAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGCGCGATTCTTGATCTTG:1 - chrX 22641686 3' + G6 1993 2 56.55 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATATAGTACCCCTACAATCCTTACCTAAGTTCA:1 - chr3L 25598267 3' - 1360 72 1 75.00 CGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCCGAATATAGTTACTTGTTTTCAATTTTTCATTATCAACAGAATATAAAATTAGATTGACGCTGTTCATTTTGCAGTCAAGGAAAAAGAAATTCTATT:1 + chr3R 24139059 3' + roo 307 2 68.49 AGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGTGCCATTGCCTTATTTGCAATTTTCCCTGATTACTATATTTGTTTTTCTTTTTACAAATTTCTTGGCCTCTAATATGATTACGGGGATTTTCTACCCACAGA:1 - chr2R 15496507 3' - I-element 404 1 74.66 TATTATTTTTGTTTTTATATTCTTTTTTTTTGTTT:1 + chr2R 10599816 3' - mdg1 7051 2 77.14 ATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAATGTTTTAATAACCTTACTTGGCCAAGTGAGTATGTTGA:1 - chr2L 20029737 3' - Ivk 314 1 73.97 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGTGGAATGAAATGACCATTCACCATTCACCGCGTTTGCTATTGCGATTCCGTGTAATTGCGGTGCTC:1 - chr3R 27405961 3' - diver 5944 2 53.79 GCATGGATATAAATCAACCGAGTTTGAGCTACGTGAAAAGTTTTGAAAATAAAACGCTGTGTTTATGCTTTAATATGATATATTCATGCGATAAATTGTTTGTTGCGAATTGCTCTAGTAACGAACGAGTTTTATATTTGCTATGT:1 + chrX 19416909 3' - Quasimodo 398 2 73.29 ATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTACTTCGATTACTATGGAAAATGGCGTTGTTGTTTTTC:1 - chrX 5650546 3' - F-element 4273 1 75.34 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCC:1 + chr2R 16817972 3' - 412 7118 2 60.96 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATAAAATAGTTAAACGAAAAGTTAATGGTATAAATCATAGCCTTC:2 - chr3R 27083056 3' + jockey 4915 1 72.60 TTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCAAATAAAGTTCACTCAAACAGAGCAGACTCAATAATGCTCT:1 + chr2R 6493656 3' - transib2 2743 1 72.60 TGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAACTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACATACTCTTGGATTTTTATTTATTATACTGTTATGTGTCTGCTCACATGTGGCGTTTATTTGTTTTTCTC:1 + chrX 9581307 3' + diver2 4781 2 53.42 TATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTCTCGCATTACTTCCGCTAAATTAATACCGACTGCGGCTGGACCAGCGCTGGACT:1 + chr3L 13336049 3' + jockey 4854 1 63.01 GTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAACGCAGTATTTATCTATATAATCGAACCACAAAAGCCCAATGA:2 + chr3L 11844806 3' - rover 72 2 70.55 AATTGCCAACATAACACCTGTTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCTAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGGGATTTATAGATTGAATACATTGTTTTATTTTTTTTTCAGACCATTGTGGCTCTATCTTTTGCC:1 - chr2L 12054061 3' + mariner2 682 1 52.74 AATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGGCAGGACGACACTGACTATTTATGCGAATAATAATAATGGAGCTCTACGGTGGCGGGAACCCGGTTTTTTGGACCTTATCTACATATTGCAACTA:1 - chrX 2675954 3' + F-element 180 1 65.75 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATACATAAGTATCTCTATTATTAATCATGAAATGAAATATAAAGAATTTAGTTT:1 + chr3L 20898650 3' + roo 9036 1 60.00 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGCGGCGT:1 - chrX 8200174 3' - flea 4804 2 58.04 AGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGC:1 + chr3L 16973465 3' - S-element 60 2 62.33 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGGGATGAAGTTAAACGAGACACTCAGGGGACGAGGCGCATTA:1 + chr3R 11062811 3' + roo 325 2 71.92 ATAAGCCTTTGAAAGATTCTGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTTACCCGAAAAAAATATGAATAAGGAATGGGTTAAATAAAATATAATAAATGAGTTAAAACTGAGAGAGGACATG:1 + chr2R 4545162 3' + invader1 3533 1 47.14 TTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTCGGAGGAGCCTGCGGCGCCTTTGCATAGAAAAATAACTTGCTTTGACATTAGAAG:1 + chr2L 18347426 3' + transib2 2804 1 70.34 GTAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCACACGTTGATCTTATCGCCGCTGCACTGCACACACCCAAAAT:1 + chr3L 1692153 3' + blood 350 2 66.21 AAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGATACATGTCCATATGTCGATGTCAGTTCGTTGCCTCAAGAAAATTACCGCGATGCAATTGTGTTG:1 - chr3R 22590473 3' + rover 294 2 57.24 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTGACAACGAAAACAACAATGCTTAAAATGCTAAACTAAATACGTTAAACATGTATAAATAT:1 + chr3L 14720911 3' - F-element 52 1 49.60 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCC:1 - chr2R 22287434 3' - jockey 59 1 60.66 TCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTAATTATACAATATATAACTCCAAGAAGAGTATTTTAATACGGCAGCAAGCTGACAGTTAGAACATGCTATCTGCACAAATAAACATGTAAAACCTACAAATC:1 - chr2L 21338938 3' + jockey 4803 1 71.92 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGGAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATG:1 + chrX 8092505 3' - pogo 44 1 54.11 TATTTAAACTATTTGGAGACAAGTTGGTTACTTTATGGCTCGAGAGAGGAGTTGCCAGCCCTGGCTCAAGAGAGGAGTTGCCAGCCCTGGATTGAAAGGCAGAGAGAAAGAAGGCAGTTCGAAACGGGACAGTGAAGG:1 - chrX 22564571 3' - Transib5 71 1 71.74 AGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGCCTGTCCGTCTGCCCGTATGTTGGTATGATCGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGGTTGAAATTGGATATTGACATTCATAGATTCAGGCAGGTTCAAACAGATTGTTGAATTTTCAATCTA:1 - chr2L 22097807 3' + INE-1 105 1 56.16 TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATAC:1 - chr3L 11913212 3' - BS 5078 1 74.66 GGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTGTGTGTTGAAATGAACAAGTACGATTACTATTTCCATTTCCTTGAATACATGTCCCTCTGATGGACCTGAACTGAAAGATTACACCACCGAAAAATTTGGTGAGCTACTGGGACACA:1 + chr3L 18082763 3' - Circe 7370 1 71.92 CAATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGCGTCATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAACATAATGAAGTGCTAGGCAAAATTGCGTGGAC:1 - chrX 11468071 3' - BS 4678 1 75.69 ACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGAAAAGAAGGACACTAAGGGGCTCCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAAT:1 - chr3R 12100171 3' + X-element 4617 1 80.14 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTAACCTCTTTGTCCCGAACACAGTCTTTCATGGCATGTCGGCGGCTT:1 - chr3R 8075907 3' - 412 7129 2 67.81 AACACACACACACACACAGATGCAGGCAGCGCGTAATGGCGCGTAAAGTGTTGCGCCATCTTAATGCGTGCCCAAAACCGCAATTCATGGCCGCAGATTCTTTCTCTGATAAGAAGCAGCAGCATTAGCCGGATAGTGAAAGGGGA:1 - chr3R 20898849 3' + accord 184 3 69.86 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATGGCTTTTCAGCACGCCCGTGTTCTGGCAATGATCGAGACAGCCGTGGCGACAAATCTCCACCTTGCACT:1 - chrX 11767377 3' - Tabor 52 2 54.79 GAACGTCCAAATCTCAGGAACTATAAAATCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTGTTGACCCACCTTGCCACACACACGCACATATAGCTAGGAAAAAGCGAGGATAACCCAACCACCAAGCAC:1 + chr3R 30950556 3' + INE-1 141 1 58.14 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATTTAATTCTGAATCAAGATGATTAT:2 + chr3L 3501820 3' + Bari1 1648 1 58.90 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGT:2 - chr3L 15913866 3' - jockey 4837 1 72.41 AAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGCCACTATTTGATACTTATTAAGTAGAGCGGTACTGTGCCACAGACAAGCAAGTGCATTAGCCGA:1 + chrX 19980726 3' - X-element 4510 1 56.85 GAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCGACTTGGCATTATTGTGGTCTTTAAGCCACAAACTTTTAGAAACTGTTTTACACATT:1 - chr3R 26178376 3' + 412 429 2 58.90 AAGTGGGATCTGTGCCACTCCCTGCATTTTCTGAGGATCAGTGGCGTGCAGTAGTGGAAATGCAAAATCGGAATTTGGCTGAACTTGTAAAAATCATGCAAGTGACGCCGATACGTATAGCTACCACCCATCATATACATAACAAA:1 + chr3L 9428465 3' + micropia 481 1 75.34 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCAT:1 - chr3L 16970369 3' + roo 339 2 67.12 ACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTTATCTTCATTATTTTCTAGGTCTT:1 - chr3R 904899 3' - rover 6959 2 67.81 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATTTATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGG:1 - chrY 495742 3' - Doc 69 1 81.54 ANACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATGTATATAAATGCTTTTCGGTCTTTTAATTAGCAGCCCTCGGAATGTCTGG:1 - chr3L 5061553 3' + 17.6 421 2 65.75 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGGGAG:3 + chr2L 47218 3' + roo 9037 1 61.64 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAGGAGACCAAGCCGATC:1 - chr2R 14051709 3' + roo 401 1 72.39 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATTGTCCCAGGGGATAAAATGGTAATAGTTTTTATTTTCTAATTTGTAA:1 - chr2R 3564056 3' - Tabor 6914 2 66.44 GTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAATAGTAAAGCGCAGAACGACGCGAGTGAAAGTGTTAAAACAAAAGTGATAAGCTACCAT:1 + chr3R 15994825 3' + I-element 5213 1 54.62 ATATAATTAAACAATATTTGTTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCATGTTGCTTACAAGTTGCAGTTTACGATCAAAATA:1 - chr3L 17567897 3' - S-element 1609 2 75.34 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATGTACATATGCCGCGAGCATGGGTCAATTTAACACCCCACCCCC:1 + chr2L 20821281 3' - Burdock 6213 2 73.97 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTAATTATAATCAATTAACCCGGGTGGGCATGTGGTGCCCAGCAATTT:1 - chr3R 6625713 3' + flea 197 2 67.42 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCGAACTAACGGTCATACTGCGTCGGCCATTTGTCATTGTGAGCGTGACAAAAATAAGTTCTCTGAAAATC:1 - chr3R 16341928 3' + P-element 2853 1 57.03 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCTATATGTTGGTATGCTATTATACTTAAATGTTCTTTAATATTACATAGGCACATACTACACCCCTCTTCCGACCATTTCCCAATATTAATTATCAACAAGTTGCACTTGGGCAGGAAAAACAGA:1 + chr3R 9933804 3' - 412 7113 2 58.22 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGCACTCC:1 + chrX 10521772 3' + Tabor 7305 2 69.86 ACAACATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAAAGTCCCTTAACTCAGCCTCTACCAAATTCATGTTGACACCGCTATTTCGCCCAAAATAATGGAAATTATTACCGTTGCCACTTGTAGGTTATTCGTCGTAATCGATTGCAGGG:1 + chr3L 27339565 3' + HMS-Beagle2 6926 2 54.11 GACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACATTCAGGCAGTTTCAATATGTCGGTTTGCTGTATCTTGCTGAT:1 + chr2R 15005124 3' - BS 5045 1 52.74 ACTCTAAATAACGTCCAAATTCCACGAAATGATTCAGTCAGTTCACTCTGCTCAATTGCATGTGGTTTGCCATTGGATCGCTGATGCAGCAAGGATGTGACTTTTTGCCCAAGTAAAGATTTGAGTTTA:1 - chr3R 20861971 3' + Doc4-element 2389 1 72.87 GCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATC:1 + chr3R 2412144 3' + R1A1-element 5261 1 67.12 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGGTATGTAATTTATTTGGGTTAATATATTTTTCGCAGTGTATTGCTGCTGCTGCGTCACTTCACATTCGTATCATTTACATACGCAGCACTGCGGAGTGAGT:1 - chr3R 23067387 3' - roo 18 2 70.34 AGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGAGGGATCGGGTCCTATACCTTCGACAGTAGATGGACCATGGCGTACTATTATGGAAATGCAAAATACAAATTTAATTGCACTTGTGCTTGCATTATTTGTCTGGTCCTGTT:1 - chr3L 23420604 3' + invader1 396 2 79.45 TTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCACATCTCAAAAGGGCCTCGGTTTCTTTCCTGAACCATAATAAATG:1 - chr2R 12402657 3' - 412 7454 2 67.39 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGGGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAACAACGGCC:1 + chr2R 6847861 3' - Doc 49 1 55.48 GCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGAGGTGAAATAAAAAAAAAATTAGATAAAGCGTTATTGAAACATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAACAATGAATCCTTCGGACTGAGCCGGATTCATCAGAGGCTGATCGG:1 - chr3R 9855044 3' - accord2 7345 1 67.59 CGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTCAAAGATATTT:1 + chr3L 11257437 3' + 1360 25 1 59.31 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAA:1 + chr3R 24381369 3' + Juan 4138 1 74.07 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGGGGTGATTAACCGTTTTTTAGCTTCATAAAATAATGTAAGATGTTATAAATATATGGAAATGC:1 - chr3L 21996124 3' - Transpac 4946 2 71.92 ACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTACCTTTGAGCCTACAAAGTTAAGTTGGTGGCGC:1 + chrX 19980663 3' - X-element 4573 1 77.40 TAATGAAAATATCTACAAATCAACATTTTCTTAAAACTTGTAAAATATGAGTTATCAAACAAGAAGATATTAACATGAATGAAATGTATGTGATGTTTAAAGTGAAATAATTATGTAATAGTTATAGGCCTGATTAACTATTTCAT:3 - chr2L 3992088 3' + gypsy10 406 1 70.55 TAAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCTTTAATTTAAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTCCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGGTCCTAAAAGAGAGTCCTAATCTCAATCTCTCGCTG:1 - chrX 15076779 3' - S-element 82 2 91.78 AACGGGTATCTGATAGTCGGCAACTCGACCGTAGTATTCTCCCTTACCAATCTTTGTGGGGCTTTGTCAACAAACTTTCAGAACGAAGCATTAAAAATGTAACTACTTTATTCGGGGGCACATTTAAAAGAGCTACACGTATGTAC:1 + chrX 4206628 3' + INE-1 553 1 67.12 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATGATAAGCTTAATTGCAAGAAGCTGAGGTCGAAACGAGTCCAGATTTTGATAAGCGTGTCTGCATCGATTAGTACCACAATAAGCCCTGT:1 + chr3R 9003043 3' - roo 30 2 65.07 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAAATAAAAATAATTGGCAGATCGAGTAAGAGAACTAAATAAAATTGCAAAGTGCCAGGCTATCAGATTTAATTCGGGGCAATTAAAAATTGCTATTT:1 + chr3R 24381424 3' + Juan 4182 1 68.49 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACA:2 + chrX 17678734 3' + flea 204 2 55.48 CCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTTGCCTGCGTGGGTGCGTCGCTTGAGTGGCTCCTGATTCCGAC:1 - chr2L 8338104 3' + P-element 2885 2 76.60 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCTCTTAGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCCGTTAAAGAGTCCGCTATAAATCTTTTATCTGAG:1 - chr3L 22960407 3' + Tirant 8470 2 56.85 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGGGATTATATCTTAATGTAC:1 - chr2L 9782109 3' - P-element 102 1 15.75 TACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATTGTCTTCACGCGTTTGTCTGGACATCAATTCCCATCAGTGTTTTTTCGAATTTAGATAGGTAGATCGGCCACTGGCCACTAATTAGAAAATGCACTGGCGTGGTTGG:1 - chr2L 23008321 3' - transib2 213 1 67.59 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATC:1 + chr3L 27391417 3' + 1360 3361 1 61.38 AATCTCGGCTCGATGCCCACCTGATAGCTGCTTTGTTTTTGCCATTTTACAAATTACATGCTTAGTTTATCTACTTATTTTTTTGTAGTTAAATTGATAACATATCTTTATTTATTTATATACCTCCGCCTATTGCCATGTTTAAA:1 + chr2R 4803258 3' - Bari2 278 1 53.42 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGAGTCAATAAAATTATAGAAAATCGGGCGAATAAACATAGGATTGGATAACTCAGATCCGAAAGTG:1 + chr3R 19032704 3' + roo 9017 2 58.22 TAATAATAACAATTATAATGATAATGATTTATTTATACTTAAATATCTTTATTTGTAGATGAAATTTGAATGGGCCATAATATGAGCATATAAACAGGCAACGTAAAAATATAAAAAGTCTCTAAAAACCGGGCAGTTTAAAAGGC:1 - chr3L 10405135 3' + mdg1 7065 3 50.68 ATGTTGGTTGTCATATTAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACAATATAAACTCAGGATATATGTGGGATTTTAGAAATTTACACAGTTATGTTGACCATTT:1 - chr2R 17926298 3' + opus 7444 2 60.27 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCTTCAATCAATTAAGTCCGTCAATCAACTTGACACAGCTCATATTACGGGTTACACGATG:1 + chr3R 31653167 3' + roo 9026 1 56.06 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGAGGTTCACGTATCCTTACCGAAGCTATGGTTGTGCGTATCGAAATCGCGGAAAAAATAGTTACAGCCAAAGTTTTGTTGTTTGGGACAAGATGTCATTACATGTGCTGAGTT:1 + chr2L 22199747 3' - 412 9 2 75.34 CTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCACCCCCTCTTGAAAATATTATTGTATTATTGGACACATTTTTTAGTTTATTTGAAAATTTGCAGATTTCTTTTTATTAATTAATATCTTTCGATT:1 + chr2R 5124522 3' + INE-1 562 1 90.16 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGAAGCCGGCGACGAGGACGGAAAGGACGCCATGT:1 - chr3R 20140504 3' - jockey 4759 1 78.08 CATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAAATAATAATAA:1 - chrX 15148857 3' - micropia 138 4 53.42 AAATCTTAGATGTACTGGCTTTTTGTGCTGTTTCTGGGCCTGGGACAGCCGCACTTGCCGTGTTTTGACTGGCCTTTTGTCTCTCGGCTGTTAGCTGCAGGTCCACAATTGTGCAATATTTTTGTCGCCAATTAAATCA:1 - chr2L 18467403 3' - Tom1 244 1 78.42 AACAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATGACTGGAGCTGATTC:1 + chr3R 19445621 3' - INE-1 580 1 77.33 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTAC:1 + chr2L 23295886 3' - micropia 4998 4 51.11 AAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAAAACTCCAATCTCAGCAGCAGATAAATA:1 + chr2L 21657076 3' - invader1 3657 2 74.66 AACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGCGGTTGTGTCTAAGAAAGTGTATTTGTTTAGTAAGTGGAAAATCGAGATAAGTAACAGTACTATAAACATATTCCAATTTGTTTCAAAATTCCCGAAAA:1 + chr3R 6044245 3' + mdg3 5098 1 73.29 CATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGTAAAGCGAGAAGTTGGTATAGTGAGAGCTTTGCGAGAAGCGATCTACATTGCTATCTTTTTAACTGGTAACGCCAAGCGATTCCAATATAAGTATTTATATATTTTTGATTCAG:1 - chr2R 4916832 3' - S-element 385 1 80.69 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGTGCACAAATG:1 - chr3L 6397666 3' - roo 70 2 63.01 TAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCAAGGTTCCGCCGCCTAATATTAAGCCAGATGGGAAATGCTCGGC:1 + chr2R 12400500 3' + P-element 2727 1 32.88 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCG:1 + chr2L 6103028 3' - roo 64 2 63.70 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCTGCGTTTT:1 + chrX 7795626 3' + roo 360 2 52.74 ATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATGTTGACTCTCTGCTGCTCTTAAAGCACTCAATTTTAACTTTTAGTACATAAGTACGTACTACTTACGTAAGTTAGTAGTTTTTAGTACATAATTACAAAGTCGTCGTCTTCCTCAAGTAC:1 + chrX 22993830 3' + Cr1a 4212 1 54.11 CAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 7552 2 68.49 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAGTAACTAATGTCTGCAAGAGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGCCTT:1 - chr3L 22890371 3' - FB 69 1 67.15 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGCCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGGAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCA:1 + chr3R 15072672 3' + pogo 2049 1 54.11 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTCTGACGAACAAGTTTAGAGAGCAACAAAAGAACTCGGCGAAGAATAGAGTGGCAATTTGGGGGCAGTGGTTGTAACCTGCA:1 - chr3L 7300100 3' - roo 20 2 71.23 CAACAAAAAAAAAGAAAATAAATCGCTTAGGGGATATTCCCCTTTGTCAGGCCTTTATACCGATAAAAGCAAATATTTATGTATATTTCAACACACGCAATCAGCCTAAGAATACCAACTGAATACCAAGCCACATGGTACAAATC:1 + chr2R 10387694 3' + gypsy7 5003 1 72.60 CGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAGATAAAAAAAAAAGGTAATTTTGTTCGATAGAAACAAATGTATTCTAAATTTTGTAACTAGGAAACAAGTTAGTTAAAAACAAACATAACAATGCCTTTTTGTGAG:1 + chr2R 21411015 3' - Burdock 6151 2 74.66 AGCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTG:1 + chr2L 47198 3' + roo 9017 2 52.74 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTTAACCATACTAAATTAGGTTCATATAATGCGGATTAGTGAGCAAAGCTGCAAACTCTTT:1 + chr3R 20441320 3' - I-element 61 1 58.04 ATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTACGCACCGCTGCCGTCGGGCTCCTGCTCCTCCATGATAACGTGATCCTGCTTACTGCGCAATTTCTTGCTTAA:1 + chr3R 15366392 3' - flea 4836 1 63.33 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATCCCTGCGTTTCGGGTGGCG:1 - chr3L 6447060 3' + transib2 2748 1 81.45 GTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGATACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAACTGCGAATTTGCTTTCCTGCTCCACAGCTGCACATGTCAGAGACTCG:1 - chrX 7144652 3' - 1360 2993 1 67.81 ATTCGAATAAACCGTTTCAAGAAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTATATCCTTCGATGGCATGGCCACATCGTCGCAGAAAACAGTGCACTTTAATTGGCAATATTAAATG:1 - chr3L 4883663 3' + Stalker3T 289 1 55.48 TATTATTACTATTATTACTATTATGTTTGCTTAATCTGTAGCTTTTGGTGGGCAGAGGCGTGATAAAGGGGTTGTCCAACAGTAAACACCTTCAAATAATTATTTAGGAAATAATTGCTTTACAATTATCTGACATTTATAAA:1 + chr2L 5342589 3' - mdg1 40 2 59.44 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTAAATTGTAGTGCGGTTTTTCCAGTGCGGTCA:2 - chrX 19054276 3' - jockey 97 1 78.08 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGATTACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAA:1 - chr2R 22287447 3' - jockey 85 1 74.07 CAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTACATATATTTTCTTGATCAGAATCAATAGCCGGGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTACTGTCCATGTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTTTAAAAGCTAGAAGGT:1 - chrX 392288 3' - HB 22 1 73.29 TTTTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTCTGCACCTATTCTCTCGCTCTCACTCTCTCGCGAATTTCCTTTTATTATTATTATATATTGAAAACATAATTATTAAAGATCCGTTAGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGC:1 + chr2R 1879502 3' + Cr1a 258 1 57.53 AGATACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGGAGAGGCCATTACAATTGTATAAAATTAACATGTGCTGTGAAACAAGTATTGCTCGCAGTTC:1 - chr3L 18900748 3' - 1360 2968 1 68.28 AAAATAAAAAAAACAAAAAAAAATAACCCAAGGAGACAAGAAAATTGAGGGGGGTGCCAAAAA:1 - chr3L 5259162 3' + F-element 4686 2 80.95 GCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCAAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTTTGTCATTCCAAAACGCCCAAAACT:1 + chrX 22689467 3' - mariner2 43 1 68.49 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTTATCACCTGGCCTGTCCCATTACCATTAATCGACAGCGTCTTGATGAAGTGCTTGGCTCGTTATCGCTTTATCGTTATCGAACTTTT:1 - chr2R 13931504 3' + P-element 2870 1 73.08 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTCAAATGTTGTAAGCCAAAGTGATAATTCATTATTTATTAAGACAACATGTAAACTCACTTATTGGGACACTTCCAACGAAACCCATTGACCT:1 - chr3L 14366494 3' + roo 9047 1 69.86 TATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTATTCTAAAATCGAACCTTGAATAAAGAACCACTACTGTGGAGTTAAATAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAAC:1 - chr2R 4206652 3' - 1360 3021 1 73.33 CATTGTTAATCCCTTGTCCGTAGTCAATTCGTTTACTTTGATTACTATTGGGAGAAATTACTATTACTATTGCTGATACGATACACGACACGGAGT:1 - chr3R 3128991 3' + accord2 7402 1 39.58 CTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCCAGCCAACCAACCAAGCGAGTGCTGCCCCTGCAGCGACATCCACGACTACATCCTCAGTTTCCACCACCTCCAACCAGGAGATGGATACACTGGGAAA:1 + chr3R 28578377 3' + F-element 4460 1 69.86 ATGGGTAACAGGGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTCAGGGCAACACTTATCGCCTTATCGACTTAACGCAATTTAAATATAAATACCAGTGGCTG:1 - chr2L 17809143 3' + jockey 4969 1 65.73 TGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAACCCGAATGGGGTGAGAGTCAAGGGCCTTACAGGCATGAAATTTTTATTGTTATGTTGA:1 - chr3R 25454686 3' + Porto1 4277 1 60.96 TTTTTATAACTATTTTATTTTACAAAAAAAAATCTATATTTTGAAATGATAAGCATGTTCTAACAATATAAGAAAAGTATAGTTGATATAAAATAACTCCTTAGTAATTCTGAATAATATTTGTGTGCCTTCCTGCTAAAGCTCAT:1 + chr3L 16476964 3' + 1360 3093 1 69.18 TAATATAAATATACAAATACACAGTATACAAATACAAAAATACGAATAGAAATATAATGCTGTATAAAGTAATCACAACTTAAAATAAATAAAATCTTAAATAAACAACTTAATAGAAAAATCACGTGTCATAACTTCAAATCACG:5 - chr2L 21750067 3' + Stalker 6938 4 56.16 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCA:1 + chrX 8092501 3' - pogo 48 1 54.11 TTAGTCGAATAAATGATCCGTCAATAACAAAGACAAAGATATGAAAGATAGATAGATAGATTTGTATCTCAATCGTAAGTATATAGAAATCCCAACGCGGTTCGGTAAATAAATAACCAAAAGAATTCACAATCAGTCA:1 + chr2L 12493189 3' - Tom1 370 1 67.63 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAACGGACGAAAACGAAGAAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGAGAGAGGACAGGCAAAGTGCC:1 - chrX 8437658 3' + P-element 2822 1 41.78 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACGCCTGCGCCTG:1 - chrX 2214254 3' - jockey 4823 1 60.27 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAGGATTGGCATTGATGTCAAGTCTTGCATTTTGCGCAGCATCTGTGATAGCAAGAGATTACTGCTGCCACCGGGTTATTCCACGTTGCAGGACATGTTGCGAGTGGGTTT:1 + chr3R 24369176 3' - roo 8667 2 78.10 CAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGGTTGACATATTTGATTTCAATTAGTTCAGCTGACAGGGGACCAAAAACCCAAGAAGGACACATTTGAAATCAGCGTGCGA:1 - chr2R 14380453 3' + Dm88 4286 1 56.15 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATATATATGAATTACAAGAGTATTTAACATTTTGCTATTTTGCTAAATTGATTTAGATTCGATTAATTAAAACTAGGGTTCGATAGGGGATTTTCGG:1 + chr3L 14094721 3' - I-element 24 1 67.81 TTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGTAATAGTATAAGTGAAAAAGTCTCTCAGCGAATAGGGA:1 + chr2R 5303198 3' + FB 242 1 76.71 TATCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCCAGTTCCAGGGGATTTTTTTTAACGAAGTTAGAGATTAGTCACCAAAACTAAATTTGCCATTTCATGGCGAAATCTCTCATAAGCAAAGCATTCATTTTC:1 - chr2R 7230712 3' - Quasimodo 38 2 81.51 GTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTAATAAATACACAACCAGAGCAGAGCAGTGGGAGTCAAAAAGAAAAATCAACACTGCGGATGGAAG:1 + chr2R 10921608 3' - I-element 183 1 56.16 GGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGCGTCATGGCTAAAAACCACGACATGAAAACTGCATTAAATCATAAAACAACAGTTTTCCGA:1 + chr2R 23720202 3' + Osvaldo 455 1 68.42 ATTATTACTAATATTATTATTATTATTATTATGTTTATTGTTATTATTATTATTATTTTAATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTATTCTTATTATTATTATTTTTATTTAGGGAGAGATTTGAGCAGGCAAGCTCCCGCTCTA:1 + chr3R 2862992 3' - mdg1 7080 2 74.66 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACATTTTCTTCTTGTCTTCTCTC:1 - chr3L 16690852 3' + I-element 5346 1 66.21 CGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGAATATGCCACGCAAATGAGCAGGACGGCAAGCAGGTTGC:1 - chr2R 18315994 3' - HMS-Beagle2 24 2 67.81 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCGGGCTTTTGGACTCGGGTGCACGGATAATGATGATGACTCAATTGACGTACAATGGCCAACTTTCAAGTGAAGGAATTAAAGGCAAAGTATCATATCAAGTTCTCCC:1 + chr2R 16818021 3' - 412 7069 2 72.60 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGGTTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGTACATATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGT:1 - chr2R 15004746 3' + BS 5045 1 52.74 ATATGATAATAATAATAACAAATAATCTTCCCGCAATTCTATCATTTTTTAAGATTTTAGCTTTAGCTCATAAATCTTAAAATATTGTAGTAATAATAAAATTATTAGAGTGCCATAGTTCTTGATAAACGCTTATCTAGCATCTT:3 - chrX 12961664 3' + invader3 5058 1 47.26 CTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGCCAGCAGAATCCGCTGACGCACAGTGGTCACGATTGGG:1 - chrX 9615790 3' - diver 106 2 72.00 AACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTTTTTCATGCCGACAGTGTTAGACAGGAAATG:2 - chr3L 21655867 3' + HMS-Beagle2 7150 2 49.32 GTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTT:1 + chr3L 24208234 3' - Quasimodo 35 2 59.59 ATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTTTTGCAACTCGCGTAAACCGCAAATCCGTGAGTTGTGCGCCGGTGTTTTGGCCAAGATGACGGCTGATC:1 - chr2R 9169480 3' - mdg3 415 1 70.53 TAATAATATTATTAATTATTATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTATTATTAAATAATTATTAATTATTAATAAGCTCCTCCCATAGATCTTC:1 + chrX 2582973 3' + mdg1 45 2 60.00 TGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGT:1 + chr3L 23702299 3' - G4 19 1 68.49 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATGAATTTGCAAAAAAATTAAAAATGGCACTTTAAAGAAATCCTCCAAGTG:1 + chr3R 17077188 3' - roo 8735 2 68.49 CACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTACAAAGGAGAATCAAGTATTATGTATGGCTCCGGGGCTTCGTGGGTTAAGGTGTGTGTGTATGTATACAGTTGGGGTAATTATTATCTATTTATCTGGGGACGGGGCTGTT:1 - chr3L 21920744 3' - gypsy5 283 2 56.85 AATAAAAAAAAAATAAAAAAGAAATCACAAAATGTGAAAAACTTGCCCCTTTCATACGCTTTTATCTGAATAACGAGGAAAAAGAATCGAAA:1 - chr3L 2394691 3' + Rt1a 5078 6 57.61 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGCATATATAGGAGGGCATTATCTTTCACGC:1 - chr3L 16970357 3' + roo 351 2 58.90 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTTTGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCAACGAATTTAATTATTATAAATAAAAAACAATTGGAAAATGATTACA:1 - chr2L 21367227 3' - Doc 79 1 66.44 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTGCTTGATCTTTTATTTCCTGGGAGTGCTTCAATTTTGTTTCAGTCAACTCATTGATATAACTTTCGTTGATATCAGCGAGCT:2 + chr3R 15791029 3' + roo 9033 1 58.90 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGATTAATATTGTTATTTCTTTGCTGCATATTAATATGAAATTTGTTGCATACTTTTGAGCGACCGTA:1 - chr3L 5489881 3' - jockey 66 1 54.11 GTTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATACCCCTGGCTCTGA:1 - chr2R 18316032 3' - HMS-Beagle2 6945 2 56.85 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAACCTATGTGAATGCCTATCTGACCAAGGTCGAGGAGAAGCTATATCCCGCGCCCGAAGATCCAGAGAAGATCATCCAGC:1 - chr2R 16590872 3' - 412 7132 2 53.42 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAGCTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTG:1 - chr2R 22034652 3' + copia 5062 2 61.38 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAAAACGTCACTATATATATATATTTAAAACCCATAACGATTATTGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTGTAG:1 + chr2R 10411450 3' - 297 49 2 60.74 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGTCATGCTACCAAACCACAAGAATGTT:1 - chr3L 15913865 3' - jockey 4837 1 71.92 AATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTATTAGTGATTTTGTAATGGTCAGGGTCTGTCTGTTCTACATTTTTGGTTGGTTTAAATGGGTTTTCTAATTTGCCT:1 - chr2R 2127178 3' + 297 6845 2 60.43 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGTCCATTCCCTGATATATGCCCGTCCCTCTCCCTGGCAAGC:1 + chr3R 30347391 3' + P-element 2808 1 30.14 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATATGCATGTACGTTTGTCACACGATTATTGTAGATTACGTTCAATTCAATTCGATTCGAATCGATTTG:1 + chr2L 11878392 3' - blood 44 2 52.63 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTCTTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGC:1 - chr3R 6419804 3' + Tabor 7303 2 67.36 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTGTATTCAAATTTGTGCCGCCAAAGTGAAGTTGGAAGTTGGAGACACAAAAGGGGAGCAGACTCCAAAGAAATGCCGCAAA:1 - chr2L 4063815 3' + roo 9034 1 58.74 ATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCTATTGAAAGCTATTATTTCAGGAACTATCCCGAAAAAGGAAAGGCCTCCACATATAAGCGTAATGACCAGAGGAGACCTATAGAGAATAAATCAGACAACCAACAGTCTTA:2 - chr3R 2522239 3' - Tc1-2 68 1 65.75 ATTATAAAATAAATTTCAAAAAGGACTTATAATAATTTGAATATTCAGCTTGCGACGTGCTAAAAAGAATTTTGGTCTCCGCCATTCCGCATCTTACTTGTGCAGCTCCCGTACTGGTCTGCTCCTAATGAAACTTTATCCCTGGA:1 + chr2L 13699792 3' + 1360 366 1 55.48 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTG:1 + chr3R 26504298 3' + HMS-Beagle 168 2 71.72 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATC:1 - chr2R 9871037 3' + roo 342 2 65.75 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGAATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTACAATAAGTTCAATCAATCAAACTGTTAATTAAGTAACCCACAGTCGATTCATTTTTAATTTTTAATTAGTTTGTCTGCC:1 - chr2R 20010177 3' + Juan 4172 1 55.48 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATACGTGCATTTCTCTTTGCTGTTGCCCTCTGAGTCAAAGATGAAAAACAATGAAGTAAAGGGGCTGACTTTAATAA:1 - chr3L 5532908 3' + roo 9038 1 56.83 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAG:2 - chr2R 9871054 3' + roo 331 2 76.43 ATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCACCGATGAAAGTCGATATGGGTTGCACATTCGTTTGAATTCAGTAATTACCAATATATCAATCAGCCAATAGTATTTACACGTGCTAAGCTATCAA:1 - chr3R 23652456 3' - invader4 2795 2 64.38 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACATTTAATTGACTACCACAATTTCAGCATTTTGTTTG:1 - chr2L 20265961 3' + roo 8988 2 76.71 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTCTGAAACTGAGACGTCCATTTGGATCCGAGGGTTGGGTTCTGTTCG:1 - chr2L 19923950 3' - roo 73 2 67.81 GGTAGTTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAA:1 + chr3L 18125994 3' - Ivk 58 1 54.55 AACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTCTTACCAGGAAAATGCAATCTTTAATAGGATTTCATACAGTGTTACAAATGCTATTTTCGGCCATTTTGAGCTCCATT:1 + chr2R 9967152 3' + Bari1 1666 1 57.53 CAGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGTCTCTTATCTGGACGACAGTTATCAGAGCGACTCGCTGGCCCAATACCTAATCAAAGTCACACAGGCGTACATATACCCATATAC:1 - chr2R 17796527 3' - jockey 4711 1 54.11 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGGTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTA:1 - chrX 12986516 3' + roo 9026 1 51.37 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCCAGGTGGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTTTATTCAACT:2 - chr3R 4805621 3' + 1360 3312 1 69.86 AGTCGCGAAGCAAAATAAAATTTTGCAAAAAAAAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAACAGATTTTCCGAAAGAGAAAAATATTTATCGGCGAAAGCATCATGTTGGTACA:1 + chr2L 22446020 3' + HMS-Beagle2 383 1 58.22 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCACAGTGCACAGTCGCGTCTCTTTTGCTCGCCAGCGGCGCCTGGG:1 + chr2R 22989664 3' - hopper 76 1 75.56 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTATGAGAAATATAAATCAATTGATTGATTTCTCACATTATAATATTTTGAATAATAGA:1 + chr3R 18093372 3' - I-element 53 1 59.70 CGAAATCCATATCGTGGTGTCTGGAGTGGAAAATTAATTTCCTTAATTAATTAAGGATAAGAAAATGCAGGGAATGGCTGAAGATAGCGAGGGAATCATTTATATTCTTCTGAAACTGGGAAAGAGAAAGGAG:1 + chr3L 2575255 3' + invader2 4668 1 49.62 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCCCGTT:1 + chr2R 20349057 3' + transib2 2765 1 58.62 ATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCGCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGAT:1 - chr3R 10736031 3' + McClintock 420 2 61.43 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAAGTAATGCAGTTTTTATTATAATTACATTTTGCAACTTACCCAAATGAACAAATCCACATGAAAATAAGCTTCCCC:1 + chr3L 9270001 3' - copia 46 2 49.32 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGTATGACAATAGTCGTCTTGTTCTGTGGCTGCGG:1 + chr3L 5389938 3' - roo 8752 2 81.51 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGCGGCTTAAATCACATCTTTTTGGTT:1 - chrX 8200155 3' - flea 4788 2 63.70 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATGTACATATTATACGAAATATTCCACGATACCAACCCCATTCACTTGGGGGCACTTAACAACAATGGTGGACGCTATGAAAAGTTATTATTATTGTG:1 - chr3R 19407865 3' - diver 24 2 67.36 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACACGAAGCTTCTCTAAAAGTAAATAAACTACTTTGCGCATATTTTTTTCCCACTAAAATTGCATCCACACTCTAGGCATTTTAAGTTTCTTTCCTCTGT:1 + chr3L 13364537 3' - BS 5011 1 45.26 AATAAATAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACCAAAACCAAAATGAAAAAGAAAATAAAAATGCCAACCCTCTCAATGATATACATTATTTGCTTGTCAGTCCATATTTTCCACCTTTTCTTGTCTTTTGCTTTAACATTTTTTTTTT:1 + chr3R 28490848 3' + BS 5095 11 62.33 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCCATCTCTCTTGTTTATAATTTTTTTGGTTCAGCAAGGTCCAAAATAAGGCGAAAAAATAGCACCACTATCAATTTTTTAAA:2 + chrX 21100302 3' - mdg1 7054 2 75.34 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGTGAAGTGGAGTGGAGTATACTAATAGCGAAATTGCTACAAATCGTTTTGGCC:1 - chr3R 31886843 3' - hopper 65 1 64.38 AAGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCC:1 - chr2R 24427579 3' - jockey 4750 1 65.75 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGGGGGGCTCAACATTGTTGCCACTTTGGTGTTTGAAGTGCGGGCAAAAGTTTGAGCTTTGAACTTTGGCTTGTTACATTCAAGTGGCTGCC:1 + chr3L 18126023 3' - Ivk 14 1 64.84 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGT:1 - chr2L 22674753 3' - mdg1 7072 2 66.44 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACAC:1 - chr3R 17673771 3' - FB 87 1 78.08 TACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACCGGCGGCCAGGAAGAGAGCAGACAAAAAGCTTTTCCGC:1 + chr3L 20825810 3' - jockey 4893 1 73.97 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTACCAACCGAAATCTTCTGTTTTCACTCTCCGCGTCCCTTTCACC:1 + chr3L 23841662 3' + 1360 3185 1 76.87 CAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCCAGTGCAATGAGCCTGATTACTTTAATGTCCTTTGTTTAATGAGCAGCCTCAAAGAATAAAACATAAAAGATGGCCAGTCTACTTGGTTAGTCGA:1 - chr3R 8541081 3' - F-element 4324 1 69.18 GCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATGTTATTTCATCATGGAAGGACAGGAAGGGAGTCCTTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGGCAGGACACGTCAGGCAGAAAGTTTCGCCTCGCTTTCTTGTT:1 - chr2R 18514851 3' + P-element 366 1 62.33 GAAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGCCTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCA:1 + chr2R 6847800 3' - Doc 54 1 80.00 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATACATATAACAAAAATTCAATAAATTTCAATTAGGAAACAAAGGACATTTAATTGTTCGGGGATCCAGGCAAAGAATG:1 - chrX 7795494 3' - roo 42 2 58.62 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATGGGATATAAGGGACCGAGGCGAAAAAGAAGCGTCTGTCATTTTTATAAATAA:1 + chr2L 19675069 3' - 297 6632 2 65.00 AAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCNATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTCTAGAAAGACTCTAGAAAGCGGTAGCGGACAAGAACCAAAACAAAACAAAAAACTTTG:1 + chrX 13509559 3' + Doc3-element 180 1 65.07 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTC:1 + chr3R 7719827 3' - roo 55 2 59.59 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACTCGCAAATAAAGAAAAGAAACGAAATAAGCTTGATTTCGGGACACGACAGTGGAAATACCACGTGTTGGAAATAAGATTATTTATTTCTGATTC:1 + chr2R 20802704 3' + mdg3 5494 2 77.60 TTCTTGATAAGGATCAAAAGCCCAGAAAACACACCGCCCACAATTTATACTAAGCGTTTTTGATCCACCTTCTTTGATAACCACGATTGTATATGAGCAATCGGCAAGCATCGGATTATTTAATGTCGGTAATACATGCAAAAAAA:1 - chr2L 22729648 3' + INE-1 87 1 60.27 AAAATCNGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCAGTGTGTTAGTTGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGTCGGGTGTTTATTAAAAACT:1 + chr3L 7300265 3' + roo 9036 1 58.90 AAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTGTACATATTACGCTAGTTCTTGTCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATT:1 + chr3L 14971176 3' + 1360 3081 1 69.00 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTACCGCTAATGGAAATTCAAGTTTCGAGGACGGCCATCT:1 - chr2L 5582121 3' + pogo 2032 1 69.63 AAGAAAGAAAAAAAAAACAAACCAGAAATCAATGAACTCTCTATGGAGGCTTTTTAGGCCCCAAGCTTCTGGG:1 + chr2L 4034039 3' + gypsy7 5014 1 76.71 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTCCAGGAATTATTCCGTGAGTTTTAAGTTAAATATT:1 - chr2L 7125780 3' - I-element 86 1 74.66 CCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGTAAAAGAATATAATCCGGCATAAATGATTGGTGTTGAGGAGTCGCTCCAACTGCTAAACTCGACTCCTTGAAGAGC:1 - chr2R 23780504 3' + Ivk 5338 1 55.48 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCGCGTGGGCACAGCATATTGTGGTGTACTTCTGGACATGTGCGTTG:1 + chrX 9436978 3' - Quasimodo 37 2 85.19 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAGTATGTATACCGCCAAAATGCGTACAAATTTATGTCGGCGCTTTTTCATGCGAGCTCGGTCGGAAGTATGCAATGGTCCGGGCAGATTAA:1 + chr3L 21996292 3' + Transpac 282 2 63.45 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTTACCATGCGTACCATCTACGTGATGCTATATGCCATTGTTATCGGAGAGCACTTGGTAGCTTTCAATAACTATGATGAGAGTTCTTATAAGGTATACCGTGTAGA:1 + chr3R 7420347 3' - 1360 16 1 76.03 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCATATTCCATGGGGAGTAC:1 - chrX 19074708 3' - mdg1 4 2 77.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTATTTGGGATTTTACACTTGTACCACAAAAGGAGTAATCGACTGATTTACAACCATGTTGTACCCTGTGTTTTGTCAGGTGACTTCACTCTGCAGAAGATTAATAATCTAACAAAATACGTA:3 + chrX 10167513 3' + roo 9054 2 71.23 AAAGTCTATTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGAATTTGCGAAAATATTCGTATATATTCGAGGCAATCCGTGGTTCTTTTGTAAATTTATGTGTTATGCTTTAAGAATTAAGCTGGCTGTCAAAATACATTCCATACTTTTCAAT:1 - chrX 18396024 3' + roo 404 1 70.55 ATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGACTTGACACCGAACTTGGAATAGGGAGAGCGTGAGAGAGATGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTTTGAATACACGTTCGGCTACTTAAAC:1 - chr3L 8859256 3' - Doc3-element 480 1 79.26 ATTGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGTGTGTACGTGAGATAAGCTCGTGCGGTGGTAATTGGTCAATGGAAGTGTCAACATTAGACAAA:1 + chr3L 8453835 3' - FB 58 1 54.11 TGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGCTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGGTTTTTTGGGGATTCGGGGTCACGAGATTGCGGGATTAGAAGAGATTGCGAGTACTTTCGTTCCTCAGCGGCATTTTCTGCGATTTTGGTG:1 - chrX 7676927 3' - I-element 438 1 70.29 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGAATTTCCAATCATGACTGATATGACTTAATTTTATTACAATAA:1 - chr2R 16510121 3' - F-element 94 1 70.55 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAATTTGCAGAATATTCACGG:1 - chr3R 14860100 3' + BS 5072 1 65.75 AATTACAACTCTCCCCTTAGTATGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGATTCTATGTTTGAGTTTTTAGCTTAGAAAGCAGATTTTCGAAAAGTATTTGTAAGCGCCCCTTCTGTTGCCACATAG:1 - chr2L 17944160 3' + Doc2-element 4297 1 58.22 TCTTACACTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAAATATATAAATACCGCAAAAAATGGGGAAAACTGAAGAAAAGCTGAAGGCGCAAAAGCCAACGATGCGTGCACATAAAACAGCAACGTCAATACGCACAGATATA:1 - chr2R 14393278 3' + 1360 3290 1 79.14 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCT:1 - chr2L 4123848 3' - transib2 57 1 57.53 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGAGGAATTTGGTAACTATTTTATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTACTCATTAAGTGTTTGGAGCTGC:1 - chrX 8092365 3' + pogo 2060 1 57.24 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACA:1 + chr3R 16630357 3' - FB 65 1 61.64 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACATACTAAACTAGACTAGATCATAATGTTTTCAAAAAATAGTTGTTACTTGAGCAGATTTTTAAGAACACATAGAAAAGCAAAGAGTTTT:1 - chr2L 7580871 3' - Transpac 28 2 43.15 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGG:1 + chrX 21224601 3' + roo 331 2 81.30 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGTCTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGAATCAAATCAAGGTTCGAGTACTCACTCGAAA:1 - chr2R 8735601 3' + mdg1 358 2 76.67 AGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTGTAGATCTTCTGTTGCATTGTGCGTTTTTCATTTGGGAAAATCTACGAACAAGGTTGCTGTGGGTTTTTTCCCCCACTCTCCAATGT:1 + chrX 7058280 3' - Quasimodo 345 2 60.00 TTAAATTTTTATATTTATTTTTAAATTTACACTTTGTATTTTAAATTGATACACTATCTCAACAAGCTTCCTGTTCCTTGTATTTTACATATTTGGGGTTTTTGCTGATTTTTTATTTGCCTTGTGGGCGTTTTTGTTTCATTAA:1 - chr3L 10384326 3' + copia 4659 1 58.62 TAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAGTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCATGTAATGTATAGATTTTAAACGTAATAATAATAATAGGTAATCAATTAATTTAATGCTATATCTGCATGGTGCGAC:1 - chr3R 4830763 3' - Tc1 1496 1 52.05 TTATTAATATTAATATTAATATTTAATCATTTCTGAACCACTCATTGAAACTAACTATAAAGGCAATATGCTTCTTCTTAATCTCTTAACAGATACTCCTTTAGCAAGTTTTCAATGTCGGTTCAGTCGGACTCCGGCGAGGGCTA:1 + chr2R 13301132 3' - mdg1 7076 2 45.21 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAG:2 + chr2R 8157293 3' - mdg1 7080 2 56.85 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTTCAGGTCTCTGGCTCGAAAATTCCCCCGCCCTCCCCC:1 + chr2L 16540988 3' + hobo 2863 1 76.42 GGTCTTGGATGGCACTTCGGCTTGCATATTTTTCCTTATGGGTCACGCATTTTCCTGCGCTAGCCAATTTCCTATCTTCTTCCTTGTAAGGG:1 - chr2R 25119068 3' - gypsy10 5678 2 72.83 AACATAAAACATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCATAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACAACAAAAAGTAACTGAAGTTAAAATATTAATGTTGCCAAGAGTAAGTTCTGTTGGA:1 + chr3R 2336706 3' + I-element 467 1 78.08 ACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGAATATTTAATATTTTTAATTTATTTTTTGATTTACAGACTAATACATATACTCTAAAGATACATTGCATGTAAATAGCATTTGTCAGCTACTAAAACTAAATTTTTCAATCTTTTCCAT:1 - chr2L 10589045 3' + S-element 1541 1 40.41 AAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAATTATTATTAAAGCTATTGTAATATTTGGAACTTTTTTTTTAACATTTCCAAGCCTGTTCTAAAAAATGGTCAAAAATAATGGTCATAATTAATA:1 - chr4 120716 3' - Tc1 1384 1 75.97 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTCTTTAGGATAGTAAAATGTCCACTAAGATTGAATTTTTCGTCGTTGTATTACGTTTTAATTTTCCTTCAATCTGTTAAA:1 - chr2L 18549806 3' - roo 40 2 55.48 ATTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGGCAGAACTTTTAATACGTGGACGGGTTTTGTAGCCATTGAAATCAGCGCTCCACGAACTTAACTACAATCAAATC:1 + chr2R 6885621 3' - P-element 42 1 55.17 GAATCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATGCTGGACCACAGTGCAATGGATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' + transib2 2792 1 88.24 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAATGCTACCATGGATTTCTAAACAAATATATGAAACTGCAATGCCACAATTGTGGTGCATACTTTTA:1 - chr3L 4219459 3' - jockey 65 1 56.16 GATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAGAAA:1 + chr2L 22684621 3' - transib3 50 1 58.90 ACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTGGTCGGCGGTGTTTAATTTCTAGACGCCACCGGCGGGTGAG:1 - chrX 10871768 3' - accord 7379 2 67.72 TAACACTGCAATAACTAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGTCATCGTCATAGTTAGAAAGCAATTTGCATTTGGCAGCTCATCAAAGCACCTTACAACAAATCACAACAACCACCTGGGAATAGTA:1 + chr3R 23796097 3' + Doc 491 1 58.33 GCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCACGACAAAATTATTTGTTATATGTATTTTCATTTTACTTATTTTCATTGTT:1 - chrX 14631163 3' + hopper2 1514 1 43.31 AGTATAAGACTACATATACTTACACACACACACACCAGCACACATTCCGGCACTTTCATATATATGTATATTTGAATAAAAATTAGCTACGTTTTATTTTATGTTATTTTTCCCTGTTACAGAAAATATCAAATAAAAGTTAATTG:1 + chr3R 14528230 3' + Quasimodo 18 2 46.58 CGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTATTTTGTTTTTCCTTTGACCCTATTACCTTCTCATTTTTCTCATTTGTCAATTTATAGACAGTTGTCTGGCTCATCTCCTTTTTGTCTAAAGTTTTCCTTAGTTTCT:1 - chrX 12945863 3' - Quasimodo 173 2 73.43 ATTATGATTGTTTATTATTATTTCCATTCCGTTTACTTACGTTTATTGTCTTGTTGACCAGGGGCTGCGATTTATTCAACTCGACACCATTTGCC:1 - chr2R 18999933 3' - flea 5000 2 56.84 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTG:1 + chr2L 6647714 3' - mdg3 79 2 68.49 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTAAGGTCCTTTTTATGATTTTCGGGCTTCTCTTGCACCCTCTTTGGCTTCTGTTTT:1 + chr2L 18226871 3' - roo 63 2 62.07 ATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATATACATAATAAGTATCTGGATATAGACAGACACACTCATGCCATGGATCCAAATTTATGCTCAAAGTGTGCCAAGATCGCCTTGAGACTGGGCCAATGTT:1 - chrX 1263902 3' + Burdock 246 2 75.18 AGTTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGTATGCAATATTTAGGTACAATAATTTGAATTTTTGAGAGTACATTGCGTGGGGTGAGTGTTATGTTTTTATTTTTTTTGAAACACTATTATTCATCAGGGT:1 + chr3R 29011390 3' - TAHRE 10393 1 69.18 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTCAATTTGGAATTTAATTCCATGCCTGTAGGACTTCAATTTTTAAGTTTCTTAACTCTCGATTTAAGTTATTTATTTTGCATAAATCTTTTCAA:1 - chrX 12986496 3' + roo 9046 1 66.44 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAAGCAGACATATCTTTTTTTCATTCTTAATTTAAAGGCTGCAAAAGGAGTCTTTATGTGCATATGAAGAACAAATTCTAGACTTAACAAATTATTAGGTGCAAATGCGTATTGCCAAGCAGTGAAGA:1 + chr2L 16539804 3' - Juan 4029 1 79.45 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCCGAAAAAAAGAAACGCTCCAACTAATAACACTTAA:1 + chr3L 6447102 3' + transib2 2741 1 74.66 GAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAACTAGAGTTTAACGGGAAGTGTGAGTCCCGAAAATAGTTTTGTTATTATAACTGACCAATGACAA:1 - chr3L 21974383 3' - GATE 50 3 56.16 TTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATGTTGAGCCCCATATCAAATTGCCACGGATGCATGTGGGGTGCATTGAGTGTGGTCAGGGTGTTTCAAGTTGGACAAACGGAAAGTTG:1 - chr3L 18125880 3' + Ivk 5346 1 57.53 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAAAAAAGAGTAATCCTCTATACATACATGTCAACAATTATACAAG:1 - chr3R 26961714 3' + Juan 4134 1 70.14 TAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCAATGTCAACAATATTCATGCAAACTATAGTAAGTTCCAAAAATTTTTCAATATATCC:1 - chr3L 19115307 3' + Doc 142 1 63.64 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACGTCGTGGTCACAAGACCGACTTCCGTGGAGTTGATCCGCCGATGTGGCTG:1 + chr3R 11810750 3' + roo 9048 2 50.00 TTTTATTTGATTTCTTTATTAACAATTGTTTTTGTACATTTTCTCTTTTGTAATTCAATGCCGTAAATCTTATTGTGTGTTTGTGTGGTGTGTGTAAGTGTTATGCAAGTATGTTGATTTGTGTATGGATTGCAAATTAGTTTAAA:1 - chrX 12656828 3' - X-element 4714 1 69.86 TGTATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATTCAT:1 + chrX 21772472 3' - springer 7200 2 50.59 AAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTAAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATTTTATGAGAGACTGTGAAAGTTTACAA:1 + chr3L 3505463 3' - Bari1 1467 1 80.14 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGGTTTATAGCCTTTAGCCAGACACTAGGCTTAT:1 + chr2L 9636147 3' - 412 68 2 75.00 AACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTATAGATAGACATAGATTATACATAGACGCCATGCCAACTGCTGCATGGATAGAATTTAATCTAATTAGCATATTTACCTTGTGG:1 + chr3R 10955726 3' + INE-1 142 1 65.25 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTCTGGGCCACGCCAACACCCAGTTTGCTGAAAAGCAAGTACATATGTAGATGGAGCACACATGTGCTATATAACGAG:1 - 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chrX 10723451 3' + INE-1 129 1 62.69 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATAGACGCACTTAATATTATCTAATATTTTAAAGGCAACAACAATACATAATATGCACTCTTTTTTCACACGATTTAAAATTTAGTAA:1 - chr2L 15936739 3' + copia 254 1 61.64 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCCGAGGGGTTTCAAGTGCTTAAC:3 - chr3L 6518524 3' - 412 30 2 65.75 TAATTTTAATTTTAATTTTTAAATTTTAGTATTTAATTTTAAGTAAAGTATAAAAAATTTATATCACAAAAAATTAAAAATGATAGAATTAAAACTTTTTTCACTTATCCCTTCTTAAGTATTAACACTAAATGAACAGAAGTGGG:1 - chr2R 6697579 3' - Rt1b 94 1 49.32 GTGGAGTCTAGTCGTGAAAAGTTTGTGTCGTTGTAAAATTATAATCTGCGGGCGTGGAAAAGAGGGGGTGGGGTTCAAGTGAAAATGGGAAGGCGCAAAGAAAGAAAGTGCTAAGGTTGAAAATTTT:1 + chr3R 16666887 3' + Gypsy12A_LTR 281 1 57.48 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACCTTAAAAATAACGCCTTTGTTGGTGCTCTTTCTGGCTTCGCCCATAAAGAT:1 + chr2R 8099213 3' + jockey 4924 1 67.83 GATGGATATAGTATGGGAAATGGAATTTCTTCTATTTCTATTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACAACATCATAAATGGGTTGCGTGGGTGAGGCTCTGGTATTTTTTTTGTATTATTGTTGGT:1 + chr2L 13421395 3' - 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chr3L 15103806 3' + Transpac 247 2 60.96 GTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTTGTAATAGTAT:1 + chr2R 5303169 3' + FB 213 1 56.85 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCATGTCAAATAAACGTAATAATAAAATTGTTGCATA:1 - chr2R 18316045 3' - HMS-Beagle2 75 2 67.12 AATAATAATAACAATAATAATAATAATAACAAAAATAATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGG:1 + chr2L 15763088 3' + mdg1 7063 2 51.37 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAAAGTTCATCATTACACTGGATTTTATGTTAACATACACCAGAAGGTACATTATATGTTCAAAACTTAACCCAAAAGAAAACTTAAGCGCTGAA:2 - chr2L 71155 3' + 412 447 2 53.42 TATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATGAAGGGGGAAGCTCGGTGCCTGGATTGACTGGGTTGAATGTTTGATTGGTACATGGTTTAAATACGCGCCTGA:1 + chr3L 1626521 3' - accord 425 2 53.73 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGTTTTGTATCTGGGATTCATTGT:1 - 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chr2L 15936780 3' + copia 215 2 67.36 ATAAAATATTAAAAAATATATTAAAAAAATATTCACCTTATGTGACTAGAAATGTGCAATTTATGTTTGCCCAATTATTTATAATATAAGAAAAACTAAAATTTACATGGTCATAATAAAAGTGTCAAAACAATTGTCTTTTCCTG:1 - chr2L 16423627 3' + transib4 2280 1 51.37 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTAATAATGCTCTCATCTTCAAGCTTTGCTGGCTTAGCTATTTCCATCAGTGCGTACAAGAATTCATGTAAACTCCATCTT:1 - chr2R 6421465 3' + roo 347 2 53.42 ATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTC:1 + chr3R 30987562 3' - F-element 148 1 71.72 GGCAGAGCTGGGTCCATCATACCAGACCAATTCACCAAACAAGGAACGTCGCCTCCGGCGGC:1 + chrX 8758331 3' - R1-2 3097 1 70.97 TATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATATCTGTGTCAACCGACTAATGAGGTTTGGGGAACTTTCGTT:1 - chr3L 21655897 3' + HMS-Beagle2 7120 2 69.18 AATACCGTGCTGAAACCCCTCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCAAGTTAGTTAGCTATGCGGTATTTGG:1 - 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chr2L 12569981 3' - micropia 3 2 75.22 GTGTGTGTGTGTGTGTGTACATTTCTTTTCATGCCTGCGCTTTCTCTTTGCTTTCTTTTCGGCACCTAGTTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGCCTGCAGGTGTTTG:1 + chrX 10169054 3' - accord 7027 2 63.93 ACATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAA:1 - chr2L 23299998 3' - invader4 410 1 81.51 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATCCATTTGAATTCATGTGGGGCTTTCAAAATTTGGCGAATT:1 + chr3L 21380602 3' - I-element 82 1 72.60 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGTCTCAGGGACATGTGTTCATGGCACAGTCAAGTGCGGGGAATAGTGCACTACAGTGTCTAGAAATAAATAGCAACCAACACCAAAGGGAAGCAGGGAAAAATCTACGATAA:1 + chr3R 25709924 3' + hopper 1407 2 75.34 AGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCATGACCAACTTGCAACCACCCCACCACCCAAGGCACCCACCAAAACAGAACCACCGCACTCAAACAGACGTCGTCTGCCTGCCACTTGAGCCCTTCACTGTAAGCC:1 + chrX 875166 3' + Bica 4604 1 76.03 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCTTATTTGT:5 + chr3R 9039063 3' + Juan 4199 1 73.97 ATGTATATTCTTAAGCAGGATCATGGTCATGTTCACTCATCCGCCTGTCCGTCCGTGAAAAACGTCTTCTGGAGAGTCCACAAAATTTCGCTAGTGGGCAAGCAAAATAACGAGTATTGGTTAAAAAAAAAGAGAAGGGGGCACCC:1 + chr3L 21854083 3' + INE-1 80 1 64.38 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTAT:2 - chr3L 10795198 3' - Quasimodo 78 2 68.49 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCGACTATTGT:1 - chr2L 12818215 3' + hobo 2897 1 55.48 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGG:1 + chr2L 12818375 3' - hobo 18 1 71.92 ATGTGCGGATATTATGTACATAGAACGACTATGGGTAGATTGAAGGGTAAATATGGCCTTATAAACGCTATTGCTCTCATTGATTTCACAACCGAAAATATAATTAAAGTGTCACGCAATAATACATTCCAGATTTCCTAATTTGC:3 + chrX 20811982 3' - gypsy11 211 2 69.18 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGAGAGTCCTTTTAGAGTTAATTGAG:1 - chr2R 14051724 3' + roo 9038 1 56.55 TAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACCAGCCAACTCCCAGGACTTCTCGCCTGTAGAGCTACGTG:1 - chrX 21567778 3' - micropia 447 2 73.29 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTTCCAGAACTTGTTACCTTTAACCCGTCCAGTGAAGAGACATCCGAGT:1 - chr3L 18930974 3' + I-element 5288 1 64.38 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATTTCGATTTTGACTGCTGTTTGCTTGTGTTTTGCAGTTTACGGGCTTCAGCTTTGCA:1 + chrX 22840573 3' + copia 5064 2 57.93 CTGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGT:1 - chrX 22906772 3' + transib3 2737 1 69.86 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAACAGAAGACAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATATTATTCATAATTTTATTTTCAAAATC:1 + chr2R 1916461 3' - Juan 50 1 48.63 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATACTATTATAAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAAT:2 + chrX 5323158 3' + Juan 4187 1 32.88 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGCATTTCCGCAATTTCCAAGCGCCTTTGGCTGCGACGACAGGGGCACAAATGGTCCGTAGAATAG:1 - chr3L 6397653 3' - roo 8720 2 52.41 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAA:2 - chr3R 1869764 3' - 1360 48 1 47.59 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTCGTGTTCGTTTTGCTCCT:1 + chr2L 16946092 3' + hopper 1357 1 76.92 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATAGTCGGTGGCTTATTTTTGGCATTATATTATCGTTTTGCTTTGCATCTAGTCGAAGTTTTTTCAAC:1 - chr2L 22193409 3' - roo 8718 2 54.79 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTAGGGAATCTTCATGATTTTATTTAAACATTTTGAATTTATATTTCCTCACTTCTTG:1 + chrX 14722206 3' - diver 49 2 54.55 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGCCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCCCCCGCCCCTTGTGCCACCTTTTCTTCTTGTCT:1 - chr3L 16690858 3' + I-element 5339 1 58.90 ATAGTAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCTGCTGTAGTAGTTACTTTTGCATCTG:1 + chr2L 15763133 3' + mdg1 26 4 69.66 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCGGATAAGCAAGGTTCCTCATAAGTGGATATTTGGTATGATATGGAGTTTGTTAGCAAAACATCCACAATGATAGTCTAAGTAG:9 - chr3L 19454904 3' - mdg1 40 2 56.85 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTTTTATGTTCGTATATACTACAAATTACATTAGCTAAGTTTGGAGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTT:1 + chr2R 8157295 3' - mdg1 28 2 61.94 ATAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGAC:1 + chrX 21224603 3' + roo 322 2 80.60 GACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAATCGCGTAGTATAAAAATATCATGTTTGTTTGCAAATATATAGAATATTTCCATATTATCTGACCTTTATCATATAATTACTCTGTTGGGTT:1 + chr2L 17180196 3' - Juan 2 1 77.78 ATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTT:1 + chr2L 22036461 3' - INE-1 300 1 53.42 TTGTTTTACTTTTTTTTTTTCTGTTGTT:1 + chr3R 29003021 3' - Doc2-element 249 1 82.14 AAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTTCTACTTTGTTTTATTCAAAAAATCTACCATAAATATTTAGCAACATCATAAAAAAGCGAATGAT:1 - chr3L 18783039 3' + S-element 163 2 63.01 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAATTAGGTTACAAATTACTAGCCCCCAACAATCGGGTGATGAATGGGTTCGCATTTCTTGGCTCTTGC:1 + chrX 21216821 3' - roo 44 2 53.79 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGCAGGACGAGCAGCTTCGCTTCGTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGATCGGTCCAAAAACGATGACGTAGTCGGCGTCCTTTTGCTGGC:1 + chr2L 8338234 3' + P-element 2857 1 62.86 CTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCTTTCTTGTTTCGCATTACGCTGAAAACGATGATGAAATTGCGAAAATAAATCGCCCG:1 + chr3R 26504315 3' + HMS-Beagle 184 2 60.27 TTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTATGCCATGACAACCCATTCTAATCATATAAAAACTTTTAATTTTTTCAAATATTTTTTT:1 + chr3L 18167662 3' - I-element 390 1 57.69 GTAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAATGAAATTACGTCTATG:1 + chr4 373102 3' - pogo 16 1 73.29 AGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGTAACCAGAACAAGAAACAGCGTCACAAAGCGTCGGAGCAACAGGCGGAGGATGACCAACAGGACA:1 + chr2L 12429874 3' + INE-1 172 1 54.86 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTAACTTATAAATGATGCGCTTTAAAGCCCCGGCCAAAAGAAACTAATTA:1 - 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chr3L 13174216 3' - TAHRE 29 1 56.85 ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGATAATTTCTTTTTTTGCATTGCCTTAACGGTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATATTGTTTATGATTATTGGATATCAGAGTTATCTTACAAAATACGAAATTTAATGAACAGCTTG:1 + chrX 9318155 3' + 1360 263 1 56.16 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACAAAAAAGTCACAAAAATAGGGGACAAAATCCAGAAGATGGCCAAAAAAATCACACGAGAGACTGGATTTACACCCAACGCGGACCTTCGAATTGTTATAATGGTTATCTC:1 - chr3R 5732860 3' + BS 5076 1 70.55 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGATAATAAATAACAAAAGCATTTGGGGGCTGCGCTGCGGTTATTGGATACACAAGCGGATAT:1 - chr2R 16817874 3' + 412 472 2 59.81 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCGTGTCAGTGGCTGTATAA:1 - chrX 12066109 3' - transib2 35 1 51.64 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGACGATGATTG:1 - chr3R 16157232 3' + pogo 2089 1 73.29 TTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCAC:1 - chr3R 14860137 3' + BS 5035 1 59.59 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCCTATTTGGGATTTTACAATTTGTATGCTAATAAGCCAATTGAATTGTTATGTAAGGC:1 - chr3L 16970385 3' + roo 8987 2 76.71 TAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACTCGTATGTATTGACGAAGGTGTTGGAAAACCAACGATATTAAAGATTGCATGGTAATTT:1 + chr3R 4682988 3' + Burdock 6332 2 64.14 ATTGGATAGGGGGTAGAAAGAAAATTTGTATAATTAAAGCTAAGAAAAGCGAAAAAAAAAAGTTAAACAAATA:1 - chr3R 10529498 3' + invader2 4711 1 86.30 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCCGACTGCTAAAAAACAGAACTCAAGTGTTGGAACACAGCCCCCTTTGTGTCTTTTGTGGCCTTTTGCTGTTTGTTTGTCAACAGCAG:1 - chr2R 22989559 3' - hopper 31 1 64.38 ATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATCGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGATGCACAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTATGC:1 - chrY 917823 3' + 1360 3104 1 58.90 GGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATTCGTTATGTCAAACCAAAGCTCTTTCCAGAATCACCTTTGCAAACACTCGGGA:1 + chr3L 25254443 3' + 1731 4589 1 73.04 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGGAATATTTATATGATTACTTTGACGAACAATTTTAGAGAGCAACAAA:1 - 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chrX 23338825 3' + GATE 380 1 53.42 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGACTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAAAAAAA:1 - chrX 2479452 3' + mdg3 5473 2 61.64 AATATTACAATTAAAGAAGAAGGAATAAGTAACAGCTCGATATCTGTTTTATAGCCATTTAGTGTAAATATCGTTAAGAATGTCTTGGCCATTCATGAGTACCAGTCAGAATGAATGTAAATATATATATCTATCATTTCGAAAGG:1 + chr2L 10104356 3' - Juan 89 1 84.25 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACA:1 - chr3R 9038887 3' - Juan 4030 1 68.49 AATAATTAATTATATTTTATTTCCATGTTCCCCATAAAATCCTAATTCATTCAACACTCACACAACCTGATCAATGAACATTTTTATAAGCAACTCAAACGCATAACTATGCCATAACAATTTATAAGGTCCAACATGCATAGAGT:1 + chr2R 21793084 3' - NOF 3961 1 67.12 TAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATAGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCATTTTAGAATAAAGTTGTATAGAGTACTATTCGTGTTTTTTTTCGTAGTCCAATTTGCT:1 - chr3L 26875750 3' + McClintock 6088 2 57.93 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCATATTCGGGGCC:1 + chr3R 23618247 3' - hopper 2 2 77.78 TGATGTTAGTAATGCCTTTTGCCTTATGCTCTTTATATGTTGCCGTTTAAGACAAGTTTGAGATAAGCCGATTGGTTCTGTTGGATGAATGGATCAAAGGAGATCAAAATCATATTTATGAGGTGCCCAGGGAGGAGAGTTCGGAA:1 + chr3L 19176413 3' + transib3 484 1 75.34 TCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAAATTCGCGGTTG:1 + chr2R 7850050 3' + roo 365 1 53.79 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCAT:1 + chrX 11661493 3' - pogo 62 1 63.70 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGGTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATAT:1 + chr2R 330262 3' - HMS-Beagle2 15 2 73.97 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAAGGTTTTCATTTCCAGTGTAGAAAGCTTATGTAAATCACTCTAATATTTCAAAAACTTTAATGGGTTCTAATAGATTTTAGCAAGGGTTGCTCAACTAGTCG:1 - chr2R 21116437 3' + mdg1 403 2 50.68 AATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATGCACCACTAAACTCACAACAAATCGATGCACAGTCCACAACACCAACAAACACAAGTTATACAAC:1 - chr2L 12404146 3' + 1360 3100 1 56.16 ATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAATTTCACACTTTCCCCTCTGCGTTTCCACCCGCAGTGCTTTCTTTGGGCGGGAA:1 + chr3R 30987574 3' - F-element 137 1 63.70 ATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATTTTTTTTATTTATTAACTTTTAATTCTGTTAAAG:1 + chr3R 18971762 3' - Juan 4111 1 74.48 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGAAATACTTTACGGATAAAACAATAGTTAGCTATTAACCATTATGTAACTATACCCTCCGAGTAAAATAAATGTAAAATATAAGA:1 + chr3L 20711719 3' - jockey 4800 1 54.79 TTTGAATTATTTTACAAAAAACATTGGAATTAGCATTATTATTCTGCCGAGCGAAGCAAATTGCATTTGACAGACGGACAAACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGGCAGGCAATGAAGTGAGCAGGGCTGAAGAGTCCAA:1 + chrX 2516495 3' - HeT-A 5803 1 77.78 TATCTATCGATATCTCAGAAACATGATGCAATTTCGAGTTTGAATTCACACCAATCAGTAACGGGTATCCAATAGTTGGGGAACTAATCTTTATCATTCTCTTACTTGTATGTATATATGAATGAGAAAAATATCTTGAAAATAAA:1 + chr3L 25671073 3' + INE-1 499 1 73.29 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAAGCTTAAAATTAACTTGCGGTTTTGTCTGGCGCAACTTTGACGCC:2 + chr3L 13581720 3' - jockey 4839 1 71.23 TCTCACGAATCGAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGAT:1 + chr3L 23940541 3' + Cr1a 4384 1 60.96 AAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGTGGCTTCTGATTGTTGACCTCTTGAACTGTATCGGGACTTAATAGAAACGCAATCA:1 - chr3R 12242255 3' + transib2 2763 1 55.48 ATTATTATTATTATTTTTATTATTTTCATTAATTCCTTTCAAATAATATTCACAGCTCATAAGGCCATAGATAATTTGTAAACAGTATTCA:1 + chr2R 579467 3' - mdg1 7068 2 82.42 AATATAATTATTAAAGATCCGTTCTTTTCGCGAGTGATTCTTTCTGATTTTTCTATCTTTTCCGATTTGCCGTCTGCAGTGCAGTTTTTTATTGTTTGTTTTTAATTATAAATA:1 - chrX 5920027 3' + Cr1a 109 1 50.00 AAATATATAAATATGTATATACCTCTGGATACTAGCTATAATATCGGCTATTT:1 - chr3L 9531218 3' + G3 4505 1 79.25 TTCTTATTGGATACATGAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTAGTGTATGGCTGTAAATCCAATTGGTTACCTCAAAGACCCACGAAAAAGCTATAGTGCAACCCTTGTGAAAATCAAAACCTATCTTAAAAAAA:1 + chr3R 14999390 3' - Quasimodo 115 2 59.59 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGATTTCACTTTAATGTTTTGCTGAGTGCGCAGTACGATTCCGTTCTCAAAAGTGAGATCCTC:1 - chr2L 5265716 3' + mdg1 7385 2 56.12 TGTTTGGTGGGCCTGTCATAATTGTTGGTTTAGGGCTTGATCCCGGGTTGGCGGGTTGGAGGTCTTGTTGTTTTTGTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGAAGGGGGGACGGAACAAAGGTGTTTTGTGTGTG:1 - chr3R 25596789 3' - I-element 184 1 75.56 ACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAACATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACTG:1 + chr3L 24934426 3' + HMS-Beagle2 298 2 73.02 ATGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTATATATCTATATTTTATATATTTTATTTGCAATCTTGTTATGCCATTCGTACACAAATAGGAATTC:1 - chr2R 13176475 3' - opus 7152 4 59.23 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCA:1 + chr2R 5674729 3' - S-element 77 1 67.81 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTGTGTGTCTGTTTGATTGTGGGTATTTGTACGCGGCTCGAAGCGCTTTAATTAATTAATTTGGCT:1 + chrX 7795619 3' + roo 353 2 55.48 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATAATTCATGCGAACTTAGGGATTATTTTTGGAAAGGTTTGGAAATTATTGTGAGAATTTCCCATGTTTG:1 + chr2L 11357931 3' + blood 7336 1 54.11 CCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTG:1 + chr3R 15790096 3' - flea 4752 1 54.68 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAGAATTTTTTTCGCGCTTTCGTGTAATAACTTTTTTTGGCGCCGCTTCAAGCG:1 + chr3L 21763943 3' - jockey 76 1 63.70 ATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTAT:3 + chr3R 21276658 3' + BS 5067 1 57.53 ATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAGGAGGGCTTGCCCTTGCTATGTATATGCCAGTTCATCT:1 + chr2L 4389434 3' - R1A1-element 5220 1 74.80 AAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAACCCACTGCACCGGAACGACCAATGGCCCACTGTCAATTTTAAGTTAGCCTAACTGAAAATGGAGATGTGGAAGGAAAAGGGAGTGTGCAGATGTTTTGCGCATTCGGAATTTCAAGCTC:1 - chr3R 22567032 3' + Doc3-element 4545 1 42.47 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGGGGAGGAAGAGAGCAAAGTTAAACAATTGAAA:1 + chrX 21224666 3' + roo 9053 2 63.85 ATGAGCATGCATTCACCTCAGGAAATAGACTGTTCTCCAAGAATGACTTGGAGAACTTGAATAAAGACTTGAATAAAATTACCTCTTGAATTTGCGCACAACTTGGTCCGGTCAAAGACACTAGAATATTCTAGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 5876940 3' + Bari2 870 1 51.37 TAAAACAGTGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTACCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATAGGTCAAACCTATTCAGTTGAGACAAAAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAAAT:1 - 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mdg1 7063 2 65.07 CATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTTCTTATCTAAGCT:1 - chrX 10445507 3' + INE-1 541 1 81.82 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCAAAAGAAACCTTCTCTGATTGATTTGTGAGGCTTTATC:1 - chr2L 18226794 3' + roo 8990 2 75.34 TTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTAGCTAAATTGCCCTATTTGCCAATCGCATAGCCGAATGCCTCCATTCTCTTTAAATGCCAGTACGATGGGAGAGATCCATAAACTTG:1 + chr3L 25729796 3' - TLD2_LTR 50 1 64.38 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTAT:1 + chr3L 7889639 3' + roo 8991 2 73.29 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAACACGAAAAGCAGGAGAAACGCGTTTAAAACGCTCGCCGCGTCGATG:1 + chr2L 4180539 3' + jockey 4917 1 68.49 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAATTATTAACATAAAAACCCAGTGAACCATGGTCATGCAACCCAACATCCAGCACAATCC:2 - chr3L 16690890 3' + I-element 5307 1 53.42 TTTTTTTTTTTGTTTTTTAAAAACTTTCCATTTCTTTTCCGGCCTTTTGTGGGGGCTTGAGGGGGGGTTTTTTTTTTTGGGGG:1 - chr3R 27211478 3' + hopper 153 7 37.35 ATCTGGGCCTCATCTTCAATAGCTACACTTTCTTGTCCGATTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTACCTTTTGCCTTTTGTTAGTATATTCTAAGTATATTTTATGTACCGTTCAGTACCAAAATGAAGTTAAACGGAATT:1 + chr3L 3831488 3' + Circe 20 2 56.85 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGAGACAGGGATGGCAAGGATTAAGCGGGTTGGGCGATGTCA:1 + chrX 4341342 3' - roo 79 2 71.03 ATAAACGATCGCTTGCGATCTACAAAACGAAAAAGAATAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAAATATTCTAAGTACGTTTAGGTGGCATTGTATCTGTGTGTATGGGCAG:1 + chr3R 20257717 3' + HMS-Beagle2 7160 2 75.35 TCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAACATACCCTTTCATTCTCCATGTGTGGCTATTACGTACTTTGTATAAATTCTAACATATATCTAAAATTT:1 + chr2L 11391593 3' - 1360 54 1 54.11 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTGATCCTCTTTTCCGTTATGTACAGCACACCCTCGCAAAAAGGCACAAGCTGACGATCTAATTAGGCAAAAGTATTGCAAATACAAATAAGTTAACATTC:1 + chrX 1341772 3' - 412 22 2 69.18 AATTTTCATTAATATAAATTAAATTCTTCACAATTTCTTTGTTTAATTACCTTTTTCGGGGTTCGAACTGGCTGCCACAAAAGTATCTTCGGCTATAGTTTTGTAGACCTCCTTGGAATCGGGT:1 + chr3R 7977614 3' - Transib5 2595 1 75.81 ATCCGGATCAAGAGCCGAGTCGATCTATCCATGTCCTGTGAGTCCTGCCAGTCCTGCCAGTCGTGAAAACCTTTCGGTGACGGCGAGCGCGGATTATGGCGCGTTTGTCGAGCACTTGTCG:1 - chrX 20607140 3' + INE-1 93 1 77.69 TATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGCAAATATATAATACAAAAAATAAAAAAAAGAATGCGGAAAAACAAGTAACCTAAAATTTTTAAGAAACATTGTGACAGCTGCCCGTTTCAGGTTCACACTAGATGGCACTC:1 - chr2R 19060862 3' + Rt1b 5112 1 70.71 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAACTATTTTTATTTTTAAGTCGTAATCTGACTTATTCACATTACATATATATATATATACATACATATGTAT:1 + chr3R 23085629 3' - transib2 36 1 58.99 TTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGCTTTGTCAATTATATGTGCTCTTTTACCCATTTTAAAAAATATTTTATATTGGTCCCATACATCCTATATATGTTAAGCGTAAGAAATATAAATATTTGGACTTAA:1 + chr3L 24240970 3' - Idefix 7121 2 75.34 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTGTCGAGTTTTATTTCCTGAATGGTAGTGCTTGAATCTGAATCTGTTAATTCTTGATCTGGTGATATATCTTGAATTGAAACAGCGGGTA:2 - chr2R 4855151 3' - transib2 30 1 65.07 AACATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGGAAGTTCTTAACCGCAGAAACGGGCACGTCCGCAATTTCAAAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr3L 23210710 3' - INE-1 256 1 69.78 AACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATTGTCAGC:2 - chr2L 13556336 3' + transib2 2766 1 58.22 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTAGGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATTTATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTATTA:1 - chr3L 24291998 3' - 1360 72 1 76.15 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATGGGCTCAAGTGCATGTGTTTGCCCTGACGTTGATAAGCCGCA:1 - chrX 4808497 3' + mdg3 5474 2 62.90 GAAAATATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTTTTGTAAAGTTTATTCCGGGCTTCACTCGCATTTTCGCCTAGAAATCCCCTGAACCAAATCTCCTCAGACCATTGAACAAATTTAT:1 - chr2R 17032528 3' - transib2 2357 1 69.86 CTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTAATGAGAA:1 + chr2R 4270299 3' - gypsy9 5035 2 59.59 AACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCTTGAATGTGGCCATCAGTTTGTAATG:1 + chr2L 1924043 3' - G2 2993 1 65.75 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGACTGGACTGGGCTACACCACACTGAACCCCACTGAAGTTGGTCA:1 - chr3R 30347325 3' - P-element 75 1 36.30 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCACCCACCCACCGCCCACTTTCACCACTGTTGTCAACGACAGTTGTTGTTTTGTGGCCCCGGAGCATTTGTGGGGTTCGGTTTTTATTTCATTTCGCCAAAAA:1 + chr3L 21327218 3' - copia 15 2 72.22 TAATAATTATAATAATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATAATTAATAATATAATACATTATATATTAAAAATTAATAATGTTACAGATTGGGCAACCCGCTTTAAAAATCGCATTGTACCCAAAAATTTATATATT:1 - chr2R 8186628 3' + mdg1 39 8 46.85 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGGAACAATTAGCCTGGCCAGTTAGGAAAAGTAATTTCCCCTCATTTA:1 + chr3L 12249890 3' + roo 334 2 68.49 CCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCAAGAAGAAGGACAAGAAGCCGTGCTACCTT:1 - chr3L 17424971 3' + invader4 2947 2 76.00 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGGGCGAAAGAGTCAAGTGAAATGAAAATTCTATTGACAAATGACTTATTTGTTGCTCTGCTTTCGCTGGCGAACCCTAACGAAAA:1 - chr2R 10161758 3' - transib2 35 1 61.64 AAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACG:1 + chrX 8027476 3' - Juan 74 1 65.75 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAATTGGTAATCGGAAGAATAAGAAATGATATTTTGCACTGTATGCATA:1 + chr3R 15325198 3' - 297 6622 2 52.48 CTTGCCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGAATTATTCGTCACATATTGTATAATGTCCCCCCACAGGTTTTCAATCGGGCTTAAATCGGAAGATTGTGCCGACCCTGGTTACCTTAAGTTTATATATTGCATGTACTTTTTCAC:1 - chr2L 21827638 3' - HB 1213 1 66.21 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTT:1 - chrX 22840484 3' - copia 4940 2 67.12 AATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAAT:3 + chr2R 2875235 3' + TLD2_LTR 101 1 64.38 GTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGGCAATGGGAAAATTATGAGCAAGTTGCCATATCTAATAGATGTGGGTGGATGCAGTCAACAGCAAAATTAAATTAACTGACACGACAGCCAAAC:1 + chr2L 17399896 3' + F-element 4373 1 66.44 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCCCTCTGGCTCCTCTATCCAATTGAAAAATACAAAAACACTCCTGAGAAGCGGGGCCAAACCGTCTTCATGTTGCTCCTTCATGCATAATAGTAATTTGCCAA:1 - chr2R 23180149 3' - roo 8666 2 81.25 CAACAACATTTCTGGGTAAACACCAGTGCCCAAAATGCTGACCAGACAAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATAAAAATTTTGCAAAAAAAATTCGTTGGTTAAATTAGCACTTGCGTTATGCGACAGAGTGTGCGGTGTGTAGAT:2 - chrX 5744884 3' + HMS-Beagle2 6924 2 73.97 TATTTATTCAGTTCTCGATTTTCCTGTAAAATAAACAAACATATGTAGTGTTTATTGCTACTGTTAGTGTTATTACTACTTCTTCTTCCTTTACGTTAATCAACGTAAAATTTCTTTACGAAATATATAAATGTAGCCACTTTGAT:1 - chr2L 5079892 3' - invader4 296 2 76.71 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATACCTAAAATATGTCAAGTCCAGAGCTGTGGGAGTCATTCAATCAAAACGACATTAAAATTAAACTCCTTAGGCGACATAAGTCTTTCTCACGA:1 + chr2L 22369288 3' - rover 20 2 72.60 AGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCCGCATGAACGTCGAGAGCTCAGGAACTATTAAAGCTAGACTATTGACTTGACCCCATTCGCCAGGTATCATAGATATCATTATTTCAATAAATGTTCCTATCTAGGTGGAATGTTTGTGT:1 + chr3R 17828837 3' + INE-1 110 1 55.48 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCGTGCCAAAAGTCGTAAGAAAAACAAAAAATGCCAGAGAAGCAGACAAAAGTCAAAAGC:1 - chr2L 17205892 3' - jockey 4767 1 60.27 TATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACGAGATTT:1 + chr3L 5061656 3' - 17.6 50 1 59.59 GATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTAATAGATTTCCTTACTGCAATTTTGATAAACGCTTTACATATTCAGTTTCGTTTGGGGTATGAGTATACTTAAGCAATGCCTTAAAGGATAAGTTTACAAATCAG:1 - chr3L 14385245 3' - I-element 4882 1 68.49 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGGAGTTCCCATCCCAGTAATTCATGTGTATTAATACACATCCTTAGGAATCAGAATGGCAGCACTCAGTGTCCTT:1 - chr3R 30946495 3' - Transpac 45 2 54.79 ACATATATATACATATATACATATGTATATATGTATGTACACTGAGGCATATATAATGCATATATAAATATAAATATATATTTATACAGGTTATACTCCCGTTTCGCTTGGCTTTTCGTTTCCATATTTTCACTATCACAAGATTG:2 - chr3L 18642296 3' - G3 4509 1 69.86 AGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATTGCATGGGAACATAACTAAAAATTTATGTATACATCTTAGACTAG:1 + chr3L 15252727 3' - I-element 4966 1 73.10 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCC:3 - chr3R 9038902 3' - Juan 4045 1 58.22 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACCCACACACCCATGCACACACACACACACACACATACATACTCACTCCGCCATCTCGCTCTGGCTCTAAAGCTTTGTATCTGGGATT:1 - chrX 15357627 3' + hopper 1382 1 59.31 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAAGCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAAT:1 + chrX 8200297 3' + flea 4952 1 59.59 AAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATAACACATGGAAAGATTATCTCCTACTTTAAGCTTCCTTTTTTTTTATCAATAAAATCCCATCAAGCCCAGTAAGATAGTTAAAA:1 + chr3R 24219395 3' + roo 9037 1 60.27 AAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCATTCGAAGTCAACAGTTTCTTCCAGTGCAGCCCTGCTTTGGG:1 - chr3R 7017546 3' + Doc 4428 1 71.92 ACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCCACTTCCGATTTCAACATAATTATGATCAAAGTGGATCTTATCTAGGATGGAGTTTCCTAGATTTGTTATTGAAAGTCTAAAAACTGTTTCAAT:2 - chr3L 17184611 3' + diver 5749 1 56.16 TATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATCGTGCAATGCATGAACAATACGTGTGCTGTCCCTGTATGCG:1 - chrX 3464224 3' - hopper 87 1 75.34 GTTATGCTTGGGCGCTGCATTTCGGATGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCTCGTTCGGAATTACACAACTGGTAGTGACTCATTAACTTTCTCTTCTGCACAATGAATATTTATCGAGTTAGTTCTTTGTTACTGG:1 + chr3L 18398319 3' + diver2 173 2 62.86 ATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAACAATAATAACGTTAAGGCAATACTTTTTTGGCAGATTTGGTGCAACTACACACAGAATTTCTAACATTCATATTAGAAAATATGTATAATAGAATAGTATTAA:1 + chr3R 29228004 3' - 1360 346 1 67.81 GAGAATACATCTCTATGAACTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGAGAAACTCCTGTCCTCCACTGGCCAACAACGCCAGCGAAGACGGAGGATTGTCAAAAGAAATAATAACCCACGG:1 + chrX 5870698 3' + G5A 2688 1 59.38 TTTTTTTTTTTATTTTGGTCGCATTTACTACCATATTTTTGGGAACGCCATCTGTTCTCTTGTTTGTCAAGGTTTTTTTGTTTTCATCGAATGCGGGTGTTTTGTTCACGTTTTATTGGGGTAATCT:1 - chrX 5501662 3' - R2-element 3580 1 79.53 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGATGAAATAACATGTTATAACATGTTATTTCATCATGGACTCGCATTCCGAGATACCGAGATACAGATACGAATGTGCCAATGGCAAATAATAATAATCGAGTCCGAGAATACTTT:2 + chr3R 23295632 3' + P-element 2883 2 54.11 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACTCTAG:1 - chr3R 23618110 3' + hopper 1369 1 54.11 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCAAATCATAAAGAAACGAAAGATGGATGTATCTGTGGACATTTTGCCCAAAAATGACATAGCCACTATTT:2 + chr2R 6965596 3' - Transpac 51 2 52.05 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGCACTCCAAACTTTGC:1 + chrX 10521781 3' + Tabor 7314 2 76.03 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTGACTTATGCGGGGACAAATCTTTTTTGTAAGCAAAGATTTTGAGTCAAAAAGCCGTACAAGAGTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAATGAAAAATTAA:1 - chr3L 23287169 3' + 1360 3380 2 79.45 AATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACATGGCAGGGGAACGCAGTGAAGCGACTGTTGGTG:1 - chr2R 19318695 3' + baggins 5335 1 57.35 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGACCACTAACAAAATGCAAAGCAACAAACAATCAAATCTAAAGTTTTTTGTTCAGTAATTTGCGCGGCTAAATCTGATTG:1 + chr2R 21160784 3' - Transpac 39 2 54.11 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACCATAGCATTCTCTATTGTTTTGAGCACGAAACATTTGTTATGCGTTGCGCCTTTTAGGAGTATACTTTGAACATAGAACGTTTAAAATAA:1 - chr3L 13428175 3' + INE-1 545 1 43.75 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTAC:1 - chr2R 1234691 3' + HMS-Beagle 6970 2 67.12 ATAATTTCGTTTAACAAATTTAATAAAAAAAGGAAACATAAATAATACACTTTGCGGGGGTAAAAAAAAAAACGACAGAAAAAACGCTAATCACGTTTATTAAATCATGCTGCTGCTGGCTGAAATTTTTCATAGATTTCGAATTG:1 - chrX 8846693 3' + jockey2 3393 1 71.23 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACAGCATGAATATATTTCAATTCATAATAAAACAACGATTAGGTTAATAAA:1 - chrX 17343397 3' - I-element 73 1 69.18 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGGGCGTATGTGTGATGCACACAATATTAAGTAAATAAATGTTCTC:2 + chr2L 18347372 3' + transib2 2749 1 67.81 AAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGAGGTAGTGCTT:1 + chr2R 2875216 3' + TLD2_LTR 126 1 73.53 TGTATTTTTTTTTCTTTTTTTGGGAATTAGAAGTAATTCTTTCCCCGTGTGAACAATTTGCATGGCTACACGTTTTTCTCAGAGCTC:1 + chrX 7247632 3' - gypsy7 5008 1 59.77 TTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTAGTTGCATGTGCTCCCAACCGAACTCCTCCTCGATGGAACTCGGACTGCGATT:1 - chr3R 18060455 3' - mdg1 211 2 64.38 ATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAACTATTTTTTTTTTATTCTATTTATTTTGGTTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAGCCTAATGTGTGTATGAATGAATAT:1 - chr2L 14703376 3' + G2 3027 2 59.12 AAAGTAGGGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCACGTTTAAAAAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGATTTCTATATTATAAGTATTTATTTCAGC:1 - 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chr2L 13585681 3' - Idefix 31 2 62.33 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATACTATACTATAATACTTTAAATAGGTCTTAATCGCACTGTATTTTCTTAATTT:1 + chr3L 13836703 3' - 412 7121 2 63.70 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAGAAAAACAAGA:1 + chr2R 4673661 3' - Quasimodo 19 2 41.10 ATGAACGGAGCCCAAAAATGCAAGTCTTTAAAAAAAATCGGGCTCATGAGTGAACAAACAGCCTTCAACCGGCCTGCCCCCCGAAACGCGCCGCGTTGA:1 - chr2R 7849954 3' - roo 35 2 44.44 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTAGGCTGCCGCAAAAAAGCGACGGACATATTGGTGTGCGAGCGAACAGAGAGGCTAGTGGAGAAAGTGAGCAAAGGTAAACAATTGAAATTGAAATTAGTTGGTAAGCGTAAAA:1 + chrX 21224691 3' + roo 401 1 76.39 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGTATCCATGCGAATACTACCGCAGCACTAATTATTCCTTAATTGGTAGATAGTTTCTAGTTCCGCTTCGCTAGTTTTATTGGCAGA:1 + chr2R 11159377 3' + roo 9037 1 60.96 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGTCAAGAACCTGATAATCGAATAAAGCTGGGCAAAGGTGAAAAGCATGACTCATAGAA:1 + chr3R 13973048 3' + 412 7483 2 59.59 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATCACATCAAATATGATTCTGACAATTTGTTGACACTTCTGTTTGTAGCTTGTGGGGGCTTTT:1 - 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chr3R 17736836 3' - opus 7024 2 66.41 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTATCACTTGTTACGGACTACCAAAGAATCAATCGTTTTCTTTTTTTGTGTATATGTATGTACTATTCCCTTTTGCACATTCTCTC:1 + chr4 303844 3' + pogo 2078 1 68.61 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGAGGGTTAAAGCCTTGGCTTTCGGTTTCAGTCCGCAATTCTCG:1 - chrX 12066126 3' - transib2 77 1 70.55 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACATTAGGTCTTCATTTAACAGCTAAATATGGTAATGAGTAAAGCACTTGTCTCAGCTTGCGCAGAGCTTGTGCAGCAGCTTATGCCAGG:3 + chr2L 47215 3' + roo 9034 1 59.59 ANTAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGAACGACACAAATGCTCGATTTAA:1 + chr3R 15325152 3' - 297 6602 2 68.00 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTGCTGAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGAACTATCACGGAGCGCACACTAACATTTTTTTAAATATATTAAAGAGAATAATTAATTGTTAA:1 - chr2L 16858661 3' + Burdock 6368 2 69.86 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCTGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCG:1 - chr3R 21276512 3' - BS 5036 1 54.11 AACGGGGTGCCTAGAGTACCAAGTGTTTGTCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAGAAGTTATATAAATCTTGGTAACTGTATATATTAGATAACCCATAGACAAAGGAAAACCAATTCTTGATCCG:1 - chr2L 12818223 3' + hobo 2889 1 50.68 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTCTTTTATTTTCATTGGTTTGTGGCCACGGG:1 + chrX 6736746 3' - BS 35 1 69.47 AAATAAATAATAAATAATAAAATAATATTAATACTTAGTGAATAAAATCAATTTAAGCAATAATCAATTGTTTGAACTTAAAATAGTTACTTTCTGGCTAATTGACTTATTGGTTTAAAATATAAAAAAAATATATCATTTAGAAG:1 + chr3L 15477388 3' + BS 5094 2 48.63 ATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGTTTCAATGCAGCTTGTCATGCATATCACCAAGTGTCTGTCCAGATTTTCCCACTCCCGGGCGCTCCATTGGGCTTCGCAGAAACGAAATCAGTATG:1 + chr2R 21079487 3' + Juan 413 1 56.16 AATTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGTTTAGGTTTCTTTTAAAGTTTCCGTTTGAATTGCTATTTGGTATTGATATTAAAGACGCCGGATACAAATAATTGCT:1 + chr3L 9429559 3' - Burdock 429 1 49.32 GTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTGTGAGGGGTTGGTGCTGCATGTGTGTGTTCGACTACGGAGACTTTGGTTTTCCATAGCAGCTTGCCTGGGCTGCGGTCCGAACTGCGACGAGCGACTAGAGGGACAGAGG:1 + chr3L 5032629 3' - gypsy3 418 1 61.94 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCATATTCGCAAAACGAAAGACTCCAGAACACGAACTTGCTCTCGAGCGCTCTCCGCAAACACCGGCTACTTGTTG:1 + chr2R 8735686 3' - mdg1 7087 2 52.05 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGTGCGAGTCGAAGTCGTCGAGGCGAAGGACACACGAAGCGCTCTCTCCCACACAC:1 - chr3R 23295529 3' - P-element 36 1 42.74 ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTGTACCTGCAATATTGTAAAGGCTTTATAATAACTGAAACAAATTCCACTTAAAGGAACTAA:1 + chr2R 7306570 3' - Max-element 8265 2 52.17 GTTGTTGTTGTTTCTTTTTATAGGTGGCTTATGTATAGTTGAGTTTGACTTTGTTACAAGAGAGTTGGGAGTTGTTCGATCAGAACCTTACGAATGGTTTCGGCTAGTTGTTCGCGCTGCTTAT:1 + chr2R 76689 3' - gypsy9 450 2 69.35 AAAAAAAAAGAAAAAAAAAACGAAAAAAGATAATAATGAAAGCCACTAATTTGGCGGAAAAATAAATGCATAAAATGTGACCAGAAGCCACTGGGTTTAACTGGCAATTTGCTTCGGC:1 + chr3R 9956604 3' - hopper 142 9 83.90 CTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACAATAAACAAACATGAAACAAACACCCACAAGAAGTTGAAGTAATTATAACAACAATTAAGCAAACGGCGTGCGTTTTTACAGCTA:1 + chr3L 4422965 3' + I-element 336 1 60.00 CATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAAAGTGTGTGTACAAGTATGGAATGCGAGCAAGGGAGAAGGAGATGAAAAACAAAAAGAGAGCGATGCATAAACACTTGCAGGTGCCATATATTGATTGGATGTTCATTACTAAAAATAAAA:1 - chr3L 10146601 3' - accord 184 3 74.66 TATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGT:1 - chrX 20999472 3' + BS 5066 1 62.33 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGA:1 + chrX 20999614 3' - BS 34 1 56.16 ANCAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATCACTTTGATTTTTTATTTCAATTCGCTAAGCGGAGGGGGAGTTTAGAGGCCAGGAGGGCGCATCTCAATCC:1 - chr3L 6518545 3' - 412 51 2 51.37 TTCAATTATTTTGTTTACAAAAAGCAAAAAAAAAGAAGCTTTTTTATTGTTATGAAAATACTTTAAGGAATATATGAATTTTCACATATCGTGAATCTTTTGGAAATGGGTACTACGAACACGCTGCAAATGATATCCAAAGACTA:1 - chr2L 20531700 3' - Fw3 19 1 69.18 GATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGCGACGGCAATTGTTCAAAGTATTTATGGGTGCTGAATTTGAATTGCTTGGCAGAAGACGATTGGTTTTAAC:1 + chr2L 17875093 3' - I-element 291 1 53.42 TGGCCAATTTCGTAACAATATGATAAAATTGCACGCTGATTAAAAATATCAAATTGGATTTAAAAAAAAGCCCAATGAGACACGATCCCCGGCAGGTGAAGACCTAGCAAATATCACCACACTCACACGTTTATC:1 + chr3R 19770963 3' - 1360 3116 1 50.37 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACAAATTGCGTAAAAATGCAAAGTTGAATATAAGATAAAATAAGTTGTGCCAAAATCCAACATTAATAAATACAACAATAATAAGTATTGTTAGA:1 - chr2R 10809100 3' + mdg1 37 10 76.71 CTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACTGTAGTGGACTGTATTTATTTG:1 - chr3R 19450151 3' - roo 9002 2 81.51 AAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAAAAAAAACTTTAATTAAATTTGAATAGTGCGTTTTGTAGATGTAAGGAGGGGTTCGGCCGAAGTGTATAGATAGATAG:1 + chr2L 21363121 3' + X-element 4674 1 60.45 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGCGGCTTAAATCACATCTTTTTGGTTTTTTGATGTGAGCGAAACGAA:1 - chrX 8200133 3' - flea 4767 2 77.40 ATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAATAGTTTAAGGAGTGTAAATTTCTGTGGAAAACGTTGTAGCCGGGCAAAGCTAGACA:1 + chr3R 31864362 3' + I-element 228 1 61.64 TAAAAAATTTAACAATTTATCACTTGTTGCTTCATCTTTAAATGAAATCAACTAGGCTCTCTCCAAAAAAAAGAAAATACATACTGCAATGTGTGTAAAAATTCCTATTTCGGAATTTGCTTGAAAGTGAATTTTAAAATATTTA:1 + chr3L 16988325 3' + NOF 4123 2 73.79 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTCCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGATGGGCGAGAGG:1 - chr2L 17205189 3' - hopper 58 1 62.79 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTGTGTTGCTTCACAATCAACAAACAAAATATCGTGTGGGCTCGCAAA:1 - chrX 19266841 3' + roo 347 2 61.94 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTCTTTTACTTTATTTATATATCCTTTTTAAGGAAAT:2 + chr2R 23780587 3' - Ivk 99 1 74.66 CGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGTTAAAAAGGTAATATTGTGACCTCTGAAAAAATTAGATTTTTGATTACAGATCTAATT:1 - chr2R 5539211 3' - R2-element 3310 1 60.27 GTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGGGGCTTGTCTGCATTTACATATTATCGATTCCCGCTGCCTCCTTCGCCC:1 + chr3R 9886151 3' - hobo 171 1 63.89 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGGGTTATATATTTAGAGGTAACTGTTTTGGATTTCTTTATTTGTGTGTCTTGTCTGCGACGCGTTTGGCTCATTCAACTTAGCCATCGCGTTTCGTTGT:1 - chr3R 23911301 3' - 3S18 5788 2 68.49 CCTGAATATAATTTATCGCTCTGGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTAT:1 + chr2L 20266024 3' - roo 8740 2 69.18 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTGCAATTGGTAATTACACAGGCAGTCGAAAGGGACAAACAATTGCACGCTCTTACTGCTCACTTTTCCTCGAATTTTGTTTTAGAATAAATACACA:1 + chr2L 6647766 3' - mdg3 27 2 67.81 GCCATACATTGGTTTGGCACTATGCTCTCCACTTTTATCGCTTTATGAATTATGCGTCGCGTGCGTGCGGTGGCGTTGCGCATACGCAATGTTGGACCTGCCGCCTTCAATTCGCTGGCACTC:1 + chr3R 31142982 3' - 1360 3357 1 44.72 AGTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCC:1 + chr3L 25401034 3' - Doc 35 1 52.74 TCGAAAAGTGCAGTTTATGTGAATGCAAAAAAACGCCCACCAAAAACCACGCAAAAAAAAACCGAGCTAGTCCAGCATTCAAAATGGCCAAACAGAAACAAGCAAACGCAAACCAAAAAGGAAAAATATCATACAGTTTTAGGAA:1 - chr2L 7846672 3' - Cr1a 271 1 76.55 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTACATGCTCGCACAGTTAGCAAAAGTTTATTAATTTGCTGCACATCGGGTTTGCCCACTTTTTATTACATATTATGTGTCTTTGTGGAC:3 - chrX 18817246 3' + transib2 2794 1 65.07 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTA:1 - chr3R 4679450 3' + hopper2 1547 1 57.53 ATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTACAGTCTTTTGTTTTTGATTTATTATATGTTTTTGATTTATTAATGTCTTCATTATTTAACATTTTGGTGTTAGTTACATCAATTTTGCCAGTGTGAATAGTTTCCATTTAGGTTTTCAA:1 - chr2R 5398965 3' + 1360 420 1 71.23 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCGGGGCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCG:1 + chrX 21087686 3' + mdg3 240 2 67.62 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACCAATTTAACGAACAATCAGCAGGTGTAATATCACGTTTGGCCACTTCAAATATACATTTTTTTTGGTATAA:2 + chr2R 6847853 3' - Doc 56 1 53.79 ATATTATTATTAATAATTATTTATTCAGAATAAAAATATTGAATATTTGTATTATATAAAAAATATCATAGAGAAGTGATTTTTTGTTCAAACATGATGCTGAGCAAATTCCCCAGATATATTGACTAGATCTTTATAATTTTTTA:1 - chr2R 11534684 3' - gypsy9 297 2 54.11 ATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGA:2 - chr3R 22642313 3' - blood 7103 2 78.08 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATTGAGTTTCCATTATAAGATTGATGCGAATGATTGCGCATACGAAAAAT:1 + chr3R 19225085 3' + HMS-Beagle2 275 4 55.36 GCTGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACTCGACCATTAGGCCACCGACCATCATGGTGAGTCTTTCCGCCGCACAAGGTGATTGTCTCACCTGATCTCTTAATGAACCTGTTTATTT:1 - chr3R 31722535 3' - Circe 7211 2 50.00 AATAATTATAAATTTAGGTTCGCCCAAGTGCCATAAATATGCAAATATGTTACGTGATTTCTTTTACAGATTCTGCGATCGTAAAGCAAGCTATCAAA:1 - chr3L 18505960 3' - I-element 246 1 76.53 AATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGACTGCATGGCGCTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATACATATTTTCAACACTCCTTCTCAATGCAATATGTCAACC:1 - chr3L 26544686 3' + Dm88 4172 1 69.18 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTAATCACTTTAAACATTTACTTAACCCATTTTATGCTGATTACGCCCCGCAATTAAATG:2 - chr3L 18505650 3' + I-element 5288 1 62.33 TAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATAATTATAGGATATAGTAATTATATGAATGGATTAAATGTAGGCAAATAATAAATACAAATATTATAC:2 + chrX 5323320 3' + Juan 4154 1 54.11 GGGCGTTGCCAGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGCGACAGTAGAGCGCGAAAGTCAAAATTAAACTTAAAATACGAAACTAAAAACCAAGCCAAGTAAATGATGTAAGTTTACACAAGAATACCCAAAAAAGAAGAACTTC:1 - chr3R 7184394 3' + Rt1b 37 1 56.16 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTTTTATTTTCCAACGCTTCGTCCAAGAAAATA:1 + chr3L 20898599 3' + roo 320 2 80.14 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCATAATAGCAATTCAGGGAACAGGCAGCGATATTAA:1 - 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INE-1 552 1 77.40 AAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTACACACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAGACTACTGCGATGACTTTTGCCCGATTTC:1 + chr3L 22960835 3' + Tirant 205 2 78.77 GGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCGAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATACGAAATCTAAACATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTC:1 + chr3L 14971177 3' - 1360 3342 1 78.08 AGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCAGGCCGTAGAAATGAACTATTGAACTAACGCAGTAAAATCTCTTCGAACTT:1 + chr3R 27083105 3' - jockey 4611 1 72.60 GTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATGTTTATATATACTCTATGAGCGCATAAGCCAAAAGTCCAAAGTCATGGACTAGGCAACG:1 + chr3L 5061650 3' - 17.6 56 1 63.70 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGTGTCTGTATTAAAAAGGCTAGTGTGCTGTTTTCCGCTAACAAATGGCAACCACC:1 + chr3L 19111602 3' - Doc 69 1 65.28 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGATGATGCTGCTGCTTTGTTGTGTAGTAG:1 - chrX 20434136 3' - hobo 56 1 74.55 TAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAGCACCTGAAAGCGAAACACCTGCTGCAGATGCCACAGCATGGCAAAGGCTCAC:1 + chr3L 1692113 3' + blood 7321 1 64.38 CACACAATAGGTTAAGGTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCCTGGAGGCACGGGACCGCAATCAAATAGGA:1 + chr2L 22225108 3' + G5 4777 1 75.71 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGTCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCTGCGTCCTTCGTCCTGGGATCCCTTTT:1 - chr2L 8338145 3' - P-element 43 1 32.98 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCT:1 + chr3L 7889637 3' + roo 8989 2 74.66 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCTCCCTCCTTCTGAATTTTATTTTGACTAGATTTATATTGCATACTTTGTTTTAAAAATTTGAAATCAAGATGTTATATTTCAATTGCAGTATATCCGCATTTCTA:1 - chr2L 12394967 3' - Tabor 6857 2 67.81 CGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTCAACATATTTCAACACATAATAAATGATGGTATATAAGGGCTT:1 + chr3L 19350056 3' - 1360 3214 1 58.90 CTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTCGACCAATCCCTTTTTTCCTACA:1 - chr2R 1320624 3' + diver2 359 2 74.66 ATTTATGAAAAAAAAACAATGAAAACACTTAAAAAAGATTTATACTTATGCAAATGTATTTCATAAGGATTATTATTATGCTTCTATTCTTTGCTTAAACATAATAAATATGAATAATAATATACCACTAAGCTACCACATATAAA:1 + chr3L 10500566 3' + looper1 1693 1 65.75 TTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCTAAAGCTGGACGTCGGCATTTTACGGGCTCGTGGGGCAATCAGCACGCAACGAAACGAGAGAGAAATCAAAGATTTGCCAATCGAAATTCCTCAGCAATTTGTGTCGACTCTT:1 + chrX 17017435 3' - FB 128 1 74.65 TTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTGTTAATTGATTTATATAACCTAGAAAGTTAATTTTAGATTTGGTTTCGATGGCAGATTGGAATCTTCCGA:1 - chr2L 2889516 3' - Doc 4461 1 52.05 CGGTCATCAAAAAAACGGGATATTGTTGAAACGCATTGCGTGTGAAAACAAAAGCGAAACTCTATAGCTTAAGGCTGGAAAGCCATTTA:1 - chrX 9479019 3' - HMS-Beagle2 6831 1 57.30 GTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTC:1 + chrX 8200287 3' + flea 4942 1 67.81 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCTGCTTTTATGGAAATGTTTGATATCTGTTTGCTGCATATCAATTCAGTTATATT:1 - chr2L 13556342 3' + transib2 2787 1 53.78 AGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTGTAGCAAATGCAGCAGTTAGGGCAACAGTAACAACAATA:1 - chrX 14573062 3' + F-element 404 1 46.62 TTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGC:1 + chrX 13490727 3' + 297 323 2 80.74 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGATGCCTACGAGATTGTTGTTCAAGAGTTAAAAGAGAGCTTGAACAAGGCTTCAGTTGATTTTACTCAGCTAAAAAGCAACAGTGAGAAGCTACACAAA:1 - chr3R 15790806 3' - roo 8665 2 70.73 CTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCC:1 - chr3R 4357528 3' + Tc3 1663 1 54.62 AAATGTGGCTGCATAGTGCCCAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTCAGTGAGAGACGTGCGGGAGCGTAAAGCCATTTGTTGGCGGGGTCCG:1 - chr2R 3073459 3' + 1360 3344 1 57.14 GTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAGAGGGCGGTATCATCTCTGCTTGGCTGCCATATATCAAAACTAATTGGGTGTGTCCGTGATCCAATAA:1 - chr2L 19924679 3' - roo 8614 1 53.42 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATTTGTTATATATTTATTCATTTGTCCGAACAAATTAGAAGAGCAAACTCTGAACATATGCAATAGTTATACAAATTGTTTGAAAACTCAAAA:1 - chrX 2479457 3' + mdg3 5486 2 66.41 AAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGCGCACGTTTCCAAAAGCCTTAATTTTTTCT:1 + chr3L 12889489 3' - Cr1a 149 1 45.89 CGATATCTCAGGAAATATAAAAGCTAGGCTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGATAAAGACGCAGTGATCAAAATTTCTGAAGACTATGGCAAGTGACAGCGATGTGGACAGCGCATAAACCGAACAATGAAAAAGACGCAG:1 + chr3L 17281101 3' + INE-1 147 1 50.69 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGA:1 + chrX 11661509 3' - pogo 46 1 54.11 CTATCGNTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGGCAAATTGGTCGCGACCGCTGACGGATAGATACATTAGGCCAAAACACCCGCTGATCGTATTTATTTTGGGGTAGTTAGTTGACGATGATTGTTTAATGACAATGTACTAT:1 - chr3R 16157213 3' - pogo 8 1 44.52 AAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATT:1 - chr3L 22861784 3' - S-element 76 1 69.18 CGTTCCTAATGTACCATTAGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTGTTTCTTTTTTCCGTTGTTGTTTTCAAGCCGCTCAGAGTTTGTTACATGCTTTGTGTCATAATTCACGATAGCTCCTTAGGTGTTGTATGTCT:1 - chr3L 24264759 3' - Porto1 4365 1 60.71 ATTTGATTTTGATTATTGGCCTTTTGGCAAACGGTGATCTATAGATTGCTACATCGTATAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACTCTCTCTTATTCGCAGAAATTTATGTGACTTCAATTAGATAAATAAGCTTTTAATGATTTTC:1 + chr2R 11662638 3' + 3S18 412 1 56.16 AAAAAAATAAATATAAATTAAATTTAAATTATCTCTGGCAAGACGAATATTAACAAAATAATAATATCAGAACGATATATATTAATGGGTCGTATTTAAGTAAAATGAATTTATGTTAATATAGACTATATTTAGGGCATTGCAAT:2 - chr3L 12731659 3' - S2 97 1 73.97 ATGCTTTCGCTGCGTAGGAACCATGGTGCCCCAGTGATAGTCGCAGAATTGCAGAGCCGGTTCCAGTTCATCGATTACCAGCTTGCCCAGACCTAGATTAAAGAG:1 - chr2R 16692335 3' - Doc2-element 4466 1 66.67 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATATTAGTTTTCAGGCGAAAAACCATTGCCTACTTTTC:1 - chr2L 17809202 3' + jockey 4938 1 67.83 ATTTTAACTTTTTTAGTACATAACACTAATATATATTAGAGTTATTTTACATTATATTAATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCAAACCAAGTTTTCTTTTTATTTAAATGGGGTGGTGAATTTTATTGAATCTTCTCTTGGTATAT:1 + chr2R 5284498 3' + Cr1a 4268 1 56.85 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCTGTCTATTAAATTTAATTTTTTTCCAGACATCATATTATTATATTATTTTTTAAATAGGTTCTTTTACATAAAAAGTTCGCACACGTGCCCAAAATGAAAATCAAATAATAACG:2 - chr2R 15326787 3' + copia 248 1 79.45 TATGTATATCTGTATATATATGCACTATACTACGAGTATATGTACATATATGCACCGATATCGCGTGGGGAGATCTCGGCTTGACATTGGCATCTCAACGGCAAGCAGGG:1 - chrX 15543344 3' + G3 4508 1 73.64 CAACAGCAACATTTAAATAATACAACAGATCCAAACCCGAGAATCTAGTAAGCCCCGGGGCTGGCAACACTTCCCACCATAAATG:1 + chr3L 18356384 3' + Doc4-element 2634 1 71.76 GAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTATACAACATCGAAAAAATGAACTAAGACAACCTTGATT:1 + chr3L 3501797 3' + Bari1 1625 1 74.66 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACAGCCTTCAACCGGCCTGCCCCCAGAAACGCGCCGC:1 - chr2R 7849959 3' - roo 66 2 73.60 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGTAGTATAGTTAAGGTCTTGCAAGTATAATTAGTAT:1 - chr2R 7244839 3' - diver 88 2 76.03 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGTTTGCTAGTAACTGTGAATGACACCGCGAAACGTTGTGGAATCGTGGA:1 + chr2L 16690715 3' + P-element 2820 1 37.93 GTTAGAGTCTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATAAAGAAAAATGCGGCATGCATAAGTAAAATTCATGTTCAATTTGTTTGAATTTCCTAAGAATAGG:1 - chr3R 5130062 3' + invader1 99 2 68.75 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACTTATATACAAAGGCGACAGCGCCCTCTAGCGCTTTTCCTTTTACAATAAT:1 - chr2R 15375349 3' - 1360 71 1 57.46 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGGTCGCCTAAAACGTGATCAAATTGCTCGACCGAAGGCACGAAATACAATGAGCACTTTAATTGAATTTCGCTTTGTTTACAAACTTTTCTTTT:1 - chr3L 12004206 3' + P-element 2862 1 65.52 ATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTAGCAACATAG:1 - chrX 15903136 3' - INE-1 95 1 73.29 AATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGCACTATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCTTTCGTAAAAATTAGACAACGACCAAAAAAAAAAACTTTGAAAACTCCTGTGACCTAAAATGAAAC:1 + chr2R 16690165 3' + Doc3-element 94 2 53.42 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCTGCGTTCATTTCGCTGGGGTTCGGGGTTAAGTTCTTTTCATCATGTTTTAAAAGTTG:1 + chr3R 12242356 3' + transib2 2764 1 61.38 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCGAGCAAACAAACACACAATTACAGTTACAGTTGTGTTTGTCTCTCCTCGTTGCTGTGCGCACTGCAAACAAAACTTCCTAT:1 - chr2L 16540907 3' - hobo 27 1 64.66 TTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATCCTTCACGATGACAACCGTAATCGGTGGCAATTGAATTTCCGGC:1 - chr2R 7401204 3' - micropia 331 2 64.34 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGACTATGCGAAAATTCATATATAAATTTTAATTTTATTGTTTACTTTAATATGTATAATTCGGCTTTATGTCTATTTGGATAGTACAGATTATT:1 + chr2R 15326981 3' - copia 29 2 52.05 AGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTTATTTTGATTATTGTAAACTAAACGTTTCGTTTTTAATATTTTTTAAATTATTTTGTAGGGGAGCGAGGTTCGCATTACTTTTGAACCT:1 - chrX 12722896 3' - R1A1-element 5114 1 61.64 GTCCGTCCATATCGGCGTCACTCATAATGATTTTCACTACTCAATTTGTACAGCTGCGTGAGTTACCAAATTGCCTTAGATCGACACGGTGGGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGTACATATAAATCCTTCTTAT:1 - chr2R 981769 3' - micropia 418 2 58.90 CATGCAACTCATAGTTAGATTGTAAGTCCAAATGGCGAGATATGTCCTTGTGCTGGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATCTTCATTATCGTTGATGAATGAAGAATTCATTTTTT:1 - chr3L 23052367 3' - Cr1a 4160 1 60.96 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGATATAATTGTGGTACTGGATTTTCAGTTTCAACTATTTCTGTTTTTGATTCTGTTTCTTTTTCGATATTCTTCTTGTGTGGCGCTGTTTTACATTTCATAT:3 - chr2L 22674739 3' - mdg1 7058 2 76.03 TTACATAAGATTTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTTTTTAAATATATTCGGGATCATGGGGGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTTATATTAA:1 + chr2R 11164478 3' - roo 8710 2 55.77 TGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCATGCACAAACCCATGCCCATATCCATACCCATCAGCATGCACAAACCCTTTGCATTCAATCGTAAAGTTTTCATTATGTTTGAGATCTTCTCTACCTACGGA:1 + chr2R 2673488 3' - micropia 5314 2 40.00 TCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATACATACATAGGAATGGAAAGAAAATCCCATCGCGTGTCTTAGTTA:1 + chrX 13490739 3' + 297 324 2 73.97 AATCTACTCGGAACAGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAAGTTGGGACTATCAACTTCACTACGAATAAGCTTACAAATAAACCAACATCAACAAGAGAAGACCAATTAAGTGAATATTAAACAGCAACGACACCGGCACTCAACCA:1 + chrX 3701226 3' - Cr1a 4101 1 55.17 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGTTTAGATGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATATTATTGGCCAAATTTATTTATCAAATTAAAGGAATGTATAA:1 - chr3L 26505850 3' - copia 42 2 56.85 AAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAATATACCAATGATTGCAGAGGAGCTCCTTGAGTGGCGGCGATGG:1 + chr2L 11257097 3' - rover 7027 2 71.92 TTTAAATTTCAAAATTTTATAATTTTTCTAGGATATCGATAGGTACTGGGAAATAAAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTCAAATAAATATTTGTAAGATCTGCCGCGGAATTTCTTTGCGACTGATGAAGGAAGTAACGAAAAT:1 - chr3L 23984896 3' - 1360 3035 1 56.85 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTCTTTTTGCCGCTGCTGAAACTATTAACTTGCCTATGCGATGTGGTAGCTGCGGCAGCTCCACAA:1 + chr2R 7850039 3' + roo 353 2 53.42 TATAGTTATTTTGCATTATATTAATTTCCTCGTTTATATTCCATATGCCTAAATTTAGATTTTGTTTAACATTTATATT:1 + chr3R 3399907 3' + Cr1a 4318 1 56.96 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATATTTTTATATAATATTTTAATATTTATTTTTTTTGTTTGCAACTCAGATTAATTACCTAGTTCTTGTCTTAAAAGCTTGTGATA:1 - chr3L 23694787 3' + Quasimodo 7343 2 68.28 GTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGACAACTGACGGGACATTAGTTCGCCTCATAAATAAAACAACAATTTTACTTTATATGTATATCTTAAATAGAGTTTTGCTTGTCAGAACC:1 - chr2L 14074470 3' + 297 310 2 74.66 GTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATGCTTTTTTGCAAAGAAAACGTGAGATGATTATTAATGATTGTTTACTTAGCATTTTAAAGGTGAACGATTCAATGAACGAGACAGCGAAACA:1 - chr4 120443 3' + flea 496 1 65.07 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATGAAAAGAGTGAAACAAACAAGTGGATTGATTTAAAGCGCCAATAATTGAGCACTTCGGATGCAAATTTAGGATTTGGATTTTAAA:1 + chr3L 16970488 3' - roo 8699 2 58.22 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTTCTTCGGCAGTTTTACCATACATGTGAACGTATATTATACAAATGTTGAGCCACAAGTTGGGATTTTCGGTGTCTGATTTATGATAATAACTCTTGGAGGAAGGGCTT:1 + chr2L 12818379 3' - hobo 11 1 76.22 ATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTATGTACAATATATGAATGCCATGAAATCGTTCCCTGCGTCGAATA:1 + chrX 15200926 3' + 17.6 428 2 69.57 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTTATAAATAAAAGCCAATGC:1 + chr2R 15376203 3' + 1360 3351 1 56.83 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCCCGTTTCTGCAAACACCCTACAAATCAAATTAAGATGATAAAAGCAAATTGCAAATTGTCAGATGTCCGCCCCAAAGTCGCCCCCTTGGCAATGCATATTTGATGTTATCGAT:1 - chr2R 22034597 3' + copia 247 1 79.45 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTCGACTTTCTTAATGTTAATTTCTTGCGAAATATTCGTTGTTTGGATTGGGTTGTTTTGCTTTCCGAAAATGATACGTTCTTAGA:1 + chr2R 17878660 3' - Doc 43 1 56.16 GTGATCAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGGAAGGGATTTACTTTAAATCATTTTATACGATAGCTTTTAAACGTTTTAGCTTACTACTTTTTTTTT:1 + chr2R 21572954 3' + R2-element 3580 1 61.05 CTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTTAACAGGGCATCTCGTTATTTACTCCATGTACTGTTCGACTCGAAATAAAAAAAAGTACTCATGCATAAGTCCGCATTCAGGATACATTCGCCATCT:1 + chr2R 2318278 3' - ZAM 7984 2 69.18 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTTCCCCGAGCTAATCCCAGAGAGCTTTGGCAGCTTGCTTT:1 + chrX 18336662 3' - mdg3 5317 2 66.41 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAATGTAAAAAAGTTGTAGAAATCAGGCATATGAATATTAAGATGCCCTATGAGATTTGATTATTATTAATGGTAAACATATTTTTAGATAAAAGCTATTTTTGATTAGCTTAA:3 - chr2L 14874114 3' + copia 245 1 52.05 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTAACAACTAACATAAAACGATTACGCTGCAAATGTACGGTTAGCCACACAACTTCG:1 + chr2L 6103028 3' - roo 61 2 62.94 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCGCAATATGTTTTCAATCGGAAAATACAATGCACTGCATACATTTAGACACCTCACGCGGTGACTTTCATTTCGGGTAATCAAATAGTTTGAACAAATTCCAT:1 - chrX 19074724 3' - mdg1 7058 2 67.81 TATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGGT:2 - chr2L 13585682 3' - Idefix 32 2 61.64 TATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTCTGTATTTATAAACCAGAAACTGGGTTATGCGCAAACTGAGAAATCCACTCTGAATATTTGCCATTCCCAAATTTGGTAA:1 - chr2L 13585680 3' - Idefix 30 2 63.01 TAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAATTTCGACTACTTTTAAGCAGTTTATATTTATTTGGTCATCTTTTTAATTTTATT:2 + chrX 12129405 3' + flea 4951 1 60.96 TGTATGTACGTTACTTATATATATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGGGGGGGTAGATACACTACAATAACAATAAAAACACATACATT:1 - chr2R 5106301 3' - Stalker2 7287 2 68.54 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAATTGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTAAGAACGTCGATATCTCATGAACTATAAAAGCTAGAAGGTGGAGATTCAGCATACAGATTCTAGTTTTGAACGCCTTGATGCTAAAGACTACCTTT:1 + chrX 722218 3' + INE-1 89 1 78.08 AAAATAAAATAAAATAAAAAGAAGAACAAATTATATTTATTAGACAAAAAAAAGTTGGGGTGTTTTCTGTTCGTTTCTCAATTAGTTTGAATTTGCCCTACAATATTCCTTAGGTTTGCTTGGTTTGCCTCGGTTTATTTACTATT:1 - 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chrX 12986527 3' + roo 9015 2 57.53 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATAACTACAAACTACCTAATAAATCATGCTCATAACTTTCCATTACGTTCGAT:1 - chr3R 29084897 3' + 412 7474 2 65.07 CGACAGTCCAAAAAATATTGGTTCACCTCCAAGATAAAAAAAAAATCGTTGCGGAGTTGGTATGGGTTAGAGTGGGCATGCCCACTTTTCCAAAATATTCATGGGGCATACAATGAGTTCAAACAAAAGTTAGAACAAGGTAGAG:1 + chr3R 16621116 3' - hopper2 365 1 33.10 GGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTTTTTTGTTTAATTCATTTTTTCTTTAATTGCTAAAAAA:1 + chr3R 19302738 3' - F-element 4239 1 76.03 GCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGTTTCAAATCTCTAAGTGAGGTCATTTTGAACGATTTGACGGAGAGTGAGCGTCG:1 + chr3R 8288334 3' - P-element 199 1 36.62 AGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGGAAATGTATGTAAATGTATTCCTTCGCTGATTGTATTCTAATGCAATCGGTGACCAAGCGCACG:1 + chr3L 7596108 3' - Tirant 8077 1 53.12 AGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGAAATCCACGATATAATCTATCAATAATTAAACACAAC:1 - 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chr3L 27357821 3' - Tc3 1711 1 70.41 TTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTTATATGTTTAGGCAAATTAGTCTAAAGCTTTGTGAGAGTGCCAATAAGCAAATTACCCCAGTCCCAGACCCCC:1 + chr2L 15913352 3' + transib2 2801 1 64.52 AGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAGCCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCCTGTCTCCCCGTCTCACTCCCTCCCATACTGCCCGTCTCTCTCCGCGAACGTCGCGCCGTCTCTGTCC:1 - chr3L 16211468 3' - transib1 19 2 71.03 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCCTAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCCATTTCCTCGAAATACTCTACATCGTCGTTATCGGAGT:1 - chr2L 4123829 3' - transib2 38 1 58.90 TAATACTAATAATATTAATACTAATAACAATAATACGAAGAACTTAAGACACAGGAGAAGACAACATACATACAGCCATATAAATGCAATAATCGTAAAATATATAGTTCTTTAGCCATTTAAAATTCCATTCACTTTAAGTGAAT:1 - chr3L 19076318 3' + mdg1 39 2 80.14 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGTCACTGACTATTTATGCAGGCAATGTGTGTGGACCAAGATGAAACGGAAC:1 + chrX 661948 3' - 412 70 2 64.83 AAATATATTTAAATATTTGTATTCATTTTTTTTTGTTCACTTTTGTAAATTGTTTTGTGCATTACGATAAATTAA:1 + chr3L 7441386 3' + Transib-N1_DM 292 1 49.33 AGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTCGTAAAATCAGTATAGATGACATCTGTTTAAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGTAAAGGCGGAACTGTAGTTGATGTCGTTCTTGTTGTTAACATTG:1 + chr4 220320 3' - Q-element 347 2 70.55 TCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGACCTTGATTTTTTACGGTTCTCAAATTTTGTGCATGAAAA:1 + chr2R 5941410 3' - copia 4951 2 71.23 AGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTATAATTCAATGTAATTCAATAACCCATAAAATGCAGGCTTGTTCATGAAGATTTTTCCACTTG:1 - chrX 14722105 3' + diver 6054 2 56.16 TTATTAATATTATTAATATTAATATTAATATTTAATCATTTCTGAACCACTCATTGAAACTAACTATAAAGGCAATATGCTTCTTCTTAATCTCTTAACAGATACTCCTTTAGCAAGATTTCAAT:1 + chr2R 13301102 3' - mdg1 7076 2 38.40 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATATTTGAACAACTGGCGC:1 - chrX 8360481 3' - roo 8679 2 75.34 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGTCGGTAAACAAAATACGAAATTAGTTGCTTCCACTCTGTGTACTTTGATATGCGGTAATGAGCATTCTATTAGTACTTATAAA:1 + chr2R 18529986 3' + jockey 4978 1 69.17 ATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACTTTGACCGCGATTATAATTCCGCTTTAGTCAGCGTTGTTTTAAATCTTTCGTAATACTGGCATCCAT:1 - chr2L 17622948 3' + 1360 3170 1 58.06 ACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGCGTTTTGTGACCGCACGAAATTGATATTTTTTTTCGGTTGCGACTCGGGCATTATGTAATCAATATCT:1 + chr2L 1924018 3' - G2 3018 1 53.42 CTTTCAAATATCTAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTGTGAGCTGGCTTGTGGGCATCGCTTATAGGACGTGTGAAAAGGATTTAAATTCTTTAAAATAAAGATTATTACCTTTTAATTCAAATAAAATATTTAATTGAGT:1 + chr3R 3752323 3' - FB 28 1 62.33 CAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTGAAATTGGTTAGTGGCGAAAGTAACGTGGATG:1 - chrX 4808538 3' + mdg3 158 2 75.34 ATTCAGTTGCGTTCTGGCAGCGATCCATACACCTGTATGGCAAGGAACTACAATAATATGCTCTTGTAAATTTAAAGTTTGCTGCGGGCAGCAATTAACCAGGTCATTTTGGCAAGAAGTCAAGAGAAAGCATTCCAAGAGAAATT:1 + chr2R 13271032 3' - jockey2 2930 1 75.34 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAGCTATTAATCAACCGCGATAATGTAGCTAATACGAGTTCAATTGAATCGTCAGACTCTCCAG:1 + chr3R 27160168 3' - 412 58 2 57.53 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAATAAATAAAAAGATATGTCTGCATATATGATAAAAAATATTTAACTGTAAATACTTACACTGTAAATTGTAAATACT:1 - chr2L 16539641 3' + Juan 4164 1 52.05 AAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGACCTGTACAGATGAGTCATAACAAACGGGTTGAACCCACAAAAAACTGTTTGCCTATTGCTTA:1 - chr3R 9557522 3' - G2 3035 2 56.85 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAATTAATAAACTTAATATAACCAGCGCTACTTGTCCGATTTCAGGTATCGTATTATTCCTCTCAATTTCCGCTGCTAA:1 - chr2R 18258773 3' + Juan 4198 1 57.14 GATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTTTACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCATGAGCAAATACAATAAAAATACCTGTTGGCTGTTGCTGAATAGAAGGATGGATGCATTT:1 + chr2L 8811430 3' + mdg1 460 1 54.29 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTTCTCAAAATATATATTTAT:1 - chr3R 24219290 3' - roo 69 2 72.93 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATCGAGCTATGAGCAGCGTACTGAGTTCGTAACTTTATAAGCCCATTGATCTCATCTCCTTTGA:1 - chr2R 14051747 3' + roo 351 2 57.24 GCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCACATATGCAAGTCAAATAAACGTAATAATAAAATT:1 - chr2R 18316053 3' - HMS-Beagle2 83 2 72.60 CCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTT:1 - chrX 21585257 3' - mariner2 277 1 57.55 GTTTTTTTTTTGCTTTTTTTATTGTTTATGATATTTAAAAGCCGCCCCTTTGGGGAATGGTTAAATTGTTGCTCATAAACTTAGCGGAGAGTATTTTACAAATATGTGTCTTAGTATGGTATTGGGAGAAGGGT:1 - chr3L 23965472 3' - gypsy7 5007 3 85.82 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAATAAATATTTGTAAGACATTTACCATATCCATAAAACTGAA:1 + chr3R 13187492 3' + I-element 5270 1 72.60 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTGTAAAGGTCTTAGGTCATTTGCCCACCCTTATTATAATTACTTGGAATGCAAGTCAGGAACTTCAAGCTTCAAAATCAATTCCAGAGCACACAAGAA:1 - chr3R 30813292 3' - FB 23 1 69.86 AGGTCGCGCATTTCCGTTTATGTACGTTCGTTGGATGGAGAACAATGGATTGGACACGGCTATTGATATTGGTACTGGGGATTTCCACTTGTTTTCTTTTGCACTTTTTTTCTCCGATTTTCCATTTGTTGACCCGAGTGCAATTG:1 + chr2L 9138314 3' - Ivk 5018 1 78.08 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGCTTTGTGCACTCTTGAATAGAACGCTATAAAGTAAGCGAGCCAACTTCCAGTTAAAG:1 - chr3L 22960433 3' + Tirant 8495 2 53.68 CCTTAACGTTATTATTATTTGCATATAGCATAGAAATATTAATAGCCGAATCTATGTAAATTATCTCTCAGATACTTTAGTGGAGTTAGTCATAACAATAACAGTGCACATTTAATTGAAGTATTGAATATTGCCAAAGGCCAAGG:1 + chr2R 14287689 3' + 1360 308 1 54.79 GTGGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTATCTGTGGTTTTCGGGTTTCTAAGTATATAACATACGAATGCTGCATAGCCAATCCAGATGCTAAACGCTCTCGACTTTCCCACAC:1 - chrX 9029077 3' - accord 7033 4 77.87 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATAAGGAATTTAAAATCCACGGCATGCTACCAAACCACCAGAATGTTGAATTATTGATTTAAAATCACTTATATTTTCT:1 - chr3L 15913833 3' - jockey 4805 1 51.37 ATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCATCTAATAGAGCTTATGAAAACATGCGAAAATTTGAAGGCTATGATTACGACGAGTCAAATCGTAGCAAAAAAATAATTAATA:1 - chr3L 23773603 3' - Transib5 2944 1 58.40 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCAAAAATTCATTATGTAACTGCTCAAAATATATATTTATTAGG:2 - chr3R 24219286 3' - roo 8742 2 72.60 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAAATTTAATGGTTAGTATTTTT:1 + chr2L 20266057 3' - roo 8700 2 57.55 AAACTATTAAAAAAAAGCTGCAAAAACACACAAATAAACTACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAGCAGCAAAAAACAAACAAATAAACTACCCCATATATTTATATTTACTTTTTCCATATAACCATCTG:1 + chr3R 17723885 3' + Porto1 4426 1 72.60 ACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTACTTATAGATTACTTATATATATATTACATACTTTGCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACACTACGAGTAACGCGTATAAAAACTATTAACATGAGAAGAATTACTGCTTAGGAT:1 + chrX 14815844 3' - INE-1 100 1 75.34 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGCCCCTTAAAGAAATGATTTAGTAATTGGAATATAGATCGCAA:1 - chr3R 7943748 3' - blood 7091 2 70.34 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATATTGAAAACGGTGGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGCCGAATATATTGCATACTTCAAGGCAAAACCAGATGGTAAATG:1 + chrX 8092512 3' - pogo 36 1 59.31 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCATTTTTGGTTTTGCTTACTGGTTTTTTTTTTCGGTGGCTTCGATTTGGGGCCAACTGTTTTGCGCTTTTAATTATGGTTTATGTGTCGCTTACGACGAACACCGATC:1 + chr3R 9595154 3' - Tirant 10 2 79.72 ACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCCACAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGGTCCAACCGTAGTTGCCAAT:1 - chr2R 5530007 3' + 1360 3227 1 62.50 TCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAGCATTAAGCAGTAGGTTCTTAATTATCGAGTTATTAACCTGAGCAGGTGGTGG:1 - chr2R 11211575 3' + F-element 247 1 63.70 TTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTATTAATATAATAAGAGGTAGACTGCAAAAGT:1 - chr3L 24131420 3' - Transpac 86 2 78.08 GACTTTAAATTTATATTAGTTTTGATCATAGCCTTAATATGATAATTTTGTCAAAATTTGTGAAATGAATGAAATATGAAATATGTTCTTAAAACTAAACCGTTCAGAAAAGTAGGAGTTTATTTTTTAGTGCTTTTAGTTCGTTT:1 + chr3L 13358192 3' + 1360 246 1 67.81 AAATTATAAAATTTTAAAAATTAGGTAATAATAGCACATATCAGATTATTAAAAATGTTTTTCATTACAAATTATAAATAGTTTGCAGCCTTAATTTCTTTTCTAAAAAGTATATAAAGAGAAATGTAATTTAATTATGTACAATT:1 - chr3L 18245194 3' + 1360 3032 1 26.03 AATATGGGAGGCAAGAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGGGATTACCCTCATAGATCGGTCCTATGTCGTATGTCCACGCCC:1 - chr2L 4123866 3' + transib2 2695 1 55.30 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCTTAAAACTACCATCTGCAACCTTGGAGACATTCAACACCGGATAACC:1 - chr3R 13300867 3' - roo 8736 2 67.12 AGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCACTT:2 - chr3L 25008285 3' - 297 359 2 78.77 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTACAATGGCCCTGAACACAAACAAATAGAGTAATGGGGAAGTATTGGGGAACTCGATGGGAAG:1 - chr3R 4964089 3' + roo 9016 2 57.93 ATTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTGGAGCCATCATAGGCATCTGAGATGGCTGTTCCAGTTGCCTAGGCGAATCCT:1 - chr2R 10726788 3' + S-element 1501 1 63.70 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATGGCCGGAATATATAGGGGAGCCGGCCAGAACTGATTGCGTTCTCAGATTTATGACCGCACATGATGAGCAATAAAATG:1 - chr2R 11794927 3' + opus 7471 2 65.07 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGAAATGAAAAGTGTGTGATGAATTGGCTGCCTTTCCTTGGAGCTGCATACTTTTAGGCCAATGAATCTGCATATGGAATTCGCTGATGGCCAAA:1 - chr3R 8051091 3' - jockey 4789 1 65.07 ACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACGTCAAATTGCCAGCCAATTTGTTGCCCTTTTTCATTCGTTTCGGTTCGGTCGCCTTTTTTTTCCCATTTTGTTTCTAT:1 + chr3R 11040177 3' - Bari1 10 1 73.45 CTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCTACTATTAAATTATTGTTCCAGCTTCCGCGG:1 - chr3L 21996186 3' - Transpac 79 2 74.26 GAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGTTAAGGCAAAGTTCCATAATTTCTTCTGGGATATATATATATATTGGGGATAATAAAATAAGAGAAAATTTAAAAAT:1 - chrX 21452477 3' - INE-1 575 1 74.10 GGTTATTATTATTATTATTATAGTTCATCGGTGGCTCCGGCGTTTTGTTGATAATAATGACCATCACTCTGCTGTCACTTTATCGCCGAAAGGAGTTTTTCCAGCAGTTTGATGCGAGACTTAATGACATTGATGCAGT:1 + chr2L 12138438 3' - mdg1 16 2 57.55 GATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCTCACACAGGAAAAAAACGTGAAGATCAAACTAATACTGTGTAC:1 + chr3R 28385614 3' - transib2 75 1 67.81 TCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCGCAGACAACGCAGCACCCAGCTGCACAACCACGGCAGCCACTACAATGTAATCAACAACGCCCCATGCGACGC:1 - chr3L 22256449 3' + G2 2891 1 72.55 AACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGACAAACGCAATGGGTGCAGCAGTTACCATCTGTTCGTCCCGCTCTCTCACTCCCCGTTGC:1 + chr2R 20349059 3' + transib2 2766 1 57.53 ACATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTATTTCGTGCATAACTCTTTAATCATACATTTTTTTTTATAAATTTTTTATTTTATAAATCCTACGATTCTAATTGCTTTA:1 - chr3R 17421194 3' - pogo 37 1 56.16 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGAATGTTGGTTCAAAATAAATAGTTGCAAATGACATCAATAATAA:1 + chr3L 16470346 3' - jockey 4750 1 67.83 GAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAG:1 + chr3L 19350051 3' - 1360 3219 1 58.22 ACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTATATATATATATATATATATATATTTGTAATTTTCGTCTAGTCCTCTATGAGCTCGACTATGTGCTTCTTCTATTATAATAGCTTT:1 - chr3R 904922 3' - rover 6980 2 52.05 GAATACTCTAATGACAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATATTATTATATATATTATATTACATATTATTATATACTTACGTAGTTATTAATTTTGTCAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAA:1 + chr2R 3146361 3' - 1360 402 1 46.58 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGGCCCAAAAATTTTCAATTGAATAGATTACACGCAGGTCGGGGGCACCTTCTGCCAAATTCTTTGCTGCACGAAAATATTTGTGGCTTTTCGG:1 - chrX 22840441 3' - copia 4897 2 64.38 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTACTAAATTATTTTCCCTGTTCCGCCCACTGTGCACTCATCTCTTTTCGCAAGGAGGCGGTGCT:1 - chr3L 5881570 3' - pogo 31 1 55.37 GTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTAATGATTATATGATTATATTGGAATATATATGATTTTGTCATAATCCGCA:1 + chr4 834840 3' - INE-1 556 1 37.67 AGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTACTACGCTAATTCGCTTGGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAACTTAAGCGACTAAAAAAATTATGGAAAAATACTCAACAATTTTGAAAAAATGTGGGCGTGGCAGTTTT:1 + chr3L 21609977 3' - INE-1 562 1 54.79 AGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACCAACCGTAACCCGCTGGAGACTCCCGCCCAACACGGTGTCATTGGTG:1 - chr3R 5368601 3' + 1360 3321 1 69.06